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Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTGTCT--ACTAAC-GGTGAT--GAGG-AAAGCATGCGGACGCGGCCAGAATGATTTCCTTTT-AAATTTAG-CAATCGATCTAT-CAGAGTCCG--GTT----CCAAAA---AAAATAAAAAG-TATA--CT-GTAAT------TCCTAACAACAACAAACAACAACAACAA--AAGAATGTCAA-TAC-G-ATAAAGAAACTT-TAA-TCATATATA-ATTTTCCTTTCTAGTCATG-AATCA--ATTCC-CTCAA---TGA-TT-CATTACA-CGGAGC-TG-AC-T-ATGTATG----------------TA-TA-----TT-TGGTTAAAAG-----TATT-TTATAGG-T-CATGTT--TGCCTGTTA-AATATAG-TTTA-TAAAAATG-TA-GTA--TGATTTTCAAACTGTCA-GTGAAAA--TCATTTATACATA--TTTTTTAA-GGGA-C---ATG-----TTTGATA-----------------ACGAG--AAA--GAGCTAAGAAACTATAAAAAATGAAAACAA--TGGTC-TGTTCTATGGAATTAGCCTG-TTGCATACTTTACATG-TTTTAAT-CAG--ACAGGTTTTGAATGT-TATTTTTA-ACATCGTC-GT-GTCATTTTTGATATTTAATAAATG-ACCATTTTTAGT-T-AT-G-T-GGAC-TTGCTTTTATTTATTTTGGAGAGGCA-ACAGGCAACT-TCAGCTTAAACTCCAAGATCCCGCTA-GGAGCCTCAGGACA-TGCGAGAGCTTCTATAGAGCACACGAAGCAAATATACTCCCCAC-ATGTTCCGACGAGATAAAATTTCGATATTTTAAATTAAA-CTGATTAATTGCAATTTAGATAT--GT-GCATAAAGAC--TGGCA-GTGTAAATGAAACCTTAATTGACACACATTCAAAAGCATATGTTAGAT-AT-AACTTTT--TTGTACTGTTAAACAATACAAA-CATACTAATT-------ATAAGAAAAAAACA-TAACCAAAAAAGCCAAAAAA--AAAAAAAAAAAACCCAAAAAACAAACAATC-ATGGAAC-TTTAATTCTATATTCATGTAATACATAAGAAATAAAAACAATTAAA--TGA-TTTTTTTAAAAATTCATTTGTATAAAAGCTGTGTTTTGCCACCCT--ACATACAACAGATAAATACAGCCACTTGGG--ACG---TAGTTTA--CTTTCTGAAAGTGCATA---TTTTTTGCTCTGTTTATTTGAAATC-GTATAATTGAGCA-ATAAAAATTTCAAATCCATTCATATTTGAAAAACAAATGAAG---GAAGGTAA-ACTTTTATG-TCCAATGATAGAGCTAAAACTACAGATTGAACAAATAAGAGGAGAAAGGTTTACACACTAAATTCAGTTCCCAAGGTATC-TGTGGATAAAGAAAAAAAAATAC--GTA-------CGT-ATA---TTTTTTCG-TCGGAATA-CAGGT-TT--TCT---TTTTAAAAAAAAATTGACACAT--ACTATAG-ATCAAT-GA-TAGAATTTGATATGGAA-TCCTCT-GGCGCACCGTCCATG--TTCCT-GTATCATC-GTTAGT--AGACAGTTACTCAA-TTTCT-TAAC-AA---TAATT--C-CAACT----A-GA-TCTATCCTCG-TCTACAA-CGATTT-CGT-TGGTT-CA-TTTAAAATGTCTTCG-GGAATTATTTG-AAATCCTTC-TCTGATAT-CCAA-TTC-TTG-TGT-TAA-ATTCCAAATGCCTTTAAATT--TTTC---A--CTT--T--C-AT--T--C-GGT-GAC-TTT-----C-----CAACTGT-A-----ATTT-------A-AT--GA--CGGTCT------------G-GCA-TTC----A--GGTCC-C-TTGT-A-A---TCACAG--ATA---CAAT-AAC--ACT----G--CA---CCAC-C-T-A-A----A-----ACA---A--AAAG--AATAA-T-AA--TTT-ACA---GC-AG---T-TTG---TC-CTACA---TC-AAAAC----CGGATAGTA---ATG-A-A-TCCCCAA---TCATA-AACCG--T-TTTTCCAAATTT--T-TGAAAG---C-CT-T---GG---ACC-A---GT--CACG--ACCAAAAAC-G-G--TG-T------AAATA-----TC-GTGAACC--AAT-C-CAG-AG-CA-TATT-TTTTTGAA--TT--C--GG----------ACATT-C-CGTT-GA-AACC-C--TCACGTG-T-----C---GT--AA--AC-AAA---ACTTTC---C--CTGTCC-T-TTTTTGACA-AGAT-TG-G--G----CG-AA---TT-T--GGAC-T-A-C--AAA--CAAA-GAAA-CATT-TGTCTTCATG---AT-G----A-T--TATAG-AAAGGAT--TGA--TT--------GGA---TCCAA--AAT--T-GAC--CAA-T---TA-TACC-A-C---GGG-AT-AT---------T--AA-T-AAAC--C-AC-TCT--------A--AAGTA---G-G--T----ATC-G-CCTCG-ATC----TTTC-TA-C-G-A--CAGA-ATT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGAGG-----G--AA---T---G-TG-TCA-AA--C--CT-TG---ATAATAT-GTTTT-GGTAA---G--CA----AT--G-A--TGA--AT-G---G--TA---------------AG--AA--C---AT-GCAT-TTA----T----CTATG-TG----CTG-TTATT--TTGTA-TGACA-ATA--TCATA-----AGTAAG-AA---AT-CAA--CGC-TTTC--TC-ATTG-TATTGCTG-A-GCAA-T-CA-CCTTCTTGT-AACAG-GTTT-C--CACCG-CG-CCA-TC--TTTAA-AAG-CGACCATTCC-GC--TCAGGTTA-CAC-G--ACAGTG
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gi|3                          : acataagaaataaaacaataaaaaatgaatttttttaaaaattcatttgtataagctacacccctaaaatacaacagataaatacagcacttgggggacgggatagtttaacttttctgaaatgcatagtgttttttgctctgtttatttgaaatctgtataattgagcacataaaatttcaatccattaatttgaaaacaaatgaagtttaatggtaatacttttatggtccattgaagagctaaaactaagattgaacaaataagaggagagaggtcagcacactaaattcagttcccaagtatcttgtgataaagaaaaaaaataccggtaggcctaccgtcatatctttttttcgttcggaatatcaggtagttctttttaaaaaaaaCTGTCT--ACTAAC-G-TGAT--GAGGGAAAGCATG--GAC-CGGCCAAGATGATTCC--TTT-AAATTTAA-CAATCGATCTAG-CAGAGTCCA--CTTGTGGCCAAAATATAAAATAAAC---------CT-GTACA------TCCTAACAACAA----------CAACAA--AAGAATGGCAACTACCG-A-AAAAAAACTTGTAAATCATATATA-ATTT-CCTTTCTGATCATG-AATCA---TTCCGCTCAAAATTGAATT-CAT-ACAACGGAGT-TGTAC-TTATGCCCGCCCCCCCCCCCAAAATTA-TAATTTCCT-TGGTTAAAAAAAGTTTATTATTATAGG-TTCATGTT--TGCCTGT-G-AATA-AG-TTTA-TAAA--TG-TA-GTAAAGGATTTCAAAACTTTCA-G-GAAAAAGTCAGT-ATACATT--TTTTTAAA-GGGA-CCATGTG-----TTTGATACACCTCCCCCCTCCCGCGCGAG--GAAAGGAGCTA-GAGA-TATAAAAAATGAAAACAAATTGTTCCTGTTCTATGAATTTAGCCTGGTTGCA-ACTTTATATGGTTTTAAA-TGGCAACAGGTTTTGAATGTGTATTTTTGTACATCTTCTGTTGTCATTTTTGATATT-AATAAATTTACCATTTT-AGT-TTAT-GGT-GGACCTTGCTT--ATCTATTT-GGAGAGGCAGACAGG-AATTGTCAGC--AAGCCCCAAGATCCGGCTAAGGAGCCTCAG-ACAATCGGAGAG-TTCTATAG-GCAC-CGAAGCACATATACTCCC-ACGATGTCCCGACGTGATAAATATTCGATATTT-AAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGA-ATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAA-CGTAA-TGACA-A-ATTC-AAAGCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTATTGT--AACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAAAAAAAAACATTAACCCAAAAAGCCCAAAAAGGAAAAAAAAAAGA---AAAAAAAAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTATtactcaagtttctgtaacaaataattcccaactagactctatccttctctacaacgatttcgttggttccattttaaaatgtcttctggaattatttgtaatttcgtctggtatccaagttctttgtgttaaattccaattccttcaattattcaggattttcattatcggtgactttcgcactgtaaattttgacggtctgggcatcagggtccgccgtacatcacagaatgaacactggcaccctaaaacaaaaagaaaaataaatttacaacatttgtcctacatccaaccattaatatgaacccaatcatacggtttttttcaattgaaagccttgggaccaagtccacgaccaaaactggtgtaaatatcgtgaccaatccagagcatattgttttgaatttctggacatccgtggaccactccgtgtcgtaaacaaactttccctgtccgtttttgacacatactgtctgaattttggaactaacaaacaagaacatttgtcctctgatcgattaataaaggagtgattttgggatccaagaattgacacaatataaccacgggggatgatcaaatacacgcactctgataagtacgggtatcgacctcgatttctacgacagaagtacacttcaacttggagaggtaatgtgtcaaaccttgataatatttttggtaagcggcaatggatgaatgtagaacatgcatttatctatgattctgttattgtgtatgacaattcatagagaaaatcaaatcgcgtttctcaattgattctgcagcactccacctttgtaacagtttcctccccgtcgccatctttaaaaagaccattccgcaatcaggtacacgacagt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aCTGTCT--ACTAAC-GGTGAT--GAGG-AAAGCATG--GACGCG-CCAGA-TGATTCCTTTTT-AAATTTAT-CAATCGATCTA--CAGAGTCCCT-GTG----CCAAAA---AAA-TAAAAAG-TATA--CTAGTAACCTGTAATCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAATGGCAA-TACCG-ATAAAGAAACTT-TAA-TCATATATA-A-TTTCCTTTCTGATCATG-AATCA--ATCCC-CTCAA---TGA-TT-CA-TACA-CGGAGC-TGTACTT-ATGCAT-----------------TA-TA-----TTCTGG-TAAATG-----TATT-TTATAGGTT-CATGTT--TGCCTG-TA-AATATAGTTTTA-TAAAAATG-TA-GTA--TGATTTtat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTGTCTT-AGTAACCGGTGATTTGAGG-AAAGCATG-GGACGCG-CCAGA-TGATTTCCTTTTTAAATTTAC-TCATCGATCTTTACAGGGTCCCTTGTG----CCAAAA---AAA-TAAAAAGCTATAACCG-GTAAT-------CCTAACA-------------ACAACAA--AAGAATGGCAA-TAC-GCATAAAGAAACTT-TTA-TCATATATATATTTTCCTTTCTGATCATGCAATCATTATCCC-CTCAAT--TGA-TTGCA-TACA-CGAAGCGTG-ACTT-ATGCAT-----------------TACTA-----TTCTCGGTAAATG-----TATT-TTATAGGTT-CATGTTTCTGCCTGTTAGAATATAG-TTTATTAAAAATGCTAGGTA--TGATTTTCAAACT-TCACGTGAAAGT-TCA--TATACATATTTTTTTTAATGGGACC---ATGGTTTTTTTGATA-----------------ACGAGGAAAA--GAGCTA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCGTACTTT-TATGGTTTTAATGCA---ACAGGTTTTGAATGT-TATTTTGT-TCATC-TT-TT-GTCATTTATCGTA-TTAATAAATT-ACCA-TTTTAGTCT-ATGG-G-GGAC-TTGC-TTCATTTA-TTTGGAGAGGCAGACAGga
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATG-ACCA-TTTTAGTCT-AT-G-GAGGAC-ATGA-ATTATTTA-TTTGAAGAGGC
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTGTAG-ATCGATTGA-TA-AATTTAAAAAGGAA-TCATCT-GGCG---CGTCCATGCTTTCCT--CATCACC-GTTAGT--AGACAGcatcctaacaacaacaacaaaagaatggcaactaccgaaaaaaaacttgtaaatcatatataatttcctttctgatcatgaatcattccgctcaaaattgaattcatacaacggagttgtacttatgcccgcccccccccccaaaattataatttccttggttaaaaaaagtttattattataggttcatgtttgcctgtgaataagtttataaatgtagtaaaggatttcaaaactttcaggaaaaagtcagtatacatttttttaaagggaccatgtgtttgatacacctcccccctcccgcgcgaggaaaggagctagagatataaaaaatgaaaacaaattgttcctgttctatgaatttagcctggttgcaactttatatggttttaaatggcaacaggttttgaatgtgtatttttgtacatcttctgttgtcatttttgatattaataaatttaccattttagtttatggtggaccttgcttatctatttggagaggcagacaggaattgtcagcaagccccaagatccggctaaggagcctcagacaatcggagagttctataggcaccgaagcacatatactcccacgatgtcccgacgtgataaatattcgatatttaaattaaaactgattaattgcaatttagaatcagtggcataaagactttggcatgtgtaaatgaaacgtaatgacaaattcaaagcatatgttagataatgaaccttttattgtattgtaacaatacaaaccatactaattgaccaaaataaaaaaaaaacattaacccaaaaagcccaaaaaggaaaaaaaaaagaaaaaaaaaaacaatcgatggaacttttaattctattat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAAAG-ATCGAT-GAGTA-AATTTAAAAAGGAAATCATCT-GGCGCGTC--CCATGCTTTCCTCAAATCACCGGTTACTA-AGACAGagtccctgtgccaaaaaaataaaaagtatactagtaacctgtaatcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagaatggcaataccgataaagaaactttaatcatatataatttcctttctgatcatgaatcaatcccctcaatgattcatacacggagctgtacttatgcattatattctggtaaatgtattttataggttcatgtttgcctgtaaatatagttttataaaaatgtagtatgattt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTAGTT-AGACAGT-ATTCAA-TTTCTGTAAC-AAAATTAATTACC-CAACTTAGAACGA-TCTATCCTCG-TCCAC-A-CAATTT-CGT-TGGTT----TT-----TGT------------------AAATTCTTG-T-TGAT-T-CCAA-TGC-------C-TAATATTC------------AGTT---TTC---A--TTT--------------C-GGT-GAC-TTT-----CG----CAATTGT-A-----AATT---------AT--GA--CGGTCTG-----------G-GCA--TC----A--GGTCC-G-CTGT-A-A---TCACAG--------TAAT-AAC--ACTGG--G--CA---CCAC-C-T-A-A----A-----ACA---A--AAAG--AA-AA-T-AA--TTT-ACA---GC-AG---T-TTG---TC-CTACA---TC-AAAAC----CTTAT-------ATG-A-A-TCCCCAAG--TCAT---ACCG--T-TTTTTCA-------T-TG-AAG---C-CT-T---GG---ACC-A---GTC-CACG--ACCAAAACT-G-G--TG-T------AAATT-----AC-GTG-ACC--AAT-C-CAG-AG-CA-TA-T-TTTTTGAA--TTTCT--GG----------ACATT-C-CGTT-GG-AACCAC--TC-CGTA-T-----C---GT--AA--AC-AAA-----CTCC---C--CTGTCCGTGTTTTTGACA-ATAC-T--G--T----CG-AA---TT-T--GGA--T-A-C--AAA--AACA-G-AA-CATT-TGTC-TCATG---ATCG----A-T--TAT---AAAGGAG--TGAT-TT--------GGA---TCCAA--GAT--T-GACA-CAA-----TA-TACC-A-CG--GGG-AT-AT---------CA-AA-T-AAACG-C-AC-TCTG-------A--AAGTAC--G-G--T----GTC-G-CCTCG-A------TTTC-TA-C-G-A--CAGA-AGT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGAGGT----A--AA---T---G-TG-TCA-AA--C--CT-TG---ATAATAT--TTTT-GGTAACG-G--CA----TG--G-A--TGA--AT-G---GA-TA---------------GG--AA--C---AT-GCAT-TTA----T----CTAT--TGATT-CTG-TTA-T--TTGTA-TGACA-ATA--TCAT------AGTAAG-AA---AT-CAA--CGC-TTTC--TC-A-TG-GATT-CTG-A-GCAC-T-CA-CCT--TTGT-AACA--GTTT-C--C-CCGTCG-CCA-TC--TTTAA-AA---GACCATTCC-GCA-TCAGG-TA-CAC-G--ACcagggtcccttgtgccaaaaaaataaaaagctataaccggtaatcctaacaacaacaaaagaatggcaatacgcataaagaaacttttatcatatatatattttcctttctgatcatgcaatcattatcccctcaattgattgcatacacgaagcgtgacttatgcattactattctcggtaaatgtattttataggttcatgtttctgcctgttagaatatagtttattaaaaatgctaggtatgattttcaaacttcacgtgaaagttcatatacatattttttttaatgggaccatggtttttttgataacgaggaaaagagctaga
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T-GG-AACCAC--TT--GTG-T-----C---GTTAAA--AC-AAA---ACTTTC---C--CTGTCCGT-TTTTTGACA-ATAC-TA-T-------CG-AAAT-TT-T--GGAT-A-A-C--AAAAGCAAAAGAAA-CATT-GGTCT-CATG---ATCG----AGT--TATA---AAGGAT--TGA--TTT-------GGA---TCCAA--GAT--T-GACA-CAA-T----A-TAAC-C-C---GGG-AT-ATCAAAAAAAAT--AA-A-AAACG-C-AC-TCTGAA-----A--AAGTACG-G-G--T----ATCAG-CCTCG-ATT----TTGC-TAAC-G-A--CAGA-AGT-AC-AAAAC-T-CAGAA-AC-T-TG-GAGAGACGGTAG--AA---T---AATG-TCA-AA--C--CTATG---ATA-TAT--TTTT-GGTAACG-G--CT----AT--GGA--TGA--AT-G---G--TA---------------TG--AAATC---AT-GCAT-T-A----TTGCGCTAT--TGAGGTCTG-TTATT--T-GTAATGACA-ATA--CAATA------GTAAGGAA---AT-CAA--CGC-TTTC--TC-ATTG--ATTTCTG-A-GCAC-T-CA-CCT--TTGT-A--AA-GTTT-cag
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atGACCATTCC-ACA-TCAGGT-A-CAC-G--ACAGT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaACCATTCC-GCA-TCAGGT-A-CAC-G--ACAGT
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGTCTCATAGAATCAGAGATGTAAATTGTAAAGGTGTGATTCCTTGGAGAATACCAAGAGACATTTGTAAACACAATATACCACGGCGAGACTAGCTTAATATAAACGCACCGGAAAAGTACGG






Alignments
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Reference ( family-80 )       :   CTGTCTTACTAAC-GGTGAT--GAGG-AAAGCATG-GGACGCGGCCAGAGTGATT-CCNTTTTAAATTTANCAATCGATCTAT-CAGAGTCCN--T-GTGCCAAAAAAA-TAAAAAG-TATA--C-T-GTAAN------TCCTAACAACAA---------ACAACAA-----------AAGAATGGCAA-TACCGATAAAGAAACTT-TAA-TCATATATA-ATTTTCCTTTCTGATCATG-AATCA--ATCCCCTCAA---T-GA-TT-CAT-ACA-CGGAGC-TGTACTTATGC-----------------AT-TA-TA--TTC--T-GGT------AAATGTATT-TTATAGGTTCATGTT--TGCCTGTTA-AATATAG-TTTA-TAAAAATG-TA-GTA--TGATTTCNAAACTTTCACGTGAAAGNGTCAGTTATACATNTTTTTTTNAATGGGACCCATGTGGTTTTTTTGATACACCTCCCCCCTCCCGCGCGAGGAGAAAGGAGCTA-GAGA-TATAAAAAATGAAAACAAATTGTTCCTGTTCTATGAATTTAGCCTGGTTGCGTACTTTATATGGTTTTAANGCGGCAACAGGTTTTGAATGTGTATTTTNNTNCATCTTCTNTTGTCATTTNTCGTATTTAATAAATT-ACCATTTT-AGTCTATGG-GG-AC-TTGCTTC-ATTTATTT-GGAGAGGCAGACAGG-AATTGTCAGC--AAGCCCCAAGATCCGGCTAAGGAGCCTCAG-ACAATCGGAGAG-TTCTATAG-GCAC-CGAAGCACATATACTCCC-ACGATGTCCCGACGTGATAAATATTCGATATTT-AAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGA-ATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACGT-AAT-GACA-A-ATTCAAA-GCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTATTGT--AACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAAAAAAAAACATTAACCCAAAAAGCCCAAAAAGGAAAAAAAAAAGA---AAAAAAAAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTATNNNNNNNNNNNACATAAGAAATAAAA-CAATAAAAAATGAATTTTTTTAAAAATTCATTTGTATAA--GCTA--------CACCCCTAAAATACAACAGATAAATACAGC-ACTTGGGGGACGGGATAGTTTAACTTTTCTGAAA-TGCATAGTGTTTTTTGCTCTGTTTATTTGAAATCTGTATAATTGAGCACATAAAA-TTTCAA-TCCATT-A-ATTTGAAAA-CAAATGAAGTTTAATGGTAATACTTTTATGGTCCATTGA-AGAGCTAAAACTA-AGATTGAACAAATAAGAGGAGAGAGGTCAGCACACTAAATTCAGTTCCCAAG-TATCT-TGTGATAAAGAAAAAAAA-TACCGGTAGGCCTACCGTCATATCTTTTTTTCGTTCGGAATATCAGGTANTATTCTATATTTTGGNNANAANTNGACNCATGGGCTATAG-ATCGATGATNAAATTTAAAAAGGAATCATCTGGCGC--CGTCCATGCTTTCCT-CATCACCGTTAGT-AAGACAGTTATTCAA-TTTCTGTAAC-AA---TAATT-CACAACT----A-GA-TCTATCCTCG-TCCACAA-CAATTT-CGTTG-GTT--GTT---AAATGT-TTC-GG---TT-TTTGAAATCCTTCGT---CTGATAT-CC--AA-TTC-TTG-TGT-TAAATTCC-AA-TGCCTTTAAATT--TTTC---GCTTT--C-AT--T--C-GGT-GAC-----TTT---CGC-AACTG-TA-----ATTT--------A-T----GA--CGGT---CT---------G--GG-C-A--T-C-----GG--G-TCCGC-TG--TA-A-TCAC----AG---TATAAT-AAC--AC--TGG---CA--CCAC-C-T-A-A-A-----ACA---AAAAG--AA-AA--T-A-A--TTT-AC---AGC-AGT-TT---G---TC-CTA-CA---TC-AAAAC----CGNTTATT---NATG-A-ATCCCC---AAGTCATA-NCCCG--T-TTTTT--CA----TTTGAAA--GC-CT-TG--GG--AC-C-AGT-C--CACG--A-CC-AAAA-CCG-G-T--G-T------AAATA-----TC-GTGAACC--AAT-C-CAG-AG-C-ATATT-TTTTTGAATTTCT--CT------GGACATT-C-CGTTGG-AA-CC-ACTC-CGT-GTC---G-----T--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-AA---TT-T--GGAC-T-A-C--AAA--CAAA-GAAA-CATT-TGTCTTC---AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA--AGGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--T-G---AC-AC-AA-T---TA-T-ACC-A-C-G--GGGA---T-A--TCAA-A-----TAAA---C-GC-AC-T-CTGA-AA--GT-ACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GAT-TTT-C-T-A-C-G-A--CAGA-AGT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGA-G---GT-GA--A--T-G-TG-TCA-AA--C--CT-TG---ATAATAT--TTTT-GGTAA--CGG-CGAT--G-A--TGA--AT-G---G--TA---------------NG--AA--C---AT-GCAT-TTA----T----CTA-T-T-GAT-TCTG-TTATT--TTGTA-TGACA-ATA--TCATA-----AGTAAG-AA---AT-CAA--C-GC-TTTC--TC-ATTGGA---TT-CTG-A-GCAC-T-CA-CCT--TT--GT-AACAG---GTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTAA-AAGAGAC-CATTCCGC-ATCAGGTTA-CAC-G--ACAGTG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T-TT---G---TC-CTA-CA---TCCAAAAC----CAATTATT---TATG-A-ATCCCC---AAGTCATA-TCC-G--T-TTTTT--CA----TT-GAAAAGGC-CC-TT--GG--AC-C-AGT-C--C-CG--A-CC-AAAA-CTGCG-T--G-T------AAA-A-----TC-GTGA-CC--AATTC-CAG-GGGC-ATATT-TTTT-GAATTTCT----------GGACATTTC-CGTTGG-AA-CCCACTC-CGT-GTC---G-----T--AA--AA-CAA---ACT---TTCC--ATGTCCGT-TTT--G-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-GA---TTCT--GGAC-T-A-C--AAAA-CAAA-GAA--CATT--GTCT-C---AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA---GGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--TTG---AC-AC-AA-T----A-T-ACCCA-C-G--GG-A---T-A--TCAA-A-----TAAA---C-GCCAC-T-CTGA-AA--GC-ACG-GGGTC---------ATC-G-CCTC------GAT-GTT-C-TTA-C-GGA--C-GA-GCT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGACG---GT-AATTG--T-G-TG-TCA-AAACC--TT-TG---ATAATAT--TTTT-G-TAA--CGG---AT--GGA--TGA--ATTG---G--TA---------------TATTAA--C---AT-GCATCTTA----T----CTA-T-TTGAT--CTG-TTATT--T-GTA-TGACA-ATA--TCATA-----GATAAG-AA---AT-CAA--CCGC-TTTCCTTCGATTTGA---TT-CTG-A-GCGC---CA-CCT--TT--GT-AACAG---CTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTTA-AAAAGAC-CATTCCG--ATCAGGTTA-CAC-G--AC
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -TGT-TAAATTCCCAA-TACCATTAAAAT--TTGCAT-GCTTT--T-ATATT--CAGGTCGACGCTTCTCT---CGC-TACTC-GA-----ATTT--------G-TATGCGA--CGTT---CT---------G--G--C-A--T-CAAAAAGG--T-TCCGC-TG--TA-A-TCAC----AG-----GAAT-AAC---C--TG
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -A-TTG-TA-AA---GGTGTG---A-TTCCTT----G--GAGAATACCAAG--AGACATT--T-GTAAAC-AC-AA-T----A-T-ACC-A-C-G--GCGAGACT-AGCTTAATA-----TAAA---C-GC-AC-C-GGAA-AA--GT-ACG-G
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATG-ACCATTTT-AGTCTATGGAGG-AC-ATGAATT-ATTTATTT-GAAGAGGC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGAC-CATTCCAC-ATCAGG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aAC-CATTCCGC-ATCAGG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|3                          :   CTGTCT-ACTAAC-G-TGAT--GAGGGAAAGCATG-G-AC-CGGCCAAGATGATT-CC--TTTAAATTTAACAATCGATCTAG-CAGAGTCCACTT-GTGGCCAAAATA-TAAAA---TAAA--CCT-GTACA------TCCTAACAACAA----------CAACAA-----------AAGAATGGCAACTACCGA-AAAAAAACTTGTAAATCATATATA-ATTT-CCTTTCTGATCATG-AATCA--TTCCGCTCAAAATT-GAATT-CAT-ACAACGGAGT-TGTACTTATGCCCGCCCCCCCCCCCAAAAT-TA-TAATTTCCTT-GGTTAAAAAAAGTTTATTATTATAGGTTCATGTT--TGCCTGT-G-AATA-AG-TTTA-TAAA--TG-TA-GTAAAGGATTTCAAAACTTTCA-G-GAAAAAGTCAGT-ATACAT--TTTTTTAAA-GGGACC-ATGTG-----TTTGATACACCTCCCCCCTCCCGCGCGAGGA--AAGGAGCTA-GAGA-TATAAAAAATGAAAACAAATTGTTCCTGTTCTATGAATTTAGCCTGGTTGCA-ACTTTATATGGTTTTAAA-TGGCAACAGGTTTTGAATGTGTATTTTTGTACATCTTCTGTTGTCATTTTTGATATT-AATAAATTTACCATTTT-AGTTTATGGTGG-ACCTTGCTT--ATCTATTT-GGAGAGGCAGACAGG-AATTGTCAGC--AAGCCCCAAGATCCGGCTAAGGAGCCTCAG-ACAATCGGAGAG-TTCTATAG-GCAC-CGAAGCACATATACTCCC-ACGATGTCCCGACGTGATAAATATTCGATATTT-AAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGA-ATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACGT-AAT-GACA-A-ATTCAAA-GCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTATTGT--AACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAAAAAAAAACATTAACCCAAAAAGCCCAAAAAGGAAAAAAAAAAGA---AAAAAAAAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aGACAGTTATTCAA-T----------------AATT-CACAACT------GA----ATCCTCGCTCCACAAGCAATTT-CGT---ATT--GTT------TGT-----------------AAATCTTTCGTGGGTTGATAT-CATAAA-TTC-TGA-TGG-TTAATTCC-AA-TGCCCTTAAATT--TTCA---GCTTTATCGAT--T--T-CGT-GAC-----TTTTTTCGCCAACTG-TA-----AGCG--------G-T-----A--CG-T---GG---------G--GG-C-A--T-C-----AGCGG-TCCGCGTG--TA-AATCACGCTAAG---T-TAAT-AAC--AC--TGGGCGCA--CCACTC-T-AGA-A-----ACA---AAAAG--GA-AAACT-A-AATTTT-AC---AGCGAGT-TTTTTG---TC-CTA-CA---TC-AAAAC----C-----TT---AATG-ACATTCCCCAAAAGTCATA-TCCCG--T-TTTTTTTCA----TT-GAAA--GCTCT-TGCGGA--AC-C-AGTTC--CACGGTA-CC-AAAAACTG-G-TTTG-T------AAATA-----CC-GCTGACC--AAT-C-CAGCAG-C-ATATT-TTTATGAAATT-T--CT------GGACATT-CTCGTTGG-AAACC-ACTC-CCTTGTC---GACGCGT--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATACGT-GTGTTTT----C-G-AATTCTT-T--GGACTT-A-CCAAAA--C-AA-GAAA-CA-T-TGTCTCTGGGAT-GAC-CG----TATTA-AA--AGGAGTG---A-TTGGATTTTGG--GA---T-CCAGA--G-----T--TGG---AC-AC-AATT---TATT-ACC-A-C-G--GGTA---T-A--TCAA-A-----TAAA---C-GC-AC-TCCTGA-AA--GTAACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GA--TTT-C-T-A-CAG-AC-CAGA-AGTAAC-A---C-TCCA----AC-T-TGCGAAC-G---GT-AA--ATTT-G-TG-TCAGAA--CGTCT-TGC--ATAATA----TTT-GGTAAC-CGGCCGAT--G-GATTGA--AT-G---GCCTAATCCTAGTTATTAATAG--AA--C---ATGGCA--TTA----T----CTA-T-T-GAT-TCTGTTTATT--TGTTA-T-ACA-ATAATTCATAGTAACAGTAAA-AAAATAT-CAA--C-GC-TTTC--TC-AAT-GATTTTT-CTGAA-GCACTT-CA-CC---TT--GT-AACAGTGTGTA--CCC-CCGTCG-CCA-TCTTTTTTA-AAGAGAC-CATTCCGG-ATCAGGGTA-CACGG--ACAGTGtat
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Reference ( family-80 )       :   CTGTCT-ACTAAC-GGTGAT--GAGG-AAAGCATG-GGACGCGGCCAGAATGATT-CCTTTTTAAATTTANCAATCGATCTAT-CAGAGTCCN--T-GTGCC-AAAAAAATAAAAAG-TATA--C-T-GTAAN------TCCTAACAACA---------AACAACAA-----------AAGAATGGCAA-TACCGATAAAGAAACTT-TAA-TCATATATA-ATTTTCCTTTCTGATCATG-AATCA--ATCCCCTCAA---TGA-TT-CA-TACA-CGGAGCTGT-ACTTATGC-----------------AT-TA-TA--TTC--TGGTTAAA-----TGTATT-TTATAGGTTCATGTT--TGCCTGTTA-AATATAG-TTTA-TAAAAATG-TA-GTA--TGATTTTCAAACTTTCA-GTGAAAA--TCA-TTATACATA-TTTTTTTAA-GGGACCATG---TGTTTGATA---------------ACGCGAGGAGAAAGGAGCT-AGAGACTATAAAAAATGAAAACAAATTGNTCCTGTTCTATGGANTTAGCCTGGTTGCGTACTTTATATGGTTTTAATCGG-AACAGGTTTTGAATGT-TATTTTTNTACATCTTCT--TGTCATTTTTGATA-TTAATAAATN-ACCA-TTTTAGTCTAT-GG-GGAC-TTGC-TTTATTTA-TTTGGAGAGGCAGACAGGCAACTGTCAGCTTAAGCCCCAAGATCCNGCTAAGGAGCCTCAGGACAATNNGAGAGCTTCTATAGAGCACACGAAGCANATATACTCCCCACGATGTCCCGACGNGATAAANNTTCGATATTTTAAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGATATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACNTTAATTGACACACATTCAAAAGCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTACTGTTAAACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAGAAAAAAACATTAACCNAAAAAGCCNAAAAAGGAAAAAAAAAAGACCCAAAAAANAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTATATTCATGTAATACATAAGAAATAAAAACAATNAAAAATGAATTTTTTTAAAAATTCATTTGTATAAAAGCTGTGTTTTGCCACCCCTAANATACAACAGATAAATACAGCCACTTGGGGGACGGGATAGTTTAACCTTTCTGAAAGTGCATAGTGTTTTTTGCTCTGTTTATTTGAAATCTGTATAATTGAGCACATAAAAATTTCAAATCCATTCATATTTGAAAAACAAATGAAGTTTGANGGTAATACTTTTATGGTCCANTGATAGAGCTAAAACTACAGATTGAACAAATAAGAGGAGAGAGGTCNGCACACTAAATTCAGTTCCCAAGGTATCTGTGTGATAAAGAAAAAAAAATACCGGTAGGCCTACCGTCATATCTTTTTTTCGTTCGGAATATCAGGTAGTTTCTTTTTAAAAAAAANTTGACACATGGACTATAGTATCGNTGATNGAATTTGATATGGAATCCTCTGGCGCACCGTCCATGTTTTCCTGCATC----AT----CG--TTAGT-AAGACAGTTACTCAA-TTTCTGTAAC-AA---TAATT-CACAACT----A-GA-TCTATCCTCG-TCCACA-GCGATTT-CGTTG-GTT--GTT---AAATG---T----TGG---TT-TTTGAAATCTTTCGT---CTGATAT-CC--AA-TTC-TTG-TGT-TAAATTCC-AATGCCTT----TAA--A-TTTTCNAG-CTTT--C-AT-T-T-C-GGT-GAC-----TTT---CGC-AACTG-TA-----ANTT--------AT----GA--CGGT---CT---------G--GG-C-A--TCAA---GG-T-CCGC-TG--TA-A-TCAC----AG---TATAAT-AAC--AC-TGGGC--A--CCAC-C-T-A-A-A-----ACA---AAAAG--AA-AA--T-A-A--TTT-AC---AGC-AGT-TT---G---TC-CTA-CA---TC-AAA-AC----CG--TTATT-A-TG-A-----ATCCCC---AAGT--CAT-A-CCCG--T-TTTTT--C-A-----TTGAAA--GC-CT-TG--GG--AC-C-AGT-C--CACG--A-CC-AAAA-CTG-G-T--G-T------AAATA-----TC-GTGAACC--AAT-C-CAG-AG-C-ATATT-TTTTTGAA-TTTCTGG----------ACATT-C-CGTTGG-AA-CC-ACTC-CGT-GTC---G-----T--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-AA---TT-T--GGAC-T-A-C--AAA--CAAA-GAAA-CATT-TGTC-TC----AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA--AGGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--T-G---AC-AC-AA-T---TA-T-ACC-A-C-G--GGGA---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GC-AC-T-CTGA-AA--GT-ACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GAT-TTT-C-T-A-C-G-A--CAGA-AGT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGA-G---GT-A-A--A--T-G-TG-TCA-AA--C--CT-TG---ATAATAT--TTTT-GGT-AA-C--GGC--AT-GGA-T-GA--AT-G---G--TA---------------NG--AA--C---AT-G-CAT-TTA----T----CTAT-T-GAT-TCTG-TTATT--TTGTA-TGACA-ATA--TCATA-----AGTAAG-AA---AT-CAA--C-GC-TTTC--TC-ATTGGA---TT-CTG-A-GCAC-T-CA-CCT--TT--GT-AACAG---GTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTAA-AAGAGAC-CATTCCGC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGTG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T-TT---G---TC-CTA-CA---TCCAAA-AC----CAA-TTATTTA-TG-A-----ATCCCC---AAGT--CAT-A-TCCG--T-TTTTT--C-A-----TTGAAAAGGC-CC-TT--GG--AC-C-AGT-C--C-CG--A-CC-AAAA-CTGCG-T--G-T------AAA-A-----TC-GTGA-CC--AATTC-CAG-GGGC-ATATT-TTTT-GAA-TTTCTGG----------ACATTTC-CGTTGG-AA-CCCACTC-CGT-GTC---G-----T--AA--AA-CAA---ACT---TTCC--ATGTCCGT-TTT--G-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-GA---TTCT--GGAC-T-A-C--AAAA-CAAA-GAA--CATT--GTC-TC----AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA---GGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--TTG---AC-AC-AA-T----A-T-ACCCA-C-G--GG-A---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GCCAC-T-CTGA-AA--GC-ACG-GGGTC---------ATC-G-CCTC------GAT-GTT-C-TTA-C-GGA--C-GA-GCT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGACG---GT-A-ATTG--T-G-TG-TCA-AAACC--TT-TG---ATAATAT--TTTT-G-T-AA-C--GG---AT-GGA-T-GA--ATTG---G--TA---------------TATTAA--C---AT-G-CATCTTA----T----CTAT-TTGAT--CTG-TTATT--T-GTA-TGACA-ATA--TCATA-----GATAAG-AA---AT-CAA--CCGC-TTTCCTTCGATTTGA---TT-CTG-A-GCGC---CA-CCT--TT--GT-AACAG---CTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTTA-AAAAGAC-CATTCCG--ATCA-GGTTA-CAC-G--AC
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TGT-TAAATTCCCAATACCAT----TAA--AATTTGCATG-CTTT--T-ATAT-T-CAGGTCGACGCTTCTCT---CGC-TACTC-GA-----ATTT--------GTATGCGA--CGTT---CT---------G--G--C-A--TCAAAAAGG-TTCCGC-TG--TA-A-TCAC----AG-----GAAT-AAC---C-TG
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -A-TTG-TA-AA---GGTGTG---A-TTCCTT----G--GAGAATACCAAG--AGACATT--T-GTAAAC-AC-AA-T----A-T-ACC-A-C-G--GCGAGACT-AGCTTAATA-----T-AAA---C-GC-AC-C-GGAA-AA--GT-ACG-G
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATG-ACCA-TTTTAGTCTAT-GGAGGAC-ATGA-ATTATTTA-TTTGAAGAGGC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGAC-CATTCCAC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aAC-CATTCCGC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|3                          :   CTGTCT-ACTAAC-G-TGAT--GAGGGAAAGCATG-G-AC-CGGCCAAGATGATT-CCTTT--AAATTTAACAATCGATCTAG-CAGAGTCCACTT-GTGGC-CAAAATATAAAA---TAAA--CCT-GTACA------TCCTAACAACA---------A-CAACAA-----------AAGAATGGCAACTACCGA-AAAAAAACTTGTAAATCATATATA-ATTT-CCTTTCTGATCATG-AATCA--TTCCGCTCAAAATTGAATT-CA-TACAACGGAGTTGT-ACTTATGCCCGCCCCCCCCCCCAAAAT-TA-TAATTTCCTTGGTTAAAAAAAGTTTATTATTATAGGTTCATGTT--TGCCTGT-G-AATA-AG-TTTA-TAAA--TG-TA-GTAAAGGATTTCAAAACTTTCA-G-GAAAAAGTCA-GTATACAT--TTTTTTAAA-GGGACCATG---TGTTTGATACACCTCCCCCCTCCCGCGCGAGGA--AAGGAGCT-AGAGA-TATAAAAAATGAAAACAAATTGTTCCTGTTCTATGAATTTAGCCTGGTTGCA-ACTTTATATGGTTTTAAATGGCAACAGGTTTTGAATGTGTATTTTTGTACATCTTCTGTTGTCATTTTTGATA-TTAATAAATTTACCA-TTTTAGTTTAT-GGTGGACCTTGC-TT-ATCTA-TTTGGAGAGGCAGACAGG-AATTGTCAGC--AAGCCCCAAGATCCGGCTAAGGAGCCTCAG-ACAATCGGAGAG-TTCTATAG-GCAC-CGAAGCACATATACTCCC-ACGATGTCCCGACGTGATAAATATTCGATATTT-AAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGA-ATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACGT-AAT-GACA-A-ATTCAAA-GCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTATTGT--AACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAAAAAAAAACATTAACCCAAAAAGCCCAAAAAGGAAAAAAAAAAGA---AAAAAAAAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aC-AA---TAATT-CACAACT------GA----ATCCTCGCTCCACAAGCAATTT-CGT---ATT--GTT------TG---T-----------------AAATCTTTCGTGGGTTGATAT-CATAAA-TTC-TGA-TGG-TTAATTCC-AATGCCCT----TAA--A-TTTTC-AG-CTTTATCGAT-T-T-C-G-T-GAC-----TTTTTTCGCCAACTG-TA-----AGCG--------GT-----A--CG-T---GG---------G--GG-C-A--TCAGC--GG-T-CCGCGTG--TA-AATCACGCTAAG---T-TAAT-AAC--AC-TGGGCGCA--CCACTC-T-AGA-A-----ACA---AAAAG--GA-AAACT-A-AATTTT-AC---AGCGAGT-TTTTTG---TC-CTA-CA---TC-AAA-AC----C---TTA---A-TG-AC----ATTCCCCAAAAGT--CAT-ATCCCG--T-TTTTTTTC-A-----TTGAAA--GCTCT-TGCGGA--AC-C-AGTTC--CACGGTA-CC-AAAAACTG-G-TTTG-T------AAATA-----CC-GCTGACC--AAT-C-CAGCAG-C-ATATT-TTTATGAAATTTCTGG----------ACATT-CTCGTTGG-AAACC-ACTC-CCTTGTC---GACGCGT--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATACGT-GTGTTTT----C-G-AATTCTT-T--GGACTT-A-CCAAAA--C-AA-GAAA-CA-T-TGTC-TCTGGGAT-GAC-CG----TATTA-AA--AGGAGTG---A-TTGGATTTTGG--GA---T-CCAGA--G-----T--TGG---AC-AC-AATT---TATT-ACC-A-C-G--GGTA---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GC-AC-TCCTGA-AA--GTAACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GA--TTT-C-T-A-CAG-AC-CAGA-AGTAAC-A---C-TCCA----AC-T-TGCGAAC-G---GT-A-A--ATTT-G-TG-TCAGAA--CGTCT-TGC--ATAATA----TTT-GGT-AACC--GGCCGAT-GGATT-GA--AT-G---GCCTAATCCTAGTTATTAATAG--AA--C---ATGG-CA--TTA----T----CTAT-T-GAT-TCTGTTTATT--TGTTA-T-ACA-ATAATTCATAGTAACAGTAAA-AAAATAT-CAA--C-GC-TTTC--TC-AAT-GATTTTT-CTGAA-GCACTT-CA-CC---TT--GT-AACAGTGTGTA--CCC-CCGTCG-CCA-TCTTTTTTA-AAGAGAC-CATTCCGG-ATCAGGG-TA-CACGG--ACAGTGtat
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Reference ( family-80 )       :   CTGTCT-ACTAAC-GGTGAT--GAGG-AAAGCATG-GGACGCGGCCAGAATGATT-CCTTTTTAAATTTANCAATCGATCTAT-CAGAGT-CCN--TGTGCCAAAAAAA-TAAAAAG-TATA--C-T-GTAAN------TCCTAACAACAA---------ACAACAA-----------AAGAATGGCAA-TACCGATAAAGAAACTT-TAA-TCATATATA-ATTTTCCTTTCTGATCATG-AATCA--ATCCCCTCAA---TGA-TT-CAT-ACA-CGGAGCTGT-ACTTATGC-----------------AT-TA-TA--TTC--TGGTTAAA-----TGTATT-TTATAGGTTCATGTT--TGCCTGTTA-AATATAG-TTTA-TAAAAATG-TA-GTA--TGATTTTCAAACTTTCA-GTGAAAA--TCA-T--ATACATA-TTTTTTTAA-GGGACCATG---TGTTTGATA-ACC-------------GAGGAGAAAGGAGCTA-GAGACTATAAAAAATGAAAACAAATTGNTCCTGTTCTATGGANTTAGCCTGGTTGCGTACTTTATATGGTTTTAATCGG-AACAGGTTTTGAATGT-TATTTTTNTACATCTTCT--TGTCATTTTTGATATT-AATAAATN-ACCATTTT-AGTCTAT-GG-GGAC-TTGCTTT-ATTTATTT-GGAGAGGCAGACAGGCAACTGTCAGCTTAAGCCCCAAGATCCNGCTAAGGAGCCTCAGGACAATNNGAGAGCTTCTATAGAGCACACGAAGCANATATACTCCCCACGATGTCCCGACGNGATAAANNTTCGATATTTTAAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGATATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACNTTAATTGACACACATTCAAAAGCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTACTGTTAAACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAGAAAAAAACATTAACCNAAAAAGCCNAAAAAGGAAAAAAAAAAGACCCAAAAAANAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTATATTCATGTAATACATAAGAAATAAAAACAATNAAAAATGAATTTTTTTAAAAATTCATTTGTATAAAAGCTGTGTTTTGCCACCCCTAANATACAACAGATAAATACAGCCACTTGGGGGACGGGATAGTTTAACCTTTCTGAAAGTGCATAGTGTTTTTTGCTCTGTTTATTTGAAATCTGTATAATTGAGCACATAAAAATTTCAAATCCATTCATATTTGAAAAACAAATGAAGTTTGANGGTAATACTTTTATGGTCCANTGATAGAGCTAAAACTACAGATTGAACAAATAAGAGGAGAGAGGTCNGCACACTAAATTCAGTTCCCAAGGTATCTGTGTGATAAAGAAAAAAAAATACCGGTAGGCCTACCGTCATATCTTTTTTTCGTTCGGAATATCAGGTAGTTTCTTTTTAAAAAAAANTTGACACATGGACTATAGTATCGNTGATNGAATTTGATATGGAATCCTCTGGCGCACCGTCCATGTTTTCCCGNATC----AT----CG--TTAGT--AGACAGTTACTCAA-TTTCTGTAAC-AA---TAATT-CACAACT----A-GA-TCTATCCTCG-TCCAC-AGCGATTT-CGTTG-GTT--GTT---AAATGTGTT---------TTTGAA--ATC-----TTTCGT---CTGATAT-C--CAA-TTC-TTG-TGT-TAAATTCC-AATGCCTT----TAA--A-TTTTCA-G--C-TT--T-C-AT-T-T-C-GGT-GAC-----TTTCG-CAACTG-TA-----ANTT--------AT----GA--CGGT---CT---------G--GG-C-A--T-CA----G-GGTCCGC-TG--T-A-A-TCAC----AG---TATAAT-AAC--AC-TGG--GCA--CCAC-C-T-A-A-A-----ACA---AAAAG--AA-AA--T-A-A--TTT-AC---AGC-AG---T-TTG---TC-CTA-CA---TC-AAA-AC----CG--TTATT-A-TG-A-----ATCCCC---AAGT--CAT-A-CCCG--T-TTTTTC-A-----TTGAAA--GC-CT-T--GGG--AC-C-AG-T-C--CACG--A-CC-AAAACTG-G--TG-T------AAATA-----TC-GTGAACC--AAT-C-CAG-AG-C-ATATT-TTTTTG-AATTTCTGG----------ACATT-C-CGTTGG-AACC-ACT-C-CGT-GT-----C---GT--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-AA---TT-T--GGAC-T-A-C--AAA--CAAA-GAAA-CATT-TGTC-TC----AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA--AGGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--T-G---AC-AC-AA-T---TA-T-ACC-A-C-G--GGGA---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GC-AC-T-CTGA-AA--GT-ACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GAT-TTT-C-T-A-C-G-A--CAGA-AGT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGA-G---GT-A-A--A--T-G-TG-TCA-AA--C--CT-TG---ATAATAT--TTTT-GGT-AA-C--GGC--AT-GGA-T-GA--AT-G---G--TA---------------NG--AA--C---AT-G-CAT-TTA----T----CTAT-T-GAT-TCTG-TTATT--TTGTA-TGACA-ATA--TCATA-----AGTAAG-AA---AT-CAA--C-GC-TTTC--TC-ATTGGA---TT-CTG-A-GCAC-T-CA-CCT--TT--GT-AACAG---GTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTAA-AAGAGAC-CATTCCGC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGTG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ---T-TTG---TC-CTA-CA---TCCAAA-AC----CAA-TTATTTA-TG-A-----ATCCCC---AAGT--CAT-A-TCCG--T-TTTTTC-A-----TTGAAAAGGC-CC-T--TGG--AC-C-AG-T-C--C-CG--A-CC-AAAACTGCG--TG-T------AAA-A-----TC-GTGA-CC--AATTC-CAG-GGGC-ATATT-TTTT-G-AATTTCTGG----------ACATTTC-CGTTGG-AACCCACT-C-CGT-GT-----C---GT--AA--AA-CAA---ACT---TTCC--ATGTCCGT-TTT--G-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-GA---TTCT--GGAC-T-A-C--AAAA-CAAA-GAA--CATT--GTC-TC----AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA---GGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--TTG---AC-AC-AA-T----A-T-ACCCA-C-G--GG-A---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GCCAC-T-CTGA-AA--GC-ACG-GGGTC---------ATC-G-CCTC------GAT-GTT-C-TTA-C-GGA--C-GA-GCT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGACG---GT-A-ATTG--T-G-TG-TCA-AAACC--TT-TG---ATAATAT--TTTT-G-T-AA-C--GG---AT-GGA-T-GA--ATTG---G--TA---------------TATTAA--C---AT-G-CATCTTA----T----CTAT-TTGAT--CTG-TTATT--T-GTA-TGACA-ATA--TCATA-----GATAAG-AA---AT-CAA--CCGC-TTTCCTTCGATTTGA---TT-CTG-A-GCGC---CA-CCT--TT--GT-AACAG---CTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTTA-AAAAGAC-CATTCCG--ATCA-GGTTA-CAC-G--AC
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -A-TTG-TA-AA---GGTGTG---A-TTCCTT----G--GAGAATACCAAG--AGACATT--T-GTAAAC-AC-AA-T----A-T-ACC-A-C-G--GCGAGACT-AGCTTAATA-----T-AAA---C-GC-AC-C-GGAA-AA--GT-ACG-G
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATG-ACCATTTT-AGTCTAT-GGAGGAC-ATGAATT-ATTTATTT-GAAGAGGC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGAC-CATTCCAC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aAC-CATTCCGC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|3                          :   CTGTCT-ACTAAC-G-TGAT--GAGGGAAAGCATG-G-AC-CGGCCAAGATGATT-CCTTT--AAATTTAACAATCGATCTAG-CAGAGT-CCACTTGTGGCCAAAATA-TAAAA---TAAA--CCT-GTACA------TCCTAACAACAA----------CAACAA-----------AAGAATGGCAACTACCGA-AAAAAAACTTGTAAATCATATATA-ATTT-CCTTTCTGATCATG-AATCA--TTCCGCTCAAAATTGAATT-CAT-ACAACGGAGTTGT-ACTTATGCCCGCCCCCCCCCCCAAAAT-TA-TAATTTCCTTGGTTAAAAAAAGTTTATTATTATAGGTTCATGTT--TGCCTGT-G-AATA-AG-TTTA-TAAA--TG-TA-GTAAAGGATTTCAAAACTTTCA-G-GAAAAAGTCAGT--ATACAT--TTTTTTAAA-GGGACCATG---TGTTTGATACACCTCCCCCCTCCCGCGCGAGGAAAGGAGCTA-GAGA-TATAAAAAATGAAAACAAATTGTTCCTGTTCTATGAATTTAGCCTGGTTGCA-ACTTTATATGGTTTTAAATGGCAACAGGTTTTGAATGTGTATTTTTGTACATCTTCTGTTGTCATTTTTGATATT-AATAAATTTACCATTTT-AGTTTAT-GGTGGACCTTGCTT--ATCTATTT-GGAGAGGCAGACAGG-AATTGTCAGC--AAGCCCCAAGATCCGGCTAAGGAGCCTCAG-ACAATCGGAGAG-TTCTATAG-GCAC-CGAAGCACATATACTCCC-ACGATGTCCCGACGTGATAAATATTCGATATTT-AAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGA-ATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACGT-AAT-GACA-A-ATTCAAA-GCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTATTGT--AACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAAAAAAAAACATTAACCCAAAAAGCCCAAAAAGGAAAAAAAAAAGA---AAAAAAAAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aC-AA---TAATT-CACAACT------GA----ATCCTCGCTCCACAAGCAATTT-CGT---ATT--GTT------TGT----------------AA--ATC-----TTTCGTGGGTTGATAT-CATAAA-TTC-TGA-TGG-TTAATTCC-AATGCCCT----TAA--A-TTTTCA-G--C-TTTAT-CGAT-T-T-C--GT-GACTTT--TTTCGCCAACTG-TA-----AGCG--------GT-----A--C-GT---GG---------G--GG-C-A--T-CA----GCGGTCCGCGTG--TAA-A-TCACGCTAAG---T-TAAT-AAC--AC-TGGGCGCA--CCACTC-T-AGA-A-----ACA---AAAAG--GA-AAACT-A-AATTTT-AC---AGCGAGTTTT-TTG---TC-CTA-CA---TC-AAA-AC----C---TTA---A-TG-AC----ATTCCCCAAAAGT--CAT-ATCCCGTTT-TTTTTC-A-----TTGAAA--GCTCT-TGCGGA--AC-C-AGTT-C--CACGGTA-CCAAAAACTG-GTTTG-T------AAATA-----CC-GCTGACC--AAT-C-CAGCAG-C-ATATT-TTTATGAAATTTCTGG----------ACATT-CTCGTTGGAAACC-ACTCC-CTT-GTCGACGC---GT--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATACGT-GTGTTTT----C-G-AATTCTT-T--GGACTT-A-CCAAAA--C-AA-GAAA-CA-T-TGTC-TCTGGGAT-GAC-CG----TATTA-AA--AGGAGTG---A-TTGGATTTTGG--GA---T-CCAGA--G-----T--TGG---AC-AC-AATT---TATT-ACC-A-C-G--GGTA---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GC-AC-TCCTGA-AA--GTAACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GA--TTT-C-T-A-CAG-AC-CAGA-AGTAAC-A---C-TCCA----AC-T-TGCGAAC-G---GT-A-A--ATTT-G-TG-TCAGAA--CGTCT-TGC--ATAATA----TTT-GGT-AACC--GGCCGAT-GGATT-GA--AT-G---GCCTAATCCTAGTTATTAATAG--AA--C---ATGG-CA--TTA----T----CTAT-T-GAT-TCTGTTTATT--TGTTA-T-ACA-ATAATTCATAGTAACAGTAAA-AAAATAT-CAA--C-GC-TTTC--TC-AAT-GATTTTT-CTGAA-GCACTT-CA-CC---TT--GT-AACAGTGTGTA--CCC-CCGTCG-CCA-TCTTTTTTA-AAGAGAC-CATTCCGG-ATCAGGG-TA-CACGG--ACAGTGtat
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Reference ( family-80 )       :   CTGTCT-ACTAAC-GGTGAT--GAGG-AAAGCATG-GGACGCGGCCAGAATGATT-CCTTTTTAAATTTANCAATCGATCTAT-CAGAGTCCN--T-GTGCCAAAAAAA-TAAAAAG-TATA--C-T-GTAAN------TCCTAACAACAA---------ACAACAA-----------AAGAATGGCAA-TACCGATAAAGAAACTT-TAA-TCATATATA-ATTTTCCTTTCTGATCATG-AATCA--ATCCCCTCAA---TGA-TT-CAT-ACA-CGGAGCTGT-ACTTATGC-----------------AT-TA-TA--TTC--TGGTTAAA-----TGTATT-TTATAGGTTCATGTT--TGCCTGTTA-AATATAG-TTTA-TAAAAATG-TA-GTA--TGATTTTCAAACTTTCA-GTGAAAA--TCA-T--ATACATA--TTTTTTAA-GGGACCATG---TGTTTGATA-ACC-------------G-GGGGAAAGGAGCTA-GAGACTATAAAAAATGAAAACAAATTGNTCCTGTTCTATGGANTTAGCCTGGTTGCGTACTTTATATGGTTTTAATCGG-AACAGGTTTTGAATGT-TATTTTTNTACATCTTCT--TGTCATTTTTGATATT-AATAAATN-ACCATTTT-AGTCTAT-GG-GGAC-TTGCTTT-ATTTATTT-GGAGAGGCAGACAGGCAACTGTCAGCTTAAGCCCCAAGATCCNGCTAAGGAGCCTCAGGACAATNNGAGAGCTTCTATAGAGCACACGAAGCANATATACTCCCCACGATGTCCCGACGNGATAAANNTTCGATATTTTAAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGATATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACNTTAATTGACACACATTCAAAAGCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTACTGTTAAACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAGAAAAAAACATTAACCNAAAAAGCCNAAAAAGGAAAAAAAAAAGACCCAAAAAANAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTATATTCATGTAATACATAAGAAATAAAAACAATNAAAAATGAATTTTTTTAAAAATTCATTTGTATAAAAGCTGTGTTTTGCCACCCCTAANATACAACAGATAAATACAGCCACTTGGGGGACGGGATAGTTTAACCTTTCTGAAAGTGCATAGTGTTTTTTGCTCTGTTTATTTGAAATCTGTATAATTGAGCACATAAAAATTTCAAATCCATTCATATTTGAAAAACAAATGAAGTTTGANGGTAATACTTTTATGGTCCANTGATAGAGCTAAAACTACAGATTGAACAAATAAGAGGAGAGAGGTCNGCACACTAAATTCAGTTCCCAAGGTATCTGTGTGATAAAGAAAAAAAAATACCGGTAGGCCTACCGTCATATCTTTTTTTCGTTCGGAATATCAGGTAGTTTCTTTTTAAAAAAAANTTGACACATGGACTATAGTATCGNTGATNGAATTTGATATGGAATCCTCTGGCGCACCGTCCATGTTTTCCCGNATC----AT----CG--TTAGT--AGACAGTTACTCAA-TTTCTGTAAC-AA---TAATT-CACAACT----A-GA-TCTATCCTCG-TCCACA-GCGATTT-CGTTG-GTT--GTT---AAAT--GTTT----------TTTGAAATC--------TTTCGT---CTGATAT-CC--AA-TTC-TTG-TGT-TAAATTCC-AATGCCTT----TAA--A-TTTTCA-G--CTTT--C-AT-T-T-C-GGT-GAC-----TTT---CGC-AACTG-TA-----ANTT--------AT----GA--CGGT---CT---------G--GG-C-A--T-CA----G-GGTCCGC-TG--TA-A-TCAC----AGT----T--AAT-AAC--AC-TGGGC--A--CCAC-C-T-A-A-A-----ACA---AAAAG--AA-AA--T-A-A--TTT-AC---AGC-AG-T-TT---G---TC-CTA-CA---TC-AAA-AC----CG--TTATT-A-TG-A-----ATCCCC---AAGT--CAT-A-CCCG--T-TTTTT--C-A-----TTGAAA--GC-CT-TG--GG--AC-C-AGT-C--CACG--A-CC-AAAA-CTG-G-T--G-T------AAATA-----TC-GTGAACC--AAT-C-CAG-AG-C-ATATT-TTTTTGAA-TTTCTGG----------ACATT-C-CGTTGG-AA-CC-ACTC-CGT-GTC---G-----T--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-AA---TT-T--GGAC-T-A-C--AAA--CAAA-GAAA-CATT-TGTC-TC----AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA--AGGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--T-G---AC-AC-AA-T---TA-T-ACC-A-C-G--GGGA---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GC-AC-T-CTGA-AA--GT-ACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GAT-TTT-C-T-A-C-G-A--CAGA-AGT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGA-G---GT-A-A--A--T-G-TG-TCA-AA--C--CT-TG---ATAATAT--TTTT-GGT-AA-C--GGC--AT-GGA-T-GA--AT-G---G--TA---------------NG--AA--C---AT-G-CAT-TTA----T----CTAT-T-GAT-TCTG-TTATT--TTGTA-TGACA-ATA--TCATA-----AGTAAG-AA---AT-CAA--C-GC-TTTC--TC-ATTGGA---TT-CTG-A-GCAC-T-CA-CCT--TT--GT-AACAG---GTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTAA-AAGAGAC-CATTCCGC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGTG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -T-TT---G---TC-CTA-CA---TCCAAA-AC----CAA-TTATTTA-TG-A-----ATCCCC---AAGT--CAT-A-TCCG--T-TTTTT--C-A-----TTGAAAAGGC-CC-TT--GG--AC-C-AGT-C--C-CG--A-CC-AAAA-CTGCG-T--G-T------AAA-A-----TC-GTGA-CC--AATTC-CAG-GGGC-ATATT-TTTT-GAA-TTTCTGG----------ACATTTC-CGTTGG-AA-CCCACTC-CGT-GTC---G-----T--AA--AA-CAA---ACT---TTCC--ATGTCCGT-TTT--G-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-GA---TTCT--GGAC-T-A-C--AAAA-CAAA-GAA--CATT--GTC-TC----AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA---GGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--TTG---AC-AC-AA-T----A-T-ACCCA-C-G--GG-A---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GCCAC-T-CTGA-AA--GC-ACG-GGGTC---------ATC-G-CCTC------GAT-GTT-C-TTA-C-GGA--C-GA-GCT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGACG---GT-A-ATTG--T-G-TG-TCA-AAACC--TT-TG---ATAATAT--TTTT-G-T-AA-C--GG---AT-GGA-T-GA--ATTG---G--TA---------------TATTAA--C---AT-G-CATCTTA----T----CTAT-TTGAT--CTG-TTATT--T-GTA-TGACA-ATA--TCATA-----GATAAG-AA---AT-CAA--CCGC-TTTCCTTCGATTTGA---TT-CTG-A-GCGC---CA-CCT--TT--GT-AACAG---CTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTTA-AAAAGAC-CATTCCG--ATCA-GGTTA-CAC-G--AC
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -A-TTG-TA-AA---GGTGTG---A-TTCCTT----G--GAGAATACCAAG--AGACATT--T-GTAAAC-AC-AA-T----A-T-ACC-A-C-G--GCGAGACT-AGCTTAATA-----T-AAA---C-GC-AC-C-GGAA-AA--GT-ACG-G
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATG-ACCATTTT-AGTCTAT-GGAGGAC-ATGAATT-ATTTATTT-GAAGAGGC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGAC-CATTCCAC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aAC-CATTCCGC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|3                          :   CTGTCT-ACTAAC-G-TGAT--GAGGGAAAGCATG-G-AC-CGGCCAAGATGATT-CCTTT--AAATTTAACAATCGATCTAG-CAGAGTCCACTT-GTGGCCAAAATA-TAAAA---TAAA--CCT-GTACA------TCCTAACAACAA----------CAACAA-----------AAGAATGGCAACTACCGA-AAAAAAACTTGTAAATCATATATA-ATTT-CCTTTCTGATCATG-AATCA--TTCCGCTCAAAATTGAATT-CAT-ACAACGGAGTTGT-ACTTATGCCCGCCCCCCCCCCCAAAAT-TA-TAATTTCCTTGGTTAAAAAAAGTTTATTATTATAGGTTCATGTT--TGCCTGT-G-AATA-AG-TTTA-TAAA--TG-TA-GTAAAGGATTTCAAAACTTTCA-G-GAAAAAGTCAGT--ATACATT--TTTTTAAA-GGGACCATG---TGTTTGATACACCTCCCCCCTCCCGCGCGAGGAAAGGAGCTA-GAGA-TATAAAAAATGAAAACAAATTGTTCCTGTTCTATGAATTTAGCCTGGTTGCA-ACTTTATATGGTTTTAAATGGCAACAGGTTTTGAATGTGTATTTTTGTACATCTTCTGTTGTCATTTTTGATATT-AATAAATTTACCATTTT-AGTTTAT-GGTGGACCTTGCTT--ATCTATTT-GGAGAGGCAGACAGG-AATTGTCAGC--AAGCCCCAAGATCCGGCTAAGGAGCCTCAG-ACAATCGGAGAG-TTCTATAG-GCAC-CGAAGCACATATACTCCC-ACGATGTCCCGACGTGATAAATATTCGATATTT-AAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGA-ATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACGT-AAT-GACA-A-ATTCAAA-GCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTATTGT--AACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAAAAAAAAACATTAACCCAAAAAGCCCAAAAAGGAAAAAAAAAAGA---AAAAAAAAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aC-AA---TAATT-CACAACT------GA----ATCCTCGCTCCACAAGCAATTT-CGT---ATT--GTT------T--GT----------------AAATC--------TTTCGTGGGTTGATAT-CATAAA-TTC-TGA-TGG-TTAATTCC-AATGCCCT----TAA--A-TTTTCA-G--CTTTATCGAT-T-T-C-G-T-GAC-----TTTTTTCGCCAACTG-TA-----AGCG--------GT-----A--CG-T---GG---------G--GG-C-A--T-CA----GCGGTCCGCGTG--TA-AATCACGCTAAGT----T--AAT-AAC--AC-TGGGCGCA--CCACTC-T-AGA-A-----ACA---AAAAG--GA-AAACT-A-AATTTT-AC---AGCGAG-T-TTTTTG---TC-CTA-CA---TC-AAA-AC----C---TTA---A-TG-AC----ATTCCCCAAAAGT--CAT-ATCCCG--T-TTTTTTTC-A-----TTGAAA--GCTCT-TGCGGA--AC-C-AGTTC--CACGGTA-CC-AAAAACTG-G-TTTG-T------AAATA-----CC-GCTGACC--AAT-C-CAGCAG-C-ATATT-TTTATGAAATTTCTGG----------ACATT-CTCGTTGG-AAACC-ACTC-CCTTGTC---GACGCGT--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATACGT-GTGTTTT----C-G-AATTCTT-T--GGACTT-A-CCAAAA--C-AA-GAAA-CA-T-TGTC-TCTGGGAT-GAC-CG----TATTA-AA--AGGAGTG---A-TTGGATTTTGG--GA---T-CCAGA--G-----T--TGG---AC-AC-AATT---TATT-ACC-A-C-G--GGTA---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GC-AC-TCCTGA-AA--GTAACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GA--TTT-C-T-A-CAG-AC-CAGA-AGTAAC-A---C-TCCA----AC-T-TGCGAAC-G---GT-A-A--ATTT-G-TG-TCAGAA--CGTCT-TGC--ATAATA----TTT-GGT-AACC--GGCCGAT-GGATT-GA--AT-G---GCCTAATCCTAGTTATTAATAG--AA--C---ATGG-CA--TTA----T----CTAT-T-GAT-TCTGTTTATT--TGTTA-T-ACA-ATAATTCATAGTAACAGTAAA-AAAATAT-CAA--C-GC-TTTC--TC-AAT-GATTTTT-CTGAA-GCACTT-CA-CC---TT--GT-AACAGTGTGTA--CCC-CCGTCG-CCA-TCTTTTTTA-AAGAGAC-CATTCCGG-ATCAGGG-TA-CACGG--ACAGTGtat
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Reference ( family-80 )       :   CTGTCT-ACTAAC-GGTGAT--GAGG-AAAGCATG-GGACGCGGCCAGAATGATT-CCTTTTTAAATTTANCAATCGATCTAT-CAGAGT-CCN--TGTGCCAAAAAAA-TAAAAAG-TATA--C-T-GTAAN------TCCTAACAACAA---------ACAACAA-----------AAGAATGGCAA-TACCGATAAAGAAACTT-TAA-TCATATATA-ATTTTCCTTTCTGATCATG-AATCA--ATCCCCTCAA---TGA-TT-CAT-ACA-CGGAGCTGT-ACTTATGC-----------------AT-TA-TA--TTC--TGGTTAAA-----TGTATT-TTATAGGTTCATGTT--TGCCTGTTA-AATATAG-TTTA-TAAAAATG-TA-GTA--TGATTTTCAAACTTTCA-GTGAAAA--TCA-T--ATACATA--TTTTTTAA-GGGACCATG---TGTTTGATA-----------------ACGAGGAAAGGAGCTA-GAGACTATAAAAAATGAAAACAAATTGNTCCTGTTCTATGGANTTAGCCTGGTTGCGTACTTTATATGGTTTTAATCGG-AACAGGTTTTGAATGT-TATTTTTNTACATCTTCT--TGTCATTTTTGATATT-AATAAATN-ACCATTTT-AGTCTAT-GG-GGAC-TTGCTTT-ATTTATTT-GGAGAGGCAGACAGGCAACTGTCAGCTTAAGCCCCAAGATCCNGCTAAGGAGCCTCAGGACAATNNGAGAGCTTCTATAGAGCACACGAAGCANATATACTCCCCACGATGTCCCGACGNGATAAANNTTCGATATTTTAAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGATATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACNTTAATTGACACACATTCAAAAGCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTACTGTTAAACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAGAAAAAAACATTAACCNAAAAAGCCNAAAAAGGAAAAAAAAAAGACCCAAAAAANAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTATATTCATGTAATACATAAGAAATAAAAACAATNAAAAATGAATTTTTTTAAAAATTCATTTGTATAAAAGCTGTGTTTTGCCACCCCTAANATACAACAGATAAATACAGCCACTTGGGGGACGGGATAGTTTAACCTTTCTGAAAGTGCATAGTGTTTTTTGCTCTGTTTATTTGAAATCTGTATAATTGAGCACATAAAAATTTCAAATCCATTCATATTTGAAAAACAAATGAAGTTTGANGGTAATACTTTTATGGTCCANTGATAGAGCTAAAACTACAGATTGAACAAATAAGAGGAGAGAGGTCNGCACACTAAATTCAGTTCCCAAGGTATCTGTGTGATAAAGAAAAAAAAATACCGGTAGGCCTACCGTCATATCTTTTTTTCGTTCGGAATATCAGGTAGTTTCTTTTTAAAAAAAANTTGACACATGGACTATAGTATCGNTGATNGAATTTGATATGGAATCCTCTGGCGCACCGTCCATGTTTTCCCGNATC----AT----CG--TTAGT--AGACAGTTACTCAA-TTTCTGTAAC-AA---TAATT-CACAACT----A-GA-TCTATCCTCG-TCCACA-GCGATTT-CGTTG-GTT--GTT---AAAT--GT-T-----------TTTGAAATC--------TTTCGT---CTGATAT-CC--AA-TTC-TTG-TGT-TAAATTCC-AATGCCTT----TAA--A-TTTTCA-G--C-TTT--C-AT-T-T-C-GGT-GAC-----TTT---CGC-AACTG-TA-----ANTT--------AT----GA--CGGT---CT---------G--GG-C-A--T-CA----G-GGTCCGC-TG--TA-A-TCAC----A-G---T-AAT-A-----AC--AC-TGGGC--A--CCAC-C-T-A-A-A-----ACA---AAAAG--AA-AA--T-A-A--TTT-AC---AGC-AG-T-TT---G---TC-CTA-CA---TC-AAA-AC----CG--TTATT-A-TG-A-----ATCCCC---AAGT--CAT-A-CCCG--T-TTTTT--C-A-----TTGAAA--GC-CT-TG--GG--AC-C-AGT-C--CACG--A-CC-AAAA-CTG-G-T--G-T------AAATA-----TC-GTGAACC--AAT-C-CAG-AG-C-ATATT-TTTTTGAA-TTTCTGG----------ACATT-C-CGTTGG-AA-CC-ACTC-CGT-GTC---G-----T--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-AA---TT-T--GGAC-T-A-C--AAA--CAAA-GAAA-CATT-TGTC-TC----AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA--AGGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--T-G---AC-AC-AA-T---TA-T-ACC-A-C-G--GGGA---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GC-AC-T-CTGA-AA--GT-ACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GAT-TTT-C-T-A-C-G-A--CAGA-AGT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGA-G---GT-A-A--A--T-G-TG-TCA-AA--C--CT-TG---ATAATAT--TTTT-GGT-AA-C--GGC--AT-GGA-T-GA--AT-G---G--TA---------------NG--AA--C---AT-G-CAT-TTA----T----CTAT-T-GAT-TCTG-TTATT--TTGTA-TGACA-ATA--TCATA-----AGTAAG-AA---AT-CAA--C-GC-TTTC--TC-ATTGGA---TT-CTG-A-GCAC-T-CA-CCT--TT--GT-AACAG---GTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTAA-AAGAGAC-CATTCCGC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGTG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -T-TT---G---TC-CTA-CA---TCCAAA-AC----CAA-TTATTTA-TG-A-----ATCCCC---AAGT--CAT-A-TCCG--T-TTTTT--C-A-----TTGAAAAGGC-CC-TT--GG--AC-C-AGT-C--C-CG--A-CC-AAAA-CTGCG-T--G-T------AAA-A-----TC-GTGA-CC--AATTC-CAG-GGGC-ATATT-TTTT-GAA-TTTCTGG----------ACATTTC-CGTTGG-AA-CCCACTC-CGT-GTC---G-----T--AA--AA-CAA---ACT---TTCC--ATGTCCGT-TTT--G-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-GA---TTCT--GGAC-T-A-C--AAAA-CAAA-GAA--CATT--GTC-TC----AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA---GGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--TTG---AC-AC-AA-T----A-T-ACCCA-C-G--GG-A---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GCCAC-T-CTGA-AA--GC-ACG-GGGTC---------ATC-G-CCTC------GAT-GTT-C-TTA-C-GGA--C-GA-GCT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGACG---GT-A-ATTG--T-G-TG-TCA-AAACC--TT-TG---ATAATAT--TTTT-G-T-AA-C--GG---AT-GGA-T-GA--ATTG---G--TA---------------TATTAA--C---AT-G-CATCTTA----T----CTAT-TTGAT--CTG-TTATT--T-GTA-TGACA-ATA--TCATA-----GATAAG-AA---AT-CAA--CCGC-TTTCCTTCGATTTGA---TT-CTG-A-GCGC---CA-CCT--TT--GT-AACAG---CTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTTA-AAAAGAC-CATTCCG--ATCA-GGTTA-CAC-G--AC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGG-AA-CC-ACTT--GT-GTC---G-----TTAAA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATAC-T-A-----T----C-G-AAAT-TT-T--GGAT-A-A-C--AAAAGCAAAAGAAA-CATT-GGTC-TC----AT-GAT-CG-AGTTA-TA-AA---GGATTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--T-G---AC-AC-AA-T----A-T-AAC-C-C-G--GG-A---T-A--TCAA-AAAAAAT-AAAAAAC-GC-AC-T-CTGA-AAAAGT-ACG-GG--T---------ATCAG-CCTC------GAT-TTTGC-T-AAC-G-A--CAGA-AGT-AC-AAAAC-T-CAGAA-AC-T-TG-GAGA-GACGGT-AGA--A--T-AATG-TCA-AA--C--CTATG---ATA-TAT--TTTT-GGT-AA-C--GGCT-AT-GGA-T-GA--AT-G---G--TA---------------TG--AAATC---AT-G-CAT-T-A----TTGCGCTAT-T-GAGGTCTG-TTATT--T-GTAATGACA-ATA--CAATA------GTAAGGAA---AT-CAA--C-GC-TTTC--TC-ATTGAT---TT-CTG-A-GCAC-T-CA-CCT--TT--GT-A--AA---GTT--Tcag
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -A-TTG-TA-AA---GGTGTG---A-TTCCTT----G--GAGAATACCAAG--AGACATT--T-GTAAAC-AC-AA-T----A-T-ACC-A-C-G--GCGAGACT-AGCTTAATA-----T-AAA---C-GC-AC-C-GGAA-AA--GT-ACG-G
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATG-ACCATTTT-AGTCTAT-GGAGGAC-ATGAATT-ATTTATTT-GAAGAGGC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGAC-CATTCCAC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aAC-CATTCCGC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|3                          :   CTGTCT-ACTAAC-G-TGAT--GAGGGAAAGCATG-G-AC-CGGCCAAGATGATT-CCTTT--AAATTTAACAATCGATCTAG-CAGAGT-CCACTTGTGGCCAAAATA-TAAAA---TAAA--CCT-GTACA------TCCTAACAACAA----------CAACAA-----------AAGAATGGCAACTACCGA-AAAAAAACTTGTAAATCATATATA-ATTT-CCTTTCTGATCATG-AATCA--TTCCGCTCAAAATTGAATT-CAT-ACAACGGAGTTGT-ACTTATGCCCGCCCCCCCCCCCAAAAT-TA-TAATTTCCTTGGTTAAAAAAAGTTTATTATTATAGGTTCATGTT--TGCCTGT-G-AATA-AG-TTTA-TAAA--TG-TA-GTAAAGGATTTCAAAACTTTCA-G-GAAAAAGTCAGT--ATACATT--TTTTTAAA-GGGACCATG---TGTTTGATACACCTCCCCCCTCCCGCGCGAGGAAAGGAGCTA-GAGA-TATAAAAAATGAAAACAAATTGTTCCTGTTCTATGAATTTAGCCTGGTTGCA-ACTTTATATGGTTTTAAATGGCAACAGGTTTTGAATGTGTATTTTTGTACATCTTCTGTTGTCATTTTTGATATT-AATAAATTTACCATTTT-AGTTTAT-GGTGGACCTTGCTT--ATCTATTT-GGAGAGGCAGACAGG-AATTGTCAGC--AAGCCCCAAGATCCGGCTAAGGAGCCTCAG-ACAATCGGAGAG-TTCTATAG-GCAC-CGAAGCACATATACTCCC-ACGATGTCCCGACGTGATAAATATTCGATATTT-AAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGA-ATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACGT-AAT-GACA-A-ATTCAAA-GCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTATTGT--AACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAAAAAAAAACATTAACCCAAAAAGCCCAAAAAGGAAAAAAAAAAGA---AAAAAAAAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aC-AA---TAATT-CACAACT------GA----ATCCTCGCTCCACAAGCAATTT-CGT---ATT--GTT------T--GT-----------------AAATC--------TTTCGTGGGTTGATAT-CATAAA-TTC-TGA-TGG-TTAATTCC-AATGCCCT----TAA--A-TTTTCA-G--C-TTTATCGAT-T-T-C-G-T-GAC-----TTTTTTCGCCAACTG-TA-----AGCG--------GT-----A--CG-T---GG---------G--GG-C-A--T-CA----GCGGTCCGCGTG--TA-AATCACGCTAA-G---TTAAT-A-----AC--AC-TGGGCGCA--CCACTC-T-AGA-A-----ACA---AAAAG--GA-AAACT-A-AATTTT-AC---AGCGAG-T-TTTTTG---TC-CTA-CA---TC-AAA-AC----C---TTA---A-TG-AC----ATTCCCCAAAAGT--CAT-ATCCCG--T-TTTTTTTC-A-----TTGAAA--GCTCT-TGCGGA--AC-C-AGTTC--CACGGTA-CC-AAAAACTG-G-TTTG-T------AAATA-----CC-GCTGACC--AAT-C-CAGCAG-C-ATATT-TTTATGAAATTTCTGG----------ACATT-CTCGTTGG-AAACC-ACTC-CCTTGTC---GACGCGT--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATACGT-GTGTTTT----C-G-AATTCTT-T--GGACTT-A-CCAAAA--C-AA-GAAA-CA-T-TGTC-TCTGGGAT-GAC-CG----TATTA-AA--AGGAGTG---A-TTGGATTTTGG--GA---T-CCAGA--G-----T--TGG---AC-AC-AATT---TATT-ACC-A-C-G--GGTA---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GC-AC-TCCTGA-AA--GTAACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GA--TTT-C-T-A-CAG-AC-CAGA-AGTAAC-A---C-TCCA----AC-T-TGCGAAC-G---GT-A-A--ATTT-G-TG-TCAGAA--CGTCT-TGC--ATAATA----TTT-GGT-AACC--GGCCGAT-GGATT-GA--AT-G---GCCTAATCCTAGTTATTAATAG--AA--C---ATGG-CA--TTA----T----CTAT-T-GAT-TCTGTTTATT--TGTTA-T-ACA-ATAATTCATAGTAACAGTAAA-AAAATAT-CAA--C-GC-TTTC--TC-AAT-GATTTTT-CTGAA-GCACTT-CA-CC---TT--GT-AACAGTGTGTA--CCC-CCGTCG-CCA-TCTTTTTTA-AAGAGAC-CATTCCGG-ATCAGGG-TA-CACGG--ACAGTGtat
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Reference ( family-80 )       :   CTGTCT-ACTAAC-GGTGAT--GAGG-AAAGCATG-GGACGCGGCCAGAATGATT-CCTTTTTAAATTTANCAATCGATCTAT-CAGAGTCCN--T-GTGCC-AAAAAAATAAAAAG-TATA--C-T-GTAAN------TCCTAACAACA---------AACAACAA-----------AAGAATGGCAA-TACCGATAAAGAAACTT-TAA-TCATATATA-ATTTTCCTTTCTGATCATG-AATCA--ATCCCCTCAA---TGA-TT-CA-TACA-CGGAGCTGT-ACTTATGC-----------------AT-TA-TA--TTC--TGGTTAAA-----TGTATT-TTATAGGTTCATGTT--TGCCTGTTA-AATATAG-TTTA-TAAAAATG-TA-GTA--TGATTTTCAAACTTTCA-GTGAAAA--TCA--TATACATA--TTTTTTAA-GGGACCATG---TGTTTGATA-----------------ACGAGGAAAGGAGCT-AGAGACTATAAAAAATGAAAACAAATTGNTCCTGTTCTATGGANTTAGCCTGGTTGCGTACTTTATATGGTTTTAATCGG-AACAGGTTTTGAATGT-TATTTTTNTACATCTTCT--TGTCATTTTTGATA-TTAATAAATN-ACCA-TTTTAGTCTAT-GG-GGAC-TTGC-TTTATTTA-TTTGGAGAGGCAGACAGGCAACTGTCAGCTTAAGCCCCAAGATCCNGCTAAGGAGCCTCAGGACAATNNGAGAGCTTCTATAGAGCACACGAAGCANATATACTCCCCACGATGTCCCGACGNGATAAANNTTCGATATTTTAAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGATATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACNTTAATTGACACACATTCAAAAGCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTACTGTTAAACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAGAAAAAAACATTAACCNAAAAAGCCNAAAAAGGAAAAAAAAAAGACCCAAAAAANAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTATATTCATGTAATACATAAGAAATAAAAACAATNAAAAATGAATTTTTTTAAAAATTCATTTGTATAAAAGCTGTGTTTTGCCACCCCTAANATACAACAGATAAATACAGCCACTTGGGGGACGGGATAGTTTAACCTTTCTGAAAGTGCATAGTGTTTTTTGCTCTGTTTATTTGAAATCTGTATAATTGAGCACATAAAAATTTCAAATCCATTCATATTTGAAAAACAAATGAAGTTTGANGGTAATACTTTTATGGTCCANTGATAGAGCTAAAACTACAGATTGAACAAATAAGAGGAGAGAGGTCNGCACACTAAATTCAGTTCCCAAGGTATCTGTGTGATAAAGAAAAAAAAATACCGGTAGGCCTACCGTCATATCTTTTTTTCGTTCGGAATATCAGGTAGTTTCTTTTTAAAAAAAANTTGACACATGGACTATAGTATCGNTGATNGAATTTGATATGGAATCCTCTGGCGCACCGTCCATGTTTTCCCGNATC----AT----CG--TTAGT--AGACAGTTACTCAA-TTTCTGTAAC-AA---TAATT-CACAACT----A-GA-TCTATCCTCG-TCCACA-GCGATTT-CGTTG-GTT--GTT---AAAT--G--T------------TTTGAAATC--------TTTCGT---CTGATAT-CC--AA-TTC-TTG-TGT-TAAATTCC-AATGCCTT----TAA--A-TTTTCA-G--C-TTT--C-AT-T-T-C-GGT-GAC-----TTT---CGC-AACTG-TA-----ANTT--------AT----GA--CGGT---CT---------G--GG-C-A--T-CA----G-GGTCCGC-TG--TA-A-TCAC----A-G---T-AAT-A-----AC--AC-TGGGC--A--CCAC-C-T-A-A-A-----ACA---AAAAG--AA-AA--T-A-A--TTT-AC---AGC-AG-T-TT---G---TC-CTA-CA---TC-AAA-AC----CG--TTATT-A-TG-A-----ATCCCC---AAGT--CAT-A-CCCG--T-TTTTT--C-A-----TTGAAA--GC-CT-TG--GG--AC-C-AGT-C--CACG--A-CC-AAAA-CTG-G-T--G-T------AAATA-----TC-G-TG-ACC--AAT-C-CAG-AG-C-ATATT-TTTTTGAA-TTTCTGG----------ACATT-C-CGTTGG-AA-CC-ACTC-CGT-GTC---G-----T--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-AA---TT-T--GGAC-T-A-C--AAA--CAAA-GAAA-CATT-TGTC-TC----AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA--AGGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--T-G---AC-AC-AA-T---TA-T-ACC-A-C-G--GGGA---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GC-AC-T-CTGA-AA--GT-ACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GAT-TTT-C-T-A-C-G-A--CAGA-AGT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGA-G---GT-A-A--A--T-G-TG-TCA-AA--C--CT-TG---ATAATAT--TTTT-GGT-AA-C--GGC--AT-GGA-T-GA--AT-G---G--TA---------------NG--AA--C---AT-G-CAT-TTA----T----CTAT-T-GAT-TCTG-TTATT--TTGTA-TGACA-ATA--TCATA-----AGTAAG-AA---AT-CAA--C-GC-TTTC--TC-ATTGGA---TT-CTG-A-GCAC-T-CA-CCT--TT--GT-AACAG---GTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTAA-AAGAGAC-CATTCCGC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGTG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -T-TT---G---TC-CTA-CA---TCCAAA-AC----CAA-TTATTTA-TG-A-----ATCCCC---AAGT--CAT-A-TCCG--T-TTTTT--C-A-----TTGAAAAGGC-CC-TT--GG--AC-C-AGT-C--C-CG--A-CC-AAAA-CTGCG-T--G-T------AAA-A-----TC-G-TG-ACC--AATTC-CAG-GGGC-ATATT-TTTT-GAA-TTTCTGG----------ACATTTC-CGTTGG-AA-CCCACTC-CGT-GTC---G-----T--AA--AA-CAA---ACT---TTCC--ATGTCCGT-TTT--G-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-GA---TTCT--GGAC-T-A-C--AAAA-CAAA-GAA--CATT--GTC-TC----AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA---GGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--TTG---AC-AC-AA-T----A-T-ACCCA-C-G--GG-A---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GCCAC-T-CTGA-AA--GC-ACG-GGGTC---------ATC-G-CCTC------GAT-GTT-C-TTA-C-GGA--C-GA-GCT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGACG---GT-A-ATTG--T-G-TG-TCA-AAACC--TT-TG---ATAATAT--TTTT-G-T-AA-C--GG---AT-GGA-T-GA--ATTG---G--TA---------------TATTAA--C---AT-G-CATCTTA----T----CTAT-TTGAT--CTG-TTATT--T-GTA-TGACA-ATA--TCATA-----GATAAG-AA---AT-CAA--CCGC-TTTCCTTCGATTTGA---TT-CTG-A-GCGC---CA-CCT--TT--GT-AACAG---CTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTTA-AAAAGAC-CATTCCG--ATCA-GGTTA-CAC-G--AC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGG-AA-CC-ACTT--GT-GTC---G-----TTAAA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATAC-T-A-----T----C-G-AAAT-TT-T--GGAT-A-A-C--AAAAGCAAAAGAAA-CATT-GGTC-TC----AT-GAT-CG-AGTTA-TA-AA---GGATTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--T-G---AC-AC-AA-T----A-T-AAC-C-C-G--GG-A---T-A--TCAA-AAAAAAT-AAAAAAC-GC-AC-T-CTGA-AAAAGT-ACG-GG--T---------ATCAG-CCTC------GAT-TTTGC-T-AAC-G-A--CAGA-AGT-AC-AAAAC-T-CAGAA-AC-T-TG-GAGA-GACGGT-AGA--A--T-AATG-TCA-AA--C--CTATG---ATA-TAT--TTTT-GGT-AA-C--GGCT-AT-GGA-T-GA--AT-G---G--TA---------------TG--AAATC---AT-G-CAT-T-A----TTGCGCTAT-T-GAGGTCTG-TTATT--T-GTAATGACA-ATA--CAATA------GTAAGGAA---AT-CAA--C-GC-TTTC--TC-ATTGAT---TT-CTG-A-GCAC-T-CA-CCT--TT--GT-A--AA---GTT--Tcag
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -TGT-TAAATTCCCAATACCAT----TAA--AATTTGCATG--C-TTT--T-ATAT-T-CAGGTCGACGCTTCTCT---CGC-TACTC-GA-----ATTT--------GTATGCGA--CGTT---CT---------G--G--C-A--T-CAAAAAG-GTTCCGC-TG--TA-A-TCAC----A-G---G-AAT-A-----AC---C-TG
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -A-TTG-TA-AA---GGTGTG---A-TTCCTT----G--GAGAATACCAAG--AGACATT--T-GTAAAC-AC-AA-T----A-T-ACC-A-C-G--GCGAGACT-AGCTTAATA-----T-AAA---C-GC-AC-C-GGAA-AA--GT-ACG-G
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATG-ACCA-TTTTAGTCTAT-GGAGGAC-ATGA-ATTATTTA-TTTGAAGAGGC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGAC-CATTCCAC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aAC-CATTCCGC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|3                          :   CTGTCT-ACTAAC-G-TGAT--GAGGGAAAGCATG-G-AC-CGGCCAAGATGATT-CCTTT--AAATTTAACAATCGATCTAG-CAGAGTCCACTT-GTGGC-CAAAATATAAAA---TAAA--CCT-GTACA------TCCTAACAACA---------A-CAACAA-----------AAGAATGGCAACTACCGA-AAAAAAACTTGTAAATCATATATA-ATTT-CCTTTCTGATCATG-AATCA--TTCCGCTCAAAATTGAATT-CA-TACAACGGAGTTGT-ACTTATGCCCGCCCCCCCCCCCAAAAT-TA-TAATTTCCTTGGTTAAAAAAAGTTTATTATTATAGGTTCATGTT--TGCCTGT-G-AATA-AG-TTTA-TAAA--TG-TA-GTAAAGGATTTCAAAACTTTCA-G-GAAAAAGTCAG-TATACATT--TTTTTAAA-GGGACCATG---TGTTTGATACACCTCCCCCCTCCCGCGCGAGGAAAGGAGCT-AGAGA-TATAAAAAATGAAAACAAATTGTTCCTGTTCTATGAATTTAGCCTGGTTGCA-ACTTTATATGGTTTTAAATGGCAACAGGTTTTGAATGTGTATTTTTGTACATCTTCTGTTGTCATTTTTGATA-TTAATAAATTTACCA-TTTTAGTTTAT-GGTGGACCTTGC-TT-ATCTA-TTTGGAGAGGCAGACAGG-AATTGTCAGC--AAGCCCCAAGATCCGGCTAAGGAGCCTCAG-ACAATCGGAGAG-TTCTATAG-GCAC-CGAAGCACATATACTCCC-ACGATGTCCCGACGTGATAAATATTCGATATTT-AAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGA-ATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACGT-AAT-GACA-A-ATTCAAA-GCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTATTGT--AACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAAAAAAAAACATTAACCCAAAAAGCCCAAAAAGGAAAAAAAAAAGA---AAAAAAAAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aC-AA---TAATT-CACAACT------GA----ATCCTCGCTCCACAAGCAATTT-CGT---ATT--GTT------T--G--T----------------AAATC--------TTTCGTGGGTTGATAT-CATAAA-TTC-TGA-TGG-TTAATTCC-AATGCCCT----TAA--A-TTTTCA-G--C-TTTATCGAT-T-T-C-G-T-GAC-----TTTTTTCGCCAACTG-TA-----AGCG--------GT-----A--CG-T---GG---------G--GG-C-A--T-CA----GCGGTCCGCGTG--TA-AATCACGCTAA-G---TTAAT-A-----AC--AC-TGGGCGCA--CCACTC-T-AGA-A-----ACA---AAAAG--GA-AAACT-A-AATTTT-AC---AGCGAG-T-TTTTTG---TC-CTA-CA---TC-AAA-AC----C---TTA---A-TG-AC----ATTCCCCAAAAGT--CAT-ATCCCG--T-TTTTTTTC-A-----TTGAAA--GCTCT-TGCGGA--AC-C-AGTTC--CACGGTA-CC-AAAAACTG-G-TTTG-T------AAATA-----CC-GCTG-ACC--AAT-C-CAGCAG-C-ATATT-TTTATGAAATTTCTGG----------ACATT-CTCGTTGG-AAACC-ACTC-CCTTGTC---GACGCGT--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATACGT-GTGTTTT----C-G-AATTCTT-T--GGACTT-A-CCAAAA--C-AA-GAAA-CA-T-TGTC-TCTGGGAT-GAC-CG----TATTA-AA--AGGAGTG---A-TTGGATTTTGG--GA---T-CCAGA--G-----T--TGG---AC-AC-AATT---TATT-ACC-A-C-G--GGTA---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GC-AC-TCCTGA-AA--GTAACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GA--TTT-C-T-A-CAG-AC-CAGA-AGTAAC-A---C-TCCA----AC-T-TGCGAAC-G---GT-A-A--ATTT-G-TG-TCAGAA--CGTCT-TGC--ATAATA----TTT-GGT-AACC--GGCCGAT-GGATT-GA--AT-G---GCCTAATCCTAGTTATTAATAG--AA--C---ATGG-CA--TTA----T----CTAT-T-GAT-TCTGTTTATT--TGTTA-T-ACA-ATAATTCATAGTAACAGTAAA-AAAATAT-CAA--C-GC-TTTC--TC-AAT-GATTTTT-CTGAA-GCACTT-CA-CC---TT--GT-AACAGTGTGTA--CCC-CCGTCG-CCA-TCTTTTTTA-AAGAGAC-CATTCCGG-ATCAGGG-TA-CACGG--ACAGTGtat
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Reference ( family-80 )       :   CTGTCT-ACTAAC-GGTGAT--GAGG-AAAGCATG-GGACGCGGCCAGAATGATT-CCTTTTTAAATTTANCAATCGATCTAT-CAGAGTCCN--T-GTGCC-AAAAAAATAAAAAG-TATA--C-T-GTAAN------TCCTAACAACA---------AACAACAA-----------AAGAATGGCAA-TACCGATAAAGAAACTT-TAA-TCATATATA-ATTTTCCTTTCTGATCATG-AATCA--ATCCCCTCAA---TGA-TT-CA-TACA-CGGAGCTGT-ACTTATGC-----------------AT-TA-TA--TTC--TGGTTAAA-----TGTATT-TTATAGGTTCATGTT--TGCCTGTTA-AATATAG-TTTA-TAAAAATG-TA-GTA--TGATTTTCAAACTTTCA-GTGAAAA--TCA--TATACATA--TTTTTTAA-GGGACCATG---TGTTTGATA-----------------ACGAGGAAAAGAGCT-AGAGACTATAAAAAATGAAAACAAATTGNTCCTGTTCTATGGANTTAGCCTGGTTGCGTACTTTATATGGTTTTAATCGG-AACAGGTTTTGAATGT-TATTTTTNTACATCTTCT--TGTCATTTTTGATA-TTAATAAATN-ACCA-TTTTAGTCTAT-GG-GGAC-TTGC-TTTATTTA-TTTGGAGAGGCAGACAGGCAACTGTCAGCTTAAGCCCCAAGATCCNGCTAAGGAGCCTCAGGACAATNNGAGAGCTTCTATAGAGCACACGAAGCANATATACTCCCCACGATGTCCCGACGNGATAAANNTTCGATATTTTAAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGATATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACNTTAATTGACACACATTCAAAAGCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTACTGTTAAACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAGAAAAAAACATTAACCNAAAAAGCCNAAAAAGGAAAAAAAAAAGACCCAAAAAANAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTATATTCATGTAATACATAAGAAATAAAAACAATNAAAAATGAATTTTTTTAAAAATTCATTTGTATAAAAGCTGTGTTTTGCCACCCCTAANATACAACAGATAAATACAGCCACTTGGGGGACGGGATAGTTTAACCTTTCTGAAAGTGCATAGTGTTTTTTGCTCTGTTTATTTGAAATCTGTATAATTGAGCACATAAAAATTTCAAATCCATTCATATTTGAAAAACAAATGAAGTTTGANGGTAATACTTTTATGGTCCANTGATAGAGCTAAAACTACAGATTGAACAAATAAGAGGAGAGAGGTCNGCACACTAAATTCAGTTCCCAAGGTATCTGTGTGATAAAGAAAAAAAAATACCGGTAGGCCTACCGTCATATCTTTTTTTCGTTCGGAATATCAGGTAGTTTCTTTTTAAAAAAAANTTGACACATGGACTATAGTATCGNTGATNGAATTTGATATGGAATCCTCTGGCGCACCGTCCATGTTTTCCCGNATC----AT----CG--TTAGT--AGACAGTTACTCAA-TTTCTGTAAC-AA---TAATT-CACAACT----A-GA-TCTATCCTCG-TCCACA-GCGATTT-CGTTG-GTT--GTT---AAAT--G--T------------TTTGAAATC--------TTTCGT---CTGATAT-CC--AA-TTC-TTG-TGT-TAAATTCC-AATGCCTT----TAA--A-TTTTCA-G--C-TTT--C-AT-T-T-C-GGT-GAC-----TTT---CGC-AACTG-TA-----ANTT--------AT----GA--CGGT---CT---------G--GG-C-A--T-CA----G-GGTCCGC-TG--TA-A-TCAC----A-G---T-AAT-A-----AC--AC-TGGGC--A--CCAC-C-T-A-A-A-----ACA---AAAAG--AA-AA--T-A-A--TTT-AC---AGC-AG-T-TT---G---TC-CTA-CA---TC-AAA-AC----CG--TTATT-A-TG-A-----ATCCCC---AAGT--CAT-A-CCCG--T-TTTTT--C-A-----TTGAAA--GC-CT-TG--GG--AC-C-AGT-C--CACG--A-CC-AAAA-CTG-G-T--G-T------AAATA-----TC-G-TG-ACC--AAT-C-CAG-AG-C-ATATT-TTTTTGAA-TTTCTGG----------ACATT-C-CGTTGG-AA-CC-ACTC-CGT-GTC---G-----T--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-AA---TT-T--GGAC-T-A-C--AAA--CAAA-GAAA-CATT-TGTC-TC----AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA--AGGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--T-G---AC-AC-AA-T---TA-T-ACC-A-C-G--GGGA---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GC-AC-T-CTGA-AA--GT-ACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GAT-TTT-C-T-A-C-G-A--CAGA-AGT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGA-G---GT-A-A--A--T-G-TG-TCA-AA--C--CT-TG---ATAATAT--TTTT-GGT-AA-C--GGC--AT-GGA-T-GA--AT-G---G--TA---------------NG--AA--C---AT-G-CAT-TTA----T----CTAT-T-GAT-TCTG-TTATT--TTGTA-TGACA-ATA--TCATA-----AGTAAG-AA---AT-CAA--C-GC-TTTC--TC-ATTGGA---TT-CTG-A-GCAC-T-CA-CCT--TT--GT-AACAG---GTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTAA-AAGAGAC-CATTCCGC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGTG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -T-TT---G---TC-CTA-CA---TCCAAA-AC----CAA-TTATTTA-TG-A-----ATCCCC---AAGT--CAT-A-TCCG--T-TTTTT--C-A-----TTGAAAAGGC-CC-TT--GG--AC-C-AGT-C--C-CG--A-CC-AAAA-CTGCG-T--G-T------AAA-A-----TC-G-TG-ACC--AATTC-CAG-GGGC-ATATT-TTTT-GAA-TTTCTGG----------ACATTTC-CGTTGG-AA-CCCACTC-CGT-GTC---G-----T--AA--AA-CAA---ACT---TTCC--ATGTCCGT-TTT--G-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-GA---TTCT--GGAC-T-A-C--AAAA-CAAA-GAA--CATT--GTC-TC----AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA---GGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--TTG---AC-AC-AA-T----A-T-ACCCA-C-G--GG-A---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GCCAC-T-CTGA-AA--GC-ACG-GGGTC---------ATC-G-CCTC------GAT-GTT-C-TTA-C-GGA--C-GA-GCT-AC-A---C-T-CA----AC-T-TG-GAGACG---GT-A-ATTG--T-G-TG-TCA-AAACC--TT-TG---ATAATAT--TTTT-G-T-AA-C--GG---AT-GGA-T-GA--ATTG---G--TA---------------TATTAA--C---AT-G-CATCTTA----T----CTAT-TTGAT--CTG-TTATT--T-GTA-TGACA-ATA--TCATA-----GATAAG-AA---AT-CAA--CCGC-TTTCCTTCGATTTGA---TT-CTG-A-GCGC---CA-CCT--TT--GT-AACAG---CTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTTA-AAAAGAC-CATTCCG--ATCA-GGTTA-CAC-G--AC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGG-AA-CC-ACTT--GT-GTC---G-----TTAAA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATAC-T-A-----T----C-G-AAAT-TT-T--GGAT-A-A-C--AAAAGCAAAAGAAA-CATT-GGTC-TC----AT-GAT-CG-AGTTA-TA-AA---GGATTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--T-G---AC-AC-AA-T----A-T-AAC-C-C-G--GG-A---T-A--TCAA-AAAAAAT-AAAAAAC-GC-AC-T-CTGA-AAAAGT-ACG-GG--T---------ATCAG-CCTC------GAT-TTTGC-T-AAC-G-A--CAGA-AGT-AC-AAAAC-T-CAGAA-AC-T-TG-GAGA-GACGGT-AGA--A--T-AATG-TCA-AA--C--CTATG---ATA-TAT--TTTT-GGT-AA-C--GGCT-AT-GGA-T-GA--AT-G---G--TA---------------TG--AAATC---AT-G-CAT-T-A----TTGCGCTAT-T-GAGGTCTG-TTATT--T-GTAATGACA-ATA--CAATA------GTAAGGAA---AT-CAA--C-GC-TTTC--TC-ATTGAT---TT-CTG-A-GCAC-T-CA-CCT--TT--GT-A--AA---GTT--Tcag
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -TGT-TAAATTCCCAATACCAT----TAA--AATTTGCATG--C-TTT--T-ATAT-T-CAGGTCGACGCTTCTCT---CGC-TACTC-GA-----ATTT--------GTATGCGA--CGTT---CT---------G--G--C-A--T-CAAAAAG-GTTCCGC-TG--TA-A-TCAC----A-G---G-AAT-A-----AC---C-TG
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -A-TTG-TA-AA---GGTGTG---A-TTCCTT----G--GAGAATACCAAG--AGACATT--T-GTAAAC-AC-AA-T----A-T-ACC-A-C-G--GCGAGACT-AGCTTAATA-----T-AAA---C-GC-AC-C-GGAA-AA--GT-ACG-G
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATG-ACCA-TTTTAGTCTAT-GGAGGAC-ATGA-ATTATTTA-TTTGAAGAGGC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGAC-CATTCCAC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aAC-CATTCCGC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|3                          :   CTGTCT-ACTAAC-G-TGAT--GAGGGAAAGCATG-G-AC-CGGCCAAGATGATT-CCTTT--AAATTTAACAATCGATCTAG-CAGAGTCCACTT-GTGGC-CAAAATATAAAA---TAAA--CCT-GTACA------TCCTAACAACA---------A-CAACAA-----------AAGAATGGCAACTACCGA-AAAAAAACTTGTAAATCATATATA-ATTT-CCTTTCTGATCATG-AATCA--TTCCGCTCAAAATTGAATT-CA-TACAACGGAGTTGT-ACTTATGCCCGCCCCCCCCCCCAAAAT-TA-TAATTTCCTTGGTTAAAAAAAGTTTATTATTATAGGTTCATGTT--TGCCTGT-G-AATA-AG-TTTA-TAAA--TG-TA-GTAAAGGATTTCAAAACTTTCA-G-GAAAAAGTCAG-TATACATT--TTTTTAAA-GGGACCATG---TGTTTGATACACCTCCCCCCTCCCGCGCGAGGAAAGGAGCT-AGAGA-TATAAAAAATGAAAACAAATTGTTCCTGTTCTATGAATTTAGCCTGGTTGCA-ACTTTATATGGTTTTAAATGGCAACAGGTTTTGAATGTGTATTTTTGTACATCTTCTGTTGTCATTTTTGATA-TTAATAAATTTACCA-TTTTAGTTTAT-GGTGGACCTTGC-TT-ATCTA-TTTGGAGAGGCAGACAGG-AATTGTCAGC--AAGCCCCAAGATCCGGCTAAGGAGCCTCAG-ACAATCGGAGAG-TTCTATAG-GCAC-CGAAGCACATATACTCCC-ACGATGTCCCGACGTGATAAATATTCGATATTT-AAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGA-ATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACGT-AAT-GACA-A-ATTCAAA-GCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTATTGT--AACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAAAAAAAAACATTAACCCAAAAAGCCCAAAAAGGAAAAAAAAAAGA---AAAAAAAAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aC-AA---TAATT-CACAACT------GA----ATCCTCGCTCCACAAGCAATTT-CGT---ATT--GTT------T--G--T----------------AAATC--------TTTCGTGGGTTGATAT-CATAAA-TTC-TGA-TGG-TTAATTCC-AATGCCCT----TAA--A-TTTTCA-G--C-TTTATCGAT-T-T-C-G-T-GAC-----TTTTTTCGCCAACTG-TA-----AGCG--------GT-----A--CG-T---GG---------G--GG-C-A--T-CA----GCGGTCCGCGTG--TA-AATCACGCTAA-G---TTAAT-A-----AC--AC-TGGGCGCA--CCACTC-T-AGA-A-----ACA---AAAAG--GA-AAACT-A-AATTTT-AC---AGCGAG-T-TTTTTG---TC-CTA-CA---TC-AAA-AC----C---TTA---A-TG-AC----ATTCCCCAAAAGT--CAT-ATCCCG--T-TTTTTTTC-A-----TTGAAA--GCTCT-TGCGGA--AC-C-AGTTC--CACGGTA-CC-AAAAACTG-G-TTTG-T------AAATA-----CC-GCTG-ACC--AAT-C-CAGCAG-C-ATATT-TTTATGAAATTTCTGG----------ACATT-CTCGTTGG-AAACC-ACTC-CCTTGTC---GACGCGT--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATACGT-GTGTTTT----C-G-AATTCTT-T--GGACTT-A-CCAAAA--C-AA-GAAA-CA-T-TGTC-TCTGGGAT-GAC-CG----TATTA-AA--AGGAGTG---A-TTGGATTTTGG--GA---T-CCAGA--G-----T--TGG---AC-AC-AATT---TATT-ACC-A-C-G--GGTA---T-A--TCAA-A-----T-AAA---C-GC-AC-TCCTGA-AA--GTAACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GA--TTT-C-T-A-CAG-AC-CAGA-AGTAAC-A---C-TCCA----AC-T-TGCGAAC-G---GT-A-A--ATTT-G-TG-TCAGAA--CGTCT-TGC--ATAATA----TTT-GGT-AACC--GGCCGAT-GGATT-GA--AT-G---GCCTAATCCTAGTTATTAATAG--AA--C---ATGG-CA--TTA----T----CTAT-T-GAT-TCTGTTTATT--TGTTA-T-ACA-ATAATTCATAGTAACAGTAAA-AAAATAT-CAA--C-GC-TTTC--TC-AAT-GATTTTT-CTGAA-GCACTT-CA-CC---TT--GT-AACAGTGTGTA--CCC-CCGTCG-CCA-TCTTTTTTA-AAGAGAC-CATTCCGG-ATCAGGG-TA-CACGG--ACAGTGtat
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Reference ( family-80 )       :   CTGTCT-ACTAAC-GGTGAT--GAGG-AAAGCATG-GGACGCGGCCAGAATGATT-CCTTTTTAAATTTANCAATCGATCTAT-CAGAGTCCN--T-GTGCCAAAAAAA-TAAAAAG-TATA--C-T-GTAAN------TCCTAACAACAA---------ACAACAA-----------AAGAATGGCAA-TACCGATAAAGAAACTT-TAA-TCATATATA-ATTTTCCTTTCTGATCATG-AATCA--ATCCCCTCAA---TGA-TT-CAT-ACA-CGGAGCTGT-ACTTATGC-----------------AT-TA-TA--TTC--TGGTTAAA-----TGTATT-TTATAGGTTCATGTT--TGCCTGTTA-AATATAG-TTTA-TAAAAATG-TA-GTA--TGATTTTCAAACTTTCA-GTGAAAA--TCA-T--ATACATA--TTTTTTAA-GGGACCATG---TGTTTGATA-----------------ACGAGGAAAAGAGCTA-GAGACTATAAAAAATGAAAACAAATTGNTCCTGTTCTATGGANTTAGCCTGGTTGCGTACTTTATATGGTTTTAATCGG-AACAGGTTTTGAATGT-TATTTTTNTACATCTTCT--TGTCATTTTTGATATT-AATAAATN-ACCATTTT-AGTCTAT-GG-GGAC-TTGCTTT-ATTTATTT-GGAGAGGCAGACAGGCAACTGTCAGCTTAAGCCCCAAGATCCNGCTAAGGAGCCTCAGGACAATNNGAGAGCTTCTATAGAGCACACGAAGCANATATACTCCCCACGATGTCCCGACGNGATAAANNTTCGATATTTTAAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGATATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACNTTAATTGACACACATTCAAAAGCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTACTGTTAAACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAGAAAAAAACATTAACCNAAAAAGCCNAAAAAGGAAAAAAAAAAGACCCAAAAAANAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTATATTCATGTAATACATAAGAAATAAAAACAATNAAAAATGAATTTTTTTAAAAATTCATTTGTATAAAAGCTGTGTTTTGCCACCCCTAANATACAACAGATAAATACAGCCACTTGGGGGACGGGATAGTTTAACCTTTCTGAAAGTGCATAGTGTTTTTTGCTCTGTTTATTTGAAATCTGTATAATTGAGCACATAAAAATTTCAAATCCATTCATATTTGAAAAACAAATGAAGTTTGANGGTAATACTTTTATGGTCCANTGATAGAGCTAAAACTACAGATTGAACAAATAAGAGGAGAGAGGTCNGCACACTAAATTCAGTTCCCAAGGTATCTGTGTGATAAAGAAAAAAAAATACCGGTAGGCCTACCGTCATATCTTTTTTTCGTTCGGAATATCAGGTAGTTTCTTTTTAAAAAAAANTTGACACATGGACTATAGTATCGNTGATNGAATTTGATATGGAATCCTCTGGCGCACCGTCCATGTTTTCCCGNATC----AT----CG--TTAGT-A--GACAGTTACTCAA-TTTCTGTAACAA---TAATT-CACAACT----A-----C-----ATCCTCG-TCCACA-GCGAT--------TT-C-----------GT----TG-G------T---TG-TAAA-----------------------TCT------TTC--GT---CTGATAT-CC--AA-TTCTT-G-TGT-TAAATTCC-AATGCCTT----TAA--A-TTTTCA-G--C-TTT--C-AT-T-T-C-GGT-GAC-----TTT---CGC-AACTG-TA-----ANTT--------AT----GA--CGGT---CT---------G--GG-C-A--T-CA----G-GGTCCGC-TG--TA-A-TCAC----A-G---T-AAT-A-----AC--AC-TGGGC--A--CCAC-C-T-A-A-A-----ACA---AAAAG--AA-AA--TA-A--TTT-AC---AGC-AG-T-TT---G---TC-CTA-CA---TC-AAA-AC----CG--TTATT-A-TG-A-----ATCCCC---AAGT--CAT-A-CCCG--T-TTTTT--CA-----TTGAAA--GC-CT-TG--GG--AC-CA-GT-C--CACG--A-CC-AAAA-CTG-G-T--G-T------AAATA-----TC-G-TG-ACC--AAT-C-CAG-AG-C-ATATT-TTTTTGAA-TTTCTGG----------ACATT-C-CGTTGG-AA-CC-ACTC-CGT-GTC---G-----T--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-AA---TT-T--GGAC-T-A-C--AAA--CAAA-GAAA-CATT-TGTC-TC----AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA--AGGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--T-G---AC-AC-----AA--TA-T-ACC-A-C-G--GGGA---T-A--TC-----AA-AT---AAAC-GC-AC-T-CTG--A-AAGT-ACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GAT-TTT-C-T-A-C-G-A--CAGA-AGT-AC---AC-T-C---A----AC-T-TG-GAGA---G-GT-A-A--A--T-G-TG-TCA-AA--C--CT-TG---ATAATAT--TTTT-GGT-AA-C--GGC--AT-GGA-T-GA--AT-G---G--TA---------------NG--AA--C---AT-G-CAT-TTA----T----CTAT-T-GA-TTCTG-TTATT--TTGT-ATGACA-ATA--TCAT-AG-TAA----GAA-----AT-CAA--C-GC-TTTC--TC-A--TNG-A---TT-CTG-A-GCAC-T-CA-CCT--TT--GT-AACAG---GTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTAA-AAGAGAC-CATTCCGC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGTG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -T-TT---G---TC-CTA-CA---TCCAAA-AC----CAA-TTATTTA-TG-A-----ATCCCC---AAGT--CAT-A-TCCG--T-TTTTT--CA-----TTGAAAAGGC-CC-TT--GG--AC-CA-GT-C--C-CG--A-CC-AAAA-CTGCG-T--G-T------AAA-A-----TC-G-TG-ACC--AATTC-CAG-GGGC-ATATT-TTTT-GAA-TTTCTGG----------ACATTTC-CGTTGG-AA-CCCACTC-CGT-GTC---G-----T--AA--AA-CAA---ACT---TTCC--ATGTCCGT-TTT--G-ACA-ATAC-T-G-----T----C-G-GA---TTCT--GGAC-T-A-C--AAAA-CAAA-GAA--CATT--GTC-TC----AT-GAT-CG-A-TTA-TA-AA---GGAGTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--TTG---AC-AC-----AA--TA-T-ACCCA-C-G--GG-A---T-A--TC-----AA-AT---AAAC-GCCAC-T-CTG--A-AAGC-ACG-GGGTC---------ATC-G-CCTC------GAT-GTT-C-TTA-C-GGA--C-GA-GCT-AC---AC-T-C---A----AC-T-TG-GAGAC--G-GT-A-ATTG--T-G-TG-TCA-AAACC--TT-TG---ATAATAT--TTTT-G-T-AA-C--GG---AT-GGA-T-GA--ATTG---G--TA---------------TATTAA--C---AT-G-CATCTTA----T----CTAT-TTGA-T-CTG-TTATT--T-GT-ATGACA-ATA--TCAT-AGATAA----GAA-----AT-CAA--CCGC-TTTCCTTC-GATTTG-A---TT-CTG-A-GCGC---CA-CCT--TT--GT-AACAG---CTT--TCC-CCGTCG-CCA-TC--TTTTA-AAAAGAC-CATTCCG--ATCA-GGTTA-CAC-G--AC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGG-AA-CC-ACTT--GT-GTC---G-----TTAAA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATAC-T-A-----T----C-G-AAAT-TT-T--GGAT-A-A-C--AAAAGCAAAAGAAA-CATT-GGTC-TC----AT-GAT-CG-AGTTA-T--AA--AGGATTG---A-TT---T----G--GA---T-CCAAG--A-----T--T-G---AC-AC-----AA--TA-T-AAC---C-C--GGGA---T-A--TCAAAAAAA-ATAAAAAAC-GC-AC-T-CTGAAA-AAGT-ACG-GG--T---------ATCAG-CCTC------GAT-TTTGC-TAA-C-G-A--CAGA-AGT-ACAAAAC-T-CAGAA----AC-T-TG-GAGAGACG-GT-AGA--A--TAA-TG-TCA-AA--C--CTATG---AT-ATAT--TTTT-GGT-AA-C--GGCT-AT-GGA-T-GA--AT-G---G--TA---------------TG--AAATC---AT-G-CA--TTA----TTGCGCTAT-T-GAGGTCTG-TTA-T--TTGTAATGACA-ATA--CAAT-AG-TAAG---GAA-----AT-CAA--C-GC-TTTC--TC-A--TTG-AT--TT-CTG-A-GCAC-T-CA-CCT--TT--GT-A--AA---GTT--Tcag
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -A-TTG-TA-AA---GGTGTG---A-TTCCTT----G--GAGAATACCAAG--AGACATT--T-GTAAAC-AC-----AA--TA-T-ACC-A-C-G--GCGAGACT-AGCTT-----AATAT---AAAC-GC-AC-C-GGA--A-AAGT-ACG-G
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AT-AG-TAA----GAA-----ATGTAA--C-GC-TTTC--TC-A--TTG-A---TT-CTG-AGGCAC-T-CA-CCT--T----T-AACA----GTT--TTC-CCGTCG--CA-TC--TTTAA-A--AGACGCATTCCGC-ATCA-GG-TA--AC-G--ACAGT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ---------ATC-G-CCTC------GAT-TT--C-T-A-C-G-A--CAGA-AGT-AC------T-C---A----AT-T-TG-GAGA---G-GT-A-A--A--T-G-
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATG-ACCATTTT-AGTCTAT-GGAGGAC-ATGAATT-ATTTATTT-GAAGAGGC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGAC-CATTCCAC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aAC-CATTCCGC-ATCA-GG-TA-CAC-G--ACAGT
gi|3                          :   CTGTCT-ACTAAC-G-TGAT--GAGGGAAAGCATG-G-AC-CGGCCAAGATGATT-CCTTT--AAATTTAACAATCGATCTAG-CAGAGTCCACTT-GTGGCCAAAATA-TAAAA---TAAA--CCT-GTACA------TCCTAACAACAA----------CAACAA-----------AAGAATGGCAACTACCGA-AAAAAAACTTGTAAATCATATATA-ATTT-CCTTTCTGATCATG-AATCA--TTCCGCTCAAAATTGAATT-CAT-ACAACGGAGTTGT-ACTTATGCCCGCCCCCCCCCCCAAAAT-TA-TAATTTCCTTGGTTAAAAAAAGTTTATTATTATAGGTTCATGTT--TGCCTGT-G-AATA-AG-TTTA-TAAA--TG-TA-GTAAAGGATTTCAAAACTTTCA-G-GAAAAAGTCAGT--ATACATT--TTTTTAAA-GGGACCATG---TGTTTGATACACCTCCCCCCTCCCGCGCGAGGAAAGGAGCTA-GAGA-TATAAAAAATGAAAACAAATTGTTCCTGTTCTATGAATTTAGCCTGGTTGCA-ACTTTATATGGTTTTAAATGGCAACAGGTTTTGAATGTGTATTTTTGTACATCTTCTGTTGTCATTTTTGATATT-AATAAATTTACCATTTT-AGTTTAT-GGTGGACCTTGCTT--ATCTATTT-GGAGAGGCAGACAGG-AATTGTCAGC--AAGCCCCAAGATCCGGCTAAGGAGCCTCAG-ACAATCGGAGAG-TTCTATAG-GCAC-CGAAGCACATATACTCCC-ACGATGTCCCGACGTGATAAATATTCGATATTT-AAATTAAAACTGATTAATTGCAATTTAGA-ATCAGTGGCATAAAGACTTTGGCATGTGTAAATGAAACGT-AAT-GACA-A-ATTCAAA-GCATATGTTAGATAATGAACCTTTTATTGTATTGT--AACAATACAAACCATACTAATTGACCAAAATAAAAAAAAAACATTAACCCAAAAAGCCCAAAAAGGAAAAAAAAAAGA---AAAAAAAAAACAATCGATGGAACTTTTAATTCTAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aCAA---TAATT-CACAACT----G-----A-----ATCCTCGCTCCACAAGCAAT--------TT-C-----------GTAT--TG-T------T---TG-TAAA-----------------------TCT------TTC--GTGGGTTGATAT-CATAAA-TTCTG-A-TGG-TTAATTCC-AATGCCCT----TAA--A-TTTTCA-G--C-TTTATCGAT-T-T-C-G-T-GAC-----TTTTTTCGCCAACTG-TA-----AGCG--------GT-----A--CG-T---GG---------G--GG-C-A--T-CA----GCGGTCCGCGTG--TA-AATCACGCTAA-G---TTAAT-A-----AC--AC-TGGGCGCA--CCACTC-T-AGA-A-----ACA---AAAAG--GA-AAACTA-AATTTT-AC---AGCGAG-T-TTTTTG---TC-CTA-CA---TC-AAA-AC----C---TTA---A-TG-AC----ATTCCCCAAAAGT--CAT-ATCCCG--T-TTTTTTTCA-----TTGAAA--GCTCT-TGCGGA--AC-CA-GTTC--CACGGTA-CC-AAAAACTG-G-TTTG-T------AAATA-----CC-GCTG-ACC--AAT-C-CAGCAG-C-ATATT-TTTATGAAATTTCTGG----------ACATT-CTCGTTGG-AAACC-ACTC-CCTTGTC---GACGCGT--AA--AC-AAA---ACT---TTCC--CTGTCCGT-TTTTTG-ACA-ATACGT-GTGTTTT----C-G-AATTCTT-T--GGACTT-A-CCAAAA--C-AA-GAAA-CA-T-TGTC-TCTGGGAT-GAC-CG----TATTA-AA--AGGAGTG---A-TTGGATTTTGG--GA---T-CCAGA--G-----T--TGG---AC-AC-----AATTTATT-ACC-A-C-G--GGTA---T-A--TC-----AA-AT---AAAC-GC-AC-TCCTG--A-AAGTAACG-GG--T---------ATC-G-CCTC------GA--TTT-C-T-A-CAG-AC-CAGA-AGTAAC---AC-TCC---A----AC-T-TGCGAAC---G-GT-A-A--ATTT-G-TG-TCAGAA--CGTCT-TGC--ATAATA----TTT-GGT-AACC--GGCCGAT-GGATT-GA--AT-G---GCCTAATCCTAGTTATTAATAG--AA--C---ATGG-CA--TTA----T----CTAT-T-GA-TTCTGTTTATT--TGTT-AT-ACA-ATAATTCAT-AG-TAACAGTAAAAAAATAT-CAA--C-GC-TTTC--TC-A--ATG-ATTTTT-CTGAA-GCACTT-CA-CC---TT--GT-AACAGTGTGTA--CCC-CCGTCG-CCA-TCTTTTTTA-AAGAGAC-CATTCCGG-ATCAGGG-TA-CACGG--ACAGTGtat
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