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gi|7                          : tagttttacatgtcagtttttgtgggatactgtagtttacctgtcagttttatactgctgtagtttacctgttcagttgtgttatactgtagtgtaccatgtctgttttattttctgctatatttatttctgtcagttttataactgacgtattgttacgctgtccagttttaaatactgaccgtagttattctgttcaatttattattactgctgtgttattcaggtaagaattatttaaattgggtagtatagcctgtcagtatttttttattgcttgtacgttacactgtcagtttttatactgagtgtagttaccggtcagaactctcttcctgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaATCTGCCAGTTTTTTAATG-CA----GTAGTT-----ATCTGCTAG-TTTTA-TACTGCTGTAGTAGCCTGTCAGTATTCTA--CTG----ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTCGTT-A-CCTGT-TA-G--TTT-TATACTG--CTGTA-G-T--AACCT--GTC-AGTATT-C-T------ACTGCTGTC-GT-TACCTGTTAGTTTTATACTGCTGTACTTACCT-GA--GT-T--C--GTCCTCTCCTGGAGATTGGTATGTGTTTC------ATCTGGAGATT-CACGTGGACTTGCCC---CTTGTT-CTGTGCATATTTCATTATCAGCA-TTTAGCCTTCTTCGTTTTCTACAAGGACCCTATGTACATGAAA-GTAAATATATGGTTAT---AATTCAAT-TTGAAGGTTTG-GGC----------AC-TTTTAGGTTT-AGGTAATGCTATTAAATTATTTTATGTGTGAGTTAAAGTTGTC-GATA-ACTAGAATTAATTG--TGTATA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atactgctgcagttACCTGTCAGCTGAT-AGCAACTGACTGTAGTT-----ACC-GTTAGAGTCTTGTATTG----ATC----TGCTG---TACTTACCTGTCT-GTTTT-----ATACTG--CATGTAGTTTAGCCTGTCCT-GCTTAT-TATACTGCACTGTAGG-TAATACCT--GTCGAGT-TTGC----AC--ACTGCTG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgttagtttatcatatacctgcttgatagttacctgttcagttttattaacttggcggtagttccctgattcagtgttgtttacgggctgttaagttaccggtaccttttgttatactgctggtagttcgcctgtcagtttaaatactactacttgtcagttACCTGTCAG-TTTT-A-TA-CTGT-TGTAGTT-----ACCTGTCAGATTttaggttggtgaccatcgattaagtttttatactgctatgcctaaatgtaaccatgtcagtatatttttatacagtcagaatacgtcctttcagttttctatactgcctggagttatatagtactggtgttttattaccatgttcagtttttgaatcgactgcatgttgtttattagcgctgtcagccttctatacctgaccatgtagatactctcctgtgcagttgtctaactctactagctgatatgagtttcctgcttacgggtacctgtcagattttatatatcatcagcatgctcgtattaccatggttaggttgcttacggactgctgtacagttacctagtattgctcatcaattattggctatcactgctgttagttttacctgttagttttatactggctggagttagctgtcagtatatactgctgtagttacctgtcagtttatcgcttgctgtagtttacc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttatactggtgtggttCTGTCAG--TTT-CATA-CTGT-TATAGTT-----ACCTGTCAGATTAGT-TACGG----GATANCATACTCGTATAATTACCTGTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagttacctgtcagtttcatactgttatagttacct
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTTATATTGCATGT-AG----TC-TAC-G----AAT----T-----TGTAC----CTGTCA-GTTT--------ATTATGCATGTAGTTTAGCTTGTTCAAGGTTTC-TATACTG--CTGTAAGCT--TATCTTGGTC-A---CT-CGTTTATTGACTGCTGTAGGTTTACCTG--
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTTTT-----ATACTGTT---GTAGTT-A-CCTGTG-A-GATTT---ATACCA--CTGTA-G-T--TACCT--GTC-TGT------TGTAT--ATTGTTGTA-GT-TACCTG--A--TCTCT--TCCTCT-CTTGGAT-GATGGTCT--CT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tgttaAATACTGCT---GTAGTT-A-CCTGT-CA-TATTTTATATA--G--CCTTA-G-T--AATCT--GCC-A---TT-T-TTTGT--ACTGCTGgtttgatctggaaattcacgtggactgaccccttcttctgtaaatatgtctttatcagcaagaggatcctatacacatggaagtaaatacaagaatatgtttaaacattaaattttgataacttttaagtcagttgatatcattaaatcatttgatgtgtgatttagagttttagtagactataataacttgtatatataccaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatgacgtcgataaagtgttcaatacacaaaaagacaatgcaacacggtgtaataatttgttcataaatattaaattacaacattaaaaataatgcacgtgagaaaaccgggaagtctgaaaattgcaggaaagaaagactttcattatcataattatttgctgttgtttgtgtaggaaataagtttacaattccactgacggagtttatctcggaattgtaacttctcccctggggatgttttgcctttgttttaaagtgtgcatcaaatcgtcgaacagtgttggcattttacaatttttttcatttaattttcttttgaaatggttccatgatagcaatatgggtccaacatttacaattacaaattaggttaacggagaatacttgat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ctgctctagatacctgtccgtatATACTGGT---GTGGTT-A-CCTGT-CA-G--TTT-TATACTG--TTGTA-G-T--TACCT--GTC-AGA-TT-ttgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTAGTT-ACCTT---CA-G--TTT-CATAATG--CTGTAAG-----AACC--GTC-AAT-TT-A----AC--ACTGCTGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagttacctgtcagtttcatactgttatagttacct
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaattgctgtgagttatctgtcagttttatctgcgtCTGT-CA-G--TTT-CATACTG--TTATA-G-T--TACCT--GTC-AGA-TT-
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTT-TATACTG--TTGTA-G-T--TACCT--GTG-AG-----A-TTTAT--ACCACTGTA-GT-TACCTG-----TCTGT--TG---TATATTGTTG--TAGT-TACCT-GATCTCTTCCTCTCTTGGATGATGGTCTCTGTTTGATCTGGAAATT-CACGTGGACTGACCC---CTTCTT-CTGTAAATATGTCTTTATCAGCA-A---------------------GAGGATCCTATACACATGGAA-GTAAATACAAGAATAT---GTTTAAACATTAAA--TTTT-GATA---------ACTTTTAAG--TC-AGTTGATATCATTAAATCATTTGATGTGTGATTTAGAGTTTT--AGTAGACTATAATAACTTG--TATATATACCAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TTATGACGTCGATAAAGTGTTCAATACACAAAAAGACAATGCAACACGGTGTAATAATTTGTTCATAAATATTAAATTACAACATTAAAAATAATGCACGTGAGAAAACCGGGAAGTCTGAAAATTGCAGGAAAGAAAGACTTTCATTATCATAATTATTTGCTGTTGTTTGTGTA------------GGAAAT---AAG-TTT-ACAATT------------------CCACT-----GACGGAGTTTA-TCTCGGAATTGTAACTTCTCCCCTGGG----GATGTTTTG-CCTT---------------------TGTTTTAAAGT---GT-GCATCAAATCGTCGAACAGTGTTGGCATTTTACA----ATT-TTTTTCATTT--AATTTTCTTTTGAAATGGTTCCATGATAGCAATATGGGTC-CAACATTTACAATT-ACAAATTAG--GT-TAACGGAGAATACTTG-A-Tagttacgggatancatactcgtataattacctgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgttagT-TATACTG--GTGTG-G-T--TACCT--GTC-AGT------TTTAT--ACTGTTGTA-GT-TACCTG--
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T-TA-ATTG--CTGTGAG-T--TATCT--GTC-AGT------TTTAT---CTGCGTTA-GT-TACCTtcagattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagttacctgtcagtttcatactgttatagttacct
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CT--GTC-AGT-TT-C----AT--ACTGTTATA-GT-TACCTG--tcagtttcataatgctgtaagaaccgtcaatttaacactgctg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCTTTATTGAATCTGGAAATT-CATGTGGACTGACGC---ATTGTT-CTGTAAATATGACTTTAAAAGCA-GTTGGCCTCCTTCGATTTTTAACAGGACCCTATACACATGGAA-GTAAATACAAGAGTAT---GTTTAAACATTAAA--TTTT-GATC---------ACGTTTAAG--TC-AGCTGATATCATTAAATCATTTGATGTGTGATTTGGAGTTCT--GGTAAACTGTAATAAATTGTATATATATACCAAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATGACGTCGATAAAGTGTTCAATACACAAAAAGAGAATGCAACACGCTGTAATAATTTGTTCATAAATACTAAATTACAACATTAAACATAATACACGTGAGAAAACCGAGAAGCCTGAACATTGCAGGAAGGAGAGACTTTCACTATCATAATTATCTGCTGTTGTTTGTGTACGATCGCAGGGTGGAACTGGGAAGTTTT-CCAATTCTAGAGAAAATAAGTTTACAATTCAACTGACGGAGTTTA-TCTCGGAGTTGTAACTTCTCCCCTGGG----AATGTTTTG-CCTT---------------------TATtcagattagttacgggatancatactcgtataattacctgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttccactcccggatgatagTCTCTGTTTGATCTGGAAATT-GAAGCTGAATGACCC---CTTGTT-CTGTATATATGTC---ATCAGCA-TTTAGCCCCCTTCGTTTTCTAACAGGGCCCTATAGACATGAAA-TTAAATACACGATAAT---GATTAAACTTGAAA--TGTTAGGCA----------CGTTTAAG--TC-AGATGATACTATAAAATAATTATTTGTGTGATTTGAAGTTGT--CGAAAACTACAATGAATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ctcgtcctctgcgttatgatggTCTGCTTCATCTGAAGATTTCACGTGGACTTGCCC---CTTGTT-CTGTGCATATTTCAGTACCAGCA-TTTAGCCTCCTTCGTTTTCTACAAGGACCCTATGTACATGGAA-GTAAATACATGGTTAT---AATTAAATTTGAAA--TTGT-GGC----------ACATTT-AGTTTT-AGGTGATACTATTCAATTATTT-ATGTGTGAGTTAAAGTTGTC-GATA-ACTAGAATGAATTG--T-TAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtcctctcctggagaatggtatTCTGCTTCATCTGAAGATT-CACGTGGACTTGCCC---CTTGTT-CTGTGCATATTTCAGTACCAGCA-TTTAGCCTCCTTCGTTTTCTACAAGGA-CCTATGTACATGGAA-GTAAATACATGGTTATTAAG-TTAAATTTGAAA--TTGT-GGC----------ACATTT-AGT-TT-AGGTGATACTATTCAATTATTT-ATGTGTGAGTTAAAGTTGTCCGATA-ACTAGAATGAATTG--TATAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cgtcctctcctggagaatggtatTCTGCTTCATCTGAAGATT-CACGTGGACTTGCCCTCCCTTGTTTCTGTGCATATTTCAGTACCAGCATATTAGCCTCCTTCG-TTTCTACAAGGACC-TA-GTACATGGGAAGTAAATACATG-GT-T---ATT---ATATTAAA--TTT--GAAATTGTAGGGCACATTTAGG--TTTAGGTGATACTATTCAATTATTTTATGTGTGAGTTAAAGTTGTC-GATA-ACTAGAATGAATTG--TATA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcgtcctctcctggagaatggtaA------------GGATAC---GAG-TTTTACAATA------------------CCACT-----GACG-AGTTTTGTGTTGGAGT-GTAACAT-TCTCCTCGAATTTGATGTTTTGGCCTTTAATGTGCAAGTACAATGTAATATTTTAAAGTTCAGCAGTGT-ACATC------CAA-ATTGGC----CACAGCCCA-TATTTGTCATTCTAAAGTTTCTTTTCAA-TGTTTCCATGGTAGCGATATGGGACACAA-ATGT-CAATGAATAAGTCAG--GTA-ACCGCAGAA-ACATGCACTAGAAACATGTGTACACGAC-TATTATA--------A-ACAGTAC--------ACAGGA-------AACG-G------A---CG-----TTGCTATAACCAG--TA-CACG-----TA--ACACAG---ACTG----GA-----TATAA--CAG---TA-C-ACGTTA-A--CAGGC---ATAACA-GT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       taACAATT-AACAGTTTGCAGT-TAACAGACA----TT--A-TA---ACA-GTTGACA--CT-TA--AGA--------G-ATATTATA-------ACAGTT-------TACA-G------A---CG-----T---TATAA-CAactaataatactcaatagtgattatttccatttatgcatcaataaatactggaactcaaacaataatgaaatactttctatatgtgaaagcacaacactacatgaaatttacacactagtttacgtaatagtgacttacccgcctcccgttaccggagctgtcggtggagatcttgctatccgccattactagaccattacagtgatcacccgtcattgctgaaaaataaaaaccacatgcgatatgacgtaaatcattacggacttatttcatcatcatataattataccttttctgctaattcatctagataaactatcgaactcccatcaaataaacaacaatcaattatgatttgaaaatttctcgatatttttctgaacaacaagtcgtcgggaaagttgtctatactcttctgtactaatgtatttgggaaaatctcgatatttatgtatgtaaattgtgactggcccgggaatcaaaccagggacccctt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cagttaacagacattataacagttaacagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaacagtggacagttaacagacattataatagtgtacagttaacagacattataacagctgAACAGACAATA-TTA-A-TA----CG-GTTGACA--CT-TT--ACC--------ATACATTATA-------ACAGGT-------TAAA-C------AGAACA-----TGC-TATAG-CA----A-TG-GACCCATTCAA-ACAG---ACCACT--CA-----TAT----CAGT-TGA-CCA-GCTT-AACCAGACATTATAACACATTGAC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACAGTTAACACATA-T-TA-AAACA-GTGTAGA--GT-TA--ACA--------G-ACATTATG-------ACACTT-------TACAGTTAACAGA---CA-----T---TATAA-CAGag
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TATAAA-A-GTTTACA--GT-TA--ACA--------A-ACATTTTA-------ACAGTTGAAAATTTAAA-T------A---CA-----T---TATAA-CAGTTTA-CA-G-----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aacagacatAACA-GTGGACA--GT-TA--ACA--------G-ACATTATAATAGTGTACAGTT-------AACA-G------A---CA-----T---TATAA-CAGCTGA-CA-A-----TT--A-ACAGTTTGCAGTTAACAGACATTATAA--CAGT-TGA-C-A-CTTA-A--GAGATATTATAACA-GTTTACacattataa
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cagttaacagacattataacagttaacagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttA-GTTGACA--GT-TA--ACA--------G-ACATTATA-------ACAGagacgttataaca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cagtttacagatattatattGACA--TTATA--ACA--------C-AT----TG-------ACAGTT--------ACA-C------A---CACGTTCT---TACAC-CAGTCTGGCA-G-----TT--A-ACAG---AC------CA-----TATAACCCAGTGCGA-C-A-GTCTAA--CA-ACATTATAAC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aACA--GT-TA--ACACATATTAAA-ACAGTGTA-------G-AGTT-------AACA-G------A---CA-----T---TATGA-CACTTTA-CA-G-----TT--A-ACAG---A-CATT-A---------TAA--CAG
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CA--GT-TT--ACA--------G-ATATTATATTAGTTGACAGTT-------AACA-G------A---CA-----T---TATAA-CAG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A--------A-ACAGTATA-------ACAATT-------TACA-T------A---TA-----T---TATAA-CAGTTGA-CA-G-----TT--A-ACAG---A
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -------ACAGTT-------AACA-C------A---TA-----T---TAAAA-CAGTGTA-GA-G-----TT--A-ACAG---AC-ATT-A---------TGA--CACT-TTA-C-A-GTTA-A--CAGACATTATAACA-
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAGTT-------TACA-G------A---TA-----T---TATAT-TAGTTGA-CA-G-----TT--A-ACAG---A-CATT-A---------TAA--CAGg
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|16 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACGTATGACTTACCCGCCCCTCATCGCCAGGGTTATCTGTGGAATCTTCCTCCTCGTCAC






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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T--GATGGTCTCTGTTTGATCTGGAAATT-GAAGCTGAATGACCC---CTTGTT-CTGTATATATGTCAT---CAGCAT-TTAGCCCCCTTCGTTTTCTAACAGGGCCCTATAGACATGA-AATTAAATACACGATAAT--GAT--TAAACTTGAAATGTTA-GGC-ACGTTTAAG--TC-AGATGATACTATAAAATAATTATTTGTGTGATTTGAAGTTGT-CGAAA-A-CTACAATGAATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctcgtcctctgcgttaCAGTT-A--ACAGACATTATA-------ACA-GT------T-AACAG--ACN---------N---NNNNN-NNNNNN-N-NN-NNN--N-NNNN---NNNNNNN-N-------NNNNNNNNNTTAA--CAGT-GGA-CA-GT-TAA--CAGACATTATAATA-GTGTAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A-ACA---GTGGACAGTT-A--ACAGACATTATAATAGTGTACA-GT------T-AACAG--ACA---------T---TATAA-CAGCTG-A-CA-ATT--A-ACAGTTTGCAGTTA-ACAGACATTA--------TAA--CAGT-TGA-CA-CT-TAA--GAGATATTATAACA-GTTTACagttaacagacattataacagctgacaattaacagtttgcagttaacagacattataacagttgacacttaagagatattataacagtttacagacgttataaca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cagttaacagacattataacagttaacagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttA---T-----------A----C----T-----------GGT------G---T--G---G-T--T----A--C-C-TG--T-C-----A--G-T----TT-T--AT-A-----C----------TG--T----T--G--T--A-------G--T--T----A----C-C-T--G-T-C-AGA-T---T-agacgttataaca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tt----T--G--T--A-------G--T--T----A----C-C-T--G-T-C-AGT-T---T-C------AT----ACT--G-T-T-AT--AG--T-T--ACC--T--annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagttacctgtcagtttcatactgttatagttacct
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttatactggtgtggttacctgtcagttttatactgttgtagttacctgtcagattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAGACAATAT------TA-AT-ACG---GTTGACACTTTA--CCATACATTATA-------ACAGGT------TAAACAGA-ACA---------TGC-TATAG-CAATGG-ACCC-ATTCAA-ACAG---ACCACTC-A-------TA--------T----CAGT-TGACCA-GC-TTAACCAGACATTATAACACATTGAC
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATA--T--TGCATGTA---GTCTACGAATTTG-TA-CC-T-G--T-----C---A--GTT--T-----------------------A----T----T-----------ATG--CAT-G---T--A---G-T--TTA--G--C-T-TG--TTC-----AAGG-T----TT-C-TAT-A-----C----------TG--C----T--G--T--A-------AGCT--T----A----T-C-TTGG-T-C-A---C---T-CGT--TTATTG--ACT--G-C-T-GT--AGGTT-T--ACC--T--G--ag
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agttAGACATTATA-------ACACAT------T-GACAGTTACACACACGTTCT---TACAC-CAGTCTGG-CA-GTT--A-ACAG---ACC-----A-------TA--------TAACCCAGTGCGA-CA-GTCTAA--CA-ACATTATAAC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -TG--T-T-----A--G-T----TT-T--AT-A-----C----------TG--T----T--G--T--A-------G--T--T----A----C-C-T--G-T-G-AG--------A-T--TTAT----ACC--A-C-T-GT--AG--T-T--ACC--T--G-----TC--TGT-------TGTA-TA---TTGTT-G-TAGTTACCT-GATCTCTTCCTCTCTTGGAT--GATGGTCTCTGTTTGATCTGGAAATT-CACGTGGACTGACCC---CTTCTT-CTGTAAATATGTCTTTATCAGCA----AG------------------AGGATCCTATACACATGG-AAGTAAATACAAGAATAT--GTT--TAAACATTAAATTTT--GATAACTTTTAAG--TC-AGTTGATATCATTAAATCATTTGATGTGTGATTTAGAGTT-T-TAGTAGA-CTATAATAACTTGTATATATA--CCAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TTATGACGTCGATAAAGTGTTCAATACACAAAAAGACAATGCAACACGGTGTAATAATTTGTTCATAAATATTAAATTACAACATTAAAAATAATGCACGTGAGAAAACCGGGAAGTCTGAAAATTGCAGGAAAGAAAGACTTTCATTATCATAATTATTTGCTGTTGTTTGTGTA------------GGAAAT---AAG-TTT-ACAATTCCA-----------------------CTGACGGAGTTTATCTCGGAATTGTAAC-TTCTCCCCTGGG---GATGTTTT-GCCTT---------------------TGTTTTAAAGT---GT-GCATCAAATCGTCGAACAGTGTTGGCATTTTACA----ATT-TTTTTCATTT--AATTTTCTTTTGAAATGGTTCCATGATAGCAATATGGGTC-C-AACATTTACAAT-TACAAATTAGGT-TAACGGAGAATACTTG-A-T
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAG--ACA---------T---TATAA-AAGTTT-A-CA-GTT--A-ACAA---ACATTT--------------------TAA--CAGT-TGA-AA-AT-TTA--AATACATTATAACA-GTTTAC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aA-ACA---GTTGAAAATT-T--AAATACATTATA-------ACA-GT------T-TACAG--ACA---------T---TATAA-agacattataa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aacagacattataaaagtttacagttaacaaacatttt-------ACA-GT------T-AACAC--ATA---------T---TAAAA-CAGTGT-A-GA-GTT--A-ACAG---AC----A-T-------TA--------TGA--CACT-TTA-CA-GT-TAA--CAGACATTATAACA-G
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTGT-C-A-G-TTT-C--A---T--A----CTGT----------TAT-AG-T--T-----AC-C-TG--TCA-G-ATTAGT-TAC-GG----GATA--NCATAC---TC---GTATAA-----T--TA-CC-T-G--T-----
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAACAGTATA-------ACA-AT------T-TACAT--ATA---------T---TATAA-CAGTTG-A-CA-GTT--A-ACAG---A
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -CA-GTT--T-ACAG---A----TA-T-------TA--------TAT--TAGT-TGA-CA-GT-TAA--CAGACATTATAACA-G
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -TG--T-T-----A--G-T----TTAT-CAT-ATAC--C----------TG--C----TTGA--T--A-------G--T--T----A----C-C-T--GTT-C-AGT-T---T-T-A--TTA-----ACTTGG-C-G-GT--AG--T-T--CCC--T--G--A-TTCAGTGT-------TGTT-TAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -TG--TTA-G-----TT-TAT-CA----TATA--CC-TGC---TT---G-ATAG-----T--TA-CC-T-G--TT----C---A--GTT--T-T----AT---T-----------AA---C----T-----------TGG--C-G-G---T--A---G-T--T----C--C-C-TGATT-C-----A--G-T----GT-TGTTT-A-----C----------GGG-C----T--G--TTAA-------G--T--T----A----C-C-G--G-T-A-CCT-T---T-T-G--TTAT----ACT--G-C-TGGT--AG--T-TC-GCC--T--GTCAGTTgggctgttaagttaccggtaccttttgttatactgctggtagttcgcctgtcagtttaaatactactacttgtcagttacctgtcagctgatagcaactgactgtagttaccgttagagtcttgtattgatctgctgtacttacctgtctgttttatactgcatgtagtttagcctgtcctgcttattatactgcactgtaggtaatacctgtcgagtttgcacactgctgttaggttggtgaccatcgattaagtttttatactgctatgcctaaatgtaaccatgtcagtatatttttatacagtcagaatacgtcctttcagttttctatactgcctggagttatatagtactggtgttttattaccatgttcagtttttgaatcgactgcatgttgtttattagcgctgtcagccttctatacctgaccatgtagatactctcctgtgcagttgtctaactctactagctgatatgagtttcctgcttacgggtacctgtcagattttatatatcatcagcatgctcgtattaccatggttaggttgcttacggactgctgtacagttacctagtattgctcatcaattattggctatcactgctgttagttttacctgttagttttatactggctggagttagctgtcagtatatactgctgtagttacctgtcagtttatcgcttgctgtagtttacc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACCTGTTC-A-G-TTT-T--A-T-T--AAC--TTGG-C--------GGT-AG-T--T-----CC-C-TGATTCA-GTGTTGTT-TAC-GG----G-----C--TGT---TAA--GT-TAC-----CGGTA-CC-T----T-----T---T--GTT----------A---T-----------A----C----T-----------G----C-T-GG--T--A---G-T--TC---G--C-C-TG--T-C-----A--G-T----TT-A-AAT-A-----C----------TA--CTACTT--G--TC-A-------G--T--T----A----C-C-T--G-T-C-AG----------C--TGATAGCAACT--GAC-T-GT--AG--T-T--ACCG-TTAG--AGTCT--TGTATTGATCTGCTGTACT-TACCT-G-----T--CT-GTTTTATACTGCATGTAGTTTAGCCTGTC-CTGCTTtaaatactactacttgtcagttacctgtcagctgatagcaactgactgtagttaccgttagagtcttgtattgatctgctgtacttacctgtctgttttatactgcatgtagtttagcctgtcctgcttattatactgcactgtaggtaatacctgtcgagtttgcacactgctgttaggttggtgaccatcgattaagtttttatactgctatgcctaaatgtaaccatgtcagtatatttttatacagtcagaatacgtcctttcagttttctatactgcctggagttatatagtactggtgttttattaccatgttcagtttttgaatcgactgcatgttgtttattagcgctgtcagccttctatacctgaccatgtagatactctcctgtgcagttgtctaactctactagctgatatgagtttcctgcttacgggtacctgtcagattttatatatcatcagcatgctcgtattaccatggttaggttgcttacggactgctgtacagttacctagtattgctcatcaattattggctatcactgctgttagttttacctgttagttttatactggctggagttagctgtcagtatatactgctgtagttacctgtcagtttatcgcttgctgtagtttacc
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taCCACTCCCG------GAT--GATAGTCTTTATTGAATCTGGAAATT-CATGTGGACTGACGC---ATTGTT-CTGTAAATATGACTTTAAAAGCAG-TTGGCCTCCTTCGATTTTTAACAGGACCCTATACACATGG-AAGTAAATACAAGAGTAT--GTT--TAAACATTAAATTTT--GATCACGTTTAAG--TC-AGCTGATATCATTAAATCATTTGATGTGTGATTTGGAGTTCT--GGTA-AACTGTAATAAATTGTATATATATACCAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TTATGACGTCGATAAAGTGTTCAATACACAAAAAGAGAATGCAACACGCTGTAATAATTTGTTCATAAATACTAAATTACAACATTAAACATAATACACGTGAGAAAACCGAGAAGCCTGAACATTGCAGGAAGGAGAGACTTTCACTATCATAATTATCTGCTGTTGTTTGTGTACGATCGCAGGGTGGAACTGGGAAGTTTT-CCAATTCTAGAGAAAATAAGTTTACAATTCAACTGACGGAGTTTATCTCGGAGTTGTAAC-TTCTCCCCTGGG---AATGTTTT-GCCTT---------------------TATactaataatactcaatagtgattatttccatttatgcatcaataaatactggaactcaaacaataatgaaatactttctatatgtgaaagcacaacactacatgaaatttacacactagtttacgtaatagtgacttacccgcctcccgttaccggagctgtcggtggagatcttgctatccgccattactagaccattacagtgatcacccgtcattgctgaaaaataaaaaccacatgcgatatgacgtaaatcattacggacttatttcatcatcatataattataccttttctgctaattcatctagataaactatcgaactcccatcaaataaacaacaatcaattatgatttgaaaatttctcgatatttttctgaacaacaagtcgtcgggaaagttgtctatactcttctgtactaatgtatttgggaaaatctcgatatttatgtatgtaaattgtgactggcccgggaatcaaaccagggacccctt
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Reference ( family-7611 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACCTGT-C-A-G-TTT-T--A-A-T--A----C--------TGC-C-TG--T-A---G-T--T-----AC-C-TG-------TCA--G---A--TTTTT-TAC-TG----AATA--C--TGC---TA---GTATAC-----T--TACC--T-G-T-CN-----G---T-T--TT-----A-A---T-----------A----CTG-TC--TG---T--A---GT-T--------------A--C-C-TG--T-C-----A--G-T----TT-T-TAT-A-----C----------TG--C----T-G---T--A-------G--T--TA----C-C-T--G-T-C-AGT-T-T-C-T--TTAT----ACT-G-C-T-GT--AG--T-T--ACC-T--G--AGTTCTGT-------TGCT-TACT-TAGCT-GATGGTTCT--GTCCTCTCCCGGAGANTGGTGNT-G-TCTCTGCTTNATCTGGAGATT-CACGTGGACTNGCCC---CTTGTT-CTGTGCATATNTCATTACCAGCAT-TTAGCCTCCTTCGTTTTCTACAAGGACCCTATGCACATGG-AAGTAAATACANGGTTAT--GNT--TAAACTTGAAATTTT--GGCAACGTTTAAG--TC-AGGTGATACTATTAAATCATTTTATGTGTGANTTAAAGTTGT-CGATA-A-CTANAATGAATTGTATA--TATACCAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TTATGACGTCGATAAAGTGTTCAATACACAAAAAGACAATGCAACACGCTGTAATAATTTGTTCATAAATATTAAATTACAACATTAAAAATAATACACGTGAGAAAACCGAGAAGNCTGAAAATTGCAGGAAAGAAAGACTTTCACTATCATAATTATTTGCTGTTGTTTGTGTA------------GGAAAT---AAG-TTT-ACAATTCCA-----------------------CTGACGGAGTTTATCTCGGAGTTGTAAC-TTCTCCCCTGGG---GATGTTTTG-CCTTTATTTTA-AAGCGCG-CGTCAAATC-----GCCGAACAGTGTTGGCATT----TT----ACA----ATTTTTGTCATTT--AANTTTCTTTTNAAATGTTTCCATGGTAGCGATATGGGAC-CAACATNTACAAT-NACAAATTAGGTGTAACGGAGAATACNTG-A-TAGA------AACA---GTNGAC-AG-TT-A--AC-AGACATTATAACA-G-T------TAA-CAG--A-CA---------T---TATAA-CAGTNT-ACA-GTT--A-ACAGACCGTTA-ATA--------TAA--CAGT-TGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAGTTTAC
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAT-GGTCTCTGTTTGATCTGGAAATT-GAAGCTGAATGACCC---CTTGTT-CTGTATATATGTCAT---CAGCAT-TTAGCCCCCTTCGTTTTCTAACAGGGCCCTATAGACATGA-AATTAAATACACGATAAT--GAT--TAAACTTGAAATGTTA-GGC-ACGTTTAAG--TC-AGATGATACTATAAAATAATTATTTGTGTGATTTGAAGTTGT-CGAAA-A-CTACAATGAATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctcgtcctctgcgttaC-AG-TT-A--AC-AGACATTATAACA-G-T------TAA-CAG--A-CN---------N---NNNNN-NNNNNN-NNN-NNN--N-NNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNTTAA--CAGT-GGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAATAGTGTAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAACAGTGGACAGTTA-A-CAGACATTATAATA---GTGTAC-AG-TT-A--AC-AGACATTATAACA-G-C------TGA-CA------A---------T---TA--A-CAGTTT-GCA-GTT--A-ACAGAC----A-TTA--------TAA--CAGT-TGAC-A-C-T-TAAG-AGATATTATAACAGTTTACagttaacagacattataacagctgacaattaacagtttgcagttaacagacattataacagttgacacttaagagatattataacagtttacagacgttataaca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cagttaacagacattataacagttaacagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt-A---T-----------A----CTG-G---TG---T--G---GT-T--------------A--C-C-TG--T-C-----A--G-T----TT-T--AT-A-----C----------TG--T----T-G---T--A-------G--T--TA----C-C-T--G-T-C-AGA-T-T-agacgttataaca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tt----T-G---T--A-------G--T--TA----C-C-T--G-T-C-AGT-T-T-C------AT----ACT-G-T-T-AT--AG--T-T--ACC-T--annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagttacctgtcagtttcatactgttatagttacct
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttatactggtgtggttacctgtcagttttatactgttgtagttacctgtcagattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAGACAATA-TTA-A-TA----------CG---GTTGAC-AC-TTTA--CC-ATACATTATAACA-GGT------TAAACAG--AACA---------TGC-TATAG-CAATGG-ACCCATTCAA-ACAGACCACTC-ATA--------T----CAGT-TGACCA-GCT-TAACCAGACATTATAACA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CA---GTTGACCAGCTT-A--ACCAGACATTATAACACA-T------TGA-CAG--cattgacag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aacagacaatattaatacggttgacactttaccatacattataacaggttaaacagaacatgctatagcaatggacccattcaaacagaccactcatatATA--T--TGCATGTA---GTCTACGAATTTG-TACC--T-G-T-CA-----G---T-T--T------A-T---T-----------A-----TG-CA--TG---T--A---GT-TTA------------G--C-T-TG--TTC-----AAGG-T----TT-C-TAT-A-----C----------TG--C----T-G---T--A-------AGCT--TA----T-C-TTGG-T-C-A---C-T-CGT--TTATTG--ACT-G-C-T-GT--AGGTT-T--ACC-T--G--
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      agtt-AGACATTATAACACA-T------TGA-CAGTTA-CACACACGTTCT---TACAC-CAGTCTGGCA-GTT--A-ACAGACC-----ATA--------TAACCCAGTGCGAC-A-G-TCTAAC-A-ACATTATAAC
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --TACC--T-G-T-CC-----G---T-A--T------A-A---T-----------A----CTG--C--TG---T--A---GT-T--------------A--C-C-TG--T-C-----A--T-A----TT-T-TAT-A-----T----------AG--C----C-T---T--A-------G--T--AA----T-C-T--G-C-C-A---T-T-T-T--TTGT----ACT-G-C-T-GT--TG--T-
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-T--A-A-T----------------TGC---TG--TGA---G-T--T-----AT-C-TG-------TCA--G--------TTT-TAT-------------C--TGC--------GT-TAG-----T--TACC--T---T-CA-----G---T-T--TC-------A---T-----------A----ATG--C--TG---T--A---AG-A--------------A--C-C--G--T-C-----A--A------TT-T-AAC-A-----C----------TG--C----T-G---agaaccgtcaatttaacactgctg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AA-CAG--A-CA---------T---TATAA-AAGTTT-ACA-GTT--A-ACAAACATTT-------------TAA--CAGT-TGAA-A-A-T-TTAA-ATACATTATAACAGTTTAC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ------AACA---GTTGAA-AA-TT-T--AA-ATACATTATAACA-G-T------TTA-CAG--A-CA---------T---TATAA-agacattataa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aacagacattataaaagtttacagttaacaaacattttACA-G-T------TAA-CAC--A-TA---------T---TAAAA-CAGTGT-AGA-GTT--A-ACAGAC----A-TTA--------TGA--CACT-TTAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTGT-C-A-G-TTT-C--A---T--A----C--------TGT---TA--T-A---G-T--T-----AC-C-TG-------TCA--G---A--TTAGT-TAC-GG----GATA--NCATAC---TC---GTATAA-----T--TACC--T-G-T-
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -AAACAGTATAACA-A-T------TTA-CAT--A-TA---------T---TATAA-CAGTTG-ACA-GTT--A-ACAGA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CA-GTT--T-ACAGA----TA-TTA--------TAT--TAGT-TGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TG-------TTA--G---------TT-TAT-CA----TATA--CC-TGC---TT---G-ATAG-----T--TACC--T-G-TTCA-----G---T-T--TT-----A-T---T-----------AAC--TTG-GC--GG---T--A---GT-T--------------C--C-C-TGATT-C-----A--G-T----GT-TGTTT-A-----C----------GGG-C----T-G---TTAA-------G--T--TA----C-C-G--G-T-A-CCT-T-T-T-G--TTAT----ACT-G-C-TGGT--AG--T-TC-GCC-T--GTCAGTT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGAT-GGTCTCTGTTTGATCTGGAAATT-GAAGCTGAATGACCC---CTTGTT-CTGTATATATGTCAT---CAGCAT-TTAGCCCCCTTCGTTTTCTAACAGGGCCCTATAGACATGA-AATTAAATACACGATAAT--GAT--TAAACTTGAAATGTTA-GGC-ACGTTTAAG--TC-AGATGATACTATAAAATAATTATTTGTGTGATTTGAAGTTGT-CGAAA-A-CTACAATGAATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctcgtcctctgcgttaC-AG-TT-A--AC-AGACATTATAACA-G-T------T-AA-CAG--A-CN---------N---NNNNN-NNNNNN-NNN-NNN--N-NNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNTTAA--CAGT-GGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAATAGTGTAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAACAGTGGACAGTTA-A-CAGACATTATAATA---GTGTAC-AG-TT-A--AC-AGACATTATAACA-G-C------T-GA-CA------A---------T---TA--A-CAGTTT-GCA-GTT--A-ACAGAC----A-TTA--------TAA--CAGT-TGAC-A-C-T-TAAG-AGATATTATAACAGTTTACagttaacagacattataacagctgacaattaacagtttgcagttaacagacattataacagttgacacttaagagatattataacagtttacagacgttataaca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cagttaacagacattataacagttaacagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt---A---T--A----C--------TGG-------------------TG---T--G---G-T-T--------------A--C-C-TG-T-C-----A--G-T----T-T--T-AT--A-----C----------TG--T----T--G---T--A-------G--T--TA----C-C-T----------G-T-C-AGA-T-T-agacgttataaca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttACCTGT-C-A-G-TTT-T--A---T--A----C--------TG-T---TG--TA---G-T--T-----AC----C-TG-------T-CA--G---A--TTANNN-NNN-NN--NNNN-----N--N-NN---NN---NN---NNN---------N-----N-------NN-N------N-NN----------N-N-----N-N---N-N--NN----N---N---N--N----N--------NNNN------------------NN---N--N---N-N-N--------------N--N-N-NN-N-N-----N--N-N----N-N--NNNN--N-----N----------NN--N----N--N---N--N-------N--N--NN----N-N-N----------N-N-N-NNN-N-N-N-N--NNNN----NNN--N-N-TG-T--AG--T-T--A--CC-T--GTCAGTTTCATAC--TGT-------T-A---TAG--T--------TA-CCT-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagttacctgtcagtttcatactgttatagttacct
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttatactggtgtggtt----T--G---T--A-------G--T--TA----C-C-T----------G-T-C-AGT-T-T-C------AT----ACT--G-T-TA-T--AG--T-T--A--CC-T--
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttatactggtgtggttacctgtcagttttatactgttgtagttacctgtcagattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAGACAATA-TTA-A-TA----------CG---GTTGAC-AC-TTTA--CC-ATACATTATAACA-GGT------T-AAACAG--AACA---------TGC-TATAG-CAATGG-ACCCATTCAA-ACAGACCACTC-ATA--------T----CAGT-TGACCA-GCT-TAACCAGACATTATAACA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CA---GTTGACCAGCTT-A--ACCAGACATTATAACACA-T------T-GA-CAG--cattgacag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aacagacaatattaatacggttgacactttaccatacattataacaggttaaacagaacatgctatagcaatggacccattcaaacagaccactcatatATA-----T--T-GCATGTA---GT---CTA---------CGAATTTG------TA-C------C-TG----------T-C-----A-G---T-T--T-----A---T---T--A-------------TGCA------------------TG---T--A---G-T-TTA------------G--C-T-TG-TTC-----AAGG-T----T-T--CTAT--A-----C----------TG--C----T--G---T--A-------AGCT--TA----T-C-TTG--------G-T-C-A---C-T-CGT--TTATTG--ACT--G-C-TG-T--AGGTT-T--A--CC-T--G--
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agtt-AGACATTATAACACA-T------T-GA-CAGTTA-CACACACGTTCT---TACAC-CAGTCTGGCA-GTT--A-ACAGACC-----ATA--------TAACCCAGTGCGAC-A-G-TCTAAC-A-ACATTATAAC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -TG-T-T-----A--G-T----T-T--T-AT--A-----C----------TG--T----T--G---T--A-------G--T--TA----C-C-T----------G-T-G-AG------A-T--TTAT----ACC--A-C-TG-T--AG--T-T--A--CC-T--G-----T-----C--TGT-------T-GTA-TAT--TGTTGTAGTTA-CCT-GA--TCT---CT---TCCTCTCTTGGA---TGATG---G-TCTCTGTTTGATCTGGAAATT-CACGTGGACTGACCC---CTTCTT-CTGTAAATATGTCTTTATCAGCA----AG------------------AGGATCCTATACACATGG-AAGTAAATACAAGAATAT--GTT--TAAACATTAAATTTT--GATAACTTTTAAG--TC-AGTTGATATCATTAAATCATTTGATGTGTGATTTAGAGTT-T-TAGTAGA-CTATAATAACTTGTATA--TATACCAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TTATGACGTCGATAAAGTGTTCAATACACAAAAAGACAATGCAACACGGTGTAATAATTTGTTCATAAATATTAAATTACAACATTAAAAATAATGCACGTGAGAAAACCGGGAAGTCTGAAAATTGCAGGAAAGAAAGACTTTCATTATCATAATTATTTGCTGTTGTTTGTGTA------------GGAAAT---AAG-TTT-ACAATTCCA-----------------------CTGACGGAGTTTATCTCGGAATTGTAAC-TTCTCCCCTGGG---GATGTTTTG-CCTTTGTTTTA-AAGTGTG-CATCAAATC-----GTCGAACAGTGTTGGCATT----TT----ACA----ATTTTTTTCATTT--AATTTTCTTTTGAAATGGTTCCATGATAGCAATATGGGTC-CAACATTTACAAT-TACAAATTAGGT-TAACGGAGAATACTTG-A-T
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -------TA-C------C-TG----------T-C-----C-G---T-A--T-----A---A---T--A----C--------TG-C------------------TG---T--A---G-T-T--------------A--C-C-TG-T-C-----A--T-A----T-T--TTAT--A-----T----------AG--C----C--T---T--A-------G--T--AA----T-C-T----------G-C-C-A---T-T-T-T--TTGT----ACT--G-C-TG-T--TG--T-
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -----T-------TA-T------C-TG----------T-C-----A-G---T-T--TT--------A---T-------C--------TGCG------------------T----T--A---G-T-T--------------A--C-C-T--T-C-----A--G------T-T--TCAT--A-----A----------TG--C----T--G---T--A-------A--G--AA----C-C------------G-T-C-AAT-T-T-A------AC----ACT--G-C-TG-agaaccgtcaatttaacactgctg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttaattgctgtgag-AA-CAG--A-CA---------T---TATAA-AAGTTT-ACA-GTT--A-ACAAAC----A-TTT--------TAA--CAGT-TGAA-A-A-T-TTAA-ATACATTATAACAGTTTAC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ------AACA---GTTGAA-AA-TT-T--AA-ATACATTATAACA-G-T------T-TA-CAG--A-CA---------T---TATAA-agacattataa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aacagacattataaaagtttacagttaacaaacattttACA-G-T------T-AA-CAC--A-TA---------T---TAAAA-CAGTGT-AGA-GTT--A-ACAGAC----A-TTA--------TGA--CACT-TTAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTGT-C-A-G-TTT-C--A---T--A----C--------TG-T---TA--TA---G-T--T-----AC----C-TG-------T-CA--G---A--TT-AGT-TAC-GG--GATA-----NCAT-AC---TC---GT---ATA---------A-----T-------TA-C------C-TG----------T-
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -AAACAGTATAACA-A-T------T-TA-CAT--A-TA---------T---TATAA-CAGTTG-ACA-GTT--A-ACAGA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CA-GTT--T-ACAGA----TA-TTA--------TAT--TAGT-TGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -TG-T-T-----A--G-T----T-TA-TCAT--ATAC--C----------TG--C----TTGA---T--A-------G--T--TA----C-C-T----------GTT-C-AGT-T-T-T-A--TTA-----ACTTGG-C-GG-T--AG--T-T--C--CC-T--G--A-TT-----CAGTGT-------T-GTT-TAC--
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACCTGTTC-A-G-TTT-T--A-T-T--AAC--T--------TG-G-C-GG--TA---G-T--T-----CC----C-TGAT-----T-CA--GT--G--TT-GTT-TAC-GG--G--------C--T-GT---TAA--GT----TA---------C-----CGG-----TA-C------C-TT----------T-T-------G---T-T------------A---T--A----C--------TGCT------------------GG---T--A---G-T-TC-------------G--C-C-TG-T-C-----A--G-T----T-T--AAAT--A-----C----------TA--CTACTT--G---TC-A-------G--T--TA----C-C-T----------G-T-C-AG--------C--TGATAGCAACT--GAC-TG-T--AG--T-T--A--CCGTTAG--AGTC-----T--TGTATTGATCT-GCTGTAC--T--------TA-CCT-G-----T---CT--GTTTTATACTGgggctgttaagttaccggtaccttttgttatactgctggtagttcgcctgtcagtttaaatactactacttgtcagttacctgtcagctgatagcaactgactgtagttaccgttagagtcttgtattgatctgctgtacttacctgtctgttttatactgcatgtagtttagcctgtcctgcttattatactgcactgtaggtaatacctgtcgagtttgcacactgctgttaggttggtgaccatcgattaagtttttatactgctatgcctaaatgtaaccatgtcagtatatttttatacagtcagaatacgtcctttcagttttctatactgcctggagttatatagtactggtgttttattaccatgttcagtttttgaatcgactgcatgttgtttattagcgctgtcagccttctatacctgaccatgtagatactctcctgtgcagttgtctaactctactagctgatatgagtttcctgcttacgggtacctgtcagattttatatatcatcagcatgctcgtattaccatggttaggttgcttacggactgctgtacagttacctagtattgctcatcaattattggctatcactgctgttagttttacctgttagttttatactggctggagttagctgtcagtatatactgctgtagttacctgtcagtttatcgcttgctgtagtttacc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgttagtttatcatatacctgcttgatagtt-A-T--A----C--------TG-C-T-GG--TA---G-T--TC----GC----C-TG-------T-CA--G----------TT-TA------AATA-----C--T-AC---TACTTGT----CA---------G-----T-------TA-C------C-TG----------T-C-----A-G---C-T--------G---A---T--AGCAAC--------TGAC------------------TG---T--A---G-T-T--------------A--C-C--G-T-T-----A--GAG----T-C--TTGT--ATTGATC----------TG--C----T--G---T--A-------C--T--TA----C-C-T----------G-T-C-TGT-------T--TTAT----ACT--G-CATG-T--AG--T-TTAG--CC-T--G-----T-----C----C-------T-GCT-TA---T--------TATACT-Gcatgtagtttagcctgtcctgcttattatactgcactgtaggtaatacctgtcgagtttgcacactgctgttaggttggtgaccatcgattaagtttttatactgctatgcctaaatgtaaccatgtcagtatatttttatacagtcagaatacgtcctttcagttttctatactgcctggagttatatagtactggtgttttattaccatgttcagtttttgaatcgactgcatgttgtttattagcgctgtcagccttctatacctgaccatgtagatactctcctgtgcagttgtctaactctactagctgatatgagtttcctgcttacgggtacctgtcagattttatatatcatcagcatgctcgtattaccatggttaggttgcttacggactgctgtacagttacctagtattgctcatcaattattggctatcactgctgttagttttacctgttagttttatactggctggagttagctgtcagtatatactgctgtagttacctgtcagtttatcgcttgctgtagtttacc
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A------------GGATAC---GAG-TTTTACAATACCA-----------------------CTGACGAGTTTTGTGTTGGAGT-GTAACATTCTCCTC-GAATTTGATGTTTTGGCCTTTAATGTGCAAGTACAATGTAATATTTTAAAGTTCAGCAGTGT--ACATCCAAATTGGCCACAGCCCATATTTGTCATTCTAAAGTTTCTTTTCAA-TGTTTCCATGGTAGCGATATGGGACACAA-ATGT-CAATGAATAAGTCAGGTA-ACCGCAGAA-ACATGCACTAGA------AACATGTGTACAC-GA-CT-ATTAT-AAACAGTAC-ACA-G-G------A-AA-CGG--A-CG---------TTGCTATAACCAGTAC-AC--GTA--ACACAGACTG--G-ATA--------TAA--CAGT---AC-ACG-T-TAAC-AGGC---ATAACAGT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-7611 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACCTGT-C-A-G-TTT-T--A-A-T--A----C--------TG-C-C-TG--TA---G-T--T-----AC----C-TG-------T-CA--G---A--TT-TTT-TAC-TG--AATA-----C--T-GC---TA---GT---ATA---------C-----T-------TA-C------C-TG----------T-C-----A-G---T-T--TT----A---A---T--A----C--------TG------------------CC-TG--T--A---G-T-T-----A--C-C-TG-T-C-----A--G-T----T-T--TTAT--A-----C----------TG--C----T--G---T--A-------G--T--TA----C-C-T----------G-T-C-AGT-T-T-C-T--TTAT----ACT--G-C-TG-T--AG--T-T--A--CC-T--G--AGTT-----C--TGT-------T-GCT-TAC--T--------TACCTGA-------GTT---CT--GTCCTCTCCTGGAGAATGGTGAT-G-TCTCTGTTTNATCTGGAGATT-CACGTGGACTNGCCC---CTTGTT-CTGTGCATATNTCATTACCAGCAT-TTAGCCTCCTTCGTTTTCTACAAGGACCCTATGCACATGG-AAGTAAATACANGGTTAT--GNT--TAAACTTGAAATTTT--GGCAACGTTTAAG--TC-AGGTGATACTATTAAATCATTTTATGTGTGANTTAAAGTTGT-CGATA-A-CTANAATGAATTGTATA--TATACCAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TTATGACGTCGATAAAGTGTTCAATACACAAAAAGACAATGCAACACGCTGTAATAATTTGTTCATAAATATTAAATTACAACATTAAAAATAATACACGTGAGAAAACCGAGAAGNCTGAAAATTGCAGGAAAGAAAGACTTTCACTATCATAATTATTTGCTGTTGTTTGTGTA------------GGAAAT---AAG-TTT-ACAATTCCA-----------------------CTGACGGAGTTTATCTCGGAGTTGTAAC-TTCTCCCCTGGG---GATGTTTTG-CCTTTATTTTA-AAGCGCG-CGTCAAATC-----GTCGAGCAGTGTTGGCATT----TT----ACA----ATTTTTGTCATTT--AANTTTCTTTTNAAATGTTTCCATGGTAGCGATATGGGAC-CAACATNTACAAT-NACAAATTAGGTGTAACGGAGAATACTTG-A-TAGA------AACA---GTNGAC-AG-TT-A--AC-AGACATTATAACA-G-T------TAA-CAG--A-CA---------T---TATAA-CAGTNT-ACA-GTT--A-ACAGACCG--A-NTA----------TAA--CAGT-TGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAGTTTAC
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        c--GTCCTCTCCTGGAGAATGGT-AT-----TCTGCTTCATCTGAAGATTTCACGTGGACTTGCCC---CTTGTT-CTGTGCATATTTCAGTACCAGCAT-TTAGCCTCCTTCGTTTTCTACAAGGACCCTATGTACATGG-AAGTAAATACATGGTTAT--AAT--TAAATTTGAAATTGT--GGC-ACATTT-AGTTTT-AGGTGATACTATTCAATTA-TTTATGTGTGAGTTAAAGTTGT-CGATA-A-CTAGAATGAATTGT-TA--T
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGAT-GGTCTCTGTTTGATCTGGAAATT-GAAGCTGAATGACCC---CTTGTT-CTGTATATATGTCAT---CAGCAT-TTAGCCCCCTTCGTTTTCTAACAGGGCCCTATAGACATGA-AATTAAATACACGATAAT--GAT--TAAACTTGAAATGTTA-GGC-ACGTTTAAG--TC-AGATGATACTATAAAATAATTATTTGTGTGATTTGAAGTTGT-CGAAA-A-CTACAATGAATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctcgtcctctgcgttaC-AG-TT-A--AC-AGACATTATAACA-G-T------TAA-CAG--A-CN---------N---NNNNN-NNNNNN-NNN-NNN--N-NNNNNNNN--N-NNNNNNNNNNNNTTAA--CAGT-GGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAATAGTGTAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAACAGTGGACAGTTA-A-CAGACATTATAATA---GTGTAC-AG-TT-A--AC-AGACATTATAACA-G-C------TGA-CA------A---------T---TA--A-CAGTTT-GCA-GTT--A-ACAGAC----A-TTA----------TAA--CAGT-TGAC-A-C-T-TAAG-AGATATTATAACAGTTTACagttaacagacattataacagctgacaattaacagtttgcagttaacagacattataacagttgacacttaagagatattataacagtttacagacgttataaca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cagttaacagacattataacagttaacagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt------AACA---GTTGAC-AC-TT-A--AG-AGATATTATAACA-G-T------TTA-CAG--A-CG---------T---TATAA-CAagacgttataaca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cagttaacagacattataacagttaacagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaacagtggacagttaacagacattataatagtgtacagttaacagacattataacagctgacaattaacagtttgcagttaacagacattat---A---T--A----C--------TG------------------G--TG--T--G---G-T-T-----A--C-C-TG-T-C-----A--G-T----T-T--T-AT--A-----C----------TG--T----T--G---T--A-------G--T--TA----C-C-T----------G-T-C-AGA-T-T-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttACCTGT-C-A-G-TTT-T--A---T--A----C--------TG-T---TG--TA---G-T--T-----AC----C-TG-------T-CA--G---A--TTANNN-NNN-NN--NNNN-----N--N-NN---NN---NN---NNN---------N-----N-------NN-N------N-NN----------N-N-----N-N---N-N--NN----N---N---N--N----N--------NN------------------NN-NN--N--N---N-N-N-----N--N-N-NN-N-N-----N--N-N----N-N--NNNN--N-----N----------NN--N----N--N---N--N-------N--N--NN----N-N-N----------N-N-N-NNN-N-N-N-N--NNNN----NNN--N-N-TG-T--AG--T-T--A--CC-T--GTCAGTTTCATAC--TGT-------T-A---TAG--T--------TACCTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagttacctgtcagtttcatactgttatagttacct
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttatactggtgtggttAACAGACAATA-TTA-A-TA----------CG---GTTGAC-AC-TTTA--CC-ATACATTATAACA-GGT------TAAACAG--AACA---------TGC-TATAG-CAATGG-ACCCATTCAA-ACAGACCA--C-TCA----------TAT--CAGT-TGACCA-GCT-TAACCAGACATTATAACA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CA---GTTGACCAGCTT-A--ACCAGACATTATAACACA-T------TGA-CAG--cattgacag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aacagacaatattaatacggttgacactttaccatacattataacaggttaaacagaacatgctatagcaatggacccattcaaacagaccactcatatATA-----T--T-GCATGTA---GT---CTA---------CGAATTTG------TA-C------C-TG----------T-C-----A-G---T-T--T-----A---T---T--A-------------TG------------------CA-TG--T--A---G-T-TTA---G--C-T-TG-TTC-----AAGG-T----T-T--CTAT--A-----C----------TG--C----T--G---T--A-------AGCT--TA----T-C-TTG--------G-T-C-A---C-T-CGT--TTATTG--ACT--G-C-TG-T--AGGTT-T--A--CC-T--G--
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agtt-AGACATTATAACACA-T------TGA-CAGTTA-CACACACGTTCT---TACAC-CAGTCTGGCA-GTT--A-ACAGACC-----ATA----------TAACCCAGTGCGAC-A-G-TCTAAC-A-ACATTATAAC
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -------TA-C------C-TG----------T-C-----C-G---T-A--T-----A---A---T--A----C--------TG------------------C--TG--T--A---G-T-T-----A--C-C-TG-T-C-----A--T-A----T-T--TTAT--A-----T----------AG--C----C--T---T--A-------G--T--AA----T-C-T----------G-C-C-A---T-T-T-T--TTGT----ACT--G-C-TG-T--TG--T-
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -----T-------TA-T------C-TG----------T-C-----A-G---T-T--TT--------A---T-------C--------TG------------------CG-T---T--A---G-T-T-----A--C-C-T--T-C-----A--G------T-T--TCAT--A-----A----------TG--C----T--G---T--A-------A--G--AA----C-C------------G-T-C-AAT-T-T-A------AC----ACT--G-C-TG-agaaccgtcaatttaacactgctg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttaattgctgtgagAA-CAG--A-CA---------T---TATAA-AAGTTT-ACA-GTT--A-ACAAAC----A-TTT----------TAA--CAGT-TGAA-A-A-T-TTAA-ATACATTATAACAGTTTAC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ------AACA---GTTGAA-AA-TT-T--AA-ATACATTATAACA-G-T------TTA-CAG--A-CA---------T---TATAA-agacattataa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aacagacattataaaagtttacagttaacaaacattttACA-G-T------TAA-CAC--A-TA---------T---TAAAA-CAGTGT-AGA-GTT--A-ACAGAC----A-TTA----------TGA--CACT-TTAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTGT-C-A-G-TTT-C--A---T--A----C--------TG-T---TA--TA---G-T--T-----AC----C-TG-------T-CA--G---A--TT-AGT-TAC-GG--GATA-----NCAT-AC---TC---GT---ATA---------A-----T-------TA-C------C-TG----------T-
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -AAACAGTATAACA-A-T------TTA-CAT--A-TA---------T---TATAA-CAGTTG-ACA-GTT--A-ACAGA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CA-GTT--T-ACAGAT----A-TTA----------TAT--TAGT-TGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -TG-T-T-----A--G-T----T-TA-TCAT--ATAC--C----------TG--C----TTGA---T--A-------G--T--TA----C-C-T----------GTT-C-AGT-T-T-T-A--TTA-----ACTTGG-C-GG-T--AG--T-T--C--CC-T--G--A-TT-----CAGTGT-------T-GTT-TAC--
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACCTGTTC-A-G-TTT-T--A-T-T--AAC--T--------TG-G-C-GG--TA---G-T--T-----CC----C-TGAT-----T-CA--GT--G--TT-GTT-TAC-GG--G--------C--T-GT---TAA--GT----TA---------C-----CGG-----TA-C------C-TT----------T-T-------G---T-T------------A---T--A----C--------TG------------------CT-GG--T--A---G-T-TC----G--C-C-TG-T-C-----A--G-T----T-T--AAAT--A-----C----------TA--CTACTT--G---TC-A-------G--T--TA----C-C-T----------G-T-C-AG--------C--TGATAGCAACT--GAC-TG-T--AG--T-T--A--CCGTTAG--AGTC-----T--TGTATTGATCT-GCTGTAC--T--------TACCTG----------T---CT--GTTTTATACTGgggctgttaagttaccggtaccttttgttatactgctggtagttcgcctgtcagtttaaatactactacttgtcagttacctgtcagctgatagcaactgactgtagttaccgttagagtcttgtattgatctgctgtacttacctgtctgttttatactgcatgtagtttagcctgtcctgcttattatactgcactgtaggtaatacctgtcgagtttgcacactgctgttaggttggtgaccatcgattaagtttttatactgctatgcctaaatgtaaccatgtcagtatatttttatacagtcagaatacgtcctttcagttttctatactgcctggagttatatagtactggtgttttattaccatgttcagtttttgaatcgactgcatgttgtttattagcgctgtcagccttctatacctgaccatgtagatactctcctgtgcagttgtctaactctactagctgatatgagtttcctgcttacgggtacctgtcagattttatatatcatcagcatgctcgtattaccatggttaggttgcttacggactgctgtacagttacctagtattgctcatcaattattggctatcactgctgttagttttacctgttagttttatactggctggagttagctgtcagtatatactgctgtagttacctgtcagtttatcgcttgctgtagtttacc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgttagtttatcatatacctgcttgatagtt-A-T--A----C--------TG-C-T-GG--TA---G-T--TC----GC----C-TG-------T-CA--G----------TT-TA------AATA-----C--T-AC---TACTTGT----CA---------G-----T-------TA-C------C-TG----------T-C-----A-G---C-T--------G---A---T--AGCAAC--------TG------------------AC-TG--T--A---G-T-T-----A--C-C--G-T-T-----A--GAG----T-C--TTGT--ATTGATC----------TG--C----T--G---T--A-------C--T--TA----C-C-T----------G-T-C-TGT-------T--TTAT----ACT--G-CATG-T--AG--T-TTAG--CC-T--G-----T-----C----C-------T-GCT-TAT--TA-------TACcatgtagtttagcctgtcctgcttattatactgcactgtaggtaatacctgtcgagtttgcacactgctgttaggttggtgaccatcgattaagtttttatactgctatgcctaaatgtaaccatgtcagtatatttttatacagtcagaatacgtcctttcagttttctatactgcctggagttatatagtactggtgttttattaccatgttcagtttttgaatcgactgcatgttgtttattagcgctgtcagccttctatacctgaccatgtagatactctcctgtgcagttgtctaactctactagctgatatgagtttcctgcttacgggtacctgtcagattttatatatcatcagcatgctcgtattaccatggttaggttgcttacggactgctgtacagttacctagtattgctcatcaattattggctatcactgctgttagttttacctgttagttttatactggctggagttagctgtcagtatatactgctgtagttacctgtcagtttatcgcttgctgtagtttacc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgttagtttatcatatacctgcttgatagttacctgttcagttttattaacttggcggtagttccctgattcagtgttgtttacgggctgttaagttaccggtaccttttgttACCTGT-C-A-G-CT-----G-A-T--AGCAAC--------TG-A-C-TG--TA---G-T--T-----AC----C--G-------T-TA--G---A--GT-CTTGTAT-TG--A-T------C--T-GC---TG---------TA---------C-----T-------TA-C------C-TG----------T-C-----T-G---T-T--TT--------A---T--A----C--------TG------------------CA-TG--T--A---G-T-TTA---G--C-C-TG-T-C-----CT-G-C----T-TA-TTAT--A-----C----------TGCAC----T--G---T--AG------G--TAATA----C-C-T----------G-T-CGAGT-T-TGC------AC----ACT--G-C-TG-T--tgcactgtaggtaatacctgtcgagtttgcacactgctgttaggttggtgaccatcgattaagtttttatactgctatgcctaaatgtaaccatgtcagtatatttttatacagtcagaatacgtcctttcagttttctatactgcctggagttatatagtactggtgttttattaccatgttcagtttttgaatcgactgcatgttgtttattagcgctgtcagccttctatacctgaccatgtagatactctcctgtgcagttgtctaactctactagctgatatgagtttcctgcttacgggtacctgtcagattttatatatcatcagcatgctcgtattaccatggttaggttgcttacggactgctgtacagttacctagtattgctcatcaattattggctatcactgctgttagttttacctgttagttttatactggctggagttagctgtcagtatatactgctgtagttacctgtcagtttatcgcttgctgtagtttacc
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-7611 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACCTGT-C-A-G-TTT-T--A-A-T--A----C--------TG-C-C-TG--TA---G-T--T-----AC----C-TG-------T-CA--G---A--TT-TTT-TAC-TG--AATA-----C--T-GC---TA---GT---ATA---------C-----T-------TA-C------C-TG----------T-C-----A-G---T-T--TT----A---A---T--A----C--------TG------------------CC-TG--T--A---G-T-T-----A--C-C-TG-T-C-----A--G-T----T-T--TTAT--A-----C----------TG--C----T--G---T--A-------G--T--TA----C-C-T----------G-T-C-AGT-T-T-C-T--TTAT----ACT--G-C-TG-T--AG--T-T--A--CC-T--G--AGTT-----C--TGT-------T-GCT-TAC--T--------TACCTGA-------GTT---CT--GTCCTCTCCTGGAGAATGGTGAT-G-TCTCTGTTTNATCTGGAGATT-CACGTGGACTNGCCC---CTTGTT-CTGTGCATATNTCATTACCAGCAT-TTAGCCTCCTTCGTTTTCTACAAGGACCCTATGCACATGG-AAGTAAATACANGGTTAT--GNT--TAAACTTGAAATTTT--GGCAACGTTTAAG--TC-AGGTGATACTATTAAATCATTTTATGTGTGANTTAAAGTTGT-CGATA-A-CTANAATGAATTGTATA--TATACCAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TTATGACGTCGATAAAGTGTTCAATACACAAAAAGACAATGCAACACGCTGTAATAATTTGTTCATAAATATTAAATTACAACATTAAAAATAATACACGTGAGAAAACCGAGAAGNCTGAAAATTGCAGGAAAGAAAGACTTTCACTATCATAATTATTTGCTGTTGTTTGTGTA------------GGAAAT---AAG-TTT-ACAATTCCA-----------------------CTGACGGAGTTTATCTCGGAGTTGTAAC-TTCTCCCCTGGG---GATGTTTTG-CCTTTATTTTA-AAGCGCG-CGTCAAATC-----GTCGAGCAGTGTTGGCATT----TT----ACA----ATTTTTGTCATTT--AANTTTCTTTTNAAATGTTTCCATGGTAGCGATATGGGAC-CAACATNTACAAT-NACAAATTAGGTGTAACGGAGAATACTTG-A-TAGA------AACA-GTTGAC-AG-TT-AAC-A-GAC-ATTAT-AACA-G-T------T-NA-CA-------G--A-CA---------T---TATAA-CAGTNT-ACA-GTT--A-ACAGACCAT-T-A-----------TAA--CAGT-TGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAGTTTAC
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        c--GTCCTCTCCTGGAGAATGGT-AT-----TCTGCTTCATCTGAAGATTTCACGTGGACTTGCCC---CTTGTT-CTGTGCATATTTCAGTACCAGCAT-TTAGCCTCCTTCGTTTTCTACAAGGACCCTATGTACATGG-AAGTAAATACATGGTTAT--AAT--TAAATTTGAAATTGT--GGC-ACATTT-AGTTTT-AGGTGATACTATTCAATTA-TTTATGTGTGAGTTAAAGTTGT-CGATA-A-CTAGAATGAATTGT-TA--T
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGAT-GGTCTCTGTTTGATCTGGAAATT-GAAGCTGAATGACCC---CTTGTT-CTGTATATATGTCAT---CAGCAT-TTAGCCCCCTTCGTTTTCTAACAGGGCCCTATAGACATGA-AATTAAATACACGATAAT--GAT--TAAACTTGAAATGTTA-GGC-ACGTTTAAG--TC-AGATGATACTATAAAATAATTATTTGTGTGATTTGAAGTTGT-CGAAA-A-CTACAATGAATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctcgtcctctgcgttaC-AG-TT-AAC-A-GAC-ATTAT-AACA-G-T------T-AA-CA-------G--A-CN---------N---NNNNN-NNNNNN-NNN-NNN--N-NNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNTTAA--CAGT-GGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAATAGTGTAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAACAGTGGACAGTTA-A-CAGACATTATAATA-GTGTAC-AG-TT-AAC-A-GAC-ATTAT-AACA-G-C------T-GA-CA-------------A---------T---TA--A-CAGTTT-GCA-GTT--A-ACAGAC-AT-T-A-----------TAA--CAGT-TGAC-A-C-T-TAAG-AGATATTATAACAGTTTACagttaacagacattataacagctgacaattaacagtttgcagttaacagacattataacagttgacacttaagagatattataacagtttacagacgttataaca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cagttaacagacattataacagttaacagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt---A---T--A----C--------TG------------------G--TG--T--G---G-T-T-----A--C-C-TG-T-C-----A--G-T----T-T--T-AT--A-----C----------TG--T----T--G---T--A-------G--T--TA----C-C-T----------G-T-C-AGA-T-T-agacgttataaca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttACCTGT-C-A-G-TTT-T--A---T--A----C--------TG-T---TG--TA---G-T--T-----AC----C-TG-------T-CA--G---A--TTANNN-NNN-NN--NNNN-----N--N-NN---NN---NN---NNN---------N-----N-------NN-N------N-NN----------N-N-----N-N---N-N--NN----N---N---N--N----N--------NN------------------NN-NN--N--N---N-N-N-----N--N-N-NN-N-N-----N--N-N----N-N--NNNN--N-----N----------NN--N----N--N---N--N-------N--N--NN----N-N-N----------N-N-N-NNN-N-N-N-N--NNNN----NNN--N-N-TG-T--AG--T-T--A--CC-T--GTCAGTTTCATAC--TGT-------T-A---TAG--T--------TACCTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagttacctgtcagtttcatactgttatagttacct
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttatactggtgtggttAACAGACAATA-TTA-A-TA----------CG-GTTGAC-AC-TTTACC-A-TAC-ATTAT-AACA-GGT------T-AAACA-------G--AACA---------TGC-TATAG-CAATGG-ACCCATTCAA-ACAGACCAC-TCA-----------TAT--CAGT-TGACCA-GCT-TAACCAGACATTATAACA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CA-GTTGACCAGCTT-AACCA-GAC-ATTAT-AACACA-T------T-GA-CA-------G--cattgacag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aacagacaatattaatacggttgacactttaccatacattataacaggttaaacagaacatgctatagcaatggacccattcaaacagaccactcatatATA-----T--T-GCATGTA---GT---CTA---------CGAATTTG------TA-C------C-TG----------T-C-----A-G---T-T--T-----A---T---T--A-------------TG------------------CA-TG--T--A---G-T-TTA---G--C-T-TG-TTC-----AAGG-T----T-T--CTAT--A-----C----------TG--C----T--G---T--A-------AGCT--TA----T-C-TTG--------G-T-C-A---C-T-CGT--TTATTG--ACT--G-C-TG-T--AGGTT-T--A--CC-T--G--
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtt-A-GAC-ATTAT-AACACA-T------T-GA-CA-------GTTA-CACACACGTTCT---TACAC-CAGTCTGGCA-GTT--A-ACAGACCA--T-A-----------TAACCCAGTGCGAC-A-G-TCTAAC-A-ACATTATAAC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -TG-T-T-----A--G-T----T-T--T-AT--A-----C----------TG--T----T--G---T--A-------G--T--TA----C-C-T----------G-T-G-AG------A-T--TTAT----ACC--A-C-TG-T--AG--T-T--A--CC-T--G-----T-----C--TGT-------T-GTA-TAT--TGTTGTAGTTACCTGA-------TCT---CT---TCCTCTCTTGGA---TGATG---G-TCTCTGTTTGATCTGGAAATT-CACGTGGACTGACCC---CTTCTT-CTGTAAATATGTCTTTATCAGCA----AG------------------AGGATCCTATACACATGG-AAGTAAATACAAGAATAT--GTT--TAAACATTAAATTTT--GATAACTTTTAAG--TC-AGTTGATATCATTAAATCATTTGATGTGTGATTTAGAGTT-T-TAGTAGA-CTATAATAACTTGTATA--TATACCAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TTATGACGTCGATAAAGTGTTCAATACACAAAAAGACAATGCAACACGGTGTAATAATTTGTTCATAAATATTAAATTACAACATTAAAAATAATGCACGTGAGAAAACCGGGAAGTCTGAAAATTGCAGGAAAGAAAGACTTTCATTATCATAATTATTTGCTGTTGTTTGTGTA------------GGAAAT---AAG-TTT-ACAATTCCA-----------------------CTGACGGAGTTTATCTCGGAATTGTAAC-TTCTCCCCTGGG---GATGTTTTG-CCTTTGTTTTA-AAGTGTG-CATCAAATC-----GTCGAACAGTGTTGGCATT----TT----ACA----ATTTTTTTCATTT--AATTTTCTTTTGAAATGGTTCCATGATAGCAATATGGGTC-CAACATTTACAAT-TACAAATTAGGT-TAACGGAGAATACTTG-A-T
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -------TA-C------C-TG----------T-C-----C-G---T-A--T-----A---A---T--A----C--------TG------------------C--TG--T--A---G-T-T-----A--C-C-TG-T-C-----A--T-A----T-T--TTAT--A-----T----------AG--C----C--T---T--A-------G--T--AA----T-C-T----------G-C-C-A---T-T-T-T--TTGT----ACT--G-C-TG-T--TG--T-
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -----T-------TA-T------C-TG----------T-C-----A-G---T-T--TT--------A---T-------C--------TG------------------CG-T---T--A---G-T-T-----A--C-C-T--T-C-----A--G------T-T--TCAT--A-----A----------TG--C----T--G---T--A-------A--G--AA----C-C------------G-T-C-AAT-T-T-A------AC----ACT--G-C-TG-agaaccgtcaatttaacactgctg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttaattgctgtgagA-CA-------G--A-CA---------T---TATAA-AAGTTT-ACA-GTT--A-ACAAA-CAT-T-T-----------TAA--CAGT-TGAA-A-A-T-TTAA-ATACATTATAACAGTTTAC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             a------AACA-GTTGAA-AA-TT-TAA-A-TAC-ATTAT-AACA-G-T------T-TA-CA-------G--A-CA---------T---TATAA-agacattataa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aacagacattataaaagtttacagttaacaaacattttACA-G-T------T-AA-CA-------C--A-TA---------T---TAAAA-CAGTGT-AGA-GTT--A-ACAGAC-AT-T-A-----------TGA--CACT-TTAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTGT-C-A-G-TTT-C--A---T--A----C--------TG-T---TA--TA---G-T--T-----AC----C-TG-------T-CA--G---A--TT-AGT-TAC-GG--GATA-----NCAT-AC---TC---GT---ATA---------A-----T-------TA-C------C-TG----------T-
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -A-AAC-AGTAT-AACA-A-T------T-TA-CA-------T--A-TA---------T---TATAA-CAGTTG-ACA-GTT--A-ACAGA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CA-GTT--T-ACAGAT-AT-T-A-----------TAT--TAGT-TGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -TG-T-T-----A--G-T----T-TA-TCAT--ATAC--C----------TG--C----TTGA---T--A-------G--T--TA----C-C-T----------GTT-C-AGT-T-T-T-A--TTA-----ACTTGG-C-GG-T--AG--T-T--C--CC-T--G--A-TT-----CAGTGT-------T-GTT-TAC--
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACCTGTTC-A-G-TTT-T--A-T-T--AAC--T--------TG-G-C-GG--TA---G-T--T-----CC----C-TGAT-----T-CA--GT--G--TT-GTT-TAC-GG--G--------C--T-GT---TAA--GT----TA---------C-----CGG-----TA-C------C-TT----------T-T-------G---T-T------------A---T--A----C--------TG------------------CT-GG--T--A---G-T-TC----G--C-C-TG-T-C-----A--G-T----T-T--AAAT--A-----C----------TA--CTACTT--G---TC-A-------G--T--TA----C-C-T----------G-T-C-AG--------C--TGATAGCAACT--GAC-TG-T--AG--T-T--A--CCGTTAG--AGTC-----T--TGTATTGATCT-GCTGTAC--T--------TACCTG----------T---CT--GTTTTATACTGgggctgttaagttaccggtaccttttgttatactgctggtagttcgcctgtcagtttaaatactactacttgtcagttacctgtcagctgatagcaactgactgtagttaccgttagagtcttgtattgatctgctgtacttacctgtctgttttatactgcatgtagtttagcctgtcctgcttattatactgcactgtaggtaatacctgtcgagtttgcacactgctgttaggttggtgaccatcgattaagtttttatactgctatgcctaaatgtaaccatgtcagtatatttttatacagtcagaatacgtcctttcagttttctatactgcctggagttatatagtactggtgttttattaccatgttcagtttttgaatcgactgcatgttgtttattagcgctgtcagccttctatacctgaccatgtagatactctcctgtgcagttgtctaactctactagctgatatgagtttcctgcttacgggtacctgtcagattttatatatcatcagcatgctcgtattaccatggttaggttgcttacggactgctgtacagttacctagtattgctcatcaattattggctatcactgctgttagttttacctgttagttttatactggctggagttagctgtcagtatatactgctgtagttacctgtcagtttatcgcttgctgtagtttacc
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-7611 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACCTGT-C-A-G-TTT-T--A-A-T--A----C--------TG-C-C-TG--TA---G-T--T-----AC----C-TG-------T-CA--G---A--TT-TTT-TAC-TG--AATA-----C--T-GC---TA---GT---ATA---------C-----T-------TA-C------C-TG----------T-C-----A-G---T-T--TT----A---A---T--A----C--------TG------------------CC-TG--T--A---G-T-T-----A--C-C-TG-T-C-----A--G-T----T-T--TTAT--A-----C----------TG--C----T--G---T--A-------G--T--TA----C-C-T----------G-T-C-AGT-T-T-C-T--TTAT----ACT--G-C-TG-T--AG--T-T--A--CC-T--G--AGTT-----C--TGT-------T-GCT-TAC--T--------TACCTGA-------GTT---CT--GTCCTCTCCTGGAGAATGGTGAT-G-TCTCTGTTTNATCTGGAGATT-CACGTGGACTNGCCC---CTTGTT-CTGTGCATATNTCATTACCAGCAT-TTAGCCTCCTTCGTTTTCTACAAGGACCCTATGCACATGG-AAGTAAATACANGGTTAT--GNT--TAAACTTGAAATTTT--GGCAACGTTTAAG--TC-AGGTGATACTATTAAATCATTTTATGTGTGANTTAAAGTTGT-CGATA-A-CTANAATGAATTGTATA--TATACCAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TTATGACGTCGATAAAGTGTTCAATACACAAAAAGACAATGCAACACGCTGTAATAATTTGTTCATAAATATTAAATTACAACATTAAAAATAATACACGTGAGAAAACCGAGAAGNCTGAAAATTGCAGGAAAGAAAGACTTTCACTATCATAATTATTTGCTGTTGTTTGTGTA------------GGAAAT---AAG-TTT-ACAATTCCA-----------------------CTGACGGAGTTTATCTCGGAGTTGTAAC-TTCTCCCCTGGG---GATGTTTTG-CCTTTATTTTA-AAGCGCG-CGTCAAATC-----GTCGAGCAGTGTTGGCATT----TT----ACA----ATTTTTGTCATTT--AANTTTCTTTTNAAATGTTTCCATGGTAGCGATATGGGAC-CAACATNTACAAT-NACAAATTAGGTGTAACGGAGAATACTTG-A-TAGA------AACA-GTTGAC-AG-TT-AAC-A-GAC-ATTAT-AACA-G-T------T-NA-CA-------G--A-CA---------T---TATAA-CAGTNT-ACA-GTT--A-ACAGACCAT-T-A-----------TAA--CAGT-TGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAGTTTAC
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        c--GTCCTCTCCTGGAGAATGGT-AT-----TCTGCTTCATCTGAAGATTTCACGTGGACTTGCCC---CTTGTT-CTGTGCATATTTCAGTACCAGCAT-TTAGCCTCCTTCGTTTTCTACAAGGACCCTATGTACATGG-AAGTAAATACATGGTTAT--AAT--TAAATTTGAAATTGT--GGC-ACATTT-AGTTTT-AGGTGATACTATTCAATTA-TTTATGTGTGAGTTAAAGTTGT-CGATA-A-CTAGAATGAATTGT-TA--T
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGAT-GGTCTCTGTTTGATCTGGAAATT-GAAGCTGAATGACCC---CTTGTT-CTGTATATATGTCAT---CAGCAT-TTAGCCCCCTTCGTTTTCTAACAGGGCCCTATAGACATGA-AATTAAATACACGATAAT--GAT--TAAACTTGAAATGTTA-GGC-ACGTTTAAG--TC-AGATGATACTATAAAATAATTATTTGTGTGATTTGAAGTTGT-CGAAA-A-CTACAATGAATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctcgtcctctgcgttaC-AG-TT-AAC-A-GAC-ATTAT-AACA-G-T------T-AA-CA-------G--A-CN---------N---NNNNN-NNNNNN-NNN-NNN--N-NNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNTTAA--CAGT-GGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAATAGTGTAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAACAGTGGACAGTTA-A-CAGACATTATAATA-GTGTAC-AG-TT-AAC-A-GAC-ATTAT-AACA-G-C------T-GA-CA-------------A---------T---TA--A-CAGTTT-GCA-GTT--A-ACAGAC-AT-T-A-----------TAA--CAGT-TGAC-A-C-T-TAAG-AGATATTATAACAGTTTACagttaacagacattataacagctgacaattaacagtttgcagttaacagacattataacagttgacacttaagagatattataacagtttacagacgttataaca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cagttaacagacattataacagttaacagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt---A---T--A----C--------TG------------------G--TG--T--G---G-T-T-----A--C-C-TG-T-C-----A--G-T----T-T--T-AT--A-----C----------TG--T----T--G---T--A-------G--T--TA----C-C-T----------G-T-C-AGA-T-T-agacgttataaca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttACCTGT-C-A-G-TTT-T--A---T--A----C--------TG-T---TG--TA---G-T--T-----AC----C-TG-------T-CA--G---A--TTANNN-NNN-NN--NNNN-----N--N-NN---NN---NN---NNN---------N-----N-------NN-N------N-NN----------N-N-----N-N---N-N--NN----N---N---N--N----N--------NN------------------NN-NN--N--N---N-N-N-----N--N-N-NN-N-N-----N--N-N----N-N--NNNN--N-----N----------NN--N----N--N---N--N-------N--N--NN----N-N-N----------N-N-N-NNN-N-N-N-N--NNNN----NNN--N-N-TG-T--AG--T-T--A--CC-T--GTCAGTTTCATAC--TGT-------T-A---TAG--T--------TACCTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagttacctgtcagtttcatactgttatagttacct
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttatactggtgtggttAACAGACAATA-TTA-A-TA----------CG-GTTGAC-AC-TTTACC-A-TAC-ATTAT-AACA-GGT------T-AAACA-------G--AACA---------TGC-TATAG-CAATGG-ACCCATTCAA-ACAGACCAC-TCA-----------TAT--CAGT-TGACCA-GCT-TAACCAGACATTATAACA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CA-GTTGACCAGCTT-AACCA-GAC-ATTAT-AACACA-T------T-GA-CA-------G--cattgacag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aacagacaatattaatacggttgacactttaccatacattataacaggttaaacagaacatgctatagcaatggacccattcaaacagaccactcatatATA-----T--T-GCATGTA---GT---CTA---------CGAATTTG------TA-C------C-TG----------T-C-----A-G---T-T--T-----A---T---T--A-------------TG------------------CA-TG--T--A---G-T-TTA---G--C-T-TG-TTC-----AAGG-T----T-T--CTAT--A-----C----------TG--C----T--G---T--A-------AGCT--TA----T-C-TTG--------G-T-C-A---C-T-CGT--TTATTG--ACT--G-C-TG-T--AGGTT-T--A--CC-T--G--
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtt-A-GAC-ATTAT-AACACA-T------T-GA-CA-------GTTA-CACACACGTTCT---TACAC-CAGTCTGGCA-GTT--A-ACAGACCA--T-A-----------TAACCCAGTGCGAC-A-G-TCTAAC-A-ACATTATAAC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -TG-T-T-----A--G-T----T-T--T-AT--A-----C----------TG--T----T--G---T--A-------G--T--TA----C-C-T----------G-T-G-AG------A-T--TTAT----ACC--A-C-TG-T--AG--T-T--A--CC-T--G-----T-----C--TGT-------T-GTA-TAT--TGTTGTAGTTACCTGA-------TCT---CT---TCCTCTCTTGGA---TGATG---G-TCTCTGTTTGATCTGGAAATT-CACGTGGACTGACCC---CTTCTT-CTGTAAATATGTCTTTATCAGCA----AG------------------AGGATCCTATACACATGG-AAGTAAATACAAGAATAT--GTT--TAAACATTAAATTTT--GATAACTTTTAAG--TC-AGTTGATATCATTAAATCATTTGATGTGTGATTTAGAGTT-T-TAGTAGA-CTATAATAACTTGTATA--TATACCAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TTATGACGTCGATAAAGTGTTCAATACACAAAAAGACAATGCAACACGGTGTAATAATTTGTTCATAAATATTAAATTACAACATTAAAAATAATGCACGTGAGAAAACCGGGAAGTCTGAAAATTGCAGGAAAGAAAGACTTTCATTATCATAATTATTTGCTGTTGTTTGTGTA------------GGAAAT---AAG-TTT-ACAATTCCA-----------------------CTGACGGAGTTTATCTCGGAATTGTAAC-TTCTCCCCTGGG---GATGTTTTG-CCTTTGTTTTA-AAGTGTG-CATCAAATC-----GTCGAACAGTGTTGGCATT----TT----ACA----ATTTTTTTCATTT--AATTTTCTTTTGAAATGGTTCCATGATAGCAATATGGGTC-CAACATTTACAAT-TACAAATTAGGT-TAACGGAGAATACTTG-A-T
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -------TA-C------C-TG----------T-C-----C-G---T-A--T-----A---A---T--A----C--------TG------------------C--TG--T--A---G-T-T-----A--C-C-TG-T-C-----A--T-A----T-T--TTAT--A-----T----------AG--C----C--T---T--A-------G--T--AA----T-C-T----------G-C-C-A---T-T-T-T--TTGT----ACT--G-C-TG-T--TG--T-
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -----T-------TA-T------C-TG----------T-C-----A-G---T-T--TT--------A---T-------C--------TG------------------CG-T---T--A---G-T-T-----A--C-C-T--T-C-----A--G------T-T--TCAT--A-----A----------TG--C----T--G---T--A-------A--G--AA----C-C------------G-T-C-AAT-T-T-A------AC----ACT--G-C-TG-agaaccgtcaatttaacactgctg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttaattgctgtgagA-CA-------G--A-CA---------T---TATAA-AAGTTT-ACA-GTT--A-ACAAA-CAT-T-T-----------TAA--CAGT-TGAA-A-A-T-TTAA-ATACATTATAACAGTTTAC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             a------AACA-GTTGAA-AA-TT-TAA-A-TAC-ATTAT-AACA-G-T------T-TA-CA-------G--A-CA---------T---TATAA-agacattataa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aacagacattataaaagtttacagttaacaaacattttACA-G-T------T-AA-CA-------C--A-TA---------T---TAAAA-CAGTGT-AGA-GTT--A-ACAGAC-AT-T-A-----------TGA--CACT-TTAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTGT-C-A-G-TTT-C--A---T--A----C--------TG-T---TA--TA---G-T--T-----AC----C-TG-------T-CA--G---A--TT-AGT-TAC-GG--GATA-----NCAT-AC---TC---GT---ATA---------A-----T-------TA-C------C-TG----------T-
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -A-AAC-AGTAT-AACA-A-T------T-TA-CA-------T--A-TA---------T---TATAA-CAGTTG-ACA-GTT--A-ACAGA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CA-GTT--T-ACAGAT-AT-T-A-----------TAT--TAGT-TGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -TG-T-T-----A--G-T----T-TA-TCAT--ATAC--C----------TG--C----TTGA---T--A-------G--T--TA----C-C-T----------GTT-C-AGT-T-T-T-A--TTA-----ACTTGG-C-GG-T--AG--T-T--C--CC-T--G--A-TT-----CAGTGT-------T-GTT-TAC--
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACCTGTTC-A-G-TTT-T--A-T-T--AAC--T--------TG-G-C-GG--TA---G-T--T-----CC----C-TGAT-----T-CA--GT--G--TT-GTT-TAC-GG--G--------C--T-GT---TAA--GT----TA---------C-----CGG-----TA-C------C-TT----------T-T-------G---T-T------------A---T--A----C--------TG------------------CT-GG--T--A---G-T-TC----G--C-C-TG-T-C-----A--G-T----T-T--AAAT--A-----C----------TA--CTACTT--G---TC-A-------G--T--TA----C-C-T----------G-T-C-AG--------C--TGATAGCAACT--GAC-TG-T--AG--T-T--A--CCGTTAG--AGTC-----T--TGTATTGATCT-GCTGTAC--T--------TACCTG----------T---CT--GTTTTATACTGgggctgttaagttaccggtaccttttgttatactgctggtagttcgcctgtcagtttaaatactactacttgtcagttacctgtcagctgatagcaactgactgtagttaccgttagagtcttgtattgatctgctgtacttacctgtctgttttatactgcatgtagtttagcctgtcctgcttattatactgcactgtaggtaatacctgtcgagtttgcacactgctgttaggttggtgaccatcgattaagtttttatactgctatgcctaaatgtaaccatgtcagtatatttttatacagtcagaatacgtcctttcagttttctatactgcctggagttatatagtactggtgttttattaccatgttcagtttttgaatcgactgcatgttgtttattagcgctgtcagccttctatacctgaccatgtagatactctcctgtgcagttgtctaactctactagctgatatgagtttcctgcttacgggtacctgtcagattttatatatcatcagcatgctcgtattaccatggttaggttgcttacggactgctgtacagttacctagtattgctcatcaattattggctatcactgctgttagttttacctgttagttttatactggctggagttagctgtcagtatatactgctgtagttacctgtcagtttatcgcttgctgtagtttacc
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A------------GGATAC---GAG-TTTTACAATACCA-----------------------CTGACGAGTTTTGTGTTGGAGT-GTAACATTCTCCTC-GAATTTGATGTTTTGGCCTTTAATGTGCAAGTACAATGTAATATTTTAAAGTTCAGCAGTGT--ACATCCAAATTGGCCACAGCCCATATTTGTCATTCTAAAGTTTCTTTTCAA-TGTTTCCATGGTAGCGATATGGGACACAA-ATGT-CAATGAATAAGTCAGGTA-ACCGCAGAA-ACATGCACTAGA------AACATGT------G-T---AC-ACGACTATTATAAACA-G-T------A-CA-CAGGAAACGG--A-CG---------TTGCTATAACCAGTAC-AC--GTA--ACACAGACTGGAT-A-----------TAA--CAGT---AC-ACG-T-TAAC-AGGC---ATAACAGT


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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cGTCCTCTCCTG-GAGAATGGTA---TTCTGCTTCATCTGAAGATTTCACGTGGACTTGCCC---CTTGTT-CTGTGCATATTTCAGTACCAGCAT-TTAGCCTCCTTCGTTTTCTACAAGGACCCTATGTACATGG-AAGTAAATACATGGTTAT--AAT--TAAATTTGAAATTGT--GGC-ACATTT-AGTTTT-AGGTGATACTATTCAATTA-TTTATGTGTGAGTTAAAGTTGT-CGATA-A-CTAGAATGAATTGT-TA--T
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGATGGT-CTCTGTTTGATCTGGAAATT-GAAGCTGAATGACCC---CTTGTT-CTGTATATATGTCAT---CAGCAT-TTAGCCCCCTTCGTTTTCTAACAGGGCCCTATAGACATGA-AATTAAATACACGATAAT--GAT--TAAACTTGAAATGTTA-GGC-ACGTTTAAG--TC-AGATGATACTATAAAATAATTATTTGTGTGATTTGAAGTTGT-CGAAA-A-CTACAATGAATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctcgtcctctgcgttC-AG-TT-AAC-A-GAC-ATTAT-AACA-G-T------TAA-CA-------G--A-CN---------N---NNNNN-NNNNNN-N-NN-NNN--N-NNNNN-N-NN---N-NNNNNNNNNNNNTTAA--CAGT-GGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAATAGTGTAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAACAGTGGACAGTTA-A-CAGACATTATAATA-GTGTAC-AG-TT-AAC-A-GAC-ATTAT-AACA-G-C------TGA-CA-------------A---------T---TA--A-CAGTTT-G-CA-GTT--A-ACAGA-C-AT---T-A------------TAA--CAGT-TGAC-A-C-T-TAAG-AGATATTATAACAGTTTACagttaacagacattataacagctgacaattaacagtttgcagttaacagacattataacagttgacacttaagagatattataacagtttacagacgttataaca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cagttaacagacattataacagttaacagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt-TTAT--A-----CTG--G--T-G---TG-------G--T--T-A----C-C-T--G-T-C-AGT-T-T--------TA-T--A-C--------T-G-T-T-G--T---A-G--T--------------T-----A-C-C-T-G-TC-----A-G--AT---T--agacgttataaca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACCTG--TC-AG-TTT-T--A---T--A----C--------TGT--TG--T--A---G-TT-----AC-C-TG-T-CA-G---A--TTANNN-NNN-NN-NNNN-----N--NNN---NN---NN---NNNN-----N-------NN-NN-NN----------N-N-N-N---N-N--N---N----N---NN--N----NNN------------------NNNNN--NNN-N-----N--N-NNNN-N-----N--N-N--NN-NNNN--N-----NNN--N--N-N---NN-------N--N--N-N----N-N-N--N-N-N-NNN-N-N-N-N--N-NN-N--N-N--------N-N-N-T-G--T---A-G--T--------------T-----A-C-C-T-G-TC-----A-G--TT---T--CA-T----AC-TG--T--TATA-G--T--TA-CC-T---annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagttacctgtcagtttcatactgttatagttacct
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttatactggtgtggttAACAGACAATA-TTA-A-TA----------CG-GTTGAC-AC-TTTACC-A-TAC-ATTAT-AACA-GGT------TAAACA-------G--AACA---------TGC-TATAG-CAATGG-A-CCCATTCAA-ACAGA-CCAC---TCA------------TAT--CAGT-TGACCA-GCT-TAACCAGACATTATAACA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CA-GTTGACCAGCTT-AACCA-GAC-ATTAT-AACACA-T------TGA-CA-------G--cattgacag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aacagacaatattaatacggttgacactttaccatacattataacaggttaaacagaacatgctatagcaatggacccattcaaacagaccactcatatATA-----T--TGCATGTA---GT---CTACGAATTTG------TA-CC-TG----------T-C-A-G---T-T--T--------A---TT--A-----TG------------------CATGT--AGT-TTA---G--C-TTGTTC-----AAGG-T--TT-CTAT--A-----CTG--C--T-G---TA-------AGCT--T-A----T-C-TTGG-T-C-A---C-T-CGT--T-TA-TTGA-C--------T-G-C-T-G--T---A-GGTT--------------T-----A-C-C-T-G-
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agtt-A-GAC-ATTAT-AACACA-T------TGA-CA-------GTTA-CACACACGTTCT---TACAC-CAGTCTGG-CA-GTT--A-ACAGA-C-CA---T-A------------TAACCCAGTGCGAC-A-G-TCTAAC-A-ACATTATAAC
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aACA-G-T------TAA-CA-------C--A-TA---------T---TAAAA-CAGTGT-A-GA-GTT--A-ACAGA-C-AT---T-A------------TGA--CACT-TTAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAGagacattataa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTG--TC-AG-TTT-C--A---T--A----C--------TGT--TA--T--A---G-TT-----AC-C-TG-T-CA-G---A--TT-AGT-TAC-GG-GATA-----NCATAC---TC---GT---ATAA-----T-------TA-CC-TG----------T-
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AA-CAGTAT-AACA-ATT--T-ACATA-T-AT---T-A------------TAA--CAGT-TGAC-A-G-T-TAAC-AGA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      a-CA-GTT--T-ACAGA-T-AT---T-A------------TAT--TAGT-TGAC-A-G-T-TAAC-AGACATTATAACAG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TG--TT-AG-TTTAT--C-A-T--ATAC-C--------TGCT-TGA-T--A---G-TT-----AC-C-TG-TTCA-G---------TTT-TAT-TA-ACT---------TGG---CG---GT---AG-------T-------TC-CC-TGAT--------T-C-A-G---T-G--T---T----G---TTT-A----CGG------------------GCTGTTAAGT-T-----A--C-CGGTAC-----C--T-T--TTGTTAT--A-----CTG--C--T-GG--TA-------G--T--TCG----C-C-T--G-T-C-AGT-T-T-A-A--A-TACT--A-C--------T-A-C-TTG--TC--A-G--T--------------T-----A-C-C-T-G-TC-----A-G---C---T--GA-TAGCAAC-TGA-C--TGTA-G--T--TA-CC--------GT---------TA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCTGATTC-AG-TGT-T--G-T-TT-A----C--------GGGC-TG--TTAA---G-TT-----AC-C-GG-T--------A--CC-TTT-TGT-T---ATA-----C--TGC---TG---GT---A-GT-----T-------CG-CC-TG----------T-C-A-G---T-T--TAAAT----A---CT--A----CTA------------------CTTGTC-AGT-T-----A--C-CTGT-C-----A--G-C--TG-ATAGCAA-----CTGA-C--T-G---TA-------G--T--T-A----C-C----G-T-T-AGA-G-T-C-T--TGTA-TTGATC--------T-G-C-T-G--T---A-C--T--------------T-----A-C-C-T-G-TC-----T-G--TT---T--TA-T----AC-TG--CA-TGTAGT--T--TAGCC-T---G-gagtcttgtattgatctgctgtacttacctgtctgttttatactgcatgtagtttagcctgtcctgcttattatactgcactgtaggtaatacctgtcgagtttgcacactgctgttaggttggtgaccatcgattaagtttttatactgctatgcctaaatgtaaccatgtcagtatatttttatacagtcagaatacgtcctttcagttttctatactgcctggagttatatagtactggtgttttattaccatgttcagtttttgaatcgactgcatgttgtttattagcgctgtcagccttctatacctgaccatgtagatactctcctgtgcagttgtctaactctactagctgatatgagtttcctgcttacgggtacctgtcagattttatatatcatcagcatgctcgtattaccatggttaggttgcttacggactgctgtacagttacctagtattgctcatcaattattggctatcactgctgttagttttacctgttagttttatactggctggagttagctgtcagtatatactgctgtagttacctgtcagtttatcgcttgctgtagtttacc
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gi|6                          :                                                                                                                                                                          tagttttacatgtcagtttttgtgggatactgtagtttacctgtcagttttatactgctgtagtttacctgttcagttgtgttatactgtagtgtaccatgtctgttttattttctgctatatttatttctgtcagttttataactgacgtattgttacgctgtccagttttaaatactgaccgtagttattctgttcaatttattattactgctgtgttattcaggtaagaattatttaaattgggtagtatagcctgtcagtatttttttattgcttgtacgttacaATCTG--TC-AGATTT-T--A-A-T--A----C--------TTTC-TG--T--A---G-TTTATT-AC-C-TG-T-CA-G---A--TT-TTT-TAC-TG-AAT---------TAC---TA---AT---ATAC-----T-------T---C-TG----------T-C-TTG---T-T--T---TCTCAA---AT--A----CTGTT----------------CTTGT--AGT-T-----AA-C-CTGTAC-----A--GAT--TT-TTAT--A-----CTG--C--T-G---TAA------G--T--T-A----C-C-T--G-T-C-AGT-T-T-C-T--T-TA-T--A-C--------T-G-C-T-G--C---A-G--TC-------------T-----A-C-C-T-G-cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaatctgtcagattttaatactttctgtagtttattacctgtcagattttttactgaattactaatatacttctgtcttgttttctcaaatactgttcttgtagttaacctgtacagatttttatactgctgtaagttacctgtcagtttctttatactgctgcagtctacctgagt
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A------------GGATAC---GAG-TTTTACAATACCA-----------------------CTGACGAGTTTTGTGTTGGAGT-GTAACATTCTCCTC-GAATTTGATGTTTTGGCCTTTAATGTGCAAGTACAATGTAATATTTTAAAGTTCAGCAGTGT--ACATCCAAATTGGCCACAGCCCATATTTGTCATTCTAAAGTTTCTTTTCAA-TGTTTCCATGGTAGCGATATGGGACACAA-ATGT-CAATGAATAAGTCAGGTA-ACCGCAGAA-ACATGCACTAGA------AACATGT------G-T---AC-ACGACTATTATAAACA-G-T------ACA-CAGGAAACGG--A-CG---------TTGCTATAACCAGTAC-A-C--GTA--ACACAGA-C--TGGAT-A------------TAA--CAGT---AC-ACG-T-TAAC-AGGC---ATAACAGT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): TTCTCTCCGCACTCATTACTCTTGTACCAGTGATCCGTCCATTGTGCCTCGAAGATTTACAACCACAATGACGTTAATCATACAACACTATTTCATCATCATTTCCACGTTTTCTCGTTAATTTATCCCAATAAACTTAATAACTCCTCCTTACTAAAACCCCAATTCCAGTCTATGATTGGAAATTTATTCCCGCGCCTCTCTAAACTATCACAGTCCGGAATATGAATCCCTGCTACTAACCTTGCCATTTCGGAATTCTCGAGCGTTTTTTTGTAA
Unaligned ( gi|16 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACGTATGACTTACCCGCCCCTCATCGCCAGGGTTATCTGTGGAATCTTCCTCCTCGTCAC