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Reference ( gi|3 )            :  GGCCAAATA-A-A-A--TTGAAATT--A-------C-------T----CA---G-GC-GC---CG-CGCGCA-TC-TG--T-TT-T-G-A-G---G--TTG-C-C--GC-A-T--TG----C-G--ATTTT-AT-CG-AATTT--TC-A--T---TA--GAA--TAAAA---TAGTT-GG----T---A--T--CGC-T---TA--C---GT-ATCTGGGA---A-A--AAA-ATAAA-TCC----GCA--T-TCAT-T-TT---GAATC-T-T-TGT-G--AC-T-TCCGA-A-T-CAAGGGCC-AGTA-AA--G-TA-TATA-T--ACTTCCT-AC----A-TG-TA-C--C-AAATTAAT----GAAATTGGTGTTTCCGT-TTAA-TAT-C--A-----G---T-CCAAATAAA--CGTCTGC-A-C-TCG-GCATATGATCAT--GCC-T-G--ACT-CGGTG-CA-A-TC-T-TTCA-TAT----------TCGGAGCTACTTTC-GATT-TT---------G--ACCGAG----------------C------------CATA-T-TGAC--A-TTA-ATG-T-CTA----G-TGA--T-TCAG-CG-AT--G-C----A--GTC-GCC-T-----ACCA--T-TGA-AAAAAT----C-G---T-TGCT-AAA-TT-ACG-A--T----A-TG-----A-----T-----AA-GG-TA-TG-A-CTTT-AGTCAAACT-G-AAATCT---GA--TA-----CC-G--A--T-TGT-TTGGT-GA-CACA-T-TT--ATTG-T--GC--T--A----GATTG--CC---GT-----TTTTC-A--T-C-TTTCGTGT--TT-TTAA--T-TTCCGG--AAC-G---GGCA-AT--A-----------------------ACTTC-TAA---CTTTGTG-TT-TTTAAT-TTC-CGGAACGGG-CGATACA-TCTA-AATTTTGAATAGTGCTG-ACA-----AT-GGC--TG-TCG-ATGA-AAGTGAA-T-CATC---TC---CGT----TATT-CAGAGA--GCAACGCG-TT-G-TTGTGTTG--AAAG-TA-TTAC-GGAGAAAAC--A-AG--------CATG-------ACC--ACCTT-AC--A-AACAGAGCA---TA---ATATATATGGA-A---T-TGATAAT----ATT-T-G-TAAAC--TA--T--AG-AAAACTACGAC-G-TA-TGCA-A-AT-A--AAGGT---AGGCCTATTCA-A-CATCA---AGTTG-ACATAACA-TG-ACG-C-GAGTTTTT-A-GCATCGTTCTG-T---TT---A-AAA--TAA------------------------GTA--CCGATGG----TAGTGGTCTATAC-CATAC-TA-C---CGT-AA--TT-AAAAC----AAGACCAACA-CTTTTCTGGTT------GATACA-GCGA-CGTT-TTT----AAAA-AAAT--AAAA-TGGATCAGTACCAGC--AAGA-GAAGT----GG---AAC-ACGAACTAAAGGTATC-CCAACCCAGTTC--TGATTTC
gi|6                          :  GGCCAAATA-A-A-A--TTGAAATT--A-------CGGTTC--T----CA---G-GC--C---CG-CACGCA-TC-TG--T-TT-T-G-A-G---G--TTG-C-C--GC-A-T--TG----CCG--ATTTT-AT-CG-AATTT--TC-A--A---TA--AAA--TAAAA----AGTT-GG----T---AA-TG-CGC-T---TA--C---GT-ATCTGGGA---A-A--AAA-ATAAA-TCC----GCA--T-TCAT-T-TT---GAATC-T-T-TGT-G--AC-T-TCCGA-A-T-CAAGGGCC-AGTA-AAG-G-TA-TATA----ACTTCCT-AC----A-TG-TACC--C-AAATTAAT----G-AATT-GTG-TTCCGTATTAA-TAT-C--AG----G---T-CCAAATAAAT-CGTCTGC-A-C-TCG-GC--ATGATCAT--GCC-T-G--ACT-CGGTG-CA-A-TC-T-TTCT-TA-----------TCGGAGCTACGTTT-G-TT-TT---------G--A-CGTGC---------------C------------CATA-T-TGAC--A-TCA-ATG-T-CTA----G--GA--T-TCAG-CG-AT--G-C----A--GTC-GCC-T-----ACCA--T-----GAAAAT----C-G---T-TGCT-AAA-TT-ACG-A--T----A-TG-----A-----T------A-GG-TA-TG-A-CTTT-AGTCAAACT-G-AAATCT----A--TA-----CG-G--A--T-TG--TTGGT-GA-C-CA---TT--ATTG-T--GC--T--A----GATTG--CC---G------TTTTC-A--C-CTTTTCGTGT--TT-TTAA----TTCCGG--AAC-G---GGCG-AT--A-----------------------AC-TC-TAA---CTTTGTG-TT-TTTAAT-TTC-CGGAACGGG-C-ATAAC-TCTA-AA--TTGAATAGTGC---ACA-----AT-GGC--TG-ATG-ATGA-AGAT--A-T-C-TC---TC---CG-----TATT-CAG-GA--GCAACGCG--T-G-TTGTG-TG--AAAG-TA-TTAC-G--AAAAAC--AGAG-----------G-------ACC--ACCTT-AC--A-AACAGCATA---TATTTATATATATGGA-A---T---AAAAT----ATT-T-G-
gi|1                          : aGGCCAAATAGA-A-A--TTGAAATT--A-------CGGTTC--T----CA---G-GC--T---CG-CGCGCA-TC-TG--T-TT-T-G-A-G---G--TTGGC-C--GC-AGT--TGGC--C-G--ATTTT-ATTCG-AATTT--TC-AAATGAATA--GAG--TAAAA----AGTTTGG----T---AAGTG-CGC-T---TA--C---GT-ATATGGGA---A-ATGAAA-ATAAA-TCGTTAGGCAATT-CCATGT-TT---GGAAT-T-C-TGT-G--ACAT-TCCGA-AGT-GAAGGGCCGAGTA-AA--GGTA--ATAGT--AATTCCTGAC----AGTG-TA-C--CCAAATTA-T-----AAATTGTTGTTGCAATATTAA-TAT-CTAG-----G---T-CCATATAAT--CGTCTGC-AGCATCGTGCAT--GATCACTGGGC-T-GGAACT-CGGTGGCC-A-TC-T-GTCA-TAT-----------CGA--CTACTTTC-GATT-TT---------GTAACGGGGTG--------------C------------CATA-T-TGAC--AGTCA-ATG-T-CTAAACTG-TGA--T-TCAGGCG-ATTGG-C----ATAGT--GCC-T-----ACCC--TGTGA-AAAAAT----C-G---T-TGCT-AAA-TTGACGTA--T----A-TG-----A-----T-----AATGG-TA-TG-A-CTTT-AGTCAAACT-G-AA--TT---GA--TA-----CC-G--A--TCTGTGTCGGT-GA-C-CA-T-TT---TTG-T--GC--T--A----GATTG--CCG--GT-----TTTTC-A--C-C-TTT-GTGT--TT-TTAA--T-TTCCGG--AAC-G---GGCG-AT--A-----------------------A--TC-TAA---TTTTGTG--T-TTTAAT-TTCGCGGAACGGG-CGATATACTCTA-GAATTGAAACAGTGGCA-GCA-----ATGGGC--TG-ACG-ATGA-GA--------TATCT--TT---CG-----TATT-CAGGAG--GCAACGCG-TTGG-TTGTG-TG--AAAG-TA-TTAC-GGA-AAAAC--A-GA-----------G-------ACC--ACCTTAAC--A-AACAGAGCA---TAT--ATAT-TTTGGA-A---T---AGAAT----ATT-T-G-T-AAC--T---T--GGTAAAACTACGAC-G-TA-TGCATA-AT-A--AGGTT---AGG-CTAGTAA-ATCATCAAATAGTT--ACAT-ACA-TGTACG-T-GAGTTCTT-A-GC-TCGTT-TG-T---TTTGAA-AAG--TAA------------------------G-A--CCTAGGG----T--TGTTGTATAC-CATACTTA-C---CGTGAA--TA-AAAAC------CGCCAACA-CTTTTCTGGTT------TATTCAGGCGA-CGTT-TTA----AAAA-AAAT--AAAAGTGGATGAGTACCAGTAGAAGATGAAGTTGTAGGCCTAAC-ACGAACTAAA--TATCGCGAACCCGTTTC--TG-TTT
gi|13                         :  GGCCAAATA-A-A-A--TTGAAATT--A-------CGGTTC--T----CA---G-GC--C---CG-CGCGCA-TC-TG--T-TT-T-G-A-G---G--TTG-C-C--GC-A-T--TG----CCG--ATTTT-AT-CG-AATTT--TC-A--A---TA--AAA--TAAAA----AGTT-GG----T---AA-TG-CGC-T---TA--C---GT-ATCTGGGA---A-A--AAA-ATAAA-TCC----GCA--T-TCAT-T-TT---GAATC-T-T-TGT-G--AC-T-TCCGA-A-T-CAAGGGCC-AGTA-AAG-G-TA-TATA----ACTTCCT-AC----A--G-TACC--C-AAATTAAT----GAA----------------TAA-TAT-C--AG----G---T-CCAAATAAA--------------TCG-------------------------CT-CGGTG-CA-A-TC-T-TTCA-TA-----------TCGAAGC
gi|4                          : aGGCCAAATA-AGA-A--TTGAAATT--ATGCGTTAC-------T----CGATGG-GC--C---CGACGCAC--TC-TG--T-TTAT-G-G-GATGG--TTG-CGT--GC-A-T--TG----CCG--ATCT--AT-CG-AATTT--TC-A--A---TAAAGGA--TAATA---AAGTT-GGCTAAT---G--C--CAC-T---TA--C---GTCATCTGGGA---A-A--AAA-ATAAA-TCCCGT-GCA--T-TCAT-T-TTTA-GAGTC-T-T-TGTGG--AC-T-TCTGA-A-T-CACAGGCC-AGTA-AAAGG-TACTATA----ACTTCCT-AC----A-TGTTACC--C-AAATTCTT----GACCT--GTG-TCCCGTATTAATTAT-T--ATTTAGG---TGCCAAATAAAT-CGTCTGC-A-C-----GCA--------------------------GTG-AA-A-TCTT-TTCA-TATAGATATGATATCGGAACCATTTTC-GATT-TT---------G--ACCAGGGTTGCCCTGTAATTACC------------CATA---GGAC--T-TCA-ATG-T-TTA----G-TGATCT-TCAA-CG-AT--A-CTTATG--GTC-GAC-TGAACCACCA--T-TG---CAAAT----T-GCGCT-CGCT-AAACTT-ACG-A--C------TG-----C-----TCACGCAA-GGTTA-TG-A-CTCT-TATCAAACT-G-AAATCGCAAGA---A-----CC-G--A--T-AGT-ATGGT-GAGCAT--T-TT--ATTGTT--GC--TGGA----GATTG--CCAAGAT-----TTTT-----T-T-GTGCTTGT--TT-TTAA--TATTCCGG--AAC-G---GACATAT--------------------------ACTCA-TAA---CTTTAT
gi|16                         : aGGCCAAATA-A-A-ATTTTACAGTT----------C-------T----CA---GAAT-G-----G-CACATA-TC-CA--T-TT-T-G-A-G---G--TTG-C-C--GT-A-T--TGT---C-A--ACTTC-AT-TG-AAATT--TC-A--A---TG--AAA--T-AAA---TAGAT-GG----TA--A--TG-TGC-T---TA--C---GT-ATCTCGAA---G-A--AAA-Aactattgtgcacttatatggtcttgacgtattgaattgaagtacatctctctcgttattcagggaatgcacacgatttcgtgtgaaagatatttgttgaaaaaagaccatgtgctaggaccaccttacttataacagagcacttatatatgggaaaaaatattgtgtaaactatgtagaacactaagacgtatgcataatattaaggttgggtcattaaacatgaagtgacatgtgtgcgggttcttttat
gi|20                         : aGGCCAAATA-G-A-A--TTGTAATTTCAGTT----C-------T----CA---T-GC-CCATGCA-CGCTCA-TC-CA--T-TT-T-G-A-G---G--TTG-C-T--GC-A-T--TG----C-a
gi|14                         : aGGCCAAATG-A-A-A--TTGGAATT--ACAGCT--C-------T----CA---G-TC--T---CA-TGTGCA-TC-TG--TGTT-TGG-A-A---G--TTG-C-A--ACAA-T--TAATGTC-A--ATTTC-AT-CA-AATTT--a
gi|2                          :  aGCCAAATA-A-A-A--TTGAAATT--A-------CGGTT---T----CA---G-GC-CC---CG-CGCGCA-TCATG--T-TT-T-G-A-G---GGTTTG-C-C--GC-A-T--TG----C-G--GATTT-ATCCG-AATTT--TCAA--T---AA--GAA--TAAAA----AGTTGGG----T---A--A--TGCGC---TA--C---GA-TTCTGGGA---A-A--AA----AAA-TCC----GCAT-T-TCAT-T-TTTTGAAATCTT-T-TGT-G--AC----CCGA-A-TGCAAGGGCC-A-TAGAA--G-TG-TATA-TTAACTT-CT-AC----A-TG-TACC--C-AAATTTAT----GAACT--GTG-TTCCGTATTAA-TAT-C--A-----GGTCT-CTAAATAAACTCGTCTGC-A-C-TC--GCATG-GAT-AT--GCCTT-G--ACT-C-GTG-CAGA-TC-T-TTCA-TA-----------TCGGAGCTACTTGC-GATTATT---------G--ACCGTG----------------CCGCTAATTGCCACATA-T-TGAC--A--CA-ATGTT-CTA----GTTGA--T-TCAG-CG-AT--GCC----A--GTC-GCC-T-----ACCG--T-TGA-ACAAAT----C-G---T-TGCT-AAA-TT-ACG-AGTT----A-TG-----AT----T-----AA-GG-TATTG-A-C-TT-AGTC-AACT-GAAAATCT---GA--TA-----CC-G--A------T-TTGGT-GA-C-CATT-TT--ATGG-T--GC--T--A----GATTGGTCC---GT-----TTTTCGA--C-C-TGTCGTGT--TTCTTAA--T-TTCCGT--AAC-G---GGCG-ATTAA-----------------------ACCTCTTAA---CTTTGTG-TT-TTTAAT-TTC-CGGAACGGG-CG-TAAC-TCTA-AA--TTGAATAG-GC---ACA-----AT-GGC--TG-ACG-ATGATGAGATAA-T-C-TC---TC---CG-----TATT-CAG-GA--GCAACGCG-TT-A-TTGTG-TG--AAAG-TATTTACGGGAAAAAAC--A-AG---------AGG-------GAC--ACCTT-ACA-A-AACAGAGCA---TAT--ATATATATGGACA---T---AAAAT----ATT-T-G-AAAAC--TATGT--AG-AAA--CACGACAG-TA-TGCA-A-AT-A--AAGGT---AGGGCTA-TAA-A-CATTA---AGTTGAACAT-ACATTGTACG-CGGAGTTCTT-AGGCATCG-TGTG-T---TT---G-AAAATTAA------------------------GTAACCC-----------GTGGTCTATAC-CATAC-TA-CCAACGT-AA--TTGAAAACGAATAACGCCAACA-CTTTT-TGGTT------GATACA-GCGA-CG---TTT----AAAAGAAATGAAAAA-TGGATCA-TACCAGC---AGA-GAAGT----GT---AAC-ACGAACTAcaatccaatattagcaaaggagctttttgtaattatcgtaaattatttggaaaatggaattagaaggtgaaaatatttgaaactttgaca
gi|7                          :   GCCAAATA-A-A-A--TTGAAATT--A-------CGGCTTTCT----CA---G-GC--C---CG-CGCCGA-TC-TG--T-TT---G-A-G---G--T-G-CGCAGGC-A-TGGTG----CCG--ATTTTGAT-CG-AATTT--TC-A--T---TA--TAAACTAAGAAAGTAGTT-GG----T---AA-TGGCGC-T---TA--CCAGGT-ATCTGGGA---A-A--AAA--TAAA-TCC----GCA--T-TCAT-T-TT---GAATC-T-TGTGT-G--AC-T-TCCGA-A-TTCAAGGGCC-AGTA-AA--GGTA-TATA----ACTTCCT-ACTAATG-TG-TA-C--CCAGATTAAT----GA--TTCGTGTT--CGTATTAA-TAT-C--A-----GG--T-CCAAATAAAT-CGTCTGC-A-C-TCG-GCATGCAAT-----GCC-TTG--A-T-CGGTG-CA-A-TC-T-TTCA-TAT----------C--GAGCTACTT-C-GATT-TT---------G--ACCGGG----------------CTGGC--------CATG-TATTAC--A-TCA-A-G-T-CTA----G-TGAC-T-TCAG-CG-AT--G-C----A--GTC-GCC-T-----ACCA--T-TGA-AAAAAT----CTA---T-TGCT-AAA-TT-ACG-A--TGGTGA-TG-----AAGTGTT-----AG-GG-TA--G-ATCTTTAAGTCCAACT-G-AAATCT---GGATTA-----CCTGATA--T-TG--TTGGT-GA-C-CA-TGTTAAATTG-TGGGC--T--AAGTGGATTG--CC---GT-----TTTTC-C--T-C-TTT-G-GT--TT-TTAATGT-TTCCGG--AAC-GGGTGGCG-AT--ACACTCTAAATTGTGGTGTTTGTTACCTC-TAA---CTTTGTG-TT-TTTAAT-TTC-CGGAACGCG-CGATAAC-TCTA-AA-TTTGAATAGTGC---ACAAT---AT-GGC--TG-ACG-ATGA-AGAT--A-T-C-TC---CC---CA-----TATT-CAG-GA--G
gi|10                         :   GCCAAATA-A-ACA--TTGAAATT--G-------C-------CGTTCCA---G-GC--C---CG-CGCGCA-TC-TGG-T-TT-T-G-A-G---A--TTG-C-C--AC-A-T--TG----CCG--ATTTT-AT-CG-A---T--TA-A--T---TA--AAA--TAAAA---AAGTTCGG----T---AA-TG-CGC-T---TA--C---GT-ATCTAGGA---A-A--AAATATAAG--CC----G-A--T-TCAT-T-TTT--GAATC-T-T-TGT-G--AC-T-TCCG--A-T-CACAGGCC-AGTA-AAG-G-TA-TATA----ACTTCCT-AC----A-TG-TA----C-AAA--AATTCTGGAAACT-GTG-TTCCGTATTGATTAT-T--AC----G---T-CCAAATAGT--CGTCTGCAA-T-TCG-GC----------------------------TG-CA-A-TC-C-TTCACTA-----------TCGGATCTA-GTTC-GATT-TT---------G--ACCG-GTCACTATTACC-----C------------CATATT-TGAC--T-TCATATGAT-TTA----G-TGAT-T-TCAG-CGTAT--A-C----G--GTC-GCCGG-----ACCAT-T-TGC-CAAAAT----C-G---TACGCT-AAA-TT-ACG-T--A----A-TGAATAAA-----T-----AA-GG-TA-TG-A-CTT
gi|9                          :   GCCAAATA-A-A----TTGAAATT--G-------CCGTTC--T----CA---G-GA-CC---CG-CGCGCAATC-TGGTT-CT-T-GGA-G---A--TTG-C-C--AC-A-T--TG----CCG--ATTTT-AT-CG-AGTTT---A-A--T---TA--AAA--TTAAA---AAGTTCGG----T---A--A--TGCCT---TA--C---GT-ATCTAGGA---A-A--AAATATAAG-CCG----ACA--T-TCAT-T-TT---GAATC-TGT-TGT-G--AC-T-TCCG--A-T-CACAGGCC-AGTA-AAAGG-TA-TATA-A--ACTTCCT-AC----A-TG-TA-CAAA-AAATTCAT----GAACT--GTG-TTCCGTATTGATTAT-T--ACC---G---T-CCAAATAGT--CGTCTGC-A-T-TCG-GC----------------------------TG-CA-ATTC-T-TTCC-TA-----------TCGGATCTAGTTCC-GATT-TT---------G--ACCAGGTGCACTAATTAC----C------------CATATT-TGAC--T-TCATATGAT-TTA----G-TGAT-T-TCAG-CG-A---A-C----G--GTC-GCCGG-----ACCA--T-TGACCAAAAT----C-G---T-CGCT-AAA-TT-ACG-T--A----A-TGAATAAA-----T-----AA-GG-TA-TG-A-CTT
gi|15                         :      AAACA-A-A-A--ATGAAAAT--A-------CCATTC--T----TA---G-GTTG-----G-CACACA-AT-CA--T-TT-T-G-A-G------TGG-C-T--GC-A-T--TG----C-GGGACTTT-AT-TG-AAATT--TC-A--T---GA--AAT--TAAAA-----ATT-CG----T---AA-TG-TGC-T---AAA-T---GT-ATCTGGGGGGGA-A--AAA-GTAAAATAT----GCA--T-TCAT-T-CT---
gi|12                         :       AATA-AGA-A--TTGAAATT--A-------CGTTTC--T----CA---G-GC------CG-CGCGCA-TC-TG--TATT-C-G-ATG---G--TTG-C-CC-GC-A-T---G----C-C--ATTTT-AT-CGGAATTTATTC-A--A---TA--AAA--TAAAA---AAGTT-GG----T---AA-TG-CGC-T---TAGTC---GT-ATCTGGGA---A-A--AAA-ATAAA-TCC----GCA--TCTCAT-TATT---GAATC-T-T-TGT-GCGAC-TCTCCGAGA-T-CAAGGGCC-AGTA-AA--GGTA-TATA----ACTTCCT-AC----AGTG-TA-T--C-AAATTAA-----GAAATTG-TGTTCCTAT-TAAA-TATTC--A-----GG--T-CCAGAAAAA--TCTCTGC-A---TGG-GCAT--GATCAT--GCC-T-G--ACTTCGGTG-CA-A-TC-TGTTCA-TA-----------TCGGAGCTACTCAC-GATT-TT---------G--ACCGTG----------------C------------CATA-T-TGACTGA-TCA-ATG-T-CTA----G-TGAT-T-TCAG-CG-AT--G-C----CTTGTC-GCC-T-----
gi|18                         :                                                                                                                                       aggc-AATTT--TC-A--A---TA--AAA--TAAAAG--TTGTT-AA----TTAAA--TG-TGC-TAATTA--T---GT-ATCTGGGA---AGA--AAA-ATAAA-TCT----GCA--T-TCAT-T-CT---GAAT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 AT-T-TT---GGATA-T-T-TGT-G--AC----CTGA-A-T-CACAGGTC-AGTA-AA----TG-TA--------TTCCT-AC----t
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTACTTTCCGATT-TTTGTACACAAG--GCCAAGCTAATTGC--------C------------CATA-T-TGAC--A-TC--ATG-TGCTA----G-TGA--TATCAG-CG-AT--G-CAA--A--GTCGGCC-T-----ACCGACT-TGA-AAAAAT----C-G---T-TGCTGAAA-TT-ACG-A--T----ATTG-----A-----T-----AA-AG-TA-TGCA-C-TT-AGTCAAACT---AAATCT---GA--TATACCGCC-G--AATT-TGC-TTGGTCGA-C-CA-TATT--ATTG-T--GTCAT--A----GATTG--CC---TTTCACGTTTTC-AGCC-C-TTTCGTGTCCTT-TTAA--T-TT-CGGTAAACGG---GGCG-AT--A-----------------------ACTTC-TAAT--CTTTGTGCTT-TTTAAT-TTC-CGGAACGGGCCGATAAC-TCTA-ACTTTTGAATAG-GCGC-ACA-----AT-TGG--TG-ACG-ATGA-A---GAA-T--ATCTCATC---CGT----GATT-CTGGGATGGCAACGCGATT-GTTTGTG-TG--AAAG-TA-TATC-GGATAAAACAGA-AGGACGGGTACATG--------CCTGACATT-AC--A-AACAAGCCAGTTTA---GT-TATATAGT-A---TATGGCAATAAAAATT-T-GTTAAAC--TATGT--AG-AACACTACGAC-GTTATTGCA-AGAT-A--AAGGTGTGAGGCC---TTA-A--ATCA---G--TG-ACAT-ACA-TGTACGCC-GAGTTCTTAA-GCATCGTT-TG-T---TG---A-AAA--TAACCTGCCTCCCAGTTGATGGTTTGGGCA--CCGGTGGAAGATAGTGGT-TATACGCATAT-CACC---CGT-AAATTT-AAAAA----AACCTCAACATCTTTTCTGGTTGGATTAGACATA-GCAATCGTTATTTAATAAAAA-AAAT--TAAA-TGGATTAGTACCAGA--TAGA-GAA-T----GGTATAACAAAGGACTAcccatttcttcaactttgttttgtattagatctattagctcca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --T-TGA-ATAAATAATGC-G---T-TGCT-AAA-TTTACG-AA-T----A-TG-----A-----T-----A--GG-TA-TG-A-CTTT-TGTCAAACTTG-AAATCT---GA--TA-----GC----A--T-TGT-TTG-T-GC-CAT--T-TT--ATTG-TT-GC--T--A----GATTGG-CC---GT-----TTTCC-A--CGC-ATTGTTGT--TT-TTAAATT-TCCCGG--AAC-G---GGCG-AT--A-----------------------ACT-C-TAAAAACTTTGTG-TTCTTTAAT-TTC-CGGAACGGG-CGATAAC-TCTA-AA-TTTGAATA-TGC---ACAC----AT-GGC--TGAACG-AT---AGATG-A-T-C-TC---TC---CG------ATTGCAG-GA--GCAACGCG--T-G-TTGTGT----GAAG-TACTTAC-GGA-AAAAC--AGAG--------GACG-------CAC--TCTTT-ACATA-AACAGAGCA---TAT--ATATATAT-GA-A---T---AAAAT----ATT-TCGTTAAAC--TATGT--AG--AAACTGCGAC----A-CGCA-A-ATAA--AAGGT---A-GCCTAGTAAGA-CATCA---AGTTG-ACAT-ACATTGTGCG-C-GAG-TCTT-A-GCATCGGTTTGTT---TT---G-AAA--TA------------------------------------------AGTGGTCTATAC-CAGAC-TACC---CGT-AAT-TT-AAAAA----AAACCCAACA-CTGTTCTGGTT------GAT-CA-GC-A-CGTT-TTT----AAAA-AAAT--AAAA-TGGATCAGTACCATC---AGA--AAGT----GT---AAC-ACG-ACTAAAGGTATC-CGAACCCAGTTTCATGATTTCgcaag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T-G-AAATCT---GA--CA-----TC-G--A--T-AGT-CGGG--GA--GCA-T-TT--ATAG-T--GC--T-------GATTG--CC---GT-----TTTTA-A--T-C-TT-CGTTG--TT-TTGA--T-ATCCGG--AAT-G---GGCT-AT--A-----------------------A-TTC-AAA---ATTT
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                attgcaacaatcgataggTTT-TAAT--CTTCGTT-GT-TTTGAT-ATC-CGGAATGGG-CTATA-A-TTCA-AAATTTAATTAGCGT---ACA-----AT-GGC--CG-CCG-ACCC-AGG--AA-T-T-TC---TT---GGTGTCCCATT---------GTAACTCT-TT---CTGTTTTGTAAAAG-TA-CTA---GGGAAAAT-----G--------TAGG-------ACT---TCTT-A---A-AA---AACA---TATC-GTAGATACGGA-AACAT-T-----T----ATT-T-G-TAAACCATG--T--AG-AAA-----GAC-A-TA-GGCA-A-TT-A--CAGGT---AAGTCTA---A-A-TAGAA---AATTG-ACAT----------------GCTTTT--------GTTCTT-TGCATC---AGAGG--TAA------------------------TTA-----ATAG----TAGTGG--TATGC-CATAT-T--C---CAC-AT--CT-GATA-----AAAAC--ACA-----TCTGCTT------GATACA-
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Reference ( family-7567 )     :                                                              GGCCAAATA-A-A-ATTGAAATTACG-G--TT-CTCA---GG-C-CC--G-CGCGC--A-TC-C-G--T-TT-T-G-A-G---G--TT-GC-C--GC-A-T---T-GCCG-ATTTT-A-T-CG-AATTT--TC-----ANTA-A-A--A-T-AA-AA-A----G-TT-GG-TAA-T-----G-C-GCT---TA--C---GT-ATCT---GGGAA-A--AAA-AT-AAATC----C---GCA--T-TCA-T-T-TT---GAATC-T-T-TGTG--AC-T-TCCGA-A-T-CAAGGGCC-AGT-A-AA-G-GT-A-TA-T-A-ACTTCCT-AC----A-TG-TAC-CCAAATTAATGAAATT-G-TG-TT-CCGTATT-AA---TA-TC--A-----G---T-CCAAATAAA--CGTCTGC-A-C-TCG-GC--AT-G--A----T-A-GCC-TG--AC-TCGGT-GCA-A-TCT-TTC------------A-TA-TCGGAGCTACTTTCGATT-TTG--ACC-GG-----GT--------------C-----------CATA-T-TGAC--A-TCA-ATG-T-CTA----G-TGAT-TTCAGCG-AT--G-C----GGTC-GCC-T-----ACCG--T-TGA-AAAAAT----C-G---T-CGCT-AAA-TT-ACG-A--T----A-TG-----A-----T-----AA-GG-TA-TG-A-CTTT-AGTCAAACT-G-AAATCT---GA--TA-----CC-G--A--T-TGT-TTGGT-GAC-CA-T-TT--ATTG-T--GC--T--A----GATTG--CC--GT-----TTTTC-A--C-C-TTT---CGTGT--TT-TTAA--T-TTCCGG--AAC-G---GGCGAT--A-ACTTC-TAA---CTT----TGT-------------------G-TT-TTTAAT-TTC-CGGAACGGG-CGATA-ACTC-TA-AA-TTTGAATA-----GT-GC--A-C--A--AT-GGC--TG-ACG-ATGA--AGATGAA-T-CATC---TC---CGT----TATT-CAGGGA--GCAACGCG-TT--G-TTGTGTTGAAAG-TA-TTAC-G--GAGAAAA---CAAG----ANGAC-----CA--C-C-----TT---AC--A-AACAGAGCA-------TA--T-ATA-TATATGG-A-AT--AAAATATT-T-G-TAAACTATGTAGAAAACTACGAC-G-TA-TGCA-A-AT-A--AAGGT---AGGNCTA-TAA-A-CATCA---AGTTG-ACAT-ACA-TGTACG-C-GAGTTCTT-A-GCATC-GTT-TG-TTCGAAA--TAA------------------------GTA--CC-ATGG----TAGTGGTCTATAC-CATACTACC--CGTAA--TT--AA-----AANAACGCCAACA-CTTTTCTGGTT------GATACA-GCGA-CGTT-TTT----AAAA-AAAT--AAAA-TGGATCAGTACCAG-C-AGA----GAAGT-----GNCTAAC-ACGAACTAAAGGTATCGCGAACCCGNTTCCATGATTTC
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T-G-AAATCT---GA--CA-----TC-G--A--T-AGT-CGGG--GAG-CA-T-TT--ATAG-T--GC--T-------GATTG--CC--GT-----TTTTA-A--T-C-TT----CGTTG--TT-TTGA--T-ATCCGG--AAT-G---GGCTAT--A-A-TTC-AAA---ATT----T
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tggtgaccatcgatagtTTT-TAAT--CTT----CGT-------------------T-GT-TTTGAT-ATC-CGGAATGGG-CTATA-ATTC-AA-AA-TTTAATTA-----GC-GT--A-C--A--AT-GGC--CG-CCG-ACCC--AG--GAA-T-T-TC---TT---GGTGTCCCATT---------GTAACTCT-TTCTG-TTTTGT-AAAAG-TA-CTA-----GGGAAAA---T--GT---AGGAC-----T---T-C-----TT---A---A-AA---AACA-------TA--TCGTA-GATACGG-A-AA--CATTTATT-T-G-TAAACCATGTAGAAA-----GAC-A-TA-GGCA-A-TT-A--CAGGT---AAGTCTA---A-A-TAGAA---AATTG-ACAT-GCT-TTT--------GTTCTT-T-GCATC-A---------GAGG--TAA------------------------TTA-----ATAG----TAGTGGT--ATGC-CATATT--C--CACAT--CT--GAT----AAAAAC----ACA-----TCTGCTT------GATACA-aattagcgtacaatggccgccgacccaggaatttcttggtgtcccattgtaactctttctgttttgtaaaagtactagggaaaatgtaggacttcttaaaaaacatatcgtagatacggaaacatttatttgtaaaccatgtagaaagacataggcaattacaggtaagtctaaatagaaaattgacatgcttttgttctttgcatcagaggtaattaatagtagtggtatgccatattccacatctgataaaaacacatctgcttgatacacaggtaattaaggccaaacataatat
gi|12                         : tggtgaccatcgatagttgaaatctgacatcgatagtcggggagcatttatagtgctgattgccgtAATA-AGA-ATTGAAATTACG-T--TT-CTCA---GG-C-C---G-CGCGC--A-TC-T-G--TATT-C-G-ATG---G--TT-GC-CC-GC-A-T-----GCC--ATTTT-A-T-CGGAATTTATTC-----AATA-A-A--A-T-AA-AA-AA---G-TT-GG-TAA-T-----G-C-GCT---TAGTC---GT-ATCT---GGGAA-A--AAA-AT-AAATC----C---GCA--TCTCA-T-TATT---GAATC-T-T-TGTGCGAC-TCTCCGAGA-T-CAAGGGCC-AGT-A-AA-G-GT-A-TA-T-A-ACTTCCT-AC----AGTG-TA--TCAAATTAA-GAAATT-G-TG-TT-CC-TATTAAA---TATTC--AG----G---T-CCAGAAAAA--TCTCTGC-A---TGG-GC--AT-G--A----TCATGCC-TG--ACTTCGGT-GCA-A-TCTGTTC------------A-TA-TCGGAGCTACTCACGATT-TTG--ACC-GT-----G---------------C-----------CATA-T-TGACTGA-TCA-ATG-T-CTA----G-TGAT-TTCAGCG-AT--G-CCT--TGTC-GCC-T-----caggtaattaaggccaaacataatat
gi|13                         :                                                          aggcGGCCAAATA-A-A-ATTGAAATTACG-G--TT-CTCA---GG-C-CC--G-CGCGC--A-TC-T-G--T-TT-T-G-A-G---G--TT-GC-C--GC-A-T---T-GCCG-ATTTT-A-T-CG-AATTT--TC-----AATA-A-A--A-T-AA-AA-A----G-TT-GG-TAA-T-----G-C-GCT---TA--C---GT-ATCT---GGGAA-A--AAA-AT-AAATC----C---GCA--T-TCA-T-T-TT---GAATC-T-T-TGTG--AC-T-TCCGA-A-T-CAAGGGCC-AGT-A-AA-G-GT-A-TA-T-A-ACTTCCT-AC----A--G-TAC-CCAAATTAATGAA------------------T-AA---TA-TC--AG----G---T-CCAAATAAA--------------TCG-----------------------------C-TCGGT-GCA-A-TCT-TTC------------A-TA-TCGAAGC
gi|14                         :                                                             aGGCCAAATG-A-A-ATTGGAATTACA-G--CT-CTCA---GT-C-TC--A-TGTGC--A-TC-T-G--TGTT-TGG-A-A---G--TT-GC-A--ACAA-TTAAT-GTCA-ATTTC-A-T-CA-AA-TT--TC-----AATC-C-A--A-T-A
gi|15                         :                                                                 aAAACA-A-A-AATGAAAATACC-A--TT-CTTA---GG-T-TG--G-CACAC--A-AT-C-A--T-TT-T-G-A-G------TG-GC-T--GC-A-T---T-GCGGGACTTT-A-T-TG-AAATT--TC-----A-TG-A-A--A-T-TA-AA-A----A-TT-CG-TAA-T-----G-T-GCT---AAA-T---GT-ATCTGGGGGGGA-A--AAA-GTAAAATA----T---GCA--T-TCA-T-T-CT---ttagcaaaggagctttttgtaattatcgtaaattatttggaaaatggaattagaaggtgaaaatatttgaaactttgaca
gi|16                         :                                                              GGCCAAATA-A-A-ATT----TTACA-G--TT-CTCA---GA-A-TG--G-CACAT--A-TC-C-A--T-TT-T-G-A-G---G--TT-GC-C--GT-A-T---T-GTCA-ACTTC-A-T-TG-AAATT--TC-----AATG-A-A--A-T-AA-AT-A----G-AT-GG-TAA-T-----G-T-GCT---TA--C---GT-ATCT---CGAAG-A--AAA-A
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aA-T-T-TT---GGATA-T-T-TGTG--AC----CTGA-A-T-CACAGGTC-AGT-A-AA-T-GT-A----------TTCCT-AC-----------C-CC--ATTTCTTCAACT-T-TG-TT-TTGTATT-AGATCTA-TT--A-----GC--T-CCAa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                         -AATTT--TC-----AATA-A-A--A-T-AA-AA------G-TT-GT-TAA-TTAAATG-T-GCTAATTA--T---GT-ATCT---GGGAAGA--AAA-AT-AAATC----T---GCA--T-TCA-T-T-CT---GAAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T-G-AAATCT---GA--CA-----TC-G--A--T-AGT-T-GGT-GGG-CA-T-TT--ATTG-T--GC--C--G----GATTT--CC--GG-----TTTTt
gi|2                          :                                             attgcaacaatcgataggGCCAAATA-A-A-ATTGAAATTACG-G--TT--TCA---GGCC-CC--G-CGCGC--A-TCAT-G--T-TT-T-G-A-G---GGTTT-GC-C--GC-A-T---T-GCGG-A-TTT-A-TCCG-AATTT--TC-----AATA-AGA--A-T-AA-AA-A----G-TTGGG-TAA-T-----G-C-GC----TA--C---GA-TTCT---GGGAA-A--AA-----AAATC----C---GCAT-T-TCA-T-T-TTTTGAAATCTT-T-TGTG--AC----CCGA-A-TGCAAGGGCC-A-T-AGAA-GTGT-A-TATT-A-ACTT-CT-AC----A-TG-TAC-CCAAATTTATG-AACT-G-TG-TT-CCGTATT-AA---TA-TC--A-----GGTCT-CTAAATAAACTCGTCTGC-A-C-TC--GC--ATGG--A----T-ATGCCTTG--AC-TC-GT-GCAGA-TCT-TTC------------A-TA-TCGGAGCTACTTGCGATTATTG--ACC-GT-----GC--------------CGCTAATTGCCACATA-T-TGAC--A--CA-ATGTT-CTA----GTTGA--TTCAGCG-AT--GCC----AGTC-GCC-T-----ACCG--T-TGA-ACAAAT----C-G---T-TGCT-AAA-TT-ACG-AGTT----A-TG-----AT----T-----AA-GG-TATTG-A-C-TT-AGTC-AACT-GAAAATCT---GA--TA-----CC-G--A------T-TTGGT-GAC-CATT-TT--ATGG-T--GC--T--A----GATTGGTCC--GT-----TTTTCGA--C-C-TGT---CGTGT--TTCTTAA--T-TTCCGT--AAC-G---GGCGATTAA-ACCTCTTAA---CTT----TGT-------------------G-TT-TTTAAT-TTC-CGGAACGGG-CG-TA-ACTC-TA-AA--TTGAATA-----G--GC--A-C--A--AT-GGC--TG-ACG-ATGATGAGAT-AA-T-C-TC---TC---CG-----TATT-CA-GGA--GCAACGCG-TT--A-TTGTG-TGAAAG-TATTTACGG--GAAAAAA---CAAG----AGGGA-----CA--C-C-----TT---ACA-A-AACAGAGCA-------TA--T-ATA-TATATGG-ACAT--AAAATATT-T-G-AAAACTATGTAGAAA--CACGACAG-TA-TGCA-A-AT-A--AAGGT---AGGGCTA-TAA-A-CATTA---AGTTGAACAT-ACATTGTACG-CGGAGTTCTT-AGGCATC-GTG-TG-TTTGAAAATTAA------------------------GTAACCC-----------GTGGTCTATAC-CATACTACCAACGTAA--TT--GAAAACGAATAACGCCAACA-CTTTT-TGGTT------GATACA-GCGA-CG---TTT----AAAAGAAATGAAAAA-TGGATCA-TACCAG-C-AGA----GAAGT-----G--TAAC-ACGAACTAaattt
gi|20                         :                                                              GGCCAAATA-G-A-ATTGTAATTTCA-G--TT-CTCA---TG-C-CCATG-CACGCTCA-TC-C-A--T-TT-T-G-A-G---G--TT-GC-T--GC-A-T---T-GC
gi|3                          :                                                             aGGCCAAATA-A-A-ATTGAAATTAC---------TCA---GG-CGCC--G-CGCGC--A-TC-T-G--T-TT-T-G-A-G---G--TT-GC-C--GC-A-T---T-GC-G-ATTTT-A-T-CG-AATTT--TC-----ATTA-G-A--A-T-AA-AATA----G-TT-GG-TA--T-------C-GCT---TA--C---GT-ATCT---GGGAA-A--AAA-AT-AAATC----C---GCA--T-TCA-T-T-TT---GAATC-T-T-TGTG--AC-T-TCCGA-A-T-CAAGGGCC-AGT-A-AA---GT-A-TA-T-ATACTTCCT-AC----A-TG-TA--CCAAATTAATGAAATTGG-TGTTT-CCGT-TT-AA---TA-TC--A-----G---T-CCAAATAAA--CGTCTGC-A-C-TCG-GCATAT-G--A----TCATGCC-TG--AC-TCGGT-GCA-A-TCT-TTC------------A-TATTCGGAGCTACTTTCGATT-TTG--ACC-GA-----G---------------C-----------CATA-T-TGAC--A-TTA-ATG-T-CTA----G-TGA--TTCAGCG-AT--G-C----AGTC-GCC-T-----ACCA--T-TGA-AAAAAT----C-G---T-TGCT-AAA-TT-ACG-A--T----A-TG-----A-----T-----AA-GG-TA-TG-A-CTTT-AGTCAAACT-G-AAATCT---GA--TA-----CC-G--A--T-TGT-TTGGT-GACACA-T-TT--ATTG-T--GC--T--A----GATTG--CC--GT-----TTTTC-A--T-C-TTT---CGTGT--TT-TTAA--T-TTCCGG--AAC-G---GGCAAT--A-ACTTC-TAA---CTT----TGT-------------------G-TT-TTTAAT-TTC-CGGAACGGG-CGATA-CATC-TA-AATTTTGAATA-----GT-GCTGA-C--A--AT-GGC--TG-TCG-ATGA--AAGTGAA-T-CATC---TC---CGT----TATT-CAGAGA--GCAACGCG-TT--G-TTGTGTTGAAAG-TA-TTAC-G--GAGAAAA---CAAGC---ATGAC-----CA--C-C-----TT---AC--A-AACAGAGCA-------TA----ATA-TATATGG-A-ATTGATAATATT-T-G-TAAACTA--TAGAAAACTACGAC-G-TA-TGCA-A-AT-A--AAGGT---AGGCCTATTCA-A-CATCA---AGTTG-ACATAACA-TG-ACG-C-GAGTTTTT-A-GCATC-GTTCTG-TTTAAAA--TAA------------------------GTA--CCGATGG----TAGTGGTCTATAC-CATACTA-C--CGTAA--TT--AA-----AACAAGACCAACA-CTTTTCTGGTT------GATACA-GCGA-CGTT-TTT----AAAA-AAAT--AAAA-TGGATCAGTACCAG-CAAGA----GAAGT-----GG--AAC-ACGAACTAAAGGTATC-CCAACCCAGTTC--TGATTTCa
gi|4                          :                                                              GGCCAAATA-AGA-ATTGAAATTATGCG--TTACTCGATGGG-C-CC--GACGCAC----TC-T-G--T-TTAT-G-G-GATGG--TT-GCGT--GC-A-T---T-GCCG-ATCT--A-T-CG-AATTT--TC-----AATA-A-AGGA-T-AATAA-A----G-TT-GGCTAA-T-----G-CCACT---TA--C---GTCATCT---GGGAA-A--AAA-AT-AAATC----CCGTGCA--T-TCA-T-T-TTTA-GAGTC-T-T-TGTGG-AC-T-TCTGA-A-T-CACAGGCC-AGT-A-AAAG-GT-ACTA-T-A-ACTTCCT-AC----A-TGTTAC-CCAAATTCTTG-ACCT-G-TG-TC-CCGTATT-AAT--TA-TT--ATTTAGG---TGCCAAATAAAT-CGTCTGC-A-C-----GC--A----------------------------GT-GAA-A-TCT-TTTCATATAGATATGA-TA-TCGGAACCATTTTCGATT-TTG--ACCAGG-----GTTGCCCTGTAATTACC-----------CATA---GGAC--T-TCA-ATG-T-TTA----G-TGATCTTCAACG-AT--A-CTTATGGTC-GAC-TGAACCACCA--T-TG---CAAAT----T-GCGCT-CGCT-AAACTT-ACG-A--C------TG-----C-----TCACGCAA-GGTTA-TG-A-CTCT-TATCAAACT-G-AAATCGCAAGA---A-----CC-G--A--T-AGT-ATGGT-GAG-CATT-TT--ATTGTT--GC--TGGA----GATTG--CCAAGA-----TTTT---------TTTGTGCTTGT--TT-TTAA--TATTCCGG--AAC-G---GAC-AT--ATACTCA-TAA---CTT----TAT-------------------
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