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gi|1 : tagagaggactATTT--A--------------T--T------TCA-TAT--A------A--A--G-A-AAT-TA-C-----------AATAAAA-----AAA-A---------GC-TCGCA------C--ATTA-AATA--GCG-CTT----T-AGGGA-T-TGTA--AATAATCTAG-A----ACAT-CAG--GC------------ATAA------------------TTA-CT-A-A--TTTTTGCG--GATTCACATGAACTGCGTATT-TATAATGG-----AC---------ATTA--CGATTGGATACAAATA--AAAG----TATTTGAGGAAtgcgatggtgaaagcagaaattttgcgttttaacaagacgaagcgagtcgcagtttgtcttcgttaggataataaacttgctttcgcacagattcctcgtcgtaatttcatttaaattcttatcaatttatttcatataaagaaattacaataaaaaaaagctcgcacattaaatagcgctttagggattgtaaataatctagaacatcaggcataattactaatttttgcggattcacatgaactgcgtatttataatggacattacgattggatacaaataaaagtatttgaggaaa
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gi|12 : gtggatgatgtttcaattatgacaacaaaatacttctgtatatacgttcattgaatttgcatttatt-GAAAA-CGTTGAAGCTCGAAGCCCGTGGCT-T-CT-GCACAAAAGT-----T-TC----A-GCGAA--T--TG-TTATGACTGG-C-ATCGTCCAA-TTAGAACGTTA--A-GGGG-CGGAGCAAAATCACCACT-----C-----CG--GC-GTGG-GAAAA---------C---------G--ataagacaaatcataagttcttatc
gi|12 : agtcTC----T----CATTT--A--------------TTTT------TT--TTT--A-------TTA--G-A-AA------T--GC---------TTACTAAAG-----TTA-tatccatttcatttcttatcagttcaattctttctacatctactgacttctcatttatttttttttattagaaatgcttactaaagttag
gi|13 : agtcgaaaacgttgaagctcgaagcccgtggcttctgcacaaaagtttcagcgaattgttatgactggcatcgtccaattagaacgttaaggggcggagcaaaatcaccactccggcgtgggaaaacgtatccatttcatttcttatcagttcaattctttctacatctactgactCAA-TCAGGTTG-TA--G-GAGGC-GGATCAAGATCA----T-----CAGCCCTG--AC-GTGG-GAAAA---------CCAGT-----G--GTCGCCG-----TGGAA-GA--------------C---A---------------A-----TT----T----CATTC--AAT------------TCCT------TC--TAC--T-------TTA-------A------T-T-----------TTGTTAAAG-----TGA-C---------GT-T--AA------A--AGGA-AAAT--GCG-CTTACC-AAAGT-TT--TG--AA------AC-A----AAAT-AAT--AC------------ATg
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gi|16 : ccttctacggcatttgtttaaatatgtagtgtttactaatgacgttaaatactgtagatatatT--C---T---------------ACG-T-------T----CATTT-----------------TGTT------TC-------A------GTTA--G-T-AT------G-TGT---------TTACTAAAG-----TGA-C---------GT-T-G-G------A--ATGA-AAAT--GCA-CTTACCAACG-T-TT--TT--AA------AC-A----AAAT-AAT--AC------------ATAA------------------CAT-C--TA-TAATTTC-GCG--GATCC--------TGccccac
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Alignments
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lowQualScore : . . . . . . .... . . ..... . ...... . .. .. . . . . . . . .. .. .. . .................... . . ................................................................................................................... ....................... .... . .................... ................................. .. . . .. . ............................... . .. ............ .................. . . .. . . .. ........ . . ................ .. . . . .. ...... ...... . .................... .
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consensus : TTGT-GAAAA-CGTTGAAGTTCGAAGCGCG-GGCN-T-CT-GCAGAAAAGT-----T-TC----A-GCGAA--T--TG-TTTCGACTGG-CTATCGTCCAA-TTAGAACG-TA--G-GAGGCCGGAGCNAAATCA----T-----C-----CG--GC-GTGG-GAAAG---------C---------G--GTCGCCG-----TGGAA-GA--NTC-GTCGAT--C---A---------------ACG-TGTC----T----CATTT--A--------------TCTT------TC--TAC--A------ATTA--G-A-AA------T-TGC---------TTACTAAAG-----TTA-C---------GT-T-GAA------A--ATGA-AAAT--GCG-CTTACC-ANA-T-TG--TA--AA------AC-A----AAAT-CAT--GC------------ATAA------------------TAT-C--TA-TATTTTT-GCG--GATCC--------TGCGNATT-TATAGTGG-----AC---------ATTG--CGAT-TGGATANAGATA--AAAG----T-TTTGAGGAATTCAT----GGAAAT-AA----------------CTGNTC-CCCCCCCCCGC
Reference ( family-732 ) : TTGT-GAAAA-CGTTGAAGTTCGAAGCGCG-GGCN-T-CT-GCAGAAAAGT-----T-TC----A-GCGAA--T--TG-TTTCGACTGG-CTATCGTCCAA-TTAGAACG-TA--G-GAGGCCGGAGCNAAATCA----T-----C-----CG--GC-GTGG-GAAAG---------C---------G--GTCGCCG-----TGGAA-GA--NTC-GTCGAT--C---A---------------ACG-TGTC----T----CATTT--A--------------TCTT------TC--TAC--A------ATTA--G-A-AA------T-TGC---------TTACTAAAG-----TTA-C---------GT-T-GAA------A--ATGA-AAAT--GCG-CTTACC-ANA-T-TG--TA--AA------AC-A----AAAT-CAT--GC------------ATAA------------------TAT-C--TA-TATTTTT-GCG--GATCC--------TGCGNATT-TATAGTGG-----AC---------ATTG--CGAT-TGGATANAGATA--AAAG----T-TTTGAGGAATTCAT----GGAAAT-AA----------------CTGNTC-CCCCCCCCCGC
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gi|10 : tagagaggactatctgacagagaaaagtattatgtaaaaattggtttcgactggctattgtataatttagaacgttaggagtgcgatggtgaaagcagaaattttgcgttttaacaagacgaagcgagtcgcagtttgtcttcgttaggataataaacttgctttcgcacagattcctcgtcgtaatttcatttaaattcttatca------ATTA--GTATAA------T-TA-----------TACCTAAG-----TTAAC---------GT-T-GAATCAATAA--ATGA-AAATT-GTGGTTTACCTATG-T-TG--TATCAA------AC-A----AAATTCAT--GC------------ATAA------------------TATGC--TAATATTTTTTGCGGAGACTC--------TGCGTATTATAAAGTGGAATATACATTAAACTAATTA--CGAT-TGGATAAAGAGATTAAAGTTTAT-TTTGAGGAATTCATGCAGGGAAAT-AAGATTATGTTTTATTTTCTCCTC-CCCCCCCCCGCa
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gi|12 : agtcTC----T----CATTT--A--------------TTTT------TT--TTT--A-------TTA--G-A-AA------T--GC---------TTACTAAAG-----TTA-tatccatttcatttcttatcagttcaattctttctacatctactgacttctcatttatttttttttattagaaatgcttactaaagttag
gi|13 : agtcgaaaacgttgaagctcgaagcccgtggcttctgcacaaaagtttcagcgaattgttatgactggcatcgtccaattagaacgttaaggggcggagcaaaatcaccactccggcgtgggaaaacgtatccatttcatttcttatcagttcaattctttctacatctactgactCAA-TCAGGTTG-TA--G-GAGGC-GGATCAAGATCA----T-----CAGCCCTG--AC-GTGG-GAAAA---------CCAGT-----G--GTCGCCG-----TGGAA-GA--------------C---A---------------A-----TT----T----CATTC--AAT------------TCCT------TC--TAC--T-------TTA-------A------T-T-----------TTGTTAAAG-----TGA-C---------GT-T--AA------A--AGGA-AAAT--GCG-CTTACC-AAAGT-TT--TG--AA------AC-A----AAAT-AAT--AC------------ATg
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gi|18 : AGT-----T-TC----A-GCGAA--TATTG-TTTTGACTGA-CTATTGTCCAA-TCAGAACG-TA--G-
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Reference ( family-732 ) : TTGT-GAAAA-CGTTGAAGTTCGAAGCGCG-GGCAATCTG-CAGA--AAAGT-----T-TC----A-GCGAA--T--TG-TTTCGACTGG-CTATCGTCCAA-TTAGAACG-TA--G-GAGGCCGGAGCNAAATCATCAG-C-CC-G--GCGTGGGA-AAG---------C---------G--GTCGCCG-----TGGAA-GA--NTC-GTCGA---T--CA---------------ACG-TGTC----T----CATTT--A--------------TCTT------TC--TAC--A------ATTA--G-A-AA------T-TGC---------TTACTAAAG-----TTA-C---------GT-T-GAA------A--ATGA-AAAT--GCG-CTTACC--AANG-T--TGTA--AA------AC-AAAAT-CAT--GC------------ATAA------------------TAT-C--T-ATA-TTTTTGCG--GATCC--------TGCGNATT-TATAGTGG-----AC---------ATTG--CGAT-TGGATANAGATA--AAAG----T-TTTGAGGAATTCAT-----GAAATAA----------------CTGTTC-CCCCCCCCCGC
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