lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2222222222 555555555555555555555555 111 11
lowQualScore : 6 3 6 6 4 55 4 1 0 99 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6666666666 6 5 3 1 555 222222222222222222222222 7 555 0 5 66 999999 0
lowQualScore : . . . . . .. . . . .. ................................................................ .......... . . . . ... ........................ . ... . . .. ...... .
lowQualScore : 4 2 4 7 0 55 0 8 3 88 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 8888888888 7 4 3 3 888 222222222222222222222222 1 999 2 0 00 222222 2
consensus : NCCTTTCTACACTTGCAGACGGTTTCGCCC-CA--T-TTTAAATTCGCCCA-GACACAG--A-CG-GT-TANAA---AAG-TA-AGA-NAACG-------ATT--------T-AA-----TTTGCCC---AATC---T-TAAAT-TCGCCCACT---GACAA---CAA-G-G-CGAAAGGG-GNA-AAATAAAAC-GGGGC-AAA-TATT-TTC--CTGTATAC
Reference ( gi|5 ) : ACCTTTCTACACTTGCAAACAGTTATGCCC-CA--T-TTAAAATTTGCCCA-AACACAG--A-CA-GT-TATAA---AAATTACAGGTCAATG-------ATTT-------TGAA-----TTTGCCC---CATG---T-TGAAT-TTGCCCACT---GACAA---CAA-G-G-TGAAAGGGTATATAAATGAAGCAGGGGC-AAT-TATT-TCC--CTGTATAC
gi|1 : CCATTCTACATTTACATATGGTTTGGCCC-CA--T-TTTAAATT
gi|6 : ttgtacacatggttacttttgctctgtgtcatttctCCTTTTTACATTTGTACATGGCTTCACCA-CA--T-TTTAATTTTGCTAA-AACAGAGTGG-C--GT-TAAAA---GAG--AGAGGAGAAAG-------------------GAAACATTTTTGCCC---AGTC---T-TAAAT-T-GCCCACT---GACAA---CAA-GAG-CAAAAGAGT-TTTGAATAA---AAGGCC-AATATATT---C--CTGcatcatgacatgtatgcattcaaaaaaaacccagaaaatcttaaatttgctcactgacaataagggtgaaaggggccaaaataaaacagtgacaaatgttttcctgtatgc
gi|19 : ttttgCCCTTCTACACTTGCAGAT-GTTTTGCCC-CA--T-TTTAAATTTGCCCA-GACA
gi|8 : tCCTTTATGCACTTCCAGATGGTTTCACCCTCA--T-TTTAGAT---------ACATGT--A-TG-TT-TAGAG---AAG---CA----AAGA-------ATTC-------T--------TTTGCCT---AGTT---T-TAAAG-TCGCCCACT---GGCAA---TAT-G-G--GCAAG--------AATAAAGC--GGGC-AAC-TATT-TTT--CTGTAT
gi|3 : ctgCCTTGCAACA-TTA-AAACAGTT-TATCC-AAACT-TTAAAATTTGCCAA-GACACA---A-TG-GTGTTTAAGAGAAGATA---ATCAGCG-------ACTGGGCAAAATGAA-----TTTACTC---AGTC---TGTCAAT-CTGCCCACT---CACAA-----------TG--AGGGCGAATAATTAAAAT-GGGGCAAAA-TATG-TAC--CTTTATAC
gi|18 : tttccCCCTTCTACAATTGCTAACGGTTTTGATC-CG--T-TTTGAACTCGCCCA-GACAag
gi|17 : ggCTTTCTATACTTGCTGACGATTTTGCCC-CG--T-TTAAAATTCGCCCA-GACA
gi|2 : tttgaTTCTACAATTGTAAACGGTTTCACCC-CA--T-TTTGAATTTGCTCA-GACA-AG--AGAA-AT-TACGA---ATTTTAAAGATTATTGTCCTGATATTT-------TTAA-----ATTGCCT---AACT---T-TAAAT-TCTCCCATT---GACAA---TGA-G-G-GCAATAGGAGCAAAAATAAAACTGAGAT-GAA-AATT-TTC--CTATATGC
gi|4 : TACATTTGCAGACAGATTTGCTT-TA--T-TTTAAATTCTTCCA-GATACAT--T-TGTGT-TAGAA-------TACAG--C-------------------------------TTCGCTC---AGTC---T-TAAATGTCGTCCACT---GACAA---CAA-G-GCCGAGAGGA-GGAAAAATAAAACCAAGGC-AAA-TATTGTCCAGCTGTagtaact
gi|11 : caggcttctttttgtccttctacatgATGCCC-TA--TATTTGAATTCACCCTTGACATAG--------T-TATAA---GAG----AGA-AAACG-------AT------------------TTCGCCC---AATC---T-TAAAT-TCGCTCACT---GACGA---TGA-GAG-TG
gi|12 : gccttttttgcctctcttatac-------ATTT-------TAAA-----GTTGCCC----ATT---TCTGAAT-TTGCCCATTCAGGATGAGGGCAA-A-G-TAAAAGA------AAATAAAACAATTGT-AAC-AATT-TTC--CATTATA
gi|19 : -----TTTGCCC---CATT---T-TAAAT-TTGCCCA-----GACAtgatagtaacaccatcaactata
gi|15 : tcccttctacacttgcagatgt-----TTTGCCCAGTCTTA---T-TAAAT-TTGCCCACT---GA
gi|7 : gtTTGTCG---CATAGATT-TAAAT-ACGCCCACT---GACAG---CAATG-G-CAATTGGGGATA------AAAC-GGGGC-GAA-CATT-TTT--CTACATAggaggagccaaaaaaaaaaccacagagaaaatattctctggtatac
gi|1 : tttattttacccttgtgaacggtctggatccaggtacatattaaaatatgttataagaaagaaatccctgtcccgtataATC---T-TAAAT-TTGCTCACT---GACAA---TAAGG-G-TGAAAGGGGCCA-AAATAAAACAGTGAC-AAA-TGTT-TTC--CTGTATGCaagt
gi|16 : ttgtacacatggttacttttgctctgtgtcatttctccattctacatttacatatggtttggccccattttaaattcatcatgacatgtatgcattcaaaaaaaacccagaaaATC---T-TAAAT-TTGCCCACT---GACTA---TAA-A-G-
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): TTTTGCCTTTCAACCCTTGTAGATGGTTTCACTGTGTTTTAAATTTTTGTTAAAGGAGAACAAACAGTTTCAACTCGGTCTTAAATTCACCCACTGACAAGGGCAAAAATCAAAAGGGGTGAACTTTTTTTTTTAT
Unaligned ( gi|10 ): TTTTGCGTTTCTTCACTTGTAATAAGTTCGGTCCGTTTTCAAATTGCCCATACATTATACTGTAATAGGAGAAAAAACAGTTTCGCCCAGTCTTATAAATTTCCCCAGTGATGAAGCCGAAAATA
Unaligned ( gi|13 ): TTCAAAAGAGAGATAAAGGGAAAACAGTTTTTGCCCAGTCTTAGACTGACCCACCAAGGGCAAAATGGGCGAAAATAAAACTGGGCAAATATTTCCTACAAACAGTAC
Unaligned ( gi|14 ): ATTTTCGCCTTTCTACACGCGCAGTAGCTTTCGGCATGCTTTAAATTCGCACAGACAAGAGATAGAAGAGAAGTTAATATCGCCTAGTCCTAAATCCGCCCATTGACG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111 3333333333 1111
lowQualScore : 2 0 3 3 3 0 3 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 66666 2 555 2 1 22222 3 3 5555555555 2222 3 3
lowQualScore : . . . . . . . ........................................................................ . ..... . ... . . ..... . . .......... .... . .
lowQualScore : 3 8 1 1 1 2 1 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 9 88888 9 000 9 1 77777 1 3 5555555555 6666 6 6
consensus : NCCTTTCTACACTTGCAGACGGTTTCGCCC-CGT-TTTAAA-TTCGCCCA-GACACAGATG-G--T-TANAA-------GAG----AAGANAA----C------GAT----T--------T---AT-TCGCCCA----GTCT-TA---AAT-TCGCCCACTGACAAT-AA-G-G-CGAAAGG-G-G---A-AAATAAAA-C-GG-GGC-GAATATTTTCCTGTATAC
Reference ( family-7173 ) : NCCTTTCTACACTTGCAGACGGTTTCGCCC-CAT-TTTAAA-TTCGCCCA-GACACAGACG-G--T-TANAA-------AAGT---AAGANAA----C------GAT----T--------T--AAT-TTGCCCA----ATCT-TA---AAT-TCGCCCACTGACAAC-AA-G-G-CGAAAGG-G-G-N-A-AAATAAAA-C-GG-GGC-AAATATTTTCCTGTATAC
gi|1 : CCATTCTACATTTACATATGGTTTGGCCC-CAT-TTTAAA-TTCATCAT-GACATGTATGCA--T-T-CAA-------AA--------AAAA----C---------------------------------CCAGAAAATCT-TA---AAT-TTGCTCACTGACAAT-AAGG-G-TGAAAGG-G-GCC-A-AAATAAAA-C-AGTGAC-AAATGTTTTCCTGTATGC
gi|11 : ttgtacacatggttacttttgctctgtgtcatttctGCCC-TATATTTGAA-TTCACCCTTGACATAG-------T-TATAA-------GAG-----AGAAAA----C------GAT----T--------T-------CGCCCA----ATCT-TA---AAT-TCGCTCACTGACGAT-GA-G-
gi|13 : gccttttttgcctctcttatacatATAA-------AGG------GAAAA----C------AGT----T--------T------TTGCCCA----GTCT-TA---GAC-TGACCCAC---CAA---G-G-G-CAAAATG-G-G-CGA-AAATAAAA-C-TG-GGC-AAATATTTCCagtg
gi|14 : ttcaaaagagagCCTTTCTACACGCGCAGTAGCTTTCGGCA-TGC-TTTAAA-TTCGCACA-GACA-AGA---G--A-TAGAA-------GAG----AAG----------------------T--------T--AATATCGCCTA----GTCC-TA---AAT-CCGCCCATTGACtacaaacagtac
gi|15 : attttcgT-TTGCCCA----GTCT-TATTAAAT-TTGCCCACTGAGGAG-GA-G-C-CAAAA---------A-AAAAACCA-C-AG-AGA-AAATATTCTCTGGTATACg
gi|16 : gt-------AAGG---AAGAAAAA---C------ACT----T--------T--CAT-T----CA----ATCT-TA---AAT-TTGCCCACTGACTAT-AA-A-G-
gi|17 : atatggatCTTTCTATACTTGCTGACGATTTTGCCC-CGT-TTAAAA-TTCGCCCA-GACAgt
gi|18 : tttgaCCCTTCTACAATTGCTAACGGTTTTGATC-CGT-TTTGAA-CTCGCCCA-GACA
gi|19 : ggCCCTTCTACACTTGCAGATG-TTTTGCCC-CAT-TTTAAA-TTTGCCCA-GACA
gi|2 : tTTCTACAATTGTAAACGGTTTCACCC-CAT-TTTGAA-TTTGCTCA-GACA-AGA-G-AAAT-TACGA-------ATTTTA-AAGATTA----TTGTCCTGATATTTT--------T--AAA-TTGCCTA----ACTT-TA---AAT-TCTCCCATTGACAATGAG-G-G-CAATAGG-A-GCA-A-AAATAAAA-CTGA-GAT-GAAAATTTTCCTATATGC
gi|3 : CCTTGCAACA-TTA-AAACAGTTTATCCA-AAC-TTTAAAATTTGCCAA-GACACA-ATG-G--TGTTTAA-------GAG----AAGATAATCAGC------GAC----TGGGCAAAATG-AAT-TTACTCA----GTCTGTC---AAT-CTGCCCACTCACAATGAG-G-G-CGAA----------T-AATTAAAA-T-GG-GGCAAAATATGTACCTTTATACagtaact
gi|4 : tttccTACATTTGCAGACAGATTTGCTT-TAT-TTTAAA-TTCTTCCA-GATACATTTGTG--T-TAGAA----------T---A---CAG----C---------------------------T-TCGCTCA----GTCT-TA---AATGTCGTCCACTGACAAC-AA-G-GCCGAGAGGAG-G-A-A-AAATAAAACC-AA-GGC-AAATATTGTCCag
gi|5 : caggcttctttttgtccttctacatgCCTTTCTACACTTGCAAACAGTTATGCCC-CAT-TTAAAA-TTTGCCCA-AACACAGACA-G--T-TATAA-------AAATTACAGGTCAA----T------GAT----T--------TTGAAT-TTGCCCC----ATGT-TG---AAT-TTGCCCACTGACAAC-AA-G-G-TGAAAGG-GTA-T-ATAAATGAAG-CAGG-GGC-AATTATTTCCCTGTATACagctgt
gi|6 : aCCTTTTTACATTTGTACATGGCTTCACCA-CAT-TTTAAT-TTTGCTAA-AACAGAGTGGCG--T-TAAAAGAGAGAGGAGA---AAGGAAA----C-------AT----T-------------T-TTGCCCA----GTCT-TA---AAT-T-GCCCACTGACAAC-AA-GAG-CAAAAGA-GTT-T-T-GAATAAAA------GGC-CAATATATTCCTG
gi|7 : ttttgT-TA---AAT-ACGCCCACTGACAGC-AATG-G-CAATTGG-G-G-------ATAAAA-C-GG-GGC-GAACATTTTTCTACATA
gi|8 : tttattttacccttgtgaacggtctggatccaggtacatattaaaatatgttataagaaagaaatccctgtcccgtatattgtcgcatagatCCTTTATGCACTTCCAGATGGTTTCACCCTCAT-TTTAGA-T---------ACATGTATG-T--T-TAGAG-------AAGC---AA-AGAA----T--------T----C--------T----T-TTGCCTA----GTTT-TA---AAG-TCGCCCACTGGCAAT-AT-G-G--GCAAG-----------AATAAAG-C--G-GGC-AACTATTTTTCTGTATaagt
gi|9 : ctgCCTTTCAACCCTTGTAGATGGTTTCACTG-TGT-TTTAAA-TTTTT---------------G--T-TAAAG-------GAG----AACA-AA----C------AGT----T--------T--CA----ACTCG----GTCT-TA---AAT-TCACCCACTGAC--------------AAGG-G-C-A-A-AAATCAAA-A-GG-GGT-GAACTTTTTTTTTTAT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): TTTTGCGTTTCTTCACTTGTAATAAGTTCGGTCCGTTTTCAAATTGCCCATACATTATACTGTAATAGGAGAAAAAACAGTTTCGCCCAGTCTTATAAATTTCCCCAGTGATGAAGCCGAAAATA
Unaligned ( gi|12 ): ATTTTAAAGTTGCCCATTTCTGAATTTGCCCATTCAGGATGAGGGCAAAGTAAAAGAAAATAAAACAATTGTAACAATTTTCCATTATATGATAGTAACACCATCAACTATA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 444444444444444444 1111
lowQualScore : 2 0 3 2 2 2 2 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 555 5555 55 444 2 1 88 5 2 333 111111111111111111 1111 3 66
lowQualScore : . . . . . . . .......................................................................................... ... .... .. ... . . .. . . ... .................. .... . ..
lowQualScore : 3 1 1 9 9 2 9 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 3333 99 444 5 7 44 3 7 000 666666666666666666 0000 6 11
consensus : NCCTTTCTACACTTGCAGACGGTTTCGCCC-CGT-TTT-AAATTCGCCCA-GACA-CAGATG-G--T-TANAAG----AG----A--------A-------GAAAA----C------G----AT----T--------T---A--TT--CGCCCAG----TCT--TA---AAT-TCGCCCACTGACGAT-AA-G-G-CGAAA-G---GG----G--A---AAATAAAA-C-GG-GGC-GAATATTTTCCTGTATAC
Reference ( family-7173 ) : NCCTTTCTACACTTGCAGACGGTTTCGCCC-CGT-TTT-AAATTCGCCCA-GACA-CAGATG-G--T-TANAAG----AG----A--------A-------GANAA----C------G----AT----T--------T---A--TT--CGCCCAG----TCT--TA---AAT-TCGCCCACTGACAAT-AA-G-G-CGAAA-G---GG----G--A---AAATAAAA-C-GG-GGC-GAATATTTTCCTGTATAC
gi|1 : CCATTCTACATTTACATATGGTTTGGCCC-CAT-TTT-AAATTCATCAT-GACA-TGTATGCA--T-TCAAAA----AA----A--------A--------------------------------------------------------CCCAGAAAATCT--TA---AAT-TTGCTCACTGACAAT-AAGG-G-TGAAA-G---GG----GCCA---AAATAAAA-C-AGTGAC-AAATGTTTTCCTGTATGC
gi|10 : ttgtacacatggttacttttgctctgtgtcatttctTTTCTTCACTTGTA-ATAAGTTCGGTC-CGT-TTTCAAATT-GCCCA-TACATTATACT-G--T-AATAGG----AG----A--------A--------AAAA----C------A----GT--------------------TT--CGCCCAG----TCTTATA---AAT-TTCCCCAGTGATG---AA-G-C-CGAAA-
gi|11 : ttttgcgGCCC-TATATTT-GAATTCACCCTTGACA-TAG-------T-TATAAG----AG----A----------------GAAAA----C------G----AT----T--------T----------CGCCCAA----TCT--TA---AAT-TCGCTCACTGACGAT-GA-G-ata
gi|12 : gccttttttgcctctcttatacatT--TGCCCAT----TTC--TG---AAT-TTGCCCATTCAGGAT-GA-G-G-GCAAA-GTAAAA----G--A---AAATAAAA-C-agtg
gi|13 : attttaaag--T-CAAAAG----AG----A--------GATAAAGGGAAAA----C------A----GT----T--------T-------T--TGCCCAG----TCT--TA---GAC-TGACCCAC---CAA---G-G-G-CAAAATG---GGC---G--A---AAATAAAA-C-TG-GGC-AAATATTTCCaattgtaacaattttccattatatgatagtaacaccatcaactata
gi|14 : tCCTTTCTACACGCGCAGTAGCTTTCGGCA-TGC-TTT-AAATTCGCACA-GACA--AGA---G--A-TAGAAG----AG----A--------A-------GTTAA-------------------------------T---A---T--CGCCTAG----TCC--TA---AAT-CCGCCCATTGACtacaaacagtac
gi|15 : attttcg--TT--TGCCCAG----TCT--TATTAAAT-TTGCCCACTGAGGAG-GA-G-C-CAAAA--------------A---AAAAACCA-C-AG-AGA-AAATATTCTCTGGTATACg
gi|16 : gtATG-G-----ATAAG-----G----A--------A-------GAAAA----A------C----AC----T--------T-------T--CATTCAA----TCT--TA---AAT-TTGCCCACTGACTAT-AA-A-G-
gi|17 : atCTTTCTATACTTGCTGACGATTTTGCCC-CGT-TTA-AAATTCGCCCA-GACA-gt
gi|18 : tttgaCCCTTCTACAATTGCTAACGGTTTTGATC-CGT-TTT-GAACTCGCCCA-GACA-
gi|19 : ggCCCTTCTACACTTGCAGATG-TTTTGCCC-CAT-TTT-AAATTTGCCCA-GACA-
gi|2 : tTTCTACAATTGTAAACGGTTTCACCC-CAT-TTT-GAATTTGCTCA-GACA--AGA-G-AAAT-TACGAATTTTA-----A--------A-------GATTA----TTGTCCTG----ATATTTT--------T---AAATT---GCCTAA----CTT--TA---AAT-TCTCCCATTGACAATGAG-G-G-CAATA-G---GA----GCAA---AAATAAAA-CTGA-GAT-GAAAATTTTCCTATATGC
gi|3 : T-TTA-AAATTTGCCAA-GACA-CA-ATG-G--TGTTTAAG----AG----A--------A-------GATAATCAGC------G----AC----TGGGCAAAATGA-A--TT--TACTCAG----TCTG-TC---AAT-CTGCCCACTCACAATGAG-G-G-CGAA---------------T---AATTAAAA-T-GG-GGCAAAATATGTACCTTTATACagtaact
gi|4 : tttccccttgcaacattaaaacagtttatccaaacTACATTTGCAGACAGATTTGCTT-TAT-TTT-AAATTCTTCCA-GATA-CATTTGTG--T-TA---------G----A--------A-------TACAG----C---------------------------------TT--CGCTCAG----TCT--TA---AATGTCGTCCACTGACAAC-AA-G-GCCGAGA-GGA-GG----A--A---AAATAAAACC-AA-GGC-AAATATTGTCCag
gi|5 : caggcttctttttgtccttctacatgCCTTTCTACACTTGCAAACAGTTATGCCC-CAT-TTA-AAATTTGCCCA-AACA-CAGACA-G--T-TATAAA----AATTACA--------G-------GTCAA----T------G----AT----T--------TTGAA--TT--TGCCCCA----TGT--TG---AAT-TTGCCCACTGACAAC-AA-G-G-TGAAA-G---GG----T--ATATAAATGAAG-CAGG-GGC-AATTATTTCCCTGTATACagctgt
gi|6 : aCCTTTTTACATTTGTACATGGCTTCACCA-CAT-TTT-AATTTTGCTAA-AACA-GAG-TG-GCGT-TAAAAG----AG----AGAGGAGAAA-------GGAAA----C-----------AT----T--------T-------T--TGCCCAG----TCT--TA---AAT-T-GCCCACTGACAAC-AA-GAG-CAAAA-G---AGTTTTG-------AATAAAA------GGC-CAATATATTCCTG
gi|7 : ttttg-G--T-TATAAG----A-----A--------A-------GAAAT----CCCT---GTCCCGT----A--------T---A--TTGTCGCATAG----ATT--TA---AAT-ACGCCCACTGACAGC-AATG-G-CAATT-G---GG----G--A------TAAAA-C-GG-GGC-GAACATTTTTCTACATA
gi|8 : tttattttacccttgtgaacggtctggatccaggtacatattaaaatatCCTTTATGCACTTCCAGATGGTTTCACCCTCAT-TTT-AGAT---------ACA-TGTATG-T--T-TA---G----AG----A--------A-------GCAAA----G------A----AT----T--------C---T--TT--TGCCTAG----TTT--TA---AAG-TCGCCCACTGGCAAT-AT-G-G--GCAA-G-----------------AATAAAG-C--G-GGC-AACTATTTTTCTGTATaagt
gi|9 : ctgCCTTTCAACCCTTGTAGATGGTTTCACTG-TGT-TTT-AAATTT---------------TT-G--T-TAAAGG----AG----A--------A-------CA-AA----C------A----GT----T--------TCA-A--CT--CG----G----TCT--TA---AAT-TCACCCACTGACA---AG-G-G-C---------------A--A---AAATCAAA-A-GG-GGT-GAACTTTTTTTTTTAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3333333333333333 1111
lowQualScore : 2 0 3 2 2 2 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 55 444 2 1 9999 5 2 33 3 9999999999999999 1111 3 66
lowQualScore : . . . . . . . .......................................................................................... .. ... . . .... . . .. . ................ .... . ..
lowQualScore : 3 1 1 9 9 2 9 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 99 444 5 7 4444 3 7 00 1 3333333333333333 0000 6 11
consensus : NCCTTTCTACACTTGCAGACGGTTTCGCCC-CGT-TTT-AAATTCGCCCA-GACA-CAGATG-G--T-T-ANAAGAG----A--------A-------GAAAA----C---G----ATT--------T---AT-T--C-------GCCCAGTCT--TA---AAT-TCGCCCACTGACGAT-AA-G-G-CGAAA-G---GG----G--A---AAATAAAA-C-GG-GGC-GAATATTTTCCTGTATAC
Reference ( family-7173 ) : NCCTTTCTACACTTGCAGACGGTTTCGCCC-CGT-TTT-AAATTCGCCCA-GACA-CAGATG-G--T-T-ANAAGAG----A--------A-------GAAAA----C---G----ATT--------T---AT-T--C-------GCCCAGTCT--TA---AAT-TCGCCCACTGACGAT-AA-G-G-CGAAA-G---GG----G--A---AAATAAAA-C-GG-GGC-GAATATTTTCCTGTATAC
gi|1 : CCATTCTACATTTACATATGGTTTGGCCC-CAT-TTT-AAATTCATCAT-GACA-TGTATGCA--T-TCAAAAAAA----ACCC-----A-------GAAAA------------------------------------------------TCT--TA---AAT-TTGCTCACTGACAAT-AAGG-G-TGAAA-G---GG----GCCA---AAATAAAA-C-AGTGAC-AAATGTTTTCCTGTATGC
gi|10 : ttgtacacatggttacttttgctctgtgtcatttctTTTCTTCACTTGTA-ATAAGTTCGGTC-CGT-TTTCAAATT-GCCCA-TACATTATACT-G--T-A-ATAGGAG----A--------A--------AAAA----C---A----GT--------------T-T--C-------GCCCAGTCTTATA---AAT-TTCCCCAGTGATG---AA-G-C-CGAAA-
gi|11 : ttttgcgGCCC-TATATTT-GAATTCACCCTTGACA-TAG-------T-T-ATAAGAG----A----------------GAAAA----C---G----ATT--------T---------C-------GCCCAATCT--TA---AAT-TCGCTCACTGACGAT-GA-G-ata
gi|12 : gccttttttgcctctcttatacat-T--T-------GCCCATTTC--TG---AAT-TTGCCCATTCAGGAT-GA-G-G-GCAAA-GTAAAA----G--A---AAATAAAA-C-agtg
gi|13 : attttaaag--T-C-AAAAGAG----A--------GATAAAGGGAAAA----C---A----GTT--------T------T--T-------GCCCAGTCT--TA---GAC-TGACCCACCAA------G-G-G-CAAAATG---GGC---G--A---AAATAAAA-C-TG-GGC-AAATATTTCCaattgtaacaattttccattatatgatagtaacaccatcaactata
gi|14 : tCCTTTCTACACGCGCAGTAGCTTTCGGCA-TGC-TTT-AAATTCGCACA-GACA--AGA---G--A-T-AGAAGAG----A--------A-------G------------------TT--------A---ATAT--C-------GCCTAGTCC--TA---AAT-CCGCCCATTGACGtacaaacagtac
gi|15 : attttcgT-T--T-------GCCCAGTCT--TATTAAAT-TTGCCCACTGAGGAG-GA-G-C-CAAAA--------------A---AAAAACCA-C-AG-AGA-AAATATTCTCTGGTATAC
gi|16 : gtATG-G------ATAAG-G----A--------A-------GAAAA----A---C----ACT--------T------T--C-------ATTCAATCT--TA---AAT-TTGCCCACTGACTAT-AA-A-G-
gi|17 : atCTTTCTATACTTGCTGACGATTTTGCCC-CGT-TTA-AAATTCGCCCA-GACA-gt
gi|18 : tttgaCCCTTCTACAATTGCTAACGGTTTTGATC-CGT-TTT-GAACTCGCCCA-GACA-
gi|19 : ggCCCTTCTACACTTGCAGATG-TTTTGCCC-CAT-TTT-AAATTTGCCCA-GACA-
gi|2 : tTTCTACAATTGTAAACGGTTTCACCC-CAT-TTT-GAATTTGCTCA-GACA--AGA-G-AAAT-T-AC----G----A--------ATTTT---AAAGA----T---T----ATTGTCCTGA-T---AT-T--TTTAAATTGCCTAACTT--TA---AAT-TCTCCCATTGACAATGAG-G-G-CAATA-G---GA----GCAA---AAATAAAA-CTGA-GAT-GAAAATTTTCCTATATGC
gi|3 : T-TTA-AAATTTGCCAA-GACA-CA-ATG-G--TGT-TTAAGAG----A--------A-------GATAATCAGC---G----ACTGGGCAAAATGA-AT-T--T-------ACTCAGTCTG-TC---AAT-CTGCCCACTCACAATGAG-G-G-CGAA---------------T---AATTAAAA-T-GG-GGCAAAATATGTACCTTTATACagtaact
gi|4 : tttccccttgcaacattaaaacagtttatccaaacTACATTTGCAGACAGATTTGCTT-TAT-TTT-AAATTCTTCCA-GATA-CATTTGTG--T-T-A-----G----A--------A-------TACAG----C------------------------T-T--C-------GCTCAGTCT--TA---AATGTCGTCCACTGACAAC-AA-G-GCCGAGA-GGA-GG----A--A---AAATAAAACC-AA-GGC-AAATATTGTCCag
gi|5 : caggcttctttttgtccttctacatgCCTTTCTACACTTGCAAACAGTTATGCCC-CAT-TTA-AAATTTGCCCA-AACA-CAGACA-G--T-T-ATAAAAATTACA--------G-------GTCAA----T---G----ATT--------TTGAAT-T--T-------GCCCCATGT--TG---AAT-TTGCCCACTGACAAC-AA-G-G-TGAAA-G---GG----T--ATATAAATGAAG-CAGG-GGC-AATTATTTCCCTGTATACagctgt
gi|6 : aCCTTTTTACATTTGTACATGGCTTCACCA-CAT-TTT-AATTTTGCTAA-AACA-GAG-TG-GCGT-T-AAAAGAG----AGAGGAGAAA-------GGAAA----C--------ATT--------T------T--T-------GCCCAGTCT--TA---AAT-T-GCCCACTGACAAC-AA-GAG-CAAAA-G---AGTTTTG-------AATAAAA------GGC-CAATATATTCCTG
gi|7 : ttttg-G--T-T-ATAAGA-----A--------A-------GAAAT----CCCTGTCCCGTA--------T---AT-TGTC-------GCATAGATT--TA---AAT-ACGCCCACTGACAGC-AATG-G-CAATT-G---GG----G--A------TAAAA-C-GG-GGC-GAACATTTTTCTACATA
gi|8 : tttattttacccttgtgaacggtctggatccaggtacatattaaaatatCCTTTATGCACTTCCAGATGGTTTCACCCTCAT-TTT-AGAT---------ACA-TGTATG-T--T-T-A---GAG----A--------A-------GCAAA----G---A----ATT--------C---TT-T--T-------GCCTAGTTT--TA---AAG-TCGCCCACTGGCAAT-AT-G-G--GCAA-G-----------------AATAAAG-C--G-GGC-AACTATTTTTCTGTATaagt
gi|9 : ctgCCTTTCAACCCTTGTAGATGGTTTCACTG-TGT-TTT-AAATTT---------------TT-G--T-T-AAAGGAG----A--------A-------CAAA-----C---A----GTT--------TCA-AC-T--C-------G----GTCT--TA---AAT-TCACCCACTGAC--------------AA-G---GGC---A--A---AAATCAAA-A-GG-GGT-GAACTTTTTTTTTTAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3333333333333333 1111
lowQualScore : 2 0 3 2 2 2 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 55 444 2 1 9999 5 2 33 3 9999999999999999 1111 3 66
lowQualScore : . . . . . . . .......................................................................................... .. ... . . .... . . .. . ................ .... . ..
lowQualScore : 3 1 1 9 9 2 9 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 99 444 5 7 4444 3 7 00 1 3333333333333333 0000 6 11
consensus : NCCTTTCTACACTTGCAGACGGTTTCGCCC-CGT-TTT-AAATTCGCCCA-GACA-CAGATG-G--T-T-ANAAGAG----A--------A-------GAAAA----C---G----ATT--------T---AT-T--C-------GCCCAGTCT--TA---AAT-TCGCCCACTGACGAT-AA-G-G-CGAAA-G---GG----G--A---AAATAAAA-C-GG-GGC-GAATATTTTCCTGTATAC
Reference ( family-7173 ) : NCCTTTCTACACTTGCAGACGGTTTCGCCC-CGT-TTT-AAATTCGCCCA-GACA-CAGATG-G--T-T-ANAAGAG----A--------A-------GAAAA----C---G----ATT--------T---AT-T--C-------GCCCAGTCT--TA---AAT-TCGCCCACTGACGAT-AA-G-G-CGAAA-G---GG----G--A---AAATAAAA-C-GG-GGC-GAATATTTTCCTGTATAC
gi|1 : CCATTCTACATTTACATATGGTTTGGCCC-CAT-TTT-AAATTCATCAT-GACA-TGTATGCA--T-TCAAAAAAA----ACCC-----A-------GAAAA------------------------------------------------TCT--TA---AAT-TTGCTCACTGACAAT-AAGG-G-TGAAA-G---GG----GCCA---AAATAAAA-C-AGTGAC-AAATGTTTTCCTGTATGC
gi|10 : ttgtacacatggttacttttgctctgtgtcatttctTTTCTTCACTTGTA-ATAAGTTCGGTC-CGT-TTTCAAATT-GCCCA-TACATTATACT-G--T-A-ATAGGAG----A--------A--------AAAA----C---A----GT--------------T-T--C-------GCCCAGTCTTATA---AAT-TTCCCCAGTGATG---AA-G-C-CGAAA-
gi|11 : ttttgcgGCCC-TATATTT-GAATTCACCCTTGACA-TAG-------T-T-ATAAGAG----A----------------GAAAA----C---G----ATT--------T---------C-------GCCCAATCT--TA---AAT-TCGCTCACTGACGAT-GA-G-ata
gi|12 : gccttttttgcctctcttatacat-T--T-------GCCCATTTC--TG---AAT-TTGCCCATTCAGGAT-GA-G-G-GCAAA-GTAAAA----G--A---AAATAAAA-C-agtg
gi|13 : attttaaag--T-C-AAAAGAG----A--------GATAAAGGGAAAA----C---A----GTT--------T------T--T-------GCCCAGTCT--TA---GAC-TGACCCACCAA------G-G-G-CAAAATG---GGC---G--A---AAATAAAA-C-TG-GGC-AAATATTTCCaattgtaacaattttccattatatgatagtaacaccatcaactata
gi|14 : tCCTTTCTACACGCGCAGTAGCTTTCGGCA-TGC-TTT-AAATTCGCACA-GACA--AGA---G--A-T-AGAAGAG----A--------A-------G------------------TT--------A---ATAT--C-------GCCTAGTCC--TA---AAT-CCGCCCATTGACGtacaaacagtac
gi|15 : attttcgT-T--T-------GCCCAGTCT--TATTAAAT-TTGCCCACTGAGGAG-GA-G-C-CAAAA--------------A---AAAAACCA-C-AG-AGA-AAATATTCTCTGGTATAC
gi|16 : gtATG-G------ATAAG-G----A--------A-------GAAAA----A---C----ACT--------T------T--C-------ATTCAATCT--TA---AAT-TTGCCCACTGACTAT-AA-A-G-
gi|17 : atCTTTCTATACTTGCTGACGATTTTGCCC-CGT-TTA-AAATTCGCCCA-GACA-gt
gi|18 : tttgaCCCTTCTACAATTGCTAACGGTTTTGATC-CGT-TTT-GAACTCGCCCA-GACA-
gi|19 : ggCCCTTCTACACTTGCAGATG-TTTTGCCC-CAT-TTT-AAATTTGCCCA-GACA-
gi|2 : tTTCTACAATTGTAAACGGTTTCACCC-CAT-TTT-GAATTTGCTCA-GACA--AGA-G-AAAT-T-AC----G----A--------ATTTT---AAAGA----T---T----ATTGTCCTGA-T---AT-T--TTTAAATTGCCTAACTT--TA---AAT-TCTCCCATTGACAATGAG-G-G-CAATA-G---GA----GCAA---AAATAAAA-CTGA-GAT-GAAAATTTTCCTATATGC
gi|3 : T-TTA-AAATTTGCCAA-GACA-CA-ATG-G--TGT-TTAAGAG----A--------A-------GATAATCAGC---G----ACTGGGCAAAATGA-AT-T--T-------ACTCAGTCTG-TC---AAT-CTGCCCACTCACAATGAG-G-G-CGAA---------------T---AATTAAAA-T-GG-GGCAAAATATGTACCTTTATACagtaact
gi|4 : tttccccttgcaacattaaaacagtttatccaaacTACATTTGCAGACAGATTTGCTT-TAT-TTT-AAATTCTTCCA-GATA-CATTTGTG--T-T-A-----G----A--------A-------TACAG----C------------------------T-T--C-------GCTCAGTCT--TA---AATGTCGTCCACTGACAAC-AA-G-GCCGAGA-GGA-GG----A--A---AAATAAAACC-AA-GGC-AAATATTGTCCag
gi|5 : caggcttctttttgtccttctacatgCCTTTCTACACTTGCAAACAGTTATGCCC-CAT-TTA-AAATTTGCCCA-AACA-CAGACA-G--T-T-ATAAAAATTACA--------G-------GTCAA----T---G----ATT--------TTGAAT-T--T-------GCCCCATGT--TG---AAT-TTGCCCACTGACAAC-AA-G-G-TGAAA-G---GG----T--ATATAAATGAAG-CAGG-GGC-AATTATTTCCCTGTATACagctgt
gi|6 : aCCTTTTTACATTTGTACATGGCTTCACCA-CAT-TTT-AATTTTGCTAA-AACA-GAG-TG-GCGT-T-AAAAGAG----AGAGGAGAAA-------GGAAA----C--------ATT--------T------T--T-------GCCCAGTCT--TA---AAT-T-GCCCACTGACAAC-AA-GAG-CAAAA-G---AGTTTTG-------AATAAAA------GGC-CAATATATTCCTG
gi|7 : ttttg-G--T-T-ATAAGA-----A--------A-------GAAAT----CCCTGTCCCGTA--------T---AT-TGTC-------GCATAGATT--TA---AAT-ACGCCCACTGACAGC-AATG-G-CAATT-G---GG----G--A------TAAAA-C-GG-GGC-GAACATTTTTCTACATA
gi|8 : tttattttacccttgtgaacggtctggatccaggtacatattaaaatatCCTTTATGCACTTCCAGATGGTTTCACCCTCAT-TTT-AGAT---------ACA-TGTATG-T--T-T-A---GAG----A--------A-------GCAAA----G---A----ATT--------C---TT-T--T-------GCCTAGTTT--TA---AAG-TCGCCCACTGGCAAT-AT-G-G--GCAA-G-----------------AATAAAG-C--G-GGC-AACTATTTTTCTGTATaagt
gi|9 : ctgCCTTTCAACCCTTGTAGATGGTTTCACTG-TGT-TTT-AAATTT---------------TT-G--T-T-AAAGGAG----A--------A-------CAAA-----C---A----GTT--------TCA-AC-T--C-------G----GTCT--TA---AAT-TCACCCACTGAC--------------AA-G---GGC---A--A---AAATCAAA-A-GG-GGT-GAACTTTTTTTTTTAT
blockSeqs : G T A C C T AGAGAAATTACGAATTTTAAAGATTATTGTCCTGATATTTTTAAATT TA TTA G T AATG T A CC T TAAAAGA CTG . AA
blockSeqs : G . . . C . CAATGGTGTTTAAGAGAAGATAATCAGCGACTGGGCAAAATGAATTT G . . C AATG . . C . GGTATAT CCA . A
blockSeqs : A . . . C . CAGACAGTTATAAAAATTACAGGTCAATGATTTTGAATTT . . . T GAT . . G . AGTTTTG CAG . A
blockSeqs : G . . . C . GAGTGGCGTTAAAAGAGAGAGGAGAAAGGAAACATTTTT . . . G GAT . . C . GAGCAA CT . G
blockSeqs : A . . . T . TTATACTGTAATAGGAGAAAAAACAGTTTC . . . C GAG . . C . GAGGAA CA . A
blockSeqs : G . . . T . TGTATGTTTAGAGAAGCAAAGAATTCTTTT . . . T TAT . . C . GGCGA TG . A
blockSeqs : A . . . T . TTGTTAAAGGAGAACAAACAGTTTCAACTC . . . T AAC . . C . GGCAA CG . C
blockSeqs : C . . . C . TAGTTATAAGAGAGAAAACGATTTC . . . C AAC . . T . GGGA AG . G
blockSeqs : G . . . T . AGAGATAGAAGAGAAGTTAATATC . . . T AAC . . C . A C . A
blockSeqs : G . . . T . CATTTGTGTTAGAATACAGCTTC . . . C AGC . . C . T . . G
blockSeqs : . . . . T . . . . T AAT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . C . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : GGAA************
originalCons : NCCTTTCTACACTTGCAGACGGTTTCGCCC-CGT-TTT-AAATTCGCCCA-GACA-CAGATG-G--T-T-ANAAGAG----A--------A-------GAAAA----C---G----ATT--------T---AT-T--C-------GCCCAGTCT--TA---AAT-TCGCCCACTGACGAT-AA-G-G-CGAAA-G---GG----G--A---AAATAAAA-C-GG-GGC-GAATATTTTCCTGTATAC
finalCons : NCCTTTCTACACTTGCAGACGGTTTCGCCC-CGT-TTT-AAATTCGCCCA-GACA-CAGATG-G--T-T-ANAAGAG----A--------A-------GAAAA----C---G----ATT--------T---AT-T--C-------GCCCAGTCT--TA---AAT-TCGCCCACTGACGAT-AA-G-G-CGAAA-GGGAA------------AAATAAAA-C-GG-GGC-GAATATTTTCCTGTATAC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111 222222222222 1111
lowQualScore : 2 0 3 2 2 2 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 55 444 2 1 6666 5 00000 3 44 555555555555 1111 3 66
lowQualScore : . . . . . . . .......................................................................................... .. ... . . .... . ..... . .. ............ .... . ..
lowQualScore : 3 1 1 9 9 2 9 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 99 444 5 7 8888 3 44444 1 66 222222222222 0000 6 11
consensus : NCCTTTCTACACTTGCAGACGGTTTCGCCC-CGT-TTT-AAATTCGCCCA-GACA-CAGATG-G--T-T-ANAAGAG----A--------A-------GAAAA----C---G----ATT--------T---AT-T--C-------GCCCAGTCT--TA---AAT-TCGCCCACTGACGAT-AA-G-G-CGAAA-G--GG---A--A-A---AATAAAA-C-GG-GGC-GAATATTTTCCTGTATAC
Reference ( family-7173 ) : NCCTTTCTACACTTGCAGACGGTTTCGCCC-CGT-TTT-AAATTCGCCCA-GACA-CAGATG-G--T-T-ANAAGAG----A--------A-------GAAAA----C---G----ATT--------T---AT-T--C-------GCCCAGTCT--TA---AAT-TCGCCCACTGACGAT-AA-G-G-CGAAA-G--GG---A--A-A---AATAAAA-C-GG-GGC-GAATATTTTCCTGTATAC
gi|1 : CCATTCTACATTTACATATGGTTTGGCCC-CAT-TTT-AAATTCATCAT-GACA-TGTATGCA--T-TCAAAAAAA----ACCC-----A-------GAAAA------------------------------------------------TCT--TA---AAT-TTGCTCACTGACAAT-AAGG-G-TGAAA-G--GG---GCCA-A---AATAAAA-C-AGTGAC-AAATGTTTTCCTGTATGC
gi|10 : ttgtacacatggttacttttgctctgtgtcatttctTTTCTTCACTTGTA-ATAAGTTCGGTC-CGT-TTTCAAATT-GCCCA-TACATTATACT-G--T-A-ATAGGAG----A--------A--------AAAA----C---A----GT--------------T-T--C-------GCCCAGTCTTATA---AAT-TTCCCCAGTGATG---AA-G-C-CGAAA-
gi|11 : ttttgcgGCCC-TATATTT-GAATTCACCCTTGACA-TAG-------T-T-ATAAGAG----A----------------GAAAA----C---G----ATT--------T---------C-------GCCCAATCT--TA---AAT-TCGCTCACTGACGAT-GA-G-ata
gi|12 : gccttttttgcctctcttatacat-T--T-------GCCCATTTC--TG---AAT-TTGCCCATTCAGGAT-GA-G-G-GCAAA-G--TA---A--A-AGAAAATAAAA-C-agtg
gi|13 : attttaaag--T-C-AAAAGAG----A--------GATAAAGGGAAAA----C---A----GTT--------T------T--T-------GCCCAGTCT--TA---GAC-TGACCCACCAA------G-G-G-CAAAATG--GGC--G--A-A---AATAAAA-C-TG-GGC-AAATATTTCCaattgtaacaattttccattatatgatagtaacaccatcaactata
gi|14 : tCCTTTCTACACGCGCAGTAGCTTTCGGCA-TGC-TTT-AAATTCGCACA-GACA--AGA---G--A-T-AGAAGAG----A--------A-------G------------------TT--------A---ATAT--C-------GCCTAGTCC--TA---AAT-CCGCCCATTGACGtacaaacagtac
gi|15 : attttcgT-T--T-------GCCCAGTCT--TATTAAAT-TTGCCCACTGAGGAG-GA-G-C-CAAAA---------A--A-A---AA-ACCA-C-AG-AGA-AAATATTCTCTGGTATAC
gi|16 : gtATG-G------ATAAG-G----A--------A-------GAAAA----A---C----ACT--------T------T--C-------ATTCAATCT--TA---AAT-TTGCCCACTGACTAT-AA-A-G-
gi|17 : atCTTTCTATACTTGCTGACGATTTTGCCC-CGT-TTA-AAATTCGCCCA-GACA-gt
gi|18 : tttgaCCCTTCTACAATTGCTAACGGTTTTGATC-CGT-TTT-GAACTCGCCCA-GACA-
gi|19 : ggCCCTTCTACACTTGCAGATG-TTTTGCCC-CAT-TTT-AAATTTGCCCA-GACA-
gi|2 : tTTCTACAATTGTAAACGGTTTCACCC-CAT-TTT-GAATTTGCTCA-GACA--AGA-G-AAAT-T-AC----G----A--------ATTTT---AAAGA----T---T----ATTGTCCTGA-T---AT-T--TTTAAATTGCCTAACTT--TA---AAT-TCTCCCATTGACAATGAG-G-G-CAATA-G--GAGC-A--A-A---AATAAAA-CTGA-GAT-GAAAATTTTCCTATATGC
gi|3 : T-TTA-AAATTTGCCAA-GACA-CA-ATG-G--TGT-TTAAGAG----A--------A-------GATAATCAGC---G----ACTGGGCAAAATGA-AT-T--T-------ACTCAGTCTG-TC---AAT-CTGCCCACTCACAAT-GA-G-G-------G--CG---A--ATA---ATTAAAA-T-GG-GGCAAAATATGTACCTTTATACagtaact
gi|4 : tttccccttgcaacattaaaacagtttatccaaacTACATTTGCAGACAGATTTGCTT-TAT-TTT-AAATTCTTCCA-GATA-CATTTGTG--T-T-A-----G----A--------A-------TACAG----C------------------------T-T--C-------GCTCAGTCT--TA---AATGTCGTCCACTGACAAC-AA-G-GCCGAGA-GGAGG---A--A-A---AATAAAACC-AA-GGC-AAATATTGTCCag
gi|5 : caggcttctttttgtccttctacatgCCTTTCTACACTTGCAAACAGTTATGCCC-CAT-TTA-AAATTTGCCCA-AACA-CAGACA-G--T-T-ATAAAAATTACA--------G-------GTCAA----T---G----ATT--------TTGAAT-T--T-------GCCCCATGT--TG---AAT-TTGCCCACTGACAAC-AA-G-G-TGAAA-G--GGTATA--T-A---AATGAAG-CAGG-GGC-AATTATTTCCCTGTATACagctgt
gi|6 : aCCTTTTTACATTTGTACATGGCTTCACCA-CAT-TTT-AATTTTGCTAA-AACA-GAG-TG-GCGT-T-AAAAGAG----AGAGGAGAAA-------GGAAA----C--------ATT--------T------T--T-------GCCCAGTCT--TA---AAT-T-GCCCACTGACAAC-AA-GAG-CAAAA-G--AGTT-T--T-G---AATAAAA------GGC-CAATATATTCCTG
gi|7 : ttttg-G--T-T-ATAAGA-----A--------A-------GAAAT----CCCTGTCCCGTA--------T---AT-TGTC-------GCATAGATT--TA---AAT-ACGCCCACTGACAGC-AATG-G-CAATT-G--GG---G--A-------TAAAA-C-GG-GGC-GAACATTTTTCTACATA
gi|8 : tttattttacccttgtgaacggtctggatccaggtacatattaaaatatCCTTTATGCACTTCCAGATGGTTTCACCCTCAT-TTT-AGAT---------ACA-TGTATG-T--T-T-A---GAG----A--------A-------GCAAA----G---A----ATT--------C---TT-T--T-------GCCTAGTTT--TA---AAG-TCGCCCACTGGCAAT-AT-G---------G--GC---A--A-G---AATAAAG-C--G-GGC-AACTATTTTTCTGTATaagt
gi|9 : ctgCCTTTCAACCCTTGTAGATGGTTTCACTG-TGT-TTT-AAATTT---------------TT-G--T-T-AAAGGAG----A--------A-------CAAA-----C---A----GTT--------TCA-AC-T--C-------G----GTCT--TA---AAT-TCACCCACTGAC--------------AA-G--GGC--A--A-A---AATCAAA-A-GG-GGT-GAACTTTTTTTTTTAT