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gi|4                          :                                                                                                                                                       TGA--GTGACAGTATCTC--C---ACAGAGGT--GCATTTGTG----GG----GGTGC-GCTGGT--TTGGTCGG---GTGTGGC----------CC----------TCATTC-C--GC-GAGCTC-GCTATGTCC--TCAGCT---G-TTG--CCAGTAC----CAGCTT--C----TTT-C-T-C--T----TG--CTCTT-CAGATTGATGGTTCATATGA-TCTCCCTT-----CACCTC-----CCACG-------GTC--ATCTGCTTGT--CCCTCCCA----TCTC-T-----GGTC-------AAT-GCC---AGAGCTTTCAT-GTCT-CTTCT--T--ACAT---A--C-G--T-TCTGAAGCGCA-GTGTGAGCGGACC---CG--C-----A---CT--T-TA----C----TCTC----ATTA-CAGC-ACTCCAT-AGAGGAT-T-CTTTTAGGAAATG------CGGGC-ATC---TCAT-GTCGG-TGGCACATGGCCC-AG-C-AG-CGGTAAGTATG-CGTT--GCCTGAGG-GAGGGTATAC-TGCTGG----AGCCAGCGCGA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                    GGTC-GCATTTGTG----CCT---TGA-T-TCTGGT--CTC-TTG-A-CATTTG------------TT----------TCCTTT-CC-GC-GGGCTC-TCT-TTTCT--GCCACT---G-GTGT------------CATCTT--C----TCT-CCG-C--CATCGTG--------CAGGT-GTTTGT---G--GC-T-TT--TC-----CAGCTG-----GTGCG-------GTC--ATTAGCTTGG--TCCACCCAA--GACTT-T---G-TGTT-------GAT-GTC--GAGTGCTTTCAT-GTCT-C-TCT--T--GCAC---A--C-A--TCTTTGTACCTTAATTGTGGGCGG-CC---AG--T-----G---CT--T-CTATGCC----CTTC-GA---TA--ATC-TCTCTGT-AGAGGACGT-CCTTT--GGGAC-------CGACC-ATCC-TCTGT-A-CGG-T-GACCGT-GCCT-AGCC-AG-C-GC-AG-CTGATCTC--GTCTCA-G---CGGTGAACATGGCGGGA-AGGCCAGCGCGAgtacaatatttcagtgtttggaggacgtgtcagtctcacccactttcatgccaggatgcgcacggatgctttctcaagttggaaggtgttgagtctcctttcctgctggcatctgtggtacatgcctcgcccctacaacagagtata
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                  gagtggcagtcaatattgcttt----------TCCTTT-CT-GC-AGGGTC-GCTCTCTCT--TCTGCC---A-CTGCTG-A---T----CAACTT--CA---CTT-CGC-CAGC----TA--T-ATT-TAGCT-GTGTGTT-AG--AG-TGCTTCTC-----C-TCTG-----GTACG-------GTCCCATTTGCAAGG--TCCTCCCAG--GACTT-C---G-TGTTT------GAT-G-C--GAGCGCCTTCA--AT-----TCT--T--A-AT---A--CTG--TTT-------GC---TGTGGGCGG-CCAAGTG--T-----T---CT--C-CG----C----CTT-------TATAAGC-TTGCCTTTGGGGGAA-----TTC--GAAA------------C-ATCCCTCCATTA-CGGAT-GAACGTGGCCA-AGCCCAG-C-GC-AGGCCGACATTCGGTCTCA-GTAAAAGTGTACATGGTGGGGGAGGCCAGCGCGAgacaggacgttagtgttggtcaccctgtcttgccaagaaaaaccgagtatgcgcc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gttccgctctctttcctgccactattTCTGCATGC--CC-TCCCAACCAATTC-TCTTGCGGTCCCTATTTAATAGTC--GAGAGATTTCAT-GTCT-C-TCT--TTAACGG---AACC-GTCTCTCTGAAGT-CA----TGGATGG-TT---TG--T-----G---CCGGC-CT----C------TCACATATTCCCAA--TCTCCAT-Agacagggccgtcaaagtgtcggtcaccttgtcctccgccaggagataccaagtatgtgtcggaggcttctgaggtggacagtatt
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-6350 )     :                                                                                                                                                    TAGTAGGCCTCCGTCGGTCA--GAGCTGACCAT-GGANA-G-T-ACA-CC-TT-AGTTC-CTGGGCTG---GC---TCG-CT--G---CT--C-----GGCT---AGAGC--A--GCGT--CTC--GT-GTGGCTG-TA-GAGGCCAA---TGC-GNGAGTGAC-AG--TCTCTNCTGCAGNGGTC-GCATCTGTG-GGT-GGT-CGCTGGTCTG-TCGG-----A-GGTGTGGCCCTCCTTC-CT-GCGG-GCTC-GCT-TNTCC--TCNGCCN---CTGCT-CCG--CCAGCTTC----TTTCCT-C--CTGN-CTT---CAGNT-GTTTGTTCAG--GGTGCTCCTC-----CACCTNNTAC----------GG-------TC--ATTTGCATGGCCCTCCCAG--GACTC-----CGTG-TC-------GAT-GT-CGA-G-CGCCTTCAT-GTCT-C-TCTT--AC---A-CA-----CG--TCTCTGNAGCGC-A-G-T-GTG---GGC-GG-CC---CGCG---CT--CC-T----C----CTTC-CA-ATT---A--AGC-TC----TCCGTAGAGGAC-GTCCT---TTG-GG---ATTCG-ACC-AT-CCTCCA-TA-CGG-CGA-ACGTGG-CCNAG-CCAG-CG--CAGCCCG-CG--TC--GTCT--CA-G----T-AGGGTGTACAT--GGT-GGGGAGGCCAGCGCGA
gi|1                          :                                                                                                                                                      GTAGGCCTTCTTCGGTCACTG-GCTGACCATTGGATGCG-T-G-A-CC-CT-ACGTC-C---ACTA---ACATATTGTCT--G---CT--C-----TGCT---TGAGC--A--ATGC--CTT--TTTGTG-CTG-TA-A--GCCAA---TGCCGAGAGTG-C-AG--CCTTTGTTGCATTGGTCCGCATCTGTG-CAC-TAT-C-CTAGTCTG-TTGG-----A-TGT-TG--TTTCCTTC-TT-GC-G-GCTT-GCT-TCT----TCTGCCA---C-G----TG--TCAGCTTC----TCTTCG-C--CAGA-GTG---CA-TT-G--TGGTGAA--AAAGCTTCTCAGTTGCACCACAGACACGACATTGAGGGGTCGGTTC--GTTTGCA--GTCCTCCCAG--GACTCA----TGTG-TC-------GA--GTCCGACG-CGCCTTCACGGTCT-C-TCTA--GC---A-CAATTTGTG--TATCTTAAGC----------TT---GGC-GGACC---AGTG---CC--TC-TCTGCC----CTTT-CT-A-T---A--AGC-TC----TCCGCTAAGGA--GTCCC---TTT-GA---ATTC--ACC-AT-CCTTTA-TA-CAG-CGA-A-GTGGCCCAAG-CCAGCCG--CAGCCGA-CGGTTC--GTTTTATA-GAGCTT-AGAGTG-ACAGGAGGG-GGGGGGGGCAGCGCGA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCCTTT-CT-GCAG-GGTC-GCTCTCTCT--TCTGCCA---CTGCT---GA-TCAACTTCA---CTTCGC-CAGCTAT-ATT---TAGCT-GTGTGTT-AG--AGTGCTTCTC-----C-TCTGGTAC----------GG-------TCCCATTTGCAAGGTCCTCCCAG--GACTT-----CGTGTTT-------GAT-G--CGA-G-CGCCTTCA--AT-----TCTT--A----A-TA-----C---TGTTTGC----------T-GTG---GGC-GG-CCAAGTGTT---CT--CC-G----C----CTT--TA---T---A--AGC-T-------TG-----------CCT---TTG-GGGGAATTCGAAAC-ATCCCTCCATTA-CGGATGA-ACGTGG-CCAAGCCCAG-CG--CAGGCCGACA--TTCGGTCT--CA-G----TAAAAGTGTACAT--GGTGGGGGAGGCCAGCGCGAgatatgacgtcagttgttgttcaacttgacttcgccaggaagataccgagtatgcgtctaaggtttcttgaggtggagggtattctattgagcctttctcttgacgggcgttacttggttccatgtctcactgcccatacgctagggtgct
gi|11                         :                                                                                                                           gttccgctctctttcctgccactattAGTAGGCTTTCGTCGGTCA--GAGTTGACCAT-GGAAA-G-T-ACA-TC-TTTAGTTT-CTTGGCTGCGTGG---TCG-CT--G---CT--T-----GGCT---AG-GC--A--GTGT--CTC--GT-GTGGCTG-TA-GAGTCCAA---TGT-GTGAGTGAC-AG--TCTCACCCGCAGAGGTT-GCATCTGTG-GGT-GGT-CGCTGGTCTG-TCGG-----G-GGTGTGGCCCTCCTTC-CT-GCGA-GCCC-GCT-TGTCC--TCAGC-----TTGTT-GCA--CCAGCTTC----TTTTCT-C--CTGA-CTT---CAGAT-GTTGGTTCAA--GATGTTCGTC-----CACTTCCCAC----------GG-------TC--ATCTGCATGTCCCTCCCAA--GTCTC-----TGTG-TC-------AAT-GT-CAA-G-AGCTTTCAT-GTCT-C-TCTT--AC---A-gacagggccgtcaaagtgtcggtcaccttgtcctccgccaggagataccaagtatgtgtcggaggcttctgaggtggacagtatt
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Reference ( family-6350 )     :                                                                                                                                                    TAGTAGGCCTCCGTCGGTCA--GAGCTGACCAT-GGATA-G-T-ACA-CC-TT-AGTTCCCGGGCTG---GC---TCG-CT--G---CT--C-----GGCT---AGAGC--A--GCGT--CTC--GT-GTGGCTG-TA-GAGGCCAA---TGC-GNGAGTGAC-AG--TCTCTNCTGCAGNGGTC-GCATCTGTG-GGT-GGT-CGCTGGTCTG-TCGG-----A-GGTGTGGCCCTCCTTC-CT-GCGG-GCTCGCT-TCTCC--TCTGCCA---CTGCT-C-G--CCAGCTTC-----TTT-CCNCC---TGN-CTT-CAGNT-GTTTGTTCAGAGTG--CTCC-TC-----CACCTCG--CACGG---------------TC--ATTTGCATGGCCCTCCCAG--GACTC-----CGTG-TC-------GAT-GTC-GA-G-CGCTTTCATG-TCT-C-TCTT--AC---A-CA-----CG--TCTCTGNAGCGC-A-G-T-GTG---GGC-GG-CC-NGCG---CT--CC-T----C----CTTC-CA-ATT---A--AGC-TC----TCCGTAGAGGAC-GTCCT---TTG-GG---ATTCG-ACC-AT-CCTCCA-TA-CGG-CGA-ACGTGG-CCNAG-CCAG-CG--CA-GCCGGCG--TC--GTCT--CA-G----T-AGGGTGTACAT--GGT-GGGGAGGCCAGCGCGA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCCTTT-CT-GCAG-GGTCGCTCTCTCT--TCTGCCA---CTGCT-G-A--TCAACTTC-----ACT-TCGCCAGCTAT-ATT-TAGCT-GTGTGTT-AGAGTG--CTTC-TC-----C-TCTGG--TACGG---------------TCCCATTTGCAAGGTCCTCCCAG--GACTT-----CGTGTTT-------GAT-G-C-GA-G-CGCCTTCA-A-T-----TCTT--A----A-TA-----C---TGTTTGC----------T-GTG---GGC-GG-CCAAGTGTT-CT--CC-G----C----CTT--TA---T---A--AGC-T-------TG-----------CCT---TTG-GGGGAATTCGAAAC-ATCCCTCCATTA-CGGATGA-ACGTGG-CCAAGCCCAG-CG--CAGGCCGACA--TTCGGTCT--CA-G----TAAAAGTGTACAT--GGTGGGGGAGGCCAGCGCGAgatatgacgtcagttgttgttcaacttgacttcgccaggaagataccgagtatgcgtctaaggtttcttgaggtggagggtattctattgagcctttctcttgacgggcgttacttggttccatgtctcactgcccatacgctagggtgct
gi|11                         :                                                                                                                           gttccgctctctttcctgccactattAGTAGGCTTTCGTCGGTCA--GAGTTGACCAT-GGAAA-G-T-ACA-TC-TTTAGTTTCTTGGCTGCGTGG---TCG-CT--G---CT--T-----GGCT---AG-GC--A--GTGT--CTC--GT-GTGGCTG-TA-GAGTCCAA---TGT-GTGAGTGAC-AG--TCTCACCCGCAGAGGTT-GCATCTGTG-GGT-GGT-CGCTGGTCTG-TCGG-----G-GGTGTGGCCCTCCTTC-CT-GCGA-GCCCGCT-TGTCC--TCAGC-----TTGTTGC-A--CCAGCTTC-----TTT-TCTCC---TGA-CTT-CAGAT-GTTGGTTCAAGATG--TTCG-TC-----CACTTCC--CACGG---------------TC--ATCTGCATGTCCCTCCCAA--GTCTC-----TGTG-TC-------AAT-GTC-AA-G-AGCTTTCATG-TCT-C-TCTT--AC---A-gacagggccgtcaaagtgtcggtcaccttgtcctccgccaggagataccaagtatgtgtcggaggcttctgaggtggacagtatt
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tGAGTGAC-AG--TATCTCC-ACAGAGGT--GCATTTGTG-GG--GGTGCGCTGGTTTGGTCGG--------GTGTGGCCCTCATTC-C--GCGA-GCTCGCTATGTCC--TCAGCTG---TTGCC-A-GTACCAGCTTC-----TTT-C-TCT---TGCTCTT-CAGATTGATGGTTCATA-TGATCTCCCTT-----CACCTCC--CACGG---------------TC--ATCTGCTTGTCCCTCCCAT----CTC-----TG-G-TC-------AAT-GCC--A-G-AGCTTTCATG-TCT-CTTCTT--AC---A-TA-----CG--T-TCTGAAGCGC-A-G-T-GTG---AGC-GGACC-CGCA---CT--TT-A----C----TCTC----ATT---AC-AGC-AC----TCCATAGAGGAT--TCTT---TTA-GGAA-ATGCG-GGC-AT-C--TCA-TGTCGG-TGGCACATGG-CCCAG--CAG-CGGTAA-GTATGCG--TT--GCCT--GAGG----G-AGGGTATAC-T--GCT-GG---AGCCAGCGCGAgacaagtaggatagtagttgaattgtctgcagagatatcgggtacgtgatgctttaagtggaagtcttagtgttttcttgatcgttagtggtcatgttcactgaatacgatgggt
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Reference ( family-6350 )     :                                                                                                                                                    TAGTAGGCCTCCGTCGGTCA--GAGCTGACCAT-GGATA-G-T-ACA-CC-TT-AGTTCCCGGGCTG---GC---TCG-CT--G---CT--C-----GGCT---AGAGC--A--GCGT--CTC--GT-GTGGCTG-TA-GAGGCCAA---TGC-GNGAGTGAC-AG--TCTCTNCTGCAGNGGTC-GCATCTGTG-GGT-GGT-CGCTGGTCTG-TCGG-----A-GGTGTGGCCCTCCTTC-CT-GCGG-GCTCGCT-TCTCC--TCTGCCA---CTGCT-CG--CCAGCTTC-T---CTCCGCC---TGN-CTT-CAGNT-GTTTGTTCAGAGTG--CTCC-TC-----CACCTCG--CACGG---------------TC--ATTTGCATGGCCCTCCCAG--GACTC-----CGTG-TC-------GAT-GTC-GA-G-CGCTTTCATG-TCT-C-TCTT--AC---A-CA-----CG--TCTCTGNAGC-C---A-G-T-GTG---GGC-GG-CC-NGCG---CT--CC-T----C----CTTC-CA-ATT---A--AGC-TC----TCCGTAGAGGAC-GTCCT---TTG-GG---ATTCG-ACC-AT-CCTCCA-TA-CGG-CGA-ACGTGG-CCNAG-CCAG-CG--CA-GCCGACG--TC--GTCT--CA-G----T-AGGGTGTACAT--GGT-GGGGAGGCCAGCGCGA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCCTTT-CT-GCAG-GGTCGCTCTCTCT--TCTGCCA---CTGCT-GA--TCAACTTC-A---CTTCGCCAGCTAT-ATT-TAGCT-GTGTGTT-AGAGTG--CTTC-TC-----C-TCTGG--TACGG---------------TCCCATTTGCAAGGTCCTCCCAG--GACTT-----CGTGTTT-------GAT-G-C-GA-G-CGCCTTCA-A-T-----TCTT--A----A-TA-----C---TGTTTGC------------T-GTG---GGC-GG-CCAAGTGTT-CT--CC-G----C----CTT--TA---T---A--AGC-T-------TG-----------CCT---TTG-GGGGAATTCGAAAC-ATCCCTCCATTA-CGGATGA-ACGTGG-CCAAGCCCAG-CG--CAGGCCGACA--TTCGGTCT--CA-G----TAAAAGTGTACAT--GGTGGGGGAGGCCAGCGCGAgatatgacgtcagttgttgttcaacttgacttcgccaggaagataccgagtatgcgtctaaggtttcttgaggtggagggtattctattgagcctttctcttgacgggcgttacttggttccatgtctcactgcccatacgctagggtgct
gi|11                         :                                                                                                                           gttccgctctctttcctgccactattAGTAGGCTTTCGTCGGTCA--GAGTTGACCAT-GGAAA-G-T-ACA-TC-TTTAGTTTCTTGGCTGCGTGG---TCG-CT--G---CT--T-----GGCT---AG-GC--A--GTGT--CTC--GT-GTGGCTG-TA-GAGTCCAA---TGT-GTGAGTGAC-AG--TCTCACCCGCAGAGGTT-GCATCTGTG-GGT-GGT-CGCTGGTCTG-TCGG-----G-GGTGTGGCCCTCCTTC-CT-GCGA-GCCCGCT-TGTCC--TCAGC-----TTGTTGCA--CCAGCTTC-T---TTTCTCC---TGA-CTT-CAGAT-GTTGGTTCAAGATG--TTCG-TC-----CACTTCC--CACGG---------------TC--ATCTGCATGTCCCTCCCAA--GTCTC-----TGTG-TC-------AAT-GTC-AA-G-AGCTTTCATG-TCT-C-TCTT--AC---A-gacagggccgtcaaagtgtcggtcaccttgtcctccgccaggagataccaagtatgtgtcggaggcttctgaggtggacagtatt
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tGAGTGAC-AG--TATCTCC-ACAGAGGT--GCATTTGTG-GG--GGTGCGCTGGTTTGGTCGG--------GTGTGGCCCTCATTC-C--GCGA-GCTCGCTATGTCC--TCAGCTG---TTGCC-AGTACCAGCTTC-T---TTCT-CT---TGCTCTT-CAGATTGATGGTTCATA-TGATCTCCCTT-----CACCTCC--CACGG---------------TC--ATCTGCTTGTCCCTCCCAT----CTC-----TG-G-TC-------AAT-GCC--A-G-AGCTTTCATG-TCT-CTTCTT--AC---A-TA-----CG--T-TCTGAAGCGC---A-G-T-GTG---AGC-GGACC-CGCA---CT--TT-A----C----TCTC----ATT---AC-AGC-AC----TCCATAGAGGAT--TCTT---TTA-GGAA-ATGCG-GGC-AT-C--TCA-TGTCGG-TGGCACATGG-CCCAG--CAG-CGGTAA-GTATGCG--TT--GCCT--GAGG----G-AGGGTATAC-T--GCT-GG---AGCCAGCGCGAgacaagtaggatagtagttgaattgtctgcagagatatcgggtacgtgatgctttaagtggaagtcttagtgttttcttgatcgttagtggtcatgttcactgaatacgatgggt
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-6350 )     :                                                                                                                                                    TAGTAGGCCTCCGTCGGTCA--GAGCTGACCAT-GGATA-G-T-ACA-CC-TT-AGTTCCCGGGCTG---GC---TCG-CT--G---CT--C-----GGCT---AGAGC--A--GCGT--CTC--GT-GTGGCTG-TA-GAGGCCAA---TGC-GNGAGTGAC-AG--TCTCTNCTGCAGNGGTC-GCATCTGTG-GGT-GGT-CGCTGGTCTG-TCGG-----A-GGTGTGGCCCTCCTTC-CT-GCGG-GCTCGCT-TCTCC--TCTGCCA---CTGCT-CG--CCAGCTTC-T---CTCCGCC---TGN-CTT-CAGNT-GTTTGTTCAGAGTG--CTCC-TC-----CACCTCG--CACGG---------------TC--ATTTGCATGGCCCTCCCAG--GACTC-----CGTG-TC-------GAT-GTC-GA-G-CGCTTTCATG-TCT-C-TCTT--AC---A-CA-----CG--TCTCTGNAGC-C---A-G-T-GTG---GGC-GG-CC-NGCG---CT--CC-T----C----CTTC-CA-ATT---A--AGC-TC----TCCGTAGAGGAC-GTCCT---TTG-GG---ATTCG-ACC-AT-CCTCCA-TA-CGG-CGA-ACGTGG-CCNAG-CCAG-CG--CA-GCCGACG--TC--GTCT--CA-G----T-AGGGTGTACAT--GGT-GGGGAGGCCAGCGCGA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCCTTT-CT-GCAG-GGTCGCTCTCTCT--TCTGCCA---CTGCT-GA--TCAACTTC-A---CTTCGCCAGCTAT-ATT-TAGCT-GTGTGTT-AGAGTG--CTTC-TC-----C-TCTGG--TACGG---------------TCCCATTTGCAAGGTCCTCCCAG--GACTT-----CGTGTTT-------GAT-G-C-GA-G-CGCCTTCA-A-T-----TCTT--A----A-TA-----C---TGTTTGC------------T-GTG---GGC-GG-CCAAGTGTT-CT--CC-G----C----CTT--TA---T---A--AGC-T-------TG-----------CCT---TTG-GGGGAATTCGAAAC-ATCCCTCCATTA-CGGATGA-ACGTGG-CCAAGCCCAG-CG--CAGGCCGACA--TTCGGTCT--CA-G----TAAAAGTGTACAT--GGTGGGGGAGGCCAGCGCGAgatatgacgtcagttgttgttcaacttgacttcgccaggaagataccgagtatgcgtctaaggtttcttgaggtggagggtattctattgagcctttctcttgacgggcgttacttggttccatgtctcactgcccatacgctagggtgct
gi|11                         :                                                                                                                           gttccgctctctttcctgccactattAGTAGGCTTTCGTCGGTCA--GAGTTGACCAT-GGAAA-G-T-ACA-TC-TTTAGTTTCTTGGCTGCGTGG---TCG-CT--G---CT--T-----GGCT---AG-GC--A--GTGT--CTC--GT-GTGGCTG-TA-GAGTCCAA---TGT-GTGAGTGAC-AG--TCTCACCCGCAGAGGTT-GCATCTGTG-GGT-GGT-CGCTGGTCTG-TCGG-----G-GGTGTGGCCCTCCTTC-CT-GCGA-GCCCGCT-TGTCC--TCAGC-----TTGTTGCA--CCAGCTTC-T---TTTCTCC---TGA-CTT-CAGAT-GTTGGTTCAAGATG--TTCG-TC-----CACTTCC--CACGG---------------TC--ATCTGCATGTCCCTCCCAA--GTCTC-----TGTG-TC-------AAT-GTC-AA-G-AGCTTTCATG-TCT-C-TCTT--AC---A-gacagggccgtcaaagtgtcggtcaccttgtcctccgccaggagataccaagtatgtgtcggaggcttctgaggtggacagtatt
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tGAGTGAC-AG--TATCTCC-ACAGAGGT--GCATTTGTG-GG--GGTGCGCTGGTTTGGTCGG--------GTGTGGCCCTCATTC-C--GCGA-GCTCGCTATGTCC--TCAGCTG---TTGCC-AGTACCAGCTTC-T---TTCT-CT---TGCTCTT-CAGATTGATGGTTCATA-TGATCTCCCTT-----CACCTCC--CACGG---------------TC--ATCTGCTTGTCCCTCCCAT----CTC-----TG-G-TC-------AAT-GCC--A-G-AGCTTTCATG-TCT-CTTCTT--AC---A-TA-----CG--T-TCTGAAGCGC---A-G-T-GTG---AGC-GGACC-CGCA---CT--TT-A----C----TCTC----ATT---AC-AGC-AC----TCCATAGAGGAT--TCTT---TTA-GGAA-ATGCG-GGC-AT-C--TCA-TGTCGG-TGGCACATGG-CCCAG--CAG-CGGTAA-GTATGCG--TT--GCCT--GAGG----G-AGGGTATAC-T--GCT-GG---AGCCAGCGCGAgacaagtaggatagtagttgaattgtctgcagagatatcgggtacgtgatgctttaagtggaagtcttagtgttttcttgatcgttagtggtcatgttcactgaatacgatgggt
gi|5                          :                                                                                                                                                   tTAGTGGGCCTCCGTCGGTCA--GAGTTGACCAT-GGAAA-G-T-ACA-TC-TT-AGTTTCTGGGCTG---GC---TCG-CT--G---CT--TCA---GGCT---AGAGC--A--GCGT--CTC--GT-GTGGCTG-TA-GAGGCCAG---TAC-GTGAG-GAC-AG--TATCTCCCGCAGAGGTC-GCATCTGTG-GGT-GGT-CGCTGGTCTG-TCGG-----A-GGTGTGGCCCTCCTTC-CT-GCGA-GCCCGCT-TGTCC--TCGGCTT---TTGTTCCA--CCAGCTTC-T---TTCCTCC---TGA-CTT-CAGAT-GTTGGTTCAGGATG--TTCC-TC-----CACCTCC--CACAG---------------TC--ATCTGCATGCCCCTCCCAA--GACTC-----TGGG-TC-------AAT-GTC-AA-G-AGCTTCCATA-TCT-C-TCTT--AC---A-GA-----CG--TCTCTGAAGCGC---AGG-T-GTG---GGC-GG-TC-TGGA---CT--CC-T----C----CTTC-CA-ATT---AGCAGC-TC----TCCATAGAGGAT-GTCTT---TTG-CA---ATGCG-GCC-AT-CCTCCA-TG-CGG-TGC-ACGTGG-CCCAG-CCAG-CG--TA-GTCTGTG--TT--GCCT--GA-G----A-AGGGCGTACAT--GCT-GGGAAGGCCAGCGCGAgtacaatatttcagtgtttggaggacgtgtcagtctcacccactttcatgccaggatgcgcacggatgctttctcaagttggaaggtgttgagtctcctttcctgctggcatctgtggtacatgcctcgcccctacaacagagtata
gi|6                          :                                                                                                                                                                            GCTGACCAT-GGATA-G-T-CCA-C---T-AG---CCGGTATC---GC-------CT--G---CT--C-----GGTT---TGAGC--TTTGCCT--CTCAAGT-GTGGCTG-AA-GAGACCAAAT-TGC-GAGAGTGGC-AAA-TCTTTGTTACAATGGTC-GCATCTGTG-CAT-TGA-TTCTGGTCTG-T------------TGT----TTCCTTT-CT-GCGG-GGTCGCT-TCTCT--TCTGCCA---CTA----G--CTATTTCC-T---TTCTGC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCTGCG-GG---GT-CGCTTCTCT--TCTGCCACTA-GCTAT----TTCCTTT-CT-GCAG-GGTCGCT-TCTCTCTTCTGCCAACTTTGCT-TG--TCAACTTC-AAAACTTCGCCAGCTAT-ATT-TAGCT-GTGTGTTTAGAGTG--CTTC-TC-----CATCTGG--TACGG---------------TC--ATTTGCAAGGTCCTCCCAG--GACTT-----CGTG-TT-------GAT-GCC-GA-G-CGCCTTCATG-T-----TCTT--A----A-TA-----CT--TTT-----GC---------T-GTG---GGC-GG-CC-AGTGGTTCT--CCGC----C----CTTT-TA---T---A--AGC-T------------------GCCTT---TGG-GG---ATTCG-AAC-AT-CCTCCA-TA-CGG-AGA-ACGTGG-CCAAG-CCAG-CG--CA-GCCGACA--TC--GTCT--CA-G----T-AAAGTGTACAT--GGT-GGGGAGACCAGCGCGAagggtcgcttctctcttctgccaactttgcttgtcaacttcaaaacttcgccagctatatttagctgtgtgtttagagtgcttctccatctggtacggtcatttgcaaggtcctcccaggacttcgtgttgatgccgagcgccttcatgttcttaatacttttgctgtgggcggccagtggttctccgcccttttataagctgcctttggggattcgaacatcctccatacggagaacgtggccaagccagcgcagccgacatcgtctcagtaaagtgtacatggtggggagaccagcgcgaga
gi|7                          : gctgaccatggatagtccactagccggtatcgcctgctcggtttgagctttgcctctcaagtgtggctgaagagaccaaattgcgagagtggcaaatctttgttacaatggtcgcatctgtgcattgattctggtctgttgtttccttAGTAGCCCTCCA-CGGTCA--TAGCTGACCAT-GGGTG-G-T-G-A-CCACT-CGTCCACTAACAG---GTA--TCGTCT--G---CT--C-----AGAT---TGAGC--A--GTGT--CTC--TT-GTGGCTG-TA-GAGATCAA---TGC-GAGAGTGGC-AG--TCTTTGTTGCATTGGCT-GCATCTGCG-CAT-TGA-TTCTGGTCTG-TCGG-----CTGCTGT----TTCCTTT-CT-GTGG-GTTCGCT-TCTCT--CCTGCCA---CCGCT--G--TCAGATTC-T---CCTCGCC---AGC-GTA-TAGCT-GTGTGTGAAGAGTG--CTCC-TC-----CA-----------G---------------TC--ATTTGCAAGGACCTCCCGG--GACTT-----CGTG-TT-------GAT-GTT-GA-A-CGCTTTCAAA-TCT-C-TTTT--AC---A-CC-----CA--TCTTTGTA-C-CTCTA-C-T-GTG---GGC-GG-CC-AGTG---C-------------------------TT---A--AGC-TC----TTCATAGAGTGC-GTCGT---TTG-GA---ATCCG-ACC-AT-CCTCCA-TA-CGG-CGA-ACGTGG-CCTAA-CCAG-CG--CA-GCCGACG--TC--CTCT--CA-A----T-AGGGTATACAT--GGT-GGGGAGGTCAACGCGAga
gi|8                          :                                                                                                                                                   cTAGTAGGC-TCTGTCG--CA--GAG--AACCAT-GGGAA-T-T-ACA-TCGTT-AGTTTC--GGCTG----T---TCG-CCTGG---CTTTC-----GGCT---AGAGC--A--GCGTTCCTC--AT-GCTGCTGCTA-GAGAC--A---TGC-GTGAGTGAC-TG---CTCTTCT-CAGAGATC-ACATCTGTG-GGT-G-T-CGT--GTTTG-TCGG-----A-GGTATGGCCCTCCTTCTCTAGCGGAGCCCAAA-TTGTC--TCGGCT----TTGTTGCA--CCAGCTTCTT---TTCTGGC---TGA-CTT--AGAT-GTTTTTTCAG---G--TTCC-TC-----CACCTCC--AACAG---------------TC--A-TCACAT--CCCTCCCAA--GTCT------TGGG-TC-------AAT-G-C-GA-GACG---TCATA-TCTAC-TACT--AC---AGAA-----CG--TCTCAGAAGCAC---A-G-G-TTGCCCGGCTGG-CC-CACA---CT--CT-C----C----CTTC-CT-ATT---AGCAGCGTC----TCCATAGAGGA--GTTCTAAAATGTAG---AAACG-GCCAAG-CCTCCA-TG-CGG-TGgatcagaagtcagt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gGAGTGGC-AG--TCAATATTGCTTTGGTC-GCATTTGTG-CCT-TGA-TTCTGGTCTC-TTG------A-CATTTG--TTTCCTTT-CC-GCGG-GCTC----TCTTT--TCTGCCA---CTGGT--G--TCATCTTC-T---CTCCGCC----AT-CGTGCAGGT-GTTTGT-----G-G--CTTT-TC-----CAGCTGG--TGCGG---------------TC--ATTAGCTTGGTCCACCCAA--GACTT-----TGTG-TT-------GAT-GTC-GA-G-TGCTTTCATG-TCT-C-TCTT--GC---A-CA-----CA--TCTTTGTA-C-CTTAA-T-T-GTG---GGC-GG-CC-AGTG---CT--TC-TATGCC----CTTC-GA---T---A--ATC-TC----TCTGTAGAGGAC-GTCCT---TTG-GG---A-CCG-ACC-AT-CCTCTG-TA-CGG-TGA-CCGT-G-CCTAG-CCAG-CG--CA-GCTGATC--TC--GTCT--CA-G----C---GGTGAACAT--GGC-GGGAAGGCCAGCGCGA


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .    T       .   TG  . ACTTCTTAGTTTCTGGGCTGGCTC              .  .    C           A       A        .    .   .       .  .        .     . A       .  .      G     TT   C          AGTG    . T        . C  AG          GGCC       .  .    .       .    T    T  TG      ATC  .         . .         AGCG      .   A .  TG  TC  GA  .     .  .         CCC      .                .        A T         .     T       G .  C         . C .  . C          .   . .    .   .   .  .     G        A CCTTAATT        .     .  .  C  C CTCTCCCTTCCTATTAGC                      .  .              C      .     .  .    T  .   .  .      .  .   A   .      .  T  .    .  .   .       .   .     .   . T                .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .    T       .   AA  . GACCCTCCGTCCACTAGCAGTTA               .  .    C           T       A        .    .   .       .  .        .     . T       .  .      G     TT   T          CATT    . G        . C  CT          GGCC       .  .    .       .    T    T  TT      CCA  .         . .         TGAC      .   A .  TG  TT  AG  .     .  .         CCC      .                .        T C         .     C       T .  A         . T .  . T          .   . .    .   .   .  .     T        A GCGCAGT         .     .  .  T  G CTTCTATGCCCTTCGATA                      .  .              C      .     .  .    C  .   .  .      .  .   C   .      .  T  .    .  .   .       .   .     .   . T                .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .    T       .   TG  . GACCCTCTGTCCACTAACAGTTA               .  .    C           A       A        .    .   .       .  .        .     . A       .  .      G     GA   C          GGTG    . G        . C  AG          GT         .  .    .       .    T    A  CA      CTT  .         . .         AGCG      .   C .  GT  GA  AG  .     .  .         GGT      .                .        T G         .     C       T .  A         . C .  . A          .   . .    .   .   .  .     A        T GCACAGG         .     .  .  A  T TTCTCCGCCTTTATA                         .  .              .      .     .  .    A  .   .  .      .  .   T   .      .  .  .    .  .   .       .   .     .   . C                .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .    C       .   AA  . ACATCGTTAGTTTCGGCTGTTCG               .  .    T           A       A        .    .   .       .  .        .     . A       .  .      C     GA   C          CATT    . T        . C  AG          GT         .  .    .       .    C    G  CA      CC   .         . .         TGAC      .   C .  GT  TC  A   .     .  .         CCA      .                .        A G         .     T       G .  G         . T .  . A          .   . .    .   .   .  .     G        A GTCA            .     .  .  A  T CTTTACTCTCATTAC                         .  .              .      .     .  .    C  .   .  .      .  .   T                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .    T       .   TA  . CCACTAGCCAGGATCGC                     .  .    T           A       A        .    .   .       .  .        .     . T       .  .      C     AT   T          CATT    . G        . C  AC          .          .  .    .       .    C    T  CA      CT   .         . .         TTG       .   A .  TT  T   G   .     .  .         GGT      .                .        A G         .     T       T .  G         . T .  . C          .   . .    .   .   .  .     A        T GCT             .     .  .  C  C CTTA                                    .  .              .                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             C       .   TG  . CCACTAGCCGGTATCGC                     .  .    C           T       A        .    .   .       .  .        .     . A       .  .      G     TT   C          GGTG    . T        . T  .           .          .  .    .       .    T    T  T       CT   .         . .         ATC       .   G .  TT  .   .   .     .  .         .        .                .        T .         .     T       . .  A         . . .  . C          .   . .    .   .   .  .     .        . T               .     .  .  A  T                                                                                                                                                                                    
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-6350 )     :                                                                                                                                                    TAGTAGGCCTCCGTCGGTCA--GAGCTGACCAT-GGATA-G-T-ACA-CC-TT-A-GTTT-CTGGGCC-G-GT--T--CG-C-T--GCT--C-----GGCT---AGAGC--A--GCGT--CTC--GT-GTGGCTG-TA-GAGGCCAA---TGC-GNGAGTGAC-AG--TCTCTNCTGCAGNGGTC-GCATCTGTG-GGT-GGT-CGCTGGTCTG-TCGG-----AGG-TGTGGCCCTCCTTC-CT-GCGG-GCTCGCT-TCTCC--TCTGCCA---CTGCT-G-CGCCAGCTTC-T---CTCCGCC---TGN-CTT-CAGNT-GTTTGTTCAGAGTG--CTCC-TC-----CACC-------TNNCA---------CGGT-C--ATTTGCATGGCCCTCCCAG--GACT-T-CGTG----------TC-GAT-GTC-GA-G-CGCTTTCATG-TCT-C-TCTT--AC---A-CACGTCTCTGNACCTTAGNTGTG---GGC-GG-CC-NGCGCTTCTCCNCCCTT-CTATAAGC----TCTCCGTAGAGGACGTCCT---TTG-GG---ATTCG-ACC-AT-CCTCCA-TA-CGG-CGA-ACGTGG-CCNAG-CCAG-CG--CA-GCCGACG--TC--GTCT--CA-G----T-AGGGTGTACAT--GGT-GGGGAGGCCAGCGCGA
gi|1                          :                                                                                                                                                      GTAGGCCTTCTTCGGTCACTG-GCTGACCATTGGATGCG-T-G-A-CC-CT-ACGTCCACTAA-CA-T-AT--T--GT-C-T--GCT--C-----TGCT---TGAGC--A--ATGC--CTT--TTTGTG-CTG-TA-A--GCCAA---TGCCGAGAGTG-C-AG--CCTTTGTTGCATTGGTCCGCATCTGTG-CAC-TAT-C-CTAGTCTG-TTGG-----ATG-T-TG--TTTCCTTC-TT-GCGG--CTTGCT-TCT----TCTGCCA---C-----G-TGTCAGCTTC-T---CTTCGCC---AGA-GTG-CA-TT-GT--GGTGAAAAAG--CTTC-TCAGTTGCACCACAGACACGACATTGAGGGGTCGGTTC--GTTTGCA--GTCCTCCCAG--GACT-CATGTG----------TC-GA--GTCCGACG-CGCCTTCACGGTCT-C-TCTA--GC---A-CA-ATTTGTGTATCTTAAGCTTG---G-C-GGACC-AGTGCCTCTCTGCCCTTTCTATAAGC----TCTCCGCTAAGGA-GTCCC---TTT-GA---ATTC--ACC-AT-CCTTTA-TA-CAG-CGA-A-GTGGCCCAAG-CCAGCCG--CA-GCCGACGGTTC--GTTTTATA-GAGCTT-AGAGTG-ACAGGAGGG-GGGGGGGGCAGCGCGA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCCTTT-CT-GCAG-GGTCGCTCTCTCT--TCTGCCA---CTGCT-G--ATCAACTTC-A---CTTCGCCAGCTAT-ATT-TAGCT-GTGTGTT-AGAGTG--CTTC-TC-----C-TC-------TGGTA---------CGGT-CCCATTTGCAAGGTCCTCCCAG--GACT-T-CGTG----------TTTGAT-G-C-GA-G-CGCCTTCA-A-T-----TCTT--A----A-TAC-----TG----TTTGCTGTG---GGC-GG-CCAAGTG-TTCTCCGCC--T-TTATAAGC----T---TG----------CCT---TTG-GGGGAATTCGAAAC-ATCCCTCCATTA-CGGATGA-ACGTGG-CCAAGCCCAG-CG--CAGGCCGACA--TTCGGTCT--CA-G----TAAAAGTGTACAT--GGTGGGGGAGGCCAGCGCGAgatatgacgtcagttgttgttcaacttgacttcgccaggaagataccgagtatgcgtctaaggtttcttgaggtggagggtattctattgagcctttctcttgacgggcgttacttggttccatgtctcactgcccatacgctagggtgct
gi|11                         :                                                                                                                           gttccgctctctttcctgccactattAGTAGGCTTTCGTCGGTCA--GAGTTGACCAT-GGAAA-G-T-ACA-TC-TTTA-GTTT-CTTGGCT-GCGTGGT--CG-C-T--GCT--T-----GGCT---AG-GC--A--GTGT--CTC--GT-GTGGCTG-TA-GAGTCCAA---TGT-GTGAGTGAC-AG--TCTCACCCGCAGAGGTT-GCATCTGTG-GGT-GGT-CGCTGGTCTG-TCGG-----GGG-TGTGGCCCTCCTTC-CT-GCGA-GCCCGCT-TGTCC--TCAGC-----TTGTT-G-CACCAGCTTC-T---TTTCTCC---TGA-CTT-CAGAT-GTTGGTTCAAGATG--TTCG-TC-----CACT-------TCCCA---------CGGT-C--ATCTGCATGTCCCTCCCAA--GTCT-C-TGTG----------TC-AAT-GTC-AA-G-AGCTTTCATG-TCT-C-TCTT--AC---A-gacagggccgtcaaagtgtcggtcaccttgtcctccgccaggagataccaagtatgtgtcggaggcttctgaggtggacagtatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                             TC--GT-GTAGCTT-TA-GAGGCCAA---TGC-GTGAGTGAC-AG--TATCTCCAGCAGAGGTT-GCATTTGTG-GGT-CGT-CGCTGGTCTG-TCGG-----AGG-TGTGGCCCTCATTC-CT-GCGA-GCTCGCT-TGTCC--TCAGCT-----TGTT-G-CACCAGCTTC-T---TTTCTCT---TGA-CTT-CAGAT-GATGGTTCAAGATG--TCCC-TC-----CACC-------TCCCA---------CGGT-C--ATCTGCTTGTCCCTCCCAA--GTCT-C-TGGG----------TC-AAT-GCC-AA-G-AGCTTTCATG-TCT-C-TCTT--AC---A-TACGTCTCTGAAGCGTAGGTGTG---AGC-GG-CC-CGCACTCCTCCTTCC
gi|13                         :                                                                                                                                                    TAATAGGTCTCCGTTGGTCA--GGGTTGACT---------G-T-TCA-CT-GT-G-ACTT---------A-GT--T--CA-C-T--GCT--T-----GGCC---AGAGC--A--GCGT--CTC--GT-GTGACTG-AA-GAGGCCAA---TAC-GTGAGTAAC-AG--TCTCTTCTGCAGAGATC-ACATCTGTG-GGT-GGT-CGCTGGTCTG-TCGG-----AGG-TGTGACCCTCCTTC-CT-GTGC-GCCCACT-TGTCC--TCAGC-----TTGTT-G-C
gi|14                         :                                                                                                                                                                        tgtagCTGACCAT-G-ATA-GAT-CCA-C---T-A-----------CC-G-GTA-T--CG-CCT--GCT--C-----GGTTTAGAGAGC--TT-GCCT--CTCAAGT-G-GGCTG-AAAGAGACCAAAATTGC-GAGAGTGGC-AAATTTTTTGTTCCAT--GT--GCATCTGTG-CATTGAT-TTCTGGTCTG-T------------TGT----TTCCTTT-CT-GCGG-GTTCGCT-TCTCT--TCT--CA---C--CT-ATCGCTAATTTT-T---TTCCttgttgtatcttatttgtattctaca
gi|15                         :                                                                                                                                                            attggcCGGTCA--GAGTTGACCAT-GAA---G-T-ACAATC-TC-A-GTTT-CTGGGCT-G-GC--T--CG-C-T--GCT--C-----GGCT---AGAGC--A--GCGT--CGCA-AT-GTGGCTG-TA-GAGGCCAA---TGC-GTGAGTGAC-A---TCTCTCCCGCAGAGGTT-GCATCTGTG-AGT-GGT-CGCTGGTCTG-TCGG-----AGG-TGTGGCCCTCCcc
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gi|19                         :                                                                                                                                                  tgTAGTAGGCCTCCGTCGGTCA--GAATTGACCAT-GGATA-G-T-ACA-TC-TT-A-GTTT-CTGGGCT-G-GT--T--CG-C-T--GCT--T-----GACT---AGAAC--A--GCGT--CTA--GT-GTGGGTG-TA-TAGGCCAA---TGC-GTGAGTGAC-AG--TCTCcattgatttctgtct
gi|2                          :                                                                                                                                                 ctagAGTAGGCCTATCTCGGTCT--TGGTCGAACAT-GGATG-G-TGAC--CC-TC-C-GTCCACTAG--C-A-GT--T---A-T-T--G-T--CAATAGGACT---TGACC--A--TTGC--CTC--TT-GTGG-TG-TT-AAGACAAA---TGC-AAGATTGGC-AAA-TCTTTGTTGCATTGATC-GCGTCTCTG-CAT-TGA-TTCTGGTATT-TTGG-----CTG-T-TG--TTTCCTTT-CC-GCGG-GATTGCT-TTTCT--TCTGCCA---CTGC----CGCCAGCTTC-T---CTTCGCC---AGC-GTG-CAGCT-GTGTGTAAAGAGTG--CTTC-TC-----CACC-------TGGTA---------CGGT-C--ATTTGCAAGGTCCTCCAAG--GGCA-T-CGCG----------TT-AAT-GTC-AA-G-CGCCTTCATG-TTT-C-TCTT--GC---A-CATATCTTTGTACTTTAGCTGTG---GGC-AT-CA-TGTGCTTCTCTACCCTT-CTATAAG-----TCTCCGTAGAAAACGTCCT---TTG-GG---ATTCG-ACC-AT-CCTCCA-TA-CGG-CGA-ACGTAG-CCTAG-CCAG-CG--CA-GCCGACG--TC--GTCT--CA-G----T-AGAGTGTACAA--GGT-GGGGAAGCCAGCGC
gi|20                         :                                                                                                                                                      GTAGGACTCTGTCAGTCA--CAGTGGACCAT-GGAAA-A-T-ACT-TC-TT-A-GTTT-CTGGGCT-G-GC--T--C-------------------GCT---AGAGC--A--GCAT--CTC--AT-GTGGCTG-TA-tagacaggacgtcagtgttggttacctctttttgcaaggagacaccgagtatgcgtcggaagcttctatggaaggtatttagccttttgtcttgataggcgtacgcggtcaatgtctcactgccatacagtagggtg
gi|3                          :                                                                                                                                                tgtcTAGTATGCCTTCCTCGGTCA--TGGCTGACCTT-GGATG-G-TGAC--CC-TC-T-GTCCACTAA--C-A-GT--TATTG-T-C--TCT--T-----GGCT---AGAGC--A--TTGC--CTC--TT-ATGGCTG-TA-GAGACCAA---TAT-AAGAGTGAC-AA--TATCTGTTACATTGGTT-ACCTCTGTGCGAT-GAT-T-CTGGTCTG-T------------TGT----TTCCTTT-CT-GCAG-GCTTGCT-TCTCT--TCTGCCA---CTGCT-G-T--CAGCTTT-T---CTTTGCC---TTG--TG-CAACT-TTGTGGGAAGAGTG--CTTC-TC-----CACC-------TGGTG---------TAG--C--ATTTGCAAGGTCCTCCCAG--AACC-T-CATG----------TT-CAT-GCC-AA-G-TGCCTTCATA-TTT-C-TCTT--GC---T-CACATCTTTGTACCTTAGTTGTG---GGC-GG-CC-AGTGTTTCTCTTCCTTT-CAATAAGC----TCTCCGTAGAGGACGTCCT---TTG-GG---ATTTT-ACC-AT-TCTCCA-TA-TGG-AAA-ACGTAG------------------------CA--TT--GTCT--CG-G----T-AGGTTGTACAT--GGT--GGGAGGCtgatc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tGAGTGAC-AG--TATCTCC-ACAGAGGT--GCATTTGTG-GG--GGTGCGCTGGTTTGGTCGG-------G-TGTGGCCCTCATTC-C--GCGA-GCTCGCTATGTCC--TCAGCTG---TTGCCAG-TACCAGCTTC-T---TTCT-CT---TGCTCTT-CAGATTGATGGTTCATA-TGATCTCCCTT-----CACC-------TCCCA---------CGGT-C--ATCTGCTTGTCCCTCCCAT----CT-C-TG-G----------TC-AAT-GCC--A-G-AGCTTTCATG-TCT-CTTCTT--AC---A-TACGT-TCTGAAGCGCAG-TGTG---AGC-GGACC-CGCACTT-TACTCTCAT--TAC-AGC----ACTCCATAGAGGAT-TCTT---TTA-GGAA-ATGCG-GGC-AT-C--TCA-TGTCGG-TGGCACATGG-CCCAG--CAG-CGGTAA-GTATGCG--TT--GCCT--GAGG----G-AGGGTATAC-T--GCT-GG---AGCCAGCGCGAgacaagtaggatagtagttgaattgtctgcagagatatcgggtacgtgatgctttaagtggaagtcttagtgttttcttgatcgttagtggtcatgttcactgaatacgatgggt
gi|5                          :                                                                                                                                                   tTAGTGGGCCTCCGTCGGTCA--GAGTTGACCAT-GGAAA-G-T-ACA-TC-TT-A-GTTT-CTGGGCT-G-GC--T--CG-C-T--GCT--TCA---GGCT---AGAGC--A--GCGT--CTC--GT-GTGGCTG-TA-GAGGCCAG---TAC-GTGAG-GAC-AG--TATCTCCCGCAGAGGTC-GCATCTGTG-GGT-GGT-CGCTGGTCTG-TCGG-----AGG-TGTGGCCCTCCTTC-CT-GCGA-GCCCGCT-TGTCC--TCGGCTT---TTGTT-C-CACCAGCTTC-T---TTCCTCC---TGA-CTT-CAGAT-GTTGGTTCAGGATG--TTCC-TC-----CACC-------TCCCA---------CAGT-C--ATCTGCATGCCCCTCCCAA--GACT-C-TGGG----------TC-AAT-GTC-AA-G-AGCTTCCATA-TCT-C-TCTT--AC---A-GACGTCTCTGAAGCGCAGGTGTG---GGC-GG-TC-TGGACTCCTCCTTCCAA-TTAGCAGC----TCTCCATAGAGGATGTCTT---TTG-CA---ATGCG-GCC-AT-CCTCCA-TG-CGG-TGC-ACGTGG-CCCAG-CCAG-CG--TA-GTCTGTG--TT--GCCT--GA-G----A-AGGGCGTACAT--GCT-GGGAAGGCCAGCGCGAgtacaatatttcagtgtttggaggacgtgtcagtctcacccactttcatgccaggatgcgcacggatgctttctcaagttggaaggtgttgagtctcctttcctgctggcatctgtggtacatgcctcgcccctacaacagagtata
gi|6                          :                                                                                                                                                                            GCTGACCAT-GGATA-G-T-CCA-C---T-A-G---------CC-G-GTA-T--CG-CCT--GCT--C-----GGTT---TGAGC--TTTGCCT--CTCAAGT-GTGGCTG-AA-GAGACCAAAT-TGC-GAGAGTGGC-AAA-TCTTTGTTACAATGGTC-GCATCTGTG-CAT-TGA-TTCTGGTCTG-T------------TGT----TTCCTTT-CT-GCGG-GGTCGCT-TCTCT--TCTGCCA---CTA------GCTATTTCC-T---TTCTGC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCTGCG-GG---GT-CGCTTCTCT--TCTGCCACTAGC-TAT----TTCCTTT-CT-GCAG-GGTCGCT-TCTCTCTTCTGCCAACTTTGCT---TGTCAACTTC-AAAACTTCGCCAGCTAT-ATT-TAGCT-GTGTGTTTAGAGTG--CTTC-TC-----CATC-------TGGTA---------CGGT-C--ATTTGCAAGGTCCTCCCAG--GACT-T-CGTG----------TT-GAT-GCC-GA-G-CGCCTTCATG-T-----TCTT--A---------------ATACTTTTGCTGTG---GGC-GG-CC-AGTGGTTCTCCGCCCTT-TTATAAGC----T-------------GCCTT---TGG-GG---ATTCG-AAC-AT-CCTCCA-TA-CGG-AGA-ACGTGG-CCAAG-CCAG-CG--CA-GCCGACA--TC--GTCT--CA-G----T-AAAGTGTACAT--GGT-GGGGAGACCAGCGCGAagggtcgcttctctcttctgccaactttgcttgtcaacttcaaaacttcgccagctatatttagctgtgtgtttagagtgcttctccatctggtacggtcatttgcaaggtcctcccaggacttcgtgttgatgccgagcgccttcatgttcttaatacttttgctgtgggcggccagtggttctccgcccttttataagctgcctttggggattcgaacatcctccatacggagaacgtggccaagccagcgcagccgacatcgtctcagtaaagtgtacatggtggggagaccagcgcgaga
gi|7                          : gctgaccatggatagtccactagccggtatcgcctgctcggtttgagctttgcctctcaagtgtggctgaagagaccaaattgcgagagtggcaaatctttgttacaatggtcgcatctgtgcattgattctggtctgttgtttccttAGTAGCCCTCCA-CGGTCA--TAGCTGACCAT-GGGTG-G-T-G-A-CCACT-C-GTCCACTAA-CA-G-GTA-T--CGTC-T--GCT--C-----AGAT---TGAGC--A--GTGT--CTC--TT-GTGGCTG-TA-GAGATCAA---TGC-GAGAGTGGC-AG--TCTTTGTTGCATTGGCT-GCATCTGCG-CAT-TGA-TTCTGGTCTG-TCGG-----CTGCTGT----TTCCTTT-CT-GTGG-GTTCGCT-TCTCT--CCTGCCA---CCGCT-G-T--CAGATTC-T---CCTCGCC---AGC-GTA-TAGCT-GTGTGTGAAGAGTG--CTCC-TC-----CA-------------------------GT-C--ATTTGCAAGGACCTCCCGG--GACT-T-CGTG----------TT-GAT-GTT-GA-A-CGCTTTCAAA-TCT-C-TTTT--AC---A-CCCATCTTTGTACCTCTACTGTG---GGC-GG-CC-AGTGCT---------------TAAGC----TCTTCATAGAGTGCGTCGT---TTG-GA---ATCCG-ACC-AT-CCTCCA-TA-CGG-CGA-ACGTGG-CCTAA-CCAG-CG--CA-GCCGACG--TC--CTCT--CA-A----T-AGGGTATACAT--GGT-GGGGAGGTCAACGCGAga
gi|8                          :                                                                                                                                                   cTAGTAGGC-TCTGTCG--CA--GAG--AACCAT-GGGAA-T-T-ACA-TCGTT-A-GTTT-C--GGCT-G--T--T--CG-C-CTGGCTTTC-----GGCT---AGAGC--A--GCGTTCCTC--AT-GCTGCTGCTA-GAGAC--A---TGC-GTGAGTGAC-TG---CTCTTCT-CAGAGATC-ACATCTGTG-GGT-G-T-CGT--GTTTG-TCGG-----AGG-TATGGCCCTCCTTCTCTAGCGGAGCCCAAA-TTGTC--TCGGCT----TTGTT-G-CACCAGCTTCTT---TTCTGGC---TGA-CTT--AGAT-GTTTTTTCAG---G--TTCC-TC-----CACC-------TCCAA---------CAGT-C--A-TCACAT--CCCTCCCAA--GTCT-T--GGG----------TC-AAT-G-C-GA-GACG---TCATA-TCTAC-TACT--AC---AGAACGTCTCAGAAGCACAGGT-TGCCCGGCTGG-CC-CACACT----CTCCCTTCCTATTAGCAGCGTCTCCATAGAGGA-GTTCTAAAATGTAG---AAACG-GCCAAG-CCTCCA-TG-CGG-TGgatcagaagtcagt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gGAGTGGC-AG--TCAATATTGCTTTGGTC-GCATTTGTG-CCT-TGA-TTCTGGTCTC-TTG------ACA-TTTG--TTTCCTTT-CC-GCGG-GCTC----TCTTT--TCTGCCA---CTG---G-TGTCATCTTC-T---CTCCGCC----AT-CGTGCAGGT-GTTTGT-----G-G--CTTT-TC-----CAGC-------TGGTG---------CGGT-C--ATTAGCTTGGTCCACCCAA--GACT-T-TGTG----------TT-GAT-GTC-GA-G-TGCTTTCATG-TCT-C-TCTT--GC---A-CACATCTTTGTACCTTAATTGTG---GGC-GG-CC-AGTGCTTCTATGCCCTT-CGATAATC----TCTCTGTAGAGGACGTCCT---TTG-GG---A-CCG-ACC-AT-CCTCTG-TA-CGG-TGA-CCGT-G-CCTAG-CCAG-CG--CA-GCTGATC--TC--GTCT--CA-G----C---GGTGAACAT--GGC-GGGAAGGCCAGCGCGA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): TCTCGGTGTTGGGTACTCTATCTTCCCACTATGCCCAGGATGTGACGGATGCTTCACAAGTGGAAGGTGTTTAATCTTCTTTCCTGTCTGGCATATGTGGTCCATGCCTCGCTCCTATACAACAGAGT
Unaligned ( gi|21 ): AGGTGTTGAGTCTTCTTTCCTGTCTGGCATTGTGTGGTCAATGCCTCGCTCCGATATAACAGAGTACT
Unaligned ( gi|22 ): GTTGCTCTTCAATGTATCCTTGTACCTCAGTTTTGGGCGTCCTTATTTGCGCGCGCC