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gi|7 : TTAACA-TT-T-G---GGAA-TTTAGGGGTC---------CATTTGGG-CCCCT--AACTTT----TTTA-A-C-TT-TT-A-CGGGCCCACATTGGAAATC--AGG-A-G-CCC-A-CA-TTACGATAAT-ACCAATT-TTTAAAAAAT---TCCAGTCAGAAA--ATT--AAATGTCAA------ATATTTTT-------AATGGCCT-TCAAATTCTC--TCTC-TC-TGTT-TTT-TATA-T-T-CG-T-CA-TG-CTT--TTTA-C-T-A-AA-CAAAA-CG----------TACC-CC-------G-CTGT-CA-G-TTGTATCCTTTAAGCCAAGG--TCTA-ATTT-T-TACCA-T--TTT---TGGAAAAAAAC-GA-TAGG-------G-A--T--TTTGG-----AG--TC----A--TACTCCCCCAAAGTA-ACCTTT-CCG-GTCAGGTTTT-----ACTT-TTTATTTTGGGGA-C----A----------C---------
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blockSeqs : . . . . . C . . . . AT . CT . T . A A . . . . . . . TAT AT . . . . . . G . C T . . G T . . . T A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . GATC . . . . . C . T . . . . . . C . AT . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . TA . CT . T . A A . . . . . . . TAT AT . . . . . . C . C . . . A T . . . A A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . AT . . . . . C . T . . . . . . G . AC . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT . AG . T . A A . . . . . . . TAC AT . . . . . . A . C . . . A T . . . T A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . GA . . . . . C . T . . . . . . G . GG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . CG . T . G . . . . . . . . TAC . . . . . . . G . C . . . A T . . . T A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . GA . . . . . C . . . . . . . . G . AC . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . CT . T . A . . . . . . . . TA . . . . . . . G . A . . . A A . . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . G . AC
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . CT . T . . . . . . . . . . C . . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . GA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . CT . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . T . C . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): GCCGTCCATGGAAATTTTATTTAAAGTCGGTATTTT
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Reference ( family-5924 ) : TTAACA-TT-T-G---G-AA-TTTAGGGG-C---------CATGTGGG-CCCCT--AACTTT----T--A-A-C-TT-TT-A-CGGGCCCACATTGGAAATC-CAGG-A-G-CCC-A-CA-TTACGATAAT-ACCAATT-TTTAAAAAAT---TCCAGTCAGAAA--A-T--AAATGTCGA-----A---T-C--TTTT-------AATG---C-TCAAATTCTCT-TCTC-TC-TGTT-TTT-TATA-T-T-CG-T-CA-TG-CTT--TTTA-C-T-A-AA-C-AAA-CG----------TACC-CC-------G-CTGT-CA-G-TGGTATCCTTC-AGCCAAGG--TCTA-ATTT-T-CACCA-T--TTT---TG--AGAAAAC-GA-TAGG-------G-A--T--TTTGG-----AG--TC----A--TACT-CCCCAAAGTA-ACCTTT-CCG-GTCAGGCTTT-----TC-T-TTTATCTTGGGGA-C----G----------C---------GA--GA---CACCATCG---ATAAAG
gi|1 : TTAACAGTTGT-G---G-AA-TTTAGGGG-C---------CATGTGGGGCCCCT--AACATTATTAT--A-A-C-TT-TTTA-CGGGCCCACATTGG-AATC-CAGG-A-G-CCC-ACCA-TTACGATAATGACCAATT-TTTAAAAAACAAATCCAGTCAGGAA--A-T--AAATGTCCA-----A---TAT--TTTT-------AATC---C-TCAAATTCTC--TCTCTTC-TGTT-TTTACATATT-T-CG-TCCA-TG-TCT--TT------------------CG----------TA---CC-------GACTGTACA-GATGGTATCCTTC-AGCCAAGGCTTCCA-ATTT-T-TACCA-T--TTT---TG--AGAAAACTGATTAGG-------G-ATGT--TTTGG-----AG--TC----ATTTAC--CCCCAAAGTA-ACC-TT-CCGTGTCAGGTGTT-----TC-TATTTAT-TTGGGGACC----A----------C---------GATGGA---CACCATCGAATATAAAG
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gi|12 : tgtgcttaacatttggaatttaggggccatgtgggcccctaactttttaactttacgggcccacattggaatccaggagcccacattacgataataccaattttttaaaaattccagtcagaaaataaattttaaatatttttaattctcaaattctctctctctgtttttatatttcgtcatgctttttactaaacaaacgtaccccgctgtcagtggtatgccaaggtctaatttttaccatttttgagaaaacgataggTTAACA-TT-T-GAGGG-AA-TTCAGGGG-C---------CATGTGGG-CCCCT---ACTTTA---T--A-A-C--T-TT-A-CGGGCCCACATTGG-AATCACAGGAA-G-CCC-A-CATTTGCGATAAT-ACCAATT-TTT-TAAAAT---TCCAGTCAGAAAATA-T--AAATGTCCAACTCCA---T-C--TTTT-------AATG---C-TCAAATTC----TCTC-TC-TGTT-TTT-TA-A-TCT-CG-T-CA-TG-CTT--TTTA-C-TAA-AA-CAAAA-CG----------TACC-CC-------G-CTGT-CA-G-TGGTATTCCT
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gi|6 : tgatgtgcccTTAACA-TT---G---G-GA-TTTAGGGG-C---------CATGTGG--CCCCT--AACTTT----T--A-A-C-TT-TT-A-CGGGCCCACATTGGAAATC-CA-G-A-G-CCC-A-CA-TTATGATAAT-ACCAATT-TTTAAAAAAT---TCCAGTCAGAAA--A-TA-AAATGTCAA-----A---T-A--TTTT-------AATG---C-TCAAATTCTCT-TCTC-TC-TGTT-TTT-TATA-T-T-CG-T-CA-TG-CTT--TTTA-C-T-A-AA-C-AAA-CG----------TACC-CC-------G-CTGT-CA-G-TGGTATCCTTT-AGCCAA-G--TCTA-ATTT-T-TACCA-T--TTT---TG--AGAAAAC-GA-TAGG-------G-A--T--TTTGG-----AG--TC----A--TACT-CCCCAAAGTA-ACCTTT-CCG-GTCAGGTTTT-----TC-T-TTTATTTTGGGGA-C----AT---------C---------GAT-GA---CACCATCG---ATAAAGcact
gi|7 : TTAACA-TT-T-G---GGAA-TTTAGGGGTC---------CATTTGGG-CCCCT--AACTTT----TTTA-A-C-TT-TT-A-CGGGCCCACATTGGAAATC--AGG-A-G-CCC-A-CA-TTACGATAAT-ACCAATT-TTTAAAAAAT---TCCAGTCAGAAA--ATT--AAATGTCAA-----A---TAT--TTTT-------AATGGCCT-TCAAATTCTC--TCTC-TC-TGTT-TTT-TATA-T-T-CG-T-CA-TG-CTT--TTTA-C-T-A-AA-CAAAA-CG----------TACC-CC-------G-CTGT-CA-G-TTGTATCCTTTAAGCCAAGG--TCTA-ATTT-T-TACCA-T--TTT---TGGAAAAAAAC-GA-TAGG-------G-A--T--TTTGG-----AG--TC----A--TACTCCCCCAAAGTA-ACCTTT-CCG-GTCAGGTTTT-----ACTT-TTTATTTTGGGGA-C----A----------C---------
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