lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 3 333 1111 99999999999999 1 44 3 3 333 7777777777777 22 3 444444444444 11 3333333 1 1 1 1 111 1 666666666666666666666666666666666666666666 33333333333333333 22222 44444444444444444444444444444444444444444 111 222 11 111111 1111 22222 2 7777777777777777777777777777777 11111 222222 2222222 11111 11111 33333333333 11 1 11 22222222 111 111111111 22222 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2222 11 11111 4444444444 1111111 111 11 222222222 111 111111111 111111 4444444444444444 2222222222 111111 1111 11 11111 11 11 3333333 11 111 1111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 4444444444444444 1111 22222 11 1 3 000000000000000000000000000000000000000000000000 222222 555555555 11 111 11 11 444444444 2222 333333333 22222222 3333333 11 2222
lowQualScore : 2 3 5 222 5 6666 5 5 44444444444444 0 88 0 0 5 5 6 77 222 0000000000000 2 6 22 1 99 5 999999999999 44 4444444 3 3 5 6 9 6 3 6 9 9 99 6 1 6 222 0 666666666666666666666666666666666666666666 3 99999999999999999 77777 77777777777777777777777777777777777777777 1 444 0 555 5 11 99 4 777777 9 666 2222 1 7 00000 6 6 99 99 6 6 6 99 6 9999999999999999999999999999999 88 999 88888 6 3 77 7 3 5 222222 66 5 4 2 4 6 4 4 1111111 5 00000 5 22222 5 22222222222 55 4 4 8 22 55 4 8 2 4 888 88888 4 99 4 88888888 222 8 4 444444444 4 4 55 777 44444 4 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8 7777 4 00 4 55555 4 1111111111 4 4 4444444 4 222 4 4 00 4 2 111111111 888 55 55 222222222 8 111111 4444444444444444 3 4444444444 4 66 66 4 888888 77 4 4444 4 4 4 4 66 00 4 00000 00 99 6666666 66 4 99 5 5 111 0000 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5 5 5 66 11 5 5 5 5 0000000000000000 6 0000 99 99999 2 44 1 0 99 6 666666666666666666666666666666666666666666666666 999 1 8 444444 6 111111111 8 44 888 5 66 00 33 5 000000000 5 77 3 2222 0 444444444 0 11111111 0000000 3 8 11 8 8 2 7777 3
lowQualScore : . . . ... . .... . . .............. . .. . . . . . .. ... ............. . . .. . .. . ............ .. ....... . . . . . . . . . . .. . . . ... . .......................................... . ................. ..... ......................................... . ... . ... . .. .. . ...... . ... .... . . ..... . . .. .. . . . .. . ............................... .. ... ..... . . .. . . . ...... .. . . . . . . . ....... . ..... . ..... . ........... .. . . . .. .. . . . . ... ..... . .. . ........ ... . . ......... . . .. ... ..... . ............................................................................................... . .... . .. . ..... . .......... . . ....... . ... . . .. . . ......... ... .. .. ......... . ...... ................ . .......... . .. .. . ...... .. . .... . . . . .. .. . ..... .. .. ....... .. . .. . . ... .... .......................................................................... . . . .. .. . . . . ................ . .... .. ..... . .. . . .. . ................................................ ... . . ...... . ......... . .. ... . .. .. .. . ......... . .. . .... . ......... . ........ ....... . . .. . . . .... .
lowQualScore : 2 3 7 444 7 0000 7 7 66666666666666 9 66 7 1 7 7 4 99 666 2222222222222 5 0 22 0 22 8 333333333333 55 2222222 3 5 3 7 2 7 3 7 3 7 22 7 0 7 555 8 888888888888888888888888888888888888888888 3 00000000000000000 00000 00000000000000000000000000000000000000000 4 999 7 666 7 88 22 0 777777 0 888 1111 7 3 00000 7 7 22 22 7 7 7 22 7 2222222222222222222222222222222 00 888 00000 7 7 99 3 0 7 333333 99 4 4 2 4 4 4 0 5555555 0 88888 0 55555 0 77777777777 55 0 0 0 99 55 0 0 0 0 555 33333 0 00 0 55555555 222 9 4 666666666 0 0 55 111 00000 0 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 9 2222 4 66 4 66666 4 0000000000 4 4 4444444 4 222 4 4 66 4 0 999999999 666 55 55 333333333 0 555555 3333333333333333 9 4444444444 4 11 11 4 444444 00 4 0000 4 4 4 4 11 66 4 99999 66 44 8888888 11 4 44 0 0 222 6666 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 99 99 0 0 0 0 0000000000000000 7 3333 22 22222 5 22 7 2 88 7 000000000000000000000000000000000000000000000000 888 0 0 222222 7 222222222 5 88 888 0 99 11 66 3 000000000 7 11 0 9999 7 111111111 1 44444444 2222222 0 0 00 0 0 0 7777 7
consensus : NNGTAATGGTGCTAAGTTTGATT-AGTGGGC-TAT---G-TTTT-TATATTCA-T-ACATA---CACACCCTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTC-AC-ACC-ACT--ACA--AGGTACACTTACA---ATA-TATAT-CCTTGGGGGATTTGA--TCATGG-GTCT-----G---A--GTGTGGTCA-TTT--GTATGAAGGGT-TTTATT-GGTC-AGTTTT-TGT-CAAGTTCTATT-TGGTTGGTTTTTC--TTG-TCTTGC-CGCCAG-TTTTGAG-A---------A---------TGATC---------CGGGAC-CTTTGTAGAGATTAGA--C-C--GA-ATTTTCAGACAAAGACGGACT-----ATTTTGA--TAT-AGA---------------GACTTTG--AATTCTTCA-TT-TCCCTGGTAAG--TNACA--TA--TTTATAC-TAAT----TTCCTTTGCTACTG-----GTC-TA-TTTAAAAG--TC--TA-T-C-TATA--GA-TA-T---T-GCA----A---TA--AA--CG---TTCCCATTC--GCAA-A---TT-CACNAAAT--GATTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TGNGAC-TTA-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA-----T--AA-T-GT-A-AGGT-G-NTAT--A-AAT-CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--TA-TA----T---GTC---AAA-A-GTA-------TTT-G-A--TGA-C-TTT-----G-TTCAAA--A----T--G--CA------------A-CT-GA----TAT-T--------------T---------------A-T-T-----------GC----ATGT-A-AA-TAG-TG--ATTT-T-----AC-AT--C--CA--TGGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-G------TAGA-T-------CT-AA-GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-AGT--AT-NT-TCT--G-AG-GGA-A-G-CT--TC--T-TCT----CATA--GAGG-GGTA-C----GT--TAG-AC-A-GT-A-T-TG----TT---NTACT---A-----T--TA---T-----A--CAA--T--A-CTTT-TA-N--------AA--TA-----TAT-T-A-TT--G--GGAG-AA-A-TGC-TA-T--TT--GACT-A--AATA-ATGG--ATTT--AAGAG--T--TATCGCCCTTAACCGATTA-AACGT-ATCT-TA--T---TG----GA-ATC-AGT-GAAT---A-TG-A-ATT---TNT--TTTACTACTGTATAG-GNT-TCTCATTGTTAGATTTAT-GCTATA-----TTGTTGTGTTACTATAT--TT-C--AGGGC-TATCTT--TTCCTTAT---T-TTTC-CTT-ATACTGAT--TTCCATCACT---GT--CCGAATAAATTGTTTATAGAACCTGAACCCCTACAGG-AG--TTTTG-TTA-TTCATTGGAGGAAAA-CC-CTNTTG
Reference ( gi|1 ) : TGGTAATGGTGTTAAGTT-GATT-AGTGAAC-TAC---G-TTTT-TATATT-A-T-A-ATA-ACTACATCTTTAGATATTTAGATCCACCCCATTATTT-AC-ACCGACT--ACA--AGGTACACTTACA--CATAGTATAC-CCTTAGGGAGTTTAA--TCATGGCGTCT-----A---T--GTTCGGTCAATTT--TTATGAAGGGT-TTTATTTGGTC-AGTTTTGTGT-CAAGTCCTATT-TGGTTGTTTTTTC--TTG-TTTTGC-CGCCGG-TTGTGAG-A---------A---------TG------------CAGGACTCTTTGCAGATAATAGA--C-C--GA-ATTTTCCGAAAAAGACAGATC-----ATTTTGA--TAT-AGA---------------GACCTTA--AATTCTTCAATT-TCCCTGGTAAG--TAACA--TA--TCTATAT-TAAT----TTCCTTTGTTACTG-----GTC-TA-TTTAAAAG--TC--TA-T-C-TATA--GA-TA-T---T-GCA----A---TA--AA--CA---TTCCAATTC--GCAA-A---TT-CACTAAAT--GACTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TGGGAC-TTA-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA-----T--A--T-AT-A-AGGT-G-TTAT--A-AAT-CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--TA-TA----T---GTC---AAA-A-GTA-------TCT-G-A--TGA-C-TTT-----G-TTCAAA--A----T--G--CA------------A-CT-GA----GAT-T--------------T---------------A-T-T-----------GC----ATGT-A-A--TAG-TG--ATTT-T-----AC-AT--C--TA--TGGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-G------TAGA-T-------CT-AA-GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-AGG--AT-AT-TCT--G-AG-GGA-A-G-CT--TC--T-TCT----CATA--GAA--GGT--C----GT--TAG-A--A-GT-A-T-TG----TT---ATACT---A-----T--TA---T-----A--CAA--T--A-CTTT-TA-A--------AA--TA-----TAT-T-A-TT--G--GGAG-AA-A-TGC-TA-T--T---GACT-T--AATA-ATTG--ATTT--AAGAG--G--TATCGCCGCTAATCGATTAGAACGT-ATCT-TA--T---TG----GACATC-AGT-GAAT---A-TGCA-ATT---TTT--TTTACTACTGTATAG-GAT-TTTCATTGTTAGATTTAT-GC-ATA---C-TTGTTGTATTACAATA---TT-C--AGGGC-CATCTT--TTCCTTAT---TGTTTC-CTT-ATACTAAT--TTCCATCACT---GT--CTGAATAAATTGTTTATAAAACTTGAATCCTTAAAAG-AG--TTTTG-TTA-TTCACTGGAGGAAAAATC-CTCTTG
gi|3 : GTAATAGTGCTAAGTTTGATT-AGTAGCCATAT---G-TTTT-TATATTCA-T-ACATA---CACACCCTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTC-AC-ATC-ACT--ACAC-AGG-ACACTTACA--AATGATAT---CCTTGGGGC-TTTGA--TCATGG-GTCTTGAGAG---T--GT-CAGTTA--TT--TTATGAAGGGT-TTTATTGGGTCCAGTTTTTTGTACAAGTTCTATTGTGGTTGTTTT--C--TTC-TCTAGCGCGCATT-TTTCGAG-A---------AC--------TGTTAATCTAACTCCAGG--CCTTGGTAGAGTTTAGAACC-T--GC-ATTTTC--------GCA--CT-----ATTTTGACTTAT--GA---------------AACTTTT--GAATCTTCATTT-TC--TGGTAAG--TTACT--TA--TTTATACATAAT----TTCCTTTGCTACTAA----GTCATA-TTTAAAAGAGTC--TA-T-CCTTTA--GA-TA-T---TTGCA----A---TATAAA--CG---TCC--ATTT--GCAACA---TTATACAACAT--GAATTGAC-GA--G-T-GAGTAAA--TAGAAC-TTA-TTG--TAT--GAAAT-CA----GT-A-GT--C--TTATA-----TAT-ATTCCTA-----CTAA--T-GT-A-AGGT-G-ATAT--A-AAT-CA-G-T-TAC---TAAGG--ATT-TC-TA-TATT--T---GTC---AAACA-GTA-------TTT-GCA--TGA-CTTTT-----G-TTCAAATGAGCACC--G--CC------------A-TT-GA----TAT-TTTTAGTATTAAATCT---------------A-T-T-----------AC----ATGT-AGA--TAGTTG--ATTT-T-----ACAAT--CA-CA--TGGA-T-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-G-GTCTA--A--ATC---C--TACA--T--G-T--C-CATG------CAG--T-----------A-GA-AT------T---TGTC-A--TCAA-GCTAGT--AT-TT-TCT--GCAG-GGAGA-G-CT--TC--T-TC-----CATAC-GAAG-GGTA-C----GTTATAG-AC-A-GTAA-T-TG----CT---AT-TT---A-----TTCTA---T-----C--TAAT-T--A-CTTT-TA-T--------AA--CA-----TAT-TAA-TT--G--GGAG-AA-A-TGC-T
gi|2 : TAATGGTGTTAAGTTTGATT-AGTGG-C-TAT---GGTTTT-TATATTCA-T-ACATA---CACACTTTTAGAT-CCTAGACCCACCCCTTTATTT-AT-ACC-ACT--ACA---GGTACACTTACA---ATA-TATATACCTTGGGGGCTTTAA--CCATGA-GTCT-----A---A--GTTTGGTCA-TTT--GTATGAAGGAA-TTTATT-GGTC-AGTAT-GTGT-CAAGTCTTATT-TG-TTGGTTTTCC--T-G-TCTTGC-CAACTG-TTGTGAG-A---------A---------TG------------CAAGAC-CTTTTCGGACATTAGA--C-CT-GG-ATTTTCAGACAAAGACAAATC-----ATTTTGA--TACGAGACCTCATTTTGATACGAACCTTG--AATTCTTCA--T-TTCCTGACAAG--TAACA--TA--TTTATAT-TAAT----TTCCTTTGCTACTG-----GTC-TA-TTTAAAAG--TC--TA-TAC-TATA--GA-TA-C---T--------------------------TCCCATTC--GCAA-A---TT-CACTAAAT--GATT-AAA-GA--GG--GAGTAAA--TGCGAC-TTA-TTG-TTAG-AGAAAT-CA----GT-A-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA-----T--AA-T-GT-A-AAGT-G-TTAT--A-AAT-CAAGTT-TA---GTA--G--AAT-TA-TA-TT----T---GTG---AAC-A-GTA-------T-T-G-A--TTA---TTT-----G-TTCAAA-------T--GAGCA------------A-TT-GA----TAT-T--------------TTAATATTTAAT----A-TAT-----------GC----ATGT-A-AA-TAG-TA--ATTT-T-----AC-ATA-C--CA--TGGT-A-GT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--TACA-G------TAGA-T-------CT-A--GA-ATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-AGT--AT-AT-TCT--G-AG-GGA-A-G-CTAGTC--T-TCT----CATA--GAA--GGGA-C----GT--TAG-A--A-AT-A-C-TG----TTTGTATACT---AATCTAT--TAATTT-----AATCAG--TTGG-TTTA-TA-C--------AC--TA-----T-T-T-A-TT--GT-GGAG-AA-AATGC-TA-T--TT--GACT-A--AAAATATGG--ATTT--AAGAG--T--TAT-GACGCTAACCGATTAAAGTG----CT-TAAAT---TGTAATAATAT--AGT-GA-T---ACTGAATATT---GTT--TTTACTACTGCATAAAGCTGTTTCATTGTTAGATTTAT-GCTATA-----TTGTTGTATTACTATA---TTTC--AGGAT-TATCTT--TTCCTTAT---TGTTTC-CTT-ACACTAATG-TTCCATCACTG--GT--CTGAATAAATTGCTTA
gi|13 : GTGCTAAGTTTGATT-AGT-AGC-TAT---G-TTTT-TATATTCA-TTC-ATA---CACACCCTTAGAT-------TCAACCCT-TTATTC-AC-ATC-ACT--ACACAAGGTACACTTACAATC-TA-TATAC-C-TTGGGGGATTTGA--TCATGG-GTCT-----G---A--GTGTGGTCATCTT--GTATGAAGGGTCTTTATT-GGTC-AGTTTT-TGT-CAAATTCTCTT-TAGTTG-GTTTTC--TTG-TTTTGC-CGCCAG-TTTTGAG-GACAGTTAATA---------TGATC---------CGGGA--CCTTGTAGAGATTAGA--C-A--TG-ATTTTCAGACTAAGACGGACT----------------T-AGA---------------GATTTTG--AAATATTC-ATT-TC
gi|16 : aTGCTAAGTTTGATTTAGTGG-C-TATTTGG-TTTTATATATTCA-T-A-GCGTAC-ACACTTTTAGAT-CTTAGATCCACCCC-TTATTTAAC-AC--ACT--ACA----GTACACTtgggttatcttctttcttttctctttttcttt
gi|12 : AAGTTTGATT-AGTAGGC-TAT---G-TTTT-TATATTCATT-C-ATA---CACACCCTTAGAT-------TCAACCCT-TTATTC-AC-ATC-ACTACACA--AGGTACACTTACA--TCTA-TATA--CCTTGGGGGATTTGA--TCATGG-GTCT-----G---A--GTGTGGTCAATCTTGTTATGAAGGGTCTTTA-TTGGTC--GTTTT-TGT-CAAATTCTCTT-TAGTTGGTTTTGCCTTTGTTTTTGC-CGCCAGTTTTTGAG-GACAGTTAATA---------TGATC---------CGGGAC-CGTTGTAGA-GATTGA--CAT--GA---TTTCAGACTAAGACGGACTTAGAGATTTTGA--AAT-A
gi|8 : gtggctaTT-AATT-AGT-AGC-TAT---G-TTTT-TACATTCA-T-ACATA-A--ACACCTTTAGAT-CTTAGATAAACCCCTTTATTT-AC-ACC-ACT--ACA---GGTACGCTTAC----------------TTGGGGGCTTTGA--TCATGG-GTCT-----G---A--GTGTGGTCA-TTT--GTATGAAGGGT-TTTTATTGGTC-AGTTTT-TGT-CAAGTTCTATT-TGGTTG-GTTTTC--ATG-TCTTGC-TGCCAG-TATTGAGAA---------A---------TGTTAATACAATC-CAGGA--CCTTGTAGAGATTAGA--CAT--GAGATTTTCAGACAAAGAC--------------TGA--CTT-AGA---------------GACTTTG--AATTCTTC---T-TTTCTGGTAAG--TTACT--TA--TTTTTAC-TAAT----TTCCTTTGCTACTA-----Gttcatcttctgggttatcttcttttcttttctcttt
gi|11 : gtACT-AGTGG-C-TAT---G-TTTT-TATATTCA-T-ACAT---TCACG-CTTTAGAT-CTTAGATCCATCCT-TTATTT-ATTACC-ACT--ACA---GGTACACCTACA---ATA-TATATACCTTGGGGGATTTAAGTCCGTTGAGTCT-----GGAGTCAGTTTGGACA---T--GTATCAAGGGT-GT-ATGGGG-C-A-TTTTGTCT---AGTTCTATT-TGGTTGGTTTT-C--TTG-TCTTGT-GGCCAA-TTTTGAG-A---------ACAGTTAATATGAAC---------CAGGAC-CTTTGTGGG-AATTAA--T-CTTAA-ATTGTTAGACAAAGACAGACC-----ATTTTGA--TAT-ACA---------------GACTTTG--AATTCTTCACTT-TC--TGTTAAG--TAACA--TAA-TTTATAC-TAAT----TTCCTTTGCTACTG-----GTC-TA-TTTGAAAG--TC--TA-TCC-TATA--GA-TATT---T-GGA----ATG-TA--AA--C----TTCCAATTT--GCAA-T---TT-CACTAAAT--GATTGAAA-GA---GT-GCGTAAA--TGCGAT-TTA-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcctataatgtaaggtgatatgaatcagtttacataaattttatatttgtcaaaagtatttgatgacattgttcaaaatgagcaatttgatattttagcatatattatctattcataggcgccttggtcaatgatattgttatatatcagt
gi|5 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnGA---------------AACCTTT--GATC--TCA--T-TTCCTGGTAAG--TAACAAGTGATTCTAT-T-TAGTAAAATTCC-TTGCTACTG-----GTC-TAGCTTAAAAG--TC--TA-TAC-TATA--GATTA-TGTGT-GCAAAATA---TA--AGACCACTCTTCCCATTCTTGCAA-AACCTT-CACGAGGTCAGATTAAAATGA--GGGAGAGTAA
gi|4 : acA---------------GACTTCAGGAATCCTTTATTTGTTCGTGGTA-GCTTTACA---A--T-TATGT-TAAA----TTCCATA--TACTAAATAAGTC-AA-TTTATAAG--TTGTTACT-C-CACACTAC-TA-CC--T-GCA----AATATA--AA--CG---TTTTATTAT--GCAC-T---TT-TACAAAAT--GATTGAAA-GACCAGT-GAGCGAAATTGAGGCAAAA-TTTACTATGAAAAAT-TATAC-ATGA-A----------A-----TATATCTCCTA-----T--AAGT-AT-G-TGAT-A--TAT--A-AAT-CA-GCTGTAC--ATA--G--ATT-TTATA-TA----T---GTC---AAA-AGGTA-------TTT-G-A--TGACC-TTT-----GATTAGAA--A----T--G--AG------------A-AC-GATTTTGAT-T--------------TTTTATTTAATTAATAA-T-T-----------TCACTAATGTGA-G--TAG-TGT-ATTT-T-----AT-ATTGC--C---TGGC-A--T-------TT-GT---C-ATAATC-CATA-AAG------G--ATTC--CTATACA--T--G-T--G-CA-A------ATGT-T-------CT----GAGATTTA--AA---TGTC-C--T--A-GC-TGT--AT-TT-CCT-------GGA-A-A-TT--AA--TGTCC----CATACCAGG--GGTA-C----GT--TAA-AC-A-GT-A-A-TG----TT---TGACT---A---------A---T--------CAT--T--ACCTTT-TA-T--------AA--C------TTT-T-A-TT--G--GAAG-AA-A-TAC-gactgccgaatctttccatatgccgtaaaaatattcttaatttgttgagtataaatcgcagggtaagtcgatttaataaatattttcctaaatactgtacaaggtgattatataatgcaagttgacgtgataattattatatttctgtaaacagtaacaagacttgatcttaatgagttcaaaaaatgagcaacttgatattatttaatactgaatacttgcacgtaaattgtgatttttatatacaacaacatggtaactttatgtttaaatgttatatgagatgaattggtttaattgtcatcagtagatcttgagattttttacacgatgcaagttatgattctttgagtggaatgcttccttctcatagagggtacgttagaatgtactcgagtcttctaatcttatcttaaatattacttttataaatctatgtatttggcggagaagatgcttattatgactaaaatagtggatttacaagaggtttatcgcccttaaccgattaacgtatcttactaatggaaatcagtgaacggaatgaattgttt
gi|17 : taattacattactaagcaaagatacacttcaacaactcaaattgctcacatgggggcttctgatgaagtggctctgggagtaaatcatttcgtgtggaggttatttcattgtcatgttgtgtaaaggtggtaaaatttggattgcttagccctgattgccctatttttaccgatggcagaactttaatatttccagaacattgtggacagtagacatgcattttagcaccaataatgaggacttgcAT----TCCCTTTGCTACTA-----GTC-AA-TTTAAAAG--TC--TA-TCC-TACA--GA-TATT---T-GCAAT--A---TA--AA--C----TTCCCATGT--GCAC-A---TT-TACTAAAT--GATTGAAA-GA---GT-GActaatgtctagcaaaacaat
gi|7 : AAT--GATTGAAA-GA--G-T-GACTAAA--TGAGGC-AAA-GTGACTGT-GATAAT-TA----GTAATGC--A--TA-TA-----TAT-T--CCTA-----A--AG-T-GT-A-AGGT-G-ATAT--A-AAT-CA-GTT-TAC--ATA--A--ATT-T--TA-TATT--T---GTCA--AAA-A-GTA-------TTT-C-A--TGA-C-CTT-----G-TTCGAA--A----TGAG--CACGTTGGTATTTTA-TT-AT----AAT-T--------------C---------------A-T-T-----------GC----TTGT-ATG--TAG-TT--ATCT-T-----AC-AT--A--CA--TGTC-A-CT-------TT-GT---T-A-TTT--TATA-GTA---T--A--ATTC--C--TAGA--T--G-T--G-CA-GTTATTCTAGA-TGAACGCCCT-AGCGATATTCTAGATGAACGCC-C--T--A-GC-GGT--AT-TT-TCT--G-AG-GGT-A-G-TT--TC--G-ACC----AATA--CAG--GGGCAC----GT--TAG-AC-A-GT-A-A-TG----TT---GTTTT---G-----A--TA---T-----G--TTAGGT--A-CTTT-TA-T--------AA--T------TAT-T-A-AT--G--GAAG-AA-A-TAT-TA-T--T---ATCG-CAAAATA-ATGT--ATCT--AAGAC--T--TATCCCCTTTAACTGATTA-AGGGT-AT-T-TA--T---TA-------ATC-A----------A-TGCG-ATTGGATGTGGTTTA-----GTTTAA-GAT---------TTAAATTGAT-GT-TTT---T-TTGCTGT-TTA-AGTATGCTT-C--AGGGC-GA------TTACCTAT---CCTATG-CTT--TACTG----TACCATTA-----------GAATGAATTATTTAC---ACCTGAA-CCCTACGGG-AG--TTTTA-TTA-CTCA
gi|10 : gT-GAGTAAA--TGGGAC-TTAATTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTT-----A--A--T-AT-A-AGGTTG-TTAT--A-AAT-CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--TA-TA----TTT-GTC---AAA-A-GTA-------TCT-G-A--TGA-C-TTT-----G-TTCAAA--A----TG-G--TA------------A-CT-T-----GATGT--------------T---------------A-T-T-----------GC----ATGTAA-A--TAG-TG--ATGT-T-----AC-A------TA--TGGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--GTT--T-CA-G------TAGA-T-------CT--A-GAGATT----AT---TGT--C--T--A-GC-AGT--AT-AT-TCT--G-AG-GGA-A-G-CT--TC--T-TCT----CATA--GAAG-GGT--A----GT--TAG-A--A-GT-A-T-TG----TT---ATACT---A-----T--TA---T-----AT-CAAT-T--A-CTTT-TA-T--------AA--TA-----T-T-T-A-TT--G--GGAG-AA-A-TGC-TATT--T---GACT-A--AATA-ATTG--ATTT--AAGAG--T--TATCGCCCTTAA-CGATTA-AACGT--TCT-TA--T---T-----GACATC-AGT-G-AT---A-TG-A-A-----TAT--TTTACTACTGTATAG-GG--TTTCATTGTTAGATTTAT-GCTATA-------GTTGTATTAACTTAT--TT-C--AGGGC-TATCTT--TTCCATAG---T-TTTC-CTT-ATACTAAT--TTCCATCACTG--GT--CTGAATAAATTGTTTATAAAA-TTGAATCC-TAAAAG-AGTTTTTTG-TTA-TTCACTGGAGGAAAAACCGCTTTTGtactacaagaacacattgttccataacgattgacatgat
gi|6 : aT-GAGTAA---TGAGAC-T-A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GT-A-GT--A--TT-T------TAT-TTTCCTA-----T--AA-T-GTTA-AGGTTG-ATAT--A-AAT-CATGTT-TAC--ATA--G--ATG-T---A-TA----TTTTGTT---CAA-A-GCA-------TTT-G-----GA-C-TTT-----G-TTGAAA--A----T--GAGCAC-----------A-CTCGA----TAT-T--------------TTAGT-----------A-T-TTTAAATCTATAAC----ATGT-A-AATTAG-TG--ATTTAT-----AC-AC--C--CACATGGTTA-CT-------TTTAT---T-A-GAT--TATA-GAGT--A--G--ATTATCC--TACA--TTAG-T--C-CA-G------TAGA-T-------CT-AG-AAGAT-----AT---TGTT-CCTT--A-GC--GT--AT-TTGTCT--G-AG-GGA-A-GGCT--TC--T-TCTGTCCCACA--GAAAGGGTG-C----GA--TAG-ACCA-GT-A-C-TG----TT----TATTTTAA-----TC-TA---T-----T--CAAATT--A-CTTTATA-A--------AC--TA-----T---T-A-CT--G--GGAGGAA-A-TGC-TA-T--TTT-G-CT-A--AATA-ACTGTGATTT--AAGAG--T--TATCTCCCTTAACTGATTA-AACGTTATCT-GA--T----G----GAAATCCAGTAGAGA---A-TGAA-ATAA--TCG--TTTAGGTCAGTATAG-GGC-TC-CATTGTTAGATTTAT-GC-ATA---TATTGTTGTTTTACTATA---TT-C--AGGGC-TATCTA--TTCC---------TTTC-CCT-ATTATGGT--TTCCTCCTGT---GT--CCGAATAAAATATTT---AGACCTGAAC------AGGCAG--TTTCG-TTATTTCATTGAGGGAACA--C-CTCcaataaaattgtgca
gi|9 : AAA--TGCGAT-TTA-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----gttacctaatttgcgcg
gi|5 : gaaatgcaagtagtaaatttatattttcctatagatgtaggggtgtcattgaaatgcagtttaccggtagatttgatgtattgctgtcaaaagtaattaatcttttatgactcttgcgctcaaatgagcaaagcttgaagcttgattagtttttagttaaaatttaaagtctattgctatgtaaaatagtgttatttttacatgacatggtactgttctgcttgtgtgaaattatggagtaggattctctacactggttcagtagagtatgaagagtgtgccttcctagcagtatattctaaaagggaagctttcactctcatagaggggtacgagttagaaagtatcttttgtacttcgtagaatctattaattattggcaatttataagctattatttagggaaaaattctactttggactaaagtatggacttaagagttttacggccttgaaccgattaaacgtatctctatatttgttactttgtttattactgcatcggcttctcattgttagatttagagctataaggattgttttgttactatatttcgagggctcattcttttttcgcttaataAT-TTG-TTGAGTAT-A--AAT-CGCAGGGTAA-GTCGA--TT-TAATAAATAT-TTTCCTAAATACT--G--T-AC-A-AGGT-GATTAT--ATAATGCAAGTT-GAC--GTG--ATAATTAT--TA-TA----T---TTCTGTAAACA-GTA-------ACAAG-ACTTGA-T-CTTAATGAG-TTCAAA--AAA--T--GAGCA------------A-CTTGA----TAT-TATTTAATACTGAA-T---------------ACT-T-----------GC----ACGT-A-AA-TTG-TG--ATTT-TTATATAC-AA--CAACA--TGGT-AACT-------TT-ATGTTT-A-AATGTTATATGAG---ATGA--ATTG--G--TTTAATT--G-TCAT-CA-G------TAGA-T-------CT-T--GAGATT----TT---TTACAC--G--ATGC-AAGTTATGAT-TCTTTG-AGTGGA-ATG-CT--TCC-T-TCT----CATA--GAG--GGTA-C----GT--TAG-A--ATGT-ACT-CGAGTCTT---CTAAT---C-----T--TA---TCTTAAA--TAT--T--A-CTTT-TATA--------AA--TC-----TATGT-ATTT--GGCGGAG-AAGA-TGCTTA-TTAT---GACTAA--AATA-GTGG--ATTTACAAGAG--GTTTATCGCCCTTAACCGATT--AACGT-ATCT-TA--CTAATG----GAAATC-AGT-GAACGGAA-TG-A-ATT---GTT--T
gi|9 : acgaaacctttgatctcatttcctggtaagtaacaagtgattctatttagtaaaattccttgctactggtctagcttaaaagtctatactatagattatgtgtgcaaaatataagaccactcttcccattcttgcaaaaccttcacgaggtcagattaaaatgagggagagtaagactgccgaatctttccatatgccgtaaaaatattcttaGAAATGCAA---GT-A-GT--AAATT-TA-----TAT-TTTCCTA-----TAGA--T-GT-AGGGGT-G-TCATTGA-AATGCA-GTT-TACCGGTA--G--ATT-TGATG-TATTGCT---GTC---AAA-A-GTAATTAATCTTT-T-A--TGA-C-TCTTGC--G-CTCAAA--
gi|8 : TTCCTA-----T--AA-T-GT-A-AGGT-G-ATAT--G-AAT-CA-GTT-TAC--ATA--A--ATT-T--TA-TA----TTT-GTC---AAA-A-GTA-------TTT-G-A--TGA-C-ATT-----G-TTCAAA--A----TGAG--CA------------ATTT-GA----TAT-T--------------T-----------------T-A-----------GC----ATAT-A-T--TAT-CT--ATT---------C-A------TA---GGC-G-CC-------TT-GG---T-C-AAT--GAT--------------ATTG--T--TATA--T--A----T-CA-G------Ttgagcaaagcttgaagcttgattagtttttagttaaaatttaaagtctattgctatgtaaaatagtgttatttttacatgacatggtactgttctgcttgtgtgaaattatggagtaggattctctacactggttcagtagagtatgaagagtgtgccttcctagcagtatattctaaaagggaagctttcactctcatagaggggtacgagttagaaagtatcttttgtacttcgtagaatctattaattattggcaatttataagctattatttagggaaaaattctactttggactaaagtatggacttaagagttttacggccttgaaccgattaaacgtatctctatatttgttactttgtttattactgcatcggcttctcattgttagatttagagctataaggattgttttgttactatatttcgagggctcattcttttttcgcttaatatgatttctataaccaataaatcgcattt
gi|18 : gtttaattagtagctatgtttttacattcatacataaacacctttagatcttagataaacccctttatttacaccactacaggtacgcttacttgggggctttgatcatgggtctgagtgtggtcatttgtatgaagggtttttattggtcagtttttgtcaagttctatttggttggttttcatgtcttgctgccagtattgagaaatgttaatacaatccaggaccttgtagagattagacatgagattttcagacaaagactgacttagagactttgaattcttcttttctggtaagttacttatttttactaatttcctttgctactagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCCTA-----T--A--TTGC-A-AGGT-G-ACGT--A-AAT-CA-GTT-TAC--ATA--T--ATC-T--TATTA----T---G
gi|9 : attattatatatatatacacaT-G-A--TTA-G-TTTTTA--G-TT-AAA--A----T--T--TA------------A-----A----G-T-C--------------T---------------A-T-T-----------GCT---ATGT-A-AAATAG-TGTTATTT-TT----AC-ATGAC---A--TGGT-A-CTGTTCTGCTT-GTG--TGA-AAT--TATG-GAG---T--AGGATTCT-C--TACA--CTGG-T--T-CA-G------TAGAGT-------ATGAA-GAGTGT----GC---CTTC-C--T--A-GC-AGT--AT-AT-TCTAAA-AG-GGA-A-G-CT--TTCAC-TCT----CATA--GAG--GGG--TACGAGT--TAGAA--A-GT-A-TCTT----TT---GTACT---------T--CG---T-----A--GAA--T----CTAT-TA-ATTATTGGCAATTTATAAGCTAT-T-A-TTTAG--GGAA-AA-A-TTC-TA-C--TTTGGACT-A--AAGT-ATGG--ACTT--AAGAGTTT--TACGGCCTTGAACCGATTA-AACGT-ATCTCTA--T----------------------AT---T-TGTT-ACT---TTG--TTTATTACTGCATCG-GCT-TCTCATTGTTAGATTTAGAGCTATAAGGA-TTGTTTTGTTACTATA---TT-TCGAGGGCTCATTCT--TT-----------TTTCGCTTAATA-TGAT--TTCTATAACC----------AATAAATCGattttgttcatcttattatgaccttgtt
gi|19 : gaaatgcaagtagtaaatttatattttcctatagatgtaggggtgtcattgaaatgcagtttaccggtagatttgatgtattgctgtcaaaagtaattaatcttttatgactcttgcgctcaaatgagcaaagcttgaagct---A--A--ATC---C--TACA--T--G-T--C-CATG------CAG----------------GAGAT-----AT---TGTC-A--T--A-GC-TGT--AT-AT-TCT--G-AG-GGG-A-G-CT--TC--T-TCC----CATA--GAAG-GGTA-C----GT--TAG-A--cattt
gi|21 : agtTCATTGTTAGATTTAA-GCTATA-----TTGTTTTGTTACTATAT--TT-C--AGGGC-TATCTcatt
gi|14 : ATC---TT-C--TGGGT-TATCTTCTTTTCTT-T---TCTCTT-TTT-CTTTTAGCGGTTCCATCACTCGTGT--C-GAATAAACTATTTTTAGACCCTGTAACCCTACAGG-AG--TTTTGTTTA-TTCATTGGAGGAAA
gi|15 : ttc---TT-C--TGGGT-TATCTTC-TTTCTTTTCTCTTTTTC-TTT-ATACGG----TTCCATCACT---GTGTCCGAATAAAT-ATTTTTAGA-CCTGAACCCT-ACAGG-AG--TTTTG-TTA-TTCATTGGAGGAAAACCC-CTGTTccgcctgttacattt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): GTCATAGTGCTAATTTTGATTAGTGGCTATGTTTTGATATGCATACATACACAC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2 1 111 11111 222 1111 11 111111111 11 111111 11111111 00000000000000000000000000000000000000000 2222222 6666666666666666666666666666666 22222 22222222 2 5555555555555555555555555555 1111 11111 111 1111 1 11111 1 11 2222222222222222 111 2222222 111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 11111 22222 1111111 111 111111111 111 11 111111 3333333333333333 11111 111 11 11111 6666666666666666666666666666666666666666666666666 11111 111 11 1 11 222222222222 1111 222222222222222222222222 1111 111111 11 222222222222 2222222 1 1 1
lowQualScore : 5 4 7 4 777 4 4 4 66 0 5 0 0 4 4 4 66 66 777 4 66 55 11111 000 0000 4 5 5 33 5 555555555 5 5 11 5 999 000000 5 66 5 5 5 5 888 5 5 88 3 66 5 5 5 5 88888888 5 22222222222222222222222222222222222222222 2 5 6 0 1 66 8888888 999999 0 1111111111111111111111111111111 4 66 4 4 11111 1 00000000 5 5 99 5 66 5 5 5 77 77 5 8 77 5 0000000000000000000000000000 4 2222 44444 5 1 66 5 5 777 0 55 1 3 1 4 4 4 3 7777 5 4 88888 4 11111 4 88 3 3 88 3 3 666 3 55 3 7 0 3 666 66666 3 77 3 9999999999999999 000 7 3 2222222 3 3 3 3 44 111 77 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222 4 4 4 99 4 44444 4 44444 55 4 4 4 3333333 4 111 4 4 99 4 0 888888888 666 55 55 00 3 8888 7 000000 4444444444444444 2 99999 777 4 55 55 4 000 8888 1 4 4 55 4 4 4 4 55 4 99 88888 8 77 55 55 44 4 11111 777 66 0000000000000000000000000000000000000000000000000 4 11111 1 444 4 4 4 22 8 4 4 4 9999 4 0 66 5 5 5 5 77 77 33 5 5 0 5 0 5 666666666666 7777 666666666666666666666666 6 5 6 1 5555 5 5 222222 4 5 5 4 0 33 666666666666 5 5 55 2 999 0 3333333 99999 7 5 6 99 6 6 6 999 6 1
lowQualScore : . . . . ... . . . .. . . . . . . . .. .. ... . .. .. ..... ... .... . . . .. . ......... . . .. . ... ...... . .. . . . . ... . . .. . .. . . . . ........ . ......................................... . . . . . .. ....... ...... . ............................... . .. . . ..... . ........ . . .. . .. . . . .. .. . . .. . ............................ . .... ..... . . .. . . ... . .. . . . . . . . .... . . ..... . ..... . .. . . .. . . ... . .. . . . . ... ..... . .. . ................ ... . . ....... . . . . .. ... .. ............................................................................... .... . . . .. . ..... . ..... .. . . . ....... . ... . . .. . . ......... ... .. .. .. . .... . ...... ................ . ..... ... . .. .. . ... .... . . . .. . . . . .. . .. ..... . .. .. .. .. . ..... ... .. ................................................. . ..... . ... . . . .. . . . . .... . . .. . . . . .. .. .. . . . . . . ............ .... ........................ . . . . .... . . ...... . . . . . .. ............ . . .. . ... . ....... ..... . . . .. . . . ... . .
lowQualScore : 0 4 9 4 888 4 4 4 11 5 0 4 7 4 4 4 11 11 999 4 99 11 11111 111 6666 9 0 0 88 0 222222222 0 0 99 0 444 111111 0 99 0 0 0 0 888 0 0 88 9 99 0 0 0 0 11111111 0 00000000000000000000000000000000000000000 0 0 2 1 4 99 9999999 000000 5 2222222222222222222222222222222 4 11 9 4 11111 0 77777777 7 7 77 0 99 0 7 7 99 99 7 6 99 7 9999999999999999999999999999 3 7777 11111 7 0 99 0 0 666 8 55 0 6 1 0 8 0 6 7777 8 4 66666 4 11111 4 66 6 6 66 6 6 000 6 00 6 3 9 6 888 66666 6 33 6 2222222222222222 000 3 6 3333333 3 3 3 3 66 777 99 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5555 0 0 0 55 0 00000 0 66666 55 0 0 0 0000000 0 000 0 0 55 0 9 333333333 000 00 00 00 6 1111 3 555555 4444444444444444 5 77777 000 0 55 55 0 666 5555 0 0 0 55 0 0 0 0 55 0 55 99999 0 00 55 55 00 4 11111 888 11 6666666666666666666666666666666666666666666666666 4 11111 0 222 8 4 4 22 9 4 4 4 4444 4 0 99 0 0 0 7 99 99 66 7 7 7 7 1 7 444444444444 9999 777777777777777777777777 7 2 7 0 1111 7 7 666666 0 7 1 4 8 88 000000000000 0 0 44 5 000 4 8888888 22222 7 2 7 22 7 7 0 222 0 0
consensus : NNGTAATGGTGCTAA-GTTTGATT-AGTGG-C-TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCTTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACT--A--CA--AGG-TACACTT--ACA-ATA-T-ATATAC-CT----TGGGGGNTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--G-T-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTTTC--TTG-TCTTGCCGC-CAG-TTTT-G--------AG-A---------AC--------TG--------A------T----CCAGGAC-CTTTGTAGAGATTAGA--CAC--GA-ATTTT--CA--GACAAAGACGGACTATTTTGA--TAT-AGA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCA-TTT--CCCTGGTAAGTNACA--------T-ATTTA-TAC-TAATTTCCTT-TGCTA--CT-GGTC-TA-TTTAAA--AGTC--TA-TCCTATA--GA-TATT---TGCAA---A---TAA-AC-----TTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA--GGTGAGTAAA--TGNGAC-TTA-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--AT-AT--A-AAT-CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--TA-TATT--T---G-------TC---AAA-A-GTA-------TT-TG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-A-C-----T-GA-----TATT--------------T-A-T-------A-T-T-----------GC----ATGTAAA-T-AG-TG--ATTT-T-----AC-AT--C--CA--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-G------TAGA-T-------CT-AA-GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GT----ATNT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAG-GGGTACG--T--TAGAC-AGT-A---T-T---GT--TN------TA--CT---AT--TA---T-----A--CAA--T---------A-CT-----TTTATAA-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TG-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AACCGATTA-AACG-TATCT-TA--TT----GAA-AT----CAGT-G-AAT---A-TG-AAT-T--TNTTTT-ACTACTGTATAG-GNT-TCTCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTNTT-ACTATATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCTT---AT---T-TT-TC-CTT-ATACTGAT-TTCCATCACT-GT--CCGAATAAATTGTTTATAGAACCTGAA-CCCTACAGG-AG--TTTTG-TTA-TTCATTGGAGGAAAAA-C-C-CTGTTG
Reference ( family-533 ) : NNGTAATGGTGCTAA-GTTTGATT-AGTGGGC-TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCCTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTCAC-AC-C-ACT--A--CA--AGG-TACACTT--ACA-ATA-T-ATAT-C-CT----TGGGGGATT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--G-T-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTTTC--TTG-TCTTGCCGC-CAG-TTTT-G--------AG-A---------A---------TG--------A------T----CCGGGAC-CTTTGTAGAGATTAGA--C-C--GA-ATTTT--CA--GACAAAGACGGACTATTTTGA--TAT-AGA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCA-TTT--CCCTGGTAAGTNACA--------T-ATTTA-TAC-TAATTTCCTT-TGCTA--CT-GGTC-TA-TTTAAA--AGTC--TA-T-CTATA--GA-TA-T---TGCA----A---TAA-AC----GTTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACNAAAT--G-ATTGAAA-GA--GGTGAGTAAA--TGNGAC-TTA-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--NT-AT--A-AAT-CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--TA-TA----T---G-------TC---AAA-A-GTA-------TT-TG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-A-C-----T-GA-----TATT--------------T-----------A-T-T-----------GC----ATGTAAA-T-AG-TG--ATTT-T-----AC-AT--C--CA--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-G------TAGA-T-------CT-AA-GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GT----ATNT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAG-GGGTACG--T--TAGAC-AGT-A---T-T---GT--TN------TA--CT---AT--TA---T-----A--CAA--T---------A-CT-----TTTANAA-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TG-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AACCGATTA-AACG-TATCT-TA--TT----GGA-AT----CAGT-G-AAT---A-TG-AAT-T--TNTTTT-ACTACTGTATAG-GNT-TCTCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTGTT-ACTATATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCTT---AT---T-TT-TC-CTT-ATACTGAT-TTCCATCACT-GT--CCGAATAAATTGTTTATAGAACCTGAACCCCTACAGG-AG--TTTTG-TTA-TTCATTGGAGG-AAAA-C-C-CTNTTG
gi|1 : GTAATGGTGTTAA-GTT-GATT-AGTGAAC-TAC---G-TTTT-TATATT-ATA--ATAACTACATCTTTAGATATTTAGATCCACCCCATTATTTAC-AC-CGACT--A--CA--AGG-TACACTT--ACACATAGT-ATAC-C-CT----TAGGGAGTT-TAA-TCA--TGGCGTCT---A-----TGTTC-GG-TCAA-T-TT-T-TATGAAGG--G-T-TTTATTTGG--TCAG-TTTTGTGT-CAAGTCC-TA---TT-TGG-TTGTTTTTTC--TTG-TTTTGCCGC-CGG-TTGT-G--------AG-A---------A---------TG---------------------CAGGACTCTTTGCAGATAATAGA--C-C--GA-ATTTT--CC--GAAAAAGACAGATCATTTTGA--TAT-AGA---------------GAC-CTT--AAATTCTTCAATTT--CCCTGGTAAGTAACA--------T-ATCTA-TAT-TAATTTCCTT-TGTTA--CT-GGTC-TA-TTTAAA--AGTC--TA-T-CTATA--GA-TA-T---TGCA----A---TAA-AC----ATTCCAATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ACTGAAA-GA--GGTGAGTAAA--TGGGAC-TTA-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--T--ATAT-A--AGG-T-G--TT-AT--A-AAT-CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--TA-TA----T---G-------TC---AAA-A-GTA-------TC-TG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-A-C-----T-GA-----GATT--------------T-----------A-T-T-----------GC----ATGT-AA-T-AG-TG--ATTT-T-----AC-AT--C--TA--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-G------TAGA-T-------CT-AA-GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GG----ATAT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GA--AGGT-CG--T--TAGA--AGT-A---T-T---GT--TA------TA--CT---AT--TA---T-----A--CAA--T---------A-CT-----TTTAAAA-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-A-T-T--GACTTAA-TA-A-TT-GATTTA--AGAG--GTAT--CGCCGCT-AATCGATTAGAACG-TATCT-TA--TT----GGACAT----CAGT-G-AAT---A-TGCAAT-T--TTTTTT-ACTACTGTATAG-GAT-TTTCATTGTTAGATTTAT-GC--AT----ACTTGTTGTATT-ACAATA-TTC-AGGGCCATCTT--TTCCTT---AT---TGTT-TC-CTT-ATACTAAT-TTCCATCACT-GT--CTGAATAAATTGTTTATAAAACTTGAATCCTTAAAAG-AG--TTTTG-TTA-TTCACTGGAGGAAAAA-T-C-CTCTTG
gi|10 : tgTGAGTAAA--TGGGAC-TTAATTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCT---TA-ATAT-A--AGGTT-G--TT-AT--A-AAT-CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--TA-TATT--T---G-------TC---AAA-A-GTA-------TC-TG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----TG-G--TA-A-CT----T-GA-----TG-T--------------T-----------A-T-T-----------GC----ATGTAAA-T-AG-TG--ATGT-T-----AC-AT------A--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--GTT--T-CA-G------TAGA-T-------CT--A-GAGATT----AT---TGT--C--T--A-GC-A-GT----ATAT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAA-GGGTA-G--T--TAGA--AGT-A---T-T---GT--TA------TA--CT---AT--TA---T-----AT-CAAT-T---------A-CT-----TTTATAA-TAT-T-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TT-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AA-CGATTA-AACG-T-TCT-TA--TT----GAC-AT----CAGT-G--AT---A-TG-AA-----TATTTT-ACTACTGTATAG-GGT-T-TCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A---GTTGTATTAACT-TATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCAT---AG---T-TT-TC-CTT-ATACTAAT-TTCCATCACTGGT--CTGAATAAATTGTTTATAAAA-TTGAA-TCCTAAAAG-AGTTTTTTG-TTA-TTCACTGGAGGAAAAA-C-CGCTTTTG
gi|11 : aACT-AGTGG-C-TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATT--CACGCT-TTAGAT-CTTAGATCCATCC-TTTATTTATTAC-C-ACT--A--CA---GG-TACACCT--ACA-ATA-T-ATATAC-CT----TGGGGGATT-TAAGTCCGTTGA-GTCT---GGAGTCAGTTT-GG-ACA--T----G-TATCAAGG--G-T-GT-ATG-GG--GCA---TTT-TGT-CTAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTT-C--TTG-TCTTGTGGC-CAA-TTTT-G--------AG-A---------ACAGTTAATATG--------A------A----CCAGGAC-CTTTGTGGGAATTA-A--T-CTTAA-ATTGT--TA--GACAAAGACAGACCATTTTGA--TAT-ACA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCA-CTT---TCTGTTAAGTAACA--------TAATTTA-TAC-TAATTTCCTT-TGCTA--CT-GGTC-TA-TTTGAA--AGTC--TA-TCCTATA--GA-TATT---TGGA----ATG-TAA-AC-----TTCCAATT-T--GCAA-T---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA---GTGCGTAAA--TGCGAT-TTA-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----caataaaattgtgca
gi|12 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnGCTAAAGTTTGATT-AGTAGGC-TAT---G-TTTT-TATATTCATT-CATA--CACACC--------CTTAGATTCAACCCTTTATTCAC-AT-C-ACTACA--CA--AGG-TACACTT--AC--ATC-T-ATATAC-CT----TGGGGGATT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCAATC-TT-GTTATGAAGG--G-TCTTTATT-GG--TC-G-TTTT-TGT-CAAATTC-TC---TT-TAG-TTGGTTTTGCCTTTGTTTTTGCCGC-CAGTTTTT-G--------AG-GACAGTTAATA---------TG--------A------T----CCGGGAC-CGTTGTAGAGATT-GA--CAT--GA---TTT--CA--GACTAAGACGGACT-----------T-AGA---------------GAT-TTT--GAAATATTCA-TCT--TCTGGGT
gi|13 : gtgGTGCTAA-GTTTGATT-AGTAG-C-TAT---G-TTTT-TATATTCATT-CATA--CACACCCTTAGAT-T-------CAACCCTTTATTCAC-AT-C-ACT--A--CACAAGG-TACACTT--ACA-ATC-T-ATATAC-CT----TGGGGGATT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--TCTT-G-TATGAAGG--G-TCTTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAATTC-TC---TT-TAG-TTGG-TTTTC--TTG-TTTTGCCGC-CAG-TTTT-G--------AG-GACAGTTAATA---------TG--------A------T----CCGGGAC-C-TTGTAGAGATTAGA--C-A--TG-ATTTT--CA--GACTAAGACGGACT-----------T-AGA---------------GAT-TTT--GAAATATTCA-TTT--Ctatcttcttttcttttctcttt
gi|14 : aTTC-TGGGTTATCTTCTTTTCTT---TTCTCT-TT-TT-CTT-TTAGCGGT-T-CCATCACTCGTG-TCGAATAAACTATTTTTAGACCCTGTAACCCTACAGG-AG--TTTTGTTTA-TTCATTGGAGG-AAAC-CGC-CTGTTtgggttatcttctttcttttctctttttcttt
gi|15 : ttcatcATTTC-TGGGTTATCTTCTTTCTTTTCTCT---T-TT-TC-TTT-ATACGG---TTCCATCACT-GTGTCCGAATAAAT-ATTTTTAGA-CCTGAACCC-TACAGG-AG--TTTTG-TTA-TTCATTGGAGG-AAAACC-C-CTGTTacattt
gi|16 : tattcTGCTAA-GTTTGATTTAGTGG-C-TATTTGG-TTTTATATATTCATAGCGTA--CACACTTTTAGAT-CTTAGATCCACCCC-TTATTTA--ACAC-ACT--A--CA----G-TACACTacatt
gi|17 : ATTCCCTT-TGCTA--CT-AGTC-AA-TTTAAA--AGTC--TA-TCCTACA--GA-TATT---TGCAAT--A---TAA-AC-----TTCCCATG-T--GCAC-A---TT-TACTAAAT--G-ATTGAAA-GA---GTGA
gi|18 : CCTA--TA-TTGC-A--AGG-T-G--AC-GT--A-AAT-CA-GTT-TAC--ATA--T--ATC-T--TATTA----T---GATTTTGTTC---A------TC-------TTATT-ATGA-C-CT--T---G--TT
gi|19 : attattatatatatatacaca---A--A--ATC---C--TACA--T--G-T--C-CATG------CAG----------------GAGAT-----AT---TGTC-A--T--A-GC-T-GT----ATAT-TCTG-A--G-GGG-A-G-CT--TC-T--TCC----CATA-GAA-GGGTACG--T--TAGAC-A
gi|2 : agtTAATGGTGTTAA-GTTTGATT-AGTGG-C-TAT---GGTTTT-TATATTCATA-CATA--CACACTTTTAGAT-CCTAGACCCACCCCTTTATTTAT-AC-C-ACT--A--CA---GG-TACACTT--ACA-ATA-T-ATATAC-CT----TGGGGGCTT-TAA-CCA--TGA-GTCT---A-----AGTTT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--A-A-TTTATT-GG--TCAG-TATG-TGT-CAAGTCT-TA---TT-TG--TTGGTTTTCC--T-G-TCTTGCCAA-CTG-TTGT-G--------AG-A---------A---------TG---------------------CAAGAC-CTTTTCGGACATTAGA--C-CT-GG-ATTTT--CA--GACAAAGACAAATCATTTTGA--TACGAGACCTCATTTTGATACGAAC-CTT--GAATTCTTCA-TTT--CC-TGACAAGTAACA--------T-ATTTA-TAT-TAATTTCCTT-TGCTA--CT-GGTC-TA-TTTAAA--AGTC--TA-TACTATA--GA-TA-C---T-----------------------TCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATT-AAA-GA--GG-GAGTAAA--TGCGAC-TTA-TTG-TTAG-AGAAAT-CA----GT-A-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA-ATGT-A--AAG-T-G--TT-AT--A-AAT-CAAGTT-TA---GTA--G--AAT-TA-TA-TT----T---G-------TG---AAC-A-GTA-------TT--G-ATTA---TT--T---G--TTCAAATGA-------G--CA-A-T-----T-GA-----TATT--------------TTAATATTTAATA-TAT-----------GC----ATGTAAA-T-AG-TA--ATTT-T-----AC-ATA-C--CA--T-GGT-A-GT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--TACA-G------TAGA-T-------CT-A--GA-ATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GT----ATAT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CTAGTC-T--TCT----CATA-GAA-GGG-ACG--T--TAGA--AAT-A---C-T---GT--TTGTATACTAATCT---AT--TAATTT-----AATCAG--TTG-------G-TT-----TATACAC-TAT-T-T-ATT--GTGGAG-AA-AATGC----T-ATT-T--GACTAAA-AATA-TG-GATTTA--AGAG--TTATGACGC---T-AACCGATTA-AA-G-TG-CT-TAAATT----GTA-ATAATATAGT-G-A-T---ACTG-AATAT--TGTTTTTACTACTGCATAAAGCTGTTTCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTATT-ACTATATTTC-AGGATTATCTT--TTCCTT---AT---TGTT-TC-CTT-ACACTAATGTTCCATCACTGGT--CTGAATAAATTGCTTAtt
gi|20 : GTCATAGTGCTAA-TTTTGATT-AGTGG-C-TAT---G-TTTT-GATATGCATA-CATA--CACAC
gi|21 : TCATTGTTAGATTTAA-GC-TAT----A-TTGTTTTGTT-ACTATATTTC-AGGGCTATCT
gi|3 : GTAATAGTGCTAA-GTTTGATT-AGTAGCCATAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCCTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTCAC-AT-C-ACT--A--CAC-AGG--ACACTT--ACA-A-A-TGATAT-C-CT----T-GGGGCTT-TGA-TCA--TGG-GTCTTGAG-----AGTGTCAG-TTA--T-TT---TATGAAGG--G-T-TTTATT-GGGTCCAGTTTTT-TGTACAAGTTC-TA---TTGTGG-TTG--TTTTC--TTC-TCTAG-CGCGCAT-TTTTCG--------AG-A---------ACTGT-----TA--------ATCTAACT----CCAGG-C-CTTGGTAGAGTTTAGAACC-T--GC-ATTTT--------------CGCACTATTTTGACTTAT--GA---------------AACTTTT--GAA-TCTTCA-TTT---TCTGGTAAGTTACT--------T-ATTTA-TACATAATTTCCTT-TGCTA--CTAAGTCATA-TTTAAAAGAGTC--TA-TCCTTTA--GA-TATT---TGCAAT--A---TAA-AC----GT--CCATT-T--GCAACA---TTATACAACAT--GAATTG-AC-GA---GTGAGTAAA--TAGAAC-TTA-TTG--TAT--GAAAT-CA----GT-A-GT--C--TTATA-----TAT-ATTCCTAC-TA-ATGT-A--AGG-T-G--AT-AT--A-AAT-CA-G-T-TAC---TAAGG--ATT-TC-TA-TATT--T---G-------TC---AAACA-GTA-------TT-TGCATGA-CTTT--T---G--TTCAAATGAGCACC--G--CC-A-T-----T-GA-----TATTTTTAGTATTAAATCT-----------A-T-T-----------AC----ATGTAGA-T-AGTTG--ATTT-T-----ACAAT--CA-CA--T-GGA-T-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-G-GTCTA--A--ATC---C--TACA--T--G-T--C-CATG------CAG--T-----------A-GA-AT------T---TGTC-A--TCAA-GCTA-GT----ATTT-TCTGCA--G-GGAGA-G-CT--TC-T--TC-----CATACGAA-GGGTACG--TTATAGAC-AGTAA---T-T---GC--TA------T---TT---ATTCTA---T-----C--TAAT-T---------A-CT-----TTTATAA-CATAT-TAATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-
gi|4 : TAATTAC-AT-T-ACT--AAGCA--AAGATACACTTCAACA-ACT-C-AAAT-TGCTCACATGGGGGCTTCTGA-TGAAGTGG-CTCT---G-----GGAGT-AAATCA--T-TTCG-TGTGGAGGTTA-T-TTCATT-G---TCAT-GTTG-TGT-AAAGGTGGTAAAATT-TGGATTGCTTAGCC--CTG--ATTGCC-C-TAT-TTTT-ACCGATGGCAG-A---------ACTT------TA--------A------TATTTCCAGAAC-ATT-GTGGACAGTAGA--CAT--GC-ATTTTAGCACCAATAATGA-GGACT-----------T-GCA---------------GAC-TTCAGGAATCCTTTA-TTTGTTCGTGGTAGCTT-TA--------C-AATTA-TGT-TAAATTCCATATACTAAATA-AGTC-AA-TTTATA--AGTTGTTACT-CCACACTAC-TA-CC--TGCA----AATATAA-AC----GTTTT-ATTAT--GCAC-T---TT-TACAAAAT--G-ATTGAAA-GACCAGTGAGCGAAATTGAGGCAAAA-TTTACTATGAAAAAT-TATAC-ATGA-A----------A-----TATATCTCCTA--TA-A-GT----ATG-T-GATAT-AT--A-AAT-CA-GCTGTAC--ATA--G--ATT-TTATA-TA----T---G-------TC---AAA-AGGTA-------TT-TG-ATGACC-TT--T---GA-TTAGAA--A----T--GA-GA-A-CGATTTT-GATTTTTTATT--------------TAATTAATA---A-T-T-----------TCACTAATGTGAG-T-AG-TGT-ATTT-T-----AT-ATTGC--C---T-GGC-A--T-------TT-GT---C-ATAATC-CATA-AAG------G--ATTC--CTATACA--T--G-T--G-CA-A------ATGT-T-------CT----GAGATTTA--AA---TGTC-C--T--A-GC-T-GT----ATTT-CCT-------GGA-A-A-TT--AA-TG-TCC----CATACCAG-GGGTACG--T--TAAAC-AGT-A---A-T---GT--TT------GA--CT---A----A---T--------CAT--T---------ACCT-----TTTATAA-C-TTT-T-ATT--G-GAAG-AA-A-TACCTAAT-GTC-T--AGCAAAA-CA-A-T
gi|5 : C-TTT--GA--TCT-CA-TTT--CC-TGGTAAGTAACAAGTGATTCT-ATTTAGTA---AAATTCCTT--GCTA--CT-GGTC-TAGCTTAAA--AGTC--TA-TACTATA--GATTA-TGTGTGCAAAATA---TAAGACCACTCTTCCCATT-CTTGCAA-AACCTT-CACGAGGTCAG-ATTAAAATGA--GG-GAG--AG--TAAGAC-T
gi|5 : acgaaacAT-TTG-TTGAGTAT-A--AAT-CGCAGGGTAA-GTCGA--TT-TAATAAATAT-TTTCCTAAATA-CTGT-ACAAGG-T-G--ATTAT--ATAATGCAAGTT-GAC--GTG--ATAATTAT--TA-TA----T---T-------TCTGTAAACA-GTAACAAGA-CT-TG-AT---C-TTAAT---GAGTTCAAA--AAA--T--GAGCA-A-C-----TTGA-----TATTATTTAATACTGAA-T-----------ACT-T-----------GC----ACGTAAA-T-TG-TG--ATTT-TTATATAC-AA--CAACA--T-GGT-AACT-------TT-ATGTTT-A-AATGTTATATGAG---ATGA--ATTG--G--TTTAATT--G-TCAT-CA-G------TAGA-T-------CT-T--GAGATT----TT---TTACAC--G--ATGC-AAGTTATGATTC-TTTG-A--GTGGA-ATG-CT--TCCT--TCT----CATA-GAG-GG-TACG--T--TAGAA-TGT-A---C-TCGAGTCTTC------TA--AT---CT--TA---TCTTAAA--TAT--T---------A-CT-----TTTATAAATCTATGT-ATTTGGCGGAG-AAGA-TGC----TTATTAT--GACTAAAATA-G-TG-GATTTACAAGAGGTTTAT--CGCCCTT-AACCGATT--AACG-TATCT-TA--CTAATGGAA-AT----CAGT-G-AACGGAA-TG-AAT-T--GTTTgccgaatctttccatatgccgtaaaaatattcttaatttgttgagtataaatcgcagggtaagtcgatttaataaatattttcctaaatactgtacaaggtgattatataatgcaagttgacgtgataattattatatttctgtaaacagtaacaagacttgatcttaatgagttcaaaaaatgagcaacttgatattatttaatactgaatacttgcacgtaaattgtgatttttatatacaacaacatggtaactttatgtttaaatgttatatgagatgaattggtttaattgtcatcagtagatcttgagattttttacacgatgcaagttatgattctttgagtggaatgcttccttctcatagagggtacgttagaatgtactcgagtcttctaatcttatcttaaatattacttttataaatctatgtatttggcggagaagatgcttattatgactaaaatagtggatttacaagaggtttatcgcccttaaccgattaacgtatcttactaatggaaatcagtgaacggaatgaattgttt
gi|6 : acgaaacctttgatctcatttcctggtaagtaacaagtgattctatttagtaaaattccttgctactggtctagcttaaaagtctatactatagattatgtgtgcaaaatataagaccactcttcccattcttgcaaaaccttcacgaggtcagattaaaatgagggagagtaagactgccgaatctttccatatgccgtaaaaatattcttaTGAGTAA---TGAGAC-T-A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GT-A-GT--A--TT-T------TAT-TTTCCTA--TA-ATGTTA--AGG-TTG--AT-AT--A-AAT-CATGTT-TAC--ATA--G--ATG-T---A-TA----TTTTG-------TT---CAA-A-GCA-------TT-TG---GA-C-TT--T---G--TTGAAA--A----T--GAGCACA-C-----TCGA-----TATT--------------TTAGT-------A-T-TTTAAATCTATAAC----ATGTAAA-TTAG-TG--ATTTAT-----AC-AC--C--CACAT-GGTTA-CT-------TTTAT---T-A-GAT--TATA-GAGT--A--G--ATTATCC--TACA--TTAG-T--C-CA-G------TAGA-T-------CT-AG-AAGAT-----AT---TGTT-CCTT--A-GC---GT----ATTTGTCTG-A--G-GGA-A-GGCT--TC-T--TCTGTCCCACA-GAAAGGGTGCG--A--TAGACCAGT-A---C-T---GT--T-------TA--TTTTAATC-TA---T-----T--CAAATT---------A-CT-----TT-ATAA-ACTAT-T-ACT--G-GGAGGAA-A-TGC----T-ATT-T--TGCTAAA-TA-ACTGTGATTTA--AGAG--TTAT--CTCCCTT-AACTGATTA-AACGTTATCT-GA--TG----GAA-ATC---CAGTAG-AGA---A-TG-AAA-TAATCGTTT-AGGTCAGTATAG-GGC-TC-CATTGTTAGATTTAT-GCATAT----A-TTGTTGTTTT-ACTATA-TTC-AGGGCTATCTA--TTCC------------TT-TC-CCT-ATTATGGT-TTCCTCCTGT-GT--CCGAATAAAATATTTA---GACCTGA------ACAGGCAG--TTTCG-TTATTTCATTGAGGG-AACA-C-CTCTGTT
gi|7 : AAT--G-ATTGAAA-GA--G-TGACTAAA--TGAGGC-AAA-GTGACTGT-GATAAT-TA----GTAATGC--A--TA-TA-----TAT-T--CCTA--AA-GTGT-A--AGG-T-G--AT-AT--A-AAT-CA-GTT-TAC--ATA--A--ATT-T--TA-TATT--T---G-------TCA--AAA-A-GTA-------TT-TC-ATGA-C-CT--T---G--TTCGAA--A----TGAG--CACG-T-----T-GG-----TATT--------------TTATTATAATTCA-T-T-----------GC----TTGTATG-T-AG-TT--ATCT-T-----AC-AT--A--CA--T-GTC-A-CT-------TT-GT---T-A-TTT--TATA-GTA---T--A--ATTC--C--TAGA--T--G-T--G-CA-GTTATTCTAGA-TGAACGCCCT-AGCGATATTCTAGATGAACGCC-C--T--A-GC-G-GT----ATTT-TCTG-A--G-GGT-A-G-TT--TC-G--ACC----AATA-CAG-GGGCACG--T--TAGAC-AGT-AATGT-T---GT--TT------TG--AT---AT--GT---T-----A---GG--T---------A-CT-----TTTATAA-T-TAT-T-AAT--G-GAAG-AA-A-TAT----T-ATTAT--CGCAAAA-TA-A-TG-TATCTA--AGAC--TTAT--CCCCTTT-AACTGATTA-AGGG-TAT-T-TA--TT------A-AT----CAAT-GCGAT-----TG-GAT-G--TGGTTT-A-----GTTTAA-GAT---------TTAAATTGAT-GT-TTT----T-TTGCTGTTTA-AGTATGCTTC-AGGGCGA------TTACCT---AT---C-CTATG-CTT--TACTG---TACCATTA---------GAATGAATTATTTAC---ACCTGAA-CCCTACGGG-AG--TTTTA-TTA-CTCATacctaatttgcgcg
gi|8 : g-GTTTAATT-AGTAG-C-TAT---G-TTTT-TACATTCATA-CATA--AACACCTTTAGAT-CTTAGATAAACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACT--A--C---AGG-TACGCTT--A----------------CT----TGGGGGCTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--GTT-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGG-TTTTC--ATG-TCTTGCTGC-CAG-TATT-G--------AGAA---------A---------TGTTAATACAA------T----CCAGGAC-C-TTGTAGAGATTAGA--CAT--GAGATTTT--CA--GACAAAGACTGACT-----------T-AGA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCT-TTT----CTGGTAAGTTACT--------T-ATTTT-TAC-TAATTTCCTT-TGCTA--CT-AGactacaagaacacattgttccataacgattgacatgat
gi|8 : TTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--AT-AT--G-AAT-CA-GTT-TAC--ATA--A--ATT-T--TA-TATT--T---G-------TC---AAA-A-GTA-------TT-TG-ATGA-C-AT--T---G--TTCAAA--A----TGAG--CA-ATT-----T-GA-----TATT--------------T-------------T-A-----------GC----ATATA--------TT--ATCT----------AT--T--CA--TAGGC-G-CC-------TT-GG---T-C-AAT--GAT--------------ATTG--T--TATA--T--A----T-CA-G------Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcctataatgtaaggtgatatgaatcagtttacataaattttatatttgtcaaaagtatttgatgacattgttcaaaatgagcaatttgatattttagcatatattatctattcataggcgccttggtcaatgatattgttatatatcagt
gi|9 : gtttaattagtagctatgtttttacattcatacataaacacctttagatcttagataaacccctttatttacaccactacaggtacgcttacttgggggctttgatcatgggtctgagtgtggtcatttgtatgaagggtttttattggtcagtttttgtcaagttctatttggttggttttcatgtcttgctgccagtattgagaaatgttaatacaatccaggaccttgtagagattagacatgagattttcagacaaagactgacttagagactttgaattcttcttttctggtaagttacttatttttactaatttcctttgctactagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGAAATGCAA---GT-A-GT--AAATT-TA-----TAT-TTTCCTA--TAGATGT-AG-GGG-T-G--TC-ATTGA-AATGCA-GTT-TACCGGTA--G--ATT-TGATG-TATTGCT---G-------TC---AAA-A-GTAATTAATCTT-TT-ATGA-C-TC--TTGCG--CTCAAA--
gi|9 : T-TG-ATTA-G-TT--TTTAG--TT-AAA--A----T----------T-----T-AA-----AGTC--------------T-----------A-T-T-----------GCT---ATGTAAAAT-AG-TGTTATTT-TT----AC-AT--GA-CA--T-GGT-A-CTGTTCTGCTT-GTG--TGA-AAT--TATG-GAG---T--AGGATTCT-C--TACA--CTGG-T--T-CA-G------TAGAGT-------ATGAA-GAGTGT----GC---CTTC-C--T--A-GC-A-GT----ATAT-TCTA-AAAG-GGA-A-G-CT--TT-CACTCT----CATA-GAG-GGGTACGAGT--TAGAA-AGT-A---TCT---TT--TG------TA--CT----T--CG---T-----A--GAA--TCTATTAATTA-TTGGCAATTTATAA-GCTAT-T-ATTTAG-GGAA-AA-A-TTC----T-ACT-TTGGACTAAA-GT-A-TG-GACTTA--AGAG--TTTTA-CGGCCTTGAACCGATTA-AACG-TATCTCTA--T---------AT----TTGT-----T---A-C----T-T--TG-TTT-ATTACTGCATCG-GCT-TCTCATTGTTAGATTTAGAGC-TATAAGGA-TTGTTTTGTT-ACTATATTTCGAGGGC--TCAT--T--CT-----T---T-TT-TCGCTTAATA-TGAT-TTCTATAACC--------AATAAATCGtgagcaaagcttgaagcttgattagtttttagttaaaatttaaagtctattgctatgtaaaatagtgttatttttacatgacatggtactgttctgcttgtgtgaaattatggagtaggattctctacactggttcagtagagtatgaagagtgtgccttcctagcagtatattctaaaagggaagctttcactctcatagaggggtacgagttagaaagtatcttttgtacttcgtagaatctattaattattggcaatttataagctattatttagggaaaaattctactttggactaaagtatggacttaagagttttacggccttgaaccgattaaacgtatctctatatttgttactttgtttattactgcatcggcttctcattgttagatttagagctataaggattgttttgttactatatttcgagggctcattcttttttcgcttaatatgatttctataaccaataaatcgcattt
gi|9 : gaaatgcaagtagtaaatttatattttcctatagatgtaggggtgtcattgaaatgcagtttaccggtagatttgatgtattgctgtcaaaagtaattaatcttttatgactcttgcgctcaaatgagcaaagcttgaagcAAA--TGCGAT-TTA-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----cattt
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 1111111 1111 11 111111111 11 111111 11111111 0000000000000000000000000000000000 11111 6666666666666666666666666666666 22222 22222222 111111 3333333333333333 1111 11111 111 11 2222222222222222 11111 11 1 11 1111 2222222 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 22222 1111111 111 111111111 111 11 111111 3333333333333333 11111 111 11 11111 5555555555555555555555555555555555555555555555 11111 111 11 1 11 222222222222 1111 222222222222222222222222 1111 111111 11 222222222222 111111111 1111
lowQualScore : 5 4 4 4 66 777 4 4 4 66 55 5 0 4 4 4 66 66 333 4 66 6666666 9 0000 1 5 5 33 5 555555555 5 5 11 5 999 000000 5 66 5 5 5 5 888 5 5 88 3 66 5 5 5 5 88888888 5555555555555555555555555555555555 5 6 0 1 5 22222 999999 0 1111111111111111111111111111111 4 66 4 4 11111 1 00000000 5 5 99 5 66 5 5 5 77 77 000000 111 4444444444444444 5 2222 44444 5 1 66 5 5 777 4 11 55 55 3 6666 3 3 3 3 0000000000000000 4 00000 4 77 33 7777 6 3 7777 3 44 3 11 0 3 555 55555 3 55 44 3 7777 44 44 3 3333 0000000 1 3 3 3 44 555 77 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 999999 44 3 3 88 4 44444 4 44444 55 4 4 4 3333333 4 111 4 4 99 4 0 888888888 666 55 55 00 3 8888 7 000000 4444444444444444 2 99999 777 4 55 55 4 000 8888 1 4 4 55 4 4 4 4 55 4 99 88888 8 77 55 55 44 4 11111 777 66 2222222222222222222222222222222222222222222222 4 11111 777 4 888 4 4 4 22 8 4 4 4 9999 4 0 66 5 5 5 5 77 77 33 5 5 0 5 0 5 222222222222 7777 666666666666666666666666 6 5 6 1 5555 5 5 222222 1 5 5 4 0 33 666666666666 5 5 55 2 999 0 999999999 2 4444 6 6 6 99 6 6 5 8
lowQualScore : . . . . .. ... . . . .. .. . . . . . .. .. ... . .. ....... . .... . . . .. . ......... . . .. . ... ...... . .. . . . . ... . . .. . .. . . . . ........ .................................. . . . . . ..... ...... . ............................... . .. . . ..... . ........ . . .. . .. . . . .. .. ...... ... ................ . .... ..... . . .. . . ... . .. .. .. . .... . . . . ................ . ..... . .. .. .... . . .... . .. . .. . . ... ..... . .. .. . .... .. .. . .... ....... . . . . .. ... .. ......................................................................................................................... ...... .. . . .. . ..... . ..... .. . . . ....... . ... . . .. . . ......... ... .. .. .. . .... . ...... ................ . ..... ... . .. .. . ... .... . . . .. . . . . .. . .. ..... . .. .. .. .. . ..... ... .. .............................................. . ..... ... . ... . . . .. . . . . .... . . .. . . . . .. .. .. . . . . . . ............ .... ........................ . . . . .... . . ...... . . . . . .. ............ . . .. . ... . ......... . .... . . . .. . . . .
lowQualScore : 0 4 4 4 11 888 4 4 4 11 44 0 4 4 4 4 11 11 333 4 99 2222222 5 6666 0 0 0 88 0 222222222 0 0 99 0 444 111111 0 99 0 0 0 0 888 0 0 88 9 99 0 0 0 0 11111111 2222222222222222222222222222222222 0 2 1 4 0 44444 000000 5 2222222222222222222222222222222 4 11 9 4 11111 0 77777777 7 7 77 0 99 0 7 7 99 99 111111 666 9999999999999999 7 7777 11111 7 9 99 0 0 666 0 00 00 00 6 5555 6 5 6 3 0000000000000000 0 00000 0 99 88 1111 7 3 6666 3 66 3 22 0 3 444 33333 3 88 66 3 1111 66 66 3 8888 4444444 3 3 3 3 66 888 99 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222 00 6 6 66 0 00000 0 66666 55 0 0 0 0000000 0 000 0 0 55 0 9 333333333 000 00 00 00 6 1111 3 555555 4444444444444444 5 77777 000 0 55 55 0 666 5555 0 0 0 55 0 0 0 0 55 0 55 99999 0 00 55 55 00 4 11111 888 11 4444444444444444444444444444444444444444444444 4 11111 888 4 777 8 4 4 22 9 4 4 4 4444 4 0 99 0 0 0 7 99 99 66 7 7 7 7 1 7 666666666666 9999 777777777777777777777777 7 2 7 0 1111 7 7 666666 0 7 1 4 8 88 000000000000 0 0 44 5 000 4 666666666 2 2222 7 7 7 22 7 7 4 0
consensus : NNGTAATGGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCTTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACT--A--CA--AGG-TACACTT--ACA-ATA-T-ATATACCT----TGGGGGNTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--G-T-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTTTC--TTG-TCTTGCCGC-CAG-TTTT-G--------AGAACAGTTAATAT--G--------A-------T----CCAGGAC-CTTTGTAGAGATTAG-ACATGA-ATTTT--CA--GACAAAGACGGACTATTTTGA--TAT-AGA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCA-TTT--CCCTGGTAAGTNACA--------T-ATTTA-TAC-TAATTTCCTT-TGCTA--CT-GGTC-TA-TTTAAA--AGTC--TATCCTATA--G---ATATTTGCAAT--ATA--AA------C-TTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TG-NGA--C-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TTTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-----A----------C-----T-GA-----T---------------A--T--T---------T---------A----------T-----A-T-T-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TG--ATTT-T-----AC-AT--C--CA--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-GT------AGA-T-------CT-AA-GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GT----ATNT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAG-GGGTACG--T--TAGAC-AGT-A---T-T---GT--TN------TA--CT---AT--TA-T-----A-CAA--T---------A-CT-----T---TTATA-A-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TG-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AACCGATTA-AACG-TATCT-TA--TT----GAA-AT----CAGT-G-AAT---A-TG-AAT-T--TNTTTT-ACTACTGTATAG-GNT-TCTCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTNTT-ACTATATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCTT---AT---T-TT-TC-CTT-ATACTGAT-TTCCATCAC--T-GT-CCGAATAAATTGTTTATAGAACCTG-AA-CCCTACAGG-AG--TTTTG-TTA-TTCATTGGAGGAAAACCC-CTGTTG
Reference ( family-533 ) : NNGTAATGGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCTTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACT--A--CA--AGG-TACACTT--ACA-ATA-T-ATATACCT----TGGGGGNTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--G-T-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTTTC--TTG-TCTTGCCGC-CAG-TTTT-G--------AGAAC--------T--G--------A-------T----CCAGGAC-CTTTGTAGAGATTAG-ACACGA-ATTTT--CA--GACAAAGACGGACTATTTTGA--TAT-AGA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCA-TTT--CCCTGGTAAGTNACA--------T-ATTTA-TAC-TAATTTCCTT-TGCTA--CT-GGTC-TA-TTTAAA--AGTC--TATCCTATA--G---ATATTTGCAA---ATA--AA------C-TTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TG-NGA--C-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TTTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-----A----------C-----T-GA-----T---------------A--T--T---------T---------A----------T-----A-T-T-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TG--ATTT-T-----AC-AT--C--CA--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-GT------AGA-T-------CT-AA-GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GT----ATNT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAG-GGGTACG--T--TAGAC-AGT-A---T-T---GT--TN------TA--CT---AT--TA-T-----A-CAA--T---------A-CT-----T---TTATA-A-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TG-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AACCGATTA-AACG-TATCT-TA--TT----GAA-AT----CAGT-G-AAT---A-TG-AAT-T--TNTTTT-ACTACTGTATAG-GNT-TCTCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTNTT-ACTATATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCTT---AT---T-TT-TC-CTT-ATACTGAT-TTCCATCAC--T-GT-CCGAATAAATTGTTTATAGAACCTG-AA-CCCTACAGG-AG--TTTTG-TTA-TTCATTGGAGGAAAAACC-CTGTTG
gi|1 : GTAATGGTGTTAA-GTT-GATT-AGT-GAAC--TAC---G-TTTT-TATATT-ATA--ATAACTACATCTTTAGATATTTAGATCCACCCCATTATTTAC-AC-CGACT--A--CA--AGG-TACACTT--ACACATAGT-ATAC-CCT----TAGGGAGTT-TAA-TCA--TGGCGTCT---A-----TGTTC-GG-TCAA-T-TT-T-TATGAAGG--G-T-TTTATTTGG--TCAG-TTTTGTGT-CAAGTCC-TA---TT-TGG-TTGTTTTTTC--TTG-TTTTGCCGC-CGG-TTGT-G--------AGAA---------T--G----------------------CAGGACTCTTTGCAGATAATAG-AC-CGA-ATTTT--CC--GAAAAAGACAGATCATTTTGA--TAT-AGA---------------GAC-CTT--AAATTCTTCAATTT--CCCTGGTAAGTAACA--------T-ATCTA-TAT-TAATTTCCTT-TGTTA--CT-GGTC-TA-TTTAAA--AGTC--TATC-TATA--G---ATATT-GCAA----TA--AA------CATTCCAATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ACTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TG-GGA--C-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA--TAT-A--AGG-T-G--T-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----T------GTCAAA-A----GTA-------TCTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-----A----------C-----T-GA-----G---------------A--T--T---------T---------A----------T---------T-----------GC-A----TGTAA--T-AG-TG--ATTT-T-----AC-AT--C--TA--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-GT------AGA-T-------CT-AA-GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GG----ATAT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GA--AGGT-CG--T--TAGA--AGT-A---T-T---GT--TA------TA--CT---AT--TA-T-----A-CAA--T---------A-CT-----T---TTAAA-A-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-A-T-T--GACTTAA-TA-A-TT-GATTTA--AGAG--GTAT--CGCCGCT-AATCGATTAGAACG-TATCT-TA--TT----GGACAT----CAGT-G-AAT---A-TGCAAT-T--TTTTTT-ACTACTGTATAG-GAT-TTTCATTGTTAGATTTAT-GC--AT----ACTTGTTGTATT-ACAATA-TTC-AGGGCCATCTT--TTCCTT---AT---TGTT-TC-CTT-ATACTAAT-TTCCATCAC--T-GT-CTGAATAAATTGTTTATAAAACTTG-AATCCTTAAAAG-AG--TTTTG-TTA-TTCACTGGAGGAAAAATC-CTCTTG
gi|10 : tgT-GAGTAAA--TG-GGA--C-TT---AATTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCT---TA-ATAT-A--AGGTT-G--T-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TCTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----TG-G--TA-----A----------CT----T-GA-----T---------------G--T---------------------------------T-----A-T-T-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TG--ATGT-T-----AC-AT------A--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--GTT--T-CA-GT------AGA-T-------CT--A-GAGATT----AT---TGT--C--T--A-GC-A-GT----ATAT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAA-GGGTA-G--T--TAGA--AGT-A---T-T---GT--TA------TA--CT---AT--TA-T-----ATCAAT-T---------A-CT-----T---TTATA-A-TAT-T-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TT-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AA-CGATTA-AACG-T-TCT-TA--TT----GAC-AT----CAGT-G--AT---A-TG-AA-----TATTTT-ACTACTGTATAG-GGT-T-TCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A---GTTGTATTAACT-TATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCAT---AG---T-TT-TC-CTT-ATACTAAT-TTCCATCAC--TGGT-CTGAATAAATTGTTTATAAAA-TTG-AA-TCCTAAAAG-AGTTTTTTG-TTA-TTCACTGGAGGAAAAACCGCTTTTG
gi|11 : aACT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATT--CACGC-TTTAGAT-CTTAGATCCATCC-TTTATTTATTAC-C-ACT--A--CA---GG-TACACCT--ACA-ATA-T-ATATACCT----TGGGGGATT-TAAGTCCGTTGA-GTCT---GGAGTCAGTTT-GG-ACA--T----G-TATCAAGG--G-T-GT-ATG-GG--GCA---TTT-TGT-CTAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTT-C--TTG-TCTTGTGGC-CAA-TTTT-G--------AGAACAGTTAATAT--G--------A-------A----CCAGGAC-CTTTGTGGGAATTAA-TCTTAA-ATTGT--TA--GACAAAGACAGACCATTTTGA--TAT-ACA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCA-CTT---TCTGTTAAGTAACA--------TAATTTA-TAC-TAATTTCCTT-TGCTA--CT-GGTC-TA-TTTGAA--AGTC--TATCCTATA--G---ATATTTGGAAT--GTA--AA------C-TTCCAATT-T--GCAA-T---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA---GT-GCGTAAA--TG-CGA--T-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----caataaaattgtgca
gi|12 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnGCTAAAGTTTGATT-AGTAGG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATT-CATA--CACACC--------CTTAGATTCAACCCTTTATTCAC-AT-C-ACT--A--CACAAGG-TACACTT--ACA--TC-T-ATATACCT----TGGGGGATT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCAATC-TT-GTTATGAAGG--G-TCTTTATT-GG--TC-G-TTTT-TGT-CAAATTC-TC---TT-TAG-TTGGTTTTGCCTTTGTTTTTGCCGC-CAGTTTTT-G--------AGGACAGTTAATAT--G--------A-------T----CCGGGAC-CGTTGTAGAGATT-G-ACATGA---TTT--CA--GACTAAGACGGACT-----------T-AGA---------------GAT-TTT--GAAATATTCA-TCT--TCTGGGT
gi|13 : gtgGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-AG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATT-CATA--CACACC--------CTTAGATTCAACCCTTTATTCAC-AT-C-ACTACA--CA--AGG-TACACTT--ACA-ATC-T-ATATACCT----TGGGGGATT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--TCTT-G-TATGAAGG--G-TCTTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAATTC-TC---TT-TAG-TTGG-TTTTC--TTG-TTTTGCCGC-CAG-TTTT-G--------AGGACAGTTAATAT--G--------A-------T----CCGGGAC-C-TTGTAGAGATTAG-ACATG--ATTTT--CA--GACTAAGACGGACT-----------T-AGA---------------GAT-TTT--GAAATATTCA-TTT--Ctatcttcttttcttttctcttt
gi|14 : aTTC-TGGGTTATCTTCTTTTCTT---TTCTCT-TT-TT-CTT-TTAGCGGT-T-CCATCAC--TCGTGTCGAATAAACTATTTTTAGACCCTGTAA-CCCTACAGG-AG--TTTTGTTTA-TTCATTGGAGGAAACCGC-CTGTTtgggttatcttctttcttttctctttttcttt
gi|15 : ttcatcATTTC-TGGGTTATCTTCTTTCTTTTCTCT---T-TT-TC-TTT-ATACGG---TTCCATCACTGT-GT-CCGAATAAA-TATTTTTAG-ACCTG-AA-CCCTACAGG-AG--TTTTG-TTA-TTCATTGGAGGAAAACCC-CTGTTacattt
gi|16 : tattcTGCTAA-GTTTGATTTAGT-GG-C--TATTTGG-TTTTATATATTCATAGCGTA--CACACTTTTAGAT-CTTAGATCCACCCC-TTATTTA--ACAC-ACT--A--CA----G-TACACTacatt
gi|17 : ATTCCCTT-TGCTA--CT-AGTC-AA-TTTAAA--AGTC--TATCCTACA--G---ATATTTGCAAT--ATA--AA------C-TTCCCATG-T--GCAC-A---TT-TACTAAAT--G-ATTGAAA-GA---GT-GA
gi|18 : CCTA--TA-TTGC-A--AGG-T-G--A-C-GT--A-AAT--CA-GTT-TAC--ATA--T--ATC-T--T--ATTATGATTT--T--GTTCAT-C----TTA-------TT---ATGA-C-CT--T---G--TT
gi|19 : attattatatatatatacaca---A--A--ATC---C--TACA--T--G-T--C-CATGC------AG----------------GAGAT-----AT---TGTC-A--T--A-GC-T-GT----ATAT-TCTG-A--G-GGG-A-G-CT--TC-T--TCC----CATA-GAA-GGGTACG--T--TAGAC-A
gi|2 : agtTAATGGTGTTAA-GTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---GGTTTT-TATATTCATA-CATA--CACACTTTTAGAT-CCTAGACCCACCCCTTTATTTAT-AC-C-ACT--A--CA---GG-TACACTT--ACA-ATA-T-ATATACCT----TGGGGGCTT-TAA-CCA--TGA-GTCT---A-----AGTTT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--A-A-TTTATT-GG--TCAG-TATG-TGT-CAAGTCT-TA---TT-TG--TTGGTTTTCC--T-G-TCTTGCCAA-CTG-TTGT-G--------AGAA---------T--G----------------------CAAGAC-CTTTTCGGACATTAG-ACCTGG-ATTTT--CA--GACAAAGACAAATCATTTTGA--TACGAGACCTCATTTTGATACGAAC-CTT--GAATTCTTCA-TTT--CC-TGACAAGTAACA--------T-ATTTA-TAT-TAATTTCCTT-TGCTA--CT-GGTC-TA-TTTAAA--AGTC--TATACTATA--G---ATA-----------------------C-TTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATT-AAA-GA--GG--GAGTAAA--TG-CGA--C-TT---A-TTG-TTAG-AGAAAT-CA----GT-A-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA-ATGT-A--AAG-T-G--T-T-AT--A-AAT--CAAGTT-TA---GTA--G--AAT-T-----A-TA----TT--T--GTGAAC-A----GTA-------TT-G-ATTA---TT--T---G--TTCAAATGA-------G--CA-----A----------T-----T-GA-----T---------------A--T--T---------TTAATATTTAA----------T-----A-TAT-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TA--ATTT-T-----AC-ATA-C--CA--T-GGT-A-GT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--TACA-GT------AGA-T-------CT-A--GA-ATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GT----ATAT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CTAGTC-T--TCT----CATA-GAA-GGG-ACG--T--TAGA--AAT-A---C-T---GT--TTGTATACTAATCT---AT--TAAT-----T-TAA--TC--------A-GT-----TGGTTTATACACTAT-T-T-ATT--GTGGAG-AA-AATGC----T-ATT-T--GACTAAA-AATA-TG-GATTTA--AGAG--TTATGACGC---T-AACCGATTA-AA-G-TG-CT-TAAATT----GTA-ATAATATAGT-G-A-T---ACTG-AATAT--TGTTTTTACTACTGCATAAAGCTGTTTCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTATT-ACTATATTTC-AGGATTATCTT--TTCCTT---AT---TGTT-TC-CTT-ACACTAATGTTCCATCAC--TGGT-CTGAATAAATTGCTTAtt
gi|20 : GTCATAGTGCTAA-TTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-GATATGCATA-CATA--CACAC
gi|21 : TCATTGTTAGATTTAA-GC-TAT----A-TTGTTTTGTT-ACTATATTTC-AGGGCTATCT
gi|3 : GTAATAGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-AG-CCATAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCCTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTCAC-AT-C-ACT--A--CAC-AGG--ACACTT--ACA-A-A-TGATAT-CCT----T-GGGGCTT-TGA-TCA--TGG-GTCTTGAG-----AGTGTCAG-TTA--T-TT---TATGAAGG--G-T-TTTATT-GGGTCCAGTTTTT-TGTACAAGTTC-TA---TTGTGG-TTG--TTTTC--TTC-TCTAG-CGCGCAT-TTTTCG--------AGAAC--------T--GTT------AATCTAACT----CCAGG-C-CTTGGTAGAGTTTAGAACCTGC-ATTTT--------------CGCACTATTTTGACTTAT--GA---------------AACTTTT--GAA-TCTTCA-TTT---TCTGGTAAGTTACT--------T-ATTTA-TACATAATTTCCTT-TGCTA--CTAAGTCATA-TTTAAAAGAGTC--TATCCTTTA--G---ATATTTGCAAT--ATA--AA------C-GT-CCATT-T--GCAACA---TTATACAACAT--GAATTG-AC-GA---GT-GAGTAAA--TA-GAA--C-TT---A-TTG--TAT--GAAAT-CA----GT-A-GT--C--TTATA-----TAT-ATTCCTAC-TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--CA-G-T-TAC---TAAGG--ATT-TC-T--A-TA----TT--T--GTCAAACA----GTA-------TTTGCATGA-CTTT--T---G--TTCAAATGAGCACC--G--CC-----A----------T-----T-GA-----T---------------ATTT--T---------T---------AGTATTAAATCT-----A-T-T-----------AC-A----TGTAGA-T-AGTTG--ATTT-T-----ACAAT--CA-CA--T-GGA-T-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-G-GTCTA--A--ATC---C--TACA--T--G-T--C-CATGC------AG--T-----------A-GA-AT------T---TGTC-A--TCAA-GCTA-GT----ATTT-TCTGCA--G-GGAGA-G-CT--TC-T--TC-----CATACGAA-GGGTACG--TTATAGAC-AGTAA---T-T---GC--TA------T---TT---ATTCTA-T-----C-TAAT-T---------A-CT-----T---TTATA-A-CATAT-TAATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-
gi|4 : TAATTAC-AT-T-ACT--AAGCA--AAGATACACTTCAACA-ACT-C-AAATTGCTCACATGGGGGCTTCTGA-TGAAGTGG-CTCT---G-----GGAGT-AAATCA--T-TTCG-TGTGGAGGTTA-T-TTCATT-G---TCAT-GTTG-TGT-AAAGGTGGTAAAATT-TGGATTGCTTAGCC--CTG--ATTGCC-C-TAT-TTTT-ACCGATGGCAGAAC--------TTTA--------A-------TATTTCCAGAAC-ATT-GTGGACAGTAG-ACATGC-ATTTTAGCACCAATAATGA-GGACT-----------T-GCA---------------GAC-TTCAGGAATCCTTTA-TTTGTTCGTGGTAGCTT-TA--------C-AATTA-TGT-TAAATTCCATATACTAAATA-AGTC-AA-TTTATA--AGTTGTTACTCCACACTA---CTACCTGCAA---ATATAAA------C-GTTTTATTAT--GCAC-T---TT-TACAAAAT--G-ATTGAAA-GACCAGT-GAGCGAAATTG-AGG--CAAA---A-TTTACTATGAAAAAT-TATAC-ATGA-A----------A-----TATATCTCCTA--TA-A-GT----ATG-T-GATA-T-AT--A-AAT--CA-GCTGTAC--ATA--G--ATT-T--T--A-TA----TA--T--GTCAAA-AG---GTA-------TTTG-ATGACC-TT--T---GA-TTAGAA--A----T--GA-GA-----A----------CGATTTT-GATTTTTT---------------A--T--T---------TA--------A----------TTAATAA-T-T-----------TC-ACTAATGTGAG-T-AG-TGT-ATTT-T-----AT-ATTGC--C---T-GGC-A--T-------TT-GT---C-ATAATC-CATA-AAG------G--ATTC--CTATACA--T--G-T--G-CA-AA------TGT-T-------CT----GAGATTTA--AA---TGTC-C--T--A-GC-T-GT----ATTT-CCT-------GGA-A-A-TT--AA-TG-TCC----CATACCAG-GGGTACG--T--TAAAC-AGT-A---A-T---GT--TT------GA--CT---A----A-T-------CAT--T---------ACCT-----T---TTATA-A-C-TTT-T-ATT--G-GAAG-AA-A-TACCTAAT-GTC-T--AGCAAAA-CA-A-T
gi|5 : C-TTT--GA--TCT-CA-TTT--CC-TGGTAAGTAACAAGTGATTCT-ATTTAGTA---AAATTCCTT--GCTA--CT-GGTC-TAGCTTAAA--AGTC--TATACTATA--GATTATGTGTGCAAAATATA--AGACCACTC-TTCCCATT-CTTGCAA-AACCTT-CACGAGGTCAG-ATTAAAATGA--GGGAGAGTAAGACTGCCGAATC-TTTCCA-TATGCCGT-AAAA-------------------------A-----TAT-TCT------TA-ATTT-----GT-T-G--AGT-AT--A-AATCGCA-GGG-TAA--GTC--G--ATT-TAATAAA-TA----TT--T--TCCTAA-ATACTGTA-------CAAG-GTGA-T-TA--T---A--T----A--A----T--G--CAAGTTGA----------CG----T-GA-----TA--------------A--TTAT---------T---------A----------T-----A-T-T-----------TC------TGTAAA-C-AG-TA--A
gi|5 : acgaaacA--T-TT---G-TTGAGTAT-A--AAT-CGCAGGGTAA-GTCGA--TT-TAATAAATAT-TTTCCTAAATA-CTGT-ACAAGG-T-G--A-TTAT--ATAATG-CAAGTT-GAC--GTG--ATAATTAT--T--A-TA----TT--TCTGTAAAC-A----GTAACAAGA-CTTG-AT---C-TTAAT---GAGTTCAAA--AAA--T--GAGCA-----A----------C-----TTGA-----T---------------A--T--TATTTAATACTGA-------A----------T-----ACT-T-----------GC-A----CGTAAA-T-TG-TG--ATTT-TTATATAC-AA--CAACA--T-GGT-AACT-------TT-ATGTTT-A-AATGTTATATGAG---ATGA--ATTG--G--TTTAATT--G-TCAT-CA-GT------AGA-T-------CT-T--GAGATT----TT---TTACAC--G--ATGC-AAGTTATGATTC-TTTG-A--GTGGA-ATG-CT--TCCT--TCT----CATA-GAG-GG-TACG--T--TAGAA-TGT-A---C-TCGAGTCTTC------TA--AT---CT--TA-TCTTAAA-TAT--T---------A-CT-----T---TTATA-AATCTATGT-ATTTGGCGGAG-AAGA-TGC----TTATTAT--GACTAAAATA-G-TG-GATTTACAAGAGGTTTAT--CGCCCTT-AACCGATT--AACG-TATCT-TA--CTAATGGAA-AT----CAGT-G-AACGGAA-TG-AAT-T--GTTTcaagacttgatcttaatgagttcaaaaaatgagcaacttgatattatttaatactgaatacttgcacgtaaattgtgatttttatatacaacaacatggtaactttatgtttaaatgttatatgagatgaattggtttaattgtcatcagtagatcttgagattttttacacgatgcaagttatgattctttgagtggaatgcttccttctcatagagggtacgttagaatgtactcgagtcttctaatcttatcttaaatattacttttataaatctatgtatttggcggagaagatgcttattatgactaaaatagtggatttacaagaggtttatcgcccttaaccgattaacgtatcttactaatggaaatcagtgaacggaatgaattgttt
gi|6 : acgaaacctttgatctcatttcctggtaagtaacaagtgattctatttagtaaaattccttgctactggtctagcttaaaagtctatactatagattatgtgtgcaaaatataagaccactcttcccattcttgcaaaaccttcacgaggtcagattaaaatgagggagagtaagactgccgaatctttccatatgccgtaaaaatattcttaT-GAGTAA---TG-AGA--C-T----A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GT-A-GT--A--TT-T------TAT-TTTCCTA--TA-ATGTTA--AGG-TTG--A-T-AT--A-AAT--CATGTT-TAC--ATA--G--ATG-TA-T--A-T-----TT--T--GTTCAA-A----GCA-------TTTG---GA-C-TT--T---G--TTGAAA--A----T--GAGCAC----A----------C-----TCGA-----T---------------A--T--T---------TTA-------G----------T-----A-T-TTTAAATCTATAAC-A----TGTAAA-TTAG-TG--ATTTAT-----AC-AC--C--CACAT-GGTTA-CT-------TTTAT---T-A-GAT--TATA-GAGT--A--G--ATTATCC--TACA--TTAG-T--C-CA-GT------AGA-T-------CT-AG-AAGAT-----AT---TGTT-CCTT--A-GC---GT----ATTTGTCTG-A--G-GGA-A-GGCT--TC-T--TCTGTCCCACA-GAAAGGGTGCG--A--TAGACCAGT-A---C-T---GT--T-------TA--TTTTAATC-TA-T-----T-CAAATT---------A-CT-----T---T-ATA-A-ACTAT-T-ACT--G-GGAGGAA-A-TGC----T-ATT-T--TGCTAAA-TA-ACTGTGATTTA--AGAG--TTAT--CTCCCTT-AACTGATTA-AACGTTATCT-GA--TG----GAA-ATC---CAGTAG-AGA---A-TG-AAA-TAATCGTTT-AGGTCAGTATAG-GGC-TC-CATTGTTAGATTTAT-GCATAT----A-TTGTTGTTTT-ACTATA-TTC-AGGGCTATCTA--TTCC------------TT-TC-CCT-ATTATGGT-TTCCTCCTG--T-GT-CCGAATAAAATATTTA---GACCTG-A------ACAGGCAG--TTTCG-TTATTTCATTGAGGGAACACCT-CTGTT
gi|7 : AAT--G-ATTGAAA-GA--G-T-GACTAAA--TG-AGG--C-AA---A-GTGACTGT-GATAAT-TA----GTAATGC--A--TA-TA-----TAT-T--CCTA--AA-GTGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--ATA--A--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-AA---GTA-------TTTC-ATGA-C-CT--T---G--TTCGAA--A----T--GAGCAC----G----------T-----T-GG-----T---------------A--T--T---------TTATTATA--A----------TTC---A-T-T-----------GC-T----TGTATG-T-AG-TT--ATCT-T-----AC-AT--A--CA--T-GTC-A-CT-------TT-GT---T-A-TTT--TATA-GTA---T--A--ATTC--C--TAGA--T--G-T--G-CA-GTTATTCTAGA-TGAACGCCCT-AGCGATATTCTAGATGAACGCC-C--T--A-GC-G-GT----ATTT-TCTG-A--G-GGT-A-G-TT--TC-G--ACC----AATA-CAG-GGGCACG--T--TAGAC-AGT-AATGT-T---GT--TT------TG--AT---AT--GT-T-----A--GG--T---------A-CT-----T---TTATA-A-T-TAT-T-AAT--G-GAAG-AA-A-TAT----T-ATTAT--CGCAAAA-TA-A-TG-TATCTA--AGAC--TTAT--CCCCTTT-AACTGATTA-AGGG-TAT-T-TA--TT------A-AT----CAAT-GCGAT-----TG-GAT-G--TGGTTT-A-----GTTTAA-GAT---------TTAAATTGAT-GT-TTT----T-TTGCTGTTTA-AGTATGCTTC-AGGGCGA------TTACCT---AT---C-CTATG-CTT--TACTG---TACCATTA----------GAATGAATTATTTAC---ACCTG-AA-CCCTACGGG-AG--TTTTA-TTA-CTCATacctaatttgcgcg
gi|8 : g-GTTTAATT-AGT-AG-C--TAT---G-TTTT-TACATTCATA-CATA--AACACCTTTAGAT-CTTAGATAAACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACT--A--CA---GG-TACGCTT--AC---------------T----TGGGGGCTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--GTT-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGG-TTTTC--ATG-TCTTGCTGC-CAG-TATT-G--------AGAAA--------T--GTTAATACAA-------T----CCAGGAC-C-TTGTAGAGATTAG-ACATGAGATTTT--CA--GACAAAGACTGACT-----------T-AGA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCT-TTT----CTGGTAAGTTACT--------T-ATTTT-TAC-TAATTTCCTT-TGCTA--CT-AGactacaagaacacattgttccataacgattgacatgat
gi|8 : TTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--G-AAT--CA-GTT-TAC--ATA--A--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TTTG-ATGA-C-AT--T---G--TTCAAA--A----TGAG--CA-----AT---------T-----T-GA-----T---------------A--T--T---------T--------------------T-----A---------------GC-A----TATA--------TT--ATCT----------AT--T--CA--TAGGC-G-CC-------TT-GG---T-C-AAT--GAT--------------ATTG--T--TATA--T--A----T-CA-GT------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcctataatgtaaggtgatatgaatcagtttacataaattttatatttgtcaaaagtatttgatgacattgttcaaaatgagcaatttgatattttagcatatattatctattcataggcgccttggtcaatgatattgttatatatcagt
gi|9 : gtttaattagtagctatgtttttacattcatacataaacacctttagatcttagataaacccctttatttacaccactacaggtacgcttacttgggggctttgatcatgggtctgagtgtggtcatttgtatgaagggtttttattggtcagtttttgtcaagttctatttggttggttttcatgtcttgctgccagtattgagaaatgttaatacaatccaggaccttgtagagattagacatgagattttcagacaaagactgacttagagactttgaattcttcttttctggtaagttacttatttttactaatttcctttgctactagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGAAATGCAA---GT-A-GT--AAATT-TA-----TAT-TTTCCTA--TAGATGT-A--GGGGT-G--T-C-ATTGA-AATG-CA-GTT-TACCGGTA--G--ATT-TGAT--G-TA----TTGCT--GTCAAA-A----GTAATTAATCTTTT-ATGA-C-TC--TTGCG--CTCAAATGA-------G--CA-----AAGCTTGAAGCT-----T-GA-----TTAGTTTTTAGTTAAAA--T--T---------T---------AAAGTC-----T-----A-T-T-----------GCTA----TGTAAAAT-AG-TGTTATTT-TT----AC-AT--GA-CA--T-GGT-A-CTGTTCTGCTT-GTG--TGA-AAT--TATG-GAG---T--AGGATTCT-C--TACA--CTGG-T--T-CA-GT------AGAGT-------ATGAA-GAGTGT----GC---CTTC-C--T--A-GC-A-GT----ATAT-TCTA-AAAG-GGA-A-G-CT--TT-CACTCT----CATA-GAG-GGGTACGAGT--TAGAA-AGT-A---TCT---TT--TG------TA--CT----T--CG-T-----A-GAA--TCTATTAATTA-TTGGCAAT---TTATA-A-GCTAT-T-ATTTAG-GGAA-AA-A-TTC----T-ACT-TTGGACTAAA-GT-A-TG-GACTTA--AGAG--TTTTA-CGGCCTTGAACCGATTA-AACG-TATCTCTA--T---------AT----TTGT-----T---A-C----T-T--TG-TTT-ATTACTGCATCG-GCT-TCTCATTGTTAGATTTAGAGC-TATAAGGA-TTGTTTTGTT-ACTATATTTCGAGGGC--TCAT--T--CT-----T---T-TT-TCGCTTAATA-TGAT-TTCTATAAC--C-------AATAAATCG
gi|9 : AAA--TG-CGA--T-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----cattt
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 1111111 1111 11 111111111 11 111111 1 111 1111111 111 6666666666666666666666666666666 111 22222222 111111 11 111111 1111 11111 111 11 1111111111111111 11111 11 1 11 1111 2222222 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 22222 1111111 111 111111111 111 11 111111 3333333333333333 11111 111 11 11111 5555555555555555555555555555555555555555555555 11111 111 11 1 11 222222222222 1111 222222222222222222222222 1111 111111 11 222222222222 111111111 1111
lowQualScore : 5 4 4 4 66 777 4 4 4 66 55 5 0 4 4 4 66 999 4 66 6666666 9 0000 1 5 5 33 5 555555555 5 5 11 5 999 000000 5 66 5 5 5 5 888 5 5 22 0 66 5 5 5 333 6666666 444 5 0 6 1 5 6 88 999999 0 1111111111111111111111111111111 4 66 4 4 66 555 1 00000000 5 5 99 5 66 5 5 5 77 77 000000 111 33 1 666666 5 2222 44444 5 1 66 5 5 777 4 11 55 55 3 6666 3 3 3 3 9999999999999999 4 00000 4 77 33 7777 6 3 7777 3 44 3 11 0 3 555 55555 3 55 44 3 7777 44 44 3 3333 0000000 1 3 3 3 44 555 77 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 999999 44 3 3 88 4 44444 4 44444 55 4 4 4 3333333 4 111 4 4 99 4 0 888888888 666 55 55 00 3 8888 7 000000 4444444444444444 2 99999 777 4 55 55 4 000 8888 1 4 4 55 4 4 4 4 55 4 99 88888 8 77 55 55 44 4 11111 777 66 2222222222222222222222222222222222222222222222 4 11111 777 4 888 4 4 4 22 8 4 4 4 9999 4 0 66 5 5 5 5 77 77 33 5 5 0 5 0 5 222222222222 7777 666666666666666666666666 6 5 6 1 5555 5 5 222222 1 5 5 4 0 33 666666666666 5 5 55 2 999 0 999999999 2 4444 6 6 6 99 6 6 8
lowQualScore : . . . . .. ... . . . .. .. . . . . . .. ... . .. ....... . .... . . . .. . ......... . . .. . ... ...... . .. . . . . ... . . .. . .. . . . ... ....... ... . . . . . . .. ...... . ............................... . .. . . .. ... . ........ . . .. . .. . . . .. .. ...... ... .. . ...... . .... ..... . . .. . . ... . .. .. .. . .... . . . . ................ . ..... . .. .. .... . . .... . .. . .. . . ... ..... . .. .. . .... .. .. . .... ....... . . . . .. ... .. ......................................................................................................................... ...... .. . . .. . ..... . ..... .. . . . ....... . ... . . .. . . ......... ... .. .. .. . .... . ...... ................ . ..... ... . .. .. . ... .... . . . .. . . . . .. . .. ..... . .. .. .. .. . ..... ... .. .............................................. . ..... ... . ... . . . .. . . . . .... . . .. . . . . .. .. .. . . . . . . ............ .... ........................ . . . . .... . . ...... . . . . . .. ............ . . .. . ... . ......... . .... . . . .. . . .
lowQualScore : 0 4 4 4 11 888 4 4 4 11 44 0 4 4 4 4 11 444 4 99 2222222 5 6666 0 0 0 88 0 222222222 0 0 99 0 444 111111 0 99 0 0 0 0 888 0 0 66 0 99 0 0 0 888 0000000 666 0 1 2 4 0 4 22 000000 5 2222222222222222222222222222222 4 11 9 4 11 000 0 77777777 7 7 77 0 99 0 7 7 99 99 111111 666 66 4 444444 7 7777 11111 7 9 99 0 0 666 0 00 00 00 6 5555 6 5 6 3 9999999999999999 0 00000 0 99 88 1111 7 3 6666 3 66 3 22 0 3 444 33333 3 88 66 3 1111 66 66 3 8888 4444444 3 3 3 3 66 888 99 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222 00 6 6 66 0 00000 0 66666 55 0 0 0 0000000 0 000 0 0 55 0 9 333333333 000 00 00 00 6 1111 3 555555 4444444444444444 5 77777 000 0 55 55 0 666 5555 0 0 0 55 0 0 0 0 55 0 55 99999 0 00 55 55 00 4 11111 888 11 4444444444444444444444444444444444444444444444 4 11111 888 4 777 8 4 4 22 9 4 4 4 4444 4 0 99 0 0 0 7 99 99 66 7 7 7 7 1 7 666666666666 9999 777777777777777777777777 7 2 7 0 1111 7 7 666666 0 7 1 4 8 88 000000000000 0 0 44 5 000 4 666666666 2 2222 7 7 7 22 7 7 0
consensus : NNGTAATGGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCTTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACTA--CA--AGG-TACACTT--ACA-ATA-T-ATATACCT----TGGGGGNTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--G-T-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTTTC--TTG-TCTTGCCGC-CAG-TTTT---GAGAACAG----TTAATATGA-TCCAGGAC-CTTTGTAGAGATTAG-ACATGA-ATTTT--CA--GACAAAGACGGACTATTTTGA--TAT-AGA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCA-TT--TCCCTGGTAAGTNACA--------T-ATTTA-TAC-TAATTTCC-TTTGCT--ACT-GGTC-TA-TTTAAA--AGT--CTATCCTATA--G---ATATTTGC--AATATAAA------C-TTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TG-NGA--C-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TTTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-----A----------C-----T-GA-----T---------------A--T--T---------T---------A----------T-----A-T-T-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TG--ATTT-T-----AC-AT--C--CA--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-GT------AGA-T-------CT-AA-GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GT----ATNT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAG-GGGTACG--T--TAGAC-AGT-A---T-T---GT--TN------TA--CT---AT--TA-T-----A-CAA--T---------A-CT-----T---TTATA-A-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TG-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AACCGATTA-AACG-TATCT-TA--TT----GAA-AT----CAGT-G-AAT---A-TG-AAT-T--TNTTTT-ACTACTGTATAG-GNT-TCTCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTNTT-ACTATATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCTT---AT---T-TT-TC-CTT-ATACTGAT-TTCCATCAC--T-GT-CCGAATAAATTGTTTATAGAACCTG-AA-CCCTACAGG-AG--TTTTGTT-A-TTCATTGGAGG-AAAACCCCTGTTG
Reference ( family-533 ) : NNGTAATGGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCTTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACTA--CA--AGG-TACACTT--ACA-ATA-T-ATATACCT----TGGGGGNTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--G-T-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTTTC--TTG-TCTTGCCGC-CAG-TTTT---GAGAACAG----TTAATATGA-TCCAGGAC-CTTTGTAGAGATTAG-ACATGA-ATTTT--CA--GACAAAGACGGACTATTTTGA--TAT-AGA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCA-TT--TCCCTGGTAAGTNACA--------T-ATTTA-TAC-TAATTTCC-TTTGCT--ACT-GGTC-TA-TTTAAA--AGT--CTATCCTATA--G---ATATTTGC--AATATAAA------C-TTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TG-NGA--C-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TTTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-----A----------C-----T-GA-----T---------------A--T--T---------T---------A----------T-----A-T-T-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TG--ATTT-T-----AC-AT--C--CA--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-GT------AGA-T-------CT-AA-GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GT----ATNT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAG-GGGTACG--T--TAGAC-AGT-A---T-T---GT--TN------TA--CT---AT--TA-T-----A-CAA--T---------A-CT-----T---TTATA-A-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TG-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AACCGATTA-AACG-TATCT-TA--TT----GAA-AT----CAGT-G-AAT---A-TG-AAT-T--TNTTTT-ACTACTGTATAG-GNT-TCTCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTNTT-ACTATATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCTT---AT---T-TT-TC-CTT-ATACTGAT-TTCCATCAC--T-GT-CCGAATAAATTGTTTATAGAACCTG-AA-CCCTACAGG-AG--TTTTGTT-A-TTCATTGGAGG-AAAACCCCTGTTG
gi|1 : GTAATGGTGTTAA-GTT-GATT-AGT-GAAC--TAC---G-TTTT-TATATT-ATA--ATAACTACATCTTTAGATATTTAGATCCACCCCATTATTTAC-AC-CGACTA--CA--AGG-TACACTT--ACACATAGT-ATAC-CCT----TAGGGAGTT-TAA-TCA--TGGCGTCT---A-----TGTTC-GG-TCAA-T-TT-T-TATGAAGG--G-T-TTTATTTGG--TCAG-TTTTGTGT-CAAGTCC-TA---TT-TGG-TTGTTTTTTC--TTG-TTTTGCCGC-CGG-TTGT---GAGAA-------------TG----CAGGACTCTTTGCAGATAATAG-AC-CGA-ATTTT--CC--GAAAAAGACAGATCATTTTGA--TAT-AGA---------------GAC-CTT--AAATTCTTCAATT--TCCCTGGTAAGTAACA--------T-ATCTA-TAT-TAATTTCC-TTTGTT--ACT-GGTC-TA-TTTAAA--AGT--CTATC-TATA--G---ATATT-GC--AATA--AA------CATTCCAATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ACTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TG-GGA--C-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA--TAT-A--AGG-T-G--T-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----T------GTCAAA-A----GTA-------TCTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-----A----------C-----T-GA-----G---------------A--T--T---------T---------A----------T---------T-----------GC-A----TGTAA--T-AG-TG--ATTT-T-----AC-AT--C--TA--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-GT------AGA-T-------CT-AA-GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GG----ATAT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GA--AGGT-CG--T--TAGA--AGT-A---T-T---GT--TA------TA--CT---AT--TA-T-----A-CAA--T---------A-CT-----T---TTAAA-A-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-A-T-T--GACTTAA-TA-A-TT-GATTTA--AGAG--GTAT--CGCCGCT-AATCGATTAGAACG-TATCT-TA--TT----GGACAT----CAGT-G-AAT---A-TGCAAT-T--TTTTTT-ACTACTGTATAG-GAT-TTTCATTGTTAGATTTAT-GC--AT----ACTTGTTGTATT-ACAATA-TTC-AGGGCCATCTT--TTCCTT---AT---TGTT-TC-CTT-ATACTAAT-TTCCATCAC--T-GT-CTGAATAAATTGTTTATAAAACTTG-AATCCTTAAAAG-AG--TTTTGTT-A-TTCACTGGAGG-AAAAATCCTCTTG
gi|10 : tgT-GAGTAAA--TG-GGA--C-TT---AATTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCT---TA-ATAT-A--AGGTT-G--T-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TCTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----TG-G--TA-----A----------CT----T-GA-----T---------------G--T---------------------------------T-----A-T-T-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TG--ATGT-T-----AC-AT------A--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--GTT--T-CA-GT------AGA-T-------CT--A-GAGATT----AT---TGT--C--T--A-GC-A-GT----ATAT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAA-GGGTA-G--T--TAGA--AGT-A---T-T---GT--TA------TA--CT---AT--TA-T-----ATCAAT-T---------A-CT-----T---TTATA-A-TAT-T-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TT-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AA-CGATTA-AACG-T-TCT-TA--TT----GAC-AT----CAGT-G--AT---A-TG-AA-----TATTTT-ACTACTGTATAG-GGT-T-TCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A---GTTGTATTAACT-TATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCAT---AG---T-TT-TC-CTT-ATACTAAT-TTCCATCAC--TGGT-CTGAATAAATTGTTTATAAAA-TTG-AA-TCCTAAAAG-AGTTTTTTGTT-A-TTCACTGGAGGAAAAACCGCTTTTG
gi|11 : aACT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATT--CACGC-TTTAGAT-CTTAGATCCATCC-TTTATTTATTAC-C-ACTA--CA---GG-TACACCT--ACA-ATA-T-ATATACCT----TGGGGGATT-TAAGTCCGTTGA-GTCT---GGAGTCAGTTT-GG-ACA--T----G-TATCAAGG--G-T-GT-ATG-GG--GCA---TTT-TGT-CTAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTT-C--TTG-TCTTGTGGC-CAA-TTTT---GAGAACAG----TTAATATGA-ACCAGGAC-CTTTGTGGGAATTAA-TCTTAA-ATTGT--TA--GACAAAGACAGACCATTTTGA--TAT-ACA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCA-CT--T-TCTGTTAAGTAACA--------TAATTTA-TAC-TAATTTCC-TTTGCT--ACT-GGTC-TA-TTTGAA--AGT--CTATCCTATA--G---ATATTTGG--AATGTAAA------C-TTCCAATT-T--GCAA-T---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA---GT-GCGTAAA--TG-CGA--T-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----caataaaattgtgca
gi|12 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnGCTAAAGTTTGATT-AGTAGG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATT-CATA--CACACC--------CTTAGATTCAACCCTTTATTCAC-AT-C-ACTA--CACAAGG-TACACTT--ACA--TC-T-ATATACCT----TGGGGGATT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCAATC-TT-GTTATGAAGG--G-TCTTTATT-GG--TC-G-TTTT-TGT-CAAATTC-TC---TT-TAG-TTGGTTTTGCCTTTGTTTTTGCCGC-CAGTTTTT---GAGGACAG----TTAATATGA-TCCGGGAC-CGTTGTAGAGATT-G-ACATGA---TTT--CA--GACTAAGACGGACT-----------T-AGA---------------GAT-TTT--GAAATATTCA-TC--TTCTGGGT
gi|13 : gtgGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-AG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATT-CATA--CACACC--------CTTAGATTCAACCCTTTATTCAC-AT-C-ACTA--CACAAGG-TACACTT--ACA-ATC-T-ATATACCT----TGGGGGATT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--TCTT-G-TATGAAGG--G-TCTTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAATTC-TC---TT-TAG-TTGGTTTT-C--TTG-TTTTGCCGC-CAG-TTTT---GAGGACAG----TTAATATGA-TCCGGGAC-CTT-GTAGAGATTAG-ACATGA--TTTT--CA--GACTAAGACGGACT-----------T-AGA---------------GAT-TTT--GAAATATTCA-TT--TCtatcttcttttcttttctcttt
gi|14 : aTTC-TGGGTTATCTTCTTTTCTT---TTCTCT-TT-TT-CTT-TTAGCGGT-T-CCATCAC--TCGTGTCGAATAAACTATTTTTAGACCCTGTAA-CCCTACAGG-AG--TTTTGTTTA-TTCATTGGAGG-AAACCGCCTGTTtgggttatcttctttcttttctctttttcttt
gi|15 : ttcatcATTTC-TGGGTTATCTTCTTTCTTTTCTCT---T-TT-TC-TTT-ATACGG---TTCCATCACTGT-GT-CCGAATAAA-TATTTTTAG-ACCTG-AA-CCCTACAGG-AG--TTTTGTT-A-TTCATTGGAGG-AAAACCCCTGTTacattt
gi|16 : tattcTGCTAA-GTTTGATTTAGT-GG-C--TATTTGG-TTTTATATATTCATAGCGTA--CACACTTTTAGAT-CTTAGATCCACCCC-TTATTTA--ACAC-ACTA--CA----G-TACACTacatt
gi|17 : ATTCCC-TTTGCT--ACT-AGTC-AA-TTTAAA--AGT--CTATCCTACA--G---ATATTTGC--AATATAAA------C-TTCCCATG-T--GCAC-A---TT-TACTAAAT--G-ATTGAAA-GA---GT-GA
gi|18 : CCTA--TA-TTGC-A--AGG-T-G--A-C-GT--A-AAT--CA-GTT-TAC--ATA--T--ATC-T--T--ATTATGATTT--T--GTTCAT-C----TTA-------TT---ATGA-C-CT--T---G--TT
gi|19 : attattatatatatatacaca---A--A--ATC---C--TACA--T--G-T--C-CATGC------AG----------------GAGAT-----AT---TGTC-A--T--A-GC-T-GT----ATAT-TCTG-A--G-GGG-A-G-CT--TC-T--TCC----CATA-GAA-GGGTACG--T--TAGAC-A
gi|2 : agtTAATGGTGTTAA-GTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---GGTTTT-TATATTCATA-CATA--CACACTTTTAGAT-CCTAGACCCACCCCTTTATTTAT-AC-C-ACTA--CA---GG-TACACTT--ACA-ATA-T-ATATACCT----TGGGGGCTT-TAA-CCA--TGA-GTCT---A-----AGTTT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--A-A-TTTATT-GG--TCAG-TATG-TGT-CAAGTCT-TA---TT-TG--TTGGTTTTCC--T-G-TCTTGCCAA-CTG-TTGT---GAGAA-------------TG----CAAGAC-CTTTTCGGACATTAG-ACCTGG-ATTTT--CA--GACAAAGACAAATCATTTTGA--TACGAGACCTCATTTTGATACGAAC-CTT--GAATTCTTCA-TT--TCC-TGACAAGTAACA--------T-ATTTA-TAT-TAATTTCC-TTTGCT--ACT-GGTC-TA-TTTAAA--AGT--CTATACTATA--G---ATA---------------------C-TTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATT-AAA-GA--GG--GAGTAAA--TG-CGA--C-TT---A-TTG-TTAG-AGAAAT-CA----GT-A-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA-ATGT-A--AAG-T-G--T-T-AT--A-AAT--CAAGTT-TA---GTA--G--AAT-T-----A-TA----TT--T--GTGAAC-A----GTA-------TT-G-ATTA---TT--T---G--TTCAAATGA-------G--CA-----A----------T-----T-GA-----T---------------A--T--T---------TTAATATTTAA----------T-----A-TAT-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TA--ATTT-T-----AC-ATA-C--CA--T-GGT-A-GT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--TACA-GT------AGA-T-------CT-A--GA-ATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GT----ATAT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CTAGTC-T--TCT----CATA-GAA-GGG-ACG--T--TAGA--AAT-A---C-T---GT--TTGTATACTAATCT---AT--TAAT-----T-TAA--TC--------A-GT-----TGGTTTATACACTAT-T-T-ATT--GTGGAG-AA-AATGC----T-ATT-T--GACTAAA-AATA-TG-GATTTA--AGAG--TTATGACGC---T-AACCGATTA-AA-G-TG-CT-TAAATT----GTA-ATAATATAGT-G-A-T---ACTG-AATAT--TGTTTTTACTACTGCATAAAGCTGTTTCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTATT-ACTATATTTC-AGGATTATCTT--TTCCTT---AT---TGTT-TC-CTT-ACACTAATGTTCCATCAC--TGGT-CTGAATAAATTGCTTAtt
gi|20 : GTCATAGTGCTAA-TTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-GATATGCATA-CATA--CACAC
gi|21 : TCATTGTTAGATTTAA-GC-TAT----A-TTGTTTTGTT-ACTATATTTC-AGGGCTATCT
gi|3 : GTAATAGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-AG-CCATAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCCTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTCAC-AT-C-ACTA--CAC-AGG--ACACTT--ACA-A-A-TGATAT-CCT----T-GGGGCTT-TGA-TCA--TGG-GTCTTGAG-----AGTGTCAG-TTA--T-TT---TATGAAGG--G-T-TTTATT-GGGTCCAGTTTTT-TGTACAAGTTC-TA---TTGTGG-TTG--TTTTC--TTC-TCTAG-CGCGCAT-TTTTC--GAGAACTG----TTAATCTAACTCCAGG-C-CTTGGTAGAGTTTAGAACCTGC-ATTTT--------------CGCACTATTTTGACTTAT--GA---------------AACTTTT--GAA-TCTTCA-TT--T-TCTGGTAAGTTACT--------T-ATTTA-TACATAATTTCC-TTTGCT--ACTAAGTCATA-TTTAAAAGAGT--CTATCCTTTA--G---ATATTTGC--AATATAAA------C-GT-CCATT-T--GCAACA---TTATACAACAT--GAATTG-AC-GA---GT-GAGTAAA--TA-GAA--C-TT---A-TTG--TAT--GAAAT-CA----GT-A-GT--C--TTATA-----TAT-ATTCCTAC-TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--CA-G-T-TAC---TAAGG--ATT-TC-T--A-TA----TT--T--GTCAAACA----GTA-------TTTGCATGA-CTTT--T---G--TTCAAATGAGCACC--G--CC-----A----------T-----T-GA-----T---------------ATTT--T---------T---------AGTATTAAATCT-----A-T-T-----------AC-A----TGTAGA-T-AGTTG--ATTT-T-----ACAAT--CA-CA--T-GGA-T-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-G-GTCTA--A--ATC---C--TACA--T--G-T--C-CATGC------AG--T-----------A-GA-AT------T---TGTC-A--TCAA-GCTA-GT----ATTT-TCTGCA--G-GGAGA-G-CT--TC-T--TC-----CATACGAA-GGGTACG--TTATAGAC-AGTAA---T-T---GC--TA------T---TT---ATTCTA-T-----C-TAAT-T---------A-CT-----T---TTATA-A-CATAT-TAATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-
gi|4 : TAATTAC-AT-T-ACTAAGCA--AAGATACACTTCAACA-ACT-C-AAATTGCTCACATGGGGGCTTCTGA-TGAAGTGG-CTCT---G-----GGAGT-AAATCA--T-TTCG-TGTGGAGGTTA-T-TTCATT-G---TCAT-GTTG-TGT-AAAGGTGGTAAAATT-TGGATTGCTTAGCC--CTG--ATTGCC-C-TAT-TTTTACCGATGGCAGAACTTTAATATT--TCCAGAAC-ATT-GTGGACAGTAG-ACATGC-ATTTTAGCACCAATAATGA-GGACT-----------T-GCA---------------GAC-TTCAGGAATCCTTTA-TTTGTTCGTGGTAGCTT-TA--------C-AATTA-TGT-TAAATTCCATATACTAAATA-AGTC-AA-TTTATA--AGTTGTTACTCCACACTA---CTACCTGCA-AATATAAA------C-GTTTTATTAT--GCAC-T---TT-TACAAAAT--G-ATTGAAA-GACCAGT-GAGCGAAATTG-AGG--CAAA---A-TTTACTATGAAAAAT-TATAC-ATGA-A----------A-----TATATCTCCTA--TA-A-GT----ATG-T-GATA-T-AT--A-AAT--CA-GCTGTAC--ATA--G--ATT-T--T--A-TA----TA--T--GTCAAA-AG---GTA-------TTTG-ATGACC-TT--T---GA-TTAGAA--A----T--GA-GA-----A----------CGATTTT-GATTTTTT---------------A--T--T---------TA--------A----------TTAATAA-T-T-----------TC-ACTAATGTGAG-T-AG-TGT-ATTT-T-----AT-ATTGC--C---T-GGC-A--T-------TT-GT---C-ATAATC-CATA-AAG------G--ATTC--CTATACA--T--G-T--G-CA-AA------TGT-T-------CT----GAGATTTA--AA---TGTC-C--T--A-GC-T-GT----ATTT-CCT-------GGA-A-A-TT--AA-TG-TCC----CATACCAG-GGGTACG--T--TAAAC-AGT-A---A-T---GT--TT------GA--CT---A----A-T-------CAT--T---------ACCT-----T---TTATA-A-C-TTT-T-ATT--G-GAAG-AA-A-TACCTAAT-GTC-T--AGCAAAA-CA-A-T
gi|5 : C-TTT--GA--TCT-CA-TT--TCC-TGGTAAGTAACAAGTGATTCT-ATTTAGTA---AAATTCC-TT-GCT--ACT-GGTC-TAGCTTAAA--AGT--CTATACTATA--GATTATGTGTGCAAAATATAAGACCACTC-TTCCCATT-CTTGCAA-AACCTT-CACGAGGTCAG-ATTAAAATGA--GGGAGAGTAAGACTGCCGAATC-TTTCCA-TATGCCGT-AAAA-------------------------A-----TAT-TCT------TA-ATTT-----GT-T-G--AGT-AT--A-AATCGCA-GGG-TAA--GTC--G--ATT-TAATAAA-TA----TT--T--TCCTAA-ATACTGTA-------CAAG-GTGA-T-TA--T---A--T----A--A----T--G--CAAGTTGA----------CG----T-GA-----TA--------------A--TTAT---------T---------A----------T-----A-T-T-----------TC------TGTAAA-C-AG-TA--A
gi|5 : acgaaacA--T-TT---G-TTGAGTAT-A--AAT-CGCAGGGTAA-GTCGA--TT-TAATAAATAT-TTTCCTAAATA-CTGT-ACAAGG-T-G--A-TTAT--ATAATG-CAAGTT-GAC--GTG--ATAATTAT--T--A-TA----TT--TCTGTAAAC-A----GTAACAAGA-CTTG-AT---C-TTAAT---GAGTTCAAA--AAA--T--GAGCA-----A----------C-----TTGA-----T---------------A--T--TATTTAATACTGA-------A----------T-----ACT-T-----------GC-A----CGTAAA-T-TG-TG--ATTT-TTATATAC-AA--CAACA--T-GGT-AACT-------TT-ATGTTT-A-AATGTTATATGAG---ATGA--ATTG--G--TTTAATT--G-TCAT-CA-GT------AGA-T-------CT-T--GAGATT----TT---TTACAC--G--ATGC-AAGTTATGATTC-TTTG-A--GTGGA-ATG-CT--TCCT--TCT----CATA-GAG-GG-TACG--T--TAGAA-TGT-A---C-TCGAGTCTTC------TA--AT---CT--TA-TCTTAAA-TAT--T---------A-CT-----T---TTATA-AATCTATGT-ATTTGGCGGAG-AAGA-TGC----TTATTAT--GACTAAAATA-G-TG-GATTTACAAGAGGTTTAT--CGCCCTT-AACCGATT--AACG-TATCT-TA--CTAATGGAA-AT----CAGT-G-AACGGAA-TG-AAT-T--GTTTcaagacttgatcttaatgagttcaaaaaatgagcaacttgatattatttaatactgaatacttgcacgtaaattgtgatttttatatacaacaacatggtaactttatgtttaaatgttatatgagatgaattggtttaattgtcatcagtagatcttgagattttttacacgatgcaagttatgattctttgagtggaatgcttccttctcatagagggtacgttagaatgtactcgagtcttctaatcttatcttaaatattacttttataaatctatgtatttggcggagaagatgcttattatgactaaaatagtggatttacaagaggtttatcgcccttaaccgattaacgtatcttactaatggaaatcagtgaacggaatgaattgttt
gi|6 : acgaaacctttgatctcatttcctggtaagtaacaagtgattctatttagtaaaattccttgctactggtctagcttaaaagtctatactatagattatgtgtgcaaaatataagaccactcttcccattcttgcaaaaccttcacgaggtcagattaaaatgagggagagtaagactgccgaatctttccatatgccgtaaaaatattcttaT-GAGTAA---TG-AGA--C-T----A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GT-A-GT--A--TT-T------TAT-TTTCCTA--TA-ATGTTA--AGG-TTG--A-T-AT--A-AAT--CATGTT-TAC--ATA--G--ATG-TA-T--A-T-----TT--T--GTTCAA-A----GCA-------TTTG---GA-C-TT--T---G--TTGAAA--A----T--GAGCAC----A----------C-----TCGA-----T---------------A--T--T---------TTA-------G----------T-----A-T-TTTAAATCTATAAC-A----TGTAAA-TTAG-TG--ATTTAT-----AC-AC--C--CACAT-GGTTA-CT-------TTTAT---T-A-GAT--TATA-GAGT--A--G--ATTATCC--TACA--TTAG-T--C-CA-GT------AGA-T-------CT-AG-AAGAT-----AT---TGTT-CCTT--A-GC---GT----ATTTGTCTG-A--G-GGA-A-GGCT--TC-T--TCTGTCCCACA-GAAAGGGTGCG--A--TAGACCAGT-A---C-T---GT--T-------TA--TTTTAATC-TA-T-----T-CAAATT---------A-CT-----T---T-ATA-A-ACTAT-T-ACT--G-GGAGGAA-A-TGC----T-ATT-T--TGCTAAA-TA-ACTGTGATTTA--AGAG--TTAT--CTCCCTT-AACTGATTA-AACGTTATCT-GA--TG----GAA-ATC---CAGTAG-AGA---A-TG-AAA-TAATCGTTT-AGGTCAGTATAG-GGC-TC-CATTGTTAGATTTAT-GCATAT----A-TTGTTGTTTT-ACTATA-TTC-AGGGCTATCTA--TTCC------------TT-TC-CCT-ATTATGGT-TTCCTCCTG--T-GT-CCGAATAAAATATTTA---GACCTG-A------ACAGGCAG--TTTCGTT-ATTTCATTGAGGG-AACACCTCTGTT
gi|7 : AAT--G-ATTGAAA-GA--G-T-GACTAAA--TG-AGG--C-AA---A-GTGACTGT-GATAAT-TA----GTAATGC--A--TA-TA-----TAT-T--CCTA--AA-GTGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--ATA--A--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-AA---GTA-------TTTC-ATGA-C-CT--T---G--TTCGAA--A----T--GAGCAC----G----------T-----T-GG-----T---------------A--T--T---------TTATTATA--A----------TTC---A-T-T-----------GC-T----TGTATG-T-AG-TT--ATCT-T-----AC-AT--A--CA--T-GTC-A-CT-------TT-GT---T-A-TTT--TATA-GTA---T--A--ATTC--C--TAGA--T--G-T--G-CA-GTTATTCTAGA-TGAACGCCCT-AGCGATATTCTAGATGAACGCC-C--T--A-GC-G-GT----ATTT-TCTG-A--G-GGT-A-G-TT--TC-G--ACC----AATA-CAG-GGGCACG--T--TAGAC-AGT-AATGT-T---GT--TT------TG--AT---AT--GT-T-----A--GG--T---------A-CT-----T---TTATA-A-T-TAT-T-AAT--G-GAAG-AA-A-TAT----T-ATTAT--CGCAAAA-TA-A-TG-TATCTA--AGAC--TTAT--CCCCTTT-AACTGATTA-AGGG-TAT-T-TA--TT------A-AT----CAAT-GCGAT-----TG-GAT-G--TGGTTT-A-----GTTTAA-GAT---------TTAAATTGAT-GT-TTT----T-TTGCTGTTTA-AGTATGCTTC-AGGGCGA------TTACCT---AT---C-CTATG-CTT--TACTG---TACCATTA----------GAATGAATTATTTAC---ACCTG-AA-CCCTACGGG-AG--TTTTATT-A-CTCATacctaatttgcgcg
gi|8 : g-GTTTAATT-AGT-AG-C--TAT---G-TTTT-TACATTCATA-CATA--AACACCTTTAGAT-CTTAGATAAACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACTA--CA---GG-TACGCTT--AC---------------T----TGGGGGCTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--GTT-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGG-TTTTC--ATG-TCTTGCTGC-CAG-TATT---GAGAAATG----TTAATACAA-TCCAGGAC-C-TTGTAGAGATTAG-ACATGAGATTTT--CA--GACAAAGACTGACT-----------T-AGA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCT-TT--T--CTGGTAAGTTACT--------T-ATTTT-TAC-TAATTTCC-TTTGCT--ACT-AGactacaagaacacattgttccataacgattgacatgat
gi|8 : TTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--G-AAT--CA-GTT-TAC--ATA--A--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TTTG-ATGA-C-AT--T---G--TTCAAA--A----TGAG--CA-----AT---------T-----T-GA-----T---------------A--T--T---------T--------------------T-----A---------------GC-A----TATA--------TT--ATCT----------AT--T--CA--TAGGC-G-CC-------TT-GG---T-C-AAT--GAT--------------ATTG--T--TATA--T--A----T-CA-GT------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcctataatgtaaggtgatatgaatcagtttacataaattttatatttgtcaaaagtatttgatgacattgttcaaaatgagcaatttgatattttagcatatattatctattcataggcgccttggtcaatgatattgttatatatcagt
gi|9 : gtttaattagtagctatgtttttacattcatacataaacacctttagatcttagataaacccctttatttacaccactacaggtacgcttacttgggggctttgatcatgggtctgagtgtggtcatttgtatgaagggtttttattggtcagtttttgtcaagttctatttggttggttttcatgtcttgctgccagtattgagaaatgttaatacaatccaggaccttgtagagattagacatgagattttcagacaaagactgacttagagactttgaattcttcttttctggtaagttacttatttttactaatttcctttgctactagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGAAATGCAA---GT-A-GT--AAATT-TA-----TAT-TTTCCTA--TAGATGT-A--GGGGT-G--T-C-ATTGA-AATG-CA-GTT-TACCGGTA--G--ATT-TGAT--G-TA----TTGCT--GTCAAA-A----GTAATTAATCTTTT-ATGA-C-TC--TTGCG--CTCAAATGA-------G--CA-----AAGCTTGAAGCT-----T-GA-----TTAGTTTTTAGTTAAAA--T--T---------T---------AAAGTC-----T-----A-T-T-----------GCTA----TGTAAAAT-AG-TGTTATTT-TT----AC-AT--GA-CA--T-GGT-A-CTGTTCTGCTT-GTG--TGA-AAT--TATG-GAG---T--AGGATTCT-C--TACA--CTGG-T--T-CA-GT------AGAGT-------ATGAA-GAGTGT----GC---CTTC-C--T--A-GC-A-GT----ATAT-TCTA-AAAG-GGA-A-G-CT--TT-CACTCT----CATA-GAG-GGGTACGAGT--TAGAA-AGT-A---TCT---TT--TG------TA--CT----T--CG-T-----A-GAA--TCTATTAATTA-TTGGCAAT---TTATA-A-GCTAT-T-ATTTAG-GGAA-AA-A-TTC----T-ACT-TTGGACTAAA-GT-A-TG-GACTTA--AGAG--TTTTA-CGGCCTTGAACCGATTA-AACG-TATCTCTA--T---------AT----TTGT-----T---A-C----T-T--TG-TTT-ATTACTGCATCG-GCT-TCTCATTGTTAGATTTAGAGC-TATAAGGA-TTGTTTTGTT-ACTATATTTCGAGGGC--TCAT--T--CT-----T---T-TT-TCGCTTAATA-TGAT-TTCTATAAC--C-------AATAAATCG
gi|9 : AAA--TG-CGA--T-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----cattt
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 1111111 1111 11 111111111 11 111111 1 111 1111111 111 6666666666666666666666666666666 111 22222222 111111 11 111111 1111 11111 111 11 1111111111111111 11111 11 1 11 1111 2222222 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 22222 1111111 111 111111111 111 11 111111 3333333333333333 11111 111 11 11111 5555555555555555555555555555555555555555555555 11111 111 11 1 11 222222222222 1111 222222222222222222222222 1111 111111 11 222222222222 111111111 1111
lowQualScore : 5 4 4 4 66 777 4 4 4 66 55 5 0 4 4 4 66 999 4 66 6666666 9 0000 1 5 5 33 5 555555555 5 5 11 5 999 000000 5 66 5 5 5 5 888 5 5 22 0 66 5 5 5 333 6666666 444 5 0 6 1 5 6 88 999999 0 1111111111111111111111111111111 4 66 4 4 66 555 1 00000000 5 5 99 5 66 5 5 5 77 77 000000 111 33 1 666666 5 2222 44444 5 1 66 5 5 777 4 11 55 55 3 6666 3 3 3 3 9999999999999999 4 00000 4 77 33 7777 6 3 7777 3 44 3 11 0 3 555 55555 3 55 44 3 7777 44 44 3 3333 0000000 1 3 3 3 44 555 77 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 999999 44 3 3 88 4 44444 4 44444 55 4 4 4 3333333 4 111 4 4 99 4 0 888888888 666 55 55 00 3 8888 7 000000 4444444444444444 2 99999 777 4 55 55 4 000 8888 1 4 4 55 4 4 4 4 55 4 99 88888 8 77 55 55 44 4 11111 777 66 2222222222222222222222222222222222222222222222 4 11111 777 4 888 4 4 4 22 8 4 4 4 9999 4 0 66 5 5 5 5 77 77 33 5 5 0 5 0 5 222222222222 7777 666666666666666666666666 6 5 6 1 5555 5 5 222222 1 5 5 4 0 33 666666666666 5 5 55 2 999 0 999999999 2 4444 6 6 6 99 6 6 8
lowQualScore : . . . . .. ... . . . .. .. . . . . . .. ... . .. ....... . .... . . . .. . ......... . . .. . ... ...... . .. . . . . ... . . .. . .. . . . ... ....... ... . . . . . . .. ...... . ............................... . .. . . .. ... . ........ . . .. . .. . . . .. .. ...... ... .. . ...... . .... ..... . . .. . . ... . .. .. .. . .... . . . . ................ . ..... . .. .. .... . . .... . .. . .. . . ... ..... . .. .. . .... .. .. . .... ....... . . . . .. ... .. ......................................................................................................................... ...... .. . . .. . ..... . ..... .. . . . ....... . ... . . .. . . ......... ... .. .. .. . .... . ...... ................ . ..... ... . .. .. . ... .... . . . .. . . . . .. . .. ..... . .. .. .. .. . ..... ... .. .............................................. . ..... ... . ... . . . .. . . . . .... . . .. . . . . .. .. .. . . . . . . ............ .... ........................ . . . . .... . . ...... . . . . . .. ............ . . .. . ... . ......... . .... . . . .. . . .
lowQualScore : 0 4 4 4 11 888 4 4 4 11 44 0 4 4 4 4 11 444 4 99 2222222 5 6666 0 0 0 88 0 222222222 0 0 99 0 444 111111 0 99 0 0 0 0 888 0 0 66 0 99 0 0 0 888 0000000 666 0 1 2 4 0 4 22 000000 5 2222222222222222222222222222222 4 11 9 4 11 000 0 77777777 7 7 77 0 99 0 7 7 99 99 111111 666 66 4 444444 7 7777 11111 7 9 99 0 0 666 0 00 00 00 6 5555 6 5 6 3 9999999999999999 0 00000 0 99 88 1111 7 3 6666 3 66 3 22 0 3 444 33333 3 88 66 3 1111 66 66 3 8888 4444444 3 3 3 3 66 888 99 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222 00 6 6 66 0 00000 0 66666 55 0 0 0 0000000 0 000 0 0 55 0 9 333333333 000 00 00 00 6 1111 3 555555 4444444444444444 5 77777 000 0 55 55 0 666 5555 0 0 0 55 0 0 0 0 55 0 55 99999 0 00 55 55 00 4 11111 888 11 4444444444444444444444444444444444444444444444 4 11111 888 4 777 8 4 4 22 9 4 4 4 4444 4 0 99 0 0 0 7 99 99 66 7 7 7 7 1 7 666666666666 9999 777777777777777777777777 7 2 7 0 1111 7 7 666666 0 7 1 4 8 88 000000000000 0 0 44 5 000 4 666666666 2 2222 7 7 7 22 7 7 0
consensus : NNGTAATGGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCTTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACTA--CA--AGG-TACACTT--ACA-ATA-T-ATATACCT----TGGGGGNTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--G-T-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTTTC--TTG-TCTTGCCGC-CAG-TTTT---GAGAACAG----TTAATATGA-TCCAGGAC-CTTTGTAGAGATTAG-ACATGA-ATTTT--CA--GACAAAGACGGACTATTTTGA--TAT-AGA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCA-TT--TCCCTGGTAAGTNACA--------T-ATTTA-TAC-TAATTTCC-TTTGCT--ACT-GGTC-TA-TTTAAA--AGT--CTATCCTATA--G---ATATTTGC--AATATAAA------C-TTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TG-NGA--C-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TTTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-----A----------C-----T-GA-----T---------------A--T--T---------T---------A----------T-----A-T-T-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TG--ATTT-T-----AC-AT--C--CA--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-GT------AGA-T-------CT-AA-GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GT----ATNT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAG-GGGTACG--T--TAGAC-AGT-A---T-T---GT--TN------TA--CT---AT--TA-T-----A-CAA--T---------A-CT-----T---TTATA-A-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TG-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AACCGATTA-AACG-TATCT-TA--TT----GAA-AT----CAGT-G-AAT---A-TG-AAT-T--TNTTTT-ACTACTGTATAG-GNT-TCTCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTNTT-ACTATATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCTT---AT---T-TT-TC-CTT-ATACTGAT-TTCCATCAC--T-GT-CCGAATAAATTGTTTATAGAACCTG-AA-CCCTACAGG-AG--TTTTGTT-A-TTCATTGGAGG-AAAACCCCTGTTG
Reference ( family-533 ) : NNGTAATGGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCTTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACTA--CA--AGG-TACACTT--ACA-ATA-T-ATATACCT----TGGGGGNTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--G-T-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTTTC--TTG-TCTTGCCGC-CAG-TTTT---GAGAACAG----TTAATATGA-TCCAGGAC-CTTTGTAGAGATTAG-ACATGA-ATTTT--CA--GACAAAGACGGACTATTTTGA--TAT-AGA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCA-TT--TCCCTGGTAAGTNACA--------T-ATTTA-TAC-TAATTTCC-TTTGCT--ACT-GGTC-TA-TTTAAA--AGT--CTATCCTATA--G---ATATTTGC--AATATAAA------C-TTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TG-NGA--C-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TTTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-----A----------C-----T-GA-----T---------------A--T--T---------T---------A----------T-----A-T-T-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TG--ATTT-T-----AC-AT--C--CA--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-GT------AGA-T-------CT-AA-GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GT----ATNT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAG-GGGTACG--T--TAGAC-AGT-A---T-T---GT--TN------TA--CT---AT--TA-T-----A-CAA--T---------A-CT-----T---TTATA-A-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TG-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AACCGATTA-AACG-TATCT-TA--TT----GAA-AT----CAGT-G-AAT---A-TG-AAT-T--TNTTTT-ACTACTGTATAG-GNT-TCTCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTNTT-ACTATATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCTT---AT---T-TT-TC-CTT-ATACTGAT-TTCCATCAC--T-GT-CCGAATAAATTGTTTATAGAACCTG-AA-CCCTACAGG-AG--TTTTGTT-A-TTCATTGGAGG-AAAACCCCTGTTG
gi|1 : GTAATGGTGTTAA-GTT-GATT-AGT-GAAC--TAC---G-TTTT-TATATT-ATA--ATAACTACATCTTTAGATATTTAGATCCACCCCATTATTTAC-AC-CGACTA--CA--AGG-TACACTT--ACACATAGT-ATAC-CCT----TAGGGAGTT-TAA-TCA--TGGCGTCT---A-----TGTTC-GG-TCAA-T-TT-T-TATGAAGG--G-T-TTTATTTGG--TCAG-TTTTGTGT-CAAGTCC-TA---TT-TGG-TTGTTTTTTC--TTG-TTTTGCCGC-CGG-TTGT---GAGAA-------------TG----CAGGACTCTTTGCAGATAATAG-AC-CGA-ATTTT--CC--GAAAAAGACAGATCATTTTGA--TAT-AGA---------------GAC-CTT--AAATTCTTCAATT--TCCCTGGTAAGTAACA--------T-ATCTA-TAT-TAATTTCC-TTTGTT--ACT-GGTC-TA-TTTAAA--AGT--CTATC-TATA--G---ATATT-GC--AATA--AA------CATTCCAATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ACTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TG-GGA--C-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA--TAT-A--AGG-T-G--T-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----T------GTCAAA-A----GTA-------TCTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-----A----------C-----T-GA-----G---------------A--T--T---------T---------A----------T---------T-----------GC-A----TGTAA--T-AG-TG--ATTT-T-----AC-AT--C--TA--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-GT------AGA-T-------CT-AA-GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GG----ATAT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GA--AGGT-CG--T--TAGA--AGT-A---T-T---GT--TA------TA--CT---AT--TA-T-----A-CAA--T---------A-CT-----T---TTAAA-A-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-A-T-T--GACTTAA-TA-A-TT-GATTTA--AGAG--GTAT--CGCCGCT-AATCGATTAGAACG-TATCT-TA--TT----GGACAT----CAGT-G-AAT---A-TGCAAT-T--TTTTTT-ACTACTGTATAG-GAT-TTTCATTGTTAGATTTAT-GC--AT----ACTTGTTGTATT-ACAATA-TTC-AGGGCCATCTT--TTCCTT---AT---TGTT-TC-CTT-ATACTAAT-TTCCATCAC--T-GT-CTGAATAAATTGTTTATAAAACTTG-AATCCTTAAAAG-AG--TTTTGTT-A-TTCACTGGAGG-AAAAATCCTCTTG
gi|10 : tgT-GAGTAAA--TG-GGA--C-TT---AATTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCT---TA-ATAT-A--AGGTT-G--T-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TCTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----TG-G--TA-----A----------CT----T-GA-----T---------------G--T---------------------------------T-----A-T-T-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TG--ATGT-T-----AC-AT------A--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--GTT--T-CA-GT------AGA-T-------CT--A-GAGATT----AT---TGT--C--T--A-GC-A-GT----ATAT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAA-GGGTA-G--T--TAGA--AGT-A---T-T---GT--TA------TA--CT---AT--TA-T-----ATCAAT-T---------A-CT-----T---TTATA-A-TAT-T-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TT-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AA-CGATTA-AACG-T-TCT-TA--TT----GAC-AT----CAGT-G--AT---A-TG-AA-----TATTTT-ACTACTGTATAG-GGT-T-TCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A---GTTGTATTAACT-TATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCAT---AG---T-TT-TC-CTT-ATACTAAT-TTCCATCAC--TGGT-CTGAATAAATTGTTTATAAAA-TTG-AA-TCCTAAAAG-AGTTTTTTGTT-A-TTCACTGGAGGAAAAACCGCTTTTG
gi|11 : aACT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATT--CACGC-TTTAGAT-CTTAGATCCATCC-TTTATTTATTAC-C-ACTA--CA---GG-TACACCT--ACA-ATA-T-ATATACCT----TGGGGGATT-TAAGTCCGTTGA-GTCT---GGAGTCAGTTT-GG-ACA--T----G-TATCAAGG--G-T-GT-ATG-GG--GCA---TTT-TGT-CTAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTT-C--TTG-TCTTGTGGC-CAA-TTTT---GAGAACAG----TTAATATGA-ACCAGGAC-CTTTGTGGGAATTAA-TCTTAA-ATTGT--TA--GACAAAGACAGACCATTTTGA--TAT-ACA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCA-CT--T-TCTGTTAAGTAACA--------TAATTTA-TAC-TAATTTCC-TTTGCT--ACT-GGTC-TA-TTTGAA--AGT--CTATCCTATA--G---ATATTTGG--AATGTAAA------C-TTCCAATT-T--GCAA-T---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA---GT-GCGTAAA--TG-CGA--T-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----caataaaattgtgca
gi|12 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnGCTAAAGTTTGATT-AGTAGG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATT-CATA--CACACC--------CTTAGATTCAACCCTTTATTCAC-AT-C-ACTA--CACAAGG-TACACTT--ACA--TC-T-ATATACCT----TGGGGGATT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCAATC-TT-GTTATGAAGG--G-TCTTTATT-GG--TC-G-TTTT-TGT-CAAATTC-TC---TT-TAG-TTGGTTTTGCCTTTGTTTTTGCCGC-CAGTTTTT---GAGGACAG----TTAATATGA-TCCGGGAC-CGTTGTAGAGATT-G-ACATGA---TTT--CA--GACTAAGACGGACT-----------T-AGA---------------GAT-TTT--GAAATATTCA-TC--TTCTGGGT
gi|13 : gtgGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-AG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATT-CATA--CACACC--------CTTAGATTCAACCCTTTATTCAC-AT-C-ACTA--CACAAGG-TACACTT--ACA-ATC-T-ATATACCT----TGGGGGATT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--TCTT-G-TATGAAGG--G-TCTTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAATTC-TC---TT-TAG-TTGGTTTT-C--TTG-TTTTGCCGC-CAG-TTTT---GAGGACAG----TTAATATGA-TCCGGGAC-CTT-GTAGAGATTAG-ACATGA--TTTT--CA--GACTAAGACGGACT-----------T-AGA---------------GAT-TTT--GAAATATTCA-TT--TCtatcttcttttcttttctcttt
gi|14 : aTTC-TGGGTTATCTTCTTTTCTT---TTCTCT-TT-TT-CTT-TTAGCGGT-T-CCATCAC--TCGTGTCGAATAAACTATTTTTAGACCCTGTAA-CCCTACAGG-AG--TTTTGTTTA-TTCATTGGAGG-AAACCGCCTGTTtgggttatcttctttcttttctctttttcttt
gi|15 : ttcatcATTTC-TGGGTTATCTTCTTTCTTTTCTCT---T-TT-TC-TTT-ATACGG---TTCCATCACTGT-GT-CCGAATAAA-TATTTTTAG-ACCTG-AA-CCCTACAGG-AG--TTTTGTT-A-TTCATTGGAGG-AAAACCCCTGTTacattt
gi|16 : tattcTGCTAA-GTTTGATTTAGT-GG-C--TATTTGG-TTTTATATATTCATAGCGTA--CACACTTTTAGAT-CTTAGATCCACCCC-TTATTTA--ACAC-ACTA--CA----G-TACACTacatt
gi|17 : ATTCCC-TTTGCT--ACT-AGTC-AA-TTTAAA--AGT--CTATCCTACA--G---ATATTTGC--AATATAAA------C-TTCCCATG-T--GCAC-A---TT-TACTAAAT--G-ATTGAAA-GA---GT-GA
gi|18 : CCTA--TA-TTGC-A--AGG-T-G--A-C-GT--A-AAT--CA-GTT-TAC--ATA--T--ATC-T--T--ATTATGATTT--T--GTTCAT-C----TTA-------TT---ATGA-C-CT--T---G--TT
gi|19 : attattatatatatatacaca---A--A--ATC---C--TACA--T--G-T--C-CATGC------AG----------------GAGAT-----AT---TGTC-A--T--A-GC-T-GT----ATAT-TCTG-A--G-GGG-A-G-CT--TC-T--TCC----CATA-GAA-GGGTACG--T--TAGAC-A
gi|2 : agtTAATGGTGTTAA-GTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---GGTTTT-TATATTCATA-CATA--CACACTTTTAGAT-CCTAGACCCACCCCTTTATTTAT-AC-C-ACTA--CA---GG-TACACTT--ACA-ATA-T-ATATACCT----TGGGGGCTT-TAA-CCA--TGA-GTCT---A-----AGTTT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--A-A-TTTATT-GG--TCAG-TATG-TGT-CAAGTCT-TA---TT-TG--TTGGTTTTCC--T-G-TCTTGCCAA-CTG-TTGT---GAGAA-------------TG----CAAGAC-CTTTTCGGACATTAG-ACCTGG-ATTTT--CA--GACAAAGACAAATCATTTTGA--TACGAGACCTCATTTTGATACGAAC-CTT--GAATTCTTCA-TT--TCC-TGACAAGTAACA--------T-ATTTA-TAT-TAATTTCC-TTTGCT--ACT-GGTC-TA-TTTAAA--AGT--CTATACTATA--G---ATA---------------------C-TTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATT-AAA-GA--GG--GAGTAAA--TG-CGA--C-TT---A-TTG-TTAG-AGAAAT-CA----GT-A-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA-ATGT-A--AAG-T-G--T-T-AT--A-AAT--CAAGTT-TA---GTA--G--AAT-T-----A-TA----TT--T--GTGAAC-A----GTA-------TT-G-ATTA---TT--T---G--TTCAAATGA-------G--CA-----A----------T-----T-GA-----T---------------A--T--T---------TTAATATTTAA----------T-----A-TAT-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TA--ATTT-T-----AC-ATA-C--CA--T-GGT-A-GT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--TACA-GT------AGA-T-------CT-A--GA-ATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GT----ATAT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CTAGTC-T--TCT----CATA-GAA-GGG-ACG--T--TAGA--AAT-A---C-T---GT--TTGTATACTAATCT---AT--TAAT-----T-TAA--TC--------A-GT-----TGGTTTATACACTAT-T-T-ATT--GTGGAG-AA-AATGC----T-ATT-T--GACTAAA-AATA-TG-GATTTA--AGAG--TTATGACGC---T-AACCGATTA-AA-G-TG-CT-TAAATT----GTA-ATAATATAGT-G-A-T---ACTG-AATAT--TGTTTTTACTACTGCATAAAGCTGTTTCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTATT-ACTATATTTC-AGGATTATCTT--TTCCTT---AT---TGTT-TC-CTT-ACACTAATGTTCCATCAC--TGGT-CTGAATAAATTGCTTAtt
gi|20 : GTCATAGTGCTAA-TTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-GATATGCATA-CATA--CACAC
gi|21 : TCATTGTTAGATTTAA-GC-TAT----A-TTGTTTTGTT-ACTATATTTC-AGGGCTATCT
gi|3 : GTAATAGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-AG-CCATAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCCTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTCAC-AT-C-ACTA--CAC-AGG--ACACTT--ACA-A-A-TGATAT-CCT----T-GGGGCTT-TGA-TCA--TGG-GTCTTGAG-----AGTGTCAG-TTA--T-TT---TATGAAGG--G-T-TTTATT-GGGTCCAGTTTTT-TGTACAAGTTC-TA---TTGTGG-TTG--TTTTC--TTC-TCTAG-CGCGCAT-TTTTC--GAGAACTG----TTAATCTAACTCCAGG-C-CTTGGTAGAGTTTAGAACCTGC-ATTTT--------------CGCACTATTTTGACTTAT--GA---------------AACTTTT--GAA-TCTTCA-TT--T-TCTGGTAAGTTACT--------T-ATTTA-TACATAATTTCC-TTTGCT--ACTAAGTCATA-TTTAAAAGAGT--CTATCCTTTA--G---ATATTTGC--AATATAAA------C-GT-CCATT-T--GCAACA---TTATACAACAT--GAATTG-AC-GA---GT-GAGTAAA--TA-GAA--C-TT---A-TTG--TAT--GAAAT-CA----GT-A-GT--C--TTATA-----TAT-ATTCCTAC-TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--CA-G-T-TAC---TAAGG--ATT-TC-T--A-TA----TT--T--GTCAAACA----GTA-------TTTGCATGA-CTTT--T---G--TTCAAATGAGCACC--G--CC-----A----------T-----T-GA-----T---------------ATTT--T---------T---------AGTATTAAATCT-----A-T-T-----------AC-A----TGTAGA-T-AGTTG--ATTT-T-----ACAAT--CA-CA--T-GGA-T-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-G-GTCTA--A--ATC---C--TACA--T--G-T--C-CATGC------AG--T-----------A-GA-AT------T---TGTC-A--TCAA-GCTA-GT----ATTT-TCTGCA--G-GGAGA-G-CT--TC-T--TC-----CATACGAA-GGGTACG--TTATAGAC-AGTAA---T-T---GC--TA------T---TT---ATTCTA-T-----C-TAAT-T---------A-CT-----T---TTATA-A-CATAT-TAATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-
gi|4 : TAATTAC-AT-T-ACTAAGCA--AAGATACACTTCAACA-ACT-C-AAATTGCTCACATGGGGGCTTCTGA-TGAAGTGG-CTCT---G-----GGAGT-AAATCA--T-TTCG-TGTGGAGGTTA-T-TTCATT-G---TCAT-GTTG-TGT-AAAGGTGGTAAAATT-TGGATTGCTTAGCC--CTG--ATTGCC-C-TAT-TTTTACCGATGGCAGAACTTTAATATT--TCCAGAAC-ATT-GTGGACAGTAG-ACATGC-ATTTTAGCACCAATAATGA-GGACT-----------T-GCA---------------GAC-TTCAGGAATCCTTTA-TTTGTTCGTGGTAGCTT-TA--------C-AATTA-TGT-TAAATTCCATATACTAAATA-AGTC-AA-TTTATA--AGTTGTTACTCCACACTA---CTACCTGCA-AATATAAA------C-GTTTTATTAT--GCAC-T---TT-TACAAAAT--G-ATTGAAA-GACCAGT-GAGCGAAATTG-AGG--CAAA---A-TTTACTATGAAAAAT-TATAC-ATGA-A----------A-----TATATCTCCTA--TA-A-GT----ATG-T-GATA-T-AT--A-AAT--CA-GCTGTAC--ATA--G--ATT-T--T--A-TA----TA--T--GTCAAA-AG---GTA-------TTTG-ATGACC-TT--T---GA-TTAGAA--A----T--GA-GA-----A----------CGATTTT-GATTTTTT---------------A--T--T---------TA--------A----------TTAATAA-T-T-----------TC-ACTAATGTGAG-T-AG-TGT-ATTT-T-----AT-ATTGC--C---T-GGC-A--T-------TT-GT---C-ATAATC-CATA-AAG------G--ATTC--CTATACA--T--G-T--G-CA-AA------TGT-T-------CT----GAGATTTA--AA---TGTC-C--T--A-GC-T-GT----ATTT-CCT-------GGA-A-A-TT--AA-TG-TCC----CATACCAG-GGGTACG--T--TAAAC-AGT-A---A-T---GT--TT------GA--CT---A----A-T-------CAT--T---------ACCT-----T---TTATA-A-C-TTT-T-ATT--G-GAAG-AA-A-TACCTAAT-GTC-T--AGCAAAA-CA-A-T
gi|5 : C-TTT--GA--TCT-CA-TT--TCC-TGGTAAGTAACAAGTGATTCT-ATTTAGTA---AAATTCC-TT-GCT--ACT-GGTC-TAGCTTAAA--AGT--CTATACTATA--GATTATGTGTGCAAAATATAAGACCACTC-TTCCCATT-CTTGCAA-AACCTT-CACGAGGTCAG-ATTAAAATGA--GGGAGAGTAAGACTGCCGAATC-TTTCCA-TATGCCGT-AAAA-------------------------A-----TAT-TCT------TA-ATTT-----GT-T-G--AGT-AT--A-AATCGCA-GGG-TAA--GTC--G--ATT-TAATAAA-TA----TT--T--TCCTAA-ATACTGTA-------CAAG-GTGA-T-TA--T---A--T----A--A----T--G--CAAGTTGA----------CG----T-GA-----TA--------------A--TTAT---------T---------A----------T-----A-T-T-----------TC------TGTAAA-C-AG-TA--A
gi|5 : acgaaacA--T-TT---G-TTGAGTAT-A--AAT-CGCAGGGTAA-GTCGA--TT-TAATAAATAT-TTTCCTAAATA-CTGT-ACAAGG-T-G--A-TTAT--ATAATG-CAAGTT-GAC--GTG--ATAATTAT--T--A-TA----TT--TCTGTAAAC-A----GTAACAAGA-CTTG-AT---C-TTAAT---GAGTTCAAA--AAA--T--GAGCA-----A----------C-----TTGA-----T---------------A--T--TATTTAATACTGA-------A----------T-----ACT-T-----------GC-A----CGTAAA-T-TG-TG--ATTT-TTATATAC-AA--CAACA--T-GGT-AACT-------TT-ATGTTT-A-AATGTTATATGAG---ATGA--ATTG--G--TTTAATT--G-TCAT-CA-GT------AGA-T-------CT-T--GAGATT----TT---TTACAC--G--ATGC-AAGTTATGATTC-TTTG-A--GTGGA-ATG-CT--TCCT--TCT----CATA-GAG-GG-TACG--T--TAGAA-TGT-A---C-TCGAGTCTTC------TA--AT---CT--TA-TCTTAAA-TAT--T---------A-CT-----T---TTATA-AATCTATGT-ATTTGGCGGAG-AAGA-TGC----TTATTAT--GACTAAAATA-G-TG-GATTTACAAGAGGTTTAT--CGCCCTT-AACCGATT--AACG-TATCT-TA--CTAATGGAA-AT----CAGT-G-AACGGAA-TG-AAT-T--GTTTcaagacttgatcttaatgagttcaaaaaatgagcaacttgatattatttaatactgaatacttgcacgtaaattgtgatttttatatacaacaacatggtaactttatgtttaaatgttatatgagatgaattggtttaattgtcatcagtagatcttgagattttttacacgatgcaagttatgattctttgagtggaatgcttccttctcatagagggtacgttagaatgtactcgagtcttctaatcttatcttaaatattacttttataaatctatgtatttggcggagaagatgcttattatgactaaaatagtggatttacaagaggtttatcgcccttaaccgattaacgtatcttactaatggaaatcagtgaacggaatgaattgttt
gi|6 : acgaaacctttgatctcatttcctggtaagtaacaagtgattctatttagtaaaattccttgctactggtctagcttaaaagtctatactatagattatgtgtgcaaaatataagaccactcttcccattcttgcaaaaccttcacgaggtcagattaaaatgagggagagtaagactgccgaatctttccatatgccgtaaaaatattcttaT-GAGTAA---TG-AGA--C-T----A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GT-A-GT--A--TT-T------TAT-TTTCCTA--TA-ATGTTA--AGG-TTG--A-T-AT--A-AAT--CATGTT-TAC--ATA--G--ATG-TA-T--A-T-----TT--T--GTTCAA-A----GCA-------TTTG---GA-C-TT--T---G--TTGAAA--A----T--GAGCAC----A----------C-----TCGA-----T---------------A--T--T---------TTA-------G----------T-----A-T-TTTAAATCTATAAC-A----TGTAAA-TTAG-TG--ATTTAT-----AC-AC--C--CACAT-GGTTA-CT-------TTTAT---T-A-GAT--TATA-GAGT--A--G--ATTATCC--TACA--TTAG-T--C-CA-GT------AGA-T-------CT-AG-AAGAT-----AT---TGTT-CCTT--A-GC---GT----ATTTGTCTG-A--G-GGA-A-GGCT--TC-T--TCTGTCCCACA-GAAAGGGTGCG--A--TAGACCAGT-A---C-T---GT--T-------TA--TTTTAATC-TA-T-----T-CAAATT---------A-CT-----T---T-ATA-A-ACTAT-T-ACT--G-GGAGGAA-A-TGC----T-ATT-T--TGCTAAA-TA-ACTGTGATTTA--AGAG--TTAT--CTCCCTT-AACTGATTA-AACGTTATCT-GA--TG----GAA-ATC---CAGTAG-AGA---A-TG-AAA-TAATCGTTT-AGGTCAGTATAG-GGC-TC-CATTGTTAGATTTAT-GCATAT----A-TTGTTGTTTT-ACTATA-TTC-AGGGCTATCTA--TTCC------------TT-TC-CCT-ATTATGGT-TTCCTCCTG--T-GT-CCGAATAAAATATTTA---GACCTG-A------ACAGGCAG--TTTCGTT-ATTTCATTGAGGG-AACACCTCTGTT
gi|7 : AAT--G-ATTGAAA-GA--G-T-GACTAAA--TG-AGG--C-AA---A-GTGACTGT-GATAAT-TA----GTAATGC--A--TA-TA-----TAT-T--CCTA--AA-GTGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--ATA--A--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-AA---GTA-------TTTC-ATGA-C-CT--T---G--TTCGAA--A----T--GAGCAC----G----------T-----T-GG-----T---------------A--T--T---------TTATTATA--A----------TTC---A-T-T-----------GC-T----TGTATG-T-AG-TT--ATCT-T-----AC-AT--A--CA--T-GTC-A-CT-------TT-GT---T-A-TTT--TATA-GTA---T--A--ATTC--C--TAGA--T--G-T--G-CA-GTTATTCTAGA-TGAACGCCCT-AGCGATATTCTAGATGAACGCC-C--T--A-GC-G-GT----ATTT-TCTG-A--G-GGT-A-G-TT--TC-G--ACC----AATA-CAG-GGGCACG--T--TAGAC-AGT-AATGT-T---GT--TT------TG--AT---AT--GT-T-----A--GG--T---------A-CT-----T---TTATA-A-T-TAT-T-AAT--G-GAAG-AA-A-TAT----T-ATTAT--CGCAAAA-TA-A-TG-TATCTA--AGAC--TTAT--CCCCTTT-AACTGATTA-AGGG-TAT-T-TA--TT------A-AT----CAAT-GCGAT-----TG-GAT-G--TGGTTT-A-----GTTTAA-GAT---------TTAAATTGAT-GT-TTT----T-TTGCTGTTTA-AGTATGCTTC-AGGGCGA------TTACCT---AT---C-CTATG-CTT--TACTG---TACCATTA----------GAATGAATTATTTAC---ACCTG-AA-CCCTACGGG-AG--TTTTATT-A-CTCATacctaatttgcgcg
gi|8 : g-GTTTAATT-AGT-AG-C--TAT---G-TTTT-TACATTCATA-CATA--AACACCTTTAGAT-CTTAGATAAACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACTA--CA---GG-TACGCTT--AC---------------T----TGGGGGCTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--GTT-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGG-TTTTC--ATG-TCTTGCTGC-CAG-TATT---GAGAAATG----TTAATACAA-TCCAGGAC-C-TTGTAGAGATTAG-ACATGAGATTTT--CA--GACAAAGACTGACT-----------T-AGA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCT-TT--T--CTGGTAAGTTACT--------T-ATTTT-TAC-TAATTTCC-TTTGCT--ACT-AGactacaagaacacattgttccataacgattgacatgat
gi|8 : TTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--G-AAT--CA-GTT-TAC--ATA--A--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TTTG-ATGA-C-AT--T---G--TTCAAA--A----TGAG--CA-----AT---------T-----T-GA-----T---------------A--T--T---------T--------------------T-----A---------------GC-A----TATA--------TT--ATCT----------AT--T--CA--TAGGC-G-CC-------TT-GG---T-C-AAT--GAT--------------ATTG--T--TATA--T--A----T-CA-GT------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcctataatgtaaggtgatatgaatcagtttacataaattttatatttgtcaaaagtatttgatgacattgttcaaaatgagcaatttgatattttagcatatattatctattcataggcgccttggtcaatgatattgttatatatcagt
gi|9 : gtttaattagtagctatgtttttacattcatacataaacacctttagatcttagataaacccctttatttacaccactacaggtacgcttacttgggggctttgatcatgggtctgagtgtggtcatttgtatgaagggtttttattggtcagtttttgtcaagttctatttggttggttttcatgtcttgctgccagtattgagaaatgttaatacaatccaggaccttgtagagattagacatgagattttcagacaaagactgacttagagactttgaattcttcttttctggtaagttacttatttttactaatttcctttgctactagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGAAATGCAA---GT-A-GT--AAATT-TA-----TAT-TTTCCTA--TAGATGT-A--GGGGT-G--T-C-ATTGA-AATG-CA-GTT-TACCGGTA--G--ATT-TGAT--G-TA----TTGCT--GTCAAA-A----GTAATTAATCTTTT-ATGA-C-TC--TTGCG--CTCAAATGA-------G--CA-----AAGCTTGAAGCT-----T-GA-----TTAGTTTTTAGTTAAAA--T--T---------T---------AAAGTC-----T-----A-T-T-----------GCTA----TGTAAAAT-AG-TGTTATTT-TT----AC-AT--GA-CA--T-GGT-A-CTGTTCTGCTT-GTG--TGA-AAT--TATG-GAG---T--AGGATTCT-C--TACA--CTGG-T--T-CA-GT------AGAGT-------ATGAA-GAGTGT----GC---CTTC-C--T--A-GC-A-GT----ATAT-TCTA-AAAG-GGA-A-G-CT--TT-CACTCT----CATA-GAG-GGGTACGAGT--TAGAA-AGT-A---TCT---TT--TG------TA--CT----T--CG-T-----A-GAA--TCTATTAATTA-TTGGCAAT---TTATA-A-GCTAT-T-ATTTAG-GGAA-AA-A-TTC----T-ACT-TTGGACTAAA-GT-A-TG-GACTTA--AGAG--TTTTA-CGGCCTTGAACCGATTA-AACG-TATCTCTA--T---------AT----TTGT-----T---A-C----T-T--TG-TTT-ATTACTGCATCG-GCT-TCTCATTGTTAGATTTAGAGC-TATAAGGA-TTGTTTTGTT-ACTATATTTCGAGGGC--TCAT--T--CT-----T---T-TT-TCGCTTAATA-TGAT-TTCTATAAC--C-------AATAAATCG
gi|9 : AAA--TG-CGA--T-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----cattt
blockSeqs : A T A . CA TTG G A G . TT . T A . AG CAA A CA ATAT A CACA A C G GT . GGAGTC C A AT C GT TTAT . GT T . A G AAA G A GT G CT T G T ACC CAGAACT ACT . T A A T GA AGCACC ATTTTGATACGAGACCTCATTTTGATACG T AG T . TG TCT A AGTGATTC A G CA A AA A A G AG TG GATT TTT AA T ACCACT . CTT AACC A T CA A T CCA A AT CC AT A TTCC A G G G CAGGGTAAGTCGA A ATAAA A AA GA ACA T T ATA T TG T CG A G CGG AGG A AA AA T TGAT GC CT C TACT ATTAATC T C C T AA TGC AG TGAGCAAAGCTTGAAGCTTGATTAGTTTTTAGTTAAAATTTAAAGTCTATT ACTAA AA T T TT A TATAT A TGC CA A T A GTTCTGC T GTT G T GT T TCTAA ATC TA AT TA T CAT T TATTCT ATGAACGCCCTAGC G TCTAG GAA A CT CA T TA TATG A G C AA T G T G AG C AC TGTCC C AA AG TA CC A ATGT CGA CT TGTATACTAATCTATTAATTTAATC C GGCAA GGT C CTA A G A TG T G G A CTAA T A TG A T C T CA GT GA G . T C CTAATGGAA AATA GAACGGAATGAATTGTT T C A G GTTT A A AAGGA A A T G CT TTTTCTCT A G AA C ATG TCGTGTC T TAAA T . C TT T T A
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT . . . . . CAA . . ATCT A . A . . AG . TGAG . . . . CG GTC . . . . . . . . . GT C . . . . C CAG AA . T G . A A TA ATTTTGACTTATGA . . A . . TCG A . . . C . . . . . . . CTA TTT A T . . AT CA . T . . . G . AC G . . T . G . . AGTAGTAAA . . . C A TA G . AG . . . G A . G ATA . GA . . . . . . G ACAAGA T . . . . . A TGAGCACCGCCATTGATATTTTTAGTATTAAATCTATT TA A . . T . T . CAA . . . . . . G . . C . ATGA CT . . TG . TA T . AGTATGAA G TTA . . . . . AA . A . . . . . . . . . G T C A . . C . TC . . GTACTTCGTAGAATCTATTAATT . . . . ATC T . . TA C . . . . . A . . . . . . . A . . . . AATTGTA C AGAGAATGAAATAATCG . C . C TCT . . A A . T . CT TTTCTCTT . . A G AT TGTGTCC C TAGA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . CC . . . . . CA . . ATAT A . A . . . . G . . . . G GTC . . . . . . . . . GT T . . . . . CAG AT . T G . A A CA ATTTTGATATACA . . A . . TC T . . . T . . . . . . . G TTT . T . . T T . T . . . G . . C . . T . A . . TACATGAA . . . . T A . . T . . . G T . A G . C . . . . . . A . T . . . . . . ATGAGAACGATTTTGATTTTTTATTTAATTAATAATT A A . . . . . . AC . . . . . . . . . . . TAGG G . . . . T . . ATCTAG G T . . . . . A . A . . . . . . . . . . C . A . . C . T . . CTAATCTTATCTTAAATATT . . . . TA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTGAC . GATACTGAATATTGT . G . G TT . . A G . T . . TTATTG . . T C GT TGGTCT T TAG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . CT . . . . . A . . AATG A . C . . . . G . . . . G GTT . . . . . . . . . GT C . . . . . CAG AT . G C . C A CA TAGA . . T . . CC T . . . T . . . . . . . G CCT . T . . T A . A . . . G . . C . . T . G . . GTAATGCA . . . . A A . . A . . . . . . G T . A . . . . . . . . A . . . . . . AAATGAGCAACTTGATATTATTTAATACTGAATACTT A A . . . . . . CA . . . . . . . . . . . TAG G . . . . C . . ATCTA G T . . . . . T . T . . . . . . . . . . T . A . . C . C . . TATTTTAATCTATTCAAATT . . . . CA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGGAA . GCGATTGGATGTGG . T . A TC . . A T . T . . ATAGT . . A C GT TGGTCT A G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . . ACTC T . C . . . . A . . . . G GT . . . . . . . . . CT T . . . . . CTG AT . T G . C A CA TAGA . . T . . TC A . . . C . . . . . . . G TGT . T . . C A . A . . . . . . G . . T . A . . GTGAGTA . . . . A A . . T . . . . . . A G . . . . . . . . . . T . . . . . . ATGAGCACACTCGATATTTTAGTATTTTAAATCTATA A G . . . . . . GA . . . . . . . . . . . AA C . . . . C . . ATCTA G T . . . . . A . T . . . . . . . . . . C . A . . A . T . . ATACTATTATATCAATT . . . . AC A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTA . GATATGAATAT . . . C . . . A T . C . . CTATC . . A A AT TGTCC T C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . TCT . . C . . . . G . . . . G AA . . . . . . . . . G . . . . . . ATG T . . C . A . CA TGCA . . T . . CC T . . . . . . . . . . . G . . . . . T T . G . . . . . . A . . A . G . . GTAGTA . . . . A A . . A . . . . . . G G . . . . . . . . . . T . . . . . . ATGAGCACGTTGGTATTTTATTATAATTCATT A A . . . . . . C . . . . . . . . . . . AA G . . . . G . . ATCTT T T . . . . . T . T . . . . . . . . . . T . G . . C . A . . ATTTATTCTATCTAATT . . . . GC A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . TACTTTG . . T G . T . . TTT . . A C . C T
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . C . . . . G . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . TAGA . . . . . C . . . . . . . . . A . . T . A . . GTAGTC . . . . A A . . A . . . . . . G G . . . . . . . . . . T . . . . . . TGAGCAATTGATATTTTAATATTTAATATAT A A . . . . . . A . . . . . . . . . . . AA C . . . . C . . TTCT G . . . . . . G . T . . . . . . . . . . C . G . . A . C . . TTGATATGTTAGGT . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . G . . GTAGTA . . . . C A . . A . . . . . . A G . . . . . . . . . . T . . . . . . ATGCAAGTTGACGTGATAATTATTATATT T A . . . . . . T . . . . . . . . . . . TA G . . . . G . . TA . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . T . G . . . . C . . TGACTAATCATT . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . T . . . . . . . . . A A . . A . . . . . . A A . . . . . . . . . . T . . . . . . ATGAGCAATTTGATATTTTA A G . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . A . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . ATGGTAACTTGATGTTATT . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . A . . . T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : ** CA* ATNT*** ** GT**** CAG**** AT* TAGA*************************** CC* TTT GTAGTA********** A* A* CA*** ATCTA*********** G* C* TATNTTAATCTATTAATT**************************** TTGAA******* GANACTGAATATCGT********* TT** A***** TTATT******* TGGTCC*** TAGG
originalCons : NNGTAATGGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCTTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACTA--CA--AGG-TACACTT--ACA-ATA-T-ATATACCT----TGGGGGNTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--G-T-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTTTC--TTG-TCTTGCCGC-CAG-TTTT---GAGAACAG----TTAATATGA-TCCAGGAC-CTTTGTAGAGATTAG-ACATGA-ATTTT--CA--GACAAAGACGGACTATTTTGA--TAT-AGA---------------GAC-TTT--GAATTCTTCA-TT--TCCCTGGTAAGTNACA--------T-ATTTA-TAC-TAATTTCC-TTTGCT--ACT-GGTC-TA-TTTAAA--AGT--CTATCCTATA--G---ATATTTGC--AATATAAA------C-TTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TG-NGA--C-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TTTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-----A----------C-----T-GA-----T---------------A--T--T---------T---------A----------T-----A-T-T-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TG--ATTT-T-----AC-AT--C--CA--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-GT------AGA-T-------CT-AA-GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GT----ATNT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAG-GGGTACG--T--TAGAC-AGT-A---T-T---GT--TN------TA--CT---AT--TA-T-----A-CAA--T---------A-CT-----T---TTATA-A-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TG-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AACCGATTA-AACG-TATCT-TA--TT----GAA-AT----CAGT-G-AAT---A-TG-AAT-T--TNTTTT-ACTACTGTATAG-GNT-TCTCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTNTT-ACTATATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCTT---AT---T-TT-TC-CTT-ATACTGAT-TTCCATCAC--T-GT-CCGAATAAATTGTTTATAGAACCTG-AA-CCCTACAGG-AG--TTTTGTT-A-TTCATTGGAGG-AAAACCCCTGTTG
finalCons : NNGTAATGGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCTTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACTA--CACA-GG-TACACTT--ACAATNT---ATATACCT----TGGGGGNTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGGGT----TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTTTC--TTG-TCTTGCCGC-CAG-TTTT---GAGAACAG----TTAATATGAT-CCAGGAC-CTTTGTAGAGATTAG-ACATGA-ATTTT--CA--GACAAAGACGGACTTAGA---------------------------GAC-TTT--GAATTCTTCA-TT--TCC-TGGTAAGTNACA--------T-ATTTA-TAC-TAATTTCC-TTTGCT--ACT-GGTC-TA-TTTAAA--AGT--CTATCCTATA--G---ATATTTGC--AATATAAA------C-TTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TG-NGA--C-TT---A-TTGGTTAT-AGAAAT-CAGTAGTA----------TT-TA-----TAT-TTTCCTA--TAA-TGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--CA-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TTTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-----A----------C-----T-GA-----T---------------A--T--T---------T---------A----------T-----A-T-T-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TG--ATTT-T-----AC-ATCA---CA--T-GGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--G-T--T-CA-GT------AGATCTA-----------GAGATT----AT---TGTC-C--T--A-GC-A-GT----ATNT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAG-GGGTACG--T--TAGAC-AGT-A---T-T---GT--TTATNTTAATCTATTAATT----------------------------A-CT-----T---TTATA-A-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-A-TGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TG-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AACCGATTA-AACG-TATCT-TATTGAA-------AT----CAGTGANACTGAATATCGT---------TTT-ACTACTGTATAG-GNTTT--CATTGTTAGATTTAT-GC-TATA-----TTGTTGTNTT-ACTATATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCTTATT-------TT-TC-CTT-ATACTGAT-TTCCATCACTGGTCC---GAATAAATTGTTTATAGGACCTG-AA-CCCTACAGG-AG--TTTTGTT-A-TTCATTGGAGG-AAAACCCCTGTTG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 333 11111 1111 11 111111111 11 111111 111 1111111 111 11 55555555555555555555555555555555555 1111 22222222 111111 111111 1111 11111 111 11 1111 1111111111 11111 11 11 1111 2222222 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111 1111 1111111 111 111111111 111 11 1111 111111 1111111111 111 1111111111 111 11 11111111111111111111 11111 111 2222222 111 11 1 11 222222222 1111 1 22222222 1111 111111 11 222222222222 11 1111
lowQualScore : 5 4 4 4 66 777 4 4 4 66 55 5 0 4 4 4 66 111 66 22222 9 0000 1 5 5 33 5 555555555 5 5 11 5 999 000000 5 66 5 5 5 5 888 5 5 88 3 66 5 5 5 333 6666666 444 5 6 0 1 5 6 00 66 66 3 55555555555555555555555555555555555 5 0000 4 66 4 66 777 1 00000000 5 5 99 5 66 5 5 5 77 77 000000 0 1 77 5 1 666666 5 2222 44444 5 1 66 5 5 777 4 11 55 3 1 3 22 333 3 0000 8 4 2222222222 00000 77 3 7777 3 6 7777 3 44 3 11 3 6 3 555 55555 3 55 44 3 7777 44 44 3 3333 0000000 3 3 3 44 555 77 0 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 999999 3 3 3 88 4 44444 4 6666 4 4 3333333 4 111 4 4 99 4 0 888888888 666 55 55 00 1111 7 000000 6666666666 66 1 111 7777777777 777 9999 55 4 000 8888 1 4 4 55 4 4 4 4 55 4 99 88888 8 77 55 55 44 4 1 55555555555555555555 4 33333 222 4 5555555 4 888 4 4 4 22 8 8 4 9999 4 0 66 5 5 5 5 77 77 33 5 1 5 0 5 0 8888 111111111 7777 5 777 1 99999999 5 3 9999 5 5 5 222222 1 5 5 4 0 33 666666666666 5 5 55 2 999 0 88 555 9999 6 6 6 99 6 6 8
lowQualScore : . . . . .. ... . . . .. .. . . . . . .. ... .. ..... . .... . . . .. . ......... . . .. . ... ...... . .. . . . . ... . . .. . .. . . . ... ....... ... . . . . . . .. .. .. . ................................... . .... . .. . .. ... . ........ . . .. . .. . . . .. .. ...... . . .. . . ...... . .... ..... . . .. . . ... . .. .. . . . .. ... . .... . . .......... ..... .. . .... . . .... . .. . .. . . . ... ..... . .. .. . .... .. .. . .... ....... . . . .. ... .. . .............................................................................................................................. ...... . . . .. . ..... . .... . . ....... . ... . . .. . . ......... ... .. .. .. .... . ...... .......... .. . ... .......... ... .... .. . ... .... . . . .. . . . . .. . .. ..... . .. .. .. .. . . .................... . ..... ... . ....... . ... . . . .. . . . .... . . .. . . . . .. .. .. . . . . . . .... ......... .... . ... . ........ . . .... . . . ...... . . . . . .. ............ . . .. . ... . .. ... .... . . . .. . . .
lowQualScore : 0 4 4 4 11 888 4 4 4 11 44 0 4 4 4 4 11 111 99 00000 5 6666 0 0 0 88 0 222222222 0 0 99 0 444 111111 0 99 0 0 0 0 888 0 0 88 9 99 0 0 0 888 0000000 666 0 2 1 4 0 4 00 99 99 6 66666666666666666666666666666666666 0 6666 4 11 9 11 888 0 77777777 7 7 77 0 99 0 7 7 99 99 111111 1 4 99 7 4 444444 7 7777 11111 7 9 99 0 0 666 0 00 00 6 5 6 55 888 3 4444 0 0 7777777777 00000 99 3 1111 3 7 6666 3 66 3 22 3 7 3 444 33333 3 88 66 3 1111 66 66 3 8888 4444444 3 3 3 66 888 99 4 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222 6 6 6 66 0 00000 0 8888 0 0 0000000 0 000 0 0 55 0 9 333333333 000 00 00 00 7777 3 555555 2222222222 44 6 222 5555555555 000 5555 55 0 666 5555 0 0 0 55 0 0 0 0 55 0 55 99999 0 00 55 55 00 4 8 44444444444444444444 4 77777 222 4 6666666 4 777 8 4 4 22 9 9 4 4444 4 0 99 0 0 0 7 99 99 66 7 7 7 7 7 1 0000 666666666 9999 7 999 4 33333333 2 2 3333 7 7 7 666666 0 7 1 4 8 88 000000000000 0 0 44 5 000 4 88 555 0000 7 7 7 22 7 7 0
consensus : NNGTAATGGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCTTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACTA--CA-A-GGTACACTT--ACA-ATN-TATATACCT----TGGGGGNTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--G-T-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTTTC--TTG-TCTTGCCGC-CAG-TTTT---GAGAACAG----TTAATATGA-TCCAGGAC-CTTTGTAGAGATTAG-ACATGA-ATTTT--CA--GACAAAGACG----------------GAC-----T---------TA-GA----GAC-TTT--GAATTCTTCA--TTT---CCTGGTAAGTNACA--------TA-TTTA-TAC-TAATTTCCTT-TGCTA--CT-GGTC-TA-TTTAAA--AGTC--TATCCTATA--G---ATATTTGC--AA-TATAAA------C-TTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TG-NGAC-TTA-TTGGTTAT-A-GAAAT-CA----GT-A-GT--A--TT---TA-----TATTTTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--C-A-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TTTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--GA-CA-----A----------C-----T-GA-----T---------------A--T--T---------T-------A----------T-----A-T--------T-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TG--ATTT-T-----AC-ATC-A-CATGGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--GT--T-CA-GT------AGA-T-------CT-AGAGATT--ATT----------G---TC-C--T--A-GC-A-GT----ATNT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAG-GGGTACG--T--TAGAC-AGT-ACT---GTT--TATACT------AATCT-AT--T--AA---TTA-CT-------TTTATA-A-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-ATGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TG-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AACCGATTA-AACG-TATCT-T--ATT----GAA-AT----CAGT-GANACTG-AAT--ATTG-TTTTACTACTGTATAGG---GTT-TCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTNTTA-CTATATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCTT---AT---T-TT-TC-CTT-ATACTGAT-TTCCATCACTG-GT-CCGAATAAATTGTTTATAGAACCTG-AA-CCCTACAGG-AG--TTTTGTT-A-TTCATTGGAGG-AAAACCCCTGTTG
Reference ( family-533 ) : NNGTAATGGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCTTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACTA--CACA-GGTACACTT--ACA-ATN-TATATACCT----TGGGGGNTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--G-T-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTTTC--TTG-TCTTGCCGC-CAG-TTTT---GAGAACAG----TTAATATGA-TCCAGGAC-CTTTGTAGAGATTAG-ACATGA-ATTTT--CA--GACAAAGACG----------------GAC-----T---------TA-GA----GAC-TTT--GAATTCTTCA--TTT---CCTGGTAAGTNACA--------TA-TTTA-TAC-TAATTTCCTT-TGCTA--CT-GGTC-TA-TTTAAA--AGTC--TATCCTATA--G---ATATTTGC--AA-TATAAA------C-TTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TG-NGAC-TTA-TTGGTTAT-A-GAAAT-CA----GT-A-GT--A--TT---TA-----TATTTTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--C-A-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TTTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-----A----------C-----T-GA-----T---------------A--T--T---------T-------A----------T-----A-T--------T-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TG--ATTT-T-----AC-ATC-A-CATGGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--GT--T-CA-GT------AGA-T-------CT-AGAGATT--ATT----------G---TC-C--T--A-GC-A-GT----ATNT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAG-GGGTACG--T--TAGAC-AGT-ATT---GTT--TATNTT------AATCT-AT--T--AA---TTA-CT-------TTTATA-A-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-ATGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TG-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AACCGATTA-AACG-TATCT-T--ATT----GAA-AT----CAGT-GANACTG-AAT--ATCG-TTTTACTACTGTATAGG---NTT-TCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTNTTA-CTATATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCTT---AT---T-TT-TC-CTT-ATACTGAT-TTCCATCACTG-GT-CCGAATAAATTGTTTATAGGACCTG-AA-CCCTACAGG-AG--TTTTGTT-A-TTCATTGGAGG-AAAACCCCTGTTG
gi|1 : GTAATGGTGTTAA-GTT-GATT-AGT-GAAC--TAC---G-TTTT-TATATT-ATA--ATAACTACATCTTTAGATATTTAGATCCACCCCATTATTTAC-AC-CGACTA--CA-A-GGTACACTT--ACACATAGTATAC-CCT----TAGGGAGTT-TAA-TCA--TGGCGTCT---A-----TGTTC-GG-TCAA-T-TT-T-TATGAAGG--G-T-TTTATTTGG--TCAG-TTTTGTGT-CAAGTCC-TA---TT-TGG-TTGTTTTTTC--TTG-TTTTGCCGC-CGG-TTGT---GAGAA-------------TG----CAGGACTCTTTGCAGATAATAG-AC-CGA-ATTTT--CC--GAAAAAGACA----------------GAT-----CATTTTGATATA-GA----GAC-CTT--AAATTCTTCAATTTC---CCTGGTAAGTAACA--------TA-TCTA-TAT-TAATTTCCTT-TGTTA--CT-GGTC-TA-TTTAAA--AGTC--TATC-TATA--G---ATATT-GC--AA-TA--AA------CATTCCAATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ACTGAAA-GA--GGT-GAGTAAA--TG-GGAC-TTA-TTGGTTAT-A-GAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT---TA-----TATTTTCCTA--T--ATAT-A--AGG-T-G--T-T-AT--A-AAT--C-A-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA--------T--GTCAAA-A----GTA-------TCTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--G--CA-----A----------C-----T-GA-----G---------------A--T--T----------------------------T-----A-T--------T-----------GC-A----TGT-AA-T-AG-TG--ATTT-T-----AC-ATC---TATGGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--GT--T-CA-GT------AGA-T-------CTAAGAGATT--ATT----------G---TC-C--T--A-GC-A-GG----ATAT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GA--AGGT-CG--T--TAGA--AGT-ATT---G-T--TATACT------ATTAT-A---C--AA----TA-CT-------TTTAAA-A-TATAT-T-ATT--G-GGAG-AA-ATGC----T-A-T-T--GACTTAA-TA-A-TT-GATTTA--AGAG--GTAT--CGCCGCT-AATCGATTAGAACG-TATCT-T--ATT----GGACAT----CAGT-GAATATGCAAT---TTT-TTTTACTACTGTATAGGA--TTT-TCATTGTTAGATTTAT-GC--AT----ACTTGTTGTATTA-CAATA-TTC-AGGGCCATCTT--TTCCTT---AT---TGTT-TC-CTT-ATACTAAT-TTCCATCACT--GT-CTGAATAAATTGTTTATAAAACTTG-AATCCTTAAAAG-AG--TTTTGTT-A-TTCACTGGAGG-AAAAATCCTCTTG
gi|10 : tgT-GAGTAAA--TG-GGAC-TTAATTGGTTAT-A-GAAAT-CA----GTGA-GT--A--TT---TA-----TATTTTCCT---TA-ATAT-A--AGG-TTG--T-T-AT--A-AAT--C-A-GTT-TAC--GTA--G--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TCTG-ATGA-C-TT--T---G--TTCAAA--A----T--GG-TA-----A----------C-----TTGA-----T---------------G--T--T----------------------------------A-T--------T-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TG--ATGT-T-----AC-AT-----ATGGT-A-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--GT--TTCA-GT------AGA-T-------CT-AGAGATT--ATT----------G---TC----T--A-GC-A-GT----ATAT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CT--TC-T--TCT----CATA-GAA-GGGTA-G--T--TAGA--AGT-ATT---GTT---ATACT------ATTAT-AT--C--AA---TTA-CT-------TTTATA-A-TAT-T-T-ATT--G-GGAG-AA-ATGC----T-ATT-T--GACTAAA-TA-A-TT-GATTTA--AGAG--TTAT--CGCCCTT-AAC-GATTA-AACG-T-TCT-T--ATT----GAC-AT----CAGT-GATA-TG-AAT--AT----TTTACTACTGTATAGG---GTT-TCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A---GTTGTATTAACT-TATTTC-AGGGCTATCTT--TTCCAT---AG---T-TT-TC-CTT-ATACTAAT-TTCCATCACTG-GT-CTGAATAAATTGTTTATAAAA-TTG-AA-TCCTAAAAG-AGTTTTTTGTT-A-TTCACTGGAGGAAAAACCGCTTTTG
gi|11 : aACT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATT--CACGC-TTTAGAT-CTTAGATCCATCC-TTTATTTATTAC-C-ACTA--CA---GGTACACCT--ACA-ATA-TATATACCT----TGGGGGATT-TAAGTCCGTTGA-GTCT---GGAGTCAGTTT-GG-ACA--T----G-TATCAAGG--G-T-GT-ATG-GG--GCA---TTT-TGT-CTAGTTC-TA---TT-TGG-TTGGTTTT-C--TTG-TCTTGTGGC-CAA-TTTT---GAGAACAG----TTAATATGA-ACCAGGAC-CTTTGTGGGAATTAA-TCTTAA-ATTGT--TA--GACAAAGACA----------------GAC-----CATTTTGATATA-CA----GAC-TTT--GAATTCTTCA--CTT---TCTGTTAAGTAACA--------TAATTTA-TAC-TAATTTCCTT-TGCTA--CT-GGTC-TA-TTTGAA--AGTC--TATCCTATA--G---ATATTTGG--AA-TGTAAA------C-TTCCAATT-T--GCAA-T---TT-CACTAAAT--G-ATTGAAA-GA---GT-GCGTAAA--TG-CGAT-TTA-TTGGTTAT-A-GAAAT-CA----caataaaattgtgca
gi|12 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnGCTAAAGTTTGATT-AGTAGG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATT-CATA--CACACC--------CTTAGATTCAACCCTTTATTCAC-AT-C-ACTA--CACAAGGTACACTT--ACA--TC-TATATACCT----TGGGGGATT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCAATC-TT-GTTATGAAGG--G-TCTTTATT-GG--TC-G-TTTT-TGT-CAAATTC-TC---TT-TAG-TTGGTTTTGCCTTTGTTTTTGCCGC-CAGTTTTT---GAGGACAG----TTAATATGA-TCCGGGAC-CGTTGTAGAGATT-G-ACATGA---TTT--CA--GACTAAGACG----------------GAC-----T---------TA-GA----GAT-TTT--GAAATATTCA--TCT---TCTGG
gi|13 : gtgGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-AG-C--TAT---G-TTTT-TATATTCATT-CATA--CACACC--------CTTAGATTCAACCCTTTATTCAC-AT-C-ACTA--CACAAGGTACACTT--ACA-ATC-TATATACCT----TGGGGGATT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--TCTT-G-TATGAAGG--G-TCTTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAATTC-TC---TT-TAG-TTGG-TTTTC--TTG-TTTTGCCGC-CAG-TTTT---GAGGACAG----TTAATATGA-TCCGGGAC-C-TTGTAGAGATTAG-ACATG--ATTTT--CA--GACTAAGACG----------------GAC-----T---------TA-GA----GAT-TTT--GAAATATTCA--TTT---CTGGGTgttatcttcttttcttttctcttt
gi|14 : aTTC-TGGGTTATCTTCTTTTCTT---TTCTCT-TT-TT-CTT-TTAGCGGT-T-CCATCACTC-GTGTCGAATAAACTATTTTTAGACCCTGTAA-CCCTACAGG-AG--TTTTGTTTA-TTCATTGGAGG-AAACCGCCTGTTtatcttctttcttttctctttttcttt
gi|15 : ttcatcATTTC-TGGGTTATCTTCTTTCTTTTCTCT---T-TT-TC-TTT-ATACGG---TTCCATCACTGTGT-CCGAATAAAT-ATTTTTAG-ACCTG-AA-CCCTACAGG-AG--TTTTGTT-A-TTCATTGGAGG-AAAACCCCTGTTacattt
gi|16 : tattcTGCTAA-GTTTGATTTAGT-GG-C--TATTTGG-TTTTATATATTCATAGCGTA--CACACTTTTAGAT-CTTAGATCCACCCC-TTATTTA--ACAC-ACTA--CA----GTACACTacatt
gi|17 : ATTCCCTT-TGCTA--CT-AGTC-AA-TTTAAA--AGTC--TATCCTACA--G---ATATTTGC--AA-TATAAA------C-TTCCCATG-T--GCAC-A---TT-TACTAAAT--G-ATTGAAA-GA---GT-GA
gi|18 : CCTA--TA-TTGC-A--AGG-T-G--A-C-GT--A-AAT--C-A-GTT-TAC--ATA--T--ATC-T--T--ATTATGATTT--T--GTTCAT-C----TTA-------TT---ATGA-C-CT--T---G--TT
gi|19 : attattatatatatatacaca---A--A--ATC---C--TACA--T--GT--C-CATGC------AG--------------GAGAT---ATT----------G---TC-A--T--A-GC-T-GT----ATAT-TCTG-A--G-GGG-A-G-CT--TC-T--TCC----CATA-GAA-GGGTACG--T--TAGAC-A
gi|2 : agtTAATGGTGTTAA-GTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---GGTTTT-TATATTCATA-CATA--CACACTTTTAGAT-CCTAGACCCACCCCTTTATTTAT-AC-C-ACTA--CA---GGTACACTT--ACA-ATA-TATATACCT----TGGGGGCTT-TAA-CCA--TGA-GTCT---A-----AGTTT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--A-A-TTTATT-GG--TCAG-TATG-TGT-CAAGTCT-TA---TT-TG--TTGGTTTTCC--T-G-TCTTGCCAA-CTG-TTGT---GAGAA-------------TG----CAAGAC-CTTTTCGGACATTAG-ACCTGG-ATTTT--CA--GACAAAGACAAATCATTTTGATACGAGACCTCATT---------TT-GATACGAAC-CTT--GAATTCTTCA--TTT---CCTGACAAGTAACA--------TA-TTTA-TAT-TAATTTCCTT-TGCTA--CT-GGTC-TA-TTTAAA--AGTC--TATACTATA--G---AT----------------A------C-TTCCCATT-C--GCAA-A---TT-CACTAAAT--G-ATT-AAA-GA--GG--GAGTAAA--TG-CGAC-TTA-TT-GTTAG-A-GAAAT-CA----GT-A-GT--A--TT---TA-----TATTTTCCTA--TA-ATGT-A--AAG-T-G--T-T-AT--A-AAT--CAA-GTT-TA---GTA--G--A-A-T--T--A-TA----TT--T--GTGAAC-A----GTA--------TTG-ATTA---TT--T---G--TTC-AA--A----TGAG--CA-----A----------T-----T-GA-----T---------------A--T--T---------TTA-----A----------T-----A-TTTAATATAT-----------GC-A----TGTAAA-T-AG-TA--ATTT-T-----AC-ATA-C-CATGGT-A-GT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-GAG---A--A--ATTG--C--TACA--T--GT--TACA-GT------AGA-T-------CT-AGA-ATT--ATT----------G---TC-C--T--A-GC-A-GT----ATAT-TCTG-A--G-GGA-A-G-CTAGTC-T--TCT----CATA-GAA-GGG-ACG--T--TAGA--AAT-ACT---GTTTGTATACT------AATCT-AT--T--AAT--TTA-ATCAGTTGGTTTATACACTAT-T-T-ATT--GTGGAGAAA-ATGC----T-ATT-T--GACTAAA-AATA-TG-GATTTA--AGAG--TTATGACGC---T-AACCGATTA-AA-G-TG-CT-TAAATT----GTA-ATAATATAGT-GATACTG-AAT--ATTGTTTTTACTACTGCATAAAGCTGTT-TCATTGTTAGATTTAT-GC-TAT----A-TTGTTGTATTA-CTATATTTC-AGGATTATCTT--TTCCTT---AT---TGTT-TC-CTT-ACACTAATGTTCCATCACTG-GT-CTGAATAAATTGCTTAtt
gi|20 : GTCATAGTGCTAA-TTTTGATT-AGT-GG-C--TAT---G-TTTT-GATATGCATA-CATA--CACAC
gi|21 : -TCATTGTTAGATTTAA-GC-TAT----A-TTGTTTTGTTA-CTATATTTC-AGGGCTATCT
gi|3 : GTAATAGTGCTAA-GTTTGATT-AGT-AG-CCATAT---G-TTTT-TATATTCATA-CATA--CACACCCTTAGAT-CTTAGATCCACCCCTTTATTCAC-AT-C-ACTA--CACA-GG-ACACTT--ACA-AAT-GATAT-CCT----T-GGGGCTT-TGA-TCA--TGG-GTCTTGAG-----AGTGTCAG-TTA--T-TT---TATGAAGG--G-T-TTTATT-GGGTCCAGTTTTT-TGTACAAGTTC-TA---TTGTGG-TTG--TTTTC--TTC-TCTAG-CGCGCAT-TTTTC--GAGAACTG----TTAATCTAACTCCAGG-C-CTTGGTAGAGTTTAGAACCTGC-ATTTT--CG--CAC-TATTTT----------------GAC-----T---------TATGA----AACTTTT--GAA-TCTTCA--TTT---TCTGGTAAGTTACT--------TA-TTTA-TACATAATTTCCTT-TGCTA--CTAAGTCATA-TTTAAAAGAGTC--TATCCTTTA--G---ATATTTGC--AA-TATAAA------C-GT-CCATT-T--GCAACA---TTATACAACAT--GAATTG-AC-GA---GT-GAGTAAA--TA-GAAC-TTA-TTG--TAT---GAAAT-CA----GT-A-GT--C--TTA--TA-----TATATTCCTAC-TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--C-A-G-T-TAC---TAAGG--ATT-TC-T--A-TA----TT--T--GTCAAACA----GTA-------TTTGCATGA-CTTT--T---G--TTCAAATGAGCACC--G--CC-----A----------T-----T-GA-----T---------------ATTT--T---------T-------AGTATTAAATCT-----A-T--------T-----------AC-A----TGTAGA-T-AGTTG--ATTT-T-----ACAATC-A-CATGGA-T-CT-------TT-GT---T-A-AAT--TATA-G-GTCTA--A--ATC---C--TACA--T--GT--C-CATGC------AG-----------T-AGA-AT----TT----------G---TC-A--TCAA-GCTA-GT----ATTT-TCTGCA--G-GGAGA-G-CT--TC-T--TC-----CATACGAA-GGGTACG--TTATAGAC-AGTAATT---G-C--TAT-TT------ATTCT-ATC-T--AA---TTA-CT-------TTTATA-A-CATAT-TAATT--G-GGAG-AA-ATGC----T-
gi|4 : TAATTAC-AT-T-ACTAAGCAAA-GATACACTTCAACA-ACT-CAAATTGCTCACATGGGGGCTTCTGA-TGAAGTGG-CTCT---G-----GGAGT-AAATCA--T-TTCG-TGTGGAGGTTA-T-TTCATT-G---TCAT-GTTG-TGT-AAAGGTGGTAAAATT-TGGATTGCTTAGCC--CTG--ATTGCC-C-TAT-TTTTACCGATGGCAGAACTTTAATATT--TCCAGAAC-ATT-GTGGACAGTAG-ACATGC-ATTTTAGCACCAATAATGA-G----------------GAC-----T---------TG-CA----GAC-TTCAGGAATCCTTTA--TTTGTTCGTGGTAGCTT-TA--------CA-ATTA-TGT-TAAATTCCATATACTAAATA-AGTC-AA-TTTATA--AGTTGTTACTCCACACTA---CTACCTGC--AAATATAAA------C-GTTTTATTAT--GCAC-T---TT-TACAAAAT--G-ATTGAAA-GACCAGT-GAGCGAAATTG-AGGCAAAA-TTTACTATGA-AAAAT-TA-----T-A--C--A--TGAAATA-----TA-TCTCCTA--TA-A-GT----ATG-T-GATA-T-AT--A-AAT--C-A-GCTGTAC--ATA--G--ATT-T--T--A-TA----TA--T--GTCAAA-AG---GTA-------TTTG-ATGACC-TT--T---GA-TTAGAA--A----T--GA-GA-----A----------CGATTTT-GATTTTTT---------------A--T--T---------TA------A----------TTAATAA-T--------T-----------TC-ACTAATGTGAG-T-AG-TGT-ATTT-T-----AT-ATT-G-CCTGGC-A--T-------TT-GT---C-ATAATC-CATA-AAG------G--ATTC--CTATACA--T--GT--G-CA-AA------TGT-T-------CT--GAGATTTAAAT----------G---TC-C--T--A-GC-T-GT----ATTT-CCT-------GGA-A-A-TT--AA-TG-TCC----CATACCAG-GGGTACG--T--TAAAC-AGT-AAT---GTT--TG-ACT------AATC----------A---TTACCT-------TTTATA-A-C-TTT-T-ATT--G-GAAG-AA-ATACCTAAT-GTC-T--AGCAAAA-CA-A-T
gi|5 : C-TTT--GA--TCT-CA--TTT---CCTGGTAAGTAACAAGTGATTCTA-TTTAGTA---AAATTCCTT--GCTA--CT-GGTC-TAGCTTAAA--AGTC--TATACTATA--GATTATGTGTGCAAAA-TATAAGACCACTC-TTCCCATT-CTTGCAA-AACCTT-CACGAGGTCAG-ATTAAAATGA--GGGAGAGTAAGACTGCCGAA-TCT-TT--CCAT-ATG-----CC----GT-A-AA--A--------A-----TATTCT------TA-ATTT-----GT-T-G--AGT-AT--A-AATCGC-A-GGG-TAA--GTC--G--ATT-TAATAAA-TA----TT--T--TCCTAA-ATACTGTA-------CAAG-GTGA-T-TA--T---A--T----A--A----T--G--CAAGTTGA----------CG----T-GA-----TA--------------A--TTAT---------T-------A----------T-----A-T--------T-----------TC------TGTAAA-C-AG-TA--A
gi|5 : acgaaacAT-TTG-TTGAGTAT-A---AAT-CGCAGGGT-AAGTCGA--TT---TAATAAATATTTTCCTAAATA-CTGT-ACAAGG-T-G--A-TTAT--ATAATG-C-AAGTT-GAC--GTG--ATAATTAT--T--A-TA----TT--TCTGTAAAC-A----GTAACAAGA-CTTG-AT---C-TTAAT---GAGTTCAAA--AAA--T--GAGCA-----A----------C-----TTGA-----T---------------A--T--TATTTAATACTGA-----A----------T-----ACT--------T-----------GC-A----CGTAAA-T-TG-TG--ATTT-TTATATAC-AAC-AACATGGT-AACT-------TT-ATGTTT-A-AATGTTATATGAG---ATGA--ATTG--G--TTTAATT--GTCAT-CA-GT------AGA-T-------CT-TGAGATT--TTT----------T---ACAC--G--ATGC-AAGTTATGATTC-TTTG-A--GTGGA-ATG-CT--TCCT--TCT----CATA-GAG-GG-TACG--T--TAGAA-TGT-ACTCGAGTC--T--TCT------AATCTTATCTT--AAATATTA-CT-------TTTATA-AATCTATGT-ATTTGGCGGAG-AAGATGC----TTATTAT--GACTAAAATA-G-TG-GATTTACAAGAGGTTTAT--CGCCCTT-AACCGATT--AACG-TATCT-T--ACTAATGGAA-AT----CAGT-GA-ACGG-AATGAATTG-TTTcaagacttgatcttaatgagttcaaaaaatgagcaacttgatattatttaatactgaatacttgcacgtaaattgtgatttttatatacaacaacatggtaactttatgtttaaatgttatatgagatgaattggtttaattgtcatcagtagatcttgagattttttacacgatgcaagttatgattctttgagtggaatgcttccttctcatagagggtacgttagaatgtactcgagtcttctaatcttatcttaaatattacttttataaatctatgtatttggcggagaagatgcttattatgactaaaatagtggatttacaagaggtttatcgcccttaaccgattaacgtatcttactaatggaaatcagtgaacggaatgaattgttt
gi|6 : acgaaacctttgatctcatttcctggtaagtaacaagtgattctatttagtaaaattccttgctactggtctagcttaaaagtctatactatagattatgtgtgcaaaatataagaccactcttcccattcttgcaaaaccttcacgaggtcagattaaaatgagggagagtaagactgccgaatctttccatatgccgtaaaaatattcttaT-GAGTAA---TG-AGAC-T-A-TTGGTTAT-A-GAAAT-CA----GT-A-GT--A--TT---T------TATTTTCCTA--TA-ATGTTA--AGG-TTG--A-T-AT--A-AAT--C-ATGTT-TAC--ATA--G--ATG-TA-T--A-T-----TT--T--GTTCAA-A----GCA-------TTTG---GA-C-TT--T---G--TTGAAA--A----T--GAGCAC----A----------C-----TCGA-----T---------------A--T--T---------TTA-----G----------T-----A-T--------TTTAAATCTATAAC-A----TGTAAA-TTAG-TG--ATTTAT-----AC-ACCCA-CATGGTTA-CT-------TTTAT---T-A-GAT--TATA-GAGT--A--G--ATTATCC--TACA--TTAGT--C-CA-GT------AGA-T-------CT-AGAAGAT--ATT----------G---TT-CCTT--A-GC---GT----ATTTGTCTG-A--G-GGA-A-GGCT--TC-T--TCTGTCCCACA-GAAAGGGTGCG--A--TAGACCAGT-ACT---GTT--TATTTT------AATCT-AT--TCAAA---TTA-CT-------TT-ATA-A-ACTAT-T-ACT--G-GGAGGAA-ATGC----T-ATT-T--TGCTAAA-TA-ACTGTGATTTA--AGAG--TTAT--CTCCCTT-AACTGATTA-AACGTTATCT-G--ATG----GAA-ATC---CAGTAGAGAATGAAATA-ATCG-TTTAGGT-CAGTATAGG---GCT-CCATTGTTAGATTTAT-GCATAT----A-TTGTTGTTTTA-CTATA-TTC-AGGGCTATCTA--TTCC------------TT-TC-CCT-ATTATGGT-TTCC-TC-CTGTGT-CCGAATAAAATATTTA---GACCTG-A------ACAGGCAG--TTTCGTT-ATTTCATTGAGGG-AACACCTCTGTT
gi|7 : AAT--G-ATTGAAA-GA--G-T-GACTAAA--TG-AGGC-AAA-GTGACTGT-G-ATAAT-TA----GT-A-AT--G--CA---TA-----TATATTCCTA--AA-GTGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--A-AAT--C-A-GTT-TAC--ATA--A--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-AA---GTA-------TTTC-ATGA-C-CT--T---G--TTCGAA--A----T--GAGCAC----G----------T-----T-GG-----T---------------A--T--T---------TTATTATAA----------TTC---A-T--------T-----------GC-T----TGTATG-T-AG-TT--ATCT-T-----AC-AT--A-CATGTC-A-CT-------TT-GT---T-A-TTT--TATA-GTA---T--A--ATTC--C--TAGA--T--GT--G-CA-GTTATTCTAGA-TGAACGCCCT-AGCGAT---ATTCTAGATGAACG---CC-C--T--A-GC-G-GT----ATTT-TCTG-A--G-GGT-A-G-TT--TC-G--ACC----AATA-CAG-GGGCACG--T--TAGAC-AGT-AAT---G-T--TGTTTT------GATAT-GT--T--AG---GTA-CT-------TTTATA-A-T-TAT-T-AAT--G-GAAG-AA-ATAT----T-ATTAT--CGCAAAA-TA-A-TG-TATCTA--AGAC--TTAT--CCCCTTT-AACTGATTA-AGGG-TAT-T-T--ATT------A-AT----CAAT-GCGATTG-GAT--GT-G-GTTTA-----GTTTAAG---AT--------TTAAATTGAT-GT-TTT----T-TTGCTGTTTAA-GTATGCTTC-AGGGCGA------TTACCT---AT---C-CTATG-CTT--TACTG---TACCATTA---------GAATGAATTATTTAC---ACCTG-AA-CCCTACGGG-AG--TTTTATT-A-CTCATacctaatttgcgcg
gi|8 : g-GTTTAATT-AGT-AG-C--TAT---G-TTTT-TACATTCATA-CATA--AACACCTTTAGAT-CTTAGATAAACCCCTTTATTTAC-AC-C-ACTA--CA---GGTACGCTT--AC--------------T----TGGGGGCTT-TGA-TCA--TGG-GTCT---G-----AGTGT-GG-TCA--T-TT-G-TATGAAGG--GTT-TTTATT-GG--TCAG-TTTT-TGT-CAAGTTC-TA---TT-TGG-TTGG-TTTTC--ATG-TCTTGCTGC-CAG-TATT---GAGAAATG----TTAATACAA-TCCAGGAC-C-TTGTAGAGATTAG-ACATGAGATTTT--CA--GACAAAGACT----------------GAC-----T---------TA-GA----GAC-TTT--GAATTCTTC---TTT---TCTGGTAAGTTACT--------TA-TTTT-TAC-TAATTTCCTT-TGCTA--CT-AGactacaagaacacattgttccataacgattgacatgat
gi|8 : TTCCTA--TA-ATGT-A--AGG-T-G--A-T-AT--G-AAT--C-A-GTT-TAC--ATA--A--ATT-T--T--A-TA----TT--T--GTCAAA-A----GTA-------TTTG-ATGA-C-AT--T---G--TTCAAA--A----TGAG--CA-----AT---------T-----T-GA-----T---------------A--T--T---------T------------------T-----A----------------------GC-A----T----A-T-AT-TA----TC-T-----AT--TC-A-TA-GGC-G-CC-------TT-GG---T-C-AAT--GAT--------------ATTG--T--TATA--T--A---T-CA-GT------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcctataatgtaaggtgatatgaatcagtttacataaattttatatttgtcaaaagtatttgatgacattgttcaaaatgagcaatttgatattttagcatatattatctattcataggcgccttggtcaatgatattgttatatatcagt
gi|9 : gtttaattagtagctatgtttttacattcatacataaacacctttagatcttagataaacccctttatttacaccactacaggtacgcttacttgggggctttgatcatgggtctgagtgtggtcatttgtatgaagggtttttattggtcagtttttgtcaagttctatttggttggttttcatgtcttgctgccagtattgagaaatgttaatacaatccaggaccttgtagagattagacatgagattttcagacaaagactgacttagagactttgaattcttcttttctggtaagttacttatttttactaatttcctttgctactagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna-GAAATGCAA---GT-A-GT--AAATT---TA-----TATTTTCCTA--TAGATGT-A--GGGGT-G--T-C-ATTGA-AATG-C-A-GTT-TACCGGTA--G--ATT-TGAT--G-TA----TTGCT--GTCAAA-A----GTAATTAATCTTTT-ATGA-C-TC--TTGCG--CTCAAATGA-------G--CA-----AAGCTTGAAGCT-----T-GA-----TTAGTTTTTAGTTAAAA--T--T---------T-------AAAGTC-----T-----A-T--------T-----------GCTA----TGTAAAAT-AG-TGTTATTT-TT----AC-ATG-A-CATGGT-A-CTGTTCTGCTT-GTG--TGA-AAT--TATG-GAG---T--AGGATTCT-C--TACA--CTGGT--T-CA-GT------AGAGT-------AT-GAAGAGT--GT-----------GCCTTC-C--T--A-GC-A-GT----ATAT-TCTA-AAAG-GGA-A-G-CT--TT-CACTCT----CATA-GAG-GGGTACGAGT--TAGAA-AGT-ATC---TTT--TGTACTTCGTAGAATCT-AT--T--AA---TTA-TTGGCAA--TTTATA-A-GCTAT-T-ATTTAG-GGAA-AA-ATTC----T-ACT-TTGGACTAAA-GT-A-TG-GACTTA--AGAG--TTTTA-CGGCCTTGAACCGATTA-AACG-TATCTCT--AT---------AT----T--T-GTTACT--------TTG--TTTATTACTGCATCGG---CTTCTCATTGTTAGATTTAGAGC-TATAAGGA-TTGTTTTGTTA-CTATATTTCGAGGGC--TCAT--T--CT-----T---T-TT-TCGCTTAATA-TGAT-TTCTATAACC--------AATAAATCG
gi|9 : AAA--TG-CGAT-TTA-TTGGTTAT-A-GAAAT-CA----cattt