lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 2 11111 1111111 1111111111111 2 111 11111 55555555555 11 111 111 11111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555 111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222222222 2222 111 11 22222 22222222 11 222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 11 111 111111 222222222 111111 111 11 22222222222222 111111111111111111 22222 22222 4444 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111 1 33333333 1 11111 22222222222222222222222 111 77777777777777777777777777 1 11 55555555555555555 1 1 2222222 22222222 1 111 1
lowQualScore : 6 6 55 00000 4 4 4 4 4 4 4 3333333 4 55 0 8888888888888 4 1 777 777 55 4 4 777 88888 55555555555 4 777 66 00 66 111 4 4 4 8888 777 4 111 4 55 44444444 4 44444444444444444444444444444444444444444444444444 0 66 4 7777 66 4 8 8888 222222 66 9999 4 4 66 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 4 88888 66 4 2 555 0000000000 4 66 66 66 0000 000 5 88 00 0 0 88888 77 88888888 5 5 5 33 0 111111111111111111111111111111111111111111111111 66 44 6666666 5 5 0 22 4 4 4 66 9 4 66 66 4 555 222222 666666666 222222 222 00 4 33333333333333 22 66 55 4 4 8 0 5 0 777777777777777777 6 5 33333 66 00000 4444 5 9999 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 6666 5 5 1 99999999 5 66 0 0 77777 66666666666666666666666 11 8 8 2 444 77777777777777777777777777 6 1 1 22 33333333333333333 7 4 3 9 6 6666666 2 6 6 44444444 5 444 6 1
lowQualScore : . . .. ..... . . . . . . . ....... . .. . ............. . . ... ... .. . . ... ..... ........... . ... .. .. .. ... . . . .... ... . ... . .. ........ . .................................................. . .. . .... .. . . .... ...... .. .... . . .. ................................................................................................................................................. . . ..... .. . . ... .......... . .. .. .. .... ... . .. .. . . ..... .. ........ . . . .. . ................................................ .. .. ....... . . . .. . . . .. . . .. .. . ... ...... ......... ...... ... .. . .............. .. .. .. . . . . . . .................. . . ..... .. ..... .... . .... ................................................................... .... . . . ........ . .. . . ..... ....................... .. . . . ... .......................... . . . .. ................. . . . . . ....... . . . ........ . ... . .
lowQualScore : 1 6 55 00000 0 0 0 0 0 0 0 0000000 0 55 7 0000000000000 0 9 666 888 44 4 4 888 88888 22222222222 4 888 11 66 11 000 0 0 4 5555 000 0 000 0 55 55555555 4 33333333333333333333333333333333333333333333333333 9 11 4 0000 11 4 9 5555 222222 11 4444 4 4 11 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 4 66666 11 4 2 222 8888888888 4 11 11 11 2222 000 7 33 88 6 8 00000 99 66666666 0 0 0 88 4 444444444444444444444444444444444444444444444444 99 55 2222222 0 0 1 22 4 4 4 11 4 4 33 11 4 666 888888 222222222 444444 222 66 4 66666666666666 00 11 55 0 0 0 9 7 6 999999999999999999 0 0 11111 99 11111 6666 0 4444 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0000 7 7 4 00000000 0 99 8 0 55555 11111111111111111111111 44 0 0 2 000 77777777777777777777777777 7 7 7 33 33333333333333333 3 8 7 3 7 2222222 8 6 7 22222222 0 000 2 4
consensus : CTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC---G-T-------TGTAG-AAAGAAAAG--TATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGTG-C-GTTTTAAGT-ATA-GT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-TTTCAT----TGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AA--------AA-C---TTT--T------N-------A----AAATA-C---G--AT-A-A---GCCA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C-----A----------------AC--------A----A-----------A--------T-----TT----T--C-----TT---GTNA--AAGC-AG---------TTTTAGAAGAC-ATATA-TT-A-CATATATTATCATATATGTGCTT-TT---G-AA--AGA-GTATGA-TGCN---------TCTACA-TAC--A--AGGGAA--AAC---AGTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAGAAATATT-----TTTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--G---------C---------GTA-A---C---------AGTTTT--TAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---CGT-NAA-T--TTC---TT---AAGATC--AAT--ATT-TC-AA-ATATCG-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AC-----AA--AAAAATG-C--TGCCATAAAGTTT--GAAAAATC-GAA----TGTCGCATATAAGAANC-AA-------TAACCTACATAACGCGTTTTCT--CGT--CGTGATG-TAG---CCTCNANNTG--AAC---TATATA-ATA-TTGATTTCGT--GATGGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTA-GCAAAAATCCCATGC-T-AATCA---TTTTCTCGAAAAGA---TTTAA-ACGT-AA--ATGAATT-CTAACCTCCGTTATTACAACCTCCATAACAAA--TTTTAAAAAAA---GTCCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGACGGATATCAAT-AT--------ATATGTGAGGCAGAC---GCTCTTTCGTCAAAATGGAAT
Reference ( gi|4 ) : CTCAGAAAAATAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC---A-T-------TGTAG-AATGAAAAA--TATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGTT-C-ATTTTAAGT-ATATGT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-TTCCAT----TGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AA--------AA-C---TAT--T------A-------A----AAATA-T---G--AT-G-A---GCCA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C-----A----------------AT-------------A-----------A--------T-----TT----T--T-----TTG--GTAA--AAAC-AG---------TTTTAGAAGAC-ATATA-TT-ATCATATATTATCATATATGTGTTT-TT---G-AA--AGA-GTATGA-TACT---------TCTACA-TAC--A--AGGGAA--AAC---TGTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAAAAATATT-----TTTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--G---------C---------GTA-A---C---------AGTTTT--TAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---CGT-TAA-T--TTC---TT---AAGATC--AAT--ATT-TC-AA-ATATCG-GGAAAA------TGT-----C---AAATA-AC-----AA--AAAAATA-T--TGCCATAAAGTTT--TTAAAATT-AAA----TGTCGCATATAAGAACCTAATAGGTTATAACCTACATAACACGTGTTCT--TGT-ACATAATG-TAG---C-----------AAT---TATATA-ATA-TGGATTTCAA--GATAGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCCCATGC-T-AATTA---TTTTCTTGAACAGA---TTTAAAACGT-AA--ATGAATT-CTAATCTCCGTTATTACAACCTCCATAATGAACGTTTTAAAAAAA--AGTCCCCGAAACAAAATGACTGGGTGGAATTACAT------CGGCGGAAATCAAT-AT--------ATATGTGAGGCACAC---GCTCTATCATCAAAATGGAAT
gi|15 : CTCAGATAA-TAGGCACAA--TATAATTA-ATCTG-C-GT-A-C-A-T-------G-TCGT--AAGTATA----GC---G-T-------TATAG-AAAGAAAAG--TATGC---T-AGA-TAAAT-AG---GTTGACTTG-C-GTTTTAAGC-AT---T-A-----------------------TTGTGATTT---A-TT-TTTCAT----TGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AA--------AT-C---T-T--T------T-------T----AAATA-T---G--AC-A-A---GCCA--A-ACG--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C-----A----------------ACACAGAAGCA----A-----------A--------TG----TT----TCCT-----TTGTTGTAA--AAGC-AG---------TTTTAGAAGAC-ATGTG-T-------------------------TT-CT---G-AA--AGA-ATATGG-TGCC---------TCTACA-AAC--A--AGGGAA--AAC---AGTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TAT
gi|23 : cattCTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGAATTTCTTGC---G-T-------TGTAG-AAAGAAAAG--TATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGTG-C-GTTT-------TACGT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-CTTCAT----TGAA---AAG-CATTCA---TGAA-AAG--AA--------AA-C---CTT--TTTTTCCA-------G----GAATT-TCCAG--TTCC-A---ATTA--A-ACG--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAg
gi|9 : gtcattCTCAGAAAA-TCGGCACAAATT-----TA-GCCGGAT-GT-A-CTC-T-------G-TCGCCGAATAATAGCTTGC---G-T-------TGTAG-AAAGAAAACGTTATCT---T-TGAATAATG-AA---GTTGGCGTTACGATTTTAAGC------T-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATTT-TTTCAT----TAAA---ATG-CATTCAT--TGAACAAGGTAA--------AA-CGTTTTT--T------G-------A----AAATA-C---GGTAT-A-A---G-CA--A-ACT--T-TTG--AAA-AGCGC----C--------AA--T----ACTG-ATGT--GC--C-----A----------------ACCACAGAAAACA--A-----------A--------TGTTTCCT----T--T-----TTT--GTCA--AAGC-AT---------TTTCAGAAGACAATATA-TTGATC--ATATTAT------TGTGCCT-TTAGAG-AA--AGA-GTATGA-TGGC---------TCTACA-TAC--A--AGGGGA--AGC---CGTATC
gi|32 : cagtcatttCTCAGAAA--TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TTGC--AAGTATATCTTGC---G-TTATGCAGTGTAG-AA-AAAAAAGTTATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGTtagccgtgtggctcgctatctatactttggaatctgtagttcttgtcttctttatcttctctattgcagtgttacccatatctttcaggcccggtcttagggtctaacccaccgtctttccggctccagaccagtacagtgtcatccttcaaatgtcctgataatgtaggtatgaagaattatgaaagttgtacttgcatatcatcggaattaaaccattaattttctttagatcatatttcaaatat
gi|18 : ttTCAGAAAA-TAGACACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC---G-T-------TGTAG-AAAGAAAAG--TATGC---T-TAA-TAAAT-GG---GTTGGCGTG-C-GTTT-------TATTT-ATTATCT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-TTTTAT----TTGA---ATG-CATTCA---TGAA-AAC--AA--------AT-C----AT--T------T-------T----CAATA-C---G--AT-A-A---GCTA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACTG-ATGTC-GC--C-----A----------------AC-------------ACAGAAACAAATA--------T-----TTCC--T--C-----TTT--GTGG--AAGC-AG---------TTTCAGAAGAC---ATA-TT-ATC
gi|36 : agtcatttTCAGAAAATTAG-CACAA--T-----TA-AACTG-T-GT-A-A-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCAACC---G-T-------CGTAG-A
gi|26 : cagccgttgcgcaaAAATAG-CACAA--T-----TA-GCCTG-CCGTTA-C-C-T-------GATCGG--AATT---TCTTGC---AGT-------TGTAG-AA----AAG--TATGA---T--GA-TAAAT-AGTGGGTTGGCGTT-T------------TACGT-ATTATTT---AAAATCG--T--ATTTGTGATTT---A-TTACTTCAT----TGAA-----G-C-TTCA---TGAA-AAG--AA--------A
gi|5 : tttcCACAA--T-----TA-GCCTA-C-AT-A-C-C-TCTGTCCTG-TCGC--AGGCATATCATGA---G-T-------TGTAG-AAAGAAAAG--TATGCACATGCGA-TAAAT-AG---GTTGGCGTG-C-GTTTTAAGT-AT-------TATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-TTTCAT----TGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AATTTTTTAAAA-A---TATGAT------A-------AGCCAAAATA-CC--G--AT-GTC---GCCA--ACACC------G--AAACAA-ATGTTTCCTTTTTAGNN--N----NNNN-NNNTC-GC--C-----A----------------AC-------------A-----------------------------------------------CAG--AAAC-AAATGTTTCCTTTTTAAAAGAG-A----------CATGTATTATCATATATGTGTTT-CT---G-GA--AGA-GTATGA-TGCT---------TCAACA-TAC--A--AGGGAA--AAC---AGTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATGAAATTATT-----TTTTCA--CTCT--------TT-GTA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--GGATAACCTCC---------ATA-A---C---------AGTTTTT-TAGTG--CATCTA-------TC-T-TAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGA------ATAT--------CATCAA----AAATT---CGT-TGA-T--TTC---TT---AAAATC--AAT--ATT-TT-AA-ATATCG-GGAAAA------TGTCATTAC---AAGTA-AC-----AA--AAAAAAA-TGCTGCCATAAAGTTT--GAAAAATC-AAA----TGTCGCATATAAGAAACTAA-A---------CTACATAACGCG---TTT--TGT--CGTGATG-TAG---CCCCCATGTG--AACTAATATGTA-ATA-TTGATCTCGT--GATAGA-TAGTC--ATTTT-TGAATGCAATATTAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCTCATAC-T-AATAA---TTTCCTTAAAAAGA---TTTAAAACGT-AA--ATGAATA-CTAACCTCCATTATTACAACCTCCATAACAAA---TTCGAAAAAC--A-TTCCCAAAACAAAAGGTCTGGGTGAAATTTCAT------TGGCGAAAATCAGT-AT--------ATATGTGAGGTActttt
gi|10 : tACAA--T-----TA-GCCTG-T-GT-ACC-C-T-------G-TCGC---AGTAAAGCTTGC---G-T-------TGTAGAAAGGAAAAG--TAGCC---T-TGA--AAATGAA---GTTTG-GTA-C-GTTT--AGT-AT---T-AT--TTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTTA--A-TT-TTTCAT----T-AA---ATGCCATTCA---TGAG-AAA--GA--------AA-CG--TTT--T------A-------G----AAATA-C---G--AT-ATA---GTCA--A-ATT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-------AA--T-----CTG-ATGTC-GCAACACAGAA----------------AC-------------A-----------AATGTTTCCT-----TT----T--T-----TT------C--AAGC-AT---------TTTCAGAAAGC-ATATAGTT-A--ATA---------GTATGTGCCG-TT---ACGA--AGA-GTA-GA--GCT---------T-TAC--TAC--A--AGGAAA--GCC---AGTACCAT---TGGGAC--TCGATCATTATTGACATA-T-----TTTTCACTCTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCAACCATG-TATA--T---------T---------TCA-AATCC---------CG--TA--CAGTA--CAT-GA-------TCTT-CAATTTAGGTAAA-T-GTA--GGTATG--AAGAA-TATG--A--AG-TTTCTGC------ATAT---------ATC-------AATA---CGT-GAA-TAGTTC---TTTTAGAGCTC--AAT--ATT-TC-AATATATC
gi|16 : gtcattctaaaaatctcaAA--T-----TACACCTG-C-GT-A-C-TAT-------G-TCGC--AAGTATATCTTGCGTGA-T-------TGTAG-AAAGAAAAG--TATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGTG-C-GTTTT------TAAGT-ATTAATT---AAT--CGC-T--A-TTGTG-TTT---A-TT-TTCCAT----TGAA---AGA-CATTCA---TGAT-AAG--AG--------AACC---TTT--T------A-------A----AAGCC-C---A--AT---A---ACCG--A-TTT--T-TTGTTTTG-GG-GC----CC-----CAAACCC----ACAG-A---------------A----------------AA-------------A-----------AAAG-----T-----TC----C--C-----TCGT-GTAA--AAGCAAG-----------TTAGAAGAC-ATA-A-AC-ATCATATACCA--------GTGTTT-CT---G-AA--AAA-GTATGATTGCT---------TCCAGA-TACCAA--AGGGGAATAAT---AGTACAAT-----GGAC-TTTGAtt
gi|3 : TGGCACG-T-ATTTCAAGTTACATGTTATTATTTTATAAA--TGGTTGAATTTGTTGTTTTTTA-TC-TTTTATCATATGAAGGTATG-CATTCACGTTGAA-ATG--GA--------AA-C---TTT--T------GGTTTTGGA----TAGTAGT---G--AT-G-GATGGTCACCA-ACTAGTATTG--AAA-AATGT----CG-----GAAA--TTATTATCGGATGTCAGT--C-----A----------------ACCAGGTTGAATATCA-----------A--------T-----CTGCGGT--C-----CTGCTGTTAGCAAGC-AT---------GTTTGGAAGAT-AGACA-TT-A------ATTAT--TGTGTGTGATTATG---G-AA--AGATGGATTA-TATTGTTTATTGCTTTACAGTAC--AGGAGGGAA--ACCATTTATGCCAT---TGGGATGTTTTTTC--TAT----ATTTTTTGGGTTTTTA--CTCTACGGCTGGTTTGCATGTT-TGTTG--CAAGTTATATTG---------CTTTAATCT-GTAGG---C---------ATTTTT--TAGTGGTCATCTATTTTTGTTC-T-GCGTT--GAT-AA-T-GTAGCGGCATGAAAAGAA-TATG-AGGTAGTT---TGT------ACATGTTAAGTCTATCGGCGTAAAATAC--CGT-TAA-T--TTTTCGTT---AAGATCTAAAT--ATTGTC--A-ATTTCG-GGGAAAGTGGAGTGT-----CGAGAGGTGCAC-----AA--AAACATGCC--TGGCATAACGTTTGAGAAAAACT-AAAAAATTATCGCATATAAGGA---AAC------TAACCTACATAACTCGT-TTTTGGTGT-G-ATGGTGATGGGTTCTCCACGTGTG-AAC---TATATATATATTGGATTTTCGTTGATAGATTAGTCTTATCTTGTTGATGCT----CAAATATTGGCTAAATTAATCCCTTTGTACAAGAATCCCATACATAAATTATCTTTTCCTTGAAAAGAT--TTTAAAAGATCAAGTATGAATT-CTAACCTCCATTA-TACTACCTCCAT-----ACGT--------------TCCCCG-AACAAAATAGCT-GGTTGAATTTCA
gi|6 : TTGTGATTT---A-TT-TTTCAT----CGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AA--------AA-C---TTT--T------T-------A----AA-TA-T---G--AT-A-A---GCCA--A-ATT--T-TTT--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C-----A----------------ACGCAAAAACA----A-----------A--------T-----GT----T--TCCGTATTT--GCCA--AAGC-AG---------TTTTAGAAGAC-ATAT-----------T-TTATCATATATGTGTTT-TA---A-AA--AGA-ATTTGA-TGCA---------TCTACA-CAC--A--AGGGAA--AAC---AGTAACAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAGAAATATTC----TTTTTA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATATAG---------C---------GTA-A---CCTCCGTTACAGTTTTTTTAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AA-T---TGT------ATAT--------CATCTG----AAATA---CGT-TAA-T--TGC---TT---AAAATC--AGT--ATT-TC-AA-ATATCG-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AC-----AA--AAAAATG-C--TGCCATAAAAGTT--GAAAAATT-GAA----TGTCACATATAAGAAAC----------TAACCTACAGAACGCA---TTT--TGT--CGTGATG-TAG---CCTGGACCTGTAAAC---GATATG-ATA-TTGATTTCAT--GATGGA-TAGTC--ATTTT-GGGGTGC-----CAAATA------A-------T-------------ATCCCATGC-T-AATCA---TTTTCTC--------------------------TGAATT-CTAACCTCCGTTATTACAACCTCAATAACAAA--TTT--AAAAAA--CGTCCCAG-AACAAAATGTCTAGGTACAATTTCAC------AGATGGATATCAAT-AA--------ATATGTGAGGCAGAC---GCTCTCTCGTCAAAATGCAATatc
gi|14 : C----CC-----AAAA--T----GCCG-ATGTC-GC--C-----AGCACAGAGAGAAATGTAT-------------C-----------A--------T-----TT----T--C-----TT----TCA--AG-C-GG---------TTTCAGAAGAC-ATA---------ATATATAATCATATATGTGATT-TT---G-AATTGAA-AT-TGA-TGCA---------TCTACA-GAC--A--AGGGAA--AAC---AGCAGCATAATTGGAAC-TTTAATAG-TATAAGAATATT-----TG--CA--CTCT--------TTTGCA-G-C-TGTCG--TCATTTACA--G---------CAATGTCTCCGTA-A---C---------AGTTTT--TAGTC--AATCCA-------TC-T-CAATT--AAT-AA-T-GCA--GGTAGGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---CGC------ATAT--------CATAGG----AAATA---TGTACAG-T--TTC---TT---AAAAgccaatgcatgtttaaaactgttgttactaaca
gi|33 : ttaaactA--AAGC-AG---------TTTTAGAAGAC-ATATA-TT-----------ACCACATGTGTGCTT-TT---T-AA--AAA-GTTCGG-TGCA---------TCTATA-TAC--A--AGGGAA--AAC---agatttaacatgttagttaattattaactccgttacaacaaccccataacaaataaaacgtatatgtataaaacatataa
gi|12 : ccTTTCA--CTCTCT------TTTGCA-G-T-TGTCAACCATGT-ATA--T---------T---------TCA-AATCC---------CGTAC----AGTA--CATG-A-------TC-TTCAATTTAGGT-AAAT-GTA--GGTATG--AAGAA-TATG--A--AG-TTTCTGC------ATAT---------ATC-------AATA---CGT-GAA-TAGTTC---TTTTAGAGCTC--AAT--ATT-TC-AATATATCag
gi|11 : TTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCA--CCAGTTATA--G---------CTTCATCTCCGTA-A---C---------AGT---------A--CATGTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGttcaattatatgtttctatgatgcagtgggattgcatggagagagaaagatgtgaaagtgtattgccaaaaaaaaattcccacaatgtttgtatttattttcttgattattcatgatattgtatggtggggaaaaatataaattaatgtatttcaaattcgggtaaatcaagtaactacaaaaaaaatgctgccataaagtttgaaaaatcaaatgtcgcatataagaacctaacctacgtaacgcgttttctcgtgatgcagctttttatgtgaactatataagattagtttcatgatagtcaattatggatgccaaataaccttagcaaa
gi|27 : A-G-TATGTTG--CAATATATA--G---------C---------GTA-A---CCTCCTAAC-ATTTTTCTTAGTG--CATCTA-------TT-A-C-ATT--GAT-AA-TGGTA--GGTATGAAAAGAA-TATGAAA--AG-T---T-T------ATATA-------AATTGG----AAATA---TGT-GAA-T--T--------------TC--AAT--ATT-TCAAA-ATA-CGCGGAAAA------TGT-----T---Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttattttctttgattattcatgtattgtaatgagtggggaaaaatataaatacatgtatttcaaatatcgggtaaatatcaagtaaccacaaaaaaaaatgctgccataaagtttgaaaaatcaaatgtcgcatataagaacctaacctacataacgcgttttctcgtgatgcagcttttatgtgaactatataagattagtttcatgatagtcaattatggatgccaaataaccctttagcaaa
gi|9 : T--GAT-AA-T-GTA--GGTATG--AAGAATTATG-AA--AG-T---TGTACTTGCATAT--------CATCGG----AATTAAACCAT-TAATT--TTC---TT---TAGATC---AT--ATT-TC-AA-ATAT
gi|29 : cagtcatttctcagaaaatcggcacaaatttagccggatgtactctgtcgccgaataatagcttgcgttgtagaaagaaaacgttatctttgaataatgaagttggcgttacgattttaagctattatttaaatgtatttgtgatttattttttcattaaaatgcattcattgaacaaggtaaaacgttttttgaaaatacggtataagcaaacttttgaaaagcgccaatactgatgtgccaaccacagaaaacaaatgtttccttttttgtcaaagcattttcagaagacaatatattgatcatattattgtgcctttagagaaagagtatgatggctctacatacaaggggaagccgtatctagccgtgtggctcgctatctatactttggaatctgtagttcttgtcttctttatcttctctattgcagtgttacccatatctttcaggcccggtcttagggtctaacccaccgtctttccggctccagaccagtacagtgtcatccttcaaatgtccA-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---TGT-----------------------TC--A------T-T--------TCG-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AG-----AAGAAAAAATG-C--TGTCATCAAGTTT--G-AAAATTCAAA----TGTTGCATATAAGAAGC----------TGACCTACATAACGCGTTTTGT--CGT-
gi|12 : AAATT--AATGTATT-TC-AA-AT-TCG-GGTAAA------T-------C---AAGTA-ACTACA-AA--AAAAATG-C--TGCCATAAAGTTT--GAAAAATC-AAA----TGTCGCATATAAGAACC----------TAACCTACGTAACGCGTTTTCT-------CGTGATG-CAG---CTTTTTATGTG-AAC---TATATA-AGA-TTAGTTTC-----AT-GA-TAGTC--AATTA-TGGATGC-----CAAATA------A-------CC--TTA-GCAAAg
gi|11 : tttcactctcttttgcagttgtcaaccatgtatatttcaaatcccgtacagtacatgatcttcaatttaggtaaatgtaggtatgaagaatatgaagtttctgcatatatcaatacgtgaatagttcttttagagctcaatatttcaatatatcttcaattatatgtttctatgatgcagtgggattgcatggagagagaaagatgtgaaagtgtattgccaaaaaaaaattcccacaatgtttgtatttattttcttgattattcatgatattgtatggtggggaaaaatatT--ATT-TC-AA-ATATCG-GGTAAA------TAT-----C---AAGTA-ACCACAAAA--AAAAATG-C--TGCCATAAAGTTT--GAAAAATC-AAA----TGTCGCATATAAGAACC----------TAACCTACATAACGCGTTTTCT-------CGTGATG-CAG---CTTTTATGTG--AAC---TATATA-AGA-TTAGTTTC-----AT-GA-TAGTC--AATTA-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTA-GCAAA
gi|2 : ttcactcttttgcagttgtcaccagttatagcttcatctccgtaacagtacatgtatctcaattgataatgtaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttattttctttgattattcatgtattgtaatgagtggggaaaaatataaatacatgTA-AC-----AA--AAAAATG-C--TGCCATAAAAGTT--GAAAAATT-GAA----TGTCACATATAAGAAACTAA----------CCTACAGAACGCAT---TT--TGT--CGTGATG-TAG---CCTGGACCTGTAAAC---GATATG-ATA-TTGATTTCAT--GATGGA-TAGTC--ATTTT-GGGGTGC-----CAAATA------A-------T-------------ATCCCATGC-T-AATCA---TTTTCTC--------------------------TGAATT-CTAACCTCCGTTATTACAACCTCAATAACAAA---TTTAAAAAAC---GTCCCAGAA-CAAAATGTCTAGGTACAATTTCAC------AGATGGATATCAAT-AA--------ATATGTGAGGCAGAC---GCTCTCTCGTCAAAATGCAAT
gi|1 : g-AC-----AA--AAACATG-C--TGTCATAAAGTTT------------GA----T--CACATATAAGAACCTAA----------CCTACATAACGCGTTTTCT--CGTGATGTACCGGTAT---CCTCCTTGTG--AAC---TATATA-ATA-TTGATTTCA-----T-GC-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTA-ACAAAA-TCCCATGC-T-AATTA---TTTTCTTGAAAAGACATTTT---ACGT-AA--ATCAATT-CTAACCTTCATTATTACAACCTCCATAGCGAA--TTATAAAAAAAAGAGTTCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGATGGAAATCAGTAAT--------ATATGTGAAGCACAC---GCTCTTTCATCAAATTGGAgccaatgcatgtttaaaactgttgttactaacaacaatgttactgtttcattacattctacatttattgattttttaggtatttcatctgggtttttttttaaccatgacttacttcgcctgttgttattacggtgtagtatgaattttctgccggttaaacatattggcacacctcttacgtaggtgataataaaagcgacatgttattatagacccccaaattacatactttccaatttttacattcaatatcctactcttgtttgatcactactaaactattgtatacgtattgcagaagatatccgttacggaggttacaatcatgacacattttaaataccatatgtaccaaatctacatctccattttgtatgaagaaaacaacagtatgacattcaaatgatccatttaatcttattacacttctggtcttttgtcttaaggtgaatagtatttatgttttatttccaatatctattataacctccgtaacacatggaaatgcatgcctctacttccatttggataaattgtttgaataataagtattttaaaacaagaacaatggcatgtatttcaaaatcttaatacagaaaaatggctttataacc
gi|38 : tA----TGTCGCATATAAGAAAC----------TAACCTACATAATGCGggatcaatgtttaacactaacatcttaaccttcggtatatgtacatgtatattttatatcatgtaaagttacttaacttcacaatgtcaatttcattatatactacatttattaattgtattgatgtatttcatctgttttttactatgacttacttcgtctgttattattacggtgtagtatgaatttcctgtattcatattggcacatctgttacgtaggcgagaatacaagtgggatgttgatatagccccaaaaatatatatacattccactttctacattcaacattatctattttgatcactaataccttgatccctttttatttataccttactaaactattgtatacgtattagagaagatacccgttacggagattacaatcatgacacatttatactatgcgtattttgtatgagcaaggtaacagtttgacataaatggatttgatacatttaattttatggcacttctggtcttttgtcttaagaagaatagcatttatgttttatttctaatatgaaaatctattatcacctccgtaacaagtagaaatacctccagtctaattggataaattgtttgaacaataagtattgcaagacatgattgatgacatgattttcaaaaaatggctatataacccattgtaacgattttttagaacttaattaaaatgttacagaggttactcatatttaatataagttaatataatttgattttttatcagaatttgaaaataactgtacaatcatcaaaagaaccaatagaccaaagaaacgcactgtaaactaatggtggtatcattattcaacctccgtaacaaaatagcatattttttgttcagttggaataaaaatctgatatcactgaaacttattgacacat
gi|35 : GA-TAGTC--AAATTATGGATGC-----C-AAT-------A-------CCTTTTA-GCAAatatgtcgt
gi|14 : agctttttattgtgacacatctatatatcgcgattagtttcatTTTCTTAAAAAGA---TTTAACATGT-TA--GTTAATTATTAA-CTCCGTTACAACAACC-CCATAACAAA
gi|22 : ttaaactcccaaaatgccgatgtcgccagcacagagagaaatgtatcattttctttcaagcggtttcagaagacataatatataatcatatatgtgattttgaattgaaattgatgcatctacagacaagggaaaacagcagcataattggaactttaatagtataagaatatttgcactcttttgcagctgtcgtcatttacagcaatgtctccgtaacagtttttagtcaatccatctcaattaataatgcaggtaggaaaagaatatgaaagtcgcatatcataggaaatatgtacagAAAAAAA--CGTTCTCGAAACAATATGCATGGGTGCAATTCCATAGTTTCCAACATATATGTAT-ATGTACCTGTATATGTGAAGCAGAC---GCTCCTTCATCAAAACGGAAtaaaacgtatatgtataaaacatataa
gi|8 : ctgT-AT--------ATATGTGAGGCA-ACTGTGTCTTTTCATCAAATTGGAATaatcaatgtgtaacaactgtctttactaacatcttaatctcaggtatgaatgaatatgatattccatataaagttagttaattttataacgccattgtttaattgcatgccgcattt
13 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): CTGTCGGTTAAACATATTGACATACGTGTTACGTAGGTGCGAAGAAAAATTACTTGTTAATACAACCCCCAAACTTATATACTTTCTAGTTTTTACAATCAATGAATACTATTATGTGATCACTAATACCTTGATCTTTTCTTTATTTATACCTCACTGAACTATTGCATTGGAAAAGAAATTCATTACGGAGGTTGCAATCATGACACATTCATATACCATATGTGCTAAATCTCCATCTGTGCATATTTTGTAAGAACAAAACAACATTGTGACAATCAAGTGACACATTTAATTTCATTACTCTTCTGGTATTTGCCCAAAGTTGATTAGTATTTATGTTTTATTTTTAAAATATATTACAACCTCCGTAACATGTGTAAATATATCTTCTTCCAATTGGATAAATTGTTTAAATAACAAGTATTATAAAACAAGATCGATGCCATGAATTTCGAAATCTCAGTACGGAATATGGCTTTATGACCCATTGTATTGATTTTTATTAACTTAATCAAAATGCTATAGTTGTTAATCATATTTATTAGCAATGTAAATTTTCAGATGCCTATCAATATAAATTAGTTAACATACTTTTATCTGTTTATCAGAAGTTGTAAATACAATCCTAAAAATAAACAATAAATCAATAGATCAATGAAACTTACTGTAACCTGATGATAGTATAATTATTCAACCTTCGTAACAAAATAGCACCTTTTTTGTACAGCTGGATTAAAAATCTG
Unaligned ( gi|13 ): CCATATGTGCTAAATCTCCATCTCTGTGTGGGTTTTTTTTAACAAACAACAGTATAACATTCAAGTGATCCATTTAATTTTATTACACTTCTTGTCTTTTGTTCTAAGGTGAATAGTGTTAATGTTTTATTTCCAATATGTATTACAACCTCCGTAACACATAGCAATACCTCTATTTCCAATTGGATAACTTCTTTGAATAATAAGTAATGTAAGACAAGATCGATGGCATGGATTTCAAAATCTCAATACAGAAAAATGGCTTTACAACCCATTATAGTATTTTTTTAGAATTTAATCAAAATGTTACGGAGGTTACTCATATTTAATAGCTAAGTAATTTTTCAGACGTCTAGCAATTACATAAGTTAACATACTTTGATCTTTTCATAAAAATTTGAAAATACAATTCTAAAAAGAACCAATAGATCGATGAAACGTA
Unaligned ( gi|17 ): TAAGGCCTGTGGGCCTCTTGTTTAAAGAACTTAATCAAAATGTTACTGAGGTTACTCATATTCAATAGCCAAGTGAATTTTCAAAAATCTAGCAATTAAAATAAGTACATGTATTATACTTTGATCTTTTTTATCAAAATGTGAAAATACAATCCTAAAAAAGAACCAATAGATCGATGAAACGTACTGTAAACTGATGGTGGAATCATCATTCAACCTCCGTTACAAAATAGCACCTTTTTTGTTCAACTGGAATAAAAATCTTATATCACTGAAACTAATTGGAATATGTT
Unaligned ( gi|19 ): TTTATTTCCAAAATCTATTATAACTTCTGTAACACATTGAAACATCTGTAAATTGTTTGAACAATAAGTATTGTAAGACAAGATCAATGACATGAATTTCGAAATCTCAATTCGGAAAAATGGTCTTATAACCCATTGTAGTATTTTTTTAAAGAACTTAATTAAAATGACTGGGTGGTTACTTATATTTACTAGCAATGTAAATTCTCAGATGTCTAGCAATTTTAGTAAGGTTTTTTTATCAGAATTTGAAAATACGACCCTAAAAAG
Unaligned ( gi|20 ): TCATATTTAATGACCATGTAAATTTTCAGATGTCTAACAAATGAAATAAGTTAACATACTTTGATCTTTTTATCAAAATTTGAAAATACAATCCTAAAAAGAACTAATTGATCAATGAAATGTACTGTAAACTGATGGTGGAATCATTATTCAACCTCCGTAATAAAATAGCACATTATTTGTTGAGCTGGAATAAAAATCTGATGTCACTGAAACTTATTGGAATGTGTT
Unaligned ( gi|21 ): TTTTCAGATGTCTATTGATTGATACAAGTTAAAATAATTTGATTTTTTACCTGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATGGAAAATCAATCCAAAAAGAACAATAGACCAAATAAAGTTTTTACCGGGAGTTGTAACTGATGCATGTCCATTATTCAAACCTCCGTAATAAATAGCCTTTTTGTCTCATGGAATAAAAATCTGATATACTGAAACTTATTGGAA
Unaligned ( gi|24 ): GAATATCTATCATAATCTCCGTAACACGTAGAAATGTCTTTAGTTCCAATTGTTTGAACAATCATTATTATTGTAAGACTTGATTTCAAAATCTCAATGCGGAAAAATGGCTTTATAATCCATTGTAATGATTTTTTCATGGTTTTTTAAAGAACTTAATTCAAATGTTACGGAGGTTACTCATATTTACTAGCA
Unaligned ( gi|25 ): CAACTGTTGTTACTAACATTTTAACCTCAGGTATACATGTATTTTTATATCATGTAAAGTTACTTAACTTCACAATGTCAGTTTCATTACATACTACATTTATTGATTTTATTGAGGTATTTCATCTGGGTTTTTTACTATGACTTACTTCGTCTTTTGTTACTAC
Unaligned ( gi|28 ): TATACTTTTTTTATCATGTAAAGTTACGTAACTTCACAATGTCAGTTTCATTACATATTACATTTATTGATTTTATTGCGGTATTTCATGGGTTTTTTTTTTTTACTATGACTTACTTTCGTCTGTTGTTATTATGATG
Unaligned ( gi|30 ): TGGCACATTTATACCATGTGTGCTAAATATTCATCTATGCGTATTTCGTGTGAACAAAACAACAGTACGACATTTAATCGATTCATTTAATTTCATTGCACTTTAGGTCTTTTGTTCGAAGGTGAAT
Unaligned ( gi|31 ): TCTTTTCATCAACTATCTATTATATGGAATACTGTAGGTCATGGTTTAACCAACTGTTATTACTAAACATTTTTAACCTGCAGTATACATGTAAATTTTTATATCAT
Unaligned ( gi|34 ): AAAAAAAAACCCCCACAATTTATGTATTTATTTTTCTTTGTTTATTCATGTATTGTAGTGAGTGGGAGAAAAAAAAAAAA
Unaligned ( gi|37 ): ACATGTTGATATCGTCTAAATTGTTTGAACAATAAGTATTGTAAGACNATACAATGTATGATGATTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111 1111111 44444444444 111 111 2222 1111111111111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111111 99999999999999999999999999999999999 11111111111 22222 22222222 11 999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111 11 111 111111 222222222 111 11 111111111 111111 111111111 22222 6666666666 222 1111 222222222222222222 1 11111 22222222222222 1111 4444444444444444444444444444 2222222 1111 2222222 22222222 111
lowQualScore : 5 55 99999 3 3 3 3 3 3 3 1111111 3 55 3 8888888 4 4 4 4 777 4 4 4 777 44 4 66666666666 4 777 55 99 55 000 3 3 7777 666 3 000 3 55 33 1111 5555555555555555 4 55 5555 777 55 55 4 55 8 3 55 8888 4 4 55 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 55 3 77777777777 3 00000000000000000000000000000000000 55 3 4 777 4 55 99999999999 3 4 1 4 55 55 55 777 888 5 55 88 33333 66 55555555 4 4 4 22 444444444444444444444444444444444444444444444444 66 11 4444444 4 4 11 4 4 4 55 7 4 44 55 4 444 111111 222222222 999999 111 55 4 11 666666666 0 55 55 3 7 3 5 444444 333333333 4 66666 66 4 66 3 8888 4 1 4444444444 999 66 0000 888 555555555555555555 777 4 9999 66 66 1 2 4 66 8 55555 33333333333333 44 55 1 6 4444 5555555555555555555555555555 0 2 7777777 4444 7 0 4 0000000 4 5 00000000 6 111 0 0
lowQualScore : . .. ..... . . . . . . . ....... . .. . ....... . . . . ... . . . ... .. . ........... . ... .. .. .. ... . . .... ... . ... . .. .. .... ................ . .. .... ... .. .. . .. . . .. .... . . .. ............................................................................. . .. . ........... . ................................... .. . . ... . .. ........... . . . . .. .. .. ... ... . .. .. ..... .. ........ . . . .. ................................................ .. .. ....... . . .. . . . .. . . .. .. . ... ...... ......... ...... ... .. . .. ......... . .. .. . . . . ...... ......... . ..... .. . .. . .... . . .......... ... .. .... ... .................. ... . .... .. .. . . . .. . ..... .............. .. .. . . .... ............................ . . ....... .... . . . ....... . . ........ . ... . .
lowQualScore : 0 00 11111 6 6 6 6 6 6 6 8888888 6 00 6 2222222 0 0 0 0 000 0 0 0 000 33 0 00000000000 0 000 55 55 55 000 6 6 7777 444 6 000 6 00 88 4444 6666666666666666 0 55 9999 000 55 55 0 55 0 4 55 5555 0 0 55 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 00 6 33333333333 6 99999999999999999999999999999999999 55 0 0 000 0 55 00000000000 7 0 0 0 55 55 55 000 888 0 99 22 33333 99 00000000 4 4 4 22 333333333333333333333333333333333333333333333333 11 99 4444444 4 4 00 0 0 0 55 3 0 88 55 0 000 555555 666666666 222222 000 00 0 00 555555555 4 55 00 6 3 6 0 444444 222222222 4 77777 11 4 11 4 5555 0 0 7777777777 666 55 6666 888 444444444444444444 888 4 4444 11 99 1 0 4 11 9 66666 77777777777777 00 88 8 7 2222 9999999999999999999999999999 1 3 7777777 7777 1 3 3 2222222 0 7 77777777 7 777 3 7
consensus : CTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTTAAGT---AT--GTATTA-TTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-TTTCAT----TGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AAAA-C----TTTTN-------AA--AA--TA-CG--AT--A-A---GCCA--AACT--T-TTG--AAAAA-GCCCAAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C----------AA--------C--------A-------------A--ATG-----TT---TCC----T----------TGTNA--AAGC-AGTTTT-----------AGAAGAC-ATATA-TT---------------A-CAT-ATATTATCATATAT--GTGTTT-TT---G-AA--AGA-----------GTATGA-TGCNTCTACA-TAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAAAAATATT-----TTTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--G---------C---------GTA-A---C---------AGTTTT--TAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---CGT-TAA-T--TTC---TT---AAGATC--AAT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AC-----AA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAANC----------TAACCTACATAACGCGTTTTCT-GT-CGTGATG----TA---G---C-CTCCA--CGTG--AAC---TATATA-AT----ATTGG--TTTCA-TGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTTGAAAAGA---TTT-AA-ACG--TAA--ATGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCCATAACGAA--TTTT-AAAAAA---NGTCCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGACGGANATCAAT-A--------TATATGTGAGGCAGAC---GCTCTTTCGTCAAAATGGAAT
Reference ( family-4814 ) : CTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTTAAGT---ATA-GTATTA-TTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-TTTCAT----TGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AAAA-C----TTTTN-------AA--AA--TA-CG--AT--A-A---GCCA--AACT--T-TTG--AAAAA-GCCCAAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C----------AA--------C--------A-------------A--AT------TT---TC-----T----------TGTNA--AAGC-AGTTTT-----------AGAAGAC-ATATA-TT---------------A-CAT-ATATTATCATATAT--GTGCTT-TT---G-AA--AGA-----------GTATGA-TGCNTCTACA-TAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAGAAATATT-----TTTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--G---------C---------GTA-A---C---------AGTTTT--TAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---CGT-NAA-T--TTC---TT---AAGATC--AAT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AC-----AA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCGAA----TGTCGCATATAA-GAANC-A-------ATAACCTACATAACGCGTTTTCTCGT-CGTGATG----TA---G---C-CTCNA--NNTG--AAC---TATATA-AT----ATTGA--TTTCG-TGATGGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTA-GCAAAAATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTCGAAAAGA---TTT-AA-ACG--TAA--ATGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCCATAACAAA--TTTT-AAAAAA---AGTCCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGACGGATATCAAT-A--------TATATGTGAGGCAGAC---GCTCTTTCGTCAAAATGGAAT
gi|1 : -AC-----AA--AAACATG-CTGTCATAAAGTTT--GA---------------TCACATATAA-GAACC----------TAACCTACATAACGCGTTTTCTCGT----GATG----TACCGGTATC-CTCCT--TGTG--AAC---TATATA-AT----ATTGA--TTTCA-TGCT-----AGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTA-AC-AAAATCCCATGC-TA----ATTATTTTCTTGAAAAGACATTTT----ACG--TAA--ATCAATTCTAACCTTCATTATTACAACCTCCATAGCGAA--TTAT-AAAAAAAAGAGTTCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGATGGAAATCAGTAA--------TATATGTGAAGCACAC---GCTCTTTCATCAAATTGGA
gi|10 : tACAA--T-----TA-GCCTG-T-GT-ACC-C-T-------G-TCGC---AGTAAAGCTTGC-GT-------TGTAGAAAGGAAAA-G-T-AGCC---T-TGA--AAATGAA---GTTTG-GT-ACG-TT----------TA-GTATTATTTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTTA--A-TT-TTTCAT----T-AA---ATGCCATTCA---TGAG-AAA--GAAA-CG---TTTTA-------GA--AA--TA-CG--AT--ATA---GTCA--AATT--T-TTG--AAAAA-GCCC--AA--T-----CTG-ATGTC-GCAACACAGA-----AA--------C--------A-------------A--ATG-----TT---TCCTT--T----------TTTTC--AAGC-ATTTTC-----------AGAAAGC-ATATAGTT---------------A--AT-A---------GTAT--GTGCCG-TT---ACGA--AGA-----------GTA-GA--GCTT-TAC--TAC--A--AGGAAA--GCCA---GTACCAT---TGGGAC--TCGATCATTATTGACATA-T-----TTTTCACTCTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCAACCATG-TATA--T---------T---------TCA-AATCC---------CG--TA--CAGTA--CAT-GA-------TCTT-CAATTTAGGTAAA-T-GTA--GGTATG--AAGAA-TATG--A--AG-TTTCTGC------ATAT---------ATC-------AATA---CGT-GAA-TAGTTC---TTTTAGAGCTC--AAT--ATT-TCAATATAT-Cggatcaatgtttaacactaacatcttaaccttcggtatatgtacatgtatattttatatcatgtaaagttacttaacttcacaatgtcaatttcattatatactacatttattaattgtattgatgtatttcatctgttttttactatgacttacttcgtctgttattattacggtgtagtatgaatttcctgtattcatattggcacatctgttacgtaggcgagaatacaagtgggatgttgatatagccccaaaaatatatatacattccactttctacattcaacattatctattttgatcactaataccttgatccctttttatttataccttactaaactattgtatacgtattagagaagatacccgttacggagattacaatcatgacacatttatactatgcgtattttgtatgagcaaggtaacagtttgacataaatggatttgatacatttaattttatggcacttctggtcttttgtcttaagaagaatagcatttatgttttatttctaatatgaaaatctattatcacctccgtaacaagtagaaatacctccagtctaattggataaattgtttgaacaataagtattgcaagacatgattgatgacatgattttcaaaaaatggctatataacccattgtaacgattttttagaacttaattaaaatgttacagaggttactcatatttaatataagttaatataatttgattttttatcagaatttgaaaataactgtacaatcatcaaaagaaccaatagaccaaagaaacgcactgtaaactaatggtggtatcattattcaacctccgtaacaaaatagcatattttttgttcagttggaataaaaatctgatatcactgaaacttattgacacat
gi|11 : gtcattctaaaaatctcaTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCA--CCAGTTATA--G---------CTTCATCTCCGTA-A---C---------AGT---------A--CATGTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGtt
gi|11 : T--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGTAAA------TAT-----C---AAGTA-ACCACAAAA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAACC----------TAACCTACATAACGCGTTTTC---T-CGTGATG----CA---G---C-TTTTA--TGTG--AAC---TATATA-AG----ATTAG--TTTCA-T----GA-TAGTC--AATTA-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTA-GCAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttattttctttgattattcatgtattgtaatgagtggggaaaaatataaatacatgtatttcaaatatcgggtaaatatcaagtaaccacaaaaaaaaatgctgccataaagtttgaaaaatcaaatgtcgcatataagaacctaacctacataacgcgttttctcgtgatgcagcttttatgtgaactatataagattagtttcatgatagtcaattatggatgccaaataaccctttagcaaa
gi|12 : ttcactcttttgcagttgtcaccagttatagcttcatctccgtaacagtacatgtatctcaattgataatgtaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttattttctttgattattcatgtattgtaatgagtggggaaaaatataaatacatgTTTCA--CTCTCT------TTTGCA-G-T-TGTCAACCATGT-ATA--T---------T---------TCA-AATCC---------CGTAC----AGTA--CATG-A-------TC-TTCAATTTAGGT-AAAT-GTA--GGTATG--AAGAA-TATG--A--AG-TTTCTGC------ATAT---------ATC-------AATA---CGT-GAA-TAGTTC---TTTTAGAGCTC--AAT--ATT-TCAATATAT-C
gi|12 : AAATT--AATGTATT-TCAA-AT-T-CG-GGTAAA------T-------C---AAGTA-ACTACA-AA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAACC----------TAACCTACGTAACGCGTTTTC---T-CGTGATG----CA---G---CTTTTTA--TGTG--AAC---TATATA-AG----ATTAG--TTTCA-T----GA-TAGTC--AATTA-TGGATGC-----CAAATA------A-------CC--TTA-GCAAAttcaattatatgtttctatgatgcagtgggattgcatggagagagaaagatgtgaaagtgtattgccaaaaaaaaattcccacaatgtttgtatttattttcttgattattcatgatattgtatggtggggaaaaatataaattaatgtatttcaaattcgggtaaatcaagtaactacaaaaaaaatgctgccataaagtttgaaaaatcaaatgtcgcatataagaacctaacctacgtaacgcgttttctcgtgatgcagctttttatgtgaactatataagattagtttcatgatagtcaattatggatgccaaataaccttagcaaa
gi|14 : tttcactctcttttgcagttgtcaaccatgtatatttcaaatcccgtacagtacatgatcttcaatttaggtaaatgtaggtatgaagaatatgaagtttctgcatatatcaatacgtgaatagttcttttagagctcaatatttcaatatatcttcaattatatgtttctatgatgcagtgggattgcatggagagagaaagatgtgaaagtgtattgccaaaaaaaaattcccacaatgtttgtatttattttcttgattattcatgatattgtatggtggggaaaaatatCCCAAAA--T----GCCG-ATGTC-GC--C----------AG--------C--------ACAGAGAGAAATGTATCAT------TT---TC-----T----------T-TCA--A-GC-GGTTTC-----------AGAAGAC-ATA-----------------------AT-ATATAATCATATAT--GTGATT-TT---G-AATTGAA-----------AT-TGA-TGCATCTACA-GAC--A--AGGGAA--AACA---GCAGCATAATTGGAAC-TTTAATAG-TATAAGAATATT-----TG--CA--CTCT--------TTTGCA-G-C-TGTCG--TCATTTACA--G---------CAATGTCTCCGTA-A---C---------AGTTTT--TAGTC--AATCCA-------TC-T-CAATT--AAT-AA-T-GCA--GGTAGGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---CGC------ATAT--------CATAGG----AAATA---TGTACAG-T--TTC---TT---AAAA
gi|14 : ttaaactCAGTTTCTTAAAAAGA---TTT-AACATG--TTA--GTTAATTATTAACTCCGTTACAACAACC-CCATAACAAA-----T-AAAAagatttaacatgttagttaattattaactccgttacaacaaccccataacaaataaaacgtatatgtataaaacatataa
gi|15 : ttaaactcccaaaatgccgatgtcgccagcacagagagaaatgtatcattttctttcaagcggtttcagaagacataatatataatcatatatgtgattttgaattgaaattgatgcatctacagacaagggaaaacagcagcataattggaactttaatagtataagaatatttgcactcttttgcagctgtcgtcatttacagcaatgtctccgtaacagtttttagtcaatccatctcaattaataatgcaggtaggaaaagaatatgaaagtcgcatatcataggaaatatgtaCTCAGATAA-TAGGCACAA--TATAATTA-ATCTG-C-GT-A-C-A-T-------G-TCGT--AAGTATA----GC-GT-------TATAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-AGA-TAAAT-AG---GTTGACTT-GCG-TTTTAAGC---AT------------------------T--ATT-GTGATTT---A-TT-TTTCAT----TGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AAAT-C----TTTTT-------AA--A---TA-TG--AC--A-A---GCCA--AACG--T-TTG--AAAAA-GCCCAAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C----------AACACAGAAGC--------A-------------A--ATG-----TT---TCCTTTGT----------TGTAA--AAGC-AGTTTT-----------AGAAGAC------------------------------------------AT--GTGTTT-CT---G-AA--AGA-----------ATATGG-TGCCTCTACA-AAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATcgtatatgtataaaacatataa
gi|16 : cattAA--T-----TACACCTG-C-GT-A-C-TAT-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GTGAT----TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTT---T---A-A-GTATTA-ATT---AAT--CGC-T--A-TTGTG-TTT---A-TT-TTCCAT----TGAA---AGA-CATTCA---TGAT-AAG--AGAACC----TTTTA-------AA--AG--CC-CA--AT--A-A----CCG--ATTT--T-TTGTTTTGGG-GCCCCAAACCC----ACAG-AAA------------------AA--------A--------A-------------A--GT------TC---CC-----TCG--------TGTAA--AAGCAAG--TT-----------AGAAGAC-ATA-A------------------A-C--------ATCATATACCAGTGTTT-CT---G-AA--AAA-----------GTATGATTGCTTCCAGA-TACCAA--AGGGGAATAATA---GTACAAT-----GGAC-TTTGAg
gi|18 : TCAGAAAA-TAGACACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TAA-TAAAT-GG---GTTGGCGT-GCG-TTTTA--T----T---TATTA-TCT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-TTTTAT----TTGA---ATG-CATTCA---TGAA-AAC--AAAT-CA---TTTTC-----------AA--TA-CG--AT--A-A---GCTA--AACT--T-TTG--AAAAA-GCCCAAAA--T----ACTG-ATGTC-GC--CAACACAGA--AA--------C--------A-------------A--ATA-----TT---TCCTCT-T----------TGTGG--AAGC-AGTTTC-----------AGAAGAC-ATAT
gi|2 : agtcatttGTA-AC-----AA--AAAAATG-CTGCCATAAAAGTT--GAAAAATTGAA----TGTCACATATAA-GAAAC----------TAACCTACAGAACGCATTTT---GT-CGTGATG----TA---G---C-CTGGA--CCTGTAAAC---GATATG-AT----ATTGA--TTTCA-TGATGGA-TAGTC--ATTTT-GGGGTGC-----CAAATA------A-------T-------------ATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTC----------------------------TGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCAATAACAAA---TTT-AAAAAA---CGTCCCAG-AACAAAATGTCTAGGTACAATTTCAC------AGATGGATATCAAT-A--------AATATGTGAGGCAGAC---GCTCTCTCGTCAAAATGCAATtatc
gi|22 : -AAAAAA---CGTTCTCGAAACAATATGCATGGGTGCAATTCCATAGTTTCCAACATATATGTAT-ATGTACCTGTATATGTGAAGCAGAC---GCTCCTTCATCAAAACGGAAgccaatgcatgtttaaaactgttgttactaacaacaatgttactgtttcattacattctacatttattgattttttaggtatttcatctgggtttttttttaaccatgacttacttcgcctgttgttattacggtgtagtatgaattttctgccggttaaacatattggcacacctcttacgtaggtgataataaaagcgacatgttattatagacccccaaattacatactttccaatttttacattcaatatcctactcttgtttgatcactactaaactattgtatacgtattgcagaagatatccgttacggaggttacaatcatgacacattttaaataccatatgtaccaaatctacatctccattttgtatgaagaaaacaacagtatgacattcaaatgatccatttaatcttattacacttctggtcttttgtcttaaggtgaatagtatttatgttttatttccaatatctattataacctccgtaacacatggaaatgcatgcctctacttccatttggataaattgtttgaataataagtattttaaaacaagaacaatggcatgtatttcaaaatcttaatacagaaaaatggctttataacc
gi|23 : ctgaCTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGAATTTCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTTA--------C-GTATTA-TTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-CTTCAT----TGAA---AAG-CATTCA---TGAA-AAG--AAAA-CCTTTTTTTC-------CAGGAATTTC-CA--GTTCC-A---ATTA--AACG--T-TTG--AAAAA-GCCCAAAaatcaatgtgtaacaactgtctttactaacatcttaatctcaggtatgaatgaatatgatattccatataaagttagttaattttataacgccattgtttaattgcatgccgcattt
gi|26 : gtcattAAA-TAG-CACAA--T-----TA-GCCTG-CCGTTA-C-C-T-------GATCGG--AATT---TCTTGCAGT-------TGTAGAAA-----A-G-T-ATGA---T--GA-TAAAT-AGTGGGTTGGCGT------TTTACGT---AT------TA-TTT---AAAATCG--T--ATTTGTGATTT---A-TTACTTCAT----TGAA-----G-C-TTCA---TGAA-AAG---AAA-C----TTTT
gi|27 : tttcA-G-TATGTTG--CAATATATA--G---------C---------GTA-A---CCTCCTAAC-ATTTTTCTTAGTG--CATCTA-------TT-A-C-ATT--GAT-AA-TGGTA--GGTATGAAAAGAA-TATGAAA--AG-T---T-T------ATATA-------AATTGG----AAATA---TGT-GAA-T--T--------------TC--AAT--ATT-TCAA-A-ATACGCGGAAAA------TGT-----T---A
gi|29 : A-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---TGT-TCA-T--TTC------------------------------------G-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AG-----AAGAAAAAATG-CTGTCATCAAGTTT--GAAAATTCAAA----TGTTGCATATAA-GAAGC----------TGACCTACATAACGCGTTTTGTCGT-
gi|3 : TGGCAC-GTA-TTTCAAGTTACATG-TTATTA-TTTTATAAA--TGGTTGAATTTGTTGTTTTTTA-TC-TTTTATCATATGAAGGTATG-CATTCACGTTGAA-ATG--GAAA-C----TTTTGGTTTTGGAT--AG--TAGTG--AT--G-GATGGTCACCAACTAGTATTG--AAAAATGTCGGAAA--TTATTATCGGATGTCAGT--C----------AA--------CCAGGTT--G-------------A--AT------ATCAATC-----TGCGGTCCTGCTGTTAGCAAGC-ATGTTT-----------GGAAGAT-AGACA-TT---------------A-------ATTAT--TGTGT--GTGATTATG---G-AA--AGATGGATTATATTGTTTAT-TGCTT-TACAGTAC--AGGAGGGAA--ACCATTTATGCCAT---TGGGATGTTTTTTC--TAT----ATTTTTTGGGTTTTTA--CTCTACGGCTGGTTTGCATGTT-TGTTG--CAAGTTATATTG---------CTTTAATCT-GTAGG---C---------ATTTTT--TAGTGGTCATCTATTTTTGTTC-T-GCGTT--GAT-AA-T-GTAGCGGCATGAAAAGAA-TATG-AGGTAGTT---TGT------ACATGTTAAGTCTATCGGCGTAAAATAC--CGT-TAA-T--TTTTCGTT---AAGATCTAAAT--ATTGTC-A-ATTT-CG-GGGAAAGTGGAGTGT-----CGAGAGGTGCAC-----AA--AAACATGCCTGGCATAACGTTTGAGAAAAACTAAAAAATTATCGCATATAAGGAAAC----------TAACCTACATAACTCGTTTT-TGGT--GTGATGGTGATG---GGT-T-CTCCACGTGTG--AAC---TATATATAT----ATTGGATTTTCGTTGATAGATTAGTCTTATCTTGTTGATGCT----CAAATATTGGCTAAATTAATCCCTTTGTACAAGAATCCCATACATAAATTATCTTTTCCTTGAAAAGAT--TTT-AA-AAGATCAAGTATGAATTCTAACCTCCATTA-TACTACCTCCAT-AC--------------------GTTCCCCGAACAAAATAGCTGGTTG-AATTTCAg
gi|32 : CTCAGAAA--TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TTGC--AAGTATATCTTGC-GTTATGCAGTGTAGAAA-AAAAA-GTT-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-atc
gi|33 : ttA--AAGC-AGTTTT-----------AGAAGAC-ATATA-TT---------------A-C----------CACATGT--GTGCTT-TT---T-AA--AAA-----------GTTCGG-TGCATCTATA-TAC--A--AGGGAA--AACA---G
gi|35 : ccC---TATATA--TCGCGATTAG--TTTCA-TGAT-----AGTC--AAATTATGGATGC-----CAA-TA--------------CCTTTTA-GCAA
gi|36 : agctttttattgtgacacatTCAGAAAA-TTAGCACAA--T-----TA-AACTG-T-GT-A-A-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCAACC-GT-------CGTAGA
gi|38 : cagccgttgcgcaaA----TGTCGCATATAA-GAAAC----------TAACCTACATAATGCGATATGTCGT-
gi|4 : CTCAGAAAAATAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-AT-------TGTAGAAT-GAAAA-A-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-TCA-TTTTAAGT---ATATGTATTA-TTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-TTCCAT----TGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AAAA-C----TATTA-------AA--AA--TA-TG--AT--G-A---GCCA--AACT--T-TTG--AAAAA-GCCCAAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C----------AA--------T--------A-------------A--TT------TT---TT-----T----------GGTAA--AAAC-AGTTTT-----------AGAAGAC-ATATA-TT---------------ATCAT-ATATTATCATATAT--GTGTTT-TT---G-AA--AGA-----------GTATGA-TACTTCTACA-TAC--A--AGGGAA--AACT---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAAAAATATT-----TTTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--G---------C---------GTA-A---C---------AGTTTT--TAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---CGT-TAA-T--TTC---TT---AAGATC--AAT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----C---AAATA-AC-----AA--AAAAATA-TTGCCATAAAGTTT--TTAAAATTAAA----TGTCGCATATAA-GAACCTAATAGGTTATAACCTACATAACACGTGTTCTTGTACATAATG----TA---G---C--------------AAT---TATATA-AT----ATGGA--TTTCA-AGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCCCATGC-TA----ATTATTTTCTTGAACAGA---TTTAAA-ACG--TAA--ATGAATTCTAATCTCCGTTATTACAACCTCCATAATGAACGTTTTAAAAAAA---AGTCCCCGAAACAAAATGACTGGGTGGAATTACAT------CGGCGGAAATCAAT-A--------TATATGTGAGGCACAC---GCTCTATCATCAAAATGGAAT
gi|5 : CACAA--T-----TA-GCCTA-C-AT-A-C-C-TCTGTCCTG-TCGC--AGGCATATCATGA-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGCACATGCGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTTAAGT---AT------TA-TTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-TTTCAT----TGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AAT--T----TTTTA-------AA--AA--TA-TG--AT--A-A---GCCA--AA------------------------A--T----ACCG-ATGTC-GC--C----------AACACCGAAAC--------A-------------A--ATGT----TT---CC-----T----------TTTTA--GNNN-NNNNNNNTCGCCAACACAGAA-AC-AAATG-TTTCCTTTTTAAAAGAGA-CAT-GTATTATCATATAT--GTGTTT-CT---G-GA--AGA-----------GTATGA-TGCTTCAACA-TAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATGAAATTATT-----TTTTCA--CTCT--------TT-GTA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--GGATAACCTCC---------ATA-A---C---------AGTTTTT-TAGTG--CATCTA-------TC-T-TAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGA------ATAT--------CATCAA----AAATT---CGT-TGA-T--TTC---TT---AAAATC--AAT--ATT-TTAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGTCATTAC---AAGTA-ACAA---AA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAAAC----------TAAACTACATAACGCGTTTT---GT-CGTGATG----TA---G---C-CCCCA--TGTG--AACTAATATGTA-AT----ATTGA--TCTCG-TGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGAATGCAATATTAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCTCATAC-TA----ATAATTTCCTTAAAAAGA---TTTAAA-ACG--TAA--ATGAATACTAACCTCCATTATTACAACCTCCATAACAAA--TTCG-AAAAAC---A-TTCCCAAAACAAAAGGTCTGGGTGAAATTTCAT------TGGCGAAAATCAGT-A--------TATATGTGAGGTA
gi|6 : tTTGTGATTT---A-TT-TTTCAT----CGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AAAA-C----TTTTT-------AA--A---TA-TG--AT--A-A---GCCA--AATT--T-TTT--AAAAA-GCCCAAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C----------AA--------CGCAAAAACA-------------A--ATG-----TT---TCCGTATT----------TGCCA--AAGC-AGTTTT-----------AGAAGAC-ATAT--------------------------T-TTATCATATAT--GTGTTT-TA---A-AA--AGA-----------ATTTGA-TGCATCTACA-CAC--A--AGGGAA--AACA---GTAACAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAGAAATATTC----TTTTTA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATATAG---------C---------GTA-A---CCTCCGTTACAGTTTTTTTAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AA-T---TGT------ATAT--------CATCTG----AAATA---CGT-TAA-T--TGC---TT---AAAATC--AGT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AC-----AA--AAAAATG-CTGCCATAAAAGTT--GAAAAATTGAA----TGTCACATATAA-GAAAC----------TAACCTACAGAACGCATTTT---GT-CGTGATG----TA---G---C-CTGGA--CCTGTAAAC---GATATG-AT----ATTGA--TTTCA-TGATGGA-TAGTC--ATTTT-GGGGTGC-----CAAATA------A-------T-------------ATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTC----------------------------TGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCAATAACAAA---TTT-AAAAAA---CGTCCCAG-AACAAAATGTCTAGGTACAATTTCAC------AGATGGATATCAAT-A--------AATATGTGAGGCAGAC---GCTCTCTCGTCAAAATGCAAT
gi|8 : T-A--------TATATGTGAGGCA-ACTGTGTCTTTTCATCAAATTGGAATgccaatgcatgtttaaaactgttgttactaaca
gi|9 : agtCTCAGAAAA-TCGGCACAAATT-----TA-GCCGGAT-GT-A-CTC-T-------G-TCGCCGAATAATAGCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAACG-TTATCT---T-TGAATAATG-AA---GTTGGCGTTACGATTTTAAGC--------TATTA-TTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATTT-TTTCAT----TAAA---ATG-CATTCAT--TGAACAAGGTAAAA-CGTT-TTTTG-------AA--AA--TA-CGGTAT--A-A---G-CA--AACT--T-TTG--AAAAGCGCC---AA--T----ACTG-ATGT--GC--CAACCACAGAAAA--------C--------A-------------A--ATGTTTCCTT---TT-----T----------TGTCA--AAGC-ATTTTC-----------AGAAGACAATATA-TT---------------G--ATCATATTAT------T--GTGCCT-TTAGAG-AA--AGA-----------GTATGA-TGGCTCTACA-TAC--A--AGGGGA--AGCC---GTATCatgttcaatgctttcaactgttgttactaaacttttaacctcaggtatacatatattttttttataatgtaagttacttaaacttcacatgtcagtttcattacatactacatttattgattgttttattgcagtattttttttcacattttttttttttttactatgacttactcatcttgttgttattgtggtgtgtgttgaatttactgccgtgttaaacttattttgaatacccgttacgtagtagagaataaaagtggcatgttgattaacccaagcaatcatattacttttccaatttctacacttcaatatttcatctttttttgatcactataatacctgtgattatatttttttatttatacttattgaactatatagtatcgtaattaaagaggttatccgttagcgagttgcaatctgacacatttataccacgtgtgctaagtttccatctatgtgtttttcgtatgagcagaaagaacagtatgacattaaatttaattgatacttttaatttattttgacatccgctctttgtccctaagaaatagcgtttttgttttatttcaatatgaatatcaattttaatctcaacag
gi|9 : cagtcatttT--GAT-AA-T-GTA--GGTATG--AAGAATTATG-AA--AG-T---TGTACTTGCATAT--------CATCGG----AATTAAACCAT-TAATT--TTC---TT---TAGATC---AT--ATT-TCAA-ATAT-tagccgtgtggctcgctatctatactttggaatctgtagttcttgtcttctttatcttctctattgcagtgttacccatatctttcaggcccggtcttagggtctaacccaccgtctttccggctccagaccagtacagtgtcatccttcaaatgtcctgataatgtaggtatgaagaattatgaaagttgtacttgcatatcatcggaattaaaccattaattttctttagatcatatttcaaatat
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): CTGTCGGTTAAACATATTGACATACGTGTTACGTAGGTGCGAAGAAAAATTACTTGTTAATACAACCCCCAAACTTATATACTTTCTAGTTTTTACAATCAATGAATACTATTATGTGATCACTAATACCTTGATCTTTTCTTTATTTATACCTCACTGAACTATTGCATTGGAAAAGAAATTCATTACGGAGGTTGCAATCATGACACATTCATATACCATATGTGCTAAATCTCCATCTGTGCATATTTTGTAAGAACAAAACAACATTGTGACAATCAAGTGACACATTTAATTTCATTACTCTTCTGGTATTTGCCCAAAGTTGATTAGTATTTATGTTTTATTTTTAAAATATATTACAACCTCCGTAACATGTGTAAATATATCTTCTTCCAATTGGATAAATTGTTTAAATAACAAGTATTATAAAACAAGATCGATGCCATGAATTTCGAAATCTCAGTACGGAATATGGCTTTATGACCCATTGTATTGATTTTTATTAACTTAATCAAAATGCTATAGTTGTTAATCATATTTATTAGCAATGTAAATTTTCAGATGCCTATCAATATAAATTAGTTAACATACTTTTATCTGTTTATCAGAAGTTGTAAATACAATCCTAAAAATAAACAATAAATCAATAGATCAATGAAACTTACTGTAACCTGATGATAGTATAATTATTCAACCTTCGTAACAAAATAGCACCTTTTTTGTACAGCTGGATTAAAAATCTG
Unaligned ( gi|13 ): CCATATGTGCTAAATCTCCATCTCTGTGTGGGTTTTTTTTAACAAACAACAGTATAACATTCAAGTGATCCATTTAATTTTATTACACTTCTTGTCTTTTGTTCTAAGGTGAATAGTGTTAATGTTTTATTTCCAATATGTATTACAACCTCCGTAACACATAGCAATACCTCTATTTCCAATTGGATAACTTCTTTGAATAATAAGTAATGTAAGACAAGATCGATGGCATGGATTTCAAAATCTCAATACAGAAAAATGGCTTTACAACCCATTATAGTATTTTTTTAGAATTTAATCAAAATGTTACGGAGGTTACTCATATTTAATAGCTAAGTAATTTTTCAGACGTCTAGCAATTACATAAGTTAACATACTTTGATCTTTTCATAAAAATTTGAAAATACAATTCTAAAAAGAACCAATAGATCGATGAAACGTA
Unaligned ( gi|17 ): TAAGGCCTGTGGGCCTCTTGTTTAAAGAACTTAATCAAAATGTTACTGAGGTTACTCATATTCAATAGCCAAGTGAATTTTCAAAAATCTAGCAATTAAAATAAGTACATGTATTATACTTTGATCTTTTTTATCAAAATGTGAAAATACAATCCTAAAAAAGAACCAATAGATCGATGAAACGTACTGTAAACTGATGGTGGAATCATCATTCAACCTCCGTTACAAAATAGCACCTTTTTTGTTCAACTGGAATAAAAATCTTATATCACTGAAACTAATTGGAATATGTT
Unaligned ( gi|19 ): TTTATTTCCAAAATCTATTATAACTTCTGTAACACATTGAAACATCTGTAAATTGTTTGAACAATAAGTATTGTAAGACAAGATCAATGACATGAATTTCGAAATCTCAATTCGGAAAAATGGTCTTATAACCCATTGTAGTATTTTTTTAAAGAACTTAATTAAAATGACTGGGTGGTTACTTATATTTACTAGCAATGTAAATTCTCAGATGTCTAGCAATTTTAGTAAGGTTTTTTTATCAGAATTTGAAAATACGACCCTAAAAAG
Unaligned ( gi|20 ): TCATATTTAATGACCATGTAAATTTTCAGATGTCTAACAAATGAAATAAGTTAACATACTTTGATCTTTTTATCAAAATTTGAAAATACAATCCTAAAAAGAACTAATTGATCAATGAAATGTACTGTAAACTGATGGTGGAATCATTATTCAACCTCCGTAATAAAATAGCACATTATTTGTTGAGCTGGAATAAAAATCTGATGTCACTGAAACTTATTGGAATGTGTT
Unaligned ( gi|21 ): TTTTCAGATGTCTATTGATTGATACAAGTTAAAATAATTTGATTTTTTACCTGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATGGAAAATCAATCCAAAAAGAACAATAGACCAAATAAAGTTTTTACCGGGAGTTGTAACTGATGCATGTCCATTATTCAAACCTCCGTAATAAATAGCCTTTTTGTCTCATGGAATAAAAATCTGATATACTGAAACTTATTGGAA
Unaligned ( gi|24 ): GAATATCTATCATAATCTCCGTAACACGTAGAAATGTCTTTAGTTCCAATTGTTTGAACAATCATTATTATTGTAAGACTTGATTTCAAAATCTCAATGCGGAAAAATGGCTTTATAATCCATTGTAATGATTTTTTCATGGTTTTTTAAAGAACTTAATTCAAATGTTACGGAGGTTACTCATATTTACTAGCA
Unaligned ( gi|25 ): CAACTGTTGTTACTAACATTTTAACCTCAGGTATACATGTATTTTTATATCATGTAAAGTTACTTAACTTCACAATGTCAGTTTCATTACATACTACATTTATTGATTTTATTGAGGTATTTCATCTGGGTTTTTTACTATGACTTACTTCGTCTTTTGTTACTAC
Unaligned ( gi|28 ): TATACTTTTTTTATCATGTAAAGTTACGTAACTTCACAATGTCAGTTTCATTACATATTACATTTATTGATTTTATTGCGGTATTTCATGGGTTTTTTTTTTTTACTATGACTTACTTTCGTCTGTTGTTATTATGATG
Unaligned ( gi|30 ): TGGCACATTTATACCATGTGTGCTAAATATTCATCTATGCGTATTTCGTGTGAACAAAACAACAGTACGACATTTAATCGATTCATTTAATTTCATTGCACTTTAGGTCTTTTGTTCGAAGGTGAAT
Unaligned ( gi|31 ): TCTTTTCATCAACTATCTATTATATGGAATACTGTAGGTCATGGTTTAACCAACTGTTATTACTAAACATTTTTAACCTGCAGTATACATGTAAATTTTTATATCAT
Unaligned ( gi|34 ): AAAAAAAAACCCCCACAATTTATGTATTTATTTTTCTTTGTTTATTCATGTATTGTAGTGAGTGGGAGAAAAAAAAAAAA
Unaligned ( gi|37 ): ACATGTTGATATCGTCTAAATTGTTTGAACAATAAGTATTGTAAGACNATACAATGTATGATGATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111 1111111 2222222222222 111 2222 444444444444444444444 11111111 111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 77777777777777777777 11111111111 22222 22222222 11 999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111 11 111 111111 222222222 111 11 111111111 111111 111111111 22222 1111111111 22222 33333333333333333333333 11 11111 11111111111111 1111 44444444444444444444 2222222 1111 1 2222222 22222222 111
lowQualScore : 5 55 99999 3 3 3 3 3 3 3 1111111 3 55 3 8888888 4 4 4 4 777 4 4 4 777 44 4 7777777777777 4 777 55 99 55 000 3 3 7777 666 3 666 3 3 55 3 1111 666666666666666666666 55 444 55 33333333 55 4 55 4 55 4 8 7777 000000 55 8888 4 4 55 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 55 3 3 66666666666666666666 55 0 4 777 4 55 99999999999 3 4 1 4 55 55 55 777 888 5 55 6 33333 66 55555555 4 4 4 22 444444444444444444444444444444444444444444444444 66 11 4444444 4 4 11 4 4 4 55 7 4 44 55 4 444 111111 222222222 999999 111 4 4 11 666666666 0 55 55 3 7 3 5 444444 333333333 4 66666 66 4 66 8888 4 1 7777777777 00000 3 66666666666666666666666 1 777 4 9999 66 4 9999 4 00 4 55555 88888888888888 44 77 1 6 4444 8 1 55555555555555555555 4444444 1111 2 0 4 0000000 1 5 00000000 6 111 0 0
lowQualScore : . .. ..... . . . . . . . ....... . .. . ....... . . . . ... . . . ... .. . ............. . ... .. .. .. ... . . .... ... . ... . . .. . .... ..................... .. ... .. ........ .. . .. . .. . . .... ...... .. .... . . .. ........................................................................... . .. . . .................... .. . . ... . .. ........... . . . . .. .. .. ... ... . .. . ..... .. ........ . . . .. ................................................ .. .. ....... . . .. . . . .. . . .. .. . ... ...... ......... ...... ... . . .. ......... . .. .. . . . . ...... ......... . ..... .. . .. .... . . .......... ..... . ....................... . ... . .... .. . .... . .. . ..... .............. .. .. . . .... . . .................... ....... .... . . . ....... . . ........ . ... . .
lowQualScore : 0 00 11111 6 6 6 6 6 6 6 8888888 6 00 6 2222222 0 0 0 0 000 0 0 0 000 33 0 2222222222222 0 000 55 55 55 000 6 6 7777 444 6 444 6 6 00 6 4444 777777777777777777777 55 444 55 33333333 55 0 55 0 55 0 0 7777 333333 55 5555 0 0 55 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 00 6 6 11111111111111111111 55 7 0 000 0 55 00000000000 7 0 0 0 55 55 55 000 888 0 99 0 33333 99 00000000 4 4 4 22 333333333333333333333333333333333333333333333333 11 99 4444444 4 4 00 0 0 0 55 3 0 88 55 0 000 555555 666666666 222222 000 0 0 00 555555555 4 55 00 6 3 6 0 444444 222222222 4 77777 11 4 11 5555 0 0 5555555555 33333 6 44444444444444444444444 9 888 4 4444 11 4 7777 4 66 4 66666 22222222222222 00 11 8 7 2222 9 3 77777777777777777777 8888888 5555 0 3 3 2222222 0 7 77777777 7 777 3 7
consensus : CTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTTAAGT---AT--GT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-TTT-CAT----TGAA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAG--AAAA-C----TTTTN----------------AA--AA--TA-C-G--AT--A-A---GCCA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C--------AA--------C----------A--------AATGT-----T---------TCC----T--T----G-TNA--AAGC-AGTTTTAGAAGACA-TATA-TTA-CAT-ATATTATCATATAT--GTGTTT-TT---G-AA--AGA-----------GTATGA-TGCNTCTACA-TAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAAAAATATT-----TTTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--G---------C---------GTA-A---C---------AGTTTT--TAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---CGT-TAA-T--TTC---TT---AAGATC--AAT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AC-----AA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAANC----------TAACCTACATAACGCGTTTTC-TGT-CGTGATG----TA---G---C-CTCCAC--GTGAAC---TATATA-AT----ATTGG--TTTCA-TGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTTGAAAAGA---TTT-AA-ACG--TAA--ATGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCCATAACGAA--TTTT-AAAAAA---CGTCCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGACGGANATCAAT-A--------TATATGTGAGGCAGAC---GCTCTTTCGTCAAAATGGAAT
Reference ( family-4814 ) : CTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTTAAGT---AT--GT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-TTT-CAT----TGAA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAG--AAAA-C----TTTTN----------------AA--AA--TA-C-G--AT--A-A---GCCA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C--------AA--------C----------A--------AATGT-----T---------TCC----T--T----G-TNA--AAGC-AGTTTTAGAAGACA-TATA-TTA-CAT-ATATTATCATATAT--GTGTTT-TT---G-AA--AGA-----------GTATGA-TGCNTCTACA-TAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAAAAATATT-----TTTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--G---------C---------GTA-A---C---------AGTTTT--TAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---CGT-TAA-T--TTC---TT---AAGATC--AAT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AC-----AA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAANC----------TAACCTACATAACGCGTTTTC-TGT-CGTGATG----TA---G---C-CTCCAC--GTGAAC---TATATA-AT----ATTGG--TTTCA-TGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTTGAAAAGA---TTT-AA-ACG--TAA--ATGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCCATAACGAA--TTTT-AAAAAA---NGTCCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGACGGANATCAAT-A--------TATATGTGAGGCAGAC---GCTCTTTCGTCAAAATGGAAT
gi|1 : -AC-----AA--AAACATG-CTGTCATAAAGTTT--GA---------------TCACATATAA-GAACC----------TAACCTACATAACGCGTTTTC-T---CGTGATG----TACCGGTATC-CTCCTT--GTGAAC---TATATA-AT----ATTGA--TTTCA-TGCTAG-----TC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTA-AC-AAAATCCCATGC-TA----ATTATTTTCTTGAAAAGACATTTT----ACG--TAA--ATCAATTCTAACCTTCATTATTACAACCTCCATAGCGAA--TTAT-AAAAAAAAGAGTTCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGATGGAAATCAGTAA--------TATATGTGAAGCACAC---GCTCTTTCATCAAATTGGA
gi|10 : tACAA--T-----TA-GCCTG-T-GT-ACC-C-T-------G-TCGC---AGTAAAGCTTGC-GT-------TGTAGAAAGGAAAA-G-T-AGCC---T-TGA--AAATGAA---GTTTG-GT-ACG-TTT--AGT---AT---T-AT--TTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTTA--ATT-TTT-CAT----T-AA---ATGCCATTCA---T-GAG-AAA--GAAA-CG---TTTTA----------------GA--AA--TA-C-G--AT--ATA---GTCA--A-ATT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-------AA--T-----CTG-ATGTC-GCAACACAGA---AA--------C----------A--------AATGT-----T---------TCCTT--T--T----T-TTC--AAGC-ATTTTCAGAAAGCA-TATAGTTA--AT-A---------GTAT--GTGCCG-TT---ACGA--AGA-----------GTA-GA--GCTT-TAC--TAC--A--AGGAAA--GCCA---GTACCAT---TGGGAC--TCGATCATTATTGACATA-T-----TTTTCACTCTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCAACCATG-TATA--T---------T---------TCA-AATCC---------CG--TA--CAGTA--CAT-GA-------TCTT-CAATTTAGGTAAA-T-GTA--GGTATG--AAGAA-TATG--A--AG-TTTCTGC------ATAT---------ATC-------AATA---CGT-GAA-TAGTTC---TTTTAGAGCTC--AAT--ATT-TCAATATAT-Cggatcaatgtttaacactaacatcttaaccttcggtatatgtacatgtatattttatatcatgtaaagttacttaacttcacaatgtcaatttcattatatactacatttattaattgtattgatgtatttcatctgttttttactatgacttacttcgtctgttattattacggtgtagtatgaatttcctgtattcatattggcacatctgttacgtaggcgagaatacaagtgggatgttgatatagccccaaaaatatatatacattccactttctacattcaacattatctattttgatcactaataccttgatccctttttatttataccttactaaactattgtatacgtattagagaagatacccgttacggagattacaatcatgacacatttatactatgcgtattttgtatgagcaaggtaacagtttgacataaatggatttgatacatttaattttatggcacttctggtcttttgtcttaagaagaatagcatttatgttttatttctaatatgaaaatctattatcacctccgtaacaagtagaaatacctccagtctaattggataaattgtttgaacaataagtattgcaagacatgattgatgacatgattttcaaaaaatggctatataacccattgtaacgattttttagaacttaattaaaatgttacagaggttactcatatttaatataagttaatataatttgattttttatcagaatttgaaaataactgtacaatcatcaaaagaaccaatagaccaaagaaacgcactgtaaactaatggtggtatcattattcaacctccgtaacaaaatagcatattttttgttcagttggaataaaaatctgatatcactgaaacttattgacacat
gi|11 : gtcattctaaaaatctcaTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCA--CCAGTTATA--G---------CTTCATCTCCGTA-A---C---------AGT---------A--CATGTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGtt
gi|11 : T--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGTAAA------TAT-----C---AAGTA-ACCACAAAA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAACC----------TAACCTACATAACGCGTTTTC---T-CGTGATG----CA---G---C-TTTTAT--GTGAAC---TATATA-AG----ATTAG--TTTCA-T----GA-TAGTC--AATTA-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTA-GCAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttattttctttgattattcatgtattgtaatgagtggggaaaaatataaatacatgtatttcaaatatcgggtaaatatcaagtaaccacaaaaaaaaatgctgccataaagtttgaaaaatcaaatgtcgcatataagaacctaacctacataacgcgttttctcgtgatgcagcttttatgtgaactatataagattagtttcatgatagtcaattatggatgccaaataaccctttagcaaa
gi|12 : ttcactcttttgcagttgtcaccagttatagcttcatctccgtaacagtacatgtatctcaattgataatgtaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttattttctttgattattcatgtattgtaatgagtggggaaaaatataaatacatgTTTCA--CTCTCT------TTTGCA-G-T-TGTCAACCATGT-ATA--T---------T---------TCA-AATCC---------CGTAC----AGTA--CATG-A-------TC-TTCAATTTAGGT-AAAT-GTA--GGTATG--AAGAA-TATG--A--AG-TTTCTGC------ATAT---------ATC-------AATA---CGT-GAA-TAGTTC---TTTTAGAGCTC--AAT--ATT-TCAATATAT-C
gi|12 : AAATT--AATGTATT-TCAA-AT-T-CG-GGTAAA------T-------C---AAGTA-ACTACA-AA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAACC----------TAACCTACGTAACGCGTTTTC---T-CGTGATG----CA---G---CTTTTTAT--GTGAAC---TATATA-AG----ATTAG--TTTCA-T----GA-TAGTC--AATTA-TGGATGC-----CAAATA------A-------CC--TTA-GCAAAttcaattatatgtttctatgatgcagtgggattgcatggagagagaaagatgtgaaagtgtattgccaaaaaaaaattcccacaatgtttgtatttattttcttgattattcatgatattgtatggtggggaaaaatataaattaatgtatttcaaattcgggtaaatcaagtaactacaaaaaaaatgctgccataaagtttgaaaaatcaaatgtcgcatataagaacctaacctacgtaacgcgttttctcgtgatgcagctttttatgtgaactatataagattagtttcatgatagtcaattatggatgccaaataaccttagcaaa
gi|14 : tttcactctcttttgcagttgtcaaccatgtatatttcaaatcccgtacagtacatgatcttcaatttaggtaaatgtaggtatgaagaatatgaagtttctgcatatatcaatacgtgaatagttcttttagagctcaatatttcaatatatcttcaattatatgtttctatgatgcagtgggattgcatggagagagaaagatgtgaaagtgtattgccaaaaaaaaattcccacaatgtttgtatttattttcttgattattcatgatattgtatggtggggaaaaatatC----CC-----AAAA--T----GCCG-ATGTC-GC--C--------AG--------C----------ACAGAGAGAAATGTATCATT---------TTC----T--T------TCA--A-GC-GGTTTCAGAAGACA-TA--------AT-ATATAATCATATAT--GTGATT-TT---G-AATTGAA-----------AT-TGA-TGCATCTACA-GAC--A--AGGGAA--AACA---GCAGCATAATTGGAAC-TTTAATAG-TATAAGAATATT-----TG--CA--CTCT--------TTTGCA-G-C-TGTCG--TCATTTACA--G---------CAATGTCTCCGTA-A---C---------AGTTTT--TAGTC--AATCCA-------TC-T-CAATT--AAT-AA-T-GCA--GGTAGGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---CGC------ATAT--------CATAGG----AAATA---TGTACAG-T--TTC---TT---AAAA
gi|14 : ttaaactCAGTTTCTTAAAAAGA---TTT-AACATG--TTA--GTTAATTATTAACTCCGTTACAACAACC-CCATAACAAA--T------AAAA---CGTagatttaacatgttagttaattattaactccgttacaacaaccccataacaaataaaacgtatatgtataaaacatataa
gi|15 : ttaaactcccaaaatgccgatgtcgccagcacagagagaaatgtatcattttctttcaagcggtttcagaagacataatatataatcatatatgtgattttgaattgaaattgatgcatctacagacaagggaaaacagcagcataattggaactttaatagtataagaatatttgcactcttttgcagctgtcgtcatttacagcaatgtctccgtaacagtttttagtcaatccatctcaattaataatgcaggtaggaaaagaatatgaaagtcgcatatcataggaaatatgtaCTCAGATAA-TAGGCACAA--TATAATTA-ATCTG-C-GT-A-C-A-T-------G-TCGT--AAGTATA----GC-GT-------TATAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-AGA-TAAAT-AG---GTTGACTT-GCG-TTTTAAGC---AT---T-A-----------------------TTGTGATTT---ATT-TTT-CAT----TGAA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAG--AAAT-C----TTTTT-----------------A--AA--TA-T-G--AC--A-A---GCCA--A-ACG--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C--------AACACAGAAGC----------A--------AATGT-----T---------TCCTTTGT--T----G-TAA--AAGC-AGTTTTAGAAGAC---------------------------AT--GTGTTT-CT---G-AA--AGA-----------ATATGG-TGCCTCTACA-AAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATatatgtataaaacatataa
gi|16 : cattAA--T-----TACACCTG-C-GT-A-C-TAT-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GTGAT----TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTT---T---AA--GT-ATTAATT---AAT--CGC-T--A-TTGTG-TTT---ATT-TTC-CAT----TGAA---AGA-CATTCA---T-GAT-AAG--AGAACC----TTTTA----------------AA--AG--CC-C-A--AT--A-A----CCG--A-TTT--T-TTGTTTTG-GG-GC----CC-----CAAACCC----ACAG-A------------------AA--------A----------A--------AAAGT-----T---------CCC----TCGT----G-TAA--AAGCAAG--TTAGAAGACA-TA-A---A-C--------ATCATATACCAGTGTTT-CT---G-AA--AAA-----------GTATGATTGCTTCCAGA-TACCAA--AGGGGAATAATA---GTACAAT-----GGAC-TTTGAg
gi|18 : TCAGAAAA-TAGACACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TAA-TAAAT-GG---GTTGGCGT-GCG-TTT----T---AT--TT-ATTATCT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-TTT-TAT----TTGA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAC--AAAT-CA---TTTTC--------------------AA--TA-C-G--AT--A-A---GCTA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACTG-ATGTC-GC--CAACACAGAAA--------C----------A--------AATAT-----T---------TCCTCT-T--T----G-TGG--AAGC-AGTTTCAGAAGACA-TAT
gi|2 : agtcatttGTA-AC-----AA--AAAAATG-CTGCCATAAAAGTT--GAAAAATTGAA----TGTCACATATAA-GAAAC----------TAACCTACAGAACGCATTT---TGT-CGTGATG----TA---G---C-CTGGACCTGTAAAC---GATATG-AT----ATTGA--TTTCA-TGATGGA-TAGTC--ATTTT-GGGGTGC-----CAAATA------A-------T-------------ATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTC----------------------------TGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCAATAACAAA---TTT-AAAAAA---CGTCCCAG-AACAAAATGTCTAGGTACAATTTCAC------AGATGGATATCAAT-A--------AATATGTGAGGCAGAC---GCTCTCTCGTCAAAATGCAATtatc
gi|22 : -AAAAAA---CGTTCTCGAAACAATATGCATGGGTGCAATTCCATAGTTTCCAACATATATGTAT-ATGTACCTGTATATGTGAAGCAGAC---GCTCCTTCATCAAAACGGAAgccaatgcatgtttaaaactgttgttactaacaacaatgttactgtttcattacattctacatttattgattttttaggtatttcatctgggtttttttttaaccatgacttacttcgcctgttgttattacggtgtagtatgaattttctgccggttaaacatattggcacacctcttacgtaggtgataataaaagcgacatgttattatagacccccaaattacatactttccaatttttacattcaatatcctactcttgtttgatcactactaaactattgtatacgtattgcagaagatatccgttacggaggttacaatcatgacacattttaaataccatatgtaccaaatctacatctccattttgtatgaagaaaacaacagtatgacattcaaatgatccatttaatcttattacacttctggtcttttgtcttaaggtgaatagtatttatgttttatttccaatatctattataacctccgtaacacatggaaatgcatgcctctacttccatttggataaattgtttgaataataagtattttaaaacaagaacaatggcatgtatttcaaaatcttaatacagaaaaatggctttataacc
gi|23 : ctgaCTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGAATTTCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTT----T---AC--GT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-CTT-CAT----TGAA---AAG-CATTCA---T-GAA-AAG--AAAA-CCTTTTTTTC----------------CAGGAATTTC-C-A--GTTCC-A---ATTA--A-ACG--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAaatcaatgtgtaacaactgtctttactaacatcttaatctcaggtatgaatgaatatgatattccatataaagttagttaattttataacgccattgtttaattgcatgccgcattt
gi|26 : gtcattAAA-TAG-CACAA--T-----TA-GCCTG-CCGTTA-C-C-T-------GATCGG--AATT---TCTTGCAGT-------TGTAGAAA-----A-G-T-ATGA---T--GA-TAAAT-AGTGGGTTGGCGT-------TT---T---AC--GT-ATTATTT---AAAATCG--T--ATTTGTGATTT---ATTACTT-CAT----TGAA-----G-C-TTCA---T-GAA-AAG---AAA-C----TTTT
gi|27 : tttcA-G-TATGTTG--CAATATATA--G---------C---------GTA-A---CCTCCTAAC-ATTTTTCTTAGTG--CATCTA-------TT-A-C-ATT--GAT-AA-TGGTA--GGTATGAAAAGAA-TATGAAA--AG-T---T-T------ATATA-------AATTGG----AAATA---TGT-GAA-T--T--------------TC--AAT--ATT-TCAA-A-ATACGCGGAAAA------TGT-----T---A
gi|29 : A-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---TGT-TCA-T--TTC------------------------------------G-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AG-----AAGAAAAAATG-CTGTCATCAAGTTT--GAAAATTCAAA----TGTTGCATATAA-GAAGC----------TGACCTACATAACGCGTTT---TGT-CGTG
gi|3 : TGGCAC-GTA-TTTCAAGTTACAT--GTTATTATTTTATAAA--TGGTTGAATTTGTTGTTTTTTATC-TTT-TATCATATGAAGGTATG-CATTCACGTT-GAA-ATG--GAAA-C----TTTTGGTTTTGG---------AT--AG--TAGT-G--AT--G-GATGGTCACCA-ACTAGTATTG--AAA-AATGT----CG-----GAAA--TTATTATCGGATGTCAGT--C--------AA--------CCAGGTT----G--------AATAT-----CAATCTGCGGTCC----TGCT----G-TTAGCAAGC-ATGTTTGGAAGATA-GACA-TTA-------ATTAT--TGTGT--GTGATTATG---G-AA--AGATGGATTATATTGTTTAT-TGCTT-TACAGTAC--AGGAGGGAA--ACCATTTATGCCAT---TGGGATGTTTTTTC--TAT----ATTTTTTGGGTTTTTA--CTCTACGGCTGGTTTGCATGTT-TGTTG--CAAGTTATATTG---------CTTTAATCT-GTAGG---C---------ATTTTT--TAGTGGTCATCTATTTTTGTTC-T-GCGTT--GAT-AA-T-GTAGCGGCATGAAAAGAA-TATG-AGGTAGTT---TGT------ACATGTTAAGTCTATCGGCGTAAAATAC--CGT-TAA-T--TTTTCGTT---AAGATCTAAAT--ATTGTC-A-ATTT-CG-GGGAAAGTGGAGTGT-----CGAGAGGTGCAC-----AA--AAACATGCCTGGCATAACGTTTGAGAAAAACTAAAAAATTATCGCATATAAGGAAAC----------TAACCTACATAACTCGTTTT--TGG-TGTGATGGTGATG---GGT-T-CTCCACGTGTGAAC---TATATATAT----ATTGGATTTTCGTTGATAGATTAGTCTTATCTTGTTGATGCT----CAAATATTGGCTAAATTAATCCCTTTGTACAAGAATCCCATACATAAATTATCTTTTCCTTGAAAAGAT--TTT-AA-AAGATCAAGTATGAATTCTAACCTCCATTA-TACTACCTCCAT-ACG----T---------------TCCCCG-AACAAAATAGCTGGTTG-AATTTCA
gi|32 : CTCAGAAA--TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TTGC--AAGTATATCTTGC-GTTATGCAGTGTAGAAA-AAAAA-GTT-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-atc
gi|33 : ttA--AAGC-AGTTTTAGAAGACA-TATA-TTA-C----------CACATGT--GTGCTT-TT---T-AA--AAA-----------GTTCGG-TGCATCTATA-TAC--A--AGGGAA--AACA---G
gi|35 : ccGCTTTT-TAT-TGTGA--------------------CAC--AT---C---TATATA--TCGCGATTAG--TTTCA-T----GA-TAGTCA-AATTA-TGGATGC-----C-AAT-------A-------CCTTTTA-GCAA
gi|36 : aTCAGAAAA-TTAGCACAA--T-----TA-AACTG-T-GT-A-A-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCAACC-GT-------CGTAGA
gi|38 : cagccgttgcgcaaA----TGTCGCATATAA-GAAAC----------TAACCTACATAATGCG--ATA-TGT-CGT
gi|4 : CTCAGAAAAATAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-AT-------TGTAGAAT-GAAAA-A-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-TCA-TTTTAAGT---ATATGT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-TTC-CAT----TGAA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAG--AAAA-C----TATTA----------------AA--AA--TA-T-G--AT--G-A---GCCA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C--------AA--------T----------A--------A---T-----T---------TTT----T--T----GGTAA--AAAC-AGTTTTAGAAGACA-TATA-TTATCAT-ATATTATCATATAT--GTGTTT-TT---G-AA--AGA-----------GTATGA-TACTTCTACA-TAC--A--AGGGAA--AACT---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAAAAATATT-----TTTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--G---------C---------GTA-A---C---------AGTTTT--TAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---CGT-TAA-T--TTC---TT---AAGATC--AAT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----C---AAATA-AC-----AA--AAAAATA-TTGCCATAAAGTTT--TTAAAATTAAA----TGTCGCATATAA-GAACCTAATAGGTTATAACCTACATAACACGTGTTCTTGTACATAATG----TA---G---C------------AAT---TATATA-AT----ATGGA--TTTCA-AGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCCCATGC-TA----ATTATTTTCTTGAACAGA---TTTAAA-ACG--TAA--ATGAATTCTAATCTCCGTTATTACAACCTCCATAATGAACGTTTTAAAAAAA---AGTCCCCGAAACAAAATGACTGGGTGGAATTACAT------CGGCGGAAATCAAT-A--------TATATGTGAGGCACAC---GCTCTATCATCAAAATGGAAT
gi|5 : CACAA--T-----TA-GCCTA-C-AT-A-C-C-TCTGTCCTG-TCGC--AGGCATATCATGA-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGCACATGCGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTTAAGT---AT-------TATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-TTT-CAT----TGAA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAG--AA---T----TTTTTAAAAATATGATAAGCCAA--AA--TA-CCG--AT--GTC---GCCA--ACACC------G--AAACAA-ATGTTTCCTTTTTAGNN--N----NNNN-NNNTC-GC--C--------AA--------C----------ACAGAAACAAATGT-----T---------TCC----T--T-------------------TTTAAAAGAGA----------CAT-GTATTATCATATAT--GTGTTT-CT---G-GA--AGA-----------GTATGA-TGCTTCAACA-TAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATGAAATTATT-----TTTTCA--CTCT--------TT-GTA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--GGATAACCTCC---------ATA-A---C---------AGTTTTT-TAGTG--CATCTA-------TC-T-TAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGA------ATAT--------CATCAA----AAATT---CGT-TGA-T--TTC---TT---AAAATC--AAT--ATT-TTAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGTCATTAC---AAGTA-ACAA---AA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAAAC----------TAAACTACATAACGCGTTT---TGT-CGTGATG----TA---G---C-CCCCAT--GTGAACTAATATGTA-AT----ATTGA--TCTCG-TGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGAATGCAATATTAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCTCATAC-TA----ATAATTTCCTTAAAAAGA---TTTAAA-ACG--TAA--ATGAATACTAACCTCCATTATTACAACCTCCATAACAAA---TTC-GAAAAA---CATTCCCAAAACAAAAGGTCTGGGTGAAATTTCAT------TGGCGAAAATCAGT-A--------TATATGTGAGGTA
gi|6 : tTTGTGATTT---ATT-TTT-CAT----CGAA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAG--AAAA-C----TTTTT----------------AA--A---TA-T-G--AT--A-A---GCCA--A-ATT--T-TTT--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C--------AA--------CGCAAAAAC--A--------AATGT-----T---------TCCGTATT--T----G-CCA--AAGC-AGTTTTAGAAGACA-TAT-----------T-TTATCATATAT--GTGTTT-TA---A-AA--AGA-----------ATTTGA-TGCATCTACA-CAC--A--AGGGAA--AACA---GTAACAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAGAAATATTC----TTTTTA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATATAG---------C---------GTA-A---CCTCCGTTACAGTTTTTTTAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AA-T---TGT------ATAT--------CATCTG----AAATA---CGT-TAA-T--TGC---TT---AAAATC--AGT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AC-----AA--AAAAATG-CTGCCATAAAAGTT--GAAAAATTGAA----TGTCACATATAA-GAAAC----------TAACCTACAGAACGCATTT---TGT-CGTGATG----TA---G---C-CTGGACCTGTAAAC---GATATG-AT----ATTGA--TTTCA-TGATGGA-TAGTC--ATTTT-GGGGTGC-----CAAATA------A-------T-------------ATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTC----------------------------TGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCAATAACAAA---TTT-AAAAAA---CGTCCCAG-AACAAAATGTCTAGGTACAATTTCAC------AGATGGATATCAAT-A--------AATATGTGAGGCAGAC---GCTCTCTCGTCAAAATGCAAT
gi|7 : ATTGCAACCTCCGTAATGAA--TTTgccaatgcatgtttaaaactgttgttactaaca
gi|8 : ctgtcggttaaacatattgacatacgtgttacgtaggtgcgaagaaaaattacttgttaatacaacccccaaacttatatactttctagtttttacaatcaatgaatactattatgtgatcactaataccttgatcttttctttatttatacctcactgaactattgcattggaaaagT-A--------TATATGTGAGGCA-ACTGTGTCTTTTCATCAAATTGGAATcatgacacattcatataccatatgtgctaaatctccatctgtgcatattttgtaagaacaaaacaacattgtgacaatcaagtgacacatttaatttcattactcttctggtatttgcccaaagttgattagtatttatgttttatttttaaaatatattacaacctccgtaacatgtgtaaatatatcttcttccaattggataaattgtttaaataacaagtattataaaacaagatcgatgccatgaatttcgaaatctcagtacggaatatggctttatgacccattgtattgatttttattaacttaatcaaaatgctatagttgttaatcatatttattagcaatgtaaattttcagatgcctatcaatataaattagttaacatacttttatctgtttatcagaagttgtaaatacaatcctaaaaataaacaataaatcaatagatcaatgaaacttactgtaacctgatgatagtataattattcaaccttcgtaacaaaatagcaccttttttgtacagctggattaaaaatctg
gi|9 : agtCTCAGAAAA-TCGGCACAAATT-----TA-GCCGGAT-GT-A-CTC-T-------G-TCGCCGAATAATAGCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAACG-TTATCT---T-TGAATAATG-AA---GTTGGCGTTACGATTTTAAGC--------T-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-TTTTCAT----TAAA---ATG-CATTCA---TTGAACAAGGTAAAA-CGTT-TTTTG----------------AA--AA--TA-C-GGTAT--A-A---GC-A--A-ACT--T-TTG--AAA-AGCGC----C--------AA--T----ACTG-ATGT--GC--C--------AA--------CCACAGAAAACA--------AATGT-----T---------TCC----T--TTTTTG-TCA--AAGC-ATTTTCAGAAGACAATATA-TTG--ATCATATTAT------T--GTGCCT-TTAGAG-AA--AGA-----------GTATGA-TGGCTCTACA-TAC--A--AGGGGA--AGCC---GTATCatgttcaatgctttcaactgttgttactaaacttttaacctcaggtatacatatattttttttataatgtaagttacttaaacttcacatgtcagtttcattacatactacatttattgattgttttattgcagtattttttttcacattttttttttttttactatgacttactcatcttgttgttattgtggtgtgtgttgaatttactgccgtgttaaacttattttgaatacccgttacgtagtagagaataaaagtggcatgttgattaacccaagcaatcatattacttttccaatttctacacttcaatatttcatctttttttgatcactataatacctgtgattatatttttttatttatacttattgaactatatagtatcgtaattaaagaggttatccgttagcgagttgcaatctgacacatttataccacgtgtgctaagtttccatctatgtgtttttcgtatgagcagaaagaacagtatgacattaaatttaattgatacttttaatttattttgacatccgctctttgtccctaagaaatagcgtttttgttttatttcaatatgaatatcaattttaatctcaacag
gi|9 : cagtcatttT--GAT-AA-T-GTA--GGTATG--AAGAATTATG-AA--AG-T---TGTACTTGCATAT--------CATCGG----AATTAAACCAT-TAATT--TTC---TT---TAGATC---AT--ATT-TCAA-ATAT-tagccgtgtggctcgctatctatactttggaatctgtagttcttgtcttctttatcttctctattgcagtgttacccatatctttcaggcccggtcttagggtctaacccaccgtctttccggctccagaccagtacagtgtcatccttcaaatgtcctgataatgtaggtatgaagaattatgaaagttgtacttgcatatcatcggaattaaaccattaattttctttagatcatatttcaaatat
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): CCATATGTGCTAAATCTCCATCTCTGTGTGGGTTTTTTTTAACAAACAACAGTATAACATTCAAGTGATCCATTTAATTTTATTACACTTCTTGTCTTTTGTTCTAAGGTGAATAGTGTTAATGTTTTATTTCCAATATGTATTACAACCTCCGTAACACATAGCAATACCTCTATTTCCAATTGGATAACTTCTTTGAATAATAAGTAATGTAAGACAAGATCGATGGCATGGATTTCAAAATCTCAATACAGAAAAATGGCTTTACAACCCATTATAGTATTTTTTTAGAATTTAATCAAAATGTTACGGAGGTTACTCATATTTAATAGCTAAGTAATTTTTCAGACGTCTAGCAATTACATAAGTTAACATACTTTGATCTTTTCATAAAAATTTGAAAATACAATTCTAAAAAGAACCAATAGATCGATGAAACGTA
Unaligned ( gi|17 ): TAAGGCCTGTGGGCCTCTTGTTTAAAGAACTTAATCAAAATGTTACTGAGGTTACTCATATTCAATAGCCAAGTGAATTTTCAAAAATCTAGCAATTAAAATAAGTACATGTATTATACTTTGATCTTTTTTATCAAAATGTGAAAATACAATCCTAAAAAAGAACCAATAGATCGATGAAACGTACTGTAAACTGATGGTGGAATCATCATTCAACCTCCGTTACAAAATAGCACCTTTTTTGTTCAACTGGAATAAAAATCTTATATCACTGAAACTAATTGGAATATGTT
Unaligned ( gi|19 ): TTTATTTCCAAAATCTATTATAACTTCTGTAACACATTGAAACATCTGTAAATTGTTTGAACAATAAGTATTGTAAGACAAGATCAATGACATGAATTTCGAAATCTCAATTCGGAAAAATGGTCTTATAACCCATTGTAGTATTTTTTTAAAGAACTTAATTAAAATGACTGGGTGGTTACTTATATTTACTAGCAATGTAAATTCTCAGATGTCTAGCAATTTTAGTAAGGTTTTTTTATCAGAATTTGAAAATACGACCCTAAAAAG
Unaligned ( gi|20 ): TCATATTTAATGACCATGTAAATTTTCAGATGTCTAACAAATGAAATAAGTTAACATACTTTGATCTTTTTATCAAAATTTGAAAATACAATCCTAAAAAGAACTAATTGATCAATGAAATGTACTGTAAACTGATGGTGGAATCATTATTCAACCTCCGTAATAAAATAGCACATTATTTGTTGAGCTGGAATAAAAATCTGATGTCACTGAAACTTATTGGAATGTGTT
Unaligned ( gi|21 ): TTTTCAGATGTCTATTGATTGATACAAGTTAAAATAATTTGATTTTTTACCTGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATGGAAAATCAATCCAAAAAGAACAATAGACCAAATAAAGTTTTTACCGGGAGTTGTAACTGATGCATGTCCATTATTCAAACCTCCGTAATAAATAGCCTTTTTGTCTCATGGAATAAAAATCTGATATACTGAAACTTATTGGAA
Unaligned ( gi|24 ): GAATATCTATCATAATCTCCGTAACACGTAGAAATGTCTTTAGTTCCAATTGTTTGAACAATCATTATTATTGTAAGACTTGATTTCAAAATCTCAATGCGGAAAAATGGCTTTATAATCCATTGTAATGATTTTTTCATGGTTTTTTAAAGAACTTAATTCAAATGTTACGGAGGTTACTCATATTTACTAGCA
Unaligned ( gi|25 ): CAACTGTTGTTACTAACATTTTAACCTCAGGTATACATGTATTTTTATATCATGTAAAGTTACTTAACTTCACAATGTCAGTTTCATTACATACTACATTTATTGATTTTATTGAGGTATTTCATCTGGGTTTTTTACTATGACTTACTTCGTCTTTTGTTACTAC
Unaligned ( gi|28 ): TATACTTTTTTTATCATGTAAAGTTACGTAACTTCACAATGTCAGTTTCATTACATATTACATTTATTGATTTTATTGCGGTATTTCATGGGTTTTTTTTTTTTACTATGACTTACTTTCGTCTGTTGTTATTATGATG
Unaligned ( gi|30 ): TGGCACATTTATACCATGTGTGCTAAATATTCATCTATGCGTATTTCGTGTGAACAAAACAACAGTACGACATTTAATCGATTCATTTAATTTCATTGCACTTTAGGTCTTTTGTTCGAAGGTGAAT
Unaligned ( gi|31 ): TCTTTTCATCAACTATCTATTATATGGAATACTGTAGGTCATGGTTTAACCAACTGTTATTACTAAACATTTTTAACCTGCAGTATACATGTAAATTTTTATATCAT
Unaligned ( gi|34 ): AAAAAAAAACCCCCACAATTTATGTATTTATTTTTCTTTGTTTATTCATGTATTGTAGTGAGTGGGAGAAAAAAAAAAAA
Unaligned ( gi|37 ): ACATGTTGATATCGTCTAAATTGTTTGAACAATAAGTATTGTAAGACNATACAATGTATGATGATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111 1111111 2222222222222 111 2222 444444444444444444444 11111111 111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 77777777777777777777 11111111111 22222 22222222 11 999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111 11 111 111111 222222222 111 11 111111111 111111 111111111 22222 1111111111 22222 33333333333333333333333 11 11111 11111111111111 1111 44444444444444444444 2222222 2222222 22222222 111
lowQualScore : 5 55 99999 3 3 3 3 3 3 3 1111111 3 55 3 8888888 4 4 4 4 777 4 4 4 777 44 4 7777777777777 4 777 55 99 55 000 3 3 7777 666 3 666 3 3 55 3 1111 666666666666666666666 55 444 55 33333333 55 4 55 4 55 4 8 7777 000000 55 8888 4 4 55 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 55 3 3 66666666666666666666 55 0 4 777 4 55 99999999999 3 4 1 4 55 55 55 777 888 5 55 6 33333 66 55555555 4 4 4 22 444444444444444444444444444444444444444444444444 66 11 4444444 4 4 11 4 4 4 55 7 4 44 55 4 444 111111 222222222 999999 111 4 4 11 666666666 0 55 55 3 7 3 5 444444 333333333 4 66666 66 4 66 8888 4 1 7777777777 00000 3 66666666666666666666666 1 777 4 9999 66 4 9999 4 00 4 55555 88888888888888 44 77 1 6 4444 8 1 55555555555555555555 1 4444444 888 7 0 4 0000000 1 5 00000000 6 111 0 0
lowQualScore : . .. ..... . . . . . . . ....... . .. . ....... . . . . ... . . . ... .. . ............. . ... .. .. .. ... . . .... ... . ... . . .. . .... ..................... .. ... .. ........ .. . .. . .. . . .... ...... .. .... . . .. ........................................................................... . .. . . .................... .. . . ... . .. ........... . . . . .. .. .. ... ... . .. . ..... .. ........ . . . .. ................................................ .. .. ....... . . .. . . . .. . . .. .. . ... ...... ......... ...... ... . . .. ......... . .. .. . . . . ...... ......... . ..... .. . .. .... . . .......... ..... . ....................... . ... . .... .. . .... . .. . ..... .............. .. .. . . .... . . .................... . ....... ... . . . ....... . . ........ . ... . .
lowQualScore : 0 00 11111 6 6 6 6 6 6 6 8888888 6 00 6 2222222 0 0 0 0 000 0 0 0 000 33 0 2222222222222 0 000 55 55 55 000 6 6 7777 444 6 444 6 6 00 6 4444 777777777777777777777 55 444 55 33333333 55 0 55 0 55 0 0 7777 333333 55 5555 0 0 55 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 00 6 6 11111111111111111111 55 7 0 000 0 55 00000000000 7 0 0 0 55 55 55 000 888 0 99 0 33333 99 00000000 4 4 4 22 333333333333333333333333333333333333333333333333 11 99 4444444 4 4 00 0 0 0 55 3 0 88 55 0 000 555555 666666666 222222 000 0 0 00 555555555 4 55 00 6 3 6 0 444444 222222222 4 77777 11 4 11 5555 0 0 5555555555 33333 6 44444444444444444444444 9 888 4 4444 11 4 7777 4 66 4 66666 22222222222222 00 11 8 7 2222 9 3 77777777777777777777 1 6666666 888 1 3 3 2222222 0 7 77777777 7 777 3 7
consensus : CTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTTAAGT---AT--GT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-TTT-CAT----TGAA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAG--AAAA-C----TTTTN----------------AA--AA--TA-C-G--AT--A-A---GCCA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C--------AA--------C----------A--------AATGT-----T---------TCC----T--T----G-TNA--AAGC-AGTTTTAGAAGACA-TATA-TTA-CAT-ATATTATCATATAT--GTGTTT-TT---G-AA--AGA-----------GTATGA-TGCNTCTACA-TAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAAAAATATT-----TTTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--G---------C---------GTA-A---C---------AGTTTT--TAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---CGT-TAA-T--TTC---TT---AAGATC--AAT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AC-----AA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAANC----------TAACCTACATAACGCGTTTTC-TGT-CGTGATG----TA---G---C-CTCCAC--GTGAAC---TATATA-AT----ATTGG--TTTCA-TGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTTGAAAAGA---TTT-AA-ACG--TAA--ATGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCCATAACGAA--TTTT-AAAAAA---CGTCCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGACGGANATCAAT-A--------TATATGTGAGGCAGAC---GCTCTTTCGTCAAAATGGAAT
Reference ( family-4814 ) : CTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTTAAGT---AT--GT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-TTT-CAT----TGAA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAG--AAAA-C----TTTTN----------------AA--AA--TA-C-G--AT--A-A---GCCA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C--------AA--------C----------A--------AATGT-----T---------TCC----T--T----G-TNA--AAGC-AGTTTTAGAAGACA-TATA-TTA-CAT-ATATTATCATATAT--GTGTTT-TT---G-AA--AGA-----------GTATGA-TGCNTCTACA-TAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAAAAATATT-----TTTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--G---------C---------GTA-A---C---------AGTTTT--TAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---CGT-TAA-T--TTC---TT---AAGATC--AAT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AC-----AA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAANC----------TAACCTACATAACGCGTTTTC-TGT-CGTGATG----TA---G---C-CTCCAC--GTGAAC---TATATA-AT----ATTGG--TTTCA-TGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTTGAAAAGA---TTT-AA-ACG--TAA--ATGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCCATAACGAA--TTTT-AAAAAA---CGTCCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGACGGANATCAAT-A--------TATATGTGAGGCAGAC---GCTCTTTCGTCAAAATGGAAT
gi|1 : -AC-----AA--AAACATG-CTGTCATAAAGTTT--GA---------------TCACATATAA-GAACC----------TAACCTACATAACGCGTTTTC-T---CGTGATG----TACCGGTATC-CTCCTT--GTGAAC---TATATA-AT----ATTGA--TTTCA-TGCTAG-----TC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTA-AC-AAAATCCCATGC-TA----ATTATTTTCTTGAAAAGACATTTT----ACG--TAA--ATCAATTCTAACCTTCATTATTACAACCTCCATAGCGAA--TTAT-AAAAAAAAGAGTTCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGATGGAAATCAGTAA--------TATATGTGAAGCACAC---GCTCTTTCATCAAATTGGA
gi|10 : tACAA--T-----TA-GCCTG-T-GT-ACC-C-T-------G-TCGC---AGTAAAGCTTGC-GT-------TGTAGAAAGGAAAA-G-T-AGCC---T-TGA--AAATGAA---GTTTG-GT-ACG-TTT--AGT---AT---T-AT--TTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTTA--ATT-TTT-CAT----T-AA---ATGCCATTCA---T-GAG-AAA--GAAA-CG---TTTTA----------------GA--AA--TA-C-G--AT--ATA---GTCA--A-ATT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-------AA--T-----CTG-ATGTC-GCAACACAGA---AA--------C----------A--------AATGT-----T---------TCCTT--T--T----T-TTC--AAGC-ATTTTCAGAAAGCA-TATAGTTA--AT-A---------GTAT--GTGCCG-TT---ACGA--AGA-----------GTA-GA--GCTT-TAC--TAC--A--AGGAAA--GCCA---GTACCAT---TGGGAC--TCGATCATTATTGACATA-T-----TTTTCACTCTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCAACCATG-TATA--T---------T---------TCA-AATCC---------CG--TA--CAGTA--CAT-GA-------TCTT-CAATTTAGGTAAA-T-GTA--GGTATG--AAGAA-TATG--A--AG-TTTCTGC------ATAT---------ATC-------AATA---CGT-GAA-TAGTTC---TTTTAGAGCTC--AAT--ATT-TCAATATAT-Cggatcaatgtttaacactaacatcttaaccttcggtatatgtacatgtatattttatatcatgtaaagttacttaacttcacaatgtcaatttcattatatactacatttattaattgtattgatgtatttcatctgttttttactatgacttacttcgtctgttattattacggtgtagtatgaatttcctgtattcatattggcacatctgttacgtaggcgagaatacaagtgggatgttgatatagccccaaaaatatatatacattccactttctacattcaacattatctattttgatcactaataccttgatccctttttatttataccttactaaactattgtatacgtattagagaagatacccgttacggagattacaatcatgacacatttatactatgcgtattttgtatgagcaaggtaacagtttgacataaatggatttgatacatttaattttatggcacttctggtcttttgtcttaagaagaatagcatttatgttttatttctaatatgaaaatctattatcacctccgtaacaagtagaaatacctccagtctaattggataaattgtttgaacaataagtattgcaagacatgattgatgacatgattttcaaaaaatggctatataacccattgtaacgattttttagaacttaattaaaatgttacagaggttactcatatttaatataagttaatataatttgattttttatcagaatttgaaaataactgtacaatcatcaaaagaaccaatagaccaaagaaacgcactgtaaactaatggtggtatcattattcaacctccgtaacaaaatagcatattttttgttcagttggaataaaaatctgatatcactgaaacttattgacacat
gi|11 : gtcattctaaaaatctcaTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCA--CCAGTTATA--G---------CTTCATCTCCGTA-A---C---------AGT---------A--CATGTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGtt
gi|11 : T--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGTAAA------TAT-----C---AAGTA-ACCACAAAA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAACC----------TAACCTACATAACGCGTTTTC---T-CGTGATG----CA---G---C-TTTTAT--GTGAAC---TATATA-AG----ATTAG--TTTCA-T----GA-TAGTC--AATTA-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTA-GCAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttattttctttgattattcatgtattgtaatgagtggggaaaaatataaatacatgtatttcaaatatcgggtaaatatcaagtaaccacaaaaaaaaatgctgccataaagtttgaaaaatcaaatgtcgcatataagaacctaacctacataacgcgttttctcgtgatgcagcttttatgtgaactatataagattagtttcatgatagtcaattatggatgccaaataaccctttagcaaa
gi|12 : ttcactcttttgcagttgtcaccagttatagcttcatctccgtaacagtacatgtatctcaattgataatgtaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttattttctttgattattcatgtattgtaatgagtggggaaaaatataaatacatgTTTCA--CTCTCT------TTTGCA-G-T-TGTCAACCATGT-ATA--T---------T---------TCA-AATCC---------CGTAC----AGTA--CATG-A-------TC-TTCAATTTAGGT-AAAT-GTA--GGTATG--AAGAA-TATG--A--AG-TTTCTGC------ATAT---------ATC-------AATA---CGT-GAA-TAGTTC---TTTTAGAGCTC--AAT--ATT-TCAATATAT-C
gi|12 : AAATT--AATGTATT-TCAA-AT-T-CG-GGTAAA------T-------C---AAGTA-ACTACA-AA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAACC----------TAACCTACGTAACGCGTTTTC---T-CGTGATG----CA---G---CTTTTTAT--GTGAAC---TATATA-AG----ATTAG--TTTCA-T----GA-TAGTC--AATTA-TGGATGC-----CAAATA------A-------CC--TTA-GCAAAttcaattatatgtttctatgatgcagtgggattgcatggagagagaaagatgtgaaagtgtattgccaaaaaaaaattcccacaatgtttgtatttattttcttgattattcatgatattgtatggtggggaaaaatataaattaatgtatttcaaattcgggtaaatcaagtaactacaaaaaaaatgctgccataaagtttgaaaaatcaaatgtcgcatataagaacctaacctacgtaacgcgttttctcgtgatgcagctttttatgtgaactatataagattagtttcatgatagtcaattatggatgccaaataaccttagcaaa
gi|14 : tttcactctcttttgcagttgtcaaccatgtatatttcaaatcccgtacagtacatgatcttcaatttaggtaaatgtaggtatgaagaatatgaagtttctgcatatatcaatacgtgaatagttcttttagagctcaatatttcaatatatcttcaattatatgtttctatgatgcagtgggattgcatggagagagaaagatgtgaaagtgtattgccaaaaaaaaattcccacaatgtttgtatttattttcttgattattcatgatattgtatggtggggaaaaatatC----CC-----AAAA--T----GCCG-ATGTC-GC--C--------AG--------C----------ACAGAGAGAAATGTATCATT---------TTC----T--T------TCA--A-GC-GGTTTCAGAAGACA-TA--------AT-ATATAATCATATAT--GTGATT-TT---G-AATTGAA-----------AT-TGA-TGCATCTACA-GAC--A--AGGGAA--AACA---GCAGCATAATTGGAAC-TTTAATAG-TATAAGAATATT-----TG--CA--CTCT--------TTTGCA-G-C-TGTCG--TCATTTACA--G---------CAATGTCTCCGTA-A---C---------AGTTTT--TAGTC--AATCCA-------TC-T-CAATT--AAT-AA-T-GCA--GGTAGGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---CGC------ATAT--------CATAGG----AAATA---TGTACAG-T--TTC---TT---AAAA
gi|14 : ttaaactCAGTTTCTTAAAAAGA---TTT-AACATG--TTA--GTTAATTATTAACTCCGTTACAACAACC-CCATAACAAA--T------AAAA---CGTagatttaacatgttagttaattattaactccgttacaacaaccccataacaaataaaacgtatatgtataaaacatataa
gi|15 : ttaaactcccaaaatgccgatgtcgccagcacagagagaaatgtatcattttctttcaagcggtttcagaagacataatatataatcatatatgtgattttgaattgaaattgatgcatctacagacaagggaaaacagcagcataattggaactttaatagtataagaatatttgcactcttttgcagctgtcgtcatttacagcaatgtctccgtaacagtttttagtcaatccatctcaattaataatgcaggtaggaaaagaatatgaaagtcgcatatcataggaaatatgtaCTCAGATAA-TAGGCACAA--TATAATTA-ATCTG-C-GT-A-C-A-T-------G-TCGT--AAGTATA----GC-GT-------TATAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-AGA-TAAAT-AG---GTTGACTT-GCG-TTTTAAGC---AT---T-A-----------------------TTGTGATTT---ATT-TTT-CAT----TGAA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAG--AAAT-C----TTTTT-----------------A--AA--TA-T-G--AC--A-A---GCCA--A-ACG--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C--------AACACAGAAGC----------A--------AATGT-----T---------TCCTTTGT--T----G-TAA--AAGC-AGTTTTAGAAGAC---------------------------AT--GTGTTT-CT---G-AA--AGA-----------ATATGG-TGCCTCTACA-AAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATatatgtataaaacatataa
gi|16 : cattAA--T-----TACACCTG-C-GT-A-C-TAT-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GTGAT----TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTT---T---AA--GT-ATTAATT---AAT--CGC-T--A-TTGTG-TTT---ATT-TTC-CAT----TGAA---AGA-CATTCA---T-GAT-AAG--AGAACC----TTTTA----------------AA--AG--CC-C-A--AT--A-A----CCG--A-TTT--T-TTGTTTTG-GG-GC----CC-----CAAACCC----ACAG-A------------------AA--------A----------A--------AAAGT-----T---------CCC----TCGT----G-TAA--AAGCAAG--TTAGAAGACA-TA-A---A-C--------ATCATATACCAGTGTTT-CT---G-AA--AAA-----------GTATGATTGCTTCCAGA-TACCAA--AGGGGAATAATA---GTACAAT-----GGAC-TTTGAg
gi|18 : TCAGAAAA-TAGACACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TAA-TAAAT-GG---GTTGGCGT-GCG-TTT----T---AT--TT-ATTATCT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-TTT-TAT----TTGA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAC--AAAT-CA---TTTTC--------------------AA--TA-C-G--AT--A-A---GCTA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACTG-ATGTC-GC--CAACACAGAAA--------C----------A--------AATAT-----T---------TCCTCT-T--T----G-TGG--AAGC-AGTTTCAGAAGACA-TAT
gi|2 : agtcatttGTA-AC-----AA--AAAAATG-CTGCCATAAAAGTT--GAAAAATTGAA----TGTCACATATAA-GAAAC----------TAACCTACAGAACGCATTT---TGT-CGTGATG----TA---G---C-CTGGACCTGTAAAC---GATATG-AT----ATTGA--TTTCA-TGATGGA-TAGTC--ATTTT-GGGGTGC-----CAAATA------A-------T-------------ATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTC----------------------------TGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCAATAACAAA---TTT-AAAAAA---CGTCCCAG-AACAAAATGTCTAGGTACAATTTCAC------AGATGGATATCAAT-A--------AATATGTGAGGCAGAC---GCTCTCTCGTCAAAATGCAATtatc
gi|22 : -AAAAAA---CGTTCTCGAAACAATATGCATGGGTGCAATTCCATAGTTTCCAACATATATGTAT-ATGTACCTGTATATGTGAAGCAGAC---GCTCCTTCATCAAAACGGAAgccaatgcatgtttaaaactgttgttactaacaacaatgttactgtttcattacattctacatttattgattttttaggtatttcatctgggtttttttttaaccatgacttacttcgcctgttgttattacggtgtagtatgaattttctgccggttaaacatattggcacacctcttacgtaggtgataataaaagcgacatgttattatagacccccaaattacatactttccaatttttacattcaatatcctactcttgtttgatcactactaaactattgtatacgtattgcagaagatatccgttacggaggttacaatcatgacacattttaaataccatatgtaccaaatctacatctccattttgtatgaagaaaacaacagtatgacattcaaatgatccatttaatcttattacacttctggtcttttgtcttaaggtgaatagtatttatgttttatttccaatatctattataacctccgtaacacatggaaatgcatgcctctacttccatttggataaattgtttgaataataagtattttaaaacaagaacaatggcatgtatttcaaaatcttaatacagaaaaatggctttataacc
gi|23 : ctgaCTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGAATTTCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTT----T---AC--GT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-CTT-CAT----TGAA---AAG-CATTCA---T-GAA-AAG--AAAA-CCTTTTTTTC----------------CAGGAATTTC-C-A--GTTCC-A---ATTA--A-ACG--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAaatcaatgtgtaacaactgtctttactaacatcttaatctcaggtatgaatgaatatgatattccatataaagttagttaattttataacgccattgtttaattgcatgccgcattt
gi|26 : gtcattAAA-TAG-CACAA--T-----TA-GCCTG-CCGTTA-C-C-T-------GATCGG--AATT---TCTTGCAGT-------TGTAGAAA-----A-G-T-ATGA---T--GA-TAAAT-AGTGGGTTGGCGT-------TT---T---AC--GT-ATTATTT---AAAATCG--T--ATTTGTGATTT---ATTACTT-CAT----TGAA-----G-C-TTCA---T-GAA-AAG---AAA-C----TTTT
gi|27 : tttcA-G-TATGTTG--CAATATATA--G---------C---------GTA-A---CCTCCTAAC-ATTTTTCTTAGTG--CATCTA-------TT-A-C-ATT--GAT-AA-TGGTA--GGTATGAAAAGAA-TATGAAA--AG-T---T-T------ATATA-------AATTGG----AAATA---TGT-GAA-T--T--------------TC--AAT--ATT-TCAA-A-ATACGCGGAAAA------TGT-----T---A
gi|29 : A-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---TGT-TCA-T--TTC------------------------------------G-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AG-----AAGAAAAAATG-CTGTCATCAAGTTT--GAAAATTCAAA----TGTTGCATATAA-GAAGC----------TGACCTACATAACGCGTTT---TGT-CGTG
gi|3 : TGGCAC-GTA-TTTCAAGTTACAT--GTTATTATTTTATAAA--TGGTTGAATTTGTTGTTTTTTATC-TTT-TATCATATGAAGGTATG-CATTCACGTT-GAA-ATG--GAAA-C----TTTTGGTTTTGG---------AT--AG--TAGT-G--AT--G-GATGGTCACCA-ACTAGTATTG--AAA-AATGT----CG-----GAAA--TTATTATCGGATGTCAGT--C--------AA--------CCAGGTT----G--------AATAT-----CAATCTGCGGTCC----TGCT----G-TTAGCAAGC-ATGTTTGGAAGATA-GACA-TTA-------ATTAT--TGTGT--GTGATTATG---G-AA--AGATGGATTATATTGTTTAT-TGCTT-TACAGTAC--AGGAGGGAA--ACCATTTATGCCAT---TGGGATGTTTTTTC--TAT----ATTTTTTGGGTTTTTA--CTCTACGGCTGGTTTGCATGTT-TGTTG--CAAGTTATATTG---------CTTTAATCT-GTAGG---C---------ATTTTT--TAGTGGTCATCTATTTTTGTTC-T-GCGTT--GAT-AA-T-GTAGCGGCATGAAAAGAA-TATG-AGGTAGTT---TGT------ACATGTTAAGTCTATCGGCGTAAAATAC--CGT-TAA-T--TTTTCGTT---AAGATCTAAAT--ATTGTC-A-ATTT-CG-GGGAAAGTGGAGTGT-----CGAGAGGTGCAC-----AA--AAACATGCCTGGCATAACGTTTGAGAAAAACTAAAAAATTATCGCATATAAGGAAAC----------TAACCTACATAACTCGTTTT--TGG-TGTGATGGTGATG---GGT-T-CTCCACGTGTGAAC---TATATATAT----ATTGGATTTTCGTTGATAGATTAGTCTTATCTTGTTGATGCT----CAAATATTGGCTAAATTAATCCCTTTGTACAAGAATCCCATACATAAATTATCTTTTCCTTGAAAAGAT--TTT-AA-AAGATCAAGTATGAATTCTAACCTCCATTA-TACTACCTCCAT------------------A---CGTTCCCCGAACAAAATAGCTGGTTG-AATTTCA
gi|32 : CTCAGAAA--TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TTGC--AAGTATATCTTGC-GTTATGCAGTGTAGAAA-AAAAA-GTT-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-atc
gi|33 : ttA--AAGC-AGTTTTAGAAGACA-TATA-TTA-C----------CACATGT--GTGCTT-TT---T-AA--AAA-----------GTTCGG-TGCATCTATA-TAC--A--AGGGAA--AACA---G
gi|35 : ccGCTTTT-TAT-TGTGA--------------------CAC--AT---C---TATATA--TCGCGATTAG--TTTCA-T----GA-TAGTCA-AATTA-TGGATGC-----C-AAT-------A-------CCTTTTA-GCAA
gi|36 : aTCAGAAAA-TTAGCACAA--T-----TA-AACTG-T-GT-A-A-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCAACC-GT-------CGTAGA
gi|38 : cagccgttgcgcaaA----TGTCGCATATAA-GAAAC----------TAACCTACATAATGCG--ATA-TGT-CGT
gi|4 : CTCAGAAAAATAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-AT-------TGTAGAAT-GAAAA-A-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-TCA-TTTTAAGT---ATATGT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-TTC-CAT----TGAA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAG--AAAA-C----TATTA----------------AA--AA--TA-T-G--AT--G-A---GCCA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C--------AA--------T----------A--------A---T-----T---------TTT----T--T----GGTAA--AAAC-AGTTTTAGAAGACA-TATA-TTATCAT-ATATTATCATATAT--GTGTTT-TT---G-AA--AGA-----------GTATGA-TACTTCTACA-TAC--A--AGGGAA--AACT---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAAAAATATT-----TTTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--G---------C---------GTA-A---C---------AGTTTT--TAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---CGT-TAA-T--TTC---TT---AAGATC--AAT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----C---AAATA-AC-----AA--AAAAATA-TTGCCATAAAGTTT--TTAAAATTAAA----TGTCGCATATAA-GAACCTAATAGGTTATAACCTACATAACACGTGTTCTTGTACATAATG----TA---G---C------------AAT---TATATA-AT----ATGGA--TTTCA-AGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCCCATGC-TA----ATTATTTTCTTGAACAGA---TTTAAA-ACG--TAA--ATGAATTCTAATCTCCGTTATTACAACCTCCATAATGAACGTTTTAAAAAAA---AGTCCCCGAAACAAAATGACTGGGTGGAATTACAT------CGGCGGAAATCAAT-A--------TATATGTGAGGCACAC---GCTCTATCATCAAAATGGAAT
gi|5 : CACAA--T-----TA-GCCTA-C-AT-A-C-C-TCTGTCCTG-TCGC--AGGCATATCATGA-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGCACATGCGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTTAAGT---AT-------TATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-TTT-CAT----TGAA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAG--AA---T----TTTTTAAAAATATGATAAGCCAA--AA--TA-CCG--AT--GTC---GCCA--ACACC------G--AAACAA-ATGTTTCCTTTTTAGNN--N----NNNN-NNNTC-GC--C--------AA--------C----------ACAGAAACAAATGT-----T---------TCC----T--T-------------------TTTAAAAGAGA----------CAT-GTATTATCATATAT--GTGTTT-CT---G-GA--AGA-----------GTATGA-TGCTTCAACA-TAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATGAAATTATT-----TTTTCA--CTCT--------TT-GTA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--GGATAACCTCC---------ATA-A---C---------AGTTTTT-TAGTG--CATCTA-------TC-T-TAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGA------ATAT--------CATCAA----AAATT---CGT-TGA-T--TTC---TT---AAAATC--AAT--ATT-TTAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGTCATTAC---AAGTA-ACAA---AA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAAAC----------TAAACTACATAACGCGTTT---TGT-CGTGATG----TA---G---C-CCCCAT--GTGAACTAATATGTA-AT----ATTGA--TCTCG-TGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGAATGCAATATTAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCTCATAC-TA----ATAATTTCCTTAAAAAGA---TTTAAA-ACG--TAA--ATGAATACTAACCTCCATTATTACAACCTCCATAACAAA---TTC-GAAAAA---CATTCCCAAAACAAAAGGTCTGGGTGAAATTTCAT------TGGCGAAAATCAGT-A--------TATATGTGAGGTA
gi|6 : tTTGTGATTT---ATT-TTT-CAT----CGAA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAG--AAAA-C----TTTTT----------------AA--A---TA-T-G--AT--A-A---GCCA--A-ATT--T-TTT--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C--------AA--------CGCAAAAAC--A--------AATGT-----T---------TCCGTATT--T----G-CCA--AAGC-AGTTTTAGAAGACA-TAT-----------T-TTATCATATAT--GTGTTT-TA---A-AA--AGA-----------ATTTGA-TGCATCTACA-CAC--A--AGGGAA--AACA---GTAACAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAGAAATATTC----TTTTTA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATATAG---------C---------GTA-A---CCTCCGTTACAGTTTTTTTAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AA-T---TGT------ATAT--------CATCTG----AAATA---CGT-TAA-T--TGC---TT---AAAATC--AGT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AC-----AA--AAAAATG-CTGCCATAAAAGTT--GAAAAATTGAA----TGTCACATATAA-GAAAC----------TAACCTACAGAACGCATTT---TGT-CGTGATG----TA---G---C-CTGGACCTGTAAAC---GATATG-AT----ATTGA--TTTCA-TGATGGA-TAGTC--ATTTT-GGGGTGC-----CAAATA------A-------T-------------ATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTC----------------------------TGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCAATAACAAA---TTT-AAAAAA---CGTCCCAG-AACAAAATGTCTAGGTACAATTTCAC------AGATGGATATCAAT-A--------AATATGTGAGGCAGAC---GCTCTCTCGTCAAAATGCAAT
gi|7 : ATTGCAACCTCCGTAATGAA--TTTgccaatgcatgtttaaaactgttgttactaaca
gi|8 : ctgtcggttaaacatattgacatacgtgttacgtaggtgcgaagaaaaattacttgttaatacaacccccaaacttatatactttctagtttttacaatcaatgaatactattatgtgatcactaataccttgatcttttctttatttatacctcactgaactattgcattggaaaagT-A--------TATATGTGAGGCA-ACTGTGTCTTTTCATCAAATTGGAATcatgacacattcatataccatatgtgctaaatctccatctgtgcatattttgtaagaacaaaacaacattgtgacaatcaagtgacacatttaatttcattactcttctggtatttgcccaaagttgattagtatttatgttttatttttaaaatatattacaacctccgtaacatgtgtaaatatatcttcttccaattggataaattgtttaaataacaagtattataaaacaagatcgatgccatgaatttcgaaatctcagtacggaatatggctttatgacccattgtattgatttttattaacttaatcaaaatgctatagttgttaatcatatttattagcaatgtaaattttcagatgcctatcaatataaattagttaacatacttttatctgtttatcagaagttgtaaatacaatcctaaaaataaacaataaatcaatagatcaatgaaacttactgtaacctgatgatagtataattattcaaccttcgtaacaaaatagcaccttttttgtacagctggattaaaaatctg
gi|9 : agtCTCAGAAAA-TCGGCACAAATT-----TA-GCCGGAT-GT-A-CTC-T-------G-TCGCCGAATAATAGCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAACG-TTATCT---T-TGAATAATG-AA---GTTGGCGTTACGATTTTAAGC--------T-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-TTTTCAT----TAAA---ATG-CATTCA---TTGAACAAGGTAAAA-CGTT-TTTTG----------------AA--AA--TA-C-GGTAT--A-A---GC-A--A-ACT--T-TTG--AAA-AGCGC----C--------AA--T----ACTG-ATGT--GC--C--------AA--------CCACAGAAAACA--------AATGT-----T---------TCC----T--TTTTTG-TCA--AAGC-ATTTTCAGAAGACAATATA-TTG--ATCATATTAT------T--GTGCCT-TTAGAG-AA--AGA-----------GTATGA-TGGCTCTACA-TAC--A--AGGGGA--AGCC---GTATCatgttcaatgctttcaactgttgttactaaacttttaacctcaggtatacatatattttttttataatgtaagttacttaaacttcacatgtcagtttcattacatactacatttattgattgttttattgcagtattttttttcacattttttttttttttactatgacttactcatcttgttgttattgtggtgtgtgttgaatttactgccgtgttaaacttattttgaatacccgttacgtagtagagaataaaagtggcatgttgattaacccaagcaatcatattacttttccaatttctacacttcaatatttcatctttttttgatcactataatacctgtgattatatttttttatttatacttattgaactatatagtatcgtaattaaagaggttatccgttagcgagttgcaatctgacacatttataccacgtgtgctaagtttccatctatgtgtttttcgtatgagcagaaagaacagtatgacattaaatttaattgatacttttaatttattttgacatccgctctttgtccctaagaaatagcgtttttgttttatttcaatatgaatatcaattttaatctcaacag
gi|9 : cagtcatttT--GAT-AA-T-GTA--GGTATG--AAGAATTATG-AA--AG-T---TGTACTTGCATAT--------CATCGG----AATTAAACCAT-TAATT--TTC---TT---TAGATC---AT--ATT-TCAA-ATAT-tagccgtgtggctcgctatctatactttggaatctgtagttcttgtcttctttatcttctctattgcagtgttacccatatctttcaggcccggtcttagggtctaacccaccgtctttccggctccagaccagtacagtgtcatccttcaaatgtcctgataatgtaggtatgaagaattatgaaagttgtacttgcatatcatcggaattaaaccattaattttctttagatcatatttcaaatat
blockSeqs : A AT ATAAT C A C T . T A CTGTCCT A CG A TATGCAG . C T T ACA G A . TGG TA A CAAGTTACATG T TAT AT GT GA TTT A T CATA GGT . CGT T C GT C CTTT TAAAAATATGATAAGCCAA TT GT GT GGATG CC C AG A TT C T GTTT TTTTTA CC TATT G A . AACCAGGTTGAATATCAATCTGCGGTCCTGCTG C GC A A TATTATCATATATTATCA CA A AGA . TT TGGATTATATT A T A G CA GG AT TTT AAT G G A TTGGG . ACGGCTGG T T A AC TAGCGTAACCTCCGTTACAGTTTTTT GT GT TTTTTGT . T TA . A G GC A T AA GT T TTC ACTTGC GTTAAGTCT GGCGTA AAC A T AG TTTTAG TA GT G T A C GTGGAG CATTAC C CACAA GA C GA AAAT G C TAATAGGTTA TCTTG A GTGATGGGTTCTCCACGT G TAA T CGCG AT T GATG T TT G AATAT TTGGCTAAATTAAT CC GT A A AATT A A TTTTAAAAGATCAAGT A CGTTTTA . A C AGTTTCC T . TGTACCTG G TGT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . . . . . . . G . TAAGTATATG . . . C . . . . . . . . . . . . GTT GGTTTTGGAT . CC . TCCA . . . . . . C . A . . . . . AACCACAGAAAACAAATGTTTCCTTTTTTG A . . . TATTGATCATATTAT . . . . . . A . C . . . . . . . A A C . CT . . . . TTGCTTTAATCTGTAGGCATTTTT . CC . . . . . . . . A . A . . . . AA GG C . . . TCGTTA . . . . . . . CGAG . TACA . . . . . C . TTTA . TAGCCTGGACCT G . . . . . GATA . A . T A CC A A . . G A TTTAACATGTTA A TTT . G C A T . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . TAAGCAT . . . . . . . . . . . . . . . . A CCAGG . T . GTC . . . . . . . . A . . . . . AGCACAGAGAGAAATGTATCATTTTCTT A . . . CATGTATTATCA . . . . . . T . T . . . . . . . A G . . . . . . . GCGTAACCTCCTAACATTTTTCT . CT . . . . . . . . A . A . . . . C GG . . . . TTA . . . . . . . C . AA . . . . . A . TATG . TAGCCTGGACCT A . . . . . GATA . . . . A CT A A . . G C TTTAAAACGTAA G TTC . A G C A . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . TAAGTAT . . . . . . . . . . . . . . . . . AAA . C . AA . . . . . . . . C . . . . . AACACAGAAGCAAATGTTTCCTTTGTTG G . . . ATATATAATCA . . . . . . T . T . . . . . . . A A . . . . . . . GGATAACCTCCATAACAGTTTTT . CT . . . . . . . . A . A . . . . C GG . . . . TTA . . . . . . . T . . . . . . . G . TTG . CAGCTTTTTAT G . . . . . GATA . . . . A CC A A . . A A TTTAAAACGTAA A TTT . A A T A . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . TTAAG . . . . . . . . . . . . . . . . . AAA . C . AA . . . . . . . . A . . . . . AACGCAAAAACAAATGTTTCCGTATTTG T . . . CATTAATTAT . . . . . . A . A . . . . . . . A . . . . . . . . GCAATGTCTCCGTAACAGTTTT . CT . . . . . . . . A . A . . . . C GG . . . . TTA . . . . . . . C . . . . . . . A . TC . CAGCTTTTAT G . . . . . GATG . . . . A CC G A . . . . . A T . . C A T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . TTACG . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . C . AA . . . . . . . . A . . . . . AACACAGAAACAAATATTTCCTCTTTG A . . . TATTACCA . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . GCTTCATCTCCGTAACAGT . CT . . . . . . . . A . A . . . . C AA . . . . TTA . . . . . . . C . . . . . . . A . TC . TAGCCCCCAT A . . . . . . . . . . A C G A . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . TAAGC . . . . . . . . . . . . . . . . . GAA . T . GA . . . . . . . . G . . . . . AACACAGAAACAAATGTTTCCTT C . . . TTTTATCA . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . TTTCAAATCCCGTAC . CT . . . . . . . . . . A . . . . C TG . . . . TTT . . . . . . . C . . . . . . . C . TG . TAGC . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . TATT . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . T . AA . . . . . . . . A . . . . . AAAAAAAGTTCCCTCGTG C . . . AACATCA . . . . . . A . A . . . . . . . . . GCGTAACAGTTTT . G . . . . . . . . . . A . . . . C GG . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TG . CAC . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TACG . . . . . . . . . . . . . . . . . C . C . AA . . . . . . . . A . . . . . AATAATTTTTTTGG . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TG .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG .
blockSeqCons : *** **** AA****** A***** ** ATTATTATCA********** A* ** ** GCGTAATCTCCGTAACAGTTTTT************************* CT ** A* *** C******** GG**** ** TTA****** TG*** CAGCCTACT************** TTT**** ***
originalCons : CTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTTAAGT---AT--GT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-TTT-CAT----TGAA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAG--AAAA-C----TTTTN----------------AA--AA--TA-C-G--AT--A-A---GCCA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C--------AA--------C----------A--------AATGT-----T---------TCC----T--T----G-TNA--AAGC-AGTTTTAGAAGACA-TATA-TTA-CAT-ATATTATCATATAT--GTGTTT-TT---G-AA--AGA-----------GTATGA-TGCNTCTACA-TAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAAAAATATT-----TTTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATA--G---------C---------GTA-A---C---------AGTTTT--TAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATG-AA--AG-T---TGT------ATAT--------CATCGG----AAATA---CGT-TAA-T--TTC---TT---AAGATC--AAT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AC-----AA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAANC----------TAACCTACATAACGCGTTTTC-TGT-CGTGATG----TA---G---C-CTCCAC--GTGAAC---TATATA-AT----ATTGG--TTTCA-TGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTTGAAAAGA---TTT-AA-ACG--TAA--ATGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCCATAACGAA--TTTT-AAAAAA---CGTCCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGACGGANATCAAT-A--------TATATGTGAGGCAGAC---GCTCTTTCGTCAAAATGGAAT
finalCons : CTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTTAAGT---AT--GT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATT-TTT-CAT----TGAA---ATG-CATTCA---T-GAA-AAG--AAAA-C----TTTTN----------------AA--AA--TA-C-G--ATAA------GCCA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CCA-----AAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C--------AA--------C----------A--------AATGT-----T---------TCC----T--T----G-TNA--AAGC-AGTTTTAGAAGACA-TAATTATTATCA----------TATAT--GTGTTT-TT---G-AA--AGA-----------GTATGA-TGCNTCTACA-TAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATCA-TATAAAAATATT-----TTTTCA--CTCT--------TTTGCA-G-T-TGTCG--CAAGTTATAGCGTAATCTCCGTAACAGTTTTT-------------------------TAGTG--CATCTA-------TC-T-CAATT--GAT-AA-T-GTA--GGTATGAAAAGAA-TATGA-A--AG-T---TGT------ATATC--------ATCGG----AAATA---CGT-TAA-T--TTCTTA------AGATC--AAT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----C---AAGTA-AC-----AA--AAAAATG-CTGCCATAAAGTTT--GAAAAATCAAA----TGTCGCATATAA-GAANC----------TAACCTACATAACGCGTTTTG---T-CGTGATGCAGCCTACT--------------GTGAAC---TATATA-AT----ATTGG--TTTCA-TGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTTGAAAAGA---TTT-AA-ACG--TAA--ATGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCCATAACGAATTT----AAAAAA---CGTCCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGACGGANATCAAT-A--------TATATGTGAGGCAGAC---GCTCTTTCGTCAAAATGGAAT
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): CCATATGTGCTAAATCTCCATCTCTGTGTGGGTTTTTTTTAACAAACAACAGTATAACATTCAAGTGATCCATTTAATTTTATTACACTTCTTGTCTTTTGTTCTAAGGTGAATAGTGTTAATGTTTTATTTCCAATATGTATTACAACCTCCGTAACACATAGCAATACCTCTATTTCCAATTGGATAACTTCTTTGAATAATAAGTAATGTAAGACAAGATCGATGGCATGGATTTCAAAATCTCAATACAGAAAAATGGCTTTACAACCCATTATAGTATTTTTTTAGAATTTAATCAAAATGTTACGGAGGTTACTCATATTTAATAGCTAAGTAATTTTTCAGACGTCTAGCAATTACATAAGTTAACATACTTTGATCTTTTCATAAAAATTTGAAAATACAATTCTAAAAAGAACCAATAGATCGATGAAACGTA
Unaligned ( gi|17 ): TAAGGCCTGTGGGCCTCTTGTTTAAAGAACTTAATCAAAATGTTACTGAGGTTACTCATATTCAATAGCCAAGTGAATTTTCAAAAATCTAGCAATTAAAATAAGTACATGTATTATACTTTGATCTTTTTTATCAAAATGTGAAAATACAATCCTAAAAAAGAACCAATAGATCGATGAAACGTACTGTAAACTGATGGTGGAATCATCATTCAACCTCCGTTACAAAATAGCACCTTTTTTGTTCAACTGGAATAAAAATCTTATATCACTGAAACTAATTGGAATATGTT
Unaligned ( gi|19 ): TTTATTTCCAAAATCTATTATAACTTCTGTAACACATTGAAACATCTGTAAATTGTTTGAACAATAAGTATTGTAAGACAAGATCAATGACATGAATTTCGAAATCTCAATTCGGAAAAATGGTCTTATAACCCATTGTAGTATTTTTTTAAAGAACTTAATTAAAATGACTGGGTGGTTACTTATATTTACTAGCAATGTAAATTCTCAGATGTCTAGCAATTTTAGTAAGGTTTTTTTATCAGAATTTGAAAATACGACCCTAAAAAG
Unaligned ( gi|20 ): TCATATTTAATGACCATGTAAATTTTCAGATGTCTAACAAATGAAATAAGTTAACATACTTTGATCTTTTTATCAAAATTTGAAAATACAATCCTAAAAAGAACTAATTGATCAATGAAATGTACTGTAAACTGATGGTGGAATCATTATTCAACCTCCGTAATAAAATAGCACATTATTTGTTGAGCTGGAATAAAAATCTGATGTCACTGAAACTTATTGGAATGTGTT
Unaligned ( gi|21 ): TTTTCAGATGTCTATTGATTGATACAAGTTAAAATAATTTGATTTTTTACCTGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATGGAAAATCAATCCAAAAAGAACAATAGACCAAATAAAGTTTTTACCGGGAGTTGTAACTGATGCATGTCCATTATTCAAACCTCCGTAATAAATAGCCTTTTTGTCTCATGGAATAAAAATCTGATATACTGAAACTTATTGGAA
Unaligned ( gi|24 ): GAATATCTATCATAATCTCCGTAACACGTAGAAATGTCTTTAGTTCCAATTGTTTGAACAATCATTATTATTGTAAGACTTGATTTCAAAATCTCAATGCGGAAAAATGGCTTTATAATCCATTGTAATGATTTTTTCATGGTTTTTTAAAGAACTTAATTCAAATGTTACGGAGGTTACTCATATTTACTAGCA
Unaligned ( gi|25 ): CAACTGTTGTTACTAACATTTTAACCTCAGGTATACATGTATTTTTATATCATGTAAAGTTACTTAACTTCACAATGTCAGTTTCATTACATACTACATTTATTGATTTTATTGAGGTATTTCATCTGGGTTTTTTACTATGACTTACTTCGTCTTTTGTTACTAC
Unaligned ( gi|28 ): TATACTTTTTTTATCATGTAAAGTTACGTAACTTCACAATGTCAGTTTCATTACATATTACATTTATTGATTTTATTGCGGTATTTCATGGGTTTTTTTTTTTTACTATGACTTACTTTCGTCTGTTGTTATTATGATG
Unaligned ( gi|30 ): TGGCACATTTATACCATGTGTGCTAAATATTCATCTATGCGTATTTCGTGTGAACAAAACAACAGTACGACATTTAATCGATTCATTTAATTTCATTGCACTTTAGGTCTTTTGTTCGAAGGTGAAT
Unaligned ( gi|31 ): TCTTTTCATCAACTATCTATTATATGGAATACTGTAGGTCATGGTTTAACCAACTGTTATTACTAAACATTTTTAACCTGCAGTATACATGTAAATTTTTATATCAT
Unaligned ( gi|34 ): AAAAAAAAACCCCCACAATTTATGTATTTATTTTTCTTTGTTTATTCATGTATTGTAGTGAGTGGGAGAAAAAAAAAAAA
Unaligned ( gi|37 ): ACATGTTGATATCGTCTAAATTGTTTGAACAATAAGTATTGTAAGACNATACAATGTATGATGATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111 1111111 2222222222222 111 111 2222 44444444444444444444444444 11111111 111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4444444444444 11111111111 1111 22222222 11 11111 222222222222 111111111 11 1111111111111 222222222 11 11111111 111111 11111 22222 1111111111 1111111 55555555555555555 11 11111 11111111111111 1111 44444444444444444444 11111111 2222222 22222222 111
lowQualScore : 5 55 99999 3 3 3 3 3 3 3 1111111 3 55 3 8888888 4 4 4 4 777 4 4 4 777 44 4 7777777777777 4 777 55 99 55 000 3 3 7777 666 3 000 3 55 3 1111 66666666666666666666666666 55 444 55 33333333 55 4 55 4 55 4 8 7777 000000 55 8888 4 4 55 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 4 1 55 3 2 1111111111111 4 8 4 55 0 4 777 4 55 99999999999 3 4 1 4 55 55 55 777 888 5 5 5 6 6 2222 66 55555555 4 4 4 22 8 66 66666 777 4 0 666666666666 66 3 555555555 11 8 4 55 7 4 44 55 5555555555555 222222222 999999 777 4 4 4 11 88888888 0 55 55 3 7 2 3 5 444444 22222 888 4 66666 66 4 66 8888 4 1 7777777777 777 3333333 4 9999 00000000000000000 4 777 4 777 4 9999 66 4 9999 4 00 4 55555 88888888888888 44 77 1 6 4444 8 1 55555555555555555555 1 11111111 888 7 0 4 0000000 1 5 00000000 6 111 0 0
lowQualScore : . .. ..... . . . . . . . ....... . .. . ....... . . . . ... . . . ... .. . ............. . ... .. .. .. ... . . .... ... . ... . .. . .... .......................... .. ... .. ........ .. . .. . .. . . .... ...... .. .... . . .. ............................................................................ . . .. . . ............. . . . .. . . ... . .. ........... . . . . .. .. .. ... ... . . . . . .... .. ........ . . . .. . .. ..... ... . . ............ .. . ......... .. . . .. . . .. .. ............. ......... ...... ... . . . .. ........ . .. .. . . . . . ...... ..... ... . ..... .. . .. .... . . .......... ... ....... . .... ................. . ... . ... . .... .. . .... . .. . ..... .............. .. .. . . .... . . .................... . ........ ... . . . ....... . . ........ . ... . .
lowQualScore : 0 00 11111 6 6 6 6 6 6 6 8888888 6 00 6 2222222 0 0 0 0 000 0 0 0 000 33 0 2222222222222 0 000 55 55 55 000 6 6 7777 444 6 000 6 00 6 4444 77777777777777777777777777 55 444 55 33333333 55 0 55 0 55 0 0 7777 333333 55 5555 0 0 55 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 00 6 1 8888888888888 0 0 0 55 7 0 000 0 55 00000000000 7 0 0 0 55 55 55 000 888 0 7 7 0 7 1111 99 00000000 4 4 4 22 9 11 00000 666 6 1 444444444444 11 9 111111111 00 0 0 55 3 0 88 55 1111111111111 666666666 222222 000 0 0 0 00 22222222 4 55 00 6 3 1 6 0 444444 55555 888 4 77777 11 4 11 5555 0 0 5555555555 000 0000000 0 9999 55555555555555555 4 888 4 888 4 4444 11 4 7777 4 66 4 66666 22222222222222 00 11 8 7 2222 9 3 77777777777777777777 1 00000000 888 1 3 3 2222222 0 7 77777777 7 777 3 7
consensus : CTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTTAAGT---AT--GT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-TTTCAT----TGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AAAA-C----TTTTN-------AA----------------AA--TA-C-G--AT--A-A---GCCA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C----------A--------A--------C--------A--------AATGT-----T---------TCCTT--T--TG-TNA--AAGC-AGTTTTAGAAGACATA-------AT-TA-TT-ATCATA-TA-T--GTGTTT-TT---G-AA--AGA-----------GTATGA-TGCNTCTACA-TAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATC-A-TATAAAAATATT-T----TTTCA--CTCT--------TTTGCA-GT-T-GTCG--CAAGT-TATA--GCG---TAAT--CTCCGTAA-CAGTTTT-TTAGTG--CATCTAT-------C-TCAATT--GAT-AATG-TAG--GTATGAAAAGAA-TATG-AA--AGT---T-GT------ATAT--------CATCGG----AAATA---C-GT-TAA-T--TTCT---T---AAGATC--AAT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----CAAG---TA-AC-----AA--AAAAATGC-TGCCATAAAGTTTGA--AAAATCAAA----TGTCGCATATAAG-AANC----------TAACCTACATAACGCG---TTTT-------GT-CGTGATG---CAG---C---CT--A---C-T-GTGA---A-C---TATATA-AT----ATTGG--TTTCA-TGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTTGAAAAGA---TTT-AA-ACG--TAA--ATGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCCATAACGAA--TT-T--AAAAAA---CGTCCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGACGGANATCAAT-A--------TATATGTGAGGCAGAC---GCTCTTTCGTCAAAATGGAAT
Reference ( family-4814 ) : CTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTTAAGT---AT--GT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-TTTCAT----TGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AAAA-C----TTTTN-------AA----------------AA--TA-C-G--AT--A-A---GCCA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C----------A--------A--------C--------A--------AATGT-----T---------TCC----T--TG-TNA--AAGC-AGTTTTAGAAGACATA-------AT-TA-TT-ATCATA-TA-T--GTGTTT-TT---G-AA--AGA-----------GTATGA-TGCNTCTACA-TAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATC-A-TATAAAAATATT-T----TTTCA--CTCT--------TTTGCA-GT-T-GTCG--CAAGT-TATA--GCG---TAAT--CTCCGTAA-CAGTTTT-TTAGTG--CATCTAT-------C-TCAATT--GAT-AATG-TAG--GTATGAAAAGAA-TATG-AA--AGT---T-GT------ATAT--------CATCGG----AAATA---C-GT-TAA-T--TTCT---T---AAGATC--AAT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----CAAG---TA-AC-----AA--AAAAATGC-TGCCATAAAGTTTGA--AAAATCAAA----TGTCGCATATAAG-AANC----------TAACCTACATAACGCG---TTTT-------GT-CGTGATG---CAG---C---CT--A---C-T-GTGA---A-C---TATATA-AT----ATTGG--TTTCA-TGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTTGAAAAGA---TTT-AA-ACG--TAA--ATGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCCATAACGAA--TT-T--AAAAAA---CGTCCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGACGGANATCAAT-A--------TATATGTGAGGCAGAC---GCTCTTTCGTCAAAATGGAAT
gi|1 : -AC-----AA--AAACATGC-TGTCATAAAGTTTGA-----------------TCACATATAAG-AACC----------TAACCTACATAACGCG---TTTT-------CT-CGTGATGTACCGGTATC---CT--C---C-TTGTGA---A-C---TATATA-AT----ATTGA--TTTCA-TGCTAG-----TC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTA-AC-AAAATCCCATGC-TA----ATTATTTTCTTGAAAAGACATTTT----ACG--TAA--ATCAATTCTAACCTTCATTATTACAACCTCCATAGCGAA--TTAT--AAAAAAAAGAGTTCCCGAAACAAAATGTCTGGGTGCAATTTCAT------CGATGGAAATCAGTAA--------TATATGTGAAGCACAC---GCTCTTTCATCAAATTGGA
gi|10 : tACAA--T-----TA-GCCTG-T-GT-ACC-C-T-------G-TCGC---AGTAAAGCTTGC-GT-------TGTAGAAAGGAAAA-G-T-AGCC---T-TGA--AAATGAA---GTTTG-GT-ACG-TTT--AGT---AT---T-AT--TTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTTA--A-TT-TTTCAT----T-AA---ATGCCATTCA---TGAG-AAA--GAAA-CG---TTTTA-------GA----------------AA--TA-C-G--AT--ATA---GTCA--A-ATT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-------AA--T-----CTG-ATGTC-GCAACACAGA-----A--------A--------C--------A--------AATGT-----T---------TCCTT--T--TT-TTC--AAGC-ATTTTCAGAAAGCATA----------TAGTT-A--ATAGTA-T--GTGCCG-TT---ACGA--AGA-----------GTA-GA--GCTT-TAC--TAC--A--AGGAAA--GCCA---GTACCAT---TGGGAC--TCGATC-ATTATTGACATA-T-T----TTTCACTCTCT--------TTTGCA-GT-T-GTCAACCATGTATATT--TCA----AAT--C-CCGTA-----------CAGTA--CAT-GAT-------CTTCAATTTAGGTAAATG-TAG--GTATG--AAGAA-TATG--A--AGTTTCT-GC------ATAT---------ATC-------AATA---C-GT-GAA-TAGTTCT---TTTAGAGCTC--AAT--ATT-TCAATATAT-Cggatcaatgtttaacactaacatcttaaccttcggtatatgtacatgtatattttatatcatgtaaagttacttaacttcacaatgtcaatttcattatatactacatttattaattgtattgatgtatttcatctgttttttactatgacttacttcgtctgttattattacggtgtagtatgaatttcctgtattcatattggcacatctgttacgtaggcgagaatacaagtgggatgttgatatagccccaaaaatatatatacattccactttctacattcaacattatctattttgatcactaataccttgatccctttttatttataccttactaaactattgtatacgtattagagaagatacccgttacggagattacaatcatgacacatttatactatgcgtattttgtatgagcaaggtaacagtttgacataaatggatttgatacatttaattttatggcacttctggtcttttgtcttaagaagaatagcatttatgttttatttctaatatgaaaatctattatcacctccgtaacaagtagaaatacctccagtctaattggataaattgtttgaacaataagtattgcaagacatgattgatgacatgattttcaaaaaatggctatataacccattgtaacgattttttagaacttaattaaaatgttacagaggttactcatatttaatataagttaatataatttgattttttatcagaatttgaaaataactgtacaatcatcaaaagaaccaatagaccaaagaaacgcactgtaaactaatggtggtatcattattcaacctccgtaacaaaatagcatattttttgttcagttggaataaaaatctgatatcactgaaacttattgacacat
gi|11 : gtcattctaaaaatctcaTTCA--CTCT--------TTTGCA-GT-T-GTCA--CCAGT-TATA--GCT---TCAT--CTCCGTAA-C---------AGTA--CATGTAT-------C-TCAATT--GAT-AATG-TAG--GTATGtt
gi|11 : T--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGTAAA------TAT-----CAAG---TA-ACCACAAAA--AAAAATGC-TGCCATAAAGTTTGA--AAAATCAAA----TGTCGCATATAAG-AACC----------TAACCTACATAACGCG---TTTT-------CT-CGTGATG---CAG---CTT-TT--A-----T-GTGA---A-C---TATATA-AG----ATTAG--TTTCA-T----GA-TAGTC--AATTA-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTA-GCAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttattttctttgattattcatgtattgtaatgagtggggaaaaatataaatacatgtatttcaaatatcgggtaaatatcaagtaaccacaaaaaaaaatgctgccataaagtttgaaaaatcaaatgtcgcatataagaacctaacctacataacgcgttttctcgtgatgcagcttttatgtgaactatataagattagtttcatgatagtcaattatggatgccaaataaccctttagcaaa
gi|12 : ttcactcttttgcagttgtcaccagttatagcttcatctccgtaacagtacatgtatctcaattgataatgtaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttattttctttgattattcatgtattgtaatgagtggggaaaaatataaatacatg----TTTCA--CTCTCT------TTTGCA-GT-T-GTCAACCATGTATATT--TCA----AAT--C-CCGTA-----------CAGTA--CAT-GAT-------CTTCAATTTAGGTAAATG-TAG--GTATG--AAGAA-TATG--A--AGTTTCT-GC------ATAT---------ATC-------AATA---C-GT-GAA-TAGTTCT---TTTAGAGCTC--AAT--ATT-TCAATATAT-C
gi|12 : AAATT--AATGTATT-TCAA-AT-T-CG-GGTAAA------T-------CAAG---TA-ACTACA-AA--AAAAATGC-TGCCATAAAGTTTGA--AAAATCAAA----TGTCGCATATAAG-AACC----------TAACCTACGTAACGCG---TTTT-------CT-CGTGATG---CAG---CTTTTT--A-----T-GTGA---A-C---TATATA-AG----ATTAG--TTTCA-T----GA-TAGTC--AATTA-TGGATGC-----CAAATA------A-------CC--TTA-GCAAAttcaattatatgtttctatgatgcagtgggattgcatggagagagaaagatgtgaaagtgtattgccaaaaaaaaattcccacaatgtttgtatttattttcttgattattcatgatattgtatggtggggaaaaatataaattaatgtatttcaaattcgggtaaatcaagtaactacaaaaaaaatgctgccataaagtttgaaaaatcaaatgtcgcatataagaacctaacctacgtaacgcgttttctcgtgatgcagctttttatgtgaactatataagattagtttcatgatagtcaattatggatgccaaataaccttagcaaa
gi|14 : tttcactctcttttgcagttgtcaaccatgtatatttcaaatcccgtacagtacatgatcttcaatttaggtaaatgtaggtatgaagaatatgaagtttctgcatatatcaatacgtgaatagttcttttagagctcaatatttcaatatatcttcaattatatgtttctatgatgcagtgggattgcatggagagagaaagatgtgaaagtgtattgccaaaaaaaaattcccacaatgtttgtatttattttcttgattattcatgatattgtatggtggggaaaaatatC----CC-----AAAA--T----GCCG-ATGTC-GC--C----------A--------G--------C--------ACAGAGAGAAATGTATCATT---------TTC----T--T--TCA--A-GC-GGTTTCAGAAGACATA-------ATATA-TA-ATCATA-TA-T--GTGATT-TT---G-AATTGAA-----------AT-TGA-TGCATCTACA-GAC--A--AGGGAA--AACA---GCAGCATAATTGGAAC-TTTAATA-G-TATAAGAATATT-T----G--CA--CTCT--------TTTGCA-GC-T-GTCG--TCATT-TACA--GC-----AATGTCTCCGTAA-CAGTTTT-T-AGTC--AATCCAT-------C-TCAATT--AAT-AATG-CAG--GTAGGAAAAGAA-TATG-AA--AGT---C-GC------ATAT--------CATAGG----AAATA---T-GTACAG-T--TTCT---T---AAAA
gi|14 : ttaaactCAGTTTCTTAAAAAGA---TTT-AACATG--TTA--GTTAATTATTAACTCCGTTACAACAACC-CCATAACAAA--T-------AAAA---CGTagatttaacatgttagttaattattaactccgttacaacaaccccataacaaataaaacgtatatgtataaaacatataa
gi|15 : ttaaactcccaaaatgccgatgtcgccagcacagagagaaatgtatcattttctttcaagcggtttcagaagacataatatataatcatatatgtgattttgaattgaaattgatgcatctacagacaagggaaaacagcagcataattggaactttaatagtataagaatatttgcactcttttgcagctgtcgtcatttacagcaatgtctccgtaacagtttttagtcaatccatctcaattaataatgcaggtaggaaaagaatatgaaagtcgcatatcataggaaatatgtaCTCAGATAA-TAGGCACAA--TATAATTA-ATCTG-C-GT-A-C-A-T-------G-TCGT--AAGTATA----GC-GT-------TATAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-AGA-TAAAT-AG---GTTGACTT-GCG-TTTTAAGC---AT---T-A-----------------------TTGTGATTT---A-TT-TTTCAT----TGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AAAT-C----TTTTT--------A----------------AA--TA-T-G--AC--A-A---GCCA--A-ACG--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C----------A--------ACACAGAAGC--------A--------AATGT-----T---------TCCTTTGT--TG-TAA--AAGC-AGTTTTAGAAGAC---------------------------A-T--GTGTTT-CT---G-AA--AGA-----------ATATGG-TGCCTCTACA-AAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATC-A-TATatatgtataaaacatataa
gi|16 : cattAA--T-----TACACCTG-C-GT-A-C-TAT-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GTGAT----TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTT---T---AA--GT-ATTAATT---AAT--CGC-T--A-TTGTG-TTT---A-TT-TTCCAT----TGAA---AGA-CATTCA---TGAT-AAG--AGAACC----TTTTA-------AA----------------AG--CC-C-A--AT--A-A----CCG--A-TTT--T-TTGTTTTG-GG-GC----CC-----CAAACCC----ACAG-A--------------------A--------A--------A--------A--------AAAGT-----T---------CCC----TCGTG-TAA--AAGCAAG--TTAGAAGACATA-------A---A--C-ATCATA-TA-CCAGTGTTT-CT---G-AA--AAA-----------GTATGATTGCTTCCAGA-TACCAA--AGGGGAATAATA---GTACAAT-----GGAC-TTTGAg
gi|18 : TCAGAAAA-TAGACACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TAA-TAAAT-GG---GTTGGCGT-GCG-TTT----T---AT--TT-ATTATCT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-TTTTAT----TTGA---ATG-CATTCA---TGAA-AAC--AAAT-CA---TTTTC-------------------------AA--TA-C-G--AT--A-A---GCTA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACTG-ATGTC-GC--CAACACAGA--A--------A--------C--------A--------AATAT-----T---------TCCTCT-T--TG-TGG--AAGC-AGTTTCAGAAGACAT--------AT-TA-T
gi|2 : agtcatttG---TA-AC-----AA--AAAAATGC-TGCCATAAAAGTTGA--AAAATTGAA----TGTCACATATAAG-AAAC----------TAACCTACAGAACGCA---TTTT-------GT-CGTGATG---TAG---C---CT--GGACC-T-GTAA---A-C---GATATG-AT----ATTGA--TTTCA-TGATGGA-TAGTC--ATTTT-GGGGTGC-----CAAATA------A-------T-------------ATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTC----------------------------TGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCAATAACAAA--TT-T--AAAAAA---CGTCCCAG-AACAAAATGTCTAGGTACAATTTCAC------AGATGGATATCAAT-A--------AATATGTGAGGCAGAC---GCTCTCTCGTCAAAATGCAATc
gi|22 : --AAAAAA---CGTTCTCGAAACAATATGCATGGGTGCAATTCCATAGTTTCCAACATATATGTAT-ATGTACCTGTATATGTGAAGCAGAC---GCTCCTTCATCAAAACGGAAgccaatgcatgtttaaaactgttgttactaacaacaatgttactgtttcattacattctacatttattgattttttaggtatttcatctgggtttttttttaaccatgacttacttcgcctgttgttattacggtgtagtatgaattttctgccggttaaacatattggcacacctcttacgtaggtgataataaaagcgacatgttattatagacccccaaattacatactttccaatttttacattcaatatcctactcttgtttgatcactactaaactattgtatacgtattgcagaagatatccgttacggaggttacaatcatgacacattttaaataccatatgtaccaaatctacatctccattttgtatgaagaaaacaacagtatgacattcaaatgatccatttaatcttattacacttctggtcttttgtcttaaggtgaatagtatttatgttttatttccaatatctattataacctccgtaacacatggaaatgcatgcctctacttccatttggataaattgtttgaataataagtattttaaaacaagaacaatggcatgtatttcaaaatcttaatacagaaaaatggctttataacc
gi|23 : ctgaCTCAGAAAA-TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGAATTTCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTT----T---AC--GT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-CTTCAT----TGAA---AAG-CATTCA---TGAA-AAG--AAAA-CCTTTTTTTC-------CAGG--------------AATTTC-C-A--GTTCC-A---ATTA--A-ACG--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAaatcaatgtgtaacaactgtctttactaacatcttaatctcaggtatgaatgaatatgatattccatataaagttagttaattttataacgccattgtttaattgcatgccgcattt
gi|26 : gtcattAAA-TAG-CACAA--T-----TA-GCCTG-CCGTTA-C-C-T-------GATCGG--AATT---TCTTGCAGT-------TGTAGAAA-----A-G-T-ATGA---T--GA-TAAAT-AGTGGGTTGGCGT-------TT---T---AC--GT-ATTATTT---AAAATCG--T--ATTTGTGATTT---A-TTACTTCAT----TGAA-----G-C-TTCA---TGAA-AAG---AAA-C----TTTT
gi|27 : tttcA-GTAT-GTTG--CAATA-TATA--GCG---TAAC--CTCC-TAA-CATTTTTCTTAGTG--CATCTAT-------T-ACA-TT--GAT-AATGGTAG--GTATGAAAAGAA-TATGAAA--AGT---T--T------ATATA-------AATTGG----AAATA---T-GT-GAA-T--T--------------TC--AAT--ATT-TCAA-A-ATACGCGGAAAA------TGT-----TA
gi|29 : A-TATG-AA--AGT---T-GT------ATAT--------CATCGG----AAATA---T-GT-TCA-T--TTC------------------------------------G-GGAAAA------TGT-----CAAG---TA-AG-----AAGAAAAAATGC-TGTCATCAAGTTTGA--AAATTCAAA----TGTTGCATATAAG-AAGC----------TGACCTACATAACGCG---TTTT-------GT-CGTG
gi|3 : TGGCAC-GTA-TTTCAAGTTACAT--GTTATTATTTTATAAA--TGGTTGAATTTGTTGTTTTTTA-TC-TTTTATCATATGAAGGTATG-CATTCACGTTGAA-ATG--GAAA-C----TTTTGGTTTTGGAT----------------AG--TAGT-G--AT--G-GATGGTCACCA-ACTAGTATTG--AAA-AATGT----CG-----GAAA--TTATTATCGGATGTCAGT--C----------A--------A--------CCAGGTT--G--------AATAT-----CAATCTGCGGTCC----TGCTG-TTAGCAAGC-ATGTTTGGAAGATAGAC------AT-TAATT-AT--TG-TG-T--GTGATTATG---G-AA--AGATGGATTATATTGTTTAT-TGCTT-TACAGTAC--AGGAGGGAA--ACCATTTATGCCAT---TGGGATGTTTTTTCTA-TAT-----TTTT-TGGGTTTTTA--CTCTACGGCTGGTTTGCATGT-TTGTTG--CAAGT-TATA--TTGCTTTAAT--CT--GTAGGCA-TTTT-TTAGTGGTCATCTATTTTTGTTC-TGCGTT--GAT-AATG-TAGCGGCATGAAAAGAA-TATG-AGGTAGT---TTGT------ACATGTTAAGTCTATCGGCGTAAAATA---CCGT-TAA-T--TTTTCGTT---AAGATCTAAAT--ATTGTCAA-TT-T-CG-GGGAAAGTGGAGTGT-----CGAGAGGTGCAC-----AA--AAACATGCCTGGCATAACGTTTGAGAAAAACTAAAAAATTATCGCATATAAGGAAAC----------TAACCTACATAACTCG---TTTTTGGTGTGAT-GGTGATG---GGT---T---CTCCA---CGT-GTGA---A-C---TATATATAT----ATTGGATTTTCGTTGATAGATTAGTCTTATCTTGTTGATGCT----CAAATATTGGCTAAATTAATCCCTTTGTACAAGAATCCCATACATAAATTATCTTTTCCTTGAAAAGAT--TTT-AA-AAGATCAAGTATGAATTCTAACCTCCATTA-TACTACCTCCAT-------------------A---CGTTCCCCGAACAAAATAGCTGGTTG-AATTTCA
gi|32 : CTCAGAAA--TAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TTGC--AAGTATATCTTGC-GTTATGCAGTGTAGAAA-AAAAA-GTT-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-atc
gi|33 : ttA--AAGC-AGTTTTAGAAGACATA----------TA-TT-ACCACA-TG-T--GTGCTT-TT---T-AA--AAA-----------GTTCGG-TGCATCTATA-TAC--A--AGGGAA--AACA---G
gi|35 : ccT--A---T-T-GTGACACATC---TATATA--TCGCGATTAG--TTTCA-T----GA-TAGTCA-AATTA-TGGATGC-----C-AAT-------A-------CCTTTTA-GCAA
gi|36 : agcttttTCAGAAAA-TTAGCACAA--T-----TA-AACTG-T-GT-A-A-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCAACC-GT-------CGTAGA
gi|38 : cagccgttgcgcaaA----TGTCGCATATAAG-AAAC----------TAACCTACATAATGCG---ATAT-------GT-CGT
gi|4 : CTCAGAAAAATAGGCACAA--T-----TA-GCCTG-C-GT-A-C-C-T-------G-TCGC--AAGTATATCTTGC-AT-------TGTAGAAT-GAAAA-A-T-ATGC---T-TGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-TCA-TTTTAAGT---ATATGT-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-TTCCAT----TGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AAAA-C----TATTA-------AA----------------AA--TA-T-G--AT--G-A---GCCA--A-ACT--T-TTG--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C----------A--------A--------T--------A--------A---T-----T---------TTT----T--TGGTAA--AAAC-AGTTTTAGAAGACATATATTATCATATA-TT-ATCATA-TA-T--GTGTTT-TT---G-AA--AGA-----------GTATGA-TACTTCTACA-TAC--A--AGGGAA--AACT---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATC-A-TATAAAAATATT-T----TTTCA--CTCT--------TTTGCA-GT-T-GTCG--CAAGT-TATA--GCG---TAA------------CAGTTTT--TAGTG--CATCTAT-------C-TCAATT--GAT-AATG-TAG--GTATGAAAAGAA-TATG-AA--AGT---T-GT------ATAT--------CATCGG----AAATA---C-GT-TAA-T--TTCT---T---AAGATC--AAT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----CAAA---TA-AC-----AA--AAAAATAT-TGCCATAAAGTTTTT--AAAATTAAA----TGTCGCATATAAG-AACCTAATAGGTTATAACCTACATAACACGTGTTCTT-------GTACATAATG---TAG---C------------------A---A-T---TATATA-AT----ATGGA--TTTCA-AGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGGATGC-----CAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCCCATGC-TA----ATTATTTTCTTGAACAGA---TTTAAA-ACG--TAA--ATGAATTCTAATCTCCGTTATTACAACCTCCATAATGAACGTT-TTAAAAAAA---AGTCCCCGAAACAAAATGACTGGGTGGAATTACAT------CGGCGGAAATCAAT-A--------TATATGTGAGGCACAC---GCTCTATCATCAAAATGGAAT
gi|5 : CACAA--T-----TA-GCCTA-C-AT-A-C-C-TCTGTCCTG-TCGC--AGGCATATCATGA-GT-------TGTAGAAA-GAAAA-G-T-ATGCACATGCGA-TAAAT-AG---GTTGGCGT-GCG-TTTTAAGT---AT-------TATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---A-TT-TTTCAT----TGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AA---T----TTTTT-------AAAAATATGATAAGCCAAAA--TA-CCG--AT--GTC---GCCA--ACACC------G--AAACAA-ATGTTTCCTTTTTAGNN--N----NNNN-NNNTC-GC--C----------AACACAGAAA--------C--------A--------AATGT-----T---------TCC----T--TT-TTA--AA---AG-------AGACATG----------TA-TT-ATCATA-TA-T--GTGTTT-CT---G-GA--AGA-----------GTATGA-TGCTTCAACA-TAC--A--AGGGAA--AACA---GTACCAT---TGGGAC-TTTGATC-A-TATGAAATTATT-T----TTTCA--CTC---------TTTGTA-GT-T-GTCG--CAAGT-TATA--GGA---TAAC--CTCCATAA-CAGTTTT-TTAGTG--CATCTAT-------C-TTAATT--GAT-AATG-TAG--GTATGAAAAGAA-TATG-AA--AGT---T-GA------ATAT--------CATCAA----AAATT---C-GT-TGA-T--TTCT---T---AAAATC--AAT--ATT-TTAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGTCATTACAAG---TA-ACAA---AA--AAAAATGC-TGCCATAAAGTTTGA--AAAATCAAA----TGTCGCATATAAG-AAAC----------TAAACTACATAACGCG---TTTT-------GT-CGTGATG---TAG---C---CC--C---CAT-GTGA---A-CTAATATGTA-AT----ATTGA--TCTCG-TGATAGA-TAGTC--ATTTT-TGAATGCAATATTAAATA------A-------CCCTTTG-GCAAAAATCTCATAC-TA----ATAATTTCCTTAAAAAGA---TTTAAA-ACG--TAA--ATGAATACTAACCTCCATTATTACAACCTCCATAACAAA--TT-C--GAAAAA---CATTCCCAAAACAAAAGGTCTGGGTGAAATTTCAT------TGGCGAAAATCAGT-A--------TATATGTGAGGTA
gi|6 : tTTGTGATTT---A-TT-TTTCAT----CGAA---ATG-CATTCA---TGAA-AAG--AAAA-C----TTTTT-------AA----------------A---TA-T-G--AT--A-A---GCCA--A-ATT--T-TTT--AAA-AA-GC----CC-----AAAA--T----ACCG-ATGTC-GC--C----------A--------A--------CGCAAAAACA--------AATGT-----T---------TCCGTATT--TG-CCA--AAGC-AGTTTTAGAAGACATA--------T-T--TT-ATCATA-TA-T--GTGTTT-TA---A-AA--AGA-----------ATTTGA-TGCATCTACA-CAC--A--AGGGAA--AACA---GTAACAT---TGGGAC-TTTGATC-A-TATAGAAATATTCT----TTTTA--CTCT--------TTTGCA-GT-T-GTCG--CAAGT-TATATAGCG---TAAC--CTCCGTTA-CAGTTTTTTTAGTG--CATCTAT-------C-TCAATT--GAT-AATG-TAG--GTATGAAAAGAA-TATG-AA--AAT---T-GT------ATAT--------CATCTG----AAATA---C-GT-TAA-T--TGCT---T---AAAATC--AGT--ATT-TCAA-ATAT-CG-GGAAAA------TGT-----CAAG---TA-AC-----AA--AAAAATGC-TGCCATAAAAGTTGA--AAAATTGAA----TGTCACATATAAG-AAAC----------TAACCTACAGAACGCA---TTTT-------GT-CGTGATG---TAG---C---CT--GGACC-T-GTAA---A-C---GATATG-AT----ATTGA--TTTCA-TGATGGA-TAGTC--ATTTT-GGGGTGC-----CAAATA------A-------T-------------ATCCCATGC-TA----ATCATTTTCTC----------------------------TGAATTCTAACCTCCGTTATTACAACCTCAATAACAAA--TT-T--AAAAAA---CGTCCCAG-AACAAAATGTCTAGGTACAATTTCAC------AGATGGATATCAAT-A--------AATATGTGAGGCAGAC---GCTCTCTCGTCAAAATGCAAT
gi|7 : ATTGCAACCTCCGTAATGAA--TT-T--gccaatgcatgtttaaaactgttgttactaaca
gi|8 : ctgtcggttaaacatattgacatacgtgttacgtaggtgcgaagaaaaattacttgttaatacaacccccaaacttatatactttctagtttttacaatcaatgaatactattatgtgatcactaataccttgatcttttctttatttatacctcactgaactattgcattggaaaagT-A--------TATATGTGAGGCA-ACTGTGTCTTTTCATCAAATTGGAATcatgacacattcatataccatatgtgctaaatctccatctgtgcatattttgtaagaacaaaacaacattgtgacaatcaagtgacacatttaatttcattactcttctggtatttgcccaaagttgattagtatttatgttttatttttaaaatatattacaacctccgtaacatgtgtaaatatatcttcttccaattggataaattgtttaaataacaagtattataaaacaagatcgatgccatgaatttcgaaatctcagtacggaatatggctttatgacccattgtattgatttttattaacttaatcaaaatgctatagttgttaatcatatttattagcaatgtaaattttcagatgcctatcaatataaattagttaacatacttttatctgtttatcagaagttgtaaatacaatcctaaaaataaacaataaatcaatagatcaatgaaacttactgtaacctgatgatagtataattattcaaccttcgtaacaaaatagcaccttttttgtacagctggattaaaaatctg
gi|9 : agtCTCAGAAAA-TCGGCACAAATT-----TA-GCCGGAT-GT-A-CTC-T-------G-TCGCCGAATAATAGCTTGC-GT-------TGTAGAAA-GAAAACG-TTATCT---T-TGAATAATG-AA---GTTGGCGTTACGATTTTAAGC--------T-ATTATTT---AAA--TG--T--ATTTGTGATTT---ATTT-TTTCAT----TAAA---ATG-CATTCAT--TGAACAAGGTAAAA-CGTT-TTTTG-------AA----------------AA--TA-C-GGTAT--A-A---G-CA--A-ACT--T-TTG--AAA-AGCGC----C--------AA--T----ACTG-ATGT--GC--CAACCACAGAAA--------A--------C--------A--------AATGT-----T---------TCCTTTTT--TG-TCA--AAGC-ATTTTCAGAAGAC--A-------ATATA-TTGATCATATTATT--GTGCCT-TTAGAG-AA--AGA-----------GTATGA-TGGCTCTACA-TAC--A--AGGGGA--AGCC---GTATCatgttcaatgctttcaactgttgttactaaacttttaacctcaggtatacatatattttttttataatgtaagttacttaaacttcacatgtcagtttcattacatactacatttattgattgttttattgcagtattttttttcacattttttttttttttactatgacttactcatcttgttgttattgtggtgtgtgttgaatttactgccgtgttaaacttattttgaatacccgttacgtagtagagaataaaagtggcatgttgattaacccaagcaatcatattacttttccaatttctacacttcaatatttcatctttttttgatcactataatacctgtgattatatttttttatttatacttattgaactatatagtatcgtaattaaagaggttatccgttagcgagttgcaatctgacacatttataccacgtgtgctaagtttccatctatgtgtttttcgtatgagcagaaagaacagtatgacattaaatttaattgatacttttaatttattttgacatccgctctttgtccctaagaaatagcgtttttgttttatttcaatatgaatatcaattttaatctcaacag
gi|9 : cagtcatttT--GAT-AATG-TAG--GTATG--AAGAATTATG-AA--AGT---T-GTACTTGCATAT--------CATCGG----AATTAAACC-AT-TAATT--TTCT---T---TAGATC---AT--ATT-TCAA-ATAT-tagccgtgtggctcgctatctatactttggaatctgtagttcttgtcttctttatcttctctattgcagtgttacccatatctttcaggcccggtcttagggtctaacccaccgtctttccggctccagaccagtacagtgtcatccttcaaatgtcctgataatgtaggtatgaagaattatgaaagttgtacttgcatatcatcggaattaaaccattaattttctttagatcatatttcaaatat
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): CCATATGTGCTAAATCTCCATCTCTGTGTGGGTTTTTTTTAACAAACAACAGTATAACATTCAAGTGATCCATTTAATTTTATTACACTTCTTGTCTTTTGTTCTAAGGTGAATAGTGTTAATGTTTTATTTCCAATATGTATTACAACCTCCGTAACACATAGCAATACCTCTATTTCCAATTGGATAACTTCTTTGAATAATAAGTAATGTAAGACAAGATCGATGGCATGGATTTCAAAATCTCAATACAGAAAAATGGCTTTACAACCCATTATAGTATTTTTTTAGAATTTAATCAAAATGTTACGGAGGTTACTCATATTTAATAGCTAAGTAATTTTTCAGACGTCTAGCAATTACATAAGTTAACATACTTTGATCTTTTCATAAAAATTTGAAAATACAATTCTAAAAAGAACCAATAGATCGATGAAACGTA
Unaligned ( gi|17 ): TAAGGCCTGTGGGCCTCTTGTTTAAAGAACTTAATCAAAATGTTACTGAGGTTACTCATATTCAATAGCCAAGTGAATTTTCAAAAATCTAGCAATTAAAATAAGTACATGTATTATACTTTGATCTTTTTTATCAAAATGTGAAAATACAATCCTAAAAAAGAACCAATAGATCGATGAAACGTACTGTAAACTGATGGTGGAATCATCATTCAACCTCCGTTACAAAATAGCACCTTTTTTGTTCAACTGGAATAAAAATCTTATATCACTGAAACTAATTGGAATATGTT
Unaligned ( gi|19 ): TTTATTTCCAAAATCTATTATAACTTCTGTAACACATTGAAACATCTGTAAATTGTTTGAACAATAAGTATTGTAAGACAAGATCAATGACATGAATTTCGAAATCTCAATTCGGAAAAATGGTCTTATAACCCATTGTAGTATTTTTTTAAAGAACTTAATTAAAATGACTGGGTGGTTACTTATATTTACTAGCAATGTAAATTCTCAGATGTCTAGCAATTTTAGTAAGGTTTTTTTATCAGAATTTGAAAATACGACCCTAAAAAG
Unaligned ( gi|20 ): TCATATTTAATGACCATGTAAATTTTCAGATGTCTAACAAATGAAATAAGTTAACATACTTTGATCTTTTTATCAAAATTTGAAAATACAATCCTAAAAAGAACTAATTGATCAATGAAATGTACTGTAAACTGATGGTGGAATCATTATTCAACCTCCGTAATAAAATAGCACATTATTTGTTGAGCTGGAATAAAAATCTGATGTCACTGAAACTTATTGGAATGTGTT
Unaligned ( gi|21 ): TTTTCAGATGTCTATTGATTGATACAAGTTAAAATAATTTGATTTTTTACCTGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATGGAAAATCAATCCAAAAAGAACAATAGACCAAATAAAGTTTTTACCGGGAGTTGTAACTGATGCATGTCCATTATTCAAACCTCCGTAATAAATAGCCTTTTTGTCTCATGGAATAAAAATCTGATATACTGAAACTTATTGGAA
Unaligned ( gi|24 ): GAATATCTATCATAATCTCCGTAACACGTAGAAATGTCTTTAGTTCCAATTGTTTGAACAATCATTATTATTGTAAGACTTGATTTCAAAATCTCAATGCGGAAAAATGGCTTTATAATCCATTGTAATGATTTTTTCATGGTTTTTTAAAGAACTTAATTCAAATGTTACGGAGGTTACTCATATTTACTAGCA
Unaligned ( gi|25 ): CAACTGTTGTTACTAACATTTTAACCTCAGGTATACATGTATTTTTATATCATGTAAAGTTACTTAACTTCACAATGTCAGTTTCATTACATACTACATTTATTGATTTTATTGAGGTATTTCATCTGGGTTTTTTACTATGACTTACTTCGTCTTTTGTTACTAC
Unaligned ( gi|28 ): TATACTTTTTTTATCATGTAAAGTTACGTAACTTCACAATGTCAGTTTCATTACATATTACATTTATTGATTTTATTGCGGTATTTCATGGGTTTTTTTTTTTTACTATGACTTACTTTCGTCTGTTGTTATTATGATG
Unaligned ( gi|30 ): TGGCACATTTATACCATGTGTGCTAAATATTCATCTATGCGTATTTCGTGTGAACAAAACAACAGTACGACATTTAATCGATTCATTTAATTTCATTGCACTTTAGGTCTTTTGTTCGAAGGTGAAT
Unaligned ( gi|31 ): TCTTTTCATCAACTATCTATTATATGGAATACTGTAGGTCATGGTTTAACCAACTGTTATTACTAAACATTTTTAACCTGCAGTATACATGTAAATTTTTATATCAT
Unaligned ( gi|34 ): AAAAAAAAACCCCCACAATTTATGTATTTATTTTTCTTTGTTTATTCATGTATTGTAGTGAGTGGGAGAAAAAAAAAAAA
Unaligned ( gi|37 ): ACATGTTGATATCGTCTAAATTGTTTGAACAATAAGTATTGTAAGACNATACAATGTATGATGATTT