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gi|14                         :                                                                           CAGGG-GGC-TG-TG-T---AGAAAA--A---A------A---A---A-CAAGA-A-CCAGAT---CCC--CC--cccccccccccccccccccccccctcctggaaaaatactcaagggaagaaggcatgcattttgcaaacccgctcgcttcaaccgacattttctcactcaaatctttaatttcaacacacacgtcagtattttaaatatccacaaataaataataacttccagttccatcctttgtcgcttatattctgatataggtgttacaacatc
gi|20                         :                                                                           CAGGG-GCT-TG-T------AG-AAA--A---A------A---A---T-CAT-A-A-T----A---CCC--CC--TAGGAAAGA--TA-CA-C----A-A-G--GAAG--ACG-C---C-A--TGTTTG--CAT--TAATG-CT------TGCCT-TAA--Ccccccccccccccccccccccccctcctggaaaaatactcaaggaagaaggcatgcattttgcaaacccgctcgcttcaaccgacattttctcactcaaatctttaaattcaaacacacacgtccagtattttaaatatccaccaaataaaataataacttccagttccatcctttgtcgcttatat
gi|24                         :                                                                         tgCAGGG-GCT-TG-TG-T---AG-AGA--A---A------T---A---T-CAA-A-A-CA---C---CCC--CC--TAGTTAAAA--TA-AA-C----A-AGG--Gt
gi|27                         :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-TAGAAG-AAA--A---A------A---A---T-CAA-G-A-C----A---CCC--C
gi|1                          :                                                                            AGGG-G---TG-T--T---AG-AAA--A---A------ACAAA---T-TCA-A-A-C----A---CCC--TC---AGTAAAA---TATCA-C----A-AGG---AAG--ACG-C---C-A--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCA-CTATTTTC-T-CA-CTTAAA--TC-T-TT-AA--TTTG-AA-CA-CT---CATG-C-C----AG----TT--AAT-ATCCG-T-----AAATAAATATT---T-TTTTTCTA-TTTG-TATC-AC-TTC--CAG-TT--AC-AATC-TTTGTC-GCTTT-C-AT-T-T--TG-CT----TAATCA---A----TT---TCT-AACGT-A----AA---CTTCCCA-A-T-GTGACAA-CTAAGT-GGC--TTT-----------C--------------------T-G--------------------C--------------A-G----CAAGCGAAAAGTATGATGT--CA--CT----CGTGCT--CTCTC-GG---GGTT-TTTCAT-ATATAGGAC-GAAGACAT-G----A---GCGTTTTGTTT---G---AA-A---T-CCTC----TCTT-CATC-C----T-ATGAAAAAC-CCTGAGA-----GAGCG-C--G--AG-C--------G-A-----------------------------------G-AA-GCC-ACTT-AGTTG---TC-C-AT---TT-GG-G---A-AG----TTTACATC-A-GAAAT--TC-AT---TAAG--CAATTA-A-AT-G-TAAGC-GAC-AAA-GGATTGT--AACTGG--AA-GT-GATACGAA-TTAGA-A----A----AAAATATTT-ATTT-----A-CGG-ATATT----A-ACTG---G-C--GT--GAG-TGT-T-CAAA--TT-AA-A-GAT-CTTAAG-TG-A-GAAAATAGC-GG--TTGAA-GCGAGC-----GGGTACATG--CAAA-A--T-G---G-CGT--CTTC--CCT-T----G-TG-TA--TTTTTACTA--GG--GGTG-T----TTTG-A---T---t
gi|5                          : ctgtattcaatgaaattaatttccgcaaattcctacaatatgatattcaatagtataacaactgaccacaggggcAGGG-GCT-TG-TG-T---AG-AAA--A---A------A---A---T-CAA-A-A-C--------ACC--CC--TAGTAAA----TA-AA-C----A-AGG--GAAG--ACG-C---C-A--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-C--TTTTC-T-CA-CTTAAA-ATC---TT-AA--TTTG-AG-CA-CT---CACG-T-C----AG----TT--AAT-ATCCG-T-----AAATAAATACT---T-TTC--CTTCTAGA-TCTC-AC-TTT--CAG-TT---C-CGTCTGTTGTC-GCTTA-C-AT-T-TATTGACT----TAATCA---A----TT---TCT-AACGT-A----AA---CCTACCC-AAT-G-GACAA-CTAAGT-GGC--TT------------C--------------------T-G--------------------T--------------C-A----T-----------------T--CG--CG----C----G--CTCTC-GG---GG-T-TTTCAT-A----GGAT-AAAGA----G----A---GTTC-----TT---A---AA-AAAAA-CCTCCTT-TCTT-GGTC-C----T-ATG-AAAACCCCC---AAA---GAGCA--A-G--GA-T--------G-ATAT----CAAAC----TTTCGC-TT-T-CGCAG-----A-ACC-ACTT-AGTTG---TC-C-AC---T--GG-GGA-A-G-----TTTACGGT-A--AGAT--TG--------AATTGAAT------T-G--AAGCGGAC---ACAGAC
gi|11                         :                                                                            AGGGCGCT-TGATG-T---AG-AAC--A---A------A---T---T-CAA-C-A----------------------TAACAC--TACAG-A----A-AAG--GAAG--ACG-TG--C-A--T-TTTG--AAT--ACCC--CTTCCAATCACTT-CAAT-CCG-CT--TATC-T-CATCTTAAA-ATTAT-TT-GA--TTTG-AA-CATCT---CACGGT-C----AG----TT--AATATTCCG-TTTTTCAGATAAATAATATGTAGTC--CTCATTGG-TATC-AC-TCC--CAGTTT--ACTAATCTTTTGTC-GCTTG-C-ATGT-TATTGGCT----TAAT-AC--AGCATTT---CTT-AATTT-A----GAACTTTTCCCC-AAT-G-GACAcgt
gi|10                         :                                                                            AGAG-GTT-TG-TG-T---AG-AAA--A---A--------------T-CAA-G---T----T---ACCGTCA--CGGAAAAAA--AA-AA-T----T-AAA--GAAG--ATGGT---C-A--T-TTCG---AT--ATCCG-CT------GTCAT-CTA--CCA-CTCTTTTC-T-TA-TTTAAT-ATC-T-TT-AA--TTTG-AA-TA-CT---AACG-C-C----AG----GT--ACTGTTCC--T-----AAATGATTAAT---T--TT--CTTACTAG--A-T-AT-TT-----A-TT--AC-AATACATTGTT-ACGTG-T-AT-T-GATTGGC--------------AG--TTTAC-TTCTAAATT-A----AA---CTGCCAA-AAT-G-GAAAG-CAAAAA-GAT--GT------------CAAT-----------------T-GAATAACGATGAC--------T--------------T-GCACCC-----------------T--CT--CT----C----T--CTCTC-GG---GGTT-TTtg
gi|19                         :                                                 aaaacagcctttgtttttgttgtaccgAGGG-ACT-TG-TG-C---AG-AAA--A---A------A---AAATT-CAA-A-A-C----A---TCC--CC--TAGTAAAAA--TA-
gi|25                         :                                  ggggcttgtgtagaaaaaaattcaaaacaccccctagtaataAGGG-GCT-TG-TG-T---AG-AAATGA---AAACAACA---A---T-CAA-G-A-C--------ACC--CC--TAG
gi|9                          :                                                                             GGG-GCT-TG-TG-T---AG-AAA--A---A------A---AAT-T-CAA-A-AAC----A---CCC--CCATTAGAATAAA--TA-AA-C----ATGGG--GAAG--ACG-C---CCA--T-TTTG--CAT--ACCTG-CT------CGCTT-CAA--CCG-CTATTTTCCT-CA-CT-AAA-ATC-T-TT-AA--TTTGAAA-CA-CT---CATG-CGC----ATGCCGTT--AAT-ATCCG-T-----AAATAAATACT---T-TTC--CTACTAGG-ACTC-ACTTTT--CAG-TTTCCC-CGTCTGTTGTC-GCTTATC-AT-T-TATTGACT----TAATCA---A----TC---TCT-AACGT-A----AA---CATC-CC-AAT-G-GACAA-CTAAGT-GGC--TT------------C--------------------T-G--------------------gggatgttttg
gi|19                         :                              tgaaaacccccgaaagagcacgagtgatattaaactttcactttctgGGG-GCT-TG-TG-T---AG-AAA--A---A------A---AT--T-CAA-A-A-C----A---CCC--CC--TAGTAAct
gi|18                         :                                                                              GG-GCT-TG-TG-T---AG-AAA--A---A------A---AAA-T-CAA-A-A-T----A---TCC--CC--TAGTAAAAT--TA-Atatatttttactaggggatgttttgaatttttttttctgcacaagtccct
gi|4                          :                                ggtttgtgcagaaaaaaaaaatcaaaacaccccctagtaaaattaaaG-GCT-TG-TG-T---AG-AAA--A---A------A---A---T-CAA-A-A-C----A---CCC--CC--TAGTAAAAA--TA-AA-C----A-AGG--GAAG--ACG-C---C-A--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-AAATTTTC-T-GC-CTTAAA-ATC-T-TT-AA--TTTG-AA-CA-CT---CACG-C-C----AG----TT--AAT-CTCCG-T-----AAATAACTACT---T--TT--CCGACTAGATCTC-AC-TTT--CAG-TT--CC-CTTCTGTTGTC-GCTTA-C-AT-T-TATTGACT----TAATCA---A----TT---TCT-AACGT-A----TA---TTTCCCA-AAT-G-GACAA-CTAAGT-GGG--TT------------C--------------------T-G--------------------T--------------A-A----C-----------------T--CG--CG----C----G--CGTTC-GG---GGAT-TTTCAT-A----GGAT-GAAGA----GTAAAA---A--------AA---A---AA-AAAAA-ACT-CCTGTCTT-GGTC-C----T-ATG-AAAACCCCCG--AAA---GAGCA-C--G--AG-T--------G-ATAT----CATAT----TTTCGCGTT-C-TGCA---G-AA-GCC-ACTT-AGTTG---TC-C-AT---T--GG-GGA-A-G-----TTTA
gi|18                         :                                                 gcctacatatagctcgaatttcccttccttG-GTT-TG-TG-C---AG-AAA--AAAAA------A---A---T-CAA-A-A-C----A---CCC--CC--TAGTAAAAT--TA-AA-
gi|15                         :                                                                                                G-AAG--T---A------A---T---T-CAA-G-A-C----A---TCC--CC--TAGTAAAAA--TA-CA-CTTGGA-AGG--GAAG--ACA-C---C-A--T-ATCG--CAT--ACCCA-CT------CGCTT-CAA--CCG-CTATTTTC-T-CA-CTTAAA-ATC-T-TT-AA--TTTG-GG-CA-CT---TCTG-C-C----AG----AT--GAT-ATCCG-T-----AAATAAATATT---T-ttaattttactaggggatattttgatttttttttctacacaagccc
gi|1                          :                                                                                                                 aa---A---T-CAA-A-A-C--------ACC--CC--TAGTAAAAA--TA-CA-C----A-AGG--GAAG--ACG-C---C-A--T-TTTG--CATGTACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-CTATTTTC-T-CA-CTTAAG-ATC-T-TT-AA--TTTG-AA-CA-CT---CACG-C-C----AG----TT--AAT-ATCCG-T-----AAATAAATATT---T-TTTT-CTAATTCG-TATC-AC-TTC--CAG-TT--AC-AATCCTTTGTC-GCTTA-C-AT-T-TAATTGCT----TAAT-G---AA--TTT---CT--GATGT-A----AA---CTTCCCA-AAT-G-GACAA-CTAAGT-GGC--TT------------C-------------------------------------------T--------------C-G----C-----------------T--CG--CG----C----T--CTCTC-AG---GGTT-TTTCAT-A----GGAT-GAAGA----G----A---GGATT----TC---A---AACAAAAC-GCT-CATGTCTT-CGTC-CTATAT-ATGAAAAAC-CCCG--AGA---GAGCA-C--G--AG-T--------G-ACAT----CATACT---TTTCGC-TTGC-TGCAG--A-AA-GCC-ACTT-AGTTG---TCAC-AT---T--GG-G---A-AG----TTTACGTT-A-GAAAT--TG-AT---TAAG--CA---A-A-AT-G-AAAGC-GAC-AA--AGATTGT--AACTGG--AA-GT------GATACAAAT-AGAAAA----AAAATATTT-ATTT-----A-CGG-ATATT----A-ACTG---G-C--AT--GAG-TGT-T-CAAA--TT-AA-A-GA--TTTAAG-TG-A-GAAAATAGT-GG--TTGAA-GCGAGC-----GGGT--ATG--CAAA-A--T-G---G-CGT--CTT---CCT-T----G-TGATA---TTTTACT---GAG-GGTG-T----TTGA-A---TTTGT--T---T-TTTCTA
gi|13                         :                                                        ctgtattcaatgaaattaatttccgcaaattcctacaatatgatattcaatagtataacaactgaccacaggggc-C----C---CCT--CC--TGG-AAAAA--TA-CT-C----A-AGG--GAAG--AAGGCATGC-A--T-TTTG--CAA--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-ACATTTTC-T-CA-CTC-AA-ATC-T-TT-AA--TTTC-AA-CA-CA---CACG-T-CAGT-AT----TTTAAAT-ATCCA-C-----AAATAAATAA------------TA-----------AC-TTC--CAG-TT---C-CATCCTTTGTC-GCTTA-T-AT-T-acacccct
gi|14                         :                                                                      cagggggctgtgtagaaaaaaaaacaagaaccagatccccccccccccccccccccccccc-C----C---CCT--CC--TGG-AAAAA--TA-CT-C----A-AGGAAGAAG--GCA-TG--C-A--T-TTTG--CAA--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-ACATTTTC-T-CA-CTC-AA-ATC-T-TTAAA--TTCA-AA-CA-CA---CACG-T-CCAGTAT----TTTAAAT-ATCC---------ACCAAATAA-------------AA-TAA-TA---AC-TTC--CAG-TT---C-CATCCTTTGTC-GCTTA-T-AT-ctgatataggtgttacaacatc
gi|17                         :                                                                             cagggggctgtgtagaaaaaaaaacaagaaccagatccccccccccccccccccccccccc---CCC--CC--TAGTAAAAAAATA-AAAC----A-AGGCGAAAG--ACG-C---C-AAAT-TCTGTACAA--ACCCGACT------CGCTT-CAAGACCG-CTATTTTC-T-CA-CTTAAATATCATATT-AAGCTTTG-AA-
gi|7                          :                                                                                                                                                          tAAAC--TA-CA-C----A-AGG--GAAG--ACT-C---C-A--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAT--CCG-CTATTTTC-T-CA-CTTAAG-ATC-T-TT-CA--TTTG-AA-CA-CT---CACG-C-C----AG----TT--AAT-ATCCG-T-----AAATAAATAAT---T-TTT--CTAATTGG-TATC-AC-TTT--CAG-TT--AC-AATCCGTTGTC-GCTTA----------AT--------CAA-----------TT---TCT-AACGT-A----AA---CTTCCCA-AAT-G-GAC----------------T------------C--------------------T-G--------------------T--------------C-G----C-----------------T--CG--CG----C----T--CTCTC-GGTTTTTTT-TTTTAT-A----GGA----------------------------------A---AC-AAAAC-ACT-CATGTC-------------------AAAAC-CCCG--AGA---GAGCA-C--G--AG-T--------G-ATAT----CATAC----TTTCGC-TT-TCTGCA---G-AA-GCC-ACTT-AGTTG---TC-C-AT---T--GGAG---A-AG----TTTGCGTT-A-GAAAT----------TAAG-TCAAT-A-A-AT-tctt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                atcgAAG--ACG-C---C-A--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CGG-CTATTTTC-T-CA-CTTAAA-ATC-T-TT-AA--TTTG-AA-AA-CT---TACG-C-C----GA----TT--AAT-ATTCA-T-----AAATAAATAAT---T-TTT--CTAATTGG-TATT-AA-TTC--CAG-TT--CC-AATGTTTGGTC-TCTTA-C-AT-T-TATTGGTT----TAATCA---A----TA---TCT-AATGT-A----AA---CTTCCCT-AAT-G-GACAA-CTATGT-GGC--TT------------CTGCAGAAAGCGAAAGTATTAT-G--------------------T--------------C-A----C-----------------T--CG--CG----C----T--CTCTC-GG---GGTT-TTTCAC-A----AGAC-AAAGA-----------------------------------------------GTTTT-CATC-C----T-ATGAAAAAC-CCCG--AGA---GAGCA-C--G--AG-C--------G-A
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                        ttttattgcttacatcaattaattggcttacgtaaacgtccctagTTC-C-C--CTGAAA-AT--T-TT-AAC-TTTA-AA-CA-CTTTCCA-G-C-T----AG----TT--AAT-AACTGCT-----AAA----TAAT---T-TTT--CTAATTGG-TAAT-CA-TTC--CAG-Ttt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CG-T-----AAATAAATAAT---T-TTC--CTTCTAGA-TCTC-TC-TTT--CAG-TT--CC-AGTCTGTTGTC-GTTTA-C-AT-T-TATTGACT----TAATCA---A----TT---TGT-AACGT-A----AA---CTTCCCC-AAT-G-GACAA-CTAAGT-GGC--TT------------C--------------------T-G--------------------T--------------C-A----C-----------------T--CG--CG----C----G--CTCTC-GG---GGGT-TTTCAT-A----GGAT-GAACA----T----ACTTC--------TT---A---AA-AA----CCT-CCTGTCTT-GGTC-C----T-ATG-AAAACCCCCG--AAA---GAGCA-C--G--CG-T--------A-ATAT----CATAC----TTTCGC-TT-TCTGCA---A-AA-GCC-ACTT-AGTTG---TC-C-A
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --CTACTAGA-TGTTCAC-TTT--CAG-TT--TC-CGTCTGTTG-C-GCTTAACGAT-T-TATTGACTTTATCAA-----------TT---TT---ACGT-AAACCTA---CCCCACC-TATCG-GACAAACTAAGT-GGC--TT------------
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTGTGTCCGCTTC-A-AT-T-CAAT---T----CAA------------T---CTT-ACCGT-A----AA---CTTCCCC-AGT-G-GACAA-CTAAGT-GG---TT------------C--------------------T-GCGAAAGCGAAAGT-------T--------------T-G----A-----------------TATCA--TC----C----TTGCTCTTTGG---GGGT-TTTCAT-A----GGAC-CAAGA----A----A---GGAGGTTTTTT---T---TA-AGAAC-TCTCTTTATC--------C----T-ATGAAAACC--CCGA-------GAGCG-CGCG--AA-T--------G-ACA---------------------------------G-AA-GCC-ACTT-AGTTG---TC-C-AT---T--GG-G---T-AGG---TTTACGTT-A-GAAAT--TG-AT---TAAGT-CAAT-A-A-AT-G-TAAGC-GAC-AA-CAGACG-G--AACTGA--AA-GT-GA---GAT-CTAGA-AG--GA----AAAGTATTT-ATTT-----A-CGG-ATATT----A-ACTG---A-C--GT--GAG-TGC-T-CAAA--TT--A-A-GAT-TTTAAG-TG-A-GAAA--AGC-GG--TTGAA-GCGAGC-----GGGT--ATG--CAAA-A--T-G---G-CGT--CTTC--CCT-T----G-TT-TA----TTTACTA--GG--GGTG-T----TTTG-A---T---T--T---T-TTTCTACA-CAAGtcctgcagaaagcgaaaattagtatgatatcaacgtgctctttcgggggtatttcatcaggaccgaagacaaggaggtgttctttatttaagaaactctctttatcctatgaaaaaccccgagagcgaagctgagtgaatagaagccgacttagttgtctattgggttaggtttacatttagaaattggattacggtcaatataatgtaagcgacaacagacgggaactgataaagtgagatctagtaggaaaagtattttattttacgagtgcctcagaataaagattttaagtgcagaaaacagccagttgaaagcgagcgggtatgcaaaacggcgttctttcccttgttttatttttactaggaggtacaatgtttgaattttatttctaccacacagcccctg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gt-GCCTA-C-AT-----ATAGCT----CGA--A-------TTTCCCTTC---CTTTA----AA---CTTCCCC-AAT-G-GACAA-CTAAGT-GGC--TT------------C--------------------T-G--------------------CAGAA----------C-G----CGAAAATATGATA-----T--CA--CTCGTGC----T--CTTTC-GG---GGGT-TTTCAT-A----GGAC-CAAGACAG-G----A---G--------TT---cccctcgt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A-T-AT-T-TATAGGTT----TAATCA---A----TT---TCT-AATGT-A----AA---CTTTCGA-AAT-G-GACAG--TAAGT-GGCGTTT------------C--------------------T-G--------------------ttttttttttttttactcttcatcctatgaaaatccccgaacgcgcgcgagttacagaacccacttagttgtccatttgggaaatatacgttagaaattgattaagtcaataaatgtaagcgacaacagaagggaactgaaagtgagatctagtcggaaaagtagttatttacggagattaactggcgtgagtgttcaaattaaagattttaaggcagaaaatttcggttgaagcgagcgggtatgcaaaatggcgtcttcccttgtttatttttactagggggtgttttgatttttttctacacaagcc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tctg-AT-T-TATTGACT----TAA-----------TT---TCT-AACGC-A----AA---CTTCTCC-AAT-G-GACAA-CTAAGT-GGC--TT------------C--------------------T-G--------------------CAGAAAGCGAAAGTAT-GAT--A-----------------T--CA--CTCGTGC----T--CTCTC-GG---GGTT-TT
gi|16                         :                                                                                                                                                         atcgaaactacacaagggaagactccattttgcatacccgctcgcttcatccgctattttctcacttaagatctttcatttgaacactcacgccagttaatatccgtaaataaataatttttctaattggtatcactttcagttacaatccgttgtcgcttaatcaatttctaacgtaaacttcccaaatggactctgtcgctcgcgctctctcggtttttttttttataggaaacaaaacactcatgtcT-T-TAAT--------CAA-----------TT---TCT-AATGT-A----AA---CTTCG-A-AAT-G-GACA---TAA-T-GGC--TT------------C--------------------T-G--------------------
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttttggtcctcatgaaaaccaaagagtgtgagcaacatttagtcatctacaaatatgtaacatactttctgT-G-GACAA-CTAAGT-GGC--TT------------T--------------------T-GCAGAAAGCGAAAGTATGATAT--------------T-A----C-----------------G--CG--TG----C----T--CTTTC-GG---GGGT-TTTCAT-A----GGAC-CAAGACAG-G----A---GGTTT----TT---A---AG-AAG---------TATGTT-CATC-C----T-ATGAAAACC-CCCGA-------GAGCG-CGCG--AG-T--------G-ACA---------------------------------G-AA-GCC-ACTT-AGTTG---TC-C-AT---T--GG-G---G-AAG---TTTACGTT-A-CAAAT--TG-AT---TAAGT-CAAT-A-A-AT-G-TAAAC-GAC-AA-CAGACTGG--AACTGA--AA-GA-GA---GAT-CTAGA-AG--GA----AAATTATTT-ATTT-----A-CGcctata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CAA-TTAATT-GGC--TTACGTAAACGTCCC--------------------TAG--------------------T--------------C-G----C-----------------T--CG--TG----C----T--CTCTC-GG---GGTT-TTTCAT-A----GGAT-GAAAA-----------------------------------------CTCTTTGTCTT-G------------TGAAAAAC-CCCGAGA-----GAGCG-C--G--AG-T--------G-ACAT----AATAC----TTTCGC-TT-TCTGCAG----AA-GCC-ACAT-AGTTG---TC-C-AT---TA-GG-G---A-AG----TTTACATT-A-GATAT--TG-AT---TAAAC-CAAT-A-A-AT-G-TAAGA-GACCAAACA--TTGG--AACTGG--AA-TT-AA---TAC-CAATT-AG--AA----AAATTATTT-ATTT-----A-TGA-ATATT----A-ATCG---G-C--GT--AAG-TTT-T-CAAA--TT-AA-A-GAT-TTTAAG-TG-A-GAAAATAGC-CG--TTGAA-GCGAGC-----GGGT--ATG--CAAA-A--T-G---G-CGT--CTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttttattgcttacat----C----T--CTTTC-GG---GGGTATTTCATCA----GGACCGAAGACAAGG----A---GGTGTTCT-TT---ATTTAA-GAAAC-TCTCTTTATC--------C----T-ATGAAAAAC-CCCGAGAGC---GAA-G-CT-G--AG-T--------G-A--------ATA------------------------G-AA-GCCGACTT-AGTTG---TC-T-AT---T--GG-GTTAG-G-----TTTACATTTA-GAAAT--TG-GA--TTACGGTCAAT-ATA-AT-G-TAAGC-GAC-AA-CAGACGGG--AACTGATAAA-GT-GA---GAT-CTAGT-AG--GA----AAAGTATTTTATTT---------------T----A--------------C--GAG-TGCCT-CAGA--AT-AA-A-GAT-TTTAAG-TGCA-GAAAACAGCCAG--TTGAAAGCGAGC-----GGGT--ATG--CAAA-A--C-G---G-CGTTCTTTC--CCT-T----GTTT-TA--TTTTTACTA--GGA-GGTA-CAATGTTTGAA---T---T--T---TATTTCTACtt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctactagatgttcactttcagtttccgtctgttgcgcttaacgatttattgactttatcaattttacgtaaacctaccccacctatcggacaaactaagtggctttcctgcagaaagcgaaaattagtatgatatcaacgtgT-TTTCAT-A----GGAT-GAAGA----T----A---G--------TTCTAA---AA-AAAAC-CCT--CTGTCTT-CATC-T----T-ATCAAAcacacagcccctg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---A---AA-ACAGC-CTT---TGTTTT-TGTTG-----T-ACCGAAAAC-CCCGAGAGA---GAG-A-GA-G--GG-T--------GCAAGT----CAT---------CGT-TA-T-T-CAATTG-A----C-ATCT-TTTTGCTTTC-C-AT---TTTGG-C---A-G-----TTTAATTT-A-GAAGT--AA-ACTGCCAA--TCAAT-A-C-AC-G-TAA-----C-AAT-------G--TATTGT--AA-TA-AA---TAT-CTAGT-AA--GA----AAATTAATC-ATTT-----A-GGA-ACAGT----A-CCTG---G-C--GT--TAG-TAT-T-CAAA--TT-AA-A-GAT-ATTAAA-TA-A-GAAAAGAGT-GG--TAGAT-GACAGC-----GGAT--AT---CGAA-A--T-G---ACCAT--CTTC--TTT-A----A-TT-TT--TTTTTTCCG--TGACGGTA-A----CTTG-A----------T---T-TTTCTACA-CAAc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTT-GGTCCT----C-ATGAAAA----CCAAAGAGTGTGAGCAACA-TTTAG-TCATCTACAA-ATATGTAACATAC----TTTC--------TGCAG----AA-GCC-A-TT-AT--G---TC-C-AT---T--TC-G---A-AG----TTTACATT-A-GAAAT--TG-AT---TAAacctct
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAACCCCCGAAA-----GAGCA-C--G--AG-T--------G-ATAT----TAAAC----TTTCAC-TT-TCTGCAG----AA-GCC-ACTT-AGTTG---TC-C-AT---T--GG-G---ATG-----TTTACGTT-A-GAGAT--TG-AT---TAAGT-CAAT-A-A-AT-GATAAGC-GAC-AA-CAGACGGGGAAACTGA--AAAGT-GA---GTC-CTAGT-AG--GA----AAAGTATTT-ATTT-----A-CGG-ATATT----A-ACGGCATG-C--GCATGAG-TGT-TTCAAA--TT-AA-A-GAT-TTT-AG-TG-AGGAAAATAGC-GG--TTGAA-GCGAGC-----AGGT--ATG--CAAA-A--TGG---G-CGT--CTTC--CCCAT----G-TT-TA--TTTATTCTAATGGG-GGTGTT----TTTG-AAT-T---T--T---T-TTTCTACA-CAAGacctata
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgT-C-TGCAG--A-AACGCC-ACTT-ACT-G---TC-C-AT---TTCGA-A---A-G-----TTTACATT-A-GAAAT--TG-AT---TAAA-CCTAT-A-A-AT-A-Tccccct
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -T-TACAG----AA-CCC-ACTT-AGTTG---TC-C-AT---TTGGG-A---A-A-----TATACGTT-A-GAAAT--TG-AT---TAAGT-CAAT-A-A-AT-G-TAAGC-GAC-AA-CAGAAGGG--AACTGA--AA-GT-GA---GAT-CTAGT-CG--GA----AAAGTAGTT-ATTT-----A-CGG-AGATT----A-ACTG---G-C--GT--GAG-TGT-T-CAAA--TT-AA-A-GAT-TTTAAG-GC-A-GAAAATTTC-GG--TTGAA-GCGAGC-----GGGT--ATG--CAAA-A--T-G---G-CGT--CTTC--CCT-T----G-TT-TA--TTTTTACTA--GGG-GGTG-T----TTTG-A---T---T--T---T-TTTCTACA-CAAG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gcctacatatagctcgaatttcccttcctttaaacttccccaatggacaactaagtggcttctgcagaacgcgaaaatatgatatcactcgtgctctttcgggggttttcataggaccaagacaggagttttttttttttttttactcttcatcctatgaaaatccccgaacgcgcgcgagTTG---TC-C-AT---T--GG-G---G-AAG---TTTACATT-A-GAAAT--TG-AT---TAAGC-CAAT-A-A-AT-G-CAAGC-GAC-AAA-AGATTGT--AACTGG--AA-GT------GATACCAAT-GA--GAC---AAATTATTT-ATTT-----A-CGG-ATATT----A-ACTG---A-C--GT--GAG-TGT-T-CAAA--TC-AA-A-TAT-TTTAAG-TG-A-GAAAATAGC-GG--TTGAA-GTGAGC-----GGGT--ATG--CAAA-A--T-G---G-CGT--CTTC--CCT-T----T-TG-TA--GTTTT-------GA-ATT-------TTTG------------------TTTCTACA-CAAGcc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctgtatttgaactattagttagttatgtagattacttggtattactaaaaccagtacaacacaaactgagaccacaggggTG---TC-C-AT---T--GG-G---G-AAAAGTTCTAAATT-AAGAAATGCTGTAT---TAAGC-CAAT-A-ACAT-G-CAAGC-GAC-AAA-AGATTAGTAAACTGG--GA-GT------GATACCAATGAG--GACTACATATTATTT-ATCTGAAAAA-CGGAATATT----A-ACTG---ACC--GT--GAGATGT-T-CAAA--TC-AA-ATAAT-TTTAAGATG-A-GATA--AGC-GGA-TTGAA-GTGATTGGAAGGGGT--ATT--CAAA-A--T-GC--A-CGT--CTTC--CTT-T----T-CTGTA--GTGTTA-----------TG-------TTG-A---A---T--T---T-GTTCTACATCAAGctaacctattaccagaaccagtcagtgatagtcaagatgtgctcgactccatatcttcatcagagaccacggca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              G---TC-C-AT---TT-GG-G---A-AG----TTTACGTT-A-GAAAT--TG-AT-----------------------TAAGC-GAC-AA-CGGATTGT--AACTGA--AA-GT-GA---TAC-CAATT-AG--AA----AAATTATTT-ATTT-----A-CGG-ATATT----A-ACTG---G-C--GT--GAG-TGT-T-CAAA--TG-AA-A-GAT-CTTAAG-TG-A-GAAAATAGC-GG--ATGAA-GCGAGC-----GGGT--ATG--CAAA-A--T-G---G-AGT--CTTC--CCT-T----G-TG-TA--GTTTcgcccttg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atcg-A-AT-A-TAAGC-GAC-AAA-GGATG-G--AACTGG--AA-GT-----------TA-T---------------TATTT-ATTT-----G-TGG-ATATTTAAAATACTG---A-C--GT--GTG-TGT-T-GAAA--TT-AA-A-GAT-TT-GAG-TG-A-GAAAATGTC-GG--TTGAA-GCGAGC-----GGGT--TTG--CAAA-A--T-GCATGCCTT--CTTC--CCT-T----G-AG-TA--TTTTT-CCA--GGA-GGtctgtcgctcgcgctctctcggtttttttttttataggaaacaaaacactcatgtcaaaaccccgagagagcacgagtgatatcatactttcgctttctgcagaagccacttagttgtccattggagaagtttgcgttagaaattaagtcaataaat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cagggggctgtgtagaaaaaaaaacaagaaccagatccccccccccccccccccccccccccc-AT-A-TAAGC-GAC-AAA-GGATG-G--AACTGG--AA-GT-----------TATT-A-------------T-TTT-ATTT-----GGTGG-ATATTTAAAATACTG---GAC--GT--GTG-TGT-T-TGAA--TTTAA-A-GAT-TT-GAG-TG-A-GAAAATGTC-GG--TTGAA-GCGAGC-----GGGT--TTG--CAAA-A--T-GC--A-TGC--CTTCTTCCT-T----G-AG-TA--TTTTT-CCA--GGA-GGctgatataggtgttacaacatc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cagggggctgtgtagaaaaaaaaacaagaaccagatcccccccccccccccccccccccccccT-AG--AA----AAATTATTT-A--------G-CAG-TTATT----A-ACTA---G-CTGGA--AAG-TGT-T-TAAAG-TT-AA-A--AT-TTTCAG--G-G-GAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A----AAAATATTT-ATTT-----A-CGG-ATATC----A-TCTG---G-C--AG--AAG-TGC-C-CAAA--TT-AA-A-GAT-TTTAAG-TG-A-GAAAATAGC-GG--TTGAA-GCGAGT-----GGGT--ATG--CGAT-A--T-G---G-TGT--CTTC--CCT-TCCAAG-TG-TA--TTTTTACTA--GGG-GATG-T----CTTG-A---A---T--T---A-CTTCattggtaatcattccagt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T-T-CAAAGCTT-AATATGATATTTAAG-TG-A-GAAAATAGC-GGTCTTGAA-GCGAGTC----GGGT--TTGTACAGA-ATTT-G---G-CGT--CTTTCGCCT-T----GTTT-TATTTTTTTACTA--GGG-GGT--C----TT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        t--ATG--CAAACA--T-G---G-CGT--CTTC--C-T-T----G-TG-TA--TCTTTCCTA--GGG-GGTA-T----TATG-A---T---T--T---T-TTTCTAC
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TGATATCACTTCAAAAACTGATACAAAGTAGAAAGTGGATG






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Reference ( family-4719 )     :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AAC-N-----CCCCC-TAGTAAAAATAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CAT-TTTGCAT--ACCCGCT------CGCTT-CAA-CCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAAATC-TTT-AA-TTTGAA-CA-CT---CACG-CCAGT-T----AATAT-CCG-T-----AAAT-AAA-TAATTT----T-TCTAATTGGT-ATCACTTC--CAGTTNCC--GTCCGTTGTCGCTTACAT-T-TATTGGCT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-AAC--TTC-CCCAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-CGCTCGCGCT---CTCTCGG---GGTTTTTCATAGGACGAAGAG----A---G----TT---A---AA-AAAAC-CCTCCTTGTCTTC-GTC-C----T-ATGAAAAAC-CCCG-AAGAGAGCGC-G--------AGT--------GATAT----CATAC----TTTCGC-TT-T-TGCAGG-AAGCCACTTAG-TTGTC-C-AT---T-GG-G--AAGTTTACGTTAGAAATTGAT-TAAG--CAATAAAT-G-TAAGC-GA-CAAACAGACGGG--AACTG-GAAGTGAG-ATCTAGTAG--GAAAANTATTTATTTACGGATATTAAC----TG-GCGTGAGTG-TTCAAA--TTAA-A-GAT-TTTAAGTGA-GAAAATAGCGG--TTGAAGCGAG-CGGGTATG--CAAAA--T-GGCGTCTTC--CCT-T----G-TTTA--T-TTTTACTA--GGGGGTG-TTTTGA--T---TTTTTTCT-ACACAAG
gi|1                          :                                                                                                                  A---T-CAA---AAC-A-----CCCC--TAGTAAAAATACA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CAT-TTTGCATGTACCCGCT------CGCTT-CAA-CCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAGATC-TTT-AA-TTTGAA-CA-CT---CACG-CCAGT-T----AATAT-CCG-T-----AAAT-AAA-TATTTT----TTTCTAATTCGT-ATCACTTC--CAGTTACA--ATCCTTTGTCGCTTACAT-T-TAATTGCT-TA-AT-G-A--A--TT---T--C-TGA-TGTA-AAC--TTC-CCAAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTC--T-CGCTCGCGCT---CTCTCAG---GGTTTTTCATAGGATGAAGAG----A---GGATTTC---A---AACAAAAC-GCTCA-TGTCTTC-GTC-CTATAT-ATGAAAAAC-CCCG--AGAGAGCAC-G--------AGT--------GACAT----CATACT---TTTCGC-TTGC-TGCAGA-AAGCCACTTAG-TTGTCAC-AT---T-GG-G--AAGTTTACGTTAGAAATTGAT-TAAG--CA--AAAT-G-AAAGC-GA-CAA--AGATTGT--AACTG-GAAGTGAT-A-CAAATAGAAAAAAAATATTTATTTACGGATATTAAC----TG-GCATGAGTG-TTCAAA--TTAA-A-GA--TTTAAGTGA-GAAAATAGTGG--TTGAAGCGAG-CGGGTATG--CAAAA--T-GGCGTCTT---CCT-T----G--TGA--TATTTTACT---GAGGGTG-TTTGAA--TTTGTTTTTTCTAACAC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cagggggctgtgtagaaaaaaaaacaagaaccagatcccccccccccccccccccccccccAAAAATATTTATTTACGGATATCATC----TG-GCAGAAGTG-CCCAAA--TTAA-A-GAT-TTTAAGTGA-GAAAATAGCGG--TTGAAGCGAG-TGGGTATG--CGATA--T-GGTGTCTTC--CCT-TCCAAG-TGTA--T-TTTTACTA--GGGGATG-TCTTGA--A---TTACTTC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTTG-GTC-C----TCATGAAAA----CCA-AAGAGTGTGA-GCAACATTTAGTCATCTACAAATATGTAACATAC----TTTC--------TGCAG--AAGCCA-TTA---TGTC-C-AT---T-TC-G--AAGTTTACATTAGAAATTGAT-TAAA--C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TTCAAAGCTTAATATGATATTTAAGTGA-GAAAATAGCGGTCTTGAAGCGAGTCGGGTTTGTACAGAATTT-GGCGTCTTTCGCCT-T----GTTTTATTT-TTTTACTA--GGGGGTC-TTctata
gi|18                         :                                                                              tG-GTT-TG-TG-C---AGAAA--AAAAA------AA---T-CAA---AAC-A-----CCCCC-TAGTAAAATTAAA-
gi|18                         :                                                                              GG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--AAA-A------AA---T-CAA---AAT-A-----TCCCC-TAGTAAAATTAAttaattttactaggggatattttgatttttttttctacacaagccc
gi|19                         :                              ggtttgtgcagaaaaaaaaaatcaaaacaccccctagtaaaattaaaGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AAT--T-CAA---AAC-A-----CCCCC-TAGTAA
gi|19                         :                                                                            AGGG-ACT-TG-TG-C---AGAAA--A---A------AAAATT-CAA---AAC-A-----TCCCC-TAGTAAAAATAtatatttttactaggggatgttttgaatttttttttctgcacaagtccct
gi|2                          :                                 ggggcttgtgtagaaaaaaattcaaaacaccccctagtaataCAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AAC-T-----CCCCC-TAGTAAAAATAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CAT-TTTGCAT--ACCCGCT------CGCTT-CAA-CTG-CTATTTTCT-CA-CTTAAAATC-TTT-AA-TTTGAA-CA-CT---CACG-CCATT-T----AATTT-CCG-T-----AAAC-AGA-TAATTG----T-TCTAATTGGT-ATTACTTT--CAGTTACA--ATCCTTTGTCGCTTACAT-T-TAATGGCT-CA-A----A--AGTTT---T--T-CAA-CGTA-TAC--TTC-ACAAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-TGCTCACTCT---CTCTCGG---GATTTTTCATAGGATGAAGAG----A---G----TT---A---AA-AAAAC-CCTCCCTGTCTTG-GTCGC----T-ATGAAAAACGTCCGAAAAAGAGCACAG--------AGT--------GATAT----CATAC----TTTCGC-TT-T-TGCAGG-AAGCCACTTGT-TTGTC-C-AT---T-GG-G--AA-TTTACGTTAGAAATTGATCTAAGTTCAATAAAT-G-TAAGC-GA-CAAACAGACGAG--AACTG-AAAGTAAG-ATCTAGTAG--GAAAAGTATTTATTTACGGATATTAAC----TG-GCGCGAGTG-TTCAAA--TTAA-A-GAT-TTTAAGTGA-GAAAATAGCAG--TTGAAGCGAG-TGGGTATG--CAAAA--T-GGCGTCTTC--CCT-T----G-TTTA--T-TTTTACTA--GGAGGTG-CTTTGA--T---TTTTTTCT-ACGCAAG
gi|20                         :                                                                           CAGGG-GCT-TG-T------AGAAA--A---A------AA---T-CAT---AAT-A-----CCCCC-TAGGAAAGATACA-CAA-G--GAAG--ACG-C---CATGTTTGCAT--TAATGCT------TGCCT-TAA-CC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                             tTTCC-C--CTGAAAAT--TTT-AACTTTAAA-CA-CTTTCCA-G-CTAGT-T----AATAA-CTG-C--------T-AAA-TAATTT----T-TCTAATTGGTAATCA-TTC--CAGTt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATAT-T-TATAGGTT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-TGTA-AAC--TTT-CGAAATGGA--------------CAG-TAA------GT-GGCGTTTCTG
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tctgTTTTCATAGGATGAAGAT----A---G----TTCTAA---AA-AAAAC-CCTC--TGTCTTC-ATC-T----T-ATCAAA
gi|24                         :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAGA--A---A------TA---T-CAA---AACAC-----CCCCC-TAGTTAAAATAAA-CAAGG--Gc
gi|25                         :                                                                            AGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAATGA---AAACAACAA---T-CAA---GAC-A------CCCC-TAG
gi|27                         :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-TAGAAGAAA--A---A------AA---T-CAA---GAC-A-----CCCCgggatgttttg
gi|3                          :                                                                           CAGGG-GCTGTG-TGGT---AGAAAT-A---A------AA---T-TCA---AAC-ATTGTACCTCC-TAGTAAAAATAAAACAAGG--GAAAGAACG-C---CGT-TTTGCAT--ACCCGCT------CGCTTTCAA-CTGGCTGTTTTCTGCA-CTTAAAATC-TTT-AT-TCTGAGGCA-CT---CG----------------TA------------AAAT-AAAATACTTT----T-CCTACTAGAT-CTCACTTTATCAGTTCCC--GTCTGTTGTCGCTTACAT-TATATTGACCGTA-AT-CCA--A--TT---T--C-TAAATGTA-AAC--CTAACCCAATAGA--------------CAACTAA------GTCGGC--TTCTATTCACTCA-GCTTCGCTCTCGG---GGTTTTTCATAGGATAAAGAG----A---GTTTCTT---AAATAA-AGAACACCTCCTTGTCTTCGGTC-C----TGATGAAATAC-CCCC-GAAAGAGCAC-G---------TT--------GATAT----CATACTAATTTTCGC-TT-TCTGCAGGAAAGCCACTTAGTTTGTC-CGATAGGT-GG-GGTAGGTTTACGT--AAAATTGAT-AAAGT-CAATAAATCGTTAAGC-G--C-AACAGACGGA--AACTG-AAAGTGAACATCTAGTAG--t
gi|4                          :                                                                               G-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AAC-A-----CCCCC-TAGTAAAAATAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CAT-TTTGCAT--ACCCGCT------CGCTT-CAA-CCG-AAATTTTCT-GC-CTTAAAATC-TTT-AA-TTTGAA-CA-CT---CACG-CCAGT-T----AATCT-CCG-T-----AAAT-AAC-TACTTT----T-CCGACTAGAT-CTCACTTT--CAGTTCCC--TTCTGTTGTCGCTTACAT-T-TATTGACT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-TAT--TTC-CCAAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGG--TTCTGT-AACTCGCGCG---CGTTCGG---GGATTTTCATAGGATGAAGAGTAAAA---A----AA---A---AA-AAAAA-ACTCC-TGTCTTG-GTC-C----T-ATGAAAACC-CCCG-AA-AGAGCAC-G--------AGT--------GATAT----CATAT----TTTCGCGTT-C-TGCA-G-AAGCCACTTAG-TTGTC-C-AT---TGGG-G--AAGTTTA
gi|5                          :                                              gcctacatatagctcgaatttcccttccttAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AAC-A-----CCCC--TAGTAAA--TAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CAT-TTTGCAT--ACCCGCT------CGCTT-CAA-CCG-CT--TTTCT-CA-CTTAAAATC-TT--AA-TTTGAG-CA-CT---CACG-TCAGT-T----AATAT-CCG-T-----AAAT-AAA-TACTTT----T-CCTTCTAGAT-CTCACTTT--CAGTT-CC--GTCTGTTGTCGCTTACAT-T-TATTGACT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-AAC--CTA-CCCAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-CATTCGCGCG---CTCTCGG---GG-TTTTCATAGGATAAAGAG----A---GTTC-TT---A---AA-AAAAA-CCTCCTT-TCTTG-GTC-C----T-ATGAAAACC-CCC---AAAGAGCAA-G--------GAT--------GATAT----CAAAC----TTTCGC-TT-T-CGCAG---AACCACTTAG-TTGTC-C-AC---TGGG-G--AAGTTTACGGTA-AGATTGA---------ATTGAAT-T-GAAGCGGA-C--ACAGAC
gi|6                          :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAACAA---A------AA---TTCAA---AAC----------------TACAAA-------AGG--GAAG--ACG-C---CAT-TTTGCAT--ACCCGCT------CACTT-CAA-CCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAAATA-TTT-GA-TTTGAA-CA-CT---CACG-TCAGT-T----AATAT-CCG-T-----AAAT-AAA-TAATTT----G-TCTCATTGGT-ATCACTTC--CAGTTACA--ATCTTTTGTCGCTTGCAT-T-TATTGGCT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-TGTA-AAC--TTC-CCCAATGGA--------------CAACTAA------cgt
gi|7                          :                                                                         ctgtatttgaactattagttagttatgtagattacttggtattactaaaaccagtacaacacaaactgagaccaAAACTACA-CAAGG--GAAG--ACT-C---CAT-TTTGCAT--ACCCGCT------CGCTT-CAT-CCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAGATC-TTT-CA-TTTGAA-CA-CT---CACG-CCAGT-T----AATAT-CCG-T-----AAAT-AAA-TAATTT----T-TCTAATTGGT-ATCACTTT--CAGTTACA--ATCCGTTGTC----------------GCT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-AAC--TTC-CCAAATGGA--------------C---------------------TCTGT-CGCTCGCGCT---CTCTCGGTTTTTTTTTTTATAGGA-------------------------A---AC-AAAAC-ACTCA-TGTC-------------------AAAAC-CCCG--AGAGAGCAC-G--------AGT--------GATAT----CATAC----TTTCGC-TT-TCTGCA-G-AAGCCACTTAG-TTGTC-C-AT---T-GGAG--AAGTTTGCGTTAGAA----AT-TAAGT-CAATAAAT-cctattaccagaaccagtcagtgatagtcaagatgtgctcgactccatatcttcatcagagaccacggca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atcgT-T-TATTG-CT-TACAT-C-A--A--TTAATTGGC-TTA-CGTA-AAC--GTC-CCTA--------------------------------------------GT-CGCTCGTGCT---CTCTCGG---GGTTTTTCATAGGATGAAAA---------------------------------CTCTTTGTCT------------T-GTGAAAAAC-CCCG--AGAGAGCGC-G--------AGT--------GACAT----AATAC----TTTCGC-TT-TCTGCA-G-AAGCCACATAG-TTGTC-C-AT---TAGG-G--AAGTTTACATTAGATATTGAT-TAAAC-CAATAAAT-G-TAAGA-GACCAAAC--ATTGG--AACTG-GAATTAAT-ACCAATTAG--AAAAATTATTTATTTATGAATATTAAT----CG-GCGTAAGTT-TTCAAA--TTAA-A-GAT-TTTAAGTGA-GAAAATAGCCG--TTGAAGCGAG-CGGGTATG--CAAAA--T-GGCGTCTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTGAAAACC-CCCG-AA-AGAGCAC-G--------AGT--------GATAT----TAAAC----TTTCAC-TT-TCTGCAG--AAGCCACTTAG-TTGTC-C-AT---T-GG-G--ATGTTTACGTTAGAGATTGAT-TAAGT-CAATAAAT-GATAAGC-GA-CAA-CAGACGGGGAAACTGAAAAGTGAG-TCCTAGTAG--GAAAAGTATTTATTTACGGATATTAACGGCATGCGCATGAGTGTTTCAAA--TTAA-A-GAT-TTT-AGTGAGGAAAATAGCGG--TTGAAGCGAG-CAGGTATG--CAAAA--TGGGCGTCTTC--CCCAT----G-TTTA--T-TTATTCTAATGGGGGTGTTTTTGAATT---TTTTTTCT-ACACAAGtt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TGATATCACTTCAAAAACTGATACAAAGTAGAAAGTGGATG






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Reference ( family-4719 )     :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AACA-----CCCCC-TAGTAAAAA--TAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAA-ATC-T-TT-AA--TTTGAA-CA-CT---CACG-CCAGT----T----AA-TAT-CCGT-----AAATAAA-TAATTT----TC-CTAATNGGT-ATCACTTC--CAG-TTAC-NATCCGTTGTCGCTTACAT-T-TATTGGCT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-AAC--TTC-CCNAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-CGCTCGCGCT---CTCTCGG---GGTTTTTCATAGGATGAAGAG----A---G----TT---A---AA-AAAAC-CCT-CC-TGTCTT-GGTC-C----T-ATGAAAAAC-CCCG-AAGAG----AGCA-C-G---AGT--------GATAT----CATAC----TTTCGCTTTCTGCAGG-AAGCCACTTAG-TTGTC-C-AT---T-GG-G--AAGTTTACGTTAGAAATTGAT-TAAG-TCAATAAAT-G-TAAGC-GAC-AAACAGACGGG--AACTG-AAAGTG-ANAC--CTAGTAGGAAAAGTATTTATTTACGGATATTAACTG---GCGC--GAGTG-TTCAAATTAAAGATTTTAAGTGA-GAAAATAGCGGTTGAAGCGAGCGGGTATGCAAAAT-GGCGTCTTCCCT-T----GTTTAT-TTTTACTA--GGGGGTG-TTTTGA--T---TTTTTTCTACGCAAG
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gi|14                         :                                                                   cagggggctgtgtagaaaaaaaaacaagaaccagatccccccccccccccccccccccccccc-----CCTCC-TGG-AAAAA--TACT-CAAGGAAGAAG--GCA-TG--CA--T-TTTG--CAA--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-ACATTTTCT-CA-CTC-AA-ATC-T-TTAAA--TTCAAA-CA-CA---CACGTCCAGTA---TTTTAAA-TAT-CC--------ACCAAA-TAA------------AATA----ATAACTTC--CAG-TT-C-CATCCTTTGTCGCTTATAT-ctgatataggtgttacaacatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cagggggctgtgtagaaaaaaaaacaagaaccagatcccccccccccccccccccccccccccAAAAATATTTATTTACGGATATCATCTG---GCAG--AAGTG-CCCAAATTAAAGATTTTAAGTGA-GAAAATAGCGGTTGAAGCGAGTGGGTATGCGATAT-GGTGTCTTCCCT-TCCAAGTGTAT-TTTTACTA--GGGGATG-TCTTGA--A---TTACTTC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTT-GGTC-C----TCATGAAAA----CCA-AAGAGTGTGAGCAAC-ATTTAGTCATCTACAAATATGTAACATAC----TTTC------TGCAG--AAGCCA-TTA---TGTC-C-AT---T-TC-G--AAGTTTACATTAGAAATTGAT-TAAA-CCTATA
gi|17                         :                                                                                                                           ---AAGA-----CCCCC-TAGTAAAAAAATAAAACAAGGCGAAAG--ACG-C---CAAAT-TCTGTACAA--ACCCGACT------CGCTT-CAAGACCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAATATCATATT-AAGCTTTGAA-
gi|18                         :                                                                              tG-GTT-TG-TG-C---AGAAA--AAAAA------AA---T-CAA---AACA-----CCCCC-TAGTAAAAT--TAAA-
gi|18                         :                                                                              GG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--AAA-A------AA---T-CAA---AATA-----TCCCC-TAGTAAAAT--TAAttaattttactaggggatattttgatttttttttctacacaagccc
gi|19                         :                              ggtttgtgcagaaaaaaaaaatcaaaacaccccctagtaaaattaaaGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---TTCAA---AACA-----CCCCC-TAGTAA
gi|19                         :                                                                            AGGG-ACT-TG-TG-C---AGAAA--A---A------AAAATT-CAA---AACA-----TCCCC-TAGTAAAAA--TAtatatttttactaggggatgttttgaatttttttttctgcacaagtccct
gi|2                          :                                 ggggcttgtgtagaaaaaaattcaaaacaccccctagtaataCAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AACT-----CCCCC-TAGTAAAAA--TAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CTG-CTATTTTCT-CA-CTTAAA-ATC-T-TT-AA--TTTGAA-CA-CT---CACG-CCATT----T----AA-TTT-CCGT-----AAACAGA-TAATTG----TT-CTAATTGGT-ATTACTTT--CAG-TTAC-AATCCTTTGTCGCTTACAT-T-TAATGGCT-CA-A----A--AGTTT---T--T-CAA-CGTA-TAC--TTC-ACAAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-TGCTCACTCT---CTCTCGG---GATTTTTCATAGGATGAAGAG----A---G----TT---A---AA-AAAAC-CCTCCC-TGTCTT-GGTCGC----T-ATGAAAAACGTCCGAAAAAG----AGCA-CAG---AGT--------GATAT----CATAC----TTTCGCTTT-TGCAGG-AAGCCACTTGT-TTGTC-C-AT---T-GG-G--AA-TTTACGTTAGAAATTGATCTAAGTTCAATAAAT-G-TAAGC-GAC-AAACAGACGAG--AACTG-AAAGTA-AGAT--CTAGTAGGAAAAGTATTTATTTACGGATATTAACTG---GCGC--GAGTG-TTCAAATTAAAGATTTTAAGTGA-GAAAATAGCAGTTGAAGCGAGTGGGTATGCAAAAT-GGCGTCTTCCCT-T----GTTTAT-TTTTACTA--GGAGGTG-CTTTGA--T---TTTTTTCTACGCAAG
gi|20                         :                                                                           CAGGG-GCT-TG-T------AGAAA--A---A------AA---T-CAT---AATA-----CCCCC-TAGGAAAGA--TACA-CAA-G--GAAG--ACG-C---CA--TGTTTG--CAT--TAATG-CT------TGCCT-TAA--CC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                    tTTCC-C--CTGAAA-AT--T-TT-AAC-TTTAAA-CA-CTTTCCA-G-CTAGT----T----AA-TAA-CTGC--------TAAA-TAATTT----TT-CTAATTGGTAATCA-TTC--CAG-Tt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATAT-T-TATAGGTT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-TGTA-AAC--TTT-CGAAATGGA--------------CAG-TAA------GT-GGCGTTTCTG
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tctgTTTTCATAGGATGAAGAT----A---G----TTCTAA---AA-AAAAC-CCT--C-TGTCTT-CATC-T----T-ATCAAA
gi|24                         :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAGA--A---A------TA---T-CAA---AACAC----CCCCC-TAGTTAAAA--TAAA-CAAGG--Gc
gi|25                         :                                                                            AGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAATGA---AAACAACAA---T-CAA---GACA------CCCC-TAG
gi|27                         :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-TAGAAGAAA--A---A------AA---T-CAA---GACA-----CCCCgggatgttttg
gi|3                          :                                                                           CAGGG-GCTGTG-TGGT---AGAAAT-A---A------AA---T-TCA---AACATTGTACCTCC-TAGTAAAAA--TAAAACAAGG--GAAAGAACG-C---CG--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTTTCAA--CTGGCTGTTTTCTGCA-CTTAAA-ATC-T-TT-AT--TCTGAGGCA-CT---CG--------------------TA-----------AAATAAAATACTTT----TC-CTACTAGAT-CTCACTTTATCAG-TTCC-CGTCTGTTGTCGCTTACAT-TATATTGACCGTA-AT-CCA--A--TT---T--C-TAAATGTA-AAC--CTAACCCAATAGA--------------CAACTAA------GTCGGC--TTCTATTCACTCA-GCTTCGCTCTCGG---GGTTTTTCATAGGATAAAGAG----A---GTTTCTT---AAATAA-AGAACACCT-CCTTGTCTTCGGTC-C----TGATGAAATAC-CCCC-GAAAG----AGCA-C-G----TT--------GATAT----CATACTAATTTTCGCTTTCTGCAGGAAAGCCACTTAGTTTGTC-CGATAGGT-GG-GGTAGGTTTACGT--AAAATTGAT-AAAG-TCAATAAATCGTTAAGC-G-C--AACAGACGGA--AACTG-AAAGTGAACAT--CTAGTAGt
gi|4                          :                                                                               G-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AACA-----CCCCC-TAGTAAAAA--TAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-AAATTTTCT-GC-CTTAAA-ATC-T-TT-AA--TTTGAA-CA-CT---CACG-CCAGT----T----AA-TCT-CCGT-----AAATAAC-TACTTT----TC-CGACTAGAT-CTCACTTT--CAG-TTCC-CTTCTGTTGTCGCTTACAT-T-TATTGACT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-TAT--TTC-CCAAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGG--TTCTGT-AACTCGCGCG---CGTTCGG---GGATTTTCATAGGATGAAGAGTAAAA---A----AA---A---AA-AAAAA-ACT-CC-TGTCTT-GGTC-C----T-ATGAAAACC-CCCG-AA-AG----AGCA-C-G---AGT--------GATAT----CATAT----TTTCGCGTTCTGCA-G-AAGCCACTTAG-TTGTC-C-AT---TGGG-G--AAGTTTA
gi|5                          :                                              gcctacatatagctcgaatttcccttccttAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AACA-----CCCC--TAGTAAA----TAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-CT--TTTCT-CA-CTTAAA-ATC-T-T--AA--TTTGAG-CA-CT---CACG-TCAGT----T----AA-TAT-CCGT-----AAATAAA-TACTTT----TC-CTTCTAGAT-CTCACTTT--CAG-TT-C-CGTCTGTTGTCGCTTACAT-T-TATTGACT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-AAC--CTA-CCCAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-CATTCGCGCG---CTCTCGG---GG-TTTTCATAGGATAAAGAG----A---GTTC-TT---A---AA-AAAAA-CCT-CC-TTTCTT-GGTC-C----T-ATGAAAACC-CCC---AAAG----AGCA-A-G---GAT--------GATAT----CAAAC----TTTCGCTTTC-GCAG---AACCACTTAG-TTGTC-C-AC---TGGG-G--AAGTTTACGGTA-AGATTG----AAT-TGAAT---T-G--AAGCGGAC---ACAGAC
gi|6                          :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAACAA---A------AA---TTCAA---AAC---------------TACAAA---------AGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CACTT-CAA--CCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAA-ATA-T-TT-GA--TTTGAA-CA-CT---CACG-TCAGT----T----AA-TAT-CCGT-----AAATAAA-TAATTT----GT-CTCATTGGT-ATCACTTC--CAG-TTAC-AATCTTTTGTCGCTTGCAT-T-TATTGGCT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-TGTA-AAC--TTC-CCCAATGGA--------------CAACTAA------cgt
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Reference ( family-4719 )     :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AACA-----CCCCC-TAGTAAAAA--TAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAA-ATC-T-TT-AA--TTTGAA-CA-CT---CACG-CCAGT----T----AA-TAT-CCGT-----AAATAAA-TAATTT----TC-CTAATNGGT-ATCACTTC--CAG-TTAC-AATCCGTTGTCGCTTACAT-T-TATTGGCT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-AAC--TTC-CCNAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-CGCTCGCGCT---CTCTCGG---GGTTTTTCATAGGATGAAGAG----A---G----TT---A---AA-AAAAC-CCT-CC-TGTCTT-GGTC-C----T-ATGAAAAAC-CCCG-AAGAG----AGCA-C-G---AGT--------GATAT----CATAC----TTTCGCTTTCTGCAGG-AAGCCACTTAG-TTGTC-C-AT---T-GG-G--AAGTTTACGTTAGAAATTGAT-TAAG-TCAATAAAT-G-TAAGC-GAC-AAACAGACGGG--AACTG-AAAGTG-ANAC--CTAGTAGGAAAAGTATTTATTTACGGATATTAACTG---GCGC--GAGTG-TTCAAATTAAAGATTTTAAGTGA-GAAAATAGCGGTTGAAGCGAGCGGGTATGCAAAAT-GGCGTCTTCCCT-T----GTTTAT-TTTTACTA--GGGGGTG-TTTTGA--T---TTTTTTCTACGCAAG
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gi|11                         :                                                 aaaacagcctttgtttttgttgtaccgAGGGCGCT-TGATG-T---AGAAC--A---A------AT---T-CAACATAACA-----C--------TACAGA--------AAAG--GAAG--ACG-TG--CA--T-TTTG--AAT--ACCC--CTTCCAATCACTT-CAAT-CCG-CT--TATCT-CATCTTAAA-ATTAT-TT-GA--TTTGAA-CATCT---CACGGTCAGT----T----AA-TATTCCGTTTTTCAGATAAA-TAATATGTAGTC-CTCATTGGT-ATCACTCC--CAGTTTACTAATCTTTTGTCGCTTGCATGT-TATTGGCT-TA-ATAC-AGCA--TT---T--CTTAA-TTTAGAACTTTTC-CCCAATGGA--------------CA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CGT-----AAATAAA-TAATTT----TC-CTTCTAGAT-CTCTCTTT--CAG-TTCC-AGTCTGTTGTCGTTTACAT-T-TATTGACT-TA-AT-C-A--A--TT---T--G-TAA-CGTA-AAC--TTC-CCCAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-CACTCGCGCG---CTCTCGG---GGGTTTTCATAGGATGAACAT----ACTTC----TT---A---AA-AA----CCT-CC-TGTCTT-GGTC-C----T-ATGAAAACC-CCCG-AA-AG----AGCA-C-G---CGT--------AATAT----CATAC----TTTCGCTTTCTGCA-A-AAGCCACTTAG-TTGTC-C-Atg
gi|13                         :                                                                                                                                  -----CCTCC-TGG-AAAAA--TACT-CAAGG--GAAG--AAGGCATGCA--T-TTTG--CAA--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-ACATTTTCT-CA-CTCAAA--TC-T-TT-AA--TTTCAA-CA-CA---CACG-TCAGTATTTT----AAATAT-CCAC-----AAATAAA-TAAT-------------------A--ACTTC--CAG-TTCC-A-TCCTTTGTCGCTTATAT-T-
gi|14                         :                                                                   cagggggctgtgtagaaaaaaaaacaagaaccagatccccccccccccccccccccccccccc-----CCTCC-TGG-AAAAA--TACT-CAAGGAAGAAG--GCA-TG--CA--T-TTTG--CAA--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-ACATTTTCT-CA-CTC-AA-ATC-T-TTAAA--TTCAAA-CA-CA---CACGTCCAGTA---TTTTAAA-TAT-CC--------ACCAAA-TAA------------AATA----ATAACTTC--CAG-TT-C-CATCCTTTGTCGCTTATAT-ctgatataggtgttacaacatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cagggggctgtgtagaaaaaaaaacaagaaccagatcccccccccccccccccccccccccccAAAAATATTTATTTACGGATATCATCTG---GCAG--AAGTG-CCCAAATTAAAGATTTTAAGTGA-GAAAATAGCGGTTGAAGCGAGTGGGTATGCGATAT-GGTGTCTTCCCT-TCCAAGTGTAT-TTTTACTA--GGGGATG-TCTTGA--A---TTACTTC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTT-GGTC-C----TCATGAAAA----CCA-AAGAGTGTGAGCAAC-ATTTAGTCATCTACAAATATGTAACATAC----TTTC------TGCAG--AAGCCA-TTA---TGTC-C-AT---T-TC-G--AAGTTTACATTAGAAATTGAT-TAAA-CCTATA
gi|17                         :                                                                                                                           ---AAGA-----CCCCC-TAGTAAAAAAATAAAACAAGGCGAAAG--ACG-C---CAAAT-TCTGTACAA--ACCCGACT------CGCTT-CAAGACCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAATATCATATT-AAGCTTTGAA-
gi|18                         :                                                                              tG-GTT-TG-TG-C---AGAAA--AAAAA------AA---T-CAA---AACA-----CCCCC-TAGTAAAAT--TAAA-
gi|18                         :                                                                              GG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--AAA-A------AA---T-CAA---AATA-----TCCCC-TAGTAAAAT--TAAttaattttactaggggatattttgatttttttttctacacaagccc
gi|19                         :                              ggtttgtgcagaaaaaaaaaatcaaaacaccccctagtaaaattaaaGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---TTCAA---AACA-----CCCCC-TAGTAA
gi|19                         :                                                                            AGGG-ACT-TG-TG-C---AGAAA--A---A------AAAATT-CAA---AACA-----TCCCC-TAGTAAAAA--TAtatatttttactaggggatgttttgaatttttttttctgcacaagtccct
gi|2                          :                                 ggggcttgtgtagaaaaaaattcaaaacaccccctagtaataCAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AACT-----CCCCC-TAGTAAAAA--TAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CTG-CTATTTTCT-CA-CTTAAA-ATC-T-TT-AA--TTTGAA-CA-CT---CACG-CCATT----T----AA-TTT-CCGT-----AAACAGA-TAATTG----TT-CTAATTGGT-ATTACTTT--CAG-TTAC-AATCCTTTGTCGCTTACAT-T-TAATGGCT-CA-A----A--AGTTT---T--T-CAA-CGTA-TAC--TTC-ACAAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-TGCTCACTCT---CTCTCGG---GATTTTTCATAGGATGAAGAG----A---G----TT---A---AA-AAAAC-CCTCCC-TGTCTT-GGTCGC----T-ATGAAAAACGTCCGAAAAAG----AGCA-CAG---AGT--------GATAT----CATAC----TTTCGCTTT-TGCAGG-AAGCCACTTGT-TTGTC-C-AT---T-GG-G--AA-TTTACGTTAGAAATTGATCTAAGTTCAATAAAT-G-TAAGC-GAC-AAACAGACGAG--AACTG-AAAGTA-AGAT--CTAGTAGGAAAAGTATTTATTTACGGATATTAACTG---GCGC--GAGTG-TTCAAATTAAAGATTTTAAGTGA-GAAAATAGCAGTTGAAGCGAGTGGGTATGCAAAAT-GGCGTCTTCCCT-T----GTTTAT-TTTTACTA--GGAGGTG-CTTTGA--T---TTTTTTCTACGCAAG
gi|20                         :                                                                           CAGGG-GCT-TG-T------AGAAA--A---A------AA---T-CAT---AATA-----CCCCC-TAGGAAAGA--TACA-CAA-G--GAAG--ACG-C---CA--TGTTTG--CAT--TAATG-CT------TGCCT-TAA--CC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                    tTTCC-C--CTGAAA-AT--T-TT-AAC-TTTAAA-CA-CTTTCCA-G-CTAGT----T----AA-TAA-CTGC--------TAAA-TAATTT----TT-CTAATTGGTAATCA-TTC--CAG-Tt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATAT-T-TATAGGTT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-TGTA-AAC--TTT-CGAAATGGA--------------CAG-TAA------GT-GGCGTTTCTG
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tctgTTTTCATAGGATGAAGAT----A---G----TTCTAA---AA-AAAAC-CCT--C-TGTCTT-CATC-T----T-ATCAAA
gi|24                         :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAGA--A---A------TA---T-CAA---AACAC----CCCCC-TAGTTAAAA--TAAA-CAAGG--Gc
gi|25                         :                                                                            AGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAATGA---AAACAACAA---T-CAA---GACA------CCCC-TAG
gi|27                         :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-TAGAAGAAA--A---A------AA---T-CAA---GACA-----CCCCgggatgttttg
gi|3                          :                                                                           CAGGG-GCTGTG-TGGT---AGAAAT-A---A------AA---T-TCA---AACATTGTACCTCC-TAGTAAAAA--TAAAACAAGG--GAAAGAACG-C---CG--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTTTCAA--CTGGCTGTTTTCTGCA-CTTAAA-ATC-T-TT-AT--TCTGAGGCA-CT---CG--------------------TA-----------AAATAAAATACTTT----TC-CTACTAGAT-CTCACTTTATCAG-TTCC-CGTCTGTTGTCGCTTACAT-TATATTGACCGTA-AT-CCA--A--TT---T--C-TAAATGTA-AAC--CTAACCCAATAGA--------------CAACTAA------GTCGGC--TTCTATTCACTCA-GCTTCGCTCTCGG---GGTTTTTCATAGGATAAAGAG----A---GTTTCTT---AAATAA-AGAACACCT-CCTTGTCTTCGGTC-C----TGATGAAATAC-CCCC-GAAAG----AGCA-C-G----TT--------GATAT----CATACTAATTTTCGCTTTCTGCAGGAAAGCCACTTAGTTTGTC-CGATAGGT-GG-GGTAGGTTTACGT--AAAATTGAT-AAAG-TCAATAAATCGTTAAGC-G-C--AACAGACGGA--AACTG-AAAGTGAACAT--CTAGTAGt
gi|4                          :                                                                               G-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AACA-----CCCCC-TAGTAAAAA--TAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-AAATTTTCT-GC-CTTAAA-ATC-T-TT-AA--TTTGAA-CA-CT---CACG-CCAGT----T----AA-TCT-CCGT-----AAATAAC-TACTTT----TC-CGACTAGAT-CTCACTTT--CAG-TTCC-CTTCTGTTGTCGCTTACAT-T-TATTGACT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-TAT--TTC-CCAAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGG--TTCTGT-AACTCGCGCG---CGTTCGG---GGATTTTCATAGGATGAAGAGTAAAA---A----AA---A---AA-AAAAA-ACT-CC-TGTCTT-GGTC-C----T-ATGAAAACC-CCCG-AA-AG----AGCA-C-G---AGT--------GATAT----CATAT----TTTCGCGTTCTGCA-G-AAGCCACTTAG-TTGTC-C-AT---TGGG-G--AAGTTTA
gi|5                          :                                              gcctacatatagctcgaatttcccttccttAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AACA-----CCCC--TAGTAAA----TAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-CT--TTTCT-CA-CTTAAA-ATC-T-T--AA--TTTGAG-CA-CT---CACG-TCAGT----T----AA-TAT-CCGT-----AAATAAA-TACTTT----TC-CTTCTAGAT-CTCACTTT--CAG-TTCC-G-TCTGTTGTCGCTTACAT-T-TATTGACT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-AAC--CTA-CCCAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-CATTCGCGCG---CTCTCGG---GG-TTTTCATAGGATAAAGAG----A---GTTC-TT---A---AA-AAAAA-CCT-CC-TTTCTT-GGTC-C----T-ATGAAAACC-CCC---AAAG----AGCA-A-G---GAT--------GATAT----CAAAC----TTTCGCTTTC-GCAG---AACCACTTAG-TTGTC-C-AC---TGGG-G--AAGTTTACGGTA-AGATTG----AAT-TGAAT---T-G--AAGCGGAC---ACAGAC
gi|6                          :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAACAA---A------AA---TTCAA---AAC---------------TACAAA---------AGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CACTT-CAA--CCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAA-ATA-T-TT-GA--TTTGAA-CA-CT---CACG-TCAGT----T----AA-TAT-CCGT-----AAATAAA-TAATTT----GT-CTCATTGGT-ATCACTTC--CAG-TTAC-AATCTTTTGTCGCTTGCAT-T-TATTGGCT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-TGTA-AAC--TTC-CCCAATGGA--------------CAACTAA------cgt
gi|7                          :                                                                        ctgtatttgaactattagttagttatgtagattacttggtattactaaaaccagtacaacacaaactgagaccaAAAC--TACA-CAAGG--GAAG--ACT-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAT--CCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAG-ATC-T-TT-CA--TTTGAA-CA-CT---CACG-CCAGT----T----AA-TAT-CCGT-----AAATAAA-TAATTT----TT-CTAATTGGT-ATCACTTT--CAG-TTAC-AATCCGTTGTC----------------GCT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-AAC--TTC-CCAAATGGA--------------C---------------------TCTGT-CGCTCGCGCT---CTCTCGGTTTTTTTTTTTATAGGA-------------------------A---AC-AAAAC-ACT-CA-TGTC-------------------AAAAC-CCCG--AGAG----AGCA-C-G---AGT--------GATAT----CATAC----TTTCGCTTTCTGCA-G-AAGCCACTTAG-TTGTC-C-AT---T-GGAG--AAGTTTGCGTTAGAA----AT-TAAG-TCAATAAAT-cctattaccagaaccagtcagtgatagtcaagatgtgctcgactccatatcttcatcagagaccacggca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atcgT-T-TATTG-CT-TACAT-C-A--A--TTAATTGGC-TTA-CGTA-AAC--GTC-CCTA--------------------------------------------GT-CGCTCGTGCT---CTCTCGG---GGTTTTTCATAGGATGAA------------------------------AAC-TCT-T--TGTCTT-G------------TGAAAAAC-CCCG-A-GAG----AGCG-C-G---AGT--------GACAT----AATAC----TTTCGCTTTCTGCAG--AAGCCACATAG-TTGTC-C-AT---TAGG-G--AAGTTTACATTAGATATTGAT-TAAA-CCAATAAAT-G-TAAGA-GACCAAACA--TTGG--AACTG-GAATTA-ATAC--CAATTAGAAAAATTATTTATTTATGAATATTAATCG---GCGT--AAGTT-TTCAAATTAAAGATTTTAAGTGA-GAAAATAGCCGTTGAAGCGAGCGGGTATGCAAAAT-GGCGTCTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tTGAAAACC-CCCG-AA-AG----AGCA-C-G---AGT--------GATAT----TAAAC----TTTCACTTTCTGCAG--AAGCCACTTAG-TTGTC-C-AT---T-GG-G--ATGTTTACGTTAGAGATTGAT-TAAG-TCAATAAAT-GATAAGC-GAC--AACAGACGGGGAAACTGAAAAGTG-AGTC--CTAGTAGGAAAAGTATTTATTTACGGATATTAACGGCATGCGCATGAGTGTTTCAAATTAAAGATTTT-AGTGAGGAAAATAGCGGTTGAAGCGAGCAGGTATGCAAAATGGGCGTCTTCCCCAT----GTTTAT-TTATTCTAATGGGGGTGTTTTTGAATT---TTTTTTCTACACAAGtt


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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TGATATCACTTCAAAAACTGATACAAAGTAGAAAGTGGATG






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Reference ( family-4719 )     :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AACA-----CCCCC-TAGTAAAAA--TAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAA-ATC-T-TT-AA--TTTGAA-CA-CT---CACG-CCAGT----T----AA-TAT-CCGT-----AAATAAA-TAATTT----TC-CTAATNGGT-ATCACTTC--CAG-TTAC-AATCCGTTGTCGCTTACAT-T-TATTGGCT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-AAC--TTC-CCNAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-CGCTCGCGCT---CTCTCGG---GGTTTTTCATAGGATGAAGAG------AG---TT--C-TA---AAAAAAC-CCT-CC-TGTCTT-GGTC-C----T-ATGAAAAAC-CCCG-AAGAG----AGCA-C-G---AGT--------GATAT----CATAC----TTTCGCTTTCTGCA-G--AAGCCACTTAG-TTGTC-C-AT---T-GG-G--AAGTTTACGTTAGAAATTGAT-TAAG-TCAATAAAT-G-TAAGC-GAC-AACAGACG--GG--AACTG-AAAGTG-ANAC--CTAGTAGGAAAAGTATTTATTTACGGATATTAACTG---GCGC--GAGTG-TTCAAATTAAAGATTTTAAGTGA-GAAAATAGCGGTTGAAGCGAGCGGGTATGCAAAAT-GGCGTCTTCCCT-T----GTTTAT-TTTTACTA--GGGGGTG-TTTTGA--T---TTTTTTCTACGCAAG
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gi|14                         :                                                                   cagggggctgtgtagaaaaaaaaacaagaaccagatccccccccccccccccccccccccccc-----CCTCC-TGG-AAAAA--TACT-CAAGGAAGAAG--GCA-TG--CA--T-TTTG--CAA--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-ACATTTTCT-CA-CTC-AA-ATC-T-TTAAA--TTCAAA-CA-CA---CACGTCCAGTA---TTTTAAA-TAT-CC--------ACCAAA-TAA------------AATA----ATAACTTC--CAG-TT-C-CATCCTTTGTCGCTTATAT-ctgatataggtgttacaacatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cagggggctgtgtagaaaaaaaaacaagaaccagatcccccccccccccccccccccccccccAAAAATATTTATTTACGGATATCATCTG---GCAG--AAGTG-CCCAAATTAAAGATTTTAAGTGA-GAAAATAGCGGTTGAAGCGAGTGGGTATGCGATAT-GGTGTCTTCCCT-TCCAAGTGTAT-TTTTACTA--GGGGATG-TCTTGA--A---TTACTTC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTT-GGTC-C----TCATGAAAA----CCA-AAGAGTGTGAGCAAC-ATTTAGTCATCTACAAATATGTAACATAC----TTTC------TGCA-G--AAGCCA-TTA---TGTC-C-AT---T-TC-G--AAGTTTACATTAGAAATTGAT-TAAA-CCTATA
gi|17                         :                                                                                                                           ---AAGA-----CCCCC-TAGTAAAAAAATAAAACAAGGCGAAAG--ACG-C---CAAAT-TCTGTACAA--ACCCGACT------CGCTT-CAAGACCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAATATCATATT-AAGCTTTGAA-
gi|18                         :                                                                              tG-GTT-TG-TG-C---AGAAA--AAAAA------AA---T-CAA---AACA-----CCCCC-TAGTAAAAT--TAAA-
gi|18                         :                                                                              GG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--AAA-A------AA---T-CAA---AATA-----TCCCC-TAGTAAAAT--TAAttaattttactaggggatattttgatttttttttctacacaagccc
gi|19                         :                              ggtttgtgcagaaaaaaaaaatcaaaacaccccctagtaaaattaaaGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---TTCAA---AACA-----CCCCC-TAGTAA
gi|19                         :                                                                            AGGG-ACT-TG-TG-C---AGAAA--A---A------AAAATT-CAA---AACA-----TCCCC-TAGTAAAAA--TAtatatttttactaggggatgttttgaatttttttttctgcacaagtccct
gi|2                          :                                 ggggcttgtgtagaaaaaaattcaaaacaccccctagtaataCAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AACT-----CCCCC-TAGTAAAAA--TAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CTG-CTATTTTCT-CA-CTTAAA-ATC-T-TT-AA--TTTGAA-CA-CT---CACG-CCATT----T----AA-TTT-CCGT-----AAACAGA-TAATTG----TT-CTAATTGGT-ATTACTTT--CAG-TTAC-AATCCTTTGTCGCTTACAT-T-TAATGGCT-CA-A----A--AGTTT---T--T-CAA-CGTA-TAC--TTC-ACAAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-TGCTCACTCT---CTCTCGG---GATTTTTCATAGGATGAAGAG------AG---T-----TA---AAAAAAC-CCTCCC-TGTCTT-GGTCGC----T-ATGAAAAACGTCCGAAAAAG----AGCA-CAG---AGT--------GATAT----CATAC----TTTCGCTTT-TGCAGG--AAGCCACTTGT-TTGTC-C-AT---T-GG-G--AA-TTTACGTTAGAAATTGATCTAAGTTCAATAAAT-G-TAAGC-GACAAACAGACG--AG--AACTG-AAAGTA-AGAT--CTAGTAGGAAAAGTATTTATTTACGGATATTAACTG---GCGC--GAGTG-TTCAAATTAAAGATTTTAAGTGA-GAAAATAGCAGTTGAAGCGAGTGGGTATGCAAAAT-GGCGTCTTCCCT-T----GTTTAT-TTTTACTA--GGAGGTG-CTTTGA--T---TTTTTTCTACGCAAG
gi|20                         :                                                                           CAGGG-GCT-TG-T------AGAAA--A---A------AA---T-CAT---AATA-----CCCCC-TAGGAAAGA--TACA-CAA-G--GAAG--ACG-C---CA--TGTTTG--CAT--TAATG-CT------TGCCT-TAA--CC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                    tTTCC-C--CTGAAA-AT--T-TT-AAC-TTTAAA-CA-CTTTCCA-G-CTAGT----T----AA-TAA-CTGC--------TAAA-TAATTT----TT-CTAATTGGTAATCA-TTC--CAG-Tt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATAT-T-TATAGGTT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-TGTA-AAC--TTT-CGAAATGGA--------------CAG-TAA------GT-GGCGTTTCTG
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tctgTTTTCATAGGATGAAGAT------AG---TT--C-TA---AAAAAAA-CCC-TC-TGTCTT-CATC-T----T-ATCAAA
gi|24                         :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAGA--A---A------TA---T-CAA---AACAC----CCCCC-TAGTTAAAA--TAAA-CAAGG--Gc
gi|25                         :                                                                            AGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAATGA---AAACAACAA---T-CAA---GACA------CCCC-TAG
gi|27                         :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-TAGAAGAAA--A---A------AA---T-CAA---GACA-----CCCCgggatgttttg
gi|3                          :                                                                           CAGGG-GCTGTG-TGGT---AGAAAT-A---A------AA---T-TCA---AACATTGTACCTCC-TAGTAAAAA--TAAAACAAGG--GAAAGAACG-C---CG--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTTTCAA--CTGGCTGTTTTCTGCA-CTTAAA-ATC-T-TT-AT--TCTGAGGCA-CT---CG--------------------TA-----------AAATAAAATACTTT----TC-CTACTAGAT-CTCACTTTATCAG-TTCC-CGTCTGTTGTCGCTTACAT-TATATTGACCGTA-AT-CCA--A--TT---T--C-TAAATGTA-AAC--CTAACCCAATAGA--------------CAACTAA------GTCGGC--TTCTATTCACTCA-GCTTCGCTCTCGG---GGTTTTTCATAGGATAAAGAG------AG---TTTCT-TAAATAAAGAACACCT-CCTTGTCTTCGGTC-C----TGATGAAATAC-CCCC-GAAAG----AGCA-C-G----TT--------GATAT----CATACTAATTTTCGCTTTCTGCA-GGAAAGCCACTTAGTTTGTC-CGATAGGT-GG-GGTAGGTTTACGT--AAAATTGAT-AAAG-TCAATAAATCGTTAAGC-G-C-AACAGACG--GA--AACTG-AAAGTGAACAT--CTAGTAGt
gi|4                          :                                                                               G-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AACA-----CCCCC-TAGTAAAAA--TAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-AAATTTTCT-GC-CTTAAA-ATC-T-TT-AA--TTTGAA-CA-CT---CACG-CCAGT----T----AA-TCT-CCGT-----AAATAAC-TACTTT----TC-CGACTAGAT-CTCACTTT--CAG-TTCC-CTTCTGTTGTCGCTTACAT-T-TATTGACT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-TAT--TTC-CCAAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGG--TTCTGT-AACTCGCGCG---CGTTCGG---GGATTTTCATAGGATGAAGAGTAAAAAAA----------A---AAAAAAA-ACT-CC-TGTCTT-GGTC-C----T-ATGAAAACC-CCCG-AA-AG----AGCA-C-G---AGT--------GATAT----CATAT----TTTCGCGTTCTGCA-G--AAGCCACTTAG-TTGTC-C-AT---TGGG-G--AAGTTTA
gi|5                          :                                              gcctacatatagctcgaatttcccttccttAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AACA-----CCCC--TAGTAAA----TAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-CT--TTTCT-CA-CTTAAA-ATC-T-T--AA--TTTGAG-CA-CT---CACG-TCAGT----T----AA-TAT-CCGT-----AAATAAA-TACTTT----TC-CTTCTAGAT-CTCACTTT--CAG-TTCC-G-TCTGTTGTCGCTTACAT-T-TATTGACT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-AAC--CTA-CCCAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-CATTCGCGCG---CTCTCGG---GG-TTTTCATAGGATAAAGAG------AG---TT--CTTA---AAAAAAA-CCT-CC-TTTCTT-GGTC-C----T-ATGAAAACC-CCC---AAAG----AGCA-A-G---GAT--------GATAT----CAAAC----TTTCGCTTTC-GCA-G--AA-CCACTTAG-TTGTC-C-AC---TGGG-G--AAGTTTACGGTA-AGATTG----AAT-TGAAT---T-G--AAGCGGAC--ACAGAC
gi|6                          :                                                                           CAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAACAA---A------AA---TTCAA---AAC---------------TACAAA---------AGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CACTT-CAA--CCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAA-ATA-T-TT-GA--TTTGAA-CA-CT---CACG-TCAGT----T----AA-TAT-CCGT-----AAATAAA-TAATTT----GT-CTCATTGGT-ATCACTTC--CAG-TTAC-AATCTTTTGTCGCTTGCAT-T-TATTGGCT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-TGTA-AAC--TTC-CCCAATGGA--------------CAACTAA------cgt
gi|7                          :                                                                        ctgtatttgaactattagttagttatgtagattacttggtattactaaaaccagtacaacacaaactgagaccaAAAC--TACA-CAAGG--GAAG--ACT-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAT--CCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAG-ATC-T-TT-CA--TTTGAA-CA-CT---CACG-CCAGT----T----AA-TAT-CCGT-----AAATAAA-TAATTT----TT-CTAATTGGT-ATCACTTT--CAG-TTAC-AATCCGTTGTC----------------GCT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-AAC--TTC-CCAAATGGA--------------C---------------------TCTGT-CGCTCGCGCT---CTCTCGGTTTTTTTTTTTATAGGA-------------------------A---ACAAAAC-ACT-CA-TGTC-------------------AAAAC-CCCG--AGAG----AGCA-C-G---AGT--------GATAT----CATAC----TTTCGCTTTCTGCA-G--AAGCCACTTAG-TTGTC-C-AT---T-GGAG--AAGTTTGCGTTAGAA----AT-TAAG-TCAATAAAT-cctattaccagaaccagtcagtgatagtcaagatgtgctcgactccatatcttcatcagagaccacggca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atcgT-T-TATTG-CT-TACAT-C-A--A--TTAATTGGC-TTA-CGTA-AAC--GTC-CCTA--------------------------------------------GT-CGCTCGTGCT---CTCTCGG---GGTTTTTCATAGGATGAA-----------------------------AAC-TCT-T--TGTCTT-G------------TGAAAAAC-CCCG-A-GAG----AGCG-C-G---AGT--------GACAT----AATAC----TTTCGCTTTCTGCA-G--AAGCCACATAG-TTGTC-C-AT---TAGG-G--AAGTTTACATTAGATATTGAT-TAAA-CCAATAAAT-G-TAAGA-GAC---CAAACATTGG--AACTG-GAATTA-ATAC--CAATTAGAAAAATTATTTATTTATGAATATTAATCG---GCGT--AAGTT-TTCAAATTAAAGATTTTAAGTGA-GAAAATAGCCGTTGAAGCGAGCGGGTATGCAAAAT-GGCGTCTT
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TGATATCACTTCAAAAACTGATACAAAGTAGAAAGTGGATG