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gi|7 : tctg-AT-T-TATTGACT----TAA-----------TT---TCT-AACGC-A----AA---CTTCTCC-AAT-G-GACAA-CTAAGT-GGC--TT------------C--------------------T-G--------------------CAGAAAGCGAAAGTAT-GAT--A-----------------T--CA--CTCGTGC----T--CTCTC-GG---GGTT-TT
gi|16 : atcgaaactacacaagggaagactccattttgcatacccgctcgcttcatccgctattttctcacttaagatctttcatttgaacactcacgccagttaatatccgtaaataaataatttttctaattggtatcactttcagttacaatccgttgtcgcttaatcaatttctaacgtaaacttcccaaatggactctgtcgctcgcgctctctcggtttttttttttataggaaacaaaacactcatgtcT-T-TAAT--------CAA-----------TT---TCT-AATGT-A----AA---CTTCG-A-AAT-G-GACA---TAA-T-GGC--TT------------C--------------------T-G--------------------
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gi|19 : AGGG-ACT-TG-TG-C---AGAAA--A---A------AAAATT-CAA---AACA-----TCCCC-TAGTAAAAA--TAtatatttttactaggggatgttttgaatttttttttctgcacaagtccct
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Reference ( family-4719 ) : CAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AACA-----CCCCC-TAGTAAAAA--TAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAA-ATC-T-TT-AA--TTTGAA-CA-CT---CACG-CCAGT----T----AA-TAT-CCGT-----AAATAAA-TAATTT----TC-CTAATNGGT-ATCACTTC--CAG-TTAC-AATCCGTTGTCGCTTACAT-T-TATTGGCT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-CGTA-AAC--TTC-CCNAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-CGCTCGCGCT---CTCTCGG---GGTTTTTCATAGGATGAAGAG------AG---TT--C-TA---AAAAAAC-CCT-CC-TGTCTT-GGTC-C----T-ATGAAAAAC-CCCG-AAGAG----AGCA-C-G---AGT--------GATAT----CATAC----TTTCGCTTTCTGCA-G--AAGCCACTTAG-TTGTC-C-AT---T-GG-G--AAGTTTACGTTAGAAATTGAT-TAAG-TCAATAAAT-G-TAAGC-GAC-AACAGACG--GG--AACTG-AAAGTG-ANAC--CTAGTAGGAAAAGTATTTATTTACGGATATTAACTG---GCGC--GAGTG-TTCAAATTAAAGATTTTAAGTGA-GAAAATAGCGGTTGAAGCGAGCGGGTATGCAAAAT-GGCGTCTTCCCT-T----GTTTAT-TTTTACTA--GGGGGTG-TTTTGA--T---TTTTTTCTACGCAAG
gi|1 : A---T-CAA---AACA-----CCCC--TAGTAAAAA--TACA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CATGTACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAG-ATC-T-TT-AA--TTTGAA-CA-CT---CACG-CCAGT----T----AA-TAT-CCGT-----AAATAAA-TATTTT----TTTCTAATTCGT-ATCACTTC--CAG-TTAC-AATCCTTTGTCGCTTACAT-T-TAATTGCT-TA-AT-G-A--A--TT---T--C-TGA-TGTA-AAC--TTC-CCAAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTC--T-CGCTCGCGCT---CTCTCAG---GGTTTTTCATAGGATGAAGAG------AGGATTT--C-AA---ACAAAAC-GCT-CA-TGTCTT-CGTC-CTATAT-ATGAAAAAC-CCCG--AGAG----AGCA-C-G---AGT--------GACAT----CATACT---TTTCGCTTGCTGCA-GA-AAGCCACTTAG-TTGTCAC-AT---T-GG-G--AAGTTTACGTTAGAAATTGAT-TAAG--CA--AAAT-G-AAAGC-GAC-AA-AGATT--GT--AACTG-GAAGTG-ATACAAATAG-AAAAAAAATATTTATTTACGGATATTAACTG---GCAT--GAGTG-TTCAAATTAAAGA-TTTAAGTGA-GAAAATAGTGGTTGAAGCGAGCGGGTATGCAAAAT-GGCGTCTT-CCT-T----G-TGATATTTTACT---GAGGGTG-TTTGAA--TTTGTTTTTTCTA
gi|10 : ctgtattcaatgaaattaatttccgcaaattcctacaatatgatattcaatagtataacaactgaccacaggggcAGAG-GTT-TG-TG-T---AGAAA--A---A-----------T-CAA---GTTA-----CCGTCACGGAAAAAA--AAAA-TTAAA--GAAG--ATGGT---CA--T-TTCG---AT--ATCCG-CT------GTCAT-CTA--CCA-CTCTTTTCT-TA-TTTAAT-ATC-T-TT-AA--TTTGAA-TA-CT---AACG-CCAGG----T----AC-TGT-TCCT-----AAATGAT-TAATTT----TC-TTACTAGAT-AT---TT-----A-TTAC-AATACATTGTTACGTGTAT-T-GATTGGC---A-GT-T-T--A--CT---T--C-TAA-ATTA-AAC--TGC-CAAAATGGAAAGCAAAAAGATGTCAATTGAATAACGAT-GAC--TTGCAC-C-CTCTCTCT---CTCTCGG---GGTTTTacacccct
gi|11 : aaaacagcctttgtttttgttgtaccgAGGGCGCT-TGATG-T---AGAAC--A---A------AT---T-CAACATAACA-----C--------TACAGA--------AAAG--GAAG--ACG-TG--CA--T-TTTG--AAT--ACCC--CTTCCAATCACTT-CAAT-CCG-CT--TATCT-CATCTTAAA-ATTAT-TT-GA--TTTGAA-CATCT---CACGGTCAGT----T----AA-TATTCCGTTTTTCAGATAAA-TAATATGTAGTC-CTCATTGGT-ATCACTCC--CAGTTTACTAATCTTTTGTCGCTTGCATGT-TATTGGCT-TA-ATAC-AGCA--TT---T--CTTAA-TTTAGAACTTTTC-CCCAATGGA--------------CA
gi|12 : CGT-----AAATAAA-TAATTT----TC-CTTCTAGAT-CTCTCTTT--CAG-TTCC-AGTCTGTTGTCGTTTACAT-T-TATTGACT-TA-AT-C-A--A--TT---T--G-TAA-CGTA-AAC--TTC-CCCAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-CACTCGCGCG---CTCTCGG---GGGTTTTCATAGGATGAACAT------AC---TT--C-TT---AAAAA---CCT-CC-TGTCTT-GGTC-C----T-ATGAAAACC-CCCG-AA-AG----AGCA-C-G---CGT--------AATAT----CATAC----TTTCGCTTTCTGCA-A--AAGCCACTTAG-TTGTC-C-Atg
gi|13 : -----CCTCC-TGG-AAAAA--TACT-CAAGG--GAAG--AAGGCATGCA--T-TTTG--CAA--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-ACATTTTCT-CA-CTCAAA--TC-T-TT-AA--TTTCAA-CA-CA---CACG-TCAGTATTTT----AAATAT-CCAC-----AAATAAA-TAAT-------------------A--ACTTC--CAG-TTCC-A-TCCTTTGTCGCTTATAT-T-
gi|14 : cagggggctgtgtagaaaaaaaaacaagaaccagatccccccccccccccccccccccccccc-----CCTCC-TGG-AAAAA--TACT-CAAGGAAGAAG--GCA-TG--CA--T-TTTG--CAA--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CCG-ACATTTTCT-CA-CTC-AA-ATC-T-TTAAA--TTCAAA-CA-CA---CACGTCCAGTA---TTTTAAA-TAT-CC--------ACCAAA-TAA------------AATA----ATAACTTC--CAG-TT-C-CATCCTTTGTCGCTTATAT-ctgatataggtgttacaacatc
gi|15 : cagggggctgtgtagaaaaaaaaacaagaaccagatcccccccccccccccccccccccccccAAAAATATTTATTTACGGATATCATCTG---GCAG--AAGTG-CCCAAATTAAAGATTTTAAGTGA-GAAAATAGCGGTTGAAGCGAGTGGGTATGCGATAT-GGTGTCTTCCCT-TCCAAGTGTAT-TTTTACTA--GGGGATG-TCTTGA--A---TTACTTC
gi|16 : TTTT-GGTC-C----TCATGAAAA----CCA-AAGAGTGTGAGCAAC-ATTTAGTCATCTACAAATATGTAACATAC----TTTC------TGCA-G--AAGCCA-TTA---TGTC-C-AT---T-TC-G--AAGTTTACATTAGAAATTGAT-TAAA-CCTATA
gi|17 : ---AAGA-----CCCCC-TAGTAAAAAAATAAAACAAGGCGAAAG--ACG-C---CAAAT-TCTGTACAA--ACCCGACT------CGCTT-CAAGACCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAATATCATATT-AAGCTTTGAA-
gi|18 : tG-GTT-TG-TG-C---AGAAA--AAAAA------AA---T-CAA---AACA-----CCCCC-TAGTAAAAT--TAAA-
gi|18 : GG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--AAA-A------AA---T-CAA---AATA-----TCCCC-TAGTAAAAT--TAAttaattttactaggggatattttgatttttttttctacacaagccc
gi|19 : ggtttgtgcagaaaaaaaaaatcaaaacaccccctagtaaaattaaaGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---TTCAA---AACA-----CCCCC-TAGTAA
gi|19 : AGGG-ACT-TG-TG-C---AGAAA--A---A------AAAATT-CAA---AACA-----TCCCC-TAGTAAAAA--TAtatatttttactaggggatgttttgaatttttttttctgcacaagtccct
gi|2 : ggggcttgtgtagaaaaaaattcaaaacaccccctagtaataCAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAA--A---A------AA---T-CAA---AACT-----CCCCC-TAGTAAAAA--TAAA-CAAGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CGCTT-CAA--CTG-CTATTTTCT-CA-CTTAAA-ATC-T-TT-AA--TTTGAA-CA-CT---CACG-CCATT----T----AA-TTT-CCGT-----AAACAGA-TAATTG----TT-CTAATTGGT-ATTACTTT--CAG-TTAC-AATCCTTTGTCGCTTACAT-T-TAATGGCT-CA-A----A--AGTTT---T--T-CAA-CGTA-TAC--TTC-ACAAATGGA--------------CAACTAA------GT-GGC--TTCTGT-TGCTCACTCT---CTCTCGG---GATTTTTCATAGGATGAAGAG------AG---T-----TA---AAAAAAC-CCTCCC-TGTCTT-GGTCGC----T-ATGAAAAACGTCCGAAAAAG----AGCA-CAG---AGT--------GATAT----CATAC----TTTCGCTTT-TGCAGG--AAGCCACTTGT-TTGTC-C-AT---T-GG-G--AA-TTTACGTTAGAAATTGATCTAAGTTCAATAAAT-G-TAAGC-GACAAACAGACG--AG--AACTG-AAAGTA-AGAT--CTAGTAGGAAAAGTATTTATTTACGGATATTAACTG---GCGC--GAGTG-TTCAAATTAAAGATTTTAAGTGA-GAAAATAGCAGTTGAAGCGAGTGGGTATGCAAAAT-GGCGTCTTCCCT-T----GTTTAT-TTTTACTA--GGAGGTG-CTTTGA--T---TTTTTTCTACGCAAG
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gi|6 : CAGGG-GCT-TG-TG-T---AGAAACAA---A------AA---TTCAA---AAC---------------TACAAA---------AGG--GAAG--ACG-C---CA--T-TTTG--CAT--ACCCG-CT------CACTT-CAA--CCG-CTATTTTCT-CA-CTTAAA-ATA-T-TT-GA--TTTGAA-CA-CT---CACG-TCAGT----T----AA-TAT-CCGT-----AAATAAA-TAATTT----GT-CTCATTGGT-ATCACTTC--CAG-TTAC-AATCTTTTGTCGCTTGCAT-T-TATTGGCT-TA-AT-C-A--A--TT---T--C-TAA-TGTA-AAC--TTC-CCCAATGGA--------------CAACTAA------cgt
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gi|8 : atcgT-T-TATTG-CT-TACAT-C-A--A--TTAATTGGC-TTA-CGTA-AAC--GTC-CCTA--------------------------------------------GT-CGCTCGTGCT---CTCTCGG---GGTTTTTCATAGGATGAA-----------------------------AAC-TCT-T--TGTCTT-G------------TGAAAAAC-CCCG-A-GAG----AGCG-C-G---AGT--------GACAT----AATAC----TTTCGCTTTCTGCA-G--AAGCCACATAG-TTGTC-C-AT---TAGG-G--AAGTTTACATTAGATATTGAT-TAAA-CCAATAAAT-G-TAAGA-GAC---CAAACATTGG--AACTG-GAATTA-ATAC--CAATTAGAAAAATTATTTATTTATGAATATTAATCG---GCGT--AAGTT-TTCAAATTAAAGATTTTAAGTGA-GAAAATAGCCGTTGAAGCGAGCGGGTATGCAAAAT-GGCGTCTT
gi|9 : tTGAAAACC-CCCG-AA-AG----AGCA-C-G---AGT--------GATAT----TAAAC----TTTCACTTTCTGCA-G--AAGCCACTTAG-TTGTC-C-AT---T-GG-G--ATGTTTACGTTAGAGATTGAT-TAAG-TCAATAAAT-GATAAGC-GAC-AACAGACG--GGGAAACTGAAAAGTG-AGTC--CTAGTAGGAAAAGTATTTATTTACGGATATTAACGGCATGCGCATGAGTGTTTCAAATTAAAGATTTT-AGTGAGGAAAATAGCGGTTGAAGCGAGCAGGTATGCAAAATGGGCGTCTTCCCCAT----GTTTAT-TTATTCTAATGGGGGTGTTTTTGAATT---TTTTTTCTACACAAGtt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TGATATCACTTCAAAAACTGATACAAAGTAGAAAGTGGATG