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Reference ( gi|3 ) : GTTTGAGCGCTTGTTGTTT--T---CT---TTC-----GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-T-------CTT-CA---T----T--TTTT-C--T---G---TA-CA----T-A------ATT------T--TA-T--T-----------TG-GC-TA-TG-A-T-------AACTAAT-A-TA-A--T-TTAGAA---CTGAAGCCT--G-C-A-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----TT------A----T--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTCT--------------CAA---T-T---T---C--GAT--AC--GTT-C--GC--TT--TCT-TT---ACTTT--CAT--A-A-A-----AT--GCG---CCC--C--T-ATT-G--TTG-----A------------CT-T---------------G----GG--CG-T--C-CGC--TT--G-T---G-GTGT-C---A-AAGATG-T--A-----T----------GTT-GAT-TA-C-G-T--TT---TA-------G--TTC-G---T-TAA--A-CATT-------TATG-T-A---T--A--TTG-GT-----T-G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--T-CTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T-T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AA-T-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-GCA---------TTTTT-CG-----C-TTG--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TTG-AT---T---TT-TG-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCG
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gi|12 : ggGCTTGT-GTTT--T---CT---TTCCG---GAT-A-CCA---ATA------------G-C-T-TTC-G-------CTT-CA---T----T--TTT--C--T---G---TA-C-----T-A------ATT------C--CA-T--T-----------TG-GC-TA-TG-A-T-------AACTAAT-A-TA-AG-T-TTAGAA---CTGAAGC-T--G-C-A-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----TA------T----T--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G----A------C-TTCT--------------CAA---T-C---T------------------------------TCT-TT---ACTTC----T--A-A-A-----AT--GCG---CCC-------ATT-GGTTTG-----A------------CTGT---------------G----GG--C--T--C-CGC--T--------------------------TG-T--A-----T----------GTT-GAT-TA-C-G-T--TT---TAC------G--TTC-G---T-TAA--A-CATT-------TATG-T-A---T-----TTG-GT-----T-G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GTG-CTAAGA---TGT--T-GCT-G-T--T-TG-TGT-----------AA-A-C-A--CTT--A--GAC-C--CG-AT-G--G--T-T----T--GAG-A--TATTC----A--AA--------TT--GT-CG--AT-T---AA-T-TGCA-AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TTG--T--T--A-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TTG-A--------TT-TG-----C-A-AAG--T-TG--C--A---------TT-TT-GCC-CTTCCGata
gi|6 : aGCTTGGTGTTT--T---CT---TTCCG---GAT-A-C-A-----T-----TG-----G-C-T-TTC-G-------CTT-CA---T----T--TTTT-T--TCATG---T--CA----T-A------ATT------C--CA-T--T-----------TG-GC-TA-TG-A-T-------AACTAAT-AATA-AG-T-TTAGAAA--CTGAAGC-T--G-CCA-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-C-C-ATT-----T--AC-----TT------A----T--T--CTGT-T-T-G-A-T---GC----C-A------TGGTCT--------------CAA---T-T---T-----------------------C--TT--TC----------TT--CATA-A-A-A-----AT--GCGC--CCC--C--T-ATTGG--TTG-----A------------CT-T---------------G----GG--CG-T--C-CGC--TT-------------------------TG-T--A-----T----------GTT-GAA-TA-G-G-T--TT---TAC------G--TTC-G---T-TAA--A-CATT-------TATG-T-A---T--G--TTG-GT-----TCG-T--G-ATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--T-CTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--CTT--A--GAA-C--CG-AT-G--G--T-T----T--G---A--TA-T-----A--AA--------TT--TT-CG--AT-T-A-AA-T-TGCAAAAAG-A---TCG-TT-----AT-T---G---T-ACATTTTTTTTTTTTTT-CG-------TTG--T--TAAA-A--T---TA-CA-A--A-T-TT----A-C-A-TTG-GA---T---TT-TG-----C-A-AAG--T-TGTTC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCccgccca
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gi|32 : ttgaaTTGTTTTTT--T---TT---TCCA----GAT-A-C-A---ACT-----TT-----G-C-T-TTC-A-------TTT-AA---T----T--TTTT-T--TCG-G---TA-CA----T-A------ATT------C--TA-T--T-----------TG-GC-TA-TG-A-T-------AACTAagccg
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consensus : GTTTGAGCGCTTGTTGTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTTT-C---T--G---T----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-AT-A-TAAG-TT--TAG-AA---CTGAAGCCT--G-CA-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--AAGTT-C--GC--TT--TCT-TT---ACTTT--CAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCG
Reference ( family-4486 ) : GTTTGAGCGCTTGTTGTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTTT-C---T--G---T----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-AT-A-TAAG-TT--TAG-AA---CTGAAGCCT--G-CA-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--AAGTT-C--GC--TT--TCT-TT---ACTTT--CAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCG
gi|1 : GTTTGAGC--TTGT-GTTT--T---CT---TTCC--A--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-T-C-------GCTT-CA---T----T--TC---C---T--G---T----AGCA---TTA------A------------TT--C--GA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------ATTTA-AT-AATAAG-TTGTTAG-AAAACTTGAAGCCTT-G-TAATA--T-TTTGTCCGATAATC-C---CC-A-TGCTT-----TTAAC-----T----TCT----AT--TTCCTGGAT-TAG-A-TA--GG-G--C-A------T-ATC-TTCTAAATGTTCTCTCA---AT-T---C---T--GATTAAAGTT-CCGGC--TTC-TGT-TT---ACTCA--TATTTA-A-ATGTCGAT--GCG---CC--CCCGT-----ATGGTTG----G-TGT-G-A-CT-TTGGTAAAAACTGCTAGGGATC----G-TTTC-CGC-T--T--G-TTTTGCGTGT-CCCAA-AAGAT-AAT--AAATGCT----------ATT-AAT-TAC-GT--TT---T-A------C-GCTTTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTA-GTGAGAGT--G-T---AATTT-ACT--GT----A-T--G--TT-----T-GTG-TTAAAT---T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-TGATTTGCGTTTAA-ATC-A--TTT--GATGAC-CG-CG-GT-G--T--A--TACCCT--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT---A-AAT--GC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-----G---T-AC----------TTTTT-CG-----CGTT-AA-T--T-AA-A--T----A-C--A--AATGTT----A-C-A-TT-GA--T-------TTTTG-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTC
gi|10 : ggTTGAGA--TTGT-GTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTTT-----T--G---T----A-TA---T-A------T------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T---------------------------TAG-AA---CTGAAGCCT--G-CA-TA--T-TTT-------------------------------T--AC-----T----T------AT--TT-CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---ATAT---T---C--GAT------------------------T---ACTT---CAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--CCC-T-----AT---TG------T-T-G-A-CT-T---------------GG---C----G-T--C-CG--T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA----ATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--AAA-TT-A-A--GT----AGT--G--TT-----T-GT--CTAA-A---T-T--TCTT-G-T--T-TA-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GA--C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC-------AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGCG-AAAG-A---TCG-T------GT-T---GT--T-ACA---------TTTTTGCG-----C-TT-G--G--T-GA-AATT---TG-C--A--T-T-TA----A-CAA-TT-GAATT-------TTT-G-----C-A-AAA--G-TG-T---A--TTTTTTCTT-TT-GCC-CTTTCcgccgc
gi|11 : gTG-CCG-----T-CACCCC-AAT-CTTAAACTC--AC-----T----T------AT--T--CTC--TCT-GCA-T---GC-G--CCA------T-GTC-T--------------CA---AT-CATCT---C--GAT--AGTTC-C--GA--TT--CCTCTT---ACTA---CAT--A-ACAT----AT--GCG---CC--CC--CCTACCAT---TGAACAG-T-T-GCA-CC-TCTTGC----------GGG--C----G-T--C-CGC-T--TC-G-TAC-G-GTGTAC---A-AA-AT-G-TCAA-----T----------GCT-TAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--T-CGGCTT-C-AA--ACACT-------T---ATGTCACTCT-A---TCGAGT-----T--G-CTCGAACTC-A-T--AT----A-TTCG--TTACTGTT-GT--CTAA-A---T-TGTCCTT-G-TCCT-CG-T-T-----------AA-C-A-A--TTT--A--AAC-C--CG-TT-G--G--T--T----TCGAA--A--TA-TC----ACCAA--------TG--TT-C---AT-TAA-AAT-CGC--CAAC-AACTCCGATT---GCAT-T---GC--T-ACACT-------TCTCT-CGC----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C-----C-T-TT----ACC-ATTT-AA--T-------TTT-G-----C-A-AAT--TATG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCcgccgccc
gi|12 : atataGCTTGT-GTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-CCA---ATA------------G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTT--C---T--G---T----A-C----T-A------A------------TT--C--CA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-AT-A-TAAG-TT--TAG-AA---CTGAAGC-T--G-CA-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----A------TT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G----A------C-TTC-T--------------CA---AT-C---T----------------------------TCT-TT---ACTTC----T--A-A-A-----AT--GCG---CC--C---------AT---TG----GTT-T-G-A-CTGT---------------GGG--C------T--C-CGC-T----------------------------T-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-----TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GTG-CTAAGA---TGT--TGCT-G-T--T-TG-TGT-----------AA-A-C-A--CTT--A--GAC-C--CG-AT-G--G--T--T----T--GAG-A--TATTC----A--AA--------TT--GT-CG--AT-T---AAT-TGCA-AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T--A-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA----------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG--C--A---------TT-TT-GCC-CTTCCGcgccgccca
gi|13 : aG-AA---CTGAAGCCT--G-CA-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--AAATTCC--GC---T--TCT-TT---AC-TT--CAT--A-A-A-----AT--GCGC--CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--T-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G-A--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AATGACTTTTTG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCccgccca
gi|14 : ttAAGC-T--G-CA-TA--T-TTTG-CCG-----TCC---CC-A-T--TT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--AAGTTCC--GC---T--TCT-TT---AC-TT--CAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-TG--------------GGG--C----G-T--C-C-C-T--T--GTT---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC--T--TT---T-A------C-G--TTC----T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-AT--T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T---T----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G----T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TCA---A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAGAA---TCG-TT---G-AT-T---G---T-GCA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT--A--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCcgccgccc
gi|15 : a--C-TGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GATCTAC-GT--TTAAAT-ATACCTCC-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------TACGATGT-A-----G---TTG-GT-----T--G-T--G-ATTT-A-T--GTTATGA-T--A--TTTTTCAT-GTTACTAAGA---T-T--CTTT-G-TG-T-TGAT-T-----------AA-C-A-A--TTT--A--GACAT--CGAGT-GTCG--T--T----TA-GA--AACTA-TC----T--AA--------TGA-TTACGAAAA-T-A-AATCTGC--AAGT-A---TCG-ATAGAG-AT-TTTCGC--T-ACA---------TTTTT-CGCAAAAC-TT-GAAT--T-AA-A--TATATA-C--ATTA-T-TT----A-C-AGTT-GAG-T-------TTT-GTCGCAC-A-AAGATT-TG-TCAAA--A------TT-TT-GCC-CTTTCcgccgccca
gi|16 : tgggacgtttcccT-TT---ACT----CAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGATGG-T--A-----T----------GTT-GAT-TACAGT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G---T-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G----T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G-----T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AA--TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTT---G-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A--T-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--A-TG-TT--A--T------TTATT-GCC-CTTTCG
gi|17 : ---CC--CC--T-----AT---TG----GCT-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T-----------TT-GCG-TA--GT--TT---TAA------C-G--TTCGC--T-T-AAACACATT-------T---ATGT-A---T-G---TT--GT-----T--G-T--GAATTTAA-T--GTC---C-T--G--TT-----T-GT--CTAATA---T-T--TCTT-G-T--T-TGTT-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CGTTT-G--GTTT--T----T--GA------A-TT----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G----T---G---T-ACAG--------TTTTT-CG-----C-TT-G--C--T-TA-A--T---TA-C--A--A---TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----CAA-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TG-GCCTCTTTCGccgccc
gi|18 : GTTT--T---CT---ATCC--T--GATTA-CTAGTTATT-----TT-----G-C-T-TTCTGTTTCCGCTT-TA---CAAA-T--TTTT-C---T--GATCT----A-CAAATT-A------AATGATCATTCCCTC--C--CA-T--TTTGTGC-TA-TT-A-TCTGACTCAACAA-ATCA-TACA-TT--TCA-AC---CTGAAGCCT--GACC-TAATT-TTCG-CCG-----A-CA--CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTC--G-T-G-AGT---AC-GACC-AACAGTCC-GTC-G--------------CA---AC-T---TTCCC--GAT--AATTTGCAGGC--TT--ACT-TTGTCACGTTGCTAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--cgccgccca
gi|19 : --TCT-TT---ACTT---CAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--CCC-T-----AT---TG----G-TCT-G-AACT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TT--GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T-----TT-----T-GT--C-GAGACC-T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-ACTTTT--A--GAC-CCTCG-TT----G--T--T----T--G---A--TA-TC----A--AG--------AG--TT-CG--AT-T-ACAAT-TGC--AACG-A---TCGCTT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTT
gi|2 : TTGT-GTTT--A---CT---TTCCCCG--GAT-A---A---ATT-----T------G-C-T-TTC-------GTTTTCA---T----T--TTTT-T---T--GG--T----AACA---T-A------A------------T---C--TA-TA-TT-G-GC-TA-TG-AAT-------AA----AT-A-TAA---------------------TCT--G-CA-TA--T-TTTG-CCG-----A-C---CC-A-T-CTT-----T--ACAA---T----T------ATA-T--CTG--T-T-G-A-CTGGGC-G--C-A------T-GTCTT--------------CAAATAT-T---T---C--GATAGAGGTT-C--GC--TT----C-TT---ACTT----AT--A-A-A----------CG---CCCGCC--TC----AT---TG----G-T-TGG-A-CT-T---------------GGG--CG---G-T--C-CGCTT--T--G-T---G-GTGT-A---A-AGAAT-G-T--A-----T----------G-T-GAT-TAC-GT--TTG--T-A------CGG--TTCG---TGTAAA--ACATT-------T----TGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT---T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTCAGAT--T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTTGAA--GA--C--CG-TT-G--G--TTGT----T--GA--A---A-TCTA--A--AA--------TG---T-CG--AT-TAA-AAT-TGC--AAAG-A---T-G-TTTC-G-ATGT---G---TCACA---------TTTTT-CG-----C-TTGG--T--T----A--T---TA-CGAA--A-TATT----A-C-A-TT-GAT-T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--AT-T------TT-TT-GCC-CTTTCgat
gi|20 : CT-TT---A--TT--CAT--A-A-A-----AT--GC----CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-A-GAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G----GAATT--A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--ATA-GA---T-T--TCT--G-T--T--G-T-T-----------AA---C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA----------TTTT-CG-----C-Ttcggcgcgcca
gi|21 : TTGAGC-TTTGT-GTTT--T---CT---TTTCCGG--GAT-ATC-A---ATT-----TTATCTGG-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----TAATTTCGC---T--G---T----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-TT-A-TAAGCTC--TAG-TA---CTGAAGCCTGCG-CA-TA--TATTTG-CCG-----TCC---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----TAAATTAAT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GATA-AAGTTCC--GC--TT--TCT-TT---
gi|22 : gT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T--------------------------------------------A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCAT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-GCA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--TAGATTGATTT-G-----C-A-AGG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTC
gi|23 : -AGGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GTCTTT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-----------ATGT-AC--T-G---TTG-GT-----TC-G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--C-AAGA---T-T--TCTTCG-TA-T-TG-T-CCTA--------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-CT-CG-TT-G--G--TG-T----T--GAACA--TA-TCAAAAA--AA--------TGTCTC-CGA-AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-cgccgccca
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Reference ( family-4486 ) : GTTTGAGCGCTTGTTGTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTTT-C---T--G---T----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-AT-A-TAAG-TT--TAG-AA---CTGAAGCCT--G-CA-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--AAGTT-C--GC--TT--TCT-TT---ACTTT--CAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCG
gi|1 : GTTTGAGC--TTGT-GTTT--T---CT---TTCC--A--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-T-C-------GCTT-CA---T----T--TC---C---T--G---T----AGCA---TTA------A------------TT--C--GA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------ATTTA-AT-AATAAG-TTGTTAG-AAAACTTGAAGCCTT-G-TAATA--T-TTTGTCCGATAATC-C---CC-A-TGCTT-----TTAAC-----T----TCT----AT--TTCCTGGAT-TAG-A-TA--GG-G--C-A------T-ATC-TTCTAAATGTTCTCTCA---AT-T---C---T--GATTAAAGTT-CCGGC--TTC-TGT-TT---ACTCA--TATTTA-A-ATGTCGAT--GCG---CC--CCCGT-----ATGGTTG----G-TGT-G-A-CT-TTGGTAAAAACTGCTAGGGATC----G-TTTC-CGC-T--T--G-TTTTGCGTGT-CCCAA-AAGAT-AAT--AAATGCT----------ATT-AAT-TAC-GT--TT---T-A------C-GCTTTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTA-GTGAGAGT--G-T---AATTT-ACT--GT----A-T--G--TT-----T-GTG-TTAAAT---T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-TGATTTGCGTTTAA-ATC-A--TTT--GATGAC-CG-CG-GT-G--T--A--TACCCT--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT---A-AAT--GC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-----G---T-AC----------TTTTT-CG-----CGTT-AA-T--T-AA-A--T----A-C--A--AATGTT----A-C-A-TT-GA--T-------TTTTG-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTC
gi|10 : ggTTGAGA--TTGT-GTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTTT-----T--G---T----A-TA---T-A------T------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T---------------------------TAG-AA---CTGAAGCCT--G-CA-TA--T-TTT-------------------------------T--AC-----T----T------AT--TT-CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---ATAT---T---C--GAT------------------------T---ACTT---CAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--CCC-T-----AT---TG------T-T-G-A-CT-T---------------GG---C----G-T--C-CG--T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA----ATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--AAA-TT-A-A--GT----AGT--G--TT-----T-GT--CTAA-A---T-T--TCTT-G-T--T-TA-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GA--C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC-------AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGCG-AAAG-A---TCG-T------GT-T---GT--T-ACA---------TTTTTGCG-----C-TT-G--G--T-GA-AATT---TG-C--A--T-T-TA----A-CAA-TT-GAATT-------TTT-G-----C-A-AAA--G-TG-T---A--TTTTTTCTT-TT-GCC-CTTTCcgccgc
gi|11 : gTG-CCG-----T-CACCCC-AAT-CTTAAACTC--AC-----T----T------AT--T--CTC--TCT-GCA-T---GC-G--CCA------T-GTC-T--------------CA---AT-CATCT---C--GAT--AGTTC-C--GA--TT--CCTCTT---ACTA---CAT--A-ACAT----AT--GCG---CC--CC--CCTACCAT---TGAACAG-T-T-GCA-CC-TCTTGC----------GGG--C----G-T--C-CGC-T--TC-G-TAC-G-GTGTAC---A-AA-AT-G-TCAA-----T----------GCT-TAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--T-CGGCTT-C-AA--ACACT-------T---ATGTCACTCT-A---TCGAGT-----T--G-CTCGAACTC-A-T--AT----A-TTCG--TTACTGTT-GT--CTAA-A---T-TGTCCTT-G-TCCT-CG-T-T-----------AA-C-A-A--TTT--A--AAC-C--CG-TT-G--G--T--T----TCGAA--A--TA-TC----ACCAA--------TG--TT-C---AT-TAA-AAT-CGC--CAAC-AACTCCGATT---GCAT-T---GC--T-ACACT-------TCTCT-CGC----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C-----C-T-TT----ACC-ATTT-AA--T-------TTT-G-----C-A-AAT--TATG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCcgccgccc
gi|12 : atataGCTTGT-GTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-CCA---ATA------------G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTT--C---T--G---T----A-C----T-A------A------------TT--C--CA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-AT-A-TAAG-TT--TAG-AA---CTGAAGC-T--G-CA-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----A------TT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G----A------C-TTC-T--------------CA---AT-C---T----------------------------TCT-TT---ACTTC----T--A-A-A-----AT--GCG---CC--C---------AT---TG----GTT-T-G-A-CTGT---------------GGG--C------T--C-CGC-T----------------------------T-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-----TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GTG-CTAAGA---TGT--TGCT-G-T--T-TG-TGT-----------AA-A-C-A--CTT--A--GAC-C--CG-AT-G--G--T--T----T--GAG-A--TATTC----A--AA--------TT--GT-CG--AT-T---AAT-TGCA-AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T--A-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA----------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG--C--A---------TT-TT-GCC-CTTCCGcgccgccca
gi|13 : aG-AA---CTGAAGCCT--G-CA-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--AAATTCC--GC---T--TCT-TT---AC-TT--CAT--A-A-A-----AT--GCGC--CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--T-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G-A--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AATGACTTTTTG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCccgccca
gi|14 : ttAAGC-T--G-CA-TA--T-TTTG-CCG-----TCC---CC-A-T--TT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--AAGTTCC--GC---T--TCT-TT---AC-TT--CAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-TG--------------GGG--C----G-T--C-C-C-T--T--GTT---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC--T--TT---T-A------C-G--TTC----T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-AT--T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T---T----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G----T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TCA---A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAGAA---TCG-TT---G-AT-T---G---T-GCA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT--A--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCcgccgccc
gi|15 : a--C-TGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GATCTAC-GT--TTAAAT-ATACCTCC-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------TACGATGT-A-----G---TTG-GT-----T--G-T--G-ATTT-A-T--GTTATGA-T--A--TTTTTCAT-GTTACTAAGA---T-T--CTTT-G-TG-T-TGAT-T-----------AA-C-A-A--TTT--A--GACAT--CGAGT-GTCG--T--T----TA-GA--AACTA-TC----T--AA--------TGA-TTACGAAAA-T-A-AATCTGC--AAGT-A---TCG-ATAGAG-AT-TTTCGC--T-ACA---------TTTTT-CGCAAAAC-TT-GAAT--T-AA-A--TATATA-C--ATTA-T-TT----A-C-AGTT-GAG-T-------TTT-GTCGCAC-A-AAGATT-TG-TCAAA--A------TT-TT-GCC-CTTTCcgccgccca
gi|16 : tgggacgtttcccT-TT---ACT----CAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGATGG-T--A-----T----------GTT-GAT-TACAGT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G---T-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G----T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G-----T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AA--TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTT---G-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A--T-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--A-TG-TT--A--T------TTATT-GCC-CTTTCG
gi|17 : ---CC--CC--T-----AT---TG----GCT-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T-----------TT-GCG-TA--GT--TT---TAA------C-G--TTCGC--T-T-AAACACATT-------T---ATGT-A---T-G---TT--GT-----T--G-T--GAATTTAA-T--GTC---C-T--G--TT-----T-GT--CTAATA---T-T--TCTT-G-T--T-TGTT-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CGTTT-G--GTTT--T----T--GA------A-TT----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G----T---G---T-ACAG--------TTTTT-CG-----C-TT-G--C--T-TA-A--T---TA-C--A--A---TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----CAA-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TG-GCCTCTTTCGccgccc
gi|18 : GTTT--T---CT---ATCC--T--GATTA-CTAGTTATT-----TT-----G-C-T-TTCTGTTTCCGCTT-TA---CAAA-T--TTTT-C---T--GATCT----A-CAAATT-A------AATGATCATTCCCTC--C--CA-T--TTTGTGC-TA-TT-A-TCTGACTCAACAA-ATCA-TACA-TT--TCA-AC---CTGAAGCCT--GACC-TAATT-TTCG-CCG-----A-CA--CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTC--G-T-G-AGT---AC-GACC-AACAGTCC-GTC-G--------------CA---AC-T---TTCCC--GAT--AATTTGCAGGC--TT--ACT-TTGTCACGTTGCTAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--cgccgccca
gi|19 : --TCT-TT---ACTT---CAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--CCC-T-----AT---TG----G-TCT-G-AACT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TT--GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T-----TT-----T-GT--C-GAGACC-T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-ACTTTT--A--GAC-CCTCG-TT----G--T--T----T--G---A--TA-TC----A--AG--------AG--TT-CG--AT-T-ACAAT-TGC--AACG-A---TCGCTT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTT
gi|2 : TTGT-GTTT--A---CT---TTCCCCG--GAT-A---A---ATT-----T------G-C-T-TTC-------GTTTTCA---T----T--TTTT-T---T--GG--T----AACA---T-A------A------------T---C--TA-TA-TT-G-GC-TA-TG-AAT-------AA----AT-A-TAA---------------------TCT--G-CA-TA--T-TTTG-CCG-----A-C---CC-A-T-CTT-----T--ACAA---T----T------ATA-T--CTG--T-T-G-A-CTGGGC-G--C-A------T-GTCTT--------------CAAATAT-T---T---C--GATAGAGGTT-C--GC--TT----C-TT---ACTT----AT--A-A-A----------CG---CCCGCC--TC----AT---TG----G-T-TGG-A-CT-T---------------GGG--CG---G-T--C-CGCTT--T--G-T---G-GTGT-A---A-AGAAT-G-T--A-----T----------G-T-GAT-TAC-GT--TTG--T-A------CGG--TTCG---TGTAAA--ACATT-------T----TGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT---T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTCAGAT--T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTTGAA--GA--C--CG-TT-G--G--TTGT----T--GA--A---A-TCTA--A--AA--------TG---T-CG--AT-TAA-AAT-TGC--AAAG-A---T-G-TTTC-G-ATGT---G---TCACA---------TTTTT-CG-----C-TTGG--T--T----A--T---TA-CGAA--A-TATT----A-C-A-TT-GAT-T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--AT-T------TT-TT-GCC-CTTTCgat
gi|20 : CT-TT---A--TT--CAT--A-A-A-----AT--GC----CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-A-GAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G----GAATT--A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--ATA-GA---T-T--TCT--G-T--T--G-T-T-----------AA---C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA----------TTTT-CG-----C-Ttcggcgcgcca
gi|21 : TTGAGC-TTTGT-GTTT--T---CT---TTTCCGG--GAT-ATC-A---ATT-----TTATCTGG-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----TAATTTCGC---T--G---T----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-TT-A-TAAGCTC--TAG-TA---CTGAAGCCTGCG-CA-TA--TATTTG-CCG-----TCC---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----TAAATTAAT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GATA-AAGTTCC--GC--TT--TCT-TT---
gi|22 : gT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T--------------------------------------------A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCAT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-GCA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--TAGATTGATTT-G-----C-A-AGG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTC
gi|23 : -AGGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GTCTTT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-----------ATGT-AC--T-G---TTG-GT-----TC-G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--C-AAGA---T-T--TCTTCG-TA-T-TG-T-CCTA--------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-CT-CG-TT-G--G--TG-T----T--GAACA--TA-TCAAAAA--AA--------TGTCTC-CGA-AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-cgccgccca
gi|24 : gtgcaaaggTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TT---C---T--G---T----A-CA---T-A-------------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AA-TATTT-A-TAAG-TT--TAG-AA---CTGAAG-CT--G-CA-T---T-TTTG-CCG-----T------C-A-T--TT-----T--ACTTAAAT----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GA-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--AA
gi|25 : GCTTGT-GTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---A-T-----TT-----G-C-T-TTC-------GC-T-CA--------T--TTTT-CAA-T--G---T----A-CAT--T-A------A------------TT--CCGTA-T--TT-G-GCATA-TG-A-T--------ACTA-A--A-TAAG-TT--TAA-AA---CTGAAG-CT--G-CA-TA--T-T-----------------------C-CTT-----T--AC----------T------ATTCT--CTG--T-T-G-A-----GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---
gi|26 : ggtga-TTC-------GCTT-CA---T----T--ATTT-C---T--G---T----A-TA---T-ACATGTAA------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TAGTG-G---------AACTA-AT-A-TAAG-TT--TAG-AA---CTGAAGCCT--GCCA-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----TTAAAT------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-A--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--AAGTT-C--
gi|27 : TTGTT-TTT--T---TT---TTCC--GA-GAT-A-C-A---ACT-----T------G-C-T-TTC-------AATT-TAATTT----T--TTTT-C---T--G---T----A-CA---T-A------A------------TTA-C--TA-TTCTT-G-GC-TA-TG-A-A-------TACTA-Acgc
gi|28 : agggggttgtatgTGTTGTTT--T---TTATTTTCC--GA-GAT-A-C-A---ACT-----T------G-C-T-TTC-------AATT-TAAT-T----T--TTTT-C---T--G---T----A-CA---T-A------A------------TTA-C--TA-TTCTT-G-GC-TA-TGAA-T-------AACgtta
gi|29 : aggggttgtgaTTTTTT--T---TT---TTCC--A--GAT-A-C-A---A-C-----TT-----G-C-T-TTC-------AATT-TAAT-T----T--TTTT-C---T--G---T----A-CA---T-AT-----A------------TTA-C--TACC--TT-G-GC-TA-TGAA-T-------AACTA-Aa
gi|3 : ttgtgattGTTTGAGCGCTTGTTGTTT--T---CT---TTC------GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------TCTT-CA---T----T--TTTT-C---T--G---T----A-CA---T-A------A------------TT--T--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-AT-A-TAA--TT--TAG-AA---CTGAAGCCT--G-CA-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--ACGTT-C--GC--TT--TCT-TT---ACTTT--CAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--CC--T-----AT---TG------T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A--------G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-A---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-GCA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GAT-T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCGgtta
gi|30 : TTGAGC--TTGTTTTGC--T---CG---TTCC--G--GTT-A-C-A---AAT-----TT-----G-C-T-TTC-------GTTT-AA--------T--TTTT-C---T--T---TACAAA-CA---T-A------A------------TTCCC--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-A
gi|31 : GTTTGCT---CT---TTCC--GACGAA-C-C-A---GAT-----TT-----G-C-T-TTC-------GTTT-CA---T----T--TTTT-C---T--A---G----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-Ag
gi|32 : gttggctgTTGTT-TTT--T---TT---TTCC--A--GAT-A-C-A---ACT-----TT-----G-C-T-TTC-------ATTT-AA---T----T--TTTT-T---TCGG---T----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-g
gi|34 : tgtgaTTGAGC--TTGT-GTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------TCTT-CA---T----T--TTTT-C---T--G---T----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT---GC-TA-TG-A-T-------AACT
gi|36 : gTTGTTT--TGCTCT---TTCT--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-CTT-TTC-------GTTT-CA---T----T--------------------------A---T-A------A-------------------TA-T--TT-G-GC-TA-TA-----------AACTA-
gi|38 : gggggaagaTTGAA-GCTTGT-GTTT--T--------TTCC-------------A---ATT-----T------G-C-T-TTC-------GCTT-CA---TA---T--TTTT-C---T--G---T----A-CA---T-A------A-------------T--C--TA-T--TT---GC-TA-
gi|4 : ggTTGT-GTTC--T---GT---TACC--G--GAT-G-A-A---ATTGTGGCTT-----G-T-TCTTC-------GCTT-CA---T----T--TTTT-C---T--G---T----A-TA---T---------------------TT--C--GA-T--TT-G--C-TC-TG-A-T--------------T-A-TGA----------AA---CTGAG--CT--G-CA-TA--C-TTT-------------------------------T--AC-----T-----------AT--T--TTG--TGT-GTA-TC--GC-G--C-A------TTGTC-T--------------CA---AT-T---T---CT-AATG-AAGTC-T--CC--TA--TCT------ACT----CAT--A-A-AT----ATT-GCG---CC--C---T-----AT---TG----G-T-T-G---CT-T---------------GGG--C----G-C--CGCGCAT--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TTA--T-A------C-G--TTCG-----T-AA--ACA-T-------T---ATGT-----T-G---TCT-GT-----T--G-T--AAATTT-A-CAAGT----A-A--G--TT-----T-GT--CTAAAAAATT-T--TCTT-GTT--T-TA-T-T-----------AA-A-CGA--TTT--A--GAC-CGTCG--T-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----C--AA--------TG--TT-TG--ATCT-A-AAT-TGC--AAAG-A---TTC-TT---G-AT-T---GTACT-ACA---------TTTTT-CG-----C-AT-G--TG-T-AATA--T---TA-C--AC-A-T-TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----CAA-AAG--T-AG-TC--ACCC------TT-TT-GCC-TTTCCata
gi|40 : ttgaaTT-----TT-----G-C-T-TTC-------GTTT-CA---TGTT-T--TTTT-CCC-T--G---T----A-CA---T-A------A------------TT--G--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-Aagccg
gi|41 : --T---TA-C--A--A-T-TTGTAAA-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TT--A--T------TT-TT-GCC-CTTTC
gi|42 : T-----TT-----G-C-T-TTC-------GTTT-CA---TGTTTT--TTTC-C---T--G---T----A-CA---T-A------A------------TT--G--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACcgccgccca
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gi|44 : -GA--TG------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TT--A--T------TT-TT-GCC-CTTTC
gi|45 : -C---T--G---T----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-Accgccgcccat
gi|5 : TTGAGC-----TTGTTT--T---CT---TTCC--A--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTTT-C---T--G---T----A-CA---T-A------A------------T---C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------ATTTA-AT-A-TAAG-TT--TA--AA---CTGAAGCCT--G-CA-TA--T-TTTG-CCT-----C-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--AAGTT-C---C--GT--TCT-TT---ACTT---CAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--CCC-T-----AT---TG------T-T-G-A-CT-T---------------GGG--CTGGCG-T--C-CGC-T--T--G-T---G--T-T-C---A-AAGAT-A-T--A-----T----------GT--AAT-TAC-GT--TT-----A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-----------ATGT-A-----G---TTG-GT-----T--G-T--GAATAT-A-T----------T--A--TT-----T-GT--GTAAGA---T-T--TCTT-G-T--T--G-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--A--T-------GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-A--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTG-C-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTC
gi|6 : gGCTTGGTGTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A-----T-----TG-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTTT-TTCAT--G---T------CA---T-A------A------------TT--C--CA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-ATAA-TAAG-TT--TAGAAA---CTGAAG-CT--GCCA-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-C-C-ATT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTGT-T-T-G-A-T---GC----C-A------TGGTC-T--------------CA---AT-T---T---------------------C--TT--TC----------TT--CATA-A-A-A-----AT--GCGC--CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T-------------------------T-G-T--A-----T----------GTT-GAA-TAG-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----TC-G-T--G-ATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--CTT--A--GAA-C--CG-AT-G--G--T--T----T--G---A--TA-T-----A--AA--------TT--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGCAAAAAG-A---TCG-TT-----AT-T---G---T-ACATTTTTTTTTTTTTT-CG-------TT-G--T--TAAA-A--T---TA-CA-A--A-T-TT----A-C-A-TTGGA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TGTTC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCcgccgccc
gi|7 : aTGTTT--T---CT---TTCC--G--G-T-A-C-A---AAT-----TT-----GTC-T-TTC-------GCTTTCA---T----T--TTTT-C---T--G---T----A-AAA--T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-------------G-AT-A-----------AG-AA---CTGAAGT-T--G-CA-TA--T-TTT----------------------------------AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GA---AAGTTCC--GC--TTCATTT-TT---AACTT--CAT--ATA-A-----ATGGGCGC--CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-C--TTGG-T---G-GTGT-CAAAA-AAGAT-G-T--A-----TG---------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--AC-TT-------T---ATGT-A---T-G----TG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TTA----TGGT--CTAAGA---T-T--TCTT-G-T--TGTG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAT-CG-CG-TTGG--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-TG--AT-T-A-AAT-TGCA-AAAG-A---TCGTTT---G-AT-T---G---T-ACA----------TTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A------TT----A-C-A-TT-GA----------TTT-G-----C-ACAAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTcgcgccat
gi|8 : gTTTGGGC--TTGT-GTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTTTTC---T--G---T----A-CA---G-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-AT-A-TAAG-TT--TAG-AA---CTGAAGCCT--G-CT-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CCCA-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-AAT---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--AAGTT-CC-GC--TT--T---TT---ACTT---CAT--A-A-A-----AT--GCGGGCCC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--TT-G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------TTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---G-T--TCTT-----------------------------------------------------------G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TT--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCtcccgcccat
gi|9 : -T-TTT-----T--AC-----A----T------GA--C--CTA--C-T-A-A-TA--GCAG--C-T------T-TTC-TA-------------CA---AT-T---T---CCGAAT--AAGTC-C--GCCCTT--CTT-TT---ACTTT--CAT--ATA-A-----ATC-GCC---CC--CC--T-----AT----G----G-T-C-G-A-CT-----------------GGG--C----GAT--CTCGC-TGTC--G-T---G-GT-T-C---ATACAAT-G-C--A-----TTGTGCCATGCGTTCGAT-TACCGT--TT---T-T------C-G--TTCGG--T-T-AA--ACATTCCACTACT---AT-T-A---TCGAATTTG-GT-----TCTGCT--GAATT--A-T--GT----A-T--GCTTT-----T-GT--CTAAGA-----T--TCTT---T--T-TG-G-T-----------AAGA-C-AT-TTT--A--GAC-C--CG-TT-------T--T----TG-GA--A--TA-TCGT--A--AA--------TG--TT-CG--AT-T---AAT-TGC--AAAG-A---TCT-CT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CGA----C-TT-G--TCAT-AA-A--T---TATC--A--A-T-TT----A-C-ACTT-GA--T-------TTT-GCA---C-A-AAT--T-TG-TC--A--T------TT-TTCGCC-TTTCCGcgccgccca
blockSeqs : GC T GC GCT ATT CCG T T C GTT T GTGGC TATCTG T T C TGTTTCC T TGTTT AA G TCA CG ATC ACAA A AAT . AATGATCATTCCC CC CG C TC T T A G A A CTGACTC T C . GC . A . C GC A . AT A . TCACC C A C AAACT . TTAAATTA TC T T C . C G TGG A AC C ACAGTC T T A AAT A ATC TCCC AG GCAGGCTT C GTC T TGC A T C T GG GGC CG CCTACC . AACAG C G C A G CTTGC . TGGC A . G T GT TG T AC . A AAA T G . CA . TGTGCCATGC C C A CT AAA A TACCTC G . GCT G A AC CCACTAC ACG C CTC C AAT A . CT C TC A . AA TATG G TC CT ACTGT G TA AAT G GT C T CC G A G CTA G . G CT GA . A CT A G TC TT TG . CG AC AC T AAAA CC TGACTTTT TC A AA C A C C AA A ACT A AGA C G TTC TAC C TTTTTTTTT G CAAAA . G AA CA A T AT ATA T GA TT . A GTAA C A T G TAGATTGA . TCGCA A C AT A T AA TTTTTTC A C T
blockSeqs : GC T . . . CGG . . T . T . T . . . . T CAAA . T AA . G . . T . CATGTAA A . . TC . . . . A . . . A . G . . . C . C . . . . TCC . . C . . TTAAATT A . . G . T A C . . . . G . . . . . CCG A CCGCTTCA . . T C . T . T T C . CT . GT . . . . . G . G . . T A . C . . . . . . . . . . G . . C . G . . . . C . . . . . . T . . . . C . . . . . C . . . TTTCA . G CC . . . . G . T . . . . . T . . . GT T . . . G . A G . . TA . . A . A . A . . G . . C TC . . . T . CT . C . . . G . . . . . A C . . . . . G . ATT . CA A . . . . . CCC . . .
blockSeqs : GC T . . . GAC . . . . T . T . . . . . ATTT . . CC . . . . A . TA A . . A . . . . . . . . . . A . . . C . C . . . . ACA . . C . . TTAAAT . . . . . . . A . . . . . . . . . . CT G CGCCCTT . . T T . . . . C C . CT . GC . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . G . . . . . . C . . . . C . . . . . . . . . A . . T . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . G . . . GT . . . . . . . . . A . . T . . . . C . G . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . GT . . . . . . . . TT . . .
blockSeqs : GC T . . . GA . . . . T . T . . . . . TGTT . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . G . . . C . . . . . . TCC . . C . . AATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . CCGCTT . . T T . . . . . C . TC . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : GC T . . . GA . . . . T . T . . . . . ATT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . . . C . . . . . . TC . . C . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . CCGCTT . . G T . . . . . . . CT . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : T T . . . G . . . . T . T . . . . . ATT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . . . T . . . . . . TC . . C . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . CGATT . . T T . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . T . . . G . . . . C . T . . . . . TA . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . . . C . . . . . . AC . . C . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . CCGCT . . T T . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . T . . . T . . . . C . T . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . . . C . . . . . . TC . . C . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . CCGCT . . T T . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . T . . . G . . . . T . T . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . . . C . . . . . . TC . . C . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . CGCTT . . T T . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . T . . . G . . . . A . T . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . . . C . . . . . . CC . . C . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . CGCTT . . T . . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . .
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blockSeqs : . . . . G . . . . C . T . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . TC . . C . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . CCGT . . T . . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . T . T . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . CTT . . T . . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . T . T . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . T . T . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . T . T . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . T . G . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . T . T . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . A . T . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . T . . . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
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originalCons : GTTTGAGCGCTTGTTGTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTTT-C---T--G---T----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-AT-A-TAAG-TT--TAG-AA---CTGAAGCCT--G-CA-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--AAGTT-C--GC--TT--TCT-TT---ACTTT--CAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCG
finalCons : GTTTGAGCGCTTGTTGTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTTT-C---T--G---T----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-AT-A-TAAG-TT--TAG-AA---CTGAAGCCT--G-CA-TA--T-TTTG-CCGTC---------CC-A-TC-TT-----T--ACTT---------------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-GTC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--AAGTTCCGCTT------TCT-TT---ACTTT--CAT--A-A-A-----AT--GCG---CC--CCT-------AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCG
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4486 ) : GTTTGAGCGCTTGTTGTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTTT-C--T---G---T----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-AT-A-TAAG-TT--TAGAA---CTGAAGCCT--G-C-A-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-G-TC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--A-AGTTCC--GC--TT--TCT--TT---ACTTT--CAT--A-A-A-----A-T--GCG---CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCG
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gi|10 : ggTTGAGA--TTGT-GTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTTT----T---G---T----A-TA---T-A------T------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T---------------------------TAGAA---CTGAAGCCT--G-C-A-TA--T-TTT-------------------------------T--AC-----T----T------AT--TT-CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-G-TC-T--------------CA---ATAT---T---C--GAT--------------------------T---ACTT---CAT--A-A-A-----A-T--GCG---CC--CCC-T-----AT---TG------T-T-G-A-CT-T---------------GG---C----G-T--C-CG--T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA----ATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--AAA-TT-A-A--GT----AGT--G--TT-----T-GT--CTAA-A---T-T--TCTT-G-T--T-TA-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GA--C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC-------AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGCG-AAAG-A---TCG-T------GT-T---GT--T-ACA---------TTTTTGCG-----C-TT-G--G--T-GA-AATT---TG-C--A--T-T-TA----A-CAA-TT-GAATT-------TTT-G-----C-A-AAA--G-TG-T---A--TTTTTTCTT-TT-GCC-CTTTCcgccgc
gi|11 : gTG-CCG-----T-CACCCC-AAT-CTTAAACTC--AC-----T----T------AT--T--CTC--TCT-GCA-T---GC-G--CCA------T-G-TC-T--------------CA---AT-CATCT---C--GAT--A--GTTCC--GA--TT--CCTC-TT---ACTA---CAT--A-ACAT----A-T--GCG---CC--CC--CCTACCAT---TGAACAG-T-T-GCA-CC-TCTTGC----------GGG--C----G-T--C-CGC-T--TC-G-TAC-G-GTGTAC---A-AA-AT-G-TCAA-----T----------GCT-TAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--T-CGGCTT-C-AA--ACACT-------T---ATGTCACTCT-A---TCGAGT-----T--G-CTCGAACTC-A-T--AT----A-TTCG--TTACTGTT-GT--CTAA-A---T-TGTCCTT-G-TCCT-CG-T-T-----------AA-C-A-A--TTT--A--AAC-C--CG-TT-G--G--T--T----TCGAA--A--TA-TC----ACCAA--------TG--TT-C---AT-TAA-AAT-CGC--CAAC-AACTCCGATT---GCAT-T---GC--T-ACACT-------TCTCT-CGC----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C-----C-T-TT----ACC-ATTT-AA--T-------TTT-G-----C-A-AAT--TATG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCcgccgccc
gi|12 : atataGCTTGT-GTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-CCA---ATA------------G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTT--C--T---G---T----A-C----T-A------A------------TT--C--CA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-AT-A-TAAG-TT--TAGAA---CTGAAGC-T--G-C-A-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----A------TT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G----A------C-T-TC-T--------------CA---AT-C---T-----------------------------TCT--TT---ACTTC----T--A-A-A-----A-T--GCG---CC--C---------AT---TG----GTT-T-G-A-CTGT---------------GGG--C------T--C-CGC-T----------------------------T-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-----TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GTG-CTAAGA---TGT--TGCT-G-T--T-TG-TGT-----------AA-A-C-A--CTT--A--GAC-C--CG-AT-G--G--T--T----T--GAG-A--TATTC----A--AA--------TT--GT-CG--AT-T---AAT-TGCA-AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T--A-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA----------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG--C--A---------TT-TT-GCC-CTTCCGcgccgccca
gi|13 : aGAA---CTGAAGCCT--G-C-A-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-G-TC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--A-AATTCC--GC--TT---CT--TT---ACTT---CAT--A-A-A-----A-T--GCG---CC--CCC-T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--T-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G-A--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AATGACTTTTTG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCccgccca
gi|14 : ttAAGC-T--G-C-A-TA--T-TTTG-CCG-----TCC---CC-A-T--TT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-G-TC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--A-AGTTCC--GC---T--TCT--TT---AC-TT--CAT--A-A-A-----A-T--GCG---CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-TG--------------GGG--C----G-T--C-C-C-T--T--GTT---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC--T--TT---T-A------C-G--TTC----T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-AT--T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T---T----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G----T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TCA---A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAGAA---TCG-TT---G-AT-T---G---T-GCA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT--A--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCcgccgccc
gi|15 : a--C-TGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GATCTAC-GT--TTAAAT-ATACCTCC-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------TACGATGT-A-----G---TTG-GT-----T--G-T--G-ATTT-A-T--GTTATGA-T--A--TTTTTCAT-GTTACTAAGA---T-T--CTTT-G-TG-T-TGAT-T-----------AA-C-A-A--TTT--A--GACAT--CGAGT-GTCG--T--T----TA-GA--AACTA-TC----T--AA--------TGA-TTACGAAAA-T-A-AATCTGC--AAGT-A---TCG-ATAGAG-AT-TTTCGC--T-ACA---------TTTTT-CGCAAAAC-TT-GAAT--T-AA-A--TATATA-C--ATTA-T-TT----A-C-AGTT-GAG-T-------TTT-GTCGCAC-A-AAGATT-TG-TCAAA--A------TT-TT-GCC-CTTTCcgccgccca
gi|16 : tgggacgtttcccT--TT---ACT----CAT--A-A-A-----A-T--GCG---CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGATGG-T--A-----T----------GTT-GAT-TACAGT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G---T-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G----T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G-----T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AA--TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTT---G-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A--T-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--A-TG-TT--A--T------TTATT-GCC-CTTTCG
gi|17 : ---CC--CC--T-----AT---TG----GCT-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T-----------TT-GCG-TA--GT--TT---TAA------C-G--TTCGC--T-T-AAACACATT-------T---ATGT-A---T-G---TT--GT-----T--G-T--GAATTTAA-T--GTC---C-T--G--TT-----T-GT--CTAATA---T-T--TCTT-G-T--T-TGTT-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CGTTT-G--GTTT--T----T--GA------A-TT----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G----T---G---T-ACAG--------TTTTT-CG-----C-TT-G--C--T-TA-A--T---TA-C--A--A---TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----CAA-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TG-GCCTCTTTCGccgccc
gi|18 : GTTT--T---CT---ATCC--T--GATTA-CTAGTTATT-----TT-----G-C-T-TTCTGTTTCCGCTT-TA---CAAA-T--TTTT-C--T---GATCT----A-CAAATT-A------AATGATCATTCCCTC--C--CA-T--TTTGTGC-TA-TT-A-TCTGACTCAACAA-ATCA-TACA-TT--TCAAC---CTGAAGCCT--GAC-C-TAATT-TTCG-CCG-----A-CA--CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTC--G-T-G-AGT---AC-GACC-AACAGTCC-G-TC-G--------------CA---AC-T---TTCCC--GAT--A-ATTTGCAGGC--TT--ACT--TTGTCACGTTGCTAT--A-A-A-----A-T--GCG---CC--cgccgccca
gi|19 : --TCT--TT---ACTT---CAT--A-A-A-----A-T--GCG---CC--CCC-T-----AT---TG----G-TCT-G-AACT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TT--GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T-----TT-----T-GT--C-GAGACC-T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-ACTTTT--A--GAC-CCTCG-TT----G--T--T----T--G---A--TA-TC----A--AG--------AG--TT-CG--AT-T-ACAAT-TGC--AACG-A---TCGCTT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTT
gi|2 : TTGT-GTTT--A---CT---TTCCCCG--GAT-A---A---ATT-----T------G-C-T-TTC-------GTTTTCA---T----T--TTTT-T--T---GG--T----AACA---T-A------A------------T---C--TA-TA-TT-G-GC-TA-TG-AAT-------AA----AT-A-TAA--------------------TCT--G-C-A-TA--T-TTTG-CCG-----A-C---CC-A-T-CTT-----T--ACAA---T----T------ATA-T--CTG--T-T-G-A-CTGGGC-G--C-A------T-G-TCTT--------------CAAATAT-T---T---C--GAT--AGAGGTTC--GC--TT----C--TT---ACTT----AT--A-A-A-----------CG---CCCGCC--TC----AT---TG----G-T-TGG-A-CT-T---------------GGG--CG---G-T--C-CGCTT--T--G-T---G-GTGT-A---A-AGAAT-G-T--A-----T----------G-T-GAT-TAC-GT--TTG--T-A------CGG--TTCG---TGTAAA--ACATT-------T----TGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT---T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTCAGAT--T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTTGAA--GA--C--CG-TT-G--G--TTGT----T--GA--A---A-TCTA--A--AA--------TG---T-CG--AT-TAA-AAT-TGC--AAAG-A---T-G-TTTC-G-ATGT---G---TCACA---------TTTTT-CG-----C-TTGG--T--T----A--T---TA-CGAA--A-TATT----A-C-A-TT-GAT-T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--AT-T------TT-TT-GCC-CTTTCgat
gi|20 : CT--TT---A--TT--CAT--A-A-A-----A-T--GC----CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-A-GAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G----GAATT--A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--ATA-GA---T-T--TCT--G-T--T--G-T-T-----------AA---C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA----------TTTT-CG-----C-Ttcggcgcgcca
gi|21 : TTGAGC-TTTGT-GTTT--T---CT---TTTCCGG--GAT-ATC-A---ATT-----TTATCTGG-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----TAATTTCGC--T---G---T----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-TT-A-TAAGCTC--TAGTA---CTGAAGCCTGCG-C-A-TA--TATTTG-CCG-----TCC---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----TAAATTAAT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-G-TC-T--------------CA---AT-T---T---C--GATA-A-AGTTCC--GC--TT--TCT--TT---
gi|22 : gT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T--------------------------------------------A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCAT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-GCA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--TAGATTGATTT-G-----C-A-AGG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTC
gi|23 : -AGGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GTCTTT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-----------ATGT-AC--T-G---TTG-GT-----TC-G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--C-AAGA---T-T--TCTTCG-TA-T-TG-T-CCTA--------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-CT-CG-TT-G--G--TG-T----T--GAACA--TA-TCAAAAA--AA--------TGTCTC-CGA-AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-cgccgccca
gi|24 : gtgcaaaggTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TT---C--T---G---T----A-CA---T-A-------------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AA-TATTT-A-TAAG-TT--TAGAA---CTGAAG-CT--G-C-A-T---T-TTTG-CCG-----T------C-A-T--TT-----T--ACTTAAAT----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GA-G--C-A------T-G-TC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--A-A
gi|25 : GCTTGT-GTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---A-T-----TT-----G-C-T-TTC-------GC-T-CA--------T--TTTT-CAAT---G---T----A-CAT--T-A------A------------TT--CCGTA-T--TT-G-GCATA-TG-A-T--------ACTA-A--A-TAAG-TT--TAAAA---CTGAAG-CT--G-C-A-TA--T-T-----------------------C-CTT-----T--AC----------T------ATTCT--CTG--T-T-G-A-----GC-G--C-A------T-G-TC-T--------------CA---AT-T---T---
gi|26 : ggtga-TTC-------GCTT-CA---T----T--ATTT-C--T---G---T----A-TA---T-ACATGTAA------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TAGTG-G---------AACTA-AT-A-TAAG-TT--TAGAA---CTGAAGCCT--GCC-A-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----TTAAAT------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-A--C-A------T-G-TC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--A-AGTTCC--GC--
gi|27 : TTGTT-TTT--T---TT---TTCC--GA-GAT-A-C-A---ACT-----T------G-C-T-TTC-------AATT-TAATTT----T--TTTT-C--T---G---T----A-CA---T-A------A------------TTA-C--TA-TTCTT-G-GC-TA-TG-A-A-------TACTA-A
gi|28 : agggggttgtatgTGTTGTTT--T---TTATTTTCC--GA-GAT-A-C-A---ACT-----T------G-C-T-TTC-------AATT-TAAT-T----T--TTTT-C--T---G---T----A-CA---T-A------A------------TTA-C--TA-TTCTT-G-GC-TA-TGAA-T-------AACgtta
gi|29 : aggggttgtgaTTTTTT--T---TT---TTCC--A--GAT-A-C-A---A-C-----TT-----G-C-T-TTC-------AATT-TAAT-T----T--TTTT-C--T---G---T----A-CA---T-AT-----A------------TTA-C--TACC--TT-G-GC-TA-TGAA-T-------AACTA-Aa
gi|3 : ttgtgattGTTTGAGCGCTTGTTGTTT--T---CT---TTC------GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------TCTT-CA---T----T--TTTT-C--T---G---T----A-CA---T-A------A------------TT--T--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-AT-A-TAA--TT--TAGAA---CTGAAGCCT--G-C-A-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-G-TC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--A-CGTTC---GC--TT--TCT--TT---ACTTT--CAT--A-A-A-----A-T--GCG---CC--CC--T-----AT---TG------T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A--------G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-A---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-GCA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GAT-T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCGgtta
gi|30 : TTGAGC--TTGTTTTGC--T---CG---TTCC--G--GTT-A-C-A---AAT-----TT-----G-C-T-TTC-------GTTT-AA--------T--TTTT-C--T---T---TACAAA-CA---T-A------A------------TTCCC--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-A
gi|31 : GTTTGCT---CT---TTCC--GACGAA-C-C-A---GAT-----TT-----G-C-T-TTC-------GTTT-CA---T----T--TTTT-C--T---A---G----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-Ag
gi|32 : gttggctgTTGTT-TTT--T---TT---TTCC--A--GAT-A-C-A---ACT-----TT-----G-C-T-TTC-------ATTT-AA---T----T--TTTT-T--TCG-G---T----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-g
gi|34 : tgtgaTTGAGC--TTGT-GTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------TCTT-CA---T----T--TTTT-C--T---G---T----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT---GC-TA-TG-A-T-------AACT
gi|36 : gTTGTTT--TGCTCT---TTCT--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-CTT-TTC-------GTTT-CA---T----T--------------------------A---T-A------A-------------------TA-T--TT-G-GC-TA-TA-----------AACTA-
gi|38 : gggggaagaTTGAA-GCTTGT-GTTT--T--------TTCC-------------A---ATT-----T------G-C-T-TTC-------GCTT-CA---TA---T--TTTT-C--T---G---T----A-CA---T-A------A-------------T--C--TA-T--TT---GC-TA-
gi|4 : ggTTGT-GTTC--T---GT---TACC--G--GAT-G-A-A---ATTGTGGCTT-----G-T-TCTTC-------GCTT-CA---T----T--TTTT-C--T---G---T----A-TA---T---------------------TT--C--GA-T--TT-G--C-TC-TG-A-T--------------T-A-TGA---------AA---CTGAG--CT--G-C-A-TA--C-TTT-------------------------------T--AC-----T-----------AT--T--TTG--TGT-GTA-TC--GC-G--C-A------TTG-TC-T--------------CA---AT-T---T---CT-AATG-A-AGTCTC---C--TA--TCT-------ACT----CAT--A-A-AT----A-TT-GCG---CC--C---T-----AT---TG----G-T-T-G---CT-T---------------GGG--C----G-C--CGCGCAT--T--G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------GTT-GAT-TAC-GT--TTA--T-A------C-G--TTCG-----T-AA--ACA-T-------T---ATGT-----T-G---TCT-GT-----T--G-T--AAATTT-A-CAAGT----A-A--G--TT-----T-GT--CTAAAAAATT-T--TCTT-GTT--T-TA-T-T-----------AA-A-CGA--TTT--A--GAC-CGTCG--T-G--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----C--AA--------TG--TT-TG--ATCT-A-AAT-TGC--AAAG-A---TTC-TT---G-AT-T---GTACT-ACA---------TTTTT-CG-----C-AT-G--TG-T-AATA--T---TA-C--AC-A-T-TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----CAA-AAG--T-AG-TC--ACCC------TT-TT-GCC-TTTCCata
gi|40 : ttgaaTT-----TT-----G-C-T-TTC-------GTTT-CA---TGTT-T--TTTT-CCCT---G---T----A-CA---T-A------A------------TT--G--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-Aagccg
gi|41 : --T---TA-C--A--A-T-TTGTAAA-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TT--A--T------TT-TT-GCC-CTTTC
gi|42 : T-----TT-----G-C-T-TTC-------GTTT-CA---TGTTTT--TTTC-C--T---G---T----A-CA---T-A------A------------TT--G--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACcgccgccca
gi|43 : ----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TC-TG-A-T-------AACTA-AT-C-TAAG-TT--TAGAA---CTGAAG
gi|44 : -GA--TG------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TT--A--T------TT-TT-GCC-CTTTC
gi|45 : -C--T---G---T----A-CA---T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-Accgccgcccat
gi|5 : TTGAGC-----TTGTTT--T---CT---TTCC--A--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTTT-C--T---G---T----A-CA---T-A------A------------T---C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------ATTTA-AT-A-TAAG-TT--TA-AA---CTGAAGCCT--G-C-A-TA--T-TTTG-CCT-----C-C---CC-A-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-G-TC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--A-AGTTCC--G----T--TCT--TT---ACTT---CAT--A-A-A-----A-T--GCG---CC--CCC-T-----AT---TG------T-T-G-A-CT-T---------------GGG--CTGGCG-T--C-CGC-T--T--G-T---G--T-T-C---A-AAGAT-A-T--A-----T----------GT--AAT-TAC-GT--TT-----A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-----------ATGT-A-----G---TTG-GT-----T--G-T--GAATAT-A-T----------T--A--TT-----T-GT--GTAAGA---T-T--TCTT-G-T--T--G-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAC-C--CG-TT-G--G--A--T-------GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-A--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTG-C-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTC
gi|6 : gGCTTGGTGTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A-----T-----TG-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTTT-T--TCATG---T------CA---T-A------A------------TT--C--CA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-AT-AATAAG-TT--TAGAAA--CTGAAGC-T--G-CCA-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CC-C-C-ATT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-TTG-A-T---GC----C-A------T-GGTC-T--------------CA---AT-T---T---C---------------------TT--TCT--T-----------CAT--A-A-A-----AAT--GCG---CC--CCC-T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--T-------------------------T-G-T--A-----T----------GTT-GAA-TAG-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----TC-G-T--G-ATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---T-T--TCTT-G-T--T-TG-T-T-----------AA-A-C-A--CTT--A--GAA-C--CG-AT-G--G--T--T----T--G---A--TA-T-----A--AA--------TT--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGCAAAAAG-A---TCG-TT-----AT-T---G---T-ACATTTTTTTTTTTTTT-CG-------TT-G--T--TAAA-A--T---TA-CA-A--A-T-TT----A-C-A-TTGGA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TGTTC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCcgccgccc
gi|7 : aTGTTT--T---CT---TTCC--G--G-T-A-C-A---AAT-----TT-----GTC-T-TTC-------GCTTTCA---T----T--TTTT-C--T---G---T----A-AAA--T-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-------------G-AT-A-----------AGAA---CTGAAGT-T--G-C-A-TA--T-TTT----------------------------------AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-A-T---GC-G--C-A------T-G-TC-T--------------CA---AT-T---T---C--GA---A-AGTTCC--GC--TTCATTT--TT---AACTT--CAT--ATA-A-----A-TGGGCGC--CC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-C--TTGG-T---G-GTGT-CAAAA-AAGAT-G-T--A-----TG---------GTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--AC-TT-------T---ATGT-A---T-G----TG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TTA----TGGT--CTAAGA---T-T--TCTT-G-T--TGTG-T-T-----------AA-A-C-A--TTT--A--GAT-CG-CG-TTGG--G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TG--TT-TG--AT-T-A-AAT-TGCA-AAAG-A---TCGTTT---G-AT-T---G---T-ACA----------TTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A------TT----A-C-A-TT-GA----------TTT-G-----C-ACAAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTcgcgccat
gi|8 : gTTTGGGC--TTGT-GTTT--T---CT---TTCC--G--GAT-A-C-A---ATT-----TT-----G-C-T-TTC-------GCTT-CA---T----T--TTTTTC--T---G---T----A-CA---G-A------A------------TT--C--TA-T--TT-G-GC-TA-TG-A-T-------AACTA-AT-A-TAAG-TT--TAGAA---CTGAAGCCT--G-C-T-TA--T-TTTG-CCG-----T-C---CCCA-T-CTT-----T--AC-----T----T------AT--T--CTG--T-T-G-AAT---GC-G--C-A------T-G-TC-T--------------CA---AT-T---T---C--GAT--A-AGTTCC--GC--TT--T----TT---ACTT---CAT--A-A-A-----A-T--GCGGGCCC--CC--T-----AT---TG----G-T-T-G-A-CT-T---------------GGG--C----G-T--C-CGC-T--TT-G-T---G-GTGT-C---A-AAGAT-G-T--A-----T----------TTT-GAT-TAC-GT--TT---T-A------C-G--TTCG---T-T-AA--ACATT-------T---ATGT-A---T-G---TTG-GT-----T--G-T--GAATTT-A-T--GT----A-T--G--TT-----T-GT--CTAAGA---G-T--TCTT-----------------------------------------------------------G--T--T----T--GA--A--TA-TC----A--AA--------TT--TT-CG--AT-T-A-AAT-TGC--AAAG-A---TCG-TT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CG-----C-TT-G--T--T-AA-A--T---TA-C--A--A-T-TT----A-C-A-TT-GA--T-------TTT-G-----C-A-AAG--T-TG-TC--A--T------TT-TT-GCC-CTTTCtcccgcccat
gi|9 : -T-TTT-----T--AC-----A----T------GA--C--CTA--C-T-A-A-TA--GCAG--C-T------T-T-TC-TA-------------CA---AT-T---T---CCGAAT--A-AGT-CC--GCCCTT--CTT--TT---ACTTT--CAT--ATA-A-----A-TC-GCC---CC--CC--T-----AT----G----G-T-C-G-A-CT-----------------GGG--C----GAT--CTCGC-TGTC--G-T---G-GT-T-C---ATACAAT-G-C--A-----TTGTGCCATGCGTTCGAT-TACCGT--TT---T-T------C-G--TTCGG--T-T-AA--ACATTCCACTACT---AT-T-A---TCGAATTTG-GT-----TCTGCT--GAATT--A-T--GT----A-T--GCTTT-----T-GT--CTAAGA-----T--TCTT---T--T-TG-G-T-----------AAGA-C-AT-TTT--A--GAC-C--CG-TT-------T--T----TG-GA--A--TA-TCGT--A--AA--------TG--TT-CG--AT-T---AAT-TGC--AAAG-A---TCT-CT---G-AT-T---G---T-ACA---------TTTTT-CGA----C-TT-G--TCAT-AA-A--T---TATC--A--A-T-TT----A-C-ACTT-GA--T-------TTT-GCA---C-A-AAT--T-TG-TC--A--T------TT-TTCGCC-TTTCCGcgccgccca
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Unaligned ( gi|35 ): ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Unaligned ( gi|37 ): GTCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|39 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN