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Reference ( gi|9 ) : CACC--TCGCAA--------GTG-TATGGAG---ATTGT--T-TT---GGGC-TG---CA-GG----C---TG---GA--------TGT-GGG---AAA--CC-GTT-AAAGT-AAT-G-C-GTT--TCC-C-GG-GGAG--AAGA-------GCTC-GA-CA-ATT----AATACA---ACA-CATTA-CATC----CCCA-----GATCAT-GAC--T-TACACC-TGTATCT-AGAAG-A--ACCT-G--CGTATGAAG-CC-G--A--C-AT------TTG-T--A--AAA-------ATAA--A-------A---CA--CCAT-GC-A-C--AGCCC----TTT-T-TAGGGC-TAC---T-TTT--AA-A-AC-A-AA---A-TA-TGAG--TGA-CA--ACA-C-CATA-A--------------C------A--------T----A----------AGT---------GC--AC-T---G-A--CA-------T--A-GTT--C-GATAAGG----TCAG----T-GCAC-T--G-G-GAAA-----A-----A--CTC-A----A--T----T-G--GC-A-C--CA----T-G---CC--A-G-------C-----TG---G-C-AC-----------T----------TG---AGC--------C-A--G--C-A-----------C------TGG-GAA--AAA--A--------T----C---A-AT--T-G-GC---A--C--C--ATG--C---------------AGC----TGGC------A-C---TG---AG----------C-CA------G-CA----C-TG---G------GAA-A------A--A-A---C--C-------GAA----T---T-GGCA--C--CA----T-G-CCAG-CTGGCA-CTGAG-C-C----AGC-----AC-TGG-------G------------C-TA---T-AAA--G--C---------------A-GA-GCC-----------CTG-G----CAC--TC--TC-A-CTCT--TC-ACA-T-C-GAC--TT-C-A-G-AC-----CC--TG-ACC---AG-AG-AA-CA-TGG---CT-C--AG--AAAC-A-GC-TAG--AA-TT-CG-TGGACAG-A-GCTCAGA-A--GA---AAGTG-A--A--T-AA--CAT-G-G-TACAGAA--AAAGACGG-----GA----ATG-AAACAAG---ATTTC-------TT-G-AGCG-A-AGA-AA-G-AT-AGA-CAGGA---GG--TAC--A-GGA-G--G-CTT---A--CA-T--GG--AC----A-----G-CAG--CTGA-AAAAGGC-----CAAG-A--C-TGAG--GAGTTTTTACC
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gi|13 : ggCACC--TATGAA--------GTG-TATGGGG---CTTGT--T-TT---GGGA-TG---CA-CA----CATATG---GA--------TGT-GGG---AAA--CA-GTC-GATAT-GAT-A-C-GTT--TCC-C-TG-GGAG--AAGA-------AGTC-GA-CA-AAC----AGTAGA---GGT-CATTA-CGTC----CGCT-----GATCAT-GAC--T-TACACG-TTTATAT-AGAAG-A--ACCC-G--CGTAAGAAG-CCGG--A--T-AT------TTT-TA-A--AAA-------ATCA--A-------A----A--CCAC-GA-A-C--AGCCC----TTT-T-TAGGAC-TAC---C-TTT--AA-A-AA-A-AA---A-TA-TGAG--TGA-C---ACA-C-AAAA-ATCTTCTTTTTAGGGC------A--------T----A----------A------------C--ACAT---A-A--CA-------CA-A-GTT--C-GATAAGG----GCAA----T-gtgccccttagtacacgagaaccattggcgctgagccagcactgggaaaaaccccaatctgcaccatgccagctggcactgagccgcactgggccaattaaaagcagagcccccctccccactctcactctacatcgacttcacgacctgacctgagaacatggctcagaaacagctagaattcgtggacagagctcagaagaaatgaatacatggtacagaaaagactggaatgcagcaaagatatttcttgagtgaagaagatagacaggaggtacaggaggcttacatggcacagcagctgaaaaaggccaaacataggagtttttacct
gi|1 : CACA--TCGCAAT-------GTGCTATGG------TTGTGAT-TT---TGGCATG---AA-AG----C---AG---GAAACCATATTGT-GGG---AAA--CCCGTT-ACAGT-GAT-G-C-GTTCTTCC-C-AAAGGAG--AAG--------GCTCTGATCAGATT----AATACA---ACAGCGTTA--ACCGGCACCCA-----GATC-T-GAC--T-TACACC-TGGAT-T-AGA-G-A--AC-T-C--CGTATGAAG-CC-G--G--CCAT------GTG-T--A--AAA-------AAAA--ATGAGATAA---TA--CCAT-GC-AAC--AGCCAG---TTT-T-TAGCGC-TAC---TTTTT--AA-A-AC-A-AA---T-AA-TGAGTTTGA-CAC-ACA-C-AA-A-A--------------C------AGT------T----A----------AAA---------GG--TC----------CA-------T----GTT--C-G-TAAA------CAGAGT-T-GCAT-C--A-T-AGCA-----G-----A--CTT-GGC--A--C----T-G--GC-A-CGACA----T-G---GCAAA-G-------CTCAATTG---C-C-AC----------------------TG---AGC--------G-A--G--C-A-----------C------TGG-GAA--AAGC-G--------TTTC-C---A-AT--T-G-G----A-----C--ATC--C---------------AGC----TGGC------A-----TG----G----------C-CA------G-CA----C-TGTGTG------GGA-A------A--A-A---C--C---------C----C---T-TGCA--C--GAG---T-G-CCAG-T--GCA-CTGGA-C-CATTTAGC-----GC-TGA-------G------------C-Tcagcaattagtgcactaaatacctccaaatcacgtgatgaacacctggcgtctagacagctgtctagacatagcctggaattacctgaacatcatcggcgatcgcgtgataggaaaaaccttttttacgggctataaaagcagagccccgctctcaccttcacatcgacttcagaccgtgacctgagaacatggggctcagaaacagctagaatccgtggacagagatcataagaaagttgatactaaggtacagaaacagatggggcctcagagcgaagaagatagacaggaggcttaccttgcacaacagttgaaacaggcgaagactgagtagtatttacc
gi|17 : taACC--TCGTAACCGAAGGGGTA-TATGCCT---GTTGA--T-TT---GGAC-TG---GA-GA----CAGTTG---GA--------TGT--GG---AAT--CA-GTC---AGC-AAT-A-C-G----------GG-GAAAATAATA-------GTTC-GA-TA-ATTTG--AAAATG---A-A-GATTA-CTTC----ATTT-----GATCAT---C--T-GA-ACT-TTTATGT--GAAG-A----TT-GCACGTACGAAT-TC-G--A--T-GTGAGAGATTA-T--C--GAA-------TGAA--A-------A---GA----A--AC-A-A--AACCC----TTT-T-TGGGGC-TAC---T-TTA--AACA-CC-A-AC---A-TA--AAA--TCA-TT--ACA-CACATG-A--------------C------A--------cagcgctggggacatatatacccaattgccctgtgccaagtgaccactgcgaatcatattagcgctggtcaggtcactgggtcgcaaaaccccattggcacttggtgaaaaaccaatgggactgtgtagcagcactggggaacggggcatataaatgcagagccctggcactcttcactcttgtccatcgacttttcagtccctgacctgagaagcatggtgcctctaggaaacacgctagaattcgtcgacagaggctcagagaaagtgtaataatctatggttacagaataaaagcggcgtaaatgcaacaggatttcttgagcgagaagataaaggggtacaggaggcttctaacatggacaacgagcagttgaaaaaggccaaaagaactatttgagtcgcagaatatttactaact
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Reference ( family-446 ) : CACC--TCGCAA--------GTG-TATGGNG--GT-T---GT-T-TT-G-GGC-TG---CA-G--G----C---TG---GA--------TGT-GGGAA-A----CN-GTC-AAAGT-GAT-AC-GTT--TCC-C-GG-GGAG--AA-GA-------GCTC-GA-CA-A-TT----AATACA-GNA-CATT-A--CNTC--CCCNGATCAT-GAC--T-TACACC-TGTATNT-AGAAG-AACC-CG-CGTACGAAG-CCG------GA-C-A-------T--T-------TG--T--A--AAA-------AT----AA-------AA---TA--CCAT-GC-AC--A-----GCC-C----TTT-T-TAGGGC-TAC---TTTT--AA-A-ACA-AA---A-T-AT-GAG--TGA-CA--A---CA-C------CAT-A-A--------------CA--------T----A-----------------------AGT---------GC--A-C-T---G-----ACA-------T---A----GTT--C-GNTAAGG----TC-AG----TGC-AC-T--G----G-G--AAA-----AA---CT-C-A----A--T----T-G--G-C-A-C--CA----T-G---CC--A-G----C------------------T--G---G---------C-A--CT-G---AGC-C-A--G-C-A-C-TG--G------GAAAA-----A-A----C--------CAA--T-T--GG-C--A--C--C--GT-G--C---------------A---G------------------C----TG------------GC------A-C---TG---AG-C-CA------G--CA----C-T-G---G------G--AAA------A-AA---C--CNAA----TT-GG---C-A--C--C--G--T-G-----CC----AG-------------CTG-----------G-CA-C---TG---AG-C-C----AGC-----AC-TG----G-------G------------C-TA---T-AAA--G--C---------------A-GA-GCC----------C----C---GG----CA-C--TC--T-C-A-C---TCT-T--C-ACA-T-C-GAC--TT--C-A-G-AC-----CC--TG-ACCN---G-AG-AA-CA-T-GG---CT-C--AG--AAA-C-A-GC-TAG--AA-TT-CG-TGGACAG-AG-CTCAGA-A--GA---AAGTG-A--A--T-AAC--AT-G-GT-ACAGA-A-ANAGACGG---GAATGC----AA-CA-AG---ATTTCTT-G-AGCG-AAGA--AAG--ATA--GACAGGA-GGTACA-GGAG--G-CTT---A--CATGNC-AC----A-G-CAGCTGA-AAAAGGCNAAG-A-------C-TGAG-----GAG-TATTTACC
gi|1 : CACA--TCGCAAT-------GTGCTATGGTT--GT-G---AT-T-TT-G-GCA-TG---AA-A--G----C---AG---GAAACCATATTGT-GGGAA-A----CCCGTT-ACAGT-GAT-GC-GTTCTTCC-C-AAAGGAG--AA-G--------GCTCTGATCAGA-TT----AATACA-ACAGCGTT-AACCGGCA-CCCAGATC-T-GAC--T-TACACC-TGGAT-T-AG-AG-AACT-C--CGTATGAAG-CCG------GC-C-A-------T--G-------TG--T--A--AAA-------AA----AAATGAGATAA---TA--CCAT-GCAAC--A-----GCCAG----TTT-T-TAGCGC-TACT--TTTT--AA-A-ACA-AA---T-A-AT-GAGTTTGA-CAC-A---CA-C------AA--A-A--------------CAGT------T----A-----------------------AAA---------GG--T-C------------CA-------T--------GTT--C-G-TAAA------C-AGAGT-TGC-AT-C--A----T-A--GCA-----GA---CT-T-GGC--A--C----T-G--G-C-A-CGACA----T-G---GCAAA-G----CTCAAT-------------T--G---C---------C-A--CT-G---AGC-G-A--G-C-A-C-TG--G------GAAAA-----G-CGTTTC--------CAA--T-T--GGAC--A--T--C--------C---------------A---G------------------C----TG------------GC------A-----TG----G-C-CA------G--CA----C-T-GTGTG------G--GAA------A-AA---C--CC------CT-TG---C-A--CG-A--G--T-G-----CC----AG-------------T-------------G-CA-C---TG---GA-C-CATTTAGC-----GC-TG----A-------G------------C-T
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gi|10 : tacacatcgcaatgtgctatggttgtgattttggcatgaaagcaggaaaccatattgtgggaaacccgttacagtgatgcgttcttcccaaaggagaaggctctgatcagattaatacaacagcgttaaccggcacccagatctgacttacacctggattagagaactccgtatgaagccggccatgtgtaaaaaaaaatgagataataccatgcaacagccagtttttagcgctactttttaaaacaaataatgagtttgacacacacaaaacagttaaaaggtccatgttcgtaaacagagttgcatcatagcagacttggcactggcacgacatggcaaagctcaattgccactgagcgagcactgggaaaagcgtttccaattgCACC--TCGCA---------GTG-TATGGAG--AT-T---GT-T-T--G-GGC-TT---CA---------T---TG---GA--------TGT-GGAAA-C----CT-GTT-TAAGT-AAT-GC-GTT--TCC-C-GG-GGAG--AA-GAG------GCTC-GA-C--A-TT----AATACA-GGA-CATT-A--CCTC--CCCAGATCAT-G-C--T-TACACC-TGTATCTAAGAAG-AACC-C--CGTATG-AG-CC-------GA-C-A-------T--T-------TG--T-----AAA-------AT----AAAT-----AA---TA--CCAT--C-AC--A-----AGC-C----CTT-T-TAGGGC-TAC---TTTT--AA-A-ACA-AA---A-T-AT-GTA--T-A-CA--A--------------AC-A-A--------------CA--------T----A-----------------------AGT---------GC--A-C-T---G-----ACA-------T---A----GTT--C-GATAAGG----TC-AG----TGC-AC-T--GT---G-A--AAA-----AA---CT-C-A----A--T----T----G-C-A-C--CA----T-T---CC--ATG----C------------------T------G---------C-A--C--G---ACC-C-AC-G-C-A-C-TG------------AA-----A-A----CT-------CAA--T-TG-GG-C--A--C--C---T-GC-C---------------A---G------------------C----T-------------GC------A-C---TG---AG-C-CA------G--CA----C-T-G---G------G--AAA------ATAA---C--CGAA----TT--G---C-A--C--C--A--T-G-----CC----AG-------------TTG-----------G-CA-----TG---AT-C-C----AGC-----AC-TG----C-------T------------C-TA---T-AAA--G--C------------------A-GCC----------C----T---GG----CA-C--TC--T-C-A-T---TCTAT--C-ACA-G-C-G-C--TT--C-A-A--------CC--TG-ACCA---G-AG-AC-CATT-GG---CT-C--AG--AAA-C-A-GC-TAG--AA-GT-CGTTGGACAG-A--CTCAGA-A--AG---AAGTG-A--A--T-AAC--ATCG-GT-ACAGA-A-AAAGAC-G---GAAT-C----AA-C--AG---ATTTCTT-G-AGCG-AAG---AAG--ATA--GAC--GA-G--ACA-GGAG--G-CTT---AATCATGGC-AC----A-G-CAGCTGA-AAAAGCCAAGG-AT------C-TGAG-----GAG-TATTTtaact
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Reference ( family-446 ) : CACC--TCGCAA--------GTG-TATG-GCG--GT-T---GT-TTT-G-GGC-TG---CA-G--G----C---TG---GA--------TGT-GGGAA-A----CA-GTC-AAAGT-GAT-AC-GTT--TCC-C-GG-GGAG--AA-GA-------GCTC-GA-CA-A-TT----AATACA-GGA-CATT-A--CNTC--CCCNGATCAT-GAC--T-TACACC-TGTATNT-AGAAG-AACC-CG-CGTACGAAG-CCG------GA-C-A-------T--T-------TG--T--A--AAA-------AT----AA-------AA---TA--CCAT-GC-AC--A-----GCC-C----TTT-T-TAGGGC-TAC---TTTT--AA-A-ACA-AA---A-T-AT-GAG--TGA-CA--A---CA-C------CAT-A-A--------------CA--------T----A-----------------------AGTGC--A-C-T---G-----ACA-------T--A----GTT--C-GNTAAGG----TC-AG----TGC-A-C-T--G----G-G--AAA-----AA---CT-C-A----A--T----T-G--G-CA-C--C-A----T-G---CC--A-G----C------------------T--G---G---------C-A--C-T-G---AG-C-CA--G-C-A-C-TG--G------GAAAA-----AA----C--------C---AA--T-T--GG---C--A-C--C--G-T-G-CC----A---G-------------C------------------TGG-C-A-C---TG-----------AGC------C-AG--C-A-C-T-G---GG--AA--AA-AAC--C----C-AA--TT-G---------GC-A--C--C--G--T-G-----CC----AG-------------CTG-----------G-CA-C-TG---AG-C-C----AGC-----ACTG----GG------------C-T-A---T--AAA--G--CA-GA-GCC----------C----C---GGCA-C-TC--T-C-A-C---TCT-T--C-ACA-T-C-GAC--TT--C-A-G-AC-----CC--TG-ACCN---G-AG-AA-CA-T-GG---CT-C--AG--AAA-C-A-GC-TAG--AA-TT-CG-TGGACAG-AG-CTCAGA-A--GA---AAGTG-A--A--T-AAC--AT-G-GT-ACAGA-A-ACAGACGG---GAATGC----AA-CA-AG---ATTTCTT-G-AGCG-A-AGA--AA-G--AT-A--GA-CAGGA---GGTAC--AGG-A-G--G-CTT---A--CAT---GGC-A--C----A-G-CAG--CTGA-AAAAGGC--GAAG-A-----C-TGAG-----GAG-TATTTACC
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Reference ( family-446 ) : CACC--TCGCAA--------GTG-TATG-GCG--GT-T---GT-TTT-G-GGC-TG---CA-G--G----C---TG---GA--------TGT-GGGAA-A----CA-GTC-AAAGT-GAT-AC-GTT--TCC-C-GG-GGAG--AA-GA-------GCTC-GA-CA-A-TT----AATACA-GGA-CATT-A--CNTC--CCCNGATCAT-GAC--T-TACACC-TGTATNT-AGAAG-AACC-CG-CGTACGAAG-CCG------GA-C-A-------T--T-------TG--T--A--AAA-------AT----AA-------AA---TA--CCAT-GC-AC--A-----GCC-C----TTT-T-TAGGGC-TAC---TTTT--AA-A-ACA-AA---A-T-AT-GAG--TGA-CA--A---CA-C------CAT-A-A--------------CA--------T----A-----------------------AGTGC--A-C-T---G-----ACA-------T--A----GTT--C-GNTAAGG----TC-AG----TGC-A-C-T--G----G-G--AAA-----AA---CT-C-A----A--T----T-G--G-CA-C--C-A----T-G---CC--A-G----C------------------T--G---G---------C-A--C-T-G---AG-C-CA--G-C-A-C-TG--G------GAAAA-----AA----C--------C---AA--T-T--GG---C--A-C--C--G-T-G-CC----A---G-------------C------------------TGG-C-A-C---TG-----------AGC------C-AG--C-A-C-T-G---GG--AA--AA-AAC--C----C-AA--TT-G---------GC-A--C--C--G--T-G-----CC----AG-------------CTG-----------G-CA-C-TG---AG-C-C----AGC-----ACTG----GG------------C-T-A---T--AAA--G--CA-GA-GCC----------C----C---GGCA-C-TC--T-C-A-C---TCT-T--C-ACA-T-C-GAC--TT--C-A-G-AC-----CC--TG-ACCN---G-AG-AA-CA-T-GG---CT-C--AG--AAA-C-A-GC-TAG--AA-TT-CG-TGGACAG-AG-CTCAGA-A--GA---AAGTG-A--A--T-AAC--AT-G-GT-ACAGA-A-ACAGACGG---GAATGC----AA-CA-AG---ATTTCTT-G-AGCG-A-AGA--AA-G--AT-A--GA-CAGGA---GGTAC--AGG-A-G--G-CTT---A--CAT---GGC-A--C----A-G-CAG--CTGA-AAAAGGC--GAAG-A-----C-TGAG-----GAG-TATTTACC
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gi|6 : ctaagaagtgtatggttgttattttgggatgcaggctggatgtgggaaacagtcaaagtgatacgtttccctgggagaagaggtcgacaaatagtagaggacattacgtccgctgatcatgacttacacctgtatatagaagagcctgcgtatgaagccggagattttaaaaaaataaaaaaccatgcacagcccttttnnnnnnnnnngattttaaaT-GAC--T-TACACC-TGTATCT-AGAAG-AACC-TG-CGTATGAAG-CCG------GA-C-A-------T--T-------TG--T--A--AAA-------AT----GA-------AA---TA---CAT-GC-AC--A-----GCC-C----TTT-T-TAGGGC-TAC---TTTT--AA-A-ACA-AA---A-T-AT-GAG--TGA-CAC-A---CA-CA-----CAT-A-A--------------CACAAAT---T----A-----------------------AGTGC--A-C-T---G-----GCA-------T--A----GTT--C-G-TAATA----TC-GT----TA------T--G----G--------------------C-A----A--T----T-G--G-CA----C-A----T-G---CC--A-G----C------------------T--G---G---------C-A--C-T-G---AG-C-CA--G-C-A-C-TG--G------GAAAA-----AAACC-C--------T---AA--T-T--GG---C--A-C--C--A-T-G-CC----A---G-------------C------------------TGG-C-A-C---TG-----------AGC------C-AG--C-A-C-TGG---GG--AA--AA-AAC--C----CTAA--TT-G---------GC-A--C--C--A--T-G-----CC----AG-------------CTG-----------G-CA-C-TG---AG-C-C----AGC-----ACTG----GG------------
gi|6 : GC-A-C-T--G----G-GGAAAA-----AA---CC-CTA----A--T----T-G--G-CA-C--C-A----T-G---CC--A-G----C------------------T--G---G---------C-A--C-T-G---AG-C-CA--G-C-A-C-TG--G------G---A-----AA----C--------T---CA--TGT--GG---C--A-C--C--A-T-G-CC----A---G-------------C------------------TGG-C-A-C----G-----------AGC------C-AG--C-A-C-T-G---GG--AA--AA-AAC--C----C-A----T-G---------GC-A--C--T--G--T-G-----CC----AGTAGACA-------CTGAGAACCATTTGG-CG-C-TG---AG-T-C----AGC-----ACTG----GG------------aaactcatgtggcaccatgccagctggcacgagccagcactgggaaaaaacccatggcactgtgccagtagacactgagaaccatttggcgctgagtcagcactgggaaaaacccgattggcactgtgaccagctggcactgagccagcactgggaaatttacggctataagacagagccctcgcactctcactcttcacatcgacttcagaccctgacctgagaacatggctcagaaacagctagaattcgtgacagagctcagaagaaagtgaataacatggtacaagaaaagactggaatgcaacagatttcttgagcgaagaagatagacagggggtacaggaagcttacatgacacagcagctgaaaaaggcctgaggagttttacct
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gi|7 : tgacttacacctgtatctagaagaacctgcgtatgaagccggacatttgtaaaaatgaaatacatgcacagccctttttagggctacttttaaaacaaaatatgagtgacacacacacataacacaaattaagtgcactggcatagttcgtaatatcgttatggcaattggcacatgccagctggcactgagccagcactgggaaaaaaaccctaattggcaccatgccagctggcactgagccagcactggggaaaaaaccctaattggcaccatgccagctggcactgagccaCACCGTCCGCCA--------GTGGTATG-GCGC-GCAT---GT-TTTTG-GGA-TG---CA-G--G----C---AG---GA--------TGTTGGGAA-A----C--GTA-CACGT-GAT-GC-GTT--TCC-C-GG-GGAG--C--GA-------GCTC-GA-CACA-TT----AATACA-GCA-CATT-A--CCTC--CCCAGATCAT-GAC--T-TACACC-TGTATCT-AGAAG-AACC-TG-CATATGAAG-CCG------GA-C-A-------A--T-------TGC-T--AACAAA-------AT----AA-------AATATTA--CCAT-GC-AC--A-----GCC-CCCTTTTC-T-TAGGGC-TAC---TTTT--AA-ACACA-AA---ATT-AT-GAG--TGA-CA--T---CA--------CAC-A-A--------------TAC-------T----A-----------------------AGTGCT-A-C-T---GA----ACA-------T--A----G-T--C-GTTAGG---------------------------------------------------C-A----A--T----TGG--G-CA-C--C-A----T-G---CC--A-G----C------------------T--G---G---------C-A--C-T-G---AG---CA--G-C-A-C-TC--G------GAAAC-----AA----CATTAACCTC---AA--T-T--GG---CAAA-C--CCAA-T-G-CC----A---G-------------C------------------TGG-C-AGC---TG-----------AGC------C-AG--C-A-C-T-G---GG--AA--AA-ACC--C----T-AA--TT-G---------GC-A-----C--A--T-G-----CC----AG-------------CTG-----------G-CA-A-TG---AG-CTC----AGC-----ACTG----GGT-----------T-T-A---TA-AAA--G--CACGA-GCC----------C----C---CTCA-C-TC--T-C-A------CT-T--C-ACA-T-C-GAC--TT--C-A-G-AC-----CC--TG-ACCA---GAAG-AA-CA-T-GG---CT-C--AGAAAAA-C-A-GC-TAG--AA-TT-C--TGGACAG-AG-CT-AGA-A--GA---AAGTG-A--AACT-AAC--AT-G-GT-AC-GA-A-AAAGAC-G---GAATGC----AACCA-AG---ATTTCTT-G-AGCG-A-AGA--AC-GC-AT-A--GA-CAGGA---GGTAC---GG-A-GGAG-CTT---A--CAT---GGCAA--C----A-GCCAG--CTGA-AAAGGCC--CAAG-A-----C-TGAG-----GAG-TATTTACCt
gi|8 : cggAA--------G-G-TATG-GTT--GT-----GT-TTT-T-GGCGTG---GC-G--G----C---TG---GA--------TGT--GGAA-A----CC-GTC--AAGT--AT-ACTGTT--CCCTC-GG-AGA---AA-GA-------GCTC-G--CA-A-AC----AGTACATGGA-CA-T-A--CGTC--C---AATCATCGAC----TACA-C-GGTATTT----AG-AACCTCG-CGTATGAA--CCG------GA-C---------T--T-------TT--T-----AAA-------AT----AA-------AA----A--CCATGGCAAC--A------CC-C----TTT-T-TATGG---AT---CTTA--AA-A-AC--AA---A-T-AT-GAG---GA-CA--A---CA-C------AA--A-A--------------CA--------T----ACAAAGTCCCGTTCATGGTCAATCAGTGC--A-C-T---GGCTTAACA-------C--AC---GTT--C-GTTAAGG----TC-AATCGTTGCAA-C-T--G----G-t
gi|8 : cgccaccggagTGC--AAC-T---G-----GCA-------T--ACACAATT--C-GTTAAGG----TCAAG----TGC-A-C-catacacaattcgttaaggtcaagtgcacacctcacgacacgtgagaacactggcgctagaacagctgtataacagagcgctggaacaaagcaggtaacacccaccttggcgtcttcagacacgctgtctagacatagtctggcaaataccgtttgtacaggcataagcagagcccccactccacgtctcacatcgactcaacccttgaactgagaacatggctcagaaacccctagaattcgggacagagctcaaagaagtgaataacatggtacagaaaaaggcaggatgcaacaagtgaagcgcacgaaatagacaggaggtcaggagcttacatagcacagtacgaaaaggtcaaagaactgaggagtattacta
gi|8 : cgccaccggagaaggtatggttgtgtttttggcgtggcggctggatgtggaaaccgtcaagtatactgttccctcggagaaagagctcgcaaacagtacatggacatacgtccaatcatcgactacacggtatttagaacctcgcgtatgaaccggactttttaaaataaaaaccatggcaacaccctttttatggatcttaaaaacaaatatgaggacaacacaaaacatacaaagtcccgttcatggtcaatcagtgcactggcttaacacacgttcgttaaggtcaatcgtAA--G--CA-GA-GCC----------C----C-----CA-C-TC----C-A-C---GTC-T--C-ACA-T-C-GAC--T---C-A-A-CC-----CT--TG-AACT---G-AG-AA-CA-T-GG---CT-C--AG--AAA-C-C-CC-TAG--AA-TT-CG--GGACAG-AG-CTCA-A-A--G----AAGTG-A--A--T-AAC--AT-G-GT-ACAGA-A-AAAGGCAG---G-ATGC----AA-CA-AG---------T-GAAGCGCA-CGA--A-----AT-A--GA-CAGGA---GGT-C--AGG-A----G-CTT---A--CAT---AGC-A--C----A-G-TA----CGA-AAAGGTC--AAAGAA-----C-TGAG-----GAG-TATTacctcacgacacgtgagaacactggcgctagaacagctgtataacagagcgctggaacaaagcaggtaacacccaccttggcgtcttcagacacgctgtctagacatagtctggcaaataccgtttgtacaggcataagcagagcccccactccacgtctcacatcgactcaacccttgaactgagaacatggctcagaaacccctagaattcgggacagagctcaaagaagtgaataacatggtacagaaaaaggcaggatgcaacaagtgaagcgcacgaaatagacaggaggtcaggagcttacatagcacagtacgaaaaggtcaaagaactgaggagtattacta
gi|9 : cgccaccggagaaggtatggttgtgtttttggcgtggcggctggatgtggaaaccgtcaagtatactgttccctcggagaaagagctcgcaaacagtacatggacatacgtccaatcatcgactacacggtatttagaacctcgcgtatgaaccggactttttaaaataaaaaccatggcaacaccctttttatggatcttaaaaacaaatatgaggacaacacaaaacatacaaagtcccgttcatggtcaatcagtgcactggcttaacacacgttcgttaaggtcaatcgttgcaactggcatacacaattcgttaaggtcaagtgcacacctcacgacacgtgagaacactggcgctagaacagctgtataacagagcgctggaacaaagcaggtaacacccaccttggcgtcttcagacacgctgtctagacatagtctggcaaataccgtttgtacaggcatCACC--TCGCAA--------GTG-TATG-GAG--AT-T---GT-TTT-G-GGC-TG---CA-G--G----C---TG---GA--------TGT-GGGAA-A----CC-GTT-AAAGT-AAT-GC-GTT--TCC-C-GG-GGAG--AA-GA-------GCTC-GA-CA-A-TT----AATACA-ACA-CATT-A--CATC--CCCAGATCAT-GAC--T-TACACC-TGTATCT-AGAAG-AACC-TG-CGTATGAAG-CCG-------A-C-A-------T--T-------TG--T--A--AAA-------AT----AA-------AA---CA--CCAT-GC-AC--A-----GCC-C----TTT-T-TAGGGC-TAC---TTTT--AA-A-ACA-AA---A-T-AT-GAG--TGA-CA--A---CA-C------CAT-A-A--------------CA--------T----A-----------------------AGTGC--A-C-T---G-----ACA-------T--A----GTT--C-GATAAGG----TC-AG----TGC-A-C-T--G----G-G--AAA-----AA---CT-C-A----A--T----T-G--G-CA-C--C-A----T-G---CC--A-G----C------------------T--G---G---------C-A--CTT-G---AG-C-CA--G-C-A-C-TG--G------GAAAA-----AA----T--------C---AA--T-T--GG---C--A-C--C--A-T-G--C----A---G-------------C------------------TGG-C-A-C---TG-----------AGC------C-AG--C-A-C-T-G---GG--AA--AA-AAC--C----G-AA--TT-G---------GC-A--C--C--A--T-G-----CC----AG-------------CTG-----------G-CA-C-TG---AG-C-C----AGC-----ACTG----GG------------C-T-A---T--AAA--G--CA-GA-GCC----------C----T---GGCA-C-TC--T-C-A-C---TCT-T--C-ACA-T-C-GAC--TT--C-A-G-AC-----CC--TG-ACCA---G-AG-AA-CA-T-GG---CT-C--AG--AAA-C-A-GC-TAG--AA-TT-CG-TGGACAG-AG-CTCAGA-A--GA---AAGTG-A--A--T-AAC--AT-G-GT-ACAGA-A-AAAGACGG---GAATGA----AA-CA-AG---ATTTCTT-G-AGCG-A-AGA--AA-G--AT-A--GA-CAGGA---GGTAC--AGG-A-G--G-CTT---A--CAT---GG--A--C----A-G-CAG--CTGA-AAAAGGC--CAAG-A-----C-TGAG-----GAG-TTTTTACCacta
blockSeqs : GT CCGAAGGG G A CAAT A ATG A T A CA AGA A GAACAC TTG . T T AAAC T TTACA T T A TTAG T CG . AT G TAATAAG . . C T TGAA C T . A A C AATTTT A C ATT C G C AA A T GA G ATGTGA AAAAGAGAA TA ATCGAAA GAA AAA TGNTTAT TTAA AT TATT AC TGGCA GA AAGAA . CCTT G A T NGA TTA C C C TAT T A A TG G AGTT T AAAACATACAAAGTCCCGTTCATGGTCAATC T AT A TGGCTTAA ACAACACCA GCC G GGCAATCAGTT A T C GTGTGGG CCTCCAGATCACGTG GT CACG G AT G A GC C CTGC C GAA . T TGCA AGACAACTGGAACCGATT TT TGA ACCATTTAG C TT TT TCT C T CC C C T G CT TGTGGA TATAT ACATTAACCTCA GG G TA GAC AA T AA CAA C G CCTT AAA TAGACAACTGGAACCGATT A C G GAT CGAATCATATT GCTGGT C GT C T C C CT TC GA T AA TGAA AAGT A NNNNNNNNN G CG TTG CA G AAAAA CCTT TAGACACTGAGAACCATTTG C GC TGT C T . GTTTT ATCA AAAATTTACGGG A A CCA TA AGC C T AATACATCATCCTAC A G GC . C T ACT A . T C G T C CT T C C T AGTGA AG C TTGA A A A T T GG T . AA A C A G GG A A T A . G AG TTG CAAT AC T A . C C . C . A GAATGCAGCAAAGAT A G C T ACAAC TT C AT A GGAATGGGT TC G A GA T . AT CAGG A AT . T C GT G A A T TT . A
blockSeqs : . . . . CAT . . . . T CG . . ACATA . . . . AA A TTAA . G T TT . G . . . G . . . . TGAA G . . . . G CCCA A . TC . T A A . . GG . ATGTAA ACA . . GC AAC TT . . T . TGCC . . . . . . C . T C C . . . . . TG G TCA . AAAAATCTTCTTTTTAGGGCATA G T . TTTGGG TACACA CA A GGCAATCATT . . . CGGGG AAAACCCTA . A . . . . AA . G . GT . . . . . C A . G TT . . . C . . . . . . . AACCCTA . . G A A . . GC . A . . TAGACACTGAGAACCATT . . G . . . . A . . . G . . . . . . TAA . . . . AAC . A A . TACACGAGAACCATTG . CT . . . . TTT . AAATTTACGG . . A G AAT . . CTAATTGGC . . . . . . . G . . C . . C . . . . . . C . CA . . A . T . . . . . . . A . . . . . . G . . CAAT . . C . . . . . . C GGTCCCAGAATAT . A . . AAGAA C . . . GGAAGGT . . . . . . . G . . . G . . . G . . T . .
blockSeqs : . . . . CGC . . . . . C . . ACAGT . . . . . A TAAT . T . TT . A . . . . . . . . G G . . . . G CGCT A . T . T A A . . G . ATGTAA AGA . . G AA . . . T . CGT . . . . . . . . T . . . . . . . TT . CA . ACATAACACAATTAAAGGTC T . . ATAA TCCA C G GGCAATCAGT . . . GGGGA AACTTCA . . . . . . T . . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . ACCTCAA . . G . . . . G . . . . TACACGAGAACCAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . C . C . . TAGACAACTG . C . . . . . . GAACGGGG . . . A AAG . . CCCCTCCCC . . . . . . . . . . C . . C . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGC . . C . . . . . . C TCCTTAGAACTAT . . . . AAG . . . . GGAGGT . . . . . . . T . . . . . . . G . . T . .
blockSeqs : . . . . AG . . . . . A . . ACAGT . . . . . G CGAT . . . TT . T . . . . . . . . . A . . . . T CGCT A . T . T A A . . G . . CA . . T A . . . A . TGA . . . . . . . . T . . . . . . . TA . CA . ACATAACACAAGTTCGTA T . . TGAA TTAA C A GTCAATCGTT . . . GTGA AAAACTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . AACCCTA . . C . . . . G . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . C . . . . ACTG . C . . . . . . T . . . . AG . . CCATTGGC . . . . . . . . . . C . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . C . . . . . . C GAATGCAACCAAG . . . . AAC . . . . GGGGGT . . . . . . . T . . . . . . . G . . T . .
blockSeqs : . . . . GG . . . . . A . . TGGC . . . . . A CTAA . . . TT . G . . . . . . . . . T . . . . T ATTT A . T . T G G . . G . . TA . . T A . . . T . CGA . . . . . . . . T . . . . . . . TC . CA . TTTGGGCATAAAAATA T . . TGA CAA C T GTCAAGT . . . GGGG AACCCCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . ACTCA . . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . T . . . . CTGC . G . . . . . . . . . . . AG . . TTCCGC . . . . . . . . . . C . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . A . . . . . . A GGTCCCAGAAAT . . . . AAA . . . . GGAGGT . . . . . . . G . . . . . . . C . . T . .
blockSeqs : . . . . GG . . . . . C . . ACA . . . . . A CAAA . . . TT . G . . . . . . . . . C . . . . T ATTT A . T . T G G . . C . . TA . . T A . . . A . TGC . . . . . . . . T . . . . . . . TC . CA . AAAAATCCTCTTGTT T . . ATG CAA C T GTCAGT . . . GGGG ACCTCCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . ATCCC . . . . . . . C . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . T . . . . TTG . C . . . . . . . . . . . AG . . CTGGC . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . G . . . . . . C GAATGCAACAAG . . . . AA . . . . GGAGGT . . . . . . . T . . . . . . . G . . A . .
blockSeqs : . . . . AA . . . . . C . . AG . . . . . A TGAT . . . TC . G . . . . . . . . . C . . . . C CCGA A . C . G G A . . A . . TA . . G G . . . T . AAC . . . . . . . . A . . . . . . . TG . A . ACATAACACAAATTA T . . TGC CAC C C GGCAAT . . . GGAG AACCCTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . CCCCA . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . T . . . . CAG . C . . . . . . . . . . . AT . . CTCGC . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . G . . . . . . C GGTCCCAGAGAT . . . . AA . . . . GGGGGT . . . . . . . T . . . . . . . G . . A . .
blockSeqs : . . . . CT . . . . . C . . AC . . . . . C CAAA . . . TT . G . . . . . . . . . G . . . . T ATTT A . T . G G A . . C . . GA . . A G . . . A . TGT . . . . . . . . A . . . . . . . TT . A . AATCCCTTCTTTTT T . . TGA TA C C GTCAGT . . . AGA AACTCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . CCCA . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . T . . . . TCG . G . . . . . . . . . . . AG . . ATGGC . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . G . . . . . . C GAATGCAACAAG . . . . AA . . . . GGAGGT . . . . . . . T . . . . . . . G . . A . .
blockSeqs : . . . CT . . . . . C . . TT . . . . . A ACAC . . . TT . C . . . . . . . . . G . . . . C CCCA A . T . T C A . . G . . GA . . G C . . . T . TGC . . . . . . . . A . . . . . . . TG . A . ACACACACAAATTA T . . TAA TA C T ATCGTT . . . GAG AAAGCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . AGCC . . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . T . . . . CTG . C . . . . . . . . . . . AG . . CACCC . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . G . . . . . . T GAATGAAACAAG . . . . AA . . . . GGAGGT . . . . . . . G . . . . . . . A . . A . .
blockSeqs : . . . CT . . . . . C . . GC . . . . . A TAAA . . . TT . A . . . . . . . . . C . . . . G CGCT A . T . G C A . . G . . CA . . G A . . . A . TGC . . . . . . . . T . . . . . . . TG . A . TAAATCTTTTTTA T . . TAA TA C T GTCAGT . . . GGG AATCCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . CCCA . . . . . . . G . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . C . . . . CTG . C . . . . . . . . . . . CG . . CTCGC . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . A . . . . . . A GATGCAACAAG . . . . AG . . . . GGAGGT . . . . . . . C . . . . . . . G . . T . .
blockSeqs : . . . CA . . . . . A . . CC . . . . . C TAC . . . TT . T . . . . . . . . . C . . . . G CCCA A . T . G A A . . G . . GA . . G A . . . A . TGC . . . . . . . . A . . . . . . . TG . A . AAATGACACA T . . TGG TA C T GCCAG . . . GGG AACTCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . CCCC . . . . . . . A . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . C . . . . CTG . T . . . . . . . . . . . G . . CCCTC . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . C . . . . . . C GGTCCAGAAAT . . . . AG . . . . AGAT . . . . . . . G . . . . . . . C . . A . .
blockSeqs : . . . CT . . . . . A . . GC . . . . . A CAA . . . TT . G . . . . . . . . . C . . . . C CCCA . . T . G A A . . G . . GA . . T A . . . T . TGC . . . . . . . . T . . . . . . . TG . A . CACAATACTA T . . TGG TA C T CCAG . . . GGG AACTCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . CTCA . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . A . . . . CTG . C . . . . . . . . . . . T . . CTGGC . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . A . . . . . . C GAATGCAACAG . . . . AA . . . . GAG . . . . . . . G . . . . . . . C . . C . .
blockSeqs : . . . TT . . . . . C . . GC . . . . . A CA . . . T . G . . . . . . . . . . . . . . G CGC . . . . G C A . . G . . CA . . G A . . . C . TGC . . . . . . . . T . . . . . . . T . C . CATGATACA T . . TGA TA . T CCAG . . . GGG AACTCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . CTCA . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . NN . . . . C . . . . CTG . C . . . . . . . . . . . T . . CAAG . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . G . . . . . . C GATGCAACAAG . . . . AA . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . C . . T . .
blockSeqs : . . . TT . . . . . A . . GC . . . . . C CA . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . G C . . . G . . CA . . T A . . . . . TC . . . . . . . . T . . . . . . . T . T . CATAGCAAA . . . CA A . A GCA . . . GGG ACCTCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . CTCA . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . T . . . . CTG . C . . . . . . . . . . . G . . CAAG . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . A . . . . . . A GAATCAACAG . . . . AA . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . A . . T . .
blockSeqs : . . . AG . . . . . A . . GC . . . . . C CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . . CA . . G A . . . . . GA . . . . . . . . T . . . . . . . C . A . CATAACATA . . . . A . . . . . . TGG AACTCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . ACCC . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . C . . . . CTG . C . . . . . . . . . . . G . . CCAG . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . C . . . . . . C CTTCAGAAAG . . . . AA . . . . T . . . . . . . G . . . . . . . G . . T . .
blockSeqs : . . G . . . . . C . . GC . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . A . . . . . TA . . . . . . . . A . . . . . . . G . A . ACAACATA . . . . . AGA AACCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . ACCT . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . C . . . . TG . C . . . . . . . . . . . T . . AAAG . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . C . . . . . . C AGCTTTCAG . . . . AA . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . C . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . C . . . . . . . . T . . . . . . . G . . . . . . . GGG ACCTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . ACTC . . . . . . . G . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . C . . . . TG . C . . . . . . . . . . . G . . CCC . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . A . . . . . . C AGCTTTCAG . . . . AA . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . A . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGG CCCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . ACCC . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . T . . . . CT . A . . . . . . . . . . . T . . CCG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . A . . . . . . A AGCTTCAGA . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG CTCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . ATCA . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T . . . . CT . C . . . . . . . . . . . G . . CCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . A . . . . . . A GGCCTCA . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . GG CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . ACC . . . . . . . G . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . . . G . . . . . . . . . . . . A . . GGC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . A . . . . . . A GGATTCA . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCC . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . G . . CCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . A G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . . CCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . .
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blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): CCGATGAATGTTAACCTCGCTAACGAAGGGGTAAATGTTTATGCTAGTCTGTTTTGGATTGTGGATACAGTTGGATGTGGTAATACGTGTATTTTACGAGTGTGAATGCACTCGGATGTTCGGTCGATAATTTGACCAAATGAGACTTTTTGAAAGTTCATATTGATATACTTGACATCTTTTAATGTGATGATTGCCCGTTCGGATCGATCGTAGAGATTATTCGAAATAAAAAGAACAA
Unaligned ( gi|26 ): AATAAATACCCTTTTCGCGCGCTACATTTACACTATATAAAATCGATCTAACACACTATAGGACACAAGTTCCATTTGGCATAAAAAAGTGTAACAGGGCAGATCACGTGATGTAACACCTACGGTGATCACTGAATGACTGCTGATCACGTG
Unaligned ( gi|27 ): CACGCGCTGGAACACCTGCAGATCACGTGGTATAACACCTGCGCTGATCACTGGAATGTCTGCTGATCACGTGGTAGGAAAGAATTCTTGCTGGCTATAGAAACGGTGCCAAGTCTTATTCTTCATTCCGACTT
Unaligned ( gi|28 ): ATCATGTGAATATGAACACCTGTCTAGACATAGCACGCGCTGGAATACCTGTGCTGAACTCGTGGCACGCGCTGGAATAATTGACATTTGGC
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Reference ( family-446 ) : CACC--TCGCAA--------GTG-TATG-GCG--GT-T---GT-TTT-G-GGC-TG---CA-G--G----C---TG---GA--------TGT-GGGAA-A----CA-GTC-AAAGT-GAT-AC-GTT--TCC-C-GG-GGAG--AA-GA-------GCTC-GA-CA-A-TT----AATACA-GGA-CATT-A--CNTC--CCCNGATCAT-GAC--T-TACACC-TGTATNT-AGAAG-AACC-CG-CGTACGAAG-CCG------GA-C-A-------T--T-------TG--T--A--AAA-------AT----AA-------AA---TA--CCAT-GC-AC--A-----GCC-C----TTT-T-TAGGGC-TAC---TTTT--AA-A-ACA-AA---A-TA-T-GAG--TGA-CA--A---CA-C------CAT-A-A--------------C------A--------T----A-----------------------AGTGC--A-C-T---G-----ACA-------T--A----GTT--C-GNTAAGG----TC-AG----T-GC-A-C-T--G----G-G--AAA-----AA---CT-C-A----A--T----T-G--G-CA-C--CA----T-G---CC--A-G----C------------------T--G---G---------C-A--C-T-G---AG-C-CA-G-C-A-C-T-G--G------GAAA-------A-----A----NC-CNA---T--T--GG---C--A--C--C--G-T-G-CC----A---G-------------C------------------TGG-C-A-C---TG-----------A-GC------C-AG--C-A-C-T-G---GG--AA--AA-A-AC--C----C-A----------A--T-T-G---------GC-A--C--C--G--T-G-----CC----AG-------------CTG-----------G-CA-C-TG---AG-C-C----AGC-----ACTG----GG------------C-T-A---T--AAA--G--CA-GA-GCC----------C----C---GGCA-C-TC--T-C-A-C---TCT-T--C-ACA-T-C-GAC--TT--C-A-G-AC-----CC--TG-ACCN---G-AG-AA-CA-T-GG---CT-C--AG--AAA-C-A-GC-TAG--AA-TT-CG-TGGACAGA-GCTCAGA-AG--A---AAGTG-A--A--T-A--A--CAT-G-G-TACAGA-A-ACAGAC-GG----G-A-T-GC--AG-C---A-AG---ATTT--CTT-G-AGCGAAG-AA-G-ATA--GACAGG-A---GGTAC--AGG-A-G--G-CTT---A--CAT---GGC-A--C----A-G-CAG--CTGA-AAAAGGC--GAAG-A-----C-TGAG-----GAG-TATTTACC
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gi|11 : tgtgtatggggcttgttttgggatgcaaagtggctgtgggaaacagttaatgtgatacgtttcccagggagaagagctcgacaaatagtagaggacattacgtccgctgatcatgacttacacgtttacataaaaaaacccgcgtacgaagccggatatttttaaaatgntG----GG------------C-T-T---T--AAAA-G--CA-GA-GCC----------C----C-----CG-C-TC--T-C-A-C---TTT-T--C-ACA-C-T-GAC--TT--C-A-G-AT-----CC--TG-ACCT---G-AG-AA-CA-T-GG---CT-C--AA--AAA-C-A-GC-TAA--AA-TT-CG-TGAACAGA-GGTCATA-AG--A---AAGTG-G--A--C-A--C--TAT-G-G-TACAGA-A-ACAGAT-GG----G-------------------------TC--CTCAG-AGTGAAG-AA-G-ATA--A-------------AC--AGG-A-G--G-CTT---A--CCT---TAC-A--C----A-G-CAG--TTGA-AACGGGC--GAAG-A-----C-TGAG-----GAG-TATTTACCtacctccagatcacgtgatgaacacctggcgatcacgcgctggaacacctgtgctgaacatctggcgatcgcgtgataggaaaaaccttttttacgggctttaaaagcagagcccccgctctcacttttcacactgacttcagatcctgacctgagaacatggctcaaaaacagctaaaattcgtgaacagaggtcataagaaagtggacactatggtacagaaacagatgggtcctcagagtgaagaagataaacaggaggcttaccttacacagcagttgaaacgggcgaagactgaggagtatttacc
gi|12 : tgtgtatggggcttgttttgggatgcaaagtggctgtgggaaacagttaatgtgatacgtttcccagggagaagagctcgacaaatagtagaggacattacgtccgctgatcatgacttacacgtttacataaaaaaacccgcgtacgaagccggatatttttaaaatgnttatatagaataacccgcgtacgaagccgggtatttttaaaataacccatgaacagtcctttttagggctacttttaaaaaaatatatatgagtgacacacacaatcccttctttttagggcataccacaagttcggtaagggcaatcattgcactagaatacctccagatcacgtgatgaacacctggcgatcacgcgctggaacacctgtgctgaacatctggcgatcgcgtgataggaaaaaccttttttac--G---G---------C-A--A-C-G---AG-C-CA-G-C-A-CGT-G--GTGTGGAGAAA-------A-----A----AG-CCA---T--T--GGGACC--A--C--T--GCT-G-CC----A---G-------------A------------------TAG-C-A-C---
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gi|9 : cgccaccggagaaggtatggttgtgtttttggcgtggcggctggatgtggaaaccgtcaagtatactgttccctcggagaaagagctcgcaaacagtacatggacatacgtccaatcatcgactacacggtatttagaacctcgcgtatgaaccggactttttaaaataaaaaccatggcaacaccctttttatggatcttaaaaacaaatatgaggacaacacaaaacatacaaagtcccgttcatggtcaatcagtgcactggcttaacacacgttcgttaaggtcaatcgttgcaactggcatacacaattcgttaaggtcaagtgcacacctcacgacacgtgagaacactggcgctagaacagctgtataacagagcgctggaacaaagcaggtaacacccaccttggcgtcttcagacacgctgtctagacatagtctggcaaataccgtttgtacaggcatCACC--TCGCAA--------GTG-TATG-GAG--AT-T---GT-TTT-G-GGC-TG---CA-G--G----C---TG---GA--------TGT-GGGAA-A----CC-GTT-AAAGT-AAT-GC-GTT--TCC-C-GG-GGAG--AA-GA-------GCTC-GA-CA-A-TT----AATACA-ACA-CATT-A--CATC--CCCAGATCAT-GAC--T-TACACC-TGTATCT-AGAAG-AACC-TG-CGTATGAAG-CCG-------A-C-A-------T--T-------TG--T--A--AAA-------AT----AA-------AA---CA--CCAT-GC-AC--A-----GCC-C----TTT-T-TAGGGC-TAC---TTTT--AA-A-ACA-AA---A-TA-T-GAG--TGA-CA--A---CA-C------CAT-A-A--------------C------A--------T----A-----------------------AGTGC--A-C-T---G-----ACA-------T--A----GTT--C-GATAAGG----TC-AG----T-GC-A-C-T--G----G-G--AAA-----AA---CT-C-A----A--T----T-G--G-CA-C--CA----T-G---CC--A-G----C------------------T--G---G---------C-A--CTT-G---AG-C-CA-G-C-A-C-T-G--G------GAAA-------A-----A----AT-CAA---T--T--GG---C--A--C--C--A-T-G--C----A---G-------------C------------------TGG-C-A-C---TG-----------A-GC------C-AG--C-A-C-T-G---GG--AA--AA-A-AC--C----G-A----------A--T-T-G---------GC-A--C--C--A--T-G-----CC----AG-------------CTG-----------G-CA-C-TG---AG-C-C----AGC-----ACTG----GG------------C-T-A---T--AAA--G--CA-GA-GCC----------C----T---GGCA-C-TC--T-C-A-C---TCT-T--C-ACA-T-C-GAC--TT--C-A-G-AC-----CC--TG-ACCA---G-AG-AA-CA-T-GG---CT-C--AG--AAA-C-A-GC-TAG--AA-TT-CG-TGGACAGA-GCTCAGA-AG--A---AAGTG-A--A--T-A--A--CAT-G-G-TACAGA-A-AAAGAC-GG----GAA-T-GA--AA-C---A-AG---ATTT--CTT-G-AGCGAAGAAA-G-ATA--GACAGG-A---GGTAC--AGG-A-G--G-CTT---A--CAT---GG--A--C----A-G-CAG--CTGA-AAAAGGC--CAAG-A-----C-TGAG-----GAG-TTTTTACCacta
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|28 ): ATCATGTGAATATGAACACCTGTCTAGACATAGCACGCGCTGGAATACCTGTGCTGAACTCGTGGCACGCGCTGGAATAATTGACATTTGGC