lowQualScore : 11111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 4 22 00000 1 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 55 4 1 11 22 444 2 6666 55555 22 1 1 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 5555555555555 11 111 333333333333 33333 1 111111 11 11 777777777777777777777777777 1 1 1 1 4444444444444444444444 1 6666666666666666 1 1 222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 333333 1 2 444444 1 999999999999999999 2 22 22 1 11 22 333333 2 333 1 2 1 555555555 222 11 222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 222222 11111111 1 111 111 11111 1 222222222 11111111 1111 11111111 11 222222222222 1 1111111 22222222222 111 111111111 2222222222222222 4444444444444444444 111111 111111 222222222222 1 2222222222222222 111 111111 111 11111 111 111111 11111111111111 111 1 111111 11111 111 22222 1111111 1111 1111 11 77777777777777777777777777777777 5555555555555555555 1
lowQualScore : 0 6 33 00000 5 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6 0 55 6 0 5 22 33 222 0 6 2222 33333 2 3 77 5 4 6 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 0000000000000 999 11 1 444 8 111111111111 0 66666 0 7 888888 88 88 555555555555555555555555555 3 3 3 7 7 0000000000000000000000 3 4444444444444444 3 2 7 444 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 777777 5 0 000000 5 222222222222222222 0 3 33 77 5 99 22 777777 0 000 5 0 5 000000000 6 222 88 333 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 3 0 88 8 777 111111 0 99 77777777 3 6 2 6 3 55 3 6 000 333 5 5 5 22222 66 5 0 0 5 111111111 2 66 5 5 88888888 5555 88888888 3 55 5 33 8888 0 222222222222 66 5 888 8 0 5 0 5 66 5 5 66 66 8 4 4 2222222 77777777777 4 8 66 1 6 4 66 4 111 666666666 888 4 11 4 55 5555555555555555 55 3333333333333333333 666 44 66 4 000000 444444 66 4 555555555555 0 0 5 2 6666666666666666 555 999 5 5 77 000000 000 5 33333 000 22 777777 99999999999999 5 777 5 7 88 99 6 222222 66666 888 00000 6 77 3333333 6 99 6 1 4444 3 9 4444 99 6 6 6 6 0 11 8 8 44444444444444444444444444444444 8 8 0000000000000000000 8 8 1
lowQualScore : . . .. ..... . ............................................................ . . .. . . . .. .. ... . . .... ..... . . .. . . . . ............................................................................................................................................................................................................................................................................. .. ............. ... .. . ... . ............ . ..... . . ...... .. .. ........................... . . . . . ...................... . ................ . . . ... ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . ...... . . ...... . .................. . . .. .. . .. .. ...... . ... . . . ......... . ... .. ... ........................................................................................................................................ . . . .. . ... ...... . .. ........ . . . . . .. . . ... ... . . . ..... .. . . . . ......... . .. . . ........ .... ........ . .. . .. .... . ............ .. . ... . . . . . .. . . .. .. . . . ....... ........... . . .. . . . .. . ... ......... ... . .. . .. ................ .. ................... ... .. .. . ...... ...... .. . ............ . . . . ................ ... ... . . .. ...... ... . ..... ... .. ...... .............. . ... . . .. .. . ...... ..... ... ..... . .. ....... . .. . . .... . . .... .. . . . . . .. . . ................................ . . ................... . . .
lowQualScore : 0 0 00 00000 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 00 0 0 0 00 00 555 0 0 5555 00000 5 0 55 0 0 0 0 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 00 0000000000000 000 00 4 000 0 000000000000 8 00000 0 0 555555 33 33 000000000000000000000000000 3 3 3 3 0 0000000000000000000000 3 7777777777777777 3 0 0 000 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 000000 5 0 000000 5 000000000000000000 0 0 00 55 5 00 55 000000 0 000 5 0 5 000000000 7 000 33 333 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 2 8 88 0 555 777777 7 22 77777777 7 7 5 7 3 00 2 7 000 888 0 0 0 55555 99 0 0 4 0 555555555 2 99 0 0 11111111 6666 44444444 8 11 0 88 1111 1 444444444444 99 0 222 8 0 0 1 0 99 0 0 99 11 9 4 4 0000000 44444444444 4 9 11 7 7 4 11 4 000 000000000 999 0 55 0 55 9999999999999999 55 9999999999999999999 444 77 11 4 777777 777777 11 0 666666666666 1 0 0 8 0000000000000000 777 333 7 7 99 111111 000 7 77777 000 00 111111 00000000000000 7 999 7 1 33 22 7 888888 77777 333 00000 7 77 5555555 7 22 7 7 2222 2 3 2222 22 7 7 7 7 8 00 0 0 22222222222222222222222222222222 0 0 0000000000000000000 0 0 8
consensus : NCTGCTGTCCCCTTATGACTTATTTTCTCGCCACGCAGTGTCCCATGGTCAAAACACAACAATTTGTAAAACAGA-TAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTA--GTCCTTATTCAAATCAGAATCAGAGATTGTTTAGTATACCAGAACCAATTCTACATTATCAGTTATTTCGATCNGACAGTATTTTAGCTNGGNANCCTCAAAACACAACTAGATNTGCCTGAAATCACATGTGGCAAACCCATGGCTCNCATAATTGTACG-TT--AT-TAAA--AACTT-A-----TTT-CGCATTGGACGA-AT----TAAT-CTANTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAG-G-NCC---AATA-AACAG--AA-CATGTCC---AATTA-TTTTGAATTGGT--ATCTC--T---AGTAT----AN-TNAAT-----TGTTGAAATA-TTTTTT--CG--------CGTTAT--TCAA-----TTTAAAAAAAAA--TTAATTA--AGT--GTAAA-TTCAA-ATTA-CAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGCA-CGG-AA-ATGATTATCA---GGCATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTC-T----TTAA-T-ATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACAT--AG----GG-T-GAT-CTT--T------GATA-TNTGC-CCACCCCCC-CCCCTCT---------AAAAAAC-AACA--CT--GTC------CG--TAAAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATNAAATT-GAACC-C---A----A--GA----TTAACGTTTGC--CGCTT---------T-CCCC-A---ACT-------ATTA-AGAA-TTTAAA--T-CTTTG----GGATTTA----------C--TTGCCAAG-A-ATT-T-CAAAC-AGTATTGTGA-G--C---CCCCCCCCCCCTGGCNTTTNTTTTT---AACGNCGATGCTCCTT-GGCACCTGNTTNATACTCCACCATCGCCATNATNAATTTCTTTCTCGCTATTAGTTTATTCTGCGTGCCTNGCTTGGTTTAAATTTTNTCATGCGTAATATTTGGCATTTATNTCTNGGACCTGGAATAATCGTCGNATCGGGTTAAAATATACTAACAGCCACACATCCCCCTTCTCGCAACTATACTATNCAATTTGTTGAATTATN--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCAATTTGACAAAATTG-TCTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTCAC-T---C---TTTTGT--GGTGAAAAATATTGA-TC-AAA---AAACGG-----TAAAAT--GA----TGA-TTTA-TTGACGAAGT-TATTAAC-TTT---TATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----GGT-AGATAGA--T-CA-T--------TC----TCCGCG--T-----TNTA-CA-CATC--AT-G--TAAACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACAGA-TCCTATT-TTATCTTA-C--CTAGTCA-TG-AAAA--AACA--TC-AAT-AT-CT---A---AA----------NAA-CGAA-G--CAATTTTATNTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---CT---------TGGTGAATAG--C-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-T--------TT--GTCTTTT--------C--T--C-GATTC--TTTTTTCTTTT--TA-TGG-A---CA---T--T--TTT-TTCC------------CGACAA-AT-TCTAA----AAA----T----GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAA---ACTGC---AAA-AT---T-ATCA---TGTTTAAAT----TGAA--GAGG-------C-TAAT---AACTGT-TAACATGTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AG-ATC--A---TTAAT-CA--ACC-TTTTCGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACCA-CCGGCGCGCAACCG-CGAGGG--TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATCACTCG----CGATGT-CGATTAGATCGC-TATA-CCTAGTGTG
Reference ( gi|1 ) : TCTG-TGTCCCTTAGTGA-----TTTCTCGCAACGCAGTGT----TGGTTATAATA--ACAATGTGTAAA-CGGAATAGAT----------GTAAT-----GTAAATT-TTAACTAATGTCCTTATCCAA-TCAGACTCAAGGATTGTTTTATATACCAG--CTAATTCTACATTATTA-TTATTTTAGTC----AATATTTT---TCGGCAACTT--AAACACACCTAAATATGTCTGAAATTACATGTG-CAACCAAATGGCTTACATAATTGTGC--TTA-AT-TAAAATCACTT-A-----TTT-CACATTGGACAACAT----TCAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAG-G-AAC---AATA-AACAG--AA-CATGTC----A-TT--TTTTGAATTTGTTAATCT---T---AGTG-----ACCTTAAT-----TGTTGAA----TTTTTT--CG--------CGTTTA--TCAA-----TTAAAAAAAAAAAATTAATTA--AGT--GTAAAATTCAA-ATTAGCAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGCA-CGGCAA-ATGATTATTA---GGTATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTC-T----GTAA-T-ATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTATT-----ACATTAAG----GG-T-GAT-CTT--T------GGT--TATGC-CCACCCCAC-CTCCTCT---------AAAAAG--AACA--CT--GT-------CG--TGAAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---A----A--GAA--GTTAACATTTGC--CGCCT---------T-CCTC-A---ACT-------ATTA-AGAC-TTTAAA--T-CTTTG----GGATTTA-------ACTT--TTGCCAAG-A-ATTAT-CAAACAAATATTGTGA-GCCC---CCCCCCCCCTCT-GTTTTTTTTTTTAAAAAAAACTATGCTCCTTTGGC--CTGATTTATA--------TCG-CA-GATA----TCTTTCT-GCT-TT---TTATTCTG-GTGCCTT-TT--GTTTAAATTTT-----G-GTAATGTTTGGCATTT-TATCTT-GAC--AGAATAATCGTCGAATTC-GTT-AA---TATT-ACA-C-ACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA--ATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATC-ATTTGACAAAATTG-TCTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTTAC-T---C---TTTTGTTTGGTGAAAAATATTGA-TC-AAA---AAACGG-----TAAGAT--GA----TGG-TTTA-TTGACGAAGT-TATTAAC-TTT---TATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGT-AGATAGA--T-CA-T--------TC----TCCGCG--T-----TATA-CA-CATC--AT-G--TAAACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACACA-TCCTATT-TTATCTTA-C--CTAGTCA-TG-AAAA--AACA--TC-AAT-AT-CT---A---AA----------TAA-CGAA-G--CAATTCTATGTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---CT---------TGGTGAATAA--C-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-T--------TT--GTCTTTT--------C-AT--C-GATTC--TTTTTTCTTTT--TA-TGA-A---CA---T--T--TTT-TTCC------------CGACAA-AT-TTTAA----AAA----T----GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAA---ACCGC---AAA-AT---T-ATTA---TGTTTAAAT----TGAA--GAAG-------C-TAAT---AACTGT-TAACA-GTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AG-ATC--A---TTAAT-CA--ACC-TTTTCGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC--CCAGGGCGCAACCG-CGA-GG--TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATCACTC-----CGATG--CGATTAAATCGC-TATA-CCAAGTGTG
gi|16 : CTGCTGTCCCCTTATGACTTATTTTCTCGCCACGCAGTGTCCCATGGTCAAAACACAACAATTTGTAAAACAGA-TAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTA--GTCCTTATTCAAATCAGAATCAGAGATTGTTTAGTATACCAGAACCAAT
gi|3 : CCAG---TAATTCTACATTATTA-TTATTTTAATCG---AATATTTT----CGGCACTTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCA-ATGTGGCAAACCCATGGCTTTCATAATTGTACG-TTT-AT-TAAA-TAACTT-AGTGCATTTGCACATTGGACAA--T----TAAT-CTACTTGTTTGCTGAAT-ACACA-------------------ACAG--A--CATGTCC---A-TTATTTTTGAATTTGT-AATCT---C---AGTGTA---ACTTAAAT-----TGTTGAT----TTTTTTTTCG--------CGTTAT--TCAA-----TTTAAAAAAAAA--TTAATTA--AGTCTGTAAA--TCAATATTA--AG-CTCTTTCCTAGCAC---TGT-AATTACTGAA--------T-GTGCAACGG-AA-ATGATTATTA---G-CGTATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTC-T----TTAT-TTATTGCAATGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAAG----GG-T-GATCCTT--T------GAT--AATGC-CCA-CCCAC---CCTCT---------AAAAAAC-AACAG-CT--GTC------CG--TGAAC---TG-A-GTGGA------------AA--TATGAAATTGGAACCAC---A----A--GA----TTAACATTTGCCGCGCTT---------T-CCTC-A---ACT-------ATTA-A-ACATTTAAA--T-GTTTA----GGATTTA----------C--TTG-CAAG-A-AT--T-CAAAC-AATATTGGAA-G--------TCCCCCCTCTGGTTTTTTTTTTT------ACCGATGCTCCTT--GC--CTGA-TTATA--------TCACCATGATGAATTTCTTTCT-GCTATT---TTATTCTG-GTGCCTT-CTTGGTTTAAATTTTG----G-GTAA-ATTT-GCATTT-TATCTTGGAC--AGAA-AATCGTCGTATTCGGTTAAA---TATTAACAGC-AC-TATCCCCCTTCTC-CAACTATAT-ATTCA--TTGTTGAATTATA--CAATTTAAAA--AGCGCACGCTCCGTACA--TC-CG----------------T--TGTAAAGGGAGTAACTGCAAAAAAT---GTAGCCCATCAAGCTGACAAAA-TG-TCTTGACATT-----------A-CTTCCAC-TTTACGT---C---TT--------TGGGAAATATTG--TC-AAA---AAACGG-----TAAAAT--GA----TGA-TTTT-ATGACGAAGTGTATTA---CTT---TATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGTAAGATAGA--T-CA-T--------TC-----CCGCGGTT-----TATA-T--CA-C--AT-G--TAAACAATTCAA-T-T-----CG--CG-GAC---ACACA-ATCTATT-TTATC-TA-C--ATAGT-A-T---AAA--AACA--TC-AAT-AT-CT-------AA----------TAA-CGAAGG--CAATTCTATGTT-AC--ATGTGAGCTATTGTTATGAG---CT---------TGGTGAATAA--CTTTTATCATTCTAG-GT--AACAGAAAGT--------TT--GTCTTTT--------C--T--C-T-TTCGATCTTTTC-TTT--TG-TG--A---CA---T--T--CTT-TCCC------------AG--AA-ATGTTTAA----AAA----T----GAGTC--ATTTTTC-TGA-A-G--T-A---ACTTC---AAA-AT---T-ATTA----GTATAAAT----TGA----GAG-------C-TAAT---AACTGT-TAACATGTAC--AA--AGC-C-GT--TTTAA-----AAC----AC-ACTCCA-A----T--A---CTAAT-CA--ACC-TTTTCGAT----AAAGCTTCCTA----TTTAATAAA-TG-A-TAC--TATAA--AAA-TATTATG-CCTACCA-CCAGCGCGC-ACCGCCGAGGG--TGTTCA-CGCGTACGCAC-AGATCAACT-----CGAGGT-CGAT--GAGCGC-TATAGCCTAGTGTG
gi|5 : TTATCAGTTATTTCGATCTGACAGTATTTTAGCTAGAAAACCTCAAAACACAACTAGATTTGCTTGAAATCACAT--------------GCTCA--------TGC------ATGTAAG-----TT-A-----TTT-CACATTGGACAA-AT----TAAA-ATAATTGTT-ACCAAAT-ATACATCAG-GTGCC---AATA-AACAG--AG-CATATTA---A-TTG-TTTTGAATTGGT--ATCTCTGT---AGCA-----GAATAAATC----TGTTGAAATATTTTTTT--TA--------CGTTAT--TCAATCGTTTT---AAAATTAAATT--TTGTCAGT--GTAAA--TCAA-ATTA-TGG-CACTC--CTAGGAC---TGC-AATGACTG-A------AAT-GTGCA----CAATATAATTATCA---GGCATGCAGCAA--CAATGAGT--TTG-----CATTGTCTCTT----TTAACT-ATTACA-TGC-AAA-GTTGGTTATTTTT-----AGATACAGCTCAGG-TAGAT-CTT--TAAATAGGGTACTGTGCTCCCTCCCCC-CTTCTTTATATAAAAAAAAAAA--AGCA--TTGCGT-------CG--CAAAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATAAAATT-TAACC-TTTGA----ATTGAAAGATCAACGCTTGC--CGCTT---------TCCCCC-A---AC--------ATTA-AGAA-TTAAAA--G-CTTTGTTTCGTTTTTATTAATTTACTTAATTGTCAAG-ATTTTTT-TATGC-AGTATTGTGA-AATCAATCCCCCCat
gi|2 : tATTGTACGTTTATAT-TAAATAAACTTGA-----GTT-TGCAATCTGCGACATAATATAATGCTACTTGT--GCTGAATGACACATCAG-A-AGCTGAAATA-AACAG--AAGCATGTCCATTA-TT--TCCTGTATTT--TGATCTC--T---AGTATGTGTAACTTAAT-----TGTTGAAG---TTTTTT--TGTTCGCAAGCGTTAA--TCAA-----TTTAAAAAAAAG--TTAATTAG-AGT--GTAAAAT-AAA-ATTTACATTCTCTT--CTTGCAC---TGTTAATTACTGGAGAAAGAAATCGTGCA-CGG-AA-ATGTCTATTATGTGGTAAATATCAAATTGATGAGTGATTGGTCAACA----CTT-TTTATGTAAAT-ATTGCA-TGCTATATGTTGGT-ATTTTTTTTTAACAT--AG----GACT-GAT-CTTCTT------GATA-TCTGC-CCACCCCCCACCCCTCT---------CAAAAACTAATATTCT--GTTTCCATGCGGTTAAATCTGTGTATGTTGATCTTATTGATCTAACTTATTGAGTT-GAATC-C---ACTAGA--GAT--CTTAACATTTGC--CTCCTCGCGTCCGCT-CCCCTATTTACTCCCTCACATTATAGAA-TTTAAAATTGCTT------AGATTTA----------C--TTGCCAAGTA-ATTATTCAAACAA-TATTGTGAAGCGC---CCCCCCCCCCCT-GCATTTATTT-----AACGA--ATGCTCCT--GGCACCTACTTAATACTCCACCATTG-CA-TATC----TCTTTCTCGCT-TTAGTTTAT-CTGCGTGCCTGGTT--GTT-AAATTTTCTCATGCGTA-TATTTG-CATTTATCTCTG-GACCTGAAATAATCGTC-AATCG-GTT-AAATATACT-ACA-CCACACATCCCCCTTCTCGCAACT-TACTATACAATTTGTT-AATTATCAACAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-ACATC-CGATGATAAGGGCAGTAAC--TGC----------------AAAAATTTGGTAGCCCATCAATGGGAC-AATTTGTTCTTGA-ATCCTTATCTACATA-CTTCCACCTTC-C-T---CCAACTCTATTTGG-GAAAAATATTGAGTCAAAA---AAACGGGGTATTAAAAT--GA----TAA-TTTATTTGACGAAGT-TATTAACTTTT---TATTTAAGT-T-AC-TAG-----A--A-TCTCCTT-A-----GGT-AGATAGA--TCCA-T--------TC----TCCGCG--------TATC-CATCATCCAAT-GTATAAACATTTTCACT-C-----CG--CG-GAC--GACACACTTCTATT-CTATCTTACC--CTAGTCA-TG-AAAAACAATA--TCAAAT-ATCCT---AACGAG----------TAA-CGAAGG--CAAT--CATGTT-AC--ATG-GAGC-ATGTTTATATGC--CT---------TGGTGAATAA--C-TTTATCATTCTTGCGT--AA-AGAAA-T--------TTCCGTCTTTT--------C-TT--CGGATTC--ATTTCTCTTTT--TCTTGA-A---CA---CAAT--TAT-TTCC------------CAACAA-AT-TTTAATAATAAA----T----GAGTC--ATTTTTTCTGACA-GGTTAA---ACGCC---AAA-ATTAAT-ATTA---TTGTTAAA-----TGAAGGGAAG-------C-GAAT---AACTGT-AAAT--GTACAGAA--AGC-C-TGTTGTAAA-----AAC---TAC-A---CA-AGAATC--A---TTAA--CA--ACCTTTTTCGGA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA--G-A-TAC-GTATAA--AAATTA-TATGACATACCAACCGCCGCGCACCAA-CGA-GGGCTGTTCACCGCGTACG-AC-AGATCACT------CGAGGT-CGA-TAGATTGC-TATA-CCTAGTGTG
gi|15 : -CTAATTGTT-GCT-AAT-GTACATCAGAG-CCC---AAGATGACACCTAA-CATGTT----AATTA-TTTTGAATTGGT--ATCTC--T---AGTG---------TAATATATCTGTTGAAATA-TTTTTT--CG--------CGCTAT--TCCA-----TT------------TT--T-----GT--GTAAA--TCTA-TTTA-TAG-A---T--CTTGCAC---TGC-AATTACTG-A------AAT-GTGCA-C
gi|14 : caaa---AATA-AACAG--AA-CATGTA----AATTA-TCTCAAATTGGT--ATCT---CTAAAGTA-----AC-----------------A----TTTTTT--CA--------CATGTGATTCAA-----TC------------TT--TT----GT--GTGAACTT-AC-AT--GCAG-CTCTT--CTTGCACTCATGC-AATTACTCAA------ACC-A-GCA-CAA-AA-ATAA-TATCA---TGCATcaa
gi|4 : tttctgctaaatctactggtgagTTGAACTACT--TAAGTCTAAATCCGCGTAT---CCATA-A--TTTCG----------------TATTG---------------------AT---GTA--------ATTTG-TAAAATGT-TCTT-ATATTT----------AACTTT---TTTCAC-TTGAC---ATTTGT--AGTTAAAA-TAT-GA-TC-AAATAAAAACG------TATAAC--CA----T-----TA-TT-AT--AGTACACTAAC-TTAAAACATT---ATAT-ATATAG-----A--AATTT-CCGTA-----GAA-AGATAGAGCT-CA-T--------TC----TCCGCG--TATTTTTAT--CA-CATCTCATTG--TAA-CAATTTCA---C-----CG--CG-GATTTGACA-A-TCCTATTATTATCTGT-C--CTAATCA-GG-ACAA--AACA--TC-AATTAT-CTTTAA---AA----------AAA-CCGA-GACCAATTTTAT-TG-AC--ATG-GA-CTATTGGTAT-TG---GT---------TGGTGAAGAG--C-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAAAT--------TT--G-----------------------------TCTTTTCTTT-------GATA---C----T--T--TTC-GTAT------------CAACGGCAT-C--------------------GAGT-------TTTTAGA-AAG--TAA---AATGC---AAATAT---T-A-CA---TGTTTACAT----TGAA--GGAG-------G-CAATAA-AACTGT-TAACATGTACAG-A--AGC-CGTA--CTCAC-----AAC---TACAA---CA-AA-TTT--A----TAAT-CC--CAC-ATTTCGAA----AAA-TTCCCTC----CTTA--AAA-TGAA-TAG-GCATAGTTAAA-CA-TAT---AT------------------G-CGAGGG--TGTTTTCCGCGAATG-ACAAGATACCTCGCGAACAATGATTGAT--AATCGC-TATA-ACTAGTGTgca
gi|18 : aTTGACACAAT-G-TCT---CATT-----------A-CTTCTA-TTTTAC-T---C---TTTTG----GTGAAAAATATTGA-TC-A
gi|7 : aaTTGA-CC-AAA---AAA-----------GAT--GAATTCTGA-TATT-TTTATCAAGT-T-----T-TTC---TATT---AT-T--C-TAGCAAGAA--A-TAT-TCA-ACTCCCGAT-TGACAGA--T-CA-TAGACTTTATCAAACTCCGGG--T-----TCGA-TA-AATC--AT----------ATT--A-T-C-----CG--CGTGTC--GACAGA-TC-TATT-TTAC--TA-C--CTAGTCA-TG-AAAA--A-CA--TC-A-T-AT-CT---A---AA-----------AA-CGAA-G--CAATTC---GTT-TA--ATG-GAGTTATT--TATA-G---CG---------TTGT--ATA---C-ATTATCAT-CTAG-TT--AA-AAA------------TT--GTCTTTT--------CTAT--C-G-TTC--TTTTTT----T--TA-T---A---CA---T--T--TTT----C------------CGATAA-AT-TCTAA----AG-----T----GGGT---ATTTTC--TGA-A-G--TAA---CTTGC---CAA-AT-----ATCA---TGATTAA-T----TGAG--GAGG-------C-TAAT---AACTGTCTAACA-TTAC--AA--AGCAC-TG--GTTAA-----AACT--TAC-----CA-AG-ATC--A---TTTAT-CA--ACA-TTTTCGAA----A---TTTGCTA----TTAA--GAT-TG-A-TAC-GTAT-A--AAA-TA-TATG---TTCC------------ACCG--------------AC----TACG-AC-AGATCACTCG----CGGT---CGATACGATCGCTTATA-CCTAGT
gi|9 : AACGG-----TAAAAT--GA----TGA-TATA-TTGACTAAAT-TAA-AAC-TTT---TATT---AC-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----AAA-AGATAGA--T-CA-T--------TC----TCCATG--C-----TTTA-CA-CATC--GT-G--TAAACAATT-------------G--CG-GAA--GACAGA-TCATATT-TTATCTTA-C--CTAGTCA-TGAAAAA--AACA--TC-AAT-AT-CT---A---AAAAAACAAATCTAA--AAA-G--CAATTTTATCTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATTTG---CT---------TGATAAATAG--C-TTTAGCATTCTAT-GT--AA-AGAAA-T--------TT--GTCTTTT--------C-TT--C-GATTC--TT
gi|6 : -----TAAGATTGGA----TGGGTTTA-TTGACGAATT-TATTAAC-TTT---TATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGT-AGATAGA--T-CA-T--------TCA---TCCGCG--T-----TATA-CA-CATC--AT-G--TAAACAATT-CA-TTC-----CG--CG-GAC--GACACAATCCTATT-TTATCTTA-C--CTAGTCA-TA-GAAA--AACA--TC-AAT-AT-CT---A---AA----------TAA-CGAA-G--CAATTCTATGTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---CT---------TGGTGAATAA--C-TTTATCATTCTAG-GTTAAA-AGAAA-T--------TT--GTCTTTT--------C-AT--C-GATTC--TTTTTTTTTTT--TA-TGA-A---CA------T--TTT-TTCC------------CGACAA-AT-TTTAA----AAA----T----GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAA---ACCGC---AAA-AT---T-ATTA---TGTTTAAAT----TGAAG-GAAG-------C-TAAT---AACTGT-TAACA-GTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AG-ATC--A---TTAAT-CA--ACC-TTTTCG-A----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACCA-CCAGGGCGCAACCG-CGAGGG--TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATCACTC-----CGATGT-CGA-TAAATCGC-TATA-ACAAGTGTG
gi|11 : ---TATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCA-A-----G-----AAAGA--T-CA-T--------TC----TCCACG--T-----TTTA-CA-CATC--AT-G--TAAACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAA--GATAGA-TCCTATT-TTATCTTA-C--TTAGTCA-TG-AAAA--CACA--TC-GAT-AT-CT---A---AA----------ACA-CGAA-G--CAATTTTATCTT-AC--CTG-GAGCTGGTGTTATATG---CT---------TGATGAATAG--C-TTTATCA-----------AA----------------TT--GTC-----------------------------TTTTCTTTT--TA-TGG-A---CA---T--T--TTT-Ta
gi|10 : ttttttgcATTG--AT-TGAC-TAG-----ACCA-TCTTCCA-A-----G---AAA-AGA--T-CAGT--------TC----TCCACG--T-----TTTATCA-CATC--AT-G--TAAAAACTTTCA-T-CGGAACCGGGCG-GAA--GATAGA-TCCTATT-TTATCTTA-CTGCTAGTCATTG-AAAG--CACAAGTCGAGT-AT-CT---A---AA----------ACA-CGAA-G--CAATTTTATCTTGACCGGTG-GCGCTGGTGTTATATGGGCCT---------TGATG-ATAAGGC-TTTATCA-----------AA----------------TT--GTCTTT-------------------TTC--TT-----TATT--TA-TGG-A---CAAAGT--T--TTT-c
gi|13 : ACA--CC-AAT-TT-CT---A---AA----------AAAGCGAA-G--CAATTTTATCTT-AC--ATG-TAGCTATTGTTTTATG---CT---------TGACGAATAG--C-TTGACCATTCTAT-GG--AA-ATAAT-T--------TT--GTCTTTT--------C-TC--C-AATGC----TTTTATTTT--TA-TGG-G---CA---G--T--TTT-TCCC------------CGACAA-A--TTTAA----AGA----A----GAGg
gi|8 : TATATG---CTCTCTTTAAATGATGAATAG--C-TTTATCATTCTAG-GT--AAGAGAAA-TTCAATTTATC--ATCTTTTTCTTCGTGC-ATAAC-GATTC--TTTGTGCGTTTAGTA-TGA-GATTCA---T--TGCTTTATTCTCTCACGCAGAAGCAACAATAT-TCTAA----AAAAAGCTTCAAAAGTCTTATTTTTTTTGA-A-G--TAAAATACAGCATAAAA-AT---TAATCACTTTGCTTTAGTACGATGAA--GAGGTGGTACCC-CAATTAAAACTGT-TAACATGTACAAAAAGAGA-C-TC--AATAATTCATGACAGATAC-G---CACAG-ACCCTACATTTAATCCAATACA-TTTTCGAATTTTACATTTGCCTAAATTTTTA--AAAGTG-ATTACGGTATgcccaagggccacatcgc
gi|17 : TT-TTCC------------CACCAG-AT-TCTAAG---AAA----T----GAGTA--ATTTTTCT-GA-A-G--AAA---AATGC---AAA-AT---T-ATCA---TGT------------------GG-------CATAA----AACTGT-TAACA-
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): ATATGTAATCCTTTCACACTGCTGACAAAAATATGTACACCAGTCCAGGTGTCAATTAACGGAACATGTTAATTATATCAAATCTGTATCTCTAATGTAATTTTTCTCTTGAAATCTGTTTTCTAACACACAGAGTGTTTCAATCTTTTAAAAATGAATGTTTTGTGTAAATCAACTTATAATAAAAAGTACTCAAATAAATCATCAAGCATATAG
Unaligned ( gi|19 ): AAGGTTTTTCCCGACAGAATCTAACAAGAGGCCCAAGGGCCACATCGC
Unaligned ( gi|20 ): GAGGTCGATAGATCGCTATACCTAGTGT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 22222 2222 11 1 2 4444444444 22222 1 22 1 11 2 333333 333 33 2222222 11111 222 55555555555555555 1 11 1 2222 1 222222222 22 33333333333333333 1111 33333333333333333 2222 33333333333333333 33 111 33333333 111 11 11 22222222222 1 4444444 1 1 1 22222 444444444 111 1 333333333 1111 1 4444444444 11 22 444444444444 111 1 555555555555 11 1 5555555555555555 11111 11 444444444444444444444444444444 1 2222 555555555555555 33333333 333333333 11 3333333333 2222 555555555 333333 1 999999999999999999999 2 55555 2 444 44444444 11 11 2 1 333 22222 66666666666666 2 2 2 111 11 111 1111 1 22222222222222222222222222222222222222 111 44444444444 333333 111 22222 111 111111 1 111 11111 111111111 11111111 1111 11 111111111111 11 111111 111111111 44444444444444444444444 111 222222222222 1111111111111111 111 111111 111 11111 1111111111 1111 11111 111 11111 1111 1111 1111 1111111111111 222222 222
lowQualScore : 5 4 77777 2 3333 4 88 3 5 0 0000000000 66666 5 77 5 3 4 88 0 3 11 444444 777 1 1 1 0 00 0 1 0 6 4444444 3 88888 7 777 3 66666666666666666 0 2 33 0 5555 0 99 1 88 3 8 0 999999999 5 77 55 66 5 0 8888 4 77 5 77 33333333333333333 4444 77 44444444444444444 1 2222 5 55555555555555555 77 00 5 5 99 6 3 99 111 6 22222222 6 6 999 8 444 0 1 5 33 33 55555555555 0 2222222 0 0 0 3 55555 777777777 111 0 333333333 7777 55 0 0 3333333333 88 33 333333333333 777 3 0 111111111111 33 1 0 6666666666666666 88888 2 33 444444444444444444444444444444 0 0000 555555555555555 22222222 6 000000000 22 4444444444 1111 1 7 555555555 111111 1 4 777777777777777777777 4 3 22222 7 3 444 6 66666666 44 33 3 1 4 6 111 7 77 88888 00000000000000 88 3 7 3 1 3 2 444 33 777 4444 0 88888888888888888888888888888888888888 777 2 3 0 777 8 55 3 88888888888 8 3 333333 8 444 0 44444 0 0 6 444 6 555555 77 77 3 5 1 66 0 1 11 1 888 4 222 4 4 4 11111 66 4 4 8 555555555 1 66 4 4 66666666 3333 777 1 8 8 22 4 66 444444444444 66 4 666 00 4 4 66 4 4 55 4 55 4 4 4 4 777 777 4 555555 777 4 99 1 4 4 55 4 666 3 444444444 555 3 3 55 7777777 99999 55 7777 11111111111111111111111 55 99 222 9999 55 88888 4 222222222222 0 4 4 2 9999999999999999 222 444 5 5 66 1 444444 5 333 888 0 2 00000 0 5 88888 8888888888 2222 5 5 44 77 5 5 77 44444 555 55555 5 5 77 0000 5 77 5 0 2222 1 6 2222 77 5 5 5 5 99 6 6 99 3 99 7777777777777 2 6 2 6 6 6 6 888888 5 222 5 5
lowQualScore : . . ..... . .... . .. . . . .......... ..... . .. . . . .. . . .. ...... ... . . . . .. . . . . ....... . ..... . ... . ................. . . .. . .... . .. . .. . . . ......... . .. .. .. . . .... . .. . .. ................. .... .. ................. . .... . ................. .. .. . . .. . . .. ... . ........ . . ... . ... . . . .. .. ........... . ....... . . . . ..... ......... ... . ......... .... .. . . .......... .. .. ............ ... . . ............ .. . . ................ ..... . .. .............................. . .... ............... ........ . ......... .. .......... .... . . ......... ...... . . ..................... . . ..... . . ... . ........ .. .. . . . . ... . .. ..... .............. .. . . . . . . ... .. ... .... . ...................................... ... . . . ... . .. . ........... . . ...... . ... . ..... . . . ... . ...... .. .. . . . .. . . .. . ... . ... . . . ..... .. . . . ......... . .. . . ........ .... ... . . . .. . .. ............ .. . ... .. . . .. . . .. . .. . . . . ... ... . ...... ... . .. . . . .. . ... . ......... ... . . .. ....... ..... .. .... ....................... .. .. ... .... .. ..... . ............ . . . . ................ ... ... . . .. . ...... . ... ... . . ..... . . ..... .......... .... . . .. .. . . .. ..... ... ..... . . .. .... . .. . . .... . . .... .. . . . . .. . . .. . .. ............. . . . . . . . ...... . ... . .
lowQualScore : 0 0 00000 5 0000 0 00 0 5 0 5555555555 55555 5 55 5 0 0 55 7 3 33 333333 000 0 0 0 7 33 7 0 7 7 0000000 7 77777 3 555 2 88888888888888888 0 0 88 0 5555 0 44 0 88 2 0 8 555555555 7 99 99 11 0 1 9999 3 99 7 99 33333333333333333 7777 99 00000000000000000 4 1111 0 11111111111111111 99 66 7 7 77 7 5 22 777 7 22222222 7 7 444 0 000 8 4 0 88 88 55555555555 0 5555555 0 0 0 2 00000 222222222 000 0 555555555 5555 88 2 0 8888888888 88 88 000000000000 555 2 0 222222222222 88 0 0 2222222222222222 55555 0 88 222222222222222222222222222222 0 8888 000000000000000 88888888 5 222222222 00 2222222222 7777 0 3 333333333 000000 0 0 333333333333333333333 7 3 00000 3 3 000 7 00000000 77 33 7 0 0 7 000 3 77 77777 77777777777777 00 3 3 3 0 7 5 888 88 555 8888 0 55555555555555555555555555555555555555 555 5 2 8 222 0 88 2 22222222222 0 2 222222 0 000 8 88888 8 8 7 000 7 333333 99 99 0 7 7 44 7 4 77 4 888 4 222 4 4 4 11111 11 4 4 9 999999999 0 11 4 4 11111111 9999 888 0 9 9 22 4 11 777777777777 11 4 222 11 4 4 11 4 4 55 0 55 0 0 0 0 000 000 9 555555 000 0 55 9 9 0 55 0 444 6 555555555 444 6 6 00 8888888 11111 00 7777 99999999999999999999999 55 00 555 4444 55 00000 4 888888888888 8 4 4 7 1111111111111111 555 666 0 0 99 4 444444 0 888 888 4 0 88888 1 0 00000 1111111111 0000 0 0 44 99 7 7 99 33333 777 99999 7 7 99 1111 7 99 7 1 1111 4 6 1111 99 7 7 7 7 22 7 7 22 5 88 7777777777777 5 7 5 7 7 7 7 999999 7 000 7 7
consensus : NCTGCTGTCCCCTNGTGACTTATTTTCTCGCNACGCAGTGTCCCATGGTCANAACACAACAATNTGTAAAACGGAATAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTAATGTCCTTATCCAAATCAGANTCAGGGATTGTTTNGTATACCAGAACCAATTCTACATTATTA-TTATTTTAATC-GA-AGTATTTT---TCGGCAACTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCACATGTG-CAA-CNCATGGCTT-CATAATTGTACGTTT--ATTAAAT-A--ACTT-A-----TTT-CGCA--TTG-GACA-A-AT-TAAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAG-GN-NC---AATA-AACAG--AA-CATGTC-AATTATTT--C-GAATTTGT--A-TCTC--TAGTGT-----AA--TNAATCTGTTGAAATA-TTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAAAAAA--TTAATTA--AG--TGTAAA--TCAA-ATT-A-CAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGC-ACGG-AA-ATG---ATTATCAGGCATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTC-TTTAT----A-TATTGC-ATGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAA------GGG-T-GAT-CTT--T------GGTA-TATGCCCACCCCCC-CCCCTCT----------AAAAAAC-AACA--CTGT-C------CG--TGAAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGA--T--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCCC-A---ACT-------ATTA-AGAATTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTA---C----TTGCCAAG-A--ATTA-TCAAACAA-TATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTG-GTTTTTTTTTTTAA-GA---C-ATGCTCCTT-GGC-CCTGATT-ATA-------ATCGC----ATGGATNTCTTTCT-GCT-TT--TTTATTCTG-GTGCCT---TTGGTTTAAATTTT----TG-GTAATATTTGGCATTT-TATCTTGGAC--GGAATAATCGTCGAAT-CGG-TTAA---ATATTA-CA--CACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCAATTTGACAAAATTGT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTC-----AC-T---CTTTTGT--GGTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ANAA------C---GAA-G--CAATTCTATNTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TCTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACTGCA------AA-ATTA---TCA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCGGCGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGCG----ATG-TCGATTAGATCGC-TATA-CCTAGTGTG
Reference ( family-424 ) : NCTGCTGTCCCCTTATGACTTATTTTCTCGCCACGCAGTGTCCCATGGTCAAAACACAACAATTTGTAAAACAGA-TAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTA--GTCCTTATTCAAATCAGAATCAGAGATTGTTTAGTATACCAGAACCAATTCTACATTATCAGTTATTTCGATCNGACAGTATTTTAGCTNGGNANCCTCAAAACACAACTAGATNTGCCTGAAATCACATGTGGCAAACCCATGGCTCNCATAATTGTACGTT---ATTAAA--A--ACTT-A-----TTT-CGCA--TTG-GACG-A-AT-TAAT-CTANTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAG-GN-CC---AATA-AACAG--AA-CATGTCCAATTATTT--T-GAATTGGT--A-TCTC--TAGTAT-----AN--TNAAT-TGTTGAAATA-TTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAAAAAA--TTAATTA--AG--TGTAAA-TTCAA-ATT-A-CAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGC-ACGG-AA-ATG---ATTATCAGGCATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTC-TTTA-----A-TATTGC-ATGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACAT--A------GGG-T-GAT-CTT--T------GATA-TNTGCCCACCCCCC-CCCCTCT----------AAAAAAC-AACA--CTGT-C------CG--TAAAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATNAAATT-GAACC-C---------A----AGA--T--TAACGTTTGC--CGCTT---------T-CCCC-A---ACT-------ATTA-AGAATTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTA---C----TTGCCAAG-A--ATT--TCAAACAG-TATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTG-GCNTTTNTTTTTAACGN---CGATGCTCCTT-GGCACCTGNTTNATACTCCACCATCGCCATNATNAATTTCTTTCTCGCTATTAGTTTATTCTGCGTGCCTNGCTTGGTTTAAATTTTNTCATGCGTAATATTTGGCATTTATNTCTNGGACCTGGAATAATCGTCGNAT-CGGGTTAAAATATACTAACAGCCACACATCCCCCTTCTCGCAACTATACTATNCAATTTGTTGAATTATN--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCAATTTGACAAAATTGT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTC-----AC-T---CTTTTGT--GGTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TNTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ANAA------C---GAA-G--CAATTTTATNTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TCTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACTGCA------AA-ATTA---TCA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCGGCGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGCG----ATG-TCGATTAGATCGC-TATA-CCTAGTGTG
gi|1 : CTG-TGTCCCTTAGTGA-----TTTCTCGCAACGCAGTGT----TGGTTATAATA--ACAATGTGTAAA-CGGAATAGAT----------GTAAT-----GTAAATT-TTAACTAATGTCCTTATCCAA-TCAGACTCAAGGATTGTTTTATATACCAG--CTAATTCTACATTATTA-TTATTTTAGTC----AATATTTT---TCGGCAACTT--AAACACACCTAAATATGTCTGAAATTACATGTG-CAACCAAATGGCTTACATAATTGTGCTTA---ATTAAA--ATCACTT-A-----TTT-CACA--TTG-GACA-ACAT-TCAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAG-GA-AC---AATA-AACAG--AA-CATGTC--ATT-TTT--T-GAATTTGTTAA-TCT---TAGTGA-----CC--TTAAT-TGTTGAA----TTTTT--TC-----------GC----GTTTATCAA----TTAAAAAAAAAAAATTAATTA--AG--TGTAAAATTCAA-ATT-AGCAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGC-ACGGCAA-ATG---ATTATTAGGTATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTC-TGTA-----A-TATTGC-ATGC-ATA-GTTGGTTATTATT-----ACATTAA------GGG-T-GAT-CTT--T------GGT--TATGCCCACCCCAC-CTCCTCT----------AAAAAG--AACA--CTGT-C-------G--TGAAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGAAGT--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCTC-A---ACT-------ATTA-AGACTTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTAACTT----TTGCCAAG-A--ATTA-TCAAACAAATATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTCTGTTTTTTTTTTTAAAAAAAACTATGCTCCTTTGGC--CTGATTTATA--------TCGC------AGATATCTTTCT-GCT--T--TTTATTCTG-GTGCCT---TTTGTTTAAATTTTG------GTAATGTTTGGCATTT-TATCTTG-AC--AGAATAATCGTCGAATTCG--TTAA----TATTA-CA--CACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA--ATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCA-TTTGACAAAATTGT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTT-----AC-T---CTTTTGTTTGGTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAG--AT--GATGG-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TATA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-CA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ATAA------C---GAA-G--CAATTCTATGTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--AC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTCAT----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-AA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TTTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACCGCA------AA-ATTA---TTA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AA--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACA-GTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC--CCAGGGCGCAACCG-CGA-GG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTC-CG----ATG--CGATTAAATCGC-TATA-CCAAGTGTG
gi|10 : t-ATTG--AT-TGAC-TAG-----ACCA-TCTTCCA-A-----G---AAA-AGA--TC-AGT--------TC----TCCACGT---TTTATCA-CATC--AT-GTA--AAAACTTTCA-T-CGGAACCGGGCG-GAA--GATA-GA-TCCTATT-TTATCTTACTGC-TAGTCATTGAAAGC--A-CAAGTCGAG-T-ATC-T---AA---AACA------C---GAA-G--CAATTTTATCTTGACCGGTG-GCGCTGGTGTTATATGGGCC-T---------TGATG-ATAAGGC-TTTATCA-----------AA--------T-----T--GTC----TTT-------------------TTC--TT-----TATT--TATG-GA---CAAAGTT--TTT-
gi|11 : ---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCA-A-----G-----AAAGA--TC-A-T--------TC----TCCACGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAA--GATA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--T-TAGTCA-TGAAAAC--A-CA--TC-GA-T-ATC-T---AA---AACA------C---GAA-G--CAATTTTATCTT-AC--CTG-GAGCTGGTGTTATATG---C-T---------TGATGAATA--GC-TTTATCA-----------AA--------T-----T--GTC---------------------------------TTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---g
gi|12 : ttttttgcCAG-GTGTC---AATT-AACGG--AA-CATGTT-AATTATAT--C-AAATCTGT--A-TCTC--TAATGT-----AA--TTTTTCTCTTGAAATC-TGTTT--TCTAACACACAGAGT----GT--TTCAATCT-TTTAAAAATGAA--T--GTTT--TG--TGTAAA--TCAA-CTT-A-TAc
gi|13 : atatgtaatcctttcacactgctgacaaaaatatgtacaccagtc--A-CA--CC-AA-T-TTC-T---AA---AAAAG-----C---GAA-G--CAATTTTATCTT-AC--ATG-TAGCTATTGTTTTATG---C-T---------TGACGAATA--GC-TTGACCATTCTAT-GG--AA-ATAAT-TT-----T--GTC----TTTTC-TC---------C--AATGC----TTTTATTTT--TATG-GG---CA---GT--TTT-T---CCC-C------------GACAA-AT-T-TAA----AGA-----A---GAGataaaaagtactcaaataaatcatcaagcatatag
gi|14 : ---AATA-AACAG--AA-CATGTA-AATTATCT--C-AAATTGGT--A-TCTC--TA---------------AA---GT---AACA-TTTTT--TC-----------ACAT--GTGATTCAA----TCT------------T--TT----G--TGTGAA-CTTAC-AT--G-CAG-CTCTT--CTTGCACTCATGC-AATTACTCAA------ACC-A-GC-ACAA-AA-ATA---A-TATCATGCATgcccaagggccacatcgc
gi|15 : tttctgctaaatctactggtgagAAA-CTAATTGTT-GCT-AAT-GTACATCAGAGC-CC---AAGATGACACCTAA-CATGTT-AATTATTT--T-GAATTGGT--A-TCTC--TAGTGT-----AA--TATATCTGTTGAAATA-TTTTT--TC-----------GC----GCTATTCCA----TTT-----------TT--------G--TGTAAA--TCTA-TTT-A-TAG-A---T--CTTGCAC---TGC-AATTACTG-A------AAT-GTGC-ACgca
gi|16 : cCTGCTGTCCCCTTATGACTTATTTTCTCGCCACGCAGTGTCCCATGGTCAAAACACAACAATTTGTAAAACAGA-TAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTA--GTCCTTATTCAAATCAGAATCAGAGATTGTTTAGTATACCAGAACCAATcaa
gi|17 : TT-T---TCC-C------------ACCAG-AT-TCTAAG---AAA-----T---GAGTA--ATTTTTCT-GA-A-G--AAAAATGCA------AA-ATTA---TCA---TGT------------------G--G-------CA-TAA----AACTGT-TAACA
gi|18 : TTGACACAAT-GT-CT---CATT-----------A-CTTCTATTTT------AC-T---CTTTTG----GTGAAAAATATTGA-TCA
gi|2 : aaATTGTACGTTTATATTAAATAA--ACTTGA-----GTT-TGCAATCTGCGACATA-ATATAATGCTACTTGT--GCTGAATGACACATCAG-AA-GCTGAAATA-AACAG--AAGCATGTCCA-TTATTTCCT-GTATTTTG--A-TCTC--TAGTATGTGTAAC--TTAAT-TGTTGAAGTT-TTTTTGTTC-----------GCAAGCGTTAATCAA----TTTAAAAAAAAG--TTAATTAG-AG--TGTAAA-ATAAA-ATTTA-CATTCTCTT--CTTGCAC---TGTTAATTACTGGAGAAAGAAATCGTGC-ACGG-AA-ATGTCTATTATGTGGTAAATATCAAATTGATGAGTGATTGGTCAACA----CTT-TTTATGTAAA-TATTGC-ATGCTATATGTTGGT-ATTTTTTTTTAACAT--A------GGACT-GAT-CTTCTT------GATA-TCTGCCCACCCCCCACCCCTCT----------CAAAAACTAATATTCTGT-TTCCATGCGGTTAAATCTGTGTATGTTGATCTTATTGATCTAACTTATTGAGTT-GAATC-C---------ACTAGAGA--TCTTAACATTTGC--CTCCTCGCGTCCGCT-CCCCTATTTACTCCCTCACATTATAGAATTTAAAATTGCTT------A--------GATTTA---C----TTGCCAAGTA--ATTATTCAAACAA-TATTGTGAAGCGCCC---CCCCCCCCCTG--CATTTATTT--AACGA-----ATGCTCCT--GGCACCTACTTAATACTCCACCATTGC----AT--ATCTCTTTCTCGCT-TTAGTTTAT-CTGCGTGCCTGG-TTG--TTAAATTTTCTCATGCGTA-TATTTG-CATTTATCTCT-GGACCTGAAATAATCGTC-AAT-CGG-TTAAA-TATACTA-CA-CCACACATCCCCCTTCTCGCAACT-TACTATACAATTTGTT-AATTATCAACAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-ACATC-CGATGATAAGGGCAGTAAC--TGC----------------AAAAATTTGGTAGCCCATCAATGGGACAAT-TTGTTCTTGA-ATCCTTATCTACATA-CTTCCACCTTCCTCCAAC-T---CTATT-T--GG-GAAAAATATTGAGTCAAA---AAAACGGGGTATTAAA--AT--GATAA-TTTATTTGACGAAGT-TATTAACTTT---TTATTTAAGT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCTTA-----GGT-AGATAGA--TCCA-T--------TC----TCCGCGT----ATC-CATCATCCAAT-GTATAAACATTTTCACT-C-----CG--CG-GAC--GACA-CACTTCTATT-CTATCTTAC--CCTAGTCA-TGAAAAACAA-TA--TC-AAAT-ATCCT---AACGAGTAA------C---GAA-GG-CAATC--ATGTT-AC--ATG-GAGC-ATGTTTATATG---CCT---------TGGTGAATA--AC-TTTATCATTCTTGCGT--AA-AGAAA-TT-----TCCGTC----TTTTC-T----------TCGGATTC--ATTTCTCTTTT--TCTT-GAACACA---AT--TAT-T---TCC-C------------AACAA-AT-TTTAATAATAAA-----T---GAGTC--ATTTTTTCTGACA-GGTTAAACGCCA------AA-ATTAATATTA---TTGTTAAAT-----GAA-G-GGAAG-------C--GAAT---AACTGT--AA-ATGTACAGAA--AGC-C-TGTTGTAAA-----AAC---TAC-A---CA-AGAATC--A---TTAA--CA--ACCTTTTTCGGA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA--G-A-TAC-GTATAA--AAATTA-TATGACATACCAACCGCCGCGCACCAA-CGAGGGCTGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGAG------G-TCGA-TAGATTGC-TATA-CCTAGTGTG
gi|20 : G----AGG-TCGAT-AGATCGC-TATA-CCTAGTGT
gi|3 : AATTCTACATTATTA-TTATTTTAATCGAA---TATTTT----CGGCACTTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCA-ATGTGGCAAACCCATGGCTTTCATAATTGTACGTTT--ATTAAAT-A--ACTT-AGTGCATTTGCACA--TTG-GAC--A-AT-TAAT-CTACTTGTTTGCTGAAT-ACACA-------------------ACAG--A--CATGTCCA-TTATTT--TTGAATTTGT--AATCTC---AGTGT-----AACTTAAAT-TGTTGATTT--TTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAAAAAA--TTAATTA--AGTCTGTAAA--TCAATATT-A--AG-CTCTTTCCTAGCAC---TGT-AATTACTG--------AAT-GTGCAACGG-AA-ATG---ATTATTA-GCGTATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTC-TTTAT----T-TATTGCAATGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAA------GGG-T-GATCCTT--T------GATA--ATGCCCA---CCC-ACCCTCT----------AAAAAAC-AACAG-CTGT-C------CG--TGAAC---TG-A-GTGGA------------AA--TATGAAATTGGAACCAC---------A----AGA--T--TAACATTTGCCGCGCTT---------T-CCTC-A---ACT-------ATTA-AACATTTAAA--T-GTTTA----G--------GATTTA---C----TTG-CAAG-A--A-T--TCAAACAA-TATTGGAA---G------TCCCCCCTCTG-GTTTTTTTTTTTA---C---CGATGCTCCTT-G---CCTGATT-AT--------ATCACCATGATGAATTTCTTTCT-GCTAT---TTTATTCTG-GTGCCTT-CTTGGTTTAAATTT-----TGGGTAA-ATTT-GCATTT-TATCTTGGAC--AGAA-AATCGTCGTAT-TCGGTTAA---ATATTAACAG-CAC-TATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATTCA--TTGTTGAATTATA--CAATTTAAAA--AGCGCACGCTCCGTACA--TC-CG----------------T--TGTAAAGGGAGTAACTGCAAAAAAT---GTAGCCCATCAAGCTGACAAAA-TGT-CTTGACATT-----------A-CTTCCACTTT------ACGT---CTT--------TGGGAAATATTG--TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTTAT-GACGAAGTGTATTA--CTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGTAAGATAGA--TC-A-T--------TC-----CCGCGG---TTTA-TATCA-C--AT-GTA--AACAATTCAA-T-T-----CG--CG-GAC---ACA-CA-ATCTATT-TTATC-TAC--A-TAGT-A-T--AAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T----A---ATAA------C---GAAGG--CAATTCTATGTT-AC--ATGTGAGCTATTGTTATGAG---C-T---------TGGTGAATA--ACTTTTATCATTCTAG-GT--AACAGAAAGTT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--T-TTCGATCTTTTC-TTT--TGT--GA---CA---TT--CTT-T---CCC-A------------G--AA-ATGTTTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTC-TGA-A-G--T-AACTTCA------AA-ATTA---TTA----GTATAAAT----TG-A-G-A---G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTAC--AA--AGC-C-GT--TTTAA-----AAC----AC-ACTCCA-A----T--A---CTAAT-CA--ACCTTTT-CGAT----AAAGCTTCCTA----TTTAATAAA-TG-A-TAC--TATAA--AAA-TATTATG-CCTACC-ACCAGCGCGC-ACCGCCGAGGG-TGTTCA-CGCGTACGCAC-AGATCAACTCGAG------G-TCGAT--GAGCGC-TATAGCCTAGTGTG
gi|4 : ccagtTTGAACTACT--TAAGTCTAAATCCGCGTAT---CCATA-A--TTTCG----------------TATTG---------------------AT---GTA--------ATTTG-TAAAATGTT-CTT-ATATTT----------AACTTT---TTTC-----AC-TTGACATTTGT--AGTTAAAA-TAT-GA-TCAAATAAAAA-CG------TATA--AC--CATTA-TT-AT-------AGTACACTAACTTAAAAC-ATT---ATAT-ATATAG-----A--AATTT-CCGTA-----GAA-AGATAGAGCTC-A-T--------TC----TCCGCGTATTTTTATCA-CATCTCATTGTA--A-CAATTTCA---C-----CG--CG-GATTTGACA--A-TCCTATTATTATCTGTC--C-TAATCA-GGACAAA--A-CA--TC-AA-TTATC-TTTAAA---AAAA------C---CGA-GACCAATTTTAT-TG-AC--ATG-GA-CTATTGGTAT-TG---G-T---------TGGTGAAGA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAAATT-----T--GTC----TT-----------------------------TTCTTT--------GA---TA---CT--TTT-CGTATCAAC------------GGCA-----TC-------------------GAGT-------TTTTAGA-AAG--TAAAATGCA------AATATTA----CA---TGTTTACAT----TGAA-GGAG--G-------CAATAA----AACTGT-TAACATGTACAG-A--AGC-CGTA--CTCAC-----AAC---TACAA---CA-AAT-TT--A----TAAT-CC--CACATTT-CGAA----AAA-TTCCCTC----CTTA--AAA-TGAA-TAG-GCATAGTTAAA-CA-TAT---AT------------------G-CGAGGG-TGTTTTCCGCGAATG-ACAAGATA-CCTCGCGAACAATGATTGAT--AATCGC-TATA-ACTAGTGTat
gi|5 : aTTATCAGTTATTTCGATCTGACAGTATTTTAGCTAGAAAACCTCAAAACACAACTAGATTTGCTTGAAATCACATG-------CTCATG-----CAT----GTAAGTT---ATT---------------------T-CACA--TTG-GACA-A-AT-TAAA-ATAATTGTT-ACCAAAT-ATACATCAG-GTGCC---AATA-AACAG--AG-CATATT-AATTGTTT--T-GAATTGGT--A-TCTCTGTAGCAG-----AA--TAAATCTGTTGAAATATTTTTT--TT-----------AC----GTTATTCAATCGTTTTAAAATTAAA--TT--TTGTCAG--TGTAAA--TCAA-ATT-A-TGG-CACTC--CTAGGAC---TGC-AATGACTG-A------AAT-GTGC-AC---AATATA---ATTATCAGGCATGCAGCAA--CAATGAGT--TTG-----CATTGTCTCTTTTA-----ACTATTAC-ATGC-AAA-GTTGGTTATTTTT-----AGAT--ACAGCTCAGG-TAGAT-CTT--TAAATAGGGTACTGTGCTC-CCTCCC-CCCTTCTTTATATAAAAAAAAAAA-AGCA--TTGCGT------CG--CAAAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATAAAATT-TAACC-TTTGAATTGAA----AGA--T--CAACGCTTGC--CGCTT---------TCCCCC-A---AC--------ATTA-AGAATTAAAA--G-CTTTGTTTCGTTTTTATTAATTTA---CTTAATTGTCAAG-ATTTTT--TTATGCAG-TATTGTGA---AATCAATCCCCCC
gi|6 : t-----TAAG--ATTGGATGGGTTTATT-GACGAATT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TCA---TCCGCGT---TATA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATT-CA-TTC-----CG--CG-GAC--GACACAA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TAGAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ATAA------C---GAA-G--CAATTCTATGTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--AC-TTTATCATTCTAG-GTTAAA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTCAT----------C--GATTC--TTTTTTTTTTT--TATG-AA---CA----T--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TTTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACCGCA------AA-ATTA---TTA---TGTTTAAAT----TGAAGG-AA--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACA-GTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CG-A----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCAGGGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTC-CG----ATG-TCGA-TAAATCGC-TATA-ACAAGTGTG
gi|7 : TTGA-CCAAA---AAA--GA-----TGAATTCT--GAT-A-TTT-TT--ATCAAGT-T-----TTTC---T-ATT---AT-T--C-TAGCAAGAA--A-TAT-TCA-ACTCCCGAT-TGACAGA--TC-A-TAGACTTTATCAAACTCCGGGT---TCGA-TA-AATC--AT----------ATT--A-T-C-----CG--CGTGTC--GACA-GA-TC-TATT-TTAC--TAC--C-TAGTCA-TGAAAAA----CA--TC-A--T-ATC-T---AA---A-AA------C---GAA-G--CAATTCG--TTT-A---ATG-GAGTTATT--TATA-G---C-G---------TTGT--ATA---C-ATTATCAT-CTAG-TT--AA-AAA----T-----T--GTC----TTTTC-T--------------AT-C--GTTCTTTTTTT--TAT---A---CA---TT--TTT-------C-C------------GATAA-AT-TCTAA----AG------T---GGGT---ATTTTC--TGA-A-G--TAACTTGCC------AA-AT-A---TCA---TGATTAA-T----TGAG-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGTCTAACAT-TACA--A--AGCAC-TG--GTTAA-----AACT--TAC-----CA-AGA-TC--A---TTTAT-CA--ACATTTT-CGAA----A---TTTGCTA----TTAA--GAT-TG-A-TAC-GTAT-A--AAA-TA-TATG---TTCC-ACCGAC----------------------------TACG-AC-AGATC-ACTCGCG------G-TCGATACGATCGCTTATA-CCTAGTa
gi|8 : TATATG---C-TCTCTTTAAATGATGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AAGAGAAA-TTCAATTT--ATCATCTTTTTC-TTCGTGCATAAC--GATTC--TTTGTGCGTTTAGTATGAGATT-CA---TTGCTTTAT---TCT-CTCACGCAGAAGCAACAATAT-TCTAA----AAAAAGCTTCAAAAGTCTTATTTTTTTTGA-A-G--TAAAATACAGCATAAAA-ATTAA--TCACTTTGCTTTAGTACGATGAA-G-AG--GTGGTACCC--CAATTAAAACTGT-TAACATGTACAAAAAGAGA-C-TC--AATAATTCATGACAGATAC-G---CACAGA-CCCTACATTTAATCCAATACATTTT-CGAATTTTACATTTGCCTAAATTTTTA--AAAGTG-ATTACGGTAT
gi|9 : AA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TATATT-GACTAAAT-TAA-AACTTT---T-ATT---AC-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----AAA-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCATGC---TTTA-CA-CATC--GT-GTA--AACAATT-------------G--CG-GAA--GACA-GA-TCATATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--AACA--TC-AA-T-ATC-T---AA---AAAAACAAATCTAAAAA-G--CAATTTTATCTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATTTG---C-T---------TGATAAATA--GC-TTTAGCATTCTAT-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTCTT----------C--GATTC--TT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): AAGGTTTTTCCCGACAGAATCTAACAAGAGGCCCAAGGGCCACATCGC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 22222 2222 11 1 1 4444444444 22222 1 11 1 11 1 1 333 3333 11 3333333333333333333 11111111 1 1 2222222 1 11 1 111111 2222222222 11 1111 22222222 1111 33333333333333333 2222 33333333333333333 11 1111 111 22222222 111 11 11 22222222222 333333333 1 1 1 22222 11 2222 111 1 333333333 1111 1 4444444444 11 22 3333333333333 111 1 555555555555 11 1 5555555555555555 11111 11 444444444444444444444444444444 1 2222 555555555555555 33333333 111 1 1 3333333333 22 7777777777777 33333 8888888888888888888888888 1 11 1 222 11 4444444 11 11 1 111 22 2222 111 1 22 22 111 11 111 1111 1 22222222222222222222222222222222222222 111 44444444444 333333 111 22222 111 111111 1 111 11111 111111111 11111111 1111 11 111111111111 11 111111 111111111 44444444444444444444444 111 222222222222 1111111111111111 111 111111 111 11111 1111111111 1111 11111 111 11111 1111 1111 1111 1111111111111 222222 222
lowQualScore : 5 1 77777 1 3333 1 88 1 5 5 0000000000 66666 5 88 5 1 1 88 3 3 555 0000 88 6 3333333333333333333 3 0 44444444 0 0 6666666 0 2 33 0 555555 99 88 3 8 0 7777777777 5 77 55 0 0 33 1 77 5 77 2222 1 44444444 4444 77 44444444444444444 1 2222 5 55555555555555555 77 33 1111 99 6 3 99 111 6 00000000 6 6 999 8 444 0 1 33 33 55555555555 999999999 0 0 0 3 55555 22 1111 111 0 333333333 7777 55 0 0 3333333333 88 33 1111111111111 777 3 0 111111111111 33 0 0 6666666666666666 88888 33 444444444444444444444444444444 0 0000 555555555555555 22222222 6 111 66 0 0 4444444444 00 8888888888888 22222 3333333333333333333333333 1 3 88 7 7 3 555 88 7777777 44 33 7 3 6 999 7 00 7 2222 666 7 3 7 00 00 2 444 33 777 4444 0 88888888888888888888888888888888888888 777 2 3 0 777 8 55 3 88888888888 8 3 333333 8 444 0 44444 0 0 6 444 6 555555 77 77 3 5 1 66 0 1 11 1 888 4 222 4 4 4 11111 66 4 4 8 555555555 1 66 4 4 66666666 3333 777 8 8 22 4 66 444444444444 66 4 666 00 4 4 66 4 4 55 4 55 4 4 4 4 777 777 4 555555 777 4 99 3 4 4 55 4 666 3 444444444 555 3 3 55 7777777 99999 55 7777 11111111111111111111111 55 99 222 9999 55 88888 4 222222222222 0 4 4 2 9999999999999999 222 444 5 5 66 1 444444 5 333 888 0 2 00000 0 5 88888 8888888888 2222 5 5 44 77 5 5 77 44444 555 55555 5 5 77 0000 5 77 5 0 2222 1 6 2222 77 5 5 5 5 99 6 6 99 3 99 7777777777777 2 6 2 6 6 6 6 888888 5 222 5 5
lowQualScore : . . ..... . .... . .. . . . .......... ..... . .. . . . .. . . ... .... .. . ................... . . ........ . . ....... . . .. . ...... .. .. . . . .......... . .. .. . . .. . .. . .. .... . ........ .... .. ................. . .... . ................. .. .. .... .. . . .. ... . ........ . . ... . ... . . .. .. ........... ......... . . . . ..... .. .... ... . ......... .... .. . . .......... .. .. ............. ... . . ............ .. . . ................ ..... .. .............................. . .... ............... ........ . ... .. . . .......... .. ............. ..... ......................... . . .. . . . ... .. ....... .. .. . . . ... . .. . .... ... . . . .. .. . ... .. ... .... . ...................................... ... . . . ... . .. . ........... . . ...... . ... . ..... . . . ... . ...... .. .. . . . .. . . .. . ... . ... . . . ..... .. . . . ......... . .. . . ........ .... ... . . .. . .. ............ .. . ... .. . . .. . . .. . .. . . . . ... ... . ...... ... . .. . . . .. . ... . ......... ... . . .. ....... ..... .. .... ....................... .. .. ... .... .. ..... . ............ . . . . ................ ... ... . . .. . ...... . ... ... . . ..... . . ..... .......... .... . . .. .. . . .. ..... ... ..... . . .. .... . .. . . .... . . .... .. . . . . .. . . .. . .. ............. . . . . . . . ...... . ... . .
lowQualScore : 0 0 00000 0 0000 0 00 0 5 5 5555555555 55555 5 55 5 0 0 55 3 3 777 7777 33 7 0000000000000000000 2 8 00000000 0 0 0000000 0 0 88 0 222222 44 88 2 0 8 7777777777 7 99 99 4 1 66 3 99 7 99 1111 6 00000000 7777 99 00000000000000000 4 1111 0 11111111111111111 99 66 7777 77 7 5 22 777 7 00000000 7 7 444 0 000 8 4 88 88 55555555555 000000000 0 0 0 2 00000 88 2222 000 0 555555555 2222 88 2 0 8888888888 88 88 8888888888888 555 2 0 222222222222 88 2 0 2222222222222222 55555 88 222222222222222222222222222222 0 8888 000000000000000 88888888 5 000 88 0 0 2222222222 00 0000000000000 33333 7777777777777777777777777 0 3 33 3 3 3 777 33 0000000 77 33 3 3 7 000 3 00 3 7777 777 3 3 3 77 77 5 000 88 555 8888 0 55555555555555555555555555555555555555 555 5 2 8 222 0 88 2 22222222222 0 2 222222 0 000 8 88888 8 8 7 000 7 333333 99 99 0 7 7 44 7 4 77 4 888 4 222 4 4 4 11111 11 4 4 9 999999999 0 11 4 4 11111111 9999 888 9 9 22 4 11 777777777777 11 4 222 11 4 4 11 4 4 55 0 55 0 0 0 0 000 000 9 555555 000 0 55 0 9 0 55 0 444 6 555555555 444 6 6 00 8888888 11111 00 7777 99999999999999999999999 55 00 555 4444 55 00000 4 888888888888 8 4 4 7 1111111111111111 555 666 0 0 99 4 444444 0 888 888 4 0 88888 1 0 00000 1111111111 0000 0 0 44 99 7 7 99 33333 777 99999 7 7 99 1111 7 99 7 1 1111 4 6 1111 99 7 7 7 7 22 7 7 22 5 88 7777777777777 5 7 5 7 7 7 7 999999 7 000 7 7
consensus : NCTGCTGTCCCCTNGTGACTTATTTTCTCGCNACGCAGTGTCCCATGGTCANAACACAACAATNTGTAAAACGGAATAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTAATGTCCTTATCCAAATCAGANTCAGGGATTGTTTNGTATACCAGAACCAATTCTACATTATTA-TTATTTTAATC-GA-A-TATTTT---TCGGCAACTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCACATGTG-CAA-CCCA-TGGCTT-CATAATTGTACGTTTAT--TAAA-TAA-CTT-A-----TTT-CGCA--TTG-GACA-A-AT-TAAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAG-G-NN-C---AATA-AACAG--AA-CATGTCAATTATTTC--GAATTTGT--A-TCTC--TAGT----GTAA--TNAATCTGTTGAAATA-TTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAAAAAA--TTAATTA--AGT--GTAAA--TCAA-A--TTA-CAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGCA-CGG-AA-ATG---ATTATCAGGCATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTTTAT----A--TATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAAG----GG-T-GAT-CTT--T------GGTA-TATGCCCACCCCCC-CCCCTCT----------AAAAAAC-AACA--CTGT--CCGCG------AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGA--T--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCCC-A---ACT-------ATTA-AGAATTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTA---C----TTGCCAAG-A-ATTAT-CAAACAA-TATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTG-GTTTTTTTTTTTAA-GA-----C--ATGCTCCTTGG--CCTGATT-A-TA-------ATCGC----AT-GATNTCTTTCT-GCTTT--TTTATTCTG-GTGCCT--TTGGTT--TAAATTTT-----G-GTAATATTTGGCATTTTATCT-TGGAC--GGAATAATCGTCG-AATCGGTTAAATAT--T-ACA-C-ACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCAATTTGACAAAATTGT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTC-----AC-T---CTTTTGT--GGTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ANAA------C---GAA-G--CAATTCTATNTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TCTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACTGCA------AA-ATTA---TCA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCGGCGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGCG----ATG-TCGATTAGATCGC-TATA-CCTAGTGTG
Reference ( family-424 ) : NCTGCTGTCCCCTNGTGACTTATTTTCTCGCNACGCAGTGTCCCATGGTCANAACACAACAATNTGTAAAACGGAATAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTAATGTCCTTATCCAAATCAGANTCAGGGATTGTTTNGTATACCAGAACCAATTCTACATTATTA-TTATTTTAATC-GA-AGTATTTT---TCGGCAACTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCACATGTG-CAA-CNCA-TGGCTT-CATAATTGTACGTTTAT--TAAA-TAA-CTT-A-----TTT-CGCA--TTG-GACA-A-AT-TAAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAG-G-NN-C---AATA-AACAG--AA-CATGTCAATTATTTC--GAATTTGT--A-TCTC--TAGT----GTAA--TNAATCTGTTGAAATA-TTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAAAAAA--TTAATTA--AGT--GTAAA--TCAA-A--TTA-CAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGCA-CGG-AA-ATG---ATTATCAGGCATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTTTAT----A--TATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAAG----GG-T-GAT-CTT--T------GGTA-TATGCCCACCCCCC-CCCCTCT----------AAAAAAC-AACA--CTGT--CCGTG------AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGA--T--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCCC-A---ACT-------ATTA-AGAATTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTA---C----TTGCCAAG-A-ATTAT-CAAACAA-TATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTG-GTTTTTTTTTTTAA-GA-----C--ATGCTCCTTGGC-CCTGATT-A-TA-------ATCGC----ATGGATNTCTTTCT-GCTTT--TTTATTCTG-GTGCCT--TTGGTT--TAAATTTT----TG-GTAATATTTGGCATTTTATCT-TGGAC--GGAATAATCGTCG-AATCGGTTAAATAT--T-ACA-C-ACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCAATTTGACAAAATTGT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTC-----AC-T---CTTTTGT--GGTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ANAA------C---GAA-G--CAATTCTATNTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TCTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACTGCA------AA-ATTA---TCA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCGGCGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGCG----ATG-TCGATTAGATCGC-TATA-CCTAGTGTG
gi|1 : CTG-TGTCCCTTAGTGA-----TTTCTCGCAACGCAGTGT----TGGTTATAATA--ACAATGTGTAAA-CGGAATAGAT----------GTAAT-----GTAAATT-TTAACTAATGTCCTTATCCAA-TCAGACTCAAGGATTGTTTTATATACCAG--CTAATTCTACATTATTA-TTATTTTAGTC-AA---TATTTT---TCGGCAACTT--AAACACACCTAAATATGTCTGAAATTACATGTG-CAA-CCAAATGGCTTACATAATTGTGC-TTAAT--TAAAATCA-CTT-A-----TTT-CACA--TTG-GACA-ACAT-TCAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAG-G-AA-C---AATA-AACAG--AA-CATGTCA-TT-TTTT--GAATTTGTTAA-TCT---TAGT----GACC--TTAAT-TGTTGAA----TTTTT--TC-----------GC----GTTTATCAA----TTAAAAAAAAAAAATTAATTA--AGT--GTAAAATTCAA-A--TTAGCAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGCA-CGGCAA-ATG---ATTATTAGGTATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTGTA-----A--TATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTATT-----ACATTAAG----GG-T-GAT-CTT--T------GGT--TATGCCCACCCCAC-CTCCTCT----------AAAAAG--AACA--CTGT--C-GTG------AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGAAGT--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCTC-A---ACT-------ATTA-AGACTTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTAACTT----TTGCCAAG-A-ATTAT-CAAACAAATATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTCTGTTTTTTTTTTTAA-AAAAAACT--ATGCTCCTTTGG-CCTGATTTA-TA--------TCGC----A--GATATCTTTCT-GCTTT--TT-ATTCTG-GTGCCT--TTTGTT--TAAATTTT-----G-GTAATGTTTGGCATTTTATCT-TG-AC--AGAATAATCGTCG-AATTCGTTAA-TAT--T-ACA-C-ACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA--ATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCA-TTTGACAAAATTGT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTT-----AC-T---CTTTTGTTTGGTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAG--AT--GATGG-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TATA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-CA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ATAA------C---GAA-G--CAATTCTATGTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--AC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTCAT----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-AA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TTTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACCGCA------AA-ATTA---TTA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AA--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACA-GTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC--CCAGGGCGCAACCG-CGA-GG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTC-CG----ATG--CGATTAAATCGC-TATA-CCAAGTGTG
gi|10 : t-ATTG--AT-TGAC-TAG-----ACCA-TCTTCCA-A-----G---AAA-AGA--TC-AGT--------TC----TCCACGT---TTTATCA-CATC--AT-GTA--AAAACTTTCA-T-CGGAACCGGGCG-GAA--GATA-GA-TCCTATT-TTATCTTACTGC-TAGTCATTGAAAGC--A-CAAGTCGAG-T-ATC-T---AA---AACA------C---GAA-G--CAATTTTATCTTGACCGGTG-GCGCTGGTGTTATATGGGCC-T---------TGATG-ATAAGGC-TTTATCA-----------AA--------T-----T--GTC----TTT-------------------TTC--TT-----TATT--TATG-GA---CAAAGTT--TTT-
gi|11 : ---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCA-A-----G-----AAAGA--TC-A-T--------TC----TCCACGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAA--GATA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--T-TAGTCA-TGAAAAC--A-CA--TC-GA-T-ATC-T---AA---AACA------C---GAA-G--CAATTTTATCTT-AC--CTG-GAGCTGGTGTTATATG---C-T---------TGATGAATA--GC-TTTATCA-----------AA--------T-----T--GTC---------------------------------TTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---g
gi|12 : ttttttgcCAG-G-TGTC---AATT-AACGG--AA-CATGTTAATTATATC--AAATCTGT--A-TCTC--TAAT----GTAA--TTTTTCTCTTGAAATC-TGTTT--TCTAACACACAGAGT----GT--TTCAATCT-TTTAAAAATGAA--T--GTTT--TGT--GTAAA--TCAA-C--TTA-TAc
gi|13 : atatgtaatcctttcacactgctgacaaaaatatgtacaccagtc--A-CA--CC-AA-T-TTC-T---AA---AAAAG-----C---GAA-G--CAATTTTATCTT-AC--ATG-TAGCTATTGTTTTATG---C-T---------TGACGAATA--GC-TTGACCATTCTAT-GG--AA-ATAAT-TT-----T--GTC----TTTTC-TC---------C--AATGC----TTTTATTTT--TATG-GG---CA---GT--TTT-T---CCC-C------------GACAA-AT-T-TAA----AGA-----A---GAGataaaaagtactcaaataaatcatcaagcatatag
gi|14 : ---AATA-AACAG--AA-CATGTAAATTATCTC--AAATTGGT--A-TCTC--TA--------AA---------GT---AACA-TTTTT--TC-----------ACAT--GTGATTCAA----TCT-----------TT--T-----GT--GTGAAC-TTAC-A---TG-CAG-CTCTT--CTTGCACTCATGC-AATTACTCAA------ACC-A-GCA-CAA-AA-ATA---A-TATCATGCATgcccaagggccacatcgc
gi|15 : tttctgctaaatctactggtgagAAA-CTAATTGTT-GCT-AAT-GTACATCAGAG-CC-C---AAGATGACACCTAA-CATGTTAATTATTTT--GAATTGGT--A-TCTC--TAGT----GTAA--TATATCTGTTGAAATA-TTTTT--TC-----------GC----GCTATTCCA----TTT-----------TT--------GT--GTAAA--TCTA-T--TTA-TAG-A---T--CTTGCAC---TGC-AATTACTG-A------AAT-GTGCA-Cgca
gi|16 : cCTGCTGTCCCCTTATGACTTATTTTCTCGCCACGCAGTGTCCCATGGTCAAAACACAACAATTTGTAAAACAG-ATAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTA--GTCCTTATTCAAATCAGAATCAGAGATTGTTTAGTATACCAGAACCAATcaa
gi|17 : TT-T---TCC-C------------ACCAG-AT-TCTAAG---AAA-----T---GAGTA--ATTTTTCT-GA-A-G--AAAAATGCA------AA-ATTA---TCA---TGT------------------G--G-------CA-TAA----AACTGT-TAACA
gi|18 : TTGACACAAT-GT-CT---CATT-----------A-CTTCTATTTT------AC-T---CTTTTG----GTGAAAAATATTGA-TCA
gi|2 : aaATTGTACGTTTATATTAAA-TAAACTTGA-----GTT-TGCAATCTGCGACATA-ATATAATGCTACTTGT--GCTGAATGACACATCAG-A-AG-CTGAAATA-AACAG--AAGCATGTCCATTATTTCCTGTATTTTG--A-TCTC--TAGTATGTGTAAC-TTAAT-TGTTGAAGTT-TTTTTGTTC-----------GCAAGCGTTAATCAA----TTTAAAAAAAAG--TTAATTAG-AGT--GTAAA--ATAA-AATTTA-CATTCTCTT--CTTGCAC---TGTTAATTACTGGAGAAAGAAATCGTGCA-CGG-AA-ATGTCTATTATGTGGTAAATATCAAATTGATGAGTGATTGGTCAACA----CTTTTTATGTAAA--TATTGCA-TGCTATATGTTGGT-ATTTTTTTTTAACAT--AG----GACT-GAT-CTTCTT------GATA-TCTGCCCACCCCCCACCCCTCT----------CAAAAACTAATATTCTGTTTCCATGCGGTTAAATCTGTGTATGTTGATCTTATTGATCTAACTTATTGAGTT-GAATC-C---------ACTAGAGA--TCTTAACATTTGC--CTCCTCGCGTCCGCT-CCCCTATTTACTCCCTCACATTATAGAATTTAAAATTGCTT------A--------GATTTA---C----TTGCCAAGTA-ATTATTCAAACAA-TATTGTGAAGCGCCC---CCCCCCCCCTG----CATTTATTTAACGA--------ATGCTCCT-GGCACCTACTT-AATACTCCACCATTGC----AT--ATCTCTTTCTCGCTTTAGTTTAT-CTGCGTGCCT----GGTTGTTAAATTTTCTCATGCGTA-TATTTG-CATTT-ATCTCTGGACCTGAAATAATCGTC--AATCGGTTAAATATACT-ACA-CCACACATCCCCCTTCTCGCAACT-TACTATACAATTTGTT-AATTATCAACAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-ACATC-CGATGATAAGGGCAGTAAC--TGC----------------AAAAATTTGGTAGCCCATCAATGGGACAAT-TTGTTCTTGA-ATCCTTATCTACATA-CTTCCACCTTCCTCCAAC-T---CTATT-T--GG-GAAAAATATTGAGTCAAA---AAAACGGGGTATTAAA--AT--GATAA-TTTATTTGACGAAGT-TATTAACTTT---TTATTTAAGT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCTTA-----GGT-AGATAGA--TCCA-T--------TC----TCCGCGT---ATC--CATCATCCAAT-GTATAAACATTTTCACT-C-----CG--CG-GAC--GACA-CACTTCTATT-CTATCTTAC--CCTAGTCA-TGAAAAACAA-TA--TC-AAAT-ATCCT---AACGAGTAA------C---GAA-GG-CAATC--ATGTT-AC--ATG-GAGC-ATGTTTATATG---CCT---------TGGTGAATA--AC-TTTATCATTCTTGCGT--AA-AGAAA-TT-----TCCGTC----TTTTC-T----------TCGGATTC--ATTTCTCTTTT--TCTT-GAACACA---AT--TAT-T---TCC-C------------AACAA-AT-TTTAATAATAAA-----T---GAGTC--ATTTTTTCTGACA-GGTTAAACGCCA------AA-ATTAATATTA---TTGTTAAAT-----GAA-G-GGAAG-------C--GAAT---AACTGT--AA-ATGTACAGAA--AGC-C-TGTTGTAAA-----AAC---TAC-A---CA-AGAATC--A---TTAA--CA--ACCTTTTTCGGA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA--G-A-TAC-GTATAA--AAATTA-TATGACATACCAACCGCCGCGCACCAA-CGAGGGCTGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGAG------G-TCGA-TAGATTGC-TATA-CCTAGTGTG
gi|20 : G----AGG-TCGAT-AGATCGC-TATA-CCTAGTGT
gi|3 : AATTCTACATTATTA-TTATTTTAATC-GA-A-TATTTT----CGGCACTTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCA-ATGTGGCAAACCCA-TGGCTTTCATAATTGTACGTTTAT--TAAA-TAA-CTT-AGTGCATTTGCACA--TTG-GACA-A--T-TAAT-CTACTTGTTTGCTGAAT-ACACA--------------------ACAG--A--CATGTCCATTATTTTT-GAATTTGT--AATCTC---AGT----GTAACTTAAAT-TGTTGATTT--TTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAAAAAA--TTAATTA--AGTCTGTAAA--TCAATA--TTA--AG-CTCTTTCCTAGCAC---TGT-AATTACTGAA--------T-GTGCAACGG-AA-ATG---ATTATTAG-CGTATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTTTAT----T--TATTGCAATGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAAG----GG-T-GATCCTT--T------GATA--ATGCCCA---CCC-ACCCTCT----------AAAAAAC-AACAG-CTGT--CCGTG------AAC---TG-A-GTGGA------------AA--TATGAAATTGGAACCAC---------A----AGA--T--TAACATTTGCCGCGCTT---------T-CCTC-A---ACT-------ATTA-AACATTTAAA--T-GTTTA----G--------GATTTA---C----TTG-CAAG-A-AT--T-CAAACAA-TATTGGAA---G------TCCCCCCTCTG-GTTTTTTTTTTT----A-----CCGATGCTCCTTG---CCTGATT-A-T--------ATCACCATGATGAATTTCTTTCT-GCTAT--TTTATTCTG-GTGCCTTCTTGGTT--TAAATTTT----GG-GTAA-ATTT-GCATTTTATCT-TGGAC--AGAA-AATCGTCGTATTCGGTTAAATAT--TAACAGC-AC-TATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATTCA--TTGTTGAATTATA--CAATTTAAAA--AGCGCACGCTCCGTACA--TC-CG----------------T--TGTAAAGGGAGTAACTGCAAAAAAT---GTAGCCCATCAAGCTGACAAAA-TGT-CTTGACATT-----------A-CTTCCACTTT------ACGT---CTT--------TGGGAAATATTG--TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTTAT-GACGAAGTGTATTA--CTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGTAAGATAGA--TC-A-T--------TC-----CCGCGG---TTTA-TATCA-C--AT-GTA--AACAATTCAA-T-T-----CG--CG-GAC---ACA-CA-ATCTATT-TTATC-TAC--A-TAGT-A-T--AAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T----A---ATAA------C---GAAGG--CAATTCTATGTT-AC--ATGTGAGCTATTGTTATGAG---C-T---------TGGTGAATA--ACTTTTATCATTCTAG-GT--AACAGAAAGTT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--T-TTCGATCTTTTC-TTT--TGT--GA---CA---TT--CTT-T---CCC-A------------G--AA-ATGTTTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTC-TGA-A-G--T-AACTTCA------AA-ATTA---TTA----GTATAAAT----TG-A-G-A---G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTAC--AA--AGC-C-GT--TTTAA-----AAC----AC-ACTCCA-A----T--A---CTAAT-CA--ACCTTTT-CGAT----AAAGCTTCCTA----TTTAATAAA-TG-A-TAC--TATAA--AAA-TATTATG-CCTACC-ACCAGCGCGC-ACCGCCGAGGG-TGTTCA-CGCGTACGCAC-AGATCAACTCGAG------G-TCGAT--GAGCGC-TATAGCCTAGTGTG
gi|4 : ccagtTTGAACTACT--TAAGTCTAAATCCGCGTAT---CCATA-A--TTTCG----------------TATTG---------------------AT---GTA--------ATTTG-TAAAATGTT-CTT-ATATTT----------AACTTT---TTTC-----AC-TTGACATTTGT--AGTTAAAA-TAT-GA-TCAAATAAAAA-CG------TATA--AC--CATTA-TT-AT-------AGTACACTAACTTAAAAC-ATT---ATAT-ATATAG-----A--AATTT-CCGTA-----GAA-AGATAGAGCTC-A-T--------TC----TCCGCGTATTTTTATCA-CATCTCATTGTA--A-CAATTTCA---C-----CG--CG-GATTTGACA--A-TCCTATTATTATCTGTC--C-TAATCA-GGACAAA--A-CA--TC-AA-TTATC-TTTAAA---AAAA------C---CGA-GACCAATTTTAT-TG-AC--ATG-GA-CTATTGGTAT-TG---G-T---------TGGTGAAGA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAAATT-----T--GTC----TT-----------------------------TTCTTT--------GA---TA---CT--TTT-CGTATCAAC------------GGCA-----TC-------------------GAGT-------TTTTAGA-AAG--TAAAATGCA------AATATTA----CA---TGTTTACAT----TGAA-GGAG--G-------CAATAA----AACTGT-TAACATGTACAG-A--AGC-CGTA--CTCAC-----AAC---TACAA---CA-AAT-TT--A----TAAT-CC--CACATTT-CGAA----AAA-TTCCCTC----CTTA--AAA-TGAA-TAG-GCATAGTTAAA-CA-TAT---AT------------------G-CGAGGG-TGTTTTCCGCGAATG-ACAAGATA-CCTCGCGAACAATGATTGAT--AATCGC-TATA-ACTAGTGTat
gi|5 : aTTATCAGTTATTTCGATCTGACAGTATTTTAGCTAGAAAACCTCAAAACACAACTAGATTTGCTTGAAATCACATG-------CTCA-TG-----CATG--------------------TAA-GTT-A-----TTT-CACA--TTG-GACA-A-AT-TAAA-ATAATTGTT-ACCAAAT-ATACATCAG-GTGC-C---AATA-AACAG--AG-CATATTAATTGTTTT--GAATTGGT--A-TCTCTGTAGC----AGAA--TAAATCTGTTGAAATATTTTTT--TT-----------AC----GTTATTCAATCGTTTTAAAATTAAA--TT--TTGTCAGT--GTAAA--TCAA-A--TTA-TGG-CACTC--CTAGGAC---TGC-AATGACTG-A------AAT-GTGCA-C---AATATA---ATTATCAGGCATGCAGCAA--CAATGAGT--TTG-----CATTGTCTCTTT-T----AACTATTACA-TGC-AAA-GTTGGTTATTTTT-----AGATACAGCTCAGG-TAGAT-CTT--TAAATAGGGTACTGTGCTC-CCTCCC-CCCTTCTTTATATAAAAAAAAAAA-AGCA--TTGCG-TCGCA------AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATAAAATT-TAACC-TTTGAATTGAA----AGA--T--CAACGCTTGC--CGCTT---------TCCCCC-A---AC--------ATTA-AGAATTAAAA--G-CTTTGTTTCGTTTTTATTAATTTA---CTTAATTGTCAAG-ATTTTTT-TATGCAG-TATTGTGA---AATCAATCCCCCC
gi|6 : t-----TAAG--ATTGGATGGGTTTATT-GACGAATT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TCA---TCCGCGT---TATA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATT-CA-TTC-----CG--CG-GAC--GACACAA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TAGAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ATAA------C---GAA-G--CAATTCTATGTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--AC-TTTATCATTCTAG-GTTAAA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTCAT----------C--GATTC--TTTTTTTTTTT--TATG-AA---CA----T--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TTTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACCGCA------AA-ATTA---TTA---TGTTTAAAT----TGAAGG-AA--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACA-GTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CG-A----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCAGGGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTC-CG----ATG-TCGA-TAAATCGC-TATA-ACAAGTGTG
gi|7 : TTGA-CCAAA---AAA--GA-----TGAATTCT--GAT-A-TTT-TT--ATCAAGT-T-----TTTC---T-ATT---AT-T--C-TAGCAAGAA--A-TAT-TCA-ACTCCCGAT-TGACAGA--TC-A-TAGACTTTATCAAACTCCGGGT---TCGA-TA-AATC--AT----------ATT--A-T-C-----CG--CGTGTC--GACA-GA-TC-TATT-TTAC--TAC--C-TAGTCA-TGAAAAA----CA--TC-A--T-ATC-T---AA---A-AA------C---GAA-G--CAATTCG--TTT-A---ATG-GAGTTATT--TATA-G---C-G---------TTGT--ATA---C-ATTATCAT-CTAG-TT--AA-AAA----T-----T--GTC----TTTTC-T--------------AT-C--GTTCTTTTTTT--TAT---A---CA---TT--TTT-------C-C------------GATAA-AT-TCTAA----AG------T---GGGT---ATTTTC--TGA-A-G--TAACTTGCC------AA-AT-A---TCA---TGATTAA-T----TGAG-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGTCTAACAT-TACA--A--AGCAC-TG--GTTAA-----AACT--TAC-----CA-AGA-TC--A---TTTAT-CA--ACATTTT-CGAA----A---TTTGCTA----TTAA--GAT-TG-A-TAC-GTAT-A--AAA-TA-TATG---TTCC-ACCGAC----------------------------TACG-AC-AGATC-ACTCGCG------G-TCGATACGATCGCTTATA-CCTAGTa
gi|8 : TATATG---C-TCTCTTTAAATGATGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AAGAGAAA-TTCAATTT--ATCATCTTTTTC-TTCGTGCATAAC--GATTC--TTTGTGCGTTTAGTATGAGATT-CA---TTGCTTTAT---TCT-CTCACGCAGAAGCAACAATAT-TCTAA----AAAAAGCTTCAAAAGTCTTATTTTTTTTGA-A-G--TAAAATACAGCATAAAA-ATTAA--TCACTTTGCTTTAGTACGATGAA-G-AG--GTGGTACCC--CAATTAAAACTGT-TAACATGTACAAAAAGAGA-C-TC--AATAATTCATGACAGATAC-G---CACAGA-CCCTACATTTAATCCAATACATTTT-CGAATTTTACATTTGCCTAAATTTTTA--AAAGTG-ATTACGGTAT
gi|9 : AA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TATATT-GACTAAAT-TAA-AACTTT---T-ATT---AC-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----AAA-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCATGC---TTTA-CA-CATC--GT-GTA--AACAATT-------------G--CG-GAA--GACA-GA-TCATATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--AACA--TC-AA-T-ATC-T---AA---AAAAACAAATCTAAAAA-G--CAATTTTATCTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATTTG---C-T---------TGATAAATA--GC-TTTAGCATTCTAT-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTCTT----------C--GATTC--TT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): AAGGTTTTTCCCGACAGAATCTAACAAGAGGCCCAAGGGCCACATCGC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 22222 2222 11 1 1 4444444444 22222 1 11 1 11 1 22222 3333 11 2222222 1 22222 11111111 1 1 2222222 1 11 1 111111 2222222222 11 2222222222222222 1111 33333333333333333 2222 33333333333333333 11 1111 111 22222222 111 11 11 22222222222 333333333 1 1 1 22222 11 2222 111 1 333333333 1111 1 4444444444 11 22 3333333333333 111 1 555555555555 11 1 5555555555555555 11111 11 444444444444444444444444444444 1 2222 555555555555555 33333333 111 1 1 3333333333 22 7777777777777 222 11 8888888888888888888888888 1 11 1 222 11 5555555 11 11 1 111 22 2222 111 1 22 22 111 11 111 1111 1 22222222222222222222222222222222222222 111 44444444444 333333 111 22222 111 111111 1 111 11111 111111111 11111111 1111 11 111111111111 11 111111 111111111 44444444444444444444444 111 222222222222 1111111111111111 111 111111 111 11111 1111111111 1111 11111 111 11111 1111 1111 1111 1111111111111 222222 222
lowQualScore : 5 1 77777 1 3333 1 88 1 5 5 0000000000 66666 5 88 5 1 1 88 3 99999 0000 88 6 8888888 3 99999 3 0 44444444 0 0 6666666 0 2 33 0 555555 99 88 3 8 0 7777777777 5 77 55 0 0 33 1 77 5 77 2222222222222222 4444 77 44444444444444444 1 2222 5 55555555555555555 77 33 1111 99 6 3 99 111 6 00000000 6 6 999 8 444 0 1 33 33 55555555555 999999999 0 0 0 3 55555 22 1111 111 0 333333333 7777 55 0 0 3333333333 88 33 7777777777777 777 3 0 111111111111 33 0 0 6666666666666666 88888 33 444444444444444444444444444444 0 0000 555555555555555 22222222 6 111 66 0 0 4444444444 00 8888888888888 777 88 5555555555555555555555555 1 3 88 7 7 3 555 88 0000000 44 33 7 3 6 999 7 00 7 2222 666 7 3 7 00 00 2 444 33 777 4444 0 88888888888888888888888888888888888888 777 2 3 0 777 8 55 3 88888888888 8 3 333333 8 444 0 44444 0 0 6 444 6 555555 77 77 3 5 1 66 0 1 11 1 888 4 222 4 4 4 11111 66 4 4 8 555555555 1 66 4 4 66666666 3333 777 8 8 22 4 66 444444444444 66 4 666 00 4 4 66 4 4 55 4 55 4 4 4 4 777 777 4 555555 777 4 99 3 4 4 55 4 666 3 444444444 555 3 3 55 7777777 99999 55 7777 11111111111111111111111 55 99 222 9999 55 88888 4 222222222222 0 4 4 2 9999999999999999 222 444 5 5 66 1 444444 5 333 888 0 2 00000 0 5 88888 8888888888 2222 5 5 44 77 5 5 77 44444 555 55555 5 5 77 0000 5 77 5 0 2222 1 6 2222 77 5 5 5 5 99 6 6 99 3 99 7777777777777 2 6 2 6 6 6 6 888888 5 222 5 5
lowQualScore : . . ..... . .... . .. . . . .......... ..... . .. . . . .. . ..... .... .. . ....... . ..... . . ........ . . ....... . . .. . ...... .. .. . . . .......... . .. .. . . .. . .. . .. ................ .... .. ................. . .... . ................. .. .. .... .. . . .. ... . ........ . . ... . ... . . .. .. ........... ......... . . . . ..... .. .... ... . ......... .... .. . . .......... .. .. ............. ... . . ............ .. . . ................ ..... .. .............................. . .... ............... ........ . ... .. . . .......... .. ............. ... .. ......................... . . .. . . . ... .. ....... .. .. . . . ... . .. . .... ... . . . .. .. . ... .. ... .... . ...................................... ... . . . ... . .. . ........... . . ...... . ... . ..... . . . ... . ...... .. .. . . . .. . . .. . ... . ... . . . ..... .. . . . ......... . .. . . ........ .... ... . . .. . .. ............ .. . ... .. . . .. . . .. . .. . . . . ... ... . ...... ... . .. . . . .. . ... . ......... ... . . .. ....... ..... .. .... ....................... .. .. ... .... .. ..... . ............ . . . . ................ ... ... . . .. . ...... . ... ... . . ..... . . ..... .......... .... . . .. .. . . .. ..... ... ..... . . .. .... . .. . . .... . . .... .. . . . . .. . . .. . .. ............. . . . . . . . ...... . ... . .
lowQualScore : 0 0 00000 0 0000 0 00 0 5 5 5555555555 55555 5 55 5 0 0 55 3 33333 7777 33 7 7777777 3 77777 2 8 00000000 0 0 0000000 0 0 88 0 222222 44 88 2 0 8 7777777777 7 99 99 4 1 66 3 99 7 99 4444444444444444 7777 99 00000000000000000 4 1111 0 11111111111111111 99 66 7777 77 7 5 22 777 7 00000000 7 7 444 0 000 8 4 88 88 55555555555 000000000 0 0 0 2 00000 88 2222 000 0 555555555 2222 88 2 0 8888888888 88 88 2222222222222 555 2 0 222222222222 88 2 0 2222222222222222 55555 88 222222222222222222222222222222 0 8888 000000000000000 88888888 5 000 88 0 0 2222222222 00 0000000000000 333 33 0000000000000000000000000 0 3 33 3 3 3 777 33 0000000 77 33 3 3 7 000 3 00 3 7777 777 3 3 3 77 77 5 000 88 555 8888 0 55555555555555555555555555555555555555 555 5 2 8 222 0 88 2 22222222222 0 2 222222 0 000 8 88888 8 8 7 000 7 333333 99 99 0 7 7 44 7 4 77 4 888 4 222 4 4 4 11111 11 4 4 9 999999999 0 11 4 4 11111111 9999 888 9 9 22 4 11 777777777777 11 4 222 11 4 4 11 4 4 55 0 55 0 0 0 0 000 000 9 555555 000 0 55 0 9 0 55 0 444 6 555555555 444 6 6 00 8888888 11111 00 7777 99999999999999999999999 55 00 555 4444 55 00000 4 888888888888 8 4 4 7 1111111111111111 555 666 0 0 99 4 444444 0 888 888 4 0 88888 1 0 00000 1111111111 0000 0 0 44 99 7 7 99 33333 777 99999 7 7 99 1111 7 99 7 1 1111 4 6 1111 99 7 7 7 7 22 7 7 22 5 88 7777777777777 5 7 5 7 7 7 7 999999 7 000 7 7
consensus : NCTGCTGTCCCCTNGTGACTTATTTTCTCGCNACGCAGTGTCCCATGGTCANAACACAACAATNTGTAAAACGGAATAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTAATGTCCTTATCCAAATCAGANTCAGGGATTGTTTNGTATACCAGAACCAATTCTACATTATTA-TTATTTTAATC-GA--ATATTTT---TCGGCAACTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCACATGTG-CAA-CCCA-TGGCTT-CATAATTGTACGTTTAT--TAAA-TAA-CTT-A-----TTT-CGCA--TTG-GACA-A-AT-TAAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAG-G-NN-C---AATA-AACAG--AA-CATGTCAATTATTTC--GAATTTGT--A-TCTC--TAGT----GTAA--TNAATCTGTTGAAATA-TTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAAAAAA--TTAATTA--AGT--GTAAA--TCAA-A--TTA-CAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGCA-CGG-AA-ATG---ATTATCAGGCATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTTTAT----A--TATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAAG----GG-T-GAT-CTT--T------GGTA-TATGCCCACCCCCC-CCCCTCT----------AAAAAAC-AACA--CTGT--CC--GCG----AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGA--T--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCCC-A---ACT-------ATTA-AGAATTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTA---C----TTGCCAAG-A-ATTAT-CAAACAA-TATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTG-GTTTTTTTTTTTAA-GA-----C--ATGCTCCTT-GGC--CTGATT-A-TA-------ATCG-CATG----ATNTCTTTCT-GCTTT--TTTATTCTG-GTGCCT--TTGGTT--TAAATTTT-----G-GTAATATTTGGCATTTTATCT-TGGAC--GGAATAATCGTCG-AATCGGTTAAATAT--T-ACA-C-ACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCAATTTGACAAAATTGT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTC-----AC-T---CTTTTGT--GGTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ANAA------C---GAA-G--CAATTCTATNTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TCTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACTGCA------AA-ATTA---TCA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCGGCGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGCG----ATG-TCGATTAGATCGC-TATA-CCTAGTGTG
Reference ( family-424 ) : NCTGCTGTCCCCTNGTGACTTATTTTCTCGCNACGCAGTGTCCCATGGTCANAACACAACAATNTGTAAAACGGAATAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTAATGTCCTTATCCAAATCAGANTCAGGGATTGTTTNGTATACCAGAACCAATTCTACATTATTA-TTATTTTAATC-GA--ATATTTT---TCGGCAACTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCACATGTG-CAA-CCCA-TGGCTT-CATAATTGTACGTTTAT--TAAA-TAA-CTT-A-----TTT-CGCA--TTG-GACA-A-AT-TAAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAG-G-NN-C---AATA-AACAG--AA-CATGTCAATTATTTC--GAATTTGT--A-TCTC--TAGT----GTAA--TNAATCTGTTGAAATA-TTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAAAAAA--TTAATTA--AGT--GTAAA--TCAA-A--TTA-CAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGCA-CGG-AA-ATG---ATTATCAGGCATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTTTAT----A--TATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAAG----GG-T-GAT-CTT--T------GGTA-TATGCCCACCCCCC-CCCCTCT----------AAAAAAC-AACA--CTGT--CC--GCG----AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGA--T--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCCC-A---ACT-------ATTA-AGAATTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTA---C----TTGCCAAG-A-ATTAT-CAAACAA-TATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTG-GTTTTTTTTTTTAA-GA-----C--ATGCTCCTT-GGC--CTGATT-A-TA-------ATCG-CATG----ATNTCTTTCT-GCTTT--TTTATTCTG-GTGCCT--TTGGTT--TAAATTTT-----G-GTAATATTTGGCATTTTATCT-TGGAC--GGAATAATCGTCG-AATCGGTTAAATAT--T-ACA-C-ACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCAATTTGACAAAATTGT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTC-----AC-T---CTTTTGT--GGTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ANAA------C---GAA-G--CAATTCTATNTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TCTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACTGCA------AA-ATTA---TCA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCGGCGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGCG----ATG-TCGATTAGATCGC-TATA-CCTAGTGTG
gi|1 : CTG-TGTCCCTTAGTGA-----TTTCTCGCAACGCAGTGT----TGGTTATAATA--ACAATGTGTAAA-CGGAATAGAT----------GTAAT-----GTAAATT-TTAACTAATGTCCTTATCCAA-TCAGACTCAAGGATTGTTTTATATACCAG--CTAATTCTACATTATTA-TTATTTTAGTC--A--ATATTTT---TCGGCAACTT--AAACACACCTAAATATGTCTGAAATTACATGTG-CAA-CCAAATGGCTTACATAATTGTGC-TTAAT--TAAAATCA-CTT-A-----TTT-CACA--TTG-GACA-ACAT-TCAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAG-G-AA-C---AATA-AACAG--AA-CATGTCA-TT-TTTT--GAATTTGTTAA-TCT---TAGT----GACC--TTAAT-TGTTGAA----TTTTT--TC-----------GC----GTTTATCAA----TTAAAAAAAAAAAATTAATTA--AGT--GTAAAATTCAA-A--TTAGCAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGCA-CGGCAA-ATG---ATTATTAGGTATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTGTA-----A--TATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTATT-----ACATTAAG----GG-T-GAT-CTT--T------GGT--TATGCCCACCCCAC-CTCCTCT----------AAAAAG--AACA--CTGT--C---GTG----AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGAAGT--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCTC-A---ACT-------ATTA-AGACTTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTAACTT----TTGCCAAG-A-ATTAT-CAAACAAATATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTCTGTTTTTTTTTTTAA-AAAAAACT--ATGCTCCTTTGGC--CTGATTTA-TA--------TCG-CA-G----ATATCTTTCT-GCTTT--TT-ATTCTG-GTGCCT--TTTGTT--TAAATTTT-----G-GTAATGTTTGGCATTTTATCT-TG-AC--AGAATAATCGTCG-AATTCGTTAA-TAT--T-ACA-C-ACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA--ATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCA-TTTGACAAAATTGT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTT-----AC-T---CTTTTGTTTGGTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAG--AT--GATGG-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TATA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-CA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ATAA------C---GAA-G--CAATTCTATGTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--AC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTCAT----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-AA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TTTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACCGCA------AA-ATTA---TTA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AA--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACA-GTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC--CCAGGGCGCAACCG-CGA-GG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTC-CG----ATG--CGATTAAATCGC-TATA-CCAAGTGTG
gi|10 : t-ATTG--AT-TGAC-TAG-----ACCA-TCTTCCA-A-----G---AAA-AGA--TC-AGT--------TC----TCCACGT---TTTATCA-CATC--AT-GTA--AAAACTTTCA-T-CGGAACCGGGCG-GAA--GATA-GA-TCCTATT-TTATCTTACTGC-TAGTCATTGAAAGC--A-CAAGTCGAG-T-ATC-T---AA---AACA------C---GAA-G--CAATTTTATCTTGACCGGTG-GCGCTGGTGTTATATGGGCC-T---------TGATG-ATAAGGC-TTTATCA-----------AA--------T-----T--GTC----TTT-------------------TTC--TT-----TATT--TATG-GA---CAAAGTT--TTT-
gi|11 : ---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCA-A-----G-----AAAGA--TC-A-T--------TC----TCCACGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAA--GATA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--T-TAGTCA-TGAAAAC--A-CA--TC-GA-T-ATC-T---AA---AACA------C---GAA-G--CAATTTTATCTT-AC--CTG-GAGCTGGTGTTATATG---C-T---------TGATGAATA--GC-TTTATCA-----------AA--------T-----T--GTC---------------------------------TTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---g
gi|12 : ttttttgcCAG-G-TGTC---AATT-AACGG--AA-CATGTTAATTATATC--AAATCTGT--A-TCTC--TAAT----GTAA--TTTTTCTCTTGAAATC-TGTTT--TCTAACACACAGAGT----GT--TTCAATCT-TTTAAAAATGAA--T--GTTT--TGT--GTAAA--TCAA-C--TTA-TAc
gi|13 : atatgtaatcctttcacactgctgacaaaaatatgtacaccagtc--A-CA--CC-AA-T-TTC-T---AA---AAAAG-----C---GAA-G--CAATTTTATCTT-AC--ATG-TAGCTATTGTTTTATG---C-T---------TGACGAATA--GC-TTGACCATTCTAT-GG--AA-ATAAT-TT-----T--GTC----TTTTC-TC---------C--AATGC----TTTTATTTT--TATG-GG---CA---GT--TTT-T---CCC-C------------GACAA-AT-T-TAA----AGA-----A---GAGataaaaagtactcaaataaatcatcaagcatatag
gi|14 : ---AATA-AACAG--AA-CATGTAAATTATCTC--AAATTGGT--A-TCTC--TA--------------AA---GT---AACA-TTTTT--TC-----------ACAT--GTGATTCAA----TCT-----------TT--T-----GT--GTGAAC-TTAC-A---TG-CAG-CTCTT--CTTGCACTCATGC-AATTACTCAA------ACC-A-GCA-CAA-AA-ATA---A-TATCATGCATgcccaagggccacatcgc
gi|15 : tttctgctaaatctactggtgagAAA-CTAATTGTT-GCT-AAT-GTACATCAGAG-CC-C---AAGATGACACCTAA-CATGTTAATTATTTT--GAATTGGT--A-TCTC--TAGT----GTAA--TATATCTGTTGAAATA-TTTTT--TC-----------GC----GCTATTCCA----TTT-----------TT--------GT--GTAAA--TCTA-T--TTA-TAG-A---T--CTTGCAC---TGC-AATTACTG-A------AAT-GTGCA-Cgca
gi|16 : cCTGCTGTCCCCTTATGACTTATTTTCTCGCCACGCAGTGTCCCATGGTCAAAACACAACAATTTGTAAAACAG-ATAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTA--GTCCTTATTCAAATCAGAATCAGAGATTGTTTAGTATACCAGAACCAATcaa
gi|17 : TT-T---TCC-C------------ACCAG-AT-TCTAAG---AAA-----T---GAGTA--ATTTTTCT-GA-A-G--AAAAATGCA------AA-ATTA---TCA---TGT------------------G--G-------CA-TAA----AACTGT-TAACA
gi|18 : TTGACACAAT-GT-CT---CATT-----------A-CTTCTATTTT------AC-T---CTTTTG----GTGAAAAATATTGA-TCA
gi|2 : aaATTGTACGTTTATATTAAA-TAAACTTGA-----GTT-TGCAATCTGCGACATA-ATATAATGCTACTTGT--GCTGAATGACACATCAG-A-AG-CTGAAATA-AACAG--AAGCATGTCCATTATTTCCTGTATTTTG--A-TCTC--TAGTATGTGTAAC-TTAAT-TGTTGAAGTT-TTTTTGTTC-----------GCAAGCGTTAATCAA----TTTAAAAAAAAG--TTAATTAG-AGT--GTAAA--ATAA-AATTTA-CATTCTCTT--CTTGCAC---TGTTAATTACTGGAGAAAGAAATCGTGCA-CGG-AA-ATGTCTATTATGTGGTAAATATCAAATTGATGAGTGATTGGTCAACA----CTTTTTATGTAAA--TATTGCA-TGCTATATGTTGGT-ATTTTTTTTTAACAT--AG----GACT-GAT-CTTCTT------GATA-TCTGCCCACCCCCCACCCCTCT----------CAAAAACTAATATTCTGTTTCCATGCGGTTAAATCTGTGTATGTTGATCTTATTGATCTAACTTATTGAGTT-GAATC-C---------ACTAGAGA--TCTTAACATTTGC--CTCCTCGCGTCCGCT-CCCCTATTTACTCCCTCACATTATAGAATTTAAAATTGCTT------A--------GATTTA---C----TTGCCAAGTA-ATTATTCAAACAA-TATTGTGAAGCGCCC---CCCCCCCCCTG----CATTTATTTAACGA--------ATGCTCCT--GGCACCTACTT-AATACTCCACCATTG-CAT-----ATCTCTTTCTCGCTTTAGTTTAT-CTGCGTGCCT----GGTTGTTAAATTTTCTCATGCGTA-TATTTG-CATTT-ATCTCTGGACCTGAAATAATCGTC--AATCGGTTAAATATACT-ACA-CCACACATCCCCCTTCTCGCAACT-TACTATACAATTTGTT-AATTATCAACAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-ACATC-CGATGATAAGGGCAGTAAC--TGC----------------AAAAATTTGGTAGCCCATCAATGGGACAAT-TTGTTCTTGA-ATCCTTATCTACATA-CTTCCACCTTCCTCCAAC-T---CTATT-T--GG-GAAAAATATTGAGTCAAA---AAAACGGGGTATTAAA--AT--GATAA-TTTATTTGACGAAGT-TATTAACTTT---TTATTTAAGT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCTTA-----GGT-AGATAGA--TCCA-T--------TC----TCCGCGT---ATC--CATCATCCAAT-GTATAAACATTTTCACT-C-----CG--CG-GAC--GACA-CACTTCTATT-CTATCTTAC--CCTAGTCA-TGAAAAACAA-TA--TC-AAAT-ATCCT---AACGAGTAA------C---GAA-GG-CAATC--ATGTT-AC--ATG-GAGC-ATGTTTATATG---CCT---------TGGTGAATA--AC-TTTATCATTCTTGCGT--AA-AGAAA-TT-----TCCGTC----TTTTC-T----------TCGGATTC--ATTTCTCTTTT--TCTT-GAACACA---AT--TAT-T---TCC-C------------AACAA-AT-TTTAATAATAAA-----T---GAGTC--ATTTTTTCTGACA-GGTTAAACGCCA------AA-ATTAATATTA---TTGTTAAAT-----GAA-G-GGAAG-------C--GAAT---AACTGT--AA-ATGTACAGAA--AGC-C-TGTTGTAAA-----AAC---TAC-A---CA-AGAATC--A---TTAA--CA--ACCTTTTTCGGA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA--G-A-TAC-GTATAA--AAATTA-TATGACATACCAACCGCCGCGCACCAA-CGAGGGCTGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGAG------G-TCGA-TAGATTGC-TATA-CCTAGTGTG
gi|20 : G----AGG-TCGAT-AGATCGC-TATA-CCTAGTGT
gi|3 : AATTCTACATTATTA-TTATTTTAATC-GA--ATATTTT----CGGCACTTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCA-ATGTGGCAAACCCA-TGGCTTTCATAATTGTACGTTTAT--TAAA-TAA-CTT-AGTGCATTTGCACA--TTG-GACA-A--T-TAAT-CTACTTGTTTGCTGAAT-ACACA--------------------ACAG--A--CATGTCCATTATTTTT-GAATTTGT--AATCTC---AGT----GTAACTTAAAT-TGTTGATTT--TTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAAAAAA--TTAATTA--AGTCTGTAAA--TCAATA--TTA--AG-CTCTTTCCTAGCAC---TGT-AATTACTGAA--------T-GTGCAACGG-AA-ATG---ATTATTAG-CGTATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTTTAT----T--TATTGCAATGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAAG----GG-T-GATCCTT--T------GATA--ATGCCCA---CCC-ACCCTCT----------AAAAAAC-AACAG-CTGT--CC--GTG----AAC---TG-A-GTGGA------------AA--TATGAAATTGGAACCAC---------A----AGA--T--TAACATTTGCCGCGCTT---------T-CCTC-A---ACT-------ATTA-AACATTTAAA--T-GTTTA----G--------GATTTA---C----TTG-CAAG-A-AT--T-CAAACAA-TATTGGAA---G------TCCCCCCTCTG-GTTTTTTTTTTT----A-----CCGATGCTCCTT--GC--CTGATT-A-T--------ATCACCATGATGAATTTCTTTCT-GCTAT--TTTATTCTG-GTGCCTTCTTGGTT--TAAATTTTG----G-GTAA-ATTT-GCATTTTATCT-TGGAC--AGAA-AATCGTCGTATTCGGTTAAATAT--TAACAGC-AC-TATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATTCA--TTGTTGAATTATA--CAATTTAAAA--AGCGCACGCTCCGTACA--TC-CG----------------T--TGTAAAGGGAGTAACTGCAAAAAAT---GTAGCCCATCAAGCTGACAAAA-TGT-CTTGACATT-----------A-CTTCCACTTT------ACGT---CTT--------TGGGAAATATTG--TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTTAT-GACGAAGTGTATTA--CTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGTAAGATAGA--TC-A-T--------TC-----CCGCGG---TTTA-TATCA-C--AT-GTA--AACAATTCAA-T-T-----CG--CG-GAC---ACA-CA-ATCTATT-TTATC-TAC--A-TAGT-A-T--AAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T----A---ATAA------C---GAAGG--CAATTCTATGTT-AC--ATGTGAGCTATTGTTATGAG---C-T---------TGGTGAATA--ACTTTTATCATTCTAG-GT--AACAGAAAGTT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--T-TTCGATCTTTTC-TTT--TGT--GA---CA---TT--CTT-T---CCC-A------------G--AA-ATGTTTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTC-TGA-A-G--T-AACTTCA------AA-ATTA---TTA----GTATAAAT----TG-A-G-A---G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTAC--AA--AGC-C-GT--TTTAA-----AAC----AC-ACTCCA-A----T--A---CTAAT-CA--ACCTTTT-CGAT----AAAGCTTCCTA----TTTAATAAA-TG-A-TAC--TATAA--AAA-TATTATG-CCTACC-ACCAGCGCGC-ACCGCCGAGGG-TGTTCA-CGCGTACGCAC-AGATCAACTCGAG------G-TCGAT--GAGCGC-TATAGCCTAGTGTG
gi|4 : ccagtTTGAACTACT--TAAGTCTAAATCCGCGTAT---CCATA-A--TTTCG----------------TATTG---------------------AT---GTA--------ATTTG-TAAAATGTT-CTT-ATATTT----------AACTTT---TTTC-----AC-TTGACATTTGT--AGTTAAAA-TAT-GA-TCAAATAAAAA-CG------TATA--AC--CATTA-TT-AT-------AGTACACTAACTTAAAAC-ATT---ATAT-ATATAG-----A--AATTT-CCGTA-----GAA-AGATAGAGCTC-A-T--------TC----TCCGCGTATTTTTATCA-CATCTCATTGTA--A-CAATTTCA---C-----CG--CG-GATTTGACA--A-TCCTATTATTATCTGTC--C-TAATCA-GGACAAA--A-CA--TC-AA-TTATC-TTTAAA---AAAA------C---CGA-GACCAATTTTAT-TG-AC--ATG-GA-CTATTGGTAT-TG---G-T---------TGGTGAAGA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAAATT-----T--GTC----TT-----------------------------TTCTTT--------GA---TA---CT--TTT-CGTATCAAC------------GGCA-----TC-------------------GAGT-------TTTTAGA-AAG--TAAAATGCA------AATATTA----CA---TGTTTACAT----TGAA-GGAG--G-------CAATAA----AACTGT-TAACATGTACAG-A--AGC-CGTA--CTCAC-----AAC---TACAA---CA-AAT-TT--A----TAAT-CC--CACATTT-CGAA----AAA-TTCCCTC----CTTA--AAA-TGAA-TAG-GCATAGTTAAA-CA-TAT---AT------------------G-CGAGGG-TGTTTTCCGCGAATG-ACAAGATA-CCTCGCGAACAATGATTGAT--AATCGC-TATA-ACTAGTGTat
gi|5 : aTTATCAGTTATTTCGATCTGACAGTATTTTAGCTAGAAAACCTCAAAACACAACTAGATTTGCTTGAAATCACATG-------CTCA-TG-----CATG--------------------TAA-GTT-A-----TTT-CACA--TTG-GACA-A-AT-TAAA-ATAATTGTT-ACCAAAT-ATACATCAG-GTGC-C---AATA-AACAG--AG-CATATTAATTGTTTT--GAATTGGT--A-TCTCTGTAGC----AGAA--TAAATCTGTTGAAATATTTTTT--TT-----------AC----GTTATTCAATCGTTTTAAAATTAAA--TT--TTGTCAGT--GTAAA--TCAA-A--TTA-TGG-CACTC--CTAGGAC---TGC-AATGACTG-A------AAT-GTGCA-C---AATATA---ATTATCAGGCATGCAGCAA--CAATGAGT--TTG-----CATTGTCTCTTT-T----AACTATTACA-TGC-AAA-GTTGGTTATTTTT-----AGATACAGCTCAGG-TAGAT-CTT--TAAATAGGGTACTGTGCTC-CCTCCC-CCCTTCTTTATATAAAAAAAAAAA-AGCA--TTGCG-TC--GCA----AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATAAAATT-TAACC-TTTGAATTGAA----AGA--T--CAACGCTTGC--CGCTT---------TCCCCC-A---AC--------ATTA-AGAATTAAAA--G-CTTTGTTTCGTTTTTATTAATTTA---CTTAATTGTCAAG-ATTTTTT-TATGCAG-TATTGTGA---AATCAATCCCCCC
gi|6 : t-----TAAG--ATTGGATGGGTTTATT-GACGAATT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TCA---TCCGCGT---TATA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATT-CA-TTC-----CG--CG-GAC--GACACAA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TAGAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ATAA------C---GAA-G--CAATTCTATGTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--AC-TTTATCATTCTAG-GTTAAA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTCAT----------C--GATTC--TTTTTTTTTTT--TATG-AA---CA----T--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TTTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACCGCA------AA-ATTA---TTA---TGTTTAAAT----TGAAGG-AA--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACA-GTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CG-A----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCAGGGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTC-CG----ATG-TCGA-TAAATCGC-TATA-ACAAGTGTG
gi|7 : TTGA-CCAAA---AAA--GA-----TGAATTCT--GAT-A-TTT-TT--ATCAAGT-T-----TTTC---T-ATT---AT-T--C-TAGCAAGAA--A-TAT-TCA-ACTCCCGAT-TGACAGA--TC-A-TAGACTTTATCAAACTCCGGGT---TCGA-TA-AATC--AT----------ATT--A-T-C-----CG--CGTGTC--GACA-GA-TC-TATT-TTAC--TAC--C-TAGTCA-TGAAAAA----CA--TC-A--T-ATC-T---AA---A-AA------C---GAA-G--CAATTCG--TTT-A---ATG-GAGTTATT--TATA-G---C-G---------TTGT--ATA---C-ATTATCAT-CTAG-TT--AA-AAA----T-----T--GTC----TTTTC-T--------------AT-C--GTTCTTTTTTT--TAT---A---CA---TT--TTT-------C-C------------GATAA-AT-TCTAA----AG------T---GGGT---ATTTTC--TGA-A-G--TAACTTGCC------AA-AT-A---TCA---TGATTAA-T----TGAG-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGTCTAACAT-TACA--A--AGCAC-TG--GTTAA-----AACT--TAC-----CA-AGA-TC--A---TTTAT-CA--ACATTTT-CGAA----A---TTTGCTA----TTAA--GAT-TG-A-TAC-GTAT-A--AAA-TA-TATG---TTCC-ACCGAC----------------------------TACG-AC-AGATC-ACTCGCG------G-TCGATACGATCGCTTATA-CCTAGTa
gi|8 : TATATG---C-TCTCTTTAAATGATGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AAGAGAAA-TTCAATTT--ATCATCTTTTTC-TTCGTGCATAAC--GATTC--TTTGTGCGTTTAGTATGAGATT-CA---TTGCTTTAT---TCT-CTCACGCAGAAGCAACAATAT-TCTAA----AAAAAGCTTCAAAAGTCTTATTTTTTTTGA-A-G--TAAAATACAGCATAAAA-ATTAA--TCACTTTGCTTTAGTACGATGAA-G-AG--GTGGTACCC--CAATTAAAACTGT-TAACATGTACAAAAAGAGA-C-TC--AATAATTCATGACAGATAC-G---CACAGA-CCCTACATTTAATCCAATACATTTT-CGAATTTTACATTTGCCTAAATTTTTA--AAAGTG-ATTACGGTAT
gi|9 : AA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TATATT-GACTAAAT-TAA-AACTTT---T-ATT---AC-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----AAA-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCATGC---TTTA-CA-CATC--GT-GTA--AACAATT-------------G--CG-GAA--GACA-GA-TCATATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--AACA--TC-AA-T-ATC-T---AA---AAAAACAAATCTAAAAA-G--CAATTTTATCTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATTTG---C-T---------TGATAAATA--GC-TTTAGCATTCTAT-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTCTT----------C--GATTC--TT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): AAGGTTTTTCCCGACAGAATCTAACAAGAGGCCCAAGGGCCACATCGC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 22222 2222 11 1 1 4444444444 22222 1 11 1 11 1 22222 3333 11 2222222 1 22222 11111111 1 1 2222222 1 11 1 111111 2222222222 11 2222222222222222 1111 33333333333333333 2222 33333333333333333 11 1111 111 22222222 111 11 11 22222222222 333333333 1 1 1 22222 11 2222 111 1 333333333 1111 1 4444444444 11 22 3333333333333 111 1 555555555555 11 1 5555555555555555 11111 11 444444444444444444444444444444 1 2222 555555555555555 33333333 111 1 1 3333333333 22 7777777777777 222 11 8888888888888888888888888 1 11 1 222 11 5555555 11 11 1 111 22 2222 111 1 22 22 111 11 111 1111 1 22222222222222222222222222222222222222 111 44444444444 333333 111 22222 111 111111 1 111 11111 111111111 11111111 1111 11 111111111111 11 111111 111111111 44444444444444444444444 111 222222222222 1111111111111111 111 111111 111 11111 1111111111 1111 11111 111 11111 1111 1111 1111 1111111111111 222222 222
lowQualScore : 5 1 77777 1 3333 1 88 1 5 5 0000000000 66666 5 88 5 1 1 88 3 99999 0000 88 6 8888888 3 99999 3 0 44444444 0 0 6666666 0 2 33 0 555555 99 88 3 8 0 7777777777 5 77 55 0 0 33 1 77 5 77 2222222222222222 4444 77 44444444444444444 1 2222 5 55555555555555555 77 33 1111 99 6 3 99 111 6 00000000 6 6 999 8 444 0 1 33 33 55555555555 999999999 0 0 0 3 55555 22 1111 111 0 333333333 7777 55 0 0 3333333333 88 33 7777777777777 777 3 0 111111111111 33 0 0 6666666666666666 88888 33 444444444444444444444444444444 0 0000 555555555555555 22222222 6 111 66 0 0 4444444444 00 8888888888888 777 88 5555555555555555555555555 1 3 88 7 7 3 555 88 0000000 44 33 7 3 6 999 7 00 7 2222 666 7 3 7 00 00 2 444 33 777 4444 0 88888888888888888888888888888888888888 777 2 3 0 777 8 55 3 88888888888 8 3 333333 8 444 0 44444 0 0 6 444 6 555555 77 77 3 5 1 66 0 1 11 1 888 4 222 4 4 4 11111 66 4 4 8 555555555 1 66 4 4 66666666 3333 777 8 8 22 4 66 444444444444 66 4 666 00 4 4 66 4 4 55 4 55 4 4 4 4 777 777 4 555555 777 4 99 3 4 4 55 4 666 3 444444444 555 3 3 55 7777777 99999 55 7777 11111111111111111111111 55 99 222 9999 55 88888 4 222222222222 0 4 4 2 9999999999999999 222 444 5 5 66 1 444444 5 333 888 0 2 00000 0 5 88888 8888888888 2222 5 5 44 77 5 5 77 44444 555 55555 5 5 77 0000 5 77 5 0 2222 1 6 2222 77 5 5 5 5 99 6 6 99 3 99 7777777777777 2 6 2 6 6 6 6 888888 5 222 5 5
lowQualScore : . . ..... . .... . .. . . . .......... ..... . .. . . . .. . ..... .... .. . ....... . ..... . . ........ . . ....... . . .. . ...... .. .. . . . .......... . .. .. . . .. . .. . .. ................ .... .. ................. . .... . ................. .. .. .... .. . . .. ... . ........ . . ... . ... . . .. .. ........... ......... . . . . ..... .. .... ... . ......... .... .. . . .......... .. .. ............. ... . . ............ .. . . ................ ..... .. .............................. . .... ............... ........ . ... .. . . .......... .. ............. ... .. ......................... . . .. . . . ... .. ....... .. .. . . . ... . .. . .... ... . . . .. .. . ... .. ... .... . ...................................... ... . . . ... . .. . ........... . . ...... . ... . ..... . . . ... . ...... .. .. . . . .. . . .. . ... . ... . . . ..... .. . . . ......... . .. . . ........ .... ... . . .. . .. ............ .. . ... .. . . .. . . .. . .. . . . . ... ... . ...... ... . .. . . . .. . ... . ......... ... . . .. ....... ..... .. .... ....................... .. .. ... .... .. ..... . ............ . . . . ................ ... ... . . .. . ...... . ... ... . . ..... . . ..... .......... .... . . .. .. . . .. ..... ... ..... . . .. .... . .. . . .... . . .... .. . . . . .. . . .. . .. ............. . . . . . . . ...... . ... . .
lowQualScore : 0 0 00000 0 0000 0 00 0 5 5 5555555555 55555 5 55 5 0 0 55 3 33333 7777 33 7 7777777 3 77777 2 8 00000000 0 0 0000000 0 0 88 0 222222 44 88 2 0 8 7777777777 7 99 99 4 1 66 3 99 7 99 4444444444444444 7777 99 00000000000000000 4 1111 0 11111111111111111 99 66 7777 77 7 5 22 777 7 00000000 7 7 444 0 000 8 4 88 88 55555555555 000000000 0 0 0 2 00000 88 2222 000 0 555555555 2222 88 2 0 8888888888 88 88 2222222222222 555 2 0 222222222222 88 2 0 2222222222222222 55555 88 222222222222222222222222222222 0 8888 000000000000000 88888888 5 000 88 0 0 2222222222 00 0000000000000 333 33 0000000000000000000000000 0 3 33 3 3 3 777 33 0000000 77 33 3 3 7 000 3 00 3 7777 777 3 3 3 77 77 5 000 88 555 8888 0 55555555555555555555555555555555555555 555 5 2 8 222 0 88 2 22222222222 0 2 222222 0 000 8 88888 8 8 7 000 7 333333 99 99 0 7 7 44 7 4 77 4 888 4 222 4 4 4 11111 11 4 4 9 999999999 0 11 4 4 11111111 9999 888 9 9 22 4 11 777777777777 11 4 222 11 4 4 11 4 4 55 0 55 0 0 0 0 000 000 9 555555 000 0 55 0 9 0 55 0 444 6 555555555 444 6 6 00 8888888 11111 00 7777 99999999999999999999999 55 00 555 4444 55 00000 4 888888888888 8 4 4 7 1111111111111111 555 666 0 0 99 4 444444 0 888 888 4 0 88888 1 0 00000 1111111111 0000 0 0 44 99 7 7 99 33333 777 99999 7 7 99 1111 7 99 7 1 1111 4 6 1111 99 7 7 7 7 22 7 7 22 5 88 7777777777777 5 7 5 7 7 7 7 999999 7 000 7 7
consensus : NCTGCTGTCCCCTNGTGACTTATTTTCTCGCNACGCAGTGTCCCATGGTCANAACACAACAATNTGTAAAACGGAATAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTAATGTCCTTATCCAAATCAGANTCAGGGATTGTTTNGTATACCAGAACCAATTCTACATTATTA-TTATTTTAATC-GA--ATATTTT---TCGGCAACTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCACATGTG-CAA-CCCA-TGGCTT-CATAATTGTACGTTTAT--TAAA-TAA-CTT-A-----TTT-CGCA--TTG-GACA-A-AT-TAAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAG-G-NN-C---AATA-AACAG--AA-CATGTCAATTATTTC--GAATTTGT--A-TCTC--TAGT----GTAA--TNAATCTGTTGAAATA-TTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAAAAAA--TTAATTA--AGT--GTAAA--TCAA-A--TTA-CAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGCA-CGG-AA-ATG---ATTATCAGGCATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTTTAT----A--TATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAAG----GG-T-GAT-CTT--T------GGTA-TATGCCCACCCCCC-CCCCTCT----------AAAAAAC-AACA--CTGT--CC--GCG----AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGA--T--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCCC-A---ACT-------ATTA-AGAATTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTA---C----TTGCCAAG-A-ATTAT-CAAACAA-TATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTG-GTTTTTTTTTTTAA-GA-----C--ATGCTCCTT-GGC--CTGATT-A-TA-------ATCG-CATG----ATNTCTTTCT-GCTTT--TTTATTCTG-GTGCCT--TTGGTT--TAAATTTT-----G-GTAATATTTGGCATTTTATCT-TGGAC--GGAATAATCGTCG-AATCGGTTAAATAT--T-ACA-C-ACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCAATTTGACAAAATTGT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTC-----AC-T---CTTTTGT--GGTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ANAA------C---GAA-G--CAATTCTATNTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TCTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACTGCA------AA-ATTA---TCA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCGGCGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGCG----ATG-TCGATTAGATCGC-TATA-CCTAGTGTG
Reference ( family-424 ) : NCTGCTGTCCCCTNGTGACTTATTTTCTCGCNACGCAGTGTCCCATGGTCANAACACAACAATNTGTAAAACGGAATAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTAATGTCCTTATCCAAATCAGANTCAGGGATTGTTTNGTATACCAGAACCAATTCTACATTATTA-TTATTTTAATC-GA--ATATTTT---TCGGCAACTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCACATGTG-CAA-CCCA-TGGCTT-CATAATTGTACGTTTAT--TAAA-TAA-CTT-A-----TTT-CGCA--TTG-GACA-A-AT-TAAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAG-G-NN-C---AATA-AACAG--AA-CATGTCAATTATTTC--GAATTTGT--A-TCTC--TAGT----GTAA--TNAATCTGTTGAAATA-TTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAAAAAA--TTAATTA--AGT--GTAAA--TCAA-A--TTA-CAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGCA-CGG-AA-ATG---ATTATCAGGCATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTTTAT----A--TATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAAG----GG-T-GAT-CTT--T------GGTA-TATGCCCACCCCCC-CCCCTCT----------AAAAAAC-AACA--CTGT--CC--GCG----AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGA--T--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCCC-A---ACT-------ATTA-AGAATTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTA---C----TTGCCAAG-A-ATTAT-CAAACAA-TATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTG-GTTTTTTTTTTTAA-GA-----C--ATGCTCCTT-GGC--CTGATT-A-TA-------ATCG-CATG----ATNTCTTTCT-GCTTT--TTTATTCTG-GTGCCT--TTGGTT--TAAATTTT-----G-GTAATATTTGGCATTTTATCT-TGGAC--GGAATAATCGTCG-AATCGGTTAAATAT--T-ACA-C-ACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCAATTTGACAAAATTGT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTC-----AC-T---CTTTTGT--GGTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ANAA------C---GAA-G--CAATTCTATNTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TCTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACTGCA------AA-ATTA---TCA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCGGCGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGCG----ATG-TCGATTAGATCGC-TATA-CCTAGTGTG
gi|1 : CTG-TGTCCCTTAGTGA-----TTTCTCGCAACGCAGTGT----TGGTTATAATA--ACAATGTGTAAA-CGGAATAGAT----------GTAAT-----GTAAATT-TTAACTAATGTCCTTATCCAA-TCAGACTCAAGGATTGTTTTATATACCAG--CTAATTCTACATTATTA-TTATTTTAGTC--A--ATATTTT---TCGGCAACTT--AAACACACCTAAATATGTCTGAAATTACATGTG-CAA-CCAAATGGCTTACATAATTGTGC-TTAAT--TAAAATCA-CTT-A-----TTT-CACA--TTG-GACA-ACAT-TCAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAG-G-AA-C---AATA-AACAG--AA-CATGTCA-TT-TTTT--GAATTTGTTAA-TCT---TAGT----GACC--TTAAT-TGTTGAA----TTTTT--TC-----------GC----GTTTATCAA----TTAAAAAAAAAAAATTAATTA--AGT--GTAAAATTCAA-A--TTAGCAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGCA-CGGCAA-ATG---ATTATTAGGTATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTGTA-----A--TATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTATT-----ACATTAAG----GG-T-GAT-CTT--T------GGT--TATGCCCACCCCAC-CTCCTCT----------AAAAAG--AACA--CTGT--C---GTG----AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGAAGT--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCTC-A---ACT-------ATTA-AGACTTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTAACTT----TTGCCAAG-A-ATTAT-CAAACAAATATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTCTGTTTTTTTTTTTAA-AAAAAACT--ATGCTCCTTTGGC--CTGATTTA-TA--------TCG-CA-G----ATATCTTTCT-GCTTT--TT-ATTCTG-GTGCCT--TTTGTT--TAAATTTT-----G-GTAATGTTTGGCATTTTATCT-TG-AC--AGAATAATCGTCG-AATTCGTTAA-TAT--T-ACA-C-ACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA--ATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCA-TTTGACAAAATTGT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTT-----AC-T---CTTTTGTTTGGTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAG--AT--GATGG-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TATA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-CA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ATAA------C---GAA-G--CAATTCTATGTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--AC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTCAT----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-AA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TTTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACCGCA------AA-ATTA---TTA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AA--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACA-GTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC--CCAGGGCGCAACCG-CGA-GG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTC-CG----ATG--CGATTAAATCGC-TATA-CCAAGTGTG
gi|10 : t-ATTG--AT-TGAC-TAG-----ACCA-TCTTCCA-A-----G---AAA-AGA--TC-AGT--------TC----TCCACGT---TTTATCA-CATC--AT-GTA--AAAACTTTCA-T-CGGAACCGGGCG-GAA--GATA-GA-TCCTATT-TTATCTTACTGC-TAGTCATTGAAAGC--A-CAAGTCGAG-T-ATC-T---AA---AACA------C---GAA-G--CAATTTTATCTTGACCGGTG-GCGCTGGTGTTATATGGGCC-T---------TGATG-ATAAGGC-TTTATCA-----------AA--------T-----T--GTC----TTT-------------------TTC--TT-----TATT--TATG-GA---CAAAGTT--TTT-
gi|11 : ---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCA-A-----G-----AAAGA--TC-A-T--------TC----TCCACGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAA--GATA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--T-TAGTCA-TGAAAAC--A-CA--TC-GA-T-ATC-T---AA---AACA------C---GAA-G--CAATTTTATCTT-AC--CTG-GAGCTGGTGTTATATG---C-T---------TGATGAATA--GC-TTTATCA-----------AA--------T-----T--GTC---------------------------------TTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---g
gi|12 : ttttttgcCAG-G-TGTC---AATT-AACGG--AA-CATGTTAATTATATC--AAATCTGT--A-TCTC--TAAT----GTAA--TTTTTCTCTTGAAATC-TGTTT--TCTAACACACAGAGT----GT--TTCAATCT-TTTAAAAATGAA--T--GTTT--TGT--GTAAA--TCAA-C--TTA-TAc
gi|13 : atatgtaatcctttcacactgctgacaaaaatatgtacaccagtc--A-CA--CC-AA-T-TTC-T---AA---AAAAG-----C---GAA-G--CAATTTTATCTT-AC--ATG-TAGCTATTGTTTTATG---C-T---------TGACGAATA--GC-TTGACCATTCTAT-GG--AA-ATAAT-TT-----T--GTC----TTTTC-TC---------C--AATGC----TTTTATTTT--TATG-GG---CA---GT--TTT-T---CCC-C------------GACAA-AT-T-TAA----AGA-----A---GAGataaaaagtactcaaataaatcatcaagcatatag
gi|14 : ---AATA-AACAG--AA-CATGTAAATTATCTC--AAATTGGT--A-TCTC--TA--------------AA---GT---AACA-TTTTT--TC-----------ACAT--GTGATTCAA----TCT-----------TT--T-----GT--GTGAAC-TTAC-A---TG-CAG-CTCTT--CTTGCACTCATGC-AATTACTCAA------ACC-A-GCA-CAA-AA-ATA---A-TATCATGCATgcccaagggccacatcgc
gi|15 : tttctgctaaatctactggtgagAAA-CTAATTGTT-GCT-AAT-GTACATCAGAG-CC-C---AAGATGACACCTAA-CATGTTAATTATTTT--GAATTGGT--A-TCTC--TAGT----GTAA--TATATCTGTTGAAATA-TTTTT--TC-----------GC----GCTATTCCA----TTT-----------TT--------GT--GTAAA--TCTA-T--TTA-TAG-A---T--CTTGCAC---TGC-AATTACTG-A------AAT-GTGCA-Cgca
gi|16 : cCTGCTGTCCCCTTATGACTTATTTTCTCGCCACGCAGTGTCCCATGGTCAAAACACAACAATTTGTAAAACAG-ATAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTA--GTCCTTATTCAAATCAGAATCAGAGATTGTTTAGTATACCAGAACCAATcaa
gi|17 : TT-T---TCC-C------------ACCAG-AT-TCTAAG---AAA-----T---GAGTA--ATTTTTCT-GA-A-G--AAAAATGCA------AA-ATTA---TCA---TGT------------------G--G-------CA-TAA----AACTGT-TAACA
gi|18 : TTGACACAAT-GT-CT---CATT-----------A-CTTCTATTTT------AC-T---CTTTTG----GTGAAAAATATTGA-TCA
gi|2 : aaATTGTACGTTTATATTAAA-TAAACTTGA-----GTT-TGCAATCTGCGACATA-ATATAATGCTACTTGT--GCTGAATGACACATCAG-A-AG-CTGAAATA-AACAG--AAGCATGTCCATTATTTCCTGTATTTTG--A-TCTC--TAGTATGTGTAAC-TTAAT-TGTTGAAGTT-TTTTTGTTC-----------GCAAGCGTTAATCAA----TTTAAAAAAAAG--TTAATTAG-AGT--GTAAA--ATAA-AATTTA-CATTCTCTT--CTTGCAC---TGTTAATTACTGGAGAAAGAAATCGTGCA-CGG-AA-ATGTCTATTATGTGGTAAATATCAAATTGATGAGTGATTGGTCAACA----CTTTTTATGTAAA--TATTGCA-TGCTATATGTTGGT-ATTTTTTTTTAACAT--AG----GACT-GAT-CTTCTT------GATA-TCTGCCCACCCCCCACCCCTCT----------CAAAAACTAATATTCTGTTTCCATGCGGTTAAATCTGTGTATGTTGATCTTATTGATCTAACTTATTGAGTT-GAATC-C---------ACTAGAGA--TCTTAACATTTGC--CTCCTCGCGTCCGCT-CCCCTATTTACTCCCTCACATTATAGAATTTAAAATTGCTT------A--------GATTTA---C----TTGCCAAGTA-ATTATTCAAACAA-TATTGTGAAGCGCCC---CCCCCCCCCTG----CATTTATTTAACGA--------ATGCTCCT--GGCACCTACTT-AATACTCCACCATTG-CAT-----ATCTCTTTCTCGCTTTAGTTTAT-CTGCGTGCCT----GGTTGTTAAATTTTCTCATGCGTA-TATTTG-CATTT-ATCTCTGGACCTGAAATAATCGTC--AATCGGTTAAATATACT-ACA-CCACACATCCCCCTTCTCGCAACT-TACTATACAATTTGTT-AATTATCAACAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-ACATC-CGATGATAAGGGCAGTAAC--TGC----------------AAAAATTTGGTAGCCCATCAATGGGACAAT-TTGTTCTTGA-ATCCTTATCTACATA-CTTCCACCTTCCTCCAAC-T---CTATT-T--GG-GAAAAATATTGAGTCAAA---AAAACGGGGTATTAAA--AT--GATAA-TTTATTTGACGAAGT-TATTAACTTT---TTATTTAAGT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCTTA-----GGT-AGATAGA--TCCA-T--------TC----TCCGCGT---ATC--CATCATCCAAT-GTATAAACATTTTCACT-C-----CG--CG-GAC--GACA-CACTTCTATT-CTATCTTAC--CCTAGTCA-TGAAAAACAA-TA--TC-AAAT-ATCCT---AACGAGTAA------C---GAA-GG-CAATC--ATGTT-AC--ATG-GAGC-ATGTTTATATG---CCT---------TGGTGAATA--AC-TTTATCATTCTTGCGT--AA-AGAAA-TT-----TCCGTC----TTTTC-T----------TCGGATTC--ATTTCTCTTTT--TCTT-GAACACA---AT--TAT-T---TCC-C------------AACAA-AT-TTTAATAATAAA-----T---GAGTC--ATTTTTTCTGACA-GGTTAAACGCCA------AA-ATTAATATTA---TTGTTAAAT-----GAA-G-GGAAG-------C--GAAT---AACTGT--AA-ATGTACAGAA--AGC-C-TGTTGTAAA-----AAC---TAC-A---CA-AGAATC--A---TTAA--CA--ACCTTTTTCGGA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA--G-A-TAC-GTATAA--AAATTA-TATGACATACCAACCGCCGCGCACCAA-CGAGGGCTGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGAG------G-TCGA-TAGATTGC-TATA-CCTAGTGTG
gi|20 : G----AGG-TCGAT-AGATCGC-TATA-CCTAGTGT
gi|3 : AATTCTACATTATTA-TTATTTTAATC-GA--ATATTTT----CGGCACTTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCA-ATGTGGCAAACCCA-TGGCTTTCATAATTGTACGTTTAT--TAAA-TAA-CTT-AGTGCATTTGCACA--TTG-GACA-A--T-TAAT-CTACTTGTTTGCTGAAT-ACACA--------------------ACAG--A--CATGTCCATTATTTTT-GAATTTGT--AATCTC---AGT----GTAACTTAAAT-TGTTGATTT--TTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAAAAAA--TTAATTA--AGTCTGTAAA--TCAATA--TTA--AG-CTCTTTCCTAGCAC---TGT-AATTACTGAA--------T-GTGCAACGG-AA-ATG---ATTATTAG-CGTATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTTTAT----T--TATTGCAATGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAAG----GG-T-GATCCTT--T------GATA--ATGCCCA---CCC-ACCCTCT----------AAAAAAC-AACAG-CTGT--CC--GTG----AAC---TG-A-GTGGA------------AA--TATGAAATTGGAACCAC---------A----AGA--T--TAACATTTGCCGCGCTT---------T-CCTC-A---ACT-------ATTA-AACATTTAAA--T-GTTTA----G--------GATTTA---C----TTG-CAAG-A-AT--T-CAAACAA-TATTGGAA---G------TCCCCCCTCTG-GTTTTTTTTTTT----A-----CCGATGCTCCTT--GC--CTGATT-A-T--------ATCACCATGATGAATTTCTTTCT-GCTAT--TTTATTCTG-GTGCCTTCTTGGTT--TAAATTTTG----G-GTAA-ATTT-GCATTTTATCT-TGGAC--AGAA-AATCGTCGTATTCGGTTAAATAT--TAACAGC-AC-TATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATTCA--TTGTTGAATTATA--CAATTTAAAA--AGCGCACGCTCCGTACA--TC-CG----------------T--TGTAAAGGGAGTAACTGCAAAAAAT---GTAGCCCATCAAGCTGACAAAA-TGT-CTTGACATT-----------A-CTTCCACTTT------ACGT---CTT--------TGGGAAATATTG--TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTTAT-GACGAAGTGTATTA--CTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGTAAGATAGA--TC-A-T--------TC-----CCGCGG---TTTA-TATCA-C--AT-GTA--AACAATTCAA-T-T-----CG--CG-GAC---ACA-CA-ATCTATT-TTATC-TAC--A-TAGT-A-T--AAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T----A---ATAA------C---GAAGG--CAATTCTATGTT-AC--ATGTGAGCTATTGTTATGAG---C-T---------TGGTGAATA--ACTTTTATCATTCTAG-GT--AACAGAAAGTT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--T-TTCGATCTTTTC-TTT--TGT--GA---CA---TT--CTT-T---CCC-A------------G--AA-ATGTTTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTC-TGA-A-G--T-AACTTCA------AA-ATTA---TTA----GTATAAAT----TG-A-G-A---G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTAC--AA--AGC-C-GT--TTTAA-----AAC----AC-ACTCCA-A----T--A---CTAAT-CA--ACCTTTT-CGAT----AAAGCTTCCTA----TTTAATAAA-TG-A-TAC--TATAA--AAA-TATTATG-CCTACC-ACCAGCGCGC-ACCGCCGAGGG-TGTTCA-CGCGTACGCAC-AGATCAACTCGAG------G-TCGAT--GAGCGC-TATAGCCTAGTGTG
gi|4 : ccagtTTGAACTACT--TAAGTCTAAATCCGCGTAT---CCATA-A--TTTCG----------------TATTG---------------------AT---GTA--------ATTTG-TAAAATGTT-CTT-ATATTT----------AACTTT---TTTC-----AC-TTGACATTTGT--AGTTAAAA-TAT-GA-TCAAATAAAAA-CG------TATA--AC--CATTA-TT-AT-------AGTACACTAACTTAAAAC-ATT---ATAT-ATATAG-----A--AATTT-CCGTA-----GAA-AGATAGAGCTC-A-T--------TC----TCCGCGTATTTTTATCA-CATCTCATTGTA--A-CAATTTCA---C-----CG--CG-GATTTGACA--A-TCCTATTATTATCTGTC--C-TAATCA-GGACAAA--A-CA--TC-AA-TTATC-TTTAAA---AAAA------C---CGA-GACCAATTTTAT-TG-AC--ATG-GA-CTATTGGTAT-TG---G-T---------TGGTGAAGA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAAATT-----T--GTC----TT-----------------------------TTCTTT--------GA---TA---CT--TTT-CGTATCAAC------------GGCA-----TC-------------------GAGT-------TTTTAGA-AAG--TAAAATGCA------AATATTA----CA---TGTTTACAT----TGAA-GGAG--G-------CAATAA----AACTGT-TAACATGTACAG-A--AGC-CGTA--CTCAC-----AAC---TACAA---CA-AAT-TT--A----TAAT-CC--CACATTT-CGAA----AAA-TTCCCTC----CTTA--AAA-TGAA-TAG-GCATAGTTAAA-CA-TAT---AT------------------G-CGAGGG-TGTTTTCCGCGAATG-ACAAGATA-CCTCGCGAACAATGATTGAT--AATCGC-TATA-ACTAGTGTat
gi|5 : aTTATCAGTTATTTCGATCTGACAGTATTTTAGCTAGAAAACCTCAAAACACAACTAGATTTGCTTGAAATCACATG-------CTCA-TG-----CATG--------------------TAA-GTT-A-----TTT-CACA--TTG-GACA-A-AT-TAAA-ATAATTGTT-ACCAAAT-ATACATCAG-GTGC-C---AATA-AACAG--AG-CATATTAATTGTTTT--GAATTGGT--A-TCTCTGTAGC----AGAA--TAAATCTGTTGAAATATTTTTT--TT-----------AC----GTTATTCAATCGTTTTAAAATTAAA--TT--TTGTCAGT--GTAAA--TCAA-A--TTA-TGG-CACTC--CTAGGAC---TGC-AATGACTG-A------AAT-GTGCA-C---AATATA---ATTATCAGGCATGCAGCAA--CAATGAGT--TTG-----CATTGTCTCTTT-T----AACTATTACA-TGC-AAA-GTTGGTTATTTTT-----AGATACAGCTCAGG-TAGAT-CTT--TAAATAGGGTACTGTGCTC-CCTCCC-CCCTTCTTTATATAAAAAAAAAAA-AGCA--TTGCG-TC--GCA----AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATAAAATT-TAACC-TTTGAATTGAA----AGA--T--CAACGCTTGC--CGCTT---------TCCCCC-A---AC--------ATTA-AGAATTAAAA--G-CTTTGTTTCGTTTTTATTAATTTA---CTTAATTGTCAAG-ATTTTTT-TATGCAG-TATTGTGA---AATCAATCCCCCC
gi|6 : t-----TAAG--ATTGGATGGGTTTATT-GACGAATT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TCA---TCCGCGT---TATA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATT-CA-TTC-----CG--CG-GAC--GACACAA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TAGAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ATAA------C---GAA-G--CAATTCTATGTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--AC-TTTATCATTCTAG-GTTAAA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTCAT----------C--GATTC--TTTTTTTTTTT--TATG-AA---CA----T--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TTTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACCGCA------AA-ATTA---TTA---TGTTTAAAT----TGAAGG-AA--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACA-GTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CG-A----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCAGGGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTC-CG----ATG-TCGA-TAAATCGC-TATA-ACAAGTGTG
gi|7 : TTGA-CCAAA---AAA--GA-----TGAATTCT--GAT-A-TTT-TT--ATCAAGT-T-----TTTC---T-ATT---AT-T--C-TAGCAAGAA--A-TAT-TCA-ACTCCCGAT-TGACAGA--TC-A-TAGACTTTATCAAACTCCGGGT---TCGA-TA-AATC--AT----------ATT--A-T-C-----CG--CGTGTC--GACA-GA-TC-TATT-TTAC--TAC--C-TAGTCA-TGAAAAA----CA--TC-A--T-ATC-T---AA---A-AA------C---GAA-G--CAATTCG--TTT-A---ATG-GAGTTATT--TATA-G---C-G---------TTGT--ATA---C-ATTATCAT-CTAG-TT--AA-AAA----T-----T--GTC----TTTTC-T--------------AT-C--GTTCTTTTTTT--TAT---A---CA---TT--TTT-------C-C------------GATAA-AT-TCTAA----AG------T---GGGT---ATTTTC--TGA-A-G--TAACTTGCC------AA-AT-A---TCA---TGATTAA-T----TGAG-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGTCTAACAT-TACA--A--AGCAC-TG--GTTAA-----AACT--TAC-----CA-AGA-TC--A---TTTAT-CA--ACATTTT-CGAA----A---TTTGCTA----TTAA--GAT-TG-A-TAC-GTAT-A--AAA-TA-TATG---TTCC-ACCGAC----------------------------TACG-AC-AGATC-ACTCGCG------G-TCGATACGATCGCTTATA-CCTAGTa
gi|8 : TATATG---C-TCTCTTTAAATGATGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AAGAGAAA-TTCAATTT--ATCATCTTTTTC-TTCGTGCATAAC--GATTC--TTTGTGCGTTTAGTATGAGATT-CA---TTGCTTTAT---TCT-CTCACGCAGAAGCAACAATAT-TCTAA----AAAAAGCTTCAAAAGTCTTATTTTTTTTGA-A-G--TAAAATACAGCATAAAA-ATTAA--TCACTTTGCTTTAGTACGATGAA-G-AG--GTGGTACCC--CAATTAAAACTGT-TAACATGTACAAAAAGAGA-C-TC--AATAATTCATGACAGATAC-G---CACAGA-CCCTACATTTAATCCAATACATTTT-CGAATTTTACATTTGCCTAAATTTTTA--AAAGTG-ATTACGGTAT
gi|9 : AA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TATATT-GACTAAAT-TAA-AACTTT---T-ATT---AC-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----AAA-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCATGC---TTTA-CA-CATC--GT-GTA--AACAATT-------------G--CG-GAA--GACA-GA-TCATATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--AACA--TC-AA-T-ATC-T---AA---AAAAACAAATCTAAAAA-G--CAATTTTATCTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATTTG---C-T---------TGATAAATA--GC-TTTAGCATTCTAT-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTCTT----------C--GATTC--TT
blockSeqs : C T CTTAT C CCCA A CA T A . CCCAAAAAGT ATTGG A . A A A AA G TGACA AGCT CA C TGGCAAA . GCTTT A GTTTATAT . A AGTGCA G G AT C TAATA TG TT G G AAGCTGA T CT AG CT T . A TG ATGTGTAACTTAAT ATAT GT TAACACACAGAGT G TCGT A AAAAGTTAATTAGA CT C AAT T T T TC TCA T GAGAAAGA C A AA T TCT C AT GA GTCAACA ATGTAAA A T T T TTTTA TA CTCA CT C TAAATAG ACTG AC A TTATATAAAA CT TT TTCCATGCGGTTA CTG T T TCTTATTGATCT CT G TTTGAATTGAA TCT CG CGCGTCCGCTCCCCTATTTACTCCCTCAC T ATTG TGTTTCGTTTTTATT CTTAA C TA TA T . AGCGCCC G AACGA G AC AATACTCCACCATTGCAT C C AG T T C TCT GT CTCATGC T G T C G CTG T GT A ACT CC A G A CT AT G CAA TC GCT ACA T ATGATAAGGGCAGTAACTGC TTG G A ATG T TG C CTTATCTACAT A T CCTCCA G TGA GTA G TAA A GGGTAT TT TG A G A TG G TT A AAA T TAA A G A CAAGA CC A T T CTCCCGAT A GC C G AGACTTTA AAAC ATT T T CA T TA TCATCGGAAC GG T TTT CA C A TG C T CA A AG G A T C TTA CGA A ACAAAT TAA G AC T C G CG T GGC C CTCTTTAAA AGG T C TA CAGAAAG CAATT CC ATCT TTCGTGCATAACGATTCT AG GA ACA AAGT GC CGTA A TCACGCAGAAGC T G C AAAAAGCTTCAA CTT TCT C A GT A GCATAA T ATA CTT A ACGAT G GGAA TGGTACCC TTAA C T GA AG A G TT TTCAT AGA ACTC C A CT CATT C AT T TTTT A C AATT AT G A T G TT T T AC A AA GCCGCGCACCAA G C C C A A G AACAAT A TAC T G
blockSeqs : . GA . . . . . . A GTTTAT . . GA . A . . AAT A T G . GTGTC . . A T G . . . GTAACTTAAAT ATC . GCAAGC T TCT A AAAAATTAATTAA . . TA C . T . . . AA . . GG . . G . . CATTGT TAAC . . . T . AC . TA . CTT ATC A . . C G GTCGCA . T . . . . CACTAG T . TCCTCAACT . T TAG C T AT TT . . AATCAAT . ACCG T . ATATCACCATGATGA T . . T . . . . GG A G . . G A . . A TA GC . . . T . G A . . CA . TTGTAAAGGGAGTAACTGCA . G A AT . TG C T . C C . . TG . . . G . . G . T G A TT A . . G . . . . . . . T GGTA T . . . . A . T T TC . . TCACTC . . A G . . . . . . . . . . . . . . A G . . G T C . . . . . . G . . . AGAAAA . . . TTCGGATTCA . G TT T . AT . . . . T TAATAAAT A TTA . . . C . . A . A T . GAG CAA T . T GA . . . . . T AA . . . T . . . . A G . . . . . . . . . C A A AGCGCGCACCGC G . C . . . G AG . TA . .
blockSeqs : . . . . A . A . . AT T T A . AGCCC . . A . G . . . GTAATTTTTC ACA . ACAT T . A TTAAATTTTGTCA . . C T . T . . . AA . . GG . . T . . TCCA ATT . . . . . . . T . T AA C . . A . CCGTG . . . . . . ACA T . TCCCCCAAC . G A C . A . . . G . T . . A . TATTG . . A TT . T T . . C . . . G . . . A . . T . A G . CT A . . . . . . . . . . . GGT T . . . . . . . . . . . TCATC . . A G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T C . . . . . . G . . . GAGAAA . . . TCTTTCGAT . G . G . T . . . . T GAAAT C CTT . . . C . . . . A T . AA CA T . T AA . . . . . . A . . . C . . . . A C . . . . . . . . . C A A AGGGCGCAACCG G . C . . . G AT . TA . .
blockSeqs : A . . . GTGCC . . A . T . . . GTAATATATC ATA . GC T . A ATGAATGTTTT . . A C . A . . . A . . . . . C AT . . . . . . . . . . . . . G . . G . A G . TT A . . . . . . . . . . . GAA T . . . . . . . . . . . CAATT . . C C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C G . . . . . . A . . . ATAAT . . . ATCGATTCT . G . A . T . . . . C AGAA C TTT . . . A . . . . A T . AG C T . T A . . . . . . A . . . T . . . . A T . . . . . . . . . . T A GAC G . . . . . G . . TA . .
blockSeqs : . . . G . T . . . AGAATAAATC GTT . GC T . . TTT . . T T . . . . . A . . . . . . . G . A . . A . . . . . . . . . . . . GGT T . . . . . . . . . . . CATTC . . C C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T G . . . . . . A . . . AGAAA . . . TTCGATTCT . T . T . T . . . . T AAAT C CT . . . C . . . . G T . AG C T . T G . . . . . . G . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . G . . . AA TT . AC . . . TT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAA C . . . . . . . . . . . TCAC . . C G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C G . . . . . . G . . . AGAAA . . . TCCAATGC . G . C . T . . . . C AAAT . CT . . . T . . . . . . . G C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . ATC . . C G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C T . . . . . . A . . . AGAAA . . . TATCG . . . T . T . . . . C AGT . T . . . A . . . . . . . A C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T C . . . . . . G . . . AAA . . . TTCT . . . T . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : GTGCC***** ** GTAATNNATC****** ATN* ATAAATTTTA******* ** T* GA****** GG* AT* C********** C***** G**** C* A* A***** TA*
originalCons : NCTGCTGTCCCCTNGTGACTTATTTTCTCGCNACGCAGTGTCCCATGGTCANAACACAACAATNTGTAAAACGGAATAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTAATGTCCTTATCCAAATCAGANTCAGGGATTGTTTNGTATACCAGAACCAATTCTACATTATTA-TTATTTTAATC-GA--ATATTTT---TCGGCAACTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCACATGTG-CAA-CCCA-TGGCTT-CATAATTGTACGTTTAT--TAAA-TAA-CTT-A-----TTT-CGCA--TTG-GACA-A-AT-TAAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAG-G-NN-C---AATA-AACAG--AA-CATGTCAATTATTTC--GAATTTGT--A-TCTC--TAGT----GTAA--TNAATCTGTTGAAATA-TTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAAAAAA--TTAATTA--AGT--GTAAA--TCAA-A--TTA-CAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGCA-CGG-AA-ATG---ATTATCAGGCATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTTTAT----A--TATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAAG----GG-T-GAT-CTT--T------GGTA-TATGCCCACCCCCC-CCCCTCT----------AAAAAAC-AACA--CTGT--CC--GCG----AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGA--T--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCCC-A---ACT-------ATTA-AGAATTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTA---C----TTGCCAAG-A-ATTAT-CAAACAA-TATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTG-GTTTTTTTTTTTAA-GA-----C--ATGCTCCTT-GGC--CTGATT-A-TA-------ATCG-CATG----ATNTCTTTCT-GCTTT--TTTATTCTG-GTGCCT--TTGGTT--TAAATTTT-----G-GTAATATTTGGCATTTTATCT-TGGAC--GGAATAATCGTCG-AATCGGTTAAATAT--T-ACA-C-ACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCAATTTGACAAAATTGT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTC-----AC-T---CTTTTGT--GGTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ANAA------C---GAA-G--CAATTCTATNTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TCTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACTGCA------AA-ATTA---TCA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCGGCGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGCG----ATG-TCGATTAGATCGC-TATA-CCTAGTGTG
finalCons : NCTGCTGTCCCCTNGTGACTTATTTTCTCGCNACGCAGTGTCCCATGGTCANAACACAACAATNTGTAAAACGGAATAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTAATGTCCTTATCCAAATCAGANTCAGGGATTGTTTNGTATACCAGAACCAATTCTACATTATTA-TTATTTTAATC-GA--ATATTTT---TCGGCAACTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCACATGTG-CAA-CCCA-TGGCTT-CATAATTGTACGTTTAT--TAAA-TAA-CTT-A-----TTT-CGCA--TTG-GACA-A-AT-TAAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAGGTGCC-----AATA-AACAG--AA-CATGTCAATTATTTC--GAATTTGT--A-TCTC--TAGTGTAATNNATC------TGTTGAAATN-TTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAATAAATTTTA-------GT--GTAAA--TCAA-A--TTAT-AG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGGA------AAT-GTGCA-CGG-AA-ATG---ATTATCAGGCATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTTTAT----A--TATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAAG----GG-T-GAT-CTT--T------GGTA-TATGCCCACCCCCC-CCCCTCT----------AAAAAAC-AACA--CTGT--CC--GCG----AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGA--T--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCCC-A---ACT-------ATTA-AGAATTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTA---C----TTGCCAAG-A-ATTAT-CAAACAA-TATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTG-GTTTTTTTTTTTAA-GA-----C--ATGCTCCTT-GGC--CTGATT-A-TA-------ATCG-CATG----ATNTCTTTCT-GCTTT--TTTATTCTG-GTGCCT--TTGGTT--TAAATTTT-----G-GTAATATTTGGCATTTTATCT-TGGAC--GGAATAATCGTCG-AATCGGTTAAATAT--T-ACA-C-ACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCAATTTGACAAAAT-GT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTC-----AC-T---CTTTTG----GTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ANAA------C---GAA-G--CAATTCTATNTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TCTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACTGCA------AA-ATTA---TCA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATGC-ATACCA-CCGGCGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGCGA-----G-TCGATA-GATCGC-TATA-CCTAGTGTG
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): AAGGTTTTTCCCGACAGAATCTAACAAGAGGCCCAAGGGCCACATCGC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 22222 2222 11 1 1 4444444444 22222 1 11 1 11 1 22222 3333 11 2222222 1 22222 11111111 1 1 2222222 1 11 1 111111 111111 11 1111 11111111 1111 22222222222222222 2222 55555555555555555555555 11 1111 11 111 333333333 111 11 11 22222222222 333333333 1 1 1 22222 11 2222 111 1 333333333 1111 1 4444444444 11 22 3333333333333 111 1 555555555555 11 1 5555555555555555 11111 11 444444444444444444444444444444 1 2222 555555555555555 33333333 111 1 1 3333333333 22 7777777777777 222 11 8888888888888888888888888 1 11 1 222 11 5555555 11 11 1 111 22 2222 111 1 22 22 111 11 111 1111 1 22222222222222222222222222222222222222 111 44444444444 333333 111 222222 111 111111 1 111 11111 111111111 11111111 1111 11 111111111111 11 111111 111111111 44444444444444444444444 111 222222222222 1111111111111111 111 111111 111 11111 1111111111 1111 11111 111 11111 1111 1111 1111 1111111111111 3333333
lowQualScore : 5 1 77777 1 3333 1 88 1 5 5 0000000000 66666 5 88 5 1 1 88 3 99999 0000 88 6 8888888 3 99999 3 0 44444444 0 0 6666666 0 2 33 0 555555 99 6 3 6 0 888888 5 77 55 0 0 33 1 77 5 77 2222 99999999 0000 77 88888888888888888 1 2222 5 44444444444444444444444 33 1111 00 6 3 99 111 6 444444444 6 6 999 8 444 0 1 33 33 55555555555 999999999 0 0 0 3 55555 22 1111 111 0 333333333 7777 55 0 0 3333333333 88 33 7777777777777 777 3 0 111111111111 33 0 0 6666666666666666 88888 33 444444444444444444444444444444 0 0000 555555555555555 22222222 6 111 66 0 0 4444444444 00 8888888888888 777 88 5555555555555555555555555 1 3 88 7 7 3 555 88 0000000 44 33 7 3 6 999 7 00 7 2222 666 7 3 7 00 00 2 444 33 777 4444 0 88888888888888888888888888888888888888 777 2 3 0 8 8 0 3 88888888888 8 3 333333 8 444 8 888888 0 6 444 6 555555 77 77 3 5 1 66 0 1 11 1 888 4 222 4 4 4 11111 66 4 4 8 555555555 1 66 4 4 66666666 3333 777 8 8 22 4 66 444444444444 66 4 666 00 4 4 66 4 4 55 4 55 4 4 4 4 777 777 4 555555 777 4 99 3 4 4 55 4 666 3 444444444 555 3 3 55 7777777 99999 55 7777 11111111111111111111111 55 99 222 9999 55 88888 4 222222222222 0 4 4 2 9999999999999999 222 444 5 5 66 1 444444 5 333 888 0 2 00000 0 5 88888 8888888888 2222 5 5 44 77 5 5 77 44444 555 55555 5 5 77 0000 5 77 5 0 2222 1 6 2222 77 5 5 5 5 99 6 6 99 3 99 7777777777777 2 6 2 6 6 6 6 7777777 5 77 5 5
lowQualScore : . . ..... . .... . .. . . . .......... ..... . .. . . . .. . ..... .... .. . ....... . ..... . . ........ . . ....... . . .. . ...... .. . . . . ...... . .. .. . . .. . .. . .. .... ........ .... .. ................. . .... . ....................... .. .... .. . . .. ... . ......... . . ... . ... . . .. .. ........... ......... . . . . ..... .. .... ... . ......... .... .. . . .......... .. .. ............. ... . . ............ .. . . ................ ..... .. .............................. . .... ............... ........ . ... .. . . .......... .. ............. ... .. ......................... . . .. . . . ... .. ....... .. .. . . . ... . .. . .... ... . . . .. .. . ... .. ... .... . ...................................... ... . . . . . . . ........... . . ...... . ... . ...... . . ... . ...... .. .. . . . .. . . .. . ... . ... . . . ..... .. . . . ......... . .. . . ........ .... ... . . .. . .. ............ .. . ... .. . . .. . . .. . .. . . . . ... ... . ...... ... . .. . . . .. . ... . ......... ... . . .. ....... ..... .. .... ....................... .. .. ... .... .. ..... . ............ . . . . ................ ... ... . . .. . ...... . ... ... . . ..... . . ..... .......... .... . . .. .. . . .. ..... ... ..... . . .. .... . .. . . .... . . .... .. . . . . .. . . .. . .. ............. . . . . . . . ....... . .. . .
lowQualScore : 0 0 00000 0 0000 0 00 0 5 5 5555555555 55555 5 55 5 0 0 55 3 33333 7777 33 7 7777777 3 77777 2 8 00000000 0 0 0000000 0 0 88 0 222222 44 7 7 7 7 333333 7 99 99 4 1 66 3 99 7 99 1111 11111111 3333 99 44444444444444444 4 1111 0 44444444444444444444444 66 7777 11 7 5 22 777 7 333333333 7 7 444 0 000 8 4 88 88 55555555555 000000000 0 0 0 2 00000 88 2222 000 0 555555555 2222 88 2 0 8888888888 88 88 2222222222222 555 2 0 222222222222 88 2 0 2222222222222222 55555 88 222222222222222222222222222222 0 8888 000000000000000 88888888 5 000 88 0 0 2222222222 00 0000000000000 333 33 0000000000000000000000000 0 3 33 3 3 3 777 33 0000000 77 33 3 3 7 000 3 00 3 7777 777 3 3 3 77 77 5 000 88 555 8888 0 55555555555555555555555555555555555555 555 5 2 8 0 0 8 2 22222222222 0 2 222222 0 000 0 666666 8 7 000 7 333333 99 99 0 7 7 44 7 4 77 4 888 4 222 4 4 4 11111 11 4 4 9 999999999 0 11 4 4 11111111 9999 888 9 9 22 4 11 777777777777 11 4 222 11 4 4 11 4 4 55 0 55 0 0 0 0 000 000 9 555555 000 0 55 0 9 0 55 0 444 6 555555555 444 6 6 00 8888888 11111 00 7777 99999999999999999999999 55 00 555 4444 55 00000 4 888888888888 8 4 4 7 1111111111111111 555 666 0 0 99 4 444444 0 888 888 4 0 88888 1 0 00000 1111111111 0000 0 0 44 99 7 7 99 33333 777 99999 7 7 99 1111 7 99 7 1 1111 4 6 1111 99 7 7 7 7 22 7 7 22 5 88 7777777777777 5 7 5 7 7 7 7 6666666 7 44 7 7
consensus : NCTGCTGTCCCCTNGTGACTTATTTTCTCGCNACGCAGTGTCCCATGGTCANAACACAACAATNTGTAAAACGGAATAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTAATGTCCTTATCCAAATCAGANTCAGGGATTGTTTNGTATACCAGAACCAATTCTACATTATTA-TTATTTTAATC-GA--ATATTTT---TCGGCAACTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCACATGTG-CAA-CCCA-TGGCTT-CATAATTGTACGTTTAT--TAAA-TAA-CTT-A-----TTT-CGCA--TTG-GACA-A-AT-TAAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAGGTGCC--AATA-AACAG--AA-CATGTCAATTATTTC--GAATTTGT--A-TCTC--TAGT----GTAA--TNNATCTGTTGAAAT-TTTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAAAAAA--T-TAATT---A-G---TGTAAA--TCAA-A--TTA-CAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGGA------AAT-GTGCA-CGG-AA-ATG---ATTATCAGGCATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTTTAT----A--TATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAAG----GG-T-GAT-CTT--T------GGTA-TATGCCCACCCCCC-CCCCTCT----------AAAAAAC-AACA--CTGT--CC--GCG----AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGA--T--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCCC-A---ACT-------ATTA-AGAATTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTA---C----TTGCCAAG-A-ATTAT-CAAACAA-TATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTG-GTTTTTTTTTTTAA-GA-----C--ATGCTCCTT-GGC--CTGATT-A-TA-------ATCG-CATG----ATNTCTTTCT-GCTTT--TTTATTCTG-GTGCCT--TTGGTT--TAAATTTT-----G-GTAATATTTGGCATTTTATCT-TGGAC--GGAATAATCGTCG-AATCGGTTAAATAT--T-ACA-C-ACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCAATTTGACAAAAT-GT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTC-----AC-T---CT-TTTGT---GTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ANAA------C---GAA-G--CAATTCTATNTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TCTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACTGCA------AA-ATTA---TCA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCGGCGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGCGA------GTCGA-TA-GATCGC-TATA-CCTAGTGTG
Reference ( family-424 ) : NCTGCTGTCCCCTNGTGACTTATTTTCTCGCNACGCAGTGTCCCATGGTCANAACACAACAATNTGTAAAACGGAATAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTAATGTCCTTATCCAAATCAGANTCAGGGATTGTTTNGTATACCAGAACCAATTCTACATTATTA-TTATTTTAATC-GA--ATATTTT---TCGGCAACTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCACATGTG-CAA-CCCA-TGGCTT-CATAATTGTACGTTTAT--TAAA-TAA-CTT-A-----TTT-CGCA--TTG-GACA-A-AT-TAAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAGGTGCC--AATA-AACAG--AA-CATGTCAATTATTTC--GAATTTGT--A-TCTC--TAGT----GTAA--TNNATCTGTTGAAAT-NTTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAATAAA--T-T--TT---A-G---TGTAAA--TCAA-A--TTA-TAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGGA------AAT-GTGCA-CGG-AA-ATG---ATTATCAGGCATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTTTAT----A--TATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAAG----GG-T-GAT-CTT--T------GGTA-TATGCCCACCCCCC-CCCCTCT----------AAAAAAC-AACA--CTGT--CC--GCG----AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGA--T--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCCC-A---ACT-------ATTA-AGAATTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTA---C----TTGCCAAG-A-ATTAT-CAAACAA-TATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTG-GTTTTTTTTTTTAA-GA-----C--ATGCTCCTT-GGC--CTGATT-A-TA-------ATCG-CATG----ATNTCTTTCT-GCTTT--TTTATTCTG-GTGCCT--TTGGTT--TAAATTTT-----G-GTAATATTTGGCATTTTATCT-TGGAC--GGAATAATCGTCG-AATCGGTTAAATAT--T-ACA-C-ACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCAATTTGACAAAAT-GT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTC-----AC-T---CT-TTTG----GTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ANAA------C---GAA-G--CAATTCTATNTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TCTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACTGCA------AA-ATTA---TCA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCGGCGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGCGA------GTCGA-TA-GATCGC-TATA-CCTAGTGTG
gi|1 : CTG-TGTCCCTTAGTGA-----TTTCTCGCAACGCAGTGT----TGGTTATAATA--ACAATGTGTAAA-CGGAATAGAT----------GTAAT-----GTAAATT-TTAACTAATGTCCTTATCCAA-TCAGACTCAAGGATTGTTTTATATACCAG--CTAATTCTACATTATTA-TTATTTTAGTC--A--ATATTTT---TCGGCAACTT--AAACACACCTAAATATGTCTGAAATTACATGTG-CAA-CCAAATGGCTTACATAATTGTGC-TTAAT--TAAAATCA-CTT-A-----TTT-CACA--TTG-GACA-ACAT-TCAT-CTACTTGTT-GCTGAAT-ACACATCAGG-AAC--AATA-AACAG--AA-CATGTCA-TT-TTTT--GAATTTGTTAA-TCT---TAGT----GACC--TTAAT-TGTTGAA----TTTTT--TC-----------GC----GTTTATCAA----TTAAAAAAAAAAAAT-TAATT---AAG---TGTAAAATTCAA-A--TTAGCAG-CTCTT--CTTGCAC---TGC-AATTACTGAA------AAT-GTGCA-CGGCAA-ATG---ATTATTAGGTATATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTGTA-----A--TATTGCA-TGC-ATA-GTTGGTTATTATT-----ACATTAAG----GG-T-GAT-CTT--T------GGT--TATGCCCACCCCAC-CTCCTCT----------AAAAAG--AACA--CTGT--C---GTG----AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATGAAATT-GAACC-C---------A----AGAAGT--TAACATTTGC--CGCCT---------T-CCTC-A---ACT-------ATTA-AGACTTTAAA--T-CTTTG----G--------GATTTAACTT----TTGCCAAG-A-ATTAT-CAAACAAATATTGTGA---GCCC---CCCCCCCCCTCTGTTTTTTTTTTTAA-AAAAAACT--ATGCTCCTTTGGC--CTGATTTA-TA--------TCG-CA-G----ATATCTTTCT-GCTTT--TT-ATTCTG-GTGCCT--TTTGTT--TAAATTTT-----G-GTAATGTTTGGCATTTTATCT-TG-AC--AGAATAATCGTCG-AATTCGTTAA-TAT--T-ACA-C-ACATATCCCCCTTCTC-CAACTATA--ATACA-TTTGTTGAATTATC--CAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-A--TC-CG----------------T--TGC----------------AAAAAT---GTAGCCCATCA-TTTGACAAAATTGT-CTTGACATTC----------A-CTTCCACTTTT-----AC-T---CT-TTTGTTTGGTGAAAAATATTGA-TCAAA---AAA-CGG-----TAAG--AT--GATGG-TTTATT-GACGAAGT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCGCGT---TATA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAC--GACA-CA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ATAA------C---GAA-G--CAATTCTATGTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--AC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTCAT----------C--GATTC--TTTTTTCTTTT--TATG-AA---CA---TT--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TTTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACCGCA------AA-ATTA---TTA---TGTTTAAAT----TGAA-G-AA--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACA-GTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CGAA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC--CCAGGGCGCAACCG-CGA-GG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTC-CGA------TGCGATTA-AATCGC-TATA-CCAAGTGTG
gi|10 : t-ATTG--AT-TGAC-TAG-----ACCA-TCTTCCA-A-----G---AAA-AGA--TC-AGT--------TC----TCCACGT---TTTATCA-CATC--AT-GTA--AAAACTTTCA-T-CGGAACCGGGCG-GAA--GATA-GA-TCCTATT-TTATCTTACTGC-TAGTCATTGAAAGC--A-CAAGTCGAG-T-ATC-T---AA---AACA------C---GAA-G--CAATTTTATCTTGACCGGTG-GCGCTGGTGTTATATGGGCC-T---------TGATG-ATAAGGC-TTTATCA-----------AA--------T-----T--GTC----TTT-------------------TTC--TT-----TATT--TATG-GA---CAAAGTT--TTT-
gi|11 : ---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCA-A-----G-----AAAGA--TC-A-T--------TC----TCCACGT---TTTA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATTTCA-T-C-----CG--CG-GAA--GATA-GA-TCCTATT-TTATCTTAC--T-TAGTCA-TGAAAAC--A-CA--TC-GA-T-ATC-T---AA---AACA------C---GAA-G--CAATTTTATCTT-AC--CTG-GAGCTGGTGTTATATG---C-T---------TGATGAATA--GC-TTTATCA-----------AA--------T-----T--GTC---------------------------------TTTTCTTTT--TATG-GA---CA---TT--TTT-T---g
gi|12 : ttttttgcCAGGTGTC--AATT-AACGG--AA-CATGTTAATTATATC--AAATCTGT--A-TCTC--TAAT----GTAA--TTTTTCTCTTGAAAT-CTGTTT--TCTAACACACAGAGT----GT--TTCAATCT-TTTAAAAATGAA--TGT--TT---T-G---TGTAAA--TCAA-C--TTA-TAc
gi|13 : atatgtaatcctttcacactgctgacaaaaatatgtacaccagtc--A-CA--CC-AA-T-TTC-T---AA---AAAAG-----C---GAA-G--CAATTTTATCTT-AC--ATG-TAGCTATTGTTTTATG---C-T---------TGACGAATA--GC-TTGACCATTCTAT-GG--AA-ATAAT-TT-----T--GTC----TTTTC-TC---------C--AATGC----TTTTATTTT--TATG-GG---CA---GT--TTT-T---CCC-C------------GACAA-AT-T-TAA----AGA-----A---GAGataaaaagtactcaaataaatcatcaagcatatag
gi|14 : T-GCTAAAT-CTAC-T--GGTGAG--AATA-AACAG--AA-CATGTAAATTATCTC--AAATTGGT--A-TCTC--TAAA----GTAA--C------------AT-TTTTTC--AC-----------AT----GTGATTCAA----TCT-----------T-T--T------G---TGTGAAC-TTAC-A---TG-CAG-CTCTT--CTTGCACTCATGC-AATTACT-CA------AAC-CAGCA-CAA-AA-ATA---A-TATCATGCATgcccaagggccacatcgc
gi|15 : tttcAAA-CTAATTGTT-GCT-AAT-GTACATCAGAGCCC--AAGATGACACCTAA-CATGTTAATTATTTT--GAATTGGT--A-TCTC--TAGT----GTAA--TATATCTGTTGAAAT-ATTTTT--TC-----------GC----GCTATTCCA----TTT-----------T-T---------G---TGTAAA--TCTA-T--TTA-TAG-A---T--CTTGCAC---TGC-AATTACT-GA------AAT-GTGCA-Cgca
gi|16 : cCTGCTGTCCCCTTATGACTTATTTTCTCGCCACGCAGTGTCCCATGGTCAAAACACAACAATTTGTAAAACAG-ATAGATCCCAAAAAGTGTAATATTGGGTAAACTATTAACTA--GTCCTTATTCAAATCAGAATCAGAGATTGTTTAGTATACCAGAACCAATcaa
gi|17 : TT-T---TCC-C------------ACCAG-AT-TCTAAG---AAA-----T---GAGTA--ATTTTTCT-GA-A-G--AAAAATGCA------AA-ATTA---TCA---TGT------------------G--G-------CA-TAA----AACTGT-TAACA
gi|18 : TTGACACAAT-GT-CT---CATT-----------A-CTTCTATTTT------AC-T---CT-TTTG----GTGAAAAATATTGA-TCA
gi|2 : aaATTGTACGTTTATATTAAA-TAAACTTGA-----GTT-TGCAATCTGCGACATA-ATATAATGCTACTTGT--GCTGAATGACACATCAGAAGCTGAAATA-AACAG--AAGCATGTCCATTATTTCCTGTATTTTG--A-TCTC--TAGTATGTGTAA--CTTAATTGTTGAAGT-TTTTTTGTTC-----------GCAAGCGTTAATCAA----TTTAAAAAAAAG--T-TAATT---A-GAG-TGTAAA--ATAA-AATTTA-CATTCTCTT--CTTGCAC---TGTTAATTACTGGAGAAAGAAATCGTGCA-CGG-AA-ATGTCTATTATGTGGTAAATATCAAATTGATGAGTGATTGGTCAACA----CTTTTTATGTAAA--TATTGCA-TGCTATATGTTGGT-ATTTTTTTTTAACAT--AG----GACT-GAT-CTTCTT------GATA-TCTGCCCACCCCCCACCCCTCT----------CAAAAACTAATATTCTGTTTCCATGCGGTTAAATCTGTGTATGTTGATCTTATTGATCTAACTTATTGAGTT-GAATC-C---------ACTAGAGA--TCTTAACATTTGC--CTCCTCGCGTCCGCT-CCCCTATTTACTCCCTCACATTATAGAATTTAAAATTGCTT------A--------GATTTA---C----TTGCCAAGTA-ATTATTCAAACAA-TATTGTGAAGCGCCC---CCCCCCCCCTG----CATTTATTTAACGA--------ATGCTCCT--GGCACCTACTT-AATACTCCACCATTG-CAT-----ATCTCTTTCTCGCTTTAGTTTAT-CTGCGTGCCT----GGTTGTTAAATTTTCTCATGCGTA-TATTTG-CATTT-ATCTCTGGACCTGAAATAATCGTC--AATCGGTTAAATATACT-ACA-CCACACATCCCCCTTCTCGCAACT-TACTATACAATTTGTT-AATTATCAACAATTTTAAA--AGCGCAC---CCGTA-ACATC-CGATGATAAGGGCAGTAAC--TGC----------------AAAAATTTGGTAGCCCATCAATGGGACAATTT-GTTCTTGA-ATCCTTATCTACATA-CTTCCACCTTCCTCCAAC-T---CTATTTG----G-GAAAAATATTGAGTCAAA---AAAACGGGGTATTAAA--AT--GATAA-TTTATTTGACGAAGT-TATTAACTTT---TTATTTAAGT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCTTA-----GGT-AGATAGA--TCCA-T--------TC----TCCGCGT---ATC--CATCATCCAAT-GTATAAACATTTTCACT-C-----CG--CG-GAC--GACA-CACTTCTATT-CTATCTTAC--CCTAGTCA-TGAAAAACAA-TA--TC-AAAT-ATCCT---AACGAGTAA------C---GAA-GG-CAATC--ATGTT-AC--ATG-GAGC-ATGTTTATATG---CCT---------TGGTGAATA--AC-TTTATCATTCTTGCGT--AA-AGAAA-TT-----TCCGTC----TTTTC-T----------TCGGATTC--ATTTCTCTTTT--TCTT-GAACACA---AT--TAT-T---TCC-C------------AACAA-AT-TTTAATAATAAA-----T---GAGTC--ATTTTTTCTGACA-GGTTAAACGCCA------AA-ATTAATATTA---TTGTTAAAT-----GAA-G-GGAAG-------C--GAAT---AACTGT--AA-ATGTACAGAA--AGC-C-TGTTGTAAA-----AAC---TAC-A---CA-AGAATC--A---TTAA--CA--ACCTTTTTCGGA----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA--G-A-TAC-GTATAA--AAATTA-TATGACATACCAACCGCCGCGCACCAA-CGAGGGCTGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTCGAG-------GTCGA-TA-GATTGC-TATA-CCTAGTGTG
gi|20 : ------GTCGA-TA-GATCGC-TATA-CCTAGTGT
gi|3 : gagAATTCTACATTATTA-TTATTTTAATC-GA--ATATTTT----CGGCACTTT--AAACACAACTAAATATGTCTGAAATCA-ATGTGGCAAACCCA-TGGCTTTCATAATTGTACGTTTAT--TAAA-TAA-CTT-AGTGCATTTGCACA--TTG-GACA-A--T-TAAT-CTACTTGTTTGCTGAAT-ACACA-----------------ACAG--A--CATGTCCATTATTTTT-GAATTTGT--AATCTC---AGT----GTAACTTAAAT-TGTTGAT-T-TTTTTT--TC-----------GC----GTTATTCAA----TTTAAAAAAAAA--T-TAATT---A-AGTCTGTAAA--TCAATA--TTA--AG-CTCTTTCCTAGCAC---TGT-AATTACTG--------AAT-GTGCAACGG-AA-ATG---ATTATTAG-CGTATAGCAA--CGATGAGT--TTG-TC--CA----CTCTTTAT----T--TATTGCAATGC-ATA-GTTGGTTATTTTT-----ACATTAAG----GG-T-GATCCTT--T------GATA--ATGCCCA---CCC-ACCCTCT----------AAAAAAC-AACAG-CTGT--CC--GTG----AAC---TG-A-GTGGA------------AA--TATGAAATTGGAACCAC---------A----AGA--T--TAACATTTGCCGCGCTT---------T-CCTC-A---ACT-------ATTA-AACATTTAAA--T-GTTTA----G--------GATTTA---C----TTG-CAAG-A-AT--T-CAAACAA-TATTGGAA---G------TCCCCCCTCTG-GTTTTTTTTTTT----A-----CCGATGCTCCTT--GC--CTGATT-A-T--------ATCACCATGATGAATTTCTTTCT-GCTAT--TTTATTCTG-GTGCCTTCTTGGTT--TAAATTTTG----G-GTAA-ATTT-GCATTTTATCT-TGGAC--AGAA-AATCGTCGTATTCGGTTAAATAT--TAACAGC-AC-TATCCCCCTTCTC-CAACTATA-TATTCA--TTGTTGAATTATA--CAATTTAAAA--AGCGCACGCTCCGTACA--TC-CG----------------T--TGTAAAGGGAGTAACTGCAAAAAAT---GTAGCCCATCAAGCTGACAAAAT-GT-CTTGACATT-----------A-CTTCCACTTT------ACGT---CT-TTGG----G----AAATATTG--TCAAA---AAA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TTTTAT-GACGAAGTGTATTA--CTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGTAAGATAGA--TC-A-T--------TC-----CCGCGG---TTTA-TATCA-C--AT-GTA--AACAATTCAA-T-T-----CG--CG-GAC---ACA-CA-ATCTATT-TTATC-TAC--A-TAGT-A-T--AAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T----A---ATAA------C---GAAGG--CAATTCTATGTT-AC--ATGTGAGCTATTGTTATGAG---C-T---------TGGTGAATA--ACTTTTATCATTCTAG-GT--AACAGAAAGTT-----T--GTC----TTTTC-T----------C--T-TTCGATCTTTTC-TTT--TGT--GA---CA---TT--CTT-T---CCC-A------------G--AA-ATGTTTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTC-TGA-A-G--T-AACTTCA------AA-ATTA---TTA----GTATAAAT----TG-A-G-A---G-------C--TAAT---AACTGT-TAACATGTAC--AA--AGC-C-GT--TTTAA-----AAC----AC-ACTCCA-A----T--A---CTAAT-CA--ACCTTTT-CGAT----AAAGCTTCCTA----TTTAATAAA-TG-A-TAC--TATAA--AAA-TATTATG-CCTACC-ACCAGCGCGC-ACCGCCGAGGG-TGTTCA-CGCGTACGCAC-AGATCAACTCGAG-------GTCGA-T--GAGCGC-TATAGCCTAGTGTG
gi|4 : ccagtTTGAACTACT--TAAGTCTAAATCCGCGTAT---CCATA-A--TTTCG----------------TATTG---------------------AT---GTA--------ATTTG-TAAAAT-GT-TCTTATATTT----------AACTTT---TTTC-----AC-TTGACA-TTTGTA--GTTAAAA-TAT-GA-TCAAATAAAAA-CG------TATA--AC--CATTA-TT-AT-------AGTACACTAACTTAAAAC-ATT---ATAT-ATATAG-----A--AATTT-CCGTA-----GAA-AGATAGAGCTC-A-T--------TC----TCCGCGTATTTTTATCA-CATCTCATTGTA--A-CAATTTCA---C-----CG--CG-GATTTGACA--A-TCCTATTATTATCTGTC--C-TAATCA-GGACAAA--A-CA--TC-AA-TTATC-TTTAAA---AAAA------C---CGA-GACCAATTTTAT-TG-AC--ATG-GA-CTATTGGTAT-TG---G-T---------TGGTGAAGA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AA-AGAAAATT-----T--GTC----TT-----------------------------TTCTTT--------GA---TA---CT--TTT-CGTATCAAC------------GGCA-----TC-------------------GAGT-------TTTTAGA-AAG--TAAAATGCA------AATATTA----CA---TGTTTACAT----TGAA-GGAG--G-------CAATAA----AACTGT-TAACATGTACAG-A--AGC-CGTA--CTCAC-----AAC---TACAA---CA-AAT-TT--A----TAAT-CC--CACATTT-CGAA----AAA-TTCCCTC----CTTA--AAA-TGAA-TAG-GCATAGTTAAA-CA-TAT---AT------------------G-CGAGGG-TGTTTTCCGCGAATG-ACAAGATA-CCTCGCGAACAATGATTGA-TA--ATCGC-TATA-ACTAGTGTat
gi|5 : aTTATCAGTTATTTCGATCTGACAGTATTTTAGCTAGAAAACCTCAAAACACAACTAGATTTGCTTGAAATCACATG-------CTCA-TG-----CATG--------------------TAA-GTT-A-----TTT-CACA--TTG-GACA-A-AT-TAAA-ATAATTGTT-ACCAAAT-ATACATCAGGTGCC--AATA-AACAG--AG-CATATTAATTGTTTT--GAATTGGT--A-TCTCTGTAGC----AGAA--TAAATCTGTTGAAATATTTTTT--TT-----------AC----GTTATTCAATCGTTTTAAAATTAAA--T-T--TTGTCA-G---TGTAAA--TCAA-A--TTA-TGG-CACTC--CTAGGAC---TGC-AATGACT-GA------AAT-GTGCA-C---AATATA---ATTATCAGGCATGCAGCAA--CAATGAGT--TTG-----CATTGTCTCTTT-T----AACTATTACA-TGC-AAA-GTTGGTTATTTTT-----AGATACAGCTCAGG-TAGAT-CTT--TAAATAGGGTACTGTGCTC-CCTCCC-CCCTTCTTTATATAAAAAAAAAAA-AGCA--TTGCG-TC--GCA----AAT---TGTA-GTGGA------------AA--TATAAAATT-TAACC-TTTGAATTGAA----AGA--T--CAACGCTTGC--CGCTT---------TCCCCC-A---AC--------ATTA-AGAATTAAAA--G-CTTTGTTTCGTTTTTATTAATTTA---CTTAATTGTCAAG-ATTTTTT-TATGCAG-TATTGTGA---AATCAATCCCCCC
gi|6 : t-----TAAG--ATTGGATGGGTTTATT-GACGAATT-TATTAACTTT---T-ATT---AT-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CTG-A-----GGT-AGATAGA--TC-A-T--------TCA---TCCGCGT---TATA-CA-CATC--AT-GTA--AACAATT-CA-TTC-----CG--CG-GAC--GACACAA-TCCTATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TAGAAAA--A-CA--TC-AA-T-ATC-T---AA---ATAA------C---GAA-G--CAATTCTATGTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATATG---C-T---------TGGTGAATA--AC-TTTATCATTCTAG-GTTAAA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTCAT----------C--GATTC--TTTTTTTTTTT--TATG-AA---CA----T--TTT-T---TCC-C------------GACAA-AT-TTTAA----AAA-----T---GAGTC--ATTTTTCTTGA-A-G--TAAACCGCA------AA-ATTA---TTA---TGTTTAAAT----TGAAGG-AA--G-------C--TAAT---AACTGT-TAACA-GTACAGAA--AGC-C-TG--GTTAA-----AAC---TAC-A---CA-AGA-TC--A---TTAAT-CA--ACCTTTT-CG-A----AAACTTTCCTA----TTTA--AAA-TG-A-TAC-GTATAA--AAA-TA-TATG-CATACC-ACCAGGGCGCAACCG-CGAGGG-TGTTCACCGCGTACG-AC-AGATC-ACTC-CGAT-----GTCGA-TA-AATCGC-TATA-ACAAGTGTG
gi|7 : TTGA-CCAAA---AAA--GA-----TGAATTCT--GAT-A-TTT-TT--ATCAAGT-T-----TTTC---T-ATT---AT-T--C-TAGCAAGAA--A-TAT-TCA-ACTCCCGAT-TGACAGA--TC-A-TAGACTTTATCAAACTCCGGGT---TCGA-TA-AATC--AT----------ATT--A-T-C-----CG--CGTGTC--GACA-GA-TC-TATT-TTAC--TAC--C-TAGTCA-TGAAAAA----CA--TC-A--T-ATC-T---AA---A-AA------C---GAA-G--CAATTCG--TTT-A---ATG-GAGTTATT--TATA-G---C-G---------TTGT--ATA---C-ATTATCAT-CTAG-TT--AA-AAA----T-----T--GTC----TTTTC-T--------------AT-C--GTTCTTTTTTT--TAT---A---CA---TT--TTT-------C-C------------GATAA-AT-TCTAA----AG------T---GGGT---ATTTTC--TGA-A-G--TAACTTGCC------AA-AT-A---TCA---TGATTAA-T----TGAG-G-AG--G-------C--TAAT---AACTGTCTAACAT-TACA--A--AGCAC-TG--GTTAA-----AACT--TAC-----CA-AGA-TC--A---TTTAT-CA--ACATTTT-CGAA----A---TTTGCTA----TTAA--GAT-TG-A-TAC-GTAT-A--AAA-TA-TATG---TTCC-ACCGAC----------------------------TACG-AC-AGATC-ACTCGCG-------GTCGA-TACGATCGCTTATA-CCTAGTa
gi|8 : TATATG---C-TCTCTTTAAATGATGAATA--GC-TTTATCATTCTAG-GT--AAGAGAAA-TTCAATTT--ATCATCTTTTTC-TTCGTGCATAAC--GATTC--TTTGTGCGTTTAGTATGAGATT-CA---TTGCTTTAT---TCT-CTCACGCAGAAGCAACAATAT-TCTAA----AAAAAGCTTCAAAAGTCTTATTTTTTTTGA-A-G--TAAAATACAGCATAAAA-ATTAA--TCACTTTGCTTTAGTACGATGAA-G-AG--GTGGTACCC--CAATTAAAACTGT-TAACATGTACAAAAAGAGA-C-TC--AATAATTCATGACAGATAC-G---CACAGA-CCCTACATTTAATCCAATACATTTT-CGAATTTTACATTTGCCTAAATTTTTA--AAAGTG-ATTACGGTAT
gi|9 : AA-CGG-----TAAA--AT--GATGA-TATATT-GACTAAAT-TAA-AACTTT---T-ATT---AC-T-AC-TAG-----A--A-TCT-CCG-A-----AAA-AGATAGA--TC-A-T--------TC----TCCATGC---TTTA-CA-CATC--GT-GTA--AACAATT-------------G--CG-GAA--GACA-GA-TCATATT-TTATCTTAC--C-TAGTCA-TGAAAAA--AACA--TC-AA-T-ATC-T---AA---AAAAACAAATCTAAAAA-G--CAATTTTATCTT-AC--ATG-GAGCTATTGTTATTTG---C-T---------TGATAAATA--GC-TTTAGCATTCTAT-GT--AA-AGAAA-TT-----T--GTC----TTTTCTT----------C--GATTC--TT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): AAGGTTTTTCCCGACAGAATCTAACAAGAGGCCCAAGGGCCACATCGC