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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGAGTCACGTGGGTATAGGGTATACATGTATCTCGTGAATCACGTGTGTATATGGTATACATGTATCCCGTGGGTCACGTGCGTATAGGGTATATCTCGTGCGTCACGTGTGTA
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Reference ( family-4063 ) : GGTGGGA--CGA--TAT--ACC-GATACCCCG-ATACAGAT-CGATATTTTC-TCTCA---AG---A-T----A--CGCTTTT---C-GA-TA-C-AGG-C--AC-T--GT-AA-TA-CCGG--TAC-G----A-CAC-GAT-A-C------A-CGAACGAC-C-TAT--------------------A------A-------AAG------TA--A-A-C-GT----------------------T-G-----------------TCTG--G-TTCC---AGGGG--A-C----CAGT-C-TAT--A-TG--TT-TGGCGGA---A---CAACAAAG--A---CA-GTG-T-T-G-A-CTC--TCTG-ATTTT---TATTAAGAAG-A--ATCTGAA-A--TAAT-CTGTTTT----G-C-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGATTTGTTTTTAATTT---A-CA-GATTTT--T-TG----TT---G-TTGA----TTAT-----A--TGATT--TATTGTCA----AA--TAGA----C--A----AA-T--AA-----------------AAAC-CTTT-A-TTC-TTAC-AAC-TC-T-ATGATCTAA------GTATATA--------------------GTATCG----------------NA-A---------CGT---------G---------TGTA-TC-G----AGATAC--G-TATC---------------------G--TA-------T-CGTA----AG-CT-T-TGTGTA-TCGTCCCACCCCTA
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|30 : gtgagacgatatactgataccccaatacagatcgatattttctctcaagatacactttttgatacaggcactgtaataccggttcgacacgatacacaaacgacctatcaaaaaaaatacctaaataaataaaataaataaaaagcgG-ATACAGAT-CG-TATTTTC-TCTCA----G---A-T----A--CGCTTTT---CCGA-TAGC-AGG-C--AC-T--GT-AA-TA-
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gi|33 : GGTGGGAGACGA--TAT--ACC-GA---------TACAGAT-CGATATTTTC-Ta
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gi|15 : caatacagatcgatattctctctcaaaatacgcttttcgatacaggcaatgtaataccgttacgacacgatacacgagcgacctatcaaaaaacaaaataaaaagcgaaagtaaacgttgtctggttccaggcaatcagtctatat-GATACCATG-TTACAGAT-C-ATATTTGC-TCTCA---AAGGAA-T----A--C-CTTTT---C-GA----C-AGG-C--AC-T---T-AA-TATCCGG--TAC-A----AACATTGATTA-C------A-CGAAC-AT-C-TAA--------------------T------A-------AAG------TA--T-A---GT----------------------T-G-----------------TCTG--G-TTCC---A--TG--A-C----C-GT-C-TAT--A-TG---T-TGCCGGA---A----AACAAA
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gi|30 : gtgagacgatatactgataccccaatacagatcgatattttctctcaagatacactttttgatacaggcactgtaataccggttcgacacgatacacaaacgacctatcaaaaaaaatacctaaataaataaaataaataaaaagcgG-ATACAGAT-CG-TATTTTC-TCTCA----G---A-T----A--CGCTTTT---CCGA-TAGC-AGG-C--AC-T--GT-AA-TA-
gi|31 : ----G-------T--GTA-TC-G------------------AGATACG-G-TATC---------------------G--GAG------T-CGTA----AGCCT-T-TGTGTATTCGTCCC
gi|32 : GTGGGA--CGA--TAT--ACC-AATACCCCG-ATACAGAT-CAATATTTTC-Tcaacc
gi|33 : GGTGGGAGACGA--TAT--ACC-GA---------TACAGAT-CGATATTTTC-Ta
gi|4 : AT-C-ATATTTTC-TC--A---AG---A-T----A--CGATGTT---T-GA-TAAC-AGG-T--ACAT--GTGAA-TA-CCGG--TAC-G----A-CAC-GATGA-C------A-CGAACGAC-CGTAT--------------------A------A-------A-G------TA--A-A-C-GT----------------------T-G-----------------GTTG------CC---AGGGA---------CAGT-C-TAT--A-TG--TT--GGCAGA---A---CAACAAAA--A---CA-GTT-T-G-G-A-CTC--CCTG-A-TTT---TATTAAGAAGAA--ATCTGAG-AATTAAT-CTGTTTT----GCC-ATC--TTGC-AA-TCCA-TGATTTGTTTTTAA-TT---A-CA-GA-TTT--T-TG----T------TTGA----T--T-----A--TGATT--TATTGGCA----AA--TAGA----C--A----AATT--AA-----------------AAAC-CTTT-AGTTC-TTA--AA--TC-T-ATGAGCTAAGTACGCGTATA------TA--------------------GTATC-GAGATACATGTATTTCATAAC-----GT----G-------T--GTATTC-G------------------AGATACATG-TATCACGAACGTGT-----------G--TATCGAGATT-CGTATCGTAA-CT-T-TGTGTA-TCGT-CCACCCCTA
gi|5 : GAT-CGATATTTTC-TCTCA---AG---A-T----A--CGGATTT---T-GA-TA-C-AGG-T--AC-T--GT-AA-TA-CCGG--TAC-G----A-CAC-GAT-A-C------A-CGAACGAC-C-TAT---------------------------A-------AAG------TA--A-A-C-GT----------------------T-G------------------GTG--G---CC---A-GGG--A-C----CAGT-C-TAT--A-TG--TT-TGGCAGA---A---CAACAAA---A---CA-GTG-T-T-G-A-CTC--TCTG-A-TTT---TATTAAGAAG-A--ATCTGAA-T--TAAT-CTG-TTT----G-C-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGATTTGTTTTTAAATT---A-CA-GA-TTT--T-TG----TT---G-TTGA----TT-T-----A--TGATT--TATTGGCA----AA--TAGA----C--A----AA-T--AA-----------------AAAC-CTTT-A-TTCTTTAC-AAC-TT-T-ATGAGCTAAGTACGCGTATA------TA--------------------GTATC-GAGATACATGTATTCATA-AC-----GT----G-------T--GTA-TC-G------------------AGATACATG-TATCACGACGTGTGTATCGAGATTCG--TA-------T-CG-A----AG-C--T-TGTG-A-TCGTCCCACCCCTAa
gi|6 : GGTGGGA--CAA--TAT--ACC-GATACTCCG-ATACAGAT-CGATATTTTC-TCTCA---AG---A-T----A--TGCTTTT---C-GA-TA-C-AGG-C--AC-T--GTCAA-TA-CCGG--TAC-A----A-CAC-GAT-A-C------A-CGAATGAC-C-TAT--------------------A------A-------AAG------TA--A-A-C-GT----------------------T-G-----------------TCTG--G-TTCC---AGGGT--A-C----CAGT-C-TAT--A-TG--TT-TGGTGGA---A---CAACAAAG--A---CA-GTG-T-T-G-A-CTC--TCTG-ATTTT---TATTAAGAAG-A--ATCTGAA-A--TAAT-CTGTTTT----G-C-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGATTTGTTTTTAATTT---A-CA-GATTTT--T-TG----TT---G-CTGA----TTAC-----A--TGATT--TATTGTCA----AA--TAGA----C--A----AA-T--AA-----------------AAAC-CTTT-A-TTC-TTAC-AAC-TC-T-ATGATCTAA------GTGTA------CA--------------------GTATC-GTA----------------AC-----AT----G-------T--GTA-TC-G------------------AGATAC--G-TATC---------------------A--TA-------T-C-TA----AG-CT-T-TGTGTA-TCGTCCCACCCCTA
gi|7 : C-TCTCA---AG---AAT----AA-CGCTTTTT--C-GA-TG-C-AGG-CCAGC-T--GT-AA-TA-CCGG--TAC-G----A-CAC-GAT-ATC------ACCAAACGAC-C-TAT--------------------A------AAAAAAATAAG------TG--A-A-A-GTAAA-------------------C-G-----------------TCTG--G-TTCC---AGGGG--A-C----CAGTCC-TAT--A-TG--TT-TGGCGG----A---CAACAACG--A---CA-CTG-TGC-G-ACCTCATTCTG-CATTT---TAATA--AAG-A--ATCTGAACA--TAAT-CTGTTTT----GCC-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGATTAGTTTTTTATTT---ATCACGATTTT--T-T-----TT---G-TTGA----TTAC-----AACTGTAT--TATTGTGA----AA---AGA----C--A----AA-TTAAA-----------------AAAC-CTTT-A-TTC-TTACAAAC-TCTT-ATGATCTAA------GT
gi|8 : cGGA--CGA--TATCTACC----ACCCCG--TACAGAT-CGATATTTTT-T-TCG----G---A-TCATTA--CGCTTTT---C-GA-TA-C-AGG-C--CC-TTAGT-AA-T--TCAG--TACCA----A-CAC--ATGA-C------A-CGAACGACAC-TAT--------------------A------T-------AAG----------A-G-CTGT----------------------TTG-----------------TCTGAGG-TTCC---GAGGG--A-C----CAGT-C-TATGTA-TG--TT-TGGCGGG---AAT-CAACA--G--A---CAAGTG-T-T-G-A-CTC--C--G-ATTTT---TATTAAGA-G-A--ATCTGAA-G--TAATACTGTTT-----G-C-ATC--TT-C-AA-T-TA-TGATTT-TATTTA-TTT-----CA-GATTTT--T--G----T----G-CTGA----ATAT-----A--TGATT--TATTGTC------A--TAGA----C--A----AA-T--AC-----------------AATC-CTTT-A-CT
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blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . CAAA . . . . C TTGT . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGTT . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACGCATTAGTATTTGAGATAAGGTATC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . CCA . . . . C TGT . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTT . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCGCATGAGTGTATTGAGGTACGTATC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . C TGT . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATACATGTATCGTATTGCATGTATATC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . C TGT . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGTT . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATACATGTATCATAACNNNNNNN . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . C TGT . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGTT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACATGTGTATCGAGATACGTATC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . C TGT . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATACATGTATCGTTAACGCGTT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . C TGG . . . G . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACGTGTGTATCGAGATTC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . C . . . . C TGT . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . CGAGATACGTATC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . C TGT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . ATAC . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . C TG . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . A TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
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finalCons : GGTGGGA--CGA--TAT--ACC-GATACCCCG-ATACAGAT-CGATATTTTC-TCTCA---AG---A-T----A--CGCTTTT---C-GA-TA-C-AGG-C--AC-T--GT-AA-TA-CCGG--TAC-G----A-CAC-GAT-A-C------A-CGAACGAC-C-TATA--------------------------A-------AAG------TA--A-A-C-GTTGT----------------------------------------CTG--G-TTCC---AGGGG--A-C----CAGT-C-TAT--A-TG--TT-TGGCGGA---A---CAACAAAG--A---CA-GTG-T-T-G-A-CTC--TCTG-ATTTT---TATTAAGAAG-A--ATCTGAA-A--TAAT-CTGTTTT----G-C-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGATTTGTTTTTAATTT---A-CA-GATTTT--TTGTT--------G-TTGA----TTAT-----A--TGATT--TATTGTCA----AA--TAGA----C--A----AA-T--AA-----------------AAAC-CTTT-A-TTC-TTAC-AAC-TC-T-ATGATCTAA------GTATA------TA--------------------GTATC-GAG----------------AC-----GC----G-------T--GTA-TC-G------------------AGATAC--G-TATC---------------------G--TA-------T-CGTA----AG-CT-T-TGTGTA-TCGTCCCACCCCTA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4063 ) : GGTGGGA--CGA--TAT--ACC-GATACCCCG-ATACAGAT-CGATATTTTC-TCTCA---AG---A-T----A--CGCTTTT---C-GA-TA-C-AGG-C--AC-T--GT-AA-TA-CCGG--TAC-G----A-CAC-GAT-A-C------A-CGAACGAC-C-TAT--------------------A------A-------AAG------TA--A-A-C-GT----------------------T-G-----------------TCTG--G-TTCC---AGGGG--A-C----CAGT-C-TAT--A-TG--TT-TGGCGGA---A---CAACAAAG--A---CA-GTG-T-T-G-A-CTC--TCTG-ATTTT---TATTAAGAAG-A--ATCTGAA-A--TAAT-CTGTTTT----G-C-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGATTTGTTTTTAATTT---A-CA-GATTTT--T-TG----TT---G-TTGA----TTAT-----A--TGATT--TATTGTCA----AA--TAGA----C--A----AA-T--AA-----------------AAAC-CTTT-A-TTC-TTAC-AAC-TC-T-ATGATCTAA------GTATA------TA--------------------GTATC-GAG----------------AC-----GC----G-------T--GTA-TC-G------------------AGATAC--G-TATC---------------------G--TA-------T-CGTA----AG-CT-T-TGTGTA-TCGTCCCACCCCTA
gi|1 : GTGGGA--CGA--TAT--ACC-GATACCCCG-ATACAGAT-CGATATTTTC-TCTCA---AG---A-T----A--CGCTTTT---C-GA-TA-C-AGG-C--AC-T--GT-AA-TA-CCGG--TAC-A----A-CAC-GAT-A-C------A-CGAGTGAC-C-TAT--------------------AAAAAATA-------AAG------TG--A-A-A-GTAAA-------------------C-G-----------------TCTG--GTTTCC---AGGGG--A-C----CAGT-C-TAT--A-TGTCTT-TGGCGAA---A----AACAAAG--A---CA-GTG-T-T-G-A-CTC--TCT--ATTTT---TA-CAAGAAT-A--ATCTGAA-A--TAAT-CTGTTTT----G-C-ATT--TAGCAAA-T-CA-TGATTGGTTTTTAATTT---A-CA-GATTTT--T-T-----TT---GTTTGA----TTAT-----A--T-ATT--TTGTGTCA----AAATTAAAAAAGCAAA----AA-T--AAAAAATAGACAAAATAAAAAAT-TTTT-A-TTC-TTAC-AACTTC-T-ATGATCTAA------GTATA------TA--------------------ATATCAGAT----------------ACATCGTGC----GGTGATCCT--GTA-TC-G------------------AGATAC--G--ATC---------------------G--TA-------T-CGTA----AG-CT-TCTGTG-A-T-GTCCCACCCC
gi|10 : GG--TAC-A----A-CAT-GAT-A-C------A-CGAACGAT-C-TAT--------------------A------A-------AAG------TA--A-A-C-GT----------------------T-G-----------------TCTG--G-TTCC---AGTGG--A-C----CAGT-C-TAT--A-TG--TT-TGGCGGA---A---CAACAAAG--T---CA-----T-T-G-A-TTT--T-----TATT---AATTAAGAAG-A--ATCTGAA-A--TAAT-CTGTTTT----G-C-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGATTTGTTTTTAATTT---A-CA-GATTTT----TG----TT---G-TTGA----TTAT-----A--TGATT--TATTGTCA----AA--TAGA----C--A----AA-T--AA-----------------ATAC-CTTT-A-TTC-TTAC-AAC-TC-T-ATGATCTAA------GTATA------TA--------------------GTATC-GAG----------------A------------------------TA------------------------------------C---------------------G--TA-------T-CGTA----AG-CA-T-TGTGTA-TCGTCCC
gi|11 : C-GATATACCG-ATACAAAT-GGATATTTTC-TCTCA---AG---A-T----A--CGCTTTT---C-GA-TA-C-AGG-C--AC-T--GT-AA-TA-CCGG--TAC-C----A-CAC-GAT-A-C------A-CAAACGAC-C-TAT--------------------A------A-------AAG------TA--A-A-C-GT----------------------T-G-----------------TCTG--G-TTCC---ATAGG--A-C----CAGT-C-TAT--A-TG--TT-TGGCAGA---A---CAACAAAG--A---CA-GTG-T-T-G-A-CTC--TCTG-ATTTT---TATTAAGAAG-A--ATCTGAA-A--TAAT-CTGTTTT----G-C-AAC--TTGC-AA-T-CA-TGATTTGTTTTTATTTT---A-CA-GATTTT--T-TT----TTCG-G-TTGA----TTAT-----A--TGATT--TATTGT
gi|12 : aGTGGGA--CGAGTTAT--ACT-GATACCCCGTAAACGAATCCAATATTTTCGTCTCAAGGAG---A-T----GATCGCTTTTTCCC-GAGTG-TGAGG-C--CT-T--GT-AACTA-CCGGGTTAC-GTATCA-C-C-GAT-A-CTAGCAAA-CGAAC-ACAT-TATCC------------------A------A-------AAC------AAACA-A-C-GT----------------------T-AAAGGGGCAGGTAAGTGTTCTG--G-TTCCAAAAGGGGCCACC----CAGT-CTTAT--A-TGA-TTATGGCAGACGGATATCAACAAAG--ACCCCG-ATGCT-T-GAA-CTC--TCTGCGTTTT---TAATAAGA
gi|13 : GGA--CGA--TAT--ACC-GATACCCCG-ATACAATT-CGATATTTTC-TCTAA---AG---A-T----A--CGTTTTT---C-AA-TA-C-AGA-C--AC-T--GT-AA-TA-CTGG--TAC-G----A-CAC-GAT-A-C------T-CAAACGAC-C-TATCAA-----------------A------A-------AAA------TA--A-ATC-ATAAATTAAAAAAGCGAATGTAAAC-G-----------------TCTG--G-TTCC---AGGGG--A-CCAAGCAGT-C-TAT--A-TG--TT-TGGCGGA---A---TTAT---GTCA---CA-GTG-T-T-G-A---C--TCTG-ATTTT---CATTAAGAAG-A--ATCTG-A-A--TAAT-ATGTTTT----G-C-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGAT
gi|14 : CA-ATACAGAT-CGATATTCTC-TCTCA---AA---A-T----A--CGCTTTT---C-GA-TA-C-AGG-C--AA-T--GT-AA-TA-CCGT--TAC-G----A-CAC-GAT-A-C------A-CGAGCGAC-C-TATCAAAAAACAAAATAAAAAGCG------A-------AAG------TA--A-A-C-GT----------------------T-G-----------------TCTG--G-TTCC---AGGCA--A-T----CAGT-C-TAT--A-T
gi|14 : TG-ATTTT---TATTAAGAA------TCTGAA-A--TAAT-ATGTTTTT---G-C-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGATTTGTTTTTAAtgatttttattaagaatctgaaataatatgtttttgcatcttgcaatcatgatttgtttttaa
gi|15 : caatacagatcgatattctctctcaaaatacgcttttcgatacaggcaatgtaataccgttacgacacgatacacgagcgacctatcaaaaaacaaaataaaaagcgaaagtaaacgttgtctggttccaggcaatcagtctatat-GATACCATG-TTACAGAT-C-ATATTTGC-TCTCA---AAGGAA-T----A--C-CTTTT---C-GA----C-AGG-C--AC-T---T-AA-TATCCGG--TAC-A----AACATTGATTA-C------A-CGAAC-AT-C-TAA--------------------T------A-------AAG------TA--T-A---GT----------------------T-G-----------------TCTG--G-TTCC---A--TG--A-C----C-GT-C-TAT--A-TG---T-TGCCGGA---A----AACAAA
gi|16 : tggaatGGA--CGA--TAT--ACCAGATACCCCG--TA-ACAT--GATATTTTC-TCTCA----G---A-T----A--CGCATTT---C-GA-TA-T-AGGGC--AC----GT-AAATA-ACGG--T-C-A----A-TAC-AAT-A-C------A-CGAACG-C-C---T--------------------A------A-------AAG------TA--AGA-C-GT----------------------T-G------------------CTG--T-TTTC---A--GG--A-C----CATT-C--AT--A-TG--TT-TGGCGG----A---CAACAAAG--A---CA-GTG-T-T---A-CTC--TCTG-ATTTtccatgcaattaattcatgtgttatgaaaaattgaa
gi|17 : tT-CCGTTTTTACTG-CCATCATTTGC-AAGT-CAATGATTGGTTTT-AATTTTACA-CA-GATTTT--TGTG----TTTTCC-TTGAAATTTTATCTCTCA--TGATTTATATTGATAGAATAA--TGGA----C--ATAGGAA-T--AA-----------------AAACTCTTTAA-TTC-TTA
gi|18 : atcCAAAG--A---CA-GTG-T-T-G-A-CTC--TCTG-ATTTT---TATTAAGAAG-ATGATCTGAT-A--TAAT-CTGTTTT----G-C-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGATTTG--TTTAATTT---A-CA-G-------T-TGGGTTTT---G-ATAA----TTTT-----A--TGATT--TATTGTCA----AA--a
gi|2 : gGGTA--CGA--TAT--ACC-GATGACCCG-ATACAGAT-CGATATTTTC-TCTCA---AG---A-T----G--CGGATTT---C-GA-TA-C-AGG-C--AC-T--GT-AA-TA-CCGG--TAT-G------CAC-TAT-A-C------A-CGAACGAC-C-TATCAAAAAAAAAAAAAGGC---G------A-------AAG------TA--A-A-C-AT-------------------------------------------CTC--G-TTCC---AGGGG--A-A-----AGT---TAT--AATG--TT-TGGCG---------TAACAAAG--A---CA-GTG-T-T-G-A-CTC--TCTA-ATCTTAATTATTAAGAAG-A--ATCTGAT-A--TAAT-CTGTTTT----C-C-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGATTCAATTTTAATTT---A-CA-GACTTTATT-TT----TT---G-TTGA----TTTT-----A--TGATT--TATTATCA----AA--TAGA----C--A----AA-T--AA-----------------AACC-CTTT-A-TTC-TTAC-AAC-TC-T-ATGATCTAA------GTATATACATGTA--------------------GTATC-GAG----------------AT-----AC----A-------T--GTA-TC-GTATCGCATGAGTGTATCAAGATAC--G-TATC---------------------G--TA-------T-CGTA----AG-CTCT-TGTGTA-----CCCACCCCTA
gi|20 : GTGGGA--CGA--TAA--ACC-GATACATC--ATACAGAT-CGATATTTTC-TCTCA---AG---A-T----A--CGCTTTT---T-GA-TA-C-AGG-C--AC-T--GT-AA-TA-CCAG--TAC-A----A-CAC-GAT-A-C------A-CGAATGAC-C-TAT--------------------A------A-------AA
gi|21 : TCTAA------GTATA------TA--------------------GTAT--------------------------------------------------C-G------------------AGATAC--G-TATC---------------------G--TA-------T-GGTA----AG-CT-T-TGTGTA-TCGTCCCACCCCTAaa
gi|22 : cttcacctctgtgtaatgtatttatagacaatggtatctgtttccttattTATA------TA--------------------GTATC-GAG----------------AT-----AC----A-------T--GTA-TC-A------------------TAACNN--N-NNNN---------------------N--NN-------N-NNNN----NN-NN-N-NATGTA-TC
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gi|23 : tatatagtatcgagatacatgtatcataacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatCTGAA-A--TA-T-CTGTTTT----G-C------TCGC-A--T-CA-TGATTT-TTTTTA-TTT---A-CA-GATTTC--T------------G-TTGA----CTAT-----A--CGATT--TATT-TC-----AA--TAGA----C--A----AA-T---A-----------------AAAC-CTTT-A-T---CTACAAAC-TC-T-ATG
gi|24 : ----------------AC-----GC----A-------TTAGTA-TTTG------------------AGATAA--GGTATC---------------------G--TA-------TTCGTA----AG-CT-T-TGTGTA-TCGTCCCACCCCta
gi|25 : tctcaaaaaggcactaaaattggcgacttttacatttTGGGA--CGA--TAT--ACC-GATACCTCG-ATACAGAT-CGATATTTTC-TCTCA---AG---A-T----G--CGCTTTT---C-GA-TA-C-AGG-C--AC-T--GT-AA-TA-CCGG--TAC-G----A-CAC-GA
gi|26 : TGGGA--CAA--TAT--ACC-GATACCCCG-ATACAGAT-CGATATTTTC-TCTCA---AG---A-T----A--CGCATTT---T-GA-TA-C-AGG-T--AC-T--GT-AA-TA-CCGG--TAC-G----A-CAC-
gi|27 : -A-C------A-CGAACGAC-C-TATCAATAAATAATTAA------A------A-------AAGCGAAGGTA--A-A-C-GT----------------------T-G-----------------TCTG--G-TTCC---AGGGG--A-C----CAGT-C-T
gi|28 : GGTGGGA--AAA--TAT--ACC-GATAC-----------A---GATATTTTC-TCTCA---AA---A-T----A--------------GG-TA-C--GG-C--AC-T---------------------------------AT-A-C------A-CGAACGAC-C-T
gi|29 : -AAC-TC-TCATGAT-TAA------GTAT-------TA--------------------GTATC-GAG----------------AT-----AC----A-------T--GTA-TC-G------------------TTA-AC--G-CGTT---------------------GTATA-------T-CGTA----
gi|3 : GTGAGA--CGA--TAT--ACT-GATACCCCA-ATACAGAT-CGATATTTTC-TCTCA---AG---A-T----A--CACTTTT---T-GA-TA-C-AGG-C--AC-T--GT-AA-TA-CCGG--TTC-G----A-CAC-GAT-A-C------A-CAAACGAC-C-TAT--------------------C------A-------AAA------AA--A-A-t
gi|3 : ------A-------AAG------TA--A-A-C-GT-------------------------------------------CTG--G-TTCC---AGGGG--A-C----CAGT-C-TTT--A-TG--CT-TAGCAGA---A---CAA---AG--A---CA-GTG-T-T-G-A-CTC--TCTG-ATTTT---TATTAAAAAG-A--ATATGAA-A--TAAT-CTGTTTT----G-C-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGATTTGTTTTTAATTT---A-CA-G-TTAT--T-TT----TT---G-TTGA----TTTT-----A--TGATT--TATTGTCA----AA--TAGA----C--A----AA-T--AA-----------------AAAC-CTTT-A-TTC-TT-----C-TC-T-ATGATCTAA------GTATA------TAGTATCGAGATACTGGTATATGTATC-ATA----------------TC-----GCATGAG-------T--GTA-TT-G------------------AGGTAC--G-TATC---------------------A--TA-------tacctaaataaataaaataaataaaaagcgaaagtaaacgtctggttccaggggaccagtctttatgcttagcagaacaaagacagtgttgactctctgatttttattaaaaagaatatgaaataatctgttttgcatcttgcaatcatgatttgtttttaatttacagttattttttgttgattttatgatttattgtcaaatagacaaataaaaacctttattcttctctatgatctaagtatatagtatcgagatactggtatatgtatcatatcgcatgagtgtattgaggtacgtatcata
gi|30 : gtgagacgatatactgataccccaatacagatcgatattttctctcaagatacactttttgatacaggcactgtaataccggttcgacacgatacacaaacgacctatcaaaaaaaatacctaaataaataaaataaataaaaagcgG-ATACAGAT-CG-TATTTTC-TCTCA----G---A-T----A--CGCTTTT---CCGA-TAGC-AGG-C--AC-T--GT-AA-TA-
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gi|32 : GTGGGA--CGA--TAT--ACC-AATACCCCG-ATACAGAT-CAATATTTTC-Tcaacc
gi|33 : GGTGGGAGACGA--TAT--ACC-GA---------TACAGAT-CGATATTTTC-Ta
gi|4 : AT-C-ATATTTTC-TC--A---AG---A-T----A--CGATGTT---T-GA-TAAC-AGG-T--ACAT--GTGAA-TA-CCGG--TAC-G----A-CAC-GATGA-C------A-CGAACGAC-CGTAT--------------------A------A-------A-G------TA--A-A-C-GT----------------------T-G-----------------GTTG------CC---AGGGA---------CAGT-C-TAT--A-TG--TT--GGCAGA---A---CAACAAAA--A---CA-GTT-T-G-G-A-CTC--CCTG-A-TTT---TATTAAGAAGAA--ATCTGAG-AATTAAT-CTGTTTT----GCC-ATC--TTGC-AA-TCCA-TGATTTGTTTTTAA-TT---A-CA-GA-TTT--T-TG----T------TTGA----T--T-----A--TGATT--TATTGGCA----AA--TAGA----C--A----AATT--AA-----------------AAAC-CTTT-AGTTC-TTA--AA--TC-T-ATGAGCTAAGTACGCGTATA------TA--------------------GTATC-GAGATACATGTATTTCATAAC-----GT----G-------T--GTATTC-G------------------AGATACATG-TATCACGAACGTGT-----------G--TATCGAGATT-CGTATCGTAA-CT-T-TGTGTA-TCGT-CCACCCCTA
gi|5 : GAT-CGATATTTTC-TCTCA---AG---A-T----A--CGGATTT---T-GA-TA-C-AGG-T--AC-T--GT-AA-TA-CCGG--TAC-G----A-CAC-GAT-A-C------A-CGAACGAC-C-TAT---------------------------A-------AAG------TA--A-A-C-GT----------------------T-G------------------GTG--G---CC---A-GGG--A-C----CAGT-C-TAT--A-TG--TT-TGGCAGA---A---CAACAAA---A---CA-GTG-T-T-G-A-CTC--TCTG-A-TTT---TATTAAGAAG-A--ATCTGAA-T--TAAT-CTG-TTT----G-C-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGATTTGTTTTTAAATT---A-CA-GA-TTT--T-TG----TT---G-TTGA----TT-T-----A--TGATT--TATTGGCA----AA--TAGA----C--A----AA-T--AA-----------------AAAC-CTTT-A-TTCTTTAC-AAC-TT-T-ATGAGCTAAGTACGCGTATA------TA--------------------GTATC-GAGATACATGTATTCATA-AC-----GT----G-------T--GTA-TC-G------------------AGATACATG-TATCACGACGTGTGTATCGAGATTCG--TA-------T-CG-A----AG-C--T-TGTG-A-TCGTCCCACCCCTAa
gi|6 : GGTGGGA--CAA--TAT--ACC-GATACTCCG-ATACAGAT-CGATATTTTC-TCTCA---AG---A-T----A--TGCTTTT---C-GA-TA-C-AGG-C--AC-T--GTCAA-TA-CCGG--TAC-A----A-CAC-GAT-A-C------A-CGAATGAC-C-TAT--------------------A------A-------AAG------TA--A-A-C-GT----------------------T-G-----------------TCTG--G-TTCC---AGGGT--A-C----CAGT-C-TAT--A-TG--TT-TGGTGGA---A---CAACAAAG--A---CA-GTG-T-T-G-A-CTC--TCTG-ATTTT---TATTAAGAAG-A--ATCTGAA-A--TAAT-CTGTTTT----G-C-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGATTTGTTTTTAATTT---A-CA-GATTTT--T-TG----TT---G-CTGA----TTAC-----A--TGATT--TATTGTCA----AA--TAGA----C--A----AA-T--AA-----------------AAAC-CTTT-A-TTC-TTAC-AAC-TC-T-ATGATCTAA------GTGTA------CA--------------------GTATC-GTA----------------AC-----AT----G-------T--GTA-TC-G------------------AGATAC--G-TATC---------------------A--TA-------T-C-TA----AG-CT-T-TGTGTA-TCGTCCCACCCCTA
gi|7 : C-TCTCA---AG---AAT----AA-CGCTTTTT--C-GA-TG-C-AGG-CCAGC-T--GT-AA-TA-CCGG--TAC-G----A-CAC-GAT-ATC------ACCAAACGAC-C-TAT--------------------A------AAAAAAATAAG------TG--A-A-A-GTAAA-------------------C-G-----------------TCTG--G-TTCC---AGGGG--A-C----CAGTCC-TAT--A-TG--TT-TGGCGG----A---CAACAACG--A---CA-CTG-TGC-G-ACCTCATTCTG-CATTT---TAATA--AAG-A--ATCTGAACA--TAAT-CTGTTTT----GCC-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGATTAGTTTTTTATTT---ATCACGATTTT--T-T-----TT---G-TTGA----TTAC-----AACTGTAT--TATTGTGA----AA---AGA----C--A----AA-TTAAA-----------------AAAC-CTTT-A-TTC-TTACAAAC-TCTT-ATGATCTAA------GT
gi|8 : cGGA--CGA--TATCTACC----ACCCCG--TACAGAT-CGATATTTTT-T-TCG----G---A-TCATTA--CGCTTTT---C-GA-TA-C-AGG-C--CC-TTAGT-AA-T--TCAG--TACCA----A-CAC--ATGA-C------A-CGAACGACAC-TAT--------------------A------T-------AAG----------A-G-CTGT----------------------TTG-----------------TCTGAGG-TTCC---GAGGG--A-C----CAGT-C-TATGTA-TG--TT-TGGCGGG---AAT-CAACA--G--A---CAAGTG-T-T-G-A-CTC--C--G-ATTTT---TATTAAGA-G-A--ATCTGAA-G--TAATACTGTTT-----G-C-ATC--TT-C-AA-T-TA-TGATTT-TATTTA-TTT-----CA-GATTTT--T--G----T----G-CTGA----ATAT-----A--TGATT--TATTGTC------A--TAGA----C--A----AA-T--AC-----------------AATC-CTTT-A-CT
gi|9 : ------A-------AAG------TA--A-A---------------------------T-G-----------------TCTG--A-TTTC---AGGG---A-C----CAGT-C-TAT--A-TG--TT-TGGCGAA---A---CAAAAAAG--A---CG-ATG-T-TTG-A-CTC--TCTG-ATTTT---TATTAAGAAG-A--ATCTGAA-A--TA-T-CTGTTTT----G-C-ATC--TTGC-AA-T-CA-TGATT-GTTTTTAATTT---A-CA-GATTTT--T-T------T---G-TTGA----TTAT-----A--TGATT--TATTGTCA----AA--TAGG----C--A----AA-T--AA-----------------AAAC-CTTT-G-TTC-TTAC-AAC-TC-T-ATGATCTAA------GTATA------TA--------------------GTATC-GAG----------------AT-----AC----A-------T--GTA-TC-GTATT--------------GCATGT--A-TATC---------------------G--TA-------T-CAGA----AG-CT-T-TGTGCA-TCGTCCCACCCCTAtc
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Unaligned ( gi|19 ): TGAGTCACGTGGGTATAGGGTATACATGTATCTCGTGAATCACGTGTGTATATGGTATACATGTATCCCGTGGGTCACGTGCGTATAGGGTATATCTCGTGCGTCACGTGTGTA