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gi|6 : ttaaccattgtgaGAC-TTTA-AAT-AA---A---A-A----A---TCAGGACAGAATA---AAT--TA-------AATT---A-C-GGGC--A-AACAGG--CAG-GGCCATACACTCA--AA-AGCTGTTCATCGCA-TTTTAATAT-TT
gi|12 : A-AAT-AA---A--------------ACAGAATA--------------A-----C-AATA---AAC-GGAC--A-A-CAGG--CAGAG--CATGCACTCACAAA-A----TTTATG-CG-TTTCCAAAT-GTC-GGTTACGAA--ATAT--A---A-ACT-GAAA------AC---G-AGT-TATAAA-GCGGT---TC-ATCTC--ATTTTAACCTAAT----TT----T-T-GTAC--AC---T-A-GG-------------------------------------------------A--TG-C-ATAATTG--TCGTTGC----TAT--------------------------------------------G---TTT-A-A-ATTGTT--T-TGTA-TGACATGTTCTTGCG-TGT-A-AA-T-TAAATTTAGAGAGT---AAACA-AAAAGT-TG-AG-TACGAAAATTGGT--------C--AAC-GTAA---TGTATGG-GAAGACC-GGTATT-ACCCGGAA-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GCAAGGTTTTA-CGCA--T-----------------G-AAAATA---T-----------------GAGCA---CT------------------------ttatgtacacgaggaagctgcatgggatctcgattgtgtattttaatgttcgtgattgtattgttgctttttattaatttgtttttcataatttttatttattggttgtattgactgttcttgcagtaagtcatggtagtatacgataattgaaaggcgacgggataattacggaattaggccggtggcgccgatacgcaacagcgcagatcttattctaaggagtcgcaagaatgcaattccatgtgtttactacataacataaggacaatacacgccaaaataaaaataaaatctatatatatgtgacgctattgcataattctgttgtattacatttgcgttatttatcttggcgcgcgaagagtgtt
gi|32 : ---T-A----G---ACAGAATA--------------------C-AATT---G-C-GGAC--A-GACAAG--CAG-G--CATAC--TCA--AA-A----TTTTTGGTG-TTTCTAGAT-TTC-GAT-ATGAA-TATAC--A---A-ACT-GAAA------Ataaaaaatgcagattactct
gi|5 : g-AACAGGGGCAG-G--C-TATATTCA--AATA----GCTATGGTG-TTTC-AAAT-TTC-GG--ACGAAATATATTTA---A-ACTTGAAATTAA--AA---CGAGT-TATAAA-GCTGT---TC-ATCTC--AATTTAA--TAAG----TTG---T-T-GTGC--AC---A-ACGGGAGCT------GACTCTCATTGAATGTAA-T----ATTTT--------AAA-TG-CCGTGATTG--TCGTTGC----TTTGATA--T----TATT--TT--------------GAG-ATAA---------T-A-A-AAGATT--A-TATAT-GACATGTTCTTGCGTTGT-A-AACT-CAAAATTAGAG-GT---AGA-ACAAAAGTATGTAG-TACAAAAATTGGTGAAATACGT--TACGGTAA---TGTATGG-AAAGA-CTAGTATT-TACCGG-A-AT----TGGC---------A-ATA--------GCAAG----TA----A--T-----------------GCAAGAT----T------------------ATTAT--CTATGG--------------------A----G---------T---CAA-------GA--GC-AA-AT-CGAT--TGA-TTTAC-G-TA-C-AAAAA--------TA--A----G-AC------------AAT---------------------A------------TA------------CT-AAAAAAAGATCTATT-----------G-C------T-TTGCAAAT---------T-CCTGT-G---T----ATT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAAGG-GCGCCTACGCcga
gi|10 : AG-GT-CATACACTCA--AA-A----ATCACGGC-----CCAACT-TTT-GGT-ACGGA-TATAT--C---A-ACT--------------------------------GC---TC-ATCTCCAATTTTAA--TAAT----TT----T-T--CAC--AC---G---GGGA-CT------GATC-TCGCTGTG--G---T----ATTCT--------AA--TG-CCGTGA-GG--TT-TTGC----cc
gi|13 : ggctgtgtgggtccaggggcgaagcccccgagcttctgaattttcaaatttttatgacgatattgtctaaatgttacaattttaacataagtatttaatggaagaaatgcttgaataaacagcggactaactgcatatgattttgatatagggcatttgaactgctctatctcgaaaaacaaaaacatacgaaccgtaaatgacaaacattttaataagtttaactttgtgatttttgttctattgaaccatccaccgtagcaG-A--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTTCAAAT-TTC-AGT-GCGAA-TATAT--A---A-AAT-GAAA------AC---G-GGA-TGTAAAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTCAA--TAAT----TT----T-T-GTAC--AC---
gi|6 : ttttacatactgtatgtgtaaaggaaaaagtgctatgaaagagcaggaaccatgcaactgcatatgacttttgatataaggcattttgaactagttctattcttagaaaacaaaacatacgaaccttaaatgacaaacatttgatgaagtttaaccattgtgactttgttcaaatttgaaccatccacctactctttttttttcatccaccAAAAGCTGT---TC-ATCGC--ATTTTAA--TATT----TT----TAT-GTAC--AC---G-A-GGAAGCTGCATGGGATC-TCG----AT-TGTGT----ATTTT--------AA--TGTTCGTGATTGTATTGTTGCTTTTTAT--TAATT----TGTT--TT--------------TCA-T-AA-T-----TTT-T-A-TTTATTGGT-TGTATTGAC-TGTTCTTGCA--GT-A-A
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gi|15 : AA-A-AA-A-A---TTT-A-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGT-A-AACT-TGAAATTAGAG-GT---ATA-A-AAA----------TA-----ATTGGT--------T--TAT--TAAAAATGTATGG-AAAGA-C--GTATT-T-CCAG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GTACAG-TTAA-CG-A--T-----------------G--AAAT----T-----------------GAGTA---TTGAAAATGCAGATTATTCTAATTGAA----G---------TC--CAC-------GAG-GC-AA-TT-CGGTG-CG--TTTAC-G-TA-C-AAACA--------TA--A----G-AC------------AATACACTTAAAAAG---------A------------T-------------CT-A-------------T-----------G-C------T-TTACAAAA---------T-TCTGT-G---TATACATT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACc
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gi|34 : gactttaaataaaaaatcaggacagaataaattaaattacgggcaaacaggcagggccatacactcaaaagctgttcatcgcattttaatatttttatgtacacgaggaagctgcatgggatctcgattgtgtattttaatgttcgtgattgtattgttgctttttattaatttgtttttcataatttttatttattggttgtattgactgttcttgcagtaagtcatggtagtatacgataattgaaaggcgacgggataattacggaattaggccggtggcgccgatacgcaacagcgcagatcttattctaaggACA--------TA--AACCTG-CC------------TAT---------------------A------------T-------------CC-G-------------C-----------GGC------T-CTTAAAAA---------T-GCAGTTA---T----ATT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAATGG-GCA-CTACGCtatcttggcgcgcgaagagtgtt
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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consensus : GGAAAAAATGCT-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGG-AAACC-------A----ACTGC-A--TA-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGT-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCGA-------------C-T-TTT-TTT---TTTCAT--C--CACC-C--CGAC-TTTA-AAT-AA---A---T-A-----G---ACAGA-ATA--AAAT-TA-----C-AATT---AC-GGAC--A-AACAGG--CAG-G--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTCCAAAT-TTC-GGT-ACG---AA-TATAT--A---A-ACT-G---AAA-----ACGAGTT--ATAAAAGCT-GT---TC-ATCTC--ATTTTAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---G-A-GGGA-CTG------A-TCTCGCTG--TT----T----ATTTT--------AA--TGC-CGTGATTGTCGTTGCTAT--TAT----TG-TT--TT--------------CAA-A-AA-G-A---TTT-A-A-ATTGT--TT-TGTA-TTGACATGTTCTTGCGTTGTA--AACT-TAAAATTAGAG-GTA---GA-A-AAAAGT-ATG-AGT-ACGAAAATTGGT--------T--TACG-TAA---TGTATGG-AAAG--A-C-GGTAT--T-TNCCGG-A-AT-T-A------TGGC---------A---ATA--------GCAAGG-TT-TACG-A--TG-AAAAT----TG--AGTAT-----------------C-T-------------------------A----A-----------------A-----------------------GTC-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATG-TGT-TT--TAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AA----G-AC------------AAT------------A------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-TCTGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
Reference ( family-406 ) : GGAAAAAATGCT-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGG-AAACC-------A----ACTGC-A--TA-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGT-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCGA-------------C-T-TTT-TTT---TTTCAT--C--CACC-C--CGAC-TTTA-AAT-AA---A---T-A-----G---ACAGA-ATA--AAAT-TA-----C-AATT---AC-GGAC--A-AACAGG--CAG-G--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTCCAAAT-TTC-GGT-ACG---AA-TATAT--A---A-ACT-G---AAA-----ACGAGTT--ATAAAAGCT-GT---TC-ATCTC--ATTTTAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---G-A-GGGA-CTG------A-TCTCGCTG-GTT----T----ATTTT--------AA--TGC-CGTGATTGTCGTTGCTAT--TAT----TG-TT--TT--------------CAA-A-AA-G-A---TTT-A-A-ATTGT--TT-TGTA-TTGACATGTTCTTGCGTTGTA--AACT-TAAAATTAGAG-GTA---GA-A-AAAAGT-ATG-AGT-ACGAAAATTGGT--------T--TACG-TAA---TGTATGG-AAAG--A-C-GGTAT--T-TNCCGG-A-AT-T-A------TGGC---------A---ATA--------GCAAGG-TT-TACG-A--TG-AAAAT----TG--AGTA------------------C-T-------------------------A----A-----------------A-----------------------GTC-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATG-TGT-TT--TAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AA----G-AC------------AAT------------A------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-TCTGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
gi|1 : A-----------GCGG-AA-CC-------A----AATGC-A--TA-TAATTAT-GACTT--T--T---AATAT--A-------TTAAGCT---------CTATGTTCTTCGAATAAA-CCAAAACTA-CAGTTA-CGAAC--CTTATTATGAC-AAAC----------TT-AT-TG------A---TT-AGCCA------------TT-GT-------------------------GA-------------T-T-TTT-TTC---TTT-ATGAC--CACC-----GA---TTATAAT-AA---A---T-A-----T---ATAGACATG--G--T-TA-----C-AATA---AC-GGAC--A-A-CAAG--GAG-G--CATAGCCTCA--AA-A----TTAGTGGCG-GTTTCAAAT---C-GGTGACG---AA-TATAT--T---ATACT-G---AAA-----ACGAGTT--ATAAAACCT-GT---TC-ATCCC--ATTTTAA--TAATTTAATTT-T-GTACTGTT---G-A-AGGG-CTG------A-TCTCGCTG--TG----C----ATTTT--------AA--AGC-CGTGATCGTTGTTGCTTT--T-T----TT-TTAATT--------------CAA-A-AA-A-AATTTTT-A-A----GT--TT-TGTA-TTGACATGTTCTTGCGTTGTAG-AACT-CAAA--TAGAG-GTAAAAGA-A-AAAAGT-AGT-AGTTACGAAAATTGGT------------AC--TA----TGTATGGTAAAA--A-C-A-TAT--TATACCAG-A-GTGT-G------TATC---------AG--ATA--------GCAAGG-TT-TAAG-A--TG-AAAATTGCATG--AGTA------------------C-TTAAAAATGCAGATTAATTATTCTACA----A-----------------A-----------------------GTC-T-AAGAG-GC-AA-TTTGATG-TG--TT--TAC-C-TA---------CAA-ACA--------T---------AA----A-ACATACACTAAAAAAAT------------A------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-CATGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
gi|10 : atgttacaattttacatactgtatgtgtacgcagaaGGAAGAAATGCT-TGA----AT-A-AA-CA-----------GCGG-A--CT-------A----ACTGC-A--TA-T-------GA-TT--T--T---GATAT--AGGGCATTT-GAACT-------G-CTCTATC--TCGAA--AAAC--AAA--AACA--TA-CGAAC--CGTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-TA-AT------AAGTTT-AACT-T-TGT-G-ATTTTT-GTTCTA---TTG-AACCA--T-CCACCGca
gi|10 : ggctgtgtgggtccaggggcgaagcccccgagcttctgaattttcaaatttttatgacgatattgtctaaatgttacaattttaacataagtatttaatAG-GT-CATACACTCA--AA-A----ATCACGGC-----CCAACT-TTT-GGT-ACG---GA-TATAT--C---A-ACT-G-------------------------------C---TC-ATCTCCAATTTTAA--TAATTT----T-T--CACA--C---G---GGGA-CTG------A-TCTCGCTG-TGG----T----ATTCT--------AA--TGC-CGTGAtagcaaggtcatacactcaaaaatcacggcccaacttttggtacggatatatcaactgctcatctccaattttaataatttttcacacggggactgatctcgctgtggtattctaatgccgtgaggttttgc
gi|11 : ggctgtgtgggtccaggggcgaagcccccgagcttctgaattttcaaatttttatgacgatattgtctaaatgttacaattttaacataagtatttaatggaagaaatgcttgaataaacagcggactaactgcatatgattttgatatagggcatttgaactgctctatctcgaaaaacaaaaacatacgaaccgtaaatgacaaacattttaataagtttaactttgtgatttttgttctattgaaccatccaccgtagcaGGAAACAGTGTT-AGT-----TGA-AA-CAA----------GCGA-AAACC-------A----ACTGC-A--TA-G-------GACTT--T--T------AT--AAGGTATTTTGAACT-------G-CTCTATTCTTCGAA--A--C--AAA--A-CAA-TATCGAAC--CTTAA-ATGAC-AAATA-------T-TTTGA-CG------AAAGTT-AACCAT-TGTGG-A-C--T-GTTCAA-ATTTGAAACTA--T-CACCCAA-------------CTT-TTT-TTT---TTTCAT--C--C-TA-C--TGAC-TTTA-AATAAA---A---T-ATATT-G---ACAGA-AAA--CAAT-TA-----C---------C-GGAC--A-AACggttttgc
gi|12 : gacaattgtgcagatgtatcaaaatcggcaaggggtccgggggggggggggcgccgtaacttctggatttcagggtttataaatgatgatattgtctaaatgtcacattacatactgtatgtgtaaaA-AAT-AA---A---------------ACAGA-ATA--ACA---A-----T-AA-----AC-GGAC--A-A-CAGG--CAGAG--CATGCACTCACAAA-A----TTTATG-CG-TTTCCAAAT-GTC-GGTTACG---AA--ATAT--A---A-ACT-G---AAA-----ACGAGTT--ATAAA-GCG-GT---TC-ATCTC--ATTTTAACCTAATTT----T-T-GTACA--C---T-A-GG-------------------------------------------------A--TGC--ATAATTGTCGTTGCTAT-------------------------------------------G---TTT-A-A-ATTGT--TT-TGTA-T-GACATGTTCTTGCGT-GTA--AA-T-TAAATTTAGAGAGTA---AACA-AAAAGT--TG-AGT-ACGAAAATTGGT--------C--AACG-TAA---TGTATGG-GAAG--ACC-GGTAT--T-ACCCGGAA-AT-T-A------TGGC---------A---ATA--------GCAAGGTTT-TACGCA--TG-AAAATA---TG--AGCA------------------CTT-------------------------A----A-----------------A-----------------------
gi|13 : GGAAAAAGTGCT--------ATGA-AA-GA-----------GCAG-GAACC-------ATGCAACTGC-A--TA-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-TTCTATTCTTAGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGT-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCTA-------------C-TCTTT-TTT---TTTCAT--C--CACC-aaatgcagattactct
gi|13 : ttttacatactgtatgtgtaaaG-A--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTTCAAAT-TTC-AGT-GCG---AA-TATAT--A---A-AAT-G---AAA-----ACGGGAT--GTAAAAGCT-GT---TC-ATCTC--ATTTCAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---gacatacactcaaaatttatggcgttttcaaatttcagtgcgaatatataaaatgaaaacgggatgtaaaagctgttcatctcatttcaataatttttgtacac
gi|14 : ttttacatactgtatgtgtaaaggaaaaagtgctatgaaagagcaggaaccatgcaactgcatatgacttttgatataaggcattttgaactagttctattcttagaaaacaaaacatacgaaccttaaatgacaaacatttgatgaagtttaaccattgtgactttgttcaaatttgaaccatccacctactctttttttttcatccaccGGAAAAATGCT-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGGAAAACC-------A----A-TGC-ATCTA-G-------GACTT--T--T----ATAT--A--GCGATTTGAACTA------G-CTCTCTTCTTCGAAAGAA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--TT--A-ATGAC-AAACAGGGGCGGTGTG-GA-TGAGACTTAAGTTTAAACCATGTGTCG-A-C-TT-GTTCAA-ATTTG-AATCAATT-CCACCAA-------------C-T-CCTGTTT---TTTCAC--T--CAGC-C--CGACTTTTA-AAT-AA---A---T-A-----AAGCACAGA-ATACCAAATCTATTACCC-AGAT---AC-GGAT--ACAACA----CGG-G--CA
gi|15 : tgtcacaattttacatactgtagtggtaaAA-A-AA-A-A---TTT-A-A-ATTGT--TT-TGTA-TTGACATGTTCTTGCGTTGTA--AACT-TGAAATTAGAG-GTA---TA-A-AAA----------T-A-----ATTGGT--------T--TAT--TAAAAATGTATGG-AAAG--A-C-G-TAT--T-T-CCAG-A-AT-T-A------TGGC---------A---ATA--------GTACAG-TT-AACG-A--TG--AAAT----TG--AGTATTGAAAATGCAGATTATTC-T-------------------------AATTGA-----------------A-----------------------GTC-C-ACGAG-GC-AA-TTCGGTG-CG--TT--TAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AA----G-AC------------AATACACTTAAAAAGA------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTACAAAA---------T-TCTGT-G---TATACA-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACa
gi|16 : aAA-A-AA-GCA---TTT-T-A-AATGT--T---GTC-TTGAAA-GTTCTTG---------AATT-TAA-------G-GTA---GA-A-AAA----------T-A-----ATTGGT--------T--TATG-TAA---TGTATG--AAAG--A-C-GGTAT--T-TCCCGG-A-TT-T-A------TGGC---------A---ATA--------GTACAG-TTAAACG-A--TG--AAAT----TGATAGTA------------------C-TTTG----------------------A----A-----------------AATGTAGATTATTCTGAATTGGGAGTT-CAAAGAG-GC-AATTTCGGTG-CG--TT--TACAG-TA---------C-A-ACT--------TA--------AA----G-AC------------AATTACACTTAAAAGA------------T-------------CGGAT-----------G-C------T-TTTAACAA---------T-TCTAT-G---T----ATTT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
gi|17 : a-A---TTT-A-A-ATTGT--TT-TGTA-TTGACATGTTCTTGCGTTGTA--AACT-TGAAATTAGAG-GTA---TA-A-AAA----------T-A-----ATTGGT--------TATTAAA-AGA---TGTATGG-AAAG--A-C-GGTAT--T-TCC--G-A-AT-T-A------TGGC---------A---ATA--------G-GACA-TT-AACG-A--TG-AAAAT----TG--AGTATTGAAAATGCAGATTATTC-T-------------------------AATTGA-----------------A-----------------------GTC-C-ACGAG-GC-AA-TTCGGTG-CG--TT--TAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AA----G-AC------------AAT------------A------------CACTTAAAAAGA--C-TAT-----------G-C------T-TTACAAAA---------T-TCTGT-G---TATACA-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-c
gi|18 : --TT--------------CAA-A-AAAG-A---TTT------TTAT--TG-TGTA-TTGACAT-TTCTTGCATTGTA--AACTATAAAATTAGAG-GTA---GA-A-AAAA---------T-A-----ATTGGT--------T----------------------AAG--A-C-GGTAT--T--CCCGG-A--C-T-A------TGG----------A---ATG----------AA---TT-TAGGTACTTG-AAAAT-----G--CATATAT---------------C-T-------------------------A----ATG---------------A-----------------------GTC-C-AAGAG-GCCAA-TTC-ATG-TGT-TT--GAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AAA---G-AC------------AAT------------ACACTTAAAAAGAT-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-TCTGTGG---T----A--T-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGCgctt
gi|19 : GGAAGAAATGCT-CAT----ATGA-A--CA-----------GGGG-AAACT-------A----ACTGC-A--TG-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCTTTGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAACCGCGTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AATTTT-AACCAT-TGT-G-A-C--T-GTTCAA-ATTTG-AACCA--TCCCACCGA-------------C---TTT-TTT---TTTCAC--C--CA---C--CGAC-ATTA-AAT-AA---A---c
gi|2 : ttttttatgacgatattgtctaaatgttacaattttacataatgtgtaaaGGAAAAAATGCT-CATGAATATGA-AA-CA-----------GCGG-AAACC-------A----ACTGT-A--TAAT-------GGCTT--T--T---GATATTTAAGGCATTTTGAACTACATGTAG-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--TTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TG-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGC-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-AACCG--T-CCACCGG-------------C-T-TTT-TTT---TTTCAT--C--CACC-C--CGAC-TTTA-AAT-AA---A---T-A-----G---ACAGG-ATAT-AAAT-TA-----C-AATT---AC-GGAC--A-AACAGG--CAG-G--CACACGCTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTCCAAAT-TTC-GGT-ACG---AA-TATAT--A---A-ACT-G---AAA-----AATAGTT--ATAAAAGCT-GT---TC-ATCTC--ATTTTGA--TAATTT----T-T-GTACA--C---G-A-GGGA-CTG------A-TTTCACTACATT----T----ATTTT--------AA--TGC-CATAATTGTTGTTGCTAT--TAT----TG-TT--TT--------------CAA-A-AA-G-A---TTT-A-A-ATTGT--TT-TGTA-TTGACATGTTCTTGCGTTGTA--AACT-CAAATTTAGAG-GTA---GA-A-AAAAGT-ATG-AGT-ACGAAAATTGGT--------T--TACG-TAA---TGTATGG-AAAT--A-C-AGTAT--T-TACTGG-A-AT-T-A------TGGC---------A---ATA--------GCAAGG-TT-TACG-A--TG-AAAAT----TG--AGTA------------------C-T------------------------------------------------A-----------------------GTC-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATG-TGT-TT--TAT-G-TA---------CTA-ACA--------T---------AA----G-AC------------AAT------------A------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-TCTGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGAGTAAGGG-GCA-CTACGCataca
gi|21 : TA-TTGACATTTTCTTGCGTTGTA--AACT-CAAAAT-------------------AAGT-ATG-------------TAGT------------ACG-TAA---TGTATGG-AAAG--A-C-GGTAT--T-TACCAG-A-AT-T-A------TGGC---------A---ATA--------GCAAGG-TT-TACG-A--TG-AAAAC----TG--AGTA------------------C-TTAAA---------------------A----ATGCAGATTATTCTATGGA-----------------------GTC-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATG-TGT-TT---AC-G-TA---------CAC-ATA--------C---------AA----G-AC------------AAT-------------------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-TGTGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAAGG-GCG-CT
gi|22 : TT-AACCAT-TGT-G-A-TTTT-TTTC
gi|22 : -T-TTT-TTT---CTTTATGAC--CACC-----GAC-TTTA-GAT-AAAATA---T-A-----G---AC----AT-----GT-TA-----C-AATA---AC-GGAC--A-AACAGG--CAG-G--CATACGCTCA--AA-A----TTTGTGGCG-TTTCCAAAT-TTC-GGT-ACG---AA-T-TAT--ATTTT-ACT-G---AAA-----A-GAGTT--ATAAAACCT-GT---TC-ATCCC--ATTTTAA--TAATTTAATCT-T-GTAC---CGTTG-A-AGGG-CTG------A-TCTCTCT--GTG----C----ATCTT--------AAAGTGC-Ctttatgaccaccgactttagataaaatatagacatgttacaataacggacaaacaggcaggcatacgctcaaaatttgtggcgtttccaaatttcggtacgaattatattttactgaaaagagttataaaacctgttcatcccattttaataatttaatcttgtaccgttgaagggctgatctctctgtgcatcttaaagtgcc
gi|23 : ttaaccattgtgaGGAAAAAATATC-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGG-AAACC-------A----ACTAT-A--TA-T-------GGCTT--T--T---GATATTAAAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGC-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-AACCG--T-CCACCGA-------------C----TT-TTT---TTCCAT--C--CACC-
gi|24 : ttacaattttacataatgtatgtgtaaaTT-CACTAC-AGT-G-A-CTTC-GTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CTGCCAA-------------C-T-------------------C--TA-------GA----TA-AA--AT---A---T-A-----G---ACAGA-ATA--------------C-AATT---AC-TGAC--A-TATAGG--CAA-G--CATACACTCA--AA-A----TGTATGGTG-TTTCCAAAT-TTC-GAT-ATA---AG-TATAT--T---A-ACT-A---AAA-----ACGAGT----TGAAAGCT-GTTCATC-ATCTC--ATTTTAA--TAATAT----T-gac
gi|25 : -----------------------GTT-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATGATGT-TT--AAC-AATAA--------CAA-ACACATTTCATT---------AA----GCAC------------AATTA----------A------------T-------------A-TAT-----------A-CAAACGGT-T--CTAAA---------TATCTGT-AATTT----A-TT-CTATTT-GCGCTATTGCGTAAGGGAGCG-CT-CGC
gi|26 : attgcagattcaatatcatacgg--TT--------------AAA-A-AA-G-A---TTTTA-A-ATTGT--TT-TGTA-TTGACATGTTCTTGCGTTGTA--AACT-TAAAATCAAAG-GTA---GA-A-AAATGT-ATGTAGT-ACAAAAATTGGT--------T--TTTG-TAA---TGTATGG-AAAG--A-C-GGTAT--T-TTCCGG-A-AT-T-A------TGGC---------A---ATA--------GTAAAG-TT-c
gi|27 : A-----------GCGG-AAACC-------A----AATGC-A--TA-TAATTATAGACTT--T--T---AATATT-AATATATT----A--A------G-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAT-ATG
gi|28 : tcaagggtttttttttaatgaatgttacaatttacatactgtatgtgtaaaggaa-CA-----------GCTG-AAATC-------A----ACTGC-A--TA-T-------GAC-T--T--T---GATAT--GAGGCATTTTGAATCA------GTTTCTATTCTTCACA--AA-C--AA
gi|29 : gttacaattttacatactacataatgataagggaaattgttaactcagagttaaaaaaacccggatgccc-----------------A-----------------------GTT-C-AAGAG-GC-AAATTCGATG-TGT-TT---AC-A-TA---------CAA--CA--------T---------AA----G-A-------------AAT------------A------------CA------------C-TA---------------------------AAAAAAAGATCTAT-TCTGT-A---TTTT-A-TT-C-ATTTTGCGCTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
gi|3 : atgcagattattctatggAAAATATT-TAT----ATGA-AA-CATGGATGCCCCAGCGA-AAACC-------A----ACTGC-A--TT-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGTATTTTAAACTA------A-CTCTACTTTTCAAA--AG-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTA-------------------------GA-TG------A----C-AAACAT-T-T-G-A--------TCAA-GTTTT-A-CTA--T-TG--TGA-------------C-T-TCG-TTCAAATTTGAA--C--CACC-CGCCGAC-ATT----------------------------CA---ACA--AAAT----------------------GC--A-AGCAG---CAG-G--CATACACTCA--AA-A----TTTATGATG-TTTCTAGAT-TTC-GGT-TTG---AA-TATTT--A---A-A-------------------GTT--A--AAAGCT-GT---TC-ATCTC--ATTTTGA--TAATTT----C-A-GTACA--C---GGA-GGGA-CTG------A-TTTCGCTG--TG----T----ATTTT--------AA--TGC-CGTGATTGTCGTTGCTTT--CAT----TG-TT--TCTTTTTTTTTTTTTACAA-A-AA-T-A---TTTTG-A-ATTGC--TT-TGTG-TAGCCATGCCCTTGCGTTGAA--AACT-TAAAACCAGAT-ATA---GA-A-AAA-GT-ATGTAGT-ACGAAAATGTGT--------T--AACA-TAA---TGAATGG-AAAG--A-C-G---T--T-TCTCCG-A----------------C---------A---ATA--------TC-----CC-TA-G-A--TA-AAAAT----GA--AG------------------------------------------------A----A-----------------A-----------------------------AAGA----------CG-TA-TGC-TT--------TA---------CAA-A-A--------T-----------------------------------------------------------T-------------C-TGT-----------G-C---------------A---------T-TC--------------------ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGCc
gi|30 : cctggattttcaaggtttttgtctcaaaatgcaacaattttacatactgtatgtgtaagggaaatgttgaatttaaacA-----------GCAG-AAACA-------A----ACTGA-A--CA-T-------GACGT--T--T---TATAT--AACGCATTTTGAACCA------G-GTCTTTTcac
gi|31 : tacaattttacatactgtatgtgtaagggaaatgttgagttatatggaacacggttgccctAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCGA-------------C-T-TT----------------------------AAA-TCTA-A-T-AA---AGTAT-A-----G---ACAGC-ATG--C--T-CG-----C-TATT---AC-GGAC--A-GGCAGG--CTA-G--CATACACTCA----------------GCG-TTTCCAGAT-T
gi|32 : ---T-A-----G---ACAGA-ATA--------------C-AATT---GC-GGAC--A-GACAAG--CAG-G--CATAC--TCA--AA-A----TTTTTGGTG-TTTCTAGAT-TTC-GAT-ATG---AA-TATAC--A---A-ACT-G---AAA-----ACGA
gi|33 : g----T-T-GTAAA--C---A-A-GGGA-CTG------A-TTTCCTTGTGTT----TTTGAATCTC--------AA--TGC-C
gi|34 : acatgttcggatattcaggcgtgctggacg-ACA--------T---------AAACCTG-CC------------TAT------------A------------T-------------C-CGC-----------GGC------T-CTTAAAAA---------T-GCAGTTA---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAATGG-GCA-CTACGCagacaatatttt
gi|36 : tcGTATGG-AAAG--A-C-GGTAT--T-TTCCGG-A-AT-T-A------TGGC---------A---ATA--------GTAAGG-TT-TATG-A--TG-AAAAT----TG--AGTA------------------C-T-------------------------cac
gi|37 : AA-A-AA-A-A---ATT-A-ATATTGT--TTCTGTA-TTGACATGTTCTTGCGTTGTA--AAAC-TGAAA-TAGAG-GT
gi|4 : GGAAGAATGCTTCAT----AGGA-AAACA-----------GCGG-AAACT-------A----ACTGCCA--TA-G-------GACTT--T--TTTTGATATTAAAGGC----------------------TATTCTTCGAA--AA-C--AAA--AACA--TA-CGAAC--CGTAA-ATGACCAAACA-------T-TTTGA-TG------AAGTTTTAGCCAT-TGT-G-A-CTTTTGTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCGA-------------C-T-TTT-TTT---TT---------CACCAC--CGAC-TTTA-AAT-AA---A---TTA-----G---ACACA-AT--------TA-----C-ATTTGTAAC-GGAC--A-AACAGGG-CAG-G--C-------------------TTTATGG---TTTTCAACT-TTTTGGT-ACG---AA-TATAT--A---A-ACT-----------------GTC--AT-----------------TCTC--ATTTTAA--TAATTT----T-TGGCACA--C---G-A-GGGA-CTG------A-TCTCGCTG-TGT----T----ATTCT--------AA--TGC-CGTGATGGTCTTTGCT-T--T-T----TG-T
gi|5 : cagtggccgtagctaggaaattttgccagtgtatcataaatcggcaggggggtctggggggacgccgtttaagccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcaattttttttatgtacgatatgtttaatttacaatatttacataagtatgtgtaaa-AACAGGGGCAG-G--C-TATATTCA--AATA----GCTATGGTG-TTTC-AAAT-TTC-GG--ACG---AAATATATTTA---A-ACTTG---AAATTAAAACGAGTT--ATAAA-GCT-GT---TC-ATCTC--AATTTAA--TAAGTTG---T-T-GTGCA--C---A-ACGGGAGCTG------ACTCTCATTG-AATGTAAT----ATTTT--------AAA-TGC-CGTGATTGTCGTTGCTTTGATAT----TA-TT--TT--------------GAG-ATAA---------T-A-A-AAGAT--TA-TATA-T-GACATGTTCTTGCGTTGTA--AACT-CAAAATTAGAG-GTA---GA-ACAAAAGT-ATGTAGT-ACAAAAATTGGTGAAATACGT--TACGGTAA---TGTATGG-AAAG--A-CTAGTAT--T-TACCGG-A-AT-T---------GGC---------A---ATA--------GCAAG-----TA---A--TGCAAGAT----T---ATTAT-----------------C-T-------------------------ATG--G-----------------A-----------------------GTC---AAGAG--C-AA-ATCGAT--TGA-TT--TAC-G-TA---------CAA-AAA--------T---------AA----G-AC------------AAT------------A------------TACTAAAAAAAGATC-TATT----------G-C------T-TTGCAAAT---------T-CCTGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAAGG-GCGCCTACGC
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-406 ) : GGAAAAAATGCT-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGG-AAACC-------A----ACTGC-A--TA-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGT-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCGA-------------C-T-TTT-TTT---TTTCAT--C--CACC-C--CGAC-TTTA-AAT-AA---A---T-A-----G---ACAGA-ATA--AAAT-TA-----C-AATT---AC-GGAC--A-AACAGG--CAG-G--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTCCAAAT-TTC-GGT-ACG---AA-TATAT--A---A-ACT-G---AAA-----ACGAGTTATAAAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTTAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---G-A-GGGA-CT------GA-TCTCG-C---TG--T-T--T----ATTTT--------AA--TG-CCGTGATTG--TCGTTGC----TAT--TA--T----TGTT--TT--------------CAA-A-AA-G-A---TTT-A-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-TAAAATTAGAG-GT---AGA-A-AAAAGTATG-AG-TACGAAAATTGGT--------T--TACG-TAA---TGTATGG-AAAGA-C-GGTATT-TNCCGG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GCAAGG-TT-TACG-A--TG-AAAAT----TG--A-GTA-------------------TC-TA----A------------------------A--------------------GTC-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATG-TGT-TT--TAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AA----G-AC------------AAT------------A------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-TCTGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
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gi|11 : ggctgtgtgggtccaggggcgaagcccccgagcttctgaattttcaaatttttatgacgatattgtctaaatgttacaattttaacataagtatttaatggaagaaatgcttgaataaacagcggactaactgcatatgattttgatatagggcatttgaactgctctatctcgaaaaacaaaaacatacgaaccgtaaatgacaaacattttaataagtttaactttgtgatttttgttctattgaaccatccaccgtagcaGGAAACAGTGTT-AGT-----TGA-AA-CAA----------GCGA-AAACC-------A----ACTGC-A--TA-G-------GACTT--T--T------AT--AAGGTATTTTGAACT-------G-CTCTATTCTTCGAA--A--C--AAA--A-CAA-TATCGAAC--CTTAA-ATGAC-AAATA-------T-TTTGA-CG------AAAGTT-AACCAT-TGTGG-A-C--T-GTTCAA-ATTTGAAACTA--T-CACCCAA-------------CTT-TTT-TTT---TTTCAT--C--C-TA-C--TGAC-TTTA-AATAAA---A---T-ATATT-G---ACAGA-AAA--CAAT-TA-----C---------C-GGAC--A-AACggttttgc
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gi|13 : GGAAAAAGTGCT--------ATGA-AA-GA-----------GCAG-GAACC-------ATGCAACTGC-A--TA-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-TTCTATTCTTAGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGT-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCTA-------------C-TCTTT-TTT---TTTCAT--C--CACC-aaatgcagattactct
gi|13 : ttttacatactgtatgtgtaaaG-A--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTTCAAAT-TTC-AGT-GCG---AA-TATAT--A---A-AAT-G---AAA-----ACGGGATGTAAAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTCAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---gacatacactcaaaatttatggcgttttcaaatttcagtgcgaatatataaaatgaaaacgggatgtaaaagctgttcatctcatttcaataatttttgtacac
gi|14 : ttttacatactgtatgtgtaaaggaaaaagtgctatgaaagagcaggaaccatgcaactgcatatgacttttgatataaggcattttgaactagttctattcttagaaaacaaaacatacgaaccttaaatgacaaacatttgatgaagtttaaccattgtgactttgttcaaatttgaaccatccacctactctttttttttcatccaccGGAAAAATGCT-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGGAAAACC-------A----A-TGC-ATCTA-G-------GACTT--T--T----ATAT--A--GCGATTTGAACTA------G-CTCTCTTCTTCGAAAGAA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--TT--A-ATGAC-AAACAGGGGCGGTGTG-GA-TGAGACTTAAGTTTAAACCATGTGTCG-A-C-TT-GTTCAA-ATTTG-AATCAATT-CCACCAA-------------C-T-CCTGTTT---TTTCAC--T--CAGC-C--CGACTTTTA-AAT-AA---A---T-A-----AAGCACAGA-ATACCAAATCTATTACCC-AGAT---AC-GGAT--ACAACA----CGG-G--CA
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gi|16 : aAA-A-AA-GCA---TTT-T-A-AATGTT-----GTCTTGAAA-GTTCTTG--------AATT-TAA-------G-GT---AGA-A-AAA----------TA-----ATTGGT--------T--TATG-TAA---TGTATG--AAAGA-C-GGTATT-TCCCGG-A-TT-T-ATGGC---------A-ATA--------GTACAG-TTAAACG-A--TG--AAAT----TGATA-GTACTTTGAAAATGTAGATTATTC-TG----AATTGGG------------------A--------------------GTT-CAAAGAG-GC-AATTTCGGTG-CG--TT--TACAG-TA---------C-A-ACT--------TA--------AA----G-AC------------AATTACACTTAAAAGA------------T-------------CGGAT-----------G-C------T-TTTAACAA---------T-TCTAT-G---T----ATTT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-406 ) : GGAAAAAATGCT-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGG-AAACC-------A----ACTGC-A--TA-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGT-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCGA-------------C-T-TTT-TTT---TTTCAT--C--CACC-C--CGAC-TTTA-AAT-AA---A---T-A-----G---ACAGA-ATA--AAAT-TA-----C-AATT---AC-GGAC--A-AACAGG--CAG-G--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTCCAAAT-TTC-GGT-ACG---AA-TATAT--A---A-ACT-G---AAA-----ACGAGTTATAAAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTTAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---G-A-GGGA-CT------GA-TCTCG-CTG----T-N-TATTTT--------AA--TG-CCGTGATTG--TCGTTGC----TAT--TA--T----TGTT--TT--------------CAA-A-AA-G-A---TTT-A-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-TAAAATTAGAG-GT---AGA-A-AAAAGTATG-AG-TACGAAAATTGGT--------T--TACG-TAA---TGTATGG-AAAGA-C-GGTATT-TCCCGG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GCAAGG-TT-TACG-A--TG-AAAAT----TG--A-GTA-------------------TC-TA----A------------------------A--------------------GTC-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATG-TGT-TT--TAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AA----G-AC------------AAT------------A------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-TCTGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
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gi|13 : ttttacatactgtatgtgtaaaG-A--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTTCAAAT-TTC-AGT-GCG---AA-TATAT--A---A-AAT-G---AAA-----ACGGGATGTAAAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTCAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---gacatacactcaaaatttatggcgttttcaaatttcagtgcgaatatataaaatgaaaacgggatgtaaaagctgttcatctcatttcaataatttttgtacac
gi|14 : ttttacatactgtatgtgtaaaggaaaaagtgctatgaaagagcaggaaccatgcaactgcatatgacttttgatataaggcattttgaactagttctattcttagaaaacaaaacatacgaaccttaaatgacaaacatttgatgaagtttaaccattgtgactttgttcaaatttgaaccatccacctactctttttttttcatccaccGGAAAAATGCT-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGGAAAACC-------A----A-TGC-ATCTA-G-------GACTT--T--T----ATAT--A--GCGATTTGAACTA------G-CTCTCTTCTTCGAAAGAA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--TT--A-ATGAC-AAACAGGGGCGGTGTG-GA-TGAGACTTAAGTTTAAACCATGTGTCG-A-C-TT-GTTCAA-ATTTG-AATCAATT-CCACCAA-------------C-T-CCTGTTT---TTTCAC--T--CAGC-C--CGACTTTTA-AAT-AA---A---T-A-----AAGCACAGA-ATACCAAATCTATTACCC-AGAT---AC-GGAT--ACAACA----CGG-G--CA
gi|15 : tgtcacaattttacatactgtagtggtaaAA-A-AA-A-A---TTT-A-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-TGAAATTAGAG-GT---ATA-A-AAA----------TA-----ATTGGT--------T--TAT--TAAAAATGTATGG-AAAGA-C-G-TATT-TCC-AG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GTACAG-TT-AACG-A--TG--AAAT----TG--A-GTATTGAAAATGCAGATTAT--TC-TAATTGA------------------------A--------------------GTC-C-ACGAG-GC-AA-TTCGGTG-CG--TT--TAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AA----G-AC------------AATACACTTAAAAAGA------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTACAAAA---------T-TCTGT-G---TATACA-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACa
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gi|17 : a-A---TTT-A-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-TGAAATTAGAG-GT---ATA-A-AAA----------TA-----ATTGGT--------TATTAAA-AGA---TGTATGG-AAAGA-C-GGTATT-TCC--G-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------G-GACA-TT-AACG-A--TG-AAAAT----TG--A-GTATTGAAAATGCAGATTAT--TC-TAATTGA------------------------A--------------------GTC-C-ACGAG-GC-AA-TTCGGTG-CG--TT--TAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AA----G-AC------------AAT------------A------------CACTTAAAAAGA--C-TAT-----------G-C------T-TTACAAAA---------T-TCTGT-G---TATACA-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-c
gi|18 : --TT--------------CAA-A-AAAG-A---TTT------TTATT--G-TGTATTGACAT-TTCTTGCATTGTA-AACTATAAAATTAGAG-GT---AGA-A-AAAA---------TA-----ATTGGT--------T----------------------AAGA-C-GGTATT--CCCGG-A--C-T-ATGG----------A-ATG----------AA---TT-TAGGTACTTG-AAAAT----GC--ATATA-------------------TC-TA----ATG----------------------A--------------------GTC-C-AAGAG-GCCAA-TTC-ATG-TGT-TT--GAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AAA---G-AC------------AAT------------ACACTTAAAAAGAT-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-TCTGTGG---T----A--T-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGCgctt
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gi|21 : TATTGACATTTTCTTGCGTTGTA-AACT-CAAAAT-------------------AAGTATG-------------TAGT------------ACG-TAA---TGTATGG-AAAGA-C-GGTATT-TACCAG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GCAAGG-TT-TACG-A--TG-AAAAC----TG--A-GTA-------------------CT-TA----A------------------------AAATGCAGATTATTCTATGGAGTC-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATG-TGT-TT---AC-G-TA---------CAC-ATA--------C---------AA----G-AC------------AAT-------------------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-TGTGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAAGG-GCG-CT
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gi|23 : ttaaccattgtgaGGAAAAAATATC-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGG-AAACC-------A----ACTAT-A--TA-T-------GGCTT--T--T---GATATTAAAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGC-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-AACCG--T-CCACCGA-------------C----TT-TTT---TTCCAT--C--CACC-
gi|24 : ttacaattttacataatgtatgtgtaaaTT-CACTAC-AGT-G-A-CTTC-GTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CTGCCAA-------------C-T-------------------C--TA-------GA----TA-AA--AT---A---T-A-----G---ACAGA-ATA--------------C-AATT---AC-TGAC--A-TATAGG--CAA-G--CATACACTCA--AA-A----TGTATGGTG-TTTCCAAAT-TTC-GAT-ATA---AG-TATAT--T---A-ACT-A---AAA-----ACGAGT--TGAAAGCTGTTCATC-ATCTC--ATTTTAA--TAATAT----T-gac
gi|25 : --TG-CAGAT----TC--A-ATA-------------------TCATAC---G------------------------G--------------------GTT-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATGATGT-TT--AAC-AATAA--------CAA-ACACATTTCATT---------AA----GCAC------------AATTA----------A------------T-------------A-TAT-----------A-CAAACGGT-T--CTAAA---------TATCTGT-AATTT----A-TT-CTATTT-GCGCTATTGCGTAAGGGAGCG-CT-CGC
gi|26 : at--TT--------------AAA-A-AA-G-A---TTTTA-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-TAAAATCAAAG-GT---AGA-A-AAATGTATGTAG-TACAAAAATTGGT--------T--TTTG-TAA---TGTATGG-AAAGA-C-GGTATT-TTCCGG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GTAAAG-TT-c
gi|27 : A-----------GCGG-AAACC-------A----AATGC-A--TA-TAATTATAGACTT--T--T---AATATT-AATATATT----A--A------G-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAT-ATG
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-406 ) : GGAAAAAATGCT-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGG-AAACC-------A----ACTGC-A--TA-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGT-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCGA-------------C-T-TTT-TTT---TTTCAT--C--CACC-C--CGAC-TTTA-AAT-AA---A---T-A-----G---ACAGA-ATA--AAAT-TA-----C-AATT---AC-GGAC--A-AACAGG--CAG-G--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTCCAAAT-TTC-GGT-ACG---AA-TATAT--A---A-ACT-G---AAA-----ACGAGTTATAAAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTTAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---G-A-GGGA-CT------GA-TCTCG-CTG--T-G-TA---TTTTAA--TG------CCGTGATTG--TCGTTGC----TAT--TA--T----TGTT--TT--------------CAA-A-AA-G-A---TTT-A-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-TAAAATTAGAG-GT---AGA-A-AAAAGTATG-AG-TACGAAAATTGGT--------T--TACG-TAA---TGTATGG-AAAGA-C-GGTATT-TCCCGG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GCAAGG-TT-TACG-A--TG-AAAAT----TG--A-GTA-------------------TC-TA----A------------------------A--------------------GTC-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATG-TGT-TT--TAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AA----G-AC------------AAT------------A------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-TCTGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
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gi|10 : ggctgtgtgggtccaggggcgaagcccccgagcttctgaattttcaaatttttatgacgatattgtctaaatgttacaattttaacataagtatttaatAG-GT-CATACACTCA--AA-A----ATCACGGC-----CCAACT-TTT-GGT-ACG---GA-TATAT--C---A-ACT-G----------------------------C---TC-ATCTCCAATTTTAA--TAATTT----T-T--CACA--C---G---GGGA-CT------GA-TCTCG-CTG--TGG-TA---TTCTAA--TG------CCGTGAtagcaaggtcatacactcaaaaatcacggcccaacttttggtacggatatatcaactgctcatctccaattttaataatttttcacacggggactgatctcgctgtggtattctaatgccgtgaggttttgc
gi|11 : ggctgtgtgggtccaggggcgaagcccccgagcttctgaattttcaaatttttatgacgatattgtctaaatgttacaattttaacataagtatttaatggaagaaatgcttgaataaacagcggactaactgcatatgattttgatatagggcatttgaactgctctatctcgaaaaacaaaaacatacgaaccgtaaatgacaaacattttaataagtttaactttgtgatttttgttctattgaaccatccaccgtagcaGGAAACAGTGTT-AGT-----TGA-AA-CAA----------GCGA-AAACC-------A----ACTGC-A--TA-G-------GACTT--T--T------AT--AAGGTATTTTGAACT-------G-CTCTATTCTTCGAA--A--C--AAA--A-CAA-TATCGAAC--CTTAA-ATGAC-AAATA-------T-TTTGA-CG------AAAGTT-AACCAT-TGTGG-A-C--T-GTTCAA-ATTTGAAACTA--T-CACCCAA-------------CTT-TTT-TTT---TTTCAT--C--C-TA-C--TGAC-TTTA-AATAAA---A---T-ATATT-G---ACAGA-AAA--CAAT-TA-----C---------C-GGAC--A-AACggttttgc
gi|12 : gacaattgtgcagatgtatcaaaatcggcaaggggtccgggggggggggggcgccgtaacttctggatttcagggtttataaatgatgatattgtctaaatgtcacattacatactgtatgtgtaaaA-AAT-AA---A---------------ACAGA-ATA--ACA---A-----T-AA-----AC-GGAC--A-A-CAGG--CAGAG--CATGCACTCACAAA-A----TTTATG-CG-TTTCCAAAT-GTC-GGTTACG---AA--ATAT--A---A-ACT-G---AAA-----ACGAGTTATAAA-GCGGT---TC-ATCTC--ATTTTAACCTAATTT----T-T-GTACA--C---T-A-GG---------------------------------------A--TG------C-ATAATTG--TCGTTGC----TAT--------------------------------------------G---TTT-A-A-ATTGTT--T-TGTAT-GACATGTTCTTGCGT-GTA-AA-T-TAAATTTAGAGAGT---AAACA-AAAAGT-TG-AG-TACGAAAATTGGT--------C--AACG-TAA---TGTATGG-GAAGACC-GGTATT-ACCCGGAA-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GCAAGGTTT-TACGCA--TG-AAAATA---TG--A-GCA-------------------CT-TA----A------------------------A--------------------
gi|13 : GGAAAAAGTGCT--------ATGA-AA-GA-----------GCAG-GAACC-------ATGCAACTGC-A--TA-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-TTCTATTCTTAGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGT-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCTA-------------C-TCTTT-TTT---TTTCAT--C--CACC-aaatgcagattactct
gi|13 : ttttacatactgtatgtgtaaaG-A--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTTCAAAT-TTC-AGT-GCG---AA-TATAT--A---A-AAT-G---AAA-----ACGGGATGTAAAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTCAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---gacatacactcaaaatttatggcgttttcaaatttcagtgcgaatatataaaatgaaaacgggatgtaaaagctgttcatctcatttcaataatttttgtacac
gi|14 : ttttacatactgtatgtgtaaaggaaaaagtgctatgaaagagcaggaaccatgcaactgcatatgacttttgatataaggcattttgaactagttctattcttagaaaacaaaacatacgaaccttaaatgacaaacatttgatgaagtttaaccattgtgactttgttcaaatttgaaccatccacctactctttttttttcatccaccGGAAAAATGCT-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGGAAAACC-------A----A-TGC-ATCTA-G-------GACTT--T--T----ATAT--A--GCGATTTGAACTA------G-CTCTCTTCTTCGAAAGAA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--TT--A-ATGAC-AAACAGGGGCGGTGTG-GA-TGAGACTTAAGTTTAAACCATGTGTCG-A-C-TT-GTTCAA-ATTTG-AATCAATT-CCACCAA-------------C-T-CCTGTTT---TTTCAC--T--CAGC-C--CGACTTTTA-AAT-AA---A---T-A-----AAGCACAGA-ATACCAAATCTATTACCC-AGAT---AC-GGAT--ACAACA----CGG-G--CA
gi|15 : tgtcacaattttacatactgtagtggtaaAA-A-AA-A-A---TTT-A-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-TGAAATTAGAG-GT---ATA-A-AAA----------TA-----ATTGGT--------T--TAT--TAAAAATGTATGG-AAAGA-C-G-TATT-TCC-AG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GTACAG-TT-AACG-A--TG--AAAT----TG--A-GTATTGAAAATGCAGATTAT--TC-TAATTGA------------------------A--------------------GTC-C-ACGAG-GC-AA-TTCGGTG-CG--TT--TAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AA----G-AC------------AATACACTTAAAAAGA------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTACAAAA---------T-TCTGT-G---TATACA-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACa
gi|16 : aAA-A-AA-GCA---TTT-T-A-AATGTT-----GTCTTGAAA-GTTCTTG--------AATT-TAA-------G-GT---AGA-A-AAA----------TA-----ATTGGT--------T--TATG-TAA---TGTATG--AAAGA-C-GGTATT-TCCCGG-A-TT-T-ATGGC---------A-ATA--------GTACAG-TTAAACG-A--TG--AAAT----TGATA-GTACTTTGAAAATGTAGATTATTC-TG----AATTGGG------------------A--------------------GTT-CAAAGAG-GC-AATTTCGGTG-CG--TT--TACAG-TA---------C-A-ACT--------TA--------AA----G-AC------------AATTACACTTAAAAGA------------T-------------CGGAT-----------G-C------T-TTTAACAA---------T-TCTAT-G---T----ATTT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
gi|17 : a-A---TTT-A-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-TGAAATTAGAG-GT---ATA-A-AAA----------TA-----ATTGGT--------TATTAAA-AGA---TGTATGG-AAAGA-C-GGTATT-TCC--G-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------G-GACA-TT-AACG-A--TG-AAAAT----TG--A-GTATTGAAAATGCAGATTAT--TC-TAATTGA------------------------A--------------------GTC-C-ACGAG-GC-AA-TTCGGTG-CG--TT--TAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AA----G-AC------------AAT------------A------------CACTTAAAAAGA--C-TAT-----------G-C------T-TTACAAAA---------T-TCTGT-G---TATACA-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-c
gi|18 : --TT--------------CAA-A-AAAG-A---TTT------TTATT--G-TGTATTGACAT-TTCTTGCATTGTA-AACTATAAAATTAGAG-GT---AGA-A-AAAA---------TA-----ATTGGT--------T----------------------AAGA-C-GGTATT--CCCGG-A--C-T-ATGG----------A-ATG----------AA---TT-TAGGTACTTG-AAAAT----GC--ATATA-------------------TC-TA----ATG----------------------A--------------------GTC-C-AAGAG-GCCAA-TTC-ATG-TGT-TT--GAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AAA---G-AC------------AAT------------ACACTTAAAAAGAT-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-TCTGTGG---T----A--T-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGCgctt
gi|19 : GGAAGAAATGCT-CAT----ATGA-A--CA-----------GGGG-AAACT-------A----ACTGC-A--TG-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCTTTGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAACCGCGTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AATTTT-AACCAT-TGT-G-A-C--T-GTTCAA-ATTTG-AACCA--TCCCACCGA-------------C---TTT-TTT---TTTCAC--C--CA---C--CGAC-ATTA-AAT-AA---A---c
gi|2 : ttttttatgacgatattgtctaaatgttacaattttacataatgtgtaaaGGAAAAAATGCT-CATGAATATGA-AA-CA-----------GCGG-AAACC-------A----ACTGT-A--TAAT-------GGCTT--T--T---GATATTTAAGGCATTTTGAACTACATGTAG-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--TTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TG-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGC-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-AACCG--T-CCACCGG-------------C-T-TTT-TTT---TTTCAT--C--CACC-C--CGAC-TTTA-AAT-AA---A---T-A-----G---ACAGG-ATAT-AAAT-TA-----C-AATT---AC-GGAC--A-AACAGG--CAG-G--CACACGCTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTCCAAAT-TTC-GGT-ACG---AA-TATAT--A---A-ACT-G---AAA-----AATAGTTATAAAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTTGA--TAATTT----T-T-GTACA--C---G-A-GGGA-CT------GA-TTTCA-CTACAT-T-TA---TTTTAA--TG------CCATAATTG--TTGTTGC----TAT--TA--T----TGTT--TT--------------CAA-A-AA-G-A---TTT-A-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-CAAATTTAGAG-GT---AGA-A-AAAAGTATG-AG-TACGAAAATTGGT--------T--TACG-TAA---TGTATGG-AAATA-C-AGTATT-TACTGG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GCAAGG-TT-TACG-A--TG-AAAAT----TG--A-GTA--------------------C-T------------------------------A--------------------GTC-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATG-TGT-TT--TAT-G-TA---------CTA-ACA--------T---------AA----G-AC------------AAT------------A------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-TCTGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGAGTAAGGG-GCA-CTACGCataca
gi|21 : TATTGACATTTTCTTGCGTTGTA-AACT-CAAAAT-------------------AAGTATG-------------TAGT------------ACG-TAA---TGTATGG-AAAGA-C-GGTATT-TACCAG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GCAAGG-TT-TACG-A--TG-AAAAC----TG--A-GTA-------------------CT-TA----A------------------------AAATGCAGATTATTCTATGGAGTC-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATG-TGT-TT---AC-G-TA---------CAC-ATA--------C---------AA----G-AC------------AAT-------------------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-TGTGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAAGG-GCG-CT
gi|22 : TT-AACCAT-TGT-G-A-TTTT-TTTC
gi|22 : -T-TTT-TTT---CTTTATGAC--CACC-----GAC-TTTA-GAT-AAAATA---T-A-----G---AC----AT-----GT-TA-----C-AATA---AC-GGAC--A-AACAGG--CAG-G--CATACGCTCA--AA-A----TTTGTGGCG-TTTCCAAAT-TTC-GGT-ACG---AA-T-TAT--ATTTT-ACT-G---AAA-----A-GAGTTATAAAACCTGT---TC-ATCCC--ATTTTAA--TAATTTAATCT-T-GTAC---CGTTG-A-AGGG-CT------GA-TCTCT-CTG--T-G-CA---TCTTAAAGTG------CCtttatgaccaccgactttagataaaatatagacatgttacaataacggacaaacaggcaggcatacgctcaaaatttgtggcgtttccaaatttcggtacgaattatattttactgaaaagagttataaaacctgttcatcccattttaataatttaatcttgtaccgttgaagggctgatctctctgtgcatcttaaagtgcc
gi|23 : ttaaccattgtgaGGAAAAAATATC-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGG-AAACC-------A----ACTAT-A--TA-T-------GGCTT--T--T---GATATTAAAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGC-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-AACCG--T-CCACCGA-------------C----TT-TTT---TTCCAT--C--CACC-
gi|24 : ttacaattttacataatgtatgtgtaaaTT-CACTAC-AGT-G-A-CTTC-GTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CTGCCAA-------------C-T-------------------C--TA-------GA----TA-AA--AT---A---T-A-----G---ACAGA-ATA--------------C-AATT---AC-TGAC--A-TATAGG--CAA-G--CATACACTCA--AA-A----TGTATGGTG-TTTCCAAAT-TTC-GAT-ATA---AG-TATAT--T---A-ACT-A---AAA-----ACGAGT--TGAAAGCTGTTCATC-ATCTC--ATTTTAA--TAATAT----T-gac
gi|25 : --TG-CAGAT----TC--A-ATA-------------------TCATAC---G------------------------G--------------------GTT-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATGATGT-TT--AAC-AATAA--------CAA-ACACATTTCATT---------AA----GCAC------------AATTA----------A------------T-------------A-TAT-----------A-CAAACGGT-T--CTAAA---------TATCTGT-AATTT----A-TT-CTATTT-GCGCTATTGCGTAAGGGAGCG-CT-CGC
gi|26 : at--TT--------------AAA-A-AA-G-A---TTTTA-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-TAAAATCAAAG-GT---AGA-A-AAATGTATGTAG-TACAAAAATTGGT--------T--TTTG-TAA---TGTATGG-AAAGA-C-GGTATT-TTCCGG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GTAAAG-TT-c
gi|27 : A-----------GCGG-AAACC-------A----AATGC-A--TA-TAATTATAGACTT--T--T---AATATT-AATATATT----A--A------G-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAT-ATG
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gi|29 : gttacaattttacatactacataatgataagggaaattgttaactcagagttaaaaaaacccggatgccc-------------------TC-TATG--G------------------------A--------------------GTT-C-AAGAG-GC-AAATTCGATG-TGT-TT---AC-A-TA---------CAA--CA--------T---------AA----G-A-------------AAT------------A------------CA------------C-TA---------------------------AAAAAAAGATCTAT-TCTGT-A---TTTT-A-TT-C-ATTTTGCGCTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
gi|3 : atgcagattatAAAATATT-TAT----ATGA-AA-CATGGATGCCCCAGCGA-AAACC-------A----ACTGC-A--TT-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGTATTTTAAACTA------A-CTCTACTTTTCAAA--AG-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTA-------------------------GA-TG------A----C-AAACAT-T-T-G-A--------TCAA-GTTTT-A-CTA--T-TG--TGA-------------C-T-TCG-TTCAAATTTGAA--C--CACC-CGCCGAC-ATT----------------------------CA---ACA--AAAT----------------------GC--A-AGCAG---CAG-G--CATACACTCA--AA-A----TTTATGATG-TTTCTAGAT-TTC-GGT-TTG---AA-TATTT--A---A-A-------------------GTTA--AAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTTGA--TAATTT----C-A-GTACA--C---GGA-GGGA-CT------GA-TTTCG-CTG--T-G-TA---TTTTAA--TG------CCGTGATTG--TCGTTGC----TTT--CA--T----TGTT--TCTTTTTTTTTTTTTACAA-A-AA-T-A---TTTTG-A-ATTGCT--T-TGTGTAGCCATGCCCTTGCGTTGAA-AACT-TAAAACCAGAT-AT---AGA-A-AAA-GTATGTAG-TACGAAAATGTGT--------T--AACA-TAA---TGAATGG-AAAGA-C-G---TT-TCTCCG-A----------C---------A-ATA--------TC-----CC-TA-G-A--TA-AAAAT----GA--A-G-------------------------A----A------------------------A--------------------------AAGA----------CG-TA-TGC-TT--------TA---------CAA-A-A--------T-----------------------------------------------------------T-------------C-TGT-----------G-C---------------A---------T-TC--------------------ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGCc
gi|30 : cctggattttcaaggtttttgtctcaaaatgcaacaattttacatactgtatgtgtaagggaaatgttgaatttaaacA-----------GCAG-AAACA-------A----ACTGA-A--CA-T-------GACGT--T--T---TATAT--AACGCATTTTGAACCA------G-GTCTTTTcac
gi|31 : tacaattttacatactgtatgtgtaagggaaatgttgagttatatggaacacggttgccctAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCGA-------------C-T-TT----------------------------AAA-TCTA-A-T-AA---AGTAT-A-----G---ACAGC-ATG--C--T-CG-----C-TATT---AC-GGAC--A-GGCAGG--CTA-G--CATACACTCA----------------GCG-TTTCCAGAT-T
gi|32 : ---T-A-----G---ACAGA-ATA--------------C-AATT---GC-GGAC--A-GACAAG--CAG-G--CATAC--TCA--AA-A----TTTTTGGTG-TTTCTAGAT-TTC-GAT-ATG---AA-TATAC--A---A-ACT-G---AAA-----ACGA
gi|33 : g----T-T-GTAAA--C---A-A-GGGA-CT------GA-TTTCC-TTG--T-G-TT---TTTGAA--T
gi|34 : acatgttcggatattcaggcgtgctggacg-ACA--------T---------AAACCTG-CC------------TAT------------A------------T-------------C-CGC-----------GGC------T-CTTAAAAA---------T-GCAGTTA---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAATGG-GCA-CTACGCctcaatgccagacaatatttt
gi|36 : tcGTATGG-AAAGA-C-GGTATT-TTCCGG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GTAAGG-TT-TATG-A--TG-AAAAT----TG--A-GTA-------------------cac
gi|37 : AA-A-AA-A-A---ATT-A-ATATTGTT--TCTGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AAAC-TGAAA-TAGAG-GT---ct
gi|4 : GGAAGAATGCTTCAT----AGGA-AAACA-----------GCGG-AAACT-------A----ACTGCCA--TA-G-------GACTT--T--TTTTGATATTAAAGGC----------------------TATTCTTCGAA--AA-C--AAA--AACA--TA-CGAAC--CGTAA-ATGACCAAACA-------T-TTTGA-TG------AAGTTTTAGCCAT-TGT-G-A-CTTTTGTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCGA-------------C-T-TTT-TTT---TT---------CACCAC--CGAC-TTTA-AAT-AA---A---TTA-----G---ACACA-AT--------TA-----C-ATTTGTAAC-GGAC--A-AACAGGG-CAG-G--C-------------------TTTATGG---TTTTCAACT-TTTTGGT-ACG---AA-TATAT--A---A-ACT-----------------GTCAT----------------TCTC--ATTTTAA--TAATTT----T-TGGCACA--C---G-A-GGGA-CT------GA-TCTCG-CTG--T-GTTA---TTCTAA--TG------CCGTGATGG--TCTTTGC----T-T--T---T----TGT
gi|5 : cagtggccgtagctaggaaattttgccagtgtatcataaatcggcaggggggtctggggggacgccgtttaagccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcaattttttttatgtacgatatgtttaatttacaatatttacataagtatgtgtaaa-AACAGGGGCAG-G--C-TATATTCA--AATA----GCTATGGTG-TTTC-AAAT-TTC-GG--ACG---AAATATATTTA---A-ACTTG---AAATTAAAACGAGTTATAAA-GCTGT---TC-ATCTC--AATTTAA--TAAGTTG---T-T-GTGCA--C---A-ACGGGAGCT------GACTCTCA-TTGAAT-G-TAATATTTTAAA-TG------CCGTGATTG--TCGTTGC----TTTGATA--T----TATT--TT--------------GAG-ATAA---------T-A-A-AAGATT--A-TATAT-GACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-CAAAATTAGAG-GT---AGA-ACAAAAGTATGTAG-TACAAAAATTGGTGAAATACGT--TACGGTAA---TGTATGG-AAAGA-CTAGTATT-TACCGG-A-AT-T---GGC---------A-ATA--------GCAAG-----TA---A--TGCAAGAT----T---A-TTA-------------------TC-TATG--G------------------------A--------------------GTC---AAGAG--C-AA-ATCGAT--TGA-TT--TAC-G-TA---------CAA-AAA--------T---------AA----G-AC------------AAT------------A------------TACTAAAAAAAGATC-TATT----------G-C------T-TTGCAAAT---------T-CCTGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAAGG-GCGCCTACGC
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gi|6 : AAAAGCTGT---TC-ATCGC--ATTTTAA--TATTTT----TAT-GTACA--C---G-A-GGAAGCTGCATGGGA-TCTCGATTG--T-G-TA---TTTTAA--TGT-----TCGTGATTGTATTGTTGCTTTTTAT--TAATT----TGTT--TT--------------TCA-T-AA-T-----TTT-T-A-TTTATTGGT-TGTATTGAC-TGTTCTTGCA--GTA-Attatgtacacgaggaagctgcatgggatctcgattgtgtattttaatgttcgtgattgtattgttgctttttattaatttgtttttcataatttttatttattggttgtattgactgttcttgcagtaagtcatggtagtatacgataattgaaaggcgacgggataattacggaattaggccggtggcgccgatacgcaacagcgcagatcttattctaaggagtcgcaagaatgcaattccatgtgtttactacataacataaggacaatacacgccaaaataaaaataaaatctatatatatgtgacgctattgcataattctgttgtattacatttgcgttatttatcttggcgcgcgaagagtgtt
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gi|8 : ttattatagagatatgctacaatgttacaattttgaacatactgtaatgtggtaagacGGAAAAAATGCT--------ATGA-AA-CA-----------GCAG-AAACC-------A----ACTGC-A--TA-T-------GAATT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCGACGAA--AA-T--AAA--A-CA--TA--------------------------------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGT-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-A-CCA--T-CCACCTA-------------C-T-TTT-TTT---TTTCTT--TTTCATC-CAGCGAC-TTTA-AAT-AA---AATAT-A-----G---ACA-----------C-TA-----C-GATT---AC-GGAC--A-AACAGG--CAG-G--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTCCAAAT-TTC-GGT-ACT---AA-TATAT--A---A-ACT-G---AAA-----ATGGGATATTAAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTTAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---G-A-GGGA-CT------G----------------------CTTTAA--TA------CCGCGATGG--TCGTTGC----T
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gi|27 : A-----------GCGG-AAACC-------A----AATGC-A--TA-TAATTATAGACTT--T--T---AATATT-AATATATT----A--A------G-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAT-ATG
gi|28 : tcaagggtttttttttaatgaatgttacaatttacatactgtatgtgtaaaggaa-CA-----------GCTG-AAATC-------A----ACTGC-A--TA-T-------GAC-T--T--T---GATAT--GAGGCATTTTGAATCA------GTTTCTATTCTTCACA--AA-C--AA
gi|29 : gttacaattttacatactacataatgataagggaaattgttaactcagagttaaaaaaacccggatgccc-------------------TC-TATG--G------------------------A--------------------GTT-C-AAGAG-GC-AAATTCGATG-TGT-TT---AC-A-TA---------CAA--CA--------T---------AA----G-A-------------AAT------------A------------CA------------C-TA---------------------------AAAAAAAGATCTAT-TCTGT-A---TTTT-A-TT-C-ATTTTGCGCTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
gi|3 : atgcagattatAAAATATT-TAT----ATGA-AA-CATGGATGCCCCAGCGA-AAACC-------A----ACTGC-A--TT-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGTATTTTAAACTA------A-CTCTACTTTTCAAA--AG-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTA-------------------------GA-TG------A----C-AAACAT-T-T-G-A--------TCAA-GTTTT-A-CTA--T-TG--TGA-------------C-T-TCG-TTCAAATTTGAA--C--CACC-CGCCGAC-ATT----------------------------CA---ACA--AAAT----------------------GC--A-AGCAG---CAG-G--CATACACTCA--AA-A----TTTATGATG-TTTCTAGAT-TTC-GGT-TTG---AA-TATTT--A---A-A-------------------GTTA--AAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTTGA--TAATTT----C-A-GTACA--C---GGA-GGGA-CT------GA-TTTCG-CTG--T-G-TA---TTTTAA--TG------CCGTGATTG--TCGTTGC----TTT--CA--T----TGTT--TCTTTTTTTTTTTTTACAA-A-AA-T-A---TTTTG-A-ATTGCT--T-TGTGTAGCCATGCCCTTGCGTTGAA-AACT-TAAAACCAGAT-AT---AGA-A-AAA-GTATGTAG-TACGAAAATGTGT--------T--AACA-TAA---TGAATGG-AAAGA-C-G---TT-TCTCCG-A----------C---------A-ATA--------TC-----CC-TA-G-A--TA-AAAAT----GA--A-G-------------------------A----A------------------------A--------------------------AAGA----------CG-TA-TGC-TT--------TA---------CAA-A-A--------T-----------------------------------------------------------T-------------C-TGT-----------G-C---------------A---------T-TC--------------------ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGCc
gi|30 : cctggattttcaaggtttttgtctcaaaatgcaacaattttacatactgtatgtgtaagggaaatgttgaatttaaacA-----------GCAG-AAACA-------A----ACTGA-A--CA-T-------GACGT--T--T---TATAT--AACGCATTTTGAACCA------G-GTCTTTTcac
gi|31 : tacaattttacatactgtatgtgtaagggaaatgttgagttatatggaacacggttgccctAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCGA-------------C-T-TT----------------------------AAA-TCTA-A-T-AA---AGTAT-A-----G---ACAGC-ATG--C--T-CG-----C-TATT---AC-GGAC--A-GGCAGG--CTA-G--CATACACTCA----------------GCG-TTTCCAGAT-T
gi|32 : ---T-A-----G---ACAGA-ATA--------------C-AATT---GC-GGAC--A-GACAAG--CAG-G--CATAC--TCA--AA-A----TTTTTGGTG-TTTCTAGAT-TTC-GAT-ATG---AA-TATAC--A---A-ACT-G---AAA-----ACGA
gi|33 : g----T-T-GTAAA--C---A-A-GGGA-CT------GA-TTTCC-TTG--T-G-TT---TTTGAA--T
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gi|36 : tcGTATGG-AAAGA-C-GGTATT-TTCCGG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GTAAGG-TT-TATG-A--TG-AAAAT----TG--A-GTA-------------------cac
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gi|5 : cagtggccgtagctaggaaattttgccagtgtatcataaatcggcaggggggtctggggggacgccgtttaagccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcaattttttttatgtacgatatgtttaatttacaatatttacataagtatgtgtaaa-AACAGGGGCAG-G--C-TATATTCA--AATA----GCTATGGTG-TTTC-AAAT-TTC-GG--ACG---AAATATATTTA---A-ACTTG---AAATTAAAACGAGTTATAAA-GCTGT---TC-ATCTC--AATTTAA--TAAGTTG---T-T-GTGCA--C---A-ACGGGAGCT------GACTCTCA-TTGAAT-G-TAATATTTTAAA-TG------CCGTGATTG--TCGTTGC----TTTGATA--T----TATT--TT--------------GAG-ATAA---------T-A-A-AAGATT--A-TATAT-GACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-CAAAATTAGAG-GT---AGA-ACAAAAGTATGTAG-TACAAAAATTGGTGAAATACGT--TACGGTAA---TGTATGG-AAAGA-CTAGTATT-TACCGG-A-AT-T---GGC---------A-ATA--------GCAAG-----TA---A--TGCAAGAT----T---A-TTA-------------------TC-TATG--G------------------------A--------------------GTC---AAGAG--C-AA-ATCGAT--TGA-TT--TAC-G-TA---------CAA-AAA--------T---------AA----G-AC------------AAT------------A------------TACTAAAAAAAGATC-TATT----------G-C------T-TTGCAAAT---------T-CCTGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAAGG-GCGCCTACGC
gi|6 : GAC-TTTA-AAT-AA---A---A-AATCAGG---ACAGA-ATA--AA-T-TA-------AATT---AC-GGGC--A-AACAGG--CAG-GGCCATACACTCA--AA-AGCTGTTCATCGCA-TTTTAATAT-TTcc
gi|6 : AAAAGCTGT---TC-ATCGC--ATTTTAA--TATTTT----TAT-GTACA--C---G-A-GGAAGCTGCATGGGA-TCTCGATTG--T-G-TA---TTTTAA--TGT-----TCGTGATTGTATTGTTGCTTTTTAT--TAATT----TGTT--TT--------------TCA-T-AA-T-----TTT-T-A-TTTATTGGT-TGTATTGAC-TGTTCTTGCA--GTA-Attatgtacacgaggaagctgcatgggatctcgattgtgtattttaatgttcgtgattgtattgttgctttttattaatttgtttttcataatttttatttattggttgtattgactgttcttgcagtaagtcatggtagtatacgataattgaaaggcgacgggataattacggaattaggccggtggcgccgatacgcaacagcgcagatcttattctaaggagtcgcaagaatgcaattccatgtgtttactacataacataaggacaatacacgccaaaataaaaataaaatctatatatatgtgacgctattgcataattctgttgtattacatttgcgttatttatcttggcgcgcgaagagtgtt
gi|6 : gactttaaataaaaaatcaggacagaataaattaaattacgggcaaacaggcagggccatacactc-------------------TC-TA----AGG----------------------A--------------------GTCGC-AAGAATGC-AA-TTCCATG-TGT-TTACTAC-A-TAACATAAGGACAATACA--------CGCCAAAATAAA----A-AT------------AAA------------A------------T-------------C-TATATATATGTGACG-C------TATTGCATAA---------T-TCTGTTG---T----A-TTAC-ATTT-GCGTTATTgtcatggtagtatacgataattgaaaggcgacgggataattacggaattaggccggtggcgccgatacgcaacagcgcagatcttattctaaggagtcgcaagaatgcaattccatgtgtttactacataacataaggacaatacacgccaaaataaaaataaaatctatatatatgtgacgctattgcataattctgttgtattacatttgcgttatttatcttggcgcgcgaagagtgtt
gi|7 : gactttaaataaaaaatcaggacagaataaattaaattacgggcaaacaggcagggccatacactcaaaagctgttcatcgcattttaatatttttatgtacacgaggaagctgcatgggatctcgattgtgtattttaatgttcgtgattgtattgttgctttttattaatttgtttttcataatttttatttattggttgtattgactgttcttgcagtaagtcatggtagtatacgataattgaaaggcgacgggataattacggaattaggccggtggcgccgatacgcaacagcgcagatcttatGAAGAAATATG-C-T----ATGACAA-CA-----------GCAG-AA-CTTCTCTATA----AC-GC-A---A-T-------AATTTACTGAT---GATAT--TAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCGTCGAT--AA----------------A-CG-------TAA-AAGAC-AT-TA-------T-TT-GAATG------AAGTTT-AAC-AT-TGT-GGA-CTTT-GTTCAAGATTTG-AGCCA--T-CCACCGAGCGCGTTCATTTTT-T-TCT-TTT---TTTCAT--C--CA---G--CGAC-TTTA-AAT------A---T-A-----A---ATATA-G-A--CAAC-TA-----CGAATT---ACGGGACAAA-AACAGG--CAG-G--CATACACTCA--AA-A-----TTATGGGGATGTCCGAACAATA-AGT-GCGCGTAG-CAGACG-A---A-ACG-GCCTAAACTT--ACTA--TATATAA--TGT---TCAATCTC--A-TTAAA--T-ATTT----T-C-GTACA--C-------GGGA-Ctatcttggcgcgcgaagagtgtt
gi|8 : ttattatagagatatgctacaatgttacaattttgaacatactgtaatgtggtaagacGGAAAAAATGCT--------ATGA-AA-CA-----------GCAG-AAACC-------A----ACTGC-A--TA-T-------GAATT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCGACGAA--AA-T--AAA--A-CA--TA--------------------------------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGT-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-A-CCA--T-CCACCTA-------------C-T-TTT-TTT---TTTCTT--TTTCATC-CAGCGAC-TTTA-AAT-AA---AATAT-A-----G---ACA-----------C-TA-----C-GATT---AC-GGAC--A-AACAGG--CAG-G--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTCCAAAT-TTC-GGT-ACT---AA-TATAT--A---A-ACT-G---AAA-----ATGGGATATTAAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTTAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---G-A-GGGA-CT------G----------------------CTTTAA--TA------CCGCGATGG--TCGTTGC----T
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blockSeqs : CATGAAT C A TGGATGCCCCA A TCTCTAT TGCA C TC A AATTATA AC GA TTTG TT ACATGTA T AG A . . A A T CG A C GGGGCGG G T A AGACTT A G G G TTT T G A AT C GCGCGTTCATTTT TT G AAA C TGA TT CCCGC T . A AAT AAATCAGG GA ACCAAATCTATTACCCAGAT G AA C GG A GC CA T GCTG A A T T CGT A ATTT . GCCT TTAAA C A AG TCA A CA CC AATC A G . GTTG C G GCATGG C GA AATGTAATA AG TCAACA TA TTTTTATTAATT . TTTTTTTTTTTTTAC G T GCA TA T GGT T . A A . C C TGTATGTAGTACAAAA GAAATACGTT GG AAA . C T . C A CA . A TACATTTTG . GTCTTATT GGT A C C CT CA A GAT T CTTTGAAAATGTAGATTATTCTGAATTGGGA CA T C T A CA ACT AG ACATAAGGA T CGCCAAAATA ACCT C . ATACTAAAAAAAGAT G ATATATGTGAC G AAACGG A A AAAGATCTA A GTATAC T A T T A C
blockSeqs : TCAT . . A . . . . . . . . . G TA A . . . . . A . . . A . . . T . . T . C . CT . . . . . . TC . . C T . TCCAG . . . . TATATTG GA ATAAATTACAATT . . . G . T . . . . . . . . . TTA . TG CTT C A AG . . . . G . . . GG . G . . G CATTTA A T . TATTATGTTT . C . . AGA TG . TC T . . . . . . AGTATGTAGTACAAAA TATT G . . . . . C . A . . . . . AG . C T . A . G . TTGAAAATGCAGATTATTCTAATTGAA GC . . A . T T AA A . CATTTCATT A . . ATACTAGAAAAAGAC . T . . . T . . GTATAC . . . . . .
blockSeqs : AGT . . . . . . . . . . . . G TA A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . CT . . . . . . T . . C T . CCAC . . . . TAAAGC GA ACAACTACGAATT . . . . . . . . . . . . . . . GA . G . A A AC . . . . . . . . G . . . . A TGGTA . . . TTTGATAT . C . . AA TT . T T . . . . . . AGCATGTATTACGGAA CA G . . . . . C . A . . . . . AG . C . . A . G . TTGAAAATGCAGATTATTCTAATTGAA C . . . . T T G . . TA . . . ACACTTAAAAAGAT . . . . . A . . AATTT . . . . . .
blockSeqs : CAT . . . . . . . . . . . . G T A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . TT . . . . . . T . . C C . TAC . . . . GTATAG GG GCTCGCTATT . . . . . . . . . . . . . . . C . G . C A AG . . . . . . . . T . . . . T TGTTA . . . TATTAT . A . . GA A . T T . . . . . . AGTATGAGTACGAAA TT A . . . . . C . T . . . . . CA . C . . A . G . CTTAAAAATGCAGATTATTCTATGGA C . . . . T T G . . T . . . TACACTTAAAAGAT . . . . . G . . ATTTT . . . . . .
blockSeqs : CAT . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . CT . . . . . . T . . C C . GCC . . . . ATATAG GA TACATTTGTA . . . . . . . . . . . . . . . A . G . C G AG . . . . . . . . G . . . . G TGCA . . . TTTCAT . G . . GA A . T T . . . . . . GTATGTAGTACGAAA TT G . . . . . C . A . . . . . GG . G . . A . C . TTTAAAAATGCAGATTATTTTATGGT C . . . . T G G . . T . . . ACACTTAAAAAGAT . . . . . G . . GGT . . . . . .
blockSeqs : CAT . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . CT . . . . . . T . . T T . CCC . . . . TTAG GC AAATTAAATT . . . . . . . . . . . . . . . A . G . C A AG . . . . . . . . A . . . . C TGTA . . . TTTT . T . . TA T . G T . . . . . . AGTTGAGTACGAAA TT G . . . . . A . A . . . . . GG . C . . A . G . TCTAATGA C . . . . T T G . . T . . . ACACTTAAAAAGA . . . . . G . . TAT . . . . . .
blockSeqs : TAT . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . CT . . . . . . T . . C T . CC . . . . TAG GA GTTACAATA . . . . . . . . . . . . . . . A . G . C A AG . . . . . . . . G . . . . G TGTT . . . TAT . C . . AA A . T T . . . . . . AGTATG TT G . . . . . A . A . . . . . AG . C . . C . G . TCATACGG C . . . . C A G . . T . . . TAAT . . . . . T . . TGT . . . . . .
blockSeqs : CT . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . CT . . . . . . T . . G A . C . . . . TAG CA ACAATTAC . . . . . . . . . . . . . . . T . A . T A G . . . . . . . . A . . . . A TGTA . . . . . . . GA A . T A . . . . . . ATA TA A . . . . . T . A . . . . . GG . T . . A . C . TCTATGGA C . . . . A T A . . C . . . ACA . . . . . G . . GT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . CT . . . . . . T . . C T . G . . . . TAG GA AACAATAA . . . . . . . . . . . . . . . A . G . . T G . . . . . . . . G . . . . C TGTT . . . . G A . T T . . . . . . TA TA G . . . . . C . A . . . . . GG . C . . A . A . TCTATGGA C . . . . T T G . . T . . . AT . . . . . G . . GT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . C T . . . . . . TAG TA CTACGATT . . . . . . . . . . . . . . . A . G . . . A . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T A . A T . . . . . . TA T . . . . . . T . A . . . . . G . . . . A . G . TCTAAGGA C . . . . . . A . . T . . . AT . . . . . G . . GT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . TAA . ACAATT . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . TA . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A . CTTAAA . . . . . . . G . . T . . . AT . . . . . . . . GT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACAATT . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . CTA . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . GT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAAAT . . . . . . . . . . . . . . . . . AAA . T . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ******* A****** ** ** ** ** A* CT* T** CCC*** GA* **** ** TATTAT************ ** GA***** *** AGTATGAGTACGAAA** TN********** G* **** T* ************
originalCons : GGAAAAAATGCT-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGG-AAACC-------A----ACTGC-A--TA-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGT-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCGA-------------C-T-TTT-TTT---TTTCAT--C--CACC-C--CGAC-TTTA-AAT-AA---A---T-A-----G---ACAGA-ATA--AAAT-TA-----C-AATT---AC-GGAC--A-AACAGG--CAG-G--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTCCAAAT-TTC-GGT-ACG---AA-TATAT--A---A-ACT-G---AAA-----ACGAGTTATAAAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTTAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---G-A-GGGA-CT------GA-TCTCG-CTG--T-G-TA---TTTTAA--TG------CCGTGATTG--TCGTTGC----TAT--TA--T----TGTT--TT--------------CAA-A-AA-G-A---TTT-A-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-TAAAATTAGAG-GT---AGA-A-AAAAGTATG-AG-TACGAAAATTGGT--------T--TACG-TAA---TGTATGG-AAAGA-C-GGTATT-TCCCGG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GCAAGG-TT-TACG-A--TG-AAAAT----TG--A-GTA-------------------TC-TA----A------------------------A--------------------GTC-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATG-TGT-TT--TAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AA----G-AC------------AAT------------A------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-TCTGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
finalCons : GGAAAAAATGCT-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGG-AAACC-------A----ACTGC-A--TA-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGT-G-ACT-TT-GTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCGA-------------C-T-TTT-TTT---TTTCAT--C--CACCC---CGAC-TTTA-AAT-AA---A---T-A-----G---ACAGA-ATA--AAAT-TA-----C-AATT---AC-GGAC--A-AACAGG--CAG-G--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTCCAAAT-TTC-GGT-ACG---AA-TATAT--A---A-ACT-G---AAA-----ACGAGTTATAAAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTTAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---G-A-GGGA-CT------GA-TCTCG-CTG--T-G-TA---TTTTAA--TG------CCGTGATTG--TCGTTGCTATTAT------------TGTT--TT--------------CAA-A-AAGA-----TTT-A-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-TAAAATTAGAG-GT---AGA-A-AAAAGTATGAGTACGAAA--ATTGGTTN----------ACG-TAA---TGTATGG-AAAGA-C-GGTATT-TCCCGG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GCAAGG-TT-TACG-A--TG-AAAAT----TG--A-GTA-------------------TC-TA----A------------------------A--------------------GTC-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATG-TGT-TT--TAC-G-TA---------CAA-ACA--------T---------AA----G-AC------------AAT------------A------------T-------------C-TAT-----------G-C------T-TTGCAAAA---------T-TCTGT-G---T----A-TT-C-ATTT-GCGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|35 ): AGTGGCGTAGCAAGGAAATTTTGCAGTGTATTCAAAATCGGCAGGTGGTCTGGGGGGCGCCGTAAGCCCCC
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Unaligned ( gi|39 ): AGTGGCGTAGCTAGGAAATTTTGCAGTGTAT
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Reference ( family-406 ) : GGAAAAAATGCT-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGG-AAACC-------A----ACTGC-A--TA-T-------GACTT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCTTCGAA--AA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--CTTAA-ATGAC-AAACA-------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGT-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-AACCA--T-CCACCGA-------------C-T-TTT-TTT---TTTCAT--C--CACC-C--CGAC-TTTA-AAT-AA---A---T-A-----G---ACAGA-ATA--AAAT-TA-----C-AATT---AC-GGAC--A-AACAGG--CAG-G--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTCCAAAT-TTC-GGT-ACG---AA-TATAT--A---A-ACT-G---AAA-----ACGAGTTATAAAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTTAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---G-A-GGGA-CT------GA-TCTCG-CTG--T-G-TA---TTTTAA--TG------CCGTGATTG--TCGTTGC----TAT--TA--T----TGTT--TT--------------CAA-A-AA-G-A---TTT-A-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-TAAAATTAGAG-GT---AGA-A-AAAAGTATG-AG-TACGAAAATTG---GT--------TNACG---TAA---TGTATGG-AA--AGA-C-GGTATT-TCCCGG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GCA-AGG-TT-TACG-A--TG-AAAAT----TG--A-GTA-------------------T-C-TA----A------------------------A--------------------GTC-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATG-TGT-TTTAC-G-TA-CA-AACA--------T-AA----G-AC------------AAT------------A------------T-------------C-TAT-G-C------TTTGCAAAA---------T----------TCTGT-G---T----A-TTC-ATTT-G-CGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
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gi|13 : ttttacatactgtatgtgtaaaG-A--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTTCAAAT-TTC-AGT-GCG---AA-TATAT--A---A-AAT-G---AAA-----ACGGGATGTAAAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTCAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---gacatacactcaaaatttatggcgttttcaaatttcagtgcgaatatataaaatgaaaacgggatgtaaaagctgttcatctcatttcaataatttttgtacac
gi|14 : ttttacatactgtatgtgtaaaggaaaaagtgctatgaaagagcaggaaccatgcaactgcatatgacttttgatataaggcattttgaactagttctattcttagaaaacaaaacatacgaaccttaaatgacaaacatttgatgaagtttaaccattgtgactttgttcaaatttgaaccatccacctactctttttttttcatccaccGGAAAAATGCT-CAT----ATGA-AA-CA-----------GCGGAAAACC-------A----A-TGC-ATCTA-G-------GACTT--T--T----ATAT--A--GCGATTTGAACTA------G-CTCTCTTCTTCGAAAGAA-C--AAA--A-CA--TA-CGAAC--TT--A-ATGAC-AAACAGGGGCGGTGTG-GA-TGAGACTTAAGTTTAAACCATGTGTCG-A-C-TT-GTTCAA-ATTTG-AATCAATT-CCACCAA-------------C-T-CCTGTTT---TTTCAC--T--CAGC-C--CGACTTTTA-AAT-AA---A---T-A-----AAGCACAGA-ATACCAAATCTATTACCC-AGAT---AC-GGAT--ACAACA----CGG-G--CA
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gi|16 : aAA-A-AA-GCA---TTT-T-A-AATGTT-----GTCTTGAAA-GTTCTTG--------AATT-TAA-------G-GT---AGA-A-AAA----------TA-----ATTG---GT--------TTATG---TAA---TGTATG--AA--AGA-C-GGTATT-TCCCGG-A-TT-T-ATGGC---------A-ATA--------GTA-CAG-TTAAACG-A--TG--AAAT----TGATA-GTACTTTGAAAATGTAGATTATT-C-TG----AATTGGG------------------A--------------------GTT-CAAAGAG-GC-AATTTCGGTG-CG--TTTACAG-TA-C--AACT--------TAAA----G-AC------------AATTACACTTAAAAGA------------T-------------CGGAT-G-C------TTTTAACAA---------T----------TCTAT-G---T----ATTTC-ATTT-G-CGTTATTGCGTAAGGG-GCG-CTACGC
gi|17 : a-A---TTT-A-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-TGAAATTAGAG-GT---ATA-A-AAA--T-------------AATTG---GTTA------TTAAA---AGA---TGTATGG-AA--AGA-C-GGTATT-TCC--G-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------G-G-ACA-TT-AACG-A--TG-AAAAT----TG--A-GTATTGAAAATGCAGATTAT--T-C-TAATTGA------------------------A--------------------GTC-C-ACGAG-GC-AA-TTCGGTG-CG--TTTAC-G-TA-CA-AACA--------T-AA----G-AC------------AAT------------A------------CACTTAAAAAGA--C-TAT-G-C------TTTACAAAA---------T----------TCTGT-G---TATACA-TTC-ATTT-G-CGTTATTGCGTAAGGG-GCG-c
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gi|25 : --TG-CAGAT----TC--A-ATA-------------------T-CATAC---G------------------------G--------------------GTT-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATGATGT-TTAAC-AATAACA-AACACATTTCATT-AA----GCAC------------AATTA----------A------------T-------------A-TAT-A-CAAACGGTT--CTAAA---------TA---------TCTGT-AATTT----A-TTCTATTT-G-CGCTATTGCGTAAGGGAGCG-CT-CGC
gi|26 : at--TT--------------AAA-A-AA-G-A---TTTTA-A-ATTGTT--T-TGTATTGACATGTTCTTGCGTTGTA-AACT-TAAAATCAAAG-GT---AGA-A-AAATGTATGTAG-TACAAAAATTG---GT--------TTTTG---TAA---TGTATGG-AA--AGA-C-GGTATT-TTCCGG-A-AT-T-ATGGC---------A-ATA--------GTA-AAG-TT-c
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gi|7 : gactttaaataaaaaatcaggacagaataaattaaattacgggcaaacaggcagggccatacactcGAAGAAATATG-C-T----ATGACAA-CA-----------GCAG-AA-CTTCTCTATA----AC-GC-A---A-T-------AATTTACTGAT---GATAT--TAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCGTCGAT--AA----------------A-CG-------TAA-AAGAC-AT-TA-------T-TT-GAATG------AAGTTT-AAC-AT-TGT-GGA-CTTT-GTTCAAGATTTG-AGCCA--T-CCACCGAGCGCGTTCATTTTT-T-TCT-TTT---TTTCAT--C--CA---G--CGAC-TTTA-AAT------A---T-A-----A---ATATA-G-A--CAAC-TA-----CGAATT---ACGGGACAAA-AACAGG--CAG-G--CATACACTCA--AA-A-----TTATGGGGATGTCCGAACAATA-AGT-GCGCGTAG-CAGACG-A---A-ACG-GCCTAAACTT--ACTA--TATATAA--TGT---TCAATCTC--A-TTAAA--T-ATTT----T-C-GTACA--C-------GGGA-Cttctgttgtattacatttgcgttatttatcttggcgcgcgaagagtgtt
gi|8 : ttattatagagatatgctacaatgttacaattttgaacatactgtaatgtggtaagacGGAAAAAATGCT--------ATGA-AA-CA-----------GCAG-AAACC-------A----ACTGC-A--TA-T-------GAATT--T--T---GATAT--AAGGCATTTTGAACTA------G-CTCTATTCGACGAA--AA-T--AAA--A-CA--TA--------------------------------T-TT-GA-TG------AAGTTT-AACCAT-TGT-G-A-CTTT-GTTCAA-ATTTG-A-CCA--T-CCACCTA-------------C-T-TTT-TTT---TTTCTT--TTTCATC-CAGCGAC-TTTA-AAT-AA---AATAT-A-----G---ACA-----------C-TA-----C-GATT---AC-GGAC--A-AACAGG--CAG-G--CATACACTCA--AA-A----TTTATGGCG-TTTCCAAAT-TTC-GGT-ACT---AA-TATAT--A---A-ACT-G---AAA-----ATGGGATATTAAAGCTGT---TC-ATCTC--ATTTTAA--TAATTT----T-T-GTACA--C---G-A-GGGA-CT------G----------------------CTTTAA--TA------CCGCGATGG--TCGTTGC----T
gi|9 : gttttttttatgatgatattgtctaaatgttacaattttacatactgtatgtgtaaa----T-T-GTAAA--C---G-A-GGGA-CT------GA-TTTCC-TTT--T-G-TT---TTTGAA--TATCAACACCAATATTG--TTTTTTC----TAT--TA--TGTTTTGTT--TT--------------CAAGA-AA-G-A---TTT-TTA-ATTGCT--T-TG-------AT---CTC---------AAT----AAATCAGAT-GT---AGA-A-AAAAGCATGTAT-TACGGAAATTG---GT--------TAACG---TAA---AGTATGG-AA--AGA-C-GGCATT-TTCCGG-ACAT-TAATAGCTACATTTTGA-ACAGTCTTATTGCA-AGG-TT-TACG-A--TG-AAAAT----TA--G-ATA-------------------T-T-TA----A------------------------AAATGCAGATTATTTTATGGTGCC-C-AAGAG-GC-AA-TTCGATG-TGCATATAC-G-TA-CA-AACA--------T-AA----A-AC------------AAT------------A------------TACTAGAAAAAGACT-TAT-G-C------TTTGCAAAA---------T----------TCTGT-G---T----A-TTC-AT----------TTGCGTAAGGG-GCG-CTACGCtt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|35 ): AGTGGCGTAGCAAGGAAATTTTGCAGTGTATTCAAAATCGGCAGGTGGTCTGGGGGGCGCCGTAAGCCCCC
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Unaligned ( gi|39 ): AGTGGCGTAGCTAGGAAATTTTGCAGTGTAT