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gi|3 : T-ACAT-GT-ACCAGC-AATTT-G-AT-TTTAT-TCC---TTTAATCGG-TG--T--CA---GA--GATAGCTATCTCTA-TGTA-TTTAGGT-AAATAT-T--TTTTT-----ACACGA-TCATA-TTA-CAG--GAA-GCATCTGC-AGGGATA-TAT-ATCTTCTATTTGTT----GT--TCAATTTAC-C-TC--TTGAACAACAGAGGGCAG-AT--GGTGAT-TTAT----TTTT-GTT-TTA-TTTA--ATTTTTT---C-AGA-AG-A-A-AAAA---TG-AGTAT-CTGTT---TTT---C----TACTT-A-----GTTT---GCTTTTCATTCA-AAAAGTTCTA-TTAACCA---GTAA-ATG-ACACT--AT-------CGTTCAT-GTTC--T--TTTTATTTCA-TGA--GTT--GCATCTGCAAA-TT----TA-CTATTTGC--TTAC-ATAAAAGTTCTCTACACAA-AC--AAAAGA-AA-TGTGTG-TT-TTATTTTCCAT-TAAT-CAAGA--ATACGTAA-AT--GAT----ACATGTAA-GGC-CAAAA--CT---GCG--CGCTCGATTT---CTATTAGAAACCT----T-------C-CGTTAA--AT-G--TGCTCGC-A--GGTCGTTCT-------------T-CACAC---A-G-GTATCATT-CTTT--T--AC-TATAT--C-AGATACTTCA---A-TTT---T-GTAAACTAAGACTGAGATTA-TTATA-AAA---T-T-T-TCAAATAC--TA--TT-AAAAG-G-ATAA--CGCTCCGC-GCTT----C---T-T-C-------CGA--C-T-T---GCT-TAGTATT--ACG-TGC-TC---C-GTTCGA-----T----T---A---AC--GGA--T-CAGTGC-TC-CAG-TGGTTTAGCGCGA---CC--GT--------ACAATTTTT--C-------------A--CCCGGTCATTT---GT-ATT-TTTCGA-A-AT-GT-G-GA--CAAA-TGA-G-GCAGA-GCTT--C-GGT---G----------T---ATT-C-TTTCTTATAGCAATT-TAGTCAAA-A--G-AC-AGTATTTGGGC--TACAAAAA----ACTG-----GCCGT-----AAACACGA-------GT-----T--ACCG--A----AATTACTA----C-AAGC---CACA-TAAG-TAC-ATTT--GCCT--T----CA-ACAGCCGT-AA------AT--A-TCG-TACCCTT--TT--------------T-C----AA--GCAAAG-TTC--A--G-----ATACG-GAA-AG-GG-C---T-AC-T--T---GA---ATCAATGC----------TTT-G-CTACT-T-A--G-ACAGAAA---AAATGTA---CT--TG-TCT---CA--A-GC---TT-TGT-TT---A-----T-TTG-A-C-TTT---TGTTTCTGTAACAATTT----G-TT--T--GGTAC---A-A-T--GATCCTGTTAAATAT-----G--CAAAA-TAAC--AA-AC-TTCAACATAGGT--TACC-----ATTGCATT-AGC-C---GC-CTCACCAC--TTC-ATG-CT--CCGTGG-GCA-----T-CC-G---GATCCCGCCGC-GG-CGTA-CGGG-ATC-GGCGATACACGG
gi|21 : c-AGTAT-CTGTTGTATTT---C----T--TTTA-----GTTT---GCTTT-CATTCATAAAAGTctg
gi|5 : AT-CAAAA--A-----AG-AT--G-TCCGAGCACTTAA-GAC-CAAAA--TC---GCT--CGCCT-ATT---------AAAA--CC----TATTATTGC-TG-TAA--GAGG--TGCT-GCAA--GGTTGTTG--------------T-C-TACTTAA-GT-C-TTGTT-CTTT--G--AT-CATGTACC-AGAT-CTCCATATA-CTT---GTGTAA-CTAAATGTGAGA-TAGTT-TATAAACTCA-TCT-TCACATACGGTACTTT-TGAAC-TTGTA----GGTCCGC-G-TT--------T-T-CTACGACGGGA-TC-T-TCG-G-T-TAGAA-T--ACG-TGC-TCTTCC-GT--GG-----T-A--T---A----C-GAGACGT-CA-TGC-TC-C-G-TGG-TTAGCG-GA---AC--GT--------A-AA-TTTT--CTCCCACTCCGCTTG--AC--GTC--TT---GTTATT-TCTAAT-A-GT-GT-G-GA--CAAATTAA-GCGCAGATGTCT--T-GGT---G----------T---A-G-T-CC--TTA----AATT-TA-TC-AA-G--C-AC-A-TA-T--GGCATTAT---AACAAGACTTATTGAGTTGT-----AAACC-GAGGTAACGA------A--A-CG--AATCTA--TACTATATGT-AAGC---TACA-AAAG-TAT-ATTTG---CC--T----CA-A-AG-AGT-AA------ATCCA-TCG-TA--CTTAATT--------------T-C----AA--GC-AAT-TTCCAA--G-----ATATG-GAA-A--GA-TG--T-AC-TCCT---GA---AT-AATGC----------TTTGGTCTACT-T-A--A-CCATGAATATAACTGCACCGCT-CTGTT-T---CA--AGGCTTGTT-T-T-GT---ATATTGT-CTG-A-C-TTT---TG-TTCTGT-ATAATTG----C-TT--T--AGCACA--ATA-T------CTTTTGAATAT-----GTCTAAAA-TATCGTAT-AC-TC----ATCG-------C-----AT--C-TT-AGC-C---GC-CT-GCCACCATG--ATGTTT--CTCT-C-GCACATACT-CCTA---GATGCCCCCGC-GGATATA-T-TG-ACCGGG-GATAGACG
gi|17 : AAGA--ATA---AG-AT--G-T----ACATGTAA-GGC-CAAAA--CT---GCagcg
gi|6 : tacataaatgtagacctacaaatacaacaaacgggtaaatatgaaatactttctatgctgattttgtacatttagtctagattgTA---AG-AT--G-T----ACATGTAA-GGC-CAAAA--CT---GCT--CGTC--ATTT---CTtc
gi|14 : T--G-T----ACATGTAA-GAC-CAAAA--TT---GCT--CG-CCTATT-----TA-TATAA--CCTTATT-------C-TG-TAA--AT-G--TGCT-G--A--AGGTGTTC--------------T-CACTT---A-GT--ATTGTT-CTTT--T--AC-TATGT--C-AGAT-CTTCA---A-TTT---T-GTACACTAAGATTGAGA-TA-TT-TA-ATC---A-T-T-TCAAATAC--TT--AT-TGAAT-T-GTAA--AGGTCCGC-G-TT----C---T-A-C-------GGA-TC-T-T---G-T-TAGAA-T--ACG-TGC-TC---C--T--GGT----T-A--T---A---AC--GGA--T-CA-TGC-TC-C-G-TGG-TTAGCG-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttttgaaactagattgagaggtagctccggttctttcggatcttgctagtatacgtgcttcgtggtatatatacggatcatgctctcgtggttagcggaccgtaattttctcaccggtcatttgtaatttttatagtgtggacaaatgaggcagagtttggtgtagtcttttagaccatttatcaaagacatagtggctacaaacgcctgaaacagagtaagattactaaatgcgacaaaagtatatatggccctcaaagcgtaaatatcgtacttttttcgagcaaagttcaagatcggaaaaggttacttgaataatgctttgtctattaaacagaaaaatgcactctattaaagctttgtttatcttacttttgttctgtacaattttttggtacaaatgaccctttaataacaaaataacaaacttcaaataggtaccatcatatatgctccgtggcatccggatccctccgcggcgtacggatcgggatacacggcg
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gi|18 : aggctacaaactgccgtaaacagagtaTT--TT--------------CTC----AA--GCAAAGTTTC--AC-G-----AT-CG-GAACACTGG-C---T-AC-T--T---GA---AT----------------CTT-GTCGA-TCT-AACT-ATAATAA---AATTGT----CT-Ct
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-3974 ) : AATCT-GGGATAACA-GTTTGC-ATA-AATA-CT-TTA-T-TCCATTT-ATAGTAATTTTT--G-A-CTAGCGATTACATGTT-TGTAAAA--T-T------GTAATG--ACGGT-ATAT-ACAT-GT-ACCAGC-AATTT-G-AT-TTTAT-TTCCT-TTTAAT-GG-TG--T--CA---GA-TGATA-CTATCT-TA-TGTA-TT-TAGGT-AAAATCT-TTTTTT----ACA-C-A-TCATATTACAT--GAA-GCAT--GC-AGGGATA-TATG-ATTTTATTTGTT--GT--TCAATTTAC-C-TC--TTGAA-AACAGAGG-CAG-AT--G-TGAT-TTA-TT-TTTGTT-TT-A-TTTT--ATGTTTTC---AGAAG----A-AAAAAACT-AGTA-TCTGTTGT-TT---T----C----T--C-T-AGTTT---GCTTT-CATTCATAAAAGTT-T-A-T--AC-A---GTAA-AT-GACA--CT--ATCG---TT-A-TGTT--C-T--TTT-ATTTCA-TGA--GTT--GCATCTGT-AAA-TT----T-ACTATTTGC-ATTAC-ATAAA-GTT-TCTACACA-A-ACAAAAGA-AATGTGTGTTT-TTATTTTC-ATCTTAT-CAAGA--ATA---AG-AT--G-T----ACATGT-AAGGC-CAAAA--CT---GCG--C-GC-CC-A-TTT---CTAT-AGAA--CC----T-------C-CGT-AAN-TG--TGCT-G--A--GGTCGTTC--------------T-CACAC---AGTACATCGTT-CTTTT--AC-TATAT--CAG-AT-CTTCA-A-T-TTN---GTA-AACTAAGACTGAGAT-A-TT-TA-AAA---A-T-T-TCAAATAC--TA--TT-TAAAG-T-GTAA--CGCTCCG-CG-TT----C---T-T-C-------GGA-TC-T---T--G-T-TAGTAT--ACGT-GC-TC---C-GT--GG-----TA--TA----A-----C-GGA--TCA-TGC-TC-C-G-TGGTT-AGCG-GA---CC--GT--------A-AATTTT--C-------------G---------ACCGGT-----CATT--TG-TATT-TTTC---------AA-A-GT-GT-G-GA--CA-AA-TG------A-G-GCAGA-G--TT-----GGTG-T----------A-G--CTT--TTATACCAATT-TA-TC-AA-A--G-AC-A-TA-TTGGGC--TAC---AA----ACT------GCCGT-----AAACA------GA-G-T--A-CG--A---------A--TACTA----C-AAGC---CACA-TAAG-TAC-ATT-T-G-GCCT--T----CA-A-AG-C-G-------TAAAT--A--T--CG-TA--C-TT--TT--------------C-C----AA--GCAAAG-TTCAA-G---AT-CG-GAA-A--GG-C---T-AC-T--T---GA---AT-AATGC----------TTT-GTCTA-T-----T-A-T-ACA-G-AA---AAA-TGTA---CT-CTG-T-T---CA--A-----GCTT--T--GT---TT-AT-CTG-A-C-TTT---TG-TTCTGT-ACAATTT----T-TT--T--GGTACA--A-A-T--GATCCTTTTAAATAT-----G--CAAAA-TAAC--AA-AC-TTCAA-ATAGG---TACC-----AT--CATT-AG-CCGC--CT-ACCAC--TT--ATG-CT--CCGT-G-G-CA-----T-CC-G---GATCCCTCCGC-GG-CGTA-C-GG-ATC-GG-GATACAC-G-GCG
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Reference ( family-3974 ) : AATCT-GGGATAACA-GTTTGC-ATA-AATA-CT-TTA-T-TCCATTT-ATAGTAATTTT-TTGA-CTAGCGATTACATGTT-TGTAAAA--T-T------GTAATG--ATGGT-ATAT-ACAT-GT-ACCAGC-AATTT-G-AT-TTTAT-TTCCT-TTTAAT-GG-TG--T--CA---GA-TGATA-CTATCT-TA-TGTA-TT-TAGGT-AAAATC----T-TTTTTTACA-C-A-TCATATTACAT--GAA-GCAT--GC-AGGGAT-ATATG-ATTTTATTTGTT--G--TTCAATTTA-C-CTC--TTGAA-AACAGAGG-CAG-AT--G-TGAT-TTA-TT-TTTGTT-TTA-TTTT--ATGTTTTC--AGAAG----A-AAAAAACT-AGTAT-CTGTTGT-TT---T----C----T--CT-AGTTT---GCTTT-CATTCATAAAAGTT-TA-T--AC-A---GTAA-AT-GACA--C--TATCG---TT-A-TGTTC--T--TTT-ATTTCA-TGA--GTT--GCATCTGT-AAA-TT----TA-CTATTTGC-ATTAC-ATAAA-GTT-TCTACACAA-AC-AAAAGA-AATGTGTGTTT-TTATTTTC-ATCTTAT-CAAGA--ATA---AG-AT--G-T----ACATGTAA-GGC-CAAAA--CT---GCG--C-G-C-CTA-TTT---CTAT-AGAA--CC----T-------C-CGT-AA-ATG--TGCT-G--A--GGTCGTTC--------------T-CACAC---A-GTACATCGTT-CTTTT--AC-TATAT--CAG-AT-CTTCA-AT-TTT---GTA-AACTAAGACTGAGAT-A-TT-TA-AAA---A-T-T-TCAAATAC--TA--TT-TAAAG-T-GTAA--CGCTCCG-CG-TT----C---T-T-C-------GGA-TC-T---T--G-T-TAGTATT-ACG-TGC-TC---C-GT--GG-----T-A--TA-----AC-GGA--TCA-TGC-TC-C-G-TGGTT-AGCG-GA---CC--GT--------A-AATTTT--C-------------G---------ACCGGT-----CATT--TG-TATT-TTTC---------AA-A-GT-GT-G-GA--CA-AA-TG------A-G-GCAGA-G--TT-----GGTG-T----------A-G--CTT--TTATACCAATT-TA-TC-AA-A--G-AC-A-TA-TTGGGC--TAC---AA----ACT------GCCGT-----AAACA------GA-G-T--A-CG--A---------A--TACTA----C-AAGC---CACA-TAAG-TAC-ATT-T-G-GCCT--T----CA-A-AG-C-G-------TAAAT--A--T--CG-TA--C-TT--TT--------------C-C----AA--GCAAAG-TTCAA-G---AT-CG-GAA-A--GG-C---T-AC-T--T---GA---AT-AATGC----------TTT-GTCTA-T-----T-A-T-ACA-G-AA---AAA-TGTA---CT-CTG-T-T---CA--A-----GCTT--T--GT---TT-AT-CTG-A-C-TTT---TG-TTCTGT-ACAATTT----T-TT--T--GGTACA--A-A-T--GATCCTTTTAAATAT-----G--CAAAA-TAAC--AA-AC-TTCAA-ATAGG---TACC-----AT--CATT-AG-CCGC--CT-ACCAC--TT--ATG-CT--CCGT-G-G-CA-----T-CC-G---GATCCCTCCGC-GG-CGTA-C-GG-ATC-GG-GATACAC-G-GCG
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gi|15 : ---T-T-C-------GGAATC-T---T--G-T-TTGTTTTAACGTTGCAGC---C-GT--GG-----TAA--TAAGAACAC-GGA--TCATTGC-TT-C-GATGGAT-AGCG-GATATTC--GTA-------A-AATTTTA-C-------------GATTCAAACCACCATTGAACGCATTTCTG-TATT-TTTTATCATAAAAAA-A-AT-GT-G-TAATCATGA-TGGATCGTA-GAGCCGA-G--TTC----GGTG-T----------A-GGTCTT--TTAGACC-ATT-CG-TT-AA-
gi|16 : gcagctagatcg-A-C-TTT---TG-TTCTGT-ATAATTG----C-TT--T--AGTACG--A-A-T--GATA-TTTTAAATAT-----G--CAAAA-------------------ATACG---TACC-----AT--CATT-AG-CCGC--CT-GCCAC--CT--ATG-TT--CCTC-G-G-CA-----T-CC-G---GATCCCTCCGC-GG-TATA-T-AG-ATG-GG-GATAGAC-G-GCG
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Reference ( family-3974 ) : AATCT-GGGATAACA-GTTTGC-ATA-AATA-CT-TTA-T-TCCATTT-ATAGTAATTTT-TTGA-CTAGCGATTACATGTT-TGTAAAA--T-T------GTAATG--ATGGT-ATAT-ACAT-GT-ACCAGC-AATTT-G-AT-TTTAT-TTCCT-TTTAAT-GG-TG--T--CA---GA-TGATA-CTATCT-TA-TGTA-TT-TAGGT-AAAATC----T-TTTTTTACA-C-A-TCATATTACAT--GAA-GCAT--GC-AGGGAT-ATATG-ATTTTATTTGTT--G--TTCAATTTA-C-CTC--TTGAA-AACAGAGG-CAG-AT--G-TGAT-TTA-TT-TTTGTT-TTA-TTTT--ATGTTTTC--AGAAG----A-AAAAAACT-AGTAT-CTGTTGT-TT---T----C----T--CT-AGTTT---GCTTT-CATTCATAAAAGTT-TA-T--AC-A---GTAA-AT-GACA--C--TATCG---TT-A-TGTTC--T--TTT-ATTTCA-TGA--GTT--GCATCTGT-AAA-TT----TA-CTATTTGC-ATTAC-ATAAA-GTT-TCTACACAA-AC-AAAAGA-AATGTGTGTTT-TTATTTTC-ATCTTAT-CAAGA--ATA---AG-AT--G-T----ACATGTAA-GGC-CAAAA--CT---GCG--C-G-C-CTA-TTT---CTAT-AGAA--CC----T-------C-CGT-AA-ATG--TGCT-G--A--GGTCGTTC--------------T-CACAC---A-GTACATCGTT-CTTTT--AC-TATAT--CAG-AT-CTTCA-AT-TTT---GTA-AACTAAGACTGAGAT-A-TT-TA-AAA---A-T-T-TCAAATAC--TA--TT-TAAAG-T-GTAA--CGCTCCG-CG-TT----C---T-T-C-------GGA-TC-T---T--G-T-TAGTATT-ACG-TGC-TC---C-GT--GG-----T-A--TA-----AC-GGA--TCA-TGC-TC-C-G-TGGTT-AGCG-GA---CC--GT--------A-AATTTT--C-------------G---------ACCGGT-----CATT--TG-TATT-TTTC---------AA-A-GT-GT-G-GA--CA-AA-TG------A-G-GCAGA-G--TT-----GGTG-T----------A-G--CTT--TTATACCAATT-TA-TC-AA-A--G-AC-A-TA-TTGGGC--TAC---AA----ACT------GCCGT-----AAACA------GA-G-T--A-CG--A---------A--TACTA----C-AAGC---CACA-TAAG-TAC-ATT-T-G-GCCT--T----CA-A-AG-C-G-------TAAAT--A--T--CG-TA--C-TT--TT--------------C-C----AA--GCAAAG-TTCAA-G---AT-CG-GAA-A--GG-C---T-AC-T--T---GA---AT-AATGC----------TTT-GTCTA-T-----T-A-T-ACA-G-AA---AAA-TGTA---CT-CTG-T-T---CA--A-----GCTT--T--GT---TT-AT-CTG-A-C-TTT---TG-TTCTGT-ACAATTT----T-TT--T--GGTACA--A-A-T--GATCCTTTTAAATAT-----G--CAAAA-TAAC--AA-AC-TTCAA-ATAGG---TACC-----AT--CATT-AG-CCGC--CT-ACCAC--TT--ATG-CT--CCGT-G-G-CA-----T-CC-G---GATCCCTCCGC-GG-CGTA-C-GG-ATC-GG-GATACAC-G-GCG
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gi|15 : ---T-T-C-------GGAATC-T---T--G-T-TTGTTTTAACGTTGCAGC---C-GT--GG-----TAA--TAAGAACAC-GGA--TCATTGC-TT-C-GATGGAT-AGCG-GATATTC--GTA-------A-AATTTTA-C-------------GATTCAAACCACCATTGAACGCATTTCTG-TATT-TTTTATCATAAAAAA-A-AT-GT-G-TAATCATGA-TGGATCGTA-GAGCCGA-G--TTC----GGTG-T----------A-GGTCTT--TTAGACC-ATT-CG-TT-AA-
gi|16 : gcagctagatcg-A-C-TTT---TG-TTCTGT-ATAATTG----C-TT--T--AGTACG--A-A-T--GATA-TTTTAAATAT-----G--CAAAA-------------------ATACG---TACC-----AT--CATT-AG-CCGC--CT-GCCAC--CT--ATG-TT--CCTC-G-G-CA-----T-CC-G---GATCCCTCCGC-GG-TATA-T-AG-ATG-GG-GATAGAC-G-GCG
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gi|18 : tacataaatgtagacctacaaatacaacaaacgggtaaatatgaaatactttctatgctgattttgtacatttagtctagattgCCT--T----CT-A--G-A-G-------TAAAC--G--TGACC-TC--T-TT--TT--------------CTC----AA--GCAAAGTTTCAC-G---AT-CG-GAACACTGG-C---T-AC-T--T---GA---AT----------------CTT-GTCGA-TCTAACT-A-T-A-A-T-AA---AAT-TGT----CT-Ctc
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gi|7 : taagatgtacatgtaaggccaaaactgctcgtcatttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAATCTTGGGATTACA-GTT-GC-ATA-A----CT-TTA-TATC--TTT-ATA--AATTT----GAACTAGCGATTACATGTT-TGTAAAA--T-T------GTAATG--A-GGT-AT-T-ACAT-GT-ACCAGC-AATTT-GGATATTTAT-TTCCT-TTGAAT-GG-TGGGT--CG---GA-TGATA-CTATCT-TA-TGTA-TT-TAGGTTAAAATC----T-TTTTTTACA-C-A-TCA-AT-ACAT--GAAAGCAT--GC-AGG-AT-ATAT--ATTTTATTTGTT--G--TTCAATTTA-C-CTC--TTGAA-AACAGAGG-CAG-AT--G-TGAT-TTATTT-TTTGTT-TTATTTTT--ATGTTTTC--AGAAG----A-AAAAAACT-AGTAT-CTGTTGT-TTTTCT----C----T--TT-A-TTT---GCTTT-CATTCATAAAAGTT-TA-T--ACAA---GTAA-ATGGACA--C--TATCG---TT-ATTGTTC--T--ATT-ATTTCAGTGA--GTT--GCATCTGTAAAA-TT----TA-CTAGTTAC-ATTAC-ATAAA-GTA-TCTACACAA-AC--AAAGA-AATGTGTGTTA-T--TTTTT-ATC-TAT-CAAGA--ATA---AG-AT--G-T----ACATGTAA-GGC-CAAAA--CT---GCG--CGG-T-CTA-ATT---CTAT-AGAA--CC----TTA-----C-CGT-AA-TTG--TGCT-G--A--GGTCGTTC----------------CACAC---A-------CGAT-ACTCT--AC-TATAT--CAGAAT-CTTCC-TT-TTT---GTA-AACTA--ACTGAGAT-A-TT-TA-AA
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blockSeqs : . TA . . . . AT . T . . . . TTG . . TT . T AT . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . T AC . T . . . . . G . . . . . . . . . . . . TGT . . . T . A . . . TCTACTT . . A . CT A . . . A T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . TT T . TT . . . . . . . . . . . G . CT . T . G . TTA . . AT . . CA TTCACACAGGTA . T . . . . A . . . . . . . . . . . T TAGA . T A . . C . . . . . CT . . AT . . . . . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . TGTC . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . AGGT . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA C . . . . . G . . . . . . . A . . . . . TC . . . . . . . . G TG . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A TA . . T . . . . . . . . C . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . TT . . TA . . . . . . . . . . . T . . . . . . . G . . T C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . T . A . . . TCTTTT . . T . T A . . . T T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T G . T . . . . . . . . . . . G . C . T . A . TTC . . CT . . A TCACACAAGTAC . G . . . . A . . . . . . . . . . . T TA . T A . . C . . . . . TA . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . AGT . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . G . . . . . . . A . . . . . CT . . . . . . . . G C . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G TA . . T . . . . . . . . C . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . TCTCTT . . T . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . . . T . T . T . A . T . . TT . . A TCTACTTAAGTC . T . . . . A . . . . . . . . . . . T TT . T A . . C . . . . . T . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTC . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . ATT . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . G . . . . . . . A . . . . . TT . . . . . . . . A C . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G TG . . T . . . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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Reference ( family-3974 ) : AATCT-GGGATAACA-GTTTGC-ATA-AATA-CT-TTA-T-TCCATTT-ATAGTAATTTTT--G-A-CTAGCGATTACATGTT-TGTAAAA--T-T------GTAATG--ATGGT-ATAT-ACAT-GT-ACCAGC-AATTT-G-AT-TTTAT-TTCCT-TTTAAT-GG-TG--T--CA---GA-TGATA-CTATCT-TA-TGTA-TT-TAGGT-AAAATCT-TTTTTTACA-CCA-TCATATTACATGAA-GCAT--GC-AGGGATA-TATG-ATTTTATTTGTT--GT--TCAATTTAC-C-TC--TTGAA-AACAGAGG-CAG-AT--G-TGAT-TTATT-TTT-GTT-TTA-TTTT--ATGTTTTC---AGAAG----A-AAAAAACT-AGTAT-CTGTTGT-TTT-C----T-CT----TAGTTT---GCTTT-CATTCATAAAAGTT-TA-T--AC-A---GTAA-ATG-ACA--CT--ATCG---TT-AT-GTTC--T--TTT-ATTTCA-TGA--GTT--GCATCTGTAAA-TT----TA-CTATTTGC-ATTAC-ATAAA-GTT--TCTACACA---A-AC-AAAAG---A-AATGTG---TG-TT-T-CTAT------TTT---C-ATCTTAT-C-------AAGA--ATA---AG-AT--G-T----ACATGTAA-GGC-CAAAA--CT---GCG--CG-C-CT-A-TTT---CTAT-AGAA--CC----T-------C-CGT-AA-ATG--TGCT-G--A--GGTCGTTC--------------TCNNNCNAGGTNTCGTT-CTTTT--AC-TATAT--CAGA-T-CTTCA-AT-TTT---GTA-AACTAAGACTGAGAT-A-TT-TA-AAA---A-T-T-TCAAATAC--TA--TT-TAAAG-T-GTAA--CGCTCCG-CG-TT----C---T-T-C-------GGA-TC-T---T--G-T-TAGTAT--ACGT-GC-TC---C-GT--GG-----TA--TA----A-----C-GGA--TCA-TGC-TC-C-G-TGGTT-AGCG-GA---CC--GT--------A-AATTTT--C-------------G---------ACCGGT-----CATT--TG-TATT-TTTC---------AA-A-GT-GT-G-GA--CA-AA-TG------A-G-GCAGA-G--TT-----GGTG-T----------A-G--CTT--TTATACCAATT-TA-TC-AA-A--G-AC-A-TA-TTGGGC--TAC---AA----ACT------GCCGT-----AAACA------GA-G-T--A-CG--A---------A--TACTA----C-AAGC---CACA-TAAG-TAC-ATT-T-G-GCCT--T----CA-A-AG-C-G-------TAAAT--A--T--CG-TA--C-TT--TT--------------C-C----AA--GCAAAG-TTCAA-G---AT-CG-GAA-A--GG-C---T-AC-T--T---GA---AT-AATGC----------TTT-GTCTA-T-----T-A-T-ACA-G-AA---AAA-TGTA---CT-CTG-T-T---CA--A-----GCTT--T--GT---TT-AT-CTG-A-C-TTT---TG-TTCTGT-ACAATTT----T-TT--T--GGTACA--A-A-T--GATCCTTTTAAATAT-----G--CAAAA-TAAC--AA-AC-TTCAA-ATAGG---TACC-----AT--CATT-AG-CCGC--CT-ACCAC--TT--ATG-CT--CCGT-G-G-CA-----T-CC-G---GATCCCTCCGC-GG-CGTA-C-GG-ATC-GG-GATACAC-G-GCG
gi|1 : AATCT-GGGAAAACA-GTTTGCTATA-AAAA-TC-ATA-T-TCCATTT-ATAGTGATTTTT--G-A-CTAGCGATTTCATGTT-TGTAAAT--T-TTGGTAAATAATGTAACGGT-A-ATCACATCGTTACCAGC-CATTTTG-AT-TTTTTATTCCT-TTTAAT-GG-TG--T--CAATAGA-TGACA-CTATCT-CA-TGTA-TT-AAGGT-AAAATCT-TTTT--ACAATCA-T-ATATCATCTGAATGCAT--GCTAGGGATA-TCTA-TTTTTATGTTTTCGGT--TCAATATACAT-TC--TTGAA-AACAGAGG-CAG-AC--GCTGAT-TTATAATTC-GTT-ATA-TTTTCTATGTTTCC---AGAAGGAATA-AAAACACT-AGTAT-CTGTTGT-TTT-TCTCGT-CT----T-GTTTTCTGCTTT-CATT-ATAAAGGTT-TA-T--AC-ACACATAA-ATG-ACATGCT--AGTGCGCTT-AT-GTTCA-TAATTT-ATTTCA-TGA--GTT--GCATCTGTAAA-TTAATATA-AAATTTGCCATTACCAGTAA-GTT--TCTACACA---AGAC-AAAAG---A-AATGTG---TG-TT-T--TAT------TT----C-ATCT-AT-C-------AAGATTATA---GA-AT--G-T----ACATGTAG-CGC-CAAAA--CTCTTGCG--CG-T-CT-AATTT---CTAT-AGAA--T-----T-------C-CGT-AA--TG--TGCT-G--ACGGGTCGTTC--------------TCAC---AAGTATCGTTTCTTTTTGAC-TATAT--CCGA-T-CTTCA-TT-TTTAGAGTA-A-CTAAGACTGAGAT-AATT-TA-AAA---AAT-T-TCACATAC--T---TT-TAAAG-T-GTAAGCCGTTAAA-CG-TTGTTCC---T-T-C-------GGA-TC-T---TT-G-T-CAGTAT--ACGT-GT-TC-----GT--GG-----TAATTAT---A-----C-GGA--TGACTGC-TC-C-G-TGGTT-AGCG-TA---C---GTTAAATAATA-AATTGTAAC-----------------------ACCCGT-----CATT--TGGTATTGTTTC---------AA-A-GT-GT-G-GA--CA-AA-TG------A-G-GCAGA-G--TTATAGAGATG-T----------A-G--CTT--ATATACCAATTAAA-TC-AAGA--GTGC-A-TA-TTAGGC--TAC---CA----ACTC-----GCCGTA----AAACA------GA-G-TCAA-CAATA---------A--TACTA----A-GAACGCTCACA-TAAGTTAC-ATT-T-GCGCC---T----CA-A-AG-C-G----------AT--GCTT--CG-TA--C-TT--TT--------------C-C----GAATGCAAAGTTTCAACGTCCAT-TGCGAA-AC-GG-CGCTT-ACTT--T---GAAGCAG-AATGCGG--------TTT-GTCTA-T-----T-ATT-CCA-G-AA---AGG-TGTA---CTCCTG-C-CAGGCACTA-----GCTTG-TTGGT---TTAAT-CTG-A-C-TTTTTCTG-TTCTGTAAAAATTTACTAT-TTAAT--GGTACACCA-A-CTAAATCCTTT--AATATAGCTAG--CAAAATTAAA--AA-ATGTTCAAGATAGAGGTTACCTGGAGAT--CAAT-AGACCGG--CC-ACCAC--TTAGATG-CTAGCCGT-GTG-CA-----TGCC-GGATGATCCCTCGGCGGG-CGTATC-GGAATC-GG-GAT-CACTG-GC
gi|10 : c-TCAAA-AC--TA--TTGTAAAG-T-GTAAA-CGCTCCG-C--TT----C---T-T-C-------GGA-TC-TC--T--G-T-TAGTATT-ACGT-GC--C---C-GT--GG-----TA--TA----A-----C-GGA--TCA-TGC-TC-C-G-TGGTT-AG-G-GA---CC--GT--------A-AATTTT--T-------------GTC-------ACCGTC-----CATT--TG-TATT-TT-C---------AA-A-GT-GT-G-AG--CA-AA-AG------A-G-GCAGA-G--TTC----GGTT-G----------A-G--TCT--TTATACCAATC-TAATC-AA-A--G-AC-A-TA-TTGGGC--TTC---AA----ACT------GCC-T-----AAAC-------GA-G-TT-A-CG--A---------A--TACTA----C-AAGC---CACA-TAAG-TAC-ATT-T-G--CCT--T----CA-A-AG-C-G-------TAAAT--A--T--CG-TA--C-TT--TTT-------------C-C----AA--GCAAAG-TTCAA-G---AT-CG-GAA-AAGGG-C---T-AC-T--T---GA---A---ATGC----------TTT-GTCTA-T-----T-A-T-ACA-G-AA---AAA-TGTT---CTTCTG-T-T---CA--A-----GCTTCGT--GT---TT-AT-CTG-AAC-TAT---TG-TTCTGT-ACAATTT----T-TT-----GGTACA--A-AAT--GATCCTTT--AATAT-----G--CAAAA--AAC--AA-AC-TTCAA--TAGG---TACC-----AT--CATT-AG--CGCG-AT-ACCAC--TT--ATG-CT--CCGT-G-G-CA-----T-CC-G---GATCCTCCCGC-GG-CGTA-C-GG-ATC--G-GATACAC-ag
gi|11 : G------A-G-GCAGA-G--TTT----GGTG-T----------A-GT-CTT--TTAGACCG-TT-TA-TC-AG-A--G-AC-A-TA-TTGGGC--TAC---AA----ACT------GCTGT-----AAACA------GA-G-T--A-CG--A---------A--TACTA----C-AAGC---CACA-TAAG-TAC-ATT-T-G-GCCT--T----CA-A-AG-C-G-------TAAAT--A--T--CG-TA--CTTT--TT--------------C-C----AA--GCAAAG-TTCAA-G---AT-CG-GAA-AG-GG-C---T-AC-T--T---GA---AT-AATGC----------TTT-GTCTA-T-----T-A-T-ACA-G-AA---AAA-TGTA---CT-CTG-T-T---CA--G-----GCTT--T--GT---TT-AT-CTG-A-C-TTC---TG-TTCTGT-ACACTTT----T-TT--T--GGTACA--A-A-T--GTTCC-TCGAAATCT-----G--CAGAC-TAAC--CA-AC-TTCAA-ATAGG---TACC-----AT--CATT-AG-CCGC--CT-ACCAC--CT--ATG-CT--CCGT-G-G-CA-----T-CC-G---GATCCCTCCGC-GG-CGTA-C-GG-ATC-GG-GATACAC-G-GTG
gi|12 : ggatcatctaactttcgtgttcggaatccttggaattttgcaattactggtctggatttcccttgtgcccctgTC-TTTC---------AA-AAGT-GTTGCGATTCA-AA-TG------AAG-GCAGA-G--TTT----GATG-A----------A-AGCCTT--TTAGACCA-TT-TA-TC-AA-A--G-AC-A-TA-TTGGGC--TAC---AA----ACT-------CCGT-----AAACA-------A-G-T--A-CG--C---------A--TACTA----C-AAGC---CACAATAAG-TAC-ATT-T-G-GCCC--T----CA-A--G-C-G-------TGAAT--AA-T--CG-TA--C-TT--TTTCGGTTCTGGTTGTC-C----AA--GCAAAG-CTCAACG---AT-CG-GAA-A--GGGC---TGAC-T--TTCTGA---TG-AATGCGTCGTCCTTGTTT-GTCTA-T-----T-A-T-ACA-G-AA---AA--TGCA---CG-CTG-T-T---CA--A-----GCTT--T--GT---TT-ATTCTG-A-C-TTT---TG-TTCTGT-ACATTTT----T-TT--TTTGGTA----A-A-T--AATCCTTT-AAATAT-----G--CAAAA-TAAC--AA-ACCTTCAA-ATTAG---TACCCC---AT--CATTTAG-CCGCGCCT-ACCAC--CT--ATG-CT--CCGT-G-GGCA-----T-CC-G---GATCC-TCCGC-GG-CGTA-C-GG-ATC-GG-GATAC-C-G-GCt
gi|13 : atGGC--TAC---AA----ACT------GCCGT-----AAACA------GA-G-T--A-C
gi|13 : a----CA-A-AG-C-G-------TAAAT--A--T--AG-TA--C-TT--TTT-------------C-C----AA--GCAAAG-TTCAA-G---AT-CG-GAA-A--GGGC---A-AC-T--T---GA---AT-AATGC----------TTT-GTCTA-T-----T-A-T-ACA-G-AT---AAA-TGTA---CT-CTT-T-T---CA--A-----GCTT--T--GT---TT-AT-CTG-A-CTTTT---TGTTTCTGT-AC-ATTT----T-TT--T--GGTATA--A-A-T--GATTCCTTT--------------------------AA-AC-TTC-A-ATAGG---TACC-----AT--CATA-AA---GC--CT-A--AC--TT--ATG-CT--CCGT-G-G-CA-----T-CC-G---GAT-CCTCTGC-GG-CGTA-C-GG--TC-GG-GATACAC-G-GTGaaagcgtaaatatagtactttttccaagcaaagttcaagatcggaaagggcaacttgaataatgctttgtctattatacagataaatgtactcttttcaagctttgtttatctgactttttgtttctgtacatttttttggtataaatgattcctttaaacttcaataggtaccatcataaagcctaacttatgctccgtggcatccggatcctctgcggcgtacggtcgggatacacggtgt
gi|14 : aggctacaaactgccgtaaacagagtaT--G-T----ACATGTAA-GAC-CAAAA--TT---GCT--CG-C-CT-A-TT-----TAT-ATAA--CCTTATT-------C-TGT-AA-ATG--TGCT-G--A--AGGTGTTC--------------TCACTTA--GTATTGTT-CTTTT--AC-TATGT--CAGA-T-CTTCA-AT-TTT---GTA-CACTAAGATTGAGAT-A-TT-TA-ATC---A-T-T-TCAAATAC--TT--AT-TGAAT-T-GTAA--AGGTCCG-CG-TT----C---T-A-C-------GGA-TC-T---T--G-T-TAGAAT--ACGT-GC-TC---C--T--GGT----TA--TA----A-----C-GGA--TCA-TGC-TC-C-G-TGGTT-AGCG-t
gi|15 : ---T-T-C-------GGAATC-T---T--G-T-TTGTTTTAACGTTGCAGC---C-GT--GG-----TAA-TA----AGAACAC-GGA--TCATTGC-TT-C-GATGGAT-AGCG-GATATTC--GTA-------A-AATTTTA-C-------------GATTCAAACCACCATTGAACGCATTTCTG-TATT-TTTTATCATAAAAAA-A-AT-GT-G-TAATCATGA-TGGATCGTA-GAGCCGA-G--TTC----GGTG-T----------A-GGTCTT--TTAGACC-ATT-CG-TT-AA-
gi|16 : gcagctagatcg-A-C-TTT---TG-TTCTGT-ATAATTG----C-TT--T--AGTACG--A-A-T--GATA-TTTTAAATAT-----G--CAAAA-------------------ATACG---TACC-----AT--CATT-AG-CCGC--CT-GCCAC--CT--ATG-TT--CCTC-G-G-CA-----T-CC-G---GATCCCTCCGC-GG-TATA-T-AG-ATG-GG-GATAGAC-G-GCG
gi|17 : TAC-ATAAATGTAGACCTACAAATACA-AC-AAACGGGTA-AATATGAAATACTT-T-CTATGCTGATTTTGTAC-ATTTAGT-CTAGATTGAAGA--ATA---AG-AT--G-T----ACATGTAA-GGC-CAAAA--CT---GC
gi|18 : CCT--T----CT-A--G-A-G-------TAAAC--G--TGACC-TC--T-TT--TT--------------CTC----AA--GCAAAGTTTCAC-G---AT-CG-GAACACTGG-C---T-AC-T--T---GA---AT----------------CTT-GTCGA-TCTAACT-A-T-A-A-T-AA---AAT-TGT----CT-Ctc
gi|2 : aAATCT-GGGATA-CA-GTT-GC-ATA-AATA-CT-TTA-T-TTCATTT-ATAGTAATTTTTT-G-A-CTAGCGATTACAT-TT-TGTAAAA--T-T------GTAATG--ATGGT-ATAT-ACAT-GT-ACCAGC-AATTT-G-AT-TTTAT-TTCCT-TTTAAT-GG-TG--T--CA---GA-TGATA-CTATCT-TA-TGTACTT-TAGGT-AAAATCT-TTTTT-ACA-CCA-TCATAT-ACATGAA-GCAT--GC-AGGGATA-TAT--ATTCGATT-GTT--GT--TCAATTTAC-C-TC--TTGAA-AACAGAGG-CAGGAT--G-TGAT-TTATT-----GTT-TTA-TTTT--ATGTTT-C---AGAAG----A-ATAAAACT-AGTAT-CTGTTGT-TTT-C----T-CT-----AGTTT---GCTTT-CATTCATAAAAGTT-TA-T--AC-A---GTAATATG-ACA--C---ATC----TT-AT-GTTC--T--TTT-ATTTCA-TGA--GTT--GCATCTGTAAA-TT----TA-CTATTTGC-ATTAC-ATAAA-GTT--TCTACACT---A-AC-AAAAG---A-A-TGTG---TG-TT-T-TTAT------TT----C-ATCTTAT-C-------AAGA--ATA---AG-AT--G-T----ACATGTAA-GGC-CAAAA--CT---GCG--CG-T-CTTA-TTT---CTAT-AGAA--CC----T-------C-CGT-AA-A-G--TGCT-G--A--GGTCGTTC--------------TCACACAGTACATCATT-CTTTT--AC-TATAT--CGGA-T-CTTCA-AT-TTG---GTA-AACTAAGACTGAGAT-A-TT-TA-AAA---A-T-T-TCAAATAC--TA--TT-TAAAG-T-GTAA--CGCTCCG-CG-TT----C---T-T-C-------GGA-TC-T---T--G-T-TAGTAT--ACGT-GC-TC---C-GT--GG-----TA--TA----A-----CTGGA--TCA-TGC-TC-C-G-TGGTT-AGCG-GA---CC--GT--------A-AATTTT--C-------------G---------ACCGGT-----CATT---G-TATT-TTTC---------AA-A-GT-GT-G-GA--CA-AA-TG------A-G-GCAGA-G--TT-----GG-G-T----------A-G--CTT--TTATACCAATT-TA-TC-AA-A--G-AC-A-TA-TTGGGC--TAC---AA----ACT------GCCGT-----AAACA------GA-A-T--A-CG--A---------A--TACTA----C-AAGC---CACA-TAAG-TACAATT-T-G-GCCT--T----CA-A-AG-C-G-------AGAAT--A--T--CG-TA--C-TT--TT--------------C-C----AA--GCAAAG-TTC-A-G---AT-CG-GAA-A--GG-C---T-AC-T--T---GA---AT-AATGC----------TTT-GTCTA-T-----T-A-T-ACA-G-AA---AAATTGTA---CT-CTG-T-T---CA--A-----GCTT--T---T---GT-AT-CTG-A-C-TTT---TG-TTCTGT-ACAATTT----T-TT--T--GGTACA--A-A-T--GATCCTTTTAAATAT-----G--CAAAA-TAAC--AA-AC-TTCAA-ATAGG---TACC-----AT--CATT-AG--CGC--CT-ACCAC--TT--ATG-CT--CCGT-G-G-CA-----T-CC-G---GATCCCTCCGC-GG-CGTA-C-GG-ATC-GG-GATACAC-G-GTG
gi|20 : T-A-TT-TA-AAC---A-T-T-TCAAATAC--TA--T------------AA--CGCTCCG-CG-TT----C---T-T-C-------GGA-TC-T---T--G-T-TA
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gi|3 : T-ACAT-GT-ACCAGC-AATTT-G-AT-TTTAT-TCC---TTTAATCGG-TG--T--CA---GA--GATAGCTATCTCTA-TGTA-TT-TAGGT-AAA-TAT-TTTTTTACA-CGA-TCATATTACAGGAA-GCATCTGC-AGGGATA-TATATCTTCTATTTGTT--GT--TCAATTTAC-C-TC--TTGAACAACAGAGGGCAG-AT--GGTGAT-TTATT-TTT-GTT-TTA-TTTA--ATTTTTTC---AGAAG----A-AAAAA--TGAGTAT-CTGTT---TTT-C----TACT----TAGTTT---GCTTTTCATTCA-AAAAGTTCTA-TTAACCA---GTAA-ATG-ACA--CT--ATCG---TTCAT-GTTC--T--TTTTATTTCA-TGA--GTT--GCATCTGCAAA-TT----TA-CTATTTGC--TTAC-ATAAAAGTTC-TCTACACA---A-AC-AAAAG---A-AATGTG---TG-TT-T--TAT------TTT---CCAT-TAAT-C-------AAGA--ATACGTAA-AT--GAT----ACATGTAA-GGC-CAAAA--CT---GCG--CG-CTCG-A-TTT---CTATTAGAAACCT----T-------C-CGTTAA-ATG--TGCTCGC-A--GGTCGTTC--------------TTCACACAGGTATCATT-CTTTT--AC-TATAT--CAGA-TACTTCA-AT-TTT---GTA-AACTAAGACTGAGATTA-TTATA-AAA---T-T-T-TCAAATAC--TA--TT-AAAAG-G-ATAA--CGCTCCG-CGCTT----C---T-T-C-------CGA--C-T---T--GCT-TAGTATT-ACGT-GC-TC---C-GTTCGA-----T---TA----A-----C-GGA--TCAGTGC-TC-CAG-TGGTTTAGCGCGA---CC--GT--------ACAATTTTT-C-------------A---------CCCGGT-----CATT--TG-TATT-TTTC---------GA-A-AT-GT-G-GA--CA-AA-TG------A-G-GCAGA-GCTTC-----GGTG-T----------ATT--CTTTCTTATAGCAATT-TAGTCAAA-A--G-AC-AGTATTTGGGC--TACAAAAA----ACTG-----GCCGT-----AAACAC-----GA-GTT--ACCG--A---------AATTACTA----C-AAGC---CACA-TAAG-TAC-ATT-T---GCCT--T----CA-ACAGCC-G-------TAAAT--A--T--CG-TACCC-TT--TT--------------T-C----AA--GCAAAG-TTC-A-G---ATACG-GAA-AG-GG-C---T-AC-T--T---GA---ATCAATGC----------TTT-G-CTACT-----T-A-G-ACA-GAAA---AAA-TGTA---CT--TG-TCT---CA--A-----GCTT--T--GT---TT-AT-TTG-A-C-TTT---TGTTTCTGTAACAATTT----G-TT--T--GGTAC---A-A-T--GATCCTGTTAAATAT-----G--CAAAA-TAAC--AA-AC-TTCAACATAGGT--TACC-----ATTGCATT-AG-CCGC--CTCACCAC--TTC-ATG-CT--CCGTGG-G-CA-----T-CC-G---GATCCCGCCGC-GG-CGTA-CGGG-ATC-GGCGATACAC-G-GCtgtn
gi|4 : cATCT-TGGATAACAAGTTTGC-ATA-AATA-CTGTTACT-TTCATTTTATAGCAATTTTT--GGA-CTAGCGAGTACA-GTTGTATAAAAACTAT------GTAATG--ATGGTTAT-T-ACAT-GT-ACCAGCCAATGC-G-AT-TTTAT---CCT-TTTAAT-GG-GT--T--CA---GAATGATA-CTAT---TA-TGTA-TT-TAGGT-GAAATCTGTCTTTTACA-ACAGTCATATTACATGAA-GCAT--GC-AGGGATA-TATG-ATTTTATTTGTT--GT--TCAATTTAC-C-TCGATTGAAGAACAGAGG-CAG-ATAAG-TGAT-TTATT-TT--GTTATTAATTTT--ATGTTTTC---AGAAG----ACAAAAAACT-AGTATTCTGTTGT-TTT-C----T-CT----TAGTTT---GCTTT-CATCAGAAAAAGTT-TAAT--AC-A---GTAA-ATG-ACA--CA--A-CG---TT-AT-GTTTCTT--TTT-ATTTCA-TGAACGTCTGGCATCTGTAAA-TT----TAACTATTTGC-ATTAC-ATAAA-GTT--TCTACACA---C-ACCAAAAA---A-AATGTG---TG-TT-TGCTAT------TTT---C-ATCTT-T-C-------AAGA--ATA---AG-ATAAG-T----ACATGTCACAGCTCAAGAACCT---GCAGCCG-T-CT-A-CTTATACTAT-AAAA--CC----T-------TACGT-AA-CTGGCTGCT-C--AACGGTCGTTC--------------TCACACAAG-TACCGTT-CTTT---------AT--TA-----CT--A-AT-ATT---GTA-AACTAAGACTGAGAT-A-TT-TA-AAA---A-T-TCTCAAATACA-TAATTT-TAAAGAT-GTAA--CGCTTCGCCG-TT----CAGAT-T-C-------GGAGTC-TTAGT--G-T-TAGGAT--ACGT-GC-TT---C-GT--GG-----TA--TA----A-----CAAGA--TCA-TGC-T--C-G-TGG-T-AGC--GA---TC--GT--------A-AATTTT--CT------------C---------ACTTGT-----CATT--TG-TATT-TTTC---------AA-A-GTGGT-G-AA--CA-AA-TG------A-A-GCAGA-GT-TT-----GGTGAT----------A-G-------TCAT-----------TC-AA-AG-G-ACAA-TA-TTGGGC--TAC---AA----ACT------GCCGTAAGTAAAACACAAGAGGG-G-T--A-CG--A---------A--TAC-A----CAAAGC---CACA-TAAG-TAC-ACCAT-A-GCAT--GAGGACACC-AG-C-GACGAACCTATAT--A--T--GG-TAATC-TT--TT--------------C-C----AA--Gtg
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gi|7 : taagatgtacatgtaaggccaaaactgctcgtcatttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAATCTTGGGATTACA-GTT-GC-ATA-A----CT-TTA-TATC--TTT-ATA--AATTT----G-AACTAGCGATTACATGTT-TGTAAAA--T-T------GTAATG--A-GGT-AT-T-ACAT-GT-ACCAGC-AATTT-GGATATTTAT-TTCCT-TTGAAT-GG-TGGGT--CG---GA-TGATA-CTATCT-TA-TGTA-TT-TAGGTTAAAATCT-TTTTTTACA-C-A-TCA-AT-ACATGAAAGCAT--GC-AGG-ATA-TAT--ATTTTATTTGTT--GT--TCAATTTAC-C-TC--TTGAA-AACAGAGG-CAG-AT--G-TGAT-TTATT-TTTTGTT-TTA-TTTTT-ATGTTTTC---AGAAG----A-AAAAAACT-AGTAT-CTGTTGT-TTTTC----T-CT----TTATTT---GCTTT-CATTCATAAAAGTT-TA-T--AC-AA--GTAA-ATGGACA--CT--ATCG---TT-ATTGTTC--T--ATT-ATTTCAGTGA--GTT--GCATCTGTAAAATT----TA-CTAGTTAC-ATTAC-ATAAA-GTA--TCTACACA---A-AC-AAA-G---A-AATGTG---TG-TTAT----T------TTT---T-ATCT-AT-C-------AAGA--ATA---AG-AT--G-T----ACATGTAA-GGC-CAAAA--CT---GCG--CGGT-CT-A-ATT---CTAT-AGAA--CC----TTA-----C-CGT-AA-TTG--TGCT-G--A--GGTCGTTC---------------CACACACGATAC-------TCT--AC-TATAT--CAGAAT-CTTCC-TT-TTT---GTA-AACTA--ACTGAGAT-A-TT-TA-AA
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gi|9 : AA--CGCTCCG-CG-TT----T---TCT-C-------GGA-TCAT---TA-G-TCTAGTATT-ACGT-GC-TC---CCGT--CGAGAGTTA--TA----------C-TGACTTCA-TGCATC-C---TG-TT-AGCC-GA---CCCAGT--------A-AATTTTGTC-----------------------ACCGCT-----CATTCCTG-TATT-CTTC---------AACA-GT-GG-G-AA--CA-AA-TG------A-G-GCAGA----TC-----GGTG-TTATTTGTATTA-G--TCT--TTATACCAAAT-TA-TC-AA-AAGG-AC-ACTA-TTGG-C--TAC---AAC---ACT------GCCGT-----AAAGA------GA------A-CG--A---------AA-TA-TA----C-AA-C---CA-A-TTAA-TAC-ATT-TCG-GCCTCAT----CA-A-AG-CTG-------TAAAT--------CGATA--C-CT--TT--------------T-TTATAAA--ACAAAG-TTCAA-G---AT-CA--AA-A--GG-C---T-AC-C--T---TG---AT-AATGC----------TTTTGTCTA-T-----TCA-TCACA-G-AA---AT--TGTA---CT-CTG-T-T---CC--A-----ACTT--T--GT---T--AT-CTGCATC-TTT---TG-TCCTGT-ACAATTT----TATT--T--GGTACAC-A-A-T---ATGTCTTTAAATAT-----G--CAACA-TAAC--AACAC-TTCAA-AT---------C-----A----ATT-AG-CCGC--CTCACTAC---T--ATG-CT--CCGT-GAG-CA-----T-CC-G---GATCCTCATGC--G-C-TA-C-GGCATC-GG-GATACAC-G-
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): ATTACACGGCGTGATGCAATAAAAACTTAAATATGGGTTTACTTAGAGTGCTTATT