lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 3333 333 66666666666666666 222 3 66666666 222 555 1 222222 55555 333 111 111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 333333333333 22222222222222222222 333 333333333 111 444444444444444 1111 11 55555555555555555555 11111 1 2222222222222 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 1111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111 1 111111111111111 22222222 111111111111111111 1111 11111 11 11111 11111111111 44444444444444444444444444444444 222 3333333333333333333333333 111 1111111111111 11 22222222 1111111 111111 11111 22222 1111111 111111111111111111111111111111111 11 1111111
lowQualScore : 5 4 5 2 8 7 2 2 6666 3 8 555 9 3 33333333333333333 3 444 3 44 55 7 3 666 55 0 8 1 33333333 888 4 999 8 1 777 2 3 3 555555 3 11111 77 666 111 55 666666 3 6 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 77777 555 111111111111 77 3 6 44 44 77777777777777777777 88 3 3 3 3 44 99 3 3 000 3 222222222 2 111 2 2 5 2 000000000000000 4444 3 00 3 55 0 00000000000000000000 44 3 3 555 3 3 3 44 555 66666 3 3 0 3 3 4444444444444 3 7 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 000000 7 99999 666 88 3 2 44 7777777777 3 44 3 3 3 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 3 999999 7777777 1 33 555 777777777777777 11111111 3 3 3 666666666666666666 1 44 3 88888 5555 3 7777 3 44 3 3 22222 77 44 11 3 6 11111 99 6 888 33333333333 44444444444444444444444444444444 3 222 555 1111111111111111111111111 3 7777 3 3 222 3 1111111111111 3 11 00000000 3 1111111 3 3 3 7 3 999999 6 44 3 3 2 22222 2 2 2 5 5 77777 44 3 3 6 7777777 7777 3 55 3 3 666666666666666666666666666666666 7 33 5 33 2 2 2 2222222 2 33 66666 777 5 33 3 3 4 4
lowQualScore : . . . . . . . . .... . . ... . . ................. . ... . .. .. . . ... .. . . . ........ ... . ... . . ... . . . ...... . ..... .. ... ... .. ...... . . .............................................................................. ...... ..... ... ............ .. . . .. .. .................... .. . . . . .. .. . . ... . ......... . ... . . . . ............... .... . .. . .. . .................... .. . . ... . . . .. ... ..... . . . . . ............. . . ...................................................................................................................... ...... . ..... ... .. . . .. .......... . .. . . . . ........................................................................ .. . ...... ....... . .. ... ............... ........ . . . .................. . .. . ..... .... . .... . .. . . ..... .. .. .. . . ..... .. . ... ........... ................................ . ... ... ......................... . .... . . ... . ............. . .. ........ . ....... . . . . . ...... . .. . . . ..... . . . . . ..... .. . . . ....... .... . .. . . ................................. . .. . .. . . . ....... . .. ..... ... . .. . . . .
lowQualScore : 7 9 7 9 6 1 9 9 6666 1 6 222 2 3 44444444444444444 3 222 3 66 00 3 6 000 55 2 0 1 66666666 000 4 444 9 1 666 2 6 6 555555 2 99999 33 555 888 00 000000 3 7 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 999999 11111 000 111111111111 99 1 2 22 22 22222222222222222222 55 1 1 1 1 55 33 3 3 444 1 000000000 9 222 9 9 7 9 333333333333333 5555 3 00 6 55 7 00000000000000000000 66 3 3 888 3 3 3 66 888 55555 6 6 0 3 3 7777777777777 3 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 555555 3 11111 444 66 6 3 22 2222222222 1 88 3 3 3 3 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22 3 666666 5555555 4 99 000 999999999999999 55555555 1 1 3 777777777777777777 2 66 3 33333 5555 6 7777 3 66 3 3 99999 99 66 22 3 7 77777 22 7 333 99999999999 44444444444444444444444444444444 3 888 888 2222222222222222222222222 6 7777 6 6 333 6 8888888888888 6 44 44444444 6 8888888 6 6 6 3 6 999999 7 66 1 1 9 44444 9 9 9 7 7 55555 22 1 3 7 5555555 1111 3 00 6 6 555555555555555555555555555555555 3 11 7 99 9 9 9 0000000 9 99 77777 333 3 77 3 3 0 0
consensus : AGTT-GGCGAA-A-GACG-CCG-GCCC-ACCGG--CGATC-TCCGATA---AAT-TTGA-TCAGATG--CC---G-AT-AGT-TTT-T-AG-AA--CCA--A-GC-CGG-ACA--CTGT-GTCCGG-TAGATTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GT-AAATCGT---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATTAC--TTTTCAAAA-GTTG---TTTATC--T--TATT---C-GATA-AC-ATG--A-A-----------AA-GTATGAA-A----ATT-AT------T----AAC---------------------G---TG------ATT-----TT---TT---T---C----T--TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC--G----GGAAATT--TCAA-TTTTGGTT-TC-T-A-CGT-GA-A-GTTTA--TGT-AT----ATC--CGGT-ATCG--AG-G-TTTG-GCGCGGC-G-----------AGT-AAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCA---T-TA-AA-AAG--A---AAGT-C---GC-T-GCC-A-GA-AGC-T-----------G-A-TAA--C----A-C-------------AA-----------C----AAA-----------------------AA----A-----------T-----G------------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAAGAC--AGA-CAAT--G-GC-------T-AAA-GT-ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T-----------TG----A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C-G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGG----T----AGAAT-AT-TCA---AAT------------TGA----------AACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAG-TTT----A-T--TGC-TA-CATT------G-TATTTGA-T-------TG-ATACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GT-CC--GGCAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-TGTAG-TTTTTGTT-AC-TTTTTAGCAATTTGTAGGACNCTGTGTCCGACAGATTAGCA-ATTTN-TAGG-ACACC--GT-GTC-C-G-----A-C-A--GAT-----T---TT-TT--AGCTC-TT-TC-G-CCAACT
Reference ( gi|4 ) : AGTT-GGTGAA-A-GACG-C-G-GCCC-ACCGGAGCGATC-TCCGACAT--AAT-TTGA-TCAGATG--CC---G-CTTAGT-TTT-T-AG-AA--CCA--A-GC-CGG-CTA--CTGTTGTCCGG-TAGATTTTTTTCATGAAATATA--CAAT-A---GT-AAATCGTACATCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATTACGTCTTTCAAAA-GTTG--GTTTATC--T--TATT---C-AATA-AC-AT---A-A-----------AA-GTA-GAATA----ATT-AT------T----AAC---------------------G---TG------ATT-----TT---TT---C---T----T--TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC--G----GAAAATT--TCAA-TTTTGGTT-TC-T-A-CGT-AA-A-GTTT---TGT-AT----A----CGGT-ATCA--AG-G-TTTG-GCGCGGC-G-----------AG--AAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCA---T-TA-AA-AAG--A---AAGT-T---GC-T-GCC-A-GA-AGT-T-----------G-A-TAA--C----A-C-------------A------------C----AAA-----------------------AA----A-----------T-----G------------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAAGAC--AGA-CAAT--G-AC-------T-AAA-GT-ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T-----------TG----A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C-G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGG----T----A-AAT-AT-TCA---AAT------------TCA----------AACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--AA-CAG-TTT----A-T--TGC-TA-TATT------T-TATTTGA-T-------TG-ATACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GT-C---GGCAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-TGTAG-TTTTTGTT-AC-TTATCAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTAGCA-ATTTC-TAGG-ACACT--GT-GTC-C-G-----A-C-A--GAT-----T---TT-TT--AGCTC-TT-TC-G-CCAACT
gi|3 : AGTTAGGCGAACA-GACC-C-G-AGCC-ACCG---CGATC-TCCGATAA--AATATTAA-TCA-ATGATCC---G-AT-AGT-TTT-A-TG-AA--CCA--ATGC-CGG-ACA--CTGT-GTCCGG-TAGAATTTTTTCA--GAATAT---CAAT-A---GTTAAAT-ATATTTCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATT-CACTTTTCAAAA--TTG---TTTATTGTT--TATT---C-AATA-ACCAT---A-A-----------AAAGTATGAATA-----TT-AT------T----CAC---------------------AGTATG------ATT-----TT---TT---TAATC----T--TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC--A----CGAAATTAGTCAA-TGTTGGTT-TA-C-A-CGT-GA-A-TCATA--TGT-AT----A----TCGT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-AT----------AGT-AAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC----T-TA-AA-AAG--A---A-GT-CTGCGC-T-GCCTA-GA-AGTCT-----------G-AATAA--CT---A-C-------------AA-----------C----AAA-----------------------AA----A-----------------G------------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAAGAT--AGA-CA-T--G-TC-------T-AA--GA-ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T-----------TG----A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CTG-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGG----T----A-AAG-ATCTCA---AAT------------TCA----------AACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAG---T----A-T--TGC-TA-CTGT------T-TATTTGA-T-------TG-ATACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCC---GGTCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-TGTAT-GTTTTGTT-AC-TT
gi|2 : gAGTTAGGCGAACA-GACC-C-G-AGCC-ACCG---CGATC-TCCGATAA--AATATTAA-TCA-ATGATCC---G-AT-AGT-TTT-A-TG-AA--CCA--ATGC-CGG-ACA--CTGT-GTCCGG-TAGAATTTTTTCA--GAATAT---CAAT-A---GTTAAAT-ATATTTCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATT-CACTTTTCAAAA--TTG---TTTATTGTT--TATT---C-AATA-ACCAT---A-A-----------AAAGTATGAATA-----TT-AT------T----CAC---------------------AGTATG------ATT-----TT---TT---TAATC----T--TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC--A----CGAAATTAGTCAA-TGTTGGTT-TA-C-A-CGT-GA-A-TCATA--TGT-AT----A----TCGT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-AT----------AGT-AAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC----T-TA-AA-AAG--A---A-GT-CTGCGC-T-GCCTA-GA-AGTCT-----------G-AATAA--CT---A-C-------------AA-----------C----AAA-----------------------AA----A-----------------G------------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAAGAT--AGA-CA-T--G-TC-------T-AA--GA-ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T-----------TG----A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CTG-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGG----T----A-AAG-ATCTCA---AAT------------TCA----------AACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAG---T----A-T--TGC-TA-CTGT------T-TATTTGA-T-------TG-ATACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCC---GGTCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-TGTAT-GTTTTGTT-AC-TTtttttagcatatgtttagggacccgtgtccaacagattttattaactttcttctctga
gi|1 : gAGTT-GGCGAA-A-GACG-CCG-GGCC-ACCGG--TGATCATCTGATAA--AAC-TTGA-TCGAATG--TCCAAG----AGT-TTT-A-GA-AA--CCA--A-GC-CGG-ACAAACTGT-GTCTGG-TAGATTTT---CA--GAATATA--CAAT-ATTAGT-AAATCGT---TCAAATAAT-A-AA-TA--ATG-CGCATTAC-TTATTCAAAA-GTTG---TTTATT--T--TATTTTGC-A-TA-AC-ATGAAA-A-----------AA-GTATGAA-A----ATT-AT------TT---AAT---------------------G---TG------ATT-----TT---TTGTTC---C----T--TATCAAACA-C--AAAA--T--------ACCC-G----GAGAATT--TCAA-TTT-GGTT--C-T-A-TGT-GA-A-GTTT---AGT-AT----ATCCGCAGT-ATCG--AG---TTGG-GC-CGGC-G-----------AGT-AAACA-T--GT--TCA--A-GA--TGTGGACAATTTTAGAAAT-----GGTCACAAA-G-TCA---T-TA-AA-AAG--A---AA-T-T---GC-T-GC--A-TA-AGC-TGAAAACACAGTG-A-CAA--C----A-A-------------AAAATAAAAGAAAC----AAA-----------------------AA----G-----------G-----G------------TAGGACAGTTCTAACCAC------AGTTG-----GA---TTAAAGAC--AGA-CAAT--GCGC-------T-AAT-GT-TTGGACA-A-TGATTCTCATTGATGTTTTAT------G-----------TGGCC-A--TG----------------CAT--A---AAATCTT--T-AT------CAA-------CT-CA--AAAA---A---------------AA--------AA-CACAAtttttagcatatgtttagggacccgtgtccaacagattttattaactttcttctctga
gi|14 : agAGTT-GGCGAA-A-GACG-C-C-GGCC-ACCG---CGATC-TCCGA-ATTAAAT-TTGG--CAAGT---CC---G----AGTATTT-T-AG-AA--CCA--A-GTTCGGACCA--CTGT-GTC-GG--AAATTTTT--CAAGAA-TATAACTAAT-ATTAGT-AAATCGT---TCAAAACAT-A-A--TA--ATAATGT--------TTTCAAAA-CTTG----TTAT---T--TATT---T-GATAGAC-ATGAGA-A-----------AA-GTATGAA-A----ATT-AT------T----AAT---------------------G---TG------ATT-----TTTTTTT---C---T----T--TATCGAA-A-C--AAAAATT--------GCC--G----G-AAATT--TCAA-TTTTGG-T-TC-T-A-TGT-GA-A-GTTT---AGT-AT----ATC--CGGT-ATCG--AG-G-TTTG-GCGCGGC-G-----------AGT-AAACA-T--GTG-CCA--A-aacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgattccaactatctaaacagttttgttaaaggttaacggatattgttaaaaaccaagtgcactcgctgatcatagtcttcaggatcaaatatcaaattgaaaccgaatcggtgattaaatagtttattttgcctacattgtattttacatgcgttttctttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtattttttgttacttttttagcaatttgataggacacttttgtcccgacagaatttttagctctttcgccaact
gi|16 : gAGTT-GGCGAA-A-GACG-C-C-GCCC-AC---GGCG-TC-TC-GATA---AAT-TTGG-TCA-ATGT-CC---G-ATCAGT-TTT-TTAG-AAAGCCA--A-GT-CGGACAA--CTGT-GTCCGGGTAAATTTTTC-----GAATATA--CAATCATT-GT-AAATCGT---TCAAAACAT-A-AA--A--T-AATGT--------TTTCAAAA-CTTG---TTTATC--T--TATT---CTGATA-AC-ATGA-A-A-----------AA-GTATGAA-A----ATT-AT------T----AAT---------------------G---TG------ATT-----TT---TT---T---T----TCTTATCGAA-A-C--AAAA--T--------GCC--G----G-AAATT--TCAA--TTTGGTTGTC-T---TGT-GA-A-GTTTA--TGTAAT----AT---CGGT-ATCG--AG-GTTTTG-GCGCGGC-G-----------AGT-AAACA-T--GTG-
gi|13 : AGTT-GGCGAA-A-GACG-CCG-GCCT-ACCGG--CGATC-TCCGATA---AAT-TTGG-TCA-ATG--TC---T-GATAGT-TTTCT-AGCAA--CCA--A-GT-CGG-ACA--CT-TTGTCCG--TAAATTTT---CA--GAATATA--CAAT-ATTAGT-AAATCGT---TCAAAACAT-T-AA-AA--TTAATGT--------TTTCAGAATGTTG---TTTATC--T--TATT---T-GATA-AC-ATGG-A-A-----------AA-GTATGAA-A----ATTAAT------T----AA----------------------G---TG------ATT-----TT---TT---T---TTTTCT--TATCGAA-A-CAAAAAA--T--------GCC--G----GAAATGT--TCAATTTTTGGTT-TCAT-A--GTGGA-A-GTTTA--TGT-ATATCCA----CGGT-ATCG--AGAG-TGT--GCGCGGCAG-----------AGT-AAACA-T--GT
gi|25 : gAGTT-GGCGAA-A-GACG-CCG-GCCC-ACCGG--CGATC-TCCGATA---AAT-TTGA-TC-GATG--TC---C-AATAGT-TTT-T-AG-AA--CCA--A-GC-CGc
gi|27 : gAGTT-GGCGAA-AAGACG-CCG-GCCC-ACCGG-GCGA-C-TC-GATA---AAT-TTTA-TCGAGT---CC---G-AT-AGT-TTT-T-AG-AA---CATTA-G--CGG-ACA--CTG-TGTTGGGTTAGA-TTTTTTCA-GAATTATtacagtgagtggattaaagacaagcaatggctaaatg
gi|29 : gAGTT-GGCGAA-A-GATGAT-G-GCCC-ACC--AGCGATC-TCCGATA---AAT-TTGA-TC-GATG--TT---T-GATAGT-TTT-T-AG-AA--
gi|31 : gAGTT-GGTGAA-A-GACGCC-G-GCCC-ACCG--ACGATC-TCCGATA---AAT-TT
gi|33 : agAGTT-GGCGAA-A-GACGCC-G-GCCC-ACCAG
gi|24 : cagGTT-GGCGAA-A-GACG-CCG-GCCCTGTTGG--CGATC-TCCGATA---AAT-TTGA-TC-GATGT-CC---GAC--AGT-GTT-T-A--AA--CCA--A-GC-CGG-ACA--CCAT-GTCCAG-TAGATTTTT--CA--GAATATA--CAAT-A---GT-AAATCGT---TCAAAA-AT-A-AA--A---TAATGTATTAc
gi|11 : TT-GGCGAA-A-GATG-CCG-GCCC-ACC--AGCGATC-TCCGATA---AAT-TTGA-TCA-ATGT-CC---G-AT-AGA-TTT-T-AG-AA--CCA--A-GC-CGG-ACA--CTGT-GTCCGG-TAGATTTAT--CA--GAATATA--CAAT-A---GT-AAATCGT---TCAAAACAT-A-AAATA--TTAATGTATTAC--TTTTCAAAA-GTTG---TTTATC--T--TATT---T-GACA-AC-ATG--A-A-----------AA-GTATGAATACT--ATN-AT------TTGATAACATGAAAAGTATGAATATTATTG---TG------ATT-----TT---TT---C---T----TCTTATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC--G----GAAA-TT--TCAA-TTTTGGTT-TC-T-A-CGT-GA-A-GTTTA--TGT-AT----ATC--CGGT-ATCG--AG-G-TTTG-GCGCAGC-G-----------AGT-AAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCA---T-TA-AA-AAG--A---AAGT-T---GC-T-GCC-A-GA-AGT-T-----------G-
gi|5 : TT-GGCGAA-A-GACG-C-CTGCCC-ACCGGA----TC-TCC-ATA---AATATTGAATC-GATGT-CC---G-AT-AGT-TTT-T-AG-AA--CCA--A-GC-GGA-C-A--CTGT-GTCCGG-TAGATTTTC--CA--GAATATA--CAAT-A---GT-AAATCGT---CCAAAAAATCA-AA------TAATGTATTAC--TTTTCAAAG-GTTATTCTTTA-C--TGATATT------ATA-AC-AT---G-G-----------AA-GTATGAA-A----ATT-ATTAGGCCT----AAT---------------------G---TGA-----ATTTATTATT---TT---T---C----T--TATCG-A-A-C--AAAA--T--------ACC--G----G--AATT--TCAG--TTTGGTT-TC-T-A-CGT-GA-G-ATTA---TA--AT----C----CGGT-ATCG--AG-G--TTG-GCGCGGC-G-----------AGT-AAACA----GTG-CCA--A-AA--------------------T-----GGTCA--GA-G-TCA---T-T---T-TAG--A---AAGT-C---GC-T-GCC-A-TA-AGC-C-----------G-A-TAA--TCAGAA-A-------------A------------C----AAA-----------------------AA----A-----------
gi|18 : agcAT-ACAA-TT--TTACTGTATT---CTTTTCAAAA-GTTT--ATTTATT--T--TAAT---T-GATA-TC-AT---A-ACATGGAAAGTTAA-GTATGAA-A----ATT-ATTTGGCCT----AAT-------------------------TGATTTATATT-----TT---TT---T---C----T--TATCGAA-A-C---AAA--T--------AC--------GGAAATT--TCAA-TTTTGGTT-TC-T-AGGGT-GA-A-GTTT---TGT-AT----ATC--CGGT-ATCG--AG-G-TTAG-GCGCGGC-T-----------AGT-AAAGG-T---TGCCCA--A-AA--T-----------------T-----AGTCA--GA-G-TCATTTT-T------AG--A---AAGT-C---GC-T-GCC-A-GA-AGC-T-----------G-A-TAaaaaaacaaaaaaaaaaaaagaacaaaaaggttaggaagtttaatggctaaagtatgatgatgatacttattgatgttttgtgtgccgtgcacaaattttgttaactcaaagaaaaatggaaccaacatatcaaacagttttgttaaagattggtaatttaaaaacaattatacactcgctgatcaccagtcttcaggatgcggtagaatatcaaatatcattcataaattaaattgaatgtgttaagataacacttattgtacattgtattgattgatgcatgttgataagttgcatttacatttttgatggtttgttctatttggtccgg
gi|21 : aa-A-AA-TA--TTAATGTATTAC--TTTTCAAAC-GTTG---TTTATC--T--TATT---T-GATA-AC-AT---G-A-----------AA---A-G--------------------------AT---------------------G---TG------ATT-----TT---TT---T---TTTC-T--TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACT--G----G-AAATT--TCAA-TTTTGGTT-TC-T-A-AGT-GA-A-GCTTA--TGT-AT----ATC--CGGT-ATCG--AG-G-TTTG-GCGCGGC-A-----------AGT-AAAC-----GTG-CCA--A-GATGTGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCA---T-TA-AA-AAG--A---AAttattcagttaacaaaaaaaaa
gi|23 : aTATTAC--TTTTCAAAA-GTTG--ATT-ATT--C--TATT---T-GATA-AC-AT--------------------GGA-GAATATGAAATTCAT------T--------------------------------T--------TT-----TT---TT---T---C----T--TATCGAA-A-C--AAAA--T--------TCA--G------AATTT--TCAA-TTTTGGTT-TC-T-A-CTT-GACG-GTTTATATGT-AT----ATC--CGAT-ATCG--AG-A-TTTG-GCGTGGC-G-----------AGT-AAA
gi|32 : A-AC-AT---GGA-----------AA-GTATGAAAA----AT--AT------T----AAT---------------------G---TG------ATT-----TT---TT---T---C----T--TATCG
gi|17 : TT-AT------T----AATAT-------------------G---TG------ATT-----TT---TT---T---TC---T--TATCGAA---C--AAAA--TCCATTGGTACC--GACA-GGAAATT--TCAA-TTTTGGTT-TC-TTA-CGT-GA-ATGTTTAT-TAT-AT----A----CGG--ATCGTGAG-G-TTTG--CGCGGC-G-----------AT--TAACAGTA-GTG-CCA--A-GA--TG-G--------------T-----GGTCA--AATA-TCA---T-TATAATAAGCAA---AAGT-A---GC-TTGCC-A-GACAGT---------------G-TAA--C----A-C-------------A------------C----AAA-----------------------AA----A-----------T-----G------------T-------------CCAC------AG--G-----GA---TTAAAGACA-AGA-CAATCCG--C-------TAAAA-GTGATG-ACA-T-TGATTCGCAT--------TCT------T-----------TGAGT-A--TG----------------CAC--A---A----TT--T-GT------CAA-------AC-GA--AAAA---A---------------A
gi|30 : TT-----TT---TT---T---C----T--TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACCTGGTACCGGAAATT--TCAA-TTTTGGTT-TC-T-A-CG
gi|6 : attT-AT----C----CGGTTATCG--AG-G-TTTG-G-GCGGC-GGAGGGCGTGGGAGGTAAACA-TTTGTG-CCA--AAGA--TGTG--------------TTTCGTGGTCA--AA-GGTCA---AATA-AA-AAA--AGAAAAGTGT---GC-T-GCC-AAGA-AAT-TTTT--------G-A-TAA--T----AAC-------------A------------CTTCAAAA-----------------------AA----A-----------T-----GAACAAAAATAATT-------------CCAC------AGTTG-----GAATATTAAAGACCAGGA-CAAT--G-GCCACGCCCT-AAA-GT-ATG-ACGTA-TGATTCTC-----------AT------T-----------TG----GATTG----------------CACA-A---A---ATT--T-GT------CAA-------CC-AACCAAAA---A---------------AA---
gi|12 : tgcattgtaaT-ATCG--AG-G-T------GCAGC-G-----------AGT-AAAGA-T--GTG-GTA--A-GA--TGTGCCCAATTAAA----T-----CTTCA--GA-G-TCA---T-TA-AA-ATG--A---AAAT-C---GC-T-ACC-A-GA-AGC-T-----------G-A-TAA--C----A-C-------------AAAG---------C----AAA-----------------------AAGGTTA-----------G-----GAAGTTTAA----T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAGAGAA--AGA-CAAT--G-GC-------T-AAG-CT-ATG-ACG-A-TGATACTCA---------TATGACATTT-----------TGTGTCA--TG----------------CAC--AC--A---TTT--TTAT------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA-----------------------------------------------G--TT-AG-G-----GTTG-T-GG-TA----AT-TT--CAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T-G-A----G--TC--TTCAAG---ACTCCATCAGGA-TGCGG----T----AGAAT-A--TCA---AATA-----------TCA----------aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgaaccaactatcttccaaacaagtttggtttaaagcgtttattatggtactaaatttaaaaaacaaagtgcactccgctgatcaacgaggtccttcagggcagttatgagatatatcaaattgaaactgaatggattgtattaaaaataaacagtttattgctaacattgtatttgaattgatacattgttgattttaaaaactgcatttttactatattgatggtgtttttgtattttgtccgtggcaattatttttaagtgtgttcttgatagtttttgtttacctttttttagcaatttgtaggacactgtgtcatgaaggaacggatttatcttttttgccctttcgcccaactct
gi|7 : TCA--AA-G-TCA---T-TA-AA-AA---A---AAGT-T---GC-T-GCCCA-GA-AGC-T-----------G-A-TAACAC----A-CAAAAAATAACAGAA------------C----AAAGGTTAGG----------------AA----G-----------TTTTACA------------T-------------CCACTGTGACAGT-T-----GA---TTAAG--C---GA-CA-T--G-G----------AAA-GT-ATG-ACG-A-TG---TTC----------TAT------T-----------TG----A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GTACACTACAAAAAAAACCA-AA--AAAA---A---------------AA---C-A--AA-C-CAAC-GA---AC---CAAACTCTACAACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTT--T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAACCT-C-GCT----TGA--TTC-C-GAA----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGG----T----AGAAT-A--TCA---AAT------------TGA----------AACTGAAT-GG----T-TTACAAA-T--GA-CAG-TTT------T--TGC-TA-CATT------G-TATTTGA-T-------TG-ATAC--T-GTT-GATT--T---CAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GT-CTG-GACAA--TTTATT-AA-GTTGTGCACG----TGGTC-TGTAG-TTTTTGTT-AC-TTTTTCGCAATTTGTAGGAACAC------------TTAG---ATGTC---GA-ACA--------------------------GAT-----T---TT-TT--AGCTC-TT-TC-G-CCAACTttgacattcatgaaattgtattttacatattttgatggttgtctatttggtctggcaacttt
gi|8 : TCA--AA-G--CA---T-TA-AG-AA---A---AAGT-T---GCCT-GAC-A-GA-AGC-T-----------GTA-TAAT-C----A-C-------------A------------C----AAATAAAATAAAGAACAA--------AA----AGTTAGGAAGTTT-----A------------T-------------CCAC------TGT-GACATTGA---TTAAAGAC--AGAACAAT--T-GC-------A-AAA-GT-ATG-ACG-A-TGATTCTC-----------AT------T-----------GG----A--TG----------------CAC--AAACA---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAA---AAACCAAAAAAAAAACAA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACCATTTTG--TTAAAAG-----GTTA-T-GG-TA----TT-TTAAAAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C-G-A----G--TCT-TTCAGG---AT-----------TGC-G----T----AGAAT-A--TCA---AAT------------TGA----------AACTGAAT--G----TGTTA-AAA-T--GA-CAG--TT----A----TGCACA--ATT------G-TATTTTG-T-------T--ATACACT-GTT-GA-TTGT---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT---G-TT-TATC-T-ATTTG-GT-CT--GGACA--ATT-TT-AA-GT-------GTCACTGTCCTTGTA--TTTTTGTT-AC-TT-TTAGCAct
gi|22 : CC-A-GA-GGC-T-----------G-A-TAA--C----A-C-------------A------------C----AAAGAATAAAGAACACAAAGGTTAGGAA----A-----------TTTA--A------------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAACAC--AGA-CAAT--G-GC-------T-AAA-GT-ATG-ACG-A-CGATTCT-----------TAT------T-----------TG----A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAATATA---------------AA---C-ACTAA-C-CAAT-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----atttgtaggacacttagagccgaccagatttttttaggctctttcgccaactc
gi|10 : ------AGT-G-----GA---TTAAAGAC--AAG-CAAT--G-GC-------T-AAATGT-ATG-ACG-A-TGGTTTTG----------TGC------C-----------------A--TG----------------CAC--A---AA--TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---CCG--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTG-TTGA-TA----AT-TT--AAAAA-C-ATT---A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCC-C-G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------G-CGTAGAATATCA--A-AATCAT-TCATAAAAT------------TGA----------AACTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAG-TTTTTTAACT--TGC-TA-CATT------G-TATTTGA-TATTGAATTG-AT-CA-T-ATG-GA-T--T---GATATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT-G-G-TT-T-TG-T-ATTTG-GTCC---GGCAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-TGTAG-TTATTGTT-AC-TTTTTAGCAATTTGTAGGACACTGTGTCCGACAGATT
gi|25 : g------AGT-G-----GA---TTAAAGAC--AAG-CAAT--G-GC-------T-AAA-tttagctctttcgccaa
gi|5 : gagttggcgaaagacgccggcccaccggcgatctccgataaatttgatcgatgtccaatagtttttagaaccaagccgtacagtgAAT--G-GC-------T-AAA-GT-ATG-ATG-A-TGATACT-----------TAT------TGATGTTTTGTGTGCC--G--TG----------------CAC--A---AA--TTT--T-GT------TAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---T-GG-AA-C-CAACATA---TC----A--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----AT---T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----ATTAT--ACA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C-C-A----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGG----T----AGAAT-A--TCA---AATATCATTCATAAATTA----------AATTGAAT--G----TGTTA-AGA-T--AA-CA--CTT----A-T--TG--TA-CATT------G-TA-TTGA-T-------TG-ATGCA-T-GTT-GA-T-------AAGTTGCA----TTT-AC-AT-TT-TTGATGG-T-TTGT-TC-T-ATTTG-GT-C---tg
gi|9 : agcttggcgaaagacgcctgcccaccggatctccataaatattgaatcgatgtccgatagtttttagaaccaagcggacactgtgtccggtagattttccagaatatacaatagtaaatcgtccaaaaaatcaaataatgtattacttttcaaaggttattctttactgatattataacatggaagtatgaaaattattaggcctaatgtgaatttattatttttcttatcgaacaaaataccggaatttcagtttggtttctacgtgagattataatccggtatcgaggttggcgcggcgagtaaacagtgccaaaatggtcagagtcattttagaaagtcgctgccataagccgataatcagaaaacaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaaaagaacaaaaaggttaggaagtttAAT--G-GC-------T-AAA-GT-ATG-ATG-AATGATTTTC-----------AT------T-----------TG----A--TGTTCTTGTGTGCCGTGCCA---A---A---TTT--T-G-------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA---T-GG-AA-C-CATC-TA---TC---TAG-------AACAGTTTTG--------------ATT-------TA----CT-TT--TAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CTGC-GCGGCATTGA--TCA-C-T-AACA-G--T------AGGTACAG---------A-TGCAG----TTAG-G-AAT-AA-TCA---AATATCAT-------TCATAAAATGTGAAATTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAG-TTT----A-TATTGC-TA-CATT------G-TATTTGA-T-------TG-ATGCA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-ACAATATT-TTGATGG----T-T-TC-T--TTTG-GT-C---CGGAA--ATT-TT-AA----------G----TGTCC-TGTAG-TTTTTGTTAAC-TTcgg
gi|1 : gaacaaaaaggttaggaagttt-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--ATTC-CAAC-TA---TC---TA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTAAC-GGATA----TTGTT--AAAAA-CCA-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T---A----G--TC--TTCAGG---AT--------------------C----A-AAT-AT--CA---AAT------------TGA----------AACCGAATCGG----TGATT-AAA-T------AG-TT-----------------TATT------T-TGCCT----------------ACA-T--------------------TGTA-T--TTT-AC-AT---------GC-G-TT-T-TC-T---TTG-GT-CC--GGCAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-TGTAT-TTTTTGTT-AC-TTtttttaggaatttttaggacactgtgtccgacagattttttagctcttttcgccaac
gi|6 : agagttggcgaaagacgccgggccaccggtgatcatctgataaaacttgatcgaatgtccaagagttttagaaaccaagccggacaaactgtgtctggtagattttcagaatatacaatattagtaaatcgttcaaataataaataatgcgcattacttattcaaaagttgtttattttattttgcataacatgaaaaaagtatgaaaattatttaatgtgattttttgttccttatcaaacacaaaatacccggagaatttcaatttggttctatgtgaagtttagtatatccgcagtatcgagttgggccggcgagtaaacatgttcaagatgtggacaattttagaaatggtcacaaagtcattaaaaagaaattgctgcataagctgaaaacacagtgacaacaaaaaataaaagaaacaaaaagggtaggacagttctaaccacagttggattaaagacagacaatgcgctaatgtttggacaatgattctcattgatgttttatgtggccatgcataaaatctttatcaactcaaaaaaaaaacacaaaacaaaaaaaaaaaa-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TCTTCCA--------AACAAGTTTGGTTT-AAAGCGTTTATTA-T-GG-TACTAAAT-TT--AAAAAAC-A-----AA-GT--GCA--CT-CCGC-----TGA--TCAAC-G-A----GGTCC--TTCAGG-----------------GCAG----TTATGA-GAT-ATATCA---AAT------------TGA----------AACTGAAT-GGATTGTATTA-AAAAT--AAACAG-TTT----A-T--TGC-TAACATT------G-TATTTGAAT-------TG-ATACA-TTGTT-GA-T--TTTAAAAACTGCA-T--TTTTAC--TATA-TTGATGGTG-TT-T-TTGT-ATTTT-GT-CCGTGGCAATTATT-TTTAA-GT-------G----T---------G-TTCTTGAT-AG-TT------------------TTTGTTTACCTTTTTTTAGCA-ATTTG-TAGG-ACACT--GT-GTCAT-GAAGGAA-C-G--GATTTATCT---TT-TT--TGCCC-TT-TC-GCCCAACTttttagcaatttgataggacacttttgtcccgacagaatttttagctctttcgccaact
gi|15 : tgcattgtaatatccggttatcgaggtttgggcggcggagggcgtgggaggtaaacatttgtgccaaagatgtgtttcgtggtcaaaggtcaaataaaaaaagaaaagtgtgctgccaagaaatttttgataataacacttcaaaaaaatgaacaaaaataattccacagttggaatattaaagaccaggacaatggccacgccctaaagtatgacgtatgattctcatttggattgcacaaaatttgtcaaccaaccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa-G--AA-C-CAAC-TAAT-TC---CA--------AAC-GTTTTG--TC-TAAA-----GTTA-T-TG-TA----AT-T---AGAAA-C-ACACATA--GTTCGCA--CT-CCGC-----TGA--TCATC-G-A--------T--TTCAGG---AT---------A-TGCAG----T----AGAAT-AT--CA---AAT------------TGA----------AAC-GAAT-GG----TGTAA-AAA-T--AA---GCTTT----A-T--TGC-TA-CATTGAATTTTGTATTTGA-T-------TGAAAACA-T-G-T-GA-T--T---AAAATTGCA-TAATTT-AC-A-ATTATTGA--G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCC---GGCAA--ATT-TT-AG-TC-------G----T-TCC-T-TAGTTTTTTGTT-AC-TTTTTAGCAct
gi|19 : -TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C-G-AACGAG--TC--TTCAGG---AT------------GCGT----T----AGAAT-AT--CA---AAT------------TGA----------AACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAG-TTT----A-T--TGC-TA-CATT------G-TATTTGA-T-------TG-ATACA-T-GTT-GA-T--TT--AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG---TT-T-TC-T-ATTTG-GT-CT--GGAAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-TGTAG-TTTTTGTT-AC-TTTTTAGCAaattttatacattgtgtccggccaatgattatttaaggtcttgtctgccaac
gi|12 : AAATTGTA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT-G-G-TT-G-TC-T-ATTTG-GT-CT--GGCAA--CTT-Tatttgtaggacactatgtccgacacagattttttagctctttctccaact
gi|20 : tatcgaggtgcagcgagtaaagatgtggtaagatgtgcccaattaaatcttcagagtcattaaaatgaaaatcgctaccagaagctgataacacaaagcaaaaaggttaggaagtttaatccacagtggattagagaaagacaatggctaagctatgacgatgatactcatatgacattttgtgtcatgcacacatttttatcaactcaaagaaaagttagggttgtggtaatttcaaaacaagtgcactcgctgatcatgagtcttcaagactccatcaggatgcggtagaatatcaaatatcattgacattcatgT-AC-ATATT-TTGATGA-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GT-CC--GGCAA--TTT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-TGTAG-TTTTTGTT-ACTTTTTTAGCAATTTGTAGGACACTGTGTCCGACAGATT
gi|26 : attggacattgcgtgtcagacagttgtagactggtacaattattccagggaagtctgcacctgtaatagtgtattctagagaTATT-TTAATAT-A-TT-T--C-T-ATCTA-AT-CT--GGCAA--ATT-TT-AT-GT-------G----TGTTC-TGTttttagctctttcgccaactct
gi|3 : atctttgTTAGCATATGTT-TAGGGAC-CC--GT-GTC-C-A-----A-C-A--GAT-----T---TTATT--AACTT-TC-Tttggcaatctataggacaccgtgaccagcagatttttttttagctcatttgccaattc
gi|2 : gagttaggcgaacagacccgagccaccgcgatctccgataaaatattaatcaatgatccgatagttttatgaaccaatgccggacactgtgtccggtagaattttttcagaatatcaatagttaaatatatttcaagaataaaataagttaatgtattcacttttcaaaattgtttattgtttattcaataaccataaaaagtatgaatattattcacagtatgatttttttaatcttatcgaaaacaaaatccacgaaattagtcaatgttggtttacacgtgaatcatatgtatatcgtttatatttgagcgcagcatagtaaacaatgccataagatgtggtggacaagtcttaaaaagaagtctgcgctgcctagaagtctgaataactacaacaaaaaagtccacagtggataaagatagacatgtctaagaatgccgatgatttcttatttgatgcactagatttcatgtcaagctaaaaaaaaagcgcgaaccaactagtttccaaacagtttgttaaaggtgaatcatttaaaaacaagtgcagctcgctgaggtcactgagtcccttcaggataatgcggtaaagatctcaaattcaaactgaatggtgtagaaattagacagtattgctactgtttatttgattgatacatgttagatataaagttgcagttttacatatttgaatgggtttttctaatttatgtccggtcaattttaatgtagtgtcctgtatgttttgttactttttTTAGCATATGTT-TAGGGAC-CC--GT-GTC-C-A-----A-C-A--GAT-----T---TTATT--AACTT-TC-Ttctctga
gi|8 : gagttaggcgaacagacccgagccaccgcgatctccgataaaatattaatcaatgatccgatagttttatgaaccaatgccggacactgtgtccggtagaattttttcagaatatcaatagttaaatatatttcaagaataaaataagttaatgtattcacttttcaaaattgtttattgtttattcaataaccataaaaagtatgaatattattcacagtatgatttttttaatcttatcgaaaacaaaatccacgaaattagtcaatgttggtttacacgtgaatcatatgtatatcgtttatatttgagcgcagcatagtaaacaatgccataagatgtggtggacaagtcttaaaaagaagtctgcgctgcctagaagtctgaataactacaacaaaaaagtccacagtggataaagatagacatgtctaagaatgccgatgatttcttatttgatgcactagatttcatgtcaagctaaaaaaaaagcgcgaaccaactagtttccaaacagtttgttaaaggtgaatcatttaaaaacaagtgcagctcgctgaggtcactgagtcccttcaggataatgcggtaaagatctcaaattcaaactgaatggtgtagaaattagacagtattgctactgtttatttgattgatacatgttagatataaagttgcagttttacatatttgaatgggtttttctaatttatgtccggtcaattttaatgtagtgtcctgtatgttttgttactttttTTAGCA-ATTTG-TAGG-ACACTTAGA-G-C-C-G-----A-CCA--GAT-----T---TT-TTTAGGCTC-TT-TC-G-CCAACTtctctga
gi|1 : tcaaagcattaagaaaaagttgcctgacagaagctgtataatcacacaaataaaataaagaacaaaaagttaggaagtttatccactgtgacattgattaaagacagaacaattgcaaaagtatgacgatgattctcattggatgcacaaacattttgtcaactcaaaaaaaaaccaaaaaaaaaacaacgaaccaactatccaaaccattttgttaaaaggttatggtattttaaaaaaacaagtgcactcgctgatcacgagtctttcaggattgcgtagaatatcaaattgaaactgaatgtgttaaaatgacagttatgcacaattgtattttgttatacactgttgattgtaaaattgcattttacatattttgatgtttatctatttggtctggacaattttaagtgtcactgtccttgtatttttgttacttTTAGCA-ATTTGATAGG-ACACT--TTTGTC-CCG-----A-C-A--GAA-----T---TT-TT--AGCTC-TT-TC-G-CCAACTc
gi|19 : agagttggcgaaagacgccgggccaccggtgatcatctgataaaacttgatcgaatgtccaagagttttagaaaccaagccggacaaactgtgtctggtagattttcagaatatacaatattagtaaatcgttcaaataataaataatgcgcattacttattcaaaagttgtttattttattttgcataacatgaaaaaagtatgaaaattatttaatgtgattttttgttccttatcaaacacaaaatacccggagaatttcaatttggttctatgtgaagtttagtatatccgcagtatcgagttgggccggcgagtaaacatgttcaagatgtggacaattttagaaatggtcacaaagtcattaaaaagaaattgctgcataagctgaaaacacagtgacaacaaaaaataaaagaaacaaaaagggtaggacagttctaaccacagttggattaaagacagacaatgcgctaatgtttggacaatgattctcattgatgttttatgtggccatgcataaaatctttatcaactcaaaaaaaaaacacaaaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgattccaactatctaaacagttttgttaaaggttaacggatattgttaaaaaccaagtgcactcgctgatcatagtcttcaggatcaaatatcaaattgaaaccgaatcggtgattaaatagtttattttgcctacattgtattttacatgcgttttctttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtattttttgttacttttTTAGCA-ATTTG-TAGG-ACACT--AT-GTC-C-GAC---A-C-A--GAT-----T---TT-TT--AGCTC-TT-TC-T-CCAACT
gi|9 : ttaaaaacaagtgcactcgctgatcacgaacgagtcttcaggatgcgttagaatatcaaattgaaactgaatggtgttaaaatgacagtttattgctacattgtatttgattgatacatgttgatttaaaattgcattttacatattttgatggttttctatttggtctggaaaattttaagtgtgtcctgtagtttttgttactttTTAGGA-ATTTT-TAGG-ACACT--GT-GTC-C-G-----A-C-A--GAT-----T---TT-TT--AGCTCTTT-TC-G-CCAAC
gi|15 : gaacaaaaaggttaggaagtttaatggctaaagtatgatgaatgattttcatttgatgttcttgtgtgccgtgccaaattttgcaactcaaagaaaatggaaccatctatctagaacagttttgatttacttttaaaacaagtgcactgcgcggcattgatcactaacagtaggtacagatgcagttaggaataatcaaatatcattcataaaatgtgaaattgaatggtgttaagataacagtttatattgctacattgtatttgattgatgcatgttgattaaaattgcattttacaatattttgatggtttcttttggtccggaaattttaagtgtcctgtagtttttgttaactttttTTAGCA-AATTT-TAT--ACATT--GT-GTC-C-G-----GCC-AATGAT-----TA--TT-TA--AGGTC-TTGTCTG-CCAAC
gi|20 : gaaccaactaattccaaacgttttgtctaaagttattgtaattagaaacacacatagttcgcactccgctgatcatcgatttcaggatatgcagtagaatatcaaattgaaacgaatggtgtaaaaataagctttattgctacattgaattttgtatttgattgaaaacatgtgattaaaattgcataatttacaattattgaggttttctatttggtccggcaaattttagtcgttccttagttttttgttactttTTAGCA-ATTTG-TAGG-ACACT--GT-GTC-C-G-----A-C-A--GAT-----T---TT-TT--AGCTC-TT-TC-G-CCAACT
gi|26 : attggacattgcgtgtcagacagttgtagactggtacaattattccagggaagtctgcacctgtaatagtgtattctagagatacatattttgatgatttttctatttggtccggcaatttttaagtgtgtcctgtagtttttgttacttttTTGGCA-ATCTA-TAGG-ACACC--GT-GAC-C-A-----G-C-A--GAT-----TTTTTT-TT--AGCTC-AT-TT-G-CCAATTct
gi|11 : atctttgtattttaatatatttctatctaatctggcaaattttatgtgtgttctgtGG-ACACT--GT-GTC-C-G-----G-T-A--GAT-----T---TA-TC--AGc
gi|5 : ttggcgaaagatgccggcccaccagcgatctccgataaatttgatcaatgtccgatagattttagaaccaagccGG-ACACT--GT-GTC-C-G-----G-T-A--GAT-----T---TT-CC--AGaatatacaatagtaaatcgttcaaaacataaaatattaatgtattacttttcaaaagttgtttatcttatttgacaacatgaaaagtatgaatactatnatttgataacatgaaaagtatgaatattattgtgattttttcttcttatcgaaacaaaataccggaaatttcaattttggtttctacgtgaagtttatgtatatccggtatcgaggtttggcgcagcgagtaaacatgtgccaagatgtgtggtcaaagtcattaaaaagaaagttgctgccagaagttg
gi|24 : agcttggcgaaagacgcctgcccaccggatctccataaatattgaatcgatgtccgatagtttttagaaccaagcGG-ACACC--AT-GTC-C-A-----G-T-A--GAT-----T---TT-TC--AGaatatacaatagtaaatcgtccaaaaaatcaaataatgtattacttttcaaaggttattctttactgatattataacatggaagtatgaaaattattaggcctaatgtgaatttattatttttcttatcgaacaaaataccggaatttcagtttggtttctacgtgagattataatccggtatcgaggttggcgcggcgagtaaacagtgccaaaatggtcagagtcattttagaaagtcgctgccataagccgataatcagaaaacaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaaaagaacaaaaaggttaggaagtttaatggctaaagtatgatgatgatacttattgatgttttgtgtgccgtgcacaaattttgttaactcaaagaaaaatggaaccaacatatcaaacagttttgttaaagattggtaatttaaaaacaattatacactcgctgatcaccagtcttcaggatgcggtagaatatcaaatatcattcataaattaaattgaatgtgttaagataacacttattgtacattgtattgattgatgcatgttgataagttgcatttacatttttgatggtttgttctatttggtccgg
gi|10 : gttggcgaaagacgccggccctgttggcgatctccgataaatttgatcgatgtccgacagtgtttaaaccaagcc-----T---TT-TT--AGCTC-TT-TC-G-CCAAaatatacaatagtaaatcgttcaaaaataaaataatgtatta
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): GCCGAAAGACGCCAGATGCCAGAGATCTCTGGTAAATTTTAATTGTCGGTAAAACTTCAAACTCTGGATACTGGACAAACTGTCCGAAGATATTGCAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 33333333 1111111 11 222 11 1 333333333333333333333333333 11111111111 111 11 11111 333333333333333 1111111 22222222222222222222 111111111111 1111 44444444444444444444 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222222222 333333333333333333333333333333333333 2222222222222222 222222 1111111 1 111111111111111 11111111 111 11111111 1111 11111 11 11111 11111 11 3333333333333333 1111 33333333333 111111111111111 1111111111 1111111 1111111 11111111 111 1111111 222 111
lowQualScore : 5 5 2 2 666 2 33 2 8 0 2 55555555 5 2 2 2 2 33 44 6 3 3 77 0000000 3 6 11 44 77 666 4 888 11 777 0 6 3 222222222222222222222222222 4 88888 3 55555555555 55 3 3 999 3 222 44 00 3 00000 6 3 44 77 77777 3 2 888888 222222222222222 2 9999 66666 777777 3333333 444 2 5 33 33 11111111111111111111 2 2 77 2 2 5 33 3 3 3 44 2 2 33 33 2 33 2 2 5 2 5 333333333333 2222 3 99 3 55 44444444444444444444 44 3 3 3 3 3 333 44 555 55555 6 9 3 3 888888 6 3 6 44 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 888888 6 77777 555 0 3 77 3 3 33 2 2 9999999 2 33 33 11111111111111 3 3 3 888888888888888888888888888888888888 44 0000000000000000 222222 888 88 3 888888 6666666 0 33 444 666666666666666 88888888 2 2 3 555 555 44444444 0 44 3 77777 2222 3 7777 3 44 3 3 11111 77 44 00 3 6 00000 88 6 22222 6666 44 11 3333333333333333 0000 3 3 77777777777 888888 555 999999999999999 1 3 6666 3 3 999 6 0000000000 3 3 0000000 3 0000000 3 3 3 3 6 55555555 6 44 2 2 2 2 000 2 2 2 5 5 33 2 33 2 3 6 6666666 6666 3 44 44 3 555 000 6 44 3 3 1 3 999 3 44 3 5 77 2 8 8 99 111 5
lowQualScore : . . . . ... . .. . . . . ........ . . . . . .. .. . . . .. ....... . . .. .. .. ... . ... .. ... . . . ........................... . ..... . ........... .. . . ... . ... .. .. . ..... . . .. .. ..... . . ...... ............... . .... ..... ...... ....... ... . . .. .. .................... . . .. . . . .. . . . .. . . .. .. . .. . . . . . ............ .... . .. . .. .................... .. . . . . . ... .. ... ..... . . . . ...... . . . .. ................................................................................................................... ...... . ..... ... . . .. . . .. . . ....... . .. .. .............. . . . .................................... .. ................ ...... ... .. . ...... ....... . .. ... ............... ........ . . . ... ... ........ . .. . ..... .... . .... . .. . . ..... .. .. .. . . ..... .. . ..... .... .. .. ................ .... . . ........... ...... ... ............... . . .... . . ... . .......... . . ....... . ....... . . . . . ........ . .. . . . . ... . . . . . .. . .. . . . ....... .... . .. .. . ... ... . .. . . . . ... . .. . . .. . . . .. ... .
lowQualScore : 3 0 5 5 333 7 77 7 0 7 9 66666666 7 9 9 9 9 99 22 2 1 1 33 0000000 1 2 55 66 99 333 0 000 00 000 0 7 3 222222222222222222222222222 2 66666 3 88888888888 88 3 3 222 3 111 66 22 3 88888 2 1 22 33 77777 1 9 222222 444444444444444 9 3333 77777 777777 3333333 777 9 7 99 99 66666666666666666666 9 9 99 9 9 7 44 1 1 1 22 9 9 99 99 7 77 7 7 3 7 3 777777777777 9999 1 22 3 00 66666666666666666666 22 1 1 1 1 1 555 22 444 11111 7 2 1 1 888888 2 1 7 66 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888888 2 77777 444 4 1 33 1 1 99 9 9 3333333 9 99 88 22222222222222 1 1 1 888888888888888888888888888888888888 22 4444444444444444 555555 555 55 1 888888 2222222 7 77 777 777777777777777 55555555 9 9 1 000 444 22222222 4 22 1 77777 8888 3 1111 1 22 1 1 99999 33 22 44 1 2 88888 55 2 33333 5555 22 55 6666666666666666 8888 5 1 77777777777 888888 444 222222222222222 5 1 5555 1 1 777 2 5555555555 1 1 0000000 1 0000000 1 1 1 1 2 11111111 2 22 9 9 7 7 777 7 7 7 3 3 77 7 99 9 1 2 2222222 5555 1 22 66 1 444 000 2 22 1 1 0 1 666 1 66 3 7 77 0 0 0 22 777 7
consensus : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCA--GATGTCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--CCA--A-GC-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA--------TA--TTA---------A--TGTATT-AC--TT-T-----------TCAAAA-GT-T-G---TTTA-TC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT------T------AAC--G---TG-A----TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TAGG-ACAC-T---GTGT-CCG--A-CAGATTAGCAATTTN-TAGGACACTGT-GTCC-GACA--GA---TTTTTTAGCTC-TTTCGCCAACT
Reference ( family-3770 ) : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCA--GATG-CCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--CCA--A-GC-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA--------TA--TTA---------A--TGTATT-AC--TT-T-----------TCAAAA-GT-T-G---TTTA-TC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT------T------AAC--G---TG-A----TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TAGG-ACNC-T---GTGT-CCG--A-CAGATTAGCAATTTN-TAGGACACCGT-GTCC-GACA--GA---TTTTTTAGCTC-TTTCGCCAACT
gi|1 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGGCC-ACCGG--TGATCATCTGA--TA-AAAC-TTGA-TCG--AATGTCCAAG-AGT-TTT-A-GA-AA--CCA--A-GC-CGGAC-AAACTG-------T-GTCTGG-TAGA--TTTT---CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAATAAT-A-AA--------TA--ATG------------CGCATT-AC--TTAT-----------TCAAAA-GT-T-G---TTTA-TT--T--TATTTTGCATA-----AC-AT-GA--AAAAAGT-----ATGAA-AATT-AT------TT-----AAT--G---TG-A----TT-----T------TTTGTTC---CT---TATCAAACA-C--AAAA--T--------ACC-C-----GGAGAAT-T--TCAA-TTT-GGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CGCAGT-ATC--GAG---TTGG-GC-CGGC-G-A------------GTAAACA-T--GT--TCA--A-GA--TGTGGACAATTTTAGAAAT-----GGTCACAAA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AA-T-T---GC-TGC--A-TA-A------G-CTG-A-AA--A---C---A--CAGTGACAACAAAAAATAAAAGAA---------------A-------------CAAA-------AA----GG----------G--------TAGGACAGTTCTAACCAC------AGTTG-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-GCGC-------T-A--AT-GT--------------TTGGACA-A-TGATTCTCATTGATGTTTTAT------G--TGGCC--------A--TG----------------CAT--A---AAATCTT--T-AT------CAA-------CT-CA--AAAA---A---------------AA--------AA-CACAA
gi|1 : ag-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--ATTC-CAAC-TA---TC---TA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTAAC-GGATA----TTGTT--AAAAA-CCA-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T-----A----G--TC--TTCAGG---AT-------------CA--------A-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACCGAATCGG----TGATT-AAA-T------AGTT-----------------------------TATTT-----------TG-CCTACA-T--------------------TGTA-T--TTT-AC-AT---------GC-G-TT-T-TC-T---TTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAT-TTTTTGTT-A---CT--TTTTTAGCA-A--TTTGATAGG-ACACTT---TTGTCCCG--A-CAG------AATTTT-TAGaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgattccaactatctaaacagttttgttaaaggttaacggatattgttaaaaaccaagtgcactcgctgatcatagtcttcaggatcaaatatcaaattgaaaccgaatcggtgattaaatagtttattttgcctacattgtattttacatgcgttttctttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtattttttgttacttttttagcaatttgataggacacttttgtcccgacagaatttttagctctttcgccaact
gi|1 : agagttggcgaaagacgccgggccaccggtgatcatctgataaaacttgatcgaatgtccaagagttttagaaaccaagccggacaaactgtgtctggtagattttcagaatatacaatattagtaaatcgttcaaataataaataatgcgcattacttattcaaaagttgtttattttattttgcataacatgaaaaaagtatgaaaattatttaatgtgattttttgttccttatcaaacacaaaatacccggagaatttcaatttggttctatgtgaagtttagtatatccgcagtatcgagttgggccggcgagtaaacatgttcaagatgtggacaattttagaaatggtcacaaagtcattaaaaagaaattgctgcataagctgaaaacacagtgacaacaaaaaataaaagaaacaaaaagggtaggacagttctaaccacagttggattaaagacagacaatgcgctaatgtttggacaatgattctcattgatgttttatgtggccatgcataaaatctttatcaactcaaaaaaaaaacacaaaacaaaaaaaaaaaaTTAGCAATTTGATAGGACACTTTTGTCCCGACA--GA---ATTTTTAGCTC-TTTCGCCAACTctctttcgccaact
gi|10 : agagttggcgaaagacgccgggccaccggtgatcatctgataaaacttgatcgaatgtccaagagttttagaaaccaagccggacaaactgtgtctggtagattttcagaatatacaatattagtaaatcgttcaaataataaataatgcgcattacttattcaaaagttgtttattttattttgcataacatgaaaaaagtatgaaaattatttaatgtgattttttgttccttatcaaacacaaaatacccggagaatttcaatttggttctatgtgaagtttagtatatccgcagtatcgagttgggccggcgagtaaacatgttcaagatgtggacaattttagaaatggtcacaaagtcattaaaaagaaattgctgcataagctgaaaacacagtgacaacaaaaaataaaagaaacaaaaagggtaggacagttctaaccacagttggattaaagacagacaatgcgctaatgtttggacaatgattctcattgatgttttatgtggccatgcataaaatctttatcaactcaaaaaaaaaacacaaaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgattccaactatctaaacagttttgttaaaggttaacggatattgttaaaaaccaagtgcactcgctgatcatagtcttcaggatcaaatatcaaattgaaaccgaatcggtgattaaatagtttattttgcctacattgtattttacatgcgttttctttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtattttttgttactttt------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AATGT--------------ATG-ACG-A-TGGTTTTG----------TGC------C---------------A--TG----------------CAC--A---AA--TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---CCG--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTG-TTGA-TA----AT-TT--AAAAA-C-ATT---A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCC-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT------------GCG-T----AGA-ATATCAAAATCATTC------ATAAAAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTT--TTTTAACTTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-TATTGAATTG-A-T-CA-T-ATG-GA-T--T---GATATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG---TT-T-TG-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTATTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TAGG-ACAC-T---GTGT-CCG--A-CAGATT
gi|10 : gTTTTTAGCTC-TTTCGCCAAtttagctctttcgccaa
gi|11 : gagtggattaaagacaagcaatggctaaatgtatgacgatggttttgtgccatgcacaaattttgtcaactcaaagaaaaaccgaaccaactatccaaacagttttgttaaaggttgttgataatttaaaaacattagtgcactcgctgatcccgagtcttcaggatgcgtagaatatcaaaatcattcataaaattgaaactgaatggtgttaagataacagttttttaacttgctacattgtatttgatattgaattgatcatatggattgatattgcattttacatattttgatggttttgtatttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtagttattgttactttttagcaatttgtaggacactgtgtccgacagaTT-GGCGAA-A-GATGCCGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCA---ATGTCCGAT-AGA-TTT-T-AG-AA--CCA--A-GC-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTAT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAACATAA-AATATTAATGTA--TTACTTTTCAAAAGTTGT-TT-AT--CT-TATTTGACAACATGAAAA-GTAT-G---AATACTA--T--NATTT-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT------T-----------G---TG-A----TT-----T------TTTCT-T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCAGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-
gi|12 : T-ATC--GAG-G-T------GCAGC-G-A------------GTAAAGA-T--GTG-GTA--A-GA--TGTGCCCAATTAAA----T-----CTTCA--GA-G-TCAT-TA-AA-A---TG--A---AAAT-C---GC-TACC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------AAG-----------CAAA-------AAGGTTAG----------GAAGTTTAAT-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAGA-GAA--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AG-CT--------------ATG-ACG-A-TGATACTCA---------TATGACATTT--TGTGTC-------A--TG----------------CAC--AC--A---TTT--TTAT------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA-----------------------------------------------G--TT-AG-G-----GTTG-T-GG-TA----AT-TT--CAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T---G-A----G--TC--TTCAAG---ACTCCATCAGGA-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT------------------------AT-CA----T---------T--GA-CA-TT--C----A--TG--A-A-ATTG-------TATTT----------------TACA-T-----------------------A-T--TTT------------GAT-G-G-TT-G-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-CAA--CTT-T
gi|13 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCT-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGG-TCA---ATGTCTGAT-AGT-TTTCT-AGCAA--CCA--A-GT-CGGAC-A--CTT-------T-GTCC-G-TAAA---TTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-T-AA--------AA--TTA---------A--TG---------TT-T-----------TCAGAATGT-T-G---TTTA-TC--T--TATTT-G-ATA-----AC-ATGGA--AAA--GT-----ATGAA-AATTAAT------T------AA---G---TG-ATTTTTT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-CAAAAAA--T--------GCC-------GGA-AATGT--TCAATTTTTGGTT-TCATA--GTGGA-A-GTT--TATGT-A-TATCCACG--GT-ATC--GAGAG-TGT--GCGCGGCAG-A------------GTAAACA-T--GT
gi|14 : gAGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCC--ACCG---CGATC-TCCGAATTA-AA-T-TTGG--CA--AGT--CCGA---GTATTT-T-AG-AA--CCA--A-GTTCGGACCA--CTG-------T-GTC-GG--AAA--TTTTT--CAA-GAATATAACTAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-A---------TA--ATA---------A--TGT---------T-T-----------TCAAAA-CT-T-G---TT-A-T---T--TATTT-G-ATAG----AC-AT-GAGAAAA--GT-----ATGAA-AATT-AT------T------AAT--G---TG-A----TT-----T------TTT---T---TTCTTTATCGAA-A-C--AAAAATT--------GCC-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-c
gi|15 : g-G--AA-C-CAAC-TAAT-TC---CA--------AAC-GTTTTG--TC-TAAA-----GTTA-T-TG-TA----AT-T---AGAAA-C-ACACATA--GTTCGCA--CT-CCGC-----TGA--TCATC---G-A--------T--TTCAGG---AT---------A-TGCAGT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAAC-GAAT-GG----TGTAA-AAA-T--AAGC--TT--T----A-TTGCTA-C-ATTGAATTTTGTATTTGA-T-------TGAA-AACA-T-G-T-GA-T--T---AAAATTGCA-TAATTT-AC-A-ATTATTGA--G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AG-TC-------G----T-TCC-T---TAGTTTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-AATTTTA-T----ACAT-T---GTGT-CCG--G-C
gi|16 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCG-CCC-AC-GG--CG-TC-TC-GA--TA-AA-T-TTGG-TCA---ATGTCCGATCAGT-TTT-TTAG-AAAGCCA--A-GT-CGGAC-AA-CTG-------T-GTCCGGGTAAA--TTTTT--C---GAATATA--CAATCATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA---------A--T-A---------A--TGT---------T-T-----------TCAAAA-CT-T-G---TTTA-TC--T--TATTCTG-ATA-----AC-AT-GA--AAAA-GT-----ATGAA-AATT-AT------T------AAT--G---TG-ATT--TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------GCC-------GGA-AAT-T--TCAA--TTTGGTTGTC-T--TGT-GA-A-GTT--TATGTAA-TAT---CG--GT-ATC--GAG-GTTTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-caatgattatttaaggtcttgtctgccaac
gi|17 : TT-AT------T------AATATG---TG-A----TT-----T------TTT---TT--CT---TATCGAA---C--AAAA--TCCATTGGTACC-GACA--GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TCTTA-CGT-GA-ATGTT--TAT-T-A-TATA--CG--G--ATCGTGAG-G-TTT--GCGCGGC-G-A------------TT-AACAGTA-GTG-CCA--A-GA--TG-G--------------T-----GGTCA--AATA-TCAT-TATAATA---AGCAA---AAGT-A---GCTTGCC-A-GACA------G--TG---TA--A---C---A--C--------------------------------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AG--G-----GA---TTAAA-GACA-AG-A-C--AATCC-GC-------TAA--AA-GTG-------------ATG-ACA-T-TGATTCGCAT--------TCT------T--TGAGT--------A--TG----------------CAC--A---A----TT--T-GT------CAA-------AC-GA--AAAA---A---------------A
gi|18 : AT-ACAA--------TT--TTA---------C--TGTATT--C--TT-T-----------TCAAAA-GT-TTA---TTTA-TT--T--TAATT-G-ATATCATAAC-AT-GG--AAA--GTTAAGTATGAA-AATT-AT------TTGGCCTAAT------TG-A----TT-----TATATTTTTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAA---T--------AC--------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TAGGGT-GA-A-GTT--T-TGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTAG-GCGCGGC-T-A------------GTAAAGG-T---TGCCCA--A-AA--T-----------------T-----AGTCA--GA-G-TCAT-T------TTTAG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TATTATT-C---AGTT----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A
gi|19 : aa-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-AACGAG--TC--TTCAGG---AT------------GCGTT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GATT--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT-G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-AAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TAGG-ACAC-T---ATGT-CCGACA-CAGATTaaa
gi|19 : TTAGCAATTTG-TAGGACACTAT-GTCC-GACACAGA---TTTTTTAGCTC-TTTCTCCAACTttttagctctttctccaact
gi|2 : ttaaaaacaagtgcactcgctgatcacgaacgagtcttcaggatgcgttagaatatcaaattgaaactgaatggtgttaaaatgacagtttattgctacattgtatttgattgatacatgttgatttaaaattgcattttacatattttgatggttttctatttggtctggaaaattttaagtgtgtcctgtagtttttgttactttAGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCAATGAT--CCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--CCA--ATGC-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAA-------TAAGTTA---------A--TGTATTCAC--TT-T-----------TCAAAA--T-T-G---TTTA-TTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT------T------CAC--AGTATG-A----TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-A---CTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGG-GACC-C---GTGT-CCA--A-CAGATT
gi|20 : gT-AC-ATATT-TTGATGA-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--TTT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---CT--TTTTTAGCA-A--TTTG-TAGG-ACAC-T---GTGT-CCG--A-CAGATTttattaactttcttctctga
gi|21 : attggacattgcgtgtcagacagttgtagactggtacaattattccagggaagtctgcacctgtaatagtgtattctagaga-A-AA--------TA--TTA---------A--TGTATT-AC--TT-T-----------TCAAAC-GT-T-G---TTTA-TC--T--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--G------ATG-----TG-AT------T---------------T-------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACT-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-AGT-GA-A-GCT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-A-A------------GTAAAC-----GTG-CCA--A-GATGTGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAttttagctctttcgccaactct
gi|22 : aCC-A-GA-G------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAGAATAAAGAACA-------------CAAAGGTTAGGAA----ATTTA-------A--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-CAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-CGATTCT-----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAATATA---------------AA---C-ACTAA-C-CAAT-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----
gi|23 : TATT-AC--TT-T-----------TCAAAA-GT-T-G---ATTA-TT--C--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GG--AGA--AT-----ATGAA-ATTC-AT------T---------------T-------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------TC--------AGA-ATT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CTT-GACG-GTTTATATGT-A-TATC--CG--AT-ATC--GAG-A-TTTG-GCGTGGC-G-A------------GTAAA
gi|24 : GTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCCTGTTGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC---GATGTCCGAC-AGT-GTT-T-A--AA--CCA--A-GC-CGGAC-A--CCA-------T-GTCCAG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAA-AT-A-AA---------A---TA---------A--TGTATT-A
gi|25 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC---GATGTCCAAT-AGT-TTT-T-AG-AA--CCA--A-GC-CGTAC-A----G-------T-G---AG-TGGA--TT
gi|25 : g------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-aaagacaagcaatggctaaatg
gi|26 : gagttggcgaaagacgccggcccaccggcgatctccgataaatttgatcgatgtccaatagtttttagaaccaagccgtacagtgTATT-TTAATAT-A-TT-T--C-T-ATCTA-ATCTG--G-CAA--ATT-TT-AT-GT-------G----TGTTC-T--G-----------------------TTTGGCA-A--TCTA-TAGG-ACAC-C---GTGA-CCA--G-CAGATTtg
gi|26 : atctttgTTGGCAATCTA-TAGGACACCGT-GACC-AGCA--GATTTTTTTTTAGCTC-ATTTGCCAATTtttttttagctcatttgccaattc
gi|27 : atctttgtattttaatatatttctatctaatctggcaaattttatgtgtgttctgtAGTT-GGCGAA-AAGACGCCGGCCC-ACCGGG-CGA-C-TC-GA--TA-AA-T-TTTA-TCG--AGT--CCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA---CATTA-G--CGGAC-A--CTG-------T-GTTGGGTTAGAT-TTTTT--CA--GAATc
gi|28 : gCGAA-A-GACGCCAGAT--GCCAG--AGATC-TCTGG--TA-AA-TTTTAA-T------TG-TCGGT-AAA-ACT-T-CA-AA--CT------C-TGGAT-A--CTGGACAAACT-GTCCGA--AGA--TATTG--CA--Gtat
gi|29 : gcAGTT-GGCGAA-A-GATGATGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC---GATGTTTGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--
gi|3 : gAGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCAATGAT--CCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--CCA--ATGC-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAA-------TAAGTTA---------A--TGTATTCAC--TT-T-----------TCAAAA--T-T-G---TTTA-TTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT------T------CAC--AGTATG-A----TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-A---CTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGG-GACC-C---GTGT-CCA--A-CAGATT
gi|30 : g----TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACCTGGTACCGGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGttattaactttcttctctga
gi|31 : attAGTT-GGTGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGA--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TT
gi|32 : agA-----AC-AT-GG--AAA--GT-----ATGAA-AAAT-AT------T------AAT--G---TG-A----TT-----T------TTT---T---CT---TATCG
gi|33 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCAG--C
gi|4 : cagAGTT-GGTGAA-A-GACGC-GGCCC-ACCGGAGCGATC-TCCGA--CATAA-T-TTGA-TCA--GATG-CCGCTTAGT-TTT-T-AG-AA--CCA--A-GC-CGGCT-A--CTG-------TTGTCCGG-TAGA--TTTTTTTCATGAAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--TACATCAAAACAT-A-AA--------TA--TTA---------A--TGTATT-ACGTCT-T-----------TCAAAA-GT-T-GG--TTTA-TC--T--TATTC-A-ATA-----AC-AT--A--AAA--GT-----A-GAATAATT-AT------T------AAC--G---TG-A----TT-----T------TTT---C---TT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GAA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-AA-A-GTT--T-TGT-A-TA----CG--GT-ATC--AAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------G-AAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A-----------------------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-AC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----A-A-ATAT---------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--AA-CAGTT--T----A-TTGCTA-T-ATTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GT-CG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTATCAGCA-N--NNNN-NNNN-NNNN-N---NNNN-NNN--N-NNNATTAGCAATTTC-TAGGACACTGT-GTCC-GACA--GA---TTTTTTAGCTC-TTTCGCCAACT
gi|5 : TT-GGCGAA-A-GACGCCTGCCC-ACCGG----ATC-TCC-A--TA-AA-TATTGAATC---GATGTCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--CCA--A-GC--GGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTC--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---CCAAAAAATCA-AA-------------TA---------A--TGTATT-AC--TT-T-----------TCAAAG-GT-T-ATTCTTTA--C--TGATATT----ATA-----AC-AT-G---GAA--GT-----ATGAA-AATT-ATTAGGCCT------AAT--G---TGAA----TTTATTAT------TTT---T---CT---TATCG-A-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----G---AAT-T--TCAG--TTTGGTT-TC-TA-CGT-G--A-GAT--TATA-----ATC--CG--GT-ATC--GAG-G--TTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA----GTG-CCA--A-AA--------------------T-----GGTCA--GA-G-TCAT-T---T-T---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-TA-A------G-CCG-A-TA--A---TCAGA--A----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AA----------A--------A-------------AAAC------AAA-A-----AA-----AAA-AAA--AGAA-CAAAAA-G-GT-------T-AGGAA-GTTTAATGGCTAAAGTATG-ATG-A-TGATACT-----------TAT------TGATGTTTTGTGTGCCG--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------TAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---TGG--AA-C-CAACATA---T----CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----AT---T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----ATTAT--ACA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---C-A----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATATCAAATA---TCATTCATA---AAT---------------T-AAATTGAAT--G----TGTTA-AGA-T--AA-CA-CT--T----A-TTG-TA-C-ATTG-------TA-TTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T-------AAGTTGCA----TTT-AC-AT-TT-TTGATGG-T-TTGT-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-
gi|6 : agcTGT-AATATC--CG--GTTATC--GAG-G-TTTG-G-GCGGC-G-GAGGGCGTGGGAGGTAAACA-TTTGTG-CCA--AAGA--TGTG--------------TTTCGTGGTCA--AA-GGTCAAATA-AA-A---AA--AGAAAAGTGT---GC-TGCC-AAGA-AATTTTTG-ATA-A-TA--A---C---A--CTTCAAAAAAATG----------A---------------A-------------CAAA-------AATA--AT-------------------T-------------CCAC------AGTTG-----GAATATTAAA-GACCAGG-A-C--AAT-G-GCCACGCCCT-A--AA-GT--------------ATG-ACGTA-TGATTCTC-----------AT------T--TG-----------GATTG----------------CACA-A---A---ATT--T-GT------CAA-------CC-AACCAAAA---A---------------AA---
gi|6 : tgcat-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TCTTCCA--------AACAAGTTTGGTTT-AAAGCGTTTATTA-T-GG-TACTAAAT-TT--AAAAAAC-A-----AA-GT--GCA--CT-CCGC-----TGA--TCAAC---G-A----GGTCC--TTCAGG-----------------GCAGTTATGAGATATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GGATTGTATTA-AAAAT--AAACAGTT--T----A-TTGCTAAC-ATTG-------TATTTGAAT-------TG-A-TACA-TTGTT-GA-T--TTTAAAAACTGCA-T--TTTTAC--TATA-TTGATGGTG-TT-T-TTGT-ATTTT-GTCCGTGG-CAATTATT-TTTAA-GT-------G----TGTTC-TTGATAG-TTTTTGTTTA---CCTTTTTTTAGCA-A--TTTG-TAGG-ACAC-T---GTGT-Caaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgaaccaactatcttccaaacaagtttggtttaaagcgtttattatggtactaaatttaaaaaacaaagtgcactccgctgatcaacgaggtccttcagggcagttatgagatatatcaaattgaaactgaatggattgtattaaaaataaacagtttattgctaacattgtatttgaattgatacattgttgattttaaaaactgcatttttactatattgatggtgtttttgtattttgtccgtggcaattatttttaagtgtgttcttgatagtttttgtttacctttttttagcaatttgtaggacactgtgtcatgaaggaacggatttatcttttttgccctttcgcccaactct
gi|7 : tgcattgtaatatccggttatcgaggtttgggcggcggagggcgtgggaggtaaacatttgtgccaaagatgtgtttcgtggtcaaaggtcaaataaaaaaagaaaagtgtgctgccaagaaatttttgataataacacttcaaaaaaatgaacaaaaataattccacagttggaatattaaagaccaggacaatggccacgccctaaagtatgacgtatgattctcatttggattgcacaaaatttgtcaaccaaccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---A---A---AAGT-T---GC-TGCCCA-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAAAATAACAGA-A-------------CAAAGGTTAGGAA----GTTTTAC-----A--------T-------------CCACTGTGACAGT-T-----GA---TTAAGCGAC--A---------T-G-G----------A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TG---TTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GTACACTACAAAAAAAACCA-AA--AAAA---A---------------AA---C-A--AA-C-CAAC-GA---AC---CAAACTCTACAACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTT--T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAACCT-C-GCT----TGA--TTC-C---GAA----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----T-TTACAAA-T--GA-CAGTT--T------TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TAC--T-GTT-GATT--T---CAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--GACAA--TTTATT-AA-GTTGTGCACG----TGGTC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTCGCA-A--TTTG-TAGGAACAC-TTAGATGT-CGA--A-CAGATTatgaaggaacggatttatcttttttgccctttcgcccaactct
gi|7 : ACA--GA---TTTTTTAGCTC-TTTCGCCAACTttttagctctttcgccaactct
gi|8 : tcaaagtcattaaaaaaaagttgctgcccagaagctgataacacacaaaaaataacagaacaaaggttaggaagttttacatccactgtgacagttgattaagcgacatggaaagtatgacgatgttctatttgatgcacaaattttgtacactacaaaaaaaaccaaaaaaaaaacaaaccaacgaaccaaactctacaacagttttgttaaaggtttggtaatttaaaaacaagtgcaacctcgcttgattccgaagtcttcaggatgcggtagaatatcaaattgaaactgaatggtttacaaatgacagtttttgctacattgtatttgattgatactgttgatttcaaattgcattttacatattttgatggtttttctatttggtctggacaatttattaagttgtgcacgtggtctgtagtttttgttactttttcgcaatttgtaggaacacttagatgtcgaTCA--AA-G--CAT-TA-AG-A---A---A---AAGT-T---GCCTGAC-A-GA-A------G-CTGTA-TA--ATCAC---A--C----------------------A---------------AATAAAATAAAGAACAAA-------AA----GTTAGGAAGTTTA--------T-------------CCAC------TGT-GACATTGA---TTAAA-GAC--AG-AAC--AAT-T-GC-------A-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC-----------AT------T--GG-----------A--TG----------------CAC--AAACA---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAA---AAACCAAAAAAAAAACAA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACCATTTTG--TTAAAAG-----GTTA-T-GG-TA----TT-TTAAAAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TCT-TTCAGG---AT-----------TGC-GT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT--G----TGTTA-AAA-T--GA-CAG-T--T----A--TGC-A-CAATTG-------TATTTTG-T-------T--A-TACACT-GTT-GA-TTGT---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT---G-TT-TATC-T-ATTTG-GTCTG--G-ACA--ATT-TT-AA-GT-------GTCACTGTCCTT--GTA--TTTTTGTT-A---C----TTTTAGCA-A--TTTG-TAGG-ACAC-TTA-GAG--CCG--ACCAGATT-----TTTT-TAGGct
gi|9 : --AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ATG-AATGATTTTC-----------AT------T--TG-----------A--TGTTCTTGTGTGCCGTGCCA---A---A---TTT--T-G-------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA---T-GG-AA-C-CATC-TA---TC---TAG-------AACAGTTTTG--------------ATT-------TA----CT-TT--TAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CTGC-GCGGCATTGA--TCA-CTAAC-A----G--T------AGGTACAG---------A-TGCAGTTA--GGA-ATAA---------TC------A---AATATCATTCATAAAATGTGAAATTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTTTAT----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-ACAATATT-TTGATGG----T-T-TC-T--TTTG-GTCCG--G--AA--ATT-TT-AA----------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AACTT---TTTTTAGGA-A--TTTT-TAGG-ACAC-T---GTGT-CCG--A-CAGATTctctttcgccaactc
gi|9 : gaacaaaaaggttaggaagtttGT-GTCC-GACA--GA---TTTTTTAGCTCTTTTCGCCAACttttagctcttttcgccaac
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 22 1111111 11 222 11 1 222222 111 11 11111 55555555555555555555555555555555555555555555555555 111 222222222222222222 111111111111 1111 44444444444444444444 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222222222 333333333333333333333333333333333333 2222222222222222 222222 1111111 1 111111111111111 11111111 111 11111111 1111 11111 11 11111 11111 11 3333333333333333 1111 33333333333 111111111111111 1111111111 1111111 1111111 11111111 111 1111111 222 111 111
lowQualScore : 5 5 2 2 666 2 33 2 8 0 2 33 5 5 2 2 2 2 33 44 44 6 4444 3 77 0000000 3 6 11 44 77 666 4 888 11 777 0 3 3 111111 0 77777 3 55 3 999 000 44 00 3 00000 6 3 44 77 77777 3 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444 66666 777777 444 222 444 2 5 33 33 555555555555555555 1 2 2 77 2 2 5 33 3 3 3 44 2 2 33 33 2 33 2 2 5 2 5 333333333333 2222 3 99 3 55 44444444444444444444 44 3 3 3 3 3 333 44 555 55555 6 9 3 3 888888 6 3 6 44 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 888888 6 77777 555 0 3 77 3 3 33 2 2 9999999 2 33 33 11111111111111 3 3 3 888888888888888888888888888888888888 44 0000000000000000 222222 888 88 3 888888 6666666 0 33 444 666666666666666 88888888 2 2 3 555 555 44444444 0 44 3 77777 2222 3 7777 3 44 3 3 11111 77 44 00 3 6 00000 88 6 22222 6666 44 11 3333333333333333 0000 3 3 77777777777 888888 555 999999999999999 1 3 6666 3 3 999 6 0000000000 3 3 0000000 3 0000000 3 3 3 3 6 55555555 6 44 2 2 2 2 000 2 2 2 5 5 33 2 33 2 3 6 6666666 6666 3 44 44 3 555 000 6 44 3 6 3 3 999 3 44 3 888 1 111 6
lowQualScore : . . . . ... . .. . . . . .. . . . . . . .. .. .. . .... . .. ....... . . .. .. .. ... . ... .. ... . . . ...... . ..... . .. . ... ... .. .. . ..... . . .. .. ..... . . .................................................. ..... ...... ... ... ... . . .. .. .................. . . . .. . . . .. . . . .. . . .. .. . .. . . . . . ............ .... . .. . .. .................... .. . . . . . ... .. ... ..... . . . . ...... . . . .. ................................................................................................................... ...... . ..... ... . . .. . . .. . . ....... . .. .. .............. . . . .................................... .. ................ ...... ... .. . ...... ....... . .. ... ............... ........ . . . ... ... ........ . .. . ..... .... . .... . .. . . ..... .. .. .. . . ..... .. . ..... .... .. .. ................ .... . . ........... ...... ... ............... . . .... . . ... . .......... . . ....... . ....... . . . . . ........ . .. . . . . ... . . . . . .. . .. . . . ....... .... . .. .. . ... ... . .. . . . . ... . .. . ... . ... .
lowQualScore : 3 0 5 5 333 7 77 7 0 7 9 22 7 7 9 9 9 9 99 22 22 2 8888 1 33 0000000 1 2 55 66 99 333 0 000 00 000 0 3 3 222222 4 33333 3 88 3 222 000 66 22 3 88888 2 1 22 33 77777 1 9 55555555555555555555555555555555555555555555555555 77777 777777 777 000 777 9 7 99 99 111111111111111111 9 9 9 99 9 9 7 44 1 1 1 22 9 9 99 99 7 77 7 7 3 7 3 777777777777 9999 1 22 3 00 66666666666666666666 22 1 1 1 1 1 555 22 444 11111 7 2 1 1 888888 2 1 7 66 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888888 2 77777 444 4 1 33 1 1 99 9 9 3333333 9 99 88 22222222222222 1 1 1 888888888888888888888888888888888888 22 4444444444444444 555555 555 55 1 888888 2222222 7 77 777 777777777777777 55555555 9 9 1 000 444 22222222 4 22 1 77777 8888 3 1111 1 22 1 1 99999 33 22 44 1 2 88888 55 2 33333 5555 22 55 6666666666666666 8888 5 1 77777777777 888888 444 222222222222222 5 1 5555 1 1 777 2 5555555555 1 1 0000000 1 0000000 1 1 1 1 2 11111111 2 22 9 9 7 7 777 7 7 7 3 3 77 7 99 9 1 2 2222222 5555 1 22 66 1 444 000 2 22 1 2 1 1 666 1 66 3 000 0 777 7
consensus : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GG-ACAC-T---GTGT-CCG--A-CAGATTGGCAATTTTTAGGACACCGTGTCCGACAGATT---TTTTAGCTC-TTTCGCCAACT
Reference ( family-3770 ) : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GG-ACAC-T---GTGT-CCG--A-CAGATTAGCAATTTNTAGGACACTGTGTCCGACAGATT---TTTTAGCTC-TTTCGCCAACT
gi|1 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGGCC-ACCGG--TGATCATCTGA--TA-AAAC-TTGA-TCGAATG-TCCAAG-AGT-TTT-A-GA-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-AAACTG-------T-GTCTGG-TAGA--TTTT---CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAATAAT-A-AA-TA--ATG-CGCATT-AC--TTATTCAAAA-GTT-G---TTTATT--T--TATTTTGCATA-----AC-AT-GA--AAAAAGT-----ATGAA-AATT-AT-------TT-----AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTTGTTC---CT---TATCAAACA-C--AAAA--T--------ACC-C-----GGAGAAT-T--TCAA-TTT-GGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CGCAGT-ATC--GAG---TTGG-GC-CGGC-G-A------------GTAAACA-T--GT--TCA--A-GA--TGTGGACAATTTTAGAAAT-----GGTCACAAA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AA-T-T---GC-TGC--A-TA-A------G-CTG-A-AA--A---C---A--CAGTGACAACAAAAAATAAAAGAA---------------A-------------CAAA-------AA----GG----------G--------TAGGACAGTTCTAACCAC------AGTTG-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-GCGC-------T-A--AT-GT--------------TTGGACA-A-TGATTCTCATTGATGTTTTAT------G--TGGCC--------A--TG----------------CAT--A---AAATCTT--T-AT------CAA-------CT-CA--AAAA---A---------------AA--------AA-CACAA
gi|1 : ag-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--ATTC-CAAC-TA---TC---TA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTAAC-GGATA----TTGTT--AAAAA-CCA-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T-----A----G--TC--TTCAGG---AT-------------CA--------A-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACCGAATCGG----TGATT-AAA-T------AGTT-----------------------------TATTT-----------TG-CCTACA-T--------------------TGTA-T--TTT-AC-AT---------GC-G-TT-T-TC-T---TTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAT-TTTTTGTT-A---CT--TTTTTAGCA-A--TTTGATA-GG-ACACTT---TTGTCCCG--A-CAG------AATTTTTAGaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgattccaactatctaaacagttttgttaaaggttaacggatattgttaaaaaccaagtgcactcgctgatcatagtcttcaggatcaaatatcaaattgaaaccgaatcggtgattaaatagtttattttgcctacattgtattttacatgcgttttctttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtattttttgttacttttttagcaatttgataggacacttttgtcccgacagaatttttagctctttcgccaact
gi|10 : agagttggcgaaagacgccgggccaccggtgatcatctgataaaacttgatcgaatgtccaagagttttagaaaccaagccggacaaactgtgtctggtagattttcagaatatacaatattagtaaatcgttcaaataataaataatgcgcattacttattcaaaagttgtttattttattttgcataacatgaaaaaagtatgaaaattatttaatgtgattttttgttccttatcaaacacaaaatacccggagaatttcaatttggttctatgtgaagtttagtatatccgcagtatcgagttgggccggcgagtaaacatgttcaagatgtggacaattttagaaatggtcacaaagtcattaaaaagaaattgctgcataagctgaaaacacagtgacaacaaaaaataaaagaaacaaaaagggtaggacagttctaaccacagttggattaaagacagacaatgcgctaatgtttggacaatgattctcattgatgttttatgtggccatgcataaaatctttatcaactcaaaaaaaaaacacaaaacaaaaaaaaaaaa------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AATGT--------------ATG-ACG-A-TGGTTTTG----------TGC------C---------------A--TG----------------CAC--A---AA--TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---CCG--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTG-TTGA-TA----AT-TT--AAAAA-C-ATT---A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCC-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT------------GCG-T----AGA-ATATCAAAATCATTC------ATAAAAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTT--TTTTAACTTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-TATTGAATTG-A-T-CA-T-ATG-GA-T--T---GATATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG---TT-T-TG-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTATTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GG-ACAC-T---GTGT-CCG--A-CAGATTctctttcgccaact
gi|10 : gT---TTTTAGCTC-TTTCGCCAAtttagctctttcgccaa
gi|11 : gagtggattaaagacaagcaatggctaaatgtatgacgatggttttgtgccatgcacaaattttgtcaactcaaagaaaaaccgaaccaactatccaaacagttttgttaaaggttgttgataatttaaaaacattagtgcactcgctgatcccgagtcttcaggatgcgtagaatatcaaaatcattcataaaattgaaactgaatggtgttaagataacagttttttaacttgctacattgtatttgatattgaattgatcatatggattgatattgcattttacatattttgatggttttgtatttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtagttattgttactttttagcaatttgtaggacactgtgtccgacagaTT-GGCGAA-A-GATGCCGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCA-ATG-TCCGAT-AGA-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTAT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AAATA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ACA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-TACT-ATNATTTGAT------AAC--A---TG-AAAAGTATGAATATTATTGTGATTTT-----T------TCT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCAGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-
gi|12 : T-ATC--GAG-G-T------GCAGC-G-A------------GTAAAGA-T--GTG-GTA--A-GA--TGTGCCCAATTAAA----T-----CTTCA--GA-G-TCAT-TA-AA-A---TG--A---AAAT-C---GC-TACC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------AAG-----------CAAA-------AAGGTTAG----------GAAGTTTAAT-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAGA-GAA--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AG-CT--------------ATG-ACG-A-TGATACTCA---------TATGACATTT--TGTGTC-------A--TG----------------CAC--AC--A---TTT--TTAT------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA-----------------------------------------------G--TT-AG-G-----GTTG-T-GG-TA----AT-TT--CAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T---G-A----G--TC--TTCAAG---ACTCCATCAGGA-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT------------------------AT-CA----T---------T--GA-CA-TT--C----A--TG--A-A-ATTG-------TATTT----------------TACA-T-----------------------A-T--TTT------------GAT-G-G-TT-G-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-CAA--CTT-T
gi|13 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCT-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCTGAT-AGT-TTTCT-AGCAA--C--CA--A-G--T-CGGAC-A--CTT-------T-GTCC-G-TAAA---TTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-T-AA-AA--TTAATG---------TT-TTCAGAATGTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-ATGGA--AAA--GT-----ATGAA-AATTAAT-------T------AA---G---TG-ATTTT-------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-CAAAAAA--T--------GCC-------GGA-AATGT--TCAATTTTTGGTT-TCATA--GTGGA-A-GTT--TATGT-A-TATCCACG--GT-ATC--GAGAG-TGT--GCGCGGCAG-A------------GTAAACA-T--GT
gi|14 : gAGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCC--ACCG---CGATC-TCCGAATTA-AA-T-TTGG--CAA--G-TCCGA---GTATTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--TTCGGACCA--CTG-------T-GTC-GG--AAA--TTTTT--CAA-GAATATAACTAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-A--TA--ATAATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TT-AT---T--TATTT-G-ATAG----AC-AT-GAGAAAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---TTCTTTATCGAA-A-C--AAAAATT--------GCC-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-c
gi|15 : g-G--AA-C-CAAC-TAAT-TC---CA--------AAC-GTTTTG--TC-TAAA-----GTTA-T-TG-TA----AT-T---AGAAA-C-ACACATA--GTTCGCA--CT-CCGC-----TGA--TCATC---G-A--------T--TTCAGG---AT---------A-TGCAGT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAAC-GAAT-GG----TGTAA-AAA-T--AAGC--TT--T----A-TTGCTA-C-ATTGAATTTTGTATTTGA-T-------TGAA-AACA-T-G-T-GA-T--T---AAAATTGCA-TAATTT-AC-A-ATTATTGA--G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AG-TC-------G----T-TCC-T---TAGTTTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-AATTTTA-T-----ACAT-T---GTGT-CCG--G-C
gi|16 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCG-CCC-AC-GG--CG-TC-TC-GA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCCGATCAGT-TTT-TTAG-AAAGC--CA--A-G--T-CGGAC-AA-CTG-------T-GTCCGGGTAAA--TTTTT--C---GAATATA--CAATCATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA--A--T-AATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TTTATC--T--TATTCTG-ATA-----AC-AT-GA--AAAA-GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-ATT---------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------GCC-------GGA-AAT-T--TCAA--TTTGGTTGTC-T--TGT-GA-A-GTT--TATGTAA-TAT---CG--GT-ATC--GAG-GTTTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-caatgattatttaaggtcttgtctgccaac
gi|17 : TT-AT-------T------AATATG---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---TT--CT---TATCGAA---C--AAAA--TCCATTGGTACC-GACA--GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TCTTA-CGT-GA-ATGTT--TAT-T-A-TATA--CG--G--ATCGTGAG-G-TTT--GCGCGGC-G-A------------TT-AACAGTA-GTG-CCA--A-GA--TG-G--------------T-----GGTCA--AATA-TCAT-TATAATA---AGCAA---AAGT-A---GCTTGCC-A-GACA------G--TG---TA--A---C---A--C--------------------------------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AG--G-----GA---TTAAA-GACA-AG-A-C--AATCC-GC-------TAA--AA-GTG-------------ATG-ACA-T-TGATTCGCAT--------TCT------T--TGAGT--------A--TG----------------CAC--A---A----TT--T-GT------CAA-------AC-GA--AAAA---A---------------A
gi|18 : AT-ACAA-TT--TTACTGTATT--C--TT-TTCAAAA-GTTTA---TTTATT--T--TAATT-G-ATATCATAAC-AT-GG--AAA--GTTAAGTATGAA-AATT-AT-------TTGGCCTAAT------TG-A-----------------------TT-----TATATTTTTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAA---T--------AC--------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TAGGGT-GA-A-GTT--T-TGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTAG-GCGCGGC-T-A------------GTAAAGG-T---TGCCCA--A-AA--T-----------------T-----AGTCA--GA-G-TCAT-T------TTTAG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TATTATT-C---AGTT----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A
gi|19 : aa-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-AACGAG--TC--TTCAGG---AT------------GCGTT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GATT--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT-G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-AAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GG-ACAC-T---ATGT-CCGACA-CAGATTaaa
gi|19 : ACAGATT---TTTTAGCTC-TTTCTCCAACTttttagctctttctccaact
gi|2 : ttaaaaacaagtgcactcgctgatcacgaacgagtcttcaggatgcgttagaatatcaaattgaaactgaatggtgttaaaatgacagtttattgctacattgtatttgattgatacatgttgatttaaaattgcattttacatattttgatggttttctatttggtctggaaaattttaagtgtgtcctgtagtttttgttactttttagcaatttgtaggacactatgtccgacAGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-A---CTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGG-AC-C-C---GTGT-CCA--A-CAGATT
gi|20 : gT-AC-ATATT-TTGATGA-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--TTT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---CT--TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GG-ACAC-T---GTGT-CCG--A-CAGATTttattaactttcttctctga
gi|21 : attggacattgcgtgtcagacagttgtagactggtacaattattccagggaagtctgcacctgtaatagtgtattctagaga-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAC-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--G------ATG-----TG-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACT-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-AGT-GA-A-GCT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-A-A------------GTAAAC-----GTG-CCA--A-GATGTGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAttttagctctttcgccaactct
gi|22 : aCC-A-GA-G------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAGAATAAAGAACA-------------CAAAGGTTAGGAA----ATTTA-------A--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-CAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-CGATTCT-----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAATATA---------------AA---C-ACTAA-C-CAAT-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----
gi|23 : TATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---ATTATT--C--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GG--AGA--AT-----ATGAA-ATTC-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------TC--------AGA-ATT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CTT-GACG-GTTTATATGT-A-TATC--CG--AT-ATC--GAG-A-TTTG-GCGTGGC-G-A------------GTAAA
gi|24 : GTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCCTGTTGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCGAC-AGT-GTT-T-A--AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CCA-------T-GTCCAG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAA-AT-A-AA--A---TAATGTATT-A
gi|25 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCAAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGTAC-A----G-------T-G---AG-TGGA--TT
gi|25 : g------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-aaagacaagcaatggctaaatg
gi|26 : gagttggcgaaagacgccggcccaccggcgatctccgataaatttgatcgatgtccaatagtttttagaaccaagccgtacagtgTATT-TTAATAT-A-TT-T--C-T-ATCTA-ATCTG--G-CAA--ATT-TT-AT-GT-------G----TGTTC-T--G-----------------------TTTGGCA-A--TCTA-TA-GG-ACAC-C---GTGA-CCA--G-CAGATTtg
gi|26 : atctttgTTGGCAATCTATAGGACACCGTGACCAGCAGATTTTTTTTTAGCTC-ATTTGCCAATTtttttttagctcatttgccaattc
gi|27 : atctttgtattttaatatatttctatctaatctggcaaattttatgtgtgttctgtAGTT-GGCGAA-AAGACGCCGGCCC-ACCGGG-CGA-C-TC-GA--TA-AA-T-TTTA-TC-GA-G-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA-----CATTA-G----CGGAC-A--CTG-------T-GTTGGGTTAGAT-TTTTT--CA--GAATc
gi|28 : gCGAA-A-GACGCCAGAT--GCCAG--AGATC-TCTGG--TA-AA-TTTTAA-T----TG-TCGG-----------T-AA-AA--CTTCA--A-ACTC-TGGAT-A--CTGGACAAACT-GTCCGA--AGA--TATTG--CA--Gtat
gi|29 : gcAGTT-GGCGAA-A-GATGATGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TTTGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--
gi|3 : gAGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-A---CTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGG-AC-C-C---GTGT-CCA--A-CAGATT
gi|30 : g-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACCTGGTACCGGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGttattaactttcttctctga
gi|31 : attAGTT-GGTGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGA--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TT
gi|32 : agA-----AC-AT-GG--AAA--GT-----ATGAA-AAAT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCG
gi|33 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCAG--C
gi|4 : cagAGTT-GGTGAA-A-GACGC-GGCCC-ACCGGAGCGATC-TCCGA--CATAA-T-TTGA-TCAGATG--CCGCTTAGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGCT-A--CTG-------TTGTCCGG-TAGA--TTTTTTTCATGAAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--TACATCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-ACGTCT-TTCAAAA-GTT-GG--TTTATC--T--TATTC-A-ATA-----AC-AT--A--AAA--GT-----A-GAATAATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---C---TT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GAA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-AA-A-GTT--T-TGT-A-TA----CG--GT-ATC--AAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------G-AAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A-----------------------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-AC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----A-A-ATAT---------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--AA-CAGTT--T----A-TTGCTA-T-ATTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GT-CG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTATCAGCA-N--NNNN-NN-NN-NNNN-N---NNNN-NNN--N-NNNATTAGCAATTTCTAGGACACTGTGTCCGACAGATT---TTTTAGCTC-TTTCGCCAACT
gi|5 : TT-GGCGAA-A-GACGCCTGCCC-ACCGG----ATC-TCC-A--TA-AA-TATTGAATC-GATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C--GGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTC--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---CCAAAAAATCA-AA------TAATGTATT-AC--TT-TTCAAAG-GTT-ATTCTTTA-C--TGATATT----ATA-----AC-AT-G---GAA--GT-----ATGAA-AATT-ATTAGGCC-T------AAT--G---TGAA-----------------------TTTATTAT------TTT---T---CT---TATCG-A-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----G---AAT-T--TCAG--TTTGGTT-TC-TA-CGT-G--A-GAT--TATA-----ATC--CG--GT-ATC--GAG-G--TTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA----GTG-CCA--A-AA--------------------T-----GGTCA--GA-G-TCAT-T---T-T---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-TA-A------G-CCG-A-TA--A---TCAGA--A----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AA----------A--------A-------------AAAC------AAA-A-----AA-----AAA-AAA--AGAA-CAAAAA-G-GT-------T-AGGAA-GTTTAATGGCTAAAGTATG-ATG-A-TGATACT-----------TAT------TGATGTTTTGTGTGCCG--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------TAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---TGG--AA-C-CAACATA---T----CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----AT---T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----ATTAT--ACA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---C-A----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATATCAAATA---TCATTCATA---AAT---------------T-AAATTGAAT--G----TGTTA-AGA-T--AA-CA-CT--T----A-TTG-TA-C-ATTG-------TA-TTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T-------AAGTTGCA----TTT-AC-AT-TT-TTGATGG-T-TTGT-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-
gi|6 : agcTGT-AATATC--CG--GTTATC--GAG-G-TTTG-G-GCGGC-G-GAGGGCGTGGGAGGTAAACA-TTTGTG-CCA--AAGA--TGTG--------------TTTCGTGGTCA--AA-GGTCAAATA-AA-A---AA--AGAAAAGTGT---GC-TGCC-AAGA-AATTTTTG-ATA-A-TA--A---C---A--CTTCAAAAAAATG----------A---------------A-------------CAAA-------AATA--AT-------------------T-------------CCAC------AGTTG-----GAATATTAAA-GACCAGG-A-C--AAT-G-GCCACGCCCT-A--AA-GT--------------ATG-ACGTA-TGATTCTC-----------AT------T--TG-----------GATTG----------------CACA-A---A---ATT--T-GT------CAA-------CC-AACCAAAA---A---------------AA---
gi|6 : tgcat-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TCTTCCA--------AACAAGTTTGGTTT-AAAGCGTTTATTA-T-GG-TACTAAAT-TT--AAAAAAC-A-----AA-GT--GCA--CT-CCGC-----TGA--TCAAC---G-A----GGTCC--TTCAGG-----------------GCAGTTATGAGATATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GGATTGTATTA-AAAAT--AAACAGTT--T----A-TTGCTAAC-ATTG-------TATTTGAAT-------TG-A-TACA-TTGTT-GA-T--TTTAAAAACTGCA-T--TTTTAC--TATA-TTGATGGTG-TT-T-TTGT-ATTTT-GTCCGTGG-CAATTATT-TTTAA-GT-------G----TGTTC-TTGATAG-TTTTTGTTTA---CCTTTTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GG-ACAC-T---GTGT-Caaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgaaccaactatcttccaaacaagtttggtttaaagcgtttattatggtactaaatttaaaaaacaaagtgcactccgctgatcaacgaggtccttcagggcagttatgagatatatcaaattgaaactgaatggattgtattaaaaataaacagtttattgctaacattgtatttgaattgatacattgttgattttaaaaactgcatttttactatattgatggtgtttttgtattttgtccgtggcaattatttttaagtgtgttcttgatagtttttgtttacctttttttagcaatttgtaggacactgtgtcatgaaggaacggatttatcttttttgccctttcgcccaactct
gi|7 : tgcattgtaatatccggttatcgaggtttgggcggcggagggcgtgggaggtaaacatttgtgccaaagatgtgtttcgtggtcaaaggtcaaataaaaaaagaaaagtgtgctgccaagaaatttttgataataacacttcaaaaaaatgaacaaaaataattccacagttggaatattaaagaccaggacaatggccacgccctaaagtatgacgtatgattctcatttggattgcacaaaatttgtcaaccaaccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---A---A---AAGT-T---GC-TGCCCA-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAAAATAACAGA-A-------------CAAAGGTTAGGAA----GTTTTAC-----A--------T-------------CCACTGTGACAGT-T-----GA---TTAAGCGAC--A---------T-G-G----------A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TG---TTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GTACACTACAAAAAAAACCA-AA--AAAA---A---------------AA---C-A--AA-C-CAAC-GA---AC---CAAACTCTACAACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTT--T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAACCT-C-GCT----TGA--TTC-C---GAA----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----T-TTACAAA-T--GA-CAGTT--T------TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TAC--T-GTT-GATT--T---CAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--GACAA--TTTATT-AA-GTTGTGCACG----TGGTC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTCGCA-A--TTTG-TA-GGAACAC-TTAGATGT-CGA--A-CAGATTatgaaggaacggatttatcttttttgccctttcgcccaactct
gi|7 : ACAGATT---TTTTAGCTC-TTTCGCCAACTttttagctctttcgccaactct
gi|8 : tcaaagtcattaaaaaaaagttgctgcccagaagctgataacacacaaaaaataacagaacaaaggttaggaagttttacatccactgtgacagttgattaagcgacatggaaagtatgacgatgttctatttgatgcacaaattttgtacactacaaaaaaaaccaaaaaaaaaacaaaccaacgaaccaaactctacaacagttttgttaaaggtttggtaatttaaaaacaagtgcaacctcgcttgattccgaagtcttcaggatgcggtagaatatcaaattgaaactgaatggtttacaaatgacagtttttgctacattgtatttgattgatactgttgatttcaaattgcattttacatattttgatggtttttctatttggtctggacaatttattaagttgtgcacgtggtctgtagtttttgttactttttcgcaatttgtaggaacacttagatgtcgaTCA--AA-G--CAT-TA-AG-A---A---A---AAGT-T---GCCTGAC-A-GA-A------G-CTGTA-TA--ATCAC---A--C----------------------A---------------AATAAAATAAAGAACAAA-------AA----GTTAGGAAGTTTA--------T-------------CCAC------TGT-GACATTGA---TTAAA-GAC--AG-AAC--AAT-T-GC-------A-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC-----------AT------T--GG-----------A--TG----------------CAC--AAACA---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAA---AAACCAAAAAAAAAACAA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACCATTTTG--TTAAAAG-----GTTA-T-GG-TA----TT-TTAAAAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TCT-TTCAGG---AT-----------TGC-GT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT--G----TGTTA-AAA-T--GA-CAG-T--T----A--TGC-A-CAATTG-------TATTTTG-T-------T--A-TACACT-GTT-GA-TTGT---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT---G-TT-TATC-T-ATTTG-GTCTG--G-ACA--ATT-TT-AA-GT-------GTCACTGTCCTT--GTA--TTTTTGTT-A---C----TTTTAGCA-A--TTTG-TA-GG-ACAC-TTA-GAG--CCG--ACCAGATT-----TTTTTAGGct
gi|9 : --AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ATG-AATGATTTTC-----------AT------T--TG-----------A--TGTTCTTGTGTGCCGTGCCA---A---A---TTT--T-G-------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA---T-GG-AA-C-CATC-TA---TC---TAG-------AACAGTTTTG--------------ATT-------TA----CT-TT--TAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CTGC-GCGGCATTGA--TCA-CTAAC-A----G--T------AGGTACAG---------A-TGCAGTTA--GGA-ATAA---------TC------A---AATATCATTCATAAAATGTGAAATTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTTTAT----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-ACAATATT-TTGATGG----T-T-TC-T--TTTG-GTCCG--G--AA--ATT-TT-AA----------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AACTT---TTTTTAGGA-A--TTTT-TA-GG-ACAC-T---GTGT-CCG--A-CAGATTctctttcgccaactc
gi|9 : gaacaaaaaggttaggaagtttTAGGACACTGTGTCCGACAGATT---TTTTAGCTCTTTTCGCCAACttttagctcttttcgccaac
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 22 1111111 11 222 11 1 222222 111 11 11111 55555555555555555555555555555555555555555555555555 111 222222222222222222 111111111111 1111 44444444444444444444 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222222222 333333333333333333333333333333333333 2222222222222222 2222222222 1111111 1 111111111111111 11111111 111 11111111 1111 11111 11 1111 11 33333333333333333 1111 33333333333 111111111111111 111111111 1111111 1111111 111111 111 1111111 222 444444 111
lowQualScore : 5 5 2 2 666 2 33 2 8 0 2 33 5 5 2 2 2 2 33 44 44 6 4444 3 77 0000000 3 6 11 44 77 666 4 888 11 777 0 3 3 111111 0 77777 3 55 3 999 000 44 00 3 00000 6 3 44 77 77777 3 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444 66666 777777 444 222 444 2 5 33 33 555555555555555555 1 2 2 77 2 2 5 33 3 3 3 44 2 2 33 33 2 33 2 2 5 2 5 333333333333 2222 3 99 3 55 44444444444444444444 44 3 3 3 3 3 333 44 555 55555 6 9 3 3 888888 6 3 6 44 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 888888 6 77777 555 0 3 77 3 3 33 2 2 9999999 2 33 33 11111111111111 3 3 3 888888888888888888888888888888888888 44 0000000000000000 2222222222 88 3 888888 6666666 0 33 444 666666666666666 88888888 2 2 3 555 555 3 11111111 0 44 3 77777 2222 3 7777 3 44 3 3 11111 77 44 00 3 6 77777 3 88 6 6 5555 44 11 22222222222222222 0000 3 3 77777777777 888888 555 999999999999999 1 3 6666 3 3 999 6 000000000 3 3 0000000 3 0000000 3 3 3 3 6 3 777777 6 44 2 2 2 2 000 2 2 2 5 5 33 2 33 2 3 6 6666666 6666 3 44 44 3 000 6 44 44 6 3 6666 44 44 3 555555 3 4 777 8
lowQualScore : . . . . ... . .. . . . . .. . . . . . . .. .. .. . .... . .. ....... . . .. .. .. ... . ... .. ... . . . ...... . ..... . .. . ... ... .. .. . ..... . . .. .. ..... . . .................................................. ..... ...... ... ... ... . . .. .. .................. . . . .. . . . .. . . . .. . . .. .. . .. . . . . . ............ .... . .. . .. .................... .. . . . . . ... .. ... ..... . . . . ...... . . . .. ................................................................................................................... ...... . ..... ... . . .. . . .. . . ....... . .. .. .............. . . . .................................... .. ................ .......... .. . ...... ....... . .. ... ............... ........ . . . ... ... . ........ . .. . ..... .... . .... . .. . . ..... .. .. .. . . ..... . .. . . .... .. .. ................. .... . . ........... ...... ... ............... . . .... . . ... . ......... . . ....... . ....... . . . . . . ...... . .. . . . . ... . . . . . .. . .. . . . ....... .... . .. .. . ... . .. .. . . .... .. .. . ...... . . ... .
lowQualScore : 3 0 5 5 333 7 77 7 0 7 9 22 7 7 9 9 9 9 99 22 22 2 8888 1 33 0000000 1 2 55 66 99 333 0 000 00 000 0 3 3 222222 4 33333 3 88 3 222 000 66 22 3 88888 2 1 22 33 77777 1 9 55555555555555555555555555555555555555555555555555 77777 777777 777 000 777 9 7 99 99 111111111111111111 9 9 9 99 9 9 7 44 1 1 1 22 9 9 99 99 7 77 7 7 3 7 3 777777777777 9999 1 22 3 00 66666666666666666666 22 1 1 1 1 1 555 22 444 11111 7 2 1 1 888888 2 1 7 66 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888888 2 77777 444 4 1 33 1 1 99 9 9 3333333 9 99 88 22222222222222 1 1 1 888888888888888888888888888888888888 22 4444444444444444 0000000000 55 1 888888 2222222 7 77 777 777777777777777 55555555 9 9 1 000 444 1 22222222 4 22 1 77777 8888 3 1111 1 22 1 1 99999 33 22 44 1 2 77777 1 55 2 2 0000 22 55 00000000000000000 8888 5 1 77777777777 888888 444 222222222222222 5 1 5555 1 1 777 2 888888888 1 1 0000000 1 0000000 1 1 1 1 2 1 333333 2 22 9 7 7 7 777 7 7 7 3 3 77 7 99 9 1 2 2222222 5555 1 22 66 1 000 2 22 11 2 0 2222 33 66 3 555555 2 2 555 0
consensus : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA-AAC--------AGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----T-GA--TCA-C-GA----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTTT----A-T--TGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-ACA-TATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AC---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACAC-C--GTGT-CCG--A-CAGATT---AATTTTTAGGACACCGTGTCCGACAGA---TTTTTTAGCTC-TTTCGCCAACT
Reference ( family-3770 ) : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA-AAC--------AGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----T-GA--TCA-C-GA----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTTT----A-T--TGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-ACA-TATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AC---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACAC-T--GTGT-CCG--A-CAGATTGGCAATTTTTAGGACACCGTGTCCGACAGA---TTTTTTAGCTC-TTTCGCCAACT
gi|1 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGGCC-ACCGG--TGATCATCTGA--TA-AAAC-TTGA-TCGAATG-TCCAAG-AGT-TTT-A-GA-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-AAACTG-------T-GTCTGG-TAGA--TTTT---CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAATAAT-A-AA-TA--ATG-CGCATT-AC--TTATTCAAAA-GTT-G---TTTATT--T--TATTTTGCATA-----AC-AT-GA--AAAAAGT-----ATGAA-AATT-AT-------TT-----AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTTGTTC---CT---TATCAAACA-C--AAAA--T--------ACC-C-----GGAGAAT-T--TCAA-TTT-GGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CGCAGT-ATC--GAG---TTGG-GC-CGGC-G-A------------GTAAACA-T--GT--TCA--A-GA--TGTGGACAATTTTAGAAAT-----GGTCACAAA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AA-T-T---GC-TGC--A-TA-A------G-CTG-A-AA--A---C---A--CAGTGACAACAAAAAATAAAAGAA---------------A-------------CAAA-------AA----GG----------G--------TAGGACAGTTCTAACCAC------AGTTG-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-GCGC-------T-A--AT-GT--------------TTGGACA-A-TGATTCTCATTGATGTTTTAT------G--TGGCC--------A--TG----------------CAT--A---AAATCTT--T-AT------CAA-------CT-CA--AAAA---A---------------AA--------AA-CACAA
gi|1 : ag-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--ATTC-CAAC-TA---TC---TA-AAC--------AGTTTTG--TT-AAAG-----GTTAAC-GGATA----TTGTT--AAAAA-CCA-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----T-GA--TCA-T--A----G--TC--TTCAGG---AT-------------CA--------A-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACCGAATCGG----TGATT-AAA-T------AGTT-----------------------------TATTT-----------TG-CCTACA-T--------------------TGTA-T--TTT-ACA-T---------GC-G-TT-T-TC-T---TTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAT-TTTTTGTT-ACT--TTTTTAGCA-A--TTTGATA-GGACACTT--TTGTCCCG--A-CAG------AATTTTTAGaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgattccaactatctaaacagttttgttaaaggttaacggatattgttaaaaaccaagtgcactcgctgatcatagtcttcaggatcaaatatcaaattgaaaccgaatcggtgattaaatagtttattttgcctacattgtattttacatgcgttttctttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtattttttgttacttttttagcaatttgataggacacttttgtcccgacagaatttttagctctttcgccaact
gi|10 : agagttggcgaaagacgccgggccaccggtgatcatctgataaaacttgatcgaatgtccaagagttttagaaaccaagccggacaaactgtgtctggtagattttcagaatatacaatattagtaaatcgttcaaataataaataatgcgcattacttattcaaaagttgtttattttattttgcataacatgaaaaaagtatgaaaattatttaatgtgattttttgttccttatcaaacacaaaatacccggagaatttcaatttggttctatgtgaagtttagtatatccgcagtatcgagttgggccggcgagtaaacatgttcaagatgtggacaattttagaaatggtcacaaagtcattaaaaagaaattgctgcataagctgaaaacacagtgacaacaaaaaataaaagaaacaaaaagggtaggacagttctaaccacagttggattaaagacagacaatgcgctaatgtttggacaatgattctcattgatgttttatgtggccatgcataaaatctttatcaactcaaaaaaaaaacacaaaacaaaaaaaaaaaa------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AATGT--------------ATG-ACG-A-TGGTTTTG----------TGC------C---------------A--TG----------------CAC--A---AA--TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---CCG--AA-C-CAAC-TA---TC---CA-AAC--------AGTTTTG--TT-AAAG-----GTTG-TTGA-TA----AT-TT--AAAAA-C-ATT---A--GT--GCA--CT-C-GC-----T-GA--TCC-C-GA----G--TC--TTCAGG---AT------------GCG-T----AGA-ATATCAAAATCATTC------ATAAAAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTTTTTTAACT--TGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-TATTGAATTG-A-T-CA-T-ATG-GA-T--T---GATATTGCA-T--TTT-ACA-TATT-TTGATGG---TT-T-TG-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTATTGTT-AC---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACAC-T--GTGT-CCG--A-CAGATTctctttcgccaact
gi|10 : gTTTTTAGCTC-TTTCGCCAAtttagctctttcgccaa
gi|11 : gagtggattaaagacaagcaatggctaaatgtatgacgatggttttgtgccatgcacaaattttgtcaactcaaagaaaaaccgaaccaactatccaaacagttttgttaaaggttgttgataatttaaaaacattagtgcactcgctgatcccgagtcttcaggatgcgtagaatatcaaaatcattcataaaattgaaactgaatggtgttaagataacagttttttaacttgctacattgtatttgatattgaattgatcatatggattgatattgcattttacatattttgatggttttgtatttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtagttattgttactttttagcaatttgtaggacactgtgtccgacagaTT-GGCGAA-A-GATGCCGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCA-ATG-TCCGAT-AGA-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTAT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AAATA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ACA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-TACT-ATNATTTGAT------AAC--A---TG-AAAAGTATGAATATTATTGTGATTTT-----T------TCT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCAGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-
gi|12 : T-ATC--GAG-G-T------GCAGC-G-A------------GTAAAGA-T--GTG-GTA--A-GA--TGTGCCCAATTAAA----T-----CTTCA--GA-G-TCAT-TA-AA-A---TG--A---AAAT-C---GC-TACC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------AAG-----------CAAA-------AAGGTTAG----------GAAGTTTAAT-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAGA-GAA--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AG-CT--------------ATG-ACG-A-TGATACTCA---------TATGACATTT--TGTGTC-------A--TG----------------CAC--AC--A---TTT--TTAT------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA------------------------------------------------G--TT-AG-G-----GTTG-T-GG-TA----AT-TT--CAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----T-GA--TCA-T-GA----G--TC--TTCAAG---ACTCCATCAGGA-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT------------------------AT-CA----T---------T--GA-CA-TTC----A----TG--A-A-ATTG-------TATTT----------------TACA-T-----------------------A-T--TTT------------GAT-G-G-TT-G-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-CAA--CTT-T
gi|13 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCT-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCTGAT-AGT-TTTCT-AGCAA--C--CA--A-G--T-CGGAC-A--CTT-------T-GTCC-G-TAAA---TTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-T-AA-AA--TTAATG---------TT-TTCAGAATGTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-ATGGA--AAA--GT-----ATGAA-AATTAAT-------T------AA---G---TG-ATTTT-------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-CAAAAAA--T--------GCC-------GGA-AATGT--TCAATTTTTGGTT-TCATA--GTGGA-A-GTT--TATGT-A-TATCCACG--GT-ATC--GAGAG-TGT--GCGCGGCAG-A------------GTAAACA-T--GT
gi|14 : gAGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCC--ACCG---CGATC-TCCGAATTA-AA-T-TTGG--CAA--G-TCCGA---GTATTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--TTCGGACCA--CTG-------T-GTC-GG--AAA--TTTTT--CAA-GAATATAACTAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-A--TA--ATAATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TT-AT---T--TATTT-G-ATAG----AC-AT-GAGAAAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---TTCTTTATCGAA-A-C--AAAAATT--------GCC-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-c
gi|15 : g-G--AA-C-CAAC-TAAT-TC---CA-AAC---------GTTTTG--TC-TAAA-----GTTA-T-TG-TA----AT-T---AGAAA-C-ACACATA--GTTCGCA--CT-CCGC-----T-GA--TCATC-GA--------T--TTCAGG---AT---------A-TGCAGT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAAC-GAAT-GG----TGTAA-AAA-T--AAGC--TTT----A-T--TGCTA-C-ATTGAATTTTGTATTTGA-T-------TGAA-AACA-T-G-T-GA-T--T---AAAATTGCA-TAATTT-ACA--ATTATTGA--G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AG-TC-------G----T-TCC-T---TAGTTTTTTGTT-AC---TTTTTAGCA-AATTTTA-T----ACAT-T--GTGT-CCG--G-C
gi|16 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCG-CCC-AC-GG--CG-TC-TC-GA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCCGATCAGT-TTT-TTAG-AAAGC--CA--A-G--T-CGGAC-AA-CTG-------T-GTCCGGGTAAA--TTTTT--C---GAATATA--CAATCATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA--A--T-AATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TTTATC--T--TATTCTG-ATA-----AC-AT-GA--AAAA-GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-ATT---------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------GCC-------GGA-AAT-T--TCAA--TTTGGTTGTC-T--TGT-GA-A-GTT--TATGTAA-TAT---CG--GT-ATC--GAG-GTTTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-caatgattatttaaggtcttgtctgccaac
gi|17 : TT-AT-------T------AATATG---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---TT--CT---TATCGAA---C--AAAA--TCCATTGGTACC-GACA--GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TCTTA-CGT-GA-ATGTT--TAT-T-A-TATA--CG--G--ATCGTGAG-G-TTT--GCGCGGC-G-A------------TT-AACAGTA-GTG-CCA--A-GA--TG-G--------------T-----GGTCA--AATA-TCAT-TATAATA---AGCAA---AAGT-A---GCTTGCC-A-GACA------G--TG---TA--A---C---A--C--------------------------------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AG--G-----GA---TTAAA-GACA-AG-A-C--AATCC-GC-------TAA--AA-GTG-------------ATG-ACA-T-TGATTCGCAT--------TCT------T--TGAGT--------A--TG----------------CAC--A---A----TT--T-GT------CAA-------AC-GA--AAAA---A---------------A
gi|18 : AT-ACAA-TT--TTACTGTATT--C--TT-TTCAAAA-GTTTA---TTTATT--T--TAATT-G-ATATCATAAC-AT-GG--AAA--GTTAAGTATGAA-AATT-AT-------TTGGCCTAAT------TG-A-----------------------TT-----TATATTTTTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAA---T--------AC--------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TAGGGT-GA-A-GTT--T-TGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTAG-GCGCGGC-T-A------------GTAAAGG-T---TGCCCA--A-AA--T-----------------T-----AGTCA--GA-G-TCAT-T------TTTAG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TATTATT-C---AGTT----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A
gi|19 : aa-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----T-GA--TCA-C-GAACGAG--TC--TTCAGG---AT------------GCGTT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTTT----A-T--TGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GATT--T---AAAATTGCA-T--TTT-ACA-TATT-TTGAT-G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-AAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AC---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACAC-T--ATGT-CCGACA-CAGAT------TTTTTAGaaa
gi|2 : AGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA-AAC--------AGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----T-GAGGTCA-CTGA----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT------A-T--TGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-ACA-TATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-ACTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-C-C--GTGT-CCA--A-CAGATTctctttctccaact
gi|20 : gT-ACA-TATT-TTGATGA-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--TTT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-ACT--TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACAC-T--GTGT-CCG--A-CAGAT------TTTTTAGttattaactttcttctctga
gi|21 : attggacattgcgtgtcagacagttgtagactggtacaattattccagggaagtctgcacctgtaatagtgtattctagaga-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAC-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--G------ATG-----TG-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACT-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-AGT-GA-A-GCT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-A-A------------GTAAAC-----GTG-CCA--A-GATGTGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AActctttcgccaactct
gi|22 : aCC-A-GA-G------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAGAATAAAGAACA-------------CAAAGGTTAGGAA----ATTTA-------A--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-CAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-CGATTCT-----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAATATA---------------AA---C-ACTAA-C-CAAT-TA---TC---CA-AAC--------AGTTTTG--TT-AAAG-----
gi|23 : TATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---ATTATT--C--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GG--AGA--AT-----ATGAA-ATTC-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------TC--------AGA-ATT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CTT-GACG-GTTTATATGT-A-TATC--CG--AT-ATC--GAG-A-TTTG-GCGTGGC-G-A------------GTAAA
gi|24 : GTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCCTGTTGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCGAC-AGT-GTT-T-A--AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CCA-------T-GTCCAG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAA-AT-A-AA--A---TAATGTATT-A
gi|25 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCAAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGTAC-A----G-------T-G---AG-TGGA--TT
gi|25 : g------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-aaagacaagcaatggctaaatg
gi|26 : gagttggcgaaagacgccggcccaccggcgatctccgataaatttgatcgatgtccaatagtttttagaaccaagccgtacagtg-TATT-TTAATAT-A-TT-T--C-T-ATCTA-ATCTG--G-CAA--ATT-TT-AT-GT-------G----TGTTC-T--G--------------------TTTGGCA-A--TCTA-TA-GGACAC-C--GTGA-CCA--G-CAGATTtg
gi|26 : atctttgTTGGCAATCTATAGGACACCGTGACCAGCAGATTTTTTTTTAGCTC-ATTTGCCAATTtttttttagctcatttgccaattc
gi|27 : atctttgtattttaatatatttctatctaatctggcaaattttatgtgtgttctgtAGTT-GGCGAA-AAGACGCCGGCCC-ACCGGG-CGA-C-TC-GA--TA-AA-T-TTTA-TC-GA-G-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA-----CATTA-G----CGGAC-A--CTG-------T-GTTGGGTTAGAT-TTTTT--CA--GAATc
gi|28 : gCGAA-A-GACGCCAGAT--GCCAG--AGATC-TCTGG--TA-AA-TTTTAA-T----TG-TCGG-----------T-AA-AA--CTTCA--A-ACTC-TGGAT-A--CTGGACAAACT-GTCCGA--AGA--TATTG--CA--Gtat
gi|29 : gcAGTT-GGCGAA-A-GATGATGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TTTGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--
gi|3 : gAGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA-AAC--------AGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----T-GAGGTCA-CTGA----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT------A-T--TGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-ACA-TATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-ACTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-C-C--GTGT-CCA--A-CAGATT
gi|30 : g-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACCTGGTACCGGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGttattaactttcttctctga
gi|31 : attAGTT-GGTGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGA--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TT
gi|32 : agA-----AC-AT-GG--AAA--GT-----ATGAA-AAAT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCG
gi|33 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCAG--C
gi|4 : cagAGTT-GGTGAA-A-GACGC-GGCCC-ACCGGAGCGATC-TCCGA--CATAA-T-TTGA-TCAGATG--CCGCTTAGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGCT-A--CTG-------TTGTCCGG-TAGA--TTTTTTTCATGAAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--TACATCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-ACGTCT-TTCAAAA-GTT-GG--TTTATC--T--TATTC-A-ATA-----AC-AT--A--AAA--GT-----A-GAATAATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---C---TT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GAA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-AA-A-GTT--T-TGT-A-TA----CG--GT-ATC--AAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------G-AAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A-----------------------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-AC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA-AAC--------AGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----T-GA--TCA-C-GA----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----A-A-ATAT---------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--AA-CAGTTT----A-T--TGCTA-T-ATTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-ACA-TATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GT-CG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AC---TTATCAGCA-N--NNNN-NN-NNNNNN-N--NNNN-NNN--N-NNNATTAGCAATTTCTAGGACACTGTGTCCGACAGA---TTTTTTAGCTC-TTTCGCCAACT
gi|5 : TT-GGCGAA-A-GACGCCTGCCC-ACCGG----ATC-TCC-A--TA-AA-TATTGAATC-GATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C--GGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTC--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---CCAAAAAATCA-AA------TAATGTATT-AC--TT-TTCAAAG-GTT-ATTCTTTA-C--TGATATT----ATA-----AC-AT-G---GAA--GT-----ATGAA-AATT-ATTAGGCC-T------AAT--G---TGAA-----------------------TTTATTAT------TTT---T---CT---TATCG-A-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----G---AAT-T--TCAG--TTTGGTT-TC-TA-CGT-G--A-GAT--TATA-----ATC--CG--GT-ATC--GAG-G--TTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA----GTG-CCA--A-AA--------------------T-----GGTCA--GA-G-TCAT-T---T-T---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-TA-A------G-CCG-A-TA--A---TCAGA--A----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AA----------A--------A-------------AAAC------AAA-A-----AA-----AAA-AAA--AGAA-CAAAAA-G-GT-------T-AGGAA-GTTTAATGGCTAAAGTATG-ATG-A-TGATACT-----------TAT------TGATGTTTTGTGTGCCG--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------TAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---TGG--AA-C-CAACATA---T----CA-AAC--------AGTTTTG--TT-AAAG-----AT---T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----ATTAT--ACA--CT-C-GC-----T-GA--TCA-C-CA----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATATCAAATA---TCATTCATA---AAT---------------T-AAATTGAAT--G----TGTTA-AGA-T--AA-CA-CTT----A-T--TG-TA-C-ATTG-------TA-TTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T-------AAGTTGCA----TTT-ACA-T-TT-TTGATGG-T-TTGT-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-
gi|6 : agcTGT-AATATC--CG--GTTATC--GAG-G-TTTG-G-GCGGC-G-GAGGGCGTGGGAGGTAAACA-TTTGTG-CCA--AAGA--TGTG--------------TTTCGTGGTCA--AA-GGTCAAATA-AA-A---AA--AGAAAAGTGT---GC-TGCC-AAGA-AATTTTTG-ATA-A-TA--A---C---A--CTTCAAAAAAATG----------A---------------A-------------CAAA-------AATA--AT-------------------T-------------CCAC------AGTTG-----GAATATTAAA-GACCAGG-A-C--AAT-G-GCCACGCCCT-A--AA-GT--------------ATG-ACGTA-TGATTCTC-----------AT------T--TG-----------GATTG----------------CACA-A---A---ATT--T-GT------CAA-------CC-AACCAAAA---A---------------AA---
gi|6 : tgcat-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TCTTCCA-AAC--------AAGTTTGGTTT-AAAGCGTTTATTA-T-GG-TACTAAAT-TT--AAAAAAC-A-----AA-GT--GCA--CT-CCGC-----T-GA--TCAAC-GA----GGTCC--TTCAGG-----------------GCAGTTATGAGATATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GGATTGTATTA-AAAAT--AAACAGTTT----A-T--TGCTAAC-ATTG-------TATTTGAAT-------TG-A-TACA-TTGTT-GA-T--TTTAAAAACTGCA-T--TTTTAC--TATA-TTGATGGTG-TT-T-TTGT-ATTTT-GTCCGTGG-CAATTATT-TTTAA-GT-------G----TGTTC-TTGATAG-TTTTTGTTTACCTTTTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACAC-T--GTGT-Caaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgaaccaactatcttccaaacaagtttggtttaaagcgtttattatggtactaaatttaaaaaacaaagtgcactccgctgatcaacgaggtccttcagggcagttatgagatatatcaaattgaaactgaatggattgtattaaaaataaacagtttattgctaacattgtatttgaattgatacattgttgattttaaaaactgcatttttactatattgatggtgtttttgtattttgtccgtggcaattatttttaagtgtgttcttgatagtttttgtttacctttttttagcaatttgtaggacactgtgtcatgaaggaacggatttatcttttttgccctttcgcccaactct
gi|7 : tgcattgtaatatccggttatcgaggtttgggcggcggagggcgtgggaggtaaacatttgtgccaaagatgtgtttcgtggtcaaaggtcaaataaaaaaagaaaagtgtgctgccaagaaatttttgataataacacttcaaaaaaatgaacaaaaataattccacagttggaatattaaagaccaggacaatggccacgccctaaagtatgacgtatgattctcatttggattgcacaaaatttgtcaaccaaccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---A---A---AAGT-T---GC-TGCCCA-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAAAATAACAGA-A-------------CAAAGGTTAGGAA----GTTTTAC-----A--------T-------------CCACTGTGACAGT-T-----GA---TTAAGCGAC--A---------T-G-G----------A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TG---TTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---AA--TTT--T-GTACACTACAAAAAAAACCA-AA--AAAA---A---------------AA---C-A--AA-C-CAAC-GA---AC---CA-AACTCTACAACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTT--T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAACCT-C-GC-----TTGA--TTC-C-GAA---G--TC--TTCAGG---AT------------GCGGT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----T-TTACAAA-T--GA-CAGTTT------T--TGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TAC--T-GTT-GA-T--TT--CAAATTGCA-T--TTT-ACA-TATT-TTGATGG-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--GACAA--TTTATT-AA-GTTGTGCACG----TGGTC-T--GTAG-TTTTTGTT-AC---TTTTTCGCA-A--TTTG-TA-GGA-----------------A-CA-----------CTTAGA------TGTCGAACAGA---TTTTTTAGCTC-TTTCGCCAACTatgaaggaacggatttatcttttttgccctttcgcccaactct
gi|8 : TCA--AA-G--CAT-TA-AG-A---A---A---AAGT-T---GCCTGAC-A-GA-A------G-CTGTA-TA--ATCAC---A--C----------------------A---------------AATAAAATAAAGAACAAA-------AA----GTTAGGAAGTTTA--------T-------------CCAC------TGT-GACATTGA---TTAAA-GAC--AG-AAC--AAT-T-GC-------A-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC-----------AT------T--GG-----------A--TG----------------CAC--AAACA---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAA---AAACCAAAAAAAAAACAA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA-AAC--------CATTTTG--TTAAAAG-----GTTA-T-GG-TA----TT-TTAAAAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----T-GA--TCA-C-GA----G--TCT-TTCAGG---AT-----------TGC-GT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT--G----TGTTA-AAA-T--GA-CAG-TT----A----TGC-A-CAATTG-------TATTTTG-T-------T--A-TACACT-GTT-GA-TTGT---AAAATTGCA-T--TTT-ACA-TATT-TTGAT---G-TT-TATC-T-ATTTG-GTCTG--G-ACA--ATT-TT-AA-GT-------GTCACTGTCCTT--GTA--TTTTTGTT-AC----TTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACAC-TTAGAG--CCG--ACCAGATT-----TTTTTAGGct
gi|9 : --AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ATG-AATGATTTTC-----------AT------T--TG-----------A--TGTTCTTGTGTGCCGTGCCA---A---A---TTT--T-G-------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA---T-GG-AA-C-CATC-TA---TC---TAGAAC--------AGTTTTG--------------ATT-------TA----CT-TT--TAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CTGC-GCGGCATT-GA--TCA-C-TAACA-G--T------AGGTACAG---------A-TGCAGTTA--GGA-ATAA---------TC------A---AATATCATTCATAAAATGTGAAATTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTTT----A-TATTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-ACAATATT-TTGATGG----T-T-TC-T--TTTG-GTCCG--G--AA--ATT-TT-AA-GT-------G----T--CC-T--GTAG-TTTTTGTT-AA---CTTT---------TTT--TA-GGA-----------------------------ATTTTTAGGACACTGTGTCCGACAGA---TTTTTTAGCTCTTTTCGCCAACctctttcgccaactc
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 22 1111111 11 222 11 1 222222 111 11 11111 55555555555555555555555555555555555555555555555555 111 222222222222222222 111111111111 1111 44444444444444444444 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222222222 333333333333333333333333333333333333 2222222222222222 222222 1111111 1 111111111111111 11111111 111 11111111 1111 11111 11 11111 11111 11 3333333333333333 1111 33333333333 111111111111111 1111111111 1111111 1111111 111111 111 1111111 222 6666666666666666666666666666666666666666666666 111
lowQualScore : 5 5 2 2 666 2 33 2 8 0 2 33 5 5 2 2 2 2 33 44 44 6 4444 3 77 0000000 3 6 11 44 77 666 4 888 11 777 0 3 3 111111 0 77777 3 55 3 999 000 44 00 3 00000 6 3 44 77 77777 3 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444 66666 777777 444 222 444 2 5 33 33 555555555555555555 1 2 2 77 2 2 5 33 3 3 3 44 2 2 33 33 2 33 2 2 5 2 5 333333333333 2222 3 99 3 55 44444444444444444444 44 3 3 3 3 3 333 44 555 55555 6 9 3 3 888888 6 3 6 44 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 888888 6 77777 555 0 3 77 3 3 33 2 2 9999999 2 33 33 11111111111111 3 3 3 888888888888888888888888888888888888 44 0000000000000000 222222 888 88 3 888888 6666666 0 33 444 666666666666666 88888888 2 2 3 555 555 44444444 0 44 3 77777 2222 3 7777 3 44 3 3 11111 77 44 00 3 6 00000 88 6 22222 6666 44 11 3333333333333333 0000 3 3 77777777777 888888 555 999999999999999 1 3 6666 3 3 999 6 0000000000 3 3 0000000 3 0000000 3 3 3 3 6 3 777777 6 44 2 2 2 444 2 2 2 5 5 33 2 33 2 3 6 6666666 6666 3 44 44 6 000 6 44 0 3 6 3 5555555555555555555555555555555555555555555555 5 000 77 5
lowQualScore : . . . . ... . .. . . . . .. . . . . . . .. .. .. . .... . .. ....... . . .. .. .. ... . ... .. ... . . . ...... . ..... . .. . ... ... .. .. . ..... . . .. .. ..... . . .................................................. ..... ...... ... ... ... . . .. .. .................. . . . .. . . . .. . . . .. . . .. .. . .. . . . . . ............ .... . .. . .. .................... .. . . . . . ... .. ... ..... . . . . ...... . . . .. ................................................................................................................... ...... . ..... ... . . .. . . .. . . ....... . .. .. .............. . . . .................................... .. ................ ...... ... .. . ...... ....... . .. ... ............... ........ . . . ... ... ........ . .. . ..... .... . .... . .. . . ..... .. .. .. . . ..... .. . ..... .... .. .. ................ .... . . ........... ...... ... ............... . . .... . . ... . .......... . . ....... . ....... . . . . . . ...... . .. . . . ... . . . . . .. . .. . . . ....... .... . .. .. . ... . .. . . . . .............................................. . ... .. .
lowQualScore : 3 0 5 5 333 7 77 7 0 7 9 22 7 7 9 9 9 9 99 22 22 2 8888 1 33 0000000 1 2 55 66 99 333 0 000 00 000 0 3 3 222222 4 33333 3 88 3 222 000 66 22 3 88888 2 1 22 33 77777 1 9 55555555555555555555555555555555555555555555555555 77777 777777 777 000 777 9 7 99 99 111111111111111111 9 9 9 99 9 9 7 44 1 1 1 22 9 9 99 99 7 77 7 7 3 7 3 777777777777 9999 1 22 3 00 66666666666666666666 22 1 1 1 1 1 555 22 444 11111 7 2 1 1 888888 2 1 7 66 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888888 2 77777 444 4 1 33 1 1 99 9 9 3333333 9 99 88 22222222222222 1 1 1 888888888888888888888888888888888888 22 4444444444444444 555555 555 55 1 888888 2222222 7 77 777 777777777777777 55555555 9 9 1 000 444 22222222 4 22 1 77777 8888 3 1111 1 22 1 1 99999 33 22 44 1 2 88888 55 2 33333 5555 22 55 6666666666666666 8888 5 1 77777777777 888888 444 222222222222222 5 1 5555 1 1 777 2 5555555555 1 1 0000000 1 0000000 1 1 1 1 2 1 333333 2 22 9 9 7 111 7 7 7 3 3 77 7 99 9 1 2 2222222 5555 1 22 66 2 000 2 22 4 1 2 0 9999999999999999999999999999999999999999999999 7 000 99 7
consensus : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AC---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTC-CG-----A-CA--GATT----ATTTTTAGGACAC-GTGTCCGA-CAGA---TTTTTT--AGCTC-TTTCGCCAACT
Reference ( family-3770 ) : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AC---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTC-CG-----A-CA--GATT---AATTTTTAGGACACCGTGTCCGA-CAGA---TTTTTT--AGCTC-TTTCGCCAACT
gi|1 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGGCC-ACCGG--TGATCATCTGA--TA-AAAC-TTGA-TCGAATG-TCCAAG-AGT-TTT-A-GA-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-AAACTG-------T-GTCTGG-TAGA--TTTT---CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAATAAT-A-AA-TA--ATG-CGCATT-AC--TTATTCAAAA-GTT-G---TTTATT--T--TATTTTGCATA-----AC-AT-GA--AAAAAGT-----ATGAA-AATT-AT-------TT-----AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTTGTTC---CT---TATCAAACA-C--AAAA--T--------ACC-C-----GGAGAAT-T--TCAA-TTT-GGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CGCAGT-ATC--GAG---TTGG-GC-CGGC-G-A------------GTAAACA-T--GT--TCA--A-GA--TGTGGACAATTTTAGAAAT-----GGTCACAAA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AA-T-T---GC-TGC--A-TA-A------G-CTG-A-AA--A---C---A--CAGTGACAACAAAAAATAAAAGAA---------------A-------------CAAA-------AA----GG----------G--------TAGGACAGTTCTAACCAC------AGTTG-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-GCGC-------T-A--AT-GT--------------TTGGACA-A-TGATTCTCATTGATGTTTTAT------G--TGGCC--------A--TG----------------CAT--A---AAATCTT--T-AT------CAA-------CT-CA--AAAA---A---------------AA--------AA-CACAA
gi|1 : ag-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--ATTC-CAAC-TA---TC---TA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTAAC-GGATA----TTGTT--AAAAA-CCA-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T-----A----G--TC--TTCAGG---AT-------------CA--------A-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACCGAATCGG----TGATT-AAA-T------AGTT-----------------------------TATTT-----------TG-CCTACA-T--------------------TGTA-T--TTT-AC-AT---------GC-G-TT-T-TC-T---TTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAT-TTTTTGTT-ACT--TTTTTAGCA-A--TTTGATA-GGACAC-----------------------------TTTT---------GT-CCCGA-CAGA---ATTTTT--AGCTC-TTTCGCCAACTaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgattccaactatctaaacagttttgttaaaggttaacggatattgttaaaaaccaagtgcactcgctgatcatagtcttcaggatcaaatatcaaattgaaaccgaatcggtgattaaatagtttattttgcctacattgtattttacatgcgttttctttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtattttttgttacttttttagcaatttgataggacacttttgtcccgacagaatttttagctctttcgccaact
gi|10 : agagttggcgaaagacgccgggccaccggtgatcatctgataaaacttgatcgaatgtccaagagttttagaaaccaagccggacaaactgtgtctggtagattttcagaatatacaatattagtaaatcgttcaaataataaataatgcgcattacttattcaaaagttgtttattttattttgcataacatgaaaaaagtatgaaaattatttaatgtgattttttgttccttatcaaacacaaaatacccggagaatttcaatttggttctatgtgaagtttagtatatccgcagtatcgagttgggccggcgagtaaacatgttcaagatgtggacaattttagaaatggtcacaaagtcattaaaaagaaattgctgcataagctgaaaacacagtgacaacaaaaaataaaagaaacaaaaagggtaggacagttctaaccacagttggattaaagacagacaatgcgctaatgtttggacaatgattctcattgatgttttatgtggccatgcataaaatctttatcaactcaaaaaaaaaacacaaaacaaaaaaaaaaaa------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AATGT--------------ATG-ACG-A-TGGTTTTG----------TGC------C---------------A--TG----------------CAC--A---AA--TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---CCG--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTG-TTGA-TA----AT-TT--AAAAA-C-ATT---A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCC-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT------------GCG-T----AGA-ATATCAAAATCATTC------ATAAAAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTT--TTTTAACTTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-TATTGAATTG-A-T-CA-T-ATG-GA-T--T---GATATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG---TT-T-TG-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTATTGTT-AC---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTC-CG-----A-CA--G-------ATTTTTAG
gi|11 : gTT-GGCGAA-A-GATGCCGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCA-ATG-TCCGAT-AGA-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTAT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AAATA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ACA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-TACT-ATNATTTGAT------AAC--A---TG-AAAAGTATGAATATTATTGTGATTTT-----T------TCT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCAGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-ctctttcgccaa
gi|12 : T-ATC--GAG-G-T------GCAGC-G-A------------GTAAAGA-T--GTG-GTA--A-GA--TGTGCCCAATTAAA----T-----CTTCA--GA-G-TCAT-TA-AA-A---TG--A---AAAT-C---GC-TACC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------AAG-----------CAAA-------AAGGTTAG----------GAAGTTTAAT-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAGA-GAA--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AG-CT--------------ATG-ACG-A-TGATACTCA---------TATGACATTT--TGTGTC-------A--TG----------------CAC--AC--A---TTT--TTAT------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA-----------------------------------------------G--TT-AG-G-----GTTG-T-GG-TA----AT-TT--CAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T---G-A----G--TC--TTCAAG---ACTCCATCAGGA-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT------------------------AT-CA----T---------T--GA-CA-TT--C----A--TG--A-A-ATTG-------TATTT----------------TACA-T-----------------------A-T--TTT------------GAT-G-G-TT-G-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-CAA--CTT-T
gi|13 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCT-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCTGAT-AGT-TTTCT-AGCAA--C--CA--A-G--T-CGGAC-A--CTT-------T-GTCC-G-TAAA---TTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-T-AA-AA--TTAATG---------TT-TTCAGAATGTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-ATGGA--AAA--GT-----ATGAA-AATTAAT-------T------AA---G---TG-ATTTT-------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-CAAAAAA--T--------GCC-------GGA-AATGT--TCAATTTTTGGTT-TCATA--GTGGA-A-GTT--TATGT-A-TATCCACG--GT-ATC--GAGAG-TGT--GCGCGGCAG-A------------GTAAACA-T--GT
gi|14 : gAGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCC--ACCG---CGATC-TCCGAATTA-AA-T-TTGG--CAA--G-TCCGA---GTATTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--TTCGGACCA--CTG-------T-GTC-GG--AAA--TTTTT--CAA-GAATATAACTAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-A--TA--ATAATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TT-AT---T--TATTT-G-ATAG----AC-AT-GAGAAAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---TTCTTTATCGAA-A-C--AAAAATT--------GCC-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-c
gi|15 : g-G--AA-C-CAAC-TAAT-TC---CA--------AAC-GTTTTG--TC-TAAA-----GTTA-T-TG-TA----AT-T---AGAAA-C-ACACATA--GTTCGCA--CT-CCGC-----TGA--TCATC---G-A--------T--TTCAGG---AT---------A-TGCAGT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAAC-GAAT-GG----TGTAA-AAA-T--AAGC--TT--T----A-TTGCTA-C-ATTGAATTTTGTATTTGA-T-------TGAA-AACA-T-G-T-GA-T--T---AAAATTGCA-TAATTT-AC-A-ATTATTGA--G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AG-TC-------G----T-TCC-T---TAGTTTTTTGTT-AC---TTTTTAGCA-AATTTTA-T----ACATTGTGTC-CG-----GCCAATGATT---A--TTTAAGG
gi|16 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCG-CCC-AC-GG--CG-TC-TC-GA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCCGATCAGT-TTT-TTAG-AAAGC--CA--A-G--T-CGGAC-AA-CTG-------T-GTCCGGGTAAA--TTTTT--C---GAATATA--CAATCATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA--A--T-AATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TTTATC--T--TATTCTG-ATA-----AC-AT-GA--AAAA-GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-ATT---------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------GCC-------GGA-AAT-T--TCAA--TTTGGTTGTC-T--TGT-GA-A-GTT--TATGTAA-TAT---CG--GT-ATC--GAG-GTTTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-tcttgtctgccaac
gi|17 : TT-AT-------T------AATATG---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---TT--CT---TATCGAA---C--AAAA--TCCATTGGTACC-GACA--GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TCTTA-CGT-GA-ATGTT--TAT-T-A-TATA--CG--G--ATCGTGAG-G-TTT--GCGCGGC-G-A------------TT-AACAGTA-GTG-CCA--A-GA--TG-G--------------T-----GGTCA--AATA-TCAT-TATAATA---AGCAA---AAGT-A---GCTTGCC-A-GACA------G--TG---TA--A---C---A--C--------------------------------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AG--G-----GA---TTAAA-GACA-AG-A-C--AATCC-GC-------TAA--AA-GTG-------------ATG-ACA-T-TGATTCGCAT--------TCT------T--TGAGT--------A--TG----------------CAC--A---A----TT--T-GT------CAA-------AC-GA--AAAA---A---------------A
gi|18 : AT-ACAA-TT--TTACTGTATT--C--TT-TTCAAAA-GTTTA---TTTATT--T--TAATT-G-ATATCATAAC-AT-GG--AAA--GTTAAGTATGAA-AATT-AT-------TTGGCCTAAT------TG-A-----------------------TT-----TATATTTTTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAA---T--------AC--------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TAGGGT-GA-A-GTT--T-TGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTAG-GCGCGGC-T-A------------GTAAAGG-T---TGCCCA--A-AA--T-----------------T-----AGTCA--GA-G-TCAT-T------TTTAG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TATTATT-C---AGTT----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A
gi|19 : aa-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-AACGAG--TC--TTCAGG---AT------------GCGTT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--TT--AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG---TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-AAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AC---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTATGTC-C----------------------------GACAC-----------AGA---TTTTTT--AGCTC-TTTCTCCAACTaaa
gi|2 : AGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-ACTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-CCGTGTC-CA-----A-CA--GATT---
gi|20 : gT-AC-ATATT-TTGATGA-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--TTT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-ACT--TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTC-CG-----A-CA--GAT------TTTTTAGttattaactttcttctctga
gi|21 : attggacattgcgtgtcagacagttgtagactggtacaattattccagggaagtctgcacctgtaatagtgtattctagaga-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAC-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--G------ATG-----TG-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACT-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-AGT-GA-A-GCT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-A-A------------GTAAAC-----GTG-CCA--A-GATGTGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AActctttcgccaactct
gi|22 : aCC-A-GA-G------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAGAATAAAGAACA-------------CAAAGGTTAGGAA----ATTTA-------A--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-CAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-CGATTCT-----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAATATA---------------AA---C-ACTAA-C-CAAT-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----
gi|23 : TATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---ATTATT--C--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GG--AGA--AT-----ATGAA-ATTC-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------TC--------AGA-ATT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CTT-GACG-GTTTATATGT-A-TATC--CG--AT-ATC--GAG-A-TTTG-GCGTGGC-G-A------------GTAAA
gi|24 : GTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCCTGTTGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCGAC-AGT-GTT-T-A--AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CCA-------T-GTCCAG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAA-AT-A-AA--A---TAATGTATT-A
gi|25 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCAAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGTAC-A----G-------T-G---AG-TGGA--TT
gi|25 : g------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-aaagacaagcaatggctaaatg
gi|26 : gagttggcgaaagacgccggcccaccggcgatctccgataaatttgatcgatgtccaatagtttttagaaccaagccgtacagtgTATT-TTAATAT-A-TT-T--C-T-ATCTA-ATCTG--G-CAA--ATT-TT-AT-GT-------G----TGTTC-T--GT--------------------TTGGCA-A--TCTA-TA-GGACACCGTGAC-CA-----G-CA--GATT---TTTTTTTAGtg
gi|26 : atctttg---AATCTATAGGACACCGTGACCAG-CAGATTTTTTTTT--AGCTC-ATTTGCCAATTctcatttgccaattc
gi|27 : atctttgtattttaatatatttctatctaatctggcaaattttatgtgtgttctgtttggcAGTT-GGCGAA-AAGACGCCGGCCC-ACCGGG-CGA-C-TC-GA--TA-AA-T-TTTA-TC-GA-G-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA-----CATTA-G----CGGAC-A--CTG-------T-GTTGGGTTAGAT-TTTTT--CA--GAATc
gi|28 : gCGAA-A-GACGCCAGAT--GCCAG--AGATC-TCTGG--TA-AA-TTTTAA-T----TG-TCGG-----------T-AA-AA--CTTCA--A-ACTC-TGGAT-A--CTGGACAAACT-GTCCGA--AGA--TATTG--CA--Gtat
gi|29 : gcAGTT-GGCGAA-A-GATGATGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TTTGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--
gi|3 : gAGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-ACTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-CCGTGTC-CA-----A-CA--GATT---
gi|30 : g-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACCTGGTACCGGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGttattaactttcttctctga
gi|31 : attAGTT-GGTGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGA--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TT
gi|32 : agA-----AC-AT-GG--AAA--GT-----ATGAA-AAAT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCG
gi|33 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCAG--C
gi|4 : cagAGTT-GGTGAA-A-GACGC-GGCCC-ACCGGAGCGATC-TCCGA--CATAA-T-TTGA-TCAGATG--CCGCTTAGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGCT-A--CTG-------TTGTCCGG-TAGA--TTTTTTTCATGAAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--TACATCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-ACGTCT-TTCAAAA-GTT-GG--TTTATC--T--TATTC-A-ATA-----AC-AT--A--AAA--GT-----A-GAATAATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---C---TT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GAA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-AA-A-GTT--T-TGT-A-TA----CG--GT-ATC--AAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------G-AAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A-----------------------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-AC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----A-A-ATAT---------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--AA-CAGTT--T----A-TTGCTA-T-ATTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GT-CG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AC---TTATCAGCA-N--NNNN-NN-NNNNNNNNNNNN-NN-----N-NN--NATTAGCAATTTCTAGGACACTGTGTCCGA-CAGA---TTTTTT--AGCTC-TTTCGCCAACT
gi|5 : TT-GGCGAA-A-GACGCCTGCCC-ACCGG----ATC-TCC-A--TA-AA-TATTGAATC-GATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C--GGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTC--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---CCAAAAAATCA-AA------TAATGTATT-AC--TT-TTCAAAG-GTT-ATTCTTTA-C--TGATATT----ATA-----AC-AT-G---GAA--GT-----ATGAA-AATT-ATTAGGCC-T------AAT--G---TGAA-----------------------TTTATTAT------TTT---T---CT---TATCG-A-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----G---AAT-T--TCAG--TTTGGTT-TC-TA-CGT-G--A-GAT--TATA-----ATC--CG--GT-ATC--GAG-G--TTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA----GTG-CCA--A-AA--------------------T-----GGTCA--GA-G-TCAT-T---T-T---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-TA-A------G-CCG-A-TA--A---TCAGA--A----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AA----------A--------A-------------AAAC------AAA-A-----AA-----AAA-AAA--AGAA-CAAAAA-G-GT-------T-AGGAA-GTTTAATGGCTAAAGTATG-ATG-A-TGATACT-----------TAT------TGATGTTTTGTGTGCCG--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------TAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---TGG--AA-C-CAACATA---T----CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----AT---T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----ATTAT--ACA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---C-A----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATATCAAATA---TCATTCATA---AAT---------------T-AAATTGAAT--G----TGTTA-AGA-T--AA-CA-CT--T----A-TTG-TA-C-ATTG-------TA-TTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T-------AAGTTGCA----TTT-AC-AT-TT-TTGATGG-T-TTGT-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-
gi|6 : agcTGT-AATATC--CG--GTTATC--GAG-G-TTTG-G-GCGGC-G-GAGGGCGTGGGAGGTAAACA-TTTGTG-CCA--AAGA--TGTG--------------TTTCGTGGTCA--AA-GGTCAAATA-AA-A---AA--AGAAAAGTGT---GC-TGCC-AAGA-AATTTTTG-ATA-A-TA--A---C---A--CTTCAAAAAAATG----------A---------------A-------------CAAA-------AATA--AT-------------------T-------------CCAC------AGTTG-----GAATATTAAA-GACCAGG-A-C--AAT-G-GCCACGCCCT-A--AA-GT--------------ATG-ACGTA-TGATTCTC-----------AT------T--TG-----------GATTG----------------CACA-A---A---ATT--T-GT------CAA-------CC-AACCAAAA---A---------------AA---
gi|6 : tgcat-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TCTTCCA--------AACAAGTTTGGTTT-AAAGCGTTTATTA-T-GG-TACTAAAT-TT--AAAAAAC-A-----AA-GT--GCA--CT-CCGC-----TGA--TCAAC---G-A----GGTCC--TTCAGG-----------------GCAGTTATGAGATATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GGATTGTATTA-AAAAT--AAACAGTT--T----A-TTGCTAAC-ATTG-------TATTTGAAT-------TG-A-TACA-TTGTT-GA-T--TTTAAAAACTGCA-T--TTTTAC--TATA-TTGATGGTG-TT-T-TTGT-ATTTT-GTCCGTGG-CAATTATT-TTTAA-GT-------G----TGTTC-TTGATAG-TTTTTGTTTACCTTTTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTCATGAAGGAA-CG--GATT---TATCTTTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgaaccaactatcttccaaacaagtttggtttaaagcgtttattatggtactaaatttaaaaaacaaagtgcactccgctgatcaacgaggtccttcagggcagttatgagatatatcaaattgaaactgaatggattgtattaaaaataaacagtttattgctaacattgtatttgaattgatacattgttgattttaaaaactgcatttttactatattgatggtgtttttgtattttgtccgtggcaattatttttaagtgtgttcttgatagtttttgtttacctttttttagcaatttgtaggacactgtgtcatgaaggaacggatttatcttttttgccctttcgcccaactct
gi|7 : tgcattgtaatatccggttatcgaggtttgggcggcggagggcgtgggaggtaaacatttgtgccaaagatgtgtttcgtggtcaaaggtcaaataaaaaaagaaaagtgtgctgccaagaaatttttgataataacacttcaaaaaaatgaacaaaaataattccacagttggaatattaaagaccaggacaatggccacgccctaaagtatgacgtatgattctcatttggattgcacaaaatttgtcaaccaaccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---A---A---AAGT-T---GC-TGCCCA-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAAAATAACAGA-A-------------CAAAGGTTAGGAA----GTTTTAC-----A--------T-------------CCACTGTGACAGT-T-----GA---TTAAGCGAC--A---------T-G-G----------A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TG---TTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GTACACTACAAAAAAAACCA-AA--AAAA---A---------------AA---C-A--AA-C-CAAC-GA---AC---CAAACTCTACAACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTT--T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAACCT-C-GCT----TGA--TTC-C---GAA----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----T-TTACAAA-T--GA-CAGTT--T------TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TAC--T-GTT-GATT--T---CAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--GACAA--TTTATT-AA-GTTGTGCACG----TGGTC-T--GTAG-TTTTTGTT-AC---TTTTTCGCA-A--TTTG-TA-GGA-----------------A-CA-------------CTTAG------ATGTCGAA-CAGA---TTTTTT--AGCTC-TTTCGCCAACTtttgccctttcgcccaactct
gi|8 : TCA--AA-G--CAT-TA-AG-A---A---A---AAGT-T---GCCTGAC-A-GA-A------G-CTGTA-TA--ATCAC---A--C----------------------A---------------AATAAAATAAAGAACAAA-------AA----GTTAGGAAGTTTA--------T-------------CCAC------TGT-GACATTGA---TTAAA-GAC--AG-AAC--AAT-T-GC-------A-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC-----------AT------T--GG-----------A--TG----------------CAC--AAACA---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAA---AAACCAAAAAAAAAACAA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACCATTTTG--TTAAAAG-----GTTA-T-GG-TA----TT-TTAAAAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TCT-TTCAGG---AT-----------TGC-GT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT--G----TGTTA-AAA-T--GA-CAG-T--T----A--TGC-A-CAATTG-------TATTTTG-T-------T--A-TACACT-GTT-GA-TTGT---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT---G-TT-TATC-T-ATTTG-GTCTG--G-ACA--ATT-TT-AA-GT-------GTCACTGTCCTT--GTA--TTTTTGTT-AC----TTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACAC--------------------------------TTAGAGC--------CGACCAGA---TTTTTTTAGGCTC-TTTCGCCAACTct
gi|9 : --AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ATG-AATGATTTTC-----------AT------T--TG-----------A--TGTTCTTGTGTGCCGTGCCA---A---A---TTT--T-G-------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA---T-GG-AA-C-CATC-TA---TC---TAG-------AACAGTTTTG--------------ATT-------TA----CT-TT--TAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CTGC-GCGGCATTGA--TCA-CTAAC-A----G--T------AGGTACAG---------A-TGCAGTTA--GGA-ATAA---------TC------A---AATATCATTCATAAAATGTGAAATTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTTTAT----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-ACAATATT-TTGATGG----T-T-TC-T--TTTG-GTCCG--G--AA--ATT-TT-AA----------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTTAAC---TTTTT--------T----TA-GG-------------------------------AATTTTTAGGACACTGTGTCCGA-CAGA---TTTTTT--AGCTCTTTTCGCCAACc
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 22 1111111 11 222 11 1 222222 111 11 11111 55555555555555555555555555555555555555555555555555 111 222222222222222222 111111111111 1111 44444444444444444444 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222222222 333333333333333333333333333333333333 2222222222222222 222222 1111111 1 111111111111111 11111111 111 11111111 1111 11111 11 11111 11111 11 3333333333333333 1111 33333333333 111111111111111 1111111111 1111111 1111111 11111111 111 1111111 222 99999999999999999999999999999999999999
lowQualScore : 5 5 2 2 666 2 33 2 8 0 2 33 5 5 2 2 2 2 33 44 44 6 4444 3 77 0000000 3 6 11 44 77 666 4 888 11 777 0 3 3 111111 0 77777 3 55 3 999 000 44 00 3 00000 6 3 44 77 77777 3 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444 66666 777777 444 222 444 2 5 33 33 555555555555555555 1 2 2 77 2 2 5 33 3 3 3 44 2 2 33 33 2 33 2 2 5 2 5 333333333333 2222 3 99 3 55 44444444444444444444 44 3 3 3 3 3 333 44 555 55555 6 9 3 3 888888 6 3 6 44 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 888888 6 77777 555 0 3 77 3 3 33 2 2 9999999 2 33 33 11111111111111 3 3 3 888888888888888888888888888888888888 44 0000000000000000 222222 888 88 3 888888 6666666 0 33 444 666666666666666 88888888 2 2 3 555 555 44444444 0 44 3 77777 2222 3 7777 3 44 3 3 11111 77 44 00 3 6 00000 88 6 22222 6666 44 11 3333333333333333 0000 3 3 77777777777 888888 555 999999999999999 1 3 6666 3 3 999 6 0000000000 3 3 0000000 3 0000000 3 3 3 3 6 55555555 6 44 2 2 2 2 000 2 2 2 5 5 33 2 33 2 3 6 6666666 6666 3 44 44 6 000 6 44 0 3 6 3 99999999999999999999999999999999999999 1 5 5 77 5 5
lowQualScore : . . . . ... . .. . . . . .. . . . . . . .. .. .. . .... . .. ....... . . .. .. .. ... . ... .. ... . . . ...... . ..... . .. . ... ... .. .. . ..... . . .. .. ..... . . .................................................. ..... ...... ... ... ... . . .. .. .................. . . . .. . . . .. . . . .. . . .. .. . .. . . . . . ............ .... . .. . .. .................... .. . . . . . ... .. ... ..... . . . . ...... . . . .. ................................................................................................................... ...... . ..... ... . . .. . . .. . . ....... . .. .. .............. . . . .................................... .. ................ ...... ... .. . ...... ....... . .. ... ............... ........ . . . ... ... ........ . .. . ..... .... . .... . .. . . ..... .. .. .. . . ..... .. . ..... .... .. .. ................ .... . . ........... ...... ... ............... . . .... . . ... . .......... . . ....... . ....... . . . . . ........ . .. . . . . ... . . . . . .. . .. . . . ....... .... . .. .. . ... . .. . . . . ...................................... . . . .. . .
lowQualScore : 3 0 5 5 333 7 77 7 0 7 9 22 7 7 9 9 9 9 99 22 22 2 8888 1 33 0000000 1 2 55 66 99 333 0 000 00 000 0 3 3 222222 4 33333 3 88 3 222 000 66 22 3 88888 2 1 22 33 77777 1 9 55555555555555555555555555555555555555555555555555 77777 777777 777 000 777 9 7 99 99 111111111111111111 9 9 9 99 9 9 7 44 1 1 1 22 9 9 99 99 7 77 7 7 3 7 3 777777777777 9999 1 22 3 00 66666666666666666666 22 1 1 1 1 1 555 22 444 11111 7 2 1 1 888888 2 1 7 66 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888888 2 77777 444 4 1 33 1 1 99 9 9 3333333 9 99 88 22222222222222 1 1 1 888888888888888888888888888888888888 22 4444444444444444 555555 555 55 1 888888 2222222 7 77 777 777777777777777 55555555 9 9 1 000 444 22222222 4 22 1 77777 8888 3 1111 1 22 1 1 99999 33 22 44 1 2 88888 55 2 33333 5555 22 55 6666666666666666 8888 5 1 77777777777 888888 444 222222222222222 5 1 5555 1 1 777 2 5555555555 1 1 0000000 1 0000000 1 1 1 1 2 11111111 2 22 9 9 7 7 777 7 7 7 3 3 77 7 99 9 1 2 2222222 5555 1 22 66 2 000 2 22 4 1 2 0 66666666666666666666666666666666666666 4 0 7 99 7 7
consensus : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AC---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTCCGACAGAT-----ATT-TTTAGGA-AC-GTGTCCGA-CAGAT-TTTTT--AGCTC-TTTCG-CCAACT
Reference ( family-3770 ) : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AC---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTCCGACAGATT----ATT-TTTAGGACAC-GTGTCCGA-CAGAT-TTTTT--AGCTC-TTTCG-CCAACT
gi|1 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGGCC-ACCGG--TGATCATCTGA--TA-AAAC-TTGA-TCGAATG-TCCAAG-AGT-TTT-A-GA-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-AAACTG-------T-GTCTGG-TAGA--TTTT---CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAATAAT-A-AA-TA--ATG-CGCATT-AC--TTATTCAAAA-GTT-G---TTTATT--T--TATTTTGCATA-----AC-AT-GA--AAAAAGT-----ATGAA-AATT-AT-------TT-----AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTTGTTC---CT---TATCAAACA-C--AAAA--T--------ACC-C-----GGAGAAT-T--TCAA-TTT-GGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CGCAGT-ATC--GAG---TTGG-GC-CGGC-G-A------------GTAAACA-T--GT--TCA--A-GA--TGTGGACAATTTTAGAAAT-----GGTCACAAA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AA-T-T---GC-TGC--A-TA-A------G-CTG-A-AA--A---C---A--CAGTGACAACAAAAAATAAAAGAA---------------A-------------CAAA-------AA----GG----------G--------TAGGACAGTTCTAACCAC------AGTTG-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-GCGC-------T-A--AT-GT--------------TTGGACA-A-TGATTCTCATTGATGTTTTAT------G--TGGCC--------A--TG----------------CAT--A---AAATCTT--T-AT------CAA-------CT-CA--AAAA---A---------------AA--------AA-CACAA
gi|1 : ag-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--ATTC-CAAC-TA---TC---TA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTAAC-GGATA----TTGTT--AAAAA-CCA-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T-----A----G--TC--TTCAGG---AT-------------CA--------A-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACCGAATCGG----TGATT-AAA-T------AGTT-----------------------------TATTT-----------TG-CCTACA-T--------------------TGTA-T--TTT-AC-AT---------GC-G-TT-T-TC-T---TTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAT-TTTTTGTT-ACT--TTTTTAGCA-A--TTTGATA-GGACAC--------------------TT-TT---------GT-CCCGA-CAGAA-TTTTT--AGCTC-TTTCG-CCAACTaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgattccaactatctaaacagttttgttaaaggttaacggatattgttaaaaaccaagtgcactcgctgatcatagtcttcaggatcaaatatcaaattgaaaccgaatcggtgattaaatagtttattttgcctacattgtattttacatgcgttttctttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtattttttgttacttttttagcaatttgataggacacttttgtcccgacagaatttttagctctttcgccaact
gi|10 : agagttggcgaaagacgccgggccaccggtgatcatctgataaaacttgatcgaatgtccaagagttttagaaaccaagccggacaaactgtgtctggtagattttcagaatatacaatattagtaaatcgttcaaataataaataatgcgcattacttattcaaaagttgtttattttattttgcataacatgaaaaaagtatgaaaattatttaatgtgattttttgttccttatcaaacacaaaatacccggagaatttcaatttggttctatgtgaagtttagtatatccgcagtatcgagttgggccggcgagtaaacatgttcaagatgtggacaattttagaaatggtcacaaagtcattaaaaagaaattgctgcataagctgaaaacacagtgacaacaaaaaataaaagaaacaaaaagggtaggacagttctaaccacagttggattaaagacagacaatgcgctaatgtttggacaatgattctcattgatgttttatgtggccatgcataaaatctttatcaactcaaaaaaaaaacacaaaacaaaaaaaaaaaa------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AATGT--------------ATG-ACG-A-TGGTTTTG----------TGC------C---------------A--TG----------------CAC--A---AA--TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---CCG--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTG-TTGA-TA----AT-TT--AAAAA-C-ATT---A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCC-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT------------GCG-T----AGA-ATATCAAAATCATTC------ATAAAAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTT--TTTTAACTTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-TATTGAATTG-A-T-CA-T-ATG-GA-T--T---GATATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG---TT-T-TG-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTATTGTT-AC---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTCCGACAG-------ATT-TTTAG
gi|11 : gTT-GGCGAA-A-GATGCCGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCA-ATG-TCCGAT-AGA-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTAT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AAATA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ACA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-TACT-ATNATTTGAT------AAC--A---TG-AAAAGTATGAATATTATTGTGATTTT-----T------TCT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCAGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-ctctttcgccaa
gi|12 : T-ATC--GAG-G-T------GCAGC-G-A------------GTAAAGA-T--GTG-GTA--A-GA--TGTGCCCAATTAAA----T-----CTTCA--GA-G-TCAT-TA-AA-A---TG--A---AAAT-C---GC-TACC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------AAG-----------CAAA-------AAGGTTAG----------GAAGTTTAAT-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAGA-GAA--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AG-CT--------------ATG-ACG-A-TGATACTCA---------TATGACATTT--TGTGTC-------A--TG----------------CAC--AC--A---TTT--TTAT------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA-----------------------------------------------G--TT-AG-G-----GTTG-T-GG-TA----AT-TT--CAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T---G-A----G--TC--TTCAAG---ACTCCATCAGGA-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT------------------------AT-CA----T---------T--GA-CA-TT--C----A--TG--A-A-ATTG-------TATTT----------------TACA-T-----------------------A-T--TTT------------GAT-G-G-TT-G-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-CAA--CTT-T
gi|13 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCT-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCTGAT-AGT-TTTCT-AGCAA--C--CA--A-G--T-CGGAC-A--CTT-------T-GTCC-G-TAAA---TTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-T-AA-AA--TTAATG---------TT-TTCAGAATGTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-ATGGA--AAA--GT-----ATGAA-AATTAAT-------T------AA---G---TG-ATTTT-------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-CAAAAAA--T--------GCC-------GGA-AATGT--TCAATTTTTGGTT-TCATA--GTGGA-A-GTT--TATGT-A-TATCCACG--GT-ATC--GAGAG-TGT--GCGCGGCAG-A------------GTAAACA-T--GT
gi|14 : gAGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCC--ACCG---CGATC-TCCGAATTA-AA-T-TTGG--CAA--G-TCCGA---GTATTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--TTCGGACCA--CTG-------T-GTC-GG--AAA--TTTTT--CAA-GAATATAACTAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-A--TA--ATAATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TT-AT---T--TATTT-G-ATAG----AC-AT-GAGAAAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---TTCTTTATCGAA-A-C--AAAAATT--------GCC-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-c
gi|15 : g-G--AA-C-CAAC-TAAT-TC---CA--------AAC-GTTTTG--TC-TAAA-----GTTA-T-TG-TA----AT-T---AGAAA-C-ACACATA--GTTCGCA--CT-CCGC-----TGA--TCATC---G-A--------T--TTCAGG---AT---------A-TGCAGT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAAC-GAAT-GG----TGTAA-AAA-T--AAGC--TT--T----A-TTGCTA-C-ATTGAATTTTGTATTTGA-T-------TGAA-AACA-T-G-T-GA-T--T---AAAATTGCA-TAATTT-AC-A-ATTATTGA--G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AG-TC-------G----T-TCC-T---TAGTTTTTTGTT-AC---TTTTTAGCA-AATTTTA-T----ACATTGTGTCCGGCCAATG----ATTATTTAAGGT-C-TTGTCTGC-CA
gi|16 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCG-CCC-AC-GG--CG-TC-TC-GA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCCGATCAGT-TTT-TTAG-AAAGC--CA--A-G--T-CGGAC-AA-CTG-------T-GTCCGGGTAAA--TTTTT--C---GAATATA--CAATCATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA--A--T-AATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TTTATC--T--TATTCTG-ATA-----AC-AT-GA--AAAA-GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-ATT---------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------GCC-------GGA-AAT-T--TCAA--TTTGGTTGTC-T--TGT-GA-A-GTT--TATGTAA-TAT---CG--GT-ATC--GAG-GTTTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-ac
gi|17 : TT-AT-------T------AATATG---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---TT--CT---TATCGAA---C--AAAA--TCCATTGGTACC-GACA--GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TCTTA-CGT-GA-ATGTT--TAT-T-A-TATA--CG--G--ATCGTGAG-G-TTT--GCGCGGC-G-A------------TT-AACAGTA-GTG-CCA--A-GA--TG-G--------------T-----GGTCA--AATA-TCAT-TATAATA---AGCAA---AAGT-A---GCTTGCC-A-GACA------G--TG---TA--A---C---A--C--------------------------------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AG--G-----GA---TTAAA-GACA-AG-A-C--AATCC-GC-------TAA--AA-GTG-------------ATG-ACA-T-TGATTCGCAT--------TCT------T--TGAGT--------A--TG----------------CAC--A---A----TT--T-GT------CAA-------AC-GA--AAAA---A---------------A
gi|18 : AT-ACAA-TT--TTACTGTATT--C--TT-TTCAAAA-GTTTA---TTTATT--T--TAATT-G-ATATCATAAC-AT-GG--AAA--GTTAAGTATGAA-AATT-AT-------TTGGCCTAAT------TG-A-----------------------TT-----TATATTTTTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAA---T--------AC--------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TAGGGT-GA-A-GTT--T-TGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTAG-GCGCGGC-T-A------------GTAAAGG-T---TGCCCA--A-AA--T-----------------T-----AGTCA--GA-G-TCAT-T------TTTAG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TATTATT-C---AGTT----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A
gi|19 : aa-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-AACGAG--TC--TTCAGG---AT------------GCGTT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GATT--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT-G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-AAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AC---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTATGTCCGAC-------------------------------A-CAGAT-TTTTT--AGCTC-TTTCT-CCAACTaaa
gi|2 : AGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-ACTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-CCGTGTCCAACAGATT-----TT-ATTA
gi|20 : gT-AC-ATATT-TTGATGA-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--TTT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-ACT--TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTCCGACAGAT------TT-TTTAGactttcttctctga
gi|21 : attggacattgcgtgtcagacagttgtagactggtacaattattccagggaagtctgcacctgtaatagtgtattctagaga-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAC-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--G------ATG-----TG-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACT-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-AGT-GA-A-GCT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-A-A------------GTAAAC-----GTG-CCA--A-GATGTGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AActctttcgccaactct
gi|22 : aCC-A-GA-G------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAGAATAAAGAACA-------------CAAAGGTTAGGAA----ATTTA-------A--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-CAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-CGATTCT-----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAATATA---------------AA---C-ACTAA-C-CAAT-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----
gi|23 : TATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---ATTATT--C--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GG--AGA--AT-----ATGAA-ATTC-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------TC--------AGA-ATT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CTT-GACG-GTTTATATGT-A-TATC--CG--AT-ATC--GAG-A-TTTG-GCGTGGC-G-A------------GTAAA
gi|24 : GTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCCTGTTGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCGAC-AGT-GTT-T-A--AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CCA-------T-GTCCAG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAA-AT-A-AA--A---TAATGTATT-A
gi|25 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCAAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGTAC-A----G-------T-G---AG-TGGA--TT
gi|25 : g------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-aaagacaagcaatggctaaatg
gi|26 : gagttggcgaaagacgccggcccaccggcgatctccgataaatttgatcgatgtccaatagtttttagaaccaagccgtacagtgTATT-TTAATAT-A-TT-T--C-T-ATCTA-ATCTG--G-CAA--ATT-TT-AT-GT-------G----TGTTC-T--GT--------------------TTGGCA-A--TCTA-TA-GGACACCGTGACCAGCAGATT----TTT-TTTtg
gi|27 : atctttgAGTT-GGCGAA-AAGACGCCGGCCC-ACCGGG-CGA-C-TC-GA--TA-AA-T-TTTA-TC-GA-G-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA-----CATTA-G----CGGAC-A--CTG-------T-GTTGGGTTAGAT-TTTTT--CA--GAATtagctcatttgccaattc
gi|28 : gCGAA-A-GACGCCAGAT--GCCAG--AGATC-TCTGG--TA-AA-TTTTAA-T----TG-TCGG-----------T-AA-AA--CTTCA--A-ACTC-TGGAT-A--CTGGACAAACT-GTCCGA--AGA--TATTG--CA--Gtat
gi|29 : gcAGTT-GGCGAA-A-GATGATGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TTTGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--
gi|3 : gAGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-ACTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-CCGTGTCCAACAGATT-----TT-ATTA
gi|30 : g-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACCTGGTACCGGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGactttcttctctga
gi|31 : attAGTT-GGTGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGA--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TT
gi|32 : agA-----AC-AT-GG--AAA--GT-----ATGAA-AAAT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCG
gi|33 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCAG--C
gi|4 : cagAGTT-GGTGAA-A-GACGC-GGCCC-ACCGGAGCGATC-TCCGA--CATAA-T-TTGA-TCAGATG--CCGCTTAGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGCT-A--CTG-------TTGTCCGG-TAGA--TTTTTTTCATGAAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--TACATCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-ACGTCT-TTCAAAA-GTT-GG--TTTATC--T--TATTC-A-ATA-----AC-AT--A--AAA--GT-----A-GAATAATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---C---TT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GAA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-AA-A-GTT--T-TGT-A-TA----CG--GT-ATC--AAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------G-AAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A-----------------------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-AC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----A-A-ATAT---------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--AA-CAGTT--T----A-TTGCTA-T-ATTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GT-CG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AC---TTATCAGCA-N--NNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNATTAGCAATT-TCTAGGACACTGTGTCCGA-CAGAT-TTTTT--AGCTC-TTTCG-CCAACT
gi|5 : TT-GGCGAA-A-GACGCCTGCCC-ACCGG----ATC-TCC-A--TA-AA-TATTGAATC-GATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C--GGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTC--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---CCAAAAAATCA-AA------TAATGTATT-AC--TT-TTCAAAG-GTT-ATTCTTTA-C--TGATATT----ATA-----AC-AT-G---GAA--GT-----ATGAA-AATT-ATTAGGCC-T------AAT--G---TGAA-----------------------TTTATTAT------TTT---T---CT---TATCG-A-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----G---AAT-T--TCAG--TTTGGTT-TC-TA-CGT-G--A-GAT--TATA-----ATC--CG--GT-ATC--GAG-G--TTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA----GTG-CCA--A-AA--------------------T-----GGTCA--GA-G-TCAT-T---T-T---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-TA-A------G-CCG-A-TA--A---TCAGA--A----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AA----------A--------A-------------AAAC------AAA-A-----AA-----AAA-AAA--AGAA-CAAAAA-G-GT-------T-AGGAA-GTTTAATGGCTAAAGTATG-ATG-A-TGATACT-----------TAT------TGATGTTTTGTGTGCCG--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------TAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---TGG--AA-C-CAACATA---T----CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----AT---T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----ATTAT--ACA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---C-A----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATATCAAATA---TCATTCATA---AAT---------------T-AAATTGAAT--G----TGTTA-AGA-T--AA-CA-CT--T----A-TTG-TA-C-ATTG-------TA-TTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T-------AAGTTGCA----TTT-AC-AT-TT-TTGATGG-T-TTGT-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-
gi|6 : agcTGT-AATATC--CG--GTTATC--GAG-G-TTTG-G-GCGGC-G-GAGGGCGTGGGAGGTAAACA-TTTGTG-CCA--AAGA--TGTG--------------TTTCGTGGTCA--AA-GGTCAAATA-AA-A---AA--AGAAAAGTGT---GC-TGCC-AAGA-AATTTTTG-ATA-A-TA--A---C---A--CTTCAAAAAAATG----------A---------------A-------------CAAA-------AATA--AT-------------------T-------------CCAC------AGTTG-----GAATATTAAA-GACCAGG-A-C--AAT-G-GCCACGCCCT-A--AA-GT--------------ATG-ACGTA-TGATTCTC-----------AT------T--TG-----------GATTG----------------CACA-A---A---ATT--T-GT------CAA-------CC-AACCAAAA---A---------------AA---
gi|6 : tgcat-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TCTTCCA--------AACAAGTTTGGTTT-AAAGCGTTTATTA-T-GG-TACTAAAT-TT--AAAAAAC-A-----AA-GT--GCA--CT-CCGC-----TGA--TCAAC---G-A----GGTCC--TTCAGG-----------------GCAGTTATGAGATATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GGATTGTATTA-AAAAT--AAACAGTT--T----A-TTGCTAAC-ATTG-------TATTTGAAT-------TG-A-TACA-TTGTT-GA-T--TTTAAAAACTGCA-T--TTTTAC--TATA-TTGATGGTG-TT-T-TTGT-ATTTT-GTCCGTGG-CAATTATT-TTTAA-GT-------G----TGTTC-TTGATAG-TTTTTGTTTACCTTTTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTC------ATG----A------AGGA-AC-G-----GA-TTTATCTTTTT--TGCCC-TTTCGCCCAACTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgaaccaactatcttccaaacaagtttggtttaaagcgtttattatggtactaaatttaaaaaacaaagtgcactccgctgatcaacgaggtccttcagggcagttatgagatatatcaaattgaaactgaatggattgtattaaaaataaacagtttattgctaacattgtatttgaattgatacattgttgattttaaaaactgcatttttactatattgatggtgtttttgtattttgtccgtggcaattatttttaagtgtgttcttgatagtttttgtttacctttttttagcaatttgtaggacactgtgtcatgaaggaacggatttatcttttttgccctttcgcccaactct
gi|7 : tgcattgtaatatccggttatcgaggtttgggcggcggagggcgtgggaggtaaacatttgtgccaaagatgtgtttcgtggtcaaaggtcaaataaaaaaagaaaagtgtgctgccaagaaatttttgataataacacttcaaaaaaatgaacaaaaataattccacagttggaatattaaagaccaggacaatggccacgccctaaagtatgacgtatgattctcatttggattgcacaaaatttgtcaaccaaccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---A---A---AAGT-T---GC-TGCCCA-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAAAATAACAGA-A-------------CAAAGGTTAGGAA----GTTTTAC-----A--------T-------------CCACTGTGACAGT-T-----GA---TTAAGCGAC--A---------T-G-G----------A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TG---TTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GTACACTACAAAAAAAACCA-AA--AAAA---A---------------AA---C-A--AA-C-CAAC-GA---AC---CAAACTCTACAACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTT--T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAACCT-C-GCT----TGA--TTC-C---GAA----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----T-TTACAAA-T--GA-CAGTT--T------TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TAC--T-GTT-GATT--T---CAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--GACAA--TTTATT-AA-GTTGTGCACG----TGGTC-T--GTAG-TTTTTGTT-AC---TTTTTCGCA-A--TTTG-TA-GGA-----------ACA------------CTTAG------ATGTCGAA-CAGAT-TTTTT--AGCTC-TTTCG-CCAACTct
gi|8 : TCA--AA-G--CAT-TA-AG-A---A---A---AAGT-T---GCCTGAC-A-GA-A------G-CTGTA-TA--ATCAC---A--C----------------------A---------------AATAAAATAAAGAACAAA-------AA----GTTAGGAAGTTTA--------T-------------CCAC------TGT-GACATTGA---TTAAA-GAC--AG-AAC--AAT-T-GC-------A-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC-----------AT------T--GG-----------A--TG----------------CAC--AAACA---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAA---AAACCAAAAAAAAAACAA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACCATTTTG--TTAAAAG-----GTTA-T-GG-TA----TT-TTAAAAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TCT-TTCAGG---AT-----------TGC-GT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT--G----TGTTA-AAA-T--GA-CAG-T--T----A--TGC-A-CAATTG-------TATTTTG-T-------T--A-TACACT-GTT-GA-TTGT---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT---G-TT-TATC-T-ATTTG-GTCTG--G-ACA--ATT-TT-AA-GT-------GTCACTGTCCTT--GTA--TTTTTGTT-AC----TTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACAC------------------------TTAGAG--------CCGACCAGAT-TTTTTTAGGCTC-TTTCG-CCAACTct
gi|9 : --AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ATG-AATGATTTTC-----------AT------T--TG-----------A--TGTTCTTGTGTGCCGTGCCA---A---A---TTT--T-G-------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA---T-GG-AA-C-CATC-TA---TC---TAG-------AACAGTTTTG--------------ATT-------TA----CT-TT--TAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CTGC-GCGGCATTGA--TCA-CTAAC-A----G--T------AGGTACAG---------A-TGCAGTTA--GGA-ATAA---------TC------A---AATATCATTCATAAAATGTGAAATTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTTTAT----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-ACAATATT-TTGATGG----T-T-TC-T--TTTG-GTCCG--G--AA--ATT-TT-AA----------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTTAAC---TTTTT--------T----TA-GGA----------------------ATT-TTTAGGACACTGTGTCCGA-CAGAT-TTTTT--AGCTCTTTTCG-CCAACc
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 22 1111111 11 222 11 1 222222 111 11 11111 55555555555555555555555555555555555555555555555555 111 222222222222222222 111111111111 1111 44444444444444444444 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222222222 333333333333333333333333333333333333 2222222222222222 222222 1111111 1 111111111111111 11111111 111 11111111 1111 11111 11 11111 11111 11 3333333333333333 1111 33333333333 111111111111111 1111111111 1111111 1111111 11111111 111 1111111 222 33333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 5 5 2 2 666 2 33 2 8 0 2 33 5 5 2 2 2 2 33 44 44 6 4444 3 77 0000000 3 6 11 44 77 666 4 888 11 777 0 3 3 111111 0 77777 3 55 3 999 000 44 00 3 00000 6 3 44 77 77777 3 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444 66666 777777 444 222 444 2 5 33 33 555555555555555555 1 2 2 77 2 2 5 33 3 3 3 44 2 2 33 33 2 33 2 2 5 2 5 333333333333 2222 3 99 3 55 44444444444444444444 44 3 3 3 3 3 333 44 555 55555 6 9 3 3 888888 6 3 6 44 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 888888 6 77777 555 0 3 77 3 3 33 2 2 9999999 2 33 33 11111111111111 3 3 3 888888888888888888888888888888888888 44 0000000000000000 222222 888 88 3 888888 6666666 0 33 444 666666666666666 88888888 2 2 3 555 555 44444444 0 44 3 77777 2222 3 7777 3 44 3 3 11111 77 44 00 3 6 00000 88 6 22222 6666 44 11 3333333333333333 0000 3 3 77777777777 888888 555 999999999999999 1 3 6666 3 3 999 6 0000000000 3 3 0000000 3 0000000 3 3 3 3 6 55555555 6 44 2 2 2 2 000 2 2 2 5 5 33 2 33 2 3 6 6666666 6666 3 44 44 3 555 000 6 44 3 6 1 11111111111111111111111111111111111111111 4 5 66 5
lowQualScore : . . . . ... . .. . . . . .. . . . . . . .. .. .. . .... . .. ....... . . .. .. .. ... . ... .. ... . . . ...... . ..... . .. . ... ... .. .. . ..... . . .. .. ..... . . .................................................. ..... ...... ... ... ... . . .. .. .................. . . . .. . . . .. . . . .. . . .. .. . .. . . . . . ............ .... . .. . .. .................... .. . . . . . ... .. ... ..... . . . . ...... . . . .. ................................................................................................................... ...... . ..... ... . . .. . . .. . . ....... . .. .. .............. . . . .................................... .. ................ ...... ... .. . ...... ....... . .. ... ............... ........ . . . ... ... ........ . .. . ..... .... . .... . .. . . ..... .. .. .. . . ..... .. . ..... .... .. .. ................ .... . . ........... ...... ... ............... . . .... . . ... . .......... . . ....... . ....... . . . . . ........ . .. . . . . ... . . . . . .. . .. . . . ....... .... . .. .. . ... ... . .. . . . ......................................... . . .. .
lowQualScore : 3 0 5 5 333 7 77 7 0 7 9 22 7 7 9 9 9 9 99 22 22 2 8888 1 33 0000000 1 2 55 66 99 333 0 000 00 000 0 3 3 222222 4 33333 3 88 3 222 000 66 22 3 88888 2 1 22 33 77777 1 9 55555555555555555555555555555555555555555555555555 77777 777777 777 000 777 9 7 99 99 111111111111111111 9 9 9 99 9 9 7 44 1 1 1 22 9 9 99 99 7 77 7 7 3 7 3 777777777777 9999 1 22 3 00 66666666666666666666 22 1 1 1 1 1 555 22 444 11111 7 2 1 1 888888 2 1 7 66 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888888 2 77777 444 4 1 33 1 1 99 9 9 3333333 9 99 88 22222222222222 1 1 1 888888888888888888888888888888888888 22 4444444444444444 555555 555 55 1 888888 2222222 7 77 777 777777777777777 55555555 9 9 1 000 444 22222222 4 22 1 77777 8888 3 1111 1 22 1 1 99999 33 22 44 1 2 88888 55 2 33333 5555 22 55 6666666666666666 8888 5 1 77777777777 888888 444 222222222222222 5 1 5555 1 1 777 2 5555555555 1 1 0000000 1 0000000 1 1 1 1 2 11111111 2 22 9 9 7 7 777 7 7 7 3 3 77 7 99 9 1 2 2222222 5555 1 22 66 1 444 000 2 22 1 2 2 66666666666666666666666666666666666666666 4 0 99 0
consensus : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTC-CGACAGAT------TT-TTTAGG-----GTGTCCGA-CAGAT-TTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
Reference ( family-3770 ) : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTC-CGACAGAT-----ATT-TTTAGGA-AC-GTGTCCGA-CAGAT-TTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
gi|1 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGGCC-ACCGG--TGATCATCTGA--TA-AAAC-TTGA-TCGAATG-TCCAAG-AGT-TTT-A-GA-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-AAACTG-------T-GTCTGG-TAGA--TTTT---CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAATAAT-A-AA-TA--ATG-CGCATT-AC--TTATTCAAAA-GTT-G---TTTATT--T--TATTTTGCATA-----AC-AT-GA--AAAAAGT-----ATGAA-AATT-AT-------TT-----AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTTGTTC---CT---TATCAAACA-C--AAAA--T--------ACC-C-----GGAGAAT-T--TCAA-TTT-GGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CGCAGT-ATC--GAG---TTGG-GC-CGGC-G-A------------GTAAACA-T--GT--TCA--A-GA--TGTGGACAATTTTAGAAAT-----GGTCACAAA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AA-T-T---GC-TGC--A-TA-A------G-CTG-A-AA--A---C---A--CAGTGACAACAAAAAATAAAAGAA---------------A-------------CAAA-------AA----GG----------G--------TAGGACAGTTCTAACCAC------AGTTG-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-GCGC-------T-A--AT-GT--------------TTGGACA-A-TGATTCTCATTGATGTTTTAT------G--TGGCC--------A--TG----------------CAT--A---AAATCTT--T-AT------CAA-------CT-CA--AAAA---A---------------AA--------AA-CACAA
gi|1 : ag-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--ATTC-CAAC-TA---TC---TA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTAAC-GGATA----TTGTT--AAAAA-CCA-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T-----A----G--TC--TTCAGG---AT-------------CA--------A-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACCGAATCGG----TGATT-AAA-T------AGTT-----------------------------TATTT-----------TG-CCTACA-T--------------------TGTA-T--TTT-AC-AT---------GC-G-TT-T-TC-T---TTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAT-TTTTTGTT-A---CT--TTTTTAGCA-A--TTTGATA-GGACAC---------------------TT-TT---------GT-CCCGA-CAGAA-TTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACTaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgattccaactatctaaacagttttgttaaaggttaacggatattgttaaaaaccaagtgcactcgctgatcatagtcttcaggatcaaatatcaaattgaaaccgaatcggtgattaaatagtttattttgcctacattgtattttacatgcgttttctttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtattttttgttacttttttagcaatttgataggacacttttgtcccgacagaatttttagctctttcgccaact
gi|10 : agagttggcgaaagacgccgggccaccggtgatcatctgataaaacttgatcgaatgtccaagagttttagaaaccaagccggacaaactgtgtctggtagattttcagaatatacaatattagtaaatcgttcaaataataaataatgcgcattacttattcaaaagttgtttattttattttgcataacatgaaaaaagtatgaaaattatttaatgtgattttttgttccttatcaaacacaaaatacccggagaatttcaatttggttctatgtgaagtttagtatatccgcagtatcgagttgggccggcgagtaaacatgttcaagatgtggacaattttagaaatggtcacaaagtcattaaaaagaaattgctgcataagctgaaaacacagtgacaacaaaaaataaaagaaacaaaaagggtaggacagttctaaccacagttggattaaagacagacaatgcgctaatgtttggacaatgattctcattgatgttttatgtggccatgcataaaatctttatcaactcaaaaaaaaaacacaaaacaaaaaaaaaaaa------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AATGT--------------ATG-ACG-A-TGGTTTTG----------TGC------C---------------A--TG----------------CAC--A---AA--TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---CCG--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTG-TTGA-TA----AT-TT--AAAAA-C-ATT---A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCC-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT------------GCG-T----AGA-ATATCAAAATCATTC------ATAAAAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTT--TTTTAACTTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-TATTGAATTG-A-T-CA-T-ATG-GA-T--T---GATATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG---TT-T-TG-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTATTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTC-CGACAGAT------------------------------------TTTT--AGCTCTTTCG-CCAA
gi|11 : gTT-GGCGAA-A-GATGCCGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCA-ATG-TCCGAT-AGA-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTAT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AAATA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ACA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-TACT-ATNATTTGAT------AAC--A---TG-AAAAGTATGAATATTATTGTGATTTT-----T------TCT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCAGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-
gi|12 : T-ATC--GAG-G-T------GCAGC-G-A------------GTAAAGA-T--GTG-GTA--A-GA--TGTGCCCAATTAAA----T-----CTTCA--GA-G-TCAT-TA-AA-A---TG--A---AAAT-C---GC-TACC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------AAG-----------CAAA-------AAGGTTAG----------GAAGTTTAAT-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAGA-GAA--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AG-CT--------------ATG-ACG-A-TGATACTCA---------TATGACATTT--TGTGTC-------A--TG----------------CAC--AC--A---TTT--TTAT------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA-----------------------------------------------G--TT-AG-G-----GTTG-T-GG-TA----AT-TT--CAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T---G-A----G--TC--TTCAAG---ACTCCATCAGGA-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT------------------------AT-CA----T---------T--GA-CA-TT--C----A--TG--A-A-ATTG-------TATTT----------------TACA-T-----------------------A-T--TTT------------GAT-G-G-TT-G-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-CAA--CTT-T
gi|13 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCT-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCTGAT-AGT-TTTCT-AGCAA--C--CA--A-G--T-CGGAC-A--CTT-------T-GTCC-G-TAAA---TTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-T-AA-AA--TTAATG---------TT-TTCAGAATGTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-ATGGA--AAA--GT-----ATGAA-AATTAAT-------T------AA---G---TG-ATTTT-------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-CAAAAAA--T--------GCC-------GGA-AATGT--TCAATTTTTGGTT-TCATA--GTGGA-A-GTT--TATGT-A-TATCCACG--GT-ATC--GAGAG-TGT--GCGCGGCAG-A------------GTAAACA-T--GT
gi|14 : gAGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCC--ACCG---CGATC-TCCGAATTA-AA-T-TTGG--CAA--G-TCCGA---GTATTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--TTCGGACCA--CTG-------T-GTC-GG--AAA--TTTTT--CAA-GAATATAACTAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-A--TA--ATAATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TT-AT---T--TATTT-G-ATAG----AC-AT-GAGAAAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---TTCTTTATCGAA-A-C--AAAAATT--------GCC-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-c
gi|15 : g-G--AA-C-CAAC-TAAT-TC---CA--------AAC-GTTTTG--TC-TAAA-----GTTA-T-TG-TA----AT-T---AGAAA-C-ACACATA--GTTCGCA--CT-CCGC-----TGA--TCATC---G-A--------T--TTCAGG---AT---------A-TGCAGT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAAC-GAAT-GG----TGTAA-AAA-T--AAGC--TT--T----A-TTGCTA-C-ATTGAATTTTGTATTTGA-T-------TGAA-AACA-T-G-T-GA-T--T---AAAATTGCA-TAATTT-AC-A-ATTATTGA--G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AG-TC-------G----T-TCC-T---TAGTTTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-AATTTTA-T----ACATTGTGTC-CGGCCAATG----ATTATTTAAGG-TC-TTGTCTGC-CA
gi|16 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCG-CCC-AC-GG--CG-TC-TC-GA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCCGATCAGT-TTT-TTAG-AAAGC--CA--A-G--T-CGGAC-AA-CTG-------T-GTCCGGGTAAA--TTTTT--C---GAATATA--CAATCATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA--A--T-AATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TTTATC--T--TATTCTG-ATA-----AC-AT-GA--AAAA-GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-ATT---------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------GCC-------GGA-AAT-T--TCAA--TTTGGTTGTC-T--TGT-GA-A-GTT--TATGTAA-TAT---CG--GT-ATC--GAG-GTTTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-ac
gi|17 : TT-AT-------T------AATATG---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---TT--CT---TATCGAA---C--AAAA--TCCATTGGTACC-GACA--GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TCTTA-CGT-GA-ATGTT--TAT-T-A-TATA--CG--G--ATCGTGAG-G-TTT--GCGCGGC-G-A------------TT-AACAGTA-GTG-CCA--A-GA--TG-G--------------T-----GGTCA--AATA-TCAT-TATAATA---AGCAA---AAGT-A---GCTTGCC-A-GACA------G--TG---TA--A---C---A--C--------------------------------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AG--G-----GA---TTAAA-GACA-AG-A-C--AATCC-GC-------TAA--AA-GTG-------------ATG-ACA-T-TGATTCGCAT--------TCT------T--TGAGT--------A--TG----------------CAC--A---A----TT--T-GT------CAA-------AC-GA--AAAA---A---------------A
gi|18 : AT-ACAA-TT--TTACTGTATT--C--TT-TTCAAAA-GTTTA---TTTATT--T--TAATT-G-ATATCATAAC-AT-GG--AAA--GTTAAGTATGAA-AATT-AT-------TTGGCCTAAT------TG-A-----------------------TT-----TATATTTTTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAA---T--------AC--------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TAGGGT-GA-A-GTT--T-TGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTAG-GCGCGGC-T-A------------GTAAAGG-T---TGCCCA--A-AA--T-----------------T-----AGTCA--GA-G-TCAT-T------TTTAG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TATTATT-C---AGTT----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A
gi|19 : aa-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-AACGAG--TC--TTCAGG---AT------------GCGTT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GATT--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT-G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-AAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTATGTC-CGAC-------------------------------A-CAGAT-TTTTT--AGCTCTTTCT-CCAACTaaa
gi|2 : AGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-A---CTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-CCGTGTC-CAACAGAT-----TTT-ATTA
gi|20 : gT-AC-ATATT-TTGATGA-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--TTT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---CT--TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTG----------------------------------TGTCCGA-CAGAT-TTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACTactttcttctctga
gi|21 : attggacattgcgtgtcagacagttgtagactggtacaattattccagggaagtctgcacctgtaatagtgtattctagaga-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAC-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--G------ATG-----TG-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACT-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-AGT-GA-A-GCT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-A-A------------GTAAAC-----GTG-CCA--A-GATGTGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAct
gi|22 : aCC-A-GA-G------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAGAATAAAGAACA-------------CAAAGGTTAGGAA----ATTTA-------A--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-CAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-CGATTCT-----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAATATA---------------AA---C-ACTAA-C-CAAT-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----
gi|23 : TATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---ATTATT--C--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GG--AGA--AT-----ATGAA-ATTC-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------TC--------AGA-ATT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CTT-GACG-GTTTATATGT-A-TATC--CG--AT-ATC--GAG-A-TTTG-GCGTGGC-G-A------------GTAAA
gi|24 : GTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCCTGTTGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCGAC-AGT-GTT-T-A--AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CCA-------T-GTCCAG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAA-AT-A-AA--A---TAATGTATT-A
gi|25 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCAAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGTAC-A----G-------T-G---AG-TGGA--TT
gi|25 : g------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-aaagacaagcaatggctaaatg
gi|26 : gagttggcgaaagacgccggcccaccggcgatctccgataaatttgatcgatgtccaatagtttttagaaccaagccgtacagtgTATT-TTAATAT-A-TT-T--C-T-ATCTA-ATCTG--G-CAA--ATT-TT-AT-GT-------G----TGTTC-T--GT-----------------------TTGGCA-A--TCTA-TA-GGACACCGTGAC-CAGCAGAT-----TTT-TTTtg
gi|27 : atctttgAGTT-GGCGAA-AAGACGCCGGCCC-ACCGGG-CGA-C-TC-GA--TA-AA-T-TTTA-TC-GA-G-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA-----CATTA-G----CGGAC-A--CTG-------T-GTTGGGTTAGAT-TTTTT--CA--GAATttagctcatttgccaattc
gi|28 : gCGAA-A-GACGCCAGAT--GCCAG--AGATC-TCTGG--TA-AA-TTTTAA-T----TG-TCGG-----------T-AA-AA--CTTCA--A-ACTC-TGGAT-A--CTGGACAAACT-GTCCGA--AGA--TATTG--CA--Gtat
gi|29 : gcAGTT-GGCGAA-A-GATGATGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TTTGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--
gi|3 : gAGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-A---CTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-CCGTGTC-CAACAGAT-----TTT-ATTA
gi|30 : g-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACCTGGTACCGGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGactttcttctctga
gi|31 : attAGTT-GGTGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGA--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TT
gi|32 : agA-----AC-AT-GG--AAA--GT-----ATGAA-AAAT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCG
gi|33 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCAG--C
gi|4 : cagAGTT-GGTGAA-A-GACGC-GGCCC-ACCGGAGCGATC-TCCGA--CATAA-T-TTGA-TCAGATG--CCGCTTAGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGCT-A--CTG-------TTGTCCGG-TAGA--TTTTTTTCATGAAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--TACATCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-ACGTCT-TTCAAAA-GTT-GG--TTTATC--T--TATTC-A-ATA-----AC-AT--A--AAA--GT-----A-GAATAATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---C---TT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GAA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-AA-A-GTT--T-TGT-A-TA----CG--GT-ATC--AAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------G-AAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A-----------------------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-AC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----A-A-ATAT---------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--AA-CAGTT--T----A-TTGCTA-T-ATTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GT-CG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTATCAGCA-N--NNNN-NN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNNATTAGCAATT-TCTAGGACACTGTGTCCGA-CAGAT-TTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
gi|5 : TT-GGCGAA-A-GACGCCTGCCC-ACCGG----ATC-TCC-A--TA-AA-TATTGAATC-GATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C--GGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTC--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---CCAAAAAATCA-AA------TAATGTATT-AC--TT-TTCAAAG-GTT-ATTCTTTA-C--TGATATT----ATA-----AC-AT-G---GAA--GT-----ATGAA-AATT-ATTAGGCC-T------AAT--G---TGAA-----------------------TTTATTAT------TTT---T---CT---TATCG-A-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----G---AAT-T--TCAG--TTTGGTT-TC-TA-CGT-G--A-GAT--TATA-----ATC--CG--GT-ATC--GAG-G--TTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA----GTG-CCA--A-AA--------------------T-----GGTCA--GA-G-TCAT-T---T-T---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-TA-A------G-CCG-A-TA--A---TCAGA--A----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AA----------A--------A-------------AAAC------AAA-A-----AA-----AAA-AAA--AGAA-CAAAAA-G-GT-------T-AGGAA-GTTTAATGGCTAAAGTATG-ATG-A-TGATACT-----------TAT------TGATGTTTTGTGTGCCG--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------TAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---TGG--AA-C-CAACATA---T----CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----AT---T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----ATTAT--ACA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---C-A----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATATCAAATA---TCATTCATA---AAT---------------T-AAATTGAAT--G----TGTTA-AGA-T--AA-CA-CT--T----A-TTG-TA-C-ATTG-------TA-TTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T-------AAGTTGCA----TTT-AC-AT-TT-TTGATGG-T-TTGT-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-
gi|6 : agcTGT-AATATC--CG--GTTATC--GAG-G-TTTG-G-GCGGC-G-GAGGGCGTGGGAGGTAAACA-TTTGTG-CCA--AAGA--TGTG--------------TTTCGTGGTCA--AA-GGTCAAATA-AA-A---AA--AGAAAAGTGT---GC-TGCC-AAGA-AATTTTTG-ATA-A-TA--A---C---A--CTTCAAAAAAATG----------A---------------A-------------CAAA-------AATA--AT-------------------T-------------CCAC------AGTTG-----GAATATTAAA-GACCAGG-A-C--AAT-G-GCCACGCCCT-A--AA-GT--------------ATG-ACGTA-TGATTCTC-----------AT------T--TG-----------GATTG----------------CACA-A---A---ATT--T-GT------CAA-------CC-AACCAAAA---A---------------AA---
gi|6 : tgcat-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TCTTCCA--------AACAAGTTTGGTTT-AAAGCGTTTATTA-T-GG-TACTAAAT-TT--AAAAAAC-A-----AA-GT--GCA--CT-CCGC-----TGA--TCAAC---G-A----GGTCC--TTCAGG-----------------GCAGTTATGAGATATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GGATTGTATTA-AAAAT--AAACAGTT--T----A-TTGCTAAC-ATTG-------TATTTGAAT-------TG-A-TACA-TTGTT-GA-T--TTTAAAAACTGCA-T--TTTTAC--TATA-TTGATGGTG-TT-T-TTGT-ATTTT-GTCCGTGG-CAATTATT-TTTAA-GT-------G----TGTTC-TTGATAG-TTTTTGTTTA---CCTTTTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTCATGA-----------------AGGA-AC-G-----GA-TTTATCTTTTT--TGCCCTTTCGCCCAACTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgaaccaactatcttccaaacaagtttggtttaaagcgtttattatggtactaaatttaaaaaacaaagtgcactccgctgatcaacgaggtccttcagggcagttatgagatatatcaaattgaaactgaatggattgtattaaaaataaacagtttattgctaacattgtatttgaattgatacattgttgattttaaaaactgcatttttactatattgatggtgtttttgtattttgtccgtggcaattatttttaagtgtgttcttgatagtttttgtttacctttttttagcaatttgtaggacactgtgtcatgaaggaacggatttatcttttttgccctttcgcccaactct
gi|7 : tgcattgtaatatccggttatcgaggtttgggcggcggagggcgtgggaggtaaacatttgtgccaaagatgtgtttcgtggtcaaaggtcaaataaaaaaagaaaagtgtgctgccaagaaatttttgataataacacttcaaaaaaatgaacaaaaataattccacagttggaatattaaagaccaggacaatggccacgccctaaagtatgacgtatgattctcatttggattgcacaaaatttgtcaaccaaccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---A---A---AAGT-T---GC-TGCCCA-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAAAATAACAGA-A-------------CAAAGGTTAGGAA----GTTTTAC-----A--------T-------------CCACTGTGACAGT-T-----GA---TTAAGCGAC--A---------T-G-G----------A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TG---TTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GTACACTACAAAAAAAACCA-AA--AAAA---A---------------AA---C-A--AA-C-CAAC-GA---AC---CAAACTCTACAACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTT--T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAACCT-C-GCT----TGA--TTC-C---GAA----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----T-TTACAAA-T--GA-CAGTT--T------TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TAC--T-GTT-GATT--T---CAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--GACAA--TTTATT-AA-GTTGTGCACG----TGGTC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTCGCA-A--TTTG-TA-GGA------------ACA------------CTTAG------ATGTCGAA-CAGAT-TTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACTct
gi|8 : TCA--AA-G--CAT-TA-AG-A---A---A---AAGT-T---GCCTGAC-A-GA-A------G-CTGTA-TA--ATCAC---A--C----------------------A---------------AATAAAATAAAGAACAAA-------AA----GTTAGGAAGTTTA--------T-------------CCAC------TGT-GACATTGA---TTAAA-GAC--AG-AAC--AAT-T-GC-------A-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC-----------AT------T--GG-----------A--TG----------------CAC--AAACA---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAA---AAACCAAAAAAAAAACAA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACCATTTTG--TTAAAAG-----GTTA-T-GG-TA----TT-TTAAAAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TCT-TTCAGG---AT-----------TGC-GT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT--G----TGTTA-AAA-T--GA-CAG-T--T----A--TGC-A-CAATTG-------TATTTTG-T-------T--A-TACACT-GTT-GA-TTGT---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT---G-TT-TATC-T-ATTTG-GTCTG--G-ACA--ATT-TT-AA-GT-------GTCACTGTCCTT--GTA--TTTTTGTT-A---C----TTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACAC-------------------------TTAGAG--------CCGACCAGAT-TTTTTTAGGCTCTTTCG-CCAACTct
gi|9 : --AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ATG-AATGATTTTC-----------AT------T--TG-----------A--TGTTCTTGTGTGCCGTGCCA---A---A---TTT--T-G-------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA---T-GG-AA-C-CATC-TA---TC---TAG-------AACAGTTTTG--------------ATT-------TA----CT-TT--TAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CTGC-GCGGCATTGA--TCA-CTAAC-A----G--T------AGGTACAG---------A-TGCAGTTA--GGA-ATAA---------TC------A---AATATCATTCATAAAATGTGAAATTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTTTAT----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-ACAATATT-TTGATGG----T-T-TC-T--TTTG-GTCCG--G--AA--ATT-TT-AA----------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AACTT---TTTTTAGGA-A--TTTT-TA-GGACACTGTGTC-CGACAGAT------TT-TTTAGc
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 22 1111111 11 222 11 1 222222 111 11 11111 55555555555555555555555555555555555555555555555555 111 222222222222222222 111111111111 1111 44444444444444444444 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222222222 333333333333333333333333333333333333 2222222222222222 222222 1111111 1 111111111111111 11111111 111 11111111 1111 11111 11 11111 11111 11 3333333333333333 1111 33333333333 111111111111111 1111111111 1111111 1111111 11111111 111 1111111 222 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 5 5 2 2 666 2 33 2 8 0 2 33 5 5 2 2 2 2 33 44 44 6 4444 3 77 0000000 3 6 11 44 77 666 4 888 11 777 0 3 3 111111 0 77777 3 55 3 999 000 44 00 3 00000 6 3 44 77 77777 3 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444 66666 777777 444 222 444 2 5 33 33 555555555555555555 1 2 2 77 2 2 5 33 3 3 3 44 2 2 33 33 2 33 2 2 5 2 5 333333333333 2222 3 99 3 55 44444444444444444444 44 3 3 3 3 3 333 44 555 55555 6 9 3 3 888888 6 3 6 44 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 888888 6 77777 555 0 3 77 3 3 33 2 2 9999999 2 33 33 11111111111111 3 3 3 888888888888888888888888888888888888 44 0000000000000000 222222 888 88 3 888888 6666666 0 33 444 666666666666666 88888888 2 2 3 555 555 44444444 0 44 3 77777 2222 3 7777 3 44 3 3 11111 77 44 00 3 6 00000 88 6 22222 6666 44 11 3333333333333333 0000 3 3 77777777777 888888 555 999999999999999 1 3 6666 3 3 999 6 0000000000 3 3 0000000 3 0000000 3 3 3 3 6 55555555 6 44 2 2 2 2 000 2 2 2 5 5 33 2 33 2 3 6 6666666 6666 3 44 44 3 555 000 6 44 3 6 1 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222 66 4
lowQualScore : . . . . ... . .. . . . . .. . . . . . . .. .. .. . .... . .. ....... . . .. .. .. ... . ... .. ... . . . ...... . ..... . .. . ... ... .. .. . ..... . . .. .. ..... . . .................................................. ..... ...... ... ... ... . . .. .. .................. . . . .. . . . .. . . . .. . . .. .. . .. . . . . . ............ .... . .. . .. .................... .. . . . . . ... .. ... ..... . . . . ...... . . . .. ................................................................................................................... ...... . ..... ... . . .. . . .. . . ....... . .. .. .............. . . . .................................... .. ................ ...... ... .. . ...... ....... . .. ... ............... ........ . . . ... ... ........ . .. . ..... .... . .... . .. . . ..... .. .. .. . . ..... .. . ..... .... .. .. ................ .... . . ........... ...... ... ............... . . .... . . ... . .......... . . ....... . ....... . . . . . ........ . .. . . . . ... . . . . . .. . .. . . . ....... .... . .. .. . ... ... . .. . . . ....................................................... .. .
lowQualScore : 3 0 5 5 333 7 77 7 0 7 9 22 7 7 9 9 9 9 99 22 22 2 8888 1 33 0000000 1 2 55 66 99 333 0 000 00 000 0 3 3 222222 4 33333 3 88 3 222 000 66 22 3 88888 2 1 22 33 77777 1 9 55555555555555555555555555555555555555555555555555 77777 777777 777 000 777 9 7 99 99 111111111111111111 9 9 9 99 9 9 7 44 1 1 1 22 9 9 99 99 7 77 7 7 3 7 3 777777777777 9999 1 22 3 00 66666666666666666666 22 1 1 1 1 1 555 22 444 11111 7 2 1 1 888888 2 1 7 66 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888888 2 77777 444 4 1 33 1 1 99 9 9 3333333 9 99 88 22222222222222 1 1 1 888888888888888888888888888888888888 22 4444444444444444 555555 555 55 1 888888 2222222 7 77 777 777777777777777 55555555 9 9 1 000 444 22222222 4 22 1 77777 8888 3 1111 1 22 1 1 99999 33 22 44 1 2 88888 55 2 33333 5555 22 55 6666666666666666 8888 5 1 77777777777 888888 444 222222222222222 5 1 5555 1 1 777 2 5555555555 1 1 0000000 1 0000000 1 1 1 1 2 11111111 2 22 9 9 7 7 777 7 7 7 3 3 77 7 99 9 1 2 2222222 5555 1 22 66 1 444 000 2 22 1 2 2 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 4
consensus : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTC-CG-----A-CA--GAT------TTT-TTA-------G---TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
Reference ( family-3770 ) : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTC-CG-----A-CA--GAT------TTT-TTAGG-----G---TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
gi|1 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGGCC-ACCGG--TGATCATCTGA--TA-AAAC-TTGA-TCGAATG-TCCAAG-AGT-TTT-A-GA-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-AAACTG-------T-GTCTGG-TAGA--TTTT---CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAATAAT-A-AA-TA--ATG-CGCATT-AC--TTATTCAAAA-GTT-G---TTTATT--T--TATTTTGCATA-----AC-AT-GA--AAAAAGT-----ATGAA-AATT-AT-------TT-----AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTTGTTC---CT---TATCAAACA-C--AAAA--T--------ACC-C-----GGAGAAT-T--TCAA-TTT-GGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CGCAGT-ATC--GAG---TTGG-GC-CGGC-G-A------------GTAAACA-T--GT--TCA--A-GA--TGTGGACAATTTTAGAAAT-----GGTCACAAA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AA-T-T---GC-TGC--A-TA-A------G-CTG-A-AA--A---C---A--CAGTGACAACAAAAAATAAAAGAA---------------A-------------CAAA-------AA----GG----------G--------TAGGACAGTTCTAACCAC------AGTTG-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-GCGC-------T-A--AT-GT--------------TTGGACA-A-TGATTCTCATTGATGTTTTAT------G--TGGCC--------A--TG----------------CAT--A---AAATCTT--T-AT------CAA-------CT-CA--AAAA---A---------------AA--------AA-CACAA
gi|1 : ag-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--ATTC-CAAC-TA---TC---TA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTAAC-GGATA----TTGTT--AAAAA-CCA-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T-----A----G--TC--TTCAGG---AT-------------CA--------A-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACCGAATCGG----TGATT-AAA-T------AGTT-----------------------------TATTT-----------TG-CCTACA-T--------------------TGTA-T--TTT-AC-AT---------GC-G-TT-T-TC-T---TTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAT-TTTTTGTT-A---CT--TTTTTAGCA-A--TTTGATA-GGACAC----------------------T------TTT-----------G---T-CCCGA-CAGAATTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACTaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgattccaactatctaaacagttttgttaaaggttaacggatattgttaaaaaccaagtgcactcgctgatcatagtcttcaggatcaaatatcaaattgaaaccgaatcggtgattaaatagtttattttgcctacattgtattttacatgcgttttctttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtattttttgttacttttttagcaatttgataggacacttttgtcccgacagaatttttagctctttcgccaact
gi|10 : agagttggcgaaagacgccgggccaccggtgatcatctgataaaacttgatcgaatgtccaagagttttagaaaccaagccggacaaactgtgtctggtagattttcagaatatacaatattagtaaatcgttcaaataataaataatgcgcattacttattcaaaagttgtttattttattttgcataacatgaaaaaagtatgaaaattatttaatgtgattttttgttccttatcaaacacaaaatacccggagaatttcaatttggttctatgtgaagtttagtatatccgcagtatcgagttgggccggcgagtaaacatgttcaagatgtggacaattttagaaatggtcacaaagtcattaaaaagaaattgctgcataagctgaaaacacagtgacaacaaaaaataaaagaaacaaaaagggtaggacagttctaaccacagttggattaaagacagacaatgcgctaatgtttggacaatgattctcattgatgttttatgtggccatgcataaaatctttatcaactcaaaaaaaaaacacaaaacaaaaaaaaaaaa------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AATGT--------------ATG-ACG-A-TGGTTTTG----------TGC------C---------------A--TG----------------CAC--A---AA--TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---CCG--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTG-TTGA-TA----AT-TT--AAAAA-C-ATT---A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCC-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT------------GCG-T----AGA-ATATCAAAATCATTC------ATAAAAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTT--TTTTAACTTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-TATTGAATTG-A-T-CA-T-ATG-GA-T--T---GATATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG---TT-T-TG-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTATTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTC-CG-----A-CA--GA--------------------------------------TTTTT--AGCTCTTTCG-CCAA
gi|11 : gTT-GGCGAA-A-GATGCCGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCA-ATG-TCCGAT-AGA-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTAT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AAATA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ACA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-TACT-ATNATTTGAT------AAC--A---TG-AAAAGTATGAATATTATTGTGATTTT-----T------TCT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCAGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-
gi|12 : T-ATC--GAG-G-T------GCAGC-G-A------------GTAAAGA-T--GTG-GTA--A-GA--TGTGCCCAATTAAA----T-----CTTCA--GA-G-TCAT-TA-AA-A---TG--A---AAAT-C---GC-TACC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------AAG-----------CAAA-------AAGGTTAG----------GAAGTTTAAT-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAGA-GAA--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AG-CT--------------ATG-ACG-A-TGATACTCA---------TATGACATTT--TGTGTC-------A--TG----------------CAC--AC--A---TTT--TTAT------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA-----------------------------------------------G--TT-AG-G-----GTTG-T-GG-TA----AT-TT--CAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T---G-A----G--TC--TTCAAG---ACTCCATCAGGA-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT------------------------AT-CA----T---------T--GA-CA-TT--C----A--TG--A-A-ATTG-------TATTT----------------TACA-T-----------------------A-T--TTT------------GAT-G-G-TT-G-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-CAA--CTT-T
gi|13 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCT-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCTGAT-AGT-TTTCT-AGCAA--C--CA--A-G--T-CGGAC-A--CTT-------T-GTCC-G-TAAA---TTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-T-AA-AA--TTAATG---------TT-TTCAGAATGTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-ATGGA--AAA--GT-----ATGAA-AATTAAT-------T------AA---G---TG-ATTTT-------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-CAAAAAA--T--------GCC-------GGA-AATGT--TCAATTTTTGGTT-TCATA--GTGGA-A-GTT--TATGT-A-TATCCACG--GT-ATC--GAGAG-TGT--GCGCGGCAG-A------------GTAAACA-T--GT
gi|14 : gAGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCC--ACCG---CGATC-TCCGAATTA-AA-T-TTGG--CAA--G-TCCGA---GTATTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--TTCGGACCA--CTG-------T-GTC-GG--AAA--TTTTT--CAA-GAATATAACTAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-A--TA--ATAATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TT-AT---T--TATTT-G-ATAG----AC-AT-GAGAAAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---TTCTTTATCGAA-A-C--AAAAATT--------GCC-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-c
gi|15 : g-G--AA-C-CAAC-TAAT-TC---CA--------AAC-GTTTTG--TC-TAAA-----GTTA-T-TG-TA----AT-T---AGAAA-C-ACACATA--GTTCGCA--CT-CCGC-----TGA--TCATC---G-A--------T--TTCAGG---AT---------A-TGCAGT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAAC-GAAT-GG----TGTAA-AAA-T--AAGC--TT--T----A-TTGCTA-C-ATTGAATTTTGTATTTGA-T-------TGAA-AACA-T-G-T-GA-T--T---AAAATTGCA-TAATTT-AC-A-ATTATTGA--G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AG-TC-------G----T-TCC-T---TAGTTTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-AATTTTA-T----ACATTGTGTC-CG-----GCCAATGAT------TAT-TTAAG-----GTCTTGTCTGC-CA
gi|16 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCG-CCC-AC-GG--CG-TC-TC-GA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCCGATCAGT-TTT-TTAG-AAAGC--CA--A-G--T-CGGAC-AA-CTG-------T-GTCCGGGTAAA--TTTTT--C---GAATATA--CAATCATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA--A--T-AATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TTTATC--T--TATTCTG-ATA-----AC-AT-GA--AAAA-GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-ATT---------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------GCC-------GGA-AAT-T--TCAA--TTTGGTTGTC-T--TGT-GA-A-GTT--TATGTAA-TAT---CG--GT-ATC--GAG-GTTTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-ac
gi|17 : TT-AT-------T------AATATG---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---TT--CT---TATCGAA---C--AAAA--TCCATTGGTACC-GACA--GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TCTTA-CGT-GA-ATGTT--TAT-T-A-TATA--CG--G--ATCGTGAG-G-TTT--GCGCGGC-G-A------------TT-AACAGTA-GTG-CCA--A-GA--TG-G--------------T-----GGTCA--AATA-TCAT-TATAATA---AGCAA---AAGT-A---GCTTGCC-A-GACA------G--TG---TA--A---C---A--C--------------------------------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AG--G-----GA---TTAAA-GACA-AG-A-C--AATCC-GC-------TAA--AA-GTG-------------ATG-ACA-T-TGATTCGCAT--------TCT------T--TGAGT--------A--TG----------------CAC--A---A----TT--T-GT------CAA-------AC-GA--AAAA---A---------------A
gi|18 : AT-ACAA-TT--TTACTGTATT--C--TT-TTCAAAA-GTTTA---TTTATT--T--TAATT-G-ATATCATAAC-AT-GG--AAA--GTTAAGTATGAA-AATT-AT-------TTGGCCTAAT------TG-A-----------------------TT-----TATATTTTTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAA---T--------AC--------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TAGGGT-GA-A-GTT--T-TGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTAG-GCGCGGC-T-A------------GTAAAGG-T---TGCCCA--A-AA--T-----------------T-----AGTCA--GA-G-TCAT-T------TTTAG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TATTATT-C---AGTT----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A
gi|19 : aa-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-AACGAG--TC--TTCAGG---AT------------GCGTT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GATT--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT-G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-AAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTATGTC-CG-----A-C------------------------------------A-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCT-CCAACTaaa
gi|2 : AGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-A---CTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-CCGTGTC-CA-----A-CA--GAT------TTTATTA
gi|20 : gT-AC-ATATT-TTGATGA-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--TTT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---CT--TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACT------------------------------------------G---TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACTactttcttctctga
gi|21 : attggacattgcgtgtcagacagttgtagactggtacaattattccagggaagtctgcacctgtaatagtgtattctagaga-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAC-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--G------ATG-----TG-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACT-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-AGT-GA-A-GCT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-A-A------------GTAAAC-----GTG-CCA--A-GATGTGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAct
gi|22 : aCC-A-GA-G------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAGAATAAAGAACA-------------CAAAGGTTAGGAA----ATTTA-------A--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-CAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-CGATTCT-----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAATATA---------------AA---C-ACTAA-C-CAAT-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----
gi|23 : TATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---ATTATT--C--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GG--AGA--AT-----ATGAA-ATTC-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------TC--------AGA-ATT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CTT-GACG-GTTTATATGT-A-TATC--CG--AT-ATC--GAG-A-TTTG-GCGTGGC-G-A------------GTAAA
gi|24 : GTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCCTGTTGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCGAC-AGT-GTT-T-A--AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CCA-------T-GTCCAG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAA-AT-A-AA--A---TAATGTATT-A
gi|25 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCAAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGTAC-A----G-------T-G---AG-TGGA--TT
gi|25 : g------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-aaagacaagcaatggctaaatg
gi|26 : gagttggcgaaagacgccggcccaccggcgatctccgataaatttgatcgatgtccaatagtttttagaaccaagccgtacagtgTATT-TTAATAT-A-TT-T--C-T-ATCTA-ATCTG--G-CAA--ATT-TT-AT-GT-------G----TGTTC-T--GT-----------------------TTGGCA-A--TCTA-TA-GGACACCGTGAC-CA-----G-CA--GAT------TT----------------------------TTTTTT--AGCTCATTTG-CCAATTtg
gi|27 : atctttgAGTT-GGCGAA-AAGACGCCGGCCC-ACCGGG-CGA-C-TC-GA--TA-AA-T-TTTA-TC-GA-G-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA-----CATTA-G----CGGAC-A--CTG-------T-GTTGGGTTAGAT-TTTTT--CA--GAATc
gi|28 : gCGAA-A-GACGCCAGAT--GCCAG--AGATC-TCTGG--TA-AA-TTTTAA-T----TG-TCGG-----------T-AA-AA--CTTCA--A-ACTC-TGGAT-A--CTGGACAAACT-GTCCGA--AGA--TATTG--CA--Gtat
gi|29 : gcAGTT-GGCGAA-A-GATGATGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TTTGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--
gi|3 : gAGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-A---CTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-CCGTGTC-CA-----A-CA--GAT------TTTATTA
gi|30 : g-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACCTGGTACCGGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGactttcttctctga
gi|31 : attAGTT-GGTGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGA--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TT
gi|32 : agA-----AC-AT-GG--AAA--GT-----ATGAA-AAAT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCG
gi|33 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCAG--C
gi|4 : cagAGTT-GGTGAA-A-GACGC-GGCCC-ACCGGAGCGATC-TCCGA--CATAA-T-TTGA-TCAGATG--CCGCTTAGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGCT-A--CTG-------TTGTCCGG-TAGA--TTTTTTTCATGAAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--TACATCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-ACGTCT-TTCAAAA-GTT-GG--TTTATC--T--TATTC-A-ATA-----AC-AT--A--AAA--GT-----A-GAATAATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---C---TT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GAA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-AA-A-GTT--T-TGT-A-TA----CG--GT-ATC--AAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------G-AAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A-----------------------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-AC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----A-A-ATAT---------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--AA-CAGTT--T----A-TTGCTA-T-ATTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GT-CG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTATCAGCA-N--NNNN-NN-NNNNNNNNNNNN-NN-----N-NN--NATTAGCAATTT-CTAGGACACTG---TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
gi|5 : TT-GGCGAA-A-GACGCCTGCCC-ACCGG----ATC-TCC-A--TA-AA-TATTGAATC-GATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C--GGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTC--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---CCAAAAAATCA-AA------TAATGTATT-AC--TT-TTCAAAG-GTT-ATTCTTTA-C--TGATATT----ATA-----AC-AT-G---GAA--GT-----ATGAA-AATT-ATTAGGCC-T------AAT--G---TGAA-----------------------TTTATTAT------TTT---T---CT---TATCG-A-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----G---AAT-T--TCAG--TTTGGTT-TC-TA-CGT-G--A-GAT--TATA-----ATC--CG--GT-ATC--GAG-G--TTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA----GTG-CCA--A-AA--------------------T-----GGTCA--GA-G-TCAT-T---T-T---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-TA-A------G-CCG-A-TA--A---TCAGA--A----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AA----------A--------A-------------AAAC------AAA-A-----AA-----AAA-AAA--AGAA-CAAAAA-G-GT-------T-AGGAA-GTTTAATGGCTAAAGTATG-ATG-A-TGATACT-----------TAT------TGATGTTTTGTGTGCCG--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------TAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---TGG--AA-C-CAACATA---T----CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----AT---T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----ATTAT--ACA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---C-A----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATATCAAATA---TCATTCATA---AAT---------------T-AAATTGAAT--G----TGTTA-AGA-T--AA-CA-CT--T----A-TTG-TA-C-ATTG-------TA-TTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T-------AAGTTGCA----TTT-AC-AT-TT-TTGATGG-T-TTGT-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-
gi|6 : agcTGT-AATATC--CG--GTTATC--GAG-G-TTTG-G-GCGGC-G-GAGGGCGTGGGAGGTAAACA-TTTGTG-CCA--AAGA--TGTG--------------TTTCGTGGTCA--AA-GGTCAAATA-AA-A---AA--AGAAAAGTGT---GC-TGCC-AAGA-AATTTTTG-ATA-A-TA--A---C---A--CTTCAAAAAAATG----------A---------------A-------------CAAA-------AATA--AT-------------------T-------------CCAC------AGTTG-----GAATATTAAA-GACCAGG-A-C--AAT-G-GCCACGCCCT-A--AA-GT--------------ATG-ACGTA-TGATTCTC-----------AT------T--TG-----------GATTG----------------CACA-A---A---ATT--T-GT------CAA-------CC-AACCAAAA---A---------------AA---
gi|6 : tgcat-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TCTTCCA--------AACAAGTTTGGTTT-AAAGCGTTTATTA-T-GG-TACTAAAT-TT--AAAAAAC-A-----AA-GT--GCA--CT-CCGC-----TGA--TCAAC---G-A----GGTCC--TTCAGG-----------------GCAGTTATGAGATATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GGATTGTATTA-AAAAT--AAACAGTT--T----A-TTGCTAAC-ATTG-------TATTTGAAT-------TG-A-TACA-TTGTT-GA-T--TTTAAAAACTGCA-T--TTTTAC--TATA-TTGATGGTG-TT-T-TTGT-ATTTT-GTCCGTGG-CAATTATT-TTTAA-GT-------G----TGTTC-TTGATAG-TTTTTGTTTA---CCTTTTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTCATGAAGGAA-CG--GAT------T-----------------TATC--------TTTTTT---GCCCTTTCGCCCAACTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgaaccaactatcttccaaacaagtttggtttaaagcgtttattatggtactaaatttaaaaaacaaagtgcactccgctgatcaacgaggtccttcagggcagttatgagatatatcaaattgaaactgaatggattgtattaaaaataaacagtttattgctaacattgtatttgaattgatacattgttgattttaaaaactgcatttttactatattgatggtgtttttgtattttgtccgtggcaattatttttaagtgtgttcttgatagtttttgtttacctttttttagcaatttgtaggacactgtgtcatgaaggaacggatttatcttttttgccctttcgcccaactct
gi|7 : tgcattgtaatatccggttatcgaggtttgggcggcggagggcgtgggaggtaaacatttgtgccaaagatgtgtttcgtggtcaaaggtcaaataaaaaaagaaaagtgtgctgccaagaaatttttgataataacacttcaaaaaaatgaacaaaaataattccacagttggaatattaaagaccaggacaatggccacgccctaaagtatgacgtatgattctcatttggattgcacaaaatttgtcaaccaaccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---A---A---AAGT-T---GC-TGCCCA-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAAAATAACAGA-A-------------CAAAGGTTAGGAA----GTTTTAC-----A--------T-------------CCACTGTGACAGT-T-----GA---TTAAGCGAC--A---------T-G-G----------A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TG---TTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GTACACTACAAAAAAAACCA-AA--AAAA---A---------------AA---C-A--AA-C-CAAC-GA---AC---CAAACTCTACAACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTT--T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAACCT-C-GCT----TGA--TTC-C---GAA----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----T-TTACAAA-T--GA-CAGTT--T------TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TAC--T-GTT-GATT--T---CAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--GACAA--TTTATT-AA-GTTGTGCACG----TGGTC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTCGCA-A--TTTG-TA-GGA-----------------A-CA-------------C-TTA-G-----A---TGTCGAA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACTct
gi|8 : TCA--AA-G--CAT-TA-AG-A---A---A---AAGT-T---GCCTGAC-A-GA-A------G-CTGTA-TA--ATCAC---A--C----------------------A---------------AATAAAATAAAGAACAAA-------AA----GTTAGGAAGTTTA--------T-------------CCAC------TGT-GACATTGA---TTAAA-GAC--AG-AAC--AAT-T-GC-------A-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC-----------AT------T--GG-----------A--TG----------------CAC--AAACA---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAA---AAACCAAAAAAAAAACAA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACCATTTTG--TTAAAAG-----GTTA-T-GG-TA----TT-TTAAAAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TCT-TTCAGG---AT-----------TGC-GT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT--G----TGTTA-AAA-T--GA-CAG-T--T----A--TGC-A-CAATTG-------TATTTTG-T-------T--A-TACACT-GTT-GA-TTGT---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT---G-TT-TATC-T-ATTTG-GTCTG--G-ACA--ATT-TT-AA-GT-------GTCACTGTCCTT--GTA--TTTTTGTT-A---C----TTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACAC---------------------------------TTAGA-----G------CCGACCAGATTTTTTTAGGCTCTTTCG-CCAACTct
gi|9 : --AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ATG-AATGATTTTC-----------AT------T--TG-----------A--TGTTCTTGTGTGCCGTGCCA---A---A---TTT--T-G-------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA---T-GG-AA-C-CATC-TA---TC---TAG-------AACAGTTTTG--------------ATT-------TA----CT-TT--TAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CTGC-GCGGCATTGA--TCA-CTAAC-A----G--T------AGGTACAG---------A-TGCAGTTA--GGA-ATAA---------TC------A---AATATCATTCATAAAATGTGAAATTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTTTAT----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-ACAATATT-TTGATGG----T-T-TC-T--TTTG-GTCCG--G--AA--ATT-TT-AA----------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AACTT---TTTTTAGGA-A--TTTT-TA-GGACACTGTGTC-CG-----A-CA--GAT------TTT-TTAGc
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 22 1111111 11 222 11 1 222222 111 11 11111 55555555555555555555555555555555555555555555555555 111 222222222222222222 111111111111 1111 44444444444444444444 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222222222 333333333333333333333333333333333333 2222222222222222 222222 1111111 1 111111111111111 11111111 111 11111111 1111 11111 11 11111 11111 11 3333333333333333 1111 33333333333 111111111111111 1111111111 1111111 1111111 11111111 111 1111111 222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000
lowQualScore : 5 5 2 2 666 2 33 2 8 0 2 33 5 5 2 2 2 2 33 44 44 6 4444 3 77 0000000 3 6 11 44 77 666 4 888 11 777 0 3 3 111111 0 77777 3 55 3 999 000 44 00 3 00000 6 3 44 77 77777 3 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444 66666 777777 444 222 444 2 5 33 33 555555555555555555 1 2 2 77 2 2 5 33 3 3 3 44 2 2 33 33 2 33 2 2 5 2 5 333333333333 2222 3 99 3 55 44444444444444444444 44 3 3 3 3 3 333 44 555 55555 6 9 3 3 888888 6 3 6 44 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 888888 6 77777 555 0 3 77 3 3 33 2 2 9999999 2 33 33 11111111111111 3 3 3 888888888888888888888888888888888888 44 0000000000000000 222222 888 88 3 888888 6666666 0 33 444 666666666666666 88888888 2 2 3 555 555 44444444 0 44 3 77777 2222 3 7777 3 44 3 3 11111 77 44 00 3 6 00000 88 6 22222 6666 44 11 3333333333333333 0000 3 3 77777777777 888888 555 999999999999999 1 3 6666 3 3 999 6 0000000000 3 3 0000000 3 0000000 3 3 3 3 6 55555555 6 44 2 2 2 2 000 2 2 2 5 5 33 2 33 2 3 6 6666666 6666 3 44 44 3 555 000 6 44 3 6 1 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 66 4
lowQualScore : . . . . ... . .. . . . . .. . . . . . . .. .. .. . .... . .. ....... . . .. .. .. ... . ... .. ... . . . ...... . ..... . .. . ... ... .. .. . ..... . . .. .. ..... . . .................................................. ..... ...... ... ... ... . . .. .. .................. . . . .. . . . .. . . . .. . . .. .. . .. . . . . . ............ .... . .. . .. .................... .. . . . . . ... .. ... ..... . . . . ...... . . . .. ................................................................................................................... ...... . ..... ... . . .. . . .. . . ....... . .. .. .............. . . . .................................... .. ................ ...... ... .. . ...... ....... . .. ... ............... ........ . . . ... ... ........ . .. . ..... .... . .... . .. . . ..... .. .. .. . . ..... .. . ..... .... .. .. ................ .... . . ........... ...... ... ............... . . .... . . ... . .......... . . ....... . ....... . . . . . ........ . .. . . . . ... . . . . . .. . .. . . . ....... .... . .. .. . ... ... . .. . . . ..................................................... .. .
lowQualScore : 3 0 5 5 333 7 77 7 0 7 9 22 7 7 9 9 9 9 99 22 22 2 8888 1 33 0000000 1 2 55 66 99 333 0 000 00 000 0 3 3 222222 4 33333 3 88 3 222 000 66 22 3 88888 2 1 22 33 77777 1 9 55555555555555555555555555555555555555555555555555 77777 777777 777 000 777 9 7 99 99 111111111111111111 9 9 9 99 9 9 7 44 1 1 1 22 9 9 99 99 7 77 7 7 3 7 3 777777777777 9999 1 22 3 00 66666666666666666666 22 1 1 1 1 1 555 22 444 11111 7 2 1 1 888888 2 1 7 66 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888888 2 77777 444 4 1 33 1 1 99 9 9 3333333 9 99 88 22222222222222 1 1 1 888888888888888888888888888888888888 22 4444444444444444 555555 555 55 1 888888 2222222 7 77 777 777777777777777 55555555 9 9 1 000 444 22222222 4 22 1 77777 8888 3 1111 1 22 1 1 99999 33 22 44 1 2 88888 55 2 33333 5555 22 55 6666666666666666 8888 5 1 77777777777 888888 444 222222222222222 5 1 5555 1 1 777 2 5555555555 1 1 0000000 1 0000000 1 1 1 1 2 11111111 2 22 9 9 7 7 777 7 7 7 3 3 77 7 99 9 1 2 2222222 5555 1 22 66 1 444 000 2 22 1 2 2 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 4
consensus : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTC-CG-----A-CA--GAT------TTT-TTA-------G-TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
Reference ( family-3770 ) : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTC-CG-----A-CA--GAT------TTT-TTA-------G-TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
gi|1 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGGCC-ACCGG--TGATCATCTGA--TA-AAAC-TTGA-TCGAATG-TCCAAG-AGT-TTT-A-GA-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-AAACTG-------T-GTCTGG-TAGA--TTTT---CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAATAAT-A-AA-TA--ATG-CGCATT-AC--TTATTCAAAA-GTT-G---TTTATT--T--TATTTTGCATA-----AC-AT-GA--AAAAAGT-----ATGAA-AATT-AT-------TT-----AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTTGTTC---CT---TATCAAACA-C--AAAA--T--------ACC-C-----GGAGAAT-T--TCAA-TTT-GGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CGCAGT-ATC--GAG---TTGG-GC-CGGC-G-A------------GTAAACA-T--GT--TCA--A-GA--TGTGGACAATTTTAGAAAT-----GGTCACAAA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AA-T-T---GC-TGC--A-TA-A------G-CTG-A-AA--A---C---A--CAGTGACAACAAAAAATAAAAGAA---------------A-------------CAAA-------AA----GG----------G--------TAGGACAGTTCTAACCAC------AGTTG-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-GCGC-------T-A--AT-GT--------------TTGGACA-A-TGATTCTCATTGATGTTTTAT------G--TGGCC--------A--TG----------------CAT--A---AAATCTT--T-AT------CAA-------CT-CA--AAAA---A---------------AA--------AA-CACAA
gi|1 : ag-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--ATTC-CAAC-TA---TC---TA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTAAC-GGATA----TTGTT--AAAAA-CCA-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T-----A----G--TC--TTCAGG---AT-------------CA--------A-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACCGAATCGG----TGATT-AAA-T------AGTT-----------------------------TATTT-----------TG-CCTACA-T--------------------TGTA-T--TTT-AC-AT---------GC-G-TT-T-TC-T---TTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAT-TTTTTGTT-A---CT--TTTTTAGCA-A--TTTGATA-GGACAC----------------------T------TTT-----------G-T-CCCGA-CAGAATTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACTaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgattccaactatctaaacagttttgttaaaggttaacggatattgttaaaaaccaagtgcactcgctgatcatagtcttcaggatcaaatatcaaattgaaaccgaatcggtgattaaatagtttattttgcctacattgtattttacatgcgttttctttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtattttttgttacttttttagcaatttgataggacacttttgtcccgacagaatttttagctctttcgccaact
gi|10 : agagttggcgaaagacgccgggccaccggtgatcatctgataaaacttgatcgaatgtccaagagttttagaaaccaagccggacaaactgtgtctggtagattttcagaatatacaatattagtaaatcgttcaaataataaataatgcgcattacttattcaaaagttgtttattttattttgcataacatgaaaaaagtatgaaaattatttaatgtgattttttgttccttatcaaacacaaaatacccggagaatttcaatttggttctatgtgaagtttagtatatccgcagtatcgagttgggccggcgagtaaacatgttcaagatgtggacaattttagaaatggtcacaaagtcattaaaaagaaattgctgcataagctgaaaacacagtgacaacaaaaaataaaagaaacaaaaagggtaggacagttctaaccacagttggattaaagacagacaatgcgctaatgtttggacaatgattctcattgatgttttatgtggccatgcataaaatctttatcaactcaaaaaaaaaacacaaaacaaaaaaaaaaaa------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AATGT--------------ATG-ACG-A-TGGTTTTG----------TGC------C---------------A--TG----------------CAC--A---AA--TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---CCG--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTG-TTGA-TA----AT-TT--AAAAA-C-ATT---A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCC-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT------------GCG-T----AGA-ATATCAAAATCATTC------ATAAAAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTT--TTTTAACTTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-TATTGAATTG-A-T-CA-T-ATG-GA-T--T---GATATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG---TT-T-TG-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTATTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTC-CG-----A-CA--GA------------------------------------TTTTT--AGCTCTTTCG-CCAA
gi|11 : gTT-GGCGAA-A-GATGCCGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCA-ATG-TCCGAT-AGA-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTAT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AAATA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ACA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-TACT-ATNATTTGAT------AAC--A---TG-AAAAGTATGAATATTATTGTGATTTT-----T------TCT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCAGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-
gi|12 : T-ATC--GAG-G-T------GCAGC-G-A------------GTAAAGA-T--GTG-GTA--A-GA--TGTGCCCAATTAAA----T-----CTTCA--GA-G-TCAT-TA-AA-A---TG--A---AAAT-C---GC-TACC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------AAG-----------CAAA-------AAGGTTAG----------GAAGTTTAAT-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAGA-GAA--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AG-CT--------------ATG-ACG-A-TGATACTCA---------TATGACATTT--TGTGTC-------A--TG----------------CAC--AC--A---TTT--TTAT------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA-----------------------------------------------G--TT-AG-G-----GTTG-T-GG-TA----AT-TT--CAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T---G-A----G--TC--TTCAAG---ACTCCATCAGGA-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT------------------------AT-CA----T---------T--GA-CA-TT--C----A--TG--A-A-ATTG-------TATTT----------------TACA-T-----------------------A-T--TTT------------GAT-G-G-TT-G-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-CAA--CTT-T
gi|13 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCT-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCTGAT-AGT-TTTCT-AGCAA--C--CA--A-G--T-CGGAC-A--CTT-------T-GTCC-G-TAAA---TTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-T-AA-AA--TTAATG---------TT-TTCAGAATGTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-ATGGA--AAA--GT-----ATGAA-AATTAAT-------T------AA---G---TG-ATTTT-------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-CAAAAAA--T--------GCC-------GGA-AATGT--TCAATTTTTGGTT-TCATA--GTGGA-A-GTT--TATGT-A-TATCCACG--GT-ATC--GAGAG-TGT--GCGCGGCAG-A------------GTAAACA-T--GT
gi|14 : gAGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCC--ACCG---CGATC-TCCGAATTA-AA-T-TTGG--CAA--G-TCCGA---GTATTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--TTCGGACCA--CTG-------T-GTC-GG--AAA--TTTTT--CAA-GAATATAACTAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-A--TA--ATAATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TT-AT---T--TATTT-G-ATAG----AC-AT-GAGAAAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---TTCTTTATCGAA-A-C--AAAAATT--------GCC-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-c
gi|15 : g-G--AA-C-CAAC-TAAT-TC---CA--------AAC-GTTTTG--TC-TAAA-----GTTA-T-TG-TA----AT-T---AGAAA-C-ACACATA--GTTCGCA--CT-CCGC-----TGA--TCATC---G-A--------T--TTCAGG---AT---------A-TGCAGT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAAC-GAAT-GG----TGTAA-AAA-T--AAGC--TT--T----A-TTGCTA-C-ATTGAATTTTGTATTTGA-T-------TGAA-AACA-T-G-T-GA-T--T---AAAATTGCA-TAATTT-AC-A-ATTATTGA--G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AG-TC-------G----T-TCC-T---TAGTTTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-AATTTTA-T----ACATTGTGTC-CG-----GCCAATGAT------TAT-TTA-------A-GGTC
gi|16 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCG-CCC-AC-GG--CG-TC-TC-GA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCCGATCAGT-TTT-TTAG-AAAGC--CA--A-G--T-CGGAC-AA-CTG-------T-GTCCGGGTAAA--TTTTT--C---GAATATA--CAATCATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA--A--T-AATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TTTATC--T--TATTCTG-ATA-----AC-AT-GA--AAAA-GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-ATT---------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------GCC-------GGA-AAT-T--TCAA--TTTGGTTGTC-T--TGT-GA-A-GTT--TATGTAA-TAT---CG--GT-ATC--GAG-GTTTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-ttgtctgccaac
gi|17 : TT-AT-------T------AATATG---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---TT--CT---TATCGAA---C--AAAA--TCCATTGGTACC-GACA--GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TCTTA-CGT-GA-ATGTT--TAT-T-A-TATA--CG--G--ATCGTGAG-G-TTT--GCGCGGC-G-A------------TT-AACAGTA-GTG-CCA--A-GA--TG-G--------------T-----GGTCA--AATA-TCAT-TATAATA---AGCAA---AAGT-A---GCTTGCC-A-GACA------G--TG---TA--A---C---A--C--------------------------------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AG--G-----GA---TTAAA-GACA-AG-A-C--AATCC-GC-------TAA--AA-GTG-------------ATG-ACA-T-TGATTCGCAT--------TCT------T--TGAGT--------A--TG----------------CAC--A---A----TT--T-GT------CAA-------AC-GA--AAAA---A---------------A
gi|18 : AT-ACAA-TT--TTACTGTATT--C--TT-TTCAAAA-GTTTA---TTTATT--T--TAATT-G-ATATCATAAC-AT-GG--AAA--GTTAAGTATGAA-AATT-AT-------TTGGCCTAAT------TG-A-----------------------TT-----TATATTTTTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAA---T--------AC--------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TAGGGT-GA-A-GTT--T-TGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTAG-GCGCGGC-T-A------------GTAAAGG-T---TGCCCA--A-AA--T-----------------T-----AGTCA--GA-G-TCAT-T------TTTAG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TATTATT-C---AGTT----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A
gi|19 : aa-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-AACGAG--TC--TTCAGG---AT------------GCGTT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GATT--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT-G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-AAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTATGTC-CG-----A-C----------------------------------A-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCT-CCAACTaaa
gi|2 : AGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-A---CTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-CCGTGTC-CA-----A-CA--GAT------TTTATTA-------
gi|20 : gT-AC-ATATT-TTGATGA-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--TTT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---CT--TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACT------------------------------------------G-TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACTactttcttctctga
gi|21 : attggacattgcgtgtcagacagttgtagactggtacaattattccagggaagtctgcacctgtaatagtgtattctagaga-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAC-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--G------ATG-----TG-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACT-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-AGT-GA-A-GCT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-A-A------------GTAAAC-----GTG-CCA--A-GATGTGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAct
gi|22 : aCC-A-GA-G------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAGAATAAAGAACA-------------CAAAGGTTAGGAA----ATTTA-------A--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-CAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-CGATTCT-----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAATATA---------------AA---C-ACTAA-C-CAAT-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----
gi|23 : TATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---ATTATT--C--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GG--AGA--AT-----ATGAA-ATTC-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------TC--------AGA-ATT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CTT-GACG-GTTTATATGT-A-TATC--CG--AT-ATC--GAG-A-TTTG-GCGTGGC-G-A------------GTAAA
gi|24 : GTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCCTGTTGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCGAC-AGT-GTT-T-A--AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CCA-------T-GTCCAG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAA-AT-A-AA--A---TAATGTATT-A
gi|25 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCAAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGTAC-A----G-------T-G---AG-TGGA--TT
gi|25 : g------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-aaagacaagcaatggctaaatg
gi|26 : gagttggcgaaagacgccggcccaccggcgatctccgataaatttgatcgatgtccaatagtttttagaaccaagccgtacagtgTATT-TTAATAT-A-TT-T--C-T-ATCTA-ATCTG--G-CAA--ATT-TT-AT-GT-------G----TGTTC-T--GT-----------------------TTGGCA-A--TCTA-TA-GGACACCGTGAC-CA-----G-CA--GAT------TT--------------------------TTTTTT--AGCTCATTTG-CCAATTtg
gi|27 : atctttgAGTT-GGCGAA-AAGACGCCGGCCC-ACCGGG-CGA-C-TC-GA--TA-AA-T-TTTA-TC-GA-G-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA-----CATTA-G----CGGAC-A--CTG-------T-GTTGGGTTAGAT-TTTTT--CA--GAATc
gi|28 : gCGAA-A-GACGCCAGAT--GCCAG--AGATC-TCTGG--TA-AA-TTTTAA-T----TG-TCGG-----------T-AA-AA--CTTCA--A-ACTC-TGGAT-A--CTGGACAAACT-GTCCGA--AGA--TATTG--CA--Gtat
gi|29 : gcAGTT-GGCGAA-A-GATGATGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TTTGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--
gi|3 : gAGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-A---CTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-CCGTGTC-CA-----A-CA--GAT------TTTATTA-------
gi|30 : g-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACCTGGTACCGGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGactttcttctctga
gi|31 : attAGTT-GGTGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGA--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TT
gi|32 : agA-----AC-AT-GG--AAA--GT-----ATGAA-AAAT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCG
gi|33 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCAG--C
gi|4 : cagAGTT-GGTGAA-A-GACGC-GGCCC-ACCGGAGCGATC-TCCGA--CATAA-T-TTGA-TCAGATG--CCGCTTAGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGCT-A--CTG-------TTGTCCGG-TAGA--TTTTTTTCATGAAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--TACATCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-ACGTCT-TTCAAAA-GTT-GG--TTTATC--T--TATTC-A-ATA-----AC-AT--A--AAA--GT-----A-GAATAATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---C---TT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GAA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-AA-A-GTT--T-TGT-A-TA----CG--GT-ATC--AAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------G-AAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A-----------------------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-AC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----A-A-ATAT---------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--AA-CAGTT--T----A-TTGCTA-T-ATTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GT-CG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTATCAGCA-N--NNNN-NN-NNNNNNNNNNNN-NN-----N-NN--NATTAGCAATTT-CTAGGACACTG-TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
gi|5 : TT-GGCGAA-A-GACGCCTGCCC-ACCGG----ATC-TCC-A--TA-AA-TATTGAATC-GATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C--GGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTC--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---CCAAAAAATCA-AA------TAATGTATT-AC--TT-TTCAAAG-GTT-ATTCTTTA-C--TGATATT----ATA-----AC-AT-G---GAA--GT-----ATGAA-AATT-ATTAGGCC-T------AAT--G---TGAA-----------------------TTTATTAT------TTT---T---CT---TATCG-A-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----G---AAT-T--TCAG--TTTGGTT-TC-TA-CGT-G--A-GAT--TATA-----ATC--CG--GT-ATC--GAG-G--TTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA----GTG-CCA--A-AA--------------------T-----GGTCA--GA-G-TCAT-T---T-T---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-TA-A------G-CCG-A-TA--A---TCAGA--A----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AA----------A--------A-------------AAAC------AAA-A-----AA-----AAA-AAA--AGAA-CAAAAA-G-GT-------T-AGGAA-GTTTAATGGCTAAAGTATG-ATG-A-TGATACT-----------TAT------TGATGTTTTGTGTGCCG--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------TAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---TGG--AA-C-CAACATA---T----CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----AT---T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----ATTAT--ACA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---C-A----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATATCAAATA---TCATTCATA---AAT---------------T-AAATTGAAT--G----TGTTA-AGA-T--AA-CA-CT--T----A-TTG-TA-C-ATTG-------TA-TTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T-------AAGTTGCA----TTT-AC-AT-TT-TTGATGG-T-TTGT-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-
gi|6 : agcTGT-AATATC--CG--GTTATC--GAG-G-TTTG-G-GCGGC-G-GAGGGCGTGGGAGGTAAACA-TTTGTG-CCA--AAGA--TGTG--------------TTTCGTGGTCA--AA-GGTCAAATA-AA-A---AA--AGAAAAGTGT---GC-TGCC-AAGA-AATTTTTG-ATA-A-TA--A---C---A--CTTCAAAAAAATG----------A---------------A-------------CAAA-------AATA--AT-------------------T-------------CCAC------AGTTG-----GAATATTAAA-GACCAGG-A-C--AAT-G-GCCACGCCCT-A--AA-GT--------------ATG-ACGTA-TGATTCTC-----------AT------T--TG-----------GATTG----------------CACA-A---A---ATT--T-GT------CAA-------CC-AACCAAAA---A---------------AA---
gi|6 : tgcat-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TCTTCCA--------AACAAGTTTGGTTT-AAAGCGTTTATTA-T-GG-TACTAAAT-TT--AAAAAAC-A-----AA-GT--GCA--CT-CCGC-----TGA--TCAAC---G-A----GGTCC--TTCAGG-----------------GCAGTTATGAGATATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GGATTGTATTA-AAAAT--AAACAGTT--T----A-TTGCTAAC-ATTG-------TATTTGAAT-------TG-A-TACA-TTGTT-GA-T--TTTAAAAACTGCA-T--TTTTAC--TATA-TTGATGGTG-TT-T-TTGT-ATTTT-GTCCGTGG-CAATTATT-TTTAA-GT-------G----TGTTC-TTGATAG-TTTTTGTTTA---CCTTTTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTCATGAAGGAA-CG--GAT------T---------------TATC--------TTTTTT---GCCCTTTCGCCCAACTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgaaccaactatcttccaaacaagtttggtttaaagcgtttattatggtactaaatttaaaaaacaaagtgcactccgctgatcaacgaggtccttcagggcagttatgagatatatcaaattgaaactgaatggattgtattaaaaataaacagtttattgctaacattgtatttgaattgatacattgttgattttaaaaactgcatttttactatattgatggtgtttttgtattttgtccgtggcaattatttttaagtgtgttcttgatagtttttgtttacctttttttagcaatttgtaggacactgtgtcatgaaggaacggatttatcttttttgccctttcgcccaactct
gi|7 : tgcattgtaatatccggttatcgaggtttgggcggcggagggcgtgggaggtaaacatttgtgccaaagatgtgtttcgtggtcaaaggtcaaataaaaaaagaaaagtgtgctgccaagaaatttttgataataacacttcaaaaaaatgaacaaaaataattccacagttggaatattaaagaccaggacaatggccacgccctaaagtatgacgtatgattctcatttggattgcacaaaatttgtcaaccaaccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---A---A---AAGT-T---GC-TGCCCA-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAAAATAACAGA-A-------------CAAAGGTTAGGAA----GTTTTAC-----A--------T-------------CCACTGTGACAGT-T-----GA---TTAAGCGAC--A---------T-G-G----------A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TG---TTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GTACACTACAAAAAAAACCA-AA--AAAA---A---------------AA---C-A--AA-C-CAAC-GA---AC---CAAACTCTACAACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTT--T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAACCT-C-GCT----TGA--TTC-C---GAA----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----T-TTACAAA-T--GA-CAGTT--T------TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TAC--T-GTT-GATT--T---CAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--GACAA--TTTATT-AA-GTTGTGCACG----TGGTC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTCGCA-A--TTTG-TA-GGA-----------------A-CA-------------C-TTA-------GATGTCGAA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACTct
gi|8 : TCA--AA-G--CAT-TA-AG-A---A---A---AAGT-T---GCCTGAC-A-GA-A------G-CTGTA-TA--ATCAC---A--C----------------------A---------------AATAAAATAAAGAACAAA-------AA----GTTAGGAAGTTTA--------T-------------CCAC------TGT-GACATTGA---TTAAA-GAC--AG-AAC--AAT-T-GC-------A-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC-----------AT------T--GG-----------A--TG----------------CAC--AAACA---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAA---AAACCAAAAAAAAAACAA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACCATTTTG--TTAAAAG-----GTTA-T-GG-TA----TT-TTAAAAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TCT-TTCAGG---AT-----------TGC-GT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT--G----TGTTA-AAA-T--GA-CAG-T--T----A--TGC-A-CAATTG-------TATTTTG-T-------T--A-TACACT-GTT-GA-TTGT---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT---G-TT-TATC-T-ATTTG-GTCTG--G-ACA--ATT-TT-AA-GT-------GTCACTGTCCTT--GTA--TTTTTGTT-A---C----TTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACAC---------------------------------TTA-------G-AG-CCGACCAGATTTTTTTAGGCTCTTTCG-CCAACTct
gi|9 : --AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ATG-AATGATTTTC-----------AT------T--TG-----------A--TGTTCTTGTGTGCCGTGCCA---A---A---TTT--T-G-------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA---T-GG-AA-C-CATC-TA---TC---TAG-------AACAGTTTTG--------------ATT-------TA----CT-TT--TAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CTGC-GCGGCATTGA--TCA-CTAAC-A----G--T------AGGTACAG---------A-TGCAGTTA--GGA-ATAA---------TC------A---AATATCATTCATAAAATGTGAAATTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTTTAT----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-ACAATATT-TTGATGG----T-T-TC-T--TTTG-GTCCG--G--AA--ATT-TT-AA----------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AACTT---TTTTTAGGA-A--TTTT-TA-GGACACTGTGTC-CG-----A-CA--GAT------TTT-TTA-------G-c
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 22 1111111 11 222 11 1 222222 111 11 11111 55555555555555555555555555555555555555555555555555 111 222222222222222222 111111111111 1111 44444444444444444444 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222222222 333333333333333333333333333333333333 2222222222222222 222222 1111111 1 111111111111111 11111111 111 11111111 1111 11111 11 11111 11111 11 3333333333333333 1111 33333333333 111111111111111 1111111111 1111111 1111111 11111111 111 1111111 222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000
lowQualScore : 5 5 2 2 666 2 33 2 8 0 2 33 5 5 2 2 2 2 33 44 44 6 4444 3 77 0000000 3 6 11 44 77 666 4 888 11 777 0 3 3 111111 0 77777 3 55 3 999 000 44 00 3 00000 6 3 44 77 77777 3 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444 66666 777777 444 222 444 2 5 33 33 555555555555555555 1 2 2 77 2 2 5 33 3 3 3 44 2 2 33 33 2 33 2 2 5 2 5 333333333333 2222 3 99 3 55 44444444444444444444 44 3 3 3 3 3 333 44 555 55555 6 9 3 3 888888 6 3 6 44 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 888888 6 77777 555 0 3 77 3 3 33 2 2 9999999 2 33 33 11111111111111 3 3 3 888888888888888888888888888888888888 44 0000000000000000 222222 888 88 3 888888 6666666 0 33 444 666666666666666 88888888 2 2 3 555 555 44444444 0 44 3 77777 2222 3 7777 3 44 3 3 11111 77 44 00 3 6 00000 88 6 22222 6666 44 11 3333333333333333 0000 3 3 77777777777 888888 555 999999999999999 1 3 6666 3 3 999 6 0000000000 3 3 0000000 3 0000000 3 3 3 3 6 55555555 6 44 2 2 2 2 000 2 2 2 5 5 33 2 33 2 3 6 6666666 6666 3 44 44 3 555 000 6 44 3 6 1 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 66 4
lowQualScore : . . . . ... . .. . . . . .. . . . . . . .. .. .. . .... . .. ....... . . .. .. .. ... . ... .. ... . . . ...... . ..... . .. . ... ... .. .. . ..... . . .. .. ..... . . .................................................. ..... ...... ... ... ... . . .. .. .................. . . . .. . . . .. . . . .. . . .. .. . .. . . . . . ............ .... . .. . .. .................... .. . . . . . ... .. ... ..... . . . . ...... . . . .. ................................................................................................................... ...... . ..... ... . . .. . . .. . . ....... . .. .. .............. . . . .................................... .. ................ ...... ... .. . ...... ....... . .. ... ............... ........ . . . ... ... ........ . .. . ..... .... . .... . .. . . ..... .. .. .. . . ..... .. . ..... .... .. .. ................ .... . . ........... ...... ... ............... . . .... . . ... . .......... . . ....... . ....... . . . . . ........ . .. . . . . ... . . . . . .. . .. . . . ....... .... . .. .. . ... ... . .. . . . ..................................................... .. .
lowQualScore : 3 0 5 5 333 7 77 7 0 7 9 22 7 7 9 9 9 9 99 22 22 2 8888 1 33 0000000 1 2 55 66 99 333 0 000 00 000 0 3 3 222222 4 33333 3 88 3 222 000 66 22 3 88888 2 1 22 33 77777 1 9 55555555555555555555555555555555555555555555555555 77777 777777 777 000 777 9 7 99 99 111111111111111111 9 9 9 99 9 9 7 44 1 1 1 22 9 9 99 99 7 77 7 7 3 7 3 777777777777 9999 1 22 3 00 66666666666666666666 22 1 1 1 1 1 555 22 444 11111 7 2 1 1 888888 2 1 7 66 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888888 2 77777 444 4 1 33 1 1 99 9 9 3333333 9 99 88 22222222222222 1 1 1 888888888888888888888888888888888888 22 4444444444444444 555555 555 55 1 888888 2222222 7 77 777 777777777777777 55555555 9 9 1 000 444 22222222 4 22 1 77777 8888 3 1111 1 22 1 1 99999 33 22 44 1 2 88888 55 2 33333 5555 22 55 6666666666666666 8888 5 1 77777777777 888888 444 222222222222222 5 1 5555 1 1 777 2 5555555555 1 1 0000000 1 0000000 1 1 1 1 2 11111111 2 22 9 9 7 7 777 7 7 7 3 3 77 7 99 9 1 2 2222222 5555 1 22 66 1 444 000 2 22 1 2 2 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 4
consensus : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTC-CG-----A-CA--GAT------TTT-TTA-------G-TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
Reference ( family-3770 ) : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTC-CG-----A-CA--GAT------TTT-TTA-------G-TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
gi|1 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGGCC-ACCGG--TGATCATCTGA--TA-AAAC-TTGA-TCGAATG-TCCAAG-AGT-TTT-A-GA-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-AAACTG-------T-GTCTGG-TAGA--TTTT---CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAATAAT-A-AA-TA--ATG-CGCATT-AC--TTATTCAAAA-GTT-G---TTTATT--T--TATTTTGCATA-----AC-AT-GA--AAAAAGT-----ATGAA-AATT-AT-------TT-----AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTTGTTC---CT---TATCAAACA-C--AAAA--T--------ACC-C-----GGAGAAT-T--TCAA-TTT-GGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CGCAGT-ATC--GAG---TTGG-GC-CGGC-G-A------------GTAAACA-T--GT--TCA--A-GA--TGTGGACAATTTTAGAAAT-----GGTCACAAA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AA-T-T---GC-TGC--A-TA-A------G-CTG-A-AA--A---C---A--CAGTGACAACAAAAAATAAAAGAA---------------A-------------CAAA-------AA----GG----------G--------TAGGACAGTTCTAACCAC------AGTTG-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-GCGC-------T-A--AT-GT--------------TTGGACA-A-TGATTCTCATTGATGTTTTAT------G--TGGCC--------A--TG----------------CAT--A---AAATCTT--T-AT------CAA-------CT-CA--AAAA---A---------------AA--------AA-CACAA
gi|1 : ag-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--ATTC-CAAC-TA---TC---TA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTAAC-GGATA----TTGTT--AAAAA-CCA-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T-----A----G--TC--TTCAGG---AT-------------CA--------A-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACCGAATCGG----TGATT-AAA-T------AGTT-----------------------------TATTT-----------TG-CCTACA-T--------------------TGTA-T--TTT-AC-AT---------GC-G-TT-T-TC-T---TTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAT-TTTTTGTT-A---CT--TTTTTAGCA-A--TTTGATA-GGACAC----------------------T------TTT-----------G-T-CCCGA-CAGAATTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACTaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgattccaactatctaaacagttttgttaaaggttaacggatattgttaaaaaccaagtgcactcgctgatcatagtcttcaggatcaaatatcaaattgaaaccgaatcggtgattaaatagtttattttgcctacattgtattttacatgcgttttctttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtattttttgttacttttttagcaatttgataggacacttttgtcccgacagaatttttagctctttcgccaact
gi|10 : agagttggcgaaagacgccgggccaccggtgatcatctgataaaacttgatcgaatgtccaagagttttagaaaccaagccggacaaactgtgtctggtagattttcagaatatacaatattagtaaatcgttcaaataataaataatgcgcattacttattcaaaagttgtttattttattttgcataacatgaaaaaagtatgaaaattatttaatgtgattttttgttccttatcaaacacaaaatacccggagaatttcaatttggttctatgtgaagtttagtatatccgcagtatcgagttgggccggcgagtaaacatgttcaagatgtggacaattttagaaatggtcacaaagtcattaaaaagaaattgctgcataagctgaaaacacagtgacaacaaaaaataaaagaaacaaaaagggtaggacagttctaaccacagttggattaaagacagacaatgcgctaatgtttggacaatgattctcattgatgttttatgtggccatgcataaaatctttatcaactcaaaaaaaaaacacaaaacaaaaaaaaaaaa------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AATGT--------------ATG-ACG-A-TGGTTTTG----------TGC------C---------------A--TG----------------CAC--A---AA--TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---CCG--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTG-TTGA-TA----AT-TT--AAAAA-C-ATT---A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCC-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT------------GCG-T----AGA-ATATCAAAATCATTC------ATAAAAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTT--TTTTAACTTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-TATTGAATTG-A-T-CA-T-ATG-GA-T--T---GATATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG---TT-T-TG-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTATTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTC-CG-----A-CA--GA------------------------------------TTTTT--AGCTCTTTCG-CCAA
gi|11 : gTT-GGCGAA-A-GATGCCGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCA-ATG-TCCGAT-AGA-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTAT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AAATA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ACA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-TACT-ATNATTTGAT------AAC--A---TG-AAAAGTATGAATATTATTGTGATTTT-----T------TCT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCAGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-
gi|12 : T-ATC--GAG-G-T------GCAGC-G-A------------GTAAAGA-T--GTG-GTA--A-GA--TGTGCCCAATTAAA----T-----CTTCA--GA-G-TCAT-TA-AA-A---TG--A---AAAT-C---GC-TACC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------AAG-----------CAAA-------AAGGTTAG----------GAAGTTTAAT-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAGA-GAA--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AG-CT--------------ATG-ACG-A-TGATACTCA---------TATGACATTT--TGTGTC-------A--TG----------------CAC--AC--A---TTT--TTAT------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA-----------------------------------------------G--TT-AG-G-----GTTG-T-GG-TA----AT-TT--CAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T---G-A----G--TC--TTCAAG---ACTCCATCAGGA-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT------------------------AT-CA----T---------T--GA-CA-TT--C----A--TG--A-A-ATTG-------TATTT----------------TACA-T-----------------------A-T--TTT------------GAT-G-G-TT-G-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-CAA--CTT-T
gi|13 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCT-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCTGAT-AGT-TTTCT-AGCAA--C--CA--A-G--T-CGGAC-A--CTT-------T-GTCC-G-TAAA---TTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-T-AA-AA--TTAATG---------TT-TTCAGAATGTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-ATGGA--AAA--GT-----ATGAA-AATTAAT-------T------AA---G---TG-ATTTT-------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-CAAAAAA--T--------GCC-------GGA-AATGT--TCAATTTTTGGTT-TCATA--GTGGA-A-GTT--TATGT-A-TATCCACG--GT-ATC--GAGAG-TGT--GCGCGGCAG-A------------GTAAACA-T--GT
gi|14 : gAGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCC--ACCG---CGATC-TCCGAATTA-AA-T-TTGG--CAA--G-TCCGA---GTATTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--TTCGGACCA--CTG-------T-GTC-GG--AAA--TTTTT--CAA-GAATATAACTAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-A--TA--ATAATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TT-AT---T--TATTT-G-ATAG----AC-AT-GAGAAAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---TTCTTTATCGAA-A-C--AAAAATT--------GCC-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-c
gi|15 : g-G--AA-C-CAAC-TAAT-TC---CA--------AAC-GTTTTG--TC-TAAA-----GTTA-T-TG-TA----AT-T---AGAAA-C-ACACATA--GTTCGCA--CT-CCGC-----TGA--TCATC---G-A--------T--TTCAGG---AT---------A-TGCAGT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAAC-GAAT-GG----TGTAA-AAA-T--AAGC--TT--T----A-TTGCTA-C-ATTGAATTTTGTATTTGA-T-------TGAA-AACA-T-G-T-GA-T--T---AAAATTGCA-TAATTT-AC-A-ATTATTGA--G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AG-TC-------G----T-TCC-T---TAGTTTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-AATTTTA-T----ACATTGTGTC-CG-----GCCAATGAT------TAT-TTA-------A-GGTC
gi|16 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCG-CCC-AC-GG--CG-TC-TC-GA--TA-AA-T-TTGG-TCA-ATG-TCCGATCAGT-TTT-TTAG-AAAGC--CA--A-G--T-CGGAC-AA-CTG-------T-GTCCGGGTAAA--TTTTT--C---GAATATA--CAATCATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA--A--T-AATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TTTATC--T--TATTCTG-ATA-----AC-AT-GA--AAAA-GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAT--G---TG-ATT---------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------GCC-------GGA-AAT-T--TCAA--TTTGGTTGTC-T--TGT-GA-A-GTT--TATGTAA-TAT---CG--GT-ATC--GAG-GTTTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-ttgtctgccaac
gi|17 : TT-AT-------T------AATATG---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---TT--CT---TATCGAA---C--AAAA--TCCATTGGTACC-GACA--GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TCTTA-CGT-GA-ATGTT--TAT-T-A-TATA--CG--G--ATCGTGAG-G-TTT--GCGCGGC-G-A------------TT-AACAGTA-GTG-CCA--A-GA--TG-G--------------T-----GGTCA--AATA-TCAT-TATAATA---AGCAA---AAGT-A---GCTTGCC-A-GACA------G--TG---TA--A---C---A--C--------------------------------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AG--G-----GA---TTAAA-GACA-AG-A-C--AATCC-GC-------TAA--AA-GTG-------------ATG-ACA-T-TGATTCGCAT--------TCT------T--TGAGT--------A--TG----------------CAC--A---A----TT--T-GT------CAA-------AC-GA--AAAA---A---------------A
gi|18 : AT-ACAA-TT--TTACTGTATT--C--TT-TTCAAAA-GTTTA---TTTATT--T--TAATT-G-ATATCATAAC-AT-GG--AAA--GTTAAGTATGAA-AATT-AT-------TTGGCCTAAT------TG-A-----------------------TT-----TATATTTTTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAA---T--------AC--------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TAGGGT-GA-A-GTT--T-TGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTAG-GCGCGGC-T-A------------GTAAAGG-T---TGCCCA--A-AA--T-----------------T-----AGTCA--GA-G-TCAT-T------TTTAG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TATTATT-C---AGTT----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A
gi|19 : aa-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-AACGAG--TC--TTCAGG---AT------------GCGTT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GATT--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT-G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-AAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTATGTC-CG-----A-C----------------------------------A-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCT-CCAACTaaa
gi|2 : AGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-A---CTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-CCGTGTC-CA-----A-CA--GAT------TTTATTA-------
gi|20 : gT-AC-ATATT-TTGATGA-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--TTT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---CT--TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACT------------------------------------------G-TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACTactttcttctctga
gi|21 : attggacattgcgtgtcagacagttgtagactggtacaattattccagggaagtctgcacctgtaatagtgtattctagaga-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAC-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--G------ATG-----TG-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACT-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-AGT-GA-A-GCT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-A-A------------GTAAAC-----GTG-CCA--A-GATGTGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAct
gi|22 : aCC-A-GA-G------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAGAATAAAGAACA-------------CAAAGGTTAGGAA----ATTTA-------A--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-CAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-CGATTCT-----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAATATA---------------AA---C-ACTAA-C-CAAT-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----
gi|23 : TATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---ATTATT--C--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GG--AGA--AT-----ATGAA-ATTC-AT-------T---------------T--------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------TC--------AGA-ATT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CTT-GACG-GTTTATATGT-A-TATC--CG--AT-ATC--GAG-A-TTTG-GCGTGGC-G-A------------GTAAA
gi|24 : GTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCCTGTTGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCGAC-AGT-GTT-T-A--AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CCA-------T-GTCCAG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAA-AT-A-AA--A---TAATGTATT-A
gi|25 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TCCAAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGTAC-A----G-------T-G---AG-TGGA--TT
gi|25 : g------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-aaagacaagcaatggctaaatg
gi|26 : gagttggcgaaagacgccggcccaccggcgatctccgataaatttgatcgatgtccaatagtttttagaaccaagccgtacagtgTATT-TTAATAT-A-TT-T--C-T-ATCTA-ATCTG--G-CAA--ATT-TT-AT-GT-------G----TGTTC-T--GT-----------------------TTGGCA-A--TCTA-TA-GGACACCGTGAC-CA-----G-CA--GAT------TT--------------------------TTTTTT--AGCTCATTTG-CCAATTtg
gi|27 : atctttgAGTT-GGCGAA-AAGACGCCGGCCC-ACCGGG-CGA-C-TC-GA--TA-AA-T-TTTA-TC-GA-G-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA-----CATTA-G----CGGAC-A--CTG-------T-GTTGGGTTAGAT-TTTTT--CA--GAATc
gi|28 : gCGAA-A-GACGCCAGAT--GCCAG--AGATC-TCTGG--TA-AA-TTTTAA-T----TG-TCGG-----------T-AA-AA--CTTCA--A-ACTC-TGGAT-A--CTGGACAAACT-GTCCGA--AGA--TATTG--CA--Gtat
gi|29 : gcAGTT-GGCGAA-A-GATGATGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GATG-TTTGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--
gi|3 : gAGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TCA-ATGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AGT--TAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTT--TATTC-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT-------T------CAC--AGTATG-A-----------------------TT-----T------TTT---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACTAG---A---TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-A---CTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-CCGTGTC-CA-----A-CA--GAT------TTTATTA-------
gi|30 : g-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACCTGGTACCGGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGactttcttctctga
gi|31 : attAGTT-GGTGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGA--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TT
gi|32 : agA-----AC-AT-GG--AAA--GT-----ATGAA-AAAT-AT-------T------AAT--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCG
gi|33 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCAG--C
gi|4 : cagAGTT-GGTGAA-A-GACGC-GGCCC-ACCGGAGCGATC-TCCGA--CATAA-T-TTGA-TCAGATG--CCGCTTAGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGCT-A--CTG-------TTGTCCGG-TAGA--TTTTTTTCATGAAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--TACATCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-ACGTCT-TTCAAAA-GTT-GG--TTTATC--T--TATTC-A-ATA-----AC-AT--A--AAA--GT-----A-GAATAATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---C---TT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GAA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-AA-A-GTT--T-TGT-A-TA----CG--GT-ATC--AAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------G-AAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A-----------------------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-AC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----A-A-ATAT---------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--AA-CAGTT--T----A-TTGCTA-T-ATTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GT-CG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTATCAGCA-N--NNNN-NN-NNNNNNNNNNNN-NN-----N-NN--NATTAGCAATTT-CTAGGACACTG-TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
gi|5 : TT-GGCGAA-A-GACGCCTGCCC-ACCGG----ATC-TCC-A--TA-AA-TATTGAATC-GATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C--GGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTC--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---CCAAAAAATCA-AA------TAATGTATT-AC--TT-TTCAAAG-GTT-ATTCTTTA-C--TGATATT----ATA-----AC-AT-G---GAA--GT-----ATGAA-AATT-ATTAGGCC-T------AAT--G---TGAA-----------------------TTTATTAT------TTT---T---CT---TATCG-A-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----G---AAT-T--TCAG--TTTGGTT-TC-TA-CGT-G--A-GAT--TATA-----ATC--CG--GT-ATC--GAG-G--TTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA----GTG-CCA--A-AA--------------------T-----GGTCA--GA-G-TCAT-T---T-T---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-TA-A------G-CCG-A-TA--A---TCAGA--A----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AA----------A--------A-------------AAAC------AAA-A-----AA-----AAA-AAA--AGAA-CAAAAA-G-GT-------T-AGGAA-GTTTAATGGCTAAAGTATG-ATG-A-TGATACT-----------TAT------TGATGTTTTGTGTGCCG--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GT------TAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---TGG--AA-C-CAACATA---T----CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----AT---T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----ATTAT--ACA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---C-A----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATATCAAATA---TCATTCATA---AAT---------------T-AAATTGAAT--G----TGTTA-AGA-T--AA-CA-CT--T----A-TTG-TA-C-ATTG-------TA-TTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T-------AAGTTGCA----TTT-AC-AT-TT-TTGATGG-T-TTGT-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-
gi|6 : agcTGT-AATATC--CG--GTTATC--GAG-G-TTTG-G-GCGGC-G-GAGGGCGTGGGAGGTAAACA-TTTGTG-CCA--AAGA--TGTG--------------TTTCGTGGTCA--AA-GGTCAAATA-AA-A---AA--AGAAAAGTGT---GC-TGCC-AAGA-AATTTTTG-ATA-A-TA--A---C---A--CTTCAAAAAAATG----------A---------------A-------------CAAA-------AATA--AT-------------------T-------------CCAC------AGTTG-----GAATATTAAA-GACCAGG-A-C--AAT-G-GCCACGCCCT-A--AA-GT--------------ATG-ACGTA-TGATTCTC-----------AT------T--TG-----------GATTG----------------CACA-A---A---ATT--T-GT------CAA-------CC-AACCAAAA---A---------------AA---
gi|6 : tgcat-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TCTTCCA--------AACAAGTTTGGTTT-AAAGCGTTTATTA-T-GG-TACTAAAT-TT--AAAAAAC-A-----AA-GT--GCA--CT-CCGC-----TGA--TCAAC---G-A----GGTCC--TTCAGG-----------------GCAGTTATGAGATATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GGATTGTATTA-AAAAT--AAACAGTT--T----A-TTGCTAAC-ATTG-------TATTTGAAT-------TG-A-TACA-TTGTT-GA-T--TTTAAAAACTGCA-T--TTTTAC--TATA-TTGATGGTG-TT-T-TTGT-ATTTT-GTCCGTGG-CAATTATT-TTTAA-GT-------G----TGTTC-TTGATAG-TTTTTGTTTA---CCTTTTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTCATGAAGGAA-CG--GAT------T---------------TATC--------TTTTTT---GCCCTTTCGCCCAACTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgaaccaactatcttccaaacaagtttggtttaaagcgtttattatggtactaaatttaaaaaacaaagtgcactccgctgatcaacgaggtccttcagggcagttatgagatatatcaaattgaaactgaatggattgtattaaaaataaacagtttattgctaacattgtatttgaattgatacattgttgattttaaaaactgcatttttactatattgatggtgtttttgtattttgtccgtggcaattatttttaagtgtgttcttgatagtttttgtttacctttttttagcaatttgtaggacactgtgtcatgaaggaacggatttatcttttttgccctttcgcccaactct
gi|7 : tgcattgtaatatccggttatcgaggtttgggcggcggagggcgtgggaggtaaacatttgtgccaaagatgtgtttcgtggtcaaaggtcaaataaaaaaagaaaagtgtgctgccaagaaatttttgataataacacttcaaaaaaatgaacaaaaataattccacagttggaatattaaagaccaggacaatggccacgccctaaagtatgacgtatgattctcatttggattgcacaaaatttgtcaaccaaccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---A---A---AAGT-T---GC-TGCCCA-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAAAATAACAGA-A-------------CAAAGGTTAGGAA----GTTTTAC-----A--------T-------------CCACTGTGACAGT-T-----GA---TTAAGCGAC--A---------T-G-G----------A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TG---TTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CACA-A---A---TTT--T-GTACACTACAAAAAAAACCA-AA--AAAA---A---------------AA---C-A--AA-C-CAAC-GA---AC---CAAACTCTACAACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTT--T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAACCT-C-GCT----TGA--TTC-C---GAA----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----T-TTACAAA-T--GA-CAGTT--T------TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TAC--T-GTT-GATT--T---CAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--GACAA--TTTATT-AA-GTTGTGCACG----TGGTC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTCGCA-A--TTTG-TA-GGA-----------------A-CA-------------C-TTA-------GATGTCGAA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACTct
gi|8 : TCA--AA-G--CAT-TA-AG-A---A---A---AAGT-T---GCCTGAC-A-GA-A------G-CTGTA-TA--ATCAC---A--C----------------------A---------------AATAAAATAAAGAACAAA-------AA----GTTAGGAAGTTTA--------T-------------CCAC------TGT-GACATTGA---TTAAA-GAC--AG-AAC--AAT-T-GC-------A-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC-----------AT------T--GG-----------A--TG----------------CAC--AAACA---TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAA---AAACCAAAAAAAAAACAA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACCATTTTG--TTAAAAG-----GTTA-T-GG-TA----TT-TTAAAAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TCT-TTCAGG---AT-----------TGC-GT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT--G----TGTTA-AAA-T--GA-CAG-T--T----A--TGC-A-CAATTG-------TATTTTG-T-------T--A-TACACT-GTT-GA-TTGT---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT---G-TT-TATC-T-ATTTG-GTCTG--G-ACA--ATT-TT-AA-GT-------GTCACTGTCCTT--GTA--TTTTTGTT-A---C----TTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACAC---------------------------------TTA-------G-AG-CCGACCAGATTTTTTTAGGCTCTTTCG-CCAACTct
gi|9 : --AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ATG-AATGATTTTC-----------AT------T--TG-----------A--TGTTCTTGTGTGCCGTGCCA---A---A---TTT--T-G-------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA---T-GG-AA-C-CATC-TA---TC---TAG-------AACAGTTTTG--------------ATT-------TA----CT-TT--TAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CTGC-GCGGCATTGA--TCA-CTAAC-A----G--T------AGGTACAG---------A-TGCAGTTA--GGA-ATAA---------TC------A---AATATCATTCATAAAATGTGAAATTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTTTAT----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-ACAATATT-TTGATGG----T-T-TC-T--TTTG-GTCCG--G--AA--ATT-TT-AA----------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AACTT---TTTTTAGGA-A--TTTT-TA-GGACACTGTGTC-CG-----A-CA--GAT------TTT-TTA-------G-c
blockSeqs : A C A T GAG . AT T A A A AA A C A C T C AG TT TT T CTC C A GACAAAC T G AT TT TG AAC C TTA AT ACA C C C ATAAGT ACGT . TG T TTC TGT GA CT . TCATA C G GA A TAAGT T A NATTTGATAACATGAAAAGTATGAATATTATTGTGATT TATTA ATATTT . AAT CTT . A AA AT CCATTGGTACCGACA G . G AG T G A GG G C T TA A A CA . T GT A T A A T AGGGCGTGGGAG GTA C TA A TG CCCAATTAAAT . T G A T T TTT CA GAA CTGC T T A C ATTTTT T T A TT CACACAAAAAATAACAGAACAAAGGTTAGGAAGTTTTACAT TGTGAC T ACATT ATA C CA A A AA C . CACGCCC A GG AT TTAATGGCTAAAGT . T A TATTGATGTTTTGTGTGCC AT TTCTTGTGTGCCGTGC AAAC A CA T ACACTA AAAAAAC C CC TAT AACCAAAAAAAAAAC GCGCG T . A GTT TTC AACTCTAC GT A CGTTT GTT . CTAA . AA A . CACAT TT TC AC G C GGCAT GG T TAAC ACGA GT CC ACTCCATCAGGA TATG G T TCAAAATCATT ATTCAT TAA ATCATTCATAAAATG G . ATTG C A TAG G TTTTAACT A A AATTTTG A ATTGAAT A . C T A TTTTA G AA T A A G GT G A G A T TG A TT A T T TGTGCAC TCAC T TG GT T ACT CTT T AT . G A NNNNNNNNNNNNATTAGCAATTTCTAGGACACTGTGTCCGA TA C
blockSeqs : A C . . GG . . . A T . AG A T . . . . . . . T TT . . . . T AT . A A . TTA AT . C . . ATAAGT CAC . G . G TGT . T . G C . . . . . . TAGGCCTAATGTGAA . . . AAT . . A . . ACCTGGTACC G . . AG . . T C . . . . . . . . . . . . A . T . TTT . TA . . TTTCGT . . . . . . . . . CTGC C T . . . T . A . TCACACAAATAAAATAAAGAACAAAAAGTTAGGAAGTTTAT . . . . . A . . . . . . . . G G . . . CATATGACATTTTGTGTC . . TAG . CA . . G C . . . GCGCG . . . GTT . G . . . GT . . . . . . TT A . G . C T GG A TG . . CC TACAGA TA G . TCAAATAT . . . G . . . . TAG A TATAT . . . . . . . . . A TTGT G . . . . G GT . . . A T . . . . . T A . . . G . . TT T . . G A TGTGTCATGAAGGAACGGATTTATC . .
blockSeqs : . . . . G . . . . A . A . . . . . . . . . . C . . . . . T . . A . TT . . C . . ATAT CAC . C . . C . T . . . . . . . . . TTGGCCTAATTGA . . . T . . . . . GCCG G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . GT . . . . . . . . . GT . C . . . . . . . CACACAAAGAATAAAGAACACAAAGGTTAGGAAATTTAAT . . . . . . . . . . . . . . A . . . . CATTCTTTGAGT . . TAG . . . . G C . . . CACT . . . AT . . . . . AT . . . . . . . . . G . . . . . TG . . T ATAA . G . TCT . . . G . . . . A . TAT . . . . . . . . . . TTT . . . . . G TG . . . . . . . . . . . A . . . G . . TT . . . . A CGTGACCAGCAGATTT . .
blockSeqs : . . . . G . . . . A . A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . GT . . C . . AAT AC . C . . C . T . . . . . . . . . TAAGTGATTTT . . . . . . . . . ACTG G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . GT . . . . . . . . . T . . . . . . . . . CACAAAGCAAAAAGGTTAGGAAGTTTAAT . . . . . . . . . . . . . . A . . . . TTATTTG . . AC . . . . . C . . . CCG . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . ATAA . G . TCT . . . C . . . . G . TAT . . . . . . . . . . TAT . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . A ACACTTAGATGTCGAA . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . GT . . C . . TAA AC . G . . C . T . . . . . . . . . TCACAGTATGA . . . . . . . . . ACCG G . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . C . . . . . . . . . CACTTCAAAAAAATGAACAAAAATAATT . . . . . . . . . . . . . . A . . . . TTATTTG . . AA . . . . . . . . . TGG . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . G . . . ATA . G . TT . . . C . . . . A . TAT . . . . . . . . . . TAT . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . A TGTGTCCGACAGA . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . . A . . TTT AC . G . . T . C . . . . . . . . . TCACAGTATGA . . . . . . . . . ACCG G . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . TCAGAAAACAAAAAAAAA . . . . . . . . . . . . . . A . . . . CTATTTG . . AA . . . . . . . . . TGG . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . G . . . ATA . G . AT . . . C . . . . G . TAT . . . . . . . . . . TTT . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . N TATGTCCGACA . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . . . . . TAT AC . G . . C . T . . . . . . . . . TAATGTGATT . . . . . . . . . ACC G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . C . . . . . . . . . CTACAACAAAAAAGT . . . . . . . . . . . . . . A . . . . CTATTTG . . AA . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . AT . G . T . . . G . . . . A . TAT . . . . . . . . . . TT . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . A TTAGAGCCGAC . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . TAT C . G . . T . T . . . . . . . . . TAATATGTGA . . . . . . . . . GCC G . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . CTACAACAAAAAAGT . . . . . . . . . . . . . . A . . . . TATTTG . . AA . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . AT . G . T . . . G . . . . A . CA . . . . . . . . . . TT . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . A TGTGTCCGA . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . G . . C . C . . . . . . . . . TAATGTGA . . . . . . . . . GCC G . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . C . . . . . . . . . CACACAAAAAATGT . . . . . . . . . . . . . . A . . . . CATTTG . . A . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . AT . G . T . . . G . . . . A . AT . . . . . . . . . . TT . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . A . . . . . . G . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . A . . . . . C . C . . . . . . . . . TAATGTGA . . . . . . . . . CCA A . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . CACACAAAAAATGT . . . . . . . . . . . . . . A . . . . CATTGG . . A . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . T . . . G . . . . G . AT . . . . . . . . . . TT . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAACGTGA . . . . . . . . . CCA . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . CATTTG . . A . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . A . . . T . . . . . . . . G . TT . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . AC . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTGCC . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . A . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : G* ** T** T* ** TAATGTGA****************************************** *** ACCG************** ** T******************* ** CTATTTG***************************** AA**** *** CG****** AT** G**** A** TAT******* TT****** ***
originalCons : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCAGATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTC-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT-------T------AAC--G---TG-A-----------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG----------------CAC--A---A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTC-CG-----A-CA--GAT------TTT-TTA-------G-TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
finalCons : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TCG-ATG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-AT--GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--T--TATTT-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-ATTAATGTGA------------------------------------------TT-----T------TTT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--TACCG--------------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTGT-------------------GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTCTATTTG-----------------------------A--TG----------------CACAA----A---TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AACG------AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTAT--GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-CG----A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-TA--A-CAGTTTAT-------TGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GATT------AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTC-CG-----A-CA--GAT------TTT-TTA-------G-TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111111 11 333 11 1 111111 111 11111 333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 222222222222222222 111111111111 1111 44444444444444444444 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222222222 333333333333333333333333333333333333 11111111111 1111111 1 111111111111111 11111111 111 11111111 1111 11111 11 11111 11111 11 3333333333333333 1111 33333333333 111111111111111 111 111111111 1111111 1111111 111111 111 1111111 222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000
lowQualScore : 5 5 2 2 666 2 33 2 8 0 2 2 2 5 5 2 2 2 2 33 44 44 6 8888 3 77 0000000 3 6 11 44 77 666 4 555 11 777 0 6 3 777777 0 77777 3 55 3 999 000 3 3 3 00000 6 3 44 77 77777 3 2 666666666666666666666666666666666666666666666666666 66666 777777 33 444 666 444 2 5 33 33 555555555555555555 1 2 2 77 2 2 5 33 3 3 3 44 2 2 33 33 2 33 2 2 5 2 5 333333333333 2222 3 99 3 55 44444444444444444444 44 3 3 3 3 3 333 44 555 55555 6 9 3 3 888888 6 3 6 44 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 888888 6 77777 555 0 3 77 3 3 33 2 2 9999999 2 33 33 11111111111111 3 3 3 888888888888888888888888888888888888 44 44444444444 555 6 77777 88 3 888888 6666666 0 33 444 666666666666666 88888888 2 2 3 555 555 44444444 0 44 3 77777 2222 3 7777 3 44 3 3 11111 77 44 00 3 6 00000 88 6 22222 6666 44 11 3333333333333333 0000 3 3 77777777777 888888 555 999999999999999 0 3 7777 3 3 000 6 111111111 3 3 0000000 3 0000000 3 3 3 3 6 6 222222 6 44 2 2 2 2 000 2 2 2 5 5 33 2 33 2 3 6 6666666 6666 3 44 44 3 555 000 6 44 3 6 1 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 66 4
lowQualScore : . . . . ... . .. . . . . . . . . . . . . .. .. .. . .... . .. ....... . . .. .. .. ... . ... .. ... . . . ...... . ..... . .. . ... ... . . . ..... . . .. .. ..... . . ................................................... ..... ...... .. ... ... ... . . .. .. .................. . . . .. . . . .. . . . .. . . .. .. . .. . . . . . ............ .... . .. . .. .................... .. . . . . . ... .. ... ..... . . . . ...... . . . .. ................................................................................................................... ...... . ..... ... . . .. . . .. . . ....... . .. .. .............. . . . .................................... .. ........... ... . ..... .. . ...... ....... . .. ... ............... ........ . . . ... ... ........ . .. . ..... .... . .... . .. . . ..... .. .. .. . . ..... .. . ..... .... .. .. ................ .... . . ........... ...... ... ............... . . .... . . ... . ......... . . ....... . ....... . . . . . . ...... . .. . . . . ... . . . . . .. . .. . . . ....... .... . .. .. . ... ... . .. . . . ..................................................... .. .
lowQualScore : 3 0 5 5 333 7 77 7 0 7 9 9 9 7 7 9 9 9 9 99 22 22 2 7777 1 33 0000000 1 2 55 66 99 333 0 999 00 000 0 7 3 888888 4 33333 3 88 3 222 000 3 3 3 88888 2 1 22 33 77777 1 9 555555555555555555555555555555555555555555555555555 77777 777777 77 777 777 777 9 7 99 99 111111111111111111 9 9 9 99 9 9 7 44 1 1 1 22 9 9 99 99 7 77 7 7 3 7 3 777777777777 9999 1 22 3 00 66666666666666666666 22 1 1 1 1 1 555 22 444 11111 7 2 1 1 888888 2 1 7 66 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888888 2 77777 444 4 1 33 1 1 99 9 9 3333333 9 99 88 22222222222222 1 1 1 888888888888888888888888888888888888 22 66666666666 444 2 00000 55 1 888888 2222222 7 77 777 777777777777777 55555555 9 9 1 000 444 22222222 4 22 1 77777 8888 3 1111 1 22 1 1 99999 33 22 44 1 2 88888 55 2 33333 5555 22 55 6666666666666666 8888 5 1 77777777777 888888 444 222222222222222 4 3 1111 3 3 555 7 222222222 3 3 8888888 3 8888888 3 3 3 3 7 7 444444 2 22 9 9 7 7 777 7 7 7 3 3 77 7 99 9 1 2 2222222 5555 1 22 66 1 444 000 2 22 1 2 2 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 4
consensus : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GA-TG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--TTATT-C-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT------T------A---------AT--G-------TG-A------------TT-----T------TT--T---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG-----------CA---C-AA--A--TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTC-CG-----A-CA--GAT------TTT-TTA-------G-TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
Reference ( family-3770 ) : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GA-TG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-AT--GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--TTATT-T-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-AATT-AT------T------A---------AT--G-------TG-A------------TT-----T------TT--T---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG-----------CA---C-AA--A--TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----AGA-ATAT---------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--AA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACCGTGTC-CG-----A-CA--GAT------TTT-TTA-------G-TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
gi|1 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGGCC-ACCGG--TGATCATCTGA--TA-AAAC-TTGA-TC-GAATG-TCCAAG-AGT-TTT-A-GA-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-AAACTG-------T-GTCTGG-TAGA--TTTT---CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAATAAT-A-AA-TA--ATG-CGCATT-AC--TTATTCAAAA-GTT-G---TTTATT--TTATT-TTGCATA-----AC-AT-GA--AAAAAGT-----ATGAA-AATT-AT------TT-----A---------AT--G-------TG-A------------TT-----T------TT--TGTTC---CT---TATCAAACA-C--AAAA--T--------ACC-C-----GGAGAAT-T--TCAA-TTT-GGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CGCAGT-ATC--GAG---TTGG-GC-CGGC-G-A------------GTAAACA-T--GT--TCA--A-GA--TGTGGACAATTTTAGAAAT-----GGTCACAAA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AA-T-T---GC-TGC--A-TA-A------G-CTG-A-AA--A---C---A--CAGTGACAACAAAAAATAAAAGAA---------------A-------------CAAA-------AA----GG----------G--------TAGGACAGTTCTAACCAC------AGTTG-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-GCGC-------T-A--AT-GT--------------TTGGACA-A-TGATTCTCATTGATGTTTTAT------G--TGGCC--------A--TG-----------CA---T-AA--AATCTT--T-AT------CAA-------CT-CA--AAAA---A---------------AA--------AA-CACAA
gi|1 : ag-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--ATTC-CAAC-TA---TC---TA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTAAC-GGATA----TTGTT--AAAAA-CCA-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T-----A----G--TC--TTCAGG---AT-------------CA--------A-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACCGAATCGG----TGATT-AAA-T------AGTT-----------------------------TATTT-----------TG-CCTACA-T--------------------TGTA-T--TTT-AC-AT---------GC-G-TT-T-TC-T---TTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAT-TTTTTGTT-A---CT--TTTTTAGCA-A--TTTGATA-GGACAC----------------------T------TTT-----------G-T-CCCGA-CAGAATTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACTaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgattccaactatctaaacagttttgttaaaggttaacggatattgttaaaaaccaagtgcactcgctgatcatagtcttcaggatcaaatatcaaattgaaaccgaatcggtgattaaatagtttattttgcctacattgtattttacatgcgttttctttggtccggcaaattttaagtgtgtcctgtattttttgttacttttttagcaatttgataggacacttttgtcccgacagaatttttagctctttcgccaact
gi|10 : agagttggcgaaagacgccgggccaccggtgatcatctgataaaacttgatcgaatgtccaagagttttagaaaccaagccggacaaactgtgtctggtagattttcagaatatacaatattagtaaatcgttcaaataataaataatgcgcattacttattcaaaagttgtttattttattttgcataacatgaaaaaagtatgaaaattatttaatgtgattttttgttccttatcaaacacaaaatacccggagaatttcaatttggttctatgtgaagtttagtatatccgcagtatcgagttgggccggcgagtaaacatgttcaagatgtggacaattttagaaatggtcacaaagtcattaaaaagaaattgctgcataagctgaaaacacagtgacaacaaaaaataaaagaaacaaaaagggtaggacagttctaaccacagttggattaaagacagacaatgcgctaatgtttggacaatgattctcattgatgttttatgtggccatgcataaaatctttatcaactcaaaaaaaaaacacaaaacaaaaaaaaaaaa------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AATGT--------------ATG-ACG-A-TGGTTTTG----------TGC------C---------------A--TG-----------CA---C-AA--A--TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---CCG--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTG-TTGA-TA----AT-TT--AAAAA-C-ATT---A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCC-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT------------GCG-T----AGA-ATATCAAAATCATTC------ATAAAAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTT--TTTTAACTTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-TATTGAATTG-A-T-CA-T-ATG-GA-T--T---GATATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG---TT-T-TG-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTATTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTC-CG-----A-CA--GA------------------------------------TTTTT--AGCTCTTTCG-CCAA
gi|11 : gTT-GGCGAA-A-GATGCCGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-AA-TG-TCCGAT-AGA-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTAT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAACATAA-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---TTTATC--TTATT-T-G-ACA-----AC-AT-GA--AAA--GT-----ATGAA-TACT-AT------N------ATTTGATAACAT--GAAAAGTATG-AATATTATTGTGATT-----T------TTTCT---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-GA-A-GTT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCAGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-
gi|12 : T-ATC--GAG-G-T------GCAGC-G-A------------GTAAAGA-T--GTG-GTA--A-GA--TGTGCCCAATTAAA----T-----CTTCA--GA-G-TCAT-TA-AA-A---TG--A---AAAT-C---GC-TACC-A-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A---------------AAG-----------CAAA-------AAGGTTAG----------GAAGTTTAAT-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAGA-GAA--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AG-CT--------------ATG-ACG-A-TGATACTCA---------TATGACATTT--TGTGTC-------A--TG-----------CA---C-AC--A--TTT--TTAT------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA-----------------------------------------------G--TT-AG-G-----GTTG-T-GG-TA----AT-TT--CAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-T---G-A----G--TC--TTCAAG---ACTCCATCAGGA-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------
gi|12 : --T---GAAATTGTA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT-G-G-TT-G-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-CAA--CTT-Tatcattgacattcatgaaattgtattttacatattttgatggttgtctatttggtctggcaacttt
gi|13 : tatcgaggtgcagcgagtaaagatgtggtaagatgtgcccaattaaatcttcagagtcattaaaatgaaaatcgctaccagaagctgataacacaaagcaaaaaggttaggaagtttaatccacagtggattagagaaagacaatggctaagctatgacgatgatactcatatgacattttgtgtcatgcacacatttttatcaactcaaagaaaagttagggttgtggtaatttcaaaacaagtgcactcgctgatcatgagtcttcaagactccatcaggatgcggtagaatatcaaatatcattgacattcaAGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCT-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGG-TC-AA-TG-TCTGAT-AGT-TTTCT-AGCAA--C--CA--A-G--T-CGGAC-A--CTT-------T-GTCC-G-TAAA---TTTT--CA--GAATATA--CAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-T-AA-AA--TTAATG---------TT-TTCAGAATGTT-G---TTTATC--TTATT-T-G-ATA-----AC-ATGGA--AAA--GT-----ATGAA-AATTAAT------T------A---------A---G-------TG-ATTTT--------TT-----T------TT--T---T---CT---TATCGAA-A-CAAAAAA--T--------GCC-------GGA-AATGT--TCAATTTTTGGTT-TCATA--GTGGA-A-GTT--TATGT-A-TATCCACG--GT-ATC--GAGAG-TGT--GCGCGGCAG-A------------GTAAACA-T--GT
gi|14 : gAGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCC--ACCG---CGATC-TCCGAATTA-AA-T-TTGG--C-AA--G-TCCGA---GTATTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--TTCGGACCA--CTG-------T-GTC-GG--AAA--TTTTT--CAA-GAATATAACTAAT-ATTAGTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-A--TA--ATAATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TT-AT---TTATT-T-G-ATAG----AC-AT-GAGAAAA--GT-----ATGAA-AATT-AT------T------A---------AT--G-------TG-A------------TT-----T------TT--T---T---TTCTTTATCGAA-A-C--AAAAATT--------GCC-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT--C-TA-TGT-GA-A-GTT--TA-GT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-CCA--A-c
gi|15 : g-G--AA-C-CAAC-TAAT-TC---CA--------AAC-GTTTTG--TC-TAAA-----GTTA-T-TG-TA----AT-T---AGAAA-C-ACACATA--GTTCGCA--CT-CCGC-----TGA--TCATC---G-A--------T--TTCAGG---AT---------A-TGCAGT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAAC-GAAT-GG----TGTAA-AAA-T--AAGC--TT--T----A-TTGCTA-C-ATTGAATTTTGTATTTGA-T-------TGAA-AACA-T-G-T-GA-T--T---AAAATTGCA-TAATTT-AC-A-ATTATTGA--G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--ATT-TT-AG-TC-------G----T-TCC-T---TAGTTTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-AATTTTA-T----ACATTGTGTC-CG-----GCCAATGAT------TAT-TTA-------A-GGTC
gi|16 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCG-CCC-AC-GG--CG-TC-TC-GA--TA-AA-T-TTGG-TC-AA-TG-TCCGATCAGT-TTT-TTAG-AAAGC--CA--A-G--T-CGGAC-AA-CTG-------T-GTCCGGGTAAA--TTTTT--C---GAATATA--CAATCATT-GTAAATCG--T---TCAAAACAT-A-AA--A--T-AATGT---------T-TTCAAAA-CTT-G---TTTATC--TTATTCT-G-ATA-----AC-AT-GA--AAAA-GT-----ATGAA-AATT-AT------T------A---------AT--G-------TG-ATT----------TT-----T------TT--T---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------GCC-------GGA-AAT-T--TCAA--TTTGGTTGTC-T--TGT-GA-A-GTT--TATGTAA-TAT---CG--GT-ATC--GAG-GTTTTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA-T--GTG-ttgtctgccaac
gi|17 : TT-AT------T------A---------ATATG-------TG-A------------TT-----T------TT--T---TT--CT---TATCGAA---C--AAAA--TCCATTGGTACC-GACA--GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TCTTA-CGT-GA-ATGTT--TAT-T-A-TATA--CG--G--ATCGTGAG-G-TTT--GCGCGGC-G-A------------TT-AACAGTA-GTG-CCA--A-GA--TG-G--------------T-----GGTCA--AATA-TCAT-TATAATA---AGCAA---AAGT-A---GCTTGCC-A-GACA------G--TG---TA--A---C---A--C--------------------------------------A-------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AG--G-----GA---TTAAA-GACA-AG-A-C--AATCC-GC-------TAA--AA-GTG-------------ATG-ACA-T-TGATTCGCAT--------TCT------T--TGAGT--------A--TG-----------CA---C-AA------TT--T-GT------CAA-------AC-GA--AAAA---A---------------A
gi|18 : AT-ACAA-TT--TTACTGTATT--C--TT-TTCAAAA-GTTTA---TTTATT--TTAAT-T-G-ATATCATAAC-AT-GG--AAA--GTTAAGTATGAA-AATT-AT------TTGGCCTA---------AT----------TG-A------------TT-----TATATTTTT--T---T---CT---TATCGAA-A-C--AAA---T--------AC--------GGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TAGGGT-GA-A-GTT--T-TGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTAG-GCGCGGC-T-A------------GTAAAGG-T---TGCCCA--A-AA--T-----------------T-----AGTCA--GA-G-TCAT-T------TTTAG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-GA-A------G-CTG-A-TATTATT-C---AGTT----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A
gi|19 : aa-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-AACGAG--TC--TTCAGG---AT------------GCGTT----AGA-ATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--GA-CAGTT--T----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GATT--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT-G-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--G-AAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTATGTC-CG-----A-C----------------------------------A-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCT-CCAACTaaa
gi|2 : AGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TC-AA-TGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AG--TTAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTTTATT-C-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT------TCAC---A---------GT--A-------TG-A------------TT-----T------TT--T---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG-----------CA---CTAG--A--TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-A---CTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-CCGTGTC-CA-----A-CA--GAT------TTTATTA-------
gi|20 : gT-AC-ATATT-TTGATGA-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-CAA--TTT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---CT--TTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACT------------------------------------------G-TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACTactttcttctctga
gi|21 : attggacattgcgtgtcagacagttgtagactggtacaattattccagggaagtctgcacctgtaatagtgtattctagaga-A-AA-TA--TTAATGTATT-AC--TT-TTCAAAC-GTT-G---TTTATC--TTATT-T-G-ATA-----AC-AT-GA--AAA--G------------------------------------------AT--G-------TG-A------------TT-----T------TT--T---TTTTCT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACT-G-----G-A-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-AGT-GA-A-GCT--TATGT-A-TATC--CG--GT-ATC--GAG-G-TTTG-GCGCGGC-A-A------------GTAAAC-----GTG-CCA--A-GATGTGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAct
gi|22 : aCC-A-GA-G------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAGAATAAAGAACA-------------CAAAGGTTAGGAA----ATTTA-------A--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-CAC--AG-A-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-CGATTCT-----------TAT------T--TG-----------A--TG-----------CA---C-AA--A--TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAATATA---------------AA---C-ACTAA-C-CAAT-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----
gi|23 : TATT-AC--TT-TTCAAAA-GTT-G---ATTATT--CTATT-T-G-ATA-----AC-AT-GG--AGA--AT-----ATGAA-ATTC-AT------T-----------------T--------------------------TT-----T------TT--T---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------TC--------AGA-ATT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CTT-GACG-GTTTATATGT-A-TATC--CG--AT-ATC--GAG-A-TTTG-GCGTGGC-G-A------------GTAAA
gi|24 : GTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCCTGTTGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GA-TG-TCCGAC-AGT-GTT-T-A--AA--C--CA--A-G--C-CGGAC-A--CCA-------T-GTCCAG-TAGA--TTTTT--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---TCAAAA-AT-A-AA--A---TAATGTATT-A
gi|25 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GA-TG-TCCAAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGTAC-A----G-------T-G---AG-TGGA--TT
gi|25 : g------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AA-G-C--AAT-G-GC-------T-A--AA-aaagacaagcaatggctaaatg
gi|26 : gagttggcgaaagacgccggcccaccggcgatctccgataaatttgatcgatgtccaatagtttttagaaccaagccgtacagtgTATT-TTAATAT-A-TT-T--C-T-ATCTA-ATCTG--G-CAA--ATT-TT-AT-GT-------G----TGTTC-T--GT-----------------------TTGGCA-A--TCTA-TA-GGACACCGTGAC-CA-----G-CA--GAT------TT--------------------------TTTTTT--AGCTCATTTG-CCAATTtg
gi|27 : atctttgAGTT-GGCGAA-AAGACGCCGGCCC-ACCGGG-CGA-C-TC-GA--TA-AA-T-TTTA-TC-GA--G-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA-----CATTA-G----CGGAC-A--CTG-------T-GTTGGGTTAGAT-TTTTT--CA--GAATc
gi|28 : gCGAA-A-GACGCCAGAT--GCCAG--AGATC-TCTGG--TA-AA-TTTTAA-T-----TG-TCGG-----------T-AA-AA--CTTCA--A-ACTC-TGGAT-A--CTGGACAAACT-GTCCGA--AGA--TATTG--CA--Gtat
gi|29 : gcAGTT-GGCGAA-A-GATGATGGCCC-ACCAG--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TTGA-TC-GA-TG-TTTGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--
gi|3 : gAGTTAGGCGAACA-GAC-CCGAGCC-ACCG---CGATC-TCCGA--TA-AAATATTAA-TC-AA-TGATCCGAT-AGT-TTT-A-TG-AA--C--CA--ATG--C-CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGAATTTTTT--CA--GAATAT---CAAT-AG--TTAAATATATT---TCAAGA-AT-A-AAATAAGTTAATGTATTCAC--TT-TTCAAAA--TT-G---TTTATTGTTTATT-C-A-ATA-----ACCAT-AA--AAA--GT-----ATGAA-TATT-AT------TCAC---A---------GT--A-------TG-A------------TT-----T------TT--T---TAATCT---TATCGAA-AAC--AAAA--T---------CC-A-----CGA-AAT-TAGTCAA-TGTTGGTT-TA-CA-CGT-GA-A-TCA--TATGT-A-TATC------GT-TT----AT-A-TTTGAGCGCAGC-ATA------------GTAAACA----ATG-CCATAA-GA--TGTGG-------------T-----GGACA--A--G-TC-T-TA-AA-A---AG--A---A-GT-CTGCGC-TGCCTA-GA-A------GTCTG-AATA--A---CT--A--C----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----A-----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---T-AAA-GAT--AG-A-C--A-T-G-TC-------T-A--A--GA--------------ATG-CCG-A-TGATTTCT----------TAT------T--TG-----------A--TG-----------CA---CTAG--A--TTTCAT-GT------CAAG------CT-AA--AAAA---A---------------AAGCGC-G--AA-C-CAAC-TAGTTTC---CA--------AACAGTTT-G--TT-AAAG-----GTGA----A-TC----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAG-CT-C-GC-----TGAGGTCA-CT--G-A----G--TCCCTTCAGG---AT---------AATGCGGT----A-A-AGATC--------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTAG-AAA-TTAGA-CAGT--------A-TTGCTA-C-TGTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTTAGA-TA-T---AAAGTTGCAGT--TTT-AC-ATATT-TGAATGG-GTTT-T-TC-TAATTTATGTCCG--G-TCA--ATT-TT-AATGTA------G----TGTCC-T--GTAT-GTTTTGTT-A---CTT-TTTTTAGCATA--TGTT-TAGGGAC-CCGTGTC-CA-----A-CA--GAT------TTTATTA-------
gi|30 : g------------TT-----T------TT--T---T---CT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACCTGGTACCGGA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGactttcttctctga
gi|31 : attAGTT-GGTGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCGA--CGATC-TCCGA--TA-AA-T-TT
gi|32 : agA-----AC-AT-GG--AAA--GT-----ATGAA-AAAT-AT------T------A---------AT--G-------TG-A------------TT-----T------TT--T---T---CT---TATCG
gi|33 : AGTT-GGCGAA-A-GACGCCGGCCC-ACCAG--C
gi|4 : cagAGTT-GGTGAA-A-GACGC-GGCCC-ACCGGAGCGATC-TCCGA--CATAA-T-TTGA-TCAGA-TG--CCGCTTAGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G--C-CGGCT-A--CTG-------TTGTCCGG-TAGA--TTTTTTTCATGAAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--TACATCAAAACAT-A-AA-TA--TTAATGTATT-ACGTCT-TTCAAAA-GTT-GG--TTTATC--TTATT-C-A-ATA-----AC-AT--A--AAA--GT-----A-GAATAATT-AT------T------A---------AC--G-------TG-A------------TT-----T------TT--T---C---TT---TATCGAA-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----GAA-AAT-T--TCAA-TTTTGGTT-TC-TA-CGT-AA-A-GTT--T-TGT-A-TA----CG--GT-ATC--AAG-G-TTTG-GCGCGGC-G-A------------G-AAACA-T--GTG-CCA--A-GA--TGTG--------------T-----GGTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---AG--A---AAGT-T---GC-TGCC-A-GA-A------G-TTG-A-TA--A---C---A--C----------------------A-----------------------------CAAA-------AA----AT----------G--------T-------------CCAC------AGT-G-----GA---TTAAA-GAC--AG-A-C--AAT-G-AC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC----------TAT------T--TG-----------A--TG-----------CA---C-AA-----TTT--T-GT------CAA-------CT-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTTA-T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TC--TTCAGG---AT---------A-TGCGGT----A-A-ATAT---------TC------A---AAT---------------TCAAACTGAAT-GG----TGTTA-AAA-T--AA-CAGTT--T----A-TTGCTA-T-ATTT-------TATTTGA-T-------TG-A-TACA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-G-TT-T-TC-T-ATTTG-GT-CG--G-CAA--ATT-TT-AA-GT-------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTATCAGCA-N--NNNN-NN-NNNNNNNNNNNN-NN-----N-NN--NATTAGCAATTT-CTAGGACACTG-TGTCCGA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACT
gi|5 : TT-GGCGAA-A-GACGCCTGCCC-ACCGG----ATC-TCC-A--TA-AA-TATTGAATC-GA-TG-TCCGAT-AGT-TTT-T-AG-AA--C--CA--A-G----CGGAC-A--CTG-------T-GTCCGG-TAGA--TTTTC--CA--GAATATA--CAAT-A---GTAAATCG--T---CCAAAAAATCA-AA------TAATGTATT-AC--TT-TTCAAAG-GTT-ATTCTTTA-C--TGATA-T-T-ATA-----AC-AT-G---GAA--GT-----ATGAA-AATT-ATTAGGCCT------A---------AT--G-------TGAA------------TTTATTAT------TT--T---T---CT---TATCG-A-A-C--AAAA--T--------ACC-G-----G---AAT-T--TCAG--TTTGGTT-TC-TA-CGT-G--A-GAT--TATA-----ATC--CG--GT-ATC--GAG-G--TTG-GCGCGGC-G-A------------GTAAACA----GTG-CCA--A-AA--------------------T-----GGTCA--GA-G-TCAT-T---T-T---AG--A---AAGT-C---GC-TGCC-A-TA-A------G-CCG-A-TA--A---TCAGA--A----------------------A---------------A-------------CAAA-------AA----AA----------A--------A-------------AAAC------AAA-A-----AA-----AAA-AAA--AGAA-CAAAAA-G-GT-------T-AGGAA-GTTTAATGGCTAAAGTATG-ATG-A-TGATACT-----------TAT------TGATGTTTTGTGTGCCG--TG-----------CA---C-AA--A--TTT--T-GT------TAA-------CTCAA--AGAA---A---------------AA---TGG--AA-C-CAACATA---T----CA--------AACAGTTTTG--TT-AAAG-----AT---T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----ATTAT--ACA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---C-A----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATATCAAATA---TCATTCATA---AAT---------------T-AAATTGAAT--G----TGTTA-AGA-T--AA-CA-CT--T----A-TTG-TA-C-ATTG-------TA-TTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T-------AAGTTGCA----TTT-AC-AT-TT-TTGATGG-T-TTGT-TC-T-ATTTG-GTCCG--G-
gi|6 : agcTGT-AATATC--CG--GTTATC--GAG-G-TTTG-G-GCGGC-G-GAGGGCGTGGGAGGTAAACA-TTTGTG-CCA--AAGA--TGTG--------------TTTCGTGGTCA--AA-GGTCAAATA-AA-A---AA--AGAAAAGTGT---GC-TGCC-AAGA-AATTTTTG-ATA-A-TA--A---C---A--CTTCAAAAAAATG----------A---------------A-------------CAAA-------AATA--AT-------------------T-------------CCAC------AGTTG-----GAATATTAAA-GACCAGG-A-C--AAT-G-GCCACGCCCT-A--AA-GT--------------ATG-ACGTA-TGATTCTC-----------AT------T--TG-----------GATTG-----------CA---C-AA--A--ATT--T-GT------CAA-------CC-AACCAAAA---A---------------AA---
gi|6 : tgcat-AA--AAAA---A---------------AA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TCTTCCA--------AACAAGTTTGGTTT-AAAGCGTTTATTA-T-GG-TACTAAAT-TT--AAAAAAC-A-----AA-GT--GCA--CT-CCGC-----TGA--TCAAC---G-A----GGTCC--TTCAGG-----------------GCAGTTATGAGATATAT----------C------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GGATTGTATTA-AAAAT--AAACAGTT--T----A-TTGCTAAC-ATTG-------TATTTGAAT-------TG-A-TACA-TTGTT-GA-T--TTTAAAAACTGCA-T--TTTTAC--TATA-TTGATGGTG-TT-T-TTGT-ATTTT-GTCCGTGG-CAATTATT-TTTAA-GT-------G----TGTTC-TTGATAG-TTTTTGTTTA---CCTTTTTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACACTGTGTCATGAAGGAA-CG--GAT------T---------------TATC--------TTTTTT---GCCCTTTCGCCCAACTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgaaccaactatcttccaaacaagtttggtttaaagcgtttattatggtactaaatttaaaaaacaaagtgcactccgctgatcaacgaggtccttcagggcagttatgagatatatcaaattgaaactgaatggattgtattaaaaataaacagtttattgctaacattgtatttgaattgatacattgttgattttaaaaactgcatttttactatattgatggtgtttttgtattttgtccgtggcaattatttttaagtgtgttcttgatagtttttgtttacctttttttagcaatttgtaggacactgtgtcatgaaggaacggatttatcttttttgccctttcgcccaactct
gi|7 : tgcattgtaatatccggttatcgaggtttgggcggcggagggcgtgggaggtaaacatttgtgccaaagatgtgtttcgtggtcaaaggtcaaataaaaaaagaaaagtgtgctgccaagaaatttttgataataacacttcaaaaaaatgaacaaaaataattccacagttggaatattaaagaccaggacaatggccacgccctaaagtatgacgtatgattctcatttggattgcacaaaatttgtcaaccaaccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaTCA--AA-G-TCAT-TA-AA-A---A---A---AAGT-T---GC-TGCCCA-GA-A------G-CTG-A-TA--A---C---A--C----------------------ACAAAAAATAACAGA-A-------------CAAAGGTTAGGAA----GTTTTAC-----A--------T-------------CCACTGTGACAGT-T-----GA---TTAAGCGAC--A---------T-G-G----------A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TG---TTC----------TAT------T--TG-----------A--TG-----------CA---C-AA--A--TTT--T-GTACACTACAAAAAAAACCA-AA--AAAA---A---------------AA---C-A--AA-C-CAAC-GA---AC---CAAACTCTACAACAGTTTTG--TT-AAAG-----GTT--T-GG-TA----AT-TT--AAAAA-C-A-----A--GT--GCAACCT-C-GCT----TGA--TTC-C---GAA----G--TC--TTCAGG--------------A-TGCGGT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT-GG----T-TTACAAA-T--GA-CAGTT--T------TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TAC--T-GTT-GATT--T---CAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGATGG-T-TT-T-TC-T-ATTTG-GTCTG--GACAA--TTTATT-AA-GTTGTGCACG----TGGTC-T--GTAG-TTTTTGTT-A---C---TTTTTCGCA-A--TTTG-TA-GGA-----------------A-CA-------------C-TTA-------GATGTCGAA-CAGATTTTTT--AGCTCTTTCG-CCAACTct
gi|8 : TCA--AA-G--CAT-TA-AG-A---A---A---AAGT-T---GCCTGAC-A-GA-A------G-CTGTA-TA--ATCAC---A--C----------------------A---------------AATAAAATAAAGAACAAA-------AA----GTTAGGAAGTTTA--------T-------------CCAC------TGT-GACATTGA---TTAAA-GAC--AG-AAC--AAT-T-GC-------A-A--AA-GT--------------ATG-ACG-A-TGATTCTC-----------AT------T--GG-----------A--TG-----------CA---C-AAACA--TTT--T-GT------CAA-------CTCAA--AAAA---AAACCAAAAAAAAAACAA---C-G--AA-C-CAAC-TA---TC---CA--------AACCATTTTG--TTAAAAG-----GTTA-T-GG-TA----TT-TTAAAAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CT-C-GC-----TGA--TCA-C---G-A----G--TCT-TTCAGG---AT-----------TGC-GT----AGA-ATA----------TC------A---AAT---------------TGAAACTGAAT--G----TGTTA-AAA-T--GA-CAG-T--T----A--TGC-A-CAATTG-------TATTTTG-T-------T--A-TACACT-GTT-GA-TTGT---AAAATTGCA-T--TTT-AC-ATATT-TTGAT---G-TT-TATC-T-ATTTG-GTCTG--G-ACA--ATT-TT-AA-GT-------GTCACTGTCCTT--GTA--TTTTTGTT-A---C----TTTTAGCA-A--TTTG-TA-GGACAC---------------------------------TTA-------G-AG-CCGACCAGATTTTTTTAGGCTCTTTCG-CCAACTct
gi|9 : --AAT-G-GC-------T-A--AA-GT--------------ATG-ATG-AATGATTTTC-----------AT------T--TG-----------A--TGTTCTTGTGTGCCGTGCC-AA--A--TTT--T-G-------CAA-------CT-CA--AAGA---A---------------AA---T-GG-AA-C-CATC-TA---TC---TAG-------AACAGTTTTG--------------ATT-------TA----CT-TT--TAAAA-C-A-----A--GT--GCA--CTGC-GCGGCATTGA--TCA-CTAAC-A----G--T------AGGTACAG---------A-TGCAGTTA--GGA-ATAA---------TC------A---AATATCATTCATAAAATGTGAAATTGAAT-GG----TGTTA-AGA-T--AA-CAGTTTAT----A-TTGCTA-C-ATTG-------TATTTGA-T-------TG-A-TGCA-T-GTT-GA-T--T---AAAATTGCA-T--TTT-ACAATATT-TTGATGG----T-T-TC-T--TTTG-GTCCG--G--AA--ATT-TT-AA----------G----TGTCC-T--GTAG-TTTTTGTT-AACTT---TTTTTAGGA-A--TTTT-TA-GGACACTGTGTC-CG-----A-CA--GAT------TTT-TTA-------G-c