lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 11 11 222222 111 11 111 11 1 1 1 11 1 111 111 11 444444444444444444444444444444444444444444 111 6666666666666666666666666666 111 11 222 1 11 1111 111 111 11 1 1111 11 11 11111 11111 33333333333333333 11 222 1111 2222222 1 444444444444444444444444 111 222222222222222 222222222222222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111111111 2222 1 1111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 3333333333 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 1111 222222 222 1111111 22222 111111111 1111111111 11 111111
lowQualScore : 3 6 0 4 8 00 1 11 11 3 0 6 4 5 333333 5 111 66 1 1 77 4 0 8 0 3 666 0 11 3 6 55 0 8 0 6 0 0 8 0 1 6 6 1 66 22 8 7 7 5 77 000 5 6 6 3 6 99 111 77 88 99 555555555555555555555555555555555555555555 99 3 6 111 1 2222222222222222222222222222 222 1 0 0 99 99 1 6 88 3 222 0 6 88 6 4444 3 6 000 77 000 9999999 999 00 5 2 6 5 66 0000 5 5 5 5 5 3 11 5 5 11 99999 33333 8 55555555555555555 55 5 555 5 5 4444 77 5 5 4444444 5 5 5 0 888 111111111111111111111111 55 777 4 111 777 000000000000000 2 3 55 666666666666666666 666 7 55 555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 66666666666 3 3 1 5555 3 3 5 3 55 3 55 44 3 7777 555 3 2222222 99 7777 88888888888888888888888888888888888888888888888888888 555 3 2222 3 6666 0 3 3 3 5555555555 44 3 44 44 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33 33 999999 66 2 0000 2 888888 555555 2 33 3 999999999 999 3 333 3 3 3333333 3 3 3 44444 0 3 88 3 55 44 3 2 0 33 000000000 9999 7777777777 33 33 66666 33 888 2 2 6 1 77 555555 3 3 44 3 3 3 3 88888 4
lowQualScore : . . . . . .. . .. .. . . . . . ...... . ... .. . . .. . . . . . ... . .. . . .. . . . . . . . . . . . . .. .. . . . . .. ... . . . . . .. ... .. .. .. .......................................... .. . . ... . ............................ ... . . . .. .. . . .. . ... . . .. . .... . . ... .. ... ....... ... .. . . . . .. .... . . . . . . .. . . .. ..... ..... . ................. .. . ... . . .... .. . . ....... . . . . ... ........................ .. ... . ... ... ............... . . .. .................. ... . .. ... ............................................................................. ........... . . . .... . . . . .. . .. .. . .... ... . ....... .. .... ..................................................... ... . .... . .... . . . . .......... .. . .. .. .............................................................................................................................................................. .. .. ...... .. . .... . ...... ...... . .. . ......... ... . ... . . ....... . . . ..... . . .. . .. .. . . . .. ......... .... .......... .. .. ..... .. ... . . . . .. ...... . . .. . . . . ..... .
lowQualScore : 2 0 0 5 0 88 4 00 44 8 8 0 8 8 000000 0 666 44 4 0 44 0 8 0 8 8 000 8 00 8 6 88 2 0 0 0 8 6 0 2 0 7 7 7 77 66 0 5 7 7 99 000 7 7 7 3 7 22 777 77 00 22 666666666666666666666666666666666666666666 22 5 7 777 7 2222222222222222222222222222 444 4 8 6 22 22 0 7 33 5 555 8 7 33 7 2222 2 7 000 99 000 8888888 999 55 0 4 2 0 99 6666 0 0 0 0 0 4 99 0 0 99 11111 33333 9 00000000000000000 22 0 666 7 7 3333 99 7 7 9999999 0 0 0 0 888 666666666666666666666666 55 000 0 000 000 777777777777777 3 6 00 888888888888888888 444 3 00 888 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 44444444444 6 6 9 7777 6 6 1 6 00 6 88 66 3 2222 888 3 2222222 22 1111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 888 3 9999 3 5555 1 1 1 1 0000000000 22 1 22 22 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 99 99 888888 55 9 0000 9 222222 555555 9 00 1 999999999 666 1 000 1 1 1111111 1 1 3 33333 3 3 88 1 22 66 1 9 1 77 555555555 6666 0000000000 77 88 77777 77 333 9 9 2 5 33 555555 1 1 22 1 1 1 3 33333 0
consensus : ATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAGCAATTTCNACAA------TTTNTATGCTGAAAT-ATTTATATATTTCAATTCAT-GCAAAAAATGCCAGAACATCAATGATTTGAAANTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTNACAATTGGATAC-GGAGTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTTAAAAA-GC--TA---AGAC-ATATG--AATTTTC-----ANGA---T-TT---ACC-CTA-TC-------------AAAAC--TTGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACA--TC------T--AT-G-AAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGA--TGTATAAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATAG-ATTTTCTT-GGAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTG-TAAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--G-T-TGCA--GAATTT-A--ATTTT-AA--AATA-CT-----------------CAAT-AAT-CT--CC-T-ATGT-AA--CA-AA-T-N--T--TCTCTC-AG-GAAA-AT-TAAG---AAA-A---NTGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT---AGAG---AAAATG--T---------TGAGG-A--C------------------AAT---G-A--AC---AC--------------G---------A------T----------A-A------A--A-TGT--------A--------AAA-CAT-------AT-ATGGGAAATAA-CCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--A-T-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCT----AATTTC-T-ACTA-TAG-GCAACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG------TATT--GTA---GAATTCAAG-GAC--ATT-GA-AGAA-AG--------TACC-------GA------AAAA-TAT--A-T-CTGCTC------------------------ATGT--------------------A--C------------T--C--ATTGG----TA-TAT-A----AAAG-GTTAC------ATA-N----AG-A-TTTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT--GATGAAATTATGT-GATACA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--T-GT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGAG-----TG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AAG-G----G-CAA-AT--T-GA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
Reference ( gi|1 ) : ATACTGATATTGGTT-ATATATTGAAAACAAG-TGC-CACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAACAATTTCAACAA------TTTCTATGCTGAAGT-ATTTATATATTTCAATTCAT-TCAAAAAATGCCAGAACATCAATGATATGAAATTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTTTTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAGTTGGATAC-AGAGTGGTTTAAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTTTTGAATGGTTT-TACGATAATTTTAGAACAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTCAAAAA-GC--TA---AGAA-ATGTG--AATTTTC-----AACA---T-TT---ACC-GTA-TC-------------AAAAC--TTACGTA-T---GAAACTCAAATTTGAAA--TCACA--TC------T--AT-G-AAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGA--GGTATACAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATAA-ATTTTCTT-AGAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTG-TAAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--G-T-TGCA--GAATTTAA--ATTTT-GA--AATA-CT-----------------CAAA-AAT-CT--AC-T-ACGT-AA--CA-AA-T-C--T--TTTCTC-AG-GAAA-AT-TAAG---AAA-T---CTGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT---AGAG---AAATTG--T---------TGAAG-A--C------------------AAT---G-A--AC---A---------------A---------A------T----------A-A------A--A-TGT--------A-------GAAA-CAT-------AT-ATGGGAAATAA-CTT---AA-AAAT-TACAAAATT-TGAC--A-T-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCT----AATTTC-T-ACTA-TAG-GCAACT-TT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-----ATATTG-GTA---GACTTCAAG-GA---ATT-GA-AGAA-TG-------ATACC-------GA------AAAA-TATG-A-T-TTGCTC------------------------ATGT--------------------A--C------------T--C--ATTTG----TA-TAT-A----AAAG-GTTAC------ATA-A----AG-A-TTTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAT--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT--ATTGAAATTATGT-GATACA-CGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--T-GT------TAT---TAAGA----------CATGC--GCCCCAG-----TG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AAG-A----G-CAA-AT--T-GA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
gi|3 : ATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGATTT--GAAAGATTTTGAGTTAATTAGCAATTTCAACAA------TTTGTATGCTGAAAT-ATTTATATATTTCAATTCAT-GCAAAAAATGCCAGAACATTCATGATTTGAAATTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAATGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAATTGTTTAC-AGAGTGGTTTCAAATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAACGAT----AATCTT------------------------AGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-CTTTAAAAA-GC--TA---AGAC-ATGTG--AATTTCC-----ATGA---T-TT---ACC-CTA-TC-------------AATAC--CTGCGTA-T---AAA-----------AAA--TC-CA--TT----------T-G-AAATAAACC---------------TGATATAAT--CATCGAAAACGAT-GTTATAAAGTTTTTAGTAAAAAAGGAAATTTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATGGAAAAACT--TTAAA---TA--TT---GATAG-ATTTTCTT-GGAGA-CTAA-TTTAC-AAAAA--CAAAA----TTG-TAAA-T-ATG-TAATGAAAAAAAAG--G-T-TGCA--G-ATTT-A--ATTTT-AA--AATA-CT-----------------CAAATAAT-CT--CC-T-ATGTAAA--CA-AA-T-CATT--TCTCTC-AG-GAAA-AT-TAAGAAAAAA-T---T--AA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT---AGAG---AAAATG--T---------TGAGG-A--C------------------AAT---GAA--AC---ACTT------------G---------A------TTTATCATTTAA-A------A--A-TGTAAAAAAAAA-------AAAA-AAA-------AT-ATGGGAAATAA-CCT---------T-TAC----------C-------AAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-
gi|13 : ataaatagtttttgcatagaaaggaATACTGATATTGATTTATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATAAGCAATTTCAATAA------TTTCTATGCTGAAAT-ATTTATATATTTCAATTCAT-GCAAAAAATGCCAGAACATCAATGATTTGAAATTGTATG-ATGTTTTATTTCAA--GCATTGT--GATGTAACAAACTATTTCAATAAAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTTACGATTGGATAC-GGAGTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TAAGTAATAT-CTTTAAAAA-GC--TA---AGAC-ATATG--AATTTTC-----A
gi|9 : cattgaaaggaATACTGATAT-GATT-ATATATT-AAAACAAGATACATACAGTTATACGAACGATT--AAGT-AAT-AACAATTC--ATAA------TTTACATGCTGAAATTATTTATATATTTCAATTCATGCCAAAAAAAGCCAGAACATCAATTATTTGACAATGTATTTATGGTT-A-GTCAAAACCAT-GT--GATG-AAAAAACTATTT-AATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTGT-ACAAT--GA-AC-GGAGTT-TTTCAGATATGTAGTTGATTATTGTGGTAAGAAAA-GG--TTAAACCTATTGAATGTTTTCTACGATAATCTTAGAATGAAAAGAAACATTTTTATGACCGAGTA---CAATAATTA-TAAGTAATATCTTTTAAAAAGGC--TACCCAGAACATA-G--AA-TTTC-----ATGA---TCCT---ACC-CTATTC-------------AAAAT--CTGCGTATT---GAAA
gi|21 : ataaataagtatttgcatgaaaggatTACTAATATTGATT-AGATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACAATTTTGAGTTAATTAGAAATTTCCACAA------TTTGTATGCTGAAAT-ATTTATATATTTCAATTCAT-GCAGAAATTA-CAGAACATCAATGCTATGAAAGTGTATA-ATGTTTTATATCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTTTTTAAATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattacttctgtaaaatcagcaattaatgaaataaatgattttagtaa
gi|19 : tcaatagtttttgcattgaaaggaatacatgAACGAA-TAC-CGCAGATTT--CAACGATCTGAACTCA-TTACCACGTTCTACAAGGAACTTTTCTGTGCC----------------TTCAATGAAG-T---AAATTGCCA-AGTGTCTAAGATA--GAACCG-ATG-AGGTATTACGCCAA----AATATCAGGTTCAACAAAAATTT-CAATCTAAAGGGAAAATAT-TATATTTTCAAAATTGGA-ATGAAAGTGGCTTAA-ATATGTAAAAGA-TCTTGTGG-AATAAAATGGAATAAAAC
gi|14 : G-GAAATGTGTATTTATTGACAATTGGATAC-AGAGTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAGGAAACA-TTTTATA--CGAGTA---CAA-A
gi|17 : aGAGATGAATTTGA-TATAGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---TAA-AATTA-TGAGTAATAT-TATCAAAAA-GC--TA---AGAC-A--TG--AATTTTC-----ATGA---T-TT---ACC-CTA-TC-------------AAAAC--TTGCGTA-T---GAAGCTCAATTTTGAAA--TCATA--TC------G--AT-GAAAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTTATAT-AT--CATCGAAAACGA--TGTATGAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTGC-ATAAA----CCCATATACCAATCC-TTTTT-AATtctagcgtatgaaactcaatttcgaaatcacgtctatcaaaaaaatccattaaaataactgatatatcaacgaaaacgatgtataaagtttttgtaagaaagaaattttatcaacccacataccaatcttttttaaatagatctttgaatattgaaagattttcttggagactaatttacgaaaaacaaaattgtaaatatgtattaaagaacaggttgcagaatttatttttttaatactcaatgatct
gi|2 : GATAGCCTGAGAA-GAAAAGAAACA-TGTTATG--CGAGTA---AAA-AATTA-TGAGTAATAT-TCTTTAAAA-GC--TA---A----ATATG--AATTTTC-----AAGA---T-TT---ATT-TTA-TC-------------AAAAT--TTACGTA-T---GAAACTCAACT-----------CA-------------AT-G-AACACATCCATTGGAA--TAA--CTAATAT-ATAACATCGGAAACAA--TGTATACAATTTTT-GTAAAAA-GAAA--TTTC-ATAGA----CCCGTGTACCAAT------------------ACT--TTAAA---T----------------TTTCTT-GGAGA-GTAATTT-AC-AAAAA--CAAAA----TTG-TAAA-T-ATG-T-ACGAAAAATAAA--G-T-TGCA--AAATTTGA--TTTTA-AA--AATA-GT-----------------CAAC-AAT-CT--CC-T-ATGA-AA--CA-AA-T-A--T--TTTATC-AG-GAAA-AT-TAAG---AAA-A---CTGAA--------------TCTG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT---AGAG---AAAATT--T---------TGAAC-A--C------------------AAT---G-A--AC---ACTTG-----------ATTTATCATTG------T----------A-A------AT-A-TGT--------A--------AAA-C---------AT-ATGGAAAATAA-CCTA--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--A-T-AAAA--TGG-AAACATAA---TCTTATTGGATTTCATATT-A----T--TG--A----AAAC---------AACCAAAAATTAGAC--------------A--------------T---TT-TG-----------------AATCTC-T-ACTA-TAG-A-AACTGTT--ATAT-ACAAATA--AA--AAA-------A--------A---GA----AAA-AA---A---GATAGAA--A-------ATACC--------A------AAAA-TAT--A-T-CTACTCGTGTTAACTGAAGATTCTTTAAGGATGT--------------------A--C------------T--C--ACTGG----TA-TAT-A----AAAG-GTTAC------ATA-T----AA-A-TTTC----A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AGTC-AG-TAA-------T-A-C-ATTAT--GATGAAATTATGT-ATCACA-TGT-ACTTGA-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--T-GT------TAT---CAAGG----------CATGC--TCCAGAG-----TG--TC---TTG-A-AC-ATAGT--AAG------G-CAA-AT--T-GA-AA-TAT-GAATTTTA-TAAAAAC
gi|6 : AGAAA-----TTGTG--CGTGTAAGGTAA-AGCTAATAA--AATTT-TTTTAAAAA-GCCGTA---AGAC-ATAGGGAAATTTTCGTTATAGCAATTT-TTCTAAGC-GCC-TCCTAGAAATTCAATAAGACATTTGCGTA-TAATGAAACTCAA-TTTGAAAATTCACAATTCGGGAGTTGAAT-A-AAATAATCCATGGAAAATTAAAACTGA-AT-AT--CA-CGAAA-TGATTGTTATAAAAGTTTT-GTAAAAAAGGAAATTTTCGATAAAAACCCCCTTATAACCATCCTTTTTTTAATAG---AACTCGTTAAAAATTA--TTTTAGATAG-TTTTTCTT-GGAGAGCTAATTATAC-AAAAAAACAAAGAATGTTG-TAAAAT-ATGGT-ATGAAAAAAAGGTCG-TGTGCA--GAATTTAA--ATTTT--A--AATAACT-----------------CAAA-ATTTCT--CC-TTATGT-AA--CATAA-T-CA-T--TCTCT--AG-GAAATAT-TAAG---AAAAT---ATGAAGATATGTAGACAGATCAG--AAAAATAGGGTGA-ATTATGTAAGAGAG---AAAATGTTT---------TGAGG-ACTC------------------AAT---G-A--AC---A---------------ctttg
gi|14 : -----AACA---T-TTTATACGAGTA--C-------------AAATC--TAGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACG--TC------T--ATCA-AAAAAATCCATTAAAA--TAA--CTGATAT-AT--CAACGAAAACGA--TGTATAAAGTTTTT-GTAAGAAAGAAA--TTTT-ATCAA----CCCACATACCAATCTTTTTTA-AATAG---ATCT--TTGAA---TA--TT---GAAAG-ATTTTCTT-GGAGA-CTAA-TTTACGAAAAA--CAAAA----TTG-TAAA-T-ATG-T-ATTAAAGAACAG--G-T-TGCA--GAATTT-A--TTTTT-TT--AATA-CT-----------------CAAT-GAT-CT--cgactcgaaattttcccattgtaaagatcgtaaaaacatttgagtggaaatt
gi|24 : aggaaatgtgtatttattgacaattggatacagagtggtttcagatatgtagttgatattgtggatgaaaatggtattaaacctattgaatggttttacgataatcttagaagaaaagga--TAA--CTTATAT-ATATTATCGAAAACGA--TGTCGAAAAATTTG-GCAAAAAAGAAT--TTCT-ATAAA----CCCATGTACCAATCCTTCTTT-AATAG---AACT--TT
gi|4 : AG---AACT--TTAAA---TAAATT---GATAAGATTGGCTG-GAAAA-CTA--TTTAC-AAAAA--CAAAA----TTG-TAAA-T-ATG-T-ATGAAAA--AAG--G-T-TGCA--GGATTT-A--ATTTT-AA--AATA-CT-----------------CAAT-AAT-CTCCAC-T-A-GT-AA--CA-AA-T-C--A--TTTCTC-AG-GAAA-AT-TAAG---AAA-A---ATGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT---AGAG---AAACTA--T---------TGAGG-A--C------------------AAT---G-A--AC---ATT-------------ATTT------ATCATGTT----------A-A------AATA-TGT--------A--------AAA-CAT-------GT-ATGGG-AATAACCTC---AA-AAAT-TACCAAATT-TGAT--A-T-AAAA--TGG-AAACATAT---TTTTATTGGA-TTTA---TCA----T--TGTAA----AAATATGTA----AAA-----------C--------------A--------------T---GTATGGGA-AAT-AACCTCAAAAAT----T-AC--------CAA-------ATTT----GATA--TA--AAATGGAAACATATTT-TTATTGGATTTTTA---------T-GT-AAAA-CA---------ACC-------AA------AAAA-TATATA-T-TT--TG------------------------AT-T--------------------AACC------------T--A--ATTTC----TACTAT-AGC--AACT-GTTATTTACAAATA-A----AG-A-T
gi|5 : ---AGCT--TTAAA---TA--T----GATGA--TTTTCTTGAGAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--C-AAA----TTGTTCAA-TGATG-T-ATAGAAAAAAAG--GTT-TGCATGGAATCTAATTATTTA-GAAGAATACCT-----------------CAAT-AAT-CT--CCTT-ATG--AATCCA-AA-TAA--T--TCTATCGAG-AAGA-ATGTAAG---AAA-GGAAATGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTG--ATTATGTG--AGAG---GAAATG--G---------GGAGG-C--C------------------AAT---GAA--AC---ACGATAGTTTTATCATG---------A------T----------A-A------A--A-TGCGA------A-------GAAATCAT-------ATGATGGGAAATAA-CCTCAAAA-AAAT-TACCAAATTCTGAT--A-T-TAAA--TGG-AAACATA----TCTTATGGGATTTTA---T-A----G--TGAAA----AAAC---------AAC-----------CCAAAAAACTAGATTA--------------T---TT-TGTTTTAAT--ACCT----AATTTCATAATTA-TAGCACACTT-TT--ATGT--CAAAAA--TA--AGATG------TACTT-GTA---GAACTCAAG-GAC--ATT-G--AGAA-AG-------TTACG-------AA------AAGA-TAT--A-T-TTGCTC------------------------ATGT--------------------gtttgtagaatcaaggacgtgaggaaagtaccgaaaatattctgctcatgttaaagctcttaaatgatatcattggtaataaaaggttacaatagaattcaataatatgttcgaacaaatcagtaatgcattatgatgaattatgtgatatatgtacatgcattaatatgtttatttgtatcaagacatgtgtcttgaacatttaagggcaaattaaatatgataaaaacattat
gi|7 : A---TA--TT---GATAA-ATTTTCTT-GGAGA-CTGA-----------A--TA--------TG-TAA--T-ATG-T-ATGAAAAA---GC-G-T-TGCAA-GAATC--A--ATTTT-GA--A-TA-CTTCTTTGCTACGTTTTGTCAAT-CAT-CT---T-T-ATAA-AG--TA-AACT-T--T--TTTCTC-AGTGAAA-AT-AGAA---AAA-----CTGAAC-------------TCAG--ACAAAT---GTGA-A----------------AAAT-G--T---------TGAAGGA--C------------------AAC---G-A--AT---GCCTGGTTT-------A---------A------TTTCATTGTAAA-A------A--A-TGT--------A---------AA-CAT-------AT-ATGGG-AATAA-GCT---CA-AAAT-TAACAAATT---AC--ATT-AAAA--TGG-AAAC--AT---TCGTTTTGGATTTTA---T-A----T--TG--AACATAAACCAAAAAAGTAGA-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACTT----AATCT------------------T-TT--ATTT-ACAAATA--TA--AA--G-----GTATTG-TAA---GAATT--AG-GAC--ACT-GA-AGAAGTATCAGACTATATC-------TACCTCTTAAAC-AATG-ACC-TTCCTTTAAGG-------------------ATGT--------------------A--C------------T--T--ACTTGAT--TA-CAT-A----A-----TTAT-------TA-T----AG-A-TTTCAAT-AAAATAT---AT---GTT-CCAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATT----------------T-GATGCA-CTT-ATGTG-------AAT-ATGTTTTA--------------AT---T----------------TGC--GCC---G-----AG--TC---TTG-A-AC-ATGTT--AGG-G----G-CAGCAT--T-GA-AA-TAT-AA-----taaagcttcttttaaagatgttacaaattgtactctttcgggactgataacaggtacatatagcattaattaattcatgttcggaaagaaatcgagtaatggcattattgatggaatatgtgatatagtgtacatgcgattcaattatgtttaatttgtatcaagcatgcgcccggtgtcccttggaacacgttaaggggcaaattataatatggaataaaaata
gi|25 : --TT---GGTAG-ATTTTCTT-TGAGA-GTAATTT-AC-AAAAA--CAAAA----TTG-TAAA-T-GTC-T-ATCAAAAAAGAG--G-T-TGAA--GGATTT----ATTTTCAA--AATA-C
gi|8 : AATTTAA---TTTC-AG--AATA-TC-----------------TAAT-AAT-GT---C-T-ATGT-AA--CA-AA-T-A--TAATTTCTC-AG-GAAA-ATATAAG---AAA-A---CT-AT--------------TCAGCCACAAAT---GTGATATTATGT---AGAGCGAAAA--G--T---------TGG-G-A--C------------------AAT---G-A--ACTCTG---------------A---------T------T----------A-T------C--A-TGT--------A-------AAAA--ATCAGTAAAAT-ATGG-AAATAA-CCTCTAAACAAAT-TACCAAATT-TGAT--A-TTAAAA--TGG-AAACAT-TCTCTCTTATTGGATTTTA---T-A----G--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------AAGGAATAGATA---T---TT-TG----AAT-AACCT----AATTTC-T-ACTA-TA--GCAACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG------TATT--GTA---GAA-TCAAG-GAC--ATT-GA-GGAA-AG--------TACC--------A------AAAA-TAT--A-T-CTGCTCATGTTAAAGCTTCTTTAAAG----ATGT--------------------A--C------------T--C--ATTGG----TA-TAT-A----AAAG-GTTAC------TTA-T----AG-A-ATTCAAT-A----TT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT--GATGAAATTATGT-GATATA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTATT--T-GT------TAT---TAAAA----------CATGC--GCCCGAG-----TG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AAG-G----G-CAA-AT--T-AA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
gi|10 : TC-AG-GAAA-AT-GAAG---AAA-A---ATGAA--------------TCAG--ACAGAT---GTAA-ATTATGT---AGAG---AAAATG--T---------TGAAG-A--C------------------AAT---G-A--AC---A---------------T---------T------T----------G-ATTTATCA--T-TGT--------A-------AAAA-TGT-------A-------AAACAA-CCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--A-T-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------AAAAAATAGACA---T---TT-TG----AAT-AACCT----AATTTC-T-ACTA-TAG--CAACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG------TATTG--TA---GAAT-CAAG-GAC--ATT-GA-ACAA--A-------ATACC--------A------AAAA-TAT--A-T-CTGCTC------------------------ATGTTAAAGTTTCTTTAAGGATGTA--C------------T--C--GTTGG----TA-TAT-A----AAAG-GTTAC------ATA-ATTATAG-A-TTTCAAT-A----AT---ATAT-GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT--GATGAAATTATG---ATATA-TAT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTT------GT------TAT---CAAGA----------CATGC--TCCCGAG-----TG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AAG-G----G-CAA-AT--T-GA-AA-TAT-GA-----A-TAAa
gi|12 : tTGAA--------------TCAG--CCAAAT---GTGA-ATTATGT---AGAG---AAAATG--TTGAAGACAATGAAC-A--CTTGATTTATCATTGTAAAAATTTAA-A--AC---A---------------T---------A------T----------ACA------A--A-TGT--------A--------AAA-CAC-------AT-ACGGGAAATAG-CCT---AA-AGAA-TACCAAATT-TAAT--A-T-CAAA--GGG-AAACATAT---TCTTATTGGACTTTA---T-A----G--TG--A----AACC---------AGCCAAAAATAGA-C--------------A--------------T---TT-TT----AAT-AAGCT----AATTTC-T-ACTA-TA--GCAACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG------TGTT--GTA---GAA-TCAAG-GAC--ATT-GA-CGAA-AG--------TACC-------G-------AAAA-TAT--A-T-CTGCTTACGTTAAAGCTTCTTTAAAG----ATGT--------------------A--C------------T--C--ATTGG----TA-TATAA----AAAG-GTTAC------ATA-C----AG-A-ATTCCAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--TATC-AG-TAA-------C-G-C-ATTAT--GATGAATTTATGT-GATATA-TGT-AAATAA-A--T-AAT----CTTTAT--T-TT------T
gi|11 : aaG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT---AGAG---AAAATG--T---------GCAGG-A--C------------------AAT---G-GGGAC---ACTTGATTTATCATT-G---------A------T----------A-A------A--AATGT--------A--------AAA-CAT-------AA-ATGGGAAATAA-CTC---AA-AAATATACCAAATT-TGATTTA-T-AAAAATTGGGAAAAACAA---TCT-ATTGGATT--A---T-A----A--TG--A----AA-C---------AATT----------C--------------AAAAAATAGATATTTT---TT-TG----AATTAACCT----AATTTC-T-ACTA-TTG-ATAACTGTT--ATTT-ACAA-TA--TA--AGATG-----TTATTG--TA---GAAT-CAAGTGAC--ATT-GA-CGAA-AG--------TACC-------GA------AAA--TAT--A-T-CTGCTCTGTTAAAGCCTTCTTTTAAAG---ATGT--------------------A--C------------T--TTTATTGGC---TA-TAT-A----AAAGCGTTAC------ATATA----AG-AATGTCAAT-T----AT---AT---GTTTCGAAAA--AA-C-AG-TAA-------TGG-C-ATTGTG-AT--AAAT-------GTACA-TGTAACATGC-A-TT-AAT-ATG-TTTAT--T-GT------TATGTCCAAGA----------CA-GG--GCCCGAG-----TG--TC---
gi|20 : ag--T---------TGAAG-A--C------------------AAT---G-A--AC---A--------------------------------C----------A-A------G--A-TTT--------ATTTGCGTGAAA-----------AT-ATGGGAAATAA-CTT-------------CA----T-TGAC--A-T-------T-----ACAT------------GGATTTTA---T-G----T--TG--A----AAAC---------GAC-----------C--------------AACGAATTG------TCAGTT-TG----AAT-GACTT----AATGTC-T-ACTA-T-------CTGTT--ATTT-ACATCTT--TC--AGATC-----A------------------AAG-AA---ATT-TA-CGAA-AG--------TGCC-------GA------AAAA-TAT--A-T-GTACTCATGATAAAACTTTGAAG-------ATGT--------------------A--C------------TCGC--ATTT-----TA--AT-A----AAAG-GCTGC------AT
gi|4 : ---A---------------A---------A-----------------A-A------T--A-TGT--------A--------AAA-CAT-------GT-ATGGGAAATAA-CCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAT--A-T-AAAA--TGG-AAACATAT---TTTTATTGGATTTT----T-A----T--GT--A----AAAC---------AAC-----------CAAAAAATATAT---A--------------T---TT-TG----ATT-AACCT----AATTTC-T-ACTA-TA--GCAACTGTT--ATTT-ACAAATA---A--AGATG--------TTT-GTA---GAA-TCAAG-GA---CGT-GA-GGAA-AG--------TACC-------G-------AAAA-TAT----T-CTGCTC------------------------ATGTTAAA----------------G--CTCTTAAATGATAT--C--ATTGG----TA--AT-A----AAAG-GTTAC------A-A-T----AG-A-ATTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAACA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT--GATG-AATTATGT-GATATA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATG-TTTAT--T-TG------TAT---CAAGA----------CAT----------G-----TG--TC---TTG-A-AC-ATT-T--AAG-G----G-CAA-AT--T--A-AA-TAT-G------A-TAAAAACg
gi|18 : agaactttaaataaattgataagattggctggaaaactatttacaaaaacaaaattgtaaatatgtatgaaaaaaggttgcaggatttaattttaaaatactcaataatctccactagtaacaaatcatttctcaggaaaattaagaaaaatgaatcagacaaatgtgaattatgtagagaaactattgaggacaatgaacattatttatcatgttaaaatatgtaaaacatgtatgggaataacctcaaaaattaccaaatttgatataaaatggaaacatatttttattggatttatcattgtA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-AGGCCTAGTG--A----AAAC---------AAC-----------CAAAAAATAGAT---A--------------T---TT-TG----AAT-AACCT----AATTTC-T-ATTA-TA--GCAACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG------TATT--GTA---GAA-TCAAG-GAC--ATT-GA-GGAA-AG--------TATCTGCTCATGT------TAAA-GCTT-C-T-TTAAAG------------------------ATGT--------------------A--C------------T--C--ATTGG----TA-TAT-A----AAAG-GTTAC------ATA-T----AG-A-ATTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-attat
gi|15 : --TG--G----AAAT---------AAC-----------------------------------------T---TC-AG----AA--AAC-------ATCTC-T-ACTAATAG-GCAACTGTTCCATTTCACAAATAATTA--AGATG------TAATT-GCA---GAATCCAAG-GAC--ATTGGA-AGAA--A-------ATACC-------AA------CAAATTATACA-TGCTGCTC------------------------ATGT--------------------
gi|16 : tgtaaaaacacta----AATTTC-T-AGTA-TATTGCAATTGTT--ATTC-ACAAATA--TATAAGGTG------TGTTGTGTT---CAATT-AAA-GACATATT-GA-AGAA-T----------ACC--------A------AAAA-TATG---T-CTATTC------------------------ATGTTAAAAGCGGCTA--------G--C------------T--C--TCTTG----TA-TAT-ATGTAAAAA-TTTAC------ATA-ATAT-AG-A-TTTTAAA-A----ACTGCAT---GAT-CGAAAA--AATC-AG-TAGATCTAATT-T-C-ATTAG--GATGAAATGA----GATGCA-TG---CATAA-A-TT-GAT-ATGTTTTATAGT-GC------TAT---CAAGATCGATATGTGCATGCATGCCTGAG-----TG--TC---TTG-A-AC-ATTGTG-AAG-ACTGGG-GAA-GT--T-AA-AA-TCT-GA-----tgaagcttcttttaaggatgtagctgcattgagtatagcatgttatgaactagcgttcatattatttcaataacataatgttcgaaaaaatcagttaattgctcttagaggaaaattatgtcgatacatgtcatgcctttgatagttttattgttatataagacatgttccagatgtatgtccttttgacacgattgttaaacggcaaactgacaattatgaattaagaaaaca
gi|22 : ------------------------ATGT--------------------A--C------------T--C--ATTGG----TA-TA---------------------------------G-A-TTTCAAT-A----------T---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT--GATGAAAGTATGT-GAT------T-ATGTGT-A----AAT-ATGTTTTAT--T-GT------TAT---CAAGA----------CATGG--GCCTGAG-----TG--TC---TTG-------------------------AA-AT--T-GA-AA-TAT-AA-----A-TACAAAC
gi|23 : gcagatatatctgctcatgttaaagcttctttaagg------------------------ATGT--------------------A--C------------T--C--GCTAGAA--CA-CAT-A----AAGG-GTTAC------ATA-------------------------T---AG---GTT-CGAAA---AATC-AG-TAA-------T-G-T-ATTAT--GATGAAATTACGT-GATACA-TGT-a
gi|5 : tttattcatgttaaagcttctttaaggTGT--------------------A--C------------T--C--TTTCGGGACTG--AT-A----ACAG-GT-AC------ATA-T----AGCA-TT--AATTA----ATTC-AT---GTT-CGGAAAGAAATCGAG-TAA-------T-GGC-ATTATTGATGGAA--TATGT-GATATAGTGT-ACATGCGA-TTCAATTATGTTTAAT--T-TG------TAT---CAAG-----------CATGC--GCCC-GG-----TG--TCCC-TTGGA-AC-ACGTT--AAG-G----GGCAA-AT--T-AT-AA-TATGGA-----A-TAAAAAgtagcgtgtaaccttattg
gi|15 : agctttaaatatgatgattttcttgagagactaattttacaaaaacaaattgttcaatgatgtatagaaaaaaaggtttgcatggaatctaattatttagaagaatacctcaataatctccttatgaatccaaataattctatcgagaagaatgtaagaaaggaaatgaatcagacaaatgtgattatgtgagaggaaatggggaggccaatgaaacacgatagttttatcatgataaaatgcgaagaaatcatatgatgggaaataacctcaaaaaaattaccaaattctgatattaaatggaaacatatcttatgggattttatagtgaaaaaacaacccaaaaaactagattattttgttttaatacctaatttcataattatagcacacttttatgtcaaaaataagatgtacttgtagaactcaaggacattgagaaagttacgaaaagatatatttgctcatgttaaagcttcttttaaagatgttacaaat-A-TTTCAAT-A----AC---ATAATGTT-CGAAAA--AATC-AGTTAAT------T-G-CTCTTAG--AGGAAAATTATGTCGATACA-TGT--CATGC-CTTT-GAT-A-GTTTTAT--T-GT------TATA--TAAGA----------CAT----GTTCCAGATGTATG--TCCTTTTG-ACACGATTGTTAAAC-G----G-CAA-AC--T-GACAATTAT-GA-----ATTAAGAAta
gi|21 : tgtaaaaacactatggaaataacttcagaaaacatctctactaataggcaactgttccatttcacaaataattaagatgtaattgcagaatccaaggacattggaagaaaataccaacaaattatacatgctgctcatgttgaagcttcttttaaggatgtagctgcattgagtatagcatgttatgaactagcgttcatattT-ACATGT-A-CT-AAT-AT---TGAT--TAGA------TAT---TAAAAA---------CAAGT--GCTACAG-----T----T---TTG-A-ACAATTTT----G-A----G-TTA-AT--TAGA-AA-Taaca
gi|29 : tcaatagtttttgcattgaaaggaaATGC-A-TT-AAT-ATATTTCAT--T-CT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGAG-----TG--TC---TTG-A-ttccacaatttgtatgctgaaatatttatatatttcaattcatgcagaaattacagaacatcaatgctatgaaagtgtataatgttttatatcaaccattgtggtgtaacaaactttttaaat
gi|26 : tataatgt-ATGTTTTAT--T-TTACACTGTAT---CAAGAA---------CATGC--GCCCGAG-----TGGGTC---TTG-A-AA-ATTGT--AAGGA----G-CAA--TCGT-GA-AA-TAT-GA-----A-TAAAA
gi|27 : aGTTTTAT--T-CT------TAT---CAAGA----------CAAGT--GCCCGGG-----AG--TT---TTG-A-AT-ATTGT--AAG-G----A-CAA-AT--T-GA-AA-TAC-GA-----A-TAAACAC
gi|28 : A----------CATGC--GCCCGAG-----TT--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AAT-G----G-CAA-AT--T-AA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAACctt
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111 2222222 222222222 22222 111 111 11 444444444444444444 11 11 11 1111 1 11111 11 33333333333333333 11111 1111111 22222222222222 111111111 111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111 11111 1111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 111 1 111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 111111111 1111111 1111111111
lowQualScore : 0 8 6 6 99 1 3 1 3 6 6 6 6 7 1 6 1 111 99 1 2 6 7 7 6 2 5 5 0 5 6 0 5 66 888 5 5 5 5 77 000 5 1 77 1 8888888 666666666 33333 000 77 5 000 0 1 55 99 3 555555555555555555 77 55 5 55 1 5 5 5 5 55 5 2222 1 5 888 66 888 66 777 4 4 4 5 4 66 00000 4 4 4 4 4 3 00 4 4 66 0 4 55 4 777 4 4 11111111111111111 4 1 66 00000 88 66 5 5 9999999 4 4 4 8 4 777 55 77777777777777 55 666 3 3 666 444444444 55 666 88888 44 666666666 3 44 555 3 44 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 2 0000000 3 99 3 3 3 444 77 44 3 00000 555 3 0000000 88 6666 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 555 3 1111 3 3 3 3 888 3 44 3 44 44 3 888 3 3 555 6 3 44 3 3 777 66 777 2 2 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33 2 2 2 99 44444444 2 6666 33 5 6666 7777 66 0 2 888888888 2 33 2 2 2222222 2 2 3 3 3 3 2 2 2 3 3 3 2 33 1 777777 777 4444444444 33 444 33 888 2 2 3 44 77777 3 3 3 44 3 3 3 77777 3
lowQualScore : . . . . .. . . . . . . . . . . . . ... .. . . . . . . . . . . . . . . .. ... . . . . .. ... . . .. . ....... ......... ..... ... .. . ... . . .. .. . .................. .. .. . .. . . . . . .. . .... . . ... .. ... .. ... . . . . . .. ..... . . . . . . .. . . .. . . .. . ... . . ................. . . .. ..... .. .. . . ....... . . . . . ... .. .............. .. ... . . ... ......... .. ... ..... .. ......... . .. ... . .. .......................................................................................... . . ....... . .. . . . ... .. .. . ..... ... . ....... .. .... ..................................................... ... . .... . . . . ... . .. . .. .. . ... . . ... . . .. . . ... .. ... . . ...................................................................................................................... .. . . . .. ........ . .... .. . .... .... .. . . ......... . .. . . ....... . . . . . . . . . . . . . .. . ...... ... .......... .. ... .. ... . . . .. ..... . . . .. . . . ..... .
lowQualScore : 8 0 7 7 22 7 5 0 3 7 7 7 7 8 0 7 7 777 22 7 5 7 5 3 7 5 7 7 1 1 7 7 0 99 888 0 7 7 7 99 000 7 4 99 0 3333333 777777777 33333 000 99 7 000 1 8 22 22 2 000000000000000000 99 77 7 77 7 7 7 7 7 77 7 1111 4 7 888 99 888 11 888 4 4 4 4 4 11 22222 4 4 4 4 4 4 66 4 4 11 4 0 55 0 000 0 0 11111111111111111 4 0 11 44444 66 99 0 0 0000000 4 4 4 9 4 000 00 55555555555555 00 444 6 6 444 555555555 00 444 33333 66 777777777 3 66 888 3 66 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 5 8888888 3 22 3 3 3 777 99 22 1 22222 444 1 5555555 55 5555 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 444 1 9999 1 1 1 1 222 1 22 1 22 22 1 222 1 1 444 6 1 22 1 1 000 88 999 9 9 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 99 9 9 9 66 33333333 9 1111 99 7 1111 0000 88 1 9 666666666 9 99 9 9 1111111 9 9 1 1 1 1 2 9 9 1 1 1 9 77 1 777777 999 3333333333 77 777 77 333 9 9 1 22 77777 1 1 1 22 1 1 1 77777 6
consensus : ATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAGCAATTTCNACAATTTNTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATTTGAAANTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAATTGGATACGGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATATG--AATTTTCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---AAC--TTGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACA--TC------T--AT-G-AAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGAT-G-T-ATAAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--GT-T-GCA--GAATTT-AATT--TT-AAAA---TA-C-T-----------------C-AATAAT--CTCC--T-ATGT-AA--CA-AA-T--N-T--TTTCTCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---AN-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--C-------------GA----------T---------------A-A-A--A-T--------GT---------A-AAACAT-------AT-ATGGGAAATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TAG-GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AATTCAAG-GACAT--T-GAAGAAAG-TACCGA-AAA--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------A--------------------TG------------------------T------------AC------------T-------------------C--A-TT-G-G--TAT--------AT-A----AA--AG-GTTACA----TAT---AG--ATTTCAAT-A----AT---ATGTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-GATACA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
Reference ( family-3684 ) : ATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAGCAATTTCNACAATTTNTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATTTGAAANTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTNACAATTGGATACGGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATATG--AATTTTCANGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---AAC--TTGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACA--TC------T--AT-G-AAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGAT-G-T-ATAAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--GT-T-GCA--GAATTT-AATT--TT-AAAA---TA-C-T-----------------C-AATAAT--CTCC--T-ATGT-AA--CA-AA-T--N-T--TCTCTCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---AN-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--C-------------GA----------T---------------A-A-A--A-T--------GT---------A-AAACAT-------AT-ATGGGAAATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TAG-GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AATTCAAG-GACAT--T-GAAGAAAG-TACCGA-AAA--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------A--------------------TG------------------------T------------AC------------T-------------------C--A-TT-G-G--TAT--------AT-A----AA--AG-GTTACA----TAN---AG--ATTTCAAT-A----AT---ATGTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-GATACA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
gi|1 : ATACTGATATTGGTT-ATATATTGAAAACAAG-TGC-CACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAACAATTTCAACAATTTCTATGCTGAAGT-ATTTATATAT-TTCAATTCATTC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATATGAAATTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTTTTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAGTTGGATACAGA-GTGGTTTAAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTTTTGAATGGTTT-TACGATAATTTTAGAACAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTCAAAAA-GC--TA---AG-AAATGTG--AATTTTCAACAT-------TTAC---------CGTA-----TCAA---AAC--TTACGTA-T---GAAACTCAAATTTGAAA--TCACA--TC------T--AT-G-AAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGAG-G-T-ATACAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATA-AATTTTCTTA-GAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--GT-T-GCA--GAATTTAAATT--TT-GAAA---TA-C-T-----------------C-AAAAAT--CTAC--T-ACGT-AA--CA-AA-T--C-T--TTTCTCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---TC-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---ATTG-----TT--GA---------A-GAC--AAT---G-A--A---------------CA----------------AA----------T---------------A-A-A--A-T--------GT---------AGAAACAT-------AT-ATGGGAAATAA-CTT--AA-AAAT-TACAAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TAG-GCA-ACT-TT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATGAT-A-TTGGT-AG---ACTTCAAG-GA-AT--T-GAAGAATGATACCGA-AAA--ATATG--AT-TTG-CTC------------------------A--------------------TG------------------------T------------AC------------T-------------------C--A-TT-T-G--TAT--------AT-A----AA--AG-GTTACA----TAA---AG--ATTTCAAT-A----AT---ATGTT-CGAAAT--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-ATTG-AAATTATGT-GATACA-CGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---TAAGA----------CATGC--GCCCCA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GA-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
gi|10 : TCAG-GAA-A-AT-GAAG-AAA---AA-TGAA--------------TCAG--ACAGAT---GTAA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------A-GAC--AAT---G-A--A---------------CATTT-------------GATT--------T---------------ATC-A--T-T--------GT---------A-AAA-AT-------GT-A----AAACAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AACCAAAAAATAGAC--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TA--GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--T-GAACAAAA-TACC-A-AAA--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------ATGTTAAAGTTTCTTTAAGGATG------------------------T------------AC------------T-------------------C--G-TT-G-G--TAT--------AT-A----AA--AG-GTTACATAATTAT---AG--ATTTCAAT-AAT--AT---ATGTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTA--T-GATATA-TAT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTT---T--TGT------TAT---CAAGA----------CATGC--TCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAA
gi|11 : tG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TG--CA---------G-GAC--AAT---G-GGGA---------------CA--CTTGATTTATCATTGA----------T---------------A-A-A--AAT--------GT---------A-AAACAT-------AA-ATGGGAAATAAC-TC--AA-AAATATACCAAATT-TGATTTAT-AAAAATTGGGAAAAACAA---TCT-ATTGGATT--A---T-A----A--TG--A----AA-C---------AATT----------C--------------AAAAAATAGATATTTT---TT-TG----AATTAACCTAATTTC-T-ACTA-TTG-ATA-ACTGTT--ATTT-ACAA-TA--TA--AGATG-TTA-TT-GT-AG---AAT-CAAGTGACAT--T-GACGAAAG-TACCGA-AAA---TAT---AT-CTG-CTCTGTTAAAGCCTTCTTTTAAAG---A--------------------TG------------------------T------------AC------------T-------------------TTTA-TT-G-GC-TAT--------AT-A----AA--AGCGTTACA----TAT---AAGAATGTCAAT-T----AT---ATGTTTCGAAAA--AA-C-AG-TAA-------TGG-C-ATTGT-GATA-A----ATG----TACA-TGTAACATGC-A-TT-AAT-ATG-TTTAT--TGT------TATGTCCAAGA----------CA-GG--GCCCGA---GTG--TC---
gi|12 : ag---AA-TGAA--------------TCAG--CCAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GAGAAAATGTTG--AAGACAATGAACACTT--GATTTATCATTGTAAA--AATTTAA-A--A---------------CA--T--------------A----------T---------------ACA-A--A-T--------GT---------A-AAACAC-------AT-ACGGGAAATAGCCTA--AA-GAAT--ACCAAATT-TAAT--AT-CAAA--GGG-AAACATAT---TCTTATTGGACTTTA---T-A----G--TG--A----AACC---------AGCCAAAAATAGA-C--------------A--------------T---TT-TT----AAT-AAGCTAATTTC-T-ACTA-TA--GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-G-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--T-GACGAAAG-TACCG--AAA--ATAT---AT-CTG-CTTACGTTAAAGCTTCTTTAAAG----A--------------------TG------------------------T------------AC------------T-------------------C--A-TT-G-G--TAT--------ATAA----AA--AG-GTTACA----TAC---AG--AATTCCAT-A----AT---ATGTT-CGAAAA--TATC-AG-TAA-------C-G-C-ATTAT-GATG-AATTTATGT-GATATA-TGT-AAATAA-A--T-AAT----CTTTAT--TTT------T
gi|13 : ATACTGATATTGATTTATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATAAGCAATTTCAATAATTTCTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATTTGAAATTGTATG-ATGTTTTATTTCAA--GCATTGT--GATGTAACAAACTATTTCAATAAAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTTACGATTGGATACGGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TAAGTAATAT-CTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATATG--AATTTTCA
gi|14 : cattgaaaggaG-GAAATGTGTATTTATTGACAATTGGATACAGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAGGAAACA-TTTTATA--CGAGTA---CAA-A
gi|14 : aCAA---ATC--TAGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACG--TC------T--ATCA-AAAAAATCCATTAAAA--TAA--CTGATAT-AT--CAACGAAAACGAT-G-T-ATAAAGTTTTT-GTAAGAAAGAAA--TTTT-ATCAA----CCCACATACCAATCTTTTTTA-AATAG---ATCT--TTGAA---TA--TT---GAAA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAA-TTTACGAAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATTAAAGAACAG--GT-T-GCA--GAATTT-ATTT--TT-TTAA---TA-C-T-----------------C-AATGAT--CTtctagcgtatgaaactcaatttcgaaatcacgtctatcaaaaaaatccattaaaataactgatatatcaacgaaaacgatgtataaagtttttgtaagaaagaaattttatcaacccacataccaatcttttttaaatagatctttgaatattgaaagattttcttggagactaatttacgaaaaacaaaattgtaaatatgtattaaagaacaggttgcagaatttatttttttaatactcaatgatct
gi|15 : aggaaatgtgtatttattgacaattggatacagagtggtttcagatatgtagttgatattgtggatgaaaatggtattaaacctattgaatggttttacgataatcttagaagaaaaggaaacattttatacgagta--TG--G----AAAT---------AAC-----------------------------------------T---TC-AG----AA--AAC---ATCTC-T-ACTAATAG-GCA-ACTGTTCCATTTCACAAATAATTA--AGATG-T-AATT-GC-AG---AATCCAAG-GACAT--TGGAAGAAAA-TACCAACAAATTATAC---ATGCTG-CTC------------------------A--------------------TG------------------------TTGAA--------GC------------TTCTTTTAAGGATGTAGCTGC--A-TT-GAG--TATAGCATGTTAT-G----AACTAGCGTT-CA----TAT----T--ATTTCAAT-A----ACATAATGTT-CGAAAA--AATC-AGTTAAT------T-G-CTCTTA--GAGGAAAATTATGTCGATACA-TGT--CATGC-CTTT-GAT-A-GTTTTAT--TGT------TATA--TAAGA----------CATGT--TCCAGATGTATG--TCCTTTTG-ACACGATTGTTAAA-----CG-G-CAA-AC--TGACAATTAT-GA-----ATTAAGAA
gi|16 : tgtaaaaacactaAATTTC-T-AGTA-TATTGCA-ATTGTT--ATTC-ACAAATA--TATAAGGTG-T-G-TT-GT--GTTCAATT-AAA-GACATATT-GAAGAA---TACC-A-AAA--ATAT---GT-CTA-TTC------------------------A--------------------TG------------------------TTAAAAGCGGCTAGC------------T-------------------C--T-CT-T-G--TAT--------AT-ATGTAAA--AA-TTTACA----TAATATAG--ATTTTAAA-A----ACTGCATGAT-CGAAAA--AATC-AG-TAGATCTAATT-T-C-ATTAG-GATG-AAATGA----GATGCA-TG---CATAA-A-TT-GAT-ATGTTTTATAGTGC------TAT---CAAGATCGATATGTGCATGCATGCCTGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--GAAGACTGG-G-GAA-GT--TAA-AA-TCT-GA-----aaca
gi|17 : GAGATGAATTTGA-TATAGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---TAA-AATTA-TGAGTAATAT-TATCAAAAA-GC--TA---AG-AC--ATG--AATTTTCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---AAC--TTGCGTA-T---GAAGCTCAATTTTGAAA--TCATA--TC------G--AT-GAAAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTTATAT-AT--CATCGAAAACGAT-G-T-ATGAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTGC-ATAAA----CCCATATACCAATCC-TTTTT-AAT
gi|18 : A--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-AGGCCTAGTG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------AAAAAATAGATA---T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ATTA-TAG--CA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--T-GAGGAAAG-TATCTG-CTC--ATGTTAAAG-CTT-CTTTAAAG-------------------A--------------------TG------------------------T------------AC------------T-------------------C--A-TT-G-G--TAT--------AT-A----AA--AG-GTTACA----TAT---AG--AATTCAAT-A----AT---ATGTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-
gi|19 : AACGAA-TAC-CGCAGATTT--CAACGATCTGAACTCA-TTACCACGTTCTACAA----------GGAAC-TTTTCTGTGCCTTCAAT----GA-AGTAAATTGCCA-AGTGTCTAAGAT--AGAACCG-ATG-AGGTATTACGCCAA----AATATCAGGTTCAACAAAA-ATTTCAATCTAAAGGGAAAATAT-TATATTTTCAAAATTGGA-ATGAAAGTGGCTT-AAATATGTAAAAGA-TCTTGTGG-AATAAAATGGAATAAAAC
gi|2 : GATAGCCTGAGAAGAAAA-GAAACA-TGTTATG--CGAGTA---AAA-AATTA-TGAGTAATAT-TCTTTAAAA-GC--TA---A----ATATG--AATTTTCAAGAT-------TTAT---------TTTA-----TCAA---AAT--TTACGTA-T---GAAACTCAACT-----------CA-------------AT-G-AACACATCCATTGGAA--TAA--CTAATAT-ATAACATCGGAAACAAT-G-T-ATACAATTTTT-GTAAAAA-GAAA--TTTC-ATAGA----CCCGTGTACCAAT------------------ACT--TTAAA---T----------------TTTCTTG-GAGA-GTAA-TTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ACGAAAAATAAA--GT-T-GCA--AAATTT-GATT--TTAAAAA---TA-G-T-----------------C-AACAAT--CTCC--T-ATGA-AA--CA-AA-T--A-T--TTTATCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---AC-TGAA--------------TCTG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATT-----TT--GA---------A-CAC--AAT---G-A--A---------------CA--CTT-----------GATTTATCATTGT---------------A-A-AT-A-T--------GT---------A-AAAC---------AT-ATGGAAAATAACCTA--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAA---TCTTATTGGATTTCATATT-A----T--TG--A----AAAC---------AACCAAAAATTAGAC--------------A--------------T---TT-TG-------------AATCTC-T-ACTA-TAG-A-A-ACTGTT--ATAT-ACAAATA--AA--AAA-----A-------AG---AA---AAA-AAGAT------AGAAAA-TACC-A-AAA--ATAT---AT-CTA-CTC------------------------G--------------------TGTTAACTGAAGATTCTTTAAGGATGT------------AC------------T-------------------C--A-CT-G-G--TAT--------AT-A----AA--AG-GTTACA----TAT---AA--ATTTC----A----AT---ATGTT-CGAAAA--AGTC-AG-TAA-------T-A-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-ATCACA-TGT-ACTTGA-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGG----------CATGC--TCCAGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATAGT--AA------G-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GAATTTTA-TAAAAAC
gi|20 : -----TT--GA---------A-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--C-----------------------------------------A-A-G--A-TTTATTTGCGT---------G-AAA----------AT-ATGGGAAATAACTTC--A---------------T-TGAC--AT-------T-----ACAT------------GGATTTTA---T-G----T--TG--A----AAAC---------GAC-----------C--------------AACGAATTG------TCAGTT-TG----AAT-GACTTAATGTC-T-ACTA-T--------CTGTT--ATTT-ACA----------------T-C-TT-TC-AG---A--TCAAA-GAAAT--T-TACGAAAG-TGCCGA-AAA--ATAT---AT-GTA-CTC------------------------A--------------------TG------------------------ctttg
gi|21 : TACTAATATTGATT-AGATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACAATTTTGAGTTAATTAGAAATTTCCACAATTTGTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AGAAATT-A-CAGAACATCAATGCTATGAAAGTGTATA-ATGTTTTATATCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTTTTTAAATataaaactttgaagatgtactcgcattttaataaaaggctgcatg
gi|22 : tcaatagtttttgcattgaaaggaatacatgAG--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------A--------------------TG------------------------T------------
gi|22 : gc------------------------A--------------------TG------------------------T------------AC------------T-------------------C--A-TT-G-G--TAT--------A-------------------------------G--ATTTCAAT-A----------TGTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAAGTATGT-GAT-TA-TGT-GTA---------AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGA----------CATGG--GCCTGA---GTG--TC---TTG--------------------------AA-AT--TGA-AA-TAT-AA-----A-TACAAACtaaagcttctttaaggatgtactcattggtatagatttcaatatgttcgaaaaaatcagtaatgcattatgatgaaagtatgtgattatgtgtaaatatgttttattgttatcaagacatgggcctgagtgtcttgaaattgaaatataaatacaaaca
gi|23 : gcagatatatctgctcatgttaaagcttctttaagg------------------------A--------------------TG------------------------T------------AC------------T-------------------C--G-CT-A-GAACAC--------AT-A----AA--GG-GTTACA----TAT---AG-----------------------GTT-CGAAAA---ATC-AG-TAA-------T-G-T-ATTAT-GATG-AAATTACGT-GATACA-TGT-a
gi|24 : tttattcatgttaaagcttctttaagg--TAA--CTTATAT-ATATTATCGAAAACGAT-G-T-CGAAAAATTTG-GCAAAAAAGAAT--TTCT-ATAAA----CCCATGTACCAATCCTTCTTT-AATAG---AACT--TTgtagcgtgtaaccttattg
gi|25 : --TT---GGTA-GATTTTCTTT-GAGA-GTAATTT-AC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-GTC-T-ATCAAAAAAGAG--GT-T-GAA--GGATTT-ATTT--TC-AAAA---TA-C-
gi|26 : -ATGTTTTAT--TTTACACTGTAT---CAAGAA---------CATGC--GCCCGA---GTGGGTC---TTG-A-AA-ATTGT--AA-----GGAG-CAA--TCGTGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAA
gi|27 : aGTTTTAT--TCT------TAT---CAAGA----------CAAGT--GCCCGG---GAG--TT---TTG-A-AT-ATTGT--AA-----GG-A-CAA-AT--TGA-AA-TAC-GA-----A-TAAACAC
gi|28 : A----------CATGC--GCCCGA---GTT--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----TG-G-CAA-AT--TAA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAACctt
gi|29 : ATA-A-TGT-A--TGC-A-TT-AAT-ATATTTCAT--TCT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-at
gi|3 : tATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGATTT--GAAAGATTTTGAGTTAATTAGCAATTTCAACAATTTGTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATTCATGATTTGAAATTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAATGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAATTGTTTACAGA-GTGGTTTCAAATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAACG----------------ATAATCT-TA-GA-------AGA---AAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-CTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATGTG--AATTTCCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---TAC--CTGCGTA-T---AAA-----------AAA--TC-CA--T-------------------------TTGAAA--TAAACCTGATATAAT--CATCGAAAACGAT-GTT-ATAAAGTTTTTAGTAAAAAAGGAAATTTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATGGAAAAACT--TTAAA---TA--TT---GATA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAA-TTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-TAATGAAAAAAAAG--GT-T-GCA--G-ATTT-AATT--TT-AAAA---TA-C-T-----------------CAAATAAT--CTCC--T-ATGTAAA--CA-AA-TCAT-T--TCTCTCAG-GAA-A-AT-TAAGAAAA---AA-TTAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------G-GAC--AAT---GAA--A---------------CA--CTT-----------GA----------TTTATCATTTA-----A-A-A--A-T--------GTAAAAAAAAAA-AAAAAA-------AT-ATGGGAAATAACCT---------T-TACC----------------AAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-
gi|4 : ataaatagtttttgcatagaaaggaAG---AACT--TTAAA---TAAATT---GATAAGATTGGCTGG-AAAA-CTA--TTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATGAAAAAA--G--GT-T-GCA--GGATTT-AATT--TT-AAAA---TA-C-T-----------------C-AATAAT--CTCCACT-A-GT-AA--CA-AA-T--C-A--TTTCTCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---AA-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---ACTA-----TT--GA---------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--T-------------TATTTATCATGTT---------------A-A-AATA-T--------GT---------A-AAACAT-------GT-ATGGG-AATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAT--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TTTTATTGGA-TTTA---TCA----T--TGTAA----AAATATGTA----AAA-----------C--------------A--------------T---GTATGGGA-AAT-AACCT
gi|4 : ---------------A-A-AT-A-T--------GT---------A-AAACAT-------GT-ATGGGAAATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAT--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TTTTATTGGATTTT----T-A----T--GT--A----AAAC---------AAC-----------CAAAAAATATAT---A--------------T---TT-TG----ATT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TA--GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA---A--AGATG-T---TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACG---T-GAGGAAAG-TACCG--AAA--ATAT----T-CTG-CTC------------------------A--------------------TG------------------------TTAAA--------GCTCTTAAATGATAT-------------------C--A-TT-G-G--TA---------AT-A----AA--AG-GTTACA-----AT---AG--AATTCAAT-A----AT---ATGTT-CGAACA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG--AATTATGT-GATATA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATG-TTTAT--TTG------TAT---CAAGA----------CAT-------------GTG--TC---TTG-A-AC-ATT-T--AA-----GG-G-CAA-AT--T-A-AA-TAT-G------A-TAAAAACcaaaaattaccaaatttgatataaaatggaaacatatttttattggatttttatgtaaaacaaccaaaaaatatatattttgattaacctaatttctactatagcaactgttatttacaaataaagatgtttgtagaatcaaggacgtgaggaaagtaccgaaaatattctgctcatgttaaagctcttaaatgatatcattggtaataaaaggttacaatagaattcaataatatgttcgaacaaatcagtaatgcattatgatgaattatgtgatatatgtacatgcattaatatgtttatttgtatcaagacatgtgtcttgaacatttaagggcaaattaaatatgataaaaacattat
gi|5 : agaactttaaataaattgataagattggctggaaaactatttacaaaaacaaaattgtaaatatgtatgaaaaaaggttgcaggatttaattttaaaatactcaataatctccactagtaacaaatcatttctcaggaaaattaagaaaaatgaatcagacaaatgtgaattatgtagagaaactattgaggacaatgaacattatttatcatgttaaaatatgtaaaacatgtatgggaataacctcaaaaattaccaaatttgatataaaatggaaacatatttttattggatttatcattgtaa---AGCT--TTAAA---TA--T----GAT--GATTTTCTTGAGAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAA-----TTGTTCAA-TGATG-T-ATAGAAAAAAAG--GT-TTGCATGGAATCT-AATTATTT-AGAAGAATA-CCT-----------------C-AATAAT--CTCC--TTATG--AATCCA-AA-T--AAT--TCTATCGA-GAAGA-ATGTAAG-AAAGGAAA-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTG--ATTATGTGA---GA---------G--GA---AATG-----GG--GA---------G-GCC--AAT---G-A--AACACGATAGTTTTATCA--T-------------GA----------T---------------A-A-A--A-T--------GCGAAG-----A-AATCAT-------ATGATGGGAAATAACCTCAAAA-AAAT-TACCAAATTCTGAT--AT-TAAA--TGG-AAACATA----TCTTATGGGATTTTA---T-A----G--TGAAA----AAAC---------AAC-----------CCAAAAAACTAGATTA--------------T---TT-TGTTTTAAT--ACCTAATTTCATAATTA-TA--GCACACTTTT--ATGT--CAAAAA--TA--AGATG-T-ACTT-GT-AG---AACTCAAG-GACAT--T-G-AGAAAG-TTACGA-AAAG-ATAT---AT-TTG-CTC------------------------A--------------------TG------------------------T------------attat
gi|5 : --------------------TG------------------------T------------AC------------T-------------------C--T-TTCG-G--GACTG------AT-A----AC--AG-GT-ACA----TAT---AGC-ATT--AATTA----ATTC-ATGTT-CGGAAAGAAATCGAG-TAA-------T-GGC-ATTATTGATG-GAAT-ATGT-GATATAGTGT-ACATGCGA-TTCAATTATGTTTAAT--TTG------TAT---CAAG-----------CATGC--GCCCG----GTG--TCCC-TTGGA-AC-ACGTT--AA-----GG-GGCAA-AT--TAT-AA-TATGGA-----A-TAAAAAtaaagcttcttttaaagatgttacaaattgtactctttcgggactgataacaggtacatatagcattaattaattcatgttcggaaagaaatcgagtaatggcattattgatggaatatgtgatatagtgtacatgcgattcaattatgtttaatttgtatcaagcatgcgcccggtgtcccttggaacacgttaaggggcaaattataatatggaataaaaata
gi|6 : agctttaaatatgatgattttcttgagagactaattttacaaaaacaaattgttcaatgatgtatagaaaaaaaggtttgcatggaatctaattatttagaagaatacctcaataatctccttatgaatccaaataattctatcgagaagaatgtaagaaaggaaatgaatcagacaaatgtgattatgtgagaggaaatggggaggccaatgaaacacgatagttttatcatgataaaatgcgaagaaatcatatgatgggaaataacctcaaaaaaattaccaaattctgatattaaatggaaacatatcttatgggattttatagtgaaaaaacaacccaaaaaactagattattttgttttaatacctaatttcataattatagcacacttttatgtcaaaaataagatgtacttgtagaactcaaggacattgagaaagttacgaaaagatatatttgctcatgttaaagcttcttttaaagatgttacaaatAGAAA-----TTGTG--CGTGTAAGGTAA-AGCTAATAA--AATTT-TTTTAAAAA-GCCGTA---AG-ACATAGGGAAATTTTCGTTATAGCAATTTTTCTAAGCGCCTCCTAGAAATTCAATAAGACATTTGCGTA-TAATGAAACTCAATTT-GAAAATTCACAATTCGGGAGTTGAAT-A-AAATAATCCATGGAAAATTAAAACTGA-AT-AT--CA-CGAAA-TGATTG-TTATAAAAGTTTT-GTAAAAAAGGAAATTTTCGATAAAAACCCCCTTATAACCATCCTTTTTTTAATAG---AACTCGTTAAAAATTA--TTTTAGATA-GTTTTTCTTG-GAGAGCTAATTATAC-AAAAAAACAAAGAATGTTGT-AAAAT-ATGGT-ATGAAAAAAAGGTCGTGT-GCA--GAATTT-AAAT--TT-TAAA---TAAC-T-----------------C-AA-AATTTCTCC--TTATGT-AA--CATAA-T--CAT--TCTCT-AG-GAA-ATAT-TAAG-AAA---ATATGAAGATATGTAGACAGATCAG--AAAAATAGGGTGA-ATTATGT-AAGAGA---------G--AA---AATG-----TTTTGA---------G-GACTCAAT---G-A--A---------------CA--C-------------GA----------ta
gi|7 : A---TA--TT---GATA-AATTTTCTTG-GAGA-CTGA-----------A--TA--------TGT-AA--T-ATG-T-ATGAAAAA---GC-GT-T-GCA--AGAATC-AATT--TT-GAA----TA-C-TTCTTTGCTACGTTTTGTC-AATCAT--CTT---T-ATAA-AG--TA-AACT--T-T--TTTCTCAGTGAA-A-AT--AGA-AAA---AC-TGAAC-------------TCAG--ACAAAT---GTGA-A--------------------------A---AATG-----TT--GAA--------G-GAC--AAC---G-A--A---------------TG--CCT-----------GG----------TTTAATTTCATTGTAAA-A-A--A-T--------GT---------A-AA-CAT-------AT-ATGGGAA-TAAGCTC--AA-AA-T-TAACAAATT---AC--ATTAAAA--TGG-AAACAT-----TCGTTTTGGATTTTA---T-A----T--TG--AACATAAACCAAAAAAGTAGA-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACTTAAT--------------------CTTTT--ATTT-ACAAATA--TA--A-AGG-T-A-TT-GTAAG---AATT--AG-GACAC--T-GAAG-AAG-TATC---AGA--CTAT---AT-CTACCTCTTAAACAATGACCTTCCTTTAAGGA--------------------TG------------------------T------------AC------------T-------------------T--ACTT-G-AT-TAC--------AT-A----A-------TTAT-----TAT---AG--ATTTCAAT-AAAATAT---ATGTT-CCAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATT-T-GATG-CACTTATGT-G----------------------AAT-ATGTTTTA----AT------T----------------------TGC--G-CCGA-----G--TC---TTG-A-AC-ATGTT--AG-----GG-G-CAGCAT--TGA-AA-TAT-AA-----ctcgaaattttcccattgtaaagatcgtaaaaacatttgagtggaaatt
gi|8 : AATTT-AATT--TC-AGAA---TA-T-C-----------------T-AATAAT--GTC---T-ATGT-AA--CA-AA-T--A-TAATTTCTCAG-GAA-A-ATATAAG-AAA---AC-T-AT--------------TCAGCCACAAAT---GTGATATTATGT-A---GA---------GCGAA---AA-G-----TT--G----------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CT--CT------------GA----------T---------------T-ATC--A-T--------GT---------A-AAAAATCAGTAAAAT-ATGG-AAATAACCTCTAAACAAAT-TACCAAATT-TGAT--ATTAAAA--TGG-AAACAT-TCTCTCTTATTGGATTTTA---T-A----G--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------AAGGAATAGATA---T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TAG--CA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--T-GAGGAAAG-TACC-A-AAA--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------ATGTTAAAGCTTCTTTAAAGATG------------------------T------------AC------------T-------------------C--A-TT-G-G--TAT--------AT-A----AA--AG-GTTACT----TAT---AG--AATTCAAT-A----TT---ATGTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-GATATA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTATT--TGT------TAT---TAAAA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TAA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
gi|9 : ATACTGATAT-GATT-ATATATTAAAA-CAAGATACATACAGTTATACGAACGATT--AAGT-AAT-AACAATT--CATAATTTACATGCTGAAATTATTTATATAT-TTCAATTCATGCCAAAAAAA-GCCAGAACATCAATTATTTGACAATGTATTTATGGTT-A-GTCAAAACCAT-GT--GATG-AAAAAACTATTT-AATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTGT-ACAAT--GA-ACGGA-GTT-TTTCAGATATGTAGTTGATTATTGTGGTAAGAAAA-GG--TTAAACCTATTGAATGTTTTCTACGATAATCTTAGAATGAAAAGAAACATTTTTATGACCGAGTA---CAATAATTA-TAAGTAATATCTTTTAAAAAGGC--TACCCAGAACATA-G--AA-TTTCATGATC------CTAC---------CCTAT----TCAA---AAT--CTGCGTATT---GAAAa
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111 2222222 222222222 22222 111 111 11 444444444444444444 11 11 11 1111 1 11111 11 33333333333333333 11111 1111111 22222222222222 111111111 111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111 11111 1111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 111 1 111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111111 11111111111 111111111 1111111 1111111111
lowQualScore : 0 8 6 6 99 1 3 1 3 6 6 6 6 7 1 6 1 111 99 1 2 6 6 7 6 2 5 5 0 5 6 0 5 66 888 5 5 5 5 77 000 5 1 77 8888888 666666666 33333 000 77 5 000 0 1 55 99 3 555555555555555555 77 55 5 55 1 5 5 5 5 55 5 2222 1 5 888 66 888 66 777 4 4 4 5 4 66 00000 4 4 4 4 4 3 00 4 4 66 0 4 55 4 777 4 4 11111111111111111 4 1 66 00000 88 66 5 5 9999999 4 4 4 8 4 777 55 77777777777777 55 666 3 3 666 444444444 55 666 88888 44 666666666 3 44 555 3 44 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 2 0000000 3 99 3 3 3 444 77 44 3 00000 555 3 0000000 88 6666 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 555 3 1111 3 3 3 3 888 3 44 3 44 44 3 888 3 3 555 6 3 44 3 3 777 66 777 2 2 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 5555 444 99 33 00000000 2 6666 33 5 2 11111111111 555 66 0 2 333333333 555 2 33 2 2 2222222 2 2 3 3 3 3 2 2 2 3 3 3 2 33 1 777777 777 4444444444 33 444 33 888 2 2 3 44 77777 3 3 3 44 3 3 3 77777 3
lowQualScore : . . . . .. . . . . . . . . . . . . ... .. . . . . . . . . . . . . . . .. ... . . . . .. ... . . .. ....... ......... ..... ... .. . ... . . .. .. . .................. .. .. . .. . . . . . .. . .... . . ... .. ... .. ... . . . . . .. ..... . . . . . . .. . . .. . . .. . ... . . ................. . . .. ..... .. .. . . ....... . . . . . ... .. .............. .. ... . . ... ......... .. ... ..... .. ......... . .. ... . .. .......................................................................................... . . ....... . .. . . . ... .. .. . ..... ... . ....... .. .... ..................................................... ... . .... . . . . ... . .. . .. .. . ... . . ... . . .. . . ... .. ... . . ........................................................................................................................ . .... ... .. .. ........ . .... .. . . ........... ... .. . . ......... ... . .. . . ....... . . . . . . . . . . . . . .. . ...... ... .......... .. ... .. ... . . . .. ..... . . . .. . . . ..... .
lowQualScore : 8 0 7 7 22 7 5 0 3 7 7 7 7 8 0 7 7 777 22 7 5 7 7 3 7 5 7 7 1 1 7 7 0 99 888 0 7 7 7 99 000 7 4 99 3333333 777777777 33333 000 99 7 000 1 8 22 22 2 000000000000000000 99 77 7 77 7 7 7 7 7 77 7 1111 4 7 888 99 888 11 888 4 4 4 4 4 11 22222 4 4 4 4 4 4 66 4 4 11 4 0 55 0 000 0 0 11111111111111111 4 0 11 44444 66 99 0 0 0000000 4 4 4 9 4 000 00 55555555555555 00 444 6 6 444 555555555 00 444 33333 66 777777777 3 66 888 3 66 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 5 8888888 3 22 3 3 3 777 99 22 1 22222 444 1 5555555 55 5555 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 444 1 9999 1 1 1 1 222 1 22 1 22 22 1 222 1 1 444 6 1 22 1 1 000 88 999 9 9 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 9 4444 000 66 99 44444444 9 1111 99 7 9 77777777777 000 88 1 9 666666666 000 9 99 9 9 1111111 9 9 1 1 1 1 2 9 9 1 1 1 9 77 1 777777 999 3333333333 77 777 77 333 9 9 1 22 77777 1 1 1 22 1 1 1 77777 6
consensus : ATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAGCAATTTCNACAATTTNTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATTTGAAANTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAATTGGATACGGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATATG--AATTTTCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---AAC--TTGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACA--TC------T--AT-G-AAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGAT-G-T-ATAAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--GT-T-GCA--GAATTT-AATT--TT-AAAA---TA-C-T-----------------C-AATAAT--CTCC--T-ATGT-AA--CA-AA-T--N-T--TTTCTCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---AN-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--C-------------GA----------T---------------A-A-A--A-T--------GT---------A-AAACAT-------AT-ATGGGAAATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TAG-GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AATTCAAG-GACAT--TG-AAGAAAG-TACCGA-AAA--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---TAG--ATTTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-GATACA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
Reference ( family-3684 ) : ATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAGCAATTTCNACAATTTNTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATTTGAAANTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAATTGGATACGGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATATG--AATTTTCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---AAC--TTGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACA--TC------T--AT-G-AAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGAT-G-T-ATAAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--GT-T-GCA--GAATTT-AATT--TT-AAAA---TA-C-T-----------------C-AATAAT--CTCC--T-ATGT-AA--CA-AA-T--N-T--TTTCTCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---AN-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--C-------------GA----------T---------------A-A-A--A-T--------GT---------A-AAACAT-------AT-ATGGGAAATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TAG-GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AATTCAAG-GACAT--TG-AAGAAAG-TACCGA-AAA--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---TAG--ATTTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-GATACA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
gi|1 : ATACTGATATTGGTT-ATATATTGAAAACAAG-TGC-CACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAACAATTTCAACAATTTCTATGCTGAAGT-ATTTATATAT-TTCAATTCATTC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATATGAAATTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTTTTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAGTTGGATACAGA-GTGGTTTAAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTTTTGAATGGTTT-TACGATAATTTTAGAACAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTCAAAAA-GC--TA---AG-AAATGTG--AATTTTCAACAT-------TTAC---------CGTA-----TCAA---AAC--TTACGTA-T---GAAACTCAAATTTGAAA--TCACA--TC------T--AT-G-AAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGAG-G-T-ATACAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATA-AATTTTCTTA-GAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--GT-T-GCA--GAATTTAAATT--TT-GAAA---TA-C-T-----------------C-AAAAAT--CTAC--T-ACGT-AA--CA-AA-T--C-T--TTTCTCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---TC-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---ATTG-----TT--GA---------A-GAC--AAT---G-A--A---------------CA----------------AA----------T---------------A-A-A--A-T--------GT---------AGAAACAT-------AT-ATGGGAAATAA-CTT--AA-AAAT-TACAAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TAG-GCA-ACT-TT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATGAT-A-TTGGT-AG---ACTTCAAG-GA-AT--TG-AAGAATGATACCGA-AAA--ATATG--AT-TTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-T-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---AAG--ATTTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAT--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-ATTG-AAATTATGT-GATACA-CGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---TAAGA----------CATGC--GCCCCA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GA-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
gi|10 : TCAG-GAA-A-AT-GAAG-AAA---AA-TGAA--------------TCAG--ACAGAT---GTAA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------A-GAC--AAT---G-A--A---------------CATTT-------------GATT--------T---------------ATC-A--T-T--------GT---------A-AAA-AT-------GT-A----AAACAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AACCAAAAAATAGAC--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TA--GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--TG-AACAAAA-TACC-A-AAA--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------ATGTTAAAGTTTCTTTAAGGAT---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--G-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------ATAATTA---TAG--ATTTCAAT-AAT--AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTA--T-GATATA-TAT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTT---T--TGT------TAT---CAAGA----------CATGC--TCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAA
gi|11 : tG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TG--CA---------G-GAC--AAT---G-GGGA---------------CA--CTTGATTTATCATTGA----------T---------------A-A-A--AAT--------GT---------A-AAACAT-------AA-ATGGGAAATAAC-TC--AA-AAATATACCAAATT-TGATTTAT-AAAAATTGGGAAAAACAA---TCT-ATTGGATT--A---T-A----A--TG--A----AA-C---------AATT----------C--------------AAAAAATAGATATTTT---TT-TG----AATTAACCTAATTTC-T-ACTA-TTG-ATA-ACTGTT--ATTT-ACAA-TA--TA--AGATG-TTA-TT-GT-AG---AAT-CAAGTGACAT--TG-ACGAAAG-TACCGA-AAA---TAT---AT-CTG-CTCTGTTAAAGCCTTCTTTTAAAG---A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-TTTA-TT-G-GC-TAT--A--------T-A----AA--AGCGT-TAC------A----TA---TAAGAATGTCAAT-T----AT---AT---GTTTCGAAAA--AA-C-AG-TAA-------TGG-C-ATTGT-GATA-A----ATG----TACA-TGTAACATGC-A-TT-AAT-ATG-TTTAT--TGT------TATGTCCAAGA----------CA-GG--GCCCGA---GTG--TC---
gi|12 : ag---AA-TGAA--------------TCAG--CCAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GAGAAAATGTTG--AAGACAATGAACACTT--GATTTATCATTGTAAA--AATTTAA-A--A---------------CA--T--------------A----------T---------------ACA-A--A-T--------GT---------A-AAACAC-------AT-ACGGGAAATAGCCTA--AA-GAAT--ACCAAATT-TAAT--AT-CAAA--GGG-AAACATAT---TCTTATTGGACTTTA---T-A----G--TG--A----AACC---------AGCCAAAAATAGA-C--------------A--------------T---TT-TT----AAT-AAGCTAATTTC-T-ACTA-TA--GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-G-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--TG-ACGAAAG-TACCG--AAA--ATAT---AT-CTG-CTTACGTTAAAGCTTCTTTAAAG----A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------TAA----AA--AG-GT-TAC------A----TA---CAG--AATTCCAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--TATC-AG-TAA-------C-G-C-ATTAT-GATG-AATTTATGT-GATATA-TGT-AAATAA-A--T-AAT----CTTTAT--TTT------T
gi|13 : ATACTGATATTGATTTATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATAAGCAATTTCAATAATTTCTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATTTGAAATTGTATG-ATGTTTTATTTCAA--GCATTGT--GATGTAACAAACTATTTCAATAAAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTTACGATTGGATACGGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TAAGTAATAT-CTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATATG--AATTTTCA
gi|14 : cattgaaaggaG-GAAATGTGTATTTATTGACAATTGGATACAGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAGGAAACA-TTTTATA--CGAGTA---CAA-A
gi|14 : aCAA---ATC--TAGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACG--TC------T--ATCA-AAAAAATCCATTAAAA--TAA--CTGATAT-AT--CAACGAAAACGAT-G-T-ATAAAGTTTTT-GTAAGAAAGAAA--TTTT-ATCAA----CCCACATACCAATCTTTTTTA-AATAG---ATCT--TTGAA---TA--TT---GAAA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAA-TTTACGAAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATTAAAGAACAG--GT-T-GCA--GAATTT-ATTT--TT-TTAA---TA-C-T-----------------C-AATGAT--CTtctagcgtatgaaactcaatttcgaaatcacgtctatcaaaaaaatccattaaaataactgatatatcaacgaaaacgatgtataaagtttttgtaagaaagaaattttatcaacccacataccaatcttttttaaatagatctttgaatattgaaagattttcttggagactaatttacgaaaaacaaaattgtaaatatgtattaaagaacaggttgcagaatttatttttttaatactcaatgatct
gi|15 : aggaaatgtgtatttattgacaattggatacagagtggtttcagatatgtagttgatattgtggatgaaaatggtattaaacctattgaatggttttacgataatcttagaagaaaaggaaacattttatacgagta--TG--G----AAAT---------AAC-----------------------------------------T---TC-AG----AA--AAC---ATCTC-T-ACTAATAG-GCA-ACTGTTCCATTTCACAAATAATTA--AGATG-T-AATT-GC-AG---AATCCAAG-GACAT--TGGAAGAAAA-TACCAACAAATTATAC---ATGCTG-CTC------------------------A--------------------TGTTGAAGCTTCTTTTAAGGATG------------------------T------------AGC------------TGC--A-TT-GAG--TAT--AGCATGTTAT-G----AACTAGCGT-T-C------A----TA---T-T--ATTTCAAT-A----AC---ATAATGTT-CGAAAA--AATC-AGTTAAT------T-G-CTCTTA--GAGGAAAATTATGTCGATACA-TGT--CATGC-CTTT-GAT-A-GTTTTAT--TGT------TATA--TAAGA----------CATGT--TCCAGATGTATG--TCCTTTTG-ACACGATTGTTAAA-----CG-G-CAA-AC--TGACAATTAT-GA-----ATTAAGAA
gi|16 : tgtaaaaacactaAATTTC-T-AGTA-TATTGCA-ATTGTT--ATTC-ACAAATA--TATAAGGTG-T-G-TT-GT--GTTCAATT-AAA-GACATATTG-AAGAA---TACC-A-AAA--ATAT---GT-CTA-TTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------TTAAAAGCGGCTAG-C------------T-C--T-CT-T-G--TAT--A--------T-ATGTAAA--AA-TT-TAC------A----TAATATAG--ATTTTAAA-A----ACTGCAT---GAT-CGAAAA--AATC-AG-TAGATCTAATT-T-C-ATTAG-GATG-AAATGA----GATGCA-TG---CATAA-A-TT-GAT-ATGTTTTATAGTGC------TAT---CAAGATCGATATGTGCATGCATGCCTGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--GAAGACTGG-G-GAA-GT--TAA-AA-TCT-GA-----aaca
gi|17 : GAGATGAATTTGA-TATAGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---TAA-AATTA-TGAGTAATAT-TATCAAAAA-GC--TA---AG-AC--ATG--AATTTTCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---AAC--TTGCGTA-T---GAAGCTCAATTTTGAAA--TCATA--TC------G--AT-GAAAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTTATAT-AT--CATCGAAAACGAT-G-T-ATGAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTGC-ATAAA----CCCATATACCAATCC-TTTTT-AAT
gi|18 : A--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-AGGCCTAGTG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------AAAAAATAGATA---T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ATTA-TAG--CA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--TG-AGGAAAG-TATCTG-CTC--ATGTTAAAG-CTT-CTTTAAAG-------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---TAG--AATTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-
gi|19 : AACGAA-TAC-CGCAGATTT--CAACGATCTGAACTCA-TTACCACGTTCTACAA----------GGAAC-TTTTCTGTGCCTTCAAT----GA-AGTAAATTGCCA-AGTGTCTAAGAT--AGAACCG-ATG-AGGTATTACGCCAA----AATATCAGGTTCAACAAAA-ATTTCAATCTAAAGGGAAAATAT-TATATTTTCAAAATTGGA-ATGAAAGTGGCTT-AAATATGTAAAAGA-TCTTGTGG-AATAAAATGGAATAAAAC
gi|2 : GATAGCCTGAGAAGAAAA-GAAACA-TGTTATG--CGAGTA---AAA-AATTA-TGAGTAATAT-TCTTTAAAA-GC--TA---A----ATATG--AATTTTCAAGAT-------TTAT---------TTTA-----TCAA---AAT--TTACGTA-T---GAAACTCAACT-----------CA-------------AT-G-AACACATCCATTGGAA--TAA--CTAATAT-ATAACATCGGAAACAAT-G-T-ATACAATTTTT-GTAAAAA-GAAA--TTTC-ATAGA----CCCGTGTACCAAT------------------ACT--TTAAA---T----------------TTTCTTG-GAGA-GTAA-TTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ACGAAAAATAAA--GT-T-GCA--AAATTT-GATT--TTAAAAA---TA-G-T-----------------C-AACAAT--CTCC--T-ATGA-AA--CA-AA-T--A-T--TTTATCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---AC-TGAA--------------TCTG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATT-----TT--GA---------A-CAC--AAT---G-A--A---------------CA--CTT-----------GATTTATCATTGT---------------A-A-AT-A-T--------GT---------A-AAAC---------AT-ATGGAAAATAACCTA--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAA---TCTTATTGGATTTCATATT-A----T--TG--A----AAAC---------AACCAAAAATTAGAC--------------A--------------T---TT-TG-------------AATCTC-T-ACTA-TAG-A-A-ACTGTT--ATAT-ACAAATA--AA--AAA-----A-------AG---AA---AAA-AAGAT------AGAAAA-TACC-A-AAA--ATAT---AT-CTA-CTC------------------------G--------------------T---------------------GTTAACTGAAGATTCTTTAAGGATGT------------A-C------------T-C--A-CT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---TAA--ATTTC----A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AGTC-AG-TAA-------T-A-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-ATCACA-TGT-ACTTGA-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGG----------CATGC--TCCAGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATAGT--AA------G-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GAATTTTA-TAAAAAC
gi|20 : -----TT--GA---------A-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--C-----------------------------------------A-A-G--A-TTTATTTGCGT---------G-AAA----------AT-ATGGGAAATAACTTC--A---------------T-TGAC--AT-------T-----ACAT------------GGATTTTA---T-G----T--TG--A----AAAC---------GAC-----------C--------------AACGAATTG------TCAGTT-TG----AAT-GACTTAATGTC-T-ACTA-T--------CTGTT--ATTT-ACA----------------T-C-TT-TC-AG---A--TCAAA-GAAAT--TT-ACGAAAG-TGCCGA-AAA--ATAT---AT-GTA-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------ctttg
gi|21 : TACTAATATTGATT-AGATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACAATTTTGAGTTAATTAGAAATTTCCACAATTTGTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AGAAATT-A-CAGAACATCAATGCTATGAAAGTGTATA-ATGTTTTATATCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTTTTTAAATataaaactttgaagatgtactcgcattttaataaaaggctgcatg
gi|22 : tcaatagtttttgcattgaaaggaatacatgAG--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------TTAAA--------G-C------------T-T--C-TT--------------------T-A----AG---G-ATGTACTCATTGG----TA---TAG--ATTTCAAT-A----------T---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAAGTATGT-GAT-TA-TGT-GTA---------AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGA----------CATGG--GCCTGA---GTG--TC---TTG--------------------------AA-AT--TGA-AA-TAT-AA-----A-TACAAAC
gi|23 : gc------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--G-CT-A-GAACAC--A--------T-A----AA--GG-GT-TAC------A----TA---TAG--------------------------GTT-CGAAAA---ATC-AG-TAA-------T-G-T-ATTAT-GATG-AAATTACGT-GATACA-TGT-a
gi|24 : tttattcatgttaaagcttctttaagg--TAA--CTTATAT-ATATTATCGAAAACGAT-G-T-CGAAAAATTTG-GCAAAAAAGAAT--TTCT-ATAAA----CCCATGTACCAATCCTTCTTT-AATAG---AACT--TTgtagcgtgtaaccttattg
gi|25 : --TT---GGTA-GATTTTCTTT-GAGA-GTAATTT-AC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-GTC-T-ATCAAAAAAGAG--GT-T-GAA--GGATTT-ATTT--TC-AAAA---TA-C-
gi|26 : -ATGTTTTAT--TTTACACTGTAT---CAAGAA---------CATGC--GCCCGA---GTGGGTC---TTG-A-AA-ATTGT--AA-----GGAG-CAA--TCGTGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAA
gi|27 : aGTTTTAT--TCT------TAT---CAAGA----------CAAGT--GCCCGG---GAG--TT---TTG-A-AT-ATTGT--AA-----GG-A-CAA-AT--TGA-AA-TAC-GA-----A-TAAACAC
gi|28 : A----------CATGC--GCCCGA---GTT--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----TG-G-CAA-AT--TAA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAACctt
gi|29 : ATA-A-TGT-A--TGC-A-TT-AAT-ATATTTCAT--TCT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-at
gi|3 : tATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGATTT--GAAAGATTTTGAGTTAATTAGCAATTTCAACAATTTGTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATTCATGATTTGAAATTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAATGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAATTGTTTACAGA-GTGGTTTCAAATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAACG----------------ATAATCT-TA-GA-------AGA---AAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-CTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATGTG--AATTTCCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---TAC--CTGCGTA-T---AAA-----------AAA--TC-CA--T-------------------------TTGAAA--TAAACCTGATATAAT--CATCGAAAACGAT-GTT-ATAAAGTTTTTAGTAAAAAAGGAAATTTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATGGAAAAACT--TTAAA---TA--TT---GATA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAA-TTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-TAATGAAAAAAAAG--GT-T-GCA--G-ATTT-AATT--TT-AAAA---TA-C-T-----------------CAAATAAT--CTCC--T-ATGTAAA--CA-AA-TCAT-T--TCTCTCAG-GAA-A-AT-TAAGAAAA---AA-TTAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------G-GAC--AAT---GAA--A---------------CA--CTT-----------GA----------TTTATCATTTA-----A-A-A--A-T--------GTAAAAAAAAAA-AAAAAA-------AT-ATGGGAAATAACCT---------T-TACC----------------AAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-
gi|4 : ataaatagtttttgcatagaaaggaAG---AACT--TTAAA---TAAATT---GATAAGATTGGCTGG-AAAA-CTA--TTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATGAAAAAA--G--GT-T-GCA--GGATTT-AATT--TT-AAAA---TA-C-T-----------------C-AATAAT--CTCCACT-A-GT-AA--CA-AA-T--C-A--TTTCTCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---AA-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---ACTA-----TT--GA---------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--T-------------TATTTATCATGTT---------------A-A-AATA-T--------GT---------A-AAACAT-------GT-ATGGG-AATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAT--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TTTTATTGGA-TTTA---TCA----T--TGTAA----AAATATGTA----AAA-----------C--------------A--------------T---GTATGGGA-AAT-AACCT
gi|4 : ---------------A-A-AT-A-T--------GT---------A-AAACAT-------GT-ATGGGAAATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAT--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TTTTATTGGATTTT----T-A----T--GT--A----AAAC---------AAC-----------CAAAAAATATAT---A--------------T---TT-TG----ATT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TA--GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA---A--AGATG-T---TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACG---TG-AGGAAAG-TACCG--AAA--ATAT----T-CTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------TTAAA--------G-CTCTTAAATGATAT-C--A-TT-G-G--TA---A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A-----A---TAG--AATTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAACA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG--AATTATGT-GATATA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATG-TTTAT--TTG------TAT---CAAGA----------CAT-------------GTG--TC---TTG-A-AC-ATT-T--AA-----GG-G-CAA-AT--T-A-AA-TAT-G------A-TAAAAACcaaaaattaccaaatttgatataaaatggaaacatatttttattggatttttatgtaaaacaaccaaaaaatatatattttgattaacctaatttctactatagcaactgttatttacaaataaagatgtttgtagaatcaaggacgtgaggaaagtaccgaaaatattctgctcatgttaaagctcttaaatgatatcattggtaataaaaggttacaatagaattcaataatatgttcgaacaaatcagtaatgcattatgatgaattatgtgatatatgtacatgcattaatatgtttatttgtatcaagacatgtgtcttgaacatttaagggcaaattaaatatgataaaaacattat
gi|5 : agaactttaaataaattgataagattggctggaaaactatttacaaaaacaaaattgtaaatatgtatgaaaaaaggttgcaggatttaattttaaaatactcaataatctccactagtaacaaatcatttctcaggaaaattaagaaaaatgaatcagacaaatgtgaattatgtagagaaactattgaggacaatgaacattatttatcatgttaaaatatgtaaaacatgtatgggaataacctcaaaaattaccaaatttgatataaaatggaaacatatttttattggatttatcattgtaa---AGCT--TTAAA---TA--T----GAT--GATTTTCTTGAGAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAA-----TTGTTCAA-TGATG-T-ATAGAAAAAAAG--GT-TTGCATGGAATCT-AATTATTT-AGAAGAATA-CCT-----------------C-AATAAT--CTCC--TTATG--AATCCA-AA-T--AAT--TCTATCGA-GAAGA-ATGTAAG-AAAGGAAA-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTG--ATTATGTGA---GA---------G--GA---AATG-----GG--GA---------G-GCC--AAT---G-A--AACACGATAGTTTTATCA--T-------------GA----------T---------------A-A-A--A-T--------GCGAAG-----A-AATCAT-------ATGATGGGAAATAACCTCAAAA-AAAT-TACCAAATTCTGAT--AT-TAAA--TGG-AAACATA----TCTTATGGGATTTTA---T-A----G--TGAAA----AAAC---------AAC-----------CCAAAAAACTAGATTA--------------T---TT-TGTTTTAAT--ACCTAATTTCATAATTA-TA--GCACACTTTT--ATGT--CAAAAA--TA--AGATG-T-ACTT-GT-AG---AACTCAAG-GACAT--TG--AGAAAG-TTACGA-AAAG-ATAT---AT-TTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------attat
gi|5 : --------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--T-TTCG-G--GACTGA--------T-A----AC--AG-GT--AC------A----TA---TAGC-ATT--AATTA----ATTC-AT---GTT-CGGAAAGAAATCGAG-TAA-------T-GGC-ATTATTGATG-GAAT-ATGT-GATATAGTGT-ACATGCGA-TTCAATTATGTTTAAT--TTG------TAT---CAAG-----------CATGC--GCCCG----GTG--TCCC-TTGGA-AC-ACGTT--AA-----GG-GGCAA-AT--TAT-AA-TATGGA-----A-TAAAAAtaaagcttcttttaaagatgttacaaattgtactctttcgggactgataacaggtacatatagcattaattaattcatgttcggaaagaaatcgagtaatggcattattgatggaatatgtgatatagtgtacatgcgattcaattatgtttaatttgtatcaagcatgcgcccggtgtcccttggaacacgttaaggggcaaattataatatggaataaaaata
gi|6 : agctttaaatatgatgattttcttgagagactaattttacaaaaacaaattgttcaatgatgtatagaaaaaaaggtttgcatggaatctaattatttagaagaatacctcaataatctccttatgaatccaaataattctatcgagaagaatgtaagaaaggaaatgaatcagacaaatgtgattatgtgagaggaaatggggaggccaatgaaacacgatagttttatcatgataaaatgcgaagaaatcatatgatgggaaataacctcaaaaaaattaccaaattctgatattaaatggaaacatatcttatgggattttatagtgaaaaaacaacccaaaaaactagattattttgttttaatacctaatttcataattatagcacacttttatgtcaaaaataagatgtacttgtagaactcaaggacattgagaaagttacgaaaagatatatttgctcatgttaaagcttcttttaaagatgttacaaatAGAAA-----TTGTG--CGTGTAAGGTAA-AGCTAATAA--AATTT-TTTTAAAAA-GCCGTA---AG-ACATAGGGAAATTTTCGTTATAGCAATTTTTCTAAGCGCCTCCTAGAAATTCAATAAGACATTTGCGTA-TAATGAAACTCAATTT-GAAAATTCACAATTCGGGAGTTGAAT-A-AAATAATCCATGGAAAATTAAAACTGA-AT-AT--CA-CGAAA-TGATTG-TTATAAAAGTTTT-GTAAAAAAGGAAATTTTCGATAAAAACCCCCTTATAACCATCCTTTTTTTAATAG---AACTCGTTAAAAATTA--TTTTAGATA-GTTTTTCTTG-GAGAGCTAATTATAC-AAAAAAACAAAGAATGTTGT-AAAAT-ATGGT-ATGAAAAAAAGGTCGTGT-GCA--GAATTT-AAAT--TT-TAAA---TAAC-T-----------------C-AA-AATTTCTCC--TTATGT-AA--CATAA-T--CAT--TCTCT-AG-GAA-ATAT-TAAG-AAA---ATATGAAGATATGTAGACAGATCAG--AAAAATAGGGTGA-ATTATGT-AAGAGA---------G--AA---AATG-----TTTTGA---------G-GACTCAAT---G-A--A---------------CA--C-------------GA----------ta
gi|7 : A---TA--TT---GATA-AATTTTCTTG-GAGA-CTGA-----------A--TA--------TGT-AA--T-ATG-T-ATGAAAAA---GC-GT-T-GCA--AGAATC-AATT--TT-GAA----TA-C-TTCTTTGCTACGTTTTGTC-AATCAT--CTT---T-ATAA-AG--TA-AACT--T-T--TTTCTCAGTGAA-A-AT--AGA-AAA---AC-TGAAC-------------TCAG--ACAAAT---GTGA-A--------------------------A---AATG-----TT--GAA--------G-GAC--AAC---G-A--A---------------TG--CCT-----------GG----------TTTAATTTCATTGTAAA-A-A--A-T--------GT---------A-AA-CAT-------AT-ATGGGAA-TAAGCTC--AA-AA-T-TAACAAATT---AC--ATTAAAA--TGG-AAACAT-----TCGTTTTGGATTTTA---T-A----T--TG--AACATAAACCAAAAAAGTAGA-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACTTAAT--------------------CTTTT--ATTT-ACAAATA--TA--A-AGG-T-A-TT-GTAAG---AATT--AG-GACAC--TG-AAG-AAG-TATC---AGA--CTAT---AT-CTACCTCTTAAACAATGACCTTCCTTTAAGGA--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-T--ACTT-G-AT-TAC--A--------T-A----A-------T-TAT-----------TA---TAG--ATTTCAAT-AAAATAT---AT---GTT-CCAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATT-T-GATG-CACTTATGT-G----------------------AAT-ATGTTTTA----AT------T----------------------TGC--G-CCGA-----G--TC---TTG-A-AC-ATGTT--AG-----GG-G-CAGCAT--TGA-AA-TAT-AA-----ctcgaaattttcccattgtaaagatcgtaaaaacatttgagtggaaatt
gi|8 : AATTT-AATT--TC-AGAA---TA-T-C-----------------T-AATAAT--GTC---T-ATGT-AA--CA-AA-T--A-TAATTTCTCAG-GAA-A-ATATAAG-AAA---AC-T-AT--------------TCAGCCACAAAT---GTGATATTATGT-A---GA---------GCGAA---AA-G-----TT--G----------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CT--CT------------GA----------T---------------T-ATC--A-T--------GT---------A-AAAAATCAGTAAAAT-ATGG-AAATAACCTCTAAACAAAT-TACCAAATT-TGAT--ATTAAAA--TGG-AAACAT-TCTCTCTTATTGGATTTTA---T-A----G--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------AAGGAATAGATA---T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TAG--CA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--TG-AGGAAAG-TACC-A-AAA--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------ATGTTAAAGCTTCTTTAAAGAT---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------T----TA---TAG--AATTCAAT-A----TT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-GATATA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTATT--TGT------TAT---TAAAA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TAA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
gi|9 : ATACTGATAT-GATT-ATATATTAAAA-CAAGATACATACAGTTATACGAACGATT--AAGT-AAT-AACAATT--CATAATTTACATGCTGAAATTATTTATATAT-TTCAATTCATGCCAAAAAAA-GCCAGAACATCAATTATTTGACAATGTATTTATGGTT-A-GTCAAAACCAT-GT--GATG-AAAAAACTATTT-AATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTGT-ACAAT--GA-ACGGA-GTT-TTTCAGATATGTAGTTGATTATTGTGGTAAGAAAA-GG--TTAAACCTATTGAATGTTTTCTACGATAATCTTAGAATGAAAAGAAACATTTTTATGACCGAGTA---CAATAATTA-TAAGTAATATCTTTTAAAAAGGC--TACCCAGAACATA-G--AA-TTTCATGATC------CTAC---------CCTAT----TCAA---AAT--CTGCGTATT---GAAAa
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111 2222222 222222222 22222 111 111 11 444444444444444444 11 11 11 1111 1 11111 11 33333333333333333 11111 1111111 22222222222222 111111111 111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111 11111 1111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 111 1 111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111111 11111111111 111111111 1111111 1111111111
lowQualScore : 0 8 6 6 99 1 3 1 3 6 6 6 6 7 1 6 1 111 99 1 2 6 6 7 6 2 5 5 0 5 6 0 5 66 888 5 5 5 5 77 000 5 1 77 8888888 666666666 33333 000 77 5 000 0 1 55 99 3 555555555555555555 77 55 5 55 1 5 5 5 5 55 5 2222 1 5 888 66 888 66 777 4 4 4 5 4 66 00000 4 4 4 4 4 3 00 4 4 66 0 4 55 4 777 4 4 11111111111111111 4 1 66 00000 88 66 5 5 9999999 4 4 4 8 4 777 55 77777777777777 55 666 3 3 666 444444444 55 666 88888 44 666666666 3 44 555 3 44 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 2 0000000 3 99 3 3 3 444 77 44 3 00000 555 3 0000000 88 6666 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 555 3 1111 3 3 3 3 888 3 44 3 44 44 3 888 3 3 555 6 3 44 3 3 777 66 777 2 2 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 5555 444 99 33 00000000 2 6666 33 5 2 11111111111 555 66 0 2 333333333 555 2 33 2 2 2222222 2 2 3 3 3 3 2 2 2 3 3 3 2 33 1 777777 777 4444444444 33 444 33 888 2 2 3 44 77777 3 3 3 44 3 3 3 77777 3
lowQualScore : . . . . .. . . . . . . . . . . . . ... .. . . . . . . . . . . . . . . .. ... . . . . .. ... . . .. ....... ......... ..... ... .. . ... . . .. .. . .................. .. .. . .. . . . . . .. . .... . . ... .. ... .. ... . . . . . .. ..... . . . . . . .. . . .. . . .. . ... . . ................. . . .. ..... .. .. . . ....... . . . . . ... .. .............. .. ... . . ... ......... .. ... ..... .. ......... . .. ... . .. .......................................................................................... . . ....... . .. . . . ... .. .. . ..... ... . ....... .. .... ..................................................... ... . .... . . . . ... . .. . .. .. . ... . . ... . . .. . . ... .. ... . . ........................................................................................................................ . .... ... .. .. ........ . .... .. . . ........... ... .. . . ......... ... . .. . . ....... . . . . . . . . . . . . . .. . ...... ... .......... .. ... .. ... . . . .. ..... . . . .. . . . ..... .
lowQualScore : 8 0 7 7 22 7 5 0 3 7 7 7 7 8 0 7 7 777 22 7 5 7 7 3 7 5 7 7 1 1 7 7 0 99 888 0 7 7 7 99 000 7 4 99 3333333 777777777 33333 000 99 7 000 1 8 22 22 2 000000000000000000 99 77 7 77 7 7 7 7 7 77 7 1111 4 7 888 99 888 11 888 4 4 4 4 4 11 22222 4 4 4 4 4 4 66 4 4 11 4 0 55 0 000 0 0 11111111111111111 4 0 11 44444 66 99 0 0 0000000 4 4 4 9 4 000 00 55555555555555 00 444 6 6 444 555555555 00 444 33333 66 777777777 3 66 888 3 66 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 5 8888888 3 22 3 3 3 777 99 22 1 22222 444 1 5555555 55 5555 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 444 1 9999 1 1 1 1 222 1 22 1 22 22 1 222 1 1 444 6 1 22 1 1 000 88 999 9 9 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 9 4444 000 66 99 44444444 9 1111 99 7 9 77777777777 000 88 1 9 666666666 000 9 99 9 9 1111111 9 9 1 1 1 1 2 9 9 1 1 1 9 77 1 777777 999 3333333333 77 777 77 333 9 9 1 22 77777 1 1 1 22 1 1 1 77777 6
consensus : ATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAGCAATTTCNACAATTTNTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATTTGAAANTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAATTGGATACGGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATATG--AATTTTCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---AAC--TTGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACA--TC------T--AT-G-AAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGAT-G-T-ATAAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--GT-T-GCA--GAATTT-AATT--TT-AAAA---TA-C-T-----------------C-AATAAT--CTCC--T-ATGT-AA--CA-AA-T--N-T--TTTCTCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---AN-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--C-------------GA----------T---------------A-A-A--A-T--------GT---------A-AAACAT-------AT-ATGGGAAATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TAG-GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AATTCAAG-GACAT--TG-AAGAAAG-TACCGA-AAA--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---TAG--ATTTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-GATACA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
Reference ( family-3684 ) : ATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAGCAATTTCNACAATTTNTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATTTGAAANTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAATTGGATACGGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATATG--AATTTTCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---AAC--TTGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACA--TC------T--AT-G-AAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGAT-G-T-ATAAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--GT-T-GCA--GAATTT-AATT--TT-AAAA---TA-C-T-----------------C-AATAAT--CTCC--T-ATGT-AA--CA-AA-T--N-T--TTTCTCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---AN-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--C-------------GA----------T---------------A-A-A--A-T--------GT---------A-AAACAT-------AT-ATGGGAAATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TAG-GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AATTCAAG-GACAT--TG-AAGAAAG-TACCGA-AAA--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---TAG--ATTTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-GATACA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
gi|1 : ATACTGATATTGGTT-ATATATTGAAAACAAG-TGC-CACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAACAATTTCAACAATTTCTATGCTGAAGT-ATTTATATAT-TTCAATTCATTC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATATGAAATTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTTTTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAGTTGGATACAGA-GTGGTTTAAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTTTTGAATGGTTT-TACGATAATTTTAGAACAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTCAAAAA-GC--TA---AG-AAATGTG--AATTTTCAACAT-------TTAC---------CGTA-----TCAA---AAC--TTACGTA-T---GAAACTCAAATTTGAAA--TCACA--TC------T--AT-G-AAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGAG-G-T-ATACAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATA-AATTTTCTTA-GAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--GT-T-GCA--GAATTTAAATT--TT-GAAA---TA-C-T-----------------C-AAAAAT--CTAC--T-ACGT-AA--CA-AA-T--C-T--TTTCTCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---TC-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---ATTG-----TT--GA---------A-GAC--AAT---G-A--A---------------CA----------------AA----------T---------------A-A-A--A-T--------GT---------AGAAACAT-------AT-ATGGGAAATAA-CTT--AA-AAAT-TACAAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TAG-GCA-ACT-TT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATGAT-A-TTGGT-AG---ACTTCAAG-GA-AT--TG-AAGAATGATACCGA-AAA--ATATG--AT-TTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-T-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---AAG--ATTTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAT--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-ATTG-AAATTATGT-GATACA-CGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---TAAGA----------CATGC--GCCCCA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GA-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
gi|10 : TCAG-GAA-A-AT-GAAG-AAA---AA-TGAA--------------TCAG--ACAGAT---GTAA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------A-GAC--AAT---G-A--A---------------CATTT-------------GATT--------T---------------ATC-A--T-T--------GT---------A-AAA-AT-------GT-A----AAACAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AACCAAAAAATAGAC--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TA--GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--TG-AACAAAA-TACC-A-AAA--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------ATGTTAAAGTTTCTTTAAGGAT---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--G-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------ATAATTA---TAG--ATTTCAAT-AAT--AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTA--T-GATATA-TAT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTT---T--TGT------TAT---CAAGA----------CATGC--TCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAA
gi|11 : tG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TG--CA---------G-GAC--AAT---G-GGGA---------------CA--CTTGATTTATCATTGA----------T---------------A-A-A--AAT--------GT---------A-AAACAT-------AA-ATGGGAAATAAC-TC--AA-AAATATACCAAATT-TGATTTAT-AAAAATTGGGAAAAACAA---TCT-ATTGGATT--A---T-A----A--TG--A----AA-C---------AATT----------C--------------AAAAAATAGATATTTT---TT-TG----AATTAACCTAATTTC-T-ACTA-TTG-ATA-ACTGTT--ATTT-ACAA-TA--TA--AGATG-TTA-TT-GT-AG---AAT-CAAGTGACAT--TG-ACGAAAG-TACCGA-AAA---TAT---AT-CTG-CTCTGTTAAAGCCTTCTTTTAAAG---A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-TTTA-TT-G-GC-TAT--A--------T-A----AA--AGCGT-TAC------A----TA---TAAGAATGTCAAT-T----AT---AT---GTTTCGAAAA--AA-C-AG-TAA-------TGG-C-ATTGT-GATA-A----ATG----TACA-TGTAACATGC-A-TT-AAT-ATG-TTTAT--TGT------TATGTCCAAGA----------CA-GG--GCCCGA---GTG--TC---
gi|12 : ag---AA-TGAA--------------TCAG--CCAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GAGAAAATGTTG--AAGACAATGAACACTT--GATTTATCATTGTAAA--AATTTAA-A--A---------------CA--T--------------A----------T---------------ACA-A--A-T--------GT---------A-AAACAC-------AT-ACGGGAAATAGCCTA--AA-GAAT--ACCAAATT-TAAT--AT-CAAA--GGG-AAACATAT---TCTTATTGGACTTTA---T-A----G--TG--A----AACC---------AGCCAAAAATAGA-C--------------A--------------T---TT-TT----AAT-AAGCTAATTTC-T-ACTA-TA--GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-G-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--TG-ACGAAAG-TACCG--AAA--ATAT---AT-CTG-CTTACGTTAAAGCTTCTTTAAAG----A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------TAA----AA--AG-GT-TAC------A----TA---CAG--AATTCCAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--TATC-AG-TAA-------C-G-C-ATTAT-GATG-AATTTATGT-GATATA-TGT-AAATAA-A--T-AAT----CTTTAT--TTT------T
gi|13 : ATACTGATATTGATTTATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATAAGCAATTTCAATAATTTCTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATTTGAAATTGTATG-ATGTTTTATTTCAA--GCATTGT--GATGTAACAAACTATTTCAATAAAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTTACGATTGGATACGGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TAAGTAATAT-CTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATATG--AATTTTCA
gi|14 : cattgaaaggaG-GAAATGTGTATTTATTGACAATTGGATACAGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAGGAAACA-TTTTATA--CGAGTA---CAA-A
gi|14 : aCAA---ATC--TAGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACG--TC------T--ATCA-AAAAAATCCATTAAAA--TAA--CTGATAT-AT--CAACGAAAACGAT-G-T-ATAAAGTTTTT-GTAAGAAAGAAA--TTTT-ATCAA----CCCACATACCAATCTTTTTTA-AATAG---ATCT--TTGAA---TA--TT---GAAA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAA-TTTACGAAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATTAAAGAACAG--GT-T-GCA--GAATTT-ATTT--TT-TTAA---TA-C-T-----------------C-AATGAT--CTtctagcgtatgaaactcaatttcgaaatcacgtctatcaaaaaaatccattaaaataactgatatatcaacgaaaacgatgtataaagtttttgtaagaaagaaattttatcaacccacataccaatcttttttaaatagatctttgaatattgaaagattttcttggagactaatttacgaaaaacaaaattgtaaatatgtattaaagaacaggttgcagaatttatttttttaatactcaatgatct
gi|15 : aggaaatgtgtatttattgacaattggatacagagtggtttcagatatgtagttgatattgtggatgaaaatggtattaaacctattgaatggttttacgataatcttagaagaaaaggaaacattttatacgagta--TG--G----AAAT---------AAC-----------------------------------------T---TC-AG----AA--AAC---ATCTC-T-ACTAATAG-GCA-ACTGTTCCATTTCACAAATAATTA--AGATG-T-AATT-GC-AG---AATCCAAG-GACAT--TGGAAGAAAA-TACCAACAAATTATAC---ATGCTG-CTC------------------------A--------------------TGTTGAAGCTTCTTTTAAGGATG------------------------T------------AGC------------TGC--A-TT-GAG--TAT--AGCATGTTAT-G----AACTAGCGT-T-C------A----TA---T-T--ATTTCAAT-A----AC---ATAATGTT-CGAAAA--AATC-AGTTAAT------T-G-CTCTTA--GAGGAAAATTATGTCGATACA-TGT--CATGC-CTTT-GAT-A-GTTTTAT--TGT------TATA--TAAGA----------CATGT--TCCAGATGTATG--TCCTTTTG-ACACGATTGTTAAA-----CG-G-CAA-AC--TGACAATTAT-GA-----ATTAAGAA
gi|16 : tgtaaaaacactaAATTTC-T-AGTA-TATTGCA-ATTGTT--ATTC-ACAAATA--TATAAGGTG-T-G-TT-GT--GTTCAATT-AAA-GACATATTG-AAGAA---TACC-A-AAA--ATAT---GT-CTA-TTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------TTAAAAGCGGCTAG-C------------T-C--T-CT-T-G--TAT--A--------T-ATGTAAA--AA-TT-TAC------A----TAATATAG--ATTTTAAA-A----ACTGCAT---GAT-CGAAAA--AATC-AG-TAGATCTAATT-T-C-ATTAG-GATG-AAATGA----GATGCA-TG---CATAA-A-TT-GAT-ATGTTTTATAGTGC------TAT---CAAGATCGATATGTGCATGCATGCCTGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--GAAGACTGG-G-GAA-GT--TAA-AA-TCT-GA-----aaca
gi|17 : GAGATGAATTTGA-TATAGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---TAA-AATTA-TGAGTAATAT-TATCAAAAA-GC--TA---AG-AC--ATG--AATTTTCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---AAC--TTGCGTA-T---GAAGCTCAATTTTGAAA--TCATA--TC------G--AT-GAAAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTTATAT-AT--CATCGAAAACGAT-G-T-ATGAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTGC-ATAAA----CCCATATACCAATCC-TTTTT-AAT
gi|18 : A--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-AGGCCTAGTG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------AAAAAATAGATA---T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ATTA-TAG--CA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--TG-AGGAAAG-TATCTG-CTC--ATGTTAAAG-CTT-CTTTAAAG-------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---TAG--AATTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-
gi|19 : AACGAA-TAC-CGCAGATTT--CAACGATCTGAACTCA-TTACCACGTTCTACAA----------GGAAC-TTTTCTGTGCCTTCAAT----GA-AGTAAATTGCCA-AGTGTCTAAGAT--AGAACCG-ATG-AGGTATTACGCCAA----AATATCAGGTTCAACAAAA-ATTTCAATCTAAAGGGAAAATAT-TATATTTTCAAAATTGGA-ATGAAAGTGGCTT-AAATATGTAAAAGA-TCTTGTGG-AATAAAATGGAATAAAAC
gi|2 : GATAGCCTGAGAAGAAAA-GAAACA-TGTTATG--CGAGTA---AAA-AATTA-TGAGTAATAT-TCTTTAAAA-GC--TA---A----ATATG--AATTTTCAAGAT-------TTAT---------TTTA-----TCAA---AAT--TTACGTA-T---GAAACTCAACT-----------CA-------------AT-G-AACACATCCATTGGAA--TAA--CTAATAT-ATAACATCGGAAACAAT-G-T-ATACAATTTTT-GTAAAAA-GAAA--TTTC-ATAGA----CCCGTGTACCAAT------------------ACT--TTAAA---T----------------TTTCTTG-GAGA-GTAA-TTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ACGAAAAATAAA--GT-T-GCA--AAATTT-GATT--TTAAAAA---TA-G-T-----------------C-AACAAT--CTCC--T-ATGA-AA--CA-AA-T--A-T--TTTATCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---AC-TGAA--------------TCTG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATT-----TT--GA---------A-CAC--AAT---G-A--A---------------CA--CTT-----------GATTTATCATTGT---------------A-A-AT-A-T--------GT---------A-AAAC---------AT-ATGGAAAATAACCTA--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAA---TCTTATTGGATTTCATATT-A----T--TG--A----AAAC---------AACCAAAAATTAGAC--------------A--------------T---TT-TG-------------AATCTC-T-ACTA-TAG-A-A-ACTGTT--ATAT-ACAAATA--AA--AAA-----A-------AG---AA---AAA-AAGAT------AGAAAA-TACC-A-AAA--ATAT---AT-CTA-CTC------------------------G--------------------T---------------------GTTAACTGAAGATTCTTTAAGGATGT------------A-C------------T-C--A-CT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---TAA--ATTTC----A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AGTC-AG-TAA-------T-A-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-ATCACA-TGT-ACTTGA-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGG----------CATGC--TCCAGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATAGT--AA------G-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GAATTTTA-TAAAAAC
gi|20 : -----TT--GA---------A-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--C-----------------------------------------A-A-G--A-TTTATTTGCGT---------G-AAA----------AT-ATGGGAAATAACTTC--A---------------T-TGAC--AT-------T-----ACAT------------GGATTTTA---T-G----T--TG--A----AAAC---------GAC-----------C--------------AACGAATTG------TCAGTT-TG----AAT-GACTTAATGTC-T-ACTA-T--------CTGTT--ATTT-ACA----------------T-C-TT-TC-AG---A--TCAAA-GAAAT--TT-ACGAAAG-TGCCGA-AAA--ATAT---AT-GTA-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------ctttg
gi|21 : TACTAATATTGATT-AGATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACAATTTTGAGTTAATTAGAAATTTCCACAATTTGTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AGAAATT-A-CAGAACATCAATGCTATGAAAGTGTATA-ATGTTTTATATCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTTTTTAAATataaaactttgaagatgtactcgcattttaataaaaggctgcatg
gi|22 : tcaatagtttttgcattgaaaggaatacatgAG--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------TTAAA--------G-C------------T-T--C-TT--------------------T-A----AG---G-ATGTACTCATTGG----TA---TAG--ATTTCAAT-A----------T---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAAGTATGT-GAT-TA-TGT-GTA---------AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGA----------CATGG--GCCTGA---GTG--TC---TTG--------------------------AA-AT--TGA-AA-TAT-AA-----A-TACAAAC
gi|23 : gc------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--G-CT-A-GAACAC--A--------T-A----AA--GG-GT-TAC------A----TA---TAG--------------------------GTT-CGAAAA---ATC-AG-TAA-------T-G-T-ATTAT-GATG-AAATTACGT-GATACA-TGT-a
gi|24 : tttattcatgttaaagcttctttaagg--TAA--CTTATAT-ATATTATCGAAAACGAT-G-T-CGAAAAATTTG-GCAAAAAAGAAT--TTCT-ATAAA----CCCATGTACCAATCCTTCTTT-AATAG---AACT--TTgtagcgtgtaaccttattg
gi|25 : --TT---GGTA-GATTTTCTTT-GAGA-GTAATTT-AC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-GTC-T-ATCAAAAAAGAG--GT-T-GAA--GGATTT-ATTT--TC-AAAA---TA-C-
gi|26 : -ATGTTTTAT--TTTACACTGTAT---CAAGAA---------CATGC--GCCCGA---GTGGGTC---TTG-A-AA-ATTGT--AA-----GGAG-CAA--TCGTGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAA
gi|27 : aGTTTTAT--TCT------TAT---CAAGA----------CAAGT--GCCCGG---GAG--TT---TTG-A-AT-ATTGT--AA-----GG-A-CAA-AT--TGA-AA-TAC-GA-----A-TAAACAC
gi|28 : A----------CATGC--GCCCGA---GTT--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----TG-G-CAA-AT--TAA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAACctt
gi|29 : ATA-A-TGT-A--TGC-A-TT-AAT-ATATTTCAT--TCT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-at
gi|3 : tATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGATTT--GAAAGATTTTGAGTTAATTAGCAATTTCAACAATTTGTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATTCATGATTTGAAATTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAATGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAATTGTTTACAGA-GTGGTTTCAAATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAACG----------------ATAATCT-TA-GA-------AGA---AAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-CTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATGTG--AATTTCCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---TAC--CTGCGTA-T---AAA-----------AAA--TC-CA--T-------------------------TTGAAA--TAAACCTGATATAAT--CATCGAAAACGAT-GTT-ATAAAGTTTTTAGTAAAAAAGGAAATTTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATGGAAAAACT--TTAAA---TA--TT---GATA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAA-TTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-TAATGAAAAAAAAG--GT-T-GCA--G-ATTT-AATT--TT-AAAA---TA-C-T-----------------CAAATAAT--CTCC--T-ATGTAAA--CA-AA-TCAT-T--TCTCTCAG-GAA-A-AT-TAAGAAAA---AA-TTAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------G-GAC--AAT---GAA--A---------------CA--CTT-----------GA----------TTTATCATTTA-----A-A-A--A-T--------GTAAAAAAAAAA-AAAAAA-------AT-ATGGGAAATAACCT---------T-TACC----------------AAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-
gi|4 : ataaatagtttttgcatagaaaggaAG---AACT--TTAAA---TAAATT---GATAAGATTGGCTGG-AAAA-CTA--TTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATGAAAAAA--G--GT-T-GCA--GGATTT-AATT--TT-AAAA---TA-C-T-----------------C-AATAAT--CTCCACT-A-GT-AA--CA-AA-T--C-A--TTTCTCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---AA-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---ACTA-----TT--GA---------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--T-------------TATTTATCATGTT---------------A-A-AATA-T--------GT---------A-AAACAT-------GT-ATGGG-AATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAT--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TTTTATTGGA-TTTA---TCA----T--TGTAA----AAATATGTA----AAA-----------C--------------A--------------T---GTATGGGA-AAT-AACCT
gi|4 : ---------------A-A-AT-A-T--------GT---------A-AAACAT-------GT-ATGGGAAATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAT--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TTTTATTGGATTTT----T-A----T--GT--A----AAAC---------AAC-----------CAAAAAATATAT---A--------------T---TT-TG----ATT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TA--GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA---A--AGATG-T---TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACG---TG-AGGAAAG-TACCG--AAA--ATAT----T-CTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------TTAAA--------G-CTCTTAAATGATAT-C--A-TT-G-G--TA---A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A-----A---TAG--AATTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAACA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG--AATTATGT-GATATA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATG-TTTAT--TTG------TAT---CAAGA----------CAT-------------GTG--TC---TTG-A-AC-ATT-T--AA-----GG-G-CAA-AT--T-A-AA-TAT-G------A-TAAAAACcaaaaattaccaaatttgatataaaatggaaacatatttttattggatttttatgtaaaacaaccaaaaaatatatattttgattaacctaatttctactatagcaactgttatttacaaataaagatgtttgtagaatcaaggacgtgaggaaagtaccgaaaatattctgctcatgttaaagctcttaaatgatatcattggtaataaaaggttacaatagaattcaataatatgttcgaacaaatcagtaatgcattatgatgaattatgtgatatatgtacatgcattaatatgtttatttgtatcaagacatgtgtcttgaacatttaagggcaaattaaatatgataaaaacattat
gi|5 : agaactttaaataaattgataagattggctggaaaactatttacaaaaacaaaattgtaaatatgtatgaaaaaaggttgcaggatttaattttaaaatactcaataatctccactagtaacaaatcatttctcaggaaaattaagaaaaatgaatcagacaaatgtgaattatgtagagaaactattgaggacaatgaacattatttatcatgttaaaatatgtaaaacatgtatgggaataacctcaaaaattaccaaatttgatataaaatggaaacatatttttattggatttatcattgtaa---AGCT--TTAAA---TA--T----GAT--GATTTTCTTGAGAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAA-----TTGTTCAA-TGATG-T-ATAGAAAAAAAG--GT-TTGCATGGAATCT-AATTATTT-AGAAGAATA-CCT-----------------C-AATAAT--CTCC--TTATG--AATCCA-AA-T--AAT--TCTATCGA-GAAGA-ATGTAAG-AAAGGAAA-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTG--ATTATGTGA---GA---------G--GA---AATG-----GG--GA---------G-GCC--AAT---G-A--AACACGATAGTTTTATCA--T-------------GA----------T---------------A-A-A--A-T--------GCGAAG-----A-AATCAT-------ATGATGGGAAATAACCTCAAAA-AAAT-TACCAAATTCTGAT--AT-TAAA--TGG-AAACATA----TCTTATGGGATTTTA---T-A----G--TGAAA----AAAC---------AAC-----------CCAAAAAACTAGATTA--------------T---TT-TGTTTTAAT--ACCTAATTTCATAATTA-TA--GCACACTTTT--ATGT--CAAAAA--TA--AGATG-T-ACTT-GT-AG---AACTCAAG-GACAT--TG--AGAAAG-TTACGA-AAAG-ATAT---AT-TTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------attat
gi|5 : --------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--T-TTCG-G--GACTGA--------T-A----AC--AG-GT--AC------A----TA---TAGC-ATT--AATTA----ATTC-AT---GTT-CGGAAAGAAATCGAG-TAA-------T-GGC-ATTATTGATG-GAAT-ATGT-GATATAGTGT-ACATGCGA-TTCAATTATGTTTAAT--TTG------TAT---CAAG-----------CATGC--GCCCG----GTG--TCCC-TTGGA-AC-ACGTT--AA-----GG-GGCAA-AT--TAT-AA-TATGGA-----A-TAAAAAtaaagcttcttttaaagatgttacaaattgtactctttcgggactgataacaggtacatatagcattaattaattcatgttcggaaagaaatcgagtaatggcattattgatggaatatgtgatatagtgtacatgcgattcaattatgtttaatttgtatcaagcatgcgcccggtgtcccttggaacacgttaaggggcaaattataatatggaataaaaata
gi|6 : agctttaaatatgatgattttcttgagagactaattttacaaaaacaaattgttcaatgatgtatagaaaaaaaggtttgcatggaatctaattatttagaagaatacctcaataatctccttatgaatccaaataattctatcgagaagaatgtaagaaaggaaatgaatcagacaaatgtgattatgtgagaggaaatggggaggccaatgaaacacgatagttttatcatgataaaatgcgaagaaatcatatgatgggaaataacctcaaaaaaattaccaaattctgatattaaatggaaacatatcttatgggattttatagtgaaaaaacaacccaaaaaactagattattttgttttaatacctaatttcataattatagcacacttttatgtcaaaaataagatgtacttgtagaactcaaggacattgagaaagttacgaaaagatatatttgctcatgttaaagcttcttttaaagatgttacaaatAGAAA-----TTGTG--CGTGTAAGGTAA-AGCTAATAA--AATTT-TTTTAAAAA-GCCGTA---AG-ACATAGGGAAATTTTCGTTATAGCAATTTTTCTAAGCGCCTCCTAGAAATTCAATAAGACATTTGCGTA-TAATGAAACTCAATTT-GAAAATTCACAATTCGGGAGTTGAAT-A-AAATAATCCATGGAAAATTAAAACTGA-AT-AT--CA-CGAAA-TGATTG-TTATAAAAGTTTT-GTAAAAAAGGAAATTTTCGATAAAAACCCCCTTATAACCATCCTTTTTTTAATAG---AACTCGTTAAAAATTA--TTTTAGATA-GTTTTTCTTG-GAGAGCTAATTATAC-AAAAAAACAAAGAATGTTGT-AAAAT-ATGGT-ATGAAAAAAAGGTCGTGT-GCA--GAATTT-AAAT--TT-TAAA---TAAC-T-----------------C-AA-AATTTCTCC--TTATGT-AA--CATAA-T--CAT--TCTCT-AG-GAA-ATAT-TAAG-AAA---ATATGAAGATATGTAGACAGATCAG--AAAAATAGGGTGA-ATTATGT-AAGAGA---------G--AA---AATG-----TTTTGA---------G-GACTCAAT---G-A--A---------------CA--C-------------GA----------ta
gi|7 : A---TA--TT---GATA-AATTTTCTTG-GAGA-CTGA-----------A--TA--------TGT-AA--T-ATG-T-ATGAAAAA---GC-GT-T-GCA--AGAATC-AATT--TT-GAA----TA-C-TTCTTTGCTACGTTTTGTC-AATCAT--CTT---T-ATAA-AG--TA-AACT--T-T--TTTCTCAGTGAA-A-AT--AGA-AAA---AC-TGAAC-------------TCAG--ACAAAT---GTGA-A--------------------------A---AATG-----TT--GAA--------G-GAC--AAC---G-A--A---------------TG--CCT-----------GG----------TTTAATTTCATTGTAAA-A-A--A-T--------GT---------A-AA-CAT-------AT-ATGGGAA-TAAGCTC--AA-AA-T-TAACAAATT---AC--ATTAAAA--TGG-AAACAT-----TCGTTTTGGATTTTA---T-A----T--TG--AACATAAACCAAAAAAGTAGA-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACTTAAT--------------------CTTTT--ATTT-ACAAATA--TA--A-AGG-T-A-TT-GTAAG---AATT--AG-GACAC--TG-AAG-AAG-TATC---AGA--CTAT---AT-CTACCTCTTAAACAATGACCTTCCTTTAAGGA--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-T--ACTT-G-AT-TAC--A--------T-A----A-------T-TAT-----------TA---TAG--ATTTCAAT-AAAATAT---AT---GTT-CCAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATT-T-GATG-CACTTATGT-G----------------------AAT-ATGTTTTA----AT------T----------------------TGC--G-CCGA-----G--TC---TTG-A-AC-ATGTT--AG-----GG-G-CAGCAT--TGA-AA-TAT-AA-----ctcgaaattttcccattgtaaagatcgtaaaaacatttgagtggaaatt
gi|8 : AATTT-AATT--TC-AGAA---TA-T-C-----------------T-AATAAT--GTC---T-ATGT-AA--CA-AA-T--A-TAATTTCTCAG-GAA-A-ATATAAG-AAA---AC-T-AT--------------TCAGCCACAAAT---GTGATATTATGT-A---GA---------GCGAA---AA-G-----TT--G----------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CT--CT------------GA----------T---------------T-ATC--A-T--------GT---------A-AAAAATCAGTAAAAT-ATGG-AAATAACCTCTAAACAAAT-TACCAAATT-TGAT--ATTAAAA--TGG-AAACAT-TCTCTCTTATTGGATTTTA---T-A----G--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------AAGGAATAGATA---T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TAG--CA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--TG-AGGAAAG-TACC-A-AAA--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------ATGTTAAAGCTTCTTTAAAGAT---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------T----TA---TAG--AATTCAAT-A----TT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-GATATA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTATT--TGT------TAT---TAAAA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TAA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
gi|9 : ATACTGATAT-GATT-ATATATTAAAA-CAAGATACATACAGTTATACGAACGATT--AAGT-AAT-AACAATT--CATAATTTACATGCTGAAATTATTTATATAT-TTCAATTCATGCCAAAAAAA-GCCAGAACATCAATTATTTGACAATGTATTTATGGTT-A-GTCAAAACCAT-GT--GATG-AAAAAACTATTT-AATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTGT-ACAAT--GA-ACGGA-GTT-TTTCAGATATGTAGTTGATTATTGTGGTAAGAAAA-GG--TTAAACCTATTGAATGTTTTCTACGATAATCTTAGAATGAAAAGAAACATTTTTATGACCGAGTA---CAATAATTA-TAAGTAATATCTTTTAAAAAGGC--TACCCAGAACATA-G--AA-TTTCATGATC------CTAC---------CCTAT----TCAA---AAT--CTGCGTATT---GAAAa
blockSeqs : T A A AC T A A C T C C T T T T T AAC CA T C G T T A C T T T C T AC AGG T A C G CG CCC A T GA AGCAATT TAAGCGCCT GAAAT TAA AT T AAT T TC AT A ATTCGGGAGTTGAATA AT AC A AA A T T T A AT G AACC T T AAA CG AAT AA TTA A A G T G AA GAATG T A G G A C TC G T TG . AT A GAA A C TCTTTGCTACGTTTTGT A T TT CACT TA TC T C CATT T G T G A GGA TA GATATGTAGACAGA CC AGG T G AGA GAAAATGTT CG GAC AACAC TT TTTATCATT T TC TTA A GG CACTTGATTTATCATTTAAAAATGTAAAAAAAAA . C CAGTAAA G AA C A C TTT TA AT G TCTC TAT C GGCCTAG TA ACAT AATTCAAAAAATAGATATTT CAG A TTTT T A A A TTG C CC C AT TA . TA . A TTC T T AT G . AAC TT TAA G C GTGTTAACTGAAGATTCTTTAAGGATGTAC G TTA GA AA TG GCATGTTA A TGTA CT C G TCATTGG ATA GA T AAATAT AAT T GA G T ATCTAAT G G T T A C T G A G T C T AG G ACACTG GTC TCGATATGTG AT TGT GG CTT G C G TA AGACT A G C CG C T G ATTTT T
blockSeqs : . . . . C T T G . . . . A C . C G . C C . G T . C . . T . . . . . . . . . . . T . C . T . . . . T TT . A TCTATCA . AA . AT T . . . . AT . . T . . . . . . . . . T . . A . . . . . A C . . . . . . . . . . . C . CTT A . . . ATAA . . . A . . A C . . . . . . . . . . A . . . . . ACACGATAGTTTTATCATGATAAAATGCGAAG . C . . TA . . . C TA . . AT . . T AA . AACCCAAAAAACTAGATTA . . GGA . . . . GA . . . . . . AA . . . T . . . . GA G . . . TTAAACAATGACCTTCCTTTAAGGATGTAC . AC CG C . . . . . C . ATAAT . C . ACTGC . . . . . T . . . . . . C . . . . . . . G . A A . . . CC . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T T C G . . . . T G . T C . T A . C T . C . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . C T . A TCGATGA . . . . T . . . . . . . T . . . . . . . . . T . . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . CTT T . . . AAT . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . TGCCTGGTTTAATTTCATTGTAAAAAATGT . C . . . . . . T A . . AA . . A . . AACCAAAAAATAGACA . . . . . . . GG . . . . . . AC . . . T . . . . TG . . . . ATGTTGAAGCTTCTTTTAAGGATGTAGC . G G T . . . . . . . A . . . ATAT . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T T A A . . . . T T . T C . T C . G . . C . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . ATG . . . . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . CT T . . . CAT . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . CACTTGATTTATCATTGATAAAAATGT . A . . . . . . C A . . AT . . G . . AACCAAAAAATAGATA . . . . . . . GA . . . . . . A . . . C . . . . GA . . . . TGTTAAAGCCTTCTTTTAAAGATGTAC . A G . . . . . . . . A . . . ATTC . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . CT A . . . AT . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . CACTTGATTTATCATTGTAAATATGT . C . . . . . . C C . . AT . . T . . AACCAAAAATTAGACA . . . . . . . G . . . . . . G . . . T . . . . GA . . . . ATGTTAAAGTTTCTTTAAGGATGTAC . A G . . . . . . . . A . . . AT . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . T T . . . CA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . CATTATTTATCATGTTAAAATATGT . C . . . . . . T A . . AA . . T . . AACCAAAAAATATATA . . . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . ACGTTAAAGCTTCTTTAAAGATGTAC . T T . . . . . . . . A . . . AT . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . TT . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . CATTTGATTTATCATTGT . C . . . . . . T A . . AT . . T . . AACCAAGGAATAGATA . . . . . . . G . . . . . . A . . . . . . . . G . . . . ATGTTAAAGCTTCTTTAAAGATGTAC . A G . . . . . . . . A . . . AC . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . CACAAGATTTATTTGCGT . C . . . . . . T A . . AT . . T . . AGCCAAAAATAGACA . . . . . . . G . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . ATGTTAAAGCTCTTAAATGATA . A G . . . . . . . . A . . . AT . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . CTCTGATTATCATGT . A . . . . . . C T . . AT . . G . . CAAAAAAGTAGACA . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . . . . A . . . . ATGTTAAAAGCGGCTAGC . C A . . . . . . . . A . . . AT . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . CATATACAAATGT . . . . . . . . T . . . A . . T . . GACCAACGAATTG . . . . . . . G . . . . . . A . . . . . . . . G . . . . TAAAGATGTAC . G G . . . . . . . . A . . . AT . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . ATGTAAAACA . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . ATGTTAAAGC . A G . . . . . . . . A . . . TT . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AAC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATGTAC . T G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . .
blockSeqCons : TCATGA************ CT*** G** A** ***
originalCons : ATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAGCAATTTCNACAATTTNTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATTTGAAANTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAATTGGATACGGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATATG--AATTTTCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---AAC--TTGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACA--TC------T--AT-G-AAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGAT-G-T-ATAAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--GT-T-GCA--GAATTT-AATT--TT-AAAA---TA-C-T-----------------C-AATAAT--CTCC--T-ATGT-AA--CA-AA-T--N-T--TTTCTCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---AN-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--C-------------GA----------T---------------A-A-A--A-T--------GT---------A-AAACAT-------AT-ATGGGAAATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TAG-GCA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AATTCAAG-GACAT--TG-AAGAAAG-TACCGA-AAA--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---TAG--ATTTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-GATACA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
finalCons : ATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAGCAATTTCNACAATTTNTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATTTGAAANTGTATG-ATGTTTTATGTCAA--CCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAATTGGATACGGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATATG--AATTTTCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---AAC--TTGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACATCATGA------------AAAAAATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGAT-G-T-ATAAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTGT-AAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--GT-T-GCA--GAATTT-AATT--TT-AAAA---TA-C-T-----------------C-AATAAT--CTCCT---ATGT-AA--CA-AA-T--N-T--TTTCTCAG-GAA-A-AT-TAAG-AAA---AN-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--C-------------GA----------T---------------A-A-A--A-T--------GT---------A-AAACAT-------AT-ATGGGAAATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TAG--CA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AATTCAAG-GACAT--TG-AAGAAAG-TACCA--AAA--ATAT---AT-CTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---TAG--ATTTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-GATACA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 2222222 222222222 22222 111 111 11 44444444444444444 11 11 11 1111 1 11 1111 33333333333333333 111 1111111 22222222222222 111111111 111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111 11111 1111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111111 11111111111 111111111 1111111 1111111111
lowQualScore : 0 8 6 6 99 1 3 1 3 6 6 6 6 7 1 6 1 99 2 3 99 1 2 6 6 7 6 2 5 5 0 5 6 0 5 66 888 5 5 5 5 77 000 5 1 77 8888888 666666666 33333 000 77 5 000 0 1 55 99 3 55555555555555555 6 3 77 55 5 55 1 5 5 5 5 55 5 2222 1 5 888 66 888 66 777 4 4 4 5 4 66 9999 4 4 4 4 4 3 00 4 4 66 0 4 4 2222 8 11111111111111111 4 1 66 444 5 88 66 5 5 9999999 4 4 4 8 4 777 55 77777777777777 55 666 3 3 666 444444444 55 666 88888 44 666666666 3 44 555 3 44 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 2 0000000 3 99 3 3 3 444 77 44 3 00000 555 3 0000000 88 6666 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 555 3 1111 3 3 3 3 77 6 3 44 3 44 44 3 888 3 3 555 6 3 44 3 6 6666 66 33 66 2 2 2 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 5555 444 99 33 00000000 2 6666 33 5 2 11111111111 555 66 0 2 333333333 555 2 33 2 2 2222222 2 2 3 3 3 3 2 2 2 3 3 3 2 33 1 777777 777 4444444444 33 444 33 888 2 2 3 44 77777 3 3 3 44 3 3 3 77777 3
lowQualScore : . . . . .. . . . . . . . . . . . . .. . . .. . . . . . . . . . . . . . . .. ... . . . . .. ... . . .. ....... ......... ..... ... .. . ... . . .. .. . ................. . . .. .. . .. . . . . . .. . .... . . ... .. ... .. ... . . . . . .. .... . . . . . . .. . . .. . . . .... . ................. . . .. ... . .. .. . . ....... . . . . . ... .. .............. .. ... . . ... ......... .. ... ..... .. ......... . .. ... . .. .......................................................................................... . . ....... . .. . . . ... .. .. . ..... ... . ....... .. .... ..................................................... ... . .... . . . . .. . . .. . .. .. . ... . . ... . . .. . . .... .. .. .. . . . ........................................................................................................................ . .... ... .. .. ........ . .... .. . . ........... ... .. . . ......... ... . .. . . ....... . . . . . . . . . . . . . .. . ...... ... .......... .. ... .. ... . . . .. ..... . . . .. . . . ..... .
lowQualScore : 8 0 7 7 22 7 5 0 3 7 7 7 7 8 0 7 7 22 5 5 22 7 5 7 7 3 7 5 7 7 1 1 7 7 0 99 888 0 7 7 7 99 000 7 4 99 3333333 777777777 33333 000 99 7 000 1 8 22 22 2 77777777777777777 7 2 99 77 7 77 7 7 7 7 7 77 7 1111 4 7 888 99 888 11 888 4 4 4 4 4 11 4444 4 4 4 4 4 4 66 4 4 11 4 0 0 5555 0 11111111111111111 4 0 11 444 0 66 99 0 0 0000000 4 4 4 9 4 888 00 55555555555555 00 444 6 6 444 555555555 00 444 33333 66 777777777 3 66 888 3 66 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 5 8888888 3 22 3 3 3 777 99 22 1 22222 444 1 5555555 55 5555 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 444 1 9999 1 1 1 1 33 2 1 22 1 22 22 1 222 1 1 444 6 1 22 1 2 5555 22 99 88 9 9 9 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 9 4444 000 66 99 44444444 9 1111 99 7 9 77777777777 000 88 1 9 666666666 000 9 99 9 9 1111111 9 9 1 1 1 1 2 9 9 1 1 1 9 77 1 777777 999 3333333333 77 777 77 333 9 9 1 22 77777 1 1 1 22 1 1 1 77777 6
consensus : ATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAGCAATTTCNACAATTTNTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATTTGAAANTGTA-TGATGTTTTATGTC--AACCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAATTGGATACGGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATATG--AATTTTCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---AAC--TTGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACA--TC-A-----TGAA--AAA-AATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGAT-G-T-ATAAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTG-TAAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--G-T-TGCA--GAATTT-AATT-TT----AAAATA-CT-----------------C-AATAAT--CTCC--T-ATGT-AA--CA-AA-T--N-T--TTTCTC-AG-GAAA-AT-TAAG-AA---AAN-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--C-------------GA----------T---------------A-A-A--A-T--------GT---------A-AAACAT-------AT-ATGGGAAATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------AA--A----------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TA--G-CA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AATTCAAG-GACAT--TG-AAGAAAG-TA----CC-GA--AA--ATAT-AT-CTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---TAG--ATTTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-GATACA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
Reference ( family-3684 ) : ATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAGCAATTTCNACAATTTNTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATTTGAAANTGTA-TGATGTTTTATGTC--AACCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAATTGGATACGGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATATG--AATTTTCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---AAC--TTGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACA--TC-A-----TGAA--AAA-AATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGAT-G-T-ATAAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTG-TAAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--G-T-TGCA--GAATTT-AATT-TT----AAAATA-CT-----------------C-AATAAT--CTCC--T-ATGT-AA--CA-AA-T--N-T--TTTCTC-AG-GAAA-AT-TAAG-AA---AAN-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--C-------------GA----------T---------------A-A-A--A-T--------GT---------A-AAACAT-------AT-ATGGGAAATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TA--G-CA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AATTCAAG-GACAT--TG-AAGAAAG-TA----CC-AA--AA--ATAT-AT-CTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---TAG--ATTTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-GATACA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
gi|1 : ATACTGATATTGGTT-ATATATTGAAAACAAG-TGC-CACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATTAACAATTTCAACAATTTCTATGCTGAAGT-ATTTATATAT-TTCAATTCATTC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATATGAAATTGTA-TGATGTTTTATGTC--AACCATTGT--GGTGTAACAAACTTTTTCAATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAGTTGGATACAGA-GTGGTTTAAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTTTTGAATGGTTT-TACGATAATTTTAGAACAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-TTTCAAAAA-GC--TA---AG-AAATGTG--AATTTTCAACAT-------TTAC---------CGTA-----TCAA---AAC--TTACGTA-T---GAAACTCAAATTTGAAA--TCACA--TCTA-----TG-A--AAA-AATCCATTGAAA--TAA--CTGATAT-AT--CATCGAAAACGAG-G-T-ATACAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATAG---AACT--TTAAA---TA--TT---GATA-AATTTTCTTA-GAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--CAAAA----TTG-TAAA-T-ATG-T-ATGAAAAAAAAG--G-T-TGCA--GAATTTAAATT-TT----GAAATA-CT-----------------C-AAAAAT--CTAC--T-ACGT-AA--CA-AA-T--C-T--TTTCTC-AG-GAAA-AT-TAAG-AA---ATC-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---ATTG-----TT--GA---------A-GAC--AAT---G-A--A---------------CA----------------AA----------T---------------A-A-A--A-T--------GT---------AGAAACAT-------AT-ATGGGAAATAA-CTT--AA-AAAT-TACAAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TAG-G-CA-ACT-TT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATGAT-A-TTGGT-AG---ACTTCAAG-GA-AT--TG-AAGAATGATA----CCGAA--AA--ATATGAT-TTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-T-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---AAG--ATTTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAT--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-ATTG-AAATTATGT-GATACA-CGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---TAAGA----------CATGC--GCCCCA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GA-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
gi|10 : TC-AG-GAAA-AT-GAAG-AA---AAA-TGAA--------------TCAG--ACAGAT---GTAA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------A-GAC--AAT---G-A--A---------------CATTT-------------GATT--------T---------------ATC-A--T-T--------GT---------A-AAA-AT-------GT-A----AAACAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-A----T--TG--A----AAAC---------AACCAAAAAATAGAC--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TA--G-CA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--TG-AACAAAA-TA----CC-AA--AA--ATAT-AT-CTG-CTC------------------------ATGTTAAAGTTTCTTTAAGGAT---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--G-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------ATAATTA---TAG--ATTTCAAT-AAT--AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTA--T-GATATA-TAT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTT---T--TGT------TAT---CAAGA----------CATGC--TCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GA-----A-TAA
gi|11 : tG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TG--CA---------G-GAC--AAT---G-GGGA---------------CA--CTTGATTTATCATTGA----------T---------------A-A-A--AAT--------GT---------A-AAACAT-------AA-ATGGGAAATAAC-TC--AA-AAATATACCAAATT-TGATTTAT-AAAAATTGGGAAAAACAA---TCT-ATTGGATT--A---T-A----A--TG--A----AA-C---------AATT----------C--------------AAAAAATAGATATTTT---TT-TG----AATTAACCTAATTTC-T-ACTA-TT--GATA-ACTGTT--ATTT-ACAA-TA--TA--AGATG-TTA-TT-GT-AG---AAT-CAAGTGACAT--TG-ACGAAAG-TA----CC-GA--AA--ATAT-AT-CTG-CTCTGTTAAAGCCTTCTTTTAAAG---A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-TTTA-TT-G-GC-TAT--A--------T-A----AA--AGCGT-TAC------A----TA---TAAGAATGTCAAT-T----AT---AT---GTTTCGAAAA--AA-C-AG-TAA-------TGG-C-ATTGT-GATA-A----ATG----TACA-TGTAACATGC-A-TT-AAT-ATG-TTTAT--TGT------TATGTCCAAGA----------CA-GG--GCCCGA---GTG--TC---
gi|12 : agAA-TGAA--------------TCAG--CCAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GAGAAAATGTTG--AAGACAATGAACACTT--GATTTATCATTGTAAA--AATTTAA-A--A---------------CA--T--------------A----------T---------------ACA-A--A-T--------GT---------A-AAACAC-------AT-ACGGGAAATAGCCTA--AA-GAAT--ACCAAATT-TAAT--AT-CAAA--GGG-AAACATAT---TCTTATTGGACTTTA---T-A----G--TG--A----AACC---------AGC-----------C--------------AAAAATAGACA----T---TT-TT----AAT-AAGCTAATTTC-T-ACTA-TA--G-CA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-G-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--TG-ACGAAAG-TA----CC-GA--AA--ATAT-AT-CTG-CTTACGTTAAAGCTTCTTTAAAG----A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------TAA----AA--AG-GT-TAC------A----TA---CAG--AATTCCAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--TATC-AG-TAA-------C-G-C-ATTAT-GATG-AATTTATGT-GATATA-TGT-AAATAA-A--T-AAT----CTTTAT--TTT------T
gi|13 : ATACTGATATTGATTTATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACGATTTTAAGTTAATAAGCAATTTCAATAATTTCTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATCAATGATTTGAAATTGTA-TGATGTTTTATTTC--AAGCATTGT--GATGTAACAAACTATTTCAATAAAAAGG-AAAATGTGTATTTTTTTACGATTGGATACGGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TAAGTAATAT-CTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATATG--AATTTTCA
gi|14 : cattgaaaggaG-GAAATGTGTATTTATTGACAATTGGATACAGA-GTGGTTTCAGATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAGGAAACA-TTTTATA--CGAGTA---CAA-A
gi|14 : aCAA---ATC--TAGCGTA-T---GAAACTCAATTTCGAAA--TCACG--TCTA-----TCAA--AAA-AATCCATTAAAA--TAA--CTGATAT-AT--CAACGAAAACGAT-G-T-ATAAAGTTTTT-GTAAGAAAGAAA--TTTT-ATCAA----CCCACATACCAATCTTTTTTA-AATAG---ATCT--TTGAA---TA--TT---GAAA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAA-TTTACGAAAAA--CAAAA----TTG-TAAA-T-ATG-T-ATTAAAGAACAG--G-T-TGCA--GAATTT-ATTT-TT----TTAATA-CT-----------------C-AATGAT--CTtctagcgtatgaaactcaatttcgaaatcacgtctatcaaaaaaatccattaaaataactgatatatcaacgaaaacgatgtataaagtttttgtaagaaagaaattttatcaacccacataccaatcttttttaaatagatctttgaatattgaaagattttcttggagactaatttacgaaaaacaaaattgtaaatatgtattaaagaacaggttgcagaatttatttttttaatactcaatgatct
gi|15 : aggaaatgtgtatttattgacaattggatacagagtggtttcagatatgtagttgatattgtggatgaaaatggtattaaacctattgaatggttttacgataatcttagaagaaaaggaaacattttatacgagta--TG--G----AAAT---------AAC-----------------------------------------T---TC-AG----AA--AAC---ATCTC-T-ACTAATA--GGCA-ACTGTTCCATTTCACAAATAATTA--AGATG-T-AATT-GC-AG---AATCCAAG-GACAT--TGGAAGAAAA-TA----CC-AACAAATTATAC-ATGCTG-CTC------------------------A--------------------TGTTGAAGCTTCTTTTAAGGATG------------------------T------------AGC------------TGC--A-TT-GAG--TAT--AGCATGTTAT-G----AACTAGCGT-T-C------A----TA---T-T--ATTTCAAT-A----AC---ATAATGTT-CGAAAA--AATC-AGTTAAT------T-G-CTCTTA--GAGGAAAATTATGTCGATACA-TGT--CATGC-CTTT-GAT-A-GTTTTAT--TGT------TATA--TAAGA----------CATGT--TCCAGATGTATG--TCCTTTTG-ACACGATTGTTAAA-----CG-G-CAA-AC--TGACAATTAT-GA-----ATTAAGAA
gi|16 : tgtaaaaacactaAATTTC-T-AGTA-TATTG-CA-ATTGTT--ATTC-ACAAATA--TATAAGGTG-T-G-TT-GT--GTTCAATT-AAA-GACATATTG-AAGAA---TA----CC-AA--AA--ATAT-GT-CTA-TTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------TTAAAAGCGGCTAG-C------------T-C--T-CT-T-G--TAT--A--------T-ATGTAAA--AA-TT-TAC------A----TAATATAG--ATTTTAAA-A----ACTGCAT---GAT-CGAAAA--AATC-AG-TAGATCTAATT-T-C-ATTAG-GATG-AAATGA----GATGCA-TG---CATAA-A-TT-GAT-ATGTTTTATAGTGC------TAT---CAAGATCGATATGTGCATGCATGCCTGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--GAAGACTGG-G-GAA-GT--TAA-AA-TCT-GA-----aaca
gi|17 : GAGATGAATTTGA-TATAGTGG-ATGAAAATGGTATTAAACCTATTGAATGGTTT-TACGATAATCTTAGAAGAAAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---TAA-AATTA-TGAGTAATAT-TATCAAAAA-GC--TA---AG-AC--ATG--AATTTTCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---AAC--TTGCGTA-T---GAAGCTCAATTTTGAAA--TCATA--TCGA-----TGAA--AAA-AATCCATTGAAA--TAA--CTTATAT-AT--CATCGAAAACGAT-G-T-ATGAAATTTTT-GTAAAAAAGAAA--TTGC-ATAAA----CCCATATACCAATCC-TTTTT-AAT
gi|18 : A--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-AGGCCTAGTG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------AAAAAATAGATA---T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ATTA-TA--G-CA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--TG-AGGAAAG-TATCTGCT-CA--TG--TTAA-AG-CTT-CTTTAAAG-------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---TAG--AATTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-
gi|19 : AACGAA-TAC-CGCAGATTT--CAACGATCTGAACTCA-TTACCACGTTCTACAA----------GGAAC-TTTTCTGTGCCTTCAAT----GA-AGTAAATTGCCA-AGTGTCTAAGAT--AGAACCG-A-TGAGGTATTACGCC--AA--AATATCAGGTTCAACAAAA-ATTTCAATCTAAAGGGAAAATAT-TATATTTTCAAAATTGGA-ATGAAAGTGGCTT-AAATATGTAAAAGA-TCTTGTGG-AATAAAATGGAATAAAAC
gi|2 : GATAGCCTGAGAAGAAAA-GAAACA-TGTTATG--CGAGTA---AAA-AATTA-TGAGTAATAT-TCTTTAAAA-GC--TA---A----ATATG--AATTTTCAAGAT-------TTAT---------TTTA-----TCAA---AAT--TTACGTA-T---GAAACTCAACT-----------CA-----A-----TGAA--CAC-A-TCCATTGGAA--TAA--CTAATAT-ATAACATCGGAAACAAT-G-T-ATACAATTTTT-GTAAAAA-GAAA--TTTC-ATAGA----CCCGTGTACCAAT------------------ACT--TTAAA---T----------------TTTCTTG-GAGA-GTAA-TTTAC-AAAAA--CAAAA----TTG-TAAA-T-ATG-T-ACGAAAAATAAA--G-T-TGCA--AAATTT-GATT-TTA---AAAATA-GT-----------------C-AACAAT--CTCC--T-ATGA-AA--CA-AA-T--A-T--TTTATC-AG-GAAA-AT-TAAG-AA---AAC-TGAA--------------TCTG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATT-----TT--GA---------A-CAC--AAT---G-A--A---------------CA--CTT-----------GATTTATCATTGT---------------A-A-AT-A-T--------GT---------A-AAAC---------AT-ATGGAAAATAACCTA--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAC--AT-AAAA--TGG-AAACATAA---TCTTATTGGATTTCATATT-A----T--TG--A----AAAC---------AACCAAAAATTAGAC--------------A--------------T---TT-TG-------------AATCTC-T-ACTA-TA--G-AA-ACTGTT--ATAT-ACAAATA--AA--AAA-----A-------AG---AA---AAA-AAGAT------AGAAAA-TA----CC-AA--AA--ATAT-AT-CTA-CTC------------------------G--------------------T---------------------GTTAACTGAAGATTCTTTAAGGATGT------------A-C------------T-C--A-CT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A----TA---TAA--ATTTC----A----AT---AT---GTT-CGAAAA--AGTC-AG-TAA-------T-A-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-ATCACA-TGT-ACTTGA-A-TT-AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGG----------CATGC--TCCAGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATAGT--AA------G-G-CAA-AT--TGA-AA-TAT-GAATTTTA-TAAAAAC
gi|20 : -----TT--GA---------A-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--C-----------------------------------------A-A-G--A-TTTATTTGCGT---------G-AAA----------AT-ATGGGAAATAACTTC--A---------------T-TGAC--AT-------T-----ACAT------------GGATTTTA---T-G----T--TG--A----AAAC---------GAC-----------C--------------AACGAATTG------TCAGTT-TG----AAT-GACTTAATGTC-T-ACTA-T---------CTGTT--ATTT-ACA----------------T-C-TT-TC-AG---A--TCAAA-GAAAT--TT-ACGAAAG-TG----CCGAA--AA--ATAT-AT-GTA-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------ctttg
gi|21 : TACTAATATTGATT-AGATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGTTTT--GAACAATTTTGAGTTAATTAGAAATTTCCACAATTTGTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AGAAATT-A-CAGAACATCAATGCTATGAAAGTGTA-TAATGTTTTATATC--AACCATTGT--GGTGTAACAAACTTTTTAAATataaaactttgaagatgtactcgcattttaataaaaggctgcatg
gi|22 : tcaatagtttttgcattgaaaggaatacatg--AG--ATAT-AT-CTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------TTAAA--------G-C------------T-T--C-TT--------------------T-A----AG---G-ATGTACTCATTGG----TA---TAG--ATTTCAAT-A----------T---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAAGTATGT-GAT-TA-TGT-GTA---------AAT-ATGTTTTAT--TGT------TAT---CAAGA----------CATGG--GCCTGA---GTG--TC---TTG--------------------------AA-AT--TGA-AA-TAT-AA-----A-TACAAAC
gi|23 : gc------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--G-CT-A-GAACAC--A--------T-A----AA--GG-GT-TAC------A----TA---TAG--------------------------GTT-CGAAAA---ATC-AG-TAA-------T-G-T-ATTAT-GATG-AAATTACGT-GATACA-TGT-a
gi|24 : tttattcatgttaaagcttctttaagg--TAA--CTTATAT-ATATTATCGAAAACGAT-G-T-CGAAAAATTTG-GCAAAAAAGAAT--TTCT-ATAAA----CCCATGTACCAATCCTTCTTT-AATAG---AACT--TTgtagcgtgtaaccttattg
gi|25 : --TT---GGTA-GATTTTCTTT-GAGA-GTAATTT-AC-AAAAA--CAAAA----TTG-TAAA-T-GTC-T-ATCAAAAAAGAG--G-T-TGAA--GGATTT-ATTT-TC----AAAATA-C
gi|26 : -ATGTTTTAT--TTTACACTGTAT---CAAGAA---------CATGC--GCCCGA---GTGGGTC---TTG-A-AA-ATTGT--AA-----GGAG-CAA--TCGTGA-AA-TAT-GA-----A-TAAAA
gi|27 : aGTTTTAT--TCT------TAT---CAAGA----------CAAGT--GCCCGG---GAG--TT---TTG-A-AT-ATTGT--AA-----GG-A-CAA-AT--TGA-AA-TAC-GA-----A-TAAACAC
gi|28 : A----------CATGC--GCCCGA---GTT--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----TG-G-CAA-AT--TAA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAACctt
gi|29 : ATA-A-TGT-A--TGC-A-TT-AAT-ATATTTCAT--TCT------TAT---CAAGA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-at
gi|3 : tATACTGATATTGATT-ATATATTAAAAACAAG-TGC-TACAGATTT--GAAAGATTTTGAGTTAATTAGCAATTTCAACAATTTGTATGCTGAAAT-ATTTATATAT-TTCAATTCATGC-AAAAAAT-GCCAGAACATTCATGATTTGAAATTGTA-TGATGTTTTATGTC--AACCATTGT--GGTGTAACAAACTATTTCAATACAATGG-AAAATGTGTATTTTTTGACAATTGTTTACAGA-GTGGTTTCAAATATGTAGTTGA-TATTGTGG-ATGAAAACG----------------ATAATCT-TA-GA-------AGA---AAAAGAAACA-TTTTATG--CGAGTA---CAA-AATTA-TGAGTAATAT-CTTTAAAAA-GC--TA---AG-ACATGTG--AATTTCCATGAT-------TTAC---------CCTA-----TCAA---TAC--CTGCGTA-T---AAA-----------AAA--TC-CA--T------------------------TTGAAA--TAAACCTGATATAAT--CATCGAAAACGAT-GTT-ATAAAGTTTTTAGTAAAAAAGGAAATTTTC-ATAAA----CCCATATACCAATCCTTTTTT-AATGGAAAAACT--TTAAA---TA--TT---GATA-GATTTTCTTG-GAGA-CTAA-TTTAC-AAAAA--CAAAA----TTG-TAAA-T-ATG-TAATGAAAAAAAAG--G-T-TGCA--G-ATTT-AATT-TT----AAAATA-CT-----------------CAAATAAT--CTCC--T-ATGTAAA--CA-AA-TCAT-T--TCTCTC-AG-GAAA-AT-TAAGAAA---AAA-TTAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---AATG-----TT--GA---------G-GAC--AAT---GAA--A---------------CA--CTT-----------GA----------TTTATCATTTA-----A-A-A--A-T--------GTAAAAAAAAAA-AAAAAA-------AT-ATGGGAAATAACCT---------T-TACC----------------AAA--TGG-AAACATAT---TCTTATTGGATTTTA---T-
gi|4 : ataaatagtttttgcatagaaaggaAG---AACT--TTAAA---TAAATT---GATAAGATTGGCTGG-AAAA-CTA--TTTAC-AAAAA--CAAAA----TTG-TAAA-T-ATG-T-ATGAAAAAA--G--G-T-TGCA--GGATTT-AATT-TT----AAAATA-CT-----------------C-AATAAT--CTCCACT-A-GT-AA--CA-AA-T--C-A--TTTCTC-AG-GAAA-AT-TAAG-AA---AAA-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTGA-ATTATGT-A---GA---------G--AA---ACTA-----TT--GA---------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CA--T-------------TATTTATCATGTT---------------A-A-AATA-T--------GT---------A-AAACAT-------GT-ATGGG-AATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAT--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TTTTATTGGA-TTTA---TCA----T--TGTAA----AAATATGTA----AAA-----------C--------------A--------------T---GTATGGGA-AAT-AACCT
gi|4 : ---------------A-A-AT-A-T--------GT---------A-AAACAT-------GT-ATGGGAAATAACCTC--AA-AAAT-TACCAAATT-TGAT--AT-AAAA--TGG-AAACATAT---TTTTATTGGATTTT----T-A----T--GT--A----AAAC---------AAC-----------CAAAAAATATAT---A--------------T---TT-TG----ATT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TA--G-CA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA---A--AGATG-T---TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACG---TG-AGGAAAG-TA----CC-GA--AA--ATAT--T-CTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------TTAAA--------G-CTCTTAAATGATAT-C--A-TT-G-G--TA---A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------A-----A---TAG--AATTCAAT-A----AT---AT---GTT-CGAACA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG--AATTATGT-GATATA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATG-TTTAT--TTG------TAT---CAAGA----------CAT-------------GTG--TC---TTG-A-AC-ATT-T--AA-----GG-G-CAA-AT--T-A-AA-TAT-G------A-TAAAAACcaaaaattaccaaatttgatataaaatggaaacatatttttattggatttttatgtaaaacaaccaaaaaatatatattttgattaacctaatttctactatagcaactgttatttacaaataaagatgtttgtagaatcaaggacgtgaggaaagtaccgaaaatattctgctcatgttaaagctcttaaatgatatcattggtaataaaaggttacaatagaattcaataatatgttcgaacaaatcagtaatgcattatgatgaattatgtgatatatgtacatgcattaatatgtttatttgtatcaagacatgtgtcttgaacatttaagggcaaattaaatatgataaaaacattat
gi|5 : agaactttaaataaattgataagattggctggaaaactatttacaaaaacaaaattgtaaatatgtatgaaaaaaggttgcaggatttaattttaaaatactcaataatctccactagtaacaaatcatttctcaggaaaattaagaaaaatgaatcagacaaatgtgaattatgtagagaaactattgaggacaatgaacattatttatcatgttaaaatatgtaaaacatgtatgggaataacctcaaaaattaccaaatttgatataaaatggaaacatatttttattggatttatcattgtaa---AGCT--TTAAA---TA--T----GAT--GATTTTCTTGAGAGA-CTAATTTTAC-AAAAA--C-AAA----TTGTTCAA-TGATG-T-ATAGAAAAAAAG--GTT-TGCATGGAATCT-AATTATTTAGAAGAATACCT-----------------C-AATAAT--CTCCT-T-ATG--AATCCA-AA-TA-A-T--TCTATCGAG-AAGA-ATGTAAG-AAAGGAAA-TGAA--------------TCAG--ACAAAT---GTG--ATTATGTGA---GA---------G--GA---AATG-----GG--GA---------G-GCC--AAT---G-A--AACACGATAGTTTTATCA--T-------------GA----------T---------------A-A-A--A-T--------GCGAAG-----A-AATCAT-------ATGATGGGAAATAACCTCAAAA-AAAT-TACCAAATTCTGAT--AT-TAAA--TGG-AAACATA----TCTTATGGGATTTTA---T-A----G--TGAAA----AAAC---------AAC-----------CCAAAAAACTAGATTA--------------T---TT-TGTTTTAAT--ACCTAATTTCATAATTA-TA--G-CACACTTTT--ATGT--CAAAAA--TA--AGATG-T-ACTT-GT-AG---AACTCAAG-GACAT--TG--AGAAAGTTA----CG-AA--AAG-ATAT-AT-TTG-CTC------------------------A--------------------T---------------------G------------------------T------------attat
gi|5 : --------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--T-TTCG-G--GACTGA--------T-A----AC--AG-GT--AC------A----TA---TAGC-ATT--AATTA----ATTC-AT---GTT-CGGAAAGAAATCGAG-TAA-------T-GGC-ATTATTGATG-GAAT-ATGT-GATATAGTGT-ACATGCGA-TTCAATTATGTTTAAT--TTG------TAT---CAAG-----------CATGC--GCCCG----GTG--TCCC-TTGGA-AC-ACGTT--AA-----GG-GGCAA-AT--TAT-AA-TATGGA-----A-TAAAAAtaaagcttcttttaaagatgttacaaattgtactctttcgggactgataacaggtacatatagcattaattaattcatgttcggaaagaaatcgagtaatggcattattgatggaatatgtgatatagtgtacatgcgattcaattatgtttaatttgtatcaagcatgcgcccggtgtcccttggaacacgttaaggggcaaattataatatggaataaaaata
gi|6 : agctttaaatatgatgattttcttgagagactaattttacaaaaacaaattgttcaatgatgtatagaaaaaaaggtttgcatggaatctaattatttagaagaatacctcaataatctccttatgaatccaaataattctatcgagaagaatgtaagaaaggaaatgaatcagacaaatgtgattatgtgagaggaaatggggaggccaatgaaacacgatagttttatcatgataaaatgcgaagaaatcatatgatgggaaataacctcaaaaaaattaccaaattctgatattaaatggaaacatatcttatgggattttatagtgaaaaaacaacccaaaaaactagattattttgttttaatacctaatttcataattatagcacacttttatgtcaaaaataagatgtacttgtagaactcaaggacattgagaaagttacgaaaagatatatttgctcatgttaaagcttcttttaaagatgttacaaatAGAAA-----TTGTG--CGTGTAAGGTAA-AGCTAATAA--AATTT-TTTTAAAAA-GCCGTA---AG-ACATAGGGAAATTTTCGTTATAGCAATTTTTCTAAGCGCCTCCTAGAAATTCAATAAGACATTTGCGTA-TAATGAAACTCAATTT-GAAAATTCACAATTC-GGGAGTTGAATAAAATAATCCATGGAAAATTAAAACTGA-AT-AT--CA-CGAAA-TGATTG-TTATAAAAGTTTT-GTAAAAAAGGAAATTTTCGATAAAAACCCCCTTATAACCATCCTTTTTTTAATAG---AACTCGTTAAAAATTA--TTTTAGATA-GTTTTTCTTG-GAGAGCTAATTATAC-AAAAAAACAAAGAATGTTG-TAAAAT-ATGGT-ATGAAAAAAAGGTCG-TGTGCA--GAATTT-AAAT-TT----TAAATAACT-----------------C-AA-AATTTCTCC--TTATGT-AA--CATAA-T--CAT--TCTCT--AG-GAAATAT-TAAG-AA---AATATGAAGATATGTAGACAGATCAG--AAAAATAGGGTGA-ATTATGT-AAGAGA---------G--AA---AATG-----TTTTGA---------G-GACTCAAT---G-A--A---------------CA--C-------------GA----------ta
gi|7 : A---TA--TT---GATA-AATTTTCTTG-GAGA-CTGA-----------A--TA--------TG-TAA--T-ATG-T-ATGAAAAA---GC-G-T-TGCA--AGAATC-AATT-TT----GAA-TA-CTTCTTTGCTACGTTTTGTC-AATCAT--CTT---T-ATAA-AG--TA-AACT--T-T--TTTCTC-AGTGAAA-AT--AGA-AA---AAC-TGAAC-------------TCAG--ACAAAT---GTGA-A--------------------------A---AATG-----TT--GAA--------G-GAC--AAC---G-A--A---------------TG--CCT-----------GG----------TTTAATTTCATTGTAAA-A-A--A-T--------GT---------A-AA-CAT-------AT-ATGGGAA-TAAGCTC--AA-AA-T-TAACAAATT---AC--ATTAAAA--TGG-AAACAT-----TCGTTTTGGATTTTA---T-A----T--TG--AACATAAACCAAAAAAGTAGA-----------C--------------A--------------T---TT-TG----AAT-AACTTAAT---------------------CTTTT--ATTT-ACAAATA--TA--A-AGG-T-A-TT-GTAAG---AATT--AG-GACAC--TG-AAG-AAG-TA----TC--A--GA--CTAT-AT-CTACCTCTTAAACAATGACCTTCCTTTAAGGA--------------------T---------------------G------------------------T------------A-C------------T-T--ACTT-G-AT-TAC--A--------T-A----A-------T-TAT-----------TA---TAG--ATTTCAAT-AAAATAT---AT---GTT-CCAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATT-T-GATG-CACTTATGT-G----------------------AAT-ATGTTTTA----AT------T----------------------TGC--G-CCGA-----G--TC---TTG-A-AC-ATGTT--AG-----GG-G-CAGCAT--TGA-AA-TAT-AA-----ctcgaaattttcccattgtaaagatcgtaaaaacatttgagtggaaatt
gi|8 : AATTT-AATT-TC----AGAATA-TC-----------------T-AATAAT--GTC---T-ATGT-AA--CA-AA-T--A-TAATTTCTC-AG-GAAA-ATATAAG-AA---AAC-T-AT--------------TCAGCCACAAAT---GTGATATTATGT-A---GA---------GCGAA---AA-G-----TT--G----------G-GAC--AAT---G-A--A---------------CT--CT------------GA----------T---------------T-ATC--A-T--------GT---------A-AAAAATCAGTAAAAT-ATGG-AAATAACCTCTAAACAAAT-TACCAAATT-TGAT--ATTAAAA--TGG-AAACAT-TCTCTCTTATTGGATTTTA---T-A----G--TG--A----AAAC---------AAC-----------C--------------AAGGAATAGATA---T---TT-TG----AAT-AACCTAATTTC-T-ACTA-TA--G-CA-ACTGTT--ATTT-ACAAATA--TA--AGATG-T-A-TT-GT-AG---AA-TCAAG-GACAT--TG-AGGAAAG-TA----CC-AA--AA--ATAT-AT-CTG-CTC------------------------ATGTTAAAGCTTCTTTAAAGAT---------------------G------------------------T------------A-C------------T-C--A-TT-G-G--TAT--A--------T-A----AA--AG-GT-TAC------T----TA---TAG--AATTCAAT-A----TT---AT---GTT-CGAAAA--AATC-AG-TAA-------T-G-C-ATTAT-GATG-AAATTATGT-GATATA-TGT-ACATGC-A-TT-AAT-ATGTTTATT--TGT------TAT---TAAAA----------CATGC--GCCCGA---GTG--TC---TTG-A-AC-ATTGT--AA-----GG-G-CAA-AT--TAA-AA-TAT-GA-----A-TAAAAAC
gi|9 : ATACTGATAT-GATT-ATATATTAAAA-CAAGATACATACAGTTATACGAACGATT--AAGT-AAT-AACAATT--CATAATTTACATGCTGAAATTATTTATATAT-TTCAATTCATGCCAAAAAAA-GCCAGAACATCAATTATTTGACAATGTATTTATG-GTTA-GTCAAAACCA-TGT--GATG-AAAAAACTATTT-AATACAAAGG-AAAATGTGTATTTTGT-ACAAT--GA-ACGGA-GT-TTTTCAGATATGTAGTTGATTATTGTGGTAAGAAAA-GG--TTAAACCTATTGAATGTTTTCTACGATAATCTTAGAATGAAAAGAAACATTTTTATGACCGAGTA---CAATAATTA-TAAGTAATATCTTTTAAAAAGGC--TACCCAGAACATA-G--AA-TTTCATGATC------CTAC---------CCTAT----TCAA---AAT--CTGCGTATT---GAAAa