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Reference ( gi|12 )           :                                                       CCTGCGA-GATG-A--TCAGGGAT--ACTT-CATG-AAC--A-ATTAA-GAAA----A-A-TT-CATG--A-A-T---T---A--T----ATT--C-C-TGAA---C---C------A------G-T--T---G-AG-T--TC----G------A----C----T-C--A--T-----G-A--A-------T-------------A---A-T-----T-C-----A-T--G----A--A-C--T----A----C---C---C-A----------TG-A-A--CT-----TA-----T-T-----A---T---T-G--AAC---ACT--C-A--T-G---A----A----G------T--C--AT-----G-AA-T-T------T---A----------------A----T-T-CA-TG-A-----------------A--------AT-------A-----A--G-A----------TT-C-A-TG-A---A-T---A--TT---C----A------T-G--AA----CT--A-G--G-A------G--TAGTTC--A--T-GA-A-C---------AA--A-A-TT-GCA------G-GG--G-T---T-G----T---AT-C--T-CCA-TG-A---A--------AC-----T-------------TC--A-------T-G-A----A---C--A---------T-TC----A-A-GA-A--T--------A-----T----G---TA-----A----A-T-TC-A--T-G-A----A----A--C---TTC-AT-G-AA-C----AT--TCAAG-AA-T--ATTA--C-AATAGTAG
gi|3                          :                                                       CCTGCGA-AATG-A--TTAGA-AT--ACTT-CATG-AAC--A-ATTAA-GAAA----A-A-TT-CATG--A-A-T---T---A--TT---GTT--C-C-TGAA---C---C------A------G-T--T---G-AG-T--TC----A------G----C----T-C--AA-T-----G-A--A-------T-------------A---A-T-----T-C-----A-T--A----A--A-C--TA---A----C---C---C-A----------TG-A-A--CG-----TA-----T-T-----A-------T-G--GAC---ATT--C-A--T-A---A----A----G------T--C--AT-----GAAA-T-T------T---A----------------A----T-T-CA-TG-------------------A--------AT-------A-----A--G-A----------TT-C-A-TG-A---A-T---A--TT---C----A------C-G--AA----CT--A-G--G-G------A--AAGTCT--A--T-GA-A-G---------AA--A-A-TT-G--------G-CG--G-A---T-G----T---AA-A--T-TCA-TG-A---A--------TC-----T-------------TCG-A-------T-G-A----A---C--A---------T-TC----A-A-GA-A--TC-------A-----T----G---TA-----A----A-TGTC-A--T-T-G----A----A--C---TTC-AT-G-AA-C----AT--TCAAG-
gi|19                         :                                                       CCTGCGA-GGTG-A--TCAGGAAT--AATT-CATG-AAG--A-ATGGA-GAAA----A-G-TT-CAAG--A-A-T---T---A--T----ATT--C-C-TGAA---T---C------A------G----------------------------------C----T-C--A--T-----G-A--A-------T-------------A---A-T-----T-------------------------------------------C-A----------TG-A-A--CT-----TA-----T-C-----A---T---T-G--GAC---ATT--C-A--T-A---A----A----G------T--C--AT-----G-AA-T-T------T---A----------------A----T-T-CA-TG-A-----------------A--------ATC------A-----A--G-A----------TT-C-A-TG-A---A-T---A--TT---A----A------A-C--AA----CT--A-G--G-A------G--TAGTTC--A----GACA-T---------AA--A-T-TT-GCA------A-GG----------A----C---AT-TAGT-TCA-TG-A---A--------AT-----T-------------TC--A-------T-G-A----G---C--A---------T-TC----A-A-GA-A--T--------A-----T----ttgaagcattttgcatattcactggtgttctctcttccatgaggcatatcacatgagtgcatgtcagttagaatgtttacaagagatgcttgaagcacaaatttttatttctaaagaatgcaattgggtttgagcaactgtaaacttaattaagtcaatgatatcacctaatggtgaatgcttttgtgacgattttcattaaagatttcttgtttaaaggttgatttaagatcaaaaactaaatttcattttgcagtttgggctaaattcgattcgttaatttt
gi|4                          :                                                       CCTGCGA-AATGGA--TTAGA-AT--ACTT-CATG-A-C--A-ATTAA-GAAA----A-A-TT-CATG--AGA-T---T---A--T----ATT--C-C-TGAA---C---C------A------G-T--T---G-AGTT--TC----A------G----C----T-CAGA--T-----G-A--AT------T-------------A---A-T-----T-C-----A-T--G----A--A-C--TATACA----C---C---C-A----------TG-G-AACCT-----TA-----T-T-----A---T---TGG--AAC---ACT--C-A--T-G---A----A----G------T--C--A------G-AA-TAT------T---A----------------T----T-T-CA-TG-A-----------------AT-------AT-------ATCAATG--A-A----------TT-C-A-TG-A---A-T---G--TTTCAC----A------T-G--AAG---CT--G-G--G-T------A--TAG-TC--A--TGGA-A-C---------CA--A-A-TT-GCG------G-GC--G-A---T-G----TAAAAT-G--T---A-TGTA---A--------TC-----T-------------TA--A-------T-G-A----A---C--A---------T-TC----A-ATGA-ATTT--------C-----T----G---TAAT---A----A-T-T-----T-G-A----A----A--C---TT---T-T-AA------AT--TCAAG-AA-TGAATAA--C-AATta
gi|20                         :                                                       CCTGCGA-GGTG-A--TCAGGAAT--AATT-CATG-AAG--A-ATGGA-GAAA----A-G-TT-CAAG--A-A-T---T---A--T----ATT--C-C-TGAA---T---C------A------G----------------------------------C----T-C--A--T-----G-A--A-------T-------------A---A-T-----T-------------------------------------------C-A----------TG-A-A--CT-----TA-----T-C-----A---T---T-G--GAC---A-T--C-A--T-A---A----A----G------T--C--AT-----G-AA-T-T------T---A----------------A----T-T-CA-TG-A-----------------A--------ATC------A-----A--G-A----------TT-C-A-TG-A---A-T---A--TT---A----A------A-C--AA----CT--A-G--G-A------G--TAGTTC--A----GACA-T---------AA--A-T-TT-GCA------G-GACCA-T---TAG--------------T-TCA-TG-A---A--------A------T-------------TC--A-------T-G-A----G---C--A---------T-T-----A-A-GA-A--T--------A-----T----gagcaagcatttgcatattactggtctctgtctctgctctctgactgcatttcacaagatgaaagccacttgtagttagattgtttaacaggtcatttgtcacacttcatctgaggaatgcaattggtttgagcaatctgcatgccc
gi|13                         :                                                        CTGCGAAGATG-A--TTAGGAAT--ACTT-CATG-AAC--A-AT-AA-GACA----A-A-T--CATG--A-A-T---T---A--T----AT---C-C-TGAA---C---C------A------G-T--T---G-AG-A--TC----A------G----C----C-T--G--T-----A-A--A-------T-------------A---A-T-----T-C-----A-T--G----A--A-C--T----A----C---G---C-G----------TG-A----CT-----TA-----T-------A---T---T-G--GAT---ACT--C-A--T-G---A----A----G------T--C--AT-----G-AA-T-T------T---A----------------A----T-T-CAATG-A-----------------A---------T-------A-----A--G------------TT-C-T-TG-A---C-T---A--TT---C----A------T-G--AA----CT--A-G----A------G--TAGTCC--A--T-GA-A-C---------AA--A-A-TT-GCG------G-GG--G-A---T-G----T---AA-A--T-TCA-TG-A---A--------TC-----T-------------TC--A-------T-G-A----A---C--A---------T-TC----A-A-GA-A--T--------G-----T--------TAAATTCA----A-T-TC-A--T-G------A----A--C---TTC-AC-G-AA-C----AT--TCAGA-AA-T--ATTA--C-AATta
gi|7                          :                                                        CTGCGA-GGTG-A--TTAGGAATT-CCTT-CATG-A-C--A-ATTAA-GAAA----A-A-TT-CATG----A-T---T---A--T----ATTTCC-T-TGAA---C---C------A--------T--T-----AG-A--TC----A------G----C----T-C--A--T-----G-A--A-------A-------------A---T-T-----T-C-----ATT--G----A--A-CT-T----A----C---C---A-A----------TG-A-A--AA-----TA-----T-A-----A---TTC-T-G--GAC---ACT--CGA--T-G---A----A----G------TTCT--AT-----G-AA-T-T------T---A----------------A----T-T-CA-TG-------------------A--------AT-------A-----A--G------------TT-C-ATTG-A---A-T---A--TC---C----AT-----T-A--AA----CT--A-G--G-AC-----G--TAAT--------------------------------TT-GCG------G-GG--GCC---T-G----T---AA-T--T-CAT-TT-A---A--------TC-----T-------------TC--A-------T-G-A----A---C--A---------T-TC----A-A-GATA--T--------A----------G---TA-----A----A-T-TC-A------G----A----A--C---TTC-AC-GAAA-C----AT--GCAAG-AATT--ATAA--C-AATGGgca
gi|21                         :                                                        CTGCGA-TATG-A--TAAGGAAT--ACTT-CATG-AAC--A-ATTAA-AAAA----AAA-TT-CATG--A-A-T---T---A--T----ATT--C-C-TGAA---C---C------A------G-T--T---G-AG-A--TC----A------G----C----T-C--A--T-----G-A--A-------T-------------A---A-T-----T-C-----A-T--G----A--A-CTAT----A----C---C---C-A----------TG-A-A--CT-----TA-----T-T-----A---T---T-G--GAC---ACT--C-A--T-C---A----T----GCTTC--T--C--TT-----G-TT-T-T------TG--A----------------A----A-T-CA-TC-A-----------------A--------AT-----------------------------TT-C-A-Tagcagccatatgcatattcactgtgacgcatttcacatgagtgcagtcagttagattagtttacatgagatcttgatcgaatcacacttctatttctaa
gi|5                          :                                                         tGCGA-GATG-AA-TCAGG-AT--ACTT-CATG-AAC--A-ATTAA-GAAG----A-ATTT-CATG--A-A-T---T---A--T----ATT--C-C-TGAA-------C------A------GCC--T---G-AG-TG-TT----G------A----C----T-C--A--T-----G-A--A-------T-------------A---ATT-----T-C-----A-T--G----A--A-C-------A----C---C---C-A----------TGAA-A--CT-----TA-----T-T-----A---T---TCG--GAC---ACTC-C-A--T-G---A----A----G------T--C--AT-----G-AA-T-----------------------------A----T-T-CA-TG-A-----------------A--------AT-------A-----A--GAA----------TT-C---TGAA---A-T---A--TTC--C----A------T-G--AA----CT--A-G--GAA------G--TAGTTCT-AT-T-GA-A-CT--------AA--A-A-TTGGCA------G-GG--------T-G----T---TA-C--T-TCA-TG-A---A--------TG-----T-------------TC--A-------TAG-A----A---C--A---------T-CC----A-ATGA-A--T--------A-----T----GT--TT-----A----A-T-TCAA--T-G-A----A----A--C---TTC-AT-G-AA-T----A---TCAAG-AA-T--ATTC--G-AATAGCAG
gi|18                         :                                                           CGA-GATG-A--TTAGGAAT--ACTT-CATG-AAC--A-ATTAA-GAAA----A-A-TT-CATG--A-A-T---T---A--T----ATT--C-C-TGAA---C---C------A------G-T--T---G-AA-T--TC----A------G----C----T-C--A--T-----G-A--A-------T-------------A---A-T-----T-C-----A-T--G----A--A-C--T----A----C---C---C-A----------TG-A-A--CT-----TA-----T-T-----A---T---T-G--GAC---ATT--C-A--T-G---A----A----G------T--C--AT-----G-AATT-T------T---A----------------A----T-T-CA-TG-A-----------------A--------AT-------A-----T--G-A----------TT-C-A-TG-A---A-T---A--TT---C----A------T-G--AA----CT--A-G--G-A------G--TAGTCC--A--T-GA-A-C---------AA--A-A-TT-GCG------G-GG--G-A---T-G----T---AA-A--T-TCA-TG-A---A--------TC-----T-------------TC--A-------T-G-A----A---C--A---------T-TC----A-A-GA-A--T--------A-----T----catttgcaatccctgatccctttctcagctatgatgcattaacacaagtgatgtcagttagatatatgtttaacaccttgaaagacaatatccatgtctaagaaatggcaattggttttgagcactagcatacccttt
gi|14                         :                                                           CGA-GATG-A--TAAGGAAT--ACTT-CATG-A-C--A--TTAA-GAAA----T-A-TT-CATG--A-A-T---T---A--T----ATT--C-C-TGAA---C---C------A------G-T--T---G-AA-T--TC----A------G----C----T-C--AT-T-----G-A--A-------T-------------A---A-T-----T-C-----A-T--G----A--A-C--T----A----C---C---C-A-----------------------------------------------------GAC---ACT--C-A--T-G---A----A----G------T--CATAT-----G-AA-T-T------T---A----------------A----T-T-CA-TG-A-----------------A--------AT-------A-----A--G-A----------TT-C-A-TG-A---A-T------TT---C----A------T-G--AA----CT--A-G--G-A------G--TAGTCC--A--T-GA-A-C---------AA--A-ATTT-GCG------G-GG--A-A---T-T----T---AA-A--T-TCA-TG-A---A--------TC-----T-------------TC--A-------T---A----A---C--A---------T-TC----A-A-TA-A--T--------A-----T----G---T------A----A-T-TC-A--T-G-A----A----A--C---TTC-AT-A-AA-C----AT--TCAAG-AA-T--ATTA--CAAATAGCAGt
gi|6                          :                                                           CGA-GATG-A--TAAGAAAC-----T-CATG-AAC--A-ATTAA---AA----A-A-TT-CATG--A-A-T---T---A--T----ATT--CTC-TGAA-------C------A------G-T--T---A-A-----TC----A------G----C----T-C--A--T-----T-G--A-------T-------------AT--A-T-----G-C-----A-T--G----A--A-C--T----G----A---C---C-A----------TG-A-A--CT-----TA-----T-T-----A-------T-G--GAC---A-T--C-A--TGG---A----A----G------T------T-----A-GA-T-T------T---A----------------A------T-CATTG-A-----------------A--------ATA------A-----A--G-A----------TC-A-A-TG-----A-T---A---C---C----A------TGG--AA----CT--A-G--G-A------GA-TAAGTC--A--T-TA-A-----------AA--A-T-TT-GCG------G-GG--A-TA--T-G----T---AA-A--A-TCA-TG-C---A-----------------------------TC--A-------T-G-A----A---C--A---------TGTC----A-A-GA-A--T--------A-----T----G---GG-----A----A-G-TC-A--T-GCA----A----A--C---TTC-ACAA-AA-C----AG--TTAAA-A-----ATTA--C--ATAGCAG
gi|2                          :                                                       gcccCGA-GATG-A--TAAGAAAC-----T-CATG-AAC--A-ATTAA---AA----A-A-TT-CATG--A-A-T---T---A--T----ATT--CTC-TGAA-------C------A------G-T--T---A-A-----TC----A------G----C----T-C--A--T-----T-G--A-------T-------------AT--A-T-----G-C-----A-T--G----A--A-C--T----G----A---C---C-A----------TG-A-A--CT-----TA-----T-T-----A-------T-G--GAC---A-T--C-A--TGG---A----A----G------T------T-----A-GA-T-T------T---A----------------A------T-CATTG-A-----------------A--------ATA------A-----A--G-A----------TC-A-A-TG-----A-T---A---C---C----A------TGG--AA----CT--A-G--G-A------GA-TAAGTC--A--T-TA-A-----------AA--A-T-TT-GCG------G-GG--A-TA--T-G----T---AA-A--A-TCA-TG-C---A-----------------------------TC--A-------T-G-A----A---C--A---------TGTC----A-A-GA-A--T--------A-----T----G---GG-----A----A-G-TC-A--T-GCA----A----A--C---TTC-ACAA-AA-C----AG--TTAAA-A-----ATTA--C--ATAGCAGcatttggcatattccactgtccattcgctatgactgcatttcacatgggtgcatgtcagttatagatgtttacaagagatcttgaatcacacttctatttctaaggatg
gi|9                          :                                                              ccATG-AAGTCATGAATTTAATT-CATG-AA-----AT------AA----G-A-TT-CATG--A-----------A--T----ATT--C-A-TGAA---C---T------A------G--------G-AG-TAGTC-----------------------C--A--T-----G-A--A-------C-------------A---A-------------------------A--A-T--T----G----CGGGG---G-A----------TG-A-A--TC-----T------T-C-----A-------T-G--AAC---ATT--C-A--A-G---A----A--------------T--AT-----G------T------C---A----------------A----T-T-CA-TG-T-----------------A--------AC-----------------------------TT-C-A-TG-A---A-C---A--TT---C----A------A-G--AA----catttggcatattccactgtccattcgctatgactgcatttcacatggtgcatgtcagttatagaatgttacaaagagatctgaatcacacttctattctaagagccctgtctcttgttaacttgatcaaagttcaataaacatagtgtaatcttaatggacatttgatgaatcttgttaaaagtgtttaaagattcaaaagctaatatcatgttgcagtttggcaatttgacctggttaaggaatttttgttcatacaacaaaattatttctttttgataccaaaataaaaaatgcaaatgcaaagcattaatgttttagcataaatccacataaaataaactcttttatgaaagaaaa
gi|19                         :                 ctcatgaataattcattaactacccatgaacttatcattggacactcATG-C--TCATGAA---ATTT-CATG-AACT-A-AT--------------G-TC-CTTGCAA-A-T---T------T----ATG--T-C-TGAA---C---T------ACTCCTAG-T--T---G----T--TT----A------A----TAT--T-C--A--T-----G-A--A-------TCTTG---------A---T-T-----T-C-----A-T--G----A--A-T--T----AAA--T---T---C-A----------TG-A-C--TT-----TA-----T-G-----A---A---T-G--TCC---AAT--G-A--T-A---A----G----T------T--C--AT-----G-AA-T-T---------------------------A----T-T-CA-TG-A-----------------G--------CT----------------G-A----------TT-C-A-GG-A---A-TATAA--TT---C----T------T-G--AA----CT--tattacaatagcagcatttgcatatttcactctgctctctcactatggcgcatatcacatgagtgcatgtcagttagatatgtttacaagagatctagatcacacttctatttctaagaatgcaattggttttgagcactttcatgcccct
gi|18                         :                                    cctgcgaggtgatcaggaataattcatgaagaatggagaaaAT--ATTT-CATG-AA------TTAA---------A-A-TT-CATG--A-C-T---T----------------C-A-TGAATGTC---C------A------A-TAAT---A-AG-T--TC--------------------------A--T-----G-G--G-------T-------------A---G-T-----T-C-----A-T--G----A--A-T--T----A----T---T---C-A----------TG-A-G--CT-----GA-------------A---T---T-C--AAC-------------T-G-------------GT-----T--C--AG-----G-AA-T-A------T---A----------------A----T-T-CA-TG-A-----------------A--------TT------------------T----------TT-C-T-TA-A---T-T---G--TT---C----A------T-G--AA----GT--A-tcaagaatatta
gi|14                         :                                                              cgagatgattaggaaAT--A-TT-CTTG-AAT--G-TTTAT-GAAG----T---TT-CATG--A-A-T---T---ACAT----ATT--A-T-TGAA---T-----------------G-T--TAT-G-AA----------G------A----T----T-C--A--T-----G-A--A-------TTTA----------A---A-T-----T-CCCC--G-C--A----A--A-T--TTT--G----T---T---C-A----------TG-G-A--CTACTCCTAG----T-T-----C---A---T-G--AA----ATT--C-A--T-G---A----A----TCTTATTT--C--AT-----G-AA-T-T------A---A----------------A----T-T-CA-T-----------------------------AT----------------G-AC---------TT-C-A-TG-A---G-T---G--T---------------------------CT-------G-G------G--TAGTTC--A--T-GA-A-T-------------T-A-TT-CAA------T-GA--G-C---T-G----A---AT----T-C----------A--------AC-------------------------------T-G-------------G---------T-TC----A-G-GA-A--T--------A-----T---------------A----A-T-TC-A--T-G-A----AT---A--T---TTC-gattcatgaatattcatgaactaggagtagtccatgaacaaaattgcgggggatgtaaattcatgaatcttcatgaacattcaagaatatt
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gi|5                          :                                                                             cT--AGTT-CATGGAAT--A-TTTCA-GAATTCTTA-T-TT-CATG--A-A-T---------------ATT--C-A-TGAC---T---T------C------A-T--G---G-AG-TGTCC----G------A----A----T-A--A--T-----A-A--G-------T-------------------T-----T-C-----A-T--G----G--G----T----G----T---T---C-A----------TG-A-A--AT-----TA-----T-TC----A---TGAGT-C--AAC---ACT--C-A--G-G---C----T----G------TT-C--AG-----G-AA-T-A------T---A----------------A----T-T-CA-TG-A-----------------A--------AT----------------T-C----------TT-C-T-TA-A---T-T---G--TT---C----A------T-G--AA----GT--A-ggagtagtccatgaacaaaattgcgggggatgaatcttcatgaacattcaagaatatgtcaattcatgtaacttcatgaacattcaagaatattacaatagcagcatttgcatatttcactctgctctctcactatggcgcatatcacatgagtgcatgtcagttagatatgtttacaagagatctagatcacacttctatttctaagaatgcaattggttttgagcactttcatgcccct
gi|10                         :                                                              gcgagatgaatcaggaT--ACTTTCATG-AAC--A-ATTAA-GAAA----A---TT-CATG--A-A-C---TTA-A--T----ATT--C-C-TGAA---C----------A------T-T--T---G-AG-CA-TCA---G------C----C----T-C--A--T-----G-A--AA------T-------------A---A-T-----T-C-----A-C--A----ATTA-A--T----A----T---C---CGA----------TG-A-AA-CT-----TA-----T-T-----A---T---T-G--GAC---ACT--C-A--T-G---A----A----G------T--C--AT-----C-AA-T-T------T--------------------A----T-T-CA-TGAA-----------------A--------AT-------A-----A--G-A----------TTCC-A-TC-A---ATT---A--TT---C----ACTC---C-G--AA----CT--A-G--G-AGTACCGG--TAGTCC--AG-T-GA-A-C---------AA--A-A-TT-GCG------GCGG--G-A---T-GCAAAC---AT-C--G-TCA-T------A--------AC-----TATGCCTGTAATACTC--A-------G-C-A----A---C--A---------T-TC----ACA-AG-A--T--------A-----T----G---T------A----A-T-TC-A--A-G-A----A-----------TTC-AC-G-AA-C----AT--TCAAG-AA-T--A-TA--C-AATAGCAGggaagtagttctattgaactaaaattggcagggtgttacttcatgaatgttcatagaacatccaatgaatatgtttaattcaatgaaacttcatgaatatcaagaatattcgaatagcagcatttgcaatccctgatccctttctcagctatgatgcattaacacaagtgatgtcagttagatatatgtttaacaccttgaaagacaatatccatgtctaagaaatggcaattggttttgagcactagcatacccttt
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gi|22                         :                                    catgaaattcttaactacccatgaaacttattcacttgaacacttgcatgaagtcgAC--ATATGAA-TAAA----G-A-TT-CATG--A-----------A--T----ATT--C-A-TGAA---C---T------A------G--------G-AG-T--------A------G----T----T-C--A--T-----G-A--A-------CAA-----------A---A-T-----TGCGGGGGA-T--GT---A--A---------A----T---T---C-A----------TGAA-A--CT------------T-C-----A-------T-G--AAC---ATT--C-A--taaccaatagcagctattgcatattcactgttcatctcactatggctgcatattcacatgagtgcatgtcagtttagatttgtttacaaggatcttgaatcacactgtctattcttcaagaatgcaattggtgtgacgcacttgcatgcccc
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gi|3                          :                                                                                                          AA----G-A-TT-CATG--A-ATT---T---A--C----ATC--C------G---C---C------A------A-T--T--------T--TC----------------T----T-C--A--T-----A-G--ACTTTCCCT-------------A---G-T-----T-C-----G-T--G----A--A----T----A----T---T---C-A----------TG-A-AT-CT-----TA-----T-TCATGAA---T---T-A--AAT----TT--C-A--T-G---A----C----T------T--T--AT-----G-AA-TGTCCA---T---A----------------ATACGT-T-CA-TG-G-----------------G--------TT-------A----------G----------TT-T-A-TG-A---ATT---A--TT---C----ATTGAGCT-G--AA----CT----C--A-A------C--TGGTTC--A--G-GA-A-C---------AAT-A-A-TT--CA------T-GA--A-T---T-T----T----T-C--T-TAATTG---------------------T-------------TC--A-------T-G-A----AG--T--A---------T-TC----catttgcatattcacgtctccttcttctgctatgactgctcattcttccacatgagtgcattgtcagtttctagaaattgttaaaacaatgcttaaaaccacatcttcttattttctcaagaatgcaattgcgtgttgagcacttgcatacccttctctccgtaaatgtaatcaagatcaataaatcagcgagtcggtaaatgctctgtgacattttgataagatttcttgttaacaagtgttgaaagatcaagcaagctaatttcatttgcattttgggctaaatttaccgtccgttattttttttagattcacacgattacaacacaaaatctaatatcttgttctaattcgtataattaattgttttataccaaacataaaaatgaaacagctaaagtatttaatgtttcggcgctcatatacaatccaccaaggaacaataactctttttatgaaacgaaaa
gi|14                         :                                                                                            cctgcgaaatgattaA----A-A-TT-CATG--A-A-T---C---T--T----ATT--T-CATGAA-----------------------T--T---A-AA-T--TCATATG------A----C----TTC--A--T-----G-A--G-------TGTCTGGGT-----A---G-T-----T-C-----A-T--G----A--A-T--T----A----T---T---C-AA---------TG-A-G--CT-----GA-------------A---T---T-C--AAC-------------T-G-------------G------TT-C--AG-----G-AA-T-A------T---A----------------A----T-T-CA-TG-A-----------------AT-------AT-----------------------------TT-C---TT-A---A-T---G---T---C----A------T-G--AA----GT--A-cgatgaacattcaagaatcatgtaaatgtcattgaacttcatgaacattcaagttgaagcattttgcatattcactggtgttctctcttccatgaggcatatcacatgagtgcatgtcagttagaatgtttacaagagatgcttgaagcacaaatttttatttctaaagaatgcaattgggtttgagcaactgtaaacttaattaagtcaatgatatcacctaatggtgaatgcttttgtgacgattttcattaaagatttcttgtttaaaggttgatttaagatcaaaaactaaatttcattttgcagtttgggctaaattcgattcgttaatttt
gi|9                          :                                                                                            cgagatgataaggaaA----A-G-TTACATG--A-A-T---TGACA--T----ATT--C-T-TGAA---T-----------------G-T--TCATG-AA----------G------A----T----T-C--A--TCCCCCGCA--A-------T-------------TTT-G-T-----T-C-----A-T--G----G--A-C--T----A----C---T---C-C----------T--A-G--TT-----CA-----T-----------------G--AAT---ATT--C-A--T-G---A----A----TCTTATTT--C--AT-----G-AA-T-T------A---A----------------A----T-T-CA-TG-A----------------------------------------------C----------TT-C-A-TG-A---G-T---G--TC---CA---A------T-GATAA----GTTCA-T--G-G------G--TAGTTA--A--T-GA-A-catgaactaggagtagtccatgaacaaaatttgcggggaatttaaattcatgaatcttcataacattcaataatatgtaattcatgaaacttcataaacattcaagaatattacaaatagcag
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gi|15                         :                                                                         tctgcgatatgataaggaatacttcatgaacaattaaaaaaa-TT-CATG--A-A-T---TTACA--T----ATT--C-T-TGAA---T-----------------G-T--TCATG-AA----------G------A----T----T-C--A--T-----G-A--A-------TTTACATCCCCCGCA---A-TATTGTT-T-----A-TCGG----T--A-C--T----A----C---T-----A-----------G-A-A--CT-----T------T-C-----A---T-----G--AAT---ATT--C-A--T-G---A----A----TCTTTTTT--C--AT-----G-AA-T-T------A---A----------------A----A-T-CA-TG-A----------------------------------------------C----------TT-C-A-TG-A---G-T---G--TC---CAATAA------T-A--AG----TTC-A-T--G-G------G--TAGTTC--A--T-GA-A-atacccatgaacttattattggacactcatcatgcttctcttgtttttgaaatcatcaaatttcat
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gi|20                         :                                                                                                                     T-CATG--A-A-T---T-------------T--C-A-TGAA---C---T------A------A-T--G---G------------------------------T-C--C--T-----G-C--A---------------------A---A-T-----T-T-----A-T--GTCTGA--A-C--T----A----C---T---C--------------------CT-----AG-----T-T-----G---T---T-T--AAT---ATT--C-A--T-G---A----ATCTTGATT---T--C--AT-----G-AA-T-T------A---A----------------A----T-T-CA-TG-ACTTTATGATGTCCAAT-G--------AT-------A-----A--G------------TT-C-A-TG-A---ATT---A--TT---C----A------T-G--AG----CT-------G-A------------TTC--A--G-GA-A-T---------AT--A-A-TT--CT------T-GA--A-C---T-T----T----T-C--T-CCA-TT---------------C-----T-------------TC--A-------T-G-A----AT--T--A---------T-TC----caatagc
gi|13                         :                                                                                                                      cctgcgaggtgatcag---A--T----ATT--T-C-TGAA---T-----------------------------G-T--TC----G------------------------T-----G-A--A-------------------------G-T-----T-C-----A-T--G----A--A-T--T-------------------------------G-A-A--TT-----TAACA--T-T-----C---T---T-G--AAT---GTT--C-A--T-G---A----A----GAT----T--C--AT-----G-AA-T-T------T---ACATCCCCCGCAATTTTG----T-T-CA-TG-G-----------------A--------CT-------ACTCT-A--G------------TT-C-A-TG-A---A-T---A--GT---C----A------A-G--AA----CT-------------------TA-TTC--AT-T-GA-A-T---------TA--A-A-TT------------------------------------------CA-TG--------------AC-----T-------------TC--A-------T-G-A----G---T--A---------T-CC---------A-A--T--------A-----T---------------A----A-G-TC-A--C-G-C----GT---A--G---TTC-AT-G-AA-gcattaagaatatta
gi|5                          :                                                ctgcgaagatgattaggaatacttcatgaacaataagacaaatcatgaattatatcctgaaccagttgagatcagcctgtaaataa---A--T----ATT--C-A-TGAAGTTT---C------A--------T--T---G-AA-T--TA----A------A----CATATT-C--A--TT----G-G--A-------T-------------G---T-T-----C-T-----A-T--G----A--A-C-------A----T---T---C-A----------TG-A-A--GT---------------------------------AAC---ACC--C----T-GCCAATTTTA----G------T--TCAATA----G-AA-C-TACTTCCT---A----------------G----T-T-CA-TG-G-----------------A--------AT-------ATTTC-A--G-AATTCTTAT--TT-C-A-TG-A---A-T---A--TT---C----A------T-G--A-----CTTCATG--G-A------G--T-GTCC-------GA-A-T---------AATAA-G-TT-TCA------T-GG--G-T-----G----T-----------TCA-TG-A---A--------AT-----TAT-----------TC--A-------T-G-AGTCAA---C--ACTCAGGCTGT-TC----A-G-GA-A--T--------A-----T---------------A----A-T-TC-A--T-G-A----A----ATTC---TTC-TT-A-AT-T----GT--TCATG-AAGT--ATtacaatgca
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gi|22                         :                                                                                                                                                                cctgcgaaatgattagaatacttcatgaacaattaaga----G------A----T----T-C--A--T-----G-A--A-------T-------------A-----T-----T-C-----A-T--G----A--A-C--T----A--------------------------G-G-A--GT-----AG-----T-T-----C---A---T-G--AAC---A---------------A----A----A------T--T--GCGGG--G-GA-T-G------TA--A----------------A----T-T-CA-TG-A-----------------A--------AC-----------------------------TT-C-A-TG-A---A-C---A--TT---C----A------gcattttgcatattcactggtgttctctcttccatgaggcatatcacatgagtgcatgtcagttagaatgtttacaagagatgcttgaagcacaaatttttatttctaaagaatgcaattgggtttgagcaactgtaaacttaattaagtcaatgatatcacctaatggtgaatgcttttgtgacgattttcattaaagatttcttgtttaaaggttgatttaagatcaaaaactaaatttcattttgcagtttgggctaaattcgattcgttaatttt
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        cgagatgattaggaatacttcatgaacaattaagaaaaattcatgaattatattcctgaaccagttgaattcagc-----TA-----T-T-----T---C---T-G--AAT---GTT--C-G--T-G---A----A----G------TT-C--AT-----G-AA-T-T------G---A----------------A----T-T-----------------------------------T-------A-----A--C-A----------TT-C-T-TG-A---A-T---G--TT---C----A------T-G--AA-------------G-A------------TTC--A--T-GA-A-T-----------------TT-ACATCCCCCG-CA--A-T---T-T----T---G-----T-TCA-TG-G---ACT------ACTCTAGT-------------TC--A-------T-G-A----A---T--A---------G-TC----A-A-GA-ACTT--------ATTCATT----GAATTA-----A----A-T-TC-A--T-G-----------A--C---TTC-AT-G-AG-T----AT--CCAAtt
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T--C-G--T-G---A----A----G------T--T--CT-----G-AA-T-T------T---ACT--------------A----TAT-CT-TG-A-----------------A---------T-------G---------------------TT-C-A-TG-A---A-G---A--TT---A----AA-----T-G--AA----TT--A-C----A------G----GCCC--C--C-G----C---------AA--A---TT-AC-------------G-T---C-C----T---AG-T--T-TAA-TG-G---A--------TA-----T-------------TC--AA------T-G-A----A---CTTA---------T-TC----A-T-GA-A--T-----------------------TA-----A----A-T-TC-A--T-A-G----A----A--C---TTC-ATCG-AG-T----GT--CC-AG-AA-T--ttacaatagc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctgcgaggtgattaggaattccttcatgacaattaagaaaaattcatgattatatttccttgaaccattagatcagctcatgaaaatttcattgaacttaccaatgaaaatata------T--C--AT-----G-AA-C------------A----------------A----T-T-----A-A-----------------A--------AA-------A-----A--A-A----------TT-C-A-TG-AATTA-T---A--TT---C----C------T-G--AA----CC--A-GTTG-A------GATCAGCTC--A--T-GA-A-T-------------A-A-TT--CA------T-GA--A-C---T-A----T---A-----C-CCA-TG-----A--------AC-----TTA-----------TT--AT------T-G-G----A---C--A---------C-TC----A-aacatgcaagaattataacaatggagcagccatatgcatattcactgtgacgcatttcacatgagtgcagtcagttagattagtttacatgagatcttgatcgaatcacacttctatttctaa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tctgcgatatgataaggaatactA-TG-A-----------------A--------TA-------A-----A--G-A----------TT-C-A-TG-A---A-T---A--TT---C----A------T-G--AA----CT--A-G--G-A------G--TAGTTC--A--T-GA-A-C---------AA--A-A-TT-GCG------G-GG--G-A---T-G----T---AA-A--T-TCA-TG-A---A--------AC-----T-------------TC--A-------T-G-A----A---C--A---------T-TC----A-A-TA-A--T--------A-----T----tcatgcttctcttgtttttgaaatcatcaaatttcat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             catagaagtaaaaatcaaaattgttacat----------TT-C-A-TG-A---A-T---C--TT---T----A------T-G--AA----C----------------------ATTC--T--T-GA-A-----------AG--A-A-T----A------------------T-G----T---AA-A--T-TCA-TG-A---A--------AC-----T-------------TC--A-------T-G-A----A---C--A---------T-CC----A-A-GA-A--T--------A-----T----tacaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -A---A-T---AAGTT---C----A------T-G--------------G--G-T------A--TAGTTC--A--T-GA-A-T---------TA------TT--CA------T-GA--G-C---T-G--------AT-C--T-C----------A--------AC-----T---------------------------G-G---------------------T-TC----A-G-GA-A--T--------A-----T---------------A----A-T-TC-A--T-G-A----A----tacaatagc
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tctgcgatatgataaggaatacttcatgaacaattaaaaaaaaa-T---A--TT---C----A------T-G--AA----CT--A-G--G-A------G--TAGTCC--A--T-GA-A-C---------AA--attggacactcatcatgcttctcttgtttttgaaatcatcaaatttcat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ac--A-G--G-A------A--TACTTC--A--T-GA-A-CAATTAAAAAAA--A-A-TT--CA------T-GA--A-T---T-A----T---AT----T-CC--TG-A---A--------CCAG---T-------------TG--A---------G-A----T---C--AG--------C-TC----A-T-GA-A--T------------------------------A----A-T-TC-A--T-G-A----ACTATA--C----CC-AT-G-AA-C----
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tctgcgatatgata--A--T-GA-A-T---------AA--AGA-TT--CA------------------T-G----A---AT-A--T-TCA-TG-A---ACTAGGAGTAG-----T-------------TC--A-------T-G-A----A---C--AAAA------T-TG----C-G-GG-G--G--------A-----T----G---TA-----A----A-T-TC-A--T-G-A----A----A--C---TTC-AT-G-AA-C----AT--TCAAT-AA-T--ATTA--C-AATttattattggacactcatcatgcttctcttgtttttgaaatcatcaaatttcat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      catagaagtaaaaatcaaaattgttacat-T---T-G----G---AT-G--T-TCA-TG-A---A--------GT-----T-------------TC--A-------T-G-AATTTA---C--ATATTCT---T-TC----A-A-GA-A--T-----------------------------------G-T-TC-A--T-A-A----A----G--A---TTC-AT-G-AA-
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --T-TCA-TG-A---A--------TC-----T-------------TT--A-------T-G-A----A---C--A---------T-TCTTGAA-A-GA-A--T--------A-----T----G---TA-----A----A-T-TC-A--T-G-A----A----A--C---TTC-AT-G-AA-C----AT--CCAAG-AA-T--ATTA--C-AATAGgaatattacaatagc

Unaligned ( gi|11 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCTCTCTTGTAACTTATAATGAAAGTCAGTAATATCATAGTGGTGAAATTGCTTGTTCGACATTTTGATAATGATTCTTGGTTAAAAGAGGTTAAAAGAACAAAGCTGAATTTCTTCGCAGTTTGGGCCAATTCGGTCGGATTAAATTGTAATAGAAAATTA
Unaligned ( gi|17 ): CTGTATGTTAGTTAGATATGTTTACAAGAGATCTTGAATCACACTTCTATTTCTAAGAATGCAATTGGTTTGAGCACTTGCATGCCCCTCTCCTGTGAACTTAATCAAAGTCAATAATATCATAGTGGTAAAATGCTTATTTTGATAAGATTTCTTGTTAAAAGTGATTAAAGATCAAAATCAAAGCTAATTTCATTTTGCAGTTTGGGCCAAAGGTTCGACCCGGTTTACAATAACAACAAAATTAAATCTT
Unaligned ( gi|24 ): TTTACAAGAGATTTTGAATCACACTTCTTATTTTAACAAATGCAATTGGTTTTGAGCACTTTGCATGACCCCTC
Unaligned ( gi|25 ): CACATGAGTGCAGTCAGTTAGATTAGTTTACATGAGATCTTGATCGAATCACACTTCTATTTCTAAGA
Unaligned ( gi|26 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCAGT
Unaligned ( gi|27 ): TCTGAAGAATGCAATTGGTATTGAGCACTTTGCATGCCCAC

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lowQualScore                  :                    3    3 3 1  0   2    2     0           33 666 2       2   33  2   33 4     6666   4   2 22222222222222222   22 4 2 2  4  4 2    2   55  6666666    4   2  88  2  22  2 7777 4 777   88 22 2 2 4    4444 22 2  22 2  2 2  2      6  2  2  8 55555  2   2  2  2  2  2  555  99999   6666     2 777777 4    3 4 66 2  4  555      555    2   99   4 9999999   2  2 4444 5  6666666  44  2 2     4  4444 2 4   22 2  2 2 000000  2 2  2  2 5    2   2  5 2     33     2  2 33    33 2   66     
lowQualScore                  :                    .    . . .  .   .    .     .           .. ... .       .   ..  .   .. .     ....   .   . .................   .. . . .  .  . .    .   ..  .......    .   .  ..  .  ..  . .... . ...   .. .. . . .    .... .. .  .. .  . .  .      .  .  .  . .....  .   .  .  .  .  .  ...  .....   ....     . ...... .    . . .. .  .  ...      ...    .   ..   . .......   .  . .... .  .......  ..  . .     .  .... . .   .. .  . . ......  . .  .  . .    .   .  . .     ..     .  . ..    .. .   ..     
lowQualScore                  :                    1    1 1 0  2   7    5     2           22 555 4       4   22  4   22 7     3333   7   4 11111111111111111   88 0 0 0  0  0 0    0   55  9999999    0   0  88  0  88  0 5555 0 000   66 88 0 0 0    2222 88 0  88 0  0 0  1      0  0  0  0 00000  0   0  0  1  0  0  555  00000   2222     0 888888 0    4 0 88 0  0  555      888    1   44   2 4444444   0  0 2222 6  5555555  88  0 0     0  2222 0 0   88 0  0 5 222222  5 5  5  5 0    5   5  0 5     44     5  7 77    77 7   33     
consensus                     :             CCTGCGA-GATG-A-TNAGGAAT-ACTT-CATGAACAATTAAGAAA--A---A-TTCATGA-ATT--AT-ATT--C-CTGAA-C--CAG-TTG-AG-T-TC-AG--------CTC--A-T-G-AA-TA-A-TTCA-TGA--AC--T----ACCC-ATG-AA--CT-TA--TT-A-T--T-G--GACA-CT--C-A-T-GAAG----T--C-AT--G-AA-T-TT-AATTCA-TG-AA-AT-A-----AG-ATT-CA-TG-AA-TA-TT---CA---T-GAA----CTAGG-A------G-TAGTCC-A--T-GA-AC---AAAATT---GCGG-GGG-ATGT-AAAT----TCA-TG-A----ATCT-------TC--AT-G-AACAT-TC----A-A-GAA--T-AT-G-TA-----AA-T-TC-AT-G-AAAC-TTC-AC-G-AACAT--TCAAG-AA-T--ATTA--C-AAT--AGCAG
Reference ( family-3596 )     :             CCTGCGA-GATG-A-TNAGGAAT-ACTT-CATGAACAATTAAGAAA--A---A-TTCATGA-ATT--AT-ATT--C-CTGAA-C--CAG-TTG-AG-T-TC-GA--------CTC--A-T-G-AA-TA-A-TTCA-TGA--AC--T----ACCC-ATG-AA--CT-TA--TT-A-T--T-G--AACA-TT--C-A-T-GAAG----T--C-AT--G-AA-T-TT-AATTCA-TG-AA-AT-A-----AG-ATT-CA-TG-AA-TA-TT---CA---T-GAA----CTAGG-A------G-TAGTTC-A--T-GA-AC---AAAATT---GCGG-GGG-NTGT-ANNT----TCA-TG-A----ANCT-------TC--AT-G-AACAT-TC----A-A-GAA--T-AT-G-TA-----AA-T-TC-AT-G-AAAC-TTC-AT-G-AACAT--TCAAG-AA-T--ATTA--C-AAT--AGCAG
gi|1                          :                                                CAATTAAGAAACAA---A-ACCATGA-ATT--AT-ATT--C-CTGAACC--CAGCTTGAAA-T-TC-AG--------CTC--ATT-GTAA-TA-A-TCCA-TGATCAC--T----ACCCGATG-AAT-CT-TAGTTT-ACT--T-GCCGGCA-CT--C-ATT-GAAA----T--C-AT--G-AA-T-AT-AATTCA-TG-AA-A---------------------AA-TACTT---CA---TCGAA----CTACG-G------C-TATCCC-A--T-GA-ACCAAAAAATTGCCGCGG-CGG-ATGTAACAT----TCA-TG-A----AGCT-------TCCAAT-GAAACAT-TC----A-A-GAA--T-AT---TA-----AA-T-TC-TTGG-AAACTTTC-AC-T-AACATTCTCAAGTAA-T--ATTA--C-AAT--AGCAG
gi|10                         :                                   T-ACTTTCATGAACAATTAAGAAA--A-----TTCATGA-ACTTAAT-ATT--C-CTGAA-C---AT-TTG-AG-CATCAGC--------CTC--A-T-G-AAATA-A-TTCA-CAATTAA--T----ATCCGATG-AAA-CT-TA--TT-A-T--T-G--GACA-CT--C-A-T-GAAG----T--C-AT--C-AA-T-TT--ATTCA-TGAAA-AT-A-----AG-ATTCCA-TC-AATTA-TT---CACTCC-GAA----CTAGG-AGTACCGG-TAGTCC-AG-T-GA-AC---AAAATT---GCGGCGGG-ATGC-AAACATCGTCA-TA-ACTATGCCTGTAATACTC--AG-C-AACAT-TC----ACA-AGA--T-AT-G-T------AA-T-TC-AA-G-AA---TTC-AC-G-AACAT--TCAAG-AA-T--A-TA--C-AAT--AGCAGcatttgcatattcacgtctccttcttctgctatgactgctcattcttccacatgagtgcattgtcagtttctagaaattgttaaaacaatgcttaaaaccacatcttcttattttctcaagaatgcaattgcgtgttgagcacttgcatacccttctctccgtaaatgtaatcaagatcaataaatcagcgagtcggtaaatgctctgtgacattttgataagatttcttgttaacaagtgttgaaagatcaagcaagctaatttcatttgcattttgggctaaatttaccgtccgttattttttttagattcacacgattacaacacaaaatctaatatcttgttctaattcgtataattaattgttttataccaaacataaaaatgaaacagctaaagtatttaatgtttcggcgctcatatacaatccaccaaggaacaataactctttttatgaaacgaaaa
gi|12                         :           atCCTGCGA-GATG-A-TCAGGGAT-ACTT-CATGAACAATTAAGAAA--A---A-TTCATGA-ATT--AT-ATT--C-CTGAA-C--CAG-TTG-AG-T-TC-GA--------CTC--A-T-G-AA-TA-A-TTCA-TGA--AC--T----ACCC-ATG-AA--CT-TA--TT-A-T--T-G--AACA-CT--C-A-T-GAAG----T--C-AT--G-AA-T-TT-AATTCA-TG-AA-AT-A-----AG-ATT-CA-TG-AA-TA-TT---CA---T-GAA----CTAGG-A------G-TAGTTC-A--T-GA-AC---AAAATT---GCAG-GGG-TTGT-ATCT----CCA-TG-A----AACT-------TC--AT-G-AACAT-TC----A-A-GAA--T-AT-G-TA-----AA-T-TC-AT-G-AAAC-TTC-AT-G-AACAT--TCAAG-AA-T--ATTA--C-AAT--AGTAGcatttcctcttctgctatgactgcatc
gi|13                         :              CTGCGAAGATG-A-TTAGGAAT-ACTT-CATGAACAAT-AAGACA--A---A-T-CATGA-ATT--AT-AT---C-CTGAA-C--CAG-TTG-AG-A-TC-AG--------CCT--G-T-A-AA-TA-A-TTCA-TGA--AC--T----ACGC-GTG-A---CT-TA--T--A-T--T-G--GATA-CT--C-A-T-GAAG----T--C-AT--G-AA-T-TT-AATTCAATG-AA--T-A-----AG--TT-CT-TG-AC-TA-TT---CA---T-GAA----CTAG--A------G-TAGTCC-A--T-GA-AC---AAAATT---GCGG-GGG-ATGT-AAAT----TCA-TG-A----ATCT-------TC--AT-G-AACAT-TC----A-A-GAA--T-GT---TAAATTCAA-T-TC-AT-G--AAC-TTC-AC-G-AACAT--TCAGA-AA-T--ATTA--C-AAT---GCA
gi|14                         :                 CGA-GATG-A-TAAGGAAT-ACTT-CATGA-CA-TTAAGAAA--T---A-TTCATGA-ATT--AT-ATT--C-CTGAA-C--CAG-TTG-AA-T-TC-AG--------CTC--A-TTG-AA-TA-A-TTCA-TGA--AC--T----ACCC-A---------------------------GACA-CT--C-A-T-GAAG----T--C-ATATG-AA-T-TT-AATTCA-TG-AA-AT-A-----AG-ATT-CA-TG-AA-T--TT---CA---T-GAA----CTAGG-A------G-TAGTCC-A--T-GA-AC---AAAATTT--GCGG-GGA-ATTT-AAAT----TCA-TG-A----ATCT-------TC--AT---AACAT-TC----A-A-TAA--T-AT-G-TA-----A--T-TC-AT-G-AAAC-TTC-AT-A-AACAT--TCAAG-AA-T--ATTA--CAAAT--AGCAG
gi|15                         :                                       TT-CATGAATATTCATGAAT--CTTTT-TTCATGA-ATT--AA-AAT--C-ATG-A-CTTCA---TG-AG-TGTC-CAATAATAAGTTC--A-T-G-GG-TA-G-TTCA-TGA--AT--T----ATTC-ATG-AG--CTGTG--TT-A-G--T------CA-TT--C-T-T-GTAA----T--G-AT--G-AA-T-
gi|15                         :                                                                                                                aaaac--------CTC--A-T-G-AA-TA-A-TTCA-TGA--AC--T----ACCC-ATG-AA--CT-TA--TT-A-T--T-G--GACA-CT--C-A-T-GAAG----T--C-AT--G-AT-T-TT-AATTCA-TG-AA-AA-A-----AG-ATT-CA-TG-AA-TA-TT---CA---T-GAAAGTTCTAGT-A------G-TA--CCGA--T-AA-AC---AATATT---GCGG-GGG-ATGT-AAAT----TCA-TG-A----ATCT-------TC--AT-G-AACAT-TC----A-A-GAA--T-AT-G-TA-----AA-T-TC-AT-G-AAAC-TTC-AT-G-AACAT--TCAAG-AA-T--ATTG--C-AAT--AGTAagttctagtagtaccgataaacaatattgcgggggatgtaaattcatgaatcttcatgaacattcaagaatatgtaaattcatgaaacttcatgaacattcaagaatattgcaatagtattcactgttcctctctactacgac
gi|16                         : aaaacattcatcattacaagaatgactaacacagT-ACTT-CATGAACAATTAAGAAA--A---A-TTCATGA-ATT--AT-ATT--C-CTGTA-C--CAA-TTG-AG-A-TC-AG--------CTC--A-T-G-AA-TA-A-TTCA-TGA--AC--T----ATCC-ATG-AA--CT-TA--TT-A-T--T-G--GACA-TT--C-A-T-GAAG----T--C-AT--G-AA-T-TT-AATTCA-TG-AA-AT-A-----AG-ATT-CA-CG-AA-TA-TT---CA---T-GGA----CTAGG-A------G-TAGTCC-A--T-GA-AC---AAAATT---GCTT-GGG-ATGT-AAAT----TCA-TG-A----ATCT-------TC--AT-G-AACAT-TC----A-A-GGA--T-AT-G-TA-----AA-T-TC-AT-G-AAAG-TTC-AT-G-AACAT--TCAAG-AA-T--ATTA--C-AAT--AGCAGttcactgttcctctctactacgac
gi|18                         :                 CGA-GATG-A-TTAGGAAT-ACTT-CATGAACAATTAAGAAA--A---A-TTCATGA-ATT--AT-ATT--C-CTGAA-C--CAG-TTG-AA-T-TC-AG--------CTC--A-T-G-AA-TA-A-TTCA-TGA--AC--T----ACCC-ATG-AA--CT-TA--TT-A-T--T-G--GACA-TT--C-A-T-GAAG----T--C-AT--G-AATT-TT-AATTCA-TG-AA-AT-A-----TG-ATT-CA-TG-AA-TA-TT---CA---T-GAA----CTAGG-A------G-TAGTCC-A--T-GA-AC---AAAATT---GCGG-GGG-ATGT-AAAT----TCA-TG-A----ATCT-------TC--AT-G-AACAT-TC----A-A-GAA--T-AT-
gi|19                         :             CCTGCGA-GGTG-A-TCAGGAAT-AATT-CATGAAGAATGGAGAAA--A---G-TTCAAGA-ATT--AT-ATT--C-CTGAA-T--CAG-----------------------CTC--A-T-G-AA-TA-A-TT--------------------C-ATG-AA--CT-TA--TC-A-T--T-G--GACA-TT--C-A-T-AAAG----T--C-AT--G-AA-T-TT-AATTCA-TG-AA-ATCA-----AG-ATT-CA-TG-AA-TA-TT---AA---A-CAA----CTAGG-A------G-TAGTTC-A----GACAT---AAATTT---GCAA-GGA-CATT-A-GT----TCA-TG-A----AATT-------TC--AT-G-AGCAT-TC----A-A-GAA--T-AT-t
gi|2                          :                 CGA-GATG-A-TAAGAAAC----T-CATGAACAATTAA--AA--A---A-TTCATGA-ATT--AT-ATT--CTCTGAA----CAG-TTA-A----TC-AG--------CTC--A-T-T-GA-TATA-TGCA-TGA--AC--T----GACC-ATG-AA--CT-TA--TT-A----T-G--GACA--T--C-A-TGGAAG----T-----T--A-GA-T-TT-AA-TCATTG-AA-ATAA-----AG-ATC-AA-TG--A-TA--C---CA---TGGAA----CTAGG-A------GATAAGTC-A--T-TA-A----AAATTT---GCGG-GGATATGT-AAAA----TCA-TG-C----A----------TC--AT-G-AACATGTC----A-A-GAA--T-AT-G-GG-----AA-G-TC-AT-GCAAAC-TTC-ACAA-AACAG--TTAAA-A-----ATTA--C--AT--AGCAGta
gi|20                         :           ccCCTGCGA-GGTG-A-TCAGGAAT-AATT-CATGAAGAATGGAGAAA--A---G-TTCAAGA-ATT--AT-ATT--C-CTGAA-T--CAG-----------------------CTC--A-T-G-AA-TA-A-TT--------------------C-ATG-AA--CT-TA--TC-A-T--T-G--GACA--T--C-A-T-AAAG----T--C-AT--G-AA-T-TT-AATTCA-TG-AA-ATCA-----AG-ATT-CA-TG-AA-TA-TT---AA---A-CAA----CTAGG-A------G-TAGTTC-A----GACAT---AAATTT---GC-A-GGA-CCAT-TAGT----TCA-TG-A----AA-T-------TC--AT-G-AGCAT-T-----A-A-GAA--T-AT-catttggcatattccactgtccattcgctatgactgcatttcacatggtgcatgtcagttatagaatgttacaaagagatctgaatcacacttctattctaagagccctgtctcttgttaacttgatcaaagttcaataaacatagtgtaatcttaatggacatttgatgaatcttgttaaaagtgtttaaagattcaaaagctaatatcatgttgcagtttggcaatttgacctggttaaggaatttttgttcatacaacaaaattatttctttttgataccaaaataaaaaatgcaaatgcaaagcattaatgttttagcataaatccacataaaataaactcttttatgaaagaaaa
gi|21                         :              CTGCGA-TATG-A-TAAGGAAT-ACTT-CATGAACAATTAAAAAA--AA--A-TTCATGA-ATT--AT-ATT--C-CTGAA-C--CAG-TTG-AG-A-TC-AG--------CTC--A-T-G-AA-TA-A-TTCA-TGA--ACTAT----ACCC-ATG-AA--CT-TA--TT-A-T--T-G--GACA-CT--C-A-T-CATGCTTCT--C-TT--G-TT-T-TTGAAATCA-TC-AA-AT-----------TT-CA-Tta
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                  tA-TG-AA-TA-A-----AG-ATT-CA-TG-AA-TA-TT---CA---T-GAA----CTAGG-A------G-TAGTTC-A--T-GA-AC---AAAATT---GCGG-GGG-ATGT-AAAT----TCA-TG-A----AACT-------TC--AT-G-AACAT-TC----A-A-TAA--T-AT-
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          catagaagtaaaaatcaaaattgttacatT----TCA-TG-A----ATCT-------TT--AT-G-AACAT-TCTTGAA-A-GAA--T-AT-G-TA-----AA-T-TC-AT-G-AAAC-TTC-AT-G-AACAT--CCAAG-AA-T--ATTA--C-AAT--AGCtacaat
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   -TA-TT---CA---T-GAA----CTAGG-A------G-TAGTCC-A--T-GA-AC---AA
gi|3                          :           acCCTGCGA-AATG-A-TTAG-AAT-ACTT-CATGAACAATTAAGAAA--A---A-TTCATGA-ATT--ATTGTT--C-CTGAA-C--CAG-TTG-AG-T-TC-AG--------CTC--AAT-G-AA-TA-A-TTCA-TAA--AC--TA---ACCC-ATG-AA--CG-TA--TT-A----T-G--GACA-TT--C-A-T-AAAG----T--C-AT--GAAA-T-TT-AATTCA-TG--A-AT-A-----AG-ATT-CA-TG-AA-TA-TT---CA---C-GAA----CTAGG-G------A-AAGTCT-A--T-GA-AG---AAAATT-----GG-CGG-ATGT-AAAT----TCA-TG-A----ATCT-------TCG-AT-G-AACAT-TC----A-A-GAA--TCAT-G-TA-----AA-TGTC-AT-T-GAAC-TTC-AT-G-AACAT--TCAAG-
gi|4                          :             CCTGCGA-AATGGA-TTAG-AAT-ACTT-CATGA-CAATTAAGAAA--A---A-TTCATGAGATT--AT-ATT--C-CTGAA-C--CAG-TTG-AGTT-TC-AG--------CTCAGA-T-G-AATTA-A-TTCA-TGA--AC--TATACACCC-ATG-GAACCT-TA--TT-A-T--TGG--AACA-CT--C-A-T-GAAG----T--C-A---G-AA-TATT-ATTTCA-TG-AATAT-ATCAATGA-ATT-CA-TG-AA-TG-TTTCACA---T-GAAG---CTGGG-T------A-TAG-TC-A--TGGA-AC---CAAATT---GCGG-GCG-ATGTAAAAT----GTA-TGTA----ATCT-------TA--AT-G-AACAT-TC----A-ATGAATTT-CT-G-TAAT---AA-T-T---T-G-AAAC-TT---T-T-AA-AT--TCAAG-AA-TGAATAA--C-AATG-AGCAttgaagcattttgcatattcactggtgttctctcttccatgaggcatatcacatgagtgcatgtcagttagaatgtttacaagagatgcttgaagcacaaatttttatttctaaagaatgcaattgggtttgagcaactgtaaacttaattaagtcaatgatatcacctaatggtgaatgcttttgtgacgattttcattaaagatttcttgtttaaaggttgatttaagatcaaaaactaaatttcattttgcagtttgggctaaattcgattcgttaatttt
gi|5                          :                GCGA-GATG-AATCAGGA-T-ACTT-CATGAACAATTAAGAAG--A---ATTTCATGA-ATT--AT-ATT--C-CTGAA----CAGCCTG-AG-TGTT-GA--------CTC--A-T-G-AA-TA-ATTTCA-TGA--AC-------ACCC-ATGAAA--CT-TA--TT-A-T--TCG--GACACTC--C-A-T-GAAG----T--C-AT--G-AA-T-----ATTCA-TG-AA-AT-A-----AGAATT-C--TGAAA-TA-TTC--CA---T-GAA----CTAGGAA------G-TAGTTCTAT-T-GA-ACT--AAAATT---G-GC-AGG-GTGT-TACT----TCA-TG-A----ATGT-------TC--ATAG-AACAT-CC----A-ATGAA--T-AT-GTTT-----AA-T-TCAAT-G-AAAC-TTC-AT-G-AATA---TCAAG-AA-T--ATTC--G-AAT--AGCAGagcatttgcatattactggtctctgtctctgctctctgactgcatttcacaagatgaaagccacttgtagttagattgtttaacaggtcatttgtcacacttcatctgaggaatgcaattggtttgagcaatctgcatgccc
gi|6                          :                 CGA-GATG-A-TAAGAAAC----T-CATGAACAATTAA--AA--A---A-TTCATGA-ATT--AT-ATT--CTCTGAA----CAG-TTA-A----TC-AG--------CTC--A-T-T-GA-TATA-TGCA-TGA--AC--T----GACC-ATG-AA--CT-TA--TT-A----T-G--GACA--T--C-A-TGGAAG----T-----T--A-GA-T-TT-AA-TCATTG-AA-ATAA-----AG-ATC-AA-TG--A-TA--C---CA---TGGAA----CTAGG-A------GATAAGTC-A--T-TA-A----AAATTT---GCGG-GGATATGT-AAAA----TCA-TG-C----A----------TC--AT-G-AACATGTC----A-A-GAA--T-AT-G-GG-----AA-G-TC-AT-GCAAAC-TTC-ACAA-AACAG--TTAAA-A-----ATTA--C--AT--AGCAGcatttgcaatccctgatccctttctcagctatgatgcattaacacaagtgatgtcagttagatatatgtttaacaccttgaaagacaatatccatgtctaagaaatggcaattggttttgagcactagcatacccttt
gi|7                          :          gcccCTGCGA-GGTG-A-TTAGGAATTCCTT-CATGA-CAATTAAGAAA--A---A-TTCATG--ATT--AT-ATTTCC-TTGAA-C--CA--TT--AG-A-TC-AG--------CTC--A-T-G-AA-AA-T-TTCATTGA--ACT-T----ACCA-ATG-AA--AA-TA--TA-A-TTCT-G--GACA-CT--CGA-T-GAAG----TTCT-AT--G-AA-T-TT-AATTCA-TG--A-AT-A-----AG--TT-CATTG-AA-TA-TC---CAT--T-AAA----CTAGG-AC-----G-TAAT--------------------TT---GCGG-GGGCCTGT-A-AT----TCATTT-A----ATCT-------TC--AT-G-AACAT-TC----A-A-G-A--T-ATAG-TA-----AA-T-TC-A----GAAC-TTC-AC-GAAACAT--GCAAG-AATT--ATAA--C-AATGGAGCAGcatttggcatattccactgtccattcgctatgactgcatttcacatgggtgcatgtcagttatagatgtttacaagagatcttgaatcacacttctatttctaaggatg
gi|8                          :                                                                                                                               C--A-T-G-AA----A-TTC--TTA--AC--T----ACCC-ATG-AAA-CT-TA--TTCACT--T-G--AACA-CTTGC-A-T-GAAG----T--CGAT--G-AA-T-TT-AAT-CA--G-AA-A--A-----AG-ATT-CA-TG-AA-TT-TC---CA-----GAA----CTAGG-A------G-TAGT-C-AATT-GA-AC---AAAATT---GCGG-GGG-ATGA-ATCTA---TCA-CG-A--------------------T-G-AACAT-CA----A-G-GAA--T-AT-G-TC-----AATT-TC-AT-G-TAAC-TTCAAT-G-AACAT--TCAAG-AA-T---TTAACC-AAT--AGCAGccatatgcatattcactgtgacgcatttcacatgagtgcagtcagttagattagtttacatgagatcttgatcgaatcacacttctatttctaa
gi|9                          :                                                                                                                     --------CTC--A-T-G-AA-TA-A-TTCA-TTA--AC--T----ACCC-ATG-AA--CT-TA--TC-A-T--T-G--GACA-CT--C-A-T-GAAG----T--C-AT--G-AA-T-TT-AATTCA-TG-AA-AT-A-----AG-ATT-CA-TG-AA-TA-TT---CA---T-GAA----CTAGG-A------G-TAGTCC-A--T-GA-AC---AAAATT---GCGG-GGG----------------A-TG-A----ATCT-------TC--AT-G-AACAT-TC----A-A-GAA--T-AT-G-TC-----AA-T-TC-AT-G-TAAC-TTC-AT-G-AACAT--TCAAG-AA-T--ATTA--C-AAT--AGCAGctattgcatattcactgttcatctcactatggctgcatattcacatgagtgcatgtcagtttagatttgtttacaaggatcttgaatcacactgtctattcttcaagaatgcaattggtgtgacgcacttgcatgcccc