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Reference ( gi|1 ) : AACGTACTTTT--GTAATCAAAATTGAGATGCAAAATATACGTAAAGGACTTTGAAAGTTGTATTTTGTCTATGTTGTCAATTACTACCCTTTTGCCTCTCC--GGGACTCTGGACTTCTTTGTCTCGGCCTCCAGAAGTG--GCAGCCTTTTGACATGTGTCCAGCGCACTGCTTGG-CCGT-----A---------GT-----------CCCCTGTCAGAAT-----TGGACATA----------------GAGGATGACCCGGGGG-G-GATTGGA-CATTCCGCACTCAAATCCGACTTAGCAAGCAACTGCGGTCTGTTTGCGTCTTGGGTACTTTGCCCGAGCCCCCTTCTGACTCGCAGGACTCCCGCTCATTGATAGGCCTGACGGCGG-T---G---A--TGAGTTTGCATCAATTGAGGTACTCT-GACTGTAGCTTACGGCTGGACTGGTTTGATGGGGAGGTCGACCCAGACAAAGGAGATTTGTTCCTGTCCAACCAAGTGGTGAAACACTATTGGATTAATAAGCAACTTTTCACCTAAGATAATACCAAAGTCCCATAGAAGATGAGAGAGAGAGAGGAGGGGGGGGTGGCTCTCAGGTGAAGTTGTTGGTGGTCCCAGCTGGTCTCCGAACAGAGGTCCTGCGCCTATGCCATGACGTTCCAGCCGCTAGACATCAGAGGATG------GACCATACCAAGGCCCGGCTTAGAGATAGCTTTTTC--TGGTATGGCAT--------AGGCAGAGCAGTATGTCAGCTGTTGTGGGCCTTGCAGTCGGAATAAGCGCAAGCGCCCCCCCCCCCCCCAGCACCATGCCCGTGC--TGATCTGCTGAAGAACCATGCTAATGCTC--TTATGGAGAGGGTGCATCTAT-ATTTCC-TTGGCCCTCTG-CC-ACAAT----CCACCAAGAACAATGTGTACGTTCTGGTCATGGTTGACCAATGTACTAAATGGGTTGAGTGCGTGCTGCTCCCCTCCCAGATTTTAGAGGT----GAC-TA---CTGCAGCAGCTGTGGAT-GAGTTCTTCGCCCGA-TTTGGCG--GTCCATTCCAA--GTAA----TC--ACGGTCCAGGAT---CGGAACATTGAGAGTA-------------AGCT---------G----------TGAATTGTT-GCAGATTCAT--AAGGCGCGAACGACCACTTACCG-CTCCTCAGCTA---------ATCG--------------GACCTTGATGGATG-CTGTGC-GATGTTAT-ATTGACA-AAGCACAGGATCATTTGGACGAGCGCTTTACCCAAATTGCAGGCACTTCGCGCTC-----TGCAGT-CAATAAGTACACAGATTATAC-GGCCAACCAAT--TCATGTTGGGCAGGGAGATCAA-CATGCCTGCAGGCCTGGTGTTTGATACTCCACAGAGGGACCCTCCAGT-GGACATGGAAGCTTATGTG-GTGAACTT-----GGAGCGG-ACAATCCAG-A-CAGC-CCATGAGACGGCGAGTTCCCGCCT-------TT-------G-G--------AAGA---GT---------GGAT-----GAAGAGGGATTA-TG-ACCTT---------GA-G--AA----TTCACTCGTTCCTT-C----AATCAGG-GA-A---GC-A-AGTT--------TA---TGTCT------TAGATA----CGGCA---ACA---GTAAAG-------GGT---TGGTCTA--CGAAG----TTATC-CCCCTCCT------GA------AAGGGTC----CTGGT-ATCATCC----TGA-AG------AAAC---------TC----CCCACGTTTA-----TCGA-G-TTAA-GA--CTAG-GTC--A--TCTAT--T-AT-GGTG-----G--CTA-AC-C--ATGACT--GTTTGAAAG--GGTGTCAAA-----ACCGAGATATCCCCTTATG---GTT--GTCCCCCTATCAAGAGAAGTTT--AGGGTATC---------AGGG---G-GGAC-----C--GGACC-------------CAGACCTATAGGG--------GAGGT--GGGTG---GTAGGA--GTGCTACTG---AAAG-TGA--G--G-GGCTT---CTTCTA-------TCCC-AC--CT-AGTT--CTAC--GGGGGAGGT-GGGTG-----A----TAG--TCG-TGC-TATTG---AAAGTGA--G-GG-G-CTTCTTCTGG-------CCCACCTTCTGAGTTC----AAG----T----TAGACAGTCTCC--GGGG-----G---A-GG-G-----TT--------------------G-----G--------CGCCGGCG----------A--GGT----TAAGACCCCGTAAGGTTAAGGAGCATTCTCCAG-AC--AA-----AAGTGCTCCGACCTTCATCTTTTATCTGATTCAGATGCTTACTGCTTTTGTTGTAAACCCGATGATGGTAGGCTCATGGTTCAGTGTGACCAGTGCAATAGGTGGTGTCACG-------GGGCTTGTGTGGAGGTTACGTTTGATGATGTTTCGGGCTTGGACCAGTACATCTGCCCTCCGTGTTCGAAGGCAGGGTGCTGTCCGTTGAGATGCATCTC--T----GTCTCTTTC-AGTTCAAGCGATTCT-ATGTGAGCCCGGCACGGGGATGGCATGATGAGAGGAGGGGCCAGGTGGAGCTCCCCCCCGCCCCGTCGGTGGAGAACCACCTAGAAGTTGATCCAGGAGCCTCAGCC-GGAGGCGTGGCC---------GGAC--------CCGAGG--------AAC----------------CAGG-----T-----GGCTTAAAGACAAAGG--AGATGCGGGACCACGCTATGTAGGTACACCGCCATCCTGTACATTTAGGTGTGGGGCGCACCCAGTTCCGGAGGCGTGTCGCCTCTGGATGAGGGTTTTGAGCT--GGTTGGCCGATCAACTTCCGGGGTCCAACTGTAGTGTGGTCGCCTTGACATATTCAGGGA
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gi|9 : aGTG-GTGGACCTCCTCTGTAGCGGTGCAATCCAATATCAGTTCCATGAGACGGCGTGTTCCC--CT-------T--------------------ACA---AC-------------------AAGAGGCTTTA-TGCAACTT--------------------------TCGTTCCTT-CGCCAAATCAGG-CG-T---GT-T-AATTCTTATGGTTAACTTGTCTGGGCGATAAACG----CGCCTT--ACA---CTGAAGTTACCGGGGC---TG-TCGA--GGAA-----TTATC-CC--TCCT------GA------AAGGATC----CTGGTAATCATCT----TGACAG------AAACTGTTACATATC----ACCATCTCTGCT---TCGGTGTTTAA-GAAGTTAACGTC--AGTTTTATGAT-AT-AGTA-----GAATTATACGCGAGTGACCAAGGTTGAAGGGAGGTGCGAGG-----AACGGGATGT--CCTTGTG---GTTTAGT-CCGCTATCAAGAGAAGTTTAAAGGGCAT
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gi|2 : agcccagggaTCGTTCCTT-C----AATCAGG-GA-A---ACCG-AGTC--------TA---TTTCT------TAGATAAATACGGCT---TCA---GTGAAG-------GGC---TGGTGTA--GGAAG----TCATC-CCCCTCCT------GG------AAAGGTC----CTGGT-AT-ATCC----TGA-AG------AAAC---------TCAGCCTCCACCTCTAAGCTATCGG-G-TTAA-G---------TC--A--TCCGT--T-AT-GGTG-----G--TTA-AA-C--CTGACC--ATTTGAAGG--GATGTCGAG-----ACCGGGATATCCCCTTGTG---TTT--GTCCCGCTATCAAGAAAAGATG--AAGGCATC---------TGGG---ATGGAC-----C--GGACC-------------CAGATGTAAAAAG--------GAGGT--GGGTG---GTAAGT--GTGCAGCTG---AAAG-TGA--GT-G-GGATT---CTTCTA-------GCCC-AC--CT-
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gi|11 : gacaaaaggaagatgcaaggccacgctatacgggtacacttccaccctttgcttaagcatgtgttgctcccagatgaggattttgaactgtttgaccaaccgtagtgtgtccgcttttgcagatttattgagcacggcccggatgttaactgagcctaacaccaccctgtctgctgacctacaggaggtcctgggcgccctctgtcatttcgagtgcgtggctctcccgagcacttactccccatgaggggcgagctcaaccccgtgatgctgatccattggagagtgctgatcaacctgctaaaccatttgggggctgtgccatctgtcggctgtgggagggcgctccctccagtccatggatgttccgcaggtgttgagagCTGGGTCCCAGAA-CCCTA--ATCAATCCCC--GGGA----A---A------------AGGGA---TTGTCC-CG-------G------------------ATCACCGGCAAGGT--AGGCCCCGCAAGGTTAAGGAGCAATCTCCAGACTCAAGT-------atcccaggagaccagggcaagaacacctcccagatgtccttcaccaccccaacagatgaagtcagggcccaggacaccttcgccagtatccccggttctgaaagtttgttttccgaatggggcacgcggaagacctgcacccacgatggtcctgtagctgctgcatgaggatgacaagatccgtactccgggggcagaggaacgacct
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gi|11 : gacaaaaggaagatgcaaggccacgctatacgggtacacttccaccctttgcttaagcatgtgttgctcccagatgaggattttgaactgtttgaccaaccgtagtgtgtccgcttttgcagatttattgagcacggcccggatgttaactgagcctaacaccaccctgtctgctgacctacaggaggtcctgggcgccctctgtcatttcgagtgcgtggctctcccgagcacttactccccatgaggggcgagctcaaccccgtgatgctgatccattggagagtgctgatcaacctgctaaaccatttgggggctgtgccatctgtcggctgtgggagggcgctccctccagtccatggatgttccgcaggtgttgagagCTGGGTCCCAGAA-CCCTA--ATCAATCCCC--GGGA----A---A------------AGGGA---TTGTCC-CG-------G------------------ATCACCGGCAAGGT--AGGCCCCGCAAGGTTAAGGAGCAATCTCCAGACTCAAGT-------atcccaggagaccagggcaagaacacctcccagatgtccttcaccaccccaacagatgaagtcagggcccaggacaccttcgccagtatccccggttctgaaagtttgttttccgaatggggcacgcggaagacctgcacccacgatggtcctgtagctgctgcatgaggatgacaagatccgtactccgggggcagaggaacgacct
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Reference ( family-3541 ) : AACGTACTTTT--GTAATCAAANTTGGGATGCTAAATCCACGTAAAGGACTTTGA-AAGCTGTATTTTGTCTATGTTGTCAATTATTACCCTTTTGCCTCCCCGGGTCTCCGGACNCCTTCGTCTCGGCCTCCGNAAGTGAGGCTG-C-TTTCGACACGTGTCCGGCGCCCTGCTTGG-CCGT-----A----------GC-CCCCTG--------CC---AGA-ATTCG---------ACATGGAGGATGACCCGGGGGG-GATGGGNCATTCCGCACTCAAATCCGACTTAGCAAGCAATTGCAGTCTGTTTGCGTCTTGGGCACCTTGCCCGAGCCCCCTTCTGACTCGCAGGACTCGCGCTCACTGATAGGCCTGACGGCGGA---G---ATGAGTTTGCATCAATTCAGGGACTCT-GACTTCAGCTTACTGCTGGACTGGTTTGATGGGGAGGTCGACCCAGACGAAGGGGACTTGTTCCTGTCCAACCAAGCGGTGAAACACTATTGGATTAATAGGCAACTCTTCACCTTAGATGATACCAAAGTCCTATGGAAGATGAGAGA--------AGGGGAGGATGGCTCTCAGGCGAAGTTGTTGGTGGTCCCGGCTGGTCTCCGAACAGAGGTCCTGCGCCTATGCCATGACGTTCCAGCCGCTGGGCATCAGGGGA------TAGACCGTACCAAGGCCCGGCTTAGAGATCGCTTTTTCTGGTATGGNATGATGNGAGAGGCAGAGCAGTATGTCAGCTCCTGTGGGTCTTGCAGCCGGAATAAGCGC---------------CCCCAGCGCCATGCCCGGGCC--GAGATGCTGAAGTACCATGCTGATGCNC--CCATGGAGAGGGTGNATTTAGATTTCC-ATGGCCCTCTG-CCANAATCCACCAAGGGCAATGCGTACGTTCTGGTCATGGTTGACCAGTTTACTAAGTGGGTTGAGTGCGTGCCGCTCCCCTCCCAGACTGCAGAGGTCA----C---NG-CTGCGGNAGCTGTGGCT-GAGTTCTTCGCCCGA-TTTGGC--TGTCCGTTC------CAAGTGTTC--ACGGACCAGGGT---CGGAACNTTGAGAGTAAGCTT---TC-GGGGCCATCTTTGAATTGTT-GCAGATCCAT--AAGGCGCGGACGACCGCTTACCGGCCCCTCACCTATATGGACAAGTCGAAAATTTAATGTGGGACCTTGATGGATG-CTGT-CCGATGTTA-TATCGACA-AANCGCAGGATCATTTGGACGAGCACTTNACCCAAATTGCGGGCGCTTTGCGCTC-----TGCA-GTCAATAGGCACACGGGTTATG-CGGCCAACCG--ACTCATGNTGGGCAGGGAGATC-AACATGCCCGCACGCCTGATGTTTGGTACTCCACAGAGGGACCCTCCAG-TGGACATGGAAGCTTATGTG-GTGGACTT-----GGAGCGG-GCAATCCAG-A----------------------CAGC-CCATGAGACGGCGCGTTCCCGCCT-------TC-------GG-AAGAGCGGATGAAGAGGGATTAC-GACCTC--------GAGGAA----T--TCACTCGTTCCTT-C----AATCAGG-G-G-ANC----T-AGTC--------TA---TGTCT------TAGATA----CGGC--TTACAGTG--AA-G-------GGC---TGGTNTAG--GAAG----TTATC-CCCCTCCTGGA------AGGGTC----CTGGTA-TCATCCTGA-AG------AAACT---------CAG--C--CCACCT-----CTA--TCGG-GTT-AA-GA--CTAA-GTC--A----TCNGTT-AT-GGTG-----G--TTA-AC-CA--TGACC--GTTTGAAGGG--GTGT----CGAG-ACCGGGATATCCCCTTGTG---GTT--GTCCCGCTATCAAGAGAAGTTT--AGGGCATC------CGGG------G-GGAC-----C--GGACC-------------CAGACCTACAGGG--------GAGGT--GGGT-GGTA-GGC-------GTGCTACTGAAAG-TGAG--G-GGCTT---CTTCTAGCCCACCT-AGTCCTAC--GGGGGAGGC-GGGTG--C--GTA-G--GCGTGCNGTTGA---A-AGTGA--G-GG-G-CTTCTTCTGG-------CCCACCTTCTGGGTCCCAGAA-CCCTA--GCCAGTCCCC--GGGG----G---A------------GGG-----TT-----CG-------G------------------G-CACCGGCGAGGT--AGGCCCCGTAAGGTTAAGGAGCATTCTCCAGACTCAAGT-------CCTCCGACCTTNACCCCTTATCCGATTCAGATGCTTGCTG-A-TCT-GTCGTAAACCC-A-TGATGGTAGGCTCATGGTTCANTGTGACCAGTGCGATGGGTGGTATCACG-------GGGCTTGTGTGAGGGTTACGGTTGACGATTTATCGGGCTTGGACCAGTACATCTGCCCTCCGTGTTCGGGGGCAGGGTGCTGCCNGGTCAGATGCATCTC--T----GTCTCTTTC-AGTTCAAGCGATTCTGATGTGAGCCCGGCGCGGGGATGGCGTGATGAGAGGAGGGGCCAGGCGGAG-CCCCC-GCCCCGTCGGCGGAGANCCGCCCCGGAGTTGATCCAGGAGNCTCAGCCCGGGG-CGTGGCC--GGA-CCTAAGGAACCAGGGGGCTTTNAAGCATGCCCCTACAG--GGACNACTGTGGCGTTAAGACAAGGAAGATGCGGGACCACGCTATGCAGGTACACCTCCACCCTNTG--TTTAGGCGTGNGGTGCCCCCAGTTCCGGAGGCGTGTCGCCTCCGGATGAGGGTTTTGAACT--GGTTGGCCGACCAACTTCTGGGGCCCAACCGTAGTGTGGCCGCCTTNGCGGATTCAGNGA
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gi|11 : gacaaaaggaagatgcaaggccacgctatacgggtacacttccaccctttgcttaagcatgtgttgctcccagatgaggattttgaactgtttgaccaaccgtagtgtgtccgcttttgcagatttattgagcacggcccggatgttaactgagcctaacaccaccctgtctgctgacctacaggaggtcctgggcgccctctgtcatttcgagtgcgtggctctcccgagcacttactccccatgaggggcgagctcaaccccgtgatgctgatccattggagagtgctgatcaacctgctaaaccatttgggggctgtgccatctgtcggctgtgggagggcgctccctccagtccatggatgttccgcaggtgttgagagCTGGGTCCCAGAA-CCCTA--ATCAATCCCC--GGGA----A---A------------AGGGA---TTGTCC-CG-------G------------------ATCACCGGCAAGGT--AGGCCCCGCAAGGTTAAGGAGCAATCTCCAGACTCAAGT-------atcccaggagaccagggcaagaacacctcccagatgtccttcaccaccccaacagatgaagtcagggcccaggacaccttcgccagtatccccggttctgaaagtttgttttccgaatggggcacgcggaagacctgcacccacgatggtcctgtagctgctgcatgaggatgacaagatccgtactccgggggcagaggaacgacct
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gi|4 : tccaaattgcgggcgctttgcgtcaaaattatagtcaatagacacaaaggttatgcggtcaactgactcatgttgggcagggagatcaacatgcccgctgacctgatgtttggtacttcacagagggaccctcaattggacatggaagcttatgtggtggacttggagcgggcaatccagacatcccatgagaaggcgcgttcccaccttcgggaataggaagcgcggattaagacgaagtatgaccttgaggaattcactcgttccttcaatcaggggtaccttgtctatgtcttagatacagctaaagtgaatgaccgatgaaggaagttatccccctcctggaccagagagtgtcctagtaccatcctgaagaaactcagtcccaaccctatcgggttaagaaaaagtcatcagttatggtggttaaccatggccgtttgaaggggtgtcgagaccgcgatatccccttatagttgtcccggtatcaagagaagtttagggcatccggggtatccggCGTT-TGGTCATTGTTGACCAAATTACTAAGTGG-TTGAGTGCGTG--GC-CCCCTGCCA-ACTG-AGAGGTCATCGCC---CG-CTGCAGAAG-TGTGGCCCGAGTTCCTAGCCCGA-TTTGGCCTTGTCCGT-C------TTAGTG--C--ACAGACCAGGGTATTCGGAACTCTGAGAGTAATCTTGTTTC-CAGGCCATCTTTAAATTGTTTGCAGATTTATTAAAGCCAGGGACGACCCCTTACCGGCCCTTCACCTATATGGACAAGTCGAAAATTTAATGTGGGACCTTGTTGGATGACTGTCCCGATGTTATTGTCGACATAAAAGCAGGCT-A-TTGGACGAG-ATTTGGCCCAAATTGC-GGCCCTTTGCGCTC-----TGCAGGGCAAT-GGCACACATGTT-TACCGGCCAAACGATACTCATGATTGGCAGGGGAGTCAAACATGCCCGCACACATGA-G-TTGGTACTCCACAGAGGAATC--CCAGTTGGACAT-TAAGTTTATGCGTGTGCACTT-----GGGTGGG-GCAATCCAG-A----------------------CAGC-CCATGAGACGGCGCGTTTCCACCTCTAGGCATC-------GGTAAGAGCGGATGAAGAGGG-TTACTGACCCTTAAAGGGGGGGGAAACATT--TCACTCGTTTCTTCC----AATCTGG-A-G-ACCGGTAC-AGTA---------A---TTTCTC-----CAGATA----GGGCATTTACAGTGGTAATG-------GGCCCGTGTTTTAGGAGAAGGTATTTATTGCCCCTCCTGAA------AGGTTCACCACT-GTA-AAGCCTTGA-AGTAGAAAAAACT---------CGT--C--CCCTCT-----CTA--TCGG-GGG-AATGA--CTAA-GTCCGA----TCTGTTGATCGGTGCACTAG--TTA-AC-CA--TGACC--GTTTGAAGGG--ATGTCGGACGAGCACCAGAATATCCCCTTATGGTTGTT--GTCCCGCTATTAAGAGAAGATT--AGGGCATCGGGACGCGGAGGGAGTG-GGAC-----CGGGGGCCAGAAAAGGAAAAAAAGACC-ACAGGGGGGAACAAGAGGTACGGG--GGTA-GGT-------GTGCTACTGAAA--TGAGGTG-GGTTC---CTTCTAGTT--------TCCTGC---AGGGAGACAGGGTGTCT--TTATG--GCTAGCCGTTGC---ATATTG-----------TTCT--TGG-------CCCACCTTacacgacccaggtgttct
gi|5 : tctgcccacaattaatccaccacCTTTTTAGTAATAAAATTTGGGATGCGAAACCCACGTAAAGGACTTTGA-AGGCTGTATTTTGTCTATGTTGTCAATTATTACCCTTCTGCTTCCCCGGGTCTCCGGACTCCCTCGTCTCGGCCTCCAGAAGTGA--CTG---TTGCGACACATG
gi|5 : gacacaaatcggtctatagatcgatagaaactCTCTGTAAGCGAGACTG-CGTTTTAACATGTGTCCGGCGCCCTGCTTGG-ACGT-----G----------GC-CCCCTG--------CC---AAA-ATTCG---------ATATGGAGGGTGACCCGGGGG---ATGGATCATTCCGCACTCAAATCCGACTTAGCAAGCAATTGCAGTCTGTTTGTGTCCTG--CACCTTGCCCGAGCCCCCTTCTGACTCGC---------GCTCCCTG-TAGGCTTGACGGCGGAAGAG---ATGAGTTAGCATCAACTCAGGGACTCTTGACTTCAGCTTACTGCTGGACTGGTTTGATGGGGAGGTCGACCCAGACAAAGGTGACTTGTTCCTGTCCAACCAAGCGGTGAAACACTATTGGATTCATAGGCAACTCTTCACCTTAGATGTTACCAAAGTCCTATGGAAGATGAGA------------GGGGGGATGGCTCTCAGGCGAAGTTGTTGGTGGTCCCTGTTGGTCTCCGAACAGAAGTCCTGCGCCTATGCCATGACGTTCCAGCCGCTGGGCATCAGGGGATACTAGTAGACCGTACCAAGGCACGGCTTAGATATCGCTTTTTCTGGTATGGCATGATGAGAGAGGTAGAGCAGTATGTCAGCTC--------CTTGCAGCCGTAGTAAGCGC---------------CCCAA----CATGACCGGGCC--GCGATGCTGAAGTACCATGCTGGTGC-C--TCATagcccctaggtccattccagagctctctgtaagcgagactgcgttttaacatgtgtccggcgccctgcttggacgtggccccctgccaaaattcgatatggagggtgacccgggggatggatcattccgcactcaaatccgacttagcaagcaattgcagtctgtttgtgtcctgcaccttgcccgagcccccttctgactcgcgctccctgtaggcttgacggcggaagagatgagttagcatcaactcagggactcttgacttcagcttactgctggactggtttgatggggaggtcgacccagacaaaggtgacttgttcctgtccaaccaagcggtgaaacactattggattcataggcaactcttcaccttagatgttaccaaagtcctatggaagatgagaggggggatggctctcaggcgaagttgttggtggtccctgttggtctccgaacagaagtcctgcgcctatgccatgacgttccagccgctgggcatcaggggatactagtagaccgtaccaaggcacggcttagatatcgctttttctggtatggcatgatgagagaggtagagcagtatgtcagctccttgcagccgtagtaagcgccccaacatgaccgggccgcgatgctgaagtaccatgctggtgcctcatt
gi|6 : gacacaaatcggtctatagatcgatagaaactctttttagtaataaaatttgggatgcgaaacccacgtaaaggactttgaaggctgtattttgtctatgttgtcaattattacccttctgcttccccgggtctccggactccctcgtctcggcctccagaagtgactgttgcgacacatgagcccctaggtccattccagagctAGTCAGAGTTG---TCCTGAATCCATTTCAATCA-TTTGACAAGCTGTTTTTTGCCTCTGTTGCCt
gi|6 : ctgtgtcattttcaaaaaaatcagacaccctaaggcatcggagTACTTTT--GTAATCAAATTTGGAATGCTAATTCCACGTAAAGGACTTTGA-AAGCTGTATTCTGTCTATGGTGTCAAGTATTACCCTTTTGCCTTCACGGATCTTCGGACGCCTTCGTATCGGCCTCGAAAAGTG--GCTG---TTGCGACA----TCTGA-GCCCT-CTGGGTCCATTCCAGA----------GC-TCTCTGTGAGGCTGCCTTTGGACATGTGTACGGTGCCACATGGAGGATGACCTGGGAGA-GATGGGTTATTCCGCACTCAAATCTAACTTAGCAAGCAATTG---TCTGTTTGCGTCTTGGGCACCGTGCCCTAGCCCC-TTCTGACTCGCAGGA--------------TAGGCCTGATGGCAGA---G---GTGAGTTTGCATCAATTCGGGGACTCT-GAGTTCAGTTTACTGCTGGACTGGTTTCATGGGGAGGTCGACCCAGACGAAGGGGACTTGTTCCTGTCCAACCAAGCGGTAAAACACTATTGGATTAATAGGCAACTCTTCACCTTGGATGATACCAAAGTCCTTTGG-AGATGAGA-A--------AGGGGATGATGGCTCTCGAGCGAAGTTGTTGGTAA--CCGG-TGGTCTTGGAACAGAGGTCCTGCACC--TGTCATGACGTTCCAGCCGCATGGCATCAGGGGA------TGGATGGTACCAAGGTCCGGCTTAGAGATCGcttgacatcccgcaaaaaacacgaccaacagctggataaaaattctattaataggtaatcatgggacactaatcggtctatttctacttttgtaatcaaatttggaatgctaattccacgtaaaggactttgaaagctgtattctgtctatggtgtcaagtattacccttttgccttcacggatcttcggacgccttcgtatcggcctcgaaaagtggctgttgcgacatctgagccctctgggtccattccagagctctctgtgaggctgcctttggacatgtgtacggtgccacatggaggatgacctgggagagatgggttattccgcactcaaatctaacttagcaagcaattgtctgtttgcgtcttgggcaccgtgccctagccccttctgactcgcaggataggcctgatggcagaggtgagtttgcatcaattcggggactctgagttcagtttactgctggactggtttcatggggaggtcgacccagacgaaggggacttgttcctgtccaaccaagcggtaaaacactattggattaataggcaactcttcaccttggatgataccaaagtcctttggagatgagaaaggggatgatggctctcgagcgaagttgttggtaaccggtggtcttggaacagaggtcctgcacctgtcatgacgttccagccgcatggcatcaggggatggatggtaccaaggtccggcttagagatcg
gi|7 : ctgtgtcattttcaaaaaaatcagacaccctaaggcatcggagagtcagagttgtcctgaatccatttcaatcatttgacaagctgttttttgcctctgttgcccttgacatcccgcaaaaaacacgaccaacagctggataaaaattctattaataggtaatcatgggacactaatcggtctatttcAAGCCATTCTGATGTGAGCCCGGCGCGGGGATGGCGTGATGAGGGGAGGGACCAGGCGGAGGCTCCC-ATCCCGTCGGTGGAGAATCGCTCAGGAGTTGATCCAGGAGCCTCAGCTTGGGGGCGTGGCC--GGA-CCCAAAGAACCAGGGGGCTTTTAAA-ATGTCCCTACAG--GGAC---TGTGGCGTTAGGACAAGGAAGATGCGGGACCATACTATGCAGATACACCTCCACCCTGTG--TTTAGGCGTGGGGTGTCCCCAGTTTCGGAGGCGTGTTGCCTCCGGATGAAGGGTTTAAACT--GGTTGGCCGACTAACTTCTGGGGCCCGACCGTCATGTGGCCGCCTTGGTGGATTCAGTGA
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gi|9 : GG--------GTGAT--GGATTGGTAAGGCCCTTTGAATACTACAGAAAGATGAT--C-GGCTTTCGCATCTAGCCCACCTTAGTCAAATTGGGGGGAGGT-GGGCG--CCCGTA-GAAGCGTGTTATTGAGAAA-AGTGAAGG-GG-G-CTTCTTTTGGGTCGCTCCCCACGT-CTGGTTCCCAAAAACCCTATAGCCAGTCCCT--AGGG----GGCAA------------GGG-----AT--------------G------------------G-TACCtgtcgagttgcttcgcggacttcgcctggacccagaaccgagaagactacggggagagacattagaagtgagaatcacggggtcctttcgggtgatggattggtaaggccctttgaatactacagaaagatgatcggctttcgcatctagcccaccttagtcaaattggggggaggtgggcgcccgtagaagcgtgttattgagaaaagtgaagggggcttcttttgggtcgctccccacgtctggttcccaaaaaccctatagccagtccctagggggcaagggatggtacc
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|9 : tagaGTG-GTGGACCTCCTCTGTAGCGGTGCAATCCAATAT---------------------CAGTTCCATGAGACGGCGTGTTCCC--CTT-----------------ACAAC-----AAGAGG----------CTTTAT-------GCAA----C--TT--TCGTTCCTT-CGCCAAATCAGG-----CGTGTTAATTCTTATGGTTAACT-TGTCTGGGCGATAAACG----CGCC--TTACACTG--AA-GTTACCGGGGC---TG-TCGAG--GAA-----TTATC-CC--TCCTGAA------AGGATC----CTGGTAATCATCTTGACAG------AAACTGTTACATATCACCATCTCTGCT---TCGGTGTTTAA-GAAGTTAACGTC--AGTTTTATGAT-AT-AGTA-----GAATTATACGCGAGTGACCAAGGTTGAAGGGAGGTG-----CGAGGAACGGGATGTCC--TTGTG---GTTTAGTCC-GCTATCAAGAGAAGTTTAAAGGGCAT
gi|9 : GG--------GTGAT--GGATTGGTAAGGCCCTTTGAATACTACAGAAAGATGA-TCGGCTTTCGCATCTAGCCCACCTTAGTCAAATTGGGGGGAGGT-GGGCG--CCCGTA-GAAGCGTGTTATTGAGAAA-AGTGAAGGGGGCTTCTTTTGGGTCGCTCCCCA-CGTCTGGTTCCCAAAAACCCTATAGCCAGTCCCT--AGGG----GGCAA------------GGG-----AT--------------G------------------G-TACCtgtcgagttgcttcgcggacttcgcctggacccagaaccgagaagactacggggagagacattagaagtgagaatcacggggtcctttcgggtgatggattggtaaggccctttgaatactacagaaagatgatcggctttcgcatctagcccaccttagtcaaattggggggaggtgggcgcccgtagaagcgtgttattgagaaaagtgaagggggcttcttttgggtcgctccccacgtctggttcccaaaaaccctatagccagtccctagggggcaagggatggtacc
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Unaligned ( gi|19 ): TAGATTGGTGCCATATTCAGAAAATCAGACACCCGTAAAGGATGTCCTGAATCCTTTTCAACCATTTCACAAGCTCCATCTTGCCCCTGTTGCCCTTGGCAACCCGCCGAAAACCATGGTAGACAGATAGCTAGATATTTATAAATAATCATGGGACGCAAATCGGTCTATAGA
Unaligned ( gi|20 ): TGAGGTTTCTGAAACCAGAAGAGAGTCACAGGGAGCCAGACCGTCAGCCCTGACCAGACTTCTCACACCACCCTGCAGAGGGAACCAATACTGCTGTGTCCGAAAACCCGGACAACATCACCGAGAGCCCCTGTTCTGGAAACCTGTTTTCCGGATGGGACACGGGGAGGATC
Unaligned ( gi|24 ): ATATAGACTGGAGCCATTTTCAGAAAATCAGACACCCGTAGGCATCGGAGAGTCAGAGATGTCAAACACACTTTTCTTAAGGATGTCCT
Unaligned ( gi|25 ): TAGACTGGTGCCATTTTCAGAGAATTAGACACCCATAGGCATTTGAGAGTCAGAATTTTCAANNNNNNNAAAATGCTTC
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