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Reference ( gi|11 )           :                                  CCTATA---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTG-TTTTTTA-A----AG--T--TT--T--GT----T---GA--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C--A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-TA--TA-TT----G-CT-G----A-A-TA----A-A--ATTT-ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---C---T-TC-----TA-GG----GT---CCT--C---A-A--G-----------A-----TAC--------------C-T-T-------G------A-TT--C-A-T------------G--A-A---------A----------T-TC--A---------TTT------------T--A--------TTT---A-------AT-AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT---CA-----A-----T--TT--CC-T-GAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATGT-CTC---AACCGTGACA
gi|15                         :                                  CCTATA---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTG-CTTTTTA-A----AGC-T--TT--T--GT----T---GA--TT-GTT-G-TA-------T-GTA-C--A--TA---GTG--CC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-TA--TA-TT----G-CT-G----A-T-TA----G-A--ATTT-ATTT-T---AC-TTT-AATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--TC------AT-T-TTA---C---T-TC-----CA-GG----GT---CCT--C---A-A--G-----------A-----TAC--------------C-T-G-------G------A-GT--C-A-T------------A--A-A---------A----------T-TC--A---------TTT------------T--A--------TTT---A-------AT-AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CTA-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT---CA-----G-----T--TT--CC-T-GAA-CC------------GAA--C--TGAA--CCG-A----AAA-ATGT-CTG---AA
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gi|23                         :                                 tatacTG---TA-GT---CGGTTAA-----G-G-CTG-CTTTTTA-A----AGC-T--TT--T--GT----T---GG--CT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C--A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-TA--TA-TT----G-CT-G----A-A-TA----G-A--ATTT-ATTA-T---AC-TTT-AATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-T--CC------AT-T-TTA---C---A-TC-----CAGGG----GT---CCT--C---A-A--G-----------A-----TAC--------------C-T-G-------A------A-TT--C-A-T------------C--A-A---------A----------T-TA--A---------TTT------------T--A--------TTT---A-------TT-AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------C--------------------------------------------------------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT---CA-----G-----T--TT--CC-T-------------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATGT-CTG---AACCGTGa
gi|10                         :                                     cTA---CA-GT---CGGTT-----------CTG-CTTCCTA-A----AGC-T--TT--T--GT----T---GG--CT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C--A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-TA--TA-TT----G-CT-G----A-A-TA----G-A--ATTT-ATTA-A---AC-TTT-GATA-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---C---T-TC-----AA-GG----GT---TCT--C---A-A--G-----------A-----TAC--------------C-T-G-------G------A-TT--C-A-T------------G--A-A---------A----------T-TA--A---------TTT------------T--A--------TTT----------------------------A---A--CAGAA--C-CGA-A------------AAA-------A---A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT---CA-----G-----T--TT--CC-T-GAA-CCGAACAGTTTCCTGAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATGT-CTG---AACCGTGACA
gi|12                         :                                   gccTA---TA-GT---CTATTAA-----G-A-CTG-CTTTTTA-A----AGA-T--TT--T--TT----T---TA--TT-GTT-A-TA----T--T-GTA-T--A--TG---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GGA--T-A-T-T--AC--AT----G-T-TA--TA-TT----G-CT-G----A-A-TA----C-A--ATTT-ATTA-A---AC-TTT-GGTG-----T--G-T-GC--CTT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---C---T-TC-----CA-AG----GT---CTT--C---A-A--G-----------ATACTGTAC--------------C-T-G-------G------A-TT--C-A-T------------G--A-A---------A----------T-TA--A---------TTT------------T--A--------TTT---A-------TT-AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------AAAACCCC--GA-A---AA-CCGA----GGTT---CA-----G-----T--TT--CC-T----------------------------GAA--CCG-A----AAA-ATGT-CTG---AACCGTGACAgc
gi|7                          :                                   gccTA---TA-GT---CTAT-AA-----A-A-CTG-CTTTTTA-A----AGC-T--TT--T--CT----TTACAA--TT-GTT-G-TA----TATT-GTA-C--A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AA-TT-G-T-TA--TA-TT----G-CT-G----A-A-TA----G-A--ATTT-ATTA-A---AC-ATT-GGTG-----TTGG-T-GC---TT-TG-T---A--C-------ACC--CC------AT-T-TTA---C---T-TC-----AA-TG----GT---CCT--C---A-A--G-----------A-----TAC--------------C-T-G-------G------A-TT--C-ATT------------G--A-A---------A----------T-TA--AGT-------TTT------------T--A--------TTT---A-------TT-AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------CCG-------------AA-A-----A------------------------A------C--CG-A---AA-CCGA----GGTT---CA-----G-----T--TT--CC-T-GAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATGT-CTG---AACCGTGACAg
gi|6                          :                                     cTA---TA-GT---CTAT-AA-----A-A-CTG-CTTTTTA-A----AGC-T--TT--T--CT----TTACAA--TT-GTT-G-TA----TATT-GTA-C--A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AA-TT-G-T-TA--TA-TT----G-CT-G----A-A-TA----G-A--ATTT-ATTA-A---AC-ATT-GGTG-----TTGG-T-GC---TT-TG-T---A--C-------ACC--CC------AT-T-TTA---C---T-TC-----AA-TG----GT---CCT--C---A-A--G-----------A-----TAC--------------C-T-G-------G------A-TT--C-ATT------------G--A-A---------A----------T-TA--AGT-------TTT------------T--A--------TTT---A-------TT-AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------CCG-------------AA-A-----A------------------------A------C--CG-A---AA-CCGA----GGTT---CA-----G-----T--TT--CC-T-GAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATGT-CTG---AACCGTGACAgc
gi|13                         :                                     cTA---TA-GT---CTAT-AA-----A-A-CTG-CTTTTTA-A----AGC-T--TT--T--TT----T---AACATT-GTT-G-TA----TA-T-GTA-C--A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-TA--TA-TT----G-CT-G----A-A-TA----G-A--ATTT-ATTA-A---AC-ATT-GGTG-----T--G-T-GC---CT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---C---T-TC-----AA-TG----GT---CCT--C---A-A--G-----------A-----TAC--------------C-T-G-------G------A-TT--CGA-T------------G--A-A---------A----------T-TA--A---------GTT------------T--A---------TT---A-------TT-AC-A--C---AA--A---A--T-AAA--C-CAA-A------------CCG-------------AA-A-----A------------------------A------C--CG-A---AA-CCGA----GGTT---GC-----A-----T--TT--CC-T-GAA-CC------------GAA--C--CGAA---CG-A----AAA-ATGT-CTG---AACCGTGACAgc
gi|16                         :                                     cTA---TA-GT---CTATTAA-----G---CTG-CTTTT-A-A----AGC-T--TT--T--GT----T---GA--TT-GTT-G-TA----T--TTGTA-C--ACTTA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-TA--TA-TT----G-CT-G----A-A-TA----G-A--ATTT-ATTA-A---AC-TTT-GAAG-----T--G-T-G------------------------------CC------AT-T-TTA---C---T-TC-----CA-TG----GT---CCT--C---A-A--G-----------A-----TAC------------------G-------G------ATTT--C-A-T------------G----A---------A----------T-TA--A---------TTT------------T--A--------TTT---AT------AA-AC-A--C---AA--AAAGA--AAAAA--C-CGA-A------------CTG-----------A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT---CA-----G-----T--TT--CC-T-GAA-CT------------GAA--C--CGGA--CCGAA----AAA-ATGT-CTT---AACCGTGACAgc
gi|2                          :                                    ccTA---TA-GT---CTATTAG-----A-AGCTG-CTATTTA-A----GA--T--TT--T--GT----T---GA--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C--A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-G-GAAATT-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-TA--TA-TT----GCCT-G----A-A-TA----G-A--ATTG-ATTA-A---AC-TTT-AATG-----T--G-T-GC--CTT-TG-T---AC-C-------ATC--CC------AT-T-TTA---C---T-TC-----T--TG----GT---CCT--C---A-A--GNNNNNNNNNNNN-----NNN--------------N-N-N-------N------N-NN--N-N-N------------G--A-AGATACCTGGA----------T-TC--ATGAAATTAATTT------------T--A--------TTT---A-------TT-AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT---CA-----G-----T--TT--CC-T-------------------GAA--C--TGAA--CCG-A----AAA-ATGT-CTG---AACCGTg
gi|1                          :                                    ccTA---TA-GT---CTATTTA-----A-A-CT---CTTTTA-A----AGCTT--TT--T--TT----T---TA--TT-GTTTG-TA----C--T-G-G-C--A--TA---ATT--CT--ATCCTT-GGCTAC-T-T-GAA--TTA-TGT--GC--A--AT-C-T-TA--TAGTT----G-C-------A-A-TATTCAG-A--ATGT-ATTA-ATAAAC-TTT-GGTGACTGGT--G-C-GC--CTT-TG-CTTGA--C-------A-C--CC------AT-T-TTGTACC---TATA-----TA-GG----GT---CCT--CCAAA-A--G-----------A-----TAC--------------C-C-T-------ATGGTATA-TT--C-A-G------------G--A-A---------AAA--------TATA--G---------TTT------------T--A--------TTT---A-------TT-AC-A--C----A--A---A--TAAAA--C-CG--A------------CTG----------------A-----A------------------------G------T--GA-A---AA-CTGA----GGTTGTCCA-----G-----TTGTC--CC-C-GA---C------------GAAGTC--CGAAGTCC-------AAT-ATGT--TCTGAAACCGTGACA
gi|34                         :                                 agcccTA---TA-GT---AGATTAA-----A-A-CTC-ATTTTGG-G----AG--C--TAA-C--GT----T---GC--CT-GTT-G-TA----T-------------------ATG--CC--ATTTTT-A----A-A-T-GAA--T-A-T-C--A-----------------TA-TT----G-TT-A----A-A-TA----A-A--------------------TT-CATG-----T--T-T-GC--AAA-TG-T---A--A-------A-G--AA------AT-A-TTA---C---T-TC------A-GG----GT---CTT--C---A-A--G-----------A-----TGCAACTGCACTTCAGTC-T-T-------GA-----A-TT--C-T-T------------G--A-A----------------------TT--G---------TTT------------T--A--------TTT---T-------ATAAC-A--C---AA--A---A--TATAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-Agc
gi|25                         :                                       A---TA-GT---CG-TTAA-----G-A-CTGATTCTTTA-A----AGC-T--TT--T--GT----T---GA--TT--TT-G-TA----TA-T-GTA-C--A--TG----T---TC--ATCCTTTG----C-A---AAA--T-A-T-T--A---AT-AT---T-TA--TA-TC----G-CT------A-A-TA----A-A---TTT-ACTA-A---AC-TTT-GA-G-----T--GCT-GC--ATT--G-T---A--C-------A-C--C-------AT-T-TTA---C---T-TC-----CA-GG-----T---CGT--C---A-A--G-----------A-----AAT--------------C-T-G-------G------A-TT--C-A-T------------GAAA-A---------A----------T-TA--A---------TTT------------T--A--------TCT---A-------TT-AC-AACC---AA--A---A--TAAAAAGC-C-A-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--G--A---AA-CTGG----GTTT---CA-----G-----T--TT--CCGT-GAA------------------------------CG-A----AAA-A-GT-CTG---AACCGTGttttgtttcctgaggcaaacccaaa
gi|26                         :                                       A---TA-GT---TAATTAG-----A-A-CTC-CACTTGA-G----AG--T--TA--T--GT----T---GC--TT-GTT-G-CA----T--T-GTA-CATA--TA---ATG--TT--GTTCTT-A----A-A-T--AA--C-A-T-T--AC--TT-AT-GTT-TA--CA-TT----G-TT-T----A-ATTA----A-A--ATTT-ATTA-AG--AA-ATT-GATG-----T--T-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-G--AA------ATAT-TAA---C---T-TC-----AG-GA----GT---CCT--C---ATA--GT----------A-----TTC--------------C-T-T-------G------A-TT--C-A-T------------T--A------------------------TT--A---------TTT------------TC-A--------T--------------C-AC-A--C---AA--C---A--TATAA--C-CGA-A------------TTGA------A---A-AA-A-----A------------------------A------CA-AA-A---AA-CCAT----GATT---T------G-----T--TT--CC-T-GCA-----------------------CGAA--CTG-A----AAA-A
gi|50                         :                                       A---TA-GT---CTATTAA-----G-A-CTG-CTTTTTA-A----AG--C--TT--T--
gi|43                         :                                  agccaA---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTG-CTTT
gi|41                         : tatgtataggtctaaattttcactatctcacccagagcc---TA-GT---CCATTAA-----G-A-CTG--TTTTTA-A----AG--C--TT--TA-GT----T---GA--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C--A--TA---ATG--TC--AT
gi|9                          :                                          ccA-GT---CGATGAA-----G-A-TCG-GCTTTTT-A----AG--C--TT--T--GT----T---GA-----GTT-G-TG----TA-T-GTA-C--A--TA---ATG--TATAATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-AGT-C--AC--AT-AT-G-T--A--TA-TTATTCG-GT-G----A-A-TA----GTA--ATTG-ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--T-T-GC--TTTATG-T---A--C-------A-T--CC------TT-T-TTG---C---T-TC-----AT-GG----GTTCGCCT--C---A-ATTG-----------A-----TAC--------------C-T---------G------A-TT--C-C-T------------G--A-A---------A----------G-TT--AAT-------TTT------------T--A--------TTT---A-------TT-AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-C-A-A------------CCG-----------A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CTGA----G--T---CT-----A-----G--TT--TC-T-G-A-CT------------GAA--C--CGAA--CCG-------AA-ACGG-TTG---AA-CGTGACA
gi|28                         :                                         tgaA-GT---CTATTAA-----A-A-CTG-CTTGTGA-G----AG--C--TTA-T--GT----T---GC--CC-ATT-G-TG----T--T-GTA-C--A--T-----TG--CC--ATCCTT-A----A-A-T-AAA--T-A-T-T--AC--TT-AT-A-T-TA--TT-TT----G-TT-G----A-A-TA----A-A--ATTT-ATCA-G---A------------------G-T-CC--A----G-A---A--A-------A------------GT-T-ATA---------TC------A-GG----GT---CCT--C---A-G--T-----------A-----TTC--------------C-T-G-------G------A-GT--A-ATT------------G--A-A----------------------TC--A---------TTT------------C--A--------TTT---T-------ATCAC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------C--------------------------------------------------------T--GA-A---AA-CTGA----GG-T---CA-----ATAATGT--TT--CC-T-GAA-CT------------GAA--TGGCGAA--CCG-C----AAA-ATAT-CTG---AACgc
gi|27                         :                                               T---CGATTAA-----G-A-CTG-CTTTTTA-A----AGC-T--TT--T--GT----T---AA--TT-GTT-G-TA----T--T-GTG-C--A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-TA--TA-TT----G-CT-G----A-A-TA----G-A--ATTT-ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--CTT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---C---T-TC-----CA-TG----GT---CCT--C---A-A--G-----------A-----TAC--------------C-T-G-------G------A-TT--T-A-T------------G--A-A---------A----------T-TA--A---------TTT------------T--A--------T--------------T-AC-A--C---AA--A---A--TAAAT--C-TGA-A------------CCG----------------A-----A------------------------A------T--GA-A---A----GA-----------TA-----G-----T--TT--C--------CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATGT-CTG---AACCGTGACAtat
gi|18                         :                                               T---CGGTTAA-------A-CTG-CTTTTTA-A----AGC-T--TT--T--GT----T---AA--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C--A--TA---ATG--TC--ACCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-TA--TA-TT----G-CT-G----A-A-TA----G-A--ATTT-ATTA-A---GC-TTTGGATG-----T--G-T-GC--ATC-TG-T---A--C-------A-C--CC------AA-T-TTA---C---T-TC-----CA-GG----A------T--C---A-A--G-----------A-----TAC--------------C-T-A-------G------A-TT--C-A-T------------G--A-A---------AGTAATTTTATT-TCGGG---------TTT------------T--A--------TTT---A-------TT-AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C---------------------------------------------------------------------------C--GA-A---AA-CCGA------TT---CA-----G-----T--TT--CC-T-GAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATGT-CTG---AACCGAGACAg
gi|17                         :                                             taT---CGGTTAA-------A-CTG-CTTTTTA-A----AGC-T--TT--T--GT----T---AA--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C--A--TA---ATG--TC--ACCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-TA--TA-TT----G-CT-G----A-A-TA----G-A--ATTT-ATTA-A---GC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--ATC-TG-T---A--C-------A-C--CC------AA-T-TTA---C---T-TC-----CA-GG----A------T--C---A-A--G-----------A-----TAC--------------C-T-A-------G------A-TT--C-A-T------------G--A-A---------A----------G-TA--A---------TTT------------T--ATTTCGGGTTTT---ATTT----AT-AC-A--CA--AA--A---A--TAAAA--C---------------------------------------------------------------------------C--GA-A---AA-CCAA------TT---CA-----G-----T--TT--CC-T-GAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-AACCGAAA-ATGT-CTG---AACCGAGACAtc
gi|39                         :                                             taT---CGATTAA-----G-A-CTG--CTTTTA-A----AG--CTGTT--T--GT----T---GA--TT--TT-G-TA----T--T-GTAGC--A--TA---ATAT-TC--ATCCTT-G----C---T-GAA--T-A-T-T--
gi|30                         :                   tctaattagtcgattaagactgctttttaaagctttTAA-----G-A--TG-CTTTTTA-------G--C--TT--T--GT----T---GC--TT---T-G--A----T----GTA----A--TA---ATAGATC--ACTCT--G----C-A-T-GA---T-A-T-T--A---AT-AT---T-TA--TG-------G-CT-G----A-A-TA----G-A--ATTT-ATTA-T---AT-CTA-CATG-----T--G---------T-CG-T---A-----------------------------TA---C---T-TC-----CA-GG----AC---GCT--C---A----------------A-----TAC------------------T-------G------A--T--C-A-T------------G--A-A---------A----------T-----A---------ATT------------T--A--------TC------------AT-AT-A--C---AA--A---AACTAAAA--C-CGATA------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------T--GA-A---AA-C-------GATT---CA--------------TT--CC-T-G-A-TC------------G-A--C--CGAA--CCA-G----AAA-ATGT-CT----AA-CGTGA
gi|35                         :                                                               gcctgtagtactgTA-A----AG--C--TTG-T--GT----T---GC--CC-GTT-G-TA----T--T-GTG-C--G--TA---ATA--TC--GTCCTT-A----A-A-T-GGA--C-A-G-T--GC------T-T-T-T---TA-TT----G-------------TA-----------TT-GTTG-A---A---TA-GA-A-----T--A-T-AT--ATT--G-T---A--C-------A-G--AA------A------A---A---T-CC------A-AG----GT---CCT--------A--G-----------T-----TAT--------------TAT-T-------GG-----A-TT--C-A-T-----------------------------------------C--A---------TTT------------G--AA-------TTT---A-------TC-AT-A--C---AA--A---A--TAAAAA-C-CGA-A------------CCG-------GG--A-AA-A-----A------------------------A------T--GA-A---AA-TCGA----GGTT---agctga
gi|29                         :                                                                                               c--GC----T---GC--CT-GTT-G-TA----T--T-ATA-T--T--CA---ATA--AC--ATA--T-G----T-AAT-AAA--T-A-T-T--A---ATCAC-G-T-TAATTA-TT-------T-G----A-A-TG----A-A---CTT-ATT-----------T-G-TA-----T--T-T-GT--ATT-TC-T---A--CGGAA---A------------AA-A-TTA---C---T-C----------A----GT---CTT--C---G-T--C-----------A-----T-T--------------C-T-T-------G------AATT--C-A-A------------T--A-A---------A----------T-----A---------TTA------------A--A--------TTT---C-------AT--C-AGGC---AA--A---G--CAAAA--C-CCA-A------------TCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------------A---AA-TCAA----AATC---CACGACCA-----T--TTTTCC-T------C-------------AA--C--TGTA--CCG-A----AAA-ATGG-GTG---AACCGTGACAttgttcaggagtgttgtttcctgaattgtg
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5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|42 ): CTGAACCGTGACAGCCCTAATCACTGCTACAAATGTCATCAGATAAACAGGACCCTACCT
Unaligned ( gi|45 ): ACTATGACAGCCCTACCATTTATGTATTAATATAGACCAGTGTTAAATATGACAT
Unaligned ( gi|48 ): AACCCTAAATTAGGCCTTAGTTTCATGAATGTCATTGTCTG
Unaligned ( gi|49 ): TATTTATAAGGTTTCTAAATTTTCAGTACCTCACCTAGAGC






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gi|19                         :                                                                                                                taTATA---TA-GT---CGGTTAA-----G-A-CTGCTT-TTT--------------------TTGTT---------T-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ACCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-C--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTC-AATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG-GT---C----CC--C---A-A--G-----------A-----TGC--C-------TTG---A-TT--C-A----T------------GA-------A---------A-----T-T-A-------T---------TT------------TG-A-TT--T--------A-T-------T---AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCGA------A---A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CC-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACTATGACAtc
gi|2                          :                                                                                                                  taTA---TA-GT---CTATTAG-----A-AGCTGCTA-TTTA-A-----GA------T-T-TTGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-G-GAAATT-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----GCCT-G----A-A-T-A----G-AA-TTG-ATTA-A---AC-TTT-AATG-----T--G-T-GC--CTT-TG-T---AC-C-------ATC--CC------AT-T-TTA---CT-TCT-------TG-GT---C----CT--C---A-A--GNNNNNNNNNNNN-----NNN--N-------NNN---N-NN--N-N----N------------GA-------AGATACCTGGA-----T-TCA-------TGAAATTAATTT------------T--A-TT--T--------A-T-------T---AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--TGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccA---CC-TCTA------GG-GT---CAGTCTT--C---A-A--G-----------ACAAA-TAC--C-------TA-------T--C-A----TTCC---------GA-------A---------A-----T-TAA-------T---------TTAATGACAATTTAT--A-TT--T--------A-A-------T---GA-T--C---AATTA---A--TGAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------A--CA-A---A---CG-----GGTT------A-----A--------T--TTCC-TAAAACC------------GAA--C--GAAA--CCG-A----AAA--TG-T-CTT--G-A-ACCGTGAC
gi|21                         : tgcagaaaataaacgcaaatttatatcttactaataaatcttgcatattagaacaataatgtgacttcccccattgtaacaaacatcaccattgtttaaaaggctcggaaaaaTATA---TA-GT---CAATTAA-----A-A-CTGCTC-TTGA-G----GGC------T-T-ATTTT---G-C--AC-GT----TA----C--T-GTA-C-A--TA---ATG------AT---------------------T-A-T-T--ACTTAT-CT-T-T-T-A--TA-TT----G-TT-G----A-A-T-A------AA-TTT-TTT---------TTT---------------T-GC--ATT-TG-T---A--CAGAA---A-A--AA------AA-T-ATG---CG-T--A------GT-GT---C----CT--T--------------------A-----TTT--T-------TGG---A-TC--C-A----T------------T--------A---------A-----T-TTA-------T---------TT------------C--A-TT--T--------T-A-------T----C-A--C---AA--A---A--TAAAC--C-TGA-T------------CCG-------A---A-AA-A-----ATAGATAGAAAAAAAAAATAATAATA------C--GA-A---AA-CGGA----GATT-----TT-----C--------T--TTCC--G-----------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-GCC
gi|22                         :                                                                                                                CCTATAGA-TA-ATGCTCG-TTAA-----GGA-CTGCTT-TTTG-----------------T-TTGTT---G-----------G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--GACCTT-G----C-A-T-GAA--T-A------AC---T-ATCA-T-T-A--TA-TT----G-CTAG----ACA-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---G----T-AA-G-----T--G-T-GC--ATT-TA-T---AA-C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT---CA------GG-GT---C----C---C---A-A--G-----------A-----TGC--C-------TTG-----TT--C-A----T------------GAC------A---------A-----T-T-A-------T---------TT------------G--A-TT-----------A-T-------T---AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGC-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------AA-----C--GA-A---AAACCGA----GGTT-----CC-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--
gi|23                         :                                                                                                                    TG---TA-GT---CGGTTAA-----G-G-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---G-G--CT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-T---AC-TTT-AATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-T--CC------AT-T-TTA---CA-TCCAG-----GG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGA---A-TT--C-A----T------------CA-------A---------A-----T-TAA-------T---------TT------------T--A-TT--T--------A-T-------T---AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------C--------------------------------------------------------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGaaatcgttgagactgaca
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      c-G----A-A-T-AAA--G-AA-TTT-ATTA-A-------------------T--A-T--C--ATT-TGGT---A--A-------A-CAGCCTCATAAAT-T-TTAA--CT-TCCGCGCTATGG-AT---T----CTAAC---ATA--T-----------A-----CAC--C-------TGG---A-TT--C-A----TAGAAGAGTGGTAGA-------A---------T-----T-TTA-------T---------CT------------T--A-AA--T--------A-G-------T---ACCA--CCCCAA--A---A--TAAAAA-C-CAA-AAGTGACCACCACCCG-------A---A-AA-ATTCTGA------------------------A------C--GA-A---CA-CCGGAACCGGT------CA-----G--------T--TTTT-CCGA-CT------------GAA--C--CGAAG-CCA-A----AAATATG-TCCT---G-ACACC-TGA
gi|25                         :                                                                                                 ttacagtatttgctagaaaaA---TA-GT---CG-TTAA-----G-A-CTGATTCTTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TT--TT-G-TA----TA-T-GTA-C-A--TG----T---TC--ATCCTTTG----C-A---AAA--T-A-T-T--A---AT-AT---T-T-A--TA-TC----G-CT------A-A-T-A------AA-TTT-ACTA-A---AC-TTT-GA-G-----T--GCT-GC--ATT--G-T---A--C-------A-C--C-------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG--T---C----GT--C---A-A--G-----------A-----AAT--C-------TGG---A-TT--C-A----T------------GA-------A---------AAA---T-TAA-------T---------TT------------T--A-TC--T--------A-T-------T---AC-AACC---AA--A---A--TAAAAAGC-C-A-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---A--CTGG----GTTT-----CA-----G--------T--TTCCGTGAA-C-----------------------------G-A----AAA-A-G-T-CT---G-A-ACCGTGgcaagccac
gi|26                         :                                                                                                                     A---TA-GT---TAATTAG-----A-A-CTCCAC-TTGA-G----AG-------T-T-ATGTT---G-C--TT-GTT-G-CA----T--T-GTA-C-A--TATA-ATG--TT--GTTCTT-A----A-A-T--AA--C-A-T-T--AC--TT-AT-G-T-TTA--CA-TT----G-TT-T----A-A-TTA----A-AA-TTT-ATTA-AG--AA-ATT-GATG-----T--T-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-G--AA------AT-A-TTA---AC-TTCA------GGAGT---C----CT--C---ATA--GT----------A-----TTC--C-------TTG---A-TT--C-A----T------------TA-------------------------TTA-------T---------TT------------T--------C--------A-T-------C---AC-A--C---AA--C---A--TATAA--C-CGA-A------------TTG-------A---A-AAAA-----A------------------------A------CA-AA-A---AA-CCAT----GATT-----T------G--------T--TTCC-TGCA-----------------------CGAA--CTG-A----AAA-A
gi|27                         :                                                                                                                             T---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---A-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTG-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--CTT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------TG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--T-A----T------------GA-------A---------A-----T-TAA-------T---------TT------------T--A-T----------------------T---AC-A--C---AA--A---A--TAAAT--C-TGA-A------------CCG----------------A-----A------------------------A------T--GA-A---A----GA-------------TA-----G--------T--TTC-------CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACA
gi|28                         :                                                                                                                          A-GT---CTATTAA-----A-A-CTGCTT-GTGA-G----AGC------T-T-ATGTT---G-C--CC-ATT-G-TG----T--T-GTA-C-A--T-----TG--CC--ATCCTT-A----A-A-T-AAA--T-A-T-T--AC--TT-AT-A-T-T-A--TT-TT----G-TT-G----A-A-T-A----A-AA-TTT-ATCA-G---A------------------G-T-CC--A----G-A---A--A-------A------------GT-T-ATA---T----CA------GG-GT---C----CT--C---A-G--T-----------A-----TTC--C-------TGG---A-GT--A-AT---T------------GA-------A-----------------TCA-------T---------TT------------C--ATTT--T--------A-T-------C---AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------C--------------------------------------------------------T--GA-A---AA-CTGA----GG-T-----CAATAATG--------T--TTCC-TGAA-CT------------GAA--TGGCGAA--CCG-C----AAA-ATA-T-CT---G-A-ACg
gi|29                         :                                                                                                                                                     TT-TCGA-G----AGC------T-T-AAGCT---G-C--CT-GTT-G-TA----T--T-ATA-T-T--CA---ATA--AC--ATA--T-G----T-AAT-AAA--T-A-T-T--A---ATCAC-G-T-T-AATTA-TT-------T-G----A-A-T------G-AA-CTT-ATT-----------T-G-TA-----T--T-T-GT--ATT-TC-T---A--CGGAA---A------------AA-A-TTA---CT---CA------G---T---C----TT--C---G-T--C-----------A-----TTC--T-------TGA---A-TT--C-A----A------------TA-------A---------A-----T---A-------T---------TA------------A--A-TT--TC-------A-T-------C---AG-G--C---AA--A---G--CAAAA--C-CCA-A------------TCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------------A---AA-TCAA----AATC-----CAC----GACCATT--T--TTCC-T-----C-------------AA--C--TGTA--CCG-A----AAA-ATG-G-GT---G-A-ACCGTGACAtat
gi|3                          :                                                                                                                CCTAT----TA-GT---CTATTAAAA---G-A-CTGCTT-TTTAGA----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TTTGTT-G-TA----T--TTGTA-C-A--TATAAATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GA---T-A-T-T--AC--AT-ATTG-T-T-A--TA-T-----G-CT-G----A-A-T-A----G-AAATTTGATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GCCTGTT-GG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------TG-GTC--C----CT--G---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---C-TTGGA-A----A------------GA-------A---------A-----T-TA------------------TT------------T--A-TTTAT--------A-T-------T---A--A--C----A--A---A--TAAAAC-C-CGA-AT-----------CCG-------AT--A-AT-A-----A------------------------A------CCTGATA---AC-CCGA----GGTT-----CA-----GT-------T--TTCC-TGAA-CT------------GGA-------AA--CCG-AT---AAA-ATG-T-CTTGAA-A-ACCGT-ACAgc
gi|30                         :                                                                                                                                     TAA-----G-A--TGCTT-TTTA-------GC------T-T-T-GTT---G-C--TT---T-G--A----T----GTA---A--TA---ATAGATC--ACTCT--G----C-A-T-GA---T-A-T-T--A---AT-AT---T-T-A--TG-------G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-T---AT-CTA-CATG-----T--G---------T-CG-T---A-----------------------------TA---CT-TCCA------GG-AC---G----CT--C---A----------------A-----TA---C-------TGA------T--C-A----T------------GA-------A---------A-----T---A-------A---------TT------------T--A-TC-------------A-------T---AT-A--C---AA--A---AACTAAAA--C-CGATA------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------T--GA-A---AA-C-------GATT-----CA-----------------TTCC-TG-A-TC------------G-A--C--CGAA--CCA-G----AAA-ATG-T-CT---A-A---CGTGAg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                 gcctgtagtactg-GTT-G-TA----T--G-GCG-T-A--TA---ATG--T----------------------------A-T-T--AC--TTTAT-C-T-T-A--CA-TT----G-TT-G----A-AAT-A----A-AA-CTT-ATTA-G---AA-ATT-GATG-----T--T-T-TC--ATT-GT-T---A--C-------A-T--AG------AG-T-ACA---AG-TTCA------AA-AT---C----CT--C--------G-----------C-----TAT--CCTCATAGTGG---A-TT--C-A----T------------TG-------A---------A-----T-TT--------T---------TT------------T--C-TT--TTTA-----A-A-------C---AC-A--C---AC--A---A--CAAAA--C-TTA-A------------CCACCTCCACA---ACAA-A-----A------------------------A------T--CA-ACATAA-CCGA----TGTT-----TT-----A--------T--TTCC-GGA-----------------AA--C--CGG-----G-A----AAA-ATG-T-CT-----A-ACTGTagctga
gi|32                         :                                                                                                               tgccATG---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGTTTTGAGT-T-TTG-T---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TT---ATGT-TC--AT-CTT-G----CAA-TAAAA--T-A-T-T--AC--AT-AC-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-GCTGAA-G-T-A----A-GA-TTT--TTA-A---ACGTTT-AATG-----T--G-TGGC--A-T-TG-T---A--C---------C--CC------ATATGTTA---CT-TCTA------GGTGT---T----CT--CA--A-A--G-----------A-----TACG-C-------TTG---A-TT--C-A----T------------GA-------A---------AT----T-TCA-------T---------TT------------TTAA-TC--T--------A-A-------T---AC-A--C----A--A---C--TAAAA--T-AGA-A------------agag
gi|33                         :                                                                                                                                                                                     tatac--TT-GTT-G-CAGCTTT--T-ATC-C-A--TA---TTG--TC--GTCCTT-G----A-A-T-GAA--T-A-G-T--GC--TT-AT-G-T-A-A--TA-TT----G-TT-G----A-A-A-A----A-AA-AAT-ATAAGA---AA-TTG-AATG-----T--T-T-CC--ATT--G-TC--A--C-------A-A--AA------AT-A-A-A---CC-TATA------AG-AC---A----CT--C---A-T--T-----------A-----TTC--T-------TGG---A-CT--C-A----T------------TA-------A---------A-----T-TG--------T---------TT------------T--A-TT--TTA------A-A-------C---AC-A--C---AA--C---A--TAAAA--C-AGA-A------------CCC-------A---A-AG-G-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GTTT-----TT-----A--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--TGAA--a
gi|34                         :                                                                                                                    TA---TA-GT---AGATTAA-----A-A-CTCATT-TTGG-G----AGC------T-A-ACGTT---G-C--CT-GTT-G-TA----T------------------ATG--CC--ATTTTT-A----A-A-T-GAA--T-A-T-C--A------------------TA-TT----G-TT-A----A-A-T-A------AA-TTC-AT-----------------G-----T--T-T-GC--AAA-TG-T---A--A-------A-G--AA------AT-A-TTA---CT-TC-A------GG-GT---C----TT--C---A-A--G-----------A-----TGCAAC-------TGC---ACTT--C-AGTCTT------------GAATTCTTGA---------A-----T-TG--------T---------TT------------T--ATTT--T--------A-T-------A---AC-A--C---AA--A---A--TATAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-A---------------------------------------------------------------TT-----TT-----G--------T--TTCC-TGAG-GC------------AAA--C--CCAA--acat
gi|35                         :                                                                                                                                                          TA-A----AGC------T-T-GTGTT---G-C--CC-GTT-G-TA----T--T-GTG-C-G--TA---ATA--TC--GTCCTT-A----A-A-T-GGA--C-A-G-T--GC--TT-TTTA-T-T-G--TA-TT----G-TT-----------------G-AA-T------A-G---A-------ATA-----T--A-T-A-----T-TG-T---A--C-------A-G--AA------A------A---AT--CCA------AG-GT---C----CT--------A--G-----------T-----TAT--TAT-----TGG---A-TT--C-A----T----------------------------------------CA-------T---------TT------------G--AATT--T--------A-T-------C---AT-A--C---AA--A---A--TAAAAA-C-CGA-A------------CCG-------GG--A-AA-A-----A------------------------A------T--GA-A---AA-TCGA----GGTTTTGTTCA-----GGAGTGTTGT--TTCC-TGAA-a
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cG-GT---T----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-T----T------------GA-------A---------A-----T-TAA-------T---------TT------------T--A-TT--T--------A-T-------T---AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACttgtg
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ccatca-------T---------TT------------T--A-TT--T--------A-CCCGGTAAT---AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------CCG-------A---A-AAAA-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCATGACA
gi|39                         :                                                                                                                      ---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTgc
gi|39                         :                                                                                                                       tctaatT---CGATTAA-----G-A-CTGC-T-TTTA-A----AGC------TGT-TTGTT---G-A--TT--TT-G-TA----T--T-GTAGC-A--TA---ATAT-TC--ATCCTT-G----C---T-GAA--T-A-T-T--cgattaagactgcttttaaagctgtttgttgattttgtattgtagcataatattcatccttgctgaatatt
gi|4                          :                                                                            tctaattagtcgattaagactgctttttaaagctttCCTAT----TA-GT---CTATTAAAA---G-A-CTGCTT-TTTAGA----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TTTGTT-G-TA----T--TTGTA-C-A--TATAAATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GA---T-A-T-T--AC--AT-ATTG-T-T-A--TA-T-----G-CT-G----A-A-T-A----G-AAATTTGATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GCCTGTT-GG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------TG-GTC--C----CT--G---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---C-TTGGA-A----A------------GA-------A---------A-----T-TA------------------TT------------T--A-TTTAT--------A-T-------T---A--A--C----A--A---A--TAAAAC-C-CGA-AT-----------CCG-------AT--A-AT-A-----A------------------------A------CCTGATA---AC-CCGA----GGTT-----CA-----GT-------T--TTCC-TGAA-CT------------GGA-------AA--CCG-AT---AAA-ATG-T-CTTGAA-A-ACCGT-ACA
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-------T---------TT------------T--G-TT--C--------C-C-------C---AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--AACAG-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------G------C--AA-A---AA-CCCT----AGTT-----T------G--------T--TTCC-TGAAACC------------TAA--C--CAAT--CCG-A----AAA-ATG-TGCT---G-A-ACCGTGACAg
gi|41                         :                                                                                                                      ---TA-GT---CCATTAA-----G-A-CTG-TT-TTTA-A----AGC------T-T-TAGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATa
gi|43                         :                                                                                                                   ccA---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-T
gi|44                         :                                                                         tatgtataggtctaaattttcactatctcacccagagccCCTATACGGTA-GT---CAGTTAAATTAGG-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---GTA--TT-GT
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             ag----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-T---AC-TTT-AATG-----T--G-A-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTT-----AA-----A--------T--TTCC-TGAA-C---------------------CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-AT---G-A-ACCATGACA
gi|5                          :                                                                                                                CCTA-A---TACGT---CTATTAA-----G-A-CTA----TTTC-A----AGC------T-T-TTGTTT--G-A--TT-GTT-GGTA----T--T-GTA-CGA--TT---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-TTGAT--T-A-T-G--AT--AT-AT-GGTGT-A--TA-TT----G-CT-G----A-AAT-A----G-AA-TT--ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--CTTCTG-T---AAAC-------A-C--CC------AT-T-ATA---CT-TCCA------TC-GT---T----CT--C---A-A--G-----------AA----TATT-C-------TGG---A-T---C-A----T------------GA-------A---------A-----T-TAT-------T---------TT------------T--AAGT--T--------A-T-------T----C-AG-C---AA--A---AATTAAAA--C-CGA-T------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----TA-----G--------T--TCTC-TGAA-CT------------GAA--C--CGAA--ACG--------A-ATG-T-CT---G-A-ACCG-GACAg
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gi|6                          :                                                                                                               agccaTA---TA-GT---CTAT-AA-----A-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTCTTTACA-A--TT-GTT-G-TA----TATT-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AA-TT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-ATT-GGTG-----TTGG-T-GC---TT-TG-T---A--C-------ACC--CC------AT-T-TTA---CT-TCAA------TG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-AT---T------------GA-------A---------A-----T-TAAGT-----T---------TT------------T--A-TT--T--------A-T-------T---AC-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------CCG-------------AA-A-----A------------------------A------C--CG-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACA
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                 gccTA---TA-GT---CTAT-AA-----A-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTTTT---A-ACATT-GTT-G-TA----TA-T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-ATT-GGTG-----T--G-T-GC---CT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCAA------TG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--CGA----T---GA-A---------A--T-T-----AA--G------------T----T------------T--A--T--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--T-AAA--C-CAA-A------------CCG-------------AA-A-----A------------------------A------C--CG-A---AA-CCGA----GGTTG----CA--------------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA---CG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACAg
gi|14                         :                                                                                                               cCCTATA---TC-G-----GATTAA-----G-A-CTGCTT-TT-A-A----AGC------T-TCTTGTT---G-G--TT-GTT-G-TA----T--T-GAG-C-A--TA---TTG--T---AGCCTT-G----C-A-T-GGA--T-A-T-TTAAC--AA-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-A----A-A-T-A----G-AA-TTT-GTTA-A---AC-TTT-GGTG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--T-T-----AA--T------------T----T------------T--A--T--T--------AA-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------CCG-------A---A-GA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CCGA----AGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-AT--T-CT---G-A-ACCGTGACAgc
gi|15                         :                                                                                                                CCTATA---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T----GTA-C-A--TA---GTG--CC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-T-T-A----G-AA-TTT-ATTT-T---AC-TTT-AATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--TC------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-GT--C-A----T---AA-A---------A--T-T-----CA--T------------T----T------------T--A-TT--T--------AA-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CTA-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--TGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-g
gi|16                         :                                                                                                                   gTA---TA-GT---CTATTAA-----G---CTGCTT-TT-A-A----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T--TTGTA-C-ACTTA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTT-GAAG-----T--G-T-G------------------------------CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------TG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC-----------GG---ATTT--C-A----T---G--A---------A--T-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TT--T--------ATA------A---A----C-A--C---AA--AAAGA--AAAAA--C-CGA-A------------CTG-----------A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CT------------GAA--C--CGGA--CCGAA----AAA-ATG-T-CT---T-A-ACCGTGACA
gi|17                         :                                                                                                                           ccT---CGGTTAA-------A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---A-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ACCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---GC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--ATC-TG-T---A--C-------A-C--CC------AA-T-TTA---CT-TCCA------GG-AT---C------------A-A--G-----------A-----TAC--C-------TAG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--G-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TT--TCGGGTTTTAT-------TTATA----C-A--C---AA--A---AA-TAAAA--C-CGA-A-------------------------------------------------------------------------------AA-CCAA------TT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-AACCGAAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGAGACAg
gi|18                         :                                                                                                                           taT---CGGTTAA-------A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---A-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ACCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---GC-TTTGGATG-----T--G-T-GC--ATC-TG-T---A--C-------A-C--CC------AA-T-TTA---CT-TCCA------GG-A----------T--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TAG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--G-T-----AA--TTTTATTTCGGGTT----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C---------------------------------------------------------------------------C--GA-A---AA-CCGA------TT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGAGACA
gi|19                         :                                                                                                                taTATA---TA-GT---CGGTTAA-----G-A-CTGCTT-TTT--------------------TTGTT---------T-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ACCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-C--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTC-AATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG-GT---C----CC--C---A-A--G-----------A-----TGC--C-------TTG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--T-T-----AT--T------------T----T------------G--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCGA------A---A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CC-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACTATGACAtc
gi|2                          :                                                                                                                  taTA---TA-GT---CTATTAG-----A-AGCTGCTA-TTTA-A-----GA------T-T-TTGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-G-GAAATT-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----GCCT-G----A-A-T-A----G-AA-TTG-ATTA-A---AC-TTT-AATG-----T--G-T-GC--CTT-TG-T---AC-C-------ATC--CC------AT-T-TTA---CT-TCT-------TG-GT---C----CT--C---A-A--GNNNNNNNNNNNN-----NNN--N-------NNN---N-NN--N-N----N---GA-AGATACCTGGA--T-TCATGAAA--T------------TAATTT------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--TGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccA---CC-TCTA------GG-GT---CAGTCTT--C---A-A--G-----------ACAAA-TAC--C-------TA-------T--C-A----TTCCGA-A---------A--T-T-----AA--T------------T----TAATGACAATTTAT--A-TT--T--------AA-------T---G----A-T--C---AATTA---A--TGAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------A--CA-A---A---CG-----GGTT------A-----A--------T--TTCC-TAAAACC------------GAA--C--GAAA--CCG-A----AAA--TG-T-CTT--G-A-ACCGTGAC
gi|21                         : tgcagaaaataaacgcaaatttatatcttactaataaatcttgcatattagaacaataatgtgacttcccccattgtaacaaacatcaccattgtttaaaaggctcggaaaaaTATA---TA-GT---CAATTAA-----A-A-CTGCTC-TTGA-G----GGC------T-T-ATTTT---G-C--AC-GT----TA----C--T-GTA-C-A--TA---ATG------AT---------------------T-A-T-T--ACTTAT-CT-T-T-T-A--TA-TT----G-TT-G----A-A-T-A------AA-TTT-TTT---------TTT---------------T-GC--ATT-TG-T---A--CAGAA---A-A--AA------AA-T-ATG---CG-T--A------GT-GT---C----CT--T--------------------A-----TTT--T-------TGG---A-TC--C-A----T---T--A---------A--T-T-----TA--T------------T----T------------C--A-TT------------T-------T---AT---C-A--C---AA--A---A--TAAAC--C-TGA-T------------CCG-------A---A-AA-A-----ATAGATAGAAAAAAAAAATAATAATA------C--GA-A---AA-CGGA----GATT-----TT-----C--------T--TTCC--G-----------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-GCC
gi|22                         :                                                                                                                CCTATAGA-TA-ATGCTCG-TTAA-----GGA-CTGCTT-TTTG-----------------T-TTGTT---G-----------G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--GACCTT-G----C-A-T-GAA--T-A------AC---T-ATCA-T-T-A--TA-TT----G-CTAG----ACA-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---G----T-AA-G-----T--G-T-GC--ATT-TA-T---AA-C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT---CA------GG-GT---C----C---C---A-A--G-----------A-----TGC--C-------TTG-----TT--C-A----T---GACA---------A--T-T-----A----------------T----T------------T--G-AT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGC-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------AA-----C--GA-A---AAACCGA----GGTT-----CC-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--
gi|23                         :                                                                                                                    TG---TA-GT---CGGTTAA-----G-G-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---G-G--CT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-T---AC-TTT-AATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-T--CC------AT-T-TTA---CA-TCCAG-----GG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGA---A-TT--C-A----T---CA-A---------A--T-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------C--------------------------------------------------------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGaaatcgttgagactgaca
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      c-G----A-A-T-AAA--G-AA-TTT-ATTA-A-------------------T--A-T--C--ATT-TGGT---A--A-------A-CAGCCTCATAAAT-T-TTAA--CT-TCCGCGCTATGG-AT---T----CTAAC---ATA--T-----------A-----CAC--C-------TGG---A-TT--C-A----TA--GA-AG--------A--G-TGGTAGAA--T------------T----T------------T--A-TC--TTAA-----ATAG-----T---A----CCA--CCCCAA--A---A--TAAAAA-C-CAA-AAGTGACCACCACCCG-------A---A-AA-ATTCTGA------------------------A------C--GA-A---CA-CCGGAACCGGT------CA-----G--------T--TTTT-CCGA-CT------------GAA--C--CGAAG-CCA-A----AAATATG-TCCT---G-ACACC-TGA
gi|25                         :                                                                                                 ttacagtatttgctagaaaaA---TA-GT---CG-TTAA-----G-A-CTGATTCTTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TT--TT-G-TA----TA-T-GTA-C-A--TG----T---TC--ATCCTTTG----C-A---AAA--T-A-T-T--A---AT-AT---T-T-A--TA-TC----G-CT------A-A-T-A------AA-TTT-ACTA-A---AC-TTT-GA-G-----T--GCT-GC--ATT--G-T---A--C-------A-C--C-------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG--T---C----GT--C---A-A--G-----------A-----AAT--C-------TGG---A-TT--C-A----T---GA-A---------AAAT-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TC--T--------AT-------T---A----C-AACC---AA--A---A--TAAAAAGC-C-A-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---A--CTGG----GTTT-----CA-----G--------T--TTCCGTGAA-C-----------------------------G-A----AAA-A-G-T-CT---G-A-ACCGTGgcaagccac
gi|26                         :                                                                                                                     A---TA-GT---TAATTAG-----A-A-CTCCAC-TTGA-G----AG-------T-T-ATGTT---G-C--TT-GTT-G-CA----T--T-GTA-C-A--TATA-ATG--TT--GTTCTT-A----A-A-T--AA--C-A-T-T--AC--TT-AT-G-T-TTA--CA-TT----G-TT-T----A-A-TTA----A-AA-TTT-ATTA-AG--AA-ATT-GATG-----T--T-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-G--AA------AT-A-TTA---AC-TTCA------GGAGT---C----CT--C---ATA--GT----------A-----TTC--C-------TTG---A-TT--C-A----T---------------------T-----A---------------------T------------T--A-TT--TTC------AT-------C---A----C-A--C---AA--C---A--TATAA--C-CGA-A------------TTG-------A---A-AAAA-----A------------------------A------CA-AA-A---AA-CCAT----GATT-----T------G--------T--TTCC-TGCA-----------------------CGAA--CTG-A----AAA-A
gi|27                         :                                                                                                                             T---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---A-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTG-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--CTT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------TG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--T-A----T---GA-A---------A--T-T-----AA--T-----------------------------------TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAT--C-TGA-A------------CCG----------------A-----A------------------------A------T--GA-A---A----GA-------------TA-----G--------T--TTC-------CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACA
gi|28                         :                                                                                                                          A-GT---CTATTAA-----A-A-CTGCTT-GTGA-G----AGC------T-T-ATGTT---G-C--CC-ATT-G-TG----T--T-GTA-C-A--T-----TG--CC--ATCCTT-A----A-A-T-AAA--T-A-T-T--AC--TT-AT-A-T-T-A--TT-TT----G-TT-G----A-A-T-A----A-AA-TTT-ATCA-G---A------------------G-T-CC--A----G-A---A--A-------A------------GT-T-ATA---T----CA------GG-GT---C----CT--C---A-G--T-----------A-----TTC--C-------TGG---A-GT--A-A----T---TG-A---------A--T-C------A--T------------T----T------------C--ATTT--T--------AT-------C---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------C--------------------------------------------------------T--GA-A---AA-CTGA----GG-T-----CAATAATG--------T--TTCC-TGAA-CT------------GAA--TGGCGAA--CCG-C----AAA-ATA-T-CT---G-A-ACg
gi|29                         :                                                                                                                                                     TT-TCGA-G----AGC------T-T-AAGCT---G-C--CT-GTT-G-TA----T--T-ATA-T-T--CA---ATA--AC--ATA--T-G----T-AAT-AAA--T-A-T-T--A---ATCAC-G-T-T-AATTA-TT-------T-G----A-A-T------G-AA-CTT-ATT-----------T-G-TA-----T--T-T-GT--ATT-TC-T---A--CGGAA---A------------AA-A-TTA---CT---CA------G---T---C----TT--C---G-T--C-----------A-----TTC--T-------TGA---A-TT--C-AA---T---AA-AT--------A--T-T-----AA------------------------------------A-TT--TC-------AT-------C---A----G-G--C---AA--A---G--CAAAA--C-CCA-A------------TCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------------A---AA-TCAA----AATC-----CAC----GACCATT--T--TTCC-T-----C-------------AA--C--TGTA--CCG-A----AAA-ATG-G-GT---G-A-ACCGTGACAtat
gi|3                          :                                                                                                                CCTAT----TA-GT---CTATTAAAA---G-A-CTGCTT-TTTAGA----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TTTGTT-G-TA----T--TTGTA-C-A--TATAAATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GA---T-A-T-T--AC--AT-ATTG-T-T-A--TA-T-----G-CT-G----A-A-T-A----G-AAATTTGATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GCCTGTT-GG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------TG-GTC--C----CT--G---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---C-TTGGA-A----A---GA-A---------A--T-T-----A----------------T----T------------T--A-TTTAT--------AT-------T---A------A--C----A--A---A--TAAAAC-C-CGA-AT-----------CCG-------AT--A-AT-A-----A------------------------A------CCTGATA---AC-CCGA----GGTT-----CA-----GT-------T--TTCC-TGAA-CT------------GGA-------AA--CCG-AT---AAA-ATG-T-CTTGAA-A-ACCGT-ACAgc
gi|30                         :                                                                                                                                     TAA-----G-A--TGCTT-TTTA-------GC------T-T-T-GTT---G-C--TT---T-G--A----T----GTA---A--TA---ATAGATC--ACTCT--G----C-A-T-GA---T-A-T-T--A---AT-AT---T-T-A--TG-------G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-T---AT-CTA-CATG-----T--G---------T-CG-T---A-----------------------------TA---CT-TCCA------GG-AC---G----CT--C---A----------------A-----TA---C-------TGA------T--C-A----T---GA-A---------A----T-----AA---------------T----T------------T--A--T--C--------ATA------T---A----C-A--A---AA--A---C--TAAAA--C-CGATA------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------T--GA-A---AA-C-------GATT-----CA-----------------TTCC-TG-A-TC------------G-A--C--CGAA--CCA-G----AAA-ATG-T-CT---A-A---CGTGAg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                 gcctgtagtactg-GTT-G-TA----T--G-GCG-T-A--TA---ATG--T----------------------------A-T-T--AC--TTTAT-C-T-T-A--CA-TT----G-TT-G----A-AAT-A----A-AA-CTT-ATTA-G---AA-ATT-GATG-----T--T-T-TC--ATT-GT-T---A--C-------A-T--AG------AG-T-ACA---AG-TTCA------AA-AT---C----CT--C--------G-----------C-----TAT--CCTCATAGTGG---A-TT--C-A----T---TG-A---------A--T-T---------T------------T----T------------T--T-CT--T--------TT-------T---AAACAC-A--C---AC--A---A--CAAAA--C-TTA-A------------CCACCTCCACA---ACAA-A-----A------------------------A------T--CA-ACATAA-CCGA----TGTT-----TT-----A--------T--TTCC-GGAA-----------------A--C--CGG-----G-A----AAA-ATG-T-CT-----A-ACTGTagctga
gi|32                         :                                                                                                               tgccATG---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGTTTTGAGT-T-TTG-T---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TT---ATGT-TC--AT-CTT-G----CAA-TAAAA--T-A-T-T--AC--AT-AC-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-GCTGAA-G-T-A----A-GA-TTT--TTA-A---ACGTTT-AATG-----T--G-TGGC--A-T-TG-T---A--C---------C--CC------ATATGTTA---CT-TCTA------GGTGT---T----CT--CA--A-A--G-----------A-----TACG-C-------TTG---A-TT--C-A----T---GA-A---------AT-T-T-----CA--T------------T----T------------TTAA-TC--T--------AA-------T---A----C-A--C----A--A---C--TAAAA--T-AGA-A------------agag
gi|33                         :                                                                                                                                                                                     tatac--TT-GTT-G-CAGCTTT--T-ATC-C-A--TA---TTG--TC--GTCCTT-G----A-A-T-GAA--T-A-G-T--GC--TT-AT-G-T-A-A--TA-TT----G-TT-G----A-A-A-A----A-AA-AAT-ATAAGA---AA-TTG-AATG-----T--T-T-CC--ATT--G-TC--A--C-------A-A--AA------AT-A-A-A---CC-TATA------AG-AC---A----CT--C---A-T--T-----------A-----TTC--T-------TGG---A-CT--C-A----T---TA-A---------A--T-T-----G---T------------T----T------------T--A-TT--TTA------AA-------C---A----C-A--C---AA--C---A--TAAAA--C-AGA-A------------CCC-------A---A-AG-G-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GTTT-----TT-----A--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--TGAA--a
gi|34                         :                                                                                                                    TA---TA-GT---AGATTAA-----A-A-CTCATT-TTGG-G----AGC------T-A-ACGTT---G-C--CT-GTT-G-TA----T------------------ATG--CC--ATTTTT-A----A-A-T-GAA--T-A-T-C--A------------------TA-TT----G-TT-A----A-A-T-A------AA-TTC-AT-----------------G-----T--T-T-GC--AAA-TG-T---A--A-------A-G--AA------AT-A-TTA---CT-TC-A------GG-GT---C----TT--C---A-A--G-----------A-----TGCAAC-------TGC---ACTT--C-AGTCTT---GA-ATTCTTGA--A--T-T-----G---T------------T----T------------T--A-TT--TT-------AT-------A---A----C-A--C---AA--A---A--TATAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-A---------------------------------------------------------------TT-----TT-----G--------T--TTCC-TGAG-GC------------AAA--C--CCAA--acat
gi|35                         :                                                                                                                                                          TA-A----AGC------T-T-GTGTT---G-C--CC-GTT-G-TA----T--T-GTG-C-G--TA---ATA--TC--GTCCTT-A----A-A-T-GGA--C-A-G-T--GC--TT-TTTA-T-T-G--TA-TT----G-TT-----------------G-AA-T------A-G---A-------ATA-----T--A-T-A-----T-TG-T---A--C-------A-G--AA------A------A---AT--CCA------AG-GT---C----CT--------A--G-----------T-----TAT--TAT-----TGG---A-TT--C-A----T---CA---------------------------------------T----T------------TGAA-TT--T--------AT-------C---A----T-A--C---AA--A---A--TAAAAA-C-CGA-A------------CCG-------GG--A-AA-A-----A------------------------A------T--GA-A---AA-TCGA----GGTTTTGTTCA-----GGAGTGTTGT--TTCC-TGAA-a
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cG-GT---T----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-T----T---GA-A---------A--T-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACttgtg
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccatca--T------------T----T------------T--A-TT--T--------ACCCGGTAAT---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------CCG-------A---A-AAAA-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCATGACA
gi|39                         :                                                                                                                      ---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTgc
gi|39                         :                                                                                                                       tctaatT---CGATTAA-----G-A-CTGC-T-TTTA-A----AGC------TGT-TTGTT---G-A--TT--TT-G-TA----T--T-GTAGC-A--TA---ATAT-TC--ATCCTT-G----C---T-GAA--T-A-T-T--cgattaagactgcttttaaagctgtttgttgattttgtattgtagcataatattcatccttgctgaatatt
gi|4                          :                                                                            tctaattagtcgattaagactgctttttaaagctttCCTAT----TA-GT---CTATTAAAA---G-A-CTGCTT-TTTAGA----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TTTGTT-G-TA----T--TTGTA-C-A--TATAAATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GA---T-A-T-T--AC--AT-ATTG-T-T-A--TA-T-----G-CT-G----A-A-T-A----G-AAATTTGATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GCCTGTT-GG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------TG-GTC--C----CT--G---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---C-TTGGA-A----A---GA-A---------A--T-T-----A----------------T----T------------T--A-TTTAT--------AT-------T---A------A--C----A--A---A--TAAAAC-C-CGA-AT-----------CCG-------AT--A-AT-A-----A------------------------A------CCTGATA---AC-CCGA----GGTT-----CA-----GT-------T--TTCC-TGAA-CT------------GGA-------AA--CCG-AT---AAA-ATG-T-CTTGAA-A-ACCGT-ACA
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A--T------------T----T------------T--G-TT--C--------CC-------C---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--AACAG-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------G------C--AA-A---AA-CCCT----AGTT-----T------G--------T--TTCC-TGAAACC------------TAA--C--CAAT--CCG-A----AAA-ATG-TGCT---G-A-ACCGTGACAg
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gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTT-----AA-----A--------T--TTCC-TGAA-C---------------------CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-AT---G-A-ACCATGACA
gi|5                          :                                                                                                                CCTA-A---TACGT---CTATTAA-----G-A-CTA----TTTC-A----AGC------T-T-TTGTTT--G-A--TT-GTT-GGTA----T--T-GTA-CGA--TT---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-TTGAT--T-A-T-G--AT--AT-AT-GGTGT-A--TA-TT----G-CT-G----A-AAT-A----G-AA-TT--ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--CTTCTG-T---AAAC-------A-C--CC------AT-T-ATA---CT-TCCA------TC-GT---T----CT--C---A-A--G-----------AA----TATT-C-------TGG---A-T---C-A----T---GA-A---------A--T-T-----AT--T------------T----T------------T--AAGT--T--------AT-------T--------C-AG-C---AA--A---AATTAAAA--C-CGA-T------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----TA-----G--------T--TCTC-TGAA-CT------------GAA--C--CGAA--ACG--------A-ATG-T-CT---G-A-ACCG-GACAg
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gi|6                          :                                                                                                               agccaTA---TA-GT---CTAT-AA-----A-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTCTTTACA-A--TT-GTT-G-TA----TATT-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AA-TT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-ATT-GGTG-----TTGG-T-GC---TT-TG-T---A--C-------ACC--CC------AT-T-TTA---CT-TCAA------TG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-AT---T---GA-A---------A--T-T-----AAGTT------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------CCG-------------AA-A-----A------------------------A------C--CG-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACA
gi|7                          :                                                                                                                   cTA---TA-GT---CTAT-AA-----A-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTCTTTACA-A--TT-GTT-G-TA----TATT-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AA-TT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-ATT-GGTG-----TTGG-T-GC---TT-TG-T---A--C-------ACC--CC------AT-T-TTA---CT-TCAA------TG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-AT---T---GA-A---------A--T-T-----AAGTT------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------CCG-------------AA-A-----A------------------------A------C--CG-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACAgc
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gi|9                          :                                                                                                                          A-GT---CGATGAA-----G-ATCGGCTT-TTTA-A-----GC------T-T-T-GTT---G-A-----GTT-G-TG----TA-T-GTA-C-A--TA---ATG--TATAATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-AGT-C--AC--AT-AT-G-T---A--TA-TTATTCG-GT-G----A-A-T-A----GTAA-TTG-ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--T-T-GC--TTTATG-T---A--C-------A-T--CC------TT-T-TTG---CT-TCAT------GG-GTTCGC----CT--C---A-ATTG-----------A-----TAC--C-------TG----A-TT--C-C----T---GA-A---------AG-T-T-----AA--T------------T----T------------TT-A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-C-A-A------------CCG-----------A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CTGA-----GTC-----TA-----G--------T--TT-C-TG-A-CT------------GAA--C--CGAA--CCG-------AA-ACG-G-TT---G-A-A-CGTGACA
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-3254 )     :                                                                                                                CCTATA---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--T-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACA
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gi|19                         :                                                                                                                taTATA---TA-GT---CGGTTAA-----G-A-CTGCTT-TTT--------------------TTGTT---------T-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ACCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-C--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTC-AATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG-GT---C----CC--C---A-A--G-----------A-----TGC--C-------TTG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--T-T-----AT--T------------T----T------------G--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCGA------A---A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CC-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACTATGACAtc
gi|2                          :                                                                                                                  taTA---TA-GT---CTATTAG-----A-AGCTGCTA-TTTA-A-----GA------T-T-TTGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-G-GAAATT-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----GCCT-G----A-A-T-A----G-AA-TTG-ATTA-A---AC-TTT-AATG-----T--G-T-GC--CTT-TG-T---AC-C-------ATC--CC------AT-T-TTA---CT-TCT-------TG-GT---C----CT--C---A-A--GNNNNNNNNNNNN-----NNN--N-------NNN---N-NN--N-N----N---GA-AGATACCTGGA--T-TCATGAAA--T------------TAATTT------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--TGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccA---CC-TCTA------GG-GT---CAGTCTT--C---A-A--G-----------ACAAA-TAC--C-------TA-------T--C-A----TTCCGA-A---------A--T-T-----AA--T------------T----TAATGACAATTTAT--A-TT--T--------AA-------T---G----A-T--C---AATTA---A--TGAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------A--CA-A---A---CG-----GGTT------A-----A--------T--TTCC-TAAAACC------------GAA--C--GAAA--CCG-A----AAA--TG-T-CTT--G-A-ACCGTGAC
gi|21                         : tgcagaaaataaacgcaaatttatatcttactaataaatcttgcatattagaacaataatgtgacttcccccattgtaacaaacatcaccattgtttaaaaggctcggaaaaaTATA---TA-GT---CAATTAA-----A-A-CTGCTC-TTGA-G----GGC------T-T-ATTTT---G-C--AC-GT----TA----C--T-GTA-C-A--TA---ATG------AT---------------------T-A-T-T--ACTTAT-CT-T-T-T-A--TA-TT----G-TT-G----A-A-T-A------AA-TTT-TTT---------TTT---------------T-GC--ATT-TG-T---A--CAGAA---A-A--AA------AA-T-ATG---CG-T--A------GT-GT---C----CT--T--------------------A-----TTT--T-------TGG---A-TC--C-A----T---T--A---------A--T-T-----TA--T------------T----T------------C--A-TT------------T-------T---AT---C-A--C---AA--A---A--TAAAC--C-TGA-T------------CCG-------A---A-AA-A-----ATAGATAGAAAAAAAAAATAATAATA------C--GA-A---AA-CGGA----GATT-----TT-----C--------T--TTCC--G-----------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-GCC
gi|22                         :                                                                                                                CCTATAGA-TA-ATGCTCG-TTAA-----GGA-CTGCTT-TTTG-----------------T-TTGTT---G-----------G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--GACCTT-G----C-A-T-GAA--T-A------AC---T-ATCA-T-T-A--TA-TT----G-CTAG----ACA-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---G----T-AA-G-----T--G-T-GC--ATT-TA-T---AA-C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT---CA------GG-GT---C----C---C---A-A--G-----------A-----TGC--C-------TTG-----TT--C-A----T---GACA---------A--T-T-----A----------------T----T------------T--G-AT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGC-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------AA-----C--GA-A---AAACCGA----GGTT-----CC-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--
gi|23                         :                                                                                                                    TG---TA-GT---CGGTTAA-----G-G-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---G-G--CT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-T---AC-TTT-AATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-T--CC------AT-T-TTA---CA-TCCAG-----GG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGA---A-TT--C-A----T---CA-A---------A--T-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------C--------------------------------------------------------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGaaatcgttgagactgaca
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      c-G----A-A-T-AAA--G-AA-TTT-ATTA-A-------------------T--A-T--C--ATT-TGGT---A--A-------A-CAGCCTCATAAAT-T-TTAA--CT-TCCGCGCTATGG-AT---T----CTAAC---ATA--T-----------A-----CAC--C-------TGG---A-TT--C-A----TA--GA-AG--------A--G-TGGTAGAA--T------------T----T------------T--A-TC--TTAA-----ATAG-----T---A----CCA--CCCCAA--A---A--TAAAAA-C-CAA-AAGTGACCACCACCCG-------A---A-AA-ATTCTGA------------------------A------C--GA-A---CA-CCGGAACCGGT------CA-----G--------T--TTTT-CCGA-CT------------GAA--C--CGAAG-CCA-A----AAATATG-TCCT---G-ACACC-TGA
gi|25                         :                                                                                                 ttacagtatttgctagaaaaA---TA-GT---CG-TTAA-----G-A-CTGATTCTTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TT--TT-G-TA----TA-T-GTA-C-A--TG----T---TC--ATCCTTTG----C-A---AAA--T-A-T-T--A---AT-AT---T-T-A--TA-TC----G-CT------A-A-T-A------AA-TTT-ACTA-A---AC-TTT-GA-G-----T--GCT-GC--ATT--G-T---A--C-------A-C--C-------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG--T---C----GT--C---A-A--G-----------A-----AAT--C-------TGG---A-TT--C-A----T---GA-A---------AAAT-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TC--T--------AT-------T---A----C-AACC---AA--A---A--TAAAAAGC-C-A-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---A--CTGG----GTTT-----CA-----G--------T--TTCCGTGAA-C-----------------------------G-A----AAA-A-G-T-CT---G-A-ACCGTGgcaagccac
gi|26                         :                                                                                                                     A---TA-GT---TAATTAG-----A-A-CTCCAC-TTGA-G----AG-------T-T-ATGTT---G-C--TT-GTT-G-CA----T--T-GTA-C-A--TATA-ATG--TT--GTTCTT-A----A-A-T--AA--C-A-T-T--AC--TT-AT-G-T-TTA--CA-TT----G-TT-T----A-A-TTA----A-AA-TTT-ATTA-AG--AA-ATT-GATG-----T--T-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-G--AA------AT-A-TTA---AC-TTCA------GGAGT---C----CT--C---ATA--GT----------A-----TTC--C-------TTG---A-TT--C-A----T---------------------T-----A---------------------T------------T--A-TT--TTC------AT-------C---A----C-A--C---AA--C---A--TATAA--C-CGA-A------------TTG-------A---A-AAAA-----A------------------------A------CA-AA-A---AA-CCAT----GATT-----T------G--------T--TTCC-TGCA-----------------------CGAA--CTG-A----AAA-A
gi|27                         :                                                                                                                             T---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---A-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTG-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--CTT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------TG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--T-A----T---GA-A---------A--T-T-----AA--T-----------------------------------TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAT--C-TGA-A------------CCG----------------A-----A------------------------A------T--GA-A---A----GA-------------TA-----G--------T--TTC-------CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACA
gi|28                         :                                                                                                                          A-GT---CTATTAA-----A-A-CTGCTT-GTGA-G----AGC------T-T-ATGTT---G-C--CC-ATT-G-TG----T--T-GTA-C-A--T-----TG--CC--ATCCTT-A----A-A-T-AAA--T-A-T-T--AC--TT-AT-A-T-T-A--TT-TT----G-TT-G----A-A-T-A----A-AA-TTT-ATCA-G---A------------------G-T-CC--A----G-A---A--A-------A------------GT-T-ATA---T----CA------GG-GT---C----CT--C---A-G--T-----------A-----TTC--C-------TGG---A-GT--A-A----T---TG-A---------A--T-C------A--T------------T----T------------C--ATTT--T--------AT-------C---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------C--------------------------------------------------------T--GA-A---AA-CTGA----GG-T-----CAATAATG--------T--TTCC-TGAA-CT------------GAA--TGGCGAA--CCG-C----AAA-ATA-T-CT---G-A-ACg
gi|29                         :                                                                                                                                                     TT-TCGA-G----AGC------T-T-AAGCT---G-C--CT-GTT-G-TA----T--T-ATA-T-T--CA---ATA--AC--ATA--T-G----T-AAT-AAA--T-A-T-T--A---ATCAC-G-T-T-AATTA-TT-------T-G----A-A-T------G-AA-CTT-ATT-----------T-G-TA-----T--T-T-GT--ATT-TC-T---A--CGGAA---A------------AA-A-TTA---CT---CA------G---T---C----TT--C---G-T--C-----------A-----TTC--T-------TGA---A-TT--C-AA---T---AA-AT--------A--T-T-----AA------------------------------------A-TT--TC-------AT-------C---A----G-G--C---AA--A---G--CAAAA--C-CCA-A------------TCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------------A---AA-TCAA----AATC-----CAC----GACCATT--T--TTCC-T-----C-------------AA--C--TGTA--CCG-A----AAA-ATG-G-GT---G-A-ACCGTGACAtat
gi|3                          :                                                                                                                CCTAT----TA-GT---CTATTAAAA---G-A-CTGCTT-TTTAGA----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TTTGTT-G-TA----T--TTGTA-C-A--TATAAATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GA---T-A-T-T--AC--AT-ATTG-T-T-A--TA-T-----G-CT-G----A-A-T-A----G-AAATTTGATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GCCTGTT-GG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------TG-GTC--C----CT--G---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---C-TTGGA-A----A---GA-A---------A--T-T-----A----------------T----T------------T--A-TTTAT--------AT-------T---A------A--C----A--A---A--TAAAAC-C-CGA-AT-----------CCG-------AT--A-AT-A-----A------------------------A------CCTGATA---AC-CCGA----GGTT-----CA-----GT-------T--TTCC-TGAA-CT------------GGA-------AA--CCG-AT---AAA-ATG-T-CTTGAA-A-ACCGT-ACAgc
gi|30                         :                                                                                                                                     TAA-----G-A--TGCTT-TTTA-------GC------T-T-T-GTT---G-C--TT---T-G--A----T----GTA---A--TA---ATAGATC--ACTCT--G----C-A-T-GA---T-A-T-T--A---AT-AT---T-T-A--TG-------G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-T---AT-CTA-CATG-----T--G---------T-CG-T---A-----------------------------TA---CT-TCCA------GG-AC---G----CT--C---A----------------A-----TA---C-------TGA------T--C-A----T---GA-A---------A----T-----AA---------------T----T------------T--A--T--C--------ATA------T---A----C-A--A---AA--A---C--TAAAA--C-CGATA------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------T--GA-A---AA-C-------GATT-----CA-----------------TTCC-TG-A-TC------------G-A--C--CGAA--CCA-G----AAA-ATG-T-CT---A-A---CGTGAg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                 gcctgtagtactg-GTT-G-TA----T--G-GCG-T-A--TA---ATG--T----------------------------A-T-T--AC--TTTAT-C-T-T-A--CA-TT----G-TT-G----A-AAT-A----A-AA-CTT-ATTA-G---AA-ATT-GATG-----T--T-T-TC--ATT-GT-T---A--C-------A-T--AG------AG-T-ACA---AG-TTCA------AA-AT---C----CT--C--------G-----------C-----TAT--CCTCATAGTGG---A-TT--C-A----T---TG-A---------A--T-T---------T------------T----T------------T--T-CT--T--------TT-------T---AAACAC-A--C---AC--A---A--CAAAA--C-TTA-A------------CCACCTCCACA---ACAA-A-----A------------------------A------T--CA-ACATAA-CCGA----TGTT-----TT-----A--------T--TTCC-GGAA-----------------A--C--CGG-----G-A----AAA-ATG-T-CT-----A-ACTGTagctga
gi|32                         :                                                                                                               tgccATG---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGTTTTGAGT-T-TTG-T---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TT---ATGT-TC--AT-CTT-G----CAA-TAAAA--T-A-T-T--AC--AT-AC-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-GCTGAA-G-T-A----A-GA-TTT--TTA-A---ACGTTT-AATG-----T--G-TGGC--A-T-TG-T---A--C---------C--CC------ATATGTTA---CT-TCTA------GGTGT---T----CT--CA--A-A--G-----------A-----TACG-C-------TTG---A-TT--C-A----T---GA-A---------AT-T-T-----CA--T------------T----T------------TTAA-TC--T--------AA-------T---A----C-A--C----A--A---C--TAAAA--T-AGA-A------------agag
gi|33                         :                                                                                                                                                                                     tatac--TT-GTT-G-CAGCTTT--T-ATC-C-A--TA---TTG--TC--GTCCTT-G----A-A-T-GAA--T-A-G-T--GC--TT-AT-G-T-A-A--TA-TT----G-TT-G----A-A-A-A----A-AA-AAT-ATAAGA---AA-TTG-AATG-----T--T-T-CC--ATT--G-TC--A--C-------A-A--AA------AT-A-A-A---CC-TATA------AG-AC---A----CT--C---A-T--T-----------A-----TTC--T-------TGG---A-CT--C-A----T---TA-A---------A--T-T-----G---T------------T----T------------T--A-TT--TTA------AA-------C---A----C-A--C---AA--C---A--TAAAA--C-AGA-A------------CCC-------A---A-AG-G-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GTTT-----TT-----A--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--TGAA--a
gi|34                         :                                                                                                                    TA---TA-GT---AGATTAA-----A-A-CTCATT-TTGG-G----AGC------T-A-ACGTT---G-C--CT-GTT-G-TA----T------------------ATG--CC--ATTTTT-A----A-A-T-GAA--T-A-T-C--A------------------TA-TT----G-TT-A----A-A-T-A------AA-TTC-AT-----------------G-----T--T-T-GC--AAA-TG-T---A--A-------A-G--AA------AT-A-TTA---CT-TC-A------GG-GT---C----TT--C---A-A--G-----------A-----TGCAAC-------TGC---ACTT--C-AGTCTT---GA-ATTCTTGA--A--T-T-----G---T------------T----T------------T--A-TT--TT-------AT-------A---A----C-A--C---AA--A---A--TATAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-A---------------------------------------------------------------TT-----TT-----G--------T--TTCC-TGAG-GC------------AAA--C--CCAA--acat
gi|35                         :                                                                                                                                                          TA-A----AGC------T-T-GTGTT---G-C--CC-GTT-G-TA----T--T-GTG-C-G--TA---ATA--TC--GTCCTT-A----A-A-T-GGA--C-A-G-T--GC--TT-TTTA-T-T-G--TA-TT----G-TT-----------------G-AA-T------A-G---A-------ATA-----T--A-T-A-----T-TG-T---A--C-------A-G--AA------A------A---AT--CCA------AG-GT---C----CT--------A--G-----------T-----TAT--TAT-----TGG---A-TT--C-A----T---CA---------------------------------------T----T------------TGAA-TT--T--------AT-------C---A----T-A--C---AA--A---A--TAAAAA-C-CGA-A------------CCG-------GG--A-AA-A-----A------------------------A------T--GA-A---AA-TCGA----GGTTTTGTTCA-----GGAGTGTTGT--TTCC-TGAA-a
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cG-GT---T----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-T----T---GA-A---------A--T-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACttgtg
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccatca--T------------T----T------------T--A-TT--T--------ACCCGGTAAT---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------CCG-------A---A-AAAA-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCATGACA
gi|39                         :                                                                                                                      ---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTgc
gi|39                         :                                                                                                                       tctaatT---CGATTAA-----G-A-CTGC-T-TTTA-A----AGC------TGT-TTGTT---G-A--TT--TT-G-TA----T--T-GTAGC-A--TA---ATAT-TC--ATCCTT-G----C---T-GAA--T-A-T-T--cgattaagactgcttttaaagctgtttgttgattttgtattgtagcataatattcatccttgctgaatatt
gi|4                          :                                                                            tctaattagtcgattaagactgctttttaaagctttCCTAT----TA-GT---CTATTAAAA---G-A-CTGCTT-TTTAGA----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TTTGTT-G-TA----T--TTGTA-C-A--TATAAATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GA---T-A-T-T--AC--AT-ATTG-T-T-A--TA-T-----G-CT-G----A-A-T-A----G-AAATTTGATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GCCTGTT-GG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------TG-GTC--C----CT--G---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---C-TTGGA-A----A---GA-A---------A--T-T-----A----------------T----T------------T--A-TTTAT--------AT-------T---A------A--C----A--A---A--TAAAAC-C-CGA-AT-----------CCG-------AT--A-AT-A-----A------------------------A------CCTGATA---AC-CCGA----GGTT-----CA-----GT-------T--TTCC-TGAA-CT------------GGA-------AA--CCG-AT---AAA-ATG-T-CTTGAA-A-ACCGT-ACA
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A--T------------T----T------------T--G-TT--C--------CC-------C---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--AACAG-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------G------C--AA-A---AA-CCCT----AGTT-----T------G--------T--TTCC-TGAAACC------------TAA--C--CAAT--CCG-A----AAA-ATG-TGCT---G-A-ACCGTGACAg
gi|41                         :                                                                                                                      ---TA-GT---CCATTAA-----G-A-CTG-TT-TTTA-A----AGC------T-T-TAGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATa
gi|43                         :                                                                                                                   ccA---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-T
gi|44                         :                                                                         tatgtataggtctaaattttcactatctcacccagagccCCTATACGGTA-GT---CAGTTAAATTAGG-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---GTA--TT-GT
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             ag----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-T---AC-TTT-AATG-----T--G-A-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTT-----AA-----A--------T--TTCC-TGAA-C---------------------CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-AT---G-A-ACCATGACA
gi|5                          :                                                                                                                CCTA-A---TACGT---CTATTAA-----G-A-CTA----TTTC-A----AGC------T-T-TTGTTT--G-A--TT-GTT-GGTA----T--T-GTA-CGA--TT---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-TTGAT--T-A-T-G--AT--AT-AT-GGTGT-A--TA-TT----G-CT-G----A-AAT-A----G-AA-TT--ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--CTTCTG-T---AAAC-------A-C--CC------AT-T-ATA---CT-TCCA------TC-GT---T----CT--C---A-A--G-----------AA----TATT-C-------TGG---A-T---C-A----T---GA-A---------A--T-T-----AT--T------------T----T------------T--AAGT--T--------AT-------T--------C-AG-C---AA--A---AATTAAAA--C-CGA-T------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----TA-----G--------T--TCTC-TGAA-CT------------GAA--C--CGAA--ACG--------A-ATG-T-CT---G-A-ACCG-GACAg
gi|50                         :                                                                                                                     A---TA-GT---CTATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-Tgc
gi|6                          :                                                                                                               agccaTA---TA-GT---CTAT-AA-----A-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTCTTTACA-A--TT-GTT-G-TA----TATT-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AA-TT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-ATT-GGTG-----TTGG-T-GC---TT-TG-T---A--C-------ACC--CC------AT-T-TTA---CT-TCAA------TG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-AT---T---GA-A---------A--T-T-----AAGTT------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------CCG-------------AA-A-----A------------------------A------C--CG-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACA
gi|7                          :                                                                                                                   cTA---TA-GT---CTAT-AA-----A-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTCTTTACA-A--TT-GTT-G-TA----TATT-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AA-TT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-ATT-GGTG-----TTGG-T-GC---TT-TG-T---A--C-------ACC--CC------AT-T-TTA---CT-TCAA------TG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-AT---T---GA-A---------A--T-T-----AAGTT------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------CCG-------------AA-A-----A------------------------A------C--CG-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACAgc
gi|8                          :                                                                                                                 cTAAA---TA-GT---CGGTTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-ACTAAAGC------T-T-TTGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TT---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-T-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--CGTGTTGTA-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG-GT---C----AA--C---A-A--GAT---------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--T-T-----AT--T------------T----T------------G--A-TT--T--------AT-------A---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAG--C-CAA-A------------CCA-------AAACA-AA-A-----A------------------------A------C--AA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T---------------------------GAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACgc
gi|9                          :                                                                                                                          A-GT---CGATGAA-----G-ATCGGCTT-TTTA-A-----GC------T-T-T-GTT---G-A-----GTT-G-TG----TA-T-GTA-C-A--TA---ATG--TATAATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-AGT-C--AC--AT-AT-G-T---A--TA-TTATTCG-GT-G----A-A-T-A----GTAA-TTG-ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--T-T-GC--TTTATG-T---A--C-------A-T--CC------TT-T-TTG---CT-TCAT------GG-GTTCGC----CT--C---A-ATTG-----------A-----TAC--C-------TG----A-TT--C-C----T---GA-A---------AG-T-T-----AA--T------------T----T------------TT-A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-C-A-A------------CCG-----------A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CTGA-----GTC-----TA-----G--------T--TT-C-TG-A-CT------------GAA--C--CGAA--CCG-------AA-ACG-G-TT---G-A-A-CGTGACA


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blockSeqs                     :                                                                                                                      .    .  .         AA    . .      .    . .      .      . .     T   G     .   . .  .    A  T   . . .   TA    T   .       . .    . . .   .  . . . .   .   .  T . . . .   .  .    .  . .    . . . .    .  .   .    . .    .   .    .     .  . .  A    .  . .   A  GGAA    CC    .       . .   .    .    .       .  C   .     .  .   . .  T           A       T  .         .   .  .  . T    .    . G         G  . GGTAGAAT               .    .            T  .  .  TC        A       .   .    . .  .    .  .   .      C  .   . T              AA          .  . .     ACCT                                . .    .    .       .      .     T        .     . GAAACC               .  .     .    . T      .   . .  T   . .
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blockSeqs                     :                                                                                                                      .    .  .         .     . .      .    . .      .      . .     .   A     .   . .  .    .  .   . . .   .     .   .       . .    . . .   .  . . . .   .   .  . . . . .   .  .    .  . .    . . . .    .  .   .    . .    .   .    .     .  . .  A    .  . .   .  .       C     .       . .   .    .    .       .  .   .     .  .   . .  .           .       .  .         .   .  .  . .    .    . .         .  . AAG                    .    .            .  .  .  .         .       .   .    . .  .    .  .   .      .  .   . .              A           .  . .     AC                                  . .    .    .       .      .     .        .     . GAACC                .  .     .    . .      .   . .  .   . .
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blockSeqs                     :                                                                                                                      .    .  .         .     . .      .    . .      .      . .     .   A     .   . .  .    .  .   . . .   .     .   .       . .    . . .   .  . . . .   .   .  . . . . .   .  .    .  . .    . . . .    .  .   .    . .    .   .    .     .  . .  A    .  . .   .  .       T     .       . .   .    .    .       .  .   .     .  .   . .  .           .       .  .         .   .  .  . .    .    . .         .  . TAT                    .    .            .  .  .  .         .       .   .    . .  .    .  .   .      .  .   . .              A           .  . .     AC                                  . .    .    .       .      .     .        .     . GAACC                .  .     .    . .      .   . .  .   . .
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blockSeqs                     :                                                                                                                      .    .  .         .     . .      .    . .      .      . .     .   C     .   . .  .    .  .   . . .   .     .   .       . .    . . .   .  . . . .   .   .  . . . . .   .  .    .  . .    . . . .    .  .   .    . .    .   .    .     .  . .  C    .  . .   .  .       G     .       . .   .    .    .       .  .   .     .  .   . .  .           .       .  .         .   .  .  . .    .    . .         .  . AAT                    .    .            .  .  .  .         .       .   .    . .  .    .  .   .      .  .   . .              A           .  . .     AT                                  . .    .    .       .      .     .        .     . GAACT                .  .     .    . .      .   . .  .   . .
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blockSeqs                     :                                                                                                                      .    .  .         .     . .      .    . .      .      . .     .   A     .   . .  .    .  .   . . .   .     .   .       . .    . . .   .  . . . .   .   .  . . . . .   .  .    .  . .    . . . .    .  .   .    . .    .   .    .     .  . .  C    .  . .   .  .       C     .       . .   .    .    .       .  .   .     .  .   . .  .           .       .  .         .   .  .  . .    .    . .         .  . AA                     .    .            .  .  .  .         .       .   .    . .  .    .  .   .      .  .   . .              A           .  . .     AC                                  . .    .    .       .      .     .        .     . GAA                  .  .     .    . .      .   . .  .   . .
blockSeqs                     :                                                                                                                      .    .  .         .     . .      .    . .      .      . .     .   A     .   . .  .    .  .   . . .   .     .   .       . .    . . .   .  . . . .   .   .  . . . . .   .  .    .  . .    . . . .    .  .   .    . .    .   .    .     .  . .  A    .  . .   .  .       C     .       . .   .    .    .       .  .   .     .  .   . .  .           .       .  .         .   .  .  . .    .    . .         .  . AA                     .    .            .  .  .  .         .       .   .    . .  .    .  .   .      .  .   . .              .           .  . .     AC                                  . .    .    .       .      .     .        .     . CC                   .  .     .    . .      .   . .  .   . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .  .         .     . .      .    . .      .      . .     .   A     .   . .  .    .  .   . . .   .     .   .       . .    . . .   .  . . . .   .   .  . . . . .   .  .    .  . .    . . . .    .  .   .    . .    .   .    .     .  . .  T    .  . .   .  .       C     .       . .   .    .    .       .  .   .     .  .   . .  .           .       .  .         .   .  .  . .    .    . .         .  . GT                     .    .            .  .  .  .         .       .   .    . .  .    .  .   .      .  .   . .              .           .  . .     AC                                  . .    .    .       .      .     .        .     . G                    .  .     .    . .      .   . .  .   . .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .  .         .     . .      .    . .      .      . .     .   A     .   . .  .    .  .   . . .   .     .   .       . .    . . .   .  . . . .   .   .  . . . . .   .  .    .  . .    . . . .    .  .   .    . .    .   .    .     .  . .  .    .  . .   .  .       C     .       . .   .    .    .       .  .   .     .  .   . .  .           .       .  .         .   .  .  . .    .    . .         .  . GT                     .    .            .  .  .  .         .       .   .    . .  .    .  .   .      .  .   . .              .           .  . .     AC                                  . .    .    .       .      .     .        .     . C                    .  .     .    . .      .   . .  .   . .
blockSeqs                     :                                                                                                                              .         .     . .      .    . .      .      . .     .   A     .   . .  .    .  .   . . .   .     .   .       . .    . . .   .  . . . .   .   .  . . . . .   .  .    .  . .    . . . .    .  .   .    . .    .   .    .     .  . .  .    .  . .   .  .       T     .       . .   .    .    .       .  .   .     .  .   . .  .           .       .  .         .   .  .  . .    .    . .         .  . A                      .    .            .  .  .  .         .       .   .    . .  .    .  .   .      .  .   . .              .           .  . .     CC                                  . .    .    .       .      .     .        .     . .                    .  .     .    . .      .   . .  .   . .
blockSeqs                     :                                                                                                                              .         .     . .      .    . .      .      . .     .   A     .   . .  .    .  .   . . .   .     .   .       . .    . . .   .  . . . .   .   .  . . . . .   .  .    .  . .    . . . .    .  .   .    . .    .   .    .     .  . .  .    .  . .   .  .       .     .       . .   .    .    .       .  .   .     .  .   . .  .           .       .  .         .   .  .  . .    .    . .         .  . A                      .    .            .  .  .  .         .       .   .    . .  .    .  .   .      .  .   . .              .           .  . .     C                                   . .    .    .       .      .     .        .     . .                    .  .     .    . .      .   . .  .   . .
blockSeqs                     :                                                                                                                              .         .     . .      .    . .      .      . .     .   .     .   . .  .    .  .   . . .   .     .   .       . .    . . .   .  . . . .   .   .  . . . . .   .  .    .  . .    . . . .    .  .   .    . .    .   .    .     .  . .  .    .  . .   .  .       .     .       . .   .    .    .       .  .   .     .  .   . .  .           .       .  .         .   .  .  . .    .    . .         .  . A                      .    .            .  .  .  .         .       .   .    . .  .    .  .   .      .  .   . .              .           .  . .     C                                   . .    .    .       .      .     .        .     . .                    .  .     .    . .      .   . .  .   . .
blockSeqs                     :                                                                                                                              .         .     . .      .    . .      .      . .     .   .     .   . .  .    .  .   . . .   .     .   .       . .    . . .   .  . . . .                         .    .  . .    . . . .    .  .   .    . .    .   .    .     .  . .  .    .  . .   .  .       .     .       . .   .    .    .       .  .   .     .  .   . .  .           .       .  .         .   .  .  . .    .    . .         .  . T                      .    .            .  .  .  .         .       .   .    . .  .    .  .   .      .  .   . .              .           .  . .     T                                   . .    .    .       .      .     .        .     . .                    .  .     .    . .      .               
blockSeqs                     :                                                                                                                                        .     . .      .    . .      .      . .               .   . .  .    .  .   . . .   .     .   .                                                                 . .    . . . .    .  .   .    . .    .   .    .     .  . .  .    .  . .   .  .       .     .       . .   .    .    .       .  .   .     .  .   . .  .           .       .  .         .   .  .  . .    .    . .         .  . A                      .    .            .  .  .  .         .       .   .    . .  .    .  .   .      .  .   . .              .           .  . .     A                                   . .    .    .       .      .     .        .     . .                    .  .     .                             
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-3254 )     :                                                                                                                CCTATA---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--T-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACA
gi|1                          :                                                                                                                    TA---TA-GT---CTATTTA-----A-A-CT--CT-TTTA-A----AGC------T-T-TTTTT---TTA--TT-GTTTG-TA----C--T-G-G-C-A--TA---ATT--CT--ATCCTT-GGCTAC-T-T-GAA--TTA-TGT--GC--A--AT-C-T-T-A--TAGTT----G-C-------A-A-T-ATTCAG-AA-TGT-ATTA-ATAAAC-TTT-GGTGACTGGT--G-C-GC--CTT-TG-CTTGA--C-------A-C--CC------AT-T-TTGTACCTATATA------GG-GT---C----CT--CCAAA-A--G-----------A-----TAC--CCTA----TGGTATA-TT--C-A----G---GA-A---------AAATAT-----AG--T------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C----A--A---A--TAAAA--C-CG--A------------CTG----------------A-----A------------------------G------T--GA-A---AA-CTGA----GGTTGTC--CA-----G--------TTGTCCC-CGA---C------------GAAGTC--CGAAGTCC-------AAT-ATGTT-CT---GAA-ACCGTGACA
gi|10                         :                                                                                                               agcccTA---CA-GT---CGGTT-----------CTGCTT-CCTA-A----AGC------T-T-TTGTT---G-G--CT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTT-GATA-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCAA------GG-GT---T----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--T-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TT--T---------------------------------------A---A--CAGAA--C-CGA-A------------AAA-------A---A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CCGAACAGTTTCCTGAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACAgc
gi|11                         :                                                                                                             gccCCTATA---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGTTT-TTTA-A----AG-------T-T-TTGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----A-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCTA------GG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TTG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--T-T-----CA--T------------T----T------------T--A-TT--T--------AA-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----A--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---C-A-ACCGTGACAgc
gi|12                         :                                                                                                                    TA---TA-GT---CTATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGA------T-T-TTTTT---T-A--TT-GTT-A-TA----T--T-GTA-T-A--TG---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GGA--T-A-T-T--AC--AT----G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----C-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTT-GGTG-----T--G-T-GC--CTT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------AG-GT---C----TT--C---A-A--G-----------ATACTGTAC--C-------TGG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--T-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------AAAACCCC--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T---------------------------GAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACA
gi|13                         :                                                                                                                 gccTA---TA-GT---CTAT-AA-----A-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTTTT---A-ACATT-GTT-G-TA----TA-T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-ATT-GGTG-----T--G-T-GC---CT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCAA------TG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--CGA----T---GA-A---------A--T-T-----AA--G------------T----T------------T--A--T--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--T-AAA--C-CAA-A------------CCG-------------AA-A-----A------------------------A------C--CG-A---AA-CCGA----GGTTG----CA--------------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA---CG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACAg
gi|14                         :                                                                                                               cCCTATA---TC-G-----GATTAA-----G-A-CTGCTT-TT-A-A----AGC------T-TCTTGTT---G-G--TT-GTT-G-TA----T--T-GAG-C-A--TA---TTG--T---AGCCTT-G----C-A-T-GGA--T-A-T-TTAAC--AA-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-A----A-A-T-A----G-AA-TTT-GTTA-A---AC-TTT-GGTG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--T-T-----AA--T------------T----T------------T--A--T--T--------AA-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------CCG-------A---A-GA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CCGA----AGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-AT--T-CT---G-A-ACCGTGACAgc
gi|15                         :                                                                                                                CCTATA---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T----GTA-C-A--TA---GTG--CC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-T-T-A----G-AA-TTT-ATTT-T---AC-TTT-AATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--TC------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-GT--C-A----T---AA-A---------A--T-T-----CA--T------------T----T------------T--A-TT--T--------AA-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CTA-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--TGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-g
gi|16                         :                                                                                                                   gTA---TA-GT---CTATTAA-----G---CTGCTT-TT-A-A----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T--TTGTA-C-ACTTA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTT-GAAG-----T--G-T-G------------------------------CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------TG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC-----------GG---ATTT--C-A----T---G--A---------A--T-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TT--T--------ATA------A---A----C-A--C---AA--AAAGA--AAAAA--C-CGA-A------------CTG-----------A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CT------------GAA--C--CGGA--CCGAA----AAA-ATG-T-CT---T-A-ACCGTGACA
gi|17                         :                                                                                                                           ccT---CGGTTAA-------A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---A-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ACCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---GC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--ATC-TG-T---A--C-------A-C--CC------AA-T-TTA---CT-TCCA------GG-AT---C------------A-A--G-----------A-----TAC--C-------TAG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--G-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TT--TCGGGTTTTAT-------TTATA----C-A--C---AA--A---AA-TAAAA--C-CGA-A-------------------------------------------------------------------------------AA-CCAA------TT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-AACCGAAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGAGACAg
gi|18                         :                                                                                                                           taT---CGGTTAA-------A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---A-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ACCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---GC-TTTGGATG-----T--G-T-GC--ATC-TG-T---A--C-------A-C--CC------AA-T-TTA---CT-TCCA------GG-A----------T--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TAG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--G-T-----AA--TTTTATTTCGGGTT----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C---------------------------------------------------------------------------C--GA-A---AA-CCGA------TT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGAGACA
gi|19                         :                                                                                                                taTATA---TA-GT---CGGTTAA-----G-A-CTGCTT-TTT--------------------TTGTT---------T-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ACCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-C--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTC-AATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG-GT---C----CC--C---A-A--G-----------A-----TGC--C-------TTG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--T-T-----AT--T------------T----T------------G--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCGA------A---A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CC-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACTATGACAtc
gi|2                          :                                                                                                                  taTA---TA-GT---CTATTAG-----A-AGCTGCTA-TTTA-A-----GA------T-T-TTGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-G-GAAATT-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----GCCT-G----A-A-T-A----G-AA-TTG-ATTA-A---AC-TTT-AATG-----T--G-T-GC--CTT-TG-T---AC-C-------ATC--CC------AT-T-TTA---CT-TCT-------TG-GT---C----CT--C---A-A--GNNNNNNNNNNNN-----NNN--N-------NNN---N-NN--N-N----N---GA-AGATACCTGGA--T-TCATGAAA--T------------TAATTT------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--TGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccA---CC-TCTA------GG-GT---CAGTCTT--C---A-A--G-----------ACAAA-TAC--C-------TA-------T--C-A----TTCCGA-A---------A--T-T-----AA--T------------T----TAATGACAATTTAT--A-TT--T--------AA-------T---G----A-T--C---AATTA---A--TGAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------A--CA-A---A---CG-----GGTT------A-----A--------T--TTCC-TAAAACC------------GAA--C--GAAA--CCG-A----AAA--TG-T-CTT--G-A-ACCGTGAC
gi|21                         : tgcagaaaataaacgcaaatttatatcttactaataaatcttgcatattagaacaataatgtgacttcccccattgtaacaaacatcaccattgtttaaaaggctcggaaaaaTATA---TA-GT---CAATTAA-----A-A-CTGCTC-TTGA-G----GGC------T-T-ATTTT---G-C--AC-GT----TA----C--T-GTA-C-A--TA---ATG------AT---------------------T-A-T-T--ACTTAT-CT-T-T-T-A--TA-TT----G-TT-G----A-A-T-A------AA-TTT-TTT---------TTT---------------T-GC--ATT-TG-T---A--CAGAA---A-A--AA------AA-T-ATG---CG-T--A------GT-GT---C----CT--T--------------------A-----TTT--T-------TGG---A-TC--C-A----T---T--A---------A--T-T-----TA--T------------T----T------------C--A-TT------------T-------T---AT---C-A--C---AA--A---A--TAAAC--C-TGA-T------------CCG-------A---A-AA-A-----ATAGATAGAAAAAAAAAATAATAATA------C--GA-A---AA-CGGA----GATT-----TT-----C--------T--TTCC--G-----------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-GCC
gi|22                         :                                                                                                                CCTATAGA-TA-ATGCTCG-TTAA-----GGA-CTGCTT-TTTG-----------------T-TTGTT---G-----------G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--GACCTT-G----C-A-T-GAA--T-A------AC---T-ATCA-T-T-A--TA-TT----G-CTAG----ACA-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---G----T-AA-G-----T--G-T-GC--ATT-TA-T---AA-C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT---CA------GG-GT---C----C---C---A-A--G-----------A-----TGC--C-------TTG-----TT--C-A----T---GACA---------A--T-T-----A----------------T----T------------T--G-AT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGC-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------AA-----C--GA-A---AAACCGA----GGTT-----CC-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--
gi|23                         :                                                                                                                    TG---TA-GT---CGGTTAA-----G-G-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---G-G--CT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-T---AC-TTT-AATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-T--CC------AT-T-TTA---CA-TCCAG-----GG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGA---A-TT--C-A----T---CA-A---------A--T-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------C--------------------------------------------------------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGaaatcgttgagactgaca
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      c-G----A-A-T-AAA--G-AA-TTT-ATTA-A-------------------T--A-T--C--ATT-TGGT---A--A-------A-CAGCCTCATAAAT-T-TTAA--CT-TCCGCGCTATGG-AT---T----CTAAC---ATA--T-----------A-----CAC--C-------TGG---A-TT--C-A----TA--GA-AG--------A--G-TGGTAGAA--T------------T----T------------T--A-TC--TTAA-----ATAG-----T---A----CCA--CCCCAA--A---A--TAAAAA-C-CAA-AAGTGACCACCACCCG-------A---A-AA-ATTCTGA------------------------A------C--GA-A---CA-CCGGAACCGGT------CA-----G--------T--TTTT-CCGA-CT------------GAA--C--CGAAG-CCA-A----AAATATG-TCCT---G-ACACC-TGA
gi|25                         :                                                                                                 ttacagtatttgctagaaaaA---TA-GT---CG-TTAA-----G-A-CTGATTCTTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TT--TT-G-TA----TA-T-GTA-C-A--TG----T---TC--ATCCTTTG----C-A---AAA--T-A-T-T--A---AT-AT---T-T-A--TA-TC----G-CT------A-A-T-A------AA-TTT-ACTA-A---AC-TTT-GA-G-----T--GCT-GC--ATT--G-T---A--C-------A-C--C-------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG--T---C----GT--C---A-A--G-----------A-----AAT--C-------TGG---A-TT--C-A----T---GA-A---------AAAT-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TC--T--------AT-------T---A----C-AACC---AA--A---A--TAAAAAGC-C-A-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---A--CTGG----GTTT-----CA-----G--------T--TTCCGTGAA-C-----------------------------G-A----AAA-A-G-T-CT---G-A-ACCGTGgcaagccac
gi|26                         :                                                                                                                     A---TA-GT---TAATTAG-----A-A-CTCCAC-TTGA-G----AG-------T-T-ATGTT---G-C--TT-GTT-G-CA----T--T-GTA-C-A--TATA-ATG--TT--GTTCTT-A----A-A-T--AA--C-A-T-T--AC--TT-AT-G-T-TTA--CA-TT----G-TT-T----A-A-TTA----A-AA-TTT-ATTA-AG--AA-ATT-GATG-----T--T-T-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-G--AA------AT-A-TTA---AC-TTCA------GGAGT---C----CT--C---ATA--GT----------A-----TTC--C-------TTG---A-TT--C-A----T---------------------T-----A---------------------T------------T--A-TT--TTC------AT-------C---A----C-A--C---AA--C---A--TATAA--C-CGA-A------------TTG-------A---A-AAAA-----A------------------------A------CA-AA-A---AA-CCAT----GATT-----T------G--------T--TTCC-TGCA-----------------------CGAA--CTG-A----AAA-A
gi|27                         :                                                                                                                             T---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---A-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTG-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--CTT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------TG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--T-A----T---GA-A---------A--T-T-----AA--T-----------------------------------TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAT--C-TGA-A------------CCG----------------A-----A------------------------A------T--GA-A---A----GA-------------TA-----G--------T--TTC-------CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACA
gi|28                         :                                                                                                                          A-GT---CTATTAA-----A-A-CTGCTT-GTGA-G----AGC------T-T-ATGTT---G-C--CC-ATT-G-TG----T--T-GTA-C-A--T-----TG--CC--ATCCTT-A----A-A-T-AAA--T-A-T-T--AC--TT-AT-A-T-T-A--TT-TT----G-TT-G----A-A-T-A----A-AA-TTT-ATCA-G---A------------------G-T-CC--A----G-A---A--A-------A------------GT-T-ATA---T----CA------GG-GT---C----CT--C---A-G--T-----------A-----TTC--C-------TGG---A-GT--A-A----T---TG-A---------A--T-C------A--T------------T----T------------C--ATTT--T--------AT-------C---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------C--------------------------------------------------------T--GA-A---AA-CTGA----GG-T-----CAATAATG--------T--TTCC-TGAA-CT------------GAA--TGGCGAA--CCG-C----AAA-ATA-T-CT---G-A-ACg
gi|29                         :                                                                                                                                                     TT-TCGA-G----AGC------T-T-AAGCT---G-C--CT-GTT-G-TA----T--T-ATA-T-T--CA---ATA--AC--ATA--T-G----T-AAT-AAA--T-A-T-T--A---ATCAC-G-T-T-AATTA-TT-------T-G----A-A-T------G-AA-CTT-ATT-----------T-G-TA-----T--T-T-GT--ATT-TC-T---A--CGGAA---A------------AA-A-TTA---CT---CA------G---T---C----TT--C---G-T--C-----------A-----TTC--T-------TGA---A-TT--C-AA---T---AA-AT--------A--T-T-----AA------------------------------------A-TT--TC-------AT-------C---A----G-G--C---AA--A---G--CAAAA--C-CCA-A------------TCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------------A---AA-TCAA----AATC-----CAC----GACCATT--T--TTCC-T-----C-------------AA--C--TGTA--CCG-A----AAA-ATG-G-GT---G-A-ACCGTGACAtat
gi|3                          :                                                                                                                CCTAT----TA-GT---CTATTAAAA---G-A-CTGCTT-TTTAGA----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TTTGTT-G-TA----T--TTGTA-C-A--TATAAATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GA---T-A-T-T--AC--AT-ATTG-T-T-A--TA-T-----G-CT-G----A-A-T-A----G-AAATTTGATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GCCTGTT-GG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------TG-GTC--C----CT--G---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---C-TTGGA-A----A---GA-A---------A--T-T-----A----------------T----T------------T--A-TTTAT--------AT-------T---A------A--C----A--A---A--TAAAAC-C-CGA-AT-----------CCG-------AT--A-AT-A-----A------------------------A------CCTGATA---AC-CCGA----GGTT-----CA-----GT-------T--TTCC-TGAA-CT------------GGA-------AA--CCG-AT---AAA-ATG-T-CTTGAA-A-ACCGT-ACAgc
gi|30                         :                                                                                                                                     TAA-----G-A--TGCTT-TTTA-------GC------T-T-T-GTT---G-C--TT---T-G--A----T----GTA---A--TA---ATAGATC--ACTCT--G----C-A-T-GA---T-A-T-T--A---AT-AT---T-T-A--TG-------G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-T---AT-CTA-CATG-----T--G---------T-CG-T---A-----------------------------TA---CT-TCCA------GG-AC---G----CT--C---A----------------A-----TA---C-------TGA------T--C-A----T---GA-A---------A----T-----AA---------------T----T------------T--A--T--C--------ATA------T---A----C-A--A---AA--A---C--TAAAA--C-CGATA------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------T--GA-A---AA-C-------GATT-----CA-----------------TTCC-TG-A-TC------------G-A--C--CGAA--CCA-G----AAA-ATG-T-CT---A-A---CGTGAg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                 gcctgtagtactg-GTT-G-TA----T--G-GCG-T-A--TA---ATG--T----------------------------A-T-T--AC--TTTAT-C-T-T-A--CA-TT----G-TT-G----A-AAT-A----A-AA-CTT-ATTA-G---AA-ATT-GATG-----T--T-T-TC--ATT-GT-T---A--C-------A-T--AG------AG-T-ACA---AG-TTCA------AA-AT---C----CT--C--------G-----------C-----TAT--CCTCATAGTGG---A-TT--C-A----T---TG-A---------A--T-T---------T------------T----T------------T--T-CT--T--------TT-------T---AAACAC-A--C---AC--A---A--CAAAA--C-TTA-A------------CCACCTCCACA---ACAA-A-----A------------------------A------T--CA-ACATAA-CCGA----TGTT-----TT-----A--------T--TTCC-GGAA-----------------A--C--CGG-----G-A----AAA-ATG-T-CT-----A-ACTGTagctga
gi|32                         :                                                                                                               tgccATG---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGTTTTGAGT-T-TTG-T---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TT---ATGT-TC--AT-CTT-G----CAA-TAAAA--T-A-T-T--AC--AT-AC-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-GCTGAA-G-T-A----A-GA-TTT--TTA-A---ACGTTT-AATG-----T--G-TGGC--A-T-TG-T---A--C---------C--CC------ATATGTTA---CT-TCTA------GGTGT---T----CT--CA--A-A--G-----------A-----TACG-C-------TTG---A-TT--C-A----T---GA-A---------AT-T-T-----CA--T------------T----T------------TTAA-TC--T--------AA-------T---A----C-A--C----A--A---C--TAAAA--T-AGA-A------------agag
gi|33                         :                                                                                                                                                                                     tatac--TT-GTT-G-CAGCTTT--T-ATC-C-A--TA---TTG--TC--GTCCTT-G----A-A-T-GAA--T-A-G-T--GC--TT-AT-G-T-A-A--TA-TT----G-TT-G----A-A-A-A----A-AA-AAT-ATAAGA---AA-TTG-AATG-----T--T-T-CC--ATT--G-TC--A--C-------A-A--AA------AT-A-A-A---CC-TATA------AG-AC---A----CT--C---A-T--T-----------A-----TTC--T-------TGG---A-CT--C-A----T---TA-A---------A--T-T-----G---T------------T----T------------T--A-TT--TTA------AA-------C---A----C-A--C---AA--C---A--TAAAA--C-AGA-A------------CCC-------A---A-AG-G-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GTTT-----TT-----A--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--TGAA--a
gi|34                         :                                                                                                                    TA---TA-GT---AGATTAA-----A-A-CTCATT-TTGG-G----AGC------T-A-ACGTT---G-C--CT-GTT-G-TA----T------------------ATG--CC--ATTTTT-A----A-A-T-GAA--T-A-T-C--A------------------TA-TT----G-TT-A----A-A-T-A------AA-TTC-AT-----------------G-----T--T-T-GC--AAA-TG-T---A--A-------A-G--AA------AT-A-TTA---CT-TC-A------GG-GT---C----TT--C---A-A--G-----------A-----TGCAAC-------TGC---ACTT--C-AGTCTT---GA-ATTCTTGA--A--T-T-----G---T------------T----T------------T--A-TT--TT-------AT-------A---A----C-A--C---AA--A---A--TATAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-A---------------------------------------------------------------TT-----TT-----G--------T--TTCC-TGAG-GC------------AAA--C--CCAA--acat
gi|35                         :                                                                                                                                                          TA-A----AGC------T-T-GTGTT---G-C--CC-GTT-G-TA----T--T-GTG-C-G--TA---ATA--TC--GTCCTT-A----A-A-T-GGA--C-A-G-T--GC--TT-TTTA-T-T-G--TA-TT----G-TT-----------------G-AA-T------A-G---A-------ATA-----T--A-T-A-----T-TG-T---A--C-------A-G--AA------A------A---AT--CCA------AG-GT---C----CT--------A--G-----------T-----TAT--TAT-----TGG---A-TT--C-A----T---CA---------------------------------------T----T------------TGAA-TT--T--------AT-------C---A----T-A--C---AA--A---A--TAAAAA-C-CGA-A------------CCG-------GG--A-AA-A-----A------------------------A------T--GA-A---AA-TCGA----GGTTTTGTTCA-----GGAGTGTTGT--TTCC-TGAA-a
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cG-GT---T----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-T----T---GA-A---------A--T-T-----AA--T------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CGA-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T------------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACttgtg
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccatca--T------------T----T------------T--A-TT--T--------ACCCGGTAAT---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------CCG-------A---A-AAAA-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCATGACA
gi|39                         :                                                                                                                      ---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTgc
gi|39                         :                                                                                                                       tctaatT---CGATTAA-----G-A-CTGC-T-TTTA-A----AGC------TGT-TTGTT---G-A--TT--TT-G-TA----T--T-GTAGC-A--TA---ATAT-TC--ATCCTT-G----C---T-GAA--T-A-T-T--cgattaagactgcttttaaagctgtttgttgattttgtattgtagcataatattcatccttgctgaatatt
gi|4                          :                                                                            tctaattagtcgattaagactgctttttaaagctttCCTAT----TA-GT---CTATTAAAA---G-A-CTGCTT-TTTAGA----AGC------T-T-TTGTT---G-A--TTTGTT-G-TA----T--TTGTA-C-A--TATAAATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GA---T-A-T-T--AC--AT-ATTG-T-T-A--TA-T-----G-CT-G----A-A-T-A----G-AAATTTGATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GCCTGTT-GG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------TG-GTC--C----CT--G---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---C-TTGGA-A----A---GA-A---------A--T-T-----A----------------T----T------------T--A-TTTAT--------AT-------T---A------A--C----A--A---A--TAAAAC-C-CGA-AT-----------CCG-------AT--A-AT-A-----A------------------------A------CCTGATA---AC-CCGA----GGTT-----CA-----GT-------T--TTCC-TGAA-CT------------GGA-------AA--CCG-AT---AAA-ATG-T-CTTGAA-A-ACCGT-ACA
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A--T------------T----T------------T--G-TT--C--------CC-------C---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--AACAG-A------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------G------C--AA-A---AA-CCCT----AGTT-----T------G--------T--TTCC-TGAAACC------------TAA--C--CAAT--CCG-A----AAA-ATG-TGCT---G-A-ACCGTGACAg
gi|41                         :                                                                                                                      ---TA-GT---CCATTAA-----G-A-CTG-TT-TTTA-A----AGC------T-T-TAGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATa
gi|43                         :                                                                                                                   ccA---TA-GT---CGATTAA-----G-A-CTGCTT-T
gi|44                         :                                                                         tatgtataggtctaaattttcactatctcacccagagccCCTATACGGTA-GT---CAGTTAAATTAGG-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTGTT---GTA--TT-GT
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             ag----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-T---AC-TTT-AATG-----T--G-A-GC--ATT-TG-T---A--C-------A-C--CC------AT-T-TTA---
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTT-----AA-----A--------T--TTCC-TGAA-C---------------------CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-AT---G-A-ACCATGACA
gi|5                          :                                                                                                                CCTA-A---TACGT---CTATTAA-----G-A-CTA----TTTC-A----AGC------T-T-TTGTTT--G-A--TT-GTT-GGTA----T--T-GTA-CGA--TT---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-TTGAT--T-A-T-G--AT--AT-AT-GGTGT-A--TA-TT----G-CT-G----A-AAT-A----G-AA-TT--ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--CTTCTG-T---AAAC-------A-C--CC------AT-T-ATA---CT-TCCA------TC-GT---T----CT--C---A-A--G-----------AA----TATT-C-------TGG---A-T---C-A----T---GA-A---------A--T-T-----AT--T------------T----T------------T--AAGT--T--------AT-------T--------C-AG-C---AA--A---AATTAAAA--C-CGA-T------------CCG-------A---A-AA-A-----A------------------------A------C--GA-A---AA-CCGA----GGTT-----TA-----G--------T--TCTC-TGAA-CT------------GAA--C--CGAA--ACG--------A-ATG-T-CT---G-A-ACCG-GACAg
gi|50                         :                                                                                                                     A---TA-GT---CTATTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-Tgc
gi|6                          :                                                                                                               agccaTA---TA-GT---CTAT-AA-----A-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTCTTTACA-A--TT-GTT-G-TA----TATT-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AA-TT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-ATT-GGTG-----TTGG-T-GC---TT-TG-T---A--C-------ACC--CC------AT-T-TTA---CT-TCAA------TG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-AT---T---GA-A---------A--T-T-----AAGTT------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------CCG-------------AA-A-----A------------------------A------C--CG-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACA
gi|7                          :                                                                                                                   cTA---TA-GT---CTAT-AA-----A-A-CTGCTT-TTTA-A----AGC------T-T-TTCTTTACA-A--TT-GTT-G-TA----TATT-GTA-C-A--TA---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AA-TT-G-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-ATT-GGTG-----TTGG-T-GC---TT-TG-T---A--C-------ACC--CC------AT-T-TTA---CT-TCAA------TG-GT---C----CT--C---A-A--G-----------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-AT---T---GA-A---------A--T-T-----AAGTT------------T----T------------T--A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-CAA-A------------CCG-------------AA-A-----A------------------------A------C--CG-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-TGAA-CC------------GAA--C--CGAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACAgc
gi|8                          :                                                                                                                 cTAAA---TA-GT---CGGTTAA-----G-A-CTGCTT-TTTA-ACTAAAGC------T-T-TTGTT---G-A--TT-GTT-G-TA----T--T-GTA-C-A--TT---ATG--TC--ATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-A-T-T--AC--AT-AT-T-T-T-A--TA-TT----G-CT-G----A-A-T-A----G-AA-TTT-ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--G-T-GC--ATT-TG-T---A--CGTGTTGTA-C--CC------AT-T-TTA---CT-TCCA------GG-GT---C----AA--C---A-A--GAT---------A-----TAC--C-------TGG---A-TT--C-A----T---GA-A---------A--T-T-----AT--T------------T----T------------G--A-TT--T--------AT-------A---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAG--C-CAA-A------------CCA-------AAACA-AA-A-----A------------------------A------C--AA-A---AA-CCGA----GGTT-----CA-----G--------T--TTCC-T---------------------------GAA--CCG-A----AAA-ATG-T-CT---G-A-ACCGTGACgc
gi|9                          :                                                                                                                          A-GT---CGATGAA-----G-ATCGGCTT-TTTA-A-----GC------T-T-T-GTT---G-A-----GTT-G-TG----TA-T-GTA-C-A--TA---ATG--TATAATCCTT-G----C-A-T-GAA--T-AGT-C--AC--AT-AT-G-T---A--TA-TTATTCG-GT-G----A-A-T-A----GTAA-TTG-ATTA-A---AC-TTT-GATG-----T--T-T-GC--TTTATG-T---A--C-------A-T--CC------TT-T-TTG---CT-TCAT------GG-GTTCGC----CT--C---A-ATTG-----------A-----TAC--C-------TG----A-TT--C-C----T---GA-A---------AG-T-T-----AA--T------------T----T------------TT-A-TT--T--------AT-------T---A----C-A--C---AA--A---A--TAAAA--C-C-A-A------------CCG-----------A-AA-A-----A------------------------C------C--GA-A---AA-CTGA-----GTC-----TA-----G--------T--TT-C-TG-A-CT------------GAA--C--CGAA--CCG-------AA-ACG-G-TT---G-A-A-CGTGACA
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|36 ): TTGTTTAATAAAAATGATCAGAAATGGGGTATTGCTATTTTTACCGAAATAAAACTTTAAGGCACTTAATTCTTGGTTTCATTAAATAGCTTTATTTTCACACACAAGATAAATTTGAAACGCCAAAAAAGCG
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Unaligned ( gi|45 ): ACTATGACAGCCCTACCATTTATGTATTAATATAGACCAGTGTTAAATATGACAT
Unaligned ( gi|48 ): AACCCTAAATTAGGCCTTAGTTTCATGAATGTCATTGTCTG
Unaligned ( gi|49 ): TATTTATAAGGTTTCTAAATTTTCAGTACCTCACCTAGAGC