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blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
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originalCons : TATAC-CTC-C-GCTC--A-A-TAT-TGG--G-------TA--AACC-T-CGTC--C--G-G-GT--C-A-------CA-GG-TC-A-----G-GG-G------TTTG-GTAC-TCT
finalCons : TATAC-CTCC--GCTC--A-A-TAT-TGG--G-------TA--AACC-T-CGTC--C--G-G-GT--C-A-------CA-GG-TC-A-----G-GG-G------TTTG-GTAC-TCT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): ATTTAGACCTCGCTCAATCTTGAAGTAAAACTGTGTTCGGATTCCAC
Alignments
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lowQualScore : . ... .. . . . .. ....... .. . . .. .. . . .. . ....... . . . ..... . . ...... . .
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consensus : TATAC-CTC-C-GCTC--A-A-TAT-TGG--G-------TA--AACC-T-CGTC--C--G-G-GT--C-A-------CA-GG-TC-A-----G-GG-G------TTTG-GTAC-TCT
Reference ( family-313 ) : TATAC-CTC-C-GCTC--A-A-TAT-TGG--G-------TA--AACC-T-CGTC--C--G-G-GT--C-A-------CA-GG-TC-A-----G-GG-G------TTTG-GTAC-TCT
gi|1 : TACAC-ATC-CTGCT---A-A-TAT-TGG--GGTTGGGGTA--AACC-T-CGTT--C--G-GAGTCAC-A-------CA-GG-TTAA-----G-GG-G------GTTGTGTAC-TCT
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gi|18 : TAC-CTT-C-GCTC--A-A-TAT-TGC--G-------TA--AATA-T-CGTC--C--G-G-GT--C-A-------CA-GG-TC-AG----G-GG-G------TTTG-GTAC-ga
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): ATTTAGACCTCGCTCAATCTTGAAGTAAAACTGTGTTCGGATTCCAC