lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 11 11111 1 1 44444 1 444444444 66666666666666666666666666 11 33333333333 77777777777777777777777777777 11 1 333333333333333 2222222222 1 1 2222 1111 222 1 1 8888888888888888888888888 1 333333 1 1 1 1 11111 11111 11 1 111 11 111 22222222 55555555555555 11 99999999999999999 111 333333 11 1 22 11 1 1 11 1 111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 1 22222 1111 222 1 11 11 22 999999999999999999999999999999999999999999 11 22 1111111 222 1 111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 444444444444444444444444444 1 2222 1111 111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 33333 11 22222222222222 66666666666666 555555555555555555 222 11111 1 555555555555 22222222 1111 11 3 2222222 22222 1 333 11 44444444444444 7777777777777777777777777777777777777777777 11 55555555 11 555555555555555555 2222222 1111111 11 111111 7777777777777777777 11 111111 111 111 1111111111111 22 11 2222222 11
lowQualScore : 33 88888 3 0 0 99999 0 9 6 2 111111111 44444444444444444444444444 3 33 33333333333 2 11111111111111111111111111111 33 0 2 555555555555555 7777777777 6 0 0 4444 4444 444 0 0 3333333333333333333333333 8 0 888888 0 0 0 0 66666 55555 33 0 0 333 33 2 222 55555555 33333333333333 66 11111111111111111 555 999999 22 7 0 33 33 22 0 0 22 0 444 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5 0 55555 4444 444 2 0 33 44 33 6 0 333333333333333333333333333333333333333333 22 11 6 5555555 6 222 7 0 111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 444444444444444444444444444 4 3 0 3 2 4444 1111 3 5 888888888 5 5 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3 33 88888 33 11111111111111 8 55555555555555 99 1 333333333333333333 7 111 44444 1 222222222222 5 66 5 77777777 5 0000 99 3 8 8 0000000 00000 8 3 6 333 11 77777777777777 8 6666666666666666666666666666666666666666666 11 22222222 44 8 6 6 99 6 111111111111111111 8 8 2222222 8 7777777 999 44 8 777777 0000000000000000000 11 666666 444 8 444 0 9999999999999 0 33 11 5 8 9999999 8 6 8 11 8 88
lowQualScore : .. ..... . . . ..... . . . . ......... .......................... . .. ........... . ............................. .. . . ............... .......... . . . .... .... ... . . ......................... . . ...... . . . . ..... ..... .. . . ... .. . ... ........ .............. .. ................. ... ...... .. . . .. .. .. . . .. . ... .................................................................................... . . ..... .... ... . . .. .. .. . . .......................................... .. .. . ....... . ... . . ... ............................................................ ........................... . . . . . .... .... . . ......... . . .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. . .. ..... .. .............. . .............. .. . .................. . ... ..... . ............ . .. . ........ . .... .. . . . ....... ..... . . . ... .. .............. . ........................................... .. ........ .. . . . .. . .................. . . ....... . ....... ... .. . ...... ................... .. ...... ... . ... . ............. . .. .. . . ....... . . . .. . ..
lowQualScore : 88 55555 2 0 0 88888 0 2 0 5 888888888 00000000000000000000000000 2 88 00000000000 5 22222222222222222222222222222 88 0 5 555555555555555 5555555555 5 0 0 0000 8888 888 0 0 8888888888888888888888888 8 0 888888 0 0 0 0 00000 88888 22 2 0 555 88 0 000 55555555 00000000000000 55 88888888888888888 888 222222 55 0 0 88 88 55 0 0 00 0 888 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 0 00000 8888 000 5 0 88 88 88 5 2 000000000000000000000000000000000000000000 55 77 0 7777777 0 222 0 0 000 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111111111111111111111111 0 2 0 2 5 3333 7777 3 0 888888888 0 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 88 00000 22 22222222222222 0 99999999999999 22 7 444444444444444444 9 000 33333 4 999999999999 0 99 7 99999999 7 0000 00 2 0 0 6666666 00000 0 0 0 000 00 00000000000000 0 8888888888888888888888888888888888888888888 00 00000000 88 0 7 7 22 7 000000000000000000 0 0 2222222 0 2222222 000 00 0 222222 6666666666666666666 00 000000 000 0 000 8 8888888888888 8 44 00 0 0 6666666 0 0 0 00 0 88
consensus : AGGCC--AGCAT---T-TTTTAATT-TTTAGGTTT-ACGAA--CCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAGGAGGAGGAAAT-AA-TAA--AAAAAANA---ACTTTTT---G----------ATACA--TTATC-A-N-T---T-TATTCTGC-----CA-TGT-ACAGTGCAT-TC-ATT-TT--CA-CTGCTC----T---TT-G---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGCCA-CA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GATG-CACAAGACAGT-TGGACAC-----TTAAATT-GTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCA--CAATGGAAGCACATC----TGGACAGTTCC------TATTACA-AATAAT-GAACA----------AT-T---TTGATA--ACATGCTTNT-ATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-CG-AAT-CT-C-A-CCA-T-A-T-N-----GTTA------TT--A-------GAATT---G--GCC--GA-A--TTTTC-G--AA-GTTTTCA-TG-----AAAAGCATCAA-TTA-----AAA-T--GAGTT-C-CAGAAT-AGT--ATGTTGTCCT-CCGAGGG--------------------GCTTTG----------------AAATGATAGTATCTTTGAAAGCATGAC----C-GGAAATAN--GGAG-TT-A-CTATAG--CGTGTTAGT-----A-TT-GT-ATC--TATATTGCAAACTCTTAAAATGACATACTTTCTAT-AACGGGG---ATNA--TTTATATT-GACATNTTTTTCTAT-AACGGGG-GT-CATTTATATTTAT-CAA-G--A----ACT-TACTT-TGGTGG----GGN-GC----CA--GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CT-CA--CAT--CACGG-A--ACATC-A-AATG-CATT-----AC----GC-------TGA-----A----T-----G--GGTTA--TGGG---------AG---TG--CC-TT----------G------T-GT-A-TT--ATG--TACTACT-A-AATA--TC-GCCGA----AT-TG-CA----CGA-CAG---A-ATCCATGGG--C----G----TATG-----TAT---CAT---C--AT-T-------GC-GTTGA--TC-G-----T-TT--CGCT---C-A--TTGGCGGA-T--TTGTA---TTGAC-GT---CGGGG---------TCAATC--TCGCAACCA-T-CAGT-TTTGA-AATA-A--ACGTGTC-AT--CC-CACC-A---AACATGT--CATTGT------ACA---AT---AAAGTCGCCA-G-AAG-----TTG-TTAGTCCT-C--C-----G-A--ACGGG-CAAAAAC-GTTTTCGA-AACG--G-TACTC--CCA-T-CGA-T-GA--T-TTTT-----A-CACTAAAA--CAA--AGCC--------------AT-ACAGATTTTT-CC--AT-CG---ATCG--NTTAT--C-ATA----------AACC--GGAA----ANTACGAGTT-CCGT-AAA-TT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-GGA-AAGA--A-AAAAAA----TCNCCA-AATT-TT-CTCA--ATT---T--TATTT---TTT-TTC---TAAAAATT---C-AA-A----AACTCGAGC-GGC--GGGTT-TG--T--A-AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
Reference ( gi|3 ) : AGGCC--AGCAT---T-TTTTAATT-TTTAGGTTT-AC--A--CCC-CAGAATTATAAAGTCTCGTAGGAGGAGGAAAT-AA-TAAT-AAAAAATA---ACTTTTT---G----------ATACA--TTATC-A-C-T---T-TATTCTGC-----CA-TGT-ACA-------TT-ATTATT--CA-CTGCTC----T---TT-G---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGC-A-CA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GGTG-CACAAGACACT-TGGACA------TTAAATT-GTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCA--CAGTGGAAGCATATC----TGGACAGTTCC-----GTATCA-A-AATAAT-GAACA----------A--C---TTGATA--GCATGCTTCTCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAC-CT-C-A-CCA-T-A-T-G-----ATTA------TT--A-------GAATT---G--GCT--GA-A--TTTTC-G--AA-GTTTTC--TG-----AAAAGCATCAA-TTA-----AAA-T--GAGTT-C-CAGAAT-AGT--ATGCTGTCT--CCGAGGG--------------------GCTTTG----------------AAATGAAAGTATCTTTTGAAACATGAC----C-GGAAATAT--GGAG-TT-A-CTATAG--TATGTTAGT-----ATTT-GT-ATC--TATATTGCAAACTCTTAAAATGACAT--TTTCTAT-AACGGGG---ATCA--TTTATATTCAACATTTTTTTCTAT-AACGGGG-AT-CATTTATATTCAT-CAA-G--A----ACT-TACTT-TGGTTACTTTGGCTGCT---CA--GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--TT-C---CAT--CACGG-A--ACATT-A-AAT--CACT-----AT----G--------TGA-----A----T-----G--CGTTG--TGGG---------AG---TG--CC-TT----------G------T-GT-A-TT--ATG--TAC-AAT-A-AATA--TC-GCCGA----AT-TG-CA----CG--CAG---A-ATCCATGGA--C---TA----CATG-----TAT---CAT---C--AT-T-------GC-GTTG---TC-G-----T-TT--CGC----C-A--TTG-CGGA-T--TTGTA---CTGAC-GT---CGGGG---------TCAATC--TCGCAAC-A-T-CAGT-TTTGA-AATA-A--ACGTGTC-AT--GCACA---A---AACATGT--CATTGT------ACA---A----AAAGTCGCCA-A-AAG-----TTG-TTAGTC---C--C-----G-A--ACGGG-CAAAAAA-GTTTTCGA-AACG--G-TACTC--CCACT-CGA-T-GA--T-TTTT-----A-CATT-AA---CAA--AGCC--------------AT-ACAGATTTCT-CC--A--C----ATCA--GTTGT--C-ATA----------AACC--GGAA----AGT-CGAGTT-TCGT-AAA-TT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-AGA-AAGA--A-AAAAAA----CC-----AGTT-T--CTCA--ATT---T--TATTT---TTT-TTC---TAAAAATT---C-AA-A----AACTCGAGCTGGC--GGGTT-TG--T--ATAAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
gi|1 : AGGCC--AGCATATTT-TTTTAATT-ATTAGGTTTTACGAA--CCC-CAGAATGATAAAGTCCGGTAGGAGGAGGAAAT-AAATAAA-AGAAAATATCAACTTTTT---G----------ATACA--TTATC-AAC-T---T-TATGCTGC-----GAATGT-ACA-------TT-TATATTTACA-CTGCTTCCTTT---TT-GTAAATGCTGGTACTGAATCGAAA--GACTGCC-TTGC---CAA-TATGGCCA-CT-CAA-CAGTTA-CAAT-----AGTCAGGAGGATGGCACAAGACACT-TGGACA------TTTAATTTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCTTG-CCAG-TTCTT-CATCTT-TTCCAGATAGT--AAGCACATC----TGGACAGTTCC------TATTG-ACAATAATTGAACATATGAGATCAA--TCTATTGATAACGCATGCTCC--ATAAATCAGA-GAG-CAG-TA--ATAATTG-TG-AAC-CT-C-A-CCA-TTA-TTG-----ATTA------TTTAA-------GAAT-------GCA--GAGA--ATTTC-G--AAAGTTGTT--TGTATGAAAAAGCATCAAGTTA-----AAAAT--GAGTTTC-CAGAATTAGT--ATTTTGTCTT-CCGAGGG---------------------CTTTG----------------AAATGAA-GTATCTTTGAAAGCATGAC----C-AGAAATATTAGGAG-TTTATCTATAGCTTATGTTAGTTTAATATTTTGTTATC--TAT--TGCAAAT----------AC-----TTCGAT-AA--------ATAA--T--------GACATTTTTTTAT-T-AACGGGG-GTTCATTTATATTCAT-CAATG--AT---ACT-TACTTCTGGTTGCTT-GGCTGCCGTACATTGCCAG-TC-ATA-CAG-TTCTG--CCAC---TAT--CACGG-A--ACATT-TTAATG-CCTT-----AT----T--------TGGCTGATA----TTTGGGG--TGTGG--TGGGT--------AG---GG--CC-TT----------G------T-GTTA-TTTTATAGCTAC-TACGA-AATAGGTCTGCCGATGATAC-TG-CA-----G--T-G---T-ATCTACGGAACC---TT----TATGGCACATAT---CAT---CTAAT-T-------GCTGTGGAA-TC-GCGCTAT-TTACCGC----CCA--TTGGCGGA-TCCTTGTA---TTGAC-GTT--CGGGG---------TCAATCGGTCGCATC-ACT-CAGT----GA-TATATATTACGGTTCTATTAGCAAATC-A---AACATGTTTCATTGTTTTATCATAT--A----AACGTCGTCA-G-AGGAATGTTTGATTAGTC---C--TCTGCAGCA--ACCGG-CAATAAG-GTTT-CGA-A-CGTCG-TACTCTCCCATTTCGAGT-GA--T-TTTTCTGGTATCATT-AATATCAA--AGTCCTATATCACGTATGATTACAGATTTTT-TCTCATCC----ATCG--TTTGT--CGATA----------AACC--GGAAGTTTATT-TGAGGTATCGT-AAAATG-CGAAA--T-CTCGAT------------CTTGGGCC-GA-TGTC-A---AT-TATTCTGTA-CTTC-GGA-AAGG--C-ACAAAA----TCCCA--AATT-TTGCTCA--ATT---T--TATTTATGTTT-TCT---TAAAAATTATTC-AA-A----AACTCG-GTCGGCCGGGGTT-TT--T--A-AAC-CTAAA-AATA-AT-AAGAAA
gi|5 : ttAGGCC--AGCAT---T-TTTTTATA-TTTAGGGTT-ACGAA--CCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAAGAGGAGGAAAT-AA-------AAAAA-A---A----TT---GGGGGGGGGGGATACA--TTATC-A-AGT---T-TATTCTGC-----CA-AGT-ACAGTGTAT-TC-ATT-TT--CA-CTGCTC----T---TTTG---ATGCT----CT----CGAATTAGACT-CC-ATGC---CAA-T--GGCCA-CA-CAA-CAGTTAAAAAT-----AT-------GATT-CACACGACAGT-TGGATA------TTAAATT-GTT-AAT-TTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG----TT-CATCCT-TTCCA--CAATGGGAGCACGTC----TGGACAGTTCCTACATGTATTACG-AACAAG-GAACA----------GT-T---TTGATA--ACATG------ATAA--CAAAGGAG-TATTTA--TGTATTG-TG-AAT-CT-C-G-CCA-T-ATT-GTTCATATTAATGGCTTT--A-------GAATTCTAG--AC----A-A--TTTTC-G--AA-GAATTCA-TGA----AAAAGCATCAA-TTA-----AAA-T--GAGTT-CACA-AAT-AGA--ATGTTGTCT--CCGAAGGACTTTGACAAGTATATCCCTGCTTTA----------------AAATAATAGTACCTTTGAAAGCATGAT----CAGGAAAgatgcctggc
gi|2 : AGGCCTTAGCAT---TATTTTATCTGTTTAGGTGT-AC--GAGCCCGCAGAAT-ATAAAGTCCCGTAGGAGTGAGAAATAAA-CAATAAAAAAACA---AATTTTTTGCG----------ATACAATCTATCAA-C-T---TATATTCTGCATTAACA--GTCATA-------TTCATTCTT--CATCTGCTC----TTCATT-G---ATGCT----CT----CGGAACAGACT-TCATTGTGCGCAAGT--GGC-GCCA-CAACCAGCTTACCATAAGTAAG-------GATG-CACAAGACAATGTGAACACATAAGTTAAATT-GTTCAATGCTCGATCACGTCGGTCT-GCCCAGCTTCTTGCATCCTCTTCCA--CAATTG-AGCACATTGCTGTGAACAGTTTC-----CTATAC-A-AATAAT-AAACA----------ATGT---TTCATA--ACATGCTTGTCATTAA-CAAAAGAG-CA--TAGGTAGATTGTTG-AATACTGCGA-CCAGT-A-T-T-----GGTA------GT--ACTTCACTCAATA---GATGCTAGGA-AAGTTGTCTG--AA-GTTTTCAATG-----AAAAG-AGCAG-TTAATAACAAA-TGGGAGCTAC-CAGAAT-AGTAAATGTTGCCCTGCTGAGGT--------------------GCaag
gi|4 : aGCC--AGCAT---T-TGT-AATT-TTTAGGTTT-ACTAA--CCA-CAGCATTATAAAGTCCCTTAG-AGGAGAGAAT-TT-TAA--AAAAAAGA---ACTTTGT--------------AT-TA--TTATT-A-A-TAACT-TATT--GC-----TA-TGT-ACAGTACATTTC-ATT-TT--CA-TT-CTT----T---TT-C---ATGCT----TT----CGAAACAGAAT-CC-TTG----CAA-T--GTC-A-CATCAA-CATTT----AT-----------------------AGACAGT-TGGACAT-----TTAAATT-GCT-AAT-CTC-ATCAA-T--GTC--G--CAA-TTTCT-CATC---TTTCA--CAATGGAAGCACA-------AGACAGTTCC------TATTACA-AATAAT--AATA----------A--CA--CTGATA--ACATGC-TATAATAAATCAAAAGAGACA--TA--TAAATTG-CATAAT-CT-C-ACCCA-T-A-T-T-----GTTA-------T--A-------GAATT---GCAGAC--AA-A--TT----GGTAA-GTTTTCA-TG-----AAAAG-ATCAA-TTA-----AAA-T--GAGTA-T-CAGAAT-AGT--AT-TTATCC--C----GG--------------------GCTTTGATATTATCCCTCCTTCAAATGATA-CATCTTTGAAAGCATGGC----A-GAAAA-A---GGAG-TT-A-CTATAG---GTGTTA---------TT-AG-ATC----TATTGCAAAC-CTTAAAA-GACATACTTTCTAT--ACGGTC---AT-A--TTTATatcgtgtgacaattgtattcaagtgacttttaaatgttatagatcatttctactgaaagagctatgacaggaaaagggtttctatggtatcattagtatagttcgatccattgccaagaactagttagagatgtacatatacctttcatatattttatcaaggtaacttactttggtgagatgggcagcaagtctataacgttctggttcacatatcaagggaacattccaatcagtgaatcatacgcgtggaaatctggtcgttaatgggagtgtgccttgagtgtattatgtactactaaatatcccgaacgtgacagcgacagatatccatggggcatcatcatttgcatttggttctgcattgcgtgtcactcattggccgatttgtatgccagtcgggggctcatgactcaatctcgcaaccatgcagtgtttgagaattaagtatcattccaatctaacatgtcattggcaataaagtcgccagaagttgttagtcctccgaacgggcaaaaaacgtttgacaacggttctcaccatcgataaatttgtacactaaacaaagccatacagatcttaccacggtaacctaccatacgtgtccaataaccggaagctacgagttccgtaaattccaagaactctcgatcccgattgcaaatttgcacatcggaagataaaaaaatcgtcaaatttgctcaggattacattattttttttctaaaaatgcaaaactcgagcgggccggttctgtaaacctaaataaataaaaaaatagctg
gi|7 : aCTTTG----------------AAATGATGGTATCTTTAAAAGCATGAC----C-AGGAATAA--GGGGCTT-A-CCA-----CATG--AGT-----A-----T-AT-----TACTGCCAACTCTTAAAATGACATACTTTCTAT-AATGGGGGTTATTA--TTTATcaaagaactatacttttgggcagccgtcatacgattctctcacatcacgaacatcaaatgcattacggtgaatggtatgggagtgccttggttatattatactagaatatcgccaaatgcagccgacagccatcgtatatcatttgttaatctgcatttgctcactttgtggaattggtatcatcggatcaatttcgcaaccatcaattttgaattaaacttcattccacaaacatgtatgtacataaagtccagaagttggttagtcctccgaacgcaaaacgtttcgaaacgttactcccatcgatatattttacactaaacaaagccatacagattaccatcatcttatcataaacccaggaaattacgagttccgctaattaacatctcgaccccgatacgaatttaatcggaaaaaaaaaaatcttccaattttctcaatttttttttttcttctaatattcaaaaactcgactgcggttgtaaaaccttataaataaaaaaatgctgc
gi|9 : ctttgacaatttatccctcCTTTG----------------AAATGATGGTATCTTTAAAAGCATGAC----C-AGGAATAA--GGccagaacttactttggagagggcagccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgccttcagtgccttcgtgtattatgtactactaaatatcgccaaatacagcaacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacatgtcatcccacaaatatgtcattgtacatgtacaataaagtcgccaggaatttgttagtcttcggaacgggcaaaaacgtttcga
gi|6 : atatattgtgaatcttgaaatattcttcatattaaaagctttagaattgtagacaattttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaggggctttgacaatttatccctcAAGTATCTTTGAAAGCATTTCAAGGC-AGAAAAAT--GG-G-TT-A-CTATAT--TGTG---GT-----AATT-GTGGTTAGTATATTGTA---T------AT----T--TTTCTATGAACGGGGT--CTCATTTTTTTATTCAA
gi|6 : tattccttttatggtTATATT--GTATATTTTTCTATGAACGGGGTCT-CATTT-T-TTTATTCAA-G--A----ACT-TACTG-TGG-------GG--GC-----A--GCCAGGTC-AT----G-TTCTGGGCT-CA--CATTTCACGG-A--ACATTTA-AATTGCATT-----AT----ACCGCCTGCTGA-----A----TTA---G--GGTTGGGTGGG---------A----TG--CCGTT----------GGTGATTTAGT-ACTT--ATG--TAA-ATT-A-GCTT--TT-G--GT----AT-TG-CAGACCCGATCAG---A-ATC-ATGGG--CATCTAATTCTGTG-----TATTTGCAG---T--AT-T-------GC-GTTGGTCCC-A-----C-TT--TGCGGCTT-A--TTG-CGGA-T--T-GTAGATCTGAA-ATAATCGGG----------TCA-TC--TCGCAACCA-G-CAGT-TTTGA-A-TA-A--TCGTGTC-AT--CCCCAGCCA---AACATGT--CATTGT------AC---------AAAGTCTCCAGA-AAG-----TTG-TTAGTCCTTC--C-----G-A--ATGGATC--AAAC-GTTT--GA-TACG--G-TACgaacttactgtgggggcagccaggtcatgttctgggctcacatttcacggaacatttaaattgcattataccgcctgctgaattagggttgggtgggatgccgttggtgatttagtacttatgtaaattagcttttggtattgcagacccgatcagaatcatgggcatctaattctgtgtatttgcagtattgcgttggtcccactttgcggcttattgcggattgtagatctgaaataatcgggtcatctcgcaaccagcagttttgaataatcgtgtcatccccagccaaacatgtcattgtacaaagtctccagaaagttgttagtccttccgaatggatcaaacgtttgatacggtac
gi|4 : tattccttttatggtaagtatctttgaaagcatttcaaggcagaaaaatgggttactatattgtggtaattgtggttagTTTCTAT-A-CGG---------TCATATTTAT-CAAAG--A----ACTATACTT-T--------TGG--GC-----A--GCC-G-TC-ATA-C-GATTCTC--TC-A---CAT--CACG--A--ACATC-A-AATG-CATT-----AC----GG-------TGA-----A----T-----G---GT-A--TGGG---------AG---TG--CC-TT----------GGT----T-AT-A-TT--AT----AC---T-AGAATA--TC-GCCAA----AT--G-CA-----G--CCG---ACAGCCAT-----------------CG-----TAT----AT---C--AT-T--------T-GTTAA--TCTG-----CATT--TGCT---C-ACTTTG-TGGAAT--TGGTA---T---C-AT---CGGA----------TCAATT--TCGCAACCA-T-CAAT-TTTGA-ATTA-A--AC-T-TC-AT--TC-CAC--A---AACATGT---AT-GT------ACA---T----AAAGTC--CA-G-AAG-----TTGGTTAGTC---CTCC-----G-A--ACG---CAAAACG---TTTCGA-AACG--T-TACTC--CCA-T-CGA-T--A--TATTTT-----A-CACT-AAA--CAA--AGCC--------------AT-ACAGATTAC---C--AT-C----ATC----TTAT--C-ATA----------AACCCAGGAA----ATTACGAGTT-CCGC-TAA-TT--AACA--T-CTCGAC------------C-----CC-GA-TA-CGA---AT-T----TA-A---TC-GGA-AA-A--A-AAAAAATCTTCC-----AATT-TT-CTCA--ATT---T--TTTTT---TTTCTTC---T-AATATT---C-AA-A----AACTCGA-CT-GC--GG--T-TG--T--AAAAC-CTTAT-A--A-ATAAAAAAATGCTG
gi|7 : agccagcatttgtaatttttaggtttactaaccacagcattataaagtcccttagaggagagaattttaaaaaaaagaactttgtattattattaataacttattgctatgtacagtacatttcattttcattctttttcatgctttcgaaacagaatccttgcaatgtcacatcaacatttatagacagttggacatttaaattgctaatctcatcaatgtcgcaatttctcatctttcacaatggaagcacaagacagttcctattacaaataataataacactgataacatgctataataaatcaaaagagacatataaattgcataatctcacccatattgttatagaattgcagacaaattggtaagttttcatgaaaagatcaattaaaatgagtatcagaatagtatttatcccgggctttgatattatccctccttcaaatgatacatctttgaaagcatggcagaaaaaggagttactataggtgttattagatctattgcaaaccttaaaagacatacTTTCTAT-AATGGGG-GT-TATT---ATTTAT-CCA-G--A----ACT-TACTT-TGGAGA---GGGCAGC----CA--GNNNN-NN-NNN-N-N-NNNNN--NN-N---NNN--NNNNN-N--NNNNN-N-NNN--NNNN-----NN----N--------NNN-----N----N-----N--NNNNN--NNNN---------NNNNTTG--CC-TTCAGTGCCTTCG------T-GT-A-TT--ATG--TACTACT-A-AATA--TC-GCCAA----AT-c
gi|2 : ctttgacaatttatccctcctttgaaatgatggtatctttaaaagcatgaccaggaataaggggcttaccacatgagtatattactgccaactcttaaaatgacatacT-CATATAT-TTTAT-CAA-GGTA----ACT-TACTT-TGGTGA-----GATGGG---CA--GCAAG-TCTATAAC-G-TTCTGG-TT-CACATAT--CAAGGGA--ACATT-CCAAT--CAGTGAATCATACGCG--------TGG-----AAATCT-----GGTCGTTAA-TGGG---------AG---TGTGCC-TT----------GAG----T-GT-A-TT--ATG--TACTACT-A-AATA--TC--CCGA----ACGTGACAG---CGA-CAG---ATATCCATGGG-------G----CAT------CAT---CATTTGC--AT-TTGGTTCTGC-ATTG----C-G-----T-GT--CACT---C-A--TTGGCCGA-T--TTGTA----TGCCAGT---CGGGGGCTCATGACTCAATC--TCGCAACCA-TGCAGTGTTTGAGAATT-A--A-GTATC-AT--TC-CA---ATCTAACATGT--CATTG-------GCA---AT---AAAGTCGCCA-G-AAG-----TTG-TTAGTCCT-C--C-----G-A--ACGGG-CAAAAAACGTTT--GACAACG--G-TTCTCA-CCA-T-CGA-TAAA--T-TTGT-----A-CACTAAA---CAA--AGCC--------------AT-ACAGATCTTA-CC--A--CG---GTAA--CCTAC--C-ATACGTGTCCAATAACC--GGAA----GCTACGAGTT-CCGT-AAA-TTCCAAGAACT-CTCGAT------------C-----CC-GATTG-CAA---AT-T----TGCA-CATC-GGA-AGAT--A-AAAAAA----TCGTCA-AATT-TG-CTCAGGATTACAT--TATTT---TTT-TTC---TAAAAATG---C--A-A----AACTCGAGCGGGC--CGGTTCTG--T--A-AAC-CTAAATA--A-AT-AAAAAAacagcaacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacatgtcatcccacaaatatgtcattgtacatgtacaataaagtcgccaggaatttgttagtcttcggaacgggcaaaaacgtttcga
gi|11 : aaggccttagcattattttatctgtttaggtgtacgagcccgcagaatataaagtcccgtaggagtgagaaataaacaataaaaaaacaaattttttgcgatacaatctatcaacttatattctgcattaacagtcatattcattcttcatctgctcttcattgatgctctcggaacagacttcattgtgcgcaagtggcgccacaaccagcttaccataagtaaggatgcacaagacaatgtgaacacataagttaaattgttcaatgctcgatcacgtcggtctgcccagcttcttgcatcctcttccacaattgagcacattgctgtgaacagtttcctatacaaataataaacaatgtttcataacatgcttgtcattaacaaaagagcataggtagattgttgaatactgcgaccagtattggtagtacttcactcaatagatgctaggaaagttgtctgaagttttcaatgaaaagagcagttaataacaaatgggagctaccagaatagtaaatgttgccctgctgaggtgcatcgtgtgacaattgtattcaagtgacttttaaatgttatagatcatttctactgaaagagctatgacaggaaaagggtttctatggtatcattagtatagttcgatccattgccaagaactagttagagatgtacatataccttTATTTAT-CAA-G--ATCGAACT-TACTT-TGGTGG----GGC--------A--GCAAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--GT-C-----------------ACATC-A-AATG-CATT-----AC----GC-------TGA-----A----A-----G--GGTTA--TGGG---------AG---TG--CC-TTG---------G------T-GT-A-TT--ATG--TACTACT-A-AATA--TT-GCCGA----A--TG-CA-----G--CAACATA-ATCCATGG--------G----CAT-------------AT---C--AT-T-------GC-ATTatagctg
gi|10 : aatgacatactttctatT-CAA-G--A----ACT-TACTT-TGGT------GGGGGC-----A--GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CT-CA--CGC--CACGG-A--ATATC-A-AATG-TATT-----AC----GC-------TGA-----A----T-----G--GGTTC--TGGGACTGTCTTCAG---TG--CC-TTG---------G------T-GT-A-TT--ATG--CACTATT-A-AATA--TC-----A----A-----CA----CGA-CAT---A-ATCCATGGG--C----A----TATG-----ATT---TGG---T--ATAT-------AC-CTTG---T--G-----T-TT--TA-------A--TTG-CGGA-T--TTGTA---TTtggt
gi|14 : -CAA-A--T----ACT-TACTT-GGGT------GGGGGC-----A--GCCAG-TC-ATG-C-A-TTCTGC-TT-A---CAT--CACGG-AGCACATC-A-AAT--t
gi|7 : gtcataatttga--ACATGTC-AT--CC-CAC--A---AATATGT--CATTGT------ACATGTACAATAAAGTCGCCAGG-AAT-----TTG-TTAGTCTT-C--G-----G-A--ACGGG-CAAAAAC-G-TTTCGA-gcatttcgtttagtggg
gi|13 : ctttgacaatttatccctcctttgaaatgatggtatctttaaaagcatgaccaggaataaggggcttaccacatgagtatattactgccaactcttaaaatgacatactttctataatgggggttattatttatccagaacttactttggagagggcagccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgccttcagtgccttcgtgtattatgtactactaaatatcgccaaatacagcaacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---AACATGT--CATCG-------ACA---AT---AAAGTC-TCA-G-GAG-----TAG-CTAGTC---CACT-----G-A--ATGGC-CAAATAC-GTTT--GA-AACT--G-TACTC--CCA-T-CGA-T-AA--A-TTTT-----A-TGCTAAA---CAA--AGTC--------------AT-ACAGATCT
gi|16 : CA---AT---AAAGTCGCCA-GGAAG-----TTG-TTAGTCTT-C--G-----G-A--ACGGaccatgataacc
gi|8 : TAGTC---C--TT----G-ACAGCGGG-CAAAAACTGTTTT-GA-AACG--GGTTCTC--CCA-T-GGA-T-GAAAT-TGTT-----A-CACT-AAAC-CAAGAAGCC--------------AT-G-AGACTCTTACC--A--CGGTAATCACCATCGTGAC-A-A----------AACC--GGAA-----GTACGAGTA-TCATGAAA-TT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---ATAT----TG-A-CATC-GAATAAGA--A-AAAATC----CCG----AATT-T--CTCA--ATT---TTATATTT---TTT-TTC---TAAAAATT---CAAA-A----AACTCGAGC--GC--GGGTT-TC--T--A-AAC-CT--A-A--A-AT--AAAAATGCTGcc
gi|15 : --C----ATC---GTTAT--C-AGA----------AACC--GGAA----AATATGAGTT--CGT-AAA-TT-CAAAA--T-gcg
gi|12 : -TT-CAAAA--TTCTCGATTACTTTCTTCAGC-----CCAGA-TG-T-ACAAAT-T----TG-AGCATCTGGG-AAGATAATAAAAAA----TCTCCATAATTGT--TTCA--ATT---T--TATTT---TTT-ATCATATATAAATT---C-AATAAACCAACTCGAGC-GGC--GGTTT-TGAATTAATAACACTAAA-A--ATCT-AAAAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111111 111 22222 4444444444444 11 222222222 222222222 1 22222222 11111 1111111111 111 11 4444444444444444444 11 333333 11 11 1111 333333 11 333333333333333333 11 3333 11 11 1111 111 777777777777777777777777777777777777777 11 11 1111 1 22222 11 111 11 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111 1111 1 1111 333333333333333 1111 11 11111111111 222222 1 11 11111 111111111 4444444444444444444444 11 11 2222222 1111111 111 4444444444444 2222 444444444444444444444444 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222222222222222 3333333333 3333333333333 1111111 1111111111111111 1 11111 1 11111111 22 11 1111111 11111 111 3333333333333 2222 22222222 444444444444444444 111 11 1 444444444444444444 11111 1111 1 222222 111111 111 111 111 1111 11111111
lowQualScore : 77 5 5 000 5 222222 8888 5 88 6 5 8 444 88 8 55555 6666666666666 0 11 777777777 8 555555555 6 8 22222222 77777 8888888888 3 8 8 444 8 11 5 8 8 4444444444444444444 33 3 8 666666 8 8 8 8 11 88 8 88 8 3 8 11 0 7777 8 111111 0 8 0 11 999999999999999999 11 4444 66 3 8 99 11 2222 8 8 000 8 8 1 8 8 888888888888888888888888888888888888888 8 11 5 8 11 7777 88 8 8 0 8 00000 8 11 777 8 11 5 3 8 3 6666666666666666666666666666666666666666666666666666 66 0 5 5 22222 888 0000 5 5 888 9 3 6 6666 6 66 2 111111111111111 3333 33 6 88888888888 6 6 3 222222 4 8 0 1 0 0 8 0 22 00000 4 444444444 4 4 4 6666666666666666666666 4 4 4 4 4 00 4 22 4 66 4 7777 777 4 66 2222222 55 4 6666666 66 222 5 7777777777777 888 66 5 3333 5 66 66 5 88 66 77 999999999999999999999999 5 5 66 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 5 88 5 77 2 000000000000000 5555555555 0 99 4 6 77 77 6 7777777777777 3 8888888 77 0 9999999999999999 5 5 5 22222 0 4 00000000 5 5 5 0 11 5 77 5 77 6 55 6 2222222 66666 6 7 777 99 99 6666666666666 3333 99999999 6 111111111111111111 99 111 99 33 3 5 77 5 000000000000000000 6 6 6 66666 6 4444 3 6 6 6 111111 9 777 6 99 111111 111 6 111 111 6 6 4444 2 99 99 99 6 66666666 6 3 6 99 6 6
lowQualScore : .. . . ... . ...... .... . .. . . . ... .. . ..... ............. . .. ......... . ......... . . ........ ..... .......... . . . ... . .. . . . ................... .. . . ...... . . . . .. .. . .. . . . .. . .... . ...... . . . .. .................. .. .... .. . . .. .. .... . . ... . . . . . ....................................... . .. . . .. .... .. . . . . ..... . .. ... . .. . . . . .................................................... .. . . . ..... ... .... . . ... . . . .... . .. . ............... .... .. . ........... . . . ...... . . . . . . . . .. ..... . ......... . . . ...................... . . . . . .. . .. . .. . .... ... . .. ....... .. . ....... .. ... . ............. ... .. . .... . .. .. . .. .. .. ........................ . . .. ....................................................................... . . .. . .. . ............... .......... . .. . . .. .. . ............. . ....... .. . ................ . . . ..... . . ........ . . . . .. . .. . .. . .. . ....... ..... . . ... .. .. ............. .... ........ . .................. .. ... .. .. . . .. . .................. . . . ..... . .... . . . . ...... . ... . .. ...... ... . ... ... . . .... . .. .. .. . ........ . . . .. . .
lowQualScore : 99 7 7 000 7 111111 3333 7 77 7 6 0 000 88 0 88888 0000000000000 8 00 000000000 0 222222222 0 0 00000000 00000 2222222222 2 0 0 000 0 00 0 0 0 6666666666666666666 00 2 0 444444 0 0 0 0 00 88 0 88 0 2 0 88 8 0000 0 000000 8 0 8 22 000000000000000000 00 6666 44 8 0 00 00 0000 0 0 000 0 0 0 0 0 222222222222222222222222222222222222222 0 00 6 0 00 0000 88 0 0 0 0 00000 0 00 222 0 00 0 2 0 2 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 99 4 0 0 55555 888 6666 0 1 999 8 3 7 2222 7 33 5 555555555555555 2222 33 7 55555555555 7 7 2 222222 0 0 8 0 6 8 0 8 44 11111 4 666666666 4 4 4 4444444444444444444444 4 4 4 4 4 66 4 22 4 11 4 1111 888 4 11 2222222 88 4 7777777 11 888 0 5555555555555 888 99 0 8888 0 99 99 0 44 99 55 999999999999999999999999 0 0 99 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6 7 11 7 99 9 666666666666666 2222222222 8 22 3 7 55 55 7 2222222222222 7 0000000 99 1 9999999999999999 0 6 0 55555 0 4 22222222 0 0 0 1 11 0 99 7 99 7 88 7 5555555 77777 7 3 333 22 22 7777777777777 8888 33333333 7 888888888888888888 22 888 22 00 3 7 99 7 888888888888888888 7 7 7 00000 7 2222 3 7 7 7 888888 8 555 7 22 888888 777 7 777 777 7 7 2222 5 22 22 22 7 22222222 7 5 7 22 7 7
consensus : AGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAA-AAAAAAA----AACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAA-T---T--TATTCTGCCA-TGTACAGT-ATATT-CATT-TTCA-CTGCTC----T---TT-G---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GATG-CACAAGACANT-TGGACAT-----TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAATGG-AAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT-GAACA----------AT-TT--TGATAAC--ATGCTTCTCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAT-CT-C-A-CCA-T-ATTG-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCC--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC-ATG-AAAA-GCATCAA-TTA-----AAA-T--GAGTT-C-CAGAAT-AGT--ATGTTGTCCT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATA-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGAC----C-GGAAATA--AGGAG-TTA-CTATAGC--GT-GTTAGTATT-GT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTATANT-GACATATTTTTCTAT-AACGGGGG-TCATTTATATTTAT-CAA-G--A----ACT-TACTT-TGG-TG-----GG--GG---CA------GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-AT--CACGG-A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CAG-----CGA-CAGA-ATC--CATGGGC-GT--------ATGTAT---CATC--AT-T-GC-GTT-G-GT---------C-G-----T-TT--CG-CTCA-TTGGCGGA-T--TTGTA---TTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAACCAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCATCCC--A-CCAAACATG--TCATTG---TA-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-C-AAAAAC-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CACTAA-A-CAA--AG--CCA-------------TACAGATTTTT--CCATCGATCG-TTATC-AT-------A----------AACC--GGAAA-NTA--CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-GGA-AAGA--A-AAAAAATCTCCA-AATTTT-CTCA--ATT---T--TATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGC-GG--C--GGGTTTG---T-A--AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
Reference ( family-3108 ) : AGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAA-AAAAAAN----AACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAN-T---T--TATTCTGCCA-TGTACAGT-GCATT-CATT-TTCA-CTGCTC----T---TT-G---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GATG-CACAAGACAGT-TGGACAC-----TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAATGG-AAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT-GAACA----------AT-TT--TGATAAC--ATGCTTNT-ATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-CG-AAT-CT-C-A-CCA-T-ATNG-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCC--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC-ATG-AAAA-GCATCAA-TTA-----AAA-T--GAGTT-C-CAGAAT-AGT--ATGTTGTCCT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATA-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGAC----C-GGAAATA--NGGAG-TTA-CTATAGC--GT-GTTAGTATT-GT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AACGGGG---ATNATTTATATT-GACATNTTTTTCTAT-AACGGGGG-TCATTTATATTTAT-CAA-G--A----ACT-TACTT-TGG-TG-----GG--GNGC-CA------GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-AT--CACGG-A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTA--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CA------CGA-CAGA-ATC--CATGGGC-GT--------ATGTAT---CATC--AT-T-GC-GTT-G-AT---------C-G-----T-TT--CG-CTCA-TTGGCGGA-T--TTGTA---TTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAACCAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCATCCC--A-CCAAACATG--TCATTG---TA-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-C-AAAAAC-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CACTAA-AACAA--AG--CCA-------------TACAGATTTTT--CCATCGATCGNTTATC-AT-------A----------AACC--GGAAA-NTA--CGAGTT-CCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-GGA-AAGA--A-AAAAAATCNCCA-AATTTT-CTCA--ATT---T--TATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGC-GG--C--GGGTTTG---T-A--AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
gi|1 : AGGCC--AG-C-ATATTT-TTT--TA--ATT-A--TTAGGTTTTAC-GAACCC-CAGAATGATAAAGTCCGGTAGGAG-GAGG---AAATAAATAA-AAGAAAATATCAACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAACT---T--TATGCTGCGAATGTACATT--TAT---ATT-TACA-CTGCTTCCTTT---TT-GTAAATGCTGGTACTGAATCGAAA--GACTGCC-TTGC---CAA-TATGGCCACT-CAA-CAGTTA-CAAT-----AGTCAGGAGGATGGCACAAGACACT-TGGACAT-----TTAATTTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCTTG-CCAG-TTCTT-CATCTT-TTCCA-GATAGTAAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATTGACAA-TAATTGAACATATGAGATCAAT-CTATTGATAACGCATGCTCC--ATAAATCAGA-GAG-CAG-TA--ATAATTG-TG-AAC-CT-C-A-CCA-TTATTGATT-A-----------TTTAA-------GAAT-------GCA--GAGA--ATTTC-G--AAAGTTGTTTGT-ATG-AAAAAGCATCAAGTTA-----AAAAT--GAGTTTC-CAGAATTAGT--ATTTTGTCTT-CCGAGGG-C------------TT---------TG--------------------A------AATG--A-A-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGAC----C-AGAAATATTAGGAGTTTATCTATAGCTTAT-GTTAGTTTA-AT-ATT--T-T--GTT------ATCT-ATTG-CAA-----ATA---C-TTC-GAT-AA---------------ATAAT-GACATTTTTTTAT-T-AACGGGGGTTCATTTATATTCAT-CAATG--AT---ACT-TACTTCTGGTTGCTT--GG--CTGC-CGTACATTGCCAG-TC-ATA-CAG-TTCTG--C-CACTAT--CACGG-A--ACATT--T-TA---AT-GCCT--TATTTG----GC-TGATATT--T--GG--GGTG--TGGTG-------------GGTAGGG--CC-TT-G--TGTTATTTTATAGCTACT-AC-GAAATAGGTCTGCC----GATGATAC-TG-CAGTGTATCTA-CGGA-ACCTTTATG----GC--------ACATAT---CATCTAAT-T-GCTGTG-GAAT---------C-GCGCTAT-TTACCG-CCCA-TTGGCGGA-TCCTTGTA---TTGAC-GTT---CGGGG---------TCAATCGGTCGCATCACT-CAG----TGA-TATATATT----ACGGTTCTATTAGCAA--A-TCAAACATGTTTCATTGTTTTATCAT-----ATAAACGTCGTCAG-AGGAATGTTTGATTAGTCC-TC--TGCAGCAACCGG-C-AATAA--GGTTTCG--AACGTCG-TACTCTC-CCATTTCGAGT-GA--T-TTTTCTGGTATCATTAATATCAA--AGTCCTATATCACGTATGATTACAGATTTTTTCTCATCCATCGTTTGTCGAT-------A----------AACC--GGAAGTTTATTTGAGGTATCGTAAAATG-CGAAA--T-CTCGAT------------CTTGGGCC-GA-TGTC-A---AT-TATTCTGTA-CTTC-GGA-AAGG--C-ACAAAATC-CCA-AATTTTGCTCA--ATT---T--TATTTATGTTT-TCT---TAAAAATTATTC-AA-A----AACTCGGTC-GG--CCGGGGTTTT---T-A--AAC-CTAAA-AATA-AT-AAGAAA
gi|1 : ttGCC--AGGC-AT---C-TTTCTTATTATT-T--TTAGGTTT-AA-AAACCC-CGGgatgcctggc
gi|10 : ttaggccagcatatttttttaattattaggttttacgaaccccagaatgataaagtccggtaggaggaggaaataaataaaagaaaatatcaactttttgatacattatcaactttatgctgcgaatgtacatttatatttacactgcttcctttttgtaaatgctggtactgaatcgaaagactgccttgccaatatggccactcaacagttacaatagtcaggaggatggcacaagacacttggacatttaatttgttaatctcatcattgtcttgccagttcttcatcttttccagatagtaagcacatctggacagttcctattgacaataattgaacatatgagatcaatctattgataacgcatgctccataaatcagagagcagtaataattgtgaacctcaccattattgattatttaagaatgcagagaatttcgaaagttgtttgtatgaaaaagcatcaagttaaaaatgagtttccagaattagtattttgtcttccgagggctttgaaatgaagtatctttgaaagcatgaccagaaatattaggagtttatctatagcttatgttagtttaatattttgttatctattgcaaatacttcgataaataatgacatttttttattaacgggggttcatttatattcatcaatgatacttacttctggttgcttggctgccgtacattgccagtcatacagttctgccactatcacggaacattttaatgccttatttggctgatatttggggtgtggtgggtagggccttgtgttattttatagctactacgaaataggtctgccgatgatactgcagtgtatctacggaacctttatggcacatatcatctaattgctgtggaatcgcgctatttaccgcccattggcggatccttgtattgacgttcggggtcaatcggtcgcatcactcagtgatatatattacggttctattagcaaatcaaacatgtttcattgttttatcatataaacgtcgtcagaggaatgtttgattagtcctctgcagcaaccggcaataaggtttcgaacgtcgtactctcccatttcgagtgatttttctggtatcattaatatcaaagtcctatatcacgtatgattacagattttttctcatccatcgtttgtcgataaaccggaagtttatttgaggtatcgtaaaatgcgaaatctcgatcttgggccgatgtcaattattctgtacttcggaaaggcacaaaatcccaaattttgctcaattttatttatgttttcttaaaaattattcaaaaactcggtcggT-CAA-G--A----ACT-TACTT-TGG-TG-----GG--GG---CA------GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-GC--CACGG-A--ATA-T--C-AA---AT-GTAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTC--TGG-GACTGTCTTC----AGT---G--CC-TTGG--TG-TA--TTATG--CACT-AT-TAAATA--TC---------A----A-----CA------CGA-CATA-ATC--CATGGGC-AT--------ATGATT---TGGT--ATAT-AC-CTT-G------------T-G-----T-TT------TAA-TT-GCGGA-T--TTGTA---TT
gi|11 : TATTTAT-CAA-G--ATCGAACT-TACTT-TGG-TG-----GG--G----CA------GCAAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--GTCAC-AT------------------C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----A--GG--GTTA--TGG-G-------------AGT---G--CC-TTGG--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TT-GCC----GA----A--TG-CAG-----CAA-CATA-ATC--CATGGGC-AT------------------ATC--AT-T-GC-ATT-t
gi|12 : aatgacatactttctatTT-CAAAA--TTCTCGATTACTTTCTTCAGC-----CCAGA-TG-T-ACAAAT-T----TG-AGCATCTGGG-AAGATAATAAAAAATCTCCATAATTGT-TTCA--ATT---T--TATTT---TTT-ATCATATATAA---ATTC-AATAAACCAACTCGAGC-GG--C--GGTTTTGAATT-AATAACACTAAA-A--ATCT-AAAAAAtggt
gi|13 : tcgtagtataattAACATG--TCATCG----A-CA------ATAAA-GTC-TCAG-GAG-----TAG-CTAGTCC-AC--TG----AATGGC-C-AAATAC-GTTT--GA-AACT--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-AA--A-TTT-----TA-TGCT-A-AACAA--AG--TCA-------------TACAGATCT
gi|14 : G-TCAT--A-ATTTGA-CAA-A--T----ACT-TACTT-GGG-TG-----GG--GG---CA------GCCAG-TC-ATG-C-A-TTCTG--CTTAC-AT--CACGG-AGCACA-T--C-AA---AT-GCAT--TTC-------GT-TTA-G----T--GG--Gaccatgataacc
gi|15 : ATCG-TTATC-AG-------A----------AACC--GGAAA-ATA--TGAGTT--CGT-AAATT-CAAAA--T-
gi|16 : c-CA------ATAAA-GTCGCCAGGAAG-----TTG-TTAGTCT-TC--GG----AACGG
gi|2 : AGGCCTTAG-C-AT---TATTT--TA--TCTGT--TTAGGTGT-AC-GAGCCCGCAGAAT-ATAAAGTCCCGTAGGAGTGAGAAATAAACAA-TAA-AAAAACA----AATTTTTTGCG----------ATACAATCTATCAA-C---TTATATTCTG-CA-TTAACAGTCATATT-CATTCTTCATCTGCTC----TTCATT-G---ATGCT----CT----CGGAACAGACT-TCATTGTGCGCAAGT--GGCGCCA-CAACCAGCTTACCATAAGTAAG-------GATG-CACAAGACAATGTGAACACATAAGTTAAATTGTTCAATGCTCGATCACGTCGGTCT-GCCCAGCTTCTTGCATCCTCTTCCACAATTG--AGCACATTGCTGTGAACAGTTTCC------TA-T-ACAAATAAT-AAACA----------ATGTT--TCATAAC--ATGCTTGTCATTAA-CAAAAGAG-CA--TAGGTAGATTGTTG-AATACTGCGA-CCAGT-ATTG-GT-A-----------GT--ACTTCACTCAATA---GATGCTAGGA-AAGTTGTCTG--AA----GTTTTCAATG-AAAA-G-AGCAG-TTAATAACAAA-TGGGAGCTAC-CAGAAT-AGTAAATGTTGCCCTGCTGAGGTGCATCGTGTGACAATTGTATTCAAGTG--------------------ACTTTTAAATGTTATA-G-ATCATTTCTACTGAAAGAGCTATGAC----A-GGAA--A--AGG-G-TTT-CTATGGT--ATCATTAGTATA-GT--TC--GATCCATTGCCAAGAACTAGTTAGAGATGTACATATACCTTTCATAT-Acc
gi|2 : a-TCATATAT-TTTAT-CAA-GGTA----ACT-TACTT-TGG-TG-----AGATGGGC--A------GCAAG-TCTATAAC-G-TTCTGG-TTCAC-ATATCAAGGGA--ACA-TTCC-AATCAGT-GAATCATAC-------GCGTGG-AAATCT--GGTCGTTAA-TGG-G-------------AGT---GTGCC-TT-GAGTG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC--CC----GA----ACGTGACAG-----CGA-CAGATATC--CATGGG--------------GCAT---CATC--AT-TTGC-ATTTG-GTTCTGCATTGC-G-----T-GT--CA-CTCA-TTGGCCGA-T--TTGTA---T-GCCAG-T---CGGGGGCTCATGACTCAATC--TCGCAACCATGCAGTGTTTGAGAATT-A------A-G----TATCATTCC--AATCTAACATG--TCATTG----G-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-CAAAAAAC-GTTT--GACAACG--G-TT--CTCACCA--TCGA-TAAA--T-TTG-----TA-CACT-A-AACAA--AG--CCA-------------TACAGATCTTA--CCA-CGGTAACCTACC-AT-------ACGTGTCCAATAACC--GGAAG-CTA--CGAGTT-CCGT-AAATTCCAAGAACT-CTCGAT------------C-----CC-GATTG-CAA---AT-T----TGCA-CATC-GGA-AGAT--A-AAAAAATCGTCA-AATTTG-CTCAGGATTACAT--TATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATGC--A-A----AACTCGAGC-GGGCC--GGTTCTG---T-A--AAC-CTAAATA--A-AT-AAAAAAttttatcaaggtaacttactttggtgagatgggcagcaagtctataacgttctggttcacatatcaagggaacattccaatcagtgaatcatacgcgtggaaatctggtcgttaatgggagtgtgccttgagtgtattatgtactactaaatatcccgaacgtgacagcgacagatatccatggggcatcatcatttgcatttggttctgcattgcgtgtcactcattggccgatttgtatgccagtcgggggctcatgactcaatctcgcaaccatgcagtgtttgagaattaagtatcattccaatctaacatgtcattggcaataaagtcgccagaagttgttagtcctccgaacgggcaaaaaacgtttgacaacggttctcaccatcgataaatttgtacactaaacaaagccatacagatcttaccacggtaacctaccatacgtgtccaataaccggaagctacgagttccgtaaattccaagaactctcgatcccgattgcaaatttgcacatcggaagataaaaaaatcgtcaaatttgctcaggattacattattttttttctaaaaatgcaaaactcgagcgggccggttctgtaaacctaaataaataaaaaaatagctg
gi|2 : aaggccttagcattattttatctgtttaggtgtacgagcccgcagaatataaagtcccgtaggagtgagaaataaacaataaaaaaacaaattttttgcgatacaatctatcaacttatattctgcattaacagtcatattcattcttcatctgctcttcattgatgctctcggaacagacttcattgtgcgcaagtggcgccacaaccagcttaccataagtaaggatgcacaagacaatgtgaacacataagttaaattgttcaatgctcgatcacgtcggtctgcccagcttcttgcatcctcttccacaattgagcacattgctgtgaacagtttcctatacaaataataaacaatgtttcataacatgcttgtcattaacaaaagagcataggtagattgttgaatactgcgaccagtattggtagtacttcactcaatagatgctaggaaagttgtctgaagttttcaatgaaaagagcagttaataacaaatgggagctaccagaatagtaaatgttgccctgctgaggtgcatcgtgtgacaattgtattcaagtgacttttaaatgttatagatcatttctactgaaagagctatgacaggaaaagggtttctatggtatcattagtatagttcgatccattgccaagaactagttagagatgtacatataccttC--AG-CTAT---T-TTT--TT--ATT-TATTTAGGTTT-ACAGAACCatagctg
gi|3 : aaggccttagcattattttatctgtttaggtgtacgagcccgcagaatataaagtcccgtaggagtgagaaataaacaataaaaaaacaaattttttgcgatacaatctatcaacttatattctgcattaacagtcatattcattcttcatctgctcttcattgatgctctcggaacagacttcattgtgcgcaagtggcgccacaaccagcttaccataagtaaggatgcacaagacaatgtgaacacataagttaaattgttcaatgctcgatcacgtcggtctgcccagcttcttgcatcctcttccacaattgagcacattgctgtgaacagtttcctatacaaataataaacaatgtttcataacatgcttgtcattaacaaaagagcataggtagattgttgaatactgcgaccagtattggtagtacttcactcaatagatgctaggaaagttgtctgaagttttcaatgaaaagagcagttaataacaaatgggagctaccagaatagtaaatgttgccctgctgaggtgcatcgtgtgacaattgtattcaagtgacttttaaatgttatagatcatttctactgaaagagctatgacaggaaaagggtttctatggtatcattagtatagttcgatccattgccaagaactagttagagatgtacatatacctttcatatattttatcaaggtaacttactttggtgagatgggcagcaagtctataacgttctggttcacatatcaagggaacattccaatcagtgaatcatacgcgtggaaatctggtcgttaatgggagtgtgccttgagtgtattatgtactactaaatatcccgaacgtgacagcgacagatatccatggggcatcatcatttgcatttggttctgcattgcgtgtcactcattggccgatttgtatgccagtcgggggctcatgactcaatctcgcaaccatgcagtgtttgagaattaagtatcattccaatctaacatgtcattggcaataaagtcgccagaagttgttagtcctccgaacgggcaaaaaacgtttgacaacggttctcaccatcgataaatttgtacactaaacaaagccatacagatcttaccacggtaacctaccatacgtgtccaataaccggaagctacgagttccgtaaattccaagaactctcgatcccgattgcaaatttgcacatcggaagataaaaaaatcgtcaaatttgctcaggattacattattttttttctaaaaatgcaaaactcgagcgggccAGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC---ACCC-CAGAATTATAAAGTCTCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAATAAAAAAT----AACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAC-T---T--TATTCTGCCA-TGTACA-------T-TATTATTCA-CTGCTC----T---TT-G---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGC-ACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GGTG-CACAAGACACT-TGGACA------TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAGTGG-AAGCATATC----TGGACAG-TTCCG-----TATC-A-AAATAAT-GAACA----------AC-TT---GATAGC--ATGCTTCTCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAC-CT-C-A-CCA-T-ATGA-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCT--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC--TG-AAAA-GCATCAA-TTA-----AAA-T--GAGTT-C-CAGAAT-AGT--ATGCTGTC-T-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--AAA-GTATC-TTT-----TGAAA---CATGAC----C-GGAAATA--TGGAG-TTA-CTATAGT--AT-GTTAGTATTTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACAT-----TTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTATATTCAACATTTTTTTCTAT-AACGGGGA-TCATTTATATTCAT-CAA-G--A----ACT-TACTT-TGG-TTACTTTGG--CTGCTCA------GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--TTC-C-AT--CACGG-A--ACA-T--T-AA---AT--CAC--TAT-------G--TGA-A----T--GC--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TAC--AA-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CA------CG--CAGA-ATC--CATGGACTAC--------ATGTAT---CATC--AT-T-GC-GTT-G--T---------C-G-----T-TT--CG-C-CA-TTG-CGGA-T--TTGTA---CTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAAC-AT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCATGC---A-CAAAACATG--TCATTG---TA-CA------A-AAA-GTCGCCAA-AAG-----TTG-TTAGTCC-----CG----AACGGG-C-AAAAAA-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCAC-TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CATTAA---CAA--AG--CCA-------------TACAGATTTCT--CCAC--ATCAGTTGTC-AT-------A----------AACC--GGAAA-GT---CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-AGA-AAGA--A-AAAAAA---CCA-G--TTT-CTCA--ATT---T--TATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGCTGG--C--GGGTTTG---T-AT-AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
gi|4 : GCC--AG-C-AT---T-TGT---A--ATT-T--TTAGGTTT-AC-TAACCA-CAGCATTATAAAGTCCCTTAG-AG-GAGA---GAATTT-TAA-AAAAAAG----AACTTTGT-------------AT-TA--TTATTAA-TAACT--TATT--GCTA-TGTACAGT-ACATTTCATT-TTCA-TT-CTT----T---TT-C---ATGCT----TT----CGAAACAGAAT-CC-TTGC----AA-T--G-TCACATCAA-CATTTA---------------------T------AGACAGT-TGGACAT-----TTAAATTGCT-AAT-CTC-ATCAA-T--GTC--G--CAA-TTTCT-CATC---TTTCACAATGG-AAGCACA-------AGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT--AATA----------AC-AC--TGATAAC--ATGCTATA-ATAAATCAAAAGAGACA--TA--TAAATTG-CATAAT-CT-C-ACCCA-T-ATTG-TT-A------------T--A-------GAATT---GCAGAC--AA-A--TT----GGTAA----GTTTTC-ATG-AAAA-G-ATCAA-TTA-----AAA-T--GAGTA-T-CAGAAT-AGT--AT-TTATCCC------GGGC------------TT---------TGATATTATCCCTCCTTC----A------AATG--ATA--CATC-TTT-----GAAAG---CATGG-----C-AGAAA-A--AGGAG-TTA-CTATAG---GT-GT---TATT-AG-ATC----T--ATTGC---AAAC--CTTA-AAA-G-ACATA---CTTTC-TAT--ACGGTC---AT-ATTTAT
gi|4 : a-GACATACTTT-CTAT-A-CGG--------TCATATTTAT-CAAAG--A----ACTATACTT-T---TG-----GG-------CA------GCC-G-TC-ATA-C-GATTCT---CTCAC-AT--CACG--A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GG-TGA-A----T--GG----TA--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-GGTTA-TA--TTAT----ACT-A---GAATA--TC-GCC----AA----AT--G-CAGC----CGA-CAG----C--CAT---C-GT--------AT--------ATC--AT-T--T-GTT-A-AT---------CTG-----CATT--TG-CTCACTTTGTGGAAT--TGGTA---T---C-A-T---CGGA----------TCAATT--TCGCAACCAT-CAAT-TTTGA-ATTA-A------AC-----T-TCATTCC--A-C-AAACATG--T-AT-G---TA-CA-------TAAA-GTC--CAG-AAG-----TTGGTTAGTCC-TC--CG----AACG---C-AAAA-C-GTTT-CGA-AACG--T-TA--CTC-CCA--TCGA-T--A--TATTT-----TA-CACTAA-A-CAA--AG--CCA-------------TACAGATTA----CCATC-ATC--TTATC-AT-------A----------AACCCAGGAAA-TTA--CGAGTT-CCGC-TAATT--AACA--T-CTCGAC------------C-----CC-GA-TA-CGA---AT-T----TA-A---TC-GGA-AA-A--A-AAAAAATCTTCC-AATTTT-CTCA--ATT---T--TTTTT---TTTCTTC---T-AAT---ATTC-AA-A----AACTCGA-C-TG--C--GG--TTG---TAA--AAC-CTTAT-A--A-ATAAAAAAATGCTGcaaagaactatacttttgggcagccgtcatacgattctctcacatcacgaacatcaaatgcattacggtgaatggtatgggagtgccttggttatattatactagaatatcgccaaatgcagccgacagccatcgtatatcatttgttaatctgcatttgctcactttgtggaattggtatcatcggatcaatttcgcaaccatcaattttgaattaaacttcattccacaaacatgtatgtacataaagtccagaagttggttagtcctccgaacgcaaaacgtttcgaaacgttactcccatcgatatattttacactaaacaaagccatacagattaccatcatcttatcataaacccaggaaattacgagttccgctaattaacatctcgaccccgatacgaatttaatcggaaaaaaaaaaatcttccaattttctcaatttttttttttcttctaatattcaaaaactcgactgcggttgtaaaaccttataaataaaaaaatgctgc
gi|5 : agccagcatttgtaatttttaggtttactaaccacagcattataaagtcccttagaggagagaattttaaaaaaaagaactttgtattattattaataacttattgctatgtacagtacatttcattttcattctttttcatgctttcgaaacagaatccttgcaatgtcacatcaacatttatagacagttggacatttaaattgctaatctcatcaatgtcgcaatttctcatctttcacaatggaagcacaagacagttcctattacaaataataataacactgataacatgctataataaatcaaaagagacatataaattgcataatctcacccatattgttatagaattgcagacaaattggtaagttttcatgaaaagatcaattaaaatgagtatcagaatagtatttatcccgggctttgatattatccctccttcaaatgatacatctttgaaagcatggcagaaaaaggagttactataggtgttattagatctattgcaaaccttaaaaAGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TT--ATA-T--TTAGGGTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAAGAG-GAGG---AAATAA---A-AAAAAA-----------TT--GGGGGGGGGGGATACA--TTATCAAGT---T--TATTCTGCCA-AGTACAGT-GTATT-CATT-TTCA-CTGCTC----T---TTTG---ATGCT----CT----CGAATTAGACT-CC-ATGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAAAAAT-----AT-------GATT-CACACGACAGT-TGGATA------TTAAATTGTT-AAT-TTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG----TT-CATCCT-TTCCACAATGG-GAGCACGTC----TGGACAG-TTCCTACATGTATT-ACGAACAAG-GAACA----------GT-TT--TGATAAC--ATG------ATAA--CAAAGGAG-TATTTA--TGTATTG-TG-AAT-CT-C-G-CCA-T-ATTG-TTCATATTAATGGCTTT--A-------GAATTCTAG--AC----A-A--TTTTC-G--AA----GAATTC-ATGAAAAA-GCATCAA-TTA-----AAA-T--GAGTT-CACA-AAT-AGA--ATGTTGT-CT-CCGAAGGAC------------TT---------TGACAAGTATATCCCTGCTTTAA------AATA--ATA-GTACC-TTT-----GAAAG---CATGAT----CAGGAAAc
gi|6 : ATG--GTAAGTATC-TTT-----GAAAG---CATTTCAAGGC-AGAAAAA--TGG-G-TTA-CTATATT--GT-GGTA--ATT-GTGGTTAGTAT--ATTGT---ATATT---------------------TTTC-TATGAACGGGG---aag
gi|6 : tattccttttTATATT-G-TATATTTTTCTATGAACGGGGTCTCATTT-T-TTTATTCAA-G--A----ACT-TACT----G-TG-----GG--GG---CA------GCCAGGTC-AT----G-TTCTGGGCTCAC-ATTTCACGG-A--ACA-T--TTAA---ATTGCAT--TATACCGCCTGC-TGA-A----TTAGG--GTTGGGTGG-G-------------A-T---G--CCGTT-GG-TG-AT--TTA-G--TACTTATGTAAAT---TA-GCTTTTGGT----AT-TG-CAGACC--CGATCAGA-ATC---ATGGGC-ATCTAATTCTGTGTATTTGCAGT--AT-T-GC-GTT-G-GT---------C-CCAC--T-TTG-CGGCTTA-TTG-CGGA-T--T-GTAGATCTGAA-A-TAATCGGG----------TCA-TC--TCGCAACCAG-CAGT-TTTG--AATA-A------TCG----TGTCATCCCCAG-CCAAACATG--TCATTG---TA-C---------AAA-GTCTCCAGAAAG-----TTG-TTAGTCCTTC--CG----AATGGATC---AAAC-GTTT--GA-TACG--G-TA--Ctctcatttttttattcaagaacttactgtgggggcagccaggtcatgttctgggctcacatttcacggaacatttaaattgcattataccgcctgctgaattagggttgggtgggatgccgttggtgatttagtacttatgtaaattagcttttggtattgcagacccgatcagaatcatgggcatctaattctgtgtatttgcagtattgcgttggtcccactttgcggcttattgcggattgtagatctgaaataatcgggtcatctcgcaaccagcagttttgaataatcgtgtcatccccagccaaacatgtcattgtacaaagtctccagaaagttgttagtccttccgaatggatcaaacgtttgatacggtac
gi|7 : tattccttttatggtaagtatctttgaaagcatttcaaggcagaaaaatgggttactatattgtggtaattgtggttagC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATG-GTATC-TTT-----AAAAG---CATGAC----C-AGGAATA--AGGGGCTTA-CCA---C--AT-G--AGTA----T-AT-----T--ACTGC---CAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AATGGGGGTTATTATTTAT
gi|7 : ctttgacaatttatccctcTTAAAAT-GACATACTTT-CTAT-AATGGGGG-TTATT---ATTTAT-CCA-G--A----ACT-TACTT-TGG-AG-----AG--GG---CA------GCCAG-NN-NNN-N-N-NNNNN--NNNNN-NN--NNNNN-N--NNN-N--N-NN---NN-NNNN--NNN-------NN-NNN-N----N--NN--NNNN--NNN-NNNNNNTTGCCTTCAGT---G--CC-TTCG--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----AA----AT--A-CAG-----CAA-CAGA-NNN--NNNNNNN-NN--------NNNNNN---NNNN--NN-N-NN-NNN-N-NN---------N-N-----N-NN--NN-NNNN-NNNNNNNN-N--NNNNN---NNNNN-N-N---NNNNN---------NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNNN-NNNNNNNACA----TGTCATCCC--A-C-AAATATG--TCATTG---TA-CATGTACAATAAA-GTCGCCAGGAAT-----TTG-TTAGTCT-TC--GG----AACGGG-C-AAAAAC-G-TTTCGA-ccagaacttactttggagagggcagccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgccttcagtgccttcgtgtattatgtactactaaatatcgccaaatacagcaacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacatgtcatcccacaaatatgtcattgtacatgtacaataaagtcgccaggaatttgttagtcttcggaacgggcaaaaacgtttcga
gi|8 : ctttgacaatttatccctcctttgaaatgatggtatctttaaaagcatgaccaggaataaggggcttaccacatgagtatattactgccaactcTAGTCC-TTGAC-----AGCGGG-C-AAAAACTGTTTT-GA-AACG--GGTT--CTC-CCA--TGGA-T-GAAAT-TGT-----TA-CACTAA-ACCAAGAAG--CCA-------------TG-AGACTCTTA-CCA-CGGT-AATCACC-ATCGTGACAA----------AACC--GGAA--GTA--CGAGTA-TCATGAAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---ATAT----TG-A-CATC-GAATAAG-----AAAAAATCCCGA-A--TTT-CTCA--ATT---TTATATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATTCAAA-A----AACTCGAGC--G--C--GGGTTTC---T-A--AAC-CT--A-A--A-AT--AAAAATGCTG
gi|9 : C------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATG-GTATC-TTT-----AAAAG---CATGAC----C-AGGAATA--AGGgcg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111111 111 2222 4444444444444 11 22222222 1111111 22222222 11111 1111111111 111 11 4444444444444444444 11 222222 11 11 1111 333333 11 333333333333333333 11 22222 11 11 111 1 777777777777777777777777777777777777777 11 11 1111 1 1 22222 11 11 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111 1111 1 33333333333333333333333333333 1111 11 11111111111 222222 1 1111111111111 111111111 111111 22222222222222 11 11 2222222 1111111 111 4444444444444 2222 2222222222222222 11111111111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222222222222222 3333333333 3333333333333 111111 1111111111111111 1 11111 1 11111111 22 11 1111111 11111 111 3333333333333 222 44444444444444 333333333333333 111 1 444444444444444444 11111 1111 111 222222 1 111111 111 111 111 1111 11111111
lowQualScore : 77 5 5 000 5 222222 8888 5 88 6 5 8 444 88 1 5555 3 6666666666666 0 11 66666666 8 6666666 8 8 22222222 77777 8888888888 3 8 8 444 8 11 5 8 8 4444444444444444444 33 1 8 333333 0 8 8 8 8 11 88 8 88 8 3 8 11 0 7777 8 111111 0 8 0 11 999999999999999999 11 00000 66 0 8 99 11 8 8 8 8 000 6 8 8 888888888888888888888888888888888888888 8 11 5 8 11 7777 88 6 0 8 8 00000 11 8 999 8 11 5 0 8 8 6666666666666666666666666666666666666666666666666666 66 0 5 5 22222 888 0000 2 9 66 4 3 6 11111111111111111111111111111 3333 33 6 88888888888 6 6 3 666666 77 1 5 5 2 999 8888888888888 4 444444444 4 4 222222 22222222222222 9999 4 4 4 4 4 00 4 22 4 66 4 7777 777 4 66 2222222 55 4 6666666 66 222 5 7777777777777 888 66 5 3333 5 66 66 5 88 66 77 2222222222222222 66666666666666 5 66 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 5 9 5 77 2 000000000000000 5555555555 0 99 0 6 77 77 6 7777777777777 3 3 555555 77 0 9999999999999999 5 5 5 22222 0 4 00000000 5 5 5 0 11 5 77 5 77 6 55 6 2222222 66666 6 6 6 111 99 6666666666666 1 000 11111111111111 6 444444444444444 99 111 99 3 6 3 5 77 5 000000000000000000 6 6 6 66666 6 4444 999 6 6 111111 5 6 3 6 99 111111 111 6 111 111 6 6 4444 2 99 99 99 6 66666666 6 3 6 99 6 6
lowQualScore : .. . . ... . ...... .... . .. . . . ... .. . .... . ............. . .. ........ . ....... . . ........ ..... .......... . . . ... . .. . . . ................... .. . . ...... . . . . . .. .. . .. . . . .. . .... . ...... . . . .. .................. .. ..... .. . . .. .. . . . . ... . . . ....................................... . .. . . .. .... .. . . . . ..... .. . ... . .. . . . . .................................................... .. . . . ..... ... .... . . .. . . . ............................. .... .. . ........... . . . ...... .. . . . . ... ............. . ......... . . ...... .............. .... . . . . . .. . .. . .. . .... ... . .. ....... .. . ....... .. ... . ............. ... .. . .... . .. .. . .. .. .. ................ .............. . .. ........................................................................ . . . . .. . ............... .......... . .. . . .. .. . ............. . . ...... .. . ................ . . . ..... . . ........ . . . . .. . .. . .. . .. . ....... ..... . . . ... .. ............. . ... .............. . ............... .. ... .. . . . . .. . .................. . . . ..... . .... ... . . ...... . . . . .. ...... ... . ... ... . . .... . .. .. .. . ........ . . . .. . .
lowQualScore : 99 7 7 000 7 111111 3333 7 77 7 6 0 000 88 0 0000 2 0000000000000 8 00 00000000 0 0000000 0 0 00000000 00000 2222222222 2 0 0 000 0 00 0 0 0 6666666666666666666 00 0 0 888888 8 0 0 0 0 00 88 0 88 0 2 0 88 8 0000 0 000000 8 0 8 22 000000000000000000 00 00000 44 8 0 00 00 0 0 0 0 000 0 0 0 222222222222222222222222222222222222222 0 00 6 0 00 0000 88 0 0 0 0 00000 00 0 222 0 00 0 0 0 2 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 99 4 0 0 55555 888 6666 0 5 99 2 3 7 33333333333333333333333333333 2222 33 7 55555555555 7 7 2 666666 99 0 7 7 0 000 0000000000000 4 666666666 4 4 888888 22222222222222 4444 4 4 4 4 4 66 4 22 4 11 4 1111 888 4 11 2222222 88 4 7777777 11 444 0 5555555555555 888 99 0 8888 0 99 99 0 44 99 55 0000000000000000 99999999999999 0 99 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 6 7 4 7 99 9 666666666666666 2222222222 8 22 2 7 55 55 7 2222222222222 7 7 555555 99 1 9999999999999999 0 6 0 55555 0 4 22222222 0 0 0 1 11 0 99 7 99 7 88 7 5555555 77777 7 7 7 777 22 7777777777777 7 444 66666666666666 7 333333333333333 22 888 22 2 7 3 7 99 7 888888888888888888 7 7 7 00000 7 2222 222 7 7 888888 3 7 2 7 22 888888 777 7 777 777 7 7 2222 5 22 22 22 7 22222222 7 5 7 22 7 7
consensus : AGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAAAAAAAAAT---AACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAA-T---T--TATTCTGCCA-TGTACAGT-ATATT-CATT-TTCA-CTGCTC----T---TT-G---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GATG-CACAAGACANT-TGGACAT-----TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAATGG-AAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT-GAACA----------AT-TT--TGATAAC--ATGCTTNTCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAT-CT-C-A-CCA-TATTG-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCC--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC-ATGAAAAAGCATCAA-TT-A-----AAAT--GAG-TT-C-CAGAA-TAGT--ATGTTGTCCT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATA-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGAC----CAGAAATA--AGGAG-TTA-CTATAGC--GT-GTTAGTA-TTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTAT--AAT-GAC-ATACTTTTCTAT-AACGGGGG-TCATTTATATTTAT-CAA-G--A----ACT-TACTT-TGG------TGG---G---G-----GCA----GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-AT--CACGG-A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CAG---C-G-----A-CAGA-ATC--CATGGGC-GT--------ATGTAT---CATC--AT-T-GCG-TT-GG--T---------C-G-----T-TT--CG-CTCA-TTGGCGGA-T--TTGTA---TTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAACCAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCATCCC--A-CCAAACATG--TCATTG---TA-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-C-AAAAAC-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATTTTT--CCATCG---AT--C-G-TTATC-AT----A----------AACC--GGAAA-NTA--CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-GGA-AAGA--A-AAAAAATC-CCA-AATTTT-CTCA--ATT---T--TATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGC-GG--C--GGGTTTG---T-A--AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
Reference ( family-3108 ) : AGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAAAAAAAAA----AACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAA-T---T--TATTCTGCCA-TGTACAGT-ATATT-CATT-TTCA-CTGCTC----T---TT-G---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GATG-CACAAGACANT-TGGACAT-----TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAATGG-AAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT-GAACA----------AT-TT--TGATAAC--ATGCTTCTCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAT-CT-C-A-CCA-TATTG-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCC--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC-ATG-AAAAGCATCAA-TT-A-----AAAT--GAG-TT-C-CAGAA-TAGT--ATGTTGTCCT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATA-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGAC----CGGAAATA--AGGAG-TTA-CTATAGC--GT-GTTAGTA-TTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTAT--ANT-GAC-ATATTTTTCTAT-AACGGGGG-TCATTTATATTTAT-CAA-G--A----ACT-TACTT-TGG------TGG---G---G-----GCA----GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-AT--CACGG-A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CAG---C-G-----A-CAGA-ATC--CATGGGC-GT--------ATGTAT---CATC--AT-T-GCG-TT-GG--T---------C-G-----T-TT--CG-CTCA-TTGGCGGA-T--TTGTA---TTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAACCAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCATCCC--A-CCAAACATG--TCATTG---TA-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-C-AAAAAC-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATTTTT--CCATCG---AT--C-G-TTATC-AT----A----------AACC--GGAAA-NTA--CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-GGA-AAGA--A-AAAAAATCTCCA-AATTTT-CTCA--ATT---T--TATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGC-GG--C--GGGTTTG---T-A--AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
gi|1 : AGGCC--AG-C-ATATTT-TTT--TA--ATT-A--TTAGGTTTTAC-GAACCC-CAGAATGATAAAGTCCGGTAGGAG-GAGG---AAATAAATAAAAGAAAATATCAACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAACT---T--TATGCTGCGAATGTACATT--TAT---ATT-TACA-CTGCTTCCTTT---TT-GTAAATGCTGGTACTGAATCGAAA--GACTGCC-TTGC---CAA-TATGGCCACT-CAA-CAGTTA-CAAT-----AGTCAGGAGGATGGCACAAGACACT-TGGACAT-----TTAATTTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCTTG-CCAG-TTCTT-CATCTT-TTCCA-GATAGTAAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATTGACAA-TAATTGAACATATGAGATCAAT-CTATTGATAACGCATGCTCC--ATAAATC-AGAGAG-CAG-TA--ATAATTG-TG-AAC-CT-C-A-CCATTATTGATT-A-----------TTTAA-------GAAT-------GCA--GAGA--ATTTC-G--AAAGTTGTTTGT-ATGAAAAAGCATCAAGTTAA-----AAAT--GAGTTT-C-CAGAATTAGT--ATTTTGTCTT-CCGA-GGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--A-A-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGAC----CAGAAATATTAGGAGTTTATCTATAGCTTAT-GTTAGTT-TAAT-ATT--T-T--GTT------ATCT-ATTG-CAA-----ATA---C-TTC-GAT-AA---------------AT--AAT-GAC-ATTTTTTTAT-T-AACGGGGGTTCATTTATATTCAT-CAATG--AT---ACT-TACTTCTGG------TTGCTTG---GCTGCCGTACATTGCCAG-TC-ATA-CAG-TTCTG--C-CACTAT--CACGG-A--ACATT--T-TA---AT-GCCT--TATTTG----GC-TGATATT--T--GG--GGTG--TGGTG-------------GGTAGGG--CC-TT-G--TGTTATTTTATAGCTACT-AC-GAAATAGGTCTGCC----GATGATAC-TG-CAG---T-GTATCTA-CGGA-ACCTTTATG----GC--------ACATAT---CATCTAAT-T-GCT-GT-GGAAT---------C-GCGCTAT-TTACCG-CCCA-TTGGCGGA-TCCTTGTA---TTGAC-GTT---CGGGG---------TCAATCGGTCGCATCACT-CAG----TGA-TATATATT----ACGGTTCTATTAGCAA--A-TCAAACATGTTTCATTGTTTTATCAT-----ATAAACGTCGTCAG-AGGAATGTTTGATTAGTCC-TC--TGCAGCAACCGG-C-AATAA--GGTTTCG--AACGTCG-TACTCTC-CCATTTCGAGT-GA--T-TTTTCTGGTATCATTAATATC---AAAGTCCTATATCACGTATGATTACAGATTTTTTCTCATCC---AT--C-GTTTGTCGAT----A----------AACC--GGAAGTTTATTTGAGGTATCGTAAAATG-CGAAA--T-CTCGAT------------CTTGGGCC-GA-TGTC-A---AT-TATTCTGTA-CTTC-GGA-AAGG--C-ACAAAATC-CCA-AATTTTGCTCA--ATT---T--TATTTATGTTT-TCT---TAAAAATTATTC-AA-A----AACTCGGTC-GG--CCGGGGTTTT---T-A--AAC-CTAAA-AATA-AT-AAGAAA
gi|1 : ttGCC--AGGC-AT---C-TTTCTTATTATT-T--TTAGGTTT-AA-AAACCC-CGGgatgcctggc
gi|10 : ttaggccagcatatttttttaattattaggttttacgaaccccagaatgataaagtccggtaggaggaggaaataaataaaagaaaatatcaactttttgatacattatcaactttatgctgcgaatgtacatttatatttacactgcttcctttttgtaaatgctggtactgaatcgaaagactgccttgccaatatggccactcaacagttacaatagtcaggaggatggcacaagacacttggacatttaatttgttaatctcatcattgtcttgccagttcttcatcttttccagatagtaagcacatctggacagttcctattgacaataattgaacatatgagatcaatctattgataacgcatgctccataaatcagagagcagtaataattgtgaacctcaccattattgattatttaagaatgcagagaatttcgaaagttgtttgtatgaaaaagcatcaagttaaaaatgagtttccagaattagtattttgtcttccgagggctttgaaatgaagtatctttgaaagcatgaccagaaatattaggagtttatctatagcttatgttagtttaatattttgttatctattgcaaatacttcgataaataatgacatttttttattaacgggggttcatttatattcatcaatgatacttacttctggttgcttggctgccgtacattgccagtcatacagttctgccactatcacggaacattttaatgccttatttggctgatatttggggtgtggtgggtagggccttgtgttattttatagctactacgaaataggtctgccgatgatactgcagtgtatctacggaacctttatggcacatatcatctaattgctgtggaatcgcgctatttaccgcccattggcggatccttgtattgacgttcggggtcaatcggtcgcatcactcagtgatatatattacggttctattagcaaatcaaacatgtttcattgttttatcatataaacgtcgtcagaggaatgtttgattagtcctctgcagcaaccggcaataaggtttcgaacgtcgtactctcccatttcgagtgatttttctggtatcattaatatcaaagtcctatatcacgtatgattacagattttttctcatccatcgtttgtcgataaaccggaagtttatttgaggtatcgtaaaatgcgaaatctcgatcttgggccgatgtcaattattctgtacttcggaaaggcacaaaatcccaaattttgctcaattttatttatgttttcttaaaaattattcaaaaactcggtcggT-CAA-G--A----ACT-TACTT-TGG------TGG---G---G-----GCA----GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-GC--CACGG-A--ATA-T--C-AA---AT-GTAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTC--TGG-GACTGTCTTC----AGT---G--CC-TTGG--TG-TA--TTATG--CACT-AT-TAAATA--TC---------A----A-----CA----C-G-----A-CATA-ATC--CATGGGC-AT--------ATGATT---TGGT--ATAT-ACC-TT-G-------------T-G-----T-TT------TAA-TT-GCGGA-T--TTGTA---TT
gi|11 : --AAT-GAC-ATACTTT-CTAT-----------------TATTTAT-CAA-G--ATCGAACT-TACTT-TGG------TGG---G---G------CA----GCAAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--GTCAC-AT------------------C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----A--GG--GTTA--TGG-G-------------AGT---G--CC-TTGG--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TT-GCC----GA----A--TG-CAG---C-A-----A-CATA-ATC--CATGGGC-AT------------------ATC--AT-T-GCATTT-GG--T---------t
gi|12 : TT-CAAAA--TTCTCGATTACTTTCTTCAGC-----CCAGA-TG-T-ACAAAT-T----TG-AGCATCTGGG-AAGATAATAAAAAATCTCCATAATTGT-TTCA--ATT---T--TATTT---TTT-ATCATATATAA---ATTC-AATAAACCAACTCGAGC-GG--C--GGTTTTGAATT-AATAACACTAAA-A--ATCT-AAAAAA
gi|13 : tcgtagtataattAACATG--TCATCG----A-CA------ATAAA-GTC-TCAG-GAG-----TAG-CTAGTCC-AC--TG----AATGGC-C-AAATAC-GTTT--GA-AACT--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-AA--A-TTT-----TA-TGCTAA-A-C---AAAG--TCA-------------TACAGATCT
gi|14 : G-TCAT--A-ATTTGA-CAA-A--T----ACT-TACTT-GGG------TGG---G---G-----GCA----GCCAG-TC-ATG-C-A-TTCTG--CTTAC-AT--CACGG-AGCACA-T--C-AA---AT-GCAT--TTC-------GT-TTA-G----T--GG--Gaccatgataacc
gi|15 : ---AT--C-G-TTATC-AG----A----------AACC--GGAAA-ATA--TGAG-T-TCGT-AAATT-CAAAA--T-
gi|16 : c-CA------ATAAA-GTCGCCAGGAAG-----TTG-TTAGTCT-TC--GG----AACGG
gi|2 : AGGCCTTAG-C-AT---TATTT--TA--TCTGT--TTAGGTGT-AC-GAGCCCGCAGAAT-ATAAAGTCCCGTAGGAGTGAGAAATAAACAA-TAAAAAAACA----AATTTTTTGCG----------ATACAATCTATCAA-C---TTATATTCTG-CA-TTAACAGTCATATT-CATTCTTCATCTGCTC----TTCATT-G---ATGCT----CT----CGGAACAGACT-TCATTGTGCGCAAGT--GGCGCCA-CAACCAGCTTACCATAAGTAAG-------GATG-CACAAGACAATGTGAACACATAAGTTAAATTGTTCAATGCTCGATCACGTCGGTCT-GCCCAGCTTCTTGCATCCTCTTCCACAATTG--AGCACATTGCTGTGAACAGTTTCC------TA-T-ACAAATAAT-AAACA----------ATGTT--TCATAAC--ATGCTTGTCATTAA-CAAAAGAG-CA--TAGGTAGATTGTTG-AATACTGCGA-CCAGTATTG-GT-A-----------GT--ACTTCACTCAATA---GATGCTAGGA-AAGTTGTCTG--AA----GTTTTCAATG-AAAAG-AGCAG-TT-AATAACAAATGGGAG-CTAC-CAGAA-TAGTAAATGTTGCCCTGCTGAGGTGCATCGTGTGACAATTGTATTCAAGTG--------------------ACTTTTAAATGTTATA-G-ATCATTTCTACTGAAAGAGCTATGAC----AGGAA--A--AGG-G-TTT-CTATGGT--ATCATTAGTA-TAGT--TC--GATCCATTGCCAAGAACTAGTTAGAGATGTACATATACCTTTCATAT-Acc
gi|2 : a-TCATATAT-TTTAT-CAA-GGTA----ACT-TACTT-TGG------TGA---GATGG-----GCA----GCAAG-TCTATAAC-G-TTCTGG-TTCAC-ATATCAAGGGA--ACA-TTCC-AATCAGT-GAATCATAC-------GCGTGG-AAATCT--GGTCGTTAA-TGG-G-------------AGT---GTGCC-TT-GAGTG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC--CC----GA----ACGTGACAG---C-G-----A-CAGATATC--CATGGG--------------GCAT---CATC--AT-TTGCA-TTTGG--TTCTGCATTGC-G-----T-GT--CA-CTCA-TTGGCCGA-T--TTGTA---T-GCCAG-T---CGGGGGCTCATGACTCAATC--TCGCAACCATGCAGTGTTTGAGAATT-A------A-G----TATCATTCC--AATCTAACATG--TCATTG----G-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-CAAAAAAC-GTTT--GACAACG--G-TT--CTCACCA--TCGA-TAAA--T-TTG-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATCTTA--CCA-CG---GTAAC---CTACC-AT----ACGTGTCCAATAACC--GGAAG-CTA--CGAGTT-CCGT-AAATTCCAAGAACT-CTCGAT------------C-----CC-GATTG-CAA---AT-T----TGCA-CATC-GGA-AGAT--A-AAAAAATCGTCA-AATTTG-CTCAGGATTACAT--TATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATGC--A-A----AACTCGAGC-GGGCC--GGTTCTG---T-A--AAC-CTAAATA--A-AT-AAAAAAttttatcaaggtaacttactttggtgagatgggcagcaagtctataacgttctggttcacatatcaagggaacattccaatcagtgaatcatacgcgtggaaatctggtcgttaatgggagtgtgccttgagtgtattatgtactactaaatatcccgaacgtgacagcgacagatatccatggggcatcatcatttgcatttggttctgcattgcgtgtcactcattggccgatttgtatgccagtcgggggctcatgactcaatctcgcaaccatgcagtgtttgagaattaagtatcattccaatctaacatgtcattggcaataaagtcgccagaagttgttagtcctccgaacgggcaaaaaacgtttgacaacggttctcaccatcgataaatttgtacactaaacaaagccatacagatcttaccacggtaacctaccatacgtgtccaataaccggaagctacgagttccgtaaattccaagaactctcgatcccgattgcaaatttgcacatcggaagataaaaaaatcgtcaaatttgctcaggattacattattttttttctaaaaatgcaaaactcgagcgggccggttctgtaaacctaaataaataaaaaaatagctg
gi|2 : aaggccttagcattattttatctgtttaggtgtacgagcccgcagaatataaagtcccgtaggagtgagaaataaacaataaaaaaacaaattttttgcgatacaatctatcaacttatattctgcattaacagtcatattcattcttcatctgctcttcattgatgctctcggaacagacttcattgtgcgcaagtggcgccacaaccagcttaccataagtaaggatgcacaagacaatgtgaacacataagttaaattgttcaatgctcgatcacgtcggtctgcccagcttcttgcatcctcttccacaattgagcacattgctgtgaacagtttcctatacaaataataaacaatgtttcataacatgcttgtcattaacaaaagagcataggtagattgttgaatactgcgaccagtattggtagtacttcactcaatagatgctaggaaagttgtctgaagttttcaatgaaaagagcagttaataacaaatgggagctaccagaatagtaaatgttgccctgctgaggtgcatcgtgtgacaattgtattcaagtgacttttaaatgttatagatcatttctactgaaagagctatgacaggaaaagggtttctatggtatcattagtatagttcgatccattgccaagaactagttagagatgtacatataccttC--AG-CTAT---T-TTT--TT--ATT-TATTTAGGTTT-ACAGAACCatagctg
gi|3 : aaggccttagcattattttatctgtttaggtgtacgagcccgcagaatataaagtcccgtaggagtgagaaataaacaataaaaaaacaaattttttgcgatacaatctatcaacttatattctgcattaacagtcatattcattcttcatctgctcttcattgatgctctcggaacagacttcattgtgcgcaagtggcgccacaaccagcttaccataagtaaggatgcacaagacaatgtgaacacataagttaaattgttcaatgctcgatcacgtcggtctgcccagcttcttgcatcctcttccacaattgagcacattgctgtgaacagtttcctatacaaataataaacaatgtttcataacatgcttgtcattaacaaaagagcataggtagattgttgaatactgcgaccagtattggtagtacttcactcaatagatgctaggaaagttgtctgaagttttcaatgaaaagagcagttaataacaaatgggagctaccagaatagtaaatgttgccctgctgaggtgcatcgtgtgacaattgtattcaagtgacttttaaatgttatagatcatttctactgaaagagctatgacaggaaaagggtttctatggtatcattagtatagttcgatccattgccaagaactagttagagatgtacatatacctttcatatattttatcaaggtaacttactttggtgagatgggcagcaagtctataacgttctggttcacatatcaagggaacattccaatcagtgaatcatacgcgtggaaatctggtcgttaatgggagtgtgccttgagtgtattatgtactactaaatatcccgaacgtgacagcgacagatatccatggggcatcatcatttgcatttggttctgcattgcgtgtcactcattggccgatttgtatgccagtcgggggctcatgactcaatctcgcaaccatgcagtgtttgagaattaagtatcattccaatctaacatgtcattggcaataaagtcgccagaagttgttagtcctccgaacgggcaaaaaacgtttgacaacggttctcaccatcgataaatttgtacactaaacaaagccatacagatcttaccacggtaacctaccatacgtgtccaataaccggaagctacgagttccgtaaattccaagaactctcgatcccgattgcaaatttgcacatcggaagataaaaaaatcgtcaaatttgctcaggattacattattttttttctaaaaatgcaaaactcgagcgggccAGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC---ACCC-CAGAATTATAAAGTCTCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAATAAAAAAT---AACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAC-T---T--TATTCTGCCA-TGTACATT-AT------TA-TTCA-CTGCTC----T---TT-G---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGC-ACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GGTG-CACAAGACACT-TGGACAT-----T-AAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAGTGG-AAGCATATC----TGGACAG-TTCCG-----TATC-A-AAATAAT-GAACA----------AC-TT---GATAGC--ATGCTTCTCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAC-CT-C-A-CCA-TATGA-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCT--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC--TG-AAAAGCATCAA-TT-A-----AAAT--GAG-TT-C-CAGAA-TAGT--ATGCTGT-CT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--AAA-GTATC-TTT-----TGAAA---CATGAC----CGGAAATA--TGGAG-TTA-CTATAGT--AT-GTTAGTATTTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACAT-----TTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTAT--ATTCAAC-ATTTTTTTCTAT-AACGGGGA-TCATTTATATTCAT-CAA-G--A----ACT-TACTT-TGGTTACTTTGGCT-G---C-----TCA----GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--TTC-C-AT--CACGG-A--ACA-T--T-AA---AT--CAC--TAT-------G--TGA-A----T--GC--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TAC--AA-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CA----C-G-------CAGA-ATC--CATGGACTAC--------ATGTAT---CATC--AT-T-GCG-TT--G--T---------C-G-----T-TT--CG-C-CA-TT-GCGGA-T--TTGTA---CTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAA-CAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCAT-GC--A-CAAAACATG--TCATTG---TA-CA------A-AAA-GTCGCCAA-AAG-----TTG-TTAGTC---C--CG----AACGGG-C-AAAAAA-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCAC-TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CATT-A-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATTTCT--CCAC-----AT--CAG-TTGTC-AT----A----------AACC--GGAAA-GT---CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-AGA-AAGA--A-AAAAAA---CCA-G--TTT-CTCA--ATT---T--TATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGCTGG--C--GGGTTTG---T-AT-AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
gi|4 : GCC--AG-C-AT---T-TGT---A--ATT-T--TTAGGTTT-AC-TAACCA-CAGCATTATAAAGTCCCTTAG-AG-GAGA---GAATTT-TAAAAAAAAG----AACTTTGT-------------AT-TA--TTATTAA-TAACT--TATT--GCTA-TGTACAGT-ACATTTCATT-TTCA-TT-CTT----T---TT-C---ATGCT----TT----CGAAACAGAAT-CC-TTGC----AA-T--G-TCACATCAA-CATTTA---------------------T------AGACAGT-TGGACAT-----TTAAATTGCT-AAT-CTC-ATCAA-T--GTC--G--CAA-TTTCT-CATC---TTTCACAATGG-AAGCACA-------AGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT--AATA----------AC-AC--TGATAAC--ATGC-TATAATAAATCAAAAGAGACA--TA--TAAATTG-CATAAT-CT-C-ACCCA-TATTG-TT-A------------T--A-------GAATT---GCAGAC--AA-A--TT----GGTAA----GTTTTC-ATG-AAAAG-ATCAA-TT-A-----AAAT--GAG-TA-T-CAGAA-TAGT--AT-TTATCCC------GGGC------------TT---------TGATATTATCCCTCCTTC----A------AATG--ATA--CATC-TTT-----GAAAG---CATGG-----CAGAAA-A--AGGAG-TTA-CTATAG---GT-GT---TA-TTAG-ATC----T--ATTGC---AAAC--CTTA-AAA-G-ACATA---CTTTC-TAT--ACGGTC---AT-ATTTATCAAAG-AACTATACTTTT
gi|4 : a-GAC-ATACTTT-CTAT-A-CGG--------TCATATTTAT-CAAAG--A----ACTATACTT-T--------TGG---G----------CA----GCC-G-TC-ATA-C-GATTCT---CTCAC-AT--CACG--A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GG-TGA-A----T--GG----TA--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-GGTTA-TA--TTAT----ACT-A---GAATA--TC-GCC----AA----AT--G-CAG---CCG-----A-CAG----C--CAT---C-GT--------AT--------ATC--AT-T--TG-TT-AA--T---------CTG-----CATT--TG-CTCACTTTGTGGAAT--TGGTA---T---C-A-T---CGGA----------TCAATT--TCGCAACCAT-CAAT-TTTGA-ATTA-A------AC-----T-TCATTCC--A-C-AAACATG--T-AT-G---TA-CA-------TAAA-GTC--CAG-AAG-----TTGGTTAGTCC-TC--CG----AACG---C-AAAA-C-GTTT-CGA-AACG--T-TA--CTC-CCA--TCGA-T--A--TATTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGA--TTA--CCATC----AT--C---TTATC-AT----A----------AACCCAGGAAA-TTA--CGAGTT-CCGC-TAATT--AACA--T-CTCGAC------------C-----CC-GA-TA-CGA---AT-T----TA----ATC-GGA-AA-A--A-AAAAAATCTTCC-AATTTT-CTCA--ATT---T--TTTTT---TTTCTTC---T-AAT---ATTC-AA-A----AACTCGA-C-TG--C--GG--TTG---TAA--AAC-CTTAT-A--A-ATAAAAAAATGCTGgggcagccgtcatacgattctctcacatcacgaacatcaaatgcattacggtgaatggtatgggagtgccttggttatattatactagaatatcgccaaatgcagccgacagccatcgtatatcatttgttaatctgcatttgctcactttgtggaattggtatcatcggatcaatttcgcaaccatcaattttgaattaaacttcattccacaaacatgtatgtacataaagtccagaagttggttagtcctccgaacgcaaaacgtttcgaaacgttactcccatcgatatattttacactaaacaaagccatacagattaccatcatcttatcataaacccaggaaattacgagttccgctaattaacatctcgaccccgatacgaatttaatcggaaaaaaaaaaatcttccaattttctcaatttttttttttcttctaatattcaaaaactcgactgcggttgtaaaaccttataaataaaaaaatgctgc
gi|5 : agccagcatttgtaatttttaggtttactaaccacagcattataaagtcccttagaggagagaattttaaaaaaaagaactttgtattattattaataacttattgctatgtacagtacatttcattttcattctttttcatgctttcgaaacagaatccttgcaatgtcacatcaacatttatagacagttggacatttaaattgctaatctcatcaatgtcgcaatttctcatctttcacaatggaagcacaagacagttcctattacaaataataataacactgataacatgctataataaatcaaaagagacatataaattgcataatctcacccatattgttatagaattgcagacaaattggtaagttttcatgaaaagatcaattaaaatgagtatcagaatagtatttatcccgggctttgatattatccctccttcaaatgatacatctttgaaagcatggcagaaaaaggagttactataggtgttattagatctattgcaaaccttaaaaAGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TT--ATA-T--TTAGGGTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAAGAG-GAGG---AAATAA------AAAAA----AA----TT--GGGGGGGGGGGATACA--TTATCAAGT---T--TATTCTGCCA-AGTACAGT-GTATT-CATT-TTCA-CTGCTC----T---TTTG---ATGCT----CT----CGAATTAGACT-CC-ATGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAAAAAT-----AT-------GATT-CACACGACAGT-TGGATA------TTAAATTGTT-AAT-TTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG----TT-CATCCT-TTCCACAATGG-GAGCACGTC----TGGACAG-TTCCTACATGTATT-ACGAACAAG-GAACA----------GT-TT--TGATAAC--ATG------ATAA--CAAAGGAG-TATTTA--TGTATTG-TG-AAT-CT-C-G-CCA-TATTG-TTCATATTAATGGCTTT--A-------GAATTCTAG--AC----A-A--TTTTC-G--AA----GAATTC-ATGAAAAAGCATCAA-TT-A-----AAAT--GAG-TT-CACA-AA-TAGA--ATGTTGT-CT-CCGAAGGAC------------TT---------TGACAAGTATATCCCTGCTTTAA------AATA--ATA-GTACC-TTT-----GAAAG---CATGAT----CAGGAAAA--AGc
gi|6 : ATG--GTAAGTATC-TTT-----GAAAG---CATTTCAAGGCAGAAA-A--ATGGG-TTA-CTATATT--GT-GGTA--A-TTGTGGTTAGTAT--ATTGT---ATATT---------------------TTTC-TATGAACGGGGT--CTCATTT
gi|6 : tattccttttTAT--ATT-G-T-ATATTTTTCTATGAACGGGGTCTCATTT-T-TTTATTCAA-G--A----ACT-TACT----G------TGG---G---G-----GCA----GCCAGGTC-AT----G-TTCTGGGCTCAC-ATTTCACGG-A--ACA-T--TTAA---ATTGCAT--TATACCGCCTGC-TGA-A----TTAGG--GTTGGGTGG-G-------------A-T---G--CCGTT-GG-TG-AT--TTA-G--TACTTATGTAAAT---TA-GCTTTTGGT----AT-TG-CAGACCC-G-----ATCAGA-ATC---ATGGGC-ATCTAATTCTGTGTATTTGCAGT--AT-T-GCG-TT-GG--T---------C-CCAC--T-TTG-CGGCTTA-TTG-CGGA-T--T-GTAGATCTGAA-A-TAATCGGG----------TCA-TC--TCGCAACCAG-CAGT-TTTG--AATA-A------TCG----TGTCATCCCCAG-CCAAACATG--TCATTG---TA-C---------AAA-GTCTCCAGAAAG-----TTG-TTAGTCCTTC--CG----AATGGATC---AAAC-GTTT--GA-TACG--G-TA--Cttttattcaagaacttactgtgggggcagccaggtcatgttctgggctcacatttcacggaacatttaaattgcattataccgcctgctgaattagggttgggtgggatgccgttggtgatttagtacttatgtaaattagcttttggtattgcagacccgatcagaatcatgggcatctaattctgtgtatttgcagtattgcgttggtcccactttgcggcttattgcggattgtagatctgaaataatcgggtcatctcgcaaccagcagttttgaataatcgtgtcatccccagccaaacatgtcattgtacaaagtctccagaaagttgttagtccttccgaatggatcaaacgtttgatacggtac
gi|7 : tattccttttatggtaagtatctttgaaagcatttcaaggcagaaaaatgggttactatattgtggtaattgtggttagC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATG-GTATC-TTT-----AAAAG---CATGAC----CAGGAATA--AGGGGCTTA-CCA---C--AT-G--AGTA----T-AT-----T--ACTGC---CAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AATGGGGGTTATTATTTAT--
gi|7 : ctttgacaatttatccctcTTAA--AAT-GAC-ATACTTT-CTAT-AATGGGGG-TTATT---ATTTAT-CCA-G--A----ACT-TACTT-TGG------AGA---G---G-----GCA----GCCAG-NN-NNN-N-N-NNNNN--NNNNN-NN--NNNNN-N--NNN-N--N-NN---NN-NNNN--NNN-------NN-NNN-N----N--NN--NNNN--NNN-NNNNNNTTGCCTTCAGT---G--CC-TTCG--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----AA----AT--A-CAG---C-A-----A-CAGA-NNN--NNNNNNN-NN--------NNNNNN---NNNN--NN-N-NNN-NN-NN--N---------N-N-----N-NN--NN-NNNN-NNNNNNNN-N--NNNNN---NNNNN-N-N---NNNNN---------NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNNN-NNNNNNNACA----TGTCATCCC--A-C-AAATATG--TCATTG---TA-CATGTACAATAAA-GTCGCCAGGAAT-----TTG-TTAGTCT-TC--GG----AACGGG-C-AAAAAC-G-TTTCGA-ccagaacttactttggagagggcagccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgccttcagtgccttcgtgtattatgtactactaaatatcgccaaatacagcaacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacatgtcatcccacaaatatgtcattgtacatgtacaataaagtcgccaggaatttgttagtcttcggaacgggcaaaaacgtttcga
gi|8 : ctttgacaatttatccctcctttgaaatgatggtatctttaaaagcatgaccaggaataaggggcttaccacatgagtatattactgccaactcTAGTCC-TTGAC-----AGCGGG-C-AAAAACTGTTTT-GA-AACG--GGTT--CTC-CCA--TGGA-T-GAAAT-TGT-----TA-CACTAA-A-CCAAGAAG--CCA-------------TG-AGACTCTTA-CCA-CGGTAAT--C-A-CCATC-GTGACAA----------AACC--GGAA--GTA--CGAGTA-TCATGAAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---ATAT----TG-A-CATC-GAATAAG-----AAAAAATC-CCG-AA-TTT-CTCA--ATT---TTATATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATTCAAA-A----AACTCGAGC--G--C--GGGTTTC---T-A--AAC-CT--A-A--A-AT--AAAAATGCTG
gi|9 : C------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATG-GTATC-TTT-----AAAAG---CATGAC----CAGGAATA--AGGgcg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111111 111 22222 4444444444444 11 22222222 1111111 33333333 111 1111111111 111 11 4444444444444444444 11 333333 11 11 1111 333333 11 44444444444444444 11 1111 11 11 111 1 777777777777777777777777777777777777777 11 11 1111 11 11 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111 11111 1 1 33333333333333333333333333333 1111 11 11111111111 222222 11 1111111111111 1111 111111 2222222222222 11 11 2222222 1111111 111 4444444444444 2222 2222222222222222 11111111111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222222222222222 3333333333 3333333333333 111111 1111111111111111 1 11111 1 11111111 22 11 1111111 11111 111 3333333333333 222 44444444444444 333333333333333 111 1 444444444444444444 11111 1111 111 1111 22 111 111 111 111 1111 11111111
lowQualScore : 77 5 5 000 5 222222 8888 5 88 6 5 8 444 88 55555 0 6666666666666 0 11 66666666 8 6666666 8 8 00000000 444 8888888888 3 8 8 444 8 11 3 8 8 4444444444444444444 33 1 8 333333 8 8 8 8 11 88 8 88 8 3 8 11 0 7777 8 111111 0 8 0 11 88888888888888888 11 6666 66 0 8 99 11 8 8 8 8 000 6 8 8 888888888888888888888888888888888888888 8 11 5 8 11 7777 88 0 8 8 8 8 8 11 8 999 8 11 5 0 8 8 6666666666666666666666666666666666666666666666666666 66 0 5 5 22222 888 55555 2 66 4 3 6 11111111111111111111111111111 3333 33 6 88888888888 6 6 3 666666 11 88 5 0 5 6 999 8888888888888 4 8888 66 4 4 4 222222 1111111111111 9999 4 4 4 4 4 00 3 4 22 4 66 4 7777 777 4 66 2222222 55 4 6666666 66 222 5 7777777777777 888 66 5 3333 5 66 66 5 88 66 77 2222222222222222 66666666666666 5 66 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 5 9 5 77 2 000000000000000 5555555555 0 99 0 6 77 77 6 7777777777777 3 3 555555 77 0 9999999999999999 5 5 5 22222 0 4 00000000 5 5 5 0 11 5 77 5 77 6 55 6 2222222 66666 6 6 6 111 99 6666666666666 1 000 11111111111111 6 444444444444444 99 111 99 3 6 3 5 77 5 000000000000000000 6 6 6 66666 6 4444 999 6 6 1 0000 22 88 99 99 111 99 111 6 111 111 6 6 4444 2 99 99 99 6 66666666 6 3 6 99 6 6
lowQualScore : .. . . ... . ...... .... . .. . . . ... .. ..... . ............. . .. ........ . ....... . . ........ ... .......... . . . ... . .. . . . ................... .. . . ...... . . . . .. .. . .. . . . .. . .... . ...... . . . .. ................. .. .... .. . . .. .. . . . . ... . . . ....................................... . .. . . .. .... .. . . . . . . .. . ... . .. . . . . .................................................... .. . . . ..... ... ..... . .. . . . ............................. .... .. . ........... . . . ...... .. .. . . . . ... ............. . .... .. . . . ...... ............. .... . . . . . .. . . .. . .. . .... ... . .. ....... .. . ....... .. ... . ............. ... .. . .... . .. .. . .. .. .. ................ .............. . .. ........................................................................ . . . . .. . ............... .......... . .. . . .. .. . ............. . . ...... .. . ................ . . . ..... . . ........ . . . . .. . .. . .. . .. . ....... ..... . . . ... .. ............. . ... .............. . ............... .. ... .. . . . . .. . .................. . . . ..... . .... ... . . . .... .. .. .. .. ... .. ... . ... ... . . .... . .. .. .. . ........ . . . .. . .
lowQualScore : 99 7 7 000 7 111111 3333 7 77 7 6 0 000 88 44444 6 0000000000000 8 00 00000000 0 0000000 0 0 00000000 000 2222222222 2 0 0 000 0 00 2 0 0 6666666666666666666 00 0 0 666666 0 0 0 0 00 88 0 88 0 2 0 88 8 0000 0 000000 8 0 8 22 00000000000000000 00 6666 44 8 0 00 00 0 0 0 0 000 0 0 0 222222222222222222222222222222222222222 0 00 6 0 00 0000 88 8 0 0 0 0 0 00 0 222 0 00 0 0 0 2 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 99 4 0 0 55555 888 11111 6 99 2 3 7 33333333333333333333333333333 2222 33 7 55555555555 7 7 2 666666 99 11 0 4 0 7 000 0000000000000 4 3333 11 4 4 4 888888 1111111111111 4444 4 4 4 4 4 66 0 4 22 4 11 4 1111 888 4 11 2222222 88 4 7777777 11 444 0 5555555555555 888 99 0 8888 0 99 99 0 44 99 55 0000000000000000 99999999999999 0 99 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 6 7 4 7 99 9 666666666666666 2222222222 8 22 2 7 55 55 7 2222222222222 7 7 555555 99 1 9999999999999999 0 6 0 55555 0 4 22222222 0 0 0 1 11 0 99 7 99 7 88 7 5555555 77777 7 7 7 777 22 7777777777777 7 444 66666666666666 7 333333333333333 22 888 22 2 7 3 7 99 7 888888888888888888 7 7 7 00000 7 2222 222 7 7 0 8888 55 33 88 22 777 22 777 7 777 777 7 7 2222 5 22 22 22 7 22222222 7 5 7 22 7 7
consensus : AGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAAAAAAAAATA---ACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAA-T---T--TATTCTGCCA-TGTACAGT-ATATT-CATT-TTCA-CTGCTC----T---TTG---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GATG-CACAAGACANT-TGGACAT-----TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAATGG-AAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT-GAACA----------AT-CT--TGATAAC--ATGCTT-TCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAT-CT-C-A-CCA-TATTG-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCC--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC-ATGAAAA-AGCA-TCAA-TT-A-AAAT--GAG-TT-C-CAGAA-TAGT--ATGTTGTCCT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATA-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGAC----CAGGAATA--AGGAG-TTA-CTATAGC--GT-GTTAGTA-TTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTAT--AAT-GAC-ATACTTTTCTA-T-AACGGGGG-TCATTTATATTTAT-CAA----G--A-ACT-TACTT-TGG------TGG---G---G-----GCA----GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-AT--CACGG-A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CAG---C-G-----A-CAGA-ATC--CATGGGC-GT--------ATGTAT---CATC--AT-T-GCG-TT-GG--T---------C-G-----T-TT--CG-CTCA-TTGGCGGA-T--TTGTA---TTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAACCAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCATCCC--A-CCAAACATG--TCATTG---TA-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-C-AAAAAC-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATTTTT--CCATCG---AT--C-G-TTATC-AT----A----------AACC--GGAAA-NTA--CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-GGA-AAGA--A-AAAAAATC--CCA-AATTTT-CTCA--ATT---TTAT--TT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGC-GG--C--GGGTTTG---T-A--AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
Reference ( family-3108 ) : AGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAAAAAAAAATA---ACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAA-T---T--TATTCTGCCA-TGTACAGT-ATATT-CATT-TTCA-CTGCTC----T---TTG---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GATG-CACAAGACANT-TGGACAT-----TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAATGG-AAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT-GAACA----------AT-TT--TGATAAC--ATGCTTNTCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAT-CT-C-A-CCA-TATTG-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCC--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC-ATGAAAA-AGCA-TCAA-TT-A-AAAT--GAG-TT-C-CAGAA-TAGT--ATGTTGTCCT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATA-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGAC----CAGAAATA--AGGAG-TTA-CTATAGC--GT-GTTAGTA-TTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTAT--AAT-GAC-ATACTTTTCTA-T-AACGGGGG-TCATTTATATTTAT-CAA----G--A-ACT-TACTT-TGG------TGG---G---G-----GCA----GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-AT--CACGG-A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CAG---C-G-----A-CAGA-ATC--CATGGGC-GT--------ATGTAT---CATC--AT-T-GCG-TT-GG--T---------C-G-----T-TT--CG-CTCA-TTGGCGGA-T--TTGTA---TTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAACCAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCATCCC--A-CCAAACATG--TCATTG---TA-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-C-AAAAAC-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATTTTT--CCATCG---AT--C-G-TTATC-AT----A----------AACC--GGAAA-NTA--CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-GGA-AAGA--A-AAAAAATC--CCA-AATTTT-CTCA--ATT---TTAT--TT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGC-GG--C--GGGTTTG---T-A--AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
gi|1 : AGGCC--AG-C-ATATTT-TTT--TA--ATT-A--TTAGGTTTTAC-GAACCC-CAGAATGATAAAGTCCGGTAGGAG-GAGG---AAATAAATAAAAGAAAATATCAACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAACT---T--TATGCTGCGAATGTACATT--TAT---ATT-TACA-CTGCTTCCTTT---TTGTAAATGCTGGTACTGAATCGAAA--GACTGCC-TTGC---CAA-TATGGCCACT-CAA-CAGTTA-CAAT-----AGTCAGGAGGATGGCACAAGACACT-TGGACAT-----TTAATTTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCTTG-CCAG-TTCTT-CATCTT-TTCCA-GATAGTAAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATTGACAA-TAATTGAACATATGAGATCAAT-CTATTGATAACGCATGCTC--CATAAATC-AGAGAG-CAG-TA--ATAATTG-TG-AAC-CT-C-A-CCATTATTGATT-A-----------TTTAA-------GAAT-------GCA--GAGA--ATTTC-G--AAAGTTGTTTGT-ATGAAAA-AGCA-TCAAGTTAA-AAAT--GAGTTT-C-CAGAATTAGT--ATTTTGTCTT-CCGA-GGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--A-A-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGAC----CAGAAATATTAGGAGTTTATCTATAGCTTAT-GTTAGTT-TAAT-ATT--T-T--GTT------ATCT-ATTG-CAA-----ATA---C-TTC-GAT-AA---------------AT--AAT-GAC-AT--TTTTTTATT-AACGGGGGTTCATTTATATTCAT-CAAT---G--ATACT-TACTTCTGG------TTGCTTG---GCTGCCGTACATTGCCAG-TC-ATA-CAG-TTCTG--C-CACTAT--CACGG-A--ACATT--T-TA---AT-GCCT--TATTTG----GC-TGATATT--T--GG--GGTG--TGGTG-------------GGTAGGG--CC-TT-G--TGTTATTTTATAGCTACT-AC-GAAATAGGTCTGCC----GATGATAC-TG-CAG---T-GTATCTA-CGGA-ACCTTTATG----GC--------ACATAT---CATCTAAT-T-GCT-GT-GGAAT---------C-GCGCTAT-TTACCG-CCCA-TTGGCGGA-TCCTTGTA---TTGAC-GTT---CGGGG---------TCAATCGGTCGCATCACT-CAG----TGA-TATATATT----ACGGTTCTATTAGCAA--A-TCAAACATGTTTCATTGTTTTATCAT-----ATAAACGTCGTCAG-AGGAATGTTTGATTAGTCC-TC--TGCAGCAACCGG-C-AATAA--GGTTTCG--AACGTCG-TACTCTC-CCATTTCGAGT-GA--T-TTTTCTGGTATCATTAATATC---AAAGTCCTATATCACGTATGATTACAGATTTTTTCTCATCC---AT--C-GTTTGTCGAT----A----------AACC--GGAAGTTTATTTGAGGTATCGTAAAATG-CGAAA--T-CTCGAT------------CTTGGGCC-GA-TGTC-A---AT-TATTCTGTA-CTTC-GGA-AAGG--C-ACAAAATC--CCA-AATTTTGCTCA--ATT---TTAT--TTATGTTT-TCT---TAAAAATTATTC-AA-A----AACTCGGTC-GG--CCGGGGTTTT---T-A--AAC-CTAAA-AATA-AT-AAGAAA
gi|1 : ttGCC--AGGC-AT---C-TTTCTTATTATT-T--TTAGGTTT-AA-AAACCC-CGGgatgcctggc
gi|10 : ttaggccagcatatttttttaattattaggttttacgaaccccagaatgataaagtccggtaggaggaggaaataaataaaagaaaatatcaactttttgatacattatcaactttatgctgcgaatgtacatttatatttacactgcttcctttttgtaaatgctggtactgaatcgaaagactgccttgccaatatggccactcaacagttacaatagtcaggaggatggcacaagacacttggacatttaatttgttaatctcatcattgtcttgccagttcttcatcttttccagatagtaagcacatctggacagttcctattgacaataattgaacatatgagatcaatctattgataacgcatgctccataaatcagagagcagtaataattgtgaacctcaccattattgattatttaagaatgcagagaatttcgaaagttgtttgtatgaaaaagcatcaagttaaaaatgagtttccagaattagtattttgtcttccgagggctttgaaatgaagtatctttgaaagcatgaccagaaatattaggagtttatctatagcttatgttagtttaatattttgttatctattgcaaatacttcgataaataatgacatttttttattaacgggggttcatttatattcatcaatgatacttacttctggttgcttggctgccgtacattgccagtcatacagttctgccactatcacggaacattttaatgccttatttggctgatatttggggtgtggtgggtagggccttgtgttattttatagctactacgaaataggtctgccgatgatactgcagtgtatctacggaacctttatggcacatatcatctaattgctgtggaatcgcgctatttaccgcccattggcggatccttgtattgacgttcggggtcaatcggtcgcatcactcagtgatatatattacggttctattagcaaatcaaacatgtttcattgttttatcatataaacgtcgtcagaggaatgtttgattagtcctctgcagcaaccggcaataaggtttcgaacgtcgtactctcccatttcgagtgatttttctggtatcattaatatcaaagtcctatatcacgtatgattacagattttttctcatccatcgtttgtcgataaaccggaagtttatttgaggtatcgtaaaatgcgaaatctcgatcttgggccgatgtcaattattctgtacttcggaaaggcacaaaatcccaaattttgctcaattttatttatgttttcttaaaaattattcaaaaactcggtcggT-CAA----G--A-ACT-TACTT-TGG------TGG---G---G-----GCA----GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-GC--CACGG-A--ATA-T--C-AA---AT-GTAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTC--TGG-GACTGTCTTC----AGT---G--CC-TTGG--TG-TA--TTATG--CACT-AT-TAAATA--TC---------A----A-----CA----C-G-----A-CATA-ATC--CATGGGC-AT--------ATGATT---TGGT--ATAT-ACC-TT-G-------------T-G-----T-TT------TAA-TT-GCGGA-T--TTGTA---TT
gi|11 : --AAT-GAC-ATAC-TTTCTA-T-----------------TATTTAT-CAAGATCG--A-ACT-TACTT-TGG------T-G---G---G-----GCA----GCAAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--GTC----------------ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----A--GG--GTTA--TGG-G-------------AGT---G--CC-TTGG--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TT-GCC----GA----A--TG-CAG---C-A-----A-CATA-ATC--CATGGGC-AT------------------ATC--AT-T-GCATTT-GG--T---------t
gi|12 : TT-CAAAA--TTCTCGATTACTTTCTTCAGC-----CCAGA-TG-T-ACAAAT-T----TG-AGCATCTGGG-AAGATAATAAAAAATCT-CCATAATTGT-TTCA--ATT---TTAT--TT---TTT-ATCATATATAA---ATTC-AATAAACCAACTCGAGC-GG--C--GGTTTTGAATT-AATAACACTAAA-A--ATCT-AAAAAA
gi|13 : tcgtagtataattAACATG--TCATCG----A-CA------ATAAA-GTC-TCAG-GAG-----TAG-CTAGTCC-AC--TG----AATGGC-C-AAATAC-GTTT--GA-AACT--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-AA--A-TTT-----TA-TGCTAA-A-C---AAAG--TCA-------------TACAGATCT
gi|14 : G-TCAT--A-ATTTGA-CAA----A--T-ACT-TACTT-GGG------TGG---G---G-----GCA----GCCAG-TC-ATG-C-A-TTCTG--CTTAC-AT--CACGG-AGCACA-T--C-AA---AT-GCAT--TTC-------GT-TTA-G----T--GG--Gaccatgataacc
gi|15 : ---AT--C-G-TTATC-AG----A----------AACC--GGAAA-ATA--TGAG-T-TCGT-AAATT-CAAAA--T-
gi|16 : c-CA------ATAAA-GTCGCCAGGAAG-----TTG-TTAGTCT-TC--GG----AACGG
gi|2 : AGGCCTTAG-C-AT---TATTT--TA--TCTGT--TTAGGTGT-AC-GAGCCCGCAGAAT-ATAAAGTCCCGTAGGAGTGAGAAATAAACAA-TAAAAAAACA-A---ATTTTTTGCG----------ATACAATCTATCAA-C---TTATATTCTG-CA-TTAACAGTCATATT-CATTCTTCATCTGCTC----TTCATTG---ATGCT----CT----CGGAACAGACT-TCATTGTGCGCAAGT--GGCGCCA-CAACCAGCTTACCATAAGTAAG-------GATG-CACAAGACAATGTGAACACATAAGTTAAATTGTTCAATGCTCGATCACGTCGGTCT-GCCCAGCTTCTTGCATCCTCTTCCACAATTG--AGCACATTGCTGTGAACAGTTTCC------TA-T-ACAAATAAT-AAACA----------ATGTT--TCATAAC--ATGCTTGTCATTAA-CAAAAGAG-CA--TAGGTAGATTGTTG-AATACTGCGA-CCAGTATTG-GT-A-----------GT--ACTTCACTCAATA---GATGCTAGGA-AAGTTGTCTG--AA----GTTTTCAATGAAAAGAGCAGTTAA-TA-ACAAATGGGAG-CTAC-CAGAA-TAGTAAATGTTGCCCTGCTGAGGTGCATCGTGTGACAATTGTATTCAAGTG--------------------ACTTTTAAATGTTATA-G-ATCATTTCTACTGAAAGAGCTATGA-----CAGGAA-A--AGG-G-TTT-CTATGGT--ATCATTAGTA-TAGT--TC--GATCCATTGCCAAGAACTAGTTAGAGATGTACATATACCTTTCATAT-Acc
gi|2 : a-TCATATAT-TTTAT-CAA----GGTA-ACT-TACTT-TGG------TGA---GATGG-----GCA----GCAAG-TCTATAAC-G-TTCTGG-TTCAC-ATATCAAGGGA--ACA-TTCC-AATCAGT-GAATCATAC-------GCGTGG-AAATCT--GGTCGTTAA-TGG-G-------------AGT---GTGCC-TT-GAGTG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC--CC----GA----ACGTGACAG---C-G-----A-CAGATATC--CATGGG--------------GCAT---CATC--AT-TTGCA-TTTGG--TTCTGCATTGC-G-----T-GT--CA-CTCA-TTGGCCGA-T--TTGTA---T-GCCAG-T---CGGGGGCTCATGACTCAATC--TCGCAACCATGCAGTGTTTGAGAATT-A------A-G----TATCATTCC--AATCTAACATG--TCATTG----G-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-CAAAAAAC-GTTT--GACAACG--G-TT--CTCACCA--TCGA-TAAA--T-TTG-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATCTTA--CCA-CG---GTAAC---CTACC-AT----ACGTGTCCAATAACC--GGAAG-CTA--CGAGTT-CCGT-AAATTCCAAGAACT-CTCGAT------------C-----CC-GATTG-CAA---AT-T----TGCA-CATC-GGA-AGAT--A-AAAAAATCG-TCA-AATTTG-CTCAGGATTACATTAT--TT---TTT-TTC---TAAAA---ATGC--A-A----AACTCGAGC-GGGCC--GGTTCTG---T-A--AAC-CTAAATA--A-AT-AAAAAAttttatcaaggtaacttactttggtgagatgggcagcaagtctataacgttctggttcacatatcaagggaacattccaatcagtgaatcatacgcgtggaaatctggtcgttaatgggagtgtgccttgagtgtattatgtactactaaatatcccgaacgtgacagcgacagatatccatggggcatcatcatttgcatttggttctgcattgcgtgtcactcattggccgatttgtatgccagtcgggggctcatgactcaatctcgcaaccatgcagtgtttgagaattaagtatcattccaatctaacatgtcattggcaataaagtcgccagaagttgttagtcctccgaacgggcaaaaaacgtttgacaacggttctcaccatcgataaatttgtacactaaacaaagccatacagatcttaccacggtaacctaccatacgtgtccaataaccggaagctacgagttccgtaaattccaagaactctcgatcccgattgcaaatttgcacatcggaagataaaaaaatcgtcaaatttgctcaggattacattattttttttctaaaaatgcaaaactcgagcgggccggttctgtaaacctaaataaataaaaaaatagctg
gi|2 : aaggccttagcattattttatctgtttaggtgtacgagcccgcagaatataaagtcccgtaggagtgagaaataaacaataaaaaaacaaattttttgcgatacaatctatcaacttatattctgcattaacagtcatattcattcttcatctgctcttcattgatgctctcggaacagacttcattgtgcgcaagtggcgccacaaccagcttaccataagtaaggatgcacaagacaatgtgaacacataagttaaattgttcaatgctcgatcacgtcggtctgcccagcttcttgcatcctcttccacaattgagcacattgctgtgaacagtttcctatacaaataataaacaatgtttcataacatgcttgtcattaacaaaagagcataggtagattgttgaatactgcgaccagtattggtagtacttcactcaatagatgctaggaaagttgtctgaagttttcaatgaaaagagcagttaataacaaatgggagctaccagaatagtaaatgttgccctgctgaggtgcatcgtgtgacaattgtattcaagtgacttttaaatgttatagatcatttctactgaaagagctatgacaggaaaagggtttctatggtatcattagtatagttcgatccattgccaagaactagttagagatgtacatataccttC--AG-CTAT---T-TTT--TT--ATT-TATTTAGGTTT-ACAGAACCatagctg
gi|3 : aaggccttagcattattttatctgtttaggtgtacgagcccgcagaatataaagtcccgtaggagtgagaaataaacaataaaaaaacaaattttttgcgatacaatctatcaacttatattctgcattaacagtcatattcattcttcatctgctcttcattgatgctctcggaacagacttcattgtgcgcaagtggcgccacaaccagcttaccataagtaaggatgcacaagacaatgtgaacacataagttaaattgttcaatgctcgatcacgtcggtctgcccagcttcttgcatcctcttccacaattgagcacattgctgtgaacagtttcctatacaaataataaacaatgtttcataacatgcttgtcattaacaaaagagcataggtagattgttgaatactgcgaccagtattggtagtacttcactcaatagatgctaggaaagttgtctgaagttttcaatgaaaagagcagttaataacaaatgggagctaccagaatagtaaatgttgccctgctgaggtgcatcgtgtgacaattgtattcaagtgacttttaaatgttatagatcatttctactgaaagagctatgacaggaaaagggtttctatggtatcattagtatagttcgatccattgccaagaactagttagagatgtacatatacctttcatatattttatcaaggtaacttactttggtgagatgggcagcaagtctataacgttctggttcacatatcaagggaacattccaatcagtgaatcatacgcgtggaaatctggtcgttaatgggagtgtgccttgagtgtattatgtactactaaatatcccgaacgtgacagcgacagatatccatggggcatcatcatttgcatttggttctgcattgcgtgtcactcattggccgatttgtatgccagtcgggggctcatgactcaatctcgcaaccatgcagtgtttgagaattaagtatcattccaatctaacatgtcattggcaataaagtcgccagaagttgttagtcctccgaacgggcaaaaaacgtttgacaacggttctcaccatcgataaatttgtacactaaacaaagccatacagatcttaccacggtaacctaccatacgtgtccaataaccggaagctacgagttccgtaaattccaagaactctcgatcccgattgcaaatttgcacatcggaagataaaaaaatcgtcaaatttgctcaggattacattattttttttctaaaaatgcaaaactcgagcgggccAGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC---ACCC-CAGAATTATAAAGTCTCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAATAAAAAATA---ACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAC-T---T--TATTCTGCCA-TGTACATT-AT------TA-TTCA-CTGCTC----T---TTG---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GG-CACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GGTG-CACAAGACACT-TGGACA------TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAGTGG-AAGCATATC----TGGACAG-TTCCG-----TATC-A-AAATAAT-GAACA----------A--CT--TGATAGC--ATGCTTCTCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAC-CT-C-A-CCA-TATGA-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCT--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC--TG-AAA-AGCA-TCAA-TT-A-AAAT--GAG-TT-C-CAGAA-TAGT--ATGCTGT-CT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--AAA-GTATC-TTT-----TGAAA---CATGAC----CGGAAATA--TGGAG-TTA-CTATAGT--AT-GTTAGTATTTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACAT-----TTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTAT--ATTCAAC-ATTTTTTTCTA-T-AACGGGGA-TCATTTATATTCAT-CAA----G--A-ACT-TACTT-TGGTTACTTTGGCT-G---C-----TCA----GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--TTC-C-AT--CACGG-A--ACA-T--T-AA---AT--CAC--TAT-------G--TGA-A----T--GC--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TAC--AA-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CA----C-G-------CAGA-ATC--CATGGACTAC--------ATGTAT---CATC--AT-T-GCG-TT--G--T---------C-G-----T-TT--CG-C-CA-TT-GCGGA-T--TTGTA---CTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAA-CAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCAT-GC--A-CAAAACATG--TCATTG---TA-CA------A-AAA-GTCGCCAA-AAG-----TTG-TTAGTC---C--CG----AACGGG-C-AAAAAA-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCAC-TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CATT-A-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATTTCT--CCAC-----AT--CAG-TTGTC-AT----A----------AACC--GGAAA-GT---CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-AGA-AAGA--A-AAAAAA----CCA-G--TTT-CTCA--ATT---TTAT--TT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGCTGG--C--GGGTTTG---T-AT-AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
gi|4 : GCC--AG-C-AT---T-TGT---A--ATT-T--TTAGGTTT-AC-TAACCA-CAGCATTATAAAGTCCCTTAG-AG-GAGA---GAATTT-TAAAAAAAAG-A---ACTTTGT-------------AT-TA--TTATTAA-TAACT--TATT--GCTA-TGTACAGT-ACATTTCATT-TTCA-TT-CTT----T---TTC---ATGCT----TT----CGAAACAGAAT-CC-TTGC----AA-T--G-TCACATCAA-CATTTA---------------------T------AGACAGT-TGGACAT-----TTAAATTGCT-AAT-CTC-ATCAA-T--GTC--G--CAA-TTTCT-CATC---TTTCACAATGG-AAGCACA-------AGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT--AATA----------AC-AC--TGATAAC--ATGC-TATAATAAATCAAAAGAGACA--TA--TAAATTG-CATAAT-CT-C-ACCCA-TATTG-TT-A------------T--A-------GAATT---GCAGAC--AA-A--TT----GGTAA----GTTTTC-ATGAAAA-G--A-TCAA-TT-A-AAAT--GAG-TA-T-CAGAA-TAGT--AT-TTATCCC------GGGC------------TT---------TGATATTATCCCTCCTTC----A------AATG--ATA--CATC-TTT-----GAAAG---CATGG-----CAGAAA-A--AGGAG-TTA-CTATAG---GT-GT---TA-TTAG-ATC----T--ATTGC---AAAC--CTTA-AAA-G-ACATA---CTTTC-TAT--ACGGTC---AT-ATTTATCAAAG-AACTATACTTTT
gi|4 : aTTAA--AA--GAC-ATACTTT-CTA-T-A-CGG--------TCATATTTAT-CAAA---G--A-ACTATACTT-T--------TGG---G----------CA----GCC-G-TC-ATA-C-GATTCT---CTCAC-AT--CACG--A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GG-TGA-A----T--GG----TA--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-GGTTA-TA--TTAT----ACT-A---GAATA--TC-GCC----AA----AT--G-CAG---CCG-----A-CAG----C--CAT---C-GT--------AT--------ATC--AT-T--TG-TT-AA--T---------CTG-----CATT--TG-CTCACTTTGTGGAAT--TGGTA---T---C-A-T---CGGA----------TCAATT--TCGCAACCAT-CAAT-TTTGA-ATTA-A------AC-----T-TCATTCC--A-C-AAACATG--T-AT-G---TA-CA-------TAAA-GTC--CAG-AAG-----TTGGTTAGTCC-TC--CG----AACG---C-AAAA-C-GTTT-CGA-AACG--T-TA--CTC-CCA--TCGA-T--A--TATTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGA--TTA--CCATC----AT--C---TTATC-AT----A----------AACCCAGGAAA-TTA--CGAGTT-CCGC-TAATT--AACA--T-CTCGAC------------C-----CC-GA-TA-CGA---AT-T----TA----ATC-GGA-AA-A--A-AAAAAATCTTCC--AATTTT-CTCA--ATT---TTTT--TT---TTTCTTC---T-AAT---ATTC-AA-A----AACTCGA-C-TG--C--GG--TTG---TAA--AAC-CTTAT-A--A-ATAAAAAAATGCTGgggcagccgtcatacgattctctcacatcacgaacatcaaatgcattacggtgaatggtatgggagtgccttggttatattatactagaatatcgccaaatgcagccgacagccatcgtatatcatttgttaatctgcatttgctcactttgtggaattggtatcatcggatcaatttcgcaaccatcaattttgaattaaacttcattccacaaacatgtatgtacataaagtccagaagttggttagtcctccgaacgcaaaacgtttcgaaacgttactcccatcgatatattttacactaaacaaagccatacagattaccatcatcttatcataaacccaggaaattacgagttccgctaattaacatctcgaccccgatacgaatttaatcggaaaaaaaaaaatcttccaattttctcaatttttttttttcttctaatattcaaaaactcgactgcggttgtaaaaccttataaataaaaaaatgctgc
gi|5 : agccagcatttgtaatttttaggtttactaaccacagcattataaagtcccttagaggagagaattttaaaaaaaagaactttgtattattattaataacttattgctatgtacagtacatttcattttcattctttttcatgctttcgaaacagaatccttgcaatgtcacatcaacatttatagacagttggacatttaaattgctaatctcatcaatgtcgcaatttctcatctttcacaatggaagcacaagacagttcctattacaaataataataacactgataacatgctataataaatcaaaagagacatataaattgcataatctcacccatattgttatagaattgcagacaaattggtaagttttcatgaaaagatcaattaaaatgagtatcagaatagtatttatcccgggctttgatattatccctccttcaaatgatacatctttgaaagcatggcagaaaaaggagttactataggtgttattagatctattgcaaaccAGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TT--ATA-T--TTAGGGTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAAGAG-GAGG---AAATAA----AAAAAAAT----------T--GGGGGGGGGGGATACA--TTATCAAGT---T--TATTCTGCCA-AGTACAGT-GTATT-CATT-TTCA-CTGCTCT---T---TTG---ATGCT----CT----CGAATTAGACT-CC-ATGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAAAAAT-----AT-------GATT-CACACGACAGT-TGGATA------TTAAATTGTT-AAT-TTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG----TT-CATCCT-TTCCACAATGG-GAGCACGTC----TGGACAG-TTCCTACATGTATT-ACGAACAAG-GAACA----------GT-TT--TGATAAC--ATG------ATAA--CAAAGGAG-TATTTA--TGTATTG-TG-AAT-CT-C-G-CCA-TATTG-TTCATATTAATGGCTTT--A-------GAATTCTAG--AC----A-A--TTTTC-G--AA----GAATTC-ATGAAAA-AGCA-TCAA-TT-A-AAAT--GAG-TT-CACA-AA-TAGA--ATGTTGT-CT-CCGAAGGAC------------TT---------TGACAAGTATATCCCTGCTTTAA------AATA--ATA-GTACC-TTT-----GAAAG---CATGAT----CAGGAAAA--AGc
gi|6 : ATG--GTAAGTATC-TTT-----GAAAG---CATTTCAAGGCAGAAA-A--ATGGG-TTA-CTATATT--GT-GGTA--A-TTGTGGTTAGTAT--ATTGT---ATATT---------------------TTTC-TATGAACGGGGT--CTCATTT
gi|6 : tattccttttTAT--ATT-G-T-ATATTTTTCTA-TGAACGGGGTCTCATTT-T-TTTATTCAA----G--A-ACT-TACT----G------TGG---G---G-----GCA----GCCAGGTC-AT----G-TTCTGGGCTCAC-ATTTCACGG-A--ACA-T--TTAA---ATTGCAT--TATACCGCCTGC-TGA-A----TTAGG--GTTGGGTGG-G-------------A-T---G--CCGTT-GG-TG-AT--TTA-G--TACTTATGTAAAT---TA-GCTTTTGGT----AT-TG-CAGACCC-G-----ATCAGA-ATC---ATGGGC-ATCTAATTCTGTGTATTTGCAGT--AT-T-GCG-TT-GG--T---------C-CCAC--T-TTG-CGGCTTA-TTG-CGGA-T--T-GTAGATCTGAA-A-TAATCGGG----------TCA-TC--TCGCAACCAG-CAGT-TTTG--AATA-A------TCG----TGTCATCCCCAG-CCAAACATG--TCATTG---TA-C---------AAA-GTCTCCAGAAAG-----TTG-TTAGTCCTTC--CG----AATGGATC---AAAC-GTTT--GA-TACG--G-TA--Cttttattcaagaacttactgtgggggcagccaggtcatgttctgggctcacatttcacggaacatttaaattgcattataccgcctgctgaattagggttgggtgggatgccgttggtgatttagtacttatgtaaattagcttttggtattgcagacccgatcagaatcatgggcatctaattctgtgtatttgcagtattgcgttggtcccactttgcggcttattgcggattgtagatctgaaataatcgggtcatctcgcaaccagcagttttgaataatcgtgtcatccccagccaaacatgtcattgtacaaagtctccagaaagttgttagtccttccgaatggatcaaacgtttgatacggtac
gi|7 : tattccttttatggtaagtatctttgaaagcatttcaaggcagaaaaatgggttactatattgtggtaattgtggttagC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATG-GTATC-TTT-----AAAAG---CATGAC----CAGGAATA--AGGGGCTTA-CCA---C--AT-G--AGTA----T-AT-----T--ACTGC---CAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AATGGGGGTTATTATTTATC-CAG-AAC-TTACTTT
gi|7 : ctttgacaatttatccctcTTAA--AAT-GAC-ATACTTT-CTA-T-AATGGGGG-TTATT---ATTTAT-CCA----G--A-ACT-TACTT-TGG------AGA---G---G-----GCA----GCCAG-NN-NNN-N-N-NNNNN--NNNNN-NN--NNNNN-N--NNN-N--N-NN---NN-NNNN--NNN-------NN-NNN-N----N--NN--NNNN--NNN-NNNNNNTTGCCTTCAGT---G--CC-TTCG--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----AA----AT--A-CAG---C-A-----A-CAGA-NNN--NNNNNNN-NN--------NNNNNN---NNNN--NN-N-NNN-NN-NN--N---------N-N-----N-NN--NN-NNNN-NNNNNNNN-N--NNNNN---NNNNN-N-N---NNNNN---------NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNNN-NNNNNNNACA----TGTCATCCC--A-C-AAATATG--TCATTG---TA-CATGTACAATAAA-GTCGCCAGGAAT-----TTG-TTAGTCT-TC--GG----AACGGG-C-AAAAAC-G-TTTCGA-ggagagggcagccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgccttcagtgccttcgtgtattatgtactactaaatatcgccaaatacagcaacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacatgtcatcccacaaatatgtcattgtacatgtacaataaagtcgccaggaatttgttagtcttcggaacgggcaaaaacgtttcga
gi|8 : ctttgacaatttatccctcctttgaaatgatggtatctttaaaagcatgaccaggaataaggggcttaccacatgagtatattactgccaactcTAGTCC-TTGAC-----AGCGGG-C-AAAAACTGTTTT-GA-AACG--GGTT--CTC-CCA--TGGA-T-GAAAT-TGT-----TA-CACTAA-A-CCAAGAAG--CCA-------------TG-AGACTCTTA-CCA-CGGTAAT--C-A-CCATC-GTGACAA----------AACC--GGAA--GTA--CGAGTA-TCATGAAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---ATAT----TG-A-CATC-GAATAAGA--A-AAAA--TC--CCG-AATTT--CTCA--ATT---TTATATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATTCAAA-A----AACTCGAGC--G--C--GGGTTTC---T-A--AAC-CT--A-A--A-AT--AAAAATGCTG
gi|9 : C------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATG-GTATC-TTT-----AAAAG---CATGAC----CAGGAATA--AGGgcg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111111 111 22222 4444444444444 11 22222222 1111111 33333333 111 1111111111 111 11 4444444444444444444 11 222222 11 11 1111 333333 11 44444444444444444 11 222 11 11 111 777777777777777777777777777777777777777 11 11 1111 11 111 11 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111 33333333333333333333333333333 1111 11 11111111111 222222 11 11111111111111111111 1111 111111 222222222222222 11 11 2222222 1111111 111 4444444444444 2222 2222222222222222 11111111111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222222222222222 3333333333 3333333333333 111111 1111111111111111 1 11111 1 11111111 22 11 1111111 11111 111 3333333333333 222 44444444444444 333333333333333 111 1 444444444444444444 11111 1111 111 1111 22 111 111 111 111 1111 11111111
lowQualScore : 77 5 5 000 5 222222 8888 5 88 6 5 8 444 88 55555 0 6666666666666 0 11 66666666 8 6666666 8 8 00000000 444 8888888888 3 8 8 444 8 11 5 8 8 4444444444444444444 33 1 8 333333 0 8 8 8 8 11 88 8 88 8 3 8 11 0 7777 8 111111 0 8 0 11 77777777777777777 11 555 66 3 8 99 11 8 8 8 8 000 8 8 8 8 888888888888888888888888888888888888888 8 11 5 8 11 7777 88 0 8 8 8 8 8 11 777 8 11 5 0 8 3 6666666666666666666666666666666666666666666666666666 66 0 5 5 22222 888 4 888 9 66 4 6 888 11111111111111111111111111111 3333 33 6 88888888888 6 6 3 666666 11 88 5 0 5 88888888888888888888 4 8888 66 4 4 4 222222 444444444444444 66 4 4 4 4 4 00 3 4 22 4 66 4 7777 777 4 66 2222222 55 4 6666666 66 222 5 7777777777777 888 66 5 3333 5 66 66 5 88 66 77 2222222222222222 66666666666666 5 66 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 5 9 5 77 2 000000000000000 5555555555 0 99 0 6 77 77 6 7777777777777 3 3 555555 77 0 9999999999999999 5 5 5 22222 0 4 00000000 5 5 5 0 11 5 77 5 77 6 55 6 2222222 66666 6 6 6 111 99 6666666666666 1 000 11111111111111 6 444444444444444 99 111 99 3 6 3 5 77 5 000000000000000000 6 6 6 66666 6 4444 999 6 6 1 0000 22 88 99 99 111 99 111 6 111 111 6 6 4444 2 99 99 99 6 66666666 6 3 6 99 6 6
lowQualScore : .. . . ... . ...... .... . .. . . . ... .. ..... . ............. . .. ........ . ....... . . ........ ... .......... . . . ... . .. . . . ................... .. . . ...... . . . . . .. .. . .. . . . .. . .... . ...... . . . .. ................. .. ... .. . . .. .. . . . . ... . . . . ....................................... . .. . . .. .... .. . . . . . . .. ... . .. . . . . .................................................... .. . . . ..... ... . ... . .. . . ... ............................. .... .. . ........... . . . ...... .. .. . . . .................... . .... .. . . . ...... ............... .. . . . . . .. . . .. . .. . .... ... . .. ....... .. . ....... .. ... . ............. ... .. . .... . .. .. . .. .. .. ................ .............. . .. ........................................................................ . . . . .. . ............... .......... . .. . . .. .. . ............. . . ...... .. . ................ . . . ..... . . ........ . . . . .. . .. . .. . .. . ....... ..... . . . ... .. ............. . ... .............. . ............... .. ... .. . . . . .. . .................. . . . ..... . .... ... . . . .... .. .. .. .. ... .. ... . ... ... . . .... . .. .. .. . ........ . . . .. . .
lowQualScore : 99 7 7 000 7 111111 3333 7 77 7 6 0 000 88 44444 6 0000000000000 8 00 00000000 0 0000000 0 0 00000000 000 2222222222 2 0 0 000 0 00 0 0 0 6666666666666666666 00 0 0 888888 8 0 0 0 0 00 88 0 88 0 2 0 88 8 0000 0 000000 8 0 8 22 22222222222222222 00 666 44 8 0 00 00 0 0 0 0 000 0 0 0 0 222222222222222222222222222222222222222 0 00 6 0 00 0000 88 8 0 0 0 0 0 00 222 0 00 0 0 0 2 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 99 4 0 0 55555 888 5 888 8 99 2 7 777 33333333333333333333333333333 2222 33 7 55555555555 7 7 2 666666 99 11 0 4 0 88888888888888888888 4 3333 11 4 4 4 888888 444444444444444 11 4 4 4 4 4 66 0 4 22 4 11 4 1111 888 4 11 2222222 88 4 7777777 11 444 0 5555555555555 888 99 0 8888 0 99 99 0 44 99 55 0000000000000000 99999999999999 0 99 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 6 7 4 7 99 9 666666666666666 2222222222 8 22 2 7 55 55 7 2222222222222 7 7 555555 99 1 9999999999999999 0 6 0 55555 0 4 22222222 0 0 0 1 11 0 99 7 99 7 88 7 5555555 77777 7 7 7 777 22 7777777777777 7 444 66666666666666 7 333333333333333 22 888 22 2 7 3 7 99 7 888888888888888888 7 7 7 00000 7 2222 222 7 7 0 8888 55 33 88 22 777 22 777 7 777 777 7 7 2222 5 22 22 22 7 22222222 7 5 7 22 7 7
consensus : AGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAAAAAAAAATA---ACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAA-T---T--TATTCTGCCA-TGTACAGT-ATATT-CATT-TTCA-CTGCTC----T---TTG---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GATG-CACAAGACANT-TGGACAT-----TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAATGG-AAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT-GAACA----------AT-CT--TGATAAC--ATGCTT-TCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAT-CT-C-A-CCA-T-ATTG-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCC--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC-ATGAAAA-AGCA-TCAA-TTA-AAA-T--GAGTT-C-CAGAAT-AGT--ATGTTGTCCT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATA-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGACCAG---GAATA--AGGAG-TT-A-CTATAGC--GT-GTTAGTA-TTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTAT--AAT-GAC-ATACTTTTCTAT-AACGGGGG-T-CATTTATATTTAT-CAA----G--A-ACT-TACTT-TGG------TGG---G---G-------GCA--GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-AT--CACGG-A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CAG---C-G-----A-CAGA-ATC--CATGGGC-GT--------ATGTAT---CATC--AT-T-GCG-TT-GG--T---------C-G-----T-TT--CG-CTCA-TTGGCGGA-T--TTGTA---TTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAACCAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCATCCC--A-CCAAACATG--TCATTG---TA-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-C-AAAAAC-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATTTTT--CCATCG---AT--C-G-TTATC-AT----A----------AACC--GGAAA-NTA--CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-GGA-AAGA--A-AAAAAATC--CCA-AATTTT-CTCA--ATT---TTAT--TT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGC-GG--C--GGGTTTG---T-A--AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
Reference ( family-3108 ) : AGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAAAAAAAAATA---ACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAA-T---T--TATTCTGCCA-TGTACAGT-ATATT-CATT-TTCA-CTGCTC----T---TTG---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GATG-CACAAGACANT-TGGACAT-----TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAATGG-AAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT-GAACA----------AT-CT--TGATAAC--ATGCTT-TCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAT-CT-C-A-CCA-T-ATTG-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCC--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC-ATGAAAA-AGCA-TCAA-TTA-AAA-T--GAGTT-C-CAGAAT-AGT--ATGTTGTCCT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATA-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGACCAG---GAATA--AGGAG-TT-A-CTATAGC--GT-GTTAGTA-TTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTAT--AAT-GAC-ATACTTTTCTAT-AACGGGGG-T-CATTTATATTTAT-CAA----G--A-ACT-TACTT-TGG------TGG---G---G-------GCA--GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-AT--CACGG-A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CAG---C-G-----A-CAGA-ATC--CATGGGC-GT--------ATGTAT---CATC--AT-T-GCG-TT-GG--T---------C-G-----T-TT--CG-CTCA-TTGGCGGA-T--TTGTA---TTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAACCAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCATCCC--A-CCAAACATG--TCATTG---TA-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-C-AAAAAC-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATTTTT--CCATCG---AT--C-G-TTATC-AT----A----------AACC--GGAAA-NTA--CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-GGA-AAGA--A-AAAAAATC--CCA-AATTTT-CTCA--ATT---TTAT--TT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGC-GG--C--GGGTTTG---T-A--AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
gi|1 : AGGCC--AG-C-ATATTT-TTT--TA--ATT-A--TTAGGTTTTAC-GAACCC-CAGAATGATAAAGTCCGGTAGGAG-GAGG---AAATAAATAAAAGAAAATATCAACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAACT---T--TATGCTGCGAATGTACATT--TAT---ATT-TACA-CTGCTTCCTTT---TTGTAAATGCTGGTACTGAATCGAAA--GACTGCC-TTGC---CAA-TATGGCCACT-CAA-CAGTTA-CAAT-----AGTCAGGAGGATGGCACAAGACACT-TGGACAT-----TTAATTTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCTTG-CCAG-TTCTT-CATCTT-TTCCA-GATAGTAAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATTGACAA-TAATTGAACATATGAGATCAAT-CTATTGATAACGCATGCTC--CATAAATCAGA-GAG-CAG-TA--ATAATTG-TG-AAC-CT-C-A-CCA-TTATTGATT-A-----------TTTAA-------GAAT-------GCA--GAGA--ATTTC-G--AAAGTTGTTTGT-ATGAAAA-AGCA-TCAAGTTA-AAAAT--GAGTTTC-CAGAATTAGT--ATTTTGTCTT-CCGAGGG-C------------TT---------TG--------------------A------AATG--A-A-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGACCAG---AAATATTAGGAG-TTTATCTATAGCTTAT-GTTAGTT-TAAT-ATT--T-T--GTT------ATCT-ATTG-CAA-----ATA---CTT-C-GAT-AA---------------AT--AAT-GAC-AT--TTTTTTATTAACGGGGG-TTCATTTATATTCAT-CAAT---G--ATACT-TACTTCTGG------TTGCTTG---GCTGCCGTACATTGCCAG-TC-ATA-CAG-TTCTG--C-CACTAT--CACGG-A--ACATT--T-TA---AT-GCCT--TATTTG----GC-TGATATT--T--GG--GGTG--TGGTG-------------GGTAGGG--CC-TT-G--TGTTATTTTATAGCTACT-AC-GAAATAGGTCTGCC----GATGATAC-TG-CAG---T-GTATCTA-CGGA-ACCTTTATG----GC--------ACATAT---CATCTAAT-T-GCT-GT-GGAAT---------C-GCGCTAT-TTACCG-CCCA-TTGGCGGA-TCCTTGTA---TTGAC-GTT---CGGGG---------TCAATCGGTCGCATCACT-CAG----TGA-TATATATT----ACGGTTCTATTAGCAA--A-TCAAACATGTTTCATTGTTTTATCAT-----ATAAACGTCGTCAG-AGGAATGTTTGATTAGTCC-TC--TGCAGCAACCGG-C-AATAA--GGTTTCG--AACGTCG-TACTCTC-CCATTTCGAGT-GA--T-TTTTCTGGTATCATTAATATC---AAAGTCCTATATCACGTATGATTACAGATTTTTTCTCATCC---AT--C-GTTTGTCGAT----A----------AACC--GGAAGTTTATTTGAGGTATCGTAAAATG-CGAAA--T-CTCGAT------------CTTGGGCC-GA-TGTC-A---AT-TATTCTGTA-CTTC-GGA-AAGG--C-ACAAAATC--CCA-AATTTTGCTCA--ATT---TTAT--TTATGTTT-TCT---TAAAAATTATTC-AA-A----AACTCGGTC-GG--CCGGGGTTTT---T-A--AAC-CTAAA-AATA-AT-AAGAAA
gi|1 : ttGCC--AGGC-AT---C-TTTCTTATTATT-T--TTAGGTTT-AA-AAACCC-CGGgatgcctggc
gi|10 : ttaggccagcatatttttttaattattaggttttacgaaccccagaatgataaagtccggtaggaggaggaaataaataaaagaaaatatcaactttttgatacattatcaactttatgctgcgaatgtacatttatatttacactgcttcctttttgtaaatgctggtactgaatcgaaagactgccttgccaatatggccactcaacagttacaatagtcaggaggatggcacaagacacttggacatttaatttgttaatctcatcattgtcttgccagttcttcatcttttccagatagtaagcacatctggacagttcctattgacaataattgaacatatgagatcaatctattgataacgcatgctccataaatcagagagcagtaataattgtgaacctcaccattattgattatttaagaatgcagagaatttcgaaagttgtttgtatgaaaaagcatcaagttaaaaatgagtttccagaattagtattttgtcttccgagggctttgaaatgaagtatctttgaaagcatgaccagaaatattaggagtttatctatagcttatgttagtttaatattttgttatctattgcaaatacttcgataaataatgacatttttttattaacgggggttcatttatattcatcaatgatacttacttctggttgcttggctgccgtacattgccagtcatacagttctgccactatcacggaacattttaatgccttatttggctgatatttggggtgtggtgggtagggccttgtgttattttatagctactacgaaataggtctgccgatgatactgcagtgtatctacggaacctttatggcacatatcatctaattgctgtggaatcgcgctatttaccgcccattggcggatccttgtattgacgttcggggtcaatcggtcgcatcactcagtgatatatattacggttctattagcaaatcaaacatgtttcattgttttatcatataaacgtcgtcagaggaatgtttgattagtcctctgcagcaaccggcaataaggtttcgaacgtcgtactctcccatttcgagtgatttttctggtatcattaatatcaaagtcctatatcacgtatgattacagattttttctcatccatcgtttgtcgataaaccggaagtttatttgaggtatcgtaaaatgcgaaatctcgatcttgggccgatgtcaattattctgtacttcggaaaggcacaaaatcccaaattttgctcaattttatttatgttttcttaaaaattattcaaaaactcggtcggT-CAA----G--A-ACT-TACTT-TGG------TGG---G---G-------GCA--GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-GC--CACGG-A--ATA-T--C-AA---AT-GTAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTC--TGG-GACTGTCTTC----AGT---G--CC-TTGG--TG-TA--TTATG--CACT-AT-TAAATA--TC---------A----A-----CA----C-G-----A-CATA-ATC--CATGGGC-AT--------ATGATT---TGGT--ATAT-ACC-TT-G-------------T-G-----T-TT------TAA-TT-GCGGA-T--TTGTA---TT
gi|11 : --AAT-GAC-ATAC-TTTCTAT------------------TATTTAT-CAAGATCG--A-ACT-TACTT-TGG------T-G---G---G-------GCA--GCAAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--GTC----------------ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----A--GG--GTTA--TGG-G-------------AGT---G--CC-TTGG--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TT-GCC----GA----A--TG-CAG---C-A-----A-CATA-ATC--CATGGGC-AT------------------ATC--AT-T-GCATTT-GG--T---------t
gi|12 : TT-CAAAA--TTCTCGATTACTTTCTTCAGC-----CCAGA-TG-T-ACAAAT-T----TG-AGCATCTGGG-AAGATAATAAAAAATCT-CCATAATTGT-TTCA--ATT---TTAT--TT---TTT-ATCATATATAA---ATTC-AATAAACCAACTCGAGC-GG--C--GGTTTTGAATT-AATAACACTAAA-A--ATCT-AAAAAA
gi|13 : tcgtagtataattAACATG--TCATCG----A-CA------ATAAA-GTC-TCAG-GAG-----TAG-CTAGTCC-AC--TG----AATGGC-C-AAATAC-GTTT--GA-AACT--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-AA--A-TTT-----TA-TGCTAA-A-C---AAAG--TCA-------------TACAGATCT
gi|14 : G-T-CAT--A-ATTTGA-CAA----A--T-ACT-TACTT-GGG------TGG---G---G-------GCA--GCCAG-TC-ATG-C-A-TTCTG--CTTAC-AT--CACGG-AGCACA-T--C-AA---AT-GCAT--TTC-------GT-TTA-G----T--GG--Gaccatgataacc
gi|15 : ---AT--C-G-TTATC-AG----A----------AACC--GGAAA-ATA--TGAG-T-TCGT-AAATT-CAAAA--T-
gi|16 : c-CA------ATAAA-GTCGCCAGGAAG-----TTG-TTAGTCT-TC--GG----AACGG
gi|2 : AGGCCTTAG-C-AT---TATTT--TA--TCTGT--TTAGGTGT-AC-GAGCCCGCAGAAT-ATAAAGTCCCGTAGGAGTGAGAAATAAACAA-TAAAAAAACA-A---ATTTTTTGCG----------ATACAATCTATCAA-C---TTATATTCTG-CA-TTAACAGTCATATT-CATTCTTCATCTGCTC----TTCATTG---ATGCT----CT----CGGAACAGACT-TCATTGTGCGCAAGT--GGCGCCA-CAACCAGCTTACCATAAGTAAG-------GATG-CACAAGACAATGTGAACACATAAGTTAAATTGTTCAATGCTCGATCACGTCGGTCT-GCCCAGCTTCTTGCATCCTCTTCCACAATTG--AGCACATTGCTGTGAACAGTTTCC------TA-T-ACAAATAAT-AAACA----------ATGTT--TCATAAC--ATGCTTGTCATTAA-CAAAAGAG-CA--TAGGTAGATTGTTG-AATACTGCGA-CCAGT-ATTG-GT-A-----------GT--ACTTCACTCAATA---GATGCTAGGA-AAGTTGTCTG--AA----GTTTTCAATGAAAAGAGCAGTTAA-TAACAAA-TGGGAGCTAC-CAGAAT-AGTAAATGTTGCCCTGCTGAGGTGCATCGTGTGACAATTGTATTCAAGTG--------------------ACTTTTAAATGTTATA-G-ATCATTTCTACTGAAAGAGCTATGA-CAG---GAA-A--AGG-G-TT-T-CTATGGT--ATCATTAGTA-TAGT--TC--GATCCATTGCCAAGAACTAGTTAGAGATGTACATATACCTTTCATAT-Acc
gi|2 : a-T-CATATAT-TTTAT-CAA----GGTA-ACT-TACTT-TGG------TGA---GATGG-------GCA--GCAAG-TCTATAAC-G-TTCTGG-TTCAC-ATATCAAGGGA--ACA-TTCC-AATCAGT-GAATCATAC-------GCGTGG-AAATCT--GGTCGTTAA-TGG-G-------------AGT---GTGCC-TT-GAGTG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC--CC----GA----ACGTGACAG---C-G-----A-CAGATATC--CATGGG--------------GCAT---CATC--AT-TTGCA-TTTGG--TTCTGCATTGC-G-----T-GT--CA-CTCA-TTGGCCGA-T--TTGTA---T-GCCAG-T---CGGGGGCTCATGACTCAATC--TCGCAACCATGCAGTGTTTGAGAATT-A------A-G----TATCATTCC--AATCTAACATG--TCATTG----G-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-CAAAAAAC-GTTT--GACAACG--G-TT--CTCACCA--TCGA-TAAA--T-TTG-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATCTTA--CCA-CG---GTAAC---CTACC-AT----ACGTGTCCAATAACC--GGAAG-CTA--CGAGTT-CCGT-AAATTCCAAGAACT-CTCGAT------------C-----CC-GATTG-CAA---AT-T----TGCA-CATC-GGA-AGAT--A-AAAAAATCG-TCA-AATTTG-CTCAGGATTACATTAT--TT---TTT-TTC---TAAAA---ATGC--A-A----AACTCGAGC-GGGCC--GGTTCTG---T-A--AAC-CTAAATA--A-AT-AAAAAAttttatcaaggtaacttactttggtgagatgggcagcaagtctataacgttctggttcacatatcaagggaacattccaatcagtgaatcatacgcgtggaaatctggtcgttaatgggagtgtgccttgagtgtattatgtactactaaatatcccgaacgtgacagcgacagatatccatggggcatcatcatttgcatttggttctgcattgcgtgtcactcattggccgatttgtatgccagtcgggggctcatgactcaatctcgcaaccatgcagtgtttgagaattaagtatcattccaatctaacatgtcattggcaataaagtcgccagaagttgttagtcctccgaacgggcaaaaaacgtttgacaacggttctcaccatcgataaatttgtacactaaacaaagccatacagatcttaccacggtaacctaccatacgtgtccaataaccggaagctacgagttccgtaaattccaagaactctcgatcccgattgcaaatttgcacatcggaagataaaaaaatcgtcaaatttgctcaggattacattattttttttctaaaaatgcaaaactcgagcgggccggttctgtaaacctaaataaataaaaaaatagctg
gi|2 : aaggccttagcattattttatctgtttaggtgtacgagcccgcagaatataaagtcccgtaggagtgagaaataaacaataaaaaaacaaattttttgcgatacaatctatcaacttatattctgcattaacagtcatattcattcttcatctgctcttcattgatgctctcggaacagacttcattgtgcgcaagtggcgccacaaccagcttaccataagtaaggatgcacaagacaatgtgaacacataagttaaattgttcaatgctcgatcacgtcggtctgcccagcttcttgcatcctcttccacaattgagcacattgctgtgaacagtttcctatacaaataataaacaatgtttcataacatgcttgtcattaacaaaagagcataggtagattgttgaatactgcgaccagtattggtagtacttcactcaatagatgctaggaaagttgtctgaagttttcaatgaaaagagcagttaataacaaatgggagctaccagaatagtaaatgttgccctgctgaggtgcatcgtgtgacaattgtattcaagtgacttttaaatgttatagatcatttctactgaaagagctatgacaggaaaagggtttctatggtatcattagtatagttcgatccattgccaagaactagttagagatgtacatataccttC--AG-CTAT---T-TTT--TT--ATT-TATTTAGGTTT-ACAGAACCatagctg
gi|3 : aaggccttagcattattttatctgtttaggtgtacgagcccgcagaatataaagtcccgtaggagtgagaaataaacaataaaaaaacaaattttttgcgatacaatctatcaacttatattctgcattaacagtcatattcattcttcatctgctcttcattgatgctctcggaacagacttcattgtgcgcaagtggcgccacaaccagcttaccataagtaaggatgcacaagacaatgtgaacacataagttaaattgttcaatgctcgatcacgtcggtctgcccagcttcttgcatcctcttccacaattgagcacattgctgtgaacagtttcctatacaaataataaacaatgtttcataacatgcttgtcattaacaaaagagcataggtagattgttgaatactgcgaccagtattggtagtacttcactcaatagatgctaggaaagttgtctgaagttttcaatgaaaagagcagttaataacaaatgggagctaccagaatagtaaatgttgccctgctgaggtgcatcgtgtgacaattgtattcaagtgacttttaaatgttatagatcatttctactgaaagagctatgacaggaaaagggtttctatggtatcattagtatagttcgatccattgccaagaactagttagagatgtacatatacctttcatatattttatcaaggtaacttactttggtgagatgggcagcaagtctataacgttctggttcacatatcaagggaacattccaatcagtgaatcatacgcgtggaaatctggtcgttaatgggagtgtgccttgagtgtattatgtactactaaatatcccgaacgtgacagcgacagatatccatggggcatcatcatttgcatttggttctgcattgcgtgtcactcattggccgatttgtatgccagtcgggggctcatgactcaatctcgcaaccatgcagtgtttgagaattaagtatcattccaatctaacatgtcattggcaataaagtcgccagaagttgttagtcctccgaacgggcaaaaaacgtttgacaacggttctcaccatcgataaatttgtacactaaacaaagccatacagatcttaccacggtaacctaccatacgtgtccaataaccggaagctacgagttccgtaaattccaagaactctcgatcccgattgcaaatttgcacatcggaagataaaaaaatcgtcaaatttgctcaggattacattattttttttctaaaaatgcaaaactcgagcgggccAGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC---ACCC-CAGAATTATAAAGTCTCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAATAAAAAATA---ACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAC-T---T--TATTCTGCCA-TGTACATT-AT------TA-TTCA-CTGCTC----T---TTG---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGC-ACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GGTG-CACAAGACACT-TGGACAT-----T-AAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAGTGG-AAGCATATC----TGGACAG-TTCCG-----TATC-A-AAATAAT-GAACA----------A--CT--TGATAGC--ATGCTTCTCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAC-CT-C-A-CCA-T-ATGA-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCT--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC--TG-AAA-AGCA-TCAA-TTA-AAA-T--GAGTT-C-CAGAAT-AGT--ATGCTGT-CT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--AAA-GTATC-TTT-----TGAAA---CATGACCGG---AAATA--TGGAG-TT-A-CTATAGT--AT-GTTAGTATTTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACAT-----TTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTAT--ATTCAAC-ATTTTTTTCTAT-AACGGGGA-T-CATTTATATTCAT-CAA----G--A-ACT-TACTT-TGGTTACTTTGGCT-G---C-------TCA--GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--TTC-C-AT--CACGG-A--ACA-T--T-AA---AT--CAC--TAT-------G--TGA-A----T--GC--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TAC--AA-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CA----C-G-------CAGA-ATC--CATGGACTAC--------ATGTAT---CATC--AT-T-GCG-TT--G--T---------C-G-----T-TT--CG-C-CA-TT-GCGGA-T--TTGTA---CTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAA-CAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCAT-GC--A-CAAAACATG--TCATTG---TA-CA------A-AAA-GTCGCCAA-AAG-----TTG-TTAGTC---C--CG----AACGGG-C-AAAAAA-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCAC-TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CATT-A-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATTTCT--CCAC-----AT--CAG-TTGTC-AT----A----------AACC--GGAAA-GT---CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-AGA-AAGA--A-AAAAAA----CCA-G--TTT-CTCA--ATT---TTAT--TT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGCTGG--C--GGGTTTG---T-AT-AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
gi|4 : GCC--AG-C-AT---T-TGT---A--ATT-T--TTAGGTTT-AC-TAACCA-CAGCATTATAAAGTCCCTTAG-AG-GAGA---GAATTT-TAAAAAAAAG-A---ACTTTGT-------------AT-TA--TTATTAA-TAACT--TATT--GCTA-TGTACAGT-ACATTTCATT-TTCA-TT-CTT----T---TTC---ATGCT----TT----CGAAACAGAAT-CC-TTGC----AA-T--G-TCACATCAA-CATTTA---------------------T------AGACAGT-TGGACAT-----TTAAATTGCT-AAT-CTC-ATCAA-T--GTC--G--CAA-TTTCT-CATC---TTTCACAATGG-AAGCACA-------AGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT--AATA----------AC-AC--TGATAAC--ATGCTA-TAATAAATCAAAAGAGACA--TA--TAAATTG-CATAAT-CT-C-ACCCA-T-ATTG-TT-A------------T--A-------GAATT---GCAGAC--AA-A--TT----GGTAA----GTTTTC-ATGAAAA-G--A-TCAA-TTA-AAA-T--GAGTA-T-CAGAAT-AGT--AT-TTATCCC------GGGC------------TT---------TGATATTATCCCTCCTTC----A------AATG--ATA--CATC-TTT-----GAAAG---CATGG-CAG---AAA-A--AGGAG-TT-A-CTATAG---GT-GT---TA-TTAG-ATC----T--ATTGC---AAAC--CTTA-AAA-G-ACATA---CTTTC-TAT--ACGGTC---AT-ATTTATCAAAG-AACTATACTTTT
gi|4 : aTTAA--AA--GAC-ATACTTT-CTAT-A-CGG---------TCATATTTAT-CAAA---G--A-ACTATACTT-T--------TGG---G------------CA--GCC-G-TC-ATA-C-GATTCT---CTCAC-AT--CACG--A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GG-TGA-A----T--GG----TA--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-GGTTA-TA--TTAT----ACT-A---GAATA--TC-GCC----AA----AT--G-CAG---CCG-----A-CAG----C--CAT---C-GT--------AT--------ATC--AT-T--TG-TT-AA--T---------CTG-----CATT--TG-CTCACTTTGTGGAAT--TGGTA---T---C-A-T---CGGA----------TCAATT--TCGCAACCAT-CAAT-TTTGA-ATTA-A------AC-----T-TCATTCC--A-C-AAACATG--T-AT-G---TA-CA-------TAAA-GTC--CAG-AAG-----TTGGTTAGTCC-TC--CG----AACG---C-AAAA-C-GTTT-CGA-AACG--T-TA--CTC-CCA--TCGA-T--A--TATTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGA--TTA--CCATC----AT--C---TTATC-AT----A----------AACCCAGGAAA-TTA--CGAGTT-CCGC-TAATT--AACA--T-CTCGAC------------C-----CC-GA-TA-CGA---AT-T----TA----ATC-GGA-AA-A--A-AAAAAATCTTCC--AATTTT-CTCA--ATT---TTTT--TT---TTTCTTC---T-AAT---ATTC-AA-A----AACTCGA-C-TG--C--GG--TTG---TAA--AAC-CTTAT-A--A-ATAAAAAAATGCTGgggcagccgtcatacgattctctcacatcacgaacatcaaatgcattacggtgaatggtatgggagtgccttggttatattatactagaatatcgccaaatgcagccgacagccatcgtatatcatttgttaatctgcatttgctcactttgtggaattggtatcatcggatcaatttcgcaaccatcaattttgaattaaacttcattccacaaacatgtatgtacataaagtccagaagttggttagtcctccgaacgcaaaacgtttcgaaacgttactcccatcgatatattttacactaaacaaagccatacagattaccatcatcttatcataaacccaggaaattacgagttccgctaattaacatctcgaccccgatacgaatttaatcggaaaaaaaaaaatcttccaattttctcaatttttttttttcttctaatattcaaaaactcgactgcggttgtaaaaccttataaataaaaaaatgctgc
gi|5 : agccagcatttgtaatttttaggtttactaaccacagcattataaagtcccttagaggagagaattttaaaaaaaagaactttgtattattattaataacttattgctatgtacagtacatttcattttcattctttttcatgctttcgaaacagaatccttgcaatgtcacatcaacatttatagacagttggacatttaaattgctaatctcatcaatgtcgcaatttctcatctttcacaatggaagcacaagacagttcctattacaaataataataacactgataacatgctataataaatcaaaagagacatataaattgcataatctcacccatattgttatagaattgcagacaaattggtaagttttcatgaaaagatcaattaaaatgagtatcagaatagtatttatcccgggctttgatattatccctccttcaaatgatacatctttgaaagcatggcagaaaaaggagttactataggtgttattagatctattgcaaaccAGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TT--ATA-T--TTAGGGTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAAGAG-GAGG---AAATAA----AAAAAAAT----------T--GGGGGGGGGGGATACA--TTATCAAGT---T--TATTCTGCCA-AGTACAGT-GTATT-CATT-TTCA-CTGCTCT---T---TTG---ATGCT----CT----CGAATTAGACT-CC-ATGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAAAAAT-----AT-------GATT-CACACGACAGT-TGGATA------TTAAATTGTT-AAT-TTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG----TT-CATCCT-TTCCACAATGG-GAGCACGTC----TGGACAG-TTCCTACATGTATT-ACGAACAAG-GAACA----------GT-TT--TGATAAC--ATG------ATAA--CAAAGGAG-TATTTA--TGTATTG-TG-AAT-CT-C-G-CCA-T-ATTG-TTCATATTAATGGCTTT--A-------GAATTCTAG--AC----A-A--TTTTC-G--AA----GAATTC-ATGAAAA-AGCA-TCAA-TTA-AAA-T--GAGTT-CACA-AAT-AGA--ATGTTGT-CT-CCGAAGGAC------------TT---------TGACAAGTATATCCCTGCTTTAA------AATA--ATA-GTACC-TTT-----GAAAG---CATGATCAG---GAAAA--AGc
gi|6 : ATG--GTAAGTATC-TTT-----GAAAG---CATTTCAAGGCAGAAAA--ATGGG-TT-A-CTATATT--GT-GGTA--A-TTGTGGTTAGTAT--ATTGT---ATATT---------------------TTTC-TATGAACGGGGT--CTCATTT
gi|6 : tattccttttTAT--ATT-G-T-ATATTTTTCTATGAACGGGGTCT-CATTT-T-TTTATTCAA----G--A-ACT-TACT----G------TGG---G---G-------GCA--GCCAGGTC-AT----G-TTCTGGGCTCAC-ATTTCACGG-A--ACA-T--TTAA---ATTGCAT--TATACCGCCTGC-TGA-A----TTAGG--GTTGGGTGG-G-------------A-T---G--CCGTT-GG-TG-AT--TTA-G--TACTTATGTAAAT---TA-GCTTTTGGT----AT-TG-CAGACCC-G-----ATCAGA-ATC---ATGGGC-ATCTAATTCTGTGTATTTGCAGT--AT-T-GCG-TT-GG--T---------C-CCAC--T-TTG-CGGCTTA-TTG-CGGA-T--T-GTAGATCTGAA-A-TAATCGGG----------TCA-TC--TCGCAACCAG-CAGT-TTTG--AATA-A------TCG----TGTCATCCCCAG-CCAAACATG--TCATTG---TA-C---------AAA-GTCTCCAGAAAG-----TTG-TTAGTCCTTC--CG----AATGGATC---AAAC-GTTT--GA-TACG--G-TA--Cttttattcaagaacttactgtgggggcagccaggtcatgttctgggctcacatttcacggaacatttaaattgcattataccgcctgctgaattagggttgggtgggatgccgttggtgatttagtacttatgtaaattagcttttggtattgcagacccgatcagaatcatgggcatctaattctgtgtatttgcagtattgcgttggtcccactttgcggcttattgcggattgtagatctgaaataatcgggtcatctcgcaaccagcagttttgaataatcgtgtcatccccagccaaacatgtcattgtacaaagtctccagaaagttgttagtccttccgaatggatcaaacgtttgatacggtac
gi|7 : tattccttttatggtaagtatctttgaaagcatttcaaggcagaaaaatgggttactatattgtggtaattgtggttagC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATG-GTATC-TTT-----AAAAG---CATGACCAG---GAATA--AGGGGCTT-A-CCA---C--AT-G--AGTA----T-AT-----T--ACTGC---CAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AATGGGGGTTATTATTTATC-CAG-AAC-TTACTTT
gi|7 : ctttgacaatttatccctcTTAA--AAT-GAC-ATACTTT-CTAT-AATGGGGG-T-TATT---ATTTAT-CCA----G--A-ACT-TACTT-TGG------AGA---G---G-------GCA--GCCAG-NN-NNN-N-N-NNNNN--NNNNN-NN--NNNNN-N--NNN-N--N-NN---NN-NNNN--NNN-------NN-NNN-N----N--NN--NNNN--NNN-NNNNNNTTGCCTTCAGT---G--CC-TTCG--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----AA----AT--A-CAG---C-A-----A-CAGA-NNN--NNNNNNN-NN--------NNNNNN---NNNN--NN-N-NNN-NN-NN--N---------N-N-----N-NN--NN-NNNN-NNNNNNNN-N--NNNNN---NNNNN-N-N---NNNNN---------NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNNN-NNNNNNNACA----TGTCATCCC--A-C-AAATATG--TCATTG---TA-CATGTACAATAAA-GTCGCCAGGAAT-----TTG-TTAGTCT-TC--GG----AACGGG-C-AAAAAC-G-TTTCGA-ggagagggcagccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgccttcagtgccttcgtgtattatgtactactaaatatcgccaaatacagcaacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacatgtcatcccacaaatatgtcattgtacatgtacaataaagtcgccaggaatttgttagtcttcggaacgggcaaaaacgtttcga
gi|8 : ctttgacaatttatccctcctttgaaatgatggtatctttaaaagcatgaccaggaataaggggcttaccacatgagtatattactgccaactcTAGTCC-TTGAC-----AGCGGG-C-AAAAACTGTTTT-GA-AACG--GGTT--CTC-CCA--TGGA-T-GAAAT-TGT-----TA-CACTAA-A-CCAAGAAG--CCA-------------TG-AGACTCTTA-CCA-CGGTAAT--C-A-CCATC-GTGACAA----------AACC--GGAA--GTA--CGAGTA-TCATGAAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---ATAT----TG-A-CATC-GAATAAGA--A-AAAA--TC--CCG-AATTT--CTCA--ATT---TTATATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATTCAAA-A----AACTCGAGC--G--C--GGGTTTC---T-A--AAC-CT--A-A--A-AT--AAAAATGCTG
gi|9 : C------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATG-GTATC-TTT-----AAAAG---CATGACCAG---GAATA--AGGgcg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111111 111 22222 4444444444444 11 22222222 1111111 33333333 111 1111111111 111 11 4444444444444444444 11 222222 11 11 1111 333333 11 44444444444444444 11 222 11 11 111 777777777777777777777777777777777777777 11 11 1111 11 111 11 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111 33333333333333333333333333333 1111 11 11111111111 222222 11 11111111111111111111 1111 111111 222222222222222 11 11 2222222 1111111 111 4444444444444 2222 2222222222222222 11111111111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222222222222222 3333333333 3333333333333 111111 1111111111111111 1 11111 1 11111111 22 11 1111111 11111 111 3333333333333 222 44444444444444 333333333333333 111 1 444444444444444444 11111 1111 111 1111 22 111 111 111 111 1111 11111111
lowQualScore : 77 5 5 000 5 222222 8888 5 88 6 5 8 444 88 55555 0 6666666666666 0 11 66666666 8 6666666 8 8 00000000 444 8888888888 3 8 8 444 8 11 5 8 8 4444444444444444444 33 1 8 333333 0 8 8 8 8 11 88 8 88 8 3 8 11 0 7777 8 111111 0 8 0 11 77777777777777777 11 555 66 3 8 99 11 8 8 8 8 000 8 8 8 8 888888888888888888888888888888888888888 8 11 5 8 11 7777 88 0 8 8 8 8 8 11 777 8 11 5 0 8 3 6666666666666666666666666666666666666666666666666666 66 0 5 5 22222 888 4 888 9 66 4 6 888 11111111111111111111111111111 3333 33 6 88888888888 6 6 3 666666 11 88 5 0 5 88888888888888888888 4 8888 66 4 4 4 222222 444444444444444 66 4 4 4 4 4 00 3 4 22 4 66 4 7777 777 4 66 2222222 55 4 6666666 66 222 5 7777777777777 888 66 5 3333 5 66 66 5 88 66 77 2222222222222222 66666666666666 5 66 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 5 9 5 77 2 000000000000000 5555555555 0 99 0 6 77 77 6 7777777777777 3 3 555555 77 0 9999999999999999 5 5 5 22222 0 4 00000000 5 5 5 0 11 5 77 5 77 6 55 6 2222222 66666 6 6 6 111 99 6666666666666 1 000 11111111111111 6 444444444444444 99 111 99 3 6 3 5 77 5 000000000000000000 6 6 6 66666 6 4444 999 6 6 1 0000 22 88 99 99 111 99 111 6 111 111 6 6 4444 2 99 99 99 6 66666666 6 3 6 99 6 6
lowQualScore : .. . . ... . ...... .... . .. . . . ... .. ..... . ............. . .. ........ . ....... . . ........ ... .......... . . . ... . .. . . . ................... .. . . ...... . . . . . .. .. . .. . . . .. . .... . ...... . . . .. ................. .. ... .. . . .. .. . . . . ... . . . . ....................................... . .. . . .. .... .. . . . . . . .. ... . .. . . . . .................................................... .. . . . ..... ... . ... . .. . . ... ............................. .... .. . ........... . . . ...... .. .. . . . .................... . .... .. . . . ...... ............... .. . . . . . .. . . .. . .. . .... ... . .. ....... .. . ....... .. ... . ............. ... .. . .... . .. .. . .. .. .. ................ .............. . .. ........................................................................ . . . . .. . ............... .......... . .. . . .. .. . ............. . . ...... .. . ................ . . . ..... . . ........ . . . . .. . .. . .. . .. . ....... ..... . . . ... .. ............. . ... .............. . ............... .. ... .. . . . . .. . .................. . . . ..... . .... ... . . . .... .. .. .. .. ... .. ... . ... ... . . .... . .. .. .. . ........ . . . .. . .
lowQualScore : 99 7 7 000 7 111111 3333 7 77 7 6 0 000 88 44444 6 0000000000000 8 00 00000000 0 0000000 0 0 00000000 000 2222222222 2 0 0 000 0 00 0 0 0 6666666666666666666 00 0 0 888888 8 0 0 0 0 00 88 0 88 0 2 0 88 8 0000 0 000000 8 0 8 22 22222222222222222 00 666 44 8 0 00 00 0 0 0 0 000 0 0 0 0 222222222222222222222222222222222222222 0 00 6 0 00 0000 88 8 0 0 0 0 0 00 222 0 00 0 0 0 2 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 99 4 0 0 55555 888 5 888 8 99 2 7 777 33333333333333333333333333333 2222 33 7 55555555555 7 7 2 666666 99 11 0 4 0 88888888888888888888 4 3333 11 4 4 4 888888 444444444444444 11 4 4 4 4 4 66 0 4 22 4 11 4 1111 888 4 11 2222222 88 4 7777777 11 444 0 5555555555555 888 99 0 8888 0 99 99 0 44 99 55 0000000000000000 99999999999999 0 99 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 6 7 4 7 99 9 666666666666666 2222222222 8 22 2 7 55 55 7 2222222222222 7 7 555555 99 1 9999999999999999 0 6 0 55555 0 4 22222222 0 0 0 1 11 0 99 7 99 7 88 7 5555555 77777 7 7 7 777 22 7777777777777 7 444 66666666666666 7 333333333333333 22 888 22 2 7 3 7 99 7 888888888888888888 7 7 7 00000 7 2222 222 7 7 0 8888 55 33 88 22 777 22 777 7 777 777 7 7 2222 5 22 22 22 7 22222222 7 5 7 22 7 7
consensus : AGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAAAAAAAAATA---ACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAA-T---T--TATTCTGCCA-TGTACAGT-ATATT-CATT-TTCA-CTGCTC----T---TTG---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GATG-CACAAGACANT-TGGACAT-----TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAATGG-AAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT-GAACA----------AT-CT--TGATAAC--ATGCTT-TCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAT-CT-C-A-CCA-T-ATTG-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCC--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC-ATGAAAA-AGCA-TCAA-TTA-AAA-T--GAGTT-C-CAGAAT-AGT--ATGTTGTCCT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATA-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGACCAG---GAATA--AGGAG-TT-A-CTATAGC--GT-GTTAGTA-TTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTAT--AAT-GAC-ATACTTTTCTAT-AACGGGGG-T-CATTTATATTTAT-CAA----G--A-ACT-TACTT-TGG------TGG---G---G-------GCA--GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-AT--CACGG-A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CAG---C-G-----A-CAGA-ATC--CATGGGC-GT--------ATGTAT---CATC--AT-T-GCG-TT-GG--T---------C-G-----T-TT--CG-CTCA-TTGGCGGA-T--TTGTA---TTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAACCAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCATCCC--A-CCAAACATG--TCATTG---TA-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-C-AAAAAC-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATTTTT--CCATCG---AT--C-G-TTATC-AT----A----------AACC--GGAAA-NTA--CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-GGA-AAGA--A-AAAAAATC--CCA-AATTTT-CTCA--ATT---TTAT--TT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGC-GG--C--GGGTTTG---T-A--AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
Reference ( family-3108 ) : AGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAAAAAAAAATA---ACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAA-T---T--TATTCTGCCA-TGTACAGT-ATATT-CATT-TTCA-CTGCTC----T---TTG---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GATG-CACAAGACANT-TGGACAT-----TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAATGG-AAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT-GAACA----------AT-CT--TGATAAC--ATGCTT-TCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAT-CT-C-A-CCA-T-ATTG-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCC--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC-ATGAAAA-AGCA-TCAA-TTA-AAA-T--GAGTT-C-CAGAAT-AGT--ATGTTGTCCT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATA-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGACCAG---GAATA--AGGAG-TT-A-CTATAGC--GT-GTTAGTA-TTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTAT--AAT-GAC-ATACTTTTCTAT-AACGGGGG-T-CATTTATATTTAT-CAA----G--A-ACT-TACTT-TGG------TGG---G---G-------GCA--GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-AT--CACGG-A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CAG---C-G-----A-CAGA-ATC--CATGGGC-GT--------ATGTAT---CATC--AT-T-GCG-TT-GG--T---------C-G-----T-TT--CG-CTCA-TTGGCGGA-T--TTGTA---TTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAACCAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCATCCC--A-CCAAACATG--TCATTG---TA-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-C-AAAAAC-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATTTTT--CCATCG---AT--C-G-TTATC-AT----A----------AACC--GGAAA-NTA--CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-GGA-AAGA--A-AAAAAATC--CCA-AATTTT-CTCA--ATT---TTAT--TT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGC-GG--C--GGGTTTG---T-A--AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
gi|1 : AGGCC--AG-C-ATATTT-TTT--TA--ATT-A--TTAGGTTTTAC-GAACCC-CAGAATGATAAAGTCCGGTAGGAG-GAGG---AAATAAATAAAAGAAAATATCAACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAACT---T--TATGCTGCGAATGTACATT--TAT---ATT-TACA-CTGCTTCCTTT---TTGTAAATGCTGGTACTGAATCGAAA--GACTGCC-TTGC---CAA-TATGGCCACT-CAA-CAGTTA-CAAT-----AGTCAGGAGGATGGCACAAGACACT-TGGACAT-----TTAATTTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCTTG-CCAG-TTCTT-CATCTT-TTCCA-GATAGTAAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATTGACAA-TAATTGAACATATGAGATCAAT-CTATTGATAACGCATGCTC--CATAAATCAGA-GAG-CAG-TA--ATAATTG-TG-AAC-CT-C-A-CCA-TTATTGATT-A-----------TTTAA-------GAAT-------GCA--GAGA--ATTTC-G--AAAGTTGTTTGT-ATGAAAA-AGCA-TCAAGTTA-AAAAT--GAGTTTC-CAGAATTAGT--ATTTTGTCTT-CCGAGGG-C------------TT---------TG--------------------A------AATG--A-A-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGACCAG---AAATATTAGGAG-TTTATCTATAGCTTAT-GTTAGTT-TAAT-ATT--T-T--GTT------ATCT-ATTG-CAA-----ATA---CTT-C-GAT-AA---------------AT--AAT-GAC-AT--TTTTTTATTAACGGGGG-TTCATTTATATTCAT-CAAT---G--ATACT-TACTTCTGG------TTGCTTG---GCTGCCGTACATTGCCAG-TC-ATA-CAG-TTCTG--C-CACTAT--CACGG-A--ACATT--T-TA---AT-GCCT--TATTTG----GC-TGATATT--T--GG--GGTG--TGGTG-------------GGTAGGG--CC-TT-G--TGTTATTTTATAGCTACT-AC-GAAATAGGTCTGCC----GATGATAC-TG-CAG---T-GTATCTA-CGGA-ACCTTTATG----GC--------ACATAT---CATCTAAT-T-GCT-GT-GGAAT---------C-GCGCTAT-TTACCG-CCCA-TTGGCGGA-TCCTTGTA---TTGAC-GTT---CGGGG---------TCAATCGGTCGCATCACT-CAG----TGA-TATATATT----ACGGTTCTATTAGCAA--A-TCAAACATGTTTCATTGTTTTATCAT-----ATAAACGTCGTCAG-AGGAATGTTTGATTAGTCC-TC--TGCAGCAACCGG-C-AATAA--GGTTTCG--AACGTCG-TACTCTC-CCATTTCGAGT-GA--T-TTTTCTGGTATCATTAATATC---AAAGTCCTATATCACGTATGATTACAGATTTTTTCTCATCC---AT--C-GTTTGTCGAT----A----------AACC--GGAAGTTTATTTGAGGTATCGTAAAATG-CGAAA--T-CTCGAT------------CTTGGGCC-GA-TGTC-A---AT-TATTCTGTA-CTTC-GGA-AAGG--C-ACAAAATC--CCA-AATTTTGCTCA--ATT---TTAT--TTATGTTT-TCT---TAAAAATTATTC-AA-A----AACTCGGTC-GG--CCGGGGTTTT---T-A--AAC-CTAAA-AATA-AT-AAGAAA
gi|1 : ttGCC--AGGC-AT---C-TTTCTTATTATT-T--TTAGGTTT-AA-AAACCC-CGGgatgcctggc
gi|10 : ttaggccagcatatttttttaattattaggttttacgaaccccagaatgataaagtccggtaggaggaggaaataaataaaagaaaatatcaactttttgatacattatcaactttatgctgcgaatgtacatttatatttacactgcttcctttttgtaaatgctggtactgaatcgaaagactgccttgccaatatggccactcaacagttacaatagtcaggaggatggcacaagacacttggacatttaatttgttaatctcatcattgtcttgccagttcttcatcttttccagatagtaagcacatctggacagttcctattgacaataattgaacatatgagatcaatctattgataacgcatgctccataaatcagagagcagtaataattgtgaacctcaccattattgattatttaagaatgcagagaatttcgaaagttgtttgtatgaaaaagcatcaagttaaaaatgagtttccagaattagtattttgtcttccgagggctttgaaatgaagtatctttgaaagcatgaccagaaatattaggagtttatctatagcttatgttagtttaatattttgttatctattgcaaatacttcgataaataatgacatttttttattaacgggggttcatttatattcatcaatgatacttacttctggttgcttggctgccgtacattgccagtcatacagttctgccactatcacggaacattttaatgccttatttggctgatatttggggtgtggtgggtagggccttgtgttattttatagctactacgaaataggtctgccgatgatactgcagtgtatctacggaacctttatggcacatatcatctaattgctgtggaatcgcgctatttaccgcccattggcggatccttgtattgacgttcggggtcaatcggtcgcatcactcagtgatatatattacggttctattagcaaatcaaacatgtttcattgttttatcatataaacgtcgtcagaggaatgtttgattagtcctctgcagcaaccggcaataaggtttcgaacgtcgtactctcccatttcgagtgatttttctggtatcattaatatcaaagtcctatatcacgtatgattacagattttttctcatccatcgtttgtcgataaaccggaagtttatttgaggtatcgtaaaatgcgaaatctcgatcttgggccgatgtcaattattctgtacttcggaaaggcacaaaatcccaaattttgctcaattttatttatgttttcttaaaaattattcaaaaactcggtcggT-CAA----G--A-ACT-TACTT-TGG------TGG---G---G-------GCA--GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-GC--CACGG-A--ATA-T--C-AA---AT-GTAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTC--TGG-GACTGTCTTC----AGT---G--CC-TTGG--TG-TA--TTATG--CACT-AT-TAAATA--TC---------A----A-----CA----C-G-----A-CATA-ATC--CATGGGC-AT--------ATGATT---TGGT--ATAT-ACC-TT-G-------------T-G-----T-TT------TAA-TT-GCGGA-T--TTGTA---TT
gi|11 : --AAT-GAC-ATAC-TTTCTAT------------------TATTTAT-CAAGATCG--A-ACT-TACTT-TGG------T-G---G---G-------GCA--GCAAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--GTC----------------ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----A--GG--GTTA--TGG-G-------------AGT---G--CC-TTGG--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TT-GCC----GA----A--TG-CAG---C-A-----A-CATA-ATC--CATGGGC-AT------------------ATC--AT-T-GCATTT-GG--T---------t
gi|12 : TT-CAAAA--TTCTCGATTACTTTCTTCAGC-----CCAGA-TG-T-ACAAAT-T----TG-AGCATCTGGG-AAGATAATAAAAAATCT-CCATAATTGT-TTCA--ATT---TTAT--TT---TTT-ATCATATATAA---ATTC-AATAAACCAACTCGAGC-GG--C--GGTTTTGAATT-AATAACACTAAA-A--ATCT-AAAAAA
gi|13 : tcgtagtataattAACATG--TCATCG----A-CA------ATAAA-GTC-TCAG-GAG-----TAG-CTAGTCC-AC--TG----AATGGC-C-AAATAC-GTTT--GA-AACT--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-AA--A-TTT-----TA-TGCTAA-A-C---AAAG--TCA-------------TACAGATCT
gi|14 : G-T-CAT--A-ATTTGA-CAA----A--T-ACT-TACTT-GGG------TGG---G---G-------GCA--GCCAG-TC-ATG-C-A-TTCTG--CTTAC-AT--CACGG-AGCACA-T--C-AA---AT-GCAT--TTC-------GT-TTA-G----T--GG--Gaccatgataacc
gi|15 : ---AT--C-G-TTATC-AG----A----------AACC--GGAAA-ATA--TGAG-T-TCGT-AAATT-CAAAA--T-
gi|16 : c-CA------ATAAA-GTCGCCAGGAAG-----TTG-TTAGTCT-TC--GG----AACGG
gi|2 : AGGCCTTAG-C-AT---TATTT--TA--TCTGT--TTAGGTGT-AC-GAGCCCGCAGAAT-ATAAAGTCCCGTAGGAGTGAGAAATAAACAA-TAAAAAAACA-A---ATTTTTTGCG----------ATACAATCTATCAA-C---TTATATTCTG-CA-TTAACAGTCATATT-CATTCTTCATCTGCTC----TTCATTG---ATGCT----CT----CGGAACAGACT-TCATTGTGCGCAAGT--GGCGCCA-CAACCAGCTTACCATAAGTAAG-------GATG-CACAAGACAATGTGAACACATAAGTTAAATTGTTCAATGCTCGATCACGTCGGTCT-GCCCAGCTTCTTGCATCCTCTTCCACAATTG--AGCACATTGCTGTGAACAGTTTCC------TA-T-ACAAATAAT-AAACA----------ATGTT--TCATAAC--ATGCTTGTCATTAA-CAAAAGAG-CA--TAGGTAGATTGTTG-AATACTGCGA-CCAGT-ATTG-GT-A-----------GT--ACTTCACTCAATA---GATGCTAGGA-AAGTTGTCTG--AA----GTTTTCAATGAAAAGAGCAGTTAA-TAACAAA-TGGGAGCTAC-CAGAAT-AGTAAATGTTGCCCTGCTGAGGTGCATCGTGTGACAATTGTATTCAAGTG--------------------ACTTTTAAATGTTATA-G-ATCATTTCTACTGAAAGAGCTATGA-CAG---GAA-A--AGG-G-TT-T-CTATGGT--ATCATTAGTA-TAGT--TC--GATCCATTGCCAAGAACTAGTTAGAGATGTACATATACCTTTCATAT-Acc
gi|2 : a-T-CATATAT-TTTAT-CAA----GGTA-ACT-TACTT-TGG------TGA---GATGG-------GCA--GCAAG-TCTATAAC-G-TTCTGG-TTCAC-ATATCAAGGGA--ACA-TTCC-AATCAGT-GAATCATAC-------GCGTGG-AAATCT--GGTCGTTAA-TGG-G-------------AGT---GTGCC-TT-GAGTG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC--CC----GA----ACGTGACAG---C-G-----A-CAGATATC--CATGGG--------------GCAT---CATC--AT-TTGCA-TTTGG--TTCTGCATTGC-G-----T-GT--CA-CTCA-TTGGCCGA-T--TTGTA---T-GCCAG-T---CGGGGGCTCATGACTCAATC--TCGCAACCATGCAGTGTTTGAGAATT-A------A-G----TATCATTCC--AATCTAACATG--TCATTG----G-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-CAAAAAAC-GTTT--GACAACG--G-TT--CTCACCA--TCGA-TAAA--T-TTG-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATCTTA--CCA-CG---GTAAC---CTACC-AT----ACGTGTCCAATAACC--GGAAG-CTA--CGAGTT-CCGT-AAATTCCAAGAACT-CTCGAT------------C-----CC-GATTG-CAA---AT-T----TGCA-CATC-GGA-AGAT--A-AAAAAATCG-TCA-AATTTG-CTCAGGATTACATTAT--TT---TTT-TTC---TAAAA---ATGC--A-A----AACTCGAGC-GGGCC--GGTTCTG---T-A--AAC-CTAAATA--A-AT-AAAAAAttttatcaaggtaacttactttggtgagatgggcagcaagtctataacgttctggttcacatatcaagggaacattccaatcagtgaatcatacgcgtggaaatctggtcgttaatgggagtgtgccttgagtgtattatgtactactaaatatcccgaacgtgacagcgacagatatccatggggcatcatcatttgcatttggttctgcattgcgtgtcactcattggccgatttgtatgccagtcgggggctcatgactcaatctcgcaaccatgcagtgtttgagaattaagtatcattccaatctaacatgtcattggcaataaagtcgccagaagttgttagtcctccgaacgggcaaaaaacgtttgacaacggttctcaccatcgataaatttgtacactaaacaaagccatacagatcttaccacggtaacctaccatacgtgtccaataaccggaagctacgagttccgtaaattccaagaactctcgatcccgattgcaaatttgcacatcggaagataaaaaaatcgtcaaatttgctcaggattacattattttttttctaaaaatgcaaaactcgagcgggccggttctgtaaacctaaataaataaaaaaatagctg
gi|2 : aaggccttagcattattttatctgtttaggtgtacgagcccgcagaatataaagtcccgtaggagtgagaaataaacaataaaaaaacaaattttttgcgatacaatctatcaacttatattctgcattaacagtcatattcattcttcatctgctcttcattgatgctctcggaacagacttcattgtgcgcaagtggcgccacaaccagcttaccataagtaaggatgcacaagacaatgtgaacacataagttaaattgttcaatgctcgatcacgtcggtctgcccagcttcttgcatcctcttccacaattgagcacattgctgtgaacagtttcctatacaaataataaacaatgtttcataacatgcttgtcattaacaaaagagcataggtagattgttgaatactgcgaccagtattggtagtacttcactcaatagatgctaggaaagttgtctgaagttttcaatgaaaagagcagttaataacaaatgggagctaccagaatagtaaatgttgccctgctgaggtgcatcgtgtgacaattgtattcaagtgacttttaaatgttatagatcatttctactgaaagagctatgacaggaaaagggtttctatggtatcattagtatagttcgatccattgccaagaactagttagagatgtacatataccttC--AG-CTAT---T-TTT--TT--ATT-TATTTAGGTTT-ACAGAACCatagctg
gi|3 : aaggccttagcattattttatctgtttaggtgtacgagcccgcagaatataaagtcccgtaggagtgagaaataaacaataaaaaaacaaattttttgcgatacaatctatcaacttatattctgcattaacagtcatattcattcttcatctgctcttcattgatgctctcggaacagacttcattgtgcgcaagtggcgccacaaccagcttaccataagtaaggatgcacaagacaatgtgaacacataagttaaattgttcaatgctcgatcacgtcggtctgcccagcttcttgcatcctcttccacaattgagcacattgctgtgaacagtttcctatacaaataataaacaatgtttcataacatgcttgtcattaacaaaagagcataggtagattgttgaatactgcgaccagtattggtagtacttcactcaatagatgctaggaaagttgtctgaagttttcaatgaaaagagcagttaataacaaatgggagctaccagaatagtaaatgttgccctgctgaggtgcatcgtgtgacaattgtattcaagtgacttttaaatgttatagatcatttctactgaaagagctatgacaggaaaagggtttctatggtatcattagtatagttcgatccattgccaagaactagttagagatgtacatatacctttcatatattttatcaaggtaacttactttggtgagatgggcagcaagtctataacgttctggttcacatatcaagggaacattccaatcagtgaatcatacgcgtggaaatctggtcgttaatgggagtgtgccttgagtgtattatgtactactaaatatcccgaacgtgacagcgacagatatccatggggcatcatcatttgcatttggttctgcattgcgtgtcactcattggccgatttgtatgccagtcgggggctcatgactcaatctcgcaaccatgcagtgtttgagaattaagtatcattccaatctaacatgtcattggcaataaagtcgccagaagttgttagtcctccgaacgggcaaaaaacgtttgacaacggttctcaccatcgataaatttgtacactaaacaaagccatacagatcttaccacggtaacctaccatacgtgtccaataaccggaagctacgagttccgtaaattccaagaactctcgatcccgattgcaaatttgcacatcggaagataaaaaaatcgtcaaatttgctcaggattacattattttttttctaaaaatgcaaaactcgagcgggccAGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC---ACCC-CAGAATTATAAAGTCTCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAATAAAAAATA---ACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAC-T---T--TATTCTGCCA-TGTACATT-AT------TA-TTCA-CTGCTC----T---TTG---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGC-ACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GGTG-CACAAGACACT-TGGACAT-----T-AAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAGTGG-AAGCATATC----TGGACAG-TTCCG-----TATC-A-AAATAAT-GAACA----------A--CT--TGATAGC--ATGCTTCTCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAC-CT-C-A-CCA-T-ATGA-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCT--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC--TG-AAA-AGCA-TCAA-TTA-AAA-T--GAGTT-C-CAGAAT-AGT--ATGCTGT-CT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--AAA-GTATC-TTT-----TGAAA---CATGACCGG---AAATA--TGGAG-TT-A-CTATAGT--AT-GTTAGTATTTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACAT-----TTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTAT--ATTCAAC-ATTTTTTTCTAT-AACGGGGA-T-CATTTATATTCAT-CAA----G--A-ACT-TACTT-TGGTTACTTTGGCT-G---C-------TCA--GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--TTC-C-AT--CACGG-A--ACA-T--T-AA---AT--CAC--TAT-------G--TGA-A----T--GC--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TAC--AA-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CA----C-G-------CAGA-ATC--CATGGACTAC--------ATGTAT---CATC--AT-T-GCG-TT--G--T---------C-G-----T-TT--CG-C-CA-TT-GCGGA-T--TTGTA---CTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAA-CAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCAT-GC--A-CAAAACATG--TCATTG---TA-CA------A-AAA-GTCGCCAA-AAG-----TTG-TTAGTC---C--CG----AACGGG-C-AAAAAA-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCAC-TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CATT-A-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATTTCT--CCAC-----AT--CAG-TTGTC-AT----A----------AACC--GGAAA-GT---CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-AGA-AAGA--A-AAAAAA----CCA-G--TTT-CTCA--ATT---TTAT--TT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGCTGG--C--GGGTTTG---T-AT-AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
gi|4 : GCC--AG-C-AT---T-TGT---A--ATT-T--TTAGGTTT-AC-TAACCA-CAGCATTATAAAGTCCCTTAG-AG-GAGA---GAATTT-TAAAAAAAAG-A---ACTTTGT-------------AT-TA--TTATTAA-TAACT--TATT--GCTA-TGTACAGT-ACATTTCATT-TTCA-TT-CTT----T---TTC---ATGCT----TT----CGAAACAGAAT-CC-TTGC----AA-T--G-TCACATCAA-CATTTA---------------------T------AGACAGT-TGGACAT-----TTAAATTGCT-AAT-CTC-ATCAA-T--GTC--G--CAA-TTTCT-CATC---TTTCACAATGG-AAGCACA-------AGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT--AATA----------AC-AC--TGATAAC--ATGCTA-TAATAAATCAAAAGAGACA--TA--TAAATTG-CATAAT-CT-C-ACCCA-T-ATTG-TT-A------------T--A-------GAATT---GCAGAC--AA-A--TT----GGTAA----GTTTTC-ATGAAAA-G--A-TCAA-TTA-AAA-T--GAGTA-T-CAGAAT-AGT--AT-TTATCCC------GGGC------------TT---------TGATATTATCCCTCCTTC----A------AATG--ATA--CATC-TTT-----GAAAG---CATGG-CAG---AAA-A--AGGAG-TT-A-CTATAG---GT-GT---TA-TTAG-ATC----T--ATTGC---AAAC--CTTA-AAA-G-ACATA---CTTTC-TAT--ACGGTC---AT-ATTTATCAAAG-AACTATACTTTT
gi|4 : aTTAA--AA--GAC-ATACTTT-CTAT-A-CGG---------TCATATTTAT-CAAA---G--A-ACTATACTT-T--------TGG---G------------CA--GCC-G-TC-ATA-C-GATTCT---CTCAC-AT--CACG--A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GG-TGA-A----T--GG----TA--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-GGTTA-TA--TTAT----ACT-A---GAATA--TC-GCC----AA----AT--G-CAG---CCG-----A-CAG----C--CAT---C-GT--------AT--------ATC--AT-T--TG-TT-AA--T---------CTG-----CATT--TG-CTCACTTTGTGGAAT--TGGTA---T---C-A-T---CGGA----------TCAATT--TCGCAACCAT-CAAT-TTTGA-ATTA-A------AC-----T-TCATTCC--A-C-AAACATG--T-AT-G---TA-CA-------TAAA-GTC--CAG-AAG-----TTGGTTAGTCC-TC--CG----AACG---C-AAAA-C-GTTT-CGA-AACG--T-TA--CTC-CCA--TCGA-T--A--TATTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGA--TTA--CCATC----AT--C---TTATC-AT----A----------AACCCAGGAAA-TTA--CGAGTT-CCGC-TAATT--AACA--T-CTCGAC------------C-----CC-GA-TA-CGA---AT-T----TA----ATC-GGA-AA-A--A-AAAAAATCTTCC--AATTTT-CTCA--ATT---TTTT--TT---TTTCTTC---T-AAT---ATTC-AA-A----AACTCGA-C-TG--C--GG--TTG---TAA--AAC-CTTAT-A--A-ATAAAAAAATGCTGgggcagccgtcatacgattctctcacatcacgaacatcaaatgcattacggtgaatggtatgggagtgccttggttatattatactagaatatcgccaaatgcagccgacagccatcgtatatcatttgttaatctgcatttgctcactttgtggaattggtatcatcggatcaatttcgcaaccatcaattttgaattaaacttcattccacaaacatgtatgtacataaagtccagaagttggttagtcctccgaacgcaaaacgtttcgaaacgttactcccatcgatatattttacactaaacaaagccatacagattaccatcatcttatcataaacccaggaaattacgagttccgctaattaacatctcgaccccgatacgaatttaatcggaaaaaaaaaaatcttccaattttctcaatttttttttttcttctaatattcaaaaactcgactgcggttgtaaaaccttataaataaaaaaatgctgc
gi|5 : agccagcatttgtaatttttaggtttactaaccacagcattataaagtcccttagaggagagaattttaaaaaaaagaactttgtattattattaataacttattgctatgtacagtacatttcattttcattctttttcatgctttcgaaacagaatccttgcaatgtcacatcaacatttatagacagttggacatttaaattgctaatctcatcaatgtcgcaatttctcatctttcacaatggaagcacaagacagttcctattacaaataataataacactgataacatgctataataaatcaaaagagacatataaattgcataatctcacccatattgttatagaattgcagacaaattggtaagttttcatgaaaagatcaattaaaatgagtatcagaatagtatttatcccgggctttgatattatccctccttcaaatgatacatctttgaaagcatggcagaaaaaggagttactataggtgttattagatctattgcaaaccAGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TT--ATA-T--TTAGGGTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAAGAG-GAGG---AAATAA----AAAAAAAT----------T--GGGGGGGGGGGATACA--TTATCAAGT---T--TATTCTGCCA-AGTACAGT-GTATT-CATT-TTCA-CTGCTCT---T---TTG---ATGCT----CT----CGAATTAGACT-CC-ATGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAAAAAT-----AT-------GATT-CACACGACAGT-TGGATA------TTAAATTGTT-AAT-TTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG----TT-CATCCT-TTCCACAATGG-GAGCACGTC----TGGACAG-TTCCTACATGTATT-ACGAACAAG-GAACA----------GT-TT--TGATAAC--ATG------ATAA--CAAAGGAG-TATTTA--TGTATTG-TG-AAT-CT-C-G-CCA-T-ATTG-TTCATATTAATGGCTTT--A-------GAATTCTAG--AC----A-A--TTTTC-G--AA----GAATTC-ATGAAAA-AGCA-TCAA-TTA-AAA-T--GAGTT-CACA-AAT-AGA--ATGTTGT-CT-CCGAAGGAC------------TT---------TGACAAGTATATCCCTGCTTTAA------AATA--ATA-GTACC-TTT-----GAAAG---CATGATCAG---GAAAA--AGc
gi|6 : ATG--GTAAGTATC-TTT-----GAAAG---CATTTCAAGGCAGAAAA--ATGGG-TT-A-CTATATT--GT-GGTA--A-TTGTGGTTAGTAT--ATTGT---ATATT---------------------TTTC-TATGAACGGGGT--CTCATTT
gi|6 : tattccttttTAT--ATT-G-T-ATATTTTTCTATGAACGGGGTCT-CATTT-T-TTTATTCAA----G--A-ACT-TACT----G------TGG---G---G-------GCA--GCCAGGTC-AT----G-TTCTGGGCTCAC-ATTTCACGG-A--ACA-T--TTAA---ATTGCAT--TATACCGCCTGC-TGA-A----TTAGG--GTTGGGTGG-G-------------A-T---G--CCGTT-GG-TG-AT--TTA-G--TACTTATGTAAAT---TA-GCTTTTGGT----AT-TG-CAGACCC-G-----ATCAGA-ATC---ATGGGC-ATCTAATTCTGTGTATTTGCAGT--AT-T-GCG-TT-GG--T---------C-CCAC--T-TTG-CGGCTTA-TTG-CGGA-T--T-GTAGATCTGAA-A-TAATCGGG----------TCA-TC--TCGCAACCAG-CAGT-TTTG--AATA-A------TCG----TGTCATCCCCAG-CCAAACATG--TCATTG---TA-C---------AAA-GTCTCCAGAAAG-----TTG-TTAGTCCTTC--CG----AATGGATC---AAAC-GTTT--GA-TACG--G-TA--Cttttattcaagaacttactgtgggggcagccaggtcatgttctgggctcacatttcacggaacatttaaattgcattataccgcctgctgaattagggttgggtgggatgccgttggtgatttagtacttatgtaaattagcttttggtattgcagacccgatcagaatcatgggcatctaattctgtgtatttgcagtattgcgttggtcccactttgcggcttattgcggattgtagatctgaaataatcgggtcatctcgcaaccagcagttttgaataatcgtgtcatccccagccaaacatgtcattgtacaaagtctccagaaagttgttagtccttccgaatggatcaaacgtttgatacggtac
gi|7 : tattccttttatggtaagtatctttgaaagcatttcaaggcagaaaaatgggttactatattgtggtaattgtggttagC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATG-GTATC-TTT-----AAAAG---CATGACCAG---GAATA--AGGGGCTT-A-CCA---C--AT-G--AGTA----T-AT-----T--ACTGC---CAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AATGGGGGTTATTATTTATC-CAG-AAC-TTACTTT
gi|7 : ctttgacaatttatccctcTTAA--AAT-GAC-ATACTTT-CTAT-AATGGGGG-T-TATT---ATTTAT-CCA----G--A-ACT-TACTT-TGG------AGA---G---G-------GCA--GCCAG-NN-NNN-N-N-NNNNN--NNNNN-NN--NNNNN-N--NNN-N--N-NN---NN-NNNN--NNN-------NN-NNN-N----N--NN--NNNN--NNN-NNNNNNTTGCCTTCAGT---G--CC-TTCG--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----AA----AT--A-CAG---C-A-----A-CAGA-NNN--NNNNNNN-NN--------NNNNNN---NNNN--NN-N-NNN-NN-NN--N---------N-N-----N-NN--NN-NNNN-NNNNNNNN-N--NNNNN---NNNNN-N-N---NNNNN---------NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNNN-NNNNNNNACA----TGTCATCCC--A-C-AAATATG--TCATTG---TA-CATGTACAATAAA-GTCGCCAGGAAT-----TTG-TTAGTCT-TC--GG----AACGGG-C-AAAAAC-G-TTTCGA-ggagagggcagccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgccttcagtgccttcgtgtattatgtactactaaatatcgccaaatacagcaacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacatgtcatcccacaaatatgtcattgtacatgtacaataaagtcgccaggaatttgttagtcttcggaacgggcaaaaacgtttcga
gi|8 : ctttgacaatttatccctcctttgaaatgatggtatctttaaaagcatgaccaggaataaggggcttaccacatgagtatattactgccaactcTAGTCC-TTGAC-----AGCGGG-C-AAAAACTGTTTT-GA-AACG--GGTT--CTC-CCA--TGGA-T-GAAAT-TGT-----TA-CACTAA-A-CCAAGAAG--CCA-------------TG-AGACTCTTA-CCA-CGGTAAT--C-A-CCATC-GTGACAA----------AACC--GGAA--GTA--CGAGTA-TCATGAAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---ATAT----TG-A-CATC-GAATAAGA--A-AAAA--TC--CCG-AATTT--CTCA--ATT---TTATATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATTCAAA-A----AACTCGAGC--G--C--GGGTTTC---T-A--AAC-CT--A-A--A-AT--AAAAATGCTG
gi|9 : C------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATG-GTATC-TTT-----AAAAG---CATGACCAG---GAATA--AGGgcg
blockSeqs : TT G T . A CTTATT TAT . AG G T T AAT T TA GGGGGGGGGGG AT TAACT . CATATT C T TTCA . CT C . A GCG G . G T C ACCATAAGTAAG G A G CATAAG C G G G CG T C CT G C C A GCTG T TACATG . A ATGTT . TGT AT A A TT GG T T A G GA G . . C TATTAATGGCTTTAGAATTCTAGAC . AG G T GT . AA G G . C . GG AC . AA G C G G ATCGTGTGACAATTGTATTCAAGTGACTTTTA TT A A CTACT AGC C GCA T . A C T TATCATTAGTATAGTTCGATCC CAAG AG G TGTACATATAC A G C GTTATT CA TC T T AACGGGGATCATTTATA T GATC GT . A . TTACTT GATGG . G T A . A GG A . AT G GC . TCC TCA T CA ACCGCCT CG . AATCT TC GGG . NNNNNTTGCCTTC . TG G GAG . . . T TG . G TTTGGTATTG GACCCGAT T . GGCATCTAATTCTGTGTATTTGCAGTATTGCGTTGGTCCCACTTTGCGG T C G A . T GATCTGAAATAAT GGCTCATGAC . G TG AG . NNNNNNACA A T CAGCC . TACATGTACAAT . G G . G T GAC T A T TC C . G . A C . GAAAT . . . . CAA . . T TA CGGTAATCA . ACGTGTCCAAT CA AA . T . G C AC T TACTTTCTTCAGC A T . ACAA A . AG T T G TAAT TT AT T GG ACA AT . C ATA . A T AACC G TG GC . T AATTAAT A A T . T A
blockSeqs : . . . . . TA GT . A . T . . T A GCG . CTTA . ACATTT . . TT . CT C . . . . . C . . ACAATAG G C . T . . . . . T . T . C . A . . G . G ACAC . TCT AT A . . . . . . . AC . . . . GTACTTCACTCAATAGATGCTAG . . T . . . A . . . . . . CA . . G C . G TTTGACAAGTATATCCCTGCTTTAA . . . . . T . A . A . A TATGTTAGTATTTGTATCTAT A C . TGACATA . . C TCTC C T . T GAACGGGGTCTCATTTT . A . . . . . CTGC . . . . . . G A . TT . . . TT . . . . C . TTA . AA . ACTGTCTTC . . . GGT . . . . T . G GAACGTGA GCCGA . . GGGCATCATCATTTGCATTTGGTTCTGCATTGCGTGTCA T . T . . T TGCCAGT G . . T A . ACG G T AATC . ACAAT . G A . . . TG . . . TC . . . . . . . AAAT . . . . . . . T A CGGTAAC . GACAA . GC . T . . . . . C . . . AA . . CA . . A A T A G . . . . . . . . . . G G . . T TAT . A . . . .
blockSeqs : . . . . . TT T . G . T . . T A G . GTT . GTATT . . T . TT C . . . . . C . . AAAATAT T G . T . . . . . T . T . C . G . . . . G GTTT . AT A A . . . . . . . A . . . . TAGAATTGCAGAC . . T . . . A . . . . . . C . . G . . G TTTGATATTATCCCTCCTTCA . . . . . C . A . G . A TGTGGTAATTGTGGTTAGTAT A C . TGACAT . . C ATC . G . T AATGGGGGTTATTA . . . . . . . GG . . . . . . . A . . . . . C . . . . C . T . C . . . . . GG . . . . C . G GAATTG GCAA . . GACTACATGTATCATCATTGCGTTGTCGTTTCG T . G . . T CTGACGT N . . T A . TCG G C ACA . GCAAT . G G . . . GG . . . C . . . . . . . AAA . . . . . . . T T CATCAG . A . AG . T . . . . . C . . . GA . . A . . G A G A T . . . . . . . . . . G G . . G TAA . A . . . .
blockSeqs : . . . . . TA T . T . . . . . T . . TT . AT . . T . CT T . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACT . . . G . . . . . . . G . . . . TTAGAATTGGCT . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A TTTGA . . . . . C . T . G . A GTGTTATTAGATCT A C . GACATA . . T AT . T . T ACGGTCATA . . . . . . . GG . . . . . . . A . . . . . C . . . . T . A . A . . . . . GG . . . . C . G GAATG GCGA . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN T . N . . G NNNNNNN . . . T N . AG G C AC . TACAA . T . . . . CG . . . T . . . . . . . GAT . . . . . . . C A TCATC . A . AT . T . . . . . C . . . A . . A . . G A . G T . . . . . . . . . . G T . . G TA . T . . . .
blockSeqs : . . . . . TT T . G . TTTGA . . . . . C . T . . . A CATGAGTATATT C . . . . . . G . . TA . . . . . . . GG . . . . . . . A . . . . . C . . . . G . T . G . . . . . GG . . . . A . G AAATG GCAA . . GGCATATGATTTGGTATATACCTTGTGTTT N . . . . N TCAT . . . N . . AC . . AC . TACAT . G . . . . CG . . . . . . . . . . . ATA . . . . . . . . . A . G . . . . . . . C . . . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A T . . TTTGA . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . GG . . . . . . . N . . . . . T . . . . C . T . A . . . . . CG . . . . C . . AAATA CGA . . CGTATATCATTTGTTAATCTGCATTTG . . . . . . . TAC . . . . . . CG . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . C . . . . N . T . N . . . . . G . . . . . . . AA CG . . . . . . . . CG . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . N . . GG
blockSeqCons : *** T* A**** TT****** GCATT** T******* *** CT******** ** AATA*************** G* T* A* G* ACT************** ** T** ** A** **** ** A** A*** TGACATA**** ATC*** AACGGGGTCATTCTA***** **** GG************* ** ******* T****** *** GG** ** ** ** G* GAATG*********** GCGA********** ** ** CGNNNGT******** G********* ** T* ACG********** AGCC** ** NNNAT*********** ***** CG****** ** ** ** ** ***** ** ************* A** CTATC********* AN* ** C***************** GA*** **** T* T* *** *** ** **
originalCons : AGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAAAAAAAAATA---ACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAA-T---T--TATTCTGCCA-TGTACAGT-ATATT-CATT-TTCA-CTGCTC----T---TTG---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAACAAT-----AG-------GATG-CACAAGACANT-TGGACAT-----TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAATGG-AAGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAAT-GAACA----------AT-CT--TGATAAC--ATGCTT-TCATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAT-CT-C-A-CCA-T-ATTG-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCC--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC-ATGAAAA-AGCA-TCAA-TTA-AAA-T--GAGTT-C-CAGAAT-AGT--ATGTTGTCCT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATA-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGACCAG---GAATA--AGGAG-TT-A-CTATAGC--GT-GTTAGTA-TTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTAT--AAT-GAC-ATACTTTTCTAT-AACGGGGG-T-CATTTATATTTAT-CAA----G--A-ACT-TACTT-TGG------TGG---G---G-------GCA--GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-AT--CACGG-A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-A----T--GG--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TT-G--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TC-GCC----GA----AT-TG-CAG---C-G-----A-CAGA-ATC--CATGGGC-GT--------ATGTAT---CATC--AT-T-GCG-TT-GG--T---------C-G-----T-TT--CG-CTCA-TTGGCGGA-T--TTGTA---TTGAC-G-T---CGGGG---------TCAATC--TCGCAACCAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACG----TGTCATCCC--A-CCAAACATG--TCATTG---TA-CA------ATAAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-C-AAAAAC-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATTTTT--CCATCG---AT--C-G-TTATC-AT----A----------AACC--GGAAA-NTA--CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG-C-A---AT-T----TG-A-CATC-GGA-AAGA--A-AAAAAATC--CCA-AATTTT-CTCA--ATT---TTAT--TT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGC-GG--C--GGGTTTG---T-A--AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
finalCons : AGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAGGAG-GAGG---AAATAAT-AAAAAAAAAA----ACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAATT------TATTCTGCCA-TGTACAGTGCATT--CATT-TTCA-CTGCTCT-------TTG---ATGCTCT--------CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGTTAAATA---------------GATG-CACAAGACANT-TGGACAT-----TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAATGGA-AGCACATC----TGGACAG-TTCC------TATT-ACAAATAATG-AACAACT--------------TGATAAC--ATGCTT--CATAAATCAAAAGAG-CA--TA--TAAATTG-TG-AAT-CT-CA--CCA-T-ATTG-TT-A-----------TT--A-------GAATT---G--GCC--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC-ATGAAAA-AGCA-TCAA-TTA-AAA-T--GAGTT-C-CAGAAT-AGT--ATGTTGTCCT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATA-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGACCAG---GAATA--AGGAG-TTA--CTATAGC--GT-GTTAGTA-TTGT-ATC--TAT--ATTGCA---AACT-CTTA-AAATGACATA----CTTTC-TAT-AACGGGGATC---ATTTAT--AAT-GAC-ATACTTTTCTATAACGGGGTCATTCTA-----TTTAT-CAA----G--A-ACT-TACTT-TGG------TGGGG-------------GCA--GCCAG-TC-ATA-C-G-TTCTG--CTCAC-AT--CACGG-A--ACA-T--C-AA---AT-GCAT--TAC-------GC-TGA-AT------GG--GTTG--TGG-G-------------AGT---G--CC-TTGG--TG-TA--TTATG--TACT-AC-TAAATA--TCG-CCGAATG-----------CAGCGA----------CAGA-ATC--CATGGGC-GT--------ATGTAT---CATC--AT-T-GCG-TT-GG--T---------C-G-----T-TT--CG-CTCA-TTGGCGGA-T--TTGTACGNNNGT--------CGGGG---------TCAATC--TCGCAACCAT-CAGT-TTTGA-AATA-AACG----------TGTCATCCCAGCC--AAACATG--TCATTGNNNAT-----------AAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TCCG------AACGGG-C-AAAAAC-GTTT--GA-AACG--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGATTTTA--CCACTATC---------TTATC-AT----A----------AACC--GGAAAN-TA--CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGATC-----------------CC-GA-TG-CGA---AT-T----TG-A-CATC-GGA-AAGA--A-AAAAAATCT-CCA-AATTTT-CTCA--ATT---TTAT--TT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGC-GG--C--GGGTTTG---T-A--AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111111 111 2222 4444444444444 11 22222222 2222222 1 22222222 11111 1111111111 1111 11 888888888888888888888888888888888 2222222 11 11 1111 222222222 11 66666666666666666 11 33 11111 111 1 77777777777777777777777777777777777777777 11 11 1111 11 11 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111 1 33333333333333333333333333333 1111 11 11111111111 333333333333333 11111111 555555555555555555555555555555555555555555555 1111 11 1111 111111 22222222222 11111111111 4444444444444 11 11111111111 11111111111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1111 4444444444444 2222222222 222222 11 222222 333333333333333333 1 11111 1 11111111 11 11 1111111 11111 111 3333333333333 22222 444444444 333333333333333 111 1 444444444444444444 1111 1111 111 222222 1 111111 111 111 111 1111 11111111
lowQualScore : 77 5 5 000 5 222222 8888 5 88 6 5 3 8 444 88 1 5555 3 6666666666666 0 11 66666666 5 8 8888888 0 6 8 22222222 77777 8888888888 3 8 8 7777 8 11 5 8 8 000000000000000000000000000000000 1 8 1111111 8 8 8 8 11 88 8 8 3 8 3 8 11 0 7777 8 8 555555555 0 11 11111111111111111 8 11 00 66 0 8 8 33333 8 8 8 8 000 6 8 77777777777777777777777777777777777777777 8 11 5 8 11 7777 88 0 8 8 8 8 8 11 8 999 8 11 5 0 8 8 6666666666666666666666666666666666666666666666666666 66 0 5 5 22222 888 4 888 9 66 4 3 6 11111111111111111111111111111 3333 33 6 88888888888 6 777777777777777 77777777 4 777777777777777777777777777777777777777777777 0000 4 55 3333 4 4 0 222222 22222222222 9999 4 4 4 66 0 0 7777 66 1 8 0 4 88888888888 3 4 77777 33 888 5 7777777777777 888 5 00 5 5 66 66 5 88 66 999999 66 77777777777 66666666666666 5 66 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 5 6 3333 1111111111111 0 6666666666 0 99 0 6 77 77 6 888888 111 00 1 777777 77 0 000000000000000000 5 5 5 22222 0 4 00000000 5 5 5 66 5 77 5 77 6 55 6 2222222 66666 6 6 6 111 99 6666666666666 33333 6 333333333 6 444444444444444 99 111 99 3 6 3 5 77 5 000000000000000000 6 6 8888 6 4444 999 6 6 111111 5 6 3 6 99 111111 111 6 111 111 6 6 4444 2 99 99 99 6 66666666 6 3 6 99 6 6
lowQualScore : .. . . ... . ...... .... . .. . . . . ... .. . .... . ............. . .. ........ . . ....... . . . ........ ..... .......... . . . .... . .. . . . ................................. . . ....... . . . . .. .. . . . . . . .. . .... . . ......... . .. ................. . .. .. .. . . . ..... . . . . ... . . ......................................... . .. . . .. .... .. . . . . . . .. . ... . .. . . . . .................................................... .. . . . ..... ... . ... . .. . . . ............................. .... .. . ........... . ............... ........ . ............................................. .... . .. .... . . . ...... ........... .... . . . .. . . .... .. . . . . ........... . . ..... .. ... . ............. ... . .. . . .. .. . .. .. ...... .. ........... .............. . .. ........................................................................ . . . .... ............. . .......... . .. . . .. .. . ...... ... .. . ...... .. . .................. . . . ..... . . ........ . . . .. . .. . .. . .. . ....... ..... . . . ... .. ............. ..... . ......... . ............... .. ... .. . . . . .. . .................. . . .... . .... ... . . ...... . . . . .. ...... ... . ... ... . . .... . .. .. .. . ........ . . . .. . .
lowQualScore : 99 7 7 000 7 111111 3333 7 77 7 6 2 0 000 88 0 0000 2 0000000000000 8 00 00000000 6 0 6666666 8 0 0 00000000 00000 2222222222 2 0 0 2222 0 00 0 0 0 000000000000000000000000000000000 0 0 6666666 0 0 0 0 00 88 0 0 8 0 2 0 88 8 0000 0 0 888888888 8 22 66666666666666666 0 00 00 44 8 0 0 00000 0 0 0 0 000 0 0 22222222222222222222222222222222222222222 0 00 6 0 00 0000 88 8 0 0 0 0 0 00 0 222 0 00 0 0 0 2 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 99 4 0 0 55555 888 5 888 8 99 2 3 7 33333333333333333333333333333 2222 33 7 55555555555 7 999999999999999 88888888 4 000000000000000000000000000000000000000000000 6666 4 00 9999 4 4 1 888888 88888888888 4444 4 4 4 11 2 2 0000 11 3 9 4 4 88888888888 1 4 22222 66 555 0 5555555555555 888 0 66 0 0 99 99 0 44 99 444444 99 88888888888 99999999999999 0 99 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 6 7 6 0000 4444444444444 2 8888888888 8 22 2 7 55 55 7 333333 222 33 0 222222 99 1 444444444444444444 0 6 0 55555 0 4 22222222 0 0 0 99 7 99 7 99 7 88 7 5555555 77777 7 7 7 777 22 7777777777777 22222 7 555555555 7 333333333333333 22 888 22 2 7 3 7 99 7 888888888888888888 7 7 0000 7 2222 222 7 7 888888 3 7 2 7 22 888888 777 7 777 777 7 7 2222 5 22 22 22 7 22222222 7 5 7 22 7 7
consensus : AGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAAAAAAAAAT---AACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAA-T---T--TATTCTGCCA-TGTACAGT-ATA-TTCATT-TTCA-CTGCTC----T---TT-G---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGT------TA-A--A--TA--G--------A-TG-CACAAGACANT-TGGACAT-----TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAATGG-AAGCACATC----TGGACAG-TTCC-TA------TT-ACAAATAAT-GAACA----------A--T---TT-GATAAC--ATGCTT-TCATAAATCAAAAGAG-CA-T--A--TAAATTG-TG-AAT-CT-C-A-CCA-TATTG-TT-------AT-----T--A-------GAATT---G--GCC--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC-ATGAAAA-AGCA-TCAA-TT-A-AAAT--GAG-TT-C-CAGAA-TAGT--ATGTTGTCCT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATA-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGACCAG---GAATA--AGGAG-TTA-CTATAGC--GT-GTTAGTA-TTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AACGGGG---AT-ATTTAT--AA--T-GAC-ATACTTT------------------TCTA-T-AACGGGG--TC--ATTT-T-ATT----TAT-CAA--GA----ACT-TACTT-TGG------TGG---GG-----GCA----GCCA-GTCATAC-G-TTCT--GCTCAC-A--TCACGGA--ACA-TCAAA-TGCATTA-------C---GCTGA-A--T--GGGTT--GTGG-G-------------AGT---GCC-TTG-GT-G-TA--TTATG--TAC-TAC-TAAATA--TC-GC---CG--A--A---TG---CAG---C-G-----A-CAGA-ATC--CATGGGC-G--------TATGTAT---CATC--A-T-TGCG-TTGG--T---------C---G-----T-TT--C-GCTCA-TTGGCGGA-T--TTGTA-CGNCCG------TCGGGG---------TCAATC--TCGCAACCAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACGTGTCAT-NCCAGC----CAAACATG--TCATTG------NACAT-------AAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-C-AAAAAC-GTTT--GA-AACG--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGA--TT-TTACCA-CGGCA-TCG-TTATC-AT----A----------AACC--GGAAA-NTA--CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG--CGAAT-T----TG-A-CATC-GGA-AAGA--A-AAAAAATC-CCA-AATTTT-CTCA--ATT---T--TATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGC-GG--C--GGGTTTG---T-A--AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
Reference ( family-3108 ) : AGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAAAAAAAAA----AACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAA-T---T--TATTCTGCCA-TGTACAGT-GCA-TTCATT-TTCA-CTGCTC----T---TT-G---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGT------TA-A--A--TA--G--------A-TG-CACAAGACANT-TGGACAT-----TTAAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAATGG-AAGCACATC----TGGACAG-TTCC-TA------TT-ACAAATAAT-GAACA----------A--C---TT-GATAAC--ATGCT--TCATAAATCAAAAGAG-CA-T--A--TAAATTG-TG-AAT-CT-C-A-CCA-TATTG-TT-------AT-----T--A-------GAATT---G--GCC--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC-ATGAAAA-AGCA-TCAA-TT-A-AAAT--GAG-TT-C-CAGAA-TAGT--ATGTTGTCCT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATA-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGACCAG---GAATA--AGGAG-TTA-CTATAGC--GT-GTTAGTA-TTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTAT--AA--T-GAC-ATACTTT------------------TCTA-T-AACGGGG--TC--ATTC-T-ATT----TAT-CAA--GA----ACT-TACTT-TGG------TGG---GG-----GCA----GCCA-GTCATAC-G-TTCT--GCTCAC-A--TCACGGA--ACA-TCAAA-TGCATTA-------C---GCTGA-A--T--GGGTT--GTGG-G-------------AGT---GCC-TTG-GT-G-TA--TTATG--TAC-TAC-TAAATA--TC-GC---CG--A--A---TG---CAG---C-G-----A-CAGA-ATC--CATGGGC-G--------TATGTAT---CATC--A-T-TGCG-TTGG--T---------C---G-----T-TT--C-GCTCA-TTGGCGGA-T--TTGTA-CGNNNG------TCGGGG---------TCAATC--TCGCAACCAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACGTGTCAT-CCCAGC----CAAACATG--TCATTG------NNNAT-------AAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-C-AAAAAC-GTTT--GA-AACG--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGA--TT-TTACCA-C--TA-TC--TTATC-AT----A----------AACC--GGAAA-NTA--CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG--CGAAT-T----TG-A-CATC-GGA-AAGA--A-AAAAAATCTCCA-AATTTT-CTCA--ATT---T--TATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGC-GG--C--GGGTTTG---T-A--AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
gi|1 : AGGCC--AG-C-ATATTT-TTT--TA--ATT-A--TTAGGTTTTAC-GAACCC-CAGAATGATAAAGTCCGGTAGGAG-GAGG---AAATAAATAAAAGAAAATATCAACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAACT---T--TATGCTGCGAATGTACATT--TA-T--ATT-TACA-CTGCTTCCTTT---TT-GTAAATGCTGGTACTGAATCGAAA--GACTGCC-TTGC---CAA-TATGGCCACT-CAA-CAGT------TACA--A--TA--GTCAGGAGGA-TGGCACAAGACACT-TGGACAT-----TTAATTTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCTTG-CCAG-TTCTT-CATCTT-TTCCA-GATAGTAAGCACATC----TGGACAG-TTCC-TA------TTGACAA-TAATTGAACATATGAGATCAA--TCTATT-GATAACGCATGCT--CCATAAATC-AGAGAG-CAGT--A--ATAATTG-TG-AAC-CT-C-A-CCATTATTGATT-------AT-----TTAA-------GAAT-------GCA--GAGA--ATTTC-G--AAAGTTGTTTGT-ATGAAAA-AGCA-TCAAGTTAA-AAAT--GAGTTT-C-CAGAATTAGT--ATTTTGTCTT-CCGA-GGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--A-A-GTATC-TTT-----GAAAG---CATGACCAG---AAATATTAGGAGTTTATCTATAGCTTAT-GTTAGTT-TAAT-ATT--T-T--GTT------ATCT-ATTG-CAA-----ATA---C-TTC-GAT-AA---------------AT--AA--T-GAC-AT--TTT------------------TTTATT-AACGGGGGTTC--ATTTAT-ATT----CAT-CAAT-GAT---ACT-TACTTCTGG------TTGCTTGGCTGCCGTACATTGCCA-GTCATACAG-TTCT--GC-CACTA--TCACGGA--ACATTTTAA-TGCCTTA-------TTTGGCTGATATTT--GGGGT--GTGGTG-------------GGTAGGGCC-TT--GT-GTTATTTTATAGCTAC-TAC-GAAATAGGTCTGC---CG--ATGATACTG---CAG---T-GTATCTA-CGGA-ACCTTTATG----G--------CACATAT---CATCTAA-T-TGCT-GTGGAAT---------C---GCGCTAT-TTACC-GCCCA-TTGGCGGA-TCCTTGTATTGACGT------TCGGGG---------TCAATCGGTCGCATCACT-CAG----TGA-TATATATT----ACG-GTTCT-ATTAGCAAATCAAACATGTTTCATTGTTTTATCATAT-------AAACGTCGTCAG-AGGAATGTTTGATTAGTCC-TC--TGCAGCAACCGG-C-AATAAG-GTTT--CG-AACGTCG-TACTCTC-CCATTTCGAGT-GA--T-TTTTCTGGTATCATTAATATC---AAAGTCCTATATCACGTATGATTACAGATTTT-TTCTCATC--CA-TCGTTTGTCGAT----A----------AACC--GGAAGTTTATTTGAGGTATCGTAAAATG-CGAAA--T-CTCGAT------------CTTGGGCC-GA-TG--TCAAT-TATTCTGTA-CTTC-GGA-AAGG--C-ACAAAATC-CCA-AATTTTGCTCA--ATT---T--TATTTATGTTT-TCT---TAAAAATTATTC-AA-A----AACTCGGTC-GG--CCGGGGTTTT---T-A--AAC-CTAAA-AATA-AT-AAGAAA
gi|1 : ttGCC--AGGC-AT---C-TTTCTTATTATT-T--TTAGGTTT-AA-AAACCC-CGGgatgcctggc
gi|10 : ttaggccagcatatttttttaattattaggttttacgaaccccagaatgataaagtccggtaggaggaggaaataaataaaagaaaatatcaactttttgatacattatcaactttatgctgcgaatgtacatttatatttacactgcttcctttttgtaaatgctggtactgaatcgaaagactgccttgccaatatggccactcaacagttacaatagtcaggaggatggcacaagacacttggacatttaatttgttaatctcatcattgtcttgccagttcttcatcttttccagatagtaagcacatctggacagttcctattgacaataattgaacatatgagatcaatctattgataacgcatgctccataaatcagagagcagtaataattgtgaacctcaccattattgattatttaagaatgcagagaatttcgaaagttgtttgtatgaaaaagcatcaagttaaaaatgagtttccagaattagtattttgtcttccgagggctttgaaatgaagtatctttgaaagcatgaccagaaatattaggagtttatctatagcttatgttagtttaatattttgttatctattgcaaatacttcgataaataatgacatttttttattaacgggggttcatttatattcatcaatgatacttacttctggttgcttggctgccgtacattgccagtcatacagttctgccactatcacggaacattttaatgccttatttggctgatatttggggtgtggtgggtagggccttgtgttattttatagctactacgaaataggtctgccgatgatactgcagtgtatctacggaacctttatggcacatatcatctaattgctgtggaatcgcgctatttaccgcccattggcggatccttgtattgacgttcggggtcaatcggtcgcatcactcagtgatatatattacggttctattagcaaatcaaacatgtttcattgttttatcatataaacgtcgtcagaggaatgtttgattagtcctctgcagcaaccggcaataaggtttcgaacgtcgtactctcccatttcgagtgatttttctggtatcattaatatcaaagtcctatatcacgtatgattacagattttttctcatccatcgtttgtcgataaaccggaagtttatttgaggtatcgtaaaatgcgaaatctcgatcttgggccgatgtcaattattctgtacttcggaaaggcacaaaatcccaaattttgctcaattttatttatgttttcttaaaaattattcaaaaactcggtcggT-CAA--GA----ACT-TACTT-TGG------TGG---GG-----GCA----GCCA-GTCATAC-G-TTCT--GCTCAC-G--CCACGGA--ATA-TCAAA-TGTATTA-------C---GCTGA-A--T--GGGTT--CTGG-GACTGTCTTC----AGT---GCC-TTG-GT-G-TA--TTATG--CAC-TAT-TAAATA--TC----------A--A--------CA----C-G-----A-CATA-ATC--CATGGGC-A--------TATGATT---TGGT--A-TATACC-TTG-------------T---G-----T-TT------TAA-TT-GCGGA-T--TTGTA-
gi|11 : --AA--T-GAC-ATACTTT-------------------CTA-T-------------------T-ATT----TAT-CAA--GATCGAACT-TACTT-TGG------TGG---GG------CA----GCAA-GTCATAC-G-TTCT--GGTCAC-A--T-------------CAAA-TGCATTA-------C---GCTGA-A--A--GGGTT--ATGG-G-------------AGT---GCC-TTG-GT-G-TA--TTATG--TAC-TAC-TAAATA--TT-GC---CG--A--A---TG---CAG---C-A-----A-CATA-ATC--CATGGGC-A--------T----------ATC--A-T-TGCATTTGG--T---------ttt
gi|12 : TT-CAAAA--TTCTCGATTACTTTCTTCAGC-----CCAGA-TGTACAAAT-T----TG-AGCATCTGGG-AAGATAATAAAAAATCTCCATAATTGT-TTCA--ATT---T--TATTT---TTT-ATCATATATAA---ATTC-AATAAACCAACTCGAGC-GG--C--GGTTTTGAATT-AATAACACTAAA-A--ATCT-AAAAAA
gi|13 : tcgtagtataattAACATG--TCATCG------ACAAT-------AAA-GTC-TCAG-GAG-----TAG-CTAGTCC-AC--TG----AATGGC-C-AAATAC-GTTT--GA-AACT--G-TA--CTC-CCA--TCGA-T-AA--A-TTT-----TA-TGCTAA-A-C---AAAG--TCA-------------TACAGA---T-CTACCA-
gi|14 : -ATT----TGA-CAA--AT----ACT-TACTT-GGG------TGG---GG-----GCA----GCCA-GTCATGC-A-TTCT--GCTTAC-A--TCACGGAGCACA-TCAAA-TGCATTT-------C---GTTTA-G--T--GGGtgataacc
gi|15 : gtcataA-TCG-TTATC-AG----A----------AACC--GGAAA-ATA--TGAG-T-TCGT-AAATT-CAAAA--T-
gi|16 : cAT-------AAA-GTCGCCAGGAAG-----TTG-TTAGTCT-TC--GG----AACGG
gi|2 : caAGGCCTTAG-C-AT---TATTT--TA--TCTGT--TTAGGTGT-AC-GAGCCCGCAGAAT-ATAAAGTCCCGTAGGAGTGAGAAATAAACAA-TAAAAAAACA----AATTTTTTGCG----------ATACAATCTATCAA-C---TTATATTCTG-CA-TTAACAGTCATA-TTCATTCTTCATCTGCTC----TTCATT-G---ATGCT----CT----CGGAACAGACT-TCATTGTGCGCAAGT--GGCGCCA-CAACCAGCTTACCATA-A--G--TAAGG--------A-TG-CACAAGACAATGTGAACACATAAGTTAAATTGTTCAATGCTCGATCACGTCGGTCT-GCCCAGCTTCTTGCATCCTCTTCCACAATTG--AGCACATTGCTGTGAACAGTTTCC-TA-------T-ACAAATAAT-AAACA----------ATGT---TT-CATAAC--ATGCTTGTCATTAA-CAAAAGAG-CA-T--AGGTAGATTGTTG-AATACTGCGA-CCAGTATTG-GT-------AG-----T--ACTTCACTCAATA---GATGCTAGGA-AAGTTGTCTG--AA----GTTTTCAATGAAAAGAGCAGTTAA-TA-ACAAATGGGAG-CTAC-CAGAA-TAGTAAATGTTGCCCTGCTGAGGTGCATCGTGTGACAATTGTATTCAAGTG--------------------ACTTTTAAATGTTATA-G-ATCATTTCTACTGAAAGAGCTATGA-CAG---GAA-A--AGG-G-TTT-CTATGGT--ATCATTAGTA-TAGT--TC--GATCCATTGCCAAGAACTAGTTAGAGATGTACATATACCTTTCATAT-----------AT--TTTATC-AAGGT-AAC-TTACTTTGGTGAGATGGGCAGCAAGTCTA-T-AACG----------TTC-TGGTTCACATAT-CAAGGGA----AC---ATTC-CAA------T-------------CA----GTGA-ATCATAC-G------------------CGTGGA--A-A-TC----TG-GT---------C---GTT-A-A--T--GG-------GA-G-------------TGT---GCC-TTGAGT-G-TA--TTATG--TAC-TAC-TAAATA--TC--C---CG--A--A---CGTGACAG---C-G-----A-CAGATATC--CATGGG--------------GCAT---CATC--ATT-TGCATTTGG--TTCTGCATTGC---G-----T-GT--C-ACTCA-TTGGCCGA-T--TTGTA-TGCCAG------TCGGGGGCTCATGACTCAATC--TCGCAACCATGCAGTGTTTGAGAATT-A------A-GTATCAT-TCCAAT----CTAACATG--TCATTG------GCAAT-------AAA-GTCGCCAG-AAG-----TTG-TTAGTCC-TC--CG----AACGGG-CAAAAAAC-GTTT--GACAACG--G-TT--CTCACCA--TCGA-TAAA--T-TTG-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGA--TC-TTACCA-CGGTA-AC--CTACC-AT----ACGTGTCCAATAACC--GGAAG-CTA--CGAGTT-CCGT-AAATTCCAAGAACT-CTCGAT------------C-----CC-GATTG--CAAAT-T----TGCA-CATC-GGA-AGAT--A-AAAAAATCGTCA-AATTTG-CTCAGGATTACAT--TATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATGC--A-A----AACTCGAGC-GGGCC--GGTTCTG---T-A--AAC-CTAAATA--A-AT-AAAAAAcc
gi|2 : aC--AG-CTAT---T-TTT--TT--ATT-TATTTAGGTTT-ACAGAACCatagctg
gi|3 : aaggccttagcattattttatctgtttaggtgtacgagcccgcagaatataaagtcccgtaggagtgagaaataaacaataaaaaaacaaattttttgcgatacaatctatcaacttatattctgcattaacagtcatattcattcttcatctgctcttcattgatgctctcggaacagacttcattgtgcgcaagtggcgccacaaccagcttaccataagtaaggatgcacaagacaatgtgaacacataagttaaattgttcaatgctcgatcacgtcggtctgcccagcttcttgcatcctcttccacaattgagcacattgctgtgaacagtttcctatacaaataataaacaatgtttcataacatgcttgtcattaacaaaagagcataggtagattgttgaatactgcgaccagtattggtagtacttcactcaatagatgctaggaaagttgtctgaagttttcaatgaaaagagcagttaataacaaatgggagctaccagaatagtaaatgttgccctgctgaggtgcatcgtgtgacaattgtattcaagtgacttttaaatgttatagatcatttctactgaaagagctatgacaggaaaagggtttctatggtatcattagtatagttcgatccattgccaagaactagttagagatgtacatatacctttcatatattttatcaaggtaacttactttggtgagatgggcagcaagtctataacgttctggttcacatatcaagggaacattccaatcagtgaatcatacgcgtggaaatctggtcgttaatgggagtgtgccttgagtgtattatgtactactaaatatcccgaacgtgacagcgacagatatccatggggcatcatcatttgcatttggttctgcattgcgtgtcactcattggccgatttgtatgccagtcgggggctcatgactcaatctcgcaaccatgcagtgtttgagaattaagtatcattccaatctaacatgtcattggcaataaagtcgccagaagttgttagtcctccgaacgggcaaaaaacgtttgacaacggttctcaccatcgataaatttgtacactaaacaaagccatacagatcttaccacggtaacctaccatacgtgtccaataaccggaagctacgagttccgtaaattccaagaactctcgatcccgattgcaaatttgcacatcggaagataaaaaaatcgtcaaatttgctcaggattacattattttttttctaaaaatgcaaaactcgagcgggccAGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TA--ATT-T--TTAGGTTT-AC---ACCC-CAGAATTATAAAGTCTCGTAGGAG-GAGG---AAATAA-TAATAAAAAAT---AACTTTTT--G----------ATACA--TTATCAC-T---T--TATTCTGCCA-TGTACA--------TTATTATTCA-CTGCTC----T---TT-G---ATGCT----CT----CGAAACAGACT-CC-TTGC---CAA-T--GGC-ACA-CAA-CAGT------TA-ACAA--TA--G--------GGTG-CACAAGACACT-TGGACAT-----T-AAATTGTT-AAT-CTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTCTT-CATCCT-TTCCACAGTGG-AAGCATATC----TGGACAG-TTCCGTA------TC-A-AAATAAT-GAACA----------A--C---TT-GATAGC--ATGCTTCTCATAAATCAAAAGAG-CA-T--A--TAAATTG-TG-AAC-CT-C-A-CCA-TATGA-TT-------AT-----T--A-------GAATT---G--GCT--GA-A--TTTTC-G--AA----GTTTTC--TG-AAA-AGCA-TCAA-TT-A-AAAT--GAG-TT-C-CAGAA-TAGT--ATGCTGT-CT-CCGAGGGGC------------TT---------TG--------------------A------AATG--AAA-GTATC-TTT-----TGAAA---CATGACCGG---AAATA--TGGAG-TTA-CTATAGT--AT-GTTAGTATTTGT-ATC--TAT--ATTGC---AAACT-CTTA-AAATG-ACAT-----TTTC-TAT-AACGGGG---ATCATTTAT--AT--TCAAC-ATTTTTT------------------TCTA-T-AACGGGGA-TC--ATTTAT-ATT----CAT-CAA--GA----ACT-TACTT-TGGTTACTTTGGCT-GC-----TCA----GCCA-GTCATAC-G-TTCT--GTTC-C-A--TCACGGA--ACA-TTAAA-T-CACTA-------T---G-TGA-A--T--GCGTT--GTGG-G-------------AGT---GCC-TT--GT-G-TA--TTATG--TAC--AA-TAAATA--TC-GC---CG--A--AT--TG---CA----C-G-------CAGA-ATC--CATGGACTA--------CATGTAT---CATC--A-T-TGCG-TT-G--T---------C---G-----T-TT--C-GC-CA-TT-GCGGA-T--TTGTA-CTGACG------TCGGGG---------TCAATC--TCGCAA-CAT-CAGT-TTTGA-AATA-A------ACGTGTCAT-GC--AC----AAAACATG--TCATTG------TACAA-------AAA-GTCGCCAA-AAG-----TTG-TTAGTC---C--CG----AACGGG-C-AAAAAA-GTTTTCGA-AACG--G-TA--CTC-CCAC-TCGA-T-GA--T-TTT-----TA-CATT-A-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGA--TT-TCTCCA-C---A-TCAGTTGTC-AT----A----------AACC--GGAAA-GT---CGAGTT-TCGT-AAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG--C-AAT-T----TG-A-CATC-AGA-AAGA--A-AAAAAA---CCA-G--TTT-CTCA--ATT---T--TATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATTC-AA-A----AACTCGAGCTGG--C--GGGTTTG---T-AT-AAC-CTAAA-A--A-AT-AAAAAATGCTG
gi|4 : GCC--AG-C-AT---T-TGT---A--ATT-T--TTAGGTTT-AC-TAACCA-CAGCATTATAAAGTCCCTTA-GAG-GAGA---GAATTT-TAAAAAAAAG----AACTTTGT-------------AT-TA--TTATTAA-TAACT--TAT--TGCTA-TGTACAGT-ACATTTCATT-TTCA-TT-CTT----T---TT-C---ATGCT----TT----CGAAACAGAAT-CC-TTG----CAA-T---GTCACATCAA-CATT------T-----A--T---------------------AGACAGT-TGGACAT-----TTAAATTGCT-AAT-CTC-ATCAA-T--GTC--G--CAA-TTTCT-CATC---TTTCACAATGG-AAGCACA-------AGACAG-TTCC-TA------TT-ACAAATAAT--AATA----------A--CA--CT-GATAAC--ATGCTA-TAATAAATCAAAAGAGACA-T--A--TAAATTG-CATAAT-CT-C-ACCCA-TATTG-TT-------A------T--A-------GAATT---GCAGAC--AA-A--TT----GGTAA----GTTTTC-ATGAAAA-G--A-TCAA-TT-A-AAAT--GAG-TA-T-CAGAA-TAGT--AT-TTATCCC------GGGC------------TT---------TGATATTATCCCTCCTTC----A------AATG--ATA--CATC-TTT-----GAAAG---CATGG-CAG---AAA-A--AGGAG-TTA-CTATAG---GT-GT---TA-TTAG-ATC----T--ATTGC---AAAC--CTTA-AAA-G-ACATA---CTTTC-TAT--ACGGTC---AT-ATTTATCAAA--G-AACTATACTTT------------------T
gi|4 : aTTAA--AA----GAC-ATACTTT-------------------CTA-T-A-CGG----TC--AT-----ATT----TAT-CAAA-GA----ACTATACTT-T--------TGG---G-------CA----GCC--GTCATAC-GATTCT---CTCAC-A--TCACG-A--ACA-TCAAA-TGCATTA-------C---GGTGA-A--T--GG--T--ATGG-G-------------AGT---GCC-TTG-GTTA-TA--TTAT----AC-TA---GAATA--TC-GC---CA--A--A---TG---CAG---CCG-----A-CAG----C--CAT---C-G--------TAT--------ATC--A-T-T-TG-TTAA--T---------CT--G-----CATT--T-GCTCACTTTGTGGAAT--TGGTA----TCA------TCGGA----------TCAATT--TCGCAACCAT-CAAT-TTTGA-ATTA-A------AC-T-TCAT-TCCA------CAAACATG--T-AT-G------TACAT-------AAA-GTC--CAG-AAG-----TTGGTTAGTCC-TC--CG----AACG---C-AAAA-C-GTTTC-GA-AACG--T-TA--CTC-CCA--TCGA-T--A--TATTT-----TA-CACTAA-A-C---AAAG--CCA-------------TACAGA-----TTACCA-T--CA-TC--TTATC-AT----A----------AACCCAGGAAA-TTA--CGAGTT-CCGC-TAATT--AACA--T-CTCGAC------------C-----CC-GA-TA--CGAAT-T----TA----ATC-GGA-AA-A--A-AAAAAATCTTCC-AATTTT-CTCA--ATT---T--TTTTT---TTTCTTC---T-AAT---ATTC-AA-A----AACTCGA-C-TG--C--GG--TTG---TAA--AAC-CTTAT-A--A-ATAAAAAAATGCTGgggcagccgtcatacgattctctcacatcacgaacatcaaatgcattacggtgaatggtatgggagtgccttggttatattatactagaatatcgccaaatgcagccgacagccatcgtatatcatttgttaatctgcatttgctcactttgtggaattggtatcatcggatcaatttcgcaaccatcaattttgaattaaacttcattccacaaacatgtatgtacataaagtccagaagttggttagtcctccgaacgcaaaacgtttcgaaacgttactcccatcgatatattttacactaaacaaagccatacagattaccatcatcttatcataaacccaggaaattacgagttccgctaattaacatctcgaccccgatacgaatttaatcggaaaaaaaaaaatcttccaattttctcaatttttttttttcttctaatattcaaaaactcgactgcggttgtaaaaccttataaataaaaaaatgctgc
gi|5 : agccagcatttgtaatttttaggtttactaaccacagcattataaagtcccttagaggagagaattttaaaaaaaagaactttgtattattattaataacttattgctatgtacagtacatttcattttcattctttttcatgctttcgaaacagaatccttgcaatgtcacatcaacatttatagacagttggacatttaaattgctaatctcatcaatgtcgcaatttctcatctttcacaatggaagcacaagacagttcctattacaaataataataacactgataacatgctataataaatcaaaagagacatataaattgcataatctcacccatattgttatagaattgcagacaaattggtaagttttcatgaaaagatcaattaaaatgagtatcagaatagtatttatcccgggctttgatattatccctccttcaaatgatacatctttgaaagcatggcagaaaaaggagttactataggtgttattagatctattgcaaaccAGGCC--AG-C-AT---T-TTT--TT--ATA-T--TTAGGGTT-AC-GAACCC-CAGAATTATAAAGTCCCGTAAGAG-GAGG---AAATAA------AAAAA----AA----TT--GGGGGGGGGGGATACA--TTATCAAGT---T--TATTCTGCCA-AGTACAGT-GTA-TTCATT-TTCA-CTGCTC----T---TTTG---ATGCT----CT----CGAATTAGACT-CC-ATGC---CAA-T--GGCCACA-CAA-CAGT------TA-A--AAATAT-G--------A-TT-CACACGACAGT-TGGATAT-----T-AAATTGTT-AAT-TTC-ATCAT-T--GTCT-G-CCAG-TTC----ATCCT-TTCCACAATGG-GAGCACGTC----TGGACAG-TTCC-TACATGTATT-ACGAACAAG-GAACA----------G--T---TTTGATAAC--ATG------ATAA--CAAAGGAG-TA-TTTA--TGTATTG-TG-AAT-CT-C-G-CCA-TATTG-TTCATATTAATGGCTTT--A-------GAATTCTAG--AC----A-A--TTTTC-G--AA----GAATTC-ATGAAAA-AGCA-TCAA-TT-A-AAAT--GAG-TT-CACA-AA-TAGA--ATGTTGT-CT-CCGAAGGAC------------TT---------TGACAAGTATATCCCTGCTTTAA------AATA--ATA-GTACC-TTT-----GAAAG---CATGATCAG---GAAAA--AGc
gi|6 : ATG--GTAAGTATC-TTT-----GAAAG---CATTTCAAGGCAGAAAA--ATGGG-TTA-CTATATT--GT-GGTA--A-TTGTGGTTAGTAT--ATTGT---ATATT---------------------TTTC-TATGAACGGGG---
gi|6 : tattccttttTAT--AT--T-G-T-ATATTTT------------------TCTA-TGAACGGGG--TCTCATTT-T--TT----TATTCAA--GA----ACT-TACT----G------TGG---GG-----GCA----GCCAGGTCAT---G-TTCTGGGCTCAC-ATTTCACGGA--ACATTTAAATTGCATTATACCGCCT---GCTGA-A--TTAGGGTTGGGTGG-G-------------A-T---GCCGTTG-GT-G--A--TTTAG--TACTTATGTAAAT---TA-GCTTTTGGTA--T---TG---CAGACCC-G-----ATCAGA-AT---CATGGGC-ATCTAATTCTGTGTATTTGCAGT--A-T-TGCG-TTGG--T---------CCCAC-----T-TTG-CGGCTTA-TT-GCGGA----TTGTA-GATCTGAAATAATC-GGG---------TC-ATC--TCGCAACCAG-CAGT-TTTG--AATA-A------TCGTGTCATCCCCAGC----CAAACATG--TCATTG--------TAC-------AAA-GTCTCCAGAAAG-----TTG-TTAGTCCTTC--CG----AATGGATC---AAAC-GTTT--GA-TACG--G-TA--Ctctcatttttttattcaagaacttactgtgggggcagccaggtcatgttctgggctcacatttcacggaacatttaaattgcattataccgcctgctgaattagggttgggtgggatgccgttggtgatttagtacttatgtaaattagcttttggtattgcagacccgatcagaatcatgggcatctaattctgtgtatttgcagtattgcgttggtcccactttgcggcttattgcggattgtagatctgaaataatcgggtcatctcgcaaccagcagttttgaataatcgtgtcatccccagccaaacatgtcattgtacaaagtctccagaaagttgttagtccttccgaatggatcaaacgtttgatacggtac
gi|7 : tattccttttatggtaagtatctttgaaagcatttcaaggcagaaaaatgggttactatattgtggtaattgtggttagC------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATG-GTATC-TTT-----AAAAG---CATGACCAG---GAATA--AGGGGCTTA-CCA---C--AT-G--AGTA----T-AT-----T--ACTGC---CAACT-CTTA-AAATG-ACATA---CTTTC-TAT-AATGGGGGTTATTATTTATC-CA--G-AAC-TTACTTT------------------
gi|7 : ctttgacaatttatccctcTTAA--AA--T-GAC-ATACTTT-------------------CTA-T-AATGGGGG-TT--ATT----ATT----TAT-CCA--GA----ACT-TACTT-TGG------AGA---GG-----GCA----GCCA-GNNNNNN-N-NNNN--NNNNNN-N--NNNNNNN--NNN-NNNNN-NNNNNNN-------N---NNNNN-N--N--NNNNN--NNNN-NNNNNNTTGCCTTCAGT---GCC-TTC-GT-G-TA--TTATG--TAC-TAC-TAAATA--TC-GC---CA--A--A---TA---CAG---C-A-----A-CAGA-NNN--NNNNNNN-N--------NNNNNNN---NNNN--N-N-NNNN-NNNN--N---------N---N-----N-NN--N-NNNNN-NNNNNNNN-N--NNNNN-NNNNNN------NNNNNN---------NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNNN-NNNNNNNACATGTCAT-CCCA------CAAATATG--TCATTG------TACATGTACAATAAA-GTCGCCAGGAAT-----TTG-TTAGTCT-TC--GG----AACGGG-C-AAAAAC-GTTT--ggagagggcagccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgccttcagtgccttcgtgtattatgtactactaaatatcgccaaatacagcaacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacatgtcatcccacaaatatgtcattgtacatgtacaataaagtcgccaggaatttgttagtcttcggaacgggcaaaaacgtttcga
gi|8 : ctttgacaatttatccctcctttgaaatgatggtatctttaaaagcatgaccaggaataaggggcttaccacatgagtatattactgccaactcTAGTCC-TTGAC-----AGCGGG-C-AAAAACTGTTTT-GA-AACG--GGTT--CTC-CCA--TGGA-T-GAAAT-TGT-----TA-CACTAA-A-CCAAGAAG--CCA-------------TG-AGA--CTCTTACCA-CGGTAATCA-CCATC-GTGACAA----------AACC--GGAA--GTA--CGAGTA-TCATGAAATT-CAAAA--T-CTCGAT------------C-----CC-GA-TG--C-AATAT----TG-A-CATC-GAATAAG-----AAAAAATC-CCG-AA-TTT-CTCA--ATT---TTATATTT---TTT-TTC---TAAAA---ATTCAAA-A----AACTCGAGC--G--C--GGGTTTC---T-A--AAC-CT--A-A--A-AT--AAAAATGCTGcga
gi|9 : C------------TT---------TG--------------------A------AATG--ATG-GTATC-TTT-----AAAAG---CATGACCAG---GAATA--AGGgcg