lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 666666666666666666666666666 555555555555555 1 11111111111 44444444444444444444444444444 333333333333 33333 1111111 111 4444 1111 11111111111 1111 111 2222222222222222 333333333333333333 1111 11111111 222222 11111 2222222222222222222222222222222 3333333333333 1111111 11 11 1111 111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 11111 1111 2222 111 22222222 22222222 111 111 999999999999999999999999999999999999 111 111111111 33333 111111 111111 222222 111111111 11 111111111 111111111111 11111 11111111111 111111111 11 22222222222222222 11111111 111111 11111 11 11 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 11 1 1 2 33333333 2222222 11 11 11 11 22222 1 2222222 444444444444 111 1111 2222222 3 11 55555555555555 22222 111 44444444 111 2222 11111 55555555555 2222222222
lowQualScore : 6 6 9 4 3 55 1 444444444444444444444444444 55555 000000000000000 0 2 5 2 33 3 3 6666 8 888888 3 3 3 2 2 8 66 0 77777777777 3 2 3 3 11111111111111111111111111111 44 7777 222222222222 00000 3 99 0000000 77777 3 3 2 3 1 3 000 44 3 44 3 3 6666 3 3 3 8888 8 1 6666 55555555555 3 555 3 99 44 3 7777 77 999999 3 2222 44 6 111 77 0000000000000000 9 6666 888 44 3 2 2 2 2 666666666666666666 6666 3333 2 00000000 2 555 2 2 66 2 33 99 2 444444 2 2 2 8888 22222 2 66 3 77 3 8888888888888888888888888888888 666 3 666 4444444444444 3 1111111 22 4 66 777 8 777 4 22 5555 88888 66 5 5 6 888 777777 5 5 77 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 77 000 77 44444 77 5 5 5 2222 3 3333 5 000 555 5 77 0 66666666 5 6 6 44444444 99 6 111 6 111 6 6 6 6 5 333333333333333333333333333333333333 77 6 111 9 999999999 9 1 6 00000 000000 5 888 4 222222 66 66 4 444444 666666666 4 99 4 777 11 3 99999 333333333 444444444444 8 22222 55 99999999999 4 4 77 3 3 3 444444444 3 9999 00 99999999999999999 666 55 3 1 3 0 11111111 777 333333 4 55555 55 99 4 33 6666 33 5 1 5 77 6 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33 33 0 0 0 66666666 1111111 11 8 11 11 22 55555 0 6666666 888888888888 555 6666 6666666 55 55 4 777 4 0 66 5 5 5 11 5 5 5 22222222222222 66666 000 5 77 1 22222222 3 6 6 6 444 2 7 6 2222 6 44444 5 5 22222222222 77 5 0 5555555555 5 5 99 6 6
lowQualScore : . . . . . .. . ........................... ..... ............... . . . . .. . . .... . ...... . . . . . . .. . ........... . . . . ............................. .. .... ............ ..... . .. ....... ..... . . . . . . ... .. . .. . . .... . . . .... . . .... ........... . ... . .. .. . .... .. ...... . .... .. . ... .. ................ . .... ... .. . . . . . .................. .... .... . ........ . ... . . .. . .. .. . ...... . . . .... ..... . .. . .. . ............................... ... . ... ............. . ....... .. . .. ... . ... . .. .... ..... .. . . . ... ...... . . .. ..................................................................... .. ... .. ..... .. . . . .... . .... . ... ... . .. . ........ . . . ........ .. . ... . ... . . . . . .................................... .. . ... . ......... . . . ..... ...... . ... . ...... .. .. . ...... ......... . .. . ... .. . ..... ......... ............ . ..... .. ........... . . .. . . . ......... . .... .. ................. ... .. . . . . ........ ... ...... . ..... .. .. . .. .... .. . . . .. . ........................................................................................................................ .. .. . . . ........ ....... .. . .. .. .. ..... . ....... ............ ... .... ....... .. .. . ... . . .. . . . .. . . . .............. ..... ... . .. . ........ . . . . ... . . . .... . ..... . . ........... .. . . .......... . . .. . .
lowQualScore : 7 7 3 0 6 55 4 666666666666666666666666666 44444 777777777777777 6 7 3 7 77 1 1 5555 5 888888 1 1 1 9 9 6 99 7 33333333333 1 9 1 1 55555555555555555555555555555 88 1111 444444444444 88888 3 44 0000000 77777 1 1 7 1 5 1 888 11 3 66 3 3 8888 3 3 3 2222 2 2 2222 88888888888 3 888 3 22 22 3 2222 44 666666 3 1111 55 7 999 00 4444444444444444 2 5555 555 22 1 9 9 9 9 999999999999999999 1111 1111 9 44444444 9 000 9 9 88 9 99 66 9 111111 9 9 9 9999 11111 9 88 1 33 1 4444444444444444444444444444444 444 6 444 5555555555555 6 8888888 33 0 11 888 0 000 0 88 6666 44444 99 0 0 7 333 111111 7 7 77 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 99 000 99 33333 99 7 7 7 1111 0 7777 7 000 999 7 99 3 77777777 7 7 7 22222222 22 7 777 7 777 7 7 7 7 7 555555555555555555555555555555555555 77 7 777 2 333333333 2 0 7 88888 111111 0 888 4 888888 11 11 4 999999 666666666 4 55 0 000 00 3 88888 333333333 999999999999 0 22222 55 00000000000 0 0 22 6 6 6 666666666 6 1111 00 55555555555555555 444 00 6 3 3 2 55555555 000 111111 0 55555 55 55 3 00 4444 66 7 4 7 99 7 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 88 22 0 0 0 22222222 2222222 00 0 00 00 55 00000 0 5555555 777777777777 777 7777 4444444 44 44 4 888 4 6 99 7 7 7 66 7 7 7 33333333333333 44444 000 7 33 6 66666666 9 0 7 7 777 2 2 7 3333 7 22222 7 7 00000000000 99 7 1 0000000000 7 7 22 7 7
consensus : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-GTGCAT--GCTTT------T-------A-T-------T--GAT--C--TCCTGTGCCATA--G-GTNCTGGAA-TGCCTTTTC-CCTGA-T-GA--TA-C-TT----GGGTAACA------T-TTTTA-CA-ATTGGAGC-A-T-G-NTATACTA---A---A--AGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTCAT------------------------CT--ACACAATTAATCAAAA-GC----AATG--G-----C---TGATGACAT-----G-ATGA-GCA-------TC-----CT-CT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-G-CCTTC-A--TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATCAA------ACCT-TA--GTA-ACA-TA--AAAAAN-AATTG----------------CA-TT----TA---C--AG-TGATT-T-G-A-CTG-------------N-A--CG----TACTG--C-AA-C--------AT-GT---G-TA-A--T-T--AA--TG-T--A---CTC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-GA--TGG-CT--A-T-A------TT--TCT---T-----T----T-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-T-------ATA--AAGCC-GT--G---CTTA-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--AT-A-ATT-ACA-TG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTT--G-C-A-ATC-G-------C-CTG---TCA-TAAA----A-----------GA---A------A--CA---TA--AT-----TT--A-TG-ATA-TT----TCAT--N-CC-TT---TAA-T-A-CG--TATTG-----ANTTTT-CAC-G-TTCA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTTACTG-TACTT--TG----CTA----GT-C-AGCAAT--A-----CG-TCC-TG---GGCGGA--T------AGGGTGCGTGCGG-TACTT-----AA---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------ATA--ATAAAGATG--C-AC----G-AATA-G---T---C-TAAAT--C-AAG---C--AT-GTCG--C--TC---------AT-------T-T--AA-TT-C---AT--TT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-A---ATTTT-TG-C-T--TATGT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-AA----TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAA-CAGGTGC--TGCGGCAGGTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGNNNNAANATATAANANAANAGGGTCGATTCGTCGCGAGCGCNTN-TGT---AG-G----TG--CTGAT-GAAA-AAT-CACATTG--------CTTGT----A-GAGGTG--CC-ATCTTTTTC--GCA--TAAG-CAT-----GATC-TACCTTT---ACAACTTCGTGG-G--CGGTAGTAAGGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGNAGCC-GTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-GT-TGTT--TTTCACTTA-T-AGAT-CGCCCGTTCTTA-TCT-CGGGATTTCTCA-TTCACG---C-----TTTTGTTT-----ATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT------TCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTCTTGCGAAATT-ACAT--NGGAGTTA-CAAT--ACTTT-GAAGTGAAA-ATA---CTTCC--T--T-GTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
Reference ( gi|1 ) : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-GTGCAT--GCTTT------T-------A-C-------T--GAT--C--TCCTGTGCCAT---G-GTTCT-----TGCCTTTTC-CCTGA-T-GA--TA-C-TT----GG-TAACA------T-TTTTA-CA-ATTGGAGC-A-T-G-CTATACTA---A---A--AGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTCAT------------------------CT--ACACAATTAATCAAAA-GC----AATG--T-----C---TGATGATAT----TG-ATGA-ACA-------TC-----CT-CT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAT---GA-CG-G-CCTTCGATCTTTCCAGTTTGTGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-GTCAA------ACCT-TA--GTA-ACA-TA--AAAAAA-AATTG----------------CA-TT----TA---C--AG-TGATT-T-G-A-CTG-------------A-A--CG----TACTG--T-AA-C--------AT-GT---G-TA-A--T-T--AA--TG-T--T---CTC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-GA--TGG-CT--A-T-A------TT--TCT---T-----T----T-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-T-------ATA--AAGCC-GT--G---TTTA-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--AT-A-ATT-ACA-TG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTT--G-C-A-ATT-G-------C-CT----TCA-TAAA----A-----------GA---A------A--CA---TA--AT-----TT--A-TG-ATA-TT----TCAT--C-CC-TT---TAA-T-A-CA--TATTG-----ATTTTT-CAC-G-TTCA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTTACTG-TACTTTGTG----CTA----GT-CTAGCAATTTA-----CG-TCC-TG---GGTGGA--T------AGGGTGCATGTGG-TACTT-----AA---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------ATA--ATAAAGATG--C-AC----A-AATA-A---T---C-TAAAT--C-AAG---C--AT-GTCG--C--TC---------AT-------T-T--AA-TT-C---AT--TT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-A---ATCTT-TG-C-T--TATGT--AAT--------------CT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-AA----TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAA-CAGGTGC--TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTC-TGT---AG-G----TG--CTGAT-GAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----A-AAGGTG--CC-ATCTTTTTC--ACA--TAAG-CAT-----GATC-TACC-TT---ACAACTTCGTGG-G--CAGTAGTAAGGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGTAGCT-GTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-GTGTGTT--TTTCACTTA-T-AGAT-CGCCCGTTCGCA-TCT-CGGGATTTCTCA-TTCACG---C-----T----TTT-----ATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT------TCTTTTATGTATGAAGAGTGCATATTAAGA-ACAT-TAACTTTTGCGAAATT-ACAT--TAGAGTTA-CGAT--ACTTT-GAAGTGAAA-AT----CT--C--T--T-GTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
gi|19 : TTTCAA--TCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-GTGCAA--GCTTT------T-------AAT-------T--GAT--C--TCCTGTGCCAT---A-GATAC-----TGCCTTTTC-CCTGA-T-GA--TA-C-TT----GGGTAACA------T-TTTTA-CA-ATTGGAGC-A-T-G-CTATACTA---A---A---GAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTCAT------------------------CT--ACACAATTAATCAAAA-GCTATCAATA--G-----CAATTAATCAAAT-----G-ATGA-GCA-------TC-----CT-CA-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-G-CCTTCGAT--TTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AA---TT-ATCAA------ACCT-TA--GTA-ACA-TA--AAAAAT-AATTG----------------CA-TT----CA---C--AG-TGATT-T-G-A-CGGA------------A-A--CG----TAATG--C-AA-C--------AT-GT---G-TA-A--T-T--AA--TG-T--A---CTC-AGA-GTTG-AAA----AT-----CA-GA--TGG-CT--A-T-A------TT--TCT---T-----T----T-
gi|23 : TTTCAAAATCAGTCC-T-A-GCC-TCTGCAC-G--CAT--G-TCA------A-------A-T-------C--GAT-----TCCTGTGCCAT---A-GGTAC-----TGC-TTTTC-CCTGA-C-GA---A-C-TG----GG-TA-CA------T-TT--A-CA-AT-GGAGC-A-T-G-ATATAC-----A---A--AGAG-CGATC-C-AAACCAAAA-TGC-TATCCAT------------------------CTCTACACAATTAATCAAAA-GC----AATGGCC-----C---TAAT-ATA-----TG-ATGA-GCA-------TC-----CC-TT----G-AGC--T-TCGGCTA---AACATC-C--CCAATA-CAA-TCAT-T---GG-CG-GTCTTTCGA-CTTCCAAGTTTATGC--CGAAA------TAT-----C-----TG-TC----AA-TA--ATATCA-----AAAGCTTAATC-A-----T-ATCAA------ACCT-TA--G-A-A-A-T---AAAAAT-AATTG----------------CATTT----TA---C--AG-TGATT-T---A-CTG---------------A--CG----TACTG--C--A-C--------AT-GT---G-TA-A--T-T--AAC-TG-T--A---CTC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-GA--
gi|44 : TTTCCAAATCAGTCC-TTACGCCCTCTGCACCGTTCAT--GCTTT------T-------AAT-------T--GAT--C--TCCTGTGCCATTAGG-GTACT-----GCCCTTTTC-CCTGA-T-GA--agcatat
gi|4 : tTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-GTGCAT--GCTTT------T-------A-C-------TT-GAT--C--TCCTGTGCCATA--G-GTTCT------GCCTTTTC-CCTGA-T-GA--TA-C-TT----GGGTAACA------T-TTTTA-CA-ATTGGAGC-A-T-G-CTATACTA---A---A---GAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTCAT------------------------CT--ACACAATTAATCAAAA-GC----AATG--T-----C---TGATGATAT-----G-ATGA-ACA-------TC-----CT-CT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAT---GA-CG-G-CCTTCGATCTTTCCAGTTTGTGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-GTCAA------ACCT-TA--GTA-ACA-TA--AAAAAA-AATTG----------------CA-TT----TA---C--AG-TGATT-T-G-A-CTG-------------A-A--CG----TACTG--T-AA-C--------AT-GT---G-TA-A--T-T--AA--TG-T--A---CTC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-GA--TGG-CT--A-T-A------TT--TCT---T-----T----T-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-T-------ATA--AAGCC-GT--G---TTTA-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--AT-A-ATT-ACA-TG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTT--G-CAA-ATC-G-------C-CT----TCA-TAAA----A-----------GA---A------A--CA---TA--AT-----TT--A-TG-ATA-TT----TCAT--C-CCTTT---TAATT-A-CA--TATTG-----ATTTTT-CACGG-TTCA--------TTTCCA--TTTACTGTC---G--C---TGTTA-T-T-AATG-AGTAACTG-TACTTTGTG----CTA----GT-CTAGCAATTTA-----CG-TCC-T----GGTGGA--T------AGGGTGCATGTGG-TACTT-----AA---G---ACAC-T---GTAAAAT-C------ATA--ATAAAGATG--C-AC----A-AATA-A---T---C-TAAAT--C-AAG---C--AT-GTCG--C--TC---------AT-------T-T--AA-TT-C---AT--TT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-A---ATCTT-TG-C-T--TATGT--AAT--------------CT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-AA----TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TGA-TAGGCCGATCTATTAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAA-CAG
gi|21 : TTCAAAATC-GTCC-T-A-GCC-TCTGCTC-G--CAT--G--TT------T-------A------------AAT--CGATTCTGTGCCATA--G-GTACT-----CGC-TTTTC-CCTGA-C-GA--TA-C-TT----GGGTAACA------T-TTT-A-CA---TGGAGC-A-T-G-ATATA-TC---A---A--AGAGACGATC-----ACCAAAA-TGC-TATCCAT------------------------CTCTACACAATTAATCAAAAAGC----AATGG-C-----C---TAATTAT-T----TGCATGG--CA-------TC-----CTTCT-GT-G-AGCT---TCGGC-A---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TA-T-T---GG-CG-G-TCTTCGATCTTTCCAGTTTATGC-TCG-GAAA----TAT-----C-----TGTTC---AAA-TA--AT----ATC--AAAGCTTAATC-A-----T-ATC-A------ACCT-TA--G-A-ACA-T----AAAAT-AATTG----------------CATTT----TA---C--AG-TGATT-T-G-A-CTG---------------A--CG----TACTG--C-AA-C--------AT-GT---G-TA-A--T-T---A--TG-T--A---CTC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-GA--AGG-CTTAA-TGA------TT--TCT---T-----T----
gi|35 : AATCAGTCCCT-ATGCC-TCTGCAC-GT
gi|2 : -TTTACAT-GTGCAT--GCTTT------CCCCTTTAA-T-------T--GGT--A--TCCTGTGTCATA--G-GTACTGGAA-TGCCTTTTC-CCTGA-T-GA--TA-CATG----GG-TAACA------T-TTTCA-CA-ATTTGAGC-A-T-G-TTATACTA---T---A---GAG-CGATC-CCAAAACAAAA-CGAATA---------------------------------GCACAAT----CAAAA-GC----AATG--G-----C---TGATGACAT-----G-ATGA-GCA-------TC-----CT-CT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-CTC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-A-CCTTC----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAA-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATT-A------ACCT-TAC-ATACAAA-TA--ANNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCA-TT----TA---C--AG-TAATT-TGG-A-CTGTCTTTATTACACCA-G--CA----CACTA--TAAA-CGAGTTACGAT-GT---G-TA-AATT-T--AA--TG-TACT---ATC-AGAGGATGTAAT----ATATCTGCATGA--TGA-CT--ACT-A------AT--TCC---TACATGT----G-CA---A-ATAGGTTTCT------ACTG-C-T-------ATA--AAGCC-GT--G---CTTA-G---T-ATTCATATAATCATGG---G-TAT--AT-ATCTC-ACC-TAAACT-TAATAATC-TAcgttatgagtacatggtaacaaaagtcggttaattaatttgatctacctgcctcgaagattttaagggtactgctccgcgtctccttcgcctgattgatagcttaatgggtaaatttttacaattcgagcaatggccatataacttatcagagcgattccaa
gi|3 : caatttaaatgcaaaacaaacaaagaaatgggaaaaatacataaaaattataatatataaaattaaaaaaaaaacaacatcaaaaccaaataacaaaaaataaatatcaaaaatataagaatatttaaaaaaaaatgcaattcatatataagacaaaaatgaaaatttaaaaaataataaccacaagattttgttcaaattttaacataatagtaatcagtatatgtataaaatatatcaattagaatttttaaaaaaaaaattgctggtgaattttgaagaatggaaaacaaatgaaatttacataatgttagctgcaaacttaattacctccctttgtggaatctaaattaaaaacatggttataaacagctgaactaatctt-TTTACAT-GTGCA---GCTTT------C-------C-C-------TTTAATGGC--TCCGATGCCATAC-G-GTATTGGAA-TGCTTTTCG-CCTGAAT-GA--TA-C-TC----GG-TAACA------T-TTTTAATA-ATAGG-GC-A-TAG-ATATACTAT--A---A--AGAG-CG--T-CCAAACCAAAA-TCC-TATTCA-------------------------------------AAT------GC----AATG--G-----CA--TGATGACAG----TG-ATGA-GCAATCTGCATC-----CT--T-GTGG------T-TCGGCTACAAAA-ATA-A--CCATAA-CAA-TAA-AC---GA-TG-G-TCTTC-----TTTCAGTTTATGCTTCGAGAATAAA-TATACTG-C-----TG-CT---CAA-TACCATATTAATC--AA-GCT--ATC-ATAAATT-ATTAA------ACATACG--ATA-AAA-TA--ATATGA-GATAG----------------TA-G------A---C--A--T-ATT-T-G-A-CTG-------------TTA--CG----TACTG--C-A--C--------AT-TC---G-TA-A--T-T--AA--TT-T--A---CTC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-GA--TGC-TT--A-T-ATAAAC-TT--TCC---TTA---T----T-CA---A-A---GTTT---------ATG-C-T-------ATAC-AAGCT-Gtatgtatcatgtcacgagtaaaaagagagtctcgaaacaaattaacaataatcgaattattgatcattactttgactgtactattactataaaataacccatgtcctcagagagctggtaaaggctgtggctagatgtccaacatctacttgtatgaaatcactgttaaatattctcagagagagaggaaagattgcacgagatttaggttctataactccaaccattctatggtcgcacattaatttattttcatattgagagaaaagtaatattcctttcaattttatgctaatacatcattcactacaggtttttaaaaaatataataacctcaagactgattctgtagg
gi|7 : caaggaggctgcagaggtatacaaacccccccaatcaacagctagcatggttcttgatataatcatataataattttaactcaaaagacagtaaaacaatgagccatataatgtatcatttatgatttattaattctaatgttcattgcacaactgtttaacaatgcaaaaaatttaaataaatacacatcaaaccaaatgaaataataagaaatttatatacaacacatgaatttaaaaaaacataaccacaaggttttggtcaactttctaacacagatatgtataatatgtgttgaagatataccaaattataattaatttttagagctggtgaattatttgaagaatgggtaaaaaaccgaaatttacataataattgtgaaaaatggaattacctcccctttgcaaaaatctacaaattcaaaaactgtgaaatactgt-TTTACAT-GTGCATAAGCTTTCCCCTTT-------A-A-------T--GGT--C--TCAGATGCAAC---G-GTACTGGGAATGCTTTTCG-CCTGAAT-GA--TA-C-TC----GG-TAACA------T-TTTAA-TA-AT---AG--A-TAG-ATATACTATA-A---A--AGAG-CG-----TAAACCAAAAATCC-TATTCA-------------------------------------AATCGA----C----AATG-------------GATGATACAAAGTG-ATGAGACA-------TCTGCATCC-TT-GT----GCT---TCGGCTACAAAA-ATAAC--CCAATAACAA-TAACAT---G-----G-TCTTC-----TTTCAGTTT-TGCTTCGAGAATAAAATATACATGC-----TG-CT---CAA-TACCATATTAATC--AA-GCTCA-TC-AT---------AA------A--T-TA--TTA-ACA-TACGAATAAA-AATAA----------------TA-TAGAGATA---G--AGACAATT-T-G-A-CTG-------------T-A--CG----TA-TG--C-A--C--------AT-TC---G-TA-AA-TAT--AA--TT-TA-C---CTC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-GA--T-G-CT--A-T-ATAAACCTT--TCCTTAT-----T----C-CAAACA-A---GTTT---------ATGCC-T-------ATAC-AAGC
gi|9 : atgaaaaaaatttaaataaccatcaaaccaaagaatattagatatatacaaaccatgaatttaaaaacatacacacaaggtctttggtcaaactttcctaacacgatagtatcaatatgtgtatgaaagatatcaacacaacatttattaccattctttatagctggtgaatatttgaagaatgggataaaacgaaaaatataattgtgaaaaatggaattactcccctttgcaaaatctaccacaaaaatgtgtcacaatcaactt-TTTACAT-GTGCAT--GCTTT------CCCCTGTAA-T-------T--GGT--C--TCCTGTGCCAT---AAGTATTGGAA-TGCCTTTTC-CATGA-T-GA--TA-C-TT----GGGTAACA------A-TTTTA-CA-ACTGGAGC-A-T-G-TTATACT
gi|5 : aaggaggctggaggttcattatttttttccccaaaattcataatactagcattgttacttgacataatcaatggtacataatttagcatcaaagacaataaataaatgtagccatatttttatgattttattactttaaatgtgttattgcaaataatattacataaacacataaaaaaaaataataaatacaaaacaaccaaaaaaaatcgggcaaaatacataacaataaaatatatcaaataaaaaaaaaacatcaaaccaaataacaaaacatatctaaatatcaaaactataagaatatttttaaaaaaaatgcaattcatatatataacaaaaataaaaaagaaataaaaaaaataataaccacaatattgtgtttaaattttaacataatggtgatcaatatatgtataaaatatatcaattagaatttatttttttttttgctggtgaattttgaataatggggaaagaatgaaatttacataatattagctgcaaaattaattacctccctttgcagaatctacaagatggttacaaacagctcaactaatcttCAT-GTGCAT--GGTTTCCCCTAT-------A-CATGTAATT--GGT--C--TCCTGCGCCATA--G-GTGCTGGAA-TGCCTT----CTTG-------------------GG-TAACATTTTTTT-TTTTA-TA-ATTGGAGC-A-T-G-TTATACT----A---A--AGAA-TAATC-ACAAACCAAAA-TGC-TATCCAT------------------------CT--ACACATTTAATCGAAT-GC----AATG--G-----C---TGATG
gi|17 : ggctggagggtcatccaattttttccccaaaattcaaaaaactagcatggttacttggcataatcatatacataattttaacaccaaagacaatttaacaaaattagccatatttttatgatttattacttctaatgttattgcacataataatacataaacacataacaaaacaattcaaatacaaaccaaaccaaaaaaaaaaggcaaaacatacaataattaatatatcaaataaaaaaccatcaaaaaccaaataacaaaacataaatatcaaaaatataaggaaattttaaaaaaaatgcaattcatatataacaaaaatgaaaataaaaaaataataaccacaagatttgttcaaattttaacataaatgataatcagtatatatgttaaaatatatgaattggaattaaaaaattttgctgtgaattaagatggaatgggggaaaatgaaaatttcataaatttggctacacaaatttaattacctccctttgcagaatcttaaccgctgaaccatagacgtaaagcaaaacgtgttgctttacgtctatggctgaactgatcgttttgtaaaCTTT------A-------A-T-------T--GGT--C--TCATGTGCCATA--G-GTACTGGAA-TGCTTTTTC-CTTGA-T-GA--CA-G-TT----GGGTAACA------T-TTTTA-CA-ATTGGAGC-A-T-G-TTATACTA---A---A---GAG-CGACC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTCAT------------------------CT--GCTTAATTAATCAAAT-GC----AATG--G-----C---TGATGATAT-----G-ATGA-GCA-------T------------GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-CTC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CA-A-CCTTC----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATCAACGGTAAACCT-TA-------CA-TA--CAAATA-A-TTG----------------CA-TT----TA---C--AG-TGATT-T-A-A-CTG-------------T-A--CG----TACTG--C-AA-C--------AT-GT---G-TA-A--T-T--AA--TG-T--A---CTT-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-GA--TGA-CT-----------------------------------------A-A---GTTTA-------AA---C-T-------ATA--AAGCC-GT--G---CTTA-G---T-ATgatgc
gi|54 : ttaattacctccctttgcagaatctaaaaactgaactaatcttgctttccc--GAT--C--TCCTGTGCCAT---A-GGTAC-----TGCCTTTTC-CCTGA-T-GA--
gi|22 : ---G-GTTAA-----TGCCTTT-C-CCTGG-T-GAAATA-G-CT----AG-TAACA------TATTCTT-CATATTGGAGC-AAT-GTCTGTA-TAGGCA---A--AGA--CGACCTCCAAACCAAAA-TGC--A-TCATGG----------------------CT--ACA
gi|29 : ataaaaagatataaaccacaatgacggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattataataatacaattgaaatttgacatctataatttgctgggtgaattttggaaggaaatagggcaaatgaatttacataattcagctgctaaaataattaccattaccgctgtatggccagaaattagaagcatggctacaatcaagcctgaactcaggtaccttttggcatatttgccatgctctctctcgcttttatatagggctctcccgttgtcagcgtactg-----TGCCTTTTC-CCTGA-T-GA--TA-C-TT----GGGTAACG------T-TTTTA-CA-ATTGGAGC-A-T-G-TTATACTA---A---A--GG-G-CGATC-CCAAAGCAAAA-TGC-TATTCATAGAT--------------------CT--ACACAATTAATCAAAT-GC----AATG--CAATGGC---TGATGACAT-----G-ATGA-GCA-------TC-----CT-CT-GTAC-AGCTGT-TCAGCTA---AA-CTC-C--CCAATA-CAA-T-ATAC---GG-CG-G-CCTT--A--TTCCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----CTTCTTTG-TCTCGAGA-TAA-A-ATTACTC--AA
gi|35 : aTTCGCCTGA-TTGA--TAGC-TTAATGGG-TAA-A------T-TTTTA-CA-ATTCGAGCAA-TGG-CCATA-TA---ACTTATCAGAG-CGATT-CCAAgaatggccacgacactggaggacccttaagcag
gi|25 : aatcagtccctatgcctctgcacgtcgttatgagtacatggtaacaaaagtcggttaattaatttgatctacctgcctcgaagattttaagggtactgctccgcgtctccTGGAGC-A-T-G-TTATACTA---A---A---GAG-CTATC-CCAAACCATAA-TGC-TATTCAT------------------------CT--ACACAATTAATCAAAA-GC----AATG--G-----C---TAATGATAT-----G-ATGA-GCA-------TC-----CT-TT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-A--CCAATA-CAA-TAATAC---AA-CG-G-CCTTC----TTTCCAGTTTATGCTTCGTGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATCAT------ACCT-TA--GTA-ACA-T---AAAAAT-AATTG----------------CA-TT----TA---C--AA-TGATT-T-G-A-CTG---------------------------------AA-C--------AT-GT---G-TA-A--T-T--AA--TG-T--A---CTC-AGA-G-----------AT-----CA-GA--TGG-CT--A-T-ATT----TT--TTT---T-----T----T-CA---A-A---GTTT---------ATG-C-T-------ATA--AAGTC-GT--G---TTTA-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--AT-A-AT
gi|27 : -CCAAACCAAAA-TGC-TATTCATGTAAAGGCAAATGTAAAGGCACATCT--ACACAATTAATCAATA-G-------------------------GACAC-----G-ATGA-GCA-------TC-----TT-CT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-CTC-C--ACAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-G-CCTT-----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----CAT-----A-----TA-TC---AAA-TAC-ATATTAACC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATGAA------ACCT---------ACA-T---ACAAAT-AATTG----------------CA-TT----TA---C--AG-TGATT-T-G-A-CTG-------------T-A--CG----TACAG--C-AA-C--------AT-GT---G-TA-A--T-T--AA--TG-T--A---CTCAAGG-GATG-AAA----AT-----CG-GA--TGG-CT--A-T-A------TT--TCT---T-----T----T-CA---A-A---ATTT---------ATG-C-C-------ATA--AAGCC-GT--G---CTTA-G---T-ATC-ATA----
gi|53 : GATGACAT-----G-ATGA-GCA-------TC-----CT-CT-GTAG-AGATGT-TCGGCTA---AA-
gi|6 : GA-GCA-------TC-----CT-CTCGTGGGAGCTGGGTCGGTCA---GA-CTT-CAGCCAATA-CAAATAACACCGAGATCGCA-CCTTC----TTTCCA----------C-AGTATA---CAT-----C-----TG-TC---AAACTAC-AAATTAAATGAAAAGCTTAATCCAT---TT-GTTAA-------CC------GTA--CAGTA--CAATGA-A--TG----------------CA-TT----TA---C--AA-TGTTG-T-GGA-CT----------------A--CGCCCCTACTGC-T-AA-C--------AT-GC---T-TA-A--T-A--AT--TG-C--TATACTC-AGA-GATG-AAG-----------CA-GAA-TGG-CTT-A-T-A------CT--TCC---T-----CACTCT-CA---ACA---GTTTATGTCATGACTA-C-T-------ACA--AAGCC-TTTGG---CTTAAG---T-ATTGATA----CATGG-ACG-TTTTGATTA-ATT-ACAATG---T--AAT-AT--TA--TTAT--TTTTCGTC-A-AT--A-------T-CA----GCA-TAAAT---A-----------GA---A------AGTCA---TA--ACATATCTT--ACTG-ATA-TT----T--T--C-TC--------A-T-A-CG--TATT----------TT-CAC-G-TTTGTGTGTGACCTTCTAGCCTTACT-TCAGGGC-CGGTTGTCA-TCT-AATGTAGTCA----TGCGTAGTGATTACTA----GT-CAAATAA---AAAACCCG-TCC-TG---GGCGGAAAT------AGGGTGGGTGCGGGTACTTTATAAAA---G--AA-AC-C---GTACAAT-TCACTCAATA--ATAAAGATT--C-AT----GTAATA-GGTCC---C-TAA-T--C-AAG---C--TT-GTC---C--TCTTTCATTGAAT-------T-TTAAA-TTTC---AT--TT-----------GAATAG-AAGT-TC-GTTTC-TTT-ATTTGTGTG-TG-C-T--CATGT--AATT-------------CA-AGT---ACAGG--TCGTAAAAAA-A-AA-AATATTTTAC---C--C---GACT-GAGC---TTCGATG--TAc
gi|28 : atgTAACC--AAAGGCTAATC-AT---TTTATCAA------ACCT-TACAGTA--CAGTA--ACAAAGTAATTG----------------TA-TT----TAATAC--AG-TGATT-T-G-A-CTG-------------A-AATTG----TACTGGGC-AA-C--------AT-GT---GGTACA--T-T--AAACTG-T--A---CTC-AAG-GCGG-AAA----AT-----CA-GAATCGG-CT--A-T------------------------------------------GTTTA-------A----C-T-------ATA--AAGCCCGT--G---TTTA-G---T-ATT-ATAGA--CAAGGCA-G-TTT--AT-A-ATTGACA-TG---T--AAT-ATC-TAC-TTATATTTC--G-T-ATATCCG-------CATT----TCA-TAAA----G-----------AA---AGTCTCAA--CA---TA--AT-----TT--A-TG-ATA-TT----TCATAAA-CC-TT---TAA-T-AGCGATTATGT-----ATTTTT-Cc
gi|37 : -AATTG----------------TACTT----TAG--CGAAG-TGATTGT-G-AACTG-------------T-A--CG-----ACTG--C-AAAC--------AT-GT---G-TA-A--A-T--AAA-TG-T--G---CTC-AGA-GATG-AAATAAGATGCA--TA-GA--TGG-CT--A-T-AT-----TT--TCT---T-----T----TACA---A-A---GTTAT-------AATA-CTT-------ATAACAAGCC-G---G---CTTAGG---TAATA-ATA----CAT-G-A-G-TTC--AT-A-ga
gi|20 : ttTT-T-G-A-ATG-------------C----CG----TACTG--C-AA-C--------ATGGTAGGA-TA-A--T-TTAAA--TGAT--A---CTA-CGG-GATG-CAAT---AT-----CG-GA--TGATCT--A-TAA------TTTATCT---T-----T----T-CA---A-G---TTTTAT------AGAG-C-TATACACCATA--AAGTC-GC--GGGTTTTA-GGTAT-ATA-ATA----CATGG-A-GATTT--A--A-ATT-A-A-TG---T-AACT-CTT-TATATTAT--GTT--G-----ATT-GTATGAGAT-CTGACATCA-TATATAGCA-----------GATCTA------A--GACTTCA--AC-----TTTAA-TG-ATA-TT----TAAT----AC-TT---TA----A-CA--TGTGC-----ATTTTTGCAC-GTTTCA--------CTTTCA--TT---T-TC---GCTC---TGATACT-T-AATGTA-TTACTG-GGTT---TG----CTAACATGT-C--GCAA--TA-----C--TCC-TGTGCGG-GGA--T------AGGGTGC-TGTGA--A--T-----AA---A--AACGCATCTGGTAAAAT-C------ATA--ATGAGAATG--CAAC----A-AATT-A---T---T-CTAAT--CAAAG---C--A---TCG--T--TC---------GT-------
gi|34 : -G---T-AT--ATA----CAATG-A---TCT--AC-A-CTT-A-A-TG---TATAAT-CTCATGC-TCA------------A-ATC-G-------C-CTG---TCAATAAA----ATGAAAAGTGCTAA---A------A--CA---TATAAT-----TT--A-TGCATAATTGTCCTCAT--TACC-TTATCTAA-TTA-CA--TATTATTGTTACTTTC-CAC-G-TTCA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-TAAATGTA-TT-CTG-TACT---------CTA----GT-C
gi|18 : tt-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTT--G-T-ATATC-A-------C-ATA---GCA-TAAA----G-----------TCT--A------A--CA---TA--AT-----TT--A-TG-ATA-TT----TTAT--A-CC-TT---TAA-T-A-CA--TCATG-----TATTTT-CAT-G-TTCA--------TTTTCA--TTTACT-TC---AC-C---TGTCT-T-T-AATGTAGTTACTG-TACT---------------------AGCAAT--A-----CA-TTA-TG---GGCGGA--TCATATTAGGGTGCGTGCGG-TACTG-----AA---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------GTA--ATAAAGATG--C-ACG---A-AATA-G---A---C-TAAATGCT-AAT---C--AT-GTCGT-C--TC---------AT-------T-TA-AA-TT-C---AT--TT-----------AAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-A---AT-TT-TG-C-TA-TA-GT--AAT--------------TT-AGT---ACGTG--T-GT-------GAAA-AA----TTATATAC--C---GACT-GA------TC--TG--TA-GCCTAT-TA-TAGT-C-----TC-GATAGT-TT--GGTGAA-CAG
gi|33 : agagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntg---A------A--CA---TA--AT-----TT--A-TG-ATA-TT----TCAC--A-CC-TT---TAA-T-A-CA--TTCCG-----TATTTT-CAC-G-TTCA--------TTTTCA--TTTATT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTTACTAATAC-----------------G----AGCAATA-A-----CG-CCCCTG---GGCGGA--T------AGGGTGCGTGCGA-TACTTTTAA-AA---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------ATG--CTAAAGATG--A-AA----G-AAAA-G---T---C-TAAAT--C-AAG---A--AT-GTCG--C--TC---------GT-------T-
gi|8 : agtctTG-TACTTT-TA----CT-----GTACT--CAACT-A-----CGCTCC-TG---G-CGG---T------AGGATGCGTGCGA-TACTT-----AACATGTCAACAC-T---G----AT-C------TTA--ATACAGTAG--C-AC----GCAATC-G---T---CCTAAACG-C-AAG---C--AT--TCG--CG-TT---------AT-------TAT--AG-TT-C----TCATT-----------GAAAAG-GA-T-TCTGTTCA-TTT-G---------CG-CGT--TATGT--GAT--------------TT--GT---AC-GG--T-G-AAAAAA-AAAA-AA----
gi|39 : catttaaatattaccctatcttcca---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------ACA--ATAAAGATG--C-AC----G-AATT-G---T---C-T-AAT--C-AAG---CATAT-GTCG--T--TC---------AT-------T-T--AATTT-C---AT--AA-----------CAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-A---ATTTT-TG-C-T--TATGT--GATGATATTTGCTTATGTT-AGT---ACTGG--T-GTAAAAAA-aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaataaaaaagaattattacccgactgattctgtaggccgatctatgtcgtagtattgatgtacaggtgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgtagaattcgtcacgagcctctatgtagatgctgatgaaaaagcaatcgcttgtagaggtgccatctttttcacattcataataacaatcgcagccgccattgtggttgagtagatctttttggtgtttttcacttatagatcgcccgttcttatctggggattttgtttatctgagtcttttattatcttctatgtatgaagagtgcatactaagaacattaactgttgcgaaattacataggagttacaatacttggaagtgaaaatattctttgtcgcgagataaaattactcaagaatggcaacgacactgaagaaccct
gi|12 : -T---GTAAAATTC------ATA--ATAAACGTGGCC-AC----A-A-TATA---T---C-TAAAT--C-AAG---C--ATAGTCG--CCGTC---------AT-------T-TT-AA-TT-TTCAAA--TT-----------GAAA-G-AA-T-CC-GCTAA-TTT-A--------------------GT--AA------------------------ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-TA----TTAC---C--C---GAGT-GA-----TTC--TGATTAGGCCGAT-TA-TAGTAAT-GGTCC-GCTAGT-TT--GGTGAACCAGGTGC--TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTAAATAACAGAATAGAAGGGTCAATTCGTTCACGAGCCGCGT---AATG----TGTGCTGA--GGAA-AAT-CACATTC--------CTTGT----ATACGGTG--CC-ATCTTTTTC--GCGATTAAGCCAT-----GATC-TACT-TTACAACAACTTC-TGG-G--CG--AGT-AGGGTAAC--ACGA-TAACATACGGACATGCTAGCT-GTCA-T-GTGG-T---TAGATCTTTTT-GT-TGTC--TTTCACTTA-TGAGATCCGCCCGTTCGTATTCTCCGGGATTTCTCA-TTCACG---C-----TTTTGTTT-----ATCTTCCACA-CCAGTGGTTATGAGT-TCTTATCA-------TCTTCTATGTGT
gi|36 : g-C------ATAGCATAAAGATG--C-ATTTTGATAATA-G---TATCC-TAAAT--A-AAGGCTCTGAC-GTTGACT--TC---------ATAAATAAAT-T--AA-TTTC---AT--TT-----------GAAAAG-AA-TACC-GTTAAGTTT-A---ATTTTATGACAT--TATGTAGAGT--------------TTAAGT---ACAAGGTT-GT--AAAA-AAGA-TA----TTAC---CT-C---GACTAGA-----TTC--TG--TA
gi|40 : T--C-AAG---C--AA-GTCG--C--TC---------AT-------T-T--AA-TTTC---AT--TT-----------CAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-A---ATTTT-TG-C-T--TATGT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-TTAAAAAATAAAA-AA----ATAT---T-------ACT-TG-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTG
gi|2 : -GTCG--C--AC---------AT-------T----AA-TT-T---AT--TTTCATATTGAGAGAAAAGTAA-T----ATTCC-TTTCA---ATTTTATG-C-TAATACAT--CAT--------------TC-ACT---ACAGG--T-TTTTAAAA-AATATAA----TAAC---C--TCAAGACT-GA-----TTC--TG--TAGG
gi|51 : caatttaaatgcaaaacaaacaaagaaatgggaaaaatacataaaaattataatatataaaattaaaaaaaaaacaacatcaaaaccaaataacaaaaaataaatatcaaaaatataagaatatttaaaaaaaaatgcaattcatatataagacaaaaatgaaaatttaaaaaataataaccacaagattttgttcaaattttaacataatagtaatcagtatatgtataaaatatatcaattagaatttttaaaaaaaaaattgctggtgaattttgaagaatggaaaacaaatgaaatttacataatgttagctgcaaacttaattacctccctttgtggaatctaaattaaaaacatggttataaacagctgaactaatctttttacatgtgcatgctttcccctttaattggtatcctgtgtcataggtactggaatgccttttccctgatgatacatgggtaacattttcacaatttgagcatgttatactatagagcgatcccaaaacaaaacgaatagcacaatcaaaagcaatggctgatgacatgatgagcatcctctgtagagctgttcggctaaactccccaatacaataatacgacgaccttctttccagtttatgcttcgagaattatctgtcaaataaatattaatcaaagcttaatcatttattaaccttacatacaaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcatttacagtaatttggactgtctttattacaccagcacactataaacgagttacgatgtgtaaatttaatgtactatcagaggatgtaatatatctgcatgatgactactaattcctacatgtgcaaataggtttctactgctataaagccgtgcttagtattcatataatcatgggtatatatctcacctaaacttaataatctatatgtatcatgtcacgagtaaaaagagagtctcgaaacaaattaacaataatcgaattattgatcattactttgactgtactattactataaaataacccatgtcctcagagagctggtaaaggctgtggctagatgtccaacatctacttgtatgaaatcactgttaaatattctcagagagagaggaaagattgcacgagatttaggttctataactccaaccattctatg-GTCG--C--TC---------AT-------T-T--AATTT-C---AT--TT-----------GAAAAG-AA-T--C-GTTCA-TTT-A---ATTTT-
gi|10 : C-ATTGA-TTT-A---ACTTT-TG-C-T--TATGTCTAAT--------------TT-AGTTCAACAGG--T-GTAAAAAC-ATA--------TTAC---CGGC---ACCT-GGAACATTTC--GG--TGG--CGATCTG--AGTACTTGC-TT-G-TGGT-TTTAGGTGAA-CCGTTG----GCGGCAGGTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGCCGTAAATTATAATAAGAGAGGGTCAATTCGTCACGAGCACTTG-TGTGATAG-G----TG--CTGATCGAAACAATTCATATTGGTCTCGATCTTGTGCATA-TAGGTGGCCCGATCTTTTTTCGACA--TAAG--ATTACTGGATAATACC-CT----TAACTTCGTGG-GGGC-GTA--AAGGGTAATTAAT-A--AACATG-----ATCAGAGCTCGCCATTTGTGAGT---TGTATTTTTTTTGTCTGTTGTTTTCACTAACT-AGAT-CGTC-GTTCGTA-TTC-GGGGATTTCTCACTTCACGACGC-----T----TTTGTCTTATCTT---CAACCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT-------CTTCTATGTAAGAGAAG-GCATACGAAGACACATCTAA---TTGCAAACTTTACAT--T-GAGTTA-C-----ACTTTTGAAGTGATA-ATATAATT--C--T--TTGT-TCG-GATAGAATTACTACTATCTACTCTA-TAATGGCC-ACG
gi|45 : tG-C-T--TATGT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-ATA--------TTAC---C--C---GATT-GA-----TTC--AG--TAGGCCGATCTA-
gi|8 : TAAAAAA-GAAT-TA----TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-------T-G--TC-G-TAGTATT--GATGTA-CAGGTGC--Tcttcgtggtgcagtaagggtaaac
gi|24 : catttaaatattaccctatcttccatgtacttttactgtactcaactacgctcctggcggtaggatgcgtgcgatacttaacatgtcaacactgatcttaatacagtagcacgcaatcgtcctaaacgcaagcattcgcgttattatagttctcattgaaaaggattctgttcatttgcgcgttatgtgatttgtacggtgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaa-G--TCTG-TAGT-TT--GGTGAA-CAGGTGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATGTACATATAGAATAGAAGGGTCAATTCGTCATGAGTCCCTA-TAT---AG-GCCGATG--CTGAT-AAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----A-GAGGTG--CC-ATCTATTTC--GCA--TAAG-CAT-----GATC-CACCTTT---ACTACTTCGTGG-G----GCAGTAGGGGTAA---ACAA-TAACA-------ATCAAAGCC-GTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-GT-TGTT--TTTCACTTA-T-AGAT-TGCCCGTTCTTA-TCT-CGGGATTTCTCA-GTCACG---CTTTTTT----TTT-----ATCTT---CA-CCATGATTTATGAGTCTTTTATTA-------TCTTCTATGTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgtagaattcgtcacgagcctctatgtagatgctgatgaaaaagcaatcgcttgtagaggtgccatctttttcacattcataataacaatcgcagccgccattgtggttgagtagatctttttggtgtttttcacttatagatcgcccgttcttatctggggattttgtttatctgagtcttttattatcttctatgtatgaagagtgcatactaagaacattaactgttgcgaaattacataggagttacaatacttggaagtgaaaatattctttgtcgcgagataaaattactcaagaatggcaacgacactgaagaaccct
gi|8 : -TGT---AG-A----TG--CTGAT-GAAA-AAG-CA-ATCG--------CTTGT----A-GAGGTG--CC-ATCTTTTTC--ACA--T
gi|26 : catttaaatattaccctatcttccatgtacttttactgtactcaactacgctcctggcggtaggatgcgtgcgatacttaacatgtcaacactgatcttaatacagtagcacgcaatcgtcctaaacgcaagcattcgcgttattatagttctcattgaaaaggattctgttcatttgcgcgttatgtgatttgtacggtgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaataaaaaagaattattacccgactgattctgtaggccgatctatgtcgtagtattgatgtacaggtgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgtagaattcgtcacgagcctctaTGT----A-GAGGTG--CC-ATCTTTTTC--GCA--TAAG-CAT-----AATC-TACCTTT---ACAACTTCGTGG-G----ACAATAAGGGTAA---ACAA-TAACA-------ATCGTAGCC-GTCATT-GTGGTT---TAGATC-TTTT-GT-TGTT--TTTCACTTA-T-AGAT-CGCCCGTTCTTA-TCT-CGGGATTTCTCA-TTCACG---C-----TTTTGTTT-----ATCTT---CG-CCATGGTTTATGAGTCTTTTATCA-------TCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-AAAT-TAACTCTTGCAAAATT-ACAC--AGGGGTTA-CAGA--AATTT-GAATTGAAA-AT----CTTCT--T--T-GTCTTGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAtcataataacaatcgcagccgccattgtggttgagtagatctttttggtgtttttcacttatagatcgcccgttcttatctggggattttgtttatctgagtcttttattatcttctatgtatgaagagtgcatactaagaacattaactgttgcgaaattacataggagttacaatacttggaagtgaaaatattctttgtcgcgagataaaattactcaagaatggcaacgacactgaagaaccct
gi|45 : ACTTCGTGGTG--CAGTA---AGGGTAA---AC-
gi|50 : gcttatgtaatttagtacaggtgtaaaaaaatattacccgattgattcagtaggccgatctACTTCGTGGTG--CAGTA---AGGGTAA---AC-A--------------------CC-GTCAAT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-GT-TGCT--TTTCAC
gi|30 : GTAA---AC-AATAACA-------ATCGTAGCT-GTCATG-G-GGTA---TAGATCTTTTT-GT-TATT--TTTCACTTA-T-AGAT-CGCCCGTTCGTA-TCC-CCGGATTTCTCA-TTCACG---C-----T----TTTGTTT-ATCTT---CA-CCATGGGTTAAGAGTCTTTTATTAT-------CTTTTATGAATGAAGAATGCATACTAAGA-ACAT-TAATTCTTGCAAAATT-ACAT--CAGAGTTA-CAAT--ACTTT-GAAGTGAAA-AT----CTTCT--T--T-GTCTCGAGATAGAATTACT----------CAA-AAATGGCC-ACGA--TACTG-G-AGGAC
gi|8 : a-A-TAACA-------ATCGCAGCC-GCCATT-GTGGTTGAGTAGATCTTTTT-G-GTGTT--TTTCACTTA-T-AGAT-CGCCCGTTCTTA-TCT-GGGGATTTT---------G--------------TTT-----ATCT------------------GAGTCTTTTATTAT-------CTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTGTTGCGAAATT-ACAT--AGGAGTTA-CAAT--ACTTG-GAAGTGAAA-ATA---TT--CT-T--T-GTCGCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCA-ACGA--CACTG-A-AGAACCCT
gi|22 : catttaaatattaccctatcttccatgtacttttactgtactcaactacgctcctggcggtaggatgcgtgcgatacttaacatgtcaacactgatcttaatacagtagcacgcaatcgtcctaaacgcaagcattcgcgttattatagttctcattgaaaaggattctgttcatttgcgcgttatgtgatttgtacggtgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaataaaaaagaattattacccgactgattctgtaggccgatctatgtcgtagtattgatgtacaggtgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgtagaattcgtcacgagcctctatgtagatgctgatgaaaaagcaatcgcttgtagaggtgccatctttttcacattcataAGCC-GTCATT-GTGGTT---TATATCTTTTT-AT
gi|32 : GCC-GTCATT-GTGGTT---TATATCTTTTT-AT-TGGT--TTCCACTTA-T-AGAT-CGCCCGTTCTAA-TCT-CGGGATTTCTCA-TTCACG---C-----TTTTGTTT-----ATCTT---CA-CCATG--------GTCTTTTGTTATCTTCTACCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT---------------TT-ACAT--AGGAGTTA-CAAT--ACTTT-GAAGTGAAA-AT----CTTCT--T--T-GTCTCGAGATGAAATAACT----------CAA-GAATGACC-ACGA--CACTG-G-AGGGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattataataatacaattgaaatttgacatctataatttgctgggtgaattttggaaggaaatagggcaaatgaatttacataattcagctgctaaaataattaccattaccgctgtatggccagaaattagaagcatggctacaatcaagcctgaactcaggtaccttttggcatatttgccatgctctctctcgcttttatatagggctctcccgttgtcagcgtactgggttaatgcctttccctggtgaaatagctagtaacatattcttcatattggagcaatgtctgtataggcaaagacgacctccaaaccaaaatgcatcatggctaca
gi|38 : ATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-AC-T-TAACTCTTGCGAA----ACATTATAGAGTTAGCAATTGACTTT-GAAGTGAAA-ATACG-TT--C--TTGT-GTCTCGGACTAAAATTACT----------CGACGAATGGCCAACGAACCACTGCGCAGGAACC
gi|29 : AT--GCTTC-GA---GAATTAT----CT--TCTT--T-GTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAAcgtt
14 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TAAGGAGGGCGTGAAGCCAGGGATCAGTCCAATTTTCTTTTTCCAATTTCACACAACAGCAATGTTGGTTTACTTGAATGAATAAGTATCCAATGGTGAATATCTTAACTAAAATCAAAGACATACAAATAGCCATATTTTTTATGATTTATTACTCTAATGTTATTGCACATAATGTTACTGACGAACCACATAGGAAAAAGACAATGTTGGTGTAAATGCAAAACAAACAAAGAACGAAATTGGGAAATAATTATCATAACAATTATAAATATATATAAATTTGTAAAAAACAAAAATCCATCAAAACAGCATAACAAGATAAATAATATATCAGAAATATATAACCGAATATTAAAAAAAAAATAATGCAATTCAGTTTATAGTATAAGACAAAAAATGAAAATTTAAAAAATTAATAAACACACAGATTTTGTTCAATTATTAAACATATAGTTAATCAGTATTATGTTATATGATAATATATCAATTAGAATTTTTTAAAAAAAAAAATTGGCTGAGTGAATTTTGAAAGAATGGAAAAACAAAATGAAATTGTACTAATGTTGTAGGACATTGCAGCTATGTAAACTTAAATTACC
Unaligned ( gi|13 ): AAGGCTGGAGAGTCATCCAATTTTTTTTCCAAAATTTACAAAACTAGCATGGTTACTTGGCATAATCATATACATAATTTTAACATCAAAGACAATAACAAAATTAGCCATATTTTTATGATTTATTACTTCTAATGTCATTGCACATAATGTTGCATGAAGAAAAACCAAAAACAATTTAAATACAAAACAAATCAAGAAATTGGTAAAATACATAACAATAATACTATATCAAATAAAAAACACCATCAAAACCAAATAAAACATAAATATCAAAAGTTATTTGAATATTTAAAAAAAAATGCCAATTCATATATGTATAACAAAAATTAAAATAAAAAAAATATAACCACAAGATTTTGTTCAAATTTTAACATAATAGTAATCAGTATATGTATGAAATATATCAATTAGAATTCAATTTTTTTGCTGGTGAATTTTGAAGAATGGGGAAAAATTACATAATATTAGCTGCAAATTAATTACCTCCCTTTGCAGAATCTAAAACATGGTTACAAACAGCTGAACTAATCTTTTTAC
Unaligned ( gi|14 ): AAGGCTGGAGAGTCTCCACTTTTTTTCGCAAAATTTACAAAACTAGCATGGTTATTGGCAGAATCATATACATAATTTAATAACATCCAAGAACAATACAAAAATTAAGCCATATTTTTATGATTTATTACTTCTAATGTCATTGCAACATAATGTTGCATGAAGAAAACCAAAAAACAATTTAAATACAAACAAATCAAGAAATTGGTAAATACATAACAATAATACTATATCAAAATAAAAACCCATTCAAACCAAATAAAAACATAAATATCAAAAGTATTTGACTATAAAAAAAAAATGCAATTCATATATGTTATAAAAAAATATAAATAAAAAATAATAACCACAAGAATTTTGTTCAAATTTTAACATAATAGTATCAGTATATGTATGAAATATATCAATTAGAATTCAATTTTTGCTGGTGAATTGAAGAATGGGGAAAAATTACAATAATATTAGCTGCAAAATTAATTACCTCCCTTTGCAGAATCTTAAAACATGGTTACAAACACTGAACTAAT
Unaligned ( gi|15 ): GGGCTGGAGGCGTCATCAATTTTTTTCTCTCCAAAAATTCATAAAGCTAGGCATGGTTACTTGGCATAATCTATACATAATTTAAACATCCAAAGACATAACCAAATTAGCCATATTTTTATGATTTATTACTCTAATTGTTATTGCACATAATGTTACATGAAACACATGGCAAAAACAATTTAATACATAAAAAAACAAAGAAATAGGCCAAAATAACATAACAATAATAAATATATCAAATAAAAAAAACCATTCAAACCAAAAATAACAAAATATTAAATATAAAAGTTTAAGTATATTTTAAAAAAAATGCCAATTCATATATATAACAAAAATTGAAAAAAAAAAAAATAATAATAACCACAGATTTTGTCAATTTTAAAATAATGGTAATCAGTATATGTATAAAATTTATCAATTTTAGAATTGAAATTTTTTGGCTGGTGAATTTTAAAGAAATGGGGAAAAAATTGAATTTACATAAT
Unaligned ( gi|16 ): AATTTTTTCTCTCCAAAATTCATAAAGCTAGCATGGTTACTTGGCATAATCATATACATAATTTTAACATCAAAGACAATAACAAAATTAGCCATATTTTTATGATTTATTACTTCTAATGTTATTGCACATAATGTTACATGAACACATGGCAAAAACAATTTAAATACATAAAAAAACAAAGAAATAGGCAAAATACATAACAATAATAATATATCAAATAAAAAAACCATCAAAACCAAATAACAAAATATAAATATAAAAAGTATAAGTATATTTAAAAAAAAATGCAATTCATATATATAACAAAAATGAAAAAAAAAAAAATAATAATAACCACAAGATTTTGTTCAAATTTTAAAATAATGGTAATCAGTATATGTATAAAATATATCAATTAGAATTGAATTTTTTGGCTGGTGAATTTTAAAGAAATGGGGAAAAAATGAAATTTACATAAT
Unaligned ( gi|31 ): TAAGGAGGCTGGAGGGTCATCCAAGCCCCCCCCCCCAACAATAAAACCAGATGGTTACTTGGATAATATATACATAATTAAACACCAAAGACAATAACAAAATTAGCCATATTTTCTATTATTTATTTTATTTCTAATTTATTGCACATAATGTTACATGAACACATAACAATAAAATTTAAATACAATCCAAACAAAAAAGGCAAAGTACATAACAATAATAATATATCAAATTTAAAAAAAAAACCATCAAAATTAAAT
Unaligned ( gi|41 ): GAGGTTGGAGGGTCATCAATTTTTTTTTTTCTAAAATTTATAAAAACTAGCATGGTTACTTGGCATAATATATATACATGGTTTTAGCATCAAAGACAATAACAACATTAGCCATATTTTTATGATTT
Unaligned ( gi|42 ): AAGGAGGCTGGGGGTCATTTATTTTTTTTCAAAATTCATAAAACTAGCATGGTTATTTGATATAATCATACACACCATATTGACATCAAAGACAGTGACAAAATTAGCCATATTTTCATGATTTATT
Unaligned ( gi|43 ): ATTTTGAAGAATGGGGAAAAAAATAAAATTCACCATAACATTAGCTGCAAAATTAATAACCTCCCTTTGCAGAATCTATTGAAACATGGTTACAAACAGTTGAACGAATATTTTTACT
Unaligned ( gi|46 ): AAATATTAGAAATATAACAATATTTTTTTTAAGATATAACAAAAATGAAAATTAAAAAATAACCACAAGATTTTGTTCAAATTTT
Unaligned ( gi|47 ): TTCGCTGCAAAATTAAATTACCTCCCTTTGCAGAATTTCTAAAACATTGTTACAAATAGATAGACTGAAACTAATATCTTTATA
Unaligned ( gi|48 ): GCTGCAAAATTAATTACCTCCCTTTGCAGAATCTAAAACATTGGTTACAAATAGATAGCTGAACTAATATCTTTATA
Unaligned ( gi|49 ): TGAATTTTGAAGAATGGGGGAAAAAATAAACATTTACACAATATTATCTGCAAAATTAATTACCTCCATTTGCAGAA
Unaligned ( gi|52 ): AAACCATAGATGTAAAGTAAAGCTTTACGTCTATGATTAAACT
Alignments
lowQualScore : 1111111111 333333333333333333333333333333333333 1111111111111 2222222222 111111 1111111 33333333333333333333333333333333 111111111111111 444444 1111 11111 1111 2222222222 2222222222222222 11111 11111111111111111 11111 222222 11111111111111 22222222 2222222 11 1111 11 111111 22222 4444444444444444444 5555555555555555555555555555 11111 1111 1111 2222222222 22222222 111 66666666666666666666666666666666666666 333333333 22222 111111 1111111111111111111111 11 1111111111 1111111 1111111 11 11111 11111111111 11111111111111 111111 11111 11 1 44444444444444444444444 111111111 111 11 2222222222 2 22222222 1111 22222 111 4444444 111 11 2222222 11111 33333333 33333 2222222222
lowQualScore : 5 5 6 3 7777777777 555 888888888888888888888888888888888888 2 444 33 2 2 4444444444444 2 1 7777777777 5 2 33 5 5555 0 2 111111 2 2 2 5 0000000 33 66 9 2 2 2 2 33333333333333333333333333333333 33 0 3 888888 6666 999999 0 888 3 3 000000000000000 2 1 2 1 2 2 555 555 33 3 44 3 3 555 3 3 222222 3 2 1111 44444 77777 3 555 3 777 33 3 5555 3 888888 3 2222 3 3 0000000000 2 2 1111111111111111 8 777 33 2 2 2 2 2 33 66666 33 6666666 2 88888888888888888 2 444 777 2 66 2 33 99 2 66 2 2 2 8888 11111 2 2 33 2 2 33 2 2 666666 2 55555555555555 3 555 3 555 99999999 0 3 3 2222222 3 55 777 4 3 666 3 00 4444 555 4 66 4 4 5 00 333333 5 5 5 77 44444 5 1111111111111111111 5 2222222222222222222222222222 66 888 66 22222 66 5 5 5 0000 1 4444 5 888 5 5 5 66 6666666666 5 5 5 00000000 77 5 000 5 888 5 5 5 5 66 5 5 22222222222222222222222222222222222222 000000000 1 5 66666 888 66 4 777 4 111111 55 3 55 3 6666666666666666666666 3 88 22 3 555 2222222222 4444444 888888 0000000 3 7 22 11111 77777777777 3 3 55 3 3 3 11 555 6 3 8888 3 99 99999999999999 6 555 44 3 0 3 9999 44 666 111111 3 44444 55 88 2 5 1 66 11 5 0 5 66 5 0 55555555555555555555555 888888888 1 1 1 444 1 8 8 5 33 1 99 0000000000 88 8 8 3 99999999 4444 1 6 99 6 6 6 99 8 00000 8 3 1 000 0000000 0 333 8 33 3333333 33 4 4 777 00000 4 5 5 5 3 5 5 5 888 5 0 5 888 5 33 0 55555555 5 5 333 0 77 5 33 5 66 00000 4 5 1111111111 5 5 77 5 5
lowQualScore : . . . . .......... ... .................................... . ... .. . . ............. . . .......... . . .. . .... . . ...... . . . . ....... .. .. . . . . . ................................ .. . . ...... .... ...... . ... . . ............... . . . . . . ... ... .. . .. . . ... . . ...... . . .... ..... ..... . ... . ... .. . .... . ...... . .... . . .......... . . ................ . ... .. . . . . . .. ..... .. ....... . ................. . ... ... . .. . .. .. . .. . . . .... ..... . . .. . . .. . . ...... . .............. . ... . ... ........ . . . ....... . .. ... . . ... . .. .... ... . .. . . . .. ...... . . . .. ..... . ................... . ............................ .. ... .. ..... .. . . . .... . .... . ... . . . .. .......... . . . ........ .. . ... . ... . . . . .. . . ...................................... ......... . . ..... ... .. . ... . ...... .. . .. . ...................... . .. .. . ... .......... ....... ...... ....... . . .. ..... ........... . . .. . . . .. ... . . .... . .. .............. . ... .. . . . .... .. ... ...... . ..... .. .. . . . .. .. . . . .. . . ....................... ......... . . . ... . . . . .. . .. .......... .. . . . ........ .... . . .. . . . .. . ..... . . . ... ....... . ... . .. ....... .. . . ... ..... . . . . . . . . ... . . . ... . .. . ........ . . ... . .. . .. . .. ..... . . .......... . . .. . .
lowQualScore : 7 7 6 3 9999999999 666 333333333333333333333333333333333333 9 777 77 7 7 1111111111111 7 0 6666666666 0 5 44 7 1111 7 9 111111 9 7 7 3 3333333 77 88 6 9 7 9 9 99999999999999999999999999999999 99 4 1 333333 5555 666666 7 555 1 1 999999999999999 9 2 9 9 9 9 000 000 11 1 22 1 1 444 1 1 444444 1 3 9999 22222 77777 1 444 1 777 99 1 9999 1 888888 1 0000 1 1 0000000000 1 9 8888888888888888 6 999 99 9 7 7 7 7 77 99999 77 9999999 7 77777777777777777 7 777 333 7 33 7 77 00 7 33 7 7 7 3333 33333 7 7 77 9 9 99 9 9 111111 9 33333333333333 1 888 3 888 00000000 3 3 3 1111111 6 55 000 0 6 444 6 66 0000 333 4 11 4 4 7 00 444444 0 0 7 99 66666 7 4444444444444444444 7 0000000000000000000000000000 99 888 99 55555 99 0 0 0 6666 4 6666 0 888 0 0 0 99 2222222222 0 7 7 77777777 99 7 000 0 888 0 0 0 6 99 0 0 44444444444444444444444444444444444444 111111111 7 7 44444 888 99 4 888 0 555555 55 6 00 6 2222222222222222222222 6 00 55 3 888 8888888888 8888888 888888 0000000 3 3 33 55555 33333333333 6 6 66 3 3 3 77 888 7 3 3333 3 22 66666666666666 7 888 66 3 5 1 5555 66 444 000000 6 11111 00 66 5 0 4 44 99 0 0 0 99 7 8 44444444444444444444444 888888888 0 0 0 000 8 0 0 0 44 0 00 0000000000 88 0 0 2 00000000 2222 0 7 22 7 7 7 22 0 00000 0 8 0 000 9999999 1 888 9 22 1111111 00 0 0 000 00000 0 0 0 0 0 0 0 0 888 0 1 0 888 0 99 2 00000000 7 7 999 4 99 7 11 7 99 66666 0 0 9999999999 0 0 99 7 7
consensus : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC----------GTGCAT--G-----------C--TT--T------T-------A--T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------ACA-ATTGGAGC-A-T-G---N---TATA--CTA--AAAGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGA-------G-------CATCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCT---A---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCTTC------TTTCC-AGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TA-C-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-NA--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGC-A-ATC-GC-------C--TG---T---CA-TAAA----A-----------GA---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--A-CC-TT---TAA-T-A-CG--TATTG-----ATTTTT-CAC-GTT-CA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTT--AC-T-GTACT--T--TGCTA----GTC-AGCAA--T-A-------CG-TCCTGGGCGG--A------TAGGGTGCGTGC-GGTACTT-----AA---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---G-A--A---TAG---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGC------TGCGGCAGGTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGCCGNAANATATAANANAANAG---GGTCAA-TTCGT-CACGAGC-NCCTA-TGT---AGG----TGCTGAT-GAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CA--TAAGC-AT-----GATC-TACCTTTACAAC---TTCGTGG-GC--GCAGTAAGGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGTAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCNTAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT------TCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTCTTGCGAA--ATT-ACATNGGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAATA-C--TTCTT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
Reference ( family-2937 ) : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC----------GTGCAT--G-----------C--TT--T------T-------A--T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTNCTG----G---AATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------ACA-ATTGGAGC-A-T-G---N---TATA--CTA--AAAGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGA-------G-------CATCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCT---A---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCTTC--A---TTTCC-AGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TA-C-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAANAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-NA--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGC-A-ATC-GC-------C--TG---T---CA-TAAA----A-----------GA---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--N-CC-TT---TAA-T-A-CG--TATTG-----ANTTTT-CAC-GTT-CA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTT--AC-T-GTACT--T--TGCTA----GTC-AGCAA--T-A-------CG-TCCTGGGCGG--A------TAGGGTGCGTGC-GGTACTT-----AA---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---G-A--A---TAG---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGC------TGCGGCAGGTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGNNNNAANATATAANANAANAG---GGTCGA-TTCGT-CGCGAGC-GCNTN-TGT---AGG----TGCTGAT-GAAA-AAT-CACATTG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CA--TAAGC-AT-----GATC-TACCTTTACAAC---TTCGTGG-GCG-GTAGTAAGGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGNAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCTTAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT------TCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTCTTGCGAA--ATT-ACATNGGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAATA-C--TTCCT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
gi|1 : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC----------GTGCAT--G-----------C--TT--T------T-------A--C-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T-----G-GTTCT-----------TGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GG-TAACAT-TTTT------ACA-ATTGGAGC-A-T-G---C---TATA--CTA--AAAGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGT--C---TGATGATA---TTG-ATGA-------A-------CATCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCT---A---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAT---GA-CG-GCCTTC--GATCTTTCC-AGTTTGTGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TA-C-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-GTC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAAAAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-AA--CGTACTG--T-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TTC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGC-A-ATT-GC-------C--T----T---CA-TAAA----A-----------GA---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--C-CC-TT---TAA-T-A-CA--TATTG-----ATTTTT-CAC-GTT-CA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTT--AC-T-GTACT--TTGTGCTA----GTCTAGCAATTT-A-------CG-TCCTGGGTGG--A------TAGGGTGCATGT-GGTACTT-----AA---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---A-A--A---TAA---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATC---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------CT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGC------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNN-NNNNN-NNNNNNN-NNTTC-TGT---AGG----TGCTGAT-GAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AAA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CA-CA--TAAGC-AT-----GATC-TACC-TTACAAC---TTCGTGG-GCA-GTAGTAAGGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGTAGC-TGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GTGTGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCGCAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-T----T-TTATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT------TCTTTTATGTATGAAGAGTGCATATTAAGA-ACAT-TAACTTTTGCGAA--ATT-ACATTAGAGTTA-CGAT--ACTTTGAAGTGAAAAT--C--T--CT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
gi|10 : C-ATTGA-TTT-AACT---TT-TG-C-T--TAT-GTCTAAT--------------TT-AGTTCAACAGG--T-GTAAAAAC-ATA-------TTAC---CGGC---ACCT-GGAACATTTC--GG--TGG--CGATCTG--AGTACTTGC-TT-G-TGGT-TTTAGGTGAAC-CGTTG--------GCGGCAGGTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGCCGTAAATTATAATAAGAGAG---GGTCAA-TTCGT-CACGAGC-ACTTG-TGTGATAGG----TGCTGATCGAAACAATTCATATTGGTCTCGATCTTGTGCATATA-GGTGGCCCGATCTTTTTTCGACA--TAAG--ATTACTGGATAATACCCTTA--AC---TTCGTGG-GGGCGTA--AAGGGTAATTAAT-A--AACATG-----ATCAGAGCTCGCCATTTGTGAGT---TGTATTTTTTTTGTCTGT-TGTTTT-CACTAACT-AGATC-GTC-GTTCGTAT-TCG-GGGATTTCTCACTTCACGACGC-TTTTGTCTTATCTT---CAACCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT-------CTTCTATGTAAGAGAAG-GCATACGAAGACACATCTAA---TTGCAAA--CTTTACATTG-AGTTA-CACT----TTTGAAGTGATAATA-TAATTCTT-TGT-TCG-GATAGAATTACTACTATCTACTCTA-TAATGGCC-ACG
gi|12 : t-T---GTAAAATTC------ATA--ATAAACGT-GGCC-AC---A-AT-A---TA----T---C-TA-AAT--C-AAG---C--ATA-----GTCG--CCG--TCA------T-------T-TTAA--TT-TTCAAATT-----------GAAA-G-AA-T-CC-GCTAA-TTT-A---------------------GT--AA------------------------ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-T-A--TTAC---C--C---GAGT-GA-----TTC--TGATTAGGCCGAT-TA-TAGTAAT-GGTCC-GCTAGT-TT--GGTGAACCAGGTGC------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTAAATAACAGAATAGAAGGGTCAA-TTCGTTCACGAGCCGCGTAATGT-----G----TGCTGA--GGAA-AAT-CACATTC--------CTTGT----ATACGGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CGATTAAGCCAT-----GATC-TAC-TTTACAACAACTTC-TGG-GCG---AGTA-GGGTAAC--ACGA-TAACATACGGACATGCTAGC-TGTCAT--GTGGTT----AGATCTTTTT-----GT-TGTCTTTCACTTA-TGAGATCCGCCCGTTCGTATTCTCCGGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTTCCACA-CCAGTGGTTATGAGT-TCTTATCA-------TCTTCTATGTGT
gi|17 : g-----------C--TT--T------A-------A--T-T---GGT--CT-CATGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCTTTTTCCTTGA-T-GA--CA-GTT---GGGTAACAT-TTTT------ACA-ATTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CT---AAAGAG-CGACC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--GCTTAATTAATC-AAA----T-GC----AATGG--C---TGATGATA---T-G-ATGA-------G-------CA------T-GTAG-AGCTGT-TCGGCT---A---AA-CTC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CA-ACCTTC------TTTCC-AGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TA-C-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATCAACGGTAAACCT-T-------ACA-T------A---CAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-A-A-CT--G-TA--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TT-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGA-C-T----------------------------------------A-A---GTTTA-------AA---C-TATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-AT
gi|18 : ttaattacctccctttgcagaatctaaaaactgaactaatcttgctttccc-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGT-ATATC-AC-------A--TA---G---CA-TAAA----G-----------TCT--A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TTAT--A-CC-TT---TAA-T-A-CA--TCATG-----TATTTT-CAT-GTT-CA--------TTTTCA--TTTACT-TC---AC-C---TGTCT-T-T-AATGTAGTT--AC-T-GTACT------------------AGCAA--T-A-------CA-TTATGGGCGG--ATCATATTAGGGTGCGTGC-GGTACTG-----AA---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------GTA--ATAAAGAT-G--C-AC---GAA--A---TAG---A---C-TA-AATGCT-AAT---C--AT------GTCGT-C----TCA------T-------T-TAAA--TT-C---ATTT-----------AAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AA-T---TT-TG-C----TATAGT--AAT--------------TT-AGT---ACGTG--T-GT-------GAAA-A-A--TTATATAC--C---GACT-GA------TC--TG--TA-GCCTAT-TA-TAGT-C-----TC-GATAGT-TT--GGTGAAC-AG
gi|19 : agagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTTTCAA--TCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC----------GTGCAA--G-----------C--TT--T------T-------AA-T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-ATACTG------------CCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------ACA-ATTGGAGC-A-T-G---C---TATA--CTA--AA-GAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GCTATCAATAG--CAATTAATCAAA---T-G-ATGA-------G-------CATCC-TCA-GTAG-AGCTGT-TCGGCT---A---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCTTCG-A---TTTCC-AGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TA-C-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AA---TT-ATC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTCA---C--AG-TGATT-T-G-A-CG--GAAA--CGTAATG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GTTG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-
gi|2 : -TTTACAT----------GTGCAT--G-----------C--TT--T------CCCCTTTAA--T-T---GGT--AT-CCTGT-GTCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CAT---GGGTAACAT-TTTC------ACA-ATTTGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--TA-GAG-CGATC-CCAAAACAAAA-CGAATA---------------------------------------GCACAAT----C-AAA----A-GC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGA-------G-------CATCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCT---A---AA-CTC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-ACCTTC------TTTCC-AGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TA-A-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATT-------AACCT-TAC-ATACAAA-TA-----A---NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNTCA-TTTA---C--AG-TAATT-TGG-A-CT--G-TC--TTTATTA--C-ACCAGCA-CACTATAAACGAGTTACGATG-T---G---TA-AATT-T--AA--TG-TACTATC-AGAGGATGTAAT----ATATCTGCATG-A--TGA-C-T--ACT-A------AT-TC----C---TACATGTG-CA---A-ATAGGTTTCT------ACTG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATTCATATAATCATGG---G-TAT--A-TATCTC-AC-CTAAACT-TAATAATC-TA
gi|2 : caatttaaatgcaaaacaaacaaagaaatgggaaaaatacataaaaattataatatataaaattaaaaaaaaaacaacatcaaaaccaaataacaaaaaataaatatcaaaaatataagaatatttaaaaaaaaatgcaattcatatataagacaaaaatgaaaatttaaaaaataataaccacaagattttgttcaaattttaacataatagtaatcagtatatgtataaaatatatcaattagaatttttaaaaaaaaaattgctggtgaattttgaagaatggaaaacaaatgaaatttacataatgttagctgcaaacttaattacctccctttgtggaatctaaattaaaaacatggttataaacagctgaactaatcttAAAGATTG--C-AC---G-A--GATTTAGGT-T---C-TATAACTCC-AAC---C--ATTCTATGGTCG--C----ACA------T-------T---AA--TT-T---ATTTTCATATTGAGAGAAAAGTAA-T----ATTCC-TTTCAATT---TTATG-C-TAATAC-AT--CAT--------------TC-ACT---ACAGG--T-TTTTAAAA-AATATA-A--TAAC---C--TCAAGACT-GA-----TTC--TG--TAGGtatgtatcatgtcacgagtaaaaagagagtctcgaaacaaattaacaataatcgaattattgatcattactttgactgtactattactataaaataacccatgtcctcagagagctggtaaaggctgtggctagatgtccaacatctacttgtatgaaatcactgttaaatattctcagagagagaggaaagattgcacgagatttaggttctataactccaaccattctatggtcgcacattaatttattttcatattgagagaaaagtaatattcctttcaattttatgctaatacatcattcactacaggtttttaaaaaatataataacctcaagactgattctgtagg
gi|20 : caatttaaatgcaaaacaaacaaagaaatgggaaaaatacataaaaattataatatataaaattaaaaaaaaaacaacatcaaaaccaaataacaaaaaataaatatcaaaaatataagaatatttaaaaaaaaatgcaattcatatataagacaaaaatgaaaatttaaaaaataataaccacaagattttgttcaaattttaacataatagtaatcagtatatgtataaaatatatcaattagaatttttaaaaaaaaaattgctggtgaattttgaagaatggaaaacaaatgaaatttacataatgttagctgcaaacttaattacctccctttgtggaatctaaattaaaaacatggttataaacagctgaactaatctttttacatgtgcatgctttcccctttaattggtatcctgtgtcataggtactggaatgccttttccctgatgatacatgggtaacattttcacaatttgagcatgttatactatagagcgatcccaaaacaaaacgaatagcacaatcaaaagcaatggctgatgacatgatgagcatcctctgtagagctgttcggctaaactccccaatacaataatacgacgaccttctttccagtttatgcttcgagaattatctgtcaaataaatattaatcaaagcttaatcatttattaaccttacatacaaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcatttacagtaatttggactgtctttattacaccagcacactataaacgagttacgatgtgtaaatttaatgtactatcagaggatgtaatatatctgcatgatgactactaattcctacatgtgcaaataggtttctactgctataaagccgtgcttagtattcatataatcatgggtatatatctcacctaaacttaataatctatatgtatcatgtcacgagtaaaaagagagtctcgaaacaaattaacaataatcgaattattgatcattactttgactgtactattactataaaataacccatgtcctcagagagctggtaaaggctgtggctagatgtccaacatctacttgtatgaaatcactgttaaatattctcagagagagaggTT-T-G-A-AT--G-C---CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATGGT---AGGATA-A--T-TTAAA--TGATAC--TA-CGG-GATG-CAAT---AT-----CG-G-A--TGATC-T--A-T-AAT----TTATC----T---T-----TT-CA---A-G---TTTTAT------AGAG-C-TATACACCATAAAGTC-GC--GGGTTTT-A-GGTAT-ATA-ATA----CATGG-A-GATTT--A--A-ATT-A--ATG---T-AACT-CTT-TATATTAT--GTTG----ATT-GTATGAGATC--TGACAT---CA-TATATAGCA-----------GATCTA------A--GACTTCA--A-----CTTTAA-TG-ATA-TT----TAAT--A-C--TT---TAA-C-A-TG--TGC-------ATTTTTGCAC-GTTTCA--------CTTTCA--TTT----TC---GCTC---TGATACT-T-AATGTA-TT--AC-T-GGG-T--T--TGCTAACATGTC--GCAA--T-A-------C--TCCTGTGCGGGGA------TAGGGTGC-TGT-GA-A--T-----AA---A--AACGCATCTGGTAAAAT-C------ATA--ATGAGAAT-G--CAAC---A-A--AT--TAT---T---C-T--AAT--CAAAG---C--A--------TCG--T----TCG------T-------
gi|21 : TTCAAAATC-GTCC-T-A-GCC-TCTGCTC----------G--CAT--G-----------T--TT--A------A-------A--T-C---GAT--T---CTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTC----G--------CTTTTCCCTGA-C-GA--TA-CTT---GGGTAACA--TTTT------ACA---TGGAGC-A-T-G---A---TATA---TC--AAAGAGACGATC-----ACCAAAA-TGC-TATCC------------------------ATCT----CT--ACACAATTAATCAAAA----A-GC----AATGGC-C---TAATTATT---T-GCATG--------G-------CATCCTTCT-GT-G-AGC--T-TCGGC----A---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TATT-----GG-CG-GTCTTC--GATCTTTCC-AGTTTATGC-TCG-GAAA----TAT-----C-----TGTTC---AAA-TA---AT----ATC--AAAGCTTAATC-A-----T-ATC-------AACCT-TA--G-A-ACA-T----------AAAATAAT-TG----------------CATTTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G--A--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T---A--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--AGG-C-TTAA-TGA------TT-TC----T---T-----T
gi|22 : AGC-CGTCATT-GTGGTT---TATATCTTTTT-----AT-
gi|22 : --G-----------C--TT--T------T-------A--TATAGGGCT--CT-CCCGTTGTCA-------------GCGTACTG----GGTTAATGCCTTT-CCCTGG-T-GAAATAGCT-----AGTAACATATTCT------TCATATTGGAGC-AAT-G---TCTGTATA--GGC--AAAGA--CGACCTCCAAACCAAAA-TGC--A-TC------------------------A--TGG--CT--ACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattataataatacaattgaaatttgacatctataatttgctgggtgaattttggaaggaaatagggcaaatgaatttacataattcagctgctaaaataattaccattaccgctgtatggccagaaattagaagcatggctacaatcaagcctgaactcaggtaccttttggcatatttgccatgctctctctcgcttttatatagggctctcccgttgtcagcgtactgggttaatgcctttccctggtgaaatagctagtaacatattcttcatattggagcaatgtctgtataggcaaagacgacctccaaaccaaaatgcatcatggctaca
gi|23 : ataaaaagatataaaccacaatgacggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattataataatacaattgaaatttgacatctataatttgctgggtgaattttggaaggaaatagggcaaatgaatttacataattcagctgctaaaataattaccattaccgctgtatggccagaaattagaagcatggctacaatcaagcctgaactcaggtaccttttggcatatttgccatgctctctctcTTTCAAAATCAGTCC-T-A-GCC-TCTGCAC----------G--CAT--G--------------TC--A------A-------A--T-C---GAT---T-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG-------------CTTTTCCCTGA-C-GA---A-CT----GGGTA-CAT-TT--------ACA-AT-GGAGC-A-T-G---A---TATA--C----AAAGAG-CGATC-C-AAACCAAAA-TGC-TATCC------------------------A--T----CTCTACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGGCCC---TAAT-ATA---T-G-ATGA-------G-------CATCC-CTT----G-AGC--T-TCGGCT---A---AACATC-C--CCAATA-CAA-TCAT-T---GG-CG-GTCTTTCGA---CTTCCAAGTTTATGC--CGAAA------TAT-----C-----TG-TC----AA-TA---ATATCA-----AAAGCTTAATC-A-----T-ATC------AAACCT-TA--G-A-A-A-T------A---AAAATAAT-TG----------------CATTTTA---C--AG-TGATT-T---A-CT--G--A--CGTACTG--C-------A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AAC-TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--
gi|24 : -G--TCTG-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATGT----ACATATAGAATAGAAG---GGTCAA-TTCGT-CATGAGT-CCCTA-TAT---AGGCCGATGCTGAT-AAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTATTT-CG-CA--TAAGC-AT-----GATC-CACCTTTACTAC---TTCGTGG-G---GCAGTAGGGGTAA---AC-AATAACA-------ATCAAAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATT-GCCCGTTCTTAT-CTC-GGGATTTCTCA-GTCACG---CTTTTTTT-TTATCTT---CA-CCATGATTTATGAGTCTTTTATTA-------TCTTCTATGTATagcatat
gi|25 : TGGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--AA-GAG-CTATC-CCAAACCATAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGG--C---TAATGATA---T-G-ATGA-------G-------CATCC-TTT-GTAG-AGCTGT-TCGGCT---A---AA-ATC-A--CCAATA-CAA-TAATAC---AA-CG-GCCTTC------TTTCC-AGTTTATGCTTCGTGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TA-C-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATC------ATACCT-TA--GTA-ACA-T------A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AA-TGATT-T-G-A-CT--G----------------A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-G-----------AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-ATT----TT-TT----T---T-----TT-CA---A-A---GTTT---------ATG-C-TATA-------AAGTC-GT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-AT
gi|26 : TGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CA--TAAGC-AT-----AATC-TACCTTTACAAC---TTCGTGG-G---ACAATAAGGGTAA---ACAA-TAACA-------ATCGTAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATC-TTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCTTAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CG-CCATGGTTTATGAGTCTTTTATCA-------TCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-AAAT-TAACTCTTGCAAA--ATT-ACACAGGGGTTA-CAGA--AATTTGAATTGAAAAT--C--TTCTT-TGTCTTGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTA
gi|27 : -CCAAACCAAAA-TGC-TATTCATGTAAAGGCAAATGTAAAGGCACA--T----CT--ACACAATTAATC-AAT----A-G--------------------GACA---C-G-ATGA-------G-------CATCT-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCT---A---AA-CTC-C--ACAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCTT-------TTTCC-AGTTTATGCTTCGAGAAT----CAT-----A-----TA-TC---AAA-TA-C-ATATTAACC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATG------AAACCT---------ACA-T------A---CAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-TA--CGTACAG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TCAAGG-GATG-AAA----AT-----CG-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---ATTT---------ATG-C-CATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATC-ATA----
gi|28 : TAACC--AAAGGCTAATC-AT---TTTATC------AAACCT-TACAGTA--CAGTA-----AC--AAAGTAAT-TG----------------TA-TTTAATAC--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-AAATTGTACTGGGC-A-----A-C-----------------ATG-T---GG--TACA--T-T--AAACTG-TAC--TC-AAG-GCGG-AAA----AT-----CA-G-AATCGG-C-T--A-T-----------------------------------------GTTTA-------A----C-TATA-------AAGCCCGT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATAGA--CAAGGCA-G-TTT--A-TA-ATTGAC-ATG---T--AAT-ATC-TAC-TTATATTTCGT-ATATCCGC-------A--TT---T---CA-TAAA----G-----------AA---AGTCTCAA--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCATAAA-CC-TT---TAA-T-AGCGATTATGT-----ATTTTT-C
gi|29 : ATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACGT-TTTT------ACA-ATTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--AAGG-G-CGATC-CCAAAGCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--TAGATCT--ACACAATTAATC-AAATGCAATGC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGA-------G-------CATCC-TCT-GTAC-AGCTGT-TCAGCT---A---AA-CTC-C--CCAATA-CAA-T-ATAC---GG-CG-GCCTT---A---TTCCC-AGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----CTTCTTTG-TCTCGAGA-TA-A-A-ATTACTC--AAga
gi|29 : AT--GCTTCGAG----AATTATC--TTCTT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAAgaatggccacgacactggaggacccttaagcag
gi|3 : atgccttttccctgatgatacttgggtaacgtttttacaattggagcatgttatactaaagggcgatcccaaagcaaaatgctattcatagatctacacaattaatcaaatgcaatgcaatggctgatgacatgatgagcatcctctgtacagctgttcagctaaactccccaatacaatatacggcggccttattcccagttt-TTTACAT----------GTGCA---G-----------C--TT--T------C-------CCTT-T---AATGGCT-CCGAT-GCCA-------T--AC-G-GTATTG----G---AATGCTTTTCGCCTGAAT-GA--TA-CTC---GG-TAACAT-TTTTA-----ATA-ATAGG-GC-A-TAG---A---TATA--CTAT-AAAGAG-CG--T-CCAAACCAAAA-TCC-TATTC------------------------A---------------AAT---------------GC----AATGG--CA--TGATGACAG--T-G-ATGAGCAATCTG-------CATCC-T-T-GTG------GT-TCGGCTACAA---AA-ATA-A--CCATAA-CAA-TAA-AC---GA-TG-GTCTTC-------TTTC-AGTTTATGCTTCGAGAATAAA-TATACTG-C-----TG-CT---CAA-TACC-ATATTAATC---AAGCT--ATC-ATAAATT-ATT------AAACATACG--ATA-AAA-TA-----ATATGAGATAGT-AGA---------------CA-T--------------ATT-T-G-A-CT--GTTA--CGTACTG--C-------A-C-----------------ATT-C---G---TA-A--T-T--AA--TT-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGC-T-T--A-T-ATAAAC-TT-TC----C---TTA---TT-CA---A-A---GTTT---------ATG-C-TATAC------AAGCT-Ggcag
gi|30 : caaggaggctgcagaggtatacaaacccccccaatcaacagctagcatggttcttgatataatcatataataattttaactcaaaagacagtaaaacaatgagccatataatgtatcatttatgatttattaattctaatgttcattgcacaactgtttaacaatgcaaaaaatttaaataaatacacatcaaaccaaatgaaataataagaaatttatatacaacacatgaatttaaaaaaacataaccacaaggttttggtcaactttctaacacagatatgtataatatgtgttgaagatataccaaattataattaatttttagagctggtgaattatttgaagaatgggtaaaaaaccgaaatttacataataattgtgaaaaatggaattacctcccctttgcaaaaatctacaaattcaaaaactgtgaaatactgtGTAA---AC-AATAACA-------ATCGTAGC-TGTCATG-G-GGTA---TAGATCTTTTT-----GT-TATTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCGTAT-CCC-CGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATGGGTTAAGAGTCTTTTATTA-------TCTTTTATGAATGAAGAATGCATACTAAGA-ACAT-TAATTCTTGCAAA--ATT-ACATCAGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAAT--C--TTCTT-TGTCTCGAGATAGAATTACT----------CAA-AAATGGCC-ACGA--TACTG-G-AGGAC
gi|32 : aGC-CGTCATT-GTGGTT---TATATCTTTTT-----AT-TGGTTTCCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCTAAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATG--------GTCTTTTGTTATCTTCTACCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-----------------TT-ACATAGGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAAT--C--TTCTT-TGTCTCGAGATGAAATAACT----------CAA-GAATGACC-ACGA--CACTG-G-AGGGC
gi|33 : ---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAC--A-CC-TT---TAA-T-A-CA--TTCCG-----TATTTT-CAC-GTT-CA--------TTTTCA--TTTATT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTT--AC-TAATAC-------G-----------AGCAA--TAA-------CGCCCCTGGGCGG--A------TAGGGTGCGTGC-GATACTTTTAA-AA---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------ATG--CTAAAGAT-G--A-AA---G-A--A---AAG---T---C-TA-AAT--C-AAG---A--AT------GTCG--C----TCG------T-------T-
gi|34 : agtct-G---T-AT--ATA----CAATG-A---TCT--A-CA-CTT-A--ATG---TATAAT-CTCATGC-TCA---------A-ATC-GC-------C--TG---T---CAATAAA----ATGAAAAGTGCTAA---A------A--CAT---ATAA-----TTT--A-TGCATAATTGTCCTCAT--TACC-TTATCTAA-TTA-CA--TATTATTGTTACTTTC-CAC-GTT-CA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-TAAATGTA-TT---C-T-GTACT-------CTA----GTC-
gi|35 : ttAATCAGTCCCT-ATGCC-TCTGCACGTCGTTATGAGTACAT--GGTAACAAAAGTCGGTTAAT------T-------AATT-T---GAT--CTACCTGC-CTCGAAGATTTT--AAGG-GTACTGCTCCG---CGTCTCCTTCGCCTGA-TTGA--TAGCTTAATGGGTAA-AT-TTTT------ACA-ATTCGAGCAA-T-GGCCA---TATAACTTA--TCAGAG-CGATT-CCAA
gi|36 : -C------ATAGCATAAAGAT-G--C-ATTTTG-ATAA---TAG---TATCC-TA-AAT--A-AAGGCTCTGAC------GTTGACT----TCA------TAAATAAAT-T-AA--TTTC---ATTT-----------GAAAAG-AA-TACC-GTTAAGTTT-AATT---TTATGACAT--TAT-GTAGAGT--------------TTAAGT---ACAAGGTT-GT--AAAA-AAGA-T-A--TTAC---CT-C---GACTAGA-----TTC--TG--TA
gi|37 : AAT-TG----------------TACTTTAG--CGAAG-TGATTGT-G-AACT--G-TA--CG-ACTG--C-A-----AAC-----------------ATG-T---G---TA-A--A-T--AAA-TG-TGC--TC-AGA-GATG-AAATAAGATGCA--TA-G-A--TGG-C-T--A-T-AT-----TT-TC----T---T-----TTACA---A-A---GTTAT-------AATA-CTTATAAC-----AAGCC-G---G---CTT-AGG---TAATA-ATA----CAT-G-A-G-TTC--A-TA-
gi|38 : ttATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-AC-T-TAACTCTTGCGAAACATT-ATA---GAGTTAGCAATTGACTTTGAAGTGAAAATA-CG-TTCTTGTGTCTCGGACTAAAATTACT----------CGACGAATGGCCAACGAACCACTGCGCAGGAACC
gi|39 : ---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------ACA--ATAAAGAT-G--C-AC---G-A--A---TTG---T---C-T--AAT--C-AAG---CATAT------GTCG--T----TCA------T-------T-T-AAT-TT-C---ATAA-----------CAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--GATGATATTTGCTTATGTT-AGT---ACTGG--T-GTAAAAAA-cgtt
gi|4 : TTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC----------GTGCAT--G-----------C--TT--T------T-------AC-T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTTCTG------------CCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------ACA-ATTGGAGC-A-T-G---C---TATA--CTA--AA-GAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGT--C---TGATGATA---T-G-ATGA-------A-------CATCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCT---A---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAT---GA-CG-GCCTTC--GATCTTTCC-AGTTTGTGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TA-C-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-GTC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAAAAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-AA--CGTACTG--T-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGCAA-ATC-GC-------C--T----T---CA-TAAA----A-----------GA---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--C-CCTTT---TAATT-A-CA--TATTG-----ATTTTT-CACGGTT-CA--------TTTCCA--TTTACTGTC---G--C---TGTTA-T-T-AATG-AGTA--AC-T-GTACT--TTGTGCTA----GTCTAGCAATTT-A-------CG-TCCT-GGTGG--A------TAGGGTGCATGT-GGTACTT-----AA---G---ACAC-T---GTAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---A-A--A---TAA---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATC---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------CT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TGA-TAGGCCGATCTATTAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AG
gi|40 : T--C-AAG---C--AA------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TTTC---ATTT-----------CAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-TTAAAAAATAAAA-A-A--ATAT---T-------ACT-TG-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTG
gi|44 : TTTCCAAATCAGTCC-TTACGCCCTCTGCACC---------GTTCAT--G-----------C--TT--T------T-------AA-T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------TTAG--G-GTACTG-----------CCCTTTTCCCTGA-T-GA--
gi|45 : tG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-ATA-------TTAC---C--C---GATT-GA-----TTC--AG--TAGGCCGATCTA-
gi|45 : AC---TTCGTGGTGC----AGTAAGGGTAA---AC-cttcgtggtgcagtaagggtaaac
gi|5 : gcttatgtaatttagtacaggtgtaaaaaaatattacccgattgattcagtaggccgatctCC-CCTATAC----------ATGTA-------------------------------------A--T-T---GGT--CT-CCTGC-GCCA-------T--A--G-GTGCTG----G---AATGCCTT------------------CTT---GGGTAACAT-TTTTTTTTTTATA-ATTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--AA-GAA-TAATC-ACAAACCAAAA-TGC-TATCC------------------------A--T----CT--ACACATTTAATC-GAA----T-GC----AATGG--C---TGATG
gi|50 : ggctggagggtcatccaattttttccccaaaattcaaaaaactagcatggttacttggcataatcatatacataattttaacaccaaagacaatttaacaaaattagccatatttttatgatttattacttctaatgttattgcacataataatacataaacacataacaaaacaattcaaatacaaaccaaaccaaaaaaaaaaggcaaaacatacaataattaatatatcaaataaaaaaccatcaaaaaccaaataacaaaacataaatatcaaaaatataaggaaattttaaaaaaaatgcaattcatatataacaaaaatgaaaataaaaaaataataaccacaagatttgttcaaattttaacataaatgataatcagtatatatgttaaaatatatgaattggaattaaaaaattttgctgtgaattaagatggaatgggggaaaatgaaaatttcataaatttggctacacaaatttaattacctccctttgcagaatcttaaccgctgaaccatagacgtaaagcaaaacgtgttgctttacgtctatggctgaactgatcgttttgtaaacatgtgcatggtttAC---TTCGTGGTGC----AGTAAGGGTAA---AC-A--------------------C-CGTCAAT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGCTTTTCACgatgc
gi|51 : ------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AAT-TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T--C-GTTCA-TTT-AATT---TT-
gi|53 : GATGACA---T-G-ATGA-------G-------CATCC-TCT-GTAG-AGATGT-TCGGCT---A---AA-
gi|54 : ---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTAC------------TGCCTTTTCCCTGA-T-GA--c
gi|6 : GA-------G-------CATCC-TCTCGTGGGAGCTGGGTCGGTC---A---GA-CTT-CAGCCAATA-CAAATAACACCGAGATCGCACCTTC------TTTCC-ACAGTATAC--------------AT-----C-----TG-TC---AAACTA-C-AAATTAAATGAAAAGCTTAATCCAT---TT-GTT------AA-CCG-TACAGTA-CAA-TG-----A---A--------TG----------------CA-TTTA---C--AA-TGTTG-T-GGA-CTACG-CC--CCTACTG--CTA-----A-C-----------------ATG-CTTAA---TA-A--T-T--GC--TA-TAC--TC-AGA-GATG-AAG-----------CA-GAA--TGG-CTT--A-T-A------CT-TCCTCAC---T-----CT-CA---ACA---GTTTATGTCATGACTA-C-TACA-------AAGCC-TTTGG---CTTAA-G---T-ATTGATA----CATGG-ACG-TTTTGATTA-ATT-ACAATG-----TAAT-AT--TA--TTAT--TTT------TC-GT-------CAATA---TCAGCA-TAAAT---A-----------GA---A------AGTCAT---A--ACATATCTT--ACTG-ATA-TT----T----------TC---TCA-T-A-CG--TA----------TTTT-CAC-GTT-TGTGTGTGACCTTCTAGCCTTACT-TCAGGGC-CGGTTGTCA-TCT-AATGTAGTC--ATGC-GTAGTGAT--TACTA----GTC-A--AA--T-AAAAAACCCG-TCCTGGGCGGAAA------TAGGGTGGGTGCGGGTACTTTATAAAA---G--AA-AC-C---GTACAAT-TCACTCAATA--ATAAAGAT-T--C-AT---GTA--A---TAGGTCC---C-T--AAT--C-AAG---C--TT------GTC---CTCTTTCATTGAATT-------T-T-AAATTT-C---ATTT-----------GAATAG-AAGT-TC-GTTTC-TTT-ATTTGTGTG-TG-C-T--CAT-GT--AAT--------------TCAAGT---ACAGG--TCGTAAAAAA-AAAA-ATATTTTAC---C--C---GACT-GAGC---TTCGATG--TA
gi|7 : atg-TTTACAT----------GTGCATAAG-----------C--TT--TCCCCTTT-------A--A-T---GGT--CT-CAGAT-GCAA-------C-----G-GTACTG----GG--AATGCTTTTCGCCTGAAT-GA--TA-CTC---GG-TAACAT-TTTA------ATA-AT---AG--A-TAG---A---TATA--CTATAAAAGAG-CG-----TAAACCAAAAATCC-TATTC------------------------A-------------------AATC-GA--------C----AATGG--A---TGAT-ACAAAGT-G-ATGA-------GACATCTGCATCC-T-T-GT----GCT---TCGGCT---ACAAAA-ATAAC--CCAATAACAA-TAACAT---G-----GTCTTC-------TTTC-AGTTT-TGCTTCGAGAATAAAATATACATGC-----TG-CT---CAA-TA-CCATATTAATC--AA-GCTCA-TC-AT---------------AAA--T-TA--TTA-ACA-TACGAATA---AAAATAATATA----------------GA-GATA---G--AGACAATT-T-G-A-CT--G-TA--CGTA-TG--C-A-------C-----------------ATT-C---G---TA-AA-TAT--AA--TT-TACC-TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--T-G-C-T--A-T-ATAAACCTT-TC----CTTAT-----TC-CAAACA-A---GTTT---------ATGCC-TATAC------AAGCc
gi|8 : atgaaaaaaatttaaataaccatcaaaccaaagaatattagatatatacaaaccatgaatttaaaaacatacacacaaggtctttggtcaaactttcctaacacgatagtatcaatatgtgtatgaaagatatcaacacaacatttattaccattctttatagctggtgaatatttgaagaatgggataaaacgaaaaatataattgtgaaaaatggaattactcccctttgcaaaatctaccacaaaaatgtgtcacaatcaacttC-C---TATCT-T-C-CATGTACTTTTAC-T-GTACT----------------C-AAC----T-A-------CGCTCCTGG-CGG---------TAGGATGCGTGC-GATACTT-----AACATGTCAACAC-T---G----AT-C------TTA--ATACAGTA-G--C-AC---GCA--A---TCG---T---CCTA-AACG-C-AAG---C--AT-------TCG--CG---TTA------T-------TAT-AG--TT-CTC-ATT------------GAAAAG-GA-T-TCTGTTCA-TTT-G---------CG-CGT--TAT-GT--GAT--------------TT--GT---AC-GG--T-GAAAAAAA-AAAA-A-A--
gi|8 : catttaaatattacTAAAAAA-GAAT-T-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-T-------G--TC-G-TAGTATT--GATGTAC-AGG------------------TGC----TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAG---TGTAGAATTCGT-CACGAGC-CTCTA-TGT---AGA----TGCTGAT-GAAA-AAG-CA-ATCG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CA-CA--Taaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaataaaaaagaattattacccgactgattctgtaggccgatctatgtcgtagtattgatgtacaggtgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgtagaattcgtcacgagcctctatgtagatgctgatgaaaaagcaatcgcttgtagaggtgccatctttttcacattcataataacaatcgcagccgccattgtggttgagtagatctttttggtgtttttcacttatagatcgcccgttcttatctggggattttgtttatctgagtcttttattatcttctatgtatgaagagtgcatactaagaacattaactgttgcgaaattacataggagttacaatacttggaagtgaaaatattctttgtcgcgagataaaattactcaagaatggcaacgacactgaagaaccct
gi|8 : catttaaatattaccctatcttccatgtacttttactgtactcaactacgctcctggcggtaggatgcgtgcgatacttaacatgtcaacactgatcttaatacagtagcacgcaatcgtcctaaacgcaagcattcgcgttattatagttctcattgaaaaggattctgttcatttgcgcgttatgtgatttgtacggtgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaa-A-TAACA-------ATCGCAGC-CGCCATT-GTGGTTGAGTAGATCTTTTT-----GG-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCTTAT-CTG-GGGATTT-------------------TGT-TTATCT------------------GAGTCTTTTATTAT-------CTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTGTTGCGAA--ATT-ACATAGGAGTTA-CAAT--ACTTGGAAGTGAAAATA----TTCTT-TGTCGCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCA-ACGA--CACTG-A-AGAACCCTtcataataacaatcgcagccgccattgtggttgagtagatctttttggtgtttttcacttatagatcgcccgttcttatctggggattttgtttatctgagtcttttattatcttctatgtatgaagagtgcatactaagaacattaactgttgcgaaattacataggagttacaatacttggaagtgaaaatattctttgtcgcgagataaaattactcaagaatggcaacgacactgaagaaccct
gi|9 : catttaaatattaccctatcttccatgtacttttactgtactcaactacgctcctggcggtaggatgcgtgcgatacttaacatgtcaacactgatcttaatacagtagcacgcaatcgtcctaaacgcaagcattcgcgttattatagttctcattgaaaaggattctgttcatttgcgcgttatgtgatttgtacggtgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaataaaaaagaattattacccgactgattctgtaggccgatctatgtcgtagtattgatgtacaggtgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgtagaattcgtcacgagcctctatgtagatgctgatgaaaaagcaatcgcttgtagaggtgccatctttttcacattcata-TTTACAT----------GTGCAT--G-----------C--TT--T------CCCCTGTAA--T-T---GGT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--A-GTATTG----G---AATGCCTTTTCCATGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAA-TTTT------ACA-ACTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CT
14 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TAAGGAGGGCGTGAAGCCAGGGATCAGTCCAATTTTCTTTTTCCAATTTCACACAACAGCAATGTTGGTTTACTTGAATGAATAAGTATCCAATGGTGAATATCTTAACTAAAATCAAAGACATACAAATAGCCATATTTTTTATGATTTATTACTCTAATGTTATTGCACATAATGTTACTGACGAACCACATAGGAAAAAGACAATGTTGGTGTAAATGCAAAACAAACAAAGAACGAAATTGGGAAATAATTATCATAACAATTATAAATATATATAAATTTGTAAAAAACAAAAATCCATCAAAACAGCATAACAAGATAAATAATATATCAGAAATATATAACCGAATATTAAAAAAAAAATAATGCAATTCAGTTTATAGTATAAGACAAAAAATGAAAATTTAAAAAATTAATAAACACACAGATTTTGTTCAATTATTAAACATATAGTTAATCAGTATTATGTTATATGATAATATATCAATTAGAATTTTTTAAAAAAAAAAATTGGCTGAGTGAATTTTGAAAGAATGGAAAAACAAAATGAAATTGTACTAATGTTGTAGGACATTGCAGCTATGTAAACTTAAATTACC
Unaligned ( gi|13 ): AAGGCTGGAGAGTCATCCAATTTTTTTTCCAAAATTTACAAAACTAGCATGGTTACTTGGCATAATCATATACATAATTTTAACATCAAAGACAATAACAAAATTAGCCATATTTTTATGATTTATTACTTCTAATGTCATTGCACATAATGTTGCATGAAGAAAAACCAAAAACAATTTAAATACAAAACAAATCAAGAAATTGGTAAAATACATAACAATAATACTATATCAAATAAAAAACACCATCAAAACCAAATAAAACATAAATATCAAAAGTTATTTGAATATTTAAAAAAAAATGCCAATTCATATATGTATAACAAAAATTAAAATAAAAAAAATATAACCACAAGATTTTGTTCAAATTTTAACATAATAGTAATCAGTATATGTATGAAATATATCAATTAGAATTCAATTTTTTTGCTGGTGAATTTTGAAGAATGGGGAAAAATTACATAATATTAGCTGCAAATTAATTACCTCCCTTTGCAGAATCTAAAACATGGTTACAAACAGCTGAACTAATCTTTTTAC
Unaligned ( gi|14 ): AAGGCTGGAGAGTCTCCACTTTTTTTCGCAAAATTTACAAAACTAGCATGGTTATTGGCAGAATCATATACATAATTTAATAACATCCAAGAACAATACAAAAATTAAGCCATATTTTTATGATTTATTACTTCTAATGTCATTGCAACATAATGTTGCATGAAGAAAACCAAAAAACAATTTAAATACAAACAAATCAAGAAATTGGTAAATACATAACAATAATACTATATCAAAATAAAAACCCATTCAAACCAAATAAAAACATAAATATCAAAAGTATTTGACTATAAAAAAAAAATGCAATTCATATATGTTATAAAAAAATATAAATAAAAAATAATAACCACAAGAATTTTGTTCAAATTTTAACATAATAGTATCAGTATATGTATGAAATATATCAATTAGAATTCAATTTTTGCTGGTGAATTGAAGAATGGGGAAAAATTACAATAATATTAGCTGCAAAATTAATTACCTCCCTTTGCAGAATCTTAAAACATGGTTACAAACACTGAACTAAT
Unaligned ( gi|15 ): GGGCTGGAGGCGTCATCAATTTTTTTCTCTCCAAAAATTCATAAAGCTAGGCATGGTTACTTGGCATAATCTATACATAATTTAAACATCCAAAGACATAACCAAATTAGCCATATTTTTATGATTTATTACTCTAATTGTTATTGCACATAATGTTACATGAAACACATGGCAAAAACAATTTAATACATAAAAAAACAAAGAAATAGGCCAAAATAACATAACAATAATAAATATATCAAATAAAAAAAACCATTCAAACCAAAAATAACAAAATATTAAATATAAAAGTTTAAGTATATTTTAAAAAAAATGCCAATTCATATATATAACAAAAATTGAAAAAAAAAAAAATAATAATAACCACAGATTTTGTCAATTTTAAAATAATGGTAATCAGTATATGTATAAAATTTATCAATTTTAGAATTGAAATTTTTTGGCTGGTGAATTTTAAAGAAATGGGGAAAAAATTGAATTTACATAAT
Unaligned ( gi|16 ): AATTTTTTCTCTCCAAAATTCATAAAGCTAGCATGGTTACTTGGCATAATCATATACATAATTTTAACATCAAAGACAATAACAAAATTAGCCATATTTTTATGATTTATTACTTCTAATGTTATTGCACATAATGTTACATGAACACATGGCAAAAACAATTTAAATACATAAAAAAACAAAGAAATAGGCAAAATACATAACAATAATAATATATCAAATAAAAAAACCATCAAAACCAAATAACAAAATATAAATATAAAAAGTATAAGTATATTTAAAAAAAAATGCAATTCATATATATAACAAAAATGAAAAAAAAAAAAATAATAATAACCACAAGATTTTGTTCAAATTTTAAAATAATGGTAATCAGTATATGTATAAAATATATCAATTAGAATTGAATTTTTTGGCTGGTGAATTTTAAAGAAATGGGGAAAAAATGAAATTTACATAAT
Unaligned ( gi|31 ): TAAGGAGGCTGGAGGGTCATCCAAGCCCCCCCCCCCAACAATAAAACCAGATGGTTACTTGGATAATATATACATAATTAAACACCAAAGACAATAACAAAATTAGCCATATTTTCTATTATTTATTTTATTTCTAATTTATTGCACATAATGTTACATGAACACATAACAATAAAATTTAAATACAATCCAAACAAAAAAGGCAAAGTACATAACAATAATAATATATCAAATTTAAAAAAAAAACCATCAAAATTAAAT
Unaligned ( gi|41 ): GAGGTTGGAGGGTCATCAATTTTTTTTTTTCTAAAATTTATAAAAACTAGCATGGTTACTTGGCATAATATATATACATGGTTTTAGCATCAAAGACAATAACAACATTAGCCATATTTTTATGATTT
Unaligned ( gi|42 ): AAGGAGGCTGGGGGTCATTTATTTTTTTTCAAAATTCATAAAACTAGCATGGTTATTTGATATAATCATACACACCATATTGACATCAAAGACAGTGACAAAATTAGCCATATTTTCATGATTTATT
Unaligned ( gi|43 ): ATTTTGAAGAATGGGGAAAAAAATAAAATTCACCATAACATTAGCTGCAAAATTAATAACCTCCCTTTGCAGAATCTATTGAAACATGGTTACAAACAGTTGAACGAATATTTTTACT
Unaligned ( gi|46 ): AAATATTAGAAATATAACAATATTTTTTTTAAGATATAACAAAAATGAAAATTAAAAAATAACCACAAGATTTTGTTCAAATTTT
Unaligned ( gi|47 ): TTCGCTGCAAAATTAAATTACCTCCCTTTGCAGAATTTCTAAAACATTGTTACAAATAGATAGACTGAAACTAATATCTTTATA
Unaligned ( gi|48 ): GCTGCAAAATTAATTACCTCCCTTTGCAGAATCTAAAACATTGGTTACAAATAGATAGCTGAACTAATATCTTTATA
Unaligned ( gi|49 ): TGAATTTTGAAGAATGGGGGAAAAAATAAACATTTACACAATATTATCTGCAAAATTAATTACCTCCATTTGCAGAA
Unaligned ( gi|52 ): AAACCATAGATGTAAAGTAAAGCTTTACGTCTATGATTAAACT
Alignments
lowQualScore : 1111111111 333333333333333333333333333333333333 1111111111111 2222222222 1111111 1 33333333333333333333333333333333 111 111111111 1111 11111 1111 2222222222 2222222222222222 111111 11111111111111111 11111 222222 11111111111111 22222222 2222222 11 1111 11 111111 22222 4444444444444444444 5555555555555555555555555555 11111 1111 11 2222222222 22222222 111 66666666666666666666666666666666666666666 333333333 22222 111111 1111111111111111111111 11 1111111111 1111111 1111111 11 11111 11111111111 11111111111111 111111 11111 11 1 444444444444444 1111 11111111 111 2222222222 1 22222222 1111 22222 111 222 111 1 2222222 11111 33333333 33333 2222222222
lowQualScore : 5 5 6 3 3 4444444444 555 888888888888888888888888888888888888 2 444 33 2 2 4444444444444 2 7777777777 5 2 33 5 5555 0 2 888888 2 2 2 2 5 0000000 33 66 3 2 2 2 2 33333333333333333333333333333333 33 3 888888 6666 999999 0 888 3 3 9999999 9999999 2 1 2 1 2 2 000 33 3 44 3 3 555 3 3 6666 999999999 2 1111 44444 77777 3 555 3 77 33 3 5555 3 888888 3 2222 3 3 2222222222 2 1111111111111111 8 777 33 2 2 2 2 2 33 666666 33 2 6666666 88888888888888888 2 444 777 2 66 2 33 99 2 66 2 2 2 8888 11111 2 2 33 2 2 33 2 2 666666 2 55555555555555 3 555 3 555 99999999 0 3 3 2222222 3 55 777 4 3 666 3 00 4444 555 4 66 4 4 5 00 333333 5 5 5 77 44444 5 1111111111111111111 5 2222222222222222222222222222 66 888 66 22222 66 5 5 5 0000 1 11 5 888 5 5 5 66 5555555555 5 5 5 00000000 77 5 000 5 888 5 5 5 5 66 5 5 22222222222222222222222222222222222222222 000000000 1 5 66666 888 66 777 4 4 111111 55 3 55 3 6666666666666666666666 3 88 22 3 555 2222222222 4444444 888888 0000000 3 7 22 11111 77777777777 3 3 55 3 3 3 11 555 6 3 8888 3 99 99999999999999 6 555 44 3 0 3 9999 44 666 111111 3 44444 55 88 2 5 1 66 11 5 0 5 66 5 5 222222222222222 1111 33333333 1 1 1 444 8 8 11 8 8 0000000000 88 8 8 6 99999999 4444 1 6 99 6 6 6 99 8 00000 8 3 1 000 222 55 333 3 88 3333333 22 4 4 777 00000 4 5 5 5 1 5 5 5 888 5 0 5 888 5 33 0 55555555 5 5 333 0 77 5 33 5 66 00000 5 1111111111 5 5 77 5 5
lowQualScore : . . . . . .......... ... .................................... . ... .. . . ............. . .......... . . .. . .... . . ...... . . . . . ....... .. .. . . . . . ................................ .. . ...... .... ...... . ... . . ....... ....... . . . . . . ... .. . .. . . ... . . .... ......... . .... ..... ..... . ... . .. .. . .... . ...... . .... . . .......... . ................ . ... .. . . . . . .. ...... .. . ....... ................. . ... ... . .. . .. .. . .. . . . .... ..... . . .. . . .. . . ...... . .............. . ... . ... ........ . . . ....... . .. ... . . ... . .. .... ... . .. . . . .. ...... . . . .. ..... . ................... . ............................ .. ... .. ..... .. . . . .... . .. . ... . . . .. .......... . . . ........ .. . ... . ... . . . . .. . . ......................................... ......... . . ..... ... .. ... . . ...... .. . .. . ...................... . .. .. . ... .......... ....... ...... ....... . . .. ..... ........... . . .. . . . .. ... . . .... . .. .............. . ... .. . . . .... .. ... ...... . ..... .. .. . . . .. .. . . . .. . . ............... .... ........ . . . ... . . .. . . .......... .. . . . ........ .... . . .. . . . .. . ..... . . . ... ... .. ... . .. ....... .. . . ... ..... . . . . . . . . ... . . . ... . .. . ........ . . ... . .. . .. . .. ..... . .......... . . .. . .
lowQualScore : 7 7 6 3 3 6666666666 666 333333333333333333333333333333333333 9 777 77 7 7 1111111111111 7 6666666666 0 5 44 7 1111 7 9 222222 9 9 7 7 3 3333333 77 88 1 9 7 9 9 99999999999999999999999999999999 99 1 333333 5555 666666 7 555 1 1 3333333 3333333 9 2 9 9 9 9 000 11 1 22 1 1 444 1 1 5555 666666666 3 9999 22222 77777 1 444 1 77 99 1 9999 1 888888 1 0000 1 1 5555555555 9 8888888888888888 6 999 99 9 7 7 7 7 77 999999 77 7 9999999 77777777777777777 7 777 333 7 33 7 77 00 7 33 7 7 7 3333 33333 7 7 77 9 9 99 9 9 111111 9 33333333333333 1 888 3 888 00000000 3 3 3 1111111 6 55 000 0 6 444 6 66 0000 333 4 11 4 4 7 00 444444 0 0 7 99 66666 7 4444444444444444444 7 0000000000000000000000000000 99 888 99 55555 99 0 0 0 6666 4 99 0 888 0 0 0 99 9999999999 0 7 7 77777777 99 7 000 0 888 0 0 0 6 99 0 0 44444444444444444444444444444444444444444 111111111 7 7 44444 888 99 888 4 0 555555 55 6 00 6 2222222222222222222222 6 00 55 3 888 8888888888 8888888 888888 0000000 3 3 33 55555 33333333333 6 6 66 3 3 3 77 888 7 3 3333 3 22 66666666666666 7 888 66 3 5 1 5555 66 444 000000 6 11111 00 66 5 0 4 44 99 0 0 0 99 7 0 000000000000000 6666 44444444 0 0 0 000 0 0 44 0 0 0000000000 88 0 0 0 00000000 2222 0 7 22 7 7 7 22 0 00000 0 8 0 000 444 99 888 3 22 1111111 44 0 0 000 00000 0 0 0 0 0 0 0 0 888 0 1 0 888 0 99 2 00000000 7 7 999 4 99 7 11 7 99 66666 0 9999999999 0 0 99 7 7
consensus : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-G----------TGCAT--G-----------C--TT--T------T-------A--T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---N---TATA--CTA--AAAGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-N-A--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGC-A-ATC-GC-------C--TG---T---CA-TAAA----A-----------GA---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--ACC-TT---TAA-T-A-CG--TATTG-----ATTTTT-CAC-GTT-CA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTT--AC-T-GTACT--T--TG--CTA----GTC-AGCAA--T--A-------CG-TCCTGGGCGG--A------TAGGGTGCGTGC-GGTACTT-----AA---G--AACAC---TG-TAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---G-A--A---TAG---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGC------TGCGGCAGGTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGCCGNAANATATAANANAANAG---GGTC-AATTCGT-CACGAGCCCC-TA-TGT---AGG----TGCTGAT-GAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CA--TAAGC-AT-----GATC-TACCTTTACAAC---TTCGTGGGC-GCAGTAA-GGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGTAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCNTAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT------TCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTCTTGCGAA--ATT-ACATNGGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAATA-C--TTCTT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
Reference ( family-2937 ) : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-G----------TGCAT--G-----------C--TT--T------T-------A--T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---N---TATA--CTA--AAAGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-N-A--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGC-A-ATC-GC-------C--TG---T---CA-TAAA----A-----------GA---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--ACC-TT---TAA-T-A-CG--TATTG-----ATTTTT-CAC-GTT-CA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTT--AC-T-GTACT--T--TG--CTA----GTC-AGCAA--T--A-------CG-TCCTGGGCGG--A------TAGGGTGCGTGC-GGTACTT-----AA---G--AACAC---TG-TAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---G-A--A---TAG---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGC------TGCGGCAGGTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGCCGNAANATATAANANAANAG---GGTC-AATTCGT-CACGAGCNCC-TA-TGT---AGG----TGCTGAT-GAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CA--TAAGC-AT-----GATC-TACCTTTACAAC---TTCGTGGGC-GCAGTAA-GGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGTAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCNTAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT------TCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTCTTGCGAA--ATT-ACATNGGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAATA-C--TTCTT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
gi|1 : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-G----------TGCAT--G-----------C--TT--T------T-------A--C-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T-----G-GTTCT-----------TGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GG-TAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---C---TATA--CTA--AAAGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGT--C---TGATGATA---TTG-ATGAA-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAT---GA-CG-GCCT----T----CGATCTTTCCAGTTTGTGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-GTC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAAAAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-A-A--CGTACTG--T-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TTC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGC-A-ATT-GC-------C--T----T---CA-TAAA----A-----------GA---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--CCC-TT---TAA-T-A-CA--TATTG-----ATTTTT-CAC-GTT-CA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTT--AC-T-GTACT--T--TGTGCTA----GTCTAGCAA--TTTA-------CG-TCCTGGGTGG--A------TAGGGTGCATGT-GGTACTT-----AA---G--AACAC---TG-TAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---A-A--A---TAA---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATC---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------CT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGC------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNNT-TC-TGT---AGG----TGCTGAT-GAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AAA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CA-CA--TAAGC-AT-----GATC-TACC-TTACAAC---TTCGTGGGCAGTAGTAA-GGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGTAGC-TGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GTGTGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCGCAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-T----T-TTATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT------TCTTTTATGTATGAAGAGTGCATATTAAGA-ACAT-TAACTTTTGCGAA--ATT-ACATTAGAGTTA-CGAT--ACTTTGAAGTGAAAAT--C--T--CT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
gi|10 : C-ATTGA-TTT-AACT---TT-TG-C-T--TAT-GTCTAAT--------------TT-AGTTCAACAGG--T-GTAAAAAC-ATA-------TTAC---CGGC---ACCT-GGAACATTTC--GG--TGG--CGATCTG--AGTACTTGC-TT-G-TGGT-TTTAGGTGAAC-CGTTG--------GCGGCAGGTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGCCGTAAATTATAATAAGAGAG---GGTC-AATTCGT-CACGAGCACT-TG-TGTGATAGG----TGCTGATCGAAACAATTCATATTGGTCTCGATCTTGTGCATATA-GGTGGCCCGATCTTTTTTCGACA--TAAG--ATTACTGGATAATACCCTTA--AC---TTCGTGGGG-GC-GTAAAGGGTAATTAAT-A--AACATG-----ATCAGAGCTCGCCATTTGTGAGT---TGTATTTTTTTTGTCTGT-TGTTTT-CACTAACT-AGATC-GTC-GTTCGTAT-TCG-GGGATTTCTCACTTCACGACGC-TTTTGTCTTATCTT---CAACCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT-------CTTCTATGTAAGAGAAG-GCATACGAAGACACATCTAA---TTGCAAA--CTTTACATTG-AGTTA-CACT----TTTGAAGTGATAATA-TAATTCTT-TGT-TCG-GATAGAATTACTACTATCTACTCTA-TAATGGCC-ACG
gi|12 : t---TG-TAAAATTC------ATA--ATAAACGT-GGCC-AC---A-AT-A---TA----T---C-TA-AAT--C-AAG---C--ATA-----GTCG--CCG--TCA------T-------T-TTAA--TT-TTCAAATT-----------GAAA-G-AA-T-CC-GCTAA-TTT-A---------------------GT--AA------------------------ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-T-A--TTAC---C--C---GAGT-GA-----TTC--TGATTAGGCCGAT-TA-TAGTAAT-GGTCC-GCTAGT-TT--GGTGAACCAGGTGC------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTAAATAACAGAATAGAAGGGTC-AATTCGTTCACGAGCCGCGTAATGT-----G----TGCTGA--GGAA-AAT-CACATTC--------CTTGT----ATACGGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CGATTAAGCCAT-----GATC-TAC-TTTACAACAACTTC-TGGGC-G-AGTA--GGGTAAC--ACGA-TAACATACGGACATGCTAGC-TGTCAT--GTGGTT----AGATCTTTTT-----GT-TGTCTTTCACTTA-TGAGATCCGCCCGTTCGTATTCTCCGGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTTCCACA-CCAGTGGTTATGAGT-TCTTATCA-------TCTTCTATGTGT
gi|17 : g-----------C--TT--T------A-------A--T-T---GGT--CT-CATGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCTTTTTCCTTGA-T-GA--CA-GTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--AA-GAG-CGACC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--GCTTAATTAATC-AAA----T-GC----AATGG--C---TGATGATA---T-G-ATGAG-------CA-------T-------GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-CTC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CA-ACCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATCAACGGTAAACCT-T-------ACA-T------A---CAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-A-A-CT--G-T-A--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TT-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGA-C-T----------------------------------------A-A---GTTTA-------AA---C-TATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-AT
gi|18 : ttaattacctccctttgcagaatctaaaaactgaactaatcttgctttccc-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGT-ATATC-AC-------A--TA---G---CA-TAAA----G-----------TCT--A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TTAT--ACC-TT---TAA-T-A-CA--TCATG-----TATTTT-CAT-GTT-CA--------TTTTCA--TTTACT-TC---AC-C---TGTCT-T-T-AATGTAGTT--AC-T-GTACT--------------------AGCAA--T--A-------CA-TTATGGGCGG--ATCATATTAGGGTGCGTGC-GGTACTG-----AA---G--AACAC---TG-TAAAAT-C------GTA--ATAAAGAT-G--C-AC---GAA--A---TAG---A---C-TA-AATGCT-AAT---C--AT------GTCGT-C----TCA------T-------T-TAAA--TT-C---ATTT-----------AAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AA-T---TT-TG-C----TATAGT--AAT--------------TT-AGT---ACGTG--T-GT-------GAAA-A-A--TTATATAC--C---GACT-GA------TC--TG--TA-GCCTAT-TA-TAGT-C-----TC-GATAGT-TT--GGTGAAC-AG
gi|19 : agagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTTTCAA--TCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-G----------TGCAA--G-----------C--TT--T------T-------AA-T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-ATACTG------------CCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---C---TATA--CTA--AA-GAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GCTATCAATAG--CAATTAATCAAA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCA-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCT----T----CGA--TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AA---TT-ATC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTCA---C--AG-TGATT-T-G-A-CG--GAA-A--CGTAATG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GTTG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-
gi|2 : -TTTACAT-G----------TGCAT--G-----------C--TT--T------CCCCTTTAA--T-T---GGT--AT-CCTGT-GTCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CAT---GGGTAACAT-TTTC------A-CA-ATTTGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--TA-GAG-CGATC-CCAAAACAAAA-CGAATA---------------------------------------GCACAAT----C-AAA----A-GC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-CTC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-ACCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAA-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATT-------AACCT-TAC-ATACAAA-TA-----A---NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNTCA-TTTA---C--AG-TAATT-TGG-A-CT--G-T-C--TTTATTA--C-ACCAGCA-CACTATAAACGAGTTACGATG-T---G---TA-AATT-T--AA--TG-TACTATC-AGAGGATGTAAT----ATATCTGCATG-A--TGA-C-T--ACT-A------AT-TC----C---TACATGTG-CA---A-ATAGGTTTCT------ACTG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATTCATATAATCATGG---G-TAT--A-TATCTC-AC-CTAAACT-TAATAATC-TA
gi|2 : caatttaaatgcaaaacaaacaaagaaatgggaaaaatacataaaaattataatatataaaattaaaaaaaaaacaacatcaaaaccaaataacaaaaaataaatatcaaaaatataagaatatttaaaaaaaaatgcaattcatatataagacaaaaatgaaaatttaaaaaataataaccacaagattttgttcaaattttaacataatagtaatcagtatatgtataaaatatatcaattagaatttttaaaaaaaaaattgctggtgaattttgaagaatggaaaacaaatgaaatttacataatgttagctgcaaacttaattacctccctttgtggaatctaaattaaaaacatggttataaacagctgaactaatcttAAAGATTG--C-AC---G-A--GATTTAGGT-T---C-TATAACTCC-AAC---C--ATTCTATGGTCG--C----ACA------T-------T---AA--TT-T---ATTTTCATATTGAGAGAAAAGTAA-T----ATTCC-TTTCAATT---TTATG-C-TAATAC-AT--CAT--------------TC-ACT---ACAGG--T-TTTTAAAA-AATATA-A--TAAC---C--TCAAGACT-GA-----TTC--TG--TAGGtatgtatcatgtcacgagtaaaaagagagtctcgaaacaaattaacaataatcgaattattgatcattactttgactgtactattactataaaataacccatgtcctcagagagctggtaaaggctgtggctagatgtccaacatctacttgtatgaaatcactgttaaatattctcagagagagaggaaagattgcacgagatttaggttctataactccaaccattctatggtcgcacattaatttattttcatattgagagaaaagtaatattcctttcaattttatgctaatacatcattcactacaggtttttaaaaaatataataacctcaagactgattctgtagg
gi|20 : caatttaaatgcaaaacaaacaaagaaatgggaaaaatacataaaaattataatatataaaattaaaaaaaaaacaacatcaaaaccaaataacaaaaaataaatatcaaaaatataagaatatttaaaaaaaaatgcaattcatatataagacaaaaatgaaaatttaaaaaataataaccacaagattttgttcaaattttaacataatagtaatcagtatatgtataaaatatatcaattagaatttttaaaaaaaaaattgctggtgaattttgaagaatggaaaacaaatgaaatttacataatgttagctgcaaacttaattacctccctttgtggaatctaaattaaaaacatggttataaacagctgaactaatctttttacatgtgcatgctttcccctttaattggtatcctgtgtcataggtactggaatgccttttccctgatgatacatgggtaacattttcacaatttgagcatgttatactatagagcgatcccaaaacaaaacgaatagcacaatcaaaagcaatggctgatgacatgatgagcatcctctgtagagctgttcggctaaactccccaatacaataatacgacgaccttctttccagtttatgcttcgagaattatctgtcaaataaatattaatcaaagcttaatcatttattaaccttacatacaaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcatttacagtaatttggactgtctttattacaccagcacactataaacgagttacgatgtgtaaatttaatgtactatcagaggatgtaatatatctgcatgatgactactaattcctacatgtgcaaataggtttctactgctataaagccgtgcttagtattcatataatcatgggtatatatctcacctaaacttaataatctatatgtatcatgtcacgagtaaaaagagagtctcgaaacaaattaacaataatcgaattattgatcattactttgactgtactattactataaaataacccatgtcctcagagagctggtaaaggctgtggctagatgtccaacatctacttgtatgaaatcactgttaaatattctcagagagagaggTT-T-G-A-AT--G-C----CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATGGT---AGGATA-A--T-TTAAA--TGATAC--TA-CGG-GATG-CAAT---AT-----CG-G-A--TGATC-T--A-T-AAT----TTATC----T---T-----TT-CA---A-G---TTTTAT------AGAG-C-TATACACCATAAAGTC-GC--GGGTTTT-A-GGTAT-ATA-ATA----CATGG-A-GATTT--A--A-ATT-A--ATG---T-AACT-CTT-TATATTAT--GTTG----ATT-GTATGAGATC--TGACAT---CA-TATATAGCA-----------GATCTA------A--GACTTCA--A-----CTTTAA-TG-ATA-TT----TAAT--AC--TT---TAA-C-A-TG--TGC-------ATTTTTGCAC-GTTTCA--------CTTTCA--TTT----TC---GCTC---TGATACT-T-AATGTA-TT--AC-T-GGG-T--T--TG--CTAACATGTC--GCAA--T--A-------C--TCCTGTGCGGGGA------TAGGGTGC-TGT-GA-A--T-----AA---A--AACGCATCTGGTAAAAT-C------ATA--ATGAGAAT-G--CAAC---A-A--AT--TAT---T---C-T--AAT--CAAAG---C--A--------TCG--T----TCG------T-------
gi|21 : TTCAAAATC-GTCC-T-A-GCC-TCTGCTC-G------------CAT--G-----------T--TT--A------A-------A--T-C---GAT--T---CTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTC----G--------CTTTTCCCTGA-C-GA--TA-CTT---GGGTAACA--TTTT------A-CA---TGGAGC-A-T-G---A---TATA---TC--AAAGAGACGATC-----ACCAAAA-TGC-TATCC------------------------ATCT----CT--ACACAATTAATCAAAA----A-GC----AATGGC-C---TAATTATT---T-GCATG-G-------CA-------TCCTTCT-GT-G-AGC--T-TCGGC-A---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TATT-----GG-CG-GTCTTCGAT----C----TTTCCAGTTTATGC-TCG-GAAA----TAT-----C-----TGTTC---AAA-TA--AT----ATC--AAAGCTTAATC-A-----T-ATC-------AACCT-TA--G-A-ACA-T----------AAAATAAT-TG----------------CATTTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G---A--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T---A--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--AGG-C-TTAA-TGA------TT-TC----T---T-----T
gi|22 : AGC-CGTCATT-GTGGTT---TATATCTTTTT-----AT-
gi|22 : --G-----------C--TT--T------T-------A--TATAGGGCT--CT-CCCGTTGTCA-------------GCGTACTG----GGTTAATGCCTTT-CCCTGG-T-GAAATAGCT-----AGTAACATATTCT------T-CATATTGGAGC-AAT-G---TCTGTATA--GGC--AAAGA--CGACCTCCAAACCAAAA-TGC--A-TC------------------------A--TGG--CT--ACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattataataatacaattgaaatttgacatctataatttgctgggtgaattttggaaggaaatagggcaaatgaatttacataattcagctgctaaaataattaccattaccgctgtatggccagaaattagaagcatggctacaatcaagcctgaactcaggtaccttttggcatatttgccatgctctctctcgcttttatatagggctctcccgttgtcagcgtactgggttaatgcctttccctggtgaaatagctagtaacatattcttcatattggagcaatgtctgtataggcaaagacgacctccaaaccaaaatgcatcatggctaca
gi|23 : ataaaaagatataaaccacaatgacggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattataataatacaattgaaatttgacatctataatttgctgggtgaattttggaaggaaatagggcaaatgaatttacataattcagctgctaaaataattaccattaccgctgtatggccagaaattagaagcatggctacaatcaagcctgaactcaggtaccttttggcatatttgccatgctctctctcTTTCAAAATCAGTCC-T-A-GCC-TCTGCAC-G------------CAT--G--------------TC--A------A-------A--T-C---GAT---T-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG-------------CTTTTCCCTGA-C-GA---A-CT----GGGTA-CAT-TT--------A-CA-AT-GGAGC-A-T-G---A---TATA--C----AAAGAG-CGATC-C-AAACCAAAA-TGC-TATCC------------------------A--T----CTCTACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGGCCC---TAAT-ATA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-CTT----G-AGC--T-TCGGCTA---AACATC-C--CCAATA-CAA-TCAT-T---GG-CG-GTCT----TTCGAC----TTCCAAGTTTATGC--CGAAA------TAT-----C-----TG-TC----AA-TA--ATATCA-----AAAGCTTAATC-A-----T-ATC------AAACCT-TA--G-A-A-A-T------A---AAAATAAT-TG----------------CATTTTA---C--AG-TGATT-T---A-CT--G---A--CGTACTG--C-------A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AAC-TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--
gi|24 : -G--TCTG-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATGT----ACATATAGAATAGAAG---GGTC-AATTCGT-CATGAGTCCC-TA-TAT---AGGCCGATGCTGAT-AAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTATTT-CG-CA--TAAGC-AT-----GATC-CACCTTTACTAC---TTCGTGGG--GCAGTAG-GGGTAA---ACAA-TAACA-------ATCAAAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATT-GCCCGTTCTTAT-CTC-GGGATTTCTCA-GTCACG---CTTTTTTT-TTATCTT---CA-CCATGATTTATGAGTCTTTTATTA-------TCTTCTATGTATagcatat
gi|25 : TGGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--AA-GAG-CTATC-CCAAACCATAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGG--C---TAATGATA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TTT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-A--CCAATA-CAA-TAATAC---AA-CG-GCCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGTGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATC------ATACCT-TA--GTA-ACA-T------A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AA-TGATT-T-G-A-CT--G-----------------A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-G-----------AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-ATT----TT-TT----T---T-----TT-CA---A-A---GTTT---------ATG-C-TATA-------AAGTC-GT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-AT
gi|26 : TGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CA--TAAGC-AT-----AATC-TACCTTTACAAC---TTCGTGGG--ACAATAA-GGGTAA---ACAA-TAACA-------ATCGTAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATC-TTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCTTAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CG-CCATGGTTTATGAGTCTTTTATCA-------TCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-AAAT-TAACTCTTGCAAA--ATT-ACACAGGGGTTA-CAGA--AATTTGAATTGAAAAT--C--TTCTT-TGTCTTGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTA
gi|27 : -CCAAACCAAAA-TGC-TATTCATGTAAAGGCAAATGTAAAGGCACA--T----CT--ACACAATTAATC-AAT----A-G--------------------GACA---C-G-ATGAG-------CA-------TCT-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-CTC-C--ACAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCT----T---------TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----CAT-----A-----TA-TC---AAA-TAC-ATATTAACC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATG------AAACCT---------ACA-T------A---CAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-T-A--CGTACAG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TCAAGG-GATG-AAA----AT-----CG-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---ATTT---------ATG-C-CATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATC-ATA----
gi|28 : TAACC--AAAGGCTAATC-AT---TTTATC------AAACCT-TACAGTA--CAGTA-----AC--AAAGTAAT-TG----------------TA-TTTAATAC--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-A-AATTGTACTGGGC-A-----A-C-----------------ATG-T---GG--TACA--T-T--AAACTG-TAC--TC-AAG-GCGG-AAA----AT-----CA-G-AATCGG-C-T--A-T-----------------------------------------GTTTA-------A----C-TATA-------AAGCCCGT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATAGA--CAAGGCA-G-TTT--A-TA-ATTGAC-ATG---T--AAT-ATC-TAC-TTATATTTCGT-ATATCCGC-------A--TT---T---CA-TAAA----G-----------AA---AGTCTCAA--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCATAAACC-TT---TAA-T-AGCGATTATGT-----ATTTTT-C
gi|29 : ATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACGT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--AAGG-G-CGATC-CCAAAGCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--TAGATCT--ACACAATTAATC-AAATGCAATGC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAC-AGCTGT-TCAGCTA---AA-CTC-C--CCAATA-CAA-T-ATAC---GG-CG-GCCT----T----A----TTCCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----CTTCTTTG-TCTCGAGA-TAA-A-ATTACTC--AAga
gi|29 : AT--GCTTCGAG----AATTATC--TTCTT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAAgaatggccacgacactggaggacccttaagcag
gi|3 : atgccttttccctgatgatacttgggtaacgtttttacaattggagcatgttatactaaagggcgatcccaaagcaaaatgctattcatagatctacacaattaatcaaatgcaatgcaatggctgatgacatgatgagcatcctctgtacagctgttcagctaaactccccaatacaatatacggcggccttattcccagttt-TTTACAT-G----------TGCA---G-----------C--TT--T------C-------CCTT-T---AATGGCT-CCGAT-GCCA-------T--AC-G-GTATTG----G---AATGCTTTTCGCCTGAAT-GA--TA-CTC---GG-TAACAT-TTTT------AATA-ATAGG-GC-A-TAG---A---TATA--CTAT-AAAGAG-CG--T-CCAAACCAAAA-TCC-TATTC------------------------A-------------------AAT-----------GC----AATGG--CA--TGATGACAG--T-G-ATGAG-------CAATCTGCATCC-T-T-GTGG------T-TCGGCTACAAAA-ATA-A--CCATAA-CAA-TAA-AC---GA-TG-GTCT----T----C----TTTC-AGTTTATGCTTCGAGAATAAA-TATACTG-C-----TG-CT---CAA-TACCATATTAATC--AA-GCT--ATC-ATAAATT-ATT------AAACATACG--ATA-AAA-TA-----ATATGAGATAGT-AGA---------------CA-T--------------ATT-T-G-A-CT--G-TTA--CGTACTG--C-A-------C-----------------ATT-C---G---TA-A--T-T--AA--TT-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGC-T-T--A-T-ATAAAC-TT-TC----C---TTA---TT-CA---A-A---GTTT---------ATG-C-TATAC------AAGCT-Ggcag
gi|30 : caaggaggctgcagaggtatacaaacccccccaatcaacagctagcatggttcttgatataatcatataataattttaactcaaaagacagtaaaacaatgagccatataatgtatcatttatgatttattaattctaatgttcattgcacaactgtttaacaatgcaaaaaatttaaataaatacacatcaaaccaaatgaaataataagaaatttatatacaacacatgaatttaaaaaaacataaccacaaggttttggtcaactttctaacacagatatgtataatatgtgttgaagatataccaaattataattaatttttagagctggtgaattatttgaagaatgggtaaaaaaccgaaatttacataataattgtgaaaaatggaattacctcccctttgcaaaaatctacaaattcaaaaactgtgaaatactgtGTAA---AC-AATAACA-------ATCGTAGC-TGTCATG-G-GGTA---TAGATCTTTTT-----GT-TATTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCGTAT-CCC-CGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATGGGTTAAGAGTCTTTTATTA-------TCTTTTATGAATGAAGAATGCATACTAAGA-ACAT-TAATTCTTGCAAA--ATT-ACATCAGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAAT--C--TTCTT-TGTCTCGAGATAGAATTACT----------CAA-AAATGGCC-ACGA--TACTG-G-AGGAC
gi|32 : aGC-CGTCATT-GTGGTT---TATATCTTTTT-----AT-TGGTTTCCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCTAAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATG--------GTCTTTTGTTATCTTCTACCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-----------------TT-ACATAGGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAAT--C--TTCTT-TGTCTCGAGATGAAATAACT----------CAA-GAATGACC-ACGA--CACTG-G-AGGGC
gi|33 : ---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAC--ACC-TT---TAA-T-A-CA--TTCCG-----TATTTT-CAC-GTT-CA--------TTTTCA--TTTATT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTT--AC-TAATAC-------G-------------AGCAA--TA-A-------CGCCCCTGGGCGG--A------TAGGGTGCGTGC-GATACTTTTAA-AA---G--AACAC---TG-TAAAAT-C------ATG--CTAAAGAT-G--A-AA---G-A--A---AAG---T---C-TA-AAT--C-AAG---A--AT------GTCG--C----TCG------T-------T-
gi|34 : agtct-G---T-AT--ATA----CAATG-A---TCT--A-CA-CTT-A--ATG---TATAAT-CTCATGC-TCA---------A-ATC-GC-------C--TG---T---CAATAAA----ATGAAAAGTGCTAA---A------A--CAT---ATAA-----TTT--A-TGCATAATTGTCCTCATT-ACC-TTATCTAA-TTA-CA--TATTATTGTTACTTTC-CAC-GTT-CA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-TAAATGTA-TT---C-T-GTACT---------CTA----GTC-
gi|35 : ttAATCAGTCCCT-ATGCC-TCTGCAC-GTCGTTATGAGTACAT--GGTAACAAAAGTCGGTTAAT------T-------AATT-T---GAT--CTACCTGC-CTCGAAGATTTT--AAGG-GTACTGCTCCG---CGTCTCCTTCGCCTGA-TTGA--TAGCTTAATGGGTAA-AT-TTTT------A-CA-ATTCGAGCAA-T-GGCCA---TATAACTTA--TCAGAG-CGATT-CCAA
gi|36 : -C------ATAGCATAAAGAT-G--C-ATTTTG-ATAA---TAG---TATCC-TA-AAT--A-AAGGCTCTGAC------GTTGACT----TCA------TAAATAAAT-T-AA--TTTC---ATTT-----------GAAAAG-AA-TACC-GTTAAGTTT-AATT---TTATGACAT--TAT-GTAGAGT--------------TTAAGT---ACAAGGTT-GT--AAAA-AAGA-T-A--TTAC---CT-C---GACTAGA-----TTC--TG--TA
gi|37 : TAAT-TG----------------TACTTTAG--CGAAG-TGATTGT-G-AACT--G-T-A--CG-ACTG--C-A-----AAC-----------------ATG-T---G---TA-A--A-T--AAA-TG-TGC--TC-AGA-GATG-AAATAAGATGCA--TA-G-A--TGG-C-T--A-T-AT-----TT-TC----T---T-----TTACA---A-A---GTTAT-------AATA-CTTATAAC-----AAGCC-G---G---CTT-AGG---TAATA-ATA----CAT-G-A-G-TTC--A-TA-
gi|38 : tATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-AC-T-TAACTCTTGCGAAACATT-ATA---GAGTTAGCAATTGACTTTGAAGTGAAAATA-CG-TTCTTGTGTCTCGGACTAAAATTACT----------CGACGAATGGCCAACGAACCACTGCGCAGGAACC
gi|39 : ---G--AACAC---TG-TAAAAT-C------ACA--ATAAAGAT-G--C-AC---G-A--A---TTG---T---C-T--AAT--C-AAG---CATAT------GTCG--T----TCA------T-------T-T-AAT-TT-C---ATAA-----------CAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--GATGATATTTGCTTATGTT-AGT---ACTGG--T-GTAAAAAA-cgtt
gi|4 : TTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-G----------TGCAT--G-----------C--TT--T------T-------AC-T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTTCTG------------CCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---C---TATA--CTA--AA-GAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGT--C---TGATGATA---T-G-ATGAA-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAT---GA-CG-GCCT----T----CGATCTTTCCAGTTTGTGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-GTC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAAAAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-A-A--CGTACTG--T-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGCAA-ATC-GC-------C--T----T---CA-TAAA----A-----------GA---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--CCCTTT---TAATT-A-CA--TATTG-----ATTTTT-CACGGTT-CA--------TTTCCA--TTTACTGTC---G--C---TGTTA-T-T-AATG-AGTA--AC-T-GTACT--TTGTG--CTA----GTCTAGCAATTT--A-------CG-TCCT-GGTGG--A------TAGGGTGCATGT-GGTACTT-----AA---G---ACAC---TG-TAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---A-A--A---TAA---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATC---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------CT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TGA-TAGGCCGATCTATTAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AG
gi|40 : T--C-AAG---C--AA------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TTTC---ATTT-----------CAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-TTAAAAAATAAAA-A-A--ATAT---T-------ACT-TG-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTG
gi|44 : TTTCCAAATCAGTCC-TTACGCCCTCTGCACCG----------TTCAT--G-----------C--TT--T------T-------AA-T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------TTAG--G-GTACTG-----------CCCTTTTCCCTGA-T-GA--
gi|45 : tG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-ATA-------TTAC---C--C---GATT-GA-----TTC--AG--TAGGCCGATCTA-
gi|45 : AC---TTCGTGG-T-GCAGTAA-GGGTAA---AC-cttcgtggtgcagtaagggtaaac
gi|5 : gcttatgtaatttagtacaggtgtaaaaaaatattacccgattgattcagtaggccgatctCC-CCTATAC-A----------TGTA-------------------------------------A--T-T---GGT--CT-CCTGC-GCCA-------T--A--G-GTGCTG----G---AATGCCTT------------------CTT---GGGTAACAT-TTTTTTTTTTA-TA-ATTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--AA-GAA-TAATC-ACAAACCAAAA-TGC-TATCC------------------------A--T----CT--ACACATTTAATC-GAA----T-GC----AATGG--C---TGATG
gi|50 : ggctggagggtcatccaattttttccccaaaattcaaaaaactagcatggttacttggcataatcatatacataattttaacaccaaagacaatttaacaaaattagccatatttttatgatttattacttctaatgttattgcacataataatacataaacacataacaaaacaattcaaatacaaaccaaaccaaaaaaaaaaggcaaaacatacaataattaatatatcaaataaaaaaccatcaaaaaccaaataacaaaacataaatatcaaaaatataaggaaattttaaaaaaaatgcaattcatatataacaaaaatgaaaataaaaaaataataaccacaagatttgttcaaattttaacataaatgataatcagtatatatgttaaaatatatgaattggaattaaaaaattttgctgtgaattaagatggaatgggggaaaatgaaaatttcataaatttggctacacaaatttaattacctccctttgcagaatcttaaccgctgaaccatagacgtaaagcaaaacgtgttgctttacgtctatggctgaactgatcgttttgtaaacatgtgcatggtttAC---TTCGTGG-T-GCAGTAA-GGGTAA---AC-A--------------------C-CGTCAAT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGCTTTTCACgatgc
gi|51 : ------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AAT-TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T--C-GTTCA-TTT-AATT---TT-
gi|53 : GATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGATGT-TCGGCTA---AA-
gi|54 : ---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTAC------------TGCCTTTTCCCTGA-T-GA--c
gi|6 : GAG-------CA-------TCC-TCTCGTGGGAGCTGGGTCGGTCA---GA-CTT-CAGCCAATA-CAAATAACACCGAGATCGCACCT----T----C----TTTCCACAGTATAC--------------AT-----C-----TG-TC---AAACTAC-AAATTAAATGAAAAGCTTAATCCAT---TT-GTT------AA-CCG-TACAGTA--CA---------------ATGAA-TG----------------CA-TTTA---C--AA-TGTTG-T-GGA-CTACG-C-C--CCTACTG--CTA-----A-C-----------------ATG-CTTAA---TA-A--T-T--GC--TA-TAC--TC-AGA-GATG-AAG-----------CA-GAA--TGG-CTT--A-T-A------CT-TCCTCAC---T-----CT-CA---ACA---GTTTATGTCATGACTA-C-TACA-------AAGCC-TTTGG---CTTAA-G---T-ATTGATA----CATGG-ACG-TTTTGATTA-ATT-ACAATG-----TAAT-AT--TA--TTAT--TTT------TC-GT-------CAATA---TCAGCA-TAAAT---A-----------GA---A------AGTCAT---A--ACATATCTT--ACTG-ATA-TT----T---------TC---TCA-T-A-CG--TA----------TTTT-CAC-GTT-TGTGTGTGACCTTCTAGCCTTACT-TCAGGGC-CGGTTGTCA-TCT-AATGTAGTC--ATGC-GTAGTGAT--TA--CTA----GTC-A--AA--T--AAAAAACCCG-TCCTGGGCGGAAA------TAGGGTGGGTGCGGGTACTTTATAAAA---G--AA-AC---CG-TACAAT-TCACTCAATA--ATAAAGAT-T--C-AT---GTA--A---TAGGTCC---C-T--AAT--C-AAG---C--TT------GTC---CTCTTTCATTGAATT-------T-T-AAATTT-C---ATTT-----------GAATAG-AAGT-TC-GTTTC-TTT-ATTTGTGTG-TG-C-T--CAT-GT--AAT--------------TCAAGT---ACAGG--TCGTAAAAAA-AAAA-ATATTTTAC---C--C---GACT-GAGC---TTCGATG--TA
gi|7 : atg-TTTACAT-G----------TGCATAAG-----------C--TT--TCCCCTTT-------A--A-T---GGT--CT-CAGAT-GCAA-------C-----G-GTACTG----GG--AATGCTTTTCGCCTGAAT-GA--TA-CTC---GG-TAACAT-TTTA------A-TA-AT---AG--A-TAG---A---TATA--CTATAAAAGAG-CG-----TAAACCAAAAATCC-TATTC------------------------A-------------------AATC-GA--------C----AATGG--A---TGAT-ACAAAGT-G-ATGAGACATCTGCA-------TCC-T-T-GT----GCT---TCGGCTACAAAA-ATAAC--CCAATAACAA-TAACAT---G-----GTCT----T----C----TTTC-AGTTT-TGCTTCGAGAATAAAATATACATGC-----TG-CT---CAA-TACCATATTAATC--AA-GCTCA-TC-AT---------------AAA--T-TA--TTA-ACA-TACGAATA---AAAATAATATA----------------GA-GATA---G--AGACAATT-T-G-A-CT--G-T-A--CGTA-TG--C-A-------C-----------------ATT-C---G---TA-AA-TAT--AA--TT-TACC-TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--T-G-C-T--A-T-ATAAACCTT-TC----CTTAT-----TC-CAAACA-A---GTTT---------ATGCC-TATAC------AAGCc
gi|8 : atgaaaaaaatttaaataaccatcaaaccaaagaatattagatatatacaaaccatgaatttaaaaacatacacacaaggtctttggtcaaactttcctaacacgatagtatcaatatgtgtatgaaagatatcaacacaacatttattaccattctttatagctggtgaatatttgaagaatgggataaaacgaaaaatataattgtgaaaaatggaattactcccctttgcaaaatctaccacaaaaatgtgtcacaatcaacttC-C---TATCT-T-C-CATGTACTTTTAC-T-GTACT------------------C-AAC----T--A-------CGCTCCTGG-CGG---------TAGGATGCGTGC-GATACTT-----AACATGTCAACAC---TG-----AT-C------TTA--ATACAGTA-G--C-AC---GCA--A---TCG---T---CCTA-AACG-C-AAG---C--AT-------TCG--CG---TTA------T-------TAT-AG--TT-CTC-ATT------------GAAAAG-GA-T-TCTGTTCA-TTT-G---------CG-CGT--TAT-GT--GAT--------------TT--GT---AC-GG--T-GAAAAAAA-AAAA-A-A--
gi|8 : catttaaatattacTAAAAAA-GAAT-T-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-T-------G--TC-G-TAGTATT--GATGTAC-AG------------------GTGC----TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAG---TGTAGAATTCGT-CACGAGCCTC-TA-TGT---AGA----TGCTGAT-GAAA-AAG-CA-ATCG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CA-CA--Taaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaataaaaaagaattattacccgactgattctgtaggccgatctatgtcgtagtattgatgtacaggtgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgtagaattcgtcacgagcctctatgtagatgctgatgaaaaagcaatcgcttgtagaggtgccatctttttcacattcataataacaatcgcagccgccattgtggttgagtagatctttttggtgtttttcacttatagatcgcccgttcttatctggggattttgtttatctgagtcttttattatcttctatgtatgaagagtgcatactaagaacattaactgttgcgaaattacataggagttacaatacttggaagtgaaaatattctttgtcgcgagataaaattactcaagaatggcaacgacactgaagaaccct
gi|8 : catttaaatattaccctatcttccatgtacttttactgtactcaactacgctcctggcggtaggatgcgtgcgatacttaacatgtcaacactgatcttaatacagtagcacgcaatcgtcctaaacgcaagcattcgcgttattatagttctcattgaaaaggattctgttcatttgcgcgttatgtgatttgtacggtgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaa-A-TAACA-------ATCGCAGC-CGCCATT-GTGGTTGAGTAGATCTTTTT-----GG-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCTTAT-CTG-GGGATTT-------------------TGT-TTATCT------------------GAGTCTTTTATTAT-------CTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTGTTGCGAA--ATT-ACATAGGAGTTA-CAAT--ACTTGGAAGTGAAAATA----TTCTT-TGTCGCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCA-ACGA--CACTG-A-AGAACCCTtcataataacaatcgcagccgccattgtggttgagtagatctttttggtgtttttcacttatagatcgcccgttcttatctggggattttgtttatctgagtcttttattatcttctatgtatgaagagtgcatactaagaacattaactgttgcgaaattacataggagttacaatacttggaagtgaaaatattctttgtcgcgagataaaattactcaagaatggcaacgacactgaagaaccct
gi|9 : catttaaatattaccctatcttccatgtacttttactgtactcaactacgctcctggcggtaggatgcgtgcgatacttaacatgtcaacactgatcttaatacagtagcacgcaatcgtcctaaacgcaagcattcgcgttattatagttctcattgaaaaggattctgttcatttgcgcgttatgtgatttgtacggtgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaataaaaaagaattattacccgactgattctgtaggccgatctatgtcgtagtattgatgtacaggtgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgtagaattcgtcacgagcctctatgtagatgctgatgaaaaagcaatcgcttgtagaggtgccatctttttcacattcata-TTTACAT-G----------TGCAT--G-----------C--TT--T------CCCCTGTAA--T-T---GGT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--A-GTATTG----G---AATGCCTTTTCCATGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAA-TTTT------A-CA-ACTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CT
14 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TAAGGAGGGCGTGAAGCCAGGGATCAGTCCAATTTTCTTTTTCCAATTTCACACAACAGCAATGTTGGTTTACTTGAATGAATAAGTATCCAATGGTGAATATCTTAACTAAAATCAAAGACATACAAATAGCCATATTTTTTATGATTTATTACTCTAATGTTATTGCACATAATGTTACTGACGAACCACATAGGAAAAAGACAATGTTGGTGTAAATGCAAAACAAACAAAGAACGAAATTGGGAAATAATTATCATAACAATTATAAATATATATAAATTTGTAAAAAACAAAAATCCATCAAAACAGCATAACAAGATAAATAATATATCAGAAATATATAACCGAATATTAAAAAAAAAATAATGCAATTCAGTTTATAGTATAAGACAAAAAATGAAAATTTAAAAAATTAATAAACACACAGATTTTGTTCAATTATTAAACATATAGTTAATCAGTATTATGTTATATGATAATATATCAATTAGAATTTTTTAAAAAAAAAAATTGGCTGAGTGAATTTTGAAAGAATGGAAAAACAAAATGAAATTGTACTAATGTTGTAGGACATTGCAGCTATGTAAACTTAAATTACC
Unaligned ( gi|13 ): AAGGCTGGAGAGTCATCCAATTTTTTTTCCAAAATTTACAAAACTAGCATGGTTACTTGGCATAATCATATACATAATTTTAACATCAAAGACAATAACAAAATTAGCCATATTTTTATGATTTATTACTTCTAATGTCATTGCACATAATGTTGCATGAAGAAAAACCAAAAACAATTTAAATACAAAACAAATCAAGAAATTGGTAAAATACATAACAATAATACTATATCAAATAAAAAACACCATCAAAACCAAATAAAACATAAATATCAAAAGTTATTTGAATATTTAAAAAAAAATGCCAATTCATATATGTATAACAAAAATTAAAATAAAAAAAATATAACCACAAGATTTTGTTCAAATTTTAACATAATAGTAATCAGTATATGTATGAAATATATCAATTAGAATTCAATTTTTTTGCTGGTGAATTTTGAAGAATGGGGAAAAATTACATAATATTAGCTGCAAATTAATTACCTCCCTTTGCAGAATCTAAAACATGGTTACAAACAGCTGAACTAATCTTTTTAC
Unaligned ( gi|14 ): AAGGCTGGAGAGTCTCCACTTTTTTTCGCAAAATTTACAAAACTAGCATGGTTATTGGCAGAATCATATACATAATTTAATAACATCCAAGAACAATACAAAAATTAAGCCATATTTTTATGATTTATTACTTCTAATGTCATTGCAACATAATGTTGCATGAAGAAAACCAAAAAACAATTTAAATACAAACAAATCAAGAAATTGGTAAATACATAACAATAATACTATATCAAAATAAAAACCCATTCAAACCAAATAAAAACATAAATATCAAAAGTATTTGACTATAAAAAAAAAATGCAATTCATATATGTTATAAAAAAATATAAATAAAAAATAATAACCACAAGAATTTTGTTCAAATTTTAACATAATAGTATCAGTATATGTATGAAATATATCAATTAGAATTCAATTTTTGCTGGTGAATTGAAGAATGGGGAAAAATTACAATAATATTAGCTGCAAAATTAATTACCTCCCTTTGCAGAATCTTAAAACATGGTTACAAACACTGAACTAAT
Unaligned ( gi|15 ): GGGCTGGAGGCGTCATCAATTTTTTTCTCTCCAAAAATTCATAAAGCTAGGCATGGTTACTTGGCATAATCTATACATAATTTAAACATCCAAAGACATAACCAAATTAGCCATATTTTTATGATTTATTACTCTAATTGTTATTGCACATAATGTTACATGAAACACATGGCAAAAACAATTTAATACATAAAAAAACAAAGAAATAGGCCAAAATAACATAACAATAATAAATATATCAAATAAAAAAAACCATTCAAACCAAAAATAACAAAATATTAAATATAAAAGTTTAAGTATATTTTAAAAAAAATGCCAATTCATATATATAACAAAAATTGAAAAAAAAAAAAATAATAATAACCACAGATTTTGTCAATTTTAAAATAATGGTAATCAGTATATGTATAAAATTTATCAATTTTAGAATTGAAATTTTTTGGCTGGTGAATTTTAAAGAAATGGGGAAAAAATTGAATTTACATAAT
Unaligned ( gi|16 ): AATTTTTTCTCTCCAAAATTCATAAAGCTAGCATGGTTACTTGGCATAATCATATACATAATTTTAACATCAAAGACAATAACAAAATTAGCCATATTTTTATGATTTATTACTTCTAATGTTATTGCACATAATGTTACATGAACACATGGCAAAAACAATTTAAATACATAAAAAAACAAAGAAATAGGCAAAATACATAACAATAATAATATATCAAATAAAAAAACCATCAAAACCAAATAACAAAATATAAATATAAAAAGTATAAGTATATTTAAAAAAAAATGCAATTCATATATATAACAAAAATGAAAAAAAAAAAAATAATAATAACCACAAGATTTTGTTCAAATTTTAAAATAATGGTAATCAGTATATGTATAAAATATATCAATTAGAATTGAATTTTTTGGCTGGTGAATTTTAAAGAAATGGGGAAAAAATGAAATTTACATAAT
Unaligned ( gi|31 ): TAAGGAGGCTGGAGGGTCATCCAAGCCCCCCCCCCCAACAATAAAACCAGATGGTTACTTGGATAATATATACATAATTAAACACCAAAGACAATAACAAAATTAGCCATATTTTCTATTATTTATTTTATTTCTAATTTATTGCACATAATGTTACATGAACACATAACAATAAAATTTAAATACAATCCAAACAAAAAAGGCAAAGTACATAACAATAATAATATATCAAATTTAAAAAAAAAACCATCAAAATTAAAT
Unaligned ( gi|41 ): GAGGTTGGAGGGTCATCAATTTTTTTTTTTCTAAAATTTATAAAAACTAGCATGGTTACTTGGCATAATATATATACATGGTTTTAGCATCAAAGACAATAACAACATTAGCCATATTTTTATGATTT
Unaligned ( gi|42 ): AAGGAGGCTGGGGGTCATTTATTTTTTTTCAAAATTCATAAAACTAGCATGGTTATTTGATATAATCATACACACCATATTGACATCAAAGACAGTGACAAAATTAGCCATATTTTCATGATTTATT
Unaligned ( gi|43 ): ATTTTGAAGAATGGGGAAAAAAATAAAATTCACCATAACATTAGCTGCAAAATTAATAACCTCCCTTTGCAGAATCTATTGAAACATGGTTACAAACAGTTGAACGAATATTTTTACT
Unaligned ( gi|46 ): AAATATTAGAAATATAACAATATTTTTTTTAAGATATAACAAAAATGAAAATTAAAAAATAACCACAAGATTTTGTTCAAATTTT
Unaligned ( gi|47 ): TTCGCTGCAAAATTAAATTACCTCCCTTTGCAGAATTTCTAAAACATTGTTACAAATAGATAGACTGAAACTAATATCTTTATA
Unaligned ( gi|48 ): GCTGCAAAATTAATTACCTCCCTTTGCAGAATCTAAAACATTGGTTACAAATAGATAGCTGAACTAATATCTTTATA
Unaligned ( gi|49 ): TGAATTTTGAAGAATGGGGGAAAAAATAAACATTTACACAATATTATCTGCAAAATTAATTACCTCCATTTGCAGAA
Unaligned ( gi|52 ): AAACCATAGATGTAAAGTAAAGCTTTACGTCTATGATTAAACT
Alignments
lowQualScore : 1111111111 333333333333333333333333333333333333 1111111111111 2222222222 1111111 1 33333333333333333333333333333333 111 111111111 1111 11111 1111 2222222222 2222222222222222 111111 11111111111111111 11111 222222 11111111111111 22222222 2222222 11 1111 11 111111 22222 4444444444444444444 5555555555555555555555555555 11111 1111 11 2222222222 22222222 111 66666666666666666666666666666666666666666 333333333 22222 111111 1111111111111111111111 11 1111111111 1111111 1111111 11 11111 11111111111 11111111111111 111111 11111 11 1 444444444444444 1111 11111111 111 2222222222 1 22222222 1111 22222 111 222 111 1 2222222 11111 33333333 33333 2222222222
lowQualScore : 5 5 6 3 3 4444444444 555 888888888888888888888888888888888888 2 444 33 2 2 4444444444444 2 7777777777 5 2 33 5 5555 0 2 888888 2 2 2 2 5 0000000 33 66 3 2 2 2 2 33333333333333333333333333333333 33 3 888888 6666 999999 0 888 3 3 9999999 9999999 2 1 2 1 2 2 000 33 3 44 3 3 555 3 3 6666 999999999 2 1111 44444 77777 3 555 3 77 33 3 5555 3 888888 3 2222 3 3 2222222222 2 1111111111111111 8 777 33 2 2 2 2 2 33 666666 33 2 6666666 88888888888888888 2 444 777 2 66 2 33 99 2 66 2 2 2 8888 11111 2 2 33 2 2 33 2 2 666666 2 55555555555555 3 555 3 555 99999999 0 3 3 2222222 3 55 777 4 3 666 3 00 4444 555 4 66 4 4 5 00 333333 5 5 5 77 44444 5 1111111111111111111 5 2222222222222222222222222222 66 888 66 22222 66 5 5 5 0000 1 11 5 888 5 5 5 66 5555555555 5 5 5 00000000 77 5 000 5 888 5 5 5 5 66 5 5 22222222222222222222222222222222222222222 000000000 1 5 66666 888 66 777 4 4 111111 55 3 55 3 6666666666666666666666 3 88 22 3 555 2222222222 4444444 888888 0000000 3 7 22 11111 77777777777 3 3 55 3 3 3 11 555 6 3 8888 3 99 99999999999999 6 555 44 3 0 3 9999 44 666 111111 3 44444 55 88 2 5 1 66 11 5 0 5 66 5 5 222222222222222 1111 33333333 1 1 1 444 8 8 0 8 8 0000000000 88 8 8 6 99999999 4444 1 6 99 6 6 6 99 8 00000 8 3 1 000 222 55 333 3 88 3333333 22 4 4 777 00000 4 5 5 5 1 5 5 5 888 5 0 5 888 5 33 0 55555555 5 5 333 0 77 5 33 5 66 00000 5 1111111111 5 5 77 5 5
lowQualScore : . . . . . .......... ... .................................... . ... .. . . ............. . .......... . . .. . .... . . ...... . . . . . ....... .. .. . . . . . ................................ .. . ...... .... ...... . ... . . ....... ....... . . . . . . ... .. . .. . . ... . . .... ......... . .... ..... ..... . ... . .. .. . .... . ...... . .... . . .......... . ................ . ... .. . . . . . .. ...... .. . ....... ................. . ... ... . .. . .. .. . .. . . . .... ..... . . .. . . .. . . ...... . .............. . ... . ... ........ . . . ....... . .. ... . . ... . .. .... ... . .. . . . .. ...... . . . .. ..... . ................... . ............................ .. ... .. ..... .. . . . .... . .. . ... . . . .. .......... . . . ........ .. . ... . ... . . . . .. . . ......................................... ......... . . ..... ... .. ... . . ...... .. . .. . ...................... . .. .. . ... .......... ....... ...... ....... . . .. ..... ........... . . .. . . . .. ... . . .... . .. .............. . ... .. . . . .... .. ... ...... . ..... .. .. . . . .. .. . . . .. . . ............... .... ........ . . . ... . . . . . .......... .. . . . ........ .... . . .. . . . .. . ..... . . . ... ... .. ... . .. ....... .. . . ... ..... . . . . . . . . ... . . . ... . .. . ........ . . ... . .. . .. . .. ..... . .......... . . .. . .
lowQualScore : 7 7 6 3 3 6666666666 666 333333333333333333333333333333333333 9 777 77 7 7 1111111111111 7 6666666666 0 5 44 7 1111 7 9 222222 9 9 7 7 3 3333333 77 88 1 9 7 9 9 99999999999999999999999999999999 99 1 333333 5555 666666 7 555 1 1 3333333 3333333 9 2 9 9 9 9 000 11 1 22 1 1 444 1 1 5555 666666666 3 9999 22222 77777 1 444 1 77 99 1 9999 1 888888 1 0000 1 1 5555555555 9 8888888888888888 6 999 99 9 7 7 7 7 77 999999 77 7 9999999 77777777777777777 7 777 333 7 33 7 77 00 7 33 7 7 7 3333 33333 7 7 77 9 9 99 9 9 111111 9 33333333333333 1 888 3 888 00000000 3 3 3 1111111 6 55 000 0 6 444 6 66 0000 333 4 11 4 4 7 00 444444 0 0 7 99 66666 7 4444444444444444444 7 0000000000000000000000000000 99 888 99 55555 99 0 0 0 6666 4 99 0 888 0 0 0 99 9999999999 0 7 7 77777777 99 7 000 0 888 0 0 0 6 99 0 0 44444444444444444444444444444444444444444 111111111 7 7 44444 888 99 888 4 0 555555 55 6 00 6 2222222222222222222222 6 00 55 3 888 8888888888 8888888 888888 0000000 3 3 33 55555 33333333333 6 6 66 3 3 3 77 888 7 3 3333 3 22 66666666666666 7 888 66 3 5 1 5555 66 444 000000 6 11111 00 66 5 0 4 44 99 0 0 0 99 7 0 000000000000000 6666 44444444 0 0 0 000 0 0 4 0 0 0000000000 88 0 0 0 00000000 2222 0 7 22 7 7 7 22 0 00000 0 8 0 000 444 99 888 3 22 1111111 44 0 0 000 00000 0 0 0 0 0 0 0 0 888 0 1 0 888 0 99 2 00000000 7 7 999 4 99 7 11 7 99 66666 0 9999999999 0 0 99 7 7
consensus : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-G----------TGCAT--G-----------C--TT--T------T-------A--T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---N---TATA--CTA--AAAGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-N-A--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGC-A-ATC-GC-------C--TG---T---CA-TAAA----A-----------GA---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--ACC-TT---TAA-T-A-CG--TATTG-----ATTTTT-CAC-GTT-CA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTT--AC-T-GTACT--T--TG--CTA----GTC-AGCAA--T--A-------CG-TCCTGGGCGG--A------TAGGGTGCGTGC-GGTACTT-----AA---G--AACAC---TG-TAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---G-A--A---TAG---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGC------TGCGGCAGGTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGCCGNAANATATAANANAANAG---GGTC-AATTCGT-CACGAGCCCC-TA-TGT---AGG----TGCTGAT-GAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CA--TAAGC-AT-----GATC-TACCTTTACAAC---TTCGTGGGC-GCAGTAA-GGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGTAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCNTAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT------TCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTCTTGCGAA--ATT-ACATNGGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAATA-C--TTCTT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
Reference ( family-2937 ) : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-G----------TGCAT--G-----------C--TT--T------T-------A--T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---N---TATA--CTA--AAAGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-N-A--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGC-A-ATC-GC-------C--TG---T---CA-TAAA----A-----------GA---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--ACC-TT---TAA-T-A-CG--TATTG-----ATTTTT-CAC-GTT-CA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTT--AC-T-GTACT--T--TG--CTA----GTC-AGCAA--T--A-------CG-TCCTGGGCGG--A------TAGGGTGCGTGC-GGTACTT-----AA---G--AACAC---TG-TAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---G-A--A---TAG---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGC------TGCGGCAGGTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGCCGNAANATATAANANAANAG---GGTC-AATTCGT-CACGAGCCCC-TA-TGT---AGG----TGCTGAT-GAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CA--TAAGC-AT-----GATC-TACCTTTACAAC---TTCGTGGGC-GCAGTAA-GGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGTAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCNTAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT------TCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTCTTGCGAA--ATT-ACATNGGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAATA-C--TTCTT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
gi|1 : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-G----------TGCAT--G-----------C--TT--T------T-------A--C-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T-----G-GTTCT-----------TGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GG-TAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---C---TATA--CTA--AAAGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGT--C---TGATGATA---TTG-ATGAA-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAT---GA-CG-GCCT----T----CGATCTTTCCAGTTTGTGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-GTC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAAAAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-A-A--CGTACTG--T-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TTC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGC-A-ATT-GC-------C--T----T---CA-TAAA----A-----------GA---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--CCC-TT---TAA-T-A-CA--TATTG-----ATTTTT-CAC-GTT-CA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTT--AC-T-GTACT--T--TGTGCTA----GTCTAGCAA--TTTA-------CG-TCCTGGGTGG--A------TAGGGTGCATGT-GGTACTT-----AA---G--AACAC---TG-TAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---A-A--A---TAA---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATC---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------CT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGC------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNNT-TC-TGT---AGG----TGCTGAT-GAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AAA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CA-CA--TAAGC-AT-----GATC-TACC-TTACAAC---TTCGTGGGCAGTAGTAA-GGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGTAGC-TGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GTGTGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCGCAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-T----T-TTATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT------TCTTTTATGTATGAAGAGTGCATATTAAGA-ACAT-TAACTTTTGCGAA--ATT-ACATTAGAGTTA-CGAT--ACTTTGAAGTGAAAAT--C--T--CT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
gi|10 : C-ATTGA-TTT-AACT---TT-TG-C-T--TAT-GTCTAAT--------------TT-AGTTCAACAGG--T-GTAAAAAC-ATA-------TTAC---CGGC---ACCT-GGAACATTTC--GG--TGG--CGATCTG--AGTACTTGC-TT-G-TGGT-TTTAGGTGAAC-CGTTG--------GCGGCAGGTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGCCGTAAATTATAATAAGAGAG---GGTC-AATTCGT-CACGAGCACT-TG-TGTGATAGG----TGCTGATCGAAACAATTCATATTGGTCTCGATCTTGTGCATATA-GGTGGCCCGATCTTTTTTCGACA--TAAG--ATTACTGGATAATACCCTTA--AC---TTCGTGGGG-GC-GTAAAGGGTAATTAAT-A--AACATG-----ATCAGAGCTCGCCATTTGTGAGT---TGTATTTTTTTTGTCTGT-TGTTTT-CACTAACT-AGATC-GTC-GTTCGTAT-TCG-GGGATTTCTCACTTCACGACGC-TTTTGTCTTATCTT---CAACCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT-------CTTCTATGTAAGAGAAG-GCATACGAAGACACATCTAA---TTGCAAA--CTTTACATTG-AGTTA-CACT----TTTGAAGTGATAATA-TAATTCTT-TGT-TCG-GATAGAATTACTACTATCTACTCTA-TAATGGCC-ACG
gi|12 : t---TG-TAAAATTC------ATA--ATAAACGT-GGCC-AC---A-AT-A---TA----T---C-TA-AAT--C-AAG---C--ATA-----GTCG--CCG--TCA------T-------T-TTAA--TT-TTCAAATT-----------GAAA-G-AA-T-CC-GCTAA-TTT-A---------------------GT--AA------------------------ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-T-A--TTAC---C--C---GAGT-GA-----TTC--TGATTAGGCCGAT-TA-TAGTAAT-GGTCC-GCTAGT-TT--GGTGAACCAGGTGC------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTAAATAACAGAATAGAAGGGTC-AATTCGTTCACGAGCCGCGTAATGT-----G----TGCTGA--GGAA-AAT-CACATTC--------CTTGT----ATACGGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CGATTAAGCCAT-----GATC-TAC-TTTACAACAACTTC-TGGGC-G-AGTA--GGGTAAC--ACGA-TAACATACGGACATGCTAGC-TGTCAT--GTGGTT----AGATCTTTTT-----GT-TGTCTTTCACTTA-TGAGATCCGCCCGTTCGTATTCTCCGGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTTCCACA-CCAGTGGTTATGAGT-TCTTATCA-------TCTTCTATGTGT
gi|17 : g-----------C--TT--T------A-------A--T-T---GGT--CT-CATGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCTTTTTCCTTGA-T-GA--CA-GTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--AA-GAG-CGACC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--GCTTAATTAATC-AAA----T-GC----AATGG--C---TGATGATA---T-G-ATGAG-------CA-------T-------GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-CTC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CA-ACCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATCAACGGTAAACCT-T-------ACA-T------A---CAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-A-A-CT--G-T-A--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TT-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGA-C-T----------------------------------------A-A---GTTTA-------AA---C-TATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-AT
gi|18 : ttaattacctccctttgcagaatctaaaaactgaactaatcttgctttccc-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGT-ATATC-AC-------A--TA---G---CA-TAAA----G-----------TCT--A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TTAT--ACC-TT---TAA-T-A-CA--TCATG-----TATTTT-CAT-GTT-CA--------TTTTCA--TTTACT-TC---AC-C---TGTCT-T-T-AATGTAGTT--AC-T-GTACT--------------------AGCAA--T--A-------CA-TTATGGGCGG--ATCATATTAGGGTGCGTGC-GGTACTG-----AA---G--AACAC---TG-TAAAAT-C------GTA--ATAAAGAT-G--C-AC---GAA--A---TAG---A---C-TA-AATGCT-AAT---C--AT------GTCGT-C----TCA------T-------T-TAAA--TT-C---ATTT-----------AAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AA-T---TT-TG-C----TATAGT--AAT--------------TT-AGT---ACGTG--T-GT-------GAAA-A-A--TTATATAC--C---GACT-GA------TC--TG--TA-GCCTAT-TA-TAGT-C-----TC-GATAGT-TT--GGTGAAC-AG
gi|19 : agagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTTTCAA--TCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-G----------TGCAA--G-----------C--TT--T------T-------AA-T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-ATACTG------------CCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---C---TATA--CTA--AA-GAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GCTATCAATAG--CAATTAATCAAA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCA-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCT----T----CGA--TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AA---TT-ATC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTCA---C--AG-TGATT-T-G-A-CG--GAA-A--CGTAATG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GTTG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-
gi|2 : -TTTACAT-G----------TGCAT--G-----------C--TT--T------CCCCTTTAA--T-T---GGT--AT-CCTGT-GTCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CAT---GGGTAACAT-TTTC------A-CA-ATTTGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--TA-GAG-CGATC-CCAAAACAAAA-CGAATA---------------------------------------GCACAAT----C-AAA----A-GC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-CTC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-ACCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAA-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATT-------AACCT-TAC-ATACAAA-TA-----A---NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNTCA-TTTA---C--AG-TAATT-TGG-A-CT--G-T-C--TTTATTA--C-ACCAGCA-CACTATAAACGAGTTACGATG-T---G---TA-AATT-T--AA--TG-TACTATC-AGAGGATGTAAT----ATATCTGCATG-A--TGA-C-T--ACT-A------AT-TC----C---TACATGTG-CA---A-ATAGGTTTCT------ACTG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATTCATATAATCATGG---G-TAT--A-TATCTC-AC-CTAAACT-TAATAATC-TA
gi|2 : caatttaaatgcaaaacaaacaaagaaatgggaaaaatacataaaaattataatatataaaattaaaaaaaaaacaacatcaaaaccaaataacaaaaaataaatatcaaaaatataagaatatttaaaaaaaaatgcaattcatatataagacaaaaatgaaaatttaaaaaataataaccacaagattttgttcaaattttaacataatagtaatcagtatatgtataaaatatatcaattagaatttttaaaaaaaaaattgctggtgaattttgaagaatggaaaacaaatgaaatttacataatgttagctgcaaacttaattacctccctttgtggaatctaaattaaaaacatggttataaacagctgaactaatcttAAAGATTG--C-AC---G-A--GATTTAGGT-T---C-TATAACTCC-AAC---C--ATTCTATGGTCG--C----ACA------T-------T---AA--TT-T---ATTTTCATATTGAGAGAAAAGTAA-T----ATTCC-TTTCAATT---TTATG-C-TAATAC-AT--CAT--------------TC-ACT---ACAGG--T-TTTTAAAA-AATATA-A--TAAC---C--TCAAGACT-GA-----TTC--TG--TAGGtatgtatcatgtcacgagtaaaaagagagtctcgaaacaaattaacaataatcgaattattgatcattactttgactgtactattactataaaataacccatgtcctcagagagctggtaaaggctgtggctagatgtccaacatctacttgtatgaaatcactgttaaatattctcagagagagaggaaagattgcacgagatttaggttctataactccaaccattctatggtcgcacattaatttattttcatattgagagaaaagtaatattcctttcaattttatgctaatacatcattcactacaggtttttaaaaaatataataacctcaagactgattctgtagg
gi|20 : caatttaaatgcaaaacaaacaaagaaatgggaaaaatacataaaaattataatatataaaattaaaaaaaaaacaacatcaaaaccaaataacaaaaaataaatatcaaaaatataagaatatttaaaaaaaaatgcaattcatatataagacaaaaatgaaaatttaaaaaataataaccacaagattttgttcaaattttaacataatagtaatcagtatatgtataaaatatatcaattagaatttttaaaaaaaaaattgctggtgaattttgaagaatggaaaacaaatgaaatttacataatgttagctgcaaacttaattacctccctttgtggaatctaaattaaaaacatggttataaacagctgaactaatctttttacatgtgcatgctttcccctttaattggtatcctgtgtcataggtactggaatgccttttccctgatgatacatgggtaacattttcacaatttgagcatgttatactatagagcgatcccaaaacaaaacgaatagcacaatcaaaagcaatggctgatgacatgatgagcatcctctgtagagctgttcggctaaactccccaatacaataatacgacgaccttctttccagtttatgcttcgagaattatctgtcaaataaatattaatcaaagcttaatcatttattaaccttacatacaaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcatttacagtaatttggactgtctttattacaccagcacactataaacgagttacgatgtgtaaatttaatgtactatcagaggatgtaatatatctgcatgatgactactaattcctacatgtgcaaataggtttctactgctataaagccgtgcttagtattcatataatcatgggtatatatctcacctaaacttaataatctatatgtatcatgtcacgagtaaaaagagagtctcgaaacaaattaacaataatcgaattattgatcattactttgactgtactattactataaaataacccatgtcctcagagagctggtaaaggctgtggctagatgtccaacatctacttgtatgaaatcactgttaaatattctcagagagagaggTT-T-G-A-AT--G-C----CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATGGT---AGGATA-A--T-TTAAA--TGATAC--TA-CGG-GATG-CAAT---AT-----CG-G-A--TGATC-T--A-T-AAT----TTATC----T---T-----TT-CA---A-G---TTTTAT------AGAG-C-TATACACCATAAAGTC-GC--GGGTTTT-A-GGTAT-ATA-ATA----CATGG-A-GATTT--A--A-ATT-A--ATG---T-AACT-CTT-TATATTAT--GTTG----ATT-GTATGAGATC--TGACAT---CA-TATATAGCA-----------GATCTA------A--GACTTCA--A-----CTTTAA-TG-ATA-TT----TAAT--AC--TT---TAA-C-A-TG--TGC-------ATTTTTGCAC-GTTTCA--------CTTTCA--TTT----TC---GCTC---TGATACT-T-AATGTA-TT--AC-T-GGG-T--T--TG--CTAACATGTC--GCAA--T--A-------C--TCCTGTGCGGGGA------TAGGGTGC-TGT-GA-A--T-----AA---A--AACGCATCTGGTAAAAT-C------ATA--ATGAGAAT-G--CAAC---A-A--AT--TAT---T---C-T--AAT--CAAAG---C--A--------TCG--T----TCG------T-------
gi|21 : TTCAAAATC-GTCC-T-A-GCC-TCTGCTC-G------------CAT--G-----------T--TT--A------A-------A--T-C---GAT--T---CTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTC----G--------CTTTTCCCTGA-C-GA--TA-CTT---GGGTAACA--TTTT------A-CA---TGGAGC-A-T-G---A---TATA---TC--AAAGAGACGATC-----ACCAAAA-TGC-TATCC------------------------ATCT----CT--ACACAATTAATCAAAA----A-GC----AATGGC-C---TAATTATT---T-GCATG-G-------CA-------TCCTTCT-GT-G-AGC--T-TCGGC-A---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TATT-----GG-CG-GTCTTCGAT----C----TTTCCAGTTTATGC-TCG-GAAA----TAT-----C-----TGTTC---AAA-TA--AT----ATC--AAAGCTTAATC-A-----T-ATC-------AACCT-TA--G-A-ACA-T----------AAAATAAT-TG----------------CATTTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G---A--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T---A--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--AGG-C-TTAA-TGA------TT-TC----T---T-----T
gi|22 : AGC-CGTCATT-GTGGTT---TATATCTTTTT-----AT-
gi|22 : --G-----------C--TT--T------T-------A--TATAGGGCT--CT-CCCGTTGTCA-------------GCGTACTG----GGTTAATGCCTTT-CCCTGG-T-GAAATAGCT-----AGTAACATATTCT------T-CATATTGGAGC-AAT-G---TCTGTATA--GGC--AAAGA--CGACCTCCAAACCAAAA-TGC--A-TC------------------------A--TGG--CT--ACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattataataatacaattgaaatttgacatctataatttgctgggtgaattttggaaggaaatagggcaaatgaatttacataattcagctgctaaaataattaccattaccgctgtatggccagaaattagaagcatggctacaatcaagcctgaactcaggtaccttttggcatatttgccatgctctctctcgcttttatatagggctctcccgttgtcagcgtactgggttaatgcctttccctggtgaaatagctagtaacatattcttcatattggagcaatgtctgtataggcaaagacgacctccaaaccaaaatgcatcatggctaca
gi|23 : ataaaaagatataaaccacaatgacggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattataataatacaattgaaatttgacatctataatttgctgggtgaattttggaaggaaatagggcaaatgaatttacataattcagctgctaaaataattaccattaccgctgtatggccagaaattagaagcatggctacaatcaagcctgaactcaggtaccttttggcatatttgccatgctctctctcTTTCAAAATCAGTCC-T-A-GCC-TCTGCAC-G------------CAT--G--------------TC--A------A-------A--T-C---GAT---T-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG-------------CTTTTCCCTGA-C-GA---A-CT----GGGTA-CAT-TT--------A-CA-AT-GGAGC-A-T-G---A---TATA--C----AAAGAG-CGATC-C-AAACCAAAA-TGC-TATCC------------------------A--T----CTCTACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGGCCC---TAAT-ATA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-CTT----G-AGC--T-TCGGCTA---AACATC-C--CCAATA-CAA-TCAT-T---GG-CG-GTCT----TTCGAC----TTCCAAGTTTATGC--CGAAA------TAT-----C-----TG-TC----AA-TA--ATATCA-----AAAGCTTAATC-A-----T-ATC------AAACCT-TA--G-A-A-A-T------A---AAAATAAT-TG----------------CATTTTA---C--AG-TGATT-T---A-CT--G---A--CGTACTG--C-------A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AAC-TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--
gi|24 : -G--TCTG-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATGT----ACATATAGAATAGAAG---GGTC-AATTCGT-CATGAGTCCC-TA-TAT---AGGCCGATGCTGAT-AAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTATTT-CG-CA--TAAGC-AT-----GATC-CACCTTTACTAC---TTCGTGGG--GCAGTAG-GGGTAA---ACAA-TAACA-------ATCAAAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATT-GCCCGTTCTTAT-CTC-GGGATTTCTCA-GTCACG---CTTTTTTT-TTATCTT---CA-CCATGATTTATGAGTCTTTTATTA-------TCTTCTATGTATagcatat
gi|25 : TGGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--AA-GAG-CTATC-CCAAACCATAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGG--C---TAATGATA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TTT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-A--CCAATA-CAA-TAATAC---AA-CG-GCCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGTGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATC------ATACCT-TA--GTA-ACA-T------A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AA-TGATT-T-G-A-CT--G-----------------A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-G-----------AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-ATT----TT-TT----T---T-----TT-CA---A-A---GTTT---------ATG-C-TATA-------AAGTC-GT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-AT
gi|26 : TGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CA--TAAGC-AT-----AATC-TACCTTTACAAC---TTCGTGGG--ACAATAA-GGGTAA---ACAA-TAACA-------ATCGTAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATC-TTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCTTAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CG-CCATGGTTTATGAGTCTTTTATCA-------TCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-AAAT-TAACTCTTGCAAA--ATT-ACACAGGGGTTA-CAGA--AATTTGAATTGAAAAT--C--TTCTT-TGTCTTGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTA
gi|27 : -CCAAACCAAAA-TGC-TATTCATGTAAAGGCAAATGTAAAGGCACA--T----CT--ACACAATTAATC-AAT----A-G--------------------GACA---C-G-ATGAG-------CA-------TCT-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-CTC-C--ACAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCT----T---------TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----CAT-----A-----TA-TC---AAA-TAC-ATATTAACC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATG------AAACCT---------ACA-T------A---CAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-T-A--CGTACAG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TCAAGG-GATG-AAA----AT-----CG-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---ATTT---------ATG-C-CATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATC-ATA----
gi|28 : TAACC--AAAGGCTAATC-AT---TTTATC------AAACCT-TACAGTA--CAGTA-----AC--AAAGTAAT-TG----------------TA-TTTAATAC--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-A-AATTGTACTGGGC-A-----A-C-----------------ATG-T---GG--TACA--T-T--AAACTG-TAC--TC-AAG-GCGG-AAA----AT-----CA-G-AATCGG-C-T--A-T-----------------------------------------GTTTA-------A----C-TATA-------AAGCCCGT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATAGA--CAAGGCA-G-TTT--A-TA-ATTGAC-ATG---T--AAT-ATC-TAC-TTATATTTCGT-ATATCCGC-------A--TT---T---CA-TAAA----G-----------AA---AGTCTCAA--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCATAAACC-TT---TAA-T-AGCGATTATGT-----ATTTTT-C
gi|29 : ATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACGT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--AAGG-G-CGATC-CCAAAGCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--TAGATCT--ACACAATTAATC-AAATGCAATGC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAC-AGCTGT-TCAGCTA---AA-CTC-C--CCAATA-CAA-T-ATAC---GG-CG-GCCT----T----A----TTCCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----CTTCTTTG-TCTCGAGA-TAA-A-ATTACTC--AAga
gi|29 : AT--GCTTCGAG----AATTATC--TTCTT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAAgaatggccacgacactggaggacccttaagcag
gi|3 : atgccttttccctgatgatacttgggtaacgtttttacaattggagcatgttatactaaagggcgatcccaaagcaaaatgctattcatagatctacacaattaatcaaatgcaatgcaatggctgatgacatgatgagcatcctctgtacagctgttcagctaaactccccaatacaatatacggcggccttattcccagttt-TTTACAT-G----------TGCA---G-----------C--TT--T------C-------CCTT-T---AATGGCT-CCGAT-GCCA-------T--AC-G-GTATTG----G---AATGCTTTTCGCCTGAAT-GA--TA-CTC---GG-TAACAT-TTTT------AATA-ATAGG-GC-A-TAG---A---TATA--CTAT-AAAGAG-CG--T-CCAAACCAAAA-TCC-TATTC------------------------A-------------------AAT-----------GC----AATGG--CA--TGATGACAG--T-G-ATGAG-------CAATCTGCATCC-T-T-GTGG------T-TCGGCTACAAAA-ATA-A--CCATAA-CAA-TAA-AC---GA-TG-GTCT----T----C----TTTC-AGTTTATGCTTCGAGAATAAA-TATACTG-C-----TG-CT---CAA-TACCATATTAATC--AA-GCT--ATC-ATAAATT-ATT------AAACATACG--ATA-AAA-TA-----ATATGAGATAGT-AGA---------------CA-T--------------ATT-T-G-A-CT--G-TTA--CGTACTG--C-A-------C-----------------ATT-C---G---TA-A--T-T--AA--TT-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGC-T-T--A-T-ATAAAC-TT-TC----C---TTA---TT-CA---A-A---GTTT---------ATG-C-TATAC------AAGCT-Ggcag
gi|30 : caaggaggctgcagaggtatacaaacccccccaatcaacagctagcatggttcttgatataatcatataataattttaactcaaaagacagtaaaacaatgagccatataatgtatcatttatgatttattaattctaatgttcattgcacaactgtttaacaatgcaaaaaatttaaataaatacacatcaaaccaaatgaaataataagaaatttatatacaacacatgaatttaaaaaaacataaccacaaggttttggtcaactttctaacacagatatgtataatatgtgttgaagatataccaaattataattaatttttagagctggtgaattatttgaagaatgggtaaaaaaccgaaatttacataataattgtgaaaaatggaattacctcccctttgcaaaaatctacaaattcaaaaactgtgaaatactgtGTAA---AC-AATAACA-------ATCGTAGC-TGTCATG-G-GGTA---TAGATCTTTTT-----GT-TATTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCGTAT-CCC-CGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATGGGTTAAGAGTCTTTTATTA-------TCTTTTATGAATGAAGAATGCATACTAAGA-ACAT-TAATTCTTGCAAA--ATT-ACATCAGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAAT--C--TTCTT-TGTCTCGAGATAGAATTACT----------CAA-AAATGGCC-ACGA--TACTG-G-AGGAC
gi|32 : aGC-CGTCATT-GTGGTT---TATATCTTTTT-----AT-TGGTTTCCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCTAAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATG--------GTCTTTTGTTATCTTCTACCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-----------------TT-ACATAGGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAAT--C--TTCTT-TGTCTCGAGATGAAATAACT----------CAA-GAATGACC-ACGA--CACTG-G-AGGGC
gi|33 : ---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAC--ACC-TT---TAA-T-A-CA--TTCCG-----TATTTT-CAC-GTT-CA--------TTTTCA--TTTATT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTT--AC-TAATAC-------G-------------AGCAA--TA-A-------CGCCCCTGGGCGG--A------TAGGGTGCGTGC-GATACTTTTAA-AA---G--AACAC---TG-TAAAAT-C------ATG--CTAAAGAT-G--A-AA---G-A--A---AAG---T---C-TA-AAT--C-AAG---A--AT------GTCG--C----TCG------T-------T-
gi|34 : agtct-G---T-AT--ATA----CAATG-A---TCT--A-CA-CTT-A--ATG---TATAAT-CTCATGC-TCA---------A-ATC-GC-------C--TG---T---CAATAAA----ATGAAAAGTGCTAA---A------A--CAT---ATAA-----TTT--A-TGCATAATTGTCCTCATT-ACC-TTATCTAA-TTA-CA--TATTATTGTTACTTTC-CAC-GTT-CA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-TAAATGTA-TT---C-T-GTACT---------CTA----GTC-
gi|35 : ttAATCAGTCCCT-ATGCC-TCTGCAC-GTCGTTATGAGTACAT--GGTAACAAAAGTCGGTTAAT------T-------AATT-T---GAT--CTACCTGC-CTCGAAGATTTT--AAGG-GTACTGCTCCG---CGTCTCCTTCGCCTGA-TTGA--TAGCTTAATGGGTAA-AT-TTTT------A-CA-ATTCGAGCAA-T-GGCCA---TATAACTTA--TCAGAG-CGATT-CCAA
gi|36 : -C------ATAGCATAAAGAT-G--C-ATTTTG-ATAA---TAG---TATCC-TA-AAT--A-AAGGCTCTGAC------GTTGACT----TCA------TAAATAAAT-T-AA--TTTC---ATTT-----------GAAAAG-AA-TACC-GTTAAGTTT-AATT---TTATGACAT--TAT-GTAGAGT--------------TTAAGT---ACAAGGTT-GT--AAAA-AAGA-T-A--TTAC---CT-C---GACTAGA-----TTC--TG--TA
gi|37 : TAAT-TG----------------TACTTTAG--CGAAG-TGATTGT-G-AACT--G-T-A--CG-ACTG--C-A-----AAC-----------------ATG-T---G---TA-A--A-T--AAA-TG-TGC--TC-AGA-GATG-AAATAAGATGCA--TA-G-A--TGG-C-T--A-T-AT-----TT-TC----T---T-----TTACA---A-A---GTTAT-------AATA-CTTATAAC-----AAGCC-G---G---CTT-AGG---TAATA-ATA----CAT-G-A-G-TTC--A-TA-
gi|38 : tATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-AC-T-TAACTCTTGCGAAACATT-ATA---GAGTTAGCAATTGACTTTGAAGTGAAAATA-CG-TTCTTGTGTCTCGGACTAAAATTACT----------CGACGAATGGCCAACGAACCACTGCGCAGGAACC
gi|39 : ---G--AACAC---TG-TAAAAT-C------ACA--ATAAAGAT-G--C-AC---G-A--A---TTG---T---C-T--AAT--C-AAG---CATAT------GTCG--T----TCA------T-------T-T-AAT-TT-C---ATAA-----------CAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--GATGATATTTGCTTATGTT-AGT---ACTGG--T-GTAAAAAA-cgtt
gi|4 : TTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-G----------TGCAT--G-----------C--TT--T------T-------AC-T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTTCTG------------CCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---C---TATA--CTA--AA-GAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGT--C---TGATGATA---T-G-ATGAA-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAT---GA-CG-GCCT----T----CGATCTTTCCAGTTTGTGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-GTC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAAAAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-A-A--CGTACTG--T-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGCAA-ATC-GC-------C--T----T---CA-TAAA----A-----------GA---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--CCCTTT---TAATT-A-CA--TATTG-----ATTTTT-CACGGTT-CA--------TTTCCA--TTTACTGTC---G--C---TGTTA-T-T-AATG-AGTA--AC-T-GTACT--TTGTG--CTA----GTCTAGCAATTT--A-------CG-TCCT-GGTGG--A------TAGGGTGCATGT-GGTACTT-----AA---G---ACAC---TG-TAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---A-A--A---TAA---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATC---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------CT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TGA-TAGGCCGATCTATTAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AG
gi|40 : T--C-AAG---C--AA------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TTTC---ATTT-----------CAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-TTAAAAAATAAAA-A-A--ATAT---T-------ACT-TG-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTG
gi|44 : TTTCCAAATCAGTCC-TTACGCCCTCTGCACCG----------TTCAT--G-----------C--TT--T------T-------AA-T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------TTAG--G-GTACTG-----------CCCTTTTCCCTGA-T-GA--
gi|45 : tG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-ATA-------TTAC---C--C---GATT-GA-----TTC--AG--TAGGCCGATCTA-
gi|45 : AC---TTCGTGG-T-GCAGTAA-GGGTAA---AC-cttcgtggtgcagtaagggtaaac
gi|5 : gcttatgtaatttagtacaggtgtaaaaaaatattacccgattgattcagtaggccgatctCC-CCTATAC-A----------TGTA-------------------------------------A--T-T---GGT--CT-CCTGC-GCCA-------T--A--G-GTGCTG----G---AATGCCTT------------------CTT---GGGTAACAT-TTTTTTTTTTA-TA-ATTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--AA-GAA-TAATC-ACAAACCAAAA-TGC-TATCC------------------------A--T----CT--ACACATTTAATC-GAA----T-GC----AATGG--C---TGATG
gi|50 : ggctggagggtcatccaattttttccccaaaattcaaaaaactagcatggttacttggcataatcatatacataattttaacaccaaagacaatttaacaaaattagccatatttttatgatttattacttctaatgttattgcacataataatacataaacacataacaaaacaattcaaatacaaaccaaaccaaaaaaaaaaggcaaaacatacaataattaatatatcaaataaaaaaccatcaaaaaccaaataacaaaacataaatatcaaaaatataaggaaattttaaaaaaaatgcaattcatatataacaaaaatgaaaataaaaaaataataaccacaagatttgttcaaattttaacataaatgataatcagtatatatgttaaaatatatgaattggaattaaaaaattttgctgtgaattaagatggaatgggggaaaatgaaaatttcataaatttggctacacaaatttaattacctccctttgcagaatcttaaccgctgaaccatagacgtaaagcaaaacgtgttgctttacgtctatggctgaactgatcgttttgtaaacatgtgcatggtttAC---TTCGTGG-T-GCAGTAA-GGGTAA---AC-A--------------------C-CGTCAAT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGCTTTTCACgatgc
gi|51 : ------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AAT-TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T--C-GTTCA-TTT-AATT---TT-
gi|53 : GATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGATGT-TCGGCTA---AA-
gi|54 : ---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTAC------------TGCCTTTTCCCTGA-T-GA--c
gi|6 : GAG-------CA-------TCC-TCTCGTGGGAGCTGGGTCGGTCA---GA-CTT-CAGCCAATA-CAAATAACACCGAGATCGCACCT----T----C----TTTCCACAGTATAC--------------AT-----C-----TG-TC---AAACTAC-AAATTAAATGAAAAGCTTAATCCAT---TT-GTT------AA-CCG-TACAGTA--CA---------------ATGAA-TG----------------CA-TTTA---C--AA-TGTTG-T-GGA-CTACG-C-C--CCTACTG--CTA-----A-C-----------------ATG-CTTAA---TA-A--T-T--GC--TA-TAC--TC-AGA-GATG-AAG-----------CA-GAA--TGG-CTT--A-T-A------CT-TCCTCAC---T-----CT-CA---ACA---GTTTATGTCATGACTA-C-TACA-------AAGCC-TTTGG---CTTAA-G---T-ATTGATA----CATGG-ACG-TTTTGATTA-ATT-ACAATG-----TAAT-AT--TA--TTAT--TTT------TC-GT-------CAATA---TCAGCA-TAAAT---A-----------GA---A------AGTCAT---A--ACATATCTT--ACTG-ATA-TT----T---------TC---TCA-T-A-CG--TA----------TTTT-CAC-GTT-TGTGTGTGACCTTCTAGCCTTACT-TCAGGGC-CGGTTGTCA-TCT-AATGTAGTC--ATGC-GTAGTGAT--TA--CTA----GTC-A--AA--T--AAAAAACCCG-TCCTGGGCGGAAA------TAGGGTGGGTGCGGGTACTTTATAAAA---G--AA-AC---CG-TACAAT-TCACTCAATA--ATAAAGAT-T--C-AT---GTA--A---TAGGTCC---C-T--AAT--C-AAG---C--TT------GTC---CTCTTTCATTGAATT-------T-T-AAATTT-C---ATTT-----------GAATAG-AAGT-TC-GTTTC-TTT-ATTTGTGTG-TG-C-T--CAT-GT--AAT--------------TCAAGT---ACAGG--TCGTAAAAAA-AAAA-ATATTTTAC---C--C---GACT-GAGC---TTCGATG--TA
gi|7 : atg-TTTACAT-G----------TGCATAAG-----------C--TT--TCCCCTTT-------A--A-T---GGT--CT-CAGAT-GCAA-------C-----G-GTACTG----GG--AATGCTTTTCGCCTGAAT-GA--TA-CTC---GG-TAACAT-TTTA------A-TA-AT---AG--A-TAG---A---TATA--CTATAAAAGAG-CG-----TAAACCAAAAATCC-TATTC------------------------A-------------------AATC-GA--------C----AATGG--A---TGAT-ACAAAGT-G-ATGAGACATCTGCA-------TCC-T-T-GT----GCT---TCGGCTACAAAA-ATAAC--CCAATAACAA-TAACAT---G-----GTCT----T----C----TTTC-AGTTT-TGCTTCGAGAATAAAATATACATGC-----TG-CT---CAA-TACCATATTAATC--AA-GCTCA-TC-AT---------------AAA--T-TA--TTA-ACA-TACGAATA---AAAATAATATA----------------GA-GATA---G--AGACAATT-T-G-A-CT--G-T-A--CGTA-TG--C-A-------C-----------------ATT-C---G---TA-AA-TAT--AA--TT-TACC-TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--T-G-C-T--A-T-ATAAACCTT-TC----CTTAT-----TC-CAAACA-A---GTTT---------ATGCC-TATAC------AAGCc
gi|8 : atgaaaaaaatttaaataaccatcaaaccaaagaatattagatatatacaaaccatgaatttaaaaacatacacacaaggtctttggtcaaactttcctaacacgatagtatcaatatgtgtatgaaagatatcaacacaacatttattaccattctttatagctggtgaatatttgaagaatgggataaaacgaaaaatataattgtgaaaaatggaattactcccctttgcaaaatctaccacaaaaatgtgtcacaatcaacttC-C---TATCT-T-C-CATGTACTTTTAC-T-GTACT------------------C-AAC----T--A-------CGCTCCTGG-CGG---------TAGGATGCGTGC-GATACTT-----AACATGTCAACAC---TG-----AT-C------TTA--ATACAGTA-G--C-AC---GCA--A---TCG---T---CCTA-AACG-C-AAG---C--AT-------TCG--CG---TTA------T-------TAT-AG--TT-CTC-ATT------------GAAAAG-GA-T-TCTGTTCA-TTT-G---------CG-CGT--TAT-GT--GAT--------------TT--GT---AC-GG--T-GAAAAAAA-AAAA-A-A--
gi|8 : catttaaatattacTAAAAAA-GAAT-T-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-T-------G--TC-G-TAGTATT--GATGTAC-AG------------------GTGC----TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAG---TGTAGAATTCGT-CACGAGCCTC-TA-TGT---AGA----TGCTGAT-GAAA-AAG-CA-ATCG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CA-CA--Taaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaataaaaaagaattattacccgactgattctgtaggccgatctatgtcgtagtattgatgtacaggtgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgtagaattcgtcacgagcctctatgtagatgctgatgaaaaagcaatcgcttgtagaggtgccatctttttcacattcataataacaatcgcagccgccattgtggttgagtagatctttttggtgtttttcacttatagatcgcccgttcttatctggggattttgtttatctgagtcttttattatcttctatgtatgaagagtgcatactaagaacattaactgttgcgaaattacataggagttacaatacttggaagtgaaaatattctttgtcgcgagataaaattactcaagaatggcaacgacactgaagaaccct
gi|8 : catttaaatattaccctatcttccatgtacttttactgtactcaactacgctcctggcggtaggatgcgtgcgatacttaacatgtcaacactgatcttaatacagtagcacgcaatcgtcctaaacgcaagcattcgcgttattatagttctcattgaaaaggattctgttcatttgcgcgttatgtgatttgtacggtgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaa-A-TAACA-------ATCGCAGC-CGCCATT-GTGGTTGAGTAGATCTTTTT-----GG-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCTTAT-CTG-GGGATTT-------------------TGT-TTATCT------------------GAGTCTTTTATTAT-------CTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTGTTGCGAA--ATT-ACATAGGAGTTA-CAAT--ACTTGGAAGTGAAAATA----TTCTT-TGTCGCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCA-ACGA--CACTG-A-AGAACCCTtcataataacaatcgcagccgccattgtggttgagtagatctttttggtgtttttcacttatagatcgcccgttcttatctggggattttgtttatctgagtcttttattatcttctatgtatgaagagtgcatactaagaacattaactgttgcgaaattacataggagttacaatacttggaagtgaaaatattctttgtcgcgagataaaattactcaagaatggcaacgacactgaagaaccct
gi|9 : catttaaatattaccctatcttccatgtacttttactgtactcaactacgctcctggcggtaggatgcgtgcgatacttaacatgtcaacactgatcttaatacagtagcacgcaatcgtcctaaacgcaagcattcgcgttattatagttctcattgaaaaggattctgttcatttgcgcgttatgtgatttgtacggtgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaataaaaaagaattattacccgactgattctgtaggccgatctatgtcgtagtattgatgtacaggtgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgtagaattcgtcacgagcctctatgtagatgctgatgaaaaagcaatcgcttgtagaggtgccatctttttcacattcata-TTTACAT-G----------TGCAT--G-----------C--TT--T------CCCCTGTAA--T-T---GGT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--A-GTATTG----G---AATGCCTTTTCCATGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAA-TTTT------A-CA-ACTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CT
blockSeqs : C T C C C TCGTTATGAG TAA GTAACAAAAGTCGGTTAATTAAT A AGG GG A T AAGATTTTAAG C CTCCGCG A T AA G TAAT A TTTTTT A T A A A TCTG AC TA A A T A A ATGTAAAGGCAAATGTAAAGGCACAT CT A TGCAAT TATC CAAT AAG . C ACATCTG ATCTGCA T C C A G G CAA CA A AG A A CGA T C TCGA TCGAC T AAAA ACATG TTCTT T TCG C CC GA C TAAA T AACGGT A CAGT C G ACGAATA A NNNNNNNNNNNNNNNT T ATA GA A G G G A AC AAAT GG T CCAGCA ACTATAAACGAGTTACG G TTA GGA C AT A TA AC A TA A G T TAAG ATCTG T A AT T T TA C G TAAACC A CTACATG A AAC C TAG ATGTCATG C T CACCATA C TG GGT A G GTA A TC TAAT CA A TG T T G CA AACTT A A A AT GTAT C ATGAGATCTGACAT A ATGAAAAGTGCTAAA GT TTC TA CATAT TA C C A GTCC T AA T ATC T T G AT TTATTGTTAC G G T TGTGTGAC GC G AGG T GGT C C A G TT G A GATTACTAGTCAAATAAAAAACCCG ATCATAT G G TATAA CAT TC ATC G T CACTCA GC T GC A TTTGATAATAGTATC C AT GC A GCT ATTCTATG CTCTT TTGAAT AAATAAA A T AT TTCA TCATATTGAGA T G AC T G C AC GTG A A TAA A CT GATATTTGCTTATG A TCA GT C T ATA TT ATA TCAA A AACAT GA AT C T A TT GT T C A TA C T CANNNNNNNNNNNNN GACG CGTAAATT T A G AAG G T G A AGGCCGA TC C T T GTCTCGAT GCAT T C GC G T A AT C TACTG A C A AAC GG AA TTA G AT TACGGAC AG T T GAG TGTCT . C G C G T C C ACG T C CCA A GG TCTTCTAC C C CTC AC T TT G TG ATAA G ACTATCTACT C A AC C C
blockSeqs : . . T . . . A CTTTCCCCTTTAA . . . . . TTAG . GGTTAA A . . G T . . . . . . A GCCA . T A . . . . ATAGAT . . T . CCC G . . . . . C . A . . CAA C . . . . . . . . CGATC T AAA ACTG . . . . CC . . T . . . CAGT . . AATAT . A T G . . . . . . . AAA . . AA . . . G . A . . C . C . . . T GCA . . . . . . . . TAAAC . CTCACT . . . . CT . . AC . . . . . . . TG GA AC . . . . . C TAT . . . . GTAT . CAATATCAG . TAGCAGATCTA . . . . . . . . . A T . . . . . . ATGTA . . . . . . . . . . . . G . . . TTGTGCTAGTCTAGCAATTTACG GGA G . TTAA . . . . . . . . . . GAGATTTAGGTT . A TC . . TGAC CCG . . . A T CTC . . . C . . . AT . A . AT . AG . A . . . . AAT . . GGC . GC . A C . A T C . A . . . G CTNNNNNNN NNNN NNAATTAA C G T . . . . . GATAGG T . . C . . T . . . . . . . . . T T . GC G C A T TG CT . . . . . . . . G . . . . . . . . GG T . . TTC . . CA . . ATC . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . T CTTTCCCCTGTAA . . . . . TAC . GGAA . . . . T . . . . . . . T . . A . . . . ATCT . . A . CC . . . . . . C . A . . . A . . . . . . . . CGA T . . . . . . C . . A . . . CAT . . AAC . . C . . . . . . . . TTA . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . AT . CTTAT . . . . AT . . C . . . . . . . A . A . . . . . C TA . . . . GCAA . ATAG . GAAAGTCTCA . . . . . . . . . C . . . . . . . TGTAT . . . . . . . . . . . . G . . . TTGCTAACATGTCGCAATAC AAA A . . . . . . . . . . . . GTAATAGGTCC . A G . . ATAT ACT . . . . T TC . . . C . . . AT . . . GT . . . . . . . . AT . . TC . . . . C . A T . . . . . . G GCGGCAG NNNN NNNNNNNN A T A . . . . . AGA T . . . . . G . . . . . . . . . T A . G A . A T . AA . . . . . . . . T . . . . . . . . AT T . . CTC . . TC . . ACG . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . T CTTTCCCCTTTA . . . . . TA . GAA . . . . T . . . . . . . C . . G . . . . ATGG . . A . CA . . . . . . T . A . . . C . . . . . . . . C T . . . . . . C . . T . . . GT . . AA . . . . . . . . . . . TA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . CTTA . . . . A . . C . . . . . . . T . A . . . . . C TT . . . . G . ATTT . GTCTA . . . . . . . . . C . . . . . . . CCGTA . . . . . . . . . . . . G . . . GAGCAATAACGC A G . . . . . . . . . . . . GAAATAGA . A . . . ATA TC . . . . . TC . . . C . . . AT . . . T . . . . . . . . AA . . C . . . . C . A T . . . . . . . . . ACAT N N N . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . T . . G A . . T . GT . . . . . . . . T . . . . . . . . GT T . . CTG . . TA . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T CTTTCCCT . . . . . TA . GAA . . . . T . . . . . . . T . . A . . . . AT . . A . C . . . . . . T . A . . . A . . . . . . . . C T . . . . . . A . . T . . . GT . . AA . . . . . . . . . . . TC . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . TT . . . . A . . . . . . . . . . C . A . . . . . . T . . . . A . CTGT . TAGAA . . . . . . . . . C . . . . . . . TTGAT . . . . . . . . . . . . C . . . AGCAATACA A G . . . . . . . . . . . . AAATTATT . A . . . AT CG . . . . . C . . . C . . . AT . . . T . . . . . . . . AT . . C . . . . C . . . . . . . . . . G . . . . . . . T A . . T . GT . . . . . . . . G . . . . . . . . GG T . . . . . TA . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T CTTTTAA . . . . . TA . GAA . . . . T . . . . . . . A . . A . . . . AT . . A . C . . . . . . C . A . . . A . . . . . . . . C T . . . . . . C . . T . . . AT . . AA . . . . . . . . . . . TA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . T . . . . . . . . . . T . A . . . . . . T . . . . . . CTT . AGAA . . . . . . . . . C . . . . . . . CAT . . . . . . . . . . . . . . . . CAACTACGC . . . . . . . . . . . . . . GCAATCGT . A . . . AT C . . . . . T . . . C . . . AT . . . T . . . . . . . . AA . . C . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . GC . . . . . . . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . T CTTTTAC . . . . . TA . GAA . . . . C . . . . . . . A . . A . . . . AT . . A . C . . . . . . C . G . . . C . . . . . . . . C T . . . . . . C . . T . . . GT . . A . . . . . . . . . . . TA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . A . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AATATAT . A . . . AT T . . . . . C . . . T . . . AT . . . T . . . . . . . . AA . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . T . A . . . .
blockSeqs : . . . T CTTTTAA . . . . . TA . GAA . . . . T . . . . . . . T . . . . . . . AT . . A . C . . . . . . C . A . . . C . . . . . . . . A T . . . . . . A . . T . . . TT . . A . . . . . . . . . . . AA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . GAAAAGT . . . . . AA C . . . . . C . . . T . . . TT . . . T . . . . . . . . AA . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T CTTTAA . . . . . TA . G . . . . T . . . . . . . T . . . . . . . AT . . A . C . . . . . . C . A . . . A . . . . . . . . C T . . . . . . C . . T . . . G . . A . . . . . . . . . . . CC . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAATTGT . . . . . TT T . . . . . C . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . TT . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TTTAAA . . . . . TA . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . AT . . T . C . . . . . . C . G . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . C . . T . . . G . . A . . . . . . . . . . . TA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . AAATAAT . . . . . AT C . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . CTTTTA . . . . . TA . . . . . . T . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TCAAA . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : CTTTTAA***************************** TA*********** C******** AA******** GA*** CTAT*************** GAAATCTA******************** TTGGATGCAATAACGC************************* A******** GCGGCAG******** AGG******* N** T*******
originalCons : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-G----------TGCAT--G-----------C--TT--T------T-------A--T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---N---TATA--CTA--AAAGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-N-A--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGC-A-ATC-GC-------C--TG---T---CA-TAAA----A-----------GA---A------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--ACC-TT---TAA-T-A-CG--TATTG-----ATTTTT-CAC-GTT-CA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTT--AC-T-GTACT--T--TG--CTA----GTC-AGCAA--T--A-------CG-TCCTGGGCGG--A------TAGGGTGCGTGC-GGTACTT-----AA---G--AACAC---TG-TAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---G-A--A---TAG---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGC------TGCGGCAGGTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGCCGNAANATATAANANAANAG---GGTC-AATTCGT-CACGAGCCCC-TA-TGT---AGG----TGCTGAT-GAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CA--TAAGC-AT-----GATC-TACCTTTACAAC---TTCGTGGGC-GCAGTAA-GGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGTAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCNTAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT------TCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTCTTGCGAA--ATT-ACATNGGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAATA-C--TTCTT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
finalCons : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-G----------TGCAT--GCTTTTAA-----------------------------T-T---GAT--CT-CCTGT-GCCATA-----------G-GTACTG----G---AATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---N---TATA--CTA--AAAGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCT----TC--------TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TAA--------AAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-N-A--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATG-T---G---TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT-TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-TATA-------AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGA---ATC-GCCTAT---------------CA-TAAAGAAATCTA--------------------A--CAT---A--A-----TTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--ACC-TT---TAA-T-A-CG--TATTG-----ATTTTT-CAC-GTT-CA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGTT--AC-T-GTACTTTGGATGCAATAACGC-------------------------TCCTGGGCGGA--------TAGGGTGCGTGC-GGTACTT-----AA---G--AACAC---TG-TAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---G-A--A---TAG---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGGCGGCAG--------GTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGCCGNAANATATAANANAANAG---GGTC-AATTCGT-CACGAGCCCC-TA-TGTAGG-------TGCTGAT-GAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CA--TAAGC-AT-----GATC-TACCTTTACAAC---TTCGTGGN--GCAGTAA-GGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGTAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCNTAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTAT-------CTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTCTTGCGAA--ATT-ACATNGGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAATA-C--TTCTT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
14 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TAAGGAGGGCGTGAAGCCAGGGATCAGTCCAATTTTCTTTTTCCAATTTCACACAACAGCAATGTTGGTTTACTTGAATGAATAAGTATCCAATGGTGAATATCTTAACTAAAATCAAAGACATACAAATAGCCATATTTTTTATGATTTATTACTCTAATGTTATTGCACATAATGTTACTGACGAACCACATAGGAAAAAGACAATGTTGGTGTAAATGCAAAACAAACAAAGAACGAAATTGGGAAATAATTATCATAACAATTATAAATATATATAAATTTGTAAAAAACAAAAATCCATCAAAACAGCATAACAAGATAAATAATATATCAGAAATATATAACCGAATATTAAAAAAAAAATAATGCAATTCAGTTTATAGTATAAGACAAAAAATGAAAATTTAAAAAATTAATAAACACACAGATTTTGTTCAATTATTAAACATATAGTTAATCAGTATTATGTTATATGATAATATATCAATTAGAATTTTTTAAAAAAAAAAATTGGCTGAGTGAATTTTGAAAGAATGGAAAAACAAAATGAAATTGTACTAATGTTGTAGGACATTGCAGCTATGTAAACTTAAATTACC
Unaligned ( gi|13 ): AAGGCTGGAGAGTCATCCAATTTTTTTTCCAAAATTTACAAAACTAGCATGGTTACTTGGCATAATCATATACATAATTTTAACATCAAAGACAATAACAAAATTAGCCATATTTTTATGATTTATTACTTCTAATGTCATTGCACATAATGTTGCATGAAGAAAAACCAAAAACAATTTAAATACAAAACAAATCAAGAAATTGGTAAAATACATAACAATAATACTATATCAAATAAAAAACACCATCAAAACCAAATAAAACATAAATATCAAAAGTTATTTGAATATTTAAAAAAAAATGCCAATTCATATATGTATAACAAAAATTAAAATAAAAAAAATATAACCACAAGATTTTGTTCAAATTTTAACATAATAGTAATCAGTATATGTATGAAATATATCAATTAGAATTCAATTTTTTTGCTGGTGAATTTTGAAGAATGGGGAAAAATTACATAATATTAGCTGCAAATTAATTACCTCCCTTTGCAGAATCTAAAACATGGTTACAAACAGCTGAACTAATCTTTTTAC
Unaligned ( gi|14 ): AAGGCTGGAGAGTCTCCACTTTTTTTCGCAAAATTTACAAAACTAGCATGGTTATTGGCAGAATCATATACATAATTTAATAACATCCAAGAACAATACAAAAATTAAGCCATATTTTTATGATTTATTACTTCTAATGTCATTGCAACATAATGTTGCATGAAGAAAACCAAAAAACAATTTAAATACAAACAAATCAAGAAATTGGTAAATACATAACAATAATACTATATCAAAATAAAAACCCATTCAAACCAAATAAAAACATAAATATCAAAAGTATTTGACTATAAAAAAAAAATGCAATTCATATATGTTATAAAAAAATATAAATAAAAAATAATAACCACAAGAATTTTGTTCAAATTTTAACATAATAGTATCAGTATATGTATGAAATATATCAATTAGAATTCAATTTTTGCTGGTGAATTGAAGAATGGGGAAAAATTACAATAATATTAGCTGCAAAATTAATTACCTCCCTTTGCAGAATCTTAAAACATGGTTACAAACACTGAACTAAT
Unaligned ( gi|15 ): GGGCTGGAGGCGTCATCAATTTTTTTCTCTCCAAAAATTCATAAAGCTAGGCATGGTTACTTGGCATAATCTATACATAATTTAAACATCCAAAGACATAACCAAATTAGCCATATTTTTATGATTTATTACTCTAATTGTTATTGCACATAATGTTACATGAAACACATGGCAAAAACAATTTAATACATAAAAAAACAAAGAAATAGGCCAAAATAACATAACAATAATAAATATATCAAATAAAAAAAACCATTCAAACCAAAAATAACAAAATATTAAATATAAAAGTTTAAGTATATTTTAAAAAAAATGCCAATTCATATATATAACAAAAATTGAAAAAAAAAAAAATAATAATAACCACAGATTTTGTCAATTTTAAAATAATGGTAATCAGTATATGTATAAAATTTATCAATTTTAGAATTGAAATTTTTTGGCTGGTGAATTTTAAAGAAATGGGGAAAAAATTGAATTTACATAAT
Unaligned ( gi|16 ): AATTTTTTCTCTCCAAAATTCATAAAGCTAGCATGGTTACTTGGCATAATCATATACATAATTTTAACATCAAAGACAATAACAAAATTAGCCATATTTTTATGATTTATTACTTCTAATGTTATTGCACATAATGTTACATGAACACATGGCAAAAACAATTTAAATACATAAAAAAACAAAGAAATAGGCAAAATACATAACAATAATAATATATCAAATAAAAAAACCATCAAAACCAAATAACAAAATATAAATATAAAAAGTATAAGTATATTTAAAAAAAAATGCAATTCATATATATAACAAAAATGAAAAAAAAAAAAATAATAATAACCACAAGATTTTGTTCAAATTTTAAAATAATGGTAATCAGTATATGTATAAAATATATCAATTAGAATTGAATTTTTTGGCTGGTGAATTTTAAAGAAATGGGGAAAAAATGAAATTTACATAAT
Unaligned ( gi|31 ): TAAGGAGGCTGGAGGGTCATCCAAGCCCCCCCCCCCAACAATAAAACCAGATGGTTACTTGGATAATATATACATAATTAAACACCAAAGACAATAACAAAATTAGCCATATTTTCTATTATTTATTTTATTTCTAATTTATTGCACATAATGTTACATGAACACATAACAATAAAATTTAAATACAATCCAAACAAAAAAGGCAAAGTACATAACAATAATAATATATCAAATTTAAAAAAAAAACCATCAAAATTAAAT
Unaligned ( gi|41 ): GAGGTTGGAGGGTCATCAATTTTTTTTTTTCTAAAATTTATAAAAACTAGCATGGTTACTTGGCATAATATATATACATGGTTTTAGCATCAAAGACAATAACAACATTAGCCATATTTTTATGATTT
Unaligned ( gi|42 ): AAGGAGGCTGGGGGTCATTTATTTTTTTTCAAAATTCATAAAACTAGCATGGTTATTTGATATAATCATACACACCATATTGACATCAAAGACAGTGACAAAATTAGCCATATTTTCATGATTTATT
Unaligned ( gi|43 ): ATTTTGAAGAATGGGGAAAAAAATAAAATTCACCATAACATTAGCTGCAAAATTAATAACCTCCCTTTGCAGAATCTATTGAAACATGGTTACAAACAGTTGAACGAATATTTTTACT
Unaligned ( gi|46 ): AAATATTAGAAATATAACAATATTTTTTTTAAGATATAACAAAAATGAAAATTAAAAAATAACCACAAGATTTTGTTCAAATTTT
Unaligned ( gi|47 ): TTCGCTGCAAAATTAAATTACCTCCCTTTGCAGAATTTCTAAAACATTGTTACAAATAGATAGACTGAAACTAATATCTTTATA
Unaligned ( gi|48 ): GCTGCAAAATTAATTACCTCCCTTTGCAGAATCTAAAACATTGGTTACAAATAGATAGCTGAACTAATATCTTTATA
Unaligned ( gi|49 ): TGAATTTTGAAGAATGGGGGAAAAAATAAACATTTACACAATATTATCTGCAAAATTAATTACCTCCATTTGCAGAA
Unaligned ( gi|52 ): AAACCATAGATGTAAAGTAAAGCTTTACGTCTATGATTAAACT
Alignments
lowQualScore : 1111111111 11111111111111 444444444444 1111111111111 2222222222 1111111 1 33333333333333333333333333333333 111 111111111 1111 11111 1111 2222222222 2222222222222222 111111 11111111111111111 11111 2222222222222222222222222222 22222222 1111111 11 11 1111 11 111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 1111 11 2222222222 22222222 111 111111111 999999999999999999999999999999999 222222222 22222 111111 1111111111111111111111 11 1111111111 1111111 1111111 11 11111 11111111111 11111111111111 111111 11111 11 1 44444444444444444 1111111 111 2222222222 1 22222222 1111 22222 111 111 11 2222222 11111 1111111 33333 2222222222
lowQualScore : 5 5 6 3 3 4444444444 44 66666666666666 33 666666666666 2 22 333 2 2 4444444444444 2 7777777777 5 2 33 5 5555 0 2 888888 2 2 2 2 5 0000000 33 66 3 2 2 2 2 33333333333333333333333333333333 33 3 888888 6666 999999 0 888 3 3 9999999 9999999 2 1 2 1 2 2 000 33 3 44 3 3 555 3 3 6666 999999999 2 1111 44444 77777 3 555 3 77 33 3 5555 3 888888 3 2222 3 3 2222222222 2 1111111111111111 8 777 33 2 2 2 2 2 33 666666 33 2 6666666 88888888888888888 2 999 2 2 66 2 33 99 2 66 2 2 2 8888 11111 2 2 33 2 2 33 2 4444444444444444444444444444 3 555 3 555 99999999 0 3 3 0000000 11 3 55 777 4 3 666 3 00 4444 555 4 66 4 4 5 00 333333 5 5 5 77 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0000 888 66 5 5 5 0000 1 11 5 888 5 5 5 66 5555555555 5 5 5 00000000 77 5 000 5 888 5 5 5 5 555555555 5 66 333333333333333333333333333333333 77 222222222 1 5 66666 888 66 4 777 4 111111 55 3 55 3 6666666666666666666666 3 88 22 3 555 2222222222 4444444 888888 0000000 3 7 22 11111 77777777777 3 3 55 3 3 3 11 555 6 3 8888 3 99 99999999999999 6 555 44 3 0 3 9999 44 666 111111 3 44444 55 88 2 5 1 66 11 5 0 5 66 5 0 55555555555555555 1 5555555 1 1 1 444 8 8 0 8 8 0000000000 88 8 8 6 99999999 4444 1 6 99 6 6 6 99 8 00000 8 3 1 000 888 3 55 333 8 33 3333333 22 4 4 777 00000 4 5 5 5 1 5 5 5 888 5 0 5 888 5 33 0 5 6666666 5 5 333 0 77 5 33 5 66 00000 5 1111111111 5 5 77 5 5
lowQualScore : . . . . . .......... .. .............. .. ............ . .. ... . . ............. . .......... . . .. . .... . . ...... . . . . . ....... .. .. . . . . . ................................ .. . ...... .... ...... . ... . . ....... ....... . . . . . . ... .. . .. . . ... . . .... ......... . .... ..... ..... . ... . .. .. . .... . ...... . .... . . .......... . ................ . ... .. . . . . . .. ...... .. . ....... ................. . ... . . .. . .. .. . .. . . . .... ..... . . .. . . .. . ............................ . ... . ... ........ . . . ....... .. . .. ... . . ... . .. .... ... . .. . . . .. ...... . . . .. ......................................................... .... ... .. . . . .... . .. . ... . . . .. .......... . . . ........ .. . ... . ... . . . . ......... . .. ................................. .. ......... . . ..... ... .. . ... . ...... .. . .. . ...................... . .. .. . ... .......... ....... ...... ....... . . .. ..... ........... . . .. . . . .. ... . . .... . .. .............. . ... .. . . . .... .. ... ...... . ..... .. .. . . . .. .. . . . .. . . ................. . ....... . . . ... . . . . . .......... .. . . . ........ .... . . .. . . . .. . ..... . . . ... ... . .. ... . .. ....... .. . . ... ..... . . . . . . . . ... . . . ... . .. . . ....... . . ... . .. . .. . .. ..... . .......... . . .. . .
lowQualScore : 7 7 6 6 3 6666666666 22 44444444444444 99 444444444444 9 99 999 7 7 1111111111111 7 6666666666 0 5 44 7 1111 7 9 222222 9 9 7 7 3 3333333 77 88 1 9 7 9 9 99999999999999999999999999999999 99 1 333333 5555 666666 7 555 1 1 3333333 3333333 9 2 9 9 9 9 000 11 1 22 1 1 444 1 1 5555 666666666 3 9999 22222 77777 1 444 1 77 99 1 9999 1 888888 1 0000 1 1 5555555555 9 8888888888888888 6 999 99 9 7 7 7 7 77 999999 77 7 9999999 77777777777777777 7 333 7 7 33 7 77 00 7 33 7 7 7 3333 33333 7 7 77 9 9 99 9 2222222222222222222222222222 1 888 3 888 00000000 3 3 3 8888888 22 6 55 000 0 6 444 6 66 0000 333 4 11 4 4 7 00 444444 0 0 7 99 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 6666 888 99 0 0 0 6666 4 99 0 888 0 0 0 99 9999999999 0 7 7 77777777 99 7 000 0 888 0 0 0 6 555555555 0 99 555555555555555555555555555555555 99 333333333 7 7 44444 888 99 4 888 0 555555 55 6 00 6 2222222222222222222222 6 00 55 3 888 8888888888 8888888 888888 0000000 3 3 33 55555 33333333333 6 6 66 3 3 3 77 888 7 3 3333 3 22 66666666666666 7 888 66 3 5 1 5555 66 444 000000 6 11111 00 66 5 0 4 44 99 0 0 0 99 7 8 88888888888888888 0 6666666 0 0 0 000 0 0 4 0 0 0000000000 88 0 0 0 00000000 2222 0 7 22 7 7 7 22 0 00000 0 8 0 000 999 0 99 888 9 22 1111111 44 0 0 000 00000 0 0 0 0 0 0 0 0 888 0 1 0 888 0 99 2 0 2222222 7 7 999 4 99 7 11 7 99 66666 0 9999999999 0 0 99 7 7
consensus : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-GT----------GCAT--G-----------C--TT--T------------TA-ATT-GG--TCT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---N---TATA--CTA--AAAGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-N-A--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------AT-GT---G-TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT--TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-T-------ATA--AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTG--A---------AT---C-GCC--TAT---CA-TA---A--A--GAAA--T-C-T-AA----CA---TAATTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--ACC-TT---TAA-T-A-CG--TATTG-----ATTTTT-CAC-G-TTCA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGT------T--ACT-G--TACT--TTG-------GNT------GCAA-TNACGC-TCCTGGGC--GG--A------TAGGGTGCGTGC-GGTACTT-----AA---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---G-A--A---TAG---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGCTGCGGCAGGTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGCCGAA---ANATATAANANAANAG---GGTC-AATTCGT-CACGAGCCCC-TA-TGT---AGG----TGCTGAT-GAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CA--TAAGC-AT-----GATC-TACCTTTACAAC---TTCGTGG--NGCAGTAA-GGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGTAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCNTAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTA-T-------CTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTCTTGCGAA--ATT-ACATNGGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAATA-C--TTCTT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
Reference ( family-2937 ) : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-GT----------GCAT--G-----------C--TT--T------------TA-ATT-GA--TCT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---N---TATA--CTA--AAAGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-N-A--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------AT-GT---G-TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT--TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-T-------ATA--AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTG--A---------AT---C-GCC--TAT---CA-TA---A--A--GAAA--T-C-T-AA----CA---TAATTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--ACC-TT---TAA-T-A-CG--TATTG-----ATTTTT-CAC-G-TTCA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGT------T--ACT-G--TACT--TTG-------GAT------GCAA-TAACGC-TCCTGGGC--GG--A------TAGGGTGCGTGC-GGTACTT-----AA---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---G-A--A---TAG---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTG--GCGGCAGGTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGCCGNA---ANATATAANANAANAG---GGTC-AATTCGT-CACGAGCCCC-TA-TGT---AGG----TGCTGAT-GAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CA--TAAGC-AT-----GATC-TACCTTTACAAC---TTCGTGG--NGCAGTAA-GGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGTAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCNTAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTA-T-------CTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTCTTGCGAA--ATT-ACATNGGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAATA-C--TTCTT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
gi|1 : TTTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-GT----------GCAT--G-----------C--TT--T------------TA--CT-GA--TCT-CCTGT-GCCA-------T-----G-GTTCT-----------TGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GG-TAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---C---TATA--CTA--AAAGAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGT--C---TGATGATA---TTG-ATGAA-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAT---GA-CG-GCCT----T----CGATCTTTCCAGTTTGTGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-GTC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAAAAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-A-A--CGTACTG--T-A-----A-C-----------------AT-GT---G-TA-A--T-T--AA--TG-TTC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT--TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-T-------ATA--AAGCC-GT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGC-A---------AT---T-GCC--T-T---CA-TA---A--A--AGA---------AA----CA---TAATTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--CCC-TT---TAA-T-A-CA--TATTG-----ATTTTT-CAC-G-TTCA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGT------T--ACT-G--TACT--TTGT------GCTAGTCTAGCAATTTACG--TCCTGGGT--GG--A------TAGGGTGCATGT-GGTACTT-----AA---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---A-A--A---TAA---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATC---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------CT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNNT-TC-TGT---AGG----TGCTGAT-GAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AAA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CA-CA--TAAGC-AT-----GATC-TACC-TTACAAC---TTCGTGGGCAGTAGTAA-GGGTAA---AC-A-TAACA-------ATCGTAGC-TGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GTGTGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCGCAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-T----T-TTATCTT---CA-CCATGGGTTATGAGTCTTTTATTATT-------CTTTTATGTATGAAGAGTGCATATTAAGA-ACAT-TAACTTTTGCGAA--ATT-ACATTAGAGTTA-CGAT--ACTTTGAAGTGAAAAT--C--T--CT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAA
gi|10 : C-ATTGA-TTT-AACT---TT-TG-C-T--TAT-GTCTAAT--------------TT-AGTTCAACAGG--T-GTAAAAAC-ATA-------TTAC---CGGC---ACCT-GGAACATTTC--GG--TGG--CGATCTG--AGTACTTGC-TT-G-TGGT-TTTAGGTGAAC-CGTTG--GCGGCAGGTGCGACGTACTCTTGTCTTTTGCGCTACCCCGTCTATCTCTTATAAATGCCGTA---AATTATAATAAGAGAG---GGTC-AATTCGT-CACGAGCACT-TG-TGTGATAGG----TGCTGATCGAAACAATTCATATTGGTCTCGATCTTGTGCATATA-GGTGGCCCGATCTTTTTTCGACA--TAAG--ATTACTGGATAATACCCTTA--AC---TTCGTGG--GGGCGTAAAGGGTAATTAAT-A--AACATG-----ATCAGAGCTCGCCATTTGTGAGT---TGTATTTTTTTTGTCTGT-TGTTTT-CACTAACT-AGATC-GTC-GTTCGTAT-TCG-GGGATTTCTCACTTCACGACGC-TTTTGTCTTATCTT---CAACCATGGGTTATGAGTCTTTTATTA-T-------CTTCTATGTAAGAGAAG-GCATACGAAGACACATCTAA---TTGCAAA--CTTTACATTG-AGTTA-CACT----TTTGAAGTGATAATA-TAATTCTT-TGT-TCG-GATAGAATTACTACTATCTACTCTA-TAATGGCC-ACG
gi|12 : t-T---GTAAAATTC------ATA--ATAAACGT-GGCC-AC---A-AT-A---TA----T---C-TA-AAT--C-AAG---C--ATA-----GTCG--CCG--TCA------T-------T-TTAA--TT-TTCAAATT-----------GAAA-G-AA-T-CC-GCTAA-TTT-A---------------------GT--AA------------------------ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-T-A--TTAC---C--C---GAGT-GA-----TTC--TGATTAGGCCGAT-TA-TAGTAAT-GGTCC-GCTAGT-TT--GGTGAACCAGGTGCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA---TTAAATAACAGAATAGAAGGGTC-AATTCGTTCACGAGCCGCGTAATGT-----G----TGCTGA--GGAA-AAT-CACATTC--------CTTGT----ATACGGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CGATTAAGCCAT-----GATC-TAC-TTTACAACAACTTCTGGG--CG-AGTA--GGGTAAC--ACGA-TAACATACGGACATGCTAGC-TGTCAT--GTGGTT----AGATCTTTTT-----GT-TGTCTTTCACTTA-TGAGATCCGCCCGTTCGTATTCTCCGGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTTCCACA-CCAGTGGTTATGAGT-TCTTATCA-T-------CTTCTATGTGT
gi|17 : g-----------C--CT--T------------TA-ATT-GG--TCT-CATGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCTTTTTCCTTGA-T-GA--CA-GTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--AA-GAG-CGACC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--GCTTAATTAATC-AAA----T-GC----AATGG--C---TGATGATA---T-G-ATGAG-------CA-------T-------GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-CTC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CA-ACCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATCAACGGTAAACCT-T-------ACA-T------A---CAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-A-A-CT--G-T-A--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------AT-GT---G-TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TT-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGA-C-T-----------------------------------------A-A---GTTTA-------AA---C-T-------ATA--AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-AT
gi|18 : ttaattacctccctttgcagaatctaaaaactgaactaatcttgctttcc-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGT-AT--------AT---C-ACA--TAG---CA-TA---A--A--G-----T-C-T-AA----CA---TAATTT--A-TG-ATA-TT----TTAT--ACC-TT---TAA-T-A-CA--TCATG-----TATTTT-CAT-G-TTCA--------TTTTCA--TTTACT-TC---AC-C---TGTCT-T-T-AATGTAGT------T--ACT-G--TACT-------------A-------GCAA-T-ACA--TTATGGGC--GG--ATCATATTAGGGTGCGTGC-GGTACTG-----AA---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------GTA--ATAAAGAT-G--C-AC---GAA--A---TAG---A---C-TA-AATGCT-AAT---C--AT------GTCGT-C----TCA------T-------T-TAAA--TT-C---ATTT-----------AAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AA-T---TT-TG-C----TATAGT--AAT--------------TT-AGT---ACGTG--T-GT-------GAAA-A-A--TTATATAC--C---GACT-GA------TC--TG--TA-GCCTAT-TA-TAGT-C-----TC-GATAGT-TT--GGTGAAC-AG
gi|19 : agagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTTTCAA--TCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-GT----------GCAA--G-----------C--TT--T------------TA-ATT-GA--TCT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-ATACTG------------CCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---C---TATA--CTA--AA-GAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GCTATCAATAG--CAATTAATCAAA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCA-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCT----T----CGA--TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AA---TT-ATC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTCA---C--AG-TGATT-T-G-A-CG--GAA-A--CGTAATG--C-A-----A-C-----------------AT-GT---G-TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GTTG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT--TC----T---T-----TT-
gi|2 : -TTTACAT-GT----------GCAT--G-----------C--TT--TCCCCTT------TA-ATT-GG--TAT-CCTGT-GTCA-------T--A--G-GTACTG----G---AATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CAT---GGGTAACAT-TTTC------A-CA-ATTTGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--TA-GAG-CGATC-CCAAAACAAAA-CGAATA---------------------------------------GCACAAT----C-AAA----A-GC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-CTC-C--CCAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-ACCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAA-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATT-------AACCT-TAC-ATACAAA-TA-----A---NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNTCA-TTTA---C--AG-TAATT-TGG-A-CT--G-T-C--TTTATTA--C-ACCAGCA-CACTATAAACGAGTTACGAT-GT---G-TA-AATT-T--AA--TG-TACTATC-AGAGGATGTAAT----ATATCTGCATG-A--TGA-C-T--ACT-A------AT--TC----C---TACATGTG-CA---A-ATAGGTTTCT------ACTG-C-T-------ATA--AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATTCATATAATCATGG---G-TAT--A-TATCTC-AC-CTAAACT-TAATAATC-TA
gi|2 : caatttaaatgcaaaacaaacaaagaaatgggaaaaatacataaaaattataatatataaaattaaaaaaaaaacaacatcaaaaccaaataacaaaaaataaatatcaaaaatataagaatatttaaaaaaaaatgcaattcatatataagacaaaaatgaaaatttaaaaaataataaccacaagattttgttcaaattttaacataatagtaatcagtatatgtataaaatatatcaattagaatttttaaaaaaaaaattgctggtgaattttgaagaatggaaaacaaatgaaatttacataatgttagctgcaaacttaattacctccctttgtggaatctaaattaaaaacatggttataaacagctgaactaatcttAAAGATTG--C-AC---G-A--GATTTAGGT-T---C-TATAACTCC-AAC---C--ATTCTATGGTCG--C----ACA------T-------T---AA--TT-T---ATTTTCATATTGAGAGAAAAGTAA-T----ATTCC-TTTCAATT---TTATG-C-TAATAC-AT--CAT--------------TC-ACT---ACAGG--T-TTTTAAAA-AATATA-A--TAAC---C--TCAAGACT-GA-----TTC--TG--TAGGtatgtatcatgtcacgagtaaaaagagagtctcgaaacaaattaacaataatcgaattattgatcattactttgactgtactattactataaaataacccatgtcctcagagagctggtaaaggctgtggctagatgtccaacatctacttgtatgaaatcactgttaaatattctcagagagagaggaaagattgcacgagatttaggttctataactccaaccattctatggtcgcacattaatttattttcatattgagagaaaagtaatattcctttcaattttatgctaatacatcattcactacaggtttttaaaaaatataataacctcaagactgattctgtagg
gi|20 : caatttaaatgcaaaacaaacaaagaaatgggaaaaatacataaaaattataatatataaaattaaaaaaaaaacaacatcaaaaccaaataacaaaaaataaatatcaaaaatataagaatatttaaaaaaaaatgcaattcatatataagacaaaaatgaaaatttaaaaaataataaccacaagattttgttcaaattttaacataatagtaatcagtatatgtataaaatatatcaattagaatttttaaaaaaaaaattgctggtgaattttgaagaatggaaaacaaatgaaatttacataatgttagctgcaaacttaattacctccctttgtggaatctaaattaaaaacatggttataaacagctgaactaatctttttacatgtgcatgctttcccctttaattggtatcctgtgtcataggtactggaatgccttttccctgatgatacatgggtaacattttcacaatttgagcatgttatactatagagcgatcccaaaacaaaacgaatagcacaatcaaaagcaatggctgatgacatgatgagcatcctctgtagagctgttcggctaaactccccaatacaataatacgacgaccttctttccagtttatgcttcgagaattatctgtcaaataaatattaatcaaagcttaatcatttattaaccttacatacaaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcatttacagtaatttggactgtctttattacaccagcacactataaacgagttacgatgtgtaaatttaatgtactatcagaggatgtaatatatctgcatgatgactactaattcctacatgtgcaaataggtttctactgctataaagccgtgcttagtattcatataatcatgggtatatatctcacctaaacttaataatctatatgtatcatgtcacgagtaaaaagagagtctcgaaacaaattaacaataatcgaattattgatcattactttgactgtactattactataaaataacccatgtcctcagagagctggtaaaggctgtggctagatgtccaacatctacttgtatgaaatcactgttaaatattctcagagagagaggTT-T-G-A-AT--G-C----CGTACTG--C-A-----A-C-----------------ATGGTAGGA-TA-A--T-TTAAA--TGATAC--TA-CGG-GATG-CAAT---AT-----CG-G-A--TGATC-T--A-TAA------TTTATC----T---T-----TT-CA---A-G---TTTTAT------AGAG-C-TATACACCATA--AAGTC-GC--GGGTTTT-A-GGTAT-ATA-ATA----CATGG-A-GATTT--A--A-ATT-A--ATG---T-AACT-CTT-TATATTAT--GTTG--ATTGTATGAGAT---CTGAC---AT---CA-TATATA--G--CAGA--T-C-T-AA----GACTTCAACTTTAA-TG-ATA-TT----TAAT--A-C-TT---TAA-C-A-TG--TGC-------ATTTTTGCAC-GTTTCA--------CTTTCA--TT---T-TC---GCTC---TGATACT-T-AATGTA-T------T--ACT-G---GGT--TTGCTAACATGTC------GCAA-TA---C-TCCTGTGCGGGG--A------TAGGGTGC-TGT-GA-A--T-----AA---A--AACGCATCTGGTAAAAT-C------ATA--ATGAGAAT-G--CAAC---A-A--AT--TAT---T---C-T--AAT--CAAAG---C--A--------TCG--T----TCG------T-------
gi|21 : TTCAAAATC-GTCC-T-A-GCC-TCTGCTC-G------------CAT--G--------------TT--T------------AA-ATC-GA--TT---CTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTC----G--------CTTTTCCCTGA-C-GA--TA-CTT---GGGTAACA--TTTT------A-CA---TGGAGC-A-T-G---A---TATA---TC--AAAGAGACGATC-----ACCAAAA-TGC-TATCC------------------------ATCT----CT--ACACAATTAATCAAAA----A-GC----AATGGC-C---TAATTATT---T-GCATG-G-------CA-------TCCTTCT-GT-G-AGC--T-TCGGC-A---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TATT-----GG-CG-GTCTTCGAT----C----TTTCCAGTTTATGC-TCG-GAAA----TAT-----C-----TGTTC---AAA-TA--AT----ATC--AAAGCTTAATC-A-----T-ATC-------AACCT-TA--G-A-ACA-T----------AAAATAAT-TG----------------CATTTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G---A--CGTACTG--C-A-----A-C-----------------AT-GT---G-TA-A--T-T---A--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--AGG-C-TTAA-TGA------TT--TC----T---T-----T
gi|22 : AGC-CGTCATT-GTGGTT---TATATCTTTTT-----AT-
gi|22 : --G-----------C--TT--T------------TATATA-GGGCTCT-CCCGTTGTCA-------------GCGTACTG----GGTTAATGCCTTT-CCCTGG-T-GAAATAGCT-----AGTAACATATTCT------T-CATATTGGAGC-AAT-G---TCTGTATA--GGC--AAAGA--CGACCTCCAAACCAAAA-TGC--A-TC------------------------A--TGG--CT--ACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattataataatacaattgaaatttgacatctataatttgctgggtgaattttggaaggaaatagggcaaatgaatttacataattcagctgctaaaataattaccattaccgctgtatggccagaaattagaagcatggctacaatcaagcctgaactcaggtaccttttggcatatttgccatgctctctctcgcttttatatagggctctcccgttgtcagcgtactgggttaatgcctttccctggtgaaatagctagtaacatattcttcatattggagcaatgtctgtataggcaaagacgacctccaaaccaaaatgcatcatggctaca
gi|23 : ataaaaagatataaaccacaatgacggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattataataatacaattgaaatttgacatctataatttgctgggtgaattttggaaggaaatagggcaaatgaatttacataattcagctgctaaaataattaccattaccgctgtatggccagaaattagaagcatggctacaatcaagcctgaactcaggtaccttttggcatatttgccatgctctctctcTTTCAAAATCAGTCC-T-A-GCC-TCTGCAC-G------------CAT--G---------------T--C------------AA-ATC-GA--T-T-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTACTG-------------CTTTTCCCTGA-C-GA---A-CT----GGGTA-CAT-TT--------A-CA-AT-GGAGC-A-T-G---A---TATA--C----AAAGAG-CGATC-C-AAACCAAAA-TGC-TATCC------------------------A--T----CTCTACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGGCCC---TAAT-ATA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-CTT----G-AGC--T-TCGGCTA---AACATC-C--CCAATA-CAA-TCAT-T---GG-CG-GTCT----TTCGAC----TTCCAAGTTTATGC--CGAAA------TAT-----C-----TG-TC----AA-TA--ATATCA-----AAAGCTTAATC-A-----T-ATC------AAACCT-TA--G-A-A-A-T------A---AAAATAAT-TG----------------CATTTTA---C--AG-TGATT-T---A-CT--G---A--CGTACTG--C-------A-C-----------------AT-GT---G-TA-A--T-T--AAC-TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--
gi|24 : -G--TCTG-TAGT-TT--GGTGAAC-AGGTGC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATGTACATATAGAATAGAAG---GGTC-AATTCGT-CATGAGTCCC-TA-TAT---AGGCCGATGCTGAT-AAAA-AAT-CA-ATTG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTATTT-CG-CA--TAAGC-AT-----GATC-CACCTTTACTAC---TTCGTGG--GGCAGTAG-GGGTAA---AC-AATAACA-------ATCAAAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATT-GCCCGTTCTTAT-CTC-GGGATTTCTCA-GTCACG---CTTTTTTT-TTATCTT---CA-CCATGATTTATGAGTCTTTTATTA-T-------CTTCTATGTATagcatat
gi|25 : TGGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--AA-GAG-CTATC-CCAAACCATAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGG--C---TAATGATA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TTT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-A--CCAATA-CAA-TAATAC---AA-CG-GCCT----T----C----TTTCCAGTTTATGCTTCGTGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATC------ATACCT-TA--GTA-ACA-T------A---AAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AA-TGATT-T-G-A-CT--G-----------------A-----A-C-----------------AT-GT---G-TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-G-----------AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-ATT----TT--TT----T---T-----TT-CA---A-A---GTTT---------ATG-C-T-------ATA--AAGTC-GT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-AT
gi|26 : TGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CG-CA--TAAGC-AT-----AATC-TACCTTTACAAC---TTCGTGG--GACAATAA-GGGTAA---ACAA-TAACA-------ATCGTAGC-CGTCATT-GTGGTT---TAGATC-TTTT-----GT-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCTTAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CG-CCATGGTTTATGAGTCTTTTATCA-T-------CTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-AAAT-TAACTCTTGCAAA--ATT-ACACAGGGGTTA-CAGA--AATTTGAATTGAAAAT--C--TTCTT-TGTCTTGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTA
gi|27 : -CCAAACCAAAA-TGC-TATTCATGTAAAGGCAAATGTAAAGGCACA--T----CT--ACACAATTAATC-AAT----A-G--------------------GACA---C-G-ATGAG-------CA-------TCT-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-CTC-C--ACAATA-CAA-TAATAC---GA-CG-GCCT----T---------TTTCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----CAT-----A-----TA-TC---AAA-TAC-ATATTAACC--AAAGCTTAATC-AT---TT-ATG------AAACCT---------ACA-T------A---CAAATAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-T-A--CGTACAG--C-A-----A-C-----------------AT-GT---G-TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TCAAGG-GATG-AAA----AT-----CG-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT--TC----T---T-----TT-CA---A-A---ATTT---------ATG-C-C-------ATA--AAGCC-GT--G---CTT-A-G---T-ATC-ATA----
gi|28 : TAACC--AAAGGCTAATC-AT---TTTATC------AAACCT-TACAGTA--CAGTA-----AC--AAAGTAAT-TG----------------TA-TTTAATAC--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-A-AATTGTACTGGGC-A-----A-C-----------------AT-GT---GGTACA--T-T--AAACTG-TAC--TC-AAG-GCGG-AAA----AT-----CA-G-AATCGG-C-T--A-T------------------------------------------GTTTA-------A----C-T-------ATA--AAGCCCGT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATAGA--CAAGGCA-G-TTT--A-TA-ATTGAC-ATG---T--AAT-ATC-TAC-TTATATTTCG--T---------ATATCC-GCA--TTT---CA-TA---A--A--GAAAG-T-C-TCAA----CA---TAATTT--A-TG-ATA-TT----TCATAAACC-TT---TAA-T-AGCGATTATGT-----ATTTTT-C
gi|29 : ATGCCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACGT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--AAGG-G-CGATC-CCAAAGCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--TAGATCT--ACACAATTAATC-AAATGCAATGC----AATGG--C---TGATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAC-AGCTGT-TCAGCTA---AA-CTC-C--CCAATA-CAA-T-ATAC---GG-CG-GCCT----T----A----TTCCCAGTTTATGCTTCGAGAAT----TAT-----CTTCTTTG-TCTCGAGA-TAA-A-ATTACTC--AAga
gi|29 : AT--GCTTCGAG----AATTATC--TTCTT-TGTCTCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCC-ACGA--CACTG-G-AGGACCCTTAAgaatggccacgacactggaggacccttaagcag
gi|3 : atgccttttccctgatgatacttgggtaacgtttttacaattggagcatgttatactaaagggcgatcccaaagcaaaatgctattcatagatctacacaattaatcaaatgcaatgcaatggctgatgacatgatgagcatcctctgtacagctgttcagctaaactccccaatacaatatacggcggccttattcccagttt-TTTACAT-GT----------GCA---G-----------C--TT--TCCCTT-------TA-ATG-G----CT-CCGAT-GCCA-------T--AC-G-GTATTG----G---AATGCTTTTCGCCTGAAT-GA--TA-CTC---GG-TAACAT-TTTT------AATA-ATAGG-GC-A-TAG---A---TATA--CTAT-AAAGAG-CG--T-CCAAACCAAAA-TCC-TATTC------------------------A-------------------AAT-----------GC----AATGG--CA--TGATGACAG--T-G-ATGAG-------CAATCTGCATCC-T-T-GTGG------T-TCGGCTACAAAA-ATA-A--CCATAA-CAA-TAA-AC---GA-TG-GTCT----T----C----TTTC-AGTTTATGCTTCGAGAATAAA-TATACTG-C-----TG-CT---CAA-TACCATATTAATC--AA-GCT--ATC-ATAAATT-ATT------AAACATACG--ATA-AAA-TA-----ATATGAGATAGT-AGA---------------CA-T--------------ATT-T-G-A-CT--G-TTA--CGTACTG--C-A-------C-----------------AT-TC---G-TA-A--T-T--AA--TT-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGC-T-T--A-T-ATAAAC-TT--TC----C---TTA---TT-CA---A-A---GTTT---------ATG-C-T-------ATAC-AAGCT-Ggcag
gi|30 : caaggaggctgcagaggtatacaaacccccccaatcaacagctagcatggttcttgatataatcatataataattttaactcaaaagacagtaaaacaatgagccatataatgtatcatttatgatttattaattctaatgttcattgcacaactgtttaacaatgcaaaaaatttaaataaatacacatcaaaccaaatgaaataataagaaatttatatacaacacatgaatttaaaaaaacataaccacaaggttttggtcaactttctaacacagatatgtataatatgtgttgaagatataccaaattataattaatttttagagctggtgaattatttgaagaatgggtaaaaaaccgaaatttacataataattgtgaaaaatggaattacctcccctttgcaaaaatctacaaattcaaaaactgtgaaatactgtGTAA---AC-AATAACA-------ATCGTAGC-TGTCATG-G-GGTA---TAGATCTTTTT-----GT-TATTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCGTAT-CCC-CGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATGGGTTAAGAGTCTTTTATTA-T-------CTTTTATGAATGAAGAATGCATACTAAGA-ACAT-TAATTCTTGCAAA--ATT-ACATCAGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAAT--C--TTCTT-TGTCTCGAGATAGAATTACT----------CAA-AAATGGCC-ACGA--TACTG-G-AGGAC
gi|32 : aGC-CGTCATT-GTGGTT---TATATCTTTTT-----AT-TGGTTTCCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCTAAT-CTC-GGGATTTCTCA-TTCACG---C-TTTTGT-TTATCTT---CA-CCATG--------GTCTTTTGTTA-TCTTCTACCTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-----------------TT-ACATAGGAGTTA-CAAT--ACTTTGAAGTGAAAAT--C--TTCTT-TGTCTCGAGATGAAATAACT----------CAA-GAATGACC-ACGA--CACTG-G-AGGGC
gi|33 : AG--T-C-T-AA----CA---TAATTT--A-TG-ATA-TT----TCAC--ACC-TT---TAA-T-A-CA--TTCCG-----TATTTT-CAC-G-TTCA--------TTTTCA--TTTATT-TC---GC-C---TGTCA-T-T-AATGTAGT------T--ACTAA--TAC-------------GA-------GCAA-TAACGC-CCCTGGGC--GG--A------TAGGGTGCGTGC-GATACTTTTAA-AA---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------ATG--CTAAAGAT-G--A-AA---G-A--A---AAG---T---C-TA-AAT--C-AAG---A--AT------GTCG--C----TCG------T-------T-
gi|34 : -G---T-AT--ATA----CAATG-A---TCT--A-CA-CTT-A--ATG---TATAAT-CTCATGC-TCA---------A---------AT---C-GCC--TGT---CAATA---A--AATGAAAAGTGC-T-AAAACATA---TAATTT--A-TGCATAATTGTCCTCATT-ACC-TTATCTAA-TTA-CA--TATTATTGTTACTTTC-CAC-G-TTCA--------CTTCCA--TTTACT-TC---GC-C---TGTCA-T-TAAATGTA-T------T---CT-G--TACT--CTA-------G
gi|35 : ttAATCAGTCCCT-ATGCC-TCTGCAC-GTCGTTATGAGTACAT--GGTAACAAAAGTCGGTTAAT------------TA-ATTTGA--TCTACCTGC-CTCGAAGATTTT--AAGG-GTACTGCTCCG---CGTCTCCTTCGCCTGA-TTGA--TAGCTTAATGGGTAA-AT-TTTT------A-CA-ATTCGAGCAA-T-GGCCA---TATAACTTA--TCAGAG-CGATT-CCAAtc
gi|36 : -C------ATAGCATAAAGAT-G--C-ATTTTG-ATAA---TAG---TATCC-TA-AAT--A-AAGGCTCTGAC------GTTGACT----TCA------TAAATAAAT-T-AA--TTTC---ATTT-----------GAAAAG-AA-TACC-GTTAAGTTT-AATT---TTATGACAT--TAT-GTAGAGT--------------TTAAGT---ACAAGGTT-GT--AAAA-AAGA-T-A--TTAC---CT-C---GACTAGA-----TTC--TG--TA
gi|37 : TAAT-TG----------------TACTTTAG--CGAAG-TGATTGT-G-AACT--G-T-A--CG-ACTG--C-A-----AAC-----------------AT-GT---G-TA-A--A-T--AAA-TG-TGC--TC-AGA-GATG-AAATAAGATGCA--TA-G-A--TGG-C-T--A-T-AT-----TT--TC----T---T-----TTACA---A-A---GTTAT-------AATA-CTT-------ATAACAAGCC-G---G---CTT-AGG---TAATA-ATA----CAT-G-A-G-TTC--A-TA-
gi|38 : tATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-AC-T-TAACTCTTGCGAAACATT-ATA---GAGTTAGCAATTGACTTTGAAGTGAAAATA-CG-TTCTTGTGTCTCGGACTAAAATTACT----------CGACGAATGGCCAACGAACCACTGCGCAGGAACC
gi|39 : ---G--AACAC-T---GTAAAAT-C------ACA--ATAAAGAT-G--C-AC---G-A--A---TTG---T---C-T--AAT--C-AAG---CATAT------GTCG--T----TCA------T-------T-T-AAT-TT-C---ATAA-----------CAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--GATGATATTTGCTTATGTT-AGT---ACTGG--T-GTAAAAAA-cgtt
gi|4 : TTCAAAATCAGTCC-T-ACGCC-TCTGCAC-GT----------GCAT--G-----------C--TT--T------------TA-CTT-GA--TCT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTTCTG------------CCTTTTCCCTGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAT-TTTT------A-CA-ATTGGAGC-A-T-G---C---TATA--CTA--AA-GAG-CGATC-CCAAACCAAAA-TGC-TATTC------------------------A--T----CT--ACACAATTAATC-AAA----A-GC----AATGT--C---TGATGATA---T-G-ATGAA-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGCTGT-TCGGCTA---AA-ATC-C--CCAATA-CAA-TAATAT---GA-CG-GCCT----T----CGATCTTTCCAGTTTGTGCTTCGAGAAT----TAT-----C-----TG-TC---AAA-TAC-ATATTAATC--AAAGCTTAATC-AT---TT-GTC------AAACCT-TA--GTA-ACA-TA-----A---AAAAAAAT-TG----------------CA-TTTA---C--AG-TGATT-T-G-A-CT--G-A-A--CGTACTG--T-A-----A-C-----------------AT-GT---G-TA-A--T-T--AA--TG-TAC--TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--TGG-C-T--A-T-A------TT--TC----T---T-----TT-CA---A-A---GTTTA-------AATG-C-T-------ATA--AAGCC-GT--G---TTT-A-G---T-ATT-ATA----CATGG-A-G-TTT--A-TA-ATT-AC-ATG---T-TAAT-ATC-TAC-TTAT--TTTGCAA---------AT---C-GCC--T-T---CA-TA---A--A--AGA---------AA----CA---TAATTT--A-TG-ATA-TT----TCAT--CCCTTT---TAATT-A-CA--TATTG-----ATTTTT-CACGG-TTCA--------TTTCCA--TTTACTGTC---G--C---TGTTA-T-T-AATG-AGT------A--ACT-G--TACT--TTGT------GCTAGTCTAGCAATTTACG--TCCT-GGT--GG--A------TAGGGTGCATGT-GGTACTT-----AA---G---ACAC-T---GTAAAAT-C------ATA--ATAAAGAT-G--C-AC---A-A--A---TAA---T---C-TA-AAT--C-AAG---C--AT------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATC---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------CT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-AAAA-A-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TGA-TAGGCCGATCTATTAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTGAAC-AG
gi|40 : T--C-AAG---C--AA------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AA--TTTC---ATTT-----------CAAAAG-AA-T-CC-GTTCA-TTT-AATT---TT-TG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-TTAAAAAATAAAA-A-A--ATAT---T-------ACT-TG-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-TAGTACT-G--TC-G-TAGT-TT--GGTG
gi|44 : TTTCCAAATCAGTCC-TTACGCCCTCTGCACCGT----------TCAT--G-----------C--TT--T------------TA-ATT-GA--TCT-CCTGT-GCCA-------TTAG--G-GTACTG-----------CCCTTTTCCCTGA-T-GA--
gi|45 : tG-C-T--TAT-GT--AAT--------------TT-AGT---ACAGG--T-GTAAAAAA-ATA-------TTAC---C--C---GATT-GA-----TTC--AG--TAGGCCGATCTA-
gi|45 : AC---TTCGTGG--TGCAGTAA-GGGTAA---AC-cttcgtggtgcagtaagggtaaac
gi|5 : gcttatgtaatttagtacaggtgtaaaaaaatattacccgattgattcagtaggccgatctCAT-GT----------GCAT--G-----------G--TT--TCCCCTATACATGTA-ATT-GG--TCT-CCTGC-GCCA-------T--A--G-GTGCTG----G---AATGCCTT------------------CTT---GGGTAACAT-TTTTTTTTTTA-TA-ATTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CTA--AA-GAA-TAATC-ACAAACCAAAA-TGC-TATCC------------------------A--T----CT--ACACATTTAATC-GAA----T-GC----AATGG--C---TGATG
gi|50 : ggctggagggtcatccaattttttccccaaaattcaaaaaactagcatggttacttggcataatcatatacataattttaacaccaaagacaatttaacaaaattagccatatttttatgatttattacttctaatgttattgcacataataatacataaacacataacaaaacaattcaaatacaaaccaaaccaaaaaaaaaaggcaaaacatacaataattaatatatcaaataaaaaaccatcaaaaaccaaataacaaaacataaatatcaaaaatataaggaaattttaaaaaaaatgcaattcatatataacaaaaatgaaaataaaaaaataataaccacaagatttgttcaaattttaacataaatgataatcagtatatatgttaaaatatatgaattggaattaaaaaattttgctgtgaattaagatggaatgggggaaaatgaaaatttcataaatttggctacacaaatttaattacctccctttgcagaatcttaaccgctgaaccatagacgtaaagcaaaacgtgttgctttacgtctatggctgaactgatcgttttgtaaaAC---TTCGTGG--TGCAGTAA-GGGTAA---AC-A--------------------C-CGTCAAT-GTGGTT---TAGATCTTTTT-----GT-TGCTTTTCACgatgc
gi|51 : ------GTCG--C----TCA------T-------T-T-AAT-TT-C---ATTT-----------GAAAAG-AA-T--C-GTTCA-TTT-AATT---TT-
gi|53 : GATGACA---T-G-ATGAG-------CA-------TCC-TCT-GTAG-AGATGT-TCGGCTA---AA-
gi|54 : -GA--TCT-CCTGT-GCCA-------T--A--G-GTAC------------TGCCTTTTCCCTGA-T-GA--c
gi|6 : GAG-------CA-------TCC-TCTCGTGGGAGCTGGGTCGGTCA---GA-CTT-CAGCCAATA-CAAATAACACCGAGATCGCACCT----T----C----TTTCCACAGTATAC--------------AT-----C-----TG-TC---AAACTAC-AAATTAAATGAAAAGCTTAATCCAT---TT-GTT------AA-CCG-TACAGTA--CA---------------ATGAA-TG----------------CA-TTTA---C--AA-TGTTG-T-GGA-CTACG-C-C--CCTACTG--CTA-----A-C-----------------AT-GCTTAA-TA-A--T-T--GC--TA-TAC--TC-AGA-GATG-AAG-----------CA-GAA--TGG-CTT--A-T-A------CT--TCCTCAC---T-----CT-CA---ACA---GTTTATGTCATGACTA-C-T-------ACA--AAGCC-TTTGG---CTTAA-G---T-ATTGATA----CATGG-ACG-TTTTGATTA-ATT-ACAATG-----TAAT-AT--TA--TTAT--TTT--------------T---C-GTCAATATCAGCA-TA---AATA--GAAAG-T-CAT-AA----CA---TATCTT--ACTG-ATA-TT----T---------TC---TCA-T-A-CG--TA----------TTTT-CAC-G-TTTGTGTGTGACCTTCTAGCCTTACT-TCAGGGC-CGGTTGTCA-TCT-AATGTAGTCATGCGT--AGT-GATTACTAGTCA-------AAT------AAAA--AACCCGTCCTGGGC--GGAAA------TAGGGTGGGTGCGGGTACTTTATAAAA---G--AA-AC-C---GTACAAT-TCACTCAATA--ATAAAGAT-T--C-AT---GTA--A---TAGGTCC---C-T--AAT--C-AAG---C--TT------GTC---CTCTTTCATTGAATT-------T-T-AAATTT-C---ATTT-----------GAATAG-AAGT-TC-GTTTC-TTT-ATTTGTGTG-TG-C-T--CAT-GT--AAT--------------TCAAGT---ACAGG--TCGTAAAAAA-AAAA-ATATTTTAC---C--C---GACT-GAGC---TTCGATG--TA
gi|7 : atg-TTTACAT-GT----------GCATAAG-----------C--TT--TCCCCTT------TA-AT--GG--TCT-CAGAT-GCAA-------C-----G-GTACTG----GG--AATGCTTTTCGCCTGAAT-GA--TA-CTC---GG-TAACAT-TTTA------A-TA-AT---AG--A-TAG---A---TATA--CTATAAAAGAG-CG-----TAAACCAAAAATCC-TATTC------------------------A-------------------AATC-GA--------C----AATGG--A---TGAT-ACAAAGT-G-ATGAGACATCTGCA-------TCC-T-T-GT----GCT---TCGGCTACAAAA-ATAAC--CCAATAACAA-TAACAT---G-----GTCT----T----C----TTTC-AGTTT-TGCTTCGAGAATAAAATATACATGC-----TG-CT---CAA-TACCATATTAATC--AA-GCTCA-TC-AT---------------AAA--T-TA--TTA-ACA-TACGAATA---AAAATAATATA----------------GA-GATA---G--AGACAATT-T-G-A-CT--G-T-A--CGTA-TG--C-A-------C-----------------AT-TC---G-TA-AA-TAT--AA--TT-TACC-TC-AGA-GATG-AAA----AT-----CA-G-A--T-G-C-T--A-T-ATAAACCTT--TC----CTTAT-----TC-CAAACA-A---GTTT---------ATGCC-T-------ATAC-AAGCc
gi|8 : atgaaaaaaatttaaataaccatcaaaccaaagaatattagatatatacaaaccatgaatttaaaaacatacacacaaggtctttggtcaaactttcctaacacgatagtatcaatatgtgtatgaaagatatcaacacaacatttattaccattctttatagctggtgaatatttgaagaatgggataaaacgaaaaatataattgtgaaaaatggaattactcccctttgcaaaatctaccacaaaaatgtgtcacaatcaacttC-C---TATCT-T-C-CATGTACT------TTTACT-G--TACT----------------------CAA-CTACGC-TCCTGG-C--GG---------TAGGATGCGTGC-GATACTT-----AACATGTCAACAC-T---G----AT-C------TTA--ATACAGTA-G--C-AC---GCA--A---TCG---T---CCTA-AACG-C-AAG---C--AT-------TCG--CG---TTA------T-------TAT-AG--TT-CTC-ATT------------GAAAAG-GA-T-TCTGTTCA-TTT-G---------CG-CGT--TAT-GT--GAT--------------TT--GT---AC-GG--T-G-AAAAAA-AAAA-A-A--
gi|8 : catttaaatattacTAAAAAA-GAAT-T-A--TTAC---C--C---GACT-GA-----TTC--TG--TAGGCCGATCTA-T-------G--TC-G-TAGTATT--GATGTAC-AGG------------TGC----TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNAG---TGTAGAATTCGT-CACGAGCCTC-TA-TGT---AGA----TGCTGAT-GAAA-AAG-CA-ATCG--------CTTGT----AGA-GGTG--CC-ATCTTTTT-CA-CA--Taaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaataaaaaagaattattacccgactgattctgtaggccgatctatgtcgtagtattgatgtacaggtgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgtagaattcgtcacgagcctctatgtagatgctgatgaaaaagcaatcgcttgtagaggtgccatctttttcacattcataataacaatcgcagccgccattgtggttgagtagatctttttggtgtttttcacttatagatcgcccgttcttatctggggattttgtttatctgagtcttttattatcttctatgtatgaagagtgcatactaagaacattaactgttgcgaaattacataggagttacaatacttggaagtgaaaatattctttgtcgcgagataaaattactcaagaatggcaacgacactgaagaaccct
gi|8 : catttaaatattaccctatcttccatgtacttttactgtactcaactacgctcctggcggtaggatgcgtgcgatacttaacatgtcaacactgatcttaatacagtagcacgcaatcgtcctaaacgcaagcattcgcgttattatagttctcattgaaaaggattctgttcatttgcgcgttatgtgatttgtacggtgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaa-A-TAACA-------ATCGCAGC-CGCCATT-GTGGTTGAGTAGATCTTTTT-----GG-TGTTTTTCACTTA-T-AGATC-GCCCGTTCTTAT-CTG-GGGATTT-------------------TGT-TTATCT------------------GAGTCTTTTATTA-T-------CTTCTATGTATGAAGAGTGCATACTAAGA-ACAT-TAACTGTTGCGAA--ATT-ACATAGGAGTTA-CAAT--ACTTGGAAGTGAAAATA----TTCTT-TGTCGCGAGATAAAATTACT----------CAA-GAATGGCA-ACGA--CACTG-A-AGAACCCTtcataataacaatcgcagccgccattgtggttgagtagatctttttggtgtttttcacttatagatcgcccgttcttatctggggattttgtttatctgagtcttttattatcttctatgtatgaagagtgcatactaagaacattaactgttgcgaaattacataggagttacaatacttggaagtgaaaatattctttgtcgcgagataaaattactcaagaatggcaacgacactgaagaaccct
gi|9 : catttaaatattaccctatcttccatgtacttttactgtactcaactacgctcctggcggtaggatgcgtgcgatacttaacatgtcaacactgatcttaatacagtagcacgcaatcgtcctaaacgcaagcattcgcgttattatagttctcattgaaaaggattctgttcatttgcgcgttatgtgatttgtacggtgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaataaaaaagaattattacccgactgattctgtaggccgatctatgtcgtagtattgatgtacaggtgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgtagaattcgtcacgagcctctatgtagatgctgatgaaaaagcaatcgcttgtagaggtgccatctttttcacattcata-TTTACAT-GT----------GCAT--G-----------C--TT--TCCCCTG------TA-ATT-GG--TCT-CCTGT-GCCA-------T--A--A-GTATTG----G---AATGCCTTTTCCATGA-T-GA--TA-CTT---GGGTAACAA-TTTT------A-CA-ACTGGAGC-A-T-G---T---TATA--CT
14 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TAAGGAGGGCGTGAAGCCAGGGATCAGTCCAATTTTCTTTTTCCAATTTCACACAACAGCAATGTTGGTTTACTTGAATGAATAAGTATCCAATGGTGAATATCTTAACTAAAATCAAAGACATACAAATAGCCATATTTTTTATGATTTATTACTCTAATGTTATTGCACATAATGTTACTGACGAACCACATAGGAAAAAGACAATGTTGGTGTAAATGCAAAACAAACAAAGAACGAAATTGGGAAATAATTATCATAACAATTATAAATATATATAAATTTGTAAAAAACAAAAATCCATCAAAACAGCATAACAAGATAAATAATATATCAGAAATATATAACCGAATATTAAAAAAAAAATAATGCAATTCAGTTTATAGTATAAGACAAAAAATGAAAATTTAAAAAATTAATAAACACACAGATTTTGTTCAATTATTAAACATATAGTTAATCAGTATTATGTTATATGATAATATATCAATTAGAATTTTTTAAAAAAAAAAATTGGCTGAGTGAATTTTGAAAGAATGGAAAAACAAAATGAAATTGTACTAATGTTGTAGGACATTGCAGCTATGTAAACTTAAATTACC
Unaligned ( gi|13 ): AAGGCTGGAGAGTCATCCAATTTTTTTTCCAAAATTTACAAAACTAGCATGGTTACTTGGCATAATCATATACATAATTTTAACATCAAAGACAATAACAAAATTAGCCATATTTTTATGATTTATTACTTCTAATGTCATTGCACATAATGTTGCATGAAGAAAAACCAAAAACAATTTAAATACAAAACAAATCAAGAAATTGGTAAAATACATAACAATAATACTATATCAAATAAAAAACACCATCAAAACCAAATAAAACATAAATATCAAAAGTTATTTGAATATTTAAAAAAAAATGCCAATTCATATATGTATAACAAAAATTAAAATAAAAAAAATATAACCACAAGATTTTGTTCAAATTTTAACATAATAGTAATCAGTATATGTATGAAATATATCAATTAGAATTCAATTTTTTTGCTGGTGAATTTTGAAGAATGGGGAAAAATTACATAATATTAGCTGCAAATTAATTACCTCCCTTTGCAGAATCTAAAACATGGTTACAAACAGCTGAACTAATCTTTTTAC
Unaligned ( gi|14 ): AAGGCTGGAGAGTCTCCACTTTTTTTCGCAAAATTTACAAAACTAGCATGGTTATTGGCAGAATCATATACATAATTTAATAACATCCAAGAACAATACAAAAATTAAGCCATATTTTTATGATTTATTACTTCTAATGTCATTGCAACATAATGTTGCATGAAGAAAACCAAAAAACAATTTAAATACAAACAAATCAAGAAATTGGTAAATACATAACAATAATACTATATCAAAATAAAAACCCATTCAAACCAAATAAAAACATAAATATCAAAAGTATTTGACTATAAAAAAAAAATGCAATTCATATATGTTATAAAAAAATATAAATAAAAAATAATAACCACAAGAATTTTGTTCAAATTTTAACATAATAGTATCAGTATATGTATGAAATATATCAATTAGAATTCAATTTTTGCTGGTGAATTGAAGAATGGGGAAAAATTACAATAATATTAGCTGCAAAATTAATTACCTCCCTTTGCAGAATCTTAAAACATGGTTACAAACACTGAACTAAT
Unaligned ( gi|15 ): GGGCTGGAGGCGTCATCAATTTTTTTCTCTCCAAAAATTCATAAAGCTAGGCATGGTTACTTGGCATAATCTATACATAATTTAAACATCCAAAGACATAACCAAATTAGCCATATTTTTATGATTTATTACTCTAATTGTTATTGCACATAATGTTACATGAAACACATGGCAAAAACAATTTAATACATAAAAAAACAAAGAAATAGGCCAAAATAACATAACAATAATAAATATATCAAATAAAAAAAACCATTCAAACCAAAAATAACAAAATATTAAATATAAAAGTTTAAGTATATTTTAAAAAAAATGCCAATTCATATATATAACAAAAATTGAAAAAAAAAAAAATAATAATAACCACAGATTTTGTCAATTTTAAAATAATGGTAATCAGTATATGTATAAAATTTATCAATTTTAGAATTGAAATTTTTTGGCTGGTGAATTTTAAAGAAATGGGGAAAAAATTGAATTTACATAAT
Unaligned ( gi|16 ): AATTTTTTCTCTCCAAAATTCATAAAGCTAGCATGGTTACTTGGCATAATCATATACATAATTTTAACATCAAAGACAATAACAAAATTAGCCATATTTTTATGATTTATTACTTCTAATGTTATTGCACATAATGTTACATGAACACATGGCAAAAACAATTTAAATACATAAAAAAACAAAGAAATAGGCAAAATACATAACAATAATAATATATCAAATAAAAAAACCATCAAAACCAAATAACAAAATATAAATATAAAAAGTATAAGTATATTTAAAAAAAAATGCAATTCATATATATAACAAAAATGAAAAAAAAAAAAATAATAATAACCACAAGATTTTGTTCAAATTTTAAAATAATGGTAATCAGTATATGTATAAAATATATCAATTAGAATTGAATTTTTTGGCTGGTGAATTTTAAAGAAATGGGGAAAAAATGAAATTTACATAAT
Unaligned ( gi|31 ): TAAGGAGGCTGGAGGGTCATCCAAGCCCCCCCCCCCAACAATAAAACCAGATGGTTACTTGGATAATATATACATAATTAAACACCAAAGACAATAACAAAATTAGCCATATTTTCTATTATTTATTTTATTTCTAATTTATTGCACATAATGTTACATGAACACATAACAATAAAATTTAAATACAATCCAAACAAAAAAGGCAAAGTACATAACAATAATAATATATCAAATTTAAAAAAAAAACCATCAAAATTAAAT
Unaligned ( gi|41 ): GAGGTTGGAGGGTCATCAATTTTTTTTTTTCTAAAATTTATAAAAACTAGCATGGTTACTTGGCATAATATATATACATGGTTTTAGCATCAAAGACAATAACAACATTAGCCATATTTTTATGATTT
Unaligned ( gi|42 ): AAGGAGGCTGGGGGTCATTTATTTTTTTTCAAAATTCATAAAACTAGCATGGTTATTTGATATAATCATACACACCATATTGACATCAAAGACAGTGACAAAATTAGCCATATTTTCATGATTTATT
Unaligned ( gi|43 ): ATTTTGAAGAATGGGGAAAAAAATAAAATTCACCATAACATTAGCTGCAAAATTAATAACCTCCCTTTGCAGAATCTATTGAAACATGGTTACAAACAGTTGAACGAATATTTTTACT
Unaligned ( gi|46 ): AAATATTAGAAATATAACAATATTTTTTTTAAGATATAACAAAAATGAAAATTAAAAAATAACCACAAGATTTTGTTCAAATTTT
Unaligned ( gi|47 ): TTCGCTGCAAAATTAAATTACCTCCCTTTGCAGAATTTCTAAAACATTGTTACAAATAGATAGACTGAAACTAATATCTTTATA
Unaligned ( gi|48 ): GCTGCAAAATTAATTACCTCCCTTTGCAGAATCTAAAACATTGGTTACAAATAGATAGCTGAACTAATATCTTTATA
Unaligned ( gi|49 ): TGAATTTTGAAGAATGGGGGAAAAAATAAACATTTACACAATATTATCTGCAAAATTAATTACCTCCATTTGCAGAA
Unaligned ( gi|52 ): AAACCATAGATGTAAAGTAAAGCTTTACGTCTATGATTAAACT