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gi|1                          :                                                                                                                                                                  aaTTCTTCGTTGCGTTATAATTTA-GATAAGTATTATAACAGC-ATGCATCAGGTTCACAATTCTTTCTGTA-TATTTT--G-TGCATGCATTTGT-TGCTGT-TTGTCTCC-ATAAGA-CTCCT---TA-GCAGT-AATAGGTCCAGAG-TATGC-ACGAATATCAGTA----CACTTTATA-CTCAAAATG-CTTCTTTTCAATTGAG----CAAAGATGCA---TATACATCAATATA-CC-GAA-ATCCAATTCCTAGTAGTTTATTGAAATGT-CAATT--ATA--TGAATTA------CA-TCATGA-CGATTTC-CTTAACT----C--T-T-------------TC--CT---------------------------ATTAAAA-TGGGA-TT-TT--CTCTTAA--TTTCC---AATCACATAACCAAA---ATG---TC-C---GTA-TAA--TATTGTAT---TGTGCGT----AA----TAAA-T-CATGAGTT--GTGG-C-TTAT--T--TAT--CAAAT----C-ATTA---CACCT-TGGA---AAGTATAC-T-TT-GTT-TATAT-T-TTC----------G-CA-ATT-TAGTTC----ATAA-T-GATT-------TT-C--T---TAAACC-A---CAT-GGAT------CC---ACCTC--G--A-----TGTTTTGAATAA--CGTC-T-CAAAAC-CAAAATCAATAT-G-GTAT-T---GCAAGC---T-G-C-TC--A-C-G-T--CT--G--GACTAA------------A---CCTCTTG-CG-A--ATTT-------A-C---G-CCAGCGAT--CGGTCTCT--TTT-GTGAAAC-G-G----CGA--TTTAGG---C-GG--TC-TAGGATTA--TTT-GG--CGT-A-ACTTTA-G--TTA-GTC----GGC---CTAAGTT--TACG-CCCAGTAAT-T-T-AC-AATTACACCT--T-T--TTGTGA--AA-C---GGGCC
gi|5                          : gggatgggggacgggcatgtgtaggagggagggtggtttaacttttgaactttaataagaggagacaaacaataatgtatactatattaggatgcatgctttgttttcacacaatatgtacataaattatagcttgatatttttatttattcatttaaaatacccatttaagtaacgaagcatacagcataatgagattttagatcttaattctaaactcaatgtttacttagcataaatatccaagccaaaatgttttaatagcatcaagaactgagatgaaacgtaacaaatacctagcatgtttaacgatttttgtttgatgtttaaA----C--TTTATA-CT-AATATG-CTTTTTTT---AT-------AGAA-----A---GAT-GATGAAT-------------C-AATTC----T-GTTAGACTG-ATGT--AATT--TTAA-TGA-------------TTA-GA--GATTT-----AACT-------T-T--G-G-----TTTTA--TT-TGTTGATA-TA------T-C-A----ATTAAAATTGGGG-AT-TT--CT--TAA--TT--T---ATTT------ACATA--TATT---AA-C----TA-TAG--A--TATATGTATTTGCTTTG--T-----TA-A-T-CA-GAG---TGT-G-C-TTATAATTATAT--CAAAT---AA-ATT----C--AT-TGGA---ATG--TAT-TATTAGTT-TAT-T-T-C--------------CA-AATCTAGTT------TGAAT-TTTT-------TC-T--T---AAAAC----A-CAT---GT------CC---TCC-A--A--A-----TGTTTT--AAT---TGAG-TTCAAATA-C-AAATT-ATATA----AT-TTGAGC---CA--T-G-CTTC--A-A-GCT--TT--G----CTAA------------A---CC------CGAA--ATTT---------C---G-CCA--GATG-CG---TCT--TTT-GTAGAAT-AGC----GAT--TTTAGG--CT-GT--C--TA-GAT----TTG-GG--T-T-A-AC--GA-G--TTA--TTC--G------CTAA--T--TATGCGACAT-GATAT-T-AA-A-------CCT-T-T--TTGTG---AA-C---GGGc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atataattacA----C--TTTATA-CTCAAAATG-CTT-CTTT---TT-------CAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acCTCAAAATG-CTTCTTTC---TCAAATAAGCAAA-----AATGTATATATT-ATATACC--AAA-ATC-AGTTACCATA-GTTTAT---------------------TGAAATGTG----CAGTCATGATCGATTTC-CTCGACTCTTCCAATGC--G-GT-GAATTGTC--TTCTGTTGATA-CAgtgag
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATA-C--CAATATC-AATT---AGT---TTGTTGAAATGT-TTACTCAGTAAACGAAACATACATGCA-TCATTACTGATTTC-CTTAACTCTTCT--T-TCCG-T--GAGTTGTCA-TT-TGTTGATG-CAA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T--ATAA-TGAAACA------CA-TCATGATCGATTAA-CTTAACTCTCCC--T-T--GCGTTGAATTGTC--ttg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agT-TGTTCAAG-TAAA----T-C-ACATAATTAAAAATGGTA-TT-TTTTCT--TAAATTT--CGA-ATTCACAC--CTAAA--TATA---CT-CGAGTTA-TAAAATA-TGAAT---TTTGCTT----A-----TA-A-CGCATGAGTT-T-TGG-TGCTAT--TG-TAT--CAA-T---ACGATTAAACC--TTCTGGG---AGTG-TAT-T-TC-GTTCTAT-T-T-CTCTCGCGATAAAGGCA-AAT-TAGTTC----ATGATTATATT-------TC-T--T---AAAAAC-AAAACATATGATAGTTCCCCGAAACCTC--G--AGTGATTATTTAAAAATA--GTTC-ATCAAACC-CAAATTC-ATATAG-GTATCT---GC--GCAGTT-GCC-TCA-A-A-G-TCGCTGAG--AACTAA------------C---TC----GCCGTA--ATTT-------A-CTCGGCCCAGCGATAGCGAACTCT--TTT-GTG-AAT-A-TTGCAGGATCTTTAGG--CCAGG--TCCTAGGATGGTGTAT-GGGCCGT-A----CTA-G--TTA-GATC--AGAC---CTAAA-GTTTACGTCCCTG-AAT-TATAAC-A-------CCATT-T--TTGTGA--AA-CAGAGGGC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATA-TTAACTGAT-C-A----ATTAAAAATGGGA-TTCTT--CT--TTA--TT--TCA-ATTCACA---CCAAACTTATTTTTCCGC---TTAATAA--A--TGTAT---TT-GCTA----A------ATAAC-CAGGAGT---GTGC-CCTTAT--T---ATTCCATAT---AC-AT-A---C--AT-TTAA---G----TATAT-TC-GTT--AT-T-TACT------------ACA-AAT-TA-GTC----ATAAAT-TATT-------TT-TCTT---AAAACC-A---CAT-TAAT------CC---ACCTC--A--A-----TGGTTTAAAATA---GTT-CTCAAACCACAAAATC-ATATAGCGTAT-T---GC--GCA--TCG-C-CA--A-A-G-T--CT--GGAGACACA------------ACT-TC----G-C--------T-------ATC---GCCCAGCGCTA-CG----CT--TTT-GTGAAACTG-C----GAG--TTTAGGTTCC-GGTCT--TA-GAT----TTTGGG--CGTCATAC-TTATG--CTACGTCTTAGATC---CTAAG-T--T-CACCCCTG-AAT-T-T-ATAA-------CC--T-TTCTTGTAATTAA-C---TGGC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T--CAA--TT--C---A--CA-----CTAAA--TATG---CC-CC--TTA-TGA--TA-TGTAT---TT-ACTT----TAAAAATA-A-C-CATGAGTC--GTGGGC-TTAT--T--TAT--CAAAT---AC-ATTA---CA-TT-TGGA---AGTA-TAT-T-TC-GTT-TAT-T-T-TTC----------GGCA-AAT-TAGTTC----AT-----TATT-------TTCT--T---AAAACC-A---CAT-TGAT------CC---ACCTC--G--A-----TGTTTTAAAATA---GTC-TCAAAACC--AAAATC-ATATAG-GTAT-T---GC--GCA--T-G-C-TC--A-AAG-T--CT--G--GACGAA------------ACAGTC----G-CGAA---TTT-------A-C---GCCCAGCGATA-CG--CTCT--TTT-GTGAAAC-G-C-----GA--TTTAGG--CC-GG--TC-TA-GAT----TTT-AG--CGT-A-AC-TTA-G--TTA-GTC----GGC---CTag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TT-AAT-T-T-CTT----------AGTA-A---TA-TTCTTTTATAA-T-TCCTCTGGAGCTT-T--T---AAAACA-AT--C-T-TGAT------CC---ACCTC--A--A-----CGTTTTGAAATACATGTGGTCTAAAAA-TAAAA---AAAAA----------------CA--T-G-C-TC--A-A-A-T--GT--G--GTCTAAGACTGGTGTACTA---TT----T-CGAG---TTC-------A-C---GCCCACCATTA-TG--CTCC--TTT-GTGAAAC-G-C-----GA--TTTATG--CC-AGTCT--TA--AT----TTT--G--TGC-A-AA-TTA-G--T------C--G--------------------CCCAA-AAT-T-T-AC-A-------CC--T-A--TTGTGA--A
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttgcttaatttacgcacaaagcttgtgtctttaatttaaacaatcatgacatattgtattctttatccatactattatatcttcaggcgtaaa-TGAT------TC---ACCCC--GCAA-----TGTTTTAAAATA--gga
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     c-TGAT------TC---ACCCC--GCAA-----TGTTTTAAAATA--aacaatagcaatgcacgcaagcctcagagttgatcttaggttggtgtactattcatgttgaagccagttcttgcgcctcgtttagtgaaacacgataggtcgtctagatttgtgtaaatagttaatcgggcctacgttacgcctagatttgccatcttttgtgaagccgag
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          c------CC---ACCTC--G--A-----TGTTTTAAAATA---GTC-T-CAAAAC-TAAAATC-Aaacaatagcaatgcacgcaagcctcagagttgatcttaggttggtgtactattcatgttgaagccagttcttgcgcctcgtttagtgaaacacgataggtcgtctagatttgtgtaaatagttaatcgggcctacgttacgcctagatttgccatcttttgtgaagccgagtc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCCC--A--A-----TGTTTTAAAATA-------------------AA-C-ACATAG-CAAT-T---GC--GCA--A-G-C-TC--AGA-G-T--TT--G--ATCTTA------------GGT-TG----G-TGTACTATTTCATGTTGA-A---GCCCAGTCTTG-CG--CTCG--TTT-GTGAAAC-A-C----G-A--TTCAGG--TC-GT--C--TA-GAT----TTT-GG--TGT-A-AA-TTA-G--TTA-ATC----GGC---CTACG-T--TACGCTCTAG--AT-T-T-GC-A-------TC--T-T--TTGTGA--AG-C---CGG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                C-CAAAATC-ATATAG-GCAT-T---GC--GCA--T-G-C-TC--ATA-G-T--CT--G-------------------------T----G----A--ATTT-------A-C---GCCCAGCGATA-CG--CTCT--TTT-GTGAAAC-G-C-----GA--TTTAGG--CC-GG--TC-TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-AC-TTA-G--TTA-GTC----GGC---CTAAG-T--TACGCCCT-G-AAT-T-T-AC-A-------CCT-T-T--TTGTGA--AA-C---GGGCC
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTAACAACA-CG--CTCC--TTT-GTG-AAT-A-G----CTA--GTTAAG--CC-GG--TC-TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-AA-TTA-T--TTA-GTC----GTC---CTAGG-T--TACTCCC--------T-C-AC-A-------CC--TCT--TTGTGA--AA-
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --CTCG--TTTAGTGAAAC-A-C----GA-----TAGG--TC-GT--C--TA-GAT----TT---G--TGT-A-AA-T-A-G--TTA-ATC---GGGC---CTACG-T--TACGCCT-AG-ATT-T-G-CC-A-------TC--T-T--TTGTGA--AG-C---aag
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGGGGGGGGGGGGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGATAGAAGTACAAACTCTAGTTTCATTTTATGAAAAAATACAAATAACTATTTTTGAATGATTGCTAATAAGGATGAAGTTTTCTTTTACTTGGAACATTATGTCACATGGCTTGTAACTATGGCATCCATTTCTTC
Unaligned ( gi|15 ): GGGGGGGGGGGGGGGCGGGGGTGGTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGATTGCAATACTCTTGATTGGTGCATTATCTAAAGAATAACGAAATGCGTCTTCACTTTTACCATTATATCACTGTTATACTAAAACTGTACAGTGTATTCCCTTGCAT
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Alignments
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ctgattcaccccgcaatgttttaaaataaacaatagcaatgcacgcaagcctcagagttgatcttaggttggtgtactattcatgttgaagccagttcttgcgc-TGAT------TC---ACCCC--GCAA-----TGTTTTAAAATA------cgagtc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                c--CTCG--TTTAGTGAA-A-C-AC-GA-----TAGG--TC-G-T-C-TA-GAT----TT---G--TGT-A-AA-T-A-G--TTA-A-T-C---GGGCCTACG--TTACG-CCTAG-ATT-T-G-CC-A-------TC--T-T--TTGTGA--AG-C---aacaatagcaatgcacgcaagcctcagagttgatcttaggttggtgtactattcatgttgaagccagttcttgcgcctcgtttagtgaaacacgataggtcgtctagatttgtgtaaatagttaatcgggcctacgttacgcctagatttgccatcttttgtgaagccgag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ctgattcaccccgcaatgttttaaaataaacaatagcaatgcacgcaagcctcagagttgatcttaggttggtgtactattcatgttgaagccagttcttgcgcCCCC--A--A-----TGTTTTAAAATA----------------------AA-CACATA-G-CAAT-T---GC--GCA--A-G-C-TC--AGAG-T--TT--G--ATCTTAGGTTGGTGTACTAT------------T---TC----A-TG----TTGA-A---GCCCAGTCTTG-CG--CTCG--TTT-GTGAA-A-C-AC-G-A--TTCAGG--TC-G-T-C-TA-GAT----TTT-GG--TGT-A-AA-TTA-G--TTA-A-T-C----GGCCTACG--TTACGCTCTAG--AT-T-T-GC-A-------TC--T-T--TTGTGA--AG-C---CGGcgag
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            C-CAAAATCATATA-G-GCAT-T---GC--GCA--T-G-C-TC--ATAG-T--CT--G----------------------------------------------TG-AA-TTTA-C---GCCCAGCGATA-CG--CTCT--TTT-GTGAA-A-C-GC-G-A--TTTAGG--CC-GGT-C-TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-AC-TTA-G--TTA-G-T-C----GGCCTAAG--TTACGCCCT-G-AAT-T-T-AC-A-------CCT-T-T--TTGTGA--AA-C---GGGCC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                       -CTCAAAATG-CTTCTTTC---TCAAATAAGCAAA-----AATGTATATATTA-TATACC-AAAATC-AGTTACCATA-GTT-TATTGAAATGT--------------------------GCAGTCATGATCGATTTC-CTCGACTCTTCCAATGC-G-G-TGAATTGTC--TTCTGTTGATA-CA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                             TATACC-AATATC-AATT---AGT---T-TGTTGAAATGT-TTACTCAGTAAACGAAA-CATACATGCA-TCATTACTGATTTC-CTTAACTCTTCT--T-TCC-G-TGAGTTGTCA-TT-TGTTGATG-CAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTAACAACA-CG--CTCC--TTT-GTGAA-T-A-GC-T-A--GTTAAG--CC-GGT-C-TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-AA-TTA-T--TTA-G-T-C----GTCCTAGG--TTACTCCC--------T-C-AC-A-------CC--TCT--TTGTGA--AA-ttg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AA--TT--C--AATTCACA---CA-AAA--TATG---TC-C---CTAATTA---A----------------------A--TA-A-C-CATGA-AT-T-GTT-AGC-TTAC--T--TAT--CAaag
gi|2                          :   TTCTT-GT-ACGTTGTA--TTTAGACAAG-ATTATAACAAC-ATGCACCAGTTACAAAATTTTTT-TGTA-TATTTT--GGTGCATGCATGTGTGTGTTTTGTT---CCTGATAAG-ACTCCT--T--AACAGTAAATATTT-CAGAGGTATGCCACGTATATCAGTAGCAC--CTT-TA-CTCAAAATGTCTTCCTTT---TC----------A-----A---TATACAT-AATATACCGGAAATC-AATTCCTAGT-AGT-TATTGAAATGTGCATTT--ATAA-TGAAATT------ACA-TCATGATCG--TTCGCTTAACTCTTCC--T-T-GCG-TGAATTGTCAATT-TGTTAATATTAAA---ATGCAA----ATTAAAAATGGGATTT-TT--CT--TAA--TT--TCAAATTCA-A----C-AAA--TATGC--CC-C---TTAC-TA---A--TA--GTG-TTTGCTTAAAA-A--TA-A-C-CATGA-G--T-TGTGGGC-TTAT--T--TAT--CAAATAAC-GATTTACAT-TT----GGAA-GTATAT--TTCGTT-TAT-TCT-CTC----------GGCATA-AT-TAGTTCATAAAT-TATT-------TT-C--TTAAAAAACCA-A--TATT-TGAT------CC---ACCTCCGA--A-----TGTTTTAAAATA------GT-CT---AACC-CAAAATCATATA-G-GTA--T---GC--GCA--TCG-C-TTCAA-AG-T--CT--G--G--------------ACTAA------------AC--TCG---G-CG-AA-TTTA-TCG-GCCCAGCTATA-C---CTCTTGTTT-GTGAA-A-C-GT-CGA---TTAGG---C-GGT-C-TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-AT-GTA-AGTTTA-G-T-C----GGCCTAAG--TTACGCCCT-G-AAT-T-T-AC-A-------CT--T-T--TTGTGA--AACC---GGGCC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaT--ATAA-TGAAA-C------ACA-TCATGATCGATTAA-CTTAACTCTCCC--T-T-GCGTTGAATTGTC--
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ag------CC---ACCTC--G--A-----TGTTTTAAAATA------GT-C-TCAAAAC-TAAAATCA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctgattcaccccgcaatgttttaaaataaacaatagcaatgcacgcaagcctcagagttgatcttaggttggtgtactattcatgttgaagccagttcttgcgc-TGAT------TC---ACCCC--GCAA-----TGTTTTAAAATA------cgagtc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                c--CTCG--TTTAGTGAA-A-C-AC-GA-----TAGG--TC-G-T-C-TA-GAT----TT---G--TGT-A-AA-T-A-G--TTA-A-T-C---GGGCCTACG--TTACG-CCTAG-ATT-T-G-CC-A-------TC--T-T--TTGTGA--AG-C---aacaatagcaatgcacgcaagcctcagagttgatcttaggttggtgtactattcatgttgaagccagttcttgcgcctcgtttagtgaaacacgataggtcgtctagatttgtgtaaatagttaatcgggcctacgttacgcctagatttgccatcttttgtgaagccgag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ctgattcaccccgcaatgttttaaaataaacaatagcaatgcacgcaagcctcagagttgatcttaggttggtgtactattcatgttgaagccagttcttgcgcCCCC--A--A-----TGTTTTAAAATA----------------------AA-CACATA-G-CAAT-T---GC--GCA--A-G-C-TC--AGA-G-T--TT--G--ATCTTAGGTTGGTGTACTAT------------T---TC----A-TG----TTGA-A---GCCCAGTCTTG-CG--CTCG--TTT-GTGAA-A-C-AC-G-A--TTCAGG--TC-G-T-C-TA-GAT----TTT-GG--TGT-A-AA-TTA-G--TTA-A-T-C----GGCCTACG--TTACGCTCTAG--AT-T-T-GC-A-------TC--T-T--TTGTGA--AG-C---CGGcgag
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C-CAAAATCATATA-G-GCAT-T---GC--GCA--T-G-C-TC--ATA-G-T--CT--G----------------------------------------------TG-AA-TTTA-C---GCCCAGCGATA-CG--CTCT--TTT-GTGAA-A-C-GC-G-A--TTTAGG--CC-GGT-C-TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-AC-TTA-G--TTA-G-T-C----GGCCTAAG--TTACGCCCT-G-AAT-T-T-AC-A-------CCT-T-T--TTGTGA--AA-C---GGGCC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                      -CTCAAAATG-CTTCTTTCTCAAATAAGCAAA-----AATGTATATATTA-TATACC-AAAATC-AGTTACCATA-GTT-TATTGAAATGT--------------------------GCAGTCATGATCGATTTC-CTCGACTCTTCCAATGC-G-G-TGAATTGTC--TTCTGTTGATA-CA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                         TATACC-AATATC-AATT---AGT---T-TGTTGAAATGT-TTACTCAGTAAACGAAA-CATACATGCA-TCATTACTGATTTC-CTTAACTCTTCT--T-TCC-G-TGAGTTGTCA-TT-TGTTGATG-CAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTAACAACA-CG--CTCC--TTT-GTGAA-T-A-GC-T-A--GTTAAG--CC-GGT-C-TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-AA-TTA-T--TTA-G-T-C----GTCCTAGG--TTACTCCC--------T-C-AC-A-------CC--TCT--TTGTGA--AA-ttg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AA--TT--C--AATTCACA---CA-AAA--TATG---TC-C---CTAATTA---A----------------------A--TA-A-C-CATGA-AT-T-GTT-AGC-TTAC--T--TAT--CAaag
gi|2                          :   TTCTT-GT-ACGTTGTAT-TTAGACAAG-ATTATAACAAC-ATGCACCAGTTACAAAATT-TTTTTGTA-TATTTTG-G-TGCATGCATGTGTGTG-T-TTTGT-TCCTGATAAG-ACTCCT---TA-ACAGTAAATATTT-CAGAGGTATGCCACGTATATCAGTAGCAC--CTT-TA-CTCAAAATGTCTTCCTTTTC----------A-----A---TATACAT-AATATACCGGAAATC-AATTCCTAGT-AGT-TATTGAAATGTGCATTT--ATAA-TGAAATT------ACA-TCATGATCG--TTCGCTTAACTCTTCC--T-T-GCG-TGAATTGTCAATT-TGTTAATATTAAA---ATGCAA----ATTAAAAATGGGATTT-TT--CT--TAA--TT--TCAAATTCA-A----C-AAA--TATGC--CC-C---TTAC-TA---A--TA--GTG-TTTGCTTAAAA-A--TA-A-C-CATGA-G--T-TGTGGGC-TTAT--T--TAT--CAAATAAC-GATTTACA---T-TT--GGAA-GTAT--AT--TTCGTT-TAT-TCT-CTC----------GGCATA-AT-TAGTTCATAAAT-TATT-------TT-C--TTAAAAAACCA-A--TATT-TGAT------CC---ACCTCCGA--A-----TGTTTTAAAATA------GT-CT---AACC-CAAAATCATATA-G-GTA--T---GC--GCA--TCG-C-TTCAA-A-G-T--CT--G--G--------------ACTAA------------AC--TCG---G-CG-AA-TTTA-TCG-GCCCAGCTATA-C---CTCTTGTTT-GTGAA-A-C-GT-CGA---TTAGG---C-GGT-C-TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-AT-GTA-AGTTTA-G-T-C----GGCCTAAG--TTACGCCCT-G-AAT-T-T-AC-A-------CT--T-T--TTGTGA--AACC---GGGCC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaT--ATAA-TGAAA-C------ACA-TCATGATCGATTAA-CTTAACTCTCCC--T-T-GCGTTGAATTGTC--
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ag------CC---ACCTC--G--A-----TGTTTTAAAATA------GT-C-TCAAAAC-TAAAATCA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctgattcaccccgcaatgttttaaaataaacaatagcaatgcacgcaagcctcagagttgatcttaggttggtgtactattcatgttgaagccagttcttgcgc-TGAT------TC---ACCCC--GCAA-----TGTTTTAAAATA------cgagtc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                c--CTCG--TTTAGTGAA-A-C-AC-GA-----TAGG--TC-G-T-C-TA-GAT----TT---G--TGT-A-AA-T-A-G--TTA-A-T-C---GGGCCTACG--TTACG-CCTAG-ATT-T-G-CC-A-------TC--T-T--TTGTGA--AG-C---aacaatagcaatgcacgcaagcctcagagttgatcttaggttggtgtactattcatgttgaagccagttcttgcgcctcgtttagtgaaacacgataggtcgtctagatttgtgtaaatagttaatcgggcctacgttacgcctagatttgccatcttttgtgaagccgag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ctgattcaccccgcaatgttttaaaataaacaatagcaatgcacgcaagcctcagagttgatcttaggttggtgtactattcatgttgaagccagttcttgcgcCCCC--A--A-----TGTTTTAAAATA----------------------AA-CACATA-G-CAAT-T---GC--GCA--A-G-C-TC--AGA-G-T--TT--G--ATCTTAGGTTGGTGTACTAT------------T---TC----A-TG----TTGA-A---GCCCAGTCTTG-CG--CTCG--TTT-GTGAA-A-C-AC-G-A--TTCAGG--TC-G-T-C-TA-GAT----TTT-GG--TGT-A-AA-TTA-G--TTA-A-T-C----GGCCTACG--TTACGCTCTAG--AT-T-T-GC-A-------TC--T-T--TTGTGA--AG-C---CGGcgag
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C-CAAAATCATATA-G-GCAT-T---GC--GCA--T-G-C-TC--ATA-G-T--CT--G----------------------------------------------TG-AA-TTTA-C---GCCCAGCGATA-CG--CTCT--TTT-GTGAA-A-C-GC-G-A--TTTAGG--CC-GGT-C-TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-AC-TTA-G--TTA-G-T-C----GGCCTAAG--TTACGCCCT-G-AAT-T-T-AC-A-------CCT-T-T--TTGTGA--AA-C---GGGCC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                      -CTCAAAATG-CTTCTTTCTCAAATAAGCAAA-----AATGTATATATTA-TATACC-AAAATC-AGTTACCATA-GTT-TATTGAAATGT--------------------------GCAGTCATGATCGATTTC-CTCGACTCTTCCAATGC-G-G-TGAATTGTC--TTCTGTTGATA-CA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                         TATACC-AATATC-AATT---AGT---T-TGTTGAAATGT-TTACTCAGTAAACGAAA-CATACATGCA-TCATTACTGATTTC-CTTAACTCTTCT--T-TCC-G-TGAGTTGTCA-TT-TGTTGATG-CAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTAACAACA-CG--CTCC--TTT-GTGAA-T-A-GC-T-A--GTTAAG--CC-GGT-C-TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-AA-TTA-T--TTA-G-T-C----GTCCTAGG--TTACTCCC--------T-C-AC-A-------CC--TCT--TTGTGA--AA-ttg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AA--TT--C--AATTCACA---CA-AAA--TATG---TC-C---CTAATTA---A----------------------A--TA-A-C-CATGA-AT-T-GTT-AGC-TTAC--T--TAT--CAaag
gi|2                          :   TTCTT-GT-ACGTTGTAT-TTAGACAAG-ATTATAACAAC-ATGCACCAGTTACAAAATT-TTTTTGTA-TATTTTG-G-TGCATGCATGTGTGTG-T-TTTGT-TCCTGATAAG-ACTCCT---TA-ACAGTAAATATTT-CAGAGGTATGCCACGTATATCAGTAGCAC--CTT-TA-CTCAAAATGTCTTCCTTTTC----------A-----A---TATACAT-AATATACCGGAAATC-AATTCCTAGT-AGT-TATTGAAATGTGCATTT--ATAA-TGAAATT------ACA-TCATGATCG--TTCGCTTAACTCTTCC--T-T-GCG-TGAATTGTCAATT-TGTTAATATTAAA---ATGCAA----ATTAAAAATGGGATTT-TT--CT--TAA--TT--TCAAATTCA-A----C-AAA--TATGC--CC-C---TTAC-TA---A--TA--GTG-TTTGCTTAAAA-A--TA-A-C-CATGA-G--T-TGTGGGC-TTAT--T--TAT--CAAATAAC-GATTTACA---T-TT--GGAA-GTAT--AT--TTCGTT-TAT-TCT-CTC----------GGCATA-AT-TAGTTCATAAAT-TATT-------TT-C--TTAAAAAACCA-A--TATT-TGAT------CC---ACCTCCGA--A-----TGTTTTAAAATA------GT-CT---AACC-CAAAATCATATA-G-GTA--T---GC--GCA--TCG-C-TTCAA-A-G-T--CT--G--G--------------ACTAA------------AC--TCG---G-CG-AA-TTTA-TCG-GCCCAGCTATA-C---CTCTTGTTT-GTGAA-A-C-GT-CGA---TTAGG---C-GGT-C-TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-AT-GTA-AGTTTA-G-T-C----GGCCTAAG--TTACGCCCT-G-AAT-T-T-AC-A-------CT--T-T--TTGTGA--AACC---GGGCC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaT--ATAA-TGAAA-C------ACA-TCATGATCGATTAA-CTTAACTCTCCC--T-T-GCGTTGAATTGTC--
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ag------CC---ACCTC--G--A-----TGTTTTAAAATA------GT-C-TCAAAAC-TAAAATCA
gi|22                         :                                                                                                                                                                         ---AC--TTTATA-CTCAAAATG-CTTCTTTTTCA------
gi|3                          : acTTCTTTGT-ACGTTGTA--TT-GATAAGTATTATAACAACGATGCACCATTTACATAATTCTTTTTGTAATATTTTTTGCTGCATGCATGTGTGTGTT-GTTTTCT----ATAAGAACTCCTAATTAAGCAGT-AATATTTCAAGAGGTATGCCAAGTATATCAGT---AC--TTTATATCTCAAAATG-CTTCCTTCTT-------CAAA-----A---TAT-CATGAATATAC--GAAATC-AATTCCTAGT-GTT-TATTTGCATGT-TAATT--ATAA-TGAAA-T-------CA-TCATGATCGATTTC-CTTAACTCTTCC--T-T-G-G--GAATTGTC--TT-TGTTAATA-TAAA---AT-C-A----ATTAAAAATGGGA-TT-TT--CT--TAA--TT--C--A-TTC------CC-AAA--TATG---CC-C---TTA--TA---A--T-T-GTATTTTGCTT-----T--TATA-C-CATGA-GT-T-TGT-GGC-TTAT--T--TAT--CAAAT-GC-A--TTAC----T-TT--GGAA----T--AT--TTTGTT-TAT-T-T-CTC----------GGCA-A-AT-TA-TTCATAAAT-TATT-------TT-T--T---AAAACCATA--CA-T-TGAT------CC---ACCTC--G--A-----TGTTTTAAAATAT-----GT-CTCCAAACC-CAAAATCATATA-G-GTAT-T---GC--GCA--T-G-C-TC--A-A-G-T--CT--G--G--------------ACTAA------------A---TC----G-CG-AAATTTA-C---GCCCAGCGATA-CG--CTCT--TTT-GTGCA-A-C-AC-GGA--TTTAGG--CC-GGT---TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-AC-TTA-G--TTA-G-TCC---GGGCCTAAG--GTACGCCCCAG-AAT-T-T-AC-A-------CC--T-T--TTGTGA--AA-C---GGGCCagtgag
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T-TGTTCAAG-TAAA----T-C-ACATAATTAAAAATGGTA-TT-TTTTCT--TAAATTT--CG-AATTCACA---CCTAAA--TATA---CT-CGAGTTA--TA---AAATAT-GAATTTTGCTT-----A--TA-A-CGCATGA-GT-T-T-T-GGTGCTAT--TG-TAT--CAA-T-ACGA--TTAAACCTT-CT--GGGA-G--TGTAT--TTCGTTCTAT-T-T-CTCTCGCGATAAAGGCA-A-AT-TAGTTCATGATTATATT-------TC-T--T---AAAAACA-AAACA-TATGATAGTTCCCCGAAACCTC--G--AGTGATTATTTAAAAATA------GTTCATCAAACC-CAAATTCATATA-G-GTATCT---GC--GCAGTT-GCC-TCA-A-A-G-TCGCTGAG--A--------------ACTAA------------C---TC----GCCGTAA-TTTA-CTCGGCCCAGCGATAGCGAACTCT--TTT-GTGAATATT-GCAGGATCTTTAGG--CCAGGTCC-TAGGATGGTGTAT-GGGCCGT-A----CTA-G--TTA-GAT-C---AGACCTAAAGTTTACGTCCCTG-AAT-TATAAC-A-------CCATT-T--TTGTGA--AA-CAGAGGGC
gi|5                          :                                                                                                                                                                         ---AC--TTTATA-CT-AATATG-CTTTTTTT--A------TAGA-----A------AGATGA------T-GAA-TC-AATTC----T-GTTAGACTGA--TGT--AATT--TTAA-TGA--------------TTA-GA--GATTT-----AACT-------T-T-G-G-T---TT-TA--TT-TGTTGATA-TA------T-C-A----ATTAAAATTGGGG-AT-TT--CT--TAA--TT--T---ATTTACA---T----A--TATT---AA-C----TA--TAGATA--TAT-GTA-TTTGCTTTG---T--TA-A-T-CA-GA-G----TGT--GC-TTATAATTATAT--CAAAT-AA-A--TT-CA-----TT--GGAATG--T--ATTATTAGTT-TAT-T-T-C--------------CA-A-ATCTAGTT--TGAAT-TTTT-------TC-T--T---AAAAC---A--CA-T---GT------CC---TCC-A--A--A-----TGTTTT--AATT------GA-GTTCAAATA-C-AAATTATATA-----AT-TTGAGC---CA--T-G-CTTC--A-A-GCT--TT--G------------------CTAA------------A---CC------CG-AA-ATTT-C---G-CCA--GATG-CG---TCT--TTT-GTAGA-A-TAGC-GAT--TTTAGG--CT--GT-C-TA-GAT----TTG-GG--T-T-A-AC--GA-G--TTA-T-T-C---G---CTAA---TTATGCGACAT-GATAT-T-AA-A-------CCT-T-T--TTGTG---AA-C---GGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atataattacATA-TTAACTGAT-C-A----ATTAAAAATGGGA-TTCTT--CT--TTA--TTT-C--AATTCACA---CC-AAACTTATTTTTCCGC---TTAA-TA---A---AT-GTATTT-GCTA-----AA-TA-A-C-CAGGA-GT----GT-GCCCTTAT--T---ATTCCATAT-AC-A--T-ACA---T-TT----AA-G--T--ATA-TTCGTT--AT-T-TACT------------ACA-A-AT-TAGT-CATAAAT-TATT-------TT-TCTT---AAAACCA----CA-T-TAAT------CC---ACCTC--A--A-----TGGTTTAAAATA------GT-TCTCAAACCACAAAATCATATA-GCGTAT-T---GC--GCA--TCG-C-CA--A-A-G-T--CT--GGAG--------------ACACA------------ACT-TC----G-C-------TATC---GCCCAGCGCTA-CG----CT--TTT-GTGAA-A-CTGC-GAG--TTTAGGTTCC-GGT-CTTA-GAT----TTTGGG--CGTCATAC-TTATG--CTACG-T-CTTAGATCCTAAG--TT-CACCCCTG-AAT-T-T-ATAA-------CC--T-TTCTTGTAATTAA-C---TGGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            a--TGT-GTCTTTAATTT-----AAACA-A-T-CATGACATAT-TGT-A---TTCT--T--TAT--CCA-T-ACTA--TTATA---T-CTTCAGGC-G--T--A-----AATT-AAT-T-T-CTT----------AGTA-ATAT-TCTTTTATAA-T-TCCTCTGGAGCTT-T--T---AAAAC-A-A--TC-T-TGAT------CC---ACCTC--A--A-----CGTTTTGAAATACATGTGGT-CT--AAAAA-TAAAA--AAAAA-----------------CA--T-G-C-TC--A-A-A-T--GT--G--G--------------TCTAAGACTGGTGTACTA---TT----T-CG-AG-TTCA-C---GCCCACCATTA-TG--CTCC--TTT-GTGAA-A-C-GC--GA--TTTATG--CC-AGT-C-TT-AAT----TTT--G--TGC-A------A-A--TTA-G-T-C---G----------------CCCAA-AAT-T-T-AC-A-------CC--T-A--TTGTGA--Aag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttgcttaatttacgcacaaagctT--C--AATTCACA---CT-AAA--TATG---CC-CC--TTA--TG---A--TAT-GTATTT-ACTTTAAAAA--TA-A-C-CATGA-GT-CGTG--GGC-TTAT--T--TAT--CAAAT-AC-A--TTACA---T-TT--GGAA-G--T--ATATTTCGTT-TAT-T-T-TTC----------GGCA-A-AT-TAGTTCAT-----TATT-------TTCT--T---AAAACCA----CA-T-TGAT------CC---ACCTC--G--A-----TGTTTTAAAATA------GT-CT-CAAAAC-CAAAATCATATA-G-GTAT-T---GC--GCA--T-G-C-TC--A-AAG-T--CT--G--G--------------ACGAA------------ACAGTC----G-CG-AA-TTTA-C---GCCCAGCGATA-CG--CTCT--TTT-GTGAA-A-C-GC--GA--TTTAGG--CC-GGT-C-TA-GAT----TTT-AG--CGT-A-AC-TTA-G--TTA-G-T-C----GGCCTgga


blockSeqs                     :        T  .        T   A      T           G              A    C        A      TTGC             G  TT      C CCTG     AA     AAT  A     A       C     G     C            AGC  .       T         T        TCAAATAAGCAAAAATGT           T A     CG      .    ACC   G   A      A    GC    CAG  AA   AACATACATG   G      T      CG            AA G GCGTTG     G  AA  C    G   T  AATCACATA             A     T  C  TT  .    AT  TCA          CCT      CT    TTTCCGCT     AT  GAT AATAT    T  T    TAAAAA    T . G     C TTGTTAGC        AA TA   TC   A A  G AT     CCTT   TC    GTA  GT  TA      CT  . C A  CTCGCGATAAA G  T T  C          A A    CTGGAGC  C CT TAA     C AAA   T A    AGTTCC  GAA     GCA   GTGAT            CATGTGGTCT      C A            GC     C TGA  .    GT C C T  CA G A C CG  GA ATCTTAGGTTGGTGTACTATTTCA                        T  A    T TCG           G  AA    TG   A     T T A  AGGATCT     TTC A G C T  G   GGTG  TG  GC   C TACTT  T GT   C A C TTAG        GT     C  TA .   A A A  A .        AT C TC      TT  C AGA
blockSeqs                     :        .  .        .   .      .           .              T    .        .      GG               G  T       . .        A      .    .     .       .     G     C            .    .       .         .        TTCAAAAT                     G A     C       .    CCT   A   .      A    T     A    A    AATTA        .      C      C             .  . CCGTG      G  A   .    G   .  AACTGATCA             A     .  .  .   .    .   CG           CA       .     CTCGAGT      C   .   TAT      T  T    AAAAA     . . .     . TTGTGGGC        .  G    .    A .  T .      T      .     TG   .   AT      T   . . .  C           G  . .  .          A .    .        . .  .       C TA    . .    .       .       GCA   .                TGTCTC          A .            G      . .    .    .  C . .  A  T . . .   .  GTCTAAGACTGGTGTACTATTT                          .  .    . CG            .  .     .    A     . . T  GGAT        T   . G . .  .   .     T   .    . AATT   . .    . . . G           .      C  TA .   . . .  . .        T  . .       .   . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                         .    .       .         .        ATAGAA                       G .     C       .    CCT   G   .      A    T     A    A    AACA         .      T      C             .  . GCGTG      G  .   .    A   .  AAATGCAA              A     .  .  .   .    .   TC           CC       .     CCCCT        A   .   TGT      T  T    TGT       . . .     . TTTGTGGC        .  .    .    A .  . .      T      .     G    .   A       T   . . .  C           G  . .  .          T .    .        . .  .       C A     . .    .       .       CGA   .                GTTCAT          C .            G      . .    .    .  . . .  .  . . . .   .  GAGACACAACTTCG                                  .  .    . .             .  .     .    .     . . .  GATT        T   . G . .  .   .     T   .    . ACTT   . .    . . . G           .      C  TA .   . . .  . .        T  . .       .   . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                         .    .       .         .        TCAAT                        . .     T       .    C     G   .      C    .     A    A    AAT          .      T      A             .  . GGTG       G  .   .    A   .  AAATCA                T     .  .  .   .    .   C            CC       .     CCCCT        .   .   TAT      T  T    AAA       . . .     . TTTTGGTG        .  .    .    A .  . .      T      .     G    .   .       T   . . .  T           A  . .  .          A .    .        . .  .       C A     . .    .       .       A     .                GAGTT           C .            G      . .    .    .  . . .  .  . . . .   .  GACGAAACAGTCG                                   .  .    . .             .  .     .    .     . . .  GAGT        T   . G . .  .   .     T   .    . AATT   . .    . . . G           .      C  CA .   . . .  . .        .  . .       .   . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                      .         .                                             .       .    .     .   .      .    .     T    A    G            .      T      C             .  . GGG        G  .   .    C   .  TCA                   A     .  .  .   .    .   C            CT       .     TCCC         .   .   TA       T  A    AA        . . .     . TCGTGGGC        .  .    .    A .  . .      T      .     G    .   .       A   . . .  C           G  . .  .          A .    .        . .  .       C A     . .    .       .       G     .                GTTCT           T .            G      . .    .    .  . . .  .  . . . .   .  GACTAAACTCGG                                    .  .    . .             .  .     .    .     . . .  GAT         C   . G . .  .   .     T   .    . ATGT   . .    . . . A           .      C  CT .   . . .  . .        .  . .       .   . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                       .    .    .            .      .      .             .  . GGT        .  .   .    G   .                                             .   T            C        .     CCCT         .   .   TT       .  .    A         . . .     . TGTGCCC         .  .    .    . .  . .      T      .     G    .   .       T   . . .  .           G  . .  .          . .    .        . .  .       . .     . .    .       .       G     .                GTCT            C .            G      . .    .    .  . . .  .  . . . .   .  AACTAACTCGC                                     .  .    . .             .  .     .    .     . . .  GAT         C   . G . .  .   .     T   .    . ACTT   . .    . . . G           .      T  CA .   . . .  . .        .  . .       .   . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .                                                 C            T        .     AAC          .   .   AT       .  .    T         . . .     . TATTGTA         .  .    .    . .  . .      .      .     .    .   .       .   . . .  .           .  . .  .          . .    .        . .  .       . .     . .    .       .       G     .                GTCT            A .            G      . .    .    .  . . .  .  . . . .   .  GACTAAATCG                                      .  .    . .             .  .     .    .     . . .  TAG         C   . G . .  .   .     T   .    . ACTT   . .    . . . G           .      C  CT .   . . .  . .        .  . .       .   . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .        .  .    A         . . .     . TGTGC           .  .    .                                                                                                                                 .    .       .       A     .                GTCT            A .            .      . .    .    .  . . .  .  . . . .   .  CTAAACC                                         .  .    . .             .  .     .    .     . . .  CGA         C   . G . .  .   .     G   .    . AAT    . .    . . . .           .      C  CA .   . . .  . .        .  . .       .   . .  
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .       .       A     .                                  .                                                                                                                                 .  .     .    .     . . .  GAT         C   . . . .  .   .     T   .    . ACG    . .    . . . .           .      .  T  .   . . .  . .        .  . .       .   .    
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        c--CTCG--TTTAGTGAA----AC-A-C-GA--T--AGG--TC-G-T-C-TA-GAT----TT---G--TGT-A-A-AT-A-G--TTA-A-T-C---GGGCCTACG--TTACG-CCTAG-ATT-T-G-CC-A-------TC--T-T--TTGTGA--AG-C---aacaatagcaatgcacgcaagcctcagagttgatcttaggttggtgtactattcatgttgaagccagttcttgcgcctcgtttagtgaaacacgataggtcgtctagatttgtgtaaatagttaatcgggcctacgttacgcctagatttgccatcttttgtgaagccgagtc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctgattcaccccgcaatgttttaaaataaacaatagcaatgcacgcaagcctcagagttgatcttaggttggtgtactattcatgttgaagccagttcttgcgc-TGAT------TC---ACCCC--GCAA-----TGTTTTAAAATA------cgagtc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        c--CTCG--TTTAGTGAA----AC-A-C-GA--T--AGG--TC-G-T-C-TA-GAT----TT---G--TGT-A-A-AT-A-G--TTA-A-T-C---GGGCCTACG--TTACG-CCTAG-ATT-T-G-CC-A-------TC--T-T--TTGTGA--AG-C---aacaatagcaatgcacgcaagcctcagagttgatcttaggttggtgtactattcatgttgaagccagttcttgcgcctcgtttagtgaaacacgataggtcgtctagatttgtgtaaatagttaatcgggcctacgttacgcctagatttgccatcttttgtgaagccgag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctgattcaccccgcaatgttttaaaataaacaatagcaatgcacgcaagcctcagagttgatcttaggttggtgtactattcatgttgaagccagttcttgcgcCCCC--A--A-----TGTTTTAAAATA------------------------AA-CACATA-G-CAAT-T---GC--GCA--A-G-C-TC--AGA-G-T--TT--G--ATCTTAG-G---T--TG-G----------TGTACTATTTCATGTTGA-A---GCCCAGTCTTG-CG--CTCG--TTT-GTGAA----AC-A-C-GA--TTCAGG--TC-G-T-C-TA-GAT----TTT-GG--TGT-A-A-ATTA-G--TTA-A-T-C----GGCCTACG--TTACGCTCTAG--AT-T-T-GC-A-------TC--T-T--TTGTGA--AG-C---CGGcgag
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C-CAAAATCATATA-G-GCAT-T---GC--GCA--T-G-C-TC--ATA-G-T--CT--G-------------------------------TG-A--ATTT-------A-C---GCCCAGCGATA-CG--CTCT--TTT-GTGAA----AC-G-C-GA--TTTAGG--CC-GGT-C-TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-A-CTTA-G--TTA-G-T-C----GGCCTAAG--TTACGCCCT-G-AAT-T-T-AC-A-------CCT-T-T--TTGTGA--AA-C---GGGCC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                      -CTCAAAATG-CTTCTTT-CT-------CAAATAAGCAAAAATGTATATATTA-TATACC-AAAATC-AGTTACCATA-GTT-TATTGAAATGTGCA-------------------------GTCATGATCGATTTC-CTCGACTCTTCCAATGCGG-TGAATTGTC--TTCTGTTGATA-CA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                            TATACC-AATATC-AATT---AGT---T-TGTTGAAATGT-TTACTCAGTAAACGAAA-CATACATGCATCATTACTGATTTC-CTTAACTCTTCT-TTCC-G-TGAGTTGTCA-TT-TGTTGATG-CAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTAACAACA-CG--CTCC--TTT-GTGAA----TA-G-C-TA--GTTAAG--CC-GGT-C-TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-A-ATTA-T--TTA-G-T-C----GTCCTAGG--TTACTCCC--------T-C-AC-A-------CC--TCT--TTGTGA--AA-ttg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AA--TT--C--AATTCACA---CA-AAA--TA---TGTCCC-------TA---A--T----TA-------------A-A-TAA-C-CATGA---ATT-GTTA-GCTTAC--T--TAT--CAaag
gi|2                          :   TTCTT-GT-ACGTTGTAT-TTAGACAAG-ATTATAACAAC-ATGCACCAGTTACAAAATT-TTTTTGTA-TATTTTG-G-TGCATGCATGTGTGTG-T-TTTGT-TCCTGATAAG-ACTCCT---TA-ACAGTAAATATTT-CAGAGGTATGCCACGTATATCAGTAGCAC--CTT-TA-CTCAAAATGTCTTCCTT-TT-------C--A-----------ATATACAT-AATATACCGGAAATC-AATTCCTAGT-AGT-TATTGAAATGTGCATTT--ATAA-TGAAATTA------CATCATGATCG--TTCGCTTAACTCTTCC-TTGC-G-TGAATTGTCAATT-TGTTAATATTAAA---ATGCA---AATTAAAAATGGGATTT-TT--CT--TAA--TT--TCAAATTCA-A----C-AAA--TA---TGCCCC--TT-ACTA---A--TA--GTG-TTTGC-TTAAA-A-A-TAA-C-CATGA---GTT-GTGG-GCTTAT--T--TAT--CAAATAAC-GATTTACA---T-TT--GGAA-GTAT--AT--TTCGTT-TAT-TCT-CTC----------GGCATA-AT-TAGTTCATAAAT-TATT-------TT--CTTAAAAAACCA-A--TATT-TGAT------CC---ACCTCCGA--A-----TGTTTTAAAATA------G-TC--T---AACC-CAAAATCATATA-G-GTA--T---GC--GCA--TCG-C-TTCAA-A-G-T--CT--G--GACT-AA-A---C--TCGG----------CG-A--ATTT-------A-TCG-GCCCAGCTATA-C---CTCTTGTTT-GTGAA----AC-GTC-GA---TTAGG---C-GGT-C-TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-A-TGTA-AGTTTA-G-T-C----GGCCTAAG--TTACGCCCT-G-AAT-T-T-AC-A-------CT--T-T--TTGTGA--AACC---GGGCC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaT--ATAA-TGAAA-CA------CATCATGATCGATTAA-CTTAACTCTCCC-TTGC-GTTGAATTGTC--
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ag------CC---ACCTC--G--A-----TGTTTTAAAATA------G-TC--TC-AAAAC-TAAAATCA
gi|22                         :                                                                                                                                                                         ---AC--TTTATA-CTCAAAATG-CTTCTTT-TT-------CA
gi|3                          : acTTCTTTGT-ACGTTGTA--TT-GATAAGTATTATAACAACGATGCACCATTTACATAATTCTTTTTGTAATATTTTTTGCTGCATGCATGTGTGTGTT-GTTTTCT----ATAAGAACTCCTAATTAAGCAGT-AATATTTCAAGAGGTATGCCAAGTATATCAGT---AC--TTTATATCTCAAAATG-CTTCCTTCTT-------CAAA-----------ATAT-CATGAATATAC--GAAATC-AATTCCTAGT-GTT-TATTTGCATGT-TAATT--ATAA-TGAAA-T-------CATCATGATCGATTTC-CTTAACTCTTCC-TTG--G--GAATTGTC--TT-TGTTAATA-TAAA---AT-CA---A-TTAAAAATGGGA-TT-TT--CT--TAA--TT--C--A-TTC------CC-AAA--TA---TGCCC---TT-A-TA---A--T-T-GTATTTTGC-TT----TTA-TA--C-CATGA---GTTTGTGG--CTTAT--T--TAT--CAAAT-GC-A--TTAC----T-TT--GGAA----T--AT--TTTGTT-TAT-T-T-CTC----------GGCA-A-AT-TA-TTCATAAAT-TATT-------TT--TT---AAAACCATA--CA-T-TGAT------CC---ACCTC--G--A-----TGTTTTAAAATAT-----G-TC--TCCAAACC-CAAAATCATATA-G-GTAT-T---GC--GCA--T-G-C-TC--A-A-G-T--CT--G--GACT-AA-A------TC-G----------CGAA--ATTT-------A-C---GCCCAGCGATA-CG--CTCT--TTT-GTGCA----AC-A-CGGA--TTTAGG--CC-GGT---TA-GAT----TTT-GG--CGT-A-A-CTTA-G--TTA-G-TCC---GGGCCTAAG--GTACGCCCCAG-AAT-T-T-AC-A-------CC--T-T--TTGTGA--AA-C---GGGCCagtgag
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T-TGTTCAAG-TAAA----T-CACATAATTAAAAATGGTA-TT-TTTTCT--TAAATTT--CG-AATTCACA---CCTAAA--TA---TACTCGAGTT-A-TA---AAATAT-GAATTTTGC-TT----A---TAA-CGCATGA---GTT-TTGGTGCT-AT--TG-TAT--CAA-T-ACGA--TTAAACCTT-CT--GGGA-G--TGTAT--TTCGTTCTAT-T-T-CTCTCGCGATAAAGGCA-A-AT-TAGTTCATGATTATATT-------TC--TT---AAAAACA-AAACA-TATGATAGTTCCCCGAAACCTC--G--AGTGATTATTTAAAAATA------G-TTCATC-AAACC-CAAATTCATATA-G-GTATCT---GC--GCAGTT-GCC-TCA-A-A-G-TCGCTGAG--AACT--A-A---C--TC-GC---------CGTA--ATTT-------A-CTCGGCCCAGCGATAGCGAACTCT--TTT-GTGAATATTGC-A-G-GATCTTTAGG--CCAGGTCC-TAGGATGGTGTAT-GGGCCGT-A----CTA-G--TTA-GAT-C---AGACCTAAAGTTTACGTCCCTG-AAT-TATAAC-A-------CCATT-T--TTGTGA--AA-CAGAGGGC
gi|5                          :                                                                                                                                                                         ---AC--TTTATA-CT-AATATG-CTTTTTT-TA-------TAGA-----------A---AGATGA------T-GAA-TC-AATTC----T-GTTAGACTGA--TGT--AATT--TTAA-TGA-------------TTA-GA--GATTT-----AACT------TTG-------GTTTTA--TT-TGTTGATA-TA------T-CA---A-TTAAAATTGGGG-AT-TT--CT--TAA--TT--T---ATTTACA---T----A--TA---TTAAC----T-A-TAGATA--TAT-GTA-TTTGCTTT----G-T-TAA-T-CA-GA---G-T-GT---GCTTATAATTATAT--CAAAT-AA-A--TT-CA-----TT--GGAATG--T--ATTATTAGTT-TAT-T-T-C--------------CA-A-ATCTAGTT--TGAAT-TTTT-------TC--TT---AAAAC---A--CA-T---GT------CC---TCC-A--A--A-----TGTTTTAATTGA------G-T---TC-AAATA-C-AAATTATATA-----AT-TTGAGC---CA--T-G-CTTC--A-A-GCT--TT--G----CT-AA-A---C--CC-G-----------A-A--ATTT---------C---G-CCA--GATG-CG---TCT--TTT-GTAGA----ATAG-C-GAT-TTTAGG--CT--GT-C-TA-GAT----TTG-GG--T-T-A-A-C-GA-G--TTA-T-T-C---G---CTAA---TTATGCGACAT-GATAT-T-AA-A-------CCT-T-T--TTGTG---AA-C---GGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atataattacATA-TTAACTGAT-CA---A-TTAAAAATGGGA-TTCTT--CT--TTA--TTT-C--AATTCACA---CC-AAACTTATTTTTCCGC--TTAA-TA---A---AT-GTA-TTTGC-TA----A-A-TAA-C-CAGGA---G-T-GTGC-CCTTA---T--TATTCCATAT-AC-A---TACA---T-TT----AA-G--T--ATA-TTCG-T-TAT-T-TACT------------ACA-A-AT-TAG-TCATAAAT-TATT-------TTTCTT---AAAACC--A--CA-T-TAAT------CC---ACCTC--A--A-----TGGTTTAAAATA------GTTC--TC-AAACCACAAAATCATATA-GCGTAT-T---GC--GCA--TCG-C-CA--A-A-G-T--CT--GGAGACA-CA-A---CT-TC-G----------C--------T-------ATC---GCCCAGCGCTA-CG----CT--TTT-GTGAA----ACTG-C-GAG-TTTAGGTTCC-GGT-CTTA-GAT----TTTGGG--CGTCATA-CTTATG--CTACG-T-CTTAGATCCTAAG--TT-CACCCCTG-AAT-T-T-ATAA-------CC--T-TTCTTGTAATTAA-C---TGGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          a--TGT-GTCTTTAAT-TT----A-AACAA-T-CATGACATATT-GTA----TTCT--T--TAT--CCA-T-ACTA--TTATA---T-CTTCAGGC-G--T--A-----AATT-AAT-T-T-CTT----------AGTA-ATAT-TCTTTTATAA-T-TCCTCTGGAGCTT--TT---AAAAC-A-A--TC-T-TGAT------CC---ACCTC--A--A-----CGTTTTGAAATACATGTGG-TC--TA-AAAAT-AAAAA----AAA-A---------------CA--T-G-C-TC--A-A-A-T--GT--G--GTCT-AAGA---C--TG-GTGTACTATTTCG-A--GTTC-------A-C---GCCCACCATTA-TG--CTCC--TTT-GTGAA----AC-G-C-GA--TTTATG--CC-AGT-C-TT-AAT----TTT--G--TGC-A-A-A-------TTA-G-T-C---G----------------CCCAA-AAT-T-T-AC-A-------CC--T-A--TTGTGA--Aag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttgcttaatttacgcacaaagctT--C--AATTCACA---CT-AAA--TA---TGCCCC--TT-A-TG---A--TAT-GTATTT-AC-TTTAAAA-A-TAA-C-CATGA---GTC-GTGG-GCTTAT--T--TAT--CAAAT-AC-A--TTACA---T-TT--GGAA-G--T--ATATTTCGTT-TAT-T-T-TTC----------GGCA-A-AT-TAGTTCAT-----TATT-------TTC-TT---AAAACCA----CA-T-TGAT------CC---ACCTC--G--A-----TGTTTTAAAATA------G-TC--TC-AAAAC-CAAAATCATATA-G-GTAT-T---GC--GCA--T-G-C-TC--A-AAG-T--CT--G--GACG-AA-A---CAGTC-G----------CG-A--ATTT-------A-C---GCCCAGCGATA-CG--CTCT--TTT-GTGAA----AC-G-C-GA--TTTAGG--CC-GGT-C-TA-GAT----TTT-AG--CGT-A-A-CTTA-G--TTA-G-T-C----GGCCTgga
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): GGGGGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAAGGTTCTCTTTTGAACTTTAATAAGAGGAAACAACAATAATGTACCATAATAGATGCATGCTTCATTTCCAGCATTATGTACATAAATTAAAGCTGATATTTATTTCTTCATGCTAAAGTACGAATGTGTACAGCTATATGAATTTGATTCTTAATCTAATACCATGTTTACTTAGCATAAATACACCAAAATTGTTTAAAGCATCAATACGGAATTGGAAACGTCAAATACCTACAGTTATTAA
Unaligned ( gi|10 ): GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGGGGGGGGGGGGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGATAGAAGTACAAACTCTAGTTTCATTTTATGAAAAAATACAAATAACTATTTTTGAATGATTGCTAATAAGGATGAAGTTTTCTTTTACTTGGAACATTATGTCACATGGCTTGTAACTATGGCATCCATTTCTTC
Unaligned ( gi|15 ): GGGGGGGGGGGGGGGCGGGGGTGGTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGATTGCAATACTCTTGATTGGTGCATTATCTAAAGAATAACGAAATGCGTCTTCACTTTTACCATTATATCACTGTTATACTAAAACTGTACAGTGTATTCCCTTGCAT