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Reference ( family-2919 ) : AAAGGAAGNT--GTAAANATTCGCC-G-A--TTTCCCGA--TT-T-CTCGGTTT-TATCCCT-CT-CAT-A-ATCTCAAAACGGCTA-C-TGAA-AT-A-T-AAA-AACTCG-ACATTTGGGAAAC-AA-A-CA-ATG-T-TT-A-T-AGGTCAT-A-CG--AAA-A--CATT-------A----CG-C-AA--T-T-CACGAATG--CGA-AAT---CATT---TT---A--ACAT-CTAAA-TA--C-G-TA-T---GGA--C--AACG--TA----T--CT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-CGAA--AATCGT-AA-ATA----T-TT-A-CATG------C-AAACCTGGT-CACACC--G-GCG---C-G--CAAAA-ATT-GGT-GT-A-G-TTT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-CCGC------A--T----G-G----A-TN-T---TT-CG--C-AT---T--T-C-TT--A-ATA-AT-GCGCT-TATTG-GCCGC-A----TGCCCC--------CC--CCC-C--CTA-C-GGTC-T---T---CAAAT----AG---G-GTCACCG---TTTG--A--CCT---CCATAAAGTATCGA-----------GGCATTA-CTG-GTATGAA-TT--------CTTG-----GC---TTCA-----TAANAT-T-TTTC---AT-TAA---CAT-C-GA-C-CCA-ATTC---TGCGA-NTTCGTATTTCTCGTGTTTGA-GTT----------G-TTATANG---AATTTTNTTC----TTTCCACAGTT-TTTAGT-TCTTG---G--AG---A-ATA---ATTCAA-GGCA-GTTTTTAATGAATA--GA-TGCCC-------GT-C----AAG-G--T-CACAC-TCAA-TAGG--C-ACA-CTGA--AN--TG-TA---T------TTTCTA-AACACAGAA-GA-TC-T-CAC-AT-TATTTGGTTTC-----AG-GG-CCC-AG-AATGCGA-AGT---ATT-GTC-CTCTGA-CNA-ACG-GATNNAC-G--ACAGTCC-C-----CGCC--GTA--GCAGG------A---TA----CCACG-A-----------T-TCGG-G-AC-GG-T-GT--GGG-ACA-TGACC-C------------T-C-ATC-ATGTTCTG------CTGC---------C-G-G-CTT--C-TG--AAA-----CG-T-TGACAAAACT-T-AC-GTG----------T-TTCT-A-TTCC-GCATT--TT-CA--T--ATTGTCACTAACATATT----CTCA-CCGTT-TA---AAC--GC-ATT----T-TGAGC--AC-TTGA-AATTC-AATATTTAC-GATAACT-TA-GCG-CG--AT-GT----TTTGTC--GACT-T-G-CCAACCTTTTTTCAAAA---CNAAA-TTTAGGAANA--ATT-TT-AGC-TT-AAATTTATTCC-TC-TGA-A--CAGATTGGATGGATAATTTTT---TTTGTATG-AATT-GTG-TACAC--G--T--TTGAAA------T-T----ATATTTCCTCTCC-GACT---TCGGT-CTTATTTCTTTG--T--TT--A-ACCAAG----TAAT-----TGTAGNCC--CCTANTTTGAGG-TTACCCC-C-CCT-TTGAAGATCGGAGAAAT--ACACCAC-AA-CCC-AA-GCAT-ATGTTGANG-CCGTTNATCT-TAAA-TACT-AATTANNCCCG-TG-AGT--CCAAC--TC-------G-GTTTG-A-TCT--GTTAA-G---T-GTT-----CAA-TTAG----T-ATGGGG-C-TA-T-GCTAGG-AC-ACC-AAA--TT---GA--AC-CAG-AATGCAGAT--TCTCCA---TTAAA--ATA-CCGGAAAAAT-TTGA--AAGATATG-CATGAA-TT--CAA-AG-A---T-C---A-T-G-TAC-G-T-GAAAT-C--G-AATTTAATTA-GCA--AT-TT----TAAA-AATTT--TG-TAAATA-C--ATT--AC--GGATT-G--A-TAA-C-TG--A--TTGT-A--T---A--ATAAAAT-TAAA---TC-AT-T--G---T-CT-T--GT----CT--AATG---AA-A------CNATT-----T--TCA--GGGGAAA-T-AT--------NCAT-----NNT-TCT---A-CA-AAG-T---TA---TTTCAA--T-TTGAAAAGTA--A--GC-A-C-A--CGT--GTC--T--AA-TA--TTT-C-AC--TGC-----CGAAAC--GGC--GCCGAAAT-CA-AA--TGANTC-CCA-A-----GG---AAGTAA-A-------TC---A---TAGTTAACGT--C-A---G-TT---A--T-CT-T--G--CT-C--C---T----------A--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AA--GT----AT--GCAAT-----T--GAT-A---A----T-G-A-A-AG-GGG---C-ACC---TG-TTG--T-G-------------C-A---AA----T----TTGG-CA---TT-TTT-T----GG-NGGTAAATTAA--G-TTGTCTTC
gi|1 : AAGGAAGTT--GTAAAT-TTC-CC-G-A--TTTCCCGA--TT-T-CTCGGTTT-TACCCTT-CT-CAT-ATACCTCAAAACG--CA-G-TGAATATCA-C-AAACAATGGG-ACATTTTGGGAAC-AA-A-CATCTGTT-TT-ATT-AGGTCAT-A-AC--AAA-A--CATT------------CG-C-AA--T-T-CACG-ATG---GA-AA-----ATT---TC---ATTACAT-CTAAA-TA----G-TA-TATGGGA--CAAAACG--TAT---T--CT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-TG-A--AATGCT-AA-ATA----T-TTAA-CATG------C-CAACCTGGT-CACAACAAG-ACG---C-A--C---A-ATT-G---GT-A-GTTTT----GAACA--CCT--A-ACCA------------ATCACC---AA-AAG-CCGC---------T----G-G----A-TT-T---TC-CG--C-AT---TGGT-CTTT--A-CTA-AT-GCGCTATATTGCGCCA--A----TG--CC--------CC--CCT-C--CTATC-GGTC-T---T---C-AAT----AG---G-GGCGTCA---CTTG--A--CCT---CCAT-AAGTATCGA------------GCATTA-CT--GTATGAA-TT--------C-TG-----GCTTTTTCG-----TAAGAT-TCTTTC---ATCTA-----AT-C-GA-C-CCA-A-TC---TGCGA-TTTCGTATTTCT-GTGTTTGA-GTT---------------TAAG---AATTTATTCT----TTTCCA-AG---TTTAGTGTCTTG---G--AG---A-AT----ATTC-A-GGCA----TTTAAT-AATA--GA--GCCC-------AT-C----AGG-GCCT-CATAG-GCAACTAGG--T-GTT-TTGA--CT--CA-TA---TTGCTTCTTTCTCTAACACCGAA-GA-TC-T--ACGAT-TATTT-GTTTA-----AG-GG--CC-AG-AATGCGA-AAT---GTTCGT---TCTGA-C---AGG-GATAAAC-G--ACAGTCC-CCGAGGCGCTTGGTA--GCAGGAGT---A---CA----CCACG-A-----------T-T-GG-G-AC-GGCT-GT--GGGTACA-TG-CT-C------------TGCGATC-ATG-TCTG------CTGC---------C-G-G-CTTTCT-TG--AAA-----CG-T-TGAAGAAAGT-T-AC-ATG----------T-TCAT-A-TGTC-GTATTTGTT-CA--T--ATTGTCACTAAGTTATTTCGGCACA-CAGTC-TA---AACG-GC-GAT----T-TGAGCGAACATTG--AATTCGAATA-ATAC-GAT-ACT-TA-GCG-CG--ATGGTTTAATTTGTC--GACT-T-G-C--AC---TTTTTAAAC---CAAAA-TTTAGGGAGA--ATT-TT-AGC-TT-AAA-TTATT---TC-TGA-AATCAGAT--GGTGGATAA----T---TTTGTATGAAATT-GGG-TATACTGG--TGGTGGAAAATGGTCT-A----ATCTTTCCTCTCC-AAAT---TCGGT-CTTATTTCTTTG--T--TA--A-AACAGA----T-AT-----TGCCAACT--CATCATTTG
gi|1 : cGTAGACCTCCCTA-TTTGAGG-GTTCCCA-C-CCTCTTGAAGATCGGAGAAAT----ATCACAAA-CCT-AT-GCAT-ATGTTGAGG-CCGTT-ATCT-T--A-TACTGAATTAACTCCG-TG-AGTCCCCAACGATCG------G-GTTTG-A-TCT--GTTAA-G---T-GT--------A-TTA-----T----GGG-C-TG-T-GCTAGG-AC-ACC-AAA---T---GACGAC-GAG--ATGCAGAT----TCCA---TTAAA--ATA-CCGGAAAA---TTG---AAGATATA-CACGAA-TT--CAA-AG-A---T-CT--A-T-GTTAC-G-T-ATAAT-C--G-AA-TTAATTA-GCA--AT-TTAAAATAAA-AATTT--TG-T-ACTA-C--ATT--ACGAGAATT-G--ATTAA-CGTGGTA--TTGT-A--T---A--ACAAATC-TAAA---TC-AT-TCGG---T-TTCT--GT----CT--AATG---AA-GGGATATCCATTGTTTGT--CCAGTGGGGAAA-T-AT--------CAAT-----GTT-TCT---A-C--AAG-T---TA---TTTCAA----TTGAAAAGTA--GTTGC-A-C-A--CGT--GTC--T--AA-TA---TT-C-AC--TGC-----CGA-------C--GCCGAAAT-CACAA--TGA--C-CCA-AGGG--GG---AAGTAATC-------TC---AC--TAGTTATCGT--C-A---GTTT---A--TCCT-T--G--CT----C---T----------A--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AAACGT----AT--GCAAT-----T--GATAA---A----T-GAA-A-AG-GGG---C-A-C---TGCTTG--T-G-------------C-A---AA----T----TTGG-CAT--TT-TTT-T----GG-GGGT-AATTAA--G-TTGTCTTCttgtggtcattatattggtggtagacctccctatttgagggttcccaccctcttgaagatcggagaaatatcacaaacctatgcatatgttgaggccgttatcttatactgaattaactccgtgagtccccaacgatcgggtttgatctgttaagtgtattatgggctgtgctaggacaccaaatgacgacgagatgcagattccattaaaataccggaaaattgaagatatacacgaattcaaagatctatgttacgtataatcgaattaattagcaatttaaaataaaaattttgtactacattacgagaattgattaacgtggtattgtataacaaatctaaatcattcggtttctgtctaatgaagggatatccattgtttgtccagtggggaaatatcaatgtttctacaagttatttcaattgaaaagtagttgcacacgtgtctaatattcactgccgacgccgaaatcacaatgacccaagggggaagtaatctcactagttatcgtcagtttatccttgctctatcgcaatatgcatgaaacgtatgcaattgataaatgaaaaggggcactgcttgtgcaaatttggcatttttttgggggtaattaagttgtcttctaa
gi|10 : caaggaagttgtaaatttcccgatttcccgatttctcggttttacccttctcatatacctcaaaacgcagtgaatatcacaaacaatgggacattttgggaacaaacatctgttttattaggtcataacaaaacattcgcaattcacgatggaaaatttcattacatctaaatagtatatgggacaaaacgtattcttttcgtgtacagcatgaaatgctaaatatttaacatgccaacctggtcacaacaagacgcacaattggtagttttgaacacctaaccaatcaccaaaagccgctggattttccgcattggtctttactaatgcgctatattgcgccaatgcccccctcctatcggtcttcaataggggcgtcacttgacctccataagtatcgagcattactgtatgaattctggctttttcgtaagattctttcatctaatcgacccaatctgcgatttcgtatttctgtgtttgagtttaagaatttattcttttccaagtttagtgtcttggagaatattcaggcatttaataatagagcccatcagggcctcataggcaactaggtgttttgactcatattgcttctttctctaacaccgaagatctacgattatttgtttaagggccagaatgcgaaatgttcgttctgacagggataaacgacagtccccgaggcgcttggtagcaggagtacaccacgattgggacggctgtgggtacatgctctgcgatcatgtctgctgccggctttcttgaaacgttgaagaaagttacatgttcatatgtcgtatttgttcatattgtcactaagttatttcggcacacagtctaaacggcgatttgagcgaacattgaattcgaataatacgatacttagcgcgatggtttaatttgtcgacttgcactttttaaaccaaaatttagggagaattttagcttaaattatttctgaaatcagatggtggataattttgtatgaaattgggtatactggtggtggaaaatggtctaatctttcctctccaaattcggtcttatttctttgttaaaacagatattgccaactcatcatttgttgtggtcattatattggtgACC-C------------T-T-ATC-ATGTTCTG------TTGC---------C-G-G-CTT--C-TA--AAA-----CG-T-TGACAAAACG-T-AC-GTG----------T-T-CT-A-TCCT-GCATT--TT-CA--T--ATTGTCATTA-CATATT----CTCA-CCGTT-TA---AA---GC-ATT----T-TGAAC--AC-TTGA-AATTC-AATATT-AC-GATA-CT-TA-ACG-CG--AT-TG----TTTGTC--GACT-T-G-C--ACCTTTTTTAAAAA---CAAAA-TTTAGGAAAT--ATT-TT-AGC-TT-AAATT-----------------CAGGT-GGATTGATAATTTTT------GTATG-AATT-GTG-TACAC--G--T--T-GAAAATA---T-C----ATAATTCCTCTCTAGACT---TCGGT-CTTATT-CTTTG--T--TTT-A-ACCGGGGTTTTAACCAGTATTTAGTCT--CCTTATATGAG--TTACCCC-C-TCT-TTGAAGATCGGAGAAAT--ACA-CAC-AA-CCCGAG-GTAT-ATGTTGAGG-CCGTT-ATCT-TAAA-TACT--ATTAtaa
gi|10 : CT--ATTAA-G---T-AT-------AA-TTAA----T----GGG-C-TA-T-GCTAGG-AC-ATC-AAA--TT---G---AC-CAG--ATGTAGAT--T---CA---TTAAA--ATA-CCGAAAA----TTGA--Aagtataattaatgggctatgctaggacatcaaattgaccagatgtagattcattaaaataccgaaaattgaaga
gi|11 : acccttatcatgttctgttgccggcttctaaaacgttgacaaaacgtacgtgttctatcctgcattttcatattgtcattacatattctcaccgtttaaagcattttgaacacttgaaattcaatattacgatacttaacgcgattgtttgtcgacttgcaccttttttaaaaacaaaatttaggaaatattttagcttaaattcaggtggattgataatttttgtatgaattgtgtacacgttgaaaatatcataattcctctctagacttcggtcttattctttgttttaaccggggttttaaccagtatttagtctccttatatgagttaccccctctttgaagatcggagaaatacacacaacccgaggtatatgttgaggccgttatcttaaataA---TTAAACAATA-C-GCAAGAGA-TTGA--AGCATATG-CATAA---T--CAA-AG-A---TTC---A---G-TTC-G-T-GAAATTC--G-AATTTAATTA-GCA--AT-TT------AA-AATTT--TG-AAAATA-C--ATT--A----GATT-G--A-TAA-CGTG--A--TTGT-AATT---A--ACAAA-T-TAAT---TC-ATCT--G---T-TC-T--GT----CT--AATG---AAGA------CCATT-----T---CA--GGA-AAA-T------------CAT-----GAT-CTT---A-CA-AAG-T---TT---TTTCAA--AATTGAAA-GTA-----GC-A-CTA--CGT--GTC--T--AA-TA--TT--C-AC--TGC-----TGAAAC--AAC----CGAAAT-CA-AA--TGATCC-CTA-A-----GG---GAGGTA-A-------TA---C---TAGTTA-CGT--C-A---G-TT---A--T-CT-T--G--CT-C--C---T----------A--TCG-A-AT-A-TG-CA-G-AA--GT----AT---CAAT-----TTGAAG-A---A----T-G-A-A-AG-GGG---C-ACC---TG-TTG--G-T-------------CAA---AA----T----TTGG-CA---TT-TTT-TTGGGGG-TGGTAA--TAA--G-TTGTCTTCga
gi|12 : tttaatgtaattaatggctatggacacaaatacatatcttatcactcgaactacca-T-CTCGGTTT-TGTCCCT-TTTCAT-A-ATCTCAAAACGGCTA-C-TG-A-AT-G-T-AAA-
gi|12 : AA-CT-A-T-CAA-AACTCG-ACATTTGGGAAAC-AA-AACA-ATG-T-TTTA-TTAGGTCAT-A-CG--AAA-A--CATT-------T----CG-C-AA--T-T-CACGA-TG--CGA-AATTT-CAAT---T-------ACAA-CTAAA-TA--C-G-TA-T---GGC--C--AACG--TA----TTTCT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-CGCA--AATCGT-AA-ATA----T-AT-A-CATGTACATAC-AAACGTAGT-CACATC--G------------CAAAA-ATT-GGT----A-G-TTT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-ACGC------A--T----G-G----A-TA-T---TT-CG--C-AT---T--T-CTTT--A-ATA-AT-GCGGT-TATTG-G--GC-A--------CC--------CC--CCT-C--CTC-C-TGTC-T---T---C-AAT----GG---G-GTCACCA-----TG--A--CCT---CCATAAGG-AGTGG-----------GGCAggcaaagataacgaacagtgaatatcaaactatcaaaactcgacatttgggaaacaaaacaatgttttattaggtcatacgaaaacatttcgcaattcacgatgcgaaatttcaattacaactaaatacgtatggccaacgtatttcttttcgtgtacagcacgcaaatcgtaaatatatacatgtacatacaaacgtagtcacatcgcaaaaattggtagtttgaacacctaacacattccaaaagacgcatggatatttcgcatttctttaataatgcggttattgggcacccccctcctcctgtcttcaatggggtcaccatgacctccataaggagtggggcagccgca
gi|13 : tctcggttttgtcccttttcataatctcaaaacggctactgaatgtaaaggcaaagataacgaacagtgaatatcaAATG-C--ATT--TC--GGATC-GG-A-TAA-C-TG--ACCTTGTTA--T---AC-ACACAGTCTCAA---TA-AT-T--G---TTCC-T--GT----CT--CATG---AA-A------CCATT-----T--TCA--GGGGAAACT-ATCATCGGTAACTT-----TCT-CCT---ACCACAAG-TATCTC---TCTCAAC-T-TTGAAAAGTG--A--GC-ACC-A--CGTC-GCC--TC-AA-TA--TTTCC-AC--TGCACATGCAACAC--AGC--GCCGAAAgccgca
gi|13 : -------TC---A---T-GT--ACTT--C-G---G-TTC--AC-T-CTAT--G--CT-C--TCCGT----------A--TCGCACAT-A--G-CATGCAACCGTC---AT--GCAAT-----T--GAT-ACGAA----T-G-A-A-GG-AGC---C-ACC---TG-TTGCAT-G-------------C-A---AA----CCTTATTGGCCACCTTC-TTT-T----GGCTGGT-AATTAACCG--TGTCTaatcctctgatcactccgtacggtcgcagaactacgggggaataccgatacacaatccacacaccgtcatgtacttcggttcactctatgctctccgtatcgcacatagcatgcaaccgtcatgcaattgatacgaatgaaggagccacctgttgcatgcaaaccttattggccaccttcttttggctggtaattaaccgtgtctctcaa
gi|14 : aatgcatttcggatcggataactgaccttgttatacacacagtctcaataattgttcctgtctcatgaaaccattttcaggggaaactatcatcggtaactttctcctaccacaagtatctctctcaactttgaaaagtgagcaccacgtcgcctcaatatttccactgcacatgcaacacagcgccgaaaaatcctctgatcactccgtacggtcgcagaactacgggggaataccgatacacaatccacacaccg-T---TA---TCCCAA--T-TTGAAAAGT---A--GCAA-C-A--CGTGAGTCTAT--AA-TACTTTT-CAAC--TGC-----TGAAACAAGGC---CCGAAAT-CA-ctcaa
gi|14 : tttA--TGATACACCA-A-----GGGGAAAGTAA-A-------TCTGTAAGCTAGTT-ACGT--C-A---G-TTCCAA--T-CT-A--A--CT-CGAC---TAAGGACCCCAA--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AAT-GT----A---GCAACTTCAAT--GAT-A---AAAGCT-G-A-A-AG-GGGAGAC-ACCATGCG-TTG--T-GGACCATGAAGCTAC-A---AA----T----TTGG-CA---TTATTTAT----GGCTGGTAAAcagttaaaaagcggatgggccctgtggtcacgccaggtggatattatgatacaccaaggggaaagtaaatctgtaagctagttacgtcagttccaatctaactcgactaaggaccccaatcgcaatatgcatgaatgtagcaacttcaatgataaaagctgaaaggggagacaccatgcgttgtggaccatgaagctacaaatttggcattatttatggctggtaaa
gi|15 : tttttatcccaatttgaaaagtagcaacacgtgagtctataatacttttcaactgctgaaacaaggcccgaaatcacagttaaaaagcggatgggccctgtggtcacgccaggtggatattGGGAAAC-AA-A-------------A-C-A--TCATAA-CG--AAC-A--CATT-------A----TG-CAAA--TAT-TAC--ATC--TAT-AAT---CGTA---TT---G--ACG----AAA-TA--------------GA--C--TACATCTG----T--CT-T----TTCTTTCCAT-GT-ACCAGC---A-CGGA--AATCGT-CA-ATA----T-TT-A-CATG------CAAAACCTATTCCACATC--G-GC---------CAATA-A---GG--GTCA-T-TTT----TAACACTCTT--A-ACAC------------ATT-CC---AAGAAGACAAA------A--T----G-G----ACTA-TAACTT-CG--CGATCTGT--C-T-TT--A-ATA-A
gi|16 : tttgg-A-CGTG------T-AAACATGCT-C---CC--GAGCG---CCA--TAAAA-ACT-ATG-GT-A-T-TTTTCTAGAACA--CCTTGACACAC------------ATT-CA---TA-AAG-CCGCC-----ACCT----GAG----A-TA-T---TTGCG--C-AT---T--TTC-TTTAA-ATATAT-GCGCT-TATTG---CGC-AAAAATGCCCC--------CC--CCCTC--CTA-C-GGTC-T---T---ACAAT----AA---GCGTCACatcgatcaccccactc
gi|17 : CAAC--TC-------G-GTGTG-AATCTTGGTTAA-G---T-ATA-----TAA-TTA-----C-ATGGGGGC-TA-T-GCTAGG-AC-AT---AA--TT---G---AC-CAG--ATGTAGATG-TGGGCA----TAAG--ATA-CCG--AAAAT-TGGA--AGGTTAT--CATGGACTT--TAATAGAA---T-CT--A-T-G-CAC-G-A-GAAAT-CTTG-AGCTTAATTA-CCA--AT-TT----gcatt
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gi|19 : -AAACCTAGT-CACATC--G------------CAAAA-GTT-GAT----A-G-CAT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-ACAC------A--TCCATG-G----A-TA-T---TT-CG--T-AT---T--T-T-TT--A-ATA-AT-GCGCT-TATTG---TGCAA----TGTCCC--------CCTTCCA-C--CT-----GTC-T---T---C-AAT----GG---G-GTCACC-----TTG--A--CCT---CC
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Reference ( family-2919 ) : AAAGGAAGTT--GTAAATTTCG--CCGA--TTTCNCGA--TT-T-CTCGGTTT-TATCCCT-CT-CAT-A-ATCTCAAAACGGCTA-C-TGAA-AT-A-T-AAA-AACTCG-ACATTTGGGAAAC-AA-A-CA-ATG-T-TT-A-T-AGGTCAT-A-CG--AAA-A--CATT-------A----CG-C-AA--T-T-CACGAATG--CGA-AAT---CATT---TT---A--ACAT-CTAAA-TA--C-G-TA-T---GGA--C--AACG--TA----T--CT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-CGAA--AATCNT-AA-ATA----T-TT-A-CATG------C-AAACCTGGT-CACACC--G-GCG---C-G--CAAAA-ATT-GGT-GT-A-G-TTT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-CCGC------A--T----G-G-----A-T-AT---TT-CG--C-AT---T--T-C-TT--A-ATA-AT-GCGCT-TATTG-GCCGC-A----TGCCCC--------CC--CCC-C--CTA-C-GGTC-T---T---CAAAT----AG---G-GTCACCG---TTTG--A--CCT---CCATAAAGTATCGA-----------GGCATTA-CTG-GTATGAA-TT--------CTTG-----GC--TTTCA-----TAATATT-TTTC---AT-TAA---CAT-C-GA-C-CCA-ATTC---TGCGA-ATTCGTATTTCT-G-TGTTTGA-GTT----------A-TTATAGG---AATTTTTTTC----TTTCCACAGTT-TTTAGT-TCTTG---G--AG---A-ATA---ATTCAA-GGCA-GTTTTTAATGAATA--GA-TGCCC-------GT-C----AAG-G--T-CACAC-TCAA-TAGG--C-ACA-CTGA--AN--TG-TA---T------TTTCTA-AACACAGAA-GA-TC-T-CAC-AT-TATTTGGTTTC-----AG-GG-CCC-AG-AATGCGA-AGT---ATT-GTC-CTCTGAC--A--ACG-GATTTAC-G--AC-GGTCC-C-----CGC-C--GTAGCAGG------A---TA----CCACG-A-----------T-TCGG-G-AC-GG-T-GT--GGG-ACA-TGACC-C------------T-C-ATC-ATGTTCTG------CTGC---------C-G-G-C-TTC-TG-AAAA----CG-T-TGACAAAACT-TAC--GCG----------T--TTCTA-TTCC-GCATT--TT-CA--T--ATTGTCACTAACATATT----CTCA-CCGTT-TA---AAC--GC-ATT----T-TGAGC--AC-TTGA-AATTC-AATATTTACG-ATAACT-TA-GCG-CG--AT-GT----TTTGTC--G-ACT-T-G-C--ACCTTTTTTCAAAA---C--GAAA-TTTAGGAAAN--ATT-TT-AGCTT-AAATTTATTCCT-C-TGA-A--CAGATTGGATGGATAATTTTT--TT-----TGTATG-AATT-GTG-TATAC--G--T--TTGAAA-AT--TC--A-TATTTCCTCTCCAGACTTC---GGTC-TTATTTCTTTG--TT--T--A-ACCAAG----TAAT-----TGTAGN---CCCCTAATTTG--------A-------GG-T--TA---CCCC--CT-CTTTGAAGA-----------TCGGAGA------AAT--ACACCAC-AACCC-AA-GCAT-ATGTTGA-GGCCG-T-T-ATCT--TAAA-TACT-AA--TT--A--CCCG-TG-AGT--CCAAC--TC-------G-GTTTG-A-TCT--GTTAAG---TGT-------A--A-TT----A-AT-TGGGGC-TA-T-GCTAGG-AC-ACC-AAA--TT---GA--AC-CAG--ATG---CAGAT--TCTCCA---TTAAA--ATA-CCGGAAAAAT-TTGA--AAGATATG-CATGAA-TT--CAA-AG-A---T-C---A-T-G-TAC-G-T-GAAAT-C--G-AATTTAATTA-GCA--AT-TT----TAAA-AATTT--TG-TAAATA-C--ATT--AC--GGATT-G--A-TAA-C-TG--A--TTGT-A--T---A-AC--AAAAT-TNAA---TC-AT-T--G---T-CT-T--GT----CT--AATG---AA-A------CCATT-----T--TCA--GGGGAAA-T-AT-C-AT-----G--------NT-TCT---A-CA-AAG-T---TA---TTTCAA--T-TTGAAAAGTA--A--GC-A-C-A--CGT--GTC--T--AA-TA--TTT-C-AC--TGC-----CGAAAC--GGC--GCCGAAAT-CA-AA--TG-A-T-C-CC-AA-----GG---AAGTAA-A-------TC---A---TAGTTAACGT--C-A---G-TT---A--T-CT-T--G--CT-C--C---T----------A--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AA--GT----AT--GCAAT-----T--GAT-A---A----T-G-A-A-AG-GGG---C-ACC---TG-TTG--T-G-------------C-A---AA----T----TTGG-CA---TT-TTT-T----GG-TGGTAAATTAA--G-TTGTCTTC
gi|1 : AAGGAAGTT--GTAAATTTC---CCGA--TTTCCCGA--TT-T-CTCGGTTT-TACCCTT-CT-CAT-ATACCTCAAAACG--CA-G-TGAATATCA-C-AAACAATGGG-ACATTTTGGGAAC-AA-A-CATCTGTT-TT-ATT-AGGTCAT-A-AC--AAA-A--CATT------------CG-C-AA--T-T-CACG-ATG---GA-AA-----ATT---TC---ATTACAT-CTAAA-TA----G-TA-TATGGGA--CAAAACG--TAT---T--CT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-TG-A--AATGCT-AA-ATA----T-TTAA-CATG------C-CAACCTGGT-CACAACAAG-ACG---C-A--C---A-ATT-G---GT-A-GTTTT----GAACA--CCT--A-ACCA------------ATCACC---AA-AAG-CCGC---------T----G-G-----A-T-TT---TC-CG--C-AT---TGGT-CTTT--A-CTA-AT-GCGCTATATTGCGCCA--A----TG--CC--------CC--CCT-C--CTATC-GGTC-T---T---C-AAT----AG---G-GGCGTCA---CTTG--A--CCT---CCAT-AAGTATCGA------------GCATTA-CT--GTATGAA-TT--------C-TG-----GCTTTTTCG-----TAAGATTCTTTC---ATCTA-----AT-C-GA-C-CCA-A-TC---TGCGA-TTTCGTATTTCT-G-TGTTTGA-GTT---------------TAAG---AATTTATTCT----TTTCCA-AG---TTTAGTGTCTTG---G--AG---A-AT----ATTC-A-GGCA----TTTAAT-AATA--GA--GCCC-------AT-C----AGG-GCCT-CATAG-GCAACTAGG--T-GTT-TTGA--CT--CA-TA---TTGCTTCTTTCTCTAACACCGAA-GA-TC-T--ACGAT-TATTT-GTTTA-----AG-GG--CC-AG-AATGCGA-AAT---GTTCGT---TCTGAC--A--G-G-GATAAAC-G--AC-AGTCC-CCGAGGCGC-TTGGTAGCAGGAGT---A---CA----CCACG-A-----------T-T-GG-G-AC-GGCT-GT--GGGTACA-TG-CT-C------------TGCGATC-ATG-TCTG------CTGC---------C-G-G-CTTTC-TT-GAAA----CG-T-TGAAGAAAGT-TAC--ATG----------T--TCATA-TGTC-GTATTTGTT-CA--T--ATTGTCACTAAGTTATTTCGGCACA-CAGTC-TA---AACG-GC-GAT----T-TGAGCGAACATTG--AATTCGAATA-ATACG-AT-ACT-TA-GCG-CG--ATGGTTTAATTTGTC--G-ACT-T-G-C--AC---TTTTTAAAC---C--AAAA-TTTAGGGAGA--ATT-TT-AGCTT-AAA-TTATT--T-C-TGA-AATCAGAT--GGTGGATAA----T--TT-----TGTATGAAATT-GGG-TATACTGG--TGGTGGAAA-ATGGTCTAA-TCTTTCCTCTCCAAA-TTC---GGTC-TTATTTCTTTG--TT--A--A-AACAGA----T-AT-----TGCCAA---CTCATCATTTGTTGTGGTCATTATATTGG-TGGTAGACCTCC--CT-ATTTGAGGGTTCCCACCCTCTTGAAGATCGGAGAA---ATATCACAAACCT-AT-GCAT-ATGTTGA-GGCCG-T-T-ATCT--T--A-TACTGAA--TT--AACTCCG-TG-AGTCCCCAACGATCG------G-GTTTG-A-TCT--GTTAAG---TGT----------A-TT------AT---GGGC-TG-T-GCTAGG-AC-ACC-AAA---T---GACGAC-GAG--ATG---CAGAT----TCCA---TTAAA--ATA-CCGGAAAA---TTG---AAGATATA-CACGAA-TT--CAA-AG-A---T-CT--A-T-GTTAC-G-T-ATAAT-C--G-AA-TTAATTA-GCA--AT-TTAAAATAAA-AATTT--TG-T-ACTA-C--ATT--ACGAGAATT-G--ATTAA-CGTGGTA--TTGT-A--T---A-AC--AAATC-TAAA---TC-AT-TCGG---T-TTCT--GT----CT--AATG---AA-GGGATATCCATTGTTTGT--CCAGTGGGGAAA-T-AT-CAAT-----G--------TT-TCT---A-C--AAG-T---TA---TTTCAA----TTGAAAAGTA--GTTGC-A-C-A--CGT--GTC--T--AA-TA---TT-C-AC--TGC-----CGA-------C--GCCGAAAT-CACAA--TG-A---C-CC-AAGGG--GG---AAGTAATC-------TC---AC--TAGTTATCGT--C-A---GTTT---A--TCCT-T--G--CT----C---T----------A--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AAACGT----AT--GCAAT-----T--GATAA---A----T-GAA-A-AG-GGG---C-A-C---TGCTTG--T-G-------------C-A---AA----T----TTGG-CAT--TT-TTT-T----GG-GGGT-AATTAA--G-TTGTCTTC
gi|10 : cACC-C------------T-T-ATC-ATGTTCTG------TTGC---------C-G-G-C-TTC-T--AAAA----CG-T-TGACAAAACG-TAC--GTG----------T--T-CTA-TCCT-GCATT--TT-CA--T--ATTGTCATTA-CATATT----CTCA-CCGTT-TA---AA---GC-ATT----T-TGAAC--AC-TTGA-AATTC-AATATT-ACG-ATA-CT-TA-ACG-CG--AT-TG----TTTGTC--G-ACT-T-G-C--ACCTTTTTTAAAAA---C--AAAA-TTTAGGAAAT--ATT-TT-AGCTT-AAATT-----------------CAGGT-GGATTGATAATTTTT----------GTATG-AATT-GTG-TACAC--G--T--T-GAAA-ATA-TC--A-TAATTCCTCTCTAGACTTC---GGTC-TTATT-CTTTG--TT--TT-A-ACCGGGGTTTTAACCAGTATTTAGT---CTCCTTATATG--------A-------G--T--TA---CCCC--CT-CTTTGAAGA-----------TCGGAGA------AAT--ACA-CAC-AACCCGAG-GTAT-ATGTTGA-GGCCG-T-T-ATCT--TAAA-TACT--A--TT--A--taa
gi|10 : CT--ATTAAG---TAT-------A--A-TT----A-AT---GGGC-TA-T-GCTAGG-AC-ATC-AAA--TT---G---AC-CAG--ATG---TAGAT--T---CA---TTAAA--ATA-CCGAAAA----TTGA--Aagtataattaatgggctatgctaggacatcaaattgaccagatgtagattcattaaaataccgaaaattgaaga
gi|11 : acccttatcatgttctgttgccggcttctaaaacgttgacaaaacgtacgtgttctatcctgcattttcatattgtcattacatattctcaccgtttaaagcattttgaacacttgaaattcaatattacgatacttaacgcgattgtttgtcgacttgcaccttttttaaaaacaaaatttaggaaatattttagcttaaattcaggtggattgataatttttgtatgaattgtgtacacgttgaaaatatcataattcctctctagacttcggtcttattctttgttttaaccggggttttaaccagtatttagtctccttatatgagttaccccctctttgaagatcggagaaatacacacaacccgaggtatatgttgaggccgttatcttaaataTTAA----TGT-------A--A-TT----A-AT----GGC-TA-T-G----G-AC-AC--AAA--TA---CAT-AT-CTT--ATCACTCGAAC--TACCAA---TTAAACAATA-C-GCAAGAGA-TTGA--AGCATATG-CATAA---T--CAA-AG-A---TTC---A---G-TTC-G-T-GAAATTC--G-AATTTAATTA-GCA--AT-TT------AA-AATTT--TG-AAAATA-C--ATT--A----GATT-G--A-TAA-CGTG--A--TTGT-AATT---A-AC--AAA-T-TAAT---TC-ATCT--G---T-TC-T--GT----CT--AATG---AAGA------CCATT-----T---CA--GG--AAA---AT-C-AT-----G--------AT-CTT---A-CA-AAG-T---TT---TTTCAA--AATTGAAA-GTA-----GC-A-CTA--CGT--GTC--T--AA-TA--TT--C-AC--TGC-----TGAAAC--AAC----CGAAAT-CA-AA--TG-A-T-C-CCTAA-----GG---GAGGTA-A-------TA---C---TAGTT-ACGT--C-A---G-TT---A--T-CT-T--G--CT-C--C---T----------A--TCG-A-AT-A-TG-CA-G-AA--GT----AT---CAAT-----TTGAAG-A---A----T-G-A-A-AG-GGG---C-ACC---TG-TTG--G-T-------------CAA---AA----T----TTGG-CA---TT-TTT-TTGGGGG-TGGTAA--TAA--G-TTGTCTTCga
gi|12 : t-T-CTCGGTTT-TGTCCCT-TTTCAT-A-ATCTCAAAACGGCTA-C-TG-A-AT-G-T-AAA-
gi|12 : AA-CT-A-T-CAA-AACTCG-ACATTTGGGAAAC-AA-AACA-ATG-T-TTTA-TTAGGTCAT-A-CG--AAA-A--CATT-------T----CG-C-AA--T-T-CACGA-TG--CGA-AATTT-CAAT---T-------ACAA-CTAAA-TA--C-G-TA-T---GGC--C--AACG--TA----TTTCT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-CGCA--AATCGT-AA-ATA----T-AT-A-CATGTACATAC-AAACGTAGT-CACATC--G------------CAAAA-ATT-GGT----A-G-TTT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-ACGC------A--T----G-G-----A-T-AT---TT-CG--C-AT---T--T-CTTT--A-ATA-AT-GCGGT-TATTG-G--GC-A--------CC--------CC--CCT-C--CTC-C-TGTC-T---T---C-AAT----GG---G-GTCACCA-----TG--A--CCT---CCATAAGG-AGTGG-----------GGCAggcaaagataacgaacagtgaatatcaaactatcaaaactcgacatttgggaaacaaaacaatgttttattaggtcatacgaaaacatttcgcaattcacgatgcgaaatttcaattacaactaaatacgtatggccaacgtatttcttttcgtgtacagcacgcaaatcgtaaatatatacatgtacatacaaacgtagtcacatcgcaaaaattggtagtttgaacacctaacacattccaaaagacgcatggatatttcgcatttctttaataatgcggttattgggcacccccctcctcctgtcttcaatggggtcaccatgacctccataaggagtggggcagccgca
gi|13 : tctcggttttgtcccttttcataatctcaaaacggctactgaatgtaaaggcaaagataacgaacagtgaatatcaAATG-C--ATT--TC--GGATC-GG-A-TAA-C-TG--ACCTTGTTA--T---ACAC--ACAGTCTCAA---TA-AT-T--G---TTCC-T--GT----CT--CATG---AA-A------CCATT-----T--TCA--GGGGAAACT-AT-C-ATC----GGTAACTTTCT-CCT---ACCACAAG-TATCTC---TCTCAAC-T-TTGAAAAGTG--A--GC-ACC-A--CGTC-GCC--TC-AA-TA--TTTCC-AC--TGCACATGCAACAC--AGC--GCCGAAAgccgca
gi|13 : -------TC---A---T-GT--ACTT--C-G---G-TTC--AC-T-CTAT--G--CT-C--TCCGT----------A--TCGCACAT-A--G-CATGCAACCGTC---AT--GCAAT-----T--GAT-ACGAA----T-G-A-A-GG-AGC---C-ACC---TG-TTGCAT-G-------------C-A---AA----CCTTATTGGCCACCTTC-TTT-T----GGCTGGT-AATTAACCG--TGTCTaatcctctgatcactccgtacggtcgcagaactacgggggaataccgatacacaatccacacaccgtcatgtacttcggttcactctatgctctccgtatcgcacatagcatgcaaccgtcatgcaattgatacgaatgaaggagccacctgttgcatgcaaaccttattggccaccttcttttggctggtaattaaccgtgtctctcaa
gi|14 : aatgcatttcggatcggataactgaccttgttatacacacagtctcaataattgttcctgtctcatgaaaccattttcaggggaaactatcatcggtaactttctcctaccacaagtatctctctcaactttgaaaagtgagcaccacgtcgcctcaatatttccactgcacatgcaacacagcgccgaaaaatcctctgatcactccgtacggtcgcagaactacgggggaataccgatacacaatccacacaccg-T---TA---TCCCAA--T-TTGAAAAGT---A--GCAA-C-A--CGTGAGTCTAT--AA-TACTTTT-CAAC--TGC-----TGAAACAAGGC---CCGAAAT-CA-ctcaa
gi|14 : tttA--TG-A-TACACC-AA-----GGGGAAAGTAA-A-------TCTGTAAGCTAGTT-ACGT--C-A---G-TTCCAA--T-CT-A--A--CT-CGAC---TAAGGACCCCAA--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AAT-GT----A---GCAACTTCAAT--GAT-A---AAAGCT-G-A-A-AG-GGGAGAC-ACCATGCG-TTG--T-GGACCATGAAGCTAC-A---AA----T----TTGG-CA---TTATTTAT----GGCTGGTAAAcagttaaaaagcggatgggccctgtggtcacgccaggtggatattatgatacaccaaggggaaagtaaatctgtaagctagttacgtcagttccaatctaactcgactaaggaccccaatcgcaatatgcatgaatgtagcaacttcaatgataaaagctgaaaggggagacaccatgcgttgtggaccatgaagctacaaatttggcattatttatggctggtaaa
gi|15 : tttttatcccaatttgaaaagtagcaacacgtgagtctataatacttttcaactgctgaaacaaggcccgaaatcacagttaaaaagcggatgggccctgtggtcacgccaggtggatattGGGAAAC-AA-A-------------A-C-A--TCATAA-CG--AAC-A--CATT-------A----TG-CAAA--TAT-TAC--ATC--TAT-AAT---CGTA---TT---G--ACG----AAA-TA--------------GA--C--TACATCTG----T--CT-T----TTCTTTCCAT-GT-ACCAGC---A-CGGA--AATCGT-CA-ATA----T-TT-A-CATG------CAAAACCTATTCCACATC--G-GC---------CAATA-A---GG--GTCA-T-TTT----TAACACTCTT--A-ACAC------------ATT-CC---AAGAAGACAAA------A--T----G-G-----ACT-ATAACTT-CG--CGATCTGT--C-T-TT--A-ATA-A
gi|16 : tttgg-A-CGTG------T-AAACATGCT-C---CC--GAGCG---CCA--TAAAA-ACT-ATG-GT-A-T-TTTTCTAGAACA--CCTTGACACAC------------ATT-CA---TA-AAG-CCGCC-----ACCT----GAG-----A-T-AT---TTGCG--C-AT---T--TTC-TTTAA-ATATAT-GCGCT-TATTG---CGC-AAAAATGCCCC--------CC--CCCTC--CTA-C-GGTC-T---T---ACAAT----AA---GCGTCACatcgatcaccccactc
gi|17 : CAAC--TC-------G-GTGTG-AATCTTGGTTAAG---TAT-------ATAA-TT----ACAT-GGGGGC-TA-T-GCTAGG-AC-AT---AA--TT---G---AC-CAG--ATG---TAGATG-TGGGCA----TAAG--ATA-CCG--AAAAT-TGGA--AGGTTAT--CATGGACTT--TAATAGAA---T-CT--A-T-G-CAC-G-A-GAAAT-CTTG-AGCTTAATTA-CCA--AT-TT----gcatt
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gi|19 : -AAACCTAGT-CACATC--G------------CAAAA-GTT-GAT----A-G-CAT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-ACAC------A--TCCATG-G-----A-T-AT---TT-CG--T-AT---T--T-T-TT--A-ATA-AT-GCGCT-TATTG---TGCAA----TGTCCC--------CCTTCCA-C--CT-----GTC-T---T---C-AAT----GG---G-GTCACC-----TTG--A--CCT---CC
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Reference ( family-2919 ) : AAAGGAAGTT--GTAAATTTCC--CCGA--TTTCNCGA--TT-T-CTCGGTTT-TATCCCT-CT-CAT-A-ATCTCAAAACGGCTA-C-TGAA-AT-A-T-AAA-AACTCG-ACATTTGGGAAAC-AA-A-CA-ATG-T-TT-A-T-AGGTCAT-A-CG--AAA-A--CATT-------A----CG-C-AA--T-T-CACGAATG--CGA-AAT---CATT---TT---A--ACAT-CTAAA-TA--C-G-TA-T---GGA--C--AACG--TA----T--CT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-CGAA--AATCNT-AA-ATA----T-TT-A-CATG------C-AAACCTGGT-CACACC--G-GCG---C-G--CAAAA-ATT-GGT-GT-A-G-TTT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-CCGC------A--T----G-G-----A-T-AT---TT-CG--C-AT---T--T-C-TT--A-ATA-AT-GCGCT-TATTG-GCCGC-A----TGCCCC--------CC--CCC-C--CTA-C-GGTC-T---T---CAAAT----AG---G-GTCACCG---TTTG--A--CCT---CCATAAAGTATCGA-----------GGCATTA-CTG-GTATGAA-TT--------CTTG-----GC--TTTCA-----NAATATT-TTTC---AT-TAA---CAT-C-GA-C-CCA-ATTC---TGCGA-ATTCGTATTTCT-G-TGTTTGA-GTT----------A-TTATAGG---AATTTTTTTC----TTTCCACAGTT-TTTAGT-TCTTG---G--AG---A-ATA---ATTCAA-GGCA-GTTTTTAATGAATA--GA-TGCCC-------GT-C----AAG-G--T-CACAC-TCAA-TAGG--C-ACA-CTGA--AN--TG-TA---T------TTTCTA-AACACAGAA-GA-TC-T-CAC-AT-TATTTGGTTTC-----AG-GG-CCC-AG-AATGCGA-AGT---ATT-GTC-CTCTGAC--A--ACG-GATTTAC-G--AC-GGTCC-C-----CGC-C--GTAGCAGG------A---TA----CCACG-A-----------T-TCGG-G-AC-GG-T-GT--GGG-ACA-TGACC-C------------T-C-ATC-ATGTTCTG------CTGC---------C-G-G-C-TTC-TG-AAAA----CG-T-TGACAAAACT-TAC--GCG----------T--TTCTA-TTCC-GCATT--TT-CA--T--ATTGTCACT-A-C-A--TATT----CTCA-CCGTT-TA---AAC--GC-ATT----T-TGAGC--AC-TTGA-AATTC-AATATTTACG-AT-ACT-TA-GCG-CG--AT-GT----TTTGTC--G-ACT-T-G-C--ACCTTTTTTCAAAA---C--GAAA-TTTAGGAAA--TATT-TT-AGCTT-AAATTTATTCCT-CTGA-A--CAGATTGGATGGATAATTTTT--TT-----TGTATG-AA-TTGTG-TATAC--G--T--TTGAAA-AT--TC--A-TATTTCCTCTCCAGACTTC---GGTC-TTATTTCTTTG--T--TT--A-ACCAGG----TAAT-----TGTAGNCC--CCTA-ATTTGAG--TTACC-CC--CT-CTTTGAAGATCGGAGAAAT--ACACCACAA-CCC-AA-GCAT-ATGTTGA-GGCCG-T-T-ATCT--TAAA-TACT-AA--TT--A--CCCG-TG-AGT-CC--AAC--TC-------G-G-TTTG-A-TCT--GTTAAG---TGT-------A--A-TT-A------AT-GGG-G-C-TA-T-GCTAGG-AC-ACC-AAA--TT---GA--AC-CAG--ATG---CAGAT-T---T--CCA---TTAAA--ATA-CCGGAAAAAT-TTGA--AAGATATG-CATGAA-TT--CAA-AG-A---T-C---A-T-G-T-AC-G-T-GAAAT-C--G-AATTTAATTA-GCA--AT-TT----TAAA-AATTT--TG-TAAATA-C--ATT--AC-GG--ATT-G--AT-AA-C-TG--A--TTGT-A--T---A-AC--AAAAT-TNAA---TC-AT-T--GT---CT-T--GT----CT--AATGA---A-A------CCATT-----T--TCAG--GGGAAA-T-AT-C-A-T-----G--------NT-T-CT---A-CA-AAG-T---TA---TTTCAA--T-TT-GAAAAGTA--A--GC-A-C-A--CGT--G-TC--T--AA-TA--TTT-C-ACT--GC-----CGAAAC--GGC--GCCGAAAT-CA-AA--TG-A-T-C-CC-AA----GGG--AAGTAA-A-------TC----A--TA-GTT-A-C-GT--C-A---GTT---A--TC-T-T--G--CT-C--C---T----------A--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AA--GT----AT--GCAAT-----T--GAT-A---A----T-G-A-A-A-G-GGG---C-ACC---TG-TTG--T-G-------------C-A---AA----T----TTGG-CA---TT-TTT-T----GG-TGGTAAATTAA--G-TTGTCTTC
gi|1 : AAGGAAGTT--GTAAATTTCC--C-GA--TTTCCCGA--TT-T-CTCGGTTT-TACCCTT-CT-CAT-ATACCTCAAAACG--CA-G-TGAATATCA-C-AAACAATGGG-ACATTTTGGGAAC-AA-A-CATCTGTT-TT-ATT-AGGTCAT-A-AC--AAA-A--CATT------------CG-C-AA--T-T-CACG-ATG---GA-AA-----ATT---TC---ATTACAT-CTAAA-TA----G-TA-TATGGGA--CAAAACG--TAT---T--CT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-TG-A--AATGCT-AA-ATA----T-TTAA-CATG------C-CAACCTGGT-CACAACAAG-ACG---C-A--C---A-ATT-G---GT-A-GTTTT----GAACA--CCT--A-ACCA------------ATCACC---AA-AAG-CCGC---------T----G-G-----A-T-TT---TC-CG--C-AT---TGGT-CTTT--A-CTA-AT-GCGCTATATTGCGCCA--A----TG--CC--------CC--CCT-C--CTATC-GGTC-T---T---C-AAT----AG---G-GGCGTCA---CTTG--A--CCT---CCAT-AAGTATCGA------------GCATTA-CT--GTATGAA-TT--------C-TG-----GCTTTTTCG-----TAAGATTCTTTC---ATCTA-----AT-C-GA-C-CCA-A-TC---TGCGA-TTTCGTATTTCT-G-TGTTTGA-GTT---------------TAAG---AATTTATTCT----TTTCCA-AG---TTTAGTGTCTTG---G--AG---A-AT----ATTC-A-GGCA----TTTAAT-AATA--GA--GCCC-------AT-C----AGG-GCCT-CATAG-GCAACTAGG--T-GTT-TTGA--CT--CA-TA---TTGCTTCTTTCTCTAACACCGAA-GA-TC-T--ACGAT-TATTT-GTTTA-----AG-GG--CC-AG-AATGCGA-AAT---GTTCGT---TCTGAC--A--G-G-GATAAAC-G--AC-AGTCC-CCGAGGCGC-TTGGTAGCAGGAGT---A---CA----CCACG-A-----------T-T-GG-G-AC-GGCT-GT--GGGTACA-TG-CT-C------------TGCGATC-ATG-TCTG------CTGC---------C-G-G-CTTTC-TT-GAAA----CG-T-TGAAGAAAGT-TAC--ATG----------T--TCATA-TGTC-GTATTTGTT-CA--T--ATTGTCACT-A---AGTTATTTCGGCACA-CAGTC-TA---AACG-GC-GAT----T-TGAGCGAACATTG--AATTCGAATA-ATACG-AT-ACT-TA-GCG-CG--ATGGTTTAATTTGTC--G-ACT-T-G-C--AC---TTTTTAAAC---C--AAAA-TTTAGGGAG--AATT-TT-AGCTT-AAA-TTATT--T-CTGA-AATCAGAT--GGTGGATAA----T--TT-----TGTATGAAA-TTGGG-TATACTGG--TGGTGGAAA-ATGGTCTAA-TCTTTCCTCTCCAAA-TTC---GGTC-TTATTTCTTTG--T--TA--A-AACAGA----T-AT-----TGCCAACT--CATC-ATTTG
gi|1 : cGTAGACCTCCCTA--TTTGAGGGTTCCCACC--CT-CTT-GAAGATCGGAGAAAT--AT--CACAAACCT-AT-GCAT-ATGTTGA-GGCCG-T-T-ATCT--TA---TACTGAA--TT--AACTCCG-TG-AGT-CCCCAACGATC-------G-GGTTTG-A-TCT--GTTAAG---TGT-------A----TT-A-------T-GGG---C-TG-T-GCTAGG-AC-ACC-AAA--T----GACGAC-GAG--ATG---CAGAT-T------CCA---TTAAA--ATA-CCGGAAAA---TTGA--A-GATATA-CACGAA-TT--CAA-AG-A---T-CT--A-T-G-TTAC-G-T-ATAAT-C--G-AATT-AATTA-GCA--AT-TTAAAATAAA-AATTT--TG-TAC-TA-C--ATT--AC-GAGAATT-G--ATTAA-CGTGGTA--TTGT-A--T---A-AC--AAATC-TAAA---TC-AT-TCGGT---TTCT--GT----CT--AATGA---A-GGGATATCCATTGTTTGT--CCAGTGGGGAAA-T-AT-C-AAT-----G--------TT-T-CT---A-CA-A-G-T---TA---TTTCAA--T-T--GAAAAGTA--GTTGC-A-C-A--CGT--G-TC--T--AA-TA--TT--C-ACT--GC-----CGA-------C--GCCGAAAT-CACAA--TG-A---C-CC-AA----GGGGGAAGTAATC-------TC----AC-TA-GTT-ATC-GT--C-A---GTTT--A--TCCT-T--G--CT-C------T----------A--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AAACGT----AT--GCAAT-----T--GAT-A---AA---T-G-A-A-AAG-GGG---C-AC----TGCTTG--T-G-------------C-A---AA----T----TTGG-CAT--TT-TTT-T----GG-GGGT-AATTAA--G-TTGTCTTCttgtggtcattatattggtggtagacctccctatttgagggttcccaccctcttgaagatcggagaaatatcacaaacctatgcatatgttgaggccgttatcttatactgaattaactccgtgagtccccaacgatcgggtttgatctgttaagtgtattatgggctgtgctaggacaccaaatgacgacgagatgcagattccattaaaataccggaaaattgaagatatacacgaattcaaagatctatgttacgtataatcgaattaattagcaatttaaaataaaaattttgtactacattacgagaattgattaacgtggtattgtataacaaatctaaatcattcggtttctgtctaatgaagggatatccattgtttgtccagtggggaaatatcaatgtttctacaagttatttcaattgaaaagtagttgcacacgtgtctaatattcactgccgacgccgaaatcacaatgacccaagggggaagtaatctcactagttatcgtcagtttatccttgctctatcgcaatatgcatgaaacgtatgcaattgataaatgaaaaggggcactgcttgtgcaaatttggcatttttttgggggtaattaagttgtcttctaa
gi|10 : caaggaagttgtaaatttcccgatttcccgatttctcggttttacccttctcatatacctcaaaacgcagtgaatatcacaaacaatgggacattttgggaacaaacatctgttttattaggtcataacaaaacattcgcaattcacgatggaaaatttcattacatctaaatagtatatgggacaaaacgtattcttttcgtgtacagcatgaaatgctaaatatttaacatgccaacctggtcacaacaagacgcacaattggtagttttgaacacctaaccaatcaccaaaagccgctggattttccgcattggtctttactaatgcgctatattgcgccaatgcccccctcctatcggtcttcaataggggcgtcacttgacctccataagtatcgagcattactgtatgaattctggctttttcgtaagattctttcatctaatcgacccaatctgcgatttcgtatttctgtgtttgagtttaagaatttattcttttccaagtttagtgtcttggagaatattcaggcatttaataatagagcccatcagggcctcataggcaactaggtgttttgactcatattgcttctttctctaacaccgaagatctacgattatttgtttaagggccagaatgcgaaatgttcgttctgacagggataaacgacagtccccgaggcgcttggtagcaggagtacaccacgattgggacggctgtgggtacatgctctgcgatcatgtctgctgccggctttcttgaaacgttgaagaaagttacatgttcatatgtcgtatttgttcatattgtcactaagttatttcggcacacagtctaaacggcgatttgagcgaacattgaattcgaataatacgatacttagcgcgatggtttaatttgtcgacttgcactttttaaaccaaaatttagggagaattttagcttaaattatttctgaaatcagatggtggataattttgtatgaaattgggtatactggtggtggaaaatggtctaatctttcctctccaaattcggtcttatttctttgttaaaacagatattgccaactcatcatttgttgtggtcattatattggtgACC-C------------T-T-ATC-ATGTTCTG------TTGC---------C-G-G-C-TTC-T--AAAA----CG-T-TGACAAAACG-TAC--GTG----------T--T-CTA-TCCT-GCATT--TT-CA--T--ATTGTCATT-A-C-A--TATT----CTCA-CCGTT-TA---AA---GC-ATT----T-TGAAC--AC-TTGA-AATTC-AATATT-ACG-AT-ACT-TA-ACG-CG--AT-TG----TTTGTC--G-ACT-T-G-C--ACCTTTTTTAAAAA---C--AAAA-TTTAGGAAA--TATT-TT-AGCTT-AAATT----------------CAGGT-GGATTGATAATTTTT----------GTATG-AA-TTGTG-TACAC--G--T--T-GAAA-ATA-TC--A-TAATTCCTCTCTAGACTTC---GGTC-TTATT-CTTTG--T--TTT-A-ACCGGGGTTTTAACCAGTATTTAGTCT--CCTT-ATATGAG--TTACC-CC--CT-CTTTGAAGATCGGAGAAAT--ACA-CACAA-CCCGAG-GTAT-ATGTTGA-GGCCG-T-T-ATCT--TAAA-TACT--A--TT--A----------AGT-AT--AA-----------------------------TTAA------------------------------T-GG--G-C-TA-T-GCTAGG-AC-ATC-AAA--TT---G---AC-CAG--ATG---TAGAT-T-------CA---TTAAA--ATA-CCGAAAA----TTGA--Ataa
gi|11 : TTAA----TGT-------A--A-TT-A------AT-GG----C-TA-T-G----G-AC-AC--AAA--TA---CAT-AT-CTT--ATCACTCGAAC-T---A--CCAA--TTAAACAATA-C-GCAAGAGA-TTGA--AGCATATG-CATAA---T--CAA-AG-A---TTC---A---G-T-TC-G-T-GAAATTC--G-AATTTAATTA-GCA--AT-TT------AA-AATTT--TG-AAAATA-C--ATT--A---G--ATT-G--AT-AA-CGTG--A--TTGT-AATT---A-AC--AAA-T-TAAT---TC-ATCT--GT---TC-T--GT----CT--AATGA---AGA------CCATT-----T---CAG--G--AAA---AT-C-A-T-----G--------AT-C-TT---A-CA-AAG-T---TT---TTTCAA--AATT-GAAA-GTA-----GC-A-CTA--CGT--G-TC--T--AA-TA--TT--C-ACT--GC-----TGAAAC--AAC----CGAAAT-CA-AA--TG-A-T-C-CCTAA----GGG--AGGT-A-A-------TA----C--TA-GTT-A-C-GT--C-A---GTT---A--TC-T-T--G--CT-C--C---T----------A--TCG-A-AT-A-TG-CA-G-AA--GT----AT---CAAT-----TTGAAG-A---A----T-G-A-A-A-G-GGG---C-ACC---TG-TTG--G-T-------------CAA---AA----T----TTGG-CA---TT-TTT-TTGGGGG-TGGTAA--TAA--G-TTGTCTTCga
gi|12 : t-T-CTCGGTTT-TGTCCCT-TTTCAT-A-ATCTCAAAACGGCTA-C-TG-A-AT-G-T-AAA-
gi|12 : AA-CT-A-T-CAA-AACTCG-ACATTTGGGAAAC-AA-AACA-ATG-T-TTTA-TTAGGTCAT-A-CG--AAA-A--CATT-------T----CG-C-AA--T-T-CACGA-TG--CGA-AATTT-CAAT---T-------ACAA-CTAAA-TA--C-G-TA-T---GGC--C--AACG--TA----TTTCT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-CGCA--AATCGT-AA-ATA----T-AT-A-CATGTACATAC-AAACGTAGT-CACATC--G------------CAAAA-ATT-GGT----A-G-TTT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-ACGC------A--T----G-G-----A-T-AT---TT-CG--C-AT---T--T-CTTT--A-ATA-AT-GCGGT-TATTG-G--GC-A--------CC--------CC--CCT-C--CTC-C-TGTC-T---T---C-AAT----GG---G-GTCACCA-----TG--A--CCT---CCATAAGG-AGTGG-----------GGCAggcaaagataacgaacagtgaatatcaaactatcaaaactcgacatttgggaaacaaaacaatgttttattaggtcatacgaaaacatttcgcaattcacgatgcgaaatttcaattacaactaaatacgtatggccaacgtatttcttttcgtgtacagcacgcaaatcgtaaatatatacatgtacatacaaacgtagtcacatcgcaaaaattggtagtttgaacacctaacacattccaaaagacgcatggatatttcgcatttctttaataatgcggttattgggcacccccctcctcctgtcttcaatggggtcaccatgacctccataaggagtggggcagccgca
gi|13 : tctcggttttgtcccttttcataatctcaaaacggctactgaatgtaaaggcaaagataacgaacagtgaatatcaAATG-C--ATT--TC-GG--ATC-GG-AT-AA-C-TG--ACCTTGTTA--T---ACAC--ACAGTCTCAA---TA-AT-T--GTT--CC-T--GT----CT--CATGA---A-A------CCATT-----T--TCAG--GGGAAACT-AT-C-A-TC----GGTAACTTTCT-C-CT---ACCACAAG-TATCTC---TCTCAAC-T-TT-GAAAAGTG--A--GC-ACC-A--CGTC-G-CC--TC-AA-TA--TTTCC-ACT--GCACATGCAACAC--AGC--GCCGAAAgccgca
gi|13 : -------TC----A--TG---T-A-C-TT--C-G---GTTC--AC-TC-TAT--G--CT-C--TCCGT----------A--TCGCACAT-A--G-CATGCAACCGTC---AT--GCAAT-----T--GAT-ACGAA----T-G-A-A-G-G-AGC---C-ACC---TG-TTGCAT-G-------------C-A---AA----CCTTATTGGCCACCTTC-TTT-T----GGCTGGT-AATTAACCG--TGTCTaatcctctgatcactccgtacggtcgcagaactacgggggaataccgatacacaatccacacaccgtcatgtacttcggttcactctatgctctccgtatcgcacatagcatgcaaccgtcatgcaattgatacgaatgaaggagccacctgttgcatgcaaaccttattggccaccttcttttggctggtaattaaccgtgtctctcaa
gi|14 : aatgcatttcggatcggataactgaccttgttatacacacagtctcaataattgttcctgtctcatgaaaccattttcaggggaaactatcatcggtaactttctcctaccacaagtatctctctcaactttgaaaagtgagcaccacgtcgcctcaatatttccactgcacatgcaacacagcgccgaaaaatcctctgatcactccgtacggtcgcagaactacgggggaataccgatacacaatccacacaccg-T---TA---TCCCAA--T-TT-GAAAAGT---A--GCAA-C-A--CGTGAG-TCTAT--AA-TACTTTT-CAACT--GC-----TGAAACAAGGC---CCGAAAT-CA-ctcaa
gi|14 : tttA--TG-A-TACACC-AA----GGGGAAAGTAA-A-------TCTGTAAGCTA-GTT-A-C-GT--C-A---GTTCCAA--TC-T-A--A--CT-CGAC---TAAGGACCCCAA--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AAT-GT----A---GCAACTTCAAT--GAT-A---AAAGCT-G-A-A-A-G-GGGAGAC-ACCATGCG-TTG--T-GGACCATGAAGCTAC-A---AA----T----TTGG-CA---TTATTTAT----GGCTGGTAAAcagttaaaaagcggatgggccctgtggtcacgccaggtggatattatgatacaccaaggggaaagtaaatctgtaagctagttacgtcagttccaatctaactcgactaaggaccccaatcgcaatatgcatgaatgtagcaacttcaatgataaaagctgaaaggggagacaccatgcgttgtggaccatgaagctacaaatttggcattatttatggctggtaaa
gi|15 : tttttatcccaatttgaaaagtagcaacacgtgagtctataatacttttcaactgctgaaacaaggcccgaaatcacagttaaaaagcggatgggccctgtggtcacgccaggtggatattGGGAAAC-AA-A-------------A-C-A--TCATAA-CG--AAC-A--CATT-------A----TG-CAAA--TAT-TAC--ATC--TAT-AAT---CGTA---TT---G--ACG----AAA-TA--------------GA--C--TACATCTG----T--CT-T----TTCTTTCCAT-GT-ACCAGC---A-CGGA--AATCGT-CA-ATA----T-TT-A-CATG------CAAAACCTATTCCACATC--G-GC---------CAATA-A---GG--GTCA-T-TTT----TAACACTCTT--A-ACAC------------ATT-CC---AAGAAGACAAA------A--T----G-G-----ACT-ATAACTT-CG--CGATCTGT--C-T-TT--A-ATA-A
gi|16 : tttgg-A-CGTG------T-AAACATGCT-C---CC--GAGCG---CCA--TAAAA-ACT-ATG-GT-A-T-TTTTCTAGAACA--CCTTGACACAC------------ATT-CA---TA-AAG-CCGCC-----ACCT----GAG-----A-T-AT---TTGCG--C-AT---T--TTC-TTTAA-ATATAT-GCGCT-TATTG---CGC-AAAAATGCCCC--------CC--CCCTC--CTA-C-GGTC-T---T---ACAAT----AA---GCGTCACatcgatcaccccactc
gi|17 : C--AAC--TC-------G-G-TGTG-AATCTTGGTTAAG---TAT-------ATAA-TT-AC-----AT-GGG-GGC-TA-T-GCTAGG-AC-AT---AA--TT---G---AC-CAG--ATG---TAGAT-G---TGGGCA----TAAG--ATA-CCG--AAAAT-TGGA--AGGTTAT--CATGGACTT--TAATAGAA---T-CT--A-T-G-C-AC-G-A-GAAAT-CTTG-AGCTTAATTA-CCA--AT-TT----gcatt
gi|18 : AT--ACAC-ACAA-CC-----GCAA-A-GTTG----TCA-T-T-ATTT--TAAAACGCT-TA--TT--A--TCCG----------------------------G-TTTA-A-TCC--GGGAA----TGT-------A--A-TT-A------AT-GGG---T-TA-T-GCTAGG-AT-ACC-AAT--TT---G---AC-CAG--ATG---TAGA--T---T--CTA---TTCTA--GTG-TC-GAAGAAT-C--A--ATAATGTT-CGTAAA-AT--CAA-AG-T---T-C---ga
gi|19 : -AAACCTAGT-CACATC--G------------CAAAA-GTT-GAT----A-G-CAT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-ACAC------A--TCCATG-G-----A-T-AT---TT-CG--T-AT---T--T-T-TT--A-ATA-AT-GCGCT-TATTG---TGCAA----TGTCCC--------CCTTCCA-C--CT-----GTC-T---T---C-AAT----GG---G-GTCACC-----TTG--A--CCT---CC
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Reference ( family-2919 ) : AAAGGAAGTT--GTAAATTTCC--CCGA--TTTCNCGA--TT-T-CTCGGTTT-TATCCCT-CT-CAT-A-ATCTCAAAACGGCTA-C-TGAA-AT-A-T-AAA-AACTCG-ACATTTGGGAAAC-AA-A-CA-ATG-T-TT-A-T-AGGTCAT-A-CG--AAA-A--CATT-------A----CG-C-AA--T-T-CACGAATG--CGA-AAT---CATT---TT---A--ACAT-CTAAA-TA--C-G-TA-T---GGA--C--AACG--TA----T--CT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-CGAA--AATCNT-AA-ATA----T-TT-A-CATG------C-AAACCTGGT-CACACC--G-GCG---C-G--CAAAA-ATT-GGT-GT-A-G-TTT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-CCGC------A--T----G-G-----A-T-AT---TT-CG--C-AT---T--T-C-TT--A-ATA-AT-GCGCT-TATTG-GCCGC-A----TGCCCC--------CC--CCC-C--CTA-C-GGTC-T---T---CAAAT----AG---G-GTCACCG---TTTG--A--CCT---CCATAAAGTATCGA-----------GGCATTA-CTG-GTATGAA-TT--------CTTG-----GC--TTTCA-----NAATATT-TTTC---AT-TAA---CAT-C-GA-C-CCA-ATTC---TGCGA-ATTCGTATTTCT-G-TGTTTGA-GTT----------A-TTATAGG---AATTTTTTTC----TTTCCACAGTT-TTTAGT-TCTTG---G--AG---A-ATA---ATTCAA-GGCA-GTTTTTAATGAATA--GA-TGCCC-------GT-C----AAG-G--T-CACAC-TCAA-TAGG--C-ACA-CTGA--AN--TG-TA---T------TTTCTA-AACACAGAA-GA-TC-T-CAC-AT-TATTTGGTTTC-----AG-GG-CCC-AG-AATGCGA-AGT---ATT-GTC-CTCTGAC--A--ACG-GATTTAC-G--AC-GGTCC-C-----CGC-C--GTAGCAGG------A---TA----CCACG-A-----------T-TCGG-G-AC-GG-T-GT--GGG-ACA-TGACC-C------------T-C-ATC-ATGTTCTG------CTGC---------C-G-G-C-TTC-TG-AAAA----CG-T-TGACAAAACT-TAC--GCG----------T--TTCTA-TTCC-GCATT--TT-CA--T--ATTGTCACT-A-C-A--TATT----CTCA-CCGTT-TA---AAC--GC-ATT----T-TGAGC--AC-TTGA-AATTC-AATATTTACG-AT-ACT-TA-GCG-CG--AT-GT----TTTGTC--G-ACT-T-G-C--ACCTTTTTTCAAAA---C--GAAA-TTTAGGAAA--TATT-TT-AGCTT-AAATTTATTCCT-CTGA-A--CAGATTGGATGGATAATTTTT--TT-----TGTATG-AA-TTGTG-TATAC--G--T--TTGAAA-AT--TC--A-TATTTCCTCTCCAGACTTC---GGTC-TTATTTCTTTG--T--TT--A-ACCAGG----TAAT-----TGTAGNCC--CCTA-ATTTGAG--TTACC-CC--CT-CTTTGAAGATCGGAGAAAT--ACACCACAA-CCC-AA-GCAT-ATGTTGA-GGCCG-T-T-ATCT--TAAA-TACT-AA--TT--A--CCCG-TG-AGT-CC--AAC--TC-------G-G-TTTG-A-TCT--GTTAAG---TGT-------A--A-TT-A------AT-GGG-G-C-TA-T-GCTAGG-AC-ACC-AAA--TT---GA--AC-CAG--ATG---CAGAT-T---T--CCA---TTAAA--ATA-CCGGAAAAAT-TTGA--AAGATATG-CATGAA-TT--CAA-AG-A---T-C---A-T-G-T-AC-G-T-GAAAT-C--G-AATTTAATTA-GCA--AT-TT----TAAA-AATTT--TG-TAAATA-C--ATT--AC-GG--ATT-G--AT-AA-C-TG--A--TTGT-A--T---A-AC--AAAAT-TNAA---TC-AT-T--GT---CT-T--GT----CT--AATGA---A-A------CCATT-----T--TCAG--GGGAAA-T-AT-C-A-T-GA--------T-T-CT---A-CA-AAG-T---TA---TTTCAA--T-TT-GAAAAGTA--A--GC-A-C-A--CGT--G-TC--T--AA-TA--TTT-C-ACT--GC-----CGAAAC--GGC--GCCGAAAT-CA-AA--TG-A-T-C-CC-AA----GGG--AAGTAA-A-------TC----A--TA-GTT-A-C-GT--C-A---GTT---A--TC-T-T--G--CT-C--C---T----------A--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AA--GT----AT--GCAAT-----T--GAT-A---A----T-G-A-A-A-G-GGG---C-ACC---TG-TTG--T-G-------------C-A---AA----T----TTGG-CA---TT-TTT-T----GG-TGGTAAATTAA--G-TTGTCTTC
gi|1 : AAGGAAGTT--GTAAATTTCC--C-GA--TTTCCCGA--TT-T-CTCGGTTT-TACCCTT-CT-CAT-ATACCTCAAAACG--CA-G-TGAATATCA-C-AAACAATGGG-ACATTTTGGGAAC-AA-A-CATCTGTT-TT-ATT-AGGTCAT-A-AC--AAA-A--CATT------------CG-C-AA--T-T-CACG-ATG---GA-AA-----ATT---TC---ATTACAT-CTAAA-TA----G-TA-TATGGGA--CAAAACG--TAT---T--CT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-TG-A--AATGCT-AA-ATA----T-TTAA-CATG------C-CAACCTGGT-CACAACAAG-ACG---C-A--C---A-ATT-G---GT-A-GTTTT----GAACA--CCT--A-ACCA------------ATCACC---AA-AAG-CCGC---------T----G-G-----A-T-TT---TC-CG--C-AT---TGGT-CTTT--A-CTA-AT-GCGCTATATTGCGCCA--A----TG--CC--------CC--CCT-C--CTATC-GGTC-T---T---C-AAT----AG---G-GGCGTCA---CTTG--A--CCT---CCAT-AAGTATCGA------------GCATTA-CT--GTATGAA-TT--------C-TG-----GCTTTTTCG-----TAAGATTCTTTC---ATCTA-----AT-C-GA-C-CCA-A-TC---TGCGA-TTTCGTATTTCT-G-TGTTTGA-GTT---------------TAAG---AATTTATTCT----TTTCCA-AG---TTTAGTGTCTTG---G--AG---A-AT----ATTC-A-GGCA----TTTAAT-AATA--GA--GCCC-------AT-C----AGG-GCCT-CATAG-GCAACTAGG--T-GTT-TTGA--CT--CA-TA---TTGCTTCTTTCTCTAACACCGAA-GA-TC-T--ACGAT-TATTT-GTTTA-----AG-GG--CC-AG-AATGCGA-AAT---GTTCGT---TCTGAC--A--G-G-GATAAAC-G--AC-AGTCC-CCGAGGCGC-TTGGTAGCAGGAGT---A---CA----CCACG-A-----------T-T-GG-G-AC-GGCT-GT--GGGTACA-TG-CT-C------------TGCGATC-ATG-TCTG------CTGC---------C-G-G-CTTTC-TT-GAAA----CG-T-TGAAGAAAGT-TAC--ATG----------T--TCATA-TGTC-GTATTTGTT-CA--T--ATTGTCACT-A---AGTTATTTCGGCACA-CAGTC-TA---AACG-GC-GAT----T-TGAGCGAACATTG--AATTCGAATA-ATACG-AT-ACT-TA-GCG-CG--ATGGTTTAATTTGTC--G-ACT-T-G-C--AC---TTTTTAAAC---C--AAAA-TTTAGGGAG--AATT-TT-AGCTT-AAA-TTATT--T-CTGA-AATCAGAT--GGTGGATAA----T--TT-----TGTATGAAA-TTGGG-TATACTGG--TGGTGGAAA-ATGGTCTAA-TCTTTCCTCTCCAAA-TTC---GGTC-TTATTTCTTTG--T--TA--A-AACAGA----T-AT-----TGCCAACT--CATC-ATTTG
gi|1 : cGTAGACCTCCCTA--TTTGAGGGTTCCCACC--CT-CTT-GAAGATCGGAGAAAT--AT--CACAAACCT-AT-GCAT-ATGTTGA-GGCCG-T-T-ATCT--TA---TACTGAA--TT--AACTCCG-TG-AGT-CCCCAACGATC-------G-GGTTTG-A-TCT--GTTAAG---TGT-------A----TT-A-------T-GGG---C-TG-T-GCTAGG-AC-ACC-AAA--T----GACGAC-GAG--ATG---CAGAT-T------CCA---TTAAA--ATA-CCGGAAAA---TTGA--A-GATATA-CACGAA-TT--CAA-AG-A---T-CT--A-T-G-TTAC-G-T-ATAAT-C--G-AATT-AATTA-GCA--AT-TTAAAATAAA-AATTT--TG-TAC-TA-C--ATT--AC-GAGAATT-G--ATTAA-CGTGGTA--TTGT-A--T---A-AC--AAATC-TAAA---TC-AT-TCGGT---TTCT--GT----CT--AATGA---A-GGGATATCCATTGTTTGT--CCAGTGGGGAAA-T-AT-C-AAT-GT--------T-T-CT---A-CA-A-G-T---TA---TTTCAA--T-T--GAAAAGTA--GTTGC-A-C-A--CGT--G-TC--T--AA-TA--TT--C-ACT--GC-----CGA-------C--GCCGAAAT-CACAA--TG-A---C-CC-AA----GGGGGAAGTAATC-------TC----AC-TA-GTT-ATC-GT--C-A---GTTT--A--TCCT-T--G--CT-C------T----------A--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AAACGT----AT--GCAAT-----T--GAT-A---AA---T-G-A-A-AAG-GGG---C-AC----TGCTTG--T-G-------------C-A---AA----T----TTGG-CAT--TT-TTT-T----GG-GGGT-AATTAA--G-TTGTCTTCttgtggtcattatattggtggtagacctccctatttgagggttcccaccctcttgaagatcggagaaatatcacaaacctatgcatatgttgaggccgttatcttatactgaattaactccgtgagtccccaacgatcgggtttgatctgttaagtgtattatgggctgtgctaggacaccaaatgacgacgagatgcagattccattaaaataccggaaaattgaagatatacacgaattcaaagatctatgttacgtataatcgaattaattagcaatttaaaataaaaattttgtactacattacgagaattgattaacgtggtattgtataacaaatctaaatcattcggtttctgtctaatgaagggatatccattgtttgtccagtggggaaatatcaatgtttctacaagttatttcaattgaaaagtagttgcacacgtgtctaatattcactgccgacgccgaaatcacaatgacccaagggggaagtaatctcactagttatcgtcagtttatccttgctctatcgcaatatgcatgaaacgtatgcaattgataaatgaaaaggggcactgcttgtgcaaatttggcatttttttgggggtaattaagttgtcttctaa
gi|10 : caaggaagttgtaaatttcccgatttcccgatttctcggttttacccttctcatatacctcaaaacgcagtgaatatcacaaacaatgggacattttgggaacaaacatctgttttattaggtcataacaaaacattcgcaattcacgatggaaaatttcattacatctaaatagtatatgggacaaaacgtattcttttcgtgtacagcatgaaatgctaaatatttaacatgccaacctggtcacaacaagacgcacaattggtagttttgaacacctaaccaatcaccaaaagccgctggattttccgcattggtctttactaatgcgctatattgcgccaatgcccccctcctatcggtcttcaataggggcgtcacttgacctccataagtatcgagcattactgtatgaattctggctttttcgtaagattctttcatctaatcgacccaatctgcgatttcgtatttctgtgtttgagtttaagaatttattcttttccaagtttagtgtcttggagaatattcaggcatttaataatagagcccatcagggcctcataggcaactaggtgttttgactcatattgcttctttctctaacaccgaagatctacgattatttgtttaagggccagaatgcgaaatgttcgttctgacagggataaacgacagtccccgaggcgcttggtagcaggagtacaccacgattgggacggctgtgggtacatgctctgcgatcatgtctgctgccggctttcttgaaacgttgaagaaagttacatgttcatatgtcgtatttgttcatattgtcactaagttatttcggcacacagtctaaacggcgatttgagcgaacattgaattcgaataatacgatacttagcgcgatggtttaatttgtcgacttgcactttttaaaccaaaatttagggagaattttagcttaaattatttctgaaatcagatggtggataattttgtatgaaattgggtatactggtggtggaaaatggtctaatctttcctctccaaattcggtcttatttctttgttaaaacagatattgccaactcatcatttgttgtggtcattatattggtgACC-C------------T-T-ATC-ATGTTCTG------TTGC---------C-G-G-C-TTC-T--AAAA----CG-T-TGACAAAACG-TAC--GTG----------T--T-CTA-TCCT-GCATT--TT-CA--T--ATTGTCATT-A-C-A--TATT----CTCA-CCGTT-TA---AA---GC-ATT----T-TGAAC--AC-TTGA-AATTC-AATATT-ACG-AT-ACT-TA-ACG-CG--AT-TG----TTTGTC--G-ACT-T-G-C--ACCTTTTTTAAAAA---C--AAAA-TTTAGGAAA--TATT-TT-AGCTT-AAATT----------------CAGGT-GGATTGATAATTTTT----------GTATG-AA-TTGTG-TACAC--G--T--T-GAAA-ATA-TC--A-TAATTCCTCTCTAGACTTC---GGTC-TTATT-CTTTG--T--TTT-A-ACCGGGGTTTTAACCAGTATTTAGTCT--CCTT-ATATGAG--TTACC-CC--CT-CTTTGAAGATCGGAGAAAT--ACA-CACAA-CCCGAG-GTAT-ATGTTGA-GGCCG-T-T-ATCT--TAAA-TACT--A--TT--A----------AGT-AT--AA-----------------------------TTAA------------------------------T-GG--G-C-TA-T-GCTAGG-AC-ATC-AAA--TT---G---AC-CAG--ATG---TAGAT-T-------CA---TTAAA--ATA-CCGAAAA----TTGA--Ataa
gi|11 : TTAA----TGT-------A--A-TT-A------AT-GG----C-TA-T-G----G-AC-AC--AAA--TA---CAT-AT-CTT--ATCACTCGAAC-T---A--CCAA--TTAAACAATA-C-GCAAGAGA-TTGA--AGCATATG-CATAA---T--CAA-AG-A---TTC---A---G-T-TC-G-T-GAAATTC--G-AATTTAATTA-GCA--AT-TT------AA-AATTT--TG-AAAATA-C--ATT--A---G--ATT-G--AT-AA-CGTG--A--TTGT-AATT---A-AC--AAA-T-TAAT---TC-ATCT--GT---TC-T--GT----CT--AATGA---AGA------CCATT-----T---CAG--G--AAA---AT-C-A-T-GA--------T-C-TT---A-CA-AAG-T---TT---TTTCAA--AATT-GAAA-GTA-----GC-A-CTA--CGT--G-TC--T--AA-TA--TT--C-ACT--GC-----TGAAAC--AAC----CGAAAT-CA-AA--TG-A-T-C-CCTAA----GGG--AGGT-A-A-------TA----C--TA-GTT-A-C-GT--C-A---GTT---A--TC-T-T--G--CT-C--C---T----------A--TCG-A-AT-A-TG-CA-G-AA--GT----AT---CAAT-----TTGAAG-A---A----T-G-A-A-A-G-GGG---C-ACC---TG-TTG--G-T-------------CAA---AA----T----TTGG-CA---TT-TTT-TTGGGGG-TGGTAA--TAA--G-TTGTCTTCga
gi|12 : t-T-CTCGGTTT-TGTCCCT-TTTCAT-A-ATCTCAAAACGGCTA-C-TG-A-AT-G-T-AAA-
gi|12 : AA-CT-A-T-CAA-AACTCG-ACATTTGGGAAAC-AA-AACA-ATG-T-TTTA-TTAGGTCAT-A-CG--AAA-A--CATT-------T----CG-C-AA--T-T-CACGA-TG--CGA-AATTT-CAAT---T-------ACAA-CTAAA-TA--C-G-TA-T---GGC--C--AACG--TA----TTTCT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-CGCA--AATCGT-AA-ATA----T-AT-A-CATGTACATAC-AAACGTAGT-CACATC--G------------CAAAA-ATT-GGT----A-G-TTT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-ACGC------A--T----G-G-----A-T-AT---TT-CG--C-AT---T--T-CTTT--A-ATA-AT-GCGGT-TATTG-G--GC-A--------CC--------CC--CCT-C--CTC-C-TGTC-T---T---C-AAT----GG---G-GTCACCA-----TG--A--CCT---CCATAAGG-AGTGG-----------GGCAggcaaagataacgaacagtgaatatcaaactatcaaaactcgacatttgggaaacaaaacaatgttttattaggtcatacgaaaacatttcgcaattcacgatgcgaaatttcaattacaactaaatacgtatggccaacgtatttcttttcgtgtacagcacgcaaatcgtaaatatatacatgtacatacaaacgtagtcacatcgcaaaaattggtagtttgaacacctaacacattccaaaagacgcatggatatttcgcatttctttaataatgcggttattgggcacccccctcctcctgtcttcaatggggtcaccatgacctccataaggagtggggcagccgca
gi|13 : tctcggttttgtcccttttcataatctcaaaacggctactgaatgtaaaggcaaagataacgaacagtgaatatcaAATG-C--ATT--TC-GG--ATC-GG-AT-AA-C-TG--ACCTTGTTA--T---ACAC--ACAGTCTCAA---TA-AT-T--GTT--CC-T--GT----CT--CATGA---A-A------CCATT-----T--TCAG--GGGAAACT-AT-C-A-TCGGTAACTTTCT-C-CT---ACCACAAG-TATCTC---TCTCAAC-T-TT-GAAAAGTG--A--GC-ACC-A--CGTC-G-CC--TC-AA-TA--TTTCC-ACT--GCACATGCAACAC--AGC--GCCGAAAgccgca
gi|13 : -------TC----A--TG---T-A-C-TT--C-G---GTTC--AC-TC-TAT--G--CT-C--TCCGT----------A--TCGCACAT-A--G-CATGCAACCGTC---AT--GCAAT-----T--GAT-ACGAA----T-G-A-A-G-G-AGC---C-ACC---TG-TTGCAT-G-------------C-A---AA----CCTTATTGGCCACCTTC-TTT-T----GGCTGGT-AATTAACCG--TGTCTaatcctctgatcactccgtacggtcgcagaactacgggggaataccgatacacaatccacacaccgtcatgtacttcggttcactctatgctctccgtatcgcacatagcatgcaaccgtcatgcaattgatacgaatgaaggagccacctgttgcatgcaaaccttattggccaccttcttttggctggtaattaaccgtgtctctcaa
gi|14 : aatgcatttcggatcggataactgaccttgttatacacacagtctcaataattgttcctgtctcatgaaaccattttcaggggaaactatcatcggtaactttctcctaccacaagtatctctctcaactttgaaaagtgagcaccacgtcgcctcaatatttccactgcacatgcaacacagcgccgaaaaatcctctgatcactccgtacggtcgcagaactacgggggaataccgatacacaatccacacaccg-T---TA---TCCCAA--T-TT-GAAAAGT---A--GCAA-C-A--CGTGAG-TCTAT--AA-TACTTTT-CAACT--GC-----TGAAACAAGGC---CCGAAAT-CA-ctcaa
gi|14 : tttA--TG-A-TACACC-AA----GGGGAAAGTAA-A-------TCTGTAAGCTA-GTT-A-C-GT--C-A---GTTCCAA--TC-T-A--A--CT-CGAC---TAAGGACCCCAA--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AAT-GT----A---GCAACTTCAAT--GAT-A---AAAGCT-G-A-A-A-G-GGGAGAC-ACCATGCG-TTG--T-GGACCATGAAGCTAC-A---AA----T----TTGG-CA---TTATTTAT----GGCTGGTAAAcagttaaaaagcggatgggccctgtggtcacgccaggtggatattatgatacaccaaggggaaagtaaatctgtaagctagttacgtcagttccaatctaactcgactaaggaccccaatcgcaatatgcatgaatgtagcaacttcaatgataaaagctgaaaggggagacaccatgcgttgtggaccatgaagctacaaatttggcattatttatggctggtaaa
gi|15 : tttttatcccaatttgaaaagtagcaacacgtgagtctataatacttttcaactgctgaaacaaggcccgaaatcacagttaaaaagcggatgggccctgtggtcacgccaggtggatattGGGAAAC-AA-A-------------A-C-A--TCATAA-CG--AAC-A--CATT-------A----TG-CAAA--TAT-TAC--ATC--TAT-AAT---CGTA---TT---G--ACG----AAA-TA--------------GA--C--TACATCTG----T--CT-T----TTCTTTCCAT-GT-ACCAGC---A-CGGA--AATCGT-CA-ATA----T-TT-A-CATG------CAAAACCTATTCCACATC--G-GC---------CAATA-A---GG--GTCA-T-TTT----TAACACTCTT--A-ACAC------------ATT-CC---AAGAAGACAAA------A--T----G-G-----ACT-ATAACTT-CG--CGATCTGT--C-T-TT--A-ATA-A
gi|16 : tttgg-A-CGTG------T-AAACATGCT-C---CC--GAGCG---CCA--TAAAA-ACT-ATG-GT-A-T-TTTTCTAGAACA--CCTTGACACAC------------ATT-CA---TA-AAG-CCGCC-----ACCT----GAG-----A-T-AT---TTGCG--C-AT---T--TTC-TTTAA-ATATAT-GCGCT-TATTG---CGC-AAAAATGCCCC--------CC--CCCTC--CTA-C-GGTC-T---T---ACAAT----AA---GCGTCACatcgatcaccccactc
gi|17 : C--AAC--TC-------G-G-TGTG-AATCTTGGTTAAG---TAT-------ATAA-TT-AC-----AT-GGG-GGC-TA-T-GCTAGG-AC-AT---AA--TT---G---AC-CAG--ATG---TAGAT-G---TGGGCA----TAAG--ATA-CCG--AAAAT-TGGA--AGGTTAT--CATGGACTT--TAATAGAA---T-CT--A-T-G-C-AC-G-A-GAAAT-CTTG-AGCTTAATTA-CCA--AT-TT----gcatt
gi|18 : AT--ACAC-ACAA-CC-----GCAA-A-GTTG----TCA-T-T-ATTT--TAAAACGCT-TA--TT--A--TCCG----------------------------G-TTTA-A-TCC--GGGAA----TGT-------A--A-TT-A------AT-GGG---T-TA-T-GCTAGG-AT-ACC-AAT--TT---G---AC-CAG--ATG---TAGA--T---T--CTA---TTCTA--GTG-TC-GAAGAAT-C--A--ATAATGTT-CGTAAA-AT--CAA-AG-T---T-C---ga
gi|19 : -AAACCTAGT-CACATC--G------------CAAAA-GTT-GAT----A-G-CAT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-ACAC------A--TCCATG-G-----A-T-AT---TT-CG--T-AT---T--T-T-TT--A-ATA-AT-GCGCT-TATTG---TGCAA----TGTCCC--------CCTTCCA-C--CT-----GTC-T---T---C-AAT----GG---G-GTCACC-----TTG--A--CCT---CC
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Reference ( family-2919 ) : AAAGGAAGTT--GTAAATTTCC--CCGA--TTTCNCGA--TT-T-CTCGGTTT-TATCCCT-CT-CAT-A-ATCTCAAAACGGCTA-C-TGAA-AT-A-T-AAA-AACTCG-ACATTTGGGAAAC-AA-A-CA-ATG-T-TT-A-T-AGGTCAT-A-CG--AAA-A--CATT-------A----CG-C-AA--T-T-CACGAATG--CGA-AAT---CATT---TT---A--ACAT-CTAAA-TA--C-G-TA-T---GGA--C--AACG--TA----T--CT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-CGAA--AATCNT-AA-ATA----T-TT-A-CATG------C-AAACCTGGT-CACACC--G-GCG---C-G--CAAAA-ATT-GGT-GT-A-G-TTT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-CCGC------A--T----G-G-----A-T-AT---TT-CG--C-AT---T--T-C-TT--A-ATA-AT-GCGCT-TATTG-GCCGC-A----TGCCCC--------CC--CCC-C--CTA-C-GGTC-T---T---CAAAT----AG---G-GTCACCG---TTTG--A--CCT---CCATAAAGTATCGA-----------GGCATTA-CTG-GTATGAA-TT--------CTTG-----GC--TTTCA-----NAATATT-TTTC---AT-TAA---CAT-C-GA-C-CCA-ATTC---TGCGA-ATTCGTATTTCT-G-TGTTTGA-GTT----------A-TTATAGG---AATTTTTTTC----TTTCCACAGTT-TTTAGT-TCTTG---G--AG---A-ATA---ATTCAA-GGCA-GTTTTTAATGAATA--GA-TGCCC-------GT-C----AAG-G--T-CACAC-TCAA-TAGG--C-ACA-CTGA--AN--TG-TA---T------TTTCTA-AACACAGAA-GA-TC-T-CAC-AT-TATTTGGTTTC-----AG-GG-CCC-AG-AATGCGA-AGT---ATT-GTC-CTCTGAC--A--ACG-GATTTAC-G--AC-GGTCC-C-----CGC-C--GTAGCAGG------A---TA----CCACG-A-----------T-TCGG-G-AC-GG-T-GT--GGG-ACA-TGACC-C------------T-C-ATC-ATGTTCTG------CTGC---------C-G-G-C-TTC-TG-AAAA----CG-T-TGACAAAACT-TAC--GCG----------T--TTCTA-TTCC-GCATT--TT-CA--T--ATTGTCACT-A-C-A--TATT----CTCA-CCGTT-TA---AAC--GC-ATT----T-TGAGC--AC-TTGA-AATTC-AATATTTACG-AT-ACT-TA-GCG-CG--AT-GT----TTTGTC--G-ACT-T-G-C--ACCTTTTTTCAAAA---C--GAAA-TTTAGGAAA--TATT-TT-AGCTT-AAATTTATTCCT-CTGA-A--CAGATTGGATGGATAATTTTT--TT-----TGTATG-AA-TTGTG-TATAC--G--T--TTGAAA-AT--TC--A-TATTTCCTCTCCAGACTTC---GGTC-TTATTTCTTTG--T--TT--A-ACCAGG----TAAT-----TGTAGNCC--CCTA-ATTTGAG--TTACC-CC--CT-CTTTGAAGATCGGAGAAAT--ACACCACAA-CCC-AA-GCAT-ATGTTGA-GGCCG-T-T-ATCT--TAAA-TACT-AA--TT--A--CCCG-TG-AGT-CC--AAC--TC-------G-G-TTTG-A-TCT--GTTAAG---TGT-------A--A-TT-A------AT-GGG-G-C-TA-T-GCTAGG-AC-ACC-AAA--TT---GA--AC-CAG--ATG---CAGAT-T---T--CCA---TTAAA--ATA-CCGGAAAAAT-TTGA--AAGATATG-CATGAA-TT--CAA-AG-A---T-C---A-T-G-T-AC-G-T-GAAAT-C--G-AATTTAATTA-GCA--AT-TT----TAAA-AATTT--TG-TAAATA-C--ATT--AC-GG--ATT-G--AT-AA-C-TG--A--TTGT-A--T---A-AC--AAAAT-TNAA---TC-AT-T--GT---CT-T--GT----CT--AATGA---A-A------CCATT-----T--TCAG--GGGAAA-T-AT-C-A-T-GA--------T-T-CT---A-CA-AAG-T---TA---TTTCAA--T-TT-GAAAAGTA--A--GC-A-C-A--CGT--G-TC--T--AA-TA--TTT-C-ACT--GC-----CGAAAC--GGC--GCCGAAAT-CA-AA--TG-A-T-C-CC-AA----GGG--AAGTAA-A-------TC----A--TA-GTT-A-C-GT--C-A---GTT---A--TC-T-T--G--CT-C--C---T----------A--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AA--GT----AT--GCAAT-----T--GAT-A---A----T-G-A-A-A-G-GGG---C-ACC---TG-TTG--T-G-------------C-A---AA----T----TTGG-CA---TT-TTT-T----GG-TGGTAAATTAA--G-TTGTCTTC
gi|1 : AAGGAAGTT--GTAAATTTCC--C-GA--TTTCCCGA--TT-T-CTCGGTTT-TACCCTT-CT-CAT-ATACCTCAAAACG--CA-G-TGAATATCA-C-AAACAATGGG-ACATTTTGGGAAC-AA-A-CATCTGTT-TT-ATT-AGGTCAT-A-AC--AAA-A--CATT------------CG-C-AA--T-T-CACG-ATG---GA-AA-----ATT---TC---ATTACAT-CTAAA-TA----G-TA-TATGGGA--CAAAACG--TAT---T--CT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-TG-A--AATGCT-AA-ATA----T-TTAA-CATG------C-CAACCTGGT-CACAACAAG-ACG---C-A--C---A-ATT-G---GT-A-GTTTT----GAACA--CCT--A-ACCA------------ATCACC---AA-AAG-CCGC---------T----G-G-----A-T-TT---TC-CG--C-AT---TGGT-CTTT--A-CTA-AT-GCGCTATATTGCGCCA--A----TG--CC--------CC--CCT-C--CTATC-GGTC-T---T---C-AAT----AG---G-GGCGTCA---CTTG--A--CCT---CCAT-AAGTATCGA------------GCATTA-CT--GTATGAA-TT--------C-TG-----GCTTTTTCG-----TAAGATTCTTTC---ATCTA-----AT-C-GA-C-CCA-A-TC---TGCGA-TTTCGTATTTCT-G-TGTTTGA-GTT---------------TAAG---AATTTATTCT----TTTCCA-AG---TTTAGTGTCTTG---G--AG---A-AT----ATTC-A-GGCA----TTTAAT-AATA--GA--GCCC-------AT-C----AGG-GCCT-CATAG-GCAACTAGG--T-GTT-TTGA--CT--CA-TA---TTGCTTCTTTCTCTAACACCGAA-GA-TC-T--ACGAT-TATTT-GTTTA-----AG-GG--CC-AG-AATGCGA-AAT---GTTCGT---TCTGAC--A--G-G-GATAAAC-G--AC-AGTCC-CCGAGGCGC-TTGGTAGCAGGAGT---A---CA----CCACG-A-----------T-T-GG-G-AC-GGCT-GT--GGGTACA-TG-CT-C------------TGCGATC-ATG-TCTG------CTGC---------C-G-G-CTTTC-TT-GAAA----CG-T-TGAAGAAAGT-TAC--ATG----------T--TCATA-TGTC-GTATTTGTT-CA--T--ATTGTCACT-A---AGTTATTTCGGCACA-CAGTC-TA---AACG-GC-GAT----T-TGAGCGAACATTG--AATTCGAATA-ATACG-AT-ACT-TA-GCG-CG--ATGGTTTAATTTGTC--G-ACT-T-G-C--AC---TTTTTAAAC---C--AAAA-TTTAGGGAG--AATT-TT-AGCTT-AAA-TTATT--T-CTGA-AATCAGAT--GGTGGATAA----T--TT-----TGTATGAAA-TTGGG-TATACTGG--TGGTGGAAA-ATGGTCTAA-TCTTTCCTCTCCAAA-TTC---GGTC-TTATTTCTTTG--T--TA--A-AACAGA----T-AT-----TGCCAACT--CATC-ATTTG
gi|1 : cGTAGACCTCCCTA--TTTGAGGGTTCCCACC--CT-CTT-GAAGATCGGAGAAAT--AT--CACAAACCT-AT-GCAT-ATGTTGA-GGCCG-T-T-ATCT--TA---TACTGAA--TT--AACTCCG-TG-AGT-CCCCAACGATC-------G-GGTTTG-A-TCT--GTTAAG---TGT-------A----TT-A-------T-GGG---C-TG-T-GCTAGG-AC-ACC-AAA--T----GACGAC-GAG--ATG---CAGAT-T------CCA---TTAAA--ATA-CCGGAAAA---TTGA--A-GATATA-CACGAA-TT--CAA-AG-A---T-CT--A-T-G-TTAC-G-T-ATAAT-C--G-AATT-AATTA-GCA--AT-TTAAAATAAA-AATTT--TG-TAC-TA-C--ATT--AC-GAGAATT-G--ATTAA-CGTGGTA--TTGT-A--T---A-AC--AAATC-TAAA---TC-AT-TCGGT---TTCT--GT----CT--AATGA---A-GGGATATCCATTGTTTGT--CCAGTGGGGAAA-T-AT-C-AAT-GT--------T-T-CT---A-CA-A-G-T---TA---TTTCAA--T-T--GAAAAGTA--GTTGC-A-C-A--CGT--G-TC--T--AA-TA--TT--C-ACT--GC-----CGA-------C--GCCGAAAT-CACAA--TG-A---C-CC-AA----GGGGGAAGTAATC-------TC----AC-TA-GTT-ATC-GT--C-A---GTTT--A--TCCT-T--G--CT-C------T----------A--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AAACGT----AT--GCAAT-----T--GAT-A---AA---T-G-A-A-AAG-GGG---C-AC----TGCTTG--T-G-------------C-A---AA----T----TTGG-CAT--TT-TTT-T----GG-GGGT-AATTAA--G-TTGTCTTCttgtggtcattatattggtggtagacctccctatttgagggttcccaccctcttgaagatcggagaaatatcacaaacctatgcatatgttgaggccgttatcttatactgaattaactccgtgagtccccaacgatcgggtttgatctgttaagtgtattatgggctgtgctaggacaccaaatgacgacgagatgcagattccattaaaataccggaaaattgaagatatacacgaattcaaagatctatgttacgtataatcgaattaattagcaatttaaaataaaaattttgtactacattacgagaattgattaacgtggtattgtataacaaatctaaatcattcggtttctgtctaatgaagggatatccattgtttgtccagtggggaaatatcaatgtttctacaagttatttcaattgaaaagtagttgcacacgtgtctaatattcactgccgacgccgaaatcacaatgacccaagggggaagtaatctcactagttatcgtcagtttatccttgctctatcgcaatatgcatgaaacgtatgcaattgataaatgaaaaggggcactgcttgtgcaaatttggcatttttttgggggtaattaagttgtcttctaa
gi|10 : caaggaagttgtaaatttcccgatttcccgatttctcggttttacccttctcatatacctcaaaacgcagtgaatatcacaaacaatgggacattttgggaacaaacatctgttttattaggtcataacaaaacattcgcaattcacgatggaaaatttcattacatctaaatagtatatgggacaaaacgtattcttttcgtgtacagcatgaaatgctaaatatttaacatgccaacctggtcacaacaagacgcacaattggtagttttgaacacctaaccaatcaccaaaagccgctggattttccgcattggtctttactaatgcgctatattgcgccaatgcccccctcctatcggtcttcaataggggcgtcacttgacctccataagtatcgagcattactgtatgaattctggctttttcgtaagattctttcatctaatcgacccaatctgcgatttcgtatttctgtgtttgagtttaagaatttattcttttccaagtttagtgtcttggagaatattcaggcatttaataatagagcccatcagggcctcataggcaactaggtgttttgactcatattgcttctttctctaacaccgaagatctacgattatttgtttaagggccagaatgcgaaatgttcgttctgacagggataaacgacagtccccgaggcgcttggtagcaggagtacaccacgattgggacggctgtgggtacatgctctgcgatcatgtctgctgccggctttcttgaaacgttgaagaaagttacatgttcatatgtcgtatttgttcatattgtcactaagttatttcggcacacagtctaaacggcgatttgagcgaacattgaattcgaataatacgatacttagcgcgatggtttaatttgtcgacttgcactttttaaaccaaaatttagggagaattttagcttaaattatttctgaaatcagatggtggataattttgtatgaaattgggtatactggtggtggaaaatggtctaatctttcctctccaaattcggtcttatttctttgttaaaacagatattgccaactcatcatttgttgtggtcattatattggtgACC-C------------T-T-ATC-ATGTTCTG------TTGC---------C-G-G-C-TTC-T--AAAA----CG-T-TGACAAAACG-TAC--GTG----------T--T-CTA-TCCT-GCATT--TT-CA--T--ATTGTCATT-A-C-A--TATT----CTCA-CCGTT-TA---AA---GC-ATT----T-TGAAC--AC-TTGA-AATTC-AATATT-ACG-AT-ACT-TA-ACG-CG--AT-TG----TTTGTC--G-ACT-T-G-C--ACCTTTTTTAAAAA---C--AAAA-TTTAGGAAA--TATT-TT-AGCTT-AAATT----------------CAGGT-GGATTGATAATTTTT----------GTATG-AA-TTGTG-TACAC--G--T--T-GAAA-ATA-TC--A-TAATTCCTCTCTAGACTTC---GGTC-TTATT-CTTTG--T--TTT-A-ACCGGGGTTTTAACCAGTATTTAGTCT--CCTT-ATATGAG--TTACC-CC--CT-CTTTGAAGATCGGAGAAAT--ACA-CACAA-CCCGAG-GTAT-ATGTTGA-GGCCG-T-T-ATCT--TAAA-TACT--A--TT--A----------AGT-AT--AA-----------------------------TTAA------------------------------T-GG--G-C-TA-T-GCTAGG-AC-ATC-AAA--TT---G---AC-CAG--ATG---TAGAT-T-------CA---TTAAA--ATA-CCGAAAA----TTGA--Ataa
gi|11 : TTAA----TGT-------A--A-TT-A------AT-GG----C-TA-T-G----G-AC-AC--AAA--TA---CAT-AT-CTT--ATCACTCGAAC-T---A--CCAA--TTAAACAATA-C-GCAAGAGA-TTGA--AGCATATG-CATAA---T--CAA-AG-A---TTC---A---G-T-TC-G-T-GAAATTC--G-AATTTAATTA-GCA--AT-TT------AA-AATTT--TG-AAAATA-C--ATT--A---G--ATT-G--AT-AA-CGTG--A--TTGT-AATT---A-AC--AAA-T-TAAT---TC-ATCT--GT---TC-T--GT----CT--AATGA---AGA------CCATT-----T---CAG--G--AAA---AT-C-A-T-GA--------T-C-TT---A-CA-AAG-T---TT---TTTCAA--AATT-GAAA-GTA-----GC-A-CTA--CGT--G-TC--T--AA-TA--TT--C-ACT--GC-----TGAAAC--AAC----CGAAAT-CA-AA--TG-A-T-C-CCTAA----GGG--AGGT-A-A-------TA----C--TA-GTT-A-C-GT--C-A---GTT---A--TC-T-T--G--CT-C--C---T----------A--TCG-A-AT-A-TG-CA-G-AA--GT----AT---CAAT-----TTGAAG-A---A----T-G-A-A-A-G-GGG---C-ACC---TG-TTG--G-T-------------CAA---AA----T----TTGG-CA---TT-TTT-TTGGGGG-TGGTAA--TAA--G-TTGTCTTCga
gi|12 : t-T-CTCGGTTT-TGTCCCT-TTTCAT-A-ATCTCAAAACGGCTA-C-TG-A-AT-G-T-AAA-
gi|12 : AA-CT-A-T-CAA-AACTCG-ACATTTGGGAAAC-AA-AACA-ATG-T-TTTA-TTAGGTCAT-A-CG--AAA-A--CATT-------T----CG-C-AA--T-T-CACGA-TG--CGA-AATTT-CAAT---T-------ACAA-CTAAA-TA--C-G-TA-T---GGC--C--AACG--TA----TTTCT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-CGCA--AATCGT-AA-ATA----T-AT-A-CATGTACATAC-AAACGTAGT-CACATC--G------------CAAAA-ATT-GGT----A-G-TTT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-ACGC------A--T----G-G-----A-T-AT---TT-CG--C-AT---T--T-CTTT--A-ATA-AT-GCGGT-TATTG-G--GC-A--------CC--------CC--CCT-C--CTC-C-TGTC-T---T---C-AAT----GG---G-GTCACCA-----TG--A--CCT---CCATAAGG-AGTGG-----------GGCAggcaaagataacgaacagtgaatatcaaactatcaaaactcgacatttgggaaacaaaacaatgttttattaggtcatacgaaaacatttcgcaattcacgatgcgaaatttcaattacaactaaatacgtatggccaacgtatttcttttcgtgtacagcacgcaaatcgtaaatatatacatgtacatacaaacgtagtcacatcgcaaaaattggtagtttgaacacctaacacattccaaaagacgcatggatatttcgcatttctttaataatgcggttattgggcacccccctcctcctgtcttcaatggggtcaccatgacctccataaggagtggggcagccgca
gi|13 : tctcggttttgtcccttttcataatctcaaaacggctactgaatgtaaaggcaaagataacgaacagtgaatatcaAATG-C--ATT--TC-GG--ATC-GG-AT-AA-C-TG--ACCTTGTTA--T---ACAC--ACAGTCTCAA---TA-AT-T--GTT--CC-T--GT----CT--CATGA---A-A------CCATT-----T--TCAG--GGGAAACT-AT-C-A-TCGGTAACTTTCT-C-CT---ACCACAAG-TATCTC---TCTCAAC-T-TT-GAAAAGTG--A--GC-ACC-A--CGTC-G-CC--TC-AA-TA--TTTCC-ACT--GCACATGCAACAC--AGC--GCCGAAAgccgca
gi|13 : -------TC----A--TG---T-A-C-TT--C-G---GTTC--AC-TC-TAT--G--CT-C--TCCGT----------A--TCGCACAT-A--G-CATGCAACCGTC---AT--GCAAT-----T--GAT-ACGAA----T-G-A-A-G-G-AGC---C-ACC---TG-TTGCAT-G-------------C-A---AA----CCTTATTGGCCACCTTC-TTT-T----GGCTGGT-AATTAACCG--TGTCTaatcctctgatcactccgtacggtcgcagaactacgggggaataccgatacacaatccacacaccgtcatgtacttcggttcactctatgctctccgtatcgcacatagcatgcaaccgtcatgcaattgatacgaatgaaggagccacctgttgcatgcaaaccttattggccaccttcttttggctggtaattaaccgtgtctctcaa
gi|14 : aatgcatttcggatcggataactgaccttgttatacacacagtctcaataattgttcctgtctcatgaaaccattttcaggggaaactatcatcggtaactttctcctaccacaagtatctctctcaactttgaaaagtgagcaccacgtcgcctcaatatttccactgcacatgcaacacagcgccgaaaaatcctctgatcactccgtacggtcgcagaactacgggggaataccgatacacaatccacacaccg-T---TA---TCCCAA--T-TT-GAAAAGT---A--GCAA-C-A--CGTGAG-TCTAT--AA-TACTTTT-CAACT--GC-----TGAAACAAGGC---CCGAAAT-CA-ctcaa
gi|14 : tttA--TG-A-TACACC-AA----GGGGAAAGTAA-A-------TCTGTAAGCTA-GTT-A-C-GT--C-A---GTTCCAA--TC-T-A--A--CT-CGAC---TAAGGACCCCAA--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AAT-GT----A---GCAACTTCAAT--GAT-A---AAAGCT-G-A-A-A-G-GGGAGAC-ACCATGCG-TTG--T-GGACCATGAAGCTAC-A---AA----T----TTGG-CA---TTATTTAT----GGCTGGTAAAcagttaaaaagcggatgggccctgtggtcacgccaggtggatattatgatacaccaaggggaaagtaaatctgtaagctagttacgtcagttccaatctaactcgactaaggaccccaatcgcaatatgcatgaatgtagcaacttcaatgataaaagctgaaaggggagacaccatgcgttgtggaccatgaagctacaaatttggcattatttatggctggtaaa
gi|15 : tttttatcccaatttgaaaagtagcaacacgtgagtctataatacttttcaactgctgaaacaaggcccgaaatcacagttaaaaagcggatgggccctgtggtcacgccaggtggatattGGGAAAC-AA-A-------------A-C-A--TCATAA-CG--AAC-A--CATT-------A----TG-CAAA--TAT-TAC--ATC--TAT-AAT---CGTA---TT---G--ACG----AAA-TA--------------GA--C--TACATCTG----T--CT-T----TTCTTTCCAT-GT-ACCAGC---A-CGGA--AATCGT-CA-ATA----T-TT-A-CATG------CAAAACCTATTCCACATC--G-GC---------CAATA-A---GG--GTCA-T-TTT----TAACACTCTT--A-ACAC------------ATT-CC---AAGAAGACAAA------A--T----G-G-----ACT-ATAACTT-CG--CGATCTGT--C-T-TT--A-ATA-A
gi|16 : tttgg-A-CGTG------T-AAACATGCT-C---CC--GAGCG---CCA--TAAAA-ACT-ATG-GT-A-T-TTTTCTAGAACA--CCTTGACACAC------------ATT-CA---TA-AAG-CCGCC-----ACCT----GAG-----A-T-AT---TTGCG--C-AT---T--TTC-TTTAA-ATATAT-GCGCT-TATTG---CGC-AAAAATGCCCC--------CC--CCCTC--CTA-C-GGTC-T---T---ACAAT----AA---GCGTCACatcgatcaccccactc
gi|17 : C--AAC--TC-------G-G-TGTG-AATCTTGGTTAAG---TAT-------ATAA-TT-AC-----AT-GGG-GGC-TA-T-GCTAGG-AC-AT---AA--TT---G---AC-CAG--ATG---TAGAT-G---TGGGCA----TAAG--ATA-CCG--AAAAT-TGGA--AGGTTAT--CATGGACTT--TAATAGAA---T-CT--A-T-G-C-AC-G-A-GAAAT-CTTG-AGCTTAATTA-CCA--AT-TT----gcatt
gi|18 : AT--ACAC-ACAA-CC-----GCAA-A-GTTG----TCA-T-T-ATTT--TAAAACGCT-TA--TT--A--TCCG----------------------------G-TTTA-A-TCC--GGGAA----TGT-------A--A-TT-A------AT-GGG---T-TA-T-GCTAGG-AT-ACC-AAT--TT---G---AC-CAG--ATG---TAGA--T---T--CTA---TTCTA--GTG-TC-GAAGAAT-C--A--ATAATGTT-CGTAAA-AT--CAA-AG-T---T-C---ga
gi|19 : -AAACCTAGT-CACATC--G------------CAAAA-GTT-GAT----A-G-CAT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-ACAC------A--TCCATG-G-----A-T-AT---TT-CG--T-AT---T--T-T-TT--A-ATA-AT-GCGCT-TATTG---TGCAA----TGTCCC--------CCTTCCA-C--CT-----GTC-T---T---C-AAT----GG---G-GTCACC-----TTG--A--CCT---CC
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blockSeqs : . . . . C . A . T . CC . . T . T T C A . . C . C C . G . . CA TTTTA . . . . . . GAA . . . . . GA . . TTTCAATTA T . CGTAAT . . . GT . . . . . . . . A . C . . . . . . . . GC . CGCTCG . . TGGT . . . . . . . . . . CC CACCTGAG . A . . . . . . . . TA . . . CCCGCAA . . . . ACG ATTCA A . . . GT . . . T GA . G . CTTG A . ATTACATT . . A . A . . T . TTTATAG T . A TT T . . . . . . G G TTG A . . . . . T . . . ACT T G . . TT . T T . C . . . . . . GT . . . C GA A . G CC C AAACGG . . . . . C G ATA GA . CG . . . . . C . . TT . C . . . . . . . GA . . . . GCGTCG G . T . T . . . CA . T . G . . C A . . . . . . T . . . . . ATTG T . . . . . . T A C . . . . . TC . A A G TTT A . T . T . TAT TGT . . . . T . . AGTAAT GT A . AT AG . . G T . CC . CAA . GC . . . . TA A . . C CGTAGTCCAACTCGT . . . G AATTTAATCATGG . . . . . . TACAT . A . TATT . . . CGG AAT . T G . . . . TTC T C . GC . . . T . . . AA . . . C . . . . A . . . . . TAT . . AC A A . . . TCCT . . . . . TT A G TA . . . . . . . . . . . TT CT . AA A . . . . . . . T T . . T AGGCG . . . . GT . . . . TATCAA . . . . . . . GAT . . . . . CTGAT . . T . T . . A T TG G . . . . . . G . . . . . . . . . T G . . . . . . A . .
blockSeqs : T . . . . . . T T C T . . A . C T . C . . CA TATTA . . . . . . TA . . . . . GA . . TTTCAATT T . CGTAT . . . AT . . . . . . . . G . A . . . . . . . . AG . GGC . . GTGT . . . . . . . . . . AC ATCCATGG . A . . . . . . . . A . . . TGCAAT . . . . ACG CTTCA A . . . A . . . G A . . . CTTG . . A . . . . A . . . . GTAGG A . C T . . . . . . . . G TG T . . . . . A . . . C T C . . AT . T C . A . . . . . . G . . . G AA C . G CT A AACACG . . . . . C G ATA A . G . . . . . A . . TC . C . . . . . . . AA . . . . AATGT T . T . T . . . TA . T . C . . A A . . . . . . T . . . . . ATTG T . . . . . . C A G . . . . . TC . A A T TTT A . T . T . TTT AT . . . . T . . GTATT GG A . AA G . . T T . C . AG . AG . . . . TA A . . C TGAGTCCCTCGG . . . G AGTTCAATGGGAG . . . . . . TTCAG . . . CTA . . . GC AAT . A T . . . . TCT T T . T . . . T . . . T . . . C . . . . A . . . . . AAT . . AT G A . . . TCT . . . . . TT G A T . . . . . . . . . . . TA T . A A . . . . . . . T T . . . AGCG . . . . T . . . . ATCAC . . . . . . . A . . . . . CTAA . . A . T . . C T T T . . . . . . G . . . . . . . . . T G . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C A . . C . . C . . . . CT TTTA . . . . . . T . . . . . A . . TCGTATTG T . CAGTA . . . AT . . . . . . . . A . C . . . . . . . . GG . CGG . . ATGT . . . . . . . . . . CC ATGG . A . . . . . . . . A . . . GCAAT . . . . AAG TTAC A . . . . . . . A A . . . . . . . . G T G . . . . . A . . . T T G . . AA . T . . A . . . . . . G . . . C A A . G C A TCGCG . . . . . C . ATA G . . . . . . . T . . TC . C . . . . . . . A . . . . GTGT T . C . . . . . TA . T . C . . . A . . . . . . C . . . . . TTGT . . . . . . . C C G . . . . . TC . G A . GT . . T . C . GTT AT . . . . T . . TAT T T . A C . . . G . C . A . AT . . . . A A . . C AGTATAA . . . G AATTAATGGG . . . . . . ATTGG . . . CTT . . . CG AAT . A A . . . . CTC T T . A . . . G . . . A . . . C . . . . A . . . . . AT . . AT T A . . . CTG . . . . . TT A . T . . . . . . . . . . . TA T . A A . . . . . . . T T . . . GGCG . . . . T . . . . ATAC . . . . . . . A . . . . . CTA . . T . T . . . T T T . . . . . . G . . . . . . . . . T G . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . C . . . . A . . . . . . A . . . . . A . . TCATTTTA . . . . . . T . . . . . . . . A . A . . . . . . . . GG . G . . GT . . . . . . . . . . AG ATGG . T . . . . . . . . A . . . CGCAA . . . . ACA TTC C . . . . . . . A A . . . . . . . . . . C A . . . AA . T . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . ACG . . . . . C . AT G . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . G . . . . GCT . . T . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTGT . . . . . . . . C A . . . . . . . A . . . . . . . . . TT . . . . . A T . A . C . . . . . . . . T . . . . G . . . G ATTAATTGGC . . . . . . TTGA . . . ATT . . . CG A . A G . . . . TTC T G . T . . . T . . . . . . . C . . . . . . . . . . T . . T A A . . . TCT . . . . . T G . T . . . . . . . . . . . AA T . A A . . . . . . . T T . . . AGGG . . . . T . . . . ATCA . . . . . . . A . . . . . CTA . . T . A . . . T T T . . . . . . G . . . . . . . . . T G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . GA . G . . AT . . . . . . . . . . CC ATGG . A . . . . . . . . A . . . GGCA . . . . CCT TTC . . . . . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . G . . . . . . . . . . . . . . AATTAATGG . . . . . . TTG . . . TT . . . GG A . . G . . . . TC . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . TT . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T T . A A . . . . . . . . T . . . GAGG . . . . T . . . . ATC . . . . . . . A . . . . . CTA . . T . . . . . T T T . . . . . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . GT . . . . . . . . . . C ATGG . A . . . . . . . . T . . . CGAT . . . . . CA . . . . . . . . AATTAATGG . . . . . . TTG . . . TT . . . CG . . . . . . . . TC . . . . A . . . . . . . . . . . . . AAC . . . . . . . A . . . . . TTA . . . . . . . . . T A . . . . . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C ATG . . . . . . . . . . A . . TGGG . . . . . . TTG . . . TC . . . G . . . . . . . . A . . . . . CTA . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqCons : T** T* A* CA** TTTTA*** A*********** GAA CGTAT******** ** ATT***** GG************* GGT*** ATGG****************** ** ACG** TTCA******* G**** CTTGC**************** ATTAATC*********** AC TT* G* G* ATG ** AAC* T** T********* GG G* CC* AACGCG**** ***** C*** ATA************* G** TC************** GA* GCGGT************* ** CA**** **** C** ** TT NTNN******* TC A*** A* ** TTT**** AT*** ** GGTAAT********* AG** C* AG** A* C** NGAGTCCAACTCG***************** AATTAATGGG********************* TTGA******* TT******* CG* AA** T** TA**** ** ** AAT***** ** TCT****** ****** TT******* G** A***** T* AGCG**** T** ** ATCAC************* A***** CTA***************** ** **** G** ***
originalCons : AAAGGAAGTT--GTAAATTTCC--CCGA--TTTCNCGA--TT-T-CTCGGTTT-TATCCCT-CT-CAT-A-ATCTCAAAACGGCTA-C-TGAA-AT-A-T-AAA-AACTCG-ACATTTGGGAAAC-AA-A-CA-ATG-T-TT-A-T-AGGTCAT-A-CG--AAA-A--CATT-------A----CG-C-AA--T-T-CACGAATG--CGA-AAT---CATT---TT---A--ACAT-CTAAA-TA--C-G-TA-T---GGA--C--AACG--TA----T--CT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-CGAA--AATCNT-AA-ATA----T-TT-A-CATG------C-AAACCTGGT-CACACC--G-GCG---C-G--CAAAA-ATT-GGT-GT-A-G-TTT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-CCGC------A--T----G-G-----A-T-AT---TT-CG--C-AT---T--T-C-TT--A-ATA-AT-GCGCT-TATTG-GCCGC-A----TGCCCC--------CC--CCC-C--CTA-C-GGTC-T---T---CAAAT----AG---G-GTCACCG---TTTG--A--CCT---CCATAAAGTATCGA-----------GGCATTA-CTG-GTATGAA-TT--------CTTG-----GC--TTTCA-----NAATATT-TTTC---AT-TAA---CAT-C-GA-C-CCA-ATTC---TGCGA-ATTCGTATTTCT-G-TGTTTGA-GTT----------A-TTATAGG---AATTTTTTTC----TTTCCACAGTT-TTTAGT-TCTTG---G--AG---A-ATA---ATTCAA-GGCA-GTTTTTAATGAATA--GA-TGCCC-------GT-C----AAG-G--T-CACAC-TCAA-TAGG--C-ACA-CTGA--AN--TG-TA---T------TTTCTA-AACACAGAA-GA-TC-T-CAC-AT-TATTTGGTTTC-----AG-GG-CCC-AG-AATGCGA-AGT---ATT-GTC-CTCTGAC--A--ACG-GATTTAC-G--AC-GGTCC-C-----CGC-C--GTAGCAGG------A---TA----CCACG-A-----------T-TCGG-G-AC-GG-T-GT--GGG-ACA-TGACC-C------------T-C-ATC-ATGTTCTG------CTGC---------C-G-G-C-TTC-TG-AAAA----CG-T-TGACAAAACT-TAC--GCG----------T--TTCTA-TTCC-GCATT--TT-CA--T--ATTGTCACT-A-C-A--TATT----CTCA-CCGTT-TA---AAC--GC-ATT----T-TGAGC--AC-TTGA-AATTC-AATATTTACG-AT-ACT-TA-GCG-CG--AT-GT----TTTGTC--G-ACT-T-G-C--ACCTTTTTTCAAAA---C--GAAA-TTTAGGAAA--TATT-TT-AGCTT-AAATTTATTCCT-CTGA-A--CAGATTGGATGGATAATTTTT--TT-----TGTATG-AA-TTGTG-TATAC--G--T--TTGAAA-AT--TC--A-TATTTCCTCTCCAGACTTC---GGTC-TTATTTCTTTG--T--TT--A-ACCAGG----TAAT-----TGTAGNCC--CCTA-ATTTGAG--TTACC-CC--CT-CTTTGAAGATCGGAGAAAT--ACACCACAA-CCC-AA-GCAT-ATGTTGA-GGCCG-T-T-ATCT--TAAA-TACT-AA--TT--A--CCCG-TG-AGT-CC--AAC--TC-------G-G-TTTG-A-TCT--GTTAAG---TGT-------A--A-TT-A------AT-GGG-G-C-TA-T-GCTAGG-AC-ACC-AAA--TT---GA--AC-CAG--ATG---CAGAT-T---T--CCA---TTAAA--ATA-CCGGAAAAAT-TTGA--AAGATATG-CATGAA-TT--CAA-AG-A---T-C---A-T-G-T-AC-G-T-GAAAT-C--G-AATTTAATTA-GCA--AT-TT----TAAA-AATTT--TG-TAAATA-C--ATT--AC-GG--ATT-G--AT-AA-C-TG--A--TTGT-A--T---A-AC--AAAAT-TNAA---TC-AT-T--GT---CT-T--GT----CT--AATGA---A-A------CCATT-----T--TCAG--GGGAAA-T-AT-C-A-T-GA--------T-T-CT---A-CA-AAG-T---TA---TTTCAA--T-TT-GAAAAGTA--A--GC-A-C-A--CGT--G-TC--T--AA-TA--TTT-C-ACT--GC-----CGAAAC--GGC--GCCGAAAT-CA-AA--TG-A-T-C-CC-AA----GGG--AAGTAA-A-------TC----A--TA-GTT-A-C-GT--C-A---GTT---A--TC-T-T--G--CT-C--C---T----------A--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AA--GT----AT--GCAAT-----T--GAT-A---A----T-G-A-A-A-G-GGG---C-ACC---TG-TTG--T-G-------------C-A---AA----T----TTGG-CA---TT-TTT-T----GG-TGGTAAATTAA--G-TTGTCTTC
finalCons : AAAGGAAGTT--GTAAATTTCC--CCGA--TTTCNCGA--TTT--CTCGGTTT-TATCCCT-CT-CAT-A-ATCTCAAAACGGCTA-C-TGAAA-T-A-T-AAA-AACTCG-ACATTTGGGAAAC-AA-ACA--ATGTTTTA---T-AGGTCAT-A-CG--AAA-A--CATTA-----------CG-C-AA--T-T-CACGAATG--CGA-AAT---CATT---TT---A--ACAT-CTAAA-TACGTAT--------GGA--C--AACG--TATT-----CT-T----TT-----CGT-GT-A-CAGC---A-CGAA--AATCNT-AA-ATA----T-TT-A-CATG------C-AAACCTGGT-CACACCGG-------------CAAAA-ATT-GGGT---A-G-TTT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-CCGCATGG------------------A-T-AT---TT-CG--C-AT---T--T-C-TT--A-ATA-AT-GCGCT-TATTG-GCCGC-A----TGCCCC--------CC--CCC-C--CTACG--GTCTTCA-------AAT----AG---G-GTCACCG----TTG--A--CCT---CCATAAAGTATCGA-----------GGCATTA-CTG-GTATGAA-TTCTTGC----------------TTTCA-----NAATATT-TTTCATTAATC-----------GA-C-CCA-ATTC---TGCGA-ATTCGTATTTCT-G-TGTTTGA-GTT----------A-TTATAGG---AATTTTTTTC----TTTCCACAGTT-TTTAGT-TCTTG---G--AG---A-ATA---ATTCAG-GGCAG-TTTTTAATGAATA--GA-TGCCC-------GT-C----AAG-G--T-CAAAC-TCAT--AGG--C-ACA-CTGA--AN--TG-TAT---------TTTCTA-AACACAGAA-GA-TC-T-CAC-AT-TATTTGGTTTC-----AG-GG-CCC-AG-AATGCGA-AGT---ATTG-TCC-TCTGACAACGCG----ATTTAC-G--AC-GGTCC-C-----CGCC---GTAGCAGGATA-------------CCACG-A-----------T-TCGGG--AC-GG-T-GT--GGG-ACA-TGACC-CTC--------------ATC-ATGTTCTG------CTGC---------C-G-G-C-TTC-TGA-AAA----CG-T-TGACAAAACT-TACGCGGT-------------TTCTA-TTCC-GCATT--TT-CA--T--ATTGTCACT-ACA----TATT----CTCA-CCGTT-TA---AAC--GC-ATT----T-TGAGC--AC-TTGA-AATTC-AATATTTACG-AT-ACT-TA-GCG-CGNTNN-------TTTGTC--G-ACT-T-G-C--ACCTTTTTTCAAAA---C--GAAA-TTTAGGAAA--TATT-TT-AGCTT-AAATTTATTCCT-CTGAA---CAGATTGGATGGATAATTTTT--TT-----TGTATGA-A-TTGTG-TATAC--GTTT----GAAAAT---TC--A-TATTTCCTCTCCAGACTTC---GGTC-TTATTTCTTTG--T--TT--A-ACCAGGTAAT---------TGTAGNCC--CCTA-ATTTGAG--TTACC-CC--CT-CTTTGAAGATCGGAGAAAT--ACAC-ACAA-CCCAG--GCAT-ATGTTGA-GGCCG-T-T-ATCT--TAAA-TACTA-A--TT--AC--CCGNGAGTCCAACTCG-----------------TTTG-A-TCT--GTTAAG---TGTAATTAATGGG---------------------C-TA-T-GCTAGG-AC-ACC-AAATTGA-------AC-CAG--ATG---CAGATT-------CCA---TTAAA--ATA-CCG-AAAAA--TTGA--AAGATATG-CATGAA-TT--CAA-AG-A---T-C---A-T-GT--AC-G-T-GAAAT-C--G-AATTTAATTA-GCA--AT-TTTA----AA-AATTT--TG-TAAATA-C--ATT--AC-GG--ATT-G--AT-AA-C-TG--A--TTGTAAT-----A-AC--AAAAT-TNAA---TC-AT-T--GTTCT------GT----CT--AATGA---A-A------CCATTTT-------CAG--GGGAAA-T-AT-C-A-T-GA--------T-T-CT---A-CA-AAG-T---TA---TTTCAA--T-TT-GAAAAGTA-----GC-A-C-A--CGT--G-TC--T--AA-TA--TTT-C-ACT--GC-----CGAAACAGCG----CCGAAAT-CA-AA--TG-AT--C-CC-AA----GGG--AAGTAAATCAC-------------TA-GTT-A-C-GT--C-A---GTTA-----TC-T-T--G--CT-CCTA-----------------TCGCA-AT-A-TG-CATG-AA--GT----AT--GCAAT-----T--GAT-A---A----T-G-A-A-AG--GGG---C-ACC---TG-TTG--T-G-------------C-A---AA----T----TTGG-CA---TT-TTT-T----GG-TGGTAAATTAA--G-TTGTCTTC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|14 : aatgcatttcggatcggataactgaccttgttatacacacagtctcaataattgttcctgtctcatgaaaccattttcaggggaaactatcatcggtaactttctcctaccacaagtatctctctcaactttgaaaagtgagcaccacgtcgcctcaatatttccactgcacatgcaacacagcgccgaaaaatcctctgatcactccgtacggtcgcagaactacgggggaataccgatacacaatccacacaccgtcatg-T---TA---TCCCAA--T-TT-GAAA---AGT-A---GCAA-C-A--CGTGAG-TCTAT--AA-TACTTTT-CAACT--GC-----TGAAA---CAAGGC-CCGAAAT-CA-ctcaa
gi|14 : tttA--TG-A-TACACC-AA----GGGGAAAGT-AA-ATCTGTAAGCTA-GT------T-A-C-GT--C-A---G-TTCCAA--T-CT-A--A--CT-CGAC---TAAGGACCCCAA--TCGCA-AT-A-TG-CATG-AAT-GT----A---GCAACTTCAAT--GAT-A---AAAGCT-G-A-A-AG-GGGAGAC-ACCATGCG-TTG--T-GGACCATGAAGCTAC-A---AA----T----TTGG-CA---TTATTTAT----GGCTGGTAAAcagttaaaaagcggatgggccctgtggtcacgccaggtggatattatgatacaccaaggggaaagtaaatctgtaagctagttacgtcagttccaatctaactcgactaaggaccccaatcgcaatatgcatgaatgtagcaacttcaatgataaaagctgaaaggggagacaccatgcgttgtggaccatgaagctacaaatttggcattatttatggctggtaaa
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gi|17 : C-AAC--TC--G--G-------TGTG-AAT-C-TTGGTTAAG---TAT-------ATAATT----AC-AT---GGGGGC--TAT-GCTAGG-AC-AT--AA--TT---G---AC-CAG--A-TGTA---G--A--T----GTGGGCA----TAAG--ATA-C-C-G-AAAAT--TGG--AAGGTTAT--CATGGACTT--TAATAGAA---T-CT--A-T-G-CAC-G-A-GAAAT-CTTG-AGCTTAATTA-CCA--AT-TT----gcatt
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gi|19 : -AAACCTAGT-CAC-ATC--G-----------CA--AA-A-GTTG-A--T-AG-C---AT----GAACA--CCT--A-ACAC------------ATT-CC---AA-AAG-ACAC------A--TCCATG-G-----A-T-AT---TT-CG--T-AT---T--T-T-TT--AATA-AT-GCGCT-TATTG---TGCAA----TGTCCC--------CCTTCCA-C--CT-----GT-C-T---T---C-AAT----GG---G---GTCAC---C-TT-G--A---CCT---C--C
gi|2 : tAAAGGA--TT--GTA--TTTTC--CGGA--TTTCGGGAGATT-T-CTCGGTTT-TATCCCT-CT-CA--A-A-CTCAAAACGGCTA-C-TGAA-AT-A-T-AAA-AA-TGG-ACATTTGGGAAAC-AA-A-CA-ATGTTT-A-T-AGGT-AT-A-CG--AAA-A--CAT--------A----CG-CAA--TT-CACGAATG--CGACAAT---CATT---TT---A--ACATTCTA-AA-TA--C-GCTA-T---GGA--C--AA--CGT-------------------T-CTTT-TCGT-GT-A-CGGC---A-TGA--ATAAT-CCT-AA-ATA----T-TT-A-CATG------C-AAACCTGGT-CAC-ACC--AGGCGGTCCGAGCA--AA-A-ATTG-GTGT-AG-T---TT----GAACA--CCT--A-AC-C------------ATT-CC---AA-AAG-CCGC------A--T----G-G-----A-T-TT---TT-CG--C--T---T--T-C-TT--AATA-AT-GCGCT-TATTG-GCCGC-A----TGCCCC--------CC--CCC-C--CTA-C-GGT-CAT---T---CAAAT----AG---G---GTCAC---CGTTCG--A---CCT---C--CA-----TAAAGTA-TCG----A-----------GGCATTA-CTGCG-TA--TGAA-TT--------------CTTGG--CTT---CA-----AAA-ATCT-TTTC---AT-TA-A--TATGC----GA-CTCCA-ATTC---TGCGA-ATTCGTATTTCTTG-TGTTTGA-GTT----------AATTAAAAG---AATTTTTTTC----TTTCCA-AGTCATTCAGT-TCTTG---G--AG---A-ATA---ATTCAA-GGCA-GTTTTTAATGAATA--GA-T-CCC-------AT-C----AAG-G--T-CACACTCAATAGGGCC--ACA-C-GA--TT--TG-C--------A---T--------TTTCTA-AACACAGAA-GA-TC-T-CAC-AT-TATTTGGTTTC-----AG-GG-CCC-AG-AATGCGA-AGT---ATT-GTC-CTCTGACA-AACG--GATAAAC-G--AC-AGTCC-C-----CGC-C--GTA-CAGG------A---T------CACG-A-----------T-TCGGAA-AC-GG-T-GT--GGG-ACA-TGACC-C------------T-C-ATC-ATGTTCTG------CTGC---------C-G-G-C-TTC-TG--AAA----CG-TATGACAAACCT-T-ACA-ATG---------TTTC-T-A-TTCT-GTATT--TT-CAGGT--ATTGTCACTAA-T-A--TATT----TTCAGCCGTT-TA---AAC--GC--TT----T-TG-GC--AC-TTGATAATTC-AATATTTACG-ATAACT-TA-GCG-CGA----A--AGTTTTGTC--G-ACT-T-GACCAACCTTTATTCAAAA---C--CAGA-TTTAGGAAT--AATT-TT-AGCTT-AAATTTATTCCT-C-TGA-A--CAGATTGGATGGATAATTTTT--TT-----TGTATG-AATT-G-G-TATAT--G--T--CTGAAA-----TT--A-TATTTCCTCT-CAGAA-TC---GGTC-TTATTTCTTTG--TT--T--ACACCAAG----TAAT-----TGTAGACC--CCTA-TTTTGAAGTTTACT-CTAGC--CTTTGAAGATCGGAGAAAA-A-CACTACAAACC-A-GCAT-AT-TAGG-CGCCG-T-TAATCTTA--AA--ACT-AAT--TAAA--CCCGT-G-AGT--CC---C--TCG-G--T-------T-TG-A-T-C-T--GTTAAG---TGTTTAAAACA--ATTAGGAA--ATATAGGG--C--TAT-GCT-GG-AC-ACCAAA--TT---GA--ACACAGA-A-TGCA---G--A--TTCTCTC---CAATGTTAAA--ATAGC-CGGAAAAATCCTGA--AAGA-TA-A-CATGAT-TT--CAAGAG-A---T-C---A-T-G-TAC-G-TCGAAAT-C--G-AATTTAATTA-GCA--AC-TT----TAAACAATTT--TG-TAAATA-C--ATTA-AC--GGATT-G--A-TAA-C-TG--A--TTG--TA--AT-------AAAAT-TAA--C-AT-T-G--T--CT-G-GT----CT--AATGG---A-A------CGATT-----T--TCA--AGGGAAA-T-ATAC-AT-TA--------T-T-CT---A-CA-AAG-T---TA---TTACAA--T-TT-GACA---AGTAA---GC---C-A--CGT--G-TC--CTGAA-TA---TT-C-ACT--GC-----C-AAA---CG--GCGCCGGAAT-CA-AA--TGAA-T-C-CC-AA-----GG--AAGT-AA-ATC-----A-TA-GT------TGA-C-GT--C-A---G-TT---A--T-CT-T--G--CT-C--C---T----------A--TCGCA-AT-A-AG-CA-G-AA--GT----A---GC-AT-----T--GAT-A---A----T-GTATA-AG-GGG---C-ACT---TG-TT---T-G-------------C-A---AA----T----TT-G-CA---AT-TTT-T----GG-GGGTAAATTAAC-G-TTGTCTTC
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gi|8 : G-A-T-C-A--GCTAAAGGATGT-------A--ATT----A--AT---GG---C--T-T-GCTAGG-AC-ACCAAAA-TT---GG--AC-CAG--A-T-CA---GGTA--T----TC---CG---ATAAA--ATA-C-----GAAAT--TGA--A-GA-TATAACATGAA-T---CAA-AG-A---TTC---A-T-G-TAG-GGC-GAAATTC--G-AATATAATAA-GCA--AT-TT-----AAA-AATTT--TGGTAAATA-C--ATT--ACT-GGATT-G----TAA-C-TGC-G--TTG--TA--AT-A--C--AA--T-CTAATCGAT-T-G--TGTTC-TTGTGATGCT--AATGATAAA-A------GCATT-----T---CA--GGGAAAA-T-AT-C-AT-GA--------T-TTCT---A-CA-AAG-T---T-----TTCAA--T-TTTGAAA---AGT-A---GC-A-C-A--CGT--GGTC--T--AAGTA--TTT-C-ACTTTGC-----CGAAA---CG--AGGCCGACAT-CA-CA--AG-A-T-C-CC-AA----GGG--AAGT-AA-ATC-----ACTAGGT------T-A-C--T--C-A-----TT---A--T-CTAT--GCACC-C--C---T----------A--T-GCA-AT-A--G-CA-G-AA--GTC---AT--GCAAT-----T--GA--A---A----T-G-A-ACAG-GGG---CGACC---TG-TTG--T-G-------------C-ATTGAA----T----TT-G-CA----T-TTT-T----GG-GGGT-AATTAA--GCTTGTCTTCgtgct
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): CATATCCCCAACAAAGCTACTATGTAAAGGCTAAGATAACGAACAGTG