lowQualScore                  :           1  1  1  1        11111                888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888                                              1         666666666666666666666666666666666666666                 555555555555555555555555555555            1     111             111               333    
lowQualScore                  :       2   5  3  0  0        66666   7            222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222  2 6666       555  4      6  3      77       3       4 999999999999999999999999999999999999999        999    4 888888888888888888888888888888     1 99   2  4  000      5 88   111  44      6    111    
lowQualScore                  :       .   .  .  .  .        .....   .            ..........................................................................................  . ....       ...  .      .  .      ..       .       . .......................................        ...    . ..............................     . ..   .  .  ...      . ..   ...  ..      .    ...    
lowQualScore                  :       5   5  3  0  8        66666   3            111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111  9 1111       000  6      3  3      55       4       9 555555555555555555555555555555555555555        222    4 555555555555555555555555555555     0 22   3  0  222      0 55   888  44      0    333    
consensus                     :    TGGNCCTAGC-AA-TGGGTGGGTGCCCTNTAGT-GATCAGCCTGTG----------TGTG-CGTGC-GT-GCATG--------T----GTC--CAT-C---CATGTA---A-A--CTTT--T--C-TG-AA---C-TT-T----TTTGGCT---ATCCCTGCAGCT-ATTGAAT-TGAAAATTTATACATGAA-----------CATGT-ANTA-AT---TNAT---T-TACAGATCAAG-TTTGA-GCTGTAGCATGGGCTTTNTTGAC---NTA--TTTTTGA--AAGAGTNATG--GACCTTGAACTTAGCAAATTTCAGGGATTTG-GCAGTT
Reference ( gi|5 )            :    TGGGCCTAGC-AA-TGAGTGAGTGCCGTTCAGT-GATCAGCCTGTG----------TGTG-TGTGC-GT-GCATG--------T----GTT--CAT-T---CATGTA---A-A--CTTT--T--C-TG-AAA--CATT-T----TTTGGCT---ATCCCTGCAACT-ATTGAAC-TGAAAATGTATACATAAA-----------CATGT-AATA-AT---TTAT---T-TACAGATCAAG-TTTGA-GCTGTAGCATGTATTTTTTTAAC---CTA--TTTTTGA--AAGTGTAATA--GACCTTAAATTTATCGAATTTCAGGGGTTTG-G-AATT
gi|6                          :    TGGGCCTAGCCAA-TGAGTGAGTGC-GTTCAGTTGATCAGCCTGTGG---------TGTGGTGTGC-GTTGCATG--------T----GTT--CAT-----CATGTA---A-A--CTTT--T--C--G-AAA--TATT-T----TTTGGCT---ATGCTGACAACT-ATTGAAC-TGAAAATGTATACATAAA-----------CATGT-AATA-AT---TTAT---T-T-CAGATCAAGTTTTGA-GCTGTAGCATGTATTTTTTTAAC---CTCTTTTTTTGA--AAGTGTAATA--GACCTTAA--TTATCGA
gi|15                         : aattGGTCCT-GC-AAGTG-GTGATTGCCCTATTGT-GATCAGTCTGTT----------CATG-CATGT-----CAT---------T----GTG--CAT-C---CATGAA---A-ATGCTTT--T--C-C--AGA--CTTTCT----TTTGGTT---ATTCTTGCt
gi|13                         :             C-AA-TAGGTGGGTACC-CTAAGTTGATCATCCTATG----------TGT-----GC-AT-GCATC--------T----ATC--TGT-C---TATG-A---T-A--TGTT--T--C-TA-AAGGCTTTT-T----TTTGGCT---AT------A-------GAAC-TG-AAATATATAC
gi|4                          :              ctA-TGGATGGGTGCTCTATATT-GATCAGCCTGTG----------TGTT-TTTGT-GT-GTGTG--------T----ACC--CAT-C---CATTCA---A-------T--T--CATGCAAA--------------TG----------CTGCAGCT-ACTGAAT-TGAAAATTTATGCATGAT-----------CTTAT-ATTA-A----TGGG---T-TACAGATCAAG--TTAA-G----AG---------TTTTAGG---C-----TTTTGA--AAGAGTTATG--GACCTTGAACTAAACAAACGTCAGGAATCTG-ACAATT
gi|16                         :          attatggctccacctGTGCCCTATAGT-GATCAGCCTATG----------TGTG-TGTGT-TT-GTCTG--------T-----TT--AAT-T---tatcatgctgcttttgaattttaaatcatgaactcatcagcaagttacatatcaatttgtaagaaaataaatgtcattagaaattgaa
gi|11                         :      tcagggcgccacctacaggcagCCCTCTAGT-GATCATCCTGTG----------CATG-CTTGT-AT-CTCTG--------C----GTTGACAC-TTCCCAT--------A--TTTT--T--------------TT-T----TCTGTCTTAAATCTCGGCAGCT-ATTGAAT-TGAGAATTTATAAATAGACTTG-------CATGT-Atcaaacactgagtttgatcggaaa
gi|14                         :                               TTTAGT-GATTAGCCCTTG----------TGTC-TGTGT-GT-GCATACGCAAATCT----GTC--TGT-C---TGTTTA---A-A--TCCTAGT--C-TG-GA---CTTT-T----TATGGCT---CTACCTGCAGCT-ATTGAAtatcaa
gi|10                         :                             gctcCAGT-GATCAGCCTGTG----------TGT------CAGT-CCAAG--------T----GCT--CAT-G---CATCAAC--A-G--CTTT--C--C-AG-AG-----TT-T----TCTCTCT---ATCACTGCTGCT-ATTAAAT-TGAAAATTTATACATGAA-----------C---T-TATA-GG---TTGT--------AGATCAAG-TTTGA-GCT
gi|8                          :                       agccctgcttaAGT-GATCAGGCTGTGCTTGTGAGTGTATG-TGTGT-GT-GCATG--------TCCATGTA--TATGT---CATGTATTGATA--GTTT--T--C-TG-AT---CATT-C----TG-GGTT---ATTCCTTCTACT-ATTGAAT-TAAAAAC-T-TACAT---------------ATGTGGGCA-AT---TTATAA-TATACAGATCAAG-TTTGA-GTAGTA-CATGTAttcttg
gi|2                          :                  ttagggccccgcccatAGT-GATCAGCCTGTG-------------------C-AT-GC-----------------TT--C-------CAT--------------------C-TG-A----CTTG-T----TTGGGCT---ATTCCTGCAGCTTCTTAAATATGAAAATACATACATGAA-----------CTTAT--ATC-AT---TGGG---T-CACAGATCAAG-ATTGG-GTT------TGGGCTTTGCTGAC---GGA--TTTTTTGTTCAGAGTAATG--GAAGTTCAGCCTAGCACATTTCAGGGATTTG-
gi|7                          :  tttttagagccccacctatcggtggtcagaagtGC-GATCAGCCTGTG----------TGTG-AGTTC-GT--------------T----GTC--CGC--------GCA---A-A--CATT--TAGC-TG------TACT-TCCTGTTTGGCT---ATCTGAGCAGCT-ATTGAAG-TGAAAATTTACGCATAA-------------ATGG-A----------------T-TACTGATCAA----TGACGC-GTTTCCTGGGCTTTGTTGACAGGGTT--TTTTTTA--CAGAGTTATG--GACCTTGAACGTAGCAAG---CAGGGacagatttcctgacttttaaggatttgaaaattggttacagatgaagttttgagttcaaactatgttgatttttttttaggaaaaaaaatgttatggacgttgaatgt
gi|3                          :                                                           cctatatcTGT-GT-GCATG--------T----GCC--TAT-C---AGTATA---A-A--TGCT--T--G-TGCGGA--C-TT-T----TTGGGCT---ATCCTTTGAGCT-ATTGAAT-TGAAAATTTATACATGAAATAATTACTTACATAC-AACA-ATGGATTAT---T-----GATCAAA-TCTTA-GTT------TGGGCTTTGTTGAC---ATA--TTTTTGA--AAGAGCTATG--GACCTCGAAATTAGCCAATTTCAcatttttgtgacgcttgccgtcataatg
gi|22                         :                                            gcttaattggcagataccctatggtgaaaatccTG--------C----GTC--CAT-T---CGTGCA---A-ATGCTTT--T--C-CG-GA-----CT-C----TTTGGCT---ATTCCTGtcgacttacgattcttcagattttcttggctatttctagagctattctaaaatttaatcatgaactgacatgaacaggttacagatcaatttt
gi|9                          :                                                                                              T--CAT-A---CATTTG---ACA--GTTT--T--C-AG-AA---C-TC-T----TTTGGCT---ATTCCTGCAGCT-ATTGAAT-TGAAAATTCATGCATGAT-----------CTTAT-ATTA-ATG--GCA------TAGAGATCAAG-TTTGA-GTT
gi|1                          :                                                                                  attttgaaaagagttatggatcttgaacttagctaatttcatacattcaactgttttcTT-T----TTTGGCC---ATCATTGCAGCT-TTTGATT-TGAAAATTAATACATGA-------------ATGT-ATTATAT---GAATGGGT-TGCAGATTA-----TG-----GTTGCAGG------TTTGAA---CTA--TTTTTAG--AA--GAAATATGGACCTTGAATTTAGC-AATTTCAAGGATTTGAG-AGTT
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): CTGCAGCTTTTGATTTTAGAATAGAAACCTGAAATTATATCAAGGGGTTACTGTACATATCAAGTTTGGGATTGGAAAGAATTATGCACCTTTATCATGGCAAATTTCAGGGATTTGACATT
Unaligned ( gi|17 ): GTCAGCCTATGTGTTCATGCATTGACAGCTTTCCAGACTCTCTACAAATATTGATTTATAGAAAATTTACACATGAACTTATA
Unaligned ( gi|18 ): TGGACTATTCCCACAGTTGAGTATTGATACATGAACTTATACCAATGGATTGCAGAGGAATTTTGAGCTTCGGCTTTGTTGA
Unaligned ( gi|19 ): CTTTTTAAGAGTTATGAACCTTGCATTTAGCTAATGATTCCACAAAGCGGGGCCTTTTTGTGATGCTTGTCATCACAATGA
Unaligned ( gi|20 ): ACCACAACACAGTGCCCTTTTGTGATCTTTGCCATCACAATGATATCTAGTTTTCA
Unaligned ( gi|21 ): TGCGGACTTTTGGAGCCCATCCATTCAGCATTGATTTAAAAATTTATAAATGA






Alignments
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Reference ( family-278 )      :                                                                                                                                                                                                                               TGGNCCTAGC-AATGGGTGGGTGCCCTNTA--G-T-GATCAGC--------CTGTG--TGTG-CGTGCGT-GCATGTGTC--CAT---CCATGTA-A-A--C---------------TTT--T--C-TG--AA--C-TT--T---TT-TG---G---CT---ATCCCTGCAGCT-A------TTGAA-------T---T---GA--AAATTTAT--ACATGAA-----------CATGTANTA-A----TTNAT---T-TACAGATCAAGTTT-GA-GCTGTAGCATGGGCTTTNTTGACN---TA--TTTTTGA--AAGAGTNATGGACCTTGAACTTAGCAAATTTCAGGG-ATTTGGCAGTT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ---CT---ATCCTTGCAGCT-C------TTACT-------T---T---GA--AAATGTATGTACATGAA-----------CTTTTGTTA-A----TGGGT------GCAAATCAAGTTT-GA-
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ---------------TTT--T--C-AA--GA--T-TT--T---TT-TG---G---CC---ATCATTGCAGCT-T------TTGAT-------T---T---GA--AAATTAAT--ACATGA-------------ATGTATTATA----TGAATGGGT-TGCAGATTA----T-G-----GTTGCA-GG-----TTTGAAC---TA--TTTTTAG--AAGAAATATGGACCTTGAATTTAGC-AATTTCAAGG-ATTTGAGAGTTtttatgttcaaagaagttttaacaaatagttttcaagatttttttggccatcattgcagcttttgatttgaaaattaatacatgaatgtattatatgaatgggttgcagattatggttgcaggtttgaactatttttagaagaaatatggaccttgaatttagcaatttcaaggatttgagagttatccctgcagctaactgttttgaaaaatgtatcagtggttaaattgatgcatgaacttgtatcagtggtttaccggttaattttgaggttataggattttcttacctctagagagttgaggaccttcaacttcacaa
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                         ctatccttgcagctcttactttgaaaatgtatgtacatgaacttttgttaatgggtgcaaatcaagtttgatttatgttcaaagaagttttaacaaatag---TT-TGAGAG---TT---ATCCCTGCAGCT-AACTGTTTTGAAAAATGTATCAGT---GGTTAAATTGAT--GCATGAA-----------CTTGTATCA-G-----TGGT---T-TACCGGTTAATTTT-GA-G--GT--TATAGGATTTTCTTACC---TC--T-----A--GAGAGTTGAGGACCTTCAACTTCACAAatccctgcagctaactgttttgaaaaatgtatcagtggttaaattgatgcatgaacttgtatcagtggtttaccggttaattttgaggttataggattttcttacctctagagagttgaggaccttcaacttcacaa
gi|10                         : ctatccttgcagctcttactttgaaaatgtatgtacatgaacttttgttaatgggtgcaaatcaagtttgatttatgttcaaagaagttttaacaaatagttttcaagatttttttggccatcattgcagcttttgatttgaaaattaatacatgaatgtattatatgaatgggttgcagattatggttgcaggtttgaactatttttagaagaaatatggaccttgaatttagcaatttcaaggaCTTACA--G-T-GATCAGC--------CTGTG--TGT--CA---GT-CCAAGTGCT--CAT---GCATCAACA-G--C---------------TTT--C--C-AG--AG----TT--T---TC-TC---T---CT---ATCACTGCTGCT-A------TTAAA-------T---T---GA--AAATTTAT--ACATGAA-----------CTTATAG------------G---T-TGTAGATCAAGTTT-GA-GCT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                               agccctgCCCTCTA--G-T-GATCATC--------CTGTG--CATG-CTTGTAT-CTCTGCGTTGACACTTCCCATAT-----------------------TTT--T--------------TT--T---TC-TG---T---CTTAAATCTCGGCAGCT-A------TTGAA-------T---T---GA--GAATTTAT--AAATAGACTTG-------CATGTAttcttg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTGCAGCT-T------TTGAT-------T---T---TA--GAATAGAA--ACCTGAA-----------ATTATATCA-AGGGGTTACT---G-TACATATCAAGTTT-GG-G----------------ATTG---------------GA--AAGAATTATGCACCTTTATCATGGCAAATTTCAGGG-ATTTGACAtatcaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                        C-AATAGGTGGGTACCCTA-A--GTT-GATCATC--------CTATG--TGTG-CATGCAT-CTATCTGTC--TAT----GATATG-----------------------TT--T--C-TA--AAGGC-TT--T---TT-T-----------------TTG--GCT-A------TAGAA-------C---T---G---AAATATAT--ACtt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                   ctGCTCTTTA--G-T-GATTAGCCCTTGTGTCTGTG--TGTG-CATACGC-AAATCTGTC--TGT---CTGTTTA-A-A--T---------------CCTAGT--C-TG--GA--C-TT--T---TTATG---G---CT---CTACCTGCAGCT-A------TTGAA-------
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                GGTCCT-GC-AAGTGGTGATTGCCCTATT--G-T-GATCAGT--------CTGTT--CATG-CATGT----CAT-TGTG--CAT---CCATGAA-A-ATGC---------------TTT--T--C-CA--GA--C-TTTCT---TT-TG---G---TT---ATTCTTGC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                              GGCAGGTGCCCTATA--G-T-GATCAGC--------CTATG--TGTG-TGTGTTT-GTCTGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcagggcgccacctacaATGTGTT--CAT---GCATTGA-C-A--G---------------CTT--T--C-CA--GA--C-T--------------------------CTCTACAAAT-A------TTGAT-------T---TATAGA--AAATTTAC--ACATGAA-----------CTTATAttaatttcaaacactgagtttgatcggaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtcagcctG---A---CT---ATTCCCACAG----------TTGAG-------T-------------ATTGAT--ACATGAA-----------CTTATACCA-A----TGGA----T-TGCAGAGGAATTTT-GA-GCT------TCGGCTTTGTTGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                         tgTA--G-T-GATCAGC--------CTGTG----------------CATGCTTC--CAT---C--TG-----A--C---------------TTG--T--T-TG--------------------G---G---CT---ATTCCTGCAGCTTC------TTAAA-------TA--T---GA--AAATACAT--ACATGAA-----------CTTATA-TC-A----TTGGG---T-CACAGATCAAGATT-GG-GTT------TGGGCTTTGCTGACG---GA--TTTTTTGTTCAGAGTAATGGAAGTTCAGCCTAGCACATTTCAGGG-ATTTGACAG
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttttagagccccacctatcggtggtcagaag--T---TT-TG---GAGCCC---ATCCATTCAGC--A------TTGAT-------T---T---AA--AAATTTAT--AAATGAatttcctgacttttaaggatttgaaaattggttacagatgaagttttgagttcaaactatgttgatttttttttaggaaaaaaaatgttatggacgttgaatgt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgcggacTGCGTC--CAT---TCGTGCA-A-ATGC---------------TTT--T--C-CG--GA--C-TC--T---TT--G---G---CT---ATTCCTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                         -AATTGGCAGATACCCTATG--G-T-GAAAATC--------CTGTG--TG------------CATGTGCC--TAT---CAGTATA-A-ATGC---------------TTG--T--G-CG--GA--C-TT--T---TT-GG---G---CT---ATCCTTTGAGCT-A------TTGAA-------T---T---GA--AAATTTAT--ACATGAAATAATTACTTACATACAACA-A----TGGAT---T--ATTGATCAAATCT-TA-GTT------TGGGCTTTGTTGACA---TA--TTTTTGA--AAGAGCTATGGACCTCGAAATTAGCCAATTTCATCG-ACTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gcttTT--CAT---CGACTTACG-A--T---------------TCT--T--C-AG--A---T-TT--T---CT-TG---G---CT---ATTTCTAGAGCT-A------TT----------C---T----A--AAATTTAA--TCATGAA-----------C-TGACATG-A----ACAGG---T-TACAGATCAATTTT-acgattcttcagattttcttggctatttctagagctattctaaaatttaatcatgaactgacatgaacaggttacagatcaatttt
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                           attaTGGGCCTAGC-AATGAGTGAGTGCCGTTCA--G-T-GATCAGC--------CTGTG--TGTG-TGTGCGT-GCATGTGTT--CAT---TCATGTA-A-A--C---------------TTT--T--C-TG--AAA-CATT--T---TT-TG---G---CT---ATCCCTGCAACT-A------TTGAA-------C---T---GA--AAATGTAT--ACATAAA-----------CATGTAATA-A----TTTAT---T-TACAGATCAAGTTT-GA-GCTGTAGCATGTATTTTTTTAACC---TA--TTTTTGA--AAGTGTAATAGACCTTAAATTTATCGAATTTCAGGG-GTTTGGtatcatgctgcttttgaattttaaatcatgaactcatcagcaagttacatatcaatttgtaagaaaataaatgtcattagaaattgaa
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                              ctatccttgcagctcttactttgaaaatgtatgtacatgaacttttgttaatgggtgcaaatcaagtttgatttatgttcaaagaagttttaacaaatag---TT-TGAGAG---TT---ATCCCTGCAGCT-AACTGTTTTGAAAAATGTATCAGT---GGTTAAATTGAT--GCATG-----AA-------CTTGTAT-CA-G----TGGTT----TACCGGTTAAT-TTT-GA-G---GT--TATAGGATTTTCTTAC---CTC--T-------A--GAGA----GTTGAGGACCTTCAACTTCACAAatccctgcagctaactgttttgaaaaatgtatcagtggttaaattgatgcatgaacttgtatcagtggtttaccggttaattttgaggttataggattttcttacctctagagagttgaggaccttcaacttcacaa
gi|10                         :           ctatccttgcagctcttactttgaaaatgtatgtacatgaacttttgttaatgggtgcaaatcaagtttgatttatgttcaaagaagttttaacaaatagttttcaagatttttttggccatcattgcagcttttgatttgaaaattaatacatgaatgtattatatgaatgggttgcagattatggttgcaggtttgaactatttttagaagaaatatggaccttgaatttagcaatttcaaggaCTTACA--GT-GATCAGCC--TGTG--T--GT--CA----GT-CCA----AGTGCT--CAT---GCATCAAC-A--G---------------CTT--T--CCA-GAG-TT--T---TC-TC---T---CT---ATCACTGCTGCT-A------TTAAA-------T---T---GA--AAATTTAT--ACATG-----AA-------CTTATA-----------GG-T----TGTAGATCAAG-TTT-GA-GC-TTT--CTTG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                         agccctgCCCTCTA--GT-GATCATCC--TGTG--C--ATG-CTTG-TAT-CTC----TGCGTTGACACTTCCCATAT----------------------TTT--T----------TT--T---TC-TG---T---CTTAAATCTCGGCAGCT-A------TTGAA-------T---T---GA--GAATTTAT--AAATA-----GA-------CTTGCA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTGCAGCT-T------TTGAT-------T---T---TA--GAATAGAA--ACCTG-----AA-------ATTATAT-CA-AG---GGGTTACTGTACATATCAAG-TTT-GG-G-----------------ATTG-----------------GA--AAGA----ATTATGCACCTTTATCATGGCAAATTTCAGGG-ATTTGACAtgtatatcaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                  C-AATAGGTGGGTACCCTA-A--GTTGATCATCC--TATG--T--GTG-CATG-CAT-CTA----TCTGTC--TATG--ATATGT----------------------TTC--T--AAA-GGC-TT--T---TT-T-----------------TTG--GCT-A------TAGAA-------C---T---G---AAATATAT--ACtt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                             ctGCTCTTTA--GT-GATTAGCCCTTGTG--TCTGTG-TGTG-CAT-ACGCAAATCTGTC--TGT---CTGTTTAA-A--T---------------CCTAGT--CTG-GAC-TT--T---TTATG---G---CT---CTACCTGCAGCT-A------TTGAA-------
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                          GGTCCT-GC-AAGTGGTGATTGCCCTATT--GT-GATCAGTC--TGTT--C--ATG-CATGTCAT--------TGTG----CAT---CCATGAAA-ATGC---------------TTT--T--CCA-GAC-TTTCT---TT-TG---G---TT---ATTCTTGC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                        GGCAGGTGCCCTATA--GT-GATCAGCC--TATG--T--GTG-TGTG-TTT-GTC----TGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              tcagggcgccacctaca----TGTGTT--CAT---GCATTGAC-A--G---------------CTT--T--CCA-GAC-T--------------------------CTCTACAAAT-A------TTGAT-------T---TATAGA--AAATTTAC--ACATG-----AA-------CTTATAttaatttcaaacactgagtttgatcggaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtcagcctaG---A---CT---ATTCCCACAG----------TTGAG-------T-------------ATTGAT--ACATG-----AA-------CTTATAC-CA-A----TGGAT----TGCAGAGGAAT-TTT-GA-GC-T-T--C---GGCTTTGTTGA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tg--TTTTT------AAGA----GTTATGAACCTTGCATTTAGCTAAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                    cTA--GT-GATCAGCC--TGTG--C--ATG-C-----------------T-TC--CAT---CT--------------------------------------GAC-TT--G---TT-TG---GG--CT---ATTCCTGCAGCTTC------TTAAA-------TA--T---GA--AAATACAT--ACATG-----AA-------CTTATA--TC-AT---TGGGT----CACAGATCAAG-ATT-GG-GT-T------TGGGCTTTGCTGAC---GGA--TTTTT--TGTTCAGA----GTAATGGAAGTTCAGCCTAGCACATTTCAGGG-ATTTGACAGgattccacaaagcggggcctttttgtgatgcttgtcatcacaatga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tttttagagccccacctatcggtggtcagaagA-AT---TGGTT-----ACAGATGAAG-TTTTGA-GT-T----CA--AACTATGTTGAT---TTT--TTTTTAGGA--AAAAAAATGTTATGGACGTTGAAatttcctgacttttaaggatttgaaaattggttacagatgaagttttgagttcaaactatgttgatttttttttaggaaaaaaaatgttatggacgttgaatgt
gi|21                         :                                                                                                                  tttttagagccccacctatcggtggtcagaagtagtgatcagcctgtgcatgcttccatctgacttgtttgggctattcctgcagcttcttaaatatgaaaatacatacatgaacttatatcattgggtcacagatcaagattgggtttgggctttgctgacggattttttgttcagagtaatggaagttcagcctagcacatttcagggatttgacagatttcctgacttttaaggatttgaaCG-GAC-TT--T---T---G---GAGCCC---ATCCATTCAGC--A------TTGAT-------T---T---AA--AAATTTAT--AAATG-----Atgt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tg----TGCGTC--CAT---TCGTGCAA-ATGC---------------TTT--T--CCG-GAC--T--C---TT-TG---G---CT---ATTCCTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                   -AATTGGCAGATACCCTATG--GT-GAAAATCC--TGTG--T--G-------------CA----TGTGCC--TAT---CAGTATAA-ATGC---------------TTG--T--GCG-GAC-TT--T---TT-GG---G---CT---ATCCTTTGAGCT-A------TTGAA-------T---T---GA--AAATTTAT--ACATG-----AAATAATTACTTACATACA-ACAA-TGGAT----TATTGATCAAA-TCT-TA-GT-T------TGGGCTTTGTTGAC---ATA--TTTTT--GA--AAGA----GCTATGGACCTCGAAATTAGCCAATTTCATCG-ACTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gctt---------------TTC--T--TCA-GAT-TT--T---CT-TG---G---CT---ATTTCTAGAGCT-A------TT----------C---T----A--AAATTTAA--TCATG-----AA-------CTGACAT-GA-AC---AGG-T----TACAGATCAAT-TTT-acgattcttcagattttcttggctatttctagagctattctaaaatttaatcatgaactgacatgaacaggttacagatcaatttt
gi|4                          : gcttaattggcagataccctatggtgaaaatcctgtgtgcatgtgcctatcagtataaatgcttgtgcggactttttgggctatcctttgagctattgaattgaaaatttatacatgaaataattacttacatacaacaatggattattgatcaaatcttagtttgggctttgttgacatatttttgaaagagctatggacctcgaaattagccaatttcatcgacttacgaTGGCTCCACC-TATGGATGGGTGCTCTATA--TT-GATCAGCC--TGTG--T--GTT-TTTG-TGT-GTG----TGTACC--CAT---CCAT-TCA-A--T---------------TCA--T--GCA-AA-------------TG----------------CTGCAGCT-A------CTGAA-------T---T---GA--AAATTTAT--GCATG-----AT-------CTTATAT-TA-AT---GGGTT-----ACAGATCAAG-TT--------------AAGAGTTTTA--GGC---------TTTT--GA--AAGA----GTTATGGACCTTGAACTAAACAAACGTCAGGA-ATCTGACAATT
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                         TGGGCCTAGCCAATGAGTGAGTGCGTT-CA--GTTGATCAGCC--TGTGG-T--GTGGTGTG-CGTTGCA----TGTGTT--CAT---C-ATGTAA-A--C---------------TTT--T--CGA-AATATT--T---TT-TG---G---CT---ATGCTGACAACT-A------TTGAA-------C---T---GA--AAATGTAT--ACATA-----AA-------CATGTAA-TA-AT---TTATT----T-CAGATCAAGTTTT-GA-GC-TGTAGCATGTATTTTTTTAAC---CTCTTTTTTT--GA--AAGT----GTAATAGACCTTAAgaatt
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gi|10                         :           ctatccttgcagctcttactttgaaaatgtatgtacatgaacttttgttaatgggtgcaaatcaagtttgatttatgttcaaagaagttttaacaaatagttttcaagatttttttggccatcattgcagcttttgatttgaaaattaatacatgaatgtattatatgaatgggttgcagattatggttgcaggtttgaactatttttagaagaaatatggaccttgaatttagcaatttcaaggaCTTACA--GT-GATCAGCC--TGTG-T--GT--CA----GT-CCA----AGTGCT--CAT---GCATCAAC-A--G---------------CTT--T--CCA-GA----G-TT--T---TC-TC---T---CT---ATCACTGCTGCT-A------TTAAA-------T---T---GA--AAATTTAT--ACATG-----AA-------C---TTATA----------GGT----TGTAGATCAAG-TT-T-GA---GCT-T--
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                         agccctgCCCTCTA--GT-GATCATCC--TGTG-C--ATG-CTTG-TAT-CTC----TGCGTTGACACTTCCCATAT----------------------TTT--T--------------TT--T---TC-TG---T---CTTAAATCTCGGCAGCT-A------TTGAA-------T---T---GA--GAATTTAT--AAATA-----GA-------C---TTGCAT-tcttg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTGCAGCT-T------TTGAT-------T---T---TA--GAATAGAA--ACCTG-----AA-------A---TTATAT-CAAG--GGGTTACTGTACATATCAAG-TT-T-GG---G----------------ATTG---------------GA--AA-GA----ATTATGCACCTTTATCATGGCAAATTTCAGGG-ATTTGACAgtatatcaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                  C-AATAGGTGGGTACCCTA-A--GTTGATCATCC--TATG-T--GTG-CATG-CAT--C-------TATC--TGT---CTATG-AT-A--T---------------GTT--T--CTA-AAGGCTT-TT--T---TT-TG---G---CT---ATtt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                             ctGCTCTTTA--GT-GATTAGCCCTTGTG-TCTGTG-TGTG-CAT-ACGCAAATCTGTC--TGT---CTGTTTAA-A--T---------------CCTAGT--CTG-GA----C-TT--T---TTATG---G---CT---CTACCTGCAGCT-A------TTGAA-------agaactgaaatatatac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                          GGTCCT-GC-AAGTGGTGATTGCCCTATT--GT-GATCAGTC--TGTT-C--ATG-CATGTCAT--------TGTG----CAT---CCATGAAA-ATGC---------------TTT--T--CCA-GA----C-TTTCT---TT-TG---G---TT---ATTCTTGC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                        GGCAGGTGCCCTATA--GT-GATCAGCC--TATG-T--GTG-TGTG-TTT-GTC----TGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcagggcgccacctaca----TGTGTT--CAT---GCATTGAC-A--G---------------CTT--T--CCA-GA----C-T--------------------------CTCTACAAAT-A------TTGAT-------T---TATAGA--AAATTTAC--ACATG-----AA-------C---TTATAttaatttcaaacactgagtttgatcggaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtcagcctaG---A---CT---ATTCCCACAG----------TTGAG-------T-------------ATTGAT--ACATG-----AA-------C---TTATAC-CAA---TGGAT----TGCAGAGGAAT-TT-T-GA---GCT-T--C---GGCTTTGTTGA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgTTTTT------AA-GA----GTTATGAACCTTGCATTTAGCTAAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                    cTA--GT-GATCAGCC--TGTG-C--ATG-C-----------------T-TC--CAT---CT--------------------------------------GA----C-TT--G---TT-TG---GG--CT---ATTCCTGCAGCTTC------TTAAA-------TA--T---GA--AAATACAT--ACATG-----AA-------C---TTATAT-CA-T--TGGGT----CACAGATCAAG-AT-T-GG---GTT-T-----GGGCTTTGCTGAC---GGATTTTT--TGTTCA-GA----GTAATGGAAGTTCAGCCTAGCACATTTCAGGG-ATTTGACAGgattccacaaagcggggcctttttgtgatgcttgtcatcacaatga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tttttagagccccacctatcggtggtcagaagAAT--TGG-T----TACAGATGAAG-TT-TTGA---G-T-T--CA--AACTATGTTGAT---TTTTTTTTAGGA--AA-AAAAATGTTATGGACGTTGAAatttcctgacttttaaggatttgaaaattggttacagatgaagttttgagttcaaactatgttgatttttttttaggaaaaaaaatgttatggacgttgaatgt
gi|21                         :                                                                                                                 tttttagagccccacctatcggtggtcagaagtagtgatcagcctgtgcatgcttccatctgacttgtttgggctattcctgcagcttcttaaatatgaaaatacatacatgaacttatatcattgggtcacagatcaagattgggtttgggctttgctgacggattttttgttcagagtaatggaagttcagcctagcacatttcagggatttgacagatttcctgacttttaaggatttgaaCG-GA----C-TT--T---T---G---GAGCCC---ATCCATTCAGC--A------TTGAT-------T---T---AA--AAATTTAT--AAATG-----Atgt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tg----TGCGTC--CAT---TCGTGCAA-ATGC---------------TTT--T--CCG-GA----C--T--C---TT-TG---G---CT---ATTCCTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                   -AATTGGCAGATACCCTATG--GT-GAAAATCC--TGTG---------------T-GCA----TGTGCC--TAT---CAGTATAA-ATGC---------------TTG--T--GCG-GA----C-TT--T---TT-GG---G---CT---ATCCTTTGAGCT-A------TTGAA-------T---T---GA--AAATTTAT--ACATG-----AAATAATTAC---TTACATACAACAATGGAT----TATTGATCAAA-TC-T-TA---GTT-T-----GGGCTTTGTTGAC---ATATTTTT--GA--AA-GA----GCTATGGACCTCGAAATTAGCCAATTTCATCG-ACTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gctt---------------TTC--T--TCA-GA----T-TT--T---CT-TG---G---CT---ATTTCTAGAGCT-A------TT----------C---T----A--AAATTTAA--TCATG-----AA-------C---TGACAT-GAA---CAGGT----TACAGATCAAT-TT-T-acgattcttcagattttcttggctatttctagagctattctaaaatttaatcatgaactgacatgaacaggttacagatcaatttt
gi|4                          : gcttaattggcagataccctatggtgaaaatcctgtgtgcatgtgcctatcagtataaatgcttgtgcggactttttgggctatcctttgagctattgaattgaaaatttatacatgaaataattacttacatacaacaatggattattgatcaaatcttagtttgggctttgttgacatatttttgaaagagctatggacctcgaaattagccaatttcatcgacttacgaTGGCTCCACC-TATGGATGGGTGCTCTATA--TT-GATCAGCC--TGTG-T--GTT-TTTG-TGT-GTG----TGTACC--CAT---CCAT-TCA-A--T---------------TCA--T--GCA-AA-----------------TG----------------CTGCAGCT-A------CTGAA-------T---T---GA--AAATTTAT--GCATG-----AT-------C---TTATAT-TAA---TGGGT----TACAGATCAAG-TTAA-GA---GTT-T----TAGGC----------------TTTT--GA--AA-GA----GTTATGGACCTTGAACTAAACAAACGTCAGGA-ATCTGACAATT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                     attaTGGGCCTAGC-AATGAGTGAGTGCCGTTCA--GT-GATCAGCC--TGTG-T--GTG-TGTG-CGT-GCA----TGTGTT--CAT---TCATGTAA-A--C---------------TTT--T--CTGAAA----CATT--T---TT-TG---G---CT---ATCCCTGCAACT-A------TTGAA-------C---T---GA--AAATGTAT--ACATA-----AA-------C---ATGTAA-TAAT--TTATT----TACAGATCAAG-TT-T-GA---GCTGTAGCATGTATTTTTTTAAC---CTATTTTT--GA--AA-GT----GTAATAGACCTTAAATTTATCGAATTTCAGGG-GTTTGtatcatgctgcttttgaattttaaatcatgaactcatcagcaagttacatatcaatttgtaagaaaataaatgtcattagaaattgaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                         TGGGCCTAGCCAATGAGTGAGTGCGTT-CA--GTTGATCAGCC--TGTGGT--GTGGTGTG-CGTTGCA----TGTGTT--CAT---C-ATGTAA-A--C---------------TTT--T--CGA-AA----TATT--T---TT-TG---G---CT---ATGCTGACAACT-A------TTGAA-------C---T---GA--AAATGTAT--ACATA-----AA-------C---ATGTAA-TAAT--TTATT----T-CAGATCAAGTTT-T-GA---GCTGTAGCATGTATTTTTTTAACCT-CTTTTTTT--GA--AA-GT----GTAATAGACCTTAAgaatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                             aattCCTATATCGC-GATCAGCC--TGTG-T--GTG-AGTT-CGT----------TGTC--CGC-------GCAA-A--C---------------ATT--TAGCTG-TA----C-TT--CCTGTT-TG---G---CT---ATCTGAGCAGCT-A------TTGAA-------G---T---GA--AAATTTAC--GCATA-----AA------------------------TGGAT----TACTGATCAA-----T-GACGCGTT-T--CCTGGGCTTTGTTGACAGGGTTTTTTT--TA--CA-GA----GTTATGGACCTTGAACGTAGCAAG---CAGGGCATTTttatcgat
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gi|10                         :           ctatccttgcagctcttactttgaaaatgtatgtacatgaacttttgttaatgggtgcaaatcaagtttgatttatgttcaaagaagttttaacaaatagttttcaagatttttttggccatcattgcagcttttgatttgaaaattaatacatgaatgtattatatgaatgggttgcagattatggttgcaggtttgaactatttttagaagaaatatggaccttgaatttagcaatttcaaggaCTTACA--GT-GATCAGCC--TGTG-T--GT--CA----GT-CCA----AGTGCT--CAT---GCATCAAC-A--G---------------CTT--T--CCA-GA----G-TT--T---TC-TC---T---CT---ATCACTGCTGCT-A------TTAAA-------T---T---GA--AAATTTAT--ACATG-----AA-------C---T------TATA----------GGT----TGTAGATCAAG-TT-T-GA---GCT-T--
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                         agccctgCCCTCTA--GT-GATCATCC--TGTG-C--ATG-CTTG-TAT-CTC----TGCGTTGACACTTCCCATAT----------------------TTT--T--------------TT--T---TC-TG---T---CTTAAATCTCGGCAGCT-A------TTGAA-------T---T---GA--GAATTTAT--AAATA-----GA-------C---TTGCATGTATAT-CAAtcttg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTGCAGCT-T------TTGAT-------T---T---TA--GAATAGAA--ACCTG-----AA-------A---T------TATAT-CAAG--GGGTTACTGTACATATCAAG-TT-T-GG---G----------------ATTG---------------GA--AA-GA----ATTATGCACCTTTATCATGGCAAATTTCAGGG-ATTTGACA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                  C-AATAGGTGGGTACCCTA-A--GTTGATCATCC--TATG-T--GTG-CATG-CAT--C-------TATC--TGT---CTATG-AT-A--T---------------GTT--T--CTA-AAGGCTT-TT--T---TT-TG---G---CT---ATtt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                             ctGCTCTTTA--GT-GATTAGCCCTTGTG-TCTGTG-TGTG-CAT-ACGCAAATCTGTC--TGT---CTGTTTAA-A--T---------------CCTAGT--CTG-GA----C-TT--T---TTATG---G---CT---CTACCTGCAGCT-A------TTGAA-------agaactgaaatatatac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                          GGTCCT-GC-AAGTGGTGATTGCCCTATT--GT-GATCAGTC--TGTT-C--ATG-CATGTCAT--------TGTG----CAT---CCATGAAA-ATGC---------------TTT--T--CCA-GA----C-TTTCT---TT-TG---G---TT---ATTCTTGC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                        GGCAGGTGCCCTATA--GT-GATCAGCC--TATG-T--GTG-TGTG-TTT-GTC----TGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcagggcgccacctaca----TGTGTT--CAT---GCATTGAC-A--G---------------CTT--T--CCA-GA----C-T--------------------------CTCTACAAAT-A------TTGAT-------T---TATAGA--AAATTTAC--ACATG-----AA-------C---T------TATAttaatttcaaacactgagtttgatcggaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtcagcctaG---A---CT---ATTCCCACAG----------TTGAG-------T-------------ATTGAT--ACATG-----AA-------C---T------TATAC-CAA---TGGAT----TGCAGAGGAAT-TT-T-GA---GCT-T--C---GGCTTTGTTGA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgTTTTT------AA-GA----GTTATGAACCTTGCATTTAGCTAAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                    cTA--GT-GATCAGCC--TGTG-C--ATG-C-----------------T-TC--CAT---CT--------------------------------------GA----C-TT--G---TT-TG---GG--CT---ATTCCTGCAGCTTC------TTAAA-------TA--T---GA--AAATACAT--ACATG-----AA-------C---T------TATAT-CA-T--TGGGT----CACAGATCAAG-AT-T-GG---GTT-T-----GGGCTTTGCTGAC---GGATTTTT--TGTTCA-GA----GTAATGGAAGTTCAGCCTAGCACATTTCAGGG-ATTTGACAGgattccacaaagcggggcctttttgtgatgcttgtcatcacaatga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tttttagagccccacctatcggtggtcagaagAAT--TGG-T----TACAGATGAAG-TT-TTGA---G-T-T--CA--AACTATGTTGAT---TTTTTTTTAGGA--AA-AAAAATGTTATGGACGTTGAAatttcctgacttttaaggatttgaaaattggttacagatgaagttttgagttcaaactatgttgatttttttttaggaaaaaaaatgttatggacgttgaatgt
gi|21                         :                                                                                                                 tttttagagccccacctatcggtggtcagaagtagtgatcagcctgtgcatgcttccatctgacttgtttgggctattcctgcagcttcttaaatatgaaaatacatacatgaacttatatcattgggtcacagatcaagattgggtttgggctttgctgacggattttttgttcagagtaatggaagttcagcctagcacatttcagggatttgacagatttcctgacttttaaggatttgaaCG-GA----C-TT--T---T---G---GAGCCC---ATCCATTCAGC--A------TTGAT-------T---T---AA--AAATTTAT--AAATG-----Atgt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tg----TGCGTC--CAT---TCGTGCAA-ATGC---------------TTT--T--CCG-GA----C--T--C---TT-TG---G---CT---ATTCCTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                   -AATTGGCAGATACCCTATG--GT-GAAAATCC--TGTG---------------T-GCA----TGTGCC--TAT---CAGTATAA-ATGC---------------TTG--T--GCG-GA----C-TT--T---TT-GG---G---CT---ATCCTTTGAGCT-A------TTGAA-------T---T---GA--AAATTTAT--ACATG-----AAATAATTAC---T------TACATACAACAATGGAT----TATTGATCAAA-TC-T-TA---GTT-T-----GGGCTTTGTTGAC---ATATTTTT--GA--AA-GA----GCTATGGACCTCGAAATTAGCCAATTTCATCG-ACTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gctt---------------TTC--T--TCA-GA----T-TT--T---CT-TG---G---CT---ATTTCTAGAGCT-A------TT----------C---T----A--AAATTTAA--TCATG-----AA-------C---T------GACAT-GAA---CAGGT----TACAGATCAAT-TT-T-acgattcttcagattttcttggctatttctagagctattctaaaatttaatcatgaactgacatgaacaggttacagatcaatttt
gi|4                          : gcttaattggcagataccctatggtgaaaatcctgtgtgcatgtgcctatcagtataaatgcttgtgcggactttttgggctatcctttgagctattgaattgaaaatttatacatgaaataattacttacatacaacaatggattattgatcaaatcttagtttgggctttgttgacatatttttgaaagagctatggacctcgaaattagccaatttcatcgacttacgaTGGCTCCACC-TATGGATGGGTGCTCTATA--TT-GATCAGCC--TGTG-T--GTT-TTTG-TGT-GTG----TGTACC--CAT---CCAT-TCA-A--T---------------TCA--T--GCA-AA-----------------TG----------------CTGCAGCT-A------CTGAA-------T---T---GA--AAATTTAT--GCATG-----AT-------C---T------TATAT-TAA---TGGGT----TACAGATCAAG-TTAA-GA---GTT-T----TAGGC----------------TTTT--GA--AA-GA----GTTATGGACCTTGAACTAAACAAACGTCAGGA-ATCTGACAATT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                     attaTGGGCCTAGC-AATGAGTGAGTGCCGTTCA--GT-GATCAGCC--TGTG-T--GTG-TGTG-CGT-GCA----TGTGTT--CAT---TCATGTAA-A--C---------------TTT--T--CTGAAA----CATT--T---TT-TG---G---CT---ATCCCTGCAACT-A------TTGAA-------C---T---GA--AAATGTAT--ACATA-----AA-------C---A------TGTAA-TAAT--TTATT----TACAGATCAAG-TT-T-GA---GCTGTAGCATGTATTTTTTTAAC---CTATTTTT--GA--AA-GT----GTAATAGACCTTAAATTTATCGAATTTCAGGG-GTTTGtatcatgctgcttttgaattttaaatcatgaactcatcagcaagttacatatcaatttgtaagaaaataaatgtcattagaaattgaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                         TGGGCCTAGCCAATGAGTGAGTGCGTT-CA--GTTGATCAGCC--TGTGGT--GTGGTGTG-CGTTGCA----TGTGTT--CAT---C-ATGTAA-A--C---------------TTT--T--CGA-AA----TATT--T---TT-TG---G---CT---ATGCTGACAACT-A------TTGAA-------C---T---GA--AAATGTAT--ACATA-----AA-------C---A------TGTAA-TAAT--TTATT----T-CAGATCAAGTTT-T-GA---GCTGTAGCATGTATTTTTTTAACCT-CTTTTTTT--GA--AA-GT----GTAATAGACCTTAAgaatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                             aattCCTATATCGC-GATCAGCC--TGTG-T--GTG-AGTT-CGT----------TGTC--CGC-------GCAA-A--C---------------ATT--TAGCTG-TA----C-TT--CCTGTT-TG---G---CT---ATCTGAGCAGCT-A------TTGAA-------G---T---GA--AAATTTAC--GCATA-----AA------------------------------TGGAT----TACTGATCAA-----T-GACGCGTT-T--CCTGGGCTTTGTTGACAGGGTTTTTTT--TA--CA-GA----GTTATGGACCTTGAACGTAGCAAG---CAGGGCATTTttatcgat
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gi|10                         :           ctatccttgcagctcttactttgaaaatgtatgtacatgaacttttgttaatgggtgcaaatcaagtttgatttatgttcaaagaagttttaacaaatagttttcaagatttttttggccatcattgcagcttttgatttgaaaattaatacatgaatgtattatatgaatgggttgcagattatggttgcaggtttgaactatttttagaagaaatatggaccttgaatttagcaatttcaaggaCTTACA--GT-GATCAGCC--TGTG-T--GT--CA----GT-CCA----AGTGCT--CAT---GCATCAAC-A--G---------------CTT--T--CCA-GA----G-TT--T---TC-TC---T---CT---ATCACTGCTGCT-A------TTAAA-------T---T---GA--AAATTTAT--ACATG-----AA-------C---T------TATA----------GGT----TGTAGATCAAG-TT-T-GA---GCT-T--
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                         agccctgCCCTCTA--GT-GATCATCC--TGTG-C--ATG-CTTG-TAT-CTC----TGCGTTGACACTTCCCATAT----------------------TTT--T--------------TT--T---TC-TG---T---CTTAAATCTCGGCAGCT-A------TTGAA-------T---T---GA--GAATTTAT--AAATA-----GA-------C---TTGCATGTATAT-CAAtcttg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTGCAGCT-T------TTGAT-------T---T---TA--GAATAGAA--ACCTG-----AA-------A---T------TATAT-CAAG--GGGTTACTGTACATATCAAG-TT-T-GG---G----------------ATTG---------------GA--AA-GA----ATTATGCACCTTTATCATGGCAAATTTCAGGG-ATTTGACA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                  C-AATAGGTGGGTACCCTA-A--GTTGATCATCC--TATG-T--GTG-CATG-CAT--C-------TATC--TGT---CTATG-AT-A--T---------------GTT--T--CTA-AAGGCTT-TT--T---TT-TG---G---CT---ATtt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                             ctGCTCTTTA--GT-GATTAGCCCTTGTG-TCTGTG-TGTG-CAT-ACGCAAATCTGTC--TGT---CTGTTTAA-A--T---------------CCTAGT--CTG-GA----C-TT--T---TTATG---G---CT---CTACCTGCAGCT-A------TTGAA-------agaactgaaatatatac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                          GGTCCT-GC-AAGTGGTGATTGCCCTATT--GT-GATCAGTC--TGTT-C--ATG-CATGTCAT--------TGTG----CAT---CCATGAAA-ATGC---------------TTT--T--CCA-GA----C-TTTCT---TT-TG---G---TT---ATTCTTGC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                        GGCAGGTGCCCTATA--GT-GATCAGCC--TATG-T--GTG-TGTG-TTT-GTC----TGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcagggcgccacctaca----TGTGTT--CAT---GCATTGAC-A--G---------------CTT--T--CCA-GA----C-T--------------------------CTCTACAAAT-A------TTGAT-------T---TATAGA--AAATTTAC--ACATG-----AA-------C---T------TATAttaatttcaaacactgagtttgatcggaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtcagcctaG---A---CT---ATTCCCACAG----------TTGAG-------T-------------ATTGAT--ACATG-----AA-------C---T------TATAC-CAA---TGGAT----TGCAGAGGAAT-TT-T-GA---GCT-T--C---GGCTTTGTTGA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgTTTTT------AA-GA----GTTATGAACCTTGCATTTAGCTAAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                    cTA--GT-GATCAGCC--TGTG-C--ATG-C-----------------T-TC--CAT---CT--------------------------------------GA----C-TT--G---TT-TG---GG--CT---ATTCCTGCAGCTTC------TTAAA-------TA--T---GA--AAATACAT--ACATG-----AA-------C---T------TATAT-CA-T--TGGGT----CACAGATCAAG-AT-T-GG---GTT-T-----GGGCTTTGCTGAC---GGATTTTT--TGTTCA-GA----GTAATGGAAGTTCAGCCTAGCACATTTCAGGG-ATTTGACAGgattccacaaagcggggcctttttgtgatgcttgtcatcacaatga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tttttagagccccacctatcggtggtcagaagAAT--TGG-T----TACAGATGAAG-TT-TTGA---G-T-T--CA--AACTATGTTGAT---TTTTTTTTAGGA--AA-AAAAATGTTATGGACGTTGAAatttcctgacttttaaggatttgaaaattggttacagatgaagttttgagttcaaactatgttgatttttttttaggaaaaaaaatgttatggacgttgaatgt
gi|21                         :                                                                                                                 tttttagagccccacctatcggtggtcagaagtagtgatcagcctgtgcatgcttccatctgacttgtttgggctattcctgcagcttcttaaatatgaaaatacatacatgaacttatatcattgggtcacagatcaagattgggtttgggctttgctgacggattttttgttcagagtaatggaagttcagcctagcacatttcagggatttgacagatttcctgacttttaaggatttgaaCG-GA----C-TT--T---T---G---GAGCCC---ATCCATTCAGC--A------TTGAT-------T---T---AA--AAATTTAT--AAATG-----Atgt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tg----TGCGTC--CAT---TCGTGCAA-ATGC---------------TTT--T--CCG-GA----C--T--C---TT-TG---G---CT---ATTCCTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                   -AATTGGCAGATACCCTATG--GT-GAAAATCC--TGTG---------------T-GCA----TGTGCC--TAT---CAGTATAA-ATGC---------------TTG--T--GCG-GA----C-TT--T---TT-GG---G---CT---ATCCTTTGAGCT-A------TTGAA-------T---T---GA--AAATTTAT--ACATG-----AAATAATTAC---T------TACATACAACAATGGAT----TATTGATCAAA-TC-T-TA---GTT-T-----GGGCTTTGTTGAC---ATATTTTT--GA--AA-GA----GCTATGGACCTCGAAATTAGCCAATTTCATCG-ACTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gctt---------------TTC--T--TCA-GA----T-TT--T---CT-TG---G---CT---ATTTCTAGAGCT-A------TT----------C---T----A--AAATTTAA--TCATG-----AA-------C---T------GACAT-GAA---CAGGT----TACAGATCAAT-TT-T-acgattcttcagattttcttggctatttctagagctattctaaaatttaatcatgaactgacatgaacaggttacagatcaatttt
gi|4                          : gcttaattggcagataccctatggtgaaaatcctgtgtgcatgtgcctatcagtataaatgcttgtgcggactttttgggctatcctttgagctattgaattgaaaatttatacatgaaataattacttacatacaacaatggattattgatcaaatcttagtttgggctttgttgacatatttttgaaagagctatggacctcgaaattagccaatttcatcgacttacgaTGGCTCCACC-TATGGATGGGTGCTCTATA--TT-GATCAGCC--TGTG-T--GTT-TTTG-TGT-GTG----TGTACC--CAT---CCAT-TCA-A--T---------------TCA--T--GCA-AA-----------------TG----------------CTGCAGCT-A------CTGAA-------T---T---GA--AAATTTAT--GCATG-----AT-------C---T------TATAT-TAA---TGGGT----TACAGATCAAG-TTAA-GA---GTT-T----TAGGC----------------TTTT--GA--AA-GA----GTTATGGACCTTGAACTAAACAAACGTCAGGA-ATCTGACAATT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                     attaTGGGCCTAGC-AATGAGTGAGTGCCGTTCA--GT-GATCAGCC--TGTG-T--GTG-TGTG-CGT-GCA----TGTGTT--CAT---TCATGTAA-A--C---------------TTT--T--CTGAAA----CATT--T---TT-TG---G---CT---ATCCCTGCAACT-A------TTGAA-------C---T---GA--AAATGTAT--ACATA-----AA-------C---A------TGTAA-TAAT--TTATT----TACAGATCAAG-TT-T-GA---GCTGTAGCATGTATTTTTTTAAC---CTATTTTT--GA--AA-GT----GTAATAGACCTTAAATTTATCGAATTTCAGGG-GTTTGtatcatgctgcttttgaattttaaatcatgaactcatcagcaagttacatatcaatttgtaagaaaataaatgtcattagaaattgaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                         TGGGCCTAGCCAATGAGTGAGTGCGTT-CA--GTTGATCAGCC--TGTGGT--GTGGTGTG-CGTTGCA----TGTGTT--CAT---C-ATGTAA-A--C---------------TTT--T--CGA-AA----TATT--T---TT-TG---G---CT---ATGCTGACAACT-A------TTGAA-------C---T---GA--AAATGTAT--ACATA-----AA-------C---A------TGTAA-TAAT--TTATT----T-CAGATCAAGTTT-T-GA---GCTGTAGCATGTATTTTTTTAACCT-CTTTTTTT--GA--AA-GT----GTAATAGACCTTAAgaatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                             aattCCTATATCGC-GATCAGCC--TGTG-T--GTG-AGTT-CGT----------TGTC--CGC-------GCAA-A--C---------------ATT--TAGCTG-TA----C-TT--CCTGTT-TG---G---CT---ATCTGAGCAGCT-A------TTGAA-------G---T---GA--AAATTTAC--GCATA-----AA------------------------------TGGAT----TACTGATCAA-----T-GACGCGTT-T--CCTGGGCTTTGTTGACAGGGTTTTTTT--TA--CA-GA----GTTATGGACCTTGAACGTAGCAAG---CAGGGCATTTttatcgat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                               GCCC-ATA--GT-GATCAGGC--TGTG-CTTGTG-AGTG-TAT-GTG----TGTGTG--CATGT-CCATGTAT-A--TGTCATGTATTGATAGTTT--T--CTG-AT----C-AT--T---CT-GG---G---TT---ATTCCTTCTACT-A------TTGAA-------T---T---AA--AAACTTAC--ATATGTGGGCAA-------T---T------TATAA-TA-------------TACAGATCAAG-TT-T-GA---Gttgtgacgcttgccgtcataatg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttagggccccTTTT--GA--AAAGA----GTTATGGATCTTGAACTTAGCTAATTTCATAC-ATTCAACTGTTtagtacatgta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       a--CAT---ACATTTGACA--G---------------TTT--T--CAG-AA----C-TC--T---TT-TG---G---CT---ATTCCTGCAGCT-A------TTGAA-------T---T---GA--AAATTCAT--GCATG-----AT-------C---T------TATAT-TAA---TGGCA----TAGAGATCAAG-TT-T-GA---GTT-ttctcatacatttgacagttttcagaactcttttggctattcctgcagctattgaattgaaaattcatgcatgatcttatattaatggcatagagatcaagtttgagtt


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                            C   A  C   T  T         C  TC  T        CT    TCTGTGTGTGCATACGCAAA          GA   GTCCATGTATATGTCATGTATTGATAG       AG AGCTG   GGCTT   TC CTG  A  AGAG     TAA            T ACTGTT     AAATGTATCAG ATA  TT        .      TGGGC  ATAATTACT             TAC ACAAT  TTACTG           T  A T  CGC CTGTAGCATG      T     AGGGTT     TGTT    A  AAAT                     A          C
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                            G   A  .   T  C         A  .   T        .     GTGTGGTGTGCGTTGCA             .    CCATGAAAATGC                      .  CTGA    CA      .  .    .  GAGC     .              . .          TA          .    .         .      .      CTTGCATG              TG  AGG    GT               .  . .  .   CTGTAGCATG      A     CTCTT      AGGA    .  .                        A          .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                            G   A  .   G  C         T  .   .        .     CTTGTGAGTGTATGTG              .    TCGTGCAAATGC                      .  CCA     TA      .  .    .  GG       .              . .          T           .    .         .      .      TGTAT                 TC  ATT    TT               .  . .  .   TTTCCTG         G     CTC        GA      .  .                        T          .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .   G  T         A  .   .        .     CATGCTTGTATCTC                .    CAGTATAAATGC                      .  CTA     G       .  .    .  T        .              . .          T           .    .         .      .      CT                    TC  ATT    GT               .  . .  .   GTTATA          G     GGA        GA      .  .                        A          .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                    A  .   .        .     TGTGTGTGCGTGCA                .    GCATTGACAG                        .  CCA     C       .  .    .  G        .              . .          T           .    .         .      .      CT                    TC  GT     AT               .  . .  .   TTTG            T     CTA        GA      .  .                        G          .
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                  C-AATAGGTGGGTACCCTA-A--GTTGATCATCC--TATG--T--GTG-CATG-C--AT---C-----T-AT----CTGT--CTATG-ATA--T---------------GTT--T--CTA-AAGGCTT-TT--T---TT-T----G---G---CT---ATtt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                             ctGCTCTTTA--GT-GATTAGCCCTTGTG--TCTGTG-TGTG-C--AT-A-CGCAAAT-CTGT--CTGT--CTGTTTAAA--T---------------CCTAGT--CTG-GA----C-TT--T---TTAT----G---G---CT---CTACCTGCAGCT-A------TTGAA-------agaactgaaatatatac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                          GGTCCT-GC-AAGTGGTGATTGCCCTATT--GT-GATCAGTC--TGTT--C--ATG-CATGTC--AT---------T-GTG----CAT--CCATGAAAATGC---------------TTT--T--CCA-GA----C-TTTCT---TT-T----G---G---TT---ATTCTTGC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                        GGCAGGTGCCCTATA--GT-GATCAGCC--TATG--T--GTG-TGTG-T--TT-GTC-----T-GT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcagggcgccacctaca-----T-GTGT--TCAT--GCATTGACA--G---------------CTT--T--CCA-GA----C-T------------------------------CTCTACAAAT-A------TTGAT-------T---TATAGA--AAATTTA--CACATG-----A-------AC---T------TATAttaatttcaaacactgagtttgatcggaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtcagccta----G---A---CT---ATTCCCACAG----------TTGAG-------T-------------ATTGA--TACATG-----A-------AC---T------TATAC----CAA-TGGAT-----TGCAGAGGAA------T-TTT-G-AGCT------T---CGGCTTTGTTGA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgTTTTT------AA-GA----GTTATGAACCTTGCATTTAGCTAAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                    cTA--GT-GATCAGCC--TGTG--------------C--AT-G-C-----T----T--CCAT--CTG-------------------------------------A----C-TT--G---TT-T----G---GG--CT---ATTCCTGCAGCTTC------TTAAA-------TA--T---GA--AAATACA--TACATG-----A-------AC---T------TATAT----CAT-TGGGT-----CACAGATCAA------G-ATT-G-GGTT------T---GGGCTTTGCTGAC---GGATTTTT--TGTTCA-GA----GTAATGGAAGTTCAGCCTAGCACATTTCAGGG-ATTTGACAGgattccacaaagcggggcctttttgtgatgcttgtcatcacaatga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tttttagagccccacctatcggtggtcagaagAA-TTGGT-----TACAGATGAA------GTTTT-G-AGTT------C---AAACTATGTTGAT---TTTTTTTTAGGA--AA-AAAAATGTTATGGACGTTGAAatttcctgacttttaaggatttgaaaattggttacagatgaagttttgagttcaaactatgttgatttttttttaggaaaaaaaatgttatggacgttgaatgt
gi|21                         :                                                                                                                    tttttagagccccacctatcggtggtcagaagtagtgatcagcctgtgcatgcttccatctgacttgtttgggctattcctgcagcttcttaaatatgaaaatacatacatgaacttatatcattgggtcacagatcaagattgggtttgggctttgctgacggattttttgttcagagtaatggaagttcagcctagcacatttcagggatttgacagatttcctgacttttaaggatttgaaCG-GA----C-TT--T---T-------G---GAGCCC---ATCCATTCAGC--A------TTGAT-------T---T---AA--AAATTTA--TAAATG-----A-------tgt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tg-----T-GCGT--CCAT--TCGTGCAAATGC---------------TTT--T--CCG-GA----C--T--C---TT-T----G---G---CT---ATTCCTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                   -AATTGGCAGATACCCTATG--GT-GAAAATCC--TGTG--T--GCA-TGTG-C---------------------CTAT--CAGTATAAATGC---------------TTG--T--GCG-GA----C-TT--T---TT-G----G---G---CT---ATCCTTTGAGCT-A------TTGAA-------T---T---GA--AAATTTA--TACATG-----AAATAATTAC---T------TACATACAACAA-TGGAT-----TATTGATCAA------A-TCT-T-AGTT------T---GGGCTTTGTTGAC---ATATTTTT--GA--AA-GA----GCTATGGACCTCGAAATTAGCCAATTTCATCG-ACTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gctt---------------TTC--T--TCA-GA----T-TT--T---CT-T----G---G---CT---ATTTCTAGAGCT-A------TT----------C---T----A--AAATTTA--ATCATG-----A-------AC---T------GACAT----GAA-CAGGT-----TACAGATCAA------T-TTT-acgattcttcagattttcttggctatttctagagctattctaaaatttaatcatgaactgacatgaacaggttacagatcaatttt
gi|4                          : gcttaattggcagataccctatggtgaaaatcctgtgtgcatgtgcctatcagtataaatgcttgtgcggactttttgggctatcctttgagctattgaattgaaaatttatacatgaaataattacttacatacaacaatggattattgatcaaatcttagtttgggctttgttgacatatttttgaaagagctatggacctcgaaattagccaatttcatcgacttacgaTGGCTCCACC-TATGGATGGGTGCTCTATA--TT-GATCAGCC--TGTG--T--GTT-TTTG-T--GT-G-------T-GTGTACCCAT--CCAT-TCAA--T---------------TCA--T--GCA-AA-----------------T----G----------------CTGCAGCT-A------CTGAA-------T---T---GA--AAATTTA--TGCATG-----A-------TC---T------TATAT----TAA-TGGGT-----TACAGATCAA------G-TTAAG-AGTT------TT--AGGCTTT----------------T--GA--AA-GA----GTTATGGACCTTGAACTAAACAAACGTCAGGA-ATCTGACAATT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 attaTGCTGCT-T------TTGAA-------T---T---TT--AAAT-------CATG-----A-------AC---T--------CAT----CAG-CAAGT-----TACATATCAA--------TTT-G-tatcatgctgcttttgaattttaaatcatgaactcatcagcaagttacatatcaatttgtaagaaaataaatgtcattagaaattgaa
gi|5                          :           attatggctccacctatggatgggtgctctatattgatcagcctgtgtgtttttgtgtgtgtgtacccatccattcaattcatgcaaatgctgcagctactgaattgaaaatttatgcatgatcttatattaatgggttacagatcaagttaagagttttaggcttttgaaagagttatggaccttgaactaaacaaacgtcaggaatctgacaatttatcaTGGGCCTAGC-AATGAGTGAGTGCCGTTCA--GT-GATCAGCC--TGTG--T--GTG-TGTG-C--GT-G-CA----T-GTGT--TCAT--TCATGTAAA--C---------------TTT--T--CTGAAA----CATT--T---TT-T----G---G---CT---ATCCCTGCAACT-A------TTGAA-------C---T---GA--AAATGTA--TACATA-----A-------AC---A------TGTAA----TAATTTATT-----TACAGATCAA------G-TTT-G-AGCTGTAGCAT---GTATTTTTTTAAC---CTATTTTT--GA--AA-GT----GTAATAGACCTTAAATTTATCGAATTTCAGGG-GTTTGtaagaaaataaatgtcattagaaattgaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                         TGGGCCTAGCCAATGAGTGAGTGCGTT-CA--GTTGATCAGCC--TGTGG-T--GTGGTGTG-C--GTTG-CA----T-GTGT--TCAT--C-ATGTAAA--C---------------TTT--T--CGA-AA----TATT--T---TT-T----G---G---CT---ATGCTGACAACT-A------TTGAA-------C---T---GA--AAATGTA--TACATA-----A-------AC---A------TGTAA----TAA-TTTAT-----TTCAGATCAA------GTTTT-G-AGCTGTAGCAT---GTATTTTTTTAACCT-CTTTTTTT--GA--AA-GT----GTAATAGACCTTAAgaatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                             aattCCTATATCGC-GATCAGCC--TGTG--T--GTG-AGTT-C--GT------------TGT--CC------GCGCAAA--C---------------ATT--TAGCTG-TA----C-TT--CCTGTT-T----G---G---CT---ATCTGAGCAGCT-A------TTGAA-------G---T---GA--AAATTTA--CGCATA-----------------------------------AA-TGGAT-----TACTGATCAATGACGCG-TTT-----CC------T---GGGCTTTGTTGACAGGGTTTTTTT--TA--CA-GA----GTTATGGACCTTGAACGTAGCAAG---CAGGGCATTTttatcgat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                               GCCC-ATA--GT-GATCAGGC--TGTGCTT--GTG-AGTG-T--AT-G-TG----T-GTGT--GCATGTCCATGTATA--TGTCATGTATTGATAGTTT--T--CTG-AT----C-AT--T---CT-G----G---G---TT---ATTCCTTCTACT-A------TTGAA-------T---T---AA--AAACTTA--CATATGTGGGCA-------AT---T------TAT-------AA-TA--------TACAGATCAA------G-TTT-G-AGttgtgacgcttgccgtcataatg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttagggccccTTTT--GA--AAAGA----GTTATGGATCTTGAACTTAGCTAATTTCATAC-ATTCAACTGTTtagtacatgta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               a---------------TTT--T--CAG-AA----C-TC--T---TT-T----G---G---CT---ATTCCTGCAGCT-A------TTGAA-------T---T---GA--AAATTCA--TGCATG-----A-------TC---T------TATAT----TAA-TGGCA-----TAGAGATCAA------G-TTT-G-AGTT------ttctcatacatttgacagttttcagaactcttttggctattcctgcagctattgaattgaaaattcatgcatgatcttatattaatggcatagagatcaagtttgagtt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): ACCACAACACAGTGCCCTTTTGTGATCTTTGCCATCACAATGATATCTAGTTTTCA