lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 3333333333 111 111111 55555555555555 2 1111 11 11111111 222 333333 1111111111 11111 11111 2222222 111111 11 111111111111 222222222 4444 1 1 111 44 222222 22222222222222222222222222222222222222 11111 11 5555555555555 2 111 44 11111 22222222222222222222222222 444444444444444444444 22222222222222222222 111 11111 22 6666666 1 22222222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 1 111111 111 444444444444444 3333333 2222222 222 111 111 11 11 11
lowQualScore : 5 1 3333333333 0 66 5 5 5 77 77 5 777 666666 99999999999999 77 5 4 99 4 3333 4 777 00 4 8 66666666 888 5 5 4 0 4 66 000000 4 4 7777777777 4 4 88888 00000 2222222 4 4 777 4 4 555555 5 33 5 66 333333333333 777 666666666 4 4444 4 4 8 0 66 55 5 0 5 4 000 5 555 5 66 4 4 4 33 4 444444 4 4 4 666 88888888888888888888888888888888888888 4 4 4 11111 4 4 1 0 666 4 00 4 55 7777777777777 4 4 1 777 4 111 44 4 4 44 4 44444 3 3 0 4 777 8888 0 99999999999999999999999999 4 55 0 111111111111111111111 1 55 4 1 44444444444444444444 000 00000 66 4 1 4 55 4 4 4444444 5 5 0 55555555555 66 4 66 4 4 9 4 1 55 9999999 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3333 777 5 5 0 5 5 5 5 222222 5 5 4 4 222 1 4 222222222222222 66 777 4 4 4 66 777 4 8 66 5555555 3 4 66 3333333 4 2 5 333 66 88 77 000 5 5 88 000 33 5 0 11 0 88 11
lowQualScore : . . .......... . .. . . . .. .. . ... ...... .............. .. . . .. . .... . ... .. . . ........ ... . . . . . .. ...... . . .......... . . ..... ..... ....... . . ... . . ...... . .. . .. ............ ... ......... . .... . . . . .. .. . . . . ... . ... . .. . . . .. . ...... . . . ... ...................................... . . . ..... . . . . ... . .. . .. ............. . . . ... . ... .. . . .. . ..... . . . . ... .... . .......................... . .. . ..................... . .. . . .................... ... ..... .. . . . .. . . ....... . . . ........... .. . .. . . . . . .. ....... .............................................................. .... ... . . . . . . . ...... . . . . ... . . ............... .. ... . . . .. ... . . .. ....... . . .. ....... . . . ... .. .. .. ... . . .. ... .. . . .. . .. ..
lowQualScore : 7 7 9999999999 2 99 0 0 0 99 99 7 999 444444 33333333333333 99 7 6 00 4 9999 4 888 66 4 9 11111111 555 0 0 4 1 4 11 444444 0 0 5555555555 0 0 00000 00000 2222222 0 0 000 0 0 555555 7 66 0 99 000000000000 888 999999999 4 4444 4 4 9 0 99 44 0 0 0 5 999 0 222 0 99 4 4 4 33 4 000000 4 4 4 999 11111111111111111111111111111111111111 4 4 4 11111 4 4 1 1 222 4 66 0 55 5555555555555 0 0 2 000 0 000 88 4 4 00 4 77777 6 6 9 0 000 5555 7 33333333333333333333333333 0 55 7 444444444444444444444 1 55 0 1 88888888888888888888 888 88888 11 4 1 4 66 4 4 3333333 0 0 0 11111111111 99 4 11 4 4 4 0 9 55 8888888 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4444 666 0 0 0 0 0 0 0 888888 0 0 4 4 222 0 4 000000000000000 11 888 4 4 4 11 888 4 9 11 6666666 4 4 11 3333333 4 5 0 888 99 77 44 000 7 7 44 000 33 2 8 00 8 88 00
consensus : ACCCTAAGT-CCCAA--G-------TTTTG--T-C-GTA-AGT--G--T-T---AAA------AAAA------------TCT--TT-GTTA-CCAN-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA--TAT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-----ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGA---GT--GT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCT-AG--TCAAG---G-G-GATT-GGTATTCT---A-CGAN-C--TA-ATTTTA--AA-CAG-A-TTTAGTGCG-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCTAC-G-AATA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AGC-C-GTCA-TT-CAA---N--TAC-ATACC-ATG-ATTT--ATTA--T----------G-TCTG-CATATATCA-------CGT-CTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA--TT-TC-GTCGC-CACACAAA-A-TGTGGTCTA---CGT-AC---AC-ATATTTCCGT-CA-GTGCGCGGATCAAA--CAA-AG--T--GACAG-G-TGTACTTGTGT-T---CT----CGCACAAA-C-C------AT--A--TT-------TTGT-T--AAATGA-----CTT-------TTCAGTTTTTG--CA-TTGC-AAG--------ACT-----GTTA-A-TTG--TA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACCCTTA--TTTCGA-CACC-CC------TTCA-CA-C-GTAC------T----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCCT-ACACAT--A---CA--AAAC-ATG-----TATGATGA--AACTCACCGG-----CTATCCAATGT-T--TTGC-NCCCAGA-GGTTTTG-CA-TTTC--GG-TAGAA-TTT-TG-TTGT-A-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G---AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---T-CA-AT--T-----AAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAAG--G--GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
Reference ( gi|5 ) : ACCCTAAGT-CCCAA--A-------TTTTG--T-C-GTA-AGT--G--T-T---AAA------AA--------------TCT--TT-GTTAACCAA-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA--TAT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-----ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGA---GA--GT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCT-AG--TCAAG---G-G-GATT-GGTATTCT---ACCGAC-C--TA-ATTT----AA-CAG-A-TTTAGTGCG-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCTAC-A-AATA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AGC-C-GTC--TT-CAA---C--TAC-ATACC-ATG-ATTT--ATTA--T----------G-TCTG-CATATATCACTCGTCGCGT-CTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA--TTATC-GTCATGCATACAAA-A-TGTGGACTA---CGT-AC---AC-ATATTTCCGT-CA-GTGCGCGGATCAAAACCAA-AG--T--GACAG-G-TGTACTTGTGT-T---CT----CGCACAAA-A-C------AT--A--TT-------TTGT-T--AAATGA-----CTT-------TTCAGTTTTTG--CA-TTGCAAAG--------ACT-----GTTA-A-TTG--TA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACCCTTAT-TTTCGA-CACC-CCATAA--TTCA-CA-C-GTAC------T----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCCT-ATACAT--A---CA--AAAC-ATGT---ATATGATGA--AAC-CACCGG-----CTATCC--TGT-T--TTGC-CCCCAGA-GGTTTTG-CA-TTTT--GG-TAGAA-TTT-TG-TTGT-A-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G---AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---T-CA-AT--T----AAAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA---G--GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCTTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
gi|1 : ACCCTAAGT-CCCAAGTA-------TTATG--TTC-GTACAGT--G--TGT---AAA------AAAAA-----------TAT--TTCGTTTACCAT-GG-TAA----CTACGAATCATT---TAACAA-TGG-------T--------ATGTA--TAT-TTTC-GATAATCACAAGAT--CAATCTCATAGTAATGACAATGGATG-TGC----------GCACA-CAC-AAT-T-----TG-------A---GT--GT-TT-C---ACG-ATA-GTT-----CCAGTA--GCCT-AGGATCAAA---GAG-GTTT-TGTATTCTTTAAGAGA-----TA-ATTT----AAACAG-ACTTTAGTGCGAGAGAGAGTCGTT-CGA-T-CACTCCTACGA-AATA-CAATTG--AA-TGCAATGTACC-AGC-C-GTCA-TT-CAA---G--TACTATACC-ATG-ATTT---TTAATT----------G-TCTGGCA-ATATT--TCATCG--T-CTAAACCACCT-CGCCCGTGTTTTACTGATGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA----ATT--TCGTACACACAAATA-TGTGGTCTA---CGT-AC---ACAATATTTCCGT-CATGTGCGCGAATCAAA--CAA-AGC-T--GACAG-GTTGTACTTGTG--T---CT----CGCACAAA-ACC------ATC-A--TT-------TTGTATTAAAATGA-----CTT-------TGCA---TATG--C-----CAAAG----------T-----GTT--A-TTG--TA-AGGACCAT-ATGCAC-TAGACCCTTTA-TTTCGA-TACCACCGT----CTCA-CAGC-GTAC-----------T--CATAGC--AC-AA-AGCCCTCGTACAC--AGGGCA--AAAC-------------ATGA--AAC-TA---A-----CTA--C--T-----------CCTCA-A-GTTTTTG--G-TTTC--GA-T-GAA-TTTCTGATGGT-A-TA-GTAA--T---C-ATCCA-GTA-TTTTATATG-GGAAG-ACA--AC-GTATAT--GA--C---A--T-TC-TTT--TT---T-CACAT--T------AAAGAAAAGGTAG--AGC------TG-TGT-CAA---GGTGAT--CCTACA---TC-CCCACCCCTCCAGAGGCA---GGG-CACTCACTTGCTATACTTAGG--TT
gi|4 : tatgtacaggagtgcaccgtttttaccaaaaggtcgtaagtcctaaacttatcgtaagacataacttcgatgtacgacaggttgtacaaagaattttagacttacgggtatactgacgaaattcgcttcgtaagtttctacaaccgcccgggggcgACCCTAA-T-CCTAA-------------TGATC-C-GTA-TGT--G--T-C---AAA------AAAA------------TCTATCT-ATTACATAT-GG-TAA----TTAC-AATAA-T---CAAGA--T-G-CTGCCAT--------TTCtcgt
gi|8 : tccagggcccgtttctacaaaagtcgtaagttcctaactactctaagcataattcttcgactatacgaccgtctacaaagatttacttacgagttacgacgaaagttcagtcgctaagttacggaccgcccgggcgCCCTAAGT-CCCAA--G-------TTTTG--T-C-GTA-AGT--G--T-T---AAA------AAAATCTAAAAAAAAATCT--TT-GTTA-CCAT-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA---AT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA------TGATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AGCGT-----TG-----CGA---GT--GA-TT-C-----G-A-A-GT------CCA-TATAGCCT-AG--TCAAG---G-G-GATT-GGTATTCT---AC-GAG-C--TA-ATTTTA--AA-CAG-A-TTTAGTTCG-GAGAGA--TGTT-AGA-TTCA-TTCTAC-G-AATA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AGC-C-GTCA-TT-CAA---G--CAC-ATAC--ATG-ATTT--ATTA--TT---------G-TCTG-CATATATCAT------CGT-CTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-CC-TCTGAT-AA--TTTCT-GTC-T---CACAAA-A-TGTGGTCTA---CGT-AC---AC-ATATTTCCGT-CA-GTGCGTGGATCAAA--CAA-AGAAG--GACGG-G-T---CTTGTGT-T---CT----CGTAC-AA-A-C------AT--A-----------TTGT-T--AAATGA-----C---------------TTTTG--CA-TTGC-AAG--------ACT-----GTTA----TA--T----GA--AT-ATGCAC-TAAGACCTTA---TTCGA-CACC-CTACAgctaaaacacacaagtatgcatgcgagtgtcttcacgtatagttccccgattactcgtatatccattatgaactaattgatttggtattagtcaaggaaaatgagatcctaacgaccgccaattttaaacagcatttgcggagaatgtatatcatcttcaatacaaatttaaatctgtaccagccgtcattttaaaagctacataccatgatttattatatattatattgtctgcaaaatcatactaaccacctcttgtttacttttacaatgcgtcatcttcctctataaatttacgtcacacaaaattgtggtctacgtaaacatgattccgtcagtcgccgatcaaacaacagtgacactgaacggtgttctcgcacaaaccatactctttgtaaatgaaaatggttctgacttttgccattttaagactgttaattaacaaaaatatgcactagacccttatttcgacaccccttcaccatgtacttcatgaacaaaccatacacatcgataaaacaatgtcaaatacaatgaacttggaaatattattcgattaatcacgtaccaatgttttgtagaatttttataatcaacaggtatttatgaaaaaactgtactgttttcttttttcaattaagaaaaaagtgagtat
gi|2 : CCCTAAGTTCCCAA--GGAGTGTGTTGTG--T-CAGTA-GGT--GATT-T---AAAGAAAGAAA--------------TCT--TT-GTTA-CCAATGG-TAAATTATCAC-AATCCTTGATCCACAGCTGGACTGTCATAGTAAATTTTCTAATTATTGTTCTGATC-T-ACAA-AA--CAATCTCA------TAATAA-TGATG-T-C----------AAACA-CACTAACGTA----TG-----CGA---GAT-GT-TT-CCACACG-ATAAGT------CCA-TAA-GCCT-AG--TCAAGTTGG-GCGATTTGGTATTCT---ACCGAG-CA-TA-ATTTTTTAAG-CAG-ACTTTAGTGCGAGAGAGA--TGTTTAGAATACA-TC-TAC-GGAATAACAATCTGTAAGTGC--TGTACC-AGCGT-GCCA-TTACAAG--T--TAC-ATACCCATG-ATTTTAATTG--T------------TCTG-CATAT-TTACTATTTG--T-CTAA-C-ACTC-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTG-T--A--TT-TC-GCCGT-CACAC-AA-A-TGTGG--TA---A---AC---AC--TATTTCCGcatacaaaacatgaaactcactatccaatgttttggtagtatttatgaggaagaaacgatattgcatttctttttttcagtttaaaaaaaaaggtgagtgcaatatgtgttaagggatccctaacgggggggggggggggtcactttatattaggttgta
gi|3 : ccattttcttaagtgtaaggacgcatatggttataacgaatgtatgtcaatcgttatttaaaccaagattgatagggatttatgggtctacaacgaaaatcttgggaggtctaagtctacgaccgcaacgggggcacgatCCTAAGT-CCCAG----------TTTTG--T-C-GTC-AGCTGG--T-TCC-AAA------AA--------------TCT--TT-ATTA-CCAA-GGGTACC---TTAC-AATC-TT---CA-CA--TGG-CTG-CAT--------TTCC---TAT-GTTC-GATA-TCACAA-----CA-TCTCA------TATT----GATG-TGC----------GA-CATCAC-AACGTA----CG-----CGA---GT--GT-TTTC---ACG-ATA-GTTATAAGCC--TG--GCCT-AG--TCAAG---G-G-GAT--GGTATTCT---A--AGCAC--TACATTTTA--AA-C-G-A-TTTAGTGCG--AGCGC--TGTT-AGA-T-CA-TC-TAC-A-AATA--ACTTT-TAA-TGC--TGTAC--AGC-CCGTCA-TT-CAA---C--TAC-ATACC-ATG-CTTT--ATTA--TTC--------G-TCTA-GAT----------T----T-TTAA-ACAACT-T-----TGTTT--CTG-T--ACA-TGTGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA--TT--C-GTCA--CA-ATAAA-T-CGTGGCTTAACCCGT-ACC--AC-ATATTTCCGTTCA-GTGCGCGGATCAA---CAA-AG--T--GGCCG-G-TG-ACTTGTGT-TTATCT----CGCACCAA-C-C------AT--A--T--------------------GA-----CTT-------TTCAGTTTTGC--CA-TTGCCA-G--------ACT-----GTTA---TTG--TC-GG----AT--TGCACGTAGACC-TTAT-T----G-CACG-C-------TTCA-CA-C-GTA-------T----T--CAT-GC--AC-CA-G---CT-ATACAT--A---CA--AAAC-ATTT---G-ATG--GA--AAA-CTCCGG-----CT-TACAATGG-T--TTGC-ACC---A-GGGTTTG-CA-TTTTTTGG-TAGAA-TTT-TG-TTGT-A-TA-GTAA--T---C----CA-GTA-TT---TATGAGGAAGTA-A--AC-AGATAT--TGGCC---AT-TATC-TTT--TT---C-CA-AT--T----AAAAAA-----GT-G--AG-------TG-TGT-TCG---G--GATA-CCTA-ACCCCC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GAC-CACTCATTT--TAT--TTAGGGCTTGTgatgtacttatgttctgcgccacaccaaaccatattttgttatggctctcttttggccatttaaagctcagcggactatatagttaaattgcgtaaggaatatgcactagacctctctatttcgaacacccttcatacgtacccctacttcatgggtacaagtctctaaaccatataatgatgaacacttcctatcacattgtcatttgggtagattttatattgttatagtaatcatcagtatttatgaggggcatttctttttccaccaattaaaaaacggtttgtgttgttaagtgggatcgcctaattgcccgccgtccgggggtgggattcacttttattcggttgta
gi|6 : ggcccgttttctaaaggtcgtaagtcctacaccttagtcgtacgacatgctacgatgtacgccgttttacaaagattctaggacttgccgggcttaacgacgaaatgtcggtcgtaagtactagcgagcccgggggcgaCTAAGT-CC-AA--G-------TTTTG--T-C-GTA-AGT--G--T-TTAAAAA------AA--------------TCT--TT-GTTA--CAA-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-AAT--------T-CTA---AT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCT-------ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGA----A--GT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCTAAG--TCAAG---G-G-TA-T-GGTATTCT---A-CGAC-T--TA-TTTTA---AA-CAG-A-TTAAGTGCG-GGAGGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCTAC---AATA-CAATTT-TAA-TGC--TGTA-C-AGC-C-GTCA-TT-CAA---C--TAC-ATA-C-ATG-ATTT--ATTAT-T----------GTTCTG-CATATATC--------TGT-CTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA---TC-C--TCTGA--AA--TT-TC-GT----CACACAAA-A-TGTGT-CTA---CGTAAC---AC-ATATTT-CGT-CA-GTGCGCGGATCAAA--CAA-GA--T--GACAGAG-TGTACTTGTGT-T---CT----CGC-CAAA-C-C------AT--A--TT-------TGGT-T--AAATGA-----CTT-------TTCAG-TTTTG--CA-TTGC-AAG--------ACT-----GTTA-A-TTG--TA-AGGA--ATCATGCAC-TAGACCCTTA---TTCGA-CACC-CC------TTCA-CA-CTGTAC------T----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCCT-ATACAT--A---C----AAC-ATG-----TATGATGA--AACTCACCGG------TG-CCAATGT-T--TTG--CACCAGA-GGTTTTG-CA-TTTT--GA-TAGAA-TTT-TG-TTGT-A-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTATTT---TATGAGG-AG-A-ACGAC-GAT-AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---T-CA-AT--T------AAAAAAAGGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA---G--GGAT-CCTA-A---CC-CCC-CC---TCGGGGGGA---GGT-CA-TCAC-T--TATA-TTAAG--GTGTag
gi|16 : TAAGT-CCTAA--A-------CTTAG--T-C-GTA-AGa
gi|7 : gggcccgttttacaaaagatcgAA--G-------TTTTG--T-C-GTA-AGT--G--T-T---AAA------AAAA------------TCT--TT-GTTA-CCAA-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA---AT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA------TAAGAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGA---AA--GT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCT-AG--TCAAG---G-G-AATT-GGTATTCT---A-CGAC-C--AA-ATTTTA--AA-CAG-A-TTCAGTGCG-GACAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCTAC-A-AATA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACCAAGC-C-GTCATTT-CA--------AT-ATACC-ATGTATTT--ATTAT-T----------G-TC-G----ATATTACTT----CGT-TCAA-ACACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-CCGTCTGATCAA--TTTTCGGTCACACA---AAA-G-TGTGGTCTA---CGT-AC---AC--TATTTCC-T-CA-GTGCGCGGATCAAA--CAA-AG--TGGGACAG-G-TGTACTT-TGT-G---CT----CGCACAAACC-C------AT--A---T-------TTGT-T--AAAGGA-----CTT-------TTCAG-TTTTG--CATTTGC--AG--------AC-------TTA-A-TTG--TA-AGG---AT-AT-CAT-AAGACCCTTA--TTTCGA-CACC-CC------TTCA-CA-CGGTAC------TATTAT--CCT-TA--AC-AA-A-CTCT-ATACAT--A---C---AAAC-ATG-----TATGATGA--AACTCATCGG------TATCCA-TGT-T--TTGC-ACCCAGAGGGTTTTG-TA-TTTT--GGTTAGAC-TTT-TG-TTGT-ATTA-GTAA--T---CGAT-CA-GTA-TT---TATGAGGAGA-A-G--AC-G---ATTGTG--C---AT-T-TCTTTT--TT---T-CA-AT--T-------AAAAAAAGGT-G--AG-------TG-T-T-TAAG--G--GATC-CCCT-A---CC-CCC-CCCCTCCAGGGGGA---acataacttatgatgtacgatgaaggccgcgatttacaaaaac
gi|15 : ACTAT-GG-TAA----TTAA-AATCATT---CAAGA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA-----------------------AT---AATCTCA------TAATAA-AGACG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGATGCGAGTGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CC
gi|13 : t-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTTTA---AT-GTTC-GATG-CCACAA-AT--CAATCACA------TAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-TAC-AATGT-----TG-----CGA---TT--GT-TT-C---ACA-ATA-GT------CCA-TA--ACCT-AG--TCAA-------------GGTATTAT---A-CGAG-C--TA-ATTTTA--AA-CAG-A-c
gi|4 : TA-TTACAT-ATGGTAATTACA-----ATAATCA-AGATGCTGCCATTTCGCTAAAACA-CAC-AA-GTATGCATG-----CGA---GT--GTCTT-C---ACGTATA-GT------TC
gi|17 : tccagggcccgtttctacaaaagtcgtaagttcctaactactctaagcataattcttcgactatacgaccgtctacaaagatttacttacgagttacgacgaaagttcagtcgctaagttacggaccgcccgggcgaccctaatcctaatgatccgtatgtgtcaaaaaaatctatcA-----ATAATAA-AGACG-TGA----------GAACA-CAG-AACGT-----TGCATTCCGA---GT--GT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCcccgattactcgtatatccattatgaactaattgatttggtattagtcaaggaaaatgagatcctaacgaccgccaattttaaacagcatttgcggagaatgtatatcatcttcaatacaaatttaaatctgtaccagccgtcattttaaaagctacataccatgatttattatatattatattgtctgcaaaatcatactaaccacctcttgtttacttttacaatgcgtcatcttcctctataaatttacgtcacacaaaattgtggtctacgtaaacatgattccgtcagtcgccgatcaaacaacagtgacactgaacggtgttctcgcacaaaccatactctttgtaaatgaaaatggttctgacttttgccattttaagactgttaattaacaaaaatatgcactagacccttatttcgacaccccttcaccatgtacttcatgaacaaaccatacacatcgataaaacaatgtcaaatacaatgaacttggaaatattattcgattaatcacgtaccaatgttttgtagaatttttataatcaacaggtatttatgaaaaaactgtactgttttcttttttcaattaagaaaaaagtgagtat
gi|4 : ggctgcatttctaatT-AG--TCAAG---G-A-AAAT-GAGATCCT---AACGAC-CGCCA-ATTTTA--AA-CAGCA-TTT---GCG-GAGA-A--TGT--ATA-T-CA-TCTT-C-A-A-TA-CAAATT-TAA-ATC--TGTACC-AGC-C-GTCATTT-TAAAAGC--TAC-ATACC-ATG-ATTT--ATTA--TATATTATATTG-TCTG-CA-AAATCA---------TACTAA-CCACCTCT-----TGTTT-ACT--TTTACAATGCGTCATC-TTCC--TCT-AT-AAATTTA-C-GT----CACACAAA-ATTGTGGTCTA---CGT-AA---AC-ATGATTCCGT-CA-GT-CGCCGATCAAA--CAACAG--T--GACA--C-TGAAC-GGTGT-T---CT----CGCACAAA-C-C------AT--ACTCT-------TTG--T--AAATGAAAATGGTT-------CTGACTTTTGC--CA-TTTT-AAG--------ACT-----GTTA-A-TTA--AC-AAAA--AT-ATGCAC-TAGACCCTTA--TTTCGA-CACC-CC------TTCACCA-T-GTAC------T----T--CAT-GA--AC-AA-A-CCAT-ACACATCGA---TA--AAACAATGTCAAATACAATG---AAC---TTGGAAATATTATTC--GAT-TAATCACGTACCA-A-TGTTTT------------G-TAGAA-TTT-T-----T-A-----TAA--T---C-AA-CAGGTA-TT---TAT---GAAA-A-A--ACTGT--AC--TG--T----T-T-TC-TTT--TT---T-CA-AT--T----AAGAAAAAA--GT-G--AG-------TA-Tcccggatagt
gi|10 : tccagggcccgtttctacaaaagtcgtaagttcctaactactctaagcataattcttcgactatacgaccgtctacaaagatttacttacgagttacgacgaaagttcagtcgctaagttacggaccgcccgggcgaccctaatcctaatgatccgtatgtgtcaaaaaaatctatctattacatatggtaattacaataatcaagatgctgccatttcgctaaaacacacaagtatgcatgcgagtgtcttcacgtatagttccccgattactcgtatatccattatgaactaattgatttggtatTTCT---AGTTAA-C--TG-ATTT----A--------TTTAGTGCA-GGGAGA--TGTA-AAA-T--A-TCCTAC-A-AAAA-GAAGG---AA-GGC--TGTGCC-AGC-T-GCCA-TT-AAA---G--TAC-GTACC-ATG-ATTT--GTTAT-T----------G-TCTG-CATACAT--------GCGT-C----CCACCT-T-----TGTT--------------TGCGTCA-CATT-A--TCTGGT-AA--CT-TC-GTCAC-----CAAA-A-CGGTGCTTA---CGT-GTAGAAC-ATGTTGCCGT-CA-GTGGGCGGATC-AAACAAA-AG--C--GGCAG-G-TG
gi|18 : TACC-AGC-C-GTCA-TT-TAA---AAGTAC-ATACC-AT---------------------------------ATATAT-----------T-CTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGcgtgccataacttttcaatgcattttttaaagtatgcatggcacccttttacatggacat
gi|14 : -C--TCTGAT-AA--TT-TC-GTCAC----ACAAA-A-TGTGATCTA---CGT-AA---AC-AT--TTCCGT-CA-GTGCGTGGATCAAA--CAA-AG--T--GACAG-G-TGTACATGAGT-T---CT----CGCACAAA-C-CCTGTTAAT-----TT-------TTGT-T--AAATAA------TG-------TTGA-CTTTTG--CA-TT
gi|11 : cAT-AA--TT-TT-GTCA--CATA--AA-A-TGTGGTCTG---CGT-AA---AC-ATATTTTCGT-CA-GTGCGCGGATCAAA--CAA-AG--G--GACAG-G-TGTACTTGTGT-T---CT----CGCACAAA-C-C------AT--A--TT-------TTGT-T--AAATGA-----T-------------ATATATG--CA-TTGC-AAG--------ACT-----ATTA-A-TTA--AG-AGAA--AT-ATGCGC-TAGACCCTTA--TTTCGA-CACT-CC------TTCA-CA-C-ATAC------T----T--CAT-GG--AC-AA-AGCCAT-ACAAAT--A---CATGAAAC-TTG
gi|2 : CGG-A-TGTACTTATGT-T---CTGCGCCACACCAA-A-CC-----AT--A--TT-------TTGT-T--A--TGG-----CTC-------TC----TTTTGGCCA-TT-TAAAGCTCAGCGGACTATATAGTTA-AATTGCGTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACCTCTCTATTTCGAACACC-C-------TTCA-TA-C-GTACCCCTACT----T--CAT-GGGTAC-AA-GTCTCT-A---------------AACC-ATAT---A-ATGATGA--A---CACT----------TCC--TAT----------CACA-------TTGTCA-TTTG--GG-TAGAT-TTTATA-TTGTTA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGG--------------------G--C---AT-T-TC-TTT--TTCCAC-CA-AT--T-------AAAAAACGGT-T--TG-------TGTTGT-TAAGTGG--GATCGCCTA-A---TTGCCC-GCCGTCCGGGGGTG---GG---ATTCACTT--T-TA-TTCGG--TTGTgaagttctctatcaaataacactattgatcgattatcactatccaatgtttt
gi|9 : ccattttcttaagtgtaaggacgcatatggttataacgaatgtatgtcaatcgttatttaaaccaagattgatagggatttatgggtctacaacgaaaatcttgggaggtctaagtctacgaccgcaacgggggcacgatccctaagttcccaaggagtgtgttgtgtcagtaggtgatttaaagaaagaaatctttgttaccaatggtaaattatcacaatccttgatccacagctggactgtcatagtaaattttctaattattgttctgatctacaaaacaatctcataataatgatgtcaaacacactaacgtatgcgagatgtttccacacgataagtccataagcctagtcaagttgggcgatttggtattctaccgagcataattttttaagcagactttagtgcgagagagatgtttagaatacatctacggaataacaatctgtaagtgctgtaccagcgtgccattacaagttacatacccatgattttaattgttctgcatatttactatttgtctaacactcttgtttactgtgtacaatgcgtcacttctctgtatttcgccgtcacacaaatgtggtaaacactatttc-G-TGTACTTCTGTGT---CT----CGCACAAG-C-C------ATCTA--TCCAATGTGTGGT-T--AGA-AA-----CTTCTAAAATTTCAGTTG--G--CA-T-GCAA-G--------AC------GTTATA-ATG--TATAGGA--AT-AT-CA--TA-ACCCTTAT-AT-CGA-C----TCACAAGCCTCA-CA-C-G-AT------G----TAACAT-GA--ACCAACAGCCCT-ACACAT--A---CA--AAAC-A----------GATGAGTAACGCA-CAA-----C-AT----TGTAT--ATAA-ACGCA----TTTTTG-C-----C--AG-TAGAA-TTA-AG-TTGT-A-TAGGTAAAGTTCAC-AT-CA--TA-TT---ATTGATGGTG-G-G--TC-G---ATA-TG--TCTAAT-T-TC-TTTTCTT---T-CATATAATGAAAAAAAAAAAAAGAG-G--AGT------TG-TGTGTAA---G--Ga
gi|12 : AT-CA--AC-AA-AGCCCT-ATACAT--A---CA--AAAC-ATG-----TATGA-GA--AACTCATCGG-----C-ATCCAATGT-T--TTGCACCACAGA-GGTTTTG-CATTTTT--GG-TAGAATTTT-TG-TTG--A-TA-GTAA------C-AT-AA-A-A-TTA--TATGAGGAAG-A-A-----G---ATAATG--C---ATAT-TC-TTT--TT---T-CA-AT--T-------AAAAAAAGGT-GATAG-------TG-T-T-TAAG--G--GATC-CCT--A---CC-CCC-CCCTTCCGGGGGGAACCGGGCCACTCAC
gi|8 : CCCT-ACACAT--A---CA--AAAC-------------ATGA--AACTCA---------CTATCCAATGT-T--TTG
gi|8 : ccctaagtcccaagttttgtcgtaagtgttaaaaaaatctaaaaaaaaatctttgttaccatggtaattacaatcattcaacatggctgcatttctaatgttcgatatcacaaatcaatctcatgataaagatgtgcgaacacacagcgttgcgagtgattcgaagtccatatagcctagtcaaggggattggtattctacgagctaattttaaacagatttagttcggagagatgttagattcattctacgaatacaattttaatgctgtaccagccgtcattcaagcacatacatgatttattattgtctgcatatatcatcgtctaaccacctttgtttactgtgtacaatgcgtcacttcctctgataatttctgtctcacaaaatgtggtctacgtacacatatttccgtcagtgcgtggatcaaacaaagaaggacgggtcttgtgttctcgtacaaacatattgttaaatgacttttgcattgcaagactgttatatgaatatgcactaagaccttattcgacaA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G---ATATTG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TTCA-GT--T----TAAAAAAAAAGGT-G--AGTGCAATATG-TGT-TAAG--G--GATC-CCTA-A---C-----------GGGGGGGGG---GGG-GGGTCACTT--TATA-TTAGG--TTGTgtagtatttatgaggaagaaacgatattgcatttctttttttcagtttaaaaaaaaaggtgagtgcaatatgtgttaagggatccctaacgggggggggggggggtcactttatattaggttgta
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): AAGTCCTAAACTTACTTGCAAGACATATACTTACAAAGTAAGGGCCACTTTACAAAGAT
Unaligned ( gi|20 ): CATTTTACAAAAGATCGCAAGTCCTAAACTTAGTCATAAGACATAAC
Unaligned ( gi|21 ): GGGCCCCTTTTTACAAAAAGTCGTAAGTCCTAGACCTAGTC
Unaligned ( gi|22 ): GGCCCGTTTTACAAAAGGTCGTAAGTCCTAAACTTA
Alignments
lowQualScore : 1111111 11 444444444444 1111 11111111 222 222222 1111111111 22222 111111 11 111 111 1111111 11 4444444444444444444444444444444444444444444 11111 22222 11111 111 33333333333333333 44444444444444444444 11111111 111111 11111111 11111111 4444444444444444444 333333333333333333333333333 111111 1111 111111 111 3333333 222222 2222222 11 11
lowQualScore : 5 6666666 5 5 66 5 5 5 66 11 5 111111111111 66 5 4 4 4 55 4 2222 4 777 99 4 8 44444444 444 4 4 4 4 55 666666 3 3 5555555555 3 3 55555 99999 33 3 3 666 3 3 444444 66 00 4 55 888888888888 3 666 55 111 55 4 88 3 111 3 7 3333333 8 55 44 8 4 4 1 4 00 4 8 4 4 66 4 4 4 4 4 8888 77777 4 4 4 55 2222222222222222222222222222222222222222222 4 4 00000 4 4 4 4 4 99 7 3 3 44444 3 3 7 0 666 3 88888 3 3 3 55 3 3 22222 3 3 000 7777 3 3 3 11111111111111111 6666 22222222222222222222 55 3 3 44 44444444 000000 888 55 88 55 4 4 4 4 4 44 4 4 66666666 4 4 66666666 99999 55 55555 3 3 8 666 1 3 55 777 4444444444444444444 55555 666666666666666666666666666 33 55 3 0 2 777777 1111 4 4 4 8 4 4 4 4 000000 4 4 4 4 111 4 66666 4 2222222 55 777 4 4 8 55 777 8 4 55 999999 4 55 1111111 4 1 4 66 4 00 55 888 5 5 3 888 00 3 99 6 99
lowQualScore : . ....... . . .. . . . .. .. . ............ .. . . . . .. . .... . ... .. . . ........ ... . . . . .. ...... . . .......... . . ..... ..... .. . . ... . . ...... .. .. . .. ............ . ... .. ... .. . .. . ... . . ....... . .. .. . . . . . .. . . . . .. . . . . . .... ..... . . . .. ........................................... . . ..... . . . . . .. . . . ..... . . . . ... . ..... . . . .. . . ..... . . ... .... . . . ................. .... .................... .. . . .. ........ ...... ... .. .. .. . . . . . .. . . ........ . . ........ ..... .. ..... . . . ... . . .. ... ................... ..... ........................... .. .. . . . ...... .... . . . . . . . . ...... . . . . ... . ..... . ....... .. ... . . . .. ... . . .. ...... . .. ....... . . . .. . .. .. ... . . . ... .. . .. . ..
lowQualScore : 7 2222222 0 0 99 0 0 0 99 99 0 222222222222 99 0 4 4 4 44 0 5555 0 000 55 0 0 55555555 333 4 4 0 0 55 888888 6 6 9999999999 6 6 55555 11111 88 6 6 444 6 6 111111 33 66 0 55 000000000000 6 444 00 555 00 5 66 6 555 6 3 0000000 0 55 99 0 0 0 6 0 44 0 0 0 0 11 0 0 0 0 0 5555 99999 0 0 0 55 2222222222222222222222222222222222222222222 0 0 00000 0 0 4 4 0 55 3 6 6 33333 6 6 3 5 444 6 33333 6 6 6 00 6 6 55555 3 3 000 7777 6 6 6 55555555555555555 3333 77777777777777777777 00 6 6 77 55555555 888888 888 55 77 55 0 0 0 0 0 88 0 0 00000000 0 0 11111111 22222 55 77777 6 6 2 444 8 6 00 111 3333333333333333333 55555 888888888888888888888888888 55 00 6 1 6 222222 4444 4 4 4 9 4 4 4 4 333333 4 4 0 0 000 0 88888 0 3333333 55 000 0 0 0 55 000 0 0 55 555555 0 55 0000000 0 1 4 11 4 66 44 888 0 0 4 888 00 0 22 7 22
consensus : ACCCTAAGT-CCCAAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-TAAAAAAA------------TC--TTT-GTT-A-C-CAN-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA--TAT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-----ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCT-AG--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--A-C-G--AGC--TA-ATTTT--AAACAG-A-TTTAGTGC-------G-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACG-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAN--T-AC-ATACC-ATG-ATTT--ATTAT-T----------G-TCTG-CA-TATATCA-------C-----GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-TT-TCGTCGT-CACACAAA-A-T-GTGGTCTA---CGT-A-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTTTG--CA-T-TGC-AA--------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TA-TTTCGACAC-C-C---C----TTCA-CA-C-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TACACA-T--ACA--AAAC-ATG---------T-AT--GATG--A--AAC---TCACCG------G-----CTATC-CAAT--GT-TTTGCACC-CAGA-GGTTTTGCA--TTTCGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G---AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-----AAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA--GG-GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
Reference ( family-2715 ) : ACCCTAAGT-CCCAAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-TAAAAAAA------------TC--TTT-GTT-A-C-CAN-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA--TAT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-----ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCT-AG--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--A-C-G--ANC--TA-ATTTT--AAACAG-A-TTTAGTGC-------G-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACG-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAN--T-AC-ATACC-ATG-ATTT--ATTA--T----------G-TCTG-CA-TATATCA-------C-----GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-TT-TCGTCGC-CACACAAA-A-T-GTGGTCTA---CGT-A-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTTTG--CA-T-TGC-AA--------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TA-TTTCGACAC-C-C---C----TTCA-CA-C-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TACACA-T--ACA--AAAC-ATG---------T-AT--GATG--A--AAC---TCACCG------G-----CTATC-CAAT--GT-TTTGCNCC-CAGA-GGTTTTGCA--TTTCGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G---AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-----AAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA--GG-GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
gi|1 : ACCCTAAGT-CCCAAG-------TATTATG--TTC-GTACAGT--G--TGTAAAAAAAA-----------TA--TTTCGTTTA-C-CAT-GG-TAA----CTACGAATCATT---TAACAA-TGG-------T--------ATGTA--TAT-TTTC-GATAATCACAAGAT--CAATCTCATAGTAATGACAATGGATG-TGC----------GCACA-CAC-AAT-T-----TG-------AG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GTT-----CCAGTA--GCCT-AGGATCAAA---GAG-GTTT-TGTAT-TC---TTTA-A-G--AGA--TA-ATTT---AAACAG-ACTTTAGTGC-------GAGAGAGAGTCGTT-CGA-T-CACTCCT-ACG-AAATA-CAATTG--AA-TGCAATGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAG--T-ACTATACC-ATG-ATTT---TTAATT----------G-TCTGGCAATATTTCAT------C-----GTCTAAACCACCT-CGCCCGTGTTTTACTGATGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGATAAA-TT-TCGT--A-CACACAAATA-T-GTGGTCTA---CGT-A-C---ACAATATTTCCG-TCATGTGCGCGAATCAAA--C-AA-AGC-T--GACAG-GTTGTACTTGTG----TCT----CGCA-CAAAA-CCATC-A-----TT-------TTGTATTAAAATGAC---------------------TTTG--CA-TATGC-CA--------AAGT-----GTT---ATT--GTA-AGGACCAT-ATGCAC-TAGACC-CTT-TA-TTTCGATAC-CAC---CGT--CTCA-CAGC-G------TAC-----T--CATAGC--AC-AA-AGCCCTCGTACACAGG--GCA--AAAC--------------------ATG--A--AAC---TAAC-------------------------------TACTCC-TCAA-GTTTTTG-G--TTTCGA-T-GAA-TTTCTGATGG-TA-TA-GTAA--T---C-ATCCA-GTA-TTTTATATG-GGAAG-ACA--AC-GTATAT--GA--C---A--T-TC-TTT--TT---TCACA-T--T------AAAGAAAAGGTAG--AGC------TG-TGT-CAA--GGTGAT--CCTACA---TC-CCCACCCCTCCAGAGGCA---GGG-CACTCACTTGCTATACTTAGG--TT
gi|10 : tatgtacaggagtgcaccgtttttaccaaaaggtcgtaagtcctaaacttatcgtaagacataacttcgatgtacgacaggttgtacaaagaattttagacttacgggtatactgacgaaattcgcttcgtaagtttctacaaccgcccgggggcgT-TC---T--A---GTTAAC--TG-ATTT----------A-TTTAGTGC-------A-GGGAGA--TGTA-AAA-T--A-TCCT-ACA-AA-AA-GAAGG---AA-GGC--TGTGCC-AG-C-TGCCA-TT-A----AAG--T-AC-GTACC-ATG-ATTT--GTTAT-T----------G-TCTG-CA-TACAT-G-------C-----GTC----CCACCT-T-----TGTT--------------TGCGTCA-CATT-A--TCTGGT-AA-CT-TCGTCAC-CA---AAA-C-G-GTGCT-TA---CGT-G-TAGAAC-ATGTTGCCG-TCA-GTGGGCGGATCAAA--CAAA-AG--C--GGCAG-G-TGtcgt
gi|11 : AT-AA-TT-TTGTC----ACATAAA-A-T-GTGGTCTG---CGT-A-A---AC-ATATTTTCG-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--G--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAT------------------ATATATG--CA-T-TGC-AA--------GACT-----ATT-A-ATT--AAG-AGAA--AT-ATGCGC-TAGACC-C-T-TA-TTTCGACAC-T-C---C----TTCA-CA-C-A------TACT----T--CAT-GG--AC-AA-AGCCA---TACAAA-T--ACATGAAAC-TTGGAAGTTCTCT-ATCAAATA--A--CACTATTGATCGATTATCA-----CTATC-CAAT--GT-TTTcgtgccataacttttcaatgcattttttaaagtatgcatggcacccttttacatggacat
gi|12 : AT-CA--AC-AA-AGCCC---TATACA-T--ACA--AAAC-ATG---------T-AT--GA-G--A--AAC---TCATCG------G-----C-ATC-CAAT--GT-TTTGCACCACAGA-GGTTTTGCAT-TTTTGG-TAGAATTTT-TG-TTG--A-TA-GTAA------C-AT-AA-A-A-TTA--TATGAGGAAG-A-A-----G---ATAATG--C---ATAT-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-------AAAAAAAGGT-GATAG-------TG-T-T-TAA--GG-GATC-CCT--A---CC-CCC-CCCTTCCGGGGGGAACCGGGCCACTCAC
gi|13 : -TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTTTA---AT-GTTC-GATG-CCACAA-AT--CAATCACA------TAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-TAC-AATGT-----TG-----CGAT-TGT-TT-C---ACA-ATA-GT------CCA-TA--ACCT-AG--TCAA-------------GGTAT-TA---T--A-C-G--AGC--TA-ATTTT--AAACAG-A-
gi|14 : -C--TCTGAT-AA-TT-TCGTC----ACACAAA-A-T-GTGATCTA---CGT-A-A---AC-AT--TTCCG-TCA-GTGCGTGGATCAAA--C-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACATGAGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCCT--GTTAATTT-------TTGT-T--AAATAA------TG-------TTGA-CTTTTG--CA-T-T
gi|15 : cT-A-C-TAT-GG-TAA----TTAA-AATCATT---CAAGA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA-----------------------AT---AATCTCA------TAATAA-AGACG-TGC----------GAACA-CAC-AACGTTGCGATG-----CGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CC
gi|17 : A-----ATAATAA-AGACG-TGA----------GAACA-CAG-AACGT-----TGCATTCCGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCc
gi|18 : ggctgcatttctaatTACC-AG-C-CGTCA-TT-T----AAAAGT-AC-ATACC-AT---------------------------------A-TATAT----------------TCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGcccggatagt
gi|2 : CCCTAAGTTCCCAAGGAGTGTGT-TG-TG--T-CAGTA-GGT--GATT-TAAAGAAAGAAA--------TC--TTT-GTT-A-C-CAATGG-TAAATTATCAC-AATCCTTGATCCACAGCTGGACTGTCATAGTAAATTTTCTAATTATTGTTCTGATC-T-ACAA-AA--CAATCTCA------TAATAA-TGATG-T-C----------AAACA-CACTAACGTA----TG-----CGAGATGT-TT-CCACACG-ATAAGT------CCA-TAA-GCCT-AG--TCAAGTTGG-GCGATTTGGTAT-TC---T--A-CCG--AGCA-TA-ATTTTTTAAGCAG-ACTTTAGTGC-------GAGAGAGA--TGTTTAGAATACA-TC-T-ACGGAA-TAACAATCTGTAAGTGC--TGTACC-AG-CGTGCCA-TTAC----AAG--TTAC-ATACCCATG-ATTTTAATTG--T------------TCTG-CA-TAT-TTA-------CTATTTGTCTAA-C-ACTC-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTG-T--A-TT-TCGCCGT-CACAC-AA-A-T-GTGGT-------AA-A-C---AC--TATTTC------------CGGAT---------------------------GTACTTATGT---TCTGCGCCACACC-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T----ATGGC-----TC-------T----CTTTTGGCCA-T-TTA-AAGCTCAGCGGACTATATAGTTAA-ATTGCGTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACCTC-TCTA-TTTCGA-ACAC-C---C----TTCA-TA-C-GTACCCCTACT----T--CAT-GGGTAC-AA-GTCTC---TAAAC-------------C-ATA---------TAAT--GATG--A--A------CACTT------C-----CTATCACATT--GT----------------------CA--TTTGGG-TAGAT-TTTATA-TTGTTA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGG--------------------G--C---AT-T-TC-TTT--TTCCACCA-A-T--T-------AAAAAACGGT-T--TG-------TGTTGT-TAAGTGG-GATCGCCTA-A---TTGCCC-GCCGTCCGGGGGTG---GG---ATTCACTT--T-TA-TTCGG--TTGT
gi|3 : ccattttcttaagtgtaaggacgcatatggttataacgaatgtatgtcaatcgttatttaaaccaagattgatagggatttatgggtctacaacgaaaatcttgggaggtctaagtctacgaccgcaacgggggcacgatCCTAAGT-CCCA-G-------T-TT-TG--T-C-GTC-AGCTGG--T-TCCAAAAA------------TC--TTT-ATT-A-C-CAA-GGGTACC---TTAC-AATC-TT---CA-CA--TGG-CTG-CAT--------TTCC---TAT-GTTC-GATA-TCACAA-----CA-TCTCA------TATT----GATG-TGC----------GA-CATCAC-AACGTA----CG-----CGAG-TGT-TTTC---ACG-ATA-GTTATAAGCC--TG--GCCT-AG--TCAAG---G-G-GAT--GGTAT-TC---T--A-A-G--CAC--TACATTTT--AAAC-G-A-TTTAGTGC-------G--AGCGC--TGTT-AGA-T-CA-TC-T-ACA-AA-TA--ACTTT-TAA-TGC--TGTA-C-AGCC-CGTCA-TT-C----AAC--T-AC-ATACC-ATG-CTTT--ATTA--TTC--------G-TCTA-GA-T-T------------------TTTAA-ACAACT-T-----TGTTT--C---TGTAC-ATGTGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-T-----TCGT-CACAATAA-A-TCGTGGCTTAACCCGT-ACC---AC-ATATTTCCGTTCA-GTGCGCGGATC-AA--C-AA-AG--T--GGCCG-G-TG-ACTTGTGTTTATCT----CGCA-C-CAA-CCAT---------------------------ATGAC-----TT-------TTCAGTTTTGC--CA-T-TGC-CA--------GACT-----GTT---ATT--GT---CGG--AT--TGCACGTAGA-C-C-T-TA-TT---GCA--C-G---C----TTCA-CA-C-G------TA-T----T--CAT-GC--AC-CA-G---C---TATACA-T--ACA--AAAC-AT----------T--T--GATGGAA--AAC---T--CCG------G-----CT-TA-CAAT--GG-TTTGCACC----A-GGGTTTGCATTTTTTGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C----CA-GTA-TT---TATGAGGAAGTA-A--AC-AGATAT--TGGCC---AT-TATC-TTT--TT---CCA-A-T--T-----AAAAAA----GT-G--AG-------TG-TGT-T-C--GG-GATA-CCTA-ACCCCC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GAC-CACTCATTT--TAT--TTAGGGCTTGTa
gi|4 : ggcccgttttctaaaggtcgtaagtcctacaccttagtcgtacgacatgctacgatgtacgccgttttacaaagattctaggacttgccgggcttaacgacgaaatgtcggtcgtaagtactagcgagcccgggggcgaACCCTAA-T-CCTAA-------------TGATC-C-GTA-TGT--G--T-CAAAAAAA------------TCTATCT-ATT-A-CATAT-GG-TAA----TTAC-AATAA-T---CAAGA--T-G-CTGCCAT--------TTCag
gi|4 : tccagggcccgtttctacaaaagtcgtaagttcctaactactctaagcataattcttcgactatacgaccgtctacaaagatttacttacgagttacgacgaaagttcagtcgctaagttacggaccgcccgggcgTA-TTACAT-ATGGTAATTACA-----ATAATCA-AGATGCTGCCATTTCGCTAAAACA-CAC-AA-GTATGCATG-----CGAG-TGTCTT-C---ACGTATA-GT------TC-------CCC-GA--TT-----------ACT-CGTATATCCATT--A-T-G--AAC--TA-ATT---------G-A-TTTGGTATTAGTCAAG-GA-AAA--TG---AG-----A-TCCTAACG-AC-CGCCAATTT-TAA-gctaaaacacacaagtatgcatgcgagtgtcttcacgtatagttccccgattactcgtatatccattatgaactaattgatttggtattagtcaaggaaaatgagatcctaacgaccgccaattttaaacagcatttgcggagaatgtatatcatcttcaatacaaatttaaatctgtaccagccgtcattttaaaagctacataccatgatttattatatattatattgtctgcaaaatcatactaaccacctcttgtttacttttacaatgcgtcatcttcctctataaatttacgtcacacaaaattgtggtctacgtaaacatgattccgtcagtcgccgatcaaacaacagtgacactgaacggtgttctcgcacaaaccatactctttgtaaatgaaaatggttctgacttttgccattttaagactgttaattaacaaaaatatgcactagacccttatttcgacaccccttcaccatgtacttcatgaacaaaccatacacatcgataaaacaatgtcaaatacaatgaacttggaaatattattcgattaatcacgtaccaatgttttgtagaatttttataatcaacaggtatttatgaaaaaactgtactgttttcttttttcaattaagaaaaaagtgagtat
gi|4 : tccagggcccgtttctacaaaagtcgtaagttcctaactactctaagcataattcttcgactatacgaccgtctacaaagatttacttacgagttacgacgaaagttcagtcgctaagttacggaccgcccgggcgaccctaatcctaatgatccgtatgtgtcaaaaaaatctatcT-AG--TCAAG---G-A-AAAT-GAGAT-CC---T--AAC-G--ACCGCCA-ATTTT--AAACAGCA-TTT---GC-------G-GAGA-A--TGT--ATA-T-CA-TCTT--C--AA-TA-CAAATT-TAA-ATC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-TTAAAAGC--T-AC-ATACC-ATG-ATTT--ATTA--TATATTATATTG-TCTG-CA-AA-ATCA-------T-----A-CTAA-CCACCTCT-----TGTTT-ACTT-T-TACAATGCGTCATC-TT-CC-TCT-AT-AA-AT-TTA-CGT-CACACAAA-A-TTGTGGTCTA---CGT-A-A---AC-ATGATTCCG-TCA-GT-CGCCGATCAAA--C-AACAG--T--GACAC---TGAACG-GTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----CTCT-----TTGT----AAATGAAAATGGTT-------CTGACTTTTGC--CA-T-TTT-AA--------GACT-----GTT-A-ATT--AAC-AAAA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TA-TTTCGACAC-C-C---C----TTCACCA-T-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-A-CCA---TACACA-TCGATA--AAACAATGTCAAA----T-AC--AATG-----AAC---T---TG------GAAATATTATT-CGATTAAT-CACGTACC---AA-TGTTTT----------G-TAGAA-TTT-T------TA-----TAA--T---C-AA-CAGGTA-TT---TAT---GAAA-A-A--ACTGT--AC--TG--T----T-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-----AAGAAAAAA-GT-G--AG-------TA-Tacagcatttgcggagaatgtatatcatcttcaatacaaatttaaatctgtaccagccgtcattttaaaagctacataccatgatttattatatattatattgtctgcaaaatcatactaaccacctcttgtttacttttacaatgcgtcatcttcctctataaatttacgtcacacaaaattgtggtctacgtaaacatgattccgtcagtcgccgatcaaacaacagtgacactgaacggtgttctcgcacaaaccatactctttgtaaatgaaaatggttctgacttttgccattttaagactgttaattaacaaaaatatgcactagacccttatttcgacaccccttcaccatgtacttcatgaacaaaccatacacatcgataaaacaatgtcaaatacaatgaacttggaaatattattcgattaatcacgtaccaatgttttgtagaatttttataatcaacaggtatttatgaaaaaactgtactgttttcttttttcaattaagaaaaaagtgagtat
gi|5 : tccagggcccgtttctacaaaagtcgtaagttcctaactactctaagcataattcttcgactatacgaccgtctacaaagatttacttacgagttacgacgaaagttcagtcgctaagttacggaccgcccgggcgaccctaatcctaatgatccgtatgtgtcaaaaaaatctatctattacatatggtaattacaataatcaagatgctgccatttcgctaaaacacacaagtatgcatgcgagtgtcttcacgtatagttccccgattactcgtatatccattatgaactaattgatttggtatACCCTAAGT-CCCAAA-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-TAAAAA--------------TC--TTT-GTT-AAC-CAA-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA--TAT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-----ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAG-AGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCT-AG--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--ACC-G--ACC--TA-ATTT----AACAG-A-TTTAGTGC-------G-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACA-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTC--TT-C----AAC--T-AC-ATACC-ATG-ATTT--ATTA--T----------G-TCTG-CA-TATATCACTCGTCGC-----GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-TTATCGTCATGCATACAAA-A-T-GTGGACTA---CGT-A-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGCGGATCAAAACC-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-ACAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTTTG--CA-T-TGCAAA--------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TATTTTCGACAC-C-C---CATAATTCA-CA-C-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TATACA-T--ACA--AAAC-ATGTA-------T-AT--GATG--A--AAC----CACCG------G-----CTATC-C--T--GT-TTTGCCCC-CAGA-GGTTTTGCA--TTTTGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G---AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--TA----AAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA---G-GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCTTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
gi|6 : CTAAGT-CC-AAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--GT-T-TAAAAAAA------------TC--TTT-GTT-A---CAA-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-AA---------TTCTA---AT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCT-------ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAA--GT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCTAAG--TCAAG---G-G-TA-T-GGTAT-TC---T--A-C-G--A-C--TT-ATTTT--AAACAG-A-TTAAGTGC-------G-GGAGGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-AC--AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTA-C-AG-C-CGTCA-TT-C----AAC--T-AC-ATA-C-ATG-ATTT--ATTAT-T----------GTTCTG-CA-TATATC--------T-----GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA---TC-C--TCTGA--AA-TT-TCGT----CACACAAA-A-T-GT-GTCTA---CGTAA-C---AC-ATATTT-CG-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-GA--T--GACAGAG-TGTACTTGTGT---TCT----CGC--C-AAA-CCAT--A-----TT-------TGGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAG-TTTTG--CA-T-TGC-AA--------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--ATCATGCAC-TAGACC-C-T-TA--TTCGACAC-C-C---C----TTCA-CA-CTG------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TATACA-T--AC----AAC-ATG---------T-AT--GATG--A--AAC---TCACCG------G------TG-C-CAAT--GT-TTTGCA-C-CAGA-GGTTTTGCA--TTTTGA-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTATTT---TATGAGG-AG-A-ACGAC-GAT-AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T------AAAAAAAGGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA--GG-GAT--CCTA-A---CC-CCC-CC---TCGGGGGGA---GGT-CA-TCAC-T--TATA-TTAAG--GTGT
gi|7 : AAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-TAAAAAAA------------TC--TTT-GTT-A-C-CAA-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA---AT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA------TAAGAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAA-AGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCT-AG--TCAAG---G-G-AATT-GGTAT-TC---T--A-C-G--ACC--AA-ATTTT--AAACAG-A-TTCAGTGC-------G-GACAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACA-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACCAAG-C-CGTCATTT-C----AAT-------ATACC-ATGTATTT--ATTAT-T----------G-TCGA-TA-T-TACTT-------C-----GTTCAA-ACACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-CCGTCTGATCAATTT-TCG--GT-CACACAAA-AGT-GTGGTCTA---CGT-A-C---AC--TATTTCC--TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--TGGGACAG-G-TGTACTT-TGT---GCT----CGCA-C-AAACCCAT--A------T-------TTGT-T--AAAGGAC-----TT-------TTCAG-TTTTG--CATT-TGC--A--------GAC-------TT-A-ATT--GTA-AGG---AT-AT-CAT-AAGACC-C-T-TA-TTTCGACAC-C-C---C----TTCA-CA-CGG------TACTATTAT--CCT-TA--AC-AA-A-CTC---TATACA-T--AC---AAAC-ATG---------T-AT--GATG--A--AAC---TCATCG------G------TATC-C-AT--GT-TTTGCACC-CAGAGGGTTTTGTA--TTTTGGTTAGAC-TTT-TG-TTG-TATTA-GTAA--T---CGAT-CA-GTA-TT---TATGAGGAGA-A-G--AC-G---ATTGTG--C---AT-T-TCTTTT--TT---TCA-A-T--T-------AAAAAAAGGT-G--AG-------TG-T-T-TAA--GG-GATC-CCCT-A---CC-CCC-CCCCTCCAGGGGGA---a
gi|8 : CCCTAAGT-CCCAAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-TAAAAAAATCTAAAAAAAAATC--TTT-GTT-A-C-CAT-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA---AT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA------TGATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AGCGT-----TG-----CGAG-TGA-TT-C-----G-A-A-GT------CCA-TATAGCCT-AG--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--A-C-G--AGC--TA-ATTTT--AAACAG-A-TTTAGTTC-------G-GAGAGA--TGTT-AGATT-CA-TTCT-ACG-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAG--C-AC-ATA-C-ATG-ATTT--ATTAT-T----------G-TCTG-CA-TATATCAT------C-----GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TTCC--TCTGAT-AA-TT-TC--TGT-CTCACAAA-A-T-GTGGTCTA---CGT-A-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGTGGATCAAA--C-AA-AGAAG--GACGG-G-T---CTTGTGT---TCT----CGTA-C-AAA--CAT--A--------------TTGT-T--AAATGAC--------------------TTTTG--CA-T-TGC-AA--------GACT-----GTT-A---T--AT----GA--AT-ATGCAC-TAAGAC-C-T-TA--TTCGACAC-C-C----------TA-CA-C----------------------------------------------A-T--ACA--AAAC--------------------ATG--A--AAC---TCA---------------CTATC-CAAT--GT-TTTG
gi|8 : A-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-GAT-AT--TG--C---AT-T-TCTTTT--TT---TCA-GTT--T-----AAAAAAAAAGGT-G--AGTGCAATATG-TGT-TAA--GG-GATC-CCTA-A---C-----------GGGGGGGGG---GGG-GGGTCACTT--TATA-TTAGG--TTGTgtagtatttatgaggaagaaacgatattgcatttctttttttcagtttaaaaaaaaaggtgagtgcaatatgtgttaagggatccctaacgggggggggggggggtcactttatattaggttgta
gi|9 : ccctaagtcccaagttttgtcgtaagtgttaaaaaaatctaaaaaaaaatctttgttaccatggtaattacaatcattcaacatggctgcatttctaatgttcgatatcacaaatcaatctcatgataaagatgtgcgaacacacagcgttgcgagtgattcgaagtccatatagcctagtcaaggggattggtattctacgagctaattttaaacagatttagttcggagagatgttagattcattctacgaatacaattttaatgctgtaccagccgtcattcaagcacatacatgatttattattgtctgcatatatcatcgtctaaccacctttgtttactgtgtacaatgcgtcacttcctctgataatttctgtctcacaaaatgtggtctacgtacacatatttccgtcagtgcgtggatcaaacaaagaaggacgggtcttgtgttctcgtacaaacatattgttaaatgacttttgcattgcaagactgttatatgaatatgcactaagaccttattcgacaccctacacatacaaaacatgaaactcactatccaatgttttggt-G-TGTACTTCTGTG--TCT----CGCA-C-AAG-CCATCTA-----TCCAATGTGTGGT-T--AGA-AAC-----TTCTAAAATTTCAGTTG--G--CA-T--GC-AA--------GAC------GTT-ATAAT--GTATAGGA--AT-AT-CA--TA-ACC-C-T-TA-TATCGACTC-A-CAAGC----CTCA-CA-C-G-------ATG----TAACAT-GA--ACCAACAGCCC---TACACA-T--ACA--AAAC-A-----------------GATG--AGTAAC---GCACAA------------------CATT--GTATATAAACG-CA----TTTTTGC------CAG-TAGAA-TTA-AG-TTG-TA-TAGGTAAAGTTCAC-AT-CA--TA-TT---ATTGATGGTG-G-G--TC-G---ATA-TG--TCTAAT-T-TC-TTTTCTT---TCATA-TAATGAAAAAAAAAAAAAGAG-G--AGT------TG-TGTGTAA--GG-a
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): GGGCCCGTTTTACAAAAGATCGTAAGTCCTAAACTTAGTCGTAAGACATAACTTATGATGTACGATGAAGGCCGCGATTTACAAAAAC
Unaligned ( gi|19 ): AAGTCCTAAACTTACTTGCAAGACATATACTTACAAAGTAAGGGCCACTTTACAAAGAT
Unaligned ( gi|20 ): CATTTTACAAAAGATCGCAAGTCCTAAACTTAGTCATAAGACATAAC
Unaligned ( gi|21 ): GGGCCCCTTTTTACAAAAAGTCGTAAGTCCTAGACCTAGTC
Unaligned ( gi|22 ): GGCCCGTTTTACAAAAGGTCGTAAGTCCTAAACTTA
Alignments
lowQualScore : 1111111 444444444444 1111 11111111 222 222222 1111111111 22222 111111 11 1111111 11 11111111111 33333333333 11111 111 11111 11111 111 33333333333333333 33333333333333333333 11111111 111111 11111111 11111111 4444444444444444444 3333333333333333333333 222222 1111 111111 111 3333333 222222 2222222 11 11
lowQualScore : 5 6666666 5 5 66 5 5 5 66 66 5 5 111111111111 66 5 4 4 4 55 4 2222 4 777 99 4 8 44444444 444 4 4 4 4 55 666666 3 3 5555555555 3 3 55555 99999 33 3 3 666 3 3 444444 66 00 4 55 888888888888 4 777 55 888 888 4 4 888 3 7 3333333 8 55 44 8 4 4 1 4 00 4 8 4 4 66 4 4 4 4 4 8888 77777 4 4 4 2 88888888888 8 4 4 0 3 99999999999 4 4 00000 4 4 4 4 4 99 7 3 3 44 333 3 3 7 666 11111 3 3 3 55 3 3 22222 3 3 000 7777 3 3 3 11111111111111111 6666 88888888888888888888 2 55 3 3 0 88888888 000000 888 55 88 55 4 4 4 4 4 44 4 4 66666666 4 4 66666666 99999 55 55555 3 3 8 666 1 3 55 55 4444444444444444444 55555 4444444444444444444444 3 55 55 3 0 0 222222 1111 4 4 4 8 4 4 4 4 000000 4 4 4 4 111 4 66666 4 2222222 55 777 4 4 8 55 777 8 4 55 999999 4 55 1111111 4 1 4 66 4 00 55 888 5 5 3 888 00 3 99 6 99
lowQualScore : . ....... . . .. . . . .. .. . . ............ .. . . . . .. . .... . ... .. . . ........ ... . . . . .. ...... . . .......... . . ..... ..... .. . . ... . . ...... .. .. . .. ............ . ... .. ... ... . . ... . . ....... . .. .. . . . . . .. . . . . .. . . . . . .... ..... . . . . ........... . . . . . ........... . . ..... . . . . . .. . . . .. ... . . . ... ..... . . . .. . . ..... . . ... .... . . . ................. .... .................... . .. . . . ........ ...... ... .. .. .. . . . . . .. . . ........ . . ........ ..... .. ..... . . . ... . . .. .. ................... ..... ...................... . .. .. . . . ...... .... . . . . . . . . ...... . . . . ... . ..... . ....... .. ... . . . .. ... . . .. ...... . .. ....... . . . .. . .. .. ... . . . ... .. . .. . ..
lowQualScore : 7 2222222 0 0 99 0 0 0 99 99 0 0 222222222222 99 0 4 4 4 44 0 5555 0 000 55 0 0 55555555 333 4 4 0 0 55 888888 6 6 9999999999 6 6 55555 11111 88 6 6 444 6 6 111111 33 66 0 55 000000000000 0 000 55 666 777 0 0 777 6 3 0000000 0 55 99 0 0 0 6 0 44 0 0 0 0 11 0 0 0 0 0 5555 99999 0 0 0 4 33333333333 0 0 0 8 4 77777777777 0 0 00000 0 0 4 4 0 55 3 6 6 00 000 6 6 3 444 99999 6 6 6 00 6 6 55555 3 3 000 7777 6 6 6 55555555555555555 3333 33333333333333333333 0 00 6 6 7 55555555 888888 888 55 77 55 0 0 0 0 0 88 0 0 00000000 0 0 11111111 22222 55 77777 6 6 2 444 8 6 00 00 3333333333333333333 55555 1111111111111111111111 6 88 00 6 1 1 111111 4444 4 4 4 9 4 4 4 4 333333 4 4 0 0 000 0 88888 0 3333333 55 000 0 0 0 55 000 0 0 55 555555 0 55 0000000 0 1 4 11 4 66 44 888 0 0 4 888 00 0 22 7 22
consensus : ACCCTAAGT-CCCAAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAAAAA------------TC--TTT-GTT-A-C-CAN-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA--TAT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-----ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCTA-G--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--A-C-GA--GC-TA-ATTTT--AAACAG-A-TTTAGTGC-------G-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACG-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAN--T-AC-ATACC-ATG-ATTTATTAT---------T-GT-CTG-CA-TATATCA-C-------GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-TT-TCGTCGT-CACACAAA-A-T-GTGGTCTA---CGTA-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTTTG--CA-T-TGCAA--------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TATTT-CGACAC-C-C---C----TTCA-CA-C-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TACACA-T--ACA--AAAC-ATG---------T-AT--GATG--A--AAC---TCACCG------G-----CTATC-CAAT--GT-TTTGCACC-CAGA-GGTTTTGCA--TTTCGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G---AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-----AAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA--GG-GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
Reference ( family-2715 ) : ACCCTAAGT-CCCAAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAAAAA------------TC--TTT-GTT-A-C-CAN-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA--TAT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-----ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCTA-G--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--A-C-GA--GC-TA-ATTTT--AAACAG-A-TTTAGTGC-------G-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACG-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAN--T-AC-ATACC-ATG-ATTTATTAT---------T-GT-CTG-CA-TATATCA-C-------GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-TT-TCGTCGT-CACACAAA-A-T-GTGGTCTA---CGTA-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTTTG--CA-T-TGCAA--------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TATTT-CGACAC-C-C---C----TTCA-CA-C-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TACACA-T--ACA--AAAC-ATG---------T-AT--GATG--A--AAC---TCACCG------G-----CTATC-CAAT--GT-TTTGCACC-CAGA-GGTTTTGCA--TTTCGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G---AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-----AAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA--GG-GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
gi|1 : ACCCTAAGT-CCCAAG-------TATTATG--TTC-GTACAGT--G--TGT-AAAAAAAA-----------TA--TTTCGTTTA-C-CAT-GG-TAA----CTACGAATCATT---TAACAA-TGG-------T--------ATGTA--TAT-TTTC-GATAATCACAAGAT--CAATCTCATAGTAATGACAATGGATG-TGC----------GCACA-CAC-AAT-T-----TG-------AG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GTT-----CCAGTA--GCCTA-GGATCAAA---GAG-GTTT-TGTAT-TC---TTTA-A-GA--GA-TA-ATTT---AAACAG-ACTTTAGTGC-------GAGAGAGAGTCGTT-CGA-T-CACTCCT-ACG-AAATA-CAATTG--AA-TGCAATGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAG--T-ACTATACC-ATG-ATTTTTAAT---------T-GT-CTGGCAATATTTCATC-------GTCTAAACCACCT-CGCCCGTGTTTTACTGATGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGATAAA-TT-TCGTA---CACACAAATA-T-GTGGTCTA---CGTA-C---ACAATATTTCCG-TCATGTGCGCGAATCAAA--C-AA-AGC-T--GACAG-GTTGTACTTGTG----TCT----CGCA-CAAAA-CCATC-A-----TT-------TTGTATTAAAATGAC---------------------TTTG--CA-TATGCCA--------AAGT-----GTT---ATT--GTA-AGGACCAT-ATGCAC-TAGACC-CTT-TATTT-CGATAC-CAC---CGT--CTCA-CAGC-G------TAC-----T--CATAGC--AC-AA-AGCCCTCGTACACAGG--GCA--AAAC--------------------ATG--A--AAC---TAA---------------CTACT-C--------------CT-CA-A-GTTTTTG-G--TTTCGA-T-GAA-TTTCTGATGG-TA-TA-GTAA--T---C-ATCCA-GTA-TTTTATATG-GGAAG-ACA--AC-GTATAT--GA--C---A--T-TC-TTT--TT---TCACA-T--T------AAAGAAAAGGTAG--AGC------TG-TGT-CAA--GGTGAT--CCTACA---TC-CCCACCCCTCCAGAGGCA---GGG-CACTCACTTGCTATACTTAGG--TT
gi|10 : tatgtacaggagtgcaccgtttttaccaaaaggtcgtaagtcctaaacttatcgtaagacataacttcgatgtacgacaggttgtacaaagaattttagacttacgggtatactgacgaaattcgcttcgtaagtttctacaaccgcccgggggcg-A-TTTAGTGC-------A-GGGAGA--TGTA-AAA-T--A-TCCT-ACA-AA-AA-GAAGG---AA-GGC--TGTGCC-AG-C-TGCCA-TT-A----AAG--T-AC-GTACC-ATG-ATTTGTTAT---------T-GT-CTG-CA-TACAT-G-C-------GTC----CCACCT-T-----TGTT--------------TGCGTCA-CATT-A--TCTGGT-AA-CT----TCGT-CAC-CAAA-A-C-GGTGCTTA---CGTG-TAGAAC-ATGTTGCCG-TCA-GTGGGCGGATCAAA--CAAA-AG--C--GGCAG-G-TGtcgt
gi|11 : ttctagttaactgatttAT-AA-TT-TTGTC----ACATAAA-A-T-GTGGTCTG---CGTA-A---AC-ATATTTTCG-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--G--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAT------------------ATATATG--CA-T-TGCAA--------GACT-----ATT-A-ATT--AAG-AGAA--AT-ATGCGC-TAGACC-C-T-TATTT-CGACAC-T-C---C----TTCA-CA-C-A------TACT----T--CAT-GG--AC-AA-AGCCA---TACAAA-T--ACATGAAAC-TTGGAAGTTCTCT-ATCAAATA--A--CACTATTGATCGATTATCA-----CTATC-CAAT--GT-TTTcgtgccataacttttcaatgcattttttaaagtatgcatggcacccttttacatggacat
gi|12 : AT-CA--AC-AA-AGCCC---TATACA-T--ACA--AAAC-ATG---------T-AT--GA-G--A--AAC---TCATCG------G-----C-ATC-CAAT--GT-TTTGCACCACAGA-GGTTTTGCAT-TTTTGG-TAGAATTTT-TG-TTG--A-TA-GTAA------C-AT-AA-A-A-TTA--TATGAGGAAG-A-A-----G---ATAATG--C---ATAT-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-------AAAAAAAGGT-GATAG-------TG-T-T-TAA--GG-GATC-CCT--A---CC-CCC-CCCTTCCGGGGGGAACCGGGCCACTCAC
gi|13 : -TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTTTA---AT-GTTC-GATG-CCACAA-AT--CAATCACA------TAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-TAC-AATGT-----TG-----CGAT-TGT-TT-C---ACA-ATA-GT------CCA-TA--ACCTA-G--TCAA-------------GGTAT-TA---T--A-C-GA--GC-TA-ATTTT--AAACAG-A-
gi|14 : -C--TCTGAT-AA-TT-TCGTC----ACACAAA-A-T-GTGATCTA---CGTA-A---AC-AT--TTCCG-TCA-GTGCGTGGATCAAA--C-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACATGAGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCCT--GTTAATTT-------TTGT-T--AAATAA------TG-------TTGA-CTTTTG--CA-T-T
gi|15 : cT-A-C-TAT-GG-TAA----TTAA-AATCATT---CAAGA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA-----------------------AT---AATCTCA------TAATAA-AGACG-TGC----------GAACA-CAC-AACGTTGCGATG-----CGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CC
gi|17 : A-----ATAATAA-AGACG-TGA----------GAACA-CAG-AACGT-----TGCATTCCGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCc
gi|18 : ggctgcatttctaatTACC-AG-C-CGTCA-TT-T----AAAAGT-AC-ATACC-AT------------------------------A-TATAT------------TCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGcccggatagt
gi|2 : CCCTAAGTTCCCAAGGAGTGTGT-TG-TG--T-CAGTA-GGT--GATT-T-AAAGAAAGAAA--------TC--TTT-GTT-A-C-CAATGG-TAAATTATCAC-AATCCTTGATCCACAGCTGGACTGTCATAGTAAATTTTCTAATTATTGTTCTGATC-T-ACAA-AA--CAATCTCA------TAATAA-TGATG-T-C----------AAACA-CACTAACGTA----TG-----CGAGATGT-TT-CCACACG-ATAAGT------CCA-TAA-GCCTA-G--TCAAGTTGG-GCGATTTGGTAT-TC---T--A-CCGA--GCATA-ATTTTTTAAGCAG-ACTTTAGTGC-------GAGAGAGA--TGTTTAGAATACA-TC-T-ACGGAA-TAACAATCTGTAAGTGC--TGTACC-AG-CGTGCCA-TTAC----AAG--TTAC-ATACCCATG-ATTT-TAAT---------T-GTTCTG-CA-TAT-TTA-CTATTT--GTCTAA-C-ACTC-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTG-T--A-TT-TCGCCGT-CACAC-AA-A-T-GTGGT-------AAA-C---AC--TATTTC------------CGGAT---------------------------GTACTTATGT---TCTGCGCCACACC-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T----ATGGC-----TC-------T----CTTTTGGCCA-T-TTAAAGCTCAGCGGACTATATAGTTAA-ATTGCGTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACCTC-TCTATTT-CGA-ACAC-C---C----TTCA-TA-C-GTACCCCTACT----T--CAT-GGGTAC-AA-GTCTC---TAAAC-------------C-ATA---------TAAT--GATG--A--A------CACTT------C-----CTATCACATT--GT----------------------CA--TTTGGG-TAGAT-TTTATA-TTGTTA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGG--------------------G--C---AT-T-TC-TTT--TTCCACCA-A-T--T-------AAAAAACGGT-T--TG-------TGTTGT-TAAGTGG-GATCGCCTA-A---TTGCCC-GCCGTCCGGGGGTG---GG---ATTCACTT--T-TA-TTCGG--TTGT
gi|3 : ccattttcttaagtgtaaggacgcatatggttataacgaatgtatgtcaatcgttatttaaaccaagattgatagggatttatgggtctacaacgaaaatcttgggaggtctaagtctacgaccgcaacgggggcacgatCCTAAGT-CCCA-G-------T-TT-TG--T-C-GTC-AGCTGG--T-T-CCAAAAA------------TC--TTT-ATT-A-C-CAA-GGGTACC---TTAC-AATC-TT---CA-CA--TGG-CTG-CAT--------TTCC---TAT-GTTC-GATA-TCACAA-----CA-TCTCA------TATT----GATG-TGC----------GA-CATCAC-AACGTA----CG-----CGAG-TGT-TTTC---ACG-ATA-GTTATAAGCC--TG--GCCTA-G--TCAAG---G-G-GAT--GGTAT-TC---T--A-A-GC--AC-TACATTTT--AAAC-G-A-TTTAGTGC-------G--AGCGC--TGTT-AGA-T-CA-TC-T-ACA-AA-TA--ACTTT-TAA-TGC--TGTA-C-AGCC-CGTCA-TT-C----AAC--T-AC-ATACC-ATG-CTTTATTAT---------TCGT-CTA-GA-T-T--------------TTTAA-ACAACT-T-----TGTTT--C---TGTAC-ATGTGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-T-----TCGT-CACAATAA-A-TCGTGGCTTAACCCGTACC---AC-ATATTTCCGTTCA-GTGCGCGGATC-AA--C-AA-AG--T--GGCCG-G-TG-ACTTGTGTTTATCT----CGCA-C-CAA-CCAT---------------------------ATGAC-----TT-------TTCAGTTTTGC--CA-T-TGCCA--------GACT-----GTT---ATT--GT---CGG--AT--TGCACGTAGA-C-C-T-TATT----GCA--C-G---C----TTCA-CA-C-G------TA-T----T--CAT-GC--AC-CA-G---C---TATACA-T--ACA--AAAC-AT----------T--T--GATGGAA--AAC---T--CCG------G-----CT-TA-CAAT--GG-TTTGCACC----A-GGGTTTGCATTTTTTGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C----CA-GTA-TT---TATGAGGAAGTA-A--AC-AGATAT--TGGCC---AT-TATC-TTT--TT---CCA-A-T--T-----AAAAAA----GT-G--AG-------TG-TGT-T-C--GG-GATA-CCTA-ACCCCC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GAC-CACTCATTT--TAT--TTAGGGCTTGTa
gi|4 : ggcccgttttctaaaggtcgtaagtcctacaccttagtcgtacgacatgctacgatgtacgccgttttacaaagattctaggacttgccgggcttaacgacgaaatgtcggtcgtaagtactagcgagcccgggggcgaACCCTAA-T-CCTAA-------------TGATC-C-GTA-TGT--G--T-C-AAAAAAA------------TCTATCT-ATT-A-CATAT-GG-TAA----TTAC-AATAA-T---CAAGA--T-G-CTGCCAT--------TTCag
gi|4 : tccagggcccgtttctacaaaagtcgtaagttcctaactactctaagcataattcttcgactatacgaccgtctacaaagatttacttacgagttacgacgaaagttcagtcgctaagttacggaccgcccgggcgTA-TTACAT-ATGGTAATTACA-----ATAATCA-AGATGCTGCCATTTCGCTAAAACA-CAC-AA-GTATGCATG-----CGAG-TGTCTT-C---ACGTATA-GT------TC-------CCCG-A--TT-----------ACT-CGTATATCCATT--A-T-GA--AC-TA-ATT---------G-A-TTTGGTATTAGTCAAG-GA-AAA--TG---AG-----A-TCCTAACG-AC-CGCCAATTT-TAA-gctaaaacacacaagtatgcatgcgagtgtcttcacgtatagttccccgattactcgtatatccattatgaactaattgatttggtattagtcaaggaaaatgagatcctaacgaccgccaattttaaacagcatttgcggagaatgtatatcatcttcaatacaaatttaaatctgtaccagccgtcattttaaaagctacataccatgatttattatatattatattgtctgcaaaatcatactaaccacctcttgtttacttttacaatgcgtcatcttcctctataaatttacgtcacacaaaattgtggtctacgtaaacatgattccgtcagtcgccgatcaaacaacagtgacactgaacggtgttctcgcacaaaccatactctttgtaaatgaaaatggttctgacttttgccattttaagactgttaattaacaaaaatatgcactagacccttatttcgacaccccttcaccatgtacttcatgaacaaaccatacacatcgataaaacaatgtcaaatacaatgaacttggaaatattattcgattaatcacgtaccaatgttttgtagaatttttataatcaacaggtatttatgaaaaaactgtactgttttcttttttcaattaagaaaaaagtgagtat
gi|4 : tccagggcccgtttctacaaaagtcgtaagttcctaactactctaagcataattcttcgactatacgaccgtctacaaagatttacttacgagttacgacgaaagttcagtcgctaagttacggaccgcccgggcgaccctaatcctaatgatccgtatgtgtcaaaaaaatctatcTA-G--TCAAG---G-A-AAAT-GAGAT-CC---T--AAC-GACCGC-CA-ATTTT--AAACAGCA-TTT---GC-------G-GAGA-A--TGT--ATA-T-CA-TCTT--C--AA-TA-CAAATT-TAA-ATC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-TTAAAAGC--T-AC-ATACC-ATG-ATTTATTATATATTATATT-GT-CTG-CA-AA-ATCA-T-------A-CTAA-CCACCTCT-----TGTTT-ACTT-T-TACAATGCGTCATC-TT-CC-TCT-AT-AA-AT-TTA-CGT-CACACAAA-A-TTGTGGTCTA---CGTA-A---AC-ATGATTCCG-TCA-GT-CGCCGATCAAA--C-AACAG--T--GACAC---TGAACG-GTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----CTCT-----TTGT----AAATGAAAATGGTT-------CTGACTTTTGC--CA-T-TTTAA--------GACT-----GTT-A-ATT--AAC-AAAA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TATTT-CGACAC-C-C---C----TTCACCA-T-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-A-CCA---TACACA-TCGATA--AAACAATGTCAAA----T-AC--AATG-----AAC---T---TG------GAAATATTATT-CGATTAAT-CACGTACC---AA-TGTTTT----------G-TAGAA-TTT-T------TA-----TAA--T---C-AA-CAGGTA-TT---TAT---GAAA-A-A--ACTGT--AC--TG--T----T-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-----AAGAAAAAA-GT-G--AG-------TA-Tacagcatttgcggagaatgtatatcatcttcaatacaaatttaaatctgtaccagccgtcattttaaaagctacataccatgatttattatatattatattgtctgcaaaatcatactaaccacctcttgtttacttttacaatgcgtcatcttcctctataaatttacgtcacacaaaattgtggtctacgtaaacatgattccgtcagtcgccgatcaaacaacagtgacactgaacggtgttctcgcacaaaccatactctttgtaaatgaaaatggttctgacttttgccattttaagactgttaattaacaaaaatatgcactagacccttatttcgacaccccttcaccatgtacttcatgaacaaaccatacacatcgataaaacaatgtcaaatacaatgaacttggaaatattattcgattaatcacgtaccaatgttttgtagaatttttataatcaacaggtatttatgaaaaaactgtactgttttcttttttcaattaagaaaaaagtgagtat
gi|5 : tccagggcccgtttctacaaaagtcgtaagttcctaactactctaagcataattcttcgactatacgaccgtctacaaagatttacttacgagttacgacgaaagttcagtcgctaagttacggaccgcccgggcgaccctaatcctaatgatccgtatgtgtcaaaaaaatctatctattacatatggtaattacaataatcaagatgctgccatttcgctaaaacacacaagtatgcatgcgagtgtcttcacgtatagttccccgattactcgtatatccattatgaactaattgatttggtatACCCTAAGT-CCCAAA-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAAA--------------TC--TTT-GTT-AAC-CAA-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA--TAT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-----ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAG-AGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCTA-G--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--A-CCGA--CC-TA-ATTT----AACAG-A-TTTAGTGC-------G-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACA-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTC--TT-C----AAC--T-AC-ATACC-ATG-ATTTATTAT-----------GT-CTG-CA-TATATCA-CTCGTCGCGTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-TTATCGTCATGCATACAAA-A-T-GTGGACTA---CGTA-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGCGGATCAAAACC-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-ACAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTTTG--CA-T-TGCAAA-------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TATTTTCGACAC-C-C---CATAATTCA-CA-C-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TATACA-T--ACA--AAAC-ATG---------T-ATATGATG--A--AAC----CACCG------G-----CTATC-C--T--GT-TTTGCCCC-CAGA-GGTTTTGCA--TTTTGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G---AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--TA----AAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA---G-GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCTTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
gi|6 : CTAAGT-CC-AAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-TTAAAAAAA------------TC--TTT-GTT-A-C--AA-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-AAT--------T-CTA---AT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCT-------ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAA--GT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCTAAG--TCAAG---G-G-TAT--GGTAT-TC---T--A-C-GA---C-TT-ATTTT--AAACAG-A-TTAAGTGC-------G-GGAGGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-AC--AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTAC--AG-C-CGTCA-TT-C----AAC--T-AC-ATAC--ATG-ATTTATTAT---------T-GTTCTG-CA-TATATC--T-------GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA---TC-C--TCTGA--AA-TT-TCGTC----ACACAAA-A-T-GTG-TCTA---CGTAAC---AC-ATATTTC-G-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-GA--T--GACAGAG-TGTACTTGTGT---TCT----CGC--C-AAA-CCAT--A-----TT-------TGGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTT-G--CA-T-TGCAA--------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--ATCATGCAC-TAGACC-C-T-TATT--CGACAC-C-C---C----TTCA-CA-CTG------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TATACA-T--ACA--A--C-ATG---------T-AT--GATG--A--AAC---TCACCG------G------TG-C-CAAT--GT-TTTGCACC--AGA-GGTTTTGCA--TTTTGA-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTATTT---TATGAGG-AG-A-ACGAC-GAT-AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T------AAAAAAAGGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA--GG-GAT--CCTA-A---CC-CCC-CC---TCGGGGGGA---GGT-CA-TCAC-T--TATA-TTAAG--GTGT
gi|7 : AAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAAAAA------------TC--TTT-GTT-A-C-CAA-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA---AT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA------TAAGAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAA-AGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCTA-G--TCAAG---G-G-AATT-GGTAT-TC---T--A-C-GA--CC-AA-ATTTT--AAACAG-A-TTCAGTGC-------G-GACAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACA-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACCAAG-C-CGTCATTT-C----AAT-------ATACC-ATGTATTTATTAT---------T-GT-CGA-TA-T-TACTT-C-------GTTCAA-ACACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-CCGTCTGATCAATTT-TCG--GT-CACACAAA-AGT-GTGGTCTA---CGTA-C---AC--TATTTCC--TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--TGGGACAG-G-TGTACTT-TGT---GCT----CGCA-C-AAACCCAT--A------T-------TTGT-T--AAAGGAC-----TT-------TTCAG-TTTTG--CATT-TGC-A--------GAC-------TT-A-ATT--GTA-AGG---AT-AT-CAT-AAGACC-C-T-TATTT-CGACAC-C-C---C----TTCA-CA-CGG------TACTATTAT--CCT-TA--AC-AA-A-CTC---TATACA-T--AC---AAAC-ATG---------T-AT--GATG--A--AAC---TCATCG------G------TATC-C-AT--GT-TTTGCACC-CAGAGGGTTTTGTA--TTTTGGTTAGAC-TTT-TG-TTG-TATTA-GTAA--T---CGAT-CA-GTA-TT---TATGAGGAGA-A-G--AC-G---ATTGTG--C---AT-T-TCTTTT--TT---TCA-A-T--T-------AAAAAAAGGT-G--AG-------TG-T-T-TAA--GG-GATC-CCCT-A---CC-CCC-CCCCTCCAGGGGGA---a
gi|8 : CCCTAAGT-CCCAAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAAAAATCTAAAAAAAAATC--TTT-GTT-A-C-CAT-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA---AT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA------TGATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AGCGT-----TG-----CGAG-TGA-TT-C-----G-A-A-GT------CCA-TATAGCCTA-G--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--A-C-GA--GC-TA-ATTTT--AAACAG-A-TTTAGTTC-------G-GAGAGA--TGTT-AGATT-CA-TTCT-ACG-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAG--C-AC-ATA-C-ATG-ATTTATTAT---------T-GT-CTG-CA-TATATCATC-------GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TTCC--TCTGAT-AA-TT-TC--TGT-CTCACAAA-A-T-GTGGTCTA---CGTA-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGTGGATCAAA--C-AA-AGAAG--GACGG-G-T---CTTGTGT---TCT----CGTA-C-AAA--CAT--A--------------TTGT-T--AAATGAC--------------------TTTTG--CA-T-TGCAA--------GACT-----GTT-A---T--AT----GA--AT-ATGCAC-TAAGAC-C-T-TA-TT-CGACAC-C-C----------TA-CA-C----------------------------------------------A-T--ACA--AAAC--------------------ATG--A--AAC---TCA---------------CTATC-CAAT--GT-TTTG
gi|8 : A-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-GAT-AT--TG--C---AT-T-TCTTTT--TT---TCA-GTT--T-----AAAAAAAAAGGT-G--AGTGCAATATG-TGT-TAA--GG-GATC-CCTA-A---C-----------GGGGGGGGG---GGG-GGGTCACTT--TATA-TTAGG--TTGTgtagtatttatgaggaagaaacgatattgcatttctttttttcagtttaaaaaaaaaggtgagtgcaatatgtgttaagggatccctaacgggggggggggggggtcactttatattaggttgta
gi|9 : ccctaagtcccaagttttgtcgtaagtgttaaaaaaatctaaaaaaaaatctttgttaccatggtaattacaatcattcaacatggctgcatttctaatgttcgatatcacaaatcaatctcatgataaagatgtgcgaacacacagcgttgcgagtgattcgaagtccatatagcctagtcaaggggattggtattctacgagctaattttaaacagatttagttcggagagatgttagattcattctacgaatacaattttaatgctgtaccagccgtcattcaagcacatacatgatttattattgtctgcatatatcatcgtctaaccacctttgtttactgtgtacaatgcgtcacttcctctgataatttctgtctcacaaaatgtggtctacgtacacatatttccgtcagtgcgtggatcaaacaaagaaggacgggtcttgtgttctcgtacaaacatattgttaaatgacttttgcattgcaagactgttatatgaatatgcactaagaccttattcgacaccctacacatacaaaacatgaaactcactatccaatgttttggt-G-TGTACTTCTGTG--TCT----CGCA-C-AAG-CCATCTA-----TCCAATGTGTGGT-T--AGA-AAC-----TTCTAAAATTTCAGTTG--G--CA-T--GCAA--------GAC------GTT-ATAAT--GTATAGGA--AT-AT-CA--TA-ACC-C-T-TATAT-CGACTC-A-CAAGC----CTCA-CA-C-G-------ATG----TAACAT-GA--ACCAACAGCCC---TACACA-T--ACA--AAAC-A-----------------GATG--AGTAAC---GCACAA------------------CATT--GTATATAAACG-CA----TTTTTGC------CAG-TAGAA-TTA-AG-TTG-TA-TAGGTAAAGTTCAC-AT-CA--TA-TT---ATTGATGGTG-G-G--TC-G---ATA-TG--TCTAAT-T-TC-TTTTCTT---TCATA-TAATGAAAAAAAAAAAAAGAG-G--AGT------TG-TGTGTAA--GG-a
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): GGGCCCGTTTTACAAAAGATCGTAAGTCCTAAACTTAGTCGTAAGACATAACTTATGATGTACGATGAAGGCCGCGATTTACAAAAAC
Unaligned ( gi|19 ): AAGTCCTAAACTTACTTGCAAGACATATACTTACAAAGTAAGGGCCACTTTACAAAGAT
Unaligned ( gi|20 ): CATTTTACAAAAGATCGCAAGTCCTAAACTTAGTCATAAGACATAAC
Unaligned ( gi|21 ): GGGCCCCTTTTTACAAAAAGTCGTAAGTCCTAGACCTAGTC
Unaligned ( gi|22 ): GGCCCGTTTTACAAAAGGTCGTAAGTCCTAAACTTA
Alignments
lowQualScore : 1111111 444444444444 1111 11111111 222 222222 1111111111 22222 111111 11 1111111 11 11111111111 33333333333 11111 111 11111 11111 111 33333333333333333 33333333333333333333 11111111 111111 11111111 11111111 4444444444444444444 3333333333333333333333 222222 1111 111111 111 3333333 222222 2222222 11 11
lowQualScore : 5 6666666 5 5 66 5 5 5 66 66 5 5 111111111111 66 5 4 4 4 55 4 2222 4 777 99 4 8 44444444 444 4 4 4 4 55 666666 3 3 5555555555 3 3 55555 99999 33 3 3 666 3 3 444444 66 00 4 55 888888888888 4 777 55 888 888 4 4 888 3 7 3333333 8 55 44 8 4 4 1 4 00 4 8 4 4 66 4 4 4 4 4 8888 77777 4 4 4 2 88888888888 8 4 4 0 3 99999999999 4 4 00000 4 4 4 4 4 99 7 3 3 44 333 3 3 7 666 11111 3 3 3 55 3 3 22222 3 3 000 7777 3 3 3 11111111111111111 6666 88888888888888888888 2 55 3 3 0 88888888 000000 888 55 88 55 4 4 4 4 4 44 4 4 66666666 4 4 66666666 99999 55 55555 3 3 8 666 1 3 55 55 4444444444444444444 55555 4444444444444444444444 3 55 55 3 0 0 222222 1111 4 4 4 8 4 4 4 4 000000 4 4 4 4 111 4 66666 4 2222222 55 777 4 4 8 55 777 8 4 55 999999 4 55 1111111 4 1 4 66 4 00 55 888 5 5 3 888 00 3 99 6 99
lowQualScore : . ....... . . .. . . . .. .. . . ............ .. . . . . .. . .... . ... .. . . ........ ... . . . . .. ...... . . .......... . . ..... ..... .. . . ... . . ...... .. .. . .. ............ . ... .. ... ... . . ... . . ....... . .. .. . . . . . .. . . . . .. . . . . . .... ..... . . . . ........... . . . . . ........... . . ..... . . . . . .. . . . .. ... . . . ... ..... . . . .. . . ..... . . ... .... . . . ................. .... .................... . .. . . . ........ ...... ... .. .. .. . . . . . .. . . ........ . . ........ ..... .. ..... . . . ... . . .. .. ................... ..... ...................... . .. .. . . . ...... .... . . . . . . . . ...... . . . . ... . ..... . ....... .. ... . . . .. ... . . .. ...... . .. ....... . . . .. . .. .. ... . . . ... .. . .. . ..
lowQualScore : 7 2222222 0 0 99 0 0 0 99 99 0 0 222222222222 99 0 4 4 4 44 0 5555 0 000 55 0 0 55555555 333 4 4 0 0 55 888888 6 6 9999999999 6 6 55555 11111 88 6 6 444 6 6 111111 33 66 0 55 000000000000 0 000 55 666 777 0 0 777 6 3 0000000 0 55 99 0 0 0 6 0 44 0 0 0 0 11 0 0 0 0 0 5555 99999 0 0 0 4 33333333333 0 0 0 8 4 77777777777 0 0 00000 0 0 4 4 0 55 3 6 6 00 000 6 6 3 444 99999 6 6 6 00 6 6 55555 3 3 000 7777 6 6 6 55555555555555555 3333 33333333333333333333 0 00 6 6 7 55555555 888888 888 55 77 55 0 0 0 0 0 88 0 0 00000000 0 0 11111111 22222 55 77777 6 6 2 444 8 6 00 00 3333333333333333333 55555 1111111111111111111111 6 88 00 6 1 1 111111 4444 4 4 4 9 4 4 4 4 333333 4 4 0 0 000 0 88888 0 3333333 55 000 0 0 0 55 000 0 0 55 555555 0 55 0000000 0 1 4 11 4 66 44 888 0 0 4 888 00 0 22 7 22
consensus : ACCCTAAGT-CCCAAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAAAAA------------TC--TTT-GTT-A-C-CAN-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA--TAT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-----ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCTA-G--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--A-C-GA--GC-TA-ATTTT--AAACAG-A-TTTAGTGC-------G-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACG-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAN--T-AC-ATACC-ATG-ATTTATTAT---------T-GT-CTG-CA-TATATCA-C-------GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-TT-TCGTCGT-CACACAAA-A-T-GTGGTCTA---CGTA-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTTTG--CA-T-TGCAA--------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TATTT-CGACAC-C-C---C----TTCA-CA-C-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TACACA-T--ACA--AAAC-ATG---------T-AT--GATG--A--AAC---TCACCG------G-----CTATC-CAAT--GT-TTTGCACC-CAGA-GGTTTTGCA--TTTCGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G---AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-----AAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA--GG-GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
Reference ( family-2715 ) : ACCCTAAGT-CCCAAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAAAAA------------TC--TTT-GTT-A-C-CAN-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA--TAT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-----ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCTA-G--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--A-C-GA--GC-TA-ATTTT--AAACAG-A-TTTAGTGC-------G-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACG-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAN--T-AC-ATACC-ATG-ATTTATTAT---------T-GT-CTG-CA-TATATCA-C-------GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-TT-TCGTCGT-CACACAAA-A-T-GTGGTCTA---CGTA-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTTTG--CA-T-TGCAA--------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TATTT-CGACAC-C-C---C----TTCA-CA-C-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TACACA-T--ACA--AAAC-ATG---------T-AT--GATG--A--AAC---TCACCG------G-----CTATC-CAAT--GT-TTTGCACC-CAGA-GGTTTTGCA--TTTCGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G---AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-----AAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA--GG-GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
gi|1 : ACCCTAAGT-CCCAAG-------TATTATG--TTC-GTACAGT--G--TGT-AAAAAAAA-----------TA--TTTCGTTTA-C-CAT-GG-TAA----CTACGAATCATT---TAACAA-TGG-------T--------ATGTA--TAT-TTTC-GATAATCACAAGAT--CAATCTCATAGTAATGACAATGGATG-TGC----------GCACA-CAC-AAT-T-----TG-------AG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GTT-----CCAGTA--GCCTA-GGATCAAA---GAG-GTTT-TGTAT-TC---TTTA-A-GA--GA-TA-ATTT---AAACAG-ACTTTAGTGC-------GAGAGAGAGTCGTT-CGA-T-CACTCCT-ACG-AAATA-CAATTG--AA-TGCAATGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAG--T-ACTATACC-ATG-ATTTTTAAT---------T-GT-CTGGCAATATTTCATC-------GTCTAAACCACCT-CGCCCGTGTTTTACTGATGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGATAAA-TT-TCGTA---CACACAAATA-T-GTGGTCTA---CGTA-C---ACAATATTTCCG-TCATGTGCGCGAATCAAA--C-AA-AGC-T--GACAG-GTTGTACTTGTG----TCT----CGCA-CAAAA-CCATC-A-----TT-------TTGTATTAAAATGAC---------------------TTTG--CA-TATGCCA--------AAGT-----GTT---ATT--GTA-AGGACCAT-ATGCAC-TAGACC-CTT-TATTT-CGATAC-CAC---CGT--CTCA-CAGC-G------TAC-----T--CATAGC--AC-AA-AGCCCTCGTACACAGG--GCA--AAAC--------------------ATG--A--AAC---TAA---------------CTACT-C--------------CT-CA-A-GTTTTTG-G--TTTCGA-T-GAA-TTTCTGATGG-TA-TA-GTAA--T---C-ATCCA-GTA-TTTTATATG-GGAAG-ACA--AC-GTATAT--GA--C---A--T-TC-TTT--TT---TCACA-T--T------AAAGAAAAGGTAG--AGC------TG-TGT-CAA--GGTGAT--CCTACA---TC-CCCACCCCTCCAGAGGCA---GGG-CACTCACTTGCTATACTTAGG--TT
gi|10 : tatgtacaggagtgcaccgtttttaccaaaaggtcgtaagtcctaaacttatcgtaagacataacttcgatgtacgacaggttgtacaaagaattttagacttacgggtatactgacgaaattcgcttcgtaagtttctacaaccgcccgggggcg-A-TTTAGTGC-------A-GGGAGA--TGTA-AAA-T--A-TCCT-ACA-AA-AA-GAAGG---AA-GGC--TGTGCC-AG-C-TGCCA-TT-A----AAG--T-AC-GTACC-ATG-ATTTGTTAT---------T-GT-CTG-CA-TACAT-G-C-------GTC----CCACCT-T-----TGTT--------------TGCGTCA-CATT-A--TCTGGT-AA-CT----TCGT-CAC-CAAA-A-C-GGTGCTTA---CGTG-TAGAAC-ATGTTGCCG-TCA-GTGGGCGGATCAAA--CAAA-AG--C--GGCAG-G-TGtcgt
gi|11 : ttctagttaactgatttAT-AA-TT-TTGTC----ACATAAA-A-T-GTGGTCTG---CGTA-A---AC-ATATTTTCG-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--G--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAT------------------ATATATG--CA-T-TGCAA--------GACT-----ATT-A-ATT--AAG-AGAA--AT-ATGCGC-TAGACC-C-T-TATTT-CGACAC-T-C---C----TTCA-CA-C-A------TACT----T--CAT-GG--AC-AA-AGCCA---TACAAA-T--ACATGAAAC-TTGGAAGTTCTCT-ATCAAATA--A--CACTATTGATCGATTATCA-----CTATC-CAAT--GT-TTTcgtgccataacttttcaatgcattttttaaagtatgcatggcacccttttacatggacat
gi|12 : AT-CA--AC-AA-AGCCC---TATACA-T--ACA--AAAC-ATG---------T-AT--GA-G--A--AAC---TCATCG------G-----C-ATC-CAAT--GT-TTTGCACCACAGA-GGTTTTGCAT-TTTTGG-TAGAATTTT-TG-TTG--A-TA-GTAA------C-AT-AA-A-A-TTA--TATGAGGAAG-A-A-----G---ATAATG--C---ATAT-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-------AAAAAAAGGT-GATAG-------TG-T-T-TAA--GG-GATC-CCT--A---CC-CCC-CCCTTCCGGGGGGAACCGGGCCACTCAC
gi|13 : -TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTTTA---AT-GTTC-GATG-CCACAA-AT--CAATCACA------TAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-TAC-AATGT-----TG-----CGAT-TGT-TT-C---ACA-ATA-GT------CCA-TA--ACCTA-G--TCAA-------------GGTAT-TA---T--A-C-GA--GC-TA-ATTTT--AAACAG-A-
gi|14 : -C--TCTGAT-AA-TT-TCGTC----ACACAAA-A-T-GTGATCTA---CGTA-A---AC-AT--TTCCG-TCA-GTGCGTGGATCAAA--C-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACATGAGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCCT--GTTAATTT-------TTGT-T--AAATAA------TG-------TTGA-CTTTTG--CA-T-T
gi|15 : cT-A-C-TAT-GG-TAA----TTAA-AATCATT---CAAGA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA-----------------------AT---AATCTCA------TAATAA-AGACG-TGC----------GAACA-CAC-AACGTTGCGATG-----CGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CC
gi|17 : A-----ATAATAA-AGACG-TGA----------GAACA-CAG-AACGT-----TGCATTCCGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCc
gi|18 : ggctgcatttctaatTACC-AG-C-CGTCA-TT-T----AAAAGT-AC-ATACC-AT------------------------------A-TATAT------------TCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGcccggatagt
gi|2 : CCCTAAGTTCCCAAGGAGTGTGT-TG-TG--T-CAGTA-GGT--GATT-T-AAAGAAAGAAA--------TC--TTT-GTT-A-C-CAATGG-TAAATTATCAC-AATCCTTGATCCACAGCTGGACTGTCATAGTAAATTTTCTAATTATTGTTCTGATC-T-ACAA-AA--CAATCTCA------TAATAA-TGATG-T-C----------AAACA-CACTAACGTA----TG-----CGAGATGT-TT-CCACACG-ATAAGT------CCA-TAA-GCCTA-G--TCAAGTTGG-GCGATTTGGTAT-TC---T--A-CCGA--GCATA-ATTTTTTAAGCAG-ACTTTAGTGC-------GAGAGAGA--TGTTTAGAATACA-TC-T-ACGGAA-TAACAATCTGTAAGTGC--TGTACC-AG-CGTGCCA-TTAC----AAG--TTAC-ATACCCATG-ATTT-TAAT---------T-GTTCTG-CA-TAT-TTA-CTATTT--GTCTAA-C-ACTC-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTG-T--A-TT-TCGCCGT-CACAC-AA-A-T-GTGGT-------AAA-C---AC--TATTTC------------CGGAT---------------------------GTACTTATGT---TCTGCGCCACACC-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T----ATGGC-----TC-------T----CTTTTGGCCA-T-TTAAAGCTCAGCGGACTATATAGTTAA-ATTGCGTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACCTC-TCTATTT-CGA-ACAC-C---C----TTCA-TA-C-GTACCCCTACT----T--CAT-GGGTAC-AA-GTCTC---TAAAC-------------C-ATA---------TAAT--GATG--A--A------CACTT------C-----CTATCACATT--GT----------------------CA--TTTGGG-TAGAT-TTTATA-TTGTTA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGG--------------------G--C---AT-T-TC-TTT--TTCCACCA-A-T--T-------AAAAAACGGT-T--TG-------TGTTGT-TAAGTGG-GATCGCCTA-A---TTGCCC-GCCGTCCGGGGGTG---GG---ATTCACTT--T-TA-TTCGG--TTGT
gi|3 : ccattttcttaagtgtaaggacgcatatggttataacgaatgtatgtcaatcgttatttaaaccaagattgatagggatttatgggtctacaacgaaaatcttgggaggtctaagtctacgaccgcaacgggggcacgatCCTAAGT-CCCA-G-------T-TT-TG--T-C-GTC-AGCTGG--T-T-CCAAAAA------------TC--TTT-ATT-A-C-CAA-GGGTACC---TTAC-AATC-TT---CA-CA--TGG-CTG-CAT--------TTCC---TAT-GTTC-GATA-TCACAA-----CA-TCTCA------TATT----GATG-TGC----------GA-CATCAC-AACGTA----CG-----CGAG-TGT-TTTC---ACG-ATA-GTTATAAGCC--TG--GCCTA-G--TCAAG---G-G-GAT--GGTAT-TC---T--A-A-GC--AC-TACATTTT--AAAC-G-A-TTTAGTGC-------G--AGCGC--TGTT-AGA-T-CA-TC-T-ACA-AA-TA--ACTTT-TAA-TGC--TGTA-C-AGCC-CGTCA-TT-C----AAC--T-AC-ATACC-ATG-CTTTATTAT---------TCGT-CTA-GA-T-T--------------TTTAA-ACAACT-T-----TGTTT--C---TGTAC-ATGTGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-T-----TCGT-CACAATAA-A-TCGTGGCTTAACCCGTACC---AC-ATATTTCCGTTCA-GTGCGCGGATC-AA--C-AA-AG--T--GGCCG-G-TG-ACTTGTGTTTATCT----CGCA-C-CAA-CCAT---------------------------ATGAC-----TT-------TTCAGTTTTGC--CA-T-TGCCA--------GACT-----GTT---ATT--GT---CGG--AT--TGCACGTAGA-C-C-T-TATT----GCA--C-G---C----TTCA-CA-C-G------TA-T----T--CAT-GC--AC-CA-G---C---TATACA-T--ACA--AAAC-AT----------T--T--GATGGAA--AAC---T--CCG------G-----CT-TA-CAAT--GG-TTTGCACC----A-GGGTTTGCATTTTTTGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C----CA-GTA-TT---TATGAGGAAGTA-A--AC-AGATAT--TGGCC---AT-TATC-TTT--TT---CCA-A-T--T-----AAAAAA----GT-G--AG-------TG-TGT-T-C--GG-GATA-CCTA-ACCCCC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GAC-CACTCATTT--TAT--TTAGGGCTTGTa
gi|4 : ggcccgttttctaaaggtcgtaagtcctacaccttagtcgtacgacatgctacgatgtacgccgttttacaaagattctaggacttgccgggcttaacgacgaaatgtcggtcgtaagtactagcgagcccgggggcgaACCCTAA-T-CCTAA-------------TGATC-C-GTA-TGT--G--T-C-AAAAAAA------------TCTATCT-ATT-A-CATAT-GG-TAA----TTAC-AATAA-T---CAAGA--T-G-CTGCCAT--------TTCag
gi|4 : tccagggcccgtttctacaaaagtcgtaagttcctaactactctaagcataattcttcgactatacgaccgtctacaaagatttacttacgagttacgacgaaagttcagtcgctaagttacggaccgcccgggcgTA-TTACAT-ATGGTAATTACA-----ATAATCA-AGATGCTGCCATTTCGCTAAAACA-CAC-AA-GTATGCATG-----CGAG-TGTCTT-C---ACGTATA-GT------TC-------CCCG-A--TT-----------ACT-CGTATATCCATT--A-T-GA--AC-TA-ATT---------G-A-TTTGGTATTAGTCAAG-GA-AAA--TG---AG-----A-TCCTAACG-AC-CGCCAATTT-TAA-gctaaaacacacaagtatgcatgcgagtgtcttcacgtatagttccccgattactcgtatatccattatgaactaattgatttggtattagtcaaggaaaatgagatcctaacgaccgccaattttaaacagcatttgcggagaatgtatatcatcttcaatacaaatttaaatctgtaccagccgtcattttaaaagctacataccatgatttattatatattatattgtctgcaaaatcatactaaccacctcttgtttacttttacaatgcgtcatcttcctctataaatttacgtcacacaaaattgtggtctacgtaaacatgattccgtcagtcgccgatcaaacaacagtgacactgaacggtgttctcgcacaaaccatactctttgtaaatgaaaatggttctgacttttgccattttaagactgttaattaacaaaaatatgcactagacccttatttcgacaccccttcaccatgtacttcatgaacaaaccatacacatcgataaaacaatgtcaaatacaatgaacttggaaatattattcgattaatcacgtaccaatgttttgtagaatttttataatcaacaggtatttatgaaaaaactgtactgttttcttttttcaattaagaaaaaagtgagtat
gi|4 : tccagggcccgtttctacaaaagtcgtaagttcctaactactctaagcataattcttcgactatacgaccgtctacaaagatttacttacgagttacgacgaaagttcagtcgctaagttacggaccgcccgggcgaccctaatcctaatgatccgtatgtgtcaaaaaaatctatcTA-G--TCAAG---G-A-AAAT-GAGAT-CC---T--AAC-GACCGC-CA-ATTTT--AAACAGCA-TTT---GC-------G-GAGA-A--TGT--ATA-T-CA-TCTT--C--AA-TA-CAAATT-TAA-ATC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-TTAAAAGC--T-AC-ATACC-ATG-ATTTATTATATATTATATT-GT-CTG-CA-AA-ATCA-T-------A-CTAA-CCACCTCT-----TGTTT-ACTT-T-TACAATGCGTCATC-TT-CC-TCT-AT-AA-AT-TTA-CGT-CACACAAA-A-TTGTGGTCTA---CGTA-A---AC-ATGATTCCG-TCA-GT-CGCCGATCAAA--C-AACAG--T--GACAC---TGAACG-GTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----CTCT-----TTGT----AAATGAAAATGGTT-------CTGACTTTTGC--CA-T-TTTAA--------GACT-----GTT-A-ATT--AAC-AAAA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TATTT-CGACAC-C-C---C----TTCACCA-T-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-A-CCA---TACACA-TCGATA--AAACAATGTCAAA----T-AC--AATG-----AAC---T---TG------GAAATATTATT-CGATTAAT-CACGTACC---AA-TGTTTT----------G-TAGAA-TTT-T------TA-----TAA--T---C-AA-CAGGTA-TT---TAT---GAAA-A-A--ACTGT--AC--TG--T----T-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-----AAGAAAAAA-GT-G--AG-------TA-Tacagcatttgcggagaatgtatatcatcttcaatacaaatttaaatctgtaccagccgtcattttaaaagctacataccatgatttattatatattatattgtctgcaaaatcatactaaccacctcttgtttacttttacaatgcgtcatcttcctctataaatttacgtcacacaaaattgtggtctacgtaaacatgattccgtcagtcgccgatcaaacaacagtgacactgaacggtgttctcgcacaaaccatactctttgtaaatgaaaatggttctgacttttgccattttaagactgttaattaacaaaaatatgcactagacccttatttcgacaccccttcaccatgtacttcatgaacaaaccatacacatcgataaaacaatgtcaaatacaatgaacttggaaatattattcgattaatcacgtaccaatgttttgtagaatttttataatcaacaggtatttatgaaaaaactgtactgttttcttttttcaattaagaaaaaagtgagtat
gi|5 : tccagggcccgtttctacaaaagtcgtaagttcctaactactctaagcataattcttcgactatacgaccgtctacaaagatttacttacgagttacgacgaaagttcagtcgctaagttacggaccgcccgggcgaccctaatcctaatgatccgtatgtgtcaaaaaaatctatctattacatatggtaattacaataatcaagatgctgccatttcgctaaaacacacaagtatgcatgcgagtgtcttcacgtatagttccccgattactcgtatatccattatgaactaattgatttggtatACCCTAAGT-CCCAAA-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAAA--------------TC--TTT-GTT-AAC-CAA-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA--TAT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-----ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAG-AGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCTA-G--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--A-CCGA--CC-TA-ATTT----AACAG-A-TTTAGTGC-------G-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACA-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTC--TT-C----AAC--T-AC-ATACC-ATG-ATTTATTAT-----------GT-CTG-CA-TATATCA-CTCGTCGCGTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-TTATCGTCATGCATACAAA-A-T-GTGGACTA---CGTA-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGCGGATCAAAACC-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-ACAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTTTG--CA-T-TGCAAA-------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TATTTTCGACAC-C-C---CATAATTCA-CA-C-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TATACA-T--ACA--AAAC-ATG---------T-ATATGATG--A--AAC----CACCG------G-----CTATC-C--T--GT-TTTGCCCC-CAGA-GGTTTTGCA--TTTTGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G---AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--TA----AAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA---G-GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCTTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
gi|6 : CTAAGT-CC-AAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-TTAAAAAAA------------TC--TTT-GTT-A-C--AA-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-AAT--------T-CTA---AT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCT-------ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAA--GT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCTAAG--TCAAG---G-G-TAT--GGTAT-TC---T--A-C-GA---C-TT-ATTTT--AAACAG-A-TTAAGTGC-------G-GGAGGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-AC--AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTAC--AG-C-CGTCA-TT-C----AAC--T-AC-ATAC--ATG-ATTTATTAT---------T-GTTCTG-CA-TATATC--T-------GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA---TC-C--TCTGA--AA-TT-TCGTC----ACACAAA-A-T-GTG-TCTA---CGTAAC---AC-ATATTTC-G-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-GA--T--GACAGAG-TGTACTTGTGT---TCT----CGC--C-AAA-CCAT--A-----TT-------TGGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTT-G--CA-T-TGCAA--------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--ATCATGCAC-TAGACC-C-T-TATT--CGACAC-C-C---C----TTCA-CA-CTG------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TATACA-T--ACA--A--C-ATG---------T-AT--GATG--A--AAC---TCACCG------G------TG-C-CAAT--GT-TTTGCACC--AGA-GGTTTTGCA--TTTTGA-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTATTT---TATGAGG-AG-A-ACGAC-GAT-AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T------AAAAAAAGGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA--GG-GAT--CCTA-A---CC-CCC-CC---TCGGGGGGA---GGT-CA-TCAC-T--TATA-TTAAG--GTGT
gi|7 : AAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAAAAA------------TC--TTT-GTT-A-C-CAA-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA---AT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA------TAAGAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAA-AGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCTA-G--TCAAG---G-G-AATT-GGTAT-TC---T--A-C-GA--CC-AA-ATTTT--AAACAG-A-TTCAGTGC-------G-GACAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACA-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACCAAG-C-CGTCATTT-C----AAT-------ATACC-ATGTATTTATTAT---------T-GT-CGA-TA-T-TACTT-C-------GTTCAA-ACACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-CCGTCTGATCAATTT-TCG--GT-CACACAAA-AGT-GTGGTCTA---CGTA-C---AC--TATTTCC--TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--TGGGACAG-G-TGTACTT-TGT---GCT----CGCA-C-AAACCCAT--A------T-------TTGT-T--AAAGGAC-----TT-------TTCAG-TTTTG--CATT-TGC-A--------GAC-------TT-A-ATT--GTA-AGG---AT-AT-CAT-AAGACC-C-T-TATTT-CGACAC-C-C---C----TTCA-CA-CGG------TACTATTAT--CCT-TA--AC-AA-A-CTC---TATACA-T--AC---AAAC-ATG---------T-AT--GATG--A--AAC---TCATCG------G------TATC-C-AT--GT-TTTGCACC-CAGAGGGTTTTGTA--TTTTGGTTAGAC-TTT-TG-TTG-TATTA-GTAA--T---CGAT-CA-GTA-TT---TATGAGGAGA-A-G--AC-G---ATTGTG--C---AT-T-TCTTTT--TT---TCA-A-T--T-------AAAAAAAGGT-G--AG-------TG-T-T-TAA--GG-GATC-CCCT-A---CC-CCC-CCCCTCCAGGGGGA---a
gi|8 : CCCTAAGT-CCCAAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAAAAATCTAAAAAAAAATC--TTT-GTT-A-C-CAT-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA---AT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA------TGATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AGCGT-----TG-----CGAG-TGA-TT-C-----G-A-A-GT------CCA-TATAGCCTA-G--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--A-C-GA--GC-TA-ATTTT--AAACAG-A-TTTAGTTC-------G-GAGAGA--TGTT-AGATT-CA-TTCT-ACG-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAG--C-AC-ATA-C-ATG-ATTTATTAT---------T-GT-CTG-CA-TATATCATC-------GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TTCC--TCTGAT-AA-TT-TC--TGT-CTCACAAA-A-T-GTGGTCTA---CGTA-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGTGGATCAAA--C-AA-AGAAG--GACGG-G-T---CTTGTGT---TCT----CGTA-C-AAA--CAT--A--------------TTGT-T--AAATGAC--------------------TTTTG--CA-T-TGCAA--------GACT-----GTT-A---T--AT----GA--AT-ATGCAC-TAAGAC-C-T-TA-TT-CGACAC-C-C----------TA-CA-C----------------------------------------------A-T--ACA--AAAC--------------------ATG--A--AAC---TCA---------------CTATC-CAAT--GT-TTTG
gi|8 : A-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-GAT-AT--TG--C---AT-T-TCTTTT--TT---TCA-GTT--T-----AAAAAAAAAGGT-G--AGTGCAATATG-TGT-TAA--GG-GATC-CCTA-A---C-----------GGGGGGGGG---GGG-GGGTCACTT--TATA-TTAGG--TTGTgtagtatttatgaggaagaaacgatattgcatttctttttttcagtttaaaaaaaaaggtgagtgcaatatgtgttaagggatccctaacgggggggggggggggtcactttatattaggttgta
gi|9 : ccctaagtcccaagttttgtcgtaagtgttaaaaaaatctaaaaaaaaatctttgttaccatggtaattacaatcattcaacatggctgcatttctaatgttcgatatcacaaatcaatctcatgataaagatgtgcgaacacacagcgttgcgagtgattcgaagtccatatagcctagtcaaggggattggtattctacgagctaattttaaacagatttagttcggagagatgttagattcattctacgaatacaattttaatgctgtaccagccgtcattcaagcacatacatgatttattattgtctgcatatatcatcgtctaaccacctttgtttactgtgtacaatgcgtcacttcctctgataatttctgtctcacaaaatgtggtctacgtacacatatttccgtcagtgcgtggatcaaacaaagaaggacgggtcttgtgttctcgtacaaacatattgttaaatgacttttgcattgcaagactgttatatgaatatgcactaagaccttattcgacaccctacacatacaaaacatgaaactcactatccaatgttttggt-G-TGTACTTCTGTG--TCT----CGCA-C-AAG-CCATCTA-----TCCAATGTGTGGT-T--AGA-AAC-----TTCTAAAATTTCAGTTG--G--CA-T--GCAA--------GAC------GTT-ATAAT--GTATAGGA--AT-AT-CA--TA-ACC-C-T-TATAT-CGACTC-A-CAAGC----CTCA-CA-C-G-------ATG----TAACAT-GA--ACCAACAGCCC---TACACA-T--ACA--AAAC-A-----------------GATG--AGTAAC---GCACAA------------------CATT--GTATATAAACG-CA----TTTTTGC------CAG-TAGAA-TTA-AG-TTG-TA-TAGGTAAAGTTCAC-AT-CA--TA-TT---ATTGATGGTG-G-G--TC-G---ATA-TG--TCTAAT-T-TC-TTTTCTT---TCATA-TAATGAAAAAAAAAAAAAGAG-G--AGT------TG-TGTGTAA--GG-a
blockSeqs : T GAGTGTG . . AT . A . TG AT . T TCTAAAAAAAAA TA . . A A AT G ATTA . GAT GC A T AGTAAATT ATT T T . . GG A . C CATTTCGCTA T T TGCGA CATTC AT C T CAC T A TATAAG A TA A . TTGGGCGATTT A CAT . CC CCG A C TTT C C TAGTCAA A . TT A A . C A GG . A G G . A C G T A TAAA AAGT . C T G ATATTATATT T . . A CACTCGTCGC . C . . . T A C CG C T A GT ATG . G C ACC TAGA . T . AC A C TGG A . TTA GCGC C . C CTATCCAATGTG T TTCTAAAATTTCAGT T GC T . GCTCAGCG TATATA AA GC AT . C G T . C TT A . CATAA C . GTACCCC TATTA AA GGGT C C G . C . CG TG TTGGAAGTTCTCTATCA GAA TATTGATCGATTATCAC A AA TA A ACAGA CATT T T T A . T T G AGTTCA G . G T A T ACGA T GATAT GC CTA A A T TC CCA T T AA GAAAAA . AT TGCAATA T G G GT . CG A CCC G . T ACC GC C . . GC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . GAAA . . . . . T . C . . . . C . T . . . . . A . . . . . ATGCA . T . . . . . . A A . . GAAAAT . . . AC G . . T . . . . . A T . . C . A . C . . . . . . . . . GTT . . . A TC T . . A TACTATTT . . . . . . . . C . . . GT GT . . T . CC . . . . . . AAG . . G . . . . GTTAATTT T AATGGTTCTGACT T . . . A T AT . G . . . . . . T . . AAGC . . TG T . GG . . G . T . . . AATGTCAAATAC AGT TTGGAAATAT . AA . . CAGAG CAT G . . . . . . . T . . . . . . AA . ATAA . . . . T . . . . . AA . . T . G . . . C A . . . G . C T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . A . T . . . . . . A . . . GGGATT . . . CC G . . T . . . . . T . . . T . A . . . . . . . . . . . GT . . . A T . . . A CATC . . . . . . . . . . . . GC GT . . . . AC . . . . . . C . . . . . . . ACTCT T TTTTCAGT T . . . . T A . A . . . . . . T . . C . . GG T . CA . . T . A . . . ATGTATAT A TCATCGGC . AT . . CAGA CA T . . . . . . . T . . . . . . AA . ATAT . . . . . . . . . . A . . . . G . . . A A . . . C . G C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . T . . . . . . A . . . GGAATT . . . C A . . T . . . . . T . . . C . G . . . . . . . . . . . CT . . . A T . . . A CAT . . . . . . . . . . . . GT GT . . . . A . . . . . . G . . . . . . . ATT T TTTTCAGT G . . . . T A . C . . . . . . T . . C . . A T . GC . . G . T . . . ATATAAT A CACTTCC . AA . . AGA CA T . . . . . . . T . . . . . . AA . ATTG . . . . . . . . . . A . . . . G . . . C A . . . T . T C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . A . . . GGGATT . . . A A . . T . . . . . T . . . C . A . . . . . . . . . . . CT . . . A T . . . A TTC . . . . . . . . . . . . GT GT . . . . A . . . . . . T . . . . . . . ATT T TTTTCAGT G . . . . T A . A . . . . . . T . . C . . G T . GA . . G . C . . . ATGTAT A CACCGGC . GA . . AA CA T . . . . . . . T . . . . . . GA . ATAT . . . . . . . . . . A . . . . G . . . C T . . . C . G G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . A . . . GGGAT . . . T C . . T . . . . . T . . . C . A . . . . . . . . . . . CT . . . A T . . . A GC . . . . . . . . . . . . T GT . . . . C . . . . . . T . . . . . . . ATT T TGTTGAC T . . . . T A . A . . . . . . T . . C . . G T . GA . . G . T . . . ATGTAT A TCACCGG . AA . . CA TA T . . . . . . . T . . . . . . AA . TAC . . . . . . . . . . . . . . . G . . . C A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . GGTAT . . . C C . . T . . . . . T . . . C . G . . . . . . . . . . . CT . . . A T . . . A CT . . . . . . . . . . . . T GT . . . . A . . . . . . T . . . . . . . ATT T TTTTCAG T . . . . T A . A . . . . . . T . . C . . G T . GA . . . . T . . . ATGTAT A TCATCGG . AA . . A C C . . . . . . . T . . . . . . GT . ATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . ACT . . . C G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . AT T TCTC T . . . . . A . . . . . . . . . . . C . . G G . TA . . . . T . . . ATTT A TCCGGC . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . A . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . C . . . A A GCACAA . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCAC . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ************ ** *** ****** ****** A* ** GGGATT****** ** T** ** ** CGC******** ***** GT* T**** ATT************** T*** TTTTCAGT************ A** ** C******* T**** GA*** *** ATGTAT************* TCATCGGC************** AA CAGA** CA** *** AA*** ATAN*** ******* C* A* **
originalCons : ACCCTAAGT-CCCAAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAAAAA------------TC--TTT-GTT-A-C-CAN-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA--TAT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-----ATAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCTA-G--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--A-C-GA--GC-TA-ATTTT--AAACAG-A-TTTAGTGC-------G-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACG-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAN--T-AC-ATACC-ATG-ATTTATTAT---------T-GT-CTG-CA-TATATCA-C-------GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-TT-TCGTCGT-CACACAAA-A-T-GTGGTCTA---CGTA-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTTTG--CA-T-TGCAA--------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TATTT-CGACAC-C-C---C----TTCA-CA-C-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TACACA-T--ACA--AAAC-ATG---------T-AT--GATG--A--AAC---TCACCG------G-----CTATC-CAAT--GT-TTTGCACC-CAGA-GGTTTTGCA--TTTCGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G---AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-----AAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA--GG-GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
finalCons : ACCCTAAGT-CCCAAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAAAAA------------TC--TTT-GTT-A-C-CAN-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-CTG-CAT--------TTCTA---AT-GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA------TAATAA-AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CCA-TA--GCCTA-G--TCAAGGGGATT------GGTAT-TC---T--A-C-GA--GC-TA-ATTTT--AAACAG-A-TTTAGTGC-------G-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACG-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAN--T-AC-ATACC-ATG-ATTTATTAT---------T-GT-CTG-CA-TATATCGC--------GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-TT-TCGTCGT-CACACAAA-A-T-GTGGTCTA---CGTA-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AGT----GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCATATT--------------TTGTT---AAATGACTTTTCAGT------------TTTTG--CA-T-TGCAA--------GACT-----GTTA--ATT--GTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TATTT-CGACAC-C-CC-------TTCA-CA-C-G------TACT----T--CATGA---AC-AA-AGCCC---TACACA-T--ACA--AAACATGTAT-------------GATG--A--AACTCATCGGC--------------TATC-CAAT--GT-TTTGCACCCAGA--GGTTTTGCA--TTTCGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-AAA---C-GATAN---TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-----AAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA--GG-GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): GGGCCCGTTTTACAAAAGATCGTAAGTCCTAAACTTAGTCGTAAGACATAACTTATGATGTACGATGAAGGCCGCGATTTACAAAAAC
Unaligned ( gi|19 ): AAGTCCTAAACTTACTTGCAAGACATATACTTACAAAGTAAGGGCCACTTTACAAAGAT
Unaligned ( gi|20 ): CATTTTACAAAAGATCGCAAGTCCTAAACTTAGTCATAAGACATAAC
Unaligned ( gi|21 ): GGGCCCCTTTTTACAAAAAGTCGTAAGTCCTAGACCTAGTC
Unaligned ( gi|22 ): GGCCCGTTTTACAAAAGGTCGTAAGTCCTAAACTTA
Alignments
lowQualScore : 1111111 222222222222 1111 1111 11111111 1111111 1111111111 22222 111111 1111 1111111 11 111111111 444444444444444444 11111 111 11111 11111 111 33333333333333333 33333333333333333333 11111111 111111 11111111 11111111 4444444444444444444 333333333333333333333 1111 1111 111111 111 222222 2222222 11 11
lowQualScore : 5 6666666 5 5 66 5 5 5 66 66 5 5 555555555555 5555 66 5 4 4 4 55 4 2222 4 777 99 3 3 7 33333333 4 8888 4 3 0 88888 7 1111111 3 5555555555 3 3 55555 99999 33 3 3 666 3 3 444444 1111 4 4 55 888888888888 4 777 55 888 888 4 4 888 3 7 3333333 8 55 44 8 4 4 1 4 00 4 8 4 4 66 4 4 4 4 4 8888 77777 4 4 4 2 666666666 4 8 4 4 0 222222222222222222 4 4 00000 4 4 4 4 4 99 7 3 3 44 333 3 3 7 666 11111 3 3 3 55 3 3 22222 3 3 000 7777 3 3 3 11111111111111111 6666 88888888888888888888 2 55 3 3 44 44444444 000000 888 55 88 55 4 4 4 4 4 4 0 4 4 66666666 4 4 66666666 99999 55 55555 3 3 8 666 1 3 55 55 4444444444444444444 55555 3 999999999999999999999 3 5 55 1 9999 4 777 1111 4 4 4 8 4 4 4 4 000000 4 4 4 4 111 4 66666 4 4 88 55 777 4 4 8 55 777 8 4 55 999999 4 55 1111111 4 1 4 66 4 00 55 888 5 5 3 888 00 3 99 6 99
lowQualScore : . ....... . . .. . . . .. .. . . ............ .... .. . . . . .. . .... . ... .. . . . ........ . .... . . . ..... . ....... . .......... . . ..... ..... .. . . ... . . ...... .... . . .. ............ . ... .. ... ... . . ... . . ....... . .. .. . . . . . .. . . . . .. . . . . . .... ..... . . . . ......... . . . . . .................. . . ..... . . . . . .. . . . .. ... . . . ... ..... . . . .. . . ..... . . ... .... . . . ................. .... .................... . .. . . .. ........ ...... ... .. .. .. . . . . . . . . . ........ . . ........ ..... .. ..... . . . ... . . .. .. ................... ..... . ..................... . . .. . .... . ... .... . . . . . . . . ...... . . . . ... . ..... . . .. .. ... . . . .. ... . . .. ...... . .. ....... . . . .. . .. .. ... . . . ... .. . .. . ..
lowQualScore : 7 2222222 0 0 99 0 0 0 99 99 0 0 666666666666 6666 99 0 4 4 4 44 0 5555 0 000 55 6 6 3 22222222 0 5555 0 6 5 44444 3 8888888 6 9999999999 6 6 55555 11111 88 6 6 444 6 6 111111 3333 4 0 55 000000000000 0 000 55 666 777 0 0 777 6 3 0000000 0 55 99 0 0 0 6 0 44 0 0 0 0 11 0 0 0 0 0 5555 99999 0 0 0 4 000000000 0 0 0 0 8 111111111111111111 0 0 00000 0 0 4 4 0 55 3 6 6 00 000 6 6 3 444 99999 6 6 6 00 6 6 55555 3 3 000 7777 6 6 6 55555555555555555 3333 33333333333333333333 0 00 6 6 77 55555555 888888 888 55 77 55 0 0 0 0 0 0 8 0 0 00000000 0 0 11111111 22222 55 77777 6 6 2 444 8 6 00 00 3333333333333333333 55555 6 555555555555555555555 6 7 00 2 3333 4 888 4444 4 4 4 9 4 4 4 4 333333 4 4 0 0 000 0 88888 0 0 66 55 000 0 0 0 55 000 0 0 55 555555 0 55 0000000 0 1 4 11 4 66 44 888 0 0 4 888 00 0 22 7 22
consensus : ACCCTAAGT-CCCAAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAA------------AAA----TC--TTT-GTT-A-C-CAN-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-C-TG-CAT--------TTCTA-AT----GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-TAATAA-------AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CC--A-TA-GCCTA-G--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--A-C-GA--GC-TA-ATTTT--AAACAG-A-TTTAGTGC-------G-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACG-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAN--T-AC-ATACC-ATG-ATTTATTAT---------T-GT-CTG-CA-TATA-------TCG-C-----GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-TT-TCGTCGT-CACACAAA-A-T-GTGGTCTA---CGTA-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTTTG--CA-T-TGC-AA--------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TA-TTTCGACAC-C-C---C----TTCA-CA-C-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TACACA-T--ACA--AAAC-ATG---------T-AT--GATG--A--A-AC---TC----ATCG------GCTATC-CAAT--GTTTTGCACC-CAGA-GG---TTTTGCA--TTTCGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G-ATATTG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-----AAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA--GG-GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
Reference ( family-2715 ) : ACCCTAAGT-CCCAAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAA------------AAA----TC--TTT-GTT-A-C-CAN-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-C-TG-CAT--------TTCTA-AT----GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-TAATAA-------AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CC--A-TA-GCCTA-G--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--A-C-GA--GC-TA-ATTTT--AAACAG-A-TTTAGTGC-------G-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACG-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAN--T-AC-ATACC-ATG-ATTTATTAT---------T-GT-CTG-CA-TATA-------TCG-C-----GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-TT-TCGTCGT-CACACAAA-A-T-GTGGTCTA---CGTA-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTTTG--CA-T-TGC-AA--------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TA-TTTCGACAC-C-C---C----TTCA-CA-C-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TACACA-T--ACA--AAAC-ATG---------T-AT--GATG--A--A-AC---TC----ATCG------GCTATC-CAAT--GTTTTGCACC-CAGA-GG---TTTTGCA--TTTCGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G-ATANTG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-----AAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA--GG-GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
gi|1 : ACCCTAAGT-CCCAAG-------TATTATG--TTC-GTACAGT--G--TGT-AAAA------------AAAA---TA--TTTCGTTTA-C-CAT-GG-TAA----CTACGAATCATT---TAACAA-TGG-TATG-TAT--------------AT----TTTC-GATAATCACAAGAT--CAATCTCA-TAGTAATGACAATGGATG-TGC----------GCACA-CAC-AAT-T-----TG-------AG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GTT-----CC--AGTA-GCCTA-GGATCAAA---GAG-GTTT-TGTAT-TC---TTTA-A-GA--GA-TA-ATTT---AAACAG-ACTTTAGTGC-------GAGAGAGAGTCGTT-CGA-T-CACTCCT-ACG-AAATA-CAATTG--AA-TGCAATGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAG--T-ACTATACC-ATG-ATTTTTAAT---------T-GT-CTGGCAATATT-------TCATC-----GTCTAAACCACCT-CGCCCGTGTTTTACTGATGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGATAAA-TT-TCGTA---CACACAAATA-T-GTGGTCTA---CGTA-C---ACAATATTTCCG-TCATGTGCGCGAATCAAA--C-AA-AGC-T--GACAG-GTTGTACTTGTG----TCT----CGCA-CAAAA-CCATC-A-----TT-------TTGTATTAAAATGAC---------------------TTTG--CA-TATGC-CA--------AAGT-----GTT---ATT--GTA-AGGACCAT-ATGCAC-TAGACC-CTT-TA-TTTCGATAC-CAC---CGT--CTCA-CAGC-G------TAC-----T--CATAGC--AC-AA-AGCCCTCGTACACAGG--GCA--AAAC--------------------ATG--A--A-AC---TA----A----------CTACT-C-------------CT-CA-A-GT---TTTTG-G--TTTCGA-T-GAA-TTTCTGATGG-TA-TA-GTAA--T---C-ATCCA-GTA-TTTTATATG-GGAAG-ACA--AC-GTATATGA--C---A--T-TC-TTT--TT---TCACA-T--T------AAAGAAAAGGTAG--AGC------TG-TGT-CAA--GGTGAT--CCTACA---TC-CCCACCCCTCCAGAGGCA---GGG-CACTCACTTGCTATACTTAGG--TT
gi|10 : tatgtacaggagtgcaccgtttttaccaaaaggtcgtaagtcctaaacttatcgtaagacataacttcgatgtacgacaggttgtacaaagaattttagacttacgggtatactgacgaaattcgcttcgtaagtttctacaaccgcccgggggcg-A-TTTAGTGC-------A-GGGAGA--TGTA-AAA-T--A-TCCT-ACA-AA-AA-GAAGG---AA-GGC--TGTGCC-AG-C-TGCCA-TT-A----AAG--T-AC-GTACC-ATG-ATTTGTTAT---------T-GT-CTG-CA-TACA-------T-G-C-----GTC----CCACCT-T-----TGTT--------------TGCGTCA-CATT-A--TCTGGT-AA-CT----TCGT-CAC-CAAA-A-C-GGTGCTTA---CGTG-TAGAAC-ATGTTGCCG-TCA-GTGGGCGGATCAAA--CAAA-AG--C--GGCAG-G-TGtcgt
gi|11 : ttctagttaactgatttAT-AA-TT-TTGTC----ACATAAA-A-T-GTGGTCTG---CGTA-A---AC-ATATTTTCG-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--G--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAT------------------ATATATG--CA-T-TGC-AA--------GACT-----ATT-A-ATT--AAG-AGAA--AT-ATGCGC-TAGACC-C-T-TA-TTTCGACAC-T-C---C----TTCA-CA-C-A------TACT----T--CAT-GG--AC-AA-AGCCA---TACAAA-T--ACATGAAAC-TTGGAAGTTCTCT-ATCAAATA--A--C-ACTATTG----ATCGATTATCACTATC-CAAT--GTTTTcgtgccataacttttcaatgcattttttaaagtatgcatggcacccttttacatggacat
gi|12 : AT-CA--AC-AA-AGCCC---TATACA-T--ACA--AAAC-ATG---------T-AT--GA-G--A--A-AC---TC----ATCG------GC-ATC-CAAT--GTTTTGCACCACAGA-GG---TTTTGCAT-TTTTGG-TAGAATTTT-TG-TTG--A-TA-GTAA------C-AT-AA-A-A-TTA--TATGAGGAAG-A-A-----G-ATAATG--C---ATAT-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-------AAAAAAAGGT-GATAG-------TG-T-T-TAA--GG-GATC-CCT--A---CC-CCC-CCCTTCCGGGGGGAACCGGGCCACTCAC
gi|13 : -TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-C-TG-CAT--------TTTTA-AT----GTTC-GATG-CCACAA-AT--CAATCACA-TAATAA-------AGATG-TGC----------GAACA-TAC-AATGT-----TG-----CGAT-TGT-TT-C---ACA-ATA-GT------CC--A-TA-ACCTA-G--TCAA-------------GGTAT-TA---T--A-C-GA--GC-TA-ATTTT--AAACAG-A-
gi|14 : -C--TCTGAT-AA-TT-TCGTC----ACACAAA-A-T-GTGATCTA---CGTA-A---AC-AT--TTCCG-TCA-GTGCGTGGATCAAA--C-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACATGAGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCCT--GTTAATTT-------TTGT-T--AAATAA------TG-------TTGA-CTTTTG--CA-T-T
gi|15 : cT-A-C-TAT-GG-TAA----TTAA-AATCATT---CAAGA--TGG-C-TG-CAT--------TTCTA-AT--------------------------AATCTCA-TAATAA-------AGACG-TGC----------GAACA-CAC-AACGTTGCGATG-----CGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CC--
gi|17 : GG-C-TG-CAT--------TTCTA-AT----A---------------------------A-TAATAA-------AGACG-TGA----------GAACA-CAG-AACGT-----TGCATTCCGAG-TGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CC--c
gi|18 : TACC-AG-C-CGTCA-TT-T----AAAAGT-AC-ATACC-AT------------------------------A-TATA-------T----------TCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGcccggatagt
gi|2 : CCCTAAGTTCCCAAGGAGTGTGT-TG-TG--T-CAGTA-GGT--GATT-T-AAAG------------AAAGAAATC--TTT-GTT-A-C-CAATGG-TAAATTATCAC-AATCCTTGATCCACAGCTGGAC-TGTCATAGTAAATTTTCTA-ATTATTGTTCTGATC-T-ACAA-AA--CAATCTCA-TAATAA-------TGATG-T-C----------AAACA-CACTAACGTA----TG-----CGAGATGT-TT-CCACACG-ATAAGT------CC--A-TAAGCCTA-G--TCAAGTTGG-GCGATTTGGTAT-TC---T--A-CCGA--GCATA-ATTTTTTAAGCAG-ACTTTAGTGC-------GAGAGAGA--TGTTTAGAATACA-TC-T-ACGGAA-TAACAATCTGTAAGTGC--TGTACC-AG-CGTGCCA-TTAC----AAG--TTAC-ATACCCATG-ATTT-TAAT---------T-GTTCTG-CA-TAT--------TTA-CTATTTGTCTAA-C-ACTC-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTG-T--A-TT-TCGCCGT-CACAC-AA-A-T-GTGGT-------AAA-C---AC--TATTTC------------CGGAT---------------------------GTACTTATGT---TCTGCGCCACACC-AAA-CCAT--A-----TT-------TTGT-T----ATGGC-----TC-------T----CTTTTGGCCA-T-TTA-AAGCTCAGCGGACTATATAGTTAA-ATTGCGTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACCTC-TCTA-TTTCGA-ACAC-C---C----TTCA-TA-C-GTACCCCTACT----T--CAT-GGGTAC-AA-GTCTC---TAAAC-------------C-ATA---------TAAT--GATG--A--ACAC---T------TC--------CTATCACATT--GT------------------------CA--TTTGGG-TAGAT-TTTATA-TTGTTA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGG------------------G--C---AT-T-TC-TTT--TTCCACCA-A-T--T-------AAAAAACGGT-T--TG-------TGTTGT-TAAGTGG-GATCGCCTA-A---TTGCCC-GCCGTCCGGGGGTG---GG---ATTCACTT--T-TA-TTCGG--TTGT
gi|3 : ccattttcttaagtgtaaggacgcatatggttataacgaatgtatgtcaatcgttatttaaaccaagattgatagggatttatgggtctacaacgaaaatcttgggaggtctaagtctacgaccgcaacgggggcacgatCCTAAGT-CCCA-G-------T-TT-TG--T-C-GTC-AGCTGG--T-T-CCAA------------AAA----TC--TTT-ATT-A-C-CAA-GGGTACC---TTAC-AATC-TT---CA-CA--TGG-C-TG-CAT--------TTCCT-AT----GTTC-GATA-TCACAA-----CA-TCTCA-TATT----------GATG-TGC----------GA-CATCAC-AACGTA----CG-----CGAG-TGT-TTTC---ACG-ATA-GTTATAAGCC----TG-GCCTA-G--TCAAG---G-G-GAT--GGTAT-TC---T--A-A-GC--AC-TACATTTT--AAAC-G-A-TTTAGTGC-------G--AGCGC--TGTT-AGA-T-CA-TC-T-ACA-AA-TA--ACTTT-TAA-TGC--TGTA-C-AGCC-CGTCA-TT-C----AAC--T-AC-ATACC-ATG-CTTTATTAT---------TCGT-CTA-GA-T-T-------------------TTTAA-ACAACT-T-----TGTTT--C---TGTAC-ATGTGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-T-----TCGT-CACAATAA-A-TCGTGGCTTAACCCGTACC---AC-ATATTTCCGTTCA-GTGCGCGGATC-AA--C-AA-AG--T--GGCCG-G-TG-ACTTGTGTTTATCT----CGCA-C-CAA-CCAT---------------------------ATGAC-----TT-------TTCAGTTTTGC--CA-T-TGC-CA--------GACT-----GTT---ATT--GT---CGG--AT--TGCACGTAGA-C-C-T-TA-TT---GCA--C-G---C----TTCA-CA-C-G------TA-T----T--CAT-GC--AC-CA-G---C---TATACA-T--ACA--AAAC-AT----------T--T--GATGGAA--A-AC---TC------CG------GCT-TA-CAAT--GGTTTGCACC----A-GG---GTTTGCATTTTTTGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C----CA-GTA-TT---TATGAGGAAGTA-A--ACAG-ATATTGGCC---AT-TATC-TTT--TT---CCA-A-T--T-----AAAAAA----GT-G--AG-------TG-TGT-T-C--GG-GATA-CCTA-ACCCCC-CCC-CCCCTCCGGGGGGA---GAC-CACTCATTT--TAT--TTAGGGCTTGTa
gi|4 : ggcccgttttctaaaggtcgtaagtcctacaccttagtcgtacgacatgctacgatgtacgccgttttacaaagattctaggacttgccgggcttaacgacgaaatgtcggtcgtaagtactagcgagcccgggggcgaACCCTAA-T-CCTAA-------------TGATC-C-GTA-TGT--G--T-C-AAAA------------AAA----TCTATCT-ATT-A-CATAT-GG-TAA----TTAC-AATAA-T---CAAGA--T-G-C-TGCCAT--------TTCag
gi|4 : tccagggcccgtttctacaaaagtcgtaagttcctaactactctaagcataattcttcgactatacgaccgtctacaaagatttacttacgagttacgacgaaagttcagtcgctaagttacggaccgcccgggcgTA-TTACAT-ATGGTAATTACAATAATCA-------AGATGCTGCCATTTCGCTAAAACA-CAC-AA-GTATGCATG-----CGAG-TGTCTT-C---ACGTATA-GT------TC--------CCCG-A--TT-----------ACT-CGTATATCCATT--A-T-GA--AC-TA-ATT---------G-A-TTTGGTATTAGTCAAG-GA-AAA--TG---AG-----A-TCCTAACG-AC-CGCCAATTT-TAA-gctaaaacacacaagtatgcatgcgagtgtcttcacgtatagttccccgattactcgtatatccattatgaactaattgatttggtattagtcaaggaaaatgagatcctaacgaccgccaattttaaacagcatttgcggagaatgtatatcatcttcaatacaaatttaaatctgtaccagccgtcattttaaaagctacataccatgatttattatatattatattgtctgcaaaatcatactaaccacctcttgtttacttttacaatgcgtcatcttcctctataaatttacgtcacacaaaattgtggtctacgtaaacatgattccgtcagtcgccgatcaaacaacagtgacactgaacggtgttctcgcacaaaccatactctttgtaaatgaaaatggttctgacttttgccattttaagactgttaattaacaaaaatatgcactagacccttatttcgacaccccttcaccatgtacttcatgaacaaaccatacacatcgataaaacaatgtcaaatacaatgaacttggaaatattattcgattaatcacgtaccaatgttttgtagaatttttataatcaacaggtatttatgaaaaaactgtactgttttcttttttcaattaagaaaaaagtgagtat
gi|4 : tccagggcccgtttctacaaaagtcgtaagttcctaactactctaagcataattcttcgactatacgaccgtctacaaagatttacttacgagttacgacgaaagttcagtcgctaagttacggaccgcccgggcgaccctaatcctaatgatccgtatgtgtcaaaaaaatctatcTA-G--TCAAG---G-A-AAAT-GAGAT-CC---T--AAC-GACCGC-CA-ATTTT--AAACAGCA-TTT---GC-------G-GAGA-A--TGT--ATA-T-CA-TCTT--C--AA-TA-CAAATT-TAA-ATC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-TTAAAAGC--T-AC-ATACC-ATG-ATTTATTATATATTATATT-GT-CTG-CA-AA-A-------TCA-T-----A-CTAA-CCACCTCT-----TGTTT-ACTT-T-TACAATGCGTCATC-TT-CC-TCT-AT-AA-AT-TTA-CGT-CACACAAA-A-TTGTGGTCTA---CGTA-A---AC-ATGATTCCG-TCA-GT-CGCCGATCAAA--C-AACAG--T--GACAC---TGAACG-GTGT---TCT----CGCA-C-AAA-CCAT--A-----CTCT-----TTGT----AAATGAAAATGGTT-------CTGACTTTTGC--CA-T-TTT-AA--------GACT-----GTT-A-ATT--AAC-AAAA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TA-TTTCGACAC-C-C---C----TTCACCA-T-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-A-CCA---TACACA-TCGATA--AAACAATGTCAAA----T-AC--AATG-----A-AC---TTGGAAAT--------ATTATT-CGATTAATCACGTACC---AA-TG---TTTT----------G-TAGAA-TTT-T------TA-----TAA--T---C-AA-CAGGTA-TT---TAT---GAAA-A-A--AC-T-GTACTG--T----T-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T-----AAGAAAAAA-GT-G--AG-------TA-Tacagcatttgcggagaatgtatatcatcttcaatacaaatttaaatctgtaccagccgtcattttaaaagctacataccatgatttattatatattatattgtctgcaaaatcatactaaccacctcttgtttacttttacaatgcgtcatcttcctctataaatttacgtcacacaaaattgtggtctacgtaaacatgattccgtcagtcgccgatcaaacaacagtgacactgaacggtgttctcgcacaaaccatactctttgtaaatgaaaatggttctgacttttgccattttaagactgttaattaacaaaaatatgcactagacccttatttcgacaccccttcaccatgtacttcatgaacaaaccatacacatcgataaaacaatgtcaaatacaatgaacttggaaatattattcgattaatcacgtaccaatgttttgtagaatttttataatcaacaggtatttatgaaaaaactgtactgttttcttttttcaattaagaaaaaagtgagtat
gi|5 : tccagggcccgtttctacaaaagtcgtaagttcctaactactctaagcataattcttcgactatacgaccgtctacaaagatttacttacgagttacgacgaaagttcagtcgctaagttacggaccgcccgggcgaccctaatcctaatgatccgtatgtgtcaaaaaaatctatctattacatatggtaattacaataatcaagatgctgccatttcgctaaaacacacaagtatgcatgcgagtgtcttcacgtatagttccccgattactcgtatatccattatgaactaattgatttggtatACCCTAAGT-CCCAAA-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAA------------A------TC--TTT-GTT-AAC-CAA-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-C-TG-CAT--------TTCTATAT----GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCAATAATAA-------AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAG-AGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CC--A-TA-GCCTA-G--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--ACC-GA--CC-TA-ATTT----AACAG-A-TTTAGTGC-------G-GAGAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACA-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTC--TT-C----AAC--T-AC-ATACC-ATG-ATTTATTA----------T-GT-CTG-CA-TATATCACTCGTCG-C-----GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-C--TCTGAT-AA-TTATCGTCATGCATACAAA-A-T-GTGGACTA---CGTA-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGCGGATCAAAACC-AA-AG--T--GACAG-G-TGTACTTGTGT---TCT----CGCA-C-AAA-ACAT--A-----TT-------TTGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTTTG--CA-T-TGCAAA--------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--AT-ATGCAC-TAGACC-C-T-TATTTTCGACAC-C-C---CATAATTCA-CA-C-G------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TATACA-T--ACA--AAAC-ATGTA-------T-AT--GATG--A--A-AC----C----ACCG------GCTATC-C--T--GTTTTGCCCC-CAGA-GG---TTTTGCA--TTTTGG-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G-AT--TG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--TA----AAAAAAAAAGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA---G-GATC-CCTA-A---CC-CCC-CCCTTCCGGGGGGA---GGG-CACTCACTT--TATA-TTAGG--TTGT
gi|6 : CTAAGT-CC-AAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-TTAAAA------------AAA----TC--TTT-GTT-A-C--AA-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-C-TG-AAT--------T-CTA-AT----GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCT-A-TAATAA-------AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAA--GT-TT-C---ACG-ATA-GT------CC--A-TA-GCCTAAG--TCAAG---G-G-TAT--GGTAT-TC---T--A-C-GA---C-TT-ATTTT--AAACAG-A-TTAAGTGC-------G-GGAGGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-AC--AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTAC--AG-C-CGTCA-TT-C----AAC--T-AC-ATAC--ATG-ATTTATTAT---------T-GTTCTG-CA-TATA-------TC--T-----GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA---TC-C--TCTGA--AA-TT-TCGTC----ACACAAA-A-T-GTG-TCTA---CGTAAC---AC-ATATTTC-G-TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-GA--T--GACAGAG-TGTACTTGTGT---TCT----CGC--C-AAA-CCAT--A-----TT-------TGGT-T--AAATGAC-----TT-------TTCAGTTTT-G--CA-T-TGC-AA--------GACT-----GTT-A-ATT--GTA-AGGA--ATCATGCAC-TAGACC-C-T-TA-TT-CGACAC-C-C---C----TTCA-CA-CTG------TACT----T--CAT-GA--AC-AA-AGCCC---TATACA-T--ACA--A--C-ATG---------T-AT--GATG--A--A-AC---TC----ACCG------G-TG-C-CAAT--GTTTTGCACC--AGA-GG---TTTTGCA--TTTTGA-TAGAA-TTT-TG-TTG-TA-TA-GTAA--T---C-AT-CA-GTATTT---TATGAGG-AG-A-ACGAC-G-ATATTG--C---AT-T-TC-TTT--TT---TCA-A-T--T------AAAAAAAGGGT-G--AG-------TG-TGT-TAA--GG-GAT--CCTA-A---CC-CCC-CC---TCGGGGGGA---GGT-CA-TCAC-T--TATA-TTAAG--GTGT
gi|7 : AAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAA------------AAA----TC--TTT-GTT-A-C-CAA-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-C-TG-CAT--------TTCTA-AT----GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-TAAGAA-------AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AACGT-----TG-----CGAA-AGT-TT-C---ACG-ATA-GT------CC--A-TA-GCCTA-G--TCAAG---G-G-AATT-GGTAT-TC---T--A-C-GA--CC-AA-ATTTT--AAACAG-A-TTCAGTGC-------G-GACAGA--TGTT-AGA-T-CA-TCCT-ACA-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACCAAG-C-CGTCATTT-C----AAT-------ATACC-ATGTATTTATTAT---------T-GT-CGA-TA-T-TA-------CTT-C-----GTTCAA-ACACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TT-CCGTCTGATCAATTT-TCG--GT-CACACAAA-AGT-GTGGTCTA---CGTA-C---AC--TATTTCC--TCA-GTGCGCGGATCAAA--C-AA-AG--TGGGACAG-G-TGTACTT-TGT---GCT----CGCA-C-AAACCCAT--A------T-------TTGT-T--AAAGGAC-----TT-------TTCAG-TTTTG--CATT-TGC--A--------GAC-------TT-A-ATT--GTA-AGG---AT-AT-CAT-AAGACC-C-T-TA-TTTCGACAC-C-C---C----TTCA-CA-CGG------TACTATTAT--CCT-TA--AC-AA-A-CTC---TATACA-T--AC---AAAC-ATG---------T-AT--GATG--A--A-AC---TC----ATCG------G-TATC-C-AT--GTTTTGCACC-CAGAGGG---TTTTGTA--TTTTGGTTAGAC-TTT-TG-TTG-TATTA-GTAA--T---CGAT-CA-GTA-TT---TATGAGGAGA-A-G--AC-G-ATTGTG--C---AT-T-TCTTTT--TT---TCA-A-T--T-------AAAAAAAGGT-G--AG-------TG-T-T-TAA--GG-GATC-CCCT-A---CC-CCC-CCCCTCCAGGGGGA---a
gi|8 : CCCTAAGT-CCCAAG-------T-TT-TG--T-C-GTA-AGT--G--T-T-AAAAAAATCTAAAAAAAAA----TC--TTT-GTT-A-C-CAT-GG-TAA----TTAC-AATCATT---CAACA--TGG-C-TG-CAT--------TTCTA-AT----GTTC-GATA-TCACAA-AT--CAATCTCA-TGATAA-------AGATG-TGC----------GAACA-CAC-AGCGT-----TG-----CGAG-TGA-TT------CG-A-A-GT------CCATA-TA-GCCTA-G--TCAAG---G-G-GATT-GGTAT-TC---T--A-C-GA--GC-TA-ATTTT--AAACAG-A-TTTAGTTC-------G-GAGAGA--TGTT-AGATT-CA-TTCT-ACG-AA-TA-CAATTT-TAA-TGC--TGTACC-AG-C-CGTCA-TT-C----AAG--C-AC-ATA-C-ATG-ATTTATTAT---------T-GT-CTG-CA-TATA-------TCATC-----GTCTAA-CCACCT-T-----TGTTT-ACTG-TGTACAATGCGTCA-C-TTCC--TCTGAT-AA-TT-TC--TGT-CTCACAAA-A-T-GTGGTCTA---CGTA-C---AC-ATATTTCCG-TCA-GTGCGTGGATCAAA--C-AA-AGAAG--GACGG-G-T---CTTGTGT---TCT----CGTA-C-AAA--CAT--A--------------TTGT-T--AAATGAC--------------------TTTTG--CA-T-TGC-AA--------GACT-----GTT-A---T--AT----GA--AT-ATGCAC-TAAGAC-C-T-TA--TTCGACAC-C-C----------TA-CA-C----------------------------------------------A-T--ACA--AAAC--------------------ATG--A--A-AC---TC----A----------CTATC-CAAT--GTTTTG
gi|8 : A-GTA-TT---TATGAGGAAG-A-A--AC-G-ATATTG--C---AT-T-TCTTTT--TT---TCA-GTT--T-----AAAAAAAAAGGT-G--AGTGCAATATG-TGT-TAA--GG-GATC-CCTA-A---C-----------GGGGGGGGG---GGG-GGGTCACTT--TATA-TTAGG--TTGTgtagtatttatgaggaagaaacgatattgcatttctttttttcagtttaaaaaaaaaggtgagtgcaatatgtgttaagggatccctaacgggggggggggggggtcactttatattaggttgta
gi|9 : ccctaagtcccaagttttgtcgtaagtgttaaaaaaatctaaaaaaaaatctttgttaccatggtaattacaatcattcaacatggctgcatttctaatgttcgatatcacaaatcaatctcatgataaagatgtgcgaacacacagcgttgcgagtgattcgaagtccatatagcctagtcaaggggattggtattctacgagctaattttaaacagatttagttcggagagatgttagattcattctacgaatacaattttaatgctgtaccagccgtcattcaagcacatacatgatttattattgtctgcatatatcatcgtctaaccacctttgtttactgtgtacaatgcgtcacttcctctgataatttctgtctcacaaaatgtggtctacgtacacatatttccgtcagtgcgtggatcaaacaaagaaggacgggtcttgtgttctcgtacaaacatattgttaaatgacttttgcattgcaagactgttatatgaatatgcactaagaccttattcgacaccctacacatacaaaacatgaaactcactatccaatgttttggt-G-TGTACTTCTGTG--TCT----CGCA-C-AAG-CCATCTA-----TCCAATGTGTGGT-T--AGA-AAC-----TTCTAAAATTTCAGTTG--G--CA-T--GC-AA--------GAC------GTT-ATAAT--GTATAGGA--AT-AT-CA--TA-ACC-C-T-TA-TATCGACTC-A-CAAGC----CTCA-CA-C-G-------ATG----TAACAT-GA--ACCAACAGCCC---TACACA-T--ACA--AAAC-A-----------------GATG--AGTA-AC---GC----A----------------CAAC--A--TTGTATA-TAAA-CGCATTTTTGC------CAG-TAGAA-TTA-AG-TTG-TA-TAGGTAAAGTTCAC-AT-CA--TA-TT---ATTGATGGTG-G-G--TC-G-ATA-TG--TCTAAT-T-TC-TTTTCTT---TCATA-TAATGAAAAAAAAAAAAAGAG-G--AGT------TG-TGTGTAA--GG-a
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): GGGCCCGTTTTACAAAAGATCGTAAGTCCTAAACTTAGTCGTAAGACATAACTTATGATGTACGATGAAGGCCGCGATTTACAAAAAC
Unaligned ( gi|19 ): AAGTCCTAAACTTACTTGCAAGACATATACTTACAAAGTAAGGGCCACTTTACAAAGAT
Unaligned ( gi|20 ): CATTTTACAAAAGATCGCAAGTCCTAAACTTAGTCATAAGACATAAC
Unaligned ( gi|21 ): GGGCCCCTTTTTACAAAAAGTCGTAAGTCCTAGACCTAGTC
Unaligned ( gi|22 ): GGCCCGTTTTACAAAAGGTCGTAAGTCCTAAACTTA