lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222222 1111 11111 1111 11 33333333 222222 44444444444444444444 11 1111 4444444 11111 111111 1111 111 111 1111 222222222222 555555555555 4444444444444 11111 111111 2222 11 1 11111111 22222 22222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 333333 1 222 444444444444444444 11 1111 2222222222222222 8888888888888888888 111111 11111 3333333333333 11111 1111 333 11 222 111 2 1111 11 11111111 11 3 1 111111 4444444444 3333 11 1 11111 1 22 3333333333333 1 11111111 2222222222222222222222222222222 222 2222 222 11 00000000000000000000 111 1111111 2 33333333333333333333 11 55555555 1 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111111111 222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 11 22 11 1111 4444444444444444 11 555555 1 222 1111 111111111 1 111 44444444444 333 111111 11 33333333 111 1111 1111 2222222 11111 11 111 2222 1111 6666666666666666666666666666666 111 111111 22222 2 1111 1111111 1111 1111 44444444444444444444444444 1 2222222 5555 3333333 11111 111 33333333333333333333 444444444444444 1 1111 888888888888888888888888888888888888888888 222222 11 4444444444444444444444444444444 11 1 55555 1
lowQualScore : 0 9999999 4 7777 00000 4444 00 5 5 5 22222222 1 5 5 000000 7 00000000000000000000 00 5 5 2222 0000000 5 7 77 6 77777 333333 2222 000 77 6666 1 5 000 5 77 2222 999999999999 77 666666666666 66 7777777777777 66 22222 5 999999 0000 5 66 33 0 5555 0 88888888 5 3 88 00000 00000 5 77 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 66 222222 8 2 5 5 5 5 0 444 99999 66 66 0 4 444444444444444444 66 1 00 777 4 777 8 4 4 3333 6666666666666666 0000000000000000000 4 4 222222 66 11111 1111111111111 55555 66 4 0000 66 66 777 000 3 4 777 777 4 9999 8888 55 999 222 4 4 7 66 1 4 4 1111 4 4 66 4 22 8 8 4 4 4 8 4 55555555 66 9999 4 2 8 00 66 66 4 1 777 4 7777 8 4 9 4 777 66 88 66 111111 2222222222 88 3333 66 11 0 33333 999999 0 5 888 3 5 99 3 2222222222222 3 0 5 88888888 888 9999999999999999999999999999999 5 5 4 555 3 66 5 66 5 0000 5 5 777 8 99 77 5 66666666666666666666 5 000 7777777 5 5 6 5 44444444444444444444 55 5 00000000 5 1 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7 555555555 6 1 333333 99 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5 8 99 0 8 11 11 11 8 6666 0 0 0000000000000000 11 8 777777 0 7 1 222 7777 999999999 1 5 111 5 77777777777 5 0 5 111 5 555555 5 33 44444444 222 5 7777 5 1 5 2222 5 0000000 5 44444 88 7 5 000 0000 0 5 2222 888 5 5 1111111111111111111111111111111 000 4 77 666666 5 00000 77 1 0 1111 5 5 8888888 2222 4444 55555555555555555555555555 3 6 6 6 99 5555555 4444 6 6666666 66666 111 00000000000000000000 6 333333333333333 6 6 6 6 3 6 3333 333333333333333333333333333333333333333333 444444 55 6 1111111111111111111111111111111 88 3 7 99999 3
lowQualScore : . ....... . .... ..... .... .. . . . ........ . . . ...... . .................... .. . . .... ....... . . .. . ..... ...... .... ... .. .... . . ... . .. .... ............ .. ............ .. ............. .. ..... . ...... .... . .. .. . .... . ........ . . .. ..... ..... . .. ...................................................................................................... .. ...... . . . . . . . ... ..... .. .. . . .................. .. . .. ... . ... . . . .... ................ ................... . . ...... .. ..... ............. ..... .. . .... .. .. ... ... . . ... ... . .... .... .. ... ... . . . .. . . . .... . . .. . .. . . . . . . . ........ .. .... . . . .. .. .. . . ... . .... . . . . ... .. .. .. ...... .......... .. .... .. .. . ..... ...... . . ... . . .. . ............. . . . ........ ... ............................... . . . ... . .. . .. . .... . . ... . .. .. . .................... . ... ....... . . . . .................... .. . ........ . . .......................................................................................................................... . ......... . . ...... .. .......................................................... . . .. . . .. .. .. . .... . . ................ .. . ...... . . . ... .... ......... . . ... . ........... . . . ... . ...... . .. ........ ... . .... . . . .... . ....... . ..... .. . . ... .... . . .... ... . . ............................... ... . .. ...... . ..... .. . . .... . . ....... .... .... .......................... . . . . .. ....... .... . ....... ..... ... .................... . ............... . . . . . . .... .......................................... ...... .. . ............................... .. . . ..... .
lowQualScore : 7 6666666 3 7777 11111 3333 77 7 7 7 11111111 7 7 7 111111 1 11111111111111111111 44 7 7 1111 7777777 7 1 99 6 33333 666666 1111 000 99 6666 4 0 000 7 99 1111 999999999999 99 000000000000 99 9999999999999 99 55555 0 444444 8888 0 99 88 4 5555 0 11111111 0 2 00 66666 44444 7 99 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 77 222222 6 5 0 0 0 0 0 222 66666 11 11 8 4 444444444444444444 11 9 66 888 4 888 9 4 4 9999 2222222222222222 6666666666666666666 4 4 444444 11 11111 7777777777777 66666 33 4 7777 11 11 888 000 6 4 222 888 4 4444 9999 22 444 222 4 4 2 11 9 4 4 4444 4 4 11 4 22 9 9 4 4 4 9 4 88888888 11 4444 4 7 9 66 11 11 4 1 888 4 0000 9 4 8 4 888 99 22 99 888888 2222222222 22 4444 99 22 0 11111 666666 0 0 888 2 0 55 2 0000000000000 2 0 0 11111111 888 2222222222222222222222222222222 0 7 9 000 2 99 0 99 6 7777 7 7 999 7 99 99 7 77777777777777777777 0 000 4444444 7 7 1 7 44444444444444444444 99 7 00000000 7 4 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 333333333 7 7 555555 22 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 0 00 8 0 00 44 00 0 6666 8 6 8888888888888888 00 0 222222 8 1 7 333 9999 777777777 4 7 666 7 77777777777 7 1 7 444 7 777777 7 66 44444444 111 7 7777 0 3 7 1111 7 3333333 7 33333 44 1 7 000 7777 7 7 1111 666 0 7 1111111111111111111111111111111 000 4 99 444444 7 00000 99 1 7 7777 7 0 6666666 1111 2222 00000000000000000000000000 3 7 7 7 22 5555555 8888 7 2222222 77777 777 33333333333333333333 7 777777777777777 7 7 7 7 3 7 5555 888888888888888888888888888888888888888888 000000 88 7 3333333333333333333333333333333 33 3 3 00000 3
consensus : TATTACAACCAACGGG-T-A-CATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATC-ATA-CTAGT-GG-C-TTCAAGATGGG-----GTAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-CAG----ATAT----GG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---TAATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTG--AAA-GTATAC-T-N-A--AAGTCT-A---A---T--TCA--AGTT-----TTAC-TT------ATTA---TTTTCAT-G--AA--AATATAAG-GG-TT--------TA-TAATGATTTCTGAG-NTTA----AAGGAC-CTCTGA-CC--AAAAAAATAA-AA--ATCTC------NA-AA-A-CA-----ACACCCCCC-------------CCCCA------------AAAAAAAACCC--ATACAAACAAATANAAAAAATTGGGAAGATAAAGG-CCCACTTGA-----AAGNCCT-G-ACG-G-T-GTTATNN-TCAAACGT--C--TATATA--AA--ATAA-ACCAAC--ATG--A---------GAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AAG-T-G----ATA------AATG----AACAT-GA---TG---C-------AG-C-AGC--A--G--AT-----GGAA---C-------AT-----AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CA---GT--ACAAAGACT-ATG--GGT---CC-A----GA-G--TTGGA-TTTTCAGG---CCA---GC-CAT-ATGTTTTT--GAAT-C-A-T--TTC-TCT-GC--TTG-T--CCTTT-CA-CACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGA-C--A--GG--C-ATTTCTT---T-G-T--TTT-G-C-AAA-AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTC--AGCA-T--TGTACC---AATA---AACCT-AAAN--NTAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AACAAGT---G-T--ATT--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAGAAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAGT-AAAATACTAGTAAA-CAGT--AA-AAA--GT-TG-AACGAT-AC-AGATT---TTC---A-CA-CCA-T-ATAATATCTG-GG-------A-C-TA-----C-ATATTCTGCGAAT-CTA-------AAAAAT-T-CTA----A----T--ACC------------C--CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTTN---T----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT--------A----AGGGT-TTTCA-----T--AAA-T-GC-AT--TA--T-C-----AGTGTAT-T-TGTA-TTTTAA-T--CTTTGGAAA-TCTT--AC-TCT--CTTTTTTTTTA----A-ATA-T---TGGAAG--T-ACAA----GTACA-TATGTACAGGAAAT----AC-T---AA-CAGT-AAA-TAAA-T-GT-CAC-N--T-TAN--GTA-TGATG-C---TACC-A--C---A-TG--TA-----T--GTAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AAT-CCT-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAG--CAAA-CAGA----GA-A-----CACA---TCTCCA--TCA------AG-G-----AAT--AC-TGCTGTCTG-TT-GGC-AAATTATT-------TC----TTTA----CC---AC-C-T-TCATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGCA--ATG-C--AG-TCAGT--TGAT-TTGA-----TA---TCTA--------GT--GC-A-T-TCTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCCN-------TTCGAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTG----AGAAT-GCAATTT
Reference ( gi|2 ) : TATTACAACCAACAG--T-A-CATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATC-ATA-CTAGT-GA-C-TTCAAGATGGG-----ATAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-CAG----ATAT----G--TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---TAATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTG--AAA-G-ATACGT-C-A--AAGTCT-A---A---T--CCA--AGTT-----TTAC-TT------ATTA---TTTTCAT-G--AA--AATATAAG-GG-TT--------TA-TAATGATTTCTGAG-CTTA----AAGGAC-CTCTGA-CC--AAAAAAATAA-AA--ATCTC------CA-AACA-CA-----ACACCCCCC-------------CCCCA------------AAAAAAAACCC--ATACAAACCAATAAAAAAAATTGGGAAGATAAAGG-CCCACTTG------AAGTCCT-G-ACG-G-T-GTTATAT-TCAAACGT--C--TATATA--AA--ATAA-ACCAAC--AT---A---------GAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AAG-T-G----ATA------AATG----AACATCGA-ATTG---C-------AG-C-AGC--A--G--AT-----GG-A---C-------AT-----AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CA---G---ACAAAGACT-ATG--GGT---CC-A----GA-G--TTGGA-TTTTCAGG--CCCA---GC-CAT-ATGTATTT--GAAT-C-A-T--TTC-TCT-GC--TTG-T--CCTTT-CA-CACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AAA-C--A--GG--C-A-TTCTT---T-G-T--TTT-G-CAAAA-AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTC--AGCA-T--TGTACC---A--A---AACCT-AAAT--ATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTCAAACAAGT---G-T--ATT--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATGCA-TGTACTTAATAAGAAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAGTTAAAATACTAGTAAAACAGT--AA-AA----T-TG-AACAATAACAAGATT---TTC---A-CA-CCA-TAATAATATCTG-GG-------A-C-TA-----T-ATATTCTGCGAAT-CT--------AAAAAT-T-CTA----A----T--ACC------------C--CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTTA---T----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT--------A----AGG---TTTCA-----T--AGA-T-GC-AT--TA--T-C-----AGTGTAT-T-TGT--TTTTAA-T--CTTTGGAAATTCTT--AC-TCT--TTTTTTTTTTA----A-ATA-T---T-GAAG--T-ACAAACTTGTACA-TATGTACAAGAAAT----AC-T---AA-CAGT-AAA-TAAA-T-GT-CAC-A--T-TAT--GTA-TGATG-C---TACC-A--C---A-TG--TA-----T-TGTAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AAT-CCT-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAGTTCAAA-CAGA----GA-A-----TACA---TCTTCA--TCA------AG-G-----AAT--ACTTGCTGTCTG-TT-GGC-AAATTATT-------TC----TTTA----CC---AC-C-T-TCATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGTAA-ATGAC-AAG-TCAGT--T-ATGTTGA-----TA---TCTA--------GT--GC-A-T-CCTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCCC-------TTTAAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAATCAGAAT-GCAATTT
gi|3 : TATTACAACCAACAGG-T-A-CATGT-CATAAA---TAGGA---AAA-A-CAAAATT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATC-ATA-CTAGT-GG-A-CTCAAGATGGG------TAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-CAG----ATAT----GG-TA-CACAGAGCC-TG--CCAA----TAATG----C-TGAT----GAC---CACT--AAA-G-TTTTCATAGAAAT---GGC--ATTGAA----TCA---------CTTTCTG--AAA-A-GAAC---T-A--ACGTCT-A-------T--ATA--AGTT-----T-ACGTT------ATTA---TTTTCAT-G--AA--AA---AAA-GG-TT--------TA-TAAT-ATTTCTGAG-CTTA----AAGGAC-CTC-GA-CCAAAAAAAAATAATAA--ATCTC------AA-AACA--A-----ACACCCCCC-------------CCCC-------------AAAAAAAACCC--ATACAAACAAATAAAAAAA--TGGGAAGATAAAGG--CCACTTG------AAAGCCT-G-ACG-G-T-GTTAT-T-TCAAACGT--C--TATAT---AA--ATAA-ACCAAC--ATG--A---------GAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA--T-G----AT-------AATG----AACAT-GA---TG---C-------AG-C-AGC--A--G--AT-----GGAA---C-------AT-----AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CA---GT--ACCAAGACT-AT---GGT---CC-A----GA-G--TTGGA--TTTCAGG---CCA---GC-CAT-ATGT-TTT--GAAT-C-A----TTC-TCT-GT--TTG-T--CCTTT-CA-CACA-A-TCTA-T-G-----AC-A--A----TGGA-AAA-C--A--GG--C-ATTTCTT---T-G-T--TTT-G-CAA-----AT---TTTTCA--GGCCAC-TTC--AGCA-T--TGTACC---A--ATATAACCT-AAAA--TTAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AACAAGT---G-T--TAT--TTCAC-T-GC--------A---A-TGAATA---------TACAT--ACATG-T--AATGCA-TG-AC-TAA-AAGAAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAGT--AAATACTAGT-AAACAGT--AA-AA----T-TG--ACAATAAC-AGATT---TTC---A-CA-CCA-T-ATAATATCTG-GG-------A-C-TA-----TAATATT-TGCGAAT-CT--------AAAAAT-T-CTA----AT---T--ACC------------C--CCCC--CCCC----CCAA--------CTTTTCTTTA---T----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TT-------------CTTTAGAA-TTGAA--TT-TGGTAAAAG-CTGG-TGG--CT--------A----AGG---TTTCA-----TG-AAA-T-GC-AT--TA--T-C------GTGTA--T-TGT--TTTTAATT--CTTTGGAAATTCTT--AC-TC----TTTTTTTTTA----A-ATA-TG--TGGAAG--T-AC-AACTTG-ACA-TATGC-----AAAT----AC-T---AA-CAGT-AAA-TAAA-T-GT-CAC-T--T-TATA-GTA-TGATG-CT--TACC-A--C---AGTG--TA--------GTAGC--GAC-TG--TAAAATCT-TG----CATTCCT----AAT-CCT-----AA--CTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAGTTCAAAGCAGA----GATA-----TACA---TCTTCA--TCA------AG-G-----AAT--ACTGGCTGTCTG-TTGGGC-AAATTATT-------TC----TTTA----CC---AC-C-T-TC-TGACC----C---TTTGG-A-AAAA-T--AAA-AGTAA-ATG-C--AG-TCAGT--TGATTTTGA-----TA---TCTA--------GT--GC-A-T--CTAC-AT--------TGT----TATTCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCCTGAAATAATTTTAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
gi|7 : TATTACAACCAACAGGTT-A-CATGTAC-TAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-AACCAT-C---------TAGAAGATC-ATAACTATG-GA-CCTTCAAGATGGG------TATGTC--------ACCATAAAAAA-GA-CAG----ATAT----GGATAACACAAAGCCATG--CCA-----TTATA----C-TGAT----AACATGCACT--AAAAG-TTTTCATAGAAA----G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTG--AAAAG-ATAT-----A--AAGTCT-A---AATAT--CAA--AGTT-----TTAC-TTT-----ATTAATATTTCAAT-G--AA----TATAAG-GGATT--------TAATAATGATTTCTGAG-ATTAGAAAAAGGACGCTCTGAACC--AAAAAAATAT-ATTTATACA------CA-AAAA-CATACCCACATCCCCCACCTAACTTCCCGCCCCACCCAAAA-----AAAAAAAACCCCAAAACAAATAAATAAAAAAAATTGGAAAGATAAAGGTCCCACTTGA-----AAGGCCT-G-ACG-G-T-GTTATTA-TCAAACGT--C--TAT-TA--AA--ATAA-ACCAATTAATGAAA---------GATTGGAAATT--AGGAAA---ACAG---TCC-CAG-T-G----AT-------AATG----AACAT-GA---TGC--C-------AG-C-AGC--A--G--AT-----GG-AC--C-------ATA----AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CA---GT--AC-AAGACT-AT---GGT---CC-A----GATG--TTGGA-TTTTCAGG---CCA---GC-CATAATGTTTTT--GAAT-CAA-T--TTC-GCTCGC--TTG-T--TCTTT-CA-CAC--A-TC-A-T-G-----ACAA--A----TGGA-AGA-C--AATGGCCC-ATTTCTT---T-G-T--TTT-G-GCAAA-AGAT---
gi|16 : aTATTACA-CCAACAGG-T-A--ACGTACATAAAA--TTG-A---AAA-AACAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAG-TCAATA-CTAGTGGA-C-TTCAAGATGGG------T-T-TC--------ACC-TAAGAAA-GA-CAG----ATATG---G--TA-CACAAAGCCATG--CCAAAT--TAATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAATTTTTCCTA-AAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTG--AAA-G-A----T-C-ACTAAGTCT-AAATA---T--CAA--AGTT-----TTAC-TT------ACTA---TTTTCAT-G---A--AATATAAG-GG-TT--------TA-TAATGATTTTTGAG-
gi|1 : ACAACCAAGAG--T-AACATGTACATAAAAACTAG-AAAGAAA-A-CAAA-TTAA-CCATACAACTTTATTTAAAACTCC-ATA-CTAGTGGA-C-TTCA--GT-GA-----ATAA-TC--------ACAATAAATAA-AG-CTG----AAATCATGG--CC-CACAAAGCCATGACCCAAAACTCAATGCATCC-CGATAAAAAAC---CACTCAAAAAA-TCCTC--AGAAATATAG-CCAATTGAAAAACTCA---------C-TTCTGAAAAA-G-ATA-GTACAA--AAGTCT-A---A---TTATCAATAGTTAAATATCAC-TT------ACTA----TTTCAT-GAAAA--AATATAAGCGG-TTAACCTACATA-AAATGATTTC-----CT------AAAGAC-CAACAA-CC--CAAAAAA-AA-CA--ATTTG------GAGAAGATCA-----A-ACCCCGCAA-----------CCC---------------------ACCC--ATTCGAA--AATGCACTGAACTGGT-CGATA------TTACTCA------AAGTC-----A-------ATTA-AT-ACAAAT-----------TA--AA--ACCA-ATAAAT--G----A---------GAT--GAAATCTAAGACAA---A-AAACTTCCAAAG-TAG----AAAATTCACAATGAAAAAACAT-GA-A-TG---CA------AA-CAAGCCAA--G--ACTCGAAGA-A---CGATAACAAC-----AAAT-AC-AAG---CATGGAATGCATT--CA---AGATACAAAGACTAATG--GGT---CCAA----GA-GGCTTGGA-TTTTCAGG---CCA---G--CAT-CTGCTTTT--GAAT-C-C-TTCTTC-TCT-GCCATTGAT--CCTTTCCACCACAGA-TC-GCT-GCACCAAC-A--GCCCCTGGAGAAA-CA-A--GG--C-A-TTTCTAAAT-GAT--TTT-GACGAAA-ACATACATCTTCA--GGCCACATTCAAAGCA-TCATGTACCAATA--A---AACCT-AAAA--TTAAACTAGC-CAA-TAATT-AG---GAAATTAA-CAAATATAATATTCCACAAAGTTCGA-T--A-C--TTCAC-TAGC--------AACCATTGAA-ACAATAAATTTAAAT--ACATGATCAAATACAGTGTACT---TAAAAAA--ACAT-GGAACACCAAATGAT-TG-TTAG-TAAAATACTAGTAAACGAGT--AACAAAAGGT-CGCAACAGT-AC-AGATTTTATTA---A-CA-CCA-TCATAATATCTG-GG-------ACC-TAATC--C-ATA-TCTGCGAAT-CTAACACCAAAAAAATAT-CTA----A----TTAACC------------CAACCACAACCAA----CAGAAAAGAATGTTTTTATTTAACGTCGTAACTTACCAA-----------------------------------------TTATAA-TTGAA-----TGGT-AGAA-T--G-TGGAACTATTACAAAA----GGG---TCTTACCCCCT--AAA-TAGCTATA-TAAGT-CAAGCAAATGTAT-TATGTA-TATTAA-T--CTTTGGAAA-TCTT--AC-T-T--CTTTTTTTTTA----C-ACT-TCCCT-GAAG--T-ACAA----GTACACTATGTACA--GAAT----AC---------------A-T-------T-CAT-A-----------A-TGCCGTC---TA-C-A--C---A-TG--TA-----C-TGTAGC--GACTTG--A-AAATCTATG----CA-TCC------AC-CCTAAAAAAAACC-GATGACA---AATAG---AGA-C-TT----CA---GAG-AGA-A----CCAAA-GAAA----GA-ACCTACCACA---TTTCAA--TCAAACCGCAA-A-----AAT--AACTGCTGT-TG-TTAAGA-AAATTACTCATTATATC----GTTAATACCC---ACAC-T-TCA--ATCCCATC---TTT-G-A-AAAA-TAAAAA-AGCAC-ATGAC--AG-TC-GTGAT-ATACTGACCTACTA---CATA--------GT--GCAA-TACCTACAATAAAG----CAT----TA-TCATATATACCATACCATCT-CC-TAAATTACCCC-------TCCAAAAATTACT--------------AACTCACTGG--ACCAACTTAATTC-T-----------TAA--T-------AACTAA-ATTAataa
gi|6 : aatattacaacCAACCAAAGG--TTA-CATGTA-ATAA----TAG-A---AA----CAA--TT-A-TTAT-CAG-------TAGAAGATC-ATA-CTAGT-GGTC-TTCAAGA-GGG-----GTAT--C--------ACCATAG---A-GA-CAG----ATAT----GG-TA-CACA--GCCATG--C-AAA---TAATG----CCTGAT----AAC---CACT--AACAG-TTTTCAT-GAAAT---G-C--ATTGAA----TC------------TTCTG--AAA-ATATAC-T-A-A--AAGTCTAA---A---TA-TCA--AGTT-----TTAC-TT------ATT----TTTTCAT-G--AAATAATAC----GG-TT--------TA-TAATGATTTCTGAT-ATT-----AAGGAC---TTGA-CC--AAAAAAA-AA-AA--AT-------------------------TACCC----------------------------------AAAAAAACC-----AAAAACT-------AAAATTGGGAAGATAAAGG---CACTTGA-----AAGCCAT-G-ACA-G-TGGTTATGTATCAAACGT--C--TATATA--AA--AGAA-ATAATA--ATG--A---------GAT--G--ATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AAG-T-G----AT-------AATG-----ACAT-GA---TG------------A-C-AG------G--AT-----GGAA---C-------AT-----AAAC--T-CA----CATGGAATG--TT--CA---G---ATAAAGACT-ATG--GGG---TC-A----GA-G--TTGGATTTTTCAGA---CCA---GC-CAT-ATAT-TTT--G-AT-C-ATT--TTT-TCT-GC--TTG-TTACCTTT-CA-CACA-A-TC-A-T-A--------A--A----TGGA-AGACC--A--GG--C-ATTTCTT---T-G-T--TTTGG-C--AA-AGAT---TTTTCA--TGGCAC--TC--AG---T--TGTAGC------A---TACCT--AAT------AT--GC--AA-TA--C--G---T--ATT-A-GA---ATG-T-TTC--AC-AGT---GTT--ATT--TTT-C-T-GC--------A---ATTG-A-A---------TAC-----TCTG-T----TACA-TGGTCTT--TAAG-AA--ACAT-G--A-AC----TAAT-TG-TTAGT--AAATACTAGTAAA--AGT--AA-AAATTGT-TG-A--GAT-AC-AGA-T---TTC---A--A-CCA-T-ATAATATCTG-GG-------A-C-T------C-ATA-TCTGCGAAT-CTA-------AAAAAT-T-CTG----A----T----------------------TA--CCCA----------------TTTTTCTTTT---T----ATCTTCC------AGTGT-TTTTATTTAAGTGGTA-------------CTTTATAATTTG-A--AT-T-GT-AAAGTT--GTTGG--CT--------A----AGGGT-TTTCA-----TTAAGATT-TC-ATGCTA--T--------GTGTAT-ata
gi|5 : ttCAACCAAAGG--TTA-CATGTA-ATAA----TAG-A---AA----CAA--TT-A-TTAT-CAG-------TAGAAGATC-ATA-CTAGT-GGTC-TTCAAGA-GGG-----GTAT--C--------ACCATAG---A-GA-CAG----ATAT----GG-TA-CACA--GCCATG--C-AAA---TAATG----CCTGAT----AAC---CACT--AACAG-TTTTCAT-GAAAT---G-C--ATTGAA----TC------------TTCTG--AAA-ATATAC-T-A-A--AAGTCTAA---A---TA-TCA--AGTT-----TTAC-TT------ATT----TTTTCAT-G--AAATAATAC----GG-TT--------TA-TAATGATTTCTGAT-ATT-----AAGGAC---TTGA-CC--AAAAAAA-AA-AA--AT-------------------------TACCC----------------------------------AAAAAAACC-----AAAAACT-------AAAATTGGGAAGATAAAGG---CACTTGA-----AAGCCAT-G-ACA-G-TGGTTATGTATCAAACGT--C--TATATA--AA--AGAA-ATAATA--ATG--A---------GAT--G--ATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AAG-T-G----AT-------AATG-----ACAT-GA---TG------------A-C-AG------G--AT-----GGAA---C-------AT-----AAAC--T-CA----CATGGAATG--TT--CA---G---ATAAAGACT-ATG--GGG---TC-A----GA-G--TTGGATTTTTCAGA---CCA---GC-CAT-ATAT-TTT--G-AT-C-ATT--TTT-TCT-GC--TTG-TTACCTTT-CA-CACA-A-TC-A-T-A--------A--A----TGGA-AGACC--A--GG--C-ATTTCTT---T-G-T--TTTGG-C--AA-AGAT---TTTTCA--TGGCAC--TC--AG---T--TGTAGC------A---TACCT--AAT------AT--GC--AA-TA--C--G---T--ATT-A-GA---ATG-T-TTC--AC-AGT---GTT--ATT--TTT-C-T-GC--------A---ATTG-A-A---------TAC-----TCTG-T----TACA-TGGTCTT--TAAG-AA--ACAT-G--A-AC----TAAT-TG-TTAGT--AAATACTAGTAAA--AGT--AA-AAATTGT-TG-A--GAT-AC-AGA-T---TTC---A--A-CCA-T-ATAATATCTG-GG-------A-C-T------C-ATA-TCTGCGAAT-CTA-------AAAAAT-T-CTG----A----T----------------------TA--CCCA----------------TTTTTCTTTT---T----ATCTTCC------AGTGT-TTTTATTTAAGTGGTA-------------CTTTATAATTTG-A--AT-T-GT-AAAGTT--GTTGG--CT--------A----AGGGT-TTTCA-----TTAAGATT-TC-ATGCTA--T--------GTGTAT-
gi|11 : ttACCAACAG-------GT-TACATAAAA--TAC-C---ATATA-CAAA-TT-A-CCAC-CA--------TAGAAGATC-ATA-CAAAT-G-----TCAACACGGGTTTCAGTAT-TTCAAAGGTAACCATAAGAAATGATCTGTTGTGTAT----GGTTA-CACAAATCCATG--TTGAA----AATG----C-TGAT----A--------------------CCATAG-CAT---G-C--ATTGAT----TCAACACAAACCCTATCTG--AAA-GTATAC
gi|10 : ctttcaagtgactttttgtgaaaaataagggccttttttagggcaaaattcttaaagaatgagggctatttttaggatattttaggaatttcaggcaaaataagggtaaaaaaacttcctaattaaacccccaatgaattaatttgtactt-A--AAGTCT-A---AA--TA-TCA--AGTT-----TTAC-TT------ACTA---TTT-CATTG--AA--AATATAAA-GG-GT--------TA-TTATGATTTATGAGATTTA----AAGGAC-CTCTGA-CC--AAAAAAA--A-AA--ATCTCTAAACACA-AACA-CA-----ACACCCCCC-------------CCCCACCCCTCCACCCA-AAAAAAACCCGAAAACAAACACAT-CAAAAAATTGGGAAGATAAAGG-CCCACTTGAA----AAGCGCTGG-ACG-GTT-GTTATTA-TCAAACGT--A--TATATA--AA--AT-A-ACCAAT--ATG--A---------GAT--GAAATT--AGAC-A---A-AA---TCC-AAG-T-G----ATA------ATGG----AACAT--G-ATCG---C-------AG-C-AGC--ATGG--AT-----GGAA---C-------AT-----AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CA---GT--ACAAGGACT-ATG--GGT---CC-A----GA-G--TGGGATTTTTCAGG---CCA---GC-CAT-ATGTTTTTTGGAAT-C-A-T--TTC-TCT-GC--TTG-G--CCTTT-CA-CACA-ATTC-ATT-G-----AC-A--A----TGGA-AGA-C--A--GG--C-ATTTCTT---TGG-T--TTT-G-CCAAA-AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTC--AGCT-T--GGAACC---AATA---AACCTAAAAA--ATAAAT--GC-AAATTA--T-GG---T--ATT-ACCA---ATGAT-TTCAACAAAGT-----T--GTTACTTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-tatataagttgatttgacatactttttgacttttagcaagtgaagtcttacttacgaatttttttttgtaaaattaggattttcatgggaaaataagggatttttaggaatttggagcttaaataaggaaaaataagggcctctgacaaaaaaaataaggaaaaattaggaaaataagggcccgcttgaaagc
gi|11 : --AAGTCT-T---ACT-T--ACG--AATT-----TTTT-TTTGTAAAATTAGGATTTTCAT-G--GG--AAAATAAG-GGATT--------TT-TAGGAATTTG-GAG-CTTA----AA--------TAA-----GGAAAAATAA-GG--GCCTC------TG-A------------------------------------CA------------AAAAAAA-------TA---------AGGAAAAATTAGGAAAATAAGGG-CCCGCTTG------AAta
gi|12 : ctttcaagtgactttttgtgaaaaataagggccttttttagggcaaaattcttaaagaatgagggctatttttaggatattttaggaatttcaggcaaaataagggtaaaaaaacttcctaattaaacccccaatgaattaatttgtacttaccaacaggttacataaaataccatatacaaattaccaccatagaagatcatacaaatgtcaacacgggtttcagtatttcaaaggtaaccataagaaatgatctgttgtgtatggttacacaaatccatgttgaaaatgctgataccatagcatgcattgattcaacacaaaccctatctgaaagtatactatataagttgatttgacatactttttgacttttagcaagtgAAAATTGGGAAGATAAAGG-ACCACTTG------AAAGCCT-G-ACG-G-T-GTTATTG-TCAAACGT--C--TATATA--CA--ATAA-ACCAAT--ATG--A---------GAT--GAAATT--AGACAA---A-AA---TCC-AAG-T-G----ATA------A-TG----AACAT-GA---TG---C-------AG-C-AAA--A--G--AT-----GG-AA--C-------AT-----AAAC-AT-TAG---CATGGAATG--TT--CA---GT--ACAA-GACT-ATG--GGT---CC-A----GA-G--TTGGA-TTTTCAGG--CC-A---GC-CAT-ATGCTTTT--GAAT-C-A-T--TTC-TCT-GC--TTG-T--CCTTT-CA-CACG-A-TC-A-T-G-----AA-A--A----TGGA-AGA-C--A--GG--C-ATTTCTT---T-G-T--TTT-G-C-AAA-AGAT---TTTTCA--GGCCTT-TTC--AGCA-T--TGTACC---AATA---AACCT-AAA---ATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-TA---ATGAT-TTC-AACAAGT---T-T---TC--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAATA---------TACAT--ACATG-A--AATACA-TGTACTTAA-AAGAAA--ACAT-G--ACagc
gi|9 : GAAGACAAAGG-CCCACTTACTTGGAAAGGCCT-GGACAAG-T-GTTATTA-TCAAACGTGTC--TATATATTAAGTATAA-ACCAAC--AT---G---------AAT--GAAATTT-AGGACA---A-AA---TCC-AAAAT-GG---ATA--------TG----AACAT-GA---TG---CCACCAAAGG-C-AGC--A--G--AT-----GG-AACAC-------AT-----AAAC-AT-CAA---CATGGAATG--T---CA---GT--ACAA-TACA-ATG--GCT---CC-T----G-----TTGGA-TTCTCAAGAGCGTAAGTGC-CAT-ATAT-TTT--TAAT-C-A-T--TTCCTCT-GA--CTG-T--CCTTT-CA-CACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGA-CGAG--GG--C-ATTTCTT---T-A----TTT-G-C-AAA-AGAT---TTTTCATTTGCCAT-TTC---GCACT--TGTACC---C--ATT-AACCT-ACACGAGTAAAT--GCAAAA-TA--T-AGGTTT--TTT-A-CA---ATGAT-TC--GACAAGT---G-T--TAT--TTCACTT-GC--------A---AT-----A---------GGCAG--AC-T--------------TACTTAA----AAT--ACAT-G--AAACA--ATGATCTG-TTAA-TAAAATACTAGT-AATCAGTAAAA-AA----T-TGTGATGATACT--GATT---TTC---ACCACCCA-T-ATAATATCTG-GG-------A-C-TA-----T-AT-TCCTGCAAAT-GTCATC----ACAATT-T-CTA----AT---T--ACC------------C--CCCC--CCC
gi|4 : TACGT-TCACACGT--TCATATATA--AC--ATGATAACAACCTAT---AACTCTGTAAGAT--GAAATT--AGTCAATATA-AA---TCCTAAA-T-GAATAATA------GAT-----AGCATTAATACTGACAC-------AGCC-AGC--A--GTAAT-----GG-A---T-------ATCATAGAAACTATACAGCTACATCAAATG--TTAACAGCTG---AGACAGACT-ATGTCCGTTACCC-ATAATGA----TTGGA--TTTCAGG--CCCAC--GCACAT-ATGTTTTT--GAATAC-A-T--TTC-TCT-GC--TTG-T--CCTTTGCATCACA-A-TT-A-TGG-----AC-AACA----TGGA-AGA-C--A--GG--CAA-TTCTG---T-G-TTGTTT-G-CAAAACAGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTC--AGCA----GGTACC---AATA---AACCT-AAA---ATAAAT---C-AAAGTA--TCGG---T--ATTAA-CA---ATGAT-TTC--ACAAGT---G-TTAATA--TTCACTT-GCTAATAGCAA---ATTTAC-A---------TACATACACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAGAAAATACATGG--ACAC---ATGAT-TGATTAGTAAAATTACTAGTAA-----T--A-------------------------ATT---TTCCTTATCA-CCG-TATAAATATCTG-GGCAGCTTCA-CTTAATAATT-ATATACTACGAACACTG-------AAAAAT-TACTACGGTACATTT--ACCCCCCCCCCCCCGC--CCCC--CCCATCATC-----------TTTTTCTTTT---T----CTTTACCAACGCAGATGTATTT-----------Tccccccccccccctaaaaaacaccccaactttt
gi|8 : TTAAAAGGAAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAGTAGAAATACTAGATAAACAGT--AA-AAA---TGTG-GACAA--ACA-GATT---TT----A-CA-CCACTTATAATATCTTTGG-------A-C-TA-----T-CTAT-CTGCGAAT-CT--------AAAAAT-TTCTA----A----TTAACC------------C--ACCC--CCCAAAA-C----------------CCCCA---A----ACTCACCAA---GAATGT-TTT-----------TATTTAACGTGGTAACTTTATAATTTGAG--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT--------ATTAAAGGGTCTTCCA-----T--AAA-T-GC--T--TA--T-C-----AGTGTAT-T-TGT--TTTTAA-T--CTTTGGAAA-TATT--ACTTCTTCTTTTTTTTTTA----ATATG-T---G-GAAG--T-ACA-----GTACA-TAT-TAC-AGAAAT----AC-TATCAA-AAGT-AAA-TAAATT-GTCCAC-T--T-TAG--TTA-TGA-G-CT--TACC-A--C---A-TGT-TA-----TGCATAGC--AAC--G--A-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCCCT-----AACCCTGA-GACA---AA-AG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG--------AAA-CAGA----A---------ACA---TCTTCA--TCA------AG-G-----AAT--AC-TGCTGTCTG-TT-GGCAAAATTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CTT-TCAGAACC----CT--TTT-GCA-AAAA-T--AAA-AGCAC-ATG-C--AG-TCAGT--TGAT-CTGA-----TA---TCTA--------GT--GC-A-T-CCTAC-AT---G----TA-----TA-TCATAT-TACC-TACCATCTACC-T--ATTACCCTAAATAA-TTCTAA----ACT--------------A------TGGGAAC--ATT--ATTCTT-----------AAATTT-------AATTAATTTTACA--CA-T-ATGT------GAAT-GCAATTTtgttaacgtcaaacgccaggtaaatgtttaaagtgagattatttgaatcatgcggtatttggattaaagggttttgataaaatgcattatacagtgatattgtaggtttaatttctttggataatcttacactctctattttgttacttcagtatttgaaagttacaagtacattatggttaagaaataactaaccagtcaaactaaatggtcactttagtactgatgtctataccaacatgtagctgtttctagcgagactgttaaatcttgctctcatcccatcttgaaccctcggcatcctatattcaggtgagaaggaagacacagcgctcacagagtctcatgtcaaggtgggaaatcaactcctgtaaggtgttaaatttttctatttttactccaacctctcatgaccggaccggtttagataaaattaaacagcaacgtgatgaagctcagttgattttgataccttctatattatctgtcgacacttcttcatgaggatgttacgtatcatattacctactctcctattagccctttacaactaatctgacacactaatggacattaattcttacctttagtaaaattaatgtggataatatacatgcattaatgtgagaatcgcaattt
gi|4 : ATTATTTGAATCATGCGGT-A----T--T-TGG--ATTA------A----AGGGT-TTTGA-----T--AAAAT-GC-AT--TA--TAC-----AGTG-ATAT-TGTAGGTTTAA-TTTCTTTGGATAATCTTACAC-TCT--CTATTTTGTTACTTCA-GTATT---T-GAAAGTT-ACAA----GTACATTATGGTTAAGAAATA---AC-T---AACCAGTCAAACTAAA-TGGT-CAC-T--T-TA---GTACTGATG-TCTATACCAA--C---A-TG--TAGCTGTT-TCTAGCGAGAC-TGT-T-AAATCT-TGCTCTCA-TCCC-----AT-CTT-----GAACCCTC-GGCATCCTATA----------TT----CAGGTGAG-AAG-GAAG---ACA-CAGC----GC-T-----CACAGAGTC-TCATGTCA------AG-GTGGGAAATCAACTC-CTGTAAG-GT-GTT-AAATT-TT-------TCTATTTTTA----CTCCAAC-C-TCTCATGACCGGA-CCGGTTTAG-ATAAAATT--AAACAGCAACGTGATGAAGCTCAGT--TGATTTTGA-----TACCTTCTATATTATCTGTCGAC-ACT-TCTTC-AT---GAGGATGTTACGTA-TCATAT-TACC-TA-C-TCT-CC-T--ATTAGCCC-------TTTACA----ACTAATCTGACACACTAA------TGG--AC--ATTA-ATTC-TTACCTTTAGTAAAA--TTAATGTGGA-TAA-TATACATGCATTAATGTG----AGAATCGCAATTT
gi|15 : tacgttcacacgttcatatataacatgataacaacctataactctgtaagatgaaattagtcaatataaatcctaaatgaataatagatagcattaatactgacacagccagcagtaatggatatcatagaaactatacagctacatcaaatgttaacagctgagacagactatgtccgttacccataatgattggatttcaggcccacgcacatatgtttttgaatacatttctctgcttgtcctttgcatcacaattatggacaacatggaagacaggcaattctgtgttgtttgcaaaacagatttttcaggccacttcagcaggtaccaataaacctaaaataaatcaaagtatcggtattaacaatgatttcacaagtgttaatattcacttgctaatagcaaatttacatacatacacatgtaatacatgtacttaaaagaaaatacatggacacatgattgattagtaaaattactagtaataattttccttatcaccgtataaatatctgggcagcttcacttaataattatatactacgaacactgaaaaattactacggtacatttacccccccccccccgccccccccatcatctttttctttttctttaccaacgcagatgtatttttgttaacgtcaaacgccaggtaaatgtttaaagtgag--TA--T-CG----AGTGTAT-T-TGT--TTT--A-T--CTTTGAAA--TCTT--AC-TCT--CTTTT---TTA----A-ATA-T---TGGAAG--TAACAA----GTACAGTATGTACATGAAATTGAAACTT---AA-CAGTCAAA-TAAATT-GT-CAC-AGTC-TATTAGTA-TGATT-CAAGTACT-A--CACTA-TGGTTA-----T-ATTAGC--GAA-TGATT-AAAGAT-T------A-TCTTAGGCAAT-CTT-----AAATC-GA-GAGC---CCT------GACCATTACCACGC--GAGCAGGCAAAG--CAGA-GAGATCGCGA-G-----CACG----CT-----TCA------AGTGT----AGT--AC-TGCTGTCGG-TG-GTC-AAATTATT-------TC----TT
gi|14 : A-TATGTACAG--ACT----AC-T---AA--AGT-AAA-TAAA-T-GT-CACTA--TGTAA--GTA-TGATG-C---TTCC-AAAC---A-TG--TA-----T--GTAG---AAC-TG--T-A---TT-TG----CA-TC-T----AAT-CCT-----AA--CTGA-GACA---AATAGGAGAGACC-TT----CAG--G-G-AG--AAGG---AAA-CAG-----GA-A-----AACA---TTTCCA--TCA------AG-G-----AAT--AC-TGTTGTCTGTTT-GGC-AA--TATT-------TC----TTTA----CC---A----T-T--TGAAC----T---TTG-G-A-AAAA-T--AAA-GCC---ATG----AG-TCAGT--G-AT-TTGA-----TA---TCTA--------GT-----A-T-TCTAA-AT--------TAT----TA-TCATAT-TA-C-TA-CATCT-CTAT--ACCACTTA-------TTTGA-------T--------------A------TGG------ATT--ATTC-T-----------ATA--T-------AA-T---TTTAC
gi|13 : A-TATGTACAG--ACT----AC-T---AA--AGT-AAA-TAAA-T-GT-CACTA--TGTAA--GTA-TGATG-C---TTCC-AAAC---A-TG--TA-----T--GTAG---AAC-TG--T-A---TT-TG----CA-TC-T----AAT-CCT-----AA--CTGA-GACA---AATAGGAGAGACC-TT----CAG--G-G-AG--AAGG---AAA-CAG-----GA-A-----AACA---TTTCCA--TCA------AG-G-----AAT--AC-TGTTGTCTGTTT-GGC-AA--TATT-------TC----TTTA----CC---A----T-T--TGAAC----T---TTG-G-A-AAAA-T--AAA-GCC---ATG----AG-TCAGT--G-AT-TTGA-----TA---TCTA--------GT-----A-T-TCTAA-AT--------TAT----TA-TCATAT-TA-C-TA-CATCT-CTAT--ACCACTTA-------TTTGA-------T--------------A------TGG------ATT--ATTC-T-----------ATA--T-------AA-T---TTTACtaaggta
11 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): CCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCCATCTTTTATTTTTCATTTTGCGTGCGTTCATCGTTCAGTTAGCGTTTTCTATATTTCAGTGAACGTCTAGTTAAGGAATTGGGGTAAAATTATCGGTAATCATCGGTGAGTTCTCGGGAGTTTCCGGAATAAAATGCTTTTACAATCCAGAGTGCTATCGTAG
Unaligned ( gi|18 ): GGCTTTTTGTGAAAAAATTAATGGGCCTTATTTTTATGAACGAAAGTCTTCTTAAATGAGGGCTATTTTAAGATATATACGGATTTTGCATTCAGACAAGTGGTATGGGTAACTATAAAAAAATAATCTGTATTCACCCTAAAGGTAACATGTATATAAACAAA
Unaligned ( gi|19 ): TTGAGTGACTTTTGTGAAAAATAAGCCTTTATAGGGCAAAATTCTTTAAAAAAAGGGCTATTTTAAGATATTTTAGGAATATTTCAGACAAAAAATAAGGGGTAGAAATTCCTAATTTAACCCCCCAAGAAATTAATCTTACTTACTACAGATACATAAA
Unaligned ( gi|20 ): GCTTTCAAGTGACTTTTGTGCAAATAAGGGCCTTTTTCTAGGGCAAAATTCTTAAAAAATAAGGGCTATTTTTACGGATATTTTAGGAATTTTCAGGCAAAAATAAGGGTAAACTTCCTAATTAATCCCCAATGAATTAATTTGTACTTACCAAACAGGT
Unaligned ( gi|21 ): GCTTTCAAGTGACTATTTGTGAAAAATAAGGGCCTTTTTCAGGGCTAAAATCTTAAATAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAAGATTTTTCAAACAAAAAGTAGGGGTAAAACTTCCTTATAAATACT
Unaligned ( gi|22 ): GGACTTTTCAAGAAAATAAGGGCTTTTTTAGGGCAAAATTCTTTAAAACTAAGTGGCTATTAGATTTATTTAGGGATTTTTCAAGCAAAAATAAGGGTGTAAAAATCCTTCTCAATAAAGTTACAAAAAA
Unaligned ( gi|23 ): TCTTCAAGTGACTTTTTAAATGAAAAATAAGGACTTTTTAGGGCAAAATGTTCCTTATAAGGATAGGGTATTTTATGATATTTTGAGATATATTCAAAGCAAAATAGGAGGTCAAAACTTTCAAA
Unaligned ( gi|24 ): AGGGTGACTTTTTTATGAAAAATGAGGGCCTTTTTATGGCAAAATTCTTCATAAAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAGAATTG
Unaligned ( gi|25 ): GTGACTTTTTATGAAAAATGAGGGCCTTTTTATGGCAAAATTCTTCATAAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAGAATTGT
Unaligned ( gi|26 ): TTTGGAAATTAGATAAGGAATATAAGGGCCTCTGACAAAATGTAAGGAAAATAAGGGCCC
Unaligned ( gi|27 ): GCTTTCAAGTGACCTTTTTATGAAAAATAAGGGCCTTTTAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111 1111 22222222 22 22222222222222222222 1111 111111 444444444444444444444444444444444444 1111 333333333333333333333333 4444444444444 11111 111111 1111 11 11111111 1111 11 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2222222222222222 11111 11 11 111 1111 111111111 111 333333333 222222222 1111111 111 111 11 11111 11 111 111 22222 11 222222222 11111111 222222222 1111 11111 111 1111 11 111 444444444444444 11 1 4444444444444444 11 22222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111111 111111 88888888888888888888888888 111111 222222222222 1111 111 11 111 1111111 1 111 1 111 1111 111 1111 1 11 1111 111111 1 1 3333333333333 222 11 33333333333 1111 1111 1111111 11111 11 111 1111 111 111 222222222222222 111111 11111 11 1 1 1111111 1111 1111 111111 1111 22222222 1 111 3333333 222 22222222 1 111 22222222 111 11111 33333333 1111 1 1 666666666666666666666666666666666666666666 111111 11 222222222222222222222222 1 11 1 44444 1
lowQualScore : 5 888 2 0 2 3333 5 888 0000 88 5 5 5 88888888 0 5 5 66 5 66666666666666666666 66 5 5 66 0000 5 5 5 5 5 66 4 222222 111111111111111111111111111111111111 888 66 5 66 5 55 3 888 5 66 5 5 0000 3 3 888888888888888888888888 4444444444444 66 11111 4 777777 7777 4 66 22 1 4 8 66666666 4 1 2 5 0000 55 5 33 5 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 4444444444444444 4 33 00000 9 00 55 4 4 8 333 55 99 4444 4 55 666666666 55 55 0 777 111 777 4 4 4 4 4 8 000000000 0 4 4 4 55 4 111111111 4 4 999999 55 8888 8888 3333333 55 4 44 4 8888 55 55 55 222 2 4 55 777 4 8888 7777 4 8 99 4 777 777 4 111 4 4 55 4 8 4 55 4 11 8 8 4 4 4 8 4 00000 8888888888 4 77 55 55 777 4 55 4 111 55 777 66 66 66 777777 4 333 4 44444 1 66 99 8 99999 777 66 8 4 777 1 4 66 66 8 222222222 1 8 4 66666666 777 3 8 000000000 0000 0 22222 5 99 4 555 66 4 66 3 2222 5 5 5 44 5 5 5 111 888 111111111111111 5 3 888 888 22 5 66 0 5 5 66 5 1111111111111111 11 5 44444444 66 5 5 5 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888 777777777 999999 5 44444444444444444444444444 5 5 99999 4 5 0 777777 77 999999999999 4 2222 5 5 666 00 5 000 5 9999999 5 5 777 6 99 6 3 99 000 4444 99 333 2 6 6 4444 99 5 0 88 5555 5 666666 0 5 5 0 5 1111111111111 5 5 222 5 5 33 5 5 77777777777 999 5 4444 3 5 0000 5 4444444 5 22222 33 5 5 888 777 5 0000 66 3 5 555 999 5 666666666666666 888 77 444444 5 77777 11 5 5 0 0 88 6666666 0000 2222 111111 5 6666 66666666 7 5 5 5 222 5 5555555 555 5 33333333 1 5 000 00000000 444 00000 5 33333333 2222 5 5 4 5 1 5 1 77 444444444444444444444444444444444444444444 777777 33 5 888888888888888888888888 1 888 33 0 3 11111 0
lowQualScore : . ... . . . .... . ... .... .. . . . ........ . . . .. . .................... .. . . .. .... . . . . . .. . ...... .................................... ... .. . .. . .. . ... . .. . . .... . . ........................ ............. .. ..... . ...... .... . .. .. . . . ........ . . . . .... .. . .. . ............................................................................ . ................ . .. ..... . .. .. . . . ... .. .. .... . .. ......... .. .. . ... ... ... . . . . . . ......... . . . . .. . ......... . . ...... .. .... .... ....... .. . .. . .... .. .. .. ... . . .. ... . .... .... . . .. . ... ... . ... . . .. . . . .. . .. . . . . . . . ..... .......... . .. .. .. ... . .. . ... .. ... .. .. .. ...... . ... . ..... . .. .. . ..... ... .. . . ... . . .. .. . ......... . . . ........ ... . . ......... .... . ..... . .. . ... .. . .. . .... . . . .. . . . ... ... ............... . . ... ... .. . .. . . . .. . ................ .. . ........ .. . . . ....................................................... ......... ...... . .......................... . . ..... . . . ...... .. ............ . .... . . ... .. . ... . ....... . . ... . .. . . .. ... .... .. ... . . . .... .. . . .. .... . ...... . . . . . ............. . . ... . . .. . . ........... ... . .... . . .... . ....... . ..... .. . . ... ... . .... .. . . ... ... . ............... ... .. ...... . ..... .. . . . . .. ....... .... .... ...... . .... ........ . . . . ... . ....... ... . ........ . . ... ........ ... ..... . ........ .... . . . . . . . .. .......................................... ...... .. . ........................ . ... .. . . ..... .
lowQualScore : 0 888 5 0 5 2222 0 888 2222 22 0 0 0 11111111 4 0 0 99 1 00000000000000000000 88 0 0 99 6666 0 0 0 0 1 99 5 999999 111111111111111111111111111111111111 888 99 0 99 0 11 2 888 0 99 0 0 6666 2 1 222222222222222222222222 0000000000000 11 11111 4 222222 4444 4 11 22 9 4 9 11111111 4 9 6 0 6666 88 0 88 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 5555555555555555 0 22 00000 7 66 00 4 4 9 999 55 55 0000 0 55 333333333 55 55 8 000 000 000 0 0 0 0 0 0 111111111 8 0 0 0 55 0 000000000 0 0 333333 55 5555 5555 0000000 55 0 88 0 6666 55 55 55 777 3 0 55 000 0 5555 0000 0 0 55 0 000 000 0 222 0 0 55 0 0 0 55 0 00 0 0 0 0 0 0 0 00000 8888888888 0 55 55 55 000 0 55 0 000 55 000 11 33 11 333333 6 777 4 99999 9 11 00 9 66666 888 11 9 4 888 9 4 11 33 9 333333333 9 9 4 11111111 888 6 9 000000000 4444 2 66666 0 88 4 666 11 4 11 9 0000 0 0 0 44 0 0 0 000 888 000000000000000 0 2 888 888 55 0 99 0 0 0 99 0 9999999999999999 66 0 44444444 99 0 0 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 999999999 444444 7 77777777777777777777777777 0 0 77777 3 7 1 444444 99 666666666666 3 1111 7 7 444 00 0 111 0 1111111 0 0 555 7 22 7 3 22 222 2222 22 555 5 7 7 2222 22 0 4 44 6666 0 555555 0 0 0 0 0 9999999999999 0 0 555 0 0 88 0 0 88888888888 444 0 4444 2 0 6666 0 2222222 0 55555 88 1 0 888 555 0 6666 99 2 0 666 444 0 000000000000000 888 22 444444 0 55555 99 0 0 0 0 22 2222222 6666 1111 000000 7 3333 77777777 1 7 7 7 999 7 0000000 000 7 66666666 4 7 000 77777777 444 66666 7 66666666 1111 7 7 3 7 4 7 4 99 111111111111111111111111111111111111111111 999999 66 7 777777777777777777777777 4 666 88 0 2 22222 0
consensus : TATTACAAC-CAAC---GGGT-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--CTTCAAGATGGG-----GTAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-T-A-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-T------------------GAT--------AAC---C--A-CT--AAAAG-TTTTC-ATAGAAAT---G-C--ATT-GA-A----TCACTTTCTGA--------AA---ATA-T-AC-T-AAAGTCTA---AA--T--T--CA--AGTT-----TTAC-TT------ATTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------TA-TAATGATTTCTGAGATT-A----AAGGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--TAA-AA--AT-CTCNAAA-------A---CA-----ACACCCCCC-------------CCCCA-----------AAAAAAAACCC--ATACAAACAAATAAAAAAAATTGGGAAGATAAAGG-CCCACTT-----GAAAGNC--CTG--ACG-GT-G-TTATNN-TCAAACGT--CTATATA--AA----AT-AA--ACC---AAC---ATG--AGAT--GAAA---TT---AGGCAA---A-A-ATCC-A-AG-TG-ATAA--------ATGAACA-T-G-A--T-G-C-------AG-C-AGC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CA--GT--ACAAAGACT-ATG--GGT---CC-A----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTT--GAAT-C-AT--TTC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-CA-CACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTC--AGCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT-AAA--AATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAAA--GTTG-AACGAT-AC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---C---------ATATTCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---NT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-AAA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGTAT-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACTC--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-T-ACAA----GT--ACA-TATGTACAGGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC-----T-T-TA-AGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-A--TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAG--CAAA-CAGA----GA-A-----CACA---TCTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGC-A-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT--GCA-TT--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------ATTTNAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAAC-AGAAT-GCAATTT
Reference ( family-2636 ) : TATTACAAC-CAAC---GGGT-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--CTTCAAGATGGG-----GTAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-T-A-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-T------------------GAT--------AAC---C--A-CT--AAAAG-TTTTC-ATAGAAAT---G-C--ATT-GA-A----TCACTTTCTGA--------AA---GTA-T-AC-TNAAAGTCTA---A---T--T--CA--AGTT-----TTAC-TT------ATTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------TA-TAATGATTTCTGAGNTT-A----AAGGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--TAA-AA--AT-CTCNAAA-------A---CA-----ACACCCCCC-------------CCCCA-----------AAAAAAAACCC--ATACAAACAAATANAAAAAATTGGGAAGATAAAGG-CCCACTT-----GAAAGNC--CTG--ACG-GT-G-TTATNN-TCAAACGT--CTATATA--AA----AT-AA--ACC---AAC---ATG--AGAT--GAAA---TT---AGGCAA---A-A-ATCC-A-AG-TG-ATAA--------ATGAACA-T-G-A--T-G-C-------AG-C-AGC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CA--GT--ACAAAGACT-ATG--GGT---CC-A----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTT--GAAT-C-AT--TTC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-CA-CACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTC--AGCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT-AAA--NNTAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAAA--GTTG-AACGAT-AC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---C---------ATATTCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---NT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-AAA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGTAT-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACTC--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-T-ACAA----GT--ACA-TATGTACAGGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC-----N-T-TA-NGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-A--TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAG--CAAA-CAGA----GA-A-----CACA---TCTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGC-A-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT--GCA-TT--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------NTTCGAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTG----AGAAT-GCAATTT
gi|1 : TATTACAACACAACCAAGAGTAACATGTACATAAAAACTAG-AAAGAAA-A-CAAA-TTAA-CCATACAACTTTATTTAAAACTCCA-TA-CTAGTGGA-CTTCA--GT-GA-----ATAA-TC--------ACAATAAATAA-AG-CTGAA----ATCATGG-C-C-CACAAAGCCATGACCCAAAACTC-AATGCATCC-C------------------GATAAAA----AAC---C--A-CTCAAAAAA-TCCTC---AGAAATATAG-CCAATT-GA-AAAACTCAC-TTCTGA--------AAAAGATAGT-AC--AAAAGTCTA---A---TTAT--CAATAGTTAAATATCAC-TT------ACTA----TTTCAT-GAAAAA--ATATAAGCGG-TTAACCTACATA-AAATGATTTC-----CT-A----AA-GAC-CAACAA-CCCAAAAAA---AA-CA--AT-TTGGAGA-------AGATCA-----A-ACCCCGCAA-----------CCC--------------------ACCC--ATTCGA--AAATGCACTGAACTGGT-CGATA------TTACTC------AAAGTCAATTAATACA-A--A-TTAAAA-CCAA-------TAAATG--AG----ATGAA--ATC----------TA--AGAC--AAAAAACTTCCAAAGTAG---A-AAATTC-ACAA-TG-A-AA--------A--AACA-T-GAA--T-G-CA------AA-CAAGCCAA--G--ACTCGAAGA----ACGATAACAA--C-AAAT-AC-AAG---CATGGAATGCATT--CAAGAT--ACAAAGACTAATG--GGT---CCAA----GA-GGCTTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---G----CAT-CTGCTTTT--GAAT-C-CTTCTTC-T-CT-GCCATTGAT--CCTTTCCACCACAGA-TC-GCT-GCACCAAC-A--GCCCCTGGAGAAACA-A--GG--CATTTCTAAATG-AT--TTT-GACGAAA--ACATACATCTTCA--GGCCACATTCAAAGCA-TCATGTACCAATAA-AACCT-AAA--ATTAAACTAGC-CAA-TAATT-AG---GAAATTAA-CAAATATAATATTC-CAC-AAA-G-TTCGATAC--TTCAC-TAGC--------AACCATTGAA-ACAATAAATTTAAAT--ACATGATCAAATACAGTGTACTTAA-A---AAA--ACAT-GGAACACCAAATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAACGAGTAACAAAAG--GTCGCAACAGT-AC-AGATTTTATTA---A-CA-CCA--TCAT-AATATCTG-GG--ACCT--AATCC---------ATA-TCTGCGAAT-CTAACACCAAA--AAAA-TAT-CTA----A----TTAACCCAA----------CCACAACCAA----CAGAAAAGAATGTTTTTATTTAACGTCGTAACTTACCAA-----------------------------------------TTATAA-TTGAA-----TGGT-AGAA-T--G-TGGAACTATTACAAA----AGGGTCTTACCCC-CT-AAA-TAGCTATATAAGT-CAAGCAAATG-TATTATGTAT-ATTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACT---TCTTTTTTTTTA----CACTTC-C-CTGAAG-T-ACAA----GT--ACACTATGTACAG--AAT----AC---------------A-T-------TC-A----------TA----A-TGCCGTC---T-A-C-A--CA-TGT-AC-TG-------TAGC--GACTTG--A-AAATCTATG----CA-TCC------ACCC-TAAAAAAAACC-GATGACA---AATAG---AGA-C-TT----CA---GAG-AG---AAC--CAAA-GAAA----GA-ACCTACCACA---TTTC-AATCAAACCGCAA-A-----AATA-AC-T-GCTGT-TG-TTAAGAAAA-TTACTCATTATATC----GTTAATACCC---ACACT-T-CA--ATCCCATC---TTT-G-A-AAAA-TAAAAA-AGC-AC----ATGAC-AG-TC-GTGATATACTGA-C-CTACTA---CATA--------GT--GCA-ATACCTACAATAAAG----CAT----TA-TCATATATACCATACCATCT-CC-TAAATTACCC-------CTCCAAAAATTACT--------------AACTCACTGG--ACCAACTTAATTC-T-----------TAA--T-------AACTAA-ATTA
gi|10 : aaAAAGTCTA---AA--TA-T--CA--AGTT-----TTAC-TT------ACTA---TTT-CATTG--AAA--ATATAAA-GG-GT--------TA-TTATGATTTATGAGATTTA----AAGGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA----A-AA--AT-CTCTAAACACAAACA---CA-----ACACCCCCC-------------CCCCACCCCTCCACCCAAAAAAAACCCGAAAACAAACACAT-CAAAAAATTGGGAAGATAAAGG-CCCACTT-----GAAAAGCG-CTGG-ACG-GTTG-TTATTA-TCAAACGT--ATATATA--AA----AT-AA---CC---AAT---ATG--AGAT--GAAA---TT---AGACAA---A-A--TCC-A-AG-TG-ATAA--------TGGAACA-T-G-A--TCG-C-------AG-C-AGC--ATGG--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CA--GT--ACAAGGACT-ATG--GGT---CC-A----GA-G--TGGGATTTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTTTGGAAT-C-AT--TTC-T-CT-GC--TTG-G--CCTTT-CA-CACA-ATTC-ATT-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TTGGT--TTT-GCC-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTC--AGCT-T--GGAACCAAT-A-AACCTAAAA--AATAAAT--GC-AAATTA--T-GG---T--ATT-ACCA---ATGAT-TTC-AACAAAGT--T---GT-TACTTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-ata
gi|11 : AC-CAAC---AGGT------TACATAAAA--TAC-C---ATATA-CAAA-TT-A-CCAC-CA--------TAGAAGATCA-TA-CAAATG-----TCAACACGGGTTTCAGTAT-TTCAAAGGTAACCATAAGAAATGATC--TGTTGTGT-ATGG-TTA-CACAAATCCATG--TTGAA-----AATG----C-TGATACCATAGCATGCATTGATTCAACACAAAC---CCTATCT--GAAAG-TATACTATATAAGT---T-G--ATTTGACA----T-ACTTTTTGACTTTTAGCAA---GTG---------AAGTCTT---A---C--TTACG--AATT-----TTTT-TTTGTAAAATTAGGATTTTCAT-G--GGA--AAATAAG-GGATT--------TT-TAGGAATTTG-GAGCTT-A----AA--------TAA---GGAAAAA--TAA-GG--GC-CTCTGA--------------------------------------------CA-----------AAAAAAA-------TA---------AGGAAAAATTAGGAAAATAAGGG-CCCGCTT-----GAAAGta
gi|12 : ctttcaagtgactttttgtgaaaaataagggccttttttagggcaaaattcttaaagaatgagggctatttttaggatattttaggaatttcaggcaaaataagggtaaaaaaacttcctaattaaacccccaatgaattaatttgtacttAAAATTGGGAAGATAAAGG-ACCACTT-----GAAAG-C--CTG--ACG-GT-G-TTATTG-TCAAACGT--CTATATA--CA----AT-AA--ACC---AAT---ATG--AGAT--GAAA---TT---AGACAA---A-A-ATCC-A-AG-TG-ATAA---------TGAACA-T-G-A--T-G-C-------AG-C-AAA--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-TAG---CATGGAATG--TT--CA--GT--ACAA-GACT-ATG--GGT---CC-A----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGCTTTT--GAAT-C-AT--TTC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-CA-CACG-A-TC-A-T-G-----AA-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCTT-TTC--AGCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT-AAA---ATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-TA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTT-T----T-C--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAATA---------TACAT--ACATG-A--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACc
gi|13 : A-TATGTACAG--ACT----AC-TA---A--AGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC-----TATGTA-AGTA-TGATG-C---T-TCC-AAACA-TGT-A--TG-------TAG---AAC-TG--T-A---TT-TG----CA-TC-T----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAGGAGAGACC-TT----CAG--G-G-AG---AAG--GAAA-CAG-----GA-A-----AACA---TTTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GTTGTCTGTTT-GGCAA---TATT-------TC----TTTA----CC---A---T-T---TGAAC----T---TTG-G-A-AAAA-T---AA-AGC-C-----ATG---AG-TCAG--------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT----A-TT--CTAA-AT--------TAT----TA-TCATAT-TA-C-TA-CATCT-CTAT--ACCACTT-------ATTTGA-------T--------------A------TGG------ATT--ATTC-T-----------ATA--T-------AA-T---TTTAC
gi|14 : A-TATGTACAG--ACT----AC-TA---A--AGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC-----TATGTA-AGTA-TGATG-C---T-TCC-AAACA-TGT-A--TG-------TAG---AAC-TG--T-A---TT-TG----CA-TC-T----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAGGAGAGACC-TT----CAG--G-G-AG---AAG--GAAA-CAG-----GA-A-----AACA---TTTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GTTGTCTGTTT-GGCAA---TATT-------TC----TTTA----CC---A---T-T---TGAAC----T---TTG-G-A-AAAA-T---AA-AGC-C-----ATG---AG-TCAG--------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT----A-TT--CTAA-AT--------TAT----TA-TCATAT-TA-C-TA-CATCT-CTAT--ACCACTT-------ATTTGA-------T--------------A------TGG------ATT--ATTC-T-----------ATA--T-------AA-T---TTTACtaaggta
gi|15 : -TA--T-CG----AGTG-TATT-TGT---TTTA--T--CTTTG-A-AA-TCTT--ACTC--TC---TTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-TAACAA----GT--ACAGTATGTACATGAAATTGAAACTTA---A-CAGTCAAA-TAAATT-GTC-ACAGTCTA-T-TA--GTA-TGATT-CAAGT-ACT-A--CA-C-T-A--TGGTTATATTAGC--GAA-TGATT-AAAGAT-T------A-TCTTAGGCAATCT-T-----AAATC-GA-GAGC---CCT------GACCATTACCACGC--GAGCAGGCAAAG--CAGA-GAGATCGCGA-G-----CACG----CT----TCA------AGTGT----AGT--AC-T-GCTGTCGG-TG-GTCAAA-TTATT-------TC----TTtaaggta
gi|16 : TATTACA-C-CAAC---AGGT-A-ACGTACATAAAA--TTG-A---AAA-AACAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAG-TCAATA-CTAGTGGA-CTTCAAGATGGG------T-T-TC--------ACC-TAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-T-A-CACAAAGCCATG--CCAAA---TTAATG----C-T------------------GAT--------AAC---C--A-CT--AAAAATTTTTC-CTA-AAAT---G-C--ATT-GA-A----TCACTTTCTGA--------AA---G-A-TCAC-T--AAGTCTAAATA---T--C--AA--AGTT-----TTAC-TT------ACTA---TTTTCAT-G---AA--ATATAAG-GG-TT--------TA-TAATGATTTTTGAGAT
gi|2 : TATTACAAC-CAAC---AG-T-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGA--CTTCAAGATGGG-----ATAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATG--T-A-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-T------------------GAT--------AAC---C--A-CT--AAAAG-TTTTC-ATAGAAAT---G-C--ATT-GA-A----TCACTTTCTGA--------AA---G-A-T-ACGTCAAAGTCTA---A---T--C--CA--AGTT-----TTAC-TT------ATTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------TA-TAATGATTTCTGAGCTT-A----AAGGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--TAA-AA--AT-CTCCAAAC------A---CA-----ACACCCCCC-------------CCCCA-----------AAAAAAAACCC--ATACAAACCAATAAAAAAAATTGGGAAGATAAAGG-CCCACTT-----G-AAGTC--CTG--ACG-GT-G-TTATAT-TCAAACGT--CTATATA--AA----AT-AA--ACC---AAC---AT---AGAT--GAAA---TT---AGGCAA---A-A-ATCC-A-AG-TG-ATAA--------ATGAACA-TCG-AATT-G-C-------AG-C-AGC--A--G--AT----GG-----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CA--G---ACAAAGACT-ATG--GGT---CC-A----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGGC-C-CA---GC---CAT-ATGTATTT--GAAT-C-AT--TTC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-CA-CACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AAAC--A--GG--CA-TTCT---TT-GT--TTT-G-CAAAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTC--AGCA-T--TGTACCA---A-AACCT-AAA--TATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTCAAAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATGCA-TGTACTTAATAAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAGTTA-AAA-TACTAG-TAAAAC-AGT---AAAA----TTG-AACAATAACAAGATT---TTC---A-CA-CCA--TAAT-AATATCTG-GG--A-CT--A---T---------ATATTCTGCGAAT-CT--------A--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---AT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGG--TTT----C-AT-AGA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGT-T-TTTAA-T--CTTTGGA-AATTCTT--ACTC--TTTTTTTTTTTA----AA--TA-T-T-GAAG-T-ACAAACTTGT--ACA-TATGTACAAGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC-----A-T-TA-TGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-AT-TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAGTTCAAA-CAGA----GA-A-----TACA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--ACTT-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGTAA-----ATGACAAG-TCAGT-------T-A-TGTTGATA---TCTA--------GT--GCA-TC--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------CTTTAAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAATCAGAAT-GCAATTTaa
gi|3 : TATTACAAC-CAAC---AGGT-ACATGT-CATAAA---TAGGA---AAA-A-CAAAATT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--ACTCAAGATGGG------TAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-T-A-CACAGAGCC-TG--CCAA----T-AATG----C-T------------------GAT--------GAC---C--A-CT--AAA-G-TTTTC-ATAGAAAT---GGC--ATT-GA-A----TCACTTTCTGA--------AA---AGA---AC-T-AACGTCTAT--A---T------A--AGTT-----T-ACGTT------ATTA---TTTTCAT-G--AAA--A---AAA-GG-TT--------TA-TAAT-ATTTCTGAGCTT-A----AAGGAC-CTC-GA-CCAAAAAAAAATAATAA--AT-CTCAAAA-------C---AA-----ACACCCCCC-------------CCCCA-----------AAAAAAA-CCC--ATACAAACAAATAAAAAAA--TGGGAAGATAAAGG-CC-ACTT-----GAAAG-C--CTG--ACG-GT-G-TTATT--TCAAACGT--CTATATA--AA-----T-AA--ACC---AAC---ATG--AGAT--GAAA---TT---AGGCAA---A-A-ATCC-A-A--TG-ATAA---------TGAACA-T-G-A--T-G-C-------AG-C-AGC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CA--GT--ACCAAGACT-ATG--G-T---CC-A----GA-G--TTGGA-TTT--CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTT---GAAT-C-AT--T-C-T-CT-GT--TTG-T--CCTTT-CA-CACA-A-TCTA-T-G-----AC-A--A----TGGA-AAAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA-----T---TTTTCA--GGCCAC-TTC--AGCA-T--TGTACCAAT-ATAACCT-AAA--ATTAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---TA-T--TTCAC-T-GC--------A---A-TGAATA---------TACAT--ACATG-T--AATGCA-TG-AC-TAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAA----TTG--ACAATAAC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---TA--------ATATT-TGCGAAT-CT--------A--AAAA-T-T-CTA----AT---T--ACCC------------CCCC--CCCC----CCAA--------CTTTTCTTT---AT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TT-------------CTTTAGAA-TTGAA--TT-TGGTAAAAG-CTGG-TGG--CT-------A----AGG--TTT----C-ATGAAA-T-GC-AT-TA--T-C------GTG-TA-T-TGT-T-TTTAATT--CTTTGGA-AATTCTT--A--C--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-TGTGGAAG-T-ACAA----CTTGACA-TATGC-----AAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC-----T-T-TATAGTA-TGATG-CT--T-ACC-A--CAGTGT-A---G-------TAGC--GAC-TG--TAAAATCT-TG----CATTCCT----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAGTTCAAAGCAGA----GATA-----TACA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--AC-TGGCTGTCTG-TTGGGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-C-TGACC----C---TTTGG-A-AAAA-T--AAA-AGTAA-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGATT-TTGATA---TCTA--------GT--GCA--T--CTAC-AT--------TGT----TATTCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCCTGAAATAATTTTAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAAC-AGAAT-GCAATTT
gi|4 : TACGT-TCACACGT--TCATATAT-AACATGAT-AACAACCTATAACTCTGTA--AGAT--GAAA---TT---AGTCAATATA-A-ATCCTA-AA-TGAATAATAGATAGCATTAATACT-G-A--C-A-C-------AGCC-AGC--A--GTAAT----GGATATCAT-------A--G-AAACTATACAGCTACATCAAATG--TTAACA--GCTGAGACAGACT-ATGTCCGTTACCC-ATAATGA----TTGGA--TTT-CAGG--C-CC---ACGCACAT-ATGTTTTT--GAATAC-AT--TTC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTTGCATCACA-A-TT-A-TGG-----AC-AACA----TGGA-AGAC--A--GG--CAATTCT---GT-GTTGTTT-G-C-AAAACAGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTC--AGCA----GGTACCAAT-A-AACCT-AAA---ATAAAT---C-AAAGTA--TCGG---T--ATTAA-CA---ATGAT-TTC--AC-AAGTG-TTA-AT-A--TTCACTT-GCTAATAGCAA---ATTTAC-A---------TACATACACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAAATACATGG--ACAC---ATGAT-TGATTAG-TA-AAATTACTAG-T-AA-----T---A-----------------------ATT---TTCCTTATCA-CCG--T-ATAAATATCTG-GGCAG-CTTCA---CTTAATAATTATATACTACGAACACT-------GA--AAAA-T-TACTACGGTACATTT--ACCCCCCCCCCCCCGCCCCC--CCCATCATC-----------TTTTTCTTT---TT----CTTTACCAACGCAGATGTATTT-----------T
gi|4 : ATTATTTGAATCATGCGGT-A----T--T-TGG--ATTA-----A----AGGGTTTT----G-AT-AAAAT-GC-AT-TA--TAC-----AGTGATATT--GTAGGTTTAA-TTTCTTTGGATAA-TCTTACACTC--TCTATTTTGTTACTTCAG--TATT-TGAAAGTT-ACAA----GT--ACATTATGGTTAAGAAATA---AC-TA---ACCAGTCAAACTAAA-TGGTC-AC-----T-T-TA--GTACTGATG-TCTAT-ACCAA--CA-TGT-AGCTGTTTC---TAGCGAGAC-TGT-T-AAATCT-TGCTCTCA-TCCC-----ATCT-T-----GAACCCTC-GGCATCCTATA----------TT----CAGGTGAG-AAG-GAAG---ACA-CAGC----GC-T-----CACAGAGTCTCATGTCA------AG-GTGGGAAATCAAC-T-CCTGTAAG-GT-GTTAAA-TT-TT-------TCTATTTTTA----CTCCAAC-CTCT-CATGACCGGA-CCGGTTTAG-ATAAAATT--AAACAGC-AACGTGATG-A-AGCTCAGT-------TGATT-TTGATACCTTCTATATTATCTGTCGACACTT--CTTC-AT---GAGGATGTTACGTA-TCATAT-TACC-TA-C-TCT-CC-T--ATTAGCC-------CTTTACA----ACTAATCTGACACACTAA------TGG--AC--ATTA-ATTC-TTACCTTTAGTAAAA--TTAATGTGGA-TAA-TATACATGCATTAATGTG----AGAATCGCAATTTtgttaacgtcaaacgccaggtaaatgtttaaagtgagattatttgaatcatgcggtatttggattaaagggttttgataaaatgcattatacagtgatattgtaggtttaatttctttggataatcttacactctctattttgttacttcagtatttgaaagttacaagtacattatggttaagaaataactaaccagtcaaactaaatggtcactttagtactgatgtctataccaacatgtagctgtttctagcgagactgttaaatcttgctctcatcccatcttgaaccctcggcatcctatattcaggtgagaaggaagacacagcgctcacagagtctcatgtcaaggtgggaaatcaactcctgtaaggtgttaaatttttctatttttactccaacctctcatgaccggaccggtttagataaaattaaacagcaacgtgatgaagctcagttgattttgataccttctatattatctgtcgacacttcttcatgaggatgttacgtatcatattacctactctcctattagccctttacaactaatctgacacactaatggacattaattcttacctttagtaaaattaatgtggataatatacatgcattaatgtgagaatcgcaattt
gi|5 : tacgttcacacgttcatatataacatgataacaacctataactctgtaagatgaaattagtcaatataaatcctaaatgaataatagatagcattaatactgacacagccagcagtaatggatatcatagaaactatacagctacatcaaatgttaacagctgagacagactatgtccgttacccataatgattggatttcaggcccacgcacatatgtttttgaatacatttctctgcttgtcctttgcatcacaattatggacaacatggaagacaggcaattctgtgttgtttgcaaaacagatttttcaggccacttcagcaggtaccaataaacctaaaataaatcaaagtatcggtattaacaatgatttcacaagtgttaatattcacttgctaatagcaaatttacatacatacacatgtaatacatgtacttaaaagaaaatacatggacacatgattgattagtaaaattactagtaataattttccttatcaccgtataaatatctgggcagcttcacttaataattatatactacgaacactgaaaaattactacggtacatttacccccccccccccgccccccccatcatctttttctttttctttaccaacgcagatgtatttttgttaacgtcaaacgccaggtaaatgtttaaagtgagCAAC-CAAA---GGTT-ACATGTA-ATAA----TAG-A---AA----CAA--TT-A-TTAT-CAG-------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGGT-CTTCAAGA-GGG-----GTAT--C--------ACCATAG---A-GA-C--AG----AT-ATGG-T-A-CACA--GCCATG--C-AAA---T-AATG----CCT------------------GAT--------AAC---C--A-CT--AACAG-TTTTC-AT-GAAAT---G-C--ATT-GA-A----TC---TTCTGA--------AA---ATA-T-AC-TAAAAGTCTA---AA--TA-T--CA--AGTT-----TTAC-TT------ATT----TTTTCAT-G--AAATAATAC----GG-TT--------TA-TAATGATTTCTGATATT-A----A-GGAC-TT--GA-CCAAAAAAA---AA-AA--AT-T--------------------------ACCC---------------------------------AAAAAAACCA--A---AAAC---TA----AAATTGGGAAGATAAAGG-C--ACTT-----GAAAGCC--ATG--ACA-GT-GGTTATGTATCAAACGT--CTATATA--AA----AG-AA--ATA---ATA---ATG--AGAT--GA-----TT---AGGCAA---A-A-ATCC-A-AG-TG-ATAA---------TGA-CA-T-G-A--T-G----------A-C-AG------G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC--T-CA----CATGGAATG--TT--CA--G---ATAAAGACT-ATG--GGG---TC-A----GA-G--TTGGA-TTTTTCAGA--C-CA---GC---CAT-ATATTTT----GAT-C-AT--TTT-TTCT-GC--TTG-TTACCTTT-CA-CACA-A-TC-A-T-A-----A-----A----TGGA-AGACC-A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-G-CAA--AGAT---TTTTCA--TGGCAC--TC--AG---T--TGTAGC-AT----ACCT-AA-----T--AT--GC--AA-TA--C--G---T--ATT-A-GA---ATG-T-TTC--AC--AGTGTT---AT-T--TTT-C-T-GC--------A---ATTG-A-A---------TAC-----TCTG-T----TACA-TGGTCTTTA-A---GAA--ACAT-G--A-AC----TAAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAA--AGT---AAAAATTGTTG-A--GAT-AC-AGA-T---TTC---A--A-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT------C---------ATA-TCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTG----A----T--------------------TA--CCCA----------------TTTTTCTTT---TT----ATCTTCC------AGTGT-TTTTATTTAAGTGGTA-------------CTTTATAATTTG-A--AT-T-GT-AAAGTT--GTTGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-TAA---G--AT-T---T-C-----A-TGCTATG-TGTAT-
gi|6 : ttCAAC-CAAA---GGTT-ACATGTA-ATAA----TAG-A---AA----CAA--TT-A-TTAT-CAG-------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGGT-CTTCAAGA-GGG-----GTAT--C--------ACCATAG---A-GA-C--AG----AT-ATGG-T-A-CACA--GCCATG--C-AAA---T-AATG----CCT------------------GAT--------AAC---C--A-CT--AACAG-TTTTC-AT-GAAAT---G-C--ATT-GA-A----TC---TTCTGA--------AA---ATA-T-AC-TAAAAGTCTA---AA--TA-T--CA--AGTT-----TTAC-TT------ATT----TTTTCAT-G--AAATAATAC----GG-TT--------TA-TAATGATTTCTGATATT-A----A-GGAC-TT--GA-CCAAAAAAA---AA-AA--AT-T--------------------------ACCC---------------------------------AAAAAAACCA--A---AAAC---TA----AAATTGGGAAGATAAAGG-C--ACTT-----GAAAGCC--ATG--ACA-GT-GGTTATGTATCAAACGT--CTATATA--AA----AG-AA--ATA---ATA---ATG--AGAT--GA-----TT---AGGCAA---A-A-ATCC-A-AG-TG-ATAA---------TGA-CA-T-G-A--T-G----------A-C-AG------G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC--T-CA----CATGGAATG--TT--CA--G---ATAAAGACT-ATG--GGG---TC-A----GA-G--TTGGA-TTTTTCAGA--C-CA---GC---CAT-ATATTTT----GAT-C-AT--TTT-TTCT-GC--TTG-TTACCTTT-CA-CACA-A-TC-A-T-A-----A-----A----TGGA-AGACC-A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-G-CAA--AGAT---TTTTCA--TGGCAC--TC--AG---T--TGTAGC-AT----ACCT-AA-----T--AT--GC--AA-TA--C--G---T--ATT-A-GA---ATG-T-TTC--AC--AGTGTT---AT-T--TTT-C-T-GC--------A---ATTG-A-A---------TAC-----TCTG-T----TACA-TGGTCTTTA-A---GAA--ACAT-G--A-AC----TAAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAA--AGT---AAAAATTGTTG-A--GAT-AC-AGA-T---TTC---A--A-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT------C---------ATA-TCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTG----A----T--------------------TA--CCCA----------------TTTTTCTTT---TT----ATCTTCC------AGTGT-TTTTATTTAAGTGGTA-------------CTTTATAATTTG-A--AT-T-GT-AAAGTT--GTTGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-TAA---G--AT-T---T-C-----A-TGCTATG-TGTAT-
gi|7 : ttTATTACAAC-CAAC---AGGTTACATGTAC-TAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-AACCAT-C---------TAGAAGATCA-TAACTA-TGGACCTTCAAGATGGG------TATGTC--------ACCATAAAAAA-GA-C--AG----AT-ATGGAT-AACACAAAGCCATG--CCA-----T-TATA----C-T------------------GAT--------AACATGC--A-CT--AAAAG-TTTTC-ATAGAAA----G-C--ATT-GA-A----TCACTTTCTGA--------AA---AGA-T-A---TAAAGTCTA---AATAT--C--AA--AGTT-----TTAC-TTT-----ATTAATATTTCAAT-G--AA----TATAAG-GGATT--------TAATAATGATTTCTGAGATT-AGAAAAAGGACGCTCTGAACCAAAAAAA--TAT-ATTTATACACAAAA-------A---CATACCCACATCCCCCACCTAACTTCCCGCCCCACCCAAAA----AAAAAAAACCCCAAAACAAATAAATAAAAAAAATTGGAAAGATAAAGGTCCCACTT-----GAAAGGC--CTG--ACG-GT-G-TTATTA-TCAAACGT--CTAT-TA--AA----AT-AA--ACC---AATTA-ATGAAAGATTGGAAA---TT---AGGAAA---ACA-GTCC-C-AG-TG-AT-A--------ATGAACA-T-G-A--T-GCC-------AG-C-AGC--A--G--AT----GGA----CC-------A--TAAAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CA--GT--AC-AAGACT-AT---GGT---CC-A----GATG--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CATAATGTTTTT--GAAT-CAAT--TTC-G-CTCGC--TTG-T--TCTTT-CA-CAC--A-TC-A-T-G-----ACAA--A----TGGA-AGAC--AATGGCCCATTTCT---TT-GT--TTTGG-C-AAA--AGAT---
gi|8 : aTTAA-AAGGAAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TAGAAA-TACTAGAT-AAAC-AGT---AAAAA--TGTG-GACAA--AC-AGATT---TT----A-CA-CCACTT-AT-AATATCTTTGG--A-CT--A---T---------CTAT-CTGCGAAT-CT-------AA--AAAT-T-T-CTA----A----TTAACCC------------ACCC--CCCAAAA-C----------------CCCC---AA----ACTCACCAA---GAATGT-TTT-----------TATTTAACGTGGTAACTTTATAATTTGAG--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------ATTAAAGGGTCTT----CCAT-AAA-T-GC--T-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGT-T-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TATT--ACTTCTTCTTTTTTTTTT----AA--TA-TGTGGAAG-T-ACA-----GT--ACA-TAT-TACAG-AAAT----AC-TATCAA-AAGT-AAA-TAAA-TTGTCCAC-----T-T-TA-GTTA-TGA-G-C---TTACC-A--CA-TGTTA--TGCA-----TAGC--AAC--G--A-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCCCT-----AACCCTGA-GACA---AA-AG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAA--------CAGA----AA---------CA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAAATTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-TTCAGAACC----C---TTTTGCA-AAAA-T--AAA-AGC-AC----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-CTGATA---TCTA--------GT--GCA-TC--CTAC-AT---G----TA-----TA-TCATAT-TACC-TACCATCTACC-T--ATTACCCTAAATA-ATTCTAA----ACT--------------A------TGGGAAC--ATT--ATTCTT-----------AAATTT-------AATTAATTTTACA--CA-T-ATGT------GAAT-GCAATTT
gi|9 : GAAGACAAAGG-CCCACTTACTTGGAAAGGC--CTGG-ACAAGT-G-TTATTA-TCAAACGTGTCTATATATTAAGT--AT-AA--ACC---AAC---ATG--A-AT--GAAA---TTT--AGGACA---A-A-ATCC-A-AAATGGATA----------TGAACA-T-G-A--T-G-CCACCAAAGG-C-AGC--A--G--AT----GGA----AC-------ACAT-AAAC-AT-CAA---CATGGAATG--T---CA--GT--ACAA-TACA-ATG--GCT---CC-T----G-----TTGGA-TTCT-CAAGAGCGTAAGTGC---CAT-ATATTTTT---AAT-C-AT--TTCCT-CT-GA--CTG-T--CCTTT-CA-CACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGACGAG--GG--CATTTCT---TT-A---TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCATTTGCCAT-TTC---GCACT--TGTACCCAT-T-AACCT-ACACGAGTAAAT--GCAAAA-TA--T-AGGTTT--TTT-A-CA---ATGA--TTC-GAC-AAGTG-T---TA-T--TTCACTT-GC--------A---ATAGGC-A---------GACTT--ACTTA-A--AATACA-TG-------------AA--ACA------------ATGATCTG-TTAA-TA-AAA-TACTAG-T-AATC-AGT---AAAAA--ATTGTGATGAT-AC-TGATT---TTC---ACCACCCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---T---------AT-TCCTGCAAAT-GT-------CATCACAATT-T-CTA----AT---T--ACCC------------CCCC--CCC
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): CCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCCATCTTTTATTTTTCATTTTGCGTGCGTTCATCGTTCAGTTAGCGTTTTCTATATTTCAGTGAACGTCTAGTTAAGGAATTGGGGTAAAATTATCGGTAATCATCGGTGAGTTCTCGGGAGTTTCCGGAATAAAATGCTTTTACAATCCAGAGTGCTATCGTAG
Unaligned ( gi|18 ): GGCTTTTTGTGAAAAAATTAATGGGCCTTATTTTTATGAACGAAAGTCTTCTTAAATGAGGGCTATTTTAAGATATATACGGATTTTGCATTCAGACAAGTGGTATGGGTAACTATAAAAAAATAATCTGTATTCACCCTAAAGGTAACATGTATATAAACAAA
Unaligned ( gi|19 ): TTGAGTGACTTTTGTGAAAAATAAGCCTTTATAGGGCAAAATTCTTTAAAAAAAGGGCTATTTTAAGATATTTTAGGAATATTTCAGACAAAAAATAAGGGGTAGAAATTCCTAATTTAACCCCCCAAGAAATTAATCTTACTTACTACAGATACATAAA
Unaligned ( gi|20 ): GCTTTCAAGTGACTTTTGTGCAAATAAGGGCCTTTTTCTAGGGCAAAATTCTTAAAAAATAAGGGCTATTTTTACGGATATTTTAGGAATTTTCAGGCAAAAATAAGGGTAAACTTCCTAATTAATCCCCAATGAATTAATTTGTACTTACCAAACAGGT
Unaligned ( gi|21 ): GCTTTCAAGTGACTATTTGTGAAAAATAAGGGCCTTTTTCAGGGCTAAAATCTTAAATAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAAGATTTTTCAAACAAAAAGTAGGGGTAAAACTTCCTTATAAATACT
Unaligned ( gi|22 ): GGACTTTTCAAGAAAATAAGGGCTTTTTTAGGGCAAAATTCTTTAAAACTAAGTGGCTATTAGATTTATTTAGGGATTTTTCAAGCAAAAATAAGGGTGTAAAAATCCTTCTCAATAAAGTTACAAAAAA
Unaligned ( gi|23 ): TCTTCAAGTGACTTTTTAAATGAAAAATAAGGACTTTTTAGGGCAAAATGTTCCTTATAAGGATAGGGTATTTTATGATATTTTGAGATATATTCAAAGCAAAATAGGAGGTCAAAACTTTCAAA
Unaligned ( gi|24 ): AGGGTGACTTTTTTATGAAAAATGAGGGCCTTTTTATGGCAAAATTCTTCATAAAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAGAATTG
Unaligned ( gi|25 ): GTGACTTTTTATGAAAAATGAGGGCCTTTTTATGGCAAAATTCTTCATAAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAGAATTGT
Unaligned ( gi|26 ): TTTGGAAATTAGATAAGGAATATAAGGGCCTCTGACAAAATGTAAGGAAAATAAGGGCCC
Unaligned ( gi|27 ): GCTTTCAAGTGACCTTTTTATGAAAAATAAGGGCCTTTTAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111 1111 22222222 22 22222222222222222222 1111 1 111111 1111 1 1111 1111 2222222222 111 2 11111 1111 11 11111111 22222222 11 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 222222 2222222 11111111111 11111 111111 111 11 1111 1111 444444444 111111111111 1111111 11111 1111 111 11 11111 11111 111 111 111111 11 222222222 11111111 222222222 1111 11111 111 1111 11 111 444444444444444 11 1 4444444444444444 11 22222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111111 111111 88888888888888888888888888 111111 222222222222 1111 111 11 111 1111111 1 111 1 111 1111 111 1111 1 11 1111 111111 1 1 22222222222 222 11 33333333333 1111 1111 1111111 11111 11 111 1111 111 111 222222222222222 111111 11111 11 1 1 1111111 1111 1111 111111 1111 22222222 1 111 3333333 222 22222222 1 111 22222222 111 11111 33333333 1111 1 1 555555555555555555555555555555555555555555 111111 11 222222222222222222222222 1 11 1 22222 1
lowQualScore : 5 888 2 0 2 3333 5 888 0000 88 5 5 5 88888888 0 5 5 66 5 66666666666666666666 66 5 5 66 0000 5 0 5 5 66 4 222222 0000 0 0000 888 66 0 5 0 3 888 5 66 0000 3333333333 3 888 55 8 6 4 7777 11111 0 4 4 2222 4 66 22 1 4 8 66666666 4 9999 0 5 88888888 3 5 00 5 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 555555 3333333 1 7 66 99999999999 4 00000 55 9 4 8 222222 4 4 8 555 55 55 33 4444 55 55 777 3333 55 55 55 0 99 777 4 777 4 666 4 8 111111111 99999 4 4 99 4 777777777777 4 999999 55 8888 8888 3333333 55 4 44 4 8888 55 55 88888 2 4 55 777 2222 7777 4 8 99 4 777 777 4 111 4 4 55 4 8 4 55 4 11 4 4 4 4 4 4 4 8 4 00000 8888888888 4 55555 55 777 4 55 4 111 55 777 66 66 66 777777 4 333 888888 1 66 99 8 99999 777 66 8 4 777 1 4 66 66 8 222222222 1 8 4 66666666 777 3 8 000000000 0000 0 22222 5 99 4 555 66 4 66 3 2222 5 5 5 44 5 5 5 111 888 111111111111111 5 3 888 888 22 5 66 0 5 5 66 5 1111111111111111 11 5 44444444 66 5 5 5 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888 777777777 999999 5 44444444444444444444444444 5 5 99999 4 5 0 777777 77 999999999999 4 2222 5 5 666 00 5 000 5 9999999 5 5 777 6 99 6 3 99 000 4444 99 333 2 6 6 4444 99 5 0 88 5555 5 666666 0 5 5 0 5 22222222222 5 5 222 5 5 33 5 5 77777777777 999 5 4444 3 5 0000 5 4444444 5 22222 33 5 5 888 777 5 0000 66 3 5 555 999 5 666666666666666 888 77 444444 5 77777 11 5 5 0 0 88 6666666 0000 2222 111111 5 6666 66666666 7 5 5 5 222 5 5555555 555 5 33333333 1 5 000 00000000 444 00000 5 33333333 2222 5 5 4 5 1 5 1 77 555555555555555555555555555555555555555555 777777 33 5 888888888888888888888888 1 888 33 0 3 77777 0
lowQualScore : . ... . . . .... . ... .... .. . . . ........ . . . .. . .................... .. . . .. .... . . . . .. . ...... .... . .... ... .. . . . . ... . .. .... .......... . ... .. . . . .... ..... . . . .... . .. .. . . . ........ . .... . . ........ . . .. . ..................................................................................... . ...... ....... . . .. ........... . ..... .. . . . ...... . . . ... .. .. .. .... .. .. ... .... .. .. .. . .. ... . ... . ... . . ......... ..... . . .. . ............ . ...... .. .... .... ....... .. . .. . .... .. .. ..... . . .. ... .... .... . . .. . ... ... . ... . . .. . . . .. . .. . . . . . . . . . ..... .......... . ..... .. ... . .. . ... .. ... .. .. .. ...... . ... ...... . .. .. . ..... ... .. . . ... . . .. .. . ......... . . . ........ ... . . ......... .... . ..... . .. . ... .. . .. . .... . . . .. . . . ... ... ............... . . ... ... .. . .. . . . .. . ................ .. . ........ .. . . . ....................................................... ......... ...... . .......................... . . ..... . . . ...... .. ............ . .... . . ... .. . ... . ....... . . ... . .. . . .. ... .... .. ... . . . .... .. . . .. .... . ...... . . . . . ........... . . ... . . .. . . ........... ... . .... . . .... . ....... . ..... .. . . ... ... . .... .. . . ... ... . ............... ... .. ...... . ..... .. . . . . .. ....... .... .... ...... . .... ........ . . . . ... . ....... ... . ........ . . ... ........ ... ..... . ........ .... . . . . . . . .. .......................................... ...... .. . ........................ . ... .. . . ..... .
lowQualScore : 0 888 5 0 5 2222 0 888 2222 22 0 0 0 11111111 4 0 0 99 1 00000000000000000000 88 0 0 99 6666 0 0 0 1 99 5 999999 6666 0 6666 888 99 1 0 1 2 888 0 99 6666 2222222222 1 888 99 9 7 4 0000 11111 8 4 4 7777 4 11 22 9 4 9 11111111 4 4444 1 0 88888888 2 0 66 0 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 999999 1111111 9 2 11 00000000000 0 00000 55 7 4 9 888888 4 4 9 333 55 55 55 0000 55 55 000 9999 55 55 55 8 55 000 0 000 0 222 0 0 666666666 33333 0 0 55 0 111111111111 0 333333 55 5555 5555 0000000 55 0 88 0 6666 55 55 22222 3 0 55 000 5555 0000 0 0 55 0 000 000 0 222 0 0 55 0 0 0 55 0 00 0 0 0 0 0 0 0 0 0 00000 8888888888 0 55555 55 000 0 55 0 000 55 000 11 33 11 333333 6 777 777777 9 11 00 9 66666 888 11 9 4 888 9 4 11 33 9 333333333 9 9 4 11111111 888 6 9 000000000 4444 2 66666 0 88 4 666 11 4 11 9 0000 0 0 0 44 0 0 0 000 888 000000000000000 0 2 888 888 55 0 99 0 0 0 99 0 9999999999999999 66 0 44444444 99 0 0 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 999999999 444444 7 77777777777777777777777777 0 0 77777 3 7 1 444444 99 666666666666 3 1111 7 7 444 00 0 111 0 1111111 0 0 555 7 22 7 3 22 222 2222 22 555 5 7 7 2222 22 0 4 44 6666 0 555555 0 0 0 0 0 22222222222 0 0 555 0 0 88 0 0 88888888888 444 0 4444 2 0 6666 0 2222222 0 55555 88 1 0 888 555 0 6666 99 2 0 666 444 0 000000000000000 888 22 444444 0 55555 99 0 0 0 0 22 2222222 6666 1111 000000 7 3333 77777777 1 7 7 7 999 7 0000000 000 7 66666666 4 7 000 77777777 444 66666 7 66666666 1111 7 7 3 7 4 7 4 99 333333333333333333333333333333333333333333 999999 66 7 777777777777777777777777 4 666 88 0 2 22222 0
consensus : TATTACAAC-CAAC---GGGT-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--CTTCAAGATGGG-----GTAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---ATA-TACTAAA-GTCTAAATATC-A--A-GTT-----TTAC-TT-ACTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------TA-TAATGATTT----CTGAGATT-A--------AAGGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--T----AA-AA--AT-CTCGAAA-------A---CA-----ACACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCC--A-ACAAACAAA----TAAAAAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--GNC-CTG-A------CG-GT-G-TTATTN-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA--------ATGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT-AAA--AATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAAA--GTTG-AACGAT-AC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---C---------ATATTCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---NT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-AAA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGTAT-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACTC--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-T-ACAA----GT--ACA-TATGTACAGGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--T-T-TA--AGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-A--TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAG--CAAA-CAGA----GA-A-----CACA---TCTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGC-A-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT--GCA-TT--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------ATTTNAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
Reference ( family-2636 ) : TATTACAAC-CAAC---GGGT-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--CTTCAAGATGGG-----GTAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---ATA-TACTAAA-GTCTAAAT-TC-A--A-GTT-----TTAC-TT-ATTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------TA-TAATGATTT----CTGAGATT-A--------AAGGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--T----AA-AA--AT-CTCNAAA-------A---CA-----ACACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCC--ATACAAACAAA----TAAAAAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--GNC-CTG-A------CG-GT-G-TTATNN-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA--------ATGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT-AAA--AATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAAA--GTTG-AACGAT-AC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---C---------ATATTCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---NT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-AAA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGTAT-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACTC--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-T-ACAA----GT--ACA-TATGTACAGGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--T-T-TA--AGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-A--TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAG--CAAA-CAGA----GA-A-----CACA---TCTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGC-A-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT--GCA-TT--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------ATTTNAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
gi|1 : TATTACAACACAACCAAGAGTAACATGTACATAAAAACTAG-AAAGAAA-A-CAAA-TTAA-CCATACAACTTTATTTAAAACTCCA-TA-CTAGTGGA-CTTCA--GT-GA-----ATAA-TC--------ACAATAAATAA-AG-CTGAA----ATCATGG-CC-CACAAAGCCATGACCCAAAACTC-AATGCATCC-CGATAAAAAAC---CACTCAAAAAA-TCCTC--AGAAATATAG-CCAATTGAAAAACTCA---------C-TTCTGAAAAAGATAGTACAAAA-GTCTAATTATC-AATA-GTTAAATATCAC-TT-ACTA----TTTCAT-GAAAAA--ATATAAGCGG-TTAACCTACATA-AAATGATTT----C-----CT-A--------AA-GAC-CAACAA-CCCAAAAAA-------AA-CA--AT-TTGGAGA-------AGATCA-----A-ACCCCGCAACC-------------CACCCA-----------
gi|1 : aaAAAGACC--A-ACAACCCAA----AAAAAACAATTTGGAGAAGATCAAACCCCGCAACCCA-CCCATTC-----GAAAATGCA-CTG-AACTGGTCG-AT-A-TTA--C-TCAAA-GT--CAATTAATAC-AA----ATTAAA--ACC---AAT---AAATG--AGAT--GAAATCTAAGACAA---A-AAACTTCC-AAAG-TAG-AAAATTCACA--ATGAAAAAACA-T-GAA-T-G-C-------AAACAAGCCAA--G--ACTCGAAGA----ACGATAACAA--C-AAAT-AC-AAG---CATGGAATGCATT--CAAGAT--ACAAAGACTAATG--GGT---CCAA---GA-GGCTTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC----AT-CTGCTTTT--GAAT-C-CTTCTTC-T-CT-GCCATTGAT--CCTTT-CCA-CCACAGA-TC-GCT-GCACCAAC-A--GCCCCTGGAGAAAC--AA-GG--CATTTCTAAATG-AT--TTT-GACGAAA--ACATACATCTTCA--GGCCACATTCAAAGCA-TCATGTACCAATAA-AACCT-AAA--ATTAAACTAGC-CAA-TAATT-AG---GAAATTAA-CAAATATAATATTC-CAC-AAA-G-TTCGATAC--TTCAC-TAGC--------AACCATTGAA-ACAATAAATTTAAAT--ACATGATCAAATACAGTGTACTTAA-A---AAA--ACAT-GGAACACCAAATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAACGAGTAACAAAAG--GTCGCAACAGT-AC-AGATTTTATTA---A-CA-CCA--TCAT-AATATCTG-GG--ACCT--AATCC---------ATA-TCTGCGAAT-CTAACACCAAA--AAAA-TAT-CTA----A----TTAACCCAA----------CCACAACCAA----CAGAAAAGAATGTTTTTATTTAACGTCGTAACTTACCAA-----------------------------------------TTATAA-TTGAA-----TGGT-AGAA-T--G-TGGAACTATTACAAA----AGGGTCTTACCCC-CT-AAA-TAGCTATATAAGT-CAAGCAAATG-TATTATGTAT-ATTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACT---TCTTTTTTTTTA----CACTTC-C-CTGAAG-T-ACAA----GT--ACACTATGTACAG--AAT----AC---------------A-T-------TC-A-------TA-----A-TGCCGTC---T-A-C-A--CA-TGT-AC-TG-------TAGC--GACTTG--A-AAATCTATG----CA-TCC------ACCC-TAAAAAAAACC-GATGACA---AATAG---AGA-C-TT----CA---GAG-AG---AAC--CAAA-GAAA----GA-ACCTACCACA---TTTC-AATCAAACCGCAA-A-----AATA-AC-T-GCTGT-TG-TTAAGAAAA-TTACTCATTATATC----GTTAATACCC---ACACT-T-CA--ATCCCATC---TTT-G-A-AAAA-TAAAAA-AGC-AC----ATGAC-AG-TC-GTGATATACTGA-C-CTACTA---CATA--------GT--GCA-ATACCTACAATAAAG----CAT----TA-TCATATATACCATACCATCT-CC-TAAATTACCC-------CTCCAAAAATTACT--------------AACTCACTGG--ACCAACTTAATTC-T-----------TAA--T-------AACTAA-ATTAttcgaaaatgcactgaactggtcgatattactcaaagtcaattaatacaaattaaaaccaataaatgagatgaaatctaagacaaaaaacttccaaagtagaaaattcacaatgaaaaaacatgaatgcaaacaagccaagactcgaagaacgataacaacaaatacaagcatggaatgcattcaagatacaaagactaatgggtccaagaggcttggattttcaggccagcatctgcttttgaatccttcttctctgccattgatcctttccaccacagatcgctgcaccaacagcccctggagaaacaaggcatttctaaatgattttgacgaaaacatacatcttcaggccacattcaaagcatcatgtaccaataaaacctaaaattaaactagccaataattaggaaattaacaaatataatattccacaaagttcgatacttcactagcaaccattgaaacaataaatttaaatacatgatcaaatacagtgtacttaaaaaaacatggaacaccaaatgattgttagtaaaatactagtaaacgagtaacaaaaggtcgcaacagtacagattttattaacaccatcataatatctgggacctaatccatatctgcgaatctaacaccaaaaaaatatctaattaacccaaccacaaccaacagaaaagaatgtttttatttaacgtcgtaacttaccaattataattgaatggtagaatgtggaactattacaaaagggtcttaccccctaaatagctatataagtcaagcaaatgtattatgtatattaatctttggaaatcttacttctttttttttacacttccctgaagtacaagtacactatgtacagaatacattcataatgccgtctacacatgtactgtagcgacttgaaaatctatgcatccaccctaaaaaaaaccgatgacaaatagagacttcagagagaaccaaagaaagaacctaccacatttcaatcaaaccgcaaaaataactgctgttgttaagaaaattactcattatatcgttaatacccacacttcaatcccatctttgaaaaataaaaaagcacatgacagtcgtgatatactgacctactacatagtgcaatacctacaataaagcattatcatatataccataccatctcctaaattacccctccaaaaattactaactcactggaccaacttaattcttaataactaaattaata
gi|10 : aatattacaacacaaccaagagtaacatgtacataaaaactagaaagaaaacaaattaaccatacaactttatttaaaactccatactagtggacttcagtgaataatcacaataaataaagctgaaatcatggcccacaaagccatgacccaaaactcaatgcatcccgataaaaaaccactcaaaaaatcctcagaaatatagccaattgaaaaactcacttctgaaaaagatagtacaaaagtctaattatcaatagttaaatatcacttactatttcatgaaaaaatataagcggttaacctacataaaatgatttcctAAA-GTCTAAATATC-A--A-GTT-----TTAC-TT-ACTA---TTT-CATTG--AAA--ATATAAA-GG-GT--------TA-TTATGATTT----ATGAGATTTA--------AAGGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--------A-AA--AT-CTCTAAACACAAACA---CA-----ACACCCC----CC-------------C-CCCACCCCTCCACCCAAAAAAAACCCGAAAACAAACACA----TCAAAAAA-TT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--AGCGCTGGA------CG-GTTG-TTATTA-TCAAACGT--ATAT--ATA--AA----AT--AA---CC---AAT---A--TG--AGAT--GAAATT--AGACAA---A-A----TCC-AA-G-T-G-ATAA--------TGGAA----CA-T-GA--TCG-C-------AG-CA-GC--ATGG--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAGGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TGGGATTTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTTTGGAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-G--CCTTT-C-A-C-ACA-ATTC-ATT-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TTGGT--TTT-GCC-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCT-T--GGAACCAAT-A-AACCTAAAA--AATAAAT--GC-AAATTA--T-GG---T--ATT-ACCA---ATGAT-TTC-AACAAAGT--T---GT-TACTTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-ata
gi|11 : AC-CAAC---AGGT------TACATAAAA--TAC-C---ATATA-CAAA-TT-A-CCAC-CA--------TAGAAGATCA-TA-CAAATG-----TCAACACGGGTTTCAGTAT-TTCAAAGGTAACCATAAGAAATGATC--TGTTGTGT-ATGGTTA-CACAAATCCATG--TTGAA-----AATG----C-TGAT----A--------------------CCATAG-CAT---G-C--ATTGAT----TCAACACAAACCCTATCTGAAA---GTA-TACTA----TATAAGT-TG-A-----TT-----TGAC-AT-ACT----TTTTta
gi|11 : ctttcaagtgactttttgtgaaaaataagggccttttttagggcaaaattcttaaagaatgagggctatttttaggatattttaggaatttcaggcaaaataagggtaaaaaaacttcctaattaaacccccaatgaattaatttgtacttA---TTTTCAT-G--GGA--AAATAAG-GGATT--------TT-TAGGAATTTGGAGCTTAAATA-AGGAAAAATAAGGGC-CTCTGA-CAAAAAAAA--TAAGGAA-AA--AT-TAGGAAA-------A---TA-----Agacttttagcaagtgaagtcttacttacgaatttttttttgtaaaattaggattttcatgggaaaataagggatttttaggaatttggagcttaaataaggaaaaataagggcctctgacaaaaaaaataaggaaaaattaggaaaataagggcccgcttgaaagc
gi|11 : ctttcaagtgactttttgtgaaaaataagggccttttttagggcaaaattcttaaagaatgagggctatttttaggatattttaggaatttcaggcaaaataagggtaaaaaaacttcctaattaaacccccaatgaattaatttgtacttaccaacaggttacataaaataccatatacaaattaccaccatagaagatcatacaaatgtcaacacgggtttcagtatttcaaaggtaaccataagaaatgatctgttgtgtatggttacacaaatccatgttgaaaatgctgataccatagcatgcattgattcaacacaaaccctatctgaaagtatactatataagttgatttgacatactttttgacttttagcaagtgaagtcttacttacgaatttttttttgtaaaattaggAAAAATT--AGGAAAATAAGG-----------G-CCCGCTT-----GAAA--Ggggcccgcttgaaagc
gi|12 : ctttcaagtgactttttgtgaaaaataagggccttttttagggcaaaattcttaaagaatgagggctatttttaggatattttaggaatttcaggcaaaataagggtaaaaaaacttcctaattaaacccccaatgaattaatttgtacttaccaacaggttacataaaataccatatacaaattaccaccatagaagatcatacaaatgtcaacacgggtttcagtatttcaaaggtaaccataagaaatgatctgttgtgtatggttacacaaatccatgttgaaaatgctgataccatagcatgcattgattcaacacaaaccctatctgaaagtatactatataagttgatttgacatactttttgacttttagcaagtgaagtcttacttacgaatttttttttgtaaaattaggattttcatgggaaaataagggatttttaggaatttggagcttaaataaggaaaaataagggcctctgacaaaaaaaataaggAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-ACCACTT-----GAAA--G-C-CTG-A------CG-GT-G-TTATTG-TCAAACGT--CTAT--ATA--CA----AT--AA--ACC---AAT---A--TG--AGAT--GAAATT--AGACAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA---------TGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-AA--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-TAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAA-GACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGCTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACG-A-TC-A-T-G-----AA-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCTT-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT--AA--AATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-TA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTT-T----T-C--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAATA---------TACAT--ACATG-A--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACc
gi|13 : A-TATGTACAG--ACT----AC-TA---A--AGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--TATGTA--AGTA-TGATG-C---T-TCC-AAACA-TGT-A--TG-------TAG---AAC-TG--T-A---TT-TG----CA-TC-T----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAGGAGAGACC-TT----CAG--G-G-AG---AAG--GAAA-CAG-----GA-A-----AACA---TTTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GTTGTCTGTTT-GGCAA---TATT-------TC----TTTA----CC---A---T-T---TGAAC----T---TTG-G-A-AAAA-T---AA-AGC-C-----ATG---AG-TCAG--------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT----A-TT--CTAA-AT--------TAT----TA-TCATAT-TA-C-TA-CATCT-CTAT--ACCACTT-------ATTTGA-------T--------------A------TGG------ATT--ATTC-T-----------ATA--T-------AA-T---TTTAC
gi|14 : A-TATGTACAG--ACT----AC-TA---A--AGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--TATGTA--AGTA-TGATG-C---T-TCC-AAACA-TGT-A--TG-------TAG---AAC-TG--T-A---TT-TG----CA-TC-T----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAGGAGAGACC-TT----CAG--G-G-AG---AAG--GAAA-CAG-----GA-A-----AACA---TTTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GTTGTCTGTTT-GGCAA---TATT-------TC----TTTA----CC---A---T-T---TGAAC----T---TTG-G-A-AAAA-T---AA-AGC-C-----ATG---AG-TCAG--------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT----A-TT--CTAA-AT--------TAT----TA-TCATAT-TA-C-TA-CATCT-CTAT--ACCACTT-------ATTTGA-------T--------------A------TGG------ATT--ATTC-T-----------ATA--T-------AA-T---TTTACtaaggta
gi|15 : -TA--T-CG----AGTG-TATT-TGT---TTTA--T--CTTTG-A-AA-TCTT--ACTC--TC---TTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-TAACAA----GT--ACAGTATGTACATGAAATTGAAACTTA---A-CAGTCAAA-TAAATT-GTC-ACAGT-C-TATTAGTA-TGATT-CAAGT-ACT-A--CA-C-T-A--TGGTTATATTAGC--GAA-TGATT-AAAGAT-T------A-TCTTAGGCAATCT-T-----AAATC-GA-GAGC---CCT------GACCATTACCACGC--GAGCAGGCAAAG--CAGA-GAGATCGCGA-G-----CACG----CT----TCA------AGTGT----AGT--AC-T-GCTGTCGG-TG-GTCAAA-TTATT-------TC----TTtaaggta
gi|16 : TATTACA-C-CAAC---AGGT-A-ACGTACATAAAA--TTG-A---AAA-AACAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAG-TCAATA-CTAGTGGA-CTTCAAGATGGG------T-T-TC--------ACC-TAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---TTAATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAATTTTTCCTA-AAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAAG--AT--CACT-AA-GTCTAAATATCAA--A-GTT-----TTAC-TT-ACTA---TTTTCAT-G---AA--ATATAAG-GG-TT--------TA-TAATGATTT----TTGAGAT
gi|2 : TATTACAAC-CAAC---AG-T-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGA--CTTCAAGATGGG-----ATAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATG--TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAAG--ATA-CGTCAAA-GTCT-AAT-CC-A--A-GTT-----TTAC-TT-ATTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------TA-TAATGATTT----CTGAGCTT-A--------AAGGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--T----AA-AA--AT-CTCCAAAC------A---CA-----ACACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCC--ATACAAACCAA----TAAAAAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----G-AA--GTC-CTG-A------CG-GT-G-TTATAT-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--T---AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA--------ATGAA----CA-TCGAATT-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GG-----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG-----ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGGC-C-CA---GC---CAT-ATGTATTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AAAC--A--GG--CA-TTCT---TT-GT--TTT-G-CAAAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCA---A-AACCT-AAA--TATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTCAAAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATGCA-TGTACTTAATAAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAGTTA-AAA-TACTAG-TAAAAC-AGT---AAAA----TTG-AACAATAACAAGATT---TTC---A-CA-CCA--TAAT-AATATCTG-GG--A-CT--A---T---------ATATTCTGCGAAT-CT--------A--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---AT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGG--TTT----C-AT-AGA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGT-T-TTTAA-T--CTTTGGA-AATTCTT--ACTC--TTTTTTTTTTTA----AA--TA-T-T-GAAG-T-ACAAACTTGT--ACA-TATGTACAAGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--A-T-TA--TGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-AT-TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAGTTCAAA-CAGA----GA-A-----TACA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--ACTT-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGTAA-----ATGACAAG-TCAGT-------T-A-TGTTGATA---TCTA--------GT--GCA-TC--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------CTTTAAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAATCAGAAT-GCAATTTaa
gi|3 : TATTACAAC-CAAC---AGGT-ACATGT-CATAAA---TAGGA---AAA-A-CAAAATT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--ACTCAAGATGGG------TAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAGAGCC-TG--CCAA----T-AATG----C-TGAT----GAC---CACT--AAA-G-TTTTCATAGAAAT---GGC--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---AGA--ACTAAC-GTCTATAT----A--A-GTT-----T-ACGTT-ATTA---TTTTCAT-G--AAA--A---AAA-GG-TT--------TA-TAAT-ATTT----CTGAGCTT-A--------AAGGAC-CTC-GA-CCAAAAAAAAAT----AATAA--AT-CTCAAAA-------C---AA-----ACACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAA-CCC--ATACAAACAAA----TAAAAAAA--T--GGGAAGATAAAG-----------G-CC-ACTT-----GAAA--G-C-CTG-A------CG-GT-G-TTATT--TCAAACGT--CTAT--ATA--AA-----T--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA---T-G-ATAA---------TGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACCAAGACTA-TG--G-T---CCA----GA-G--TTGGA-TTT--CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTT---GAAT-C-ATT---C-T-CT-GT--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TCTA-T-G-----AC-A--A----TGGA-AAAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA-----T---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-ATAACCT-AAA--ATTAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---TA-T--TTCAC-T-GC--------A---A-TGAATA---------TACAT--ACATG-T--AATGCA-TG-AC-TAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAA----TTG--ACAATAAC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---TA--------ATATT-TGCGAAT-CT--------A--AAAA-T-T-CTA----AT---T--ACCC------------CCCC--CCCC----CCAA--------CTTTTCTTT---AT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TT-------------CTTTAGAA-TTGAA--TT-TGGTAAAAG-CTGG-TGG--CT-------A----AGG--TTT----C-ATGAAA-T-GC-AT-TA--T-C------GTG-TA-T-TGT-T-TTTAATT--CTTTGGA-AATTCTT--A--C--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-TGTGGAAG-T-ACAA----CTTGACA-TATGC-----AAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--T-T-TAT-AGTA-TGATG-CT--T-ACC-A--CAGTGT-A---G-------TAGC--GAC-TG--TAAAATCT-TG----CATTCCT----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAGTTCAAAGCAGA----GATA-----TACA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--AC-TGGCTGTCTG-TTGGGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-C-TGACC----C---TTTGG-A-AAAA-T--AAA-AGTAA-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGATT-TTGATA---TCTA--------GT--GCA--T--CTAC-AT--------TGT----TATTCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCCTGAAATAATTTTAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
gi|4 : TACGT-TCACACGT--TCAT--ATAT-AACATGAT--AACAACCTATAACTCTG--TA--AGAT--GAAATT--AGTCAATATA-AA---TCCTAA-A-T-GAATAATAGATAGCATTAA----TACT-GA--C-A-C-------AGCCA-GC--A--GTAAT----GGATATCAT-------A--G-AAACTATACAGCTACATCAAATG--TTAACAG--CTGAGACAGACTA-TGTCCGTTACCCATAATGA----TTGGA--TTT-CAGG--C-CC---ACGCACAT-ATGTTTTT--GAATAC-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTTGC-ATC-ACA-A-TT-A-TGG-----AC-AACA----TGGA-AGAC--A--GG--CAATTCT---GT-GTTGTTT-G-C-AAAACAGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA----GGTACCAAT-A-AACCT--AA--AATAAAT---C-AAAGTA--TCGG---T--ATTAA-CA---ATGAT-TTC--AC-AAGTG-TTA-AT-A--TTCACTT-GCTAATAGCAA---ATTTAC-A---------TACATACACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAAATACATGG--ACAC---ATGAT-TGATTAG-TA-AAATTACTAG-T-AA-----T---A-----------------------ATT---TTCCTTATCA-CCG--T-ATAAATATCTG-GGCAG-CTTCA---CTTAATAATTATATACTACGAACACT-------GA--AAAA-T-TACTACGGTACATTT--ACCCCCCCCCCCCCGCCCCC--CCCATCATC-----------TTTTTCTTT---TT----CTTTACCAACGCAGATGTATTT-----------T
gi|4 : ATTATTTGAATCATGCGGT-A----T--T-TGG--ATTA-----A----AGGGTTTT----G-AT-AAAAT-GC-AT-TA--TAC-----AGTGATATT--GTAGGTTTAA-TTTCTTTGGATAA-TCTTACACTC--TCTATTTTGTTACTTCAG--TATT-TGAAAGTT-ACAA----GT--ACATTATGGTTAAGAAATA---AC-TA---ACCAGTCAAACTAAA-TGGTC-AC--T-T-T---AGTACTGATG-TCTAT-ACCAA--CA-TGT-AGCTGTTTC---TAGCGAGAC-TGT-T-AAATCT-TGCTCTCA-TCCC-----ATCT-T-----GAACCCTC-GGCATCCTATA----------TT----CAGGTGAG-AAG-GAAG---ACA-CAGC----GC-T-----CACAGAGTCTCATGTCA------AG-GTGGGAAATCAAC-T-CCTGTAAG-GT-GTTAAA-TT-TT-------TCTATTTTTA----CTCCAAC-CTCT-CATGACCGGA-CCGGTTTAG-ATAAAATT--AAACAGC-AACGTGATG-A-AGCTCAGT-------TGATT-TTGATACCTTCTATATTATCTGTCGACACTT--CTTC-AT---GAGGATGTTACGTA-TCATAT-TACC-TA-C-TCT-CC-T--ATTAGCC-------CTTTACA----ACTAATCTGACACACTAA------TGG--AC--ATTA-ATTC-TTACCTTTAGTAAAA--TTAATGTGGA-TAA-TATACATGCATTAATGTG----AGAATCGCAATTTtgttaacgtcaaacgccaggtaaatgtttaaagtgagattatttgaatcatgcggtatttggattaaagggttttgataaaatgcattatacagtgatattgtaggtttaatttctttggataatcttacactctctattttgttacttcagtatttgaaagttacaagtacattatggttaagaaataactaaccagtcaaactaaatggtcactttagtactgatgtctataccaacatgtagctgtttctagcgagactgttaaatcttgctctcatcccatcttgaaccctcggcatcctatattcaggtgagaaggaagacacagcgctcacagagtctcatgtcaaggtgggaaatcaactcctgtaaggtgttaaatttttctatttttactccaacctctcatgaccggaccggtttagataaaattaaacagcaacgtgatgaagctcagttgattttgataccttctatattatctgtcgacacttcttcatgaggatgttacgtatcatattacctactctcctattagccctttacaactaatctgacacactaatggacattaattcttacctttagtaaaattaatgtggataatatacatgcattaatgtgagaatcgcaattt
gi|5 : tacgttcacacgttcatatataacatgataacaacctataactctgtaagatgaaattagtcaatataaatcctaaatgaataatagatagcattaatactgacacagccagcagtaatggatatcatagaaactatacagctacatcaaatgttaacagctgagacagactatgtccgttacccataatgattggatttcaggcccacgcacatatgtttttgaatacatttctctgcttgtcctttgcatcacaattatggacaacatggaagacaggcaattctgtgttgtttgcaaaacagatttttcaggccacttcagcaggtaccaataaacctaaaataaatcaaagtatcggtattaacaatgatttcacaagtgttaatattcacttgctaatagcaaatttacatacatacacatgtaatacatgtacttaaaagaaaatacatggacacatgattgattagtaaaattactagtaataattttccttatcaccgtataaatatctgggcagcttcacttaataattatatactacgaacactgaaaaattactacggtacatttacccccccccccccgccccccccatcatctttttctttttctttaccaacgcagatgtatttttgttaacgtcaaacgccaggtaaatgtttaaagtgagCAAC-CAAA---GGTT-ACATGTA-ATAA----TAG-A---AA----CAA--TT-A-TTAT-CAG-------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGGT-CTTCAAGA-GGG-----GTAT--C--------ACCATAG---A-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACA--GCCATG--C-AAA---T-AATG----CCTGAT----AAC---CACT--AACAG-TTTTCAT-GAAAT---G-C--ATTGAA----TC------------TTCTGAAA---ATA-TACTAAAAGTCTAAATATC-A--A-GTT-----TTAC-TT-ATT----TTTTCAT-G--AAATAATAC----GG-TT--------TA-TAATGATTT----CTGATATT-A--------A-GGAC-TT--GA-CCAAAAAAA-------AA-AA--AT-T--------------------------ACCC--------------------------------------AAAAAAACCA--A---AAAC-------TAAAA----TT--GGGAAGATAAAG-----------G-C--ACTT-----GAAA--GCC-ATG-A------CA-GT-GGTTATGTATCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AG--AA--ATA---ATA---A--TG--AGAT--GA--TT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA---------TGA-----CA-T-GA--T-G----------A-CA-G------G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC--T-CA----CATGGAATG--TT--CAG-----ATAAAGACTA-TG--GGG---TCA----GA-G--TTGGA-TTTTTCAGA--C-CA---GC---CAT-ATATTTT----GAT-C-ATT--TT-TTCT-GC--TTG-TTACCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-A-----A-----A----TGGA-AGACC-A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-G-CAA--AGAT---TTTTCA--TGGCAC--TCA--G---T--TGTAGC-AT----ACCT------AAT--AT--GC--AA-TA--C--G---T--ATT-A-GA---ATG-T-TTC--AC--AGTGTT---AT-T--TTT-C-T-GC--------A---ATTG-A-A---------TAC-----TCTG-T----TACA-TGGTCTTTA-A---GAA--ACAT-G--A-AC----TAAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAA--AGT---AAAAATTGTTG-A--GAT-AC-AGA-T---TTC---A--A-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT------C---------ATA-TCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTG----A----T--------------------TA--CCCA----------------TTTTTCTTT---TT----ATCTTCC------AGTGT-TTTTATTTAAGTGGTA-------------CTTTATAATTTG-A--AT-T-GT-AAAGTT--GTTGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-TAA---G--AT-T---T-C-----A-TGCTATG-TGTAT-
gi|6 : ttCAAC-CAAA---GGTT-ACATGTA-ATAA----TAG-A---AA----CAA--TT-A-TTAT-CAG-------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGGT-CTTCAAGA-GGG-----GTAT--C--------ACCATAG---A-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACA--GCCATG--C-AAA---T-AATG----CCTGAT----AAC---CACT--AACAG-TTTTCAT-GAAAT---G-C--ATTGAA----TC------------TTCTGAAA---ATA-TACTAAAAGTCTAAATATC-A--A-GTT-----TTAC-TT-ATT----TTTTCAT-G--AAATAATAC----GG-TT--------TA-TAATGATTT----CTGATATT-A--------A-GGAC-TT--GA-CCAAAAAAA-------AA-AA--AT-T--------------------------ACCC--------------------------------------AAAAAAACCA--A---AAAC-------TAAAA----TT--GGGAAGATAAAG-----------G-C--ACTT-----GAAA--GCC-ATG-A------CA-GT-GGTTATGTATCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AG--AA--ATA---ATA---A--TG--AGAT--GA--TT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA---------TGA-----CA-T-GA--T-G----------A-CA-G------G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC--T-CA----CATGGAATG--TT--CAG-----ATAAAGACTA-TG--GGG---TCA----GA-G--TTGGA-TTTTTCAGA--C-CA---GC---CAT-ATATTTT----GAT-C-ATT--TT-TTCT-GC--TTG-TTACCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-A-----A-----A----TGGA-AGACC-A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-G-CAA--AGAT---TTTTCA--TGGCAC--TCA--G---T--TGTAGC-AT----ACCT------AAT--AT--GC--AA-TA--C--G---T--ATT-A-GA---ATG-T-TTC--AC--AGTGTT---AT-T--TTT-C-T-GC--------A---ATTG-A-A---------TAC-----TCTG-T----TACA-TGGTCTTTA-A---GAA--ACAT-G--A-AC----TAAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAA--AGT---AAAAATTGTTG-A--GAT-AC-AGA-T---TTC---A--A-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT------C---------ATA-TCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTG----A----T--------------------TA--CCCA----------------TTTTTCTTT---TT----ATCTTCC------AGTGT-TTTTATTTAAGTGGTA-------------CTTTATAATTTG-A--AT-T-GT-AAAGTT--GTTGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-TAA---G--AT-T---T-C-----A-TGCTATG-TGTAT-
gi|7 : ttTATTACAAC-CAAC---AGGTTACATGTAC-TAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-AACCAT-C---------TAGAAGATCA-TAACTA-TGGACCTTCAAGATGGG------TATGTC--------ACCATAAAAAA-GA-C--AG----AT-ATGGATAACACAAAGCCATG--CCA-----T-TATA----C-TGAT----AACATGCACT--AAAAG-TTTTCATAGAAA----G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---AGA-TA-TAAA-GTCTAAATATC-A--AAGTT-----TTAC-TTTATTAATATTTCAAT-G--AA----TATAAG-GGATT--------TAATAATGATTT----CTGAGATT-AGAAA----AAGGACGCTCTGAACCAAAAAAA--T----AT-ATTTATACACAAAA-------A---CATACCCACATCCC----CCACCTAACTTCCCGC-CCCACCCAAAA----AAAAAAAACCC---CA-AAACAAATAAATAAAAAAAATT--GGAAAGATAAAG-----------GTCCCACTT-----GAAA--GGC-CTG-A------CG-GT-G-TTATTA-TCAAACGT--CTAT---TA--AA----AT--AA--ACC---AATTA-A--TGAAAGATTGGAAATT--AGGAAA---ACAG---TCC-CA-G-T-G-AT-A--------ATGAA----CA-T-GA--T-GCC-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----CC-------A--TAAAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--AC-AAGACTA-T---GGT---CCA----GATG--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CATAATGTTTTT--GAAT-CAATT--TC-G-CTCGC--TTG-T--TCTTT-C-A-C-AC--A-TC-A-T-G-----ACAA--A----TGGA-AGAC--AATGGCCCATTTCT---TT-GT--TTTGG-C-AAA--AGAT---
gi|8 : aTTAA-AAGGAAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TAGAAA-TACTAGAT-AAAC-AGT---AAAAA--TGTG-GACAA--AC-AGATT---TT----A-CA-CCACTT-AT-AATATCTTTGG--A-CT--A---T---------CTAT-CTGCGAAT-CT-------AA--AAAT-T-T-CTA----A----TTAACCC------------ACCC--CCCAAAA-C----------------CCCC---AA----ACTCACCAA---GAATGT-TTT-----------TATTTAACGTGGTAACTTTATAATTTGAG--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------ATTAAAGGGTCTT----CCAT-AAA-T-GC--T-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGT-T-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TATT--ACTTCTTCTTTTTTTTTT----AA--TA-TGTGGAAG-T-ACA-----GT--ACA-TAT-TACAG-AAAT----AC-TATCAA-AAGT-AAA-TAAA-TTGTCCAC--T-T-TA--GTTA-TGA-G-C---TTACC-A--CA-TGTTA--TGCA-----TAGC--AAC--G--A-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCCCT-----AACCCTGA-GACA---AA-AG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAA--------CAGA----AA---------CA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAAATTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-TTCAGAACC----C---TTTTGCA-AAAA-T--AAA-AGC-AC----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-CTGATA---TCTA--------GT--GCA-TC--CTAC-AT---G----TA-----TA-TCATAT-TACC-TACCATCTACC-T--ATTACCCTAAATA-ATTCTAA----ACT--------------A------TGGGAAC--ATT--ATTCTT-----------AAATTT-------AATTAATTTTACA--CA-T-ATGT------GAAT-GCAATTT
gi|9 : GAAGACAAAG-----------G-CCCACTTACTTGGAAA--GGC-CTGGA------CAAGT-G-TTATTA-TCAAACGTGTCTAT--ATATTAAGT--AT--AA--ACC---AAC---A--TG--A-AT--GAAATTT-AGGACA---A-AA---TCC-AA-AAT-GGATA----------TGAA----CA-T-GA--T-G-CCACCAAAGG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------ACAT-AAAC-AT-CAA---CATGGAATG--T---CAG--T--ACAA-TACAA-TG--GCT---CCT----G-----TTGGA-TTCT-CAAGAGCGTAAGTGC---CAT-ATATTTTT---AAT-C-ATT--TCCT-CT-GA--CTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGACGAG--GG--CATTTCT---TT-A---TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCATTTGCCAT-TTC---GCACT--TGTACCCAT-T-AACCT-ACACGAGTAAAT--GCAAAA-TA--T-AGGTTT--TTT-A-CA---ATGA--TTC-GAC-AAGTG-T---TA-T--TTCACTT-GC--------A---ATAGGC-A---------GACTT--ACTTA-A--AATACA-TG-------------AA--ACA------------ATGATCTG-TTAA-TA-AAA-TACTAG-T-AATC-AGT---AAAAA--ATTGTGATGAT-AC-TGATT---TTC---ACCACCCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---T---------AT-TCCTGCAAAT-GT-------CATCACAATT-T-CTA----AT---T--ACCC------------CCCC--CCC
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): CCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCCATCTTTTATTTTTCATTTTGCGTGCGTTCATCGTTCAGTTAGCGTTTTCTATATTTCAGTGAACGTCTAGTTAAGGAATTGGGGTAAAATTATCGGTAATCATCGGTGAGTTCTCGGGAGTTTCCGGAATAAAATGCTTTTACAATCCAGAGTGCTATCGTAG
Unaligned ( gi|18 ): GGCTTTTTGTGAAAAAATTAATGGGCCTTATTTTTATGAACGAAAGTCTTCTTAAATGAGGGCTATTTTAAGATATATACGGATTTTGCATTCAGACAAGTGGTATGGGTAACTATAAAAAAATAATCTGTATTCACCCTAAAGGTAACATGTATATAAACAAA
Unaligned ( gi|19 ): TTGAGTGACTTTTGTGAAAAATAAGCCTTTATAGGGCAAAATTCTTTAAAAAAAGGGCTATTTTAAGATATTTTAGGAATATTTCAGACAAAAAATAAGGGGTAGAAATTCCTAATTTAACCCCCCAAGAAATTAATCTTACTTACTACAGATACATAAA
Unaligned ( gi|20 ): GCTTTCAAGTGACTTTTGTGCAAATAAGGGCCTTTTTCTAGGGCAAAATTCTTAAAAAATAAGGGCTATTTTTACGGATATTTTAGGAATTTTCAGGCAAAAATAAGGGTAAACTTCCTAATTAATCCCCAATGAATTAATTTGTACTTACCAAACAGGT
Unaligned ( gi|21 ): GCTTTCAAGTGACTATTTGTGAAAAATAAGGGCCTTTTTCAGGGCTAAAATCTTAAATAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAAGATTTTTCAAACAAAAAGTAGGGGTAAAACTTCCTTATAAATACT
Unaligned ( gi|22 ): GGACTTTTCAAGAAAATAAGGGCTTTTTTAGGGCAAAATTCTTTAAAACTAAGTGGCTATTAGATTTATTTAGGGATTTTTCAAGCAAAAATAAGGGTGTAAAAATCCTTCTCAATAAAGTTACAAAAAA
Unaligned ( gi|23 ): TCTTCAAGTGACTTTTTAAATGAAAAATAAGGACTTTTTAGGGCAAAATGTTCCTTATAAGGATAGGGTATTTTATGATATTTTGAGATATATTCAAAGCAAAATAGGAGGTCAAAACTTTCAAA
Unaligned ( gi|24 ): AGGGTGACTTTTTTATGAAAAATGAGGGCCTTTTTATGGCAAAATTCTTCATAAAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAGAATTG
Unaligned ( gi|25 ): GTGACTTTTTATGAAAAATGAGGGCCTTTTTATGGCAAAATTCTTCATAAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAGAATTGT
Unaligned ( gi|26 ): TTTGGAAATTAGATAAGGAATATAAGGGCCTCTGACAAAATGTAAGGAAAATAAGGGCCC
Unaligned ( gi|27 ): GCTTTCAAGTGACCTTTTTATGAAAAATAAGGGCCTTTTAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111 1111 22222222 22 22222222222222222222 1111 1 111111 1111 1 1111 1111 2222222222 111 2222222222222222222222222 11111 11 11111111 11111 111111111 3333333333333333333 11 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222 1111111 11111111111 11111 1111 11 1111 1111 444444444 111111111111 1111111 11111 1111 111 11 11111 11111 111 111 111111 11 222222222 11111111 222222222 1111 11111 111 1111 11 111 444444444444444 11 1 4444444444444444 11 22222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111111 111111 88888888888888888888888888 111111 222222222222 1111 111 11 111 1111111 1 111 1 111 1111 111 1111 1 11 1111 111111 1 1 22222222222 222 11 33333333333 1111 1111 1111111 11111 11 111 1111 111 111 222222222222222 111111 11111 11 1 1 1111111 1111 1111 111111 1111 22222222 1 111 3333333 222 22222222 1 111 22222222 111 11111 33333333 1111 1 1 555555555555555555555555555555555555555555 111111 11 222222222222222222222222 1 11 1 22222 1
lowQualScore : 5 888 2 0 2 3333 5 888 0000 88 5 5 5 88888888 0 5 5 66 5 66666666666666666666 66 5 5 66 0000 5 0 5 5 66 4 222222 0000 0 0000 888 66 0 5 0 3 888 5 66 0000 3333333333 3 888 55 777 8 9999 66 9999999999999999999999999 11111 4 9999 9999 4 66 22 1 4 4 4 66666666 66 4 11111 9999 777777777 1 5 2222222222222222222 5 00 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 22222222 6666666 5 1 7 66 99999999999 4 00000 55 9 4 8 66 4 8 8 2222 55 55 33 4444 55 55 777 3333 55 55 55 0 99 777 4 777 4 666 4 8 111111111 99999 4 4 99 4 777777777777 4 999999 55 8888 8888 3333333 55 4 44 4 8888 55 55 88888 2 4 55 777 2222 7777 4 8 99 4 777 777 4 111 4 4 55 4 8 4 55 4 11 4 4 4 4 4 4 4 8 4 00000 8888888888 4 55555 55 777 4 55 4 111 55 777 66 66 66 777777 4 333 888888 1 66 99 8 99999 777 66 8 4 777 1 4 66 66 8 222222222 1 8 4 66666666 777 3 8 000000000 0000 0 22222 5 99 4 555 66 4 66 3 2222 5 5 5 44 5 5 5 111 888 111111111111111 5 3 888 888 22 5 66 0 5 5 66 5 1111111111111111 11 5 44444444 66 5 5 5 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888 777777777 999999 5 44444444444444444444444444 5 5 99999 4 5 0 777777 77 999999999999 4 2222 5 5 666 00 5 000 5 9999999 5 5 777 6 99 6 3 99 000 4444 99 333 2 6 6 4444 99 5 0 88 5555 5 666666 0 5 5 0 5 22222222222 5 5 222 5 5 33 5 5 77777777777 999 5 4444 3 5 0000 5 4444444 5 22222 33 5 5 888 777 5 0000 66 3 5 555 999 5 666666666666666 888 77 444444 5 77777 11 5 5 0 0 88 6666666 0000 2222 111111 5 6666 66666666 7 5 5 5 222 5 5555555 555 5 33333333 1 5 000 00000000 444 00000 5 33333333 2222 5 5 4 5 1 5 1 77 555555555555555555555555555555555555555555 777777 33 5 888888888888888888888888 1 888 33 0 3 77777 0
lowQualScore : . ... . . . .... . ... .... .. . . . ........ . . . .. . .................... .. . . .. .... . . . . .. . ...... .... . .... ... .. . . . . ... . .. .... .......... . ... .. ... . .... .. ......................... ..... . .... .... . .. .. . . . . ........ .. . ..... .... ......... . . ................... . .. . ...................................................................................... . ........ ....... . . . .. ........... . ..... .. . . . .. . . . .... .. .. .. .... .. .. ... .... .. .. .. . .. ... . ... . ... . . ......... ..... . . .. . ............ . ...... .. .... .... ....... .. . .. . .... .. .. ..... . . .. ... .... .... . . .. . ... ... . ... . . .. . . . .. . .. . . . . . . . . . ..... .......... . ..... .. ... . .. . ... .. ... .. .. .. ...... . ... ...... . .. .. . ..... ... .. . . ... . . .. .. . ......... . . . ........ ... . . ......... .... . ..... . .. . ... .. . .. . .... . . . .. . . . ... ... ............... . . ... ... .. . .. . . . .. . ................ .. . ........ .. . . . ....................................................... ......... ...... . .......................... . . ..... . . . ...... .. ............ . .... . . ... .. . ... . ....... . . ... . .. . . .. ... .... .. ... . . . .... .. . . .. .... . ...... . . . . . ........... . . ... . . .. . . ........... ... . .... . . .... . ....... . ..... .. . . ... ... . .... .. . . ... ... . ............... ... .. ...... . ..... .. . . . . .. ....... .... .... ...... . .... ........ . . . . ... . ....... ... . ........ . . ... ........ ... ..... . ........ .... . . . . . . . .. .......................................... ...... .. . ........................ . ... .. . . ..... .
lowQualScore : 0 888 5 0 5 2222 0 888 2222 22 0 0 0 11111111 4 0 0 99 1 00000000000000000000 88 0 0 99 6666 0 0 0 1 99 5 999999 6666 0 6666 888 99 1 0 1 2 888 0 99 6666 2222222222 1 888 99 888 9 4444 44 8888888888888888888888888 11111 4 4444 7777 4 11 22 9 8 4 4 11111111 11 4 11111 4444 888888888 7 0 4444444444444444444 0 66 0 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 66666666 9999999 0 9 2 11 00000000000 0 00000 55 7 4 9 11 4 9 9 1111 55 55 55 0000 55 55 000 9999 55 55 55 8 55 000 0 000 0 222 0 0 666666666 33333 0 0 55 0 111111111111 0 333333 55 5555 5555 0000000 55 0 88 0 6666 55 55 22222 3 0 55 000 5555 0000 0 0 55 0 000 000 0 222 0 0 55 0 0 0 55 0 00 0 0 0 0 0 0 0 0 0 00000 8888888888 0 55555 55 000 0 55 0 000 55 000 11 33 11 333333 6 777 777777 9 11 00 9 66666 888 11 9 4 888 9 4 11 33 9 333333333 9 9 4 11111111 888 6 9 000000000 4444 2 66666 0 88 4 666 11 4 11 9 0000 0 0 0 44 0 0 0 000 888 000000000000000 0 2 888 888 55 0 99 0 0 0 99 0 9999999999999999 66 0 44444444 99 0 0 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 999999999 444444 7 77777777777777777777777777 0 0 77777 3 7 1 444444 99 666666666666 3 1111 7 7 444 00 0 111 0 1111111 0 0 555 7 22 7 3 22 222 2222 22 555 5 7 7 2222 22 0 4 44 6666 0 555555 0 0 0 0 0 22222222222 0 0 555 0 0 88 0 0 88888888888 444 0 4444 2 0 6666 0 2222222 0 55555 88 1 0 888 555 0 6666 99 2 0 666 444 0 000000000000000 888 22 444444 0 55555 99 0 0 0 0 22 2222222 6666 1111 000000 7 3333 77777777 1 7 7 7 999 7 0000000 000 7 66666666 4 7 000 77777777 444 66666 7 66666666 1111 7 7 3 7 4 7 4 99 333333333333333333333333333333333333333333 999999 66 7 777777777777777777777777 4 666 88 0 2 22222 0
consensus : TATTACAAC-CAAC---GGGT-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--CTTCAAGATGGG-----GTAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---ATA-TACTA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GAGATT-A----AA-------------GGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--T----AA-AA--AT-CTC-AAA-------A---CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCC---A-ACAAACAAA----TAAA-AAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--GNC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA--------ATGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT-AAA--AATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAAA--GTTG-AACGAT-AC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---C---------ATATTCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---NT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-AAA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGTAT-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACTC--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-T-ACAA----GT--ACA-TATGTACAGGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--T-T-TA--AGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-A--TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAG--CAAA-CAGA----GA-A-----CACA---TCTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGC-A-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT--GCA-TT--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------ATTTNAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
Reference ( family-2636 ) : TATTACAAC-CAAC---GGGT-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--CTTCAAGATGGG-----GTAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---ATA-TACTA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GAGATT-A----AA-------------GGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--T----AA-AA--AT-CTCGAAA-------A---CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCC---A-ACAAACAAA----TAAA-AAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--GNC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TN-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA--------ATGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT-AAA--AATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAAA--GTTG-AACGAT-AC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---C---------ATATTCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---NT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-AAA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGTAT-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACTC--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-T-ACAA----GT--ACA-TATGTACAGGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--T-T-TA--AGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-A--TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAG--CAAA-CAGA----GA-A-----CACA---TCTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGC-A-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT--GCA-TT--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------ATTTNAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
gi|1 : TATTACAACACAACCAAGAGTAACATGTACATAAAAACTAG-AAAGAAA-A-CAAA-TTAA-CCATACAACTTTATTTAAAACTCCA-TA-CTAGTGGA-CTTCA--GT-GA-----ATAA-TC--------ACAATAAATAA-AG-CTGAA----ATCATGG-CC-CACAAAGCCATGACCCAAAACTC-AATGCATCC-CGATAAAAAAC---CACTCAAAAAA-TCCTC--AGAAATATAG-CCAATTGAAAAACTCA---------C-TTCTGAAAAAGATAGTACAA---AA-G----TCTAA-TTAT--------------C-AATA-----GTTAAATATCAC-TT----ACTA----TTTCAT-GAAAAA--ATATAAGCGG-TTAACCTACAT--A-A-----AAT----GATTTC--------------CT-A----AA--------------GAC-CAACAA-CCCAAAAAA-------AA-CA--AT-TTGGAGA-------AGATCA-----A--ACCCCGCAACC-------------CACCCA-----------
gi|1 : aaAAAGACC---A-ACAACCCAA----AAAA-AACAATTTGGAGAAGATCAAACCCCGCAACCCA-CCCATTC-----GAAAATGCA-CTG-AACTG-GTCG-ATAT-TACTCAAA-GT--CAATTAATAC-AA----ATTAAA--ACC---AAT---AAATG--AGAT--GAAATCTAAGACAA---A-AAACTTCC-AAAG-TAG-AAAATTCACA--ATGAAAAAACA-T-GAA-T-G-C-------AAACAAGCCAA--G--ACTCGAAGA----ACGATAACAA--C-AAAT-AC-AAG---CATGGAATGCATT--CAAGAT--ACAAAGACTAATG--GGT---CCAA---GA-GGCTTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC----AT-CTGCTTTT--GAAT-C-CTTCTTC-T-CT-GCCATTGAT--CCTTT-CCA-CCACAGA-TC-GCT-GCACCAAC-A--GCCCCTGGAGAAAC--AA-GG--CATTTCTAAATG-AT--TTT-GACGAAA--ACATACATCTTCA--GGCCACATTCAAAGCA-TCATGTACCAATAA-AACCT-AAA--ATTAAACTAGC-CAA-TAATT-AG---GAAATTAA-CAAATATAATATTC-CAC-AAA-G-TTCGATAC--TTCAC-TAGC--------AACCATTGAA-ACAATAAATTTAAAT--ACATGATCAAATACAGTGTACTTAA-A---AAA--ACAT-GGAACACCAAATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAACGAGTAACAAAAG--GTCGCAACAGT-AC-AGATTTTATTA---A-CA-CCA--TCAT-AATATCTG-GG--ACCT--AATCC---------ATA-TCTGCGAAT-CTAACACCAAA--AAAA-TAT-CTA----A----TTAACCCAA----------CCACAACCAA----CAGAAAAGAATGTTTTTATTTAACGTCGTAACTTACCAA-----------------------------------------TTATAA-TTGAA-----TGGT-AGAA-T--G-TGGAACTATTACAAA----AGGGTCTTACCCC-CT-AAA-TAGCTATATAAGT-CAAGCAAATG-TATTATGTAT-ATTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACT---TCTTTTTTTTTA----CACTTC-C-CTGAAG-T-ACAA----GT--ACACTATGTACAG--AAT----AC---------------A-T-------TC-A-------TA-----A-TGCCGTC---T-A-C-A--CA-TGT-AC-TG-------TAGC--GACTTG--A-AAATCTATG----CA-TCC------ACCC-TAAAAAAAACC-GATGACA---AATAG---AGA-C-TT----CA---GAG-AG---AAC--CAAA-GAAA----GA-ACCTACCACA---TTTC-AATCAAACCGCAA-A-----AATA-AC-T-GCTGT-TG-TTAAGAAAA-TTACTCATTATATC----GTTAATACCC---ACACT-T-CA--ATCCCATC---TTT-G-A-AAAA-TAAAAA-AGC-AC----ATGAC-AG-TC-GTGATATACTGA-C-CTACTA---CATA--------GT--GCA-ATACCTACAATAAAG----CAT----TA-TCATATATACCATACCATCT-CC-TAAATTACCC-------CTCCAAAAATTACT--------------AACTCACTGG--ACCAACTTAATTC-T-----------TAA--T-------AACTAA-ATTAttcgaaaatgcactgaactggtcgatattactcaaagtcaattaatacaaattaaaaccaataaatgagatgaaatctaagacaaaaaacttccaaagtagaaaattcacaatgaaaaaacatgaatgcaaacaagccaagactcgaagaacgataacaacaaatacaagcatggaatgcattcaagatacaaagactaatgggtccaagaggcttggattttcaggccagcatctgcttttgaatccttcttctctgccattgatcctttccaccacagatcgctgcaccaacagcccctggagaaacaaggcatttctaaatgattttgacgaaaacatacatcttcaggccacattcaaagcatcatgtaccaataaaacctaaaattaaactagccaataattaggaaattaacaaatataatattccacaaagttcgatacttcactagcaaccattgaaacaataaatttaaatacatgatcaaatacagtgtacttaaaaaaacatggaacaccaaatgattgttagtaaaatactagtaaacgagtaacaaaaggtcgcaacagtacagattttattaacaccatcataatatctgggacctaatccatatctgcgaatctaacaccaaaaaaatatctaattaacccaaccacaaccaacagaaaagaatgtttttatttaacgtcgtaacttaccaattataattgaatggtagaatgtggaactattacaaaagggtcttaccccctaaatagctatataagtcaagcaaatgtattatgtatattaatctttggaaatcttacttctttttttttacacttccctgaagtacaagtacactatgtacagaatacattcataatgccgtctacacatgtactgtagcgacttgaaaatctatgcatccaccctaaaaaaaaccgatgacaaatagagacttcagagagaaccaaagaaagaacctaccacatttcaatcaaaccgcaaaaataactgctgttgttaagaaaattactcattatatcgttaatacccacacttcaatcccatctttgaaaaataaaaaagcacatgacagtcgtgatatactgacctactacatagtgcaatacctacaataaagcattatcatatataccataccatctcctaaattacccctccaaaaattactaactcactggaccaacttaattcttaataactaaattaata
gi|10 : aatattacaacacaaccaagagtaacatgtacataaaaactagaaagaaaacaaattaaccatacaactttatttaaaactccatactagtggacttcagtgaataatcacaataaataaagctgaaatcatggcccacaaagccatgacccaaaactcaatgcatcccgataaaaaaccactcaaaaaatcctcagaaatatagccaattgaaaaactcacttctgaaaaagatagtacaaaagtctaattatcaatagttaaatatcacttactatttcatgaaaaaatataagcggttaacctacataaaatgatttcctA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTT-CATTG--AAA--ATATAAA-GG-GT--------T--A-T-----TAT----GATTTAT---------GAGATTTA----AA-------------GGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--------A-AA--AT-CTCTAAACACAAACA---CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCACCCCTCCACCCAAAAAAAACCCGAAA-ACAAACACA----TCAA-AAAA-TT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--AGCGCTGGA--CG-GTTG-TTAT-TA-TCAAACGT--ATAT--ATA--AA----AT--AA---CC---AAT---A--TG--AGAT--GAAATT--AGACAA---A-A----TCC-AA-G-T-G-ATAA--------TGGAA----CA-T-GA--TCG-C-------AG-CA-GC--ATGG--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAGGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TGGGATTTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTTTGGAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-G--CCTTT-C-A-C-ACA-ATTC-ATT-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TTGGT--TTT-GCC-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCT-T--GGAACCAAT-A-AACCTAAAA--AATAAAT--GC-AAATTA--T-GG---T--ATT-ACCA---ATGAT-TTC-AACAAAGT--T---GT-TACTTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-ata
gi|11 : AC-CAAC---AGGT------TACATAAAA--TAC-C---ATATA-CAAA-TT-A-CCAC-CA--------TAGAAGATCA-TA-CAAATG-----TCAACACGGGTTTCAGTAT-TTCAAAGGTAACCATAAGAAATGATC--TGTTGTGT-ATGGTTA-CACAAATCCATG--TTGAA-----AATG----C-TGAT----A--------------------CCATAG-CAT---G-C--ATTGAT----TCAACACAAACCCTATCTGAAA---GTA-TACTATATAA-GTTGATTTGACATACTTTTTGACTTTTAGC-A--AGTGAAGTC-----TTAC-TT----ACGAATTTTTTTTT-G--TAA--A-ATTAG-GA-TT--------TTCA-TGGGAAAATAAGGGATTTTTAGGAATTTGGAGCTT-A----AATAAGGAAAAATAAGGGC-CTCTGA-CAAAAAAAA--TAAGGAA-AA--AT-TAGGAAA-------A---TA-----A-ta
gi|11 : ctttcaagtgactttttgtgaaaaataagggccttttttagggcaaaattcttaaagaatgagggctatttttaggatattttaggaatttcaggcaaaataagggtaaaaaaacttcctaattaaacccccaatgaattaatttgtacttAAAAAAA----TAAGGAAAAATT--AGGAAAATAAGG-----------G-CCCGCTT-----GAAA--Ggggcccgcttgaaagc
gi|12 : ctttcaagtgactttttgtgaaaaataagggccttttttagggcaaaattcttaaagaatgagggctatttttaggatattttaggaatttcaggcaaaataagggtaaaaaaacttcctaattaaacccccaatgaattaatttgtacttaccaacaggttacataaaataccatatacaaattaccaccatagaagatcatacaaatgtcaacacgggtttcagtatttcaaaggtaaccataagaaatgatctgttgtgtatggttacacaaatccatgttgaaaatgctgataccatagcatgcattgattcaacacaaaccctatctgaaagtatactatataagttgatttgacatactttttgacttttagcaagtgaagtcttacttacgaatttttttttgtaaaattaggattttcatgggaaaataagggatttttaggaatttggagcttaaataaggaaaaataagggcctctgacaAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-ACCACTT-----GAAA--G-C-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TG-TCAAACGT--CTAT--ATA--CA----AT--AA--ACC---AAT---A--TG--AGAT--GAAATT--AGACAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA---------TGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-AA--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-TAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAA-GACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGCTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACG-A-TC-A-T-G-----AA-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCTT-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT--AA--AATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-TA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTT-T----T-C--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAATA---------TACAT--ACATG-A--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACc
gi|13 : A-TATGTACAG--ACT----AC-TA---A--AGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--TATGTA--AGTA-TGATG-C---T-TCC-AAACA-TGT-A--TG-------TAG---AAC-TG--T-A---TT-TG----CA-TC-T----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAGGAGAGACC-TT----CAG--G-G-AG---AAG--GAAA-CAG-----GA-A-----AACA---TTTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GTTGTCTGTTT-GGCAA---TATT-------TC----TTTA----CC---A---T-T---TGAAC----T---TTG-G-A-AAAA-T---AA-AGC-C-----ATG---AG-TCAG--------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT----A-TT--CTAA-AT--------TAT----TA-TCATAT-TA-C-TA-CATCT-CTAT--ACCACTT-------ATTTGA-------T--------------A------TGG------ATT--ATTC-T-----------ATA--T-------AA-T---TTTAC
gi|14 : A-TATGTACAG--ACT----AC-TA---A--AGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--TATGTA--AGTA-TGATG-C---T-TCC-AAACA-TGT-A--TG-------TAG---AAC-TG--T-A---TT-TG----CA-TC-T----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAGGAGAGACC-TT----CAG--G-G-AG---AAG--GAAA-CAG-----GA-A-----AACA---TTTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GTTGTCTGTTT-GGCAA---TATT-------TC----TTTA----CC---A---T-T---TGAAC----T---TTG-G-A-AAAA-T---AA-AGC-C-----ATG---AG-TCAG--------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT----A-TT--CTAA-AT--------TAT----TA-TCATAT-TA-C-TA-CATCT-CTAT--ACCACTT-------ATTTGA-------T--------------A------TGG------ATT--ATTC-T-----------ATA--T-------AA-T---TTTACtaaggta
gi|15 : -TA--T-CG----AGTG-TATT-TGT---TTTA--T--CTTTG-A-AA-TCTT--ACTC--TC---TTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-TAACAA----GT--ACAGTATGTACATGAAATTGAAACTTA---A-CAGTCAAA-TAAATT-GTC-ACAGT-C-TATTAGTA-TGATT-CAAGT-ACT-A--CA-C-T-A--TGGTTATATTAGC--GAA-TGATT-AAAGAT-T------A-TCTTAGGCAATCT-T-----AAATC-GA-GAGC---CCT------GACCATTACCACGC--GAGCAGGCAAAG--CAGA-GAGATCGCGA-G-----CACG----CT----TCA------AGTGT----AGT--AC-T-GCTGTCGG-TG-GTCAAA-TTATT-------TC----TTtaaggta
gi|16 : TATTACA-C-CAAC---AGGT-A-ACGTACATAAAA--TTG-A---AAA-AACAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAG-TCAATA-CTAGTGGA-CTTCAAGATGGG------T-T-TC--------ACC-TAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---TTAATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAATTTTTCCTA-AAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAAG--AT--CACT----AA-G----TCTAA-ATAT--------------CAA--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTTTCAT-G---AA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTTT---------GAGAT
gi|2 : TATTACAAC-CAAC---AG-T-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGA--CTTCAAGATGGG-----ATAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATG--TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAAG--ATA-CGTCA---AA-G----TCTAA--T-C--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ATTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GAGCTT-A----AA-------------GGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--T----AA-AA--AT-CTCCAAAC------A---CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCC---ATACAAACCAA----TAAA-AAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAA---GTC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-AT-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--T---AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA--------ATGAA----CA-TCGAATT-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA-----C-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG-----ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGGC-C-CA---GC---CAT-ATGTATTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AAAC--A--GG--CA-TTCT---TT-GT--TTT-G-CAAAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCA---A-AACCT-AAA--TATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTCAAAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATGCA-TGTACTTAATAAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAGTTA-AAA-TACTAG-TAAAAC-AGT---AAAA----TTG-AACAATAACAAGATT---TTC---A-CA-CCA--TAAT-AATATCTG-GG--A-CT--A---T---------ATATTCTGCGAAT-CT--------A--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---AT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGG--TTT----C-AT-AGA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGT-T-TTTAA-T--CTTTGGA-AATTCTT--ACTC--TTTTTTTTTTTA----AA--TA-T-T-GAAG-T-ACAAACTTGT--ACA-TATGTACAAGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--A-T-TA--TGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-AT-TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAGTTCAAA-CAGA----GA-A-----TACA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--ACTT-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGTAA-----ATGACAAG-TCAGT-------T-A-TGTTGATA---TCTA--------GT--GCA-TC--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------CTTTAAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAATCAGAAT-GCAATTTaa
gi|3 : TATTACAAC-CAAC---AGGT-ACATGT-CATAAA---TAGGA---AAA-A-CAAAATT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--ACTCAAGATGGG------TAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAGAGCC-TG--CCAA----T-AATG----C-TGAT----GAC---CACT--AAA-G-TTTTCATAGAAAT---GGC--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---AGA--ACTA---AC-G----TCTA---TAT----------------A--A-----GTT-----T-ACGTT----ATTA---TTTTCAT-G--AAA--A---AAA-GG-TT--------T--A-T-----AAT-----ATTTCT---------GAGCTT-A----AA-------------GGAC-CTC-GA-CCAAAAAAAAAT----AATAA--AT-CTC-AAA-------A---CA-----AACACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAA-CCC---ATACAAACAAA----TAAA-AAAA--T--GGGAAGATAAAG-----------G-CC-ACTT-----GAAA--G-C-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-T--TCAAACGT--CTAT--ATA--AA-----T--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA---T-G-ATAA---------TGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACCAAGACTA-TG--G-T---CCA----GA-G--TTGGA-TTT--CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTT---GAAT-C-ATT---C-T-CT-GT--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TCTA-T-G-----AC-A--A----TGGA-AAAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA-----T---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-ATAACCT-AAA--ATTAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---TA-T--TTCAC-T-GC--------A---A-TGAATA---------TACAT--ACATG-T--AATGCA-TG-AC-TAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAA----TTG--ACAATAAC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---TA--------ATATT-TGCGAAT-CT--------A--AAAA-T-T-CTA----AT---T--ACCC------------CCCC--CCCC----CCAA--------CTTTTCTTT---AT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TT-------------CTTTAGAA-TTGAA--TT-TGGTAAAAG-CTGG-TGG--CT-------A----AGG--TTT----C-ATGAAA-T-GC-AT-TA--T-C------GTG-TA-T-TGT-T-TTTAATT--CTTTGGA-AATTCTT--A--C--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-TGTGGAAG-T-ACAA----CTTGACA-TATGC-----AAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--T-T-TAT-AGTA-TGATG-CT--T-ACC-A--CAGTGT-A---G-------TAGC--GAC-TG--TAAAATCT-TG----CATTCCT----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAGTTCAAAGCAGA----GATA-----TACA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--AC-TGGCTGTCTG-TTGGGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-C-TGACC----C---TTTGG-A-AAAA-T--AAA-AGTAA-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGATT-TTGATA---TCTA--------GT--GCA--T--CTAC-AT--------TGT----TATTCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCCTGAAATAATTTTAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
gi|4 : -TCACACGT--TCAT--ATAT-AACATGAT--AACAACCTATAACTCTG--TA--AGAT--GAAATT--AGTCAATATA-AA---TCCTAA-A-T-GAATAATAGATAGCATTAA----TACT-GA--C-A-C-------AGCCA-GC--A--GTAAT----GGATATCAT-------A--G-AAACTATACAGCTACATCAAATG--TTAACAG--CTGAGACAGACTA-TGTCCGTTACCCATAATGA----TTGGA--TTT-CAGG--C-CC---ACGCACAT-ATGTTTTT--GAATAC-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTTGC-ATC-ACA-A-TT-A-TGG-----AC-AACA----TGGA-AGAC--A--GG--CAATTCT---GT-GTTGTTT-G-C-AAAACAGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA----GGTACCAAT-A-AACCT--AA--AATAAAT---C-AAAGTA--TCGG---T--ATTAA-CA---ATGAT-TTC--AC-AAGTG-TTA-AT-A--TTCACTT-GCTAATAGCAA---ATTTAC-A---------TACATACACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAAATACATGG--ACAC---ATGAT-TGATTAG-TA-AAATTACTAG-T-AA-----T---A-----------------------ATT---TTCCTTATCA-CCG--T-ATAAATATCTG-GGCAG-CTTCA---CTTAATAATTATATACTACGAACACT-------GA--AAAA-T-TACTACGGTACATTT--ACCCCCCCCCCCCCGCCCCC--CCCATCATC-----------TTTTTCTTT---TT----CTTTACCAACGCAGATGTATTT-----------T
gi|4 : tacgtATTATTTGAATCATGCGGT-A----T--T-TGG--ATTA-----A----AGGGTTTT----G-AT-AAAAT-GC-AT-TA--TAC-----AGTGATATT--GTAGGTTTAA-TTTCTTTGGATAA-TCTTACACTC--TCTATTTTGTTACTTCAG--TATT-TGAAAGTT-ACAA----GT--ACATTATGGTTAAGAAATA---AC-TA---ACCAGTCAAACTAAA-TGGTC-AC--T-T-T---AGTACTGATG-TCTAT-ACCAA--CA-TGT-AGCTGTTTC---TAGCGAGAC-TGT-T-AAATCT-TGCTCTCA-TCCC-----ATCT-T-----GAACCCTC-GGCATCCTATA----------TT----CAGGTGAG-AAG-GAAG---ACA-CAGC----GC-T-----CACAGAGTCTCATGTCA------AG-GTGGGAAATCAAC-T-CCTGTAAG-GT-GTTAAA-TT-TT-------TCTATTTTTA----CTCCAAC-CTCT-CATGACCGGA-CCGGTTTAG-ATAAAATT--AAACAGC-AACGTGATG-A-AGCTCAGT-------TGATT-TTGATACCTTCTATATTATCTGTCGACACTT--CTTC-AT---GAGGATGTTACGTA-TCATAT-TACC-TA-C-TCT-CC-T--ATTAGCC-------CTTTACA----ACTAATCTGACACACTAA------TGG--AC--ATTA-ATTC-TTACCTTTAGTAAAA--TTAATGTGGA-TAA-TATACATGCATTAATGTG----AGAATCGCAATTTtgttaacgtcaaacgccaggtaaatgtttaaagtgagattatttgaatcatgcggtatttggattaaagggttttgataaaatgcattatacagtgatattgtaggtttaatttctttggataatcttacactctctattttgttacttcagtatttgaaagttacaagtacattatggttaagaaataactaaccagtcaaactaaatggtcactttagtactgatgtctataccaacatgtagctgtttctagcgagactgttaaatcttgctctcatcccatcttgaaccctcggcatcctatattcaggtgagaaggaagacacagcgctcacagagtctcatgtcaaggtgggaaatcaactcctgtaaggtgttaaatttttctatttttactccaacctctcatgaccggaccggtttagataaaattaaacagcaacgtgatgaagctcagttgattttgataccttctatattatctgtcgacacttcttcatgaggatgttacgtatcatattacctactctcctattagccctttacaactaatctgacacactaatggacattaattcttacctttagtaaaattaatgtggataatatacatgcattaatgtgagaatcgcaattt
gi|5 : tacgttcacacgttcatatataacatgataacaacctataactctgtaagatgaaattagtcaatataaatcctaaatgaataatagatagcattaatactgacacagccagcagtaatggatatcatagaaactatacagctacatcaaatgttaacagctgagacagactatgtccgttacccataatgattggatttcaggcccacgcacatatgtttttgaatacatttctctgcttgtcctttgcatcacaattatggacaacatggaagacaggcaattctgtgttgtttgcaaaacagatttttcaggccacttcagcaggtaccaataaacctaaaataaatcaaagtatcggtattaacaatgatttcacaagtgttaatattcacttgctaatagcaaatttacatacatacacatgtaatacatgtacttaaaagaaaatacatggacacatgattgattagtaaaattactagtaataattttccttatcaccgtataaatatctgggcagcttcacttaataattatatactacgaacactgaaaaattactacggtacatttacccccccccccccgccccccccatcatctttttctttttctttaccaacgcagatgtatttttgttaacgtcaaacgccaggtaaatgtttaaagtgagCAAC-CAAA---GGTT-ACATGTA-ATAA----TAG-A---AA----CAA--TT-A-TTAT-CAG-------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGGT-CTTCAAGA-GGG-----GTAT--C--------ACCATAG---A-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACA--GCCATG--C-AAA---T-AATG----CCTGAT----AAC---CACT--AACAG-TTTTCAT-GAAAT---G-C--ATTGAA----TC------------TTCTGAAA---ATA-TACTA---AAAG----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ATT----TTTTCAT-G--AAATAATAC----GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GATATT-A----A--------------GGAC-TT--GA-CCAAAAAAA-------AA-AA--AT-T---------------------------ACCC--------------------------------------AAAAAAACC----A-A-AAAC-------TAAA-A----TT--GGGAAGATAAAG-----------G-C--ACTT-----GAAA--GCC-ATG-A--CA-GT-GGTTATGTA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AG--AA--ATA---ATA---A--TG--AGAT--GA--TT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA---------TGA-----CA-T-GA--T-G----------A-CA-G------G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC--T-CA----CATGGAATG--TT--CAG-----ATAAAGACTA-TG--GGG---TCA----GA-G--TTGGA-TTTTTCAGA--C-CA---GC---CAT-ATATTTT----GAT-C-ATT--TT-TTCT-GC--TTG-TTACCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-A-----A-----A----TGGA-AGACC-A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-G-CAA--AGAT---TTTTCA--TGGCAC--TCA--G---T--TGTAGC-AT----ACCT------AAT--AT--GC--AA-TA--C--G---T--ATT-A-GA---ATG-T-TTC--AC--AGTGTT---AT-T--TTT-C-T-GC--------A---ATTG-A-A---------TAC-----TCTG-T----TACA-TGGTCTTTA-A---GAA--ACAT-G--A-AC----TAAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAA--AGT---AAAAATTGTTG-A--GAT-AC-AGA-T---TTC---A--A-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT------C---------ATA-TCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTG----A----T--------------------TA--CCCA----------------TTTTTCTTT---TT----ATCTTCC------AGTGT-TTTTATTTAAGTGGTA-------------CTTTATAATTTG-A--AT-T-GT-AAAGTT--GTTGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-TAA---G--AT-T---T-C-----A-TGCTATG-TGTAT-
gi|6 : ttCAAC-CAAA---GGTT-ACATGTA-ATAA----TAG-A---AA----CAA--TT-A-TTAT-CAG-------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGGT-CTTCAAGA-GGG-----GTAT--C--------ACCATAG---A-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACA--GCCATG--C-AAA---T-AATG----CCTGAT----AAC---CACT--AACAG-TTTTCAT-GAAAT---G-C--ATTGAA----TC------------TTCTGAAA---ATA-TACTA---AAAG----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ATT----TTTTCAT-G--AAATAATAC----GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GATATT-A----A--------------GGAC-TT--GA-CCAAAAAAA-------AA-AA--AT-T---------------------------ACCC--------------------------------------AAAAAAACC----A-A-AAAC-------TAAA-A----TT--GGGAAGATAAAG-----------G-C--ACTT-----GAAA--GCC-ATG-A--CA-GT-GGTTATGTA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AG--AA--ATA---ATA---A--TG--AGAT--GA--TT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA---------TGA-----CA-T-GA--T-G----------A-CA-G------G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC--T-CA----CATGGAATG--TT--CAG-----ATAAAGACTA-TG--GGG---TCA----GA-G--TTGGA-TTTTTCAGA--C-CA---GC---CAT-ATATTTT----GAT-C-ATT--TT-TTCT-GC--TTG-TTACCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-A-----A-----A----TGGA-AGACC-A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-G-CAA--AGAT---TTTTCA--TGGCAC--TCA--G---T--TGTAGC-AT----ACCT------AAT--AT--GC--AA-TA--C--G---T--ATT-A-GA---ATG-T-TTC--AC--AGTGTT---AT-T--TTT-C-T-GC--------A---ATTG-A-A---------TAC-----TCTG-T----TACA-TGGTCTTTA-A---GAA--ACAT-G--A-AC----TAAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAA--AGT---AAAAATTGTTG-A--GAT-AC-AGA-T---TTC---A--A-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT------C---------ATA-TCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTG----A----T--------------------TA--CCCA----------------TTTTTCTTT---TT----ATCTTCC------AGTGT-TTTTATTTAAGTGGTA-------------CTTTATAATTTG-A--AT-T-GT-AAAGTT--GTTGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-TAA---G--AT-T---T-C-----A-TGCTATG-TGTAT-
gi|7 : ttTATTACAAC-CAAC---AGGTTACATGTAC-TAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-AACCAT-C---------TAGAAGATCA-TAACTA-TGGACCTTCAAGATGGG------TATGTC--------ACCATAAAAAA-GA-C--AG----AT-ATGGATAACACAAAGCCATG--CCA-----T-TATA----C-TGAT----AACATGCACT--AAAAG-TTTTCATAGAAA----G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---AGA-TA-TA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--AA----GTT-----TTAC-TTTATTAATA---TTTCAAT-G--AA----TATAAG-GGATT--------T--AAT-----AAT----GATTTCT---------GAGATT-AGAAAAA-------------GGACGCTCTGAACCAAAAAAA--T----AT-ATTTATACACAAAA-------A---CATACCCA-CATCCC----CCACCTAACTTCCCGC-CCCACCCAAAA----AAAAAAAACCC---C-A-AAACAAATAAATAAA-AAAAATT--GGAAAGATAAAG-----------GTCCCACTT-----GAAA--GGC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TA-TCAAACGT--CTAT---TA--AA----AT--AA--ACC---AATTA-A--TGAAAGATTGGAAATT--AGGAAA---ACAG---TCC-CA-G-T-G-AT-A--------ATGAA----CA-T-GA--T-GCC-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----CC-------A--TAAAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--AC-AAGACTA-T---GGT---CCA----GATG--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CATAATGTTTTT--GAAT-CAATT--TC-G-CTCGC--TTG-T--TCTTT-C-A-C-AC--A-TC-A-T-G-----ACAA--A----TGGA-AGAC--AATGGCCCATTTCT---TT-GT--TTTGG-C-AAA--AGAT---
gi|8 : aTTAA-AAGGAAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TAGAAA-TACTAGAT-AAAC-AGT---AAAAA--TGTG-GACAA--AC-AGATT---TT----A-CA-CCACTT-AT-AATATCTTTGG--A-CT--A---T---------CTAT-CTGCGAAT-CT-------AA--AAAT-T-T-CTA----A----TTAACCC------------ACCC--CCCAAAA-C----------------CCCC---AA----ACTCACCAA---GAATGT-TTT-----------TATTTAACGTGGTAACTTTATAATTTGAG--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------ATTAAAGGGTCTT----CCAT-AAA-T-GC--T-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGT-T-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TATT--ACTTCTTCTTTTTTTTTT----AA--TA-TGTGGAAG-T-ACA-----GT--ACA-TAT-TACAG-AAAT----AC-TATCAA-AAGT-AAA-TAAA-TTGTCCAC--T-T-TA--GTTA-TGA-G-C---TTACC-A--CA-TGTTA--TGCA-----TAGC--AAC--G--A-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCCCT-----AACCCTGA-GACA---AA-AG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAA--------CAGA----AA---------CA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAAATTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-TTCAGAACC----C---TTTTGCA-AAAA-T--AAA-AGC-AC----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-CTGATA---TCTA--------GT--GCA-TC--CTAC-AT---G----TA-----TA-TCATAT-TACC-TACCATCTACC-T--ATTACCCTAAATA-ATTCTAA----ACT--------------A------TGGGAAC--ATT--ATTCTT-----------AAATTT-------AATTAATTTTACA--CA-T-ATGT------GAAT-GCAATTT
gi|9 : GAAGACAAAG-----------G-CCCACTTACTTGGAAA--GGC-CTGGA--CAAGT-G-TTAT-TA-TCAAACGTGTCTAT--ATATTAAGT--AT--AA--ACC---AAC---A--TG--A-AT--GAAATTT-AGGACA---A-AA---TCC-AA-AAT-GGATA----------TGAA----CA-T-GA--T-G-CCACCAAAGG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------ACAT-AAAC-AT-CAA---CATGGAATG--T---CAG--T--ACAA-TACAA-TG--GCT---CCT----G-----TTGGA-TTCT-CAAGAGCGTAAGTGC---CAT-ATATTTTT---AAT-C-ATT--TCCT-CT-GA--CTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGACGAG--GG--CATTTCT---TT-A---TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCATTTGCCAT-TTC---GCACT--TGTACCCAT-T-AACCT-ACACGAGTAAAT--GCAAAA-TA--T-AGGTTT--TTT-A-CA---ATGA--TTC-GAC-AAGTG-T---TA-T--TTCACTT-GC--------A---ATAGGC-A---------GACTT--ACTTA-A--AATACA-TG-------------AA--ACA------------ATGATCTG-TTAA-TA-AAA-TACTAG-T-AATC-AGT---AAAAA--ATTGTGATGAT-AC-TGATT---TTC---ACCACCCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---T---------AT-TCCTGCAAAT-GT-------CATCACAATT-T-CTA----AT---T--ACCC------------CCCC--CCC
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): CCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCCATCTTTTATTTTTCATTTTGCGTGCGTTCATCGTTCAGTTAGCGTTTTCTATATTTCAGTGAACGTCTAGTTAAGGAATTGGGGTAAAATTATCGGTAATCATCGGTGAGTTCTCGGGAGTTTCCGGAATAAAATGCTTTTACAATCCAGAGTGCTATCGTAG
Unaligned ( gi|18 ): GGCTTTTTGTGAAAAAATTAATGGGCCTTATTTTTATGAACGAAAGTCTTCTTAAATGAGGGCTATTTTAAGATATATACGGATTTTGCATTCAGACAAGTGGTATGGGTAACTATAAAAAAATAATCTGTATTCACCCTAAAGGTAACATGTATATAAACAAA
Unaligned ( gi|19 ): TTGAGTGACTTTTGTGAAAAATAAGCCTTTATAGGGCAAAATTCTTTAAAAAAAGGGCTATTTTAAGATATTTTAGGAATATTTCAGACAAAAAATAAGGGGTAGAAATTCCTAATTTAACCCCCCAAGAAATTAATCTTACTTACTACAGATACATAAA
Unaligned ( gi|20 ): GCTTTCAAGTGACTTTTGTGCAAATAAGGGCCTTTTTCTAGGGCAAAATTCTTAAAAAATAAGGGCTATTTTTACGGATATTTTAGGAATTTTCAGGCAAAAATAAGGGTAAACTTCCTAATTAATCCCCAATGAATTAATTTGTACTTACCAAACAGGT
Unaligned ( gi|21 ): GCTTTCAAGTGACTATTTGTGAAAAATAAGGGCCTTTTTCAGGGCTAAAATCTTAAATAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAAGATTTTTCAAACAAAAAGTAGGGGTAAAACTTCCTTATAAATACT
Unaligned ( gi|22 ): GGACTTTTCAAGAAAATAAGGGCTTTTTTAGGGCAAAATTCTTTAAAACTAAGTGGCTATTAGATTTATTTAGGGATTTTTCAAGCAAAAATAAGGGTGTAAAAATCCTTCTCAATAAAGTTACAAAAAA
Unaligned ( gi|23 ): TCTTCAAGTGACTTTTTAAATGAAAAATAAGGACTTTTTAGGGCAAAATGTTCCTTATAAGGATAGGGTATTTTATGATATTTTGAGATATATTCAAAGCAAAATAGGAGGTCAAAACTTTCAAA
Unaligned ( gi|24 ): AGGGTGACTTTTTTATGAAAAATGAGGGCCTTTTTATGGCAAAATTCTTCATAAAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAGAATTG
Unaligned ( gi|25 ): GTGACTTTTTATGAAAAATGAGGGCCTTTTTATGGCAAAATTCTTCATAAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAGAATTGT
Unaligned ( gi|26 ): TTTGGAAATTAGATAAGGAATATAAGGGCCTCTGACAAAATGTAAGGAAAATAAGGGCCC
Unaligned ( gi|27 ): GCTTTCAAGTGACCTTTTTATGAAAAATAAGGGCCTTTTAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111 1111 22222222 22 22222222222222222222 1111 1 111111 1111 1 1111 1111 2222222222 111 2222222222222222222222222 11111 11 11111111 11111 111111111 3333333333333333333 11 222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 22222222 2222222 11111111111 11111 11 1111 1111 444444444 111111111111 1111111 11111 1111 111 11 11111 11111 111 111 111111 11 222222222 11111111 222222222 1111 11111 111 1111 11 111 444444444444444 11 1 4444444444444444 11 22222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111111 111111 88888888888888888888888888 111111 222222222222 1111 111 11 111 1111111 1 111 1 111 1111 111 1111 1 11 1111 111111 1 1 22222222222 222 11 33333333333 1111 1111 1111111 11111 11 111 1111 111 111 222222222222222 111111 11111 11 1 1 1111111 1111 1111 111111 1111 22222222 1 111 3333333 222 22222222 1 111 22222222 111 11111 33333333 1111 1 1 555555555555555555555555555555555555555555 111111 11 222222222222222222222222 1 11 1 22222 1
lowQualScore : 5 888 2 0 2 3333 5 888 0000 88 5 5 5 88888888 0 5 5 66 5 66666666666666666666 66 5 5 66 0000 5 0 5 5 66 4 222222 0000 0 0000 888 66 0 5 0 3 888 5 66 0000 3333333333 3 888 55 777 8 9999 66 9999999999999999999999999 11111 4 9999 9999 4 66 22 1 4 4 4 66666666 66 4 11111 9999 777777777 1 5 2222222222222222222 5 00 5 222 5 77 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 22222222 3333333 1 7 66 99999999999 4 00000 55 9 4 8 66 4 8 8 8 55 55 55 33 4444 55 55 777 3333 55 55 55 0 99 777 4 777 4 666 4 8 111111111 99999 4 4 99 4 777777777777 4 999999 55 8888 8888 3333333 55 4 44 4 8888 55 55 88888 2 4 55 777 2222 7777 4 8 99 4 777 777 4 111 4 4 55 4 8 4 55 4 11 4 4 4 4 4 4 4 8 4 00000 8888888888 4 55555 55 777 4 55 4 111 55 777 66 66 66 777777 4 333 888888 1 66 99 8 99999 777 66 8 4 777 1 4 66 66 8 222222222 1 8 4 66666666 777 3 8 000000000 0000 0 22222 5 99 4 555 66 4 66 3 2222 5 5 5 44 5 5 5 111 888 111111111111111 5 3 888 888 22 5 66 0 5 5 66 5 1111111111111111 11 5 44444444 66 5 5 5 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888 777777777 999999 5 44444444444444444444444444 5 5 99999 4 5 0 777777 77 999999999999 4 2222 5 5 666 00 5 000 5 9999999 5 5 777 6 99 6 3 99 000 4444 99 333 2 6 6 4444 99 5 0 88 5555 5 666666 0 5 5 0 5 22222222222 5 5 222 5 5 33 5 5 77777777777 999 5 4444 3 5 0000 5 4444444 5 22222 33 5 5 888 777 5 0000 66 3 5 555 999 5 666666666666666 888 77 444444 5 77777 11 5 5 0 0 88 6666666 0000 2222 111111 5 6666 66666666 7 5 5 5 222 5 5555555 555 5 33333333 1 5 000 00000000 444 00000 5 33333333 2222 5 5 4 5 1 5 1 77 555555555555555555555555555555555555555555 777777 33 5 888888888888888888888888 1 888 33 0 3 77777 0
lowQualScore : . ... . . . .... . ... .... .. . . . ........ . . . .. . .................... .. . . .. .... . . . . .. . ...... .... . .... ... .. . . . . ... . .. .... .......... . ... .. ... . .... .. ......................... ..... . .... .... . .. .. . . . . ........ .. . ..... .... ......... . . ................... . .. . ... . .. ....................................................................... . ........ ....... . . .. ........... . ..... .. . . . .. . . . . .. .. .. .. .... .. .. ... .... .. .. .. . .. ... . ... . ... . . ......... ..... . . .. . ............ . ...... .. .... .... ....... .. . .. . .... .. .. ..... . . .. ... .... .... . . .. . ... ... . ... . . .. . . . .. . .. . . . . . . . . . ..... .......... . ..... .. ... . .. . ... .. ... .. .. .. ...... . ... ...... . .. .. . ..... ... .. . . ... . . .. .. . ......... . . . ........ ... . . ......... .... . ..... . .. . ... .. . .. . .... . . . .. . . . ... ... ............... . . ... ... .. . .. . . . .. . ................ .. . ........ .. . . . ....................................................... ......... ...... . .......................... . . ..... . . . ...... .. ............ . .... . . ... .. . ... . ....... . . ... . .. . . .. ... .... .. ... . . . .... .. . . .. .... . ...... . . . . . ........... . . ... . . .. . . ........... ... . .... . . .... . ....... . ..... .. . . ... ... . .... .. . . ... ... . ............... ... .. ...... . ..... .. . . . . .. ....... .... .... ...... . .... ........ . . . . ... . ....... ... . ........ . . ... ........ ... ..... . ........ .... . . . . . . . .. .......................................... ...... .. . ........................ . ... .. . . ..... .
lowQualScore : 0 888 5 0 5 2222 0 888 2222 22 0 0 0 11111111 4 0 0 99 1 00000000000000000000 88 0 0 99 6666 0 0 0 1 99 5 999999 6666 0 6666 888 99 1 0 1 2 888 0 99 6666 2222222222 1 888 99 888 9 4444 44 8888888888888888888888888 11111 4 4444 7777 4 11 22 9 8 4 4 11111111 11 4 11111 4444 888888888 7 0 4444444444444444444 0 66 0 444 0 99 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 66666666 1111111 9 2 11 00000000000 0 00000 55 7 4 9 11 4 9 9 9 00 55 55 55 0000 55 55 000 9999 55 55 55 8 55 000 0 000 0 222 0 0 666666666 33333 0 0 55 0 111111111111 0 333333 55 5555 5555 0000000 55 0 88 0 6666 55 55 22222 3 0 55 000 5555 0000 0 0 55 0 000 000 0 222 0 0 55 0 0 0 55 0 00 0 0 0 0 0 0 0 0 0 00000 8888888888 0 55555 55 000 0 55 0 000 55 000 11 33 11 333333 6 777 777777 9 11 00 9 66666 888 11 9 4 888 9 4 11 33 9 333333333 9 9 4 11111111 888 6 9 000000000 4444 2 66666 0 88 4 666 11 4 11 9 0000 0 0 0 44 0 0 0 000 888 000000000000000 0 2 888 888 55 0 99 0 0 0 99 0 9999999999999999 66 0 44444444 99 0 0 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 999999999 444444 7 77777777777777777777777777 0 0 77777 3 7 1 444444 99 666666666666 3 1111 7 7 444 00 0 111 0 1111111 0 0 555 7 22 7 3 22 222 2222 22 555 5 7 7 2222 22 0 4 44 6666 0 555555 0 0 0 0 0 22222222222 0 0 555 0 0 88 0 0 88888888888 444 0 4444 2 0 6666 0 2222222 0 55555 88 1 0 888 555 0 6666 99 2 0 666 444 0 000000000000000 888 22 444444 0 55555 99 0 0 0 0 22 2222222 6666 1111 000000 7 3333 77777777 1 7 7 7 999 7 0000000 000 7 66666666 4 7 000 77777777 444 66666 7 66666666 1111 7 7 3 7 4 7 4 99 333333333333333333333333333333333333333333 999999 66 7 777777777777777777777777 4 666 88 0 2 22222 0
consensus : TATTACAAC-CAAC---GGGT-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--CTTCAAGATGGG-----GTAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---ATA-TACTA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GAGATT-A----AA-------------GGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--TAA-AA--AT-CTC-------AAA-A----CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCC---A-ACAAACAAA----TAAAAAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--GNC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA--------ATGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT-AAA--AATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAAA--GTTG-AACGAT-AC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---C---------ATATTCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---NT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-AAA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGTAT-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACTC--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-T-ACAA----GT--ACA-TATGTACAGGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--T-T-TA--AGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-A--TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAG--CAAA-CAGA----GA-A-----CACA---TCTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGC-A-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT--GCA-TT--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------ATTTNAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
Reference ( family-2636 ) : TATTACAAC-CAAC---GGGT-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--CTTCAAGATGGG-----GTAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---ATA-TACTA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GAGATT-A----AA-------------GGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--TAA-AA--AT-CTC-------AAA-A----CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCC---A-ACAAACAAA----TAAAAAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--GNC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA--------ATGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT-AAA--AATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAAA--GTTG-AACGAT-AC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---C---------ATATTCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---NT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-AAA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGTAT-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACTC--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-T-ACAA----GT--ACA-TATGTACAGGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--T-T-TA--AGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-A--TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAG--CAAA-CAGA----GA-A-----CACA---TCTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGC-A-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT--GCA-TT--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------ATTTNAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
gi|1 : TATTACAACACAACCAAGAGTAACATGTACATAAAAACTAG-AAAGAAA-A-CAAA-TTAA-CCATACAACTTTATTTAAAACTCCA-TA-CTAGTGGA-CTTCA--GT-GA-----ATAA-TC--------ACAATAAATAA-AG-CTGAA----ATCATGG-CC-CACAAAGCCATGACCCAAAACTC-AATGCATCC-CGATAAAAAAC---CACTCAAAAAA-TCCTC--AGAAATATAG-CCAATTGAAAAACTCA---------C-TTCTGAAAAAGATAGTACAA---AA-G----TCTAA-TTAT--------------C-AATA-----GTTAAATATCAC-TT----ACTA----TTTCAT-GAAAAA--ATATAAGCGG-TTAACCTACAT--A-A-----AAT----GATTTC--------------CT-A----AA--------------GAC-CAACAA-CCCAAAAAA---AA-CA--AT-TTG-------GAG-AAGATCA-----A--ACCCCGCAACC-------------CACCCA-----------
gi|1 : aaAAAGACC---A-ACAACCCAA----AAAAAACAATTTGGAGAAGATCAAACCCCGCAACCCA-CCCATTC-----GAAAATGCA-CTG-AACTG-GTCG-ATAT-TACTCAAA-GT--CAATTAATAC-AA----ATTAAA--ACC---AAT---AAATG--AGAT--GAAATCTAAGACAA---A-AAACTTCC-AAAG-TAG-AAAATTCACA--ATGAAAAAACA-T-GAA-T-G-C-------AAACAAGCCAA--G--ACTCGAAGA----ACGATAACAA--C-AAAT-AC-AAG---CATGGAATGCATT--CAAGAT--ACAAAGACTAATG--GGT---CCAA---GA-GGCTTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC----AT-CTGCTTTT--GAAT-C-CTTCTTC-T-CT-GCCATTGAT--CCTTT-CCA-CCACAGA-TC-GCT-GCACCAAC-A--GCCCCTGGAGAAAC--AA-GG--CATTTCTAAATG-AT--TTT-GACGAAA--ACATACATCTTCA--GGCCACATTCAAAGCA-TCATGTACCAATAA-AACCT-AAA--ATTAAACTAGC-CAA-TAATT-AG---GAAATTAA-CAAATATAATATTC-CAC-AAA-G-TTCGATAC--TTCAC-TAGC--------AACCATTGAA-ACAATAAATTTAAAT--ACATGATCAAATACAGTGTACTTAA-A---AAA--ACAT-GGAACACCAAATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAACGAGTAACAAAAG--GTCGCAACAGT-AC-AGATTTTATTA---A-CA-CCA--TCAT-AATATCTG-GG--ACCT--AATCC---------ATA-TCTGCGAAT-CTAACACCAAA--AAAA-TAT-CTA----A----TTAACCCAA----------CCACAACCAA----CAGAAAAGAATGTTTTTATTTAACGTCGTAACTTACCAA-----------------------------------------TTATAA-TTGAA-----TGGT-AGAA-T--G-TGGAACTATTACAAA----AGGGTCTTACCCC-CT-AAA-TAGCTATATAAGT-CAAGCAAATG-TATTATGTAT-ATTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACT---TCTTTTTTTTTA----CACTTC-C-CTGAAG-T-ACAA----GT--ACACTATGTACAG--AAT----AC---------------A-T-------TC-A-------TA-----A-TGCCGTC---T-A-C-A--CA-TGT-AC-TG-------TAGC--GACTTG--A-AAATCTATG----CA-TCC------ACCC-TAAAAAAAACC-GATGACA---AATAG---AGA-C-TT----CA---GAG-AG---AAC--CAAA-GAAA----GA-ACCTACCACA---TTTC-AATCAAACCGCAA-A-----AATA-AC-T-GCTGT-TG-TTAAGAAAA-TTACTCATTATATC----GTTAATACCC---ACACT-T-CA--ATCCCATC---TTT-G-A-AAAA-TAAAAA-AGC-AC----ATGAC-AG-TC-GTGATATACTGA-C-CTACTA---CATA--------GT--GCA-ATACCTACAATAAAG----CAT----TA-TCATATATACCATACCATCT-CC-TAAATTACCC-------CTCCAAAAATTACT--------------AACTCACTGG--ACCAACTTAATTC-T-----------TAA--T-------AACTAA-ATTAttcgaaaatgcactgaactggtcgatattactcaaagtcaattaatacaaattaaaaccaataaatgagatgaaatctaagacaaaaaacttccaaagtagaaaattcacaatgaaaaaacatgaatgcaaacaagccaagactcgaagaacgataacaacaaatacaagcatggaatgcattcaagatacaaagactaatgggtccaagaggcttggattttcaggccagcatctgcttttgaatccttcttctctgccattgatcctttccaccacagatcgctgcaccaacagcccctggagaaacaaggcatttctaaatgattttgacgaaaacatacatcttcaggccacattcaaagcatcatgtaccaataaaacctaaaattaaactagccaataattaggaaattaacaaatataatattccacaaagttcgatacttcactagcaaccattgaaacaataaatttaaatacatgatcaaatacagtgtacttaaaaaaacatggaacaccaaatgattgttagtaaaatactagtaaacgagtaacaaaaggtcgcaacagtacagattttattaacaccatcataatatctgggacctaatccatatctgcgaatctaacaccaaaaaaatatctaattaacccaaccacaaccaacagaaaagaatgtttttatttaacgtcgtaacttaccaattataattgaatggtagaatgtggaactattacaaaagggtcttaccccctaaatagctatataagtcaagcaaatgtattatgtatattaatctttggaaatcttacttctttttttttacacttccctgaagtacaagtacactatgtacagaatacattcataatgccgtctacacatgtactgtagcgacttgaaaatctatgcatccaccctaaaaaaaaccgatgacaaatagagacttcagagagaaccaaagaaagaacctaccacatttcaatcaaaccgcaaaaataactgctgttgttaagaaaattactcattatatcgttaatacccacacttcaatcccatctttgaaaaataaaaaagcacatgacagtcgtgatatactgacctactacatagtgcaatacctacaataaagcattatcatatataccataccatctcctaaattacccctccaaaaattactaactcactggaccaacttaattcttaataactaaattaata
gi|10 : aatattacaacacaaccaagagtaacatgtacataaaaactagaaagaaaacaaattaaccatacaactttatttaaaactccatactagtggacttcagtgaataatcacaataaataaagctgaaatcatggcccacaaagccatgacccaaaactcaatgcatcccgataaaaaaccactcaaaaaatcctcagaaatatagccaattgaaaaactcacttctgaaaaagatagtacaaaagtctaattatcaatagttaaatatcacttactatttcatgaaaaaatataagcggttaacctacataaaatgatttcctA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTT-CATTG--AAA--ATATAAA-GG-GT--------T--A-T-----TAT----GATTTAT---------GAGATTTA----AA-------------GGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA----A-AA--AT-CTCTAAACACAAACA----CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCACCCCTCCACCCAAAAAAAACCCGAAA-ACAAACACA----TCAAAAAA-TT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--AGCGCTGGA--CG-GTTG-TTAT-TA-TCAAACGT--ATAT--ATA--AA----AT--AA---CC---AAT---A--TG--AGAT--GAAATT--AGACAA---A-A----TCC-AA-G-T-G-ATAA--------TGGAA----CA-T-GA--TCG-C-------AG-CA-GC--ATGG--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAGGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TGGGATTTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTTTGGAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-G--CCTTT-C-A-C-ACA-ATTC-ATT-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TTGGT--TTT-GCC-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCT-T--GGAACCAAT-A-AACCTAAAA--AATAAAT--GC-AAATTA--T-GG---T--ATT-ACCA---ATGAT-TTC-AACAAAGT--T---GT-TACTTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-ata
gi|11 : AC-CAAC---AGGT------TACATAAAA--TAC-C---ATATA-CAAA-TT-A-CCAC-CA--------TAGAAGATCA-TA-CAAATG-----TCAACACGGGTTTCAGTAT-TTCAAAGGTAACCATAAGAAATGATC--TGTTGTGT-ATGGTTA-CACAAATCCATG--TTGAA-----AATG----C-TGAT----A--------------------CCATAG-CAT---G-C--ATTGAT----TCAACACAAACCCTATCTGAAA---GTA-TACTATATAA-GTTGATTTGACATACTTTTTGACTTTTAGC-A--AGTGAAGTC-----TTAC-TT----ACGAATTTTTTTTT-G--TAA--A-ATTAG-GA-TT--------TTCA-TGGGAAAATAAGGGATTTTTAGGAATTTGGAGCTT-A----AATAAGGAAAAATAAGGGC-CTCTGA-CAAAAAAAA--TAA-ta
gi|11 : ctttcaagtgactttttgtgaaaaataagggccttttttagggcaaaattcttaaagaatgagggctatttttaggatattttaggaatttcaggcaaaataagggtaaaaaaacttcctaattaaacccccaatgaattaatttgtacttAAAAATT--AGGAAAATAAGG-----------G-CCCGCTT-----GAAA--Gggaaaaattaggaaaataagggcccgcttgaaagc
gi|12 : ctttcaagtgactttttgtgaaaaataagggccttttttagggcaaaattcttaaagaatgagggctatttttaggatattttaggaatttcaggcaaaataagggtaaaaaaacttcctaattaaacccccaatgaattaatttgtacttaccaacaggttacataaaataccatatacaaattaccaccatagaagatcatacaaatgtcaacacgggtttcagtatttcaaaggtaaccataagaaatgatctgttgtgtatggttacacaaatccatgttgaaaatgctgataccatagcatgcattgattcaacacaaaccctatctgaaagtatactatataagttgatttgacatactttttgacttttagcaagtgaagtcttacttacgaatttttttttgtaaaattaggattttcatgggaaaataagggatttttaggaatttggagcttaaataaggaaaaataagggcctctgacaaaaaaaataaggAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-ACCACTT-----GAAA--G-C-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TG-TCAAACGT--CTAT--ATA--CA----AT--AA--ACC---AAT---A--TG--AGAT--GAAATT--AGACAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA---------TGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-AA--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-TAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAA-GACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGCTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACG-A-TC-A-T-G-----AA-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCTT-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT--AA--AATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-TA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTT-T----T-C--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAATA---------TACAT--ACATG-A--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACc
gi|13 : A-TATGTACAG--ACT----AC-TA---A--AGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--TATGTA--AGTA-TGATG-C---T-TCC-AAACA-TGT-A--TG-------TAG---AAC-TG--T-A---TT-TG----CA-TC-T----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAGGAGAGACC-TT----CAG--G-G-AG---AAG--GAAA-CAG-----GA-A-----AACA---TTTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GTTGTCTGTTT-GGCAA---TATT-------TC----TTTA----CC---A---T-T---TGAAC----T---TTG-G-A-AAAA-T---AA-AGC-C-----ATG---AG-TCAG--------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT----A-TT--CTAA-AT--------TAT----TA-TCATAT-TA-C-TA-CATCT-CTAT--ACCACTT-------ATTTGA-------T--------------A------TGG------ATT--ATTC-T-----------ATA--T-------AA-T---TTTAC
gi|14 : A-TATGTACAG--ACT----AC-TA---A--AGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--TATGTA--AGTA-TGATG-C---T-TCC-AAACA-TGT-A--TG-------TAG---AAC-TG--T-A---TT-TG----CA-TC-T----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAGGAGAGACC-TT----CAG--G-G-AG---AAG--GAAA-CAG-----GA-A-----AACA---TTTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GTTGTCTGTTT-GGCAA---TATT-------TC----TTTA----CC---A---T-T---TGAAC----T---TTG-G-A-AAAA-T---AA-AGC-C-----ATG---AG-TCAG--------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT----A-TT--CTAA-AT--------TAT----TA-TCATAT-TA-C-TA-CATCT-CTAT--ACCACTT-------ATTTGA-------T--------------A------TGG------ATT--ATTC-T-----------ATA--T-------AA-T---TTTACtaaggta
gi|15 : -TA--T-CG----AGTG-TATT-TGT---TTTA--T--CTTTG-A-AA-TCTT--ACTC--TC---TTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-TAACAA----GT--ACAGTATGTACATGAAATTGAAACTTA---A-CAGTCAAA-TAAATT-GTC-ACAGT-C-TATTAGTA-TGATT-CAAGT-ACT-A--CA-C-T-A--TGGTTATATTAGC--GAA-TGATT-AAAGAT-T------A-TCTTAGGCAATCT-T-----AAATC-GA-GAGC---CCT------GACCATTACCACGC--GAGCAGGCAAAG--CAGA-GAGATCGCGA-G-----CACG----CT----TCA------AGTGT----AGT--AC-T-GCTGTCGG-TG-GTCAAA-TTATT-------TC----TTtaaggta
gi|16 : TATTACA-C-CAAC---AGGT-A-ACGTACATAAAA--TTG-A---AAA-AACAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAG-TCAATA-CTAGTGGA-CTTCAAGATGGG------T-T-TC--------ACC-TAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---TTAATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAATTTTTCCTA-AAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAAG--AT--CACT----AA-G----TCTAA-ATAT--------------CAA--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTTTCAT-G---AA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTTT---------GAGAT
gi|2 : TATTACAAC-CAAC---AG-T-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGA--CTTCAAGATGGG-----ATAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATG--TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAAG--ATA-CGTCA---AA-G----TCTAA--T-C--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ATTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GAGCTT-A----AA-------------GGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--TAA-AA--AT-CTCC------AAACA----CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCC---ATACAAACCAA----TAAAAAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAA---GTC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-AT-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--T---AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA--------ATGAA----CA-TCGAATT-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA-----C-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG-----ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGGC-C-CA---GC---CAT-ATGTATTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AAAC--A--GG--CA-TTCT---TT-GT--TTT-G-CAAAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCA---A-AACCT-AAA--TATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTCAAAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATGCA-TGTACTTAATAAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAGTTA-AAA-TACTAG-TAAAAC-AGT---AAAA----TTG-AACAATAACAAGATT---TTC---A-CA-CCA--TAAT-AATATCTG-GG--A-CT--A---T---------ATATTCTGCGAAT-CT--------A--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---AT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGG--TTT----C-AT-AGA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGT-T-TTTAA-T--CTTTGGA-AATTCTT--ACTC--TTTTTTTTTTTA----AA--TA-T-T-GAAG-T-ACAAACTTGT--ACA-TATGTACAAGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--A-T-TA--TGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-AT-TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAGTTCAAA-CAGA----GA-A-----TACA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--ACTT-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGTAA-----ATGACAAG-TCAGT-------T-A-TGTTGATA---TCTA--------GT--GCA-TC--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------CTTTAAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAATCAGAAT-GCAATTTaa
gi|3 : TATTACAAC-CAAC---AGGT-ACATGT-CATAAA---TAGGA---AAA-A-CAAAATT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--ACTCAAGATGGG------TAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAGAGCC-TG--CCAA----T-AATG----C-TGAT----GAC---CACT--AAA-G-TTTTCATAGAAAT---GGC--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---AGA--ACTA---AC-G----TCTA---TAT----------------A--A-----GTT-----T-ACGTT----ATTA---TTTTCAT-G--AAA--A---AAA-GG-TT--------T--A-T-----AAT-----ATTTCT---------GAGCTT-A----AA-------------GGAC-CTC-GA-CCAAAAAAAAATAATAA--AT-CTC-------AAA-A----CA-----AACACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAA-CCC---ATACAAACAAA----TAAAAAAA--T--GGGAAGATAAAG-----------G-CC-ACTT-----GAAA--G-C-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-T--TCAAACGT--CTAT--ATA--AA-----T--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA---T-G-ATAA---------TGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACCAAGACTA-TG--G-T---CCA----GA-G--TTGGA-TTT--CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTT---GAAT-C-ATT---C-T-CT-GT--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TCTA-T-G-----AC-A--A----TGGA-AAAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA-----T---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-ATAACCT-AAA--ATTAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---TA-T--TTCAC-T-GC--------A---A-TGAATA---------TACAT--ACATG-T--AATGCA-TG-AC-TAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAA----TTG--ACAATAAC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---TA--------ATATT-TGCGAAT-CT--------A--AAAA-T-T-CTA----AT---T--ACCC------------CCCC--CCCC----CCAA--------CTTTTCTTT---AT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TT-------------CTTTAGAA-TTGAA--TT-TGGTAAAAG-CTGG-TGG--CT-------A----AGG--TTT----C-ATGAAA-T-GC-AT-TA--T-C------GTG-TA-T-TGT-T-TTTAATT--CTTTGGA-AATTCTT--A--C--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-TGTGGAAG-T-ACAA----CTTGACA-TATGC-----AAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--T-T-TAT-AGTA-TGATG-CT--T-ACC-A--CAGTGT-A---G-------TAGC--GAC-TG--TAAAATCT-TG----CATTCCT----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAGTTCAAAGCAGA----GATA-----TACA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--AC-TGGCTGTCTG-TTGGGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-C-TGACC----C---TTTGG-A-AAAA-T--AAA-AGTAA-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGATT-TTGATA---TCTA--------GT--GCA--T--CTAC-AT--------TGT----TATTCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCCTGAAATAATTTTAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
gi|4 : -TCACACGT--TCAT--ATAT-AACATGAT--AACAACCTATAACTCTG--TA--AGAT--GAAATT--AGTCAATATA-AA---TCCTAA-A-T-GAATAATAGATAGCATTAA----TACT-GA--C-A-C-------AGCCA-GC--A--GTAAT----GGATATCAT-------A--G-AAACTATACAGCTACATCAAATG--TTAACAG--CTGAGACAGACTA-TGTCCGTTACCCATAATGA----TTGGA--TTT-CAGG--C-CC---ACGCACAT-ATGTTTTT--GAATAC-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTTGC-ATC-ACA-A-TT-A-TGG-----AC-AACA----TGGA-AGAC--A--GG--CAATTCT---GT-GTTGTTT-G-C-AAAACAGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA----GGTACCAAT-A-AACCT--AA--AATAAAT---C-AAAGTA--TCGG---T--ATTAA-CA---ATGAT-TTC--AC-AAGTG-TTA-AT-A--TTCACTT-GCTAATAGCAA---ATTTAC-A---------TACATACACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAAATACATGG--ACAC---ATGAT-TGATTAG-TA-AAATTACTAG-T-AA-----T---A-----------------------ATT---TTCCTTATCA-CCG--T-ATAAATATCTG-GGCAG-CTTCA---CTTAATAATTATATACTACGAACACT-------GA--AAAA-T-TACTACGGTACATTT--ACCCCCCCCCCCCCGCCCCC--CCCATCATC-----------TTTTTCTTT---TT----CTTTACCAACGCAGATGTATTT-----------T
gi|4 : tacgtATTATTTGAATCATGCGGT-A----T--T-TGG--ATTA-----A----AGGGTTTT----G-AT-AAAAT-GC-AT-TA--TAC-----AGTGATATT--GTAGGTTTAA-TTTCTTTGGATAA-TCTTACACTC--TCTATTTTGTTACTTCAG--TATT-TGAAAGTT-ACAA----GT--ACATTATGGTTAAGAAATA---AC-TA---ACCAGTCAAACTAAA-TGGTC-AC--T-T-T---AGTACTGATG-TCTAT-ACCAA--CA-TGT-AGCTGTTTC---TAGCGAGAC-TGT-T-AAATCT-TGCTCTCA-TCCC-----ATCT-T-----GAACCCTC-GGCATCCTATA----------TT----CAGGTGAG-AAG-GAAG---ACA-CAGC----GC-T-----CACAGAGTCTCATGTCA------AG-GTGGGAAATCAAC-T-CCTGTAAG-GT-GTTAAA-TT-TT-------TCTATTTTTA----CTCCAAC-CTCT-CATGACCGGA-CCGGTTTAG-ATAAAATT--AAACAGC-AACGTGATG-A-AGCTCAGT-------TGATT-TTGATACCTTCTATATTATCTGTCGACACTT--CTTC-AT---GAGGATGTTACGTA-TCATAT-TACC-TA-C-TCT-CC-T--ATTAGCC-------CTTTACA----ACTAATCTGACACACTAA------TGG--AC--ATTA-ATTC-TTACCTTTAGTAAAA--TTAATGTGGA-TAA-TATACATGCATTAATGTG----AGAATCGCAATTTtgttaacgtcaaacgccaggtaaatgtttaaagtgagattatttgaatcatgcggtatttggattaaagggttttgataaaatgcattatacagtgatattgtaggtttaatttctttggataatcttacactctctattttgttacttcagtatttgaaagttacaagtacattatggttaagaaataactaaccagtcaaactaaatggtcactttagtactgatgtctataccaacatgtagctgtttctagcgagactgttaaatcttgctctcatcccatcttgaaccctcggcatcctatattcaggtgagaaggaagacacagcgctcacagagtctcatgtcaaggtgggaaatcaactcctgtaaggtgttaaatttttctatttttactccaacctctcatgaccggaccggtttagataaaattaaacagcaacgtgatgaagctcagttgattttgataccttctatattatctgtcgacacttcttcatgaggatgttacgtatcatattacctactctcctattagccctttacaactaatctgacacactaatggacattaattcttacctttagtaaaattaatgtggataatatacatgcattaatgtgagaatcgcaattt
gi|5 : tacgttcacacgttcatatataacatgataacaacctataactctgtaagatgaaattagtcaatataaatcctaaatgaataatagatagcattaatactgacacagccagcagtaatggatatcatagaaactatacagctacatcaaatgttaacagctgagacagactatgtccgttacccataatgattggatttcaggcccacgcacatatgtttttgaatacatttctctgcttgtcctttgcatcacaattatggacaacatggaagacaggcaattctgtgttgtttgcaaaacagatttttcaggccacttcagcaggtaccaataaacctaaaataaatcaaagtatcggtattaacaatgatttcacaagtgttaatattcacttgctaatagcaaatttacatacatacacatgtaatacatgtacttaaaagaaaatacatggacacatgattgattagtaaaattactagtaataattttccttatcaccgtataaatatctgggcagcttcacttaataattatatactacgaacactgaaaaattactacggtacatttacccccccccccccgccccccccatcatctttttctttttctttaccaacgcagatgtatttttgttaacgtcaaacgccaggtaaatgtttaaagtgagCAAC-CAAA---GGTT-ACATGTA-ATAA----TAG-A---AA----CAA--TT-A-TTAT-CAG-------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGGT-CTTCAAGA-GGG-----GTAT--C--------ACCATAG---A-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACA--GCCATG--C-AAA---T-AATG----CCTGAT----AAC---CACT--AACAG-TTTTCAT-GAAAT---G-C--ATTGAA----TC------------TTCTGAAA---ATA-TACTA---AAAG----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ATT----TTTTCAT-G--AAATAATAC----GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GATATT-A----A--------------GGAC-TT--GA-CCAAAAAAA---AA-AA--AT-T----------------------------ACCC--------------------------------------AAAAAAACC----A-A-AAAC-------TAAAA----TT--GGGAAGATAAAG-----------G-C--ACTT-----GAAA--GCC-ATG-A--CA-GT-GGTTATGTA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AG--AA--ATA---ATA---A--TG--AGAT--GA--TT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA---------TGA-----CA-T-GA--T-G----------A-CA-G------G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC--T-CA----CATGGAATG--TT--CAG-----ATAAAGACTA-TG--GGG---TCA----GA-G--TTGGA-TTTTTCAGA--C-CA---GC---CAT-ATATTTT----GAT-C-ATT--TT-TTCT-GC--TTG-TTACCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-A-----A-----A----TGGA-AGACC-A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-G-CAA--AGAT---TTTTCA--TGGCAC--TCA--G---T--TGTAGC-AT----ACCT------AAT--AT--GC--AA-TA--C--G---T--ATT-A-GA---ATG-T-TTC--AC--AGTGTT---AT-T--TTT-C-T-GC--------A---ATTG-A-A---------TAC-----TCTG-T----TACA-TGGTCTTTA-A---GAA--ACAT-G--A-AC----TAAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAA--AGT---AAAAATTGTTG-A--GAT-AC-AGA-T---TTC---A--A-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT------C---------ATA-TCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTG----A----T--------------------TA--CCCA----------------TTTTTCTTT---TT----ATCTTCC------AGTGT-TTTTATTTAAGTGGTA-------------CTTTATAATTTG-A--AT-T-GT-AAAGTT--GTTGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-TAA---G--AT-T---T-C-----A-TGCTATG-TGTAT-
gi|6 : ttCAAC-CAAA---GGTT-ACATGTA-ATAA----TAG-A---AA----CAA--TT-A-TTAT-CAG-------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGGT-CTTCAAGA-GGG-----GTAT--C--------ACCATAG---A-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACA--GCCATG--C-AAA---T-AATG----CCTGAT----AAC---CACT--AACAG-TTTTCAT-GAAAT---G-C--ATTGAA----TC------------TTCTGAAA---ATA-TACTA---AAAG----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ATT----TTTTCAT-G--AAATAATAC----GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GATATT-A----A--------------GGAC-TT--GA-CCAAAAAAA---AA-AA--AT-T----------------------------ACCC--------------------------------------AAAAAAACC----A-A-AAAC-------TAAAA----TT--GGGAAGATAAAG-----------G-C--ACTT-----GAAA--GCC-ATG-A--CA-GT-GGTTATGTA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AG--AA--ATA---ATA---A--TG--AGAT--GA--TT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA---------TGA-----CA-T-GA--T-G----------A-CA-G------G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC--T-CA----CATGGAATG--TT--CAG-----ATAAAGACTA-TG--GGG---TCA----GA-G--TTGGA-TTTTTCAGA--C-CA---GC---CAT-ATATTTT----GAT-C-ATT--TT-TTCT-GC--TTG-TTACCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-A-----A-----A----TGGA-AGACC-A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-G-CAA--AGAT---TTTTCA--TGGCAC--TCA--G---T--TGTAGC-AT----ACCT------AAT--AT--GC--AA-TA--C--G---T--ATT-A-GA---ATG-T-TTC--AC--AGTGTT---AT-T--TTT-C-T-GC--------A---ATTG-A-A---------TAC-----TCTG-T----TACA-TGGTCTTTA-A---GAA--ACAT-G--A-AC----TAAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAA--AGT---AAAAATTGTTG-A--GAT-AC-AGA-T---TTC---A--A-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT------C---------ATA-TCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTG----A----T--------------------TA--CCCA----------------TTTTTCTTT---TT----ATCTTCC------AGTGT-TTTTATTTAAGTGGTA-------------CTTTATAATTTG-A--AT-T-GT-AAAGTT--GTTGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-TAA---G--AT-T---T-C-----A-TGCTATG-TGTAT-
gi|7 : ttTATTACAAC-CAAC---AGGTTACATGTAC-TAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-AACCAT-C---------TAGAAGATCA-TAACTA-TGGACCTTCAAGATGGG------TATGTC--------ACCATAAAAAA-GA-C--AG----AT-ATGGATAACACAAAGCCATG--CCA-----T-TATA----C-TGAT----AACATGCACT--AAAAG-TTTTCATAGAAA----G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---AGA-TA-TA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--AA----GTT-----TTAC-TTTATTAATA---TTTCAAT-G--AA----TATAAG-GGATT--------T--AAT-----AAT----GATTTCT---------GAGATT-AGAAAAA-------------GGACGCTCTGAACCAAAAAAA--TAT-ATTTATACAC-------AAA-AA---CATACCCA-CATCCC----CCACCTAACTTCCCGC-CCCACCCAAAA----AAAAAAAACCC---C-A-AAACAAATAAATAAAAAAAATT--GGAAAGATAAAG-----------GTCCCACTT-----GAAA--GGC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TA-TCAAACGT--CTAT---TA--AA----AT--AA--ACC---AATTA-A--TGAAAGATTGGAAATT--AGGAAA---ACAG---TCC-CA-G-T-G-AT-A--------ATGAA----CA-T-GA--T-GCC-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----CC-------A--TAAAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--AC-AAGACTA-T---GGT---CCA----GATG--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CATAATGTTTTT--GAAT-CAATT--TC-G-CTCGC--TTG-T--TCTTT-C-A-C-AC--A-TC-A-T-G-----ACAA--A----TGGA-AGAC--AATGGCCCATTTCT---TT-GT--TTTGG-C-AAA--AGAT---
gi|8 : aTTAA-AAGGAAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TAGAAA-TACTAGAT-AAAC-AGT---AAAAA--TGTG-GACAA--AC-AGATT---TT----A-CA-CCACTT-AT-AATATCTTTGG--A-CT--A---T---------CTAT-CTGCGAAT-CT-------AA--AAAT-T-T-CTA----A----TTAACCC------------ACCC--CCCAAAA-C----------------CCCC---AA----ACTCACCAA---GAATGT-TTT-----------TATTTAACGTGGTAACTTTATAATTTGAG--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------ATTAAAGGGTCTT----CCAT-AAA-T-GC--T-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGT-T-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TATT--ACTTCTTCTTTTTTTTTT----AA--TA-TGTGGAAG-T-ACA-----GT--ACA-TAT-TACAG-AAAT----AC-TATCAA-AAGT-AAA-TAAA-TTGTCCAC--T-T-TA--GTTA-TGA-G-C---TTACC-A--CA-TGTTA--TGCA-----TAGC--AAC--G--A-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCCCT-----AACCCTGA-GACA---AA-AG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAA--------CAGA----AA---------CA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAAATTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-TTCAGAACC----C---TTTTGCA-AAAA-T--AAA-AGC-AC----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-CTGATA---TCTA--------GT--GCA-TC--CTAC-AT---G----TA-----TA-TCATAT-TACC-TACCATCTACC-T--ATTACCCTAAATA-ATTCTAA----ACT--------------A------TGGGAAC--ATT--ATTCTT-----------AAATTT-------AATTAATTTTACA--CA-T-ATGT------GAAT-GCAATTT
gi|9 : GAAGACAAAG-----------G-CCCACTTACTTGGAAA--GGC-CTGGA--CAAGT-G-TTAT-TA-TCAAACGTGTCTAT--ATATTAAGT--AT--AA--ACC---AAC---A--TG--A-AT--GAAATTT-AGGACA---A-AA---TCC-AA-AAT-GGATA----------TGAA----CA-T-GA--T-G-CCACCAAAGG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------ACAT-AAAC-AT-CAA---CATGGAATG--T---CAG--T--ACAA-TACAA-TG--GCT---CCT----G-----TTGGA-TTCT-CAAGAGCGTAAGTGC---CAT-ATATTTTT---AAT-C-ATT--TCCT-CT-GA--CTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGACGAG--GG--CATTTCT---TT-A---TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCATTTGCCAT-TTC---GCACT--TGTACCCAT-T-AACCT-ACACGAGTAAAT--GCAAAA-TA--T-AGGTTT--TTT-A-CA---ATGA--TTC-GAC-AAGTG-T---TA-T--TTCACTT-GC--------A---ATAGGC-A---------GACTT--ACTTA-A--AATACA-TG-------------AA--ACA------------ATGATCTG-TTAA-TA-AAA-TACTAG-T-AATC-AGT---AAAAA--ATTGTGATGAT-AC-TGATT---TTC---ACCACCCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---T---------AT-TCCTGCAAAT-GT-------CATCACAATT-T-CTA----AT---T--ACCC------------CCCC--CCC
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): CCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCCATCTTTTATTTTTCATTTTGCGTGCGTTCATCGTTCAGTTAGCGTTTTCTATATTTCAGTGAACGTCTAGTTAAGGAATTGGGGTAAAATTATCGGTAATCATCGGTGAGTTCTCGGGAGTTTCCGGAATAAAATGCTTTTACAATCCAGAGTGCTATCGTAG
Unaligned ( gi|18 ): GGCTTTTTGTGAAAAAATTAATGGGCCTTATTTTTATGAACGAAAGTCTTCTTAAATGAGGGCTATTTTAAGATATATACGGATTTTGCATTCAGACAAGTGGTATGGGTAACTATAAAAAAATAATCTGTATTCACCCTAAAGGTAACATGTATATAAACAAA
Unaligned ( gi|19 ): TTGAGTGACTTTTGTGAAAAATAAGCCTTTATAGGGCAAAATTCTTTAAAAAAAGGGCTATTTTAAGATATTTTAGGAATATTTCAGACAAAAAATAAGGGGTAGAAATTCCTAATTTAACCCCCCAAGAAATTAATCTTACTTACTACAGATACATAAA
Unaligned ( gi|20 ): GCTTTCAAGTGACTTTTGTGCAAATAAGGGCCTTTTTCTAGGGCAAAATTCTTAAAAAATAAGGGCTATTTTTACGGATATTTTAGGAATTTTCAGGCAAAAATAAGGGTAAACTTCCTAATTAATCCCCAATGAATTAATTTGTACTTACCAAACAGGT
Unaligned ( gi|21 ): GCTTTCAAGTGACTATTTGTGAAAAATAAGGGCCTTTTTCAGGGCTAAAATCTTAAATAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAAGATTTTTCAAACAAAAAGTAGGGGTAAAACTTCCTTATAAATACT
Unaligned ( gi|22 ): GGACTTTTCAAGAAAATAAGGGCTTTTTTAGGGCAAAATTCTTTAAAACTAAGTGGCTATTAGATTTATTTAGGGATTTTTCAAGCAAAAATAAGGGTGTAAAAATCCTTCTCAATAAAGTTACAAAAAA
Unaligned ( gi|23 ): TCTTCAAGTGACTTTTTAAATGAAAAATAAGGACTTTTTAGGGCAAAATGTTCCTTATAAGGATAGGGTATTTTATGATATTTTGAGATATATTCAAAGCAAAATAGGAGGTCAAAACTTTCAAA
Unaligned ( gi|24 ): AGGGTGACTTTTTTATGAAAAATGAGGGCCTTTTTATGGCAAAATTCTTCATAAAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAGAATTG
Unaligned ( gi|25 ): GTGACTTTTTATGAAAAATGAGGGCCTTTTTATGGCAAAATTCTTCATAAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAGAATTGT
Unaligned ( gi|26 ): TTTGGAAATTAGATAAGGAATATAAGGGCCTCTGACAAAATGTAAGGAAAATAAGGGCCC
Unaligned ( gi|27 ): GCTTTCAAGTGACCTTTTTATGAAAAATAAGGGCCTTTTAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111 1111 22222222 22 22222222222222222222 1111 1 111111 1111 1 1111 1111 2222222222 111 2222222222222222222222222 11111 11 11111111 11111 111111111 3333333333333333333 11 222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 22222222 2222222 11111111111 11111 11 1111 1111 444444444 111111111111 1111111 11111 1111 111 11 11111 11111 111 111 111111 11 222222222 11111111 222222222 1111 11111 111 1111 11 111 444444444444444 11 1 4444444444444444 11 22222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111111 111111 88888888888888888888888888 111111 222222222222 1111 111 11 111 1111111 1 111 1 111 1111 111 1111 1 11 1111 111111 1 1 22222222222 222 11 33333333333 1111 1111 1111111 11111 11 111 1111 111 111 222222222222222 111111 11111 11 1 1 1111111 1111 1111 111111 1111 22222222 1 111 3333333 222 22222222 1 111 22222222 111 11111 33333333 1111 1 1 555555555555555555555555555555555555555555 111111 11 222222222222222222222222 1 11 1 22222 1
lowQualScore : 5 888 2 0 2 3333 5 888 0000 88 5 5 5 88888888 0 5 5 66 5 66666666666666666666 66 5 5 66 0000 5 0 5 5 66 4 222222 0000 0 0000 888 66 0 5 0 3 888 5 66 0000 3333333333 3 888 55 777 8 9999 66 9999999999999999999999999 11111 4 9999 9999 4 66 22 1 4 4 4 66666666 66 4 11111 9999 777777777 1 5 2222222222222222222 5 00 5 222 5 77 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 22222222 3333333 1 7 66 99999999999 4 00000 55 9 4 8 66 4 8 8 8 55 55 55 33 4444 55 55 777 3333 55 55 55 0 99 777 4 777 4 666 4 8 111111111 99999 4 4 99 4 777777777777 4 999999 55 8888 8888 3333333 55 4 44 4 8888 55 55 88888 2 4 55 777 2222 7777 4 8 99 4 777 777 4 111 4 4 55 4 8 4 55 4 11 4 4 4 4 4 4 4 8 4 00000 8888888888 4 55555 55 777 4 55 4 111 55 777 66 66 66 777777 4 333 888888 1 66 99 8 99999 777 66 8 4 777 1 4 66 66 8 222222222 1 8 4 66666666 777 3 8 000000000 0000 0 22222 5 99 4 555 66 4 66 3 2222 5 5 5 44 5 5 5 111 888 111111111111111 5 3 888 888 22 5 66 0 5 5 66 5 1111111111111111 11 5 44444444 66 5 5 5 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888 777777777 999999 5 44444444444444444444444444 5 5 99999 4 5 0 777777 77 999999999999 4 2222 5 5 666 00 5 000 5 9999999 5 5 777 6 99 6 3 99 000 4444 99 333 2 6 6 4444 99 5 0 88 5555 5 666666 0 5 5 0 5 22222222222 5 5 222 5 5 33 5 5 77777777777 999 5 4444 3 5 0000 5 4444444 5 22222 33 5 5 888 777 5 0000 66 3 5 555 999 5 666666666666666 888 77 444444 5 77777 11 5 5 0 0 88 6666666 0000 2222 111111 5 6666 66666666 7 5 5 5 222 5 5555555 555 5 33333333 1 5 000 00000000 444 00000 5 33333333 2222 5 5 4 5 1 5 1 77 555555555555555555555555555555555555555555 777777 33 5 888888888888888888888888 1 888 33 0 3 77777 0
lowQualScore : . ... . . . .... . ... .... .. . . . ........ . . . .. . .................... .. . . .. .... . . . . .. . ...... .... . .... ... .. . . . . ... . .. .... .......... . ... .. ... . .... .. ......................... ..... . .... .... . .. .. . . . . ........ .. . ..... .... ......... . . ................... . .. . ... . .. ....................................................................... . ........ ....... . . .. ........... . ..... .. . . . .. . . . . .. .. .. .. .... .. .. ... .... .. .. .. . .. ... . ... . ... . . ......... ..... . . .. . ............ . ...... .. .... .... ....... .. . .. . .... .. .. ..... . . .. ... .... .... . . .. . ... ... . ... . . .. . . . .. . .. . . . . . . . . . ..... .......... . ..... .. ... . .. . ... .. ... .. .. .. ...... . ... ...... . .. .. . ..... ... .. . . ... . . .. .. . ......... . . . ........ ... . . ......... .... . ..... . .. . ... .. . .. . .... . . . .. . . . ... ... ............... . . ... ... .. . .. . . . .. . ................ .. . ........ .. . . . ....................................................... ......... ...... . .......................... . . ..... . . . ...... .. ............ . .... . . ... .. . ... . ....... . . ... . .. . . .. ... .... .. ... . . . .... .. . . .. .... . ...... . . . . . ........... . . ... . . .. . . ........... ... . .... . . .... . ....... . ..... .. . . ... ... . .... .. . . ... ... . ............... ... .. ...... . ..... .. . . . . .. ....... .... .... ...... . .... ........ . . . . ... . ....... ... . ........ . . ... ........ ... ..... . ........ .... . . . . . . . .. .......................................... ...... .. . ........................ . ... .. . . ..... .
lowQualScore : 0 888 5 0 5 2222 0 888 2222 22 0 0 0 11111111 4 0 0 99 1 00000000000000000000 88 0 0 99 6666 0 0 0 1 99 5 999999 6666 0 6666 888 99 1 0 1 2 888 0 99 6666 2222222222 1 888 99 888 9 4444 44 8888888888888888888888888 11111 4 4444 7777 4 11 22 9 8 4 4 11111111 11 4 11111 4444 888888888 7 0 4444444444444444444 0 66 0 444 0 99 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 66666666 1111111 9 2 11 00000000000 0 00000 55 7 4 9 11 4 9 9 9 00 55 55 55 0000 55 55 000 9999 55 55 55 8 55 000 0 000 0 222 0 0 666666666 33333 0 0 55 0 111111111111 0 333333 55 5555 5555 0000000 55 0 88 0 6666 55 55 22222 3 0 55 000 5555 0000 0 0 55 0 000 000 0 222 0 0 55 0 0 0 55 0 00 0 0 0 0 0 0 0 0 0 00000 8888888888 0 55555 55 000 0 55 0 000 55 000 11 33 11 333333 6 777 777777 9 11 00 9 66666 888 11 9 4 888 9 4 11 33 9 333333333 9 9 4 11111111 888 6 9 000000000 4444 2 66666 0 88 4 666 11 4 11 9 0000 0 0 0 44 0 0 0 000 888 000000000000000 0 2 888 888 55 0 99 0 0 0 99 0 9999999999999999 66 0 44444444 99 0 0 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 999999999 444444 7 77777777777777777777777777 0 0 77777 3 7 1 444444 99 666666666666 3 1111 7 7 444 00 0 111 0 1111111 0 0 555 7 22 7 3 22 222 2222 22 555 5 7 7 2222 22 0 4 44 6666 0 555555 0 0 0 0 0 22222222222 0 0 555 0 0 88 0 0 88888888888 444 0 4444 2 0 6666 0 2222222 0 55555 88 1 0 888 555 0 6666 99 2 0 666 444 0 000000000000000 888 22 444444 0 55555 99 0 0 0 0 22 2222222 6666 1111 000000 7 3333 77777777 1 7 7 7 999 7 0000000 000 7 66666666 4 7 000 77777777 444 66666 7 66666666 1111 7 7 3 7 4 7 4 99 333333333333333333333333333333333333333333 999999 66 7 777777777777777777777777 4 666 88 0 2 22222 0
consensus : TATTACAAC-CAAC---GGGT-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--CTTCAAGATGGG-----GTAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---ATA-TACTA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GAGATT-A----AA-------------GGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--TAA-AA--AT-CTC-------AAA-A----CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCC---A-ACAAACAAA----TAAAAAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--GNC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA--------ATGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT-AAA--AATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAAA--GTTG-AACGAT-AC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---C---------ATATTCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---NT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-AAA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGTAT-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACTC--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-T-ACAA----GT--ACA-TATGTACAGGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--T-T-TA--AGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-A--TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAG--CAAA-CAGA----GA-A-----CACA---TCTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGC-A-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT--GCA-TT--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------ATTTNAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
Reference ( family-2636 ) : TATTACAAC-CAAC---GGGT-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--CTTCAAGATGGG-----GTAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---ATA-TACTA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GAGATT-A----AA-------------GGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--TAA-AA--AT-CTC-------AAA-A----CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCC---A-ACAAACAAA----TAAAAAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--GNC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA--------ATGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT-AAA--AATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAAA--GTTG-AACGAT-AC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---C---------ATATTCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---NT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-AAA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGTAT-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACTC--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-T-ACAA----GT--ACA-TATGTACAGGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--T-T-TA--AGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-A--TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAG--CAAA-CAGA----GA-A-----CACA---TCTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGC-A-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT--GCA-TT--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------ATTTNAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
gi|1 : TATTACAACACAACCAAGAGTAACATGTACATAAAAACTAG-AAAGAAA-A-CAAA-TTAA-CCATACAACTTTATTTAAAACTCCA-TA-CTAGTGGA-CTTCA--GT-GA-----ATAA-TC--------ACAATAAATAA-AG-CTGAA----ATCATGG-CC-CACAAAGCCATGACCCAAAACTC-AATGCATCC-CGATAAAAAAC---CACTCAAAAAA-TCCTC--AGAAATATAG-CCAATTGAAAAACTCA---------C-TTCTGAAAAAGATAGTACAA---AA-G----TCTAA-TTAT--------------C-AATA-----GTTAAATATCAC-TT----ACTA----TTTCAT-GAAAAA--ATATAAGCGG-TTAACCTACAT--A-A-----AAT----GATTTC--------------CT-A----AA--------------GAC-CAACAA-CCCAAAAAA---AA-CA--AT-TTG-------GAG-AAGATCA-----A--ACCCCGCAACC-------------CACCCA-----------
gi|1 : aaAAAGACC---A-ACAACCCAA----AAAAAACAATTTGGAGAAGATCAAACCCCGCAACCCA-CCCATTC-----GAAAATGCA-CTG-AACTG-GTCG-ATAT-TACTCAAA-GT--CAATTAATAC-AA----ATTAAA--ACC---AAT---AAATG--AGAT--GAAATCTAAGACAA---A-AAACTTCC-AAAG-TAG-AAAATTCACA--ATGAAAAAACA-T-GAA-T-G-C-------AAACAAGCCAA--G--ACTCGAAGA----ACGATAACAA--C-AAAT-AC-AAG---CATGGAATGCATT--CAAGAT--ACAAAGACTAATG--GGT---CCAA---GA-GGCTTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC----AT-CTGCTTTT--GAAT-C-CTTCTTC-T-CT-GCCATTGAT--CCTTT-CCA-CCACAGA-TC-GCT-GCACCAAC-A--GCCCCTGGAGAAAC--AA-GG--CATTTCTAAATG-AT--TTT-GACGAAA--ACATACATCTTCA--GGCCACATTCAAAGCA-TCATGTACCAATAA-AACCT-AAA--ATTAAACTAGC-CAA-TAATT-AG---GAAATTAA-CAAATATAATATTC-CAC-AAA-G-TTCGATAC--TTCAC-TAGC--------AACCATTGAA-ACAATAAATTTAAAT--ACATGATCAAATACAGTGTACTTAA-A---AAA--ACAT-GGAACACCAAATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAACGAGTAACAAAAG--GTCGCAACAGT-AC-AGATTTTATTA---A-CA-CCA--TCAT-AATATCTG-GG--ACCT--AATCC---------ATA-TCTGCGAAT-CTAACACCAAA--AAAA-TAT-CTA----A----TTAACCCAA----------CCACAACCAA----CAGAAAAGAATGTTTTTATTTAACGTCGTAACTTACCAA-----------------------------------------TTATAA-TTGAA-----TGGT-AGAA-T--G-TGGAACTATTACAAA----AGGGTCTTACCCC-CT-AAA-TAGCTATATAAGT-CAAGCAAATG-TATTATGTAT-ATTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACT---TCTTTTTTTTTA----CACTTC-C-CTGAAG-T-ACAA----GT--ACACTATGTACAG--AAT----AC---------------A-T-------TC-A-------TA-----A-TGCCGTC---T-A-C-A--CA-TGT-AC-TG-------TAGC--GACTTG--A-AAATCTATG----CA-TCC------ACCC-TAAAAAAAACC-GATGACA---AATAG---AGA-C-TT----CA---GAG-AG---AAC--CAAA-GAAA----GA-ACCTACCACA---TTTC-AATCAAACCGCAA-A-----AATA-AC-T-GCTGT-TG-TTAAGAAAA-TTACTCATTATATC----GTTAATACCC---ACACT-T-CA--ATCCCATC---TTT-G-A-AAAA-TAAAAA-AGC-AC----ATGAC-AG-TC-GTGATATACTGA-C-CTACTA---CATA--------GT--GCA-ATACCTACAATAAAG----CAT----TA-TCATATATACCATACCATCT-CC-TAAATTACCC-------CTCCAAAAATTACT--------------AACTCACTGG--ACCAACTTAATTC-T-----------TAA--T-------AACTAA-ATTAttcgaaaatgcactgaactggtcgatattactcaaagtcaattaatacaaattaaaaccaataaatgagatgaaatctaagacaaaaaacttccaaagtagaaaattcacaatgaaaaaacatgaatgcaaacaagccaagactcgaagaacgataacaacaaatacaagcatggaatgcattcaagatacaaagactaatgggtccaagaggcttggattttcaggccagcatctgcttttgaatccttcttctctgccattgatcctttccaccacagatcgctgcaccaacagcccctggagaaacaaggcatttctaaatgattttgacgaaaacatacatcttcaggccacattcaaagcatcatgtaccaataaaacctaaaattaaactagccaataattaggaaattaacaaatataatattccacaaagttcgatacttcactagcaaccattgaaacaataaatttaaatacatgatcaaatacagtgtacttaaaaaaacatggaacaccaaatgattgttagtaaaatactagtaaacgagtaacaaaaggtcgcaacagtacagattttattaacaccatcataatatctgggacctaatccatatctgcgaatctaacaccaaaaaaatatctaattaacccaaccacaaccaacagaaaagaatgtttttatttaacgtcgtaacttaccaattataattgaatggtagaatgtggaactattacaaaagggtcttaccccctaaatagctatataagtcaagcaaatgtattatgtatattaatctttggaaatcttacttctttttttttacacttccctgaagtacaagtacactatgtacagaatacattcataatgccgtctacacatgtactgtagcgacttgaaaatctatgcatccaccctaaaaaaaaccgatgacaaatagagacttcagagagaaccaaagaaagaacctaccacatttcaatcaaaccgcaaaaataactgctgttgttaagaaaattactcattatatcgttaatacccacacttcaatcccatctttgaaaaataaaaaagcacatgacagtcgtgatatactgacctactacatagtgcaatacctacaataaagcattatcatatataccataccatctcctaaattacccctccaaaaattactaactcactggaccaacttaattcttaataactaaattaata
gi|10 : aatattacaacacaaccaagagtaacatgtacataaaaactagaaagaaaacaaattaaccatacaactttatttaaaactccatactagtggacttcagtgaataatcacaataaataaagctgaaatcatggcccacaaagccatgacccaaaactcaatgcatcccgataaaaaaccactcaaaaaatcctcagaaatatagccaattgaaaaactcacttctgaaaaagatagtacaaaagtctaattatcaatagttaaatatcacttactatttcatgaaaaaatataagcggttaacctacataaaatgatttcctA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTT-CATTG--AAA--ATATAAA-GG-GT--------T--A-T-----TAT----GATTTAT---------GAGATTTA----AA-------------GGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA----A-AA--AT-CTCTAAACACAAACA----CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCACCCCTCCACCCAAAAAAAACCCGAAA-ACAAACACA----TCAAAAAA-TT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--AGCGCTGGA--CG-GTTG-TTAT-TA-TCAAACGT--ATAT--ATA--AA----AT--AA---CC---AAT---A--TG--AGAT--GAAATT--AGACAA---A-A----TCC-AA-G-T-G-ATAA--------TGGAA----CA-T-GA--TCG-C-------AG-CA-GC--ATGG--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAGGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TGGGATTTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTTTGGAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-G--CCTTT-C-A-C-ACA-ATTC-ATT-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TTGGT--TTT-GCC-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCT-T--GGAACCAAT-A-AACCTAAAA--AATAAAT--GC-AAATTA--T-GG---T--ATT-ACCA---ATGAT-TTC-AACAAAGT--T---GT-TACTTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-ata
gi|11 : AC-CAAC---AGGT------TACATAAAA--TAC-C---ATATA-CAAA-TT-A-CCAC-CA--------TAGAAGATCA-TA-CAAATG-----TCAACACGGGTTTCAGTAT-TTCAAAGGTAACCATAAGAAATGATC--TGTTGTGT-ATGGTTA-CACAAATCCATG--TTGAA-----AATG----C-TGAT----A--------------------CCATAG-CAT---G-C--ATTGAT----TCAACACAAACCCTATCTGAAA---GTA-TACTATATAA-GTTGATTTGACATACTTTTTGACTTTTAGC-A--AGTGAAGTC-----TTAC-TT----ACGAATTTTTTTTT-G--TAA--A-ATTAG-GA-TT--------TTCA-TGGGAAAATAAGGGATTTTTAGGAATTTGGAGCTT-A----AATAAGGAAAAATAAGGGC-CTCTGA-CAAAAAAAA--TAA-ta
gi|11 : ctttcaagtgactttttgtgaaaaataagggccttttttagggcaaaattcttaaagaatgagggctatttttaggatattttaggaatttcaggcaaaataagggtaaaaaaacttcctaattaaacccccaatgaattaatttgtacttAAAAATT--AGGAAAATAAGG-----------G-CCCGCTT-----GAAA--Gggaaaaattaggaaaataagggcccgcttgaaagc
gi|12 : ctttcaagtgactttttgtgaaaaataagggccttttttagggcaaaattcttaaagaatgagggctatttttaggatattttaggaatttcaggcaaaataagggtaaaaaaacttcctaattaaacccccaatgaattaatttgtacttaccaacaggttacataaaataccatatacaaattaccaccatagaagatcatacaaatgtcaacacgggtttcagtatttcaaaggtaaccataagaaatgatctgttgtgtatggttacacaaatccatgttgaaaatgctgataccatagcatgcattgattcaacacaaaccctatctgaaagtatactatataagttgatttgacatactttttgacttttagcaagtgaagtcttacttacgaatttttttttgtaaaattaggattttcatgggaaaataagggatttttaggaatttggagcttaaataaggaaaaataagggcctctgacaaaaaaaataaggAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-ACCACTT-----GAAA--G-C-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TG-TCAAACGT--CTAT--ATA--CA----AT--AA--ACC---AAT---A--TG--AGAT--GAAATT--AGACAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA---------TGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-AA--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-TAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAA-GACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGCTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACG-A-TC-A-T-G-----AA-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCTT-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT--AA--AATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-TA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTT-T----T-C--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAATA---------TACAT--ACATG-A--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACc
gi|13 : A-TATGTACAG--ACT----AC-TA---A--AGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--TATGTA--AGTA-TGATG-C---T-TCC-AAACA-TGT-A--TG-------TAG---AAC-TG--T-A---TT-TG----CA-TC-T----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAGGAGAGACC-TT----CAG--G-G-AG---AAG--GAAA-CAG-----GA-A-----AACA---TTTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GTTGTCTGTTT-GGCAA---TATT-------TC----TTTA----CC---A---T-T---TGAAC----T---TTG-G-A-AAAA-T---AA-AGC-C-----ATG---AG-TCAG--------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT----A-TT--CTAA-AT--------TAT----TA-TCATAT-TA-C-TA-CATCT-CTAT--ACCACTT-------ATTTGA-------T--------------A------TGG------ATT--ATTC-T-----------ATA--T-------AA-T---TTTAC
gi|14 : A-TATGTACAG--ACT----AC-TA---A--AGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--TATGTA--AGTA-TGATG-C---T-TCC-AAACA-TGT-A--TG-------TAG---AAC-TG--T-A---TT-TG----CA-TC-T----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAGGAGAGACC-TT----CAG--G-G-AG---AAG--GAAA-CAG-----GA-A-----AACA---TTTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GTTGTCTGTTT-GGCAA---TATT-------TC----TTTA----CC---A---T-T---TGAAC----T---TTG-G-A-AAAA-T---AA-AGC-C-----ATG---AG-TCAG--------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT----A-TT--CTAA-AT--------TAT----TA-TCATAT-TA-C-TA-CATCT-CTAT--ACCACTT-------ATTTGA-------T--------------A------TGG------ATT--ATTC-T-----------ATA--T-------AA-T---TTTACtaaggta
gi|15 : -TA--T-CG----AGTG-TATT-TGT---TTTA--T--CTTTG-A-AA-TCTT--ACTC--TC---TTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-TAACAA----GT--ACAGTATGTACATGAAATTGAAACTTA---A-CAGTCAAA-TAAATT-GTC-ACAGT-C-TATTAGTA-TGATT-CAAGT-ACT-A--CA-C-T-A--TGGTTATATTAGC--GAA-TGATT-AAAGAT-T------A-TCTTAGGCAATCT-T-----AAATC-GA-GAGC---CCT------GACCATTACCACGC--GAGCAGGCAAAG--CAGA-GAGATCGCGA-G-----CACG----CT----TCA------AGTGT----AGT--AC-T-GCTGTCGG-TG-GTCAAA-TTATT-------TC----TTtaaggta
gi|16 : TATTACA-C-CAAC---AGGT-A-ACGTACATAAAA--TTG-A---AAA-AACAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAG-TCAATA-CTAGTGGA-CTTCAAGATGGG------T-T-TC--------ACC-TAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---TTAATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAATTTTTCCTA-AAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAAG--AT--CACT----AA-G----TCTAA-ATAT--------------CAA--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTTTCAT-G---AA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTTT---------GAGAT
gi|2 : TATTACAAC-CAAC---AG-T-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGA--CTTCAAGATGGG-----ATAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATG--TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAAG--ATA-CGTCA---AA-G----TCTAA--T-C--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ATTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GAGCTT-A----AA-------------GGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--TAA-AA--AT-CTCC------AAACA----CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCC---ATACAAACCAA----TAAAAAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAA---GTC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-AT-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--T---AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA--------ATGAA----CA-TCGAATT-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA-----C-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG-----ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGGC-C-CA---GC---CAT-ATGTATTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AAAC--A--GG--CA-TTCT---TT-GT--TTT-G-CAAAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCA---A-AACCT-AAA--TATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTCAAAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATGCA-TGTACTTAATAAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAGTTA-AAA-TACTAG-TAAAAC-AGT---AAAA----TTG-AACAATAACAAGATT---TTC---A-CA-CCA--TAAT-AATATCTG-GG--A-CT--A---T---------ATATTCTGCGAAT-CT--------A--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---AT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGG--TTT----C-AT-AGA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGT-T-TTTAA-T--CTTTGGA-AATTCTT--ACTC--TTTTTTTTTTTA----AA--TA-T-T-GAAG-T-ACAAACTTGT--ACA-TATGTACAAGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--A-T-TA--TGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-AT-TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAGTTCAAA-CAGA----GA-A-----TACA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--ACTT-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGTAA-----ATGACAAG-TCAGT-------T-A-TGTTGATA---TCTA--------GT--GCA-TC--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------CTTTAAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAATCAGAAT-GCAATTTaa
gi|3 : TATTACAAC-CAAC---AGGT-ACATGT-CATAAA---TAGGA---AAA-A-CAAAATT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--ACTCAAGATGGG------TAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAGAGCC-TG--CCAA----T-AATG----C-TGAT----GAC---CACT--AAA-G-TTTTCATAGAAAT---GGC--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---AGA--ACTA---AC-G----TCTA---TAT----------------A--A-----GTT-----T-ACGTT----ATTA---TTTTCAT-G--AAA--A---AAA-GG-TT--------T--A-T-----AAT-----ATTTCT---------GAGCTT-A----AA-------------GGAC-CTC-GA-CCAAAAAAAAATAATAA--AT-CTC-------AAA-A----CA-----AACACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAA-CCC---ATACAAACAAA----TAAAAAAA--T--GGGAAGATAAAG-----------G-CC-ACTT-----GAAA--G-C-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-T--TCAAACGT--CTAT--ATA--AA-----T--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA---T-G-ATAA---------TGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACCAAGACTA-TG--G-T---CCA----GA-G--TTGGA-TTT--CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTT---GAAT-C-ATT---C-T-CT-GT--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TCTA-T-G-----AC-A--A----TGGA-AAAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA-----T---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-ATAACCT-AAA--ATTAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---TA-T--TTCAC-T-GC--------A---A-TGAATA---------TACAT--ACATG-T--AATGCA-TG-AC-TAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAA----TTG--ACAATAAC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---TA--------ATATT-TGCGAAT-CT--------A--AAAA-T-T-CTA----AT---T--ACCC------------CCCC--CCCC----CCAA--------CTTTTCTTT---AT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TT-------------CTTTAGAA-TTGAA--TT-TGGTAAAAG-CTGG-TGG--CT-------A----AGG--TTT----C-ATGAAA-T-GC-AT-TA--T-C------GTG-TA-T-TGT-T-TTTAATT--CTTTGGA-AATTCTT--A--C--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-TGTGGAAG-T-ACAA----CTTGACA-TATGC-----AAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--T-T-TAT-AGTA-TGATG-CT--T-ACC-A--CAGTGT-A---G-------TAGC--GAC-TG--TAAAATCT-TG----CATTCCT----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAGTTCAAAGCAGA----GATA-----TACA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--AC-TGGCTGTCTG-TTGGGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-C-TGACC----C---TTTGG-A-AAAA-T--AAA-AGTAA-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGATT-TTGATA---TCTA--------GT--GCA--T--CTAC-AT--------TGT----TATTCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCCTGAAATAATTTTAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
gi|4 : -TCACACGT--TCAT--ATAT-AACATGAT--AACAACCTATAACTCTG--TA--AGAT--GAAATT--AGTCAATATA-AA---TCCTAA-A-T-GAATAATAGATAGCATTAA----TACT-GA--C-A-C-------AGCCA-GC--A--GTAAT----GGATATCAT-------A--G-AAACTATACAGCTACATCAAATG--TTAACAG--CTGAGACAGACTA-TGTCCGTTACCCATAATGA----TTGGA--TTT-CAGG--C-CC---ACGCACAT-ATGTTTTT--GAATAC-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTTGC-ATC-ACA-A-TT-A-TGG-----AC-AACA----TGGA-AGAC--A--GG--CAATTCT---GT-GTTGTTT-G-C-AAAACAGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA----GGTACCAAT-A-AACCT--AA--AATAAAT---C-AAAGTA--TCGG---T--ATTAA-CA---ATGAT-TTC--AC-AAGTG-TTA-AT-A--TTCACTT-GCTAATAGCAA---ATTTAC-A---------TACATACACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAAATACATGG--ACAC---ATGAT-TGATTAG-TA-AAATTACTAG-T-AA-----T---A-----------------------ATT---TTCCTTATCA-CCG--T-ATAAATATCTG-GGCAG-CTTCA---CTTAATAATTATATACTACGAACACT-------GA--AAAA-T-TACTACGGTACATTT--ACCCCCCCCCCCCCGCCCCC--CCCATCATC-----------TTTTTCTTT---TT----CTTTACCAACGCAGATGTATTT-----------T
gi|4 : tacgtATTATTTGAATCATGCGGT-A----T--T-TGG--ATTA-----A----AGGGTTTT----G-AT-AAAAT-GC-AT-TA--TAC-----AGTGATATT--GTAGGTTTAA-TTTCTTTGGATAA-TCTTACACTC--TCTATTTTGTTACTTCAG--TATT-TGAAAGTT-ACAA----GT--ACATTATGGTTAAGAAATA---AC-TA---ACCAGTCAAACTAAA-TGGTC-AC--T-T-T---AGTACTGATG-TCTAT-ACCAA--CA-TGT-AGCTGTTTC---TAGCGAGAC-TGT-T-AAATCT-TGCTCTCA-TCCC-----ATCT-T-----GAACCCTC-GGCATCCTATA----------TT----CAGGTGAG-AAG-GAAG---ACA-CAGC----GC-T-----CACAGAGTCTCATGTCA------AG-GTGGGAAATCAAC-T-CCTGTAAG-GT-GTTAAA-TT-TT-------TCTATTTTTA----CTCCAAC-CTCT-CATGACCGGA-CCGGTTTAG-ATAAAATT--AAACAGC-AACGTGATG-A-AGCTCAGT-------TGATT-TTGATACCTTCTATATTATCTGTCGACACTT--CTTC-AT---GAGGATGTTACGTA-TCATAT-TACC-TA-C-TCT-CC-T--ATTAGCC-------CTTTACA----ACTAATCTGACACACTAA------TGG--AC--ATTA-ATTC-TTACCTTTAGTAAAA--TTAATGTGGA-TAA-TATACATGCATTAATGTG----AGAATCGCAATTTtgttaacgtcaaacgccaggtaaatgtttaaagtgagattatttgaatcatgcggtatttggattaaagggttttgataaaatgcattatacagtgatattgtaggtttaatttctttggataatcttacactctctattttgttacttcagtatttgaaagttacaagtacattatggttaagaaataactaaccagtcaaactaaatggtcactttagtactgatgtctataccaacatgtagctgtttctagcgagactgttaaatcttgctctcatcccatcttgaaccctcggcatcctatattcaggtgagaaggaagacacagcgctcacagagtctcatgtcaaggtgggaaatcaactcctgtaaggtgttaaatttttctatttttactccaacctctcatgaccggaccggtttagataaaattaaacagcaacgtgatgaagctcagttgattttgataccttctatattatctgtcgacacttcttcatgaggatgttacgtatcatattacctactctcctattagccctttacaactaatctgacacactaatggacattaattcttacctttagtaaaattaatgtggataatatacatgcattaatgtgagaatcgcaattt
gi|5 : tacgttcacacgttcatatataacatgataacaacctataactctgtaagatgaaattagtcaatataaatcctaaatgaataatagatagcattaatactgacacagccagcagtaatggatatcatagaaactatacagctacatcaaatgttaacagctgagacagactatgtccgttacccataatgattggatttcaggcccacgcacatatgtttttgaatacatttctctgcttgtcctttgcatcacaattatggacaacatggaagacaggcaattctgtgttgtttgcaaaacagatttttcaggccacttcagcaggtaccaataaacctaaaataaatcaaagtatcggtattaacaatgatttcacaagtgttaatattcacttgctaatagcaaatttacatacatacacatgtaatacatgtacttaaaagaaaatacatggacacatgattgattagtaaaattactagtaataattttccttatcaccgtataaatatctgggcagcttcacttaataattatatactacgaacactgaaaaattactacggtacatttacccccccccccccgccccccccatcatctttttctttttctttaccaacgcagatgtatttttgttaacgtcaaacgccaggtaaatgtttaaagtgagCAAC-CAAA---GGTT-ACATGTA-ATAA----TAG-A---AA----CAA--TT-A-TTAT-CAG-------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGGT-CTTCAAGA-GGG-----GTAT--C--------ACCATAG---A-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACA--GCCATG--C-AAA---T-AATG----CCTGAT----AAC---CACT--AACAG-TTTTCAT-GAAAT---G-C--ATTGAA----TC------------TTCTGAAA---ATA-TACTA---AAAG----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ATT----TTTTCAT-G--AAATAATAC----GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GATATT-A----A--------------GGAC-TT--GA-CCAAAAAAA---AA-AA--AT-T----------------------------ACCC--------------------------------------AAAAAAACC----A-A-AAAC-------TAAAA----TT--GGGAAGATAAAG-----------G-C--ACTT-----GAAA--GCC-ATG-A--CA-GT-GGTTATGTA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AG--AA--ATA---ATA---A--TG--AGAT--GA--TT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA---------TGA-----CA-T-GA--T-G----------A-CA-G------G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC--T-CA----CATGGAATG--TT--CAG-----ATAAAGACTA-TG--GGG---TCA----GA-G--TTGGA-TTTTTCAGA--C-CA---GC---CAT-ATATTTT----GAT-C-ATT--TT-TTCT-GC--TTG-TTACCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-A-----A-----A----TGGA-AGACC-A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-G-CAA--AGAT---TTTTCA--TGGCAC--TCA--G---T--TGTAGC-AT----ACCT------AAT--AT--GC--AA-TA--C--G---T--ATT-A-GA---ATG-T-TTC--AC--AGTGTT---AT-T--TTT-C-T-GC--------A---ATTG-A-A---------TAC-----TCTG-T----TACA-TGGTCTTTA-A---GAA--ACAT-G--A-AC----TAAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAA--AGT---AAAAATTGTTG-A--GAT-AC-AGA-T---TTC---A--A-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT------C---------ATA-TCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTG----A----T--------------------TA--CCCA----------------TTTTTCTTT---TT----ATCTTCC------AGTGT-TTTTATTTAAGTGGTA-------------CTTTATAATTTG-A--AT-T-GT-AAAGTT--GTTGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-TAA---G--AT-T---T-C-----A-TGCTATG-TGTAT-
gi|6 : ttCAAC-CAAA---GGTT-ACATGTA-ATAA----TAG-A---AA----CAA--TT-A-TTAT-CAG-------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGGT-CTTCAAGA-GGG-----GTAT--C--------ACCATAG---A-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACA--GCCATG--C-AAA---T-AATG----CCTGAT----AAC---CACT--AACAG-TTTTCAT-GAAAT---G-C--ATTGAA----TC------------TTCTGAAA---ATA-TACTA---AAAG----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ATT----TTTTCAT-G--AAATAATAC----GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GATATT-A----A--------------GGAC-TT--GA-CCAAAAAAA---AA-AA--AT-T----------------------------ACCC--------------------------------------AAAAAAACC----A-A-AAAC-------TAAAA----TT--GGGAAGATAAAG-----------G-C--ACTT-----GAAA--GCC-ATG-A--CA-GT-GGTTATGTA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AG--AA--ATA---ATA---A--TG--AGAT--GA--TT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA---------TGA-----CA-T-GA--T-G----------A-CA-G------G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC--T-CA----CATGGAATG--TT--CAG-----ATAAAGACTA-TG--GGG---TCA----GA-G--TTGGA-TTTTTCAGA--C-CA---GC---CAT-ATATTTT----GAT-C-ATT--TT-TTCT-GC--TTG-TTACCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-A-----A-----A----TGGA-AGACC-A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-G-CAA--AGAT---TTTTCA--TGGCAC--TCA--G---T--TGTAGC-AT----ACCT------AAT--AT--GC--AA-TA--C--G---T--ATT-A-GA---ATG-T-TTC--AC--AGTGTT---AT-T--TTT-C-T-GC--------A---ATTG-A-A---------TAC-----TCTG-T----TACA-TGGTCTTTA-A---GAA--ACAT-G--A-AC----TAAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAA--AGT---AAAAATTGTTG-A--GAT-AC-AGA-T---TTC---A--A-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT------C---------ATA-TCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTG----A----T--------------------TA--CCCA----------------TTTTTCTTT---TT----ATCTTCC------AGTGT-TTTTATTTAAGTGGTA-------------CTTTATAATTTG-A--AT-T-GT-AAAGTT--GTTGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-TAA---G--AT-T---T-C-----A-TGCTATG-TGTAT-
gi|7 : ttTATTACAAC-CAAC---AGGTTACATGTAC-TAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-AACCAT-C---------TAGAAGATCA-TAACTA-TGGACCTTCAAGATGGG------TATGTC--------ACCATAAAAAA-GA-C--AG----AT-ATGGATAACACAAAGCCATG--CCA-----T-TATA----C-TGAT----AACATGCACT--AAAAG-TTTTCATAGAAA----G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---AGA-TA-TA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--AA----GTT-----TTAC-TTTATTAATA---TTTCAAT-G--AA----TATAAG-GGATT--------T--AAT-----AAT----GATTTCT---------GAGATT-AGAAAAA-------------GGACGCTCTGAACCAAAAAAA--TAT-ATTTATACAC-------AAA-AA---CATACCCA-CATCCC----CCACCTAACTTCCCGC-CCCACCCAAAA----AAAAAAAACCC---C-A-AAACAAATAAATAAAAAAAATT--GGAAAGATAAAG-----------GTCCCACTT-----GAAA--GGC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TA-TCAAACGT--CTAT---TA--AA----AT--AA--ACC---AATTA-A--TGAAAGATTGGAAATT--AGGAAA---ACAG---TCC-CA-G-T-G-AT-A--------ATGAA----CA-T-GA--T-GCC-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----CC-------A--TAAAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--AC-AAGACTA-T---GGT---CCA----GATG--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CATAATGTTTTT--GAAT-CAATT--TC-G-CTCGC--TTG-T--TCTTT-C-A-C-AC--A-TC-A-T-G-----ACAA--A----TGGA-AGAC--AATGGCCCATTTCT---TT-GT--TTTGG-C-AAA--AGAT---
gi|8 : aTTAA-AAGGAAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TAGAAA-TACTAGAT-AAAC-AGT---AAAAA--TGTG-GACAA--AC-AGATT---TT----A-CA-CCACTT-AT-AATATCTTTGG--A-CT--A---T---------CTAT-CTGCGAAT-CT-------AA--AAAT-T-T-CTA----A----TTAACCC------------ACCC--CCCAAAA-C----------------CCCC---AA----ACTCACCAA---GAATGT-TTT-----------TATTTAACGTGGTAACTTTATAATTTGAG--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------ATTAAAGGGTCTT----CCAT-AAA-T-GC--T-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGT-T-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TATT--ACTTCTTCTTTTTTTTTT----AA--TA-TGTGGAAG-T-ACA-----GT--ACA-TAT-TACAG-AAAT----AC-TATCAA-AAGT-AAA-TAAA-TTGTCCAC--T-T-TA--GTTA-TGA-G-C---TTACC-A--CA-TGTTA--TGCA-----TAGC--AAC--G--A-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCCCT-----AACCCTGA-GACA---AA-AG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAA--------CAGA----AA---------CA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAAATTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-TTCAGAACC----C---TTTTGCA-AAAA-T--AAA-AGC-AC----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-CTGATA---TCTA--------GT--GCA-TC--CTAC-AT---G----TA-----TA-TCATAT-TACC-TACCATCTACC-T--ATTACCCTAAATA-ATTCTAA----ACT--------------A------TGGGAAC--ATT--ATTCTT-----------AAATTT-------AATTAATTTTACA--CA-T-ATGT------GAAT-GCAATTT
gi|9 : GAAGACAAAG-----------G-CCCACTTACTTGGAAA--GGC-CTGGA--CAAGT-G-TTAT-TA-TCAAACGTGTCTAT--ATATTAAGT--AT--AA--ACC---AAC---A--TG--A-AT--GAAATTT-AGGACA---A-AA---TCC-AA-AAT-GGATA----------TGAA----CA-T-GA--T-G-CCACCAAAGG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------ACAT-AAAC-AT-CAA---CATGGAATG--T---CAG--T--ACAA-TACAA-TG--GCT---CCT----G-----TTGGA-TTCT-CAAGAGCGTAAGTGC---CAT-ATATTTTT---AAT-C-ATT--TCCT-CT-GA--CTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGACGAG--GG--CATTTCT---TT-A---TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCATTTGCCAT-TTC---GCACT--TGTACCCAT-T-AACCT-ACACGAGTAAAT--GCAAAA-TA--T-AGGTTT--TTT-A-CA---ATGA--TTC-GAC-AAGTG-T---TA-T--TTCACTT-GC--------A---ATAGGC-A---------GACTT--ACTTA-A--AATACA-TG-------------AA--ACA------------ATGATCTG-TTAA-TA-AAA-TACTAG-T-AATC-AGT---AAAAA--ATTGTGATGAT-AC-TGATT---TTC---ACCACCCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---T---------AT-TCCTGCAAAT-GT-------CATCACAATT-T-CTA----AT---T--ACCC------------CCCC--CCC
blockSeqs : . . G T C AA G . ATA AA . A . G A A AC C TTTCAGTATTTCAAAGGTA GA T T . TTGT . T A A . T ATT . C . ATG . T A . G . . AACACAAACC T G T TAT A TTGA CA TTTTTGACTTTTAGCAAGTGAA . G TATT AATT T . TA T A . A . TC A GGGAA AAGG AGGAATTTG A T AATAAGGAAAAATAA G CT A AAT T TT ACACAAAAACATACCCACATCCCCCACCTAACTTCCCGCCCCACCCAAAA CGAAAAC AAATAAA A A . . T ACTTG . G G G . A T G G A GT . TT CATG . CA TAT CTCT . AA TG T TAT C . T AA . A TAGATAGCA A C C AT C CCACCAAAGG . CATG TA . TATC . CA A TA A GCTA . AA CTG G . TC TAC TAAT TG T T AG G AGT GCA A TTG A A . C T C . . TA G . T . . T T T G . CAACA . AAT CC . G TG G CC AC . TT T . CACT A AT ACACG A . AA T TCG GTT . A C . A . AA AA T GTTAC A T . TAATAGCA . A T . ATAC AA . TA T AGG AT G . C A C A T AG T A A AC . AATTGTGATGAT A T . CTT TC C CT A A T CA . TCACTTAATAATT TT A G TC T . A CGGTACATTTACCCCCCCCCCCCCGCCCCCCCCATCATCT AT AACGCA A TATTTAACGTGGTAA T A TCATG G A CTGG . ATTAA G . C G AT C . A A GAG A . AGG T TT T T AC TCT CTTC . TG G T A ACTT TG G TG TGAA T TCAAA C C T G C AGTCTATTA C . AAG T A AA G T TGGTTATAT CGA . ATT A . CTCT T TTAGGCA C . AT T . TCC GAG A ACCA GT A C GCA TTC G ATCGCGAGC GAG CA . T TGGGA CA T G T G AA . TATT . CCAAC C TCAG GGACCGG G C T T A C AACGTG ACA C T T G CCT TATTATCT CGA CTT . GAGGA TACG T . C . C A A . CTTTACAACTAATCTGACACACTAA GAAC A T TACCTTTAGTAAAATTAATGTG T AAT TG T A GAAC C
blockSeqs : . . G . C AA . . AAA A . . . G . . A T ATATTC GA . . . . . A . A . C AT . C . . . . A . . . . A T G C . A . A CAAA . . . A . . TA T T . . . . . . . . C . GAAAAA . CT . T . . CTCTAAACACAAACACAACACCCCCCCCCCACCCCTCCACCC CATAC ACA A A . . . . . T . G . . . G G G . . T GT . . . TTA . . . . . . . . G . G T A . . . . CAGC . AA . . . . . . A . G . . T A . . . . G . T C . . . . T . . . . T . . . TA . . . . . . . . . . CAAA . GAG . . . . . CA . . . T . CTT A A AAAA A . A G TG . . . . . A . A A T TAATA A T . . . A T . AT TA . TA . AG . . . C A . . . A . . . AC . ATTGTTGAGAT . T . . CC . . . . . . . ATA TT . A . . . . ATTACCCCCCCCCCCCCAAC AT AAG . TATTTAAGTGGTA T A AT G . TTGT . TAA G . . . T C . A . AG C . AT . . . T . C . . TT G . . . . T AG A . ACC C . . T . TATGTAA . . CTA . . AA . . GCTGTTTC C . TA A . . . CTA . . AC T . . GAG . . . A . GA TTC . AGATAT . C . . T . . . T . A . . . AC . CAT T A . . . A . AA C . T T . . . G TT . G . . . C . . . A . TGAAATAATTTTAAACTA AC . . AAATTT . AA . . A G .
blockSeqs : . . G . C AA . . AA A . . . . . . T T TATGTC GA . . . . . . . A . C AT . . . . . . A . . . . A T . C . . . A CAAA . . . A . . . T A . . . . . . . . A . AA . CT . T . . CTCCAAACACAACACCCCCCCCCCA CATAC CAA A A . . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . T . . . . . . . . G . . A A . . . . CCAG . CA . . . . . . A . G . . T A . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAA . CA . . . . . C . . . T . CAT A A AAA A . A . TG . . . . . A . A A . ATT A . . . . A . . AT TA . TA . AG . . . C A . . . A . . . AC . ATTGTTGAGAT . T . . C . . . . . . . AT TA . A . . . . ATTAACCCACCCCCCAAAAC TT AAG . TATTTAAGTGGTA T A TT G . TTGT . A G . . . T C . A . AG C . AT . . . . . C . . TG G . . . . . AG . . AC . . . . . TATGTAA . . T . . . . . TGCA C . TT A . . . CTA . . AC T . . . . . . A . GA G . AGAAT . C . . . . . . . . A . . . AC . CAT T T . . . A . AA A . T . . . . G TT . G . . . C . . . . . TAAATAATTCTAAACTA AC . . ATAT . AA . . . . .
blockSeqs : . . T . C AA . . AA A . . . . . . T T TATTC GA . . . . . . . G . C AT . . . . . . A . . . . A T . T . . . A CAA . . . A . . . T A . . . . . . . . C . AA . CT . T . . CTCAAAACAAACACCCCCCCCCCA CCA AAA A A . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . G . . A A . . . . CAG . CA . . . . . . A . G . . T A . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAA . CA . . . . . C . . . T . CAT A A AAA A . A . TG . . . . . A . A A . TAT A . . . . A . . AT TA . GT . AG . . . C A . . . A . . . TC . TTGAACAATA . T . . C . . . . . . . AT TC . A . . . . ATACCCCCCCCCCACT TT AAG . TA T A AT G . TG . A G . . . T C . A . AG . . T . . . . . C . . T G . . . . . G . . AC . . . . . TTTATA . . . . . . . . TTG C . T A . . . CTA . . CC T . . . . . . A . GG G . CGCTC . T . . . . . . . . A . . . AC . CT C . . . . A . AC C . T . . . . G TC . . . . . C . . . . . CTTTAAAACTA AC . . ATAT . AA
blockSeqs : . . T . C A . . AA A . . . . . . . T GTATC AA . . . . . . . A . C A . . . . . . A . . . . A T . T . . . A CAA . . . A . . . T A . . . . . . . . C . AA . C . . . . TACCC AA . A . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . A . . . . CAG . CA . . . . . . A . G . . T A . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAA . A . . . . . C . . . T . CAT A A AA A . A . TG . . . . . A . G A . ATT A . . . . A . . TT AA . GT . AG . . . C A . . . . . . . A . ATGTGGACAA . T . . C . . . . . . . AT T . C . . . . ATTACCCAT TT . . TT T . AT . . TT . A . . . . . . . A . G . . T . . . . . C . . T . . . . . . G . . AC . . . . . ATTAT . . . . . . . . TG C . T A . . . TA . . . C . . . . . . A . GA C . GAAA . T . . . . . . . . A . . . A . T C . . . . . . C . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . ATTTGATA . . . AAAT . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . . . . . GTATC . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . A CAA . . . A . . . T A . . . . . . . . A . A . . . . . . TACCC AA . A . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . . . G . . . A . . . . CAG . CA . . . . . . A . G . . T A . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAA . A . . . . . G . . . T . CA C T AA A . A . TA . . . . . A . . A . ATT A . . . . G . . . T . A . . . . . . . . . . . . . . A . TTGACAATA . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . ATTACCCAT AA . . . . AT . . TG . A . . . . . . . . . A . . T . G . . A . . . . . TTTAG . . . . . . . . TG . . T . . . . TA . . . T . . . . . . . . . . . GAAA . T . . . . . . . . . . . . A . T C . . . . . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . ATTTGATA . . . AAAT . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTC . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAA . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . A . . . . CAG . CA . . . . . . A . A . . . A . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAA . A . . . . . G . . . . . T . . . . . . . C . . . . . . . . . . TAT . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . TTTA . . . . . . . . G . . A . . . . CC . . . . . . . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . C . . . . . T . . . . . . . C . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . C . .
blockSeqCons : *** AA** *** ******** ** GTATTC************** ** ** AT**** **** **** ** *** ** **** *** T* CAA********************** ***** ** ******** T** CAAN**** ** *********** ** ** A* ** ** ** ** ** *** G** ********* A**** ** CAG********* CA**** **** ******* ** T**** **** G*** ** ** ***** CAA******* A**** *** C** *** T* ** CAT*** A** AA**** ** TG*** ** *** ATT****** *** ********* TA*** AG* ** A*** A* AC* *** ATGTTGAGAT***** *** AT************** TT A******* NT******* AAG*** TATTTAAGTGGTA************* AT*** ** A*********** **** T** C* A** AG***** AT* C** ** TG* G* AC**** TNTATA***** TG********* CTA**** ***** GA* AGAAN********** ****** ** ******* **** AC**** CAT* C******* A** C** T******* TC*** G******* ** CAATAATTTNAAACTA************************** AC**** **
originalCons : TATTACAAC-CAAC---GGGT-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--CTTCAAGATGGG-----GTAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---ATA-TACTA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GAGATT-A----AA-------------GGAC-CTCTGA-CCAAAAAAA--TAA-AA--AT-CTC-------AAA-A----CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCC---A-ACAAACAAA----TAAAAAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--GNC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-T-G-ATAA--------ATGAA----CA-T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT-AAA--AATAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-T---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAAA--GTTG-AACGAT-AC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CT--A---C---------ATATTCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTT---NT----ATTTACCAA---GAATGT-TTT-----------TA-------------CTTTATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-AAA-T-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TATT-TGTAT-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACTC--TCTTTTTTTTTA----AA--TA-T-TGGAAG-T-ACAA----GT--ACA-TATGTACAGGAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--T-T-TA--AGTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-A--TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAG--CAAA-CAGA----GA-A-----CACA---TCTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGC-A-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT--GCA-TT--CTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCC-------ATTTNAA----ACT--------------A------TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
finalCons : TATTACAAC-CAAC---GGGT-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--CTTCAAGATGGGGTATTC--------------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAAT----AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---ATAT-ACTA---AA-G----TCTAA-ATATCAA----------------------GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCT---------GAGATT-A----AA-------------GGAC-CTCTGA-CCAAAAAAAT--AA-AA--AT-CTC-------AAA-A----CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCCAAN----AAACAAA----TAAAAAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--GNC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AAG--T-G-ATAA---------TGAA----CA-T-GA--T-GCAG---------CA-GCA----G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAGT----ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GAG---TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----ACAA-------TGGA-AGACA----GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-GC--AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCACT-TCA--GCAT---TGTACCAATA--AACCTAA----AATAAAT--GC-AAA-TATG---G---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTG-TATT------TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATGTA---ATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACACA---TGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAAC-AGT---AAAAATGTTGAGAT-----AC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG--A-CTAT--------------ATATTCTGCGAAT-CTA-------A--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCC--CCCA----C-----------TTTTTCTTTNT-------ATTTACCAAG---AATGT-TTTTATTTAAGTGGTA-------------CTTTATAATTTGAAAT---TGGT-AAAG-T--G-TGG--CTA-----------AGGGTTTT----C-AT-AAAT--GC-AT-TA--T-CAG-----TG-TATT-TGTAT-TTTAA-T--CTTTGGA-AA-TCTT--ACTC--TCTTTTTTTTTA----AA--TATG-TGGAAG-T-ACAA----GT--ACA-TATGTACAG-AAAT----AC-TAAC----AGT-AAA-TAAA-T-GTC-ACTNTATA-----GTA-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-ATG---------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCTA----ATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGGA-AAG--CAAA-CAGAGAAN----------ACA---TCTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CCAC----CT-TCAT-GACCC-------TTT-G-A-AAAA-TA--AA-AGC-A-----ATGC--AG-TCAGT-------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT--GCATC---CTAC-ATG-------TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CC-T--ATTACCCCAATAATTTNAAACTA--------------------------TGGAC----ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): CCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCCATCTTTTATTTTTCATTTTGCGTGCGTTCATCGTTCAGTTAGCGTTTTCTATATTTCAGTGAACGTCTAGTTAAGGAATTGGGGTAAAATTATCGGTAATCATCGGTGAGTTCTCGGGAGTTTCCGGAATAAAATGCTTTTACAATCCAGAGTGCTATCGTAG
Unaligned ( gi|18 ): GGCTTTTTGTGAAAAAATTAATGGGCCTTATTTTTATGAACGAAAGTCTTCTTAAATGAGGGCTATTTTAAGATATATACGGATTTTGCATTCAGACAAGTGGTATGGGTAACTATAAAAAAATAATCTGTATTCACCCTAAAGGTAACATGTATATAAACAAA
Unaligned ( gi|19 ): TTGAGTGACTTTTGTGAAAAATAAGCCTTTATAGGGCAAAATTCTTTAAAAAAAGGGCTATTTTAAGATATTTTAGGAATATTTCAGACAAAAAATAAGGGGTAGAAATTCCTAATTTAACCCCCCAAGAAATTAATCTTACTTACTACAGATACATAAA
Unaligned ( gi|20 ): GCTTTCAAGTGACTTTTGTGCAAATAAGGGCCTTTTTCTAGGGCAAAATTCTTAAAAAATAAGGGCTATTTTTACGGATATTTTAGGAATTTTCAGGCAAAAATAAGGGTAAACTTCCTAATTAATCCCCAATGAATTAATTTGTACTTACCAAACAGGT
Unaligned ( gi|21 ): GCTTTCAAGTGACTATTTGTGAAAAATAAGGGCCTTTTTCAGGGCTAAAATCTTAAATAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAAGATTTTTCAAACAAAAAGTAGGGGTAAAACTTCCTTATAAATACT
Unaligned ( gi|22 ): GGACTTTTCAAGAAAATAAGGGCTTTTTTAGGGCAAAATTCTTTAAAACTAAGTGGCTATTAGATTTATTTAGGGATTTTTCAAGCAAAAATAAGGGTGTAAAAATCCTTCTCAATAAAGTTACAAAAAA
Unaligned ( gi|23 ): TCTTCAAGTGACTTTTTAAATGAAAAATAAGGACTTTTTAGGGCAAAATGTTCCTTATAAGGATAGGGTATTTTATGATATTTTGAGATATATTCAAAGCAAAATAGGAGGTCAAAACTTTCAAA
Unaligned ( gi|24 ): AGGGTGACTTTTTTATGAAAAATGAGGGCCTTTTTATGGCAAAATTCTTCATAAAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAGAATTG
Unaligned ( gi|25 ): GTGACTTTTTATGAAAAATGAGGGCCTTTTTATGGCAAAATTCTTCATAAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAGAATTGT
Unaligned ( gi|26 ): TTTGGAAATTAGATAAGGAATATAAGGGCCTCTGACAAAATGTAAGGAAAATAAGGGCCC
Unaligned ( gi|27 ): GCTTTCAAGTGACCTTTTTATGAAAAATAAGGGCCTTTTAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111 1111 22222222 22 22222222222222222222 1111 1 111111 1111 1 1111 1111 2222222222 111 2222222222222222222222222 11111 11 11111111 11111 11111111 11 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111 1111111 11111111111 11111 11 1111 1111 22222222 1111111111 111111111111 1111111 11111 1111 11 11111 11111 111 11111111 11 333333333 11111111 33333333333 1111 11111 111 1111 111 44444444444444444444 11111111 1 1111111 22222222 11 22222222 333333333333 55555555555555555555555555555 2222222222222222 444444444444444444444444444444444444444444 111111 222222222222 1111 1 11 11 111 1111111 1 22 11 1 111 1111 1 1111 1 1111 111111 1 1 2222222222 222 11 33333333333 1111 1111 1111111 11111 11 111 1111 111 111 222222222222222 111111 11111 11 1 1 1111111 1111 1111 111111 1111 22222222 1 111 3333333 222 22222222 1 111 22222222 11111 33333333 1111 1 1111 111 2222222222 111 1 111111 11 222222222222222222222222 1 11 1 22222 1
lowQualScore : 5 888 2 0 2 3333 5 888 0000 88 5 5 5 88888888 0 5 5 66 5 66666666666666666666 66 5 5 66 0000 5 0 5 5 66 4 222222 0000 0 0000 888 66 0 5 0 3 888 5 66 0000 3333333333 3 888 55 777 8 9999 66 9999999999999999999999999 11111 4 9999 9999 4 66 22 1 4 4 4 66666666 66 4 11111 9999 66 33333333 5 66 5 66 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5 88888 3333333 5 66 9999 66 99999999999 4 00000 55 9 4 8 66 4 8 8 8 55 55 55 33 4444 55 55 777 3333 55 55 55 0 99 777 4 777 4 666 22222222 4 4 99999 7777777777 4 99 4 777777777777 4 999999 55 8888 8888 3333333 55 4 44 4 8888 55 55 88888 2 4 55 777 2222 7777 44 8 99 4 777 777 4 666 4 4 55 4 8 4 55 4 11 4 4 4 4 4 4 4 8 4 00000 8888888888 4 55555 55 777 4 55 4 111 55 777 66 4 1 66 777777 7 4 66 66 33333333 1 66 4 00 66 4 8888 66 8 4 777 1 4 777 4 1 111111111 1 8 4 66666666 777 22222222222 0000 0 22222 5 99 4 333 66 4 66 3 2222 5 5 5 5 88 5 5 111 66 66666666666666666666 5 888 44444444 5 66 0 5 5 6666666 5 22222222 5 99 5 44444444 66 5 5 5 555555555555 99999999999999999999999999999 3 4444444444444444 3 333333333333333333333333333333333333333333 5 5 99999 4 5 0 777777 77 999999999999 4 2222 5 1 00 00 5 000 5 9999999 0 777 00 55 6 3 99 000 4444 99 5 6 6 6 4444 99 5 66 5 5 3 5555 5 666666 0 5 5 0 5 3333333333 5 5 5 222 5 5 33 5 5 77777777777 999 5 4444 3 5 0000 5 4444444 5 22222 33 5 5 888 777 5 0000 66 3 5 555 999 5 777777777777777 888 77 444444 5 77777 11 5 5 0 0 88 6666666 0000 2222 111111 5 6666 66666666 7 5 5 5 222 5 5555555 555 5 33333333 1 5 000 00000000 77777 5 99 5 33333333 2222 5 5 4 5 1 5 0000 5 000 5555555555 1 1 666 1 5 777777 33 5 888888888888888888888888 1 888 33 0 3 77777 0
lowQualScore : . ... . . . .... . ... .... .. . . . ........ . . . .. . .................... .. . . .. .... . . . . .. . ...... .... . .... ... .. . . . . ... . .. .... .......... . ... .. ... . .... .. ......................... ..... . .... .... . .. .. . . . . ........ .. . ..... .... .. ........ . .. . .. ................................................................................... . ..... ....... . .. .... .. ........... . ..... .. . . . .. . . . . .. .. .. .. .... .. .. ... .... .. .. .. . .. ... . ... . ... ........ . . ..... .......... . .. . ............ . ...... .. .... .... ....... .. . .. . .... .. .. ..... . . .. ... .... .... .. . .. . ... ... . ... . . .. . . . .. . .. . . . . . . . . . ..... .......... . ..... .. ... . .. . ... .. ... .. . . .. ...... . . .. .. ........ . .. . .. .. . .... .. . . ... . . ... . . ......... . . . ........ ... ........... .... . ..... . .. . ... .. . .. . .... . . . . .. . . ... .. .................... . ... ........ . .. . . . ....... . ........ . .. . ........ .. . . . ............ ............................. . ................ . .......................................... . . ..... . . . ...... .. ............ . .... . . .. .. . ... . ....... . ... .. .. . . .. ... .... .. . . . . .... .. . .. . . . .... . ...... . . . . . .......... . . . ... . . .. . . ........... ... . .... . . .... . ....... . ..... .. . . ... ... . .... .. . . ... ... . ............... ... .. ...... . ..... .. . . . . .. ....... .... .... ...... . .... ........ . . . . ... . ....... ... . ........ . . ... ........ ..... . .. . ........ .... . . . . . . .... . ... .......... . . ... . . ...... .. . ........................ . ... .. . . ..... .
lowQualScore : 0 888 5 0 5 2222 0 888 2222 22 0 0 0 11111111 4 0 0 99 1 00000000000000000000 88 0 0 99 6666 0 0 0 1 99 5 999999 6666 0 6666 888 99 1 0 1 2 888 0 99 6666 2222222222 1 888 99 888 9 4444 44 8888888888888888888888888 11111 4 4444 7777 4 11 22 9 8 4 4 11111111 11 4 11111 4444 11 00000000 0 99 0 99 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 11111 9999999 0 99 7777 11 00000000000 0 00000 55 7 4 9 11 4 9 9 9 00 55 55 55 0000 55 55 000 9999 55 55 55 8 55 000 0 000 0 222 55555555 0 0 33333 5555555555 0 55 0 111111111111 0 333333 55 5555 5555 0000000 55 0 88 0 6666 55 55 22222 3 0 55 000 5555 0000 88 0 55 0 000 000 0 333 0 0 55 0 0 0 55 0 00 0 0 0 0 0 0 0 0 0 00000 8888888888 0 55555 55 000 0 55 0 000 55 000 11 4 9 11 333333 3 4 33 11 77777777 9 11 4 88 11 4 9999 11 9 4 888 9 4 111 4 9 222222222 9 9 4 11111111 888 11111111111 4444 2 66666 0 88 4 666 11 4 11 9 0000 0 0 0 0 22 0 0 000 99 88888888888888888888 0 888 99999999 0 99 0 0 0 2222222 0 66666666 0 55 0 44444444 99 0 0 0 111111111111 77777777777777777777777777777 0 9999999999999999 6 333333333333333333333333333333333333333333 0 0 77777 3 7 1 444444 99 666666666666 3 1111 7 4 77 00 0 111 0 1111111 0 000 55 88 7 3 22 222 2222 22 0 7 7 7 2222 22 0 99 0 0 2 6666 0 555555 0 0 0 0 0 1111111111 0 0 0 555 0 0 88 0 0 88888888888 444 0 4444 2 0 6666 0 2222222 0 55555 88 1 0 888 555 0 6666 99 2 0 666 444 0 888888888888888 888 22 444444 0 55555 99 0 0 0 0 22 2222222 6666 1111 000000 7 3333 77777777 1 7 7 7 999 7 0000000 000 7 66666666 4 7 000 77777777 33333 7 77 7 66666666 1111 7 7 3 7 4 7 0000 7 000 3333333333 9 0 444 4 7 999999 66 7 777777777777777777777777 4 666 88 0 2 22222 0
consensus : TATTACAAC-CAAC---GGGT-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--CTTCAAGATGGG-----GTAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---ATA-TACTA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCTGAGA--TT-A----AAGGAC-CTCTGA-CCAA--AAAAA--TAA-AA--AT-CTC-------AAA-A----CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCCA-ANAAACAAA----TA-A--AAAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--GNC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-TG--------ATAA-TG-AA----CA----------T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT--A---AA-A-TAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTGTT--AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAAC-AGTA--AAAA--T-GTTG----A--GAT-AC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG-------AC-T--A-----T-ATAT-TCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTA----AT---TT-ACCC------------CCCCCCCA----C---TTTTTCTTTNTATTTACC-------A----AGA-ATGTTTTTATTTAA-GT---------GGT-A---CT------TT--------ATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-AAAT-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TAT-T-TGTA-TTTTAA--TCTTTGGA-AA-TCTT--ACTC--TCTTTTTTTTTA----AA--TAT-TGGAAG-T-ACAA----GT--ACA-TATG--TAC-A-GAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--TTTA-TA-GT-A-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-A--TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAG--CAAA-CAGA----GA-A-----NACA---TCTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGC-A-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT--GC-A-T-CCTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CCT--ATTA-CC---C----C--AA-TAATTTNA-A-ACT-A-TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
Reference ( family-2636 ) : TATTACAAC-CAAC---GGGT-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--CTTCAAGATGGG-----GTAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---ATA-TACTA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCTGAGA--TT-A----AAGGAC-CTCTGA-CCAA--AAAAA--TAA-AA--AT-CTC-------AAA-A----CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCCA-ANAAACAAA----TA-A--AAAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--GNC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-TG--------ATAA-TG-AA----CA----------T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT--A---AA-A-TAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTGT---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAAC-AGTA--AAAA--T-GTTG----A--GAT-AC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG-------AC-T--A-----T-ATAT-TCTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCCCCCA----C---TTTTTCTTTNTATTTACC-------A----AGA-ATGTTTTTATTTAA-GT---------GGT-A---CT------TT--------ATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-AAAT-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TAT-T-TGTA-TTTTAA--TCTTTGGA-AA-TCTT--ACTC--TCTTTTTTTTTA----AA--TATGTGGAAG-T-ACAA----GT--ACA-TATG--TAC-A-GAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--TNTA-TA-GT-A-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-A--TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAG--CAAA-CAGA----GA-A-----NACA---TCTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGC-A-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT--GC-A-T-CCTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CCT--ATTA-CC---C----C--AA-TAATTTNA-A-ACT-A-TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
gi|1 : TATTACAACACAACCAAGAGTAACATGTACATAAAAACTAG-AAAGAAA-A-CAAA-TTAA-CCATACAACTTTATTTAAAACTCCA-TA-CTAGTGGA-CTTCA--GT-GA-----ATAA-TC--------ACAATAAATAA-AG-CTGAA----ATCATGG-CC-CACAAAGCCATGACCCAAAACTC-AATGCATCC-CGATAAAAAAC---CACTCAAAAAA-TCCTC--AGAAATATAG-CCAATTGAAAAACTCA---------C-TTCTGAAAAAGATAGTACAA---AA-G----TCTAA-TTAT--------------C-AATA-----GTTAAATATCAC-TT----ACTA----TTTCAT-GAAAAA--ATATAAGCGG-TTAACCTACAT--A-A-----AAT----GATTTC-------CT-A----AA-GAC-CAACAA-CCCA--AAAAA---AA-CA--AT-TTG-------GAG-AAGATCA-----A--ACCCCGCAACC-------------CACCCA-----------
gi|1 : aaAAAGACCA-ACAACCCAA----AA-A--AAACAATTTGGAGAAGATCAAACCCCGCAACCCA-CCCATTC-----GAAAATGCA-CTG-AACTG-GTCG-ATAT-TACTCAAA-GT--CAATTAATAC-AA----ATTAAA--ACC---AAT---AAATG--AGAT--GAAATCTAAGACAA---A-AAACTTCC-AAAG-TAGAAAATTCACAA-TG-AAAAAACA----------T-GAA-T-G-C-------AAACAAGCCAA--G--ACTCGAAGA----ACGATAACAA--C-AAAT-AC-AAG---CATGGAATGCATT--CAAGAT--ACAAAGACTAATG--GGT---CCAA---GA-GGCTTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC----AT-CTGCTTTT--GAAT-C-CTTCTTC-T-CT-GCCATTGAT--CCTTT-CCA-CCACAGA-TC-GCT-GCACCAAC-A--GCCCCTGGAGAAAC--AA-GG--CATTTCTAAATG-AT--TTT-GACGAAA--ACATACATCTTCA--GGCCACATTCAAAGCA-TCATGTACCAATAA-AACCT--A---AA-ATTAAACTAGC-CAA-TAATT-AG---GAAATTAA-CAAATATAATATTC-CAC-AAA-GTTCGATAC--TTCAC-TAGC--------AACCATTGAA-ACAATAAATTTAAAT--ACATGATCAAATACAGTGTACTTAA-A---AAA--ACAT-GGAACACCAAATGAT-TG-TTAG-TA-AAA-TACTAG-T-AAACGAGTAACAAAA--G-GTCGCAACA--G-T-AC-AGATTTTATTA---A-CA-CCA--TCAT-AATATCTG-GG-------AC-CTAA-----T-CCATATCTGCGAAT-CTAACACCAAA--AAAA-TAT-CTA----AT---T--AACC------------CAACCACA-----------------------ACCAACAGAAA----AGA-ATGTTTTTATTTAACGT---------CGTAA---CTTACCAATT--------ATAA-TTGAA-----TGGT-AGAA-T--G-TGGAACTATTACAAA----AGGGTCTTACCCC-CT-AAATAGCTATATAAGT-CAAGCAAATG-TAT-TATGTA-TATTAA--TCTTTGGA-AA-TCTT--ACT---TCTTTTTTTTTA----CACTTCCCT-GAAG-T-ACAA----GT--ACACTATG--TAC-A-G-AAT----AC---------------A-T-------TC-A-----TA-------A-TGCCGTC---T-A-C-A--CA-TGT-AC-TG-------TAGC--GACTTG--A-AAATCTATG----CA-TCC------ACCC-TAAAAAAAACC-GATGACA---AATAG---AGA-C-TT----CA---GAG-AG---AAC--CAAA-GAAA----GA-ACCTACCACA---TTTC-AATCAAACCGCAA-A-----AATA-AC-T-GCTGT-TG-TTAAGAAAA-TTACTCATTATATC----GTTAATACCC---ACACT-T-CA--ATCCCATC---TTT-G-A-AAAA-TAAAAA-AGC-AC----ATGAC-AG-TC-GTGATATACTGA-C-CTACTA---CATA--------GT--GCAA-TACCTACAATAAAG----CAT----TA-TCATATATACCATACCATCT-CCTAAATTA-CCCCTC----C--AA-AAATTACT-A-ACTCACTGG--ACCAACTTAATTC-T-----------TAA--T-------AACTAA-ATTAttcgaaaatgcactgaactggtcgatattactcaaagtcaattaatacaaattaaaaccaataaatgagatgaaatctaagacaaaaaacttccaaagtagaaaattcacaatgaaaaaacatgaatgcaaacaagccaagactcgaagaacgataacaacaaatacaagcatggaatgcattcaagatacaaagactaatgggtccaagaggcttggattttcaggccagcatctgcttttgaatccttcttctctgccattgatcctttccaccacagatcgctgcaccaacagcccctggagaaacaaggcatttctaaatgattttgacgaaaacatacatcttcaggccacattcaaagcatcatgtaccaataaaacctaaaattaaactagccaataattaggaaattaacaaatataatattccacaaagttcgatacttcactagcaaccattgaaacaataaatttaaatacatgatcaaatacagtgtacttaaaaaaacatggaacaccaaatgattgttagtaaaatactagtaaacgagtaacaaaaggtcgcaacagtacagattttattaacaccatcataatatctgggacctaatccatatctgcgaatctaacaccaaaaaaatatctaattaacccaaccacaaccaacagaaaagaatgtttttatttaacgtcgtaacttaccaattataattgaatggtagaatgtggaactattacaaaagggtcttaccccctaaatagctatataagtcaagcaaatgtattatgtatattaatctttggaaatcttacttctttttttttacacttccctgaagtacaagtacactatgtacagaatacattcataatgccgtctacacatgtactgtagcgacttgaaaatctatgcatccaccctaaaaaaaaccgatgacaaatagagacttcagagagaaccaaagaaagaacctaccacatttcaatcaaaccgcaaaaataactgctgttgttaagaaaattactcattatatcgttaatacccacacttcaatcccatctttgaaaaataaaaaagcacatgacagtcgtgatatactgacctactacatagtgcaatacctacaataaagcattatcatatataccataccatctcctaaattacccctccaaaaattactaactcactggaccaacttaattcttaataactaaattaata
gi|10 : aatattacaacacaaccaagagtaacatgtacataaaaactagaaagaaaacaaattaaccatacaactttatttaaaactccatactagtggacttcagtgaataatcacaataaataaagctgaaatcatggcccacaaagccatgacccaaaactcaatgcatcccgataaaaaaccactcaaaaaatcctcagaaatatagccaattgaaaaactcacttctgaaaaagatagtacaaaagtctaattatcaatagttaaatatcacttactatttcatgaaaaaatataagcggttaacctacataaaatgatttcctA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTT-CATTG--AAA--ATATAAA-GG-GT--------T--A-T-----TAT----GATTTATGAGA--TTTA----AAGGAC-CTCTGA-CCAA--AAAAA----A-AA--AT-CTCTAAACACAAACA----CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCACCCCTCCACCCAAAAAAAACCCG-A-AAACAAA----CACATCAAAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAAA--AGCGCTGGA--CG-GTTG-TTAT-TA-TCAAACGT--ATAT--ATA--AA----AT--AA---CC---AAT---A--TG--AGAT--GAAATT--AGACAA---A-A----TCC-AA-G-TG--------ATAA-TGGAA----CA----------T-GA--TCG-C-------AG-CA-GC--ATGG--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAAGGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TGGGATTTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGTTTTTTGGAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-G--CCTTT-C-A-C-ACA-ATTC-ATT-G-----AC-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TTGGT--TTT-GCC-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCT-T--GGAACCAAT-A-AACCTAAA---AA-A-TAAAT--GC-AAATTA--T-GG---T--ATT-ACCA---ATGAT-TTC-AACAAAGT-T---GT-TACTTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-ata
gi|11 : AC-CAAC---AGGT------TACATAAAA--TAC-C---ATATA-CAAA-TT-A-CCAC-CA--------TAGAAGATCA-TA-CAAATG-----TCAACACGGGTTTCAGTAT-TTCAAAGGTAACCATAAGAAATGATC--TGTTGTGT-ATGGTTA-CACAAATCCATG--TTGAA-----AATG----C-TGAT----A--------------------CCATAG-CAT---G-C--ATTGAT----TCAACACAAACCCTATCTGAAA---GTA-TACTATATAA-GTTGATTTGACATACTTTTTGACTTTTAGC-A--AGTGAAGTC-----TTAC-TT----ACGAATTTTTTTTT-G--TAA--A-ATTAG-GA-TT--------TTCA-TGGGAAAATAAGGGATTTTTAGGAATTT--------GGAG-CT-TAA-ATAAGGAAAAA--TAA-GG--GC-CTC-------TGA--------------------------------------------CA-----------AAAAAAA---TA-AGGAA-AAA----T------------T--AGGAAAATAAGG-----------G-CCCGCTT-----GAAA--Gta
gi|12 : ctttcaagtgactttttgtgaaaaataagggccttttttagggcaaaattcttaaagaatgagggctatttttaggatattttaggaatttcaggcaaaataagggtaaaaaaacttcctaattaaacccccaatgaattaatttgtacttAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-ACCACTT-----GAAA--G-C-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TG-TCAAACGT--CTAT--ATA--CA----AT--AA--ACC---AAT---A--TG--AGAT--GAAATT--AGACAA---A-AA---TCC-AA-G-TG--------ATAA-TG-AA----CA----------T-GA--T-G-C-------AG-CA-AA--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-TAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACAA-GACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATGCTTTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACG-A-TC-A-T-G-----AA-A--A----TGGA-AGAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCA--GGCCTT-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-A-AACCT--A---AA-A-TAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-TA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTTT----T-C--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAATA---------TACAT--ACATG-A--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACc
gi|13 : A-TATG--TAC-A-GAC-T----AC-TA---A--AGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--TATG-TAAGT-A-TGATG-C---T-TCC-AAACA-TGT-A--TG-------TAG---AAC-TG--T-A---TT-TG----CA-TC-T----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAGGAGAGACC-TT----CAG--G-G-AG---AAG--GAAA-CAG-----GA-A-----AACA---TTTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GTTGTCTGTTT-GGCAA---TATT-------TC----TTTA----CC---A---T-T---TGAAC----T---TTG-G-A-AAAA-T---AA-AGC-C-----ATG---AG-TCAG--------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT-----A-T-TCTAA-AT--------TAT----TA-TCATAT-TA-C-TA-CATCT-C------TA-TA---C----C--AC-TTATTTGA-----T-A-TGG------ATT--ATTC-T-----------ATA--T-------AA-T---TTTAC
gi|14 : A-TATG--TAC-A-GAC-T----AC-TA---A--AGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--TATG-TAAGT-A-TGATG-C---T-TCC-AAACA-TGT-A--TG-------TAG---AAC-TG--T-A---TT-TG----CA-TC-T----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAGGAGAGACC-TT----CAG--G-G-AG---AAG--GAAA-CAG-----GA-A-----AACA---TTTC-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GTTGTCTGTTT-GGCAA---TATT-------TC----TTTA----CC---A---T-T---TGAAC----T---TTG-G-A-AAAA-T---AA-AGC-C-----ATG---AG-TCAG--------TGA-T-TTGATA---TCTA--------GT-----A-T-TCTAA-AT--------TAT----TA-TCATAT-TA-C-TA-CATCT-C------TA-TA---C----C--AC-TTATTTGA-----T-A-TGG------ATT--ATTC-T-----------ATA--T-------AA-T---TTTACtaaggta
gi|15 : -TA--T-CG----AGTG-TAT-T-TGT---TTTA---TCTTTG-A-AA-TCTT--ACTC--TC---TTTTTTA----AA--TAT-TGGAAG-TAACAA----GT--ACAGTATG--TAC-ATGAAATTGAAACTTA---A-CAGTCAAA-TAAATT-GTC-ACAGTCTATTA-GT-A-TGATT-CAAGT-ACT-A--CA-C-T-A--TGGTTATATTAGC--GAA-TGATT-AAAGAT-T------A-TCTTAGGCAATCT-T-----AAATC-GA-GAGC---CCT------GACCATTACCACGC--GAGCAGGCAAAG--CAGA-GAGATCGCGA-G-----CACG----CT----TCA------AGTGT----AGT--AC-T-GCTGTCGG-TG-GTCAAA-TTATT-------TC----TTtaaggta
gi|16 : TATTACA-C-CAAC---AGGT-A-ACGTACATAAAA--TTG-A---AAA-AACAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAG-TCAATA-CTAGTGGA-CTTCAAGATGGG------T-T-TC--------ACC-TAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---TTAATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAATTTTTCCTA-AAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAAG--AT--CACT----AA-G----TCTAA-ATAT--------------CAA--A-----GTT-----TTAC-TT----ACTA---TTTTCAT-G---AA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTTTGAGA--T
gi|2 : TATTACAAC-CAAC---AG-T-ACATGTACATAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGA--CTTCAAGATGGG-----ATAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATG--TA-CACAAAGCCATG--CCAAA---T-AATG----C-TGAT----AAC---CACT--AAAAG-TTTTCATAGAAAT---G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAAG--ATA-CGTCA---AA-G----TCTAA--T-C--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ATTA---TTTTCAT-G--AAA--ATATAAG-GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCTGAGC--TT-A----AAGGAC-CTCTGA-CCAA--AAAAA--TAA-AA--AT-CTCC------AAACA----CA-----A-CACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAAACCCATACAAACCAA----TA-A--AAAAAATT--GGGAAGATAAAG-----------G-CCCACTT-----GAA---GTC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-AT-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AT--AA--ACC---AAC---A--T---AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-TG--------ATAAATG-AA----CA----------TCGAATT-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA-----C-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG-----ACAAAGACTA-TG--GGT---CCA----GA-G--TTGGA-TTTT-CAGGC-C-CA---GC---CAT-ATGTATTT--GAAT-C-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AAAC--A--GG--CA-TTCT---TT-GT--TTT-G-CAAAA--AGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCA---A-AACCT--A---AATA-TAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTCAAAC-AAGTGT---AT-T--TTCAC-T-GC--------A---ATTGAA-A---------TACAT--ACATG-T--AATGCA-TGTACTTAATAAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAGTTA-AAA-TACTAG-TAAAAC-AGTA--AAA------TTG----AACAATAACAAGATT---TTC---A-CA-CCA--TAAT-AATATCTG-GG-------AC-T--A-----T-ATAT-TCTGCGAAT-CT--------A--AAAA-T-T-CTA----A----T--ACCC------------CCCCCCCA----C---TTTTTCTTTATATTTACC-------A----AGA-ATGTTTT---------------------T-A---CT------TT--------ATAATTTGAA--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------A----AGG--TTT----C-AT-AGAT-GC-AT-TA--T-C-----AGTG-TAT-T-TGT--TTTTAA--TCTTTGGA-AATTCTT--ACTC--TTTTTTTTTTTA----AA--TAT-T-GAAG-T-ACAAACTTGT--ACA-TATG--TACAA-GAAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--ATTA-T--GT-A-TGATG-C---T-ACC-A--CA-TGT-AT-TG-------TAGC--GAC-TG--T-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCC-T-----AAACCTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAGTTCAAA-CAGA----GA-A-----TACA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--ACTT-GCTGTCTG-TT-GGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-CATGACC----C---TTT-G-A-AAAA-T--AAA-AGTAA-----ATGACAAG-TCAGT-------T-A-TGTTGATA---TCTA--------GT--GC-A-T-CCTAC-AT---G----TAT----TA-TCATAT-TACC-TA-CATCT-CCT--ATTA-CC---C----C--------TTTAA-A-ACT-A-TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAATCAGAAT-GCAATTTaa
gi|3 : TATTACAAC-CAAC---AGGT-ACATGT-CATAAA---TAGGA---AAA-A-CAAAATT-A-CCAT-CA--------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGG--ACTCAAGATGGG------TAT-TC--------ACCATAAGAAA-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACAGAGCC-TG--CCAA----T-AATG----C-TGAT----GAC---CACT--AAA-G-TTTTCATAGAAAT---GGC--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---AGA--ACTA---AC-G----TCTA---TAT----------------A--A-----GTT-----T-ACGTT----ATTA---TTTTCAT-G--AAA--A---AAA-GG-TT--------T--A-T-----AAT-----ATTTCTGAGC--TT-A----AAGGAC-CTC-GA-CCAA--AAAAAAATAATAA--AT-CTC-------AAA-A----CA-----AACACCCC----CC-------------C-CCCA-----------AAAAAAA-CCCATACAAACAAA----TA-A--AAAAA--T--GGGAAGATAAAG-----------G-CC-ACTT-----GAAA--G-C-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-T--TCAAACGT--CTAT--ATA--AA-----T--AA--ACC---AAC---A--TG--AGAT--GAAATT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA---TG--------ATAA-TG-AA----CA----------T-GA--T-G-C-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--ACCAAGACTA-T---GGT---CCA----GA-G--TTGGA--TTT-CAGG--C-CA---GC---CAT-ATG-TTTT--GAAT-C-A-T--TC-T-CT-GT--TTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TCTA-T-G-----AC-A--A----TGGA-AAAC--A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-C-AA-----AT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA-T--TGTACCAAT-ATAACCT--A---AA-ATTAAAT--GC-AAA-TA--T-GG---T--ATT-A-CA---ATGAT-TTC-AAC-AAGTGT---TA-T--TTCAC-T-GC--------A---A-TGAATA---------TACAT--ACATG-T--AATGCA-TG-AC-TAA-AAG-AAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-T--AAA-TACTAG-T-AAAC-AGTA--AAA------TTG----AC-AATAAC-AGATT---TTC---A-CA-CCA--T-AT-AATATCTG-GG-------AC-T--A-----TAATAT-T-TGCGAAT-CT--------A--AAAA-T-T-CTA----AT---T--ACCC------------CCCCCCCC----CCAACTTTTCTTTATATTTACC-------A----AGA-ATGTTTTT-T------------------------CT------TT--------AGAA-TTGAA--TT-TGGTAAAAG-CTGG-TGG--CT-------A----AGG--TTT----C-ATGAAAT-GC-AT-TA--T-C------GTG-TA--T-TGT--TTTTAAT-TCTTTGGA-AATTCTT--A--C--TCTTTTTTTTTA----AA--TATGTGGAAG-T-ACAA----CTTGACA-TATG--C------AAAT----AC-TA---A-CAGT-AAA-TAAA-T-GTC-AC--TTTA-TA-GT-A-TGATG-CT--T-ACC-A--CAGTGT-A---G-------TAGC--GAC-TG--TAAAATCT-TG----CATTCCT----AATCC-T-----AA--CTGA-GACA---AATAG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAAGTTCAAAGCAGA----GATA-----TACA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--AC-TGGCTGTCTG-TTGGGCAAA-TTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-T-C-TGACC----C---TTTGG-A-AAAA-T--AAA-AGTAA-----ATG-C-AG-TCAGT-------TGATT-TTGATA---TCTA--------GT--GC-A-T--CTAC-AT--------TGT----TATTCATAT-TACC-TA-CATCT-CCT--ATTA-CC---C----TGAAA-TAATTTTA-A-ACT-A-TGG--AC--ATT--ATTC-T-----------AAA--T-------AA-TAA-TTTACA--CA-TAATGTGAA-CAGAAT-GCAATTT
gi|4 : -TCACACGT--TCAT--ATAT-AACATGAT--AACAACCTATAACTCTG--TA--AGAT--GAAATT--AGTCAATATA-AA---TCCTAA-A-TGA-------ATAA-TA-GA----TAGCATTAATACT-GA--C-A-C-------AGCCA-GC--A--GTAAT----GGATATCAT-------A--G-AAACTATACAGCTACATCAAATG--TTAACAG--CTGAGACAGACTA-TGTCCGTTACCCATAATGA----TTGGA--TTT-CAGG--C-CC---ACGCACAT-ATGTTTTT--GAATAC-ATT--TC-T-CT-GC--TTG-T--CCTTTGC-ATC-ACA-A-TT-A-TGG-----AC-AACA----TGGA-AGAC--A--GG--CAATTCT---GT-GTTGTTT-G-C-AAAACAGAT---TTTTCA--GGCCAC-TTCA--GCA----GGTACCAAT-A-AACCT--A---AA-A-TAAAT---C-AAAGTA--TCGG---T--ATTAA-CA---ATGAT-TTC--AC-AAGTGTTA-AT-A--TTCACTT-GCTAATAGCAA---ATTTAC-A---------TACATACACATG-T--AATACA-TGTACTTAA-AAG-AAAATACATGG--ACAC---ATGAT-TGATTAG-TA-AAATTACTAG-T-AA-----TA------------------------------ATT---TTCCTTATCA-CCG--T-ATAAATATCTG-GGCAGCTTCACTT--AATAATT-ATAT-ACTACGAACACT-------GA--AAAA-T-TACTACGGTACATTT--ACCCCCCCCCCCCCGCCCCCCCCATCATC---TTTTTCTTTTTCTTTACC-------AACGCAGATGTATTTTTGTTAAC-GTCAAACGCCAGGT-AAATGT------TTAAAGTGAGATTATTTGAATCATGCGGT-A----T--T-TGG--ATTA-----A----AGGGTTTT----G-ATAAAAT-GC-AT-TA--TAC-----AGTG--ATAT-TGTAGGTTTAATTTCTTTGGATAA-TCTTACACTC--TCTATTTTGTTACTTCAG--TATTTGAAAGTT-ACAA----GT--ACATTATGGTTA--A-GAAATA---AC-TA---ACCAGTCAAACTAAA-TGGTC-AC--TT---TA-GT-ACTGATG-TCTAT-ACCAA--CA-TGT-AGCTGTTTC---TAGCGAGAC-TGT-T-AAATCT-TGCTCTCA-TCCC-----ATCT-T-----GAACCCTC-GGCATCCTATA----------TT----CAGGTGAG-AAG-GAAG---ACA-CAGC----GC-T-----CACAGAGTCTCATGTCA------AG-GTGGGAAATCAAC-T-CCTGTAAG-GT-GTTAAA-TT-TT-------TCTATTTTTA----CTCCAAC-CTCT-CATGACCGGA-CCGGTTTAG-ATAAAATT--AAACAGC-AACGTGATG-A-AGCTCAGT-------TGATT-TTGATACCTTCTATATTATCTGTCGAC-ACT-TCTTC-AT---GAGGATGTTACGTA-TCATAT-TACC-TA-C-TCT-CCT--ATTAGCC---CTTTAC--AACTAATCTGACACACTAA-TGG--AC--ATTA-ATTC-TTACCTTTAGTAAAA--TTAATGTGGA-TAA-TATACATGCATTAATGTG----AGAATCGCAATTT
gi|5 : tacgtCAAC-CAAA---GGTT-ACATGTA-ATAA----TAG-A---AA----CAA--TT-A-TTAT-CAG-------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGGT-CTTCAAGA-GGG-----GTAT--C--------ACCATAG---A-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACA--GCCATG--C-AAA---T-AATG----CCTGAT----AAC---CACT--AACAG-TTTTCAT-GAAAT---G-C--ATTGAA----TC------------TTCTGAAA---ATA-TACTA---AAAG----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ATT----TTTTCAT-G--AAATAATAC----GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCTGATA--TT-A----A-GGAC-TT--GA-CCAA--AAAAA---AA-AA--AT-T----------------------------ACCC--------------------------------------AAAAAAACC---AAAAAC-------TA-A--AA----TT--GGGAAGATAAAG-----------G-C--ACTT-----GAAA--GCC-ATG-A--CA-GT-GGTTATGTA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AG--AA--ATA---ATA---A--TG--AGAT--GA--TT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-TG--------ATAA-TG-A-----CA----------T-GA--T-G----------A-CA-G------G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC--T-CA----CATGGAATG--TT--CAG-----ATAAAGACTA-TG--GGG---TCA----GA-G--TTGGA-TTTTTCAGA--C-CA---GC---CAT-ATATTTT----GAT-C-ATT--TT-TTCT-GC--TTG-TTACCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-A-----A-----A----TGGA-AGACC-A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-G-CAA--AGAT---TTTTCA--TGGCAC-T-CA--G---T--TGTAGCA-T-A---CCT--A---A----TA--T--GC-AA--TA--C-G----T--ATT-A-GA---ATG-T-TTC-A-C-A-GTGTT--AT-T--TTT-C-T-GC--------A---ATTGAA-----------TAC-----TCTG-T----TACA-TGGTCTTTA-AG---AA--ACAT-G--A-AC----TAAT-TG-TTAG-TA-AA--TACTAG-T-AAA--AGTA--AAAA--TTGTTG----A--GAT-AC-AGATT---T-C---A--A-CCA--T-AT-AATATCTG-GG-------AC-T--------C-ATAT--CTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTG----A----TT-ACCC-------------------A--------TTTTTCTTTTTATCTTCC-------A----G----TGTTTTTATTTAA-GT---------GGT-A---CT------TT--------ATAATTTG-A--AT-T-GT-AAAGTT--GTTGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-TAA--G--AT-T---T-C-----A-TGCTAT-G-TGTA-T
gi|6 : ttCAAC-CAAA---GGTT-ACATGTA-ATAA----TAG-A---AA----CAA--TT-A-TTAT-CAG-------TAGAAGATCA-TA-CTAGTGGT-CTTCAAGA-GGG-----GTAT--C--------ACCATAG---A-GA-C--AG----AT-ATGG-TA-CACA--GCCATG--C-AAA---T-AATG----CCTGAT----AAC---CACT--AACAG-TTTTCAT-GAAAT---G-C--ATTGAA----TC------------TTCTGAAA---ATA-TACTA---AAAG----TCTAA-ATAT--------------C-A--A-----GTT-----TTAC-TT----ATT----TTTTCAT-G--AAATAATAC----GG-TT--------T--A-T-----AAT----GATTTCTGATA--TT-A----A-GGAC-TT--GA-CCAA--AAAAA---AA-AA--AT-T----------------------------ACCC--------------------------------------AAAAAAACC---AAAAAC-------TA-A--AA----TT--GGGAAGATAAAG-----------G-C--ACTT-----GAAA--GCC-ATG-A--CA-GT-GGTTATGTA-TCAAACGT--CTAT--ATA--AA----AG--AA--ATA---ATA---A--TG--AGAT--GA--TT--AGGCAA---A-AA---TCC-AA-G-TG--------ATAA-TG-A-----CA----------T-GA--T-G----------A-CA-G------G--AT----GGA----AC-------A--T-AAAC--T-CA----CATGGAATG--TT--CAG-----ATAAAGACTA-TG--GGG---TCA----GA-G--TTGGA-TTTTTCAGA--C-CA---GC---CAT-ATATTTT----GAT-C-ATT--TT-TTCT-GC--TTG-TTACCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-A-----A-----A----TGGA-AGACC-A--GG--CATTTCT---TT-GT--TTT-G-G-CAA--AGAT---TTTTCA--TGGCAC-T-CA--G---T--TGTAGCA-T-A---CCT--A---A----TA--T--GC-AA--TA--C-G----T--ATT-A-GA---ATG-T-TTC-A-C-A-GTGTT--AT-T--TTT-C-T-GC--------A---ATTGAA-----------TAC-----TCTG-T----TACA-TGGTCTTTA-AG---AA--ACAT-G--A-AC----TAAT-TG-TTAG-TA-AA--TACTAG-T-AAA--AGTA--AAAA--TTGTTG----A--GAT-AC-AGATT---T-C---A--A-CCA--T-AT-AATATCTG-GG-------AC-T--------C-ATAT--CTGCGAAT-CT-------AA--AAAA-T-T-CTG----A----TT-ACCC-------------------A--------TTTTTCTTTTTATCTTCC-------A----G----TGTTTTTATTTAA-GT---------GGT-A---CT------TT--------ATAATTTG-A--AT-T-GT-AAAGTT--GTTGG--CT-------A----AGGGTTTT----C-AT-TAA--G--AT-T---T-C-----A-TGCTAT-G-TGTA-T
gi|7 : ttTATTACAAC-CAAC---AGGTTACATGTAC-TAAAA--TAG-A---AAA-A-CAAA-TT-AACCAT-C---------TAGAAGATCA-TAACTA-TGGACCTTCAAGATGGG------TATGTC--------ACCATAAAAAA-GA-C--AG----AT-ATGGATAACACAAAGCCATG--CCA-----T-TATA----C-TGAT----AACATGCACT--AAAAG-TTTTCATAGAAA----G-C--ATTGAA----TCA---------CTTTCTGAAA---AGA-TA-TA---AA-G----TCTAA-ATAT--------------C-A--AA----GTT-----TTAC-TTTATTAATA---TTTCAAT-G--AA----TATAAG-GGATT--------T--AAT-----AAT----GATTTCTGAGA--TT-AGAAAAAGGACGCTCTGAACCAA--AAAAA--TAT-ATTTATACAC-------AAA-AA---CATACCCA-CATCCC----CCACCTAACTTCCCGC-CCCACCCAAAA----AAAAAAAACCCC-A-AAACAAATAAATA-A--AAAAAATT--GGAAAGATAAAG-----------GTCCCACTT-----GAAA--GGC-CTG-A--CG-GT-G-TTAT-TA-TCAAACGT--CTAT---TA--AA----AT--AA--ACC---AATTA-A--TGAAAGATTGGAAATT--AGGAAA---ACAG---TCC-CA-G-TG--------ATAA-TG-AA----CA----------T-GA--T-GCC-------AG-CA-GC--A--G--AT----GGA----CC-------A--TAAAAC-AT-CAG---CATGGAATG--TT--CAG--T--AC-AAGACTA-T---GGT---CCA----GATG--TTGGA-TTTT-CAGG--C-CA---GC---CATAATGTTTTT--GAAT-CAATT--TC-G-CTCGC--TTG-T--TCTTT-C-A-C-AC--A-TC-A-T-G-----ACAA--A----TGGA-AGAC--AATGGCCCATTTCT---TT-GT--TTTGG-C-AAA--AGAT---
gi|8 : aTTAA-AAGGAAA--ACAT-G--ACAC---ATGAT-TG-TTAG-TAGAAA-TACTAGAT-AAAC-AGTA--AAAA--T-GTGG----A--CAA-AC-AGATT---TT----A-CA-CCACTT-AT-AATATCTTTGG-------AC-T--A-----T-CTAT--CTGCGAAT-CT-------AA--AAAT-T-T-CTA----A----TTAACCC------------ACCCCCCAAAA-C--------CCCCAAACTCACC-------A----AGA-ATGTTTTTATTTAACGT---------GGT-AA--CT------TT--------ATAATTTGAG--AT-TGGT-AAAG-T--G-TGG--CT-------ATTAAAGGGTCTT----CCAT-AAAT-GC--T-TA--T-C-----AGTG-TAT-T-TGT--TTTTAA--TCTTTGGA-AA-TATT--ACTTCTTCTTTTTTTTTT----AA--TATGTGGAAG-T-ACA-----GT--ACA-TAT---TAC-A-GAAAT----AC-TATCAA-AAGT-AAA-TAAA-TTGTCCAC--TTTA----GTTA-TGA-G-C---TTACC-A--CA-TGTTA--TGCA-----TAGC--AAC--G--A-AAATCT-TG----CA-TCCT----AATCCCT-----AACCCTGA-GACA---AA-AG---AGACC-TT----CAG--GAG-AGG-AAA--------CAGA-------------AACA---TCTT-CATCA------AG-G-----AAT--AC-T-GCTGTCTG-TT-GGCAAAATTATT-------TC----TTTA----CC---AC-CT-TTCAGAACC----C---TTTTGCA-AAAA-T--AAA-AGC-AC----ATG-C-AG-TCAGT-------TGA-T-CTGATA---TCTA--------GT--GC-A-T-CCTAC-AT---G----TA-----TA-TCATAT-TACC-TACCATCTACCT--ATTA-CC---C----TA-AA-TAATTCTA-A-ACT-A-TGGGAAC--ATT--ATTCTT-----------AAATTT-------AATTAATTTTACA--CA-T-ATGT------GAAT-GCAATTT
gi|9 : GAAGACAAAG-----------G-CCCACTTACTTGGAAA--GGC-CTGGA--CAAGT-G-TTAT-TA-TCAAACGTGTCTAT--ATATTAAGT--AT--AA--ACC---AAC---A--TG--A-AT--GAAATTT-AGGACA---A-AA---TCC-AA-AATGG-------ATA--TG-AA----CA----------T-GA--T-G-CCACCAAAGG-CA-GC--A--G--AT----GGA----AC-------ACAT-AAAC-AT-CAA---CATGGAATG--T---CAG--T--ACAA-TACAA-TG--GCT---CCT----G-----TTGGA-TTCT-CAAGAGCGTAAGTGC---CAT-ATATTTTT---AAT-C-ATT--TCCT-CT-GA--CTG-T--CCTTT-C-A-C-ACA-A-TC-A-T-G-----AC-A--A----TGGA-AGACGAG--GG--CATTTCT---TT-A---TTT-G-C-AAA--AGAT---TTTTCATTTGCCAT-TTC---GCACT--TGTACCCAT-T-AACCT--ACACGA-G-TAAAT--GCAAAA-TA--T-AGGTTT--TTT-A-CA---ATGA--TTC-GAC-AAGTGT---TA-T--TTCACTT-GC--------A---ATAGGC-A---------GACTT--ACTTA-A--AATACA-TG-------------AA--ACA------------ATGATCTG-TTAA-TA-AAA-TACTAG-T-AATC-AGTA--AAAAATT-G-TG----AT-GAT-AC-TGATT---TTC---ACCACCCA--T-AT-AATATCTG-GG-------AC-T--A-----T-AT-T-CCTGCAAAT-GT-------CATCACAATT-T-CTA----AT---T--ACCC------------CCCCCCC
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): CCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCCATCTTTTATTTTTCATTTTGCGTGCGTTCATCGTTCAGTTAGCGTTTTCTATATTTCAGTGAACGTCTAGTTAAGGAATTGGGGTAAAATTATCGGTAATCATCGGTGAGTTCTCGGGAGTTTCCGGAATAAAATGCTTTTACAATCCAGAGTGCTATCGTAG
Unaligned ( gi|18 ): GGCTTTTTGTGAAAAAATTAATGGGCCTTATTTTTATGAACGAAAGTCTTCTTAAATGAGGGCTATTTTAAGATATATACGGATTTTGCATTCAGACAAGTGGTATGGGTAACTATAAAAAAATAATCTGTATTCACCCTAAAGGTAACATGTATATAAACAAA
Unaligned ( gi|19 ): TTGAGTGACTTTTGTGAAAAATAAGCCTTTATAGGGCAAAATTCTTTAAAAAAAGGGCTATTTTAAGATATTTTAGGAATATTTCAGACAAAAAATAAGGGGTAGAAATTCCTAATTTAACCCCCCAAGAAATTAATCTTACTTACTACAGATACATAAA
Unaligned ( gi|20 ): GCTTTCAAGTGACTTTTGTGCAAATAAGGGCCTTTTTCTAGGGCAAAATTCTTAAAAAATAAGGGCTATTTTTACGGATATTTTAGGAATTTTCAGGCAAAAATAAGGGTAAACTTCCTAATTAATCCCCAATGAATTAATTTGTACTTACCAAACAGGT
Unaligned ( gi|21 ): GCTTTCAAGTGACTATTTGTGAAAAATAAGGGCCTTTTTCAGGGCTAAAATCTTAAATAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAAGATTTTTCAAACAAAAAGTAGGGGTAAAACTTCCTTATAAATACT
Unaligned ( gi|22 ): GGACTTTTCAAGAAAATAAGGGCTTTTTTAGGGCAAAATTCTTTAAAACTAAGTGGCTATTAGATTTATTTAGGGATTTTTCAAGCAAAAATAAGGGTGTAAAAATCCTTCTCAATAAAGTTACAAAAAA
Unaligned ( gi|23 ): TCTTCAAGTGACTTTTTAAATGAAAAATAAGGACTTTTTAGGGCAAAATGTTCCTTATAAGGATAGGGTATTTTATGATATTTTGAGATATATTCAAAGCAAAATAGGAGGTCAAAACTTTCAAA
Unaligned ( gi|24 ): AGGGTGACTTTTTTATGAAAAATGAGGGCCTTTTTATGGCAAAATTCTTCATAAAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAGAATTG
Unaligned ( gi|25 ): GTGACTTTTTATGAAAAATGAGGGCCTTTTTATGGCAAAATTCTTCATAAATAAGGGCTATTTTTAGGATATTTTAGAATTGT
Unaligned ( gi|26 ): TTTGGAAATTAGATAAGGAATATAAGGGCCTCTGACAAAATGTAAGGAAAATAAGGGCCC
Unaligned ( gi|27 ): GCTTTCAAGTGACCTTTTTATGAAAAATAAGGGCCTTTTAT