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Reference ( family-2571 ) : TGTT-TAG-GT--TCGT-TG-AT-TCGG-AC-CAG-TCTGG-GGCA----TG-T---ATGA--TTATT-----AAT--G-A-ATGAA--TGC--AAAAAT---A------TGA-ACAA-CTA-T-T---------------A---GA-----A-A-T--AA-CG-AGTC-----AATA-T-AT-A--CA-GA-TA-AT-ATT---A-T-T-----ATA-----CAGGAT--T-A--CC--TATCC-TAAA---A-TCA---AATGGCATGGAAAC-CTA--AG---G-TAT----GGGTGCGT-AAGGCTGG-GAC-CT-----ATGCTT--GTC-TGT--GTCC-------TA-T------G-CT----TA-------GT--T---TCT-GT-CCT-TATACCG-G-ACA-GGTACCT--G-TC---T---TA-G---A----T------CT---CTA-TAC---------CCGGA---CC-GA-TCT-TG--A-----TA-----AAC--CTG---GAAATAC-T---TTAC--GACT---ATT-CTC-----C---AG--A-CC-AGTA-------TA--CTA-GCCACCGTATACTGA-NTA--ATAATA-----C----AC-G-CCGT-NT-----TA-----TAT-A--TTGCNG--T--A---CC----TT----------T-T------TA---A---------C---------T-------TCGTCG--AG-----C-TCC-ACAGNT-----G-AACT--GNC-AA-AT----CTCA-GCAGATC---GC---CCTA-TTTA-TA-----CTG---C--TGAACAC---CCG-AA--CTA---CC-CTC---GGA-TG-C-T---AT--CCAT--TGC-------T-GAACACCCGAA-CTAC------CCTCGG-ATGT-TATCCTAATGC-CCTACG-ATAAAGTCCG--GTTGACGTAAG-CTTTATNTTTAGCA--TCTA---TCTGATA-A-ATGAT-ACATCCCGA
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Reference ( family-2571 ) : TGTT-TAG-GT--TCGT-TG-AT-TCGG-AC-CAG-TCTGG-GGCA----TG-T---ATGA--TTATT-----AAT--G-A-ATGAA--TGC--AAAAAT---A------TGA-ACAA-CTA-T-T---------------A---GA-----A-A-T--AA-CG-AGTC-----AATA-T-AT-A--CA-GA-TA-AT-ATT---A-T-T-----ATA-----CAGGAT--T-A--CC--TATCC-TAAA---A-TCA---AATGGCATGGAAAC-CTA--AG---G-TAT----GGGTGCGT-AAGGCTGG-GAC-CT-----ATGCTT--GTC-TGT--GTCC-------TA-T------G-CT----TA-------GT--T---TCT-GT-CCT-TATACCG-G-ACA-GGTACCT--G-TC---T---TA-G---A----T------CT---CTA-TAC---------CCGGA---CC-GA-TCT-TG--A-----TA-----AAC--CTG---GAAATAC-T---TTAC--GACT---ATT-CTC-----C---AG--A-CC-AGTA-------TA--CTA-GCCACCGTATAC--TGA-ATA--ATAATAC----AC-G-CCGT-NT-----TA-----TAT--ATTGCNG--T--A---CC----TT----------T-T------TA---A---------C---------T-------TCGTCG--AG-----C-TCC-ACAGNT-----G-AACT--GNC-AA-AT----CTCA-GCAGATC---GC---CCTA-TTTA-TA-----CTG---C-TGAACAC---CCG-AA--CTA---CC-CTC---GGA-TG-C-T---AT--CCAT--TGC-------T-GAACACCCGAA-CTAC------CCTCGG-ATGT-TATCCTAATGC-CCTACG-ATAAAGTCCG--GTTGACGTAAG-CTTTATATTTAGCA--TCTA---TCTGATA-A-ATGAT-ACATCCCGA
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2571 ) : TGTT-TAG-GT--TCGT-TG-AT-TCGG-AC-CAG-TCTGG-GGCA----TG-T---ATGA--TTATT-----AAT--G-A-ATGAA--TGC--AAAAAT---A--TGA-ACAA-CTAT-T---------------A-----AAAA-TAA-CG-AGTC-----AATA-T-AT-A--CA-GA-TA-AT-ATT---A-T-T-----A---------TA-----C-AGGAT--T-A--CC--TATCC-TAAA---A-TCA---AATGGCATGGAAAC-CTA--AG---G--TAT----GGGTGC-GT-AAGGCTGG-GAC-CT-----AT--GCTT--GTC-TGT--GTCCTA-T--GC-TA------------GT--T---TCT-GT-CCT-----TATACCG-G-A-CA-GGTACCT--G-TC-----T-TA-G---A----T------CT---CTA-TAC---------CCGGA---CC-GA-TCT-TG--A-----TA-----AAC--CTG---GAAATAC-TTTA---C-CG---CNA--TT-CTC-----C---AG--A-CC-AGTA-------TA--CTA-GCCACCGTATACTG--A-ATA--ATAA--TAC----AC-G-CCGT-NT-----TA-----T-ATA-TTGCTG--T--A---CC----TT----------T-T------TA---A---------C---------T-------TCG----TCG--AG-----C-TCC-ACAGNT-----G-AACT--GNC-AA-AT----CTCA-GCAGATCGC---CCTA-TT-TATA--CTGC-TNA---G-C-AC---CCG-AA--CTA---CC-CTC---GGA-TG-C-TATCCATAAT-G-C-----C----AA---T-AACAC----CCGAA-CTAC------CCTCGG-ATGT-TATCCTAATGC-CCTACG-ATAAAGTCCG--GTTGACGTAAG-CTTTATATTTAGCA--TCTA---TCTGATA-A-ATGAT-ACATCCCGA
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gi|9 : g--TCGT-TG-AT-TCGG-AC-CAG-TCTGG-GGCA----TG-T---ATGA--TTATT-----AAT--G-A-ATGAA--TGC--AAA--T---A--TGA-ACAA-TTAT-T---------------A-----GAAA-TAA-CG-AGTC-----AATA-T-AA-A--CA-GA-TA-AT-ATA---A-T-T-----A---------TA-----C-AGGAT--T-A--CT--TATCC-TAAA---A-TCA---AATGACATGGAAAC-CTA--CG---G--TAT----GGGTGC-GT-AAGGCTGG-GAC-CT-----AT--GCGT--GTC-TGT--GTCCTA-T--GC-TA------------GT--T---TCT-GT-CCT-----TATACCG-G-A-CA-GGTACCT--G-TC-----T-TA-G---A----T------CT---CTA-TAC---------CATGA---CC-GA-TCT-T---------TA-----AAA--CTG---GAAATAC-TTTA---C-GA---CTA--TT-CTC-----C---AG--A-CC-AGTA-------TA--CTA-GCCACCTTATACTG--A-TTA--ATAA--TAC----AC-G-CCGT-AT-----TA-----T-ATA-TTGCGG--T--A---CC----TT----------T-T------TA---ATCAACGT--C---------TTAAC---TCG----TCG--AG-----C-TCC-ACAGAT-----G-AACT--GAC-AA-AT----CTAA-GCAGATTGT---CCTA-TT-TATA--CTGC-TGA---A-C-AC---CCG-AA--CTA---CC-CTC---GGA-TG-T-TATCC-TAAT-G-T-----C----a
gi|9 : -C-TATTTATACT-G-C-----T----GA------ACAC----CCGAA-CTAC------CCTCGG-ATGT-TATCCTAATGT-CCTACG-ATAAAGTCCG--GTTGACctacgataaagtccggttgac
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|23 ): GATCAAGACAAATGATTTTAAGAAATTGATTGTGCATAAAAATGAAATTAAGTTATAAATTACGAAAAATATTAATGATTTGTGAACAAAACGAAGATCAATATTTACAGATATTTACTTGAGATTACC
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