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Reference ( gi|2 ) : CTTGACTTATTCCTGTAACTCCTAGTGAACATAGGGCTGCAACCACACTTCTCCAGCGAACCCTGTTTTGGGCTGTTCTCTTCAGTTGGGTCCATGTCATCCCCGGTGCTCTTTATTTCTTTCTCGACTGATCTTTTCCATGTTT--GTTTGGC--TCCCAACCTTC--CTTTTCCCTTGTGGTGTTCCAATCCAGAGCTTGTCTTGTGACG-TTTTCGGT---TGG-TTT-CTTCA--GTGTG-TGA-CCTAT-C-CA--GC-CT-C-ACTTTC-----GCTT---T-T-AA--ATGGCCTC--GCTGA---TTGGAAT-TTGG-C--TGGTTTTCTTCCATA---G---TTC--TGG-A-TT--GA-GATCTTCT-CAG-GC-CACCT--G--ATG---T-G-AGGATGCGTC--TCAAGA-----ACT--T---GT--T---G-A-C---AAAAGTC--TGGA---T---CTTGA-TGG-T-GATGGTG--T--TGGTT--AC--------------T--CGCCATGTCT-CAGAC-C-CAT-A-TAG--A-AGGA-CTG--CTTT---CAC-GT----TG-GT--G-T------AAAAATGCGGATCTTG--TTGC-GCTGG-G--AT---AA-GGCTT----TGGA-G-T--CCAG-AT-AGGT-CGCAGG----G-TG-T-TGAA--G--GCG--AAC-CTG----GCTTTTGTT--ATC--C-GGC---TCC--TA-ACA-TCTT-C----A-T-CAGC--GC-C--CGCC-ATC-TG-TGCT-GACTACACTTCC----AAGG-TAA--GTGAAGCGATCAGTCT----CCTTG-ATGTTTTCTC-CC-TG--------TAGATGT-AATGG---TTGCTC-TTGTCTGTTTGTTCAAAC-CGCA-T--CACCTCTGTC-TT--TCTGGTGTTTATCTTCAG-ACGGTC--TTCTTGGC--CACTTCGGCGAG--C---TGGGTG--AGCTTGGA-CTGTGCATGT-T-GTT-GTTT-G--TG---GGACAAAAGGCCAAT-GTCGTCTG-CAAAAT-C-AGGTCCT--CT-AGCTGTTTG--GT---AA-ATGTC--CATTG--T-ATGCCGATG-TTGC-T--GCCCTC--TG-T--TG-TTTTA--CTCATT--ATCCAGTCT-ATAATG--ATTAA-AGAA--GATGG----TCGGTGA-CAG-CA---TGCA-G--C-TTGCC-TCACTCCGGTTCTCACT-G-----GAAGGG----TTAGT-CAGCTTCC---GTT-------ATGGA-TGATCT--GCAGGAAGA--GCCCTCATATAGCTGCT-GGATGA-TGTT--GATG-AG-CTCC--AGAGGGA
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gi|32 : G-GC-CACCT--G--ATG---TTG-AGGATGCGTC--TCAAGA-----ACT--T---GT--T---G-A-C---AAAAGTC--TGGA---T---CTTGA-TGG-T-GATGGTG--T--TGGTT--AC--------------T--CGCCATGTCcagttgcaccgaattcagatcctatctgcgtatgagaagagttatctctcccccaaactcttccagttcaggcgacttggccttcgtatcgatatgcacctctgtctttctggtgttgatcttcaggacggtcttcttggccacttcggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccggtgttgctgccctctgttgttttcctcgttatccaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgacagcatgcagccttaccttactccggttctcactgggaaggggt
gi|14 : GGTGTGTC--TCAAGC-----ACTG-T---GT--TCCCG-AGCGTAAAAAGTC--TGAG---TAGTCTTGT-TGG-C-AATTATTATT--TGTTT--ACGTCGCTACGTCGGGTGGCGCCACGTCTACGGAC-CGCATGA-TAGTAA-AGGA-TTG--CTTA---C-C-GTAAAATG--T--G-TT-----AAAGATGCGGAT-TTG--TTGC-GGTGG-GTGAG---AA-GGCTT----TGCA-G-T--TCCG-AT-AGGT-CACAGG----ATTG-TCTGAAC-G--GCG--AGTACT-----GCTCTTGTTTGATC--C-GGCTCATCC--TGTACA-TCTT-C------T-CA
gi|1 : C--TCAAGC-----ACT--T---GT--T---GGA-T---GAAAGTCGTTGGA---T---CTTGGGTGG-TTGAGGGT---T--TGGTTTTAC--------------T--CGC-ATGTCT-TGGAC-C-AA--A-TAG--A-AGGA-CCGGGCTTT---CAC-TT----TG-GT--G-TTTA---AAAGATGCGATCCTTG--TTGC-GTTGG-G--AA---AA-GGCTTCTTTTGGA-G-TTCCCAG-AT-TGGAACGCAGG------TG-T-TGAAAAG--GCGGAAAC-CTGTTTTGGTTTTGTTG-ATC--CCGGC---TCTCTTA-ACA-TCTT-C----A-G-CAGCTAGT-CACCGCC-ATCCTG-TGCT-GACTACACTT-C----AAGGTTAA--GTGAAATGATCAGTCT-----TTTG-ATG-TTTCTCACC-TGTT------TAGCTGTAAATGGTTTTTGCTC-TTGTCT-----TTC--AC-CACA-TCACACCTCTGTCTTT--TCTGG-G-TTATC-TCAG-CCGGTCCTTTCTTGGC--CATTCCGGCGAG--CTCTTGAGTG---GC-TGGACCTATTCATGT-T--TT-GCTT-G--TG---GGACAAAAGGCCAATGGTCATCCGCCAAAAT-C-CAGTCCCTGCC-AGCTGTTTG--GTGGGAA-GTGTC--CACTGGTC-ATGCCGTTGTTTGC-TAGGCCCTCCATGTT--TGTTTTTC--CTCATTACATCCCCCCTAATAGTG--ATTAAGAAAA--GATTG----TCGGTGA-CAG-CA---TGCA-AGCC-TTGCCACCACTTCGGTTCTCACT-G-----GAAAGGCGGTTTAGTCCAACTTCCCTTGTTTATGTAAATGGG-GAATCT--TTGGGAGAACGGCCCTCGT-T-GCTTCTGGGAT-A-TGTTTGAAGG-AGCCTTCAAAGAGGGAa
gi|13 : tcGCC--TGGA---G---TCTGT-TAG-A-GTTGGTG--T--TGGTT--CC--------------T--CTCCAGGTCT-CAGAC-C-CAT-A-AAG--G-AAGA-CTG--TCTT---CAA-AT----TG-GT--AAT------AAAGAT-------------TGA-GT--G-G--AT---AA-CGCAC----TGGA-TCT--CCAA-AT-GGGC-TGCAGA----G-TG-T-TGAA--T--ACA--TAC-CTG----GCTTTGTTT--ATG--C-GGC---TCT--TT-ATG-TCAT-C----G-C-CTGT---T-C--CACC-GTC-TT-TGCT-TGTCATACTCCC----AAGA-TAT--GTGAAGCGGTCTGTTTTGAACAGTG-ATGTTTTCTC-CG-TG--------AAATTGT-AATGG-----G-TC-TTGattccgtagtctgcattcagctcagattgttctccctgtcaacacgtagcttcttcaaaagtcaacaaaggttcctgtgcaccgagaccccctgccatttcgatggacttgctcgataatgagcgtgggtcggcgagtgggtccctgtacatgatcttcccgtctaaatcctgccctgctctactcagtcttgttggtctgcgcctctttaagtctctccaggatgaaattcggaccttgctgaagaggaccagcagcatgatccccccagtttgccacactggataaaagtcaccttctttggggtaatttttcaccaggtatcctagattccagtccggcaggccattgtcttgtttgctccatatcttctgtagaaaggataacatctgtgcctggctattgtgtccgtcagccttgaagagctttcggtgtgtggtggtgtgtgttgtgttggtgtggtgtgccgtcaaggttcctggctgccttaataactgttccttcagtttctttcaatggaacttaaaatggcttttttttggtgtggctttggtgatctctgctttggttggcggactgatgttgacacgaaggggttcctttgcttcgcaggaacatatcttaatatgcaa
gi|22 : tggtgtaggcatctgatggtgagtTGGTG--T--TGGTC--AC--------------T--CTCCATCTCA-CAGAC-T-TA-----AA--A-AGAA-CAG--CCTT---CAC-AT----TGTGT--T-T------GAGGATCCTGATCTTG--TTTT-GAGGG-G--AT---AA-TGCAC----TGGATC-T--CCAA-AT-GGGT-CGCATA----G-TG-T-TAAA--
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gi|11 : gtgcATGCGGATCTTG--TTGC-GCTGG-G--AT---AA-GGCTT----TGGA-G-TT-CCAG-AT-AGGT-CGCAGG------TG-T-TGAA--G--GCG--AAC-CTG----GCTTT-GTT--GAT--C-GGC----CC--TA-ACA-TCTT-C----A-TTCAGC--GC-C---GCC-ATC-TG---CT-GACTACACTTCC----AAGG-TAA--GTGAAGCGATCAGTCT----CCTTG-ATGTTTTCTC-CC-TG--------TAGATGT-AATGG---TTGCTCGTTGTCTG-TTGTTC-AAC-CGTA-T--CACCTCTGTC--T--TCTG-------TCCT-------GTC--TTCTTAGC--CACTTCGGCGAG--C---TGGGTG--AGC-TGGA-CTGTGCATGT-T-GTT-GTTT-G--TG---GGACAAAAGcgaagt
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gi|19 : ttttgtttgggcgtgtGCTTTTA-CCTTGTAG-GTCT-GTTTGCTT-GGAT---GGTATTAATG--CAAT-GTAATCTG-AAAAGC-CTAGATCGT--C-TAGTTTTCTT--G-TA---AGAT-TC--CAACG--GA-TACCGGCG-CT-T-T--GTTTTC--T---TG-TTTTCCT-----CAT--TACCTAGTCT-ATCACC--A--AA-AGAA---ATAGGAAATCA--GA-CAT-T-A---CAC-ATCCCTGCT-TTACTCCcca
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gi|21 : gtgcA--GAGTG-TGG-CCAAT-A-CA--TCTC-CACTTTCTTCAAGC-----TATT-----TG--CTG--GATGACAGGGTCTTGGT-TTGTCGTTTGCCACA---GAATTTC------ATTGGTAATTTTGT-CTAAC-CACCT--G--ATGT--T-A-AGTATGTGTCG-CAG-ACA----TC--T---AT--T---T-G-TA---AAGGTT--TG-TA---G---TTTGT-TGG-cgaagt
gi|22 : TTGT-TAA-A-G-TGGTG--T--TGGTC--AC--------------T--CTCCATCTCA-CAGAC-T-TA-----AA--A-AGAACAG--CCTT---CA-CAT----TGTGT---T-T-----GAGGATCCTGATCTTG--TTTT-GAGGG--GAT---AA-TGCAC----TGGATCTCC-AA-AT-GGGT-CGCATA----G-TG-T-TAAA--acgtgg
gi|24 : aatTAGAGTCTTGTC-TTGTTGTCTGTCATA---GAG-TTT--TG---TTGGTAATTTTGT-CTGGC-CACCT--A--ATGT--T-T-ATTATGTGTTG-CAG-ACA----TC--T---AT--T---T-G-TG---AAGGTG--TGTGG---T----TTGT-TGttatctcttcgttgtgcactctccatctc
gi|25 : ttcttcgagctacatgtatctgctgaatttGTTTG--GATGTCAA-AT-TC--CATCT--CA-TTCCTGTG-TTGT-T--ATTTTC--TG-TTG-TTTGTCT-----CAT--AATCCAGTCT-AT--TG---TT-A-AGAG--GA--A----TAGGAAACCAGAC-ATATTGC-AGCCTTGCT-TTACTCCtaggtg
gi|27 : tgctatatcgtctgcata-GTTCCAGTCA------TGACGAGGGACG-TGCCC------CGG-TCC-CTGCAAAGGGTG-TAC-CCAAT-A-CACTGTCT--ACTTTC-----TC-----TTTT-AG-ATGCTTTC--GGTGATTGGGGTCCTGC-TTGTTCTGCGCCA-A---G---TTCT-TC--ATTAGTGAa
gi|3 : GC-CACCT--ATCATG---TTG-AGAA-G-GTCT-CAA-GCA----CT--TAACGTAATA--G-A-CG---AAAGTCA-TA-AAAAAT---CTTGT--GG-T-GATGGT---T--TCGTA--AC--------------T--C-CCATGTCT-CG-ACAC-CAT-AATAG--A-GGAACTG--CTTTAATCA-CGT----TT--T--GTCT-----AAAGAT-CGAATCTTG--TTGT--TTA----AT---AATGACTT----TGGAGTTCC-AC-AT-AGTT-C-CAGG----G--G-T-TGAA--G--GCG--AAC-CT-----GCTTTGTTT--ATC--C-AGCA--TCC--TT-ACATTCCT-C----ATT-CAGC---C-C--TGCC-A-C-TGTTGCT-GACGACACTTCCCGAGAGGG-TAA--
gi|3 : tagcttctgcattttgagacttcccagc--CACCTCTGTC-TT--TCTGGTGTTGATCTTCAGGACGGTC--TTCTTGGC--CACTTCGGCGAGcagttgcaccgaattcagatcctatctgcgtatgagaagagttatctctcccccaaactcttccagttcaggcgacttggccttcgtatcgatatgcacctctgtctttctggtgttgatcttcaggacggtcttcttggccacttcggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccggtgttgctgccctctgttgttttcctcgttatccaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgacagcatgcagccttaccttactccggttctcactgggaaggggt
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gi|3 : tagcttctgcattttgagacttcccagcgccacctatcatgttgagaaggtctcaagcacttaacgtaatagacgaaagtcataaaaaatcttgtggtgatggtttcgtaactcccatgtctcgacaccataatagaggaactgctttaatcacgttttgtctaaagatcgaatcttgttgtttaataatgactttggagttccacatagttccaggggttgaaggcgaacctgctttgtttatccagcatccttacattcctcattcagccctgccactgttgctgacgacacttcccgagagggtaacagttgcaccgaattcagatcctatctgcgtatgagaagagttatctctcccccaaactcttccagttcaggcgacttggccttcgtatcgatatgcacctctgtctttctggtgttgatcttcaggacggtcttcttggccacttcggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTGA-CAG-C-A---TGC-AGCCTTACC-TTACTCCGGTTCTCACTGG-----GAAGGG----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgacagcatgcagccttaccttactccggttctcactgggaaggggt
gi|32 : tagcttctgcattttgagacttcccagcgccacctatcatgttgagaaggtctcaagcacttaacgtaatagacgaaagtcataaaaaatcttgtggtgatggtttcgtaactcccatgtctcgacaccataatagaggaactgctttaatcacgttttgtctaaagatcgaatcttgttgtttaataatgactttggagttccacatagttccaggggttgaaggcgaacctgctttgtttatccagcatccttacattcctcattcagccctgccactgttgctgacgacacttcccgagagggtaacagttgcaccgaattcagatcctatctgcgtatgagaagagttatctctcccccaaactcttccagttcaggcgacttggccttcgtatcgatatgcacctctgtctttctggtgttgatcttcaggacggtcttcttggccacttcggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccggtgttgctgccctctgttgttttcctcgttatccaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGC-CACCT--G--ATG---TTG-AGGATGCGTCT-CAA-GAA----CT--T---GT--T---G-A-CA---AAAGTC--TG-GA---T---CTTGA-TGG-T-GATGGTG--T--TGGTT--AC--------------T--CGCCATGTCgt
gi|34 : TT-TG-ATGCCTTT--GGTGATGGGGTCCTGCT-TTGTTCTGCGCCACA---G---TTCT-TC--ATTAGTGATATGCT-CTGGC-CATTT--A--ATG---
gi|37 : CGGCGAGC---T--GAGTG--AGCTTGGA-CTGTACAT-GT-T-----GTTT-G--T---GGGACAAAAGGACAAT-GTCGTCCG-CAAAATCC-AGGcaca
gi|38 : TGCTTG--G-TG---A-ATGTCGCTACTG--TA-TGCCTGTG-TTGCAT--GC----------TG-TTTGCCA-----CAT--GATCCAATC----AATG--A
gi|39 : CT-CTGGC-CATCT--G--ATG---C-ACAGGATACGGCG-CAA-ACccatca
gi|5 : --CACC-ATC-TT-T-CT-GACCATGCCTCC----CAAA-TTATTGTGAAGCTGTT-GTTT----CAGTG-ATGTTTTGTT-CCATG--------AAGATGT-AATAG-----GATC-ATGT-TGTTTGTTGA---------------TTCT-TC-TT--TTT----TATATCTTCA-GCCGGTC--TTCTCGGCTTC-CTTTGGCAAGT---TTTGGTTGGTAGTTCATA-TCA--CAA-GT-TCGTT-GTTT-G--T---GGAA--AGAGTTCAAC-ATCATCAG-CAAAAT-CTACATCTT--T-AAGTTGCTTA--G-TG---A-CGTTT--CATTT--TAATGCCCGT--TTG--T--ATTCTA--TA-GTG----ACCTGGTCGCAT--GATCCAATCA-ATAA-GCCATCA---GGATTGATTG----TTGGTGA-TAA-CCA---TGC-AGCCCTTCT-TCACACCAGTCGTCACT-GTAAATGAAGCA----TTAATC--GCT---C-TG----TG--GAT---TGCTTTGAGCATGTTGA--ATCTTCGTGCAGCTGCAGAATTAT-TCCTGGTGAAACTCTGGAAAGAgagtgtaactgtaccttgctgtcaagactctga
gi|6 : ACGATTTTCGGC---TGGATTTACCTCA--GTGTGATGAACCTAT-CACA--GCCCACACGTTC-----GC-----TTGTGAA-ATGACCTATAGCTGAT-GGAATTAAGCATTGGTTTTC-TTA----------TC--TGGAATTGAAGATATTCTTCAGGCACACCCTAG--ATGAGTT-G-AGG-TGCGTCAACAAAGCA----CT--T---GT--T---G-A-CGA--AAAGTT--TG-GA---TA--CTTGT-CCG-T-GATGGTG-----TAGTT--ACATA-----------C--AGCCATGT-T-C-GAC-CACATAA-TAG--ATAGGAACT--CTTT---CACCGT----TG-TTAAGT-TAAAAAAAAAATGCGGATCTTAGTTTGCAGTTGGC-GATTTAAA-GACTT----TGGAG-TCC-AGAATAAGGTACGCAGAAGACA-TGAT-TGAA--GCAGCG--AAC-GGG----GCTTTTGTTGAATC--C-GGC---TAC--CA-ACA-TCTTAA----A-T-CAGC--G--C--CGCCAATC-TG-
gi|8 : TGACCTTCGCCAGGTTTTCATTGGACGTCC--GACT-CGACGTTTGCCCTGCGA-GTTCCACTCAAGTGCGTGACGTGTAATA-GCCCC------TGT-CTC-CCG-A--GAGTG-TGG-CCACT-T-AA--TCTC-CACTTTCCTCATGC-----TATT-----TGC--TG--GATGATAGGGTCTTGGT-CTGTTGTTTGC-ACAAGGG---TTT--CG---TCATTAATATTGT-CTGGC-CACCT--G--ATG---T-TTAGTATGTGTCG-CAG-ACATCTACTAGT---AT--T---T-G-TG---AAGGTT--TG-TA---G---TTTGT-TGGAT-G-TGGTG--T--TGGTA--AC--------------T--CTCCATGTTT-CTGAT-C-ATT-A-GAG--G-AGTACAG--Catg
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gi|1 : CT-CAA-GCA-CT-----T---GT--T---GGA-TG---AAAGTCGTTG-GA---T---CTTGGGTGG-TTGAGGGT---T--TGGTTTTAC--------------T--CGC-ATGTCT-TGGAC-C-AA--A-TAG--A-AGGACCGGGCTTT---CA-CTT----TG-GT--GT-TTA---AAAGATGCGATCCTTG--TTGC-GTTGG--GAA---AA-GGCTTCTTTTGGAGTTCCCAG-ATTGGAA-CGCAGG------TG-T-TGAAAAG--GCGGAAAC-CTGTTTTGGTTTTGTTG-ATC--CCGGC---TCTCTTA-ACA-TCTT-C----A-G-CAGCTAGT-CACCGCC-ATCCTG-TGCT-GACTACACTT-C----AAGGTTAA--GTGAAATGATCAGTCT-----TTTG-ATG-TTTCTCACC-TGTT------TAGCTGTAAATGGTTTTTGCTC-TTGTCT-----TTC--AC-CACA-TCACACCTCTGTCTTT--TCTGG-G-TTATC-TCA-GCCGGTCCTTTCTTGGC--CATTCCGGCGAGCTCTT--GAGTG---GC-TGGACCTATTCATGT-T--TT-GCTT-G--TG---GGACAAAAGGCCAATGGTCATCCGCCAAAATCCAGTCCCTGC-CAGCTGTTTG--G-TGGGAA-GTGTC--CACTGGTCA-TGCCGTTGTTTGC------TAGGC---CCTCCATGTTTGTTTTT--CCTCATTACATCCCCCCTAATAGTG--ATTAAGAAAA--GATTG----TCGGTGA-CAG-C-A---TGCAAGCCTTGCCACCACTTCGGTTCTCACT-G-----GAAAGGCGGTTTAGTCCAACTTCCCTTGTTTATGTAAATGGGGAATCT--TTGGGAGAACGGCCCTCGTT--GCTTCTGGGATATGT-TTGAAGGAGC-CTTCAAAGAGGGA
gi|10 : tcGTTT--C--TTGGCCTTCC----CCGTT-TTG--TGCTTTCTTTGGGG-GCTCCAGGATAGTGATCGTCTGGTGATG----CTGGTATATGG-ATT-ACGTA--GAGTG-TGC-CCCAT-C-CA--CCTC-CATCTTC-----ACTTACATGTA-AGTATTTCCTC--TTCTA-TCGGGGCTTGGA-TTGTTCTCTGCCACA---G---TTCAATG---TTGTTGAT-TTGT-CGGG---ATCT--G--ATC---T----GGATG---------------------T---GT--T---G-A-TT---AGTGTC--TG-GA---T---ATTGT-TGG-T---TGTTG--TAACAGTT--GT--------------C--CGCCATATTT-TTGAC-C-CAT-A-attccgtagtctgcattcagctcagattgttctccctgtcaacacgtagcttcttcaaaagtcaacaaaggttcctgtgcaccgagaccccctgccatttcgatggacttgctcgataatgagcgtgggtcggcgagtgggtccctgtacatgatcttcccgtctaaatcctgccctgctctactcagtcttgttggtctgcgcctctttaagtctctccaggatgaaattcggaccttgctgaagaggaccagcagcatgatccccccagtttgccacactggataaaagtcaccttctttggggtaatttttcaccaggtatcctagattccagtccggcaggccattgtcttgtttgctccatatcttctgtagaaaggataacatctgtgcctggctattgtgtccgtcagccttgaagagctttcggtgtgtggtggtgtgtgttgtgttggtgtggtgtgccgtcaaggttcctggctgccttaataactgttccttcagtttctttcaatggaacttaaaatggcttttttttggtgtggctttggtgatctctgctttggttggcggactgatgttgacacgaaggggttcctttgcttcgcaggaacatatcttaatatgcaa
gi|11 : cctttcggtgtcgggtctccaggtctctccgtttggtGATGCGGATCTTG--TTGC-GCTGG--GAT---AA-GGCTT----TGGAGTTCC-AG-AT-AGGT-CGCAGG------TG-T-TGAA--G--GCG--AAC-CTG----GCTTT-GTT--GAT--C-GGC----CC--TA-ACA-TCTT-C----A-TTCAGC--GC-C---GCC-ATC-TG---CT-GACTACACTTCC----AAGG-TAA--GTGAAGCGATCAGTCT----CCTTG-ATGTTTTCTC-CC-TG--------TAGATGT-AATGG---TTGCTCGTTGTCTG-TTGTTC-AAC-CGTA-T--CACCTCTGTC--T--TCTG-------TCCT-------GTC--TTCTTAGC--CACTTCGGCGAGC---T--GGGTG--AGC-TGGA-CTGTGCATGT-T-GTT-GTTT-G--TG---GGACAAAAG
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gi|14 : tggtgtGGTGTGTCT-CAA-GCA-CTG----T---GT--TCCCG-AGCGTAAAAAGTC--TG-AG---TAGTCTTGT-TGG-C-AATTATTATT--TGTTT--ACGTCGCTACGTCGGGTGGCGCCACGTCTACGGAC-CGCATGA-TAGTAA-AGGATTG--CTTA---C--CGTAAAATG--T--GT-T-----AAAGATGCGGAT-TTG--TTGC-GGTGGGTGAG---AA-GGCTT----TGCAGTTCC--G-AT-AGGT-CACAGG----ATTG-TCTGAAC-G--GCG--AGTACT-----GCTCTTGTTTGATC--C-GGCTCATCC--TGTACA-TCTT-C------T-CA
gi|15 : -CCGTG--GGATG-TGC-CCAATAC-CA--GCTCACACTCTC-----TCTG-----TT-GG-ATGCTTTA--GGTGA-TGGGGTCCTGCT-TTGTTCTGCGCCACA---G---TTCT-TC--ATTGGTGATGCACT-CTGGC-CATCT--G--AAG---C-GCAATATGCGGCA-CAG-ACA-GG-----T---GT--T---G-A-TA---AAGACC--TG-TA---A---CTTGT-TGT-C-TAGACTC--T--TTG-T--ACG-------------C--CTCCAAGATT-CTGAT-C-CAT-A-TAG--C-AGGACAG--ACTT---TA-CAT----TT-GT--GT-a
gi|17 : tgtggatttcagtctcaggcaggTGTTGTTTGTT---G-GTCGGTC--TTCTCAGC--TTCCTAGGCAACT---T--TATTT--AGTTTTGT-TTGGGCGTGT-T-GTT-GTTT-G--TT---GGA---GAGGTCAAC-ATCATCAG-CAAA-TCTAGATCTT-C-GAGTTGCTTG--A-TG---A-ATGTC--CACTG--TG-TGCCCATG-TTGT------T--GT---CCAT--AG-TGG-TCAG--TCGCAT--AATCCAATCA-ATAAg
gi|18 : ttttgtttgggcgtgtTGAACTTCGCCAGGTTTTCC--TTGGACGTCCGACTC-GGCGTNN--NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN---NNN-NNN-NNNNN--NNNNN-NNN-NNNNN-N-NN--NNNN-NNNNNGT-----GCTA-----TT-----TG--CTA--GATGA-TAGGGTCTTTAT-TTTTTGTTTGCCACA---G---cca
gi|19 : tttccttttcacaGCTTTTA-CCTTGTAGGTCT-GTTTGCTT-GGATG---GTATTAATG--CAAT-GTAATCTG-AAAAGCCTAGATCGT-C-TAGTTTTCTT--G-TA---AGAT-TC--CAACG--GA-TACCGGCG-CT-T------T--GT---TTTC--T---TG-TTTT--CCTCAT--TACCTAGTCT-ATCACC--A--AA-AGAA---ATAGGAAATCA--GA-CAT-T-A---CAC-ATCCCTGCT-TTACTCCagtttcgtta
gi|2 : TGATCTTTTCCATGTTT--G--TTTGGCTCCC----A-ACC-TTC--CTTTTCCCTTGTGGTGTTCCAATCCAGAGCTTGTCTTGTGACG-TTTTCGGT---TGG-TTT-CTTCA--GTGTG-TGA-CCTAT-C-CA--GCCT-CACTTTC-----GCTT-----TT-AA-ATGGCCTC--GCTGA-TTGGAATTTGGC-TGGTTTTCTTCCATA---G---TTC--TGG-ATTGA-GATCTTCT-CAGGC-CACCT--G--ATG---T-G-AGGATGCGTCT-CAA-GAA-CT-----T---GT--T---G-A-CA---AAAGTC--TG-GA---T---CTTGA-TGG-T-GATGGTG--T--TGGTT--AC--------------T--CGCCATGTCT-CAGAC-C-CAT-A-TAG--A-AGGACTG--CTTT---CA-CGT----TG-GT--G--T-----AAAAATGCGGATCTTG--TTGC-GCTGG--GAT---AA-GGCTT----TGGAG-TCC-AG-AT-AGGT-CGCAGG----G-TG-T-TGAA--G--GCG--AAC-CTG----GCTTTTGTT--ATC--C-GGC---TCC--TA-ACA-TCTT-C----A-T-CAGC--GC-C--CGCC-ATC-TG-TGCT-GACTACACTTCC----AAGG-TAA--GTGAAGCGATCAGTCT----CCTTG-ATGTTTTCTC-CC-TG--------TAGATGT-AATGG---TTGCTC-TTGTCTGTTTGTTCAAAC-CGCA-T--CACCTCTGTC-TT--TCTGGTGTTTATCTTCA-GACGGTC--TTCTTGGC--CACTTCGGCGAGC---T--GGGTG--AGCTTGGA-CTGTGCATGT-T-GTT-GTTT-G--TG---GGACAAAAGGCCAAT-GTCGTCTG-CAAAATC-AGGTCCT-C-TAGCTGTTTG--G-TA---A-ATGTC--CATTG--TA-TGCCGATG-TTGC------T--GC---CCTC--TG-TTG-TTTT--ACTCAT--TATCCAGTCT-ATAATG--ATTAA-AGAA--GATGG----TCGGTGA-CAG-C-A---TGC-AG-CTTGCC-TCACTCCGGTTCTCACT-G-----GAAGGG----TTAGT-CAGCTTCC---G-TTATG--GA-TG---ATCT--GCAGGAAGA--GCCCTCATATAGCTGCTGGATGAT-G-TTGATGAG---CTCC--AGAGGGAat
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gi|21 : gtgcA--GAGTG-TGG-CCAAT-A-CA--TCTC-CACTTTCTTCAAGCTA-----TT-----TGC--TG--GATGA-CAGGGTCTTGGT-TTGTCGTTTGCCACA---GAATTTC------ATTGGTAATTTTGT-CTAAC-CACCT--G--ATGT--T-A-AGTATGTGTCG-CAG-ACA-TC-----T---AT--T---T-G-TA---AAGGTT--TG-TA---G---TTTGT-TGG-cgaagt
gi|22 : TTGT-TAA-A-G-TGGTG--T--TGGTC--AC--------------T--CTCCATCTCA-CAGAC-T-TA-----AA--A-AGAACAG--CCTT---CA-CAT----TGTGT---T-T-----GAGGATCCTGATCTTG--TTTT-GAGGG--GAT---AA-TGCAC----TGGATCTCC-AA-AT-GGGT-CGCATA----G-TG-T-TAAA--acgtgg
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gi|25 : ttcttcgagctacatgtatctgctgaatttGTTTG--GATGTCAA-AT-TC--CATCT--CA-TTCCTGTG-TTGT------T--AT---TTTC--TG-TTG-TTTG--TCTCAT--AATCCAGTCT-AT--TG---TT-A-AGAG--GA--A----TAGGAAACCAGAC-ATATTGC-AGCCTTGCT-TTACTCCtaggtg
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gi|3 : GC-CACCT--ATCATG---TTG-AGAA-G-GTCT-CAA-GCA-CT-----TAACGTAATA--G-A-CG---AAAGTCA-TA-AAAAAT---CTTGT--GG-T-GATGGT---T--TCGTA--AC--------------T--C-CCATGTCT-CG-ACAC-CAT-AATAG--A-GGAACTG--CTTTAATCA-CGT----TT--T--GTCT-----AAAGAT-CGAATCTTG--TTGT--TTA----AT---AATGACTT----TGGAGTTCC-AC-AT-AGTT-C-CAGG----G--G-T-TGAA--G--GCG--AAC-CT-----GCTTTGTTT--ATC--C-AGCA--TCC--TT-ACATTCCT-C----ATT-CAGC---C-C--TGCC-A-C-TGTTGCT-GACGACACTTCCCGAGAGGG-TAA--
gi|3 : tagcttctgcattttgagacttcccagc--CACCTCTGTC-TT--TCTGGTGTTGATCTTCAGGACGGTC--TTCTTGGC--CACTTCGGCGAGN---N--NNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNN-N-NNN-NNNN-N--NN---NNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNN--N-NN---N-NNNNN--NNNNN--NN-NNNNNNNN-NNGCCGGTGTT--GCTGCCCTC--TG-TTG-TTTT--CCTCGT--TATCCAATCcagttgcaccgaattcagatcctatctgcgtatgagaagagttatctctcccccaaactcttccagttcaggcgacttggccttcgtatcgatatgcacctctgtctttctggtgttgatcttcaggacggtcttcttggccacttcggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccggtgttgctgccctctgttgttttcctcgttatccaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgacagcatgcagccttaccttactccggttctcactgggaaggggt
gi|3 : tagcttctgcattttgagacttcccagcgccacctatcatgttgagaaggtctcaagcacttaacgtaatagacgaaagtcataaaaaatcttgtggtgatggtttcgtaactcccatgtctcgacaccataatagaggaactgctttaatcacgttttgtctaaagatcgaatcttgttgtttaataatgactttggagttccacatagttccaggggttgaaggcgaacctgctttgtttatccagcatccttacattcctcattcagccctgccactgttgctgacgacacttcccgagagggtaacagttgcaccgaattcagatcctatctgcgtatgagaagagttatctctcccccaaactcttccagttcaggcgacttggccttcgtatcgatatgGGTGA-CAG-C-A---TGC-AGCCTTACC-TTACTCCGGTTCTCACTGG-----GAAGGG----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgacagcatgcagccttaccttactccggttctcactgggaaggggt
gi|32 : tagcttctgcattttgagacttcccagcgccacctatcatgttgagaaggtctcaagcacttaacgtaatagacgaaagtcataaaaaatcttgtggtgatggtttcgtaactcccatgtctcgacaccataatagaggaactgctttaatcacgttttgtctaaagatcgaatcttgttgtttaataatgactttggagttccacatagttccaggggttgaaggcgaacctgctttgtttatccagcatccttacattcctcattcagccctgccactgttgctgacgacacttcccgagagggtaacagttgcaccgaattcagatcctatctgcgtatgagaagagttatctctcccccaaactcttccagttcaggcgacttggccttcgtatcgatatgcacctctgtctttctggtgttgatcttcaggacggtcttcttggccacttcggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccggtgttgctgccctctgttgttttcctcgttatccaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGC-CACCT--G--ATG---TTG-AGGATGCGTCT-CAA-GAA-CT-----T---GT--T---G-A-CA---AAAGTC--TG-GA---T---CTTGA-TGG-T-GATGGTG--T--TGGTT--AC--------------T--CGCCATGTCgt
gi|34 : -----TT-TG-ATGCCTTT--GGTGA-TGGGGTCCTGCT-TTGTTCTGCGCCACA---G---TTCT-TC--ATTAGTGATATGCT-CTGGC-CATTT--A--ATG---
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gi|6 : ACGATTTTCGGC---TGGATTTACCTCA--GTGTGATGAACCTAT-CACA--GCCCACACGTTC-----GCTT-----GTGAA-ATGACCTATAGCTGA-TGGAAT-TAAGCATTGGTTTTC-TTA----------TC--TGGAATTGAAGATATTCTTCAGGCACACCCTAG--ATGAGTT-G-AGG-TGCGTCAACAAAGCA-CT-----T---GT--T---G-A-CGA--AAAGTT--TG-GA---TA--CTTGT-CCG-T-GATGGTG-----TAGTT--ACATA-----------C--AGCCATGT-T-C-GAC-CACATAA-TAG--ATAGGAACT--CTTT---CACCGT----TG-TTAAGT-TAAAAAAAAAATGCGGATCTTAGTTTGCAGTTGGC-GATTTAAA-GACTT----TGGAG-TCC-AGAATAAGGTACGCAGAAGACA-TGAT-TGAA--GCAGCG--AAC-GGG----GCTTTTGTTGAATC--C-GGC---TAC--CA-ACA-TCTTAA----A-T-CAGC--G--C--CGCCAATC-TG-
gi|8 : TGACCTTCGCCAGGTTT--TCATTGGACGT-C----C-GAC--TCGACGTTTGCCCTGCGA-GTTCCACTCAAGTGCGTGACGTGTAATA-GCCCCTGT---C----TC-CCG-A--GAGTG-TGG-CCACT-T-AA--TCTC-CACTTTCCTCATGCTA-----TT-----TG--CTG--GATGA-TAGGGTCTTGGT-CTGTTGTTTG-CACAAGGG---TTT--CG---TCATTAATATTGT-CTGGC-CACCT--G--ATGT--T-T-AGTATGTGTCG-CAG-ACATCTACTAGT---AT--T---T-G-TG---AAGGTT--TG-TA---G---TTTGT-TGGAT-G-TGGTG--T--TGGTA--AC--------------T--CTCCATGTTT-CTGAT-C-ATT-A-GAG--G-AGTACAG--Catg
gi|9 : attccctttgattccacacgGC---TCC--TG-ATG-TCTTTC----G-T-CC-C--GCTC--CACC-ATT-CT-TGCTTGACTACACTGCG----AAGG-TAATTATGAACTTGTCAACCT----CTTTTCATGTTTTC----C-TGGGTTAAGTTGGATGG-GGTGC---ATGCACGTTGTTTGTT-GT---AACTCTCAAT--GACTTCTGTC-TTGGTCATGTGTT---CTTGA-GCCCGTC--TTCTCGGCTTCGCTTCG-CGACT---C--TGTTG--AGCTTTTT-CTGGGCGTCT-TTGAT-GTCTAG--TGAAGGAACAGGAGGGCAAT-GTCGTTGG-CGAAATCCAGGTCCT-CTCAGCTGCTTATCG-TG---A-AGGTC--CACTG--t
19 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|19 : tttccttttcacaGCTTTTA-CCTTGTAGGTCT-GTTTGCTT-GGATG---GTATTAATG--CAAT-GTAATCTG-AAAAGCCTAGATCGT-C-TAGTTTTCTT--G-TA---AGAT-TC--CAACG--GA-TACCGGCG-CT-T------T--GT---TTTC--T---TG-TTTT--CCTCAT--TACCTAGTCT-ATCACC--A--AA-AGAA---ATAGGAAATCA--GA-CAT-T-A---CAC-ATCCCTGCT-TTACTCCagtttcgtta
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gi|21 : gtgcA--GAGTG-TGG-CCAAT-A-CA--TCTC-CACTTTCTTCAAGCTA-----TT-----TGC--TG--GATGA-CAGGGTC-----TTGGTTTGTCGTTTGCCACA---GAATTTC------ATTGGTAATTTTGT-CTAAC-CACCT--G--ATGT--T-A-AGTATGTGTCG-CAG-ACA----TC--T---AT--T---T-G-TA---AAGGTT--TG-TA---G---TTTGT-TGG-cgaagt
gi|22 : TTGT-TAA-A-G-TGGTG--T--TGGTC--AC--------------T--CTCCATCTCA-CAGAC-T-TA-----AA--A-AGAACAG--CCTT---CA-CAT----TGTGT---T-T-----GAGGATCCTGATCTTG--TTTT-GAGGG--GAT---AA-TGCAC----TGGATCTCC-AA-AT-GGGT-CGCATA----G-TG-T-TAAA--acgtgg
gi|24 : aat-TAGAGTC-----TTGTCTTGTTGTCTGTCATA---GAG-TTT--TG---TTGGTAATTTTGT-CTGGC-CACCT--A--ATGT--T-T-ATTATGTGTTG-CAG-ACA----TC--T---AT--T---T-G-TG---AAGGTG--TGTGG---T----TTGT-TGttatctcttcgttgtgcactctccatctc
gi|25 : ttcttcgagctacatgtatctgctgaatttGTTTG--GATGTCAA-AT-TC--CATCT--CA-TTCCTGTG-TTGT------T--AT---TTTC--TG-TTG-TTTG--TCTCAT--AATCCAGTCT-AT--TG---TT-A-AGAG--GA--A----TAGGAAACCAGAC-ATATTGC-AGCCTTGCT-TTACTCCtaggtg
gi|27 : tgctatatcgtctgcata-GTTCCAGTCA------TGACGAGGGACG-TGCCC------CGG-TCC-CTGCAAAGGGTG-TAC-CCAAT-A-CACTGTCT--ACTTTC-----TCTT-----TT-AG-ATGCTTTC--GGTGATTGGGGTC-----CT-GCTTGTTCTGCGCCA-A---G---TTCT-TC--ATTAGTGAa
gi|3 : GC-CACCT--ATCATG---TTG-AGAA-G-GTCT-CAA-GCA----CT--TAACGTAATA--G-A-CG---AAAGTCA-TA-AAAAAT---CTTGT--GG-T-GATGGT---T--TCGTA--AC--------------T--C-CCATGTCT-CG-ACAC-CAT-AATAG--A-GGAACTG--CTTTAATCA-CGT----TT--T--GTCT-----AAAGAT-CGAATCTTG--TTGT--TTA----AT---AATGACTT----TGGAGTTCC-AC-AT-AGTT-C-CAGG----G--G-T-TGAA--G--GCG--AAC-CT-----GCTTTGTTT--ATC--C-AGCA--TCC--TT-ACATTCCT-C----ATT-CAGC---C-C--TGCC-A-C-TGTTGCT-GACGACACTTCCCGAGAGGG-TAA--
gi|3 : tagcttctgcattttgagacttcccagc--CACCTCTGTC-TT--TCTGGTGTTGATCTTCAGGACGGTC--TTCTTGGC--CACTTCGGCGAGN---N--NNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNN-N-NNN-NNNN-N--NN---NNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNN--N-NN---N-NNNNN--NNNNN--NN-NNNNNNNN-NNGCCGGTGTT--GCTGCCCTC--TG-TTG-TTTT--CCTCGT--TATCCAATCcagttgcaccgaattcagatcctatctgcgtatgagaagagttatctctcccccaaactcttccagttcaggcgacttggccttcgtatcgatatgcacctctgtctttctggtgttgatcttcaggacggtcttcttggccacttcggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccggtgttgctgccctctgttgttttcctcgttatccaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgacagcatgcagccttaccttactccggttctcactgggaaggggt
gi|3 : tagcttctgcattttgagacttcccagcgccacctatcatgttgagaaggtctcaagcacttaacgtaatagacgaaagtcataaaaaatcttgtggtgatggtttcgtaactcccatgtctcgacaccataatagaggaactgctttaatcacgttttgtctaaagatcgaatcttgttgtttaataatgactttggagttccacatagttccaggggttgaaggcgaacctgctttgtttatccagcatccttacattcctcattcagccctgccactgttgctgacgacacttcccgagagggtaacagttgcaccgaattcagatcctatctgcgtatgagaagagttatctctcccccaaactcttccagttcaggcgacttggccttcgtatcgatatgGGTGA-CAG-C-A---TGC-AGCCTTACC-TTACTCCGGTTCTCACTGG-----GAAGGG----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgacagcatgcagccttaccttactccggttctcactgggaaggggt
gi|32 : tagcttctgcattttgagacttcccagcgccacctatcatgttgagaaggtctcaagcacttaacgtaatagacgaaagtcataaaaaatcttgtggtgatggtttcgtaactcccatgtctcgacaccataatagaggaactgctttaatcacgttttgtctaaagatcgaatcttgttgtttaataatgactttggagttccacatagttccaggggttgaaggcgaacctgctttgtttatccagcatccttacattcctcattcagccctgccactgttgctgacgacacttcccgagagggtaacagttgcaccgaattcagatcctatctgcgtatgagaagagttatctctcccccaaactcttccagttcaggcgacttggccttcgtatcgatatgcacctctgtctttctggtgttgatcttcaggacggtcttcttggccacttcggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccggtgttgctgccctctgttgttttcctcgttatccaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGC-CACCT--G--ATG---TTG-AGGATGCGTCT-CAA-GAA----CT--T---GT--T---G-A-CA---AAAGTC--TG-GA---T---CTTGA-TGG-T-GATGGTG--T--TGGTT--AC--------------T--CGCCATGTCgt
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gi|39 : CT-CTGGC-CATCT--G--ATG---C-ACAGGATACGGCG-CAA-ACccatca
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blockSeqs : . C C C . . GC G A G . . . . TTT C T . CT . . TGTA . . GT . ATG GT . . . G . G . . T . A C . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . A G C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
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18 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|16 ): TAGCAATATGGTGGTGGTGGCCGGTGTTGAATGACCTCTTTAAAGAGTTCTCTCGCATCCCGATCAGTTATTCTCTTGGTATCCTGAAGTAGCAAAACCCCTCCCACTTTTCAGATTGGGTTCTTCCAGATTTATGTGTTCTCTATTGACTGTTTGTTAGGTATCCTTAGAAGTTCAATTTCCTGTCAAAGGCTGAGCGTGCCTCTTTATCATAGAA
Unaligned ( gi|23 ): CTCTGGTCGGAGCACAGAGCCTGCACACTGGACCTCCATCCGTCATTCTGTCTTGGGTCCTGCTCTCGCTTCGCACTCCCAGGTCATTTCACTGGTCCTTGAGTTCTGCTTGCGAGAGTTCTTTGCAGGGGTTGTGGACATCGGTCTCCTCCTTTCCTTTCCCC
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gi|9 : attccctttgattccacacgGC---TCC--T-GA-TG-TCTTTC----G-T-CC-C--GCTC--CACC-ATT-CT-TGCTTGACTACACTGCG----AAGG-TAATTATGAACTTGTCAACCT----CTTTTCATGTTTTC----C-TGGGTTAAGTTGGATGG-GGTGC---ATGCACG--TTGTTTG-TTGT---AACT-CTCAAT--GACTTCTGTC-TTGGTCATGTGTT---CTTGA-GCCCGTC--TTCTCGGCTTCGCTTCG-CGACT---C--TGTTG--AGCTTTTT-CTGGGCGTCT-TTGAT-GTCTAG--TGAAGGAACAGGAGGGCAAT-GTCGTTGG-CGAAATCCAGGTCCT-CTCAGCTGCTTATCG-TG---A-AGGTC--CACTG--t
18 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CCGTAGTACGCATCAGCTCCAGATTGTCTCACTGTCAACACTGTTGAAGGCTTTCTCAAAGTCAACGAAGGTCGTGTACAATGGAGACTGCCATTCGATGGACTGCTCGATGATGATGCGCAGGGTGGCGATGTGGTCTGTACATGATCTTATCCTGTCTAAATCCTGCTTGCTCTGATATCAGTCTTTTGTCTAGTGCCTTTTTAGTCTCTCCAGGATGATCGGTCAGCACCTTGCTGGGATGGACAGCAGCATGATTCCCCGCCAGTTGCCACAACTGGGAAAGGTCACCTTTCTTGGGTAATTTCACCAGGTAGCCGAAGCTTCCAGTCGGCAGGCACTTGTTCTTGCTCCCAGATCTTCTGTAGGAGAGGATTAGCATCTGTTGCTGCTGTGTTGCGTCAGCCTTAGAGCTTCTGGGGGGGATGCCGTCAAGTCCTGCTGCTTACCGTTCTTTAAGGACTTAATGGCTTTGGTGATCTCTGCTTTGGTTGGCGGGCTGATGTTGACACGAAGGAGTTCCTCTCTGCTGG
Unaligned ( gi|7 ): TTGGTTGACGGGCTGATGTTGACACGAAGGGGTTCTTCTGTTGCTGGTATGTCTATAGCAACTGGTGGTGGTAACCGGTTTGAGATCACTTCAAAATGTTCCACCCATTGTGTTCTCTGTTATGCATCACTTGTGATGGTTCTTCCGTTCTTGTCCTTGACTGGTTTGTTGGGTTTGAGGTTCTTTCTTGACAAGGCCCGTGTTATATCATAGAATCTCTTCATGTTGTTCTATCTTGCTGATGTTTCTTCTTTCGCCAGACCATGCACAAACTCTCTCTTGTGGTGTCTGGCACTTCTCCTCATTTCCCAGTTCGTCTCCAAGTATTGTGCTCTAAGATCTGTCTTATGTTGGTCCTGGC
Unaligned ( gi|12 ): AAGAAAATTGGAGAGAGTACACATCGTTGTTTAACTCCAGTTTGTATTGAAAAGCTGTCTGTGACGTTGGTGCCGCAGATCACTTGTGCTTGAAACTGGGTGTATATCTTGATGGATATGATCGTGTTTGGGATGCCATAGTGTGCAAGAATTTTCCATTGAACAGTCGGTGAACACTTTCAAAGGCTTTCGAGAAGTCGATGAAGTTGGTGTATAGTGGACAGTTCCATTCGTTGCTCTGCTCCATTATTTGTCTGAGGGTGAAGATTTGGTCGTTATATCATGCCAATCTCTGATATCA
Unaligned ( gi|16 ): TAGCAATATGGTGGTGGTGGCCGGTGTTGAATGACCTCTTTAAAGAGTTCTCTCGCATCCCGATCAGTTATTCTCTTGGTATCCTGAAGTAGCAAAACCCCTCCCACTTTTCAGATTGGGTTCTTCCAGATTTATGTGTTCTCTATTGACTGTTTGTTAGGTATCCTTAGAAGTTCAATTTCCTGTCAAAGGCTGAGCGTGCCTCTTTATCATAGAA
Unaligned ( gi|23 ): CTCTGGTCGGAGCACAGAGCCTGCACACTGGACCTCCATCCGTCATTCTGTCTTGGGTCCTGCTCTCGCTTCGCACTCCCAGGTCATTTCACTGGTCCTTGAGTTCTGCTTGCGAGAGTTCTTTGCAGGGGTTGTGGACATCGGTCTCCTCCTTTCCTTTCCCC
Unaligned ( gi|26 ): CCACACTATCAAAAGGCCTTCCTCAGAGTCGATGAAAGTTTATGGTACAGTGGCGAGTTCCATCCAGTGATTGCTCTAATGATAATTCGAGCGTTGCTATCTGGTCTGTGCATGAATCTGTCTGTTCTAAACC
Unaligned ( gi|28 ): TGCGTCAGCGTTAAGAGCTTCAAGGGGGATGCCGTCAGGACCTGCTGCCTTACCGTTCTTCAAGAACTTAATGGATTTGGTGATCTCTGCCTTGGTTGGCAGGCTGATGTTGACACGAAGGGGTTCCTCT
Unaligned ( gi|29 ): TACTTTACTTATGCCTACTACCCCTTCTGGGACATACATTTAGTAGACCGTCAACAAGATTTCTCCAGGCCCTCTATTCTGTGCAATTCGTTCCATTTCCTTCCAATTTCCCCC
Unaligned ( gi|30 ): AGATCAATATCGTCAGCAATATCTCAATCTTCCAGTCTGGTTGAAAGTCTCCATACAAGCCCTCTCGCTTGATCACTAGTGGTCTTCGTCATCACCCAGTCGATGA
Unaligned ( gi|31 ): TAATCATTTTCTCTCCGGTCAGAGCACAGGGCCTGGACACTGGACCTCCATCGTCCTTTGTCTTGGATGCTCTCCTCGCTTCACTCCA
Unaligned ( gi|33 ): TTGTATTGTCTTGTTTCCTCATTACCTAGTCTATCACCCCCAAAAGAAATAGAAAATCAGACATTACAACATCCTGCTTACTCC
Unaligned ( gi|35 ): GTTGAACGGCTTTCCTCAAAGTCAACGAAAAGGTCGTGTACAATGGAGACTGCCATTCGATGGAGCTGCTCGATGAT
Unaligned ( gi|36 ): AGTCCTCTTTGCTCCGGCCGGAGCTCAAGGCCTGTACAATAGACCTCCATCGTCTTCTGTCTTGGGCTGCTCTCT
Unaligned ( gi|40 ): GCTCTGATCTCATTCTCTTGTCTAGCGCCCCCTTTCGTCTCTCCAGGATGATTCTGGTCAGCAC
Unaligned ( gi|41 ): CGTAGTACTGCATCAGCTTCCAGATTGTCTCGAGCTCCCTGTCAACACTGTCGAAGGCTTTTCT
Unaligned ( gi|42 ): CGCCCACTAGATTTCTCTATGCACTCTGTCCGTGCAATCTGCCAGTTCTTCCAATTTCCCCCT
Unaligned ( gi|43 ): CTCTCTTGCCGGAGCACAAGGCCTGCACAATAGACCTCCATCGTCTTCTGTCTTGGGCTGC
Unaligned ( gi|44 ): GCACAAGGCCTGCACAATAGACCTCCATCGTCTTCTGTCTTGGGCTGCTTATCCTCGCC