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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                              tgttacatcaagaaataaacattttttttcataaaaacagaacaattaataggaatgattgttctgtttctaataataataatataaatttgcaaagaaatgattAGGAATTGTCTCATGGGAATA-------------A---TGGTGTTTCAAAGAGTTC--Aattaattaaataat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaaatctgtgacctttaattaagatgacatcATTGTTTCGTGGGAATAATTATC-TAAGCCA---TGATGTTTCGAG----TC--ATTTAG-A----------------TGAAAGG--C---C-----ATTCTGT--CT--------AC-GATTCCATTTGTC-CAGTGG-GTAATGATCTAAGTCATGG-TG---TTTCAAA--------------ATG--AAGA-------G-CTAA---------ATTGCG-GCTGTCCAGTTAAA----------GATTAATTAATAA-ATAATACACGAATAATTAATAA---ATAATACACGAAGGCTGTGGAAAT-ATTTT-GTCACTCCTTT-AGTTATGGGACAT----TTCTTTGTACAACCCAAAATTAGCATTCATC--TAAATACATGCAATA-----G--AATGACAATATGTTTTGAAAT---ATATCT-----GTT-------------------GT-----------------T--------A----ATTGAATAATTTAAGAGAT--AT-ATTGACAAGTCTTTGTGAAATTGCAATGTGCAATAGACACACCACAAAGAATAGGTATGA-TTTTACCTCGGACCTT-ACGGCAAAGATATCAAATGGTGCAA----TGTAGG--------TTAAAA------TGATTTAGTAGTGGCATGTACT----TCCATCTGT--TTATAATGA---ATAAACA-C-TTAAAACGGGCGTATCGTGTGCCATGGCTGTGCACTTTATTgccaggcatgcaaaggtgattcagataagagccagattgaatcgctccagttagatattgattgatgagtataatgtaagaaagctgtgaaaataattagtcacttctttcagttataggacatgtacttctttgaacaatcaaaataatgcatgttttgaaatgaagtgatttgaagaattcaagagataaatattgacaagaaaattatggttaacgtgattttgggttgatgtccatacatgcaccacaatctgttatgattttctttcgataatctacgcaaatgggtattggtcaaagttgcgtgtcgccaaatttatttattatagaaagtgtatt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atTGTCCCAAGAGATTAATTGTA-TAAGCCAATGTGGTGTTTCAAGAAGTCC--AGCTGG-ACATGCAAAAATCATTTGGATAAA--AG--CCTATAATTCCAT--CTGTCCTGTTAAAGATCCAATTTGCCCCATAGGAGGAATAATCTAAGCC-CTGGTG---TTTCAAGGGGTCCAG-TGAGCA--CCAAGAT--GCCTG-G-----G-CTA-CGTT---------------AAA--T-A----TGTCTAATT------A----------ATGA-GGGTAAAC--TAATGTAAAAAGGCCATGAAAATca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aatgataacaaatgcattattatgctatatgaagaaattaaggcacagactaccggtacaagcataataacaaagcagctctatgGAGTAATGATCTACGTCATTG-TA---TTTTAAGAAGTTCAGTTGGACATGCAAAGATAATTTTG-ATTAAAG-CCA-AATTCTG-GCTGTCCAATTAAGATTCA-ATTTGTCCCTTTGG-AGTA----------ATGATC--TAAGTCATGGTGTgtttttt
gi|6                          :                                                                                                                      atgatatggcacgtgacccgttatggggttcatgtagatttgagtccttgaatcaacaaacttttttaatttgtgcatcttcagagagatgtaaattgcagcttaaaatcaggccatttaaacttttaaaatttaaaactacgttttaagggagataatccctacataaattatacagtaaccctattcaataattaagaaatacagattttttttttttgtaaaacgtagcaacatgaataatttttatttgtttctaacagtaatgatataaacacatgcagtattgtaagtagattttacagattcgtaaaaactgacaagtacatcacacactgatggagaaattgaGATTAATTGTATAAGCCAATG-TGGTGTTTCAAGAAGTCCAGCTGGACATGCAAAAATCATTTGG-ATAAAAGCCTATAATTCCA-TCTGTCCcctacgaaattcatttggacatgcaaagatcat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aatgataacaaatgcattattatgctatatgaagaaattaaggcacagactaccggtacaagcataataacaaagcagctctatgtgtcccaagaG-TG---TTTCAAAGAGTTCAGCCAGGCATGCAAAGGTGATTCAG-ATAAGAG-CCA-GATTG---------------AA--TCGC-----TCCAGTTAG-AT-A----------TTGATTGATGAGT-ATAATGTAAGAAAGCTGTGAAAATAA--TTAGTCACTTCTTTCAGTTATAGGACATGTACTTCTTTGAACAA-TCAAAATAAtgttaaagatccaatttgccccataggaggaataatctaagccctggtgtttcaaggggtccagtgagcaccaagatgcctgggctacgttaaatatgtctaattaatgagggtaaactaatgtaaaaaggccatgaaaatgtttttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaaatctgtgacctttaattaagatgacatcaggaattgtctcatgggaataatgGT-TTAATGTAAGAAGATTGTGGAAAT----TT-GCCACTCCTTT-A------------------------ATAA------ATAAGTA---ATCCAT--ATAC-TGTAC-ACGTGTG--AAAGGAATTATCT----AGAT---ATATGT-----AATAAATGA-----------AAATAAGTTGAAATATTTCAGT--------A----CTTGAACAATTCAATATAT--AT-Atgcatgttttgaaatgaagtgatttgaagaattcaagagataaatattgacaagaaaattatggttaacgtgattttgggttgatgtccatacatgcaccacaatctgttatgattttctttcgataatctacgcaaatgggtattggtcaaagttgcgtgtcgccaaatttatttattatagaaagtgtatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCTTTTTGCAACCCAAATTAAGCA---ATT--C--ATAC-CATG--T-----GTGAAAGGAATTATCT----AAAT---ATATGT-----AAT-----ACATGTCACTTGAAATATTTCAG----------T--------AGTTTTTTCAACAATTCAAGAGAT--ATAATTG-CAAGTC-------ATTTACACTATGCAATAGACGTAATGCAAGGATTAATCTTGATTTTC-CCTCAAACCTTAAAAGCAAATATATT-----GTGCAATCTT------TGCACCAGTTAAGATTGACATGATTT--T-G-----------------TATTT----------TGA---ATAAACAGC-TG---ATGGGCATATTATATGCCGTAGTGATGCTCTTTATT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGT----AAATTACAAATGA-----AATG----A-----------AAAT-----------------TTCTAACATA----TTTTAACAATTTA-GCAAT--GT-ATTGACAAGTC-------ATTTGCAGTGTTTAGTAGAT------------ATAATCTTGA-TTTTACCT-----CT----------GATACT-----GTGCAATCTaaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgAAT---GCATGTTTTGAAAT-----G-----------AAGT-----------------G--------A----TTTGAAGAATTCAAGAGATAAAT-ATTGACAAGgattttgtgtcatacactgtcatctgtttataatgaagaaacatctgataggcgtatcctgtgctgtggtggtgcactttgctctatattta
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaaatctgtgacctttaattaagatgacatcaggaattgtctcatgggaataatggtgtttcaaagagttcagccaggcatgcaaaggtgattcagataagagccagattgaatcgctccagttagatattgattgatgagtataatgtaagaaagctgtgaaaataattagtcacttctttcagttataggacatgtacttctttgaacaatcaaaat--AT-ATTTACAAGTC-------AATAAAAATGTACAATAAACACATTTCAAAGAATAATCTT-GCTTTTATCTCAAACTTT-AAAGCAAGGATATT-----TTGCAATCTTTGCA--TG---CAGTTAGGGTTGGCATGATTT--T-GTATCCTGTTCT-TT-TCTCTAAAT--TTATAATGAATCATAAACGTCATT---AAA---AAATGGTGTGATGTAaaaattatggttaacgtgattttgggttgatgtccatacatgcaccacaatctgttatgattttctttcgataatctacgcaaatgggtattggtcaaagttgcgtgtcgccaaatttatttattatagaaagtgtatt
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Unaligned ( gi|15 ): AATTAGATTGCATTGTACATGTACTACAAAATTTGCAAAATAATGAACATGCACCTCACACAACATGCAGAGGAAT
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Reference ( family-2232 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                           AAACTGA-CAAGTACATCACACA-CNGATGGAGGAATTGTCTCGTGGGAATAATTATC-TAAGCCA---TGGTGTTTCAAGGAGTTCAGTTGGACA-TGCAAA-A--TA-TTTTGATNGA---C---CA-AATTCTGT---CTGT----CCAATTAA-GAT----TCN--ATTTGTCCCNTNGGAGTAACGATCTAAGCCATNGTGTTTCAAGGAGTTCAGCTGGACATGCAAAGAT-CATTCTG-ATAAGAGCCANATTNC-GTCTGTCCAGTTAAATCA----TGTCCAATTAGANAATGAT---CG-ATAAGT-----ATAATGTAAGAAGGCCGTGGAAAT-A---TT-GTCACTCCTTT-AGTTATGGGACAT----TTCTTTGTACAACCCAAAATAA-GCA---ATC--T--ATAC-C--GTA--A-----GAAAGGAATTATNT----AAAT---ATA--TGTAAT-A---------------AAATAT------T-----A----TTTGAACAATTCAAGAGAT--AT-ATTGACAAGTC-------ANTTGCAATGTGCAATAGACGCANCGCAAAGAATAATCTTGACTTTTACCTCGAACCTT-AAAGCAAAGATATTGTGCAATCTTTGCA--TG---CAGTTAAGATTGACATGATTT--T-GTGTCATGTACT-TC-TCTATTTAT--TTATAATGA---ATAAACATCT--NACGGGCGTATCGTGTGCCGTGGCGGTGCACTTTATTCTA
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Reference ( family-2232 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                           AAACTGA-CAAGTACGTCACACA-CAGATAGAGGAATTGTCTCGTGGGAATAATTATC-TAAGCCA---TGGTGTTTCAAGGAGTTCAGTTGGACA-TGCAA----C----ATTTTGAT-GA----C---CA-AATTCTGT---CTGT----CCAATTAA-GATTCCAT------TTGTCCCGTGGGAGTAACGATCTAAGTCATGGTGTTTCAAAGAGTTCAGCTGGACATGCAAAGAT-CATTCTG-ATAAGAGCTANATTGC-GTCTGTCCAGTTAAATCA----TGTCTAATTAAANAATGAT---CGA-TAAGTA-----TAATGTAAGAAGGCTGTGAAAAT-A---TT--GTCACTCCTTT-AGTTATGGGACGT----TTCTTTGTACAACCCAAAATAA-GCA---ATC--TA--TAC--TGTA-A-----GAAAGGNATTATCT----AAAT---ATAT--GTAAT-A---------------AAAT---------GT------TATTTGAACAATTCAAGAGAT--AT-ATTGACAAGTC-------AATCGCAATGTGCAATAGACACATTACAAGGAATAATCTTGA-TTTTACCTCAAACCTT-AAAGCAAAGATATTGTGCAATCTTTGCA--TG---CAGTTAAGGTTGACATGATTT--T-GTGTCATGCACTTT-TCTATCTGT--TTATAATGA---ATAAACATCT--GACGGGCGTATCGTGTGCCGTGGCGGTGCACTTTATTCTA
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Reference ( family-2232 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                           AAACTGA-CAAGTACGTCACACA-CAGATAGAGGAATTGTCTCGTGGGAATAATTATC-TAAGCCA---TGGTGTTTCAAGGAGTTCAGTTGGACA-TGCAA----C----ATTTTGAT-GA----C---CA-AATTCTGT---CTGT----CCAATTAA-GATTCCAT------TTGTCCCGTGGGAGTAACGATCTAAGTCATGGTGTTTCAAAGAGTTCAGCTGGACATGCAAAGAT-CATTCTG-ATAAGAGCTANATTGC-GTCTGTCCAG---TTAAATATGTTTAAT-TAAAAAATGAT---CGA-TAAGTA-----TAATGTAAGAAGGCTGTGAAAAT-A---TT--GTCACTCCTTT-AGTTATGGGACGT----TTCTTTGTACAACCCAAAATAA-GCA---ATC--TA--TAC--TGTA-A-----GAAAGGNATTATCT----AAAT---ATAT--GTAAT-A---------------AAAT---------GT------TATTTGAACAATTCAAGAGAT--AT-ATTGACAAGTC-------AATCGCAATGTGCAATAGACACATTACAAGGAATAATCTTGA-TTTTACCTCAAACCTT-AAAGCAAAGATATTGTGCAATCTTTGCA--TG---CAGTTAAGGTTGACATGATTT--T-GTGTCATGCACTTT-TCTATCTGT--TTATAATGA---ATAAACATCT--GACGGGCGTATCGTGTGCCGTGGCGGTGCACTTTATTCTA
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                         atAGACTGAACAAGCACATAACACAACAGATAGAGGAATTGTCTCGTGGTTATCTTTATC-AAAGTCA---TGGTGTTTCAAGGAGTTC-------CAATGCA-----C----ATTTTGAT-GA----TAGGCA-AATTCTATAT-CTGT----C-ATTTAA-GATTCCAT------CTGTCCCTTGGGAGTGACAATCTAAGCCATGGTATTTCAAAGTGTGCAGCTGGACATGCAAAAGT-CATTGTGAATGAGAGCTAAATTGCAGTCTGTCCAG---TTAAAGA---TTAATATAAa
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Reference ( family-2232 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                           AAACTGA-CAAGTACGTCACACA-CAGATAGAGGAATTGTCTCGTGGGAATAATTATC-TAAGCCA---TGGTGTTTCAAGGAGTTCAGTTGGACA-TGCAA----C----ATTTTGAT-GA----C---CA-AATTCTGT---CTGT----CCAATTAA-GATTCCAT------TTGTCCCGTGGGAGTAACGATCTAAGTCATGGTGTTTCAAAGAGTTCAGCTGGACATGCAAAGAT-CATTCTG-ATAAGAGCTANATTGC-GTCTGTCCAGTTAAA-------TA--TT----TAATTAAAAAATGAT---CGA-TAAGTA-----TAATGTAAGAAGGCTGTGAAAAT-A---TT--GTCACTCCTTT-AGTTATGGGACGT----TTCTTTGTACAACCCAAAATAA-GCA---ATC--TA--TAC--TGTA-A-----GAAAGGNATTATCT----AAAT---ATAT--GTAAT-A---------------AAAT---------GT------TATTTGAACAATTCAAGAGAT--AT-ATTGACAAGTC-------AATCGCAATGTGCAATAGACACATTACAAGGAATAATCTTGA-TTTTACCTCAAACCTT-AAAGCAAAGATATTGTGCAATCTTTGCA--TG---CAGTTAAGGTTGACATGATTT--T-GTGTCATGCACTTT-TCTATCTGT--TTATAATGA---ATAAACATCT--GACGGGCGTATCGTGTGCCGTGGCGGTGCACTTTATTCTA
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Reference ( family-2232 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                           AAACTGA-CAAGTACGTCACACA-CAGATAGAGGAATTGTCTCGTGGGAATAATTATC-TAAGCCA---TGGTGTTTCAAGGAGTTCAGTTGGACA-TGCAA----C----ATTTTGAT-GA----C---CA-AATTCTGT---CTGT----CCAATTAA-GATTCCAT------TTGTCCCGTGGGAGTAACGATCTAAGTCATGGTGTTTCAAAGAGTTCAGCTGGACATGCAAAGAT-CATTCTG-ATAAGAGCTANATTGC-GTCTGTCCAGTTAAA-------TA--TT----TAATTAAAAAATGAT---CGA-TAAGTA-----TAATGTAAGAAGGCTGTGAAAAT-A---TT--GTCACTCCTTT-AGTTATGGGACGT----TTCTTTGTACAACCCAAAATAA-GCA---ATC--TA--TAC--TGTA-A-----GAAAGGNATTATCT----AAAT---ATAT--GTAAT-A---------------AAAT---------GT------TATTTGAACAATTCAAGAGAT--AT-ATTGACAAGTC-------AATCGCAATGTGCAATAGACACATTACAAGGAATAATCTTGA-TTTTACCTCAAACCTT-AAAGCAAAGATATTGTGCAATCTTTGCA--TG---CAGTTAAGGTTGACATGATTT--T-GTGTCATGCACTTT-TCTATCTGT--TTATAATGA---ATAAACATCT--GACGGGCGTATCGTGTGCCGTGGCGGTGCACTTTATTCTA
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gi|4                          : gagtcctacagacaacaaactgtcaatttgcacatctaaaaaaaaatgtaaattgcagcttaaaatcaaaacttttagaatggcaaatatttattgaaaaaaaaaaactgttttaagggaggtcaccttataaatgcaataattattgcatcaaaaaatgcaccttttcttaaaatatatctacaggacaattaatatgaatagttatttcatttttaacataaatgatatagaaattatgcagtattgtactacaaaacttatgaAAACTGA-CAAGTACATCACACA-CTGATGGAGAAATTG-------AGAGTAATGATC-TACGTCA---TTGTATTTTAAGAAGTTCAGTTGGACA-TGCAA----AGATAATTTTGAT-TAAAG-C---CA-AATTCTGG---CTGT----CCAATTAA-GATTCAAT------TTGTCCCTTTGGAGTAATGATCTAAGTCATGGTGTCCTACGAAATTCATTTGGACATGCAAAGAT-CAT
gi|5                          :                                                                                     atgatatggcacgtgacccgttatggggttcatgtagatttgagtccttgaatcaacaaacttttttaatttgtgcatcttcagagagatgtaaattgcagcttaaaatcaggccatttaaacttttaaaatttaaaactacgttttaagggagataatccctacataaattatacagtaaccctattcaataattaagaaatacagattttttttttttgtaaaacgtagcaacatgaataatttttatttgtttctaacagtaatgatataaacacatgcagtattgtaagtagattttacagattcgtaaA-AAATCTGTGACCTTT------AATTAA-GATGACATCAGGAATTGTCTCATGGGAATAA------------TGGTGTTTCAAAGAGTTCAGCCAGGCATGCAAAGGT-GATTCAG-ATAAGAGCCAGATTGA-ATCGCTCCAGTTAGA-------TA--T----------------TGAT---TGA-TGAGTA-----TAATGTAAGAAAGCTGTGAAAATAA---TTA-GTCACTTCTTTCAGTTATAGGACATGTACTTCTTTGAACAA-TCAAAATAATGCA-----------------TGT-------------------TTT----GAA------AT--G---------------------AAGT---------G--------ATTTGAAGAATTCAAGAGATAAAT-ATTGACAAG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTCCCAAGAGATTAATTGTA-TAAGCCAATGTGGTGTTTCAAGAAGTCCAGCTGGACA-TGCAAAAATC----ATTTGGAT-AAAAGCC---TATAATTCCAT---CTGT----CCTGTTAAAGATCCAAT------TTGCCCCATAGGAGGAATAATCTAAGCCCTGGTGTTTCAAGGGGTCCAG-TGAGCA--CCAAGATGC---CT------GGGCTAC---------------GTTAAA-------TATGTC----TAATT----AATGA----GGG-TAAAC------TAATGTAAAAAGGCCATGAAAAT-G---TT--aaaattatggttaacgtgattttgggttgatgtccatacatgcaccacaatctgttatgattttctttcgataatctacgcaaatgggtattggtcaaagttgcgtgtcgccaaatttatttattatagaaagtgtatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aatgataacaaatgcattattatgctatatgaagaaattaaggcacagactaccggtacaagcataataacaaagcagctctatgTCTTTTTGCAACCCAAATTAA-GCA---ATT--CA--TACCATGTG-T-----GAAAGGAATTATCT----AAAT---ATAT--GTAAT-ACATGTCACTTG----AAATATTTCAGTAGT------TTTTTCAACAATTCAAGAGAT--ATAATTG-CAAGTC-------ATTTACACTATGCAATAGACGTAATGCAAGGATTAATCTTGA-TTTTCCCTCAAACCTTAAAAGCAAATATATTGTGCAATCTTTGCA--C----CAGTTAAGATTGACATGATTT--T-GT-------ATTT-------------------TGA---ATAAACAGCT--GATGGGCATATTATATGCCGTAGTGATGCTCTTTATTtttt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATTGAGGACATGTCTCAAGGGA-TAATTAAC-TAAGCTA---TGATATTTCAAGGAGTTTAGTTGG-------------C----ATTC------------------AATTCTGT---CTGTGCAATCAATTAA-GATTCCAT------TTATTCC--------AA------AA----------TTCAAAGAGTTCATCTGGACATGCAAAGAT-CACTCTG-ATAAGGGCCATATTTT-ATCTGTCCAGTTAAA-------TA---T----TAATTAAATAATaaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgttacatcaagaaataaacattttttttcataaaaacagaacaattaataggaatgattgttctgtttctaataataataatataaatttgcaaagaaatATGT----AAATTACAAAT--GAAATGA---------------AAAT---------TTCTAACATATTTTAACAATTTA-GCAAT--GT-ATTGACAAGTC-------ATTTGCAGTGTTTAGTAGATA------------TAATCTTGA-TTTTACCTC------T---------GATACTGTGCAATCT----------------------------GATTT--T-GTGTCATACACTGT-C--ATCTGT--TTATAATGA---AGAAACATCT--GATAGGCGTATCCTGTGCTGTGGTGGTGCACTTTGCTCTA


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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTT-----TAATGTAAGAAGATTGTGGAAAT----TT--GCCACTCCTTT-AAT------------------------------AAATAAGT-AATCCAT----ATACTGTAC-ACGTGT----GAAAGGAATTATCT----AGATATATGTAATAAATGAAAATAAGT------TGAAATATTTCAGTA----CTTGAACAATTCAATATAT--ATA-attaaaaaatggtgtgatgta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATTGTTTCGTGGGAATAATTATC-TAAGCCA---TGATGTTTCGAG----TCATTTAGA------------------TGA--AAGGC-C-A---TTCTGT---CT--------AC-GATTCCAT------TTGTCCAGTGGG--TAATGATCTAAGTCATGGTGT---------TTCA-----------AAA---------TG-A--AGAGCTAAATTGC-GGCTGTCCAGTTAAAG------------AT---TAAT-TAATAAATAATACACGAATAATTAATAAATAATACACGAAGGCTGTGGAAATA---TTTTGTCACTCCTTT-AGTTATGGGACAT----TTCTTTGTACAACCCAAAATTAGC-A-TTCATCTAAA-------T-ACATGCAATAGAATGACAATATGTTTTGAAATATATCTGTTG------------T------T--AA---------------TTGAATAATTTAAGAGAT--ATA-TTGACAAGTCTTTGTGAAATTGCAATGTGCAATAGACACACCACAAAGAATAGGTATGA-TTTTACCTCGGACCTTACG-GCAAAGATATCAAATGGTGCAAT-------------------GT--AGGTTAAAATGATTTAGTAGTGGCATGTACT-TCCATCT----GT------TTATAATGA---ATAAACACTTAAAACGGGCGTATCGTGTGCCATGGCTGTGCACTTTATTC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                         atAGACTGAACAAGCACATAACACAACAGATAGAGGAATTGTCTCGTGGTTATCTTTATC-AAAGTCA---TGGTGTTTCAAGGAGTTC-------CAATGCACA------TTTTGATGATAGG-C-A-AATTCTATAT-CTGTC-ATTTAA-GATTCCAT------CTGTCCCTTGGGAGTGACAATCTAAGCCATGGTATTTCAAAGTGTGCAGCTGGACATGCAAAAGT-CATTGTGAATGAGAGCTAAATTGCAGTCTGTCCAGTTAAAG------------AT---TAATATAATa
gi|4                          : gagtcctacagacaacaaactgtcaatttgcacatctaaaaaaaaatgtaaattgcagcttaaaatcaaaacttttagaatggcaaatatttattgaaaaaaaaaaactgttttaagggaggtcaccttataaatgcaataattattgcatcaaaaaatgcaccttttcttaaaatatatctacaggacaattaatatgaatagttatttcatttttaacataaatgatatagaaattatgcagtattgtactacaaaacttatgaAAACTGA-CAAGTACATCACACA-CTGATGGAGAAATTG-------AGAGTAATGATC-TACGTCA---TTGTATTTTAAGAAGTTCAGTTGGACA-TGCA-AAGATAATTTTGATTAAAGC-C-A-AATTCTGG---CTGTCCAATTAA-GATTCAAT------TTGTCCCTTTGGAGTAATGATCTAAGTCATGGTGTCCTACGAAATTCATTTGGACATGCAAAGAT-CATt
gi|5                          :                                                                              atgatatggcacgtgacccgttatggggttcatgtagatttgagtccttgaatcaacaaacttttttaatttgtgcatcttcagagagatgtaaattgcagcttaaaatcaggccatttaaacttttaaaatttaaaactacgttttaagggagataatccctacataaattatacagtaaccctattcaataattaagaaatacagattttttttttttgtaaaacgtagcaacatgaataatttttatttgtttctaacagtaatgatataaacacatgcagtattgtaagtagattttacagattcgtaa-A-AAATCTGTGACCTTT--AATTAA-GATGACATCAGGAATTGTCTCATGGGAATAA------------TGGTGTTTCAAAGAGTTCAGCCAGGCATGCAAAGGT-GATTCAG-ATAAGAGCCAGATTGA-ATCGCTCCAGTTAGAT------------AT---T--------GA----T---TGA-TGAGTA-----TAATGTAAGAAAGCTGTGAAAATAA--TTA-GTCACTTCTTTCAGTTATAGGACATGTACTTCTTTGAACAATC-AAAATA---------AT----G-------C-ATGT-----------------TTT----GAA---ATGAAGTG---------------------------------A----TTTGAAGAATTCAAGAGATAAATA-TTGACAAG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTCCCAAGAGATTAATTGTA-TAAGCCAATGTGGTGTTTCAAGAAGTCCAGCTGGACA-TGCA-AAAATCATTTGGATAAAAGC-CTATAATTCCAT---CTGTCCTGTTAAAGATCCAAT------TTGCCCCATAGGAGGAATAATCTAAGCCCTGGTGTTTCAAGGGGTCCAG-TGAGCA--CCAAGATGC---CT------GGGCTAC---------------GTTAAAT------------ATGTCTAAT-TAATGA--------GGG-TAAAC------TAATGTAAAAAGGCCATGAAAATG---TT--aaaattatggttaacgtgattttgggttgatgtccatacatgcaccacaatctgttatgattttctttcgataatctacgcaaatgggtattggtcaaagttgcgtgtcgccaaatttatttattatagaaagtgtatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aatgataacaaatgcattattatgctatatgaagaaattaaggcacagactaccggtacaagcataataacaaagcagctctatgTCTTTTTGCAACCCAAATTAAGC-AATTCAT----A-------CCATGTGT----GAAAGGAATTATCT----AAATATATGTAATA--------CA--TGTCACTTGAAATATTTCAGTAGTTTTTTCAACAATTCAAGAGAT--ATAATTG-CAAGTC-------ATTTACACTATGCAATAGACGTAATGCAAGGATTAATCTTGA-TTTTCCCTCAAACCTTAAAAGCAAATATATT-----GTGCAATCTTTGC------AC---CAGTTAAGATTGACATGATTT--T-GTAT----------------------------TT----TGA---ATAAACAGCT--GATGGGCATATTATATGCCGTAGTGATGCTCTTTATTtttt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATTGAGGACATGTCTCAAGGGA-TAATTAAC-TAAGCTA---TGATATTTCAAGGAGTTTAGTTGG-CA-TTCA-A------TTCTG----------------TCTGT---GCAATCAATTAA-GATTCCAT------TTATTCC--------AA------AA----------TTCAAAGAGTTCATCTGGACATGCAAAGAT-CACTCTG-ATAAGGGCCATATTTT-ATCTGTCCAGTTAAAT------------AT---TAAT-TAAaaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgttacatcaagaaataaacattttttttcataaaaacagaacaattaataggaatgattgttctgtttctaataataataatataaatttgcaaagaaatTA----TTTTAACAATTTA-GCAAT--GTA-TTGACAAGTC-------ATTTGCAGTGTTTAGTAGATA------------TAATCTTGA-TTTTACCTC------T---------GATACT-----GTGCAATCT-------------------------------GATTT--T-GTGTCATACACTGTCA-TCT----GT------TTATAATGA---AGAAACATCT--GATAGGCGTATCCTGTGCTGTGGTGGTGCACTTTGCTCTAataat
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): ATGTATTGCATAGCCCTTTTGGGTTTTTAAAGATTTGAGTCCTAGAATTAGTAACACTTGTAAGTCTGTGCTTCTGTCAAGAAAAATTACAGGTCAGTCAAAACTTTTTAAATAGCAAGTATTTAAAATAAAACACTGTTTAAAGGAAGGCAATCCCTACAAA
Unaligned ( gi|12 ): TAAGGGAGGTAATCTCTACTTAGGTAAGAGAGGAATTCAGTAACCCTATTCAAAAATTATTGTATTAAGGAATATACATTTCCCCATAAAATTTAGCTATATGACAATCAGTATGAATAATGATTTTGTTTCTACGAATGATGATATAAATATATGTAGTACT
Unaligned ( gi|14 ): TAAGAAAGGTAATTCCTACATCACATGTATATGTAAGAGTAATGCAAGCAACCCTATTAAAAAATAATTACAGCAAGAAAGGTACATTT
Unaligned ( gi|15 ): AATTAGATTGCATTGTACATGTACTACAAAATTTGCAAAATAATGAACATGCACCTCACACAACATGCAGAGGAAT
Unaligned ( gi|16 ): GATTCGTGTAGATTCGAGTCCTAGAATCGACAAACTTTGTCAATTT