lowQualScore                  :                                                                                              111111111111111                                                  1    
lowQualScore                  :                            2           1 1     1  2 1 33333 1 2222 4444 222 1 1  11  444 11  000000000000000  11 1 11 444    1 1 222 5555  1  1 1      77     0    
lowQualScore                  :                            .           . .     .  . . ..... . .... .... ... . .  ..  ... ..  ...............  .. . .. ...    . . ... ....  .  . .      ..     .    
lowQualScore                  :                            2           3 3     2  5 2 11111 2 7777 8888 222 2 2  66  444 66  666666666666666  77 2 77 888    3 4 444 3333  4  4 4      33     3    
consensus                     :                        CGGA-ACCCACGGTTG-A-TTACG-CT-T-C-----G-T----T----C---C-T-CT--CT---C--CA--T----CA-----TGA--T-G--G---AGAG-A-G---G----AA-CG-A-AGCGTAA-TCAACCGTGG
Reference ( gi|7 )            :                        CGGA-ACCCACGGTTG-A-TTACG-CT-T-C-----G-T----T----C---C-T-CT--CT---C--CA--T----CA-----TGA--T-G--G---AGAG-A-G---G----AA-CG-A-AGCGTAG-TCAACAGTGG
gi|8                          :                        CGGA-ACCCACGGTTG-A-TTACG-CT-T-C-----G-T----T----C---C-T-CT--CT---C--CA--T----CA-----TGA--T-G--G---AGAG-A-G---G----AA-CG-A-AGCGTAG-TCAACAGTGG
gi|1                          :                        CGGATACCCATATTTT-A-TGACG-CT-T-C-----A-T----T----C---C-T-CT--CT---CTCCA--T----CA------GA--T-G--G---AGAG-A-G---G----AA-AG-A-AGCATAA-TCCAC
gi|5                          :         catcagatatccaaaCGAA-ACCCACGGTTG-A-TTTAG--T-G-C-----G-T----T----C---C-T-CT--CT---C--CATCT----CG-----TGA--T-G--G---AGAG-A-A---GGAA-AA-CA-A-AGCa
gi|12                         :                tgattaagCGGA-ACCAACAGTTG-G-CTACG-CT-T-C-----C-T----T----C---C-T-CT--CT---C--C-------------------------------AG-A-G---G----AA-CT-A-ATCGTAT-TCacg
gi|11                         :                catcatcgCGGA-ACCCACGGTTC-A-TTACA-CT-T-CCTTAAA-T----T----T---C-T-CT--CT---T--CA--T----TA-----ac
gi|19                         : tgttggaaccctgcacggttgatCGGA-ACCCACGGTTG-A-TCACG------------------------------------------------------------TGA--T-G--G---AGAG-A-G---G----GA-CG-A-AACGac
gi|3                          :                     tcgtGAA-ACCCACGGTTG-A-TTATG-CT-T-C-----G-T----T----T---C-T-CT--CTCTAC--CG--C----CA-----GGG--T-G--AC--AGAG-A-C---G----AA-CG-A-AGTGCA--TCAAC
gi|20                         :                         GGC-ACCCACGGTTG-A-TTACG-CT-T-C-----G-T----T----C---C-T-CT--CTC--C--CA--T----CA-----Tcgatg
gi|2                          :                         GGA-ACCCACAATTG-A-TTACG-CT-T-T-----G-T----CGGAAC---C-C-ATGGCT------GA--T----TACGCTCTGT--T-G--G---AGAG-A-G---G----TA-CA-A-AGCGTAA-TCAGCTGTGtg
gi|10                         :                      gctGAA-ACCCACTGTTA-A-TTATG-CA-T-C-----G-T----T----C---C-T-------------CA-------CA-----AGA--T-G--G---AGAG-A-G---G----AT-CG-G-A
gi|13                         :      acggttggatttagtgtcgGAA-ACCCACGGTTG-A-TTACG-----------------------------------------------------CA-----AGA--T-G--G---AGAG-A-G---G----AA-TG-A-c
gi|6                          :     tcacgatttgattaaatagtgGA-ACCCACTGTTG-A-CTACG-CT-T-C-----G-T----T----C---C-T-CT--CT---C--CA--T----CA-----TGA--T-G--G---AGA--A-G---G----AA-CG-A-AGCGTAA-TCAACCGTGG
gi|4                          :                       aacGA-ACCCACGGTTG-A-TTACG-CT-TAC-----G-T----T----CCTGC-T-CT--CT---C--CT--T----------------------------G-A-G---G----AACCG-AGAGCGTAATTCAACCGTGG
gi|4                          :                   gtcgaacGA-ACCCACGGTTG-AATTACG-CTCT-C-----GGT----T----C---C-T-C-----------------------------A--A-G--G---AGAG-A-GCAGG----AA-CGTA-AGCGTAA-TCAACCGTGGg
gi|6                          :                        gtcA-ACCCACGGTTG-A-TTACG-CT-T-C-----G-T----T----C---C-T--T--CT---C--CA--T----CA-----TGA--T-G--G---AGAG-A-G---G----AA-CG-A-AGCGTAG-TCAACAGTGGgttcg
gi|18                         :                           A-ACCCACGGTTG-A-TTACA-CT-T-C-----A-T----T----C---T-T-CT--CC---C--CA--TTGCACA-----TGA--T-G--gttc
gi|1                          :                           a-ATCCAAAGTGG-A-TTATG-CT-T-C-----T-T----T----C---C-T-CT--CT---C--CA--T----C------TGA--T-GGAG---AGAG-A-G---G----AA-TG-A-AGCGT
gi|15                         :                    catcagat-ACTCACGGTTG-A-TTACG-TT-T-C-----G-T----T----C---C-T-CT--CT---A--CA--T----CA-----CAA--T-C--G---TGAG-cataaaatatgggtatccga
gi|8                          :                      tcgtcggaaCCACTGTTG-A-CTACG-CT-T-C-----G-T----T----C---C-T-CT--CT---C--CA--T----CA-----TGA--T-G--G---AGAG-A-G---G----AA-CG-A-AGCGTAA-TCAACCGTGG
gi|2                          :                          cggaacCACAGCTG-A-TTACG-CT-T-T-----G-T----A----C---C-T-CT--CT---C--CA--A----CAGAGCGTAA--TCA--G---CCAT-G-G---GTTCCGA-CA-A-AGCGTAA-TCAATTGTGG
gi|10                         :                         gctggaacACGGTTGGA-TTTAG-TG-T-C-----G-TCCGAT----C---C-T-CT--CT---C--CA--T----CT-----TG---T-G-----------A-G---G----AA-CG-A-TGCATAA-TTAACAGTGG
gi|3                          :                                  CGGTTG-A-T-GCA-CT-T-C-----G-T----T----C---G-T-CT--CTG--T--CA--C----CC-----TGG--C-G--GTAGAGAG-A-G---A----AA-CG-A-AGCATAA-TCAACCGTGGgtttcc
gi|9                          :                             gaaacCGGTAG-A-TTAAC-CTAC-C-----G-T----T----C---C-T-CT--CT---C--CA--T----CA-----TGA--T-G--G---AGAG-ATG---G----AA--G-A-AGCGTatg
gi|14                         :                            cgttatgGGTTG-A-TTACA-TG-T-C-----A-T----T----C---T-T-CT--TT---C--CA--T----CA-----TGA--T-G--G---AGAGAA-A---G----AA-AT-A-TGCCTAG-TCAatgtggtgcgac
gi|16                         :                                   GGTTA-A-TTACG-CT-T-C-----G-C----T----C---C-T-CT--CT---C--C-------------------------------AA-A-G---G----AA-CG-A-AGCGTAT-TC
gi|9                          :                             atcgtcgGTT--A-TGACG-CT-T-C-------T----T----C---CAT-CT--CT---C--CA--T----CA-----TGA--T-G--G---AGAG-A-G---G----AA-CG-
gi|17                         :                                    cTTG-A-TTACG-CT-T-C-----G-T----T----C---C-T-CT--C-----------------------TGA--T-G--G---AGAgtaggttaatctaccgatgtggtgcgac
gi|5                          :                   acatcgtcagagcccacggTG-A-TTAAGGCT-T-T-----G-T----TTTC-C---T-T-CT--CT---C--CA--T----CA-----CGAGAT-G--G---AGAG-A-G---G----AA-CG-C-A-CTAAA-TCAACCGTGG
gi|14                         :                                      TG-A-CTAGG-CA-T-A-----T-T----T----C---T-TTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGA--T-G--G---AAAG-A-A---G----AA-TG-A-CATGTAA-TCAACgtttcgacg
gi|16                         :                                       G-A-ATACG-CT-T-C-----G-T----T----C---C-T-TT---------------------------------G--G---AGAG-A-G---G----AG-CG-A-AGCGTAA-TTAACc
gi|12                         :                                atcgtcgG-A-ATACG-AT-T-A-----G-T----T----C---C-T-CT---------------------------------G--G---AGAG-A-G---G----AA-GG-A-AGCGTAG-CCAACTGTc
gi|19                         :                                      catcatcgCG-TT-T-C-----G-T----C----C---C-T-CT--CT---C--CA--T----CACG---TGA--T-tggttccgac
gi|15                         :                                                            tcgtcggaacccacggttg-CT--CA---C--GA--T----TG-----TGA--T-G--T---AGAG-A-G---G----AA-CG-A-AACGTAA-TCAACCGTG
gi|17                         :                                                                        tcgtcggaaT--CT---C--CA--T----CA--------------------GAG-A-G---G----AA-CG-A-AGCGTAA-TCAAagt
gi|20                         :                                                                                   acatcgtcagagcccacggA-----TGA--T-G--GG--AGAG-A-G---G----AA-CG-A-AGCGTAA-TCAACCGTGG





Alignments
lowQualScore                  :                                                                            11111111111111111111111                                                     
lowQualScore                  :                            2                   2 2 55555   4444 333    22  55555555555555555555555     2    2 2  444 5555 2   2  2 444    2 2 2        
lowQualScore                  :                            .                   . . .....   .... ...    ..  .......................     .    . .  ... .... .   .  . ...    . . .        
lowQualScore                  :                            5                   0 0 00000   2222 555    88  66666666666666666666666     4    5 7  777 7777 7   7  7 777    9 9 9        
consensus                     :                        CGGA-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAA-T-C-AACCGTGG
Reference ( family-1992 )     :                        CGGA-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAA-T-C-AACCGTGG
gi|1                          :                        CGGATACCCATATTTTATGACGCT-T-C-----ATT----C---CTCT--CT---CTCCA--T----CA------GATGG-AGAG-A-GG---A----A-AGA-AG-C---ATAA-T-C-CACTTTGG
gi|10                         :               catcagatatGAA-ACCCACTGTTAATTATGCA-T-C-----GTT----C---CT------------CA-------CA-----AGATGG-AGAG-A-GG---ATCGGA-CGA-CA-C---TAAA-TCC-AACCGTa
gi|11                         :                        CGGA-ACCCACGGTTCATTACACT-T-CCTTAAATT----T---CTCT--CT---T--CA--T----TA-----c
gi|12                         : tgttggaaccctgcacggttgatCGGA-ACCAACAGTTGGCTACGCT-T-C-----CTT----C---CTCT--CT---C--C------------------------AG-A-GG---A----A-CTA-AT-C---GTAT-T-C-ac
gi|13                         :                 catcatcgGAA-ACCCACGGTTGATTACG---------------------------------------------CA-----AGATGG-AGAG-A-GG---A----A-TGA-CA-CTATTTAA-T-CAAATCGTGac
gi|14                         :                                  tGGTTGATTACATG-T-C-----ATT----C---TTCT--TT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAGAA-AG---A----A-ATA-TG-C---CTAG-T-C-
gi|15                         :                            -ACTCACGGTTGATTACGTT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---A--CA--T----CA-----CAATCG-TGAG-
gi|16                         :                          tcgtcggaaGGTTAATTACGCT-T-C-----GCT----C---CTCT--CT---C--C------------------------AA-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAT-T-C-
gi|17                         :                              atcgtcgTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--C-----------------------TGATGG-AGA
gi|18                         :        acatcgtcagagcccacggA-ACCCACGGTTGATTACACT-T-C-----ATT----C---TTCT--CC---C--CA--TTGCACA-----TGATG
gi|19                         :                       aCGGA-ACCCACGGTTGATCACG----------------------------------------------------TGATGG-AGAG-A-GG---G----A-CGA-AA-C---G
gi|2                          :                     tcgtGGA-ACCCACAATTGATTACGCT-T-T-----GTCGGAAC---CCATGGCT------GA--T----TACGCTCTGTTGG-AGAG-A-GG---T----A-CAA-AG-C---GTAA-T-C-AGCTGTG
gi|20                         :                      gctGGC-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CTC--C--CA--T----CA-----T
gi|3                          :                         GAA-ACCCACGGTTGATTATGCT-T-C-----GTT----T---CTCT--CTCTAC--CG--C----CA-----GGGTGACAGAG-A-CG---A----A-CGA-AG-T---GC-A-T-C-AACCGtg
gi|4                          :                          GA-ACCCACGGTTGATTACGCT-TAC-----GTT----CCTGCTCT--CT---C--CT--T---------------------G-A-GG---A----ACCGAGAG-C---GTAATT-C-AACCGTGGatg
gi|5                          :                 gtcgaacCGAA-ACCCACGGTTGATTTAG-T-G-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CATCT----CG-----TGATGG-AGAG-A-AGGAAA----A-CAA-AGCC---TTAA-T-C-g
gi|6                          :                          GA-ACCCACTGTTGACTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGA--A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAA-T-C-AACCGTGGacg
gi|7                          :                     aacCGGA-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAG-T-C-AACAGTGG
gi|8                          :                        CGGA-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAG-T-C-AACAGTGG
gi|9                          :                                  CGGTAGATTAACCTAC-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-ATGG---A----A--GA-AG-C---GTCA-T---AAC





Alignments
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lowQualScore                  :                            2                   2 2 55555   4444 333    22  55555555555555555555555     2    2 2  444 5555 2   2  2 444    2 2 2        
lowQualScore                  :                            .                   . . .....   .... ...    ..  .......................     .    . .  ... .... .   .  . ...    . . .        
lowQualScore                  :                            5                   0 0 00000   2222 555    88  66666666666666666666666     4    5 7  777 7777 7   7  7 777    9 9 9        
consensus                     :                        CGGA-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAA-T-C-AACCGTGG
Reference ( family-1992 )     :                        CGGA-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAA-T-C-AACCGTGG
gi|1                          :                        CGGATACCCATATTTTATGACGCT-T-C-----ATT----C---CTCT--CT---CTCCA--T----CA------GATGG-AGAG-A-GG---A----A-AGA-AG-C---ATAA-T-C-CACTTTGG
gi|10                         :               catcagatatGAA-ACCCACTGTTAATTATGCA-T-C-----GTT----C---CT------------CA-------CA-----AGATGG-AGAG-A-GG---ATCGGA-CGA-CA-C---TAAA-TCC-AACCGTa
gi|11                         :                        CGGA-ACCCACGGTTCATTACACT-T-CCTTAAATT----T---CTCT--CT---T--CA--T----TA-----c
gi|12                         : tgttggaaccctgcacggttgatCGGA-ACCAACAGTTGGCTACGCT-T-C-----CTT----C---CTCT--CT---C--C------------------------AG-A-GG---A----A-CTA-AT-C---GTAT-T-C-ac
gi|13                         :                 catcatcgGAA-ACCCACGGTTGATTACG---------------------------------------------CA-----AGATGG-AGAG-A-GG---A----A-TGA-CA-CTATTTAA-T-CAAATCGTGac
gi|14                         :                                  tGGTTGATTACATG-T-C-----ATT----C---TTCT--TT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAGAA-AG---A----A-ATA-TG-C---CTAG-T-C-
gi|15                         :                            -ACTCACGGTTGATTACGTT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---A--CA--T----CA-----CAATCG-TGAG-
gi|16                         :                          tcgtcggaaGGTTAATTACGCT-T-C-----GCT----C---CTCT--CT---C--C------------------------AA-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAT-T-C-
gi|17                         :                              atcgtcgTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--C-----------------------TGATGG-AGA
gi|18                         :        acatcgtcagagcccacggA-ACCCACGGTTGATTACACT-T-C-----ATT----C---TTCT--CC---C--CA--TTGCACA-----TGATG
gi|19                         :                       aCGGA-ACCCACGGTTGATCACG----------------------------------------------------TGATGG-AGAG-A-GG---G----A-CGA-AA-C---G
gi|2                          :                     tcgtGGA-ACCCACAATTGATTACGCT-T-T-----GTCGGAAC---CCATGGCT------GA--T----TACGCTCTGTTGG-AGAG-A-GG---T----A-CAA-AG-C---GTAA-T-C-AGCTGTG
gi|20                         :                      gctGGC-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CTC--C--CA--T----CA-----T
gi|3                          :                         GAA-ACCCACGGTTGATTATGCT-T-C-----GTT----T---CTCT--CTCTAC--CG--C----CA-----GGGTGACAGAG-A-CG---A----A-CGA-AG-T---GC-A-T-C-AACCGtg
gi|4                          :                          GA-ACCCACGGTTGATTACGCT-TAC-----GTT----CCTGCTCT--CT---C--CT--T---------------------G-A-GG---A----ACCGAGAG-C---GTAATT-C-AACCGTGGatg
gi|5                          :                 gtcgaacCGAA-ACCCACGGTTGATTTAG-T-G-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CATCT----CG-----TGATGG-AGAG-A-AGGAAA----A-CAA-AGCC---TTAA-T-C-g
gi|6                          :                          GA-ACCCACTGTTGACTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGA--A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAA-T-C-AACCGTGGacg
gi|7                          :                     aacCGGA-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAG-T-C-AACAGTGG
gi|8                          :                        CGGA-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAG-T-C-AACAGTGG
gi|9                          :                                  CGGTAGATTAACCTAC-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-ATGG---A----A--GA-AG-C---GTCA-T---AAC


blockSeqs                     :                            .                   A A CTTAA   GGAA CTG    GG  CCATTGCACAT                 C    A T  GAA TCGG C   G  C TAT    T C A
blockSeqs                     :                            .                   . . .       .    .      .   GATTACGCTCT                 .    . .  .   .    .   .  . .      . . .
blockSeqs                     :                            .                   . . .       .    .      .   CTACCGCCAG                  .    . .  .   .    .   .  . .      . . .
blockSeqs                     :                            .                   . . .       .    .      .   CCATCTCGT                   .    . .  .   .    .   .  . .      . . .
blockSeqs                     :                            .                   . . .       .    .      .   CCCATCAT                    .    . .  .   .    .   .  . .      . . .
blockSeqs                     :                            .                   . . .       .    .      .   CCATCAT                     .    . .  .   .    .   .  . .      . . .
blockSeqs                     :                            .                   . . .       .    .      .   ACATCAC                     .    . .  .   .    .   .  . .      . . .
blockSeqs                     :                            .                   . . .       .    .      .   CCATCAT                     .    . .  .   .    .   .  . .      . . .
blockSeqs                     :                            .                   . . .       .    .      .   CCATCAT                     .    . .  .   .    .   .  . .      . . .
blockSeqs                     :                            .                   . . .       .    .      .   CCATCAT                     .    . .  .   .    .   .  . .      . . .
blockSeqs                     :                            .                   . . .       .    .      .   CCATCAT                     .    . .  .   .    .   .  . .      . . .
blockSeqs                     :                            .                   . . .       .    .      .   CACAA                       .    . .  .   .    .   .  . .      . . .
blockSeqs                     :                            .                   . . .       .    .      .   CCTT                        .    . .  .   .    .   .  . .      . . .
blockSeqs                     :                            .                   . . .       .    .      .   CAA                         .    . .  .   .    .   .  . .           
blockSeqs                     :                            .                   . . .       .    .      .   CC                          .    .                                  
blockSeqs                     :                                                . . .       .    .      .   CC                          .                                       
blockSeqs                     :                                                . . .       .    .      .   T                                                                   
blockSeqs                     :                                                . . .       .    .      .   T                                                                   
blockSeqs                     :                                                . . .       .    .      .                                                                       


blockSeqCons                  :                                                                            CCATCAT****************
originalCons                  :                        CGGA-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAA-T-C-AACCGTGG
finalCons                     :                        CGGA-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CTCCATCAT----------------GATGG-AGAG-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAA-T-C-AACCGTGG





Alignments
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lowQualScore                  :                            2                   2 2 55555   4444 333    22  55555555555555555555555     2    2 2  444 5555 2   2  2 444    2 2 2        
lowQualScore                  :                            .                   . . .....   .... ...    ..  .......................     .    . .  ... .... .   .  . ...    . . .        
lowQualScore                  :                            5                   0 0 00000   2222 555    88  66666666666666666666666     4    5 7  777 7777 7   7  7 777    9 9 9        
consensus                     :                        CGGA-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAA-T-C-AACCGTGG
Reference ( family-1992 )     :                        CGGA-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAA-T-C-AACCGTGG
gi|1                          :                        CGGATACCCATATTTTATGACGCT-T-C-----ATT----C---CTCT--CT---CTCCA--T----CA------GATGG-AGAG-A-GG---A----A-AGA-AG-C---ATAA-T-C-CACTTTGG
gi|10                         :               catcagatatGAA-ACCCACTGTTAATTATGCA-T-C-----GTT----C---CT------------CA-------CA-----AGATGG-AGAG-A-GG---ATCGGA-CGA-CA-C---TAAA-TCC-AACCGTa
gi|11                         :                        CGGA-ACCCACGGTTCATTACACT-T-CCTTAAATT----T---CTCT--CT---T--CA--T----TA-----c
gi|12                         : tgttggaaccctgcacggttgatCGGA-ACCAACAGTTGGCTACGCT-T-C-----CTT----C---CTCT--CT---C--C------------------------AG-A-GG---A----A-CTA-AT-C---GTAT-T-C-ac
gi|13                         :                 catcatcgGAA-ACCCACGGTTGATTACG---------------------------------------------CA-----AGATGG-AGAG-A-GG---A----A-TGA-CA-CTATTTAA-T-CAAATCGTGac
gi|14                         :                                  tGGTTGATTACATG-T-C-----ATT----C---TTCT--TT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAGAA-AG---A----A-ATA-TG-C---CTAG-T-C-
gi|15                         :                            -ACTCACGGTTGATTACGTT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---A--CA--T----CA-----CAATCG-TGAG-
gi|16                         :                          tcgtcggaaGGTTAATTACGCT-T-C-----GCT----C---CTCT--CT---C--C------------------------AA-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAT-T-C-
gi|17                         :                              atcgtcgTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--C-----------------------TGATGG-AGA
gi|18                         :        acatcgtcagagcccacggA-ACCCACGGTTGATTACACT-T-C-----ATT----C---TTCT--CC---C--CA--TTGCACA-----TGATG
gi|19                         :                       aCGGA-ACCCACGGTTGATCACG----------------------------------------------------TGATGG-AGAG-A-GG---G----A-CGA-AA-C---G
gi|2                          :                     tcgtGGA-ACCCACAATTGATTACGCT-T-T-----GTCGGAAC---CCATGGCT------GA--T----TACGCTCTGTTGG-AGAG-A-GG---T----A-CAA-AG-C---GTAA-T-C-AGCTGTG
gi|20                         :                      gctGGC-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CTC--C--CA--T----CA-----T
gi|3                          :                         GAA-ACCCACGGTTGATTATGCT-T-C-----GTT----T---CTCT--CTCTAC--CG--C----CA-----GGGTGACAGAG-A-CG---A----A-CGA-AG-T---GC-A-T-C-AACCGtg
gi|4                          :                          GA-ACCCACGGTTGATTACGCT-TAC-----GTT----CCTGCTCT--CT---C--CT--T---------------------G-A-GG---A----ACCGAGAG-C---GTAATT-C-AACCGTGGatg
gi|5                          :                 gtcgaacCGAA-ACCCACGGTTGATTTAG-T-G-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CATCT----CG-----TGATGG-AGAG-A-AGGAAA----A-CAA-AGCC---TTAA-T-C-g
gi|6                          :                          GA-ACCCACTGTTGACTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGA--A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAA-T-C-AACCGTGGacg
gi|7                          :                     aacCGGA-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAG-T-C-AACAGTGG
gi|8                          :                        CGGA-ACCCACGGTTGATTACGCT-T-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-A-GG---A----A-CGA-AG-C---GTAG-T-C-AACAGTGG
gi|9                          :                                  CGGTAGATTAACCTAC-C-----GTT----C---CTCT--CT---C--CA--T----CA-----TGATGG-AGAG-ATGG---A----A--GA-AG-C---GTCA-T---AAC