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13 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-198 ) : GAACAAAAAAAGTTTAGCAACTTGTAATATTTAATATCGCATAATCAACATCACCATAT---GTGAG---AAATTTGTATTCAGTAT--TT-ATG---AATGTCTCCATC---AAACAA----AAA-TG--A-AAACATGC---CAT-------AATAAT-CTCTAAATCAATTT-TTCAAACGAAAAGATGTCACA--G-AAA--AAA-AG--AAAGGG-TAAGG--TATGAAA-ATCCACGTTC--TTCAATACTTTG--TA-TG-GCCTCCATTAGCAGCTACCACAG-CCAAACATCG-------ACGTCTC-A----TGCTT-----CT-GATGAGGTTT--CGGAGCTCG--TGTAAT----C-GT----GA----TTTGGTTCCATTCTTGCTGAA-GC----GC-TC---GA----CTCAAATCGGCTACGTTGTTGAC-GTT--AT-G--TCGCTCTCTCACA-CGTCGACCAA-GAATGTCCCA----CACATGCTCAATT--G------GTGATAA-ATCAGGT--GA-TCT--TGCGGGCCA------TTCCA-GT-AC---NTCGATAT-TGTTCTG--C---------CGTAAAA-CGTC-CTGGGTGTGT---C-GCGCGGTGTGCGGTCGAGCGT-TATC-CTGTT--GAA-ATATGGTAACTTGACCCTGGTTCAAAA-A-C-GGCAC-AACTACA-GGA-ACCAC-AATTTCTGCA-CAATA-A-----CGCTGTGAATTCAGA--TTTCCAT--TTACT--ATGACGAGGCATGTTTTCCCATAAGAACTGATCCCCCCCCCA-AA-------CCATG-ACAC---T-AC-CA--CCACCA--TAGCGGTC--ACGTTG--A--A-TGACGTT-TTCGGG-G-A-TGAA-----ACC--GCT-CATT--TCGT--CGTC---T-CCAA-AC-ACGAGCGC-G-T-CCAT--CTGCAAAA--TC-C--ACATT-----AAAACGA-GA--CT-CGTCAGTAAACAAAA---CTGTAG-TCCATT-G-CC---GCCGAGTCCAGCGA-AG-ATGG-GT---G--G-TTGCC-CA----GGC-AACACGAGTT-TG-A--CG--AT-GACGTCG----AGTC--AAA--GGGACCG-CAACAAGA-GG-TCTCC-GA-G-CGCG-TA--GATTAGCAGTCC--GTAACC---T---G-TTTCT-------C-ACACT-CTG--AGCACC-CATCCT-CA-CTCC--A-G---ACGC---------CCG-A---T--GTA-A-CTCATCGG--CGA-C---TTTG--GGT-G--CA--GACATG---A----AGCGGTT-A-------CGTC-T-CGACG--T--CGTA---ACA---A---T-AAA--TCTGT-CT-TGGCGA-ACCGT--TG--TTTTC-----CGTGNACGCCCAT------GA-C-------GTCGAC--G-GT--CG-CTGACTTG-TC-CTG--TTA-CTC-GAAA--ACGAC-TC-AAAAGT-C-GACTNATAGTCG
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gi|1 : gC---C-CCAC-AC--CGAGCGCCG----CA---CTGGCAAA--TC-C--ACAT-------AAACGAAGA--CT-CGTGCGTA--TAAAA---CTAT---CCCATT-G-CCCT-GCCGAGTCCA-CGC-AG-ATGTCGT---G--T-CT--C-CA----GAC-AACACGAGT---G-A--CGC-AT-GCAGT------AGTC--AAA--GG-ACCG-TAA-AAGA-G--TCTCC-GA-C-CGCG-TA--GATTA-CAG-CC--G-AACC----------TTC--------C-ACAC--CTG--AGCACC-CATCC--CA-CCCC--T-T---A--C---------CCG-A---T--GTA----TCA--GGCACAA-C---TTTG--GGT----CA--GACAT----A----AGCG--T-C-------GGTC---CGACG--T--C--C---ATA---A---T-AAA----TGT-TT---GCGA-ACCGT--TT--TTTTC-----GGACGACGCCtctttcccccacaccgagcgccgcactggcaaatccacataaacgaagactcgtgcgtataaaactatcccattgccctgccgagtccacgcagatgtcgtgtctccagacaacacgagtgacgcatgcagtagtcaaaggaccgtaaaagagtctccgaccgcgtagattacagccgaaccttccacacctgagcacccatcccaccccttacccgatgtatcaggcacaactttgggtcagacataagcgtcggtccgacgtccataataaatgtttgcgaaccgtttttttcggacgacgccgctattcaaaaagtcgaactgatagttgagggatgaacaactaaattagtcgcgctaacatcctgaacgacatcccgctgaaagcacccgctagctctgtcttcattttgagtacaattagtaagaccttttccaatttgaattgtttggaaaacttgatcgtttttttgtgtacctgttcgaaatgatacccatgagtcgcttaaaattgcgtgcaatcaatcgtgactcatgtttacaaaaaatatatacgccaaccagacgttcacgtggccatactgtgctgatcaatagtattcttctctgcggttgggtaggaaataaaaatcagaaagcctaaaaatgatgtagacgaatatacctacattcaaattaattgctaagctttttctgttaagt
gi|10 : gtccattagcgctaccacagcaaacatgacatatccatgcttctagagcggagctcgtgcatcgtgtttagtcattcttgatgatgcacgatcaatcggctacgtttgacgttagtcgctcctcaacgtcgacgaatgccacacattctcaattggtgtaatcaggtgaatcttgcggccatatgatgagatattgttctggccgtataagtcctgggtgtgtgagccgcggtatgcggtccagcgtatcgctgttgaatatgtaattgaccctagttcaaaagactgtcataaacttcaggataccactaatttctgcacataatgctgggattcagatcatgattactatacaaaacattttcccataagatgattccgccccaaaccatcatacagatacacacctagcgtcactctttcCAGCATTACCATAT---CTAAG---AAATTCGTATT---------T-ATG---AATGTCTTCAAT---AAACAA----AAAATG--A-AAACATGC---CAT-------AATAAT-CTCTAAATCAGTTT-TTCAAGCGAAAAAATGTCGCA--G-AAA--AAA--G--AAAGGG-TAAGG--TATGAAA-ATTCAAGTTA--TTAAATACTTTG--TT-TG-GCCTCCATTAGCAGCTACCACAG-CCATACACCG-------ACGTCTC-A----TGCTT-----TT-GATGAGGTTT--CGGAGCTCG--TGTA-T----T-GT----GA----TTTGGTTACATTCCTACTGAA-GT----GC-AT---GA----CTCAAATAGGCTACGTTTTTGAC-GTT--AT-G--TCGCTCTCTCACA-CGTCGACCAA-GAATGTCCTA----CACATGCTCAATT--T------GTGAAAA-ATCAGGT--GA-TCT--TGCAGTCCA------TTCCA-AT-AC---GTCGATAT-TATTCTG--T---------TGTAGGA-CATC-TTGGGTGTGT---C-GCATGGTGTGCGGTCGACCGT-TATC-CTGTT--GAA-ATATGGTAACTTGACCCTGGTTCCAAA-A-T-GCCAC-AATTACA-GGA-ACCAC-TATTTCTTCA-CAATA-A-----CGCTGTGAATTCAGG--GTTACAT--TTACT--GTGACGGCGCATGTTTTCTCATACTGACTGAT-TCCATCCCA-AA-------CTAGG-ACAC---T-AC-CA---CACCA--Tgctattcaaaaagtcgaactgatagttgagggatgaacaactaaattagtcgcgctaacatcctgaacgacatcccgctgaaagcacccgctagctctgtcttcattttgagtacaattagtaagaccttttccaatttgaattgtttggaaaacttgatcgtttttttgtgtacctgttcgaaatgatacccatgagtcgcttaaaattgcgtgcaatcaatcgtgactcatgtttacaaaaaatatatacgccaaccagacgttcacgtggccatactgtgctgatcaatagtattcttctctgcggttgggtaggaaataaaaatcagaaagcctaaaaatgatgtagacgaatatacctacattcaaattaattgctaagctttttctgttaagt
gi|11 : C---------CCG-A---T--GTA-A-CTCATCGG--CGA-C---TTTG--GGC-A--CA--GACATG---A----AGCGGTT-A-------CGTC-T-CGACG--T--CGTA---ACA---A---T-AAA--TCTGT-CT-TGGCGA-ACCGT--TG--TTTTC-----CGTGAACGCCCAT------GA-C-------GTTGAC--G-GT--CG-CTGACTTG-TCTCTG--TTA-CTC-GAAA--ACGAC-TCAAAAAGT-CTGACTTATAGTCG
gi|12 : ACTTG-TC-CTG--TTA-CTC-GAAA--ATGAC-TC-AAAAGT-C-GACTAATAGTTGagggatgggacattaaattgtcgcgctaacatcctgtacggacatctcagcgttaaggcaatcccgatagctctgtttacatgtcattttcagatattcgggacgttttcccatttgtttctggaagctttagcgtttttttcgtgtgtacgctgtgtcgaatgatgacctgtggatattgctttgaaattgcgttgcaattcaatcgtgaaccaattgtttagcaaaaatttgtaaaaacgtcatctccatgactacacgtaccgcatattgtgctgaacactcatgtattgct
gi|13 : GAACAAAAAAAGTTTGGCAACTTGTAATATTTAATACCGCATAATCAATATCACCATAA---GTGAG---AAATTTGTATTCAGTAT--TT-ATG---AATGTCTCCATC---AAACAA----AAA-TG-----AACATGC---CAT-------AATAAT-CTCTAAATCATTTG-TTTAAACGAAAAGATGTCACA--G-AAA--AAA-AA--ACAGagagatggacattaaattgtcacgcttcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagattcgtggacgttttcccttttgaattttttggaacgttttttgtgtgtacgcgtgttcgaaatgatacccatgcggatgtttgctttgaaattgcgcaatcaattatgaccatttgtttaacaaaaattgtaaaacgccaacccatgacgttcacatgacgcatattgtgctgatcactcatgtattgctttctctgcgtgttatagt
gi|13 : atactAACAGCTACCACAG-GCAAACATCG-------AAGTCTC-A----TG---------T-AATGAGGTTT--CGTAACTCG--TGTA-T----T-GT----GA----TTTGGTTCCATTCTTGCTAAA-GC----GCCTC---GA----CTCAAATCGGCTACGTTGTTGAC-GTA--ATTG--TCGCTCTCTCTCAACGTCGACCAA-GAATGTCCCA----CACATGCTCAATT--ctaccacaggcaaacatcgaagtctcatgtaatgaggtttcgtaactcgtgtattgtgatttggttccattcttgctaaagcgcctcgactcaaatcggctacgttgttgacgtaattgtcgctctctctcaacgtcgaccaagaatgtcccacacatgctcaatt
gi|14 : atactgaacaaaaaaagtttggcaacttgtaatatttaataccgcataatcaatatcaccataagtgagaaatttgtattcagtatttatgaatgtctccatcaaacaaaaatgaacatgccataataatctctaaatcatttgtttaaacgaaaagatgtcacagaaaaaaaACAGGTCAAACATCGGTACAAGATG-CTC-AGCATTGCTTGTGACCTAGATGAGTTTTTCCGGAGCTCGGTTG-AAT----CTGTCACGGACGCTTTTGGTTCGATC--TGCTGAATGCCTAGGC-TCTTCGATCTTCTCAA-TCGGCTACATTGTTGACGGTTGGAT-GGTTCG-GCTCTCACA-CGTCGACGAACGATTCTCCGACCGGCGTATGCTC--TTACG------GGG------TC-GGTTAGA-ACTGCTACGGGCTAATGTTCCTCCACGTAACGTATTCGATATATGTTCTGGTCCCTCGTCTGCGTAAAATCGTCTCTGGGTGTAT---CTGCGC-GTTTGCGGTCG
gi|16 : AACAAAAAAAGTT------------ATATTTAATATCGCATAATTAACATCACCGTAT---GTGAG---AAATTTGTATTCAGTAT--TT-ATA---AATGTCTCCATC---AAACAA----AAA-TG--A-AAACATGC---CAT-------AATAAT-CTCTAAATCAATTT-TTCAAACGAAAAAATGTCACA--GAAAA--AAA-AG--AATGGG-TAAGG--TATGAAA-ATCCACGTTC--TTCGATACTTTG--TA-TG-GCCTCCCTAAGCACCTACCACAG-CCAAACATTG-------ACGTCTC-A----TGCTT-----CT-GATGAGGTTT--CGGAGCTCG--TGT-AT----C-GT----GA----TTTGGTTCC
gi|17 : tttACCTGACCCTAGTTTAAAA-A-C-GGCAT-AACTACA-GGA-ACCAC-AATTTCTGCA-CAATG-A-----TGCTGTGAATTCAGA--TTTTCAT--TTACT--ATGACAAAGCATGTTTTCCCATAAGAACTGA--ATCCTCCCA-AA-------CCATG-ATAC---T-AC-CA--CCACCA--TAGCGGTC--ATGTTG--A--A-TGACGTT-TTC-GG-G-A-TGAA-----ACT--GCT-CATT--TCGT--AGTC---T-CCAA-AC-ACGAGCAC-G-T-CCAT--CTGCAAAA--TC-A--ACATC-----AAAACGA-GA--TT-CGTCAGTAAACAAAA---ATGTAT-TCCATT-G-CC---GCCGAGTCCAGTGC-AG-
gi|18 : GAACAACAAA-GTTTAGCAACTTGT-ATATTTAATATCGGCTAATCA--ATCA-CATATA--GTGAGGGCAAATGTGTATTTAGGGT--TA-ATG---AATGTCT--ATCTCGAAACAAGAGGAGA-TGCTACAGACATGCTTTTATGATTACCAATAATCCTCTAAATCAATTTCTTCAAATGAAAAGATGTCACATTG-CAGGTAAA-TGTCATAGGG-TAAAGGTTATGAAAGATCCACGTTCTTTTCAATACTTTGGCTATTGTGCCTC
gi|19 : atattctttgttaGAACAAAAAAAGTTTAGCAACTAGTAATATTTAATATCGCATAATCAACATCACCGTAT---GTGAG---AAATTTGTATTCAGTAT--TTTATGTTTCATGTCTCCATC---AATCAA----AAA-TT--A-AAACATGC---CAT-------TATAAT-CTCTAAATCAATTT-TT-AAACGAAAAAATGTCACA--G-AAA--AAA-AG--AAAGGG-TAAGG--TATGTAA-ATCTACGTTC--TTCAATACTTTG--TA-TG-GCCTCCATTTGCAGCTACCACAG-CCAAttt
gi|2 : tatactGGACAAAAAAAGTTTAGCAACTTGTAATATTTAATATCGCATAATCAACATCACCATAT---GTGAA---AAATTTGTATTTAGTAT--TT-ATG---AATATCTCCATC---AAACAA----AAA-TA--A-AAACATGC---CAT-------AATAAT-CTCTAAA---------------------ATGTCACA--G-AAA--AAA-GG--AAAGGG-TAAGG--TATGAAA-ATACACGTTC--TTCAATGCTTTG--TA-TG-ACCTCCACTAGCAGCTACCACAG-CCAAACATCG-------ACATCTC-A----TACTT-----CT-GATGAGGTTT--CGGAGCTCG--TGTAATACATT-GT----GA----TTTGGTTCCATTCTTGCTGAG-GC----GT-TC---GA----CTCAAATCGGCTACGTTGTTGAC-GTT--AT-G--TCGCTCTCTCACA-CTTCGACCAA-GCATGTCTCA----CACATGCTCAATT--G------GTGATAG-ATCATGT--GA-TCT--TGCAGGCCA------TTCCA-GT-AC---TTTGATAT-TGTTCTG--C---------CGTAAAA-CGTC-CTTGGTGTGT---C-GCGCAGTGAGCGGTCGAGCGT-TATC-CTGTT--GAA-ATATGGTAACTTGACCCTGGTTCAAAA-A-C-GGCA---A-TACA-GGA-ACCAC-AATTTCTGCA-CAATA-A-----CGCTGTGAATTCAGA--TTTCCAT--TTACT--ATGGCAAGGCAAGTTTTCCCATAAGAACTGCCCCCCCCCCCCCAA-------CCATG-ACAC---T-AC-CA--CCACCA--TAGCGGTC--ACGTTG--A--A-TGAAGGT-TTGGGG-G-AATGGA-----ACC--GCT-CATT--TCGT--CTTC---T-CCAA-GC-ACGAGCGC-G-T-CCAT--CTGCAAAA--TC-C--ACATT-----AAAACAA-GA--TT-CGCCAGTAAACAAAA---TTGTAG-TCCATT-G-TC---GCCGAATCCAGCGA-AG-ATGG-GT---G--G-TTGCC-CA----GGC-AACACGAGTT-TG-A--CG--AT-GACGTCG----AGTC--AAA--GAGACCG-CAACAAGA-GG-TCTCC-GA-G-CGCG-TA--GATTAGCAGTCT--GTAACC---T---G-TTTCT-------C-ACACT-CTG--AACACC-CACCCT-CA-CTCC--A-G---ACGA---------CCG-A---T--GTA-A-CTCAGTGG--CGA-C---TTTG--GGT-G--TA--GATATG---A----AGCGATT-A-------CGTC-T-CGACG--T--CGTA---ACA---A---T-AAA--TCTGT-CT-TGGTGA-ACCGT--TG--TTTTC-----CGTGTACGCCCAT------GA-C-------GTCGAC--G-GT--TG-CTGACTTG-TC-CTG--TTA-CTC-TAAA--ACGAC-TC-ACAAGT-C-GACTGATAGTTG
gi|28 : TT--GAA-ATATGGTAACTTGACCCAAGTTCAAAA-A-C-GGCAT-AACTACA-GGA-ACCA
gi|29 : AATATTTAACATCGCATAATCAACATCACCATATAAAGTGAG---AAATTGGT
gi|3 : ACCAAAGCATG---CT----CACATGCTCAATTT-G------GTGATAAGATCATGT--GA-T-T--TGACAGCCA------TTTCA-GT-AC---TT-GTTAT-TGTTCTG--C---------C-TAAAA-CGTC-CTTGGTGTGT---C-GCGCAGTGAGCG-TCGAGCGT--ATT-CTGTT--GAATATA-GGTAACTTGACCCTGGTTCAAA----C-GGCA---A-TACA-G-A-ACCAC-AATTTCTGCA-CAATA-A-----CGCTGTGAATTCAGAGATTTCCAT--TTACT--ATGGCAAGGCATGTTTTCCCATAAGAACTG--CCCCCACCCC-AA-------CCATG-ACAC---T-AC-CA--CCA-CA--TAGCGGTC--ACGTTG--AATA-TGAAGGT-T--GGGCG-A-TGGA-----ACC--GCT-CATT--TCGT--CTTC---T-CCAA-GC-ACGAGCGC-G-T-CCAT--CTGCAAAA--TC-C--ACA-T-----AAAACAA-GA--TT-CGCCAGTAAACAAAA---TTGTAG-TCCA-T-G-TC---GCCGAATCCAGCGA-AG-ATGG-GT---G--GTTTGCC-CA-----GC-AACACGAG-T-TG-A--CG--AT-GACGTCG----AGTC--AA----GAACCG-CAACAAGA--G-TCTCC-GA-G-CGCGATA--CATTAGCAGTCT--GTAACC---T---T-TTTCT-------C-ACACT-CTG--AACACC-CA-CCT-CA-CTCC--A-G---ACGA---------CCGAA---T--GTA-A-CTCAGTGG--CGA-C---TTTG--GTT-G--TA--GATATGA--A----AACGATT-A-------CGTC-TCCGACG--T--CGTA---ACA---A---T-AAA---CTGT-CT-TGGTGA-ACCGT--TG---TTTC-----CGTGTACG-CCAT------GA-C-------GGCGAC--G-GT--TG-CTGACTTG-TC-CTG--TTA-CTC---AA--ACGAC-TC-ACAAGC-C-GACTGATAGTTG
gi|30 : cgaA--TCTGT-CT-TGGCGA-ACCGT--TG--TTTTC-----CATGGCCGCCCAT------GA-C-------GTagagatgaacattaaattggtcgtgctcatcctgttgacgacatccagccgtttaagccatcccgatagcccgttacgttcatttttcagaagattcgtggacgtgtgtactccgtgttcgaaatgatacccctgtggattgtttgctttgcaattcgtgaccaattatttagtcaaaaattgtataaagccaacccatggcgttcacgtgcgcatatttgctgatcacttccatgtgcttttctctgcgtgttacagtattaaaaaggttaaatcagaaagcactctaaaatatgcagacaaaattacctacattgaaatgaaattgctaaacttt
gi|31 : A-ATCAGGT--GA-TCT--TGCGGGCCA------TTTCA-GT-AC---GTCGATAT-T
gi|33 : aatGAATAAAAAAAGTTTAGTAACTTGTAATATTTA
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gi|5 : atact--TAGCGGTTCAACGGTGCCA--A-TGACTCTCTTCGGC-GCA-TGAA------CT--GCTACATT--TCGTAAC-TC---TACCAA-ACCACGAGC-C-G-C-C--T--CTGCAAAA--TT-CCAACATTTGCTTAAACCGA-GA--CC-CGTCAG-AAACAAAAACGCTATA--TCCATTTGTCC---GCCGA-TCCAGCCAGAC-ATGG-GTCCCGATG-TCGTC-CACAGCGGC-AACACAAGTC-TGGA--CG--AT-GAC--CGCTTTAGTC--AAATGGGGACCG-CAACAGCACGG-TCTCC-G--G-CGCG-TATCCATTAGCAGTCCCGGCAACCCATT---G-TTTCT-------CAACACTCCTGCAAGCACCATATCCTGCA-CCCC--GCA---ACGC---------CCG-AAATT--ACA-A-CTCATTCG--CAACC---TCTGAAGGT-A--CAACGCCATA---G----AGTATCTAA-------CGTCTT-CGACC--G--CTTACATACAACTA---C-AAACTCCTGT-CTCTGGCAACACCCT--TG--TTTCC-----C-----CGC---T------GACC-------GTTGACCGA-GT--CGCCCGACTctgtttttgttaatgcattcattttctg
gi|6 : GTTTAGCAACTTTCAATATTTGATACCGTATAAACAACATTACCATGA---ATAAG---AAATC-GTATTTAGTAA--TC-ATA---ATTATCTACCTT---AAACAA----AAG-GG---------TGC---TAT-------AATAAT-CTCTAAATCAACTT-TTCATATGAAAATATGTCACA--G-AAA--AAA--G--AAAGGAACAACG--TATGAGA-GTTTACATTA--TTCAATATCTTG--TA-TG-ACGTCCAATAGCAGCTACCACAT-CCAAACATCG-------AGGTATC-A----TACTT-----CG-GGTGAGGTTT--CGGAGCTCG--TGTA-T----T-GT----AA----TATGTTTCTATTTCTGCTGAA-GC----GT-AC---GA----TTCAAATTGTCTATTTTGTTGAC-GTT--AT-A--CGACTTTCTTACC-AGTCGATAAA-GCATGCCCCA----CAC----TCAATT--ACATGTAGTGATAA-ATCAGGT--GA-CCT--TGCAG---A------TT------------------AT-TATTTAG--C---------AGTTAAA-CGTC-TTGGGTGTGT---C-GCGCGGTGTGCGGTTGAGCGT--ATC-CTATT--GAA-ATATAGTAGCTTGACCCTGCTTAAAAA-A-C-AATAC-AACTACA-GTA-ACCCC-AAATTCTTCA-CTATC-A-----CGGTGTGAATTCAGA--GTTCTAT--TTACT--GTGACGAGGTATGCATTCCCATAATAAATAATTAAACCAC-A-AG-------CCATG-ACAC---T-AT-CA--CCACCT--TAGAGGTC--AAGTTG--A--A-TGACGTT-TTCGGG---A-TGAA-----ACC--GCT-CATT--TCAT--CGTC---T-CTAA-AC-ACGAGTGC-G-T-CCAA--CTGTAAAA--TT-C--GCATT-----AAAACGA-GA--CT-CGTCATTAAACAAAA---CTGTAT-TCCATT-G-CC---ATAGAGTCCAGCAC-AA-ATAG-GT---G--G-TTGCC-CA----GGC-AACACGAGTT-TG-A--CG--AT-GACGTTA----AGTC--AAA--GGGACCG-CAACGAGA-GG-TATCC-GA-G-C--------AATTTGTAGCCT--GT-TCC---TCACA-TTCCT-------C-ACACT-CTG--ATAACT-CATCTT-TA-TTCC--A-G---ACTC---------TTG-A---T--GTcaaaagtcacactgtcatatcttgagggatgaacataatattgtcgccgctacatcccatgcttgcgactaatacccgctcgtagcaattcccgcctgcgcctttcacgttccattttcaaggatctgctggcacccttttcccactttgactttttttcgcaaactcttgtcagcgtttattttgtgtgtacgcatgtttgctattgaaaatgcgtgcaatcacatctgaccatattggttcacgccacaaatcctctaacgccacccatgacgtttacacgtagtgcgcgacaccacctttgctgacactgtgtaattgcttctctgccgtagcagctatggaaaaatataccaattcagacagcttataccaaataaagtcagtcaaaaattactacatttcaaatttacattgctaaaccttctttttttgttaagctattataa
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13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13 : GAACAAAAAAAGTTTGGCAACTTGTAATATTTAATACCGCATAATCAATATCACCATAA---GTGAG---AAATTTGTATTCAGTAT--TT-ATG---AATGTCTCCATC---AAACAA----AAA-TG-----AACATGC---CAT-------AATAAT-CTCTAAATCATTTG-TTTAAACGAAAAGATGTCACA--G-AAA--AAA-AA--ACAGagagatggacattaaattgtcacgcttcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagattcgtggacgttttcccttttgaattttttggaacgttttttgtgtgtacgcgtgttcgaaatgatacccatgcggatgtttgctttgaaattgcgcaatcaattatgaccatttgtttaacaaaaattgtaaaacgccaacccatgacgttcacatgacgcatattgtgctgatcactcatgtattgctttctctgcgtgttatagt
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gi|33 : aatGAATAAAAAAAGTTTAGTAACTTGTAATATTTA
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13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11 : C---------CCG-A---T--GTA-A-CTCATCGG--CGA-C---TTTG--GGC-A--CA--GACATG---A----AGCGGTT-A-------CGTC-T-CGACG--T--CGTA---ACA---A---T-AAA--TCTGT-CT-TGGCGA-ACCGT--TG--TTTTC-----CGTGAACGCCCAT------GA-C-------GTTGAC--G-GT--CG-CTGACTTG-TCTCTG--TTA-CTC-GAAA--ACGAC-TCAAAAAGT-CTGACTTATAGTCG
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gi|13 : GAACAAAAAAAGTTTGGCAACTTGTAATATTTAATACCGCATAATCAATATCACCATAA---GTGAG---AAATTTGTATTCAGTAT--TT-ATG---AATGTCTCCATC---AAACAA----AAA-TG-----AACATGC---CAT-------AATAAT-CTCTAAATCATTTG-TTTAAACGAAAAGATGTCACA--G-AAA--AAA-AA--ACAGagagatggacattaaattgtcacgcttcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagattcgtggacgttttcccttttgaattttttggaacgttttttgtgtgtacgcgtgttcgaaatgatacccatgcggatgtttgctttgaaattgcgcaatcaattatgaccatttgtttaacaaaaattgtaaaacgccaacccatgacgttcacatgacgcatattgtgctgatcactcatgtattgctttctctgcgtgttatagt
gi|13 : atactAACAGCTACCACAG-GCAAACATCG-------AAGTCTC-A----TG---------T-AATGAGGTTT--CGTAACTCG--TGTA-T----T-GT----GA----TTTGGTTCCATTCTTGCTAAA-GC----GCCTC---GA----CTCAAATCGGCTACGTTGTTGAC-GTA--ATTG--TCGCTCTCTCTCAACGTCGACCAA-GAATGTCCCA----CACATGCTCAATT--ctaccacaggcaaacatcgaagtctcatgtaatgaggtttcgtaactcgtgtattgtgatttggttccattcttgctaaagcgcctcgactcaaatcggctacgttgttgacgtaattgtcgctctctctcaacgtcgaccaagaatgtcccacacatgctcaatt
gi|14 : atactgaacaaaaaaagtttggcaacttgtaatatttaataccgcataatcaatatcaccataagtgagaaatttgtattcagtatttatgaatgtctccatcaaacaaaaatgaacatgccataataatctctaaatcatttgtttaaacgaaaagatgtcacagaaaaaaaACAGGTCAAACATCGGTACAAGATG-CTC-AGCATTGCTTGTGACCTAGATGAGTTTTTCCGGAGCTCGGTTG-AAT----CTGTCACGGACGCTTTTGGTTCGATC--TGCTGAATGCCTAGGCT-CTTCGATCTTCTCAA-TCGGCTACATTGTTGACGGTTGGAT-GGTTCG-GCTCTCACA-CGTCGACGAACGATTCTCCGACCGGCGTATGCTC--TTACG------GGG------TC-GGTTAG-AACTGCTACGGGCTAATGTTCCTCCACGTAACGTATTCGATATATGTTCT-GGTCCCTCGTCTGCGTAAAATCGTCTCTGGGTGTATCTG---CGC-GTTTGCGGTCG
gi|16 : AACAAAAAAAGTT------------ATATTTAATATCGCATAATTAACATCACCGTAT---GTGAG---AAATTTGTATTCAGTAT--TT-ATA---AATGTCTCCATC---AAACAA----AAA-TG--A-AAACATGC---CAT-------AATAAT-CTCTAAATCAATTT-TTCAAACGAAAAAATGTCACA--GAAAA--AAA-AG--AATGGG-TAAGG--TATGAAA-ATCCACGTTC--TTCGATACTTTG--TA-TG-GCCTCCCTAAGCACCTACCACAG-CCAAACATTG-------ACGTCTC-A----TGCTT-----CT-GATGAGGTTT--CGGAGCTCG--TGT-AT----C-GT----GA----TTTGGTTCC
gi|17 : tttACCTGACCCTAGTTTAAAA-A-C-GGCAT-AACTACA-GGA-ACCAC-AATTTCTGCA-CAATG-A-----TGCTGTGAATTCAGA--TTTTCAT--TTACT--ATGACAAAGCATGTTTTCCCATAAGAACTGA--ATCCTCCCA-AA-------CCATG-ATAC---T-AC-CA--CCACCA--TAGCGGTC--ATGTTG--A--A-TGACGTT-TTC-GG-G-A-TGAA-----ACT--GCT-CATT--TCGT--AGTC---T-CCAA-AC-ACGAGCAC-G-T-CCAT--CTGCAAAA--TC-A--ACATC-----AAAACGA-GA--TT-CGTCAGTAAACAAAA---ATGTAT-TCCATT-G-CC---GCCGAGTCCAGTGC-AG-
gi|18 : GAACAACAAA-GTTTAGCAACTTGT-ATATTTAATATCGGCTAATCA--ATCA-CATATA--GTGAGGGCAAATGTGTATTTAGGGT--TA-ATG---AATGTCT--ATCTCGAAACAAGAGGAGA-TGCTACAGACATGCTTTTATGATTACCAATAATCCTCTAAATCAATTTCTTCAAATGAAAAGATGTCACATTG-CAGGTAAA-TGTCATAGGG-TAAAGGTTATGAAAGATCCACGTTCTTTTCAATACTTTGGCTATTGTGCCTC
gi|19 : atattctttgttaGAACAAAAAAAGTTTAGCAACTAGTAATATTTAATATCGCATAATCAACATCACCGTAT---GTGAG---AAATTTGTATTCAGTAT--TTTATGTTTCATGTCTCCATC---AATCAA----AAA-TT--A-AAACATGC---CAT-------TATAAT-CTCTAAATCAATTT-TT-AAACGAAAAAATGTCACA--G-AAA--AAA-AG--AAAGGG-TAAGG--TATGTAA-ATCTACGTTC--TTCAATACTTTG--TA-TG-GCCTCCATTTGCAGCTACCACAG-CCAAttt
gi|2 : tatactGGACAAAAAAAGTTTAGCAACTTGTAATATTTAATATCGCATAATCAACATCACCATAT---GTGAA---AAATTTGTATTTAGTAT--TT-ATG---AATATCTCCATC---AAACAA----AAA-TA--A-AAACATGC---CAT-------AATAAT-CTCTAAA---------------------ATGTCACA--G-AAA--AAA-GG--AAAGGG-TAAGG--TATGAAA-ATACACGTTC--TTCAATGCTTTG--TA-TG-ACCTCCACTAGCAGCTACCACAG-CCAAACATCG-------ACATCTC-A----TACTT-----CT-GATGAGGTTT--CGGAGCTCG--TGTAATACATT-GT----GA----TTTGGTTCCATTCTTGCTGAG-GC----GTT-C---GA----CTCAAATCGGCTACGTTGTTGAC-GTT--AT-G--TCGCTCTCTCACA-CTTCGACCAA-GCATGTCTCA----CACATGCTCAATT--G------GTGATAG-ATCATGT--G-ATCT--TGCAGGCCA------TTCCA-GT-ACT---TTGATAT-TGTTCT-G--C---------CGTAAAA-CGTC-CTTGGTGTGTC-G---CGCAGTGAGCGGTCGAGCGT-TATC-CTGTT--GAA-ATATGGTAACTTGACCCTGGTTCAAAA-A-C-GGCA---A-TACA-GGA-ACCAC-AATTTCTGCA-CAATA-A-----CGCTGTGAATTCAGA--TTTCCAT--TTACT--ATGGCAAGGCAAGTTTTCCCATAAGAACTGCCCCCCCCCCCCCAA-------CCATG-ACAC---T-AC-CA--CCACCA--TAGCGGTC--ACGTTG--A--A-TGAAGGT-TTGGGG-G-AATGGA-----ACC--GCT-CATT--TCGT--CTTC---T-CCAA-GC-ACGAGCGC-G-T-CCAT--CTGCAAAA--TC-C--ACATT-----AAAACAA-GA--TT-CGCCAGTAAACAAAA---TTGTAG-TCCATT-G-TC---GCCGAATCCAGCGA-AG-ATGG-GT---G--G-TTGCC-CA----GGC-AACACGAGTT-TG-A--CG--AT-GACGTCG----AGTC--AAA--GAGACCG-CAACAAGA-GG-TCTCC-GA-G-CGCG-TA--GATTAGCAGTCT--GTAACC---T---G-TTTCT-------C-ACACT-CTG--AACACC-CACCCT-CA-CTCC--A-G---ACGA---------CCG-A---T--GTA-A-CTCAGTGG--CGA-C---TTTG--GGT-G--TA--GATATG---A----AGCGATT-A-------CGTC-T-CGACG--T--CGTA---ACA---A---T-AAA--TCTGT-CT-TGGTGA-ACCGT--TG--TTTTC-----CGTGTACGCCCAT------GA-C-------GTCGAC--G-GT--TG-CTGACTTG-TC-CTG--TTA-CTC-TAAA--ACGAC-TC-ACAAGT-C-GACTGATAGTTG
gi|28 : TT--GAA-ATATGGTAACTTGACCCAAGTTCAAAA-A-C-GGCAT-AACTACA-GGA-ACCA
gi|29 : AATATTTAACATCGCATAATCAACATCACCATATAAAGTGAG---AAATTGGT
gi|3 : ACCAAAGCATG---CT----CACATGCTCAATTT-G------GTGATAAGATCATGT--G-AT-T--TGACAGCCA------TTTCA-GT-AC----TTGTTAT-TGTTCT-G--C---------C-TAAAA-CGTC-CTTGGTGTGTC-G---CGCAGTGAGCG-TCGAGCGT--ATT-CTGTT--GAATATA-GGTAACTTGACCCTGGTTCAAA----C-GGCA---A-TACA-G-A-ACCAC-AATTTCTGCA-CAATA-A-----CGCTGTGAATTCAGAGATTTCCAT--TTACT--ATGGCAAGGCATGTTTTCCCATAAGAACTG--CCCCCACCCC-AA-------CCATG-ACAC---T-AC-CA--CCA-CA--TAGCGGTC--ACGTTG--AATA-TGAAGGT-T--GGGCG-A-TGGA-----ACC--GCT-CATT--TCGT--CTTC---T-CCAA-GC-ACGAGCGC-G-T-CCAT--CTGCAAAA--TC-C--ACA-T-----AAAACAA-GA--TT-CGCCAGTAAACAAAA---TTGTAG-TCCA-T-G-TC---GCCGAATCCAGCGA-AG-ATGG-GT---G--GTTTGCC-CA-----GC-AACACGAG-T-TG-A--CG--AT-GACGTCG----AGTC--AA----GAACCG-CAACAAGA--G-TCTCC-GA-G-CGCGATA--CATTAGCAGTCT--GTAACC---T---T-TTTCT-------C-ACACT-CTG--AACACC-CA-CCT-CA-CTCC--A-G---ACGA---------CCGAA---T--GTA-A-CTCAGTGG--CGA-C---TTTG--GTT-G--TA--GATATGA--A----AACGATT-A-------CGTC-TCCGACG--T--CGTA---ACA---A---T-AAA---CTGT-CT-TGGTGA-ACCGT--TG---TTTC-----CGTGTACG-CCAT------GA-C-------GGCGAC--G-GT--TG-CTGACTTG-TC-CTG--TTA-CTC---AA--ACGAC-TC-ACAAGC-C-GACTGATAGTTG
gi|30 : cgaA--TCTGT-CT-TGGCGA-ACCGT--TG--TTTTC-----CATGGCCGCCCAT------GA-C-------GTagagatgaacattaaattggtcgtgctcatcctgttgacgacatccagccgtttaagccatcccgatagcccgttacgttcatttttcagaagattcgtggacgtgtgtactccgtgttcgaaatgatacccctgtggattgtttgctttgcaattcgtgaccaattatttagtcaaaaattgtataaagccaacccatggcgttcacgtgcgcatatttgctgatcacttccatgtgcttttctctgcgtgttacagtattaaaaaggttaaatcagaaagcactctaaaatatgcagacaaaattacctacattgaaatgaaattgctaaacttt
gi|31 : A-ATCAGGT--G-ATCT--TGCGGGCCA------TTTCA-GT-ACG---TCGATAT-T
gi|33 : aatGAATAAAAAAAGTTTAGTAACTTGTAATATTTA
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gi|5 : atact--TAGCGGTTCAACGGTGCCA--A-TGACTCTCTTCGGC-GCA-TGAA------CT--GCTACATT--TCGTAAC-TC---TACCAA-ACCACGAGC-C-G-C-C--T--CTGCAAAA--TT-CCAACATTTGCTTAAACCGA-GA--CC-CGTCAG-AAACAAAAACGCTATA--TCCATTTGTCC---GCCGA-TCCAGCCAGAC-ATGG-GTCCCGATG-TCGTC-CACAGCGGC-AACACAAGTC-TGGA--CG--AT-GAC--CGCTTTAGTC--AAATGGGGACCG-CAACAGCACGG-TCTCC-G--G-CGCG-TATCCATTAGCAGTCCCGGCAACCCATT---G-TTTCT-------CAACACTCCTGCAAGCACCATATCCTGCA-CCCC--GCA---ACGC---------CCG-AAATT--ACA-A-CTCATTCG--CAACC---TCTGAAGGT-A--CAACGCCATA---G----AGTATCTAA-------CGTCTT-CGACC--G--CTTACATACAACTA---C-AAACTCCTGT-CTCTGGCAACACCCT--TG--TTTCC-----C-----CGC---T------GACC-------GTTGACCGA-GT--CGCCCGACTctgtttttgttaatgcattcattttctg
gi|6 : GTTTAGCAACTTTCAATATTTGATACCGTATAAACAACATTACCATGA---ATAAG---AAATC-GTATTTAGTAA--TC-ATA---ATTATCTACCTT---AAACAA----AAG-GG---------TGC---TAT-------AATAAT-CTCTAAATCAACTT-TTCATATGAAAATATGTCACA--G-AAA--AAA--G--AAAGGAACAACG--TATGAGA-GTTTACATTA--TTCAATATCTTG--TA-TG-ACGTCCAATAGCAGCTACCACAT-CCAAACATCG-------AGGTATC-A----TACTT-----CG-GGTGAGGTTT--CGGAGCTCG--TGTA-T----T-GT----AA----TATGTTTCTATTTCTGCTGAA-GC----GTA-C---GA----TTCAAATTGTCTATTTTGTTGAC-GTT--AT-A--CGACTTTCTTACC-AGTCGATAAA-GCATGCCCCA----CAC----TCAATT--ACATGTAGTGATAA-ATCAGGT--G-ACCT--TGCAG---A------TT------------------AT-TATTTA-G--C---------AGTTAAA-CGTC-TTGGGTGTGTC-G---CGCGGTGTGCGGTTGAGCGT--ATC-CTATT--GAA-ATATAGTAGCTTGACCCTGCTTAAAAA-A-C-AATAC-AACTACA-GTA-ACCCC-AAATTCTTCA-CTATC-A-----CGGTGTGAATTCAGA--GTTCTAT--TTACT--GTGACGAGGTATGCATTCCCATAATAAATAATTAAACCAC-A-AG-------CCATG-ACAC---T-AT-CA--CCACCT--TAGAGGTC--AAGTTG--A--A-TGACGTT-TTCGGG---A-TGAA-----ACC--GCT-CATT--TCAT--CGTC---T-CTAA-AC-ACGAGTGC-G-T-CCAA--CTGTAAAA--TT-C--GCATT-----AAAACGA-GA--CT-CGTCATTAAACAAAA---CTGTAT-TCCATT-G-CC---ATAGAGTCCAGCAC-AA-ATAG-GT---G--G-TTGCC-CA----GGC-AACACGAGTT-TG-A--CG--AT-GACGTTA----AGTC--AAA--GGGACCG-CAACGAGA-GG-TATCC-GA-G-C--------AATTTGTAGCCT--GT-TCC---TCACA-TTCCT-------C-ACACT-CTG--ATAACT-CATCTT-TA-TTCC--A-G---ACTC---------TTG-A---T--GTcaaaagtcacactgtcatatcttgagggatgaacataatattgtcgccgctacatcccatgcttgcgactaatacccgctcgtagcaattcccgcctgcgcctttcacgttccattttcaaggatctgctggcacccttttcccactttgactttttttcgcaaactcttgtcagcgtttattttgtgtgtacgcatgtttgctattgaaaatgcgtgcaatcacatctgaccatattggttcacgccacaaatcctctaacgccacccatgacgtttacacgtagtgcgcgacaccacctttgctgacactgtgtaattgcttctctgccgtagcagctatggaaaaatataccaattcagacagcttataccaaataaagtcagtcaaaaattactacatttcaaatttacattgctaaaccttctttttttgttaagctattataa
gi|7 : GTAAATAAAA---CTGTAGGTCCTCT-G-CC---GTCGAGTCCAGCGA-AG-ATGG-GT---G--G-TTGCCGCA----GGC-AACACGAATTGTG-A--CAT-AT--ACGT-G----AGTC--AAA--GG-ACCGGCAACAAGA-GGGTCTCCCGA-G-CGCG-TA--GATTAGCAGTCC--ATAAA----T---G-TTTTC-------A-ACACT-CTG--AGCACT-CATCCT-CAACTCC--A-G---ACGC---------CCG-A---TT-GTA-A-CTCATCGG--CGA-C---TTTG--GG--GACCAC-GACATG---A----AGCGGTT-A-------CGTC-T-CGACG--TTTCGTA---ACA---A---T-AAA--TCTGTTCT-TGGCGA-ACCGT--TGGTTTTCC-----CGTGAACGCC-AT------GA-C-------GTTGAC--G-GT--CG-CTGACTTG-TC-CTG--TTA-CTC-GAAA--ACGACTTC-AAAAGT-C-GACTTATAGTC
gi|8 : tacAT-TGTTCT-G--C---------CGTAAAA-TGTC-CAGGGTGTGTC-G---CGCGGTGTGCGGTCGAGCGT-TATC-CTGTT--AAA-ATATGGTAACTTGACCCTGGTTCAAAA-A-C-GGCAC-AACTACA-GGA-ACCAC-AATTTCTGCA-CAATA-AGATAACGCTGTGAATTCAGA--TTTCCAT--TTACT--ATGACAAGGCATGTTTACCCATAAAAACTTATCCCCCCCCCA-AAAAAAAAACCATG-ACAC---T-AC-CA--CCACCA--TAGCGATC--ACGTTG--A--A-AGACGTT-TTTTGG-G-A-TGAA-----ACC--GCT-CATT--CCGT--CGTC---T-CCAA-AC-ACGAGCGC-G-T-CCAT--CTGCAAAA--TC-C--ACATT-----AAAACGA-GA--CT-CGTCAGTAAACAAAA---CTGTAG-TCCATT-G-CC---GCCGAGTCCAGCGA-AG-ATGG-GT---G--G-TTGTC-CA----GGC-CACACGAGTT-TG-A--CG--AT-GACGTTG----AGTC--AAA--GGGACCG-CAACAAGA-GG-TCTCC-GA-G-CGCG-TA--GATTAGCAGTCC--GTAACC---T---G-TTTCT-------C-ACTCT-CTG--AGCACT-CATCCT-CA-CTCC--A-G---ACGC---------CCG-A---T--GTA-A-TTCATTGG--CGA-C---TTTG--GGT-G--CA--GACATG---A----AGCGGTT-A-------CGTC-T-CGACG--T--CGTA---ACA---C---T-AAA--TCTGT-CT-TGGCGA-ACTGT--TG--TTTTC-----CCTGGACGCCCAT------CA-C-------Gagggatgggacattaaattgtcgcgctaacatcctttgtacgagacatccagcgtaaggcaatcccgatagtctgttacatgtcattttcagatattcgtggaacgtttcccatttgatttctggaaggctttagacgttttttcggtgtgtacgctgtgtcgaatgatgaccctgtggatattgctttgaaattgcgttgcaatcaatcgtgaccaatgttagcaaaaattggttaaaacgtcatctccatgacgtacacgtaccgcatattgtgctgaacactcatgtattgtttctctgcgttttagagtattaaaaagataaaatcagaaagccgctaaaataatgcagacaaaattacctacattcaaatgagattgctaaacttttttttgtt
gi|9 : CGAGG--TGTTTTCC-A-AAAAACTGATCACC-----A-AA-------CCATGGACAA---TGAC-CGACCCAACA--TAGCGGTC--ACGT-G--AT-ACTGACGTT-TTCGG----A-TGAATATAGGCCTAGCT-CATTATTCGT--CGTC---T-CCAAGAC-ACAGCCGC-GGTGCCATGTCTGCAAAAATCC-C--ACATT-----AAA-CGA-GA--CTGCGTC-GTAA-CAAAA----TCTAG-TCCATT-G-CCCGAGCCGAGTCCAG-GA-AG-ATGG-GT---G--G-TTTCC-CA----GGC-A-CAAGAGTT-TG-A--CG--AT-GATGTTG----AGTC--AAA--GGG--CA-C-ACAAGA-GG-TCTCCTGA-G-CGCG-TA--GATTAGCAGT-C--GTAACC---T---GTTTTCTTCATCTCC-ACACT-CTG--AGCA---CATCTC-AA-GTCC--A-GAATACGCTCTTTCTCTCTG-A---TTCGTACATCTC-TTGG--CGA-CTTATTCG--GGTCG--CA--GACATGTGCACATCAGCGTTC-GCTTTCACCGTC-T-CGACGTCT--CGT----ACA---AAATT-ATA--TCTGT-CT-T-GCAA-ATCGTCCTG--TTCTCTTTCTCATGCACTCCCATTCTCTCGA-CTGCTCTTGTC-AC--GTATTCCG-CTGCTTCGCTC-TCGCTTTACCTCTGAAATTGCACC-TC-AAACGTGC-GACTGATAGTCG
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|26 ): CCCATGACGTTCACGTGGCGGATCCCTAATGTCATGATCACTCATCATGTATTGATTTCTCTGCGTGTTACAATAT
Unaligned ( gi|27 ): CTAGTCTGGTCCCCGCCCCGCCACTCTTTGATCACTCGTCGGGGGCGGGGACCAGAC
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Unaligned ( gi|36 ): ATGTTTTATGTAAGAACTATACTTGCAAACG