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Reference ( gi|4 ) : ATTGGAG-TTT--TG--CGAA-G----TGA---TT----GT--A-ATG-------G---GGAC-A-ATGA-A--CA-GTG---G-AGACAAAAAGGGGGCA-AT-ACAAAATTTGAA-TA-AT----A--------A---GA-TGA-AA---TG-AGTA----AA-A-T-A---TT-------------CC-CC--T--AA-AC---CT-CAA-TTT-CA-TTAAT--TGT-G--A------------AGCCAGGAA---CCACCCCCC-CCC--CCCC---C------CCCC-CCAC----ACACTA-C---TTT--GT-G-TC--T---G-AAT-T---TA-AA-AT-AC-A-TG--------CCAGGT-G-T-GC-A-T-GT-AAG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CAGG--TAGGTTGA--TTTT-CTTC-C--AC-G--A---TTCAAA--G---CGCTCC-C-AT-A-CA-TTG-AAATG---A-A-----CAACATA-TAAAA---T--CTGC-GTG-A--C--A--AGGC-GAGCAC-ACA---TCTTA--TTTTA-TTCATG-AGAA-A--A-TTG-GA--GA-AAAGT-GG-A-AGGGTA-TTACTA--TTA-GTGCT-ACA-TTTTTCAT-C---A-T-CA-CCG-TTTCAG---T-CAC-CAT-----TC--AT----G-TACA-CA-----T-ACG-----T-GT-A-C-AT--GAATGT-GG-ACTGAAACGG
gi|3 : ATTGGAG-TTT--TG--CGAA------TGA---TT----GT--A-ATG-------G---GGAC-A-ATGA-A--CA-GTG---G-AGACAAAAAGGGG-CA-AT-ACAAAATTTGAA-TA-AT----AGAA-----A---GA-TGA-AA---TG-AGTA----AA-AAT-A---TT-------------CC-CC--T--AA-AC---CT-CAA-TTT-CA-TTAAT--TGT-GG-A------------AGCCAGGAA---CCACCCC----CC--CCCCCCGC------CCCC-CCAC----A-ACTA-C---TTT--GT-G--C--T---G--AT-T---TA-AA-AT-AC-A-TG--------CCAGGT-G-T-GC-A-T-GT-AAG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CAGG--TAGGTTGA--TTTT-CTTC-C--AC-G--A---TTCAAA--G---CGCTCCAC-AT-A-CA-TTG-AAATG---A-A-----CAACATA-TAAAA---T--CTGC-GTG-A--C--A--AGGC-GAGCAC-ACA---TCTTATTTTTTA-TTCATG-AGAA-A--A--TG-GA--GA-AAAGT-GG-A-AGGGTA-TTACTA--TTA-GTGCT-ACA-TTTTTCAT-C---A-T-CA-CCG-TTTCAG---T-CCA-CAT-----TC--AT----G-TACACCA-----T-ACG-----T-GT-A-C-AT--GAATGT-GG-ACTGAAA
gi|1 : ATTTGAG-CTTCTTG--CGAAAG----TGA---T-----GT--A-ATG-------G---G-AC-A-ATGA-AA-CA-C-----G-AGA--AAAAAGGGGCG-AT-ACAAA--------TA-AT----A--------AA--GA-TGA-AA---TG-AGTA----AA-A-T-G---TT-------------CC-CC--T--AA-CC---CT-CAG-TTT-CA-TTAAT--TGTGG--A------------AGCCAGG-A---CCCCCCCCC-CCT--TCCC---C------CCCC-CCAC----ACAC-A-C---TTT--GTGG-TC--T---G-AAT-T---TACAA-AT-AT-A-TG--------CCAGGT-G-TCGC-A-T-GT--AG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CA-G--TAGGTTGA---TTT-CTTC-G--AC----A---TTCAAA--G---CGCTCC-C-AT-ATCA-TTG-AAATGA--A-A-----CAACATA-TAAAACACT--CGAC-GTG-A--C--A--AGAC-GAGCAC-ACA---TCTTA--TTTTA-TTCATGCAGAA-A--ATTTG-GA--GACAAAGC--G-A-AGGGTA--TACTA--TTAGGTGCT-ACA-TTTTTAGTCC---A-T-CACCCG-TTGCAG---T-CCA-CAT-----TC--AT----G-TACAGCATACATT-ACG-----T-GT-A-C-AT--GATTGT-GG-ACTGAAACGG
gi|5 : ATTTGAG-TT----G--CGAA------TGA---TT----GA--A-A-A-------G---GAAC-A-ATGACA--CA-GCG---GGAAACAAAAAGGGGGCG-AT-ACAAA---T--A-TA-G--------------A---AA-TGA-AA---T--AGTA----AA-AAT-G---TT-------------TC-CC--TCTAA-AC---CT-CAG-TTTTCA-TTAAT--TGT-GGGA------------AGCCAGGA------------C-CCC--CCCG---C------CCCC-CCGC-----CACTA-C---TTTT-GT-G-TC--T---G-A-T-T---TA-AA-AT-AT-A-TG--------CCAGGT-GGT-GC-A-T-GT-AAG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CAGG--TAGG-TGATTTTTT-CTTC-G--A--G--A---TTCAAA--G---CGCTCC-C-AT-A-TA-TTG-AAATGA--A-A-----CAATATATTAAAC---C--CCGCGGTG-A--CCAA--AGGC-GAGCAC-ACAAT-CCTTA--TTTTATTTCATG-AGCA-A--A-TTG-GA--GA-AAAAC-TG-A-AGAGTA-TTACTA--TTA-GTGC--ACAGTTTTTCAT-CA--A-T-CA-CCG-TTTCAG---T-CCA-CAT-----TC--AT----G-TACA-CA-----T-ACG-----TGGT-A-A-CT--GATTGT-GG-A-TGAtgatgacggattgacccccccccttcttgtgaccagtacttattgttatgtatac
gi|9 : acATTTGCA-TTT--TG--CGAA-G----T-A---TG----GT--A-ATG-------A---G-AC-A-ATGA-AA-CA-GCG---G-AGACAAAA-GGGGGCA-TT-ACAAA---TACA-TG-A-----A--------A---GA-TGA-AA---TG-AGT-----AA-A-T-G---TT-------------CC-CC--T--AA-AT---CT-CAGTTTT-CA-TTAAT--TGT-G--G------------AGCCAGAA--------CCCCC-CAC--CCCA---C------TCCA-CTAC----A----------TTT--CT-G-TC--T---G-AAT-T---TA-AACAT--T-A-TG--------CCA-GT-G-T--C-A-T-GT-AAG-AA-AA-ATTTG-A-ATC-CAGG--TAGGTTG---TTTT-CTTC-G--AC-G--A---TTCAAA--G---CGCT-C-C-AT-A-TA-TTG-AAATG---A-A-----CAACAAC-TAAAA------CCGG-ATG-A--C--A--AGGC-GACAAC-ACA---TCTTA--TT
gi|11 : agacATTTGAG-TTT--TG--CGAA-G----TGA---TT----GT--A-ATA-------------AC-A-ATGA-AA-CAAGCG---G-AGACAAAAAGGGG-CG-AT-ACAAA---T-AA-TAGAA----A--------A---GAATGG-AA---TG-TGTA----AA-AAT-G---TT-------------CC-CC--T--AA-AC---CCGCAT-TTT-CT-ATAAT--TGT-GG-A------------AGCCAGGA-----------CC-CCC--CCCC---C------CCCC-TTCC----CCATTA-C---TTG--GT-C-T---T---G-AA--T---TA-AA-AC-AT-A-TG--------CCAGG--G-T-GCGA-T-GT-AAGAAA-AA-ATTTGAA-ACC-CAGG--TAGGTTGA--TTTT-CTTC-G--AC-G--A---TTCAAA--G---CGCTCC-C-AT-A-TA--TG-AAATGA--A-A-----CAATATA-
gi|15 : cTTCGAG-TTT--TGTGCGGA-GCTAGTGAAAATT----GT--T-ACT-------G---GGAC-A-ATGA-A----------------------AGGGGCG-AT-AAAAAATTTGAA-GA-AC----AGTATTGGAA---GA-TAA-AA---TG-A-TA----AAGA-TGA---TT-------------CC-CC--T--AA-AC---CT-CAA-TTT-AC-TAAAT--TGTGG--A------------AGCCAGGAA---CAACTCCCCGCCCGGCAGC---C------CCAC-ACACAGCAACACCA-CAGACTT--GT-G-GC--T---G-AAA-T---T---A-AT--C-A-TG--------TCATGT---T-GC-a
gi|2 : GAG-TTT--GG--CGAA-G----TGA---TT----GTGGA-ATACACTGATA---GGAC-A-ATGA-AGCTA-GCG---G-AGACAAAAAGGGGGCGGATGACAAA----GAA-TA-GA----A--------A---GA-TGA-AA---TG--GTA----AA-A-T-G---TT-------------CC-CCCTT--AGTAC---CT-TAG-TT---A-TT-----TGT-G--A------------AGCCAGGA-----CACCCCCC-TCC--CC---------------------------ACTAAC---TTT--GT-G-TC------G-AAT-TC--TA-AA-ATTAT-A-TG--------CCAGGTTG-T-GC-A-T-GTTAAG-AA-AA-AATTG-A-ACCACAGG--TAGGTTGA--TTTT-CTTC-G--AC-G--A---TTCAAA--G---CGCTCC-CAATAA-TA-TTGAAAATGA--A-A-----CAATATA-TAAAC---C--CCGC-GTGAA--C--A--AGGC-GAGCAC-ACA---TCTTA--TTTTATTTCATG-AGAA-A--A-TTGTGA--GA-AAAAC-TG-A-AGGGTA-TTA-TA--TTA--TGCT-ACA-TTTTTCAT-C---ATT-CA-CCG-TTTCAG---T-CCCACAT-----TC--AT----GATACA-CA-----T-ACG-----T-GT-A-C-----GGTTAT--G-ACTAAGATGGtg
gi|7 : gttGAGATTT--TG--CTAA-G-----GA---TT----GT--A-ATG---------------------A-A--C--GCG---G-AGACAAAAAGGTTGCG-AT-ACAA--TTTGAAATA-AT----AGAA-----A---GA-TGA-AA---TACAGTA----AA-A-T-----TT-------------CC-CT--A--AA-AC---CC-CAAATTT-CA-TTAAT--TG--G--A------------AGCCAGGAA---C-ACCCC---------CCC---C------CC------------CACT--C---TTT-----------T---A-AAT-----------AT-AT-T-TG--------CCATGT---T-TC-A-A-GT-AAG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CAGG--TAGGTTAG--ATTT-CTTCGG--ACTA--A---TTCAAAATG---CGCTCC-C-AT-A-TATTTG-AAATGCATG-A-----AAACATA-T-AAA---C--CCGC-GTG-A--C--A--TGGC-GAGCAC-ACA---TCTTAT-TTTTA-TTCATG-AGAAGA--A-TTT-GA--GAGGAAGC-GGAA-AGAGTA-Ttaaaccctgaaaggcaggtttacccac
gi|17 : gacat-TTT--TG--CGAA-AAGT-TGA---TTTGTTGT--A-ATG-------G---GTAC-ATGTGA-A--CA-GCG---G-AGACAAAAAAGGG-CG-AT-ACAAA--------TA-AT----A--------GACTGA-TGA-AA---TG-AGTATTTAGA-A-T-G---TT-------------CC-CC--T--AA-ACGGACT-CAG-TTT-CA-TTAAT--TGT-GA-A------------AGTCAGG-------ACCCCCC-CCC--CCCC---C------Cc
gi|6 : T----GT--A-ATG-------C---G-AC-A-ATGA-A--CA-GCGACTG-AGACCAAATG-----A-A---------TTGAA-TA-ATAGAAA--------A---GA-TGATAA---TG-AGTA----AA-A-T-ATATTT-------------CCTCC--T--AA-AC---CT-CAA-TTT-CA-TTAATTGTGT-G--AC-----------AGCCTG--------AGCCCCC-GCC--CCCC---C------C-------------CACTA-C---TTT--GT-G-TC--T---GTAAT-TTG-TA-AA-AT-AT-A-TG--------CCAGGT-G-T-GC-AGTGGT-AAG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CCAA--TAGG-TGA--TCTT-CCTT-CGAAC-G--A---ATCAAA--G---C-TTCC-C-AT-A-TA-ATG-AAGTG---ACA-----CA----A-TAAAA---C--CCGC-GTG-A--C--AACAGGC-AAGCGG-ATAAGGTATTA--CTTT--TTCAT
gi|10 : agcT----GT--ATATG-------GAGCGGACCA-ATGA-A--CA-AGG---C-GGACAAAAAGGGGGCG-AT-ACAA---TT-AA-TA-GA----A--------G---AA-TGA-AA---TG-AGTA----AA-A---A---TTAGAACTAAATCCGCC-CC--A--AA-AC---CTTCAG-TTT-CATTTAGT--TAT-G--ATGAGCACAATAGAGCCATGGA---CCGCCCACC-TCC--TCccgaatcaccgtttcagtcattattcaatgtacagcatacgtatacatgagaatgtgagtgaaacgtgatgacggatttacccccccccccctcccccctcttgtggaacatactatattcgttat
gi|12 : aaaAATT---A-TA-GG----A--------A---GA-TGA-AAGCATG-AGCA----AA-T-T-G---GT-------------CT-CC--T--AA------CC-CAA-TTT-CG-TCAAT--TGT-G--A------------AG-TAGGAAAAGCCACGCTTC-TCC--CT--------------------------------T---TTT--GT-G-CA--TATGG-GAT-TTTATA-AA-TT-ACAA-TGTAGCCGGATCAGGT-A-G-GC-A-T-GT--AT-AA-AA-ATATGTG-ACC-CAGG--TAGGCTGA---TTT-CTTG-C--A--GTTA---TTCAAaagttagtacatgttgatgtcgtgagaaaatttattaaaatactaaaatgtaaattccaggaagtaaacatggtataatgaaggaaatgtgaaccccacgccgctaattgtttgattttgggctcgagaggattcaa
gi|8 : acccaagtCACCCTCC-TCT--CACC---CGGGATACCACACCTC----ATCCTG-T---TTTTTGT-GGTCGTC---G-AATCT---TA-AA-AT-AT-AATG--------CCAGGT-G----C-A-T-AT-AGG-AAGAA-ATTTG-A-ACC-CAGG--TAGGTTGA--TTTT-CTTC-A--GC-G--GACGTTCAAA--G---CGCTCC-C-AT-A-TA-TTG--AATG---A-ACGCATCAACATAGTAAAA---CCACTGCGGTG-GACC--A--AGGC-GAGCAC-ACA-------------------ATG-AG-A-A--T-TTG-GA--G--AAAGC-G----AAGGTA-TT-CTA---TG-GTGCTGACG-TTTTTCAT-C---A-T--A--CG--TTCAG----------AT-----CCG-AC----A-TACT-TAT----T-ACG-----T-GTAA-C-AT---ATTGT-GG-ACTGAAAtgtttctttcagtaataatgtatagcgaatgaacaaactttaataaaaaccc
gi|13 : -A-TG--------CCAGGT-G-T-GC-A-T-GTAAAG-AA-AAGATTTG-ACACC-CAGGCTCAGGTTTA--TTTTACTTC-G--AC-G--AAT-TTGAGA--GGGTCGTTCC-C-AT-A-TA-CTG-AAATtatcgtga
gi|16 : tTA-TAAAA---C--CCGC-ATG-A--C--A--AGGC-GAGCAC-ACA---TCTTA--TTTTA-TTCATG-AGGA-AATA-TTG-GAAGAA-AAAGC-GA-G-AGGGTA-TTACTAT-TTA-GTGCT-ACA-TTTTTCAT-C---A-TACA--CG-TTGCAG---T-C-------------------------CA-CA-----T-GCA-----T-GT-A-A-TT--GATTGT-GG-ACTGAAACGtggaaattttttcatcattgccgttttcagtccaccaattatgctgcaatagtagtcgttaatagatttgtggatgtaccacggtgatgacgagatttagccctccccccctcactcgtcttgtgaccatacttatatatagtataca
gi|14 : cAAAC---C--CCGC-GTG-A--C--A--AGGCGGAGCACAATA---TC-TA----TTA--TCATG-AGAA-A--A-TTG-GA--GA-AAACTAGG-A-AGGGTATTTACTA--TTA-GTGCT-ACA-TTTTTTCG-C---A-T-CA-CCG-TTTCAG---T-CCA-CAT-----TC--ATA---G-TACA-CA-----T-ACG-----T-GT-A-C-AT--GATTAT-GT-ACtttgatgacggatttagcccccccccttcttgtgaaccagtacttttgttatg
gi|6 : AAGC-GG-ATAAGGTA-TTACT------------------TTTTCAT-CCGAA-T-CA-CCG-TTTCAG---T-CAT-TAT-----TCA-AT----G-TACAGCA-----T-ACG-----T-AT-A-C-ATGAGAATGT--G-AGTGAAACGatcatactgtgtattcaagacgaacgttgatgacggattttagccccccttcttgtgaccatacttattgttacgtata
gi|18 : agctgtaatgcgacaatgaacagcgactgagaccaaatgaattgaataatagaaaagatgataatgagtaaaatatatttcctcctaaacctcaatttcattaattgtgtgacagcctgagcccccgcccccccccactactttgtgtctgtaatttgtaaaatatatgccaggtgtgcagtggtaagaaaaatttgaaccccaataggtgatcttccttcgaacgaatcaaagcttcccatataatgaagtgacacaataaaacccgcgtgacaacaggcGGTA-TTACTAATTTA-GTGCT-ACA-TTTT-CAT-C---A-T-CA-CCG-TTTCAG---T-C-C-CACA----TC--AT------TACA-CA-----T-ACG-----T-AT-A-C-AT--GAATGT-GG-AGTGAAACGGtgatgacggatttacccccccccccctcccccctcttgtggaacatactatattcgttat
gi|16 : tGCT-AAA-TCCGTCAT-C---A----A-ACG-TTTCAG---T-CCA-CAA-----TC--A-------------A-----T------------T-A-C-AT--GCATGT-GG-ACTGCAACGtgataggattttagtcccccccccccccccccttttcttgtgaccatacatt
gi|13 : ctataaaacccgcatgacaaggcgagcacacatcttattttattcatgaggaaatattggaagaaaaagcgagagggtattactatttagtgctacatttttcatcataca-TTTTTCAT-C---A-T-TG-CCGTTTTCAG---TCCAC-CAA-----TT--AT----G-ccccccccttcttgtgaaccagtacttttgttatg
gi|1 : tatgccaggtgtgcatgtaaagaaaagatttgacacccaggctcaggtttattttacttcgacgaatttgagagggtcgttcccatatactgaaattggaaatTCCGT-C---A-T-CA-CCG-TTTCAG---T-CCA-CAA-----TC--AT----G-TACA-CG-----TAATGTATGCT-GT-A-C-AT--GAATGT-GG-ACTGCAACGGctgcaatagtagtcgttaatagatttgtggatgtaccacggtgatgacgagatttagccctccccccctcactcgtcttgtgaccatacttatatatagtataca
gi|6 : atttgagcttcttgcgaaagtgatgtaatgggacaatgaaacacgagaaaaaaggggcgatacaaataataaagatgaaatgagtaaaatgttcccctaaccctcagtttcattaattgtggaagccaggacccccccccccttccccccccccacacacactttgtggtctgaatttacaaatatatgccaggtgtcgcatgtagaaaaatttgaacccagtaggttgatttcttcgacattcaaagcgctcccatatcattgaaatgaaacaacatataaaacactcgacgtgacaagacgagcacacatcttattttattcatgcagaaaatttggagacaaagcgaagggtatactattaggtgctacatttttagtccatcacTCCGT-C---A-T-CA-C-G-TTTCAC---T-CAC--AT-----TCTCAT----G-TATA-CG-----T-ATGC----T-GT-A-C-ATT-GAATAA-TG-ACTGAAACGGttgacccccccccttcttgtgaccagtacttattgttatgtatac
gi|19 : agctgtaatgcgacaatgaacagcgactgagaccaaatgaattgaataatagaaaagatgataatgagtaaaatatatttcctcctaaacctcaatttcattaattgtgtgacagcctgagcccccgcccccccccactactttgtgtctgtaatttgtaaaatatatgccaggtgtgcagtggtaagaaaaatttgaaccccaataggtgatcttccttcgaacgaatcaaagcttcccatataatgaagtgacacaataaaacccgcgtgacaacaggcaagcggataaggtattactttttcatccgaatcaTCAT-C---A-T-TA-CTG-CTTCAG---T-CCA-TAT-----TT--AT----G-TACA-TA-----T-tttacccccccccccctcccccctcttgtggaacatactatattcgttat
gi|18 : ---A-T-CA-CCG-TTTCAC---T-CCA-CAT-----TC--AT----G-TATA-CG-----T-ATG-----T-GT-A---AT--G-ATGTGGG-ACTGAAACGGgtggggcgtcttcctgtgaacaaactaaa
gi|3 : tggtattactaatttagtgctacattttcatcatca-TTTCAG---T-CCA-CAT-----TC--AT----G-TACA-CG-----T-ATGG----T-GT-A-C-AT--GAATGT-GG-ACTGAAACGGaggattttagtcccccccccccccccccttttcttgtgaccatacatt
gi|2 : attggagttttgcgaatgattgtaatggggacaatgaacagtggagacaaaaaggggcaatacaaaatttgaataatagaaagatgaaatgagtaaaaatattcccctaaacctcaatttcattaattgtggaagccaggaaccaccccccccccccgcccccccacaactactttgtgctgatttaaaatacatgccaggtgtgcatgtaagaaaaatttgaacccaggtaggttgattttcttccacgattcaaagcgctccacatacattgaaatgaacaacatataaaatctgcgtgacaaggcgagcacacatcttattttttattcatgagaaaatggagaaaagtggaagggtattactattagtgctacatttttcatcatca-TTTCAGGGTT-TAC-CATCTTAGTC--ATAACCG-TACA-CG-----T-ATG-----T-GT-ATC-AT--GAATGT-GGGACTGAAACGG
gi|14 : gttgagtttggcgaagtgattgtggaatacactgataggacaatgaagctagcggagacaaaaagggggcggatgacaaagaatagaaagatgaaatggtaaaatgttcccccttagtaccttagttatttgtgaagccaggacacccccctccccactaactttgtgtcgaattctaaaattatatgccaggttgtgcatgttaagaaaaaattgaaccacaggtaggttgattttcttcgacgattcaaagcgctcccaataatattgaaaatgaaacaatatataaaccccgcgtgaacaaggcgagcacacatcttattttatttcatgagaaaattgtgagaaaaactgaagggtattatattatgctacatttttcatcattca-----TC--AT----G-TACA-CG-----T-ATG-----T-GT-A-CTAT--GAATGT-GG-ACTGAAACGGggcaggtttacccac
gi|5 : aaaccccgcgtgacaaggcggagcacaatatctattatcatgagaaaattggagaaaactaggaagggtatttactattagtgctacattttttcgcatcaCA-CG-----T-ATG-----T-GT-A-C-AT--GAATGT-GG-ACTGAAACGGttatgtacatcatactgtgtattcaagacgaacgttgatgacggattttagccccccttcttgtgaccatacttattgttacgtata
gi|19 : acatttgagttgcgaatgattgaaaaggaacaatgacacagcgggaaacaaaaagggggcgatacaaatatagaaatgaaatagtaaaaatgtttccctctaaacctcagttttcattaattgtgggaagccaggacccccccgcccccccgccactacttttgtgtctgatttaaaatatatgccaggtggtgcatgtaagaaaaatttgaacccaggtaggtgattttttcttcgagattcaaagcgctcccatatattgaaatgaaacaatatattaaaccccgcggtgaccaaaggcgagcacacaatccttattttatttcatgagcaaattggagaaaaactgaagagtattactattagtgcacagtttttcatcaatcaCA-CA-----T-A-------T-GT-A-C-AT--AAATAT-GG-ACTGAAGCAGgtaactgattgtggatga
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Reference ( family-1510 ) : ATTTGAG-TTT--TG--CGAA-G----TGA---TT----GT--A-ATG-------G---GGAC-A-ATGA-A--CA--GCG---G-AGACAAAAAGGGGGCG-AT-ACAAA--TTGA-A----TA-ANA--------AGA-TGA-AA---TG-AGTA----AA-A-TG-T---T-------------CC-CC--T--AA-AC---CT-CAG-TTT-CA-TTAAT--TGT-G--A------------AGCCAGGAA---CCACCCCCC-CCC--CCCC---C------CCCC-CCAC----ACACTA-C---TTT--GT-G-TC--TG-AAT-T--TA-AA-AT-ATA-TGC-----CAGGT-G-T-GC-A-T-GT-AAG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CAGG--TAGGTTGA--T-TTT-CTTC----G-AC-GA--TTCAAA--G---CGCTCC-C-AT-AT-A-TTG-AAAT--GAA---A-CAACATA-TAAA--AC--CCG-C-GTG-A--C--A--AGGC-GAGCAC-ACA---TCTTA--TTTTA-TTCATG-AGAA-A--A-TTG-GA--GA-AAAGC--GG-A-AGGGTA-TTACTA--TTA-GTGCT-ACA-TTTTTCAT-C---A-TCA-C-CG-T--TTCAG-T-CC-AC--ATTC-AT-G-TACA-CG-----TAC--GT-GT-A-CAT--GAAT--GTGGACTG-AAACGG
gi|1 : ATTTGAG-CTTCTTG--CGAAAG----TGA---T-----GT--A-ATG-------G---G-AC-A-ATGA-AA-CA---CG-----AGA--AAAAAGGGGCG-AT-ACAAA--T--A-A----TA-A----------AGA-TGA-AA---TG-AGTA----AA-A-TG-T---T-------------CC-CC--T--AA-CC---CT-CAG-TTT-CA-TTAAT--TGTGG--A------------AGCCAGG-A---CCCCCCCCC-CCT--TCCC---C------CCCC-CCAC----ACAC-A-C---TTT--GTGG-TC--TG-AAT-T--TACAA-AT-ATA-TGC-----CAGGT-G-TCGC-A-T-GT--AG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CA-G--TAGGTTGA----TTT-CTTC----G-AC--A--TTCAAA--G---CGCTCC-C-AT-ATCA-TTG-AAAT--GAA---A-CAACATA-TAAAACAC--TCGAC-GTG-A--C--A--AGAC-GAGCAC-ACA---TCTTA--TTTTA-TTCATGCAGAA-A--ATTTG-GA--GACAAAGC---G-A-AGGGTA--TACTA--TTAGGTGCT-ACA-TTTTTAGTCC---A-TCACC-CG-T--TGCAG-T-CC-AC--ATTC-AT-G-TACAGCATACATTAC--GT-GT-A-CAT--GATT--GTGGACTG-AAACGG
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gi|12 : cAA--TT---A----TA-GGA--------AGA-TGA-AAGCATG-AGCA----AA-T-TG-G---T-------------CT-CC--T--AA------CC-CAA-TTT-CG-TCAAT--TGT-G--A------------AG-TAGGAAAAGCCA-CGCTT-CTC--CCTT---T------TTGT-GCAT----ATGGGA-T---TTT--AT----------AAA-T--TA-CA-AT-GTA--GCCGGATCAGGT-A-G-GC-A-T-GT--AT-AA-AA-ATATGTG-ACC-CAGG--TAGGCTGA--T-TTC-TTGC----A-GT-TA--TTCAAa
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gi|13 : -TTTTTCAT-C---A-TTG-C-CGTT--TTCAG-T-CC-AC--ttttttcatcattgccgttttcagtccaccaattatgctgcaatagtagtcgttaatagatttgtggatgtaccacggtgatgacgagatttagccctccccccctcactcgtcttgtgaccatacttatatatagtataca
gi|13 : tatgccaggtgtgcatgtaaagaaaagatttgacacccaggctcaggtttattttacttcgacgaatttgagagggtcgttcccatatactgaaattggaaatA-GGGCT-AAA-TCT--CGT-C---A-TCA-C-CG-TGGTACA--T-CC-ACAAATCT-AT---TA-A-CGAC---TACTATT-GC-AGCAT---AATTGGTGGACTGAAAACGGcaattatgctgcaatagtagtcgttaatagatttgtggatgtaccacggtgatgacgagatttagccctccccccctcactcgtcttgtgaccatacttatatatagtataca
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gi|2 : TTGAG-TTT--GG--CGAA-G----TGA---TT----GTGGA-ATACACTGATA---GGAC-A-ATGA-AGCTA--GCG---G-AGACAAAAAGGGGGCGGATGACAAA----GA-A----TA-GAA--------AGA-TGA-AA---TG--GTA----AA-A-TG-T---T-------------CC-CCCTT--AGTAC---CT-TAG-TT---A-TT-----TGT-G--A------------AGCCAGGA-----CACCCCCC-TCC--CC---------------------------ACTAAC---TTT--GT-G-TC---G-AAT-TC-TA-AA-ATTATA-TGC-----CAGGTTG-T-GC-A-T-GTTAAG-AA-AA-AATTG-A-ACCACAGG--TAGGTTGA--T-TTT-CTTC----G-AC-GA--TTCAAA--G---CGCTCC-CAATAAT-A-TTGAAAAT--GAA---A-CAATATA-TAAA--CC--CCG-C-GTGAA--C--A--AGGC-GAGCAC-ACA---TCTTA--TTTTATTTCATG-AGAA-A--A-TTGTGA--GA-AAAAC--TG-A-AGGGTA-TTA-TA--TTA--TGCT-ACA-TTTTTCAT-C---ATTCA-C-CG-T--TTCAG-TCCC-AC--ATTC-AT-GATACA-CA-----TAC--GT-GT-A-C----GGTT--AT-GACTA-AGATGGgggcgtcttcctgtgaacaaactaaa
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gi|8 : gacaCACCCTCC-TCT--CACC---CGGGATACCACACCTC----ATCCTG-T---TTTTTGT-GGTCGTCG-AATCT--TA-AA-AT-ATAATGC-----CAGGT-G----C-A-T-AT-AGG-AAGAA-ATTTG-A-ACC-CAGG--TAGGTTGA--T-TTT-CTTCAGCGG-AC-G---TTCAAA--G---CGCTCC-C-AT-AT-A-TTG--AAT--GAACGCATCAACATAGTAAA--ACCACTG-CGGTG-GACC--A--AGGC-GAGCAC-ACA-------------------ATG-AG-A-A--T-TTG-GA--G--AAAGC--G----AAGGTA-TT-CTA---TG-GTGCTGACG-TTTTTCAT-C---A-T-A---CG----TTCAGAT-CCGAC--ATAC-TT-A-T-----------TAC--GT-GTAA-CAT---ATT--GTGGACTG-AAAc
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Reference ( family-1510 ) : ATTTGAG-TTT--TG--CGAA-G----TGA---TT----GT--A-ATG-------G---GGAC-A-ATGA-A--CA--GCG---G-AGACAAAAAGGGGGCG-AT-ACAAA--TTGAA------TA---G----AAAG--ATGA-AA---TG-AGTA----AA-A-TG-T---T-------------CC-CC--T--AA-AC---CT-CAG-TTT-CA-TTAAT--TGT-G--A------------AGCCAGGAA---CCACCCCCC-CCC--CCCC---C------CCCC-CCAC----ACACTA-C---TTT--GT-G-TC--TG-AAT-T--TA-AA-AT-ATA-TGC-----CAGGT-G-T-GC-A-T-GT-AAG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CAGG--TAGGTTGA--T-TTT-CTTC----G-AC-GA--TTCAAA--G---CGCTCC-C-AT-AT-A-TTG-AAAT--GAA---A-CAACATA-TAAA--AC--CCG-C-GTG-A--C--A--AGGC-GAGCAC-ACA---TCTTA--TTTTA-TTCATG-AGAA-A--A-TTG-GA--GA-AAAGC--GG-A-AGGGTA-TTACTA--TTA-GTGCT-ACA-TTTTTCAT-C---A-TCA-C-CG-T--TTCAG-T-CC-ACA--TTC-AT-G-TAC-A-CA-----TACG--T-GT-A-CAT--GANTG-TGGACTG-AAACGG
gi|1 : ATTTGAG-CTTCTTG--CGAAAG----TGA---T-----GT--A-ATG-------G---G-AC-A-ATGA-AA-CA---CG-----AGA--AAAAAGGGGCG-AT-ACAAA--T--AA------TA---------AAG--ATGA-AA---TG-AGTA----AA-A-TG-T---T-------------CC-CC--T--AA-CC---CT-CAG-TTT-CA-TTAAT--TGTGG--A------------AGCCAGG-A---CCCCCCCCC-CCT--TCCC---C------CCCC-CCAC----ACAC-A-C---TTT--GTGG-TC--TG-AAT-T--TACAA-AT-ATA-TGC-----CAGGT-G-TCGC-A-T-GT--AG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CA-G--TAGGTTGA----TTT-CTTC----G-AC--A--TTCAAA--G---CGCTCC-C-AT-ATCA-TTG-AAAT--GAA---A-CAACATA-TAAAACAC--TCGAC-GTG-A--C--A--AGAC-GAGCAC-ACA---TCTTA--TTTTA-TTCATGCAGAA-A--ATTTG-GA--GACAAAGC---G-A-AGGGTA--TACTA--TTAGGTGCT-ACA-TTTTTAGTCC---A-TCACC-CG-T--TGCAG-T-CC-ACA--TTC-AT-G-TAC-AGCATACATTACG--T-GT-A-CAT--GATTG-TGGACTG-AAACGG
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Reference ( family-1510 ) : ATTTGAG-TTT--TG--CGAA-G----TGA---TT----GT--A-ATG-------G---GGAC-A-ATGA-A--CA--GCG---G-AGACAAAAAGGGGGCG-AT-ACAAA--TTGAA------TA---G----AAAG--ATGA-AA---TG-AGTA----AA-A-TG-T---T-------------CC-CC--T--AA-AC---CT-CAG-TTT-CA-TTAAT--TGT-G--A------------AGCCAGGAA---CCACCCCCC-CCC--CCCC---C------CCCC-CCAC----ACACTA-C---TTT--GT-G-TC--TG-AAT-T--TA-AA-AT-ATA-TGC-----CAGGT-G-T-GC-A-T-GT-AAG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CAGG--TAGGTTGA--T-TTT-CTTC----G-AC-GA--TTCAAA--G---CGCTCC-C-AT-AT-A-TTG-AAAT--GAA---A-CAACATA-TAAA--AC--CCG-C-GTG-A--C--A--AGGC-GAGCAC-ACA---TCTTA--TTTTA-TTCATG-AGAA-A--A-TTG-GA--GA-AAAGC--GG-A-AGGGTA-TTACTA--TTA-GTGCT-ACA-TTTTTCAT-C---A-TCA-C-CG-T--TTCAG-T-CC-AC--A--TTC-AT-G-TAC-A-CA-----TA-----CG--T-GT-A-CAT-GA-T--TG-TGGACTG-AAACGG
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gi|13 : tatgccaggtgtgcatgtaaagaaaagatttgacacccaggctcaggtttattttacttcgacgaatttgagagggtcgttcccatatactgaaattggaaatA-GGGCT-AAA-TCT--CGT-C---A-TCA-C-CG-TGGTACA--T-CC-AC--AAATCT-AT-T-AACGA-C------TA-----CTATT-GC-AGCAT-AA-T--TGGTGGACTGAAAACGGtgtaccacggtgatgacgagatttagccctccccccctcactcgtcttgtgaccatacttatatatagtataca
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gi|7 : agctgtaatgcgacaatgaacagcgactgagaccaaatgaattgaataatagaaaagatgataatgagtaaaatatatttcctcctaaacctcaatttcattaattgtgtgacagcctgagcccccgcccccccccactactttgtgtctgtaatttgtaaaatatatgccaggtgtgcagtggtaagaaaaatttgaaccccaataggtgatcttccttcgaacgaatcaaagcttcccatataatgaagtgacacaataaaacccgcgtgacaacaggcTGAGATTT--TG--CTAA-G-----GA---TT----GT--A-ATG---------------------A-A--C---GCG---G-AGACAAAAAGGTTGCG-AT-ACAAT--TTGAAATAA--TA---G----AAAG--ATGA-AA---TACAGTA----AA-A-T--T---T-------------CC-CT--A--AA-AC---CC-CAAATTT-CA-TTAAT--TG--G--A------------AGCCAGGAA---C-ACCCC---------CCC---C------CCC---------------A-C---TCT----------------T-T--TA-AATAT-ATT-TGC-----CATGT---T-TC-A-A-GT-AAG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CAGG--TAGGTTAG--A-TTT-CTTCG---G-ACTAA--TTCAAAATG---CGCTCC-C-AT-AT-ATTTG-AAAT--GCATG-A-AAACATA-T-AA--AC--CCG-C-GTG-A--C--A--TGGC-GAGCAC-ACA---TCTTAT-TTTTA-TTCATG-AGAAGA--A-TTT-GA--GAGGAAGC--GGAA-AGAGTA-Ttgatgacggatttacccccccccccctcccccctcttgtggaacatactatattcgttat
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Reference ( family-1510 ) : ATTTGAG-TTT--TG--CGAA-G----TGA---TT----GT--A-ATG-------G---GGAC-A-ATGA-A--CA--GCG---G-AGACAAAAAGGGGGCG-AT-ACAAA--TTGAA------TA---G----AAAG--ATGA-AA---TG-AGTA----AA-A-TG-T---T-------------CC-CC--T--AA-AC---CT-CAG-TTT-CA-TTAAT--TGT-G--A------------AGCCAGGAA---CCACCCCCC-CCC--CCCC---C------CCCC-CCAC----ACACTA-C---TTT--GT-G-TC--TG-AAT-T--TA-AA-AT-ATA-TGC-----CAGGT-G-T-GC-A-T-GT-AAG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CAGG--TAGGTTGA--T-TTT-CTTC----G-AC-GA--TTCAAA--G---CGCTCC-C-AT-AT-A-TTG-AAAT--GAA---A-CAACATA-TAAA--AC--CCG-C-GTG-A--C--A--AGGC-GAGCAC-ACA---TCTTA--TTTTA-TTCATG-AGAA-A--A-TTG-GA--GA-AAAGC--GG-A-AGGGTA-TTACTA--TTA-GTGCT-ACA-TTTTTCAT-C---A-TCA-C-CG-T--TTCAG-T-CC-AC--A--TTC-AT-G-TAC-A-CA-----TA-----CG--T-GT-A-CAT-GA-T--TG-TGGACTG-AAACGG
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blockSeqs : . . . G . . . . GGA . . . CA . . G . . TAA G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A AC C . . CCCCCCGCC . . . CTT . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . G . CA . . G . . . A . .
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blockSeqs : . . . . . . . . AG . . . CA . . . . . TAA G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A G . . CC . . . GCT . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . G . A . . G . . . A . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TA G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . T .
blockSeqs : TA G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T .
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Reference ( family-1510 ) : ATTTGAG-TTT--TG--CGAA-G----TGA---TT----GT--A-ATG-------G---GGAC-A-ATGA-A--CA--GCG---G-AGACAAAAAGGGGGCG-AT-ACAAA--TTGAA------TA---G----AAAG--ATGA-AA---TG-AGTA----AA-A-TG-T---T-------------CC-CC--T--AA-AC---CT-CAG-TTT-CA-TTAAT--TGT-G--A------------AGCCAGGAA---CCACCCCCC-CCC--CCCC---C------CCCC-CCAC----ACACTA-C---TTT--GT-G-TC--TG-AAT-T--TA-AA-AT-ATA-TGC-----CAGGT-G-T-GC-A-T-GT-AAG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CAGG--TAGGTTGA--T-TTT-CTTC----G-AC-GA--TTCAAA--G---CGCTCC-C-AT-AT-A-TTG-AAAT--GAA---A-CAACATA-TAAA--AC--CCG-C-GTG-A--C--A--AGGC-GAGCAC-ACA---TCTTA--TTTTA-TTCATG-AGAA-A--A-TTG-GA--GA-AAAGC--GG-A-AGGGTA-TTACTA--TTA-GTGCT-ACA-TTTTTCAT-C---A-TCA-C-CG-T--TTCAG-T-CC-AC--A--TTC-AT-G-TAC-A-CA-----TA-----CG--T-GT-A-CAT-GA-T--TG-TGGACTG-AAACGG
gi|1 : ATTTGAG-CTTCTTG--CGAAAG----TGA---T-----GT--A-ATG-------G---G-AC-A-ATGA-AA-CA---CG-----AGA--AAAAAGGGGCG-AT-ACAAA--T--AA------TA---------AAG--ATGA-AA---TG-AGTA----AA-A-TG-T---T-------------CC-CC--T--AA-CC---CT-CAG-TTT-CA-TTAAT--TGTGG--A------------AGCCAGG-A---CCCCCCCCC-CCT--TCCC---C------CCCC-CCAC----ACAC-A-C---TTT--GTGG-TC--TG-AAT-T--TACAA-AT-ATA-TGC-----CAGGT-G-TCGC-A-T-GT--AG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CA-G--TAGGTTGA----TTT-CTTC----G-AC--A--TTCAAA--G---CGCTCC-C-AT-ATCA-TTG-AAAT--GAA---A-CAACATA-TAAAACAC--TCGAC-GTG-A--C--A--AGAC-GAGCAC-ACA---TCTTA--TTTTA-TTCATGCAGAA-A--ATTTG-GA--GACAAAGC---G-A-AGGGTA--TACTA--TTAGGTGCT-ACA-TTTTTAGTCC---A-TCACC-CG-T--TGCAG-T-CC-AC--A--TTC-AT-G-TAC-AGCATACATTA-----CG--T-GT-A-CAT-GA-T--TG-TGGACTG-AAACGG
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gi|11 : aaaATTTGAG-TTT--TG--CGAA-G----TGA---TT----GT--A-ATA-------------AC-A-ATGA-AA-CAA-GCG---G-AGACAAAAAGGGG-CG-AT-ACAAA--T--AA------TA---G----AAAAGAATGG-AA---TG-TGTA----AA-AATG-T---T-------------CC-CC--T--AA-AC---CCGCAT-TTT-CT-ATAAT--TGT-GG-A------------AGCCAGGA-----------CC-CCC--CCCC---C------CCCC-TTCC----CCATTA-C---TTG--GT-C-T---TG-AA--T--TA-AA-AC-ATA-TGC-----CAGG--G-T-GCGA-T-GT-AAGAAA-AA-ATTTGAA-ACC-CAGG--TAGGTTGA--T-TTT-CTTC----G-AC-GA--TTCAAA--G---CGCTCC-C-AT-AT-A--TG-AAAT--GAA---A-CAATATA-aagttagtacatgttgatgtcgtgagaaaatttattaaaatactaaaatgtaaattccaggaagtaaacatggtataatgaaggaaatgtgaaccccacgccgctaattgtttgattttgggctcgagaggattcaa
gi|12 : cAA--TT--A------TA---G----GAAG--ATGA-AAGCATG-AGCA----AA-T-TG-G---T-------------CT-CC--T--AA------CC-CAA-TTT-CG-TCAAT--TGT-G--A------------AG-TAGGAAAAGCCA-CGCTT-CTC--CCTT---T------TTGT-GCAT----ATGGGA-T---TTT--AT----------AAA-T--TA-CA-AT-GTA--GCCGGATCAGGT-A-G-GC-A-T-GT--AT-AA-AA-ATATGTG-ACC-CAGG--TAGGCTGA--T-TTC-TTGC----A-GT-TA--TTCAAa
gi|13 : acccaagtTA-TGC-----CAGGT-G-T-GC-A-T-GTAAAG-AA-AAGATTTG-ACACC-CAGGCTCAGGTTTA--T-TTTACTTC----G-AC-GAATTTGAGA--GGGTCGTTCC-C-AT-AT-A-CTG-AAATTGGAA---A-tgtttctttcagtaataatgtatagcgaatgaacaaactttaataaaaaccc
gi|13 : -TTTTTCAT-C---A-TTG-C-CGTT--TTCAG-T-CC-ACCAA--TT--AT-GCTGC-A--A-----TAGTAGTCG--T--T-A--ATAGATT--TG-TGGAttttttcatcattgccgttttcagtccaccaattatgctgcaatagtagtcgttaatagatttgtggatgtaccacggtgatgacgagatttagccctccccccctcactcgtcttgtgaccatacttatatatagtataca
gi|13 : tatgccaggtgtgcatgtaaagaaaagatttgacacccaggctcaggtttattttacttcgacgaatttgagagggtcgttcccatatactgaaattggaaatA-GGGCT-AAA-TCT--CGT-C---A-TCA-C-CG-TGGTACA--T-CC-AC--AAATCT-AT-T-AACGA-C------TA-----CTATT-GC-AGCAT-AA-T--TGGTGGACTGAAAACGGtgtaccacggtgatgacgagatttagccctccccccctcactcgtcttgtgaccatacttatatatagtataca
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gi|16 : TA-TAAA--AC--CCG-C-ATG-A--C--A--AGGC-GAGCAC-ACA---TCTTA--TTTTA-TTCATG-AGGA-AATA-TTG-GAAGAA-AAAGC--GA-G-AGGGTA-TTACTAT-TTA-GTGCT-ACA-TTTTTCAT-C---A-T-A-CACG-T--TGCAG-T-CC-AC--A--TGC-AT-G-TA-----A-----T-------------------T-GA-T--TG-TGGACTG-AAACGtcatgtcatgttgctg
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gi|6 : acT----GT--A-ATG-------C---G-AC-A-ATGA-A--CA--GCGACTG-AGACCAAATG-------------AA--TTGAA------TA---ATAGAAAAG--ATGATAA---TG-AGTA----AA-A-TA-TATTT-------------CCTCC--T--AA-AC---CT-CAA-TTT-CA-TTAATTGTGT-G--AC-----------AGCCTG--------AGCCCCC-GCC--CCCC---C------C-------------CACTA-C---TTT--GT-G-TC--TGTAAT-TTGTA-AA-AT-ATA-TGC-----CAGGT-G-T-GC-AGTGGT-AAG-AA-AA-ATTTG-A-ACC-CCAA--TAGG-TGA--TCTTC-CTTC----GAAC-GA--ATCAAA--G---C-TTCC-C-AT-AT-A-ATG-AAGT--GAC---A-CA----A-TAAA--AC--CCG-C-GTG-A--C--AACAGGC-AAGCGG-ATAAGGTATTA--CTTT--TTCAT
gi|6 : agcAAGC--GG-ATAAGGTA-TTACT------------------TTTTCAT-CCGAA-TCA-C-CG-T--TTCAG-T-CA-TT--A--TTCAAT-G-TAC-AGCA-----TA-----CG--T-AT-A-CAT-GA-GAATG-T-GAGTG-AAACGccgaatcaccgtttcagtcattattcaatgtacagcatacgtatacatgagaatgtgagtgaaacgtgatgacggatttacccccccccccctcccccctcttgtggaacatactatattcgttat
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gi|9 : ATTTGCA-TTT--TG--CGAA-G----T-A---TG----GT--A-ATG-------A---G-AC-A-ATGA-AA-CA--GCG---G-AGACAAAA-GGGGGCA-TT-ACAAA--T---A------CAT--G----AAAG--ATGA-AA---TG-AGT-----AA-A-TG-T---T-------------CC-CC--T--AA-AT---CT-CAGTTTT-CA-TTAAT--TGT-G--G------------AGCCAGA-------ACCCCCC-ACC--CCAC---T------C-------------CACTA-CA--TTT--CT-G-TC--TG-AAT-T--TA-AACAT--TA-TGC-----CA-GT-G-T--C-A-T-GT-AAG-AA-AA-ATTTG-A-ATC-CAGG--TAGGTTG---T-TTT-CTTC----G-AC-GA--TTCAAA--G---CGCT-C-C-AT-AT-A-TTG-AAAT--G-A---A-CAACAAC-TAAA--A---CCG-G-ATG-A--C--A--AGGC-GACAAC-ACA---TCTTA--TTtatcgtga