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Reference ( family-1469 ) : AAGATTATGGGGGA-------ATAAGCCGACCAATGTGCCCACG-CC-GTTTA--AATGCCTCTGCGACTAAGCAC-AG----------A-TCGG-AAAA-A-GTA----GA--GTCGCACGATTTTCA-AGGCA-TTAAA-CG-ATATA--CAGT-ACT--GTCCAA-AA--GAT-AC---TACATTAA-C-AAAG-T-GT-ACG---T-AATGTTGATT-T-GACATTT----A--------A-----GCTAA---A-TTA-AGGTT--------ATTTAACCAACTT-GC-CTTTTTACTGGTTTTT--TTTGGCAA--ACACAACGG--CCGCATCNTGAAGGT-----CGACC-C-ATG-ATTGTTT--ACAGTCAGGCTCGGA----------TAGAATACAT-GCAACA-CA-TG-GTATACAT--A----TC--AAAAGGCCTAACA-----ATG-A-------TT-T------AAAA----AAAACCCACG-TG-----T---A-ATCGTAA-CATAAAACGC--T-AAAAACGA-T-TG-AAC-T----A-G--ATT---A-AT-----------T---AT-----------------C-------------------T---------TG---------------A---------------------AA---------AAAA----TGTA-TT----AT-------AT-GCAT-TGTTAC-A--T--T---------AAA-----AAA---------TATTC-ACGCACGA----AA--A----AACCANA-GCG-TGATTCGA-ACACGGA--CNNTACATTAA-A--ATNCCTCCCAGA-AGAGCTCC--TCGCTAACCACTACACCACGACATCACCTCGA-TT-T-ATGCTTG--AATAACAAACTG----CTATCAGTATTAAGCAA
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gi|3 : AGATTATGGGGGA-------ATAAGCCGACCAATGTGCCCACG-CC-ATTTA--AATGCCTCTGCGACTGAGTAC-TG----------A-TCGG-AAAA-A-GTA----GA--ATCGCACGATTTTCA-AGGCATTTAAA-CG-ATATA--CAGT-ATT--GTCCAA-AA--GAT-ACATGTACATTAT-C-AAAG-T-GA-ATC---T-AATGTTAATT-T-GACATTT----G--------G-----GCTGA---A-TTA-AGGTT---------TTTAATCAACTT-GC-TTTTTTACTG---TTG--TTTGGCAA--ACACAACAG--CAGTATCTTGAAGGT-----CGACC-C-ATG-ATTGTTT--ACAGTCAGGCTCGGA----------TAGAATACAT-GCAGCA-CA-TG-GTATACAT--ACATGTCTGAAAAGGTCTAACA-----ATG-GTTT----TTT------TTAA----AAAA-CCCACG-TG-----T---A-ATCGTAA-CATAAAATAC--T-AAAA-CAG-T-TG-AACCA--G----------ACT-GTG-ACCT-----A--TT--------GT------G------------A-----------TG------G--AAAAA----TGCATT-AT-GT-GCTT-TGTTACAT-T--T--------AAA-----AAA---------TATTC-ACACACGA----AA--A----AA----ACATA-GCG-TGATTCGA-ATA--------GTAC---------ATGCCTCTACGA-ATAGCTCC--TCGCTAACCACTACACCA
gi|4 : ATTA-GGGGGA-------ATGAGCTGACGAATGTGCCCACC-GC-GTTTA--AA--------------AGCACGAG----------A-T-GG-AAAACA-GTACTATAA--GT---AC--TCGTCA-AAG-A-T---A-C--ATATATTCAAT-GCAAAGTTCAA-GTT-GATTAT---TATTTTAG-C-AA-T-T-GC--CGCTCT-ATTGTAGATT------GCTT----A--------A-----G--AATTCG-TTACATGTT--------CTTTAACCAACTTGGCACTTTTTATTG---TTT--TTTGGCAAGCACACAACGGGACCGCATCGT-AAGGTATCAGCTATCAC-ATGAATTGTTTTCACAGTCAGGCGCAGGGTTATTTTCCTAG-ATACATCGCATCATCATTT-GTAGACATTAG----TC--AAAAGGC---ACACCCACATG-A-------TTTAAAA--AAAA----AAAA-CTCACGATGTTAACT---A-ATGGTAACCATACAACTCAATAAAAA-CAA-TCTG-AAC-----ATA-----TAATT-AT--ATCTATGAGA--CC--------AT------A-T-CCTGAATCTAGTAGTT-----TT------GAAAAAAA----TGTATT-GT-AT-GCATATGTTACA--T--T--------gttacgagtacacactgtactcgtaacaac
gi|5 : ttaataAAGATTATGGGGGA-------ATGAGCTGACGAATGTGCCCACG-CC-GTTTA--AA--------------AGCAC-AG----------A-TCGN-NNNN-N-NNN----NN--NNNNNNNNNNNNNNG-A-------AAA-AGTATATA--CAGT-ACT--GTC-AA-AA--GAT-AC---TATATTAA-C-AAAG-T-GT-AAG---T-GATATTGATT-TTAACATTTGGCTA--------ATTTGTGCTAA---AATTA-AGGTTACATGGTTATTTAACCAACTT-GC-CTTTTTATT-GTTTTT--TTTGGCAAC-ACACAACGG--CCGCATCGTAAAGGT-----CGATC-C-ATGAATTGTTT--ACAGTCAGGCTCGG-----------TAGAATACAT-GCAAT--CA-TT-GTATACAT--A----TC--AAAAGGCC--ACAC----ATG-A-------TTTAAAAAAAAAA----AAAA-CCCACG-TG-----TTAAA-ATGGTAA-CAT-AAACAA--TAAAAA-CAA-T-TG-AACTA--AAT------TAATT-ATGTACCT-----ATCCT--------A-------A-T-C-----TC-AGTAG-------TT------GAAAAAAA----TGTATTGGTAAT-GCAT-TGTTACA--T--T--------At
gi|6 : ataATTATGGGGGA-------ATGAGCTGACGAATGTGCCCAC--CC-GTTTA--A--------------AAGCAC-AG----------A-TCGG-AAAA-A-GTA----gttttaaaag
gi|6 : ataga-ATATA--CAGT-ACT--GTC-AA-AA--GAT-AC---TATATTAA-C-AAAG-T-GT-AAG---T-GATATTGATT-TTAACATTTGGCTA--------ATTTGTGCTAA---AATTA-AGGTTACATGGTTATTTAACCAACTT-GC-CTTTTTATT-GTTTTT--TTTGGCAAC-ACACAACGG--CCGCATCGTAAAGGT-----CGATC-C-ATGAATTGTTT--ACAGTCAGGCTCGG-----------TAGAATACAT-GCAAT--CA-TT-GTATACAT--A----TC--AAAAGGCC--ACAC----ATG-A-------TTTAAAAAAAAAA----AAAA-CCCACG-TG-----TTAAA-ATGGTAA-CAT-AAACAA--TAAAAA-CAA-T-TG-AACTA--AAT------TAATT-ATGTACCT-----ATCCT--------A-------A-T-C-----TC-AGTAG-------TT------GAAAAAAA----TGTATTGGTAAT-GCAT-TGTTACA--T--T--------Atatacagtactgtcaaaagatactatattaacaaagtgtaagtgatattgattttaacatttggctaatttgtgctaaaattaaggttacatggttatttaaccaacttgcctttttattgttttttttggcaacacacaacggccgcatcgtaaaggtcgatccatgaattgtttacagtcaggctcggtagaatacatgcaatcattgtatacatatcaaaaggccacacatgatttaaaaaaaaaaaaaacccacgtgttaaaatggtaacataaacaataaaaacaattgaactaaattaattatgtacctatcctaatctcagtagttgaaaaaaatgtattggtaatgcattgttacattagttttaaaa
gi|7 : atagaattatgggggaatgagctgacgaatgtgcccacccgtttaaaagcacagatcggaaaaagtTT--TTTGGCAA--ACACAACAG--CCATATCTTGAAGGT-----CGACC-C-ATG-AGTGCTT--ACAGTCAGGCTCGGA----------TAGAATACAT-GCAACA-CA-TG-GTATACAT--A----TC--AAAAGGCCTAAGA-----ATA-A-------TTT------TATA----AGAA-CCC-TG-TG-----T---A-ATCGTAA-CATAAAATAC--TAAAAA-CAA-T-TG-AACTA--GAT------TAATT-ATG-ACCT-----ATTCT--------A-------A-T-C-----TC-AAGTACATGTAGTT------G-AAAATA----TGCA-T-A--AT-GCAT-TGTTACT--T--TTTTC----AAA-----AAAAT-------TATTC-ACACAGGA----AA--A----AA----CCATA-GCG-TTATTAGA-ACACGGG--CCATGCATTAA-A--GT-CCTTCCTGA-ATAGCTCC--TCGCTAACCACTACACTACGATATCACATAAA-TA-T-ATG--------TAACAAACTGCTGTCTATCAGTATTAAGCAAgttttaaaa
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blockSeqs : . . . . T . . . N . . GT . ATAC . . . . . . TA . . . . A . . T GG A . . T GT . . GG G . . . . . C A . A . T . . . TA . GTTTTTT . . . T . . CT . . A . . . . . . G ATTATAATATCA . A . ATG . . . . . . AAGAA A . . . C G C . . . AT . . C . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . NN . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A C . . . . . . . . . . G . . . . . ATTT . . . T . . CA . . A . . . . . . A ATTCTGATCGCA . A . TG . . . . . .
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finalCons : AAGATTATGGGGGA-------ATAAGCCGACCAATGTGCCCACG-CC-GTTTA--AATGCCTCTGCGACTAAGCAC-AG----------A-TCGG-AAAA-A-GTA----GA--GTCGCACGATTTTCA-AGGCATTAAACG---ATATA--CAGT-ACT--GTCCAA-AA--GAT-AC---TACATTAA-C-AAAG-T-GT-ACG---T-AATGTTGATT-T-GACATTT----A--------A-----GCTAA---A-TTA-AGGTT--------ATTTAACCAACTT-GC-CTTTTTACTGGTTTTT--TTTGGCAA--ACACAACGG--CCGCATCNTGAAGGT-----CGACC-C-ATG-ATTGTTT--ACAGTCAGGCTCGGA----------TAGAATACAT-GCAACA-CA-TG-GTATACAT--A----TC--AAAAGGCCTAACA-----ATG-A-------TTT------AAAA----AAAA-CCCACG-TGT--------A-ATCGTAA-CATAAAACGC--TAAAAA-CGA-T-TG-AACTA--GAT------TAATT-ATG-ACCT-----A--CT--------AT------A-T-C-----TC-A-----------TT------GAAAAAAA----TGTATT-AT-AT-GCAT-TGTTACA--T--T--------AAA-----AAA---------TATTC-ACGCACGA----AA--A----AA----CCANA-GCG-TGATTCGA-ACACGGA--CNNTACATTAA-AATG--CCTCCCNGA-AGAGCTCC--TCGCTAACCACTACACCACGACATCACCTCGA-TT-T-ATGCTTG--AATAACAAACTG----CTATCAGTATTAAGCAA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): TACTATCAGTATTACAGCAAGCGTTAATGAACTTGGAGTTTTG
Alignments
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consensus : AAGATTATGGGGGA-------ATAAGCCGACCAATGTGCCCACG-CC-GTTTA--AATGCCTCTGCGACTAAGCAC-AG----------A-TCGG-AAAA-A-GTA----GA--GTCGCACGATTTTCA-AGGCA-TTAAA-CG-ATATA--CAGT-ACT--GTCCAA-AA--GAT-AC---TACATTAA-C-AAAG-T-GT-ACG---T-AATGTTGATT-T-GACATTT----A--------A-----GCTAA---A-TTA-AGGTT--------ATTTAACCAACTT-GC-CTTTTTACTGGTTTTT--TTTGGCAA--ACACAACGG--CCGCATCNTGAAGGT-----CGACC-C-ATG-ATTGTTT--ACAGTCAGGCTCGGA----------TAGAATACAT-GCAACA-CA-TG-GTATACAT--A----TC--AAAAGGCCTAACA-----ATG-A-------TTT------AAAA----AAAA-CCCACG-TG-----T---A-ATCGTAA-CATAAAACGC--TAAAAA-CGA-T-TG-AACTA--GAT------TAATT-ATG-ACCT-----A--CT--------AT------A-T-C-----TC-A-----------TT------GAAAAAAA----TGTATT-AT-AT-GCAT-TGTTACA--T--T--------AAA-----AAA---------TATTC-ACGCACGA----AA--A----AA----CCANA-GCG-TGATTCGA-ACACGGA--CNNTACATTAA-A--ATGCCTCCCNGA-AGAGCTCC--TCGCTAACCACTACACCACGACATCACCTCGA-TT-T-ATGCTTG--AATAACAAACTG----CTATCAGTATTAAGCAA
Reference ( family-1469 ) : AAGATTATGGGGGA-------ATAAGCCGACCAATGTGCCCACG-CC-GTTTA--AATGCCTCTGCGACTAAGCAC-AG----------A-TCGG-AAAA-A-GTA----GA--GTCGCACGATTTTCA-AGGCA-TTAAA-CG-ATATA--CAGT-ACT--GTCCAA-AA--GAT-AC---TACATTAA-C-AAAG-T-GT-ACG---T-AATGTTGATT-T-GACATTT----A--------A-----GCTAA---A-TTA-AGGTT--------ATTTAACCAACTT-GC-CTTTTTACTGGTTTTT--TTTGGCAA--ACACAACGG--CCGCATCNTGAAGGT-----CGACC-C-ATG-ATTGTTT--ACAGTCAGGCTCGGA----------TAGAATACAT-GCAACA-CA-TG-GTATACAT--A----TC--AAAAGGCCTAACA-----ATG-A-------TTT------AAAA----AAAA-CCCACG-TG-----T---A-ATCGTAA-CATAAAACGC--TAAAAA-CGA-T-TG-AACTA--GAT------TAATT-ATG-ACCT-----A--CT--------AT------A-T-C-----TC-A-----------TT------GAAAAAAA----TGTATT-AT-AT-GCAT-TGTTACA--T--T--------AAA-----AAA---------TATTC-ACGCACGA----AA--A----AA----CCANA-GCG-TGATTCGA-ACACGGA--CNNTACATTAA-A--ATGCCTCCCNGA-AGAGCTCC--TCGCTAACCACTACACCACGACATCACCTCGA-TT-T-ATGCTTG--AATAACAAACTG----CTATCAGTATTAAGCAA
gi|1 : AAGATTATGGGGGA-------ATAAGCCGACCAATGTGCACACG-CC-GTTTA--AATGCCTCTGCGACTAAGCAC-AG----------A-TCGG-AAAA-AAGTC----GA--GTCGCACGATTTTCA-AGGCA-----A-CG-ATATA--CAGG-ACT--GTCCAA-AA--GAT-AC---TACATTAA-C-AAAG-T-GT-GCG---T-AATGTTCATT-T-GACATTT----G--------A-----GCTAA---A-TTA-AGGTT--------ATTT-------TT----TTTTTTACTG----TT--TTTGGCAA--GCACAGCAA--CCGCATCGTGAAGGT-----CAACC-CCAAG-ATTGTTT--ACAGTCAAGCTTGGA----------TAGAATACAT-GCAACA-CA-T-----------------------AAGGCCTAACA-----ACA-A-------TTA------AAAA----AAAAACCCACG-T---------------------ATAAAACAC--TAAAAAACAA-T-AG-AACTA--AAT------TAATT-ATA-ATCTCA---A--TTGCAAGTACAT------A-T-G-----TA-G-----------TT------GAAAAAA-----TGTATT-GT-TT-ACAT-TGTTTCA--T--TCAAAA---AAA-----AAA---------TATTC-ACACATGA----GA--A----AA----CCATA-TCG-TGATTCGA-ACACGGT--CCATACATTAA-A--GT-CCTTCCTGA-AGAGCTCC--TCGCTAATCACTACACTACGACATCACCTTGATTT-T-ACTCTTGTAAATAACAAACTG----CTATCAGTATTAAGCAA
gi|10 : aTT-AC-CTTTTAACTGCCTTTT------GCAA--ACACAACTG--CCAAATCCTGAAGGT-----CGACC-T-TTG-GTTGTTT--ACAGT----CTGGAA----------TATAATACAA-GCAACA-CA-TGCGTATGCAT--A----TC--AATAGGCCAAGCG-----ATA-A-------TTA------AGAA----AAAA----ATA-TG-----T---A-ATCGTA---ATAGAATGC--CAAAAA-CGA-T-TGTAGCTA--GAT------TAATT-ATA-ACGT-----A--TT--------ATA-----A-T-A-----TC-A-----------CT--------ATAAAA----TGT-TT--T-GT-GCAA-TGTCACA--TTCT--------AAA-----AAgcagagcaagttga
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gi|13 : aagag-TG-----T---ATATCG-AA-CATAAAATGC--TAAAT--CGA-T-TGTAGCTGTTAAG------TAATT-A---ACCT-----A--TT--------CT------GGT-C-----TC-A-----------CT------GAAAAA------TGTATG-AG-TT-ACAT-T-TT-----T--T--------AAA-----AA----------------------GA----CA--A----AA----CCAGACACGGTGATTCGA-ACACG----TCCTTCATTAA-A---CGC-TCCC--A-AGAGCTCC--GCACTAACCACTACt
gi|14 : catGGGGGA-------ATAAGCCAAACGATATGCCTACGTCC-GTT-A--AATGC-----------------AG----------A-T---------A-GT---------GTTGTGCGATTTTAA-AAGCA-TTTAATCG-ATATA--TAGT-ACT--GTTCAA-AA--GGT-AC---C-CACTCG-C-CAAA-T-GT-GCA---T-AATGTTGATT-T-GGCATTT----A--------A-----GCTAA---A-TTA-ACGTA--------TTTTAATCAc
gi|15 : taagaactaC-CTTTGAACTGGTTTTT------GCAA--ACACAACAG--CCATATCCTGAAGAT-----TGATC-C-ATG-CTTG-TT--AAAGT----CTCAGA----------CAAAATACAT-GCAGCA-CA-TG------CAT--A----T-------------AC----------------------------AAA----GAAG-CGCATG-TG-----C---A-ATTGTAA-CATAAAATGC--TAAAAA-TGA-T-TGTAATTA--GAT------TAAAT-A
gi|16 : -GTATACAT--A----TC--AAAAGGCCCAACA-----ATG-A-------TTT------AAAAAAAAAAAA-CCCACG-TG-----T---A-ATGGTAA-CATAAAACAA--TAAAAA-CAA-T-TG-AACTA--AAT------TAATT-ATG-ACCT-----ATCCT--------A-------A-T-C-----TC-AAGTAG------TT------GAAAAAAA----TGTATT-GT-AT-GCAT-TGTTACA--T--T--------Aa
gi|17 : AAGGTTGTGGGG-A-------ATAAAC-GACCATTG---CCACG-C-----------------------TAAGCAC-AG----------A-TCG--AAAA-A-GTA----GA--GTCGCACGATTC-----------------------A--CAGTTACT--GTCCAA-AA--GAT-AC------AT-AG-C-AAAG-T-GT-ACG---T-AATG-AGATTCT-TAT-TCT----A--------A-----TCTAA---A-TTgttt
gi|18 : ATAAA---C--TATAAA-CAA-T------CTA--GGTACTTTATAATTTATA-GCCT-----A--TT--------CTG-----A-T-C-----GC-A-----------CT------GAAGAAA-----TGTAT--A--AT-GCAT-TGTTACT--T--T--------AAA-----AAA----------A----AGAAACGA----AATGA----AA------GAA-GCG-TGATTCGA-ACACAAA--CATTACATTAgcgggaatacttttatactgt
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gi|21 : AAAGTGTCCACG-TC-GTTTA--AGTGCCTCTGCGACTAAATAC----------------TGG----A-A-GTA----GT--GTCGCACGATTTCCA-AGGC
gi|23 : AAGATTCTGTGGTA--------TAAGGCGACCAATGTGCCCACG-CC-GTTTg
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gi|4 : ATTA-GGGGGA-------ATGAGCTGACGAATGTGCCCACC-GC-GTTTA--AA--------------AGCACGAG----------A-T-GG-AAAACA-GTACTATAA--GT---AC--TCGTCA-AAG-A-T---A-C--ATATATTCAAT-GCAAAGTTCAA-GTT-GATTAT---TATTTTAG-C-AA-T-T-GC--CGCTCT-ATTGTAGATT------GCTT----A--------A-----G--AATTCG-TTACATGTT--------CTTTAACCAACTTGGCACTTTTTATTG---TTT--TTTGGCAAGCACACAACGGGACCGCATCGT-AAGGTATCAGCTATCAC-ATGAATTGTTTTCACAGTCAGGCGCAGGGTTATTTTCCTAG-ATACATCGCATCATCATTT-GTAGACATTAG----TC--AAAAGGC---ACACCCACATG-A-------TTTAAAA--AAAA----AAAA-CTCACGATGTTAACT---A-ATGGTAACCATACAACTCAATAAAAA-CAA-TCTG-AAC-----ATA-----TAATT-AT--ATCTATGAGA--CC--------AT------A-T-CCTGAATCTAGTAGTT-----TT------GAAAAAAA----TGTATT-GT-AT-GCATATGTTACA--T--T--------gttacgagtacacactgtactcgtaacaac
gi|5 : ttaataAAGATTATGGGGGA-------ATGAGCTGACGAATGTGCCCACG-CC-GTTTA--AA--------------AGCAC-AG----------A-TCGN-NNNN-N-NNN----NN--NNNNNNNNNNNNNNG-A-------AAA-AGTATATA--CAGT-ACT--GTC-AA-AA--GAT-AC---TATATTAA-C-AAAG-T-GT-AAG---T-GATATTGATT-TTAACATTTGGCTA--------ATTTGTGCTAA---AATTA-AGGTTACATGGTTATTTAACCAACTT-GC-CTTTTTATT-GTTTTT--TTTGGCAAC-ACACAACGG--CCGCATCGTAAAGGT-----CGATC-C-ATGAATTGTTT--ACAGTCAGGCTCGG-----------TAGAATACAT-GCAAT--CA-TT-GTATACAT--A----TC--AAAAGGCC--ACAC----ATG-A-------TTTAAAAAAAAAA----AAAA-CCCACG-TG-----TTAAA-ATGGTAA-CAT-AAACAA--TAAAAA-CAA-T-TG-AACTA--AAT------TAATT-ATGTACCT-----ATCCT--------A-------A-T-C-----TC-AGTAG-------TT------GAAAAAAA----TGTATTGGTAAT-GCAT-TGTTACA--T--T--------At
gi|6 : ataATTATGGGGGA-------ATGAGCTGACGAATGTGCCCAC--CC-GTTTA--A--------------AAGCAC-AG----------A-TCGG-AAAA-A-GTA----gttttaaaag
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gi|7 : atagaattatgggggaatgagctgacgaatgtgcccacccgtttaaaagcacagatcggaaaaagtTT--TTTGGCAA--ACACAACAG--CCATATCTTGAAGGT-----CGACC-C-ATG-AGTGCTT--ACAGTCAGGCTCGGA----------TAGAATACAT-GCAACA-CA-TG-GTATACAT--A----TC--AAAAGGCCTAAGA-----ATA-A-------TTT------TATA----AGAA-CCC-TG-TG-----T---A-ATCGTAA-CATAAAATAC--TAAAAA-CAA-T-TG-AACTA--GAT------TAATT-ATG-ACCT-----ATTCT--------A-------A-T-C-----TC-AAGTACATGTAGTT------G-AAAATA----TGCA-T-A--AT-GCAT-TGTTACT--T--TTTTC----AAA-----AAAAT-------TATTC-ACACAGGA----AA--A----AA----CCATA-GCG-TTATTAGA-ACACGGG--CCATGCATTAA-A--GT-CCTTCCTGA-ATAGCTCC--TCGCTAACCACTACACTACGATATCACATAAA-TA-T-ATG--------TAACAAACTGCTGTCTATCAGTATTAAGCAAgttttaaaa
gi|8 : ttaactg-CTTTCAACTGGATTTT------GCAA--ACACAACA------TATCCTGAATGT-----CGACA-C-ATG-AGTGTTT--ACAGTC----TCGGA----------TAGAATACAT-GCAATA-CA-TGCGTATACAT--A----TC--AAAAAGCTTAACG-----ATGTA-------TTTTTT---AAAA----ATA---------TG-----T---A-AACGTAA-TATAAAATCC--TAAAAA-TTA-T-TTTAAGTA--GAT------TAATT-ATA-ACCT-----A--CC--------AT------A-TTC-----TA-A-----------TTTGACTGAAAAAAAA----TGTATT-AT--T--CAT-TGTTACAATT--TGAAATCACAAA-----AAA---------GA----ATGAAAGA----AA--A----AAAGAATCAGA-CCG-TGATTCGA-ACACGGA--CATTATATT-A-A--ATGCCTCCCACA-AGAGTTCT--GCGCTA
gi|9 : C-CTTTCAACTGGTTTTT------GCAA--ACACAACA------TATCCTGAATGT-----CGAGA-C-ATG-AGTGTTT--ACAGTC----TCGGA----------TAGAATACTT-GC-----------GTATACAA--A----TC--AAAAAGCTTAACA-----ATATA-------TTTTTTTTTAAA--------------TG-TG-----T---A-ATCGTAA-TATAAAATCC--TAAAAA-TGAGC-TT-AAGTA--GAT------TAATT-ATA-ACCT-----A--CC--------ATATTCTAA-T-T-----TC-A-----------CT------G-AAAAAA----TGTATT-AT--T--CAT-TGTTGCAATT--T--------AAAATCACAAA---------AAGGA-ATGAAAGA----AA--AAAAGAA----CCAGA-CCG-TAATTCGA-ACACGGA--CATTATATT-A-A--ATGCCTCCCACA-AGAGTTCT--GCGCTAACCA
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Unaligned ( gi|22 ): TACTATCAGTATTACAGCAAGCGTTAATGAACTTGGAGTTTTG