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Reference ( gi|3 ) : ACTGGTATT-AAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---A---C--TGC---A--CTT--A-C----GGG---T-A---GC-CC-A-A-T-ATGG---CAGA-C-GAAAGT-ACAGGT-AGAA-TA--TA-A---TTT---G--C-TTTTTG--TC-A-A-ACGAT-AA---AT---AATTAA-------AC-T-GT-T-----AAA--TT--ATT-CC-AATAC--GAAC----AAAC--T--TTG-----ATTCATA-------------GAGA-TCA-G-TT----ATTGGT-CTCATTCATA-TG----TATTA--CG-TGTCTG-----GT-T---------------------T-------------------------A---------------------A---------A----------AAA-----C------AT----A---A---TGA-TGCG-T--G-TA-----A-CT-CCA-TATT--T-TCTAT-AA-TCGC-A--A--TG-A-G---T-G--TAA--C-T--GTC---AA---TA---CG-G--A-TACC--C-GTA--A-CT-TGCA--AA--CACGC-----TGG-T---GG-TT-TACAAT-AGGTG--TA-GT-TTCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CACATTT-A-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCGA-TC-A-GT--A-A-CTTTTATG--------GTTGA--AT-TTTC-AAGAACA-AA-CG-TC-AT-----A--A-TT-T-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGAGT-----A-TCA--T-T--TCT-G-AGTT--ACG--GTCA-ATC--AC-A-----------TTTC-AG-AAAG-TT-C-ATTAGTTACG-----G--GC-A-TC---AATA-A------C--GG-CAG-T----TAC-------ACG--------------C-AT--C--AT-C-A--C--TGGTA-T-C-AT-T-TT--G---GCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-AT--ACCTT--GCG-TT---CC----AAAGCA---TT-CCAA-TTT-TATAAAAATA---CACA-C--TAGA--CTA-T--A-AA-GC-TGTTT-C-AA-T-AAA--TAAATA-ACAAAAGAAAAAA----CAGAGATAAATGAC--T--AAC--CCGA--TCCTGTG-GCC--GCC-ACC-T-T-G-GGCTA---C-CCGT--AA---C--TGC--A--G---T---T-ACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAG
gi|1 : ACTGATATT-AAGGGC-CGAT--GCC-GT-------ATTAA---C--TGC---A--GTT--A-C----GGG---TTA---GC-TC-A-AGT-ATG----CAGA-C-GAAAGT-ACAAGT-AGAA--A--T------TTT---G--C-TTTTT---TC-ATA-CCCGT-AA---AA---AACTAA-------AC-TTGT-TTTTTAAAA--TT--ATTTCC-AATAC--GGACCAC-AAACA-T--TTG-----ATTCATA-------------GAGA-TCA-GGTC----ATTGGT-CTCATTCATA-TG----TATTA---G-TGTCTG-----GT-TATCCGTGGGTGTAACGTAGTAT-------------------------A---------------------A---------A----------AAA-----C------G-----A---A---TGA--GCG-T--GGTA-----AGCT-GCA--ATTGGT-CATATGAA-TCGT-G--AGATG-A-G---T-GGGTAA--C-T--GGCGA-AA---TAG--CG-G--A-TACC--CCGTA--A-CG-TGCG--AA--AACG---------------------A-AGT-AGGTG--TA--T-TTCGAGGTGGATCATGG--GA--CTTTGTGGCACAGTT-A-TCT-AGCTGGTT-AG---A-TCGAGTCGA-GT--AGA-CGTTTAGG--------GTTTA--AT-TTTCCAAGAACA-AAGCG-TC-AT-----AGGA-TTGT-A----TAGGACC-ATA-CTGTTA---A----CATGCTAGGATGACGAAGAGGCG-ATAACGGGT-------TCA--T-T--TCTCGCAGTT--ACG--GTCA--TCCGAC-A-----------TTTC-AG-AAAGGTT-C-ATTAGTTACG-----T--GC-A-TC---AG-A-G------C--GGGCA--T----TAC-------ACG--------------C-AT--C--AT-C-C--T--TGATGGT-C-ATGT-TT--G---GCG-A-TCGTGT-T--GGA--TT--TATAGACA-ATGAACGTT--GCG-TC---C------AATCA---TT-CCAA-TTT-T-TAAAA-TAAAGCACAACGATAGGAGCTA-TTGA-AG-AC-TATTT-C-AA-T-GAA--TAAATA-ACAAAAGAAAAAAAAT-CAGAGATAAATGACGGT--AA---CCGATGTCGTGTGAGCC--GCC-AGT-C-T-GTGGCTA---CGCCTC--AAG--C--TGCAGA--G---TGG-T-ACG-GGC---A-CGCG--CTT-AA
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gi|30 : cACTGGTATT-AAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---A---C--Tnag
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gi|11 : CTGGTATTGAAG--CGCGAT--GGCCGT-------A---A---C--TGC---AGTTTT--A------GGG---T-A---GC-CCGA-A-G-ATGG---CGG
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gi|9 : acTATT-GGG--C----T--ACCCGT-------A---A---C--TGC---A--GTT--A-C----GGG---C-ATCGGC-TT-A-A-T-A
gi|10 : ctggTATT-GGG--C----T--ACCCGT-------A---A---C--TGC---A--GTT--A-C----GGG---C-ATCGGC-TT-A-A-T-Atggcagacgaaagtacgccttgaatatatttttgctttttgtcatacgataaataactaaactgttaaattattccaatacggacaaactttgattcatagagatcagttattgggctcattcatatatataacgtgtctggtttatccgtgtttaacgtatgaaaaaaaaaccagaatgatgcgtgtaactgcatattcgcgatgagtgtaactggcaatacggatacccgtaacttgcaaacacgctgaaagtttacaatagctgtagtatcagtatcatg
gi|17 : actggTATT-GGG--C----T--ACCCGT-------A---A---C--TGC---A--GTT--A-C----GGG---C-ATCGGC-TT-A-A-T-Atggcagacgaaagtacggcttgaatatatttttgctttttatcgcacgataaataactaaactgttaaattattccaatacggacaaactttgattcatagagatcagttattggtctcattcatatgtattacgtgtctggtttatccgtgtttaacgtatgaaaaaatcagaatgatgcgtgtaactgcatattcgcgatgagtgtaactggcattacggatacccgtaacttgcaaacacgttggtcgattacaataggtg
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gi|22 : actggTATT-GGG--C----T--ACCCGT-------A---A---C--TGC---A--GTT--A-C----GGG---C-ATCGGC-TT-A-A-T-Atggcagacgaaagtacagcttgaatatatttttgctttttgtcatacgataaataactaaactgttaaattattccaatacggacaaactttgattcatagagatcagttattggtctcattcatattgtat
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gi|11 : cactggtattaagccgatgcccgtaaccatgcagttacggtagcccatatggcagaccgaacgacggctcgaatatatttttgcttttttatctacgtgatgacttaaactgttaattacccaatcgaaaaactcattgaataaatgcaaaagactcgtttattggtctcattcatatgttattacccgtgtctggtttattgccgctcgtttaacgtatagaaaaaacaTT--ACA--GTCA-TCC--AC-A-----------TTTC-AG-AAAG-TT-C-ATTA-TTACGCG---G--GCCA-TC---AATA-G------CCCGG-CAG-T----TACTTAGTACACG--------------CCAT--C--AT-CCA--C--TGATG-T-C-AT-T-TT--G---GCG-ACT-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-AT--ACTTT--GTGGTT---CC----AAATCA---TT-CCAAATTT-TATAAAAATA---TACA-CCCTTGA--CTAGT--G-AA-GC-TCATT-C-AAGT-AAA--TAA-TACACAAAAGAAAAAA----CAGAGATAAATGAC--T--AACCACCGA--TTCTCTG-GCC--GCC-ATC-T-TCG-GGCTA---C-CC-TAAAA---C--TGC--A--G---T---T-ACG-GCC---ATCGCG--CTTCAATACCAGc
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consensus : ACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTT--A-C----GGGT-AGC-CCA-A-T-ATGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CGGCTTGAATA--TA--TTT-TTG--C-TTTTTGTC-ATAC--GAT-AA---AT-AAC-TAA-------AC-T-GT-T-----AAA--TT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC--T--TTG-----ATTCATA-------------GAGA-TCA-G-TT----ATTGGTCT---CAT--TC----ATA-TG-----TATTA--CG-TGTCTGG----------TTT-A-T--CCGTGTTTA---ACGT-------------A---T--G-AAAAAAA---C---------A----GAA-T---G---A-TG-C---G-T--G-TA-----A-C-TGCA--------TATT---------TC-------G------C-G----A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GGC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGC-----TGGT-T---G--TT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CACATTT-A-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-A-CTTTTATG--TT-TTA----AT-TTT----C-AAGAACA-AA-CG-TC-AT-----A--A-TT-T-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGGGT-A-TCA--T-T--TCTC--AGTT--ACG-G--TCAT--------CC-A-C-A-TTT-C-AG-AAAG-TTC-ATTAGTTACG-----G--G--CA-TC---AAT-A-G------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------CAT--C--A-T-C-AC--TG--ATG-T-C-AT-T-TT--G-GCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-AT--A-CTTT-GC-GTT---CC----AAATCA---TT-CC-AATTTTATA-AAAATA---CACA--C--TAGA--CTA-T-G-AA-G-CTA-TTTC-AA-T-AAA--TAA-ATA-ACAAAAGAAAAAAAA--CAGAGATAAATGAC--T--AAC--CCGAT-TC-TGTG-GCC--GCC-A-TCTT-GGGCTA---C-CCGT--AA-CTGC--AG---T--TACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAG
Reference ( family-1329 ) : ACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTT--A-C----GGGT-AGC-CCA-A-T-ATGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CGGCTTGAATA--TA--TTT-TTG--C-TTTTTGTC-ATAC--GAT-AA---AT-AAC-TAA-------AC-T-GT-T-----AAA--TT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC--T--TTG-----ATTCATA-------------GAGA-TCA-G-TT----ATTGGTCT---CAT--TC----ATA-TG-----TATTA--CG-TGTCTGG----------TTT-A-T--CCGT--------ACGT-------------A---T--G-AAAAA-----C---------A----GAA-T---G---A-TG-C---G-T--G-TA-----A-C-TGCA--------TATTT-------ATC-------G------C-G----A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GGC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGC-----TGGT-T---G--TT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CACATTT-A-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-A-CTTTTATG--TT-TTA----AT-TTT----C-AAGAACA-AA-CG-TC-AT-----A--A-TT-T-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGGGT-A-TCA--T-T--TCTC--AGTT--ACG-G--TCAT--------CC-A-C-A-TTT-C-AG-AAAG-TTC-ATTAGTTACG-----G--G--CA-TC---AAT-A-G------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------CAT--C--A-T-C-AC--TG--ATG-T-C-AT-T-TT--G-GCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-AT--A-CTTT-GC-GTT---CC----AAATCA---TT-CC-AATTTTATA-AAAATA---CACA--C--TAGA--CTA-T-G-AA-G-CTA-TTTC-AA-T-AAA--TAA-ATA-ACAAGAGAAAAAAAA--CAGAGATAAATGAC--T--AAC--CCGAT-TC-TGTG-GCC--GCC-A-TCTT-GGGCTA---C-CCGT--AA-CTGC--AG---T--TACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAG
gi|1 : ACTGATATTAAGGGC-CGAT--GCC-GT-------ATTAAC--TGCAGTT--A-C----GGGTTAGC-TCA-AGT-ATG----CA---GA-C-GAAAGT-A--CAAGTAGAA-----A--TTT-T-G--C-TTTTT-TC-ATACCCG-T-AA---AA-AAC-TAA-------AC-TTGT-TTTTTAAAA--TT--ATTTCC-AATAC--GGACCAC-AAACA-T--TTG-----ATTCATA-------------GAGA-TCA-GGTC----ATTGGTCT---CAT--TC----ATA-TG-----TATTA---G-TGTCTGG----------TT--A-T--CCGTGGGTGTA-ACGT-------------AGTAT--A-AAAAA-----C--------------GAA-T---G---A--G-C---G-T--GGTA-----AGC-TGCAATTGGTCATATGA-------ATC-------G------T-G----AGATG-A-G---T-GGG------TAA--C-T-GGCGAAA---T------------AGCG-G--ATACC--CCGTA-------A-CG-TG-CG--AA--AACG----------------------A-----------------AGT-A------GGTG--TA--T-T-----TCGAGGTGGATCATGG--GA--CTTTGTGGCACAGTT-A-TCT-AGCTGGTT-AG---A-TCG-AGTCGA-G-T--AGA-CGTTTAGG--GT-TTA----AT-TTT----CCAAGAACA-AAGCG-TC-AT-----AGGA-TTGT-A----TAGGACC-ATA-CTGTTA---A----CATGCTAGGATGACGAAGAGGCG-ATAACGGGT---TCA--T-T--TCTCGCAGTT--ACG-G--TCAT--------CCGA-C-A-TTT-C-AG-AAAGGTTC-ATTAGTTACG-----T--G--CA-TC---AG--A-G------C-GGGCA--T-------TACACG--------------CAT--C--A-T-C-CT--TG--ATGGT-C-ATGT-TT--G-GCG-A-TCGTGT-T--GGA--TT--TATAGACA-ATGAA-CGTT-GC-GTC---C------AATCA---TT-CC-AATTTT-TA-AAA-TAAAGCACAA-CGATAGGAGCTA-TTG-AA-GACTA-TTTC-AA-T-GAA--TAA-ATA-ACAAAAGAAAAAAAAT-CAGAGATAAATGACGGT--AA---CCGATGTCGTGTGAGCC--GCC-AGTCTG-TGGCTA---CGCCTC--AAGCTGCAGAG---TGGTACG-GGC---A-CGCG--CTT-AA
gi|10 : ACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTT--A-C----GGGT-AGC-CCA-A-T-ATGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CGGCTTGAATA--TA--TTT-TTG--C-TTTTTATC-GCAC--GAT-AA---AT-AAC-TAA-------AC-T-GT-T-----AAA--TT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC--T--TTG-----ATTCATA-------------GAGA-TCA-G-TT----ATTGGTCT---CAT--TC----ATA-TG-----TATTA--CG-TGTCTGG----------TTT-A-T--CCGTGTTTA---ACGT-------------A---T--G-AAAAAAT---C---------A----GAA-T---G---A-TG-C---G-T--G-TA-----A-C-TGCA--------TAT----------TC-------G------C-G----A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GGC--AT---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGT-----TGGT-C---G--AT-TA----------------CAAT-A------GGTG--ccc
gi|11 : TT--ACA-G--TCAT--------CC-A-C-A-TTT-C-AG-AAAG-TTC-ATTA-TTACGC----G--GGCCA-TC---AAT-A-GCC----C-GG-CAG-TTACTTAGTACACGC-------------CAT--C--A-TCC-AC--TG--ATG-T-C-AT-T-TT--G-GCG-ACT-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-AT--A-CTTT-GTGGTT---CC----AAATCA---TT-CCAAATTTTATA-AAAATA---TACACCC--TTGA--CTAGT-G-AA-G-CTC-ATTC-AAGT-AAA--T-A-ATACACAAAAG--AAAAAA--CAGAGATAAATGAC--T--AACCACCGAT-TC-TCTG-GCC--GCC-A-TCTTCGGGCTA---C-CC-TAAAA-CTGC--AG---T--TACG-GCC---ATCGCG--CTTCAATACCAG
gi|12 : tACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---ACCATGCAGTT--A-C-----GGT-AGC-CC--A-T-ATGG---CA---GACC-GAACG--A--CGGCTCGAATA--TA--TTT-TTG--CTTTTTTATC--TAC--G-T--G---AT-GACTTAA-------AC-T-GT-T------AA--TT--A-C-CC-AAT-C--GAA-----AAAC--TCATTGAATAAATGCA-A-------------AAGACTCG-T-TT----ATTGGTCT---CAT--TC----ATA-TGT----TATTACCCG-TGTCTGG----------TTT-A-TTGCCGCTCGTTTA-ACGT-------------A---TAGA-AAAAA-----C---------A----G-A-T---G---A-TG-C---G-T--G-TA-----A-C-TGCA--------TAT----------TC-------G------CAG----A--TG-A-GTATT-G--------TAA--C-T-GGC--AA----------------A-CG-GATATACC--C-GTA-------A-CT-T
gi|13 : cG-----TATTA--CGCTGTCTGG----------TTT-A-T--CCGTGTTTA---ACGT-------------A---T--G-AAAAA-----C---------ACCCAGAA-T---G---ACTG-C---G-TTTG-TA-----A-C-TGCA--------AATT----------C-------G------C------A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-TTGGC--AAA--T------------A-CG-GC-ATACC--C-GTA-------AACT-TG-CA--AAA-CACGT-----TGGTCT---G--TTCTG----------------CAAT-A------GGTAGTTA-GTCT-----TCA--GT--ATCATGGCGAA--CTTTTTG-CATATTT-AATCTCAG-T----------------A-TC-A-G-T--A-A-CTTTTATG--TT-TTA----ATGTTT----C-AAGAACA-AA-CG-TC-AT-----AC-A-TG-T-A----T-GTACA-TAC-CT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GGAAAGG---ATAGCGGGT-agc
gi|14 : --G-TA-----A-C-TGCA--------TATTTGTCTGTTATC-------G------C-G----A--TG-A-G---T-G--------GAG--TGT-GGC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA---AC-----------------------A----------------CGAT--------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CACATTT-A-TCT-AA-TG--T-AC---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-A-CTTTTATG--TT-TTA----AT-TTT----C-AAGAACA-AA-CG-TC-AT-----A--A-TG-T-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAAATG---ATAGCGGGT-A-TCA--T-T--TCTC--AGTT--ACG-G--CCAT--------CC-A-C-A-TTT-C-AG-AAAT-TTC-ATTACTTATG-----G--G--CA-TC---AAT-A-tcttgc
gi|15 : A-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGGGT-A-TTG--T-T--TCTC--AGTT--ACG-G--GCAT--------CC-A-C-A-TTT-C-AG-AAAG-TTC-ATTAATTACG-----G--G--CA-TC---AAT-A-G------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------CAT--C--A-T-C-AC--AG--ATG-C-C-AT-T-TT--G-GCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACGAAT--A-CTTT-GT-GTT---CCAATTAAATCA---TT-CC-AATTTTATA-AAAATA---CACA--C--TAGA--CTA-T-G-AA-G-CTA-TTTC-AA-T-AAA--TAACAAA-AC-AGAGA
gi|16 : ---A----CA-GCTAG-ATG--AAGGAGG---ATAGCGGGT-A-TCA--T-T--TCTC--AGTT--AC--G--TCAT--------CC---C-ACTTT-C-AG-AAAG-GTT-ATTAGAGTCG-----GGCG--CA-TC---AAT-ACG------CGGG-CAG-T-------TACACG--------------CAT--CG-A-T-C-ATCATGAAATG-T-T-AT-T-GA--GAGCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GA-G-AT--A-CTTT-GT-GTT---CC----AAATCATGTTT-CC-AATTTTTTA-TAAATA---C-CA--C--ta
gi|17 : ACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTT--A-C----GGGT-AGC-CCA-A-T-ATGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CGCCTTGAATA--TA--TTT-TTG--C-TTTTTGTC-ATAC--GAT-AA---AT-AAC-TAA-------AC-T-GT-T-----AAA--TT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC--T--TTG-----ATTCATA-------------GAGA-TCA-G-TT----ATTGGGCT---CAT--TC----ATA-TG-----TATTA--CG-TGTCTGG----------TT
gi|18 : ---G-T--G-TA-----AAC-TGCAG-------TATT----------C-------G------C-G----A--TG-AAG---TAG--------TAATAC-T-GGC--AA---T------------A-CGTG--ATACC--C-GTA----------C-TG-CA--AAA-CAC-C-----TGGT-T---G--TT-TA----------------CAATTA------GGTG--TA-----------------------------------------ACATTT-A-TTC-TG-TG--TTAT---ACTCG-A-TC-A-G-TT-A-A-CTTTTATG--TT-TTTTT--AT-TTT----C-AAGAATA-AA-CG-TCCAT-----A--AATT-T-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----C
gi|19 : t-T-ATGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CAGCTTGAATA--TA--TTT-TTG--C-TTTTTGTC-ATAC--GAT-AA---AT-AA-------------------------------TT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC--T--TTG-----ATTCATA-------------GAGA--------------------T---CAT--TC----ATA-TG-----TATTA--CG-TGTCTGG----------TTT-A-T--CCGTGTTTA---ACGT-------------A---T--G-AAAAA-----
gi|2 : acacatttttataataaagcagtccactggtatGGTATTAAGG-CGCGATTAGCCCGCTGTCAGGA---TC--TGCAGTT--A-ATTAAGGGT-AGTACCA-A-T-ATGG---CA---AATC-GAAAGTTA--CAGCTTGGGTAAATAATTTT-TTG--C-TTTTCGTC-AC-C--GAT-AATATAT-AAC-TAA-------ACCT-GT-T-----AAA--TTTAATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC--T--TTG-----ATTCATAA------------GAGA-TCA-GATT----ATTGG-CT---CAT--TC----ATA-TG-----TATAA--CG-TGTCTGG----------TTTTA-T-----T--------ACGTGTTTTAATCGGTCA---T--T-AAAAAAACC-C---------A----GAAAT---A---A-TG-C---G-T--GGTA---------TGCA--------TATTT-------GTC-------AATAAGTC-GTAGAA--TG-A-G---T-G--------TAA--CCT-GGC--AA---T------------A-CG-G--ATACCATC-GTAT------A-CTATG-CA--AAACTACGC-----TGGG-T---GGGTT-TA----------------CAAT-A------GCTG--TAAGT-A-----TCA--GT--ATCATGG--GAACTTTTTTG-CACATTT-A-TCT-AG-TG--TAATATAA-TCG-A-TC-AGG-TTAA-A-CTTTTATGTTTT-TTATATTGT-TTT----C-AAGAACA-AA-CA-T--AT-----A--A-TT-T-AAAGTTAGTAAA-TTA-CT-TCAAGCA----CA-TCACGGGTG----AGGGGTTAATAGCGGGT-A-TCA--T-TCATCTC--AGTTACACG-G--CCAT--------CC-A-CGA-TTT-CAAG-AAAG-TTC-ATTAATTACAGT---G--G--CA-TCAAAAATAA-G------C-GG-CAG-TTACA---TACACG--------------CAT--TCAA-T-CAAC--TG--ATG-T-CTAT-TATT--G-GCGAA-TGGT-T-TTGGGAGTTT----T-GACG-AT--AGCTTTGGT-GCT---CC----AAATCA---TTGCC-AA-TTTATATTAAATA---CACA--C--TAGA--CTA-T-G-AATG-CTA-TTTCTAA-TAAAA--TAA-ACA-aac
gi|20 : acACTGGTATTAAG--C-TGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTT--A-C----GCGT-AGC-CCA-A-T-ATGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CAGCTTGAATA--TA--TTT-TTG--C-TTTTTGTC-ATAC--GAT-AA---AT-AAC-TAA-------AC-T-GT-T-----AAA--TT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC--T--TTG-----ATTCATA-------------GAGA-TCA-G-TT----ATTGGTCT---CAT--TC----ATATTG-----TAT
gi|21 : AAA--C-GGAT--GTTCGT-------A---AC--TACAGTT--A-C----CCGC-A-T-CCA-A-C-ATGG---CATCAGG-C-GAAAGA-AATCGG----AAT---TA--TTGGTTG--C-TTTTATTC-AATC--CATGAG---AG-AAT-----------AC-T-G--C-----AAA--TC--ATT-T---ATATCAGGAT----G-----C--TAG-----ATCCATA-------------GACA-TTA---------ATCGGT
gi|22 : ctggcggaACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTT--A-C----GGGT-AGC-CCA-A-T-ATGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CAGCTCGAATA--TA--CTT-TTG--C-TTTTTGTC-ATAC--GAT-AA---AT-AAC-Tt
gi|23 : ACTGGCGGTAAA--C-GGAT--GTTCGT-------A---AC--TGCAGTT--A-T----CCGT-A-T-CCA-A-C-ATGGCATCA---GG-C-GAAA
gi|24 : GAC--T--AAC--CCGAT-TC-TGTG-GCC--GCC-A-TCTT-GGGTTA---C-TCGT--AA-CTGC--AG---T--TACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAGaaggtcgtattcaatccgtgagaggatactgca
gi|25 : G-ACC--GCC-A-TCTT-GGGCT----C-CCGT--AA-CTGC--AGAACT--TACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAGt
gi|26 : caAGATAAATGAC--TTTCCC--CCGAT-TC-TGTG-GCC--GCC-A-TCTT-GGGCT
gi|27 : cactGTTACG-----G--G--CA-TC---AAT-A-G------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------
gi|28 : tacACTGGTATTAAG--C-CGAT--ACCCGT-------A---AC--TGC
gi|29 : cCTGGCGGTAAA--C-GGAT--GTTCGT-------A---AC--TGCAGTnag
gi|3 : cgACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCACTT--A-C----GGGT-AGC-CCA-A-T-ATGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CAGGTAGAATA--TA--ATT-T-G--C-TTTTTGTC-AAAC--GAT-AA---AT-AAT-TAA-------AC-T-GT-T-----AAA--TT--ATT-CC-AATAC--GAAC----AAAC--T--TTG-----ATTCATA-------------GAGA-TCA-G-TT----ATTGGTCT---CAT--TC----ATA-TG-----TATTA--CG-TGTCTGG----------TTT-A------------------------------------------AAAAA-----C---------A----TAA-T---G---A-TG-C---G-T--G-TA-----A-C-TCCA--------TATTTTCTATA-ATC-------G------C-A----A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GTC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGC-----TGGT-G---G--TT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CACATTT-A-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-A-CTTTTATG--GT-TGA----AT-TTT----C-AAGAACA-AA-CG-TC-AT-----A--A-TT-T-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGAGT-A-TCA--T-T--TCTG--AGTT--ACG-G--TCAA--------TC-A-C-A-TTT-C-AG-AAAG-TTC-ATTAGTTACG-----G--G--CA-TC---AAT-A-A------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------CAT--C--A-T-C-AC--TG--GTA-T-C-AT-T-TT--G-GCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-AT--A-CCTT-GC-GTT---CC----AAAGCA---TT-CC-AATTTTATA-AAAATA---CACA--C--TAGA--CTA-T-A-AA-G-CTG-TTTC-AA-T-AAA--TAA-ATA-ACAAAAG--AAAAAA--CAGAGATAAATGAC--T--AAC--CCGAT-CC-TGTG-GCC--GCC-A-CCTT-GGGCTA---C-CCGT--AA-CTGC--AG---T--TACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAG
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Reference ( family-1329 ) : ACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTTA--C----GGGT-AGC-CCA-A-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CGGCTTGAATA--TA--TTT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-TAA-C-TAAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATA-------------GA----GA-T-CA-G-TTATT----GGTCTC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-AT--C-CG--TG--T---TT-AA-CG--TA-TGAAA-AAA--A---C--A------GAA-T---G---A-TG-C---GT--G-TA-----A-C-TGCA-TATT-----------T----------C-GC-G--A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GGC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGC-----TGGT-T---G--TT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CACATTT-A-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-A-CTTTTATG--TT-TTA----AT-TTT----C-AAGAACA-AA-CG-TC-AT-----A--A-TT-T-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGGGT-A-TCA--T-T--TCTC--AGTT--ACG-G--TCAT--------CC-A-C-A-TTT-C-AG-AAAG-TTC-ATTAGTTACG-----G--G--CA-TC---AAT-A-G------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------CAT--C--A-T-C-AC--TG--ATG-T-C-AT-T-TT--G-GCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-AT--A-CTTT-GC-GTT---CC----AAATCA---TT-CC-AATTTTATA-AAAATA---CACA--C--TAGA--CTA-T-G-AA-G-CTA-TTTC-AA-T-AAA--TAAATA-ACAAAAGAAAAAAAA--CAGAGATAAATGAC--T--AAC--CCGAT-TC-TGTG-GCC--GCC-A-TCTT-GGGCTA---C-CCGT--AA-CTGC--AG---T--TACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAG
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gi|15 : A-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGGGT-A-TTG--T-T--TCTC--AGTT--ACG-G--GCAT--------CC-A-C-A-TTT-C-AG-AAAG-TTC-ATTAATTACG-----G--G--CA-TC---AAT-A-G------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------CAT--C--A-T-C-AC--AG--ATG-C-C-AT-T-TT--G-GCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACGAAT--A-CTTT-GT-GTT---CCAATTAAATCA---TT-CC-AATTTTATA-AAAATA---CACA--C--TAGA--CTA-T-G-AA-G-CTA-TTTC-------AA--TAAATA-AC---------AAAA--CAGAGATA
gi|16 : ---A----CA-GCTAG-ATG--AAGGAGG---ATAGCGGGT-A-TCA--T-T--TCTC--AGTT--AC--G--TCAT--------CC---C-ACTTT-C-AG-AAAG-GTT-ATTAGAGTCG-----GGCG--CA-TC---AAT-ACG------CGGG-CAG-T-------TACACG--------------CAT--CG-A-T-C-ATCATGAAATG-T-T-AT-T-GA--GAGCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GA-G-AT--A-CTTT-GT-GTT---CC----AAATCATGTTT-CC-AATTTTTTA-TAAATA---C-CA--C--
gi|17 : ACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTTA--C----GGGT-AGC-CCA-A-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CGCCTTGAATA--TA--TTT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-TAA-C-TAAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATA-------------GA----GA-T-CA-G-TTATT----GGGCTC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTT
gi|18 : ---GT--G-TA-----AAC-TGCAGTATT----------------------C-GC-G--A--TG-AAG---TAG--------TAATAC-T-GGC--AA---T------------A-CGTG--ATACC--C-GTA----------C-TG-CA--AAA-CAC-C-----TGGT-T---G--TT-TA----------------CAATTA------GGTG--TA-----------------------------------------ACATTT-A-TTC-TG-TG--TTAT---ACTCG-A-TC-A-G-TT-A-A-CTTTTATG--TT-TTTTT--AT-TTT----C-AAGAATA-AA-CG-TCCAT-----A--AATT-T-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----C
gi|19 : t-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CAGCTTGAATA--TA--TTT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-TAA------------------------------TT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATA-------------GA----GA---------------------TC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-AT--C-CG--TG--T---TT-AA-CG--TA-TGAAA-AAA--A---C--
gi|2 : acacatttttataataaagcagtccactggtatGGTATTAAGG-CGCGATTAGCCCGCTGTCAGGA---TC--TGCAGTTA--ATTAAGGGT-AGTACCA-A-TA-TGG---CA---AATC-GAAAGTTA--CAGCTTGGGTAAATAATTTT-TTGC--TTTTCGTCA-C-C--GAT-AATATA-TAA-C-TAAA-------CCT-GT-T-----AAATTTAATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATAA------------GA----GA-T-CA-GATTATT----GG-CTC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATAA--CG-TGT---CT-----GGTTTTAT--TACG--TG--T---TTTAATCGGTCA-TTAAA-AAA--A---CCCA------GAAAT---A---A-TG-C---GT--GGTA---------TGCA-TATT-----------TGTCAATAAGTC-GT-AGAA--TG-A-G---T-G--------TAA--CCT-GGC--AA---T------------A-CG-G--ATACCATC-GTAT------A-CTATG-CA--AAACTACGC-----TGGG-T---GGGTT-TA----------------CAAT-A------GCTG--TAAGT-A-----TCA--GT--ATCATGG--GAACTTTTTTG-CACATTT-A-TCT-AG-TG--TAATATAA-TCG-A-TC-AGG-TTAA-A-CTTTTATGTTTT-TTATATTGT-TTT----C-AAGAACA-AA-CA-T--AT-----A--A-TT-T-AAAGTTAGTAAA-TTA-CT-TCAAGCA----CA-TCACGGGTG----AGGGGTTAATAGCGGGT-A-TCA--T-TCATCTC--AGTTACACG-G--CCAT--------CC-A-CGA-TTT-CAAG-AAAG-TTC-ATTAATTACAGT---G--G--CA-TCAAAAATAA-G------C-GG-CAG-TTACA---TACACG--------------CAT--TCAA-T-CAAC--TG--ATG-T-CTAT-TATT--G-GCGAA-TGGT-T-TTGGGAGTTT----T-GACG-AT--AGCTTTGGT-GCT---CC----AAATCA---TTGCC-AA-TTTATATTAAATA---CACA--C--TAGA--CTA-T-G-AATG-CTA-TTTCTAA-TAAAA--TAAACA-
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gi|22 : ctggcggaACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTTA--C----GGGT-AGC-CCA-A-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CAGCTCGAATA--TA--CTT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-TAA-C-Tt
gi|23 : ACTGGCGGTAAA--C-GGAT--GTTCGT-------A---AC--TGCAGTTA--T----CCGT-A-T-CCA-A-CA-TGGCATCA---GG-C-GAAA
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gi|25 : G-ACC--GCC-A-TCTT-GGGCT----C-CCGT--AA-CTGC--AGAACT--TACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAGt
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gi|27 : cactGTTACG-----G--G--CA-TC---AAT-A-G------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------
gi|28 : tacACTGGTATTAAG--C-CGAT--ACCCGT-------A---AC--TGC
gi|29 : cCTGGCGGTAAA--C-GGAT--GTTCGT-------A---AC--TGCAGTnag
gi|3 : cgACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCACTTA--C----GGGT-AGC-CCA-A-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CAGGTAGAATA--TA--ATT-T-GC--TTTTTGTCA-AAC--GAT-AA---A-TAA-T-TAAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--GAAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATA-------------GA----GA-T-CA-G-TTATT----GGTCTC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-A----------------------------------A-AAA--A---C--A------TAA-T---G---A-TG-C---GT--G-TA-----A-C-TCCA-TATT-----------TTCTATAAT--C-GC-A--A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GTC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGC-----TGGT-G---G--TT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CACATTT-A-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-A-CTTTTATG--GT-TGA----AT-TTT----C-AAGAACA-AA-CG-TC-AT-----A--A-TT-T-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGAGT-A-TCA--T-T--TCTG--AGTT--ACG-G--TCAA--------TC-A-C-A-TTT-C-AG-AAAG-TTC-ATTAGTTACG-----G--G--CA-TC---AAT-A-A------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------CAT--C--A-T-C-AC--TG--GTA-T-C-AT-T-TT--G-GCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-AT--A-CCTT-GC-GTT---CC----AAAGCA---TT-CC-AATTTTATA-AAAATA---CACA--C--TAGA--CTA-T-A-AA-G-CTG-TTTC-AA-T-AAA--TAAATA-ACAAAAG--AAAAAA--CAGAGATAAATGAC--T--AAC--CCGAT-CC-TGTG-GCC--GCC-A-CCTT-GGGCTA---C-CCGT--AA-CTGC--AG---T--TACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAG
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Reference ( family-1329 ) : ACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTTA--C----GGGT-AGC-CCA-A-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CGGCTTGAATA--TA--TTT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-TAA-C-TAAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATA-------------GA----GA-T-CA-G-TTATT----GGTCTC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-AT--C-CG--TG--T---TT-AA-CG--TA-TGAAA-AAA--A---C--A------GAA-T---G---A-TG-C---GT--G-TA-----A-C-TGCA-TATT-----------T----------C-GC-G--A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GGC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGC-----TGGT-T---G--TT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CACATTT-A-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-A-CTTTTATG--TT-TTA----AT-TTT----C-AAGAACA-AA-CG-TC-AT-----A--A-TT-T-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGGGT-A-TCA--T-T--TCTC--AGTT--ACG-G--TCAT--------CC-A-C-A-TTT-C-AG-AAAG-TTC-ATTAGTTACG-----G--G--CA-TC---AAT-A-G------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------CAT--C--A-T-C-AC--TG--ATG-T-C-AT-T-TT--G-GCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-AT--A-CTTT-GC-GTT---CC----AAATCA---TT-CC-AATTTTATA-AAAATA---CACA--C--TAGA--CTA-T-G-AA-G-CTA-TTTC-AA-T-AAA--TAAATA-ACAAAAGAAAAAAAA--CAGAGATAAATGAC--T--AAC--CCGAT-TC-TGTG-GCC--GCC-A-TCTT-GGGCTA---C-CCGT--AA-CTGC--AG---T--TACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAG
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gi|10 : ACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTTA--C----GGGT-AGC-CCA-A-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CGGCTTGAATA--TA--TTT-TTGC--TTTTTATCG-CAC--GAT-AA---A-TAA-C-TAAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATA-------------GA----GA-T-CA-G-TTATT----GGTCTC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-AT--C-CG--TG--T---TT-AA-CG--TA-TGAAA-AAA--T---C--A------GAA-T---G---A-TG-C---GT--G-TA-----A-C-TGCA-TA-T-----------T----------C-GC-G--A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GGC--AT---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGT-----TGGT-C---G--AT-TA----------------CAAT-A------GGTG--ccc
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gi|15 : A-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGGGT-A-TTG--T-T--TCTC--AGTT--ACG-G--GCAT--------CC-A-C-A-TTT-C-AG-AAAG-TTC-ATTAATTACG-----G--G--CA-TC---AAT-A-G------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------CAT--C--A-T-C-AC--AG--ATG-C-C-AT-T-TT--G-GCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACGAAT--A-CTTT-GT-GTT---CCAATTAAATCA---TT-CC-AATTTTATA-AAAATA---CACA--C--TAGA--CTA-T-G-AA-G-CTA-TTTC-------AA--TAAATA-AC---------AAAA--CAGAGATA
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gi|26 : caAGATAAATGAC--TTTCCC--CCGAT-TC-TGTG-GCC--GCC-A-TCTT-GGGCT
gi|27 : cactGTTACG-----G--G--CA-TC---AAT-A-G------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------
gi|28 : tacACTGGTATTAAG--C-CGAT--ACCCGT-------A---AC--TGC
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gi|3 : cgACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCACTTA--C----GGGT-AGC-CCA-A-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CAGGTAGAATA--TA--ATT-T-GC--TTTTTGTCA-AAC--GAT-AA---A-TAA-T-TAAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--GAAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATA-------------GA----GA-T-CA-G-TTATT----GGTCTC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-A----------------------------------A-AAA--A---C--A------TAA-T---G---A-TG-C---GT--G-TA-----A-C-TCCA-TATT-----------TTCTATAAT--C-GC-A--A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GTC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGC-----TGGT-G---G--TT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CACATTT-A-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-A-CTTTTATG--GT-TGA----AT-TTT----C-AAGAACA-AA-CG-TC-AT-----A--A-TT-T-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGAGT-A-TCA--T-T--TCTG--AGTT--ACG-G--TCAA--------TC-A-C-A-TTT-C-AG-AAAG-TTC-ATTAGTTACG-----G--G--CA-TC---AAT-A-A------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------CAT--C--A-T-C-AC--TG--GTA-T-C-AT-T-TT--G-GCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-AT--A-CCTT-GC-GTT---CC----AAAGCA---TT-CC-AATTTTATA-AAAATA---CACA--C--TAGA--CTA-T-A-AA-G-CTG-TTTC-AA-T-AAA--TAAATA-ACAAAAG--AAAAAA--CAGAGATAAATGAC--T--AAC--CCGAT-CC-TGTG-GCC--GCC-A-CCTT-GGGCTA---C-CCGT--AA-CTGC--AG---T--TACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAG
gi|30 : ACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--T
gi|4 : TTAAG--C-CGAT--GCCCCT-------A---AC-----------------GGGT-AGC-CCA-A-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CAGCTTGAATA--TA--TTT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-TAA-C-TAAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATACATGTACGTTCAAAC-T--TT--G-----ATTCATA-------------GA----GA-T-CA-G-TTATT----GGTCTC---ATT--CA----TA-TG-A-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-AT--C-CG--TG--T---TT-AA-CG--TA-TGAAA-AAA--AAACC--A------GAA-TCATG---A-TG-C---GT--G-TA-----A-C-TGCA-TATT----------------------C-GC-G--A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GGC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGC-----TGGT-T---G--TT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCGTGG--GA--CTTTTTG-CACATTTTA-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCG-A-TC-A-G-T--G-A-CTTTTATG--TT-TTA----AT-TTT----C-AAGAACA-AA-CGGTT-AT-----A--A-TT-C-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----CA-GCTGGGA-----------------GTGG-T-A-TCA--TGT--TCT---AGA---ACG-G--TCAT--------CC-A-C---TTT-C-AG-AAAG-TTCTATTAGTTACG-----G--G--CAATC---AAT-A-G------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------CAT--C--ATT-C-AC--TG--ATG-T-C-A--A-TT--G-GCG-A-T-TT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-AT--A-CTTT-GT-GTT---CC----AAATCA----T-CC-AATTTTATA-AAAATA---CACA--C--TAGA--CTA-T-G-AA-GCCTATTTTC-AA-T-A-----AAATA-ACAAGAGAAAAAAAACCCAGAGATGAATGAC--T--AAT--CCGAT-TC-TGTG-GTC--GCC-A-TCTT-GGGCTA---C-CCGT--AA-CTGC--AG---T--TACG-GGC---ATCG-G--ATT-
gi|5 : gtattcactA-TCAAACAAA--A---CCCA------GAA-T---GTAAA-TGACAGAGT--A-TA-----AACATGCA-TATT-----------A----------CAGC-G--A--TG-A-----T-G--------TAAA-C-T-GGT--AA---TTCTAAAATTTGAA-CG-G--ATACC--C-GTAGAAAACCA-CC-TGGTA--AA--AAC-------TGGT-T------TT-TACAGCTCAGAACGTGGCCAAT-ATTACAAAGCA--TG-GC-TCTACGTCG--GT--ATCATAG--GA--CAAACTG-C-----T-A-TGT--G-AG--T-A----A-TCGCA-TT-A-AAT--A-AACGTTTAAG--TTCTTA----CT-TGTGTCAC-AATGACATAA-CG-GC-ATCGATAA--A-TT-TCA----TAGCACAACTATCT-TCA---ATCCGCA-CCTAGGATG--GAAGACG---CGAGTGGTTGA-GCAATT-T--TCTC--AGTT--ACGCGATCCATGACGGTGACC-AGC-A-TTTTC-AGCAAAG-TTC-AT-AGTTACGACGGCG--G--CA-TC---AAT-A-ATGCGATC-GG-CAGGT-------TA-ACGGATAACAAAACAGACATTTC--A-C-A-AC--TG--ATG-TTC-AT-T-CTTGG-GCG-A-T-AT-TCT--GGAGATTAATAT-GACG-AT----CTTT-GG-ATCAACCT----GAATCA---TC-CA-AATTTAATA-AAAATA---CACA--A--CAGAAACTA-T-GGAA-G-CTA-TTTCCAA-T-AAAACTACACA-A--AAAGAAAGAAAA--CAGGGATATATGAC--T--AAC--CCAA--TA-TGTG-GCCTGGCCGA-TCTT-GGGCTAGAGC-CCGTG-AA-CT-C--AG---G--TTCGCGGCCGGATCG-GGAGTT-AATA
gi|6 : cAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAATTAA-C----GGGT-AGC-CCATA-TA-TGG---CA---GA-CTGAAAGT-A--CAGATAGAATA--T----TT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-ATA-C-TGAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--CGAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATATTGATAGATGATAGA----GA-T-CA-G-TTACT----GGTCTC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-A---------------------A-CG--TA-TGAAA-AAA--A---C--A------GAA-T---G---A-TG-C---GT--G-TA-----A-C-TGCA-TATT-----------TGTCTCTAAT-T-GC-G--A--TG-A-G---T-GTAACTCACTAA--C-T-GGC--AA---T------------A--------------C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACAC-----TGGT-T---G--TT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CGCATTT-A-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-A-ATTTTATG--TT-TTA----AT-TTT----T-AAGAACA-AA-CG-TC-AT-----A--A-TT-T-A----TATTACA-TTA-AT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGGGT-A-TCA--T-T--TCT
gi|7 : ATA--TG--TTT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-ATA-C-TGAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--CGAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATATTGATAGATGATAGA----GA-T-CACG-TTACT----GGTCTC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-A--------------------AA-CG--TA-TGAAA-AAA--A---C--A------GAA-T---G---A-TG-C---GT--T-TA-----A-C-TGCA-TATT-----------TGTCTCTAAT-T-GC-G--A--TG-AAG---T-G--------TAA--C-T-CACT-AA---C------------T-CT-GCAATAC-----GTA-------A-CT-TG-CA--A---CACAC-----TGTT-T---T--GT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GTCT-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CGCATTT-A-TCT-AG-TG--TTAT---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-AATTTTTATG--TT-TTA----AT-TTT----T-AAGAACA-AAACG-TC-AT-----A--A-TT-T-A----TATTACA-TTA-AT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGGGT-ATTCA--T-T--TCTt
gi|8 : aatCTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTTAAAC----TGGT-AGC-CCA-A-TAATGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CAGCTTGAATA--TA--ATT-TTGCCCTTTTTGTCAATAC--GAT-AA---AATAAAC-TAAAGATACGAC-T-GTAT-----AAATTTTATTACCGAATAC--GGAC----AAAC-T--TTTTG-----ATTCATA-------------AATTAAGA-TTCA-G-TTATTAATTGGTTTCTACATTATCAATGATA-TG-TGATTTATTA---G-TGCTAGCTCATGCGGTTTTATT-C-CG--TC--TCTATT-AA-CG--TA-TGAAA-AAACGA---C--AATATAAGAA-T---G---A-TG-C---GTT-G-TATGACTA-C-TGCA-TATT-----------T----------C-GC-GA-A--TGAA-G---T-T--------TAA--C-TGGGC--AAAATT------------A-CG-GA-ATACC--C-GTATT-----A-GC-TG-CACCAA--TACACAGCTTTGGC-TTGGG--TTGTA----------------CAAT-t
gi|9 : CTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTTA--C----GGGT-AGC-CCA-A-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CGCCTTGAATA--TA--TTT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-TAA-C-TAAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATA-------------GA----GA-T-CA-G-TTATT----GGGCTC---ATT--CA----TA-TA-T-----ATAA--CG-TGT---CT-----GGTTT-AT--C-CG--TG--T---TT-AA-CG--TA-TGAAA-AAA--AAACC--A------GAA-T---G---A-TG-C---GT--G-TA-----A-C-TGCA-TA-T-----------T----------C-GC-G--A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GGC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGC-----TGAA-A---G--TT-TA----------------CAAT-A------GCTG--TA-GT-A-----TCA--GT--ATCATG
blockSeqs : G G TA TGTCAGG . CA ATTAA . A T . A CAT TCA C T T AT AA AT G CC A . G TAT A A T GATACGA C . A . TA A G CA GTTC . CA TT AATAA TTGATAGATGATA TTAA C T C A AATT TAC AT ATGA T T GATTT CC C TAG CATGC T TTGCCGCTCGT T T GT . C CG CAATATAA A CAT TAA C A AGA TT G TGACTA A G T TGTCAATAAGT A A GA . A A TAT A TAACTCAC TA G T T TTCTAAAATTTGA . T AT AT . GAAAACC A A G CC ACT ACAGCTT TTGGG C CAGCTCAGAACGTGGC T TTACAA GT A TCTACG . . CG AC . T A C . . AATATA C C . . G A TA . A TT C TATT G GTCA . T A G C CGATAA A . C AAGT A T . AGC TCCG . . TTA G T AT G CA . AC C AT GACGGTGA AG AC T A C . T ACGGC GC GC A AAA A C TGCGAT G . G TACTTAG GATAACAAAACAGA TT CA T C A CA AA . T T . A TG A A C G . C TG AA . A AG G TG AAC AATT TGT G A T . CC . AA G . G T C T T GT AC C A AA CC . TT CA . . . TG G . C GAG . AA . . AACT C CGG C GA C
blockSeqs : . . . . . . AAC . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT . . AT . . . . . TTGATAGATGATA . . . . . . . . . . . . . . . . T TTCCGTCTCTA . . . . . . AACCA . . . . . . T . AA . . T TGTCTGTTAT . . A . . A . . . A C G . AATT . . CA . . TT . . . . AC GT TGGG G . . . . . CT . . . . . . . . . . TAT . . . . . . T . A . . TT . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A GA . . . . . GT . . . . . . CC . . . TACA C . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . C TA . . A AA . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . TTACGTGT . . . . . . AACCA . . . . . . . . AA . . T TGTCTCTAAT . . . . . . . . . . . . . AT . . C . . T . . . . AC GT CTG . . . . . . CT . . . . . . . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCCGTGT . . . . . . CCCA . . . . . . . . A . . T TGTCTCTAAT . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . . . C GC CG . . . . . . T . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCCGTGT . . . . . . CCCA . . . . . . . . A . . T TTCTATAAT . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C GC TG . . . . . . A . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCCGTGT . . . . . . CCCA . . . . . . . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C GC GG . . . . . . T . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCCGTGT . . . . . . CA . . . . . . . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A AC TG . . . . . . T . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCCGTGT . . . . . . CA . . . . . . . . A . . T A . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C AC TG . . . . . . T . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C GC TT . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T C AG . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . C . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : ** *** ** ***** **** TCCGTGT********** CA*********** A****** AT******************** ** ******** ** GC***** TG****** ** ** ** A******* ** *** ** A** A*** *** ** ** ** ** ** ** ** T*****
originalCons : ACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTTA--C----GGGT-AGC-CCA-A-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CGGCTTGAATA--TA--TTT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-TAA-C-TAAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATA-------------GA----GA-T-CA-G-TTATT----GGTCTC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-AT--C-CG--TG--T---TT-AA-CG--TA-TGAAA-AAA--A---C--A------GAA-T---G---A-TG-C---GT--G-TA-----A-C-TGCA-TATT-----------T----------C-GC-G--A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GGC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGC-----TGGT-T---G--TT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CACATTT-A-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-A-CTTTTATG--TT-TTA----AT-TTT----C-AAGAACA-AA-CG-TC-AT-----A--A-TT-T-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGGGT-A-TCA--T-T--TCTC--AGTT--ACG-G--TCAT--------CC-A-C-A-TTT-C-AG-AAAG-TTC-ATTAGTTACG-----G--G--CA-TC---AAT-A-G------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------CAT--C--A-T-C-AC--TG--ATG-T-C-AT-T-TT--G-GCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-AT--A-CTTT-GC-GTT---CC----AAATCA---TT-CC-AATTTTATA-AAAATA---CACA--C--TAGA--CTA-T-G-AA-G-CTA-TTTC-AA-T-AAA--TAAATA-ACAAAAGAAAAAAAA--CAGAGATAAATGAC--T--AAC--CCGAT-TC-TGTG-GCC--GCC-A-TCTT-GGGCTA---C-CCGT--AA-CTGC--AG---T--TACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAG
finalCons : ACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTTA--C----GGGT-AGC-CCA-A-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CGGCTTGAATA--TA--TTT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-TAA-C-TAAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATA-------------GA----GA-T-CA-G-TTATT----GGTCTC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-ATCCGTGT----------TT-AA-CG--TA-TGAAA-AAA--ACA-----------GAA-T---G---A-TG-C---GT--G-TAA------C-TGCA-TATTAT--------------------C-GC-G--A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GGC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGC-----TGGTTG------TT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CACATTT-A-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-A-CTTTTATG--TT-TTA----AT-TTT----C-AAGAACA-AA-CG-TC-ATA-------A-TT-T-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGGGT-A-TCA--T-T--TCTC--AGTT--ACG-G--TCAT--------CCA--C-A-TTT-C-AG-AAAG-TTC-ATTAGTTACG-----G--G--CA-TC---AAT-A-G------C-GG-CAG-T-------TACACG--------------CAT--C--A-T-C-AC--TG--ATG-T-C-AT-T-TT--G-GCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-ATA---CTTT-GC-GTT---CC----AAATCA---TT-CC-AATTTTATA-AAAATA---CACA--C--TAGA--CTA-T-G-AA-G-CTA-TTTC-AA-T-AAA--TAAATA-ACAAAAG--AAAAAA--CAGAGATAAATGAC--T--AAC--CCGAT-TC-TGTG-GCC--GCC-A-TCTT-GGGCTA---C-CCGT--AA-CTGC--AGT-----TACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAG
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Reference ( family-1329 ) : ACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTTA--C----GGGT-AGC-CCA-A-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CGGCTTGAATA--TA--TTT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-TAA-C-TAAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATA-------------GA----GA-T-CA-G-TTATT----GGTCTC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-AT--C-CG--TG--T---TT-AA-CG--TA-TGAAA-AAA--A---C------AGAA-T---G---A-TG-C---G-T--G-TA-----A-C-TGCA-TATT----------ATCGC-G--A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GGC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGC-----TGGT-T---G--TT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CACATTT-A-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-A-CTTTTATG--TT-TTA----AT-TTT----C-AAGAACA-AA-CG-TC-AT-----A--A-TT-T-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGGGT-A-TCA--T-T--TCTC--AGTT--ACG-G--TCAT--------CC-A-C-A-TTT-C-AG-AAAG-TTC-ATTAGTTACG-----G--GC-A-TC---AAT-A-G------C--GG-CAG-T----TAC-------ACG--------------C-AT--C--AT-C-AC--TG--ATG-T-C-AT-T-TT--G-GCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-AT--A-CTTT-GCG-TT---CC----AAATCA---TT-CCAA-TTTTATA-AAAATA---CACA-C--TAGA--CTA-T-G-AA-G-C-TATTT-C-AA-T-AAA--TAAATA-ACAAAAGAAAAAA----CAGAGATAAATGAC--T--AAC--CCGAT-TC-TGTG-GCC--GCC-A-TCTT-GGGCTA---C-CCGT--AA-CTGC--AG---T--TACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAG
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gi|25 : G-ACC--GCC-A-TCTT-GGGCT----C-CCGT--AA-CTGC--AGAACT--TACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAGt
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gi|27 : cactGTTACG-----G--GC-A-TC---AAT-A-G------C--GG-CAG-T----TAC-------ACG--------------
gi|28 : tacACTGGTATTAAG--C-CGAT--ACCCGT-------A---AC--TGC
gi|29 : cCTGGCGGTAAA--C-GGAT--GTTCGT-------A---AC--TGCAGTnag
gi|3 : cgACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCACTTA--C----GGGT-AGC-CCA-A-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CAGGTAGAATA--TA--ATT-T-GC--TTTTTGTCA-AAC--GAT-AA---A-TAA-T-TAAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--GAAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATA-------------GA----GA-T-CA-G-TTATT----GGTCTC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-A----------------------------------A-AAA--A---C------ATAA-T---G---A-TG-C---G-T--G-TA-----A-C-TCCA-TATTTTCTATA---ATCGC-A--A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GTC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGC-----TGGT-G---G--TT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CACATTT-A-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-A-CTTTTATG--GT-TGA----AT-TTT----C-AAGAACA-AA-CG-TC-AT-----A--A-TT-T-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGAGT-A-TCA--T-T--TCTG--AGTT--ACG-G--TCAA--------TC-A-C-A-TTT-C-AG-AAAG-TTC-ATTAGTTACG-----G--GC-A-TC---AAT-A-A------C--GG-CAG-T----TAC-------ACG--------------C-AT--C--AT-C-AC--TG--GTA-T-C-AT-T-TT--G-GCG-A-T-GT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-AT--A-CCTT-GCG-TT---CC----AAAGCA---TT-CCAA-TTTTATA-AAAATA---CACA-C--TAGA--CTA-T-A-AA-G-C-TGTTT-C-AA-T-AAA--TAAATA-ACAAAAGAAAAAA----CAGAGATAAATGAC--T--AAC--CCGAT-CC-TGTG-GCC--GCC-A-CCTT-GGGCTA---C-CCGT--AA-CTGC--AG---T--TACG-GGC---ATCG-G--CTT-AATACCAG
gi|30 : ACTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--T
gi|4 : TTAAG--C-CGAT--GCCCCT-------A---AC-----------------GGGT-AGC-CCA-A-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CAGCTTGAATA--TA--TTT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-TAA-C-TAAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATACATGTACGTTCAAAC-T--TT--G-----ATTCATA-------------GA----GA-T-CA-G-TTATT----GGTCTC---ATT--CA----TA-TG-A-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-AT--C-CG--TG--T---TT-AA-CG--TA-TGAAA-AAA--AAACC------AGAA-TCATG---A-TG-C---G-T--G-TA-----A-C-TGCA-TATT------------CGC-G--A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GGC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGC-----TGGT-T---G--TT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCGTGG--GA--CTTTTTG-CACATTTTA-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCG-A-TC-A-G-T--G-A-CTTTTATG--TT-TTA----AT-TTT----C-AAGAACA-AA-CGGTT-AT-----A--A-TT-C-A----TAGTACA-TTA-CT-TCA---A----CA-GCTGGGA-----------------GTGG-T-A-TCA--TGT--TCT---AGA---ACG-G--TCAT--------CC-A-C---TTT-C-AG-AAAG-TTCTATTAGTTACG-----G--GC-AATC---AAT-A-G------C--GG-CAG-T----TAC-------ACG--------------C-AT--C--ATTC-AC--TG--ATG-T-C-AA-T-T---G-GCG-A-T-TT-T-T--GGAGTTT--TAT-GACG-AT--A-CTTT-GTG-TT---CC----AAATCA---T--CCAA-TTTTATA-AAAATA---CACA-C--TAGA--CTA-T-G-AA-G-CCTATTTTC-AA-T-AAA-----ATA-ACAAGAGAAAAAAAACCCAGAGATGAATGAC--T--AAT--CCGAT-TC-TGTG-GTC--GCC-A-TCTT-GGGCTA---C-CCGT--AA-CTGC--AG---T--TACG-GGC---ATCG-G--ATT-
gi|5 : gtattcactA-TCAAACAAA--A---CCC----AGAA-T---GTAAA-TGACAGAG-T--A-TA-----AACATGCA-TATT----------ACAGC-G--A--TG-A-----T-G--------TAAA-C-T-GGT--AA---TTCTAAAATTTGAA-CG-G--ATACC--C-GTAGAAAACCA-CC-TGGTA--AA--AAC-------TGGT-T------TT-TACAGCTCAGAACGTGGCCAAT-ATTACAAAGCA--TG-GC-TCTACGTCG--GT--ATCATAG--GA--CAAACTG-C-----T-A-TGT--G-AG--T-A----A-TCGCA-TT-A-AAT--A-AACGTTTAAG--TTCTTA----CT-TGTGTCAC-AATGACATAA-CG-GC-ATCGATAA--A-TT-TCA----TAGCACAACTATCT-TCA---ATCCGCA-CCTAGGATG--GAAGACG---CGAGTGGTTGA-GCAATT-T--TCTC--AGTT--ACGCGATCCATGACGGTGACC-AGC-A-TTTTC-AGCAAAG-TTC-AT-AGTTACGACGGCG--GC-A-TC---AAT-A-ATGCGATC--GG-CAGGT----TA--------ACGGATAACAAAACAGAC-ATTTC--AC-A-AC--TG--ATG-TTC-AT-T-CTTGG-GCG-A-T-AT-TCT--GGAGATTAATAT-GACG-AT----CTTT-GGA-TCAACCT----GAATCA---TC-CAAA-TTTAATA-AAAATA---CACA-A--CAGAAACTA-T-GGAA-G-C-TATTT-CCAA-T-AAAACTACACA-AAAAGAAAGAAAA----CAGGGATATATGAC--T--AAC--CCAA--TA-TGTG-GCCTGGCCGA-TCTT-GGGCTAGAGC-CCGTG-AA-CT-C--AG---G--TTCGCGGCCGGATCG-GGAGTT-AATA
gi|6 : cAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAATTAA-C----GGGT-AGC-CCATA-TA-TGG---CA---GA-CTGAAAGT-A--CAGATAGAATA--T----TT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-ATA-C-TGAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--CGAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATATTGATAGATGATAGA----GA-T-CA-G-TTACT----GGTCTC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-A---------------------A-CG--TA-TGAAA-AAA--A---C------AGAA-T---G---A-TG-C---G-T--G-TA-----A-C-TGCA-TATTTGTCTCTA--ATTGC-G--A--TG-A-G---T-GTAACTCACTAA--C-T-GGC--AA---T------------A--------------C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACAC-----TGGT-T---G--TT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GT-T-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CGCATTT-A-TCT-AG-TG--T-AT---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-A-ATTTTATG--TT-TTA----AT-TTT----T-AAGAACA-AA-CG-TC-AT-----A--A-TT-T-A----TATTACA-TTA-AT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGGGT-A-TCA--T-T--TCT
gi|7 : ATA--TG--TTT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-ATA-C-TGAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--CGAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATATTGATAGATGATAGA----GA-T-CACG-TTACT----GGTCTC---ATT--CA----TA-TG-T-----ATTA--CG-TGT---CT-----GGTTT-A--------------------AA-CG--TA-TGAAA-AAA--A---C------AGAA-T---G---A-TG-C---G-T--T-TA-----A-C-TGCA-TATTTGTCTCTA--ATTGC-G--A--TG-AAG---T-G--------TAA--C-T-CACT-AA---C------------T-CT-GCAATAC-----GTA-------A-CT-TG-CA--A---CACAC-----TGTT-T---T--GT-TA----------------CAAT-A------GGTG--TA-GTCT-----TCA--GT--ATCATGG--GA--CTTTTTG-CGCATTT-A-TCT-AG-TG--TTAT---A-TCG-A-TC-A-G-T--A-AATTTTTATG--TT-TTA----AT-TTT----T-AAGAACA-AAACG-TC-AT-----A--A-TT-T-A----TATTACA-TTA-AT-TCA---A----CA-GCTAGGATG--GAAGAGG---ATAGCGGGT-ATTCA--T-T--TCTt
gi|8 : aatCTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTTAAAC----TGGT-AGC-CCA-A-TAATGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CAGCTTGAATA--TA--ATT-TTGCCCTTTTTGTCAATAC--GAT-AA---AATAAAC-TAAAGATACGAC-T-GTAT-----AAATTTTATTACCGAATAC--GGAC----AAAC-T--TTTTG-----ATTCATA-------------AATTAAGA-TTCA-G-TTATTAATTGGTTTCTACATTATCAATGATA-TG-TGATTTATTA---G-TGCTAGCTCATGCGGTTTTATT-C-CG--TC--TCTATT-AA-CG--TA-TGAAA-AAACGA---CAATATAAGAA-T---G---A-TG-C---GTT--G-TATGACTA-C-TGCA-TATT-----------TCGC-GA-A--TGAA-G---T-T--------TAA--C-TGGGC--AAAATT------------A-CG-GA-ATACC--C-GTATT-----A-GC-TG-CACCAA--TACACAGCTTTGGC-TTGGG--TTGTA----------------CAAT-t
gi|9 : CTGGTATTAAG--C-CGAT--GCCCGT-------A---AC--TGCAGTTA--C----GGGT-AGC-CCA-A-TA-TGG---CA---GA-C-GAAAGT-A--CGCCTTGAATA--TA--TTT-TTGC--TTTTTGTCA-TAC--GAT-AA---A-TAA-C-TAAA-------C-T-GT-T-----AAATT--ATT-CC-AATAC--GGAC----AAAC-T--TT--G-----ATTCATA-------------GA----GA-T-CA-G-TTATT----GGGCTC---ATT--CA----TA-TA-T-----ATAA--CG-TGT---CT-----GGTTT-AT--C-CG--TG--T---TT-AA-CG--TA-TGAAA-AAA--AAACC------AGAA-T---G---A-TG-C---G-T--G-TA-----A-C-TGCA-TAT------------TCGC-G--A--TG-A-G---T-G--------TAA--C-T-GGC--AA---T------------A-CG-G--ATACC--C-GTA-------A-CT-TG-CA--AA--CACGC-----TGAA-A---G--TT-TA----------------CAAT-A------GCTG--TA-GT-A-----TCA--GT--ATCATG