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Reference ( family-1197 ) : AGGATTGCNNACCTTNNTGTTTCAAGCACCCGNGGGTTTTCAT-GGCCTTTTTTATG----CA-CCATT-----TTTGT-TTCCAG-T-AAAGATTC--AT-GTT-C------TAT-T-TC------------------T-ATT-G----------------CA-T-T--------------------T--GTG-TT-----------T--T-GT-AAC-------------------AA-T-ATT----------------------GT-GG-CTG----G-G-AGAA---CGC-TT-----------T----T-GGT-T-AA-T-------ACG-TTC-A-T-A---TCT----TAC-TTT---GC----------T-------A------------G-----------------G---------T------------TT-G--T-CT---CC-CA--GCC--AA----TT----TCTA----T-ATGTATTTTT--AT--CTTAG--TA-TTN---A-C-A-T-TTT--T-C-G-TCATT--TTAAAT--AAA-TG-A-C-A-A--TTT---TTTA-CAA-C----TTAA---CA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATGATTTA-CTGGGAA-ACA--AACAG-AGCTG--C--A-ATGTT-GCCTTGGA--C-TTAC---AGCACGGTTTTT-AACA---------TAAAAAAANTGTA
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Reference ( family-1197 ) : AGGATT--TCACCTTCCT-TTTCAA-C-CCTG--GGTTTTCATGG-CCTTTTTTATG----CA-CCATT-----TTTGT-TTCCAG-T-AAAGATTC--AT-GTT-C------TAT-T-TC------------------T-ATT-G----------------CA-T-T--------------------T--GTG-TT-----------T--T-GT-AAC-------------------AA-T-ATT----------------------GT-GG-CTG----G-G-AGAA---CGC-TT-----------T----T-GGT-T-AA-T-------ACG-TTC-A-T-A---TCT----TAC-TTT---GC----------T-------A------------G-----------------G---------T------------TT-G--T-CT---CC-CA--GCC--AA----TT----TCTA----T-ATGTATTT-TT--AT--CTTAG---NATTC---A-C-A-T-TTT--T-C-G-TCATT--TTAAAT--AAA-TG-A-CA-A--NTT---TTT--ACAN-C--TT-AA---CA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATGATTTA-CTGGGAA-ACA--AACAG-AGCTG--C--A-ATGTT-GCCTTGGA--C-TTGC---AGCACGGTTTTT-AACA---------TAAA---AAAATTGTA
gi|1 : GGATT--AAACTTTGGT-TTTCAA-C-CCTA--GGTTTTCATGG-CCTTTTTTATG----CA-CCATT-----TTTGT-TTCCAG-T-AAAGATTC--AT-GTT-CTATTTCTAT-T-GCATTTGTGGTTTGTAACAAT-ATT-G----------------TGGT-T--------------------T--GTA-TTAATATAATGGTT--T-AT-AAC-------------------AA-T-ATT----------------------GT-AG-CTGCATGG-G-AGAA---CGC-TT-----------T----T-CGT-T-AA-TTTTTAATACA-TTC-A-T-A---TCT----TGC-TTT---GC----------T-------A------------GTCAAGAGACGCCG----G---------T------------TT-G--T-CT---CC-CA--GCC--AA----TT----TCTC----T-ATGGATTT-T-----------------------A---A-T-TTT--C-CAG-TCATT--TAAAAT--AAA-TG-A-CA------------------C-C--AT-AA---CA----TGTTTTTTTTTTC-T-CT-----TATGATTTA-CATGGAA-AGA--AACAG-AGCTG--C--A-ATGTT-GCCTTGG---------------ACGGTTTTTAAACA---------TAA
gi|10 : TTTTATGATAGCG-CCATT-----TTTGT-TTCCAG-T-AAAGATTC--AT-GTT-C------TAT-T-TC------------------T-ATT-G----------------CA-T-T--------------------T--GTG-TT-----------T--T-GT-AAC-------------------AA-T-ATT----------------------GT-GG-CTG----G-G-AGAA---CGC-TT-----------T----T-CGT-T-AA-T-------ACT-TTG-C-T-A---G-T----TAA-GAC---GC----------C--------------------G-----------------G---------T------------TT-G--T-CT---CC-CA--GCC--AA---------------------------T-TT--AT--CTTAG---TATTC---A-C-T-T-ATT--T-C-G-TCATT--TTAAAT--AAA-TG-A-CA-A--ATT---TTT--ACAA-C--TT-AA---CA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATGATTTA-CTGGGAA-ACA--AACAG-AGCT
gi|11 : tacacggacagtatgactactgttatacTTTTATA----CA-CAATTCGTTATTAGG-TTCTAG-T-AAAGATTG--AT-AGT-G------TAT-T-T-------------------T-CTT-G----------------TA-T-T--------------------T--GTG-TT-----------T--T-GT-AA-----------------------T-ATT----------------------GT-GG-CTG----G-G-AGAA---CGCATTGGAGGTGGGGGT----G-GGT-T-AA-T-------ACT-TTA-A-T-A---TGC----TGCATTT---GTAGTCATGGTGC-------A------------G-----------------G---------T------------AA-G--T-AT---CT-CA--GCC--TT----TT----TGTT----T-CTGTATAT-TT-------TTGG---GACTC---G-T-A------------G-TC------TAAAT--GAA-TG-A-TA-A--
gi|12 : tgcatggactgtcgatatcatatttcagttaaaaG-TT-----------T--T-GT-AAC-------------------AT-T-GTC----------------------AT-GG-TTG----G-G-AGAA---CTC-T--------------------GT-T--------------G-TTT-G-T-G---T-------AT-TCG---GG----------T-------A------------GA----------------G---------T------------AG-G--T-CT---CC-CG--GCC--AG----TT----TGTG----T-CCGTATCTATT--AA----TAG---GGCTC---A-C-AGT-TTT--T-C-G-------------------------CA-A--------------CAC-C--TTTAA---CA----TATTAT------C-T-GT-----TACGATTTA-CATGGAA-ACA--AAAAG-AGCAG--C--A-ACGTT-GCCTTGGA--T-CAAC---AGCGC-GCTTTT-AAGA---------TAGA---
gi|13 : CG-TTC-G-T-A---TCT----TAC-TTTTT-GC----------T-------A------------G----------------------------------------------T-CAAGACC-AA--GCC--AA----TT----TCTA----T-AAGTATTT-TT--AT--CTTGG---GATTC---A-C-T-TGTTT--T-C-G-TCATT--TAAAAT--AA--TG-A-CA-A--TTGAAATTT--ATAC-C--TT-AA---AA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATG----------------A--AACAG-AGCTG--C--A-A--TT-A------------TAT---AGCACGGTTTTT-AACA---------TAAA---gtatattggacaaatgtttgtc
gi|14 : aacagctt--GTG-TT-----------A--T-AT-AAC-------------------AA-A-ATT----------------------GT-AA-ATG----G-G-AGAAGAACGT-TA-----------TGCAGT-GGA---AA-T-------TCG-TTA-A-T-A---TGT----TGC-ATT---TC----------T-------AATCAAGATGGA-G-----------------A---------C------------AT-G--T-AT---CC-TA--TCC--AA----TTAGTTTTTG----T-ATGCATTT-CT--A-------G---GACTT---A-C-G-T-CTT--C-CCG-TTATT--C-AAAT--AGA-CG-A-CA-A--TTT---AGT--ACTC-C--TT-AA----A----CG-TTTT-----C-T-TT-----CATGATTTA-Ccagcctcattgcaaatcgctcggcatt
gi|15 : C-G-T-A---TCT----TAC-TTT---GC----------T-------A------------G----------------------------------------------T-CAAGACC-AA--GCC--CA----TT----TCTA----T-AAGTATTT-TTT-AT--CTTGG---GATTC---A-C-T-T-GTT--T-C-G-TCATT--TTAAAT--AAA-TG-A-CA-A--AAT---TTT--ACAC-C--TT-AA---AA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATGATTTC-CTTGGAA-ACA--AACAG-AGCTG--C--A-ATTTT-atagaaa
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gi|17 : TGTATTT-T---AT--CTTAG---TATTA---A-C-A-G-TTT--T-C-G-TCATT--TTAAAT--AAA-TG-A-CA-A--ATT---TTT--ACAA-C--TT-AA---CA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATGATTTA-CT-GGAA-ACA--AACAG-AGCTG--C--A-ATGTT-GCCTTGGA--C-TTGCAT-AACATGGTTTTA-AACA---------TAAA---CAAATTATcacgcctcttaacat
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gi|2 : -A---TCT----TAC-TTT---GC----------T-------A------------G-----------------G---------TCAAGACGCCAGTTT-A--C-CT---CC-CA--GCC--AA----TT----TCTA----G-ATGTATTT-TTA-AT--CTTAG---TA-TC---A-C-A-T-TTT--T-C-GTTTATCTGTTAAAT--AAA-TG-AGCA-A--ATTC--TTT--ACAA-CTATT-AAAACCA----TGTTTTT-----CGT-GT-----TATTA-TTA-CTGGGAA-ACAAGAACAGCAGCTG--CCAA-ATGTTGGCCCTGG-----TTGCAT-AACATGGTTTTA-AACA---------TAAA---atattgccctttgttttgaaaaaaatcttactttgctaggtcaagacgccagtttacctcccagccaatttctagatgtatttttaatcttagtatcacatttttcgtttatctgttaaataaatgagcaaattctttacaactattaaaaccatgtttttcgtgttattattactgggaaacaagaacagcagctgccaaatgttggccctggttgcataacatggttttaaacataaatgagttt
gi|20 : tttccaggtaaaattcatgtctattctatattgcattagtggtttttgtaacaatattgtgtttctgttaacaattattgtggcgggagagaacgcttttggttaatactatatcttacttatattgccctttgttttgaaaaaa-AA---CA----TGTTTTT-----T-TTGG-----TATGATTTA-CTGAGAA-ACA--AACAG-GGCTG--C--A-AT-----------A--C-TT-----AGCACGGTGTTT-AACA---------Ttgagttt
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gi|5 : TGG-CCTTTTTTTT-----------TT-----TTTGT-TTCCGG-T-AAAAATTC--AT-GTT-G------TAT-T--C------------------T-ATC-G----------------CA-T-TATCTCATT------------T--GTG-TT-----------T--T-GT-AAC-------------------AA-T-ATT----------------------GT-GG-CTG----G-G-AGAA---CGC-TG-----------T----T-GTG-T-AA-T-------ACT-TTA-A-T-A---TCT----TGC-ATT---AC----------T-------A------------GTCATGACGCCG------G---------T------------TT-T--T-CT---TC-CA--GCC--AA----TT----TCTC----C-ATGTATTT-TTTAAT--TTGAG---GATTC---A-T-A-T-TTT--T-G-G-TAATT--TTAAAT--AAA-TG-G-CA-A--CTT---TTT--ACAC-C--TT-AA---CA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATGATTTA-CTTGG-----A--AACAG-AGCTC--T--A-TTACT-GCCATGGA--C-TATT---AGCACGG-CTTT-AACATGAGTAGTTTAAA---AAAATTGTA
gi|6 : AGGATTGCTCACCTTCCTGTTTCAAGCACCTGAGGGTTTTCATGGGCCTTTTTTATG----CAGCCATT-----TTTGT-TTCCAG-TAAAAGATTCATAT-GTTGC------TAT-T-TCG-----------------T-ATTGG----------------CA-T-T--------------------T--GTG-TTG----------T--TGGT-AAC-------------------AATT-ATTCGTGGTTTGTAAGCGAATATTGGT-GG-GTG----G-G-AGAA---CGC-TT-----------TTG--T-GGT-TGAA-TAG-----ACG-TTC-A-T-A---TCT----TAC-CTG---GT----------T-------G------------GGCGTAGTCAAGAGCGCCG---------T------------TTGG--T-CT---CCGCA--GCCCAAG----TT----TCTAGGAGT-GTATGTTG-TT--AT--CTTAGGTTAGTTA---A-CTA-G-TTT--T-C-G-TCATT--TTAAATTAAAG-TGAA-CA-A--TGT---TTT--ACAt
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gi|9 : -AGAA---CAG-TT-----------C----T-A---T-AA-T-------ATG-TTA-A-T-AAAATCCGTGATAC-TT-------------------------------------G-----------------G---------T------------AT-G--T-CT---CC-AA--GCC--A-----TT----TTT-----T-CTGTGTTT-TT--CT--CT------GACTT---A---A-T-TTTGTT-T-G-TCATT--CAAAAT--AAA-TG-A-CA-A--GCT---TTT--ACAC-A--TT-AA---CG----TGTTTTT-----C-T-GT-----TTTGAT----CTGTAAATAGA--AACAG-AGAAA--G--A-ATGTT-GCCTGGGA--T-TAAT---AGTAAGG-TTTT-AACA---------TAAAAACAAAATTtaacatgg
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gi|14 : aacagctt--GTG-TT-----------A--T-AT-AAC-------------------AA-A-ATT----------------------GT-AA-ATG----G-G-AGAAGAACGT-TA-----------TGCAGT-GGA---AA-T-------TCG-TTA-A-T-A---TGT----TGC-ATT---TC----------T-------AATCAAGATGGA-G-----------------A---------C------------AT-G--T-AT---CC-TA--TCC--AA----TTAGTTTTTG----T-ATGCATTT-CT--A-------GG---ACTT---A-C-G-T-CTT--C-CCG-TTATT--C-AAAT--AGA-CGA-CA-A--TT-T----AGT--ACT--CC--TT-AA----A----CGTTTT------C-T-TT-----CATGATTTA-Ccagcctcattgcaaatcgctcggcatt
gi|15 : C-G-T-A---TCT----TAC-TTT---GC----------T-------A------------G----------------------------------------------T-CAAGACC-AA--GCC--CA----TT----TCTA----T-AAGTATTT-TTT-AT--CTTGGG---ATTC---A-C-T-T-GTT--T-C-G-TCATT--TTAAAT--AAA-TGA-CA-A--AA-T----TTT--ACA--CC--TT-AA---AA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATGATTTC-CTTGGAA-ACA--AACAG-AGCTG--C--A-ATTTT-atagaaa
gi|16 : G----G-G-AGCA---CGC-TT-----------T----T-CGT-T-AA-T-------ACT-TTC-A-T-A---TCT----TGC-TTT---GC----------T-------A------------GCCAAGGCAACG------G---------T------------TT-G--T-CT---CC-CA--GCG--AA----TT----T----------------------AT--CTTACG---ATTC---A-C-A-T-TTT----C-G-TCATT--TTAAAT--AAA-TGA-CA-A--AA-T----TTT--ACA--CC--TA-AA---TA----TGTTTTT-----C-T-GT-----AATGATTTA-CCTGGAA-ACA--TATAG-aacataaacagcctcattgcaaaacgctc
gi|17 : TGTATTT-T---AT--CTTAGT---ATTA---A-C-A-G-TTT--T-C-G-TCATT--TTAAAT--AAA-TGA-CA-A--AT-T----TTT--ACA--AC--TT-AA---CA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATGATTTA-CT-GGAA-ACA--AACAG-AGCTG--C--A-ATGTT-GCCTTGGA--C-TTGCAT-AACATGGTTTTA-AACA---------TAAA---CAAATTATcacgcctcttaacat
gi|18 : --AT-ATT-G------TAT-T-T-------------------T-ATC-G----------------C--T-T--------------------T--GTG-T--------------------AAC-------------------AA-T-ATT----------------------TT-GA-CTG----G-G-AGTA---CAC-T--------------------GT-C--A-T-------A----TC-A---A---TAC----TAG-TAT---G-----------T-------G------------G-----------------G---------T------------AT-G--T-CT---CC-CA--GCC--AA----TT----TGTT----T-CTGTATTT-AT--AT---TTAGG---ATTC---G-C-T-T-TTT--T--------TT--TTAAAttcacaatac
gi|19 : atgcatcactagaatttatTT-----TTTATGCTCCAC-T----GATTC--AT-GTT-G------TAT-T-T-------------------T-ATC-G----------------CA-C-TATCCCT--------------TCGGTG-TT-----------T--T-GT-AAC-------------------AA-T-ACT----------------------GC-AG-CTG----G-G-AG
gi|2 : tT-TTCCAGGT-AAA-ATTC--AT-GT--C------TAT-TCTA------------------T-ATT-G----------------CA-T-TAGTGGTTTTTGTAACAATATT--GTG-TT-----------TC-T-GTTAAC-------------------AA-TTATT----------------------GT-GG-CGG----GAG-AGAA---CGC-TT-----------T----T-GGT-T-AA-T-------AC----T-A-T-A---TCT----TAC-TTgttaatattgtgtaatactttaac
gi|2 : -A---TCT----TAC-TTT---GC----------T-------A------------G-----------------G---------TCAAGACGCCAGTTT-A--C-CT---CC-CA--GCC--AA----TT----TCTA----G-ATGTATTT-TTA-AT--CTTAGT---A-TC---A-C-A-T-TTT--T-C-GTTTATCTGTTAAAT--AAA-TGAGCA-A--AT-TC---TTT--ACA--ACTATT-AAAACCA----TGTTTTT-----CGT-GT-----TATTA-TTA-CTGGGAA-ACAAGAACAGCAGCTG--CCAA-ATGTTGGCCCTGG-----TTGCAT-AACATGGTTTTA-AACA---------TAAA---atattgccctttgttttgaaaaaaatcttactttgctaggtcaagacgccagtttacctcccagccaatttctagatgtatttttaatcttagtatcacatttttcgtttatctgttaaataaatgagcaaattctttacaactattaaaaccatgtttttcgtgttattattactgggaaacaagaacagcagctgccaaatgttggccctggttgcataacatggttttaaacataaatgagttt
gi|20 : tttccaggtaaaattcatgtctattctatattgcattagtggtttttgtaacaatattgtgtttctgttaacaattattgtggcgggagagaacgcttttggttaatactatatcttacttatattgccctttgttttgaaaaaa-AA---CA----TGTTTTT-----T-TTGG-----TATGATTTA-CTGAGAA-ACA--AACAG-GGCTG--C--A-AT-----------A--C-TT-----AGCACGGTGTTT-AACA---------Ttgagttt
gi|21 : T-----C-T-GT-----TATTATTTA--TATGAA-A-------AG-AGCTG--C----ATGTT-GTCTTGGA--T-TAAC---AGCG-GGATTTT-ATGA---------TAAA---
gi|22 : aA-T-T--------------------T--ATGGTT-----------T--T-AT-AAC-------------------AA-T-ATC----------------------AT-GG-C-A----G-G-AGAA---C
gi|23 : ttgtattatatcgcattatcgatGCTG--C--A-ATGTT-GCCTTGGA--C-TTGCAT-AACATGGTTTTA-AACA---------TAA
gi|24 : gGG-CCTTTTTTATA----CA-CCATT-----TTTGT-TTCCAG-T-AAATATTC--AT-G
gi|25 : AAATTC--ATTGCA-C------TAT-T-TC------------------T-ATT-G----------------CA-T-T--------------------T--GTG-TT-----------T--T-GT-AAC-------------------A
gi|3 : AGGATT--TCACCTTCCT-TTTCAA-C-TCTG--GGTTTTCATGG-CCTTTTTTACG----CA-CCATT-----TTTGT-TTCCAG-T-AAAGATGT--AT-GTT-C------TAT-T-TC------------------T-ATT-G----------------CA-T-T--------------------T--GTG-TT-----------T--T-GT-AAC-------------------AA-T-ATT----------------------GT-GG-CTG----G-G-AGAA---CGT-TT-----------T----T-GGT-T-AA-T-------ACG-TTC-A-T-A---TCT----TAC-TTT---GC----------T-------A------------G-----------------G---------T------------TT-G--T-CT---CC-CA--GCC--AA----TT----TCTA----T-ATGTATTT-TT--AT--CTTAGT---ATTA---A-C-A-T-TTT--T-C-G-TCATT--TTAAAT--AAA-TGA-CA-ATTTT-T----TTT--ACA--AC--TT-AA---CA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATGATTTA-CTGAGAA-ACA--AACAG-AGCTG--C--G-ATTTT-GCCTTAGA--C-TTACTG-AGTACGGTGTTT-AACA---------TAAA---AAAAATGTA
gi|4 : GG-CCTTTTT-ATG----CA-C-ATT-----TTTGT-TTCCAG-T-AAAGATTC--AT-GTT-C------TAT-T-TCG-----------------T-ATT-GTCTTTGTTTTTGGTAACA-TAT--------------------T--GTG-GT-----------TA-T-GT-AAC-------------------AA-T-ATT----------------------GT-GGTCTG----G-GTAGAA---CGC-TT-----------T----T-GGT-T-AAAT-------ACGCTTC-AAT-A---TCT----TACATTT---GC----------T-------A------------GTCAAGACG---------G---------T------------TT-GGTT-CT---CC-CA--GC----A----TT----T-TA----G-ATGTATTT-TT--AT--CTTAGT---ACTCTGAA-C-A-T-TTT--TTC-G-TCATT--TTAAAA--TAA-TGA-CACA--AT-T----TTT--ACA--AC--TT-TA---AA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATGATTTATCTGGGAA-ACA--AACAG-AGCTGCCC--A-ATG-T-GCCTTGGA--CATTGCAATAACATGG-TTTT-AAAA---------TAAA---gcatagta
gi|5 : TGG-CCTTTTTTTT-----------TT-----TTTGT-TTCCGG-T-AAAAATTC--AT-GTT-G------TAT-T--C------------------T-ATC-G----------------CA-T-TATCTCATT------------T--GTG-TT-----------T--T-GT-AAC-------------------AA-T-ATT----------------------GT-GG-CTG----G-G-AGAA---CGC-TG-----------T----T-GTG-T-AA-T-------ACT-TTA-A-T-A---TCT----TGC-ATT---AC----------T-------A------------GTCATGACGCCG------G---------T------------TT-T--T-CT---TC-CA--GCC--AA----TT----TCTC----C-ATGTATTT-TTTAAT--TTGAGG---ATTC---A-T-A-T-TTT--T-G-G-TAATT--TTAAAT--AAA-TGG-CA-A--CT-T----TTT--ACA--CC--TT-AA---CA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATGATTTA-CTTGG-----A--AACAG-AGCTC--T--A-TTACT-GCCATGGA--C-TATT---AGCACGG-CTTT-AACATGAGTAGTTTAAA---AAAATTGTA
gi|6 : AGGATTGCTCACCTTCCTGTTTCAAGCACCTGAGGGTTTTCATGGGCCTTTTTTATG----CAGCCATT-----TTTGT-TTCCAG-TAAAAGATTCATAT-GTTGC------TAT-T-TCG-----------------T-ATTGG----------------CA-T-T--------------------T--GTG-TTG----------T--TGGT-AAC-------------------AATT-ATTCGTGGTTTGTAAGCGAATATTGGT-GG-GTG----G-G-AGAA---CGC-TT-----------TTG--T-GGT-TGAA-TAG-----ACG-TTC-A-T-A---TCT----TAC-CTG---GT----------T-------G------------GGCGTAGTCAAGAGCGCCG---------T------------TTGG--T-CT---CCGCA--GCCCAAG----TT----TCTAGGAGT-GTATGTTG-TT--AT--CTTAGGTTAGTTA---A-CTA-G-TTT--T-C-G-TCATT--TTAAATTAAAG-TGA-AC-A--ATGT----TTT--ACA--t
gi|7 : ct------TATAT-TC------------------T-ATT-G----------------CA-T-T--------------------T--GTG-TT-----------TCTT-GT-AACAATATTGTGGTGTTGTACAAA-T-ATT----------------------GTTGG-CTG----G-G-AGAAA--CGC-TT-----------T----TTGGTAT-AA-T--------CG-TCCCA-T-A---TCT----TAC-CTTTTGGC----------TTAGTGCAA------------G-----------------ACACGACGGCT------------TT-G--TTCT---CC-CA--GCCT-AA----AT----TCTA----GGATGTATTT-TT--ATGCTTTAGT---ATTA---AAC-A-T-TTT--T-C-G-TCATT--T-AAAT--AA--TGA-CA-A--AT-T----TTTTAACAAACT--TA-AA---CAACGTTGTTTTT-----C-T-GTACAATTA-GAATTA-CTGGGAA-ACA--AACAG-AGCTG--C--ATGTGCA-GCCTTGGGACC-TTGC---A
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gi|9 : -AGAA---CAG-TT-----------C----T-A---T-AA-T-------ATG-TTA-A-T-AAAATCCGTGATAC-TT-------------------------------------G-----------------G---------T------------AT-G--T-CT---CC-AA--GCC--A-----TT----TTT-----T-CTGTGTTT-TT--CT--CT---G---ACTT---A---A-T-TTTGTT-T-G-TCATT--CAAAAT--AAA-TGA-CA-A--GC-T----TTT--ACA--CA--TT-AA---CG----TGTTTTT-----C-T-GT-----TTTGAT----CTGTAAATAGA--AACAG-AGAAA--G--A-ATGTT-GCCTGGGA--T-TAAT---AGTAAGG-TTTT-AACA---------TAAAAACAAAATTtaacatgg
blockSeqs : GC G GCA AG G GATAG G C CGTTA G G A AT T GC A C CG T G TCTTTGTTTTTGGTAA . A AGTGGTTTTTGTAACAATAT CG G TCT G T AATATTGTGGTGTTGTACA T T CGTGGTTTGTAAGCGAATATTG T T . A T GAA A TGGAGGTGGGGGT T A G A AG GC C A T AAA GTGA A TTG TGGGCGTAGTCAAGAGCGCCGTT G GT T AGA G AA CA ATTT AGTT G AGGAGTG A TA GCT GTTA CTGA A T G G GT T C T TG T TA A G C TTGAAA TA AA TA T AAC ACGT . G T ACAAT T G T AG C CC CA T G ACATTGCAAT C C . TGAGTAGTT AAC
blockSeqs : . . C . . A . A . . . . . . C . . CG . . . . . GTGTTTTTTGTAACAATAT . . TC . . . . . . . . . . . A . ATGCAG . . . A . T . . . . . A TT TTAGTGCAAGACACGACGGCTT . . . AGA . . T . . G AGGA . T C T C . . G . . . . . . T . . . . TTTTT . . . . . . . . . . . T . . . . . . . ACTTGCAT C T . . .
blockSeqs : . A . C . . . . . . G . . C . . . . . ATCTCATT . . TA . . . . . . . . . . . . . TTTG . . . . . T . . . . . . . TAGGTCAAGACGCCAGTT . . . . . . . . . C TTC . A C G C . . . . . . . . . A . . . . ATTC . . . . . . . . . . . T . . . . . . . ACTTGCAT T T . . .
blockSeqs : . G . C . . . . . . G . . A . . . . . ATCCCT . . GT . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . G . . . . . . . TAAGTCAAGACGCCGGTT . . . . . . . . . T GTC . T C G C . . . . . . . . . T . . . . ATGT . . . . . . . . . . . T . . . . . . . ACTTACTG T T . . .
blockSeqs : . G . C . . . . . . G . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . G . . . . . . . TAATCAAGATGGAGACA . . . . . . . . . C ATA . . C G C . . . . . . . . . T . . . . ATT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . GACCTTGC C T . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . C . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . G . . . . . . . TAGCCAAGGCAACGGTT . . . . . . . . . G GTA . . C G T . . . . . . . . . T . . . . TTT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . ATCAAC T A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . T . . . . . . . TAGTCATGACGCCGGTT . . . . . . . . . C ATA . . C G C . . . . . . . . . T . . . . AAT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . TTGCAT C T . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . C . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . G . . . . . . . AGTCATGGTGCAGGTA . . . . . . . . . C TTC . . C G C . . . . . . . . . T . . . . AAT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . ATTAAC T T . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . T . . . . . . . TAGTCAAGACGGTT . . . . . . . . . C AGA . . C T A . . . . . . . . . T . . . . ATT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . ACTATT C . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . G . . . . . . . TAGAGTA . . . . . . . . . C ATA . . T G C . . . . . . . . . T . . . . ATT . . . . . . . . . . . T . . . . . . . ACTTGC A . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . G . . . . . . . TGGGTA . . . . . . . . . C AGA . . C T C . . . . . . . . . T . . . . CTT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . ATTAAT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . G . . . . . . . TAGGTT . . . . . . . . . C CCA . . C T A . . . . . . . . . T . . . . ATT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . ACTT
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . CGGTT . . . . . . . . . T AGA . . C T C . . . . . . . . . T . . . . ATT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . TAT
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGTA . . . . . . . . . . TC . . . G A . . . . . . . . . A . . . . GCT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . TAG . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TAG . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G T . . . . . . . . . .
blockSeqCons : C******* C****************** T************* **** ******* C** G*** C*** ATT******* ***** ACTTGCAT****
originalCons : AGGATT--TCACCTTCCT-TTTCAA-C-CCTG--GGTTTTCATGG-CCTTTTTTATG----CA-CCATT-----TTTGT-TTCCAG-T-AAAGATTC--AT-GTT-C------TAT-T-TC------------------T-ATT-G----------------CA-T-T--------------------T--GTG-TT-----------T--T-GT-AAC-------------------AA-T-ATT----------------------GT-GG-CTG----G-G-AGAA---CGC-TT-----------T----T-GGT-T-AA-T-------ACG-TTC-A-T-A---TCT----TAC-TTT---GC----------T-------A------------G-----------------G---------T------------TT-G--T-CT---CC-CA--GCC--AA----TT----TCTA----T-ATGTATTT-TT--AT--CTTAGG---ATTC---A-C-A-T-TTT--T-C-G-TCATT--TTAAAT--AAA-TGA-CA-A--AT-T----TTT--ACA--CC--TT-AA---CA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATGATTTA-CTGGGAA-ACA--AACAG-AGCTG--C--A-ATGTT-GCCTTGGA--C-TTGC---AGCACGGTTTTT-AACA---------TAAA---AAAATTGTA
finalCons : AGGATT--TCACCTTCCT-TTTCAA-C-CCTG--GGTTTTCATGG-CCTTTTTTATG----CA-CCATT-----TTTGT-TTCCAG-T-AAAGATTC--AT-GTTC-------TAT-T-TC------------------T-ATT-G----------------CA-T-T--------------------T--GTG-TTT-------------T-GT-AAC-------------------AA-T-ATT----------------------GT-GG-CTG----G-G-AGAA---CGC-TT-----------T----T-GGT-T-AA-T-------ACG-TTC-A-T-A---TCT----TAC-TTT---GC----------T-------A------------G-----------------G---------T------------TT-G--T-CT---CC-CA--GCC--AA----TT----TCTA----T-ATGTATTT-TT--ATC--TTAGG---ATTC---A-C-A-T-TTT--T-C-G-TCATT--TTAAAT--AAA-TGA-CA-AATT-------TTT--ACA--CC--TT-AA---CA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATGATTTA-CTGGGAA-ACA--AACAG-AGCTG--C--A-ATGTT-GCCTTGGACTTGCAT----AGCACGGTTTTT-AACA---------TAAA---AAAATTGTA
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consensus : AGGATT--TCACCTTCCT-TTTCAA-C-CCTG--GGTTTTCATGG-CCTTTTTTATG----CA-CCATT-----TTTGT-TTCCAG-T-AAAGATTC--AT-GTT-C------TAT-T-TC------------------T-ATT-G----------------CA-T-T--------------------T--GTG-TT-----------T--T-GT-AAC-------------------AA-T-ATT----------------------GT-GG-CTG----G-G-AGAA---CGC-TT-----------T----T-GGT-T-AA-T-------ACG-TTC-A-T-A---TCT----TAC-TTT---GC----------T-------A------------G-----------------G---------T------------TT-G--T-CT---CC-CA--GCC--AA----TT----TCTA----T-ATGTATTT-TT--AT--CTTAGG---ATTC---A-C-A-T-TTT--T-C-G-TCATT--TTAAAT--AAA-TGA-CA-A--AT-T----TTT--ACA--CC--TT-AA---CA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATGATTTA-CTGGGAA-ACA--AACAG-AGCTG--C--A-ATGTT-GCCTTGGA--C-TTGC-A-T-AGCACGGTTTTT-AAC--A---------TAAA---AAAATTGTA
Reference ( family-1197 ) : AGGATT--TCACCTTCCT-TTTCAA-C-CCTG--GGTTTTCATGG-CCTTTTTTATG----CA-CCATT-----TTTGT-TTCCAG-T-AAAGATTC--AT-GTT-C------TAT-T-TC------------------T-ATT-G----------------CA-T-T--------------------T--GTG-TT-----------T--T-GT-AAC-------------------AA-T-ATT----------------------GT-GG-CTG----G-G-AGAA---CGC-TT-----------T----T-GGT-T-AA-T-------ACG-TTC-A-T-A---TCT----TAC-TTT---GC----------T-------A------------G-----------------G---------T------------TT-G--T-CT---CC-CA--GCC--AA----TT----TCTA----T-ATGTATTT-TT--AT--CTTAGG---ATTC---A-C-A-T-TTT--T-C-G-TCATT--TTAAAT--AAA-TGA-CA-A--AT-T----TTT--ACA--CC--TT-AA---CA----TGTTTTT-----C-T-GT-----TATGATTTA-CTGGGAA-ACA--AACAG-AGCTG--C--A-ATGTT-GCCTTGGA--C-TTGC-A-T-AGCACGGTTTTT-AAC--A---------TAAA---AAAATTGTA
gi|1 : GGATT--AAACTTTGGT-TTTCAA-C-CCTA--GGTTTTCATGG-CCTTTTTTATG----CA-CCATT-----TTTGT-TTCCAG-T-AAAGATTC--AT-GTT-CTATTTCTAT-T-GCATTTGTGGTTTGTAACAAT-ATT-G----------------TGGT-T--------------------T--GTA-TTAATATAATGGTT--T-AT-AAC-------------------AA-T-ATT----------------------GT-AG-CTGCATGG-G-AGAA---CGC-TT-----------T----T-CGT-T-AA-TTTTTAATACA-TTC-A-T-A---TCT----TGC-TTT---GC----------T-------A------------GTCAAGAGACGCCG----G---------T------------TT-G--T-CT---CC-CA--GCC--AA----TT----TCTC----T-ATGGATTT-T-----------------------A---A-T-TTT--C-CAG-TCATT--TAAAAT--AAA-TGA-CA----------------------CC--AT-AA---CA----TGTTTTTTTTTTC-T-CT-----TATGATTTA-CATGGAA-AGA--AACAG-AGCTG--C--A-ATGTT-GCCTTGG-----------------ACGGTTTTTAAAC--A---------TAA
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gi|20 : tttccaggtaaaattcatgtctattctatattgcattagtggtttttgtaacaatattgtgtttctgttaacaattattgtggcgggagagaacgcttttggttaatactatatcttacttatattgccctttgttttgaaaaaa-AA---CA----TGTTTTT-----T-TTGG-----TATGATTTA-CTGAGAA-ACA--AACAG-GGCTG--C--A-AT-----------A--C-T------T-AGCACGGTGTTT-AAC--A---------Ttgagttt
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gi|6 : AGGATTGCTCACCTTCCTGTTTCAAGCACCTGAGGGTTTTCATGGGCCTTTTTTATG----CAGCCATT-----TTTGT-TTCCAG-TAAAAGATTCATAT-GTTGC------TAT-T-TCG-----------------T-ATTGG----------------CA-T-T--------------------T--GTG-TTG----------T--TGGT-AAC-------------------AATT-ATTCGTGGTTTGTAAGCGAATATTGGT-GG-GTG----G-G-AGAA---CGC-TT-----------TTG--T-GGT-TGAA-TAG-----ACG-TTC-A-T-A---TCT----TAC-CTG---GT----------T-------G------------GGCGTAGTCAAGAGCGCCG---------T------------TTGG--T-CT---CCGCA--GCCCAAG----TT----TCTAGGAGT-GTATGTTG-TT--AT--CTTAGGTTAGTTA---A-CTA-G-TTT--T-C-G-TCATT--TTAAATTAAAG-TGA-AC-A--ATGT----TTT--ACA--t
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