lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111 222 3333333333333333 111111111111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444 1111111111111 111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 1111111111 1111111111 11111111 99999999999999999999999999999999 111 2222 11 11 2222 1111 555555555555555 44444444444444444444444 333333333333333333333333333 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111111 11111111111 1111 33333333333333333 111111111111 1111111 22 444444444444 11111111 111 222222222222222222222 11111 1111 111 3333333333333333 888888888888888888888888888888 2 88888888888888888888888888888888888888888888888
lowQualScore : 5 5 222222222222222222222222222222222222222222222222 7 3 7 444 3 3 7777777777777777 4 555555555555555555 4 888 2222222222222222222222222222222222222222222222 8888888888888 3 99 8 7 3 000000 3 99999999999999999999999999999999999999999999999999999 999999 7777 3 3 3 3 3 44 6 6 3 3 3 55 99 3 66 3 0 3 6666666666 4 55 0 3 4 9999999999 3 33333333 666 3 00000000000000000000000000000000 111 4444 88 555 44 11 1111 6 3 888 1 3 3333 44 3 3 44 3 3 111111111111111 3 3 3 44 555 555 55555555555555555555555 44 3 44 4 44 444444444444444444444444444 3 44 44 3 6 3 3 3 3 3 8888 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 99 11111111111 77 66666666666 2 0000 11111111111111111 111111111111 33 2 2 0 2 5555555 3 99999 0 2 88 33 55 5 2 33 33 5 666 3 222222222222 3 555 2 3 44444444 3 3 000 3 3 999999999999999999999 555 55555 44 555 6 3 1111 2 999999 2 666 1 000 2 5555 444 7777777777777777 7777 7 2 0 2 5 2 2 000000000000000000000000000000 2 2 33 55 22 44 66666 2 4 44 33333333333333333333333333333333333333333333333 1 22 1 22 1
lowQualScore : . . ................................................ . . . ... . . ................ . .................. . ... .............................................. ............. . .. . . . ...... . ..................................................... ...... .... . . . . . .. . . . . . .. .. . .. . . . .......... . .. . . . .......... . ........ ... . ................................ ... .... .. ... .. .. .... . . ... . . .... .. . . .. . . ............... . . . .. ... ... ....................... .. . .. . .. ........................... . .. .. . . . . . . . .... .................................................................................................................. .. .. ........... .. ........... . .... ................. ............ .. . . . . ....... . ..... . . .. .. .. . . .. .. . ... . ............ . ... . . ........ . . ... . . ..................... ... ..... .. ... . . .... . ...... . ... . ... . .... ... ................ .... . . . . . . . .............................. . . .. .. .. .. ..... . . .. ............................................... . .. . .. .
lowQualScore : 0 0 555555555555555555555555555555555555555555555555 3 6 3 777 6 6 6666666666666666 0 000000000000000000 0 000 0000000000000000000000000000000000000000000000 9999999999999 2 55 0 3 6 555555 3 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 666666 1111 3 3 3 3 3 66 7 7 3 3 6 00 11 0 55 6 5 6 0000000000 0 55 7 4 0 9999999999 6 22222222 444 1 55555555555555555555555555555555 888 2222 33 888 66 22 7777 7 3 999 2 3 0000 66 3 3 22 1 1 222222222222222 1 1 1 66 222 888 11111111111111111111111 22 1 22 7 66 444444444444444444444444444 1 22 22 1 2 1 1 1 1 1 1111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 77 00 22222222222 99 88888888888 4 0000 66666666666666666 999999999999 22 4 5 6 5 9999999 3 88888 6 7 44 44 99 0 5 44 44 0 999 5 333333333333 3 888 6 3 44444444 3 3 444 3 3 999999999999999999999 444 44444 22 444 2 1 9999 9 888888 5 999 3 333 5 3333 444 2222222222222222 8888 5 5 2 5 0 5 5 999999999999999999999999999999 5 2 11 55 88 88 77777 0 0 88 99999999999999999999999999999999999999999999999 9 55 8 55 8
consensus : GGGCTTGGGG-TAAA-AAGCT---GAGTGGAGTGGAGCGGANTGGATNTGGAGCGAGCG----------ACATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA-GCTA--G---------AT-GT-ATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTCA------A---NA------------T-AT----CTAC----------ATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAA-AT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA-----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-TAAATGTCA-G-T-TTAGA-A--ACACCAGAAG-AT-AGTA-TAT----AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAGG---------TGAA-C-T-TCA----AATTA--GG--GTATG---GA--A---CA--T--GAAAAG---AATGTTA-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTA--A-C-TC--------------GT-C-ATGC-TCATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT-N---------A--GC-N--GGATACA--G-CTG--ATACCTGA--TA------------T--------------G-CT--G--C-A-GTGACA-AA-T-CTTTCAAC-GC-TCTA--C-TT-----------------A----A---------CGT--TGG-TA-A-AGGGAAA-C-TCA-----------TTC-TA-G-----T---AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TC---------A--A-TTA-TTTT-TGC-----TGTCATATG-TATTAGATT-AGA-CAA--G--TGC-A-A--AA--A-GGC---AATACAAACAT----------T-GC---ACTGAGTT-CC--T---T-A-TACATTT-CGTA--NTTG-AATATA-G-----AG--GTA--------ACA---AA-----AATT--TT---G-C-AT----TTG-CA---CC-CAG-GAAATG---AAGGA---GAGAG-AA----T---GA------CCTT-TAT--ATG----TCAAC-A-AGAT-G-A-T-CAGCTA-------C--A-T--------------AA-ACATCACA-G--AC--T--A--GCTTTTGAA---TTTCACTCC-A--C--CCACT-T------------C-------CGC-CCATTCC----AC-TCCACT-CAGCT--T-TT--TA-CCCCAAGC
Reference ( gi|3 ) : GGGCTTGGGG-TAAA-AAGCT---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATTA-AT-CTG-AAATAGGCTGAAACAA-TCAAAA-GCTA--T---------AT-AT-ATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTCA------A---TA------------T-AT----CTAC----------ATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAA-AT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA-----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-TAAATGTCA-G-T-TTAGA-A--ACTTCAAAAA-AT-AGTA-TAT----AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG---------T----C-T-TCA-TT-AATT---GG--TTAT----GA--A---CA--T--GAAAAG---TATGTTA-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTA--A-C-T---------------GT-C-ATGC-TCATT--GTTTTTA--AAAG---TCCG-TT-A---------A--GC-T--GGATACA--G-CTG--ATACCTGA--TA------------T--------------G-CT--G--C-A-GTGACA-AA-T-CTTTCAAC-GC-TCTA--C-TT-----------------A----A---------CAT--TGG-TA-A-AGGGAAA-C-TCA-----------TTC-TA-A-----T---AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TC---------A--A-TTA-TTCT-TGT-----TGTCATATG-TATTAGATT-AG--CAA--G--TGC-A-A--AA--A-GGC---AATACAAAC------------T-GC---ACTGAGTT-CC--T---T-A-TACATTT-CGTA--TTTG-AATATA-G-----AG--GTA--------ACA---AA-----AATT--TT---G-C-AT----TTG-CA---TC-CAG-GAAATG---AAAGA---GAGAG-AA----T---GA------CCTT-TA---ATG----TCAAC-A-AGAT-G-A-T-CAGCTA-------C--A-T--------------AA-ACATCACA-G--AC--T--A--GCTTTTGAA---TTTC-CTCC-A--C--CCACT-T------------C-------CGC-CCATCCA----AT-TCCACT-CAGCT--T-TT--TA-CCCCAAGC
gi|4 : GGGCTTGGGG-TAAA-AAGCTGAGTGGAGTGGAGTTTACGATTAGATCTGAAACAAGCTATACCATAAAAAATTAGAT-GT----ATGGTCT-AATCAT-TCAAGATTCCA--T---------A--ATGATGA-------A---AAAA---CATA-T---TATCCT------A---CA------------T-GT------------------ATG--------T----GAC----A---A-GTGACTCTC-AA------CAGATTAAGGTAT-C-----------TGTTTTTAG--G
gi|2 : GGCTTGGGGGTAAATAAGCT---GAGTGGAGTGGAGCGGGCGGATTGTGGAGTGAGTG----------ACATTA-AT-CTGTGAATAGTCTAATACAATTCAAAA-GCTA--C---------A--A--ATG---------------------TA-T---TATTCAGG----A---T-------------T-AT----CTACATGT------ATG--------T----GACTCTGAT-CA-GTG--------------------TAAAA-AT--AAG-------GTTTCTTaaacaattaatctccctaggctgtcatctgatgctgtgatgatttgcaatgctagcgttagaaacatcaagatataatacatcaaactccttgctaactgtccaaattagggtgtgaaaatttgaaggaatgttaactcccaataaagtgaaactcatcattgccttattgtttttagaagtgtatttagtgaggatacagtcaaaattttgtttgctgcaaatgacaatcttttaacgctccaatttcaggttacaggtccccgctccctttaattctacagtatttaataacagagaattttttttttctgtcgcagagtagacaagtgaaacaaggcactgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacacacataggaaatgtgaggacgggagaatgactttatatgtcaacacaagtgatcggcatcacaagactaagctttcactctttgccccacactccattccattccactcagctttttaccccaa
gi|9 : GGCTGGGGG-TAAA-AAGCT---GAGTGGAATGGAGTGGAGTGGAATT--------------------ACATTA-AT-CTG-AAACAAGCT-ATACAA-TCAAAA-ATTA--G---------AT-GT-ATGA-------ACTAAATGC-TCATG-T--CTAATCA------A---Taaaaaaacaacaaataaacacaaaaacaaatgatttcctgtcataccaatactgccaattctaaatgtcatggttagaaacaccaggaagacgtatatattatgacttgaaacatcatttgataccgtccgtagtacgtactcattgaggagtgaaacatatgcaaattatgggtcatgagaacatgaaaaggaatgtatgactctccaattacaaagggagtgaaaattacaaaattaggtaactgttcatagtattatgtttttattgaagtccgattcagccggatacaggtgatacatgatatctatgcaagtgaaaaaatctttcaacgcatctacttttacattaatcattatgaacgttgataaggataacctcaattatagtttattccaaactggcagcagtctcccctttcatctattttaacaagaggtcaaattatttttttctgtcatatgtattagattagacaaggctgcaaaaaaggcaatacaaacatcgcacacagagttcctataatacaattcgtaattgaatatagaggcgtcaaatttttcattttactgtttgcacctgggaaatgaaagagagagaaatgactttatatgtcacaagattgccagctacagtaacaaatccaaaaacatcacagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctttttacccaagc
gi|27 : GGCTTGGGG-TAAA-AAGCT---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------ACATTG-AT-CTG-AAATAGGCT-AAACAT-TCAAAA-taagattcataatgatgataaacatatatgtgacctgtttttaggaacaaattaattcctagctgtcatatgatgctgtgttgatttgcaatgtcagtttagaaacatcaaagatataataatcaaactcacttgcctaactgtaaaattaggatgtgaaaatttgaaaggaatgttactcccaataaagagttgaaatatgatcatgctcattgtttttagaggatacagctgtcaaccagatatcaaaatttgtttgctgcaatgacaaatcttttaacgctccaattttaggcaggtccccagccccctttaatctacagtattttttgtgtcacagagtagacaagtgcaaaaaggcaatgtatatctctctctacacacacgcatatggaatgagggagggagaatgacctttatatgtcaacacggtgatcagcatcacagactatagctttcatctttcactccactccattcagctttttaccccaag
gi|6 : aGCTTGGGG-TAAA-AAGCT---
gi|12 : gaactaagtacccatatgtattcaagatatctacatgtgactctgacagtgatcttaacagattaaaaattgggtgggtttttttttttttttttttttacaaatgatttcctgtcatccaataatgtgccatttctagatgtcagttttagaaaacacagaagattgtattattatgactttgtataatcaaactgacttgtctgactcattgaagtcaactttcaattaggttatggaacatgaaaagaaatgttactcccaattacaaagggggtgaaatacaaattggtaactcgtcatgctcattgtttttaaaagatacggctgatacctgatatgctggagtgacaaatctttcaacgctctacttttacattggtaaagggaaacctcattctagtttcattccaaacatgaattctcccctttaatctattttaacacagacagaggtcaattatttttgctgtcatatgtattagattagacaagtgcaaaaagcaaaaatgcactgagttccttatacatttcgtatttgaatatagaggcaaggtaacaaaaatgttgcatttgcacccaggaaatgaaagagatgtcaacaagatgatcagctacatatttacaaatccaaaacatcgcagactagcttttgaatttcactccactccgctccattccattccactcGCTTGGGG-TAAA-AAGCT---
gi|17 : aactcgtcatgctcattgtttttaaaagtccgttaacatggttaagctggatacagctgacacctgatatgctgcagtgaaaaatctttcaacgctctacttttacattggtaaagggaaacctcattctagtacgagttctcccctttaatctattttaacacagacagaggtcaattattcttgttgtcatatatattagattagacaagtgcaaaaaaggcaatacaaacattgcactgagttccttaatacatttcgtatttgaatatagaagcaaggtaacaaaaattttgcatttgcatccaggaaatgaaagagagagaatgacgtttatgatcagctacataaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccactccgctccattccattccactcGCTTGGGG-TAAA-AAGCT---
gi|1 : tcattctagtacgagttctcccctttaatccaatgtaatctattttaacacagacagaggtcaattattcttgttgtcatatgcaaaaaaggcaatacaaacattgcactgagttccttatacatttcgtatttgaatatagaggcaaggtaacaaaaattttgcatttgcatccaggaaatgaaagagagagaattatatgtcaacaacatgatcagctacataaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattccattccactcCTTGGGG-TAAA-AAGCT---
gi|1 : ACATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA-GCTA--G---------AT-AT-ATGA-------ACTCAGTAC-CTATA-T--GTATTCA------A---TA------------TCAT----CTACATGT------ATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGT-TCTT-AA------CAGATTAAAA-ATACG-G-------GTTgagtggagtggagtgacattaatctgaaataggctaatacaatcaaaagctagatatatgaactcagtacctatatgtattcaatatcatctacatgtatgtgactctgacagtgttcttaacagattaaaaatacgggttaaaaaaaacaaacaaacaaaaacaaatgatttcctgtaaatccaatcactgtggccaacattctaaatgtcaagtttagacaacaccagaagatgagtatatatagtatatgactatttggaacaatcaaattgactaccacgcgtagtcagactcacccttgagtgaactatcaaaaattaggtatgagaacatcgaaaagaatgttactctcaattcaaagggaaatgaaatacaaactggtaactcgcgtcatgcttcattgtttttagaagtccgtttagtgcaggatacaacgctgatacctgatatgctgcagtgaaatcttcaacgctccgagctgaacaccttttatacaatgtaacatttgaaacgttagagaaaggataaccgagtcatacgtcagttttcattctcaaacagcagtttcttcccctttcatcgtttgttaacacacgaggcattattatttttctgtcatatggtattagattaagacaagtgcaaaataaggccaatacaaacatacgccactaatacacgagttcctatacatacatttcgtaaagttgaatataagagcggtcaaatttttaattttgacatttggcaccctggaaataaagaacgagagaataatgaccttttatgctcaacgaagatgtaacaaattccaagaaacataccagactagcttttgaatttcgctccagctaccacttccactcc
gi|18 : cttggggtaaaaagctgagtggagtggagtgACATCA-AT-CTG-CAATAGGCTAAGACAA-TCAAAA-GCTA--G---------AT-GT-ATGC-------ATTCAGTAC-CAATA-T--GTATTCA------A---GAT-----------T-AT----CTACATGTACATGTATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-GA------CATATTAAAA-AT---AT-------GTTTTaaaaaaaacaaacaaacaaaaacaaatgatttcctgtaaatccaatcactgtggccaacattctaaatgtcaagtttagacaacaccagaagatgagtatatatagtatatgactatttggaacaatcaaattgactaccacgcgtagtcagactcacccttgagtgaactatcaaaaattaggtatgagaacatcgaaaagaatgttactctcaattcaaagggaaatgaaatacaaactggtaactcgcgtcatgcttcattgtttttagaagtccgtttagtgcaggatacaacgctgatacctgatatgctgcagtgaaatcttcaacgctccgagctgaacaccttttatacaatgtaacatttgaaacgttagagaaaggataaccgagtcatacgtcagttttcattctcaaacagcagtttcttcccctttcatcgtttgttaacacacgaggcattattatttttctgtcatatggtattagattaagacaagtgcaaaataaggccaatacaaacatacgccactaatacacgagttcctatacatacatttcgtaaagttgaatataagagcggtcaaatttttaattttgacatttggcaccctggaaataaagaacgagagaataatgaccttttatgctcaacgaagatgtaacaaattccaagaaacataccagactagcttttgaatttcgctccagctaccacttccactcc
gi|8 : ggcttggggtaaaatgctgagtggagtgACATTA-AT-CTG-AAATAAGCTAATATAA-GCAAAA-TTTA--CAATATGTAGAT-GT-ATGA-------ACTAAGTAC-GCATA-TAAGTAATCAGGATTCA---TAATGATGACAAATT-AT----CTAC----------ATA--------T----A--TGTGAATCG-GTGA-TCTCAAA------AAGATCAAAA-AT-Cgatttcctgtcatccaatactgtgccaattctaaatgtcagtttagaaacaccagaagatagtatatagtatgactttgtataatcaaaccgacttgtctgactcattgaagtaaact
gi|20 : gggtaaaaagctgagtggagtggagtgACATTA-ATTCTGCAAATAGGCTAAGACAA-TCAAAA-GCTA--G---------ATTGT-ATGA-------A---------------T--GTATTCA------A---GA------------TGAT----CTAC----------ATGAATGTATGT----GACTCTGA--CATGTGA-TCTC-AA------CAGATTA-AA-AA-C-----------------TGG------------------TTTTTTTAAAAA-CAAATGACTTC-------T----GTCA-T-CCAAT-AACTGTG-CCAA--TTCCTAAATGTCA-G-T-TT-GA-A--ACtattaagaacaaatgatttcctgtgtcaaatttaaatgtcagtttagaaacaccaggagatattatgactttgtataatcaaactgacaattcattaagatgaactatcaaattagggtatgagaactttaaaagaatgctaatcccaattcagtgtgatgaaatataaattagaaatactgtttgcttcagtgactgatcttttaatgctctattttatgataccctcatccttgtttcattccaaaccggggttctctcctaagtccatttaacaaagagggaagttatttttttcaatctatcatatattaggttagacaagtgcaaaatttacactgatttagaggcaagttgacatcaattctgcatttgcacccaggaaatgaaggagggagaatgacccttatatgtcaacaaagtggtcatcacagactagcttttgactttcacttcactccactccacttcactccactcagctttttacccaaagc
gi|16 : ggcttggggtaaaaaaagctgagtggagtggaatggagtgACATTA-AT-CTA-AAATAGACT------A-CCAAAA-GCTAGATCG-------AT-GT-ATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTCA------A---GA------------TGAT----CTAC----------ATG--------TATGTGACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTTAAA-AT-a
gi|28 : gagacttggagtaaaaaggtgagtggagtggagtaACATCG-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA-GTTA--G---------A--GT-ATGA-------atgtgtcttaaaaacaaatgatttcctgtcgtccaataatgtgttaattctaaatgtcagtttataaacaccagaagatagtatagaagtgaactacatgtatcaaattagggtatgagaacatgaaaagagtgttactccc
gi|4 : ctggttggagtagagcggtatggagggATTAGAT-CTG-AAACAAGCT-ATACCA-TAAAAA-ATTA--G---------AT-GT-ATGGTCTAATCATTCAAGATTCCATAAT--G-ATGAA------AAAACA------------T-ATTATCCTAC----------ATG--------T----A--TGTGA--CAAGTGACTCTC-AA------C-------AG-AT-TAAG-------GTATCT------GTTTTT-----------------AGGAAACAATTAATCTCCCTAGGCT----GTCA-T-CTGAT-G-CTGTG-ATGA--TTT-GCAATGCTA-G-CGTTAGA-A--ACATCAAGAT-AT-AATA-CAT------------------------------CAAACTC-C-T--------T-G-CTA--------ACT----------G---------T----C----CA----AATTA--GG--GTGT----GA--A---AA--TTTGAAG-G---AATGTTAACTC-CCAAT----AAA-----G-TGAAA--CTCA--------TC--A-T-T---------------GC------C-TTATT--GTTTTTA--GAAG---TGTA-TT-T---------A--G--TGAGGATACA--G-TCA--AAATTTTG--TT------------T--------------G-CT--G--CAA-ATGAC--AA-T-CTTTTAAC-GC-TCCA--A-TT----------------------T---------CA----GGTTA-C-AGG-------TC------------------------------C-----C-----------C-------GC--T--CC-----------C--TTT-----------AATTCTACAGTATTTAATA--AC-AG---AG----A---------------------A-TTTT-TTT-----TTTC---TG-TCGCAGAGT-AGA-CAA--G--TGA-A-A--CA--A-GGC---A
gi|6 : gggcttggggtaaaaagctgagtggagtggagtttacgGA-------ACTAAGTAC-CCATA-T--GTATTCA------A---GA------------T-AT----CTAC----------ATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGA-TCTT-AA------CAGATTAAAA-AT-TGGG--------------TGG--GTTTT-TTTTTTTTTTTTTTTTTA-----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-ATGTG-CCAT--TTC-TAGATGTCA-GTT-TTAGA-A--AACACAGAAG-AT-TGTA-T-T----AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG---------TCAA-C-T-T---TC-AATTA--GG--TTATG---GA--A---CA--T--GAAAAGA--AATGTTA-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTA--A-C-TC--------------GT-C-ATGC-TCATT--GTTTTTA--AAA--------------------------------GATACG--G-CTG--ATACCTGA--TA------------T--------------G-CT--G--G-A-GTGACA-AA-T-CTTTCAAC-GC-TCTA--CTTT-----------------T----A---------CAT--TGG-TA-A-AGGGAAACC-TCA-----------TTC-TA-G-----TTTCAT-----TCCAAACATGAAT-------TC--TC-CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---AC-AG-ACAG----AGG-TC---------A--A-TTA-TTTT-TGC-----TGTCATATG-TATTAGATT-AGA-CAA--G--TGC-A-A--AA--A--GC---AA---AAA-------------T-GC---ACTGAGTT-CC--T---T-A-TACATTT-CGTA--TTTG-AATATA-GAGGCAAG--GTA--------ACA---AA-----AATG--TT---G-C-AT----TTG-CA---CC-CAG-GAAATG---AAAGA---G---------------------------------ATG----TCAAC-A-AGAT-G-A-T-CAGCTA-------C--A-TATTTACAAATCCA-AA-ACATCGCA-G--AC--T--A--GCTTTTGAA---TTTCACTCC-A--C--------T------------C-------CGCTCCATTCC----AT-TCCACT-CAGCT--T-TT--TA-CCCCAAGCctgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacacacataggaaatgtgaggacgggagaatgactttatatgtcaacacaagtgatcggcatcacaagactaagctttcactctttgccccacactccattccattccactcagctttttaccccaa
gi|26 : A------A---TA------------T-AT----GTAC----------GTG-----------------CTGA--CA-GGGA-TTTC-AGTAGCAGCAGGTCAAAA-AT-C-AGCATTTTTGTTTGTTTGGTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
gi|7 : TGA-TCTC-AA------CAGATTAAAA-AT-C--T-------GTTTT
gi|5 : TTAAGA-AT-CG----------TGTTTTTGG--GGTGTTCGTTTTTGTTTTTT---------CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTCTTAAATGTCA-G-T-TTAGA-A--ACTTCAGAAACAT-AGTATTATATTGAT----TATGTACT--TTGTA-TAATCAAGATGACAT--------T-GT-TG--------ACTCA---TTGAGG---------T----CAT-TCT-TTCAATT---AGGTTTATGAGAGA--A---C---T--GAAAAG---TATGTTA-CT--CCAATATAC-AAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTA--A-C-TTCAC-----------GT-CAATGC-TCA-T--GTTTTTA--AAAAGCTTCCG-TTAA---------A--GCTT--GGATACA--G-CTG--ATACCTGA--TA------------T--------------G-CT--G--C-A-GTGCCAGAA-TCCTTTCAAC-GC-TCTA--C-TT-----------------AAATTA---------CAT--TGG-TACA-AGGAAAA-C-TCA-----------TTCATA-A-----T---ACGAG--T-----------T-------TC--C--CC-----------C--TTT------------A-TCTTT----TTT--CA--CC-AG-GCAG----AGG-TC---------A--A-TTA-TTCT-TGC-------TCATATG-TTTAAGATT-AGA-CAAATG--TGC-A-AACAA--A-GGCATTAATACAAACAT----------T-GC---AC-GAGTT-CCCTT---T-A-TACATTTCCGTA--TTTG-AGTATA-G-----AG--GCAAGGTAATCACA---CA-----AATT--TT---G-C-ATGTA-TTG-CAGACTCACAGCGAAATGAAAAAAGA---GAGAG-AA----G---AA------CCTT-TCTT-ATATCGTTCAACAA-AGATCA-A-TGCAGCTA-------C--A-T--------------CATACATCACA-G--AC--T--A--GCTTTTGAA---TTCCACTCC-A--C--CTAA---------------C-------CGCTCCATTCC----AT-TCCAGC-AGGCT--T-TT--TA-CCCCAAgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactttatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|9 : TTTTTAGGAA-CAAATTAATTCC------TAGCTGTCA-T-ATGAT-G-CTGTG-TTGA--TTT-GCAATGTCA-G-T-TTAGA-A--ACATCAAAGA---------TAT----A-------------------A-TAATCAAACTCAC-T--------T-GCCTA--------ACT-----GTAAA---------------------A-TT-A------GG--ATGT----GA--A---AATTT--GAAAGG---AATGTTA-CTC-CCAAT-----AAA-GAGT-TGAAA--TATGA--------------------------------T-C-ATGC-TCATT--GTTTTTA--GA--------------------------------GGATACA--G-CTGTCA-ACCAGA--TATCAAAATTTGTTT--------------G-CT--G--C-A-ATGACA-AA-T-CTTTTAAC-GC-TCCA--A-TT----------------------------------T--T--------AGGCAGG-T-CC--------------C-CA-G-------------------------------------C--C--CC-----------C--TTT-----------AA-TCT---------------AC-AG------------------------------TA-TTTT-TTG-----TGTCA--------CAGAGT-AGA-CAA--G--TGC-A-A--AA--A-GGC---AAT
gi|2 : ggctgggggtaaaaagctgagtggaatggagtggagtggaattacattaatctgaaacaagctatacaatcaaaaattagatgtatgaactaaatgctcatgtctaatcaattaagattcataatgatgataaacatatatgtgacctgA-----CAAATGATTTCC------T----GTCA-TACCAAT-A-CTG---CCAA--TTC-TAAATGTCATG-G-TTAGA-A--ACACCAGGAA-GA-CGTA-TAT----AT----TATG-ACT--T-GAA-ACATCAT-TTGATAC--------C-GTCCGTAGTACGTACTCA---TTGAGGAGTGAAACAT----A-T-GCA----AATTATGGG--TCAT----GAGAA---CA--T--GAAAAGGAATGTATGA-CTCTCCAAT-TACAAAG-GGAG-TGAAAATTACAAAATTAGGTA--A-C-T---------------GTTC-ATAG-T-ATTATGTTTTTATTGAAG---TCCGATT-C---------A--GC-C--GGATACA--G-GTG--ATACATGA--TA------------T----------------CTATG--C-AAGTGAAA-AAAT-CTTTCAAC-GCATCTA--C-TTTTACATTAATCATTATGA----A---------CGT--TGA-TA-A-GGATAAC-C-TCAATTATAGTTTATTC-CA-A---------AC-----T-----------GGCAGCAGTC--T--CC-----------CC-TTT-----------CA-TCTAT----TTTAACA--A--------G----AGG-TC---------A--AATTA-TTTT-TTTC----TGTCATATG-TATTAGATT-AGA-CAA--GGCTGC-A-A--AA--AAGGC---AATACAAACATCG--------C-AC---ACAGAGTT-CC--TA--T-AATACAATT-CGTA--ATTG-AATATA-G-----AG--GCG--------TCA---AATTTTTCATT--TT---A-CTGT----TTG-CA---CC-TGG-GAAATG---AAAGA---GAGAGAAA----T---GA-------CTT-TAT--ATG----TC-AC-A-AGAT-T-G-C-CAGCTA-------C--AGTAACAAATCCAA---AA-ACATCACA-G--AC--T-------T-----N---NNNN-NNNN-N--N--NNNNN-N------------N-------NNN-NNNNNNN----NN-NNNNNN-NNGCT--T-TT--TA--CCCAAGCgtatatctctctctacacacacgcatatggaatgagggagggagaatgacctttatatgtcaacacggtgatcagcatcacagactatagctttcatctttcactccactccattcagctttttaccccaag
gi|1 : ggcttgggggtaaataagctgagtggagtggagcgggcggattgtggagtgagtgacattaatctgtgaatagtctaatacaattcaaaagctacaaatgtattattcaggattatctacatgtatgtgactctgatcagtgtaaaaataaggtttcttaaaaaaacaacaaataaacacaaaaA-----CAAATGATTTCC------T----GTAAAT-CCAATCA-CTGTGGCCAACATTC-TAAATGTCAAG-T-TTAGACA--ACACCAGAAG-ATGAGTA-TAT----ATAGTATATG-ACTATTTGGAACAATCAAATTGAC-TACCACGCGTAGTCAG--------ACTCACCCTTGA-G---------TGAA-C-TATCA-AA-AATT---AG--GTAT----GAGAA---CA--TC-GAAAAG---AATGTTA-CTC-TCAAT-T-CAAAG-GGAAATGAAA--TACAAA-CT-GGTA--A-C-TCGC------------GT-C-ATGCTTCATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT-T---------AGTGC-A--GGATACAACG-CTG--ATACCTGA--TA------------T--------------G-CT--G--C-A-GTG--A-AA-T-C-TTCAAC-GC-TC
gi|8 : cttggggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataggctaatacaatcaaaagctagatatatgaactcagtacctatatgtattcaatatcatctacatgtatgtgactctgacagtgttcttaacagattaaaaatacgggttaaaaaaaacaaacaaacaaaaA-----CAAATGATTTCC------T----GT-----------------G-TCAA--ATT-TAAATGTCA-G-T-TTAGA-A--ACACCAGGAG-AT-A------------T----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC----------------A--------ATTCA---TTAAGA---------TGAA-C-TATCA----AATTA--GG--GTATGA--GA--A---CT--T--TAAAAG---AATGCTA-ATC-CCAAT-T-C--AGTGTGA-TGAAA--TATAAA-TT-AGAAATA-C-T---------------GT-T--TGC-Tcgagctgaacaccttttatacaatgtaacatttgaaacgttagagaaaggataaccgagtcatacgtcagttttcattctcaaacagcagtttcttcccctttcatcgtttgttaacacacgaggcattattatttttctgtcatatggtattagattaagacaagtgcaaaataaggccaatacaaacatacgccactaatacacgagttcctatacatacatttcgtaaagttgaatataagagcggtcaaatttttaattttgacatttggcaccctggaaataaagaacgagagaataatgaccttttatgctcaacgaagatgtaacaaattccaagaaacataccagactagcttttgaatttcgctccagctaccacttccactcc
gi|16 : gggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataagctaatataagcaaaatttacaatatgtagatgtatgaactaagtacgcatataagtaatcaggattcataatgatgacaaattatctacatatatgtgaatcggtgatctcaaaaagatcaaaaatctattaagaA-----CAAATGATTTCC------T----GTCG-T-CCAAT-A-ATGTG-TTAA--TTC-TAAATGTCA-G-T-TTATA-A--ACACCAGAAG-AT-AGTA-TAtcagtgactgatcttttaatgctctattttatgataccctcatccttgtttcattccaaaccggggttctctcctaagtccatttaacaaagagggaagttatttttttcaatctatcatatattaggttagacaagtgcaaaatttacactgatttagaggcaagttgacatcaattctgcatttgcacccaggaaatgaaggagggagaatgacccttatatgtcaacaaagtggtcatcacagactagcttttgactttcacttcactccactccacttcactccactcagctttttacccaaagc
gi|23 : gagacttggagtaaaaaggtgagtggagtggagtaacattaatctaaaatagactaccaaaagctagatcgatgtatgaactcagtacccatatgtattcaagatgatctacatgtatgtgactctgacagtgatctcaacagatttaaaatatgtgtcttaaaa-----CAAATGATTTTC------T----GTAA-C-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-TAAATGTCA-G-T-TTgaagtgaactacatgtatcaaattagggtatgagaacatgaaaagagtgttactccc
gi|7 : agtgttcttaacatattaaaaatatgggttaaaaaaacaaccccaaaaaccaaacaaaacTGACTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-ATGTG-TCAA--TTT-TAAATGTCA-G-A-TTAGA-ATTAC--CAGAAG-AT-AGTA-TAT----AT----TTTG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------AATCA---TTGAAG---------TGAA-C-TACCA----AATTA--GG--GTATGA--GA--A---CA--T--GAAAAG---AATGTTA-CTC-TCAAT-CACAAAG-GAGA-TGAAA--TACAAA-TT-AGCA--A-C-TCNNNNNNNNNNNNNNNN-N-NNNN-NNNNN--NNNNNNN--NNNN---NNNN-NN-N---------N--NN-N--NNNNNNN--N-NNN--NNNNNTGA--TA------------T--------------G-CT--G--C-A-GTGACA-AA-T-CTTTCAAC-GC-CCTA--C-TT-----------------
gi|18 : tgatctcaacagattaaaaatctgtttTGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-TAAATGTCA-G-T-TTAGA-A--ACACCAGAAG-AT-AGTA-TAT----AG----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACCGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG---------T----tatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|13 : ggcttggggtaaaatgctgagtggagtgacatcaatctgcaataggctaagacaatcaaaagctagatgtatgcattcagtaccaatatgtattcaagattatctacatgtacatgtatgtgactctgacagtgatctcgacatattaaaaatatgtttAG-AT-ATTA-TAT----AT----TATG-ATT--TTTAA-TAATCAAAATAAC-T--------T-GTCTG--------ATTCA---TTGAGG---------TGAACC-A-TCA----AATTA--GG--GTATGG--GA--A---CA--T--GAAAAG---AATGTTA-CTC-CCAAT-TACAAAG-G---------------AA-TT-TGTA--A-CTT---------------GC-C-ATGC-TCATT--GTTTTTA--AAAG---GCCG-TC-AC--------A--GC-A--GGATATT--GCCTG--ATATCAAATTTACTGCT-------T--------------G-CT--G--C-A-GTGACA-AA-T-CTTTTAAT-GC-TCTA--C-TTTTACATTAACATGTG--A----A---------CGT--TAG-TA-A-AGGATAA-CTTCA-----------TAC-TA-G----------------T-----------T-------TCATT--CCAAACAGGAGTTC--TTC------------A-TCTA-----TTTAAC---AC-AG---AG----AGG-TTTTTTTGCTGG--A-TTAGCTCTGTGC-----TGTTATATG-Taaact
gi|11 : -GTCTG--------ACTCA---TTGAAG---------T----G-A-ACAACC-AATT---GG--T-AT----GAGAA---CA--TT-GAAAA-----AAGTTAACTC-TCAAT-TACAA-G-GAGA-TGAA---TACAAA-TT-GGTA--AAC-TCGTCA----------GT-C-ATGC-TCATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TTTC---------A--GC-A--GGATACA--G------A-GCTTGA--T----------------------------G-CT--G--C-AAGTGACA-AA-T-CTTTCAAC-GC-TCTA--C-TTG----------------A----A---------CGT--TGG-TA-A-AGC---A-T-TTG-----------TAC-TAGA-----T---GA-----G-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA---------CAG----AGG-TC---------A--A-TTA-TTCT-TGC-----TGTCATATG-CA-------------AA--A--TGCAA-A--AA--A-GGC---AAAACAAAC------------
gi|10 : -AATTA--GG--GTAT----GA--AGAACA--T--GCAAAG---AATGTTA-CTC-TTAAT-TACAAAG-GAGA-TGAAA--TACAAA-TT-GGTA--A-C-TC--------------GT-C-ATGC-CCATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGTTT-C---------A--GC-A--GGATACA--G-CTG--ACACCTGA--TA------------T--------------GCCT--GGCC-A-GTGACA-AA-T-CTTTCAACGGC-TTTAAGC-TTTTTACATTAACATGTGAA----A---------CGT--TGG-TA-ACAGGGAAACC-TCA-----------TAC-TA-G-----TTTCAT-----TCCAAACGCAG-T-------TC--T--CC-----------CATTTT-----------AA-T-TAT----TTTAACACGAT-GGAACAG----AGGTTC---------A--A-TTA-TTCT-TGC-----TGTCATGTG-TATTAGATTAAA--CAA--G--TGC-A-A--AA--A-GAC---AA-ATGATA------------T-GCAGGACTGAGTTCCC--T---T-A-TACATTT-CATA--ATTGCAATATA-G-----AG----A--------GCA---AA-----GA----TT---GAC-AC----AAA-TA---TT-------AATG---AATCA----ACAG--A----T---GA------TC----AGC-ATG----AC-AT-A-AG-T-A-A-C-CAA-TC-------C--A----------------AA-ACATAATA-GAAAT--TGCG--GCTTTTGAA---TTTCACTCC-ACTC--CCATT-----------------------G---CATTCA----CTGTCCACTCCAGCT--T-TT--TA-CCCCAAGatcgaggcaagatgacaaatattttgcatttgcacccaggaaatgaaagagaaaatgaccttatatatatgtcaacaagatcagctacatatgtaacaaatccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccgctttttacccca
gi|16 : -AATTA--GG--GTAT----GAGAA---CA--T--GAAAAG---AGTGTTA-CTC-CC
gi|25 : gagacttggagtaaaaaggtgagtggagtggagtaacattaatctaaaatagactaccaaaagctagatcgatgtatgaactcagtacccatatgtattcaagatgatctacatgtatgtgactctgacagtgatctcaacagatttaaaatatgtgtcttaaaaacaaatgatttcctgtcgtccaataatgtgttaattctaaatgtcagtttataaacaccagaagatagtatagaagtgaactacatgtatcaCAAT-TCCAAAG-G---------------AA-TT-GGTA--A-C-TC--------------GT-C-ATGC-TCATT--ATTTTGA--GAAG---GCTG-TC-GC--------A--GC-A--GGATATT--G-CTG--
gi|12 : tagaatatgggaactttaaagA--A-C-TC--------------GT-C-ATGC-TCATT--GTTTTTA--AAAG---TCCG-TT-AACATGGTTAA--GC-T--GGATACA--G-CTG--ACACCTGA--TA------------T--------------G-CT--G--C-A-GTGAAA-AA-T-CTTTCAAC-GC-TCTA--CTTT-----------------T----A---------CAT--TGG-TA-A-AGGGAAACC-TCA-----------TTC-TA-G-----T---ACGA---G-----------T-------TC--TC-CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---AC-AG-ACAG----AGG-TC---------A--A-TTA-TTCT-TGT-----TGTCATATA-TATTAGATT-AGA-CAA--G--TGCAA-A--AA--A-GGC---AATACAAACAT----------T-GC---ACTGAGTT-CC--T---TAA-TACATTT-CGTA--TTTG-AATATA-GAAGCAAG--GTA--------ACA---AA-----AATT--TT---G-C-AT----TTG-CA---TC-CAG-GAAATG---AAAGA---GAGAG-AA----T---GA------CGTT-T---------------------AT-G-A-T-CAGCTA-------C--A-T--------------AA-ACATCACA-G--AC--T--A--GCTTTTGAA---TTTCACTCC-A--CT-CCAC--T------------C-------CGCTCCATTCC----AT-TCCACT-CAGCT--T-TT--TA-CCCCAAGCtctatatatcaa
gi|15 : --GGACACA--G-CTG--ATACCTGA--TA------------TCATATTTACTGCTTG-CT--A--C-A-GTGACA-AA-T-CTTTCAAA-GC-TCT---T-TT-----------------A----A---------CA
gi|8 : ttgtttcaactgaaca------------T--------------G-CT--T--C-A-GTGACT-GA-T-CTTTTAAT-GC-TCTA--T-TT-----------------T----ATGATACCCTCATCCTTG-T------------T-TCA-----------TTC-CA-A---------AC-----CGGGG-------T-------TC--T--CT-----------C--CTA-----------AG-TCCAT----TT-AACA--A-------AG----AGG-GA---------A--G-TTA-TTTT-TTTCAATCTATCATAT---ATTAGGTT-AGA-CAA--G--T---------------GC---AA---AATT------------T-AC---ACTGA------------------------------TTTA-GAGGCA-------AG--TTG--------ACA---TC-----AATT--CT---G-C-AT----TTG-CA---CC-CAG-GAAATG---AAGGA---GGGAG-AA----T---GA------CCCT-TAT--ATG----TCAAC-A-AAGT-G-G-T--------------------------------------CATCACA-G--AC--T--A--GCTTTTGAC---TTTCACTTC-A--CT-CCAC--T------------C-------CAC-T--TC------AC-TCCACT-CAGCT--T-TT--TA-CCCAAAGCcagatagctctaggtcaattatttttgttgtcatatgtataagattagacaagtgcacaaaaggcaatacaaacatagcaccaagttccttatacatttcgaaattgaatatagaggcaagtgcatttgcaaccagaaaatgaaagagagagtgtcaacaagatgatcagctacatatcaacaaatccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccactcagctttttacccca
gi|31 : gggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataagctaatataagcaaaatttacaatatgtagatgtatgaactaagtacgcatataagtaatcaggattcataatgatgacaaattatctacatatatgtgaatcggtgatctcaaaaagatcaaaaatctattaagaacaaatgatttcctgtgtcaaatttaaatgtcagtttagaaacaccaggagatattatgactttgtataatcaaactgacaattcattaagatgaactatcaaattagggtatgagaactttaaaagaatgctaatcccaattcagtgtgatgaaatataaattagaaatactgtt-----------------A----A---------CGT--TGG-TA-A-AGGATAA-CTTCA-----------TTC-TA-G-----T---
gi|7 : A-A-CGGGAAA-C-TCA-----------GAC-TA-AGTTAGC---ACCAACAT-----------TGAG----TA--T--CC-----------C--TTTT----------AA-TCTAT----TTTAACC--AC-CG-AC------AGG-CC---------A--A-Tttcattcca
gi|17 : tgatctcaacagattaaaaatctgttttgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactttatctatctaattgagcgat-TCA-----------TTC-TA-G-----T---AC-----GAG---------T-------TC--T--CC-----------C--CTTTAATCCAATGTAA-TCTAT----TTTAACA---C-AG-ACAG----AGG-TC---------A--A-TTA-TTCT-TGT-----TGTCATATG-CA------------------------A-A--AA--A-GGC---AATACAAACAT----------T-GC---ACTGAGTT-CC--T---T-A-TACATTT-CGTA--TTTG-AATATA-GAGGCAAG--GTA--------ACA---AA-----AATT--TT---G-C-AT----TTG-CA---TC-CAG-GAAATG---AAAGA---GAGAG-AA----T---TA------T---------ATG----TCAAC-A-ACAT-G-A-T-CAGCTA-------C--A-T--------------AA-ACATCACA-G--AC--T--A--GCTTTTGAA---TTTCACTCC-A--C-------------------------------T-CCATTCC----AT-TCCACT-CAGCT--T-TT--TA-CCCCAAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|1 : -TCA-----------TTC-TC-A-----A---ACAGCAGT-----------T-------TC--TTCCC-----------C--TTT-----------CA-TCG------TTTGTTA--AC-AC-AC-G----AGG--C---------ATTA-TTA-TTTT-T-C-----TGTCATATGGTATTAGATT-AAGACAA--G--TGC-A-A--AATAA-GGCC--AATACAAACATACGCCACTAAT-AC---AC-GAGTT-CC--TATAC-A-TACATTT-CGTAAAGTTG-AATATAAG-----AGCGGT----------CA---AATTTTTAATT--TT---GAC-AT----TTGGCA---CC-CTG-GAAAT----AAAGAAC-GAGAG-AA----TAATGA------CCTT-TT---ATGC---TCAACGA-AGAT-GTA-A-CAAATT-------CCAA-G--------------AA-ACATACCA-G--AC--T--A--GCTTTTGAA---TTTCGCTCC-AG-CTACCACT-T------------C-------CAC-TC
gi|19 : cttggggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataggctaatacaatcaaaagctagatatatgaactcagtacctatatgtattcaatatcatctacatgtatgtgactctgacagtgttcttaacagattaaaaatacgggttaaaaaaaacaaacaaacaaaaacaaatgatttcctgtaaatccaatcactgtggccaacattctaaatgtcaagtttagacaacaccagaagatgagtatatatagtatatgactatttggaacaatcaaattgactaccacgcgtagtcagactcacccttgagtgaactatcaaaaattaggtatgagaacatcgaaaagaatgttactctcaattcaaagggaaatgaaatacaaactggtaactcgcgtcatgcttcattgtttttagaagtccgtttagtgcaggatacaacgctgatacctgatatgctgcagtgaaatcttcaacgctccgagctgaacaccttttatacaatgtaacatttgaaacgttagagaaaggataaccgagtcatacgtcagtttC--T--CC-----------CA-TTT-----------AA-TCTAT----TT---------------------AGG-TC---------A-----------T-T-T-----TGTCA-------------------CAC--G--TGC-A-T--AA--A-GGC---AATGCTATA------------T-G------TGAGCA-----------A-AACATTT----------A-AATATA-G-----AG--GGA--------GGG---GC-----AATT--TG---A-C-ATCAATTTG-CA---CA-CGT-GGAATG---AAGGA---GGGAG-AATGAAT---GA------CCTT-CT---AT-------AAC-A-AGGT-G-A-T-CAACTAACAAATGC--A----------------AA-ACATCACT-G--ACCAT--A--TCTTTTGCA---TTTCACTCTAA--A--CCAC--T------------C-------CACTCCACTTC----AC-TCCACT-CAGCA--T-TT--AA-CTCCAAGCc
gi|24 : C--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTACAGTATTTAAT---------ACAG----AG-------------A--A-TTT-TTTT-TTTC----TGTCA--------CAGAGT-AGA-CAA--GA-TGC-A-A--AA--A-GGC---AATc
gi|15 : acgctccaatttcaggcaggtccccag-----------C--TTTCA---------AA-GCTCT----TTTAACA---C-AG-ATAGCTCTAGG-TC---------A--A-TTA-TTTT-TGT-----TGTCATATG-TATAAGATT-AGA-CAA--G--TGC-ACA--AA--A-GGC---AATACAAACA-----------TAGC---ACCAAGTT-CC--T---T-A-TACATTT-CGAA--ATTG-AATATA-G-----AG--G-----------CA---AG------------T---G-C-AT----TTG-CA---AC-CAG-AAAATG---AAAGA---GAGAG------------------------------TG----TCAAC-A-AGAT-G-A-T-CAGCTA-------C--A-TATCAACAAATCCA-AA-ACATCACA-G--AC--T--A--GCTTTTGAA---TTTCACTCC-A--C-----------------------------------------------TCCACT-CAGCT--T-TT--TA-CCCCAgt
gi|14 : ttgtttcaactgaacaggacacagctgatacctgatatcatatttactgcttgctacagtgacaaat-----------C--TTT-----------AA-T-TAT----ATCAACA--GCTAT-A-AA----AAG-T----------A--A-TT---TTT-TCC-----TGCCAAGTA--ATTAGATT-AGA-CAA--G--TGC-A-A--AA--A-G-C---AATGTAAAC------------A-GC---A-TGAGTT-TC--------A--ACATAT-CGTA--AGGA-AATATA-G-----AA--GCA---------CGTTGAA-----AATCAATTCGCG-C-AT----TT--CA------CAA-GAAATG---AAGGATGCGATGG-AA----T---GAATGACGCCTT-CATT-ATG----TCAACTA-ACAT-A-AAT-C------------C--G-A--------------AA-ACATCACA-G---C--T--ATAGCGTTTGAA---TACA-CTCCAA--T--CCACT--------------------------CCACCCA----CT------T-CAGCT--T-TTTATA-CCCCA
gi|7 : cactttaacatgaatgtttgtaatatagggaccctctactgtgtagtaagtt--CAA--G--TGC-A-A--AA--AAGGC---AACACAAACAT----------T-GC---CCTAACTT-CC--T---T-A-TACATTT-TGTA--ATTG-AATATA-G-----AG--G-----------CA---AG-----A------T---G---AT----TTG-CT---CC-CAG-GAAATG---AAAGA---GAGAG-AA----T---GA------CCTT-TAT--ATG----TCAAC-A-AGAT-GTA-A-CAAGTC-------C--A----------------AA-ACATCACA-G--AC--T--A--GCTTTTGAA---TTTCACTCC-A--C-----------------------------------------------TCCATT-CAGTT--T-TT--TA-CACCAAGgc
gi|11 : tgatctcaacagattaaaaatctgttttgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactttatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna-----AG--ATG--------ACA---AA-----TATT--TT---G-C-AT----TTG-CA---CC-CAG-GAAATG---AA--A---GAGAA-AA----T---GA------CCTTATATATATG----TCAAC-A-A----G-A-T-CAGCTA-------C--A-TATGTAACAAATCCAAA-ACATCACA-G--AC--T--A--GCTTTTGAA---TTTCACTCC-A--CT-CCGCT-T------------
gi|9 : gtctgactcattgaagtgaacaaccaattggtatgagaacattgaaaaaagttaactctcaattacaaggagatgaatacaaattggtaaactcgtcagtcatgctcattgtttttagaagtccgtttcagcaggatacagagcttgatgctgcaagtgacaaatctttcaacgctctacttgaacgttggtaaagcatttgtactagatgagttctccctttaatctattttaacacagaggtcaattattcttgctgtcatatgcaaaatgcaaaaaaggcaaaacaaacatcgaggcaG-CA---T---AT-GGAATG---AGGGA---GGGAG-AA----T---GA------CCTT-TAT--ATG----TCAAC-A-CGGT-G-A-T-CAG----------------------------------CATCACA-G--ACTAT--A--GCTTTCA-------TC-TTTC-A--C--------T------------C-------CAC---------------TCCATT-CAGCT--T-TT--TA-CCCCAAGtttacccca
gi|21 : ggctgggggtaaaaagctgagtggaatggagtggagtggaattacattaatctgaaacaagctatacaatcaaaaattagatgtatgaactaaatgctcatgtctaatcaattaagattcataatgatgataaacatatatgtgacctgtttttaggaacaaattaattcctagctgtcatatgatgctgtgttgatttgcaatgtcagtttagaaacatcaaagatataataatcaaactcacttgcctaactgtaaaattaggatgtgaaaatttgaaaggaatgttactcccaataaagagttgaaatatgatcatgctcattgtttttagaggatacagctgtcaaccagatatcaaaatttgtttgctgcaatgacaaatcttttaacgctccaattttaggcaggtccccagccccctttaatctacagtattttttgtgtcacagagtagacaagtgcaaaaaggcaatgtatatctctctctacacacac-CAT-GAAACG---AAGGA---GGGAG-AG----T---GA------CCTT-TAT--ATG----TCAAC-A-CGGT-G-A-T-CGGCTAATAAACCC--A----------------AA-ACATCAAA-G--AC--T--A--GCGTTCA-------TC-CTTC-G--CT-CCACT-T------------C-------
gi|4 : tctctttatctctctcgttctctctctccacacacaAG-GAAATGT--GAGGAC--GGGAG-AA----T---GA------C-TT-TAT--ATG----TCAAC-ACAAGT-G-A-T-CGGC----------------------------------ATCACAAG--AC--T--AA-GCTTTC--ACTCTTTG-CCCC-A--C----ACT--------------------------CCATTCC----AT-TCCACT-CAGCT--T-TT--TA-CCCCAA
gi|20 : gggcttggggtaaaaagctgagtggagtggagtttacgattagatctgaaacaagctataccataaaaaattagatgtatggtctaatcattcaagattccataatgatgaaaaaacatattatcctacatgtatgtgacaagtgactctcaacagattaaggtatctgtttttaggaaacaattaatctccctaggctgtcatctgatgctgtgatgatttgcaatgctagcgttagaaacatcaagatataatacatcaaactccttgctaactgtccaaattagggtgtgaaaatttgaaggaatgttaactcccaataaagtgaaactcatcattgccttattgtttttagaagtgtatttagtgaggatacagtcaaaattttgtttgctgcaaatgacaatcttttaacgctccaatttcaggttacaggtccccgctccctttaattctacagtatttaataacagagaattttttttttctgtcgcagagtagacaagtgaaacaaggcactgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacacacatCAT-ACA-A--TC--T--A--GCTTTTGA----TTGT-CTTA-G--C--CTATT-TGCAGAATTAATGT-------CACTCCATTCC----AC-TCCACT-CAGCTTTT-TT--TA-CCCCAAGC
gi|2 : gTCACA-G--AT--T--A----------A---TGTC-ACTC-A--CT-CCACAAT------------C-------CGC-CCGCTCC----AC-TCCACT-CAGCT--TATT--TACCCCCAAGCaatgtattcaagatgatctacatgaatgtatgtgactctgacatgtgatctcaacagattaaaaactggtttttttaaaaacaaatgacttctgtcatccaataactgtgccaattcctaaatgtcagtttgaaaca
gi|1 : gC--T--A--GCTTTTGA----TTGT-ATTA-G--C--CTATT-T------------CAGATTAATGT-CACTCCA-----C-TCCACT-CAGCT--T-TT--TA-CCCCAAGatagtctaatacaattcaaaagctacaaatgtattattcaggattatctacatgtatgtgactctgatcagtgtaaaaataaggtttcttaaaaaaacaacaaataaacacaaaaacaaatgatttcctgtcataccaatactgccaattctaaatgtcatggttagaaacaccaggaagacgtatatattatgacttgaaacatcatttgataccgtccgtagtacgtactcattgaggagtgaaacatatgcaaattatgggtcatgagaacatgaaaaggaatgtatgactctccaattacaaagggagtgaaaattacaaaattaggtaactgttcatagtattatgtttttattgaagtccgattcagccggatacaggtgatacatgatatctatgcaagtgaaaaaatctttcaacgcatctacttttacattaatcattatgaacgttgataaggataacctcaattatagtttattccaaactggcagcagtctcccctttcatctattttaacaagaggtcaaattatttttttctgtcatatgtattagattagacaaggctgcaaaaaaggcaatacaaacatcgcacacagagttcctataatacaattcgtaattgaatatagaggcgtcaaatttttcattttactgtttgcacctgggaaatgaaagagagagaaatgactttatatgtcacaagattgccagctacagtaacaaatccaaaaacatcacagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctttttacccaagc
gi|18 : C--T--A--GCTTTTGA----TTGT-CTTA-G--C--CTATT-G------------C-------AG----ATTGATGTCAC-TCCACT-CAGCA--T-TT--TA-CCCCAAGCatatatgaactcagtacctatatgtattcaatatcatctacatgtatgtgactctgacagtgttcttaacagattaaaaatacgggttaaaaaaaacaaacaaacaaaaacaaatgatttcctgtaaatccaatcactgtggccaacattctaaatgtcaagtttagacaacaccagaagatgagtatatatagtatatgactatttggaacaatcaaattgactaccacgcgtagtcagactcacccttgagtgaactatcaaaaattaggtatgagaacatcgaaaagaatgttactctcaattcaaagggaaatgaaatacaaactggtaactcgcgtcatgcttcattgtttttagaagtccgtttagtgcaggatacaacgctgatacctgatatgctgcagtgaaatcttcaacgctccgagctgaacaccttttatacaatgtaacatttgaaacgttagagaaaggataaccgagtcatacgtcagttttcattctcaaacagcagtttcttcccctttcatcgtttgttaacacacgaggcattattatttttctgtcatatggtattagattaagacaagtgcaaaataaggccaatacaaacatacgccactaatacacgagttcctatacatacatttcgtaaagttgaatataagagcggtcaaatttttaattttgacatttggcaccctggaaataaagaacgagagaataatgaccttttatgctcaacgaagatgtaacaaattccaagaaacataccagactagcttttgaatttcgctccagctaccacttccactcc
gi|9 : gT-T------------C-------CACTCCACTCC----AT-TCCACT-CAGCT--T-TT--TA-CCCCCAGCatgtatgcattcagtaccaatatgtattcaagattatctacatgtacatgtatgtgactctgacagtgatctcgacatattaaaaatatgttttgatttcctgtcatccaatactgtgccaattctaaatgtcagtttagaaacaccagaagatagtatatagtatgactttgtataatcaaaccgacttgtctgactcattgaagtaaact
gi|16 : gTCCA-----C-TCCACT-CACCT--T-TT--TA-CTCCAAGttacattaatctgaaacaagctatacaatcaaaaattagatgtatgaactaaatgctcatgtctaatcaattaagattcataatgatgataaacatatatgtgacctgtttttaggaacaaattaattcctagctgtcatatgatgctgtgttgatttgcaatgtcagtttagaaacatcaaagatataataatcaaactcacttgcctaactgtaaaattaggatgtgaaaatttgaaaggaatgttactcccaataaagagttgaaatatgatcatgctcattgtttttagaggatacagctgtcaaccagatatcaaaatttgtttgctgcaatgacaaatcttttaacgctccaattttaggcaggtccccagccccctttaatctacagtattttttgtgtcacagagtagacaagtgcaaaaaggcaatgtatatctctctctacacacacgcatatggaatgagggagggagaatgacctttatatgtcaacacggtgatcagcatcacagactatagctttcatctttcactccactccattcagctttttaccccaag
gi|4 : gagaTCCA-----C-TCCACT-CAGCT--T-TT--TA-CCCCAAGCgtaacattaatctaaaatagactaccaaaagctagatcgatgtatgaactcagtacccatatgtattcaagatgatctacatgtatgtgactctgacagtgatctcaacagatttaaaatatgtgtcttaaaaacaaatgatttcctgtcgtccaataatgtgttaattctaaatgtcagtttataaacaccagaagatagtatagaagtgaactacatgtatcaaattagggtatgagaacatgaaaagagtgttactccc
gi|33 : gg----AC-TCAACT-CAGCT--T-TT--TA-CCCCAAGgtttacgattagatctgaaacaagctataccataaaaaattagatgtatggtctaatcattcaagattccataatgatgaaaaaacatattatcctacatgtatgtgacaagtgactctcaacagattaaggtatctgtttttaggaaacaattaatctccctaggctgtcatctgatgctgtgatgatttgcaatgctagcgttagaaacatcaagatataatacatcaaactccttgctaactgtccaaattagggtgtgaaaatttgaaggaatgttaactcccaataaagtgaaactcatcattgccttattgtttttagaagtgtatttagtgaggatacagtcaaaattttgtttgctgcaaatgacaatcttttaacgctccaatttcaggttacaggtccccgctccctttaattctacagtatttaataacagagaattttttttttctgtcgcagagtagacaagtgaaacaaggcactgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacacacataggaaatgtgaggacgggagaatgactttatatgtcaacacaagtgatcggcatcacaagactaagctttcactctttgccccacactccattccattccactcagctttttaccccaa
gi|27 : gaatttcacaccAGCT--T-TT--TA-CCCCAAGC
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAAACCAAAATCTATTATTTTTCTTTCCGTCTTTTTCAATTAATTACTTACTGTCTAATAGCAAAATATTTCATTGAATTGAAAAAACGATATATATTGTTTACGGAATACAACGAATGGTCAAGATAC
Unaligned ( gi|29 ): TATGGTATTAAACACAAAGAATTATTTGTTTTCTGTCACAGAGTAGACAAGTGCAAAGATACAATGT
Unaligned ( gi|30 ): AGGCTAATACAATCAAAAGTTGGAGTATGAACTGAACTGTAAAACCG
Unaligned ( gi|32 ): TGAATTTCACTCCACTCCACTCAGCTTTTTTTACCCCA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 888888888888888888888888888888888 111111 1111 1111111 1111111 11111111 22222222 3333333333 1111111111111 111111 3333333333333333333333333333333333333 1111 1111111111 11111111 22222222222 222 1111 222222222222222222222 2222222222222222222222222222222 33333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111 11111111111 11111111111 111111111 1111111111 11111 3333333333333333333 11111 1111 1111111111111111111 666666666666666666666666666666666666666666 7777777777777777
lowQualScore : 3 3 44 44 222222222222222222222222222222222 3 3 7 3 3 555 000000 55 1111 0000000 2 4 4 55 3333333 33333333 1 99999999 4 4444444444 8888888888888 3 99 8 3 3 000000 7777777777777777777777777777777777777 3 1 5555 888888 6666 3 3 3 3 3 44 6 6 3 3 3 3 44 3 555 3 7777 7777 3 55 2 3 7777777777 3 22222222 555 1 44 55555 33333333333 44 44 3 33 3 3 888 44 6 6 3 3 6 3 666 0 3 1111 44 3 3 2 222222222222222222222 3 6666 3 3 3 44 44 555 9999999999999999999999999999999 2 44 3 44444444444444444444444444444444444444444444 2 33 33 8 2 2 2 2 2 6666 2 2 2 33 5 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33 77 00000000000 55 55555555555 2 9999 88888888888 4444 333 22 4 22 999999 222222222 2 2 22 55 4 2 33 33 4 666 2 8888888888 555 555 3 999999 3 3 44 3 666 3 3 44444 1111111111111111111 555 44444 555 33 2 2 1111 2 5555 2 2 33 666 1 888 2 444 6666666666666666666 2 4 7 2 4 4 2 1 999999999999999999999999999999999999999999 2 2 33 99 33 2 33 1 7777777777777777 0 33 2 2 33
lowQualScore : . . .. .. ................................. . . . . . ... ...... .. .... ....... . . . .. ....... ........ . ........ . .......... ............. . .. . . . ...... ..................................... . . .... ...... .... . . . . . .. . . . . . . .. . ... . .... .... . .. . . .......... . ........ ... . .. ..... ........... .. .. . .. . . ... .. . . . . . . ... . . .... .. . . . ..................... . .... . . . .. .. ... ............................... . .. . ............................................ . .. .. . . . . . . .... . . . .. . ............................................................................................................................ .. .. ........... .. ........... . .... ........... .... ... .. . .. ...... ......... . . .. .. . . .. .. . ... . .......... ... ... . ...... . . .. . ... . . ..... ................... ... ..... ... .. . . .... . .... . . .. ... . ... . ... ................... . . . . . . . . .......................................... . . .. .. .. . .. . ................ . .. . . ..
lowQualScore : 1 1 22 22 888888888888888888888888888888888 6 6 3 2 3 888 555555 00 4444 8888888 5 0 0 55 0000000 22222222 0 55555555 0 5555555555 9999999999999 2 55 0 6 6 555555 3333333333333333333333333333333333333 0 4 5555 888888 5555 1 1 1 1 1 22 2 2 1 1 3 6 22 3 111 3 7777 7777 6 00 3 6 3333333333 3 11111111 444 2 22 22222 77777777777 22 22 1 99 1 1 111 22 2 2 1 1 2 1 888 4 1 6666 22 1 1 9 555555555555555555555 1 5555 1 1 1 22 22 444 9999999999999999999999999999999 9 22 1 33333333333333333333333333333333333333333333 9 99 99 6 9 9 9 9 9 1111 9 9 7 77 3 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 99 66666666666 33 88888888888 2 4444 11111111111 5555 999 99 2 99 888888 888888888 3 2 99 33 4 2 11 11 4 111 9 2222222222 444 999 1 333333 1 1 22 1 333 1 1 33333 4444444444444444444 000 33333 000 99 9 9 1111 5 3333 4 4 22 555 9 888 4 111 9999999999999999999 4 7 1 4 7 7 4 8 666666666666666666666666666666666666666666 4 4 22 77 22 4 22 1 7777777777777777 1 77 7 7 77
consensus : GGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGAGTGGAGTG-----T-------G-G----------ACATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GT-------ATTCA--------AGA------T-ATC-TAC----------ATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-TAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTA-TAT----AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAGG--TGA-A-C---TA------TCA--AA--TTA-GG-GT-AT-GA--GAACA--T-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TC-A----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT-CA---------GC-AG-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------A----ACGTTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-A--AA--A-GGC---AATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTT-CGTAN--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TA--------AC---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG---AAGGA---GAGAGAA-T---GA------CCT---T---TA-TAT-G-TCAAC-A-AGAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCCA--C--CCACT-CCGC-CCATTCCAC--TCCAC-T-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
Reference ( family-1169 ) : GGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGAGCGGANTGGA-TNTGGAGCGAGCG----------ACATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GT-------ATTCA--------ANA------T-ATC-TAC----------ATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-TAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTA-TAT----AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAGG--TGA-A-C---T-------TCA--AA--TTA-GG-GT-AT-G---GAACA--T-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TC-A----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT-NA---------GC-NG-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------A----ACGTTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-A--AA--A-GGC---AATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTT-CGTAN--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TA--------AC---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG---AAGGA---GAGAGAA-T---GA------CCT---T---TA-TAT-G-TCAAC-A-AGAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCCA--C--CCACTTCCGC-CCATTCCAC--TCCAC-T-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|1 : CTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGAGTG-------------------------------ACATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----ATATGA-------ACTCAGTAC-CTATA-T--GT-------ATTCA--------ATA------TCATC-TACATGT------ATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGT-TCTT-AA------CAGATTAAAAATACG-G-------GTT
gi|1 : A----CAAATGATTTCC------T----GTAAAT-CCAATCA-CTGTGGCCAACATTC-TAAATGTCAAG-T-TTAGACAACAC-CAG-AAG-ATGAGTA-TAT----ATAGTATATG-ACTATTTGGAACAATCAAATTGAC-TACCACGCGTAGTCAG--------ACTCACCCTTGAG---TGA-A-C---TA------TCA--AAAATTA-GG--T-AT-GA--GAACA--TCGAAAAG-AATGT-T-A-CTC-TCAAT-T-CAAAG-GGAAATGAAA--TACAAA-CT-GGTAA-CT---C--------------GCGTC-A----T-GC-TTCATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT-TAGT-------GC-AGGATACAACGCTGATAC---CTGAT--ATGCTGCAGTGAAA--TCTTCAA------------C--------------G-CT--C--CGA-GCTGA-A-CA-C-CTTTTATACAAT-GT-AAC-A--T-TTGA---------------A----ACGTTAGAG-A---AAGGATAA-CCGAGTCATACGTCAGTTTTC-A-TTC-TCAAACA-----GC----------AG-----T-----------T-------TC--TTCCC-----------C--TTT-----------CA-TCG------TTTGTTA--AC-AC-AC-G----AGG--CATTA-TTATTT--TT------CTGTCATATGGTATTAGATTAAGACAA--G--TGC-A-A--AATAA-GGCC--AATACAAAC-ATACGCCACTAATAC---AC---GAGTT-CC--TATAC-A-TA--CATTT-CGTAAAGTTG-AATATAAG-----AGCGG-----T----------C---AAATTTTTAAT---TT--TGAC-AT----TTGGCA----CCCTG-G-A--AATA---AAGAAC--GAGAGAA-TAATGA------CCT---T---T--TAT-GCTCAACGA-AGAT-GTAA-CAAATT-------CCAA-G--------------A-------------A-ACATACCA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCGCTCCAG-CTACCACTTCCAC-TCaaaaaaaacaaacaaacaaaaacaaatgatttcctgtaaatccaatcactgtggccaacattctaaatgtcaagtttagacaacaccagaagatgagtatatatagtatatgactatttggaacaatcaaattgactaccacgcgtagtcagactcacccttgagtgaactatcaaaaattaggtatgagaacatcgaaaagaatgttactctcaattcaaagggaaatgaaatacaaactggtaactcgcgtcatgcttcattgtttttagaagtccgtttagtgcaggatacaacgctgatacctgatatgctgcagtgaaatcttcaacgctccgagctgaacaccttttatacaatgtaacatttgaaacgttagagaaaggataaccgagtcatacgtcagttttcattctcaaacagcagtttcttcccctttcatcgtttgttaacacacgaggcattattatttttctgtcatatggtattagattaagacaagtgcaaaataaggccaatacaaacatacgccactaatacacgagttcctatacatacatttcgtaaagttgaatataagagcggtcaaatttttaattttgacatttggcaccctggaaataaagaacgagagaataatgaccttttatgctcaacgaagatgtaacaaattccaagaaacataccagactagcttttgaatttcgctccagctaccacttccactcc
gi|10 : cttggggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataggctaatacaatcaaaagctagatatatgaactcagtacctatatgtattcaatatcatctacatgtatgtgactctgacagtgttcttaacagattaaaaatacgggttaaaaaaaacaaacaaacaaaa--AA--TTA-GG-GT-AT-GAA-GAACA--T-GCAAAG-AATGT-T-A-CTC-TTAAT-TACAAAG-GAGA-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TC-A----T-GC-C-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGTTT-CA---------GC-AG-----------GATACAG-CTGAC--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------GCCT--GGCC-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAACGGC-TTT-AAGC-TTTTTACATTAACATGTGAA----ACGTTGGTA-AC--AGGGA-AACC------------------TC-A-TAC-T-----A-----GTTTC-------AT-----TCCAAACGCAG-T-------TC--T--CC-----------CATTTT-----------AA-T-TAT----TTTAACACGAT-GGAACAG----AGGTTCA--A-TTATTC--TTG-----CTGTCATGTG-TATTAGATTA-AACAA--G--TGC-A-A--AA--A-G--------ACAAATGATA---------TGCAGGACT--GAGTTCCC--T---T-A-TA--CATTT-CATAA--TTGCAATATA-G-----AG---------A--------GC---AAA-----GA-----T--TG--------------A----CACAA-ATATTAATG---AATCA----ACAG-A-T---GA------TC---------AGCAT-G-AC-AT-A-AG-T-A-AC-CAA-TC-------C--A----------------A-------------A-ACATAATA-GAAAT--TGCG-GCTTTTGAAT--TTCACTCCACTC--CCATT---G---CATT-CACTGTCCAC-TCCAGCTTTT--TACCCCAAGc
gi|11 : -GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TGA-A-C---A-------ACC--AA--TT---G-GT-AT-GA--GAACA--TTGAAAAA-A--GT-T-AACTC-TCAAT-TACAA-G-GAGA-TGAA---TACAAA-TT-GGTAAACT---C--------------G--TC-AGTCAT-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGTTT-CA---------GC-AG-----------GATACA----GA---GC-TTG----------------A------------T--------------G-CT--G--CAA-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TTG----------------A----ACGTTGGTA-A---AG---------------------------C-A-TTT-------------GT----------AC-----TAGATGAG----T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---------ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----CTGTCATATG-CA------------AA--A--TGCAA-A--AA--A-GGC---AAAACAAAC-AT----------CG
gi|11 : -----AG--A-----TG--------AC---AAA-----TAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG---AA--A---GAGAAAA-T---GA------CCT---TATATA-TAT-G-TCAAC-A-A----G-AT-CAGCTA-------C--A-TATGTAACAAATCCAA-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCCA--CT-CCGCTTaggcaagatgacaaatattttgcatttgcacccaggaaatgaaagagaaaatgaccttatatatatgtcaacaagatcagctacatatgtaacaaatccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccgctttttacccca
gi|11 : gtctgactcattgaagtgaacaaccaattggtatgagaacattgaaaaaagttaactctcaattacaaggagatgaatacaaattggtaaactcgtcagtcatgctcattgtttttagaagtccgtttcagcaggatacagagcttgatgctgcaagtgacaaatctttcaacgctctacttgaacgttggtaaagcatttgtactagatgagttctccctttaatctattttaacacagaggtcaattattcttgctgtcatatgcaaaatgcaaaaaaggcaaaacaaacatcgaggcaTGGGG-TAAA-A--A--GCGGAGTGGAGTGAAtttacccca
gi|12 : gtctgactcattgaagtgaacaaccaattggtatgagaacattgaaaaaagttaactctcaattacaaggagatgaatacaaattggtaaactcgtcagtcatgctcattgtttttagaagtccgtttcagcaggatacagagcttgatgctgcaagtgacaaatctttcaacgctctacttgaacgttggtaaagcatttgtactagatgagttctccctttaatctattttaacacagaggtcaattattcttgctgtcatatgcaaaatgcaaaaaaggcaaaacaaacatcgaggcaagatgacaaatattttgcatttgcacccaggaaatgaaagagaaaatgaccttatatatatgtcaacaagatcagctacatatgtaacaaatccaaaacatcacagactagcttttgaatAA-CT---C--------------G--TC-A----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAAG---TCCG-TT-AACATGGTTAAGC-TG-----------GATACAG-CTGAC--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGAAA-AA-T-CTTT----CAAC-GC-TCT-A--CTTT-----------------T----ACATTGGTA-A---AGGGA-AACC------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------ACGA---G-----------T-------TC--TC-CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----TTGTCATATA-TATTAGATTA-GACAA--G--TGCAA-A--AA--A-GGC---AATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---TAA-TA--CATTT-CGTAT--TTG-AATATA-GAAGCAAG--G-----TA--------AC---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG---AAAGA---GAGAGAA-T---GA------CGT---T---T------------------AT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCCA--CT-CCAC-TCCGCTCCATTCCAT--TCCAC-T-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|13 : AG-AT-ATTA-TAT----AT----TATG-ATT--TTTAA-TAATCAAAATAAC-T--------T-GTCTG--------ATTCA---TTGAGG--TGA-A-C---CA------TCA--AA--TTA-GG-GT-ATGG---GAACA--T-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-G---------------AA-TT-TGTAA-CT---T--------------G--CC-A----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAAG---GCCG-TCACA---------GC-AG-----------GATATTGCCTGAT--AT-CAA-------ATTT-----ACTGCT-------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----TAAT-GC-TCT-A--C-TTTTACATTAACATGTG--A----ACGTTAGTA-A---AGGAT-AA-CT-----------------TC-A-TAC-T-----A-----G------------------T-----------T-------TCATT--CCAAACAGGAGTTC--TTC------------A-TCTA-----TTTAAC---AC-AG---AG----AGG-TT--------TTT--TTG-----CTG
gi|14 : -----------------A----ATGTTTGTA-ATATAGGGA-CC-C------------------TCTA-CTG-TGT---A-----GT----------AA-----G-----------T-------TC--T-------------------TT-----------AA-T-TAT----ATCAACA--GCTAT-A-AA----AAG-T-A--A-TT--TT--TTC-----CTGCCAAGTA--ATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-A--AA--A--GC---AATGTAAAC-A------------GC---A-T--GAGTT-TC--------A--A--CATAT-CGTAA--GGA-AATATA-G-----AA--G-----C---------ACGTTGAA-----AATCAATTCGCG-C-AT----TT--CA------CAA-G-A--AATG---AAGGATGCGATGGAA-T---GAATGACGCCT---T---CATTAT-G-TCAACTA-ACATAA-AT-C------------C--G-A--------------A-------------A-ACATCACA-G---CTAT--A-GCGTTTGAA---TACACTCCA-------------AT-CCACTCCAC---CCACTT-CAGCTTTTTATACCCCAgattagctctgtgctgttatatgt
gi|15 : cactttaacatgT-GA---------AC-AG-----------GACACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------TCATATTTACTGCTTG-CT--A--C-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAAA-GC-TCT----T-TT-----------------A----ACgc
gi|15 : ttgtttcaac-----------C--TTTCA---------AA-GCTCT----TTTAACA---C-AG-ATAGCTCTAGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----TTGTCATATG-TATAAGATTA-GACAA--G--TGC-ACA--AA--A-GGC---AATACAAAC-AT----------AGC---ACC--AAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTT-CGAAA--TTG-AATATA-G-----AG--G----------------C---AAG---------------TG-C-AT----TTG-CA----ACCAG-A-A--AATG---AAAGA---GAGAG------------------------------T-G-TCAAC-A-AGAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------ATCAACAAATCCAAA-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCAC------------------------TCCAC--TCCAC-T-CAGCTTTT--TACCCCAacagatagctctaggtcaattatttttgttgtcatatgtataagattagacaagtgcacaaaaggcaatacaaacatagcaccaagttccttatacatttcgaaattgaatatagaggcaagtgcatttgcaaccagaaaatgaaagagagagtgtcaacaagatgatcagctacatatcaacaaatccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccactcagctttttacccca
gi|16 : ttgtttcaactgaacaggacacagctgatacctgatatcatatttactgcttgctacagtgacaaatGACTTGGAG-TAAA-A--A--GGTGAGTGGAGTGGAGTA-------------------------------ACATTA-AT-CTA-AAATAGACTA-------CCAAAA---GC------T--AGATCGATGTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GT-------ATTCA--------AGA------TGATC-TAC----------ATG--------TATGTGACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTTAAAAT-
gi|16 : gaA----CAAATGATTTCC------T----GTCG-T-CCAAT-A-ATGTG-TTAA--TTC-TAAATGTCA-G-T-TTATA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTA-TAatgtgtcttaaaaacaaatgatttcctgtcgtccaataatgtgttaattctaaatgtcagtttataaacaccagaagatagtatagaagtgaactacatgtatcaaattagggtatgagaacatgaaaagagtgttactccc
gi|16 : gagacttggagtaaaaaggtgagtggagtggagtaacattaatctaaaatagactaccaaaagctagatcgatgtatgaactcagtacccatatgtattcaagatgatctacatgtatgtgactctgacagtgatctcaacagatttaaaatatgtgtcttaaaaA---TAGAAG--TGA-A-C---TACATGTATCA--AA--TTA-GG-GT-AT-GA--GAACA--T-GAAAAG-AGTGT-T-A-CTC-CCgaagtgaactacatgtatcaaattagggtatgagaacatgaaaagagtgttactccc
gi|17 : gagacttggagtaaaaaggtgagtggagtggagtaacattaatctaaaatagactaccaaaagctagatcgatgtatgaactcagtacccatatgtattcaagatgatctacatgtatgtgactctgacagtgatctcaacagatttaaaatatgtgtcttaaaaacaaatgatttcctgtcgtccaataatgtgttaattctaaatgtcagtttataaacaccagaagatagt------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----GAG---------T-------TC--T--CC-----------C--CTTTAATCCAATGTAA-TCTAT----TTTAACA---C-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----TTGTCATATG-CA-----------------------A-A--AA--A-GGC---AATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTT-CGTAT--TTG-AATATA-G-----AG--GCAAGGTA--------AC---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG---AAAGA---GAGAGAA-T---------------------TA-TAT-G-TCAAC-A-ACAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCCA--C-----------T-CCATTCCAT--TCCAC-T-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|18 : GGCTTGGGG-TAAA-A--T--GCTGAGTGGAGTG------------------------------------ACATCA-AT-CTG-CAATAGGCTAAGACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGC-------ATTCAGTAC-CAATA-T--GT-------ATTCA--------AGAT-----T-ATC-TACATGTACATGTATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-GA------CATATTAAAAAT---AT-------GTTTT
gi|18 : TGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-TAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTA-TAT----AG----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACCGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TAA-A-C---T-------gatttcctgtcatccaatactgtgccaattctaaatgtcagtttagaaacaccagaagatagtatatagtatgactttgtataatcaaaccgacttgtctgactcattgaagtaaact
gi|19 : ggcttggggtaaaatgctgagtggagtgacatcaatctgcaataggctaagacaatcaaaagctagatgtatgcattcagtaccaatatgtattcaagattatctacatgtacatgtatgtgactctgacagtgatctcgacatattaaaaatatgtttACAC--G--TGC-A-T--AA--A-GGC---AATGC---T-ATA---------TG------T--GAGCA-----------A-AA--CATTT----------A-AATATA-G-----AG--G-----GA--------GG---GGC-----AAT---TT--GA-C-ATCAATTTG-CA----CACGT-G-G--AATG---AAGGA---GGGAGAA-T---GAATGA--CCT---T---C--TAT-----AAC-A-AGGT-G-AT-CAACTAACAAATGC--A----------------A-------------A-ACATCACT-G--ACCAT--A-TCTTTTGCAT--TTCACTCTA--AA-CCACT-CCACTCCACTTCAC--TCCAC-T-CAGCATTT--AACTCCAAGC
gi|2 : ctcccatttaatctatttaggtcattttgtcGGCTTGGGGGTAAATA--A--GCTGAGTGGAGTGGAGCGG-GCGGATTGTGGAGTGAGTG----------ACATTA-AT-CTGTGAATAGTCTAATACAATTCAAAA---GC------TACAAAT----GTAT-----------------------------T-------ATTCA--------GGAT-----T-ATC-TACATGT------ATG--------T----GACTCTGAT-CA-GTG--------------------TAAAAAT--AAG-------GTTTCTTc
gi|2 : A----CAAATGATTTCC------T----GTCA-TACCAAT-A-CTG---CCAA--TTC-TAAATGTCATG-G-TTAGA-AACAC-CAGGAAG-AC--GTA-TAT----AT----TATG-ACT--T-GAA-ACATCAT-TTGATAC--------C-GTCCGTAGTACGTACTCA---TTGAGGAGTGA-AACATAT-------GCA--AA--TTATGG-GTCAT-GA--GAACA--T-GAAAAGGAATGTATGA-CTCTCCAAT-TACAAAG-GGAG-TGAAAATTACAAAATTAGGTAA-CT---G--------------T--TC-A----T-AG-T--ATTATGTTTTTATTGAAG---TCCGATT-CA---------GC-CG-----------GATACAG-GTGAT--AC-ATG-------A--T-----A------------T----------------CTATG--C-AAG-TGAAA-AAAT-CTTT----CAAC-GCATCT-A--C-TTTTACATTAATCATTATGA----ACGTTGATA-A---GGATA-AC-C------------------TC-AATTA-T-----A-----GTTTATTCCAA-AC-----T-----------GGCAGCAGTC--T--CC-----------CC-TTT-----------CA-TCTAT----TTTAACA--A--------G----AGG-TCA--AATTATTT--TTTT----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--GGCTGC-A-A--AA--AAGGC---AATACAAAC-AT----------CGC---ACACAGAGTT-CC--TA--T-AATA--CAATT-CGTAA--TTG-AATATA-G-----AG--G-----CG--------TC---AAATTTTTCAT---TT--TA-CTGT----TTG-CA----CCTGG-G-A--AATG---AAAGA---GAGAGAAAT---GA------C-T---T---TA-TAT-G-TC-AC-A-AGAT-T-GC-CAGCTA-------C--AGTAACAAATCCAA---A-------------A-ACATCACA-G--AC--T------T------N--NNNNNNNNN--N--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--NNNNN-N-NNGCTTTT--TA-CCCAAGCaaaaaaacaacaaataaacacaaaaacaaatgatttcctgtcataccaatactgccaattctaaatgtcatggttagaaacaccaggaagacgtatatattatgacttgaaacatcatttgataccgtccgtagtacgtactcattgaggagtgaaacatatgcaaattatgggtcatgagaacatgaaaaggaatgtatgactctccaattacaaagggagtgaaaattacaaaattaggtaactgttcatagtattatgtttttattgaagtccgattcagccggatacaggtgatacatgatatctatgcaagtgaaaaaatctttcaacgcatctacttttacattaatcattatgaacgttgataaggataacctcaattatagtttattccaaactggcagcagtctcccctttcatctattttaacaagaggtcaaattatttttttctgtcatatgtattagattagacaaggctgcaaaaaaggcaatacaaacatcgcacacagagttcctataatacaattcgtaattgaatatagaggcgtcaaatttttcattttactgtttgcacctgggaaatgaaagagagagaaatgactttatatgtcacaagattgccagctacagtaacaaatccaaaaacatcacagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctttttacccaagc
gi|20 : ggcttgggggtaaataagctgagtggagtggagcgggcggattgtggagtgagtgacattaatctgtgaatagtctaatacaattcaaaagctacaaatgtattattcaggattatctacatgtatgtgactctgatcagtgtaaaaataaggtttcttaaaaaaacaacaaataaacacaaaaGGCTTGGGG-TAAA-A--AAAGCTGAGTGGAGTGGAATGGAGTG--------------------------ACATTA-ATTCTGCAAATAGGCTAAGACAA-TCAAAA---GC------T--AGATT---GTATGA-------A---------------T--GT-------ATTCA--------AGA------TGATC-TAC----------ATGAATGTATGT----GACTCTGA--CATGTGA-TCTC-AA------CAGATTA-AAAA-C-----------------TGG-----------------------TTTTTTTAAAAACAAATGACTTC-------T----GTCA-T-CCAAT-AACTGTG-CCAA--TTCCTAAATGTCA-G-T-TT-GA-AACA
gi|21 : -CA----CACAT-G-A--AACG---AAGGA---GGGAGAG-T---GA------CCT---T---TA-TAT-G-TCAAC-A-CGGT-G-AT-CGGCTAATAAACCC--A----------------A-------------A-ACATCAAA-G--AC--T--A-GCGTTC--ATCCTTCGCTCCA--C--
gi|23 : tctctttatctctctcgttctctctctccaca----CAAATGATTTTC------T----GTAA-C-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-TAAATGTCA-G-T-TTttc
gi|24 : agtgttcttaacatattaaaaatatgggttaaaaaaacaaccccaaaaaccaaacaaaacC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTACAGTATTTAAT---------ACAG----AG----A--ATTTTTTT--TTT-----CTGTCA--------CAGAGTA-GACAA--GA-TGC-A-A--AA--A-GGC---AAT
gi|25 : acgctccaatttcaggcaggtccccagCAAT-TCCAAAG-G---------------AA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TC-A----T-GC-T-CATT--ATTTTGA--GAAG---GCTG-TCGCA---------GC-AG-----------GATATTG-CTGgt
gi|26 : tagaatatgggaactttaaagA--------ATA------T-ATG-TAC----------GTG-----------------CTGA--CA-GGGA-TTTC-AGTAGCAGCAGGTCAAAAAT-C-AGCATTTTTGTTTGTTTGGTGGTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTtctatatatcaa
gi|27 : GGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----------ACATTG-AT-CTG-AAATAGGCTAA-ACAT-TCAAAA---
gi|28 : aCTGGTTGGAGTAGAGCGG-------TATGGAG---G-G----------ACATCG-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GT------T--AGA-----GTATGA-------
gi|29 : -ACAA----AG----A--A-TTATTTGTTTT-----CTGTCACA--------GAGTA-GACAA--G--TGC-A-A--AG--A-TAC---AAT
gi|3 : tatggtattaaacGGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATTA-AT-CTG-AAATAGGCTGAAACAA-TCAAAA---GC------T--ATAT----ATATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GT-------ATTCA--------ATA------T-ATC-TAC----------ATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-TAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACTT-CAA-AAA-AT-AGTA-TAT----AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--T-----C---T-------TCATTAA--TT--GG-TT-AT-----GAACA--T-GAAAAG-TATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT------------------G--TC-A----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAAG---TCCG-TT-AA---------GC-TG-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------A----ACATTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----AT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----TTGTCATATG-TATTAGATTA-G-CAA--G--TGC-A-A--AA--A-GGC---AATACAAAC-------------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTT-CGTAT--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TA--------AC---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG---AAAGA---GAGAGAA-T---GA------CCT---T---TA--AT-G-TCAAC-A-AGAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTC-CTCCA--C--CCACTTCCGC-CCATCCAAT--TCCAC-T-CAGCTTTT--TACCCCAAGCgt
gi|30 : AGGCTAATACAA-TCAAAA---GT------T--GGA-----GTATGA-------ACT
gi|31 : -----------------A----ACGTTGGTA-A---AGGAT-AA-CT-----------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------gaactgtaaaaccg
gi|32 : TGGGG-TAAA-AAAA--GCTGAGTGGAGTGGAGTGAAATttcattcca
gi|33 : tgaCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTTGAGTGGTGTGAAAT
gi|33 : gaCCAC--TCAAC-T-CAGCTTTT--TACCCCAAG
gi|4 : gaatttcacaGGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGAG----------TTTA-------CG----------A--TTAGAT-CTG-AAACAAGCTA-TACCA-TAAAAA---AT------T--AGAT----GTATGGTCTAATCATTCAAGATTCCATAAT--G--------ATGAA--------AAAACATATT-ATCCTAC----------ATG--------T----A--TGTGA--CAAGTGACTCTC-AA------C-------AGAT-TAAG-------GTATCT------GTTTTTAGGAA-----------------A----CAATTAATCTCCCTAGGCT----GTCA-T-CTGAT-G-CTGTG-ATGA--TTT-GCAATGCTA-G-CGTTAGA-AACAT-CA---AG-AT-A-TA--AT----AC----------------------ATCAAACTC-C-T--------T-G-CTA--------ACT--------------G--------T-------CCA--AA--TTA-GG-GT-GT-G---AAAAT--T-TGAAGG-AATGT-T-AACTC-CCAAT----AAAG------TGAAA------------------CT---C--------------A--TC-A----TTGCCT-TATT--GTTTTTA--GAAG---TGTA-TT-TA---------GTGAG-----------GATACAG-TCAAA--AT-TTT-------G--T-----T------------T--------------G-CT--G--CAA-A-TGAC--AA-T-CTTT----TAAC-GC-TCCAA--T-TT-----------------C----AGGT---TA-C---AGG-------------------------TC--------------------------------C-----C-----------C-------GC--T--CC-----------C--TTT-----------AATTCTACAGTATTTAATA--AC-AG---AG----A-----A--T-TTTTTT--TTT-----CTGTCG--------CAGAGTA-GACAA--G--TGA-A-A--CA--A-GGC---A
gi|4 : -CA----CATAG-G-A--AATGT--GAGGAC--GGGAGAA-T---GA------C-T---T---TA-TAT-G-TCAAC-ACAAGT-G-AT-CGGC-----------------------------------------------ATCACAAG--AC--T--AAGCTTTCACTC--TTTGCCCCA--C----ACT------CCATTCCAT--TCCAC-T-CAGCTTTT--TACCCCAActgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacacacataggaaatgtgaggacgggagaatgactttatatgtcaacacaagtgatcggcatcacaagactaagctttcactctttgccccacactccattccattccactcagctttttaccccaa
gi|5 : gggcttggggtaaaaagctgagtggagtggagtttacgattagatctgaaacaagctataccataaaaaattagatgtatggtctaatcattcaagattccataatgatgaaaaaacatattatcctacatgtatgtgacaagtgactctcaacagattaaggtatctgtttttaggaaacaattaatctccctaggctgtcatctgatgctgtgatgatttgcaatgctagcgttagaaacatcaagatataatacatcaaactccttgctaactgtccaaattagggtgtgaaaatttgaaggaatgttaactcccaataaagtgaaactcatcattgccttattgtttttagaagtgtatttagtgaggatacagtcaaaattttgtttgctgcaaatgacaatcttttaacgctccaatttcaggttacaggtccccgctccctttaattctacagtatttaataacagagaattttttttttctgtcgcagagtagacaagtgaaacaaggcactgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacaTTAAGAAT-CG----------TGTTTTTGG--GGTGTT-----CGTTTTTGTTTTTT--------CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTCTTAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACTT-CAG-AAACAT-AGTATTATATTGAT----TATGTACT--TTGTA-TAATCAAGATGACAT--------T-GT-TG--------ACTCA---TTGAGG--TCATT-C---T-------TTC--AA--TTA-GGTTT-AT-GAGAGAAC---T-GAAAAG-TATGT-T-A-CT--CCAATATAC-AAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CTTCAC--------------G--TCAA----T-GC-T-CA-T--GTTTTTA--AAAAGCTTCCG-TTAAA---------GCTTG-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGCCAGAA-TCCTTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AAATTACATTGGTACA---AGGAA-AA-C------------------TC-A-TTCAT-----A-----AT----------ACGAG--T-----------T-------TC--C--CC-----------C--TTT------------A-TCTTT----TTT--CA--CC-AG-GCAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----C--TCATATG-TTTAAGATTA-GACAAATG--TGC-A-AACAA--A-GGCATTAATACAAAC-AT----------TGC---AC---GAGTT-CCCTT---T-A-TA--CATTTCCGTAT--TTG-AGTATA-G-----AG--G-----CAAGGTAATCAC---ACA-----AAT---TT--TG-C-ATGTA-TTG-CAGACTCACAGCG-A--AATGAAAAAAGA---GAGAGAA-G---AA------CCTTTCT---TA-TATCGTTCAACAA-AGATCA-ATGCAGCTA-------C--A-T--------------C-------------ATACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TCCACTCCA--C--CTAA--CCGCTCCATTCCAT--TCCAG-C-AGGCTTTT--TACCCCAA
gi|6 : GA-------ACTAAGTAC-CCATA-T--GT-------ATTCA--------AGA------T-ATC-TAC----------ATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGA-TCTT-AA------CAGATTAAAAAT-TGGG--------------TGG--GTTTT------TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-ATGTG-CCAT--TTC-TAGATGTCA-GTT-TTAGA-AA-ACACAG-AAG-AT-TGTA-T-T----AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TCA-A-C---T-------TTC--AA--TTA-GG-TT-AT-G---GAACA--T-GAAAAGAAATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TC-A----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAA---------------------------------------GATACGG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--G-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAAC-GC-TCT-A--CTTT-----------------T----ACATTGGTA-A---AGGGA-AACC------------------TC-A-TTC-T-----A-----GTTTC-------AT-----TCCAAACATGAAT-------TC--TC-CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-A--AA--A--GC---AA---AAA--------------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTT-CGTAT--TTG-AATATA-GAGGCAAG--G-----TA--------AC---AAA-----AAT---GT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG---AAAGA---G---------------------------------AT-G-TCAAC-A-AGAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-TATTTACAAATCCA-A-------------A-ACATCGCA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCCA--C-------TCCGCTCCATTCCAT--TCCAC-T-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|7 : TGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-C--T-------GTTTT
gi|7 : TGACTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-ATGTG-TCAA--TTT-TAAATGTCA-G-A-TTAGA-ATTAC-CAG-AAG-AT-AGTA-TAT----AT----TTTG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------AATCA---TTGAAG--TGA-A-C---TA------CCA--AA--TTA-GG-GT-AT-GA--GAACA--T-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-TCAAT-CACAAAG-GAGA-TGAAA--TACAAA-TT-AGCAA-CT---CNNNNNNNNNNNNNNN--NN-N----N-NN-N-NNNN--NNNNNNN--NNNN---NNNN-NN-NN---------NN-NN-----------NNNNNNN-NNNNN--NN-NTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAAC-GC-CCT-A--C-TT-----------------gacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactttatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|7 : tgatctcaacagattaaaaatctgtttA-A---CGGGA-AA-C------------------TC-A-GAC-T-----AAGTTAGC----------ACCAACAT-----------TGAG----TA--T--CC-----------C--TTTT----------AA-TCTAT----TTTAACC--AC-CG-AC------AGG-CCA--A--TA-----TCG-----C--TCA------ATTAGA-TA-GATAA--tatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|7 : tgatctcaacagattaaaaatctgttttgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactT-A--C-TC-----------------A----ATGTTGGT--------GCT-AA-C------------------TT-A-GTC-TG----A-----GT-----------------------------T-------TC--C--CG-----------T--TNN-----------NN-NNNNN----NNNNNNN--NN-NN-NNNN----NNN-NNN--N-NNNNNN--NNN-----NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN-NACAA--G--TGC-A-A--AA--AAGGC---AACACAAAC-AT----------TGC---CCT--AACTT-CC--T---T-A-TA--CATTT-TGTAA--TTG-AATATA-G-----AG--G----------------C---AAG-----A---------TG---AT----TTG-CT----CCCAG-G-A--AATG---AAAGA---GAGAGAA-T---GA------CCT---T---TA-TAT-G-TCAAC-A-AGAT-GTAA-CAAGTC-------C--A----------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCAC------------------------TCCAC--TCCAT-T-CAGTTTTT--TACACCAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|8 : tgatctcaacagattaaaaatctgttttgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactttatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggaGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGG---------------------AGTG----------ACATTA-AT-CTG-AAATAAGCTAATATAA-GCAAAATTTACAATATGT--AGAT----GTATGA-------ACTAAGTAC-GCATA-TAAGTAATCAGGATTCATAATGATGACAAAT---T-ATC-TAC----------ATA--------T----A--TGTGAATCG-GTGA-TCTCAAA------AAGATCAAAAAT-C
gi|8 : A----CAAATGATTTCC------T----GT-----------------G-TCAA--ATT-TAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-GAG----------AT----AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC----------------A--------ATTCA---TTAAGA--TGA-A-C---TA------TCA--AA--TTA-GG-GT-AT-GA--GAACT--T-TAAAAG-AATGC-T-A-ATC-CCAAT-T-C--AGTGTGA-TGAAA--TATAAA-TT-AGAAA-tattaagaacaaatgatttcctgtgtcaaatttaaatgtcagtttagaaacaccaggagatattatgactttgtataatcaaactgacaattcattaagatgaactatcaaattagggtatgagaactttaaaagaatgctaatcccaattcagtgtgatgaaatataaattagaaatactgtttgcttcagtgactgatcttttaatgctctattttatgataccctcatccttgtttcattccaaaccggggttctctcctaagtccatttaacaaagagggaagttatttttttcaatctatcatatattaggttagacaagtgcaaaatttacactgatttagaggcaagttgacatcaattctgcatttgcacccaggaaatgaaggagggagaatgacccttatatgtcaacaaagtggtcatcacagactagcttttgactttcacttcactccactccacttcactccactcagctttttacccaaagc
gi|8 : gggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataagctaatataagcaaaatttacaatatgtagatgtatgaactaagtacgcatataagtaatcaggattcataatgatgacaaattatctacatatatgtgaatcggtgatctcaaaaagatcaaaaatctattaaga------------T--------------G-CT--T--C-A-G-TGACT-GA-T-CTTT----TAAT-GC-TCT-A--T-TT-----------------T----A---TGATA-C---C--------C------------------TC-A-TCC-T-----T-----GTTTCATTCCAAAC-----CGGGG-------T-------TC--T--CT-----------C--CTA-----------AG-TCCAT----TT-AACA--A-------AG----AGG-GAA--G-TTATTT--TTTTCAATCTATCATAT---ATTAGGTTA-GAC-----------------A--A-G-------TGCAAAA-TT----------TAC---ACT--GA-----T--T---T-A-GAGGCA-------AG--TTG-A---------------------------------C---ATC-----AAT---TC--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG---AAGGA---GGGAGAA-T---GA------CCC---T---TA-TAT-G-TCAAC-A-AAGT-G-GT---------------------------------------------------CATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGACT--TTCACTTCA--CT-CCACT------CCACTTCAC--TCCAC-T-CAGCTTTT--TACCCAAAGCtactgtttgcttcagtgactgatcttttaatgctctattttatgataccctcatccttgtttcattccaaaccggggttctctcctaagtccatttaacaaagagggaagttatttttttcaatctatcatatattaggttagacaagtgcaaaatttacactgatttagaggcaagttgacatcaattctgcatttgcacccaggaaatgaaggagggagaatgacccttatatgtcaacaaagtggtcatcacagactagcttttgactttcacttcactccactccacttcactccactcagctttttacccaaagc
gi|9 : gggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataagctaatataagcaaaatttacaatatgtagatgtatgaactaagtacgcatataagtaatcaggattcataatgatgacaaattatctacatatatgtgaatcggtgatctcaaaaagatcaaaaatctattaagaacaaatgatttcctgtgtcaaatttaaatgtcagtttagaaacaccaggagatattatgactttgtataatcaaactgacaattcattaagatgaactatcaaattagggtatgagaactttaaaagaatgctaatcccaattcagtgtgatgaaatataaattagaaatactgttGGCTGGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAATGGAGTGGAGTGGA-ATT--------------------ACATTA-AT-CTG-AAACAAGCT-ATACAA-TCAAAA---AT------T--AGAT----GTATGA-------ACTAAATGC-TCATG-T--CT-------AATCA--------A
gi|9 : TTTTTAGGAACAAATTAATTCC------TAGCTGTCA-T-ATGAT-G-CTGTG-TTGA--TTT-GCAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAT-CA--AAG-AT-A-----------------TA------------A-TAATCAAACTCAC-T--------T-GCCTA--------ACT----------G--TA------------------A--AA--TTA-GG-AT-GT-G---AAA-ATTT-GAAAGG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-----AAA-GAGT-TGAAA--TATGA----------------------------------TC-A----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--GA----------------------------G-----------GATACAG-CTG-TCAAC-CAG-------A--T-----ATCAAAATTTGTTT--------------G-CT--G--C-A-A-TGACA-AA-T-CTTT----TAAC-GC-TCC-A--A-TT-------------------------TT---------AGGCA-GG-T------------------CC-----C-C-----A-----G---------------------------------------C--C--CC-----------C--TTT-----------AA-TCT---------------AC-AG---------------------TATTT--TTT-----GTGTCA--------CAGAGTA-GACAA--G--TGC-A-A--AA--A-GGC---AATttaagattcataatgatgataaacatatatgtgacctgtttttaggaacaaattaattcctagctgtcatatgatgctgtgttgatttgcaatgtcagtttagaaacatcaaagatataataatcaaactcacttgcctaactgtaaaattaggatgtgaaaatttgaaaggaatgttactcccaataaagagttgaaatatgatcatgctcattgtttttagaggatacagctgtcaaccagatatcaaaatttgtttgctgcaatgacaaatcttttaacgctccaattttaggcaggtccccagccccctttaatctacagtattttttgtgtcacagagtagacaagtgcaaaaaggcaatgtatatctctctctacacacacgcatatggaatgagggagggagaatgacctttatatgtcaacacggtgatcagcatcacagactatagctttcatctttcactccactccattcagctttttaccccaag
gi|9 : ggctgggggtaaaaagctgagtggaatggagtggagtggaattacattaatctgaaacaagctatacaatcaaaaattagatgtatgaactaaatgctcatgtctaatcaattaagattcataatgatgataaacatatatgtgacctg-G-G--AATG---AGGGA---GGGAGAA-T---GA------CCT---T---TA-TAT-G-TCAAC-A-CGGT-G-AT-CAG-----------------------------------------------CATCACA-G--ACTAT--A-GCTTTCATCT--TTCAC------------------------TCCAC--TCCAT-T-CAGCTTTT--TACCCCAAGgtatatctctctctacacacacgcatatggaatgagggagggagaatgacctttatatgtcaacacggtgatcagcatcacagactatagctttcatctttcactccactccattcagctttttaccccaag
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAAACCAAAATCTATTATTTTTCTTTCCGTCTTTTTCAATTAATTACTTACTGTCTAATAGCAAAATATTTCATTGAATTGAAAAAACGATATATATTGTTTACGGAATACAACGAATGGTCAAGATAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 88888888888888888888888888888888888 111111 1111 1111111 55555555555555555555 3333333333 1111111111111 111111 3333333333333333333333333333333333333 1111 1111111111 11111111 11111111111 1111 222222222222222222222 222222222222222222222222222222222 33333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111 11111111111 22222222222 111111111 1111111111 11111 3333333333333333333 11111 1111 1111111111111111111 666666666666666666666666666666666666666666 55555555555555555555555 1111111111
lowQualScore : 3 3 44 44 99999999999999999999999999999999999 3 3 7 3 3 555 000000 55 1111 0000000 2 4 4 55 22222222222222222222 4 4444444444 8888888888888 3 99 8 3 3 000000 7777777777777777777777777777777777777 3 1 5555 888888 6666 3 3 3 3 3 44 3 3 6 3 3 3 3 44 3 555 555 55 7777 3 55 2 3 7777777777 3 22222222 555 1 44 4 3 22222222222 44 44 2 1 5 2 33 1 5 5 2 2 5 2 666 3 1111 44 3 3 2 222222222222222222222 9999 3 3 3 44 44 555 888888888888888888888888888888888 2 44 3 44444444444444444444444444444444444444444444 2 33 33 8 2 2 2 2 2 6666 2 2 2 33 5 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33 77 00000000000 55 55555555555 2 9999 00000000000 4444 333 22 4 22 999999 222222222 2 2 22 55 4 2 33 33 4 2 333 2 8888888888 555 555 3 999999 3 3 44 3 666 3 3 44444 1111111111111111111 555 44444 555 33 2 2 1111 2 5555 2 2 33 2 6666 888 2 444 6666666666666666666 2 2 2 4 2 2 4 4 2 1 999999999999999999999999999999999999999999 2 2 33 99 33 2 33 44444444444444444444444 33 0000000000 2 33
lowQualScore : . . .. .. ................................... . . . . . ... ...... .. .... ....... . . . .. .................... . .......... ............. . .. . . . ...... ..................................... . . .... ...... .... . . . . . .. . . . . . . . .. . ... ... .. .... . .. . . .......... . ........ ... . .. . . ........... .. .. . . . . .. . . . . . . . ... . .... .. . . . ..................... .... . . . .. .. ... ................................. . .. . ............................................ . .. .. . . . . . . .... . . . .. . ............................................................................................................................ .. .. ........... .. ........... . .... ........... .... ... .. . .. ...... ......... . . .. .. . . .. .. . . ... . .......... ... ... . ...... . . .. . ... . . ..... ................... ... ..... ... .. . . .... . .... . . .. . .... ... . ... ................... . . . . . . . . . . .......................................... . . .. .. .. . .. ....................... .. .......... . ..
lowQualScore : 3 3 66 66 77777777777777777777777777777777777 6 6 3 2 3 888 555555 00 4444 8888888 5 0 0 55 00000000000000000000 0 5555555555 9999999999999 2 55 0 6 6 555555 3333333333333333333333333333333333333 0 4 5555 888888 5555 1 1 1 1 1 22 1 1 2 1 1 3 6 22 3 222 888 00 7777 6 00 3 6 3333333333 3 11111111 444 2 22 7 1 88888888888 22 22 9 2 7 9 99 9 7 7 9 9 7 9 888 1 6666 22 1 1 9 555555555555555555555 6666 1 1 1 22 22 444 666666666666666666666666666666666 9 22 1 33333333333333333333333333333333333333333333 9 99 99 6 9 9 9 9 9 1111 9 9 7 77 3 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 99 66666666666 33 88888888888 2 4444 88888888888 5555 999 99 2 99 888888 888888888 3 2 99 33 4 2 11 11 4 2 999 9 2222222222 444 999 1 333333 1 1 22 1 333 1 1 33333 4444444444444444444 000 33333 000 99 9 9 1111 5 3333 4 4 22 4 1111 888 4 111 9999999999999999999 4 4 4 7 4 4 7 7 4 8 666666666666666666666666666666666666666666 4 4 22 77 22 4 22 44444444444444444444444 44 9999999999 9 99
consensus : GGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGA-----------GTGGAGTG-G--------------ACATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTCAAGA------------------T-ATC-TAC----------ATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAGG--TGAA-CTA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT--CA-------G--C-A-G-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AA----CGTTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAN--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAG---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--C-CCAC-TCCGC-CCATTCCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
Reference ( family-1169 ) : GGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGA-----------GTGGAGTGTG-G------------ACATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTCAAGA------------------T-ATC-TAC----------ATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAGG--TGAA-CTA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT--CA-------G--C-A-G-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AA----CGTTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAN--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAG---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--C-CCAC-TCCGC-CCATTCCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|1 : CTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGA-----------GTG---------------------ACATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----ATATGA-------ACTCAGTAC-CTATA-T--GTATTCAATA------------------TCATC-TACATGT------ATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGT-TCTT-AA------CAGATTAAAAATACG-G-------GTT
gi|1 : A----CAAATGATTTCC------T----GTAAAT-CCAATCA-CTGTGGCCAACATTC-T-AAATGTCAAG-T-TTAGACAACAC-CAG-AAG-ATGAGTAT---AT--ATAGTATATG-ACTATTTGGAACAATCAAATTGAC-TACCACGCGTAGTCAG--------ACTCACCCTTGAG---TGAA-CTA------T---CA--AAAATTA-GG-T-ATGA-GA--ACATCGAAAAG-AATGT-T-A-CTC-TCAAT-T-CAAAG-GGAAATGAAA--TACAAA-CT-GGTAA-CT---C--------------GCGTCA----T-GC-TTCATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT--TA-------GTGC-A-GGATACAACGCTGATAC---CTGAT--ATGCTGCAGTGAAA--TCTTCAA------------C--------------G-CT--C--CGA-GCTGA-A-CA-CC-TTTTATACAAT-GT-AAC-A--T-TTGA---------------AA----CGTTAGAG-A---AAGGATAA-CCGAGTCATACGTCAGTTTTC-A-TTC-TCAAACA-----GC----------AG-----T-----------T-------TC--TTCCC-----------C--TTT-----------CA-TCG------TTTGTTA--AC-AC-AC-G----AGG--CATTA-TTATTT--TT------CTGTCATATGGTATTAGATTAAGACAA--G--TGC-A-AA--ATAA-GGCCA---ATACAAAC-ATACGCCACTAATAC---AC---GAGTT-CC--TATAC-A-TA--CATTTC-GTAAAGTTG-AATATAAG-----AGCGG-----T----------C---AAATTTTTAAT---TT--TGAC-AT----TTGGCA----CCCTG-G-A--AATA-AAG---AAC--GAGAGAA-TAATGA------CCTT---T-----TAT-GCT-CAACGA-A-GAT-GTAA-CAAATT-------CCAA-G--------------A-------------A-ACATACCA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCGCTCC-A--G-CTA---CCAC----TTCCAC--TC----------Caaaaaaaacaaacaaacaaaaacaaatgatttcctgtaaatccaatcactgtggccaacattctaaatgtcaagtttagacaacaccagaagatgagtatatatagtatatgactatttggaacaatcaaattgactaccacgcgtagtcagactcacccttgagtgaactatcaaaaattaggtatgagaacatcgaaaagaatgttactctcaattcaaagggaaatgaaatacaaactggtaactcgcgtcatgcttcattgtttttagaagtccgtttagtgcaggatacaacgctgatacctgatatgctgcagtgaaatcttcaacgctccgagctgaacaccttttatacaatgtaacatttgaaacgttagagaaaggataaccgagtcatacgtcagttttcattctcaaacagcagtttcttcccctttcatcgtttgttaacacacgaggcattattatttttctgtcatatggtattagattaagacaagtgcaaaataaggccaatacaaacatacgccactaatacacgagttcctatacatacatttcgtaaagttgaatataagagcggtcaaatttttaattttgacatttggcaccctggaaataaagaacgagagaataatgaccttttatgctcaacgaagatgtaacaaattccaagaaacataccagactagcttttgaatttcgctccagctaccacttccactcc
gi|10 : cttggggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataggctaatacaatcaaaagctagatatatgaactcagtacctatatgtattcaatatcatctacatgtatgtgactctgacagtgttcttaacagattaaaaatacgggttaaaaaaaacaaacaaacaaaa--AA--TTA-GGGT-ATGAAGA--ACAT-GCAAAG-AATGT-T-A-CTC-TTAAT-TACAAAG-GAGA-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-C-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGTTT--CA-------G--C-A-G-----------GATACAG-CTGAC--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------GCCT--GGCC-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAACGGC-TTT-AAGC-TTTTTACATTAACATGTGAAA----CGTTGGTA-AC--AGGGA-AACC------------------TC-A-TAC-T-----A-----GTTTC-------AT-----TCCAAACGCAG-T-------TC--T--CC-----------CATTTT-----------AA-T-TAT----TTTAACACGAT-GGAACAG----AGGTTCA--A-TTATTC--TTG-----CTGTCATGTG-TATTAGATTA-AACAA--G--TGC-A-AA--A--A-G---------ACAAATGATA---------TGCAGGACT--GAGTTCCC--T---T-A-TA--CATTTC-ATAA--TTGCAATATA-G-----AG---------AG--------C---AAA-----GA-----T--TG--------------A----CACAA-ATATTAATG-AAT---CA----ACAG-A-T---GA------TC---------AGCAT-G-A-C-AT-A-A-G-T-A-AC-CAA-TC-------C--A----------------A-------------A-ACATAATA-GAAAT--TGCG-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-ACTC-CCAT-T--G---CATT-CACTGTC----------CACTCCAGCTTTT--TACCCCAAG
gi|11 : -GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TGAA-CAA------C---CA--A---TT---GGT-ATGA-GA--ACATTGAAAAA-A--GT-T-AACTC-TCAAT-TACAA-G-GAGA-TGAA---TACAAA-TT-GGTAAACT---C--------------G--TCAGTCAT-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGTTT--CA-------G--C-A-G-----------GATACA----GA---GC-TTG----------------A------------T--------------G-CT--G--CAA-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TTG----------------AA----CGTTGGTA-A---AG---------------------------C-A-TTT-------------GT----------AC-----TAGATGAG----T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---------ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----CTGTCATATG-CA------------AA--A--TGCAA-AA--A--A-GGC-A---AAACAAAC-AT----------CG
gi|11 : -----AG--A-----TGA--------C---AAA-----TAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AA-----A---GAGAAAA-T---GA------CCTTATAT---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-----G-AT-CAGCTA-------C--A-TATGTAACAAATCCAA-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACT--------CCAC-TCCGC-T--TTTTAC--CC----------CAaggcaagatgacaaatattttgcatttgcacccaggaaatgaaagagaaaatgaccttatatatatgtcaacaagatcagctacatatgtaacaaatccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccgctttttacccca
gi|12 : gtctgactcattgaagtgaacaaccaattggtatgagaacattgaaaaaagttaactctcaattacaaggagatgaatacaaattggtaaactcgtcagtcatgctcattgtttttagaagtccgtttcagcaggatacagagcttgatgctgcaagtgacaaatctttcaacgctctacttgaacgttggtaaagcatttgtactagatgagttctccctttaatctattttaacacagaggtcaattattcttgctgtcatatgcaaaatgcaaaaaaggcaaaacaaacatcgaggcaAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAAG---TCCG-TTAACATGGTTAAG--C-T-G-----------GATACAG-CTGAC--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGAAA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--CTTT-----------------TA----CATTGGTA-A---AGGGA-AACC------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------ACGA---G-----------T-------TC--TC-CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----TTGTCATATA-TATTAGATTA-GACAA--G--TGCAA-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---TAA-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-GAAGCAAG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T---GA------CGTT---T-----------------------AT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--CTCCAC-TCCGCTCCATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|13 : AG-AT-ATTAT---AT--AT----TATG-ATT--TTTAA-TAATCAAAATAAC-T--------T-GTCTG--------ATTCA---TTGAGG--TGAA-CCA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGG-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-G---------------AA-TT-TGTAA-CT---T--------------G--CCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAAG---GCCG-TCA-CA-------G--C-A-G-----------GATATTGCCTGAT--AT-CAA-------ATTT-----ACTGCT-------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----TAAT-GC-TCT-A--C-TTTTACATTAACATGTG--AA----CGTTAGTA-A---AGGAT-AA-CT-----------------TC-A-TAC-T-----A-----G------------------T-----------T-------TCATT--CCAAACAGGAGTTC--TTC------------A-TCTA-----TTTAAC---AC-AG---AG----AGG-TT--------TTT--TTG-----CTG
gi|14 : -----------------AA----TGTTTGTA-ATATAGGGA-CC-C------------------TCTA-CTG-TGT---A-----GT----------AA-----G-----------T-------TC--T-------------------TT-----------AA-T-TAT----ATCAACA--GCTAT-A-AA----AAG-T-A--A-TT--TT--TTC-----CTGCCAAGTA--ATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A--GC-A---ATGTAAAC-A------------GC---A-T--GAGTT-TC--------A--A--CATATC-GTAA--GGA-AATATA-G-----AA--G-----C-A--------CGTTGAA-----AATCAATTCGCG-C-AT----TT--CA------CAA-G-A--AATG-AAG---GATGCGATGGAA-T---GAATGACGCCTT---C---ATTAT-G-T-CAACTA-A-CATAA-AT-C------------C--G-A--------------A-------------A-ACATCACA-G---CTAT--A-GCGTTTGAA---TACACTCCAA--T-CCAC-TCCAC-CCACT---------------------T-CAGCTTTTTATACCCCAgattagctctgtgctgttatatgt
gi|15 : cactttaacatgA-------A--C-A-G-----------GACACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------TCATATTTACTGCTTG-CT--A--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAA-GC-TCT----T-TT-----------------AA----Cgc
gi|15 : ttgtttcaactg-----------C--TTTCA---------AA-GCTCT----TTTAACA---C-AG-ATAGCTCTAGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----TTGTCATATG-TATAAGATTA-GACAA--G--TGC-ACAA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------AGC---ACC--AAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GAAA--TTG-AATATA-G-----AG--G----------------C---AAG---------------TG-C-AT----TTG-CA----ACCAG-A-A--AATG-AAA---GA---GAGAG------------------------------T-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------ATCAACAAATCCAAA-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCAC------------------------TCCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAacagatagctctaggtcaattatttttgttgtcatatgtataagattagacaagtgcacaaaaggcaatacaaacatagcaccaagttccttatacatttcgaaattgaatatagaggcaagtgcatttgcaaccagaaaatgaaagagagagtgtcaacaagatgatcagctacatatcaacaaatccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccactcagctttttacccca
gi|16 : ttgtttcaactgaacaggacacagctgatacctgatatcatatttactgcttgctacagtgacaaatGACTTGGAG-TAAA-A--A--GGTGAGTGGAGTGGA-----------GTA---------------------ACATTA-AT-CTA-AAATAGACTA-------CCAAAA---GC------T--AGATCGATGTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTCAAGA------------------TGATC-TAC----------ATG--------TATGTGACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTTAAAAT-
gi|16 : gaA----CAAATGATTTCC------T----GTCG-T-CCAAT-A-ATGTG-TTAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTATA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---Aatgtgtcttaaaaacaaatgatttcctgtcgtccaataatgtgttaattctaaatgtcagtttataaacaccagaagatagtatagaagtgaactacatgtatcaaattagggtatgagaacatgaaaagagtgttactccc
gi|16 : gagacttggagtaaaaaggtgagtggagtggagtaacattaatctaaaatagactaccaaaagctagatcgatgtatgaactcagtacccatatgtattcaagatgatctacatgtatgtgactctgacagtgatctcaacagatttaaaatatgtgtcttaaaaA---TAGAAG--TGAA-CTACATGTAT---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AGTGT-T-A-CTC-CCgaagtgaactacatgtatcaaattagggtatgagaacatgaaaagagtgttactccc
gi|17 : gagacttggagtaaaaaggtgagtggagtggagtaacattaatctaaaatagactaccaaaagctagatcgatgtatgaactcagtacccatatgtattcaagatgatctacatgtatgtgactctgacagtgatctcaacagatttaaaatatgtgtcttaaaaacaaatgatttcctgtcgtccaataatgtgttaattctaaatgtcagtttataaacaccagaagatagt------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----GAG---------T-------TC--T--CC-----------C--CTTTAATCCAATGTAA-TCTAT----TTTAACA---C-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----TTGTCATATG-CA-----------------------A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-G-----AG--GCAAGGTAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T------------------T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-CAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--C----------T-CCATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|18 : GGCTTGGGG-TAAA-A--T--GCTGAGTGGAGTG-------------------------------------ACATCA-AT-CTG-CAATAGGCTAAGACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGC-------ATTCAGTAC-CAATA-T--GTATTCAAGAT-----------------T-ATC-TACATGTACATGTATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-GA------CATATTAAAAAT---AT-------GTTTT
gi|18 : TGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AG----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACCGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TAAA-CTgatttcctgtcatccaatactgtgccaattctaaatgtcagtttagaaacaccagaagatagtatatagtatgactttgtataatcaaaccgacttgtctgactcattgaagtaaact
gi|19 : ggcttggggtaaaatgctgagtggagtgacatcaatctgcaataggctaagacaatcaaaagctagatgtatgcattcagtaccaatatgtattcaagattatctacatgtacatgtatgtgactctgacagtgatctcgacatattaaaaatatgtttACAC--G--TGC-A-TA--A--A-GGC-A---ATGC---T-ATA---------TG------T--GAGCA-----------A-AA--CATTT----------A-AATATA-G-----AG--G-----GAG--------G---GGC-----AAT---TT--GA-C-ATCAATTTG-CA----CACGT-G-G--AATG-AAG---GA---GGGAGAA-T---GAATGA--CCTT---C-----TAT------AAC-A-A-GGT-G-AT-CAACTAACAAATGC--A----------------A-------------A-ACATCACT-G--ACCAT--A-TCTTTTGCAT--TTCACTCT-A------------AA-CCACTCCAC--TCCACTTCACTCCACT-CAGCATTT--AACTCCAAGC
gi|2 : ctcccatttaatctatttaggtcattttgtcGGCTTGGGGGTAAATA--A--GCTGAGTGGAGTGGAGCGGGCGGATTGTGGAGTGAGTG------------ACATTA-AT-CTGTGAATAGTCTAATACAATTCAAAA---GC------TACAAAT----GTAT-----------------------------TATTCAGGAT-----------------T-ATC-TACATGT------ATG--------T----GACTCTGAT-CA-GTG--------------------TAAAAAT--AAG-------GTTTCTTc
gi|2 : A----CAAATGATTTCC------T----GTCA-TACCAAT-A-CTG---CCAA--TTC-T-AAATGTCATG-G-TTAGA-AACAC-CAGGAAG-AC--GTAT---AT--AT----TATG-ACT--T-GAA-ACATCAT-TTGATAC--------C-GTCCGTAGTACGTACTCA---TTGAGGAGTGAA-ACA------TATGCA--AA--TTATGGGTCATGA-GA--ACAT-GAAAAGGAATGTATGA-CTCTCCAAT-TACAAAG-GGAG-TGAAAATTACAAAATTAGGTAA-CT---G--------------T--TCA----T-AG-T--ATTATGTTTTTATTGAAG---TCCGATT--CA-------G--C-C-G-----------GATACAG-GTGAT--AC-ATG-------A--T-----A------------T----------------CTATG--C-AAG-TGAAA-AAATC-TTT----CAAC-GCATCT-A--C-TTTTACATTAATCATTATGAA----CGTTGATA-A---GGATA-AC-C------------------TC-AATTA-T-----A-----GTTTATTCCAA-AC-----T-----------GGCAGCAGTC--T--CC-----------CC-TTT-----------CA-TCTAT----TTTAACA--A--------G----AGG-TCA--AATTATTT--TTTT----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--GGCTGC-A-AA--A--AAGGC-A---ATACAAAC-AT----------CGC---ACACAGAGTT-CC--TA--T-AATA--CAATTC-GTAA--TTG-AATATA-G-----AG--G-----CGT--------C---AAATTTTTCAT---TT--TA-CTGT----TTG-CA----CCTGG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAAAT---GA------C-TT---T---A-TAT-G-T-C-AC-A-A-GAT-T-GC-CAGCTA-------C--AGTAACAAATCCAA---A-------------A-ACATCACA-G--AC--T------T-----NN--NNNNNNNN-N--N-NNNN-NNNNN-NNNNNNNNN--NN----------NNNN-NNGCTTTT--TA-CCCAAGCaaaaaaacaacaaataaacacaaaaacaaatgatttcctgtcataccaatactgccaattctaaatgtcatggttagaaacaccaggaagacgtatatattatgacttgaaacatcatttgataccgtccgtagtacgtactcattgaggagtgaaacatatgcaaattatgggtcatgagaacatgaaaaggaatgtatgactctccaattacaaagggagtgaaaattacaaaattaggtaactgttcatagtattatgtttttattgaagtccgattcagccggatacaggtgatacatgatatctatgcaagtgaaaaaatctttcaacgcatctacttttacattaatcattatgaacgttgataaggataacctcaattatagtttattccaaactggcagcagtctcccctttcatctattttaacaagaggtcaaattatttttttctgtcatatgtattagattagacaaggctgcaaaaaaggcaatacaaacatcgcacacagagttcctataatacaattcgtaattgaatatagaggcgtcaaatttttcattttactgtttgcacctgggaaatgaaagagagagaaatgactttatatgtcacaagattgccagctacagtaacaaatccaaaaacatcacagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctttttacccaagc
gi|20 : ggcttgggggtaaataagctgagtggagtggagcgggcggattgtggagtgagtgacattaatctgtgaatagtctaatacaattcaaaagctacaaatgtattattcaggattatctacatgtatgtgactctgatcagtgtaaaaataaggtttcttaaaaaaacaacaaataaacacaaaaGGCTTGGGG-TAAA-A--AAAGCTGAGTGGAGTGGA-----------ATGGAGTG----------------ACATTA-ATTCTGCAAATAGGCTAAGACAA-TCAAAA---GC------T--AGATT---GTATGA-------A---------------T--GTATTCAAGA------------------TGATC-TAC----------ATGAATGTATGT----GACTCTGA--CATGTGA-TCTC-AA------CAGATTA-AAAA-C-----------------TGG-----------------------TTTTTTTAAAAACAAATGACTTC-------T----GTCA-T-CCAAT-AACTGTG-CCAA--TTCCT-AAATGTCA-G-T-TT-GA-AACA
gi|21 : -CA----CACAT-G-A--AACG-AAG---GA---GGGAGAG-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-C-GGT-G-AT-CGGCTAATAAACCC--A----------------A-------------A-ACATCAAA-G--AC--T--A-GCGTTC--ATCCTTCGCTCC-A--C-
gi|23 : tctctttatctctctcgttctctctctccaca----CAAATGATTTTC------T----GTAA-C-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTttc
gi|24 : agtgttcttaacatattaaaaatatgggttaaaaaaacaaccccaaaaaccaaacaaaacC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTACAGTATTTAAT---------ACAG----AG----A--ATTTTTTT--TTT-----CTGTCA--------CAGAGTA-GACAA--GA-TGC-A-AA--A--A-GGC-A---AT
gi|25 : acgctccaatttcaggcaggtccccagTA-GAAT-ATGG-GA--ACTT-TAAAG-----------------CAAT-TCCAAAG-G---------------AA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--ATTTTGA--GAAG---GCTG-TCG-CA-------G--C-A-G-----------GATATTG-CTGgt
gi|26 : AATA------------------T-ATG-TAC----------GTG-----------------CTGA--CA-GGGA-TTTC-AGTAGCAGCAGGTCAAAAAT-C-AGCATTTTTGTTTGTTTGGTGGTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTtctatatatcaa
gi|27 : GGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTNNNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNACATTG-AT-CTG-AAATAGGCTAA-ACAT-TCAAAA---
gi|28 : aGAGTAGAGCGGT-----------ATGGAG---G-G------------ACATCG-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GT------T--AGA-----GTATGA-------
gi|29 : ctggttg-ACAA----AG----A--A-TTATTTGTTTT-----CTGTCACA--------GAGTA-GACAA--G--TGC-A-AA--G--A-TAC-A---AT
gi|3 : tatggtattaaacGGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTgt
gi|3 : ------------ACATTA-AT-CTG-AAATAGGCTGAAACAA-TCAAAA---GC------T--ATAT----ATATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTCAATA------------------T-ATC-TAC----------ATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACTT-CAA-AAA-AT-AGTAT---AT--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--T----CT-------T---CATTAA--TT--GGTT-AT---GA--ACAT-GAAAAG-TATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT------------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAAG---TCCG-TT--AA-------G--C-T-G-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AA----CATTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----AT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----TTGTCATATG-TATTAGATTA-G-CAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-------------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A--AT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTC-CTCC-A--C-CCACTTCCGC-CCATCCAAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacattaatctgaaataggctgaaacaatcaaaagctatatatatgaactcagtacccatatgtattcaatatatctacatgtgactctgacagtgatctcaacagattaaaaatcgaggtttttttgggttttttttttttttttttttttacaaatgatttcctgtcatccaatactgtgccaattctaaatgtcagtttagaaacttcaaaaaatagtatatattatgactttgtataatcaaactgacttgtctgactcattgaagtcttcattaattggttatgaacatgaaaagtatgttactcccaattacaaagggggtgaaatacaaattggtaactgtcatgctcattgtttttaaaagtccgttaagctggatacagctgatacctgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgctctacttaacattggtaaagggaaactcattctaatactttctccctttaatctattttaacaacagacagaggtcaattattcttgttgtcatatgtattagattagcaagtgcaaaaaggcaatacaaactgcactgagttccttatacatttcgtatttgaatatagaggtaacaaaaattttgcatttgcatccaggaaatgaaagagagagaatgacctttaatgtcaacaagatgatcagctacataaacatcacagactagcttttgaatttcctccacccacttccgcccatccaattccactcagctttttaccccaagc
gi|30 : gggcttggggtaaaaagctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGCTAATACAA-TCAAAA---GT------T--GGA-----GTATGA-------ACT
gi|31 : -----------------AA----CGTTGGTA-A---AGGAT-AA-CT-----------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------gaactgtaaaaccg
gi|32 : TGGGG-TAAA-AAAA--GCTGAGTGGAGTGGA-----------GTGAAATttcattcca
gi|33 : tgaCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTTGAGTGGT-----------GTGAAAT
gi|4 : gaGGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGA-----------GTT---TACG----------------ATTAGAT-CTG-AAACAAGCTA-TACCA-TAAAAA---AT------T--AGAT----GTATGGTCTAATCATTCAAGATTCCATAAT--G-ATGAAAAAACATAT------------T-ATCCTAC----------ATG--------T----A--TGTGA--CAAGTGACTCTC-AA------C-------AGAT-TAAG-------GTATCT------GTTTTTAGGAA-----------------A----CAATTAATCTCCCTAGGCT----GTCA-T-CTGAT-G-CTGTG-ATGA--TTT-G-CAATGCTA-G-CGTTAGA-AACAT-CA---AG-AT-A-TA----AT--AC----------------------ATCAAACTC-C-T--------T-G-CTA--------ACT----------G--T-------------C---CA--AA--TTA-GGGT-GTGA-AA--ATTT-GAAG-G-AATGT-T-AACTC-CCAAT----AAAG------TGAAA------------------CT---C--------------A--TCA----TTGCCT-TATT--GTTTTTA--GAAG---TGTA-TT--TA-------G--TGA-G-----------GATACAG-TCAAA--AT-TTT-------G--T-----T------------T--------------G-CT--G--CAA-A-TGAC--AA-TC-TTT----TAAC-GC-TCCAA--T-TT-----------------CA----GGT---TA-C---AGG-------------------------TC--------------------------------C-----C-----------C-------GC--T--CC-----------C--TTT-----------AATTCTACAGTATTTAATA--AC-AG---AG----A-----A--T-TTTTTT--TTT-----CTGTCG--------CAGAGTA-GACAA--G--TGA-A-AC--A--A-GGC-A---
gi|4 : -CA----CATAG-G-A--AATGTGAG---GAC--GGGAGAA-T---GA------C-TT---T---A-TAT-G-T-CAAC-ACA-AGT-G-AT-CGGC-----------------------------------------------ATCACAAG--AC--T--AAGCTTTCACTC--TTTGCCCC-A--C---AC-TCC-----ATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAActgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacacacataggaaatgtgaggacgggagaatgactttatatgtcaacacaagtgatcggcatcacaagactaagctttcactctttgccccacactccattccattccactcagctttttaccccaa
gi|5 : gggcttggggtaaaaagctgagtggagtggagtttacgattagatctgaaacaagctataccataaaaaattagatgtatggtctaatcattcaagattccataatgatgaaaaaacatattatcctacatgtatgtgacaagtgactctcaacagattaaggtatctgtttttaggaaacaattaatctccctaggctgtcatctgatgctgtgatgatttgcaatgctagcgttagaaacatcaagatataatacatcaaactccttgctaactgtccaaattagggtgtgaaaatttgaaggaatgttaactcccaataaagtgaaactcatcattgccttattgtttttagaagtgtatttagtgaggatacagtcaaaattttgtttgctgcaaatgacaatcttttaacgctccaatttcaggttacaggtccccgctccctttaattctacagtatttaataacagagaattttttttttctgtcgcagagtagacaagtgaaacaaggcactgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacaTTAAGAAT-CG----------TGTTTTTGG--GGTGTT-----CGTTTTTGTTTTTT--------CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-TTAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACTT-CAG-AAACAT-AGTATTATATTGAT----TATGTACT--TTGTA-TAATCAAGATGACAT--------T-GT-TG--------ACTCA---TTGAGG--TCATTCTT------T---CA--A---TTA-GGTTTATGA-GAGAAC-T-GAAAAG-TATGT-T-A-CTC-C-AATATACAA-G-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CTTCAC--------------G--TCAA---T-GC-T-CAT---GTTTTTA--AAAAGCTTCCG-TT--AAA------G--C-TTG-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGCCAGAA-TCCTTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AAATTACATTGGTACA---AGGAA-AA-C------------------TC-A-TTCAT-----A-----AT----------ACGAG--T-----------T-------TC--C--CC-----------C--TTT-----------A--TCTTT----TTTCAC----C-AG-GCAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----CT--CATATG-TTTAAGATTA-GACAAATG--TGC-A-AACAA--A-GGC-ATTAATACAAAC-AT----------TGC---AC---GAGTT-CCCTT---T-A-TA--CATTTCCGTAT--TTG-AGTATA-G-----AG--G-----CAAGGTAATCAC---ACA-----AAT---TT--TG-C-ATGTA-TTG-CAGACTCACAGCG-A--AATG-AAAAAAGA---GAGAGAA-G---AA------CCTT---TCTTA-TATCG-TTCAAC-A-AAGATCA-ATGCAGCTA-------C--A-T--------------C-------------ATACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TCCACTCC-A--C-CTAA--CCGCTCCATTCCAT--TC----------CAGC-AGGCTTTT--TACCCCAA
gi|6 : GA-------ACTAAGTAC-CCATA-T--GTATTCAAGA------------------T-ATC-TAC----------ATG--------T----GACTCTGA--CA-GTGA-TCTT-AA------CAGATTAAAAAT-TGGG--------------TGG--GTTTT------TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-ATGTG-CCAT--TTC-T-AGATGTCA-GTT-TTAGA-AA-ACACAG-AAG-AT-TGTAT----T--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TCAA-CTT------T---C---AA--TTA-GGTT-ATG--GA--ACAT-GAAAAGAAATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAA-----------------------------------------GATACGG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--G-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--CTTT-----------------TA----CATTGGTA-A---AGGGA-AACC------------------TC-A-TTC-T-----A-----GTTTC-------AT-----TCCAAACATGAAT-------TC--TC-CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A--GC-A---A---AAA--------------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-GAGGCAAG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---GT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---G---------------------------------AT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-TATTTACAAATCCA-A-------------A-ACATCGCA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACT--------CCAC-TCCGCTCCATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|7 : TGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-C--T-------GTTTT
gi|7 : TGACTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-ATGTG-TCAA--TTT-T-AAATGTCA-G-A-TTAGA-ATTAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AT----TTTG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------AATCA---TTGAAG--TGAA-CTA------C---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-TCAAT-CACAAAG-GAGA-TGAAA--TACAAA-TT-AGCAA-CT---CNNNNNNNNNNNNNNN--NNN----N-NN-N-NNNN--NNNNNNN--NNNN---NNNN-NN--NN-------N--N-N-N-----------NNNNNNN-NNNNN--NN-NTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-CCT-A--C-TT-----------------gacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactttatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|7 : tgatctcaacagattaaaaatctgtttA-A---CGGGA-AA-C------------------TC-A-GAC-T-----AAGTTAGC----------ACCAACAT-----------TGAG----TA--T--CC-----------C--TTTT----------AA-TCTAT----TTTAACC--AC-CG-AC------AGG-CCA--A--TA-----TCG-----C--TCA------ATTAGA-TA-GATAA--tatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|7 : tgatctcaacagattaaaaatctgttttgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactT-A--C-TC-----------------AA----TGTTGGT--------GCT-AA-C------------------TT-A-GTC-TG----A-----GT-----------------------------T-------TC--C--CG-----------T--TNN-----------NN-NNNNN----NNNNNNN--NN-NN-NNNN----NNN-NNN--N-NNNNNN--NNN-----NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN-NACAA--G--TGC-A-AA--A--AAGGC-A---ACACAAAC-AT----------TGC---CCT--AACTT-CC--T---T-A-TA--CATTTT-GTAA--TTG-AATATA-G-----AG--G----------------C---AAG-----A---------TG---AT----TTG-CT----CCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-GAT-GTAA-CAAGTC-------C--A----------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCAC------------------------TCCAC--TC----------CATT-CAGTTTTT--TACACCAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|8 : tgatctcaacagattaaaaatctgttttgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactttatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggaGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGA-----------GTG---------------------ACATTA-AT-CTG-AAATAAGCTAATATAA-GCAAAATTTACAATATGT--AGAT----GTATGA-------ACTAAGTAC-GCATA-TAAGTAATCAGGATTCATAATGATGACAAATT-ATC-TAC----------ATA--------T----A--TGTGAATCG-GTGA-TCTCAAA------AAGATCAAAAAT-C
gi|8 : A----CAAATGATTTCC------T----GT-----------------G-TCAA--ATT-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-GAG-AT-A------------T----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC----------------A--------ATTCA---TTAAGA--TGAA-CTA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACTT-TAAAAG-AATGC-T-A-ATC-CCAAT-T-C--AGTGTGA-TGAAA--TATAAA-TT-AGAAA-tattaagaacaaatgatttcctgtgtcaaatttaaatgtcagtttagaaacaccaggagatattatgactttgtataatcaaactgacaattcattaagatgaactatcaaattagggtatgagaactttaaaagaatgctaatcccaattcagtgtgatgaaatataaattagaaatactgtttgcttcagtgactgatcttttaatgctctattttatgataccctcatccttgtttcattccaaaccggggttctctcctaagtccatttaacaaagagggaagttatttttttcaatctatcatatattaggttagacaagtgcaaaatttacactgatttagaggcaagttgacatcaattctgcatttgcacccaggaaatgaaggagggagaatgacccttatatgtcaacaaagtggtcatcacagactagcttttgactttcacttcactccactccacttcactccactcagctttttacccaaagc
gi|8 : gggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataagctaatataagcaaaatttacaatatgtagatgtatgaactaagtacgcatataagtaatcaggattcataatgatgacaaattatctacatatatgtgaatcggtgatctcaaaaagatcaaaaatctattaaga------------T--------------G-CT--T--C-A-G-TGACT-GA-TC-TTT----TAAT-GC-TCT-A--T-TT-----------------TA-------TGATA-C---C--------C------------------TC-A-TCC-T-----T-----GTTTCATTCCAAAC-----CGGGG-------T-------TC--T--CT-----------C--CTA-----------AG-TCCAT----TT-AACA--A-------AG----AGG-GAA--G-TTATTT--TTTTCAATCTATCATAT---ATTAGGTTA-GAC-----------------A--A-G--------TGCAAAA-TT----------TAC---ACT--GA-----T--T---T-A-GAGGCA-------AG--TTG-A---------------------------------C---ATC-----AAT---TC--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAG---GA---GGGAGAA-T---GA------CCCT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-AGT-G-GT---------------------------------------------------CATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGACT--TTCACTTC-A--CTCCAC-TCCAC-----TTCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCAAAGCtactgtttgcttcagtgactgatcttttaatgctctattttatgataccctcatccttgtttcattccaaaccggggttctctcctaagtccatttaacaaagagggaagttatttttttcaatctatcatatattaggttagacaagtgcaaaatttacactgatttagaggcaagttgacatcaattctgcatttgcacccaggaaatgaaggagggagaatgacccttatatgtcaacaaagtggtcatcacagactagcttttgactttcacttcactccactccacttcactccactcagctttttacccaaagc
gi|9 : gggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataagctaatataagcaaaatttacaatatgtagatgtatgaactaagtacgcatataagtaatcaggattcataatgatgacaaattatctacatatatgtgaatcggtgatctcaaaaagatcaaaaatctattaagaacaaatgatttcctgtgtcaaatttaaatgtcagtttagaaacaccaggagatattatgactttgtataatcaaactgacaattcattaagatgaactatcaaattagggtatgagaactttaaaagaatgctaatcccaattcagtgtgatgaaatataaattagaaatactgttGGCTGGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAATGGA-----------GTGGAGTG-G-AATT---------ACATTA-AT-CTG-AAACAAGCT-ATACAA-TCAAAA---AT------T--AGAT----GTATGA-------ACTAAATGC-TCATG-T--CTAATCAA
gi|9 : TTTTTAGGAACAAATTAATTCC------TAGCTGTCA-T-ATGAT-G-CTGTG-TTGA--TTT-G-CAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAT-CA--AAG-AT-A-----------------TA------------A-TAATCAAACTCAC-T--------T-GCCT---------------------------AA-CTG------T---AA--AA--TTA-GGAT-GTGA-AA--ATTT-GAAAGG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-----AAA-GAGT-TGAAA--TATGA----------------------------------TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--G-----------------------------A-G-----------GATACAG-CTG-TCAAC-CAG-------A--T-----ATCAAAATTTGTTT--------------G-CT--G--C-A-A-TGACA-AA-TC-TTT----TAAC-GC-TCC-A--A-TT-------------------------TT---------AGGCA-GG-T------------------CC-----C-C-----A-----G---------------------------------------C--C--CC-----------C--TTT-----------AA-TCT---------------AC-AG---------------------TATTT--TTT-----GTGTCA--------CAGAGTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATttaagattcataatgatgataaacatatatgtgacctgtttttaggaacaaattaattcctagctgtcatatgatgctgtgttgatttgcaatgtcagtttagaaacatcaaagatataataatcaaactcacttgcctaactgtaaaattaggatgtgaaaatttgaaaggaatgttactcccaataaagagttgaaatatgatcatgctcattgtttttagaggatacagctgtcaaccagatatcaaaatttgtttgctgcaatgacaaatcttttaacgctccaattttaggcaggtccccagccccctttaatctacagtattttttgtgtcacagagtagacaagtgcaaaaaggcaatgtatatctctctctacacacacgcatatggaatgagggagggagaatgacctttatatgtcaacacggtgatcagcatcacagactatagctttcatctttcactccactccattcagctttttaccccaag
gi|9 : ggctgggggtaaaaagctgagtggaatggagtggagtggaattacattaatctgaaacaagctatacaatcaaaaattagatgtatgaactaaatgctcatgtctaatcaattaagattcataatgatgataaacatatatgtgacctg-G-G--AATG-AGG---GA---GGGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-C-GGT-G-AT-CAG-----------------------------------------------CATCACA-G--ACTAT--A-GCTTTCATCT--TTCAC------------------------TCCAC--TC----------CATT-CAGCTTTT--TACCCCAAGgtatatctctctctacacacacgcatatggaatgagggagggagaatgacctttatatgtcaacacggtgatcagcatcacagactatagctttcatctttcactccactccattcagctttttaccccaag
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAAACCAAAATCTATTATTTTTCTTTCCGTCTTTTTCAATTAATTACTTACTGTCTAATAGCAAAATATTTCATTGAATTGAAAAAACGATATATATTGTTTACGGAATACAACGAATGGTCAAGATAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 7777777777777777777777777777777777777 111111 1111 1111111 55555555555555555555 4444444444 11111111 111111 3333333333333333333333333333333333333 1111 1111111111 11111111 11111111111 1111 222222222222222222222 222222222222222222222222222222222 33333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111 11111111111 22222222222 111111111 1111111111 11111 3333333333333333333 11111 1111 1111111111111111111 666666666666666666666666666666666666666666 55555555555555555555555 1111111111
lowQualScore : 3 3 44 44 1111111111111111111111111111111111111 3 3 7 3 3 555 000000 55 1111 0000000 2 4 4 55 22222222222222222222 4 3333333333 44444444 3 99 8 3 3 000000 7777777777777777777777777777777777777 3 1 5555 888888 6666 3 3 3 3 3 44 3 3 6 3 3 3 3 44 3 555 555 55 7777 3 55 2 3 7777777777 3 22222222 555 1 44 4 3 22222222222 44 44 2 1 5 2 33 1 5 5 2 2 5 2 666 3 1111 44 3 3 2 222222222222222222222 9999 3 3 3 44 44 555 888888888888888888888888888888888 2 44 3 44444444444444444444444444444444444444444444 2 33 33 8 2 2 2 2 2 6666 2 2 2 33 5 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33 77 00000000000 55 55555555555 2 9999 00000000000 4444 333 22 4 22 999999 222222222 2 2 22 55 4 2 33 33 4 2 333 2 8888888888 555 555 3 999999 3 3 44 3 666 3 3 44444 1111111111111111111 555 44444 555 33 2 2 1111 2 5555 2 2 33 2 6666 888 2 444 6666666666666666666 2 2 2 4 2 2 4 4 2 1 999999999999999999999999999999999999999999 2 2 33 99 33 2 33 44444444444444444444444 33 0000000000 2 33
lowQualScore : . . .. .. ..................................... . . . . . ... ...... .. .... ....... . . . .. .................... . .......... ........ . .. . . . ...... ..................................... . . .... ...... .... . . . . . .. . . . . . . . .. . ... ... .. .... . .. . . .......... . ........ ... . .. . . ........... .. .. . . . . .. . . . . . . . ... . .... .. . . . ..................... .... . . . .. .. ... ................................. . .. . ............................................ . .. .. . . . . . . .... . . . .. . ............................................................................................................................ .. .. ........... .. ........... . .... ........... .... ... .. . .. ...... ......... . . .. .. . . .. .. . . ... . .......... ... ... . ...... . . .. . ... . . ..... ................... ... ..... ... .. . . .... . .... . . .. . .... ... . ... ................... . . . . . . . . . . .......................................... . . .. .. .. . .. ....................... .. .......... . ..
lowQualScore : 3 3 66 66 4444444444444444444444444444444444444 6 6 3 2 3 888 555555 00 4444 8888888 5 0 0 55 00000000000000000000 0 0000000000 55555555 2 55 0 6 6 555555 3333333333333333333333333333333333333 0 4 5555 888888 5555 1 1 1 1 1 22 1 1 2 1 1 3 6 22 3 222 888 00 7777 6 00 3 6 3333333333 3 11111111 444 2 22 7 1 88888888888 22 22 9 2 7 9 99 9 7 7 9 9 7 9 888 1 6666 22 1 1 9 555555555555555555555 6666 1 1 1 22 22 444 666666666666666666666666666666666 9 22 1 33333333333333333333333333333333333333333333 9 99 99 6 9 9 9 9 9 1111 9 9 7 77 3 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 99 66666666666 33 88888888888 2 4444 88888888888 5555 999 99 2 99 888888 888888888 3 2 99 33 4 2 11 11 4 2 999 9 2222222222 444 999 1 333333 1 1 22 1 333 1 1 33333 4444444444444444444 000 33333 000 99 9 9 1111 5 3333 4 4 22 4 1111 888 4 111 9999999999999999999 4 4 4 7 4 4 7 7 4 8 666666666666666666666666666666666666666666 4 4 22 77 22 4 22 44444444444444444444444 44 9999999999 9 99
consensus : GGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGA-----------GTGGAGTG------------------ACATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTCAAGA------------------T-ATC-TACATGT------ATG--------TGACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAGG--TGAA-CTA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT--CA-------G--C-A-G-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AA----CGTTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAN--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAG---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--C-CCAC-TCCGC-CCATTCCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
Reference ( family-1169 ) : GGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGA-----------GTGGAGTG---G--------------ACATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTCAAGA------------------T-ATC-TAC----------ATG--------TGACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAGG--TGAA-CTA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT--CA-------G--C-A-G-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AA----CGTTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAN--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAG---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--C-CCAC-TCCGC-CCATTCCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|1 : CTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGA-----------GTG-----------------------ACATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----ATATGA-------ACTCAGTAC-CTATA-T--GTATTCAATA------------------TCATC-TACATGT------ATG--------TGACTCTGA--CA-GTGT-TCTT-AA------CAGATTAAAAATACG-G-------GTT
gi|1 : A----CAAATGATTTCC------T----GTAAAT-CCAATCA-CTGTGGCCAACATTC-T-AAATGTCAAG-T-TTAGACAACAC-CAG-AAG-ATGAGTAT---AT--ATAGTATATG-ACTATTTGGAACAATCAAATTGAC-TACCACGCGTAGTCAG--------ACTCACCCTTGAG---TGAA-CTA------T---CA--AAAATTA-GG-T-ATGA-GA--ACATCGAAAAG-AATGT-T-A-CTC-TCAAT-T-CAAAG-GGAAATGAAA--TACAAA-CT-GGTAA-CT---C--------------GCGTCA----T-GC-TTCATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT--TA-------GTGC-A-GGATACAACGCTGATAC---CTGAT--ATGCTGCAGTGAAA--TCTTCAA------------C--------------G-CT--C--CGA-GCTGA-A-CA-CC-TTTTATACAAT-GT-AAC-A--T-TTGA---------------AA----CGTTAGAG-A---AAGGATAA-CCGAGTCATACGTCAGTTTTC-A-TTC-TCAAACA-----GC----------AG-----T-----------T-------TC--TTCCC-----------C--TTT-----------CA-TCG------TTTGTTA--AC-AC-AC-G----AGG--CATTA-TTATTT--TT------CTGTCATATGGTATTAGATTAAGACAA--G--TGC-A-AA--ATAA-GGCCA---ATACAAAC-ATACGCCACTAATAC---AC---GAGTT-CC--TATAC-A-TA--CATTTC-GTAAAGTTG-AATATAAG-----AGCGG-----T----------C---AAATTTTTAAT---TT--TGAC-AT----TTGGCA----CCCTG-G-A--AATA-AAG---AAC--GAGAGAA-TAATGA------CCTT---T-----TAT-GCT-CAACGA-A-GAT-GTAA-CAAATT-------CCAA-G--------------A-------------A-ACATACCA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCGCTCC-A--G-CTA---CCAC----TTCCAC--TC----------Caaaaaaaacaaacaaacaaaaacaaatgatttcctgtaaatccaatcactgtggccaacattctaaatgtcaagtttagacaacaccagaagatgagtatatatagtatatgactatttggaacaatcaaattgactaccacgcgtagtcagactcacccttgagtgaactatcaaaaattaggtatgagaacatcgaaaagaatgttactctcaattcaaagggaaatgaaatacaaactggtaactcgcgtcatgcttcattgtttttagaagtccgtttagtgcaggatacaacgctgatacctgatatgctgcagtgaaatcttcaacgctccgagctgaacaccttttatacaatgtaacatttgaaacgttagagaaaggataaccgagtcatacgtcagttttcattctcaaacagcagtttcttcccctttcatcgtttgttaacacacgaggcattattatttttctgtcatatggtattagattaagacaagtgcaaaataaggccaatacaaacatacgccactaatacacgagttcctatacatacatttcgtaaagttgaatataagagcggtcaaatttttaattttgacatttggcaccctggaaataaagaacgagagaataatgaccttttatgctcaacgaagatgtaacaaattccaagaaacataccagactagcttttgaatttcgctccagctaccacttccactcc
gi|10 : cttggggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataggctaatacaatcaaaagctagatatatgaactcagtacctatatgtattcaatatcatctacatgtatgtgactctgacagtgttcttaacagattaaaaatacgggttaaaaaaaacaaacaaacaaaa--AA--TTA-GGGT-ATGAAGA--ACAT-GCAAAG-AATGT-T-A-CTC-TTAAT-TACAAAG-GAGA-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-C-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGTTT--CA-------G--C-A-G-----------GATACAG-CTGAC--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------GCCT--GGCC-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAACGGC-TTT-AAGC-TTTTTACATTAACATGTGAAA----CGTTGGTA-AC--AGGGA-AACC------------------TC-A-TAC-T-----A-----GTTTC-------AT-----TCCAAACGCAG-T-------TC--T--CC-----------CATTTT-----------AA-T-TAT----TTTAACACGAT-GGAACAG----AGGTTCA--A-TTATTC--TTG-----CTGTCATGTG-TATTAGATTA-AACAA--G--TGC-A-AA--A--A-G---------ACAAATGATA---------TGCAGGACT--GAGTTCCC--T---T-A-TA--CATTTC-ATAA--TTGCAATATA-G-----AG---------AG--------C---AAA-----GA-----T--TG--------------A----CACAA-ATATTAATG-AAT---CA----ACAG-A-T---GA------TC---------AGCAT-G-A-C-AT-A-A-G-T-A-AC-CAA-TC-------C--A----------------A-------------A-ACATAATA-GAAAT--TGCG-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-ACTC-CCAT-T--G---CATT-CACTGTC----------CACTCCAGCTTTT--TACCCCAAG
gi|11 : -GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TGAA-CAA------C---CA--A---TT---GGT-ATGA-GA--ACATTGAAAAA-A--GT-T-AACTC-TCAAT-TACAA-G-GAGA-TGAA---TACAAA-TT-GGTAAACT---C--------------G--TCAGTCAT-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGTTT--CA-------G--C-A-G-----------GATACA----GA---GC-TTG----------------A------------T--------------G-CT--G--CAA-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TTG----------------AA----CGTTGGTA-A---AG---------------------------C-A-TTT-------------GT----------AC-----TAGATGAG----T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---------ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----CTGTCATATG-CA------------AA--A--TGCAA-AA--A--A-GGC-A---AAACAAAC-AT----------CG
gi|11 : -----AG--A-----TGA--------C---AAA-----TAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AA-----A---GAGAAAA-T---GA------CCTTATAT---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-----G-AT-CAGCTA-------C--A-TATGTAACAAATCCAA-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACT--------CCAC-TCCGC-T--TTTTAC--CC----------CAaggcaagatgacaaatattttgcatttgcacccaggaaatgaaagagaaaatgaccttatatatatgtcaacaagatcagctacatatgtaacaaatccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccgctttttacccca
gi|12 : gtctgactcattgaagtgaacaaccaattggtatgagaacattgaaaaaagttaactctcaattacaaggagatgaatacaaattggtaaactcgtcagtcatgctcattgtttttagaagtccgtttcagcaggatacagagcttgatgctgcaagtgacaaatctttcaacgctctacttgaacgttggtaaagcatttgtactagatgagttctccctttaatctattttaacacagaggtcaattattcttgctgtcatatgcaaaatgcaaaaaaggcaaaacaaacatcgaggcaAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAAG---TCCG-TTAACATGGTTAAG--C-T-G-----------GATACAG-CTGAC--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGAAA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--CTTT-----------------TA----CATTGGTA-A---AGGGA-AACC------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------ACGA---G-----------T-------TC--TC-CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----TTGTCATATA-TATTAGATTA-GACAA--G--TGCAA-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---TAA-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-GAAGCAAG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T---GA------CGTT---T-----------------------AT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--CTCCAC-TCCGCTCCATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|13 : AG-AT-ATTAT---AT--AT----TATG-ATT--TTTAA-TAATCAAAATAAC-T--------T-GTCTG--------ATTCA---TTGAGG--TGAA-CCA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGG-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-G---------------AA-TT-TGTAA-CT---T--------------G--CCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAAG---GCCG-TCA-CA-------G--C-A-G-----------GATATTGCCTGAT--AT-CAA-------ATTT-----ACTGCT-------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----TAAT-GC-TCT-A--C-TTTTACATTAACATGTG--AA----CGTTAGTA-A---AGGAT-AA-CT-----------------TC-A-TAC-T-----A-----G------------------T-----------T-------TCATT--CCAAACAGGAGTTC--TTC------------A-TCTA-----TTTAAC---AC-AG---AG----AGG-TT--------TTT--TTG-----CTG
gi|14 : -----------------AA----TGTTTGTA-ATATAGGGA-CC-C------------------TCTA-CTG-TGT---A-----GT----------AA-----G-----------T-------TC--T-------------------TT-----------AA-T-TAT----ATCAACA--GCTAT-A-AA----AAG-T-A--A-TT--TT--TTC-----CTGCCAAGTA--ATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A--GC-A---ATGTAAAC-A------------GC---A-T--GAGTT-TC--------A--A--CATATC-GTAA--GGA-AATATA-G-----AA--G-----C-A--------CGTTGAA-----AATCAATTCGCG-C-AT----TT--CA------CAA-G-A--AATG-AAG---GATGCGATGGAA-T---GAATGACGCCTT---C---ATTAT-G-T-CAACTA-A-CATAA-AT-C------------C--G-A--------------A-------------A-ACATCACA-G---CTAT--A-GCGTTTGAA---TACACTCCAA--T-CCAC-TCCAC-CCACT---------------------T-CAGCTTTTTATACCCCAgattagctctgtgctgttatatgt
gi|15 : cactttaacatgA-------A--C-A-G-----------GACACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------TCATATTTACTGCTTG-CT--A--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAA-GC-TCT----T-TT-----------------AA----Cgc
gi|15 : ttgtttcaactg-----------C--TTTCA---------AA-GCTCT----TTTAACA---C-AG-ATAGCTCTAGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----TTGTCATATG-TATAAGATTA-GACAA--G--TGC-ACAA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------AGC---ACC--AAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GAAA--TTG-AATATA-G-----AG--G----------------C---AAG---------------TG-C-AT----TTG-CA----ACCAG-A-A--AATG-AAA---GA---GAGAG------------------------------T-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------ATCAACAAATCCAAA-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCAC------------------------TCCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAacagatagctctaggtcaattatttttgttgtcatatgtataagattagacaagtgcacaaaaggcaatacaaacatagcaccaagttccttatacatttcgaaattgaatatagaggcaagtgcatttgcaaccagaaaatgaaagagagagtgtcaacaagatgatcagctacatatcaacaaatccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccactcagctttttacccca
gi|16 : ttgtttcaactgaacaggacacagctgatacctgatatcatatttactgcttgctacagtgacaaatGACTTGGAG-TAAA-A--A--GGTGAGTGGAGTGGA-----------GTA-----------------------ACATTA-AT-CTA-AAATAGACTA-------CCAAAA---GC------T--AGATCGATGTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTCAAGA------------------TGATC-TACATGT------ATG--------TGACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTTAAAAT-
gi|16 : gaA----CAAATGATTTCC------T----GTCG-T-CCAAT-A-ATGTG-TTAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTATA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---Aatgtgtcttaaaaacaaatgatttcctgtcgtccaataatgtgttaattctaaatgtcagtttataaacaccagaagatagtatagaagtgaactacatgtatcaaattagggtatgagaacatgaaaagagtgttactccc
gi|16 : gagacttggagtaaaaaggtgagtggagtggagtaacattaatctaaaatagactaccaaaagctagatcgatgtatgaactcagtacccatatgtattcaagatgatctacatgtatgtgactctgacagtgatctcaacagatttaaaatatgtgtcttaaaaA---TAGAAG--TGAA-CTACATGTAT---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AGTGT-T-A-CTC-CCgaagtgaactacatgtatcaaattagggtatgagaacatgaaaagagtgttactccc
gi|17 : gagacttggagtaaaaaggtgagtggagtggagtaacattaatctaaaatagactaccaaaagctagatcgatgtatgaactcagtacccatatgtattcaagatgatctacatgtatgtgactctgacagtgatctcaacagatttaaaatatgtgtcttaaaaacaaatgatttcctgtcgtccaataatgtgttaattctaaatgtcagtttataaacaccagaagatagt------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----GAG---------T-------TC--T--CC-----------C--CTTTAATCCAATGTAA-TCTAT----TTTAACA---C-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----TTGTCATATG-CA-----------------------A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-G-----AG--GCAAGGTAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T------------------T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-CAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--C----------T-CCATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|18 : GGCTTGGGG-TAAA-A--T--GCTGAGTGGAGTG---------------------------------------ACATCA-AT-CTG-CAATAGGCTAAGACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGC-------ATTCAGTAC-CAATA-T--GTATTCAAGAT-----------------T-ATC-TACATGTACATGTATG--------TGACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-GA------CATATTAAAAAT---AT-------GTTTT
gi|18 : TGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AG----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACCGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TAAA-CTgatttcctgtcatccaatactgtgccaattctaaatgtcagtttagaaacaccagaagatagtatatagtatgactttgtataatcaaaccgacttgtctgactcattgaagtaaact
gi|19 : ggcttggggtaaaatgctgagtggagtgacatcaatctgcaataggctaagacaatcaaaagctagatgtatgcattcagtaccaatatgtattcaagattatctacatgtacatgtatgtgactctgacagtgatctcgacatattaaaaatatgtttACAC--G--TGC-A-TA--A--A-GGC-A---ATGC---T-ATA---------TG------T--GAGCA-----------A-AA--CATTT----------A-AATATA-G-----AG--G-----GAG--------G---GGC-----AAT---TT--GA-C-ATCAATTTG-CA----CACGT-G-G--AATG-AAG---GA---GGGAGAA-T---GAATGA--CCTT---C-----TAT------AAC-A-A-GGT-G-AT-CAACTAACAAATGC--A----------------A-------------A-ACATCACT-G--ACCAT--A-TCTTTTGCAT--TTCACTCT-A------------AA-CCACTCCAC--TCCACTTCACTCCACT-CAGCATTT--AACTCCAAGC
gi|2 : ctcccatttaatctatttaggtcattttgtcGGCTTGGGGGTAAATA--A--GCTGAGTGGAGTGGAGCGGGCGGATTGTGGAGTGAGTG--------------ACATTA-AT-CTGTGAATAGTCTAATACAATTCAAAA---GC------TACAAAT----GTAT-----------------------------TATTCAGGAT-----------------T-ATC-TACATGT------ATG--------TGACTCTGAT-CA-GTG--------------------TAAAAAT--AAG-------GTTTCTTc
gi|2 : A----CAAATGATTTCC------T----GTCA-TACCAAT-A-CTG---CCAA--TTC-T-AAATGTCATG-G-TTAGA-AACAC-CAGGAAG-AC--GTAT---AT--AT----TATG-ACT--T-GAA-ACATCAT-TTGATAC--------C-GTCCGTAGTACGTACTCA---TTGAGGAGTGAA-ACA------TATGCA--AA--TTATGGGTCATGA-GA--ACAT-GAAAAGGAATGTATGA-CTCTCCAAT-TACAAAG-GGAG-TGAAAATTACAAAATTAGGTAA-CT---G--------------T--TCA----T-AG-T--ATTATGTTTTTATTGAAG---TCCGATT--CA-------G--C-C-G-----------GATACAG-GTGAT--AC-ATG-------A--T-----A------------T----------------CTATG--C-AAG-TGAAA-AAATC-TTT----CAAC-GCATCT-A--C-TTTTACATTAATCATTATGAA----CGTTGATA-A---GGATA-AC-C------------------TC-AATTA-T-----A-----GTTTATTCCAA-AC-----T-----------GGCAGCAGTC--T--CC-----------CC-TTT-----------CA-TCTAT----TTTAACA--A--------G----AGG-TCA--AATTATTT--TTTT----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--GGCTGC-A-AA--A--AAGGC-A---ATACAAAC-AT----------CGC---ACACAGAGTT-CC--TA--T-AATA--CAATTC-GTAA--TTG-AATATA-G-----AG--G-----CGT--------C---AAATTTTTCAT---TT--TA-CTGT----TTG-CA----CCTGG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAAAT---GA------C-TT---T---A-TAT-G-T-C-AC-A-A-GAT-T-GC-CAGCTA-------C--AGTAACAAATCCAA---A-------------A-ACATCACA-G--AC--T------T-----NN--NNNNNNNN-N--N-NNNN-NNNNN-NNNNNNNNN--NN----------NNNN-NNGCTTTT--TA-CCCAAGCaaaaaaacaacaaataaacacaaaaacaaatgatttcctgtcataccaatactgccaattctaaatgtcatggttagaaacaccaggaagacgtatatattatgacttgaaacatcatttgataccgtccgtagtacgtactcattgaggagtgaaacatatgcaaattatgggtcatgagaacatgaaaaggaatgtatgactctccaattacaaagggagtgaaaattacaaaattaggtaactgttcatagtattatgtttttattgaagtccgattcagccggatacaggtgatacatgatatctatgcaagtgaaaaaatctttcaacgcatctacttttacattaatcattatgaacgttgataaggataacctcaattatagtttattccaaactggcagcagtctcccctttcatctattttaacaagaggtcaaattatttttttctgtcatatgtattagattagacaaggctgcaaaaaaggcaatacaaacatcgcacacagagttcctataatacaattcgtaattgaatatagaggcgtcaaatttttcattttactgtttgcacctgggaaatgaaagagagagaaatgactttatatgtcacaagattgccagctacagtaacaaatccaaaaacatcacagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctttttacccaagc
gi|20 : ggcttgggggtaaataagctgagtggagtggagcgggcggattgtggagtgagtgacattaatctgtgaatagtctaatacaattcaaaagctacaaatgtattattcaggattatctacatgtatgtgactctgatcagtgtaaaaataaggtttcttaaaaaaacaacaaataaacacaaaaGGCTTGGGG-TAAA-A--AAAGCTGAGTGGAGTGGA-----------ATGGAGTG------------------ACATTA-ATTCTGCAAATAGGCTAAGACAA-TCAAAA---GC------T--AGATT---GTATGA-------A---------------T--GTATTCAAGA------------------TGATC-TAC----------ATGAATGTATGTGACTCTGA--CATGTGA-TCTC-AA------CAGATTA-AAAA-C-----------------TGG-----------------------TTTTTTTAAAAACAAATGACTTC-------T----GTCA-T-CCAAT-AACTGTG-CCAA--TTCCT-AAATGTCA-G-T-TT-GA-AACA
gi|21 : -CA----CACAT-G-A--AACG-AAG---GA---GGGAGAG-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-C-GGT-G-AT-CGGCTAATAAACCC--A----------------A-------------A-ACATCAAA-G--AC--T--A-GCGTTC--ATCCTTCGCTCC-A--C-
gi|23 : tctctttatctctctcgttctctctctccaca----CAAATGATTTTC------T----GTAA-C-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTttc
gi|24 : agtgttcttaacatattaaaaatatgggttaaaaaaacaaccccaaaaaccaaacaaaacC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTACAGTATTTAAT---------ACAG----AG----A--ATTTTTTT--TTT-----CTGTCA--------CAGAGTA-GACAA--GA-TGC-A-AA--A--A-GGC-A---AT
gi|25 : acgctccaatttcaggcaggtccccagTA-GAAT-ATGG-GA--ACTT-TAAAG-----------------CAAT-TCCAAAG-G---------------AA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--ATTTTGA--GAAG---GCTG-TCG-CA-------G--C-A-G-----------GATATTG-CTGgt
gi|26 : AATA------------------T-ATG-TAC----------GTG-------------CTGA--CA-GGGA-TTTC-AGTAGCAGCAGGTCAAAAAT-C-AGCATTTTTGTTTGTTTGGTGGTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTtctatatatcaa
gi|27 : GGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTNNNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNACATTG-AT-CTG-AAATAGGCTAA-ACAT-TCAAAA---
gi|28 : aGAGTAGAGCGGT-----------ATGGAG-G---G--------------ACATCG-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GT------T--AGA-----GTATGA-------
gi|29 : ctggttg-ACAA----AG----A--A-TTATTTGTTTT-----CTGTCACA--------GAGTA-GACAA--G--TGC-A-AA--G--A-TAC-A---AT
gi|3 : tatggtattaaacGGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTgt
gi|3 : --------------ACATTA-AT-CTG-AAATAGGCTGAAACAA-TCAAAA---GC------T--ATAT----ATATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTCAATA------------------T-ATC-TAC----------ATG--------TGACTCTGA--CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACTT-CAA-AAA-AT-AGTAT---AT--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--T----CT-------T---CATTAA--TT--GGTT-AT---GA--ACAT-GAAAAG-TATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT------------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAAG---TCCG-TT--AA-------G--C-T-G-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AA----CATTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----AT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----TTGTCATATG-TATTAGATTA-G-CAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-------------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A--AT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTC-CTCC-A--C-CCACTTCCGC-CCATCCAAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacattaatctgaaataggctgaaacaatcaaaagctatatatatgaactcagtacccatatgtattcaatatatctacatgtgactctgacagtgatctcaacagattaaaaatcgaggtttttttgggttttttttttttttttttttttacaaatgatttcctgtcatccaatactgtgccaattctaaatgtcagtttagaaacttcaaaaaatagtatatattatgactttgtataatcaaactgacttgtctgactcattgaagtcttcattaattggttatgaacatgaaaagtatgttactcccaattacaaagggggtgaaatacaaattggtaactgtcatgctcattgtttttaaaagtccgttaagctggatacagctgatacctgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgctctacttaacattggtaaagggaaactcattctaatactttctccctttaatctattttaacaacagacagaggtcaattattcttgttgtcatatgtattagattagcaagtgcaaaaaggcaatacaaactgcactgagttccttatacatttcgtatttgaatatagaggtaacaaaaattttgcatttgcatccaggaaatgaaagagagagaatgacctttaatgtcaacaagatgatcagctacataaacatcacagactagcttttgaatttcctccacccacttccgcccatccaattccactcagctttttaccccaagc
gi|30 : gggcttggggtaaaaagctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGCTAATACAA-TCAAAA---GT------T--GGA-----GTATGA-------ACT
gi|31 : -----------------AA----CGTTGGTA-A---AGGAT-AA-CT-----------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------gaactgtaaaaccg
gi|32 : TGGGG-TAAA-AAAA--GCTGAGTGGAGTGGA-----------GTGAAATttcattcca
gi|33 : tgaCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTTGAGTGGT-----------GTGAAAT
gi|4 : gaGGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGA-----------GTTTA-CG--------------------ATTAGAT-CTG-AAACAAGCTA-TACCA-TAAAAA---AT------T--AGAT----GTATGGTCTAATCATTCAAGATTCCATAAT--G-ATGAAAAAACATAT------------T-ATCCTAC----------ATG--------TA--TGTGA--CAAGTGACTCTC-AA------C-------AGAT-TAAG-------GTATCT------GTTTTTAGGAA-----------------A----CAATTAATCTCCCTAGGCT----GTCA-T-CTGAT-G-CTGTG-ATGA--TTT-G-CAATGCTA-G-CGTTAGA-AACAT-CA---AG-AT-A-TA----AT--AC----------------------ATCAAACTC-C-T--------T-G-CTA--------ACT----------G--T-------------C---CA--AA--TTA-GGGT-GTGA-AA--ATTT-GAAG-G-AATGT-T-AACTC-CCAAT----AAAG------TGAAA------------------CT---C--------------A--TCA----TTGCCT-TATT--GTTTTTA--GAAG---TGTA-TT--TA-------G--TGA-G-----------GATACAG-TCAAA--AT-TTT-------G--T-----T------------T--------------G-CT--G--CAA-A-TGAC--AA-TC-TTT----TAAC-GC-TCCAA--T-TT-----------------CA----GGT---TA-C---AGG-------------------------TC--------------------------------C-----C-----------C-------GC--T--CC-----------C--TTT-----------AATTCTACAGTATTTAATA--AC-AG---AG----A-----A--T-TTTTTT--TTT-----CTGTCG--------CAGAGTA-GACAA--G--TGA-A-AC--A--A-GGC-A---
gi|4 : -CA----CATAG-G-A--AATGTGAG---GAC--GGGAGAA-T---GA------C-TT---T---A-TAT-G-T-CAAC-ACA-AGT-G-AT-CGGC-----------------------------------------------ATCACAAG--AC--T--AAGCTTTCACTC--TTTGCCCC-A--C---AC-TCC-----ATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAActgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacacacataggaaatgtgaggacgggagaatgactttatatgtcaacacaagtgatcggcatcacaagactaagctttcactctttgccccacactccattccattccactcagctttttaccccaa
gi|5 : gggcttggggtaaaaagctgagtggagtggagtttacgattagatctgaaacaagctataccataaaaaattagatgtatggtctaatcattcaagattccataatgatgaaaaaacatattatcctacatgtatgtgacaagtgactctcaacagattaaggtatctgtttttaggaaacaattaatctccctaggctgtcatctgatgctgtgatgatttgcaatgctagcgttagaaacatcaagatataatacatcaaactccttgctaactgtccaaattagggtgtgaaaatttgaaggaatgttaactcccaataaagtgaaactcatcattgccttattgtttttagaagtgtatttagtgaggatacagtcaaaattttgtttgctgcaaatgacaatcttttaacgctccaatttcaggttacaggtccccgctccctttaattctacagtatttaataacagagaattttttttttctgtcgcagagtagacaagtgaaacaaggcactgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacaTTAAGAAT-CG----------TGTTTTTGG--GGTGTT-----CGTTTTTGTTTTTT--------CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-TTAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACTT-CAG-AAACAT-AGTATTATATTGAT----TATGTACT--TTGTA-TAATCAAGATGACAT--------T-GT-TG--------ACTCA---TTGAGG--TCATTCTT------T---CA--A---TTA-GGTTTATGA-GAGAAC-T-GAAAAG-TATGT-T-A-CTC-C-AATATACAA-G-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CTTCAC--------------G--TCAA---T-GC-T-CAT---GTTTTTA--AAAAGCTTCCG-TT--AAA------G--C-TTG-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGCCAGAA-TCCTTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AAATTACATTGGTACA---AGGAA-AA-C------------------TC-A-TTCAT-----A-----AT----------ACGAG--T-----------T-------TC--C--CC-----------C--TTT-----------A--TCTTT----TTTCAC----C-AG-GCAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----CT--CATATG-TTTAAGATTA-GACAAATG--TGC-A-AACAA--A-GGC-ATTAATACAAAC-AT----------TGC---AC---GAGTT-CCCTT---T-A-TA--CATTTCCGTAT--TTG-AGTATA-G-----AG--G-----CAAGGTAATCAC---ACA-----AAT---TT--TG-C-ATGTA-TTG-CAGACTCACAGCG-A--AATG-AAAAAAGA---GAGAGAA-G---AA------CCTT---TCTTA-TATCG-TTCAAC-A-AAGATCA-ATGCAGCTA-------C--A-T--------------C-------------ATACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TCCACTCC-A--C-CTAA--CCGCTCCATTCCAT--TC----------CAGC-AGGCTTTT--TACCCCAA
gi|6 : GA-------ACTAAGTAC-CCATA-T--GTATTCAAGA------------------T-ATC-TAC----------ATG--------TGACTCTGA--CA-GTGA-TCTT-AA------CAGATTAAAAAT-TGGG--------------TGG--GTTTT------TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-ATGTG-CCAT--TTC-T-AGATGTCA-GTT-TTAGA-AA-ACACAG-AAG-AT-TGTAT----T--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TCAA-CTT------T---C---AA--TTA-GGTT-ATG--GA--ACAT-GAAAAGAAATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAA-----------------------------------------GATACGG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--G-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--CTTT-----------------TA----CATTGGTA-A---AGGGA-AACC------------------TC-A-TTC-T-----A-----GTTTC-------AT-----TCCAAACATGAAT-------TC--TC-CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A--GC-A---A---AAA--------------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-GAGGCAAG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---GT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---G---------------------------------AT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-TATTTACAAATCCA-A-------------A-ACATCGCA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACT--------CCAC-TCCGCTCCATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|7 : TGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-C--T-------GTTTT
gi|7 : TGACTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-ATGTG-TCAA--TTT-T-AAATGTCA-G-A-TTAGA-ATTAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AT----TTTG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------AATCA---TTGAAG--TGAA-CTA------C---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-TCAAT-CACAAAG-GAGA-TGAAA--TACAAA-TT-AGCAA-CT---CNNNNNNNNNNNNNNN--NNN----N-NN-N-NNNN--NNNNNNN--NNNN---NNNN-NN--NN-------N--N-N-N-----------NNNNNNN-NNNNN--NN-NTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-CCT-A--C-TT-----------------gacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactttatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|7 : tgatctcaacagattaaaaatctgtttA-A---CGGGA-AA-C------------------TC-A-GAC-T-----AAGTTAGC----------ACCAACAT-----------TGAG----TA--T--CC-----------C--TTTT----------AA-TCTAT----TTTAACC--AC-CG-AC------AGG-CCA--A--TA-----TCG-----C--TCA------ATTAGA-TA-GATAA--tatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|7 : tgatctcaacagattaaaaatctgttttgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactT-A--C-TC-----------------AA----TGTTGGT--------GCT-AA-C------------------TT-A-GTC-TG----A-----GT-----------------------------T-------TC--C--CG-----------T--TNN-----------NN-NNNNN----NNNNNNN--NN-NN-NNNN----NNN-NNN--N-NNNNNN--NNN-----NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN-NACAA--G--TGC-A-AA--A--AAGGC-A---ACACAAAC-AT----------TGC---CCT--AACTT-CC--T---T-A-TA--CATTTT-GTAA--TTG-AATATA-G-----AG--G----------------C---AAG-----A---------TG---AT----TTG-CT----CCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-GAT-GTAA-CAAGTC-------C--A----------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCAC------------------------TCCAC--TC----------CATT-CAGTTTTT--TACACCAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|8 : tgatctcaacagattaaaaatctgttttgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactttatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggaGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGA-----------GTG-----------------------ACATTA-AT-CTG-AAATAAGCTAATATAA-GCAAAATTTACAATATGT--AGAT----GTATGA-------ACTAAGTAC-GCATA-TAAGTAATCAGGATTCATAATGATGACAAATT-ATC-TAC----------ATA--------TA--TGTGAATCG-GTGA-TCTCAAA------AAGATCAAAAAT-C
gi|8 : A----CAAATGATTTCC------T----GT-----------------G-TCAA--ATT-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-GAG-AT-A------------T----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC----------------A--------ATTCA---TTAAGA--TGAA-CTA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACTT-TAAAAG-AATGC-T-A-ATC-CCAAT-T-C--AGTGTGA-TGAAA--TATAAA-TT-AGAAA-tattaagaacaaatgatttcctgtgtcaaatttaaatgtcagtttagaaacaccaggagatattatgactttgtataatcaaactgacaattcattaagatgaactatcaaattagggtatgagaactttaaaagaatgctaatcccaattcagtgtgatgaaatataaattagaaatactgtttgcttcagtgactgatcttttaatgctctattttatgataccctcatccttgtttcattccaaaccggggttctctcctaagtccatttaacaaagagggaagttatttttttcaatctatcatatattaggttagacaagtgcaaaatttacactgatttagaggcaagttgacatcaattctgcatttgcacccaggaaatgaaggagggagaatgacccttatatgtcaacaaagtggtcatcacagactagcttttgactttcacttcactccactccacttcactccactcagctttttacccaaagc
gi|8 : gggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataagctaatataagcaaaatttacaatatgtagatgtatgaactaagtacgcatataagtaatcaggattcataatgatgacaaattatctacatatatgtgaatcggtgatctcaaaaagatcaaaaatctattaaga------------T--------------G-CT--T--C-A-G-TGACT-GA-TC-TTT----TAAT-GC-TCT-A--T-TT-----------------TA-------TGATA-C---C--------C------------------TC-A-TCC-T-----T-----GTTTCATTCCAAAC-----CGGGG-------T-------TC--T--CT-----------C--CTA-----------AG-TCCAT----TT-AACA--A-------AG----AGG-GAA--G-TTATTT--TTTTCAATCTATCATAT---ATTAGGTTA-GAC-----------------A--A-G--------TGCAAAA-TT----------TAC---ACT--GA-----T--T---T-A-GAGGCA-------AG--TTG-A---------------------------------C---ATC-----AAT---TC--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAG---GA---GGGAGAA-T---GA------CCCT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-AGT-G-GT---------------------------------------------------CATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGACT--TTCACTTC-A--CTCCAC-TCCAC-----TTCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCAAAGCtactgtttgcttcagtgactgatcttttaatgctctattttatgataccctcatccttgtttcattccaaaccggggttctctcctaagtccatttaacaaagagggaagttatttttttcaatctatcatatattaggttagacaagtgcaaaatttacactgatttagaggcaagttgacatcaattctgcatttgcacccaggaaatgaaggagggagaatgacccttatatgtcaacaaagtggtcatcacagactagcttttgactttcacttcactccactccacttcactccactcagctttttacccaaagc
gi|9 : gggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataagctaatataagcaaaatttacaatatgtagatgtatgaactaagtacgcatataagtaatcaggattcataatgatgacaaattatctacatatatgtgaatcggtgatctcaaaaagatcaaaaatctattaagaacaaatgatttcctgtgtcaaatttaaatgtcagtttagaaacaccaggagatattatgactttgtataatcaaactgacaattcattaagatgaactatcaaattagggtatgagaactttaaaagaatgctaatcccaattcagtgtgatgaaatataaattagaaatactgttGGCTGGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAATGGA-----------GTGGAGTG---GAATT----------ACATTA-AT-CTG-AAACAAGCT-ATACAA-TCAAAA---AT------T--AGAT----GTATGA-------ACTAAATGC-TCATG-T--CTAATCAA
gi|9 : TTTTTAGGAACAAATTAATTCC------TAGCTGTCA-T-ATGAT-G-CTGTG-TTGA--TTT-G-CAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAT-CA--AAG-AT-A-----------------TA------------A-TAATCAAACTCAC-T--------T-GCCT---------------------------AA-CTG------T---AA--AA--TTA-GGAT-GTGA-AA--ATTT-GAAAGG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-----AAA-GAGT-TGAAA--TATGA----------------------------------TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--G-----------------------------A-G-----------GATACAG-CTG-TCAAC-CAG-------A--T-----ATCAAAATTTGTTT--------------G-CT--G--C-A-A-TGACA-AA-TC-TTT----TAAC-GC-TCC-A--A-TT-------------------------TT---------AGGCA-GG-T------------------CC-----C-C-----A-----G---------------------------------------C--C--CC-----------C--TTT-----------AA-TCT---------------AC-AG---------------------TATTT--TTT-----GTGTCA--------CAGAGTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATttaagattcataatgatgataaacatatatgtgacctgtttttaggaacaaattaattcctagctgtcatatgatgctgtgttgatttgcaatgtcagtttagaaacatcaaagatataataatcaaactcacttgcctaactgtaaaattaggatgtgaaaatttgaaaggaatgttactcccaataaagagttgaaatatgatcatgctcattgtttttagaggatacagctgtcaaccagatatcaaaatttgtttgctgcaatgacaaatcttttaacgctccaattttaggcaggtccccagccccctttaatctacagtattttttgtgtcacagagtagacaagtgcaaaaaggcaatgtatatctctctctacacacacgcatatggaatgagggagggagaatgacctttatatgtcaacacggtgatcagcatcacagactatagctttcatctttcactccactccattcagctttttaccccaag
gi|9 : ggctgggggtaaaaagctgagtggaatggagtggagtggaattacattaatctgaaacaagctatacaatcaaaaattagatgtatgaactaaatgctcatgtctaatcaattaagattcataatgatgataaacatatatgtgacctg-G-G--AATG-AGG---GA---GGGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-C-GGT-G-AT-CAG-----------------------------------------------CATCACA-G--ACTAT--A-GCTTTCATCT--TTCAC------------------------TCCAC--TC----------CATT-CAGCTTTT--TACCCCAAGgtatatctctctctacacacacgcatatggaatgagggagggagaatgacctttatatgtcaacacggtgatcagcatcacagactatagctttcatctttcactccactccattcagctttttaccccaag
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAAACCAAAATCTATTATTTTTCTTTCCGTCTTTTTCAATTAATTACTTACTGTCTAATAGCAAAATATTTCATTGAATTGAAAAAACGATATATATTGTTTACGGAATACAACGAATGGTCAAGATAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222222222222 333333333333333 111111 1111 1111111 777777777777777777777777777777 111111 111111 3333333333333333333333333333333333333 1111 1111111111 11111111 11111111111 1111 222222222222222222222 222222222222222222222222222222222 33333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111 11111111111 22222222222 111111111 1111111111 11111 3333333333333333333 11111 1111 1111111111111111111 666666666666666666666666666666666666666666 55555555555555555555555 1111111111
lowQualScore : 3 3 44 44 88 000000000000000 111111111111111 3 3 3 7 3 3 555 000000 55 1111 0000000 2 4 4 55 8888 111111111111111111111111111111 444444 7777 2 4 4 3 3 000000 7777777777777777777777777777777777777 3 1 5555 888888 6666 3 3 3 3 3 44 3 3 6 3 3 3 3 44 3 555 555 55 7777 3 55 2 3 7777777777 3 22222222 555 1 44 4 3 22222222222 44 44 2 1 5 2 33 1 5 5 2 2 5 2 666 3 1111 44 3 3 2 222222222222222222222 9999 3 3 3 44 44 555 888888888888888888888888888888888 2 44 3 44444444444444444444444444444444444444444444 2 33 33 8 2 2 2 2 2 6666 2 2 2 33 5 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33 77 00000000000 55 55555555555 2 9999 00000000000 4444 333 22 4 22 999999 222222222 2 2 22 55 4 2 33 33 4 2 333 2 8888888888 555 555 3 999999 3 3 44 3 666 3 3 44444 1111111111111111111 555 44444 555 33 2 2 1111 2 5555 2 2 33 2 6666 888 2 444 6666666666666666666 2 2 2 4 2 2 4 4 2 1 999999999999999999999999999999999999999999 2 2 33 99 33 2 33 44444444444444444444444 33 0000000000 2 33
lowQualScore : . . .. .. .. ............... ............... . . . . . . ... ...... .. .... ....... . . . .. .... .............................. ...... .... . . . . . ...... ..................................... . . .... ...... .... . . . . . .. . . . . . . . .. . ... ... .. .... . .. . . .......... . ........ ... . .. . . ........... .. .. . . . . .. . . . . . . . ... . .... .. . . . ..................... .... . . . .. .. ... ................................. . .. . ............................................ . .. .. . . . . . . .... . . . .. . ............................................................................................................................ .. .. ........... .. ........... . .... ........... .... ... .. . .. ...... ......... . . .. .. . . .. .. . . ... . .......... ... ... . ...... . . .. . ... . . ..... ................... ... ..... ... .. . . .... . .... . . .. . .... ... . ... ................... . . . . . . . . . . .......................................... . . .. .. .. . .. ....................... .. .......... . ..
lowQualScore : 3 3 66 66 22 888888888888888 888888888888888 6 6 6 3 2 3 888 555555 00 4444 8888888 5 0 0 55 5555 000000000000000000000000000000 111111 7777 1 0 0 6 6 555555 3333333333333333333333333333333333333 0 4 5555 888888 5555 1 1 1 1 1 22 1 1 2 1 1 3 6 22 3 222 888 00 7777 6 00 3 6 3333333333 3 11111111 444 2 22 7 1 88888888888 22 22 9 2 7 9 99 9 7 7 9 9 7 9 888 1 6666 22 1 1 9 555555555555555555555 6666 1 1 1 22 22 444 666666666666666666666666666666666 9 22 1 33333333333333333333333333333333333333333333 9 99 99 6 9 9 9 9 9 1111 9 9 7 77 3 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 99 66666666666 33 88888888888 2 4444 88888888888 5555 999 99 2 99 888888 888888888 3 2 99 33 4 2 11 11 4 2 999 9 2222222222 444 999 1 333333 1 1 22 1 333 1 1 33333 4444444444444444444 000 33333 000 99 9 9 1111 5 3333 4 4 22 4 1111 888 4 111 9999999999999999999 4 4 4 7 4 4 7 7 4 8 666666666666666666666666666666666666666666 4 4 22 77 22 4 22 44444444444444444444444 44 9999999999 9 99
consensus : GGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGAGTG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTC----AAGA------------------T-----------ATC------TACATG----TATGTGACTCTGA-CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAGG--TGAA-CTA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT--CA-------G--C-A-G-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AA----CGTTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAN--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAG---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--C-CCAC-TCCGC-CCATTCCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
Reference ( family-1169 ) : GGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGAGTG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTC----AAGA------------------T-----------ATC------TACATG----TATGTGACTCTGA-CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAGG--TGAA-CTA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT--CA-------G--C-A-G-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AA----CGTTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAN--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAG---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--C-CCAC-TCCGC-CCATTCCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|1 : CTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGT-----GGAGTG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----ATATGA-------ACTCAGTAC-CTATA-T--GTATTC----AATA------------------TC----------ATC------TACATG----TATGTGACTCTGA-CA-GTGT-TCTT-AA------CAGATTAAAAATACG-G-------GTT
gi|1 : A----CAAATGATTTCC------T----GTAAAT-CCAATCA-CTGTGGCCAACATTC-T-AAATGTCAAG-T-TTAGACAACAC-CAG-AAG-ATGAGTAT---AT--ATAGTATATG-ACTATTTGGAACAATCAAATTGAC-TACCACGCGTAGTCAG--------ACTCACCCTTGAG---TGAA-CTA------T---CA--AAAATTA-GG-T-ATGA-GA--ACATCGAAAAG-AATGT-T-A-CTC-TCAAT-T-CAAAG-GGAAATGAAA--TACAAA-CT-GGTAA-CT---C--------------GCGTCA----T-GC-TTCATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT--TA-------GTGC-A-GGATACAACGCTGATAC---CTGAT--ATGCTGCAGTGAAA--TCTTCAA------------C--------------G-CT--C--CGA-GCTGA-A-CA-CC-TTTTATACAAT-GT-AAC-A--T-TTGA---------------AA----CGTTAGAG-A---AAGGATAA-CCGAGTCATACGTCAGTTTTC-A-TTC-TCAAACA-----GC----------AG-----T-----------T-------TC--TTCCC-----------C--TTT-----------CA-TCG------TTTGTTA--AC-AC-AC-G----AGG--CATTA-TTATTT--TT------CTGTCATATGGTATTAGATTAAGACAA--G--TGC-A-AA--ATAA-GGCCA---ATACAAAC-ATACGCCACTAATAC---AC---GAGTT-CC--TATAC-A-TA--CATTTC-GTAAAGTTG-AATATAAG-----AGCGG-----T----------C---AAATTTTTAAT---TT--TGAC-AT----TTGGCA----CCCTG-G-A--AATA-AAG---AAC--GAGAGAA-TAATGA------CCTT---T-----TAT-GCT-CAACGA-A-GAT-GTAA-CAAATT-------CCAA-G--------------A-------------A-ACATACCA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCGCTCC-A--G-CTA---CCAC----TTCCAC--TC----------Caaaaaaaacaaacaaacaaaaacaaatgatttcctgtaaatccaatcactgtggccaacattctaaatgtcaagtttagacaacaccagaagatgagtatatatagtatatgactatttggaacaatcaaattgactaccacgcgtagtcagactcacccttgagtgaactatcaaaaattaggtatgagaacatcgaaaagaatgttactctcaattcaaagggaaatgaaatacaaactggtaactcgcgtcatgcttcattgtttttagaagtccgtttagtgcaggatacaacgctgatacctgatatgctgcagtgaaatcttcaacgctccgagctgaacaccttttatacaatgtaacatttgaaacgttagagaaaggataaccgagtcatacgtcagttttcattctcaaacagcagtttcttcccctttcatcgtttgttaacacacgaggcattattatttttctgtcatatggtattagattaagacaagtgcaaaataaggccaatacaaacatacgccactaatacacgagttcctatacatacatttcgtaaagttgaatataagagcggtcaaatttttaattttgacatttggcaccctggaaataaagaacgagagaataatgaccttttatgctcaacgaagatgtaacaaattccaagaaacataccagactagcttttgaatttcgctccagctaccacttccactcc
gi|10 : cttggggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataggctaatacaatcaaaagctagatatatgaactcagtacctatatgtattcaatatcatctacatgtatgtgactctgacagtgttcttaacagattaaaaatacgggttaaaaaaaacaaacaaacaaaa--AA--TTA-GGGT-ATGAAGA--ACAT-GCAAAG-AATGT-T-A-CTC-TTAAT-TACAAAG-GAGA-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-C-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGTTT--CA-------G--C-A-G-----------GATACAG-CTGAC--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------GCCT--GGCC-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAACGGC-TTT-AAGC-TTTTTACATTAACATGTGAAA----CGTTGGTA-AC--AGGGA-AACC------------------TC-A-TAC-T-----A-----GTTTC-------AT-----TCCAAACGCAG-T-------TC--T--CC-----------CATTTT-----------AA-T-TAT----TTTAACACGAT-GGAACAG----AGGTTCA--A-TTATTC--TTG-----CTGTCATGTG-TATTAGATTA-AACAA--G--TGC-A-AA--A--A-G---------ACAAATGATA---------TGCAGGACT--GAGTTCCC--T---T-A-TA--CATTTC-ATAA--TTGCAATATA-G-----AG---------AG--------C---AAA-----GA-----T--TG--------------A----CACAA-ATATTAATG-AAT---CA----ACAG-A-T---GA------TC---------AGCAT-G-A-C-AT-A-A-G-T-A-AC-CAA-TC-------C--A----------------A-------------A-ACATAATA-GAAAT--TGCG-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-ACTC-CCAT-T--G---CATT-CACTGTC----------CACTCCAGCTTTT--TACCCCAAG
gi|11 : -GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TGAA-CAA------C---CA--A---TT---GGT-ATGA-GA--ACATTGAAAAA-A--GT-T-AACTC-TCAAT-TACAA-G-GAGA-TGAA---TACAAA-TT-GGTAAACT---C--------------G--TCAGTCAT-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGTTT--CA-------G--C-A-G-----------GATACA----GA---GC-TTG----------------A------------T--------------G-CT--G--CAA-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TTG----------------AA----CGTTGGTA-A---AG---------------------------C-A-TTT-------------GT----------AC-----TAGATGAG----T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---------ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----CTGTCATATG-CA------------AA--A--TGCAA-AA--A--A-GGC-A---AAACAAAC-AT----------CG
gi|11 : -----AG--A-----TGA--------C---AAA-----TAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AA-----A---GAGAAAA-T---GA------CCTTATAT---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-----G-AT-CAGCTA-------C--A-TATGTAACAAATCCAA-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACT--------CCAC-TCCGC-T--TTTTAC--CC----------CAaggcaagatgacaaatattttgcatttgcacccaggaaatgaaagagaaaatgaccttatatatatgtcaacaagatcagctacatatgtaacaaatccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccgctttttacccca
gi|12 : gtctgactcattgaagtgaacaaccaattggtatgagaacattgaaaaaagttaactctcaattacaaggagatgaatacaaattggtaaactcgtcagtcatgctcattgtttttagaagtccgtttcagcaggatacagagcttgatgctgcaagtgacaaatctttcaacgctctacttgaacgttggtaaagcatttgtactagatgagttctccctttaatctattttaacacagaggtcaattattcttgctgtcatatgcaaaatgcaaaaaaggcaaaacaaacatcgaggcaAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAAG---TCCG-TTAACATGGTTAAG--C-T-G-----------GATACAG-CTGAC--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGAAA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--CTTT-----------------TA----CATTGGTA-A---AGGGA-AACC------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------ACGA---G-----------T-------TC--TC-CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----TTGTCATATA-TATTAGATTA-GACAA--G--TGCAA-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---TAA-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-GAAGCAAG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T---GA------CGTT---T-----------------------AT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--CTCCAC-TCCGCTCCATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|13 : AG-AT-ATTAT---AT--AT----TATG-ATT--TTTAA-TAATCAAAATAAC-T--------T-GTCTG--------ATTCA---TTGAGG--TGAA-CCA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGG-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-G---------------AA-TT-TGTAA-CT---T--------------G--CCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAAG---GCCG-TCA-CA-------G--C-A-G-----------GATATTGCCTGAT--AT-CAA-------ATTT-----ACTGCT-------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----TAAT-GC-TCT-A--C-TTTTACATTAACATGTG--AA----CGTTAGTA-A---AGGAT-AA-CT-----------------TC-A-TAC-T-----A-----G------------------T-----------T-------TCATT--CCAAACAGGAGTTC--TTC------------A-TCTA-----TTTAAC---AC-AG---AG----AGG-TT--------TTT--TTG-----CTG
gi|14 : -----------------AA----TGTTTGTA-ATATAGGGA-CC-C------------------TCTA-CTG-TGT---A-----GT----------AA-----G-----------T-------TC--T-------------------TT-----------AA-T-TAT----ATCAACA--GCTAT-A-AA----AAG-T-A--A-TT--TT--TTC-----CTGCCAAGTA--ATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A--GC-A---ATGTAAAC-A------------GC---A-T--GAGTT-TC--------A--A--CATATC-GTAA--GGA-AATATA-G-----AA--G-----C-A--------CGTTGAA-----AATCAATTCGCG-C-AT----TT--CA------CAA-G-A--AATG-AAG---GATGCGATGGAA-T---GAATGACGCCTT---C---ATTAT-G-T-CAACTA-A-CATAA-AT-C------------C--G-A--------------A-------------A-ACATCACA-G---CTAT--A-GCGTTTGAA---TACACTCCAA--T-CCAC-TCCAC-CCACT---------------------T-CAGCTTTTTATACCCCAgattagctctgtgctgttatatgt
gi|15 : cactttaacatgA-------A--C-A-G-----------GACACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------TCATATTTACTGCTTG-CT--A--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAA-GC-TCT----T-TT-----------------AA----Cgc
gi|15 : ttgtttcaactg-----------C--TTTCA---------AA-GCTCT----TTTAACA---C-AG-ATAGCTCTAGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----TTGTCATATG-TATAAGATTA-GACAA--G--TGC-ACAA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------AGC---ACC--AAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GAAA--TTG-AATATA-G-----AG--G----------------C---AAG---------------TG-C-AT----TTG-CA----ACCAG-A-A--AATG-AAA---GA---GAGAG------------------------------T-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------ATCAACAAATCCAAA-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCAC------------------------TCCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAacagatagctctaggtcaattatttttgttgtcatatgtataagattagacaagtgcacaaaaggcaatacaaacatagcaccaagttccttatacatttcgaaattgaatatagaggcaagtgcatttgcaaccagaaaatgaaagagagagtgtcaacaagatgatcagctacatatcaacaaatccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccactcagctttttacccca
gi|16 : ttgtttcaactgaacaggacacagctgatacctgatatcatatttactgcttgctacagtgacaaatGACTTGGAG-TAAA-A--A--G----GTG-AGTGGAGTG---------------GAGTA---------------AC-ATTA-AT-CTA-AAATAGACTA-------CCAAAA---GC------T--AGATCGATGTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTC----AAGA------------------TG----------ATC------TACATG----TATGTGACTCTGA-CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTTAAAAT-
gi|16 : gaA----CAAATGATTTCC------T----GTCG-T-CCAAT-A-ATGTG-TTAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTATA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---Aatgtgtcttaaaaacaaatgatttcctgtcgtccaataatgtgttaattctaaatgtcagtttataaacaccagaagatagtatagaagtgaactacatgtatcaaattagggtatgagaacatgaaaagagtgttactccc
gi|16 : gagacttggagtaaaaaggtgagtggagtggagtaacattaatctaaaatagactaccaaaagctagatcgatgtatgaactcagtacccatatgtattcaagatgatctacatgtatgtgactctgacagtgatctcaacagatttaaaatatgtgtcttaaaaA---TAGAAG--TGAA-CTACATGTAT---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AGTGT-T-A-CTC-CCgaagtgaactacatgtatcaaattagggtatgagaacatgaaaagagtgttactccc
gi|17 : gagacttggagtaaaaaggtgagtggagtggagtaacattaatctaaaatagactaccaaaagctagatcgatgtatgaactcagtacccatatgtattcaagatgatctacatgtatgtgactctgacagtgatctcaacagatttaaaatatgtgtcttaaaaacaaatgatttcctgtcgtccaataatgtgttaattctaaatgtcagtttataaacaccagaagatagt------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----GAG---------T-------TC--T--CC-----------C--CTTTAATCCAATGTAA-TCTAT----TTTAACA---C-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----TTGTCATATG-CA-----------------------A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-G-----AG--GCAAGGTAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T------------------T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-CAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--C----------T-CCATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|18 : GGCTTGGGG-TAAA-A--T--GCTGAGT----------G---------------GAGTG---------------AC-ATCA-AT-CTG-CAATAGGCTAAGACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGC-------ATTCAGTAC-CAATA-T--GTATTC----AAGAT-----------------T-----------ATCTACATGTACATG----TATGTGACTCTGA-CA-GTGA-TCTC-GA------CATATTAAAAAT---AT-------GTTTT
gi|18 : TGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AG----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACCGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TAAA-CTgatttcctgtcatccaatactgtgccaattctaaatgtcagtttagaaacaccagaagatagtatatagtatgactttgtataatcaaaccgacttgtctgactcattgaagtaaact
gi|19 : ggcttggggtaaaatgctgagtggagtgacatcaatctgcaataggctaagacaatcaaaagctagatgtatgcattcagtaccaatatgtattcaagattatctacatgtacatgtatgtgactctgacagtgatctcgacatattaaaaatatgtttACAC--G--TGC-A-TA--A--A-GGC-A---ATGC---T-ATA---------TG------T--GAGCA-----------A-AA--CATTT----------A-AATATA-G-----AG--G-----GAG--------G---GGC-----AAT---TT--GA-C-ATCAATTTG-CA----CACGT-G-G--AATG-AAG---GA---GGGAGAA-T---GAATGA--CCTT---C-----TAT------AAC-A-A-GGT-G-AT-CAACTAACAAATGC--A----------------A-------------A-ACATCACT-G--ACCAT--A-TCTTTTGCAT--TTCACTCT-A------------AA-CCACTCCAC--TCCACTTCACTCCACT-CAGCATTT--AACTCCAAGC
gi|2 : ctcccatttaatctatttaggtcattttgtcGGCTTGGGGGTAAATA--A--GCTGAGTGGAGTGGAGCGGGCGGATTGTGGAGTGAGTG---------------AC-ATTA-AT-CTGTGAATAGTCTAATACAATTCAAAA---GC------TACAAAT----GTAT-----------------------------TATTC----AGGAT-----------------T-----------ATC------TACATG----TATGTGACTCTGATCA-GTG--------------------TAAAAAT--AAG-------GTTTCTTc
gi|2 : A----CAAATGATTTCC------T----GTCA-TACCAAT-A-CTG---CCAA--TTC-T-AAATGTCATG-G-TTAGA-AACAC-CAGGAAG-AC--GTAT---AT--AT----TATG-ACT--T-GAA-ACATCAT-TTGATAC--------C-GTCCGTAGTACGTACTCA---TTGAGGAGTGAA-ACA------TATGCA--AA--TTATGGGTCATGA-GA--ACAT-GAAAAGGAATGTATGA-CTCTCCAAT-TACAAAG-GGAG-TGAAAATTACAAAATTAGGTAA-CT---G--------------T--TCA----T-AG-T--ATTATGTTTTTATTGAAG---TCCGATT--CA-------G--C-C-G-----------GATACAG-GTGAT--AC-ATG-------A--T-----A------------T----------------CTATG--C-AAG-TGAAA-AAATC-TTT----CAAC-GCATCT-A--C-TTTTACATTAATCATTATGAA----CGTTGATA-A---GGATA-AC-C------------------TC-AATTA-T-----A-----GTTTATTCCAA-AC-----T-----------GGCAGCAGTC--T--CC-----------CC-TTT-----------CA-TCTAT----TTTAACA--A--------G----AGG-TCA--AATTATTT--TTTT----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--GGCTGC-A-AA--A--AAGGC-A---ATACAAAC-AT----------CGC---ACACAGAGTT-CC--TA--T-AATA--CAATTC-GTAA--TTG-AATATA-G-----AG--G-----CGT--------C---AAATTTTTCAT---TT--TA-CTGT----TTG-CA----CCTGG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAAAT---GA------C-TT---T---A-TAT-G-T-C-AC-A-A-GAT-T-GC-CAGCTA-------C--AGTAACAAATCCAA---A-------------A-ACATCACA-G--AC--T------T-----NN--NNNNNNNN-N--N-NNNN-NNNNN-NNNNNNNNN--NN----------NNNN-NNGCTTTT--TA-CCCAAGCaaaaaaacaacaaataaacacaaaaacaaatgatttcctgtcataccaatactgccaattctaaatgtcatggttagaaacaccaggaagacgtatatattatgacttgaaacatcatttgataccgtccgtagtacgtactcattgaggagtgaaacatatgcaaattatgggtcatgagaacatgaaaaggaatgtatgactctccaattacaaagggagtgaaaattacaaaattaggtaactgttcatagtattatgtttttattgaagtccgattcagccggatacaggtgatacatgatatctatgcaagtgaaaaaatctttcaacgcatctacttttacattaatcattatgaacgttgataaggataacctcaattatagtttattccaaactggcagcagtctcccctttcatctattttaacaagaggtcaaattatttttttctgtcatatgtattagattagacaaggctgcaaaaaaggcaatacaaacatcgcacacagagttcctataatacaattcgtaattgaatatagaggcgtcaaatttttcattttactgtttgcacctgggaaatgaaagagagagaaatgactttatatgtcacaagattgccagctacagtaacaaatccaaaaacatcacagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctttttacccaagc
gi|20 : ggcttgggggtaaataagctgagtggagtggagcgggcggattgtggagtgagtgacattaatctgtgaatagtctaatacaattcaaaagctacaaatgtattattcaggattatctacatgtatgtgactctgatcagtgtaaaaataaggtttcttaaaaaaacaacaaataaacacaaaaGGCTTGGGG-TAAA-A--AAAGCTGAGTGGAGTGGAATG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-ATTCTGCAAATAGGCTAAGACAA-TCAAAA---GC------T--AGATT---GTATGA-------A---------------T--GTATTC----AAGA------------------TG----------ATC------TACATGAATGTATGTGACTCTGA-CATGTGA-TCTC-AA------CAGATTA-AAAA-C-----------------TGG-----------------------TTTTTTTAAAAACAAATGACTTC-------T----GTCA-T-CCAAT-AACTGTG-CCAA--TTCCT-AAATGTCA-G-T-TT-GA-AACA
gi|21 : -CA----CACAT-G-A--AACG-AAG---GA---GGGAGAG-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-C-GGT-G-AT-CGGCTAATAAACCC--A----------------A-------------A-ACATCAAA-G--AC--T--A-GCGTTC--ATCCTTCGCTCC-A--C-
gi|23 : tctctttatctctctcgttctctctctccaca----CAAATGATTTTC------T----GTAA-C-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTttc
gi|24 : agtgttcttaacatattaaaaatatgggttaaaaaaacaaccccaaaaaccaaacaaaacC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTACAGTATTTAAT---------ACAG----AG----A--ATTTTTTT--TTT-----CTGTCA--------CAGAGTA-GACAA--GA-TGC-A-AA--A--A-GGC-A---AT
gi|25 : acgctccaatttcaggcaggtccccagTA-GAAT-ATGG-GA--ACTT-TAAAG-----------------CAAT-TCCAAAG-G---------------AA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--ATTTTGA--GAAG---GCTG-TCG-CA-------G--C-A-G-----------GATATTG-CTGgt
gi|26 : ------TATATG----TACGTG---CTGA-CA-GGGA-TTTC-AGTAGCAGCAGGTCAAAAAT-C-AGCATTTTTGTTTGTTTGGTGGTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTtctatatatcaa
gi|27 : aaGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTNNNNNNNNNNNNNNN---------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAC-ATTG-AT-CTG-AAATAGGCTAA-ACAT-TCAAAA---
gi|28 : aGAGTAGAGCGGTATG---------------GAGGG---------------AC-ATCG-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GT------T--AGA-----GTATGA-------
gi|29 : ctggttg-ACAA----AG----A--A-TTATTTGTTTT-----CTGTCACA--------GAGTA-GACAA--G--TGC-A-AA--G--A-TAC-A---AT
gi|3 : tatggtattaaacGGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTgt
gi|3 : ---------------AC-ATTA-AT-CTG-AAATAGGCTGAAACAA-TCAAAA---GC------T--ATAT----ATATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTC----AATA------------------T-----------ATC------TACATG----T----GACTCTGA-CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACTT-CAA-AAA-AT-AGTAT---AT--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--T----CT-------T---CATTAA--TT--GGTT-AT---GA--ACAT-GAAAAG-TATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT------------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAAG---TCCG-TT--AA-------G--C-T-G-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AA----CATTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----AT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----TTGTCATATG-TATTAGATTA-G-CAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-------------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A--AT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTC-CTCC-A--C-CCACTTCCGC-CCATCCAAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacattaatctgaaataggctgaaacaatcaaaagctatatatatgaactcagtacccatatgtattcaatatatctacatgtgactctgacagtgatctcaacagattaaaaatcgaggtttttttgggttttttttttttttttttttttacaaatgatttcctgtcatccaatactgtgccaattctaaatgtcagtttagaaacttcaaaaaatagtatatattatgactttgtataatcaaactgacttgtctgactcattgaagtcttcattaattggttatgaacatgaaaagtatgttactcccaattacaaagggggtgaaatacaaattggtaactgtcatgctcattgtttttaaaagtccgttaagctggatacagctgatacctgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgctctacttaacattggtaaagggaaactcattctaatactttctccctttaatctattttaacaacagacagaggtcaattattcttgttgtcatatgtattagattagcaagtgcaaaaaggcaatacaaactgcactgagttccttatacatttcgtatttgaatatagaggtaacaaaaattttgcatttgcatccaggaaatgaaagagagagaatgacctttaatgtcaacaagatgatcagctacataaacatcacagactagcttttgaatttcctccacccacttccgcccatccaattccactcagctttttaccccaagc
gi|30 : gggcttggggtaaaaagctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGCTAATACAA-TCAAAA---GT------T--GGA-----GTATGA-------ACT
gi|31 : -----------------AA----CGTTGGTA-A---AGGAT-AA-CT-----------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------gaactgtaaaaccg
gi|32 : TGGGG-TAAA-AAAA--GCTGAGTGGAGTGGAGTG---------------AAATttcattcca
gi|33 : tgaCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTTGAGTGGTGTG---------------AAAT
gi|4 : gaGGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGAGT-------------------TT---------------ACGATTAGAT-CTG-AAACAAGCTA-TACCA-TAAAAA---AT------T--AGAT----GTATGGTCTAATCATTCAAGATTCCATAAT--G-ATGA----AAAAACATAT------------T-----------ATCC-----TACATG----TATGTGAC----A--A-GTGACTCTC-AA------C-------AGAT-TAAG-------GTATCT------GTTTTTAGGAA-----------------A----CAATTAATCTCCCTAGGCT----GTCA-T-CTGAT-G-CTGTG-ATGA--TTT-G-CAATGCTA-G-CGTTAGA-AACAT-CA---AG-AT-A-TA----AT--AC----------------------ATCAAACTC-C-T--------T-G-CTA--------ACT----------G--T-------------C---CA--AA--TTA-GGGT-GTGA-AA--ATTT-GAAG-G-AATGT-T-AACTC-CCAAT----AAAG------TGAAA------------------CT---C--------------A--TCA----TTGCCT-TATT--GTTTTTA--GAAG---TGTA-TT--TA-------G--TGA-G-----------GATACAG-TCAAA--AT-TTT-------G--T-----T------------T--------------G-CT--G--CAA-A-TGAC--AA-TC-TTT----TAAC-GC-TCCAA--T-TT-----------------CA----GGT---TA-C---AGG-------------------------TC--------------------------------C-----C-----------C-------GC--T--CC-----------C--TTT-----------AATTCTACAGTATTTAATA--AC-AG---AG----A-----A--T-TTTTTT--TTT-----CTGTCG--------CAGAGTA-GACAA--G--TGA-A-AC--A--A-GGC-A---
gi|4 : -CA----CATAG-G-A--AATGTGAG---GAC--GGGAGAA-T---GA------C-TT---T---A-TAT-G-T-CAAC-ACA-AGT-G-AT-CGGC-----------------------------------------------ATCACAAG--AC--T--AAGCTTTCACTC--TTTGCCCC-A--C---AC-TCC-----ATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAActgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacacacataggaaatgtgaggacgggagaatgactttatatgtcaacacaagtgatcggcatcacaagactaagctttcactctttgccccacactccattccattccactcagctttttaccccaa
gi|5 : gggcttggggtaaaaagctgagtggagtggagtttacgattagatctgaaacaagctataccataaaaaattagatgtatggtctaatcattcaagattccataatgatgaaaaaacatattatcctacatgtatgtgacaagtgactctcaacagattaaggtatctgtttttaggaaacaattaatctccctaggctgtcatctgatgctgtgatgatttgcaatgctagcgttagaaacatcaagatataatacatcaaactccttgctaactgtccaaattagggtgtgaaaatttgaaggaatgttaactcccaataaagtgaaactcatcattgccttattgtttttagaagtgtatttagtgaggatacagtcaaaattttgtttgctgcaaatgacaatcttttaacgctccaatttcaggttacaggtccccgctccctttaattctacagtatttaataacagagaattttttttttctgtcgcagagtagacaagtgaaacaaggcactgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacaTTAAGAAT-CG----------TGTTTTTGG--GGTGTT-----CGTTTTTGTTTTTT--------CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-TTAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACTT-CAG-AAACAT-AGTATTATATTGAT----TATGTACT--TTGTA-TAATCAAGATGACAT--------T-GT-TG--------ACTCA---TTGAGG--TCATTCTT------T---CA--A---TTA-GGTTTATGA-GAGAAC-T-GAAAAG-TATGT-T-A-CTC-C-AATATACAA-G-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CTTCAC--------------G--TCAA---T-GC-T-CAT---GTTTTTA--AAAAGCTTCCG-TT--AAA------G--C-TTG-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGCCAGAA-TCCTTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AAATTACATTGGTACA---AGGAA-AA-C------------------TC-A-TTCAT-----A-----AT----------ACGAG--T-----------T-------TC--C--CC-----------C--TTT-----------A--TCTTT----TTTCAC----C-AG-GCAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----CT--CATATG-TTTAAGATTA-GACAAATG--TGC-A-AACAA--A-GGC-ATTAATACAAAC-AT----------TGC---AC---GAGTT-CCCTT---T-A-TA--CATTTCCGTAT--TTG-AGTATA-G-----AG--G-----CAAGGTAATCAC---ACA-----AAT---TT--TG-C-ATGTA-TTG-CAGACTCACAGCG-A--AATG-AAAAAAGA---GAGAGAA-G---AA------CCTT---TCTTA-TATCG-TTCAAC-A-AAGATCA-ATGCAGCTA-------C--A-T--------------C-------------ATACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TCCACTCC-A--C-CTAA--CCGCTCCATTCCAT--TC----------CAGC-AGGCTTTT--TACCCCAA
gi|6 : GA-------ACTAAGTAC-CCATA-T--GTATTC----AAGA------------------T-----------ATC------TACATG----T----GACTCTGA-CA-GTGA-TCTT-AA------CAGATTAAAAAT-TGGG--------------TGG--GTTTT------TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-ATGTG-CCAT--TTC-T-AGATGTCA-GTT-TTAGA-AA-ACACAG-AAG-AT-TGTAT----T--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TCAA-CTT------T---C---AA--TTA-GGTT-ATG--GA--ACAT-GAAAAGAAATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAA-----------------------------------------GATACGG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--G-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--CTTT-----------------TA----CATTGGTA-A---AGGGA-AACC------------------TC-A-TTC-T-----A-----GTTTC-------AT-----TCCAAACATGAAT-------TC--TC-CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A--GC-A---A---AAA--------------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-GAGGCAAG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---GT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---G---------------------------------AT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-TATTTACAAATCCA-A-------------A-ACATCGCA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACT--------CCAC-TCCGCTCCATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|7 : TGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-C--T-------GTTTT
gi|7 : TGACTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-ATGTG-TCAA--TTT-T-AAATGTCA-G-A-TTAGA-ATTAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AT----TTTG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------AATCA---TTGAAG--TGAA-CTA------C---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-TCAAT-CACAAAG-GAGA-TGAAA--TACAAA-TT-AGCAA-CT---CNNNNNNNNNNNNNNN--NNN----N-NN-N-NNNN--NNNNNNN--NNNN---NNNN-NN--NN-------N--N-N-N-----------NNNNNNN-NNNNN--NN-NTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-CCT-A--C-TT-----------------gacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactttatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|7 : tgatctcaacagattaaaaatctgtttA-A---CGGGA-AA-C------------------TC-A-GAC-T-----AAGTTAGC----------ACCAACAT-----------TGAG----TA--T--CC-----------C--TTTT----------AA-TCTAT----TTTAACC--AC-CG-AC------AGG-CCA--A--TA-----TCG-----C--TCA------ATTAGA-TA-GATAA--tatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|7 : tgatctcaacagattaaaaatctgttttgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactT-A--C-TC-----------------AA----TGTTGGT--------GCT-AA-C------------------TT-A-GTC-TG----A-----GT-----------------------------T-------TC--C--CG-----------T--TNN-----------NN-NNNNN----NNNNNNN--NN-NN-NNNN----NNN-NNN--N-NNNNNN--NNN-----NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN-NACAA--G--TGC-A-AA--A--AAGGC-A---ACACAAAC-AT----------TGC---CCT--AACTT-CC--T---T-A-TA--CATTTT-GTAA--TTG-AATATA-G-----AG--G----------------C---AAG-----A---------TG---AT----TTG-CT----CCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-GAT-GTAA-CAAGTC-------C--A----------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCAC------------------------TCCAC--TC----------CATT-CAGTTTTT--TACACCAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|8 : tgatctcaacagattaaaaatctgttttgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactttatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggaGGG-TAAA-A--A--GCTGAGT-----GGAGTG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-AT-CTG-AAATAAGCTAATATAA-GCAAAATTTACAATATGT--AGAT----GTATGA-------ACTAAGTAC-GCATA-TAAGTAATC----AGGATTCATAATGATGACAAATT-----------ATC------TACATA----TATGTGAAT-----CG-GTGA-TCTCAAA------AAGATCAAAAAT-C
gi|8 : A----CAAATGATTTCC------T----GT-----------------G-TCAA--ATT-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-GAG-AT-A------------T----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC----------------A--------ATTCA---TTAAGA--TGAA-CTA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACTT-TAAAAG-AATGC-T-A-ATC-CCAAT-T-C--AGTGTGA-TGAAA--TATAAA-TT-AGAAA-tattaagaacaaatgatttcctgtgtcaaatttaaatgtcagtttagaaacaccaggagatattatgactttgtataatcaaactgacaattcattaagatgaactatcaaattagggtatgagaactttaaaagaatgctaatcccaattcagtgtgatgaaatataaattagaaatactgtttgcttcagtgactgatcttttaatgctctattttatgataccctcatccttgtttcattccaaaccggggttctctcctaagtccatttaacaaagagggaagttatttttttcaatctatcatatattaggttagacaagtgcaaaatttacactgatttagaggcaagttgacatcaattctgcatttgcacccaggaaatgaaggagggagaatgacccttatatgtcaacaaagtggtcatcacagactagcttttgactttcacttcactccactccacttcactccactcagctttttacccaaagc
gi|8 : gggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataagctaatataagcaaaatttacaatatgtagatgtatgaactaagtacgcatataagtaatcaggattcataatgatgacaaattatctacatatatgtgaatcggtgatctcaaaaagatcaaaaatctattaaga------------T--------------G-CT--T--C-A-G-TGACT-GA-TC-TTT----TAAT-GC-TCT-A--T-TT-----------------TA-------TGATA-C---C--------C------------------TC-A-TCC-T-----T-----GTTTCATTCCAAAC-----CGGGG-------T-------TC--T--CT-----------C--CTA-----------AG-TCCAT----TT-AACA--A-------AG----AGG-GAA--G-TTATTT--TTTTCAATCTATCATAT---ATTAGGTTA-GAC-----------------A--A-G--------TGCAAAA-TT----------TAC---ACT--GA-----T--T---T-A-GAGGCA-------AG--TTG-A---------------------------------C---ATC-----AAT---TC--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAG---GA---GGGAGAA-T---GA------CCCT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-AGT-G-GT---------------------------------------------------CATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGACT--TTCACTTC-A--CTCCAC-TCCAC-----TTCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCAAAGCtactgtttgcttcagtgactgatcttttaatgctctattttatgataccctcatccttgtttcattccaaaccggggttctctcctaagtccatttaacaaagagggaagttatttttttcaatctatcatatattaggttagacaagtgcaaaatttacactgatttagaggcaagttgacatcaattctgcatttgcacccaggaaatgaaggagggagaatgacccttatatgtcaacaaagtggtcatcacagactagcttttgactttcacttcactccactccacttcactccactcagctttttacccaaagc
gi|9 : gggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataagctaatataagcaaaatttacaatatgtagatgtatgaactaagtacgcatataagtaatcaggattcataatgatgacaaattatctacatatatgtgaatcggtgatctcaaaaagatcaaaaatctattaagaacaaatgatttcctgtgtcaaatttaaatgtcagtttagaaacaccaggagatattatgactttgtataatcaaactgacaattcattaagatgaactatcaaattagggtatgagaactttaaaagaatgctaatcccaattcagtgtgatgaaatataaattagaaatactgttGGCTGGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAATGGAGTG---------------GAGTGGAATT----------AC-ATTA-AT-CTG-AAACAAGCT-ATACAA-TCAAAA---AT------T--AGAT----GTATGA-------ACTAAATGC-TCATG-T--CTAATCAATTAAGA------------------TTCATAATGATGATA------AACATA----TATGTGAC-CTG
gi|9 : TTTTTAGGAACAAATTAATTCC------TAGCTGTCA-T-ATGAT-G-CTGTG-TTGA--TTT-G-CAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAT-CA--AAG-AT-A-----------------TA------------A-TAATCAAACTCAC-T--------T-GCCT---------------------------AA-CTG------T---AA--AA--TTA-GGAT-GTGA-AA--ATTT-GAAAGG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-----AAA-GAGT-TGAAA--TATGA----------------------------------TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--G-----------------------------A-G-----------GATACAG-CTG-TCAAC-CAG-------A--T-----ATCAAAATTTGTTT--------------G-CT--G--C-A-A-TGACA-AA-TC-TTT----TAAC-GC-TCC-A--A-TT-------------------------TT---------AGGCA-GG-T------------------CC-----C-C-----A-----G---------------------------------------C--C--CC-----------C--TTT-----------AA-TCT---------------AC-AG---------------------TATTT--TTT-----GTGTCA--------CAGAGTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATtttttaggaacaaattaattcctagctgtcatatgatgctgtgttgatttgcaatgtcagtttagaaacatcaaagatataataatcaaactcacttgcctaactgtaaaattaggatgtgaaaatttgaaaggaatgttactcccaataaagagttgaaatatgatcatgctcattgtttttagaggatacagctgtcaaccagatatcaaaatttgtttgctgcaatgacaaatcttttaacgctccaattttaggcaggtccccagccccctttaatctacagtattttttgtgtcacagagtagacaagtgcaaaaaggcaatgtatatctctctctacacacacgcatatggaatgagggagggagaatgacctttatatgtcaacacggtgatcagcatcacagactatagctttcatctttcactccactccattcagctttttaccccaag
gi|9 : ggctgggggtaaaaagctgagtggaatggagtggagtggaattacattaatctgaaacaagctatacaatcaaaaattagatgtatgaactaaatgctcatgtctaatcaattaagattcataatgatgataaacatatatgtgacctg-G-G--AATG-AGG---GA---GGGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-C-GGT-G-AT-CAG-----------------------------------------------CATCACA-G--ACTAT--A-GCTTTCATCT--TTCAC------------------------TCCAC--TC----------CATT-CAGCTTTT--TACCCCAAGgtatatctctctctacacacacgcatatggaatgagggagggagaatgacctttatatgtcaacacggtgatcagcatcacagactatagctttcatctttcactccactccattcagctttttaccccaag
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAAACCAAAATCTATTATTTTTCTTTCCGTCTTTTTCAATTAATTACTTACTGTCTAATAGCAAAATATTTCATTGAATTGAAAAAACGATATATATTGTTTACGGAATACAACGAATGGTCAAGATAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222222222222 333333333333333 111111 1111 1111111 777777777777777777777777777777 111111 111111 3333333333333333333333333333333333333 1111 1111111111 11111111 11111111111 1111 222222222222222222222 222222222222222222222222222222222 33333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111 11111111111 22222222222 111111111 1111111111 11111 3333333333333333333 11111 1111 1111111111111111111 666666666666666666666666666666666666666666 55555555555555555555555 1111111111
lowQualScore : 3 3 44 44 88 000000000000000 111111111111111 3 3 3 7 3 3 555 000000 55 1111 0000000 2 4 4 55 8888 111111111111111111111111111111 444444 7777 2 4 4 3 3 000000 7777777777777777777777777777777777777 3 1 5555 888888 6666 3 3 3 3 3 44 3 3 6 3 3 3 3 44 3 555 555 55 7777 3 55 2 3 7777777777 3 22222222 555 1 44 4 3 22222222222 44 44 2 1 5 2 33 1 5 5 2 2 5 2 666 3 1111 44 3 3 2 222222222222222222222 9999 3 3 3 44 44 555 888888888888888888888888888888888 2 44 3 44444444444444444444444444444444444444444444 2 33 33 8 2 2 2 2 2 6666 2 2 2 33 5 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33 77 00000000000 55 55555555555 2 9999 00000000000 4444 333 22 4 22 999999 222222222 2 2 22 55 4 2 33 33 4 2 333 2 8888888888 555 555 3 999999 3 3 44 3 666 3 3 44444 1111111111111111111 555 44444 555 33 2 2 1111 2 5555 2 2 33 2 6666 888 2 444 6666666666666666666 2 2 2 4 2 2 4 4 2 1 999999999999999999999999999999999999999999 2 2 33 99 33 2 33 44444444444444444444444 33 0000000000 2 33
lowQualScore : . . .. .. .. ............... ............... . . . . . . ... ...... .. .... ....... . . . .. .... .............................. ...... .... . . . . . ...... ..................................... . . .... ...... .... . . . . . .. . . . . . . . .. . ... ... .. .... . .. . . .......... . ........ ... . .. . . ........... .. .. . . . . .. . . . . . . . ... . .... .. . . . ..................... .... . . . .. .. ... ................................. . .. . ............................................ . .. .. . . . . . . .... . . . .. . ............................................................................................................................ .. .. ........... .. ........... . .... ........... .... ... .. . .. ...... ......... . . .. .. . . .. .. . . ... . .......... ... ... . ...... . . .. . ... . . ..... ................... ... ..... ... .. . . .... . .... . . .. . .... ... . ... ................... . . . . . . . . . . .......................................... . . .. .. .. . .. ....................... .. .......... . ..
lowQualScore : 3 3 66 66 22 888888888888888 888888888888888 6 6 6 3 2 3 888 555555 00 4444 8888888 5 0 0 55 5555 000000000000000000000000000000 111111 7777 1 0 0 6 6 555555 3333333333333333333333333333333333333 0 4 5555 888888 5555 1 1 1 1 1 22 1 1 2 1 1 3 6 22 3 222 888 00 7777 6 00 3 6 3333333333 3 11111111 444 2 22 7 1 88888888888 22 22 9 2 7 9 99 9 7 7 9 9 7 9 888 1 6666 22 1 1 9 555555555555555555555 6666 1 1 1 22 22 444 666666666666666666666666666666666 9 22 1 33333333333333333333333333333333333333333333 9 99 99 6 9 9 9 9 9 1111 9 9 7 77 3 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 99 66666666666 33 88888888888 2 4444 88888888888 5555 999 99 2 99 888888 888888888 3 2 99 33 4 2 11 11 4 2 999 9 2222222222 444 999 1 333333 1 1 22 1 333 1 1 33333 4444444444444444444 000 33333 000 99 9 9 1111 5 3333 4 4 22 4 1111 888 4 111 9999999999999999999 4 4 4 7 4 4 7 7 4 8 666666666666666666666666666666666666666666 4 4 22 77 22 4 22 44444444444444444444444 44 9999999999 9 99
consensus : GGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGAGTG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTC----AAGA------------------T-----------ATC------TACATG----TATGTGACTCTGA-CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAGG--TGAA-CTA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT--CA-------G--C-A-G-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AA----CGTTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAN--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAG---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--C-CCAC-TCCGC-CCATTCCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
Reference ( family-1169 ) : GGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGAGTG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTC----AAGA------------------T-----------ATC------TACATG----TATGTGACTCTGA-CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAGG--TGAA-CTA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT--CA-------G--C-A-G-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AA----CGTTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAN--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAG---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--C-CCAC-TCCGC-CCATTCCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|1 : CTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGT-----GGAGTG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----ATATGA-------ACTCAGTAC-CTATA-T--GTATTC----AATA------------------TC----------ATC------TACATG----TATGTGACTCTGA-CA-GTGT-TCTT-AA------CAGATTAAAAATACG-G-------GTT
gi|1 : A----CAAATGATTTCC------T----GTAAAT-CCAATCA-CTGTGGCCAACATTC-T-AAATGTCAAG-T-TTAGACAACAC-CAG-AAG-ATGAGTAT---AT--ATAGTATATG-ACTATTTGGAACAATCAAATTGAC-TACCACGCGTAGTCAG--------ACTCACCCTTGAG---TGAA-CTA------T---CA--AAAATTA-GG-T-ATGA-GA--ACATCGAAAAG-AATGT-T-A-CTC-TCAAT-T-CAAAG-GGAAATGAAA--TACAAA-CT-GGTAA-CT---C--------------GCGTCA----T-GC-TTCATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT--TA-------GTGC-A-GGATACAACGCTGATAC---CTGAT--ATGCTGCAGTGAAA--TCTTCAA------------C--------------G-CT--C--CGA-GCTGA-A-CA-CC-TTTTATACAAT-GT-AAC-A--T-TTGA---------------AA----CGTTAGAG-A---AAGGATAA-CCGAGTCATACGTCAGTTTTC-A-TTC-TCAAACA-----GC----------AG-----T-----------T-------TC--TTCCC-----------C--TTT-----------CA-TCG------TTTGTTA--AC-AC-AC-G----AGG--CATTA-TTATTT--TT------CTGTCATATGGTATTAGATTAAGACAA--G--TGC-A-AA--ATAA-GGCCA---ATACAAAC-ATACGCCACTAATAC---AC---GAGTT-CC--TATAC-A-TA--CATTTC-GTAAAGTTG-AATATAAG-----AGCGG-----T----------C---AAATTTTTAAT---TT--TGAC-AT----TTGGCA----CCCTG-G-A--AATA-AAG---AAC--GAGAGAA-TAATGA------CCTT---T-----TAT-GCT-CAACGA-A-GAT-GTAA-CAAATT-------CCAA-G--------------A-------------A-ACATACCA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCGCTCC-A--G-CTA---CCAC----TTCCAC--TC----------Caaaaaaaacaaacaaacaaaaacaaatgatttcctgtaaatccaatcactgtggccaacattctaaatgtcaagtttagacaacaccagaagatgagtatatatagtatatgactatttggaacaatcaaattgactaccacgcgtagtcagactcacccttgagtgaactatcaaaaattaggtatgagaacatcgaaaagaatgttactctcaattcaaagggaaatgaaatacaaactggtaactcgcgtcatgcttcattgtttttagaagtccgtttagtgcaggatacaacgctgatacctgatatgctgcagtgaaatcttcaacgctccgagctgaacaccttttatacaatgtaacatttgaaacgttagagaaaggataaccgagtcatacgtcagttttcattctcaaacagcagtttcttcccctttcatcgtttgttaacacacgaggcattattatttttctgtcatatggtattagattaagacaagtgcaaaataaggccaatacaaacatacgccactaatacacgagttcctatacatacatttcgtaaagttgaatataagagcggtcaaatttttaattttgacatttggcaccctggaaataaagaacgagagaataatgaccttttatgctcaacgaagatgtaacaaattccaagaaacataccagactagcttttgaatttcgctccagctaccacttccactcc
gi|10 : cttggggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataggctaatacaatcaaaagctagatatatgaactcagtacctatatgtattcaatatcatctacatgtatgtgactctgacagtgttcttaacagattaaaaatacgggttaaaaaaaacaaacaaacaaaa--AA--TTA-GGGT-ATGAAGA--ACAT-GCAAAG-AATGT-T-A-CTC-TTAAT-TACAAAG-GAGA-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-C-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGTTT--CA-------G--C-A-G-----------GATACAG-CTGAC--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------GCCT--GGCC-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAACGGC-TTT-AAGC-TTTTTACATTAACATGTGAAA----CGTTGGTA-AC--AGGGA-AACC------------------TC-A-TAC-T-----A-----GTTTC-------AT-----TCCAAACGCAG-T-------TC--T--CC-----------CATTTT-----------AA-T-TAT----TTTAACACGAT-GGAACAG----AGGTTCA--A-TTATTC--TTG-----CTGTCATGTG-TATTAGATTA-AACAA--G--TGC-A-AA--A--A-G---------ACAAATGATA---------TGCAGGACT--GAGTTCCC--T---T-A-TA--CATTTC-ATAA--TTGCAATATA-G-----AG---------AG--------C---AAA-----GA-----T--TG--------------A----CACAA-ATATTAATG-AAT---CA----ACAG-A-T---GA------TC---------AGCAT-G-A-C-AT-A-A-G-T-A-AC-CAA-TC-------C--A----------------A-------------A-ACATAATA-GAAAT--TGCG-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-ACTC-CCAT-T--G---CATT-CACTGTC----------CACTCCAGCTTTT--TACCCCAAG
gi|11 : -GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TGAA-CAA------C---CA--A---TT---GGT-ATGA-GA--ACATTGAAAAA-A--GT-T-AACTC-TCAAT-TACAA-G-GAGA-TGAA---TACAAA-TT-GGTAAACT---C--------------G--TCAGTCAT-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGTTT--CA-------G--C-A-G-----------GATACA----GA---GC-TTG----------------A------------T--------------G-CT--G--CAA-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TTG----------------AA----CGTTGGTA-A---AG---------------------------C-A-TTT-------------GT----------AC-----TAGATGAG----T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---------ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----CTGTCATATG-CA------------AA--A--TGCAA-AA--A--A-GGC-A---AAACAAAC-AT----------CG
gi|11 : -----AG--A-----TGA--------C---AAA-----TAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AA-----A---GAGAAAA-T---GA------CCTTATAT---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-----G-AT-CAGCTA-------C--A-TATGTAACAAATCCAA-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACT--------CCAC-TCCGC-T--TTTTAC--CC----------CAaggcaagatgacaaatattttgcatttgcacccaggaaatgaaagagaaaatgaccttatatatatgtcaacaagatcagctacatatgtaacaaatccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccgctttttacccca
gi|12 : gtctgactcattgaagtgaacaaccaattggtatgagaacattgaaaaaagttaactctcaattacaaggagatgaatacaaattggtaaactcgtcagtcatgctcattgtttttagaagtccgtttcagcaggatacagagcttgatgctgcaagtgacaaatctttcaacgctctacttgaacgttggtaaagcatttgtactagatgagttctccctttaatctattttaacacagaggtcaattattcttgctgtcatatgcaaaatgcaaaaaaggcaaaacaaacatcgaggcaAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAAG---TCCG-TTAACATGGTTAAG--C-T-G-----------GATACAG-CTGAC--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGAAA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--CTTT-----------------TA----CATTGGTA-A---AGGGA-AACC------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------ACGA---G-----------T-------TC--TC-CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----TTGTCATATA-TATTAGATTA-GACAA--G--TGCAA-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---TAA-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-GAAGCAAG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T---GA------CGTT---T-----------------------AT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--CTCCAC-TCCGCTCCATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|13 : AG-AT-ATTAT---AT--AT----TATG-ATT--TTTAA-TAATCAAAATAAC-T--------T-GTCTG--------ATTCA---TTGAGG--TGAA-CCA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGG-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-G---------------AA-TT-TGTAA-CT---T--------------G--CCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAAG---GCCG-TCA-CA-------G--C-A-G-----------GATATTGCCTGAT--AT-CAA-------ATTT-----ACTGCT-------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----TAAT-GC-TCT-A--C-TTTTACATTAACATGTG--AA----CGTTAGTA-A---AGGAT-AA-CT-----------------TC-A-TAC-T-----A-----G------------------T-----------T-------TCATT--CCAAACAGGAGTTC--TTC------------A-TCTA-----TTTAAC---AC-AG---AG----AGG-TT--------TTT--TTG-----CTG
gi|14 : -----------------AA----TGTTTGTA-ATATAGGGA-CC-C------------------TCTA-CTG-TGT---A-----GT----------AA-----G-----------T-------TC--T-------------------TT-----------AA-T-TAT----ATCAACA--GCTAT-A-AA----AAG-T-A--A-TT--TT--TTC-----CTGCCAAGTA--ATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A--GC-A---ATGTAAAC-A------------GC---A-T--GAGTT-TC--------A--A--CATATC-GTAA--GGA-AATATA-G-----AA--G-----C-A--------CGTTGAA-----AATCAATTCGCG-C-AT----TT--CA------CAA-G-A--AATG-AAG---GATGCGATGGAA-T---GAATGACGCCTT---C---ATTAT-G-T-CAACTA-A-CATAA-AT-C------------C--G-A--------------A-------------A-ACATCACA-G---CTAT--A-GCGTTTGAA---TACACTCCAA--T-CCAC-TCCAC-CCACT---------------------T-CAGCTTTTTATACCCCAgattagctctgtgctgttatatgt
gi|15 : cactttaacatgA-------A--C-A-G-----------GACACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------TCATATTTACTGCTTG-CT--A--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAA-GC-TCT----T-TT-----------------AA----Cgc
gi|15 : ttgtttcaactg-----------C--TTTCA---------AA-GCTCT----TTTAACA---C-AG-ATAGCTCTAGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----TTGTCATATG-TATAAGATTA-GACAA--G--TGC-ACAA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------AGC---ACC--AAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GAAA--TTG-AATATA-G-----AG--G----------------C---AAG---------------TG-C-AT----TTG-CA----ACCAG-A-A--AATG-AAA---GA---GAGAG------------------------------T-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------ATCAACAAATCCAAA-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCAC------------------------TCCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAacagatagctctaggtcaattatttttgttgtcatatgtataagattagacaagtgcacaaaaggcaatacaaacatagcaccaagttccttatacatttcgaaattgaatatagaggcaagtgcatttgcaaccagaaaatgaaagagagagtgtcaacaagatgatcagctacatatcaacaaatccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccactcagctttttacccca
gi|16 : ttgtttcaactgaacaggacacagctgatacctgatatcatatttactgcttgctacagtgacaaatGACTTGGAG-TAAA-A--A--G----GTG-AGTGGAGTG---------------GAGTA---------------AC-ATTA-AT-CTA-AAATAGACTA-------CCAAAA---GC------T--AGATCGATGTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTC----AAGA------------------TG----------ATC------TACATG----TATGTGACTCTGA-CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTTAAAAT-
gi|16 : gaA----CAAATGATTTCC------T----GTCG-T-CCAAT-A-ATGTG-TTAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTATA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---Aatgtgtcttaaaaacaaatgatttcctgtcgtccaataatgtgttaattctaaatgtcagtttataaacaccagaagatagtatagaagtgaactacatgtatcaaattagggtatgagaacatgaaaagagtgttactccc
gi|16 : gagacttggagtaaaaaggtgagtggagtggagtaacattaatctaaaatagactaccaaaagctagatcgatgtatgaactcagtacccatatgtattcaagatgatctacatgtatgtgactctgacagtgatctcaacagatttaaaatatgtgtcttaaaaA---TAGAAG--TGAA-CTACATGTAT---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AGTGT-T-A-CTC-CCgaagtgaactacatgtatcaaattagggtatgagaacatgaaaagagtgttactccc
gi|17 : gagacttggagtaaaaaggtgagtggagtggagtaacattaatctaaaatagactaccaaaagctagatcgatgtatgaactcagtacccatatgtattcaagatgatctacatgtatgtgactctgacagtgatctcaacagatttaaaatatgtgtcttaaaaacaaatgatttcctgtcgtccaataatgtgttaattctaaatgtcagtttataaacaccagaagatagt------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----GAG---------T-------TC--T--CC-----------C--CTTTAATCCAATGTAA-TCTAT----TTTAACA---C-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----TTGTCATATG-CA-----------------------A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-G-----AG--GCAAGGTAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T------------------T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-CAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--C----------T-CCATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|18 : GGCTTGGGG-TAAA-A--T--GCTGAGT----------G---------------GAGTG---------------AC-ATCA-AT-CTG-CAATAGGCTAAGACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGC-------ATTCAGTAC-CAATA-T--GTATTC----AAGAT-----------------T-----------ATCTACATGTACATG----TATGTGACTCTGA-CA-GTGA-TCTC-GA------CATATTAAAAAT---AT-------GTTTT
gi|18 : TGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AG----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACCGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TAAA-CTgatttcctgtcatccaatactgtgccaattctaaatgtcagtttagaaacaccagaagatagtatatagtatgactttgtataatcaaaccgacttgtctgactcattgaagtaaact
gi|19 : ggcttggggtaaaatgctgagtggagtgacatcaatctgcaataggctaagacaatcaaaagctagatgtatgcattcagtaccaatatgtattcaagattatctacatgtacatgtatgtgactctgacagtgatctcgacatattaaaaatatgtttACAC--G--TGC-A-TA--A--A-GGC-A---ATGC---T-ATA---------TG------T--GAGCA-----------A-AA--CATTT----------A-AATATA-G-----AG--G-----GAG--------G---GGC-----AAT---TT--GA-C-ATCAATTTG-CA----CACGT-G-G--AATG-AAG---GA---GGGAGAA-T---GAATGA--CCTT---C-----TAT------AAC-A-A-GGT-G-AT-CAACTAACAAATGC--A----------------A-------------A-ACATCACT-G--ACCAT--A-TCTTTTGCAT--TTCACTCT-A------------AA-CCACTCCAC--TCCACTTCACTCCACT-CAGCATTT--AACTCCAAGC
gi|2 : ctcccatttaatctatttaggtcattttgtcGGCTTGGGGGTAAATA--A--GCTGAGTGGAGTGGAGCGGGCGGATTGTGGAGTGAGTG---------------AC-ATTA-AT-CTGTGAATAGTCTAATACAATTCAAAA---GC------TACAAAT----GTAT-----------------------------TATTC----AGGAT-----------------T-----------ATC------TACATG----TATGTGACTCTGATCA-GTG--------------------TAAAAAT--AAG-------GTTTCTTc
gi|2 : A----CAAATGATTTCC------T----GTCA-TACCAAT-A-CTG---CCAA--TTC-T-AAATGTCATG-G-TTAGA-AACAC-CAGGAAG-AC--GTAT---AT--AT----TATG-ACT--T-GAA-ACATCAT-TTGATAC--------C-GTCCGTAGTACGTACTCA---TTGAGGAGTGAA-ACA------TATGCA--AA--TTATGGGTCATGA-GA--ACAT-GAAAAGGAATGTATGA-CTCTCCAAT-TACAAAG-GGAG-TGAAAATTACAAAATTAGGTAA-CT---G--------------T--TCA----T-AG-T--ATTATGTTTTTATTGAAG---TCCGATT--CA-------G--C-C-G-----------GATACAG-GTGAT--AC-ATG-------A--T-----A------------T----------------CTATG--C-AAG-TGAAA-AAATC-TTT----CAAC-GCATCT-A--C-TTTTACATTAATCATTATGAA----CGTTGATA-A---GGATA-AC-C------------------TC-AATTA-T-----A-----GTTTATTCCAA-AC-----T-----------GGCAGCAGTC--T--CC-----------CC-TTT-----------CA-TCTAT----TTTAACA--A--------G----AGG-TCA--AATTATTT--TTTT----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--GGCTGC-A-AA--A--AAGGC-A---ATACAAAC-AT----------CGC---ACACAGAGTT-CC--TA--T-AATA--CAATTC-GTAA--TTG-AATATA-G-----AG--G-----CGT--------C---AAATTTTTCAT---TT--TA-CTGT----TTG-CA----CCTGG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAAAT---GA------C-TT---T---A-TAT-G-T-C-AC-A-A-GAT-T-GC-CAGCTA-------C--AGTAACAAATCCAA---A-------------A-ACATCACA-G--AC--T------T-----NN--NNNNNNNN-N--N-NNNN-NNNNN-NNNNNNNNN--NN----------NNNN-NNGCTTTT--TA-CCCAAGCaaaaaaacaacaaataaacacaaaaacaaatgatttcctgtcataccaatactgccaattctaaatgtcatggttagaaacaccaggaagacgtatatattatgacttgaaacatcatttgataccgtccgtagtacgtactcattgaggagtgaaacatatgcaaattatgggtcatgagaacatgaaaaggaatgtatgactctccaattacaaagggagtgaaaattacaaaattaggtaactgttcatagtattatgtttttattgaagtccgattcagccggatacaggtgatacatgatatctatgcaagtgaaaaaatctttcaacgcatctacttttacattaatcattatgaacgttgataaggataacctcaattatagtttattccaaactggcagcagtctcccctttcatctattttaacaagaggtcaaattatttttttctgtcatatgtattagattagacaaggctgcaaaaaaggcaatacaaacatcgcacacagagttcctataatacaattcgtaattgaatatagaggcgtcaaatttttcattttactgtttgcacctgggaaatgaaagagagagaaatgactttatatgtcacaagattgccagctacagtaacaaatccaaaaacatcacagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctttttacccaagc
gi|20 : ggcttgggggtaaataagctgagtggagtggagcgggcggattgtggagtgagtgacattaatctgtgaatagtctaatacaattcaaaagctacaaatgtattattcaggattatctacatgtatgtgactctgatcagtgtaaaaataaggtttcttaaaaaaacaacaaataaacacaaaaGGCTTGGGG-TAAA-A--AAAGCTGAGTGGAGTGGAATG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-ATTCTGCAAATAGGCTAAGACAA-TCAAAA---GC------T--AGATT---GTATGA-------A---------------T--GTATTC----AAGA------------------TG----------ATC------TACATGAATGTATGTGACTCTGA-CATGTGA-TCTC-AA------CAGATTA-AAAA-C-----------------TGG-----------------------TTTTTTTAAAAACAAATGACTTC-------T----GTCA-T-CCAAT-AACTGTG-CCAA--TTCCT-AAATGTCA-G-T-TT-GA-AACA
gi|21 : -CA----CACAT-G-A--AACG-AAG---GA---GGGAGAG-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-C-GGT-G-AT-CGGCTAATAAACCC--A----------------A-------------A-ACATCAAA-G--AC--T--A-GCGTTC--ATCCTTCGCTCC-A--C-
gi|23 : tctctttatctctctcgttctctctctccaca----CAAATGATTTTC------T----GTAA-C-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTttc
gi|24 : agtgttcttaacatattaaaaatatgggttaaaaaaacaaccccaaaaaccaaacaaaacC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTACAGTATTTAAT---------ACAG----AG----A--ATTTTTTT--TTT-----CTGTCA--------CAGAGTA-GACAA--GA-TGC-A-AA--A--A-GGC-A---AT
gi|25 : acgctccaatttcaggcaggtccccagTA-GAAT-ATGG-GA--ACTT-TAAAG-----------------CAAT-TCCAAAG-G---------------AA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--ATTTTGA--GAAG---GCTG-TCG-CA-------G--C-A-G-----------GATATTG-CTGgt
gi|26 : ------TATATG----TACGTG---CTGA-CA-GGGA-TTTC-AGTAGCAGCAGGTCAAAAAT-C-AGCATTTTTGTTTGTTTGGTGGTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTtctatatatcaa
gi|27 : aaGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTNNNNNNNNNNNNNNN---------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAC-ATTG-AT-CTG-AAATAGGCTAA-ACAT-TCAAAA---
gi|28 : aGAGTAGAGCGGTATG---------------GAGGG---------------AC-ATCG-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GT------T--AGA-----GTATGA-------
gi|29 : ctggttg-ACAA----AG----A--A-TTATTTGTTTT-----CTGTCACA--------GAGTA-GACAA--G--TGC-A-AA--G--A-TAC-A---AT
gi|3 : tatggtattaaacGGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTgt
gi|3 : ---------------AC-ATTA-AT-CTG-AAATAGGCTGAAACAA-TCAAAA---GC------T--ATAT----ATATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTC----AATA------------------T-----------ATC------TACATG----T----GACTCTGA-CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACTT-CAA-AAA-AT-AGTAT---AT--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--T----CT-------T---CATTAA--TT--GGTT-AT---GA--ACAT-GAAAAG-TATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT------------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAAG---TCCG-TT--AA-------G--C-T-G-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AA----CATTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----AT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----TTGTCATATG-TATTAGATTA-G-CAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-------------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A--AT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTC-CTCC-A--C-CCACTTCCGC-CCATCCAAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacattaatctgaaataggctgaaacaatcaaaagctatatatatgaactcagtacccatatgtattcaatatatctacatgtgactctgacagtgatctcaacagattaaaaatcgaggtttttttgggttttttttttttttttttttttacaaatgatttcctgtcatccaatactgtgccaattctaaatgtcagtttagaaacttcaaaaaatagtatatattatgactttgtataatcaaactgacttgtctgactcattgaagtcttcattaattggttatgaacatgaaaagtatgttactcccaattacaaagggggtgaaatacaaattggtaactgtcatgctcattgtttttaaaagtccgttaagctggatacagctgatacctgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgctctacttaacattggtaaagggaaactcattctaatactttctccctttaatctattttaacaacagacagaggtcaattattcttgttgtcatatgtattagattagcaagtgcaaaaaggcaatacaaactgcactgagttccttatacatttcgtatttgaatatagaggtaacaaaaattttgcatttgcatccaggaaatgaaagagagagaatgacctttaatgtcaacaagatgatcagctacataaacatcacagactagcttttgaatttcctccacccacttccgcccatccaattccactcagctttttaccccaagc
gi|30 : gggcttggggtaaaaagctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGCTAATACAA-TCAAAA---GT------T--GGA-----GTATGA-------ACT
gi|31 : -----------------AA----CGTTGGTA-A---AGGAT-AA-CT-----------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------gaactgtaaaaccg
gi|32 : TGGGG-TAAA-AAAA--GCTGAGTGGAGTGGAGTG---------------AAATttcattcca
gi|33 : tgaCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTTGAGTGGTGTG---------------AAAT
gi|4 : gaGGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGAGT-------------------TT---------------ACGATTAGAT-CTG-AAACAAGCTA-TACCA-TAAAAA---AT------T--AGAT----GTATGGTCTAATCATTCAAGATTCCATAAT--G-ATGA----AAAAACATAT------------T-----------ATCC-----TACATG----TATGTGAC----A--A-GTGACTCTC-AA------C-------AGAT-TAAG-------GTATCT------GTTTTTAGGAA-----------------A----CAATTAATCTCCCTAGGCT----GTCA-T-CTGAT-G-CTGTG-ATGA--TTT-G-CAATGCTA-G-CGTTAGA-AACAT-CA---AG-AT-A-TA----AT--AC----------------------ATCAAACTC-C-T--------T-G-CTA--------ACT----------G--T-------------C---CA--AA--TTA-GGGT-GTGA-AA--ATTT-GAAG-G-AATGT-T-AACTC-CCAAT----AAAG------TGAAA------------------CT---C--------------A--TCA----TTGCCT-TATT--GTTTTTA--GAAG---TGTA-TT--TA-------G--TGA-G-----------GATACAG-TCAAA--AT-TTT-------G--T-----T------------T--------------G-CT--G--CAA-A-TGAC--AA-TC-TTT----TAAC-GC-TCCAA--T-TT-----------------CA----GGT---TA-C---AGG-------------------------TC--------------------------------C-----C-----------C-------GC--T--CC-----------C--TTT-----------AATTCTACAGTATTTAATA--AC-AG---AG----A-----A--T-TTTTTT--TTT-----CTGTCG--------CAGAGTA-GACAA--G--TGA-A-AC--A--A-GGC-A---
gi|4 : -CA----CATAG-G-A--AATGTGAG---GAC--GGGAGAA-T---GA------C-TT---T---A-TAT-G-T-CAAC-ACA-AGT-G-AT-CGGC-----------------------------------------------ATCACAAG--AC--T--AAGCTTTCACTC--TTTGCCCC-A--C---AC-TCC-----ATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAActgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacacacataggaaatgtgaggacgggagaatgactttatatgtcaacacaagtgatcggcatcacaagactaagctttcactctttgccccacactccattccattccactcagctttttaccccaa
gi|5 : gggcttggggtaaaaagctgagtggagtggagtttacgattagatctgaaacaagctataccataaaaaattagatgtatggtctaatcattcaagattccataatgatgaaaaaacatattatcctacatgtatgtgacaagtgactctcaacagattaaggtatctgtttttaggaaacaattaatctccctaggctgtcatctgatgctgtgatgatttgcaatgctagcgttagaaacatcaagatataatacatcaaactccttgctaactgtccaaattagggtgtgaaaatttgaaggaatgttaactcccaataaagtgaaactcatcattgccttattgtttttagaagtgtatttagtgaggatacagtcaaaattttgtttgctgcaaatgacaatcttttaacgctccaatttcaggttacaggtccccgctccctttaattctacagtatttaataacagagaattttttttttctgtcgcagagtagacaagtgaaacaaggcactgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacaTTAAGAAT-CG----------TGTTTTTGG--GGTGTT-----CGTTTTTGTTTTTT--------CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-TTAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACTT-CAG-AAACAT-AGTATTATATTGAT----TATGTACT--TTGTA-TAATCAAGATGACAT--------T-GT-TG--------ACTCA---TTGAGG--TCATTCTT------T---CA--A---TTA-GGTTTATGA-GAGAAC-T-GAAAAG-TATGT-T-A-CTC-C-AATATACAA-G-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CTTCAC--------------G--TCAA---T-GC-T-CAT---GTTTTTA--AAAAGCTTCCG-TT--AAA------G--C-TTG-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGCCAGAA-TCCTTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AAATTACATTGGTACA---AGGAA-AA-C------------------TC-A-TTCAT-----A-----AT----------ACGAG--T-----------T-------TC--C--CC-----------C--TTT-----------A--TCTTT----TTTCAC----C-AG-GCAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG-----CT--CATATG-TTTAAGATTA-GACAAATG--TGC-A-AACAA--A-GGC-ATTAATACAAAC-AT----------TGC---AC---GAGTT-CCCTT---T-A-TA--CATTTCCGTAT--TTG-AGTATA-G-----AG--G-----CAAGGTAATCAC---ACA-----AAT---TT--TG-C-ATGTA-TTG-CAGACTCACAGCG-A--AATG-AAAAAAGA---GAGAGAA-G---AA------CCTT---TCTTA-TATCG-TTCAAC-A-AAGATCA-ATGCAGCTA-------C--A-T--------------C-------------ATACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TCCACTCC-A--C-CTAA--CCGCTCCATTCCAT--TC----------CAGC-AGGCTTTT--TACCCCAA
gi|6 : GA-------ACTAAGTAC-CCATA-T--GTATTC----AAGA------------------T-----------ATC------TACATG----T----GACTCTGA-CA-GTGA-TCTT-AA------CAGATTAAAAAT-TGGG--------------TGG--GTTTT------TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-ATGTG-CCAT--TTC-T-AGATGTCA-GTT-TTAGA-AA-ACACAG-AAG-AT-TGTAT----T--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TCAA-CTT------T---C---AA--TTA-GGTT-ATG--GA--ACAT-GAAAAGAAATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--AAA-----------------------------------------GATACGG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--G-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--CTTT-----------------TA----CATTGGTA-A---AGGGA-AACC------------------TC-A-TTC-T-----A-----GTTTC-------AT-----TCCAAACATGAAT-------TC--TC-CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAAC---AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A--GC-A---A---AAA--------------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAT--TTG-AATATA-GAGGCAAG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---GT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---G---------------------------------AT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-TATTTACAAATCCA-A-------------A-ACATCGCA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACT--------CCAC-TCCGCTCCATTCCAT--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|7 : TGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-C--T-------GTTTT
gi|7 : TGACTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-ATGTG-TCAA--TTT-T-AAATGTCA-G-A-TTAGA-ATTAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AT----TTTG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------AATCA---TTGAAG--TGAA-CTA------C---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-TCAAT-CACAAAG-GAGA-TGAAA--TACAAA-TT-AGCAA-CT---CNNNNNNNNNNNNNNN--NNN----N-NN-N-NNNN--NNNNNNN--NNNN---NNNN-NN--NN-------N--N-N-N-----------NNNNNNN-NNNNN--NN-NTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-CCT-A--C-TT-----------------gacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactttatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|7 : tgatctcaacagattaaaaatctgtttA-A---CGGGA-AA-C------------------TC-A-GAC-T-----AAGTTAGC----------ACCAACAT-----------TGAG----TA--T--CC-----------C--TTTT----------AA-TCTAT----TTTAACC--AC-CG-AC------AGG-CCA--A--TA-----TCG-----C--TCA------ATTAGA-TA-GATAA--tatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|7 : tgatctcaacagattaaaaatctgttttgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactT-A--C-TC-----------------AA----TGTTGGT--------GCT-AA-C------------------TT-A-GTC-TG----A-----GT-----------------------------T-------TC--C--CG-----------T--TNN-----------NN-NNNNN----NNNNNNN--NN-NN-NNNN----NNN-NNN--N-NNNNNN--NNN-----NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN-NACAA--G--TGC-A-AA--A--AAGGC-A---ACACAAAC-AT----------TGC---CCT--AACTT-CC--T---T-A-TA--CATTTT-GTAA--TTG-AATATA-G-----AG--G----------------C---AAG-----A---------TG---AT----TTG-CT----CCCAG-G-A--AATG-AAA---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-GAT-GTAA-CAAGTC-------C--A----------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCAC------------------------TCCAC--TC----------CATT-CAGTTTTT--TACACCAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|8 : tgatctcaacagattaaaaatctgttttgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactttatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggaGGG-TAAA-A--A--GCTGAGT-----GGAGTG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-AT-CTG-AAATAAGCTAATATAA-GCAAAATTTACAATATGT--AGAT----GTATGA-------ACTAAGTAC-GCATA-TAAGTAATC----AGGATTCATAATGATGACAAATT-----------ATC------TACATA----TATGTGAAT-----CG-GTGA-TCTCAAA------AAGATCAAAAAT-C
gi|8 : A----CAAATGATTTCC------T----GT-----------------G-TCAA--ATT-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-GAG-AT-A------------T----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC----------------A--------ATTCA---TTAAGA--TGAA-CTA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACTT-TAAAAG-AATGC-T-A-ATC-CCAAT-T-C--AGTGTGA-TGAAA--TATAAA-TT-AGAAA-tattaagaacaaatgatttcctgtgtcaaatttaaatgtcagtttagaaacaccaggagatattatgactttgtataatcaaactgacaattcattaagatgaactatcaaattagggtatgagaactttaaaagaatgctaatcccaattcagtgtgatgaaatataaattagaaatactgtttgcttcagtgactgatcttttaatgctctattttatgataccctcatccttgtttcattccaaaccggggttctctcctaagtccatttaacaaagagggaagttatttttttcaatctatcatatattaggttagacaagtgcaaaatttacactgatttagaggcaagttgacatcaattctgcatttgcacccaggaaatgaaggagggagaatgacccttatatgtcaacaaagtggtcatcacagactagcttttgactttcacttcactccactccacttcactccactcagctttttacccaaagc
gi|8 : gggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataagctaatataagcaaaatttacaatatgtagatgtatgaactaagtacgcatataagtaatcaggattcataatgatgacaaattatctacatatatgtgaatcggtgatctcaaaaagatcaaaaatctattaaga------------T--------------G-CT--T--C-A-G-TGACT-GA-TC-TTT----TAAT-GC-TCT-A--T-TT-----------------TA-------TGATA-C---C--------C------------------TC-A-TCC-T-----T-----GTTTCATTCCAAAC-----CGGGG-------T-------TC--T--CT-----------C--CTA-----------AG-TCCAT----TT-AACA--A-------AG----AGG-GAA--G-TTATTT--TTTTCAATCTATCATAT---ATTAGGTTA-GAC-----------------A--A-G--------TGCAAAA-TT----------TAC---ACT--GA-----T--T---T-A-GAGGCA-------AG--TTG-A---------------------------------C---ATC-----AAT---TC--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAG---GA---GGGAGAA-T---GA------CCCT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-AGT-G-GT---------------------------------------------------CATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGACT--TTCACTTC-A--CTCCAC-TCCAC-----TTCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCAAAGCtactgtttgcttcagtgactgatcttttaatgctctattttatgataccctcatccttgtttcattccaaaccggggttctctcctaagtccatttaacaaagagggaagttatttttttcaatctatcatatattaggttagacaagtgcaaaatttacactgatttagaggcaagttgacatcaattctgcatttgcacccaggaaatgaaggagggagaatgacccttatatgtcaacaaagtggtcatcacagactagcttttgactttcacttcactccactccacttcactccactcagctttttacccaaagc
gi|9 : gggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataagctaatataagcaaaatttacaatatgtagatgtatgaactaagtacgcatataagtaatcaggattcataatgatgacaaattatctacatatatgtgaatcggtgatctcaaaaagatcaaaaatctattaagaacaaatgatttcctgtgtcaaatttaaatgtcagtttagaaacaccaggagatattatgactttgtataatcaaactgacaattcattaagatgaactatcaaattagggtatgagaactttaaaagaatgctaatcccaattcagtgtgatgaaatataaattagaaatactgttGGCTGGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAATGGAGTG---------------GAGTGGAATT----------AC-ATTA-AT-CTG-AAACAAGCT-ATACAA-TCAAAA---AT------T--AGAT----GTATGA-------ACTAAATGC-TCATG-T--CTAATCAATTAAGA------------------TTCATAATGATGATA------AACATA----TATGTGAC-CTG
gi|9 : TTTTTAGGAACAAATTAATTCC------TAGCTGTCA-T-ATGAT-G-CTGTG-TTGA--TTT-G-CAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAT-CA--AAG-AT-A-----------------TA------------A-TAATCAAACTCAC-T--------T-GCCT---------------------------AA-CTG------T---AA--AA--TTA-GGAT-GTGA-AA--ATTT-GAAAGG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-----AAA-GAGT-TGAAA--TATGA----------------------------------TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--G-----------------------------A-G-----------GATACAG-CTG-TCAAC-CAG-------A--T-----ATCAAAATTTGTTT--------------G-CT--G--C-A-A-TGACA-AA-TC-TTT----TAAC-GC-TCC-A--A-TT-------------------------TT---------AGGCA-GG-T------------------CC-----C-C-----A-----G---------------------------------------C--C--CC-----------C--TTT-----------AA-TCT---------------AC-AG---------------------TATTT--TTT-----GTGTCA--------CAGAGTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATtttttaggaacaaattaattcctagctgtcatatgatgctgtgttgatttgcaatgtcagtttagaaacatcaaagatataataatcaaactcacttgcctaactgtaaaattaggatgtgaaaatttgaaaggaatgttactcccaataaagagttgaaatatgatcatgctcattgtttttagaggatacagctgtcaaccagatatcaaaatttgtttgctgcaatgacaaatcttttaacgctccaattttaggcaggtccccagccccctttaatctacagtattttttgtgtcacagagtagacaagtgcaaaaaggcaatgtatatctctctctacacacacgcatatggaatgagggagggagaatgacctttatatgtcaacacggtgatcagcatcacagactatagctttcatctttcactccactccattcagctttttaccccaag
gi|9 : ggctgggggtaaaaagctgagtggaatggagtggagtggaattacattaatctgaaacaagctatacaatcaaaaattagatgtatgaactaaatgctcatgtctaatcaattaagattcataatgatgataaacatatatgtgacctg-G-G--AATG-AGG---GA---GGGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-C-GGT-G-AT-CAG-----------------------------------------------CATCACA-G--ACTAT--A-GCTTTCATCT--TTCAC------------------------TCCAC--TC----------CATT-CAGCTTTT--TACCCCAAGgtatatctctctctacacacacgcatatggaatgagggagggagaatgacctttatatgtcaacacggtgatcagcatcacagactatagctttcatctttcactccactccattcagctttttaccccaag
blockSeqs : G T AA AA GG GGCGGATTGTGGAGT NNNNNNNNNNNNNNN G G T T G T TTT AATATG AC CGAT TCTAATC C T A AA AATT TTCATAATGATGACAAATT TACATG AATG T T T C A TAGCAG CAGCATTTTTGTTTGTTTGGTGGTTTTTTT T T AAAA CTAGGC AGCT . A . A . . C T T T G . A GG C AT TAT TG . T . A . AC . TAGTACGT . A AG G T ACATGTAT TT . T G C A GA A T G A G A T ATA T AGA AT A A A CNNNNNNNNNNNNNNN GTCA T C . AT TT GCT TTAACATGGTTAAGCTG C CA . ATATCATATTTACTGCTT C AT GC A A . G A C . G A A AG T TTACATTAATCATTATGAACGTTGATAAGGATAACCTCAATTATAGTTTATTCCAAACTGGCAGCAG AT C AAACAGGAGTT AT TAATCCAATGT T AGTA ACGATGGAAC CTCT TTC . A GT TTCAAT TGTGTATT T . AT GC A C CA . A . TTA G A AGG ACA C CTT A A GG C A C . AAGCA GCAAGGTAATCA GTT TTTTT CAA CG . T CAAT . GACT C T TT T AAAA TGC A . ATGACGCCTTCAT C . T T C A A T G C ACATATGTAACAAATCCAA T A AA TA GC A CC TCCACTCCACTCCGCTCCA TG CACTTCACTC . TA
blockSeqs : . . . . GG . GAATT . . . C T . . . . T . C . . . . TTCATAATGATG C . T . . . . . CGAGGTTTTTTTGGGTTTTTTT T T GGAA . . . . . . . . . . . . . . . G . AG . . . . . T . AT . . . G . G . ATATG . . . G T . . A . A . . A . TA . AGA . . . . TCACG A . . . . . . TTAAAGCTTG . . . ATATCAAAATTTGTTT . . . A . . . . . . . . . . T TTTACATTAACATGTGAAACGTTGGTAACAGGGAAACCTCATACTAGTTTCATTCCAAACGCAGT . C . C CA . AGTA AGCTATA . TC . T . TT TATATATT T . . A A . . . A . . . A . T . TA . . . . T . . AGGCA GCAAGGTAA . . . . . . GTA . . . . . . T C . . CCTTATATA . . . . . . C . . C ACATATCAACAAATCCAA . . . CA . . . TCCAATCCACTCCACCCA . . . .
blockSeqs : . . . . NN . . . . . . G . . . . . . C . . . . ACATATT . . T . . . . . TAAGGTATCTGTTTTTAGGAA G T . . . . . . . . . . . . . . . . G . AG . . . . . A . T . . . A . G . AC . . . G . . . A . . . . . . TA . GAG . . . . CG . . . . . . . TTTCAGCAG . . . ATTTACTGCTT . . . . . . . . . . . . . . . TACATTGGTAAAGGGAAACCTCATTCTAGTTTCATTCCAAACATGAAT . . . . T . . AACAGAC . TC . . . G TATGTATA T . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . A . . . ATGA . . . . . . . . . . . . . A . . . ATGACCTTC . . . . . . . . . C ACATATTTACAAATCCAA . . . TA . . . TCCACCCACTTCCGCCCA . . . .
blockSeqs : . . . . AG . . . . . . T . . . . . . C . . . . TG . . T . . . . . CGTGTTTTTGGGGTGTTCG T T . . . . . . . . . . . . . . . . A . AG . . . . . T . T . . . A . A . AT . . . G . . . A . . . . . . TA . GGG . . . . CG . . . . . . . TTTCAGCAG . . . ATAT . . . . . . . . . . . . . . . TTACATTAACATGTGAACGTTAGTAAAGGATAACTTCATACTAGTT . . . . . . . CACCGAC . TT . . . G TATGTATT T . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . A . . . GTAA . . . . . . . . . . . . . G . . . CCTTTCTTA . . . . . . . . . C ACAGTAACAAATCCAAA . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNN . . . .
blockSeqs : . . . . GG . . . . . . A . . . . . . A . . . . TT . . T . . . . . TGGGTGGGTTTTTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AG . . . . . T . T . . . G . G . TT . . . G . . . A . . . . . . TA . GGG . . . . CG . . . . . . . TCACAGCAG . . . ATAT . . . . . . . . . . . . . . . AAATTACATTGGTACAAGGAAAACTCATTCATAATACGAGTT . . . . . . . NNNNNNN . TC . . . G TATGTATT T . . . . . . . . . . . . . C . T . . . . T . . . GGAG . . . . . . . . . . . . . A . . . CCTTTA . . . . . . . . . C AACAAATGCAA . . . . . . . TCCACCTAACCGCTCCA . . . .
blockSeqs : . . . . TG . . . . . . T . . . . . . A . . . . TT . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . TG . . . . . T . T . . . A . C . TT . . . A . . . T . . . . . . TC . GGG . . . . TG . . . . . . . ATTCAGCCG . . . ATAT . . . . . . . . . . . . . . . AATGTTTGTAATATAGGGACCCTCTACTGTGTAGTAAGT . . . . . . . ACAGAC . TC . . . G TATGTTTA G . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . A . . . GCGT . . . . . . . . . . . . . A . . . CCTTTA . . . . . . . . . C AATAAACCCAA . . . . . . . TCCACTCCCATTGCA . . . .
blockSeqs : . . . . GG . . . . . . T . . . . . . A . . . . TG . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AG . . . . . T . T . . . G . C . AC . . . T . . . A . . . . . . TA . AGA . . . . GT . . . . . . . TCGCAGCAG . . . ATAT . . . . . . . . . . . . . . . TATGATACCCTCATCCTTGTTTCATTCCAAACCGGGGT . . . . . . . ACAGAT . TC . . . C TATGTATT G . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . T . . . GTAA . . . . . . . . . . . . . G . . . CCTTTA . . . . . . . . . C ACATA . . . . . . . TTCACTCCACTCCAC . . . .
blockSeqs : . . . . GG . . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . G . . . . . T . T . . . A . G . AT . . . G . . . T . . . . . . TA . TGA . . . . CG . . . . . . . TTTAGTGAG . . . GTTT . . . . . . . . . . . . . . . TACATTGGTAAAGGGAAACCTCATTCTAGTACGAGT . . . . . . . ACAGAC . TC . . . G NNNNNNNN T . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . T . . . GTAA . . . . . . . . . . . . . A . . . CCCTTA . . . . . . . . . C ACATA . . . . . . . TCCACTCCGCTCCA . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . A . G . GT . . . T . . . A . . . . . . CA . AGT . . . . CA . . . . . . . TTAAGCTG . . . ATAT . . . . . . . . . . . . . . . AACATTGGTAAAGGGAAACTCATTCTAATACTT . . . . . . . ACAGAC . TC . . . G AGTAATT G . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . T . . . GCA . . . . . . . . . . . . . G . . . CCTTTA . . . . . . . . . C ACATA . . . . . . . TCCACTCCGCT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . G . . . T . . . T . . . A . . . . . . T . . . . . . CG . . . . . . . NNNNNNNN . . . ATAT . . . . . . . . . . . . . . . GAACGTTGGTAAAGCATTTGTACTAGATGAGT . . . . . . . AACAG . TC . . . T TATGCA T . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . A . . . AG . . . . . . . . . . . . . A . . . CGTTT . . . . . . . . . C ACATC . . . . . . . CCCACACTCCA . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C . . . G . . . T . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . AG . . . ATAT . . . . . . . . . . . . . . . AATGTTGGTGCTAACTTAGTCTGAGTT . . . . . . . CAGGC . CC . . . T TATGCA T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . G . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . CTTTA . . . . . . . . . C CCAA . . . . . . . TCCACTCCA . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . CAGGTTACAGGTCCCC . . . . . . . ACAG . NN . . . G TATATT N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . CTTTA . . . . . . . . . G CGAA . . . . . . . TCTAAACCA . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTAGGCAGGTCCCCAG . . . . . . . ACAG . GA . . . T ATT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . TCAG . . . . . . . . . . CCAA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . AC . T . . . G CA G . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . G C . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AC . . . . . G C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AA . . . . . N C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T .
blockSeqCons : GG CGAGGTNTNTTTGGGTTTTTCG*************** ** AG* **** ** T********* *** ** TA* GGG* CG******************* TTNCAGCNG************************ ATAT**************************************** **** ** ACAGAC***** TC* ** G***** TATGTATT* ** ********** T** T***** N** ***** *** *** CCTTTA************* ACATA************************************* TCCACTCCGCTCCA*********
originalCons : GGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGAGTG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTC----AAGA------------------T-----------ATC------TACATG----TATGTGACTCTGA-CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAAT-CGAG-------GTTTTTTTGG--GTTTTT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTAT---AT--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAGG--TGAA-CTA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C--------------G--TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCG-TT--CA-------G--C-A-G-----------GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AA----CGTTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACA--AC-AG-ACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTTC-GTAN--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAG---GA---GAGAGAA-T---GA------CCTT---T---A-TAT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCC-A--C-CCAC-TCCGC-CCATTCCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
finalCons : GGGCTTGGGG-TAAA-A--A--GCTGAGTGGAGTGGAGTG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-AT-CTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGAT----GTATGA-------ACTCAGTAC-CCATA-T--GTATTC----AAGA------------------T-----------ATC------TACATG----TATGTGACTCTGA-CA-GTGA-TCTC-AA------CAGATTAAAAATCGAGGTNTNTTTGGGTTTTTCG---------------TTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTCC------T----GTCA-T-CCAAT-A-CTGTG-CCAA--TTC-T-AAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-ATAG-TAT---AT--AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGACT---------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAGG--TGAA-CTA------T---CA--AA--TTA-GGGT-ATGA-GA--ACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAATTA-CAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CTCG-------------------TCA----T-GC-T-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGTTNCAGCNG------------------------GATACAG-CTGAT--AC-CTGATAT----------------------------------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-TC-TTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AA----CGTTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----TTTAACACAGAC-----AG----AGGTC-A--A-TTATTT--TTG-----CTGTCATATGTATT-AGATTA-GACAA--G--TGC-A-AA--A--A-GGC-A---ATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CCT-----T-A-TA--CATTTC-GTAN--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TAA--------C---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG-AAG---GA---GAGAGAA-T---GACCTTTA-------------TAT-G-T-CAAC-A-A-GAT-G-AT-CAGCTACATA-------------------------------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCCACTCCGCTCCA---------TTCCAC--TC----------CACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAAACCAAAATCTATTATTTTTCTTTCCGTCTTTTTCAATTAATTACTTACTGTCTAATAGCAAAATATTTCATTGAATTGAAAAAACGATATATATTGTTTACGGAATACAACGAATGGTCAAGATAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333 111111 111111 1111111 666666666666666666 11111111111 111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111111111 11111111 11111111111 22222222222222222222 222222222222222222222222 33333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111 11111111111 1111 111111111 1111111111 11111 3333333333333333333 11111 1111 1111111111111111111 666666666666666666666666666666666666666666 1111111111111
lowQualScore : 3 3 99 2 99999999999999999999999999999999999 3 3 3 7 0 3 3 555 000000 55 111111 0000000 2 4 4 55 8888 777 8 000000000000000000 11111111111 7777 2 4 4 3 000000 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 888888 6666 3 3 6 3 44 3 3 6 3 3 3 3 3 3 555 3 7777 7777 3 55 2 3 7777777777 3 22222222 555 1 44 4 3 22222222222 44 44 2 44 2 33 2 1 5 5 2 5 2 2 666 0 3 9999 444 3 3 2 11111111111111111111 3 9999 3 3 44 44 555 555555555555555555555555 6666 2 44 3 44444444444444444444444444444444444444444444 2 33 33 8 2 2 2 2 2 6666 2 2 2 33 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33 55 11111111111 77 66666666666 2 0000 2 2 2 88888888888 4444 2 0 33 4 0 33 777 333333333 2 2 22 55 4 2 33 33 4 666 2 8888888888 555 555 3 999999 3 3 44 3 666 3 3 44444 1111111111111111111 555 44444 555 33 2 2 1111 2 5555 2 2 33 666 1 888 2 444 6666666666666666666 2 4 7 2 4 4 2 1 999999999999999999999999999999999999999999 2 2 33 99 33 2 33 55555 55555 4444444444444 22 2 33 2 33
lowQualScore : . . .. . ................................... . . . . . . . ... ...... .. ...... ....... . . . .. .... ... . .................. ........... .... . . . . ...... ..................................................... ...... .... . . . . .. . . . . . . . . . ... . .... .... . .. . . .......... . ........ ... . .. . . ........... .. .. . .. . .. . . . . . . . . ... . . .... ... . . . .................... . .... . . .. .. ... ........................ .... . .. . ............................................ . .. .. . . . . . . .... . . . .. . ............................................................................................................................ .. .. ........... .. ........... . .... . . . ........... .... . . .. . . .. ... ......... . . .. .. . . .. .. . ... . .......... ... ... . ...... . . .. . ... . . ..... ................... ... ..... ... .. . . .... . .... . . .. ... . ... . ... ................... . . . . . . . . .......................................... . . .. .. .. . .. ..... ..... ............. .. . .. . ..
lowQualScore : 3 3 22 7 66666666666666666666666666666666666 6 6 6 3 4 2 3 888 555555 00 333333 8888888 5 0 0 55 5555 000 0 555555555555555555 55555555555 7777 1 0 0 6 555555 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 888888 5555 1 1 2 1 22 1 1 2 1 1 3 6 6 3 222 3 7777 7777 6 00 3 6 3333333333 3 11111111 444 2 22 7 1 88888888888 22 22 9 11 9 99 9 9 7 7 9 7 9 9 888 4 1 7777 555 1 1 9 44444444444444444444 1 6666 1 1 22 22 444 555555555555555555555555 1111 9 22 1 33333333333333333333333333333333333333333333 9 99 99 6 9 9 9 9 9 1111 9 9 9 99 9 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 44 99 22222222222 99 88888888888 4 0000 4 4 4 66666666666 7777 2 1 11 4 7 11 333 111111111 4 4 99 33 4 2 11 11 4 111 9 2222222222 444 999 1 333333 1 1 22 1 333 1 1 33333 4444444444444444444 000 33333 000 99 9 9 1111 5 3333 4 4 22 555 9 888 4 111 9999999999999999999 4 7 1 4 7 7 4 8 666666666666666666666666666666666666666666 4 4 22 77 22 4 22 99999 99999 7777777777777 66 5 44 9 99
consensus : GGGCTTGGGG-TAAA-A--AGCTGAGTGGAGTGGAGTG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-A-TCTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGA-T----GTATGA-------ACTCAGTA-CCCAT-AT--GTATTC----AAG---A-T------------------AT----C------TAC----ATGTATGTGACTCTGA-CA-GTGA-TCTCAA------CAGATTAAAAATCG-AG-------GTNTNTTTGG--GTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTC------CT----GTCA-T-CCAAT-ACTGTG-CCAA--TT-C-TAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTA-TAT----AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAGG--TGA-ACTA------T---CA--AA--TTA-GG-GT-AT--GA-GAACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C-------------G--TC-A----TG-CT-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGT----TN-CA-------G----C-AG----GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------A----ACGTTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----T-TTAA-C-A--C----AGACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG--CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-A--AA--A-GGC---AATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTT-CGTAN--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TA--------AC---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG---AAGGA---GAGAGAA-T---GA------CCT---T---TA-TAT-G-TCAAC-A-AGAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TT-----CACTC-----CAC-----T---CCGCT-CCA-TTCCAC--TCCACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
Reference ( family-1169 ) : GGGCTTGGGG-TAAA-A--AGCTGAGTGGAGTGGAGTG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-A-TCTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGA-T----GTATGA-------ACTCAGTA-CCCAT-AT--GTATTC----AAG---A-T------------------AT----C------TAC----ATGTATGTGACTCTGA-CA-GTGA-TCTCAA------CAGATTAAAAATCG-AG-------GTNTNTTTGG--GTTTTTCGTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTC------CT----GTCA-T-CCAAT-ACTGTG-CCAA--TT-C-TAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTA-TAT----AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAGG--TGA-ACTA------T---CA--AA--TTA-GG-GT-AT--GA-GAACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C-------------G--TC-A----TG-CT-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGT----TN-CA-------G----C-NG----GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------A----ACGTTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----T-TTAA-C-A--C----AGACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG--CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-A--AA--A-GGC---AATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTT-CGTAN--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TA--------AC---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG---AAGGA---GAGAGAA-T---GA------CCT---T---TA-TAT-G-TCAAC-A-AGAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TT-----CACTC-----CAC-----T---CCGCT-CCA-TTCCAC--TCCACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|1 : CTTGGGG-TAAA-A--AGCTGAGT-----GGAGTG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-A-TCTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GC------T--AGA-T----ATATGA-------ACTCAGTA-CCTAT-AT--GTATTC----AAT---A-TC-----------------AT----C------TAC----ATGTATGTGACTCTGA-CA-GTGT-TCTTAA------CAGATTAAAAAT
gi|1 : A----CAAATGATTTC------CT----GTAAAT-CCAATCACTGTGGCCAACATT-C-TAAATGTCAAG-T-TTAGACAACAC-CAG-AAG-ATGAGTA-TAT----ATAGTATATG-ACTATTTGGAACAATCAAATTGAC-TACCACGCGTAGTCAG--------ACTCACCCTTGAG---TGA-ACTA------T---CA--AAAATTA-GG--T-AT--GA-GAACATCGAAAAG-AATGT-T-A-CTC-TCAAT-T-CAAAG-GGAAATGAAA--TACAAA-CT-GGTAA-CT---C-------------GCGTC-A----TG-CTTCATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGTTTAGTG-CA-------GGATAC-AACGCTGATAC---CTGAT--ATGCTGCAGTGAAA--TCTTCAA------------C--------------G-CT--C--CGA-GCTGA-A-CA-C-CTTTTATACAAT-GT-AAC-A--T-TTGA---------------A----ACGTTAGAG-A---AAGGATAA-CCGAGTCATACGTCAGTTTTC-A-TTC-TCAAACA-----GC----------AG-----T-----------T-------TC--TTCCC-----------C--TTT-----------CA-TCGTT----TGTTAA-C-A--C----A--C-G----AGG--CATTA-TTATTT--TT---CTGTCATATGGTATTAGATTAAGACAA--G--TGC-A-A--AATAA-GGCC--AATACAAAC-ATACGCCACTAATAC---AC---GAGTT-CC--TATAC-A-TA--CATTT-CGTAAAGTTG-AATATAAG-----AGCGG-----T----------C---AAATTTTTAAT---TT--TGAC-AT----TTGGCA----CCCTG-G-A--AATA---AAGAAC--GAGAGAA-TAATGA------CCT---T---T--TAT-GCTCAACGA-AGAT-GTAA-CAAATT-------CCAA-G--------------A-------------A-ACATACCA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TT-----CGCTC-----CA------------GCTACCACTTCCAC--TCCacgggttaaaaaaaacaaacaaacaaaaacaaatgatttcctgtaaatccaatcactgtggccaacattctaaatgtcaagtttagacaacaccagaagatgagtatatatagtatatgactatttggaacaatcaaattgactaccacgcgtagtcagactcacccttgagtgaactatcaaaaattaggtatgagaacatcgaaaagaatgttactctcaattcaaagggaaatgaaatacaaactggtaactcgcgtcatgcttcattgtttttagaagtccgtttagtgcaggatacaacgctgatacctgatatgctgcagtgaaatcttcaacgctccgagctgaacaccttttatacaatgtaacatttgaaacgttagagaaaggataaccgagtcatacgtcagttttcattctcaaacagcagtttcttcccctttcatcgtttgttaacacacgaggcattattatttttctgtcatatggtattagattaagacaagtgcaaaataaggccaatacaaacatacgccactaatacacgagttcctatacatacatttcgtaaagttgaatataagagcggtcaaatttttaattttgacatttggcaccctggaaataaagaacgagagaataatgaccttttatgctcaacgaagatgtaacaaattccaagaaacataccagactagcttttgaatttcgctccagctaccacttccactcc
gi|10 : cttggggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataggctaatacaatcaaaagctagatatatgaactcagtacctatatgtattcaatatcatctacatgtatgtgactctgacagtgttcttaacagattaaaaatacgggttaaaaaaaacaaacaaacaaaa--AA--TTA-GG-GT-AT--GAAGAACAT-GCAAAG-AATGT-T-A-CTC-TTAAT-TACAAAG-GAGA-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C-------------G--TC-A----TG-CC-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGT----TT-CA-------G----C-AG----GATACAG-CTGAC--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------GCCT--GGCC-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAACGGC-TTT-AAGC-TTTTTACATTAACATGTGAA----ACGTTGGTA-AC--AGGGA-AACC------------------TC-A-TAC-T-----A-----GTTTC-------AT-----TCCAAACGCAG-T-------TC--T--CC-----------CATTTT-----------AA-T-TAT----T-TTAA-C-A--CGATGGAACAG----AGGTTCA--A-TTATTC--TTG--CTGTCATGTG-TATTAGATTA-AACAA--G--TGC-A-A--AA--A-G--------ACAAATGATA---------TGCAGGACT--GAGTTCCC--T---T-A-TA--CATTT-CATAA--TTGCAATATA-G-----AG---------A--------GC---AAA-----GA-----T--TG--------------A----CACAA-ATATTAATG---AATCA----ACAG-A-T---GA------TC---------AGCAT-G-AC-AT-A-AG-T-A-AC-CAA-TC-------C--A----------------A-------------A-ACATAATA-GAAAT--TGCG-GCTTTTGAAT--TT-----CACTC-----CAC-----TC--CCATT-GCA-TT-CACTGTCCACTCCAGCTTTT--TACCCCAAG
gi|11 : -GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TGA-ACAA------C---CA--A---TT---G-GT-AT--GA-GAACATTGAAAAA-A--GT-T-AACTC-TCAAT-TACAA-G-GAGA-TGAA---TACAAA-TT-GGTAAACT---C-------------G--TC-AGTCATG-CT-CATT--GTTTTTA--GAAG---TCCGT----TT-CA-------G----C-AG----GATACA----GA---GC-TTG----------------A------------T--------------G-CT--G--CAA-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TTG----------------A----ACGTTGGTA-A---AG---------------------------C-A-TTT-------------GT----------AC-----TAGATGAG----T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----T-TTAA-C-----------ACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG--CTGTCATATG-CA------------AA--A--TGCAA-A--AA--A-GGC---AAAACAAAC-AT----------CG
gi|11 : -----AG--A-----TG--------AC---AAA-----TAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG---AA--A---GAGAAAA-T---GA------CCT---TATATA-TAT-G-TCAAC-A-A----G-AT-CAGCTA-------C--A-TATGTAACAAATCCAA-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TT-----CACTC-----CAC-----T---CCGCT-----TTTTAC--CCCAaggcaagatgacaaatattttgcatttgcacccaggaaatgaaagagaaaatgaccttatatatatgtcaacaagatcagctacatatgtaacaaatccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccgctttttacccca
gi|12 : gtctgactcattgaagtgaacaaccaattggtatgagaacattgaaaaaagttaactctcaattacaaggagatgaatacaaattggtaaactcgtcagtcatgctcattgtttttagaagtccgtttcagcaggatacagagcttgatgctgcaagtgacaaatctttcaacgctctacttgaacgttggtaaagcatttgtactagatgagttctccctttaatctattttaacacagaggtcaattattcttgctgtcatatgcaaaatgcaaaaaaggcaaaacaaacatcgaggcaAA-CT---C-------------G--TC-A----TG-CT-CATT--GTTTTTA--AAAG---TCCGT----TAACATGGTTAAG----C-TG----GATACAG-CTGAC--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGAAA-AA-T-CTTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------TT---ACATTGGTA-A---AGGGA-AA-CC-----------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----GAG---------T-------TC--T--CC-----------CC-TTT-----------AA-TCTAT----T-TTAA-C-A--C----AGACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG--TTGTCATATA-TATTAGATTA-GACAA--G--TGCAA-A--AA--A-GGC---AATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---TAA-TA--CATTT-CGTAT--TTG-AATATA-GAAGCAAG--G-----TA--------AC---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG---AAAGA---GAGAGAA-T---GA------CGT---T---T------------------AT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TTCACTCCACTC-----CAC-----T---CCGCT-CCA-TTCCAT--TCCACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|13 : AG-AT-ATTA-TAT----AT----TATG-ATT--TTTAA-TAATCAAAATAAC-T--------T-GTCTG--------ATTCA---TTGAGG--TGA-ACCA------T---CA--AA--TTA-GG-GT-AT--GG-GAACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-G---------------AA-TT-TGTAA-CT---T-------------G--CC-A----TG-CT-CATT--GTTTTTA--AAAG---GCCGT----CA-CA-------G----C-AG----GATATTGCCTGAT--AT-CAA-------ATTT-----ACTGCT-------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----TAAT-GC-TCT-A--C-TTTTACATTAACATGTG--A----ACGTTAGTA-A---AGGAT-AA-CT-----------------TC-A-TAC-T-----A-----G------------------T-----------T-------TCATT--CCAAACAGGAGTTC--TTC------------A-TCTA-----T-TTAA-C-A--C----AG--AG----AGG-TT--------TTT--TTG--CTG
gi|14 : -----------------A----ATGTTTGTA-ATATAGGGA-CC-C------------------TCTA-CTG-TGT---A-----GT----------AA-----G-----------T-------TC--T-------------------TT-----------AA-T-TAT----A-TCAA-C-AGCT----ATA-AA----AAG-T-A--A-TT--TT--TTC--CTGCCAAGTA--ATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-A--AA--A--GC---AATGTAAAC-A------------GC---A-T--GAGTT-TC--------A--A--CATAT-CGTAA--GGA-AATATA-G-----AA--G-----C---------ACGTTGAA-----AATCAATTCGCG-C-AT----TT--CA------CAA-G-A--AATG---AAGGATGCGATGGAA-T---GAATGACGCCT---T---CATTAT-G-TCAACTA-ACATAA-AT-C------------C--G-A--------------A-------------A-ACATCACA-G---CTAT--A-GCGTTTGAA---TA-----CACTC-----CAA-----T---CCACT-CCA--CCCAC--T----T-CAGCTTTTTATACCCCAgattagctctgtgctgttatatgt
gi|15 : cactttaacatgA-------A----C-AG----GACACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------TCATATTTACTGCTTG-CT--A--C-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAAA-GC-TCT----T-TT-----------------A----ACgc
gi|15 : ttgtttcaactg-----------C--TTTCA---------AA-GCTCT----T-TTAA-C-A--C----AGATAGCTCTAGG-TCA--A-TTATTT--TTG--TTGTCATATG-TATAAGATTA-GACAA--G--TGC-ACA--AA--A-GGC---AATACAAAC-AT----------AGC---ACC--AAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTT-CGAAA--TTG-AATATA-G-----AG--G----------------C---AAG---------------TG-C-AT----TTG-CA----ACCAG-A-A--AATG---AAAGA---GAGAG------------------------------T-G-TCAAC-A-AGAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------ATCAACAAATCCAAA-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TT-----CAC------------------------------TCCAC--TCCACT-CAGCTTTT--TACCCCAacagatagctctaggtcaattatttttgttgtcatatgtataagattagacaagtgcacaaaaggcaatacaaacatagcaccaagttccttatacatttcgaaattgaatatagaggcaagtgcatttgcaaccagaaaatgaaagagagagtgtcaacaagatgatcagctacatatcaacaaatccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccactcagctttttacccca
gi|16 : ttgtttcaactgaacaggacacagctgatacctgatatcatatttactgcttgctacagtgacaaatGACTTGGAG-TAAA-A--AG----GTG-AGTGGAGTG---------------GAGTA---------------AC-ATTA-A-TCTA-AAATAGACTA-------CCAAAA---GC------T--AGA-TCGATGTATGA-------ACTCAGTA-CCCAT-AT--GTATTC----AAG---A-TG-----------------AT----C------TAC----ATGTATGTGACTCTGA-CA-GTGA-TCTCAA------CAGATTTAAAAT---AT-------GTGTCTT
gi|16 : gaA----CAAATGATTTC------CT----GTCG-T-CCAAT-AATGTG-TTAA--TT-C-TAAATGTCA-G-T-TTATA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTA-TAaaaaacaaatgatttcctgtcgtccaataatgtgttaattctaaatgtcagtttataaacaccagaagatagtatagaagtgaactacatgtatcaaattagggtatgagaacatgaaaagagtgttactccc
gi|16 : gagacttggagtaaaaaggtgagtggagtggagtaacattaatctaaaatagactaccaaaagctagatcgatgtatgaactcagtacccatatgtattcaagatgatctacatgtatgtgactctgacagtgatctcaacagatttaaaatatgtgtcttaaaaA---TAGAAG--TGA-ACTACATGTAT---CA--AA--TTA-GG-GT-AT--GA-GAACAT-GAAAAG-AGTGT-T-A-CTC-CCgaagtgaactacatgtatcaaattagggtatgagaacatgaaaagagtgttactccc
gi|17 : gagacttggagtaaaaaggtgagtggagtggagtaacattaatctaaaatagactaccaaaagctagatcgatgtatgaactcagtacccatatgtattcaagatgatctacatgtatgtgactctgacagtgatctcaacagatttaaaatatgtgtcttaaaaacaaatgatttcctgtcgtccaataatgtgttaattctaaatgtcagtttataaacaccagaagatagt------------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------AC-----GAG---------T-------TC--T--CC-----------C--CTTTAATCCAATGTAA-TCTAT----T-TTAA-C-A--C----AGACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG--TTGTCATATG-CA-----------------------A-A--AA--A-GGC---AATACAAAC-AT----------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTT-CGTAT--TTG-AATATA-G-----AG--GCAAGGTA--------AC---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG---AAAGA---GAGAGAA-T---------------------TA-TAT-G-TCAAC-A-ACAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TT-----CACTC-----CA-------------CT-CCA-TTCCAT--TCCACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|18 : GGCTTGGGG-TAAA-A--TGCTGAGT----------G---------------GAGTG---------------AC-ATCA-A-TCTG-CAATAGGCTAAGACAA-TCAAAA---GC------T--AGA-T----GTATGC-------ATTCAGTA-CCAAT-AT--GTATTC----AAG---ATT------------------AT----CTACATGTAC----ATGTATGTGACTCTGA-CA-GTGA-TCTCGA------CATATTAAAAA--------------TATGTTTTG--ATTTCCTGT
gi|18 : TGATTTC------CT----GTCA-T-CCAAT-ACTGTG-CCAA--TT-C-TAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-AAG-AT-AGTA-TAT----AG----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACCGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TAA-ACTcatccaatactgtgccaattctaaatgtcagtttagaaacaccagaagatagtatatagtatgactttgtataatcaaaccgacttgtctgactcattgaagtaaact
gi|19 : ggcttggggtaaaatgctgagtggagtgacatcaatctgcaataggctaagacaatcaaaagctagatgtatgcattcagtaccaatatgtattcaagattatctacatgtacatgtatgtgactctgacagtgatctcgacatattaaaaatatgtttACAC--G--TGC-A-T--AA--A-GGC---AATGC---T-ATA---------TG------T--GAGCA-----------A-AA--CATTT----------A-AATATA-G-----AG--G-----GA--------GG---GGC-----AAT---TT--GA-C-ATCAATTTG-CA----CACGT-G-G--AATG---AAGGA---GGGAGAA-T---GAATGA--CCT---T---C--TAT-----AAC-A-AGGT-G-AT-CAACTAACAAATGC--A----------------A-------------A-ACATCACT-G--ACCAT--A-TCTTTTGCAT--TT-----CACTCTAAACCAC-----T---CCACT-CCA-CTTCAC--TCCACT-CAGCATTT--AACTCCAAGC
gi|2 : ctcccatttaatctatttaggtcattttgtcGGCTTGGGGGTAAATA--AGCTGAGTGGAGTGGAGCGGGCGGATTGTGGAGTGAGTG---------------AC-ATTA-A-TCTGTGAATAGTCTAATACAATTCAAAA---GC------TACAAA-T----GTAT-----------------------------TATTC----AGG---ATT------------------AT----C------TAC----ATGTATGTGACTCTGATCA-GTG-------------------TAAAAAT-A-AG-------GTTTCTTc
gi|2 : A----CAAATGATTTC------CT----GTCA-TACCAAT-ACTG---CCAA--TT-C-TAAATGTCATG-G-TTAGA-AACAC-CAGGAAG-AC--GTA-TAT----AT----TATG-ACT--T-GAA-ACATCAT-TTGATAC--------C-GTCCGTAGTACGTACTCA---TTGAGGAGTGA-AACA------TATGCA--AA--TTATGG-GTCAT--GA-GAACAT-GAAAAGGAATGTATGA-CTCTCCAAT-TACAAAG-GGAG-TGAAAATTACAAAATTAGGTAA-CT---G-------------T--TC-A----TA-GT--ATTATGTTTTTATTGAAG---TCCGA----TT-CA-------G----C-CG----GATACAG-GTGAT--AC-ATG-------A--T-----A------------T----------------CTATG--C-AAG-TGAAA-AAAT-CTTT----CAAC-GCATCT-A--C-TTTTACATTAATCATTATGA----ACGTTGATA-A---GGATA-AC-C------------------TC-AATTA-T-----A-----GTTTATTCCAA-AC-----T-----------GGCAGCAGTC--T--CC-----------CC-TTT-----------CA-TCTAT----T-TTAA-C-A-----------AG----AGG-TCA--AATTATTT--TTTT-CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--GGCTGC-A-A--AA--AAGGC---AATACAAAC-AT----------CGC---ACACAGAGTT-CC--TA--T-AATA--CAATT-CGTAA--TTG-AATATA-G-----AG--G-----CG--------TC---AAATTTTTCAT---TT--TA-CTGT----TTG-CA----CCTGG-G-A--AATG---AAAGA---GAGAGAAAT---GA------C-T---T---TA-TAT-G-TC-AC-A-AGAT-T-GC-CAGCTA-------C--AGTAACAAATCCAA---A-------------A-ACATCACA-G--AC----------TTNNNNN--NN-----NNNNN-----NNN-----N---NNNNN-NNN-NNNNNN--NNNNNN-NNGCTTTT--TA-CCCAAGCaaaaaaacaacaaataaacacaaaaacaaatgatttcctgtcataccaatactgccaattctaaatgtcatggttagaaacaccaggaagacgtatatattatgacttgaaacatcatttgataccgtccgtagtacgtactcattgaggagtgaaacatatgcaaattatgggtcatgagaacatgaaaaggaatgtatgactctccaattacaaagggagtgaaaattacaaaattaggtaactgttcatagtattatgtttttattgaagtccgattcagccggatacaggtgatacatgatatctatgcaagtgaaaaaatctttcaacgcatctacttttacattaatcattatgaacgttgataaggataacctcaattatagtttattccaaactggcagcagtctcccctttcatctattttaacaagaggtcaaattatttttttctgtcatatgtattagattagacaaggctgcaaaaaaggcaatacaaacatcgcacacagagttcctataatacaattcgtaattgaatatagaggcgtcaaatttttcattttactgtttgcacctgggaaatgaaagagagagaaatgactttatatgtcacaagattgccagctacagtaacaaatccaaaaacatcacagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctttttacccaagc
gi|20 : ggcttgggggtaaataagctgagtggagtggagcgggcggattgtggagtgagtgacattaatctgtgaatagtctaatacaattcaaaagctacaaatgtattattcaggattatctacatgtatgtgactctgatcagtgtaaaaataaggtttcttaaaaaaacaacaaataaacacaaaaGGCTTGGGG-TAAA-AAAAGCTGAGTGGAGTGGAATG---------------GAGTG---------------AC-ATTA-ATTCTGCAAATAGGCTAAGACAA-TCAAAA---GC------T--AGATT----GTATGA----------------------AT--GTATTC----AAG---A-TG-----------------AT----C------TACATGAATGTATGTGACTCTGA-CATGTGA-TCTCAA------CAGATTAAAAA-------------------CTGG-----------------TTTTTTTAAAAA-CAAATGACTT-------CT----GTCA-T-CCAATAACTGTG-CCAA--TTCC-TAAATGTCA-G-T-TT-GA-AACA
gi|21 : -CA----CACAT-G-A--AACG---AAGGA---GGGAGAG-T---GA------CCT---T---TA-TAT-G-TCAAC-A-CGGT-G-AT-CGGCTAATAAACCC--A----------------A-------------A-ACATCAAA-G--AC--T--A-GCGTTC--ATCCTT-----CGCTC-----CAC-----T---TC
gi|23 : tctctttatctctctcgttctctctctccaca----CAAATGATTTT------CT----GTAA-C-CCAAT-ACTGTG-CCAA--TT-C-TAAATGTCA-G-T-TT
gi|24 : agtgttcttaacatattaaaaatatgggttaaaaaaacaaccccaaaaaccaaacaaaacC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTACAGTAT-TTAA-T-A--C----AG--AG----A-----A--T-TTTTTT--TTT--CTGTCA--------CAGAGTA-GACAA--GA-TGC-A-A--AA--A-GGC---AAT
gi|25 : acgctccaatttcaggcaggtccccagTA-GA-AT-AT--GG-GAACTT-TAAAG-----------------CAAT-TCCAAAG-G---------------AA-TT-GGTAA-CT---C-------------G--TC-A----TG-CT-CATT--ATTTTGA--GAAG---GCTGT----CG-CA-------G----C-AG----GATATTG-CTGgt
gi|26 : ------TAT----ATGTACGTG---CTGA-CA-GGGA-TTTCAGTAGCAGCAGGTCAAAAATC--AGCATTTTTGTTTGTTTGGTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTtctatatatcaa
gi|27 : aaGGCTTGGGG-TAAA-A--AGCTNNNNNNNNNNNNNNN---------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAC-ATTG-A-TCTG-AAATAGGCTAA-ACAT-TCAAAA---
gi|28 : aGAGTAGAGCGGTATG---------------GAGGG---------------AC-ATCG-A-TCTG-AAATAGGCTAATACAA-TCAAAA---GT------T--AGA------GTATGA-------
gi|29 : ctggttgACAA----AG----A--A-TTATTTGTTTT--CTGTCACA--------GAGTA-GACAA--G--TGC-A-A--AG--A-TAC---AAT
gi|3 : tatggtattaaacGGGCTTGGGG-TAAA-A--AGCTgt
gi|3 : ---------------AC-ATTA-A-TCTG-AAATAGGCTGAAACAA-TCAAAA---GC------T--ATA-T----ATATGA-------ACTCAGTA-CCCAT-AT--GTATTC----AAT---A-T------------------AT----C------TAC----ATGT----GACTCTGA-CA-GTGA-TCTCAA------CAGATTAAAAATCG-AG-------GTTTTTTTGG--GTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTC------CT----GTCA-T-CCAAT-ACTGTG-CCAA--TT-C-TAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACTT-CAA-AAA-AT-AGTA-TAT----AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--T----CT-------T---CATTAA--TT--GG-TT-AT-----GAACAT-GAAAAG-TATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT-----------------G--TC-A----TG-CT-CATT--GTTTTTA--AAAG---TCCGT----TA--A-------G----C-TG----GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------A----ACATTGGTA-A---AGGGA-AA-C------------------TC-A-TTC-T-----A-----AT----------AC-----T-----------T-------TC--T--CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----T-TTAA-CAA--C----AGACAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG--TTGTCATATG-TATTAGATTA-G-CAA--G--TGC-A-A--AA--A-GGC---AATACAAAC-------------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTT-CGTAT--TTG-AATATA-G-----AG--G-----TA--------AC---AAA-----AAT---TT--TG-C-AT----TTG-CA----TCCAG-G-A--AATG---AAAGA---GAGAGAA-T---GA------CCT---T---TA--AT-G-TCAAC-A-AGAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-T--------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TT-----C-CTC-----CACCCACTT---CCGC--CCA-TCCAAT--TCCACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacattaatctgaaataggctgaaacaatcaaaagctatatatatgaactcagtacccatatgtattcaatatatctacatgtgactctgacagtgatctcaacagattaaaaatcgaggtttttttgggttttttttttttttttttttttacaaatgatttcctgtcatccaatactgtgccaattctaaatgtcagtttagaaacttcaaaaaatagtatatattatgactttgtataatcaaactgacttgtctgactcattgaagtcttcattaattggttatgaacatgaaaagtatgttactcccaattacaaagggggtgaaatacaaattggtaactgtcatgctcattgtttttaaaagtccgttaagctggatacagctgatacctgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgctctacttaacattggtaaagggaaactcattctaatactttctccctttaatctattttaacaacagacagaggtcaattattcttgttgtcatatgtattagattagcaagtgcaaaaaggcaatacaaactgcactgagttccttatacatttcgtatttgaatatagaggtaacaaaaattttgcatttgcatccaggaaatgaaagagagagaatgacctttaatgtcaacaagatgatcagctacataaacatcacagactagcttttgaatttcctccacccacttccgcccatccaattccactcagctttttaccccaagc
gi|30 : gggcttggggtaaaaagctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGCTAATACAA-TCAAAA---GT------T--GGA------GTATGA-------ACT
gi|31 : -----------------A----ACGTTGGTA-A---AGGAT-AA-CT-----------------TC-A-TTC-T-----A-----GT----------gaactgtaaaaccg
gi|32 : TGGGG-TAAA-AAAAGCTGAGTGGAGTGGAGTG---------------AAATttcattcca
gi|33 : tgaCTTGGGG-TAAA-A--AGCTGAGTTGAGTGGTGTG---------------AAAT
gi|4 : gaGGGCTTGGGG-TAAA-A--AGCTGAGTGGAGTGGAGT-------------------TT---------------ACGATTAGA-TCTG-AAACAAGCT-ATACCA-TAAAAA---AT------T--AGA-T----GTATGGTCTAATCATTCAAGATTCCATAAT--G-ATGA----AAAAACA-T------------------ATTATCC------TAC----ATGTATGTGAC----A--A-GTGACTCTCAA------CAGATTA--------AG-------GTATCT------GTTTTTAG------------GAAA----CAATTAATCTCCCTAGGCT----GTCA-T-CTGAT-GCTGTG-ATGA--TT-T-GCAATGCTA-G-CGTTAGA-AACAT-C---AAG-AT-A-TA--AT----AC----------------------ATCAAACT-CC-T--------T-G-CTA--------ACT----------G--T-------------C---CA--AA--TTA-GG-GT-GT--GA-AAATTT-G-AAGG-AATGT-TAA-CTC-CCAAT----AAA-----G-TGA-----------------AA-CT---C-------------A--TC-AT---TGCCT-TATT--GTTTTTA--GAAG---T--GTA---TT-TA-------G----TGAG----GATACAG-TCAAA--AT-TTT-------G--T-----T------------T--------------G-CT--G--CAA-A-TGAC--AA-T-CTTT----TAAC-GC-TCCAA--T-TT-----------------C----AGGT---TA-C---AGG-------------------------TC--------------------------------C-----C-----------C-------GC--T--CC-----------C--TTT-----------AATTCTACAGTAT-TTAA-T-A---------ACAG----AG----A--ATTTTTTT--TTT--CTGTCG--------CAGAGTA-GACAA--G--TGA-A-A--CA--A-GGC---A
gi|4 : -CA----CATAG-G-A--AATGT--GAGGAC--GGGAGAA-T---GA------C-T---T---TA-TAT-G-TCAAC-ACAAGT-G-AT-CGGC-----------------------------------------------ATCACAAG--AC--T--AAGCTTTCACTC--TT-----TGCCC-----CAC-----------ACT-CCA-TTCCAT--TCCACT-CAGCTTTT--TACCCCAActgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacacacataggaaatgtgaggacgggagaatgactttatatgtcaacacaagtgatcggcatcacaagactaagctttcactctttgccccacactccattccattccactcagctttttaccccaa
gi|5 : gggcttggggtaaaaagctgagtggagtggagtttacgattagatctgaaacaagctataccataaaaaattagatgtatggtctaatcattcaagattccataatgatgaaaaaacatattatcctacatgtatgtgacaagtgactctcaacagattaaggtatctgtttttaggaaacaattaatctccctaggctgtcatctgatgctgtgatgatttgcaatgctagcgttagaaacatcaagatataatacatcaaactccttgctaactgtccaaattagggtgtgaaaatttgaaggaatgttaactcccaataaagtgaaactcatcattgccttattgtttttagaagtgtatttagtgaggatacagtcaaaattttgtttgctgcaaatgacaatcttttaacgctccaatttcaggttacaggtccccgctccctttaattctacagtatttaataacagagaattttttttttctgtcgcagagtagacaagtgaaacaaggcactgtatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctccacacaTTAAGAATCG-----------TGTTTTTGG--GGTGTTCGTTTTTGTTTTTT--------CAAATGATTTC------CT----GTCA-T-CCAAT-ACTGTG-CCAA--TT-CTTAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACTT-CAG-AAACAT-AGTATTATATTGAT----TATGTACT--TTGTA-TAATCAAGATGACAT--------T-GT-TG--------ACTCA---TTGAGG--TCATTCTT------T---C---AA--TTA-GGTTT-ATGAGA-GAAC-T-GAAAAG-TATGT-T-A-CT--CCAATATAC-AAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CTTCAC-------------G--TCAA----TG-CT-CA-T--GTTTTTA--AAAAGCTTCCGT----TA-AA-------G----CTTG----GATACAG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGCCAGAA-TCCTTT----CAAC-GC-TCT-A--C-TT-----------------AAATTACATTGGTACA---AGGAA-AA-C------------------TC-A-TTCAT-----A-----AT----------ACGAG--T-----------T-------TC--C--CC-----------C--TTT------------A-TCTTT----T-TTCA-C----C----AGGCAG----AGG-TCA--A-TTATTC--TTG--C--TCATATG-TTTAAGATTA-GACAAATG--TGC-A-AACAA--A-GGCATTAATACAAAC-AT----------TGC---AC---GAGTT-CCCTT---T-A-TA--CATTTCCGTAT--TTG-AGTATA-G-----AG--G-----CAAGGTAATCAC---ACA-----AAT---TT--TG-C-ATGTA-TTG-CAGACTCACAGCG-A--AATGAAAAAAGA---GAGAGAA-G---AA------CCTTTCT---TA-TATCGTTCAACAA-AGATCA-ATGCAGCTA-------C--A-T--------------C-------------ATACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TC-----CACTC-----CAC-----CTAACCGCT-CCA-TTCCAT--TCCAGC-AGGCTTTT--TACCCCAA
gi|6 : GA-------ACTAAGTA-CCCAT-AT--GTATTC----AAG---A-T------------------AT----C------TAC----ATGT----GACTCTGA-CA-GTGA-TCTTAA------CAGATTAAAAATTG-GG--------------TGG--GTTTTTT-TTTTTTTTTTTTTTTA----CAAATGATTTC------CT----GTCA-T-CCAAT-AATGTG-CCAT--TT-C-TAGATGTCA-GTT-TTAGA-AA-ACACAG-AAG-AT-TGTA-T-T----AT----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------ACTCA---TTGAAG--TCA-ACTT------T---C---AA--TTA-GG-TT-AT--G--GAACAT-GAAAAGAAATGT-T-A-CTC-CCAAT-TACAAAG-GGGG-TGAAA--TACAAA-TT-GGTAA-CT---C-------------G--TC-A----TG-CT-CATT--GTTTTTA--AAA--------------------------------------GATACGG-CTGAT--AC-CTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--G-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAAC-GC-TCT-A--CTTT-----------------T----ACATTGGTA-A---AGGGA-AACC------------------TC-A-TTC-T-----A-----GTTTC-------AT-----TCCAAACATGAAT-------TC--TC-CC-----------C--TTT-----------AA-TCTAT----T-TTAA-C-A--C----AGACAG----AGG-TCA--A-TTATTT--TTG--CTGTCATATG-TATTAGATTA-GACAA--G--TGC-A-A--AA--A--GC---AA---AAA--------------TGC---ACT--GAGTT-CC--T---T-A-TA--CATTT-CGTAT--TTG-AATATA-GAGGCAAG--G-----TA--------AC---AAA-----AAT---GT--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG---AAAGA---G---------------------------------AT-G-TCAAC-A-AGAT-G-AT-CAGCTA-------C--A-TATTTACAAATCCA-A-------------A-ACATCGCA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TT-----CACTC-----CAC-----T---CCGCT-CCA-TTCCAT--TCCACT-CAGCTTTT--TACCCCAAGC
gi|7 : TGA-TCTCAA------CAGATTAAAAATC
gi|7 : TGACTTC------CT----GTCA-T-CCAAT-AATGTG-TCAA--TT-T-TAAATGTCA-G-A-TTAGA-ATTAC-CAG-AAG-AT-AGTA-TAT----AT----TTTG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC-T--------T-GTCTG--------AATCA---TTGAAG--TGA-ACTA------C---CA--AA--TTA-GG-GT-AT--GA-GAACAT-GAAAAG-AATGT-T-A-CTC-TCAAT-CACAAAG-GAGA-TGAAA--TACAAA-TT-AGCAA-CT---CNNNNNNNNNNNNNN--NN-N----NN-NN-NNNN--NNNNNNN--NNNN---NNNNN----NN-NN-------N----N-NN----NNNNNNN-NNNNN--NN-NTG-------A--T-----A------------T--------------G-CT--G--C-A-G-TGACA-AA-T-CTTT----CAAC-GC-CCT-A--C-TT-----------------tgttttgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactttatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|7 : tgatctcaacagattaaaaatctgtttA-A---CGGGA-AA-C------------------TC-A-GAC-T-----AAGTTAGC----------ACCAACAT-----------TGAG----TA--T--CC-----------C--TTTT----------AA-TCTAT----T-TTAACC-A--C----CGAC------AGG-CCA--A--TA-----TCG--C--TCA------ATTAGA-TA-GATAA--tatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|7 : tgatctcaacagattaaaaatctgttttgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactACAA--G--TGC-A-A--AA--AAGGC---AACACAAAC-AT----------TGC---CCT--AACTT-CC--T---T-A-TA--CATTT-TGTAA--TTG-AATATA-G-----AG--G----------------C---AAG-----A---------TG---AT----TTG-CT----CCCAG-G-A--AATG---AAAGA---GAGAGAA-T---GA------CCT---T---TA-TAT-G-TCAAC-A-AGAT-GTAA-CAAGTC-------C--A----------------A-------------A-ACATCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGAAT--TT-----CACTC-----CAC-----T---CC------A-T------------T-CAGTTTTT--TACACCAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaagtgcaaaaaaggcaacacaaacattgccctaacttccttatacattttgtaattgaatatagaggcaagatgatttgctcccaggaaatgaaagagagagaatgacctttatatgtcaacaagatgtaacaagtccaaaacatcacagactagcttttgaatttcactccactccattcagttttttacaccaag
gi|8 : tgatctcaacagattaaaaatctgttttgacttcctgtcatccaataatgtgtcaattttaaatgtcagattagaattaccagaagatagtatatattttgactttgtataatcaaactgacttgtctgaatcattgaagtgaactaccaaattagggtatgagaacatgaaaagaatgttactctcaatcacaaaggagatgaaatacaaattagcaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatatgctgcagtgacaaatctttcaacgccctactttatctatctaattgagcgatattggcctgtcggtggttaaaatagattaaaagggatactcaatgttggtgctaacttagtctgagtttcccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGG-TAAA-A--AGCTGAGTGGAGTGGAGTG-----------------------------------AC-ATTA-A-TCTG-AAATAAGCTAATATAA-GCAAAATTTACAATATGT--AGA-T----GTATGA-------ACTAAGTA-CGCAT-ATAAGTAATC----AGG---A-TTCATAATGATGACAAATTAT----C------TAC----ATATATGTGAATC-----G-GTGA-TCTCAA------------AAAGATCAAAA-------ATCTATTAAG--A----------------------A----CAAATGATTTC------CT----GT----------------G-TCAA--AT-T-TAAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAC-CAG-GAG-AT-A------------T----TATG-ACT--TTGTA-TAATCAAACTGAC----------------A--------ATTCA---TTAAGA--TGA-ACTA------T---CA--AA--TTA-GG-GT-AT--GA-GAACTT-TAAAAG-AATGC-T-A-ATC-CCAAT-T-C--AGTGTGA-TGAAA--TATAAA-TT-AGAAA-
gi|8 : ------------T--------------G-CT--T--C-A-G-TGACT-GA-T-CTTT----TAAT-GC-TCT-A--T-TT-----------------T----A---TGATA-C---C--------C------------------TC-A-TCC-T-----T-----GTTTCATTCCAAAC-----CGGGG-------T-------TC--T--CT-----------C--CTA-----------AG-TCCAT----T-T-AA-C-A--A----AGAGGG----AAG-TTA--T-TT-TTT--TCAATCTATCATAT---ATTAGGTTA-GAC-----------------A--A-G-------TGCAAAA-TT----------TAC---ACT--GA-----T--T---T-A-GAGGCA-------AG--TTG-A---------------------------------C---ATC-----AAT---TC--TG-C-AT----TTG-CA----CCCAG-G-A--AATG---AAGGA---GGGAGAA-T---GA------CCC---T---TA-TAT-G-TCAAC-A-AAGT-G-GT-CA--------------------------------------------------TCACA-G--AC--T--A-GCTTTTGACT--TT-----CACTT-----CAC-----T---CCACT-CCA-CTTCAC--TCCACT-CAGCTTTT--TACCCAAAGCtactgtttgcttcagtgactgatcttttaatgctctattttatgataccctcatccttgtttcattccaaaccggggttctctcctaagtccatttaacaaagagggaagttatttttttcaatctatcatatattaggttagacaagtgcaaaatttacactgatttagaggcaagttgacatcaattctgcatttgcacccaggaaatgaaggagggagaatgacccttatatgtcaacaaagtggtcatcacagactagcttttgactttcacttcactccactccacttcactccactcagctttttacccaaagc
gi|9 : gggtaaaaagctgagtggagtggagtgacattaatctgaaataagctaatataagcaaaatttacaatatgtagatgtatgaactaagtacgcatataagtaatcaggattcataatgatgacaaattatctacatatatgtgaatcggtgatctcaaaaagatcaaaaatctattaagaacaaatgatttcctgtgtcaaatttaaatgtcagtttagaaacaccaggagatattatgactttgtataatcaaactgacaattcattaagatgaactatcaaattagggtatgagaactttaaaagaatgctaatcccaattcagtgtgatgaaatataaattagaaatactgttGGCTGGGGG-TAAA-A--AGCTGAGTGGAATGGAGTG---------------GAGTGGAATT----------AC-ATTA-A-TCTG-AAACAAGCT-ATACAA-TCAAAA---AT------T--AGA-T----GTATGA-------ACTAAATG-CTCAT-GT--CTAATCAATTAAG---A-TTCATAATGATG-------AT----A------AAC----ATATATGTGAC-CTG
gi|9 : TTTTTAGGAACAAATTAATTC------CTAGCTGTCA-T-ATGAT-GCTGTG-TTGA--TT-T-GCAATGTCA-G-T-TTAGA-AACAT-CA--AAG-AT-A-----------------TA------------A-TAATCAAACTCAC-T--------T-GCCT---------------------------A-ACTG------T---AA--AA--TTA-GG-AT-GT--GA-AAATTT-GAAAGG-AATGT-T-A-CTC-CCAAT-----AAA-GAGT-TGAAA--TATGA---------------------------------TC-A----TG-CT-CATT--GTTTTTA--GA----------------------------------G----GATACAG-CTG-TCAAC-CAG-------A--T-----ATCAAAATTTGTTT--------------G-CT--G--C-A-A-TGACA-AA-T-CTTT----TAAC-GC-TCC-A--A-TT-------------------------TT---------AGGCA-GG-T------------------CC-----C-C-----A-----G---------------------------------------C--C--CC-----------C--TTT-----------AA-TCT---------------A--C----AG--------------------TATTT--TTT--GTGTCA--------CAGAGTA-GACAA--G--TGC-A-A--AA--A-GGC---AATtttttaggaacaaattaattcctagctgtcatatgatgctgtgttgatttgcaatgtcagtttagaaacatcaaagatataataatcaaactcacttgcctaactgtaaaattaggatgtgaaaatttgaaaggaatgttactcccaataaagagttgaaatatgatcatgctcattgtttttagaggatacagctgtcaaccagatatcaaaatttgtttgctgcaatgacaaatcttttaacgctccaattttaggcaggtccccagccccctttaatctacagtattttttgtgtcacagagtagacaagtgcaaaaaggcaatgtatatctctctctacacacacgcatatggaatgagggagggagaatgacctttatatgtcaacacggtgatcagcatcacagactatagctttcatctttcactccactccattcagctttttaccccaag
gi|9 : ggctgggggtaaaaagctgagtggaatggagtggagtggaattacattaatctgaaacaagctatacaatcaaaaattagatgtatgaactaaatgctcatgtctaatcaattaagattcataatgatgataaacatatatgtgacctg-G-G--AATG---AGGGA---GGGAGAA-T---GA------CCT---T---TA-TAT-G-TCAAC-A-CGGT-G-AT-CAG-----------------------------------------------CATCACA-G--ACTAT--A-GCTTTCATCT--TT-----CAC------------------------------TCCAC--TCCATT-CAGCTTTT--TACCCCAAGgtatatctctctctacacacacgcatatggaatgagggagggagaatgacctttatatgtcaacacggtgatcagcatcacagactatagctttcatctttcactccactccattcagctttttaccccaag
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAAACCAAAATCTATTATTTTTCTTTCCGTCTTTTTCAATTAATTACTTACTGTCTAATAGCAAAATATTTCATTGAATTGAAAAAACGATATATATTGTTTACGGAATACAACGAATGGTCAAGATAC