lowQualScore : 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111 2222222222222222222
lowQualScore : 11 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222 11 66666 2 1 666666666 22 1 8888888888888888888888888888888888888888888888888 111 2222 3 1 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 1 111 2 66666666666 2 44 2 1 33333 1 1 6666 4 33 44444444444444 1 33 1 55 4444 77777777777777 11 55555555555 11 1111111111 1 1 1 1 33 22 999999999999999999999999999999999 1 222 222 3 1 4 1 4 66666666666 1 222 222222222 33333 22222222 111111111 2222222 5555555555 111 3333 55555555 8888888888888888888
lowQualScore : 88 6 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 333 33 11111 0 0 666666666 11 0 8888888888888888888888888888888888888888888888888 2 777 1111 44 1 0 6 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 6 4444 6 3 000 6 6 6 0 11111111111 8 0 8 5 3 99 55 88 0 3 4 44444 7 0 1111 0 77 99999999999999 3 00 0 55 5555 3 3 22222222222222 88 88888888888 88 4444444444 2 0 0 5 0 11 66 3 8 777777777777777777777777777777777 9 5 999 5 0 666 5 1 0 0 7 0 22222222222 7 333 888888888 3 66666 4 4 66666666 4 222222222 9999999 55 8888888888 5 888 1111 6 11111111 8888888888888888888 6 4
lowQualScore : .. . .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. ... .. ..... . . ......... .. . ................................................. . ... .... .. . . . ......................................................................................................... . .... . . ... . . . . ........... . . . . . .. .. .. . . . ..... . . .... . .. .............. . .. . .. .... . . .............. .. ........... .. .......... . . . . . .. .. . . ................................. . . ... . . ... . . . . . . ........... . ... ......... . ..... . . ........ . ......... ....... .. .......... . ... .... . ........ ................... . .
lowQualScore : 22 4 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 88 55555 0 0 222222222 00 0 2222222222222222222222222222222222222222222222222 5 555 2222 55 5 0 5 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 2222 7 3 222 7 7 7 8 88888888888 0 8 0 2 8 00 00 88 0 2 5 00000 0 0 0000 0 00 22222222222222 3 77 0 00 8888 2 2 99999999999999 33 00000000000 33 3333333333 5 0 0 0 0 00 66 2 0 666666666666666666666666666666666 8 0 444 3 7 333 0 8 0 0 0 0 00000000000 0 000 000000000 0 00000 0 0 11111111 0 444444444 2222222 00 3333333333 0 222 8888 7 77777777 3333333333333333333 7 4
consensus : NTTTATAAC-AGATTANTAATTTGTTATAACAAATTACT-AA-T--CTGTT-----AAT---TTGTTAAAANNAA-TTA--CTTTTTTCA---TAAAATTTATTTTAATTGCC-ATA-GAAACATA--TACA-AAGA-CAA--ACA--GC-A-NNAG---------A----CTGGGCAGGAC-A-CACAC-AGCAGCACTCGCTCATTCCT--ATCTACTCA----TGAT-----------------GATTTAG---TAAATACAAAA-AGACATA-C---GCA---AANTATAT---NCGTANGATATG-TACCGAT---AT-TA---T-ATGCCTT---ATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGTATA-TTGTATGAAAA-TTCCTCC-G------AGATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCAGAT--A---TATTTC-AGTA--AAAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGACT---TGTG----TATCTCGAT-AAA-GTTCACATTGTGAGACATGCAGA--T--T----ATATTATACA-GATCTAAGCTAG-GT--AA-A--AC-AGA-TCTT-CCCATG----TG---C----ATCGT-TTT--TCG---TAA-TAATTCA-CCT----T-CCGTTTC-TAGAAAA--GCTGTACTTT-T-CGCTATTGTT---AGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAATT--GATG-TTAGGCAATTTGTCT-T--TGATTTTGCA-TACACAGTG-GTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGC-TCTAAATGGGCCCNNTG---ATG--TGTA-ATGT-TTC-ATCAAAATGACAATTAAATTCAA--CATGGAAGAGTTTCC------GA------ACAAAATC--AGAGATGGTGCTATAAAGAAA--TCATGATGT-ACATTTTC-TTAATCC-AATTGTT-CAGCTCTG-TCCACT-AAGCTCTCATTGA--TATCACAA-AAGAT-----AT-ATTTATTGAA------TAAA----TTTG-TTATAACAAA-TTAGTAATTTGTT-ATAACAAAT-TGATAATCTGTT-TATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTGTTATAACAAATTGATAATCTGTTAT--ATCAAAT--TGATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTATTATTCAAATTGATATA--ATTTTGTTATACGNANCNTTTAGTAATTT-G-TTAT-----A-ACAAATT-------AATAATCTGTTT-TAT-AA--CAAA-TTTG-G--ATAA-TCTTGTTATANA-CAAATTAATAATT-TG--T-TA-TAACAAATTAATAAAAGGT-----------------CACTGCTGCGGCCCTAAT-ACGCTTCCGTA
Reference ( gi|1 ) : CTTTATAAA-AGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACTCAACT--TTATTCACATAATAAATTGTTAAAAACAA-TTAGACTTTTTTCA---TAAAATTTATTTTAATTGCCCATATGAAACATAC-TACATCAGA-CAA--ACA--GC-A-TCAG---------A----CCGGGCAAGAC-G-CACAC-AGCAGCACTCGCTCATTTCTTAATCTATTCAGT-TTCAT-----------------GTTTTGG---TAAATACCAAA-AGATATA-CGGAACA---AAGTATAT---CCGTAAGATATGCTACCAATAGCATATAC-AT-ATGCCTTTTAATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGAAAAGTTGTATG-AAA-TTCCTC--G------AGATGGACTCAGGAATAT-G-----TC------A---TATTTCTAGTAACAAAGAACATGTTATCATATTTGGACT---TGTG----TATCTTGATAAAA-GTTCACATTGTGAGACATGT-GA-----T----ACATT-TACA-AATCTTAAC--A-GT--AA-A--ACGAGA-TCTT-CCAGT-----TG---C----AT-GT-TTT--TCG---TAAATAATTCA-CCT----T-CCGTTTC-TAGAAAA--GCTGTAC-TT-T-CGCTATTGTA---AGTATTATTT-AAAATATAA-ATGTAAAAACCCAAT-AAATTCGGATG-TTAA-CAATCTGTCT-T--TGAATTTGCA-TACACA-TGTGTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGGCGTCTAT-TGGGC-TAATG---ATG-ATGTA-ATGTGTTC-AT--AAATGACAATTAAATTCAAGCTATGGAAGAGTTTCC------AA---CACACAAAATC--AGG--TGATTCGCTAAAGAAA--TCATGATGT-ACATTTTC-TTAATCC-AATTGTT-CATCTCTG-TCCACTAAAGCTCTCATTGAACTATCACAA-AAGAT-----AC-ATCTGTTGCA------TAAA----CTTGATTATAACAAACTTAGTAATCTGTTTATAACAAATGTAATAATCTGTT-TATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTT-TTATTACAA-TTGATAATCTGTTATTAATTAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATAAATAGAATTCGATAATTCTCGTTATTAATCACAATGATATACGAT----CTATACGTAACATCTAGTAATTT-G-T-AT-----A-ACAAATT-------AGTAATTTGTCT-TATCAA--CAAACTTTG-G--ATAA-TCTTGTTATAAAACAAATTGATAATT-TG--TATACTAACAAATTAATAAAAGGTCTGGAGATGCGGCGACCCGCTGGTGCGGCCCTAAT-ACGCTTCCGTACA
gi|4 : TTTACAAACAGATTAGTAATTTGTTATATCAAATTACT-AATTAGTTAT
gi|15 : tgttTTGATAAC-AGATTATGAATTTGTTATAACAAATTACTaacaaattacttttttcataatatgttttattgccacagaaacatgtgtatacaagacaaacacagcaataagatgaactgagcaggacaacacacaaattcgatatctactctgatgatttataaaatagaacagacatagcaaatcatctgaaagatattacattatactttatttgacccagatcaagaatacgtatattgtatgaaaattcctctgctctatatatgacctcaggaatatgcattttcagatatatatttcattaaaagaaatggtatatgattggactgtctatgtctttatcttgataaagttcacattgtgagacatgcagattttagattacagatgtaagctaggtaataacagatcttcccatgtgtgccatcgtttttaaattcatcttccgtttctagaaaagttgtacttttcgcaattgtagtaatttaaaatataagaccaaagaaactgataagcaatttgtctcagtgattttgcataca
gi|4 : TTATAAC-TAATTAGTAATTTGATATAACAAATTACT-AA-T--CTGTT------------TGT-AAAAACAAATTA--CTTTTTTCA---TAATAT--GTTTTA-TTGCC-ACA-GAAACATGTGTATACAAGA-CAA--ACACAGC-AATAAG---------ATGAACTGAGCAGGAC-AACACAC-AA----ATTCG---AT------ATCTACTC-----TGAT-----------------GATTTAT---AAAATAG-AAC-AGACATA-----GCA---AA-T-CAT---CTGAAAGATAT--TAC--AT----TATA---------CTTT--ATTTGACCCAGATCA-A-GAATA--CGTATA-TTGTATGAAAA-TTCCTCT-GCTCTATATATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCAGATATA---TATTTC-ATTA--AAAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGACTGTCTATGTCTTTATCTTGAT-AAA-GTTCACATTGTGAGACATGCAGATTT--T----AGA-T-TACA-GATGTAAGCTAG-GT--AATA--AC-AGA-TCTT-CCCATG----TGTGCC----ATCGT-TTT--------TA---AATTCA-TCT----T-CCGTTTC-TAGAAAA--GTTGTACTTT-T-CGCAATTGT----AGTA--ATTT-AAAATAT--------AAGACCAAAG-AAACT--GATA---AG-CAATTTGTCT-CAGTGATTTTGCA-TACAattcataatctgt
gi|8 : tgTATAAC-AGATTATCAATTTGTTATAACAAATTA-TCAA
gi|6 : gtttcatcaaaatgacaattggattcaacatggatgagtttctttggtggattccaaacaaaatctgagatggtgtaataaagaaatcatgatgtataatgttgttcagctctgtccacaaacctctcattgaattacaaaagaacaaaaacattattgaaatgaaatggacttcattATAAC-AGATTACTAATTTGTTATAACAGATTACT-----------------AAT---TTGTTAAAACAAA-TTA--CTTTTTTCA---TGAAATATATTTT-ATTG-CCATA-GAAACATA--TACA--AAA-CAAACACA--ACAA-TAAGATAAAATTAA----CTTGACAGGAC-A--ACAC-A-CAGCAC---------TTTTA------TCA----TGAT-----------------GATTTAGAAATAGATACAGCA-AGTCATA-T---------AAATATAT----CATAGGATATG-TACC-AT-----------T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCA-G-GAATA--TGTATA-TTGAATG-AAA-ATTCTCCTG------AGATGACCTCAAGAATAT-GCATTTTCAGAT--A---TATTTC-AGTA--AAAGAA---------ACGGTTG--------GTG----TATCTAGAT-AAA-GTTCACATTGTGA---ATGC-GA-----G----ACATtcaaattgataatctgttgtaacaaatcaataaaaggtactgctgcggcccttatacgcatccgt
gi|12 : AA-TTA--CTTTTTTCATATTAAAATTTA-TTTAATTG-CAATA-GAAACATA--TACA-AAGA-CAA--ACA---C-A-GCA----------A----CTGGGCAAGACAA-CACACAAGCA--ACTCACTCATTCCT--ATCTgc
gi|3 : TTTTTTCA---TAAAATT-ATTT-AATTGCC-ATA-GAAACATA--TACA--AGAACAA--ACA---C-A-GCA----------A----CTGGGCAAGAC-A--ATAC-A-CAGCACTCGCTCATTCCT--ATCTATTCAGTATTCATTGATATCTATCATGATAATTTTG----TAAA-ACAAAACAGATATA-----GCA---AATCATAC---AAGTATAATATCGTAAAGATTTCAT------T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-AAATA--CGTGTA-TTGTATGAAAA-TTCCTCG-G------AGATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCAGAT--A---CATTTC-AGTA--AAAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGACT---TGTG----TATCTCGAT-AAC-GTTCACATTGTGAGACATGC-AAGATTTT----ATATTATACA-GATCTAAGCTAG-GT--AA-A--AACAGA-TCTT-CCCATG----TGTGCC----ATCGT-TTT--------TA---AATTCA-CCT----TCCCGTTTC-TAGAAAA--GCTGTACTTT-T-CGCTATTGTACATAGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAATT--GATG-TTAAGCAATTTGTC--T--TGATTTTGCA-TACA
gi|2 : G---TAAA-ACAAAA-AGATATAGCAAATCATACAAGTATATATATCATA-GATATG-TATCAATAGGAT-TACCATTATGCCTT---ATTAGACCCAGATCAAGCGAATATACGTTGTATTGTATG-AAAATTCCTC--GGA----AGATGACCTCAGGAATATTGCATTTTC------AGATTATTTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTACCATGATTGGACT---TGTG----TATC-TGATGAAACGTTCACATTGTGAAACATACAGA-----TTTTAATCTTATACA-GATC-TAGCTAG-GTAAAA-A--AC-AGATTCTT-CC-------------C----AT-GT-GTCCACCGTTTTAA--AATTCA-CCT----T-CCGTTTCTTAGAAAA--GCTGTACTTT-T-CGCTA-TGT----AGTA--ATTTAAAAATATAA-ATGT-AAAACCCAATAAAATT--GATGTTTAG-C-ATTTGTC--T--TGATTTTGCA-TACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggggctctaaatgggcctatgatatgtgtaatgtttcatcaaaatgacaattaaattcaacatggaagagtttccacaaaaaatcagagatggtgctataaagaaatcatgatgttacattttccttaatccaattgttcagctttgtccactaagctctcattgagatatatt
gi|7 : TT-TATATGATCTAAGC--ACGT--AA-ACGACGGGT-TCTTTCCA-----------------AT-GTGTTC--TCG---TTA-TAAGTCATCCTCTGCT-CCTTTTC-TAAGTAA----TGTAC-TT-TTCG-TATTGGT---TGTA--ATTT-AAAAGATAACATTTAAA----CGAA-AAAATCTGATA-TTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctctaaatgggcctactgcatatgtgtagatggttccatcaaaatgacaattaaatttcaactggaagagttccaaacaaaatcagagatggtgctataaagagaagtcatgatgtacattttcttaatccaaattgttgcagctctgttccactaagctctcattgaatcacaaaagatatattgattaatacattgttataacattagtaagatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactaaattgataatctgttatatcaattataatgttaatcaattactatttgttataacaaatcaatattgttataacaaaattgataatctgtttat
gi|13 : tataaattatgatagtattaagacatgttcattaagataaattatggtttataagaccaggtaggaaaattcatagatttatgaaattctcctgaatgtcaggctgcttcatgaatagtgcattgtgcgatatcatcatacattgtgtttcaactggtcgttactatttaatactatcagatttttagacAGA-TCTT-CCCATCTGTGTG---CCATTGT-GC-TTG--TTG---TAAGTA--TGA-C------T-TCGTTTCATAGAAAAAGACTGTAT-TTCT-CGCTAgtttca
gi|5 : atc---C----ATCGT-TTT--T-----TAAAT---TCA-CCT----T-CCGTTTC-TAGAAAA--GCTGTACTTT-T-CGCTATTGGT---AGCA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACTCAAT-AAATT--GATG-TTAAGCAAT-TGTTTCT--TGATTTTGCATTACACAGTG-GTAAA
gi|3 : gcGGGC-TCTAAATGGGC-CTATG---ATATGTGTA-ATGT-TTC-ATCAAAATGACAATTAAATTCAA--CATGGAAGAGTTTCC------A------CAAAAAATC--AGAGATGGTGCTATAAAGAAA--TCATGATGTTACATTTTCCTTAATCC-AATTGTT-CAGCTTTG-TCCACT-AAGCTCTCATTGAGATATaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatatgtgtaatgtttcatcaagatgacaattaaattcaacatggaagagttccaaattaatccaattgttcagctctgtccactaagctctctttgaatcacaaaagatataatttattg
gi|2 : ttttttcataaaattatttaattgccatagaaacatatacaagaacaaacacagcaactgggcaagacaatacacagcactcgctcattcctatctattcagtattcattgatatctatcatgataattttgtaaaacaaaacagatatagcaaatcatacaagtataatatcgtaaagatttcattatgctttattagacccagatcaggaaatacgtgtattgtatgaaaattcctcggagatgacctcaggaatatgcattttcagatacatttcagtaaaagaaatggtatatgattggacttgtgtatctcgataacgttcacattgtgagacatgcaagattttatattatacagatctaagctaggtaaaaacagatcttcccatgtgtgccatcgtttttaaattcaccttcccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattgtacatagtaatttaaaatataaatgtaaaacccaataaattgatgttaagcaatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng-TGGGCCTACTGCATATG--TGTAGATG-GTTCCATCAAAATGACAATTAAATTTCAACT--GGAAGAGTT-CC------AA------ACAAAATC--AGAGATGGTGCTATAAAGAGAAGTCATGATGT-ACATTTTC-TTAATCCAAATTGTTGCAGCTCTGTTCCACT-AAGCTCTCATTGA---ATCACAA-AAGAT-----AT-ATTGATTA-A------TACA-----TTG-TTATAACA---TTAGTAAatt
gi|5 : gtaaaacaaaaagatatagcaaatcatacaagtatatatatcatagatatgtatcaataggattaccattatgccttattagacccagatcaagcgaatatacgttgtattgtatgaaaattcctcggaagatgacctcaggaatattgcattttcagattatttcagtaaaagaaatggtaccatgattggacttgtgtatctgatgaaacgttcacattgtgaaacatacagattttaatcttatacagatctagctaggtaaaaaacagattcttcccatgtgtccaccgttttaaaattcaccttccgtttcttagaaaagctgtacttttcgctatgtagtaatttaaaaatataaatgtaaaacccaataaaattgatgtttagcatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctctaaa---ATG--TGTA-ATGT-TTC-ATCAAGATGACAATTAAATTCAA--CATGGAAGAG-TTCC------AA---gatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactaaattgataatctgttatatcaattataatgttaatcaattactatttgttataacaaatcaatattgttataacaaaattgataatctgtttat
gi|8 : gccatcgttttttaaattcaccttccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattggtagcaatttaaaatataaatgtaaaactcaataaattgatgttaagcaattgtttcttgattttgcattacacagtggtaaaaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatTTC-ATCAAAATGACAATTGGATTCAA--CATGGATGAGTTTCTTTGGTGGATTCCAAACAAAATCTGAGA--TGGTGTAATAAAGAAA--TCATGATGT-A---------TAAT----GTTGTT-CAGCTCTG-TCCAC-AAACCTCTCATTGAATTA---CAA-AAGAACAAAAAC-AT-TATTGAAATGAAATGGA----CTTCATT---------TTGATAATTTGTT-ATAACAAAT-TGATAATCTGTTATATattaatccaattgttcagctctgtccactaagctctctttgaatcacaaaagatataatttattg
gi|5 : gt-TTAATCC-AATTGTT-CAGCTCTG-TCCACT-AAGCTCTCTTTGA---ATCACAA-AAGAT-----ATAATTTATTGcaaattgataatctgttgtaacaaatcaataaaaggtactgctgcggcccttatacgcatccgt
gi|8 : gccatcgttttttaaattcaccttccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattggtagcaatttaaaatataaatgtaaaactcaataaattgatgttaagcaattgtttcttgattttgcattacacagtggtaaaaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatatgtgtaatgtttcatcaagatgacaattaaattcaacatggaagagttccaaaCTTTTATTGATTTGTTACAA-CAGAT------T-ATC---------------AA----TTTGAT-ATAACAGA-TTATCAATTTGTT-ATAACAAAT
gi|6 : gtttcatcaaaatgacaattggattcaacatggatgagtttctttggtggattccaaacaaaatctgagatggtgtaataaagaaatcatgatgtataatgttgttcagctctgtccacaaacctctcattgaattacaaaagaacaaaaacattattgaaatgaaatggacttcattttgataCTATGGCAATAAAAT-----AT-ATTTCATGAA------AAAAGTAATTTGTTT-TAACAAA-TTAGTAATCTG-TTATAACAAAT-TAGTAATCTGTT-gtactgctgcggcccttatacgcatccgt
gi|15 : atAA----TTTG-TTATAACAAATTCA-TAATCTG-TTAT--CAAAT-TCATAATCTGTaaacatatacaaaacaaacacaacaataagataaaattaacttgacaggacaacacacagcacttttatcatgatgatttagaaatagatacagcaagtcatataaatatatcataggatatgtaccattatgctttattagacccagatcaggaatatgtatattgaatgaaaattctcctgagatgacctcaagaatatgcattttcagatatatttcagtaaaagaaacggttggtgtatctagataaagttcacattgtgaatgcgagacatgc
gi|2 : agtA----TTTG-TTATAACAAA-TCAATA--TTGTT-ATAACAAAATTGATAATCTGTT-TAT
gi|4 : gtaaaacaaaaagatatagcaaatcatacaagtatatatatcatagatatgtatcaataggattaccattatgccttattagacccagatcaagcgaatatacgttgtattgtatgaaaattcctcggaagatgacctcaggaatattgcattttcagattatttcagtaaaagaaatggtaccatgattggacttgtgtatctgatgaaacgttcacattgtgaaacatacagattttaatcttatacagatctagctaggtaaaaaacagattcttcccatgtgtccaccgttttaaaattcaccttccgtttcttagaaaagctgtacttttcgctatgtagtaatttaaaaatataaatgtaaaacccaataaaattgatgtttagcatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctctaaatgggcctactgcatatgtgtagatggttccatcaaaatgacaattaaatttcaactggaagagttccaaacaaaatcagagatggtgctataaagagaagtcatgatgtacattttcttaatccaaattgttgcagctctgttccactaagctctcattgaatcacaaaagatatattgattaatacattgttataacattagtaagatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactaaattgataatctgttatatcaattataatgttaatcaattactTTATAACTAA-TTAGTAATTTGAT-ATAACAAAT-TACTAATCTGTT-TGTA
gi|8 : tgTGATAATTTGTTATAACAAATTGATAATCTGTTAT--ATCAAAT--TGATAAaaaacaaattacttttttcataatatgttttattgccacagaaacatgtgtatacaagacaaacacagcaataagatgaactgagcaggacaacacacaaattcgatatctactctgatgatttataaaatagaacagacatagcaaatcatctgaaagatattacattatactttatttgacccagatcaagaatacgtatattgtatgaaaattcctctgctctatatatgacctcaggaatatgcattttcagatatatatttcattaaaagaaatggtatatgattggactgtctatgtctttatcttgataaagttcacattgtgagacatgcagattttagattacagatgtaagctaggtaataacagatcttcccatgtgtgccatcgtttttaaattcatcttccgtttctagaaaagttgtacttttcgcaattgtagtaatttaaaatataagaccaaagaaactgataagcaatttgtctcagtgattttgcataca
gi|10 : gtttcatcaaaatgacaattggattcaacatggatgagtttctttggtggattccaaacaaaatctgagatggtgtaataaagaaatcatgatgtataatgttgttcagctctgtccacaaacctctcattgaattacaaaagaacaaaaacattattgaaatgaaatggacttcatttGTTATTATTCAAATTGATATA--ATTTTGTTATACAGAA-AT-TGATAATCT-G-T--T-----A-ATAAATTCAAAGTGAATAATTTGTATATATCAA--T---------G--ATAATTCTGGTTAT-ACACAAATTAATAAtctgttgtaacaaatcaataaaaggtactgctgcggcccttatacgcatccgt
gi|9 : tGTACCTTTTATTAATTT-G-TTAT-----G-ACAAAAT-------AATAATTCGT---TAT-AA--CAAA---TG-ATCACAA-T-TTGTTATATAACAGATTAATGAAT-TG--C-TA-TAACAGATaaggtaatacgcttccgta
gi|4 : acggaagcgcatgggggcttcagcaTAGTAATTT-GAT-AT-----A-ACAAATT-------ACTAATCTGTTTGTAAAAA--CAAATTgccaacttgttataacaaattatct
gi|4 : tgttataactaatAGTAATTT-G-T-TTTTACAA-ACAGATT-------AGTAATTTGTTA-TATCAA--acttttttcataatatgttttattgccacagaaacatgtgtatacaagacaaacacagcaataagatgaactgagcaggacaacacacaaattcgatatctactctgatgatttataaaatagaacagacatagcaaatcatctgaaagatattacattatactttatttgacccagatcaagaatacgtatattgtatgaaaattcctctgctctatatatgacctcaggaatatgcattttcagatatatatttcattaaaagaaatggtatatgattggactgtctatgtctttatcttgataaagttcacattgtgagacatgcagattttagattacagatgtaagctaggtaataacagatcttcccatgtgtgccatcgtttttaaattcatcttccgtttctagaaaagttgtacttttcgcaattgtagtaatttaaaatataagaccaaagaaactgataagcaatttgtctcagtgattttgcataca
gi|6 : tgttataactaattagtaatAGTAATTT-G-T-TTT----A-ACAAATT-------AGTAATCTG--T-TAT-AA--CAAA--TTA-G---TAA-TC-TGTTATtttttcataatatgttttattgccacagaaacatgtgtatacaagacaaacacagcaataagatgaactgagcaggacaacacacaaattcgatatctactctgatgatttataaaatagaacagacatagcaaatcatctgaaagatattacattatactttatttgacccagatcaagaatacgtatattgtatgaaaattcctctgctctatatatgacctcaggaatatgcattttcagatatatatttcattaaaagaaatggtatatgattggactgtctatgtctttatcttgataaagttcacattgtgagacatgcagattttagattacagatgtaagctaggtaataacagatcttcccatgtgtgccatcgtttttaaattcatcttccgtttctagaaaagttgtacttttcgcaattgtagtaatttaaaatataagaccaaagaaactgataagcaatttgtctcagtgattttgcataca
gi|15 : AGTAATTT-G-TTAT-----A-ACAAATT-------CATAATCTG--T-TATCAA--tttttcatgaaatatattttattgccatagaaacatatacaaaacaaacacaacaataagataaaattaacttgacaggacaacacacagcacttttatcatgatgatttagaaatagatacagcaagtcatataaatatatcataggatatgtaccattatgctttattagacccagatcaggaatatgtatattgaatgaaaattctcctgagatgacctcaagaatatgcattttcagatatatttcagtaaaagaaacggttggtgtatctagataaagttcacattgtgaatgcgagacatgc
gi|8 : TAATTT-G-TTAT-----A-ACAAATT-------GATAATCTGTTA-TAT-----CAAATT----G--ATAA-TC-TGTTGT--AACAAATCAATAAattcataatctgt
gi|10 : gtttcatcaaaatgacaattggattcaacatggatgagtttctttggtggattccaaacaaaatctgagatggtgtaataaagaaatcatgatgtataatgttgttcagctctgtccacaaacctctcattgaattacaaaagaacaaaaacattattgaaatgaaatggacttcattttgaTAATTTTG-TTAT-----ACAGAAATT-------GATAATCTGT-T-AATAAATTCAAAGT--G-A--ATAA-T-TTGT-ATATATCAA--TGATAATTCTGGTTATAC--ACAAATTAATAAAAGGTaaggtactgctgcggcccttatacgcatccgt
gi|6 : tgttattattcaaattgataATTT---C-AT-----G-AAAAA---------AGTAATTTGTTT-TA---A--CAAA--TTA-G---TAA-TCT-GTTATAA--CAAATTAGTAATC-TG--Taatacgcttccgta
gi|9 : ataATCT-G-TTAT-----A-GCAATTC-------ATTAATCTGTTA-TAT-AA--CAAA--TTGTG--ATCA-T-TTGTTATAA--CGAATTATTATTT-TG--T-CA-TAACAAATTAATAAAAGGT------------------ACTGCTGAAGCCCCCAT-GCGCTTCCGTatattttattgccatagaaacatatacaaaacaaacacaacaataagataaaattaacttgacaggacaacacacagcacttttatcatgatgatttagaaatagatacagcaagtcatataaatatatcataggatatgtaccattatgctttattagacccagatcaggaatatgtatattgaatgaaaattctcctgagatgacctcaagaatatgcattttcagatatatttcagtaaaagaaacggttggtgtatctagataaagttcacattgtgaatgcgagacatgc
gi|8 : TT-------GATAATTTGT---TAT-AA--CAAATT----G--ATAA-TCT-GTTATAT--CAAATTGATAATC-TG--T-TG-TAACAAATCAATAAAAGGT------------------ACTGCTGCGGCCCTTAT-ACGCATCCGTgccaacttgttataacaaattatct
gi|14 : gtttcatcaaaatgacaattggattcaacatggatgagtttctttggtggattccaaacaaaatctgagatggtgtaataaagaaatcatgatgtataatgttgttcagctctgtccacaaacctctcattgaattacaaaagaacaaaaacattattgaaatgaaatggacttcattTTATAA--CAAATAGATAATT-TG--T-TA-TAACAAATTAATAAAACGT------------------ACTGCTGCGGCCCTAAT-ACGCTTCCAT
gi|16 : CACTGCTGCGGCCCTAAT-ACGCTTCCATA
gi|21 : aaaaggCACTGCTGCGGCCCTAAT-ATGCTTTCATAga
gi|17 : aggGCTGG--CGGCCCTAAT-ACGCTTCCGTA
gi|19 : aaaaggtactaCTGGTGCGGCCCTAAT-ACGCTTCCGTA
gi|20 : CTGCTGCGGCCCTAAT-ACGCTTCCGTAgaagcta
gi|18 : aaaggtaCTGGTGCGGCCCTTATTACGCTTCCGTA
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TATTTCATAAAACATAAAATTACAAGACAAACAAGCAATAAAGACACACTGGACAGGGACAACACACTATTATCTATTCACTGATACATGTATCTATCATGGTGATTTGTAAAATAGGA
Alignments
lowQualScore : 8888888888888888888888 11 111 11 111 222222222 1111 111 77777777777777777 2222 222222 888888888888888888888888888 2 1111 11111 1 33333 3333333333333333 66666666666666666666666666666 111 11 111111111 111 11111 1111 111111 1111 111111 3333333333 1111 1 11 11 11 44444444444444444444444 1111 1 2222 1 22222 1 2 1 333 111 11 1 1 11 444444444444444444 11 1 444 22222 11 7777777777777777777 1 111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 1 1 22 1 3333 444444444444444444444444444444444444444444 2222222 8888888888888888888 222 1 1 3333333 1 222 11 5555555555555555555
lowQualScore : 1 9999999999999999999999 22 33 444 11 222 6 6 666666666 2222 99 6 888 22 99999999999999999 6 0000 6 777777 444 555555555555555555555555555 3 4444 44444 0 8 77777 1 1111111111111111 88888888888888888888888888888 6 0 111 3 00 99 6 6 6 999999999 1 6 3 6 3 99 6 99 6 000 3 33333 4444 999999 7 6 0000 999999 77 9999999999 4444 0 6 0 99 8 11 6 6 6 55 77777777777777777777777 5 2222 5 1 77 7777 99 6 6 6 6 6 99 2 0 0 33333 8 5 0 3 7 000 777 33 0 0 8 8 8 11 0 0 0 666666666666666666 2 3 33 0 2 8 8 8 8 8 111 0 8 00000 22 7777777777777777777 3 8 0 8 0 2 0 66 111 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 7 5 77 5 3333 222222222222222222222222222222222222222222 4 3 4 2222222 9999999999999999999 4 1 555 0 0 6666666 5 3 0 8 555 0 3 11 8 8 8 6666666666666666666 3 3 3
lowQualScore : . ...................... .. .. ... .. ... . . ......... .... .. . ... .. ................. . .... . ...... ... ........................... . .... ..... . . ..... . ................ ............................. . . ... . .. .. . . . ......... . . . . . .. . .. . ... . ..... .... ...... . . .... ...... .. .......... .... . . . .. . .. . . . .. ....................... . .... . . .. .... .. . . . . . .. . . . ..... . . . . . ... ... .. . . . . . .. . . . .................. . . .. . . . . . . . ... . . ..... .. ................... . . . . . . . .. ... . ............................................................................................... . . . .. . .... .......................................... . . . ....... ................... . . ... . . ....... . . . . ... . . .. . . . ................... . . .
lowQualScore : 0 3333333333333333333333 00 88 000 66 222 7 7 000000000 5555 22 7 555 00 77777777777777777 7 2222 7 888888 000 000000000000000000000000000 2 8888 88888 6 0 22222 0 3333333333333333 22222222222222222222222222222 7 7 777 7 33 22 7 7 3 333333333 7 7 2 7 2 22 7 22 7 888 5 33333 2222 222222 8 7 8888 222222 55 4444444444 8888 8 0 6 00 0 00 7 7 7 88 33333333333333333333333 7 1111 7 4 99 0000 22 7 7 7 7 7 22 8 8 8 66666 0 0 0 3 3 777 555 88 0 0 0 0 0 00 8 8 8 888888888888888888 5 5 88 0 5 0 0 0 0 0 222 8 0 00000 55 5555555555555555555 8 0 8 0 8 2 0 88 000 2 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 5 55 5 5555 000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0000000 0000000000000000000 0 2 888 0 0 8888888 0 2 8 0 444 8 0 00 0 0 0 2222222222222222222 6 6 6
consensus : NTTTATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACT-AA-TCTGTT-----AAT---TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---AAATTTATTTTAATTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AAGACAA--AC-A--GCAACA----------A------ACTGGGCA-GGAC-A-CACAC-A-CAGC-ACTCGCTCATTC--CT---------------------ATCTA-TCA---TGATGATTTAG---TAAATACAAAA-AGATATA-G---CAAATCATATACGTAN----------GATAT-G-T--ACCAAT---A---T---CA----T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTG------A-GATGACCTCAGGAATA-TGCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTA--AAAGAA-ATGGTA-T-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGAT-AA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGA--TT---ATATTA---TACAGATCTAAGCTAGGTA-AA-A--AC-AGA-T-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TTTT-GT-AA-TAATTCA-CCT----T-CCGTTTC-TAGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATTG----TAGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATTTGTCT-T--TGATTTTGCA-TACACAGTGTGTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGC-TCTAAATGGGCC-AATG---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCNATAA--AGAAATCATGATGT-ACATTTTC-TTAATCC-AATTGTT-CAGCTCTG-TCCACT-AAGCTCTCATTGA---ATCACAAAAGATAT-A-----TTTATTG-AATA-------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTAATAATCTG-TTATAACAAA-T-TGATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTT-TTATTACAAATTGATAATCTGTTATTAATCAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATAAATAGAATTCGATAATTCTCGTTATTANTCANANTGATATA--ATTT-GTTATAC--AG---CTAGCA-TCTG-TATAGCAAATTGATAATCTGTT-TAT-AACAAA-TT-----TGGATAATCTTGTTAT-ATA-CAAATTGATAATTT--GT-TA-TA-ACAAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCCTAAT-ACGCTTCCGTA
Reference ( family-1122 ) : NTTTATAACAGATTANTAATTTGTTATAACAAATTACT-AA-TCTGTT-----AAT---TTGTTAAAANNAATTA--CTTTTTTCATA---AAATTTATTTTAATTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AAGACAA--AC-A--GCANNA----------G------ACTGGGCA-GGAC-A-CACAC-AGCAGC-ACTCGCTCATTC--CT---------------------ATCTACTCA---TGATGATTTAG---TAAATACAAAA-AGACATACG---CAAANTATATNCGTAN----------GATAT-G-T--ACCGAT---A---T---TA----T-ATGCCTT---ATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCCG------A-GATGACCTCAGGAATA-TGCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTA--AAAGAA-ATGGTA-T-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGAT-AA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGA--TT---ATATTA---TACAGATCTAAGCTAGGT--AA-A--AC-AGA-T-CTTCCCA--TGTG---CATCGT--TTTTCGT-AA-TAATTCA-CCT----T-CCGTTTC-TAGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATTGT---TAGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAGGCAATTTGTCT-T--TGATTTTGCA-TACACAGTG-GTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGC-TCTAAATGGGCCCNNTG---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CGA---ACAAAATCAGAGATGGTGCTATAA--AGAAATCATGATGT-ACATTTTC-TTAATCC-AATTGTT-CAGCTCTG-TCCACT-AAGCTCTCATTGA--TATCACAAAAGATAT-A-----TTTATTG-AATA-------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTAGTAATTTG-TTATAACAAA-T-TGATAATCTGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTGTTATAACAAATTGATAATCTGTTAT--ATCAAAT--TGATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTATTATTCAAATTGATATA--ATTTTGTTATACGNANCNTTTAGTAATTTGTTATAACAAATTAATAATCTGTTTTAT-AACAAA-TT-----TGGATAATCTTGTTAT-ANA-CAAATTAATAATTT--GT-TA-TA-ACAAATTAATAAAAGGT-----------------CACT-GCTG-CGGCCCTAAT-ACGCTTCCGTA
gi|1 : TTTATAAAAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACTCAACTTTATTCACATAATAAATTGTTAAAAACAATTAGACTTTTTTCATA---AAATTTATTTTAATTGCCCATATGAAACAT----AC---TACATCAGACAA--AC-A--GCATCA----------G------ACCGGGCA-AGAC-G-CACAC-AGCAGC-ACTCGCTCATTT--CTTA-------------------ATCTATTCAGTTTCATGTTTTGG---TAAATACCAAA-AGATATACGGAACAAAGTATATCCGTAA----------GATAT-GCT--ACCAATAGCA---TATACA----T-ATGCCTTTTAATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGA-AAAGTTGTATG-AAATTCCT-CG------A-GATGGACTCAGGAATA-TG-----TC-----ATAT--TTCTAGTAACAAAGAACATGTTA-TCATATTTGGAC-T---TGTGT----ATC------TTGATAAA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGT--GA---T---ACATT----TACAAATCTTAAC--AGT--AA-A--ACGAGA-T-CTTCCAG--T-TG---CAT-GT--TTTTCGTAAA-TAATTCA-CCT----T-CCGTTTC-TAGAAAA--GCTGTAC-TTTCGCTATTGT---AAGTATTATTT-AAAATATAA-ATGTAAAAACCCAAT-AAAT-TCGGATGTTA-ACAATCTGTCT-T--TGAATTTGCA-TACACA-TGTGTAAA
gi|1 : cGGGCGTCTAT-TGGGCT-AATG---AT--GATGTA-ATG-TGTTCAT--AAATGACAATTAAATT-CAAGCTATGGAAGAGTTTC------------CAACACACAAAATCAGG--TGATTCGCTAA--AGAAATCATGATGT-ACATTTTC-TTAATCC-AATTGTT-CATCTCTG-TCCACTAAAGCTCTCATTGAACTATCACAAAAGATAC-A-----TCTGTTG-CATA-------------------AACTTGATTATAACAAACTTAGTAATCTGTTTATAACAAA-TGTAATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTT-TTATTAC-AATTGATAATCTGTTATTAATTAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATAAATAGAATTCGATAATTCTCGTTATTAATCACAATGATATACGAT----CTATACGTAACATCTAGTAATTTG-TATAACAAATTAGTAATTTGTCTTATCAACAAACTT-----TGGATAATCTTGTTATAAAA-CAAATTGATAATTT--GTATACTA-ACAAATTAATAAAAGGTCTGGAGATGCGGCGACCCGCT-GGTG-CGGCCCTAAT-ACGCTTCCGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggcgtctattgggctaatgatgatgtaatgtgttcataaatgacaattaaattcaagctatggaagagtttccaacacacaaaatcaggtgattcgctaaagaaatcatgatgtacattttcttaatccaattgttcatctctgtccactaaagctctcattgaactatcacaaaagatacatctgttgcataaacttgattataacaaacttagtaatctgtttataacaaatgtaataatctgtttatacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgataatttttattacaattgataatctgttattaattaaattgtgataaaaaccaaatagaattgtttataaatagaattcgataattctcgttattaatcacaatgatatacgatctatacgtaacatctagtaatttgtataacaaattagtaatttgtcttatcaacaaactttggataatcttgttataaaacaaattgataatttgtatactaacaaattaataaaaggtctggagatgcggcgacccgctggtgcggccctaatacgcttccgtaca
gi|10 : ctttataaaagattactaatttgttataacaaattactcaactttattcacataataaattgttaaaaacaattagacttttttcataaaatttattttaattgcccatatgaaacatactacatcagacaaacagcatcagaccgggcaagacgcacacagcagcactcgctcatttcttaatctattcagtttcatgttttggtaaataccaaaagatatacggaacaaagtatatccgtaagatatgctaccaatagcatatacatatgccttttaattagacccagatcagggaatacgaaaagttgtatgaaattcctcgagatggactcaggaatatgtcatatttctagtaacaaagaacatgttatcatatttggacttgtgtatcttgataaaagttcacattgtgagacatgtgatacatttacaaatcttaacagtaaaacgagatcttccagttgcatgtttttcgtaaataattcaccttccgtttctagaaaagctgtactttcgctattgtaagtattatttaaaatataaatgtaaaaacccaataaattcggatgttaacaatctgtctttgaatttgcatacacatgtgtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGTTATTATTCAAATTGATATA--ATTTTGTTATAC---------AG--------------AAATTGATAATCTGT----T-AATAAA-TTCAAAGTGAATAAT-TTG-TAT-ATATCAA--TGATAATTCTGGT-TA-TACACAAATTAATAAAAGG----------------------------------TAAT-ACGCTTCCGTAca
gi|11 : tC-ATA--AAACAT----AAAATTACA-A-GACAA--ACAA--GCAATA----------AAGACACACTGGACAGGGACAA-CACACTATTATCTATTCACTGATACATGT---------------------ATCTA-TCA---TGGTGATTT-G---TAAA
gi|12 : tatttAATTA--CTTTTTTCATATTAAAATTTATTT-AATTGCA-ATA-GAAACAT----A----TACA-AAGACAA--AC-A---CAGCA-----------------ACTGGGCA-AGACAA-CACAC-A--AGCAACTCACTCATTC--CT---------------------ATCTatagga
gi|13 : C-AGA-T-CTTCCCATCTGTGTGCCATTGTGCTTGTTGT-AAGTA--TGA-C------T-TCGTTTCATAGAAAAAGACTGTATTTCTCGCTA
gi|14 : atTTAT-A-A-CAAATAGATAATTT--GT-TA-TA-ACAAATTAATAAAACGT------------------ACT-GCTG-CGGCCCTAAT-ACGCTTCCAT
gi|15 : -------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTCATAATCTG-TTAT--CAAA-T-TCATAATCTGT
gi|16 : agtAAAAGG------------------CACT-GCTG-CGGCCCTAAT-ACGCTTCCATA
gi|17 : AAAAGGT------------------ACTAGCTGGCGGCCCTAAT-ACGCTTCCGTAga
gi|18 : AAAAGT------------------ACT-GGTG-CGGCCCTTATTACGCTTCCGTA
gi|19 : CT-GGTG-CGGCCCTAAT-ACGCTTCCGTA
gi|2 : G---TAAA-ACAAAA-AGATATA-G---CAAATCATACAAGTATATATATCATAGATAT-G-T--ATCAAT---AGGAT---TACCATT-ATGCCTT---ATTAGACCCAGATCAAGCGAATATACGTTGTA-TTGTATGAAAATTCCTCGG------AAGATGACCTCAGGAATATTGCATTTTCA-GAT-TAT--TTC-AGTA--AAAGAA-ATGGTACC-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------T-GAT-GA-AACGTTCACATTGT------GAAACATAC-AGA--TTTTAATCTTA---TACAGATCT-AGCTAGGTAAAA-A--AC-AGATT-CTTCCCA--TGTGTC-CACCGT--TT----T-AA--AATTCA-CCT----T-CCGTTTCTTAGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTA-TG----TAGTA--ATTTAAAAATATAA-ATGT-AAAACCCAATAAAAT-T--GATGTTTAGC-ATTTGTC--T--TGATTTTGCA-TACAgaagcta
gi|2 : GC-TCTAAATGGGCCTACTGCATAT--G-TGTAGATGGT-TCCATCAAAATGACAATTAAATTTCAA--C-TGGAAGAGTT-C------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCTATAAAGAGAAGTCATGATGT-ACATTTTC-TTAATCCAAATTGTTGCAGCTCTGTTCCACT-AAGCTCTCATTGA---ATCACAAAAGATAT-A-----TTGATT--AATA-------------------CA-TTG-TTATAAC--A-TTAGTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctctaaatgggcctactgcatatgtgtagatggttccatcaaaatgacaattaaatttcaactggaagagttccaaacaaaatcagagatggtgctataaagagaagtcatgatgtacattttcttaatccaaattgttgcagctctgttccactaagctctcattgaatcacaaaagatatattgattaatacattgttataacattagtaagatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactaaattgataatctgttatatcaattataatgttaatcaattactatttgttataacaaatcaatattgttataacaaaattgataatctgtttat
gi|2 : gtaaaacaaaaagatatagcaaatcatacaagtatatatatcatagatatgtatcaataggattaccattatgccttattagacccagatcaagcgaatatacgttgtattgtatgaaaattcctcggaagatgacctcaggaatattgcattttcagattatttcagtaaaagaaatggtaccatgattggacttgtgtatctgatgaaacgttcacattgtgaaacatacagattttaatcttatacagatctagctaggtaaaaaacagattcttcccatgtgtccaccgttttaaaattcaccttccgtttcttagaaaagctgtacttttcgctatgtagtaatttaaaaatataaatgtaaaacccaataaaattgatgtttagcatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAATTGATAATCTGTTAT--ATC-AAT--T-ATAAgatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactaaattgataatctgttatatcaattataatgttaatcaattactatttgttataacaaatcaatattgttataacaaaattgataatctgtttat
gi|2 : gtaaaacaaaaagatatagcaaatcatacaagtatatatatcatagatatgtatcaataggattaccattatgccttattagacccagatcaagcgaatatacgttgtattgtatgaaaattcctcggaagatgacctcaggaatattgcattttcagattatttcagtaaaagaaatggtaccatgattggacttgtgtatctgatgaaacgttcacattgtgaaacatacagattttaatcttatacagatctagctaggtaaaaaacagattcttcccatgtgtccaccgttttaaaattcaccttccgtttcttagaaaagctgtacttttcgctatgtagtaatttaaaaatataaatgtaaaacccaataaaattgatgtttagcatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctctaaatgggcctactgcatatgtgtagatggttccatcaaaatgacaattaaatttcaactggaagagttccaaacaaaatcagagatggtgctataaagagaagtcatgatgtacattttcttaatccaaattgttgcagctctgttccactaagctctcattgaatcacaaaagatatattgattaatacattgttataacattagtaagatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactATTTG-TTATAACAAA-TCAATA--TTG-TTATAACAAAAT-TGATAATCTGTTTATtgttaatcaattactatttgttataacaaatcaatattgttataacaaaattgataatctgtttat
gi|20 : gtaaaacaaaaagatatagcaaatcatacaagtatatatatcatagatatgtatcaataggattaccattatgccttattagacccagatcaagcgaatatacgttgtattgtatgaaaattcctcggaagatgacctcaggaatattgcattttcagattatttcagtaaaagaaatggtaccatgattggacttgtgtatctgatgaaacgttcacattgtgaaacatacagattttaatcttatacagatctagctaggtaaaaaacagattcttcccatgtgtccaccgttttaaaattcaccttccgtttcttagaaaagctgtacttttcgctatgtagtaatttaaaaatataaatgtaaaacccaataaaattgatgtttagcatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctctaaatgggcctactgcatatgtgtagatggttccatcaaaatgacaattaaatttcaactggaagagttccaaacaaaatcagagatggtgctataaagagaagtcatgatgtacattttcttaatccaaattgttgcagctctgttccactaagctctcattgaatcacaaaagatatattgattaatacattgttataacattagtaagatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactaaattgataatctgttatatcaattataatgttaatcaattactAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCCTAAT-ACGCTTCCGTA
gi|21 : AGG------------------CACT-GCTG-CGGCCCTAAT-ATGCTTTCATA
gi|3 : TTTTTTCATA---AAATT-ATTT-AATTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AGAACAA--AC-A---CAGCA-----------------ACTGGGCA-AGAC-A--ATAC-A-CAGC-ACTCGCTCATTC--CTATCTATTCAGTATTCATTGATATCTA-TCA---TGATAATTTTG---TAAA-ACAAAACAGATATA-G---CAAATCATACAAGTAT----------AATATCG-T--AAAGAT---T---T---CA----TTATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-AAATA--CGT-GTA-TTGTATGAAAATTCCTCGG------A-GATGACCTCAGGAATA-TGCATTTTCA-GATACAT--TTC-AGTA--AAAGAA-ATGGTA-T-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGAT-AA-C--GTTCACATTGT------GAGACATGCAAGATTTT---ATATTA---TACAGATCTAAGCTAGGTA-AA-A--AC-AGA-T-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TTT---T-A---AATTCA-CCT----TCCCGTTTC-TAGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATTGTACATAGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATTTGTC--T--TGATTTTGCA-TACA
gi|3 : GGGC-TCTAAATGGGCC-TATG---ATATG-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAC---AAAAAATCAGAGATGGTGCTATAA--AGAAATCATGATGTTACATTTTCCTTAATCC-AATTGTT-CAGCTTTG-TCCACT-AAGCTCTCATTGA------------GATAT-A-----TTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggggctctaaatgggcctatgatatgtgtaatgtttcatcaaaatgacaattaaattcaacatggaagagtttccacaaaaaatcagagatggtgctataaagaaatcatgatgttacattttccttaatccaattgttcagctttgtccactaagctctcattgagatatatt
gi|4 : ttttttcataaaattatttaattgccatagaaacatatacaagaacaaacacagcaactgggcaagacaatacacagcactcgctcattcctatctattcagtattcattgatatctatcatgataattttgtaaaacaaaacagatatagcaaatcatacaagtataatatcgtaaagatttcattatgctttattagacccagatcaggaaatacgtgtattgtatgaaaattcctcggagatgacctcaggaatatgcattttcagatacatttcagtaaaagaaatggtatatgattggacttgtgtatctcgataacgttcacattgtgagacatgcaagattttatattatacagatctaagctaggtaaaaacagatcttcccatgtgtgccatcgtttttaaattcaccttcccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattgtacatagtaatttaaaatataaatgtaaaacccaataaattgatgttaagcaatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTTATAACTAATTAGTAATTTGATATAACAAATTACT-AA-TCTGTT------------TGTAAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---ATAT--GTTTTA-TTGCC-ACA-GAAACATGTGTA----TACA-A-GACAA--AC-ACAGCAATA----------AGATGA-ACTGAGCA-GGAC-AACACAC-AA-----ATTCG---AT---------------------------ATCTACTC----TGATGATTTAT---AAAATA-GAAC-AGACATA-G---CAAATCATCT--GAAA----------GATAT---T--AC-------A---T---TA----T-A--CTTT---ATTTGACCCAGATCAAG--AATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTGCTCTATA-TATGACCTCAGGAATA-TGCATTTTCA-GATATATATTTC-ATTA--AAAGAA-ATGGTA-T-ATGATTGGAC-TGTCTATGTCTTTATC------TTGAT-AA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGA--TT------TTAGATTACAGATGTAAGCTAGGT--AATA--AC-AGA-T-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TTT---T-A---AATTCA-TCT----T-CCGTTTC-TAGAAAA--GTTGTACTTTTCGCAATTG----TAGTA--ATTT-AAAATA-------T-AAGACCAAAG-AAAC-T--GA---TAAGCAATTTGTCT-CAGTGATTTTGCA-TACA
gi|5 : tg---CATCGT--TTTT--T-AA---ATTCA-CCT----T-CCGTTTC-TAGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATTGG---TAGCA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACTCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAA-TTGTTTCT--TGATTTTGCATTACACAGTG-GTAAA
gi|5 : gc---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAGATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAG-TTC------------CAA---Aaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatatgtgtaatgtttcatcaagatgacaattaaattcaacatggaagagttccaaattaatccaattgttcagctctgtccactaagctctctttgaatcacaaaagatataatttattg
gi|5 : gccatcgttttttaaattcaccttccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattggtagcaatttaaaatataaatgtaaaactcaataaattgatgttaagcaattgtttcttgattttgcattacacagtggtaaaaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngat-TTAATCC-AATTGTT-CAGCTCTG-TCCACT-AAGCTCTCTTTGA---ATCACAAAAGATATAA-----TTTATTG-ttaatccaattgttcagctctgtccactaagctctctttgaatcacaaaagatataatttattg
gi|6 : gccatcgttttttaaattcaccttccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattggtagcaatttaaaatataaatgtaaaactcaataaattgatgttaagcaattgtttcttgattttgcattacacagtggtaaaaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatatgtgtaatgtttcatcaagatgacaattaaattcaacatggaagagttccaaaATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAGATTAC----------T-----AAT---TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATG---AAATATATTTT-ATTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AA-ACAAACAC-A--ACAATAAGATAAAATTA------ACTTGACA-GGAC-A--ACAC-A-CAGC-ACT-----------------------------------TTTA-TCA---TGATGATTTAGAAATAGATACAGCA-AGTCATAT------AAATATAT-CATAG----------GATAT-G-T--ACC-AT-----------------T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCA-G-GAATA--TGT-ATA-TTGAATGAAAATTCTCCTG------A-GATGACCTCAAGAATA-TGCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTA--AAAGAA-ACGGT-----TG-------------GTGT----ATC------TAGAT-AA-A--GTTCACATTGTGAATGCGAGACATGC-
gi|7 : TAA----------GACAT-G-TTCATTAAG---A---T---AAAT--T-ATGGTTT---ATAAGACC-AGGTAGGA-AAATT--CAT-AGA-TT-TATGAAA-TTCTCCTG------A--ATG---TCAGGC----TGC---TTCATGA-ATAG--TGC-ATTG----------TGCGA-T-ATCATCATACAT---TGTGT----TTCAACTGGTCGTT-ACTA--TTTAATACTAT------CAGATTTTT-AGA--CT------TTA---TAT-GATCTAAGC-ACGT--AA-ACGAC-GGG-TTCTTTCCAA-TGTG-----------TTCTCGT-TA-TAAGTCATCCTCTGCT-CCTTTTC-TAAGTAA----TGTACTTTTCG-TATTGG---TTGTA--ATTT-AAAAGATAACATTT-AAA--CGAAA-AAATCT--GATATT
gi|8 : tataaattatgatagtatG-T-TTCATCAAAATGACAATTGGATT-CAA--CATGGATGAGTTTCTTTGGTGGATTCCAA---ACAAAATCTGAGATGGTGTAATAA--AGAAATCATGATGT-A---------TAAT----GTTGTT-CAGCTCTG-TCCACA-AACCTCTCATTGA---ATTACAAAAGA-AC-AAAAACATTATTGAAATGAAATGGACTTCATTTTGATAATTTG-TTATAACAAA-TTGATAATCTG-TTATATCAAA-T-TGATAATCTGTTgtttca
gi|8 : TTGATAATTTGTT--AT-AACAAA-TT-------GATAATCT-GTTAT-AT--CAAATTGATAATCT--GT-TG-TA-ACAAATCAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCCTTAT-ACGCATCCGTgtaacaaatcaataaaaggtactgctgcggcccttatacgcatccgt
gi|9 : gtttcatcaaaatgacaattggattcaacatggatgagtttctttggtggattccaaacaaaatctgagatggtgtaataaagaaatcatgatgtataatgttgttcagctctgtccacaaacctctcattgaattacaaaagaacaaaaacattattgaaatgaaatggacttcattATA--ATTT-GTTATAACAAG---TTGGCA-TCTGTTATAGCAATTCATTAATCTGTTATAT-AACAAA-TT-----GTGATCAT-TTGTTAT-A-A-CGAATTATTATTTT--GT-CA-TA-ACAAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-AAGCCCCCAT-GCGCTTCCGT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111
lowQualScore : 1 000000000000000000 11 111 11 111 222222222 1111 77777777777777777777777777777 3 2222 1 8888888888888888888888888 111 22222222 1111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 11 111111111 1 11111 1111 111111 1111 111111 3333333333 1111 1 1 11 5555555555 1111 2222 22222 1 1 1 1 111 11 1 1 11 444444444444 111 11 1 1 111 22222 11 7777777777777777777 1 1 1 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 11 22 1 11111 11 111111 1111 6666666666666666666666 22 111 2222222 4444444444 222 222222222222222222
lowQualScore : 3 333333333333333333 33 444 11 222 6 6 666666666 2222 11111111111111111111111111111 6 1 6 0000 3 444 5555555555555555555555555 8 444 9 3 00000000 7777 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111 3 00 99 6 6 7 7 999999999 1 6 3 6 66 99 6 99 6 3 3 33333 4444 999999 7 7777 999999 77 9999999999 4444 0 0 0 8 6 3 55 0 4 77 0000000000 5 2222 5 5 5 77 6 0000 6 99 6 6 6 6 6 99 0 0 33333 8 5 5 3 7 3 777 33 0 0 8 8 8 11 0 0 0 111111111111 444 2 1 33 0 2 0 8 8 8 8 0 444 0 8 00000 22 7777777777777777777 3 8 0 8 0 0 66 0 0 0 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 6 3 88 77 2 5 2 1 66666 33 999999 4444 0000000000000000000000 8 33 8 444 9999999 2222222222 0 6 555 3 99 6 6 6 6 999999999999999999 3 3 3
lowQualScore : . .................. .. ... .. ... . . ......... .... ............................. . . . .... . ... ......................... . ... . . ........ .... ....................................................... ... . .. .. . . . . ......... . . . . .. .. . .. . . . ..... .... ...... . .... ...... .. .......... .... . . . . . . .. . . .. .......... . .... . . . .. . .... . .. . . . . . .. . . ..... . . . . . . ... .. . . . . . .. . . . ............ ... . . .. . . . . . . . . ... . . ..... .. ................... . . . . . . .. . . . .............................................................................................. . . . .. .. . . . . ..... .. ...... .... ...................... . .. . ... ....... .......... . . ... . .. . . . . .................. . . .
lowQualScore : 3 000000000000000000 88 000 66 222 7 7 000000000 5555 88888888888888888888888888888 7 7 7 8888 3 000 0000000000000000000000000 0 000 0 5 22222222 0000 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 777 7 33 22 7 7 3 2 333333333 7 7 2 7 33 22 7 22 7 3 5 33333 2222 222222 8 5555 222222 55 4444444444 8888 8 8 6 0 7 3 88 7 3 99 4444444444 7 1111 7 7 7 99 7 8888 7 22 7 7 7 7 7 22 8 8 66666 0 0 5 3 3 3 555 88 0 0 0 0 0 00 8 8 8 000000000000 000 5 0 88 0 5 0 0 0 0 0 8 000 8 0 00000 55 5555555555555555555 8 0 8 0 8 0 88 0 0 2 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 00 55 5 0 5 0 00000 88 000000 2222 0000000000000000000000 0 88 0 000 6666666 0000000000 8 7 777 5 22 7 7 7 7 555555555555555555 6 6 6
consensus : NTTTATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACT-AA-TCTGTT-----------TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---AAATTTATTTTAATTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AAGACAAACA--GCAACAA-------------A------CTGGGCAGG-ACA-ACACA-C----AGC-ACTCGCTCATTCCT---------------------ATCTAT-CA---TGATGATTTAGTAAATACGAAA-AGATATA----GCAAATCATATA-------CGTAN----------GATAT-G-T--ACCAATA------T-CA--T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTG------A-GATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGATAA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGA--TT---ATATTA---TACAGATCTAAGCTAGGTAAA-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TT-TT-GTAA-TAATTCA-CCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-G----T-AGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATTTGTCT-T--TGATTTTGCA-TACACAGTGTGTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGC-TCTAAATGGGCC-AATG---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCNATAAAGAAA--TCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACTAA-GCTCTCATTGAA---TCACAAAAGATAT-A-----TTTATTG-AATA-------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTAATAATCTGTT-ATAAC-AAAT-TGATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTTTATTACAA-TTGATAATCTGTTATTAATTAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATNAATAGAATTATCNGTAATTCTNGTTATTANTCA-A-TGATATA--ATTT-GT---TA-TA-CA-GTTAGC-ATNTGT-A--TANCAAATTGATAATCTGT-T-TAT-AA---CAAA-TTTG--GATAATC---------TTGTTAT-A-A-CAAATTGATAATTT--GT-TA-TA-AC-AAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTA
Reference ( family-1122 ) : NTTTATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACT-AA-TCTGTT-----AAT---TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---AAATTTATTTTAATTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AAGACAAACA--GCAACAA-------------A------CTGGGCAGG-ACACACACA-C----AGC-ACTCGCTCATTCCT---------------------ATCTAT-CA---TGATGATTTAGTAAATACAAAA-AGATATA----GCAAATCATATA-------CGTAN----------GATAT-G-T--ACCAATA------T-CA--T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTG------A-GATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGATAA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGA--TT---ATATTA---TACAGATCTAAGCTAGGTAAA-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TT-TT-GTAA-TAATTCA-CCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-G----T-AGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATTTGTCT-T--TGATTTTGCA-TACACAGTGTGTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGC-TCTAAATGGGCC-AATG---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCNATAAAGAAA--TCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACTAA-GCTCTCATTGAA---TCACAAAAGATAT-A-----TTTATTG-AATA-------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTAATAATCTGTT-ATAAC-AAAT-TGATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTTTATTACAAATTGATAATCTGTTATTAATCAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATAAATAGAATT--CGATAATTCTCGTTATTANTCANANTGATATA--ATTT-GT---TA-TA-CA-GCTAGC-ATCTGT-A--TAGCAAATTGATAATCTGT-T-TAT-AA---CAAA-TTTG--GATAATC---------TTGTTAT-ATA-CAAATTGATAATTT--GT-TA-TA-AC-AAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTA
gi|1 : TTTATAAAAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACTCAACTTTATTCACATAATAAATTGTTAAAAACAATTAGACTTTTTTCATA---AAATTTATTTTAATTGCCCATATGAAACAT----AC---TACATCAGACAAACA--GCATCAG-------------A------CCGGGCAAG-ACGCACACAGC----AGC-ACTCGCTCATTTCTTA-------------------ATCTATTCAGTTTCATGTTTTGGTAAATACCAAA-AGATATACGGAACAAAGTATATC-------CGTAA----------GATAT-GCT--ACCAATAGCATA-TACA--T-ATGCCTTTTAATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGA-AAAGTTGTATGAAA-TTCCTC-G------A-GATGGACTCAGGAATAT-G-----TCA-----TAT--TTCTAGTAACAAAGAACATGTTATCATATTTGGAC-T---TGTGT----ATC------TTGATAA-AA-GTTCACATTGT------GAGACATGT--GA--T----ACATT----TACAAATCTTAAC--AGTAAA-AC-GAGAT-CTTCCAG--T---TGC-AT-GT--TT-TTCGTAAATAATTCA-CCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTAC-TTTCGCTATT-G----TAAGTATTATTT-AAAATATAA-ATGTAAAAACCCAAT-AAAT-TCGGATGTTAA-CAATCTGTCT-T--TGAATTTGCA-TACACA-TGTGTAAA
gi|1 : cGGGCGTCTAT-TGGGCT-AATG---AT--GATGTA-ATG-TGTTCAT--AAATGACAATTAAATT-CAAGCTATGGAAGAGTTTC------------CAACACACAAAATCAGG--TGATTCGCTAAAGAAA--TCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAA-TTGTT-CATCTCTGT-CCACTAAAGCTCTCATTGAACTATCACAAAAGATAC-A-----TCTGTTG-CATA-------------------AACTTGATTATAACAAACTTAGTAATCTGTTTATAAC-AAATGTAATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTTTATTACAA-TTGATAATCTGTTATTAATTAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATAAATAGAATT--CGATAATTCTCGTTATTAATCACAATGATATACGATCT-ATACGTA--A-CA-TCTAGTAATTTGT-A--TAACAAATTAGTAATTTGTCT-TATCAA---CAAACTTTG--GATAATC---------TTGTTATAAAA-CAAATTGATAATTT--GTATACTA-AC-AAATTAATAAAAGGTCTGGAGATGCGGCGACCCGCT-GGTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggcgtctattgggctaatgatgatgtaatgtgttcataaatgacaattaaattcaagctatggaagagtttccaacacacaaaatcaggtgattcgctaaagaaatcatgatgtacattttcttaatccaattgttcatctctgtccactaaagctctcattgaactatcacaaaagatacatctgttgcataaacttgattataacaaacttagtaatctgtttataacaaatgtaataatctgtttatacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgataatttttattacaattgataatctgttattaattaaattgtgataaaaaccaaatagaattgtttataaatagaattcgataattctcgttattaatcacaatgatatacgatctatacgtaacatctagtaatttgtataacaaattagtaatttgtcttatcaacaaactttggataatcttgttataaaacaaattgataatttgtatactaacaaattaataaaaggtctggagatgcggcgacccgctggtgcggccctaatacgcttccgtaca
gi|10 : ctttataaaagattactaatttgttataacaaattactcaactttattcacataataaattgttaaaaacaattagacttttttcataaaatttattttaattgcccatatgaaacatactacatcagacaaacagcatcagaccgggcaagacgcacacagcagcactcgctcatttcttaatctattcagtttcatgttttggtaaataccaaaagatatacggaacaaagtatatccgtaagatatgctaccaatagcatatacatatgccttttaattagacccagatcagggaatacgaaaagttgtatgaaattcctcgagatggactcaggaatatgtcatatttctagtaacaaagaacatgttatcatatttggacttgtgtatcttgataaaagttcacattgtgagacatgtgatacatttacaaatcttaacagtaaaacgagatcttccagttgcatgtttttcgtaaataattcaccttccgtttctagaaaagctgtactttcgctattgtaagtattatttaaaatataaatgtaaaaacccaataaattcggatgttaacaatctgtctttgaatttgcatacacatgtgtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGTTATTATTCAAATTGATATA--ATTTTGT---TA-TA-CA-G--------------------AAATTGATAATCTGT-T-AAT-AAATTCAAA--GTG--AATAAT----------TTG-TAT-ATATCAA--TGATAATTCTGGT-TA-TACAC-AAATTAATAAAAGG-----------------------------------TAATACGCTTCCGTAca
gi|11 : tC-ATA--AAACAT----AAAATTACA-A-GACAAACAA-GCAATAA-------------AGACACACTGGACAGGGACA-ACACA-CTATTATCTATTCACTGATACATGT-------------------ATCTAT-CA---TGGTGATTT-GTAAA
gi|12 : tatttAATTA--CTTTTTTCATATTAAAATTTATTT-AATTGCA-ATA-GAAACAT----A----TACA-AAGACAAACA---CAGC-A-------------A------CTGGGCAAG-ACA-ACACA-CA---AGCAACTCACTCATTCCT---------------------ATCTatagga
gi|13 : -CAGAT-CTTCCCATCTGTGTGCCATTGTGCTTGTT-GTAAGTA--TGA-C------T-TCGTTTCAT-AGAAAAAGACTGTATTTCTCGCTA
gi|14 : atTTAT-A-A-CAAATAGATAATTT--GT-TA-TA-AC-AAATTAATAAAACGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCAT
gi|15 : -------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTCATAATCTGTT-AT--C-AAAT-TCATAATCTGT
gi|16 : agtAAAAGGC------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCATA
gi|17 : AAAAGGT------------------ACTAGCTGGCGGCCC-TAATACGCTTCCGTAga
gi|18 : AAAAGT------------------ACT-GGTG-CGGCCCTTATTACGCTTCCGTA
gi|19 : CT-GGTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTA
gi|2 : GTAAA-ACAAAA-AGATATA----GCAAATCATACA-------AGTATATATATCATAGATAT-G-T--ATCAATAGGATTAC-CA--TTATGCCTT---ATTAGACCCAGATCAAGCGAATATACGTTGTA-TTGTATGAAAATTCCTCGG------AAGATGACCTCAGGAATATTGCATTTTCA-GAT-TAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTACCATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------T-GATGA-AACGTTCACATTGT------GAAACATAC-AGA--TTTTAATCTTA---TACAGATCTA-GCTAGGTAAA-AAACAGATTCTTCCCA--TGTGT-CCACCGT--TT-T----AA--AATTCA-CCT----T-CCGTTTC-TTAGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTA-T-G----T-AGTA--ATTTAAAAATATAA-ATGT-AAAACCCAATAAAAT-T--GATGTTTAGC-ATTTGTC--T--TGATTTTGCA-TACAgaagcta
gi|2 : GC-TCTAAATGGGCCTACTGCATAT--G-TGTAGATGGT-TCCATCAAAATGACAATTAAATTTCAA--C-TGGAAGAGTT-C------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCTATAAAGAGAAGTCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAAATTGTTGCAGCTCTGTTCCACTAA-GCTCTCATTGAA---TCACAAAAGATAT-A-----TTGATT--AATA-------------------CA-TTG-TTATAAC--A-TTAGTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctctaaatgggcctactgcatatgtgtagatggttccatcaaaatgacaattaaatttcaactggaagagttccaaacaaaatcagagatggtgctataaagagaagtcatgatgtacattttcttaatccaaattgttgcagctctgttccactaagctctcattgaatcacaaaagatatattgattaatacattgttataacattagtaagatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactaaattgataatctgttatatcaattataatgttaatcaattactatttgttataacaaatcaatattgttataacaaaattgataatctgtttat
gi|2 : gtaaaacaaaaagatatagcaaatcatacaagtatatatatcatagatatgtatcaataggattaccattatgccttattagacccagatcaagcgaatatacgttgtattgtatgaaaattcctcggaagatgacctcaggaatattgcattttcagattatttcagtaaaagaaatggtaccatgattggacttgtgtatctgatgaaacgttcacattgtgaaacatacagattttaatcttatacagatctagctaggtaaaaaacagattcttcccatgtgtccaccgttttaaaattcaccttccgtttcttagaaaagctgtacttttcgctatgtagtaatttaaaaatataaatgtaaaacccaataaaattgatgtttagcatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTATCAATA--ATTATCTGTAATT-TGGTTATCACT-------ATAGA--ATTT-GA---TAATA-CA-ATTAAC--TAAGT-AGTTACTAAATTGATAATCTGT-T--AT-AT---CAAT-TATAATGTTAATCAATTACTATTTGTTAT-A-A-CAAATCAATA--TT--GT-TA-TA-ACAAAATTGATAAgatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactaaattgataatctgttatatcaattataatgttaatcaattactatttgttataacaaatcaatattgttataacaaaattgataatctgtttat
gi|2 : gtaaaacaaaaagatatagcaaatcatacaagtatatatatcatagatatgtatcaataggattaccattatgccttattagacccagatcaagcgaatatacgttgtattgtatgaaaattcctcggaagatgacctcaggaatattgcattttcagattatttcagtaaaagaaatggtaccatgattggacttgtgtatctgatgaaacgttcacattgtgaaacatacagattttaatcttatacagatctagctaggtaaaaaacagattcttcccatgtgtccaccgttttaaaattcaccttccgtttcttagaaaagctgtacttttcgctatgtagtaatttaaaaatataaatgtaaaacccaataaaattgatgtttagcatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctctaaatgggcctactgcatatgtgtagatggttccatcaaaatgacaattaaatttcaactggaagagttccaaacaaaatcagagatggtgctataaagagaagtcatgatgtacattttcttaatccaaattgttgcagctctgttccactaagctctcattgaatcacaaaagatatattgattaatacattgttataacattagtaagatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgtATTTG-TTATAACAAA-TCAATA--TTGTT-ATAACAAAAT-TGATAATCTGTTTATtctgtttat
gi|20 : gtaaaacaaaaagatatagcaaatcatacaagtatatatatcatagatatgtatcaataggattaccattatgccttattagacccagatcaagcgaatatacgttgtattgtatgaaaattcctcggaagatgacctcaggaatattgcattttcagattatttcagtaaaagaaatggtaccatgattggacttgtgtatctgatgaaacgttcacattgtgaaacatacagattttaatcttatacagatctagctaggtaaaaaacagattcttcccatgtgtccaccgttttaaaattcaccttccgtttcttagaaaagctgtacttttcgctatgtagtaatttaaaaatataaatgtaaaacccaataaaattgatgtttagcatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctctaaatgggcctactgcatatgtgtagatggttccatcaaaatgacaattaaatttcaactggaagagttccaaacaaaatcagagatggtgctataaagagaagtcatgatgtacattttcttaatccaaattgttgcagctctgttccactaagctctcattgaatcacaaaagatatattgattaatacattgttataacattagtaagatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactaaattgataatctgttatatcaattataatgttaatcaattactAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTA
gi|21 : AGGC------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATATGCTTTCATA
gi|3 : TTTTTTCATA---AAATT-ATTT-AATTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AGAACAAACA---CAGCAA--------------------CTGGGCAAG-ACA-ATACA-C----AGC-ACTCGCTCATTCCTATCTATTCAGTATTCATTGATATCTAT-CA---TGATAATTTTGTAAA-ACAAAACAGATATA----GCAAATCATACA-------AGTAT----------AATATCG-T--AAAGATT------T-CA--TTATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-AAATA--CGT-GTA-TTGTATGAAAATTCCTCGG------A-GATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATACAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGATAA-C--GTTCACATTGT------GAGACATGCAAGATTTT---ATATTA---TACAGATCTAAGCTAGGTAAA-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TT-TT-A-----AATTCA-CCT----TCCCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-GTACAT-AGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATTTGTC--T--TGATTTTGCA-TACA
gi|3 : GGGC-TCTAAATGGGCC-TATG---ATATG-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAC---AAAAAATCAGAGATGGTGCTATAAAGAAA--TCATGATGTTACATTTTCCTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTTTGT-CCACTAA-GCTCTCATTG------------AGATAT-A-----TTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggggctctaaatgggcctatgatatgtgtaatgtttcatcaaaatgacaattaaattcaacatggaagagtttccacaaaaaatcagagatggtgctataaagaaatcatgatgttacattttccttaatccaattgttcagctttgtccactaagctctcattgagatatatt
gi|4 : ttttttcataaaattatttaattgccatagaaacatatacaagaacaaacacagcaactgggcaagacaatacacagcactcgctcattcctatctattcagtattcattgatatctatcatgataattttgtaaaacaaaacagatatagcaaatcatacaagtataatatcgtaaagatttcattatgctttattagacccagatcaggaaatacgtgtattgtatgaaaattcctcggagatgacctcaggaatatgcattttcagatacatttcagtaaaagaaatggtatatgattggacttgtgtatctcgataacgttcacattgtgagacatgcaagattttatattatacagatctaagctaggtaaaaacagatcttcccatgtgtgccatcgtttttaaattcaccttcccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattgtacatagtaatttaaaatataaatgtaaaacccaataaattgatgttaagcaatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTTATAACTAATTAGTAATTTGATATAACAAATTACT-AA-TCTGTT------------TGTAAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---ATAT--GTTTTA-TTGCC-ACA-GAAACATGTGTA----TACA-A-GACAAACACAGCAATAAGATGA--------A------CTGAGCAGG-ACA-ACACA-C----AA--ATTCG---AT-------------------------ATCTAC-TC---TGATGATTTATAAAATA-GAAC-AGACATA----GCAAATCATCT---------GAAA----------GATAT---T--AC----A------T-TA--T-A--CTTT---ATTTGACCCAGATCAAG--AATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTGCTCTATA-TATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATATATATTTC-ATTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-TGTCTATGTCTTTATC------TTGATAA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGA--TT------TTAGATTACAGATGTAAGCTAGGTAAT-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TT-TT-A-----AATTCA-TCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GTTGTACTTTTCGCAATT-G----T-AGTA--ATTT-AAAATA-------T-AAGACCAAAG-AAAC-T--GA---TAAGCAATTTGTCT-CAGTGATTTTGCA-TACA
gi|5 : tgGCCATCGT--TT-TT--TAA---ATTCA-CCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-GG---T-AGCA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACTCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAA-TTGTTTCT--TGATTTTGCATTACACAGTG-GTAAA
gi|5 : ---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAGATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAG-TTC------------CAA---Aaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatatgtgtaatgtttcatcaagatgacaattaaattcaacatggaagagttccaaattaatccaattgttcagctctgtccactaagctctctttgaatcacaaaagatataatttattg
gi|5 : gccatcgttttttaaattcaccttccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattggtagcaatttaaaatataaatgtaaaactcaataaattgatgttaagcaattgtttcttgattttgcattacacagtggtaaaaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACTAA-GCTCTCTTTGAA---TCACAAAAGATATAA-----TTTATTG-ttaatccaattgttcagctctgtccactaagctctctttgaatcacaaaagatataatttattg
gi|6 : gccatcgttttttaaattcaccttccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattggtagcaatttaaaatataaatgtaaaactcaataaattgatgttaagcaattgtttcttgattttgcattacacagtggtaaaaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatatgtgtaatgtttcatcaagatgacaattaaattcaacatggaagagttccaaaATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAGATTACT-AA-T----------------TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATG---AAATATATTTTA-TTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AA-ACAAACA---CAACAATAAGATAAAATTAA------CTTGACAGG-ACA-ACACA-C----AGC-ACT---------------------------------TTTAT-CA---TGATGATTTAG-AAAT-------AGATACA----GCAAGTCATATAAATATATCATAG----------GATAT-G-T--ACC-AT-------------T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCA-G-GAATA--TGT-ATA-TTGAATGAAAATTCTCCTG------A-GATGACCTCAAGAATAT-GCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ACGGT----TG-------------GTGT----ATC------TAGATAA-A--GTTCACATTGTGAATGCGAGACATGC-
gi|7 : TAA----------GACAT-G-TTCATTAAGA------T-AAATT-ATGGTTT---ATAAGACC-AGGTAGGA-AAATT--CAT-AGA-TT-TATGAAA-TTCTCCTG------A--ATG---TCAGGC---T-GC---TTCATGA-ATAG--TGC-ATTG----------TGCGAT-ATCATCATACAT---TGTGT----TTCAACTGGTCGTTACTA--TTTAATACTAT------CAGATTTTT-AGA--CT------TTA---TAT-GATCTAAGC-ACGTAAACGA-CGGGTTCTTTCCAA-TGTGTTC--TCGT--T--------A-TAAGTCATCCTCTGCT-CCTTTTC-T-AAGTAA----TGTACTTTTCG-TATTGG----T-TGTA--ATTT-AAAAGATAACATTT-AAA--CGAAA-AAATCT--GATATT
gi|8 : tataaattatgatagtatG-T-TTCATCAAAATGACAATTGGATT-CAA--CATGGATGAGTTTCTTTGGTGGATTCCAA---ACAAAATCTGAGATGGTGTAATAAAGAAA--TCATGATG-TA---------TAAT---G-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACAAA-CCTCTCATTGAA---TTACAAAAGA-AC-AAAAACATTATTGAAATGAAATGGACTTCATTTTGATAATTTG-TTATAACAAA-TTGATAATCTGTT-ATATC-AAAT-TGATAATCTGTTgtttca
gi|8 : TTGATAATTTGT-T--AT-AA---CAAA-TT----GATAATC---------T-GTTAT-AT--CAAATTGATAATCT--GT-TG-TA-AC-AAATCAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TTATACGCATCCGTgtaacaaatcaataaaaggtactgctgcggcccttatacgcatccgt
gi|9 : gtttcatcaaaatgacaattggattcaacatggatgagtttctttggtggattccaaacaaaatctgagatggtgtaataaagaaatcatgatgtataatgttgttcagctctgtccacaaacctctcattgaattacaaaagaacaaaaacattattgaaatgaaatggacttcattATA--ATTT-GT---TA-TAACAAGTTGGC-ATCTGTTA--TAGCAATTCATTAATCTGT-TATAT-AA---CAAA-TTGT--GATCAT----------TTGTTAT-A-A-CGAATTATTATTTT--GT-CA-TA-AC-AAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-AAGCCC-CCATGCGCTTCCGT
Alignments
lowQualScore : 1 888888888888888888 11 111 11 111 222222222 1111 77777777777777777777777777777 2222 1 8888888888888888888888888 111 11111111 1111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 11 111111111 1 11111 1111 111111 1111 111111 3333333333 1111 1 1 11 5555555555 1111 2222 22222 1 1 1 1 111 11 1 1 11 444444444444 111 11 1 1 111 22222 11 7777777777777777777 1 1 1 11 1 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 11 1 4444444 11 111111 1111 555555555555555555 22 111 2222222 4444444444 222222222222222222
lowQualScore : 3 000000000000000000 7 33 444 11 222 6 6 666666666 2222 11111111111111111111111111111 6 6 6 0000 3 444 5555555555555555555555555 8 444 9 3 88888888 7777 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111 88 99 6 6 7 7 999999999 1 6 3 6 66 99 6 99 6 3 3 33333 4444 999999 7 7777 999999 77 9999999999 4444 0 0 0 8 6 3 55 0 4 77 0000000000 5 2222 5 5 5 77 6 0000 6 99 6 6 6 6 6 99 0 0 33333 8 5 5 3 7 3 777 33 0 0 8 8 8 11 0 0 0 111111111111 444 2 1 33 0 2 0 8 8 8 8 0 444 0 8 00000 22 7777777777777777777 7 0 3 0 0 3 55 3 3 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 88 88 1 5 1 1 1111111 33 999999 4444 333333333333333333 44 8 33 8 444 9999999 2222222222 0 6 99 3 99 6 6 6 6 999999999999999999 3 3 3
lowQualScore : . .................. . .. ... .. ... . . ......... .... ............................. . . . .... . ... ......................... . ... . . ........ .... ....................................................... ... .. .. . . . . ......... . . . . .. .. . .. . . . ..... .... ...... . .... ...... .. .......... .... . . . . . . .. . . .. .......... . .... . . . .. . .... . .. . . . . . .. . . ..... . . . . . . ... .. . . . . . .. . . . ............ ... . . .. . . . . . . . . ... . . ..... .. ................... . . . . . . .. . . .............................................................................................. . .. .. . . . . ....... .. ...... .... .................. .. . .. . ... ....... .......... . . .. . .. . . . . .................. . . .
lowQualScore : 3 333333333333333333 3 88 000 66 222 7 7 000000000 5555 88888888888888888888888888888 7 7 7 8888 3 000 0000000000000000000000000 0 000 0 5 22222222 0000 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 777 77 22 7 7 3 2 333333333 7 7 2 7 33 22 7 22 7 3 5 33333 2222 222222 8 5555 222222 55 4444444444 8888 8 8 6 0 7 3 88 7 3 99 4444444444 7 1111 7 7 7 99 7 8888 7 22 7 7 7 7 7 22 8 8 66666 0 0 5 3 3 3 555 88 0 0 0 0 0 00 8 8 8 000000000000 000 5 0 88 0 5 0 0 0 0 0 8 000 8 0 00000 55 5555555555555555555 0 0 2 0 8 3 00 3 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 00 55 0 0 0 0 3333333 88 000000 2222 888888888888888888 88 0 88 0 000 6666666 0000000000 8 7 22 5 22 7 7 7 7 555555555555555555 6 6 6
consensus : NTTTATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACT-AA-TCTGTT-----------TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---AAATTTATTTTAATTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AAGACAAACA--GCAACAA-------------A------CTGGGCAGG-ACA-ACACA-C----AGC-ACTCGCTCATTCCT---------------------ATCTAT-CA---TGATGATTTAGTAAATACGAAA-AGATATA----GCAAATCATATA-------CGTAN----------GATAT-G-T--ACCAATA------T-CA--T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTG------A-GATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGATAA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGA--TT---ATATTA---TACAGATCTAAGCTAGGTAAA-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TT-TT-GTAA-TAATTCA-CCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-G----T-AGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATTTGTCT-T--TGATTTTGCA-TACACAGTGTGTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGC-TCTAAATGGGCC-AATG---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCNATAAAGAAA--TCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACTAA-GCTCTCATTGAA---TCACAAAAGATAT-A-----TTTATTG-AATA-------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTAGTAATCTGTT-ATA-CAAAT-TNATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTTTATTACAATTGATAATCTGTTATTAATTAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATNAATAGAATTATCNGTAATTCTNGTTATTANT--CAA--TGATATA--ATTT-GT---TA-TA-CA-GTTAGC-ATNTGT-A--TANCAAATTGATAATCTGT-T-TAT-AA---CAAA-TTTG--GATAATC---------TTGT-TAT--AACAAATTGATAATTT--GT-TA-TA-AC-AAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTA
Reference ( family-1122 ) : NTTTATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACT-AA-TCTGTT-----------TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---AAATTTATTTTAATTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AAGACAAACA--GCAACAA-------------A------CTGGGCAGG-ACA-ACACA-C----AGC-ACTCGCTCATTCCT---------------------ATCTAT-CA---TGATGATTTAGTAAATACGAAA-AGATATA----GCAAATCATATA-------CGTAN----------GATAT-G-T--ACCAATA------T-CA--T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTG------A-GATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGATAA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGA--TT---ATATTA---TACAGATCTAAGCTAGGTAAA-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TT-TT-GTAA-TAATTCA-CCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-G----T-AGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATTTGTCT-T--TGATTTTGCA-TACACAGTGTGTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGC-TCTAAATGGGCC-AATG---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCNATAAAGAAA--TCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACTAA-GCTCTCATTGAA---TCACAAAAGATAT-A-----TTTATTG-AATA-------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTAATAATCTGTT-ATAACAAAT-TGATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTTTATTACAATTGATAATCTGTTATTAATTAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATNAATAGAATTATCNGTAATTCTNGTTATTANT--CAA--TGATATA--ATTT-GT---TA-TA-CA-GTTAGC-ATNTGT-A--TANCAAATTGATAATCTGT-T-TAT-AA---CAAA-TTTG--GATAATC---------TTGT-TAT--AACAAATTGATAATTT--GT-TA-TA-AC-AAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTA
gi|1 : TTTATAAAAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACTCAACTTTATTCACATAATAAATTGTTAAAAACAATTAGACTTTTTTCATA---AAATTTATTTTAATTGCCCATATGAAACAT----AC---TACATCAGACAAACA--GCATCAG-------------A------CCGGGCAAG-ACGCACACAGC----AGC-ACTCGCTCATTTCTTA-------------------ATCTATTCAGTTTCATGTTTTGGTAAATACCAAA-AGATATACGGAACAAAGTATATC-------CGTAA----------GATAT-GCT--ACCAATAGCATA-TACA--T-ATGCCTTTTAATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGA-AAAGTTGTATGAAA-TTCCTC-G------A-GATGGACTCAGGAATAT-G-----TCA-----TAT--TTCTAGTAACAAAGAACATGTTATCATATTTGGAC-T---TGTGT----ATC------TTGATAA-AA-GTTCACATTGT------GAGACATGT--GA--T----ACATT----TACAAATCTTAAC--AGTAAA-AC-GAGAT-CTTCCAG--T---TGC-AT-GT--TT-TTCGTAAATAATTCA-CCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTAC-TTTCGCTATT-G----TAAGTATTATTT-AAAATATAA-ATGTAAAAACCCAAT-AAAT-TCGGATGTTAA-CAATCTGTCT-T--TGAATTTGCA-TACACA-TGTGTAAA
gi|1 : cGGGCGTCTAT-TGGGCT-AATG---AT--GATGTA-ATG-TGTTCAT--AAATGACAATTAAATT-CAAGCTATGGAAGAGTTTC------------CAACACACAAAATCAGG--TGATTCGCTAAAGAAA--TCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAA-TTGTT-CATCTCTGT-CCACTAAAGCTCTCATTGAACTATCACAAAAGATAC-A-----TCTGTTG-CATA-------------------AACTTGATTATAACAAACTTAGTAATCTGTTTATAACAAATGTAATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTTTATTACAATTGATAATCTGTTATTAATTAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATAAATAGAAT--TCGATAATTCTCGTTATTAATCACAA--TGATATACGATCT-ATACGTA--A-CA-TCTAGTAATTTGT-A--TAACAAATTAGTAATTTGTCT-TATCAA---CAAACTTTG--GATAATC---------TTGT-TATAAAACAAATTGATAATTT--GTATACTA-AC-AAATTAATAAAAGGTCTGGAGATGCGGCGACCCGCT-GGTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggcgtctattgggctaatgatgatgtaatgtgttcataaatgacaattaaattcaagctatggaagagtttccaacacacaaaatcaggtgattcgctaaagaaatcatgatgtacattttcttaatccaattgttcatctctgtccactaaagctctcattgaactatcacaaaagatacatctgttgcataaacttgattataacaaacttagtaatctgtttataacaaatgtaataatctgtttatacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgataatttttattacaattgataatctgttattaattaaattgtgataaaaaccaaatagaattgtttataaatagaattcgataattctcgttattaatcacaatgatatacgatctatacgtaacatctagtaatttgtataacaaattagtaatttgtcttatcaacaaactttggataatcttgttataaaacaaattgataatttgtatactaacaaattaataaaaggtctggagatgcggcgacccgctggtgcggccctaatacgcttccgtaca
gi|10 : ctttataaaagattactaatttgttataacaaattactcaactttattcacataataaattgttaaaaacaattagacttttttcataaaatttattttaattgcccatatgaaacatactacatcagacaaacagcatcagaccgggcaagacgcacacagcagcactcgctcatttcttaatctattcagtttcatgttttggtaaataccaaaagatatacggaacaaagtatatccgtaagatatgctaccaatagcatatacatatgccttttaattagacccagatcagggaatacgaaaagttgtatgaaattcctcgagatggactcaggaatatgtcatatttctagtaacaaagaacatgttatcatatttggacttgtgtatcttgataaaagttcacattgtgagacatgtgatacatttacaaatcttaacagtaaaacgagatcttccagttgcatgtttttcgtaaataattcaccttccgtttctagaaaagctgtactttcgctattgtaagtattatttaaaatataaatgtaaaaacccaataaattcggatgttaacaatctgtctttgaatttgcatacacatgtgtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGTTATTATT--CAAATTGATATA--ATTTTGT---TA-TA-CA-G--------------------AAATTGATAATCTGT-T-AAT-AAATTCAAA--GTG--AATAAT----------TTGTATAT--ATCAA--TGATAATTCTGGT-TA-TACAC-AAATTAATAAAAGG-----------------------------------TAATACGCTTCCGTAca
gi|11 : tC-ATA--AAACAT----AAAATTACA-A-GACAAACAA-GCAATAA-------------AGACACACTGGACAGGGACA-ACACA-CTATTATCTATTCACTGATACATGT-------------------ATCTAT-CA---TGGTGATTT-GTAAA
gi|12 : tatttAATTA--CTTTTTTCATATTAAAATTTATTT-AATTGCA-ATA-GAAACAT----A----TACA-AAGACAAACA---CAGC-A-------------A------CTGGGCAAG-ACA-ACACA-CA---AGCAACTCACTCATTCCT---------------------ATCTatagga
gi|13 : -CAGAT-CTTCCCATCTGTGTGCCATTGTGCTTGTT-GTAAGTA--TGA-C------T-TCGTTTCAT-AGAAAAAGACTGTATTTCTCGCTA
gi|14 : atT-TAT--AACAAATAGATAATTT--GT-TA-TA-AC-AAATTAATAAAACGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCAT
gi|15 : -------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTCATAATCTGTT-AT--CAAAT-TCATAATCTGT
gi|16 : agtAAAAGGC------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCATA
gi|17 : AAAAGGT------------------ACTAGCTGGCGGCCC-TAATACGCTTCCGTAga
gi|18 : AAAAGT------------------ACT-GGTG-CGGCCCTTATTACGCTTCCGTA
gi|19 : CT-GGTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTA
gi|2 : GTAAA-ACAAAA-AGATATA----GCAAATCATACA-------AGTATATATATCATAGATAT-G-T--ATCAATAGGATTAC-CA--TTATGCCTT---ATTAGACCCAGATCAAGCGAATATACGTTGTA-TTGTATGAAAATTCCTCGG------AAGATGACCTCAGGAATATTGCATTTTCA-GAT-TAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTACCATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------T-GATGA-AACGTTCACATTGT------GAAACATAC-AGA--TTTTAATCTTA---TACAGATCTA-GCTAGGTAAA-AAACAGATTCTTCCCA--TGTGT-CCACCGT--TT-T----AA--AATTCA-CCT----T-CCGTTTC-TTAGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTA-T-G----T-AGTA--ATTTAAAAATATAA-ATGT-AAAACCCAATAAAAT-T--GATGTTTAGC-ATTTGTC--T--TGATTTTGCA-TACAgaagcta
gi|2 : GC-TCTAAATGGGCCTACTGCATAT--G-TGTAGATGGT-TCCATCAAAATGACAATTAAATTTCAA--C-TGGAAGAGTT-C------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCTATAAAGAGAAGTCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAAATTGTTGCAGCTCTGTTCCACTAA-GCTCTCATTGAA---TCACAAAAGATAT-A-----TTGATT--AATA-------------------CA-TTG-TTATAAC--A-TTAGTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctctaaatgggcctactgcatatgtgtagatggttccatcaaaatgacaattaaatttcaactggaagagttccaaacaaaatcagagatggtgctataaagagaagtcatgatgtacattttcttaatccaaattgttgcagctctgttccactaagctctcattgaatcacaaaagatatattgattaatacattgttataacattagtaagatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactaaattgataatctgttatatcaattataatgttaatcaattactatttgttataacaaatcaatattgttataacaaaattgataatctgtttat
gi|2 : gtaaaacaaaaagatatagcaaatcatacaagtatatatatcatagatatgtatcaataggattaccattatgccttattagacccagatcaagcgaatatacgttgtattgtatgaaaattcctcggaagatgacctcaggaatattgcattttcagattatttcagtaaaagaaatggtaccatgattggacttgtgtatctgatgaaacgttcacattgtgaaacatacagattttaatcttatacagatctagctaggtaaaaaacagattcttcccatgtgtccaccgttttaaaattcaccttccgtttcttagaaaagctgtacttttcgctatgtagtaatttaaaaatataaatgtaaaacccaataaaattgatgtttagcatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTATCAATA--ATTATCTGTAATT-TGGTTATCACT---------ATAGA--ATTT-GA---TAATA-CA-ATTAAC--TAAGT-AGTTACTAAATTGATAATCTGT-T--AT-AT---CAAT-TATAATGTTAATCAATTACTATTTGT-TAT--AACAAATCAATA--TT--GT-TA-TA-ACAAAATTGATAAgatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactaaattgataatctgttatatcaattataatgttaatcaattactatttgttataacaaatcaatattgttataacaaaattgataatctgtttat
gi|20 : gtaaaacaaaaagatatagcaaatcatacaagtatatatatcatagatatgtatcaataggattaccattatgccttattagacccagatcaagcgaatatacgttgtattgtatgaaaattcctcggaagatgacctcaggaatattgcattttcagattatttcagtaaaagaaatggtaccatgattggacttgtgtatctgatgaaacgttcacattgtgaaacatacagattttaatcttatacagatctagctaggtaaaaaacagattcttcccatgtgtccaccgttttaaaattcaccttccgtttcttagaaaagctgtacttttcgctatgtagtaatttaaaaatataaatgtaaaacccaataaaattgatgtttagcatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctctaaatgggcctactgcatatgtgtagatggttccatcaaaatgacaattaaatttcaactggaagagttccaaacaaaatcagagatggtgctataaagagaagtcatgatgtacattttcttaatccaaattgttgcagctctgttccactaagctctcattgaatcacaaaagatatattgattaatacattgttataacattagtaagatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgtAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTAtctgtttat
gi|21 : AGGC------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATATGCTTTCATA
gi|3 : TTTTTTCATA---AAATT-ATTT-AATTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AGAACAAACA---CAGCAA--------------------CTGGGCAAG-ACA-ATACA-C----AGC-ACTCGCTCATTCCTATCTATTCAGTATTCATTGATATCTAT-CA---TGATAATTTTGTAAA-ACAAAACAGATATA----GCAAATCATACA-------AGTAT----------AATATCG-T--AAAGATT------T-CA--TTATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-AAATA--CGT-GTA-TTGTATGAAAATTCCTCGG------A-GATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATACAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGATAA-C--GTTCACATTGT------GAGACATGCAAGATTTT---ATATTA---TACAGATCTAAGCTAGGTAAA-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TT-TT-A-----AATTCA-CCT----TCCCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-GTACAT-AGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATTTGTC--T--TGATTTTGCA-TACA
gi|3 : GGGC-TCTAAATGGGCC-TATG---ATATG-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAC---AAAAAATCAGAGATGGTGCTATAAAGAAA--TCATGATGTTACATTTTCCTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTTTGT-CCACTAA-GCTCTCATTG------------AGATAT-A-----TTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggggctctaaatgggcctatgatatgtgtaatgtttcatcaaaatgacaattaaattcaacatggaagagtttccacaaaaaatcagagatggtgctataaagaaatcatgatgttacattttccttaatccaattgttcagctttgtccactaagctctcattgagatatatt
gi|4 : ttttttcataaaattatttaattgccatagaaacatatacaagaacaaacacagcaactgggcaagacaatacacagcactcgctcattcctatctattcagtattcattgatatctatcatgataattttgtaaaacaaaacagatatagcaaatcatacaagtataatatcgtaaagatttcattatgctttattagacccagatcaggaaatacgtgtattgtatgaaaattcctcggagatgacctcaggaatatgcattttcagatacatttcagtaaaagaaatggtatatgattggacttgtgtatctcgataacgttcacattgtgagacatgcaagattttatattatacagatctaagctaggtaaaaacagatcttcccatgtgtgccatcgtttttaaattcaccttcccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattgtacatagtaatttaaaatataaatgtaaaacccaataaattgatgttaagcaatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTTATAACTAATTAGTAATTTGATATAACAAATTACT-AA-TCTGTT-----------T-GTAAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---ATAT--GTTTTA-TTGCC-ACA-GAAACATGTGTA----TACA-A-GACAAACACAGCAATAAGATGA--------A------CTGAGCAGG-ACA-ACACA-C----AA--ATTCG---AT-------------------------ATCTAC-TC---TGATGATTTATAAAATA-GAAC-AGACATA----GCAAATCATCT---------GAAA----------GATAT---T--AC----A------T-TA--T-A--CTTT---ATTTGACCCAGATCAAG--AATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTGCTCTATA-TATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATATATATTTC-ATTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-TGTCTATGTCTTTATC------TTGATAA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGA--TT------TTAGATTACAGATGTAAGCTAGGTAAT-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TT-TT-A-----AATTCA-TCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GTTGTACTTTTCGCAATT-G----T-AGTA--ATTT-AAAATA-------T-AAGACCAAAG-AAAC-T--GA---TAAGCAATTTGTCT-CAGTGATTTTGCA-TACA
gi|5 : tgGCCATCGT--TT-TT--TAA---ATTCA-CCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-GG---T-AGCA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACTCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAA-TTGTTTCT--TGATTTTGCATTACACAGTG-GTAAA
gi|5 : ---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAGATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAG-TTC------------CAA---Aaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatatgtgtaatgtttcatcaagatgacaattaaattcaacatggaagagttccaaattaatccaattgttcagctctgtccactaagctctctttgaatcacaaaagatataatttattg
gi|5 : gccatcgttttttaaattcaccttccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattggtagcaatttaaaatataaatgtaaaactcaataaattgatgttaagcaattgtttcttgattttgcattacacagtggtaaaaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACTAA-GCTCTCTTTGAA---TCACAAAAGATATAA-----TTTATTG-ttaatccaattgttcagctctgtccactaagctctctttgaatcacaaaagatataatttattg
gi|6 : gccatcgttttttaaattcaccttccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattggtagcaatttaaaatataaatgtaaaactcaataaattgatgttaagcaattgtttcttgattttgcattacacagtggtaaaaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatatgtgtaatgtttcatcaagatgacaattaaattcaacatggaagagttccaaaATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAGATTACT-AA-T----------------TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATG---AAATATATTTTA-TTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AA-ACAAACA---CAACAATAAGATAAAATTAA------CTTGACAGG-ACA-ACACA-C----AGC-ACT---------------------------------TTTAT-CA---TGATGATTTAG-AAATA-------GATACA----GCAAGTCATATAAATATATCATAG----------GATAT-G-T--ACCA---------T-----T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG--AATA--TGT-ATA-TTGAATGAAAATTCTCCTG------A-GATGACCTCAAGAATAT-GCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ACGGT----TG-------------GTGT----ATC------TAGATAA-A--GTTCACATTGTGAATGCGAGACATGC-
gi|7 : TAA----------GACAT-G-TTCATTAAGA------T-AAATT-ATGGTTT---ATAAGACC-AGGTAGGA-AAATT--CAT-AGA-TT-TATGAAA-TTCTCCTG------A--ATG---TCAGGC---T-GC---TTCATGA-ATAG--TGC-ATTG----------TGCGAT-ATCATCATACAT---TGTGT----TTCAACTGGTCGTTACTA--TTTAATACTAT------CAGATTTTT-AGA--CT------TTA---TAT-GATCTAAGC-ACGTAAACGA-CGGGTTCTTTCCAA-TGTGTTC--TCGT--T--------A-TAAGTCATCCTCTGCT-CCTTTTC-T-AAGTAA----TGTACTTTTCG-TATTGG----T-TGTA--ATTT-AAAAGATAACATTT-AAA--CGAAA-AAATCT--GATATT
gi|8 : tataaattatgatagtatG-T-TTCATCAAAATGACAATTGGATT-CAA--CATGGATGAGTTTCTTTGGTGGATTCCAA---ACAAAATCTGAGATGGTGTAATAAAGAAA--TCATGATG-TA---------TAAT---G-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACAAA-CCTCTCATTGAA---TTACAAAAGA-AC-AAAAACATTATTGAAATGAAATGGACTTCATTTTGATAATTTG-TTATAACAAA-TTGATAATCTGTT-ATATCAAAT-TGATAATCTGTTgtttca
gi|8 : TTGATAATTTGT-T--AT-AA---CAAA-TT----GATAATC---------T-GT-TAT--ATCAAATTGATAATCT--GT-TG-TA-AC-AAATCAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TTATACGCATCCGTgtaacaaatcaataaaaggtactgctgcggcccttatacgcatccgt
gi|9 : gtttcatcaaaatgacaattggattcaacatggatgagtttctttggtggattccaaacaaaatctgagatggtgtaataaagaaatcatgatgtataatgttgttcagctctgtccacaaacctctcattgaattacaaaagaacaaaaacattattgaaatgaaatggacttcattATA--ATTT-GT---TA-TAACAAGTTGGC-ATCTGTTA--TAGCAATTCATTAATCTGT-TATAT-AA---CAAA-TTGT--GATCAT----------TTGT-TAT--AACGAATTATTATTTT--GT-CA-TA-AC-AAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-AAGCCC-CCATGCGCTTCCGT
Alignments
lowQualScore : 1 888888888888888888 11 111 11 111 222222222 1111 77777777777777777777777777777 2222 1 8888888888888888888888888 111 11111111 1111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 11 111111111 1 11111 1111 111111 1111 111111 3333333333 1111 1 1 11 5555555555 1111 2222 22222 1 1 1 1 111 11 1 1 11 444444444444 111 11 1 1 111 22222 11 7777777777777777777 1 1 1 22 1 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 11 1 4444444 11 111111 1111 555555555555555555 22 111 2222222 4444444444 222222222222222222
lowQualScore : 3 000000000000000000 7 33 444 11 222 6 6 666666666 2222 11111111111111111111111111111 6 6 6 0000 3 444 5555555555555555555555555 8 444 9 3 88888888 7777 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111 88 99 6 6 7 7 999999999 1 6 3 6 66 99 6 99 6 3 3 33333 4444 999999 7 7777 999999 77 9999999999 4444 0 0 0 8 6 3 55 0 4 77 0000000000 5 2222 5 5 5 77 6 0000 6 99 6 6 6 6 6 99 0 0 33333 8 5 5 3 7 3 777 33 0 0 8 8 8 11 0 0 0 111111111111 444 2 1 33 0 2 0 8 8 8 8 0 444 0 8 00000 22 7777777777777777777 7 0 3 0 0 3 0 33 3 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 88 88 1 5 1 1 1111111 33 999999 4444 333333333333333333 44 8 33 8 444 9999999 2222222222 0 6 99 3 99 6 6 6 6 999999999999999999 3 3 3
lowQualScore : . .................. . .. ... .. ... . . ......... .... ............................. . . . .... . ... ......................... . ... . . ........ .... ....................................................... ... .. .. . . . . ......... . . . . .. .. . .. . . . ..... .... ...... . .... ...... .. .......... .... . . . . . . .. . . .. .......... . .... . . . .. . .... . .. . . . . . .. . . ..... . . . . . . ... .. . . . . . .. . . . ............ ... . . .. . . . . . . . . ... . . ..... .. ................... . . . . . . . .. . . .............................................................................................. . .. .. . . . . ....... .. ...... .... .................. .. . .. . ... ....... .......... . . .. . .. . . . . .................. . . .
lowQualScore : 3 333333333333333333 3 88 000 66 222 7 7 000000000 5555 88888888888888888888888888888 7 7 7 8888 3 000 0000000000000000000000000 0 000 0 5 22222222 0000 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 777 77 22 7 7 3 2 333333333 7 7 2 7 33 22 7 22 7 3 5 33333 2222 222222 8 5555 222222 55 4444444444 8888 8 8 6 0 7 3 88 7 3 99 4444444444 7 1111 7 7 7 99 7 8888 7 22 7 7 7 7 7 22 8 8 66666 0 0 5 3 3 3 555 88 0 0 0 0 0 00 8 8 8 000000000000 000 5 0 88 0 5 0 0 0 0 0 8 000 8 0 00000 55 5555555555555555555 0 0 2 0 8 2 0 22 3 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 00 55 0 0 0 0 3333333 88 000000 2222 888888888888888888 88 0 88 0 000 6666666 0000000000 8 7 22 5 22 7 7 7 7 555555555555555555 6 6 6
consensus : NTTTATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACT-AA-TCTGTT-----------TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---AAATTTATTTTAATTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AAGACAAACA--GCAACAA-------------A------CTGGGCAGG-ACA-ACACA-C----AGC-ACTCGCTCATTCCT---------------------ATCTAT-CA---TGATGATTTAGTAAATACGAAA-AGATATA----GCAAATCATATA-------CGTAN----------GATAT-G-T--ACCAATA------T-CA--T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTG------A-GATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGATAA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGA--TT---ATATTA---TACAGATCTAAGCTAGGTAAA-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TT-TT-GTAA-TAATTCA-CCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-G----T-AGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATTTGTCT-T--TGATTTTGCA-TACACAGTGTGTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGC-TCTAAATGGGCC-AATG---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCNATAAAGAAA--TCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACTAA-GCTCTCATTGAA---TCACAAAAGATAT-A-----TTTATTG-AATA-------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTAGTAATCTGTT-ATA-CAAAT-TNATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTTTATTACAATTGATAATCTGTTATTAATTAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATNAATAGAATTATCNGTAATTCTNGTTATTANT--CAA--TGATATA--ATTT-GT---TA-TA-CA-GTTAGC-ATNTGT-A--TANCAAATTGATAATCTGT-T-TAT-AA---CAAA-TTTG--GATAATC---------TTGT-TAT--AACAAATTGATAATTT--GT-TA-TA-AC-AAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTA
Reference ( family-1122 ) : NTTTATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACT-AA-TCTGTT-----------TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---AAATTTATTTTAATTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AAGACAAACA--GCAACAA-------------A------CTGGGCAGG-ACA-ACACA-C----AGC-ACTCGCTCATTCCT---------------------ATCTAT-CA---TGATGATTTAGTAAATACGAAA-AGATATA----GCAAATCATATA-------CGTAN----------GATAT-G-T--ACCAATA------T-CA--T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTG------A-GATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGATAA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGA--TT---ATATTA---TACAGATCTAAGCTAGGTAAA-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TT-TT-GTAA-TAATTCA-CCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-G----T-AGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATTTGTCT-T--TGATTTTGCA-TACACAGTGTGTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGC-TCTAAATGGGCC-AATG---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCNATAAAGAAA--TCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACTAA-GCTCTCATTGAA---TCACAAAAGATAT-A-----TTTATTG-AATA-------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTAGTAATCTGTT-ATA-CAAAT-TNATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTTTATTACAATTGATAATCTGTTATTAATTAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATNAATAGAATTATCNGTAATTCTNGTTATTANT--CAA--TGATATA--ATTT-GT---TA-TA-CA-GTTAGC-ATNTGT-A--TANCAAATTGATAATCTGT-T-TAT-AA---CAAA-TTTG--GATAATC---------TTGT-TAT--AACAAATTGATAATTT--GT-TA-TA-AC-AAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTA
gi|1 : TTTATAAAAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACTCAACTTTATTCACATAATAAATTGTTAAAAACAATTAGACTTTTTTCATA---AAATTTATTTTAATTGCCCATATGAAACAT----AC---TACATCAGACAAACA--GCATCAG-------------A------CCGGGCAAG-ACGCACACAGC----AGC-ACTCGCTCATTTCTTA-------------------ATCTATTCAGTTTCATGTTTTGGTAAATACCAAA-AGATATACGGAACAAAGTATATC-------CGTAA----------GATAT-GCT--ACCAATAGCATA-TACA--T-ATGCCTTTTAATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGA-AAAGTTGTATGAAA-TTCCTC-G------A-GATGGACTCAGGAATAT-G-----TCA-----TAT--TTCTAGTAACAAAGAACATGTTATCATATTTGGAC-T---TGTGT----ATC------TTGATAA-AA-GTTCACATTGT------GAGACATGT--GA--T----ACATT----TACAAATCTTAAC--AGTAAA-AC-GAGAT-CTTCCAG--T---TGC-AT-GT--TT-TTCGTAAATAATTCA-CCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTAC-TTTCGCTATT-G----TAAGTATTATTT-AAAATATAA-ATGTAAAAACCCAAT-AAAT-TCGGATGTTAA-CAATCTGTCT-T--TGAATTTGCA-TACACA-TGTGTAAA
gi|1 : cGGGCGTCTAT-TGGGCT-AATG---AT--GATGTA-ATG-TGTTCAT--AAATGACAATTAAATT-CAAGCTATGGAAGAGTTTC------------CAACACACAAAATCAGG--TGATTCGCTAAAGAAA--TCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAA-TTGTT-CATCTCTGT-CCACTAAAGCTCTCATTGAACTATCACAAAAGATAC-A-----TCTGTTG-CATA-------------------AACTTGATTATAACAAACTTAGTAATCTGTTTATAACAAATGTAATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTTTATTACAATTGATAATCTGTTATTAATTAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATAAATAGAAT--TCGATAATTCTCGTTATTAATCACAA--TGATATACGATCT-ATACGTA--A-CA-TCTAGTAATTTGT-A--TAACAAATTAGTAATTTGTCT-TATCAA---CAAACTTTG--GATAATC---------TTGT-TATAAAACAAATTGATAATTT--GTATACTA-AC-AAATTAATAAAAGGTCTGGAGATGCGGCGACCCGCT-GGTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggcgtctattgggctaatgatgatgtaatgtgttcataaatgacaattaaattcaagctatggaagagtttccaacacacaaaatcaggtgattcgctaaagaaatcatgatgtacattttcttaatccaattgttcatctctgtccactaaagctctcattgaactatcacaaaagatacatctgttgcataaacttgattataacaaacttagtaatctgtttataacaaatgtaataatctgtttatacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgataatttttattacaattgataatctgttattaattaaattgtgataaaaaccaaatagaattgtttataaatagaattcgataattctcgttattaatcacaatgatatacgatctatacgtaacatctagtaatttgtataacaaattagtaatttgtcttatcaacaaactttggataatcttgttataaaacaaattgataatttgtatactaacaaattaataaaaggtctggagatgcggcgacccgctggtgcggccctaatacgcttccgtaca
gi|10 : ctttataaaagattactaatttgttataacaaattactcaactttattcacataataaattgttaaaaacaattagacttttttcataaaatttattttaattgcccatatgaaacatactacatcagacaaacagcatcagaccgggcaagacgcacacagcagcactcgctcatttcttaatctattcagtttcatgttttggtaaataccaaaagatatacggaacaaagtatatccgtaagatatgctaccaatagcatatacatatgccttttaattagacccagatcagggaatacgaaaagttgtatgaaattcctcgagatggactcaggaatatgtcatatttctagtaacaaagaacatgttatcatatttggacttgtgtatcttgataaaagttcacattgtgagacatgtgatacatttacaaatcttaacagtaaaacgagatcttccagttgcatgtttttcgtaaataattcaccttccgtttctagaaaagctgtactttcgctattgtaagtattatttaaaatataaatgtaaaaacccaataaattcggatgttaacaatctgtctttgaatttgcatacacatgtgtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGTTATTATT--CAAATTGATATA--ATTTTGT---TA-TA-CA-G--------------------AAATTGATAATCTGT-T-AAT-AAATTCAAA--GTG--AATAAT----------TTGTATAT--ATCAA--TGATAATTCTGGT-TA-TACAC-AAATTAATAAAAGG-----------------------------------TAATACGCTTCCGTAca
gi|11 : tC-ATA--AAACAT----AAAATTACA-A-GACAAACAA-GCAATAA-------------AGACACACTGGACAGGGACA-ACACA-CTATTATCTATTCACTGATACATGT-------------------ATCTAT-CA---TGGTGATTT-GTAAA
gi|12 : tatttAATTA--CTTTTTTCATATTAAAATTTATTT-AATTGCA-ATA-GAAACAT----A----TACA-AAGACAAACA---CAGC-A-------------A------CTGGGCAAG-ACA-ACACA-CA---AGCAACTCACTCATTCCT---------------------ATCTatagga
gi|13 : -CAGAT-CTTCCCATCTGTGTGCCATTGTGCTTGTT-GTAAGTA--TGA-C------T-TCGTTTCAT-AGAAAAAGACTGTATTTCTCGCTA
gi|14 : atT-TAT--AACAAATAGATAATTT--GT-TA-TA-AC-AAATTAATAAAACGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCAT
gi|15 : -------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTCATAATCTGTT-AT--CAAAT-TCATAATCTGT
gi|16 : agtAAAAGGC------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCATA
gi|17 : AAAAGGT------------------ACTAGCTGGCGGCCC-TAATACGCTTCCGTAga
gi|18 : AAAAGT------------------ACT-GGTG-CGGCCCTTATTACGCTTCCGTA
gi|19 : CT-GGTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTA
gi|2 : GTAAA-ACAAAA-AGATATA----GCAAATCATACA-------AGTATATATATCATAGATAT-G-T--ATCAATAGGATTAC-CA--TTATGCCTT---ATTAGACCCAGATCAAGCGAATATACGTTGTA-TTGTATGAAAATTCCTCGG------AAGATGACCTCAGGAATATTGCATTTTCA-GAT-TAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTACCATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------T-GATGA-AACGTTCACATTGT------GAAACATAC-AGA--TTTTAATCTTA---TACAGATCTA-GCTAGGTAAA-AAACAGATTCTTCCCA--TGTGT-CCACCGT--TT-T----AA--AATTCA-CCT----T-CCGTTTC-TTAGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTA-T-G----T-AGTA--ATTTAAAAATATAA-ATGT-AAAACCCAATAAAAT-T--GATGTTTAGC-ATTTGTC--T--TGATTTTGCA-TACAgaagcta
gi|2 : GC-TCTAAATGGGCCTACTGCATAT--G-TGTAGATGGT-TCCATCAAAATGACAATTAAATTTCAA--C-TGGAAGAGTT-C------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCTATAAAGAGAAGTCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAAATTGTTGCAGCTCTGTTCCACTAA-GCTCTCATTGAA---TCACAAAAGATAT-A-----TTGATT--AATA-------------------CA-TTG-TTATAAC--A-TTAGTAA---GAT-ATA-CAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctctaaatgggcctactgcatatgtgtagatggttccatcaaaatgacaattaaatttcaactggaagagttccaaacaaaatcagagatggtgctataaagagaagtcatgatgtacattttcttaatccaaattgttgcagctctgttccactaagctctcattgaatcacaaaagatatattgattaatacattgttataacattagtaagatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactaaattgataatctgttatatcaattataatgttaatcaattactatttgttataacaaatcaatattgttataacaaaattgataatctgtttat
gi|2 : gtaaaacaaaaagatatagcaaatcatacaagtatatatatcatagatatgtatcaataggattaccattatgccttattagacccagatcaagcgaatatacgttgtattgtatgaaaattcctcggaagatgacctcaggaatattgcattttcagattatttcagtaaaagaaatggtaccatgattggacttgtgtatctgatgaaacgttcacattgtgaaacatacagattttaatcttatacagatctagctaggtaaaaaacagattcttcccatgtgtccaccgttttaaaattcaccttccgtttcttagaaaagctgtacttttcgctatgtagtaatttaaaaatataaatgtaaaacccaataaaattgatgtttagcatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTATCAATA--ATTATCTGTAATT-TGGTTATCACT---------ATAGA--ATTT-GA---TAATA-CA-ATTAAC--TAAGT-AGTTACTAAATTGATAATCTGT-T--AT-AT---CAAT-TATAATGTTAATCAATTACTATTTGT-TAT--AACAAATCAATA--TT--GT-TA-TA-ACAAAATTGATAAtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactaaattgataatctgttatatcaattataatgttaatcaattactatttgttataacaaatcaatattgttataacaaaattgataatctgtttat
gi|20 : gtaaaacaaaaagatatagcaaatcatacaagtatatatatcatagatatgtatcaataggattaccattatgccttattagacccagatcaagcgaatatacgttgtattgtatgaaaattcctcggaagatgacctcaggaatattgcattttcagattatttcagtaaaagaaatggtaccatgattggacttgtgtatctgatgaaacgttcacattgtgaaacatacagattttaatcttatacagatctagctaggtaaaaaacagattcttcccatgtgtccaccgttttaaaattcaccttccgtttcttagaaaagctgtacttttcgctatgtagtaatttaaaaatataaatgtaaaacccaataaaattgatgtttagcatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctctaaatgggcctactgcatatgtgtagatggttccatcaaaatgacaattaaatttcaactggaagagttccaaacaaaatcagagatggtgctataaagagaagtcatgatgtacattttcttaatccaaattgttgcagctctgttccactaagctctcattgaatcacaaaagatatattgattaatacattgttataacattagtaagatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgtAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTAtctgtttat
gi|21 : AGGC------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATATGCTTTCATA
gi|3 : TTTTTTCATA---AAATT-ATTT-AATTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AGAACAAACA---CAGCAA--------------------CTGGGCAAG-ACA-ATACA-C----AGC-ACTCGCTCATTCCTATCTATTCAGTATTCATTGATATCTAT-CA---TGATAATTTTGTAAA-ACAAAACAGATATA----GCAAATCATACA-------AGTAT----------AATATCG-T--AAAGATT------T-CA--TTATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-AAATA--CGT-GTA-TTGTATGAAAATTCCTCGG------A-GATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATACAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGATAA-C--GTTCACATTGT------GAGACATGCAAGATTTT---ATATTA---TACAGATCTAAGCTAGGTAAA-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TT-TT-A-----AATTCA-CCT----TCCCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-GTACAT-AGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATTTGTC--T--TGATTTTGCA-TACA
gi|3 : GGGC-TCTAAATGGGCC-TATG---ATATG-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAC---AAAAAATCAGAGATGGTGCTATAAAGAAA--TCATGATGTTACATTTTCCTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTTTGT-CCACTAA-GCTCTCATTG------------AGATAT-A-----TTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggggctctaaatgggcctatgatatgtgtaatgtttcatcaaaatgacaattaaattcaacatggaagagtttccacaaaaaatcagagatggtgctataaagaaatcatgatgttacattttccttaatccaattgttcagctttgtccactaagctctcattgagatatatt
gi|4 : ttttttcataaaattatttaattgccatagaaacatatacaagaacaaacacagcaactgggcaagacaatacacagcactcgctcattcctatctattcagtattcattgatatctatcatgataattttgtaaaacaaaacagatatagcaaatcatacaagtataatatcgtaaagatttcattatgctttattagacccagatcaggaaatacgtgtattgtatgaaaattcctcggagatgacctcaggaatatgcattttcagatacatttcagtaaaagaaatggtatatgattggacttgtgtatctcgataacgttcacattgtgagacatgcaagattttatattatacagatctaagctaggtaaaaacagatcttcccatgtgtgccatcgtttttaaattcaccttcccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattgtacatagtaatttaaaatataaatgtaaaacccaataaattgatgttaagcaatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTTATAACTAATTAGTAATTTGATATAACAAATTACT-AA-TCTGTT-----------T-GTAAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---ATAT--GTTTTA-TTGCC-ACA-GAAACATGTGTA----TACA-A-GACAAACACAGCAATAAGATGA--------A------CTGAGCAGG-ACA-ACACA-C----AA--ATTCG---AT-------------------------ATCTAC-TC---TGATGATTTATAAAATA-GAAC-AGACATA----GCAAATCATCT---------GAAA----------GATAT---T--AC----A------T-TA--T-A--CTTT---ATTTGACCCAGATCAAG--AATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTGCTCTATA-TATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATATATATTTC-ATTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-TGTCTATGTCTTTATC------TTGATAA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGA--TT------TTAGATTACAGATGTAAGCTAGGTAAT-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TT-TT-A-----AATTCA-TCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GTTGTACTTTTCGCAATT-G----T-AGTA--ATTT-AAAATA-------T-AAGACCAAAG-AAAC-T--GA---TAAGCAATTTGTCT-CAGTGATTTTGCA-TACA
gi|5 : tgGCCATCGT--TT-TT--TAA---ATTCA-CCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-GG---T-AGCA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACTCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAA-TTGTTTCT--TGATTTTGCATTACACAGTG-GTAAA
gi|5 : ---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAGATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAG-TTC------------CAA---Aaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatatgtgtaatgtttcatcaagatgacaattaaattcaacatggaagagttccaaattaatccaattgttcagctctgtccactaagctctctttgaatcacaaaagatataatttattg
gi|5 : gccatcgttttttaaattcaccttccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattggtagcaatttaaaatataaatgtaaaactcaataaattgatgttaagcaattgtttcttgattttgcattacacagtggtaaaaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACTAA-GCTCTCTTTGAA---TCACAAAAGATATAA-----TTTATTG-ttaatccaattgttcagctctgtccactaagctctctttgaatcacaaaagatataatttattg
gi|6 : gccatcgttttttaaattcaccttccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattggtagcaatttaaaatataaatgtaaaactcaataaattgatgttaagcaattgtttcttgattttgcattacacagtggtaaaaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatatgtgtaatgtttcatcaagatgacaattaaattcaacatggaagagttccaaaATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAGATTACT-AA-T----------------TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATG---AAATATATTTTA-TTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AA-ACAAACA---CAACAATAAGATAAAATTAA------CTTGACAGG-ACA-ACACA-C----AGC-ACT---------------------------------TTTAT-CA---TGATGATTTAG-AAATA-------GATACA----GCAAGTCATATAAATATATCATAG----------GATAT-G-T--ACCA---------T-----T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG--AATA--TGT-ATA-TTGAATGAAAATTCTCCTG------A-GATGACCTCAAGAATAT-GCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ACGGT----TG-------------GTGT----ATC------TAGATAA-A--GTTCACATTGTGAATGCGAGACATGC-
gi|7 : TAA----------GACAT-G-TTCATTAAGA------T-AAATT-ATGGTTT---ATAAGACC-AGGTAGGA-AAATT--CAT-AGA-TT-TATGAAA-TTCTCCTG------A--ATG---TCAGGC---T-GC---TTCATGA-ATAG--TGC-ATTG----------TGCGAT-ATCATCATACAT---TGTGT----TTCAACTGGTCGTTACTA--TTTAATACTAT------CAGATTTTT-AGA--CT------TTA---TAT-GATCTAAGC-ACGTAAACGA-CGGGTTCTTTCCAA-TGTGTTC--TCGT--T--------A-TAAGTCATCCTCTGCT-CCTTTTC-T-AAGTAA----TGTACTTTTCG-TATTGG----T-TGTA--ATTT-AAAAGATAACATTT-AAA--CGAAA-AAATCT--GATATT
gi|8 : tataaattatgatagtatG-T-TTCATCAAAATGACAATTGGATT-CAA--CATGGATGAGTTTCTTTGGTGGATTCCAA---ACAAAATCTGAGATGGTGTAATAAAGAAA--TCATGATG-TA---------TAAT---G-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACAAA-CCTCTCATTGAA---TTACAAAAGA-AC-AAAAACATTATTGAAATGAAATGGACTTCATTTTGATAATTTG-TTATAACAAA-TTGATAATCTGTT-ATATCAAAT-TGATAATCTGTTgtttca
gi|8 : TTGATAATTTGT-T--AT-AA---CAAA-TT----GATAATC---------T-GT-TAT--ATCAAATTGATAATCT--GT-TG-TA-AC-AAATCAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TTATACGCATCCGTgtaacaaatcaataaaaggtactgctgcggcccttatacgcatccgt
gi|9 : gtttcatcaaaatgacaattggattcaacatggatgagtttctttggtggattccaaacaaaatctgagatggtgtaataaagaaatcatgatgtataatgttgttcagctctgtccacaaacctctcattgaattacaaaagaacaaaaacattattgaaatgaaatggacttcattATA--ATTT-GT---TA-TAACAAGTTGGC-ATCTGTTA--TAGCAATTCATTAATCTGT-TATAT-AA---CAAA-TTGT--GATCAT----------TTGT-TAT--AACGAATTATTATTTT--GT-CA-TA-AC-AAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-AAGCCC-CCATGCGCTTCCGT
blockSeqs : . TCTGTT T . TTA TT AA . . AAAAT AAG CAACAATAAGATAAAATTAA G . . TATT T CTG TCCTATCTATTCAGTATTCATTGAT . . T T ACAAAAC . AAGTATATATATCATAGATATGTATCAATAGGATTACCATT . CG TA T . A G CTCTATAT A T A T TA AT . . . C A TGTC CTTT AACTGG C AAC GAATGC AA TTTTAATC AGAT T C A T TC C GC GTTGTAAGT T CTGC C A T AG G TACA . . A C . A C . TCAG T G . . A T CAT AT . G G . T . TTTGGTGGATTC . G T AG T C C A G T . . A AAAAC GA AAATGGACTTCATTTTGAT T . A . T . AT . C C . TA T . G T CAAAT . TGT ATA AGTTGGCATCTGTTA CT . AT . ATT TATAAT CAATTACTAT A . A TG . . C A . A G T
blockSeqs : . T . . . AT AA . . GTGTA AGA AGCAATAAAGACACA . . . A A CTC ACATGT . . A T ACAAAA . AAGTATAATATCGTAAAGATTTCATT . A . . . A G AAG A . A . TA . . . . . A AT . . T TA . A TTTTATA A T . . T A C . TTTAA . . . . . . . G . . . . . . . . TCT . . A . . . . . . . . . . . G T . . C . . . . . . . . G . T . A . T . A . G C . . GA TAA ATTAACTAAGTAGT GC . A . . TTGT C . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T TA . . A AG CAGCAATAAGATGAA . . . . . CTC TCCT . . A T TAGAAC . AAATATATCATAGGATATGTACCATT . A . . . A T AG A . A . TA . . . . . A T . . A C . A TT A T . . . . C . TAA . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT TA G . . . . . GTG . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . TA . . A AG CAGCAA . . . . . . . . . . A TA . GAAAGATATTACATTAT . . . . . A T AG A . A . T . . . . . A T . . C A . A CT A . . . . . C . TTA . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A AA CAGCAA . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . A . . . . . . . . . . A . . . . C . TTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . AT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : NA* A******** AG** CAGCAATAAGACAA*************** CT*********************** *** TAGAA*** **** *** G* TA ** A*** A* TT******** A*** TTA******* ** ** T**** ** *** *** A* TTGT*** C********* ** ******************
originalCons : NTTTATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACT-AA-TCTGTT-----------TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---AAATTTATTTTAATTGCC-ATA-GAAACAT----A----TACA-AAGACAAACA--GCAACAA-------------A------CTGGGCAGG-ACA-ACACA-C----AGC-ACTCGCTCATTCCT---------------------ATCTAT-CA---TGATGATTTAGTAAATACGAAA-AGATATA----GCAAATCATATA-------CGTAN----------GATAT-G-T--ACCAATA------T-CA--T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTG------A-GATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGATAA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGA--TT---ATATTA---TACAGATCTAAGCTAGGTAAA-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TT-TT-GTAA-TAATTCA-CCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-G----T-AGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATTTGTCT-T--TGATTTTGCA-TACACAGTGTGTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGC-TCTAAATGGGCC-AATG---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCNATAAAGAAA--TCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACTAA-GCTCTCATTGAA---TCACAAAAGATAT-A-----TTTATTG-AATA-------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTAGTAATCTGTT-ATA-CAAAT-TNATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTTTATTACAATTGATAATCTGTTATTAATTAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATNAATAGAATTATCNGTAATTCTNGTTATTANT--CAA--TGATATA--ATTT-GT---TA-TA-CA-GTTAGC-ATNTGT-A--TANCAAATTGATAATCTGT-T-TAT-AA---CAAA-TTTG--GATAATC---------TTGT-TAT--AACAAATTGATAATTT--GT-TA-TA-AC-AAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTA
finalCons : NTTTATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACT-AA-TCTGTT-----------TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---AAATTTATTTNA-TTGCC-ATA-GAAACATA--------TACAAG--ACAAACACAGCAATAAGACAA---------------CTGGGCAGG-ACA-ACACA-C----AGC-ACTCGCTCATCT-----------------------ATCTAT-CA---TGATGATTTAGTAAATAGAA---AGATATA----GCAAATCATATA-------CGTAN----------GATAT-G-T--ACCAATA------T-CA--T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGGG-AATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTG------A-GATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGATAAA---GTTCACATTGT------GAGACATGCA-GATT--------TTA---TACAGATCTAAGCTAGGTAAA-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT--TTTTA-------AATTCA-CCT----T-CCGTTTC-T-AGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-G----T-AGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATTTGTCT----TGATTTTGCA-TACACAGTGTGTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGC-TCTAAATGGGCC-AATG---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCNATAAAGAAA--TCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACTAA-GCTCTCATTGAA---TCACAAAAGATAT-A-----TTTATTG-AATA-------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTAGTAATCTGTT-ATA-CAAAT-TNATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTTTATTACAATTGATAATCTGTTATTAATTAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATNAATAGAATTATCNGTAATTCTNGTTATTANT--CAA--TGATATA--ATTT-GT---TA-TA-CA-GTTAGC-ATNTGT-A--TANCAAATTGATAATCTGT-TA-AT-AA---CAAATTGT---GATAATC---------TTGT-TAT--AACAAATTGATAATTT--GT-TA-TA-AC-AAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 888888888888888888 11 111 11 222222222 44444444444444444 2222 1 0000000000000000000000000000000000000000 111 1111 111111111 1111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 11 111111111 1 11111 1111 111111 1111 111111 222222222 3333333 1 1 11 11111 222222222 1111 1 111111 111 1 1 1 1 111 11 1 1 11 444444444444 111 11 1 1 111 22222 11 7777777777777777777 1 1 1 22 1 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 11 1 4444444 11 111111 1111 555555555555555555 11 22 111 22222222222 4444444444 222222222222222222
lowQualScore : 3 000000000000000000 7 33 444 11 1 8 6 6 666666666 6 99 6 6 77777777777777777 6 6 6 0000 3 0000000000000000000000000000000000000000 8 444 6666 999999999 7777 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111 3 00 99 6 6 7 7 999999999 1 6 3 6 66 99 6 99 6 3 3 33333 4444 999999 7 7777 999999 77 555555555 7777777 0 0 0 8 6 3 55 0 4 44444 111111111 5 5 2222 5 1 77 777777 6 99 6 6 6 6 6 99 0 8 8 444 8 5 5 3 7 3 777 33 0 0 8 8 8 11 0 0 0 111111111111 444 2 1 33 0 2 0 8 8 8 8 0 444 0 8 00000 22 7777777777777777777 7 0 3 0 0 3 0 33 3 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 88 88 1 5 1 1 1111111 33 999999 4444 333333333333333333 44 11 33 444 11111111111 2222222222 0 6 99 3 99 6 6 6 6 999999999999999999 3 3 3
lowQualScore : . .................. . .. ... .. . . . . ......... . .. . . ................. . . . .... . ........................................ . ... .... ......... .... ....................................................... ... . .. .. . . . . ......... . . . . .. .. . .. . . . ..... .... ...... . .... ...... .. ......... ....... . . . . . . .. . . ..... ......... . . .... . . .. ...... . .. . . . . . .. . . . ... . . . . . . ... .. . . . . . .. . . . ............ ... . . .. . . . . . . . . ... . . ..... .. ................... . . . . . . . .. . . .............................................................................................. . .. .. . . . . ....... .. ...... .... .................. .. .. .. ... ........... .......... . . .. . .. . . . . .................. . . .
lowQualScore : 3 333333333333333333 3 88 000 66 0 0 7 7 000000000 7 22 7 7 55555555555555555 7 7 7 8888 3 0000000000000000000000000000000000000000 0 000 7777 000000000 0000 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 777 7 33 22 7 7 3 2 333333333 7 7 2 7 33 22 7 22 7 3 5 33333 2222 222222 8 5555 222222 55 000000000 8888888 8 8 6 0 7 3 88 7 3 33333 999999999 7 7 1111 7 4 99 555555 7 22 7 7 7 7 7 22 8 0 0 000 0 0 5 3 3 3 555 88 0 0 0 0 0 00 8 8 8 000000000000 000 5 0 88 0 5 0 0 0 0 0 8 000 8 0 00000 55 5555555555555555555 0 0 2 0 8 2 0 22 3 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 00 55 0 0 0 0 3333333 88 000000 2222 888888888888888888 88 00 88 000 66666666666 0000000000 8 7 22 5 22 7 7 7 7 555555555555555555 6 6 6
consensus : NTTTATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACT-AA-TCTGTT-----------TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---AAATTTATTTTA-TTGCC-ATA-GAAACAT----A----TAC-A--AGA-CAAACACAGCAATAA-GA------C-A-ACTGGGCAGG-ACA-ACACA-C----AGC-ACTCGCT----CAT--T-----------------------T----ATCTAT-CA---TGATGATTTAGT-AAA-TA--AAA-AGATATA----GCAAATCATATA-------CGTAN----------GATAT-G-T--ACCAATA------T-CA--T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTG------A-GATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGATAA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGAT---T-----TTA------TACAGATCTAAGCTAGGTAAA-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT-----TTT-T-----A-AAT-TCA-CCT----T-CCGTTTC-TAGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-G----T-AGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATT-TGTC-T---TGATTTTGCA-TACACAGTGTGTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGC-TCTAAATGGGCC-AATG---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCNATAAAGAAA--TCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACTAA-GCTCTCATTGAA---TCACAAAAGATAT-A-----TTTATTG-AATA-------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTAGTAATCTGTT-ATA-CAAAT-TNATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTTTATTACAATTGATAATCTGTTATTAATTAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATNAATAGAATTATCNGTAATTCTNGTTATTANT--CAA--TGATATA--ATTT-GT---TA-TA-CA-GTTAGC-ATNTGT-A--TANCAAATTGATAATCTG--TTA-ATAA---CAA--A--TTGTG-ATAATC---------TTGT-TAT--AACAAATTGATAATTT--GT-TA-TA-AC-AAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTA
Reference ( family-1122 ) : NTTTATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACT-AA-TCTGTT-----------TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---AAATTTATTTNA-TTGCC-ATA-GAAACAT----A----TAC-A--AGA-CAAACACAGCAATAA-GA------C-A-ACTGGGCAGG-ACA-ACACA-C----AGC-ACTCGCT----CAT--C-----------------------T----ATCTAT-CA---TGATGATTTAGT-AAA-TA--GAA-AGATATA----GCAAATCATATA-------CGTAN----------GATAT-G-T--ACCAATA------T-CA--T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTG------A-GATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGATAA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGAT---T-----TTA------TACAGATCTAAGCTAGGTAAA-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT-----TTT-T-----A-AAT-TCA-CCT----T-CCGTTTC-TAGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-G----T-AGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATT-TGTC-T---TGATTTTGCA-TACACAGTGTGTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGC-TCTAAATGGGCC-AATG---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCNATAAAGAAA--TCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACTAA-GCTCTCATTGAA---TCACAAAAGATAT-A-----TTTATTG-AATA-------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTAGTAATCTGTT-ATA-CAAAT-TNATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTTTATTACAATTGATAATCTGTTATTAATTAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATNAATAGAATTATCNGTAATTCTNGTTATTANT--CAA--TGATATA--ATTT-GT---TA-TA-CA-GTTAGC-ATNTGT-A--TANCAAATTGATAATCTG--TTA-ATAA---CAA--A--TTGTG-ATAATC---------TTGT-TAT--AACAAATTGATAATTT--GT-TA-TA-AC-AAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTA
gi|1 : TTTATAAAAGATTACTAATTTGTTATAACAAATTACTCAACTTTATTCACATAATAAATTGTTAAAAACAATTAGACTTTTTTCATA---AAATTTATTTTAATTGCCCATATGAAACAT----AC---TAC-ATCAGA-CAAACA--GCA-TCA-GA------C-----CGGGCAAG-ACGCACACAGC----AGC-ACTCGCT----CAT--T-----------------------TCTTAATCTATTCAGTTTCATGTTTTGGT-AAA-TACCAAA-AGATATACGGAACAAAGTATATC-------CGTAA----------GATAT-GCT--ACCAATAGCATA-TACA--T-ATGCCTTTTAATTAGACCCAGATCAGG-GAATA--CGA-AAAGTTGTATGAAA-TTCCTC-G------A-GATGGACTCAGGAATAT-G-----TCA-----TAT--TTCTAGTAACAAAGAACATGTTATCATATTTGGAC-T---TGTGT----ATC------TTGATAA-AA-GTTCACATTGT------GAGACATGT--GATACAT-----TTA--------CAAATCTTAAC--AGTAAA-AC-GAGAT-CTTCCAG--T---TGC-AT-GT-----TTT-TCGTAAATAAT-TCA-CCT----T-CCGTTTC-TAGAAAA--GCTGTAC-TTTCGCTATT-G----TAAGTATTATTT-AAAATATAA-ATGTAAAAACCCAAT-AAAT-TCGGATGTTAA-CAATC-TGTCTT---TGAATTTGCA-TACACA-TGTGTAAA
gi|1 : cGGGCGTCTAT-TGGGCT-AATG---AT--GATGTA-ATG-TGTTCAT--AAATGACAATTAAATT-CAAGCTATGGAAGAGTTTC------------CAACACACAAAATCAGG--TGATTCGCTAAAGAAA--TCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAA-TTGTT-CATCTCTGT-CCACTAAAGCTCTCATTGAACTATCACAAAAGATAC-A-----TCTGTTG-CATA-------------------AACTTGATTATAACAAACTTAGTAATCTGTTTATAACAAATGTAATAATCTGTTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAATTTTTATTACAATTGATAATCTGTTATTAATTAAATTGTGATAAAAACCAAATAGAATTGTTTATAAATAGAAT--TCGATAATTCTCGTTATTAATCACAA--TGATATACGATCT-ATACGTA--A-CA-TCTAGTAATTTGT-A--TAACAAATTAGTAATTTGTCTTA-TCAA---CAA--ACTTTG-G-ATAATC---------TTGT-TATAAAACAAATTGATAATTT--GTATACTA-AC-AAATTAATAAAAGGTCTGGAGATGCGGCGACCCGCT-GGTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgggcgtctattgggctaatgatgatgtaatgtgttcataaatgacaattaaattcaagctatggaagagtttccaacacacaaaatcaggtgattcgctaaagaaatcatgatgtacattttcttaatccaattgttcatctctgtccactaaagctctcattgaactatcacaaaagatacatctgttgcataaacttgattataacaaacttagtaatctgtttataacaaatgtaataatctgtttatacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgataatttttattacaattgataatctgttattaattaaattgtgataaaaaccaaatagaattgtttataaatagaattcgataattctcgttattaatcacaatgatatacgatctatacgtaacatctagtaatttgtataacaaattagtaatttgtcttatcaacaaactttggataatcttgttataaaacaaattgataatttgtatactaacaaattaataaaaggtctggagatgcggcgacccgctggtgcggccctaatacgcttccgtaca
gi|10 : ctttataaaagattactaatttgttataacaaattactcaactttattcacataataaattgttaaaaacaattagacttttttcataaaatttattttaattgcccatatgaaacatactacatcagacaaacagcatcagaccgggcaagacgcacacagcagcactcgctcatttcttaatctattcagtttcatgttttggtaaataccaaaagatatacggaacaaagtatatccgtaagatatgctaccaatagcatatacatatgccttttaattagacccagatcagggaatacgaaaagttgtatgaaattcctcgagatggactcaggaatatgtcatatttctagtaacaaagaacatgttatcatatttggacttgtgtatcttgataaaagttcacattgtgagacatgtgatacatttacaaatcttaacagtaaaacgagatcttccagttgcatgtttttcgtaaataattcaccttccgtttctagaaaagctgtactttcgctattgtaagtattatttaaaatataaatgtaaaaacccaataaattcggatgttaacaatctgtctttgaatttgcatacacatgtgtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGTTATTATT--CAAATTGATATA--ATTTTGT---TA-TA-CA-G--------------------AAATTGATAATCTG--TTA-ATAAATTCAA--A----GTGAATAAT----------TTGTATAT--ATCAA--TGATAATTCTGGT-TA-TACAC-AAATTAATAAAAGG-----------------------------------TAATACGCTTCCGTAca
gi|11 : tC-ATA--AAACAT----AAAATTAC-A--AGA-CAAACA-AGCAATAAAGA------C-ACACTGGACAGGGACA-ACACA-CTATTATCTATTCACTGATACAT--G-----------------------T----ATCTAT-CA---TGGTGATTT-GTAAAA-TA--GGA-
gi|12 : tatttAATTA--CTTTTTTCATATTAAAATTTATTTAA-TTGCA-ATA-GAAACAT----A----TACAA--AGA-CAAACACAG---------------C-A-ACTGGGCAAG-ACA-ACACA-CA---AGCAACTCACT----CATTCC-----------------------T----ATCT
gi|13 : -CAGAT-CTTCCCATCTGTGTGCCATTGTGCTTGTTG-T-----A-AGTATGA-C------T-TCGTTTCATAGAAAAAGACTGTATTTCTCGCTA
gi|14 : atT-TAT--AACAAATAGATAATTT--GT-TA-TA-AC-AAATTAATAAAACGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCAT
gi|15 : -------------------AATTTG-TTATAACAAA-TTCATAATCTGTT-AT--CAAAT-TCATAATCTGT
gi|16 : agtAAAAGGC------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCATA
gi|17 : AAAAGGT------------------ACTAGCTGGCGGCCC-TAATACGCTTCCGTAga
gi|18 : AAAAGT------------------ACT-GGTG-CGGCCCTTATTACGCTTCCGTA
gi|19 : CT-GGTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTA
gi|2 : -AAA-CA--AAA-AGATATA----GCAAATCATACA-------AGTATATATATCATAGATAT-G-T--ATCAATAGGATTAC-CA--TTATGCCTT---ATTAGACCCAGATCAAGCGAATATACGTTGTA-TTGTATGAAAATTCCTCGG------AAGATGACCTCAGGAATATTGCATTTTCA-GAT-TAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTACCATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------T-GATGA-AACGTTCACATTGT------GAAACATAC-AGAT---T-----TTAATCTTATACAGATCTA-GCTAGGTAAA-AAACAGATTCTTCCCA--TGTGT-CCACCGT-----TTT-A-----A-AAT-TCA-CCT----T-CCGTTTCTTAGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTA-T-G----T-AGTA--ATTTAAAAATATAA-ATGT-AAAACCCAATAAAAT-T--GATGTTTAGC-ATT-TGTC-T---TGATTTTGCA-TACAgaagcta
gi|2 : gtaGC-TCTAAATGGGCCTACTGCATAT--G-TGTAGATGGT-TCCATCAAAATGACAATTAAATTTCAA--C-TGGAAGAGTT-C------------CAA---ACAAAATCAGAGATGGTGCTATAAAGAGAAGTCATGATG-TACATTTT-CTTAATCCAAATTGTTGCAGCTCTGTTCCACTAA-GCTCTCATTGAA---TCACAAAAGATAT-A-----TTGATT--AATA-------------------CA-TTG-TTATAAC--A-TTAGTAA---GAT-ATA-CAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctctaaatgggcctactgcatatgtgtagatggttccatcaaaatgacaattaaatttcaactggaagagttccaaacaaaatcagagatggtgctataaagagaagtcatgatgtacattttcttaatccaaattgttgcagctctgttccactaagctctcattgaatcacaaaagatatattgattaatacattgttataacattagtaagatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactaaattgataatctgttatatcaattataatgttaatcaattactatttgttataacaaatcaatattgttataacaaaattgataatctgtttat
gi|2 : gtaaaacaaaaagatatagcaaatcatacaagtatatatatcatagatatgtatcaataggattaccattatgccttattagacccagatcaagcgaatatacgttgtattgtatgaaaattcctcggaagatgacctcaggaatattgcattttcagattatttcagtaaaagaaatggtaccatgattggacttgtgtatctgatgaaacgttcacattgtgaaacatacagattttaatcttatacagatctagctaggtaaaaaacagattcttcccatgtgtccaccgttttaaaattcaccttccgtttcttagaaaagctgtacttttcgctatgtagtaatttaaaaatataaatgtaaaacccaataaaattgatgtttagcatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTATCAATA--ATTATCTGTAATT-TGGTTATCACT---------ATAGA--ATTT-GA---TAATA-CA-ATTAAC--TAAGT-AGTTACTAAATTGATAATCTG--TTA--TAT---CAATTA--TAATG-TTAATCAATTACTATTTGT-TAT--AACAAATCAATA--TT--GT-TA-TA-ACAAAATTGATAAtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgttttatcaataattatctgtaatttggttatcactatagaatttgataatacaattaactaagtagttactaaattgataatctgttatatcaattataatgttaatcaattactatttgttataacaaatcaatattgttataacaaaattgataatctgtttat
gi|20 : gtaaaacaaaaagatatagcaaatcatacaagtatatatatcatagatatgtatcaataggattaccattatgccttattagacccagatcaagcgaatatacgttgtattgtatgaaaattcctcggaagatgacctcaggaatattgcattttcagattatttcagtaaaagaaatggtaccatgattggacttgtgtatctgatgaaacgttcacattgtgaaacatacagattttaatcttatacagatctagctaggtaaaaaacagattcttcccatgtgtccaccgttttaaaattcaccttccgtttcttagaaaagctgtacttttcgctatgtagtaatttaaaaatataaatgtaaaacccaataaaattgatgtttagcatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctctaaatgggcctactgcatatgtgtagatggttccatcaaaatgacaattaaatttcaactggaagagttccaaacaaaatcagagatggtgctataaagagaagtcatgatgtacattttcttaatccaaattgttgcagctctgttccactaagctctcattgaatcacaaaagatatattgattaatacattgttataacattagtaagatatacatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagataatctgtAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATACGCTTCCGTAtctgtttat
gi|21 : AGGC------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TAATATGCTTTCATA
gi|3 : TTTTTTCATA---AAATT-ATTTAA-TTGCC-ATA-GAAACAT----A----TAC-A--AGAACAAACACAGCAA-----------------CTGGGCAAG-ACA-ATACA-C----AGC-ACTCGCT----CAT--TCCTATCTATTCAGTATTCATTGAT----ATCTAT-CA---TGATAATTTTGT-AAAACA--AAACAGATATA----GCAAATCATACA-------AGTAT----------AATATCG-T--AAAGATT------T-CA--TTATGCTTT---ATTAGACCCAGATCAGG-AAATA--CGT-GTA-TTGTATGAAAATTCCTCGG------A-GATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATACAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-T---TGTGT----ATC------TCGATAA-C--GTTCACATTGT------GAGACATGCAAGAT---TTTATATTA------TACAGATCTAAGCTAGGTAAA-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT-----TTT-T-----A-AAT-TCA-CCT----TCCCGTTTC-TAGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATT-GTACAT-AGTA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACCCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATT-TGTC-T---TGATTTTGCA-TACA
gi|3 : GGGC-TCTAAATGGGCC-TATG---ATATG-TGTA-ATG-T-TTCATCAAAATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAGTTTC------------CAC---AAAAAATCAGAGATGGTGCTATAAAGAAA--TCATGATGTTACATTTTCCTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTTTGT-CCACTAA-GCTCTCATTG------------AGATAT-A-----TTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggggctctaaatgggcctatgatatgtgtaatgtttcatcaaaatgacaattaaattcaacatggaagagtttccacaaaaaatcagagatggtgctataaagaaatcatgatgttacattttccttaatccaattgttcagctttgtccactaagctctcattgagatatatt
gi|4 : ttttttcataaaattatttaattgccatagaaacatatacaagaacaaacacagcaactgggcaagacaatacacagcactcgctcattcctatctattcagtattcattgatatctatcatgataattttgtaaaacaaaacagatatagcaaatcatacaagtataatatcgtaaagatttcattatgctttattagacccagatcaggaaatacgtgtattgtatgaaaattcctcggagatgacctcaggaatatgcattttcagatacatttcagtaaaagaaatggtatatgattggacttgtgtatctcgataacgttcacattgtgagacatgcaagattttatattatacagatctaagctaggtaaaaacagatcttcccatgtgtgccatcgtttttaaattcaccttcccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattgtacatagtaatttaaaatataaatgtaaaacccaataaattgatgttaagcaatttgtcttgattttgcatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTTATAACTAATTAGTAATTTGATATAACAAATTACT-AA-TCTGTT-----------T-GTAAAAACAAATTA--CTTTTTTCATA---ATAT--GTTTTA-TTGCC-ACA-GAAACATGTGTA----TAC-A--AGA-CAAACACAGCAATAA-GA------TGA-ACTGAGCAGG-ACA-ACACA-C----AA--ATTCG-------AT-------------------------------ATCTAC-TC---TGATGATTTATA-AAA-TA--GAACAGACATA----GCAAATCATCT---------GAAA----------GATAT---T--AC----A------T-TA--T-A--CTTT---ATTTGACCCAGATCAAG--AATA--CGT-ATA-TTGTATGAAAATTCCTCTGCTCTATA-TATGACCTCAGGAATAT-GCATTTTCA-GATATATATTTC-ATTAA--AAGAA-ATGGTAT-ATGATTGGAC-TGTCTATGTCTTTATC------TTGATAA-A--GTTCACATTGT------GAGACATGC-AGAT---T-----TTAGAT---TACAGATGTAAGCTAGGTAAT-AA-CAGAT-CTTCCCA--TGTGTGCCATCGT-----TTT-T-----A-AAT-TCA-TCT----T-CCGTTTC-TAGAAAA--GTTGTACTTTTCGCAATT-G----T-AGTA--ATTT-AAAATA-------T-AAGACCAAAG-AAAC-T--GA---TAAGCAATT-TGTC-TCAGTGATTTTGCA-TACA
gi|5 : tgGCCATCGT-----TTTTT-----A-AAT-TCA-CCT----T-CCGTTTC-TAGAAAA--GCTGTACTTTTCGCTATTGG----T-AGCA--ATTT-AAAATATAA-ATGT-AAAACTCAAT-AAAT-T--GATGTTAAGCAATTGTTTC-T---TGATTTTGCATTACACAGTG-GTAAA
gi|5 : ---AT--G-TGTA-ATG-T-TTCATCAAGATGACAATTAAATT-CAA--CATGGAAGAG-TTC------------CAA---Aaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatatgtgtaatgtttcatcaagatgacaattaaattcaacatggaagagttccaaattaatccaattgttcagctctgtccactaagctctctttgaatcacaaaagatataatttattg
gi|5 : gccatcgttttttaaattcaccttccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattggtagcaatttaaaatataaatgtaaaactcaataaattgatgttaagcaattgtttcttgattttgcattacacagtggtaaaaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatTTAATCCAA-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACTAA-GCTCTCTTTGAA---TCACAAAAGATATAA-----TTTATTG-ttaatccaattgttcagctctgtccactaagctctctttgaatcacaaaagatataatttattg
gi|6 : gccatcgttttttaaattcaccttccgtttctagaaaagctgtacttttcgctattggtagcaatttaaaatataaatgtaaaactcaataaattgatgttaagcaattgtttcttgattttgcattacacagtggtaaaaccagattgtcgagatcgagagagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatatgtgtaatgtttcatcaagatgacaattaaattcaacatggaagagttccaaaATAACAGATTACTAATTTGTTATAACAGATTACT-AA-T----------------TTGTTAAAACAAATTA--CTTTTTTCATG---AAATATATTTTA-TTGCC-ATA-GAAACAT----A----TAC-A--AAA-CAAACACAACAATAA-GATAAAATT-A-ACTTGACAGG-ACA-ACACA-C----AGC-ACT-------------------------------------------TTTAT-CA---TGATGATTTAG--AAA-T-------AGATACA----GCAAGTCATATAAATATATCATAG----------GATAT-G-T--ACC-AT-------------T-ATGCTTT---ATTAGACCCAGATCA-G-GAATA--TGT-ATA-TTGAATGAAAATTCTCCTG------A-GATGACCTCAAGAATAT-GCATTTTCA-GATATAT--TTC-AGTAA--AAGAA-ACGGT----TG-------------GTGT----ATC------TAGATAA-A--GTTCACATTGTGAATGCGAGACATGC-
gi|7 : TAA----------GACAT-G-TTCATTAAGA------T-AAATT-ATGGTTT---ATAAGACC-AGGTAGGA-AAATT--CAT-AGA-TT-TATGAAA-TTCTCCTG------A--ATG---TCAGGC---T-GC---TTCATGA-ATAG--TGC-ATTG----------TGCGAT-ATCATCATACAT---TGTGT----TTCAACTGGTCGTTACTA--TTTAATACTAT------CAGATTTTT-AGAC---T-----TTA------TAT-GATCTAAGC-ACGTAAACGA-CGGGTTCTTTCCAA-TGTGTTC--TCGT-----TAT---------AAG-TCATCCTCTGCT-CCTTTTC-TAAGTAA----TGTACTTTTCG-TATTGG----T-TGTA--ATTT-AAAAGATAACATTT-AAA--CGAAA-AAATCT--GATATT
gi|8 : tataaattatgatagtatG-T-TTCATCAAAATGACAATTGGATT-CAA--CATGGATGAGTTTCTTTGGTGGATTCCAA---ACAAAATCTGAGATGGTGTAATAAAGAAA--TCATGATG-TA---------TAAT---G-TTGTT-CAGCTCTGT-CCACAAA-CCTCTCATTGAA---TTACAAAAGA-AC-AAAAACATTATTGAAATGAAATGGACTTCATTTTGATAATTTG-TTATAACAAA-TTGATAATCTGTT-ATATCAAAT-TGATAATCTGTTgtttca
gi|8 : TTGATAATTTG--TTA--TAA---CAA--A--TTG---ATAATC---------T-GT-TAT--ATCAAATTGATAATCT--GT-TG-TA-AC-AAATCAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-CGGCCC-TTATACGCATCCGTgtaacaaatcaataaaaggtactgctgcggcccttatacgcatccgt
gi|9 : gtttcatcaaaatgacaattggattcaacatggatgagtttctttggtggattccaaacaaaatctgagatggtgtaataaagaaatcatgatgtataatgttgttcagctctgtccacaaacctctcattgaattacaaaagaacaaaaacattattgaaatgaaatggacttcattATA--ATTT-GT---TA-TAACAAGTTGGC-ATCTGTTA--TAGCAATTCATTAATCTG--TTATATAA---CAA--A--TTGTG-ATCAT----------TTGT-TAT--AACGAATTATTATTTT--GT-CA-TA-AC-AAATTAATAAAAGGT------------------ACT-GCTG-AAGCCC-CCATGCGCTTCCGT