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Unaligned ( gi|20 ): TTATTACAAATCAGCGCCACTTGGGCATCTCACATGAAAATATTTGAAGTTATTATACATGCCCACAAG
Alignments
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lowQualScore : .. . . .. .... . . .. . .. . . . . ...... .... .. . . . ..... .. ... . .... . . . .
lowQualScore : 11 1 1 11 9999 4 4 00 4 00 4 4 4 4 111111 1111 00 5 5 5 77777 22 777 6 4444 8 6 6 2
consensus : TAGTAGTAT--TT-A-T--T--T-AC-C-AAAT--C-A--G-GGC-CC-A-AAT------GGGC----A--TAA-A-CATGT-A-----AC--A---TATA-T----AATC-G-TT-AATAC-AATACA
Reference ( family-1091 ) : TAGTAGTAT--TT-A-T--T--T-AC-C-AAAT--C-A--G-GGC-CC-A-AAT------GGGC----A--TAA-A-CATGT-A-----AC--A---TATA-T----AATC-G-TT-AATAC-AATACA
gi|1 : C-C-AAAC--C-A--G-GGC-CCAA-AAT------AGGC----A--TCA-A-CATGA-AACTGTAC--A---TATA-T----GATT-A-TT-GATAC-
gi|10 : ataaaatagatctataggatattaaagTAGTAGTAT--TTTA-T--TGGT-ACTC-AAAT--C-A--G-G---CC-A-AAT------GG-C----A--TGA-A-CATGT-G-----AC--A---TATA------AATC-G-TT-AATAC-AAT
gi|11 : gAATAGTAT--TTTA-T--T--TTAA-C-AAAT--C-A--G-GGC-CC-A-AAT------GG------A--TAA-A-CATGT-A-----AC--A---TATA-T----AATC-G-TT-AATAC-AAg
gi|12 : TAGTATCTTT-A-T--T--T-AA-CGAAAT--C-A--G-GGC-CC-A-AAT------GG-C----A--TAA-A-CATGT-A-----AC--A---TAT--T----AATCAG-TT-AATAC-AATAata
gi|13 : aAT--TT-A-T--T--T-AC-A-AAAT--C-A--G-GAC-CC-A-AAT------GGGC----A--TAA-C-AATG--------AC------CATA-T----AATT-A-TT-GATAC-AA
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Unaligned ( gi|20 ): TTATTACAAATCAGCGCCACTTGGGCATCTCACATGAAAATATTTGAAGTTATTATACATGCCCACAAG