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Reference ( family-1049 ) : CATAGGCGGAT-TTA----G------A----GGG------G--------G----G-------GG---C----G---GC-------CC---CC-----------T-----T-TT-C----GTGA--CCAAAATT-A-C-A-T---TA--TG-T-ATAG-AA-GT-------AT-A---G--CTAAATAAA--CC--C-CT--A-AAA-GTA----A-CTTNAA--AA-GCCCTC--AA-AC--CCAA-GAGCTT-CCG-GCGGCTTC-----------GCCGGCCCTGGCC---CCCACTGT--GGG---CTTC-A-TCCTA-G-ACCTCGACTT-GCCAGCGACTTGTG-AG----CAGGCCTCACT---TTTTCAAAGNA-----CC--CC---CCCCCCTTTC--GAC-AAAT---CCT-GGA-T--CCGC-CACTG---GA----T-----TATA-CGAATAAATTGA
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Reference ( family-1049 ) : CATAGGCGGAT-TTA----G------A----GGG------G--------G----G-------GG---C----G---GC-------CC---CC-----------T-----T-TT-C----GTGA--CCAAA--ATT---A---ATTA--TG-T-ATAG-AA-GT-------ATA---G--CTAAATAAA--CC--C-CT--A-AAA-GTA----A-CTTNAA--AA-GCCCTC--AA--AC--C--C--G--AGCT-C--CGG--CGGCTT--------------CGCC----CC-TGGCC---CCCACTGT--NGG---CTTC-A-TCCTA-G-ACCTCGACTT-GCCAGCGACTTGTG-AG----CAGGCCTCACT---TTTTCAAAG-----CACC--CC---CCCCCCTTTC--GAC-AAAT---CCT-GGA-T--CCGC-CACTGNA----T-----TATA-CGAATAAATTGA
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