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Reference ( gi|21 )           :                               GTGACGTCA-TC-CA-T--T----G-TG-TTTA----G----CCA--------TTG---AA--TA--G-TT-CGA-C-T-A-T-T-C----A--A---T--C--T-A-TT---A---C--------GT--T--G--AATA-G--A-T--AA-CTA--TTC---A---------A-----C-----TGC----T-A-----T----T-G--------AACTA-T---T-C--AA------CTG-TT--G-G--C-T---A-AA---AG-CAT--G-C-AAA-TAA-G--A-GC-AAACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TT-AG-TT-TCAT-TTAGA
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gi|32                         :                       ataattcaGTGACGTCA-TC-CA-T--T----G-TG-TTTA----A----TCT--------TTG---AA--TA--G-TT-CGA-C-T-A-T-T-C----A--A---CG-C--T-A-TT---A---a
gi|32                         :                         atttcaGTGACGTCA-TC-CA-T--T----G-TG------------------------------------------------------T-T-T----A--A---T--C--T----------------------T--T--G--AATA-G--T-TC-GA-CTA--TTC---A---------A-----C------GC----T-A-----T----T-
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gi|6                          :                          tattcaTGACGTCA-TC-CA-T--T----C-TG-TTTA----G----TCA--------TTG---AA--TA--G-TT-CGA-C-T-A-T-T-C----A--A---T--A--T---TT---A---CATGTAGCAGT--T--G--AATA-G--T-C--AA-CTA--TTC---A---------A-----C-----TGC----T-AT----T----T-GT-------AAATA-T---T-C--AA------CTG-TT--T-G--CTT---T-AA---GG-CTTTGG-C-AAA-TAA-GTTA-GA-AAACTA-CAAA-T---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TT-G---T-TCAT-TT
gi|10                         :                         attaccaTGACGTCA-TC-CA-TATT----G-TG-TTTA----A----TCA--------ATG---AA--TA--G-TT-TGA-C-T-A-T-A-T----A--A---------T-A-TTTAGA---A--------GT--T--G--AACA-A--T-C--AA-CTA--TTC---AATGTC----A-----T-----TAC----T-ATTCCTT----T-T--------AATTA-T---T-C--AA------CAG-TT--G-G--T-T---T-AA---AG-TTT--G-C-AAA-TAA----A-GA-AAACTA-CAGCTT---GC--A-C-G-T--A----CA---T--TG-AG-TT-ACAT-Ttg
gi|15                         :                            ttcaaGATGTCA-TCGCAAT--T----G--G-TGTA----G----TCA--------TTG---A---TA----TT-TGA-C---A-T-T-C----A--A---C--C--TTA-AT---A---CC-------GTG-T--G--AATAAG--A-T--CA-CTA--TTG---A---------AGA---C-----T-C----T-AGT---T----T-GT-------AACTA-TGTTT-G--AA------CTG-TT--G-G--C-T---T-AA---AG-CATGAG-C-AAA-TAAGG--A-GA-AGACA---AGATT---GCG-A-C-G-G--T----AA---T--TT-AG-TT-T-AT-TT
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gi|22                         :                                   CGTTA-TC-T--T--T----G-CC-TTTACACAG----CTA--------GTG---AA--TA---------A-G-T-A-T-----------A---TA-C--T-A-TT---A---CT-------GT--T--G--AATA-G--A-T--AA-CTA--ATC---A---------A-----C-----TGCGGT-T-A-----T----T----------AACTA-T---T-C--AG------CTG-TT--G-G--T-T---T-AA---AG-CTT--G-T-AAA-TAA-G--A-GA-AAACTA-CAGATT---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TGAAG-TT-TTAG-TTTGA
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gi|7                          :                           tttcagttgGTTA-TC-TA-T--TCAACG--G-TTTA----G----CGT--------TTG---AA--TA--G-TC-GAA-C-T-A-T-T-C----A--A---T--
gi|11                         :               ttcagtgacgtcatccattgtggtttagtcA-T--T----A-TG-T------------CAA--------TTG---AAAGTA--G-TT-CGA-C-TGA-TGT-C----A--A---CG-C--T-A-AT---G---CC-------GT--TTTG--ATTA-G--A-T--AA-CTA--TTT---A---------AAC---C-----TGC----T-AC----T----T-GTA------AACTA-T---T-TCAAA------CTG-TT--G-G--C-T---T-AA---AG-CATT-G-C-AAAATAAAG--A-GA-AAACAA-CAAATT---GCAGA-C-G-T--AAATGAA---T--TC-AG-TT-Ttattaaactgctacttgtaactattaactgttttggcttacagcatgcaaatgagagaaaacaacaaattgcaacgtaaattttttagtttttatttt
gi|20                         :                                                        ttG-TTTA----G----C-G--------TTG---AA--TA--G-TC-GAA-C-T-A-T-T-C----A--A---T--tgaattttt
gi|1                          :                                 tcagtgacgtcatccattgtgtttagtcTTA----G----CAG--------TTG---AA--TA----TT-CAA-T-T-A-T-T-C----A--A---CG-T--T-A-TT---A---C--------TT--T--GTGAAGA-G--A-T--AA-CTT--TCC---A---------A-----C-----TGT----T-GAT---T----T-T--------AATTA-T---T-C--AA------CTG--T--G-GTTC-T-----AT---AG-CTT--G-A-AAA-TAA-G--A-GA-AAACTA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AT---T--TC-TG-TT-ACAT-TTTGAcgttgatagataactataactgctactgtaactattcaactgttggcttaagcatgcaatgagagaaaacaacaaattgcatcgtaaattattagtttattttg
gi|18                         : acaatcagtgacatcatccatgtacttatttcgttcctaaaaaagttatactattccatacTA----G----CAG--------TTG---A---TA--G-TT---ATC-T-A-T-T-C----A--A---C--G--T-A-AT---AG--C--------AT--T--G--AATA-G----TCGAA-CTA--TTC---A---------A-----T-----GGC----T-A-----a
gi|8                          :                                        agtgacgtcatccattggtgttTA----G----CAG--------TGA---AA--TA--G-TT---ATC-T-A-T-T-C----A--C---G--G--T-A-AT---AGC-C--------GT--T--G--AATA-G--T-C--AA-CTA--TTC---A---------A-----T-----GAC----T-A-----tatgtaactattcactgttggctaaaagcatgcaaataagagcaaacaacaaattgcacgtaaatttagtttcatttaga
gi|5                          :                                   tgtcaagtgacgtcatccatttgtgttTA----G----C-A--------GTG---AA--TA--G-CT-TAT-C-T-A-T-T-C----A--A---C--CGGTGA-TT---AG--C--------GT--T--G--AA-A-G----TCGAA-CTA--TTC---A---------A-----A-----TGcttgtacctatttcaactgttggccataatgcatgcaaataaggaaaacaacaaatgccacgtaaatattagtttcatttttg
gi|6                          :                              tttacagtgacgtcaatccattgtgtttagtcTA----G----CAG--------TTG---AA--TA--G-TT--GA-C-T-A-T-T-C----A--A------C--T-G-CT---A---C--------AT----------------G-T--AA-ATA--TTG---A---------A------------------T-AG----T----C-G--------AACTA-T---T-C--AA-----------T--G-A--C-T---A-AAC--AG-AAT--G-cttttgtaactattcaaactgtttggcttaaagcatgcaataagaggaaacaacaaattggcgcacgtaaaaagtttcatttta
gi|24                         :                                             attaccatgacgtcatcTA----G----TCA--------T-G---AA--TA--G-TTTCGA-C---G-T-T-C----A--ACGCT--T--T-A-AT---A---C--------CT--TT-G--AATA-G--A-T--AATCTA--TTTTATA---------A-----C-----TGC----T-A-----C----T-T--------AACTA-T---T-G--AAA-----CTG-TT--G-G--C-T---T-AA---AGCCAT--GCC-AAA-TAA-G--AGGA-AAACAA-CAAA-T---GC--A-C-GCT--A----AAT--T--TT-AG-TTGTCAT-TTTGAtttgtaaatattcaactgtttgctttaaggctttggcaaataagttagaaaactacaaatgcacgtaaatttgttcattttg
gi|19                         :                                                               A----G----ACA--------TTG---AA--TA--G-TT--GA-C-T-A-T-T-C----G--G------C--T-A-CTAA-A---T--------AT--T--G--AATA-GT-A-A--AA-CTA--TTC---A---------A-----a
gi|25                         :                               tttcagttgcgtcatccatattgtgtttatcaA----G----GCA--------TTA---AA--TA--G-TT--GA---T-A-T-T-C----A--A------C--T-G-CT---A---A--------GTACC--G--AATA-GTCA-A--AA-CTA--TTC---A---------G-----------TG-------A-----T----T-A--------AACttactgttgcttttagctattcaactgttggtttaaagtttgcaaactacagattgcacgtaaattcagttgcatt
gi|10                         :                                                        agtgacatcgtccaatgtCA--------TTG---AA--TA--G-TT--GA-T-T-G-T-T-C----A--ACT-T--C--T-A--A---A---T--------AT--T--A--TATA-GTCA----AA-CTA--TTC-------------A-----T-----TG-------A-----T----T-A--------AACttgctgttgaatggacacatgtatctataggctaagacatcatat
gi|17                         :                                                                                                              ttcaatgacgtcatccatattgt--T-A-TT---A---CTG------GT--T--G--AATA-T--A-T--AA-CTA--ATC---A---------A-----C-----TGCGT--T-A-----T----C-T--------AACTA-T---T-C--AG------CTG-TT--GAG--T-T---T-AA---AG-CTT--G-T-AAA-TAG-GA-A-GA-AAACTA-CAGATT---GC--A-CAG-TTAA----AA---T--TG-AG-TT-TTAtcattactattccttttaattattcaacagttggtttaaagtttgcaaataaagaaaactacagcttgcacgtacattgagttacatt
gi|1                          :                                                                                       gcatgttcgtttatcttgcctttacacaagctagtaatagtatagtact-A-TA---A---C--------GT--T--G--AATA-A--T-T--GA-ATA--TTC---A---------A-----C-----TGC----T-A-----g
gi|19                         :                                                                               acaatcagtgacatcatccatgtacttatttcgttcctaaaaaagttatactattccatact---A---C--------AT--T--G--AATA-G--T-T--GA-CTA--TTC---G---------G-----C-----TACTAAAT-A-----T----T-GAATAGTAAAACTA-T---T-C--AA------tactttgtgaagagataactttccaactgttgattttaattattcaactgtggttctatagcttgaaaataagagaaaactacaaattgcacgtaatttctgttacattttgaa
gi|29                         :                                                                                                                 tttcagttgcgtcatccatattgtgtttatca---C--------GT--T--G--A-TA-G--A-T--AA-CTA--TTC---ATA-------A-----C-----TGC----T-AC----T----T-G--------AACTA-T---T-C--AA------CTG-TT--G-G--C-CTA-A-AA---AG-CAT--G-CAAAA-TAA-G--A-GCAAAACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AA---------AG--T-TCAT-TTTGActttactgttgcttttagctattcaactgttggtttaaagtttgcaaactacagattgcacgtaaattcagttgcatt
gi|28                         :                                                                                                                                                 ---C--------GT--T--G--AATA-G--A-T--AA-GTA--ATC---A---------A-----C-----TGT----T-G-----T----T-TTC------AACTA-T---T-C--AA------CTG-TT--T-G--T-T---A-AA---AA-CAT--A-C-AAA-TAA-G--A-GA-AAACTA-CAAATT---AC--A-C-G-T--A----AA---T--AC-AG-TT-ACAa
gi|27                         :                                                                                                                                              tac---C--------GT--G--G--AATAAG--A-T--A--CTA--TTG---A---------AGA---C-----TGC----T-A-----T----TTGT-------AACTA-T---T-C--AA------CTG-TT--G-G--C-T---T-AA---AG-CATG-G-C-AAA-TAA-G--A-G--AAACAA-GAAATT---GCG-A-C-G-T-------AA---T--TT-AG-TT-GTAT-TTTGAccttga
gi|23                         :                                                                                                                                                     --------GT--T--G--TATA-G--T-T--AT-CTA--TTC---A---------A-----C-----TGCTAAAT-A-----T----T-G--------AAa
gi|30                         :                                                                                                                               ataattcagtgacgtcatccatcgtattaagatta--G--AATA-G--A-T--AA-CCA--TTC---A---------A-----C-----CCC----TTA-----C----TCGT-------AACTA-T---T-C--AG------ATG-TT--C-G--C-T---T-AA---AG-CTT--G-T-AAA-TAA-G--T-GA-AAACTA-CAAATG---GC--T-A-G-T--A----AA---T--TC-AA-TT-TTAT-TTtgttgcttctaactaatcaactgtttgtttaaagtttgcaagtaagagaaaactacgattgcatgtaatttcagttacatgttaa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                               --------AACTA-T---T-C--AA------CTG-TT--T-T--C-T---T-AA---AG-CAT--G-C-AAA-TAA-G--A-GA-AAACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TT-AG-TT-TCAT-TTTGAtaaa

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lowQualScore                  :                                                                      6  1  5 6666666 1  1   4 3333 444  77777 6  3 2222222  11  88 2  3     7  3 7 9999  4 8 4 55 55 9 0 2 55555555  2 99 77  4  4 2 2   5   77   000 222222222 33 22222   88 7 7777777777777777 0  3   7 333 3 88  888888     33 4  4 8 99  99 99 8 44444  66 8 8   4   8 33 8 00      4      444  00 4 4 8 99 9999  666 33  4  1  8  99       
consensus                     :                                                             GTGACGTCA-TC-CA-T--T----G-TG-TTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT-CGACT-AT-T-C----AA-C-G-C--T--ANT-A-C--------GT-T--G--AA-TA-G-A-TAA-CTA--TTC---A---------A--C-----TGC--T-A----T-T--G------T-AA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--G-GC-T-T--AA--A--G-C-----AT--G-C-AAA-TAA-G--A-G-AAAACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TT-AG-TT-TC--ATTTTGA
Reference ( family-1014 )     :                                                             GTGACGTCA-TC-CA-T--T----G-TG-TTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT-CGACT-AT-T-C----AA-C-G-C--T--ANT-A-C--------GT-T--G--AA-TA-G-A-TAA-CTA--TTC---A---------A--C-----TGC--T-A----T-T--G------T-AA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--G-GC-T-T--AA--A--G-C-----AT--G-C-AAA-TAA-G--A-G-AAAACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TT-AG-TT-TC--ATTTTGA
gi|1                          :                                                                                                        C-----G-TT-G-------AA--TA--A-TT--GAAT-AT-T-C----AA-CTG-C--TA-AGT-A-T--------G-----G--AA-TA-GTA-TAA-CTT--TT
gi|1                          :                                                   acaatcagtgacatcatccatgtacttatttcgttcctaaTT-A----G---CA-----G-TT-G-------AA--TA----TT-CAATT-AT-T-C----AA-C-G-T--T--ATT-A-C--------TT-T--GTGAA-GA-G-A-TAA-CTT--TCC---A---------A--C-----TGT--TGA----T-T--T------T-AA-TTA-T---T-C--AA------CTG-T--G-GT-TCT--AT--A--G-C-----TT--G-A-AAA-TAA-G--A-G-AAAACTA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AT---T--TC-TG-TT-AC--ATTTTGAttattactttgtgaagagataactttccaactgttgattttaattattcaactgtggttctatagcttgaaaataagagaaaactacaaattgcacgtaatttctgttacattttgaa
gi|10                         : acaatcagtgacatcatccatgtacttatttcgttcctaaaaaagttatactattccatacTGACGTCA-TC-CA-TATT----G-TG-TTT-A----A---TC-----A-AT-G-------AA--TA--G-TT-TGACT-AT-A-T----AA-T-A-T--T--TAG-A-A--------GT-T--G--AA-CA-A-T-CAA-CTA--TTC---AATGTC----A--T-----TAC--T-ATTCCT-T--T------T-AA-TTA-T---T-C--AA------CAGTT--G-GT-T-T--AA--A--G-T-----TT--G-C-AAA-TAA----A-G-AAAACTA-CAGCTT---GC--A-C-G-T--A----CA---T--TG-AG-TT-AC--ATTa
gi|11                         :                                                                                      ttcaaTT-AT---G---TC-----AATT-G-------AAAGTA--G-TT-CGACTGATGT-C----AA-C-G-C--T--AAT-G-CC-------GT-TTTG--AT-TA-G-A-TAA-CTA--TTT---A---------AACC-----TGC--T-AC---T-T--G------T-AAACTA-T---T-TCAAA------CTGTT--G-GC-T-T--AA--A--G-C-----ATT-G-C-AAAATAAAG--A-G-AAAACAA-CAAATT---GCAGA-C-G-T--AAATGAA---T--TC-AG-TT-TTGAATTTT
gi|12                         :                                                          ttaGTGACGTCA-TC-CA-T--T----G-TG-TTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AAA-TA--GGTT-CGACT-AT-TTC----AA-C-G-C--T--AAT-A-CC-------GC-T--G--AA-TA-G-A-TAA-CTA--CCC---A---------A--C-----TAC--T-A----C-TATG------T-AA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--G-CT-T-T--AAGAA--G-C-----AT--G-C-AAA-TA--G--A-G-AAAACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TT-AG--T-TC--ATTTt
gi|13                         :                                                          tcaGTGA-GTCA-GCTCA-T--T----G-TG-TTT------G---TC-----AATT-G-------AA--TATAG-TT-CGACT--T-T-C----AG-T-G-C--T--ACTTA-CC-------GT-T--A--AA-TA-G-AGTA---TA--TTC---A---------A--C-----TGC--T-AC---T-T--G------T-AA-CTA-T---T-C--AA------TGGTT--G-GC-A-T--AA--A--G-C-----AT--G-C-AAA-AAA-G--A-G---AACAACCAAATT---GC--A-C-G-T-------AA---T--TT-AG-TT-TC--ATTTTGAga
gi|14                         :                                                        tttcaGTG-CGTCA-TC-CA-T-------G-TG-TTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT-CGACT-AT-T-C----AG-T-G-C--T--ATT-A-CC-------GT-T--G--AAATA-G-A-TAA-CTA--TTC---A---------A--C-----TGC--T-A----C-T--G------T-AA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--G-GC-A-T--AA--A--G-C-----AT--G-C-AAA-AAA-G--A-G---AACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TT-AGTTT-TC--ATTTTGAa
gi|15                         :                                                          tttcaGATGTCA-TCGCAAT--T----G--G-TGT-A----G---TC-----A-TT-G-------A---TA----TT-TGAC--AT-T-C----AA-C-C-T--T--AAT-A-CC-------GTGT--G--AA-TAAG-A-TCA-CTA--TTG---A---------AGAC-----T-C--T-AGT--T-T--G------T-AA-CTA-TGTTT-G--AA------CTGTT--G-GC-T-T--AA--A--G-C-----ATGAG-C-AAA-TAAGG--A-G-AAGACA---AGATT---GCG-A-C-G-G--T----AA---T--TT-AG-TT-T---ATTTTGa
gi|16                         :                                                             GTG-CGTCA-TC-CA-T-------G-TG-TTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT-CGACT-AT-T-C----AG-T-G-C--T--ATT-A-CC-------GT-T--G--AAATA-G-A-TAA-CTA--TTC---A---------A--C-----TGC--T-A----C-T--G------T-AA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--G-GC-A-T--AA--A--G-C-----AT--G-C-AAA-AAA-G--A-G---AACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TT-AGTTT-TC--ATTTTGA
gi|17                         :                                                                                                                                                            ttca--T--ATT-A-CTG------GT-T--G--AA-TA-T-A-TAA-CTA--ATC---A---------A--C-----TGCGTT-A----T-C---------T-AA-CTA-T---T-C--AG------CTGTT--GAGT-T-T--AA--A--G-C-----TT--G-T-AAA-TAG-GA-A-G-AAAACTA-CAGATT---GC--A-CAG-TTAA----AA---T--TG-AG-TT-TT--
gi|18                         :            gcatgttcgtttatcttgcctttacacaagctagtaatagtatagtactGTGACGTCA-TC-CA-T--T----GGTG-TTT-A----G---CC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT-CGACT-AT-T-C----AA-T-G-C--T--ATT-A-C--------GT-T--G--AA-TA-G-A-TAA-CTA--T-C---A---------A--C-----TGC--T-A----TAT--G------T-AA-CTA-T---T-C---A------CTGTT--G-GC-T-A--AA--A--G-C-----AT--G-C-AAA-TAA-G--A-G-CAAACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TT-AG-TT-TC--ATTTAGAg
gi|19                         :                                                                aCGTCA-TC-CA-TATT----G-TG-TTT-A--------TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT-TTACT-AT-T-C----AA-T-A-T--TT-AGT-A----------GC-C--G--AA-TA-G-T-CAA-CTA--TTC---A---------A--TGTCTTTAC--T-G----T-T--GCTTT--T-AG-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--G-GT-T-T--AA--A--G-T-----TT--G-C-----------------AAACTA-CAGATT---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TC-AG-TT-GC--ATT
gi|2                          :                                                    tttcagttgGTGAC-TCA-TC-CA-T--T----G-TGGTTT-A----GGTTTCCAAAAA-TT-GTTTGGGAAA--TA--GGTT-CGACT-AT-T-C----AA-C-G-C--T--AATGA-C--------GT-T--G--AA-TA-G-A-TAA-CTA--T-----A---------A--C------GC--T-A----T-TTTG------TGAA-CTAGT---T-G--AAGAGCTGCTGTT--G-GC-T-T--AA--AAAG-C-----AT--G-CCAAA-TAA-G--A-G-AAAAACA-CAAA-----GC--A-C-C-T--A----AA---T--TT-AG-TT-TT--ATTTT
gi|20                         :                                                             GTGACGTCA-TC-CA-T--T----G-TG-TTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT-CGACT-AT-T-C----AA-C-G-C--T--AAA-C-C--------GT-T--G---A-TA-G-A-TAA-CTA--T-----A---------A--C-----TGC--T-A----C-T--G------T-AA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--G-GC-T-T---A--A--G-C-----AT--G-C--AA-TGA-G--A-G-AAAACAA-CAAATT---GC--ATC-G-T--A----AA---TTATT-AG-TT-T---ATTTTGtga
gi|21                         :                                                          tcaGTGACGTCA-TC-CA-T--T----G-TG-TTT-A----G---CC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT-CGACT-AT-T-C----AA-T---C--T--ATT-A-C--------GT-T--G--AA-TA-G-A-TAA-CTA--TTC---A---------A--C-----TGC--T-A----T-T--G--------AA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--G-GC-T-A--AA--A--G-C-----AT--G-C-AAA-TAA-G--A-G-CAAACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TT-AG-TT-TC--ATTTAGA
gi|22                         :                                                                 CGTTA-TC-T--T--T----G-CC-TTT-ACACAG---CT-----A-GT-G-------AA--TA---------AGT-AT---------A-T-A-C--T--ATT-A-CT-------GT-T--G--AA-TA-G-A-TAA-CTA--ATC---A---------A--C-----TGC--G-G----T-T--A------TTAA-CTA-T---T-C--AG------CTGTT--G-GT-T-T--AA--A--G-C-----TT--G-T-AAA-TAA-G--A-G-AAAACTA-CAGATT---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TGAAG-TT-TT--AGTTTGA
gi|23                         :                                                            tGTGACGTCA-TC-CA-T--C----G-TA-TTA-A----G----------A-TT-A-----------------TT-CAA-T-AT-T-T----AG-C-A----------------------GT-T--G--AA-TA-G-A-TAA-CTA--TAC---A---------A--C-----TGT--T-GC---T-T--C------T-AA-CTA-A---T-C--AA------CTGTT--T-GT-T-T--AA--A--G-T-----TT--G-C-AAG-TAA-G--A-G-AAAACTA-C-GATT---GC--A-T-G-T--A----AT---T--TC-AG-TT-AC--ATGTTAAa
gi|24                         :                                                                                    ataattcaT-A----G---TC-----A-T--G-------AA--TA--G-TTTCGAC--GT-T-C----AA-C-G-C--TTTAAT-A-C--------CT-TT-G--AA-TA-G-A-TAATCTA--TTTTATA---------A--C-----TGC--T-A----C-T---------T-AA-CTA-T---T-G--AAA-----CTGTT--G-GC-T-T--AA--A--GCC-----AT--GCC-AAA-TAA-G--AGG-AAAACAA-CAAA-T---GC--A-C-GCT--A----AAT--T--TT-AG-TTGTC--ATTTTGA
gi|25                         :                                                             GTGACATCG-TC-CA-A--T----G-TG-TTT-A----A---TC-----A-CT-G-------AA--TA--GTTT-TGACT-AT-T-C----GG-T-A-CT-T--AGC-A----------GT-T--G--AA-TA-T---CAA-CTA--TTT---A---------A--------TGC--C-T----T-T--G------a
gi|25                         :                                                                       aC-TA-T--TCG--G-TA-CTT-A----G---CA-----G-TT-G-------AA--TA-----T-CAACT-AT-T-T----AA-T-G-C--C--TTT-G-CT-------GT-T--G--AA-TG-G-A-CActgttgaatggacacatgtatctataggctaagacatcatat
gi|26                         :                      agtgacatcgtccaatgtgtttaatcactgaatagttttgaGACGTTA-TC--A-T--TA---G-TG-TTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-CT-TGATT-AT-T-TTTAAAA-T-A-CT-T--AAC-A----------GT-T--G--AG-TA-G-T-CAA-CTA--TTC-------------A--T-----TGT--T-A----T-T------------A-CTG-T---T-G--AA------catgtatctataggctaagacatcatat
gi|26                         :                                                                                                         attaag-TT-G-------AG--TA--G-T--CAACT-AT-T-C----AT-T-G-T--T--ATT-A-CT-------GT-T--G--AA-TA-T-A-TAG-TTGCTTTC---A---------G--C-----Ttatatagttgctttcagct
gi|27                         :                                                                                                         attaaggacgttatcattagtgtttagtcattgaatagcttgattatttttaaaatacttaacag-C--------GT-G--G--AA-TAAG-A-TA--CTA--TTG---A---------AGAC-----TGC--T-A----T-TT-G------T-AA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--G-GC-T-T--AA--A--G-C-----ATG-G-C-AAA-TAA-G--A-G--AAACAA-GAAATT---GCG-A-C-G-T-------AA---T--TT-AG-TT-GT--ATTTTGA
gi|28                         :                                                                                                                                                                          -C--------GT-T--G--AA-TA-G-A-TAA-GTA--ATC---A---------A--C-----TGT--T-G----T-T--T------TCAA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--T-GT-T-A--AA--A--A-C-----AT--A-C-AAA-TAA-G--A-G-AAAACTA-CAAATT---AC--A-C-G-T--A----AA---T--AC-AG-TT-AC--ACCTTGAa
gi|29                         :                                                                                                                                                                       tac-C--------GT-T--G--A--TA-G-A-TAA-CTA--TTC---ATA-------A--C-----TGC--T-AC---T-T--G--------AA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--G-GC-C-TAAAA--A--G-C-----AT--G-CAAAA-TAA-G--A-GCAAAACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AA---------AG--T-TC--ATTTTGA
gi|3                          :                                                             GTGACGTCA-TC-CA-T--C----GGTG-TTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--GCTT-CGACG-GT-T-C----AA-C-G-CTTT--AAT-ACC--------TT-T--G--AA-TA-G-A-TAA-CTA--TT----A---------A--C-----TGC--T-A----C-T---------T-AA-CTA-T---TGA--AA------CTGTT--G-GC-T-T--AA--A--GCC-----AT--GCC-AAA-TAA-G--AGG-AAAACAA-CAAA-T---GC--A-C-GCT--A----AAT--T--TT-AG-TTGTC--ATTTTGAa
gi|30                         :                                                                                                                                                                                 atgttca--G--AA-TA-G-A-TAA-CCA--TTC---A---------A--C-----CCC--TTA----C-TC-G------T-AA-CTA-T---T-C--AG------ATGTT--C-GC-T-T--AA--A--G-C-----TT--G-T-AAA-TAA-G--T-G-AAAACTA-CAAATG---GC--T-A-G-T--A----AA---T--TC-AA-TT-TT--ATTTTAAa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                      -T--G------T-AA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--T-TC-T-T--AA--A--G-C-----AT--G-C-AAA-TAA-G--A-G-AAAACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TT-AG-TT-TC--ATTTTGAa
gi|32                         :                                                             GTGACGTCA-TC-CA-T--T----G-TG-TTT-A----A---TC-----T-TT-G-------AA--TA--G-TT-CGACT-AT-T-C----AA-C-G-C--T--ATT-A-a
gi|33                         :                                                       atttcaGTGATGTCA-TC-TA-T--TTCAAA-TG-ATT-T----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT-TGACT-AT-T-
gi|34                         :                                                         tattcaGACGTCA-TC-CA-T--T----G-TG-TTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-T
gi|4                          :                                                             GTGACGTCA-TC-CA-T--T----C-TG-TTA-C----G---TC-----A-TG-G-------AA--TA--G-TT-TGACT-AT-T-C----AA-T-ATT--T--AGC-A-C--------AT-------AG-TA------AA-CTA--TTC---AATGCTATATA--C-----TAC--T-G----T-T--GAATAGTT-AA-TTA-T---T-C--TA------CTGTT----GC-T-T--GT--A--A-CTTACTGT--T-C-ATC-TAA----A-G-CTTGCAA--AGATT---GC--A-T-G-T--A----AT---T--TC-AG-TT-TC--AATT
gi|5                          :                                                         aataGTGACGTCAATC-CA-T--T----G-TG-TTT-A----G---TCC----A-TTTG-------AA--TA--G-TT-CGACT--T-T-C----AA-C-G-C--T--AATCA-CCG------GT-T--G--AA-TA-G-A-TAAGCTA--TTC---A------------C-----TGC--T-ACTT-T-T--G------T-AA-CTA-T---T-C--AAA-----CTGTTT-G-GC-T-T--AA--A--G-C-----AT--G-C--AA-TAA-G--A-G-GAAACAA-CAAATTGGCGC--A-C-G-T--A----AA-------A-AG-TT-TC--ATTTTcaa
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gi|7                          :                                                      attaccaGTGACGTCA-TC-CA-T--T----G-TGGTTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT-CGACT-AT-T-C----AAAC-G-C--T--AAA-C-C--------GT-T--G--AA-TA-G-A-TAA-CTA--TTA---A---------A--C-----TGC--T-AC---T-T--G------T-AA-CTA-T---T----AA------CTGTTTTG-GC-T-T--AC--A--G-C-----AT--G-C-AAA-TGA-G--A-G-AAAACAA-CAAATT---GCA-A-C-G-T--A----AATTTT--TT-AGTTT-TT--ATTTT
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Reference ( family-1014 )     :                                                             GTGACGTCA-TC-CA-T--T----G-TG-TTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT-CGACT-AT-T-C----AA-C-G-C--T--ANT-A-C--------GT-T--G--AA-TA-G-A-TAA-CTA--TTC---A---------A--C-----TGC--T-A----T-T--G------T-AA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--G-GC-T-T--AA--A--G-C-----AT--G-C-AAA-TAA-G--A-G-AAAACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TT-AG-TT-TC--ATTTTGA
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gi|25                         :                                                             GTGACATCG-TC-CA-A--T----G-TG-TTT-A----A---TC-----A-CT-G-------AA--TA--GTTT-TGACT-AT-T-C----GG-T-A-CT-T--AGC-A----------GT-T--G--AA-TA-T---CAA-CTA--TTT---A---------A--------TGC--C-T----T-T--G------a
gi|25                         :                                                                       aC-TA-T--TCG--G-TA-CTT-A----G---CA-----G-TT-G-------AA--TA-----T-CAACT-AT-T-T----AA-T-G-C--C--TTT-G-CT-------GT-T--G--AA-TG-G-A-CActgttgaatggacacatgtatctataggctaagacatcatat
gi|26                         :                      agtgacatcgtccaatgtgtttaatcactgaatagttttgaGACGTTA-TC--A-T--TA---G-TG-TTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-CT-TGATT-AT-T-TTTAAAA-T-A-CT-T--AAC-A----------GT-T--G--AG-TA-G-T-CAA-CTA--TTC-------------A--T-----TGT--T-A----T-T------------A-CTG-T---T-G--AA------catgtatctataggctaagacatcatat
gi|26                         :                                                                                                         attaag-TT-G-------AG--TA--G-T--CAACT-AT-T-C----AT-T-G-T--T--ATT-A-CT-------GT-T--G--AA-TA-T-A-TAG-TTGCTTTC---A---------G--C-----Ttatatagttgctttcagct
gi|27                         :                                                                                                         attaaggacgttatcattagtgtttagtcattgaatagcttgattatttttaaaatacttaacag-C--------GT-G--G--AA-TAAG-A-TA--CTA--TTG---A---------AGAC-----TGC--T-A----T-TT-G------T-AA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--G-GC-T-T--AA--A--G-C-----ATG-G-C-AAA-TAA-G--A-G--AAACAA-GAAATT---GCG-A-C-G-T-------AA---T--TT-AG-TT-GT--ATTTTGA
gi|28                         :                                                                                                                                                                          -C--------GT-T--G--AA-TA-G-A-TAA-GTA--ATC---A---------A--C-----TGT--T-G----T-T--T------TCAA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--T-GT-T-A--AA--A--A-C-----AT--A-C-AAA-TAA-G--A-G-AAAACTA-CAAATT---AC--A-C-G-T--A----AA---T--AC-AG-TT-AC--ACCTTGAa
gi|29                         :                                                                                                                                                                       tac-C--------GT-T--G--A--TA-G-A-TAA-CTA--TTC---ATA-------A--C-----TGC--T-AC---T-T--G--------AA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--G-GC-C-TAAAA--A--G-C-----AT--G-CAAAA-TAA-G--A-GCAAAACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AA---------AG--T-TC--ATTTTGA
gi|3                          :                                                             GTGACGTCA-TC-CA-T--C----GGTG-TTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--GCTT-CGACG-GT-T-C----AA-C-G-CTTT--AAT-ACC--------TT-T--G--AA-TA-G-A-TAA-CTA--TT----A---------A--C-----TGC--T-A----C-T---------T-AA-CTA-T---TGA--AA------CTGTT--G-GC-T-T--AA--A--GCC-----AT--GCC-AAA-TAA-G--AGG-AAAACAA-CAAA-T---GC--A-C-GCT--A----AAT--T--TT-AG-TTGTC--ATTTTGAa
gi|30                         :                                                                                                                                                                                 atgttca--G--AA-TA-G-A-TAA-CCA--TTC---A---------A--C-----CCC--TTA----C-TC-G------T-AA-CTA-T---T-C--AG------ATGTT--C-GC-T-T--AA--A--G-C-----TT--G-T-AAA-TAA-G--T-G-AAAACTA-CAAATG---GC--T-A-G-T--A----AA---T--TC-AA-TT-TT--ATTTTAAa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                      -T--G------T-AA-CTA-T---T-C--AA------CTGTT--T-TC-T-T--AA--A--G-C-----AT--G-C-AAA-TAA-G--A-G-AAAACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TT-AG-TT-TC--ATTTTGAa
gi|32                         :                                                             GTGACGTCA-TC-CA-T--T----G-TG-TTT-A----A---TC-----T-TT-G-------AA--TA--G-TT-CGACT-AT-T-C----AA-C-G-C--T--ATT-A-a
gi|33                         :                                                       atttcaGTGATGTCA-TC-TA-T--TTCAAA-TG-ATT-T----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT-TGACT-AT-T-
gi|34                         :                                                         tattcaGACGTCA-TC-CA-T--T----G-TG-TTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-T
gi|4                          :                                                             GTGACGTCA-TC-CA-T--T----C-TG-TTA-C----G---TC-----A-TG-G-------AA--TA--G-TT-TGACT-AT-T-C----AA-T-ATT--T--AGC-A-C--------AT-------AG-TA------AA-CTA--TTC---AATGCTATATA--C-----TAC--T-G----T-T--GAATAGTT-AA-TTA-T---T-C--TA------CTGTT----GC-T-T--GT--A--A-CTTACTGT--T-C-ATC-TAA----A-G-CTTGCAA--AGATT---GC--A-T-G-T--A----AT---T--TC-AG-TT-TC--AATT
gi|5                          :                                                         aataGTGACGTCAATC-CA-T--T----G-TG-TTT-A----G---TCC----A-TTTG-------AA--TA--G-TT-CGACT--T-T-C----AA-C-G-C--T--AATCA-CCG------GT-T--G--AA-TA-G-A-TAAGCTA--TTC---A------------C-----TGC--T-ACTT-T-T--G------T-AA-CTA-T---T-C--AAA-----CTGTTT-G-GC-T-T--AA--A--G-C-----AT--G-C--AA-TAA-G--A-G-GAAACAA-CAAATTGGCGC--A-C-G-T--A----AA-------A-AG-TT-TC--ATTTTcaa
gi|6                          :                                                        tttacaTGACGTCA-TC-CA-T--T----C-TG-TTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT-CGACT-AT-T-C----AA-T-A-T--T----T-A-CATGTAGCAGT-T--G--AA-TA-G-T-CAA-CTA--TTC---A---------A--C-----TGC--T-AT---T-T--G------T-AA-ATA-T---T-C--AA------CTGTT--T-GCTT-T--AA--G--G-C-----TTTGG-C-AAA-TAA-GTTA-G-AAAACTA-CAAA-T---GC--A-C-G-T--A----AA---T--TT-G---T-TC--ATTTTGa
gi|7                          :                                                      attaccaGTGACGTCA-TC-CA-T--T----G-TGGTTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT-CGACT-AT-T-C----AAAC-G-C--T--AAA-C-C--------GT-T--G--AA-TA-G-A-TAA-CTA--TTA---A---------A--C-----TGC--T-AC---T-T--G------T-AA-CTA-T---T----AA------CTGTTTTG-GC-T-T--AC--A--G-C-----AT--G-C-AAA-TGA-G--A-G-AAAACAA-CAAATT---GCA-A-C-G-T--A----AATTTT--TT-AGTTT-TT--ATTTT
gi|8                          :                                                         ttcaGTGACGTCA-TC-CA-T--TT---G-TG-TTT-A----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT--GACT-AT-T-C----AA-CGG-C--T--ATT-A-C--------CG-T--G--AA-TA-G-A-TAA-CTA--TTT---C---------A--C-----TGC--T-AC---T-T--G------T-AC-CTATT---T-C--AA------CTGTT--G-GC-CAT--AA--T--G-C-----AT--G-C-AAA-TAA-G----G-AAAACAA-CAAATG---CC--A-C-G-T--A----AA---TA-TT-AG-TT-TC--ATTTT
gi|9                          :                                                       tgtcaaGTGACGTCA-TC-C--T--T----G-TG-TTTTA----G---TC-----A-TT-G-------AA--TA--G-TT-CGACTTAT-TTC----AA-C-G-C--T--AAT-A-CC-------GT-T--G--AA-TA-G-A-TAA-CTA--CCCCC-A---------A--C-----TAC--T-AC---T-T--G------T-AA-TCA-T---T-C--AAA-----CTGTT--G-GC-T-T--AG--A----C-----TT--G-C-AAA-TA--G--A-G-AAAACAA-CAAATT---GC--A-C-G-T--A----AAT--T--TT-AG-TT-TC--ATTTTGAtg


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blockSeqs                     :                                                                      .  .  . T       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  T . . C         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . CTTG             .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . A       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . T       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  T . . C         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . CTTG             .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . A       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . T       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  T . . T         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . TATG             .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . C       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . T       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  G . . T         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . CTTC             .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . A       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . T       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  A . . T         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . TTTG             .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . A       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . T       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  A . . C         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . CTTG             .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . A       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . C       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  T . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . CTCG             .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . A       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . T       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  T . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . TTTG             .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . A       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . C       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  A . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . CTTG             .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . A       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . T       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  G . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . CTTG             .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . A       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . T       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  T . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . CTTG             .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . C       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . T       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  A . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . CTG              .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . G       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . T       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  T . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . CTG              .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . A       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . T       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  A . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . CTG              .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . A       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . T       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  T . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . TTG              .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . A       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . T       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  G . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . TTA              .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . A       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                      .  .  . .       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  A . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . TTG              .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . .       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                         .  . .       .  .   . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  A . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . TTT              .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . .       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                                             . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  T . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . TC               .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . .       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                                             . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  A . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . CT               .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . .       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                                             . .    .    .     .  . .        .   .  .  .     .  . . .     . . . .  .  . . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . TT               .  .   . .   . .   .          .  .  . . .   .  .  . .      .  . .   .   . .  . .       .      .    .  . . . .  .     .   .   .  .  .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                         .     .  . .        .   .  .  .     .  . .             .  .  . . . .         . .  .   .  . . .   .   .    .   .         .  .       .  . CT               .  .   . .   . .   .                                                                                                                    
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