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gi|2                          :                                                                                    AGTAAAAAAAATTTTATATGAT-CCTTACA-----TA-AAAC--AAATTAC--------TCTAAGGCAC--ATTAC-AT--TGGTAAGA----AAGAGGAA-TGCAACAAGGAATTAAAACGCAATAC-T----GATGAAATTGAATG--A--AAG-A---TTTATACATACA-AT-TA---TA----A--------AT-TTAAA--TATTGAAAGTAAAACAC--TGCAATCAAGGGTAAAT
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gi|6                          :              gcaaatcatgattaaatacaagtaaatacagtaattaaattcaatagagtaatttttcacaacataatcacaTAATAAAA--TGTATATAACGAATTAAAAAAACCA-AAAC--AAATTAC--------TCTAAGGCAC--TTTA--ATA-TGGTAAG-----AAGAGGAA-CGCTGCAA-----TAAATCACAACAT-TG---GAAGAAAATAAATT--ACTTAAGA---TCT-T-----CT-ATCTC---TA----A-------------AAA--TA-TCAAATTAAAACAC--TGCAATC-Ac
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Reference ( family-984 )      :                                                                                    AGTAATAAAA--TTTATATAGCGCCTTA--TA-----TAAAAC--AAATTAC--------TCTAAGGCGCTT-TACA---NTGGTAAG-----AAGAGGAA-TGCAACAA-----TAAAACACAATAC-TG---GATGAAATTAAATG--A--TAGAA---TTTATACATACA-ATGTA---TA----A--------AT-TTAAA--TATC-AAANTAAAACAC--TGCAATCANGATCGATA
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gi|15                         :                                                                                         gaAAA--TTTATATATTGCCTTAATTA-----TAAA-C--AAATTAC--------TCTTAGACGCTTATA-A---CAGGTAAG------TGAGAAA-TGCAACAA-----
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gi|3                          : ccagcaaatcatgtacaggattttaactgaaaaaatgcagcattaattttttccagcaactctttagatgatagtgatataaaatTAATGAAA--TTTATGTATCACCTTA--TA-----TAAAAC--AAATTAC--------TCCAAGGCACTT-TACA---TGGGCAAG-----AGGAGAAA-TGCAACAA-----TAAAACAAAAT-T-TA---AATGAAAGTACATG-----TAAA-----TGACAC-TATA-TGGTA---TA----AGGTTTTCTATCTTAAAATTAAC-AAAATGGAACACCATATAATCATGATCGATAggtaaattgtatattttaaatacaaaa
gi|4                          :                          accttcggaattacaagtttggataaaacagcacatttgttagagtttgtatttaaatgaTAATAAAA--TTTAGAAAGCGCCTTA--TA-----TAAAAC--AAATTAC--------TTTAAGGAGCTT-TACA---ATGGGGAG-----AAGAGGAATTGCAACAA-----TATAACGTAATA---G---GATGAAATCAAATA------AGA------TGTACATGTACATGTATCTTATAATA--------AT-TAAAA--TATC-AAATTAAAACAC--TATAATTAAGATCggtaagttgttttggctttttttttttacttttattta
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Reference ( family-984 )      :                                                                                    AGTAATAAAA--TTTATATAGCGCCTTA--TA-----TAAAAC--AAATTAC--------TCTAAGGCGCTT-TACA---NTGGTAAG-----AAGAGGAA-TGCAACAA-----TAAAACGCAATAC-TG---GATGAAATTAAATG--A--TAGAA---TTTATACATACA-ATGTA---TA----A--------AT-TTAAA--TATC-AAANTAAAACAC--TGCAATCANGATCGATA
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-984 )      :                                                                                    AGTAATAAAA--TTTATATAGCGCCTTA--TA-----TAAAAC--AAATTAC--------TCTAAGGCGCTT-TACA---NTGGTAAG-----AAGAGGAA-TGCAACAA-----TAAAACGCA--ACG-TG---GATGAAATTAAATG--A--TAGAA---TTTATACATACA-ATGTA---TA----A--------AT-TTAAA--TATC-AAANTAAAACAC--TGCAATCANGATCGATA
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gi|12                         :                                                                                           gatgatacATATAGCACCCTA--TG-----TAAAAC--AAATTAC--------GCTGAGGCGCTT-AACA---GTGGTAAA-----GAGAGGAA-TGCAGCA-------AAACCACA--A-G-TG---GATG-AATTAAATG--A--TGGAA---Tctgttaaagtatcttca
gi|13                         :                                                                     attccttagtgtagctttgtttaaatagtaATATAGCACCCTA--TG-----TAAAAC--AAATTAC--------GCTGAGGCGCTT-AACA---GTGGTAAG-----AGGAGGAA-TGCAGC--------AAAACACA--A-G-TG---GATG-AATTAAATG--A--TGGAA---Tgaca
gi|14                         :                                                         ttccttagtgtagctttgtttaaatagtaTGATAAAA--TTTATCTAGCGCCTTA--TA-----CAAAAC--AAGCTACATATGTATTCTAAGGCGCTT-TGCA---ATGGTAAG-----AAGAGGCA-TGCAATAA-----T-AAACACA--AC--TG---GATGAACTAAAATgacat
gi|15                         :                                                                                         gaAAA--TTTATATATTGCCTTAATTA-----TAAA-C--AAATTAC--------TCTTAGACGCTTATA-A---CAGGTAAG------TGAGAAA-TGCAACAA-----
gi|17                         :                                                                                                              TA--TA-----TATAACGAAAATTAT--------CCTA-GGCGCAT-TACA---TTGGTAAG-----AAGAGG-A-TGC
gi|2                          :                                                                                    AGTAAAAAAAATTTTATATGAT-CCTTA--CA-----TAAAAC--AAATTAC--------TCTAAGGCACAT-TACA---TTGGTAAGA----AAGAGGAA-TGCAACAAGGAATTAAAACGCA--ATA-CT---GATGAAATTGAATG--A--AAG-A---TTTATACATACA-AT-TA---TA----A--------AT-TTAAA--TATTGAAAGTAAAACAC--TGCAATCAA
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gi|4                          :                          accttcggaattacaagtttggataaaacagcacatttgttagagtttgtatttaaatgaTAATAAAA--TTTAGAAAGCGCCTTA--TA-----TAAAAC--AAATTAC--------TTTAAGGAGCTT-TACA---ATGGGGAG-----AAGAGGAATTGCAACAA-----TATAACGTA--ATA--G---GATGAAATCAAATA------AGA------TGTACATGTACATGTATCTTATAATA--------AT-TAAAA--TATC-AAATTAAAACAC--TATAATTAAGATCggtaagttgttttggctttttttttttacttttattta
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