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gi|3                          :                                                                             TTAAACATAT---GATTA------ATCCA--ATACA-----------TTAATTAAATTAATAGGATAGAT-TAT-C----------CTAT---GT---------------G-A-AATTTATCCTATCACT-AGTAATGTT-TAACAAGCTG-------AAA--AT--GGT-GTGTGTGATTT----TGTTTCAACTGTATACAACTGT----------------CAGT-AAGTATCAAATATATTCCTTGTC--CCTTTT--GAGAGGAGTATGTTTGGTTCTGGACAGTGTAC---AT
gi|10                         : ataaattcaacaaaatgatacttgtatgggaaaaattctccagtgaattattacatagaaaaaatattcctaaacagTAAATAAATCTAAAG-AGTCTTTAT--ATTGGATTAATCCCATGTATTATTTAAATTAATGGGATATAT-TAT-C----------CTGT---GTTTTTGG------TAGG-ATGATTTATCTTATCACT-AGT
gi|6                          :                                                                                   ttatataggaTAGGTTTAATCC------CA---C----GTATCATTTAAATTAATGGGATATAT-TAT-C----------TTAT---GTTTTT-GG-----TAGG-ATGATTTATCCTATCACT-AGTAATTTT-TACGAAATTGTGGCAGTTAAGTACCAGAT-ATGT---CCTT----TGTTTataaaatgttgtgtgtg
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gi|2                          :                                taggaaaaattctccagcaaaatgtacgttatatgggataaattctcagtgaattattatataggataaacatttctaaacagtcaaaca-ATTATTTGAATTAAT--GATACATGTAT-A----------TTATCCTGTTTTT-GGTATACTAAGGATGATTTTTCTTATCACT-AGTTATTTT-TGCGAAGCTG-------AAA--A----ATTGAGTGTGCTTTGGTTTGTTTCAACTGAA-ATAATTATTT-ATTTCATTTGT--CAGTTAAGTACCAAATAAGTCCCTTGTC--CATTTT--CAGAGAAATTTGTTTCGTTCTGGACAGTTTAC---ATGTGCAA---------GATGATGATGATTTAGGTAAAATATTACAA--TTTTCAAAACATGA----------AAGAAAATAAATAAAA-ATTAGTGTGATTGa
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gi|7                          :                                                                                                                            TTATTTAAATGAATGGGATATAT-TATCGATATATTATCCTAT---TTTTTA-G------TAGG-ATGATTTATATTATCACT-AGTAATTTT-TACGAAGCTG-------AAA--AT--GGT-GTGTGTGCTTT----TGTTTCAA
gi|4                          :                                                                                                       tttccaatgggctattatataggatgattaaatctaaagagtct-TAT-C----------CTAT---GTTTTT-GG-----TAGG-ATGATTTATCCTTTCACT-AGTAATTTT-TAAGAAT-------------------GAT-GTGTGTGCTTT----TGTTTCAACTGTATAAAATTGTTT-ATATCAATTAT--CAGTCAAGTACCAAATAAGTCCCTTGTC--CCTATC--CAGATGAGCCTATTTGGTTCTAAACATTTTAC---ACATGCAAG------ATGATGATGATAATTCTAGCAAATTGATATAA--ATTTCAAAACTGGAC-GGGAATTCCAGAAAATCAATAAGATATAAAT-TGATTGTcggta
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): TCTCAGGATCTATTCTCCAAATAAATTACACTTATTCATAGGATACATTCTCAATGAATTATAATACAGGATAAATAAATCTAAAGAGTCTTTA
Unaligned ( gi|15 ): AGTTATTATATAGGATAACTAAATCTGAAGAATCTTTGTACAGTATTAATCCAAAGTATTATTTAAATAAACGGAATA
Unaligned ( gi|16 ): TATATAGGATAAATAATTGTAAACAGTCAAATATAGGATTAATCCCATGTAATTATT






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Reference ( family-974 )      :                                                 TTAAACANATCTAGANTAGC--TT--ATCCA-CGGACAAATCCC--GTATTATTTAAATTAATGGGA----TATATT-----------ATCCTATGTTTTTGGTA------GGATGATTTATCCTATCACT-AGTAATTTTTACGAAGCTGAAAA-TGGTGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACTGTATATAATTGTTT-ATTTCATT-TGTCAGTCAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-CTTTTCAGAGGAATCTGTTTGGTTCTGGACAGTTTACATGTGCAAGAT-A----T---GATGATGATGATTTAGGTAAATTAATATAA--ATTTCAAAACATGAA-AGAAAA-TCAAGAAAATCAATAANA-ATTAA-T-TGATTGTATA
gi|1                          :                                                 TTAAATATATTCAGACTAGT--TTTGATCCATCAGACAAATC----G-ATTATTTAAATGAATAAGA----TACACT-----------ATGCTATGTTTTTG-TA------AGATGATTTACCCTATCACT-AGTGATTTTTACGAATCTGTAAA-CGATGTGTGAGCTTT----TGTTTCAATTATATATAACTGTTT-ATTTCATT-TGTCAGTCAAGTACCAAATAAGTTC---CTTGTTC-CTTTTCAGAGGAATTTGTTTGGTTCTGGACAGTTTACATATGCAAGATAA----T---GATAATGATGATTTAAGTTAATTGATATAA--ATTTCAAAACATGAA-AGAAAT-TCAAGAAAATCGATAAGA-ATTAA-TATGATTGTATA
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gi|7                          : tcttaacagtcaaatataggtttaatcccacgtatcatttaaattaatgggatatattatcttatgtttttggtaggatgatttatcctatcactagTTATTTAAATGAATGGGA----TATATTATCGATATATTATCCTAT-TTTTTAGTA------GGATGATTTATATTATCACT-AGTAATTTTTACGAAGCTGAAAA-TGGTGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACGGTA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-974 )      :                                              TTAAACATAT--CTAGACTAGT--TT--ATNCA-CG-GACAAATCCCA-GTATTATTTAAATTAATGGGA----TATATT-----------ATCCTATGTTTTTGGTA------GGATGATTTATCCTATCACT-AGTAATTTTTACGAAGCTGAAAA-TGGTGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACTGTATATAATTGTTT-ATTTCATT-TGTCAGTCAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-CTTTTCAGAGGAATCTGTTTGGTTCTGGACAGTTTACATGTGCAAGAT-A----T---GATGATGATGATTTAGGTAAATTAATATAA--ATTTCAAAACATGAA-AGAAAA-TCAAGAAAATCAATAAGA-ATTAATGTGATTGTATA
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gi|2                          :                                                                                              -GCATTATTTGAATTAATGATACATGTATATT-----------ATCCT--GTTTTTGGTATACTAAGGATGATTTTTCTTATCACT-AGTTATTTTTGCGAAGCTGAAAAAT--TGAGTGTGCTTTGGTTTGTTTCAACTGAA-ATAATTATTT-ATTTCATT-TGTCAGTTAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-ATTTTCAGAGAAATTTGTTTCGTTCTGGACAGTTTACATGTGCAA-------------GATGATGATGATTTAGGTAAAATATTACAA--TTTTCAAAACATGAA-AGAAAA-T-A--------AATAAAA-ATTAGTGTGATTG
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gi|4                          :                                                                  ataaattcaacaaaatgatacttgtatgggaaaaattctccagtgaattattacatagaT-----------ATCCTATGTTTTTGGTA------GGATGATTTATCCTTTCACT-AGTAATTTTTA--------AGAA-TGATGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACTGTATAAAATTGTTT-ATATCAAT-TATCAGTCAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-CTATCCAGATGAGCCTATTTGGTTCTAAACATTTTACACATGCAAG---A----T---GATGATGATAATTCTAGCAAATTGATATAA--ATTTCAAAAC-TGGA-CGGGAATTCCAGAAAATCAATAAGATATAAAT-TGATTGT
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gi|7                          : tcttaacagtcaaatataggtttaatcccacgtatcatttaaattaatgggatatattatcttatgtttttggtaggatgatttatcctatcactagTTATTTAAATGAATGGGA----TATATTATCGATATATTATCCTAT-TTTTTAGTA------GGATGATTTATATTATCACT-AGTAATTTTTACGAAGCTGAAAA-TGGTGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACGGTA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-974 )      :                                              TTAAATATATCTAAAC-AGT--TN--ATACA-CA-G-ATN-AATCCCA-GTATTATTTAAATTAATGGGA----TATATT-----------ATCCTATGTTTTTGGTA------GGATGATTTATCCTATCACT-AGTAATTTTTACGAAGCTGAAAA-TGGTGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACTGTATATAATTGTTT-ATTTCATT-TGTCAGTCAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-CTTTTCAGAGGAATCTGTTTGGTTCTGGACAGTTTACATGTGCAAGAT-A----T---GATGATGATGATTTAGGTAAATTAATATAA--ATTTCAAAACATGAA-AGAAAA-TCAAGAAAATCAATAAGA-ATTAATNTGATTGTATA
gi|1                          :                                              TTAAATATATTCAGACTAGT--TTTGATCCATCA-G-ACA-AATC----G-ATTATTTAAATGAATAAGA----TACACT-----------ATGCTATGTTTTTG-TA------AGATGATTTACCCTATCACT-AGTGATTTTTACGAATCTGTAAA-CGATGTGTGAGCTTT----TGTTTCAATTATATATAACTGTTT-ATTTCATT-TGTCAGTCAAGTACCAAATAAGTTC---CTTGTTC-CTTTTCAGAGGAATTTGTTTGGTTCTGGACAGTTTACATATGCAAGATAA----T---GATAATGATGATTTAAGTTAATTGATATAA--ATTTCAAAACATGAA-AGAAAT-TCAAGAAAATCGATAAGA-ATTAATATGATTGTATA
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gi|15                         :                                               TAACTAAATCTGAAG-AAT--CT--TTGTA-CA-GTATT-AATCCAAAGTATTATTTAAATAAACGGAA----TA
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gi|6                          :                                                       TCTTAAC-AGT--CA--A-ATA-TA-G-GTTTAATCCCACGTATCATTTAAATTAATGGGA----TATATT-----------ATCTTATGTTTTTGGTA------GGATGATTTATCCTATCACT-AGTAATTTTTACGAAATTG
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gi|7                          : tcttaacagtcaaatataggtttaatcccacgtatcatttaaattaatgggatatattatcttatgtttttggtaggatgatttatcctatcactagTTATTTAAATGAATGGGA----TATATTATCGATATATTATCCTAT-TTTTTAGTA------GGATGATTTATATTATCACT-AGTAATTTTTACGAAGCTGAAAA-TGGTGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACGGTA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-974 )      :                                            TTAAATATATC-TAAAC-AGTCN--A-TACA-C-A-G-ATT-AATCCCANGT-ATTATTTAAATTAATGGGA----TATATT-----------ATCCTATGTTTTTGGTA------GGATGATTTATCCTATCACT-AGTAATTTTTACGAAGCTGAAAA-TGGTGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACTGTATATAATTGTTT-ATTTCATT-TGTCAGTCAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-CTTTTCAGAGGAATCTGTTTGGTTCTGGACAGTTTACATGTGCAAGAT-A----T---GATGATGATGATTTAGGTAAATTAATATAA--ATTTCAAAACATGAA-AGAAAA-TCAAGAAAATCAATAAGA-ATTAATNTGATTGTATA
gi|1                          :                                            TTAAATATATT-CAGACTAGTTTTGA-TCCATC-A-G-ACA-AATC----G--ATTATTTAAATGAATAAGA----TACACT-----------ATGCTATGTTTTTG-TA------AGATGATTTACCCTATCACT-AGTGATTTTTACGAATCTGTAAA-CGATGTGTGAGCTTT----TGTTTCAATTATATATAACTGTTT-ATTTCATT-TGTCAGTCAAGTACCAAATAAGTTC---CTTGTTC-CTTTTCAGAGGAATTTGTTTGGTTCTGGACAGTTTACATATGCAAGATAA----T---GATAATGATGATTTAAGTTAATTGATATAA--ATTTCAAAACATGAA-AGAAAT-TCAAGAAAATCGATAAGA-ATTAATATGATTGTATA
gi|10                         :                                             TAAATAAATC-TAAAG-AGTCT--T-TATA-TTG-G-ATT-AATCCCATGT-ATTATTTAAATTAATGGGA----TATATT-----------ATCCTGTGTTTTTGGTA------GGATGATTTATCTTATCACT-AGT-AT-------------AAAA-TGTTGTGTGTGg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                     ttatataggaTAGTT-TTT-ATTTCATT-TGTCGGTCAAGTACCAAATAAGTTC---CTTCTCC-TTTTTCAGATGAATCTGTTTGGTTCTGGACAGTTTACATAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaataagGCAAATTTATATAA--ATTTCAAAACATGAA-AGAAAA-TCAAGAAAATCAATAACA-ATTAATTTGATTCTATA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                         aattCATA-TGTCAGTCAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-CTTTGCCGAGGAATCTGTTTGGTTCTGGACAGTTTACATATGagagaa
gi|15                         :                                             TAACTAAATC-TGAAG-AATCT--T-TGTA-C-A-GTATT-AATCCAAAGT-ATTATTTAAATAAACGGAA----TA
gi|16                         :                              agttattatataggaTAAATA-ATTGTAAAC-AGTCA--AATATA---G-G-ATT-AATCCCATGTAATTATT
gi|2                          :                                                                                     tatataggaGC-ATTATTTGAATTAATGATACATGTATATT-----------ATCCT--GTTTTTGGTATACTAAGGATGATTTTTCTTATCACT-AGTTATTTTTGCGAAGCTGAAAAAT--TGAGTGTGCTTTGGTTTGTTTCAACTGAA-ATAATTATTT-ATTTCATT-TGTCAGTTAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-ATTTTCAGAGAAATTTGTTTCGTTCTGGACAGTTTACATGTGCAA-------------GATGATGATGATTTAGGTAAAATATTACAA--TTTTCAAAACATGAA-AGAAAA-T-A--------AATAAAA-ATTAGTGTGATTG
gi|3                          :                                              AAATATTCC-TAAAC-AGTTA--A--ACA-T-ATG-ATT-AATCCAATAC-ATTAATTAAATTAATAGGA----TAGATT-----------ATCCTATGT---------------GA-AATTTATCCTATCACT-AGTAATGTTTAACAAGCTGAAAA-TGGTGTGTGTGATTT----TGTTTCAACTGTATACAACTGT---------------CAGT-AAGTATCAAATATATTC---CTTGTCC-CTTTTGAGAGGAGTATGTTTGGTTCTGGACAGTGTACATa
gi|4                          :                                                                ataaattcaacaaaatgatacttgtatgggaaaaattctccagtgaattattacatagaaaT-----------ATCCTATGTTTTTGGTA------GGATGATTTATCCTTTCACT-AGTAATTTTTA--------AGAA-TGATGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACTGTATAAAATTGTTT-ATATCAAT-TATCAGTCAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-CTATCCAGATGAGCCTATTTGGTTCTAAACATTTTACACATGCAAG---A----T---GATGATGATAATTCTAGCAAATTGATATAA--ATTTCAAAAC-TGGA-CGGGAATTCCAGAAAATCAATAAGATATAAAT-TGATTGT
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gi|7                          : tcttaacagtcaaatataggtttaatcccacgtatcatttaaattaatgggatatattatcttatgtttttggtaggatgatttatcctatcactagTTATTTAAATGAATGGGA----TATATTATCGATATATTATCCTAT-TTTTTAGTA------GGATGATTTATATTATCACT-AGTAATTTTTACGAAGCTGAAAA-TGGTGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACGGTA
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-974 )      :                                             TTAAATATATC-TAAAC-AGTCN--A-TACA-C-G-G-ATTAATCCCANGT-ATTATTTAAATTAATGGGA----TATATT-----------ATCCTATGTTTTTGGTA------GGATGATTTATCCTATCACT-AGTAATTTTTACGAAGCTGAAAA-TGGTGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACTGTATATAATTGTTT-ATTTCATT-TGTCAGTCAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-CTTTTCAGAGGAATCTGTTTGGTTCTGGACAGTTTACATGTGCAAGAT-A----T---GATGATGATGATTTAGGTAAATTAATATAA--ATTTCAAAACATGAA-AGAAAA-TCAAGAAAATCAATAAGA-ATTAATNTGATTGTATA
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Reference ( family-974 )      :                                             TTAAATATATC-TAAAC-AGTCN--A-TACA-C-G-G-ATTAATCCCANGT-ATTATTTAAATTAATGGGA----TATATT-----------ATCCTATGTTTTTGGTA------GGATGATTTATCCTATCACT-AGTAATTTTTACGAAGCTGAAAA-TGGTGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACTGTATATAATTGTTT-ATTTCATT-TGTCAGTCAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-CTTTTCAGAGGAATCTGTTTGGTTCTGGACAGTTTACATGTGCAAGAT-A----T---GATGATGATGATTTAGGTAAATTAATATAA--ATTTCAAAACATGAA-AGAAAA-TCAAGAAAATCAATAAGA-ATTAATNTGATTGTATA
gi|1                          :                                             TTAAATATATT-CAGACTAGTTTTGA-TCCATC-A-G-ACAAATC----G--ATTATTTAAATGAATAAGA----TACACT-----------ATGCTATGTTTTTG-TA------AGATGATTTACCCTATCACT-AGTGATTTTTACGAATCTGTAAA-CGATGTGTGAGCTTT----TGTTTCAATTATATATAACTGTTT-ATTTCATT-TGTCAGTCAAGTACCAAATAAGTTC---CTTGTTC-CTTTTCAGAGGAATTTGTTTGGTTCTGGACAGTTTACATATGCAAGATAA----T---GATAATGATGATTTAAGTTAATTGATATAA--ATTTCAAAACATGAA-AGAAAT-TCAAGAAAATCGATAAGA-ATTAATATGATTGTATA
gi|10                         :                                              TAAATAAATC-TAAAG-AGTCT--T-TATA-TTG-G-ATTAATCCCATGT-ATTATTTAAATTAATGGGA----TATATT-----------ATCCTGTGTTTTTGGTA------GGATGATTTATCTTATCACT-AGT-AT-------------AAAA-TGTTGTGTGTGg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                     ttatataggaTAGTT-TTT-ATTTCATT-TGTCGGTCAAGTACCAAATAAGTTC---CTTCTCC-TTTTTCAGATGAATCTGTTTGGTTCTGGACAGTTTACATAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaataagGCAAATTTATATAA--ATTTCAAAACATGAA-AGAAAA-TCAAGAAAATCAATAACA-ATTAATTTGATTCTATA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                         aattCATA-TGTCAGTCAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-CTTTGCCGAGGAATCTGTTTGGTTCTGGACAGTTTACATATGagagaa
gi|15                         :                                              TAACTAAATC-TGAAG-AATCT--T-TGTA-C-A-GTATTAATCCAAAGT-ATTATTTAAATAAACGGAA----TA
gi|16                         :                               agttattatataggaTAAATA-ATTGTAAAC-AGTCA--AATATA---G-G-ATTAATCCCATGTAATTATT
gi|2                          :                                                                                     tatataggaGC-ATTATTTGAATTAATGATACATGTATATT-----------ATCCT--GTTTTTGGTATACTAAGGATGATTTTTCTTATCACT-AGTTATTTTTGCGAAGCTGAAAAAT--TGAGTGTGCTTTGGTTTGTTTCAACTGAA-ATAATTATTT-ATTTCATT-TGTCAGTTAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-ATTTTCAGAGAAATTTGTTTCGTTCTGGACAGTTTACATGTGCAA-------------GATGATGATGATTTAGGTAAAATATTACAA--TTTTCAAAACATGAA-AGAAAA-T-A--------AATAAAA-ATTAGTGTGATTG
gi|3                          :                                               AAATATTCC-TAAAC-AGTTA--A--ACA-T-ATG-ATTAATCCAATAC-ATTAATTAAATTAATAGGA----TAGATT-----------ATCCTATGT---------------GA-AATTTATCCTATCACT-AGTAATGTTTAACAAGCTGAAAA-TGGTGTGTGTGATTT----TGTTTCAACTGTATACAACTGT---------------CAGT-AAGTATCAAATATATTC---CTTGTCC-CTTTTGAGAGGAGTATGTTTGGTTCTGGACAGTGTACATa
gi|4                          :                                                                ataaattcaacaaaatgatacttgtatgggaaaaattctccagtgaattattacatagaaaT-----------ATCCTATGTTTTTGGTA------GGATGATTTATCCTTTCACT-AGTAATTTTTA--------AGAA-TGATGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACTGTATAAAATTGTTT-ATATCAAT-TATCAGTCAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-CTATCCAGATGAGCCTATTTGGTTCTAAACATTTTACACATGCAAG---A----T---GATGATGATAATTCTAGCAAATTGATATAA--ATTTCAAAAC-TGGA-CGGGAATTCCAGAAAATCAATAAGATATAAAT-TGATTGT
gi|5                          :                                                                                                  TTATTTCA-TTAATAGGA----TATATT-----------ATCCTATGTTTTTGGCA------GGATGATTCATCCTATCACT-AGTATTTTATCCAAAGCTGAAAA-TGGGGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACAGTATATAATTGTTTCATTTCATT-TTTTAGT-AAGTACATAATAAGTCCATTATTGTCCTTTTTTCAGAGAAATCTGTTTGGTTCTGGACAGTTTACATGTGCAAG---A----T---GATGATGATGATTTAGGcccagagaaa
gi|6                          :                                                      TC-TTAAC-AGTCA--AATATA---G-G-TTTAATCCCACGT-ATCATTTAAATTAATGGGA----TATATT-----------ATCTTATGTTTTTGGTA------GGATGATTTATCCTATCACT-AGTAATTTTTACGAAATTG
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gi|7                          : tcttaacagtcaaatataggtttaatcccacgtatcatttaaattaatgggatatattatcttatgtttttggtaggatgatttatcctatcactagTTATTTAAATGAATGGGA----TATATTATCGATATATTATCCTAT-TTTTTAGTA------GGATGATTTATATTATCACT-AGTAATTTTTACGAAGCTGAAAA-TGGTGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACGGTA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                   taggaaaaattctccagcaaaatgtacgttatatgggataaattctcagtgaattattatataggaTTT-ATTTCAT---GTCCGTCAAG-ACCAAATAAGTTC----TTCTCT--TTTTCAGATGAAT--GTTTG--TCTGGACAGTTGAC--------GAT-A----TATGGATGAGTATTGTTTAG-TAAATTAGTTTAATAATTTCAAAACATGAATAGAAAA-TCAA


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blockSeqs                     :                                                    A   .     .    TTTGTACA       .  T       A T            A       .         .                           .                         .   A       AC  G       .  G            .                       G   .       T        C                 C         T         G    C                        A      ATATATG                                   .                .      .                  .      G
blockSeqs                     :                                                    T   .     .    AAATATAG       .  T       T T            T       .         .                           .                         .   A       CA  G       .  A            .                       G   .       A        T                 C         C         G    T                        G      AT                                        .                .      .                  .      .
blockSeqs                     :                                                    T   .     .    AAACATAT       .  T       T C            T       .         .                           .                         .   A       CG  A       .  G            .                       G   .       T        C                 C         A         G    A                        A      AT                                        .                .      .                          
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Reference ( family-974 )      :                                                                           TTAAATATATC-TAAACAGTCAA-ATATAGGAT---TAATCC------CANGT--A----TTATTTAAATTAATGGGA----TATATT-----------ATCCTATGTTTTTGGTA------GGATGATTTATCCTATCACT-AGTAATTTTTACGAAGCTGAAAA-TGGTGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACTGTATATAATTGTTT-ATTTCATT-TGTCAGTCAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-CTTTTCAGAGGAATCTGTTTGGTTCTGGACAGTTTAC---ATGTGCAAG---AT------GATGATGATGATTTAGGTAAATTAATATAA--ATTTCAAAACATGAA-AGAAAA-TCAAGAAAATCAATAAGA-ATTAATNTGATTGTATA
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              aattCATA-TGTCAGTCAAGTACCAAATAAGTCC---CTTGTCC-CTTTGCCGAGGAATCTGTTTGGTTCTGGACAGTTTAC---ATATGagagaa
gi|15                         :                                                                            TAACTAAATC-TGAAGAATCTTTGTACAGTAT---TAATCC------AAAGT--A----TTATTTAAATAAACGGAA----TA
gi|16                         :                                                             agttattatataggaTAAATA-ATTGTAAACAGTCAA-ATATAGGAT---TAATCC------CATGTA-A----TTATT
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAATT-TTT-ACGAAATTGTGGCAGTTAAGTACCAGATA----------TGTCC-TTT-------------GTTTGGTTTTGGACAGTTTAC---ATGTGCAAG---ATAGTGATGGTGATGATGATTTAGGTAAATTAATATAA--TTTTCAAAACATGtggcagttaagtaccagatatgtcctttgtttggttttggacagtttacatgtgcaagatagtgatggtgatgatgatttaggtaaattaatataattttcaaaacatg
gi|7                          : tcttaacagtcaaatataggtttaatcccacgtatcatttaaattaatgggatatattatcttatgtttttggtaggatgatttatcctatcactag-ATATAGGATGATTAAATC------TAAAG--AGTCTTTATTTAAATGAATGGGA----TATATTATCGATATATTATCCTAT-TTTTTAGTA------GGATGATTTATATTATCACT-AGTAATTTTTACGAAGCTGAAAA-TGGTGTGTGTGCTTT----TGTTTCAACGGTA
gi|8                          :                                                            tttccaatgggctattTAAACATTTC-TAAACAGTCAA-ACACAGAA-----AATCC------CAAGT--A----TTAT-----------GGA----TAGATT-----------ATCCTGTGTTT--GGTA------GGATGATTTATCCTATCACTGAGTA
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