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Reference ( gi|10 ) : CATAATTCTT--A-AA-A-T-AGATTAAAT----TCA-A---TAATTT-G-----------TT-GAC-----TT-T-A--------------CACTT-C----AGA----ATT------------G-A--TGC-TA--AT-C-----C-TG-T-TT-----T----GA---A---A-G-----AAA-----------------CA-A----A--A--A---------CT------GT--T-TA--AGACAT--TGA----AA-GTT-T-TA-A-AT-CT--TGA--T-CA--AGAT--TG--T--A---G-GTCAACACGTG
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gi|43 : CATAGTTCTT--ACAA-A-T-GGATTAAAT----TCA-A---TAATTT-G-----------TT-GAC-----taa
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gi|36 : gTTCTT--A-AAGA-T-GGAGTCATT----TCA-A---CAGTGT-G-----------TT-GACATTAATTAT-A--------------CACTT-C----AGA----ATT------------GCA--TGa
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gi|31 : a-A-T-GGACTAAAT----TCA-A---TAAAGT-G-----------TT-GAC-----TT-T-A--------------CACTT-C----AGA----ATT------------A-A--cgtataaacattaaacacc
gi|23 : -T-GGATTAAAT----TCA-A---TAATTT-G-----------TT-GGT-----TC-T-T--------------CACTT-C----AGA----ATT------------A-A--TGC-TA--AC-C-----C-TA-T-AT-----T----GA---A---A-A-----AAA-----------------CC-C----C--A--------------------GT--T-TA--AGACAT--TGA----AA-GTT-T-TA-A-AT-GT--TAG--T-AA--AGAT--TG--T--T---G-GTCAACACATGgacattgaaagttttaaatgttggtcaagatagtaggtcaacacatgtaaa
gi|22 : GATTTAAT----TCA-A---TAATTTTG-----------TT-GAC-----TT-T-G--------------CACTT-C----AGA----TTT------------G-A--TGC-TA--AC-C-----C-TG-T-TT-----A----GA---A---C-G-----GAA-----------------AA-T----A--A--C---------CA------GT--T-TA--AGACAT--TGA----AA-GTT-T-TA-A-AT-GT--TGG--T-CA--AGGT--TG--T--A---G-GTCAGCACATtaaac
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gi|28 : GATTAAAT----TCA-A---TAATTT-G-----------TT-GAC-----TT-T-A--------------CACTT-C----AGAATTGATT------------G-A--TGC-TA--AC-C-----C-TG-T-TT-----T----GA---A---A-G-----AAA-----------------AA-A----A--A--A-----------------GT--T-TA--AGACAT--TGAAATTAA-GTT-T-TA-A-AT-GT--Ttaaa
gi|30 : GATTAAAT----TCA-A---TAATTT-G-----------TT-GAC-----TT-T-A--------------CACTT-C----AGA----ATT------------G-A--TGC-TA--AC-C-----C-TG-T-TT-----T----GA---A---A-G-------A-----------------CA-A----A--A--A---------
gi|7 : gGATAAATT----TCAGA---TAATTT-G-----------T--GACA----TT-T-AA-------------CACTTTC----AGATA--ATTT-----------G-A---GC-TA--AC-C-----C-TG-TTTT-----T----GA---A---A-A-----AAA-----------------AA-A----AACA--A---------CCA-----GT--T-TA--GATTTT--TGA----AA-GTC-T-TA-ATAT-GT--TG---T-CA--AGAT--TGGTT--A---GTGTCAACaaaaacccaccagttttttacatgttgctg
gi|44 : GATTAAAT----TCA-A---TAATTT-G-----------TT-GAC-----TT-T-A--------------CACTT-C----AGA----ATT------------gttatgtaaaca
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gi|35 : tT----TCA-A---CAGTGT-G-----------TT-GAC-----TT-T-A--------------CATTT-C----AGA----ATT------------G-A--TGC-TATGAT---------TG-T-TT-----T----GA---A---A-G-----AAA-----------------taaaaa
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gi|15 : ctcttaacgatatatagTT-G-----------TTTGAC-----GT-T-A--------------TATTTTC----AGA----ATT------------G-G--TGC-TA--AC-A-----A-TG-T-TT-----T----GA---A---T-G-----AAA-----------------AA-A----A--A--A---------CA------AG--T-TAC-AGATAT--TGA----AA-GCC-T-T----AC-CTGATGG--T-CA--AGAT--TG--C--A---A-GTCGACACaat
gi|14 : cttcagatgagtatttccaaacagtgT-GTC-----TT-T-A--------------CACTT-C----AGA----ACT------------G-A--TGC-TA--GC-A-----C-TG-T-TT-----T----GA---A---A-G-----AAA------------------A-A----A--A--A-----------------------TAC-AGACAT--TGA----AG-GCT-T-TA-T-AT-GA--TGG--T-CG--AGAT--TG--T--A---A-GTCAACACGTGa
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gi|33 : ttt-----T----GA---A---A-A-----AAA------------------A-A----A--A--A---------CC------AG--T-TAC-AGACAT--TGA----AA-GTT-T-TA-T-ATGAA--GGA--TGCA--AGAT--TG--T--A---A-GTCAACACGT
gi|34 : gaa---A-G-----AAA------------------A-A----A--C--C---------CT------GT--T-TA--AAACAT--TGA----AA-GTT-T-TA-A-AT-GT--TGG--T-CA--AGAT--TG--T--A---G-GTCAACACATG
gi|31 : --T-TA--AGACAT--TGA----AA-GTT-T-TA-A-AT-GT--TGG--T-CA--AGAT--AG--T--A---G-GTCAACACATGtaaa
gi|41 : atggactaaattcaataaagtgttgactttacacttcagaa-GTT-T-TA-A-AT-GT--TGG--A-CA--AGGT--TG--T--A---G-GTCAACACATGtaaa
gi|42 : -T-TA-A-AT-GT--TGG--T-CA--AGGT--TG--T--A---G-GTCAGCAtaaaca
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AATTGGTGTTAACACTAAACTGTTACAAACATTGTAAGCTTTACATGATGGTCAAGACATGTAAACAGTAAACAAATG
Unaligned ( gi|37 ): TACACTTCGGAATTTTTGAATGAAAAAACAGCCACATGCATTGAAAGCTTTATATG
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Reference ( family-968 ) : CATAGTTCTT--A-AA-A-T-GGATTAAATTCA-A---TAATTT-----------GTT-GAC-----TT-T-A--------------CACTT-C----AGA----ATT------------G-A--TGCT-AAC-C-----C-TGTTT-----T----G-------------------------AA---A-----GA----AA-AAA---A-A--A----C-------GT-T-TA--AGACA---T--TGA----AA-G-TT-TTAA-ATGTTGG-T-CA--AGAT--TG--T--A---G-GTCAACACGTG
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gi|16 : cttcagatgagtatttccaaacagtgTTCTT--A-AA-A-T-GGATTAAATTCA-A---TAATTT-----------GTT-GAC-----TT-T-A--------------CACTT-C----AGA----ATT------------A-A--TGCT-AAG-C-----C-TGTTT-----T----A-------------------------AA---G-----GA----AA-AAA---A-A--T----CA------GT-T-TA--ATACA---T--TGA----AA-G-TT-ATAA-ATGTTGG-T-CA--AGATC-TG--T--A---G-GTCAACAa
gi|17 : TC-----------GTT-GAC-----TT-T-A--------------CACTT-C----AAA----ATT------------G-A--TGCTTAAC-A-----C-TGTTT-----T----G-------------------------AA---ACAAAAGA----A--AAA---A-T--A----C-------AA-T-TAC-AAACA---T--TGG----AA-G-TT-TTAT-ATGATGG-T-CA--AAAT--TG--TA-A---A-GTCAACACGac
gi|18 : ctcttaacgatatatagTTCA-A---CAATGT-----------GTC-TAC-----TT-T-G--------------CACAT-C----AGG----ATTATCCATTCAGTGG-AAGTACT-AAC-A-----T-TATTT----------G-------------------------AA---A-----GA----AA-AAA---A-T--A----CT------GT-C-T------CA---T---GA----AA-G-TT-TTAT-ATTATGG-T-GA--AGAT--TG--T--A---A-GTCGACACATGaat
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Reference ( family-968 ) : CATAGTTCTT--A-AA-A-T-GGATTAAATTCA-A---TAATTT-----------GTT-GAC-----TT-T-A--------------CACTT-C----AGA----ATT------------G-A--TGCT-AAC-C-----C-TGTTT-----T----G-------------------------AA---A-----GA----AA-AA---A-A-A---A----C-------GT-T-TA--AGACA---T--TGA----AA-G-TT-TT-ANATGNTGG-T-CA--AGAT--TG--T--A---G-GTCAACACGTG
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Reference ( family-968 ) : CATAGTTCTT--A-AA-A-T-GGATTAAATTCA-A---TAATTT-----------GTT-GAC-----TT-T-A--------------CACTT-C----AGA----ATT------------G-A--TGCT-AAC-C-----C-TG-TTT-----T----GAA---AGA---AA--AAA---AA---A-----C------A-------------------------GTT-TA-AGACA---T--TGA----AA-G-TT-TT-ANATGNTGG-T-CA--AGAT--TG--T--A---G-GTCAACACGTG
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