lowQualScore : 11111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 6666 333333 222 22 1 222 6666 1 33 4 00000 1 1 22 1 4 22 1 1 1 1 11 333333 1 22 111 88888888888888888888888888888888 11 3333333333333333333333333333 11 1 1111 11 2222 111111111 22222222 1111 11111111111 33 1 5555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111111 1111111111 11 11 11111111111111 222222 222222222222222 111111111111111 1111111111111 11111111 111111 1111111111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 222222 2222222 111 1 11111111 1111 555555555555555555555555 1 1111 55555555555555555555 1111111111 111 11111111111111111 1111 11111 222222222222222222 1 111111111111 111111 22222222222 2222222
lowQualScore : 5 1111 6 6 555555 6 6 6 444 11 7 6 333 6 0000 6 6 5 6 00 6 0 00000 6 5 6 5 6 11 5 0 33 2 5 5 2 3 0 0 88 6 555555 3 4 00 8 444 4 66666666666666666666666666666666 55 88888 8888888888888888888888888888 5 4 5 55 6 9999 666 3 3 2 77 3 0000 3 3 2 888888888 555 888888 2 2 11111111 2 77 5555 0 5555 444 2 5555 444 4 2 2 55555 0 777777 2 5 6 2 2 88888888888 0 99 33 2 8888 1 33 99999999 2 5555555555555555555555555555555555555555555555555 9999999 33 2 88 2 1111111 3 2 77777 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 8888888 6 444 555555555 33 1111111111 44 33 1 2 7777777 55 2 2 11 444 2 2 444 33 99 55555555555555 88 888888 444444 000000000000000 2 33 33 444444444444444 4444444444444 4 2 44444444 33 6 22 555555 666666 2 2 2 4444 8888 7777777 4 8888888888 2 2 55 66666 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 1 111111 2 444 66 2 1111111 444 2 8 2 6 2 0 1 44444 1 1 55555555 44444 2222 2 2 55555 0 22 1 000000000000000000000000 1 1 333 1 1 0 6 2 5555 1 00000000000000000000 333 3 4444 7 9999999999 22 1 555555 1 44 1 22 444 11111111111111111 2 2 2 2222 2 5 00000 3 3 777777 777777777777777777 1 1 3 1 1 999999999999 333 44444 1 22 1 44 1 999999 22 1 2 66666666666 2 4 0000000 2
lowQualScore : . .... . . ...... . . . ... .. . . ... . .... . . . . .. . . ..... . . . . . .. . . .. . . . . . . . .. . ...... . . .. . ... . ................................ .. ..... ............................ . . . .. . .... ... . . . .. . .... . . . ......... ... ...... . . ........ . .. .... . .... ... . .... ... . . . ..... . ...... . . . . . ........... . .. .. . .... . .. ........ . ................................................. ....... .. . .. . ....... . . ..... . .......................................................................................... ....... . ... ......... .. .......... .. .. . . ....... .. . . .. ... . . ... .. .. .............. .. ...... ...... ............... . .. .. ............... ............. . . ........ .. . .. ...... ...... . . . .... .... ....... . .......... . . .. ..... ............................................................................................................................................................................................ . . ...... . ... .. . ....... ... . . . . . . . ..... . . ........ ..... .... . . ..... . .. . ........................ . . ... . . . . . .... . .................... ... . .... . .......... .. . ...... . .. . .. ... ................. . . . .... . . ..... . . ...... .................. . . . . . ............ ... ..... . .. . .. . ...... .. . . ........... . . ....... .
lowQualScore : 0 0000 0 0 000000 0 0 0 000 00 0 0 000 0 0000 0 0 0 0 00 0 0 00000 0 0 0 0 0 00 0 0 00 5 0 0 0 7 0 7 33 7 000000 3 0 33 0 000 6 44444444444444444444444444444444 88 55555 1111111111111111111111111111 0 6 0 55 9 0000 555 3 3 9 77 3 2222 3 1 9 666666666 000 222222 9 9 11111111 3 33 4444 4 0000 111 4 0000 111 7 4 4 99999 4 222222 7 3 1 5 5 66666666666 1 11 00 5 8888 6 44 11111111 8 4444444444444444444444444444444444444444444444444 3333333 99 7 00 7 1111111 1 9 11111 9 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7777777 9 777 888888888 77 4444444444 33 77 4 4 6666666 77 4 4 44 111 4 4 111 22 11 77777777777777 33 222222 444444 666666666666666 7 77 77 333333333333333 7777777777777 4 5 11111111 44 7 88 111111 888888 4 4 2 7777 9999 6666666 7 8888888888 4 4 66 22222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 1 777777 7 777 33 7 4444444 888 4 2 2 8 0 3 3 88888 9 9 44444444 66666 5555 1 1 33333 4 99 9 777777777777777777777777 9 9 333 9 9 1 7 0 7777 9 44444444444444444444 333 8 0000 3 4444444444 55 8 222222 8 33 8 55 111 00000000000000000 0 0 0 2222 0 8 22222 8 8 777777 777777777777777777 6 7 4 7 7 333333333333 000 33333 7 44 7 11 7 999999 66 9 0 55555555555 1 2 8888888 2
consensus : ATGATGGATCCAA-AAACGCTTCCCTCACTCTTATGTCAACATTTGATAATTTGTAAACAATTGAGGTGAAGTTTAAGATTACACTCAGGAGACATTTTTTTGAATTATAAACATATAGGCAACGCGGTACCTGGATGAGCAAGAATT-GCAGAAAACGATGGTATGTAATAGCCCAGTGATTACCGGAGCGATGTATGGGTCGAAAAGCATGATGCTATA-AAACGAGAACANAGGGTGGTTAAGGCGTCCCGATGAAA-GTCAC--TGTGCTG--TACGTAAA-TGCGCCT-CA-GT---ATTT---GG-TG---------TCA-C----------AATA--C-A-A-AAGTACGT---CACGNACGT-ACA----GG-TC---T-ACGCGT-TGTAT-CGTGG-GGAAATG--TCATAA-TAT-T-TTAT-CGTTA-TT---TAC-T-A-CA---------A---T------T-AT-CAAG-------TGTTCAA--GC-T-GCG----T---AT-G----TGT---A-AATCTGTTT-GTC-AA-----ATGA------TTC-T-TTG-T-T--A--AN----TTTTCT-TTGATAATATATAA-G----TCTCCTG--TT--------TCTA-----------TA-----T-A---------TA-G-------T-GTGA--ATT-------TCA--AT-ATT-CT-TAATCA-TT--ACACTG-TGACCTT-G-----A-AATC-----------G------C----------------CC---C-------------C---A-----------------AT------------T-------TAGA---ATA------T--AGA--A-----A--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTTA---ATGAC-GAT-A---TTT--TC-TTTCGA------------CCAAGGCATA-TTCC------TAA-A----GGTAANT------AGTT---GC-A--GAT--TA--A-----------AGAT-------------TTTGA-CA------C-GG--ATGGT-AT--ATTTTTT------TGC-C-TCGTTTAGA-T----A---TTA-------T-TTG---------G-CA-GTGAA--TGC-----GG---------------A--------------A----AT-CCCAAC-------A-------------T--------T-GA-A---T-----TN-----A-----TGGGTATT--GC--------T-AA-A---TAC-G-AGA--GGATATT-GTACCGATCC--GGGTCACTTTT-T---------TTC-AA-TTTATC-A--TA-T---C--TAT-ATCGA------CACATC--A-AGCCCAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--GCTTG-A-A-C---CG-T-G-----GTA--ATAAAC-AACTGGAA----AGTC--TAGCGGAT--AAAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATGATG-A--CGT-AACAG---GT-N---A---GC-A---A-G----GAATTT-CC--C----AC-G--T-G------GC-A--CG-A--TG--TTTGTT-------------T---A-TA-C-AT---TGAC-AAACG---A-TTT-TT-AGTAAAATA------TGC----------G-GCG-G-TTGGAAGA-ATTT-T-A----------CTTTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTGT-TA--T---TA--C-T-CGT----TA-A--TTTC-AC-TC-G-G---AC-ACCTTAACCC
Reference ( gi|1 ) : ATGATTGATCCCATCAACGCTTCCCTTATTGTAAGATCAACATTTAATAGTTTGTGATCTATTGAGGCCAAGATTGATAATACGCTCAGGAGACATTTTTG-GCATTATAAACGTATGGGCAACGGGATACAGGGATGAACAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATAT----GTGGTTACCGGAGCGATGGATAGTTCAAAAAGCATGAGACTCTACAAACGAGTGCACATGGTGGTTACGACGTGCCGATGAAA-GCCAC--TGGGCTG--TTTTTAAA-TGTACCT-AA-GT---ACTT---GG-TA---------TCA-T----------AATA--C-A-A-AAGTACGT---C-CGAACAC-ACA----GT-TA---T-ACGCAT-TGTAT-AGTGGTGGAAACG--TCATAA-TAT-T-TCAA-CGTTA-TT---AAC-T-A-CA---------A---T------T-AT-CAAG-------CGTCCAA--GT-C-GCA----T---AT-G----TGT---A-AATCTGTTT-GTC-AA-----ATGA------TTC-T-TCG-T-T--A--AT----TTTTCC-TTGATTCTATATAA-G----TCTCATG--TT--------TCTA-----------AA-----T-A---------TA-G-------C-GCTC--ATT-------TCA--AT-ATT-TT-TAATTA-TC--ACACTG-TGACCTT-G-----A-AATC-----------G------C----------------GC---C-------------C---G-----------------AT------------T-------TAAA---ATA------C--AGA--A-----A--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-ATT-CA-AGTCTTTA---ATGAC-GAT-A---TTT--TC-ATTCGA------------CTAAGGCATG-TTCC------TAA-T----GGTAAAT------AATT---GC-A--GAT--TA--A-----------AGAT-------------TTTAA-CA------C-GG--ACGGT-AT--ATTCTTT------TGC-C-TCGTTTAGA-T----A---TTA-------T-TTT---------G-CA-GTGAA--TGC-----GG---------------A--------------G----A---------------A-------------T--------T-GA-A---T-----TG-----A-----TGGGTATC--GC--------T-AA-A---TAC-G-AGA--GAATATA-GTACCGATCC--GGGTAATTTTTGTTGTTT-TC-TTC-AA-TTTAAT-A--TA-T---C--TAT-ATCAT------CACATG--A-AGCTCAA-ATTGCAA-ATTATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--ACTTG-A-A-C---AG-T-G-----GTA--ATAAAC-AACTAAAA----AGTT--TATCGCA---AAAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTTTGATG-A--TAT-AACAG---GT-T---G---G--A---A-G----GAATTT-CC--C----AT-G--T-G------GC-A--CG-A--TG--GTTGTT-------------T---A-TA-C-AC---TGAC-AAGCG---G-TTT-TT-AGTAAAATA------TGC----------A-GCA-G-TTGGAAGA-AGTT-T-A----------CATTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTGT-TA--A---TA--C-T-TGC----TG-T--TTTC-AC-TC-G-G---AC-ACCTTAACCC
gi|7 : ATGATGGATCCAA-AAACGCTTCCCTCACTCTTATGTCAACATTTGATAATTTGTAAACAATTGAGGTGAAGTTTAAGATTACACTCAGGAGACATTTTTTTGAATTATAAACATATAGGCAACGCGGTACCTGGATGAGCAAGAATT-GCAGAAAACGATGGTATGTAATAGCCCAGTGATTACCGGAGCGATGTATGGGTCGAAAAGCATGATGCTATA-AAACGAGAACAAAGGGTGGTTAAGACGTCCCGATGAAA-GTCAC--TGTGCTG--TACATAAA-TGCACAT-CA-GT---ATGT---GA-TG---------ACA-T----------AATA--C-A-C-AACTACGT---C-CCTACAC-ACA----GT-TC---T-AGGCGT-TGTAT-CATGGTGGAA------CTTAC-TA-----CAG----TA-TT---TAC-T-A-CA---------A---A------T-AC-CAAG-------CGTCCAA--GA-T-GCATACTT---AT-G----TGT---A-AATTTGTTT-GTC-AA-----ATGA------GTC-T-TTG-C-T--A--AT----TTTTTTATTGATAATATAT---G----TCTCCTG--TTTCTAAATATCTA-----------AA-----T-A---------TA-T-------C-GTGA--ATT-------TCG--AT-ATT-TT-TCATCA-TT--AGAATG-TGACATT-A-----A-AATC-----------ACCCCCCC----------------CC---C-------------C---GTGCGC------------AT------------TGGCATTGTAGA---ATA------C--AGA--A-----A--AGCAAT-CGTA--CACACA-TA-------TCGACTTG-ATT-AA-AGCCTTTA---AAGGCTGAT-A---TTT--T
gi|53 : CACAGGGTGGTTAAGGCGTCCTGATGAAA-Gagactcacaggtttacctcaggtaa
gi|33 : agaaCGCACAGAGGAAA-TTCAC--TGTACTA--TTCATAAA-TGTGTCTCAATGT---ATTT---CA-CA---------CTA-TTTGATTTCTGAATA--C-A-A-AAGTACTT---CACG-ACGT-ACG----GG-TT---T-ACAAGT-TGTAT-CTTGG-GGAGA
gi|2 : acagagcgtaggcaagcATGAAATGCCACAATTGGCTGAGTATGTAAACTGGACCT-CA-GTGGCACTTCGCAG-TAGCGTGACGATCAGC----------AATA--CTA-ATAAGTACGTGCTCACGTACAT-ACA----GT-CAAAATGACGCGTGTGTAT-TGTGGGGAAGATA--TAAGAAATAT-TATTAATCGTTAATT---TAC-T-A-CA---------A---T------TTAT-CAAATAGTGTACGCCCAA--GG-CTGCG----T---AT-G----AGT---ATAATCTGTTT-GTC-AA-----AT--------TTA-T-TTGGT-T--A--ATGTAATTTACT-TTGAT--------A-A----TGCCATA--TA--------T-TA-----------AAAAGA-TGA---------TA-G-------T-GTGA--ATT-------TAA--AT-ATT-CT-TAATTA-CCTAAGACTGATGCGCTT-G-----A-AATC-----------G------C----------------CC---C-------------C---ATTGATCGCGCATTGTTAAT------------T-------TAGA---ATA------CTTAGA--A-----AAGGCAAATTCGTG--TATAAACTACCCACGCTCGTCTTG-GTTTCA-AGCCTTTA---A-GAT-GATTA---CTTCTTC-AGACGA------------TTAAG-CATA-TTCC------GAAGT----GGTAGATTACAGTAGTT---G--A--GAT--TA--A-----------AGAT-------------TTTGA-CAG-----C-GG--AATGTAATG-ATTGTTT------TGC-CATCGTTTAGA-T----A---TTA-------A-TTTGGGTTCTGGG-CA-GTGGAGTTGC-----GGAAATGCCAAATTCGTA--------------G----A---------------A-------------T--------T-GA-A---A-----TT-----A-----TGGGTATTTGGC--------T-AA-AACTCAT-GCAGATTGATTGTA--TCCTGA-GC--GGGTCACTTTTTCAATTTATCATTC--A-TT--AT-C--TA-C---CGGTATAATCAA------CACATC--A-AGCC--A-ACTGCAA-ATGATTTG-----AATGGCA-TTATAAG--GCTTT-A-ACC---AG-T-G-----GT----T---C-AA------------TT--TAGCGGATG-AAAAATA-GCTAT-ATGGCGT-CAGCTGGT---ATGTA--CAT-GAC-----GT------------A---A-------AATTT-CCA-C----CC-G--T-G------TC-A--CGTA--T---GTTG-------------------A-GA-C-A---------AAGCGTAAT-TTT-TT-AGTAAAATAGT----TGTCG--------G-GCG-GTTTGGGATA-ATTTGT-ATTTGAT----CTTTAA---TTTGA-----T-T--A-TG-GCT-T-TA--T---TA--C---CGT----TA-TA-TTTT-ACTTC-G-GGA-ACAACCTTAACCt
gi|36 : A-GT---AGTT---GGATG---------TCA-C----------AATAA-C-AGA-AAATATGT---CACAACCGCTACATGGGGTCTA---T-ACGCAT-TGTCT-CGTGG-GAAAATG--TCAT-A-TATGT-TTAT-CGTTA-TT----AC-T-A-CATGTAG----A---T------C-TT-CACG-------TGTTCAA--
gi|16 : t-GT---ATTT---G--------------CA-G----------AATGACC-A-A-ACGAACGT---CACGA-CTT-ACA----GG-TT---T-ACGCGT-TGTAT-CGTTGAGAAAATG--TCATA----T-T-TTAT-CATTC-TT---AAC-T-A-CA---------A---T------T-AT-CAAG-------TGTTCAA--AC-T-GTA----T---AT-G----TGT---A-CATCTGTTT-GCC-AA-----ATGA------TTC-T-TTA-T-C--A--AG----TTAACT-TTAATAAGATATA-------TATCCTG--TT--------TTTA-----------TA-----T-ATACATG---TA-G-------T-GTGG--AAT-------TTA--AT-TTG-CT-TAATCA-TT--AAATGG-TGATATT-GATTCAA-AATT-----------G------C----------------CC---C-------------C---AATGCGCAGTGAT-----AT------------T-------TACA---ATC------T--AGA--A-----A--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACGTG-GTT--A-GGCGTTTC---GTGAC-GAT-A---TTT--TC-TTTCGA------------
gi|23 : ctaaaagctgatgat----------AATA--C-G-A-AAGTACGT---C-ATGACGT-ACA----CG-TC---T-ACGTNN-NNNNN-NNNNNNNNNNNNN--NNNNNN-NNN-N-NNNN-NNNNN-TTCACAACATGA-CA---------ACGCT------T-AA-AAAG-------TGTTCAA--AC-T-GTA----T---AT-G----TGT---A-AATTTGTTT-GCC-AA-----ATGA------TTG-T-TTG-T-T--T--AG----TTTCCT-TTGACAATATACAA-GCA--TCTTGTA--TT--------TATA-----------TACACTGT-A---------TA-G-------T-GTGA--AAT-------ATA--AT-ATC-AT-TAACCA-TT--ATATTgcgagatacttagttggaaaatatttt
gi|11 : atgcacttcgcaCA----GG-TC---T-ACGTGT-AACAT-CGTGG-GGAAA-GATTCATCA-AAT-T-GTAT-CGTTG-TT---TAC-T-AACA---------G---TAGACTCC-ATTCACG-------TGTTCAA--GA-T-GTA----T---AT-G----TGT---ATAATATGTTT-GTC-AA-----GTG-------TTA-TGTTG-T-T--A--AG----TT-TCT-GTGGTGATAT-TAA-TATTTTTTTTTG--TT--------TTTATATCTATTGTGGA-----T-A---------TA-ATAAAAACC-AATC--ATTATTATTATTATCAT-ATTACT-TAATTAATT--ACATTG-TTACTTTTG-----ACAATTTATTCCCAAATG------T----------------GC---ATTA----------C---T-----------------AT------------T-------TAGA---ATA------T--AGA--A-----A--GTTAAT-CATG--TATATA-TA-------TCGACTTGCGTT-CAGAG--TGTA---ATGAC-GAT-A---TTT--TCTATTCGA------------TCAATGTATATTTCC------TAA-A----TGTAACT------CCTTTG-GCAA--GTT--TA--A-----------AGAT-------------TTTGA-CA--------GGTTATGGT-GG--GTT-TTT------TGC-C-TTGTTTAGC-A----A---ATA-------T-TTG---------G-CA-ATGAA--Ta
gi|3 : gtacgttgacggcggcattg---T-ACGCCT-TGTACCAATG-TGAAAATA--TAATGA-TAG-T-TTAC-AGTCA-TT---TAC-T-A-CA---------A---T------T-AG-CAAG-------TATCCAT--GC-T-GCA----T---AC-G----TAT---A-AATTTGTTT-GTA-AA-----A--A------TTT-T-TTC-TAT--A--AG----ATTTAT-TTGATAATACATAA-G----TCCCCTG--TT--------CCTA-----------TA-----T-ACATTATGTATA-G-------T-GTGA--ATT-------TCA--AT-ATT-CT-TAATCA-TT--ACACTG-TGACATT-G-----A-AATC-----------G------C-----------------C---CTCAATGCGCATTGC---A-----------------AT------------T-------TAGA---ATA------T--AGA--G-----A--CTCAA---GTGAATATAAA-TG-------TAGACTGG-GTT-CA-AGCCTTTA---ATGAC-AAT-A---TTT--TC-TTTCGT------------CCAAGGTATA-TTCC------AAA-A----GGT---T------AGTT---GC-A--GAT--TA--A-----------AAAT-------------TTTGA-CA------C-GG--GTGGC-AT--ATTTTTT------T-T-C-TAGTTTAAA-T----A---TTA-------T-TTG---------G-CA-GTATA--TGC-----GG---------------A--------------A----ATCCCCAAC-------A-------------T--------TAGA-A---T-----TG-----AAAGTTTGGGTGTT--GC--------T-AA-C---TTT-G-AGA--G------------GATC--------ATTTTT-----------TAA-AA-TTTATC-A--TA-T---C--TAT-ATTAA------CACATC--A-AGCCCAA-ACTGCAA-ATGATTTT-----AGT-GCA-TTA-AAG--GCTTG-A-A-C---CGAA-G-----GTA--ATAAAT-AACTGAAA----A-----TGTAGCAGATAAAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTGATATGATG-T--CGT-AACA-----T-TTAAG---C--A---A-G----GAATTTCCC--C----AC-T--T-G------GC-A--CG-A--TA--TCTGTT-------------T---A-TG-A-AT---TGAC-AAACA---G-TCT-TT-AGTAAAATA------AGC----------G-GCG-G-TTGGAATA-ATTT-T-A----------CTTTAA---TTTGA-----T-T--A-T--ACTTT-CA--T---TA--T-T-CGT----TA-A--TTTC-CC-TCGG-G---AC-ACataggaaacactcaatatttgata
gi|35 : CAAAA-AAT-C-TCA----TCA-TT---TAT-T-A-CC---------A---T------T-AT-CAAG-------TGTTGAACTGTAT-ACA----TTGTAT-G----TGT---A-AATCTGTTT-GTC-AATACATGTGAAATTTTTTT-T-TCG-T-C------T----TCTTCT-TTGAT----TATAATG----TCTGATG--CT--------TTT
gi|4 : TGA-TAT-T-TTAT-CTTCA-TT---TGC-T-A-CA---------A---T------T-AT-CAAG-------TATTAAT--GC-T-GCA----T---AC-G----TAT---A-AATCAGTTT-TTG-AA-----ATTA------TTT-T-T-G-A-T--A--AT----ATTCCA-TTGATAATACATAA-G----TATCCTG--TT--------CCTA-----------TA-----T-A---------TA-G-------T-GTGA--ATT-------TCA--AT-ATT-CT-TAATCA-TT--ACACTG-TGACATT-G-----A-AATC-----------G------C----------------CC---C-------------C---A-----------------ATGCGCATTGCAATT-------TAGA---AAA------T--AGA--G-----A--CTCAAG-CGGA--TATAAA-TG-------TAGAATGG-GTT-CA-CGCCTTTA---ATGAC-AAT-G---TTT--TC-TTTCGT------------CCAAGGTATA-TTCCAAAGGTTAG-TTGCAGGTAAAA------GATTTTGGC-ATGGATGGTATCATTTTTTCCCCTAG-C-------------TTTGA-CA------C-GG--ATGGC-AT--ATTTTTT------T-C-C-TAGTTTAAA-T----A---TTA-------T-TTG---------G-CA-GTGAA--TGC-----GG---------------AAATGCCCAACATAAG----A---------------A-------------T--------T-GA-AAG-T-----T------------TGGGTGTT--GT--------T-AA-C---TTT-G-AGA--GGATATT-ACACCGATCT--GGGTCATTTTT----TTT-TT-TAA-AA-TTCATC-A--TA-T---C--TAT-ATTAC------CACATC--A-AGCCGAA-ACTGCAA-ATGATTTT-----AGT-GCA-TTA-GAA--GCTTG-A-A-C---CG-AAG-----GTA--ATATAT-AACTGAAA----A-TA--TAGCGGAT--AAAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTGATTTGATG-T--CGT-AACA-----T-TTAAG---C--A---A-G----GAATTT-CC--CC---AC-G--T-G------GC-A--CG-A--TG--TCTGTT-------------A---A-TA-A-AT---TGAC-AAACA---A-TTT-TT-AGTAAAATA------AGC----------G-GCA-G-TTGGAATA-ATTT-T-A----------CTTTAA---TTTGA-----T-T--A-T--
gi|30 : A-TAT-T-TTAT-CGTTA-TT---TGC-T-A-AA---------A---T------T-AT-CAAGACTTTAGTGTTCAA--GC-T-GTG----T---AT-G----CGT---A-AATCTGTTT-GTG-AA-----AAGT------TTCTT-TTG-T-T------TTGG-TTTTCT-TTAATTATATATTA-C----TCTCCTG--TA--------TCTA-----------aatttca
gi|40 : tc-TAT-C-TTAT-CATTA-TT---CAC-T-A-CT---------A---T------A-AT-CAAA-------TGTTTAA--GC-T-ATG----T---AT-A----TGA---A-AATCTTTTTTGTC-AA-----AAGA------TTtctatccatctacatgtatgtaatggaa
gi|5 : ttggaaaaaaacctT-T-TTAT-CGTTA-TT---TAC-T-A-CAGCAGACTCTA---T------T-CC-C--G-------TGTTTAA--GC-T-GTT----T---AT-G----TGT---A-AATCAGTTT-GTC-AG-----ATTA------TTC-T-TTG-T-T--A--AG----TTTTCT-TTGATA--ATACAA-A----TATCCTC--TT--------TTTA-----------TA-----C-A---------TA-G-------T-G-TG--AAT-------TAA--ATTATT-CT-TA-----------------GACCTT-G-----A-AATT-----------G------C----------------CT---C-------------C---A-----------------ATGCACATTGCTATT-------TAGA---ATA------T--AGA--A-----A--GCGAGT-CGTG--TGTATA-TA-------TCGACTTG-ATT-CA-AGTGTTTA---ATGAC-GAT-A---TTT--CC-TTTCAA------------CCAAGGTATA-TTTC------TAA-C----GGAAACT------AGCA---GC-A--GAT--TT--A-----------AAAT-------------TTTGA-CG------C-GG--ATGGT-AG--AATTTTT------TGC-C-ATGTTTAGAGT----ACT-TTAGGTGATCT-TTG---------G-TA-GCCAA--TGT-----GG---------------AAATGCCCAACATTTG----A---------------A-------------T--------T-GA-A---A-----TT-----A-----TGGGTATT--GA--------T-CA-A---TAC-G-AGA--GGATATT-GTGTCGATCC--GGGCCACTTT------------TTC-AA-TTTATC-A--CA-T---C--TAT-ATCGA------CACATC--A-AGCCTAA-ACTGCAA-ATGATATG-----AGT-GCA-TTA-ATC--GCCTG-----C-------------------ATAAAC-AATT-GAA----AGTC--TA--GCAGATAAAAATA-GCTTT-A---CGT-CA-CATGTATGATG-A--CGT-AATAG---GT-A---A---AC-A---A-G----GGATTTCCC--C----AC-G--T-G------GC-A--CG-A--TG--TTTGGT-------------------TA-C-AT---TGAT-AAATA---A-TTT-TT-AGTAAAATA------TGT----------G-CCG-C-TTGGAAGA-ATTT-T-A----------CTTTAA---TTTGA-----A-TAAA-TAGGCTGT-T---A---TA--C-T-TGT----TT-A--TTTA-AC-TC-T-G---AC-
gi|8 : g-A-CA---------A---T------T-AT-CAAA-------CATTCAA--GC-C-G------T---AT-G--------------------T-GTC-AA-----ATAA------TTC-TATTT-T-A--A--ATTAA-TTTTCT-TTAATGACATGTAA-G----TCTCCTGAATT--------TATA-----------TA-----T-A---------CATG-------TAGTTTGAATT-------ACC--AT-ATT-CT-TAATCA-CT--ACACTG-TGACCTT-G-----A-AATC-----------A------T----------------TC---C-------------CAGTG-----------------ATCA----------T-------TGCT---ATT------T--AGAATA-----A--GCCA-----------------A-------TCAACTTG-GCA-CA-GG---TTAAAGATGAC-TAT-A---TTT--TC-TTTCAA------------TCAAGACGTA-TTgcatt
gi|6 : -CA---------A---T------T-AT-CATA-------TGTGCAA--GC-T-GCA----T---AT-GCATGTGT---A-GATCTGTTT-GTCCAA-----ATGA------TTC-T-TTG-T-T--A--AG----TTTTCT-TAGATAATATATAA-G----TCTCCTG--TT--------TCTA-----------TA-----T-A---------TA-G-------T-GTGA--ATT-------TCA--AT-ATT-CT-TAATCA-TT--ACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT------------G------C----------------GCATTG-------------C---A-----------------ATG-----------T-------TAGA---ATA------T--AGA--A-----A--CTCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCAAATTG-GTT-CA-AGCCTTTA---ATGAC-----A---TTT--TC--TTCGA------------CCAAAGCATA-TTTC------TAA-A----GATAATT------AGTT---GC-A--GAT--TA--A-----------ATAT-------------TTTGA-CA------C-GG--ATAGC-AT--GATTTGT------TGC-C-TCGTTTAGA-T----A---TTA-------T-TTG---------G-CC-GGGAA--TGC-----GG---------------A--------------A----A----------------------------------------GG-A---C-----TA-----ACAT--TAGG-ATT--G-----------AA-A---TAC-G-AGA--GGATATT-AAACCGATCC--GGGTCACTTGTAT-------------AA-TTTAATAA--CA-T---C--TAT-ATCAA------TACACC--A-AGGCCAA-ACTACAA-A---------------------TG-AAT--ATTTG-A-A-C---CG-T-G-----GTA--ATAAAC-AAC-AGAA----AGTC--TAGCGGAT--AAAAATT-ACTCT-A---CGT-CA-CTGGTATGATG-A--CGT-AACA----GT-TAA-G---C--A---G-G----GAGTTT-CC--CT---AC-G--T-G------GA-A--CA-A--TG--TTCGTT-------------T---A-CA-C-AT---TGAC-AAACA---A-TAT-TT-AGCAAATCA------TAC----------G-GTG-G-TAGGAAG---------A----------CTTTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTGT-TA--T---TA--C-T-CGT----TA-T--TCTC-CC-TCGG-G---AC-ACCTTACCCttttgcctcgttttgattatatttgacagtgaatgtgaaaatgcccaacatataaatcaaaattatagaaatggctacaaacgaggggatattataccgatccggatcacttttaaatttatcatatcgatacattaggcccaaactgcaaatgatttgaatgcaataattgcttatccatggtaataacaactgaaagtctagcggataaaaacagttctacctcacttgtacgaatatgtaataggaaagcatgggatttacccacgtggtatgatgtttgtttatatattgacaaaaagattttttgtaaaatacatgtatgtgacgcttgaaagaaatttactttgatttgaatatgctgtaattatttctaatttcactcattacacctttatatcaccactg
gi|29 : tatttTCCAACCGC-C-GCA----T---ATTG----TGCTAAA-AATC-GTTT-GTC-AA-----
gi|34 : ataaattcatgtcatggtatgatgacgttaacatgtaagcaagaaatttccccaagtcgcatgatgtttgtttatacaA----T---AG-G----CGT---A-AATCTGATT-GTT-AG-----ATGA------TTC---TCG-T-TTCAGTAT----TTTTTT-TTAA-ACTATATAA-G----TCTTCTA--TT--------TTTA-----------TA-----T-A---------CA-G-------T-GTGA--ATT-------AAG--AT-AAT-CT-TAATaaaaaattaccttaagttggatgtgctgttatcatacgtttatttaac
gi|14 : ttattagaatttaatgatataattaagctctat----T---AT-G----TGT---A-AATCTGTTT-GTC-AA-----ATCA------TTT-T-TTA-T-T--A--AG----ATTCCT-TTGATAATACATAA-G----TCTCCTG--TT--------TCTA-----------TA-----T-A---------TA-G-------T-GTGC--ATT-------TTG--AT-A------------------CACTG-TGACCTT-G-----A-AATC-----------G------A----------------CC---C-------------C---A-----------------ATGCGCA-------T-------TGTA---ATAATTATTT--AGA--A---------------TGTG--TACAGA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTTG---GTAAC-GAT-A---TTT--TC--TCCGA------------TCAAGGCATA-TTCG------TAA-A----GGTAATG------AATT---GC-A--GAT--TA--A-----------AGAT-------------TTTGA-CA------C-GG--TTGGC-GTG-GTTCTTT------TGC-C-TCGTTTAAA-T----A---TTA-------T-TTG---------A-CA-ATGAA--TGC-----GG---------------A--------------C----ATGCTTAAC-------A-------------T--------TAGA-A---A-----TT-----A-----TGGTTATT--GCTACATGTGT-AA-A---TAC-A-AGA--GGATATT-GTACCGATCC--GGG------TCGTT--------TTC-AA-TTTATC-A--TA-T---T--TAT-ACCAA------CACATC--A-ATCCCAA-ACTCCAA-ATGATATGACTAAAGT-GCA-TT--AAT----TTG-A-A-
gi|13 : ----T---GT-G----TGT---A-AATCTGTTA-GTC-AA-----GTGA------TTC-T-TTT-T-T--A--GC----TTT-CT-TTGATAATATGTAA-G----TCTCCTG--TT-----------------------AA-------A---------TA-G-------T-GTGC--ATT-------ACA--GA-AAT-CT-TGAT-A-TA--ACATTG-TGACCTT-G-----A-AATC-----------G------TCAACAATTTGCTTATAGC---C-----------------------------------AT------------T-------TAGA---ATA------A--AGA--A-----A--TTCAAT-CGTG--TGTACA-TA-------TCGACTTG-GCA-CA-GGTGAAAA---ATAAT-GAA-A---TTT--TC-TTTCGA------------TCAATGCATA-TTCC------TAA-----------------------------A--GAT--TT--G-----------AAAT-------------TTTGA-CACAAGGCC-GG--ATGG--AT--TTTTTTTTTAAAATGCTT-TCGTTTAGA-A----A---AGA-------T-TTG---------G-TA-GTGAA--TGT-----GG---------------G--------------A----A---------------ATACCCATTAACATT--------T-GA-A---TCAAAATG-----A-----TGAAAATT--GC--------T-AA-A---TAC-G-AGA--GCATATG-ATACCGGTGC--TGATCA----CGTT--------CTA-AA-TT--------CA-T---CA-TGT-ATCG--------ACATGTCA-AACCCAA-ACTGCAA-A-----TG-----AGT-G-----G-AAT--AC
gi|18 : G-T-T--A--AG----TTTTCT-TTGATAATATATAA-G----TCTTCCA--TT--------TCTA-----------TA-----T-A---------TA-G-------T-GTGA--ATT-------TCA--AA-ATT-CT-TAATCA-TT--GCACTG-TGACCTT-G-----A-AATC-----------G------C----------------CC---C-------------C---A-----------------ATGCGCA-------T-------TGGA---ATT------T--AGA--A---------------TGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTTA---ATGAT-GAT-A---TTT--TC-TTTCGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN------NNN-N----NNNNNNN------NNNN---NN-N--GAT--TA--A-----------AGAT-------------ATGGA-CA------A-GG--CTGGT-AT--GATTGTT------TGT-C-TCGTTAAGA-T----A---TTA-------T-TTG---------G-CA-GTGGA--TGC-----AGAAATGCCCAACATT-A--------------G----A---------------A-------------T--------T-TA-A---A-----TC-----A-----TGGGTATT--GC--------T-AA-A---TAT-G-AGA--GGATATT-GTACTGatccttcacctgtgccgatataa
gi|9 : tT-GTT-TTACAATTA-TT--ACATTG-TGACCAT-G-----A-AATC-----------G------T----------------CC---CAATGCACATTG--C---T-----------------AT------------T-------TAGA---ATA------T--AGA--G-----A--GTCAGC-GGTG--TATACA-AA-------TCGACTTG-GTT-CA-GGCGTCTA---ATGAC-GAT-A---ATT--TC-TTTCGA------------TCAAAGCAAA-TTTC------TAA------GGTAACT------AGTG---TC-A--GAT--T---------------------------------TTGA-CA------T-GG--ATGAT-AGG-ATT--TT------TGC-C-TTGTTTACA-T----G---ATA-------T-TTG---------A-CA-GTGAAA-TGT-----AG---------------A--------------GTGTCA---------------ACGATC--------T--------T-GA-AC--T-----TA-----AAATTATAGGTATT--GCAT------T-AA-A---CAC-G-AGG--GGATATCTGTACCGAATCAAGGATCCTTTTTATTG---------C-GA----GAT-C--TA-TTTCC--TAG-A-CAT------CAAATC--A-----CAA-ACAGCAA-ATAGTTTC-----AGT-GCA-TTA-ATC--GCCTG-A-A-C---CG-T-G-----GTA--ATAAAC-AACTGATAGTCCAGTGAATATCG--------AATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTTTATGATG-A--CGT-AATAG---GTAT---AAGCA--A---A-G----GCATTT-CT--CTATAAC-A--T-G------TC-A--CG-A--T----CTTTT-------------T---A-TA-CTAT---TGAA-AAACG---A-TTT-TT-AGTAAAATA------TGG----------ACGC--T-TTGGAA-A-ATTT-G-A----------CTTGAA---TAGGA-----ATT--A-T--GC-GT-TA--T---TA--CTT-TGTTACATG-TAATTTCAAC-TC-G-G---AC-AACTTAA
gi|41 : tagtgCTT-G-----A-AATC-----------A------C----------------AA---T-----------------------------------GT------------T-------TAAAGGCATT------T--AGA--ATAATGA--GTCAAT-CATT--CATAGA-CA-------ACGACTTG-ATA-TA-AGTac
gi|27 : T------------T-------TAGA---ATA------T--AGA--A-----A--GCCAAT-CCTG--TATGC--TA-------TCGACTTC-GTT-CA-GGC----------------------TTT--TC-TTTAGA------------TCAAAATATA-TTCT------TAA-A----GGTAATT------ACTT---GC-----AT--------------------AT-------------TT----------------------C-AT--ATTTTCT------TGC-C-TCATTTAGA-T----gaaagataaaga
gi|10 : TACA-TA-------TCGATTTG-GTT-CA-AGCCTTTA---ATGAC-GAA-A---ATT--TC-TTTCGA------------CCAAGGCATA-TTCT------GAA------GGTAAATT-----AGTT---AC-A--GAT--TA--A-----------AGAT-------------TGTTG-TA------C-GG--ATGGT-ATGAATT--TT------TGC-C-TCCTTTACA-T----A---TTA-------G-TTG---------A-CA-GTGAA--TGC-----AG---------------A--------------A----ATACCCAACCTTACA-A-------------T--------T-GATA---T-----T------A-----TGGATATT--GC--------T-AA-A---TAC-A-AGA--TGATATT-GTACCGA-CC--AGGTCATTTTT-----------TAA-AA-TTTATA-A--TA-T---C--TGC-ATCAA------CACTTT--G-AGCCCAA-AATGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTT-AAG--AATTG-A-A-C---CG-T-G-----GTA--ATAAAT-AGCT-GTA----AGTC--TAGCG-G---ATAAATACACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATGATG-ACGTTT-ATCAG---GT-A---A---GC-A---A-G----GATTTT-CC--CA---AT-G--T-G------GC-A--CG-A--TG--TTTGTT-------------T---A-TA-C-AT---TGAC-AAACG---A-TGT-TT-AATAAGATA------TGC----------G-GT--G-TGGGAAGA-ATTT-T-A----------CTTTAA---TTTGG-----A-T--A-C--GCTGT-TA--T---TA--C-T-CGT----TA-A--TTTC-AC-TCAG-A---AC-ACCTTAACTCgagatttggtatgatttgagtgcaataataacctgaaccgtagtaataaacaattg
gi|19 : A-TG-------TCTACTTG-GTA-CA-GGCGAACG---ATGAC-GAT-AATATTT--TC-TTTCGA------------TCAAGGCATA-TTCT------TAA-A----AGTAACT------AGAT---GC-A--AAT--TT--A-----------AGAT-------------TTTAG-CA------G-GG--AATGT-AGG-ATTCCCT------C-C-C-TTGTGTA---T----A---TTA-------TATTT---------GGCA-GTGAA--TGT-----AA---------------A--------------A----ATGCCCAAT-------A-------------T--------TGGA-A---T-----CGGCATTA-----TGGAAATT--GT--------T-AA-A---TAC-A-AGA--GGGTATc
gi|12 : ag---ATGAC-GAT-A---TTT--TC-TTTCGG------------CTAATTCATA-TTCC------CAA-C----GGTAAGT------AGTT---GC-A--GAT--TT--A-----------AGAT-------------TTTGA-CA------C-GA--ATGGT-AT--AATGTTT------TGC-C-TC---------------------------C-TTT---------G-CA-GTGAA--TAT-----GG---------------A--------------A----ATGTCCAACATTTGC-A-------------C--------T-GA-A---A-----TC-----A-----TGGGTATT--GC--------TTAATA---TAC-C-AAG--GGATATT-ATACTGAACC--GGGTAACATT------------TTC-AA-TTTATC-A--TA-A---C--GAT-ATCGA------TACATC--A-AGCCCAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTA-ATT--ACCTG-A-A-C---CG-T-G-----ATA--ATAAAC-AACT-GAA----AGTC--TAGCGGAT--AAAAATA-TCTCT-A---CGT-CA-CTTGTATTATG-A--TGT-AATAG---GT-A---A---GCAA---A-G----GATTTT-CCAAC----GT-GACT-G------AC-A--CT-G--TG--TTTCTT-------------A---A-TA-C-AT---TGAA-AAGCG---C-ATT-TC-AGTCAAATA------TGC----------G-ACG-C-TTTGAAGA-ATTT-C-A----------CTTTAA---TTTGA-----A-C--A-T--GATGT-TA--T---TA--C-T-TGA----TA-A--TTTC-AC-TC-GTG---AC-ACCATAACCtgcaatcacatgtgccgttgcgataaacaactagaaagctttcggataagaaaactcaatgtcgtttgtatgatgacgtaattgttaaagatttccaacgtggtacgatgtttgctgacgaattcatctctcaataaa
gi|8 : ttC-A--GGT--TA--A-----------AGATGACTATATTTTCTTTCAATCA--------AG--ACG----T--ATT-TTT------TGC-C-TCGTTTTGA-T----T---ATA-------T-TTG---------A-CA-GTGAA--TGT-----GA---------------A--------------A----ATGCCCAAC-------A-------------TA-------T-AA-A---TCAAAATT-----A-----TAGAAATG--GC--------T-AC-A---AAC-G-AGG--GGATATT-ATACCGATCC--GGATCACTTTTA--------------AA-TTTATC-A--TA-T---C--GAT-A------------CATT--A-GGCCCAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AAT-GCA-ATA-ATT--GCTTA-T-C-C---A--T-G-----GTA--ATAA-C-AACTGAAA-----GTC--TAGCGGAT--AAAAACA-GTTCT-A---CCT-CA-CTTGTACGAAT-A--TGT-AATAG---GA-A---A---G--C---ATG----GGATTTACC--C----AC-G--T-G------GT-A--TG-A--TG--TTTGTT-------------T---A-TA-T-AT---TGAC-AAAAA---GATTT-TT-TGTAAAATACATGTATGT----------G-ACG-C-TTGAAAGA-AATT-T-A----------CTTTGA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTGT-AA--T---TA--T-T-T-C----TA-A--TTTC-AC-TC-ATT---AC-ACCTT
gi|15 : acaattatcaaacattcaagccgtatgtgtcaaataattctattttaaattaattttctttaatgacatgtaagtctcctgaatttatatatacatgtagtttgaattaccatattcttaatcactacactgtgaccttgaaatcattcccagtgatcattgctatttagaataagccaatcaacttggcaAA-CA------CTGG--ATAGT-AG--GATGATT------TGC-C-TCGTTTAGA-A----AAATTTG-------TATTG---------G-CAAGTGAA--TGC-----CG---------------A--------------A----A---------------A-------------TACCATGTTT-GA-AATTTGCAAATG-----A-----TGAG------GG--------T-AA-A---TGCTA-AGG--GATTATC-GTAACGATCC--AGGCCCCCTTT------------TC-AAATTCAGC-A--TAAT---A--CAT-ACCGA------CACACA--A-AGC-CAA-A----AA-ACTGC--A-----AGA-ACA-TTG-A-----CTGA-A-A-A---AT-T-G-----G------AAAT-GGCTAG---------------CGAT---AAAAATA-GCTCT-A---CGT-CA-CTGGT---ATG-A------AA-----------------G--C---A-G----GGATTT-CC--C----AC-C--T-G------GCAA--TG-A--TGACGCCG---------------T---A-AA-C-A---------AAGCG---A-TGT-TG-AGGAAAATA------TGC----------A-AAACG-TGGAAATA-ATTT-T-A----------ATTTAA---TCTGA-----A-T--A-T--GCTGTATA--AT--TA--T-T-TGtatatcaccactg
gi|21 : tgTT------TGT-C-TCGTTTAGA-CTCTCA---ATA-------T-TTG---------G-CA-GTGAA--TGT-----GG---------------A--------------A----ATACCCAATATTTAACA-------------T--------T-GA-A---A-----TT-----A-----TGGATATT--CC--------TAAA-A---TA--G-AGG--GGATAT--GTACCGATTC--AAG--------GTCGCTT-TT-GACAAA-ATTATC-AACTA-T---C--GAT-ATCGA------CACATC--A-AG--CAA-ACTGGTA-ATTATATG-----G---GCA-TTA-GATTCACCTG---C-C---AA-T-G-----ACATTTTAAACAAACT---G----AGTC--TAGCATAT--GATAATA-GCTCTAA---CCTGCG-CTTGTtctcaatataatcaactcgggagttcttac
gi|17 : TTAGA-T----A---AAA-------T-CTT---------G-TA-GGGGA--TGCATGTTGG---------------AAATACC--------G----A---------------ACT-----------T--------T-GA-T---T-----CGTTATCA-----TGGAAATA--GC--------T-AA-A---TGC-A-ATA--GGGTGTT-GTACCGTTCT--GGATCATTTT--------------A-AA-TTTG---------T---C--T-T-ATCAA------TATATC--G-ACCCCAA-ACTGTAA-ATGATCAG-----AGC-ACA-CC--------CTTC-A-G-T---TG-T-GCCAATGTA--GTATAT-AACTAGAA-----GTC--T--TGCG---GAAAA------CT-A---GCT-CA-CTTGCATGATT-A--CGT-TATA-----T-T---G---A--AGCGA-G----GGTTTT-CC--A----AA-G--T-G------GC-T--CA-A--TG------TT-------------T---A-TG-T-AT---TGAC-AAACG---A-TTG-T--AATAAAATA------TGC----------G-ACA-C-TTTGAAGA-ATTT-T-T----------CTTTGA---ATTCA-----A-T--A-T--GGTGT-CA--g
gi|20 : -TTTAAT-------T---C--TTT-ATTATTTTACTCACATG--A-A--TCAATATTGCAAGATTATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--ACT-G-ATATC---AG-T-T-----GTA---TA--C-AACTAAAA----AGTT--TATCGC----AAAAATA-ACTC--A---CGT-CA-CTTGTTTGATG-A------AATAG---GT-T-------G--A---A-A----GAATTT--C--C----ATGG--T-G------CC-A--CG-A--TG--GTTGTT-------------TATAA-TA-C-AC---TGAC-AA-CG---G-----TT-AGTAAAA-A------TAC----------A--------CGGAAT--AGTT-T-A----------CATT-----T---A-----A-T--A-A--AC-GT-AA--T---TA--C-TATGC----TG----TTTC-AC-TC-G-A------ACCTTAACCtcatttatatgcgacactttgaagaat
gi|38 : atatt------CACATT--ACAGCCCAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCAGCTG-AAT--GTTTGAA-A-CGAGAG-C-G-------A--AT--AC-AACTAGAG-------T--TATGTCA---GAGAAGA-Aac
gi|22 : actgttcatttatcgtaattaataa-AGCCCAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-CTG-AAT--GTTTG-A-A-C---CG-T-G-----GAA--ATAAAC-AACT-GAA----AGTC--TAGCGGAT--AAAAATA-ACTTT-A---CTT-CA-CTGGTATTATG-A--CAT-AACGG---GT-A---A---G--C---ATG----GCATTT-CCA-C----GC-A--T-G------AC-A--CG-A--TG--TTTGTT-------------C---T-TA----------------CG---A-TTC-TT-AGTAAAATA------TGC----------G-GCA-G-TTGGAAGA-ATTT-T-A----------CTTTAA---TTTGA-----T-T--G-T--GCTGT-TA--T---TA--C-T-CGT----TA-A--TTTC-AC-TTGG-G---AC-ACCTTAACCga
gi|19 : AA-ATTGTTA-AATACAAG-----AGG-GTA-TTGCAATC-ACATG-T-G-C---CG-T-T-----GCG--ATAAAC-AACTAGAA----AGCT--T-TCGGA---TAAGAAA-ACTCA-A---TGT-CG-TTTGTATGATG-A--CGT-AA-------T-T---GTT-A--A---A-G------ATTT-CC--A----AC-G--T-G------GT-A--CG-A--TG--TTTGCT-------------
gi|31 : agatgtctacttggtacaggcgaacgatgacgataatattttctttcgatcaaggcatattcttaaaagtaactagatgcaaatttaagattttagcagggaatgtaggattccctcccttgtgtatattatatttggcagtgaatgtaaaaatgcccaatattggaatcggcattatggCAA-ATGACTTG-----ATT-GCA-TTA-ATC--AACTG-T-G-C---CG-T-G-----GAG--AAAAAC-AATCGATA----A-TC--TAGTGAA---TAAAATA-GTTCT-A---TGT-CA-CTTTTACGATG-A--TGT-AATAGATAAT-T----------A---A-G----GTATTT-CCCGC----AC-G--C-G------GT-A--CG-A--TG--TTTGTT-------------T---gacgaattcatctctcaataaa
gi|27 : cct-ATGATTTG-----AGT-GCA-AT--AATA-ACCTG-A-A-C---CG-T-A-----GTA--ATAAAC-AATT
gi|24 : tttagaatatagaaagccaatcctgtatgctatcgacttcgttcaggcttttctttagatcaaaatatattcttaaaggtaattacttgcatatttcatattttcttgcctcatttagatgagatttggtATTTG-----AGT-GCA-AT--AATA-ACCTG-A-A-C---CG-T-A-----GTA--ATAAAC-AATT-GAA----TGAC--TAGCGGAT--AAACATA-ACACT-A---CGC-CA-CTTGTATTATG-A--CGT-AA------AT-G---G---G--A---A-GCAATGGATTT-CC--CA---AC-G--T-G------GA-A--CG-A--TG--TTTGTT-------------T---A-TA-C-AT---TGACAAAACG---A-GTT-TT-ACTAAAACG------TGC----------G-ACG-T-TTGGAAGA-ATTT-T-A----------CTTTAA---TTTCA-----A-T--T-T--TCTAT-TA--T---AA--C-T-TGT----TA-A--TTTC-AC-AC-GAG---AC-ACCTCAAg
gi|25 : tgAAAC-AACTGAAT-----GTC--TAGCGGAT--AAAAATA-GTTCT-A---CAT-CA-CTTGTATGATG-A--CGT-AGTAG---GT-A---A---GC-A---G-G----GGATTT-CC--C----CTCG--T-G------GC-A--CA-A--TG--CTAGTT-------------T---A-TA-C-AT---TGAC-AAACG---A-TTT-TTTAATAAAATA------TGC----------G-ATA-C-TTGGAAGA-ATTT-C-A----------CTTTAA---TCTGA-----A-T--A-G--GCTGT-TA--T---TA--C-T-TGT----TA-A--TTTC-AC-TCAG-G---AC-ACCTTAACCC
gi|39 : AC-AACTGAAA-----GTC--TAGAGGAT--AAAAATA-ACTGT-A---CAT-CA-CTGGTATGATG-A--CGT-AACGG---GT-A---A---GC-A---A-G----GAATTTCCC--C----AC-G--T-G------GC-T--TG-A--TG--TTTGTc
gi|29 : ATA-AATTC-A---TGT-CA--TGGTATGATG-A--CGTTAACAT---GT-A---A---GC-A---A-G----AAATTT-CC--CC---AA-G--T-C------GC-A--TG-A--TG--TTTGTT-------------T---A-TA-C-AT---TGAC-AAACG---A-TTT-TT-AGCACAATA------TGC----------G-GCG-G-TTGGAAAA-AAAT-T-A----------CCTTAA---GTTGG-----A-T--G-T--GCTGT-TATCA---TA--C-
gi|26 : -A---TGT-CA-CCTGTATGATG-A--AGA-AATAA---TT-C---A---GCAA---A-G----GATTTC-CC--C----AT-G--T-ACAATGTAC-AG-CA-A--TG--GTTGTTACTGCCACTTAAAT---A-TG-A-AT---TGAC-AAACA---A-TTT-CT-AACAAAATA------TGT----------ATGC----TTGAAAGA-A-TT-T-ACTTGGCACAGCATTAATGCTTTCA-----A-T--A-T--GCTAT-TACTAGCCTA--C-T-TGT----TA-T--TTT--AC-Tgtttatttaac
gi|28 : gT-AATAG---GT-A---A---GC-A---A-G----GAATTT-TC--C----CTCG--TTG------AC-A--CG-ACATG--TTTGTT-------------T---A-TA-C-AA---TGGC-AAA-G---A-TTT-TTGAGTCAAACA------TGCGACCGTAGATA-GCT-C-TTTGAAGA-ATGT-A-A----------CTTTAA---TTTGA-----A-T--A-T--TCTGT-TT--A---TGATC-T-TG------GAT--CTTA-AC-CCGG-G---AC-
gi|32 : acgTC-CC--C----A--A--T-G------GC-AATCG-A--TG--CCTGTG-------------T---A-TATC-AT---T-AC-AAACG---A-TTTGTT-AATAAAATA------TGT----------C-ATG-G-TTGGAATATATTT-T-G----------C-TT-----TTTGAAATGTA-C--A-T--GCAGT-TA--AT--TA--C-T-TGT----TA-T--GTTC-ACTTT-G-G---AC-ACCTTTACttcctacct
gi|37 : tcT-------------T---ACTA-C-ACAGTTGAC-TAATG---A-TTTATT-AGAATAATA------TAC----------G-ACA-GCTTGGAGGA-AATA-T-A----------CTTCAA---CTTGA-----A-T--A-T--GCTGT-TT--A---Tt
gi|44 : gatgatgtggacagCG---C-TTC-TT-AGTAAAAT-------TGC------------GCA-G-T-GGAAGA-AATT-TTA----------CTTTAA---TTTGA-----T-T--GTT--GCTGT-TA--ttaaatatatcaatttcactc
gi|42 : aATA------TGC----------G-ACA-C-TTTGAAGA-ATTT-T-C----------CTTTGA---ATTCA-----A-T--A-T--GGTGT-CA--T---CA--T-T-TA--------T--TTTT-AC-CT-ACG---AC-ACCTTA
gi|43 : -TTGGAA-A-ATTT-T-A----------CTTTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTGT-TA--T---TA--T-T-TGT----TA-A--TTTT-AC-TCAG-A---AC-ATCTTAACtcatcac
gi|49 : -TA--T---TA--T-T-CGT----TA-A--TTTC-AC-TT-G-GG--AC-ACCTTAACCC
gi|50 : ---TA--C-T-TGT----TA-A--TTTC-AC-TC-G-GGACAC-ACCTTAGCCcag
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|45 ): ACATTGTGATAATGAAATCGACTCCCAATGCACATATGTCAATTTACAATTAAAGG
Unaligned ( gi|46 ): GTATTCGTCCTATTCAGCGACCCTGCCCCCATGAGCGCCCCCGGGCACTTTCCCA
Unaligned ( gi|47 ): ATATTTACTTCCGATCAAGGCAGATTCTAAAAGGAACCTACTTGCAGATTT
Unaligned ( gi|48 ): AAAAATCCTGCTTTTAATTTCACTTACTCTTCATCTCGGACT
Unaligned ( gi|51 ): TAGTTTAAAATACGCACTCAAGATGAAAATGAATTT
Unaligned ( gi|52 ): CATATTTTCTTGCCTCATTTAGATGAGATTTGGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22 11 2 22222 2 111 11 1 666666666666666666666666666666666666 11 11 22222222 111111111 111111111111 222222222222222222222222222222 11111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111 111111111111 1111111111 11111111 11111 111111111 11111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111 222222222222222222222 11111111 111111111 11 1 111111 1111111
lowQualScore : 2 3 33 2 4 3 4 4 2 4 2 4 88 3 2 55 0 55555 3 2 3 3 0 1 4 2 0 8 777 9 33 666 0 66 000000000000000000000000000000000000 00 33 5 555 999999 00000000 888 2 9999 4 66 4 4 4 8 4 888 0 77 3 3 3 2 777777 2 666666666 444 777777777 2 444 8888888 5555 2 999999999999 33 4 2 2 444 5555 33 2 4 2 33 33 9999999 5555 2 2 55555 5555 2 5555 33 0 33 999999999999999999999999999999 33 44444444444444 2 0 66 2 2 77777 2 2 2 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 6666 44 33 2 7777777 2 2 2 33 5555 333 2 333 2 111111111111 33 2 0 2 1111111111 33 2 1 2 00000000 33 33333 555555 2 2 1 000000000 8888888 2 77777777 2 2 33 2 00000 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 33 11111111 4 2 33 2 33 2 33 0 66 111111111111111111111 2 00000000 33 7777777 2 1 2 55 2 2 44444 1 1 222222222 1 4 77777777 3333 1 66 2 2 2 1 1 333 1 1 333 22 1 2 22 1 1 0 0 55 222222 1 5555 22 22 7777777777 9999999999999 555 1 1 333 1 5 1 22 3 3 555555 22 44 44 88888888888888 1 1 1 1 444444 7777777777 222 44444 1 22 1 44 1 1 3 44444 222 1 33 555555 1 1 3 5555555 2
lowQualScore : . . .. . . . . . . . . . .. . . .. . ..... . . . . . . . . . . ... . .. ... . .. .................................... .. .. . ... ...... ........ ... . .... . .. . . . . . ... . .. . . . . ...... . ......... ... ......... . ... ....... .... . ............ .. . . . ... .... .. . . . .. .. ....... .... . . ..... .... . .... .. . .. .............................. .. .............. . . .. . . ..... . . . .................................................................... ...... .... .. .. . ....... . . . .. .... ... . ... . ............ .. . . . .......... .. . . . ........ .. ..... ...... . . . ......... ....... . ........ . . .. . ..... ............................................................... . .. ........ . . .. . .. . .. . .. ..................... . ........ .. ....... . . . .. . . ..... . . ......... . . ........ .... . .. . . . . . ... . . ... .. . . .. . . . . .. ...... . .... .. .. .......... ............. ... . . ... . . . .. . . ...... .. .. .. .............. . . . . ...... .......... ... ..... . .. . .. . . . ..... ... . .. ...... . . . ....... .
lowQualScore : 5 0 00 5 0 0 0 0 5 0 5 0 55 0 5 55 0 55555 0 5 0 0 0 0 2 5 2 0 555 2 88 222 0 22 000000000000000000000000000000000000 33 66 7 999 000000 55555555 888 5 4444 4 11 4 4 4 9 4 555 8 88 3 3 1 9 777777 5 222222222 444 666666666 5 444 1111111 3333 7 555555555555 22 7 4 4 111 0000 33 5 7 4 22 22 2222222 0000 5 4 99999 0000 4 0000 22 1 22 444444444444444444444444444444 44 77777777777777 5 9 33 9 9 11111 9 9 9 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 333333 1111 33 77 4 6666666 4 4 4 99 0000 999 2 777 2 444444444444 11 4 4 5 8888888888 44 5 0 5 77777777 22 66666 888888 0 0 9 777777777 5555555 0 22222222 0 1 11 2 00000 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 9 22 88888888 7 4 22 4 22 4 44 9 33 555555555555555555555 4 99999999 22 6666666 4 9 2 33 2 0 55555 8 8 999999999 9 0 33333333 4444 8 33 0 0 0 9 8 222 8 8 333 55 8 5 55 6 8 9 4 99 333333 7 4444 44 44 6666666666 6666666666666 222 9 9 333 9 5 8 55 6 6 000000 44 88 88 88888888888888 7 7 7 7 888888 3333333333 999 22222 7 33 7 00 7 7 3 00000 999 7 66 000000 8 8 6 8888888 1
consensus : ATGATNGATCCNATNAACGCTTCCCTCACTNTNANGTCAACATTTGATAGTTTGTGANCNATTGAGGCGAAGNTTGANANTACGCTCAGGAGACATTTTTNTGNATTATAAACGTATGGGCAACGNGGTACNNGGATGAGCAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATANCCCAGTGGTTACCGGAGCGATGNATGGNTCGAAAAGCATGANGCTNTACAAACGAGAACANAGGGTGGTTAAGACGTNCCGATGAAA-GCCAC---TGTGCTG--TNCGTAAA-TGTACCTCAGT------------A----TTTG-------G-TG----TCA-NAATA--C-A-A-AAGTACGT---C-ACG-ACG----TACA---GGTC----T-A--CGCGT-TGTATCG-T-GG-GGAA-ATG--TCATAA-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAG-CTGC-------G----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TTG-T-T--A--A--G----TT----TTCT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TTCCTAAA-GGT-A------ACTAGTT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--ATGGTA-T-ANTTTTT------TGC-C-TCGTTTAGA-T----A---NTA-------T-TTGG--------C-AGTG-AA--TG-C-----GGAAATGC-CC-------A------A---C------A---T-T------G-A-AT----A-TNA-----TGGGTATT--GC--------T-AA-A--TACGAGAGGA-T--AT-TGTACC--GATCC--GGGTCAC--------TTTTTTTN----AATTT-ATCA--T-----ATC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--G-CTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACTGGAAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AACAGG--TAAGC-AAGGGATTT-CC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCGG-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TC-G-G---AC-ACCTTAACCC
Reference ( family-96 ) : ATGATGGATCCAA-AAACGCTTCCCTCACTCTTATGTCAACATTTGATAATTTGTAAACAATTGAGGTGAAGTTTAAGATTACACTCAGGAGACATTTTTTTGAATTATAAACATATAGGCAACGCGGTACCTGGATGAGCAAGAATT-GCAGAAAACGATGGTATGTAATAGCCCAGTGATTACCGGAGCGATGTATGGGTCGAAAAGCATGATGCTATA-AAACGAGAACANAGGGTGGTTAAGGCGTCCCGATGAAA-GTCAC---TGTGCTG--TACGTAAA-TGCGCCTCAGT------------A----TTTG-------G-TG----TCA-CAATA--C-A-A-AAGTACGT---C-ACGNACG----TACA---GGTC----T-A--CGCGT-TGTATCG-T-GG-GGAA-ATG--TCATAA-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAG-CTGC-------G----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TTG-T-T--A--A--N----TT----TTCT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TTCCTAAA-GGT-A------ANTAGTT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--ATGGTA-T-ATTTTTT------TGC-C-TCGTTTAGA-T----A---TTA-------T-TTGG--------C-AGTG-AA--TG-C-----GGAAAT-C-CC-------A------A---C------A---T-T------G-A-AT------TNA-----TGGGTATT--GC--------T-AA-A--TACGAGAGGA-T--AT-TGTACC--GATCC--GGGTCAC--------TTTTTTTC----AATTT-ATCA--T-----ATC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--G-CTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACTGGAAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AACAGG--TNAGC-AAGGAATTT-CC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCGG-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TC-G-G---AC-ACCTTAACCC
gi|1 : ATGATTGATCCCATCAACGCTTCCCTTATTGTAAGATCAACATTTAATAGTTTGTGATCTATTGAGGCCAAGATTGATAATACGCTCAGGAGACATTTTTG-GCATTATAAACGTATGGGCAACGGGATACAGGGATGAACAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATAT----GTGGTTACCGGAGCGATGGATAGTTCAAAAAGCATGAGACTCTACAAACGAGTGCACATGGTGGTTACGACGTGCCGATGAAA-GCCAC---TGGGCTG--TTTTTAAA-TGTACCTAAGT------------A----CTTG-------G-TA----TCA-TAATA--C-A-A-AAGTACGT---C--CGAACA----CACA---GTTA----T-A--CGCAT-TGTATAG-T-GGTGGAA-ACG--TCATAA-TAT-T-TCA-ACGTTA-TTA------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------CGT----CCAAG-TCGC-------A----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TCG-T-T--A--A--T----TT----TTCC-TTGATTCT-----ATAT----AA-G----TCTCATG--TTTCT--AA-----------A-------TA---------TAGCGCTCATT--TCA--------------ATATT-TTTAATTA--TCACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCGCC------------CG-----------------A-------------T-----T-T--------------AAAATA------CAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-ATT-CA-AGTCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCA-TTCGA------------CTA--AGGCATG-TTCCTAAT-GGT-A------AATAATT--GC-AGATTAAAGATT-TTAACA------C-GG--ACGGTA-T-ATTCTTT------TGC-C-TCGTTTAGA-T----A---TTA-------T-TTTG--------C-AGTG-AA--TG-C-----GGAGA-------------------------------A---T-T------G-A-AT------TGA-----TGGGTATC--GC--------T-AA-A--TACGAGAGAA-T--AT-AGTACC--GATCC--GGGTAATTTTTGTTGTTTTCTTC----AATTT-AATA--T-----ATC--TAT-------AT-CATCACATGA-AGCT--CAA-ATTGCAA-ATTATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--A-CTTGA-ACA-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACTAAAAA-GTTTATCGCA--A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTTTG---ATGATA--T-AACAGG--TTGG--AAGGAATTT-CC--C----A-TGT-GGC----A--CGA--TGG----------TTGTT-------------TATA---C-A-CTG---AC-AAG-CG-G--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--A-GCAG-T----------TGGAAG-A-A-GTT-TA------CA----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----AT---AC-T-TGC------TG-TTTTC-AC-TC-G-G---AC-ACCTTAACCC
gi|10 : TACA-TA-------TCGATTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GAAA---ATTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TT-CTGAA-GGTAA------ATTAGTT--AC-AGATTAAAGATTGTTG-TA------C-GG--ATGGTA-T-GAATTTT------TGC-C-TCCTTTACA-T----A---TTA-------G-TTGA--------C-AGTG-AA--TG-C-----AGAAATAC-CC-------A------A---CCTTACAA---T-T------G-ATAT------T-A-----TGGATATT--GC--------T-AA-A--TACAAGATGA-T--AT-TGTACC--GA-CC--AGGTCA---------TTTTTTAA----AATTT-ATAA--T-----ATC--TGC-------AT-CAACACTTTG-AGCC--CAA-AATGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTT-AAG--A-ATTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAT-AGCTGT-AA-GTCTAGCGGAT----AAATACACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACGTTT-ATCAGG--TAAGC-AAGGATTTT-CC--CA---A-TGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TGT-TT-AATAAGA------TA--TGC--G-GT-G-T----------GGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGG-----A-T--A-C--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TCAG-A---AC-ACCTTAACTC
gi|11 : GTACGT---TGACGG-CGGCATTGCA---GGTC----T-A--CGTGT-AACATCG-T-GG-GGAA-A-GATTCATCA-AAT-T-GTA-TCGTTG-TTT------ACTAACA---------G---TAGACTCC--ATTCAC---G-------TGT----TCAAG-ATGT-------A----TAT--GTGTATAATATGTTT-GTC-AA---GTG-----TTA-TGTTG-T-T--A--A--G----TT----T-CT-GTGGTGAT-----AT-T----AA-TATTTTTTTTTG--TTTTT--ATATCTATTGTGGA-------TA---------TAATAAAAACCAATCATTATTATTATTATCATATTACTTAATTAA-TTACATTG-TTACTTTTG-----ACAAT-TTATTCC------------CA-----------------AATGTGCATTACTAT-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GTTAAT-CATG--TATATA-TA-------TCGACTTGCGTT-CAGAG--TGT----A---ATGAC-GATA---TTTTCTATTCGA------------TCA--ATGTATATTTCCTAAA-TGT-A------ACTCCTTTGGCAAGTTTAAAGATT-TTGACA--------GGTTATGGTG---GGTTTTT------TGC-C-TTGTTTAGC-A----A---ATA-------T-TTGG--------C-AATG-AA--TA-TA----GGAAACAC-TC-------A------A---T------A---T-T------c
gi|12 : ---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGG------------CTA--ATTCATA-TTCCCAAC-GGT-A------AGTAGTT--GC-AGATTTAAGATT-TTGACA------C-GA--ATGGTA-T-AATGTTT------TGC-C-TCCTTT----------------------------G--------C-AGTG-AA--TA-T-----GGAAATGT-CC-------A------A---C------A---T-TTGCACTG-A-AA------TCA-----TGGGTATT--GC--------TTAATA--TACCAAGGGA-T--AT-TATACT--GAACC--GGGTAAC--------ATTTT--C----AATTT-ATCA--T-----AAC--GAT-------AT-CGATACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTA-ATT--A-CCTGA-ACC-G-TG-----AT-A--ATAAAC-AACTG-AAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-TCTCT-A---CGT-CA-CTTGTATT---ATGATG--T-AATAGG--TAAGC-AAAGGATTT-TC--C----AACGT-GACTGACA--CTG--TGT----------TTCTT-------------AATA---C-A-TTG---AA-AAG-CG-C--ATT-TC-AGTCAAA------TA--TGC--G-ACGC-T----------TTGAAG-A-A-TTT-CA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-C--A-T--GATG-T-T-A-----TT---AC-T-TGA------TA-ATTTC-AC-TC-GTG---AC-ACCATAACCtgata
gi|13 : tt----TGT--GTGTA-AATCTGTTA-GTC-AA---GTG----ATTC-T-TTT-T-T--A--G--C----TT----T-CT-TTGATAAT-----ATGT----AA-G----TCTCCTG--TT------------------A-------AA---------TAGTGTGCATT--ACA--------------GAAAT-CTTGAT-A--TAACATTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GTCAA------------CA-----------------A-------------T-----T-TGCTTATAGCCATTTAGAATA------AAGAAA--TTCAAT-CGTG--TGTACA-TA-------TCGACTTG-GCA-CA-GG----TGAAAA---ATAAT-GAAA---TTTTCT-TTCGA------------TCA--ATGCATA-TTCCTAAA-GAT-------------TT--G---------AAATT-TTGACACAAGGCC-GG--ATGG-A-T-TTTTTTTTTAAAATGCTT-TCGTTTAGA-A----A---AGA-------T-TTGG--------T-AGTG-AA--TG-TG----GGAAATAC-CCATT----A------A---C------AT--T-T------G-A-ATCAAAA-TGA-----TGAAAATT--GC--------T-AA-A--TACGAGAGCA-T--AT-GATACC--GGTGC--TGATCAC----------GTTCTA----AATTC-ATCA-------------TGT-------AT-CGACATGTCA-AACC--CAA-ACTGCAA-ATGAGTGG-----AAT-ACA-T
gi|14 : ----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATC----ATTT-T-TTA-T-T--A--A--G----AT----TCCT-TTGATAAT-----ACAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGCATT--TTG--------------ATA----------------CACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GACCC------------CA-----------------A-------------TGCGCAT-T--------------GTAATAATTATTTAGAA----------TGTG--TACAGA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----G---GTAAC-GATA---TTTTCT-C-CGA------------TCA--AGGCATA-TTCGTAAA-GGT-A------ATGAATT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--TTGGCG-TGGTTCTTT------TGC-C-TCGTTTAAA-T----A---TTA-------T-TTGA--------C-AATG-AA--TG-C-----GGACATGC-TT-------A------A---C------A---T-TA-----G-A-AA------TTA-----TGGTTATT--GCTACATGTGT-AA-A--TACAAGAGGA-T--AT-TGTACC--GATCC--GGGTCG------------TTTTC----AATTT-ATCA--T-----ATT--TAT-------AC-CAACACATCA-ATCC--CAA-ACTCCAA-ATGATATGACTAAAGT-GCA-TT--AAT-----TTGA-Accttcacctgtgccgatataa
gi|15 : ACA------CTGG--ATAGTA-G-GATGATT------TGC-C-TCGTTTAGA-A----AAATTTG-------TATTGG--------CAAGTG-AA--TGCC-----GAAAAT-A-CC-------ATGTTTGA---A------AT--T-T------GCA-AA------TGA-----TGAG------GG--------T-AA-A--TGCTAAGGGATT--AT-CGTAAC--GATCC--AGGCC-C--------CCTTTTCA----AATTC-AGCA--TA----ATA--CAT-------AC-CGACACACAA-AGCCAAAAA-ACTGCAA---GA-------------ACA-TTG-ACT--G----------------------------AAA--AATTGGAAATGGCTAGC-GAT-A-AAAATA-GCTCT-A---CGT-CA-CTGGTATG---A------------------AAGC--AGGGATTT-CC--C----A-CCT-GGCA---A--TGA--TG--------------------------------A---C-G-CCGTAAAC-AAAGCG-A--TGT-TG-AGGAAAA------TA--TGCAAA-ACG-------------TGGAAATA-A-TTT-TA------AT----------TTAA---TCTGA-----A-T--A-T--GCTG-TATAA-----TT---AT-T-TGT------
gi|16 : tgaGT------------A----TTTG----------------CA-GAATGACC-A-A-ACGAACGT---C-ACG-ACT----TACA---GGTT----T-A--CGCGT-TGTATCG-TTGA-GAAA-ATG--TCATA----T-T-TTA-TCATTC-TTA------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAA-CTGT-------A----TAT--GTGTA-CATCTGTTT-GCC-AA---ATG----ATTC-T-TTA-T-C--A--A--G----TT----AACT-TTAATAAG-----ATAT----A-------TATCCTG--TTTTT--AT-----------A-------TATACATG---TAGTGTGGAAT--TTA--------------ATTTG-CTTAATCA--TTAAATGG-TGATATT-GATTCAA-AAT-T-GCCCC------------CAATGCGCAGTGAT-----A-------------T-----T-T--------------ACAATC------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACGTG-GTT--A-GGCGTTT----C---GTGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------GCG--AGctcaatataatcaactcgggagttcttac
gi|17 : ctaaaagctgatgatTTAGA-T----A---AAA-------T-CTTG--------T-AGGG-GA--TG-CATGTTGGAAAT-A-CCG------A------A---C------T---T-T------G-A-TTCGTTA-TCA-----TGGAAATA--GC--------T-AA-A--TGCAATAGGG-T--GT-TGTACC--GTTCT--GGATCA------------TTTTA----AATTT-GTCT--T-----ATCAATAT-------AT-CGAC---------CC--CAA-ACTGTAA-ATGATCAG-----AGC-ACA-CC---------CTTCA-GTT-G-TGCCAATGT-A--GTATAT-AACTAGAA--GTCTTGCGGA----AAACTA-GCTC-----------A-CTTGCATG---ATTACG--T-TATATT--GAAGC-GAGGGTTTT-CC--A----A-AGT-GGC----T--CAA--TGT----------TT-----------------ATG---T-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTG-T--AATAAAA------TA--TGC--G-ACAC-T----------TTGAAG-A-A-TTT-TT------CT----------TTGA---ATTCA-----A-T--A-T--GGTG-T-C-A-----TC---AT-T-atacttagttggaaaatatttt
gi|18 : TG-T-T--A--A--G----TT----TTCT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTTCCA--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------AAATT-CTTAATCA--TTGCACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------TGCGCAT-T--------------GGAATT------TAGAA----------TGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAT-GATA---TTTTCT-TTCGAANNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN-NNNNNNNN-NNN-N------NNNNNNN--NN-NGATTAAAGATA-TGGACA------A-GG--CTGGTA-T-GATTGTT------TGT-C-TCGTTAAGA-T----A---TTA-------T-TTGG--------C-AGTG-GA--TG-C-----AGAAATGC-CC-------A------A---C------A---T-TA-----G-A-ATTTAAA-TCA-----TGGGTATT--GC--------T-AA-A--TATGAGAGGA-T--AT-TGTACT--Gtatatgcgacactttgaagaat
gi|19 : A-TG-------TCTACTTG-GTA-CA-GGCGAAC----G---ATGAC-GATAATATTTTCT-TTCGA------------TCA--AGGCATA-TTCTTAAA-AGT-A------ACTAGAT--GC-AAATTTAAGATT-TTAGCA------G-GG--AATGTA-G-GATTCCC------TCC-C-TTGTGTATA-T----T---ATA-------T-TTGG--------C-AGTG-AA--TG-T-----AAAAATGC-CC-------A------A---T------A---T-TG-----G-A-ATCGGCA-TTA-----TGGAAATT--GT--------T-AA-A--TACAAGAGGG-T--AT-TGCA
gi|19 : agG-----AGG-GTA-TTGCAATC-A-CATGT-GCC-G-TT-----GC-G--ATAAAC-AACTAGAAA-G-CTTTCGGAT-A-AGAA-A-ACTCA-A---TGT-CG-TTTGTATG---ATGACG--T-AAT-TG--TTA---AAG--ATTT-CC--A----A-CGT-GGT----A--CGA--TGT----------TTGCT-------------atcacatgtgccgttgcgataaacaactagaaagctttcggataagaaaactcaatgtcgtttgtatgatgacgtaattgttaaagatttccaacgtggtacgatgtttgctgacgaattcatctctcaataaa
gi|2 : agatgtctacttggtacaggcgaacgatgacgataatattttctttcgatcaaggcatattcttaaaagtaactagatgcaaatttaagattttagcagggaatgtaggattccctcccttgtgtatattatatttggcagtgaatgtaaaaatgcccaatattggaatcggcattatggaaattgttaaatacaaATGAAATGCCACAATTG-GCTGAGTATGTAAACTGGACCTCAGT------------GGCACTTCGCAGTAGCG-TGACGATCAGCAATA--CTA-ATAAGTACGTGCTC-ACGTACA----TACA---G-TCAAAATGA--CGCGTGTGTATTG-T-GG-GGAAGATA--TAAGAAATAT-TATTAATCGTTAATTT------ACTA-CA---------A---T------TT-AT-CAAATAG-------TGTACGCCCAAGGCTGC-------G----TAT--GAGTATAATCTGTTT-GTC-AA---AT------TTA-T-TTGGT-T--A--A--TGTAATT----TACT-TTGATAATGCCATATATTAAAAA-G--------------------AT-----------G--------A---------TAGTGTGAATT--TAA--------------ATATT-CTTAATTACCTAAGACTGATGCGCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CATTGATCGCGCATTGTTAA-------------T-----T-T--------------AGAATACT----TAGAAAAGGCAAATTCGTG--TATAAACTACCCACGCTCGTCTTG-GTTTCA-AGCCTTT----A---A-GAT-GATT---ACTTCT-TCAGA------------CGATTAAGCATA-TTCCGAAGTGGT-AGATTACAGTAGTT--G--AGATTAAAGATT-TTGACAG-----C-GG--AATGTAATGATTGTTT------TGC-CATCGTTTAGA-T----A---TTAA------T-TTGGGTTCTGGGC-AGTG-GAGTTG-C-----GGAAAT-G-CC-------A------AATTCGTAGA-A---T-T------G-A-AA------TTA-----TGGGTATTTGGC--------T-AA-AACT-CATGCAGA-TTGAT-TGTATCCTGAGC---GGGTCAC--------TTTTT--C----AATTT-ATCA--TTCATTATC--TACCGGTATAAT-CAACACATCA-AGCC----A-ACTGCAA-ATGATTTG-----AATGGCA-TTATAAG--G-CTTTA-ACCAG-TG-----GT-----T---C-AA---------TTTAGCGGATGA-AAAATA-GCTAT-ATGGCGT-CAGCTGGTATGTACATGACG--T-AA----------------AATTT-CCA-C----C-CGT-GTC----A--C-----GT----------ATGTT-------------GA-----------G---AC-AAAGCGTAATTTT-TT-AGTAAAA------TAGTTGTCGG-GCGGTT----------TGGGAT-A-A-TTTGTATTTGATCT----------TTAA---TTTGA-----T-T--A-TG-GCT--T-T-A-----TT---AC---CGT------TATATTTT-ACTTC-G-GGA-ACAACCTTAACCgacgaattcatctctcaataaa
gi|20 : TTTTT----AATTC-TTTA--TT----ATT--T-T-------AC-T--CACATGA-A--T--CAATATTGCAAGATTATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--A-CT-GATATC-A--------GT-T--GTATAC-AACTAAAAA-GTTTATCG--C-A-AAAATA-ACTC--A---CGT-CA-CTTGTTTG---ATGA------AATAGG--TTG---AAAGAATTT-CC--A----T-GGT-GCC----A--CGA--TGG----------TTGTT-------------TATAATAC-A-CTG---AC-AA--CG-G--TT-----AGTAAAA-------A--TAC--A-----------------CGGAAT-A-G-TTT--A------C--------------A---TTT-A-----A-T--A-A--AC-G-T-A-A-----TT---AC-TATGC------TG--TTTC-AC-TC-G-A------ACCTTAACC
gi|21 : ataTT------TGT-C-TCGTTTAGA-CTCTCA---ATA-------T-TTGG--------C-AGTG-AA--TG-T-----GGAAATAC-CCAATATTTA------A---C------A---T-T------G-A-AA------TTA-----TGGATATT--CC--------TAAA-A--TA-GAGGGGA-T--A--TGTACC--GATTCA-AGGTCGC--------TTTTGACA----AAATT-ATCAACT-----ATC--GAT-------AT-CGACACATCA-AG----CAA-ACTGGTA-ATTATATG-----G---GCA-TTA-GATTCA-CCTG---CCAA-TG-----AC-ATTTTAAACAAACTG---A-GTCTAGCATAT-G-ATAATA-GCTCTAA---CCTGCG-CTTGTac
gi|22 : -AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-CTG-AAT--G-TTTGA-ACC-G-TG-----GA-A--ATAAAC-AACTG-AAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTTT-A---CTT-CA-CTGGTATT---ATGACA--T-AACGGG--TAAGC-ATGGCATTT-CCA-C----G-CAT-GAC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------C----------TT---------A-CG-A--TTC-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCAG-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--G-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TTGG-G---AC-ACCTTAACCg
gi|23 : AATA--C-G-A-AAGTACGT---C-ATG-ACG----TACA---CGTC----T-A--CGTNN-NNNNNNN-N-NN-NNNN-NNN--NNNNNN-NNN-N-NNN-NNNNNN-NTTCACAACATGA-CA---------ACGCT------T--AA-AAA---G-------TGT----TCAAA-CTGT-------A----TAT--GTGTA-AATTTGTTT-GCC-AA---ATG----ATTG-T-TTG-T-T--T--A--G----TT----TCCT-TTGACAAT-----ATAC----AA-G----CATCTTG--TATTT--AT-----------ATACACTGTA---------TAGTGTGAAAT--ATA--------------ATATC-ATTAACCA--TTATATT
gi|24 : atgcacttcgcaTGATTTG-----AGT-GCA-AT--AAT--AACCTGA-ACC-G-TA-----GT-A--ATAAAC-AATTG-AAT-GACTAGCGGAT-A-AACATA-ACACT-A---CGC-CA-CTTGTATT---ATGACG--T-AAATGG--GAAGC-AATGGATTT-CC--C----AACGT-GGA----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAAACG-A--GTT-TT-ACTAAAA------CG--TGC--G-ACGT-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTCA-----A-T--T-T--TCTA-T-T-A-----TA---AC-T-TGT------TA-ATTTC-AC-AC-GAG---AC-ACCTCAAa
gi|25 : AAAC-AACTG-AAT-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-GTTCT-A---CAT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AGTAGG--TAAGC-AGGGGATTT-CC--C----CTCGT-GGC----A--CAA--TGC----------TAGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TTTAATAAAA------TA--TGC--G-ATAC-T----------TGGAAG-A-A-TTT-CA------CT----------TTAA---TCTGA-----A-T--A-G--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-TGT------TA-ATTTC-AC-TCAG-G---AC-ACCTTAACCC
gi|26 : -A---TGT-CA-CCTGTATG---ATGAAG--A-AATAAT--TCAGC-AAAGGATTT-CC--C------CAT-G-T----A--CAA--TGTACAGCAATGGTTGTTACTGCCACTTAAATATG---A-A-TTG---AC-AAA-CA-A--TTT-CT-AACAAAA------TA--TGT--ATGC---T----------TGAAAG-A-A--TT-TA------CTTGGCACAGCATTAATGCTTTCA-----A-T--A-T--GCTA-T-T-ACTAGCCT---AC-T-TGT------T--ATTTT-AC-Tc
gi|27 : g-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CCTG--TATGC--TA-------TCGACTTC-GTT-CA-GGC-------------------------TTTTCT-TTAGA------------TCA--AAATATA-TTCTTAAA-GGT-A------ATTACTT--GC---AT-----ATT-T---------------------CA-T-ATTTTCT------TGC-C-TCATTTAGA-T----G---AGA-------T-TTGG--------T-A-TG-A
gi|27 : -ATGATTTG-----AGT-GCA-AT--AATA-A-CCTGA-ACC-G-TA-----GT-A--ATAAAC-AATTGtttgagtgcaataataacctgaaccgtagtaataaacaattg
gi|28 : tttagaatatagaaagccaatcctgtatgctatcgacttcgttcaggcttttctttagatcaaaatatattcttaaaggtaattacttgcatatttcatattttcttgcctcatttagatgagatttggtACG--T-AATAGG--TAAGC-AAGGAATTTTCC--C----T-CGTTGAC----A--CGACATGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-ATG---GC-AAA--G-A--TTT-TTGAGTCAAA------CA--TGC--G-ACCG-TAGATAGCTCTTTGAAG-A-A-TGT-AA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--TCTG-T-T--------T---A-------------TG-AT-----C-TT-G-G---AT---CTTAACCC
gi|29 : ATA-AATTC-A---TGT-CA--TGGTATG---ATGACG--TTAACATG--TAAGC-AAGAAATTT-CC--CC---A-AGT-CGC----A--TGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGCACAA------TA--TGC--G-GCGG-T----------TGGAAA-A-A-AAT-TA------CC----------TTAA---GTTGG-----A-T--G-T--GCTG-T-T-A-----TC---AT-A-CGT------TT-ATTTA-AC-gggacattcctacct
gi|3 : ----T-A--CGCCT-TGTACCAAT-GT-GAAA-ATA--TAATGA-TAG-T-TTA-CAGTCA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AG-CAA---G-------TAT----CCATG-CTGC-------A----TAC--GTATA-AATTTGTTT-GTA-AA---A------ATTT-T-TTC-TAT--A--A--G----AT----TTAT-TTGATAAT-----ACAT----AA-G----TCCCCTG--TTCCT--AT-----------A-------TACATTATGTATAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACATT-G-----A-AAT-C-GCCCTCAATGCGCATTGCA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAGA--CTCAA---GTGAATATAAA-TG-------TAGACTGG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-AATA---TTTTCT-TTCGT------------CCA--AGGTATA-TTCCAAAA-GGT----------TAGTT--GC-AGATTAAAAATT-TTGACA------C-GG--GTGGCA-T-ATTTTTT------T-T-C-TAGTTTAAA-T----A---TTA-------T-TTGG--------C-AGTA-TA--TG-C-----GGAAATCC-CC-------A------A---C------A---T-TA-----G-A-AT------TGAAAGTTTGGGTGTT--GC--------T-AA-C--TTTGAGAGGA-------------------------TCA---------TTTTTTAA----AATTT-ATCA--T-----ATC--TAT-------AT-TAACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTT-----AGT-GCA-TTA-AAG--G-CTTGA-ACC-GAAG-----GT-A--ATAAAT-AACT-GAAA-ATGTAGCAGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTGATATG---ATGTCG--T-AACATT--TAAGC-AAGGAATTTCCC--C----A-CTT-GGC----A--CGA--TAT----------CTGTT-------------TATG---A-A-TTG---AC-AAA-CA-G--TCT-TT-AGTAAAA------TA--AGC--G-GCGG-T----------TGGAAT-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--A-T--ACTT-T-C-A-----TT---AT-T-CGT------TA-ATTTC-CC-TCGG-G---AC-AC
gi|30 : A-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------GCTA-AA---------A---T------T--AT-CAA---GACTTTAGTGT----TCAAG-CTGT-------G----TAT--GCGTA-AATCTGTTT-GTG-AA---AAG----TTTCTT-TTGTT-T--T--G--G----TT----TTCT-TTAATTAT-----ATAT----TA-C----TCTCCTG--TATCT--AT-----------C-------TA---------T
gi|31 : tcCAA-ATGACTTG-----ATT-GCA-TTA-ATC--A-ACTGT-GCC-G-TG-----GA-G--AAAAAC-AA-TCGATA-ATCTAGTGAAT-A-AAA-TA-GTTCT-A---TGT-CA-CTTTTACG---ATGATG--T-AATAGA--TAATT-AAGGTATTT-CCCGC----A-CGC-GGT----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------Tccatctacatgtatgtaatggaa
gi|32 : cctTC-CC--C----A--AT-GGC----AATCGA--TGC----------CTGTG-------------TATAT--C-A-TT----AC-AAA-CG-A--TTTGTT-AATAAAA------TA--TGT--C-ATGG-T----------TGGAAT-ATA-TTT-TG------CT----------T------TTTGAAATGTA-C--A-T--GCAG-T-TAA-----TT---AC-T-TGT------TA-TGTTC-ACTTT-G-G---AC-ACCTTTAC
gi|33 : tcACAGAGCGTAGGCAAGCCGCACAGAGGAAA-TTCAC---TGTACTA--TTCATAAA-TGTGTCTCAATGTATTTCACACTA----TTTG-------A-TT----TCT-GAATA--C-A-A-AAGTACTT---C-ACG-ACG----TACG---GGTT----T-A--CAAGT-TGTATCT-T-GG-GGAG-ATt
gi|34 : TT------ATTA-GA---------A---T------TTAAT-GAT---A-------TAA----TTAAG-CTCT-------A----TATAGGCGTA-AATCTGATT-GTT-AG---ATG----ATTC-T-C-G-T-TTCAGTA--T----TT----TTTT-TTAA-ACT-----ATAT----AA-G----TCTTCTA--TTTTT--AT-----------A-------TA---------CAGTGTGAATT--AAG--------------ATAAT-CTTAAT
gi|35 : -TCATCA-TTT------ATTA-CC---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TGAA--CTGTATACATTG----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AATACATGTGAAATTT-T-TTT-T-T--C--GTCT----TC----TTCT-TTGAT---------TAT----AATG----TCTGATG--CTTTT--
gi|36 : caaaaaatcAGT------------A----GTTG-------GATG----TCA-CAATAA-C-AGA-AAATATGT---C-ACAACCGC---TACATGGGGTC----T-ATACGCAT-TGTCTCG-T-GG-GAAA-ATG--TCATA--TATGT-TTA-TCGTTA--TT------ACTA-CATGTAG----A---T------C--TT-CAC---G-------TGT----TCAA
gi|37 : t-------------TACA---C-AGTTG---AC-TAA-TG-A--TTTATT-AGAATAA------TA--TAC--G-ACAGCT----------TGGAGG-A-A-ATA-TA------CT----------TCAA---CTTGA-----A-T--A-T--GCTGTT-T-A-----TTTAAAT-A-TAT------CA-ATTTC-AC-TC-
gi|38 : gatgatgtggacagttacTTC----A-TTT-ATCG--T-----AAT--TA--------AT--AACACATTACAGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCAGCTG-AAT--G-TTTGA-AAC-G-AGA----GCGA--AT--AC-AACTAGA
gi|39 : actgAC-AACTG-AAA-GTCTAGAGGAT-A-AAAATA-ACTGT-A---CAT-CA-CTGGTATG---ATGACG--T-AACGGG--TAAGC-AAGGAATTTCCC--C----A-CGT-GGC----T--TGA--TGT----------TTGTgttatgtcagagaagaaga
gi|4 : TGA-TAT-T-TTA-TCTTCA-TTT------GCTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TAT----TAATG-CTGC-------A----TAC--GTATA-AATCAGTTT-TTG-AA---ATT----ATT--T-TTG-A-T--A--A--T----AT----TCCA-TTGATAAT-----ACAT----AA-G----TATCCTG--TTCCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACATT-G-----A-AAT-C-GCCCCCAATGCGCATTGCA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAAAA------TAGAGA--CTCAAG-CGGA--TATAAA-TG-------TAGAATGG-GTT-CA-CGCCTTT----A---ATGAC-AATG---TTTTCT-TTCGT------------CCA--AGGTATA-TTCC-AAA-GGT----------TAGTT--GC-AGGTAAAAGATT-TTGGCA------T-GG--ATGGTA-TCATTTTTT------CCC-C-TAGCTTTGA-C----A---
gi|4 : T-TTGACA------C-GG--ATGGCA-T-ATTTTTT------T-C-C-TAGTTTAAA-T----A---TTA-------T-TTGG--------C-AGTG-AA--TG-C-----GGAAATGC-CC-------A------A---C------A---T-AA-----G-A-AT------TGAAAGTTTGGGTGTT--GT--------T-AA-C--TTTGAGAGGA-T--AT-TACACC--GATCT--GGGTCAT--------TTTTTTTTTTAAAATTC-ATCA--T-----ATC--TAT-------AT-TACCACATCA-AGCC--GAA-ACTGCAA-ATGATTTT-----AGT-GCA-TTA-GAA--G-CTTGA-ACC-GAAG-----GT-A--ATATAT-AACT-GAAA-ATATAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTGATTTG---ATGTCG--T-AACATT--TAAGC-AAGGAATTTCCC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------CTGTT-------------AATA---A-A-TTG---AC-AAA-CA-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--AGC--G-GCAG-T----------TGGAAT-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--A-T--cggatggcatatttttttcctagtttaaatattatttggcagtgaatgcggaaatgcccaacataagaattgaaagtttgggtgttgttaactttgagaggatattacaccgatctgggtcatttttttttttaaaattcatcatatctatattaccacatcaagccgaaactgcaaatgattttagtgcattagaagcttgaaccgaaggtaatatataactgaaaatatagcggataaaaataactctacgtcactgatttgatgtcgtaacatttaagcaaggaatttccccacgtggcacgatgtctgttaataaattgacaaacaatttttagtaaaataagcggcagttggaataattttactttaatttgattataatttca
gi|40 : tgatattttatcttcatttgctacaattatcaagtattaatgctgcatacgtataaatcagtttttgaaattatttttgataatattccattgataatacataagtatcctgttcctatatatagtgtgaatttcaatattcttaatcattacactgtgacattgaaatcgcccccaatgcgcattgcaatttagaaaatagagactcaagcggatataaatgtagaatgggttcacgcctttaatgacaatgttttctttcgtccaaggtatattccaaaggttagttgcaggtaaaagattttggcatggatggtatcattttttcccctagc-TAT-C-TTA-TCATTA-TTC------ACTA-CT---------A---T------A--AT-CAA---A-------TGT----TTAAG-CTAT-------G----TAT--ATGAA-AATCTTTTTTGTC-AA---AAG----ATTaatttca
gi|42 : ttggaaaaaaacctA------TA--TGC--G-ACAC-T----------TTGAAG-A-A-TTT-TC------CT----------TTGA---ATTCA-----A-T--A-T--GGTG-T-C-A-----TC---AT-----T------TA-TTTTT-AC-CT-ACG---AC-ACCTTA
gi|43 : -T----------TGGAA--A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AT-T-TGT------TA-ATTTT-AC-TCAG-A---AC-ATCTTAACtcatcac
gi|44 : A-CG-C--TTC-TT-AGTAAAA------T---TGC--G--CAG-T-----------GGAAG-A-AATTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--GTT--GCTG-T-T-A-----
gi|47 : ATA---TTTACT-TCCGA------------TCA--AGGCAGA-TTCTAAAA-GGA-A------CCTACTT--GC-AGATT
gi|49 : -T-A-----TT---AT-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TTGG-G---AC-ACCTTAACCCt
gi|5 : T-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CAGCAGACTCTA---T------T--CC-C-----G-------TGT----TTAAG-CTGT-------T----TAT--GTGTA-AATCAGTTT-GTC-AG---ATT----ATTC-T-TTG-T-T--A--A--G----TT----TTCT-TTGATAAT-----ACA------A-A----TATCCTC--TTTTT--AT-----------A-------CA---------TAGTGTGAATT--AAA--------------TTATT-CTTA----------------GACCTT-G-----A-AAT-T-GCCTC------------CAATGCACATTGCT-----A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCGAGT-CGTG--TGTATA-TA-------TCGACTTG-ATT-CA-AGTGTTT----A---ATGAC-GATA---TTTCCT-TTCAA------------CCA--AGGTATA-TTTCTAAC-GGA-A------ACTAGCA--GC-AGATTTAAAATT-TTGACG------C-GG--ATGGTA-G-AATTTTT------TGC-C-ATGTTTAGAGT----ACT-TTAGGTGATCT-TTGG--------T-AGCC-AA--TG-T-----GGAAATGC-CC-------A------A---C------AT--T-T------G-A-ATTGAAA-TTA-----TGGGTATT--GA--------T-CA-A--TACGAGAGGA-T--AT-TGTGTC--GATCC--GGGCCAC----------TTTTTC----AATTT-ATCA--C-----ATC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--TAA-ACTGCAA-ATGATATG-----AGT-GCA-TTA-ATC--G-CCTG---C-----------------ATAAAC-AATT-GAAA-GTCTAGCAGAT-A-AAAATA-GCTTT-A---CGT-CA-CATGTATG---ATGACG--T-AATAGG--TAAAC-AAGGGATTTCCC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGGT---------------TA---C-A-TTG---AT-AAA-TA-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGT--G-CCGC-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-TAAA-TAGGCTG-T-T-A------T---AC-T-TGT------TT-ATTTA-AC-TC-T-G---AC-cag
gi|50 : g-----TT---AC-T-TGT------TA-ATTTC-AC-TC-G-GGACAC-ACCTTAGCCgcatt
gi|52 : A-T-ATTTTCT------TGC-C-TCATTTAGA-T----G---AGA-------T-TTGG--------T-Agc
gi|53 : cAGAACACAGGGTGGTTAAGGCGTCCTGATGAAA-G
gi|6 : TA-TTT-----------CA---------A---T------T--AT-CAT---A-------TGT----GCAAG-CTGCATAT---G----CAT--GTGTA-GATCTGTTT-GTCCAA---ATG----ATTC-T-TTG-T-T--A--A--G----TT----TTCT-TAGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AATGC-GCATTG-----------CA-----------------A-------------TG----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--CTCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCAAATTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC----A---TTTTCT-T-CGA------------CCA--AAGCATA-TTTCTAAA-GAT-A------ATTAGTT--GC-AGATTAAATATT-TTGACA------C-GG--ATAGCA-T-GATTTGT------TGC-C-TCGTTTAGA-T----A---TTA-------T-TTGG--------C-CGGG-AA--TG-C-----GGAAAG-GACT-------A------A---C------A---T-T------A---------------------GG-ATT--G-----------AA-A--TACGAGAGGA-T--AT-TAAACC--GATCC--GGGTCAC--------TTGTAT------AATTTAATAA--C-----ATC--TAT-------AT-CAATACACCA-AGGC--CAA-ACTACAA-A---------------------TG-AAT--A-TTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AAC-AGAAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATT-ACTCT-A---CGT-CA-CTGGTATG---ATGACG--T-AACAGT--TAAGC-AGGGAGTTT-CC--CT---A-CGT-GGA----A--CAA--TGT----------TCGTT-------------TACA---C-A-TTG---AC-AAA-CA-A--TAT-TT-AGCAAAT------CA--TAC--G-GTGG-T----------AGGAAG----------A------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-TTCTC-CC-TCGG-G---AC-ACCTTACCC
gi|7 : ATGATGGATCCAA-AAACGCTTCCCTCACTCTTATGTCAACATTTGATAATTTGTAAACAATTGAGGTGAAGTTTAAGATTACACTCAGGAGACATTTTTTTGAATTATAAACATATAGGCAACGCGGTACCTGGATGAGCAAGAATT-GCAGAAAACGATGGTATGTAATAGCCCAGTGATTACCGGAGCGATGTATGGGTCGAAAAGCATGATGCTATA-AAACGAGAACAAAGGGTGGTTAAGACGTCCCGATGAAA-GTCAC---TGTGCTG--TACATAAA-TGCACATCAGT------------A----TGTG-------A-TG----ACA-TAATA--C-A-C-AACTACGT---C--CCTACA----CACA---GTTC----T-A--GGCGT-TGTATCA-T-GGTGGAA-CT------TAC-TA---------CAGTA-TTT------ACTA-CA---------A---A------T--AC-CAA---G-------CGT----CCAAG-ATGC-------ATACTTAT--GTGTA-AATTTGTTT-GTC-AA---ATG----AGTC-T-TTG-C-T--A--A--T----TT----TTTTATTGATAAT-----ATAT-------G----TCTCCTG--TTTCTAAATATCTAA-----A-------TA---------TATCGTGAATT--TCG--------------ATATT-TTTCATCA--TTAGAATG-TGACATT-A-----A-AAT-C-ACCCCCCCCCCCGTGCGCATTGGC------------A-------------T-----TGT--------------AGAATA------CAGAAA--AGCAAT-CGTA--CACACA-TA-------TCGACTTG-ATT-AA-AGCCTTT----A---AAGGCTGATA---TTTT
gi|8 : A-CA---------A---T------T--AT-CAA---A-------CAT----TCAAG-C--C-------G----TAT--GTGT--------------C-AA---ATA----ATTC-T-ATT-T-T--A--A--A----TTAATTTTCT-TTAATGAC-----ATGT----AA-G----TCTCCTGAATTTAT--AT-----------A-------TACATG-----TAGTTTGAATT--ACC--------------ATATT-CTTAATCA--CTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-ATTCC------------CAGTGATCATTGCT-----A-------------T-----T-T--------------AGAAT-----------AA--GCCA-----------------A-------TCAACTTG-GCA-CA-GG---TT----AAAGATGAC-TATA---TTTTCT-TTCAA------------TCA--AGACGTA-TTagactcacaggtttacctcaggtaa
gi|8 : TTTTT------TGC-C-TCGTTTTGA-T----T---ATA-------T-TTGA--------C-AGTG-AA--TG-T-----GAAAATGC-CC-------A------A---C------A---TAT------A-A-ATCAAAA-TTA-----TAGAAATG--GC--------T-AC-A--AACGAGGGGA-T--AT-TATACC--GATCC--GGATCAC--------TTTT---A----AATTT-ATCA--T-----ATC----------------GATACATTA-GGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AAT-GCA-ATA-ATT--G-CTT-A-TCC-A-TG-----GT-A--ATAA-C-AACTG-AAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAACA-GTTCT-A---CCT-CA-CTTGTACG---AATATG--T-AATAGG--AAAGC-ATGGGATTTACC--C----A-CGT-GGT----A--TGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---T-A-TTG---ACAAAA-AG-A--TTT-TT-TGTAAAATACATGTA--TGT--G-ACGC-T----------TGAAAG-A-A-ATT-TA------CT----------TTGA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-A-A-----TT---AT-T-T-C------TA-ATTTC-AC-TC-ATT---AC-ACCTTttttgcctcgttttgattatatttgacagtgaatgtgaaaatgcccaacatataaatcaaaattatagaaatggctacaaacgaggggatattataccgatccggatcacttttaaatttatcatatcgatacattaggcccaaactgcaaatgatttgaatgcaataattgcttatccatggtaataacaactgaaagtctagcggataaaaacagttctacctcacttgtacgaatatgtaataggaaagcatgggatttacccacgtggtatgatgtttgtttatatattgacaaaaagattttttgtaaaatacatgtatgtgacgcttgaaagaaatttactttgatttgaatatgctgtaattatttctaatttcactcattacacctttatatcaccactg
gi|9 : acaattatcaaacattcaagccgtatgtgtcaaataattctattttaaattaattttctttaatgacatgtaagtctcctgaatttatatatacatgtagtttgaattaccatattcttaatcactacactgtgaccttgaaatcattcccagtgatcattgctatttagaataagccaatcaacttggcacaggttaaagatgactatattttctttcaatcaagacgta---------TAGTGTG--TT--TTA----------------------CAATTA--TTACATTG-TGACCAT-G-----A-AAT-C-GTCCCAATG--------CACATTGCT----------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAGA--GTCAGC-GGTG--TATACA-AA-------TCGACTTG-GTT-CA-GGCGTCT----A---ATGAC-GATA---ATTTCT-TTCGA------------TCA--AAGCAAA-TTTCT-AA-GGT-A------ACTAGTG--TC--------AGATT-TTGACA------T-GG--ATGATAGG-A--TTTT------TGC-C-TTGTTTACA-T----G---ATA-------T-TTGA--------C-AGTGAAA--TG-T-----AG-AGT-G-TC-------A------A---C------GATCT-T------G-A-ACTTAAAATTA-----TAGGTATT--GCAT------T-AA-A--CACGAGGGGA-T--ATCTGTACC--GAATCAAGGATC-C--------TTTTT-------A--TT-GCGA--G-----ATC--TAT-------TTCCTAGACATCA-AATCA-CAA-ACAGCAA-ATAGTTTC-----AGT-GCA-TTA-ATC--G-CCTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACT-GATA-GTCCAGTGAAT-ATCGAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTTTATG---ATGACG--T-AATAGGTATAAGCAAAGGCATTT-CT--CTATAA-CAT-GTC----A--CGA--TCT----------T--TT-------------TATA---CTA-TTG---AA-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TG---G-ACGC-T----------TTGGAA-A-A-TTT-GA------CT----------TGAA---TAGGA-----ATT--A-T--GC-G-T-T-A-----TT---ACTT-TGTTACATGTA-ATTTCAAC-TC-G-G---AC-AACTTAAtatatcaccactg
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): CTTGAAATCACAATGTTTAAAGGCATTTAGAATAATGAGTCAATCATTCATAGACAACGACTTGATATAAGTGAAAGATAAAGA
Unaligned ( gi|45 ): ACATTGTGATAATGAAATCGACTCCCAATGCACATATGTCAATTTACAATTAAAGG
Unaligned ( gi|46 ): GTATTCGTCCTATTCAGCGACCCTGCCCCCATGAGCGCCCCCGGGCACTTTCCCA
Unaligned ( gi|48 ): AAAAATCCTGCTTTTAATTTCACTTACTCTTCATCTCGGACT
Unaligned ( gi|51 ): TAGTTTAAAATACGCACTCAAGATGAAAATGAATTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 11 1 22222 1 111 11 1 666666666666666666666666666666666666 11 111111 111111111 111111111111 222222222222222222222222222222 11111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111 111111111111 1111111111 11111111 11111111111111111111111111111111 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 222222222222222222222 111111111 11 1 111111 1111111
lowQualScore : 1 1 66 1 1 1 1 1 2 1 1 1 66 1 1 22 5 44444 1 1 1 1 5 1 0 1 0 8 777 9 33 1 4 0 0 000000000000000000000000000000000000 66 33 5 555 888 55 5 5 999999 888 2 9999 4 66 4 4 4 8 4 888 0 77 3 3 3 2 777777 2 666666666 444 777777777 2 444 8888888 5555 2 999999999999 33 4 2 2 444 5555 33 2 4 2 2 777777 5555 2 2 55555 5555 2 5555 33 0 33 999999999999999999999999999999 33 44444444444444 2 0 66 2 2 77777 2 2 2 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 6666 44 33 2 7777777 2 2 2 33 5555 333 2 333 2 111111111111 33 2 0 2 2222222222 33 2 1 2 22222222 33 55555 4 666666 2 2 55555555555555555555555555555555 2 2 77777777 2 2 22 2 33 88888888 22222 2 4444444444444444444444444444444444444444444444444 1 55555 2 33 11111111 4 2 33 55 2 33 0 66 111111111111111111111 2 88888888 2 33 7777777 2 1 2 55 2 2 44444 1 1 222222222 1 4 77777777 3333 1 66 2 2 2 1 1 333 1 1 333 22 1 2 22 1 0 55 222222 1 5555 22 22 7777777777 9999999999999 555 1 1 333 1 5 1 22 3 3 555555 22 44 44 88888888888888 1 1 1 1 444444 7777777777 222 44444 1 22 1 44 1 1 3 44444 222 1 33 555555 1 1 3 5555555 2
lowQualScore : . . .. . . . . . . . . . .. . . .. . ..... . . . . . . . . . . ... . .. . . . . .................................... .. .. . ... ... .. . . ...... ... . .... . .. . . . . . ... . .. . . . . ...... . ......... ... ......... . ... ....... .... . ............ .. . . . ... .... .. . . . . ...... .... . . ..... .... . .... .. . .. .............................. .. .............. . . .. . . ..... . . . .................................................................... ...... .... .. .. . ....... . . . .. .... ... . ... . ............ .. . . . .......... .. . . . ........ .. ..... . ...... . . ................................ . . ........ . . .. . .. ........ ..... . ................................................. . ..... . .. ........ . . .. .. . .. . .. ..................... . ........ . .. ....... . . . .. . . ..... . . ......... . . ........ .... . .. . . . . . ... . . ... .. . . .. . . .. ...... . .... .. .. .......... ............. ... . . ... . . . .. . . ...... .. .. .. .............. . . . . ...... .......... ... ..... . .. . .. . . . ..... ... . .. ...... . . . ....... .
lowQualScore : 0 0 55 0 0 0 0 0 5 0 0 0 55 0 0 00 5 00000 0 0 0 0 0 0 8 0 2 0 555 2 88 0 2 0 8 000000000000000000000000000000000000 77 66 7 999 888 11 0 0 888888 888 5 4444 4 11 4 4 4 9 4 555 8 88 3 3 1 9 777777 5 222222222 444 666666666 5 444 1111111 3333 7 555555555555 22 7 4 4 111 0000 33 5 7 4 4 111111 0000 4 4 99999 0000 4 0000 22 1 22 444444444444444444444444444444 44 77777777777777 5 9 33 9 9 11111 9 9 9 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 333333 1111 33 77 4 6666666 4 4 4 99 0000 999 2 777 2 444444444444 11 4 4 5 2222222222 44 5 0 7 00000000 44 77777 4 111111 1 1 88888888888888888888888888888888 0 0 22222222 0 0 99 1 11 11111111 22222 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777 8 99999 9 22 88888888 7 4 22 66 4 44 9 33 000000000000000000000 4 55555555 4 22 6666666 4 9 2 33 2 0 55555 8 8 999999999 9 0 33333333 4444 8 33 0 0 0 9 8 222 8 8 333 55 8 5 55 8 4 99 333333 7 4444 44 44 6666666666 6666666666666 222 9 9 333 9 5 8 55 6 6 000000 44 88 88 88888888888888 7 7 7 7 888888 3333333333 999 22222 7 33 7 00 7 7 3 00000 999 7 66 000000 8 8 6 8888888 1
consensus : ATGATNGATCCNATNAACGCTTCCCTCACTNTNANGTCAACATTTGATAGTTTGTGANCNATTGAGGCGAAGNTTGANANTACGCTCAGGAGACATTTTTNTGNATTATAAACGTATGGGCAACGNGGTACNNGGATGAGCAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATANCCCAGTGGTTACCGGAGCGATGNATGGNTCGAAAAGCATGANGCTNTACAAACGAGAACANAGGGTGGTTAAGACGTNCCGATGAAA-GCCAC---TGTGCTG--TNCGTAAA-TGTACCTCAGT------------A----TTTG-------G-TG----TCAN-AATA--C-A-A-AAGTACGT---C-ACG-A-C-G----TACA---GGTC----T-A--CGCGT-TGTATCG-T-GG-GGAA-ATG--TCATAA-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAG-CTGC-------G----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TTCCTAAA-GGT-A----AC--TAGTT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--ATGGTA-T-GNTT-TTT------TGC-C-TCGTTTAG-----------A----------T----AA---TA-T-TTGG--------C-A-G--TG-AA--T--------GC-----GG-AAATGC--------C--C-------AAC-------A-T-T------GAAT-----ATTA-----TGGGTATT--GC--------T-AA-A--TACGAGAGGAT--AT-TGTACC--GATCC--GGGTCAC--------TTTTTTT----AAATTT-ATCA--T-----A-TC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--G-CTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACTGGAAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AACAGG--TAAGCAAGGG-ATTT-CC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCGG-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TC-G-G---AC-ACCTTAACCC
Reference ( family-96 ) : ATGATNGATCCNATNAACGCTTCCCTCACTNTNANGTCAACATTTGATAGTTTGTGANCNATTGAGGCGAAGNTTGANANTACGCTCAGGAGACATTTTTNTGNATTATAAACGTATGGGCAACGNGGTACNNGGATGAGCAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATANCCCAGTGGTTACCGGAGCGATGNATGGNTCGAAAAGCATGANGCTNTACAAACGAGAACANAGGGTGGTTAAGACGTNCCGATGAAA-GCCAC---TGTGCTG--TNCGTAAA-TGTACCTCAGT------------A----TTTG-------G-TG----TCAN-AATA--C-A-A-AAGTACGT---C-ACG-A-C-G----TACA---GGTC----T-A--CGCGT-TGTATCG-T-GG-GGAA-ATG--TCATAA-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAG-CTGC-------G----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TTCCTAAA-GGT-A----AC--TAGTT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--ATGGTA-T-ANTT-TTT------TGC-C-TCGTTTAG-----------A----------T----AN---TA-T-TTGG--------C-A-G--TG-AA--T--------GC-----GG-AAATGC--------C--C-------AAC-------A-T-T------GAAT-----ATNA-----TGGGTATT--GC--------T-AA-A--TACGAGAGGAT--AT-TGTACC--GATCC--GGGTCAC--------TTTTTTT----NAATTT-ATCA--T-----A-TC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--G-CTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACTGGAAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AACAGG--TAAGCAAGGG-ATTT-CC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCGG-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TC-G-G---AC-ACCTTAACCC
gi|1 : ATGATTGATCCCATCAACGCTTCCCTTATTGTAAGATCAACATTTAATAGTTTGTGATCTATTGAGGCCAAGATTGATAATACGCTCAGGAGACATTTTTG-GCATTATAAACGTATGGGCAACGGGATACAGGGATGAACAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATAT----GTGGTTACCGGAGCGATGGATAGTTCAAAAAGCATGAGACTCTACAAACGAGTGCACATGGTGGTTACGACGTGCCGATGAAA-GCCAC---TGGGCTG--TTTTTAAA-TGTACCTAAGT------------A----CTTG-------G-TA----TCAT-AATA--C-A-A-AAGTACGT---C--CG-AAC-A----CACA---GTTA----T-A--CGCAT-TGTATAG-T-GGTGGAA-ACG--TCATAA-TAT-T-TCA-ACGTTA-TTA------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------CGT----CCAAG-TCGC-------A----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TCG-T-TAA-T---T--T----TT-CC-TTGATTCT-----ATAT----AA-G----TCTCATG--TTTCT--AA-----------A-------TA---------TAGCGCTCATT--TCA--------------ATATT-TTTAATTA--TCACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCGCC------------CG-----------------A-------------T-----T-T--------------AAAATA------CAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-ATT-CA-AGTCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCA-TTCGA------------CTA--AGGCATG-TTCCTAAT-GGT-A----AA--TAATT--GC-AGATTAAAGATT-TTAACA------C-GG--ACGGTA-T-ATTC-TTT------TGC-C-TCGTTTAG-----------A----------T----AT---TA-T-TTTG--------C-A-G--TG-AA--T--------GC-----GG-AGA--------------------------------A-T-T------GAAT------TGA-----TGGGTATC--GC--------T-AA-A--TACGAGAGAAT--AT-AGTACC--GATCC--GGGTAATTTTTGTTGTTTTCTT----CAATTT-AATA--T-----A-TC--TAT-------AT-CATCACATGA-AGCT--CAA-ATTGCAA-ATTATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--A-CTTGA-ACA-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACTAAAAA-GTTTATCGCA--A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTTTG---ATGATA--T-AACAGG--TTGG-AAGGA-ATTT-CC--C----A-TGT-GGC----A--CGA--TGG----------TTGTT-------------TATA---C-A-CTG---AC-AAG-CG-G--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--A-GCAG-T----------TGGAAG-A-A-GTT-TA------CA----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----AT---AC-T-TGC------TG-TTTTC-AC-TC-G-G---AC-ACCTTAACCC
gi|10 : TACA-TA-------TCGATTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GAAA---ATTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TT-CTGAA-GGTAA----AT--TAGTT--AC-AGATTAAAGATTGTTG-TA------C-GG--ATGGTA-T-GAAT-TTT------TGC-C-TCCTTTAC-----------A----------T----AT---TA-G-TTGA--------C-A-G--TG-AA--T--------GC-----AG-AAATAC--------C--C-------AACCTTACA-A-T-T------G-AT-----ATTA-----TGGATATT--GC--------T-AA-A--TACAAGATGAT--AT-TGTACC--GA-CC--AGGTCA---------TTTTTTA----AAATTT-ATAA--T-----A-TC--TGC-------AT-CAACACTTTG-AGCC--CAA-AATGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTT-AAG--A-ATTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAT-AGCTGT-AA-GTCTAGCGGAT----AAATACACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACGTTT-ATCAGG--TAAGCAAGGA-TTTT-CC--CA---A-TGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TGT-TT-AATAAGA------TA--TGC--G-GT-G-T----------GGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGG-----A-T--A-C--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TCAG-A---AC-ACCTTAACTC
gi|11 : GTACGT---TGACG-G-C-GGCATTGCA---GGTC----T-A--CGTGT-AACATCG-T-GG-GGAA-A-GATTCATCA-AAT-T-GTA-TCGTTG-TTT------ACTAACA---------G---TAGACTCC--ATTCAC---G-------TGT----TCAAG-ATGT-------A----TAT--GTGTATAATATGTTT-GTC-AA---GTG-----TTA-TGTTG-T-TAA-G---T--T----T--CT-GTGGTGAT-----AT-T----AA-TATTTTTTTTTG--TTTTT--ATATCTATTGTGGA-------TA---------TAATAAAAACCAATCATTATTATTATTATCATATTACTTAATTAA-TTACATTG-TTACTTTTG-----ACAAT-TTATTCC------------CA-----------------AATGTGCATTACTAT-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GTTAAT-CATG--TATATA-TA-------TCGACTTGCGTT-CAGAG--TGT----A---ATGAC-GATA---TTTTCTATTCGA------------TCA--ATGTATATTTCCTAAA-TGT-A----AC--TCCTTTGGCAAGTTTAAAGATT-TTGACA--------GGTTATGGTG---GGTT-TTT------TGC-C-TTGTTTAG-----------C----------A----AA---TA-T-TTGG--------C-A-A--TG-AA--T--------ATA----GG-AAACAC--------T--C-------AAT-------A-T-T------TGAT-----Ac
gi|12 : ---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGG------------CTA--ATTCATA-TTCCCAAC-GGT-A----AG--TAGTT--GC-AGATTTAAGATT-TTGACA------C-GA--ATGGTA-T-AATG-TTT------TGC-C-TCCTTT------------------------------------------G--------C-A-G--TG-AA--T--------AT-----GG-AAATGT--------C--C-------AAC-------A-T-TTGCACTGAA------ATCA-----TGGGTATT--GC--------TTAATA--TACCAAGGGAT--AT-TATACT--GAACC--GGGTAAC--------ATTTT------CAATTT-ATCA--T-----A-AC--GAT-------AT-CGATACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTA-ATT--A-CCTGA-ACC-G-TG-----AT-A--ATAAAC-AACTG-AAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-TCTCT-A---CGT-CA-CTTGTATT---ATGATG--T-AATAGG--TAAGCAAAGG-ATTT-TC--C----AACGT-GACTGACA--CTG--TGT----------TTCTT-------------AATA---C-A-TTG---AA-AAG-CG-C--ATT-TC-AGTCAAA------TA--TGC--G-ACGC-T----------TTGAAG-A-A-TTT-CA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-C--A-T--GATG-T-T-A-----TT---AC-T-TGA------TA-ATTTC-AC-TC-GTG---AC-ACCATAACC
gi|13 : tt----TGT--GTGTA-AATCTGTTA-GTC-AA---GTG----ATTC-T-TTT-T-TA--G---C--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATGT----AA-G----TCTCCTG--TT------------------A-------AA---------TAGTGTGCATT--ACA--------------GAAAT-CTTGAT-A--TAACATTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GTCAA------------CA-----------------A-------------T-----T-TGCTTATAGCCATTTAGAATA------AAGAAA--TTCAAT-CGTG--TGTACA-TA-------TCGACTTG-GCA-CA-GG----TGAAAA---ATAAT-GAAA---TTTTCT-TTCGA------------TCA--ATGCATA-TTCCTAAA-GAT-------------TT--G---------AAATT-TTGACACAAGGCC-GG--ATGG-A-T-TTTT-TTTTTAAAATGCTT-TCGTTTAG-----------A----------A----AA---GA-T-TTGG--------T-A-G--TG-AA--T--------GTG----GG-AAATAC--------C--CATT----AAC-------ATT-T------GAATCAAA-ATGA-----TGAAAATT--GC--------T-AA-A--TACGAGAGCAT--AT-GATACC--GGTGC--TGATCAC----------GTTCT----AAATTC-ATCA--------------TGT-------AT-CGACATGTCA-AACC--CAA-ACTGCAA-ATGAGTGG-----AAT-ACA-T
gi|14 : ----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATC----ATTT-T-TTA-T-TAA-G---A--T----TC-CT-TTGATAAT-----ACAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGCATT--TTG--------------ATA----------------CACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GACCC------------CA-----------------A-------------TGCGCAT-T--------------GTAATAATTATTTAGAA----------TGTG--TACAGA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----G---GTAAC-GATA---TTTTCT-C-CGA------------TCA--AGGCATA-TTCGTAAA-GGT-A----AT--GAATT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--TTGGCG-T-GGTTCTTT------TGC-C-TCGTTTAA-----------A----------T----AT---TA-T-TTGA--------C-A-A--TG-AA--T--------GC-----GG-ACATGC--------T--T-------AAC-------A-T-T------AGAA-----ATTA-----TGGTTATT--GCTACATGTGT-AA-A--TACAAGAGGAT--AT-TGTACC--GATCC--GGGTCG------------TTTT----CAATTT-ATCA--T-----A-TT--TAT-------AC-CAACACATCA-ATCC--CAA-ACTCCAA-ATGATATGACTAAAGT-GCA-TT--AAT-----TTGA-Accttcacctgtgccgatataa
gi|15 : ACA------CTGG--ATAGTA-G-GATG-ATT------TGC-C-TCGTTTAG-----------A----------A----AAATTTG-TATTGG--------C-AAG--TG-AA--T--------GCC----GA-AAATAC--------C--ATGTTTG-AAA-------T-T-T------GCAA-----ATGA-----TGAG------GG--------T-AA-A--TGCTAAGGGATT-AT-CGTAAC--GATCC--AGGCC-C--------CCTTTTC----AAATTC-AGCA--T-----AATA--CAT-------AC-CGACACACAA-AGCCAAAAA-ACTGCAA---GA-------------ACA-TTG-ACT--G----------------------------AAA--AATTGGAAATGGCTAGC-GAT-A-AAAATA-GCTCT-A---CGT-CA-CTGGTATG---A------------------AAGC-AGGG-ATTT-CC--C----A-CCT-GGCA---A--TGA--TG--------------------------------A---C-G-CCGTAAAC-AAAGCG-A--TGT-TG-AGGAAAA------TA--TGCAAA-ACG-------------TGGAAATA-A-TTT-TA------AT----------TTAA---TCTGA-----A-T--A-T--GCTG-TATAA-----TT---AT-T-TGT------
gi|16 : tgaGT------------A----TTTG----------------CAG-AATGACC-A-A-ACGAACGT---C-ACG-A-C-T----TACA---GGTT----T-A--CGCGT-TGTATCG-TTGA-GAAA-ATG--TCATA----T-T-TTA-TCATTC-TTA------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAA-CTGT-------A----TAT--GTGTA-CATCTGTTT-GCC-AA---ATG----ATTC-T-TTA-T-CAA-G---T--T----AA-CT-TTAATAAG-----ATAT----A-------TATCCTG--TTTTT--AT-----------A-------TATACATG---TAGTGTGGAAT--TTA--------------ATTTG-CTTAATCA--TTAAATGG-TGATATT-GATTCAA-AAT-T-GCCCC------------CAATGCGCAGTGAT-----A-------------T-----T-T--------------ACAATC------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACGTG-GTT--A-GGCGTTT----C---GTGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------GCG--AGctcaatataatcaactcgggagttcttac
gi|17 : ctaaaagctgatgatTTAG-----------A----------T----AA---AA-T-CTTG--------T-A-G--GG-GA--T--------GCATGTTGG-AAATAC--------C--G-------AAC-------T-T-T------GATTCGTT-ATCA-----TGGAAATA--GC--------T-AA-A--TGCAATAGGGT--GT-TGTACC--GTTCT--GGATCA------------TTTT----AAATTT-GTCT--T-----A-TCAATAT-------AT-CGAC---------CC--CAA-ACTGTAA-ATGATCAG-----AGC-ACA-CC---------CTTCA-GTT-G-TGCCAATGT-A--GTATAT-AACTAGAA--GTCTTGCGGA----AAACTA-GCTC-----------A-CTTGCATG---ATTACG--T-TATATT--GAAGCGAGGG-TTTT-CC--A----A-AGT-GGC----T--CAA--TGT----------TT-----------------ATG---T-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTG-T--AATAAAA------TA--TGC--G-ACAC-T----------TTGAAG-A-A-TTT-TT------CT----------TTGA---ATTCA-----A-T--A-T--GGTG-T-C-A-----TC---AT-T-atacttagttggaaaatatttt
gi|18 : TG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTTCCA--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------AAATT-CTTAATCA--TTGCACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------TGCGCAT-T--------------GGAATT------TAGAA----------TGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAT-GATA---TTTTCT-TTCGAANNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN-NNNNNNNN-NNN-N----NN--NNNNN--NN-NGATTAAAGATA-TGGACA------A-GG--CTGGTA-T-GATT-GTT------TGT-C-TCGTTAAG-----------A----------T----AT---TA-T-TTGG--------C-A-G--TG-GA--T--------GC-----AG-AAATGC--------C--C-------AAC-------A-T-TA-----GAATTTAA-ATCA-----TGGGTATT--GC--------T-AA-A--TATGAGAGGAT--AT-TGTACT--Gtatatgcgacactttgaagaat
gi|19 : A-TG-------TCTACTTG-GTA-CA-GGCGAAC----G---ATGAC-GATAATATTTTCT-TTCGA------------TCA--AGGCATA-TTCTTAAA-AGT-A----AC--TAGAT--GC-AAATTTAAGATT-TTAGCA------G-GG--AATGTA-G-GATT-CCC------TCC-C-TTGTGTAT-----------A----------T----TA---TA-T-TTGG--------C-A-G--TG-AA--T--------GT-----AA-AAATGC--------C--C-------AAT-------A-T-TG-----GAATCGGC-ATTA-----TGGAAATT--GT--------T-AA-A--TACAAGAGGGT--AT-TGCA
gi|19 : agG-----AGG-GTA-TTGCAATC-A-CATGT-GCC-G-TT-----GC-G--ATAAAC-AACTAGAAA-G-CTTTCGGAT-A-AGAA-A-ACTCA-A---TGT-CG-TTTGTATG---ATGACG--T-AATTGT--TAA-----AG-ATTT-CC--A----A-CGT-GGT----A--CGA--TGT----------TTGCT-------------atcacatgtgccgttgcgataaacaactagaaagctttcggataagaaaactcaatgtcgtttgtatgatgacgtaattgttaaagatttccaacgtggtacgatgtttgctgacgaattcatctctcaataaa
gi|2 : agatgtctacttggtacaggcgaacgatgacgataatattttctttcgatcaaggcatattcttaaaagtaactagatgcaaatttaagattttagcagggaatgtaggattccctcccttgtgtatattatatttggcagtgaatgtaaaaatgcccaatattggaatcggcattatggaaattgttaaatacaaATGAAATGCCACAATTG-GCTGAGTATGTAAACTGGACCTCAGT------------GGCACTTCGCAGTAGCG-TGACGATCAGCAATA--CTA-ATAAGTACGTGCTC-ACGTA-C-A----TACA---G-TCAAAATGA--CGCGTGTGTATTG-T-GG-GGAAGATA--TAAGAAATAT-TATTAATCGTTAATTT------ACTA-CA---------A---T------TT-AT-CAAATAG-------TGTACGCCCAAGGCTGC-------G----TAT--GAGTATAATCTGTTT-GTC-AA---AT------TTA-T-TTGGT-TAATG---TAAT----TTACT-TTGATAATGCCATATATTAAAAA-G--------------------AT-----------G--------A---------TAGTGTGAATT--TAA--------------ATATT-CTTAATTACCTAAGACTGATGCGCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CATTGATCGCGCATTGTTAA-------------T-----T-T--------------AGAATACT----TAGAAAAGGCAAATTCGTG--TATAAACTACCCACGCTCGTCTTG-GTTTCA-AGCCTTT----A---A-GAT-GATT---ACTTCT-TCAGA------------CGATTAAGCATA-TTCCGAAGTGGT-AGATTACAGTAGTT--G--AGATTAAAGATT-TTGACAG-----C-GG--AATGTAAT-GATTGTTT------TGC-CATCGTTTAG-----------A----------T----AT---TAAT-TTGGGTTCTGGGC-A-G--TG-GAGTT--------GC-----GG-AAATGC--------C--A-------AATTCGTAGAA-T-T------GAA------ATTA-----TGGGTATTTGGC--------T-AA-AACT-CATGCAGATTGAT-TGTATCCTGAGC---GGGTCAC--------TTTTT------CAATTT-ATCA--TTCATTA-TC--TACCGGTATAAT-CAACACATCA-AGCC----A-ACTGCAA-ATGATTTG-----AATGGCA-TTATAAG--G-CTTTA-ACCAG-TG-----GT-----T---C-AA---------TTTAGCGGATGA-AAAATA-GCTAT-ATGGCGT-CAGCTGGTATGTACATGACG--T-AA---------------A-ATTT-CCA-C----C-CGT-GTC----A--C-----GT----------ATGTT-------------GA-----------G---AC-AAAGCGTAATTTT-TT-AGTAAAA------TAGTTGTCGG-GCGGTT----------TGGGAT-A-A-TTTGTATTTGATCT----------TTAA---TTTGA-----T-T--A-TG-GCT--T-T-A-----TT---AC---CGT------TATATTTT-ACTTC-G-GGA-ACAACCTTAACCgacgaattcatctctcaataaa
gi|20 : TTTT----TAATTC-TTTA--TT----A-TT--T-T-------AC-T--CACATGA-A--T--CAATATTGCAAGATTATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--A-CT-GATATC-A--------GT-T--GTATAC-AACTAAAAA-GTTTATCG--C-A-AAAATA-ACTC--A---CGT-CA-CTTGTTTG---ATGA------AATAGG--TTG--AAAGA-ATTT-CC--A----T-GGT-GCC----A--CGA--TGG----------TTGTT-------------TATAATAC-A-CTG---AC-AA--CG-G--TT-----AGTAAAA-------A--TAC--A-----------------CGGAAT-A-G-TTT--A------C--------------A---TTT-A-----A-T--A-A--AC-G-T-A-A-----TT---AC-TATGC------TG--TTTC-AC-TC-G-A------ACCTTAACC
gi|21 : ataTT------TGT-C-TCGTTTAG-----------A----------CTCTCAA---TA-T-TTGG--------C-A-G--TG-AA--T--------GT-----GG-AAATAC--------C--CAATATTTAAC-------A-T-T------GAA------ATTA-----TGGATATT--CC--------TAAA-A--TA-GAGGGGAT--A--TGTACC--GATTCA-AGGTCGC--------TTTTGAC----AAAATT-ATCAACT-----A-TC--GAT-------AT-CGACACATCA-AG----CAA-ACTGGTA-ATTATATG-----G---GCA-TTA-GATTCA-CCTG---CCAA-TG-----AC-ATTTTAAACAAACTG---A-GTCTAGCATAT-G-ATAATA-GCTCTAA---CCTGCG-CTTGTac
gi|22 : -AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-CTG-AAT--G-TTTGA-ACC-G-TG-----GA-A--ATAAAC-AACTG-AAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTTT-A---CTT-CA-CTGGTATT---ATGACA--T-AACGGG--TAAGCATGGC-ATTT-CCA-C----G-CAT-GAC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------C----------TT---------A-CG-A--TTC-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCAG-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--G-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TTGG-G---AC-ACCTTAACCg
gi|23 : -AATA--C-G-A-AAGTACGT---C-ATG-A-C-G----TACA---CGTC----T-A--CGTNN-NNNNNNN-N-NN-NNNN-NNN--NNNNNN-NNN-N-NNN-NNNNNN-NTTCACAACATGA-CA---------ACGCT------T--AA-AAA---G-------TGT----TCAAA-CTGT-------A----TAT--GTGTA-AATTTGTTT-GCC-AA---ATG----ATTG-T-TTG-T-TTA-G---T--T----TC-CT-TTGACAAT-----ATAC----AA-G----CATCTTG--TATTT--AT-----------ATACACTGTA---------TAGTGTGAAAT--ATA--------------ATATC-ATTAACCA--TTATATT
gi|24 : atgcacttcgcaTGATTTG-----AGT-GCA-AT--AAT--AACCTGA-ACC-G-TA-----GT-A--ATAAAC-AATTG-AAT-GACTAGCGGAT-A-AACATA-ACACT-A---CGC-CA-CTTGTATT---ATGACG--T-AAATGG--GAAGCAATGG-ATTT-CC--C----AACGT-GGA----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAAACG-A--GTT-TT-ACTAAAA------CG--TGC--G-ACGT-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTCA-----A-T--T-T--TCTA-T-T-A-----TA---AC-T-TGT------TA-ATTTC-AC-AC-GAG---AC-ACCTCAAa
gi|25 : AAAC-AACTG-AAT-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-GTTCT-A---CAT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AGTAGG--TAAGCAGGGG-ATTT-CC--C----CTCGT-GGC----A--CAA--TGC----------TAGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TTTAATAAAA------TA--TGC--G-ATAC-T----------TGGAAG-A-A-TTT-CA------CT----------TTAA---TCTGA-----A-T--A-G--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-TGT------TA-ATTTC-AC-TCAG-G---AC-ACCTTAACCC
gi|26 : -A---TGT-CA-CCTGTATG---ATGAAG--A-AATAAT--TCAGCAAAGG-ATTT-CC--C------CAT-G-T----A--CAA--TGTACAGCAATGGTTGTTACTGCCACTTAAATATG---A-A-TTG---AC-AAA-CA-A--TTT-CT-AACAAAA------TA--TGT--ATGC---T----------TGAAAG-A-A--TT-TA------CTTGGCACAGCATTAATGCTTTCA-----A-T--A-T--GCTA-T-T-ACTAGCCT---AC-T-TGT------T--ATTTT-AC-Tc
gi|27 : g-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CCTG--TATGC--TA-------TCGACTTC-GTT-CA-GGC-------------------------TTTTCT-TTAGA------------TCA--AAATATA-TTCTTAAA-GGT-A----AT--TACTT--GC---AT-----ATT-T---------------------CA-T-ATTT-TCT------TGC-C-TCATTTAG-----------A----------T----GA---GA-T-TTGG--------T-A----TG-A
gi|27 : -ATGATTTG-----AGT-GCA-AT--AATA-A-CCTGA-ACC-G-TA-----GT-A--ATAAAC-AATTGtttgagtgcaataataacctgaaccgtagtaataaacaattg
gi|28 : tttagaatatagaaagccaatcctgtatgctatcgacttcgttcaggcttttctttagatcaaaatatattcttaaaggtaattacttgcatatttcatattttcttgcctcatttagatgagatttggtACG--T-AATAGG--TAAGCAAGGA-ATTTTCC--C----T-CGTTGAC----A--CGACATGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-ATG---GC-AAA--G-A--TTT-TTGAGTCAAA------CA--TGC--G-ACCG-TAGATAGCTCTTTGAAG-A-A-TGT-AA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--TCTG-T-T--------T---A-------------TG-AT-----C-TT-G-G---AT---CTTAACCC
gi|29 : ATA-AATTC-A---TGT-CA--TGGTATG---ATGACG--TTAACATG--TAAGCAAGAA-ATTT-CC--CC---A-AGT-CGC----A--TGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGCACAA------TA--TGC--G-GCGG-T----------TGGAAA-A-A-AAT-TA------CC----------TTAA---GTTGG-----A-T--G-T--GCTG-T-T-A-----TC---AT-A-CGT------TT-ATTTA-AC-gggacattcctacct
gi|3 : ----T-A--CGCCT-TGTACCAAT-GT-GAAA-ATA--TAATGA-TAG-T-TTA-CAGTCA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AG-CAA---G-------TAT----CCATG-CTGC-------A----TAC--GTATA-AATTTGTTT-GTA-AA---A------ATTT-T-TTC-TATAA-G---A--T----TT-AT-TTGATAAT-----ACAT----AA-G----TCCCCTG--TTCCT--AT-----------A-------TACATTATGTATAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACATT-G-----A-AAT-C-GCCCTCAATGCGCATTGCA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAGA--CTCAA---GTGAATATAAA-TG-------TAGACTGG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-AATA---TTTTCT-TTCGT------------CCA--AGGTATA-TTCCAAAA-GGT----------TAGTT--GC-AGATTAAAAATT-TTGACA------C-GG--GTGGCA-T-ATTT-TTT------T-T-C-TAGTTTAA-----------A----------T----AT---TA-T-TTGG--------C-A-G--TA-TA--T--------GC-----GG-AAATCC--------C--C-------AAC-------A-T-TA-----GAAT------TGAAAGTTTGGGTGTT--GC--------T-AA-C--TTTGAGAGGA------------------------TCA---------TTTTTTA----AAATTT-ATCA--T-----A-TC--TAT-------AT-TAACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTT-----AGT-GCA-TTA-AAG--G-CTTGA-ACC-GAAG-----GT-A--ATAAAT-AACT-GAAA-ATGTAGCAGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTGATATG---ATGTCG--T-AACATT--TAAGCAAGGA-ATTTCCC--C----A-CTT-GGC----A--CGA--TAT----------CTGTT-------------TATG---A-A-TTG---AC-AAA-CA-G--TCT-TT-AGTAAAA------TA--AGC--G-GCGG-T----------TGGAAT-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--A-T--ACTT-T-C-A-----TT---AT-T-CGT------TA-ATTTC-CC-TCGG-G---AC-AC
gi|30 : A-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------GCTA-AA---------A---T------T--AT-CAA---GACTTTAGTGT----TCAAG-CTGT-------G----TAT--GCGTA-AATCTGTTT-GTG-AA---AAG----TTTCTT-TTGTT-TTG-G---T--T----TT-CT-TTAATTAT-----ATAT----TA-C----TCTCCTG--TATCT--AT-----------C-------TA---------T
gi|31 : tcCAA-ATGACTTG-----ATT-GCA-TTA-ATC--A-ACTGT-GCC-G-TG-----GA-G--AAAAAC-AA-TCGATA-ATCTAGTGAAT-A-AAA-TA-GTTCT-A---TGT-CA-CTTTTACG---ATGATG--T-AATAGA--TAATTAAGGT-ATTT-CCCGC----A-CGC-GGT----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------Tccatctacatgtatgtaatggaa
gi|32 : cctTC-CC--C----A--AT-GGC----AATCGA--TGC----------CTGTG-------------TATAT--C-A-TT----AC-AAA-CG-A--TTTGTT-AATAAAA------TA--TGT--C-ATGG-T----------TGGAAT-ATA-TTT-TG------CT----------T------TTTGAAATGTA-C--A-T--GCAG-T-TAA-----TT---AC-T-TGT------TA-TGTTC-ACTTT-G-G---AC-ACCTTTAC
gi|33 : tcACAGAGCGTAGGCAAGCCGCACAGAGGAAA-TTCAC---TGTACTA--TTCATAAA-TGTGTCTCAATGTATTTCACACTA----TTTG-------A-TT----TCTG-AATA--C-A-A-AAGTACTT---C-ACG-A-C-G----TACG---GGTT----T-A--CAAGT-TGTATCT-T-GG-GGAG-ATt
gi|34 : TT------ATTA-GA---------A---T------TTAAT-GAT---A-------TAA----TTAAG-CTCT-------A----TATAGGCGTA-AATCTGATT-GTT-AG---ATG----ATTC-T-CGT-T-TCA-G---TATT----TT-TT-TTTAAACT-----ATAT----AA-G----TCTTCTA--TTTTT--AT-----------A-------TA---------CAGTGTGAATT--AAG--------------ATAAT-CTTAAT
gi|35 : -TCATCA-TTT------ATTA-CC---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TGAA--CTGTATACATTG----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AATACATGTGAAATTT-T-TTT-T-T-C-GTCTT--C----TT-CT-TTGAT---------TAT----AATG----TCTGATG--CTTTT--
gi|36 : caaaaaatcAGT------------A----GTTG-------GATG----TCAC-AATAA-C-AGA-AAATATGT---C-ACA-A-CCGC---TACATGGGGTC----T-ATACGCAT-TGTCTCG-T-GG-GAAA-ATG--TCATA--TATGT-TTA-TCGTTA--TT------ACTA-CATGTAG----A---T------C--TT-CAC---G-------TGT----TCAA
gi|37 : t-------------TACA---C-AGTTG---AC-TAA-TG-A--TTTATT-AGAATAA------TA--TAC--G-ACAGCT----------TGGAGG-A-A-ATA-TA------CT----------TCAA---CTTGA-----A-T--A-T--GCTGTT-T-A-----TTTAAAT-A-TAT------CA-ATTTC-AC-TC-
gi|38 : gatgatgtggacagttacATTT-ATCG--T-----A-AT--TA--------AT--AACACATTACAGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCAGCTG-AAT--G-TTTGA-AAC-G-AGA----GCGA--AT--AC-AACTAGA
gi|39 : actgttcAC-AACTG-AAA-GTCTAGAGGAT-A-AAAATA-ACTGT-A---CAT-CA-CTGGTATG---ATGACG--T-AACGGG--TAAGCAAGGA-ATTTCCC--C----A-CGT-GGC----T--TGA--TGT----------TTGTgttatgtcagagaagaaga
gi|4 : TGA-TAT-T-TTA-TCTTCA-TTT------GCTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TAT----TAATG-CTGC-------A----TAC--GTATA-AATCAGTTT-TTG-AA---ATT----ATT--T-TTG-A-TAA-T---A--T----TC-CA-TTGATAAT-----ACAT----AA-G----TATCCTG--TTCCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACATT-G-----A-AAT-C-GCCCCCAATGCGCATTGCA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAAAA------TAGAGA--CTCAAG-CGGA--TATAAA-TG-------TAGAATGG-GTT-CA-CGCCTTT----A---ATGAC-AATG---TTTTCT-TTCGT------------CCA--AGGTATA-TTCC-AAA-GGT----------TAGTT--GC-AGGTAAAAGATT-TTGGCA------T-GG--ATGGTA-TCATTT-TTT------CCC-C-TAGCTTTGACACGGATGGCA----------T----AT---TT-T-TTTC--------CTA-GTTTA-AA--TATTATTTGGC-----AGTGAATGCGGAAATGCC--C-------AACATAAGA-A-T-T------GAAA-----GTT------TGGGTGTT--GT--------T-AA-C--TTTGAGAGGAT--AT-TACACC--GATCT--GGGTCAT--------TTTTTTTTTTAAAATTC-ATCA--T-----A-TC--TAT-------AT-TACCACATCA-AGCC--GAA-ACTGCAA-ATGATTTT-----AGT-GCA-TTA-GAA--G-CTTGA-ACC-GAAG-----GT-A--ATATAT-AACT-GAAA-ATATAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTGATTTG---ATGTCG--T-AACATT--TAAGCAAGGA-ATTTCCC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------CTGTT-------------AATA---A-A-TTG---AC-AAA-CA-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--AGC--G-GCAG-T----------TGGAAT-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--A-T--
gi|40 : -TAT-C-TTA-TCATTA-TTC------ACTA-CT---------A---T------A--AT-CAA---A-------TGT----TTAAG-CTAT-------G----TAT--ATGAA-AATCTTTTTTGTC-AA---AAG----ATTaatttca
gi|42 : ttggaaaaaaacctA------TA--TGC--G-ACAC-T----------TTGAAG-A-A-TTT-TC------CT----------TTGA---ATTCA-----A-T--A-T--GGTG-T-C-A-----TC---AT-----T------TA-TTTTT-AC-CT-ACG---AC-ACCTTA
gi|43 : -T----------TGGAA--A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AT-T-TGT------TA-ATTTT-AC-TCAG-A---AC-ATCTTAACtcatcac
gi|44 : A-CG-C--TTC-TT-AGTAAAA------T---TGC--G--CAG-T-----------GGAAG-A-AATTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--GTT--GCTG-T-T-A-----
gi|47 : ATA---TTTACT-TCCGA------------TCA--AGGCAGA-TTCTAAAA-GGA-A----CC--TACTT--GC-AGATT
gi|49 : -T-A-----TT---AT-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TTGG-G---AC-ACCTTAACCCt
gi|5 : T-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CAGCAGACTCTA---T------T--CC-C-----G-------TGT----TTAAG-CTGT-------T----TAT--GTGTA-AATCAGTTT-GTC-AG---ATT----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ACA------A-A----TATCCTC--TTTTT--AT-----------A-------CA---------TAGTGTGAATT--AAA--------------TTATT-CTTA----------------GACCTT-G-----A-AAT-T-GCCTC------------CAATGCACATTGCT-----A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCGAGT-CGTG--TGTATA-TA-------TCGACTTG-ATT-CA-AGTGTTT----A---ATGAC-GATA---TTTCCT-TTCAA------------CCA--AGGTATA-TTTCTAAC-GGA-A----AC--TAGCA--GC-AGATTTAAAATT-TTGACG------C-GG--ATGGTA-G-AATT-TTT------TGC-C-ATGTTTAG-----------AGTACTTTAGGT----GA---TC-T-TTGG--------T-A-G--CC-AA--T--------GT-----GG-AAATGC--------C--C-------AAC-------ATT-T------GAATTGAA-ATTA-----TGGGTATT--GA--------T-CA-A--TACGAGAGGAT--AT-TGTGTC--GATCC--GGGCCAC----------TTTTT----CAATTT-ATCA--C-----A-TC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--TAA-ACTGCAA-ATGATATG-----AGT-GCA-TTA-ATC--G-CCTG---C-----------------ATAAAC-AATT-GAAA-GTCTAGCAGAT-A-AAAATA-GCTTT-A---CGT-CA-CATGTATG---ATGACG--T-AATAGG--TAAACAAGGG-ATTTCCC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGGT---------------TA---C-A-TTG---AT-AAA-TA-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGT--G-CCGC-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-TAAA-TAGGCTG-T-T-A------T---AC-T-TGT------TT-ATTTA-AC-TC-T-G---AC-cag
gi|50 : g-----TT---AC-T-TGT------TA-ATTTC-AC-TC-G-GGACAC-ACCTTAGCCgcatt
gi|52 : A-T-ATTT-TCT------TGC-C-TCATTTAG-----------A----------T----GA---GA-T-TTGG--------T-A-gc
gi|53 : cAGAACACAGGGTGGTTAAGGCGTCCTGATGAAA-G
gi|6 : TA-TTT-----------CA---------A---T------T--AT-CAT---A-------TGT----GCAAG-CTGCATAT---G----CAT--GTGTA-GATCTGTTT-GTCCAA---ATG----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TAGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AATGC-GCATTG-----------CA-----------------A-------------TG----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--CTCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCAAATTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC----A---TTTTCT-T-CGA------------CCA--AAGCATA-TTTCTAAA-GAT-A----AT--TAGTT--GC-AGATTAAATATT-TTGACA------C-GG--ATAGCA-T-GATT-TGT------TGC-C-TCGTTTAG-----------A----------T----AT---TA-T-TTGG--------C-C-G--GG-AA--T--------GC-----GG-AAAGGA--------C--T-------AAC-------A-T-T------A-------------------GG-ATT--G-----------AA-A--TACGAGAGGAT--AT-TAAACC--GATCC--GGGTCAC--------TTGTAT------AATTTAATAA--C-----A-TC--TAT-------AT-CAATACACCA-AGGC--CAA-ACTACAA-A---------------------TG-AAT--A-TTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AAC-AGAAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATT-ACTCT-A---CGT-CA-CTGGTATG---ATGACG--T-AACAGT--TAAGCAGGGA-GTTT-CC--CT---A-CGT-GGA----A--CAA--TGT----------TCGTT-------------TACA---C-A-TTG---AC-AAA-CA-A--TAT-TT-AGCAAAT------CA--TAC--G-GTGG-T----------AGGAAG----------A------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-TTCTC-CC-TCGG-G---AC-ACCTTACCC
gi|7 : ATGATGGATCCAA-AAACGCTTCCCTCACTCTTATGTCAACATTTGATAATTTGTAAACAATTGAGGTGAAGTTTAAGATTACACTCAGGAGACATTTTTTTGAATTATAAACATATAGGCAACGCGGTACCTGGATGAGCAAGAATT-GCAGAAAACGATGGTATGTAATAGCCCAGTGATTACCGGAGCGATGTATGGGTCGAAAAGCATGATGCTATA-AAACGAGAACAAAGGGTGGTTAAGACGTCCCGATGAAA-GTCAC---TGTGCTG--TACATAAA-TGCACATCAGT------------A----TGTG-------A-TG----ACAT-AATA--C-A-C-AACTACGT---C-CCT-A-C-A----CACA---GTTC----T-A--GGCGT-TGTATCA-T-GGTGGAA-CT------TAC-TA---------CAGTA-TTT------ACTA-CA---------A---A------T--AC-CAA---G-------CGT----CCAAG-ATGC-------ATACTTAT--GTGTA-AATTTGTTT-GTC-AA---ATG----AGTC-T-TTG-C-TAA-T---T--T----TT-TTATTGATAAT-----ATAT-------G----TCTCCTG--TTTCTAAATATCTAA-----A-------TA---------TATCGTGAATT--TCG--------------ATATT-TTTCATCA--TTAGAATG-TGACATT-A-----A-AAT-C-ACCCCCCCCCCCGTGCGCATTGGC------------A-------------T-----TGT--------------AGAATA------CAGAAA--AGCAAT-CGTA--CACACA-TA-------TCGACTTG-ATT-AA-AGCCTTT----A---AAGGCTGATA---TTTT
gi|8 : A-CA---------A---T------T--AT-CAA---A-------CAT----TCAAG-C--C-------G----TAT--GTGT--------------C-AA---ATA----ATTC-T-ATT-T-TAA-A---T--TAATTTT-CT-TTAATGAC-----ATGT----AA-G----TCTCCTGAATTTAT--AT-----------A-------TACATG-----TAGTTTGAATT--ACC--------------ATATT-CTTAATCA--CTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-ATTCC------------CAGTGATCATTGCT-----A-------------T-----T-T--------------AGAAT-----------AA--GCCA-----------------A-------TCAACTTG-GCA-CA-GG---TT----AAAGATGAC-TATA---TTTTCT-TTCAA------------TCA--AGACGTA-TTagactcacaggtttacctcaggtaa
gi|8 : TT-TTT------TGC-C-TCGTTTTG-----------A----------T----TA---TA-T-TTGA--------C-A-G--TG-AA--T--------GT-----GA-AAATGC--------C--C-------AAC-------A-TAT------AAATCAAA-ATTA-----TAGAAATG--GC--------T-AC-A--AACGAGGGGAT--AT-TATACC--GATCC--GGATCAC--------TTTT-------AAATTT-ATCA--T-----A-TC----------------GATACATTA-GGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AAT-GCA-ATA-ATT--G-CTT-A-TCC-A-TG-----GT-A--ATAA-C-AACTG-AAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAACA-GTTCT-A---CCT-CA-CTTGTACG---AATATG--T-AATAGG--AAAGCATGGG-ATTTACC--C----A-CGT-GGT----A--TGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---T-A-TTG---ACAAAA-AG-A--TTT-TT-TGTAAAATACATGTA--TGT--G-ACGC-T----------TGAAAG-A-A-ATT-TA------CT----------TTGA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-A-A-----TT---AT-T-T-C------TA-ATTTC-AC-TC-ATT---AC-ACCTTttttgcctcgttttgattatatttgacagtgaatgtgaaaatgcccaacatataaatcaaaattatagaaatggctacaaacgaggggatattataccgatccggatcacttttaaatttatcatatcgatacattaggcccaaactgcaaatgatttgaatgcaataattgcttatccatggtaataacaactgaaagtctagcggataaaaacagttctacctcacttgtacgaatatgtaataggaaagcatgggatttacccacgtggtatgatgtttgtttatatattgacaaaaagattttttgtaaaatacatgtatgtgacgcttgaaagaaatttactttgatttgaatatgctgtaattatttctaatttcactcattacacctttatatcaccactg
gi|9 : acaattatcaaacattcaagccgtatgtgtcaaataattctattttaaattaattttctttaatgacatgtaagtctcctgaatttatatatacatgtagtttgaattaccatattcttaatcactacactgtgaccttgaaatcattcccagtgatcattgctatttagaataagccaatcaacttggcacaggttaaagatgactatattttctttcaatcaagacgta---------TAGTGTG--TT--TTA----------------------CAATTA--TTACATTG-TGACCAT-G-----A-AAT-C-GTCCCAATG--------CACATTGCT----------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAGA--GTCAGC-GGTG--TATACA-AA-------TCGACTTG-GTT-CA-GGCGTCT----A---ATGAC-GATA---ATTTCT-TTCGA------------TCA--AAGCAAA-TTTCT-AA-GGT-A----AC--TAGTG--TC--------AGATT-TTGACA------T-GG--ATGATA-G-GA-T-TTT------TGC-C-TTGTTTAC-----------A----------T----GA---TA-T-TTGA--------C-A-G--TGAAA--T--------GT-----AG--AGTGT--------CAAC-------GAT-------C-T-T------GAACTTAAAATTA-----TAGGTATT--GCAT------T-AA-A--CACGAGGGGAT--ATCTGTACC--GAATCAAGGATC-C--------TTTTT-------A--TT-GCGA--G-----A-TC--TAT-------TTCCTAGACATCA-AATCA-CAA-ACAGCAA-ATAGTTTC-----AGT-GCA-TTA-ATC--G-CCTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACT-GATA-GTCCAGTGAAT-ATCGAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTTTATG---ATGACG--T-AATAGGTATAAGCAAAGGCATTT-CT--CTATAA-CAT-GTC----A--CGA--TCT----------T--TT-------------TATA---CTA-TTG---AA-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TG---G-ACGC-T----------TTGGAA-A-A-TTT-GA------CT----------TGAA---TAGGA-----ATT--A-T--GC-G-T-T-A-----TT---ACTT-TGTTACATGTA-ATTTCAAC-TC-G-G---AC-AACTTAAtatatcaccactg
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): CTTGAAATCACAATGTTTAAAGGCATTTAGAATAATGAGTCAATCATTCATAGACAACGACTTGATATAAGTGAAAGATAAAGA
Unaligned ( gi|45 ): ACATTGTGATAATGAAATCGACTCCCAATGCACATATGTCAATTTACAATTAAAGG
Unaligned ( gi|46 ): GTATTCGTCCTATTCAGCGACCCTGCCCCCATGAGCGCCCCCGGGCACTTTCCCA
Unaligned ( gi|48 ): AAAAATCCTGCTTTTAATTTCACTTACTCTTCATCTCGGACT
Unaligned ( gi|51 ): TAGTTTAAAATACGCACTCAAGATGAAAATGAATTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 11 1 22222 1 111 11 1 666666666666666666666666666666666666 11 111111 111111111 111111111111 222222222222222222222222222222 11111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111 111111111111 1111111111 11111111 2222222222222222222222222222 11111111111111111111111 11111 1111111111 555555555555555555555555555 11111111 1111111111 11111 111111111 11 1 111111 1111111
lowQualScore : 1 1 66 1 1 1 1 1 2 1 1 1 66 1 1 22 5 44444 1 1 1 1 5 1 0 1 0 8 777 9 33 1 4 0 0 000000000000000000000000000000000000 66 33 5 555 888 55 5 5 999999 888 2 9999 4 66 4 4 4 8 4 888 0 77 3 3 3 2 777777 2 666666666 444 777777777 2 444 8888888 5555 2 999999999999 33 4 2 2 444 5555 33 2 4 2 2 777777 5555 2 2 55555 5555 2 5555 33 0 33 999999999999999999999999999999 33 44444444444444 2 0 66 2 2 77777 2 2 2 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 6666 44 33 2 7777777 2 2 2 33 5555 333 2 333 2 111111111111 33 2 0 2 2222222222 33 2 1 2 33333333 33 4444 4 666666 2 2 2 0000000000000000000000000000 2 2 88888888888888888888888 77777777 2 2 33 22222 2222222222 000000000000000000000000000 88888888 2 33 11111111 4 2 33 55 2 33 2 2 7777777777 55555 33 2 66666666 2 33 7777777 2 1 2 55 2 2 44444 1 1 222222222 1 4 77777777 3333 1 66 2 2 2 1 1 333 1 1 333 22 1 2 22 1 0 55 222222 1 5555 22 22 7777777777 9999999999999 555 1 1 333 1 5 1 22 3 3 555555 22 44 44 88888888888888 1 1 1 1 444444 7777777777 222 44444 1 22 1 44 1 1 3 44444 222 1 33 555555 1 1 3 5555555 2
lowQualScore : . . .. . . . . . . . . . .. . . .. . ..... . . . . . . . . . . ... . .. . . . . .................................... .. .. . ... ... .. . . ...... ... . .... . .. . . . . . ... . .. . . . . ...... . ......... ... ......... . ... ....... .... . ............ .. . . . ... .... .. . . . . ...... .... . . ..... .... . .... .. . .. .............................. .. .............. . . .. . . ..... . . . .................................................................... ...... .... .. .. . ....... . . . .. .... ... . ... . ............ .. . . . .......... .. . . . ........ .. .... . ...... . . . ............................ . . ....................... ........ . . .. ..... .......... ........................... ........ . .. ........ . . .. .. . .. . . .......... ..... .. . ........ . .. ....... . . . .. . . ..... . . ......... . . ........ .... . .. . . . . . ... . . ... .. . . .. . . .. ...... . .... .. .. .......... ............. ... . . ... . . . .. . . ...... .. .. .. .............. . . . . ...... .......... ... ..... . .. . .. . . . ..... ... . .. ...... . . . ....... .
lowQualScore : 0 0 55 0 0 0 0 0 5 0 0 0 55 0 0 00 5 00000 0 0 0 0 0 0 8 0 2 0 555 2 88 0 2 0 8 000000000000000000000000000000000000 77 66 7 999 888 11 0 0 888888 888 5 4444 4 11 4 4 4 9 4 555 8 88 3 3 1 9 777777 5 222222222 444 666666666 5 444 1111111 3333 7 555555555555 22 7 4 4 111 0000 33 5 7 4 4 111111 0000 4 4 99999 0000 4 0000 22 1 22 444444444444444444444444444444 44 77777777777777 5 9 33 9 9 11111 9 9 9 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 333333 1111 33 77 4 6666666 4 4 4 99 0000 999 2 777 2 444444444444 11 4 4 5 2222222222 44 5 0 7 66666666 44 3333 4 111111 1 1 1 5555555555555555555555555555 0 0 55555555555555555555555 22222222 0 1 11 22222 9999999999 111111111111111111111111111 55555555 9 22 88888888 7 4 22 66 4 44 5 7 4444444444 22222 22 4 22222222 4 22 6666666 4 9 2 33 2 0 55555 8 8 999999999 9 0 33333333 4444 8 33 0 0 0 9 8 222 8 8 333 55 8 5 55 8 4 99 333333 7 4444 44 44 6666666666 6666666666666 222 9 9 333 9 5 8 55 6 6 000000 44 88 88 88888888888888 7 7 7 7 888888 3333333333 999 22222 7 33 7 00 7 7 3 00000 999 7 66 000000 8 8 6 8888888 1
consensus : ATGATNGATCCNATNAACGCTTCCCTCACTNTNANGTCAACATTTGATAGTTTGTGANCNATTGAGGCGAAGNTTGANANTACGCTCAGGAGACATTTTTNTGNATTATAAACGTATGGGCAACGNGGTACNNGGATGAGCAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATANCCCAGTGGTTACCGGAGCGATGNATGGNTCGAAAAGCATGANGCTNTACAAACGAGAACANAGGGTGGTTAAGACGTNCCGATGAAA-GCCAC---TGTGCTG--TNCGTAAA-TGTACCTCAGT------------A----TTTG-------G-TG----TCAN-AATA--C-A-A-AAGTACGT---C-ACG-A-C-G----TACA---GGTC----T-A--CGCGT-TGTATCG-T-GG-GGAA-ATG--TCATAA-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAG-CTGC-------G----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TTCCTAAA-GGT-A----AC--TAGTT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--ATGGTA-TGATT-TTT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------T----A--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-GTG-AA--TGC-----GGAAATGCC--C-------AAC-------A-T-T------GAAT-----ATT--------ATGGGTATT--GC--------T-AA-A--TACGAGAGGAT--AT-TGTACC--G-ATCC-GGGTCAC--------TTTTTTT----AA--ATTT-ATCA--T-----A-TC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--G-CTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACTGGAAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AACAGG--TAAGCAAGGG-ATTT-CC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCGG-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TC-G-G---AC-ACCTTAACCC
Reference ( family-96 ) : ATGATNGATCCNATNAACGCTTCCCTCACTNTNANGTCAACATTTGATAGTTTGTGANCNATTGAGGCGAAGNTTGANANTACGCTCAGGAGACATTTTTNTGNATTATAAACGTATGGGCAACGNGGTACNNGGATGAGCAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATANCCCAGTGGTTACCGGAGCGATGNATGGNTCGAAAAGCATGANGCTNTACAAACGAGAACANAGGGTGGTTAAGACGTNCCGATGAAA-GCCAC---TGTGCTG--TNCGTAAA-TGTACCTCAGT------------A----TTTG-------G-TG----TCAN-AATA--C-A-A-AAGTACGT---C-ACG-A-C-G----TACA---GGTC----T-A--CGCGT-TGTATCG-T-GG-GGAA-ATG--TCATAA-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAG-CTGC-------G----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TTCCTAAA-GGT-A----AC--TAGTT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--ATGGTA-TGNTT-TTT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------T----A--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-GTG-AA--TGC-----GGAAATGCC--C-------AAC-------A-T-T------GAAT-----ATT--------ATGGGTATT--GC--------T-AA-A--TACGAGAGGAT--AT-TGTACC--G-ATCC-GGGTCAC--------TTTTTTT----AA--ATTT-ATCA--T-----A-TC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--G-CTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACTGGAAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AACAGG--TAAGCAAGGG-ATTT-CC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCGG-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TC-G-G---AC-ACCTTAACCC
gi|1 : ATGATTGATCCCATCAACGCTTCCCTTATTGTAAGATCAACATTTAATAGTTTGTGATCTATTGAGGCCAAGATTGATAATACGCTCAGGAGACATTTTTG-GCATTATAAACGTATGGGCAACGGGATACAGGGATGAACAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATAT----GTGGTTACCGGAGCGATGGATAGTTCAAAAAGCATGAGACTCTACAAACGAGTGCACATGGTGGTTACGACGTGCCGATGAAA-GCCAC---TGGGCTG--TTTTTAAA-TGTACCTAAGT------------A----CTTG-------G-TA----TCAT-AATA--C-A-A-AAGTACGT---C--CG-AAC-A----CACA---GTTA----T-A--CGCAT-TGTATAG-T-GGTGGAA-ACG--TCATAA-TAT-T-TCA-ACGTTA-TTA------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------CGT----CCAAG-TCGC-------A----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TCG-T-TAA-T---T--T----TT-CC-TTGATTCT-----ATAT----AA-G----TCTCATG--TTTCT--AA-----------A-------TA---------TAGCGCTCATT--TCA--------------ATATT-TTTAATTA--TCACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCGCC------------CG-----------------A-------------T-----T-T--------------AAAATA------CAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-ATT-CA-AGTCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCA-TTCGA------------CTA--AGGCATG-TTCCTAAT-GGT-A----AA--TAATT--GC-AGATTAAAGATT-TTAACA------C-GG--ACGGTA-TATTC-TTT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------T----A--------T---TA-T-TT-----------------------TG--------CA-GTG-AA--TGC-----GGAGA------------------------A-T-T------GAAT------TG--------ATGGGTATC--GC--------T-AA-A--TACGAGAGAAT--AT-AGTACC--G-ATCC-GGGTAATTTTTGTTGTTTTCTT----CA--ATTT-AATA--T-----A-TC--TAT-------AT-CATCACATGA-AGCT--CAA-ATTGCAA-ATTATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--A-CTTGA-ACA-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACTAAAAA-GTTTATCGCA--A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTTTG---ATGATA--T-AACAGG--TTGG-AAGGA-ATTT-CC--C----A-TGT-GGC----A--CGA--TGG----------TTGTT-------------TATA---C-A-CTG---AC-AAG-CG-G--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--A-GCAG-T----------TGGAAG-A-A-GTT-TA------CA----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----AT---AC-T-TGC------TG-TTTTC-AC-TC-G-G---AC-ACCTTAACCC
gi|10 : TACA-TA-------TCGATTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GAAA---ATTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TT-CTGAA-GGTAA----AT--TAGTT--AC-AGATTAAAGATTGTTG-TA------C-GG--ATGGTA-TGAAT-TTT------T-GC-C-TCCTTTACA----------T----A--------T---TA-G-TT-----------------------GA--------CA-GTG-AA--TGC-----AGAAATACC--C-------AACCTTACA-A-T-T------G-AT-----ATT--------ATGGATATT--GC--------T-AA-A--TACAAGATGAT--AT-TGTACC--G-A-CC-AGGTCA---------TTTTTTA----AA--ATTT-ATAA--T-----A-TC--TGC-------AT-CAACACTTTG-AGCC--CAA-AATGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTT-AAG--A-ATTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAT-AGCTGT-AA-GTCTAGCGGAT----AAATACACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACGTTT-ATCAGG--TAAGCAAGGA-TTTT-CC--CA---A-TGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TGT-TT-AATAAGA------TA--TGC--G-GT-G-T----------GGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGG-----A-T--A-C--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TCAG-A---AC-ACCTTAACTC
gi|11 : GTACGT---TGACG-G-C-GGCATTGCA---GGTC----T-A--CGTGT-AACATCG-T-GG-GGAA-A-GATTCATCA-AAT-T-GTA-TCGTTG-TTT------ACTAACA---------G---TAGACTCC--ATTCAC---G-------TGT----TCAAG-ATGT-------A----TAT--GTGTATAATATGTTT-GTC-AA---GTG-----TTA-TGTTG-T-TAA-G---T--T----T--CT-GTGGTGAT-----AT-T----AA-TATTTTTTTTTG--TTTTT--ATATCTATTGTGGA-------TA---------TAATAAAAACCAATCATTATTATTATTATCATATTACTTAATTAA-TTACATTG-TTACTTTTG-----ACAAT-TTATTCC------------CA-----------------AATGTGCATTACTAT-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GTTAAT-CATG--TATATA-TA-------TCGACTTGCGTT-CAGAG--TGT----A---ATGAC-GATA---TTTTCTATTCGA------------TCA--ATGTATATTTCCTAAA-TGT-A----AC--TCCTTTGGCAAGTTTAAAGATT-TTGACA--------GGTTATGGTG--GGTT-TTT------T-GC-C-TTGTTTAGC----------A----A--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-ATG-AA--TATA----GGAAACACT--C-------AAT-------A-T-T------TGAT-----Ac
gi|12 : ---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGG------------CTA--ATTCATA-TTCCCAAC-GGT-A----AG--TAGTT--GC-AGATTTAAGATT-TTGACA------C-GA--ATGGTA-TAATG-TTT------T-GC-C-TCCTTT--------------------------------------------------------------G--------CA-GTG-AA--TAT-----GGAAATGTC--C-------AAC-------A-T-TTGCACTGAA------ATC--------ATGGGTATT--GC--------TTAATA--TACCAAGGGAT--AT-TATACT--G-AACC-GGGTAAC--------ATTTTC------A--ATTT-ATCA--T-----A-AC--GAT-------AT-CGATACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTA-ATT--A-CCTGA-ACC-G-TG-----AT-A--ATAAAC-AACTG-AAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-TCTCT-A---CGT-CA-CTTGTATT---ATGATG--T-AATAGG--TAAGCAAAGG-ATTT-TC--C----AACGT-GACTGACA--CTG--TGT----------TTCTT-------------AATA---C-A-TTG---AA-AAG-CG-C--ATT-TC-AGTCAAA------TA--TGC--G-ACGC-T----------TTGAAG-A-A-TTT-CA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-C--A-T--GATG-T-T-A-----TT---AC-T-TGA------TA-ATTTC-AC-TC-GTG---AC-ACCATAACC
gi|13 : tt----TGT--GTGTA-AATCTGTTA-GTC-AA---GTG----ATTC-T-TTT-T-TA--G---C--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATGT----AA-G----TCTCCTG--TT------------------A-------AA---------TAGTGTGCATT--ACA--------------GAAAT-CTTGAT-A--TAACATTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GTCAA------------CA-----------------A-------------T-----T-TGCTTATAGCCATTTAGAATA------AAGAAA--TTCAAT-CGTG--TGTACA-TA-------TCGACTTG-GCA-CA-GG----TGAAAA---ATAAT-GAAA---TTTTCT-TTCGA------------TCA--ATGCATA-TTCCTAAA-GAT-------------TT--G---------AAATT-TTGACACAAGGCC-GG--ATGG-A-TTTTT-TTTTTAAAAT-GCTT-TCGTTTAGA----------A----A--------A---GA-T-TT-----------------------GG--------TA-GTG-AA--TGTG----GGAAATACC--CATT----AAC-------ATT-T------GAATCAAA-ATG--------ATGAAAATT--GC--------T-AA-A--TACGAGAGCAT--AT-GATACC--G-GTGC-TGATCAC----------GTTCT----AA--ATTC-ATCA--------------TGT-------AT-CGACATGTCA-AACC--CAA-ACTGCAA-ATGAGTGG-----AAT-ACA-T
gi|14 : ----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATC----ATTT-T-TTA-T-TAA-G---A--T----TC-CT-TTGATAAT-----ACAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGCATT--TTG--------------ATA----------------CACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GACCC------------CA-----------------A-------------TGCGCAT-T--------------GTAATAATTATTTAGAA----------TGTG--TACAGA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----G---GTAAC-GATA---TTTTCT-C-CGA------------TCA--AGGCATA-TTCGTAAA-GGT-A----AT--GAATT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--TTGGCG-TGGTTCTTT------T-GC-C-TCGTTTAAA----------T----A--------T---TA-T-TT-----------------------GA--------CA-ATG-AA--TGC-----GGACATGCT--T-------AAC-------A-T-T------AGAA-----ATT--------ATGGTTATT--GCTACATGTGT-AA-A--TACAAGAGGAT--AT-TGTACC--G-ATCC-GGGTCG------------TTTT----CA--ATTT-ATCA--T-----A-TT--TAT-------AC-CAACACATCA-ATCC--CAA-ACTCCAA-ATGATATGACTAAAGT-GCA-TT--AAT-----TTGA-Accttcacctgtgccgatataa
gi|15 : ACA------CTGG--ATAGTA-GGATG-ATT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------A----A--------AATTTG-TATT-----------------------GG--------CAAGTG-AA--TGCC----GAAAATACC-----------AT-------G-T-TT-----GAA------ATTTGCAAATGATGAG------GG--------T-AA-A--TGCTAAGGGATT-AT-CGTAAC--G-ATCC-AGGCC-C--------CCTTTTC----AA--ATTC-AGCA--T-----AATA--CAT-------AC-CGACACACAA-AGCCAAAAA-ACTGCAA---GA-------------ACA-TTG-ACT--G----------------------------AAA--AATTGGAAATGGCTAGC-GAT-A-AAAATA-GCTCT-A---CGT-CA-CTGGTATG---A------------------AAGC-AGGG-ATTT-CC--C----A-CCT-GGCA---A--TGA--TG--------------------------------A---C-G-CCGTAAAC-AAAGCG-A--TGT-TG-AGGAAAA------TA--TGCAAA-ACG-------------TGGAAATA-A-TTT-TA------AT----------TTAA---TCTGA-----A-T--A-T--GCTG-TATAA-----TT---AT-T-TGT------
gi|16 : tgaGT------------A----TTTG----------------CAG-AATGACC-A-A-ACGAACGT---C-ACG-A-C-T----TACA---GGTT----T-A--CGCGT-TGTATCG-TTGA-GAAA-ATG--TCATA----T-T-TTA-TCATTC-TTA------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAA-CTGT-------A----TAT--GTGTA-CATCTGTTT-GCC-AA---ATG----ATTC-T-TTA-T-CAA-G---T--T----AA-CT-TTAATAAG-----ATAT----A-------TATCCTG--TTTTT--AT-----------A-------TATACATG---TAGTGTGGAAT--TTA--------------ATTTG-CTTAATCA--TTAAATGG-TGATATT-GATTCAA-AAT-T-GCCCC------------CAATGCGCAGTGAT-----A-------------T-----T-T--------------ACAATC------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACGTG-GTT--A-GGCGTTT----C---GTGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------GCG--AGctcaatataatcaactcgggagttcttac
gi|17 : ctaaaagctgatgatTTAGA----------T----A--------A---AA-T-CT-----------------------TG--------TA-GGG-GA--TGCATGTTGGAAATACC--G-------AAC-------T-T-T------GATTCGTT-ATC--------ATGGAAATA--GC--------T-AA-A--TGCAATAGGGT--GT-TGTACC--G-TTCT-GGATCA------------TTTT----AA--ATTT-GTCT--T-----A-TCAATAT-------AT-CGAC---------CC--CAA-ACTGTAA-ATGATCAG-----AGC-ACA-CC---------CTTCA-GTT-G-TGCCAATGT-A--GTATAT-AACTAGAA--GTCTTGCGGA----AAACTA-GCTC-----------A-CTTGCATG---ATTACG--T-TATATT--GAAGCGAGGG-TTTT-CC--A----A-AGT-GGC----T--CAA--TGT----------TT-----------------ATG---T-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTG-T--AATAAAA------TA--TGC--G-ACAC-T----------TTGAAG-A-A-TTT-TT------CT----------TTGA---ATTCA-----A-T--A-T--GGTG-T-C-A-----TC---AT-T-atacttagttggaaaatatttt
gi|18 : TG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTTCCA--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------AAATT-CTTAATCA--TTGCACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------TGCGCAT-T--------------GGAATT------TAGAA----------TGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAT-GATA---TTTTCT-TTCGAANNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN-NNNNNNNN-NNN-N----NN--NNNNN--NN-NGATTAAAGATA-TGGACA------A-GG--CTGGTA-TGATT-GTT------T-GT-C-TCGTTAAGA----------T----A--------T---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-GTG-GA--TGC-----AGAAATGCC--C-------AAC-------A-T-TA-----GAATTTAA-ATC--------ATGGGTATT--GC--------T-AA-A--TATGAGAGGAT--AT-TGTACT--G-tatatgcgacactttgaagaat
gi|19 : A-TG-------TCTACTTG-GTA-CA-GGCGAAC----G---ATGAC-GATAATATTTTCT-TTCGA------------TCA--AGGCATA-TTCTTAAA-AGT-A----AC--TAGAT--GC-AAATTTAAGATT-TTAGCA------G-GG--AATGTA-GGATT-CCC------T-CC-C-TTGTGTATA----------T----T--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-GTG-AA--TGT-----AAAAATGCC--C-------AAT-------A-T-TG-----GAATCGGC-ATT--------ATGGAAATT--GT--------T-AA-A--TACAAGAGGGT--AT-TGCA
gi|19 : agG-----AGG-GTA-TTGCAATC-A-CATGT-GCC-G-TT-----GC-G--ATAAAC-AACTAGAAA-G-CTTTCGGAT-A-AGAA-A-ACTCA-A---TGT-CG-TTTGTATG---ATGACG--T-AATTGT--TAA-----AG-ATTT-CC--A----A-CGT-GGT----A--CGA--TGT----------TTGCT-------------atcacatgtgccgttgcgataaacaactagaaagctttcggataagaaaactcaatgtcgtttgtatgatgacgtaattgttaaagatttccaacgtggtacgatgtttgctgacgaattcatctctcaataaa
gi|2 : agatgtctacttggtacaggcgaacgatgacgataatattttctttcgatcaaggcatattcttaaaagtaactagatgcaaatttaagattttagcagggaatgtaggattccctcccttgtgtatattatatttggcagtgaatgtaaaaatgcccaatattggaatcggcattatggaaattgttaaatacaaATGAAATGCCACAATTG-GCTGAGTATGTAAACTGGACCTCAGT------------GGCACTTCGCAGTAGCG-TGACGATCAGCAATA--CTA-ATAAGTACGTGCTC-ACGTA-C-A----TACA---G-TCAAAATGA--CGCGTGTGTATTG-T-GG-GGAAGATA--TAAGAAATAT-TATTAATCGTTAATTT------ACTA-CA---------A---T------TT-AT-CAAATAG-------TGTACGCCCAAGGCTGC-------G----TAT--GAGTATAATCTGTTT-GTC-AA---AT------TTA-T-TTGGT-TAATG---TAAT----TTACT-TTGATAATGCCATATATTAAAAA-G--------------------AT-----------G--------A---------TAGTGTGAATT--TAA--------------ATATT-CTTAATTACCTAAGACTGATGCGCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CATTGATCGCGCATTGTTAA-------------T-----T-T--------------AGAATACT----TAGAAAAGGCAAATTCGTG--TATAAACTACCCACGCTCGTCTTG-GTTTCA-AGCCTTT----A---A-GAT-GATT---ACTTCT-TCAGA------------CGATTAAGCATA-TTCCGAAGTGGT-AGATTACAGTAGTT--G--AGATTAAAGATT-TTGACAG-----C-GG--AATGTAATGATTGTTT------T-GC-CATCGTTTAGA----------T----A--------T---TAAT-TT-----------------------GGGTTCTGGGCA-GTG-GAGTTGC-----GGAAATGCC--A-------AATTCGTAGAA-T-T------GAA------ATT--------ATGGGTATTTGGC--------T-AA-AACT-CATGCAGATTGAT-TGTATCCTG-AGC--GGGTCAC--------TTTTTC------A--ATTT-ATCA--TTCATTA-TC--TACCGGTATAAT-CAACACATCA-AGCC----A-ACTGCAA-ATGATTTG-----AATGGCA-TTATAAG--G-CTTTA-ACCAG-TG-----GT-----T---C-AA---------TTTAGCGGATGA-AAAATA-GCTAT-ATGGCGT-CAGCTGGTATGTACATGACG--T-AA---------------A-ATTT-CCA-C----C-CGT-GTC----A--C-----GT----------ATGTT-------------GA-----------G---AC-AAAGCGTAATTTT-TT-AGTAAAA------TAGTTGTCGG-GCGGTT----------TGGGAT-A-A-TTTGTATTTGATCT----------TTAA---TTTGA-----T-T--A-TG-GCT--T-T-A-----TT---AC---CGT------TATATTTT-ACTTC-G-GGA-ACAACCTTAACCgacgaattcatctctcaataaa
gi|20 : TTTTT----AATTCTTT-ATTA--T-------TT--TAC--------T-C---ACATGA-A--T--CAATATTGCAAGATTATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--A-CT-GATATC-A--------GT-T--GTATAC-AACTAAAAA-GTTTATCG--C-A-AAAATA-ACTC--A---CGT-CA-CTTGTTTG---ATGA------AATAGG--TTG--AAAGA-ATTT-CC--A----T-GGT-GCC----A--CGA--TGG----------TTGTT-------------TATAATAC-A-CTG---AC-AA--CG-G--TT-----AGTAAAA-------A--TAC--A-----------------CGGAAT-A-G-TTT--A------C--------------A---TTT-A-----A-T--A-A--AC-G-T-A-A-----TT---AC-TATGC------TG--TTTC-AC-TC-G-A------ACCTTAACC
gi|21 : ataTT------T-GT-C-TCGTTTAGA----------CTCTCA--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-GTG-AA--TGT-----GGAAATACC--CAATATTTAAC-------A-T-T------GAA------ATT--------ATGGATATT--CC--------TAAA-A--TA-GAGGGGAT--A--TGTACC--G-ATTCAAGGTCGC--------TTTTGAC----AA--AATT-ATCAACT-----A-TC--GAT-------AT-CGACACATCA-AG----CAA-ACTGGTA-ATTATATG-----G---GCA-TTA-GATTCA-CCTG---CCAA-TG-----AC-ATTTTAAACAAACTG---A-GTCTAGCATAT-G-ATAATA-GCTCTAA---CCTGCG-CTTGTac
gi|22 : -AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-CTG-AAT--G-TTTGA-ACC-G-TG-----GA-A--ATAAAC-AACTG-AAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTTT-A---CTT-CA-CTGGTATT---ATGACA--T-AACGGG--TAAGCATGGC-ATTT-CCA-C----G-CAT-GAC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------C----------TT---------A-CG-A--TTC-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCAG-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--G-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TTGG-G---AC-ACCTTAACCg
gi|23 : -AATA--C-G-A-AAGTACGT---C-ATG-A-C-G----TACA---CGTC----T-A--CGTNN-NNNNNNN-N-NN-NNNN-NNN--NNNNNN-NNN-N-NNN-NNNNNN-NTTCACAACATGA-CA---------ACGCT------T--AA-AAA---G-------TGT----TCAAA-CTGT-------A----TAT--GTGTA-AATTTGTTT-GCC-AA---ATG----ATTG-T-TTG-T-TTA-G---T--T----TC-CT-TTGACAAT-----ATAC----AA-G----CATCTTG--TATTT--AT-----------ATACACTGTA---------TAGTGTGAAAT--ATA--------------ATATC-ATTAACCA--TTATATT
gi|24 : atgcacttcgcaTGATTTG-----AGT-GCA-AT--AAT--AACCTGA-ACC-G-TA-----GT-A--ATAAAC-AATTG-AAT-GACTAGCGGAT-A-AACATA-ACACT-A---CGC-CA-CTTGTATT---ATGACG--T-AAATGG--GAAGCAATGG-ATTT-CC--C----AACGT-GGA----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAAACG-A--GTT-TT-ACTAAAA------CG--TGC--G-ACGT-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTCA-----A-T--T-T--TCTA-T-T-A-----TA---AC-T-TGT------TA-ATTTC-AC-AC-GAG---AC-ACCTCAAa
gi|25 : AAAC-AACTG-AAT-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-GTTCT-A---CAT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AGTAGG--TAAGCAGGGG-ATTT-CC--C----CTCGT-GGC----A--CAA--TGC----------TAGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TTTAATAAAA------TA--TGC--G-ATAC-T----------TGGAAG-A-A-TTT-CA------CT----------TTAA---TCTGA-----A-T--A-G--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-TGT------TA-ATTTC-AC-TCAG-G---AC-ACCTTAACCC
gi|26 : -A---TGT-CA-CCTGTATG---ATGAAG--A-AATAAT--TCAGCAAAGG-ATTT-CC--C------CAT-G-T----A--CAA--TGTACAGCAATGGTTGTTACTGCCACTTAAATATG---A-A-TTG---AC-AAA-CA-A--TTT-CT-AACAAAA------TA--TGT--ATGC---T----------TGAAAG-A-A--TT-TA------CTTGGCACAGCATTAATGCTTTCA-----A-T--A-T--GCTA-T-T-ACTAGCCT---AC-T-TGT------T--ATTTT-AC-Tc
gi|27 : g-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CCTG--TATGC--TA-------TCGACTTC-GTT-CA-GGC-------------------------TTTTCT-TTAGA------------TCA--AAATATA-TTCTTAAA-GGT-A----AT--TACTT--GC---AT-----ATT-T---CA----------------TA-T--TT-TCT------T-GC-C-TCATTTAGA----------T----G--------A---GA-T-TT-----------------------GG--------TA--TG-A
gi|27 : -ATGATTTG-----AGT-GCA-AT--AATA-A-CCTGA-ACC-G-TA-----GT-A--ATAAAC-AATTGtttgagtgcaataataacctgaaccgtagtaataaacaattg
gi|28 : tttagaatatagaaagccaatcctgtatgctatcgacttcgttcaggcttttctttagatcaaaatatattcttaaaggtaattacttgcatatttcatattttcttgcctcatttagatgagatttggtACG--T-AATAGG--TAAGCAAGGA-ATTTTCC--C----T-CGTTGAC----A--CGACATGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-ATG---GC-AAA--G-A--TTT-TTGAGTCAAA------CA--TGC--G-ACCG-TAGATAGCTCTTTGAAG-A-A-TGT-AA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--TCTG-T-T--------T---A-------------TG-AT-----C-TT-G-G---AT---CTTAACCC
gi|29 : ATA-AATTC-A---TGT-CA--TGGTATG---ATGACG--TTAACATG--TAAGCAAGAA-ATTT-CC--CC---A-AGT-CGC----A--TGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGCACAA------TA--TGC--G-GCGG-T----------TGGAAA-A-A-AAT-TA------CC----------TTAA---GTTGG-----A-T--G-T--GCTG-T-T-A-----TC---AT-A-CGT------TT-ATTTA-AC-gggacattcctacct
gi|3 : ----T-A--CGCCT-TGTACCAAT-GT-GAAA-ATA--TAATGA-TAG-T-TTA-CAGTCA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AG-CAA---G-------TAT----CCATG-CTGC-------A----TAC--GTATA-AATTTGTTT-GTA-AA---A------ATTT-T-TTC-TATAA-G---A--T----TT-AT-TTGATAAT-----ACAT----AA-G----TCCCCTG--TTCCT--AT-----------A-------TACATTATGTATAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACATT-G-----A-AAT-C-GCCCTCAATGCGCATTGCA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAGA--CTCAA---GTGAATATAAA-TG-------TAGACTGG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-AATA---TTTTCT-TTCGT------------CCA--AGGTATA-TTCCAAAA-GGT----------TAGTT--GC-AGATTAAAAATT-TTGACA------C-GG--GTGGCA-TATTT-TTT------T--T-C-TAGTTTAAA----------T----A--------T---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-GTA-TA--TGC-----GGAAATCCC--C-------AAC-------A-T-TA-----GAATTGAA-AGT--------TTGGGTGTT--GC--------T-AA-C--TTTGAGAGGA------------------------TCA---------TTTTTTA----AA--ATTT-ATCA--T-----A-TC--TAT-------AT-TAACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTT-----AGT-GCA-TTA-AAG--G-CTTGA-ACC-GAAG-----GT-A--ATAAAT-AACT-GAAA-ATGTAGCAGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTGATATG---ATGTCG--T-AACATT--TAAGCAAGGA-ATTTCCC--C----A-CTT-GGC----A--CGA--TAT----------CTGTT-------------TATG---A-A-TTG---AC-AAA-CA-G--TCT-TT-AGTAAAA------TA--AGC--G-GCGG-T----------TGGAAT-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--A-T--ACTT-T-C-A-----TT---AT-T-CGT------TA-ATTTC-CC-TCGG-G---AC-AC
gi|30 : A-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------GCTA-AA---------A---T------T--AT-CAA---GACTTTAGTGT----TCAAG-CTGT-------G----TAT--GCGTA-AATCTGTTT-GTG-AA---AAG----TTTCTT-TTGTT-TTG-G---T--T----TT-CT-TTAATTAT-----ATAT----TA-C----TCTCCTG--TATCT--AT-----------C-------TA---------T
gi|31 : tcCAA-ATGACTTG-----ATT-GCA-TTA-ATC--A-ACTGT-GCC-G-TG-----GA-G--AAAAAC-AA-TCGATA-ATCTAGTGAAT-A-AAA-TA-GTTCT-A---TGT-CA-CTTTTACG---ATGATG--T-AATAGA--TAATTAAGGT-ATTT-CCCGC----A-CGC-GGT----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------Tccatctacatgtatgtaatggaa
gi|32 : cctTC-CC--C----A--AT-GGC----AATCGA--TGC----------CTGTG-------------TATAT--C-A-TT----AC-AAA-CG-A--TTTGTT-AATAAAA------TA--TGT--C-ATGG-T----------TGGAAT-ATA-TTT-TG------CT----------T------TTTGAAATGTA-C--A-T--GCAG-T-TAA-----TT---AC-T-TGT------TA-TGTTC-ACTTT-G-G---AC-ACCTTTAC
gi|33 : tcACAGAGCGTAGGCAAGCCGCACAGAGGAAA-TTCAC---TGTACTA--TTCATAAA-TGTGTCTCAATGTATTTCACACTA----TTTG-------A-TT----TCTG-AATA--C-A-A-AAGTACTT---C-ACG-A-C-G----TACG---GGTT----T-A--CAAGT-TGTATCT-T-GG-GGAG-ATt
gi|34 : TT------ATTA-GA---------A---T------TTAAT-GAT---A-------TAA----TTAAG-CTCT-------A----TATAGGCGTA-AATCTGATT-GTT-AG---ATG----ATTC-T-CGT-T-TCA-G---TATT----TT-TT-TTTAAACT-----ATAT----AA-G----TCTTCTA--TTTTT--AT-----------A-------TA---------CAGTGTGAATT--AAG--------------ATAAT-CTTAAT
gi|35 : -TCATCA-TTT------ATTA-CC---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TGAA--CTGTATACATTG----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AATACATGTGAAATTT-T-TTT-T-T-C-GTCTT--C----TT-CT-TTGAT---------TAT----AATG----TCTGATG--CTTTT--
gi|36 : caaaaaatcAGT------------A----GTTG-------GATG----TCAC-AATAA-C-AGA-AAATATGT---C-ACA-A-CCGC---TACATGGGGTC----T-ATACGCAT-TGTCTCG-T-GG-GAAA-ATG--TCATA--TATGT-TTA-TCGTTA--TT------ACTA-CATGTAG----A---T------C--TT-CAC---G-------TGT----TCAA
gi|37 : t-------------TACA---C-AGTTG---AC-TAA-TG-A--TTTATT-AGAATAA------TA--TAC--G-ACAGCT----------TGGAGG-A-A-ATA-TA------CT----------TCAA---CTTGA-----A-T--A-T--GCTGTT-T-A-----TTTAAAT-A-TAT------CA-ATTTC-AC-TC-
gi|38 : gatgatgtggacagttac--ATTT-ATCG--T-----A-AT--TA--------AT--AACACATTACAGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCAGCTG-AAT--G-TTTGA-AAC-G-AGA----GCGA--AT--AC-AACTAGA
gi|39 : actgttcAC-AACTG-AAA-GTCTAGAGGAT-A-AAAATA-ACTGT-A---CAT-CA-CTGGTATG---ATGACG--T-AACGGG--TAAGCAAGGA-ATTTCCC--C----A-CGT-GGC----T--TGA--TGT----------TTGTgttatgtcagagaagaaga
gi|4 : TGA-TAT-T-TTA-TCTTCA-TTT------GCTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TAT----TAATG-CTGC-------A----TAC--GTATA-AATCAGTTT-TTG-AA---ATT----ATT--T-TTG-A-TAA-T---A--T----TC-CA-TTGATAAT-----ACAT----AA-G----TATCCTG--TTCCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACATT-G-----A-AAT-C-GCCCCCAATGCGCATTGCA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAAAA------TAGAGA--CTCAAG-CGGA--TATAAA-TG-------TAGAATGG-GTT-CA-CGCCTTT----A---ATGAC-AATG---TTTTCT-TTCGT------------CCA--AGGTATA-TTCC-AAA-GGT----------TAGTT--GC-AGGTAAAAGATT-TTGGCA------T-GG--ATGGTA-TCATT-TTT------TCCC-C-TAGCTTTGA----------C----ACGGATGGCA---TA-T-TTTTTTCCTAGTTTAAATATTATTTGG--------CA-GTG-AA--TGC-----GGAAATGCC--C-------AACATAAGA-A-T-T------GAAA-----GTT---------TGGGTGTT--GT--------T-AA-C--TTTGAGAGGAT--AT-TACACC--G-ATCT-GGGTCAT--------TTTTTTTTTTAAA--ATTC-ATCA--T-----A-TC--TAT-------AT-TACCACATCA-AGCC--GAA-ACTGCAA-ATGATTTT-----AGT-GCA-TTA-GAA--G-CTTGA-ACC-GAAG-----GT-A--ATATAT-AACT-GAAA-ATATAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTGATTTG---ATGTCG--T-AACATT--TAAGCAAGGA-ATTTCCC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------CTGTT-------------AATA---A-A-TTG---AC-AAA-CA-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--AGC--G-GCAG-T----------TGGAAT-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--A-T--
gi|40 : -TAT-C-TTA-TCATTA-TTC------ACTA-CT---------A---T------A--AT-CAA---A-------TGT----TTAAG-CTAT-------G----TAT--ATGAA-AATCTTTTTTGTC-AA---AAG----ATTaatttca
gi|42 : ttggaaaaaaacctA------TA--TGC--G-ACAC-T----------TTGAAG-A-A-TTT-TC------CT----------TTGA---ATTCA-----A-T--A-T--GGTG-T-C-A-----TC---AT-----T------TA-TTTTT-AC-CT-ACG---AC-ACCTTA
gi|43 : -T----------TGGAA--A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AT-T-TGT------TA-ATTTT-AC-TCAG-A---AC-ATCTTAACtcatcac
gi|44 : A-CG-C--TTC-TT-AGTAAAA------T---TGC--G--CAG-T-----------GGAAG-A-AATTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--GTT--GCTG-T-T-A-----
gi|47 : ATA---TTTACT-TCCGA------------TCA--AGGCAGA-TTCTAAAA-GGA-A----CC--TACTT--GC-AGATT
gi|49 : -T-A-----TT---AT-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TTGG-G---AC-ACCTTAACCCt
gi|5 : T-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CAGCAGACTCTA---T------T--CC-C-----G-------TGT----TTAAG-CTGT-------T----TAT--GTGTA-AATCAGTTT-GTC-AG---ATT----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ACA------A-A----TATCCTC--TTTTT--AT-----------A-------CA---------TAGTGTGAATT--AAA--------------TTATT-CTTA----------------GACCTT-G-----A-AAT-T-GCCTC------------CAATGCACATTGCT-----A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCGAGT-CGTG--TGTATA-TA-------TCGACTTG-ATT-CA-AGTGTTT----A---ATGAC-GATA---TTTCCT-TTCAA------------CCA--AGGTATA-TTTCTAAC-GGA-A----AC--TAGCA--GC-AGATTTAAAATT-TTGACG------C-GG--ATGGTA-GAATT-TTT------T-GC-C-ATGTTTAGAGTACTTTAGGT----G--------A---TC-T-TT-----------------------GG--------TA-GCC-AA--TGT-----GGAAATGCC--C-------AAC-------ATT-T------GAATTGAA-ATT--------ATGGGTATT--GA--------T-CA-A--TACGAGAGGAT--AT-TGTGTC--G-ATCC-GGGCCAC--------TTTTTC------A--ATTT-ATCA--C-----A-TC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--TAA-ACTGCAA-ATGATATG-----AGT-GCA-TTA-ATC--G-CCTG---C-----------------ATAAAC-AATT-GAAA-GTCTAGCAGAT-A-AAAATA-GCTTT-A---CGT-CA-CATGTATG---ATGACG--T-AATAGG--TAAACAAGGG-ATTTCCC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGGT---------------TA---C-A-TTG---AT-AAA-TA-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGT--G-CCGC-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-TAAA-TAGGCTG-T-T-A------T---AC-T-TGT------TT-ATTTA-AC-TC-T-G---AC-cag
gi|50 : g-----TT---AC-T-TGT------TA-ATTTC-AC-TC-G-GGACAC-ACCTTAGCCgcatt
gi|52 : A-TATTT-TCT------T-GC-C-TCATTTAGA----------T----G--------A---GA-T-TT-----------------------GG--------TA-gc
gi|53 : cAGAACACAGGGTGGTTAAGGCGTCCTGATGAAA-G
gi|6 : TA-TTT-----------CA---------A---T------T--AT-CAT---A-------TGT----GCAAG-CTGCATAT---G----CAT--GTGTA-GATCTGTTT-GTCCAA---ATG----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TAGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AATGC-GCATTG-----------CA-----------------A-------------TG----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--CTCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCAAATTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC----A---TTTTCT-T-CGA------------CCA--AAGCATA-TTTCTAAA-GAT-A----AT--TAGTT--GC-AGATTAAATATT-TTGACA------C-GG--ATAGCA-TGATT-TGT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------T----A--------T---TA-T-TT-----------------------GG--------CC-GGG-AA--TGC-----GGAAAGGAC--T-------AAC-------A-T-T------A----------------------GG-ATT--G-----------AA-A--TACGAGAGGAT--AT-TAAACC--G-ATCC-GGGTCAC--------TTGTAT------A--ATTTAATAA--C-----A-TC--TAT-------AT-CAATACACCA-AGGC--CAA-ACTACAA-A---------------------TG-AAT--A-TTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AAC-AGAAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATT-ACTCT-A---CGT-CA-CTGGTATG---ATGACG--T-AACAGT--TAAGCAGGGA-GTTT-CC--CT---A-CGT-GGA----A--CAA--TGT----------TCGTT-------------TACA---C-A-TTG---AC-AAA-CA-A--TAT-TT-AGCAAAT------CA--TAC--G-GTGG-T----------AGGAAG----------A------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-TTCTC-CC-TCGG-G---AC-ACCTTACCC
gi|7 : ATGATGGATCCAA-AAACGCTTCCCTCACTCTTATGTCAACATTTGATAATTTGTAAACAATTGAGGTGAAGTTTAAGATTACACTCAGGAGACATTTTTTTGAATTATAAACATATAGGCAACGCGGTACCTGGATGAGCAAGAATT-GCAGAAAACGATGGTATGTAATAGCCCAGTGATTACCGGAGCGATGTATGGGTCGAAAAGCATGATGCTATA-AAACGAGAACAAAGGGTGGTTAAGACGTCCCGATGAAA-GTCAC---TGTGCTG--TACATAAA-TGCACATCAGT------------A----TGTG-------A-TG----ACAT-AATA--C-A-C-AACTACGT---C-CCT-A-C-A----CACA---GTTC----T-A--GGCGT-TGTATCA-T-GGTGGAA-CT------TAC-TA---------CAGTA-TTT------ACTA-CA---------A---A------T--AC-CAA---G-------CGT----CCAAG-ATGC-------ATACTTAT--GTGTA-AATTTGTTT-GTC-AA---ATG----AGTC-T-TTG-C-TAA-T---T--T----TT-TTATTGATAAT-----ATAT-------G----TCTCCTG--TTTCTAAATATCTAA-----A-------TA---------TATCGTGAATT--TCG--------------ATATT-TTTCATCA--TTAGAATG-TGACATT-A-----A-AAT-C-ACCCCCCCCCCCGTGCGCATTGGC------------A-------------T-----TGT--------------AGAATA------CAGAAA--AGCAAT-CGTA--CACACA-TA-------TCGACTTG-ATT-AA-AGCCTTT----A---AAGGCTGATA---TTTT
gi|8 : A-CA---------A---T------T--AT-CAA---A-------CAT----TCAAG-C--C-------G----TAT--GTGT--------------C-AA---ATA----ATTC-T-ATT-T-TAA-A---T--TAATTTT-CT-TTAATGAC-----ATGT----AA-G----TCTCCTGAATTTAT--AT-----------A-------TACATG-----TAGTTTGAATT--ACC--------------ATATT-CTTAATCA--CTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-ATTCC------------CAGTGATCATTGCT-----A-------------T-----T-T--------------AGAAT-----------AA--GCCA-----------------A-------TCAACTTG-GCA-CA-GG---TT----AAAGATGAC-TATA---TTTTCT-TTCAA------------TCA--AGACGTA-TTagactcacaggtttacctcaggtaa
gi|8 : TT-TTT------T-GC-C-TCGTTTTGA----------T----T--------A---TA-T-TT-----------------------GA--------CA-GTG-AA--TGT-----GAAAATGCC--C-------AAC-------A-TAT------AAATCAAA-ATT--------ATAGAAATG--GC--------T-AC-A--AACGAGGGGAT--AT-TATACC--G-ATCC-GGATCAC--------TTTT-------AA--ATTT-ATCA--T-----A-TC----------------GATACATTA-GGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AAT-GCA-ATA-ATT--G-CTT-A-TCC-A-TG-----GT-A--ATAA-C-AACTG-AAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAACA-GTTCT-A---CCT-CA-CTTGTACG---AATATG--T-AATAGG--AAAGCATGGG-ATTTACC--C----A-CGT-GGT----A--TGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---T-A-TTG---ACAAAA-AG-A--TTT-TT-TGTAAAATACATGTA--TGT--G-ACGC-T----------TGAAAG-A-A-ATT-TA------CT----------TTGA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-A-A-----TT---AT-T-T-C------TA-ATTTC-AC-TC-ATT---AC-ACCTTttttgcctcgttttgattatatttgacagtgaatgtgaaaatgcccaacatataaatcaaaattatagaaatggctacaaacgaggggatattataccgatccggatcacttttaaatttatcatatcgatacattaggcccaaactgcaaatgatttgaatgcaataattgcttatccatggtaataacaactgaaagtctagcggataaaaacagttctacctcacttgtacgaatatgtaataggaaagcatgggatttacccacgtggtatgatgtttgtttatatattgacaaaaagattttttgtaaaatacatgtatgtgacgcttgaaagaaatttactttgatttgaatatgctgtaattatttctaatttcactcattacacctttatatcaccactg
gi|9 : acaattatcaaacattcaagccgtatgtgtcaaataattctattttaaattaattttctttaatgacatgtaagtctcctgaatttatatatacatgtagtttgaattaccatattcttaatcactacactgtgaccttgaaatcattcccagtgatcattgctatttagaataagccaatcaacttggcacaggttaaagatgactatattttctttcaatcaagacgta---------TAGTGTG--TT--TTA----------------------CAATTA--TTACATTG-TGACCAT-G-----A-AAT-C-GTCCCAATG--------CACATTGCT----------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAGA--GTCAGC-GGTG--TATACA-AA-------TCGACTTG-GTT-CA-GGCGTCT----A---ATGAC-GATA---ATTTCT-TTCGA------------TCA--AAGCAAA-TTTCT-AA-GGT-A----AC--TAGTG--TC--------AGATT-TTGACA------T-GG--ATGATA-GGA-T-TTT------T-GC-C-TTGTTTACA----------T----G--------A---TA-T-TT-----------------------GA--------CA-GTGAAA--TGT-----AG-AGTGTCAAC-------GAT-------C-T-T------GAACTTAAAATT--------ATAGGTATT--GCAT------T-AA-A--CACGAGGGGAT--ATCTGTACC--GAATCA-AGG--AT--------CCTTTTT----A-----TT-GCGA--G-----A-TC--TAT-------TTCCTAGACATCA-AATCA-CAA-ACAGCAA-ATAGTTTC-----AGT-GCA-TTA-ATC--G-CCTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACT-GATA-GTCCAGTGAAT-ATCGAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTTTATG---ATGACG--T-AATAGGTATAAGCAAAGGCATTT-CT--CTATAA-CAT-GTC----A--CGA--TCT----------T--TT-------------TATA---CTA-TTG---AA-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TG---G-ACGC-T----------TTGGAA-A-A-TTT-GA------CT----------TGAA---TAGGA-----ATT--A-T--GC-G-T-T-A-----TT---ACTT-TGTTACATGTA-ATTTCAAC-TC-G-G---AC-AACTTAAtatatcaccactg
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): CTTGAAATCACAATGTTTAAAGGCATTTAGAATAATGAGTCAATCATTCATAGACAACGACTTGATATAAGTGAAAGATAAAGA
Unaligned ( gi|45 ): ACATTGTGATAATGAAATCGACTCCCAATGCACATATGTCAATTTACAATTAAAGG
Unaligned ( gi|46 ): GTATTCGTCCTATTCAGCGACCCTGCCCCCATGAGCGCCCCCGGGCACTTTCCCA
Unaligned ( gi|48 ): AAAAATCCTGCTTTTAATTTCACTTACTCTTCATCTCGGACT
Unaligned ( gi|51 ): TAGTTTAAAATACGCACTCAAGATGAAAATGAATTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 11 1 22222 1 111 11 1 666666666666666666666666666666666666 11 111111 111111111 111111111111 222222222222222222222222222222 11111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111 111111111111 1111111111 11111111 2222222222222222222222222222 11111111111111111111111 11111 1111111111 555555555555555555555555555 11111111 1111111111 11111 111111111 11 1 111111 1111111
lowQualScore : 1 1 66 1 1 1 1 1 2 1 1 1 66 1 1 22 5 44444 1 1 1 1 5 1 0 1 0 8 777 9 33 1 4 0 0 000000000000000000000000000000000000 66 33 5 555 888 55 5 5 999999 888 2 9999 4 66 4 4 4 8 4 888 0 77 3 3 3 2 777777 2 666666666 444 777777777 2 444 8888888 5555 2 999999999999 33 4 2 2 444 5555 33 2 4 2 2 777777 5555 2 2 55555 5555 2 5555 33 0 33 999999999999999999999999999999 33 44444444444444 2 0 66 2 2 77777 2 2 2 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 6666 44 33 2 7777777 2 2 2 33 5555 333 2 333 2 111111111111 33 2 0 2 2222222222 33 2 1 2 33333333 33 444 4 666666 2 2 2 0000000000000000000000000000 2 2 88888888888888888888888 77777777 2 2 33 22222 2222222222 000000000000000000000000000 88888888 2 33 11111111 4 2 33 55 2 33 2 2 7777777777 55555 33 2 66666666 2 33 7777777 2 1 2 55 2 2 44444 1 1 222222222 1 4 77777777 3333 1 66 2 2 2 1 1 333 1 1 333 22 1 2 22 1 0 55 222222 1 5555 22 22 7777777777 9999999999999 555 1 1 333 1 5 1 22 3 3 555555 22 44 44 88888888888888 1 1 1 1 444444 7777777777 222 44444 1 22 1 44 1 1 3 44444 222 1 33 555555 1 1 3 5555555 2
lowQualScore : . . .. . . . . . . . . . .. . . .. . ..... . . . . . . . . . . ... . .. . . . . .................................... .. .. . ... ... .. . . ...... ... . .... . .. . . . . . ... . .. . . . . ...... . ......... ... ......... . ... ....... .... . ............ .. . . . ... .... .. . . . . ...... .... . . ..... .... . .... .. . .. .............................. .. .............. . . .. . . ..... . . . .................................................................... ...... .... .. .. . ....... . . . .. .... ... . ... . ............ .. . . . .......... .. . . . ........ .. ... . ...... . . . ............................ . . ....................... ........ . . .. ..... .......... ........................... ........ . .. ........ . . .. .. . .. . . .......... ..... .. . ........ . .. ....... . . . .. . . ..... . . ......... . . ........ .... . .. . . . . . ... . . ... .. . . .. . . .. ...... . .... .. .. .......... ............. ... . . ... . . . .. . . ...... .. .. .. .............. . . . . ...... .......... ... ..... . .. . .. . . . ..... ... . .. ...... . . . ....... .
lowQualScore : 0 0 55 0 0 0 0 0 5 0 0 0 55 0 0 00 5 00000 0 0 0 0 0 0 8 0 2 0 555 2 88 0 2 0 8 000000000000000000000000000000000000 77 66 7 999 888 11 0 0 888888 888 5 4444 4 11 4 4 4 9 4 555 8 88 3 3 1 9 777777 5 222222222 444 666666666 5 444 1111111 3333 7 555555555555 22 7 4 4 111 0000 33 5 7 4 4 111111 0000 4 4 99999 0000 4 0000 22 1 22 444444444444444444444444444444 44 77777777777777 5 9 33 9 9 11111 9 9 9 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 333333 1111 33 77 4 6666666 4 4 4 99 0000 999 2 777 2 444444444444 11 4 4 5 2222222222 44 5 0 7 66666666 44 999 4 111111 1 1 1 5555555555555555555555555555 0 0 55555555555555555555555 22222222 0 1 11 22222 9999999999 111111111111111111111111111 55555555 9 22 88888888 7 4 22 66 4 44 5 7 4444444444 22222 22 4 22222222 4 22 6666666 4 9 2 33 2 0 55555 8 8 999999999 9 0 33333333 4444 8 33 0 0 0 9 8 222 8 8 333 55 8 5 55 8 4 99 333333 7 4444 44 44 6666666666 6666666666666 222 9 9 333 9 5 8 55 6 6 000000 44 88 88 88888888888888 7 7 7 7 888888 3333333333 999 22222 7 33 7 00 7 7 3 00000 999 7 66 000000 8 8 6 8888888 1
consensus : ATGATNGATCCNATNAACGCTTCCCTCACTNTNANGTCAACATTTGATAGTTTGTGANCNATTGAGGCGAAGNTTGANANTACGCTCAGGAGACATTTTTNTGNATTATAAACGTATGGGCAACGNGGTACNNGGATGAGCAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATANCCCAGTGGTTACCGGAGCGATGNATGGNTCGAAAAGCATGANGCTNTACAAACGAGAACANAGGGTGGTTAAGACGTNCCGATGAAA-GCCAC---TGTGCTG--TNCGTAAA-TGTACCTCAGT------------A----TTTG-------G-TG----TCAN-AATA--C-A-A-AAGTACGT---C-ACG-A-C-G----TACA---GGTC----T-A--CGCGT-TGTATCG-T-GG-GGAA-ATG--TCATAA-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAG-CTGC-------G----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TTCCTAAA-GGT-A----AC--TAGTT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--ATGGTA-TGATT-TTT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------T----A--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-GTG-AA--TGC-----GGAAATGCC--C-------AAC-------A-T-T------GAAT-----ATT--------ATGGGTATT--GC--------T-AA-A--TACGAGAGGAT--AT-TGTACC--G-ATCC-GGGTCAC--------TTTTTTT----AA--ATTT-ATCA--T-----A-TC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--G-CTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACTGGAAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AACAGG--TAAGCAAGGG-ATTT-CC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCGG-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TC-G-G---AC-ACCTTAACCC
Reference ( family-96 ) : ATGATNGATCCNATNAACGCTTCCCTCACTNTNANGTCAACATTTGATAGTTTGTGANCNATTGAGGCGAAGNTTGANANTACGCTCAGGAGACATTTTTNTGNATTATAAACGTATGGGCAACGNGGTACNNGGATGAGCAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATANCCCAGTGGTTACCGGAGCGATGNATGGNTCGAAAAGCATGANGCTNTACAAACGAGAACANAGGGTGGTTAAGACGTNCCGATGAAA-GCCAC---TGTGCTG--TNCGTAAA-TGTACCTCAGT------------A----TTTG-------G-TG----TCAN-AATA--C-A-A-AAGTACGT---C-ACG-A-C-G----TACA---GGTC----T-A--CGCGT-TGTATCG-T-GG-GGAA-ATG--TCATAA-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAG-CTGC-------G----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TTCCTAAA-GGT-A----AC--TAGTT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--ATGGTA-TGATT-TTT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------T----A--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-GTG-AA--TGC-----GGAAATGCC--C-------AAC-------A-T-T------GAAT-----ATT--------ATGGGTATT--GC--------T-AA-A--TACGAGAGGAT--AT-TGTACC--G-ATCC-GGGTCAC--------TTTTTTT----AA--ATTT-ATCA--T-----A-TC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--G-CTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACTGGAAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AACAGG--TAAGCAAGGG-ATTT-CC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCGG-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TC-G-G---AC-ACCTTAACCC
gi|1 : ATGATTGATCCCATCAACGCTTCCCTTATTGTAAGATCAACATTTAATAGTTTGTGATCTATTGAGGCCAAGATTGATAATACGCTCAGGAGACATTTTTG-GCATTATAAACGTATGGGCAACGGGATACAGGGATGAACAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATAT----GTGGTTACCGGAGCGATGGATAGTTCAAAAAGCATGAGACTCTACAAACGAGTGCACATGGTGGTTACGACGTGCCGATGAAA-GCCAC---TGGGCTG--TTTTTAAA-TGTACCTAAGT------------A----CTTG-------G-TA----TCAT-AATA--C-A-A-AAGTACGT---C--CG-AAC-A----CACA---GTTA----T-A--CGCAT-TGTATAG-T-GGTGGAA-ACG--TCATAA-TAT-T-TCA-ACGTTA-TTA------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------CGT----CCAAG-TCGC-------A----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TCG-T-TAA-T---T--T----TT-CC-TTGATTCT-----ATAT----AA-G----TCTCATG--TTTCT--AA-----------A-------TA---------TAGCGCTCATT--TCA--------------ATATT-TTTAATTA--TCACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCGCC------------CG-----------------A-------------T-----T-T--------------AAAATA------CAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-ATT-CA-AGTCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCA-TTCGA------------CTA--AGGCATG-TTCCTAAT-GGT-A----AA--TAATT--GC-AGATTAAAGATT-TTAACA------C-GG--ACGGTA-TATTC-TTT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------T----A--------T---TA-T-TT-----------------------TG--------CA-GTG-AA--TGC-----GGAGA------------------------A-T-T------GAAT------TG--------ATGGGTATC--GC--------T-AA-A--TACGAGAGAAT--AT-AGTACC--G-ATCC-GGGTAATTTTTGTTGTTTTCTT----CA--ATTT-AATA--T-----A-TC--TAT-------AT-CATCACATGA-AGCT--CAA-ATTGCAA-ATTATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--A-CTTGA-ACA-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACTAAAAA-GTTTATCGCA--A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTTTG---ATGATA--T-AACAGG--TTGG-AAGGA-ATTT-CC--C----A-TGT-GGC----A--CGA--TGG----------TTGTT-------------TATA---C-A-CTG---AC-AAG-CG-G--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--A-GCAG-T----------TGGAAG-A-A-GTT-TA------CA----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----AT---AC-T-TGC------TG-TTTTC-AC-TC-G-G---AC-ACCTTAACCC
gi|10 : TACA-TA-------TCGATTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GAAA---ATTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TT-CTGAA-GGTAA----AT--TAGTT--AC-AGATTAAAGATTGTTG-TA------C-GG--ATGGTA-TGAAT-TTT------T-GC-C-TCCTTTACA----------T----A--------T---TA-G-TT-----------------------GA--------CA-GTG-AA--TGC-----AGAAATACC--C-------AACCTTACA-A-T-T------G-AT-----ATT--------ATGGATATT--GC--------T-AA-A--TACAAGATGAT--AT-TGTACC--G-A-CC-AGGTCA---------TTTTTTA----AA--ATTT-ATAA--T-----A-TC--TGC-------AT-CAACACTTTG-AGCC--CAA-AATGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTT-AAG--A-ATTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAT-AGCTGT-AA-GTCTAGCGGAT----AAATACACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACGTTT-ATCAGG--TAAGCAAGGA-TTTT-CC--CA---A-TGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TGT-TT-AATAAGA------TA--TGC--G-GT-G-T----------GGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGG-----A-T--A-C--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TCAG-A---AC-ACCTTAACTC
gi|11 : GTACGT---TGACG-G-C-GGCATTGCA---GGTC----T-A--CGTGT-AACATCG-T-GG-GGAA-A-GATTCATCA-AAT-T-GTA-TCGTTG-TTT------ACTAACA---------G---TAGACTCC--ATTCAC---G-------TGT----TCAAG-ATGT-------A----TAT--GTGTATAATATGTTT-GTC-AA---GTG-----TTA-TGTTG-T-TAA-G---T--T----T--CT-GTGGTGAT-----AT-T----AA-TATTTTTTTTTG--TTTTT--ATATCTATTGTGGA-------TA---------TAATAAAAACCAATCATTATTATTATTATCATATTACTTAATTAA-TTACATTG-TTACTTTTG-----ACAAT-TTATTCC------------CA-----------------AATGTGCATTACTAT-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GTTAAT-CATG--TATATA-TA-------TCGACTTGCGTT-CAGAG--TGT----A---ATGAC-GATA---TTTTCTATTCGA------------TCA--ATGTATATTTCCTAAA-TGT-A----AC--TCCTTTGGCAAGTTTAAAGATT-TTGACA--------GGTTATGGTG--GGTT-TTT------T-GC-C-TTGTTTAGC----------A----A--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-ATG-AA--TATA----GGAAACACT--C-------AAT-------A-T-T------TGAT-----Ac
gi|12 : ---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGG------------CTA--ATTCATA-TTCCCAAC-GGT-A----AG--TAGTT--GC-AGATTTAAGATT-TTGACA------C-GA--ATGGTA-TAATG-TTT------T-GC-C-TCCTTT--------------------------------------------------------------G--------CA-GTG-AA--TAT-----GGAAATGTC--C-------AAC-------A-T-TTGCACTGAA------ATC--------ATGGGTATT--GC--------TTAATA--TACCAAGGGAT--AT-TATACT--G-AACC-GGGTAAC--------ATTTTC------A--ATTT-ATCA--T-----A-AC--GAT-------AT-CGATACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTA-ATT--A-CCTGA-ACC-G-TG-----AT-A--ATAAAC-AACTG-AAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-TCTCT-A---CGT-CA-CTTGTATT---ATGATG--T-AATAGG--TAAGCAAAGG-ATTT-TC--C----AACGT-GACTGACA--CTG--TGT----------TTCTT-------------AATA---C-A-TTG---AA-AAG-CG-C--ATT-TC-AGTCAAA------TA--TGC--G-ACGC-T----------TTGAAG-A-A-TTT-CA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-C--A-T--GATG-T-T-A-----TT---AC-T-TGA------TA-ATTTC-AC-TC-GTG---AC-ACCATAACC
gi|13 : tt----TGT--GTGTA-AATCTGTTA-GTC-AA---GTG----ATTC-T-TTT-T-TA--G---C--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATGT----AA-G----TCTCCTG--TT------------------A-------AA---------TAGTGTGCATT--ACA--------------GAAAT-CTTGAT-A--TAACATTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GTCAA------------CA-----------------A-------------T-----T-TGCTTATAGCCATTTAGAATA------AAGAAA--TTCAAT-CGTG--TGTACA-TA-------TCGACTTG-GCA-CA-GG----TGAAAA---ATAAT-GAAA---TTTTCT-TTCGA------------TCA--ATGCATA-TTCCTAAA-GAT-------------TT--G---------AAATT-TTGACACAAGGCC-GG--ATGG-A-TTTTT-TTTTTAAAAT-GCTT-TCGTTTAGA----------A----A--------A---GA-T-TT-----------------------GG--------TA-GTG-AA--TGTG----GGAAATACC--CATT----AAC-------ATT-T------GAATCAAA-ATG--------ATGAAAATT--GC--------T-AA-A--TACGAGAGCAT--AT-GATACC--G-GTGC-TGATCAC----------GTTCT----AA--ATTC-ATCA--------------TGT-------AT-CGACATGTCA-AACC--CAA-ACTGCAA-ATGAGTGG-----AAT-ACA-T
gi|14 : ----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATC----ATTT-T-TTA-T-TAA-G---A--T----TC-CT-TTGATAAT-----ACAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGCATT--TTG--------------ATA----------------CACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GACCC------------CA-----------------A-------------TGCGCAT-T--------------GTAATAATTATTTAGAA----------TGTG--TACAGA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----G---GTAAC-GATA---TTTTCT-C-CGA------------TCA--AGGCATA-TTCGTAAA-GGT-A----AT--GAATT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--TTGGCG-TGGTTCTTT------T-GC-C-TCGTTTAAA----------T----A--------T---TA-T-TT-----------------------GA--------CA-ATG-AA--TGC-----GGACATGCT--T-------AAC-------A-T-T------AGAA-----ATT--------ATGGTTATT--GCTACATGTGT-AA-A--TACAAGAGGAT--AT-TGTACC--G-ATCC-GGGTCG------------TTTT----CA--ATTT-ATCA--T-----A-TT--TAT-------AC-CAACACATCA-ATCC--CAA-ACTCCAA-ATGATATGACTAAAGT-GCA-TT--AAT-----TTGA-Accttcacctgtgccgatataa
gi|15 : ACA------CTGG--ATAGTA-GGATG-ATT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------A----A--------AATTTG-TATT-----------------------GG--------CAAGTG-AA--TGCC----GAAAATACC-----------AT-------G-T-TT-----GAA------ATTTGCAAATGATGAG------GG--------T-AA-A--TGCTAAGGGATT-AT-CGTAAC--G-ATCC-AGGCC-C--------CCTTTTC----AA--ATTC-AGCA--T-----AATA--CAT-------AC-CGACACACAA-AGCCAAAAA-ACTGCAA---GA-------------ACA-TTG-ACT--G----------------------------AAA--AATTGGAAATGGCTAGC-GAT-A-AAAATA-GCTCT-A---CGT-CA-CTGGTATG---A------------------AAGC-AGGG-ATTT-CC--C----A-CCT-GGCA---A--TGA--TG--------------------------------A---C-G-CCGTAAAC-AAAGCG-A--TGT-TG-AGGAAAA------TA--TGCAAA-ACG-------------TGGAAATA-A-TTT-TA------AT----------TTAA---TCTGA-----A-T--A-T--GCTG-TATAA-----TT---AT-T-TGT------
gi|16 : tgaGT------------A----TTTG----------------CAG-AATGACC-A-A-ACGAACGT---C-ACG-A-C-T----TACA---GGTT----T-A--CGCGT-TGTATCG-TTGA-GAAA-ATG--TCATA----T-T-TTA-TCATTC-TTA------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAA-CTGT-------A----TAT--GTGTA-CATCTGTTT-GCC-AA---ATG----ATTC-T-TTA-T-CAA-G---T--T----AA-CT-TTAATAAG-----ATAT----A-------TATCCTG--TTTTT--AT-----------A-------TATACATG---TAGTGTGGAAT--TTA--------------ATTTG-CTTAATCA--TTAAATGG-TGATATT-GATTCAA-AAT-T-GCCCC------------CAATGCGCAGTGAT-----A-------------T-----T-T--------------ACAATC------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACGTG-GTT--A-GGCGTTT----C---GTGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------GCG--AGctcaatataatcaactcgggagttcttac
gi|17 : ctaaaagctgatgatTTAGA----------T----A--------A---AA-T-CT-----------------------TG--------TA-GGG-GA--TGCATGTTGGAAATACC--G-------AAC-------T-T-T------GATTCGTT-ATC--------ATGGAAATA--GC--------T-AA-A--TGCAATAGGGT--GT-TGTACC--G-TTCT-GGATCA------------TTTT----AA--ATTT-GTCT--T-----A-TCAATAT-------AT-CGAC---------CC--CAA-ACTGTAA-ATGATCAG-----AGC-ACA-CC---------CTTCA-GTT-G-TGCCAATGT-A--GTATAT-AACTAGAA--GTCTTGCGGA----AAACTA-GCTC-----------A-CTTGCATG---ATTACG--T-TATATT--GAAGCGAGGG-TTTT-CC--A----A-AGT-GGC----T--CAA--TGT----------TT-----------------ATG---T-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTG-T--AATAAAA------TA--TGC--G-ACAC-T----------TTGAAG-A-A-TTT-TT------CT----------TTGA---ATTCA-----A-T--A-T--GGTG-T-C-A-----TC---AT-T-atacttagttggaaaatatttt
gi|18 : TG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTTCCA--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------AAATT-CTTAATCA--TTGCACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------TGCGCAT-T--------------GGAATT------TAGAA----------TGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAT-GATA---TTTTCT-TTCGAANNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN-NNNNNNNN-NNN-N----NN--NNNNN--NN-NGATTAAAGATA-TGGACA------A-GG--CTGGTA-TGATT-GTT------T-GT-C-TCGTTAAGA----------T----A--------T---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-GTG-GA--TGC-----AGAAATGCC--C-------AAC-------A-T-TA-----GAATTTAA-ATC--------ATGGGTATT--GC--------T-AA-A--TATGAGAGGAT--AT-TGTACT--G-tatatgcgacactttgaagaat
gi|19 : A-TG-------TCTACTTG-GTA-CA-GGCGAAC----G---ATGAC-GATAATATTTTCT-TTCGA------------TCA--AGGCATA-TTCTTAAA-AGT-A----AC--TAGAT--GC-AAATTTAAGATT-TTAGCA------G-GG--AATGTA-GGATT-CCC------T-CC-C-TTGTGTATA----------T----T--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-GTG-AA--TGT-----AAAAATGCC--C-------AAT-------A-T-TG-----GAATCGGC-ATT--------ATGGAAATT--GT--------T-AA-A--TACAAGAGGGT--AT-TGCA
gi|19 : agG-----AGG-GTA-TTGCAATC-A-CATGT-GCC-G-TT-----GC-G--ATAAAC-AACTAGAAA-G-CTTTCGGAT-A-AGAA-A-ACTCA-A---TGT-CG-TTTGTATG---ATGACG--T-AATTGT--TAA-----AG-ATTT-CC--A----A-CGT-GGT----A--CGA--TGT----------TTGCT-------------atcacatgtgccgttgcgataaacaactagaaagctttcggataagaaaactcaatgtcgtttgtatgatgacgtaattgttaaagatttccaacgtggtacgatgtttgctgacgaattcatctctcaataaa
gi|2 : agatgtctacttggtacaggcgaacgatgacgataatattttctttcgatcaaggcatattcttaaaagtaactagatgcaaatttaagattttagcagggaatgtaggattccctcccttgtgtatattatatttggcagtgaatgtaaaaatgcccaatattggaatcggcattatggaaattgttaaatacaaATGAAATGCCACAATTG-GCTGAGTATGTAAACTGGACCTCAGT------------GGCACTTCGCAGTAGCG-TGACGATCAGCAATA--CTA-ATAAGTACGTGCTC-ACGTA-C-A----TACA---G-TCAAAATGA--CGCGTGTGTATTG-T-GG-GGAAGATA--TAAGAAATAT-TATTAATCGTTAATTT------ACTA-CA---------A---T------TT-AT-CAAATAG-------TGTACGCCCAAGGCTGC-------G----TAT--GAGTATAATCTGTTT-GTC-AA---AT------TTA-T-TTGGT-TAATG---TAAT----TTACT-TTGATAATGCCATATATTAAAAA-G--------------------AT-----------G--------A---------TAGTGTGAATT--TAA--------------ATATT-CTTAATTACCTAAGACTGATGCGCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CATTGATCGCGCATTGTTAA-------------T-----T-T--------------AGAATACT----TAGAAAAGGCAAATTCGTG--TATAAACTACCCACGCTCGTCTTG-GTTTCA-AGCCTTT----A---A-GAT-GATT---ACTTCT-TCAGA------------CGATTAAGCATA-TTCCGAAGTGGT-AGATTACAGTAGTT--G--AGATTAAAGATT-TTGACAG-----C-GG--AATGTAATGATTGTTT------T-GC-CATCGTTTAGA----------T----A--------T---TAAT-TT-----------------------GGGTTCTGGGCA-GTG-GAGTTGC-----GGAAATGCC--A-------AATTCGTAGAA-T-T------GAA------ATT--------ATGGGTATTTGGC--------T-AA-AACT-CATGCAGATTGAT-TGTATCCTG-AGC--GGGTCAC--------TTTTTC------A--ATTT-ATCA--TTCATTA-TC--TACCGGTATAAT-CAACACATCA-AGCC----A-ACTGCAA-ATGATTTG-----AATGGCA-TTATAAG--G-CTTTA-ACCAG-TG-----GT-----T---C-AA---------TTTAGCGGATGA-AAAATA-GCTAT-ATGGCGT-CAGCTGGTATGTACATGACG--T-AA---------------A-ATTT-CCA-C----C-CGT-GTC----A--C-----GT----------ATGTT-------------GA-----------G---AC-AAAGCGTAATTTT-TT-AGTAAAA------TAGTTGTCGG-GCGGTT----------TGGGAT-A-A-TTTGTATTTGATCT----------TTAA---TTTGA-----T-T--A-TG-GCT--T-T-A-----TT---AC---CGT------TATATTTT-ACTTC-G-GGA-ACAACCTTAACCgacgaattcatctctcaataaa
gi|20 : TTTTT----AATTCTTT-ATTA--T-------TT--TAC--------T-C---ACATGA-A--T--CAATATTGCAAGATTATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--A-CT-GATATC-A--------GT-T--GTATAC-AACTAAAAA-GTTTATCG--C-A-AAAATA-ACTC--A---CGT-CA-CTTGTTTG---ATGA------AATAGG--TTG--AAAGA-ATTT-CC--A----T-GGT-GCC----A--CGA--TGG----------TTGTT-------------TATAATAC-A-CTG---AC-AA--CG-G--TT-----AGTAAAA-------A--TAC--A-----------------CGGAAT-A-G-TTT--A------C--------------A---TTT-A-----A-T--A-A--AC-G-T-A-A-----TT---AC-TATGC------TG--TTTC-AC-TC-G-A------ACCTTAACC
gi|21 : ataTT------T-GT-C-TCGTTTAGA----------CTCTCA--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-GTG-AA--TGT-----GGAAATACC--CAATATTTAAC-------A-T-T------GAA------ATT--------ATGGATATT--CC--------TAAA-A--TA-GAGGGGAT--A--TGTACC--G-ATTCAAGGTCGC--------TTTTGAC----AA--AATT-ATCAACT-----A-TC--GAT-------AT-CGACACATCA-AG----CAA-ACTGGTA-ATTATATG-----G---GCA-TTA-GATTCA-CCTG---CCAA-TG-----AC-ATTTTAAACAAACTG---A-GTCTAGCATAT-G-ATAATA-GCTCTAA---CCTGCG-CTTGTac
gi|22 : -AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-CTG-AAT--G-TTTGA-ACC-G-TG-----GA-A--ATAAAC-AACTG-AAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTTT-A---CTT-CA-CTGGTATT---ATGACA--T-AACGGG--TAAGCATGGC-ATTT-CCA-C----G-CAT-GAC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------C----------TT---------A-CG-A--TTC-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCAG-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--G-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TTGG-G---AC-ACCTTAACCg
gi|23 : -AATA--C-G-A-AAGTACGT---C-ATG-A-C-G----TACA---CGTC----T-A--CGTNN-NNNNNNN-N-NN-NNNN-NNN--NNNNNN-NNN-N-NNN-NNNNNN-NTTCACAACATGA-CA---------ACGCT------T--AA-AAA---G-------TGT----TCAAA-CTGT-------A----TAT--GTGTA-AATTTGTTT-GCC-AA---ATG----ATTG-T-TTG-T-TTA-G---T--T----TC-CT-TTGACAAT-----ATAC----AA-G----CATCTTG--TATTT--AT-----------ATACACTGTA---------TAGTGTGAAAT--ATA--------------ATATC-ATTAACCA--TTATATT
gi|24 : atgcacttcgcaTGATTTG-----AGT-GCA-AT--AAT--AACCTGA-ACC-G-TA-----GT-A--ATAAAC-AATTG-AAT-GACTAGCGGAT-A-AACATA-ACACT-A---CGC-CA-CTTGTATT---ATGACG--T-AAATGG--GAAGCAATGG-ATTT-CC--C----AACGT-GGA----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAAACG-A--GTT-TT-ACTAAAA------CG--TGC--G-ACGT-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTCA-----A-T--T-T--TCTA-T-T-A-----TA---AC-T-TGT------TA-ATTTC-AC-AC-GAG---AC-ACCTCAAa
gi|25 : AAAC-AACTG-AAT-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-GTTCT-A---CAT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AGTAGG--TAAGCAGGGG-ATTT-CC--C----CTCGT-GGC----A--CAA--TGC----------TAGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TTTAATAAAA------TA--TGC--G-ATAC-T----------TGGAAG-A-A-TTT-CA------CT----------TTAA---TCTGA-----A-T--A-G--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-TGT------TA-ATTTC-AC-TCAG-G---AC-ACCTTAACCC
gi|26 : -A---TGT-CA-CCTGTATG---ATGAAG--A-AATAAT--TCAGCAAAGG-ATTT-CC--C------CAT-G-T----A--CAA--TGTACAGCAATGGTTGTTACTGCCACTTAAATATG---A-A-TTG---AC-AAA-CA-A--TTT-CT-AACAAAA------TA--TGT--ATGC---T----------TGAAAG-A-A--TT-TA------CTTGGCACAGCATTAATGCTTTCA-----A-T--A-T--GCTA-T-T-ACTAGCCT---AC-T-TGT------T--ATTTT-AC-Tc
gi|27 : g-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CCTG--TATGC--TA-------TCGACTTC-GTT-CA-GGC-------------------------TTTTCT-TTAGA------------TCA--AAATATA-TTCTTAAA-GGT-A----AT--TACTT--GC---AT-----ATT-T---CA----------------TA-T--TT-TCT------T-GC-C-TCATTTAGA----------T----G--------A---GA-T-TT-----------------------GG--------TA--TG-A
gi|27 : -ATGATTTG-----AGT-GCA-AT--AATA-A-CCTGA-ACC-G-TA-----GT-A--ATAAAC-AATTGtttgagtgcaataataacctgaaccgtagtaataaacaattg
gi|28 : tttagaatatagaaagccaatcctgtatgctatcgacttcgttcaggcttttctttagatcaaaatatattcttaaaggtaattacttgcatatttcatattttcttgcctcatttagatgagatttggtACG--T-AATAGG--TAAGCAAGGA-ATTTTCC--C----T-CGTTGAC----A--CGACATGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-ATG---GC-AAA--G-A--TTT-TTGAGTCAAA------CA--TGC--G-ACCG-TAGATAGCTCTTTGAAG-A-A-TGT-AA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--TCTG-T-T--------T---A-------------TG-AT-----C-TT-G-G---AT---CTTAACCC
gi|29 : ATA-AATTC-A---TGT-CA--TGGTATG---ATGACG--TTAACATG--TAAGCAAGAA-ATTT-CC--CC---A-AGT-CGC----A--TGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGCACAA------TA--TGC--G-GCGG-T----------TGGAAA-A-A-AAT-TA------CC----------TTAA---GTTGG-----A-T--G-T--GCTG-T-T-A-----TC---AT-A-CGT------TT-ATTTA-AC-gggacattcctacct
gi|3 : ----T-A--CGCCT-TGTACCAAT-GT-GAAA-ATA--TAATGA-TAG-T-TTA-CAGTCA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AG-CAA---G-------TAT----CCATG-CTGC-------A----TAC--GTATA-AATTTGTTT-GTA-AA---A------ATTT-T-TTC-TATAA-G---A--T----TT-AT-TTGATAAT-----ACAT----AA-G----TCCCCTG--TTCCT--AT-----------A-------TACATTATGTATAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACATT-G-----A-AAT-C-GCCCTCAATGCGCATTGCA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAGA--CTCAA---GTGAATATAAA-TG-------TAGACTGG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-AATA---TTTTCT-TTCGT------------CCA--AGGTATA-TTCCAAAA-GGT----------TAGTT--GC-AGATTAAAAATT-TTGACA------C-GG--GTGGCA-T-ATT-TTT------T-TT-C-TAGTTTAAA----------T----A--------T---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-GTA-TA--TGC-----GGAAATCCC--C-------AAC-------A-T-TA-----GAATTGAA-AGT--------TTGGGTGTT--GC--------T-AA-C--TTTGAGAGGA------------------------TCA---------TTTTTTA----AA--ATTT-ATCA--T-----A-TC--TAT-------AT-TAACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTT-----AGT-GCA-TTA-AAG--G-CTTGA-ACC-GAAG-----GT-A--ATAAAT-AACT-GAAA-ATGTAGCAGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTGATATG---ATGTCG--T-AACATT--TAAGCAAGGA-ATTTCCC--C----A-CTT-GGC----A--CGA--TAT----------CTGTT-------------TATG---A-A-TTG---AC-AAA-CA-G--TCT-TT-AGTAAAA------TA--AGC--G-GCGG-T----------TGGAAT-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--A-T--ACTT-T-C-A-----TT---AT-T-CGT------TA-ATTTC-CC-TCGG-G---AC-AC
gi|30 : A-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------GCTA-AA---------A---T------T--AT-CAA---GACTTTAGTGT----TCAAG-CTGT-------G----TAT--GCGTA-AATCTGTTT-GTG-AA---AAG----TTTCTT-TTGTT-TTG-G---T--T----TT-CT-TTAATTAT-----ATAT----TA-C----TCTCCTG--TATCT--AT-----------C-------TA---------T
gi|31 : tcCAA-ATGACTTG-----ATT-GCA-TTA-ATC--A-ACTGT-GCC-G-TG-----GA-G--AAAAAC-AA-TCGATA-ATCTAGTGAAT-A-AAA-TA-GTTCT-A---TGT-CA-CTTTTACG---ATGATG--T-AATAGA--TAATTAAGGT-ATTT-CCCGC----A-CGC-GGT----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------Tccatctacatgtatgtaatggaa
gi|32 : cctTC-CC--C----A--AT-GGC----AATCGA--TGC----------CTGTG-------------TATAT--C-A-TT----AC-AAA-CG-A--TTTGTT-AATAAAA------TA--TGT--C-ATGG-T----------TGGAAT-ATA-TTT-TG------CT----------T------TTTGAAATGTA-C--A-T--GCAG-T-TAA-----TT---AC-T-TGT------TA-TGTTC-ACTTT-G-G---AC-ACCTTTAC
gi|33 : tcACAGAGCGTAGGCAAGCCGCACAGAGGAAA-TTCAC---TGTACTA--TTCATAAA-TGTGTCTCAATGTATTTCACACTA----TTTG-------A-TT----TCTG-AATA--C-A-A-AAGTACTT---C-ACG-A-C-G----TACG---GGTT----T-A--CAAGT-TGTATCT-T-GG-GGAG-ATt
gi|34 : TT------ATTA-GA---------A---T------TTAAT-GAT---A-------TAA----TTAAG-CTCT-------A----TATAGGCGTA-AATCTGATT-GTT-AG---ATG----ATTC-T-CGT-T-TCA-G---TATT----TT-TT-TTTAAACT-----ATAT----AA-G----TCTTCTA--TTTTT--AT-----------A-------TA---------CAGTGTGAATT--AAG--------------ATAAT-CTTAAT
gi|35 : -TCATCA-TTT------ATTA-CC---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TGAA--CTGTATACATTG----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AATACATGTGAAATTT-T-TTT-T-T-C-GTCTT--C----TT-CT-TTGAT---------TAT----AATG----TCTGATG--CTTTT--
gi|36 : caaaaaatcAGT------------A----GTTG-------GATG----TCAC-AATAA-C-AGA-AAATATGT---C-ACA-A-CCGC---TACATGGGGTC----T-ATACGCAT-TGTCTCG-T-GG-GAAA-ATG--TCATA--TATGT-TTA-TCGTTA--TT------ACTA-CATGTAG----A---T------C--TT-CAC---G-------TGT----TCAA
gi|37 : t-------------TACA---C-AGTTG---AC-TAA-TG-A--TTTATT-AGAATAA------TA--TAC--G-ACAGCT----------TGGAGG-A-A-ATA-TA------CT----------TCAA---CTTGA-----A-T--A-T--GCTGTT-T-A-----TTTAAAT-A-TAT------CA-ATTTC-AC-TC-
gi|38 : gatgatgtggacagttac--ATTT-ATCG--T-----A-AT--TA--------AT--AACACATTACAGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCAGCTG-AAT--G-TTTGA-AAC-G-AGA----GCGA--AT--AC-AACTAGA
gi|39 : actgttcAC-AACTG-AAA-GTCTAGAGGAT-A-AAAATA-ACTGT-A---CAT-CA-CTGGTATG---ATGACG--T-AACGGG--TAAGCAAGGA-ATTTCCC--C----A-CGT-GGC----T--TGA--TGT----------TTGTgttatgtcagagaagaaga
gi|4 : TGA-TAT-T-TTA-TCTTCA-TTT------GCTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TAT----TAATG-CTGC-------A----TAC--GTATA-AATCAGTTT-TTG-AA---ATT----ATT--T-TTG-A-TAA-T---A--T----TC-CA-TTGATAAT-----ACAT----AA-G----TATCCTG--TTCCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACATT-G-----A-AAT-C-GCCCCCAATGCGCATTGCA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAAAA------TAGAGA--CTCAAG-CGGA--TATAAA-TG-------TAGAATGG-GTT-CA-CGCCTTT----A---ATGAC-AATG---TTTTCT-TTCGT------------CCA--AGGTATA-TTCC-AAA-GGT----------TAGTT--GC-AGGTAAAAGATT-TTGGCA------T-GG--ATGGTA-TCATT-TTT------TCCC-C-TAGCTTTGA----------C----ACGGATGGCA---TA-T-TTTTTTCCTAGTTTAAATATTATTTGG--------CA-GTG-AA--TGC-----GGAAATGCC--C-------AACATAAGA-A-T-T------GAAA-----GTT---------TGGGTGTT--GT--------T-AA-C--TTTGAGAGGAT--AT-TACACC--G-ATCT-GGGTCAT--------TTTTTTTTTTAAA--ATTC-ATCA--T-----A-TC--TAT-------AT-TACCACATCA-AGCC--GAA-ACTGCAA-ATGATTTT-----AGT-GCA-TTA-GAA--G-CTTGA-ACC-GAAG-----GT-A--ATATAT-AACT-GAAA-ATATAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTGATTTG---ATGTCG--T-AACATT--TAAGCAAGGA-ATTTCCC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------CTGTT-------------AATA---A-A-TTG---AC-AAA-CA-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--AGC--G-GCAG-T----------TGGAAT-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--A-T--
gi|40 : -TAT-C-TTA-TCATTA-TTC------ACTA-CT---------A---T------A--AT-CAA---A-------TGT----TTAAG-CTAT-------G----TAT--ATGAA-AATCTTTTTTGTC-AA---AAG----ATTaatttca
gi|42 : ttggaaaaaaacctA------TA--TGC--G-ACAC-T----------TTGAAG-A-A-TTT-TC------CT----------TTGA---ATTCA-----A-T--A-T--GGTG-T-C-A-----TC---AT-----T------TA-TTTTT-AC-CT-ACG---AC-ACCTTA
gi|43 : -T----------TGGAA--A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AT-T-TGT------TA-ATTTT-AC-TCAG-A---AC-ATCTTAACtcatcac
gi|44 : A-CG-C--TTC-TT-AGTAAAA------T---TGC--G--CAG-T-----------GGAAG-A-AATTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----T-T--GTT--GCTG-T-T-A-----
gi|47 : ATA---TTTACT-TCCGA------------TCA--AGGCAGA-TTCTAAAA-GGA-A----CC--TACTT--GC-AGATT
gi|49 : -T-A-----TT---AT-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TTGG-G---AC-ACCTTAACCCt
gi|5 : T-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CAGCAGACTCTA---T------T--CC-C-----G-------TGT----TTAAG-CTGT-------T----TAT--GTGTA-AATCAGTTT-GTC-AG---ATT----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ACA------A-A----TATCCTC--TTTTT--AT-----------A-------CA---------TAGTGTGAATT--AAA--------------TTATT-CTTA----------------GACCTT-G-----A-AAT-T-GCCTC------------CAATGCACATTGCT-----A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCGAGT-CGTG--TGTATA-TA-------TCGACTTG-ATT-CA-AGTGTTT----A---ATGAC-GATA---TTTCCT-TTCAA------------CCA--AGGTATA-TTTCTAAC-GGA-A----AC--TAGCA--GC-AGATTTAAAATT-TTGACG------C-GG--ATGGTA-GAATT-TTT------T-GC-C-ATGTTTAGAGTACTTTAGGT----G--------A---TC-T-TT-----------------------GG--------TA-GCC-AA--TGT-----GGAAATGCC--C-------AAC-------ATT-T------GAATTGAA-ATT--------ATGGGTATT--GA--------T-CA-A--TACGAGAGGAT--AT-TGTGTC--G-ATCC-GGGCCAC--------TTTTTC------A--ATTT-ATCA--C-----A-TC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--TAA-ACTGCAA-ATGATATG-----AGT-GCA-TTA-ATC--G-CCTG---C-----------------ATAAAC-AATT-GAAA-GTCTAGCAGAT-A-AAAATA-GCTTT-A---CGT-CA-CATGTATG---ATGACG--T-AATAGG--TAAACAAGGG-ATTTCCC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGGT---------------TA---C-A-TTG---AT-AAA-TA-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGT--G-CCGC-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-TAAA-TAGGCTG-T-T-A------T---AC-T-TGT------TT-ATTTA-AC-TC-T-G---AC-cag
gi|50 : g-----TT---AC-T-TGT------TA-ATTTC-AC-TC-G-GGACAC-ACCTTAGCCgcatt
gi|52 : TT-TCT------T-GC-C-TCATTTAGA----------T----G--------A---GA-T-TT-----------------------GG--------TA-gc
gi|53 : catatAGAACACAGGGTGGTTAAGGCGTCCTGATGAAA-G
gi|6 : TA-TTT-----------CA---------A---T------T--AT-CAT---A-------TGT----GCAAG-CTGCATAT---G----CAT--GTGTA-GATCTGTTT-GTCCAA---ATG----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TAGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AATGC-GCATTG-----------CA-----------------A-------------TG----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--CTCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCAAATTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC----A---TTTTCT-T-CGA------------CCA--AAGCATA-TTTCTAAA-GAT-A----AT--TAGTT--GC-AGATTAAATATT-TTGACA------C-GG--ATAGCA-TGATT-TGT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------T----A--------T---TA-T-TT-----------------------GG--------CC-GGG-AA--TGC-----GGAAAGGAC--T-------AAC-------A-T-T------A----------------------GG-ATT--G-----------AA-A--TACGAGAGGAT--AT-TAAACC--G-ATCC-GGGTCAC--------TTGTAT------A--ATTTAATAA--C-----A-TC--TAT-------AT-CAATACACCA-AGGC--CAA-ACTACAA-A---------------------TG-AAT--A-TTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AAC-AGAAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATT-ACTCT-A---CGT-CA-CTGGTATG---ATGACG--T-AACAGT--TAAGCAGGGA-GTTT-CC--CT---A-CGT-GGA----A--CAA--TGT----------TCGTT-------------TACA---C-A-TTG---AC-AAA-CA-A--TAT-TT-AGCAAAT------CA--TAC--G-GTGG-T----------AGGAAG----------A------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-TTCTC-CC-TCGG-G---AC-ACCTTACCC
gi|7 : ATGATGGATCCAA-AAACGCTTCCCTCACTCTTATGTCAACATTTGATAATTTGTAAACAATTGAGGTGAAGTTTAAGATTACACTCAGGAGACATTTTTTTGAATTATAAACATATAGGCAACGCGGTACCTGGATGAGCAAGAATT-GCAGAAAACGATGGTATGTAATAGCCCAGTGATTACCGGAGCGATGTATGGGTCGAAAAGCATGATGCTATA-AAACGAGAACAAAGGGTGGTTAAGACGTCCCGATGAAA-GTCAC---TGTGCTG--TACATAAA-TGCACATCAGT------------A----TGTG-------A-TG----ACAT-AATA--C-A-C-AACTACGT---C-CCT-A-C-A----CACA---GTTC----T-A--GGCGT-TGTATCA-T-GGTGGAA-CT------TAC-TA---------CAGTA-TTT------ACTA-CA---------A---A------T--AC-CAA---G-------CGT----CCAAG-ATGC-------ATACTTAT--GTGTA-AATTTGTTT-GTC-AA---ATG----AGTC-T-TTG-C-TAA-T---T--T----TT-TTATTGATAAT-----ATAT-------G----TCTCCTG--TTTCTAAATATCTAA-----A-------TA---------TATCGTGAATT--TCG--------------ATATT-TTTCATCA--TTAGAATG-TGACATT-A-----A-AAT-C-ACCCCCCCCCCCGTGCGCATTGGC------------A-------------T-----TGT--------------AGAATA------CAGAAA--AGCAAT-CGTA--CACACA-TA-------TCGACTTG-ATT-AA-AGCCTTT----A---AAGGCTGATA---TTTT
gi|8 : A-CA---------A---T------T--AT-CAA---A-------CAT----TCAAG-C--C-------G----TAT--GTGT--------------C-AA---ATA----ATTC-T-ATT-T-TAA-A---T--TAATTTT-CT-TTAATGAC-----ATGT----AA-G----TCTCCTGAATTTAT--AT-----------A-------TACATG-----TAGTTTGAATT--ACC--------------ATATT-CTTAATCA--CTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-ATTCC------------CAGTGATCATTGCT-----A-------------T-----T-T--------------AGAAT-----------AA--GCCA-----------------A-------TCAACTTG-GCA-CA-GG---TT----AAAGATGAC-TATA---TTTTCT-TTCAA------------TCA--AGACGTA-TTagactcacaggtttacctcaggtaa
gi|8 : ATT-TTT------T-GC-C-TCGTTTTGA----------T----T--------A---TA-T-TT-----------------------GA--------CA-GTG-AA--TGT-----GAAAATGCC--C-------AAC-------A-TAT------AAATCAAA-ATT--------ATAGAAATG--GC--------T-AC-A--AACGAGGGGAT--AT-TATACC--G-ATCC-GGATCAC--------TTTT-------AA--ATTT-ATCA--T-----A-TC----------------GATACATTA-GGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AAT-GCA-ATA-ATT--G-CTT-A-TCC-A-TG-----GT-A--ATAA-C-AACTG-AAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAACA-GTTCT-A---CCT-CA-CTTGTACG---AATATG--T-AATAGG--AAAGCATGGG-ATTTACC--C----A-CGT-GGT----A--TGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---T-A-TTG---ACAAAA-AG-A--TTT-TT-TGTAAAATACATGTA--TGT--G-ACGC-T----------TGAAAG-A-A-ATT-TA------CT----------TTGA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-A-A-----TT---AT-T-T-C------TA-ATTTC-AC-TC-ATT---AC-ACCTTttttgcctcgttttgattatatttgacagtgaatgtgaaaatgcccaacatataaatcaaaattatagaaatggctacaaacgaggggatattataccgatccggatcacttttaaatttatcatatcgatacattaggcccaaactgcaaatgatttgaatgcaataattgcttatccatggtaataacaactgaaagtctagcggataaaaacagttctacctcacttgtacgaatatgtaataggaaagcatgggatttacccacgtggtatgatgtttgtttatatattgacaaaaagattttttgtaaaatacatgtatgtgacgcttgaaagaaatttactttgatttgaatatgctgtaattatttctaatttcactcattacacctttatatcaccactg
gi|9 : acaattatcaaacattcaagccgtatgtgtcaaataattctattttaaattaattttctttaatgacatgtaagtctcctgaatttatatatacatgtagtttgaattaccatattcttaatcactacactgtgaccttgaaatcattcccagtgatcattgctatttagaataagccaatcaacttggcacaggttaaagatgactatattttctttcaatcaagacgt---------TAGTGTG--TT--TTA----------------------CAATTA--TTACATTG-TGACCAT-G-----A-AAT-C-GTCCCAATG--------CACATTGCT----------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAGA--GTCAGC-GGTG--TATACA-AA-------TCGACTTG-GTT-CA-GGCGTCT----A---ATGAC-GATA---ATTTCT-TTCGA------------TCA--AAGCAAA-TTTCT-AA-GGT-A----AC--TAGTG--TC--------AGATT-TTGACA------T-GG--ATGATA-GGA-T-TTT------T-GC-C-TTGTTTACA----------T----G--------A---TA-T-TT-----------------------GA--------CA-GTGAAA--TGT-----AG-AGTGTCAAC-------GAT-------C-T-T------GAACTTAAAATT--------ATAGGTATT--GCAT------T-AA-A--CACGAGGGGAT--ATCTGTACC--GAATCA-AGG--AT--------CCTTTTT----A-----TT-GCGA--G-----A-TC--TAT-------TTCCTAGACATCA-AATCA-CAA-ACAGCAA-ATAGTTTC-----AGT-GCA-TTA-ATC--G-CCTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACT-GATA-GTCCAGTGAAT-ATCGAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTTTATG---ATGACG--T-AATAGGTATAAGCAAAGGCATTT-CT--CTATAA-CAT-GTC----A--CGA--TCT----------T--TT-------------TATA---CTA-TTG---AA-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TG---G-ACGC-T----------TTGGAA-A-A-TTT-GA------CT----------TGAA---TAGGA-----ATT--A-T--GC-G-T-T-A-----TT---ACTT-TGTTACATGTA-ATTTCAAC-TC-G-G---AC-AACTTAAtatatcaccactg
blockSeqs : G A A C T T A A G T G T TT A C CT . GCCCA T G T A . G A T AAT T AG A G C GGCACTTCGCAGTAGCGTGACGA GC AC T AT GCT GA T . GGCAT TGG G AAAA G TA G A T T G GAT AA G A A A CACAAC A GCAGACTCT CGC AGACTCC T ATA ACTTTAG ACGC G ATACATTG AG T T C TAC TGAA CT G G A T TCTT AATT A A GCCAT TAAA T ATTT AA AA ATCTATTGTGGATA AA TTATTATTATTATC A CC A T ATTCA C G T CCCCCCCGTGCGCATTGGCATTGT ATTATT AGGC TT AA C CCCACGC C T G CC GAAA AAG T ATA A ANNNNNNNNNNN TT T T AGATTACAG TG A A G CAAGGCC TT ATG C TTAAAA C T A GTACTTTAGGTGA A A TTTTCCTAGTTTAAATATTATTT GTTCTGGG A A GT ATGTT CAATATTT TCGTAGAATTGAA TGCAAATG T TG TACATGTG T T AC TG C CT A A CA TTTTA TT A TTCATT A AA CGGTATA C A C AA T G ACTAA G G GCAATCA T A TGCCAAT ATT A GT T G T C A TGG G G TAC TT T C TA C T CG TATAA T TGAC AT CA ACAGCAATGG ACTGCCACTTAAA ATA T G TAA A G T AT G T TACATG GT AA TG CGTAGATAGCTCT T T A G TTTGAT TGGCACAGCA TGC AATGT T AA T AG T A A CTAGC TAA T AT TACATG T A T GGGAC A
blockSeqs : C C . . T . T A . GTATTTCACACTATTTGATT G A . GA . A . . CGC . G . . . . . . . . G A . . . . . . TGTAG . TTA . . . . . ATATG . T . . . . A . T . . TAA . . . . . . . . . ATACATTATGTA . . . A . . . . . . CATTGATCGCGCATTGTTAATTT CT GT T . . . . . . CC . . . . . . . . . AAAT . . A . CT . TG G . . . . CACGGATGGCA . . . . . . . A CATT ATAAGAATTGAAA . T . AT A . . T . . . . CC A . . ACT . . . . G . A . . . . . AGATTCA . A AAG GA . GG . . . . . . . . . . . T . . C A AA . A . . . . T . . . . G . . A G . . CG G GGTT . . . . . . . . . . . G . . A . . . C . . . T GGGA .
blockSeqs : A C . . . . A A . AGTTGGATG G . . A . A . . T . G . . . . . . . . A N . . . . . . . . TT . . . . . ATACT . . . . . . C . . . . TAT . . . . . . . . . ATACACTGTA . . . . . . . . . . CAATTTGCTTATAGCCATTT . TT T . . . . . . CG . . . . . . . . . AAC . . T . GC . TA . . . . . CTCTCAA . . . . . . . G AAC CTTACAATTGAT . A . . . . . . . . . . CT T . . T . . . . G . . . . . . . ATAAGG . . AGA A . AG . . . . . . . . . . . T . . C A AA . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A AGCT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . AGA .
blockSeqs : . ATGTGATG C . . A . A . . A . G . . . . . . . . N A . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . ATATACATG . . . . . . . . . . CAAATGTGCATTACTATTT . GC T . . . . . . CC . . . . . . . . . AAG . . A . C . TT . . . . . AAAATT . . . . . . . C C ATTTGCACTGAA . T . . . . . . . . . . CT T . . T . . . . A . . . . . . . TAAGA . . AAG A . AG . . . . . . . . . . . T . . C . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A GCT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . GTG .
blockSeqs : ATTTG T . . A . A . . G . G . . . . . . . . A A . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . C . . . . C . . . . . . . . . ATCTAAATA . . . . . . . . . . CAATGCGCAGTGATATTT . GC T . . . . . . CG . . . . . . . . . AAT . . A . C . TG . . . . . TAT . . . . . . . . C ATTTGAATCAAA . A . . . . . . . . . . TT C . . T . . . . G . . . . . . . AATTA . . TG A . AA . . . . . . . . . . . T . . C . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A ACT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . GGG .
blockSeqs : . . C . A . . G . T . . . . . . . . G A . . . . . . . . T . . . . . G . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . . ATACATG . . . . . . . . . . CAATGCGCATTGCAATTT . CT G . . . . . . CC . . . . . . . . . NNN . . T . C . GG . . . . . AAA . . . . . . . . C ATTAGAATTTAA . T . . . . . . . . . . CT T . . T . . . . G . . . . . . . GACTG . . TG G . CG . . . . . . . . . . . C . . A . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G AGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . GAG .
blockSeqs : . C . . A . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . CAATGCGCATTGCAATTT . CT T . . . . . . CC . . . . . . . . . AAC . . A . A . TG . . . . . AAA . . . . . . . . T ATTGGAATCGGC . A . . . . . . . . . . CT T . . T . . . . A . . . . . . . GAATA . . TT T . AG . . . . . . . . . . . A . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G GTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . AGG .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . ATA . . . . . . . . . . CAATGCACATTGCTATTT . GC T . . . . . . CC . . . . . . . . . AAT . . A . G . GG . . . . . TAT . . . . . . . . G ATTAGAATTGAA . T . . . . . . . . . . CT C . . T . . . . G . . . . . . . GAATG . . TG A . AG . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A ACT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . GGG .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . . . . G . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . ATA . . . . . . . . . . CAGTGATCATTGCTATTT . CT T . . . . . . TG . . . . . . . . . ACC . . A . C . TC . . . . . TAA . . . . . . . . C ATTTGAATTGAA . T . . . . . . . . . . TC A . . T . . . . A . . . . . . . AATAA . . TG A . G . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A GGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . ACG .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . CTA . . . . . . . . . . AATGCACATTGCTATTT . AG C . . . . . . CC . . . . . . . . . AAC . . T . T . GA . . . . . TAT . . . . . . . . C ATATAAATCAAA . T . . . . . . . . . . T T . . T . . . . A . . . . . . . AATAA . . TG A . G . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A GGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . AGA .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . ATA . . . . . . . . . . CAATGCGCATT . GC . . . . . . . CC . . . . . . . . . AAT . . A . C . TG . . . . . TTA . . . . . . . . A CTTGAACTTAAA . T . . . . . . . . . . C . . . T . . . . A . . . . . . . AAAGG . . TA A . G . . . . . . . . . . . C . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G GGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . GGG .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . G . . . . . . C . . . . A . . . . . . . . . ATA . . . . . . . . . . CAATGCGCATT . GT . . . . . . . CG . . . . . . . . . AAC . . . . C . GG . . . . . TAT . . . . . . . . C TTTGATTCGTT . T . . . . . . . . . . T . . . C . . . . G . . . . . . . AATCA . . TA G . G . . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G AGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . GGG .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . T . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . ACA . . . . . . . . . . GCAATGTT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . G . . . . . TGA . . . . . . . . C ATTTGAT . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . . . . . . . GAATG . . TG A . G . . . . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A ACT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . ATT .
blockSeqs : . . . . T . . . . . G . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . ATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . TAT . . . . . . . . C ATTAGAA . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . AGAAG . . TG A . G . . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A AGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . GA .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . TGA . . . . . . . . T GTTTGAA . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . AATCG . . TG A . G . . . . . . . . . . . C . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G GCT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . GG .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . . . . . . C ATTGAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAATA . . TG A . G . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A GGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . GG .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . TTA . . . . . . . . . ATTA . . . . . . . AATTG . . . . . G . . . . . . . . . . . C . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C GCT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . TG .
blockSeqs : . . . . . TGA . . . . . . . . . . AATCG . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G GCT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . GG .
blockSeqs : . . . . . . . . . . AAT . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : ATGTGATG**************************** A* C********* ATTNGAATCGAA*************** CT******** G* GGG****
originalCons : ATGATNGATCCNATNAACGCTTCCCTCACTNTNANGTCAACATTTGATAGTTTGTGANCNATTGAGGCGAAGNTTGANANTACGCTCAGGAGACATTTTTNTGNATTATAAACGTATGGGCAACGNGGTACNNGGATGAGCAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATANCCCAGTGGTTACCGGAGCGATGNATGGNTCGAAAAGCATGANGCTNTACAAACGAGAACANAGGGTGGTTAAGACGTNCCGATGAAA-GCCAC---TGTGCTG--TNCGTAAA-TGTACCTCAGT------------A----TTTG-------G-TG----TCAN-AATA--C-A-A-AAGTACGT---C-ACG-A-C-G----TACA---GGTC----T-A--CGCGT-TGTATCG-T-GG-GGAA-ATG--TCATAA-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAG-CTGC-------G----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TTCCTAAA-GGT-A----AC--TAGTT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--ATGGTA-TGATT-TTT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------T----A--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-GTG-AA--TGC-----GGAAATGCC--C-------AAC-------A-T-T------GAAT-----ATT--------ATGGGTATT--GC--------T-AA-A--TACGAGAGGAT--AT-TGTACC--G-ATCC-GGGTCAC--------TTTTTTT----AA--ATTT-ATCA--T-----A-TC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--G-CTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACTGGAAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AACAGG--TAAGCAAGGG-ATTT-CC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCGG-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TC-G-G---AC-ACCTTAACCC
finalCons : ATGATNGATCCNATNAACGCTTCCCTCACTNTNANGTCAACATTTGATAGTTTGTGANCNATTGAGGCGAAGNTTGANANTACGCTCAGGAGACATTTTTNTGNATTATAAACGTATGGGCAACGNGGTACNNGGATGAGCAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATANCCCAGTGGTTACCGGAGCGATGNATGGNTCGAAAAGCATGANGCTNTACAAACGAGAACANAGGGTGGTTAAGACGTNCCGATGAAA-GCCAC---TGTGCTG--TNCGTAAA-TGTACCTCAGTATGTGATG----------------------------TCAN-AATA--C-A-A-AAGTACGT---CA-CG-A-C-G----TACA---GGTC----T-A--CGCGT-TGTATCG-T-GG-GGAA-ATG--TCATAA-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAG-CTGC-------G----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TTCCTAAA-GGT-A----AC--TAGTT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--ATGGTA-TGATT-TTT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------T----A--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------CA-GTG-AA--TGC-----GGAAATGCCC---------AACATTNGAATCGAA---------------ATT--------ATGGGTATT--GC--------T-AA-A--TACGAGAGGAT--AT-TGTACC--G-ATCC-GGGTCACT--------TTTTTT----AA--ATTT-ATCA--T-----A-TC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--G-CTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACTG-AAA-GTCTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AACAGG--TAAGCAAGGG-ATTT-CC--C----A-CGT-GGC----A--CGA--TGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCGG-T----------TGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGA-----A-T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CGT------TA-ATTTC-AC-TCGGG----AC-ACCTTAACCC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): CTTGAAATCACAATGTTTAAAGGCATTTAGAATAATGAGTCAATCATTCATAGACAACGACTTGATATAAGTGAAAGATAAAGA
Unaligned ( gi|45 ): ACATTGTGATAATGAAATCGACTCCCAATGCACATATGTCAATTTACAATTAAAGG
Unaligned ( gi|46 ): GTATTCGTCCTATTCAGCGACCCTGCCCCCATGAGCGCCCCCGGGCACTTTCCCA
Unaligned ( gi|48 ): AAAAATCCTGCTTTTAATTTCACTTACTCTTCATCTCGGACT
Unaligned ( gi|51 ): TAGTTTAAAATACGCACTCAAGATGAAAATGAATTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 11 1 22222 1 111 11 1 999999999999999999999999999 1111111 11 111111 111111111 111111111111 222222222222222222222222222222 11111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111 111111111111 1111111111 11111111 2222222222222222222222222222 11111111111111111111111 11111 11111111 2222222222 11111 11111111 1111 111111111111
lowQualScore : 1 1 66 1 1 1 1 1 2 1 1 1 66 1 1 22 5 44444 1 1 1 1 5 1 0 1 0 8 777 9 33 1 4 0 0 333333333333333333333333333 8888888 66 33 5 555 888 55 5 5 999999 888 2 9999 4 66 4 4 4 8 4 888 0 77 3 3 3 2 777777 2 666666666 444 777777777 2 444 8888888 5555 2 999999999999 33 4 2 2 444 5555 33 2 4 2 2 777777 5555 2 2 55555 5555 2 5555 33 0 33 999999999999999999999999999999 33 44444444444444 2 0 66 2 2 77777 2 2 2 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 6666 44 33 2 7777777 2 2 2 33 5555 333 2 333 2 111111111111 33 2 0 2 2222222222 33 2 1 2 33333333 33 444 4 666666 2 2 2 0000000000000000000000000000 2 2 88888888888888888888888 77777777 2 2 33 2 00000 333 33 2 2 1 2 55 2 2 0 1 33 11111111 4 2 33 2 33 2 33 2 0 2 0000000000 33333 33 2 9999999 33 7777777 2 1 2 55 2 2 44444 1 1 22222222 1 4 77777777 3333 1 3 1 22 2 2 1 1 333 1 1 333 22 1 2 22 1 1 8 55 2222 1 5555 1 22 22 7777777777 9999999999999 555 1 1 333 3 3 1 22 3 3 555555 22 44 44 555555555555 1 1 1 1 444444 7777777777 222 55555 22 1 44 3 1 1 55555 222 1 22 22 555555 1 5555 1 1 0 55 2
lowQualScore : . . .. . . . . . . . . . .. . . .. . ..... . . . . . . . . . . ... . .. . . . . ........................... ....... .. .. . ... ... .. . . ...... ... . .... . .. . . . . . ... . .. . . . . ...... . ......... ... ......... . ... ....... .... . ............ .. . . . ... .... .. . . . . ...... .... . . ..... .... . .... .. . .. .............................. .. .............. . . .. . . ..... . . . .................................................................... ...... .... .. .. . ....... . . . .. .... ... . ... . ............ .. . . . .......... .. . . . ........ .. ... . ...... . . . ............................ . . ....................... ........ . . .. . ..... ... .. . . . . .. . . . . .. ........ . . .. . .. . .. . . . .......... ..... .. . ....... .. ....... . . . .. . . ..... . . ........ . . ........ .... . . . .. . . . . ... . . ... .. . . .. . . . .. .... . .... . .. .. .......... ............. ... . . ... . . . .. . . ...... .. .. .. ............ . . . . ...... .......... ... ..... .. . .. . . . ..... ... . .. .. ...... . .... . . . .. .
lowQualScore : 0 0 55 0 0 0 0 0 5 0 0 0 55 0 0 00 5 00000 0 0 0 0 0 0 8 0 2 0 555 2 88 0 2 0 8 000000000000000000000000000 7777777 77 66 7 999 888 11 0 0 888888 888 5 4444 4 11 4 4 4 9 4 555 8 88 3 3 1 9 777777 5 222222222 444 666666666 5 444 1111111 3333 7 555555555555 22 7 4 4 111 0000 33 5 7 4 4 111111 0000 4 4 99999 0000 4 0000 22 1 22 444444444444444444444444444444 44 77777777777777 5 9 33 9 9 11111 9 9 9 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 333333 1111 33 77 4 6666666 4 4 4 99 0000 999 2 777 2 444444444444 11 4 4 5 2222222222 44 5 0 7 66666666 44 999 4 111111 1 1 1 5555555555555555555555555555 0 0 55555555555555555555555 22222222 0 1 11 2 00000 999 11 2 2 8 2 66 8 4 8 4 22 88888888 7 4 22 4 22 4 22 5 9 7 7777777777 77777 22 4 9999999 22 6666666 4 9 2 33 2 0 55555 8 8 99999999 9 0 33333333 4444 8 6 9 66 0 0 9 8 222 8 8 333 55 8 5 55 8 8 7 99 4444 7 4444 7 44 44 6666666666 6666666666666 222 9 9 333 8 6 8 55 6 6 000000 44 88 88 888888888888 7 7 7 7 888888 3333333333 999 88888 33 7 00 5 7 7 66666 999 7 55 44 000000 7 4444 7 7 8 00 2
consensus : ATGATNGATCCNATNAACGCTTCCCTCACTNTNANGTCAACATTTGATAGTTTGTGANCNATTGAGGCGAAGNTTGANANTACGCTCAGGAGACATTTTTNTGNATTATAAACGTATGGGCAACGNGGTACNNGGATGAGCAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATANCCCAGTGGTTACCGGAGCGATGNATGGNTCGAAAAGCATGANGCTNTACAAACGAGAACANAGGGTGGTTAAGACGTNCCGATGAAA-GCCAC---TGTGCTG--TNCGTAAA-TGTACCTCAGT------------AG-------------CGTGATG-T-----CAN-AATA--C-A-A-AAGTACGT---C-ACG-A-C-G----TACA---GGTC----T-A--CGCGT-TGTATCG-T-GG-GGAA-ATG--TCATAA-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAG-CTGC-------G----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TTCCTAAA-GGT-A----AC--TAGTT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--ATGGTA-TGATT-TTT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------T----A--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------C-AGTG-AA--TG-C-----GGAAATGCCC---AA--C-AT-TNGA-A--TTG-AAATTATGGGTATT--GC--------T-AA-ATA--CGAGAGGA-T--AT-TGTA--CCG-ATCC-GGGTCAC--------TTTTTTT----AA--ATTT-ATCA-----T-ATC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--GCTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACT-GAAA-GT--CTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AACAGG--TAAGCAAGGG-A-TTT-CC--C----A-CG----TGGC-A--CG--ATGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCGG----------TTGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGAA-----T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CG--T------TA-AT----TTC-AC-TCGGG--AC-ACCTTAACCC
Reference ( family-96 ) : ATGATNGATCCNATNAACGCTTCCCTCACTNTNANGTCAACATTTGATAGTTTGTGANCNATTGAGGCGAAGNTTGANANTACGCTCAGGAGACATTTTTNTGNATTATAAACGTATGGGCAACGNGGTACNNGGATGAGCAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATANCCCAGTGGTTACCGGAGCGATGNATGGNTCGAAAAGCATGANGCTNTACAAACGAGAACANAGGGTGGTTAAGACGTNCCGATGAAA-GCCAC---TGTGCTG--TNCGTAAA-TGTACCTCAGT------------A--------------TGTGATG-T-----CAN-AATA--C-A-A-AAGTACGT---C-ACG-A-C-G----TACA---GGTC----T-A--CGCGT-TGTATCG-T-GG-GGAA-ATG--TCATAA-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAG-CTGC-------G----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TTCCTAAA-GGT-A----AC--TAGTT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--ATGGTA-TGATT-TTT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------T----A--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------C-AGTG-AA--TG-C-----GGAAATGCCC---AA--C-AT-TNGA-A--TCG-AAATTATGGGTATT--GC--------T-AA-ATA--CGAGAGGA-T--AT-TGTA--CCG-ATCC-GGGTCAC--------TTTTTTT----AA--ATTT-ATCA-----T-ATC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--GCTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACT-GAAA-GT--CTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AACAGG--TAAGCAAGGG-A-TTT-CC--C----A-CG----TGGC-A--CG--ATGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCGG----------TTGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGAA-----T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CG--T------TA-AT----TTC-AC-TCGGG--AC-ACCTTAACCC
gi|1 : ATGATTGATCCCATCAACGCTTCCCTTATTGTAAGATCAACATTTAATAGTTTGTGATCTATTGAGGCCAAGATTGATAATACGCTCAGGAGACATTTTTG-GCATTATAAACGTATGGGCAACGGGATACAGGGATGAACAAGAATTAGCAGAAAACGATGGTATGTAATAT----GTGGTTACCGGAGCGATGGATAGTTCAAAAAGCATGAGACTCTACAAACGAGTGCACATGGTGGTTACGACGTGCCGATGAAA-GCCAC---TGGGCTG--TTTTTAAA-TGTACCTAAGT------------A--------------CTTGGTA-T-----CAT-AATA--C-A-A-AAGTACGT---C--CG-AAC-A----CACA---GTTA----T-A--CGCAT-TGTATAG-T-GGTGGAA-ACG--TCATAA-TAT-T-TCA-ACGTTA-TTA------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------CGT----CCAAG-TCGC-------A----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATG----ATTC-T-TCG-T-TAA-T---T--T----TT-CC-TTGATTCT-----ATAT----AA-G----TCTCATG--TTTCT--AA-----------A-------TA---------TAGCGCTCATT--TCA--------------ATATT-TTTAATTA--TCACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCGCC------------CG-----------------A-------------T-----T-T--------------AAAATA------CAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-ATT-CA-AGTCTTT----A---ATGAC-GATA---TTTTCA-TTCGA------------CTA--AGGCATG-TTCCTAAT-GGT-A----AA--TAATT--GC-AGATTAAAGATT-TTAACA------C-GG--ACGGTA-TATTC-TTT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------T----A--------T---TA-T-TT-----------------------TG--------C-AGTG-AA--TG-C-----GGA---------------------GA-A--TTG-AATTGATGGGTATC--GC--------T-AA-ATA--CGAGAGAA-T--AT-AGTA--CCG-ATCC-GGGTAATTTTTGTTGTTTTCTT----CA--ATTT-AATA-----T-ATC--TAT-------AT-CATCACATGA-AGCT--CAA-ATTGCAA-ATTATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--ACTTGA-ACA-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACTAAAAA-GT--TTATCGCA--A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTGTTTG---ATGATA--T-AACAGG--TTGG-AAGGA-A-TTT-CC--C----A-TG----TGGC-A--CG--ATGG----------TTGTT-------------TATA---C-A-CTG---AC-AAG-CG-G--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGC--A-GCAG----------TTGGAAG-A-A-GTT-TA------CA----------TTAA---TTTGAA-----T--A-T--GCTG-T-T-A-----AT---AC-T-TG--C------TG-TT----TTC-AC-TC-GG--AC-ACCTTAACCC
gi|10 : TACA-TA-------TCGATTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-GAAA---ATTTCT-TTCGA------------CCA--AGGCATA-TT-CTGAA-GGTAA----AT--TAGTT--AC-AGATTAAAGATTGTTG-TA------C-GG--ATGGTA-TGAAT-TTT------T-GC-C-TCCTTTACA----------T----A--------T---TA-G-TT-----------------------GA--------C-AGTG-AA--TG-C-----AGAAATACCC---AA--C-CT-TACA-A--TTG-ATATTATGGATATT--GC--------T-AA-ATA--CAAGATGA-T--AT-TGTA--CCG-A-CC-AGGTCA---------TTTTTTA----AA--ATTT-ATAA-----T-ATC--TGC-------AT-CAACACTTTG-AGCC--CAA-AATGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTT-AAG--AATTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAT-AGCT-GTAA-GT--CTAGCGGAT----AAATACACTCT-A---CGT-CA-CTTGTATG---ATGACGTTT-ATCAGG--TAAGCAAGGA-T-TTT-CC--CA---A-TG----TGGC-A--CG--ATGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TGT-TT-AATAAGA------TA--TGC--G-GT-G----------TGGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGGA-----T--A-C--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CG--T------TA-AT----TTC-AC-TCAGA--AC-ACCTTAACTC
gi|11 : GTACGT---TGACG-G-C-GGCATTGCA---GGTC----T-A--CGTGT-AACATCG-T-GG-GGAA-A-GATTCATCA-AAT-T-GTA-TCGTTG-TTT------ACTAACA---------G---TAGACTCC--ATTCAC---G-------TGT----TCAAG-ATGT-------A----TAT--GTGTATAATATGTTT-GTC-AA---GTG-----TTA-TGTTG-T-TAA-G---T--T----T--CT-GTGGTGAT-----AT-T----AA-TATTTTTTTTTG--TTTTT--ATATCTATTGTGGA-------TA---------TAATAAAAACCAATCATTATTATTATTATCATATTACTTAATTAA-TTACATTG-TTACTTTTG-----ACAAT-TTATTCC------------CA-----------------AATGTGCATTACTAT-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GTTAAT-CATG--TATATA-TA-------TCGACTTGCGTT-CAGAG--TGT----A---ATGAC-GATA---TTTTCTATTCGA------------TCA--ATGTATATTTCCTAAA-TGT-A----AC--TCCTTTGGCAAGTTTAAAGATT-TTGACA--------GGTTATGGTG--GGTT-TTT------T-GC-C-TTGTTTAGC----------A----A--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------C-AATG-AA--TA-TA----GGAAACACTC---AA--T-AT-TTGA-c
gi|12 : ---ATGAC-GATA---TTTTCT-TTCGG------------CTA--ATTCATA-TTCCCAAC-GGT-A----AG--TAGTT--GC-AGATTTAAGATT-TTGACA------C-GA--ATGGTA-TAATG-TTT------T-GC-C-TCCTTT--------------------------------------------------------------G--------C-AGTG-AA--TA-T-----GGAAATGTCC---AA--C-AT-TTGC-A--CTG-AAATCATGGGTATT--GC--------TTAATATA--CCAAGGGA-T--AT-TATA--CTG-AACC-GGGTAAC--------ATTTTC------A--ATTT-ATCA-----T-AAC--GAT-------AT-CGATACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-TTA-ATT--ACCTGA-ACC-G-TG-----AT-A--ATAAAC-AACT-GAAA-GT--CTAGCGGAT-A-AAAATA-TCTCT-A---CGT-CA-CTTGTATT---ATGATG--T-AATAGG--TAAGCAAAGG-A-TTT-TC--CA---A-CGTGACTGAC-A--CT--GTGT----------TTCTT-------------AATA---C-A-TTG---AA-AAG-CG-C--ATT-TC-AGTCAAA------TA--TGC--G-ACGC----------TTTGAAG-A-A-TTT-CA------CT----------TTAA---TTTGAA-----C--A-T--GATG-T-T-A-----TT---AC-T-TG--A------TA-AT----TTC-AC-TCGTG--AC-ACCATAACCta
gi|13 : tt----TGT--GTGTA-AATCTGTTA-GTC-AA---GTG----ATTC-T-TTT-T-TA--G---C--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATGT----AA-G----TCTCCTG--TT------------------A-------AA---------TAGTGTGCATT--ACA--------------GAAAT-CTTGAT-A--TAACATTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GTCAA------------CA-----------------A-------------T-----T-TGCTTATAGCCATTTAGAATA------AAGAAA--TTCAAT-CGTG--TGTACA-TA-------TCGACTTG-GCA-CA-GG----TGAAAA---ATAAT-GAAA---TTTTCT-TTCGA------------TCA--ATGCATA-TTCCTAAA-GAT-------------TT--G---------AAATT-TTGACACAAGGCC-GG--ATGG-A-TTTTT-TTTTTAAAAT-GCTT-TCGTTTAGA----------A----A--------A---GA-T-TT-----------------------GG--------T-AGTG-AA--TG-TG----GGAAATACCCATTAA--C-AT-TTGA-A--TCA-AAATGATGAAAATT--GC--------T-AA-ATA--CGAGAGCA-T--AT-GATA--CCG-GTGC-TGATCAC----------GTTCT----AA--ATTC-ATCA------------TGT-------AT-CGACATGTCA-AACC--CAA-ACTGCAA-ATGAGTGG-----AAT-ACA-T
gi|14 : ----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AA---ATC----ATTT-T-TTA-T-TAA-G---A--T----TC-CT-TTGATAAT-----ACAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGCATT--TTG--------------ATA----------------CACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GACCC------------CA-----------------A-------------TGCGCAT-T--------------GTAATAATTATTTAGAA----------TGTG--TACAGA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----G---GTAAC-GATA---TTTTCT-C-CGA------------TCA--AGGCATA-TTCGTAAA-GGT-A----AT--GAATT--GC-AGATTAAAGATT-TTGACA------C-GG--TTGGCG-TGGTTCTTT------T-GC-C-TCGTTTAAA----------T----A--------T---TA-T-TT-----------------------GA--------C-AATG-AA--TG-C-----GGACATGCTT---AA--C-AT-TA--------G-AAATTATGGTTATT--GCTACATGTGT-AA-ATA--CAAGAGGA-T--AT-TGTA--CCG-ATCC-GGGTCG------------TTTT----CA--ATTT-ATCA-----T-ATT--TAT-------AC-CAACACATCA-ATCC--CAA-ACTCCAA-ATGATATGACTAAAGT-GCA-TT--AAT----TTGA-Accttcacctgtgccgatataa
gi|15 : ACA------CTGG--ATAGTA-GGATG-ATT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------A----A--------AATTTG-TATT-----------------------GG--------CAAGTG-AA--TGCC-----GAAAATACC-----A--T-GT-TTGA-AATTTGCAAATGATGAG------GG--------T-AA-ATG--CTAAGGGATT--AT-CGTA--ACG-ATCC-AGGCC-C--------CCTTTTC----AA--ATTC-AGCA-----TAATA--CAT-------AC-CGACACACAA-AGCCAAAAA-ACTGCAA---GA-------------ACA-TTG-ACT--G---------------------------AAA--AATT-GGAA-ATGGCTAGC-GAT-A-AAAATA-GCTCT-A---CGT-CA-CTGGTATG---A------------------AAGC-AGGG-A-TTT-CC--C----A-CC----TGGCAA--TG--ATG--------------------------------A---C-G-CCGTAAAC-AAAGCG-A--TGT-TG-AGGAAAA------TA--TGCAAA-ACG------------TGGAAATA-A-TTT-TA------AT----------TTAA---TCTGAA-----T--A-T--GCTG-TATAA-----TT---AT-T-TGTCT------CA-ATATAATCA-AC-TCGGG--A
gi|16 : tgaTGATG-TATTTGCAG-AATGACC-A-A-ACGAACGT---C-ACG-A-C-T----TACA---GGTT----T-A--CGCGT-TGTATCG-TTGA-GAAA-ATG--TCATA----T-T-TTA-TCATTC-TTA------ACTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TCAAA-CTGT-------A----TAT--GTGTA-CATCTGTTT-GCC-AA---ATG----ATTC-T-TTA-T-CAA-G---T--T----AA-CT-TTAATAAG-----ATAT----A-------TATCCTG--TTTTT--AT-----------A-------TATACATG---TAGTGTGGAAT--TTA--------------ATTTG-CTTAATCA--TTAAATGG-TGATATT-GATTCAA-AAT-T-GCCCC------------CAATGCGCAGTGAT-----A-------------T-----T-T--------------ACAATC------TAGAAA--GCCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCGACGTG-GTT--A-GGCGTTT----C---GTGAC-GATA---TTTTCT-TTCGA------------GCG--AGgttcttac
gi|17 : ctaaaagctgaTTAGA----------T----A--------A---AA-T-CT-----------------------TG--------T-AGGG-GA--TG-CATGTTGGAAATACCG---AA--C--T-TTGA-T--TCG-TTATCATGGAAATA--GC--------T-AA-ATG--CAATAGGG-T--GT-TGTA--CCG-TTCT-GGATCA------------TTTT----AA--ATTT-GTCT-----T-ATCAATAT-------AT-CGAC---------CC--CAA-ACTGTAA-ATGATCAG-----AGC-ACA-CC--------CTTCA-GTT-G-TGCCAATGT-A--GTATAT-AACT-AGAA-GT--CTTGCGGA----AAACTA-GCTC-----------A-CTTGCATG---ATTACG--T-TATATT--GAAGCGAGGG-T-TTT-CC--A----A-AG----TGGC-T--CA--ATGT----------TT-----------------ATG---T-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTG-T--AATAAAA------TA--TGC--G-ACAC----------TTTGAAG-A-A-TTT-TT------CT----------TTGA---ATTCAA-----T--A-T--GGTG-T-C-A-----TC---AT-T-atacttagttggaaaatatttt
gi|18 : TG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTTCCA--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------AAATT-CTTAATCA--TTGCACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CA-----------------A-------------TGCGCAT-T--------------GGAATT------TAGAA----------TGTG--TATACA-TA-------TCGACTTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAT-GATA---TTTTCT-TTCGAANNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN-NNNNNNNN-NNN-N----NN--NNNNN--NN-NGATTAAAGATA-TGGACA------A-GG--CTGGTA-TGATT-GTT------T-GT-C-TCGTTAAGA----------T----A--------T---TA-T-TT-----------------------GG--------C-AGTG-GA--TG-C-----AGAAATGCCC---AA--C-AT-TAGA-A--TTT-AAATCATGGGTATT--GC--------T-AA-ATA--TGAGAGGA-T--AT-TGTA--CTG-tatatgcgacactttgaagaat
gi|19 : A-TG-------TCTACTTG-GTA-CA-GGCGAAC----G---ATGAC-GATAATATTTTCT-TTCGA------------TCA--AGGCATA-TTCTTAAA-AGT-A----AC--TAGAT--GC-AAATTTAAGATT-TTAGCA------G-GG--AATGTA-GGATT-CCC------T-CC-C-TTGTGTATA----------T----T--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------C-AGTG-AA--TG-T-----AAAAATGCCC---AA--T-AT-TGGA-A--TCG-GCATTATGGAAATT--GT--------T-AA-ATA--CAAGAGGG-T--AT-TGCA--
gi|19 : agG-----AGG-GTA-TTGCAATC-ACATGT-GCC-G-TT-----GC-G--ATAAAC-AACTAGAAA-G---CTTTCGGAT-A-AGAA-A-ACTCA-A---TGT-CG-TTTGTATG---ATGACG--T-AATTGT--TAA-----AG-A-TTT-CC--A----A-CG----TGGT-A--CG--ATGT----------TTGCT-------------atcacatgtgccgttgcgataaacaactagaaagctttcggataagaaaactcaatgtcgtttgtatgatgacgtaattgttaaagatttccaacgtggtacgatgtttgctgacgaattcatctctcaataaa
gi|2 : agatgtctacttggtacaggcgaacgatgacgataatattttctttcgatcaaggcatattcttaaaagtaactagatgcaaatttaagattttagcagggaatgtaggattccctcccttgtgtatattatatttggcagtgaatgtaaaaatgcccaatattggaatcggcattatggaaattgttaaatacaaATGAAATGCCACAATTG-GCTGAGTATGTAAACTGGACCTCAGT------------GGCACTTCGCAGTAGCGTGACGAT-----CAGCAATA--CTA-ATAAGTACGTGCTC-ACGTA-C-A----TACA---G-TCAAAATGA--CGCGTGTGTATTG-T-GG-GGAAGATA--TAAGAAATAT-TATTAATCGTTAATTT------ACTA-CA---------A---T------TT-AT-CAAATAG-------TGTACGCCCAAGGCTGC-------G----TAT--GAGTATAATCTGTTT-GTC-AA---AT------TTA-T-TTGGT-TAATG---TAAT----TTACT-TTGATAATGCCATATATTAAAAA-G--------------------AT-----------G--------A---------TAGTGTGAATT--TAA--------------ATATT-CTTAATTACCTAAGACTGATGCGCTT-G-----A-AAT-C-GCCCC------------CATTGATCGCGCATTGTTAA-------------T-----T-T--------------AGAATACT----TAGAAAAGGCAAATTCGTG--TATAAACTACCCACGCTCGTCTTG-GTTTCA-AGCCTTT----A---A-GAT-GATT---ACTTCT-TCAGA------------CGATTAAGCATA-TTCCGAAGTGGT-AGATTACAGTAGTT--G--AGATTAAAGATT-TTGACAG-----C-GG--AATGTAATGATTGTTT------T-GC-CATCGTTTAGA----------T----A--------T---TAAT-TT-----------------------GGGTTCTGGGC-AGTG-GAGTTG-C-----GGAAATGCCA---AATTC-GT--AGA-A--TTG-AAATTATGGGTATTTGGC--------T-AA-A-ACTCATGCAGA-TTGAT-TGTATCCTG-A-GC-GGGTCAC--------TTTTTC------A--ATTT-ATCATTCATT-ATC--TACCGGTATAAT-CAACACATCA-AGCC----A-ACTGCAA-ATGATTTG-----AATGGCA-TTATAAG--GCTTTA-ACCAG-TG-----GT-----T---C-AA---------T--TTAGCGGATGA-AAAATA-GCTAT-ATGGCGT-CAGCTGGTATGTACATGACG--T-AA---------------A-A-TTT-CCA-C----C-CG----TGTC-A--C-----GT----------ATGTT-------------GA-----------G---AC-AAAGCGTAATTTT-TT-AGTAAAA------TAGTTGTCGG-GCGGT---------TTGGGAT-A-A-TTTGTATTTGATCT----------TTAA---TTTGAT-----T--A-TG-GCT--T-T-A-----TT---AC---CG--T------TATAT----TTT-ACTTCGGGA-ACAACCTTAACCgacgaattcatctctcaataaa
gi|20 : TTTTT----AATTCTTT-ATTA-----T--TT--TAC--------T-C---ACATGA-A--T--CAATATTGCAAGATTATTTG-----AGT-GCA-TTG-AAT--ACT-GATATC-A--------GT-T--GTATAC-AACT-AAAAAGT--TTATCG--C-A-AAAATA-ACTC--A---CGT-CA-CTTGTTTG---ATGA------AATAGG--TTG--AAAGA-A-TTT-CC--A----T-GG----TGCC-A--CG--ATGG----------TTGTT-------------TATAATAC-A-CTG---AC-AA--CG-G--TT-----AGTAAAA-------A--TAC--A----------------CGGAAT-A-G-TTT--A------C--------------A---TTT-AA-----T--A-A--AC-G-T-A-A-----TT---AC-TATG--C------TG--T----TTC-AC-TCGA------ACCTTAACC
gi|21 : ataTT------T-GT-C-TCGTTTAGA----------CTCTCA--------A---TA-T-TT-----------------------GG--------C-AGTG-AA--TG-T-----GGAAATACCC---AA--T-AT-TTAACA--TTG-AAATTATGGATATT--CC--------TAAA-ATA---GAGGGGA-T--A--TGTA--CCG-ATTCAAGGTCGC--------TTTTGAC----AA--AATT-ATCAAC---T-ATC--GAT-------AT-CGACACATCA-AG----CAA-ACTGGTA-ATTATATG-----G---GCA-TTA-GATTCACCTG---CCAA-TG-----AC-ATTTTAAACAAACT-G--A-GT--CTAGCATAT-G-ATAATA-GCTCTAA---CCTGCG-CTTGTac
gi|22 : -AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCA-CTG-AAT--GTTTGA-ACC-G-TG-----GA-A--ATAAAC-AACT-GAAA-GT--CTAGCGGAT-A-AAAATA-ACTTT-A---CTT-CA-CTGGTATT---ATGACA--T-AACGGG--TAAGCATGGC-A-TTT-CCA-C----G-CA----TGAC-A--CG--ATGT----------TTGTT-------------C----------TT---------A-CG-A--TTC-TT-AGTAAAA------TA--TGC--G-GCAG----------TTGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGAT-----T--G-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CG--T------TA-AT----TTC-AC-TTGGG--AC-ACCTTAACCg
gi|23 : -AATA--C-G-A-AAGTACGT---C-ATG-A-C-G----TACA---CGTC----T-A--CGTNN-NNNNNNN-N-NN-NNNN-NNN--NNNNNN-NNN-N-NNN-NNNNNN-NTTCACAACATGA-CA---------ACGCT------T--AA-AAA---G-------TGT----TCAAA-CTGT-------A----TAT--GTGTA-AATTTGTTT-GCC-AA---ATG----ATTG-T-TTG-T-TTA-G---T--T----TC-CT-TTGACAAT-----ATAC----AA-G----CATCTTG--TATTT--AT-----------ATACACTGTA---------TAGTGTGAAAT--ATA--------------ATATC-ATTAACCA--TTATATT
gi|24 : atgcacttcgcaTGATTTG-----AGT-GCA-AT--AATA-ACCTGA-ACC-G-TA-----GT-A--ATAAAC-AATT-GAAT-GA--CTAGCGGAT-A-AACATA-ACACT-A---CGC-CA-CTTGTATT---ATGACG--T-AAATGG--GAAGCAATGG-A-TTT-CC--CA---A-CG----TGGA-A--CG--ATGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---ACAAAA-CG-A--GTT-TT-ACTAAAA------CG--TGC--G-ACGT----------TTGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTCAA-----T--T-T--TCTA-T-T-A-----TA---AC-T-TG--T------TA-AT----TTC-AC-ACGAG--AC-ACCTCAAa
gi|25 : AAAC-AACT-GAAT-GT--CTAGCGGAT-A-AAAATA-GTTCT-A---CAT-CA-CTTGTATG---ATGACG--T-AGTAGG--TAAGCAGGGG-A-TTT-CC--C----CTCG----TGGC-A--CA--ATGC----------TAGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TTTAATAAAA------TA--TGC--G-ATAC----------TTGGAAG-A-A-TTT-CA------CT----------TTAA---TCTGAA-----T--A-G--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-TG--T------TA-AT----TTC-AC-TCAGG--AC-ACCTTAACCC
gi|26 : -A---TGT-CA-CCTGTATG---ATGAAG--A-AATAAT--TCAGCAAAGG-A-TTT-CC--C------CA----TG-T-A--CA--ATGTACAGCAATGGTTGTTACTGCCACTTAAATATG---A-A-TTG---AC-AAA-CA-A--TTT-CT-AACAAAA------TA--TGT--ATGC------------TTGAAAG-A-A--TT-TA------CTTGGCACAGCATTAATGCTTTCAA-----T--A-T--GCTA-T-T-ACTAGCCT---AC-T-TG--T------T--AT----TTT-AC-Tc
gi|27 : g-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCCAAT-CCTG--TATGC--TA-------TCGACTTC-GTT-CA-GGC-------------------------TTTTCT-TTAGA------------TCA--AAATATA-TTCTTAAA-GGT-A----AT--TACTT--GC---AT-----ATT-T---CA----------------TA-T--TT-TCT------T-GC-C-TCATTTAGA----------T----G--------A---GA-T-TT-----------------------GG--------T-A-TG-A
gi|27 : -ATGATTTG-----AGT-GCA-AT--AATA-ACCTGA-ACC-G-TA-----GT-A--ATAAAC-AATT-Gtttgagtgcaataataacctgaaccgtagtaataaacaattg
gi|28 : tttagaatatagaaagccaatcctgtatgctatcgacttcgttcaggcttttctttagatcaaaatatattcttaaaggtaattacttgcatatttcatattttcttgcctcatttagatgagatttggtACG--T-AATAGG--TAAGCAAGGA-ATTTT-CC--C----T-CGT---TGAC-A--CGACATGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-ATG---GC-AAA--G-A--TTT-TTGAGTCAAA------CA--TGC--G-ACCGTAGATAGCTCTTTGAAG-A-A-TGT-AA------CT----------TTAA---TTTGAA-----T--A-T--TCTGTT-T-A-----TG---A--T-CT--T------GG-ATC---TTA-AC-CCGGG--AC-
gi|29 : ATA-AATTC-A---TGT-CA--TGGTATG---ATGACG--TTAACATG--TAAGCAAGAA-A-TTT-CC--CC---A-AG----TCGC-A--TG--ATGT----------TTGTT-------------TATA---C-A-TTG---AC-AAA-CG-A--TTT-TT-AGCACAA------TA--TGC--G-GCGG----------TTGGAAA-A-A-AAT-TA------CC----------TTAA---GTTGGA-----T--G-T--GCTG-T-T-A-----TC---AT-A-CG--T------TT-AT----TTA-AC-ttcctacct
gi|3 : ----T-A--CGCCT-TGTACCAAT-GT-GAAA-ATA--TAATGA-TAG-T-TTA-CAGTCA-TTT------ACTA-CA---------A---T------T--AG-CAA---G-------TAT----CCATG-CTGC-------A----TAC--GTATA-AATTTGTTT-GTA-AA---A------ATTT-T-TTC-TATAA-G---A--T----TT-AT-TTGATAAT-----ACAT----AA-G----TCCCCTG--TTCCT--AT-----------A-------TACATTATGTATAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACATT-G-----A-AAT-C-GCCCTCAATGCGCATTGCA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAGA--CTCAA---GTGAATATAAA-TG-------TAGACTGG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC-AATA---TTTTCT-TTCGT------------CCA--AGGTATA-TTCCAAAA-GGT----------TAGTT--GC-AGATTAAAAATT-TTGACA------C-GG--GTGGCA-T-ATT-TTT------T-TT-C-TAGTTTAAA----------T----A--------T---TA-T-TT-----------------------GG--------C-AGTA-TA--TG-C-----GGAAATCCCC---AA--C-AT-TAGA-A--TTG-AAAGTTTGGGTGTT--GC--------T-AA-CTT--TGAGAGGA-------------------------TCA---------TTTTTTA----AA--ATTT-ATCA-----T-ATC--TAT-------AT-TAACACATCA-AGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTT-----AGT-GCA-TTA-AAG--GCTTGA-ACC-GAAG-----GT-A--ATAAAT-AACT-GAAA-AT--GTAGCAGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTGATATG---ATGTCG--T-AACATT--TAAGCAAGGA-A-TTTCCC--C----A-CT----TGGC-A--CG--ATAT----------CTGTT-------------TATG---A-A-TTG---AC-AAA-CA-G--TCT-TT-AGTAAAA------TA--AGC--G-GCGG----------TTGGAAT-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGAT-----T--A-T--ACTT-T-C-A-----TT---AT-T-CG--T------TA-AT----TTC-CC-TCGGG--AC-AC
gi|30 : A-TAT-T-TTA-TCGTTA-TTT------GCTA-AA---------A---T------T--AT-CAA---GACTTTAGTGT----TCAAG-CTGT-------G----TAT--GCGTA-AATCTGTTT-GTG-AA---AAG----TTTCTT-TTGTT-TTG-G---T--T----TT-CT-TTAATTAT-----ATAT----TA-C----TCTCCTG--TATCT--AT-----------C-------TA---------T
gi|31 : tcCAA-ATGACTTG-----ATT-GCA-TTA-ATC--AACTGT-GCC-G-TG-----GA-G--AAAAAC-AATC-GATA-AT--CTAGTGAAT-A-AAA-TA-GTTCT-A---TGT-CA-CTTTTACG---ATGATG--T-AATAGA--TAATTAAGGT-A-TTT-CCCGC----A-CG----CGGT-A--CG--ATGT----------TTGTT-------------Tccatctacatgtatgtaatggaa
gi|32 : cctTC-CC--C----A--A----TGGC-AATCG--ATGC----------CTGTG-------------TATAT--C-A-TT----AC-AAA-CG-A--TTTGTT-AATAAAA------TA--TGT--C-ATGG----------TTGGAAT-ATA-TTT-TG------CT----------TT------TTGAAATGTAC--A-T--GCAG-T-T-AA----TT---AC-T-TG--T------TA-TG----TTC-AC-TTTGG--AC-ACCTTTAC
gi|33 : tcACAGAGCGTAGGCAAGCCGCACAGAGGAAA-TTCAC---TGTACTA--TTCATAAA-TGTGTCTCAATGTATTTCACACTA--------------TTTGATT-T-----CTG-AATA--C-A-A-AAGTACTT---C-ACG-A-C-G----TACG---GGTT----T-A--CAAGT-TGTATCT-T-GG-GGAG-ATt
gi|34 : TT------ATTA-GA---------A---T------TTAAT-GAT---A-------TAA----TTAAG-CTCT-------A----TATAGGCGTA-AATCTGATT-GTT-AG---ATG----ATTC-T-CGT-T-TCA-G---TATT----TT-TT-TTTAAACT-----ATAT----AA-G----TCTTCTA--TTTTT--AT-----------A-------TA---------CAGTGTGAATT--AAG--------------ATAAT-CTTAAT
gi|35 : -TCATCA-TTT------ATTA-CC---------A---T------T--AT-CAA---G-------TGT----TGAA--CTGTATACATTG----TAT--GTGTA-AATCTGTTT-GTC-AATACATGTGAAATTT-T-TTT-T-T-C-GTCTT--C----TT-CT-TTGAT---------TAT----AATG----TCTGATG--CTTTT--
gi|36 : caaaaaatcAGT------------AGT------------TG-GATG-T-----CAC-AATAA-C-AGA-AAATATGT---C-ACA-A-CCGC---TACATGGGGTC----T-ATACGCAT-TGTCTCG-T-GG-GAAA-ATG--TCATA--TATGT-TTA-TCGTTA--TT------ACTA-CATGTAG----A---T------C--TT-CAC---G-------TGT----TCAA
gi|37 : t-------------TACA---C-AGTTG---AC-TAA-TG-A--TTTATT-AGAATAA------TA--TAC--G-ACAGC---------TTGGAGG-A-A-ATA-TA------CT----------TCAA---CTTGAA-----T--A-T--GCTGTT-T-A-----TTTAAAT-A-TA--T------CA-AT----TTC-AC-TC
gi|38 : gatgatgtggacagttac--ATTT-ATCG-----T-AAT--TA--------AT--AACACATTACAGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AGT-GCAGCTG-AAT--GTTTGA-AAC-G-AGA----GCGA--AT--AC-AACT--AGA-GT--
gi|39 : actgttcAC-AACT-GAAA-GT--CTAGAGGAT-A-AAAATA-ACTGT-A---CAT-CA-CTGGTATG---ATGACG--T-AACGGG--TAAGCAAGGA-A-TTTCCC--C----A-CG----TGGC-T--TG--ATGT----------TTGTtatgtcagagaagaaga
gi|4 : TGA-TAT-T-TTA-TCTTCA-TTT------GCTA-CA---------A---T------T--AT-CAA---G-------TAT----TAATG-CTGC-------A----TAC--GTATA-AATCAGTTT-TTG-AA---ATT----ATT--T-TTG-A-TAA-T---A--T----TC-CA-TTGATAAT-----ACAT----AA-G----TATCCTG--TTCCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACATT-G-----A-AAT-C-GCCCCCAATGCGCATTGCA-----------------A-------------T-----T-T--------------AGAAAA------TAGAGA--CTCAAG-CGGA--TATAAA-TG-------TAGAATGG-GTT-CA-CGCCTTT----A---ATGAC-AATG---TTTTCT-TTCGT------------CCA--AGGTATA-TTCC-AAA-GGT----------TAGTT--GC-AGGTAAAAGATT-TTGGCA------T-GG--ATGGTA-TCATT-TTT------TCCC-C-TAGCTTTGA----------C----ACGGATGGCA---TA-T-TTTTTTCCTAGTTTAAATATTATTTGG--------C-AGTG-AA--TG-C-----GGAAATGCCC---AA--C-AT-AAGA-A--TTG-AAAGTTTGGGTGTT--GT--------T-AA-CTT--TGAGAGGA-T--AT-TACA--CCG-ATCT-GGGTCAT--------TTTTTTTTTTAAA--ATTC-ATCA-----T-ATC--TAT-------AT-TACCACATCA-AGCC--GAA-ACTGCAA-ATGATTTT-----AGT-GCA-TTA-GAA--GCTTGA-ACC-GAAG-----GT-A--ATATAT-AACT-GAAA-AT--ATAGCGGAT-A-AAAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTGATTTG---ATGTCG--T-AACATT--TAAGCAAGGA-A-TTTCCC--C----A-CG----TGGC-A--CG--ATGT----------CTGTT-------------AATA---A-A-TTG---AC-AAA-CA-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--AGC--G-GCAG----------TTGGAAT-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGAT-----T--A-T--
gi|40 : -TAT-C-TTA-TCATTA-TTC------ACTA-CT---------A---T------A--AT-CAA---A-------TGT----TTAAG-CTAT-------G----TAT--ATGAA-AATCTTTTTTGTC-AA---AAG----ATTaatttca
gi|42 : ttggaaaaaaacctA------TA--TGC--G-ACAC----------TTTGAAG-A-A-TTT-TC------CT----------TTGA---ATTCAA-----T--A-T--GGTG-T-C-A-----TC---AT-------T------TA-TT----TTT-AC-CTACG--AC-ACCTTA
gi|43 : ----------TTGGAA--A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGAA-----T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AT-T-TG--T------TA-AT----TTT-AC-TCAGA--AC-ATCTTAACtcatcac
gi|44 : A-CG-C--TTC-TT-AGTAAAA------T---TGC--G--CAG----------T-GGAAG-A-AATTT-TA------CT----------TTAA---TTTGAT-----T--GTT--GCTG-T-T-A-----
gi|47 : ATA---TTTACT-TCCGA------------TCA--AGGCAGA-TTCTAAAA-GGA-A----CC--TACTT--GC-AGATT
gi|49 : -T-A-----TT---AT-T-CG--T------TA-AT----TTC-AC-TTGGG--AC-ACCTTAACCCt
gi|5 : T-T-TTA-TCGTTA-TTT------ACTA-CAGCAGACTCTA---T------T--CC-C-----G-------TGT----TTAAG-CTGT-------T----TAT--GTGTA-AATCAGTTT-GTC-AG---ATT----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TTGATAAT-----ACA------A-A----TATCCTC--TTTTT--AT-----------A-------CA---------TAGTGTGAATT--AAA--------------TTATT-CTTA----------------GACCTT-G-----A-AAT-T-GCCTC------------CAATGCACATTGCT-----A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--GCGAGT-CGTG--TGTATA-TA-------TCGACTTG-ATT-CA-AGTGTTT----A---ATGAC-GATA---TTTCCT-TTCAA------------CCA--AGGTATA-TTTCTAAC-GGA-A----AC--TAGCA--GC-AGATTTAAAATT-TTGACG------C-GG--ATGGTA-GAATT-TTT------T-GC-C-ATGTTTAGAGTACTTTAGGT----G--------A---TC-T-TT-----------------------GG--------T-AGCC-AA--TG-T-----GGAAATGCCC---AA--C-AT-TTGA-A--TTG-AAATTATGGGTATT--GA--------T-CA-ATA--CGAGAGGA-T--AT-TGTG--TCG-ATCC-GGGCCAC--------TTTTTC------A--ATTT-ATCA-----C-ATC--TAT-------AT-CGACACATCA-AGCC--TAA-ACTGCAA-ATGATATG-----AGT-GCA-TTA-ATC--GCCTG---C-----------------ATAAAC-AATT-GAAA-GT--CTAGCAGAT-A-AAAATA-GCTTT-A---CGT-CA-CATGTATG---ATGACG--T-AATAGG--TAAACAAGGG-A-TTTCCC--C----A-CG----TGGC-A--CG--ATGT----------TTGGT---------------TA---C-A-TTG---AT-AAA-TA-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TGT--G-CCGC----------TTGGAAG-A-A-TTT-TA------CT----------TTAA---TTTGAA-----TAAA-TAGGCTG-T-T-A------T---AC-T-TG--T------TT-AT----TTA-AC-TCcag
gi|50 : g-----TT---AC-T-TG--T------TA-AT----TTC-AC-TCGGGACAC-ACCTTAGCCtgacagcatt
gi|52 : TT-TCT------T-GC-C-TCATTTAGA----------T----G--------A---GA-T-TT-----------------------GG--------T-Agc
gi|53 : catatAGAACACAGGGTGGTTAAGGCGTCCTGATGAAA-G
gi|6 : TA-TTT-----------CA---------A---T------T--AT-CAT---A-------TGT----GCAAG-CTGCATAT---G----CAT--GTGTA-GATCTGTTT-GTCCAA---ATG----ATTC-T-TTG-T-TAA-G---T--T----TT-CT-TAGATAAT-----ATAT----AA-G----TCTCCTG--TTTCT--AT-----------A-------TA---------TAGTGTGAATT--TCA--------------ATATT-CTTAATCA--TTACACTG-TGACCTT-G-----A-AATGC-GCATTG-----------CA-----------------A-------------TG----T-T--------------AGAATA------TAGAAA--CTCAAT-CGTG--TATACA-TA-------TCAAATTG-GTT-CA-AGCCTTT----A---ATGAC----A---TTTTCT-T-CGA------------CCA--AAGCATA-TTTCTAAA-GAT-A----AT--TAGTT--GC-AGATTAAATATT-TTGACA------C-GG--ATAGCA-TGATT-TGT------T-GC-C-TCGTTTAGA----------T----A--------T---TA-T-TT-----------------------GG--------C-CGGG-AA--TG-C-----GGAAAGGACT---AA--C-AT-TAGG-A--TTG-AAAT-----------------------------A--CGAGAGGA-T--AT-TAAA--CCG-ATCC-GGGTCAC--------TTGTAT------A--ATTTAATAA-----C-ATC--TAT-------AT-CAATACACCA-AGGC--CAA-ACTACAA-A---------------------TG-AAT--ATTTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACA-GAAA-GT--CTAGCGGAT-A-AAAATT-ACTCT-A---CGT-CA-CTGGTATG---ATGACG--T-AACAGT--TAAGCAGGGA-G-TTT-CC--CT---A-CG----TGGA-A--CA--ATGT----------TCGTT-------------TACA---C-A-TTG---AC-AAA-CA-A--TAT-TT-AGCAAAT------CA--TAC--G-GTGG----------TAGGAAG----------A------CT----------TTAA---TTTGAA-----T--A-T--GCTG-T-T-A-----TT---AC-T-CG--T------TA-TT----CTC-CC-TCGGG--AC-ACCTTACCC
gi|7 : ATGATGGATCCAA-AAACGCTTCCCTCACTCTTATGTCAACATTTGATAATTTGTAAACAATTGAGGTGAAGTTTAAGATTACACTCAGGAGACATTTTTTTGAATTATAAACATATAGGCAACGCGGTACCTGGATGAGCAAGAATT-GCAGAAAACGATGGTATGTAATAGCCCAGTGATTACCGGAGCGATGTATGGGTCGAAAAGCATGATGCTATA-AAACGAGAACAAAGGGTGGTTAAGACGTCCCGATGAAA-GTCAC---TGTGCTG--TACATAAA-TGCACATCAGT------------A--------------TGTGATG-A-----CAT-AATA--C-A-C-AACTACGT---C-CCT-A-C-A----CACA---GTTC----T-A--GGCGT-TGTATCA-T-GGTGGAA-CT------TAC-TA---------CAGTA-TTT------ACTA-CA---------A---A------T--AC-CAA---G-------CGT----CCAAG-ATGC-------ATACTTAT--GTGTA-AATTTGTTT-GTC-AA---ATG----AGTC-T-TTG-C-TAA-T---T--T----TT-TTATTGATAAT-----ATAT-------G----TCTCCTG--TTTCTAAATATCTAA-----A-------TA---------TATCGTGAATT--TCG--------------ATATT-TTTCATCA--TTAGAATG-TGACATT-A-----A-AAT-C-ACCCCCCCCCCCGTGCGCATTGGC------------A-------------T-----TGT--------------AGAATA------CAGAAA--AGCAAT-CGTA--CACACA-TA-------TCGACTTG-ATT-AA-AGCCTTT----A---AAGGCTGATA---TTTT
gi|8 : A-CA---------A---T------T--AT-CAA---A-------CAT----TCAAG-C--C-------G----TAT--GTGT--------------C-AA---ATA----ATTC-T-ATT-T-TAA-A---T--TAATTTT-CT-TTAATGAC-----ATGT----AA-G----TCTCCTGAATTTAT--AT-----------A-------TACATG-----TAGTTTGAATT--ACC--------------ATATT-CTTAATCA--CTACACTG-TGACCTT-G-----A-AAT-C-ATTCC------------CAGTGATCATTGCT-----A-------------T-----T-T--------------AGAAT-----------AA--GCCA-----------------A-------TCAACTTG-GCA-CA-GG---TT----AAAGATGAC-TATA---TTTTCT-TTCAA------------TCA--AGACGTA-TTagactcacaggtttacctcaggtaa
gi|8 : ATT-TTT------T-GC-C-TCGTTTTGA----------T----T--------A---TA-T-TT-----------------------GA--------C-AGTG-AA--TG-T-----GAAAATGCCC---AA--C-AT-ATAA-A--TCA-AAATTATAGAAATG--GC--------T-AC-AAA--CGAGGGGA-T--AT-TATA--CCG-ATCC-GGATCAC-----------TTTT----AA--ATTT-ATC--------------AT-------AT-CGATACATTA-GGCC--CAA-ACTGCAA-ATGATTTG-----AAT-GCA-ATA-ATT--GCTT-A-TCC-A-TG-----GT-A--AT-AAC-AACT-GAAA-GT--CTAGCGGAT-A-AAAACA-GTTCT-A---CCT-CA-CTTGTACG---AATATG--T-AATAGG--AAAGCATGGG-A-TTTACC--C----A-CG----TGGT-A--TG--ATGT----------TTGTT-------------TATA---T-A-TTG---ACAAAA-AG-A--TTT-TT-TGTAAAATACATGTA--TGT--G-ACGC----------TTGAAAG-A-A-ATT-TA------CT----------TTGA---TTTGAA-----T--A-T--GCTG-T-A-A-----TT---AT-T-T---C------TA-AT----TTC-AC-TCATT--AC-ACCTTttttgcctcgttttgattatatttgacagtgaatgtgaaaatgcccaacatataaatcaaaattatagaaatggctacaaacgaggggatattataccgatccggatcacttttaaatttatcatatcgatacattaggcccaaactgcaaatgatttgaatgcaataattgcttatccatggtaataacaactgaaagtctagcggataaaaacagttctacctcacttgtacgaatatgtaataggaaagcatgggatttacccacgtggtatgatgtttgtttatatattgacaaaaagattttttgtaaaatacatgtatgtgacgcttgaaagaaatttactttgatttgaatatgctgtaattatttctaatttcactcattacacctttatatcaccactg
gi|9 : acaattatcaaacattcaagccgtatgtgtcaaataattctattttaaattaattttctttaatgacatgtaagtctcctgaatttatatatacatgtagtttgaattaccatattcttaatcactacactgtgaccttgaaatcattcccagtgatcattgctatttagaataagccaatcaacttggcacaggttaaagatgactatattttctttcaatcaagacgt---------TAGTGTG--TT--TTA----------------------CAATTA--TTACATTG-TGACCAT-G-----A-AAT-C-GTCCCAATG--------CACATTGCT----------A-------------T-----T-T--------------AGAATA------TAGAGA--GTCAGC-GGTG--TATACA-AA-------TCGACTTG-GTT-CA-GGCGTCT----A---ATGAC-GATA---ATTTCT-TTCGA------------TCA--AAGCAAA-TTTCT-AA-GGT-A----AC--TAGTG--TC--------AGATT-TTGACA------T-GG--ATGATA-GGA-T-TTT------T-GC-C-TTGTTTACA----------T----G--------A---TA-T-TT-----------------------GA--------C-AGTGAAA--TG-T-----AG-AGTG-TC---AA--CGATCTTGA-AC-TTA-AAATTATAGGTATT--GCAT------T-AA-ACA--CGAGGGGA-T--ATCTGTA--CCGAATCA-AGG--AT--------CCTTTTT----A-----TT-GCGA-----G-ATC--TAT-------TTCCTAGACATCA-AATCA-CAA-ACAGCAA-ATAGTTTC-----AGT-GCA-TTA-ATC--GCCTGA-ACC-G-TG-----GT-A--ATAAAC-AACT-GATA-GT--CCAGTGAAT-ATCGAATA-ACTCT-A---CGT-CA-CTTTTATG---ATGACG--T-AATAGGTATAAGCAAAGGCA-TTT-CT--CTATAA-CA----TGTC-A--CG--ATCT----------T--TT-------------TATA---CTA-TTG---AA-AAA-CG-A--TTT-TT-AGTAAAA------TA--TG---G-ACGC----------TTTGGAA-A-A-TTT-GA------CT----------TGAA---TAGGAAT----T--A-T--GC-G-T-T-A-----TT---ACTT-TG--TTACATGTA-AT----TTCAAC-TC-GG--AC-AACTTAAtatatcaccactg
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): CTTGAAATCACAATGTTTAAAGGCATTTAGAATAATGAGTCAATCATTCATAGACAACGACTTGATATAAGTGAAAGATAAAGA
Unaligned ( gi|45 ): ACATTGTGATAATGAAATCGACTCCCAATGCACATATGTCAATTTACAATTAAAGG
Unaligned ( gi|46 ): GTATTCGTCCTATTCAGCGACCCTGCCCCCATGAGCGCCCCCGGGCACTTTCCCA
Unaligned ( gi|48 ): AAAAATCCTGCTTTTAATTTCACTTACTCTTCATCTCGGACT
Unaligned ( gi|51 ): TAGTTTAAAATACGCACTCAAGATGAAAATGAATTT