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Reference ( gi|7 )            :                                                                                                                                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC--A-T------T--T---T--T--A-CT--G----A--T-A---------A-T-TG--C-T-G-A--T--A---ATT-T-CT-G-ATA-C-TG-T-----G-CT-G--TT---GG-TGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T--G-----------------------T-GA-----------------AA----T------A-----T-------G-TG----GGTA---C--T-G--ATAA---------TTG-C-TG-G-T---AT-T-TA---C-T-G-T-GG-T---T---TT--ACT-GTG--G-G--T------A-T-TG--A---T-----TA-CT-G-A-TA-A---A-G-TA---T--G-A---TAA-A------G----T----AC-T-GT-----------G-G----G------TA-C---T---GA------T-A-----A---------TTG-C-T-G---A-T----A--T-G---TGCT-GA---T-A-T-C-TGC---CG-AG-GCTTA-TCGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----C--TT---GC--GG--CGGT-GTGC-------A--A-AT--GTGTCT--CA----G-T--------G---T---A-------AA---AAATCAAAGATAAG-GC-C--G-TTTT--T------C---AAA---A-C----TT--T-TTTTTTT--AAT--TTCT-TTTTTTCTGA--T-AT-GCAT----T-T-G---CTTT-CAG-C--A-TAT-TGA-G-ACAA-T--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTTA----T-GAA-GAAACCTG-GTTT-TGGCAG-----A--CTT-T---TTT--ATA--T-GCCTT-TC-T-TA----TT--C-TTCCAT----AA---AATTATTCTTAAAC----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-A-CAAGTG-----ATT-A-----GC---A-A--TGC--GG-C--A--TTT--CAT-G-T----TCAT-G-T---AATAAG---GAT---A---TA---TAG-T-A-TTTA-TT-TACCGACA
gi|6                          :                                                                                                                                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-AAGAGA-G-T----TC--A-T------T--TG--T--T--A-----G----A--T-A---------T-T-TG--C-T-G-A--T--A----TT-A-CT---ATA-T-TG-TT----G-CT----TT---GA-TGCT--GA-T-------A-AT-AT-TGATT--AA---------A-T--TAC-T--------------------------T-GA-----------------AA----TTT----A-----C-------T-TGC---GGTA---C----G--ATAA---------TTGGC-TG-A-T---AT-T-TA---C-T-GCT-GG-T---TCT-TT--ACC-GTG--G-G--T------A-C-TG--A---TAT---TA-CT-G-A-TA-A---T-GATAC--T--G-T---GAA-A------G---------A--T-GT-----------G-G----G------TA-C---T---GA------T-A-----A---------TT--C-T-G---A-T----A--A-G---TGCT-GA---T-A-T---TGC---CG-AG-GCTTA-TCGCT-C-GC-CCTGCGATC-GAGAAAAC--TT---GC--AGGCCGTT-GTGC-------A--ATGT--GCGTCT--AG----G-T--------A-------A-------AA---AAATCAA-GATAAG-GC-C--G-TTTT--T------TTTAAAA---A-CA---TT--T-TTTTTTC--AAT--TTCT-TTTTT-CTGAC-T-ATTGCATACCGT-T-GA--TTTT-CAG-CCTA-TAT-TGA-G-ACAA-T--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT------T-A---TG-TTTA------GAA-GAAGCCTG-GTTT-TGGCAG-----A--TTT-T---TTT--ATA----GCC-T-TC-T-TA----TT----TTCCAT----AA---AA-TATTCTTAACT----------------TCCA--C-T----A-TTT-AA---AATCAA-CCAGTGTGTCAATCGA-----GC---A-A--TGCG-GG-C--A--TTT--CAT-G-TATTATGAT-G-T---AATAGG---AAT---A---TC---TAG-TAA-TTTATTT-TACCGAC
gi|9                          :                                                                                                                                                             tGGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TCC-A-T------T--T---T--TT-A-CT--G----A--T-A---------A-T--G--C-T-G-A--T--A---ATA---CT-G-ATA-T-TG-T-----A-CT-G--TT---G--TGCT--GA-T-------A-ATTAC-TG-T---AA---------A-G--TAC-T--G-----------------------T-GA-----------------AA----T------AC----T-------G-TG----GATA---C--T-G--ATAA---------TTG-C-TG-A-T---AT-T-TA---C-T-G-T-GG-T---T---TT--ACT-GT---G-G--T------A-C-TGATA---T-----TA-TT-G-ATTA-A---A-G-TAC--T--G-T---GAA-A------G----T----AC-T-GT-----------GTG----G------TA-C---T---GA------T-A-----A---------TTG-C-T-G---A-TA---A--T-G---TGCT-GA---T-A-T-CTTGC---CG-A--GCTTATTCGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----C--TT---GCA-GG--CTGT-ATGC-------A--A-AT--GT-TCT--CA----G----------G---TAAAA-------AA---AAATC-AAGATAAG-G--C--G-TTTT--T------T---AAA---A-C--------------------AT-----T-TTTTTTCTTA--T-AT-GCAT----TAT-G---ATTTGCAG-C--A-TAT-TGA-G-ACAA-T--TCC--AAC-AT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTTT----T-GAA-GAAACCT--GTTT-TGACAG-----A--TTT-TA--TTT--A-A--T-GTCTA-TCTT-TATTTTTT--T-TTCTATA---AA---AAATATTCTTAAA-----------------TTCA--A-TGGTAA-TAT-AA-T-AA
gi|14                         :                                                                                                                                                          tactGGACG-GAA-A-ATGTA--C-G-A---GA-G-TG---TC--A-T------T--T---T--T--------------------------------TA--C-T-G-A--T--A----TT-A-CT-G-ATA-T-TG-T-----G-CT-G--TT---GG-TGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T--GATATTTTTACTGT----------T-GG-----------------AC----T------A-----TAATTACCG-TG----GGTA---C--T-G--ATAA---------TTG-C-TG-A-T---AT-T-TA---C-T-G-T-GG-T---T---TTTTACT-GTG--G-G--T------A-C-TG--A---TATT--TA-CT-G-A-TA-A---A-G-TA---C--T-G---TAA-A------G----T----AC-T-GT-----------G-G----G------TA-C---T---GA------T-A-----A---------TTG-C-T-G---A-T----A----------------------T-C-TGC---AG-AG-GCTTA-TCGCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GCG-GG--CCGT-GTGC-------A--A-AT--GTGTCT--CA----G----------G---T---A-------AA---AAATCAAA-------------G-TCTT--T----------------A-C-------------------AAT--TT-T-CGTTTTCTGA--T-AT-ACAT----TAT-GA--TTTT-CAG-C--A-TAT-TGA-G-ACAA-T--TCC--AACGAA--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTTG----T-GAA-GAAACCTatgaacatttactctagtaaatggata
gi|11                         :                                                                                                                                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC--A-T------T--T---T--T--------------------------------TA--C-T-G-A--T--A---ATT-A-CT-G-ATA-T-TG-T-----G-CT-G--TT---GG-TGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T--G-----------------------A-GATTTTTATTGTTGGTACTGA----T------ACTTACT-------G-TG----GGTG---C--T-G--ATAA---------TTG-C-TG-A-T---AT-T-TA---C-T-G-T-GGTT---T---TT--ACT-GTG--G-A--T------T-C-TG--ATATT-----TA-CT-G-A-AA-A---T-G-TAC--T--G-T---GAA-A------G----T----AC-T-GT-----------G-G----G------TA-C---T---GA------T-A-----A---------TTG-C-T-G---A-TA---A--A-G---TGCT-GA---T-A-A-C-TGC---CA-AG-GC-TA-TCGCT-C-AT-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GCG-GG--CCGT-GTGCA------A--A-AT--GTGTCT--CA----G----------A---T-----------AA---AAATC--AGATAAGAACGC--G-TTTT--T------T---AAA---A-CAATATT--T-TTTTCCG--AAT--T--T-TTTTTTCTGA--T-AT-GCATA---T-T-GA--TTTT-CAG-C--A-TAT-TGA-G-ACAA-T--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTTT-A----T-A---TG-
gi|16                         :                                                                                                                                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTT-A---GA-G-TG---TC--A-T------T--T---T--T--------------------------------TA--C-T-A-A--T--A---ATT-A-CT-G-ATA-T-TG-T-----G-CT-G--TT---GG-CGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T--GAGATTTGTACTGTTAATTGGTACT-GAT----------------AA----TT-----AC----T-------G-TG----AATG---C--T-G--ATAA---------TTG-C-TG-A-T---AT-T-TA---C-T-G-T-GG-T---T---TTT-ACT-GTG--A-G--T------T-C-TG--A---TATT--TA-CT-G-A-TG-A---T-G-TAC--T--G-T---GAA-A------G----T----AC-T-GT-----------G-G----G------TA-C---T---GA------T-A-----A---------TTG-C-T-G---A-TG---A--T-G---CGTT-GA---T-A-A-C-TAC---CG-AG-GC-TA-TCGCT-C-GT-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--AG--CCGT-GTGT-------A--A-AT--GTGTCT--CA----G----------A---T---A-------AG---AAATC-AAGATAAG-GC-C--G-TTTT--T------CA--AAA---A-C----AT--C-TTTTTTT--a
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gi|25                         :                                                                                                                                                            ctGGACG-GAA-ACGTCTA--CTG-A---GA-GATG---TA--A-T------G--T---T--T--A-CT--G----A--TCA---------A-----------G-G--T--A---CTT------G-A-A-T-TG-T-----G-CT-G--TT---GG-TGCT--GA-T-------A-ATTA--TGAT---AA---------A-G--TAC-T--GATATTTTTACTGTTGACT-----T-GA-----------------AA----T------AC----T-------G-TG----AGTA---C--T-G--ATAA---------TTG-C-T--G-T---AT-T-TA---A-T-G-T-TG---------TT--ACT-GT---G-T--T------A---TG--A---TATG--TA-CT-G-A-TA------------------------AA-A------G----T----AC-T-GT-----------G-G----G------TA-C---T---GC------T-A-----T---------TTA-C-T-GTAAA-T----AC-T-G---TGtgtaattgctgataattactgatatttactgtgggtgaccgttctgatatttactgataatgaactgtgaaagtaccgtgggtagtgagaagtgctgataactgccgaggctattgcttgccatgcgatcgacttgcgggccctgtgcaaatgtgtctcaggta
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gi|43                         :                                                                                                                                                           actGGACG-GAA-A-ATGTA--CTT-T---GA-G-TG---TC--ATT------T--T---T--T--A-CT--G----A--T-A---------A-T-TA--C-T-tatcacctgcttatggtgt
gi|44                         :                                                                                                                                                           attGGACGGCAA-A-ATGTAACTTG-A---GACG-TG---TC--A-T------T--T---T--T--AACT--G----A--T-A---------A-T-TG--C-T-attatga
gi|42                         :                                                                                                                                                          tactGGACG-CAA-A-ACATA--CGG-A---TA-G-TA---TC----T------T--T---T--C------------------------------T-TA--C-T-G-A--T--A---ATT-A-CT-A-ATA-T-TG-T-----G-CT-G--TT---a
gi|47                         :                                                                                                                                                           cctGGACG-CAA-A-ATGTA--CT------GA-G-TG---TC--A-T------T--T---T--
gi|15                         :                                                                                                                                                          ctactGACG-GAA-A-ATGTA--CTG----------CG---TC--A-T------T--T---T--TT-G-CT--G----A--T-A---------A-T-TG--C-T-G-A--T--A---ATT-A-CT-G-ATA-G-TG-T-----G-CT-G--TT---GG-TACC--GA-T-------ATTTTAC-TGTT--------------G-G--TAC-T--G-----------------------A-TA-----------------AT----T------GC----T-------G-TG----AGTG---C--T-G--ATAA---------TTG-C-TG-A-T---AT-T-TA---T-T-G-T-AGTT---T---TT--ACT-GTG--G-G--T------T-C-TG--ATATT-----TA-CT-G-A-TA-A---T-G-TA---T--------------------------------T-GT-----------G-G----G------TA-C---T---GA------T-A-----A---------TTG-C-T-G---A-TA---A--T-G---TGCT-GA---T-A-A-C-TGC---CG-AG-GC-TA-TCACT-C-GC-CTAGC--TT-G----------T---G---GG--CCGT-GTGC-------A--A-A----TGTCT--CG----G----------G---T---A-------AA---TAATC-AAGATAAG-GC-CAAG-TTTA--A------A---AAA---A-C----TT--T-TTTTCAA--AAA--T--C-TTTTTTCTGA--T-AT-ATATA---T-T-G---
gi|1                          :                                                                                                                                                               GACG-CAAGA-ATGTA--CT--A---GA-G-TACTCTT--A-T------C--TGCTT--T--A-CT--A----AAGT-G---------A-TGTG--C-TTGTA--T--A---ATA---CT-G-TTA-T-TA-T-------CA-A--TT---GT-TGTC--AA-TCATTACAA-ATTAC-T-AT---AA---------A-GATTAC-T--G-----------------------T-GA-----------------AG----TTAATACA-----T-------G-TGCCACGGTA---C--TTG--ATAA---------TTG-C-TA---T---AT-TATAAA-C-T-G-T-GG-T---TCT-TT--ACT-G----G-G--T------A-C-TG--A---TACCTTTA-CT-G-A-TA-A---A-G-TA---TCTG-A---TGA-ATAAATTG----T----AC-T-GTTAACGTGACCCA-A----G------TA-CA--TCGAGA------T-A-----A---------ATGAC-T-G---A-TTAGAA--TTG---TGCT-GAGAAT-A-T------------AA-AC-------CT-C-GC-CCTGCGA-C-GA-----C--C----GC--GG--CC-T-GTGCCTGCTGGA--A-ATTAGTGT-T--CAAAGGG-TTCCTATTGG---T---ACCAAGAAAA---AAATCAACGATAAG-CC-CACG-TTTT--A------A---AAA---A-C----AT--T-TTTTTTTCCAAT--TTCT-TTTTTTCTGA--T-AT-GCATA---T-T-GACCTTTT-CAG-C--A-TAT-CGA-G-ACAA-TGATCCAAAACGAT--ACTCAAA-CAAACAA-CCGC-A----T-T---CG-TGTA----T-GAACGAAAACCGTGTTTGGGGCAG-----G--ATG-T---ATTCAATAGGTGGCATTGTC-TGTA----TTC-C-TTCCAT----AATATAATAGTTCGTATACCCTTTTATTACTATTTTCCA--C-T----A-TTT-AACT-AATC-A-CAAGTGTTA--AAT-A-----GC---A-A--AGCAGAG-CCAA--TTT--CAT---T----TCAC-G-TTA-AAGAAGACTAATCTAA---TA----AG-T-A-TTAA-TT-T-CCGACAatattttttgttgttgttgatagactataatttaagttactata
gi|29                         :                                                                                                                                                               tACG-CAA-A-ATGTA--CAG-A---GA-G-TG---TC--A-T-----------------------------------A---------A-T-TA--C-T-G-A--T--A-------T-CC----TA-T-TG-T-----G-CTTG--GT---GG-TGCT--AT-T-------A-ATTACTTGAT----A---------A-G--TA-----A-----------------------T-GA-----------------AGTCTTT------AC----T-------G-TT----GGTA---C--T-G--ATAATGGACTGGGTTG-C-TG-A-TATAAT-T-TG---C-T-G-tgctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcgttaggtttttggataataaatgatctgtgcataaattgtatattccatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattccgaatgatacattctgatccggagttgaattcttatataacactcaaataaacatcacaatcctgacccctattttgaatcttattcgggcatgccgaaaaatcggagagtgtctcgtttcattgagcgagccctttcttattatcaaactggctttgaaattatgacacgtatatccattactagaatataatgtttcatgttcatatcactttaattatatttttttaatgataatcattgtcaattactaatgtaaatataatcttattccgctgttttttaaagctagtaattttagaagaagacttctatgtgtattcatttatgcaatcagatcaaagcccttacccttcaacgtattaattttgtacctccagtttgtaatctaattatatcctatatcgatagatctgcaccatctgtatacaagtccacagatccggacatgttatttaattttccaattcttgattttataacatacagtagtattgctagaagtgtggatacgcaacttggttggaccacggcgtatagcgataatgtttcgtatgatagcctgataataaggagcatgttcacgaaatagaactttg
gi|23                         :                                                                                                                                                           actgtACG-GAA-A-TTGTA--CTGGA---GA-G-TG---TC--A-T------T--T---T--T--T-TTAGG----A--T-A---------A-T-TG--CAT-G-ATGT--A---ATTCT-AT-G-A-A-T-TG-T-----G-CT-T--CT---GA--ACT--G------------------TGAT---AA---------T-G--TGC-T--------------------------T-G-------------------A----C------C-----T-------G-T-------TA---CATT-G--TAAA---------TT----TG----------T-TA---CTT-G-T-GG-G---T---T----CT--------G--T------A-T-TG------------TA-CT-G-AGTA-T---A-G-TAAGCT--G-A---TTG-A------GAATAT----AC-TAGT-----------A-G----G------TAGCTTGT---GAAAATAGT-A-----A---------TTG-CGG-G---A-TGCA-A--T-GT--TGCT-GA---T-C-A-C-TGC---CT-AT-GCTTA-T-GCT-T-Gaaacatgtattacgtgtttggtttttattgtggtcc
gi|2                          :                                                                                                                                                           attgaaCG-CAA-A--TGTA--ATG-A---TA-G-TG---TC--A-T------T--T---TATT--A--T--G----A----A---------A-T-TAGCC-T-T-A--T--A---ATC-TACTCG-ATATC-TT-G-----G-CT-G--TT---GG-TGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AATAAACAAACA-G--TAC-TAAG-----------------------TCGA-----------------AA----T------A-----CTG-----G-TGA---GGTAGACT--T-G--ATAAC--------TTG-C-TG---T---AT-A-TATCGC-TCG-TCGG-T---T---TT--ACT-GTGT-G-G--T------ACT-TG--A---T-----CA---------A-A---ACG-TAC--T--GTG---CAA-A------G----T----AC-T-GC-----------T-GTATCG------TA-CC--T---GA------TTA-----A---------TTG-C-T-G---A-CTA--A--T-G---TGCT-GA---TCA-T-C-TGC---CGGAGCGCTTA-TCGCT-C-AC-CCTGCGATC-AA-----C--TT---GCG-GG--CCGTAGTGC----------A-AT---TGTCT--CA---------------G---T---A-------AA---AAATC-AAGATAAG-GC-T--G-TTTTTGT------C---AAAAACA-C----TTGCT-TTTTTTT--CAA--TTCT-TTTTTTCTGC--T-AC-GCATA---T-T-G---ATTT-CAGACG-A-TATATGA-GCACAA-T--TCA--ACCGAT--AC-CAAATC-----ACCTATCA----TCA---TG-TTTT----TCGAA-GAAA-CTA-GTTT-TGGCAG-----A--TTT-TATATTT--ATA----GCCTT-T--T-TA----TA--C-TTCCAT----AAAC-AAATATCATT-AAC----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-A-C-AGTGT----CTT-A-----GCACAA-A--TGC--GGTC--AT-TTT--CAT-G-T----TCAT-GTT---AATAGG---AAT---A---TC---TAG-T-A-TTTA-TT-TACCGACA
gi|28                         :                                                                                                                                                                    act-A-ATTTT--CTG-A---AA-G-TA---TC--A-TC-----T--T---T--T--G-CT--G----A--A-A---------A-T-CG--T-T-G-C--T--A---ATT-A-CT-G-TTA-T-TG-T-----A-CT-G--TT---GG-TGAT--GA-T-------A-CGTCC-TGAT----G---------A-T--TGC-T--G---------------------------------------------A----T------A-----T-------G-T-------TA---C--T-G--ATAA---------TT---------T---ATAT-TG-------G-T-GA-TA--T---TT--ACT-G-G--G-AATT------A-T-CG--T---T-----TAGCT-C-A-TG----------A---T--G-A---TGA-G------G----A----AC-T-GA-----------G-G----AACGTGTTA-T---T---GA------T-ATTGAGA---------TTG-C-T-tgctcctctctctctctctctctctcatagaagtttcgcgttggttttggataaataaattatctgtgtcatatactgtcatatccatgacattctgataggtctttagtctcaaatgaactaattccgcgtatttgaaatcaaggagccgtgggagtgttccatttggcctgctttattaatgcaacaggcatttgaaatttgaccgtgatatccatttacttaaaaataaattgttacatttattcatttaatttattttttctaatatatacaattatcaataatgcatacattctagctattcggtcgaagctatagcctatgcctaccggttaaagcagcttcattgctttttaaagcagctttcatgttttgattcagcaagcctaactgatataattgacagggttatatagattatacttacactgtccgcctatcatccttatcaagatctgcaatctttcaagcccaatccgggacattgcttatttaattccaattctttgatagctacatgtaatatattgctgagataatgtgtggatatcgcaacggtgacaccgttacacggagcgtaggtgccatgaaataagaacttgtccggaggactttatgctctcataatgca
gi|45                         :                                                                                                                                                                    acagaacTGGA--CTG-A---GA-G-TG---TC--A-T------T--T---T--T--A-CT--G----A--T-A---------A-T-TA--A-T-G-A--T--A---
gi|17                         :                                                                                                                                                                             TA--CTG-T---GG-G-T----TCTGA-T------A--T---T--T--A-CT--G----A--TAA---------A-G-TA--C-T-G-A--T--A---A--------A-GTA-C-TG-T-----G------------GG-CACT--GA-T-------A-ATTG--TGAT---AA---------T-G--TGC-T--G-----------------------ttgtgct
gi|5                          : gattattattatgtatgcttgttaacgtttatatttctgttggacgcccttattcagtttgatactgttatttgctgttggtaatgataattactgatagtactgatatttttactgttgtacgtgataattactggatactgataattgctggatatttacttttgttctttA--CTG-A---GA-G-TG---TC--AAT------T--T---T--T--A-CT--G----A--T-A---------A-T-T---------------A---AT-------G-ATA-T-TG-T-----G-CT-G--TTC--GG-TGCT--GAAT-------A-ATTACCTGAT---AA---------A-G--TAC-T--GATCTACTCTTACCGT--------T-GAGTATGTTT---------AA----TT-----ACT---T-------G-TG----AGTA---C--TTG--ATA----------TTG-C-AT-G-T---AT-T-T----C-T-G-T-GG-T---T---TTT-ACTAGTG--G-G--T------T-TCTG--A---TAATTTTC-TT-G-A-TA-A-------TG---T--G-ACTGTGACA------G----T----ACCT-GT-----------G-A------------A-C---T---GA------T-AG----A---------TTG-C-T-G---AGT----ACGT-G---TGCTTGA---T-A-AAC-TGCACCTG-AG-GCTCAATCGCTGC-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TTGGCGC--GG--CCGTGGTGT-------AATA-AT--GTGTCT--CA----A----------A---T-----------AA---AAATCAAAG-T-GG-GC-C--G-TTTT--TAAGAAAC---GAA---A----------T-TTTTTGC--CAT--TTTT-TTTCCCTTGA--TGAT-GAATA---T-T-GA--TTTT-CAGTC--AGTAT-TG--G-ACAA-T--TCC--AACGATTCAC-C-AA-C-----A--TAT-A----C-A---TG-ATTA-------GA-GAAACT---GTTT-TGACAG---------TT-TGA-TTT--TTA--T-GCCTG-TC-C-TT----TTAAT-TTCCA-----AA---CAATATTCTT-AAC----------------TTCA--C-TTA--G-TTT-A----AATC-AGCAGATGC----ATTGA-----TC---A-A--TGC--GGCC--A--CTT--CAT-G-T----T-AT-G-TTCAAATAAG---TAT---A---TC---TAGAT-A-TCTT-TT-TAatatctgccgagcttacccgccttgcgaacgatttcgggccgtgtgcaatatataacaatataagtgtacattaaaaatacccgatttttcct
gi|33                         :                                                                                                                                                                             gg--CTG-A---GA-G-TG---TC--A-T------C--TATAT--T--A-CT--GATCCA--T-A---------ATT-TG--C---G-A--TACA---ATT-A-CT-GCATA-CTTGTT-----G-CT-GT-TT---GG-TACTTAGA-T---------ATTAC-TGACATAAA---------A-A--TACTT--G-----------------------T-GA-----------------acg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                  TG-A---GA-G-TG---TC--A-C------TCTT---T--T--A-CT--G----A--T-A---------AAG-TA--C-T-G-A--G--A---TTT-T-C-------------------A-CT-G--TT---GG-TACT--GA-T-------A-ATCAC-TG----------------------------------------------------T-GA-----------------A------------------------------------TG---C--C-G--ATAA---------TTG-C-TG-A-T---AT-T-TA---T-C-A-T-GG-T---T---CT-----------G-A--T------A-T-T-------------TG-CT-G-A-TA-A---T-G-TAC--T--G-T---GAA-A------G----T----AC-T-GT-----------A-G----G------TA-C---T---GC------T-A-----A---------TTG-C-T-G---A-TAA--A--A-G----GTT-GA---A-A-T-C-TGC---CG-AA-GC-TA-TCACT-C-GC-TTTGCAATC-GA-----C--TTCA-G---GG--CCGT-GTGC-------A--A-AT--GTGTCT--CA------T--------A---T---A-------AG---AAATC-AAGATAAG-GT-C--G-------------------------------------TTTTTTT--AATTATTGT-TTTTTTCTGA--T-AT-GGATA---T-T-GA--TTTT-CAG-C--A-TAT-TGA-G-ACAA-T--TTC--AACTAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTTA----T-GAA-GAAACATG-GTTT-CGACAG-----A--CTTAA---TTT--A-A--T-GCCTC-TCTT-TAAT--TT--C-TTCCAT----AA---
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                    ---T--T--A-CT--G----A--T-A---------T-T-TA--C-T-G------------------T-G-G------G-T-----GACC-G--TT--------CT--GA-T-------A-TTTAC-TGAT---AA---------T-G--AAC-T--G-----------------------T-GA-----------------AAG---T------AC----C-------G-TG----GGTA---G--T-G--AGAA---------GTG-C-TG-A-T---AA-C-TG---C-C-G-A-GG-C---TA--TT--GCT-
gi|17                         :                                                                                                                                      ctggacggaaaatgttctgagtgtcattttctttactgataattactgatattatgctgttggtgcttgtaattgctgataa--T--A-CT--G----A--T-A---------A-T-TG--C-T-GGA--T--ATTTACT-T-TT-G-TTC-T-TT-T-----A-CT-G--TG---GG-TTCT--GA-T-------A-TTTAC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T--GA----------------------T-AA-----------------AG----T------AC----T-------G-TG----GGCA---C--T-G--ATAA---------TTG---TG-A-TA--AT-G-TG---C-T-G-tgccatgcgatcgacttgcgggccctgtgcaaatgtgtctcaggta
gi|20                         :                                                                              gattattattatgtatgcttgttaacgtttatatttctgttggacgcccttattcagtttgatactgttatttgctgttggtaatgataattactgatagtactgatatttttactgttgtacgtgataattactgga--T--G-CT--A----A--T-G---------G-T-TGG-T-T-G-A--T--AT--ATT-TACT-G-AGC-T-TA-T-----A-TT-G--TT---GG-TACT-------------A-ATTAT-TG-----------------------C-T--G-----------------------T-G---------------------------------------------G-TT----GG-----C--T-G--ACAA---------CTG-CATT-A-T---AT-T-AA---C-C-G-T-GA-TGATT---TT--ACT-GTA--A-G--TTCTAATA-T-TC--A---T-----T---T-GGA-TA-A---TTG-TAC--T--G-T---GAA-A------G----T----AC-T-AT-----------G-G----G------TA-C---T---GA------G-A-----A---------GTG-T-T-G---A-TA---A--T-G---TGTT--------------------TG-AG-AC-TA-TCGCT-TAGC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GCAAGG--CAGT-GTGC-------A--A-AT--GTGGCT--CA----G-G--------GGAAT---A-------AA---AAATCAAA-ATGAG-GC-T--T-TTTT--T------TTA-AAA---A-C----atatctgccgagcttacccgccttgcgaacgatttcgggccgtgtgcaatatataacaatataagtgtacattaaaaatacccgatttttcct
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                               gatgtttactggaattctggttgctgg-TA--C-T-G-A--T--A---ATA-T-AT-G-ATA-T-TG-T-----G-CT-G--TT---GG-TGCT--AA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA-----------G--TAC-T--G-----------------------T-GAC----------------AA----G------A-----CTG-----G-TG----GGTA---C--T-G--ATA----------TT--C-TG-A-T---AT-T-TA-----T-G-T-GG-T---T---TTT-ACTTGTG--G-G--T------A-C--G--A---T-----T---T-T-A-TCTA---A-G-TAC--T--C-G---TGA-A------GA---T----A--T-GT-----------G-G----G------TA-C---T---GA------T-A-----A---------TTG-C-T-G---A-T----AA-T-G---TGCT-GA---T----------------------TA-TCGCT-T-GC-CCTG-GATC-GA-----CC-TT---GC--GG--CCGTAGTGC-------A--A-AT--GTGTCT--CA----G----------G---T---A-------AA---AAATCAA-GATAAG----C--G-TTTT--T------T---AAA---AACA---TT--T-TTTTTTT--AAT--TTCT-TTTTT-CTGA--TTAT-GCATACTAT-T-GA--TTTT-CAG-C--A-TAT-TGA-G-ACAA-T--TCC--AACAAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TGTTTTA----T-GAA-GAAA-ATG-GTTT-TGGC-------A--TTT-T---TTT--GTA--TAGCCTT-TC-T-TA----TT--C-TT-CATAAAAAA---AATTATTCTTAAAC----------------TTCA--CTT----A-TTT-AA-T-AATC-A-CCAGTG------TT-A-----GC---A-A--TGC--GGCC--A--TTT--CAT-G-T----TCAT-G-T----TTAAG---GA----A---TT---TAG-T-A-TTTA-TT-TACC-ACAa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                -T-G-A--T--A----TT-A-CT-G-ATA-TATGGT-----G-CT-GAATT---GG-TG-T--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------AAG--TACCT--G-----------------------T-GA-----------------AAG---T------AA----T-------G-TG----G-TA---C--T-G--ATAA---------TTG-C-TGCA-T---AA-T-TATAAC-T-G-T-GG-T---T---TTT-ACT-GTG--G-G--T------A-C-TG--A---TAATCTTA-CT-G-A-TA-A---A-G-TAC--T--G-T---GAA-A------G----T----AC-T-GT-----------G-G----G------TA-C---T---GA------T-A-----AC--------TTG-C-T-G---A-T----AA-T-G---TGCT-GA---T-A-T-C-TGCG--CG-AG-GCTTA-TCGCT-C-GCGCCTGCGATCAGA-----C--TT---GCCGGG--CCGT-GTCT-------A--A-AT--GTGTCTTTCA----G----------G---T---A-------AA---AAATCAA-GATAAG-GC-C--G-TTTT--TTT----C---AAA---A-CAA--TT--TGTTTTTTC--AAT--TTATATTTGTTCTGAATT-AT-GCAC----TATAG---ATTTGCAGGC--AATAT-TGAAG-ACAAAT--GTC--AACGA---AC-CAAA-C-----C-CTAT-A----T-AAACTG-TTTAGTGAC-GAA-GAAACCTG-GTTT-TGGCAG-----ATTCTT-T---TTT--ATA----GCCTT-TC-T-TA----TT--CCTTCCAT----AA---AAATAGTCTTAAGC----------------TTCA--C-T----AGTTTAAA-TAAATA-A-CAGATG-----ATT-A-----GC---A-A--TGC--GGCC--A--TTT--CAT-G-T----TCATGG-T---AATAAG---GA----A---TATCTTAG-T-ATTTTA-TTATACCGACAtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccttgggtttttggatactaatgatctgtgtatactttgtatcttccatggaatctcttgatcgagggtctttattcaatgaactaaaatccgcgtattgaaatctaacgaccgtgggatgtgttactgggcccgtgtttataatcaacaggctttgaaatttgacgtgatatccatttactgagaactaaattgttctttattattaatttatttttttatataattatcaatacatgtatacatgttttcggtgaagctaggtatttcgccagctctcacttgttttgatcagcaagcctaactgtaataattgaacagggtatctagttatattttcatgtcgtatcattcttatcaagatctgcaatcgtgcaagcccaatccggaattgttaattcaatttccaattcctttgatagtaataaaat
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                               gattattattatgtatgcttgttaacgtttatatttctgttggacgcccttattcag-TACT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AT---------T-A--TGC-T--G-----------------------TTGG-----------------TG----C------T-----T-------G-TA----ATTG---C--T-G--ATAA---------TTA-C-TG-A-T---AT-T-TA---C-T-G-T-GG-G---T---G---ACC-GTTCTG-A--T------A-T-T-------------TA-CT-G-A-TA-ATGAA-C-TG---T--G-A-----A-A------G----T----AC-C-GT-----------G-G----G------TA-G---T---GA------G-A-----A---------------------------------G---TGCT-GA---T-A-A-C-TGC---CG-AG-GCT-A-TTGCT-T-GC-CATGCGATC-GA-----C--TT---GCG-GG--CCCT-GTGC-------A--A-AT--GTGTCT--CA----G----------G---T---A-------ct
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctggacggaaaatgttctgagtgtcattttcttT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AATAACT----A-A--TAT-T--G-----------------------T-GC-----------------TG----T------------T-------C-TG----GGTT---C--T-G--ATAT---------TTA-C-TG-
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gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acagaacaattttctgaaagtatcatcttt------TA-C---T---GA------T-A-----A---------TTG-C-T-G---G-T----A--A-T---TACT-GA---T-A-tagctcatgatgatgaggaactgaggaacgtgttattgatattgagattgct
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gctggacggaaaatgtactaagagtgtcattttt------TA-C---T---GA------T-A-----A---------TTA-C-T-A---A-T----AT-T-G---TGCT-Gatgtgttg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cctggacgcaaaacatacggatagtatcttttct-T----A--T-T---TGCT-GA---T-AAG-G-TGC---TG-A------A-TCGCT-T-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--GGG-CCAT-GTGC-------A--A-AT--GTGTCT--CA----G----------A---T---A-------AG---AAATCAA-GATAAG-GC-C--G-TTTT--T------T---AAA---AAC----TT--T-TTTTCTC--GAA--TTTT-TTTTGTCTTA--T-AT-GCATA---T-T-GA--TTTT-CAG-G--A-CTT-TGA-G-ACAA-T--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-ACAATT-A---TG-TTCA----T-AAA-GAAACCTG-GTTT-TGACCA-----A--TTT-CA--TTT--A-A--T-GTCTT-TCTT-TAAT--TT--C-TTCTAT----GA---AAACATCCTTGAA-----------------TTCA--C-T----G-TTT-AA-C-AATC-A-TAA-TA-----ATT-A-----GC---A-AGGTG---GG-C--A--TTT--TAT-G-T----tt
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-AG-GCTTA-TCTCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GT--GG--
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTA-TCGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----CTTTT---G---GG--CCGT-CTGC-------A--A-AT--GTGTGT--CA----GAT--------A---A---A-------AA---AAATC
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTCTGA--T-AT-GCAT---------------------------AA-TGA-G-ACAA-T--TCC--AAAGAA--AC-CTAA-C-----A-CTAT-T----T-A---TG-TTGA----T-GAC-GAAACCTG-GTTT-TGACAGTTTTTT--TTT-T---TTT--AAA--T-TCCTT-TCTT-TAAT--TT--C-TTCCA-----AA---AAATATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtcgaagctgttgtcttgtgcaattgattt
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gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GCAG-----A--TTT-T---TTT---TA--TAGCCTT-TC-T-TA----TT--C-CTCCAC----AA---AAATATTCTT-AAT----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-----AGTG-----ATT-A-----GC---A-A--TGC--GC-T--A--TT-----T-G-T----TCAT-A-T---Ata
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTAAA-----------------TTCA--C-T----G-TTT-AA-T-AATC-A-TA-GTG-----ATT-ATAATAGT---A-A--TGC--GG-C--AATTTT--CATCG-C----TCCT-G-T---AATAAG---GAT---A---TT---TAG-T-A-TTTA-TT-TACCGA
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8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|12 ): ATGTAGATTAAATTGTTGATTTATTTTTTTTTTCTTATCAATAAATTATTAATTACATGTATATATTCTACTCCGTGAAGCTAGATATTTTTTTTTGGTAAAGCATCTTCATTGTTTTGATCCGCAAACCTATAACTGTATAATTGACAGGGTAATCTAGTTATTATTTACATGTCCGTATCATTCGTTATCAAGATCTGCAACGTTCAAGACCAATCCGGACATTGTTATTTAATTTCCAATTCTTTGATATGTACGTGCACGGTTAGCTAGATCAGTACATATATTGCTAGAAGTGTGGATATCGCAAGGAATATATGGTAACCGTAACGGTGACCACCGTAACGGAAGGCGTATACAACATGTTTATGAAATAAGAACTTGTCCCGAGGAACTTGTATGTTTCATACTGCA
Unaligned ( gi|18 ): ATAGAGAATTCCGCGCTAGGTTTTTGACGATAGATGCAGATGATCTTGTATACTTGTACTATTCCGATGAGACATTCGATCGAGGGTTCTTTATCTACATTGCGAACTAAACCGCTGTATATTGAAATCAACGGAAGGCCGAGGATGTGTTTATTATCCGCAGGCTTTTGAAAATTTGACGTGATATCCCTTTTAGATAAATTGTTGATTTGATTTATTTCATTATATTATATATATTTTGAAGCCTCATATATGCTATTCGGAAAAGCAGTTCATTGTTTTGCATCAGCAAGTTTATACTGTATAATTGGCAGGGCTA
Unaligned ( gi|22 ): CTGATAGAATTTTCAATATGGGTTTCTGATAATACAATGATCTGTGTATGAACTTGTATTCTCCATTGGAAATTCCTGATCGAGGGTCTTTATCTCAAATGAATTAAATCCGCGTACATTGAATTCAACAGAAAGCCGCGGGCTGTGTTTAATCACAGCTTTGAAATTTGACGTGATATCCATGTAGATTAAAATTTGTTGATTTATTCTTTATAAATTATTAATTACAGACCTTTGTTAGGGAAACCTTCAAATTTACATGGAATACA
Unaligned ( gi|24 ): GGGTTTTTGGATAATAAAATAATGATATGTGTATAACTTGTAATATTGCATGGACATTCTGATCGAGGGTCTTTATCTCAAATGAACTAAATCCGCGTATTTGAAATCAACAGAGCGCGCGGATGTGTTCATGGACCCGTGTTTATATCACAGGCTTTGAAAGAAGACCGGCGATATCCATTTACTAGAGTAAATGTTCATTTATTATATTACCATTGAATTTAAGAATATTTTTTATA
Unaligned ( gi|30 ): CTCTCATAGAAATTTCCGCGTAGGGATTTTGGATAAAATAATGATATTTGTATAACCTGTATATTCGATGGAAATACTAATCGGAGGTCTTTATCTCAAATGAACTAAATCGGCGTATTTGAAATGAAGGGAGCTGCTGGATGTGCTTTGAAATTTGACCGTGATATCCAT
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Reference ( family-919 )      :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------T-G------A--------A----A----T--AC-T-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG-T---T---TT--ACT-GTG----G----GTA-CT-GA-T---A----T--A-----CT--GA-T----AAN-G-T-A-CT-GNN-A--------AA------GTA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T----A--T-G-TGCT-GA---T-A-T-C-TGC---CG-AG-GCTTA-TCGCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TCAAAGATAAG-GC-C--G--TTTTT------C---AAAA----C--TT---T-TTTTTTC--AAT--TTCT-TTTTTTCTGA--T-AT-GCA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----AC-TAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACCTG-GTTT-TGGCA-G-----AT--TT--T---TTTATAT-----GCCTT-TC-T-TA----TT--CTTCCAT-AA-A--AA----TA-TTCTTAAAC----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-A-CAAGTG-----ATT-A-----GCA---ATGC--GG-C--A--TTT--CAT-G-T----TCAT-GT---AATAAGG-AT-A---TC-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGACA
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gi|11                         :                                             tGGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------A-G--TAC-----------------------------------------T-G------A--------G----ATTTTT--AT-T-G----TT----GGTA---CT-GATACTTACTGTGGGTGCTGATA------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GGTT---T---TT--ACT-GTG----G----ATT-CT-GA-T---ATT--T--A-----CT--GA-A----AAT-G-T-A-CT-GTG-A--------AA------GTA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-TA---A--A-G-TGCT-GA---T-A-A-C-TGC---CA-AG-GC-TA-TCGCT-C-AT-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GCG-G-G-CC-GT-G--TGCA--A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-A----T-----------AAAAA-TC--AGATAAGAACGC--G--TTTTT------T---AAAA----CAATA---T-TTTTTTCCGAAT--T--T-TTTTTTCTGA--T-AT-GCA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----AC-TTT-A----T-A---TG-tgctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcgttaggtttttggataataaatgatctgtgcataaattgtatattccatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattccgaatgatacattctgatccggagttgaattcttatataacactcaaataaacatcacaatcctgacccctattttgaatcttattcgggcatgccgaaaaatcggagagtgtctcgtttcattgagcgagccctttcttattatcaaactggctttgaaattatgacacgtatatccattactagaatataatgtttcatgttcatatcactttaattatatttttttaatgataatcattgtcaattactaatgtaaatataatcttattccgctgttttttaaagctagtaattttagaagaagacttctatgtgtattcatttatgcaatcagatcaaagcccttacccttcaacgtattaattttgtacctccagtttgtaatctaattatatcctatatcgatagatctgcaccatctgtatacaagtccacagatccggacatgttatttaattttccaattcttgattttataacatacagtagtattgctagaagtgtggatacgcaacttggttggaccacggcgtatagcgataatgtttcgtatgatagcctgataataaggagcatgttcacgaaatagaactttg
gi|13                         :                                                                  TG-A---GA-G-TG---TC-A-C------TC---T--T---------------------------T-TA--C-T-G-A--T--AAAG-TAC--T-G-AGA-T--TT-TCAC-TG--TT---GGTACT--GA-T-------A-ATCAC-TG-----------------------------------------------------------------T-G------A--------A------------------------------TG---CC-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---T-C-A-T-GG-T---T---------------------------CT-GA-T---A----TTTG-----CT--GA-T----AAT-G-T-A-CT-GTG-A--------AA------GTA--C-TGT-----------A-G----GTAC-T---GCT-A-A-TTG-C-TGA-TAA--A--A-G--GTT-GA---A-A-T-C-TGC---CG-AA-GC-TA-TCACT-C-GC-TTTGCAATC-GA-----C--TT----CAGG-G-CC-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------T-A----T---A-------AGAAA-TC-AAGATAAG-GT-C--G-----------------------------------TTTTTTT--AATTATTGT-TTTTTTCTGA--T-AT-GGA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TTC--AACTAT--AC-CAAA-C-----AC-TAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACATG-GTTT-CGACA-G-----AC--TTA-A---TTTA-AT-----GCCTC-TCTT-TAAT--TT--CTTCCAT-AA-a
gi|14                         :                                              GGACG-GAA-A-ATGTA--C-G-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-G-A--T--A--T-TAC--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTGT------T-GGACTATA--------A----T----T--AC-C-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG-T---T---TTTTACT-GTG----G----GTA-CT-GA-T---A----TTTA-----CT--GA-T----AAA-G-T-A-CT-GT--A--------AA------GTA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T----A--T-------------------C-TGC---AG-AG-GCTTA-TCGCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GCG-G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TCAAAG------------------------------------------------TCTTTAC--AAT--TT-T-CGTTTTCTGA--T-AT-ACA-TT---ATGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAA--AC-CAAA-C-----AC-TAT-A----T-A---TG-TTT----GT-GAA-GAAACCT
gi|15                         :                                               GACG-GAA-A-ATGTA--CTG----------CG---TC-A-T------TT---T--TTG-CT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-G--TG-T-GC-TG--TT---GGTACC--GA-T-------ATTTTAC-TGTT--------------G-G--TAC-T-------------------G-------------------A-T------A--------A----T----T--GC-T-G----TG----AGTG---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---T-T-G-T-AGTT---T---TT--ACT-GTG----G----GTT-CT-GA-T---A----T---------T----------------T-A-CT-GAT-A--------AT------GTA--T-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-TA---A--T-G-TGCT-GA---T-A-A-C-TGC---CG-AG-GC-TA-TCACT-C-GC-CTAG-------------C--TT---GTG-G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-A----TGTC--TCG-------------G-G----T---A-------AATAA-TC-AAGATAAG-GC-CAAG--TTTAA------A---AAAA----C--TT---T-TTTTCAA--AAA--T--C-TTTTTTCTGA--T-AT-ATA-TA---TTGA--TATTT
gi|16                         :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTT-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-A-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGCGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------A-G------ATT------T----G----T--AC-T-GTTAATT----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-TACTGTGAATGCTGATAATTG-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GGTT---T---TT--ACT-GTG----A----GTT-CT-GA-T---ATT--T--A-----CT--GA-T----GAT-G-T-A-CT-GTG-A--------AA------GTA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-TG---A--T-G-CGTT-GA---T-A-A-C-TAC---CG-AG-GC-TA-TCGCT-C-GT-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--A-G-CC-GT-G--TGT---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-A----T---A-------AGAAA-TC-AAGATAAG-GC-C--G--TTTTT------C---AAAAACATC--TT---T-TTTTtttgttgttgttgatagactataatttaagttactata
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gattattattatgtatgcttgttaacgtttatatttctgttggacgcccttattcagtttga-T----A--T-T-TGCT-GA---T-AAG-G-TGC---TG-A------A-TCGCT-T-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--G-GGCC-AT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-A----T---A-------AGAAA-TC-AAGATAAG-GC-C--G--TTTTT------TA--AAAA----C--TT---T-TTTTCTC--GAA--TTTT-TTTTGTCTTA--T-AT-GCA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-G--A-CTT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----AC-TAT-ACAATT-A---TG-TTC----AT-AAA-GAAACCTG-GTTT-TGACC-A-----AT--TT--CA--TTTA-AT-----GTCTT-TCTT-TAAT--TT--CTTCTAT-GA-A--AA----CA-TCCTTGAA-----------------TTCA--C-T----G-TTT-AA-C-AATC-A-TAA-TA-----ATT-A-----GCA---AGGTG-GG-C--A--TTT--TAT-G-T----tatataacaatataagtgtacattaaaaatacccgatttttcct
gi|2                          :                                                 CG-CAA-A--TGTA--ATG-A---TA-G-TG---TC-A-T------TT---TATT-A--T--G----A------------AAT-TAGCC-T-T-A--T--AA-TCTAC--TCG-ATA-TCTTG---GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AATAAACAAACA-G--TAC-TAA-----------------G-------------------TCG------A--------A----A----T--AC-T-GG---TGA---GGTAGACTT-GAT-------------------A------AC--------T-T-------------------G-C-TGTAT---ATAT-CG---C-TCG-TCGG-T---T---TT--ACT-GTGT---G----GTA-CT-----------------------T--GA-TCAA-AAC-G-T-A-CT-GTGCA--------AA------GTA--C-TGC-----------T-GTATCGTACCT---GATTA-A-TTG-C-TGA-CTA--A--T-G-TGCT-GA---TCA-T-C-TGC---CGGAGCGCTTA-TCGCT-C-AC-CCTGCGATC-AA-----C--TT---GC--G-GGCC-GTAG--TGC---A--A--T---TGTC--TCA-------------G------T---A-------AAAAA-TCAA-GATAAG-GC-T--G--TTTTTGT----C---AAAAACA-C--TTGCTT-TTTTTTC--AAT--T-CT-TTTTTTCTGC--T-AC-GCA-TA---TTGA--T-TT-CA-GACG-A-TATATG-AGCAC-AAT--TCA--ACCGAT--AC-CAAATC-----ACCTATCA----TCA---TG-TTT----TTCGAA-GAAAC-TA-GTTT-TGGCA-G-----AT--TT--TATATTTATA------GCCTT-T--T-TA----TA--CTTCCAT-AA-ACAAA----TA-TCATTAA-C----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-A-CA-GTGT----CTT-A-----GCACAAATGC--GGTC--A--TTTT-CAT-G-T----TCAT-GTT--AATAGGA-AT-A---TC-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGACA
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gi|21                         : gatgtttactggaattctggttgctggtgctaatggttggttgatGGACG-GAA-A-ATGTA--CTG-A---GAAG-TG---TC-A-T------TT---T----------G---------------------TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--CG-T-GC-TG--TT---GATGTT--GA-T-------A-ATTAC-TG-T---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTTTTAGTCCT-G------AT-------A----A----TT-AC-T-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG-T---T---TTT-ACT-GTG----G----GTA-CT-GA-T---A----TTTA-----CT--GA-T----AA--G-T-A-CT-GTG-A--------AA------GTA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T----AA-T-A-TGCT-GA---T-A-T-C-TGC---CG-AG-ACTTA-TCGCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--GAG-CC-a
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gi|25                         :                                        attgaaGGACG-GAA-ACGTCTA--CTG-A---GA-GATG---TA-A-T------GT---T--T-A-CT--G----A---------TCAAGG-TA--C-T-------------------T-G-A-A-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------A-ATTA--TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTGTTGACT-T-G------A--------A----A----T--AC-T-G----TG----AGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG--T---AT-T-TA---A-T-G-T-TG-T---T-------ACT-GTGTTATGATATGTA-CT-GA-T---AAAAGT--A-----CT--G--T----G-G-G-T-A-CT-GCT-ATTTACTGTAA------ATA--C-TGT-----------G-G----GCAT-T---GAT-A-A-TTA-C-T
gi|26                         :                                           actGGACG-CAA-A-ATGTA--CTA-A---GA-G-TG---T--A-T------TT---TTGT-A-CT--G----ATATATACGGT--AAT-TA------G-AACT--AA-T-TAC--T-G-AT--T--TG-T-GCTTG--TTG--GGCGTG--GA-T-------A-ATTA--TGAT--------------G-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTGTTATTACT-G------A--------A----GT---T--AG-T-G----GT----GGTG---CT-GAT-------------------A------A---------TAT-------------------G-C--G-AG---ATAT-TA---C-T-G-T-GATT---T---TT--ACT-GTG----G----ATT-CTGGA-T---ATT--T--A-----CTG-GA-T----AAT-G-C-A-CT-GTG-A--------AA------GTA--C-T-T-----------GTG----ATAC-T---GAT-c
gi|27                         :                                            atGGACG-GAA-A-ATGTT--CTG-A---G----TG---TC-A-T------TT---T------CT----------------------T-TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--TA-T-GC-TG--TT---G----------------------------------------------G--TGC-T---------------------------------------T-G------T--------A----A----T--------------------TG---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------A-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG-----------------GTG----ACC--GTT-CT-GA-T---A----TTTA-----CT--GA-T----AAT-G-A-A-CT-GTG-A--------AA------GTA--C-CGT-----------G-G----GTAG-T---GAG-A-A---------------------G-TGCT-GA---T-A-A-C-TGC---CG-AG-GC-TA-TTGCT-T-GC-CATGCGATC-GA-----C--TT---GCG-G-G-CC-CT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------
gi|28                         :                                                     ct-A-ATTTT--CTG-A---AA-G-TA---TC-A-TC-----TT---T--T-G-CT--G----A---------A--AAT-CG--T-T-G-C--T--AA-T-TAC--T-G-TTA-T--TG-T-AC-TG--TT---GGTGAT--GA-T-------A-CGTCC-TGAT----G---------A-T--TGC-T-------------------G------------------------------------------A----T--A--T-G----T-------TA---CT-GAT-------------------AATTTATA---------T-T-------------------G-G-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G---GG-A---A---TT--ATC-GT----------TTAGCT----C---A----T--G-----AT--GA-T----GAG-G-A-A-CT-GAG-G--------AAC-----GTG--T-TAT-----------T-G----ATAT-T---GA--G-A-TTG-C-T
gi|29                         :                                         acagaacACG-CAA-A-ATGTA--CAG-A---GA-G-TG---TC-A-T----------------------------------------AAT-TA--C-T-G-A--T--A----TCC-------TA-T--TG-T-GCTTG--GT---GGTGCT--AT-T-------A-ATTACTTGAT----A---------A-G--TA----------------------A-------------------T-G------A--------A----GTCTTT--AC-T-G----TT----GGTA---CT-GAT-------------------A------ATGGACTGGGT-T-------------------G-C-TG-ATATAAT-T-TG---C-T-G-
gi|3                          :                                                                                                                                     actgt-T-G-A--T--A--T-TAC--T-G-ATA-TA-TGGT-GC-TGAATT---GGTG-T--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------AAG--TACCT-------------------G-------------------T-G------A--------A----AG---T--AA-T-G----TG----G-TA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TGCAT---AA-T-TATAAC-T-G-T-GG-T---T---TTT-ACT-GTG----G----GTA-CT-GA-T---AATCTT--A-----CT--GA-T----AAA-G-T-A-CT-GTG-A--------AA------GTA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-ACTTG-C-TGA-TA---A--T-G-TGCT-GA---T-A-T-C-TGCG--CG-AG-GCTTA-TCGCT-C-GCGCCTGCGATCAGA-----C--TT---GCCGG-G-CC-GT-G--TCT---A--A-AT--GTGTCTTTCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TC-AAGATAAG-GC-C--GTTTTTTT------C---AAAA----CAATT---TGTTTTTTC--AAT--TTATATTTGTTCTGAATT-AT-GCACTA---TAGA--T-TTGCAGG-CA-A-TAT-TGAAG-ACAAAT--GTC--AACGA---AC-CAAA-C-----CC-TAT-A----T-AAACTG-TTTAGTGAC-GAA-GAAACCTG-GTTT-TGGCA-G-----ATTCTT--T---TTTATA------GCCTT-TC-T-TA----TTC-CTTCCAT-AA-A--AA----TA-GTCTTAAGC----------------TTCA--C-T----AGTTTAAA-TAAATA-A-CAGATG-----ATT-A-----GCA---ATGC--GGCC--A--TTT--CAT-G-T----TCATGGT---AATAAGGAAT-A---TCTT----AG-T-ATTTTA-TTATACCGACAaaacatgtattacgtgtttggtttttattgtggtcc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTCTGA--T-AT-GCA-TA-------------------------AT--G-AG-AC-AAT--TCC--AAAGAA--AC-CTAA-C-----AC-TAT-T----T-A---TG-TTG----AT-GAC-GAAACCTG-GTTT-TGACA-GTTTTTTT--TT--T---TTTAAAT-----TCCTT-TCTT-TAAT--TT--CTTCCA--AA-A--AA----TA-TTtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcgttgaggttttatggataataaaattgatctgtgtatcaacttgtaatattcacggacattctgatcggagggtctttatctcaaatgaactaaatccgcgtatttgaaaatcaaaggagggcagcgggatggtgtttgcatgggcccgtgtttatatcaacagggcttgaaatttgactgtgatatcccatttactaaagaataaattgttcattaatttaattcattttatttattttttttacatataaaattatcaattacatgtatacattttattcgtgaaagcctagaatatgcgtattcaagttttgatcagacccagcctaactgtataaatttagaagggtaatctagttattatttacaatgtccgtatcaattcttaattaagaatctgcaacagttcaagccccaatccggacattgtagagtttaatttccaaattcaatatattagcataagaaagtggtggatattcgaccaacggtgacaacccgtaacggaaggcgtatgtgcatgaaataagaattgtccccgaggaactcatgtagtttcaaatactgca
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTA-TCGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----CTTTT---G---G-G-CC-GT-C--TGC---A--A-AT--GTGTG--TCA-------------G-A----T---A-------AAAAA-t
gi|33                         :                                                               --CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------CTATAT--T-A-CT--GATCCA---------T--AAT-TT--G-C-G-A--TACAA-T-TAC--T-GCATACT--TGTT-GC-TGT-TT---GGTACTTAGA-T---------ATTAC-TGACATAAA---------A-A--TACTT-------------------G-------------------T-G------A--------aatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtcgaagctgttgtcttgtgcaattgattt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAA----------------TTCAAGC-T----G-TTT-AA-TGAATC-G-TT-GTG-----ATT-ACAATAGTAT--ATGC--TG-C--A--TATGGCAT-GCT----TCAT-GT---AATAAGG-AT-AAACTT-T----AG-T-A-TTTA-TT-T-CCGA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GCA-G-----AT--TT--T---TTT-TATA----GCCTT-TC-T-TA----TT--CCTCCAC-AA-A--AA----TA-TTCTT-AAT----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-----AGTG-----ATT-A-----GCA---ATGC--GC-T--A--TT-----T-G-T----TCAT-AT---Atgtg
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTAAA-----------------TTCA--C-T----G-TTT-AA-T-AATC-A-TA-GTG-----ATT-ATAATAGTA---ATGC--GG-C--AATTTT--CATCG-C----TCCT-GT---AATAAGG-AT-A---TT-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGA
gi|37                         :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-TATTTTTTT---T--T-A-TT--G----A---------T--AAT-TA--C-T-G-A--T--AA-T-AAC--T-A-ATA-T--TG-T-GC-TG--TTCTGGGTTCT--GA-T-------A-TTTAC-TGtgt
gi|38                         :                                            ctGGATG--GA-A-ATGTA--TTG-A---GA-C-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--A----A---------T--AAT-TT--C-T-A-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--
gi|4                          :                                                                                                                                 act-TA--C-T-G-A--T--AA-TATA---T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--AA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA-----------G--TAC-T-------------------G-------------------T-G------AC-------A----A----G--AC-T-GG---TG----GGTA---CT-GAT-------------------A----------------T-T---------------------C-TG-AT---AT-T-TA-----T-G-T-GG-T---T---TTT-ACTTGTG----G----GTA-C--GA-TTTTA----T--------CT-----------AA-G-T-A-CTCGTG-A--------AG------ATA----TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T----AA-T-G-TGCT-GA---T----------------------TA-TCGCT-T-GC-CCTG-GATC-GA-----CC-TT---GC--G-G-CC-GTAG--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TCAA-GATAAG----C--G--TTTTT------T---AAAAA---CA-TT---T-TTTTTTT--AAT--TTCT-TTTTT-CTGA--TTAT-GCA-TACTATTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACAAT--AC-CAAA-C-----AC-TAT-A----T-A---TGTTTT----AT-GAA-GAAA-ATG-GTTT-TGGC--------AT--TT--T---TTTGTATA----GCCTT-TC-T-TA----TT--CTT-CAT-AA-A--AAAAATTA-TTCTTAAAC----------------TTCA--CTT----A-TTT-AA-T-AATC-A-CCAGTG------TT-A-----GCA---ATGC--GGCC--A--TTT--CAT-G-T----TCAT-GT----TTAAGG-A--A---TT-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACC-ACAatcacctgcttatggtgt
gi|40                         :                                              GGACG-GAA-A-ATGTA--CTA-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---TT-T-A-CT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-G-G--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-A--TG-T-GT-TG--tcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccttgggtttttggatactaatgatctgtgtatactttgtatcttccatggaatctcttgatcgagggtctttattcaatgaactaaaatccgcgtattgaaatctaacgaccgtgggatgtgttactgggcccgtgtttataatcaacaggctttgaaatttgacgtgatatccatttactgagaactaaattgttctttattattaatttatttttttatataattatcaatacatgtatacatgttttcggtgaagctaggtatttcgccagctctcacttgttttgatcagcaagcctaactgtaataattgaacagggtatctagttatattttcatgtcgtatcattcttatcaagatctgcaatcgtgcaagcccaatccggaattgttaattcaatttccaattcctttgatagtaataaaat
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gctAAA-C-----AC-TAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACCTG-GAAT-TGGCA-G-----AT--TT--TA--TTCA-AT-----GCCGC-TC-T-T
gi|42                         :                                              GGACG-CAA-A-ACATA--CGG-A---TA-G-TA---TC---T------TT---T--C---------------------------T-TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-A-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---ta
gi|43                         :                                           cctGGACG-GAA-A-ATGTA--CTT-T---GA-G-TG---TC-ATT------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TA--C-T-
gi|44                         :                                           attGGACGGCAA-A-ATGTAACTTG-A---GACG-TG---TC-A-T------TT---T--T-AACT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-attatga
gi|45                         :                                                       tactTGGA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TA--A-T-G-A--T--Aa
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  G-AG-GCTTA-TCTCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GT--G-G-ttgtgct
gi|47                         :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CT------GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--
gi|5                          :                                                         ctactA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-A------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAA--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TTC--GGTGCT--GAAT-------A-ATTACCTGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATCTACTCTTACCGT----T-G------AGTATGTTTA----A----TT-AC-TTG----TG----AGTA---CTTGAT-------------------A----------------T-T-------------------G-CATG--T---AT-T-T----C-T-G-T-GG-T---T---TTT-ACTAGTG----G----GTTTCT-GA-T---AATTTT--C-----TT--GA-T----AAT-G-TGA-CT-GTG-A--------CA------GTA--CCTGT-----------G-A------AC-T---GAT-AGA-TTG-C-TGAGT----ACGT-G-TGCTTGA---T-A-AAC-TGCACCTG-AG-GCTCAATCGCTGC-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TTGGCGC--G-G-CC-GTGG--TGT---AATA-AT--GTGTC--TCA-------------A-A----T-----------AAAAA-TCAAAG-T-GG-GC-C--G--TTTTTAAGAAAC---GAAA------------T-TTTTTGC--CAT--TTTT-TTTCCCTTGA--TGAT-GAA-TA---TTGA--T-TTTCA-GTC--AGTAT-TG--G-AC-AAT--TCC--AACGATTCAC-C-AA-C-----A--TAT-A----C-A---TG-ATT----A---GA-GAAACT---GTTT-TGACA-G------T--TTGAT---TTT-TAT-----GCCTG-TC-C-TT----TTAATTTCCA--AA-C--AA----TA-TTCTT-AAC----------------TTCA--C-TTA--G-TTT-A----AATC-AGCAGATGC----ATTGA-----TCA---ATGC--GGCC--A--CTT--CAT-G-T----T-AT-GTTCAAATAAGT-AT-A---TC-T----AGAT-A-TCTT-TT-TA
gi|6                          :                                            ggGGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-AAGAGA-G-T----TC-A-T------TTG--T--T-A-----G----A---------T--ATT-TG--C-T-G-A--T--A--T-TAC--T---ATA-T--TG-TTGC-T---TT---GATGCT--GA-T-------A-AT-AT-TGATT--AA---------A-T--TAC-T---------------------------------------T-G------A--------A----A----TTTAC-T------TGC---GGTA---C--GAT-------------------A------A---------T-T-------------------GGC-TG-AT---AT-T-TA---C-T-GCT-GG-T---TCT-TT--ACC-GTG----G----GTA-CT-GA-T---A----TT-A-----CT--GA-T----AAT-GAT-A-CT-GTG-A--------AA------G-A----TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TT--C-TGA-T----A--A-G-TGCT-GA---T-A-T---TGC---CG-AG-GCTTA-TCGCT-C-GC-CCTGCGATC-GAGAAAAC--TT---GCA-G-G-CC-GTTG--TGC---A--ATGT--GCGTC--T-A-------------G-G----T---A-------AAAAAATCAA-GATAAG-GC-C--G--TTTTT------TTTAAAAA----CA-TT---T-TTTTTTC--AAT--TTCT-TTTTT-CTGAC-T-ATTGCA-TACCGTTGA--T-TTTCA-G-CCTA-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----AC-TAT------T-A---TG-TTT----A--GAA-GAAGCCTG-GTTT-TGGCA-G-----AT--TT--T---TTTATA------GCC-T-TC-T-TA----TT---TTCCAT--A-A--AA----TA-TTCTTAACT----------------TCCA--C-T----A-TTT-AA---AATCAA-CCAGTGTGTCAATCGA-----GCA---ATGCG-GG-C--A--TTT--CAT-G-TATTATGAT-GT---AATAGGA-AT-A---TC-T----AG-TAA-TTTATTT-TACCGACacg
gi|7                          :                                             tGGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-G-A--T--AA-T-TTC--T-G-ATA-C--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------T-G------A--------A----A----T--A--T-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-GT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG-T---T---TT--ACT-GTG----G----GTA-TT-GA-T--------T--A-----CT--GA-T----AAA-G-T-A--T-GAT-A--------AA------GTA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T----A--T-G-TGCT-GA---T-A-T-C-TGC---CG-AG-GCTTA-TCGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----C--TT---GC--G-G-CG-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------GTG----T---A-------AAAAA-TCAAAGATAAG-GC-C--G--TTTTT------C---AAAA----C--TT---T-TTTTTTT--AAT--TTCT-TTTTTTCTGA--T-AT-GCA-T----TTG---C-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----AC-TAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACCTG-GTTT-TGGCA-G-----AC--TT--T---TTTATAT-----GCCTT-TC-T-TA----TT--CTTCCAT-AA-A--AT----TA-TTCTTAAAC----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-A-CAAGTG-----ATT-A-----GCA---ATGC--GG-C--A--TTT--CAT-G-T----TCAT-GT---AATAAGG-AT-A---TA-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGACA
gi|9                          :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TCCA-T------TT---T--TTA-CT--G----A---------T--AAT--G--C-T-G-A--T--AA-T--AC--T-G-ATA-T--TG-T-AC-TG--TT---G-TGCT--GA-T-------A-ATTAC-TG-T---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------T-G------A--------A----A----T--AC-T-G----TG----GATA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG-T---T---TT--ACT-GT-----G----GTA-CT-GA-T---AT---T--A-----TT--GATT----AAA-G-T-A-CT-GTG-A--------AA------GTA--C-TGT-----------GTG----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-TA---A--T-G-TGCT-GA---T-A-T-CTTGC---CG-A--GCTTATTCGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----C--TT---GCA-G-G-CT-GT-A--TGC---A--A-AT--GT-TC--TCA-------------G-G----TAAAA-------AAAAA-TC-AAGATAAG-G--C--G--TTTTT------T---AAAA----C-------------------AT-----T-TTTTTTCTTA--T-AT-GCA-TT---ATGA--T-TTGCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AAC-AT--AC-CAAA-C-----AC-TAT-A----T-A---TG-TTT----TT-GAA-GAAACCT--GTTT-TGACA-G-----AT--TT--TA--TTTA-AT-----GTCTA-TCTT-TATTTTTT--TTTCTATAAA-A--AA----TA-TTCTTAAA-----------------TTCA--A-TGGTAA-TAT-AA-T-AA
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): AATGATCTGTGTATAATTGTATATTTCATGGACATTCTGATCGAGGGTCTTTATCTCAAATGAACTAAATCCGCGTATTTGAAATCAACGGAGCCGCGGATGTGTTTCATGGGCCCGTGTTTATATCAACAGGCTTTGAAATTTGACCGTGATATCATTTACTAGAATAAATTGTTCATTTATTCATAATTTAATTTTTTTTAATATAAATTTATCAATTACATGTATACATTTTATTCGGTGAAAGCTAGGCTATTTAAGCAGCTTCATTGTTTTGATCAGCAGCCTAACTGTATAATTGACAGGGTAATCTAGTTATTTTTACATGTCCGTATCATTCCTTATCAAGATCTGCAACGTTCAAGCCCAATCGGACATTGTTTATTAATTTCATTCTTTATAGTACATAAATATTGCTAGAAGTGTGGATATCGCAACGGTGACCACCGTAACGTAAGAGACGTATGTGCCTGAAATAAGAATTGTCCCGAGGAACTTGGTTATGTTTCATACTGCAG
Unaligned ( gi|10 ): TTCATTTAAGTATTTGTAATATTTGTATGTATATTAGTCAGACAATTATTCTGAGAATTACCATGTATACATTTTATTCGTGAACTACGGTATTTAGCAGACGTCATTGTATTGTAGGATCACGCAACTGCGTCCTAAGCTTGAGACTCATTGGTTGACAAAGATAATCTAGATATAGTATTATATGTAGCATGTCCTGTTGCACTTCCTGTAAGGGTCAACTTATCATTGTGGCCAAACGTTGAAAAAGCCCAATAGAACCGGGTACATTCAGTGCTCACTGGGTTAATATATCTTCAAATTCTAATATGTACATGATAGAAGTGTTGGTGGAGTGGCGAGGTGGCGACGGTACTGACCAACGAGGCTTGAACGGAAGGGCAGAGGGAGGTATAGGAATGAAAATAGAACTTTGTCCCGAAGGACTTAATACTGTTTTAGTAACTGCAAGCA
Unaligned ( gi|12 ): ATGTAGATTAAATTGTTGATTTATTTTTTTTTTCTTATCAATAAATTATTAATTACATGTATATATTCTACTCCGTGAAGCTAGATATTTTTTTTTGGTAAAGCATCTTCATTGTTTTGATCCGCAAACCTATAACTGTATAATTGACAGGGTAATCTAGTTATTATTTACATGTCCGTATCATTCGTTATCAAGATCTGCAACGTTCAAGACCAATCCGGACATTGTTATTTAATTTCCAATTCTTTGATATGTACGTGCACGGTTAGCTAGATCAGTACATATATTGCTAGAAGTGTGGATATCGCAAGGAATATATGGTAACCGTAACGGTGACCACCGTAACGGAAGGCGTATACAACATGTTTATGAAATAAGAACTTGTCCCGAGGAACTTGTATGTTTCATACTGCA
Unaligned ( gi|18 ): ATAGAGAATTCCGCGCTAGGTTTTTGACGATAGATGCAGATGATCTTGTATACTTGTACTATTCCGATGAGACATTCGATCGAGGGTTCTTTATCTACATTGCGAACTAAACCGCTGTATATTGAAATCAACGGAAGGCCGAGGATGTGTTTATTATCCGCAGGCTTTTGAAAATTTGACGTGATATCCCTTTTAGATAAATTGTTGATTTGATTTATTTCATTATATTATATATATTTTGAAGCCTCATATATGCTATTCGGAAAAGCAGTTCATTGTTTTGCATCAGCAAGTTTATACTGTATAATTGGCAGGGCTA
Unaligned ( gi|22 ): CTGATAGAATTTTCAATATGGGTTTCTGATAATACAATGATCTGTGTATGAACTTGTATTCTCCATTGGAAATTCCTGATCGAGGGTCTTTATCTCAAATGAATTAAATCCGCGTACATTGAATTCAACAGAAAGCCGCGGGCTGTGTTTAATCACAGCTTTGAAATTTGACGTGATATCCATGTAGATTAAAATTTGTTGATTTATTCTTTATAAATTATTAATTACAGACCTTTGTTAGGGAAACCTTCAAATTTACATGGAATACA
Unaligned ( gi|24 ): GGGTTTTTGGATAATAAAATAATGATATGTGTATAACTTGTAATATTGCATGGACATTCTGATCGAGGGTCTTTATCTCAAATGAACTAAATCCGCGTATTTGAAATCAACAGAGCGCGCGGATGTGTTCATGGACCCGTGTTTATATCACAGGCTTTGAAAGAAGACCGGCGATATCCATTTACTAGAGTAAATGTTCATTTATTATATTACCATTGAATTTAAGAATATTTTTTATA
Unaligned ( gi|30 ): CTCTCATAGAAATTTCCGCGTAGGGATTTTGGATAAAATAATGATATTTGTATAACCTGTATATTCGATGGAAATACTAATCGGAGGTCTTTATCTCAAATGAACTAAATCGGCGTATTTGAAATGAAGGGAGCTGCTGGATGTGCTTTGAAATTTGACCGTGATATCCAT
Unaligned ( gi|39 ): TTTTCATTATTGATACTGGTTAATTCTGTGCATCTTGGGAAATGGCGATATTTACAGTGGTCTGATATTTACTGATA






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Reference ( family-919 )      :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------T-G---------A--------A----A----T--AC-T-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG--T---T---TT-ACT-GTG-G--GTA-CT-GA-T---A----T--A-----CT--GA-T----A-AN-G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--GTA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T----A--T-G-TGCT-GAT-AN-C-TGC---CG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----C--TT---GC--G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TCAAAGATAAG-GC-C--G--TTTT--T------C---AAA---A----C--T---TT-TTTTTTC--AAT--TTCT-TTTTTTCTGA--T-AT-GCA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACCTG-GTTT-TGGCA-G-----AT--TT--T---TTTATAT-----GCCTT-TC-T-TA----TT--CTTCCAT-AA--A-AA----TA-TTCTTAAAC----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-A-CAAGTG-----ATT-A-----GC---A-ATGC--GG-C--A--TTT--CAT-G-T----TCAT-G-T---AATAAGG-AT-A---TC-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGACA
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gi|11                         :                                             tGGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------A-G--TAC-----------------------------------------T-G---------A--------G----ATTTTT--AT-T-G----TT----GGTA---CT-GATACTTACTGTGGGTGCTGATA------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GGT-T---T---TT-ACT-GTG-G--ATT-CT-GA-T---ATT--T--A-----CT--GA-A----A-AT-G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--GTA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-TA---A--A-G-TGCT-GAT-AA-C-TGC---CA-AG-GC-TA-T---CGCT-C-AT-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GCG-G-G-CC-GT-G--TGCA--A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-A----T-----------AAAAA-TC--AGATAAGAACGC--G--TTTT--T------T---AAA---A----CAAT---AT-TTTTTTCCGAAT--T--T-TTTTTTCTGA--T-AT-GCA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTTT-A----T-A---TG-tgctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcgttaggtttttggataataaatgatctgtgcataaattgtatattccatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattccgaatgatacattctgatccggagttgaattcttatataacactcaaataaacatcacaatcctgacccctattttgaatcttattcgggcatgccgaaaaatcggagagtgtctcgtttcattgagcgagccctttcttattatcaaactggctttgaaattatgacacgtatatccattactagaatataatgtttcatgttcatatcactttaattatatttttttaatgataatcattgtcaattactaatgtaaatataatcttattccgctgttttttaaagctagtaattttagaagaagacttctatgtgtattcatttatgcaatcagatcaaagcccttacccttcaacgtattaattttgtacctccagtttgtaatctaattatatcctatatcgatagatctgcaccatctgtatacaagtccacagatccggacatgttatttaattttccaattcttgattttataacatacagtagtattgctagaagtgtggatacgcaacttggttggaccacggcgtatagcgataatgtttcgtatgatagcctgataataaggagcatgttcacgaaatagaactttg
gi|13                         :                                                                  TG-A---GA-G-TG---TC-A-C------TC---T--T---------------------------T-TA--C-T-G-A--T--AAAG-TAC--T-G-AGA-T--TT-TCAC-TG--TT---GGTACT--GA-T-------A-ATCAC-TG-----------------------------------------------------------------T-G---------A--------A------------------------------TG---CC-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---T-C-A-T-GG--T---T---------------------CT-GA-T---A----TTTG-----CT--GA-T----A-AT-G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--GTA--C-TGT-----------A-G----GTAC-T---GCT-A-A-TTG-C-TGA-TAA--A--A-G--GTT-GAA-AT-C-TGC---CG-AA-GC-TA-T---CACT-C-GC-TTTGCAATC-GA-----C--TT----CAGG-G-CC-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------T-A----T---A-------AGAAA-TC-AAGATAAG-GT-C--G----------------------------------------TTTTTTT--AATTATTGT-TTTTTTCTGA--T-AT-GGA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TTC--AACTAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACATG-GTTT-CGACA-G-----AC--TTA-A---TTTA-AT-----GCCTC-TCTT-TAAT--TT--CTTCCAT-AA--a
gi|14                         :                                              GGACG-GAA-A-ATGTA--C-G-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-G-A--T--A--T-TAC--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATATTTTTAC---------T-GTTGGACTATA--------A----T----T--AC-C-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GGTTT---T---TT-ACT-GTG-G--GTA-CT-GA-T---ATT--T--A-----CT--GA-T----A-AA-G-T-A-CT-G-T--A-----------------A---A--GTA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T----A--T---------------C-TGC---AG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GCG-G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TCAAAG-----------------------------------------------------TCTTTAC--AAT--TT-T-CGTTTTCTGA--T-AT-ACA-TT---ATGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAA--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----GT-GAA-GAAACCT
gi|15                         :                                               GACG-GAA-A-ATGTA--CTG----------CG---TC-A-T------TT---T--TTG-CT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-G--TG-T-GC-TG--TT---GGTACC--GA-T-------ATTTTAC-TGTT--------------G-G--TAC-T-------------------G-------------------A-T---------A--------A----T----T--GC-T-G----TG----AGTG---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---T-T-G-T-AGT-T---T---TT-ACT-GTG-G--GTT-CT-GA-T---ATT--T--A-----CT--GA-T----A-AT----------------------------------------GTA--T-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-TA---A--T-G-TGCT-GAT-AA-C-TGC---CG-AG-GC-TA-T---CACT-C-GC-CTAG-------------C--TT---GTG-G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-A----TGTC--TCG-------------G-G----T---A-------AATAA-TC-AAGATAAG-GC-CAAG--TTTA--A------A---AAA---A----C--T---TT-TTTTCAA--AAA--T--C-TTTTTTCTGA--T-AT-ATA-TA---TTGA--TATTT
gi|16                         :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTT-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-A-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGCGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------A-G---------ATT------T----G----T--AC-T-GTTAATT----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-TACTGTGAATGCTGATAATTG-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GGT-T---T---TT-ACT-GTG-A--GTT-CT-GA-T---ATT--T--A-----CT--GA-T----G-AT-G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--GTA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-TG---A--T-G-CGTT-GAT-AA-C-TAC---CG-AG-GC-TA-T---CGCT-C-GT-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--A-G-CC-GT-G--TGT---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-A----T---A-------AGAAA-TC-AAGATAAG-GC-C--G--TTTT--T------C---AAA---AACATC--T---TT-TTTTtttgttgttgttgatagactataatttaagttactata
gi|17                         :                                                                                                                                                      act-TAC--T-G-TTA-T--T--T-GC-TG--TT---GGTAAT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---A------------G--TAC-TGATATTTTTACTGTTGTACG-------------------T-G---------AT-------A----A----TT-AC-T-G----------GATA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TGGAT---AT-T-TA---C-T-T-T-TG--T---TCTTTT-ACT-GTG-G--GTT-CT-GA-T---A----TTTA-----CT--GA-T----A-AA-G-T-A-CT-G-AT-A-----------------A---A--GTA--C-TGT-----------G-G----GCAC-T---GAT-A-A-TTG---TGA-TA---A--T-G-TGCT-GAT-AT-C-TGC---CG-A--GCTTA-------CC-C-GC-CTTGCGAAC-GA-----T--TT---CG--G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gattattattatgtatgcttgttaacgtttatatttctgttggacgcccttattcagtttga-T----A--T-T-TGCT-GAT-AA-GGTGC---TG-A------A-T---CGCT-T-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--G-GGCC-AT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-A----T---A-------AGAAA-TC-AAGATAAG-GC-C--G--TTTT--T------TA--AAA---A----C--T---TT-TTTTCTC--GAA--TTTT-TTTTGTCTTA--T-AT-GCA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-G--A-CTT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-ACAATT-A---TG-TTC----AT-AAA-GAAACCTG-GTTT-TGACC-A-----AT--TT--CA--TTTA-AT-----GTCTT-TCTT-TAAT--TT--CTTCTAT-GA--A-AA----CA-TCCTTGAA-----------------TTCA--C-T----G-TTT-AA-C-AATC-A-TAA-TA-----ATT-A-----GC---A-AGGTG-GG-C--A--TTT--TAT-G-T----tatataacaatataagtgtacattaaaaatacccgatttttcct
gi|2                          :                                                 CG-CAA-A--TGTA--ATG-A---TA-G-TG---TC-A-T------TT---TATT-A--T--G----A------------AAT-TAGCC-T-T-A--T--AA-TCTAC--TCG-ATA-TCTTG---GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AATAAACAAACA-G--TAC-TAA-----------------G-------------------TCG---------A--------A----A----T--AC-T-GG---TGA---GGTAGACTT-GAT-------------------A------AC--------T-T-------------------G-C-TGTAT---ATAT-CG---C-TCG-TCGG--T---T---TT-ACT-GTGTG--GTA-CT-----------------------T--GA-TCAA-A-AC-G-T-A-CT-G-TGCA-----------------A---A--GTA--C-TGC-----------T-GTATCGTACCT---GATTA-A-TTG-C-TGA-CTA--A--T-G-TGCT-GATCAT-C-TGC---CGGAGCGCTTA-T---CGCT-C-AC-CCTGCGATC-AA-----C--TT---GCG-G-G-CC-GTAG--TGC------A-AT---TGTC--TCA---------------G----T---A-------AAAAA-TC-AAGATAAG-GC-T--G--TTTTTGT------C---AAAAACA----C--TTGCTT-TTTTTTC--AA---TTCT-TTTTTTCTGC--T-AC-GCA-TA---TTGA----TTTCA-GACG-A-TATATG-AGCAC-AAT--TCA--ACCGAT--AC-CAAATC-----ACCTATCA----TCA---TG-TTT----TTCGAA-GAAA-CTA-GTTT-TGGCA-G-----AT--TT--TATATTTATA------GCCTT-T--T-TA----TA--CTTCCAT-AAACA-AA----TA-TCATT-AAC----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-A-C-AGTGT----CTT-A-----GCACAA-ATGC--GGTC--AT-TTT--CAT-G-T----TCAT-GTT---AATAGGA-AT-A---TC-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGACA
gi|20                         :                                                                                                                                           act-A--T--AT-T-TAC--T-G-AGC-T--TA-T-AT-TG--TT---GGTACT-------------A-ATTAT-TG-----------------------C-T-------------------G-------------------T-G------------------------------------G----TT----GG-----CT-GAC-------------------A------A---------C-T-------------------G-CATT-AT---AT-T-AA---C-C-G-T-GA--TGATT---TT-ACT-GTA-A--GTT-CT-AA-T---A----TTCA-----TTTGGA-T----A-ATTG-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--GTA--C-TAT-----------G-G----GTAC-T---GAG-A-A-GTG-T-TGA-TA---A--T-G-TGTT----------------TG-AG-AC-TA-T---CGCT-TAGC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GCAAG-G-CA-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGGC--TCA-------------G-GGGAAT---A-------AAAAA-TCAAA-ATGAG-GC-T--T--TTTT--T------TTA-AAA---A----C--tgctcctctctctctctctctctctcatagaagtttcgcgttggttttggataaataaattatctgtgtcatatactgtcatatccatgacattctgataggtctttagtctcaaatgaactaattccgcgtatttgaaatcaaggagccgtgggagtgttccatttggcctgctttattaatgcaacaggcatttgaaatttgaccgtgatatccatttacttaaaaataaattgttacatttattcatttaatttattttttctaatatatacaattatcaataatgcatacattctagctattcggtcgaagctatagcctatgcctaccggttaaagcagcttcattgctttttaaagcagctttcatgttttgattcagcaagcctaactgatataattgacagggttatatagattatacttacactgtccgcctatcatccttatcaagatctgcaatctttcaagcccaatccgggacattgcttatttaattccaattctttgatagctacatgtaatatattgctgagataatgtgtggatatcgcaacggtgacaccgttacacggagcgtaggtgccatgaaataagaacttgtccggaggactttatgctctcataatgca
gi|21                         : gatgtttactggaattctggttgctggtgctaatggttggttgatGGACG-GAA-A-ATGTA--CTG-A---GAAG-TG---TC-A-T------TT---T----------G---------------------TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--CG-T-GC-TG--TT---GATGTT--GA-T-------A-ATTAC-TG-T---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTTTTAGTCCT-G---------AT-------A----A----TT-AC-T-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG--T---T---TTTACT-GTG-G--GTA-CT-GA-T---A----TTTA-----CT--GA-T----A-A--G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--GTA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T----AA-T-A-TGCT-GAT-AT-C-TGC---CG-AG-ACTTA-T---CGCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--GAG-CC-a
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gi|25                         :                                        attgaaGGACG-GAA-ACGTCTA--CTG-A---GA-GATG---TA-A-T------GT---T--T-A-CT--G----A---------TCAAGG-TA--C-T-------------------T-G-A-A-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------A-ATTA--TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTGTTGACT-T-G---------A--------A----A----T--AC-T-G----TG----AGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG--T---AT-T-TA---A-T-G-T-TG--T---T------ACT-GTG-T---TA--T-GA-T---A----TGTA-----CT--GA-T----AAAA-G-T-A-CT-G-TG-GGTACTGCTATTTACTGTA---A--ATA--C-TGT-----------G-G----GCAT-T---GAT-A-A-TTA-C-T
gi|26                         :                                           actGGACG-CAA-A-ATGTA--CTA-A---GA-G-TG---T--A-T------TT---TTGT-A-CT--G----ATATATACGGT--AAT-TA------G-AACT--AA-T-TAC--T-G-AT--T--TG-T-GCTTG--TTG--GGCGTG--GA-T-------A-ATTA--TGAT--------------G-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTGTTATTACT-G---------A--------A----GT---T--AG-T-G----GT----GGTG---CT-GAT-------------------A------A---------TAT-------------------G-C--G-AG---ATAT-TA---C-T-G-T-GAT-T---T---TT-ACT-GTG-G--ATT-CTGGA-T---ATT--T--A-----CTG-GA-T----A-AT-G-C-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--GTA--C-T-T-----------GTG----ATAC-T---GAT-c
gi|27                         :                                            atGGACG-GAA-A-ATGTT--CTG-A---G----TG---TC-A-T------TT---T------CT----------------------T-TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--TA-T-GC-TG--TT---G----------------------------------------------G--TGC-T---------------------------------------T-G---------T--------A----A----T--------------------TG---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------A-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG-----------------GTG-ACCGTT-CT-GA-T---A----TTTA-----CT--GA-T----A-AT-G-A-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--GTA--C-CGT-----------G-G----GTAG-T---GAG-A-A---------------------G-TGCT-GAT-AA-C-TGC---CG-AG-GC-TA-T---TGCT-T-GC-CATGCGATC-GA-----C--TT---GCG-G-G-CC-CT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------
gi|28                         :                                                     ct-A-ATTTT--CTG-A---AA-G-TA---TC-A-TC-----TT---T--T-G-CT--G----A---------A--AAT-CG--T-T-G-C--T--AA-T-TAC--T-G-TTA-T--TG-T-AC-TG--TT---GGTGAT--GA-T-------A-CGTCC-TGAT----G---------A-T--TGC-T-------------------G---------------------------------------------A----T--A--T-G----T-------TA---CT-GAT-------------------AATTTATA---------T-T-------------------G-G-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G---GG--A---A---TT-ATC-GT-----TTAGCT----C---A----T--G-----AT--GA-T----G-AG-G-A-A-CT-G-AG-G-----------------A---AC-GTG--T-TAT-----------T-G----ATAT-T---GA--G-A-TTG-C-T
gi|29                         :                                         acagaacACG-CAA-A-ATGTA--CAG-A---GA-G-TG---TC-A-T----------------------------------------AAT-TA--C-T-G-A--T--A----TCC-------TA-T--TG-T-GCTTG--GT---GGTGCT--AT-T-------A-ATTACTTGAT----A---------A-G--TA----------------------A-------------------T-G---------A--------A----GTCTTT--AC-T-G----TT----GGTA---CT-GAT-------------------A------ATGGACTGGGT-T-------------------G-C-TG-ATATAAT-T-TG---C-T-G-
gi|3                          :                                                                                                                                     actgt-T-G-A--T--A--T-TAC--T-G-ATA-TA-TGGT-GC-TGAATT---GGTG-T--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------AAG--TACCT-------------------G-------------------T-G---------A--------A----AG---T--AA-T-G----TG----G-TA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TGCAT---AA-T-TATAAC-T-G-T-GG--T---T---TTTACT-GTG-G--GTA-CT-GA-T---AATCTT--A-----CT--GA-T----A-AA-G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--GTA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-ACTTG-C-TGA-TA---A--T-G-TGCT-GAT-AT-C-TGCG--CG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GCGCCTGCGATCAGA-----C--TT---GCCGG-G-CC-GT-G--TCT---A--A-AT--GTGTCTTTCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TC-AAGATAAG-GC-C--GTTTTTT--T------C---AAA---A----CAAT---TTGTTTTTTC--AAT--TTATATTTGTTCTGAATT-AT-GCACTA---TAGA--T-TTGCAGG-CA-A-TAT-TGAAG-ACAAAT--GTC--AACGA---AC-CAAA-C-----C-CTAT-A----T-AAACTG-TTTAGTGAC-GAA-GAAACCTG-GTTT-TGGCA-G-----ATTCTT--T---TTTATA------GCCTT-TC-T-TA----TTC-CTTCCAT-AA--A-AA----TA-GTCTTAAGC----------------TTCA--C-T----AGTTTAAA-TAAATA-A-CAGATG-----ATT-A-----GC---A-ATGC--GGCC--A--TTT--CAT-G-T----TCATGG-T---AATAAGGAAT-A---TCTT----AG-T-ATTTTA-TTATACCGACAaaacatgtattacgtgtttggtttttattgtggtcc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTTCTGA--T-AT-GCA-TA-------------------------AT--G-AG-AC-AAT--TCC--AAAGAA--AC-CTAA-C-----A-CTAT-T----T-A---TG-TTG----AT-GAC-GAAACCTG-GTTT-TGACA-GTTTTTTT--TT--T---TTTAAAT-----TCCTT-TCTT-TAAT--TT--CTTCCA--AA--A-AA----TA-TTtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcgttgaggttttatggataataaaattgatctgtgtatcaacttgtaatattcacggacattctgatcggagggtctttatctcaaatgaactaaatccgcgtatttgaaaatcaaaggagggcagcgggatggtgtttgcatgggcccgtgtttatatcaacagggcttgaaatttgactgtgatatcccatttactaaagaataaattgttcattaatttaattcattttatttattttttttacatataaaattatcaattacatgtatacattttattcgtgaaagcctagaatatgcgtattcaagttttgatcagacccagcctaactgtataaatttagaagggtaatctagttattatttacaatgtccgtatcaattcttaattaagaatctgcaacagttcaagccccaatccggacattgtagagtttaatttccaaattcaatatattagcataagaaagtggtggatattcgaccaacggtgacaacccgtaacggaaggcgtatgtgcatgaaataagaattgtccccgaggaactcatgtagtttcaaatactgca
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTTA-T---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----CTTTT---G---G-G-CC-GT-C--TGC---A--A-AT--GTGTG--TCA-------------G-A----T---A-------AAAAA-t
gi|33                         :                                                               --CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------CTATAT--T-A-CT--GATCCA---------T--AAT-TT--G-C-G-A--TACAA-T-TAC--T-GCATACT--TGTT-GC-TGT-TT---GGTACTTAGA-T---------ATTAC-TGACATAAA---------A-A--TACTT-------------------G-------------------T-G---------A--------aatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtcgaagctgttgtcttgtgcaattgattt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAA----------------TTCAAGC-T----G-TTT-AA-TGAATC-G-TT-GTG-----ATT-ACAATAGT---ATATGC--TG-C--A--TATGGCAT-GCT----TCAT-G-T---AATAAGG-AT-AAACTT-T----AG-T-A-TTTA-TT-T-CCGA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCA-G-----AT--TT--T---TTT-TATA----GCCTT-TC-T-TA----TT--CCTCCAC-AA--A-AA----TA-TTCTT-AAT----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-----AGTG-----ATT-A-----GC---A-ATGC--GC-T--A--TT-----T-G-T----TCAT-A-T---Atgtg
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTAAA-----------------TTCA--C-T----G-TTT-AA-T-AATC-A-TA-GTG-----ATT-ATAATAGT---A-ATGC--GG-C--AATTTT--CATCG-C----TCCT-G-T---AATAAGG-AT-A---TT-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGA
gi|37                         :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-TATTTTTTT---T--T-A-TT--G----A---------T--AAT-TA--C-T-G-A--T--AA-T-AAC--T-A-ATA-T--TG-T-GC-TG--TTCTGGGTTCT--GA-T-------A-TTTAC-TGtgt
gi|38                         :                                            ctGGATG--GA-A-ATGTA--TTG-A---GA-C-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--A----A---------T--AAT-TT--C-T-A-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--
gi|4                          :                                                                                                                                 act-TA--C-T-G-A--T--AA-TATA---T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--AA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA-----------G--TAC-T-------------------G-------------------T-G---------AC-------A----A----G--AC-T-GG---TG----GGTA---CT-GAT-------------------A----------------T-T---------------------C-TG-AT---AT-T-TA-----T-G-T-GG--T---T---TTTACTTGTG-G--GTA-C--GA-TTTTA----T--------CT------------AA-G-T-A-CTCG-TG-A-----------------A---G--ATA----TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T----AA-T-G-TGCT-GAT---------------------TA-T---CGCT-T-GC-CCTG-GATC-GA-----CC-TT---GC--G-G-CC-GTAG--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TCAA-GATAAG----C--G--TTTT--T------T---AAA---AA---CA-T---TT-TTTTTTT--AAT--TTCT-TTTTT-CTGA--TTAT-GCA-TACTATTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACAAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TGTTTT----AT-GAA-GAAA-ATG-GTTT-TGGC--------AT--TT--T---TTTGTATA----GCCTT-TC-T-TA----TT--CTT-CAT-AA--A-AAAAATTA-TTCTTAAAC----------------TTCA--CTT----A-TTT-AA-T-AATC-A-CCAGTG------TT-A-----GC---A-ATGC--GGCC--A--TTT--CAT-G-T----TCAT-G-T----TTAAGG-A--A---TT-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACC-ACAatcacctgcttatggtgt
gi|40                         :                                              GGACG-GAA-A-ATGTA--CTA-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---TT-T-A-CT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-G-G--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-A--TG-T-GT-TG--tcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccttgggtttttggatactaatgatctgtgtatactttgtatcttccatggaatctcttgatcgagggtctttattcaatgaactaaaatccgcgtattgaaatctaacgaccgtgggatgtgttactgggcccgtgtttataatcaacaggctttgaaatttgacgtgatatccatttactgagaactaaattgttctttattattaatttatttttttatataattatcaatacatgtatacatgttttcggtgaagctaggtatttcgccagctctcacttgttttgatcagcaagcctaactgtaataattgaacagggtatctagttatattttcatgtcgtatcattcttatcaagatctgcaatcgtgcaagcccaatccggaattgttaattcaatttccaattcctttgatagtaataaaat
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gctAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACCTG-GAAT-TGGCA-G-----AT--TT--TA--TTCA-AT-----GCCGC-TC-T-T
gi|42                         :                                              GGACG-CAA-A-ACATA--CGG-A---TA-G-TA---TC---T------TT---T--C---------------------------T-TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-A-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---ta
gi|43                         :                                           cctGGACG-GAA-A-ATGTA--CTT-T---GA-G-TG---TC-ATT------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TA--C-T-
gi|44                         :                                           attGGACGGCAA-A-ATGTAACTTG-A---GACG-TG---TC-A-T------TT---T--T-AACT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-attatga
gi|45                         :                                                       tactTGGA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TA--A-T-G-A--T--Aa
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      G-AG-GCTTA-T---CTCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GT--G-G-ttgtgct
gi|47                         :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CT------GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--
gi|5                          :                                                         ctactA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-A------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAA--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TTC--GGTGCT--GAAT-------A-ATTACCTGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATCTACTCTTACCGT----T-G---------AGTATGTTTA----A----TT-AC-TTG----TG----AGTA---CTTGAT-------------------A----------------T-T-------------------G-CATG--T---AT-T-T----C-T-G-T-GG--T---T---TTTACTAGTG-G--GTTTCT-GA-T---AATTTT--C-----TT--GA-T----A-AT-G-TGA-CT-G-TG-A-----------------C---A--GTA--CCTGT-----------G-A------AC-T---GAT-AGA-TTG-C-TGAGT----ACGT-G-TGCTTGAT-AAAC-TGCACCTG-AG-GCTCAAT---CGCTGC-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TTGGCGC--G-G-CC-GTGG--TGT---AATA-AT--GTGTC--TCA-------------A-A----T-----------AAAAA-TCAAAG-T-GG-GC-C--G--TTTT--TAAGAAAC---GAA---A------------T-TTTTTGC--CAT--TTTT-TTTCCCTTGA--TGAT-GAA-TA---TTGA--T-TTTCA-GTC--AGTAT-TG--G-AC-AAT--TCC--AACGATTCAC-C-AA-C-----A--TAT-A----C-A---TG-ATT----A---GA-GAAACT---GTTT-TGACA-G------T--TTGAT---TTT-TAT-----GCCTG-TC-C-TT----TTAATTTCCA--AA--C-AA----TA-TTCTT-AAC----------------TTCA--C-TTA--G-TTT-A----AATC-AGCAGATGC----ATTGA-----TC---A-ATGC--GGCC--A--CTT--CAT-G-T----T-AT-G-TTCAAATAAGT-AT-A---TC-T----AGAT-A-TCTT-TT-TA
gi|6                          :                                            ggGGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-AAGAGA-G-T----TC-A-T------TTG--T--T-A-----G----A---------T--ATT-TG--C-T-G-A--T--A--T-TAC--T---ATA-T--TG-TTGC-T---TT---GATGCT--GA-T-------A-AT-AT-TGATT--AA---------A-T--TAC-T---------------------------------------T-G---------A--------A----A----TTTAC-T------TGC---GGTA---C--GAT-------------------A------A---------T-T-------------------GGC-TG-AT---AT-T-TA---C-T-GCT-GG--T---TCT-TT-ACC-GTG-G--GTA-CT-GA-T---A----TT-A-----CT--GA-T----A-AT-GAT-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G-A----TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TT--C-TGA-T----A--A-G-TGCT-GAT-AT---TGC---CG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GAGAAAAC--TT---GCA-G-G-CC-GTTG--TGC---A--ATGT--GCGTC--T-A-------------G-G----T---A-------AAAAAATCAA-GATAAG-GC-C--G--TTTT--T------TTTAAAA---A----CA-T---TT-TTTTTTC--AAT--TTCT-TTTTT-CTGAC-T-ATTGCA-TACCGTTGA--T-TTTCA-G-CCTA-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT------T-A---TG-TTT----A--GAA-GAAGCCTG-GTTT-TGGCA-G-----AT--TT--T---TTTATA------GCC-T-TC-T-TA----TT---TTCCAT--A--A-AA----TA-TTCTTAACT----------------TCCA--C-T----A-TTT-AA---AATCAA-CCAGTGTGTCAATCGA-----GC---A-ATGCG-GG-C--A--TTT--CAT-G-TATTATGAT-G-T---AATAGGA-AT-A---TC-T----AG-TAA-TTTATTT-TACCGACacg
gi|7                          :                                             tGGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-G-A--T--AA-T-TTC--T-G-ATA-C--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------A-ATTAC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------T-G---------A--------A----A----T--A--T-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-GT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG--T---T---TT-ACT-GTG-G--GTA-TT-GA-T--------T--A-----CT--GA-T----A-AA-G-T-A--T-G-AT-A-----------------A---A--GTA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T----A--T-G-TGCT-GAT-AT-C-TGC---CG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----C--TT---GC--G-G-CG-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------GTG----T---A-------AAAAA-TCAAAGATAAG-GC-C--G--TTTT--T------C---AAA---A----C--T---TT-TTTTTTT--AAT--TTCT-TTTTTTCTGA--T-AT-GCA-T----TTG---C-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACCTG-GTTT-TGGCA-G-----AC--TT--T---TTTATAT-----GCCTT-TC-T-TA----TT--CTTCCAT-AA--A-AT----TA-TTCTTAAAC----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-A-CAAGTG-----ATT-A-----GC---A-ATGC--GG-C--A--TTT--CAT-G-T----TCAT-G-T---AATAAGG-AT-A---TA-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGACA
gi|9                          :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TCCA-T------TT---T--TTA-CT--G----A---------T--AAT--G--C-T-G-A--T--AA-T--AC--T-G-ATA-T--TG-T-AC-TG--TT---G-TGCT--GA-T-------A-ATTAC-TG-T---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------T-G---------A--------A----A----T--AC-T-G----TG----GATA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG--T---T---TT-ACT-GT--G--GTA-CT-GA-T---AT---T--A-----TT--GATT----A-AA-G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--GTA--C-TGT-----------GTG----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-TA---A--T-G-TGCT-GAT-AT-CTTGC---CG-A--GCTTATT---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----C--TT---GCA-G-G-CT-GT-A--TGC---A--A-AT--GT-TC--TCA-------------G-G----TAAAA-------AAAAA-TC-AAGATAAG-G--C--G--TTTT--T------T---AAA---A----C-------------------AT-----T-TTTTTTCTTA--T-AT-GCA-TT---ATGA--T-TTGCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AAC-AT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----TT-GAA-GAAACCT--GTTT-TGACA-G-----AT--TT--TA--TTTA-AT-----GTCTA-TCTT-TATTTTTT--TTTCTATAAA--A-AA----TA-TTCTTAAA-----------------TTCA--A-TGGTAA-TAT-AA-T-AA
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): AATGATCTGTGTATAATTGTATATTTCATGGACATTCTGATCGAGGGTCTTTATCTCAAATGAACTAAATCCGCGTATTTGAAATCAACGGAGCCGCGGATGTGTTTCATGGGCCCGTGTTTATATCAACAGGCTTTGAAATTTGACCGTGATATCATTTACTAGAATAAATTGTTCATTTATTCATAATTTAATTTTTTTTAATATAAATTTATCAATTACATGTATACATTTTATTCGGTGAAAGCTAGGCTATTTAAGCAGCTTCATTGTTTTGATCAGCAGCCTAACTGTATAATTGACAGGGTAATCTAGTTATTTTTACATGTCCGTATCATTCCTTATCAAGATCTGCAACGTTCAAGCCCAATCGGACATTGTTTATTAATTTCATTCTTTATAGTACATAAATATTGCTAGAAGTGTGGATATCGCAACGGTGACCACCGTAACGTAAGAGACGTATGTGCCTGAAATAAGAATTGTCCCGAGGAACTTGGTTATGTTTCATACTGCAG
Unaligned ( gi|10 ): TTCATTTAAGTATTTGTAATATTTGTATGTATATTAGTCAGACAATTATTCTGAGAATTACCATGTATACATTTTATTCGTGAACTACGGTATTTAGCAGACGTCATTGTATTGTAGGATCACGCAACTGCGTCCTAAGCTTGAGACTCATTGGTTGACAAAGATAATCTAGATATAGTATTATATGTAGCATGTCCTGTTGCACTTCCTGTAAGGGTCAACTTATCATTGTGGCCAAACGTTGAAAAAGCCCAATAGAACCGGGTACATTCAGTGCTCACTGGGTTAATATATCTTCAAATTCTAATATGTACATGATAGAAGTGTTGGTGGAGTGGCGAGGTGGCGACGGTACTGACCAACGAGGCTTGAACGGAAGGGCAGAGGGAGGTATAGGAATGAAAATAGAACTTTGTCCCGAAGGACTTAATACTGTTTTAGTAACTGCAAGCA
Unaligned ( gi|12 ): ATGTAGATTAAATTGTTGATTTATTTTTTTTTTCTTATCAATAAATTATTAATTACATGTATATATTCTACTCCGTGAAGCTAGATATTTTTTTTTGGTAAAGCATCTTCATTGTTTTGATCCGCAAACCTATAACTGTATAATTGACAGGGTAATCTAGTTATTATTTACATGTCCGTATCATTCGTTATCAAGATCTGCAACGTTCAAGACCAATCCGGACATTGTTATTTAATTTCCAATTCTTTGATATGTACGTGCACGGTTAGCTAGATCAGTACATATATTGCTAGAAGTGTGGATATCGCAAGGAATATATGGTAACCGTAACGGTGACCACCGTAACGGAAGGCGTATACAACATGTTTATGAAATAAGAACTTGTCCCGAGGAACTTGTATGTTTCATACTGCA
Unaligned ( gi|18 ): ATAGAGAATTCCGCGCTAGGTTTTTGACGATAGATGCAGATGATCTTGTATACTTGTACTATTCCGATGAGACATTCGATCGAGGGTTCTTTATCTACATTGCGAACTAAACCGCTGTATATTGAAATCAACGGAAGGCCGAGGATGTGTTTATTATCCGCAGGCTTTTGAAAATTTGACGTGATATCCCTTTTAGATAAATTGTTGATTTGATTTATTTCATTATATTATATATATTTTGAAGCCTCATATATGCTATTCGGAAAAGCAGTTCATTGTTTTGCATCAGCAAGTTTATACTGTATAATTGGCAGGGCTA
Unaligned ( gi|22 ): CTGATAGAATTTTCAATATGGGTTTCTGATAATACAATGATCTGTGTATGAACTTGTATTCTCCATTGGAAATTCCTGATCGAGGGTCTTTATCTCAAATGAATTAAATCCGCGTACATTGAATTCAACAGAAAGCCGCGGGCTGTGTTTAATCACAGCTTTGAAATTTGACGTGATATCCATGTAGATTAAAATTTGTTGATTTATTCTTTATAAATTATTAATTACAGACCTTTGTTAGGGAAACCTTCAAATTTACATGGAATACA
Unaligned ( gi|24 ): GGGTTTTTGGATAATAAAATAATGATATGTGTATAACTTGTAATATTGCATGGACATTCTGATCGAGGGTCTTTATCTCAAATGAACTAAATCCGCGTATTTGAAATCAACAGAGCGCGCGGATGTGTTCATGGACCCGTGTTTATATCACAGGCTTTGAAAGAAGACCGGCGATATCCATTTACTAGAGTAAATGTTCATTTATTATATTACCATTGAATTTAAGAATATTTTTTATA
Unaligned ( gi|30 ): CTCTCATAGAAATTTCCGCGTAGGGATTTTGGATAAAATAATGATATTTGTATAACCTGTATATTCGATGGAAATACTAATCGGAGGTCTTTATCTCAAATGAACTAAATCGGCGTATTTGAAATGAAGGGAGCTGCTGGATGTGCTTTGAAATTTGACCGTGATATCCAT
Unaligned ( gi|39 ): TTTTCATTATTGATACTGGTTAATTCTGTGCATCTTGGGAAATGGCGATATTTACAGTGGTCTGATATTTACTGATA






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Reference ( family-919 )      :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------T-G---------A--------A----A----T--AC-T-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG--T---T---TT-A-CT-GTG-G--GTA-CT-GA-T---A----T--A-----CT--GA-T----A-AN-G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T---A-AT-G-TGCT-GAT-AN-C-TGC---CG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----C--TT---GC--G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TCAAAGATAAG-GC-C--G--TTTT--T------C---AAA---A----C--T---TT-TTTTTTC--AAT--TTCT-TTTTTTCTGA--T-AT-GCA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACCTG-GTTT-TGGCA-G-----AT--TT--T---TTTATAT-----GCCTT-TC-T-TA----TT--CTTCCAT-AA--A-AA----TA-TTCTTAAAC----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-A-CAAGTG-----ATT-A-----GC---A-ATGC--GG-C--A--TTT--CAT-G-T----TCAT-G-T---AATAAGG-AT-A---TC-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGACA
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gi|11                         :                                             tGGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AA---------A-G--TAC-----------------------------------------T-G---------A--------G----ATTTTT--AT-T-G----TT----GGTA---CT-GATACTTACTGTGGGTGCTGATA------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GGT-T---T---TT-A-CT-GTG-G--ATT-CT-GA-T---ATT--T--A-----CT--GA-A----A-AT-G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T---A-AA-G-TGCT-GAT-AA-C-TGC---CA-AG-GC-TA-T---CGCT-C-AT-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GCG-G-G-CC-GT-G--TGCA--A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-A----T-----------AAAAA-TC--AGATAAGAACGC--G--TTTT--T------T---AAA---A----CAAT---AT-TTTTTTCCGAAT--T--T-TTTTTTCTGA--T-AT-GCA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTTT-A----T-A---TG-tgctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcgttaggtttttggataataaatgatctgtgcataaattgtatattccatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattccgaatgatacattctgatccggagttgaattcttatataacactcaaataaacatcacaatcctgacccctattttgaatcttattcgggcatgccgaaaaatcggagagtgtctcgtttcattgagcgagccctttcttattatcaaactggctttgaaattatgacacgtatatccattactagaatataatgtttcatgttcatatcactttaattatatttttttaatgataatcattgtcaattactaatgtaaatataatcttattccgctgttttttaaagctagtaattttagaagaagacttctatgtgtattcatttatgcaatcagatcaaagcccttacccttcaacgtattaattttgtacctccagtttgtaatctaattatatcctatatcgatagatctgcaccatctgtatacaagtccacagatccggacatgttatttaattttccaattcttgattttataacatacagtagtattgctagaagtgtggatacgcaacttggttggaccacggcgtatagcgataatgtttcgtatgatagcctgataataaggagcatgttcacgaaatagaactttg
gi|13                         :                                                                  TG-A---GA-G-TG---TC-A-C------TC---T--T---------------------------T-TA--C-T-G-A--T--AAAG-TAC--T-G-AGA-T--TT-TCAC-TG--TT---GGTACT--GA-T-------AATC-AC-TG-----------------------------------------------------------------T-G---------A--------A------------------------------TG---CC-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---T-C-A-T-GG--T---T----------------------CT-GA-T---A----TTTG-----CT--GA-T----A-AT-G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-TGT-----------A-G----GTAC-T---GCT-A-A-TTG-C-TGA-T---A-AA-A-GGTT-GAA-AT-C-TGC---CG-AA-GC-TA-T---CACT-C-GC-TTTGCAATC-GA-----C--TT----CAGG-G-CC-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------T-A----T---A-------AGAAA-TC-AAGATAAG-GT-C--G----------------------------------------TTTTTTT--AATTATTGT-TTTTTTCTGA--T-AT-GGA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TTC--AACTAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACATG-GTTT-CGACA-G-----AC--TTA-A---TTTA-AT-----GCCTC-TCTT-TAAT--TT--CTTCCAT-AA--a
gi|14                         :                                              GGACG-GAA-A-ATGTA--C-G-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-G-A--T--A--T-TAC--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATATTTTTAC---------T-GTTGGACTATA--------A----T----T--AC-C-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GGTTT---T---TT-A-CT-GTG-G--GTA-CT-GA-T---ATT--T--A-----CT--GA-T----A-AA-G-T-A-CT-G-T--A-----------------A---A--G----TA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-T--------------------TGCT-GAT-AT-C-TGC---AG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GCG-G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TCAAAG-----------------------------------------------------TCTTTAC--AAT--TT-T-CGTTTTCTGA--T-AT-ACA-TT---ATGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAA--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----GT-GAA-GAAACCT
gi|15                         :                                               GACG-GAA-A-ATGTA--CTG----------CG---TC-A-T------TT---T--TTG-CT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-G--TG-T-GC-TG--TT---GGTACC--GA-T-------ATTTTAC-TGTT---G------------G--TAC-T-------------------G-------------------A-T---------A--------A----T----T--GC-T-G----TG----AGTG---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---T-T-G-T-AG--T---T---TTTA-CT-GTG-G--GTT-CT-GA-T---A----TTTA-----CT--GA-T----A-AT-G-T-A-TT-G-TG-----------------------------------------------------G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T---A-AT-G-TGCT-GAT-AA-C-TGC---CG-AG-GC-TA-T---CACT-C-GC-CTAG-------------C--TT---GTG-G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-A----TGTC--TCG-------------G-G----T---A-------AATAA-TC-AAGATAAG-GC-CAAG--TTTA--A------A---AAA---A----C--T---TT-TTTTCAA--AAA--T--C-TTTTTTCTGA--T-AT-ATA-TA---TTGA--TATTT
gi|16                         :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTT-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-A-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGCGCT--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------A-G---------ATT------T----G----T--AC-T-GTTAATT----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-TACTGTGAATGCTGATAATTG-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GGT-T---T---TT-A-CT-GTG-A--GTT-CT-GA-T---ATT--T--A-----CT--GA-T----G-AT-G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T---G-AT-G-CGTT-GAT-AA-C-TAC---CG-AG-GC-TA-T---CGCT-C-GT-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--A-G-CC-GT-G--TGT---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-A----T---A-------AGAAA-TC-AAGATAAG-GC-C--G--TTTT--T------C---AAA---AACATC--T---TT-TTTTtttgttgttgttgatagactataatttaagttactata
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gattattattatgtatgcttgttaacgtttatatttctgttggacgcccttattcagtttgaT-A-T-TTG-C-TGA-T---A-AG-G-TGCT-GA-----------------------A-T---CGCT-T-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--G-GGCC-AT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-A----T---A-------AGAAA-TC-AAGATAAG-GC-C--G--TTTT--T------TA--AAA---A----C--T---TT-TTTTCTC--GAA--TTTT-TTTTGTCTTA--T-AT-GCA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-G--A-CTT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-ACAATT-A---TG-TTC----AT-AAA-GAAACCTG-GTTT-TGACC-A-----AT--TT--CA--TTTA-AT-----GTCTT-TCTT-TAAT--TT--CTTCTAT-GA--A-AA----CA-TCCTTGAA-----------------TTCA--C-T----G-TTT-AA-C-AATC-A-TAA-TA-----ATT-A-----GC---A-AGGTG-GG-C--A--TTT--TAT-G-T----tatataacaatataagtgtacattaaaaatacccgatttttcct
gi|2                          :                                                 CG-CAA-A--TGTA--ATG-A---TA-G-TG---TC-A-T------TT---TATT-A--T--G----A------------AAT-TAGCC-T-T-A--T--AA-TCTAC--TCG-ATA-TCTTG---GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AATAAACAAACA-G--TAC-TAA-----------------G-------------------TCG---------A--------A----A----T--AC-T-GG---TGA---GGTAGACTT-GAT-------------------A------AC--------T-T-------------------G-C-TGTAT---ATAT-CG---C-TCG-TCGG--T---T---TT-A-CT-GTGTG--GTA-CT-----------------------T--GA-TCAA-A-AC-G-T-A-CT-G-TGCA-----------------A---A--G----TA--C-TGC-----------T-GTATCGTACCT---GATTA-A-TTG-C-TGACT---A-AT-G-TGCT-GATCAT-C-TGC---CGGAGCGCTTA-T---CGCT-C-AC-CCTGCGATC-AA-----C--TT---GCG-G-G-CC-GTAG--TGC------A-AT---TGTC--TCA---------------G----T---A-------AAAAA-TC-AAGATAAG-GC-T--G--TTTTTGT------C---AAAAACA----C--TTGCTT-TTTTTTC--AA---TTCT-TTTTTTCTGC--T-AC-GCA-TA---TTGA----TTTCA-GACG-A-TATATG-AGCAC-AAT--TCA--ACCGAT--AC-CAAATC-----ACCTATCA----TCA---TG-TTT----TTCGAA-GAAA-CTA-GTTT-TGGCA-G-----AT--TT--TATATTTATA------GCCTT-T--T-TA----TA--CTTCCAT-AAACA-AA----TA-TCATT-AAC----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-A-C-AGTGT----CTT-A-----GCACAA-ATGC--GGTC--AT-TTT--CAT-G-T----TCAT-GTT---AATAGGA-AT-A---TC-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGACA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    actG-AT---GT-T-TA---C-T-G-G-AA--T---T---CT-GGTT-GCT-G--GTG-CT-AA-T---GGT--T--GG----TT--GA-T----ATAT-T-T-A-CT-G--------------------------A--GCTTATA--T-TGT-----------T-G----GTAC-T---AAT-T-A-TTG-C-TG--T---G-GT-T-GGCT-GAC-AA-C-TGC---tgctcctctctctctctctctctctcatagaagtttcgcgttggttttggataaataaattatctgtgtcatatactgtcatatccatgacattctgataggtctttagtctcaaatgaactaattccgcgtatttgaaatcaaggagccgtgggagtgttccatttggcctgctttattaatgcaacaggcatttgaaatttgaccgtgatatccatttacttaaaaataaattgttacatttattcatttaatttattttttctaatatatacaattatcaataatgcatacattctagctattcggtcgaagctatagcctatgcctaccggttaaagcagcttcattgctttttaaagcagctttcatgttttgattcagcaagcctaactgatataattgacagggttatatagattatacttacactgtccgcctatcatccttatcaagatctgcaatctttcaagcccaatccgggacattgcttatttaattccaattctttgatagctacatgtaatatattgctgagataatgtgtggatatcgcaacggtgacaccgttacacggagcgtaggtgccatgaaataagaacttgtccggaggactttatgctctcataatgca
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gi|21                         : gatgtttactggaattctggttgctggtgctaatggttggttgatGGACG-GAA-A-ATGTA--CTG-A---GAAG-TG---TC-A-T------TT---T----------G---------------------TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--CG-T-GC-TG--TT---GATGTT--GA-T-------AATT-AC-TG-T---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTTTTAGTCCT-G---------AT-------A----A----TT-AC-T-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG--T---T---TTTA-CT-GTG-G--GTA-CT-GA-T---A----TTTA-----CT--GA-T----A-A--G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T---A-AT-A-TGCT-GAT-AT-C-TGC---CG-AG-ACTTA-T---CGCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--GAG-CC-a
gi|23                         :                                              ctACG-GAA-A-TTGTA--CTGGA---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-T-TTAGG----A---------T--AAT-TG--CAT-G-ATGT--AA-T-T-CTAT-G-A-A-T--TG-T-GC-TT--CT---GA-ACT--G------------------TGAT---AA---------T-G--TGC-T---------------------------------------T-G---------A---------------------CC-T-G----T-------TA---C-------------------------------A---------T-T-------------------G-T-AA-AT---TTGT-TA---CTT-G-T-GG--G---T---T----CT-GTATT--GTA-CT-GAGT---A----T--AGTAAGCT--GA-TTGAGA-AT-A-T-A-CTAG-T--------------------A---G--G----TAGCT-TGT-----------G-A----A-AA-T---AGT-A-A-TTG-CGGGA-TGC-A-AT-GTTGCT-GAT-CA-C-TGC---CT-AT-GCTTA-T----GCT-T-G
gi|25                         :                                        attgaaGGACG-GAA-ACGTCTA--CTG-A---GA-GATG---TA-A-T------GT---T--T-A-CT--G----A---------TCAAGG-TA--C-T-------------------T-G-A-A-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------AATT-A--TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTGTTGACT-T-G---------A--------A----A----T--AC-T-G----TG----AGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG--T---AT-T-TA---A-T-G-T-TG--T---T------A-CT-GTG-T---TA--T-GA-T---A----TGTA-----CT--GA-T----AAAA-G-T-A-CT-G-TG-GGTACTGCTATTTACTGTA---A--A----TA--C-TGT-----------G-G----GCAT-T---GAT-A-A-TTA-C-T
gi|26                         :                                           actGGACG-CAA-A-ATGTA--CTA-A---GA-G-TG---T--A-T------TT---TTGT-A-CT--G----ATATATACGGT--AAT-TA------G-AACT--AA-T-TAC--T-G-AT--T--TG-T-GCTTG--TTG--GGCGTG--GA-T-------AATT-A--TGAT--------------G-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTGTTATTACT-G---------A--------A----GT---T--AG-T-G----GT----GGTG---CT-GAT-------------------A------A---------TAT-------------------G-C--G-AG---ATAT-TA---C-T-G-T-GAT-T---T---TT-A-CT-GTG-G--ATT-CTGGA-T---ATT--T--A-----CTG-GA-T----A-AT-G-C-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-T-T-----------GTG----ATAC-T---GAT-c
gi|27                         :                                            atGGACG-GAA-A-ATGTT--CTG-A---G----TG---TC-A-T------TT---T------CT----------------------T-TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--TA-T-GC-TG--TT---G----------------------------------------------G--TGC-T---------------------------------------T-G---------T--------A----A----T--------------------TG---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------A-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG------------------GTG-ACCGTT-CT-GA-T---A----TTTA-----CT--GA-T----A-AT-G-A-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-CGT-----------G-G----GTAG-T---GAG-A-A--------------------G-TGCT-GAT-AA-C-TGC---CG-AG-GC-TA-T---TGCT-T-GC-CATGCGATC-GA-----C--TT---GCG-G-G-CC-CT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------
gi|28                         :                                                     ct-A-ATTTT--CTG-A---AA-G-TA---TC-A-TC-----TT---T--T-G-CT--G----A---------A--AAT-CG--T-T-G-C--T--AA-T-TAC--T-G-TTA-T--TG-T-AC-TG--TT---GGTGAT--GA-T-------ACGT-CC-TGAT----G---------A-T--TGC-T-------------------G---------------------------------------------A----T--A--T-G----T-------TA---CT-GAT-------------------AATTTATA---------T-T-------------------G-G-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G---GG--A---A---TT-A-TC-GT-----TTAGCT----C---A----T--G-----AT--GA-T----G-AG-G-A-A-CT-G-AG-G-----------------A---AC-G----TG--T-TAT-----------T-G----ATAT-T---GA--G-A-TTG-C-T
gi|29                         :                                         acagaacACG-CAA-A-ATGTA--CAG-A---GA-G-TG---TC-A-T----------------------------------------AAT-TA--C-T-G-A--T--A----TCC-------TA-T--TG-T-GCTTG--GT---GGTGCT--AT-T-------AATT-ACTTGAT----A---------A-G--TA----------------------A-------------------T-G---------A--------A----GTCTTT--AC-T-G----TT----GGTA---CT-GAT-------------------A------ATGGACTGGGT-T-------------------G-C-TG-ATATAAT-T-TG---C-T-G-
gi|3                          :                                                                                                                                     actgt-T-G-A--T--A--T-TAC--T-G-ATA-TA-TGGT-GC-TGAATT---GGTG-T--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AA---------AAG--TACCT-------------------G-------------------T-G---------A--------A----AG---T--AA-T-G----TG----G-TA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TGCAT---AA-T-TATAAC-T-G-T-GG--T---T---TTTA-CT-GTG-G--GTA-CT-GA-T---AATCTT--A-----CT--GA-T----A-AA-G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-ACTTG-C-TGA-T---A-AT-G-TGCT-GAT-AT-C-TGCG--CG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GCGCCTGCGATCAGA-----C--TT---GCCGG-G-CC-GT-G--TCT---A--A-AT--GTGTCTTTCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TC-AAGATAAG-GC-C--GTTTTTT--T------C---AAA---A----CAAT---TTGTTTTTTC--AAT--TTATATTTGTTCTGAATT-AT-GCACTA---TAGA--T-TTGCAGG-CA-A-TAT-TGAAG-ACAAAT--GTC--AACGA---AC-CAAA-C-----C-CTAT-A----T-AAACTG-TTTAGTGAC-GAA-GAAACCTG-GTTT-TGGCA-G-----ATTCTT--T---TTTATA------GCCTT-TC-T-TA----TTC-CTTCCAT-AA--A-AA----TA-GTCTTAAGC----------------TTCA--C-T----AGTTTAAA-TAAATA-A-CAGATG-----ATT-A-----GC---A-ATGC--GGCC--A--TTT--CAT-G-T----TCATGG-T---AATAAGGAAT-A---TCTT----AG-T-ATTTTA-TTATACCGACAaaacatgtattacgtgtttggtttttattgtggtcc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTCTGA--T-AT-GCA-TA-------------------------AT--G-AG-AC-AAT--TCC--AAAGAA--AC-CTAA-C-----A-CTAT-T----T-A---TG-TTG----AT-GAC-GAAACCTG-GTTT-TGACA-GTTTTTTT--TT--T---TTTAAAT-----TCCTT-TCTT-TAAT--TT--CTTCCA--AA--A-AA----TA-TTtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcgttgaggttttatggataataaaattgatctgtgtatcaacttgtaatattcacggacattctgatcggagggtctttatctcaaatgaactaaatccgcgtatttgaaaatcaaaggagggcagcgggatggtgtttgcatgggcccgtgtttatatcaacagggcttgaaatttgactgtgatatcccatttactaaagaataaattgttcattaatttaattcattttatttattttttttacatataaaattatcaattacatgtatacattttattcgtgaaagcctagaatatgcgtattcaagttttgatcagacccagcctaactgtataaatttagaagggtaatctagttattatttacaatgtccgtatcaattcttaattaagaatctgcaacagttcaagccccaatccggacattgtagagtttaatttccaaattcaatatattagcataagaaagtggtggatattcgaccaacggtgacaacccgtaacggaaggcgtatgtgcatgaaataagaattgtccccgaggaactcatgtagtttcaaatactgca
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTTA-T---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----CTTTT---G---G-G-CC-GT-C--TGC---A--A-AT--GTGTG--TCA-------------G-A----T---A-------AAAAA-t
gi|33                         :                                                               --CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------CTATAT--T-A-CT--GATCCA---------T--AAT-TT--G-C-G-A--TACAA-T-TAC--T-GCATACT--TGTT-GC-TGT-TT---GGTACTTAGA-T--------ATT-AC-TGACATAAA---------A-A--TACTT-------------------G-------------------T-G---------A--------aatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtcgaagctgttgtcttgtgcaattgattt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAA----------------TTCAAGC-T----G-TTT-AA-TGAATC-G-TT-GTG-----ATT-ACAATAGT---ATATGC--TG-C--A--TATGGCAT-GCT----TCAT-G-T---AATAAGG-AT-AAACTT-T----AG-T-A-TTTA-TT-T-CCGA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GCA-G-----AT--TT--T---TTT-TATA----GCCTT-TC-T-TA----TT--CCTCCAC-AA--A-AA----TA-TTCTT-AAT----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-----AGTG-----ATT-A-----GC---A-ATGC--GC-T--A--TT-----T-G-T----TCAT-A-T---Atgtg
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTAAA-----------------TTCA--C-T----G-TTT-AA-T-AATC-A-TA-GTG-----ATT-ATAATAGT---A-ATGC--GG-C--AATTTT--CATCG-C----TCCT-G-T---AATAAGG-AT-A---TT-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGA
gi|37                         :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-TATTTTTTT---T--T-A-TT--G----A---------T--AAT-TA--C-T-G-A--T--AA-T-AAC--T-A-ATA-T--TG-T-GC-TG--TTCTGGGTTCT--GA-T-------ATTT-AC-TGtgt
gi|38                         :                                            ctGGATG--GA-A-ATGTA--TTG-A---GA-C-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--A----A---------T--AAT-TT--C-T-A-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--
gi|4                          :                                                                                                                                 act-TA--C-T-G-A--T--AA-TATA---T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--AA-T-------AATT-AC-TGAT---AA-----------G--TAC-T-------------------G-------------------T-G---------AC-------A----A----G--AC-T-GG---TG----GGTA---CT-GAT-------------------A----------------T-T---------------------C-TG-AT---AT-T-TA-----T-G-T-GG--T---T---TTTA-CTTGTG-G--GTA-C--GA-TTTTA----T--------CT------------AA-G-T-A-CTCG-TG-A-----------------A---G--A----TA----TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T---A-AT-G-TGCT-GAT---------------------TA-T---CGCT-T-GC-CCTG-GATC-GA-----CC-TT---GC--G-G-CC-GTAG--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TCAA-GATAAG----C--G--TTTT--T------T---AAA---AA---CA-T---TT-TTTTTTT--AAT--TTCT-TTTTT-CTGA--TTAT-GCA-TACTATTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACAAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TGTTTT----AT-GAA-GAAA-ATG-GTTT-TGGC--------AT--TT--T---TTTGTATA----GCCTT-TC-T-TA----TT--CTT-CAT-AA--A-AAAAATTA-TTCTTAAAC----------------TTCA--CTT----A-TTT-AA-T-AATC-A-CCAGTG------TT-A-----GC---A-ATGC--GGCC--A--TTT--CAT-G-T----TCAT-G-T----TTAAGG-A--A---TT-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACC-ACAatcacctgcttatggtgt
gi|40                         :                                              GGACG-GAA-A-ATGTA--CTA-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---TT-T-A-CT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-G-G--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-A--TG-T-GT-TG--tcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccttgggtttttggatactaatgatctgtgtatactttgtatcttccatggaatctcttgatcgagggtctttattcaatgaactaaaatccgcgtattgaaatctaacgaccgtgggatgtgttactgggcccgtgtttataatcaacaggctttgaaatttgacgtgatatccatttactgagaactaaattgttctttattattaatttatttttttatataattatcaatacatgtatacatgttttcggtgaagctaggtatttcgccagctctcacttgttttgatcagcaagcctaactgtaataattgaacagggtatctagttatattttcatgtcgtatcattcttatcaagatctgcaatcgtgcaagcccaatccggaattgttaattcaatttccaattcctttgatagtaataaaat
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gctAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACCTG-GAAT-TGGCA-G-----AT--TT--TA--TTCA-AT-----GCCGC-TC-T-T
gi|42                         :                                              GGACG-CAA-A-ACATA--CGG-A---TA-G-TA---TC---T------TT---T--C---------------------------T-TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-A-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---ta
gi|43                         :                                           cctGGACG-GAA-A-ATGTA--CTT-T---GA-G-TG---TC-ATT------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TA--C-T-
gi|44                         :                                           attGGACGGCAA-A-ATGTAACTTG-A---GACG-TG---TC-A-T------TT---T--T-AACT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-attatga
gi|45                         :                                                       tactTGGA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TA--A-T-G-A--T--Aa
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          G-AG-GCTTA-T---CTCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GT--G-G-ttgtgct
gi|47                         :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CT------GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--
gi|5                          :                                                         ctactA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-A------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAA--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TTC--GGTGCT--GAAT-------AATT-ACCTGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATCTACTCTTACCGT----T-G---------AGTATGTTTA----A----TT-AC-TTG----TG----AGTA---CTTGAT-------------------A----------------T-T-------------------G-CATG--T---AT-T-T----C-T-G-T-GG--T---T---TTTA-CTAGTG-G--GTTTCT-GA-T---AATTTT--C-----TT--GA-T----A-AT-G-TGA-CT-G-TG-A-----------------C---A--G----TA--CCTGT-----------G-A------AC-T---GAT-AGA-TTG-C-TGAGT---ACGT-G-TGCTTGAT-AAAC-TGCACCTG-AG-GCTCAAT---CGCTGC-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TTGGCGC--G-G-CC-GTGG--TGT---AATA-AT--GTGTC--TCA-------------A-A----T-----------AAAAA-TCAAAG-T-GG-GC-C--G--TTTT--TAAGAAAC---GAA---A------------T-TTTTTGC--CAT--TTTT-TTTCCCTTGA--TGAT-GAA-TA---TTGA--T-TTTCA-GTC--AGTAT-TG--G-AC-AAT--TCC--AACGATTCAC-C-AA-C-----A--TAT-A----C-A---TG-ATT----A---GA-GAAACT---GTTT-TGACA-G------T--TTGAT---TTT-TAT-----GCCTG-TC-C-TT----TTAATTTCCA--AA--C-AA----TA-TTCTT-AAC----------------TTCA--C-TTA--G-TTT-A----AATC-AGCAGATGC----ATTGA-----TC---A-ATGC--GGCC--A--CTT--CAT-G-T----T-AT-G-TTCAAATAAGT-AT-A---TC-T----AGAT-A-TCTT-TT-TA
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Reference ( family-919 )      :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------T-G---------A--------A----A----T--AC-T-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG--T---T---TT-A-CT-GTG-G--GTA-CT-GA-T---A----T--A-----CT--GA-T----A-AN-G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T---A-AT-G-TGCT-GAT-AN-C-TGC---CG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----C--TT---GC--G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TCAAAGATAAG-GC-C--G--TTTT--T------C---AAA---A----C--T---TT-TTTTTTC--AAT--TTCT-TTTTTTCTGA--T-AT-GCA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACCTG-GTTT-TGGCA-G-----AT--TT--T---TTTATAT-----GCCTT-TC-T-TA----TT--CTTCCAT-AA--A-AA----TA-TTCTTAAAC----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-A-CAAGTG-----ATT-A-----GC---A-ATGC--GG-C--A--TTT--CAT-G-T----TCAT-G-T---AATAAGG-AT-A---TC-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGACA
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gi|15                         :                                               GACG-GAA-A-ATGTA--CTG----------CG---TC-A-T------TT---T--TTG-CT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-G--TG-T-GC-TG--TT---GGTACC--GA-T-------ATTTTAC-TGTT---G------------G--TAC-T-------------------G-------------------A-T---------A--------A----T----T--GC-T-G----TG----AGTG---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---T-T-G-T-AG--T---T---TTTA-CT-GTG-G--GTT-CT-GA-T---A----TTTA-----CT--GA-T----A-AT-G-T-A-TT-G-TG-----------------------------------------------------G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T---A-AT-G-TGCT-GAT-AA-C-TGC---CG-AG-GC-TA-T---CACT-C-GC-CTAG-------------C--TT---GTG-G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-A----TGTC--TCG-------------G-G----T---A-------AATAA-TC-AAGATAAG-GC-CAAG--TTTA--A------A---AAA---A----C--T---TT-TTTTCAA--AAA--T--C-TTTTTTCTGA--T-AT-ATA-TA---TTGA--TATTT
gi|16                         :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTT-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-A-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGCGCT--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------A-G---------ATT------T----G----T--AC-T-GTTAATT----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-TACTGTGAATGCTGATAATTG-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GGT-T---T---TT-A-CT-GTG-A--GTT-CT-GA-T---ATT--T--A-----CT--GA-T----G-AT-G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T---G-AT-G-CGTT-GAT-AA-C-TAC---CG-AG-GC-TA-T---CGCT-C-GT-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--A-G-CC-GT-G--TGT---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-A----T---A-------AGAAA-TC-AAGATAAG-GC-C--G--TTTT--T------C---AAA---AACATC--T---TT-TTTTtttgttgttgttgatagactataatttaagttactata
gi|17                         :                                                                                                                                                      act-TAC--T-G-TTA-T--T--T-GC-TG--TT---GGTAAT--GA-T-------AATT-AC-TGAT---A------------G--TAC-TGATATTTTTACTGTTGTACG-------------------T-G---------AT-------A----A----TT-AC-T-G----------GATA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TGGAT---AT-T-TA---C-T-T-T-TG--T---TCTTTT-A-CT-GTG-G--GTT-CT-GA-T---A----TTTA-----CT--GA-T----A-AA-G-T-A-CT-G-AT-A-----------------A---A--G----TA--C-TGT-----------G-G----GCAC-T---GAT-A-A-TTG---TGA-T---A-AT-G-TGCT-GAT-AT-C-TGC---CG-A--GCTTA-------CC-C-GC-CTTGCGAAC-GA-----T--TT---CG--G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gattattattatgtatgcttgttaacgtttatatttctgttggacgcccttattcagtttgaT-A-T-TTG-C-TGA-T---A-AG-G-TGCT-GA-----------------------A-T---CGCT-T-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--G-GGCC-AT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-A----T---A-------AGAAA-TC-AAGATAAG-GC-C--G--TTTT--T------TA--AAA---A----C--T---TT-TTTTCTC--GAA--TTTT-TTTTGTCTTA--T-AT-GCA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-G--A-CTT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-ACAATT-A---TG-TTC----AT-AAA-GAAACCTG-GTTT-TGACC-A-----AT--TT--CA--TTTA-AT-----GTCTT-TCTT-TAAT--TT--CTTCTAT-GA--A-AA----CA-TCCTTGAA-----------------TTCA--C-T----G-TTT-AA-C-AATC-A-TAA-TA-----ATT-A-----GC---A-AGGTG-GG-C--A--TTT--TAT-G-T----tatataacaatataagtgtacattaaaaatacccgatttttcct
gi|2                          :                                                 CG-CAA-A--TGTA--ATG-A---TA-G-TG---TC-A-T------TT---TATT-A--T--G----A------------AAT-TAGCC-T-T-A--T--AA-TCTAC--TCG-ATA-TCTTG---GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AATAAACAAACA-G--TAC-TAA-----------------G-------------------TCG---------A--------A----A----T--AC-T-GG---TGA---GGTAGACTT-GAT-------------------A------AC--------T-T-------------------G-C-TGTAT---ATAT-CG---C-TCG-TCGG--T---T---TT-A-CT-GTGTG--GTA-CT-----------------------T--GA-TCAA-A-AC-G-T-A-CT-G-TGCA-----------------A---A--G----TA--C-TGC-----------T-GTATCGTACCT---GATTA-A-TTG-C-TGACT---A-AT-G-TGCT-GATCAT-C-TGC---CGGAGCGCTTA-T---CGCT-C-AC-CCTGCGATC-AA-----C--TT---GCG-G-G-CC-GTAG--TGC------A-AT---TGTC--TCA---------------G----T---A-------AAAAA-TC-AAGATAAG-GC-T--G--TTTTTGT------C---AAAAACA----C--TTGCTT-TTTTTTC--AA---TTCT-TTTTTTCTGC--T-AC-GCA-TA---TTGA----TTTCA-GACG-A-TATATG-AGCAC-AAT--TCA--ACCGAT--AC-CAAATC-----ACCTATCA----TCA---TG-TTT----TTCGAA-GAAA-CTA-GTTT-TGGCA-G-----AT--TT--TATATTTATA------GCCTT-T--T-TA----TA--CTTCCAT-AAACA-AA----TA-TCATT-AAC----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-A-C-AGTGT----CTT-A-----GCACAA-ATGC--GGTC--AT-TTT--CAT-G-T----TCAT-GTT---AATAGGA-AT-A---TC-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGACA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    actG-AT---GT-T-TA---C-T-G-G-AA--T---T---CT-GGTT-GCT-G--GTG-CT-AA-T---GGT--T--GG----TT--GA-T----ATAT-T-T-A-CT-G--------------------------A--GCTTATA--T-TGT-----------T-G----GTAC-T---AAT-T-A-TTG-C-TG--T---G-GT-T-GGCT-GAC-AA-C-TGC---tgctcctctctctctctctctctctcatagaagtttcgcgttggttttggataaataaattatctgtgtcatatactgtcatatccatgacattctgataggtctttagtctcaaatgaactaattccgcgtatttgaaatcaaggagccgtgggagtgttccatttggcctgctttattaatgcaacaggcatttgaaatttgaccgtgatatccatttacttaaaaataaattgttacatttattcatttaatttattttttctaatatatacaattatcaataatgcatacattctagctattcggtcgaagctatagcctatgcctaccggttaaagcagcttcattgctttttaaagcagctttcatgttttgattcagcaagcctaactgatataattgacagggttatatagattatacttacactgtccgcctatcatccttatcaagatctgcaatctttcaagcccaatccgggacattgcttatttaattccaattctttgatagctacatgtaatatattgctgagataatgtgtggatatcgcaacggtgacaccgttacacggagcgtaggtgccatgaaataagaacttgtccggaggactttatgctctcataatgca
gi|20                         :                                                                                                                                              -A--T--AT-T-TAC--T-G-AGC-T--TA-T-AT-TG--TT---GGTACT-------------AATT-AT-TG-----------------------C-T-------------------G-------------------T-G------------------------------------G----TT----GG-----CT-GAC-------------------A------A---------C-T-------------------G-CATT-AT---AT-T-AA---C-C-G-T-GA--TGATT---TT-A-CT-GTA-A--GTT-CT-AA-T---A----TTCA-----TTTGGA-T----A-ATTG-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-TAT-----------G-G----GTAC-T---GAG-A-A-GTG-T-TGA-T---A-AT-G-TGTT----------------TG-AG-AC-TA-T---CGCT-TAGC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GCAAG-G-CA-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGGC--TCA-------------G-GGGAAT---A-------AAAAA-TCAAA-ATGAG-GC-T--T--TTTT--T------TTA-AAA---A----C--attatattaaccgtgatgattttactgtaagttctaatattcatttggataattgtactgtgaaagtactatgggtactgagaagtgttgataatgtgtttgagactatcgcttagccttgcgatcgacttgcaaggcagtgtgcaaatgtggctcaggggaataaaaaatcaaaatgaggctttttttttaaaaaca
gi|21                         : gatgtttactggaattctggttgctggtgctaatggttggttgatGGACG-GAA-A-ATGTA--CTG-A---GAAG-TG---TC-A-T------TT---T----------G---------------------TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--CG-T-GC-TG--TT---GATGTT--GA-T-------AATT-AC-TG-T---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTTTTAGTCCT-G---------AT-------A----A----TT-AC-T-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG--T---T---TTTA-CT-GTG-G--GTA-CT-GA-T---A----TTTA-----CT--GA-T----A-A--G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T---A-AT-A-TGCT-GAT-AT-C-TGC---CG-AG-ACTTA-T---CGCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--GAG-CC-a
gi|23                         :                                              ctACG-GAA-A-TTGTA--CTGGA---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-T-TTAGG----A---------T--AAT-TG--CAT-G-ATGT--AA-T-T-CTAT-G-A-A-T--TG-T-GC-TT--CT---GA-ACT--G------------------TGAT---AA---------T-G--TGC-T---------------------------------------T-G---------A---------------------CC-T-G----T-------TA---C-------------------------------A---------T-T-------------------G-T-AA-AT---TTGT-TA---CTT-G-T-GG--G---T---T----CT-GTATT--GTA-CT-GAGT---A----T--AGTAAGCT--GA-TTGAGA-AT-A-T-A-CTAG-T--------------------A---G--G----TAGCT-TGT-----------G-A----A-AA-T---AGT-A-A-TTG-CGGGA-TGC-A-AT-GTTGCT-GAT-CA-C-TGC---CT-AT-GCTTA-T----GCT-T-G
gi|25                         :                                        attgaaGGACG-GAA-ACGTCTA--CTG-A---GA-GATG---TA-A-T------GT---T--T-A-CT--G----A---------TCAAGG-TA--C-T-------------------T-G-A-A-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------AATT-A--TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTGTTGACT-T-G---------A--------A----A----T--AC-T-G----TG----AGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG--T---AT-T-TA---A-T-G-T-TG--T---T------A-CT-GTG-T---TA--T-GA-T---A----TGTA-----CT--GA-T----AAAA-G-T-A-CT-G-TG-GGTACTGCTATTTACTGTA---A--A----TA--C-TGT-----------G-G----GCAT-T---GAT-A-A-TTA-C-T
gi|26                         :                                           actGGACG-CAA-A-ATGTA--CTA-A---GA-G-TG---T--A-T------TT---TTGT-A-CT--G----ATATATACGGT--AAT-TA------G-AACT--AA-T-TAC--T-G-AT--T--TG-T-GCTTG--TTG--GGCGTG--GA-T-------AATT-A--TGAT--------------G-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTGTTATTACT-G---------A--------A----GT---T--AG-T-G----GT----GGTG---CT-GAT-------------------A------A---------TAT-------------------G-C--G-AG---ATAT-TA---C-T-G-T-GAT-T---T---TT-A-CT-GTG-G--ATT-CTGGA-T---ATT--T--A-----CTG-GA-T----A-AT-G-C-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-T-T-----------GTG----ATAC-T---GAT-c
gi|27                         :                                            atGGACG-GAA-A-ATGTT--CTG-A---G----TG---TC-A-T------TT---T------CT----------------------T-TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--TA-T-GC-TG--TT---G----------------------------------------------G--TGC-T---------------------------------------T-G---------T--------A----A----T--------------------TG---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------A-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG------------------GTG-ACCGTT-CT-GA-T---A----TTTA-----CT--GA-T----A-AT-G-A-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-CGT-----------G-G----GTAG-T---GAG-A-A--------------------G-TGCT-GAT-AA-C-TGC---CG-AG-GC-TA-T---TGCT-T-GC-CATGCGATC-GA-----C--TT---GCG-G-G-CC-CT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------
gi|28                         :                                                     ct-A-ATTTT--CTG-A---AA-G-TA---TC-A-TC-----TT---T--T-G-CT--G----A---------A--AAT-CG--T-T-G-C--T--AA-T-TAC--T-G-TTA-T--TG-T-AC-TG--TT---GGTGAT--GA-T-------ACGT-CC-TGAT----G---------A-T--TGC-T-------------------G---------------------------------------------A----T--A--T-G----T-------TA---CT-GAT-------------------AATTTATA---------T-T-------------------G-G-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G---GG--A---A---TT-A-TC-GT-----TTAGCT----C---A----T--G-----AT--GA-T----G-AG-G-A-A-CT-G-AG-G-----------------A---AC-G----TG--T-TAT-----------T-G----ATAT-T---GA--G-A-TTG-C-T
gi|29                         :                                         acagaacACG-CAA-A-ATGTA--CAG-A---GA-G-TG---TC-A-T----------------------------------------AAT-TA--C-T-G-A--T--A----TCC-------TA-T--TG-T-GCTTG--GT---GGTGCT--AT-T-------AATT-ACTTGAT----A---------A-G--TA----------------------A-------------------T-G---------A--------A----GTCTTT--AC-T-G----TT----GGTA---CT-GAT-------------------A------ATGGACTGGGT-T-------------------G-C-TG-ATATAAT-T-TG---C-T-G-
gi|3                          :                                                                                                                                     actgt-T-G-A--T--A--T-TAC--T-G-ATA-TA-TGGT-GC-TGAATT---GGTG-T--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AA---------AAG--TACCT-------------------G-------------------T-G---------A--------A----AG---T--AA-T-G----TG----G-TA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TGCAT---AA-T-TATAAC-T-G-T-GG--T---T---TTTA-CT-GTG-G--GTA-CT-GA-T---AATCTT--A-----CT--GA-T----A-AA-G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-ACTTG-C-TGA-T---A-AT-G-TGCT-GAT-AT-C-TGCG--CG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GCGCCTGCGATCAGA-----C--TT---GCCGG-G-CC-GT-G--TCT---A--A-AT--GTGTCTTTCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TC-AAGATAAG-GC-C--GTTTTTT--T------C---AAA---A----CAAT---TTGTTTTTTC--AAT--TTATATTTGTTCTGAATT-AT-GCACTA---TAGA--T-TTGCAGG-CA-A-TAT-TGAAG-ACAAAT--GTC--AACGA---AC-CAAA-C-----C-CTAT-A----T-AAACTG-TTTAGTGAC-GAA-GAAACCTG-GTTT-TGGCA-G-----ATTCTT--T---TTTATA------GCCTT-TC-T-TA----TTC-CTTCCAT-AA--A-AA----TA-GTCTTAAGC----------------TTCA--C-T----AGTTTAAA-TAAATA-A-CAGATG-----ATT-A-----GC---A-ATGC--GGCC--A--TTT--CAT-G-T----TCATGG-T---AATAAGGAAT-A---TCTT----AG-T-ATTTTA-TTATACCGACAaaacatgtattacgtgtttggtttttattgtggtcc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTCTGA--T-AT-GCA-TA-------------------------AT--G-AG-AC-AAT--TCC--AAAGAA--AC-CTAA-C-----A-CTAT-T----T-A---TG-TTG----AT-GAC-GAAACCTG-GTTT-TGACA-GTTTTTTT--TT--T---TTTAAAT-----TCCTT-TCTT-TAAT--TT--CTTCCA--AA--A-AA----TA-TTtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcgttgaggttttatggataataaaattgatctgtgtatcaacttgtaatattcacggacattctgatcggagggtctttatctcaaatgaactaaatccgcgtatttgaaaatcaaaggagggcagcgggatggtgtttgcatgggcccgtgtttatatcaacagggcttgaaatttgactgtgatatcccatttactaaagaataaattgttcattaatttaattcattttatttattttttttacatataaaattatcaattacatgtatacattttattcgtgaaagcctagaatatgcgtattcaagttttgatcagacccagcctaactgtataaatttagaagggtaatctagttattatttacaatgtccgtatcaattcttaattaagaatctgcaacagttcaagccccaatccggacattgtagagtttaatttccaaattcaatatattagcataagaaagtggtggatattcgaccaacggtgacaacccgtaacggaaggcgtatgtgcatgaaataagaattgtccccgaggaactcatgtagtttcaaatactgca
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTTA-T---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----CTTTT---G---G-G-CC-GT-C--TGC---A--A-AT--GTGTG--TCA-------------G-A----T---A-------AAAAA-t
gi|33                         :                                                               --CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------CTATAT--T-A-CT--GATCCA---------T--AAT-TT--G-C-G-A--TACAA-T-TAC--T-GCATACT--TGTT-GC-TGT-TT---GGTACTTAGA-T--------ATT-AC-TGACATAAA---------A-A--TACTT-------------------G-------------------T-G---------A--------aatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtcgaagctgttgtcttgtgcaattgattt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAA----------------TTCAAGC-T----G-TTT-AA-TGAATC-G-TT-GTG-----ATT-ACAATAGT---ATATGC--TG-C--A--TATGGCAT-GCT----TCAT-G-T---AATAAGG-AT-AAACTT-T----AG-T-A-TTTA-TT-T-CCGA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GCA-G-----AT--TT--T---TTT-TATA----GCCTT-TC-T-TA----TT--CCTCCAC-AA--A-AA----TA-TTCTT-AAT----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-----AGTG-----ATT-A-----GC---A-ATGC--GC-T--A--TT-----T-G-T----TCAT-A-T---Atgtg
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTAAA-----------------TTCA--C-T----G-TTT-AA-T-AATC-A-TA-GTG-----ATT-ATAATAGT---A-ATGC--GG-C--AATTTT--CATCG-C----TCCT-G-T---AATAAGG-AT-A---TT-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGA
gi|37                         :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-TATTTTTTT---T--T-A-TT--G----A---------T--AAT-TA--C-T-G-A--T--AA-T-AAC--T-A-ATA-T--TG-T-GC-TG--TTCTGGGTTCT--GA-T-------ATTT-AC-TGtgt
gi|38                         :                                            ctGGATG--GA-A-ATGTA--TTG-A---GA-C-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--A----A---------T--AAT-TT--C-T-A-A--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-T--
gi|4                          :                                                                                                                                 act-TA--C-T-G-A--T--AA-TATA---T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--AA-T-------AATT-AC-TGAT---AA-----------G--TAC-T-------------------G-------------------T-G---------AC-------A----A----G--AC-T-GG---TG----GGTA---CT-GAT-------------------A----------------T-T---------------------C-TG-AT---AT-T-TA-----T-G-T-GG--T---T---TTTA-CTTGTG-G--GTA-C--GA-TTTTA----T--------CT------------AA-G-T-A-CTCG-TG-A-----------------A---G--A----TA----TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T---A-AT-G-TGCT-GAT---------------------TA-T---CGCT-T-GC-CCTG-GATC-GA-----CC-TT---GC--G-G-CC-GTAG--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TCAA-GATAAG----C--G--TTTT--T------T---AAA---AA---CA-T---TT-TTTTTTT--AAT--TTCT-TTTTT-CTGA--TTAT-GCA-TACTATTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACAAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TGTTTT----AT-GAA-GAAA-ATG-GTTT-TGGC--------AT--TT--T---TTTGTATA----GCCTT-TC-T-TA----TT--CTT-CAT-AA--A-AAAAATTA-TTCTTAAAC----------------TTCA--CTT----A-TTT-AA-T-AATC-A-CCAGTG------TT-A-----GC---A-ATGC--GGCC--A--TTT--CAT-G-T----TCAT-G-T----TTAAGG-A--A---TT-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACC-ACAatcacctgcttatggtgt
gi|40                         :                                              GGACG-GAA-A-ATGTA--CTA-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---TT-T-A-CT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-G-G--T--AA-T-TAC--T-G-ATA-A--TG-T-GT-TG--tcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccttgggtttttggatactaatgatctgtgtatactttgtatcttccatggaatctcttgatcgagggtctttattcaatgaactaaaatccgcgtattgaaatctaacgaccgtgggatgtgttactgggcccgtgtttataatcaacaggctttgaaatttgacgtgatatccatttactgagaactaaattgttctttattattaatttatttttttatataattatcaatacatgtatacatgttttcggtgaagctaggtatttcgccagctctcacttgttttgatcagcaagcctaactgtaataattgaacagggtatctagttatattttcatgtcgtatcattcttatcaagatctgcaatcgtgcaagcccaatccggaattgttaattcaatttccaattcctttgatagtaataaaat
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gctAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACCTG-GAAT-TGGCA-G-----AT--TT--TA--TTCA-AT-----GCCGC-TC-T-T
gi|42                         :                                              GGACG-CAA-A-ACATA--CGG-A---TA-G-TA---TC---T------TT---T--C---------------------------T-TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAC--T-A-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---ta
gi|43                         :                                           cctGGACG-GAA-A-ATGTA--CTT-T---GA-G-TG---TC-ATT------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TA--C-T-
gi|44                         :                                           attGGACGGCAA-A-ATGTAACTTG-A---GACG-TG---TC-A-T------TT---T--T-AACT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-attatga
gi|45                         :                                                       tactTGGA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TA--A-T-G-A--T--Aa
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          G-AG-GCTTA-T---CTCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GT--G-G-ttgtgct
gi|47                         :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CT------GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--
gi|5                          :                                                         ctactA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-A------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAA--T-G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TTC--GGTGCT--GAAT-------AATT-ACCTGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATCTACTCTTACCGT----T-G---------AGTATGTTTA----A----TT-AC-TTG----TG----AGTA---CTTGAT-------------------A----------------T-T-------------------G-CATG--T---AT-T-T----C-T-G-T-GG--T---T---TTTA-CTAGTG-G--GTTTCT-GA-T---AATTTT--C-----TT--GA-T----A-AT-G-TGA-CT-G-TG-A-----------------C---A--G----TA--CCTGT-----------G-A------AC-T---GAT-AGA-TTG-C-TGAGT---ACGT-G-TGCTTGAT-AAAC-TGCACCTG-AG-GCTCAAT---CGCTGC-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TTGGCGC--G-G-CC-GTGG--TGT---AATA-AT--GTGTC--TCA-------------A-A----T-----------AAAAA-TCAAAG-T-GG-GC-C--G--TTTT--TAAGAAAC---GAA---A------------T-TTTTTGC--CAT--TTTT-TTTCCCTTGA--TGAT-GAA-TA---TTGA--T-TTTCA-GTC--AGTAT-TG--G-AC-AAT--TCC--AACGATTCAC-C-AA-C-----A--TAT-A----C-A---TG-ATT----A---GA-GAAACT---GTTT-TGACA-G------T--TTGAT---TTT-TAT-----GCCTG-TC-C-TT----TTAATTTCCA--AA--C-AA----TA-TTCTT-AAC----------------TTCA--C-TTA--G-TTT-A----AATC-AGCAGATGC----ATTGA-----TC---A-ATGC--GGCC--A--CTT--CAT-G-T----T-AT-G-TTCAAATAAGT-AT-A---TC-T----AGAT-A-TCTT-TT-TA
gi|6                          :                                            ggGGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-AAGAGA-G-T----TC-A-T------TTG--T--T-A-----G----A---------T--ATT-TG--C-T-G-A--T--A--T-TAC--T---ATA-T--TG-TTGC-T---TT---GATGCT--GA-T-------AAT--AT-TGATT--AA---------A-T--TAC-T---------------------------------------T-G---------A--------A----A----TTTAC-T------TGC---GGTA---C--GAT-------------------A------A---------T-T-------------------GGC-TG-AT---AT-T-TA---C-T-GCT-GG--T---TCT-TT-A-CC-GTG-G--GTA-CT-GA-T---A----TT-A-----CT--GA-T----A-AT-GAT-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G-----A----TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TT--C-TGA-T---A-A--G-TGCT-GAT-AT---TGC---CG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GAGAAAAC--TT---GCA-G-G-CC-GTTG--TGC---A--ATGT--GCGTC--T-A-------------G-G----T---A-------AAAAAATCAA-GATAAG-GC-C--G--TTTT--T------TTTAAAA---A----CA-T---TT-TTTTTTC--AAT--TTCT-TTTTT-CTGAC-T-ATTGCA-TACCGTTGA--T-TTTCA-G-CCTA-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT------T-A---TG-TTT----A--GAA-GAAGCCTG-GTTT-TGGCA-G-----AT--TT--T---TTTATA------GCC-T-TC-T-TA----TT---TTCCAT--A--A-AA----TA-TTCTTAACT----------------TCCA--C-T----A-TTT-AA---AATCAA-CCAGTGTGTCAATCGA-----GC---A-ATGCG-GG-C--A--TTT--CAT-G-TATTATGAT-G-T---AATAGGA-AT-A---TC-T----AG-TAA-TTTATTT-TACCGACacg
gi|7                          :                                             tGGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-G-A--T--AA-T-TTC--T-G-ATA-C--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------T-G---------A--------A----A----T--A--T-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-GT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG--T---T---TT-A-CT-GTG-G--GTA-TT-GA-T--------T--A-----CT--GA-T----A-AA-G-T-A--T-G-AT-A-----------------A---A--G----TA--C-TGT-----------G-G----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T---A--T-G-TGCT-GAT-AT-C-TGC---CG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----C--TT---GC--G-G-CG-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------GTG----T---A-------AAAAA-TCAAAGATAAG-GC-C--G--TTTT--T------C---AAA---A----C--T---TT-TTTTTTT--AAT--TTCT-TTTTTTCTGA--T-AT-GCA-T----TTG---C-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACCTG-GTTT-TGGCA-G-----AC--TT--T---TTTATAT-----GCCTT-TC-T-TA----TT--CTTCCAT-AA--A-AT----TA-TTCTTAAAC----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-A-CAAGTG-----ATT-A-----GC---A-ATGC--GG-C--A--TTT--CAT-G-T----TCAT-G-T---AATAAGG-AT-A---TA-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGACA
gi|9                          :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TCCA-T------TT---T--TTA-CT--G----A---------T--AAT--G--C-T-G-A--T--AA-T--AC--T-G-ATA-T--TG-T-AC-TG--TT---G-TGCT--GA-T-------AATT-AC-TG-T---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------T-G---------A--------A----A----T--AC-T-G----TG----GATA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---C-T-G-T-GG--T---T---TT-A-CT-GT--G--GTA-CT-GA-T---AT---T--A-----TT--GATT----A-AA-G-T-A-CT-G-TG-A-----------------A---A--G----TA--C-TGT-----------GTG----GTAC-T---GAT-A-A-TTG-C-TGA-T---A-AT-G-TGCT-GAT-AT-CTTGC---CG-A--GCTTATT---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----C--TT---GCA-G-G-CT-GT-A--TGC---A--A-AT--GT-TC--TCA-------------G-G----TAAAA-------AAAAA-TC-AAGATAAG-G--C--G--TTTT--T------T---AAA---A----C-------------------AT-----T-TTTTTTCTTA--T-AT-GCA-TT---ATGA--T-TTGCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AAC-AT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----TT-GAA-GAAACCT--GTTT-TGACA-G-----AT--TT--TA--TTTA-AT-----GTCTA-TCTT-TATTTTTT--TTTCTATAAA--A-AA----TA-TTCTTAAA-----------------TTCA--A-TGGTAA-TAT-AA-T-AA


blockSeqs                     :                                                   GC  . C     AC   G AGA  A A  .    C T ATTTTT  ATA TGTACTGATATATACGGT             .  GC A . . TG AC AA C   TA C C   C CT  G C  T  AA  CTG      TA  A .          T  T  A AATAAACAAACA     .    C GATCTACTCTTACCGTTGAGTATGTTTAATTACTTGTG                                                       GAC  T   ACTTACTGTGGGTGCTGATAA                A ACTGTGAATGCTGATAATT G A  G  ATA  A .  TAA T C C C  TT GAT CTTTT  G  T   T CC  AG  G  G TTT TAGTAAG        TG  T TGAG T TT A G .  A .  C GTACTGCTATTTACTGT .   C  CTTA  GC C   .           T TATC    C .     T G C   . G   C GC  C  . T    T   C AAC    ACC  G GC  T  A .      G A  G         A  GAAAA TT  GGC  AG A G  .  A .    A   AT T  .      TT   .             T GGAA AAAA            A  A        A  G AA TT    TGTCAAAAACACTTGC                 G       CG   TA TG A          AT T  T   C  CTA    TA       G A CT G   A  A  C  A   .    .       TC  .    T .     C    C CAAT C AAC  T   AGTG  C   .        .    .     . TTTTT  TC  TATA      TATA         .  T .  TTTT  AA      TA  AC .  AAAT  .     G  C                    AG T GGTA G   A  TA     AGCAG    TGTCA   G CAATA  ACA T    G   T .  AT   GG   C C ATTA    G T TCA       A  . AAC  T .     A A T    T  A A
blockSeqs                     :                                                   C   . .     .    . .    C .  .    . . C       G   TACTGATCCAT                    .  .  . . . AC .  A  A   .  . .   . A   T T  T  T   G        .   . .          .  C  A ATAAAA           .    T GATATTTTTACTTTTAGTCCTGATAATTACTGTG                                                           .    .   AATGGACTGGG                          . .                   . A  T  .    G .  .   . . . .  T  .   CTTT   .  A   T .   TT  .  . .   ATCTTA         G   . CAA  A T  . . .  C .  . .                 .   .  .     .  .   .           T .       . .     . . .   . .   G .   .  . .    .   . TCT    G    . G   T  T .      . .  .         .  .     C   .    AA . .  .  A .    .   .  .  .      .    .             . .    A               .  A        .  . .  .     TCAAAAACATCT                     .       .    .  TT .          C  G  .   .  CCG    T        . T G  .   .  .  .  .   .    .       .   .    . .     .    . .    . .    .   .     .   .        .    .     . .      .   GAT       TATA         .  T .  AT    C       T   .  .  .     .     A  C                    .  . TA   .   .  TG     AACCA    T       G TAATA  .   .    G   C .  T    .    . . .       . . .         .  . .    . .     . . .    .  . A
blockSeqs                     :                                                   G   . .     .    . .    . .  .    . . .       .   TTTTAGGAT                      .  .  . . . .  .  A  .   .  . .   . .   . .  .  .   C        .   . .          .  .  T AAAA             .    . GATATTTTTACTGTTATTACTGAAGTTAGTGGT                                                            .    .   AATTTATA                             . .                   . .  C  .    A .  .   . . . .  T  .   TTT    .  .   . .   T   .  . .   ATTTTC         .   . .    . T  . . .  . .  . .                 .   .  .     .  .   .           . .       . .     . . .   . .   . .   .  . .    .   . AC     .    . A   T  . .      . .  .         .  .     .   .    CG . .  .  G .    .   .  .  .      .    .             . .    A               .  A        .  . .  .     TAAGAAACGAAA                     .       .    .  TC .          .  .  .   .  .      T        . . A  .   .  .  .  .   .    .       .   .    . .     .    . .    . .    .   .     .   .        .    .     . .      .   AA        AAT          .  T .  AT    .       T   .  .  .     .     A  A                    .  . .    .   .  C      ATAA     C       . .      .   .    .   C .  .    .    . . .       . . .         .  . .    . .     . . .    .  . A
blockSeqs                     :                                                   G   . .     .    . .    . .  .    . . .       .   TACTGATCA                      .  .  . . . .  .  A  .   .  . .   . .   . .  .  .   .        .   . .          .  .  A TAAA             .    . GATATTTTTACTGTTGGACTATAATTACCGTG                                                             .    .   AAC                                  . .                   . .  .  .    . .  .   . . . .  T  .   TTT    .  .   . .   A   .  . .   GTTGG          .   . .    . A  . . .  . .  . .                 .   .  .     .  .   .           . .       . .     . . .   . .   . .   .  . .    .   . TC     .    . G   T  . .      . .  .         .  .     .   .    G  . .  .  T .    .   .  .  .      .    .             . .    A               .  A        .  . .  .     TTTTAAAAACAT                     .       .    .  TA .          .  .  .   .  .      T        . . .  .   .  .  .  .   .    .       .   .    . .     .    . .    . .    .   .     .   .        .    .     . .      .   CA        TAT          .  T .  AT    .       T   .  .  .     .     A  T                    .  . .    .   .  T      ACAG     .       . .      .   .    .   C .  .    .    . . .       . . .         .  . .    . .     . . .    .  . A
blockSeqs                     :                                                   C   . .     .    . .    . .  .    . . .       .   TTGCTGAT                       .  .  . . . .  .  A  .   .  . .   . .   . .  .  .   .        .   . .          .  .  A AAA              .    . GATATTTTTACTGTTGTACGTGATAATTACTG                                                             .    .   AA                                   . .                   . .  .  .    . .  .   . . . .  .  .   TTT    .  .   . .   T   .  . .   TTTA           .   . .    . T  . . .  . .  . .                 .   .  .     .  .   .           . .       . .     . . .   . .   . .   .  . .    .   . TC     .    . G   T  . .      . .  .         .  .     .   .    G  . .  .  . .    .   .  .  .      .    .             . .    A               .  A        .  . .  .     TTAAAACAAT                       .       .    .  TC .          .  .  .   .  .      T        . . .  .   .  .  .  .   .    .       .   .    . .     .    . .    . .    .   .     .   .        .    .     . .      .   TA        TAT          .  . .  .     .       T   .  .  .     .     A  C                    .  . .    .   .  T      ACCA     .       . .      .   .    .   . .  .    .    . . .       . . .         .  . .    . .     . . .    .  . A
blockSeqs                     :                                                   C   . .     .    . .    . .  .    . . .       .   TTACTGAT                       .  .  . . . .  .  T  .   .  . .   . .   . .  .  .   .        .   . .          .  .  A AAA              .    . GATATTTTTACTGTTGACTTGAAATACTGTG                                                              .    .   AA                                   . .                   . .  .  .    . .  .   . . . .  .  .   TTT    .  .   . .   T   .  . .   TTTG           .   . .    . T  . . .  . .  . .                 .   .  .     .  .   .           . .       . .     . . .   . .   . .   .  . .    .   . AC     .    . G   T  . .      . .  .         .  .     .   .    G  . .  .  . .    .   .  .  .      .    .             . .    A               .  A        .  . .  .     TCAAAACAAT                       .       .    .  TT .          .  .  .   .  .      T        . . .  .   .  .  .  .   .    .       .   .    . .     .    . .    . .    .   .     .   .        .    .     . .      .   TA        AT           .  . .  .     .       C   .  .  .     .     A  C                    .  . .    .   .  T      ACAA     .       . .      .   .    .   . .  .    .    . . .       . . .         .  . .    . .     . . .    .  . A
blockSeqs                     :                                                   G   . .     .    . .    . .  .    . . .       .   TAACTGAT                       .  .  . . . .  .  A  .   .  . .   . .   . .  .  .   .        .   . .          .  .  A AAA              .    . GAGATTTGTACTGTTAATT                                                                          .    .   AA                                   . .                   . .  .  .    . .  .   . . . .  .  .   TTT    .  .   . .   T   .  . .   TTTA           .   . .    . A  . . .  . .  . .                 .   .  .     .  .   .           . .       . .     . . .   . .   . .   .  . .    .   . AC     .    . G   T  . .      . .  .         .  .     .   .    G  . .  .  . .    .   .  .  .      .    .             . .    A               .  .        .  . .  .     TTAAAAACAT                       .       .    .  TC .          .  .  .   .  .      T        . . .  .   .  .  .  .   .    .       .   .    . .     .    . .    . .    .   .     .   .        .    .     . .      .   T         AT           .  . .  .     .       T   .  .  .     .     A  T                    .  . .    .   .  T      ACA      .       . .      .   .    .   . .  .    .    . . .       . . .         .  . .    . .     . . .    .  . A
blockSeqs                     :                                                   G   . .     .    . .    . .  .    . . .       .   TTACTGAT                       .  .  . . . .  .  A  .   .  . .   . .   . .  .  .   .        .   . .          .  .  A AAA              .    . AAGTCGAAATACTGGTGA                                                                           .    .   AA                                   . .                   . .  .  .    . .  .   . . . .  .  .   TT     .  .   . .   A   .  . .   TTTA           .   . .    . C  . . .  . .  . .                 .   .  .     .  .   .           . .       . .     . . .   . .   . .   .  . .    .   . TC     .    . G   T  . .      . .  .         .  .     .   .    G  . .  .  . .    .   .  .  .      .    .             . .    A               .  .        .  . .  .     TTAAAAACT                        .       .    .  TC .          .  .  .   .  .      T        . . .  .   .  .  .  .   .    .       .   .    . .     .    . .    . .    .   .     .   .        .    .     . .      .   T         TA           .  . .  .     .       T   .  .  .     .     .  C                    .  . .    .   .  T      GTT      .       . .      .   .    .   . .  .    .    . . .       . . .         .  . .    . .     . . .    .  . .
blockSeqs                     :                                                   G   . .     .    . .    . .  .    . . .       .   ATTATGA                        .  .  . . . .  .  A  .   .  . .   . .   . .  .  .   .        .   . .          .  .  A AAT              .    . ATGAAGTCTTTACTGTT                                                                            .    .   AA                                   . .                   . .  .  .    . .  .   . . . .  .  .   TT     .  .   . .   G   .  . .   TTTA           .   . .    . T  . . .  . .  . .                 .   .  .     .  .   .           . .       . .     . . .   . .   . .   .  . .    .   . TC     .    . T   T  . .      . .  .         .  .     .   .    A  . .  .  . .    .   .  .  .      .    .             . .    A               .  .        .  . .  .     AAAAAACT                         .       .    .  T  .          .  .  .   .  .      T        . . .  .   .  .  .  .   .    .       .   .    . .     .    . .    . .    .   .     .   .        .    .     . .      .   T         TA           .  . .  .     .       T   .  .  .     .     .  .                    .  . .    .   .  T      ATA      .       . .      .   .    .   . .  .    .    . . .       . . .                                          
blockSeqs                     :                                                   C   . .     .    . .    . .  .    . . .       .   TGCTGAA                        .  .  . . . .  .  A  .   .  . .   . .   . .  .  .   .        .   . .          .  .  A AAA              .    . TGAGATTTTTATTGTT                                                                             .    .   AA                                   . .                   . .  .  .    . .  .   . . . .  .  .   TT     .  .   . .   T   .  . .   TTTA           .   . .    . T  . . .  . .  . .                 .   .  .     .  .   .           . .       . .     . . .   . .   . .   .  . .    .   . AC     .    . G   T  . .      . .  .         .  .     .   .    A  . .  .  . .    .   .  .  .      .    .             . .    A               .  .        .  . .  .     TCAAAACT                         .       .    .  .  .          .  .  .   .  .      C        . . .  .   .  .  .  .   .    .       .   .    . .     .    . .    . .    .   .     .   .        .    .     . .      .   T         AT           .  . .  .     .       .   .  .  .     .     .  .                    .  . .    .   .  .      A        .       . .      .   .    .   . .  .    .    . . .                                                      
blockSeqs                     :                                                   G   . .     .    . .    . .  .    . . .       .   TATTGAT                        .  .  . . . .  .  A  .   .  . .   . .   . .  .  .   .        .   . .          .  .  A AAA              .    . GTGACAAGACTGGTG                                                                              .    .   AA                                   . .                   . .  .  .    . .  .   . . . .  .  .   TT     .  .   . .   A   .  . .   TTCA           .   . .    . A  . . .  . .  . .                 .   .  .     .  .   .           . .       . .     . . .   . .   . .   .  . .    .   . TC     .    . G   T  . .      . .  .         .  .     .   .    .  . .  .  . .    .   .  .  .      .    .             . .    A               .  .        .  . .  .     TTAAAAC                          .       .    .  .  .          .  .  .   .  .      T        . . .  .   .  .  .  .   .    .       .   .    . .     .    . .    . .    .   .     .   .        .    .     . .      .   T         TA           .  . .  .     .       .   .                    .                    .  . .    .   .  .                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                   C   . .     .    . .    . .  .    . . .       .   TACTAAT                        .  .  . . . .  .  A  .   .  . .   . .   . .  .  .   .        .   . .          .  .  A AAA              .    . GTGAAAGTAATGTG                                                                               .    .   AA                                   . .                   . .  .  .    . .  .   . . . .  .  .   CT     .  .   . .   A   .  . .   TTTA           .   . .    . T  . . .  . .  . .                 .   .  .     .  .   .           . .       . .     . . .   . .   . .   .  . .    .   . AC     .    . G   T  . .      . .  .         .  .     .   .    .  . .  .  . .    .   .  .  .      .    .             . .    A               .  .        .  . .  .     .                                .       .    .  .  .          .  .  .   .  .      .        . . .  .   .  .  .  .   .    .       .   .    . .     .    . .    . .    .   .     .   .                   . .      .   T         AT           .  . .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                   C   . .     .    . .    . .  .    . . .       .   TACTGAT                        .  .  . . . .  .  A  .   .  . .   . .   . .  .  .   .        .   . .          .  .  A AAA              .    . TGAAATTTACTTGC                                                                               .    .   AA                                   . .                   . .  .  .    . .  .   . . . .  .  .   TT     .  .   . .   A   .  . .   TGTA           .   . .    . T  . . .  . .  . .                 .   .  .     .  .   .           . .       . .     . . .   . .   . .   .  . .    .   . AC     .    . G   .  . .      . .  .         .  .     .   .    .  . .  .  . .    .   .  .  .      .    .             . .    A               .  .        .  . .  .     .                                .                             .  .  .   .  .      .                                                      . .     .    . .    . .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                   G   . .     .    . .    . .  .    . . .       .   TACTGAT                        .  .  . . . .  .  A  .   .  . .   . .   . .  .  .   .        .   . .          .  .  A GA               .    . GATAATTGCTGTG                                                                                .    .   AA                                   . .                   . .  .  .    . .  .   . . . .  .  .   TT     .  .   . .   T   .  . .   TTTA           .   . .    . G  . . .  . .  . .                 .   .  .     .  .   .           . .       . .     . . .   . .   . .   .  . .    .   . TC     .    . G   .  . .      . .  .         .  .     .   .    .  . .  .  . .    .   .  .  .      .    .             . .    A               .  .        .  . .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                   C   . .     .    . .    . .  .    . . .       .   TACTGAT                        .  .  . . . .  .  A  .   .  . .   . .   . .  .  .   .        .   . .          .  .  A AA               .    . GTGAAATACTGTG                                                                                .    .   AA                                   . .                   . .  .  .    . .  .   . . . .  .  .   TT     .  .   . .   T   .  . .   TTTA           .   . .    . A  . . .  . .  . .                 .   .  .     .  .   .           . .       . .     . . .   . .   . .   .  . .    .   . TC     .    . G   .  . .      . .  .         .  .     .   .    .  . .  .  . .    .   .  .  .      .    .             . .    .               .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                   G   . .     .    . .    . .  .    . . .       .   TAGAT                          .  .  . . . .  .  A  .   .  . .   . .   . .  .  .   .        .   . .          .  .  A AA               .    . GTGAAATATGTG                                                                                 .    .   AA                                   . .                   . .  .  .    . .  .   . . . .  .  .   TT     .  .   . .   A   .  . .   TTA            .   . .    . A  . . .  . .  . .                 .   .  .     .  .   .           . .       . .     . . .   . .   . .   .  . .    .   . T      .    . .   .  . .      . .  .         .  .     .   .    .  . .  .  . .    .   .  .  .      .    .             . .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13                         :                                                                  TG-A---GA-G-TG---TC-A-C------TC---T--T---------------------------T-TA--C-T-G-A--T--AAAG-TACT--G-AGA-T--TT-TCAC-TG--TT---GGTACT--GA-T-------AATC-AC-TG-----------------------------------------------------------------T-G---------A--------A------------------------------TG---CC-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---TC-A-T-GG--T---T----------------------CT-GATA--TT-TG-CT--GA-T---A-AT-G-T-A--CT-G--TG-AA---A--G----TA--C-T-GT-----------A-G----GTA-C-T---GC------T-A-A-TTG-CTG---A-T---A-AA-AG-G----TT-GAA-AT-C-TGC---CG-AA-GC-TA-T---CACT-C-GC-TTTGCAATC-GA-----C--TT----CAGG-G-CC-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------T-A----T---A-------AGAAA-TC-AAGATAAG-GT-C--G----------------------------------------TTTTTTT--AATTATTGT-TTTTTTCTGA--T-AT-GGA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TTC--AACTAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACATG-GTTT-CGACA-GAC--T--TAA---TTT------A-----AT-GCCTC-TCTT-TAAT--TT--CTTCCAT-AA--a
gi|14                         :                                              GGACG-GAA-A-ATGTA--C-G-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-G-A--T--A--T-TACT--G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATATTTTTAC---------T-GTTGGACTATA--------A----T----T--AC-C-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---CT-G-T-GGTTT---T---TT-A-CT-GTG-G--GTA-CT-GATA--TT-TA-CT--GA-T---A-AA-G-T-A--CT-G--T--AA---A--G----TA--C-T-GT-----------G-G----GTA-C-T---GA------T-A-A-T---------------------T-G----CT-GAT-AT-C-TGC---AG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GCG-G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TCAAAG-----------------------------------------------------TCTTTAC--AAT--TT-T-CGTTTTCTGA--T-AT-ACA-TT---ATGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAA--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----GT-GAA-GAAACCT
gi|15                         :                                               GACG-GAA-A-ATGTA--CTG----------CG---TC-A-T------TT---T--TTG-CT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-G-A--T--AA-T-TACT--G-ATA-G--TG-T-GC-TG--TT---GGTACC--GA-T-------ATTTTAC-TGTT---G------------G--TAC-T-------------------G-------------------A-T---------A--------A----T----T--GC-T-G----TG----AGTG---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---TT-G-T-AG--T---T---TTTA-CT-GTG-G--GTT-CT-GATA--TT-TA-CT--GA-T---A-AT-G-T-A--TT-G--TG-------------------------------------G----GTA-C-T---GA------T-A-A-TTG-CTG---A-T---A-AT-GT-G----CT-GAT-AA-C-TGC---CG-AG-GC-TA-T---CACT-C-GC-CTAG-------------C--TT---GTG-G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-A----TGTC--TCG-------------G-G----T---A-------AATAA-TC-AAGATAAG-GC-CAAG--TTTA--A------A---AAA---A----C--T---TT-TTTTCAA--AAA--T--C-TTTTTTCTGA--T-AT-ATA-TA---TTGA--TATTT
gi|16                         :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTT-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-A-A--T--AA-T-TACT--G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGCGCT--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------A-G---------ATT------T----G----T--AC-T-GTTAATT----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-TACTGTGAATGCTGATAATTG-C-TG-AT---AT-T-TA---CT-G-T-GGT-T---T---TT-A-CT-GTG-A--GTT-CT-GATA--TT-TA-CT--GA-T---G-AT-G-T-A--CT-G--TG-AA---A--G----TA--C-T-GT-----------G-G----GTA-C-T---GA------T-A-A-TTG-CTG---A-T---G-AT-GC-G----TT-GAT-AA-C-TAC---CG-AG-GC-TA-T---CGCT-C-GT-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--A-G-CC-GT-G--TGT---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-A----T---A-------AGAAA-TC-AAGATAAG-GC-C--G--TTTT--T------C---AAA---AACATC--T---TT-TTTTtttgttgttgttgatagactataatttaagttactata
gi|17                         :                                                                                                                                                      act-TACT--G-TTA-T--T--T-GC-TG--TT---GGTAAT--GA-T-------AATT-AC-TGAT---A------------G--TAC-TGATATTTTTACTGTTGTACG-------------------T-G---------AT-------A----A----TT-AC-T-G----------GATA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TGGAT---AT-T-TA---CT-T-T-TG--T---TCTTTT-A-CT-GTG-G--GTT-CT-GATA--TT-TA-CT--GA-T---A-AA-G-T-A--CT-G--AT-AA---A--G----TA--C-T-GT-----------G-G----GCA-C-T---GA------T-A-A-TTG--TG---A-T---A-AT-GT-G----CT-GAT-AT-C-TGC---CG-A--GCTTA-------CC-C-GC-CTTGCGAAC-GA-----T--TT---CG--G-G-CC-GT-G--TGC---A--A-
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gattattattatgtatgcttgttaacgtttatatttctgttggacgcccttattcagtttga------T-A-T-TTG-CTG---A-T---A-AG-GT-G----CT-GA-----------------------A-T---CGCT-T-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--G-GGCC-AT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-A----T---A-------AGAAA-TC-AAGATAAG-GC-C--G--TTTT--T------TA--AAA---A----C--T---TT-TTTTCTC--GAA--TTTT-TTTTGTCTTA--T-AT-GCA-TA---TTGA--T-TTTCA-G-G--A-CTT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-ACAATT-A---TG-TTC----AT-AAA-GAAACCTG-GTTT-TGACC-AAT--T--T-CA--TTT------A-----AT-GTCTT-TCTT-TAAT--TT--CTTCTAT-GA--A-AA----CA-TCCTTGAA-----------------TTCA--C-T----G-TTT-AA-C-AATC-A-TAA-TA-----ATT-A-----GC---A-AGGTG-GG-C--A--TTT--TAT-G-T----tatataacaatataagtgtacattaaaaatacccgatttttcct
gi|2                          :                                                 CG-CAA-A--TGTA--ATG-A---TA-G-TG---TC-A-T------TT---TATT-A--T--G----A------------AAT-TAGCC-T-T-A--T--AA-TCTACTC-G-ATA-TCTTG---GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AATAAACAAACA-G--TAC-TAA-----------------G-------------------TCG---------A--------A----A----T--AC-T-GG---TGA---GGTAGACTT-GAT-------------------A------AC--------T-T-------------------G-C-TGTAT---ATAT-CG---CTCG-TCGG--T---T---TT-A-CT-GTGTG--GTA-CT--------------T--GA-TCAAA-AC-G-T-A--CT-G--TGCAA---A--G----TA--C-T-GC-----------T-GTATCGTA-CCT---GA------TTA-A-TTG-CTG---ACT---A-AT-GT-G----CT-GATCAT-C-TGC---CGGAGCGCTTA-T---CGCT-C-AC-CCTGCGATC-AA-----C--TT---GCG-G-G-CC-GTAG--TGC------A-AT---TGTC--TCA---------------G----T---A-------AAAAA-TC-AAGATAAG-GC-T--G--TTTTTGT------C---AAAAACA----C--TTGCTT-TTTTTTC--AA---TTCT-TTTTTTCTGC--T-AC-GCA-TA---TTGA----TTTCA-GACG-A-TATATG-AGCAC-AAT--TCA--ACCGAT--AC-CAAATC-----ACCTATCA----TCA---TG-TTT----TTCGAA-GAAA-CTA-GTTT-TGGCA-GAT--T--T-TATATTT------A-----TA-GCCTT-T--T-TA----TA--CTTCCAT-AAACA-AA----TA-TCATT-AAC----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-A-C-AGTGT----CTT-A-----GCACAA-ATGC--GGTC--AT-TTT--CAT-G-T----TCAT-GTT---AATAGGA-AT-A---TC-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGACA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   actG-AT---GT-T-TA---CT-G-G-AA--T---T---CT-GGTT-GCT-G--GTG-CT-AATG--GT-TGGTT--GA-T---ATAT-T-T-A--CT-G----------A--GCTTATA--T-T-GT-----------T-G----GTA-C-T---AA------T-T-A-TTG-CTG-----T---G-GT-TG-G----CT-GAC-AA-C-TGC---tgctcctctctctctctctctctctcatagaagtttcgcgttggttttggataaataaattatctgtgtcatatactgtcatatccatgacattctgataggtctttagtctcaaatgaactaattccgcgtatttgaaatcaaggagccgtgggagtgttccatttggcctgctttattaatgcaacaggcatttgaaatttgaccgtgatatccatttacttaaaaataaattgttacatttattcatttaatttattttttctaatatatacaattatcaataatgcatacattctagctattcggtcgaagctatagcctatgcctaccggttaaagcagcttcattgctttttaaagcagctttcatgttttgattcagcaagcctaactgatataattgacagggttatatagattatacttacactgtccgcctatcatccttatcaagatctgcaatctttcaagcccaatccgggacattgcttatttaattccaattctttgatagctacatgtaatatattgctgagataatgtgtggatatcgcaacggtgacaccgttacacggagcgtaggtgccatgaaataagaacttgtccggaggactttatgctctcataatgca
gi|20                         :                                                                                                                                              -A--T--AT-T-TACT--G-AGC-T--TA-T-AT-TG--TT---GGTACT-------------AATT-AT-TG-----------------------C-T-------------------G-------------------T-G------------------------------------G----TT----GG-----CT-GAC-------------------A------A---------C-T-------------------G-CATT-AT---AT-T-AA---CC-G-T-GA--TGATT---TT-A-CT-GTA-A--GTT-CT-AATA--TT-CA-TTTGGA-T---A-ATTG-T-A--CT-G--TG-AA---A--G----TA--C-T-AT-----------G-G----GTA-C-T---GA------G-A-A-GTG-TTG---A-T---A-AT-GT-G----TT----------------TG-AG-AC-TA-T---CGCT-TAGC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GCAAG-G-CA-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGGC--TCA-------------G-GGGAAT---A-------AAAAA-TCAAA-ATGAG-GC-T--T--TTTT--T------TTA-AAA---A----C--attatattaaccgtgatgattttactgtaagttctaatattcatttggataattgtactgtgaaagtactatgggtactgagaagtgttgataatgtgtttgagactatcgcttagccttgcgatcgacttgcaaggcagtgtgcaaatgtggctcaggggaataaaaaatcaaaatgaggctttttttttaaaaaca
gi|21                         : gatgtttactggaattctggttgctggtgctaatggttggttgatGGACG-GAA-A-ATGTA--CTG-A---GAAG-TG---TC-A-T------TT---T----------G---------------------TA--C-T-G-A--T--AA-T-TACT--G-ATA-T--CG-T-GC-TG--TT---GATGTT--GA-T-------AATT-AC-TG-T---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTTTTAGTCCT-G---------AT-------A----A----TT-AC-T-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---CT-G-T-GGT-T---T---TT-A-CT-GTG-G--GTA-CT-GATA--TT-TA-CT--GA-T---A-A--G-T-A--CT-G--TG-AA---A--G----TA--C-T-GT-----------G-G----GTA-C-T---GA------T-A-A-TTG-CTG---A-T---A-AT-AT-G----CT-GAT-AT-C-TGC---CG-AG-ACTTA-T---CGCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GC--GAG-CC-a
gi|23                         :                                              ctACG-GAA-A-TTGTA--CTGGA---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-T-TTAGG----A---------T--AAT-TG--CAT-G-A--TGTAA-T-T-CTATG-A-A-T--TG-T-GC-TT--CT---GA-ACT--G------------------TGAT---AA---------T-G--TGC-T---------------------------------------T-G---------A--------C-------------C-T-G----T-------TA---C-------------------------------A---------T-T-------------------G---TA-A----AT-T-TG----------------------TT-A-CTTGTG-G--GTT-CT-G-TA--TTGTA-CT--GAGT---A-TA-G-T-AAGCT-GATTG-AG---A--A----TATAC-TAGT-----------A-G----GTAGC-TTGTGAAAATAGT-A-A-TTG-CGGG--A-TGC-A-AT-GTTG----CT-GAT-CA-C-TGC---CT-AT-GCTTA-T----GCT-T-G
gi|25                         :                                        attgaaGGACG-GAA-ACGTCTA--CTG-A---GA-GATG---TA-A-T------GT---T--T-A-CT--G----A---------TCAAGG-TA--C-T-----------------T--G-A-A-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------AATT-A--TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTGTTGACT-T-G---------A--------A----A----T--AC-T-G----TG----AGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG--T---AT-T-TA---AT-G-T-TG----------TT-A-CT-GT--G--TTA--T-GATA--TG-TA-CT--GA-T---A--------------------AA---A--G----TA--C-T-GT-----------G-G----GTA-C-T---GC------T-A-T-TTA-CTGTAAA-T---A-CT-GT-GGGCATT-GAT-AA-T-TAC---
gi|26                         :                                           actGGACG-CAA-A-ATGTA--CTA-A---GA-G-TG---T--A-T------TT---TTGT-A-CT--G----ATATATACGGT--AAT-TA------G-AACT--AA-T-TACT--G-AT--T--TG-T-GCTTG--TTG--GGCGTG--GA-T-------AATT-A--TGAT--------------G-G--TAC-T-------------------GATATTTTTACTGTTATTACT-G---------A--------A----GT---T--AG-T-G----GT----GGTG---CT-GAT-------------------A------A---------TAT-------------------G-C--G-AG---ATAT-TA---CT-G-T-GAT-T---T---TT-A-CT-GTG-G--ATT-CTGGATA--TT-TA-CTG-GA-T---A-AT-G-C-A--CT-G--TG-AA---A--G----TA--C-T--T-----------GTG----ATA-C-T---GA------T-tc
gi|27                         :                                            atGGACG-GAA-A-ATGTT--CTG-A---G----TG---TC-A-T------TT---T------CT----------------------T-TA--C-T-G-A--T--AA-T-TACT--G-ATA-T--TA-T-GC-TG--TT---G----------------------------------------------G--TGC-T---------------------------------------T-G---------T--------A----A----T--------------------TG---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------A-C-TG-AT---AT-T-TA---CT-G-T-GG------------------GTG-ACCGTT-CT-GATA--TT-TA-CT--GA-T---A-AT-G-A-A--CT-G--TG-AA---A--G----TA--C-C-GT-----------G-G----GTA-G-T---GA------G-A-A----------------------GT-G----CT-GAT-AA-C-TGC---CG-AG-GC-TA-T---TGCT-T-GC-CATGCGATC-GA-----C--TT---GCG-G-G-CC-CT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------
gi|28                         :                                                     ct-A-ATTTT--CTG-A---AA-G-TA---TC-A-TC-----TT---T--T-G-CT--G----A---------A--AAT-CG--T-T-G-C--T--AA-T-TACT--G-TTA-T--TG-T-AC-TG--TT---GGTGAT--GA-T-------ACGT-CC-TGAT----G---------A-T--TGC-T-------------------G---------------------------------------------A----T--A--T-G----T-------TA---CT-GAT-------------------AATTTATA---------T-T-------------------G-G-TG-AT---AT-T-TA---CT-G---GG--A---A---TT-A-TC-GT-----TTAGCT-CATG------A--T--GA-T---G-AG-G-A-A--CT-G--AG-GA---AC-G----TG--T-T-AT-----------T-G----ATA-T-T---GA--------G-A-TTG-CT
gi|29                         :                                         acagaacACG-CAA-A-ATGTA--CAG-A---GA-G-TG---TC-A-T----------------------------------------AAT-TA--C-T-G-A--T--A----TCC------TA-T--TG-T-GCTTG--GT---GGTGCT--AT-T-------AATT-ACTTGAT----A---------A-G--TA----------------------A-------------------T-G---------A--------A----GTCTTT--AC-T-G----TT----GGTA---CT-GAT-------------------A------ATGGACTGGGT-T-------------------G-C-TG-ATATAAT-T-TG---CT-G-
gi|3                          :                                                                                                                                     actgt-T-G-A--T--A--T-TACT--G-ATA-TA-TGGT-GC-TGAATT---GGTG-T--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AA---------AAG--TACCT-------------------G-------------------T-G---------A--------A----AG---T--AA-T-G----TG----G-TA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TGCAT---AA-T-TATAACT-G-T-GG--T---T---TTTA-CT-GTG-G--GTA-CT-GATAATCT-TA-CT--GA-T---A-AA-G-T-A--CT-G--TG-AA---A--G----TA--C-T-GT-----------G-G----GTA-C-T---GA------T-A-ACTTG-CTG---A-T---A-AT-GT-G----CT-GAT-AT-C-TGCG--CG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GCGCCTGCGATCAGA-----C--TT---GCCGG-G-CC-GT-G--TCT---A--A-AT--GTGTCTTTCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TC-AAGATAAG-GC-C--GTTTTTT--T------C---AAA---A----CAAT---TTGTTTTTTC--AAT--TTATATTTGTTCTGAATT-AT-GCACTA---TAGA--T-TTGCAGG-CA-A-TAT-TGAAG-ACAAAT--GTC--AACGA---AC-CAAA-C-----C-CTAT-A----T-AAACTG-TTTAGTGAC-GAA-GAAACCTG-GTTT-TGGCA-GATTCT--T-T---TTT------A-----TA-GCCTT-TC-T-TA----TTC-CTTCCAT-AA--A-AA----TA-GTCTTAAGC----------------TTCA--C-T----AGTTTAAA-TAAATA-A-CAGATG-----ATT-A-----GC---A-ATGC--GGCC--A--TTT--CAT-G-T----TCATGG-T---AATAAGGAAT-A---TCTT----AG-T-ATTTTA-TTATACCGACAaaacatgtattacgtgtttggtttttattgtggtcc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTTCTGA--T-AT-GCA-TA-------------------------AT--G-AG-AC-AAT--TCC--AAAGAA--AC-CTAA-C-----A-CTAT-T----T-A---TG-TTG----AT-GAC-GAAACCTG-GTTT-TGACA-GTT--T--T-T---TTTTTTTTAA-----AT-TCCTT-TCTT-TAAT--TT--CTTCCA--AA--A-AA----TA-TTtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcgttgaggttttatggataataaaattgatctgtgtatcaacttgtaatattcacggacattctgatcggagggtctttatctcaaatgaactaaatccgcgtatttgaaaatcaaaggagggcagcgggatggtgtttgcatgggcccgtgtttatatcaacagggcttgaaatttgactgtgatatcccatttactaaagaataaattgttcattaatttaattcattttatttattttttttacatataaaattatcaattacatgtatacattttattcgtgaaagcctagaatatgcgtattcaagttttgatcagacccagcctaactgtataaatttagaagggtaatctagttattatttacaatgtccgtatcaattcttaattaagaatctgcaacagttcaagccccaatccggacattgtagagtttaatttccaaattcaatatattagcataagaaagtggtggatattcgaccaacggtgacaacccgtaacggaaggcgtatgtgcatgaaataagaattgtccccgaggaactcatgtagtttcaaatactgca
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTTA-T---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----CTTTT---G---G-G-CC-GT-C--TGC---A--A-AT--GTGTG--TCA-------------G-A----T---A-------AAAAA-t
gi|33                         :                                                               --CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------CTATAT--T-A-CT--GATCCA---------T--AAT-TT--G-C-G-A--TACAA-T-TACT--GCATACT--TGTT-GC-TGT-TT---GGTACTTAGA-T--------ATT-AC-TGACATAAA---------A-A--TACTT-------------------G-------------------T-G---------A--------aatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtcgaagctgttgtcttgtgcaattgattt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAA----------------TTCAAGC-T----G-TTT-AA-TGAATC-G-TT-GTG-----ATT-ACAATAGT---ATATGC--TG-C--A--TATGGCAT-GCT----TCAT-G-T---AATAAGG-AT-AAACTT-T----AG-T-A-TTTA-TT-T-CCGA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GCA-GAT--T--T-T---TTTT-----A-----TA-GCCTT-TC-T-TA----TT--CCTCCAC-AA--A-AA----TA-TTCTT-AAT----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-----AGTG-----ATT-A-----GC---A-ATGC--GC-T--A--TT-----T-G-T----TCAT-A-T---Atgtg
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTAAA-----------------TTCA--C-T----G-TTT-AA-T-AATC-A-TA-GTG-----ATT-ATAATAGT---A-ATGC--GG-C--AATTTT--CATCG-C----TCCT-G-T---AATAAGG-AT-A---TT-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGA
gi|37                         :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-TATTTTTTT---T--T-A-TT--G----A---------T--AAT-TA--C-T-G-A--T--AA-T-AACT--A-ATA-T--TG-T-GC-TG--TTCTGGGTTCT--GA-T-------ATTT-AC-TGtgt
gi|38                         :                                            ctGGATG--GA-A-ATGTA--TTG-A---GA-C-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--A----A---------T--AAT-TT--C-T-A-A--T--AA-T-TACT--G-ATA-T--
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                           actATT-AT-TGAT---A-----------------C-T-------------------G-------------------G-T---------T--------A----A----T--TC-T-G----TG----CATC---TT-GGG-------------------A------A---------A-T-------------------G-G-CG-AT---AT-T-TA---CA-G-T-GG--T--------------------------CT-GATA--TT-TA-CT--GA-T---A-atcacctgcttatggtgt
gi|4                          :                                                                                                                               ttttc-TA--C-T-G-A--T--AA-TATA-T--G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--AA-T-------AATT-AC-TGAT---AA-----------G--TAC-T-------------------G-------------------T-G---------AC-------A----A----G--AC-T-GG---TG----GGTA---CT-GAT-------------------A----------------T-T---------------------C-TG-AT---AT-T-TA----T-G-T-GG--T---T---TTTA-CTTGTG-G--GTA-C--GAT---TT-TATCT-----------AA-G-T-A--CTCG--TG-AA---G--A----TA----T-GT-----------G-G----GTA-C-T---GA------T-A-A-TTG-CTG---A-T---A-AT-GT-G----CT-GAT---------------------TA-T---CGCT-T-GC-CCTG-GATC-GA-----CC-TT---GC--G-G-CC-GTAG--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------G-G----T---A-------AAAAA-TCAA-GATAAG----C--G--TTTT--T------T---AAA---AA---CA-T---TT-TTTTTTT--AAT--TTCT-TTTTT-CTGA--TTAT-GCA-TACTATTGA--T-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACAAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TGTTTT----AT-GAA-GAAA-ATG-GTTT-TGGCA-TTT--T--T-T---TGT------A-----TA-GCCTT-TC-T-TA----TT--CTT-CAT-AA--A-AAAAATTA-TTCTTAAAC----------------TTCA--CTT----A-TTT-AA-T-AATC-A-CCAGTG------TT-A-----GC---A-ATGC--GGCC--A--TTT--CAT-G-T----TCAT-G-T----TTAAGG-A--A---TT-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACC-ACA
gi|40                         :                                              GGACG-GAA-A-ATGTA--CTA-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---TT-T-A-CT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-G-G--T--AA-T-TACT--G-ATA-A--TG-T-GT-TG--tcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccttgggtttttggatactaatgatctgtgtatactttgtatcttccatggaatctcttgatcgagggtctttattcaatgaactaaaatccgcgtattgaaatctaacgaccgtgggatgtgttactgggcccgtgtttataatcaacaggctttgaaatttgacgtgatatccatttactgagaactaaattgttctttattattaatttatttttttatataattatcaatacatgtatacatgttttcggtgaagctaggtatttcgccagctctcacttgttttgatcagcaagcctaactgtaataattgaacagggtatctagttatattttcatgtcgtatcattcttatcaagatctgcaatcgtgcaagcccaatccggaattgttaattcaatttccaattcctttgatagtaataaaat
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gctAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACCTG-GAAT-TGGCA-GAT--T--T-TA--TTC------A-----AT-GCCGC-TC-T-T
gi|42                         :                                              GGACG-CAA-A-ACATA--CGG-A---TA-G-TA---TC---T------TT---T--C---------------------------T-TA--C-T-G-A--T--AA-T-TACT--A-ATA-T--TG-T-GC-TG--TT---ta
gi|43                         :                                           cctGGACG-GAA-A-ATGTA--CTT-T---GA-G-TG---TC-ATT------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TA--C-T-
gi|44                         :                                           attGGACGGCAA-A-ATGTAACTTG-A---GACG-TG---TC-A-T------TT---T--T-AACT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-attatga
gi|45                         :                                                       tactTGGA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TA--A-T-G-A--T--Aa
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             G-AG-GCTTA-T---CTCT-C-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TT---GT--G-G-ttgtgct
gi|47                         :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CT------GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--
gi|5                          :                                                         ctactA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-A------TT---T--T-----------------------------TA--C-T-G-A--T--AA-T-TAAT--G-ATA-T--TG-T-GC-TG--TTC--GGTGCT--GAAT-------AATT-ACCTGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------GATCTACTCTTACCGT----T-G---------AGTATGTTTA----A----TT-AC-TTG----TG----AGTA---CTTGAT-------------------A----------------T-T-------------------G-CATG--T---AT-T-T----CT-G-T-GG--T---T---TTTA-CTAGTG-G--GTTTCT-GATAATTT-TC-TT--GA-T---A-AT-G-TGA--CT-G--TG-AC---A--G----TA--CCT-GT-----------G-A------A-C-T---GA------T-AGA-TTG-CTG---AGT---ACGT-GT-G----CTTGAT-AAAC-TGCACCTG-AG-GCTCAAT---CGCTGC-GC-CTTGCGATC-GA-----C--TTGGCGC--G-G-CC-GTGG--TGT---AATA-AT--GTGTC--TCA-------------A-A----T-----------AAAAA-TCAAAG-T-GG-GC-C--G--TTTT--TAAGAAAC---GAA---A------------T-TTTTTGC--CAT--TTTT-TTTCCCTTGA--TGAT-GAA-TA---TTGA--T-TTTCA-GTC--AGTAT-TG--G-AC-AAT--TCC--AACGATTCAC-C-AA-C-----A--TAT-A----C-A---TG-ATT----A---GA-GAAACT---GTTT-TGACA-GTT--TGAT-T---TTT------A------T-GCCTG-TC-C-TT----TTAATTTCCA--AA--C-AA----TA-TTCTT-AAC----------------TTCA--C-TTA--G-TTT-A----AATC-AGCAGATGC----ATTGA-----TC---A-ATGC--GGCC--A--CTT--CAT-G-T----T-AT-G-TTCAAATAAGT-AT-A---TC-T----AGAT-A-TCTT-TT-TA
gi|6                          :                                            ggGGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-AAGAGA-G-T----TC-A-T------TTG--T--T-A-----G----A---------T--ATT-TG--C-T-G-A--T--A--T-TACT----ATA-T--TG-TTGC-T---TT---GATGCT--GA-T-------AAT--AT-TGATT--AA---------A-T--TAC-T---------------------------------------T-G---------A--------A----A----TTTAC-T------TGC---GGTA---C--GAT-------------------A------A---------T-T-------------------GGC-TG-AT---AT-T-TA---CT-GCT-GG--T---TCT-TT-A-CC-GTG-G--GTA-CT-GATA--TT--A-CT--GA-T---A-AT-GAT-A--CT-G--TG-AA---A--G-----A----T-GT-----------G-G----GTA-C-T---GA------T-A-A-TT--CTG---A-T---A-A--GT-G----CT-GAT-AT---TGC---CG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GAGAAAAC--TT---GCA-G-G-CC-GTTG--TGC---A--ATGT--GCGTC--T-A-------------G-G----T---A-------AAAAAATCAA-GATAAG-GC-C--G--TTTT--T------TTTAAAA---A----CA-T---TT-TTTTTTC--AAT--TTCT-TTTTT-CTGAC-T-ATTGCA-TACCGTTGA--T-TTTCA-G-CCTA-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT------T-A---TG-TTT----A--GAA-GAAGCCTG-GTTT-TGGCA-GAT--T--T-T---TTT------A-----TA-GCC-T-TC-T-TA----TT---TTCCAT--A--A-AA----TA-TTCTTAACT----------------TCCA--C-T----A-TTT-AA---AATCAA-CCAGTGTGTCAATCGA-----GC---A-ATGCG-GG-C--A--TTT--CAT-G-TATTATGAT-G-T---AATAGGA-AT-A---TC-T----AG-TAA-TTTATTT-TACCGACacg
gi|7                          :                                             tGGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TC-A-T------TT---T--T-A-CT--G----A---------T--AAT-TG--C-T-G-A--T--AA-T-TTCT--G-ATA-C--TG-T-GC-TG--TT---GGTGCT--GA-T-------AATT-AC-TGAT---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------T-G---------A--------A----A----T--A--T-G----TG----GGTA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-GT---AT-T-TA---CT-G-T-GG--T---T---TT-A-CT-GTG-G--GTA-TT-GAT------TA-CT--GA-T---A-AA-G-T-A---T-G--AT-AA---A--G----TA--C-T-GT-----------G-G----GTA-C-T---GA------T-A-A-TTG-CTG---A-T---A--T-GT-G----CT-GAT-AT-C-TGC---CG-AG-GCTTA-T---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----C--TT---GC--G-G-CG-GT-G--TGC---A--A-AT--GTGTC--TCA-------------GTG----T---A-------AAAAA-TCAAAGATAAG-GC-C--G--TTTT--T------C---AAA---A----C--T---TT-TTTTTTT--AAT--TTCT-TTTTTTCTGA--T-AT-GCA-T----TTG---C-TTTCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AACGAT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----AT-GAA-GAAACCTG-GTTT-TGGCA-GAC--T--T-T---TTT------A-----TATGCCTT-TC-T-TA----TT--CTTCCAT-AA--A-AT----TA-TTCTTAAAC----------------TTCA--C-T----A-TTT-AA-T-AATC-A-CAAGTG-----ATT-A-----GC---A-ATGC--GG-C--A--TTT--CAT-G-T----TCAT-G-T---AATAAGG-AT-A---TA-T----AG-T-A-TTTA-TT-TACCGACA
gi|9                          :                                              GGACG-CAA-A-ATGTA--CTG-A---GA-G-TG---TCCA-T------TT---T--TTA-CT--G----A---------T--AAT--G--C-T-G-A--T--AA-T--ACT--G-ATA-T--TG-T-AC-TG--TT---G-TGCT--GA-T-------AATT-AC-TG-T---AA---------A-G--TAC-T-------------------G-------------------T-G---------A--------A----A----T--AC-T-G----TG----GATA---CT-GAT-------------------A------A---------T-T-------------------G-C-TG-AT---AT-T-TA---CT-G-T-GG--T---T---TT-A-CT-GT--G--GTA-CT-GATA---T-TA-TT--GATT---A-AA-G-T-A--CT-G--TG-AA---A--G----TA--C-T-GT-----------GTG----GTA-C-T---GA------T-A-A-TTG-CTG---A-T---A-AT-GT-G----CT-GAT-AT-CTTGC---CG-A--GCTTATT---CGCT-C-GC-CCTGCGATC-GA-----C--TT---GCA-G-G-CT-GT-A--TGC---A--A-AT--GT-TC--TCA-------------G-G----TAAAA-------AAAAA-TC-AAGATAAG-G--C--G--TTTT--T------T---AAA---A----C-------------------AT-----T-TTTTTTCTTA--T-AT-GCA-TT---ATGA--T-TTGCA-G-C--A-TAT-TG-AG-AC-AAT--TCC--AAC-AT--AC-CAAA-C-----A-CTAT-A----T-A---TG-TTT----TT-GAA-GAAACCT--GTTT-TGACA-GAT--T--T-TA--TTT------A-----AT-GTCTA-TCTT-TATTTTTT--TTTCTATAAA--A-AA----TA-TTCTTAAA-----------------TTCA--A-TGGTAA-TAT-AA-T-AA
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): AATGATCTGTGTATAATTGTATATTTCATGGACATTCTGATCGAGGGTCTTTATCTCAAATGAACTAAATCCGCGTATTTGAAATCAACGGAGCCGCGGATGTGTTTCATGGGCCCGTGTTTATATCAACAGGCTTTGAAATTTGACCGTGATATCATTTACTAGAATAAATTGTTCATTTATTCATAATTTAATTTTTTTTAATATAAATTTATCAATTACATGTATACATTTTATTCGGTGAAAGCTAGGCTATTTAAGCAGCTTCATTGTTTTGATCAGCAGCCTAACTGTATAATTGACAGGGTAATCTAGTTATTTTTACATGTCCGTATCATTCCTTATCAAGATCTGCAACGTTCAAGCCCAATCGGACATTGTTTATTAATTTCATTCTTTATAGTACATAAATATTGCTAGAAGTGTGGATATCGCAACGGTGACCACCGTAACGTAAGAGACGTATGTGCCTGAAATAAGAATTGTCCCGAGGAACTTGGTTATGTTTCATACTGCAG
Unaligned ( gi|10 ): TTCATTTAAGTATTTGTAATATTTGTATGTATATTAGTCAGACAATTATTCTGAGAATTACCATGTATACATTTTATTCGTGAACTACGGTATTTAGCAGACGTCATTGTATTGTAGGATCACGCAACTGCGTCCTAAGCTTGAGACTCATTGGTTGACAAAGATAATCTAGATATAGTATTATATGTAGCATGTCCTGTTGCACTTCCTGTAAGGGTCAACTTATCATTGTGGCCAAACGTTGAAAAAGCCCAATAGAACCGGGTACATTCAGTGCTCACTGGGTTAATATATCTTCAAATTCTAATATGTACATGATAGAAGTGTTGGTGGAGTGGCGAGGTGGCGACGGTACTGACCAACGAGGCTTGAACGGAAGGGCAGAGGGAGGTATAGGAATGAAAATAGAACTTTGTCCCGAAGGACTTAATACTGTTTTAGTAACTGCAAGCA
Unaligned ( gi|12 ): ATGTAGATTAAATTGTTGATTTATTTTTTTTTTCTTATCAATAAATTATTAATTACATGTATATATTCTACTCCGTGAAGCTAGATATTTTTTTTTGGTAAAGCATCTTCATTGTTTTGATCCGCAAACCTATAACTGTATAATTGACAGGGTAATCTAGTTATTATTTACATGTCCGTATCATTCGTTATCAAGATCTGCAACGTTCAAGACCAATCCGGACATTGTTATTTAATTTCCAATTCTTTGATATGTACGTGCACGGTTAGCTAGATCAGTACATATATTGCTAGAAGTGTGGATATCGCAAGGAATATATGGTAACCGTAACGGTGACCACCGTAACGGAAGGCGTATACAACATGTTTATGAAATAAGAACTTGTCCCGAGGAACTTGTATGTTTCATACTGCA
Unaligned ( gi|18 ): ATAGAGAATTCCGCGCTAGGTTTTTGACGATAGATGCAGATGATCTTGTATACTTGTACTATTCCGATGAGACATTCGATCGAGGGTTCTTTATCTACATTGCGAACTAAACCGCTGTATATTGAAATCAACGGAAGGCCGAGGATGTGTTTATTATCCGCAGGCTTTTGAAAATTTGACGTGATATCCCTTTTAGATAAATTGTTGATTTGATTTATTTCATTATATTATATATATTTTGAAGCCTCATATATGCTATTCGGAAAAGCAGTTCATTGTTTTGCATCAGCAAGTTTATACTGTATAATTGGCAGGGCTA
Unaligned ( gi|22 ): CTGATAGAATTTTCAATATGGGTTTCTGATAATACAATGATCTGTGTATGAACTTGTATTCTCCATTGGAAATTCCTGATCGAGGGTCTTTATCTCAAATGAATTAAATCCGCGTACATTGAATTCAACAGAAAGCCGCGGGCTGTGTTTAATCACAGCTTTGAAATTTGACGTGATATCCATGTAGATTAAAATTTGTTGATTTATTCTTTATAAATTATTAATTACAGACCTTTGTTAGGGAAACCTTCAAATTTACATGGAATACA
Unaligned ( gi|24 ): GGGTTTTTGGATAATAAAATAATGATATGTGTATAACTTGTAATATTGCATGGACATTCTGATCGAGGGTCTTTATCTCAAATGAACTAAATCCGCGTATTTGAAATCAACAGAGCGCGCGGATGTGTTCATGGACCCGTGTTTATATCACAGGCTTTGAAAGAAGACCGGCGATATCCATTTACTAGAGTAAATGTTCATTTATTATATTACCATTGAATTTAAGAATATTTTTTATA
Unaligned ( gi|30 ): CTCTCATAGAAATTTCCGCGTAGGGATTTTGGATAAAATAATGATATTTGTATAACCTGTATATTCGATGGAAATACTAATCGGAGGTCTTTATCTCAAATGAACTAAATCGGCGTATTTGAAATGAAGGGAGCTGCTGGATGTGCTTTGAAATTTGACCGTGATATCCAT