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Reference ( gi|4 ) : ACATTTAATTGCACACAAAAGAAATGAATATCTGGG---ATGA-------GAT-----ATA---GT----TTTTG-GC-A-------------T-AGTTT------AAT-TG----TA------A--C-G-A-------A-T-------A----CAAATA--TA----AAAT-TC----C-----T--T----T----------------------AAA-A-AAG--AGGG-----G----TG-----TGAG--GG---G----A--------------CT--TG----TA------AATTT---TT-T--A--C-------GA---TGT--TCA--A--AA---GT-T-G----A-A---A--T----TG--ATAT--T-------------TAG---------CCC--------CCC------CCCCCC------ACCCCC-----C----CCTATAT-AGC----TC--T--A-C--AAAC-AA-TTTTC-CCT--A-C-TGTTTT----TT-------------GGA-CT-TAATTGCA--GAGA-AAT--T-T---T--G--G-GA---A--TAA----AT-TA-----CACTCC---AC-----A-----CAG-T-AA--ATTGTA------TTCA-TATTAC--A-TG-T-A-AAA--A--------AC-AT--A---T---CG--G--T-A----G--TTT-----TCA-TGTTCAT-CA---------------TT--G-----T--AA---GCTTTTGTGTCAT---TTATTAAACATCGATCAAAGTAAAAACATCT
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gi|13 : aaaaacagaacaagcG---ATGA-------TAT-----ATA---TT----TTTGG-GT-T-------------C-AGTTTGGTTCAAAT-TGGTTTTA------A--C-T-G-------G-T------------CATATA--TGG---AAAT-T-----------T--T----T----------------------AAA-A-AGG--GGGG-----GGGGGTGGG---TGGG--GG---GGTGGA--------------CT--TG----TA------AATTT---TC-T--A--A-------AA---TGT--TCA--A--AA---GT-G-G----A-A---A--TG---TA--ATG-----------------------------------------------------CC------A---TT-----C----CCTGTAT-AA----------------------AA-TTTTC-CC-----C-CA--TT----TT-------------GGA-CT-TCGTT-----GAGA-AAT--C-A---T--G--G-GA---A--TAT----AT-TA-----CATTTA---AT-----A-----CTG-T-AA--ATTGT-------TTAA-CTTTGC--T-TA-T-A-AAA--GC-------AC-AA--A---T---T------T-A----T--TTT-----TCA-TTTTTAT-CATTTTTGAATTTTTTTTT--G-----T---A---GCTGTTGTGTTGT---TCAGTAAAacaaaggttgttttttttttttcatttctttcataatttagaaaaatgagtttgtaggaaa
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gi|8 : aacatttcttagaaaataagtaaatca----TA------ATTTT---TC-T--A--T-------GA---CTC--TTG--A--AA---GT-T-T----A-A---A--T----GA--AT------------------TA---------------------------------TCT------ACCCCC-----T----CC-ATAT-AAC----TA--T--A-C--AAA------TTTC-CCC--A-C--GTTGT--------------------GA-CC-TCATTA-------A-AAT--C-A---T--G--G-GG---AACTAACTACATGTA-----CATTCT---GT-----T-----CTA-T-GA--ATTGTA------CTCA-agtttactaatttggatttcgctgtcattattttaacaattatacaaaatgcctacgagtgttctttcgaactacatggtatttcgtcttggaattttcttagcagcaaagacatgataacttggtttttttttctctccttccttattttactgacaggggctcgccacgaattgacccttt
gi|7 : aacatttcttataaaataagtaaatcaA------AATTT---TTCT--A--T-------GA---CTC--TTG--A--AA---GT-T-T----A-A---A--T----GA--AT------------------TA---------------------------------TCT------ACCCCCT----C----CCTATAT-AAC----TA--T--A-C--AAA------TTTC-CCC--A-C--G--TT----TT-------------GGA-CC-TCATT------AAA-AAT--C-A---T--G--G-GG---AACTAACTACATGTA-----CATTCT---GT-----T-----CTA-T-GA--ATTGTA------CTCA-agtttactaatttggatttcgctgtcattattttaacaattatacaaaatgcctacgagtgttctttcgaactacatggtatttcgtcttggaattttcttagcagcaaagacatgataacttggttttttttctctcctccttattttactgacaggggctcgcacgaattgactctttgagctccatt
gi|44 : aacatttcttataaataagtaaatc------AATTT---TT-T--A--T-------GC---TGTAAT-A--A--AA---GT-T------A-A---A--T----TT--ATATCAT-------------T-------------C--------ACC------CCC--------------------C----CCTATAT-G-------T--T--A-CG-GAAT-A---TTTC-CCT--C-C-TGTTT---------------------GG-CT-TGATT------AGA-AAG--C-T---C--T--G-CA---A--TAA----CT-TC-----CACTCC---AC-----A-----CGG---AA--ATTGTA------TTCA-TTTTAC--ATTC-T-----C--A--------AC-ATA-A---T---T------T-G----A--TTT-----TCA-TTTTCAT-CA---------------agtttactaatttggatttcgctgtcattattttaacaattatacaaaatgcctacgagtgttctttcgaactacatggtatttcgtcttggaattttcttagcagcaaagacatgataacttggtttttttttctctccttccttattttactgacaggggctcgccacgaattgactctttgagctccatt
gi|59 : tttggt-T--A--T-------GA---TGT--T-A--A--AA---AT-T-G----A-A-----------T---ACAT--T---------------------------------------------------------ATTCCT-----C----CATATATCAGC----GT--T--A-T--ACAC-----TTTC-CTC--A-C-TGTTTT--------------------GA-CT-TAATCG-A--GAAATAAT--T-----------G-AA---A--TAA----A--TA-----TGTTCA---AT-----A-----C---T-AATTGTTGTA------TTCA-TTTTaatatt
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gi|49 : ttgtgatgcattgt----CCTATAT-AAC----TA--T--T-T--AAA--AG-TTTTA-CCC--G-C-TG--TA----TT-------------GGA-CA-TGATT-----GAGA-AA---------T--GGAG-GA---C--AAA----AT-AA-----AATTCC---AT-----T-----C-G-T-GA--GATGTG------TTCA-TTTTAC--gcgacgataattaacaaaatatttgacttcctgaagaaagaaattgtaaaaacataacttttcatcattcttgaaaaaggtttgttcatagcatgtggc
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gi|47 : acatttgatacccaaaaaaaattatggttgaatgggttgatgtatattgttggctaatagttttgatagtaataagtacaaacattaaatttcataaaacaaataaataaaatttgctttttttgatgttgaaaagttgctctgtataaTATATTAAC----TCAAT--G-C--AAA------TTTC-CCC--A-C-TGT--T----TT-------------GAA-TT-TCATC-----GAGA-AAT--C-A---T--G--G-AA---A--tattaatataa
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18 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|1 ): TTTGATTTAGTTTGACTTAAAATTAAAAAATATAATATTTGTTACAAAATTAAAGTAACTCATATTTCTATGATGCTCAAATCTTAATCATTTTATCCACTCTTCCTATGTTACTGTACAAGTATTTCACCGTTCAAAATTTTAATGAGAAATCATTGGGTGGGAAATTCCATTGTGGTCAATAAATTGTACTTATTTTACTTATTAAAAATTAAATATAACTTTCATTGGCATATTTTAAAAATGTACCTGTTGTTTAAAAATAACACGTAGAAAGAATATTTTTCACCTGACTATGTACCTTCTGTTGAACTACATGAAATTCTATGTCTTGAAAGTTTCATAACTATTTCATCTTCATATTTTTTTATTAGGAGGATACGGACAGAAACTCGCCAAAAATTGACCCGTTATCTTCTTTA
Unaligned ( gi|18 ): TTTGATTTAGTTTGACTATTAGAATTTACAAATACTGTATATAATTTTTCTTGCTAAAATGAAAGGAAGCTCATAAGAATCTATGACCCTCGCTGAAAACTTAAGATTAATCATCCAACCGCTTCCCCTATTACTATTAACAGTATTTCACGTTCATAAGAGTAATTAATGGAGAAATCATTGGGTGGAAAATTCATTTTGGTCAATAAATTGTACTTATTTTGACTTTCAAAATTTAATATCTAGCTTCATGTCATATATGGATTACAGTGTGTTTAATAAGATCATATCACAAATGAATATTTTGTCA
Unaligned ( gi|37 ): ATATATTTTTGGTCTTAGTTTGCTTGTTATAAATATAAGTAAAAAAAATCCCTGAAAAATAACAAAGGACTTACAAATAATCTGTTATTCAAATATACTACTTCTCCCGATATAACTAAAAATGAAACCCACCCCCATCCCACCCTGTTATGGACTGAATTGAAAAATCACGGGCATTCGGTGCGGTAAATCTATTTACTTTACTTATCAAAACATAATTTAGTTTTCATTT
Unaligned ( gi|40 ): CAAATGTAAACATTCCTAAAGTTTCAAAAATTAGTCAAAATTCCGTAATTGTAATTTTTTTTACTTGTATTCCTACTCTATCCCATCGGAAATGCTTATCCACTATATATATTAGACATGATTGAGAAGGCATTATAAGATTCAATTCAGTGAAATGTATTAATTTTATTATCACAGACAATCATACGTTCGATGTTTAGTTTCATCATTTTTGGA
Unaligned ( gi|42 ): AAATGTAAACATTCTAAAGTTTCAAAAATTAGTCAAAATCCGTAATGGTAATTTTTTTTACTGTATTCCTACTCTATCCAATCGGAAATCTACTCCACATATATAGTTAGAGCATGATATGAGAGGCATTAAGATTTCAATCAGTGAAACTTATTATTATTACTCAAGACAATCATACGTTTGTTTTAGTTCATCAATTTTTGAT
Unaligned ( gi|46 ): TTTGGACTTCATTGTCATCATAAAACACATGCAAAATGCATATTTTTCATTATATCTTCGGTCTTTTGAAATGCATGATGTTCACCTTTAATCATTTTCATAGTAACAAAGACCTGATAATTTTTTAAACATTTTCTATTTGAAGTATACAGACAGGGGCTCGTCACGAATGAAC
Unaligned ( gi|52 ): TGAGAAATTCAAGGCAAAAATAAGATTTCATTTTATGGTGTAATGTACATGTATTCATTTAAATTTACTTTGAAAACTATACCAACATAAATTTGGTGTCCATTTTCCTCGTTTTTGAAAAAAGAATTGATTTGTAGCATTGAGTGTCA
Unaligned ( gi|55 ): GTTAATAACAAAAATATCGATGTATGAGTTGACATACGTATATACTTATATGTTTCATTTTTCTGGTTTTAATTAGTATAAATATGAAATTCCTCAATATTCATAAACTTCTAAAAATTTCTGTGATGTTCAACAGCGAC
Unaligned ( gi|65 ): TTATACTATTGTCATCATTTTAAAAACACCTACAAAATGCATACGTTTCACAATATCCACGTTCTGTTGTTAACTACAGCTGTATTTTATGATCATTTCGACAGATCTTAACAA
Unaligned ( gi|69 ): TTCTATATAATTCTATACGAAATTTCACTCTGAATTGGGCATGATTTAGAAACTGGTCATAAATTAAGTTCAATGCAGTGAAATTCCATCATTTTACT
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gi|36 : -C--CC-C--------------------C-CTGTT-----T----T-------------------G-AA-CT---T----GATT---G----AGCAAT-CA-----T--TG-G-A----TAA-----T-TA-----CACTCC---A--T---ATG--GC-A-A--AT-----TGTATC-A-A-TT-T-----T-A--A-TT----GT-G-Atttgaacttgattgagcaatcattggataattacactccatatggcaaattgtatcaattttaattgtgagtatataaattttaaataaaaaaagtttgttgcacgtgtctttagagt
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gi|45 : tttggtCACACAAGCAAAAT--ATGG----ACGCATGAGTTGA------TAT-----C------TTT--------------T-T-----TT-TTTGGTGAGGAGGGGGGTGGGG-------------T--C-A-TT-T---GGT-TGTA-------A-T-------GT-------A--T-A------CAAA-TA------TA-------AAA--T--T----C---------------------------T------------------------AA-A-----T---------------A-----------------T------TCA---------AGGG----A--C---------TG----C-A------A--A-T-TTC-C-------TTTGC-AGT--TC----A--AAA---GT-TG----AA-AT--A----aatatt
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gi|59 : aagggcacttggg-------TATGA-TGT--T-----A--AAA---AT-TG----AA--T--A----CAT---T-------------------------A--T---TC-CT-----CCA----------TATA-TCAGC----GT--TA-T---A----CA------C----------TTT-C--CT-C--------------------A-CTGTT-----T----T---------------------GA-CT---T----AATC-------GAGAAAT-AA-----T--TG-A-A-A--TAA----A--TA-----TGTTCA---A--T---AC----T-A-ATTGT-----TGTATT-C-A-TT-T-----T-
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12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11 : G----GATGTATGGGTTGA------TATCTAAGA------TA----A--------------T-T-----TT-T------------------GAC----------T--T-AGTT-T---GGT-GGTA-------A-T-------AA-------G--A-A-CA------A------A-----TGAA-------TAA--T--T----CC----------------T--T----TTTTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA--A----------------A-A--A---A-A--------G------GGA-----GGAG----C--CA----------TG----T-A--ATT-T-TTT-C-------A-------ATGA----TGT--TC---AAA---GT-TG----AA-A--T--A----TAT---T-AA----------------TGT-A--ACGCG-----ACA----------CAAA-T-A-------TT---TA--------CA-----A---A---------------TTG--C-C-C--------------------A-C-AAT---G-----T--------T----TT-------------G-GA-CT-T----CAT---T---GA--AAAAAAT-CA-----T--GC--A-A-A--TAA----GT-T-----ACA--------------------T-G-A--A-------------------------------C-A-T-T-C-----T-----AT-A--T----CT-A-AA----G-------AT----AT--A----A----A---T------T--TA---G--TT---T---T-C-ATTTTTC---AT-CTTGTT-TT--TT------AATTTG--T---TTTG-TAGC--AT---GGGTTG-TTAAAactcacacgcagaatgaatgtttttcactctgactatttaagttcttttgaagtacatgctatgtcgtctctcggaagtttcataacaacaaagacctgttttattttcttaatattttactggtaggatactgacagggactcgccactatttgacccttgatctt
gi|12 : c--------------T-T-----TG-T------------------GCC----------T--G-AGTT-T---GATATGTA-------G-T-------AA-------G--T-A-CA------AATACATA-----TATA-------AGA--T--G----CC----------------T--T----C----------------------------A----------------A-A--A---G-A--------T--------A-----AAGG----A--TT----------T-----T----A-T-T-TTT-T-------T-------ATGG----AGT--TT---------GC-TG----AACATTT--A----TAT---T-----------------------A--CTCTT-----CAC----------TTTA-G-A-AT----TA---TA--------TC-----A---A-A-AT---------TATC--C-C-T--------------------A-C-GG----------T--------T----TA-------------G-AA-TT-T----TAT---T-------GAGGACT-CG-----T--GG--G-A-A--TGA----AT-TAAACCACACTTC---A--T---A-------A-A--A-C-----T-------GAA-----------TTC-A-T-T-T-----TAA---AC-T--T----AT-A-AA----GC------ATGCCTAC--ATATGT----A---T------T--TA---G--CT---T---T-C-A-TGTTC---AT-C----A-TT--aacaaattgtagaatcacta
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gi|15 : TG----GAAACATGTGTCGA------TTT-----A------CA----T--------------C-T-----TT-T------------------TCC----------T--TTCGTT-T---GGT-AGTG-------A-T-------AA-------G--C-A-TA------A------A-----TATA-------ACA--T--T----TC----------------T--AAAAAT------------------------AA--A----------------A-A--A---A-A--------A------TAA-----AAAG----A---T----------TGATCTT-A--A-A-T-C---C-------T-------ATGG----TGT--TCA--A-----GT-CG----AA----T--A----TAT---T-TA----------------TTT-A--ACTCT-----CTC----------TACT-T-A-AC----CC---TA--------TA-----C---A-A-AT---------TTCC--C-C-C--------------------A-C-TGT---T-----T--------T----TTTTTTTTTGAGGGGG-GATCT-C----AAT---T---G----AGAAAC-CA-----T--GG--G-A-A--CAA----AT-G-----AC--TAG---A------ATG--GT-A-A--A-T-----T-------GTG-----------TTC-A-T-C-T-----C-----TC-T--T----GT-G-AAGTGTA-------A-----A---------------------------TA---GCATT---T---T-C-A-TTTTC---AT-C----A-TT--TTTA----AA---AC-T---TTT
gi|16 : G----AATGCTTGAATTGA------TGT-----A------TA----TAAAATGTGTGTGTTT-T-----TT-T------------------TAC----------T--T-AGTT-T---CAT-TGTACACTGTAA-T-------AT-------G--T-A-CA------A------A------ATA-------AAA--TCCT----CCAAAAGAAGGACAATCGT--T----T------------------------AA--A----------------A-ATAA---A-A--------T------TAA----------------------------TG----T-C--A-T-T-TTC-C-------C-------ATGA----TAT--TCA--AAA---GT-TG----AA-A--T--A----TATA--T-TA----------------CCC-------CT-----CCC----------TATA-T---------------------------------------------------TTT--C-C-C--------------------A----GT---T-----T--------T-------------------G-GA-TT-T----AAA---T---G----AGAAAT-CT-----T--GG--G-A-G--AAA----AT-C-----ACATCCC---A--T---ACA--AT-A-C--A-T-----T-------GTA-----------TTC-A-T-T-T-----T-----AC-T--TACTGTT-A-CA----AT------A-----ACAAA----A----A---T------T--TT---G--TC---T---C-C-A-GTTTT---AT-C----A-TT--TT------taaagtttgtagcaaaagac
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gi|2 : tttctaaggataccaagaatagtgattattaaggacA--AAAAA--ATG----AATGCATGAGTTGA------TAT-----A------TA----T--------------A-T-----TT-C------------------GGT----------T--T-CATT-T---CGT-TGCA-------A-TAAGTTAAAA-------G--T-A-CA------A------A-----GCTA-------AAA--TA-TCAAACC----------------C--C----C------------------------AA--A----------------A-A--A---A-A--------T------TTG-----AATG----A--CT----------TG----T-A--A-A-T-TTT-C-------C-------ATGA----TGT--TCA--AAA---GT-TG----TG-A--T--G----AA-------A----------------CAC-A--TAACT-------C----------TTTA-T-G-AC----TA---TG--------TA-----A---A--------------TTTT--G-T-C--------------------A-C---T---C-----T--------C----AT-------------G-GA-CT-T----AAA---T-------GAAAAAT-CA-----T--GG--A-A-A--TAA----AT-T-----A---TC-----------ATG--AT-A-A--A-T-----T-------GGA-----------TTC-A-T-T-G-----T-----AC-T--T----AT-A-TA----ACATT---A-----GG--A----T----A---TAAAG--T--GA---G--TT---T---T-C-A-TTTTC---AT-C----ACTT--GT------GA---gacagtcagtcgatagatttg
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gi|25 : gttgatatatatattttttgcaagttctggctgtaattggtacaaaaagttgaaggaacttgtaaatttccagtggtattcaaaagtaatccctttcctatataactctgaaacttttacctnnnnnnnnnnccggacatggtatgctgctccatattattctaaacaaaaataattatcaattatagattaactgcantaaaaataagactccT-T------------------GAC----------T--T-AGTT-T---GGT----A-------ACT-------AA-------G--T-AACA------A------G-----AATA-------AAA--T--T----CC----------------T--T----G------------------------AA--AT---------------A-A--A---G----------------------------G----C--CC----------TG----T-C--A-A-T-ATT-T-------T-------ATGA----T-------------------------A-A--T--A----TAT---T-----------------------A--CCCCT-----CCC----------AATC-T-A-AC----TA---TA--------TA-----A---A----T---------TTTC--C-C-C--------------------AAC-TGC---T-----T--------T-------------------G-GA-CC-T------T---T---G----AGAAAT-CG-----T--AA--G-A-A--TAA----AT-T-----TCATTCC---A--T---ATG--GA-A-A--A-T-----T-------GTA-----------TTC-A-T-T-T-----T-----AC-A--T----AT-G-AA----A-------AC----AT--A----T----A---T------T--TG---G--TT---T---T-T-G-TTTTC---ATCC----A-TT--catttgaattaaaaaatatttgtttgtaacaaatatt
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gi|36 : tatata--ATG----GATACATGGATTGA------TAC-----A------AA----T--------------TAT-----GT-T------------------GGC----------A--T-GTTT-T---GG-----A-------A-T-------TA-------G--T-A-CA------A------A-----TATA-------TAA--T--T----CA----------------T--A----A------------------------AA--A----------------A-A--A---A-A--------T--------------AAGG----A--CT----------TG----T-A--A-A-T-TTT-C-------T-------GTG-------T--TAA--AAA---GT-TA----AA-A------------------TA----------------CCC----CCCC------------------------------------------------------------------------------C--C-C-C----------------------C-TGT---T-----T--------T-------------------G-AA-CT-T----GAT---T---G----AGCAAT-CA-----T--TG--G-A----TAA-----T-T-----ACACTCC---A--T---ATG--GC-A-A--A-T-----T-------GTA-----------TCA-A-T-T-T-----T-----AA-T--T----GT-G-Atctgacatttaatgaaaaaa
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gi|61 : gAAA--ATA----AATGCATTGGTTGA------TAT-----G------TG----T--------------G-T-----TT-T------------------GG---------------------------T-TGTA-------A-T-------AC-------G--T-A-CATTTGCAA------A-----TAAA-------GAA--G--T-------------------------T----T------------------------AA--A----------------A-A--A---G-A-----------------A-----GGAG-------CG----------TG----T-A--A-A-T-TTT-C-------C-------ATGA----TGT--TCA--AAA---GT-TG----A
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gi|18 : aaac-----TT-T------------------GAT----------T--T-AGTT-T---GAC-TATT-------A-G-------AAT------T--TA-CA------A------ATACTGTATA-------TAATTT-T----TC-----T--TGC--T-------------------AA--A----------------A------------------------TGA-----AAG---G----AAG---CT----------CA----T-AAG----A-A-----T-C-------TATGACCCTCGC--TGA--AAA---CT-TA----AG-A--T-------TAA---T-CA----------------TCCAA--CCGCT-----TCC----------CCTA-T-T-AC----TA---T---------TA-----A---C-A-GTA--------TTT-------C--------------------A-C--GT---T-----C--------A----TA-------------A-GA--G-T----AATTAAT---G---GAGAAAT-CAT----T--GGGTG-G-A---AA----AT-T------CATTTT---G--G---TCA--AT-A-A--A-T-----TGTACTTA-T-T-T-----TG-AC-T--T----TC-A-AA----ATTT----A----------A----T----A---T------C--TA---G---C---T---T-C-A-Tcatgtcatttttggaga
gi|19 : GT-TATA-------A-A-------AT-------G--TA-AA------A------A------A-A-------GAA--T-T----------------------------------------A--A----------------T-AA---T-A--------A------TAA-----GGG---G----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TGT-T-------TATAA----TGT--TCA--AGC---GT-TG----AA-A--C--G----TAT-------------------------G-A--TTCCT-----CCC----------TAGA-T-A-AC----TA---TG--------TA-----T---A-A-ATCCC------CCTC--C-C-C--------------------G-C-TG----------T--------T----TT-------------G-GG-CT-T----AAT---T-------------------------------A-A--TAA----AT-C-----AAATTAC---A--T---ATG--GT-A-A--A-T-----TGTACTCA-T-T-T-----T--AC-T--T----GT-A-AA----A-------GC----A-C--G----A----A---T------T--TA---A--TT---TTCAT-C-A-TTTTCAAA---A--A-C----A--GT-------T-------T-------------A----------------------T------TTGCAG--C--A-A---AAGTCG-T-CAAgtcatatatggattacagtgtgtttaataagatcatatcacaaatgaatattttgtca
gi|2 : tttctaaggataccaagaatagtgattattaaggacA--AAAAA--ATG----AATGCATGAGTTGA------TAT-----A------TA----T--------------A-T-----TT-C------------------GGT----------T--T-CATT-T---CGT-TGCA-------A-TAAGTTAAAA-------G--TA-CA------A------A-----GCTA-------AAA--TATCAAACC-----C--C----C-------------------AA--A----------------A-AA---A-A--------T------TTG-----AAT---G----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TTT-C-------CATGA----TGT--TCA--AAA---GT-TG----TG-A--T--G----AA-------A----------------CAC-A--TAACT-------C----------TTTA-T-G-AC----TA---TG--------TA-----A---A--------------TTTT--G-T-C--------------------A-C---T---C-----T--------C----AT-------------G-GA-CT-T----AAA---T-------GAAAAAT-CA-----T--GG--A-A-A--TAA----AT-T-----A---TC-----------ATG--AT-A-A--A-T-----TGGATTCA-T-T-G-----T--AC-T--T----AT-A-TA----ACATT---A-----G-G--A----T----A---TAAAG--T--GA---G--TT---T---T-C-A-TTTTC------A--T-C----A--CT-------TGTGAAACC-------------A------A-----G--T-T----TGTTTGCTTGTAG--C--A-gacagtcagtcgatagatttg
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gi|22 : ACAG--AAATA--ATG----GGTGCTTGGGTTGA------TAT-----A------CA----A--------------T-T-----TT-T------------------------------------AGTT-T---TGT-TGTA-------A-T-------AA-------G--TA-CA------A------A-----TATA-------AGC--T-T----TA-----T--T----C-------------------AA--A----------------A-------------------------GA-----AGG----------------------------------A------A-ATT-TTT-T-------TATAA----TAT--TCATTAAA---GT-TG----AA-A--T--A----CAG---T-GT----------------CCC-A------------CCC----------TATA-T-A-ACCCGATC---TA--------T------A---C-A-TT---------TTTC--C-T-C--------------------A-C-TG-------------------T----TT-------------G-GA-CT-T----CAT---T-------GAGAAAT-CA-----G--GG--G-A-A--TAA-----------------------A--T---ATG--AT-G-A--A-T-----TGTGTTGA-T-T-T-----T--AC-T--T----TT-G-AA----A-------A-----C-CT-A----A----A---T------T--TA-------T---T---G-T-A-TTTTT------A--T-C----A--TT-------T-------TTGAAAA-------A------A-----G---------T------TTGTAA--C----TCTAGAGTCG-T-TAAtggaaaataaagtgtgtctagaggtgttttcgtcaagcaaatcatgtattcgatatttatcat
gi|23 : a-------------------AA--A----------------A-AA---T-A--------T--------A-----AAG---T----A-----CT----------TG----C-A------A-A-T-TTT-C-------TGCGA----TGT--TCA--AAA---AT-GG----AA-A--T--A----TAT---T-----------------------A--CCACT-----TTC----------TGTA-T-A-AC----AC---TC--------TA-----T---G-A-AT---------CCCC--C-C-CCCCCCCCCACACACACACACA-C-TGT---T-----T--------TAATCTT------------------CA-T----GAT---T---G----AGAA-C-CA-----T--GG--A-G-A--TAA----AT-T-----ACATAAC---A--T---ACA--GT-A-A--A-T-----TGCATACA-G-T-C-----T--AC-T--A----G----AA----A-------A-----A-C--A----T----GAC-T------T--TA---G--TT---T---T-C-A-TTTCC------A--T-C----A--TC-------T-------TTGAAAA-------A------A-----G--T-TTG--T------TTGCAG--C--A-A---ATGTCG-G-TAAttg
gi|24 : aaaaaaataaaacctccgtataaagggtatgagcggggGTTGA------TAT-----A------TA----TA-------------T-T-----TT-T------------------TGC----------A----AGTTCT---GGC-TGTA-------A-T-------TG-------G--TA-CA------A------A--------------------------------------------------------------------------------------AA---G----------T------TGA-----AGG---A----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TTC-C-------AGTGG----TAT--TCA--AAA---GT--------A-A--T----------------------------------------CCCTT-----TCC----------TATA-T-A-AC----TC---T----------G-----A---A-A-CT---------TTTA--C-C-
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gi|25 : gttgatatatatattttttgcaagttctggctgtaattggtacaaaaagttgaaggaacttgtaaatttccagtggtattcaaaagtaatccctttcctatataactctgaaacttttacctnnnnnnnnnnccggacatggtatgctgctccatattattctaaacaaaaataattatcaattatagattaactgcantaaaaataagactccT-T------------------GAC----------T--T-AGTT-T---GGT----A-------ACT-------AA-------G--TAACA------A------G-----AATA-------AAA--T-T----CC-----T--T----G-------------------AA--A-----------------------------------------TAA-----AGG---C----------CC----------TG----T-C------A-A-T-ATT-T-------TATGA----T-------------------------A-A--T--A----TAT---T-----------------------A--CCCCT-----CCC----------AATC-T-A-AC----TA---TA--------TA-----A---A----T---------TTTC--C-C-C--------------------AAC-TGC---T-----T--------T-------------------G-GA-CC-T------T---T---G----AGAAAT-CG-----T--AA--G-A-A--TAA----AT-T-----TCATTCC---A--T---ATG--GA-A-A--A-T-----TGTATTCA-T-T-T-----T--AC-A--T----AT-G-AA----A-------AC----A-T--A----T----A---T------T--TG---G--TT---T---T-T-G-TTTTC------A--TCC----A--TT-------TGG-----TAAAA---------A------A-----G--T-TTA--T------TTGCAGTTC--A-A---GTGTTG-T-catttgaattaaaaaatatttgtttgtaacaaatatt
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gi|32 : ttt------A------A-----TATA-------A----T-T----TC-----T-------------------------------A----------------C-AA---A-A--------T--------A-----AGG---G----A------T----------TG----T-A------T-A-T-TTC-C-------TATG-------T--TCA--AAA---GT-TG----AA-A--T--G----TAT---T-----------------------G--CCCTT-----CCC----------AATC-A-A-AC----TC---TG--------TA-----T---A-A-AT---------TATC--C-T-C--------------------A-C-GG----------T--------T----TT-------------A-GA-CT-T----AAT---T-------GAGAAAT----------------------TAC----AT-T--------TTCA---ATGT---ATG--GT-C-A--A-T-----TATACTAT-T-T-T-----T--AC-T--T----CT-A-AA----A-------A-----atataatttctacaaaataagggattgtatatttcctatgttcaaaagttgaaatgtattgcccttcccaatcaaactctgtataaattatcctcacggttttagacttaattgagaaattacattttcaatgtatggtcaattatactatttttacttctaaaaacaaaaatttcattggtttgtttgcggcacgcataattaagaaaatg
gi|33 : tttatacaggattccataacagataagggactgtaaaattttctAT-----A------TA----T--------------T-----------------------------GAC----------T--T-AGTT-T---GGT----A-------ACT-------AA-------G--TAACA------A------G-----AATT-------AAA--T-T----CC-----T--T----G-------------------AA--A-----------------------------------------TAA-----AGG---C----------CC----------TG----T-C------A-A-T-ATT-T-------TATGA----T-------------------------A-A--T--A----TAT---T-----------------------A--CCCCT-----CCA-----------ATC-T-A-AC----TA---TA--------TA-----A---A----T---------TTTC--C-CAC--------------------AAC-TGC---T-----T--------T-------------------G-GA-CC-T------T---T---G----AGAAAT-CG-----T--AA--G-A-A--TAA----AT-T-----TCATTCC---A--T---ATG--GA-A-A--A-T-----TGTATTCA-T-A-T-----T--TC-A--T----AT-G-AA----A-------AC----A-T--A----T----A---T------T--TG---G--TT---T---T-T-G-TTTTC------A--TCC----A--TT-------T-------caaaaatttcattggtttgtttgcggcacgcataattaagaaaatg
gi|34 : -T-------AG-------A--TA-CA------A------C-----TACA--------------------T-----T--T----T-------------------AA--ATTACC-----------A-AA---GCA--------T--------A-----AGG---G----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TT--C-------TGTGA----TTA--TCA--AAA---AT-TT----GA-T--T--A----TAT-------------------------C-A--CCCCT-----TCC-------------A-C-G-AC----TA---TA--------CA-----A---A-A-AT---------TT----C-C-T--------------------A-T-CGT---T-----T--------T-------------------G-GA-CT-T----AAA---T---GATTGAAAAAT-CA-----T--AG--G-A-A--TAA----AT-C-----ATAAGCC---A--T---Aggtaaaaagtttatttgcagttcaagtgt
gi|35 : atgatgaagacaataatgggttggtaaaggtcgagggtaaaggtccggtatctcttagat----------T--T-AGGT-T---AGT-TG---------A-T-------AA-------A--TA-CA------A------A-----------------AA--T-T----CG-----C--A----C-------------------AA--A----------------A-AC---A-A--------C------T------------------AT----CT----------AG----T-A------A-A-TGTCT-C-------TATTA----T-----C---------GT-TG------------------TAT-------------------------C-A--CCCCT------------------TACA-A-ATAC----TCCC-TA--------TA-----C---A-A-AT---------TCCA--C-C-C--------------------G-C-CACACCT-----TCACCTCGCT----TT-------------G-GA-CT-T------T---T---G----AGAAAT-CA-----TTTAG--G-A-A--TTA----ATCT-----ACAC-CC---A--TTT-GTG--AT-A-A--AAT-----TGTATTCA-T-T-T-----T--CC-T--T----TC-A-TATC--A-------A-----A----A----T--------T------T--TA---T--TT---C---T-C---TTTTC------tccttcagaaaatggcgcgaaatctttattttac
gi|36 : tatata--ATG----GATACATGGATTGA------TAC-----A------AA----T--------------TAT-----GT-T------------------GGC----------A--T-GTTT-T---GG-----A-------A-T-------TA-------G--TA-CA------A------A-----TATA-------TAA--T-T----CA-----T--A----A-------------------AA--A----------------A-AA---A-A--------T--------------AAG---G----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TTT-C-------TGTG-------T--TAA--AAA---GT-TA----AA-A------------------TA----------------CCC----CCCC------------------------------------------------------------------------------C--C-C-C----------------------C-TGT---T-----T--------T-------------------G-AA-CT-T----GAT---T---G----AGCAAT-CA-----T--TG--G-A----TAA-----T-T-----ACACTCC---A--T---ATG--GC-A-A--A-T-----TGTATCAA-T-T-T-----T--AA-T--T----GT-G-Atctgacatttaatgaaaaaa
gi|37 : AT-----A------TA----T--------------T-T-----TT-G------------------GTC----------T--T-AGTT-T---GCT-TGTT-------A-T-------AA-------A--TA-TA------A------G-----TAAA-------AAA--AAT----CC-----C--T----G-------------------AA--A----------------A-AT---A-A--------C--------A-----AAG---G----A-----CT----------TA----C-A------A-A-T-AAT-C-------TGT------TAT--TCA--AA-------------------T--A----TA-------------------------CT-A--CTTCT-----CCC----------GATA-T-A-AC----T---------------A-----A---A-A-ATGAAACCCACCCCCATC-C-C--------------------A-C-CCT---G-----T--------T----AT-------------G-GA-CT-G----AAT---T---G---AA-AAAT-CA-----C--GG--G-----------------------CATTCG---G--T---GCG--GT-A-A--A-T-----C-TATTTA-C-T-T-----T--AC-T--T----AT-C-AA----A-------A-------C--A----T----AA--T------T--TA---G--TT---T---T-C-A-TTTgtatataaattttaaataaaaaaagtttgttgcacgtgtctttagagt
gi|38 : ----T-A------A-A-T-CT--C-------TGTGAA---TGT--TCC--GAA---GT--G----AA-A--C--A----TGT---G-----------------------G--CTTCT-----CTC----------AATG-TTG-AC----TCAGATA--------CA-----A--------C---------TTTC--C------------------------------T---T-----T--------G----CT-------------GTAA-CTCT----AAT---T---G----AGAAAT-CA-----T--GG--G-A-A--CAA----A--T-----ATATTCC---A--G---ATG--AT---A--A-T-----TGTTTTCA-T-TGTTA---T--AC-T--G----AT-A-AA----G-------T-----A-C--AAT--T----A---A------T--TT---G--TT---T---TAA-A-TTTTC------A-------------G-------T-------T-------------A------A--------C-T----T------TT
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gi|4 : TTAATTGCACACAA--AAGAA--ATG----AATATCTGGGATGA------GAT-----A------TA----G--------------T-T-----TT-T------------------GGC----------A--T-AGTT-T---AAT-TGTA-------A-C-------GA-------A--TA-CA------A------A-----TATA-------AAA--T-T----CC-----T--T----T-------------------AA--A----------------A-AA---G-AGGGG----TG-----TGA-----GGG---G----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TTT-T-------TACGA----TGT--TCA--AAA---GT-TG----AA-A--TTGA----TAT---T-TAGCCCCCCCCC------CCC-A--CCCCC-----CCC----------TATA-T-A-GC----TC---TA--------CA-----A---ACA-AT---------TTTC--C-C-T--------------------A-C-TGT---T-----T--------T----TT-------------G-GA-CT-T----AAT---T---GCA-GAGAAAT-TT-----T--GG--G-A-A--TAA----AT-T-----ACACTCC---A--C---ACA--GT-A-A--A-T-----TGTATTCA-T-A-T-----T--AC-A--T----GT-A-AA----A-------A-----A-C--A----T----A---T------CGGTA---G--TT---T---T-C-A-TGTTC------A--T-C----A--TT-------G-------T-------------A------A-----G--C-T----T------TTGTGT--C--A-T------TTA-T-TAAAa
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Reference ( family-91 ) : NNNNTTAAT-GCACACAA--AAAAA--ATG----GATGCATGGGTTGA------TAT-----A------TA----T--------------T-T-----TT-T------------------GGC----------T--T-AGTT-T---GGT-TGTA-------A-T-------AA-------G--TA-CA------A------A-----TATA-------AAA--T-T----CC-----T--T----T-------------------AA--A----------------A-AA---G-A--------T------TGA-----AGG---G----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TTT-C-------TATGA----TGT--TCA--AAA---GT-TG----AA-A--T--A----TAT---T-TA----------------CCC-A--CCCCT-----CCC----------TATA-T-A-AC----TC---TA--------CA-----A---A-A-AT---------TTTC--C-C-C--------------------A-C-TGT---T-----T--------T----TT-------------G-GA-CT-T----AAT---T---G---GAGAAAT-CA-----T--GG--G-A-A--TAA----AT-T-----ACATTCC---A--T---ACG--GT-A-A--A-T-----TGTATTCA-T-T-T-----T--AC-T--T----NT-A-AA----A-------A-----A-C--A----T----A---T------T--TA---G--TT---TT-C-A-TTTTC------A--T-C----A--TT-------T-------T---------A-----A-------G--T--T-------T------TTGTAG--CA---A--GTGTCG-T-TAAA
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gi|10 : --AAA---CT-TA----AA-A--T--A----AAT---C-TA----------------TCC-A--CCCCT-----CCC----------CATA-T-T-AC----CA---TA--------CA-----A---G-T-AT---------TT--------C--------------------A-C-CG----------T--------A----TA-------------A-GATTT-T----AAT-----------GAGGAAT-CATTGAGT--GG--G-------AA----AT-T-----CCATTGT---G--G---TCG--AT-A-A--A-T-----TGTACTTA-T-T-T-----T--AC-T--TA---TT-G-AA----A-------A-----T-T--A----G----A---G------T--TA---G--CT---TT-C-C-TGGTC------A--T------A--TT-------T-------TGA-------A-----A-------A---------------------TGTAC--CA--------GTCGTT-TAAAaaatgtacctgttgtttaaaaataacacgtagaaagaatatttttcacctgactatgtaccttctgttgaactacatgaaattctatgtcttgaaagtttcataactatttcatcttcatatttttttattaggaggatacggacagaaactcgccaaaaattgacccgttatcttcttta
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gi|12 : c--------------T-T-----TG-T------------------GCC----------T--G-AGTT-T---GATATGTA-------G-T-------AA-------G--TA-CA------AATACATA-----TATA-------AGA--T-G----CC-----T--T----C-----------------------A----------------A-AA---G-A--------T--------A-----AAG---G----A-----TT----------T-----T--------A-T-T-TTT-T-------TATGG----AGT--TT---------GC-TG----AACATTT--A----TAT---T-----------------------A--CTCTT-----CAC----------TTTA-G-A-AT----TA---TA--------TC-----A---A-A-AT---------TATC--C-C-T--------------------A-C-GG----------T--------T----TA-------------G-AA-TT-T----TAT---T-------GAGGACT-CG-----T--GG--G-A-A--TGA----AT-TAAACCACACTTC---A--T---A-------A-A--A-C-----TGAATTCA-T-T-T-----TAAAC-T--T----AT-A-AA----GC------ATGCCTA-C--ATATGT----A---T------T--TA---G--CT---TT-C-A-TGTTC------A--T-C----A--TT-------T-------CTGAAAAAAAA-----A-------G--T--TTG-----T------TTGCAG--CA---A--ATCTTG-G-TAAAaacaaattgtagaatcacta
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gi|14 : gaTTAAT-GCACACAA--AGAAA---TG----AATATCTGGGATGA------GAT-----A------TA----G--------------T-T-----TT-T------------------GGC----------TA-T-AATT-T-------TGTA-------A-C-------GG-------A--TA-CA------A------A-----TATA-------AAA--T-T----CC-----T--T----T-------------------AA--A----------------A-AGAGGG-G--------TG-----TGA-----GGG---G----A-----CT-----------G----T-A------A-A-T-TTT-T-------TACGA-----GT--TCA--AAA---GTGTG----AA-A--TTGA----TAT---T-TAGCCCCCCCCCCCCCCACCC-A--CCCCCAACCCCCC----------TATA-T-A-GC----TC---TA--------CA-----A---ACA-AT---------TTTC--C-C-T--------------------A-C-TGT---T-----T--------T----TT-------------G--A-CT-T----AAT---TGCAG---GAGAAAT-TT-----T--GG--G-A-A--TAA----AT-T-----ACA-TCC---A--C---ACA--GT-A-A--A-A-----TGTATTCA-T-A-T-----T--AC-A--T----G--A-AA----A-------A-----A-C--A----T----A---T------CGGTA---G--TT---TT-C-A-TGTTC------A--T-C----A--TT-------cagtaaagtcattccagtcttcagtaagatt
gi|15 : TG----GAAACATGTGTCGA------TTT-----A------CA----T--------------C-T-----TT-T------------------TCC----------T--TTCGTT-T---GGT-AGTG-------A-T-------AA-------G--CA-TA------A------A-----TATA-------ACA--T-T----TC-----T--AAAAAT-------------------AA--A----------------A-AA---A-A--------A------TAA-----AAA---G----A------T----------TGATCTT-A------A-A-T-C---C-------TATGG----TGT--TCA--A-----GT-CG----AA----T--A----TAT---T-TA----------------TTT-A--ACTCT-----CTC----------TACT-T-A-AC----CC---TA--------TA-----C---A-A-AT---------TTCC--C-C-C--------------------A-C-TGT---T-----T--------T----TTTTTTTTTGAGGGGG-GATCT-C----AAT---T---G----AGAAAC-CA-----T--GG--G-A-A--CAA----AT-G-----AC--TAG---A------ATG--GT-A-A--A-T-----TGTGTTCA-T-C-T-----C--TC-T--T----GT-G-AAGTGTA-------A-----A----------------------------TA---GCATT---TT-C-A-TTTTC------A--T-C----A--TT-------T-------TTAA------A-----A-------C--T--TTTTAAAGT------TTGTAG--CA---A--
gi|16 : G----AATGCTTGAATTGA------TGT-----A------TA----TAAAATGTGTGTGTTT-T-----TT-T------------------TAC----------T--T-AGTT-T---CAT-TGTACACTGTAA-T-------AT-------G--TA-CA------A------A------ATA-------AAA--T------CC-----T--C----C-------------------AA--A----------------A-GAAG-G-ACAATCGT-T------TAA-----AAATAAA----A-----TTAA--------TG----T-C------A-T-T-TTC-C-------CATGA----TAT--TCA--AAA---GT-TG----AA-A--T--A----TATA--T-TA----------------CCC-------CT-----CCC----------TATA-T---------------------------------------------------TTT--C-C-C--------------------A----GT---T-----T--------T-------------------G-GA-TT-T----AAA---T---G----AGAAAT-CT-----T--GG--G-A-G--AAA----AT-C-----ACATCCC---A--T---ACA--AT-A-C--A-T-----TGTATTCA-T-T-T-----T--AC-T--TACTGTT-A-CA----AT------A-----A-CAAA----A----A---T------T--TT---G--TC---TC-C-A-GTTTT------A--T-C----A--TT-------T-------T---------aagac
gi|17 : tggaacaaATGGATGGGCTGG------TTT-----A------TA----T--------------T------------------------------AC----------A--T-ACCT-T---GGT-TGTA-------A-T-------AA-------G--TG-CA------A------A-----CGTA-------AAA--T-T----CCCTGTTT--T----T-------------------AATTA----------------G-GG---G-A--------T---------------GG---G----A-----CT----------TT----T-ATCAGGGA-A----------------AAGA----TGA--TCA--AAA---GT-TG----AA-A--T--A----T-T---T-TA----------------CCT--------T-----TTC----------TATA-T-A-CA----TG---TA--------TATGAATATTCA-A-AT---------TATT--C-T-C--------------------A-A-TGT---T-----T--------T-------------------G-AA-CT-T----CAT---T---G----AGAATT-CA-----T--GA----A-G--TAA----AT-T-----TCATGTC---A--T---ACA--GT-A-A--A-T-----T-TA--------------------------------A-GA----A-------A-----G-CAAA----A----A---T------T--CA---T--GT---TT-C-A-TTTTC------A--T-T----AACTT-------T-------G---------A-----AAAAACAGA--T--TG------T------TTGTAA--CA---A--ATGTTG-T-TAAAttctcagattcaatgaa
gi|18 : aaac-----TT-T------------------GAT----------T--T-AGTT-T---GAC-TATT-------A-G-------AAT------T--TA-CA------A------ATACTGTATA-------TAATTT-T----TC-----T--TGC--T-------------------AA--A----------------A------------------------TGA-----AAG---G----AAG---CT----------CA----T-AAG----A-A-----T-C-------TATGACCCTCGC--TGA--AAA---CT-TA----AG-A--T-------TAA---T-CA----------------TCCAA--CCGCT-----TCC----------CCTA-T-T-AC----TA---T---------TA-----A---C-A-GTA--------TTT-------C--------------------A-C--GT---T-----C--------A----TA-------------A-GA--G-T----AATTAAT---G---GAGAAAT-CAT----T--GGGTG-G-A---AA----AT-T------CATTTT---G--G---TCA--AT-A-A--A-T-----TGTACTTA-T-T-T-----TG-AC-T--T----TC-A-AA----ATTT----A----------A----T----A---T------C--TA---G---C---TT-C-A-Tcatgtcatttttggaga
gi|19 : GT-TATA-------A-A-------AT-------G--TA-AA------A------A------A-A-------GAA--T-T----------------------------------------A--A----------------T-AA---T-A--------A------TAA-----GGG---G----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TGT-T-------TATAA----TGT--TCA--AGC---GT-TG----AA-A--C--G----TAT-------------------------G-A--TTCCT-----CCC----------TAGA-T-A-AC----TA---TG--------TA-----T---A-A-ATCCC------CCTC--C-C-C--------------------G-C-TG----------T--------T----TT-------------G-GG-CT-T----AAT---T-------------------------------A-A--TAA----AT-C-----AAATTAC---A--T---ATG--GT-A-A--A-T-----TGTACTCA-T-T-T-----T--AC-T--T----GT-A-AA----A-------GC----A-C--G----A----A---T------T--TA----------------A-TTTTC------A--T-C----A--TT-------T-------TC--------AAAAACA-------G--T--TTA-----T------TTGCAG--CA---A--AAGTCG-T-CAAgtcatatatggattacagtgtgtttaataagatcatatcacaaatgaatattttgtca
gi|2 : tttctaaggataccaagaatagtgattattaaggacA--AAAAA--ATG----AATGCATGAGTTGA------TAT-----A------TA----T--------------A-T-----TT-C------------------GGT----------T--T-CATT-T---CGT-TGCA-------A-TAAGTTAAAA-------G--TA-CA------A------A-----GCTA-------AAA--TATCAAACC-----C--C----C-------------------AA--A----------------A-AA---A-A--------T------TTG-----AAT---G----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TTT-C-------CATGA----TGT--TCA--AAA---GT-TG----TG-A--T--G----AA-------A----------------CAC-A--TAACT-------C----------TTTA-T-G-AC----TA---TG--------TA-----A---A--------------TTTT--G-T-C--------------------A-C---T---C-----T--------C----AT-------------G-GA-CT-T----AAA---T-------GAAAAAT-CA-----T--GG--A-A-A--TAA----AT-T-----A---TC-----------ATG--AT-A-A--A-T-----TGGATTCA-T-T-G-----T--AC-T--T----AT-A-TA----ACATT---A-----G-G--A----T----A---TAAAG--T--GA---G--TT---TT-C-A-TTTTC------A--T-C----A--CT-------TGTGAAACC---------A-----A-------G--T--T-------TGTTTGCTTGTAG--CA---A--ATgacagtcagtcgatagatttg
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gi|22 : ACAG--AAATA--ATG----GGTGCTTGGGTTGA------TAT-----A------CA----A--------------T-T-----TT-T------------------------------------AGTT-T---TGT-TGTA-------A-T-------AA-------G--TA-CA------A------A-----TATA-------AGC--T-T----TA-----T--T----C-------------------AA--A----------------A-------------------------GA-----AGG----------------------------------A------A-ATT-TTT-T-------TATAA----TAT--TCATTAAA---GT-TG----AA-A--T--A----CAG---T-GT----------------CCC-A------------CCC----------TATA-T-A-ACCCGATC---TA--------T------A---C-A-TT---------TTTC--C-T-C--------------------A-C-TG-------------------T----TT-------------G-GA-CT-T----CAT---T-------GAGAAAT-CA-----G--GG--G-A-A--TAA-----------------------A--T---ATG--AT-G-A--A-T-----TGTGTTGA-T-T-T-----T--AC-T--T----TT-G-AA----A-------A-----C-CT-A----A----A---T------T--TA-------T---TG-T-A-TTTTT------A--T-C----A--TT-------T-------TTGAAAA---A-----A-------G-------------T------TTGTAACTCT---A--GAGTCG-T-TAAtggaaaataaagtgtgtctagaggtgttttcgtcaagcaaatcatgtattcgatatttatcat
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gi|32 : ttt------A------A-----TATA-------A----T-T----TC-----T-------------------------------A----------------C-AA---A-A--------T--------A-----AGG---G----A------T----------TG----T-A------T-A-T-TTC-C-------TATG-------T--TCA--AAA---GT-TG----AA-A--T--G----TAT---T-----------------------G--CCCTT-----CCC----------AATC-A-A-AC----TC---TG--------TA-----T---A-A-AT---------TATC--C-T-C--------------------A-C-GG----------T--------T----TT-------------A-GA-CT-T----AAT---T-------GAGAAAT----------------------TAC----AT-T--------TTCA---ATGT---ATG--GT-C-A--A-T-----TATACTAT-T-T-T-----T--AC-T--T----CT-A-AA----A-------A-----atataatttctacaaaataagggattgtatatttcctatgttcaaaagttgaaatgtattgcccttcccaatcaaactctgtataaattatcctcacggttttagacttaattgagaaattacattttcaatgtatggtcaattatactatttttacttctaaaaacaaaaatttcattggtttgtttgcggcacgcataattaagaaaatg
gi|33 : tttatacaggattccataacagataagggactgtaaaattttctAT-----A------TA----T--------------T-----------------------------GAC----------T--T-AGTT-T---GGT----A-------ACT-------AA-------G--TAACA------A------G-----AATT-------AAA--T-T----CC-----T--T----G-------------------AA--A-----------------------------------------TAA-----AGG---C----------CC----------TG----T-C------A-A-T-ATT-T-------TATGA----T-------------------------A-A--T--A----TAT---T-----------------------A--CCCCT-----CCA-----------ATC-T-A-AC----TA---TA--------TA-----A---A----T---------TTTC--C-CAC--------------------AAC-TGC---T-----T--------T-------------------G-GA-CC-T------T---T---G----AGAAAT-CG-----T--AA--G-A-A--TAA----AT-T-----TCATTCC---A--T---ATG--GA-A-A--A-T-----TGTATTCA-T-A-T-----T--TC-A--T----AT-G-AA----A-------AC----A-T--A----T----A---T------T--TG---G--TT---TT-T-G-TTTTC------A--TCC----A--TT-------TGG-----TAAA------A-----A-------G--T--TTA-----T------TTGCAGTTCA---A--GTGTcaaaaatttcattggtttgtttgcggcacgcataattaagaaaatg
gi|34 : -T-------AG-------A--TA-CA------A------C-----TACA--------------------T-----T--T----T-------------------AA--ATTACC-----------A-AA---GCA--------T--------A-----AGG---G----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TT--C-------TGTGA----TTA--TCA--AAA---AT-TT----GA-T--T--A----TAT-------------------------C-A--CCCCT-----TCC-------------A-C-G-AC----TA---TA--------CA-----A---A-A-AT---------TT----C-C-T--------------------A-T-CGT---T-----T--------T-------------------G-GA-CT-T----AAA---T---GATTGAAAAAT-CA-----T--AG--G-A-A--TAA----AT-C-----ATAAGCC---A--T---A
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gi|36 : tatata--ATG----GATACATGGATTGA------TAC-----A------AA----T--------------TAT-----GT-T------------------GGC----------A--T-GTTT-T---GG-----A-------A-T-------TA-------G--TA-CA------A------A-----TATA-------TAA--T-T----CA-----T--A----A-------------------AA--A----------------A-AA---A-A--------T--------------AAG---G----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TTT-C-------TGTG-------T--TAA--AAA---GT-TA----AA-A------------------TA----------------CCC----CCCC------------------------------------------------------------------------------C--C-C-C----------------------C-TGT---T-----T--------T-------------------G-AA-CT-T----GAT---T---G----AGCAAT-CA-----T--TG--G-A----TAA-----T-T-----ACACTCC---A--T---ATG--GC-A-A--A-T-----TGTATCAA-T-T-T-----T--AA-T--T----GT-G-Atctgacatttaatgaaaaaa
gi|37 : AT-----A------TA----T--------------T-T-----TT-G------------------GTC----------T--T-AGTT-T---GCT-TGTT-------A-T-------AA-------A--TA-TA------A------G-----TAAA-------AAA--AAT----CC-----C--T----G-------------------AA--A----------------A-AT---A-A--------C--------A-----AAG---G----A-----CT----------TA----C-A------A-A-T-AAT-C-------TGT------TAT--TCA--AA-------------------T--A----TA-------------------------CT-A--CTTCT-----CCC----------GATA-T-A-AC----T---------------A-----A---A-A-ATGAAACCCACCCCCATC-C-C--------------------A-C-CCT---G-----T--------T----AT-------------G-GA-CT-G----AAT---T---G---AA-AAAT-CA-----C--GG--G-----------------------CATTCG---G--T---GCG--GT-A-A--A-T-----C-TATTTA-C-T-T-----T--AC-T--T----AT-C-AA----A-------A-------C--A----T----AA--T------T--TA---G--TT---TT-C-A-TTTgtatataaattttaaataaaaaaagtttgttgcacgtgtctttagagt
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gi|4 : TTAATTGCACACAA--AAGAA--ATG----AATATCTGGGATGA------GAT-----A------TA----G--------------T-T-----TT-T------------------GGC----------A--T-AGTT-T---AAT-TGTA-------A-C-------GA-------A--TA-CA------A------A-----TATA-------AAA--T-T----CC-----T--T----T-------------------AA--A----------------A-AA---G-AGGGG----TG-----TGA-----GGG---G----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TTT-T-------TACGA----TGT--TCA--AAA---GT-TG----AA-A--TTGA----TAT---T-TAGCCCCCCCCC------CCC-A--CCCCC-----CCC----------TATA-T-A-GC----TC---TA--------CA-----A---ACA-AT---------TTTC--C-C-T--------------------A-C-TGT---T-----T--------T----TT-------------G-GA-CT-T----AAT---T---GCA-GAGAAAT-TT-----T--GG--G-A-A--TAA----AT-T-----ACACTCC---A--C---ACA--GT-A-A--A-T-----TGTATTCA-T-A-T-----T--AC-A--T----GT-A-AA----A-------A-----A-C--A----T----A---T------CGGTA---G--TT---TT-C-A-TGTTC------A--T-C----A--TT-------G-------T---------A-----A-------G--C--T-------T------TTGTa
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gi|43 : acaaaatataaggctgcatattaagaacacttgattACTA--AAGAA--ATG----GATGCCTGGGCCAA------TAC-----AATGTCATA----T--------------T-T-----TC-C------------------AAC----------T--T-AGTT-T---TGC-TATA-------A-T-------AA-------A--CA-CA------A------A-----TATA-------AAA--T-T----CC-----T--A----T-------------------AA--C----------------------------------C------TGA------GA---G----A-----CT----------TG----T-T------A-A-T-TTT-G-------TGTGA----TGT--TCA--AAA---GT-TG----AA-A--T--A----G-----T-TG--------------------A--CCCTT-----GCC----------TATA---------------------------------------A-AT---------TGAC--C-C-C----------------------T-TAG---T-----T--------T----TG-------------G-GA-CT-T----AAT-------A---GAAAAAC-CA-----T--GG--G-A-a
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gi|47 : cagaaatcagactgaccttaaggacactt--ATG----G-CGCATGGGTTGA------TGC-----A------TA----------------------------T-T------------------GAC---------------A--T-T---GTT-TGTA-------A-C-------AC-------GTTTA-CA------A------A-----CATA-------ACA--T-------A-----T--T----T-------------------AA--AAAACAAAACAAAAAACA-AA---A-A--------C--------A-----AAA---G----A-----TT----------TG----T-A------A-A-T-TTT-C---------TGA----TG-----------------------------T--A----TAT---T-AA----------------CTC-A--------------------------A------------------TG--------CA-----A---A--------------TTTC--C-C-C--------------------A-C-TG----------T--------T----TT-------------G-AA-TT-T----CAT---C-------GAGAAAT-CA-----T--GG--A-A-A--cgta
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gi|5 : A--ACAAA--ACG----AATGTATGGGTTGA------TAA-----A------TA----T--------------T-T-----GG-G------------------GGGGGGGGGGGGAT--T-AATA-T---AGT-TGTA-------A-T-------AACTACATTG--TA-CA------A------A-----TATA-------AA---T-T----CC-----T--T----T-------------------AA--A----------------A-AAT--G-A--------T--------A-----AGG---G----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TTT-C-------TATGA----TGT--CCT--AAA---GT-TG----AA-C--C--A----CA----T-TA----------------CCC-C--CACCT-----ACTACATGTGGCATATA-T-A-AT----TC---TA--------C--------------AC---------TTTC--CTC-C--------------------A-C-TG----------C--------C----TT-------------G-GA-CT-T----AAT---T-------CAGAGGT-CA-----T--GG--G-C-A--TGA----AT-C-----ACATTCC---AG-T---A-G--AT-G-A--A-C-----AGTATTCA-T-T-T-----T--AC-T--T----AT-A-AA----A----------------------------G---C------T--TAAACG--TT---TC-C-A-TTTTCAAAAAAA--A-A----A--AT-------T-------T---------A-----AAAGGG--G--T--TG------T------TTTTAG--CA---A--GTGTCG-T-TAAtctagtaagtt
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gi|51 : ttgtgatgcattgtT-T----GAT---T---G----AGAAAC-CA-----T--GA--A-A-A--TAA----AT-T-----ACATTCG---A--T---A-G--AT-A-A--A-T-----TGTATTCA-T-T-T-----T--AC-T--T----AT---AA----A-------A-----A-C--G----T----AAT-T------T--TA---G--TT---TT-C-A-TTTTgcgacgataattaacaaaatatttgacttcctgaagaaagaaattgtaaaaacataacttttcatcattcttgaaaaaggtttgttcatagcatgtggc
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11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11 : G----GATGTATGGGTTGA------TATCTAAGA------TA----A--------------T-T-----TT-T------------------GAC----------T--T-AGTT-T---GGT-GGTA-------A-T-------AA-------G--AA-CA------A------A-----TGAA-------TAA--T-T----CC-----T--T----TTTTTTTTCAAAAAAAAAAAAA--A----------------A-AA---A-A--------A------AAA-----AGG---G----AGGAGCCA----------TG----T-A------ATT-T-TTT-C-------AATGA----TGT--TC---AAA---GT-TG----AA-A--T--A----TAT---T-AA----------------TGT-A--ACGCG-----ACA----------CAAA-T-A-------TT---TA--------CA-----A---A---------------TTG--C-C-C--------------------A-C-AAT---G-----T--------T----TT-------------G-GA-CT-T----CAT---T---GA--AAAAAAT-CA-----T--GC--A-A-A--TAA----GT-T-----ACA--------------------T-G-A--A-------------CA-T-T-C-----T--AT-A--T----CT-A-AA----G-------AT----A-T--A----A----A---T------T--TA---G--TT---TT-C-ATTTTTC------A--T-CTTGTT--TT-------T-------T---------A-----A-------T--TTGT-------T------TTGTAG--CA---T--GGGTTG-T-TAAAactcacacgcagaatgaatgtttttcactctgactatttaagttcttttgaagtacatgctatgtcgtctctcggaagtttcataacaacaaagacctgttttattttcttaatattttactggtaggatactgacagggactcgccactatttgacccttgatctt
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gi|15 : TG----GAAACATGTGTCGA------TTT-----A------CA----T--------------C-T-----TT-T------------------TCC----------T--TTCGTT-T---GGT-AGTG-------A-T-------AA-------G--CA-TA------A------A-----TATA-------ACA--T-T----TC-----T--AAAAAT-------------------AA--A----------------A-AA---A-A--------A------TAA-----AAA---G----A------T----------TGATCTT-A------A-A-T-C---C-------TATGG----TGT--TCA--A-----GT-CG----AA----T--A----TAT---T-TA----------------TTT-A--ACTCT-----CTC----------TACT-T-A-AC----CC---TA--------TA-----C---A-A-AT---------TTCC--C-C-C--------------------A-C-TGT---T-----T--------T----TTTTTTTTTGAGGGGG-GATCT-C----AAT---T---G----AGAAAC-CA-----T--GG--G-A-A--CAA----AT-G-----AC--TAG---A------ATG--GT-A-A--A-T-----TGTGTTCA-T-C-T-----C--TC-T--T----GT-G-AAGTGTA-------A-----A----------------------------TA---GCATT---TT-C-A-TTTTC------A--T-C----A--TT-------T-------TTAA------A-----A-------C--T--TTTTAAAGT------TTGTAG--CA---A--
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gi|2 : tttctaaggataccaagaatagtgattattaaggacA--AAAAA--ATG----AATGCATGAGTTGA------TAT-----A------TA----T--------------A-T-----TT-C------------------GGT----------T--T-CATT-T---CGT-TGCA-------A-TAAGTTAAAA-------G--TA-CA------A------A-----GCTA-------AAA--TATCAAACC-----C--C----C-------------------AA--A----------------A-AA---A-A--------T------TTG-----AAT---G----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TTT-C-------CATGA----TGT--TCA--AAA---GT-TG----TG-A--T--G----AA-------A----------------CAC-A--TAACT-------C----------TTTA-T-G-AC----TA---TG--------TA-----A---A--------------TTTT--G-T-C--------------------A-C---T---C-----T--------C----AT-------------G-GA-CT-T----AAA---T-------GAAAAAT-CA-----T--GG--A-A-A--TAA----AT-T-----A---TC-----------ATG--AT-A-A--A-T-----TGGATTCA-T-T-G-----T--AC-T--T----AT-A-TA----ACATT---A-----G-G--A----T----A---TAAAG--T--GA---G--TT---TT-C-A-TTTTC------A--T-C----A--CT-------TGTGAAACC---------A-----A-------G--T--T-------TGTTTGCTTGTAG--CA---A--ATgacagtcagtcgatagatttg
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gi|27 : aaaaAA--AAAAA--ACA-----ATGCGTGGGTTGC------CAT-----A------TA----T--------------T-T-----CT-T------------------TGC----------A--T-ATTC-T---GGC-TAAA-------A-T-------TA-------G--CAACA------A------A-----CATG-------AAA--T-T----CC-----T------------------------------------------------A-AA---A-A--------T------TGA-----AGG---A----A-----CT----------CG----T-A------A-A-A-TTA-T-------TGGGA----TGC--TCA--AAA---GT-TG----CG-A--C--A----TA--------------------------C-AG-TCCCT-----CCC----------TGTA-T-G-AC----TC---AA--------CA-----A---A-G--T---------TTTCA-C-C-C--------------------A-C-TGT---A-----T--------T----T----------------GA-CA-T----CAT---T---G----AGAAAT-----------GG--A-AGA--CAA----A----------A-------A--T---AAA--AT-G-A--A-A-----TGTATT-----T-T-----T--AC-T--T----TT-A-T---------------------C--A---------A---T------T--CA---G--TG---TC-C-A-TTTTT---------T-C----A--CT-------T-------TTGAAAA---A-----A-------G--T--TG------T------TTGTAG--CA---A--GTGTacaaaggttgttttttttttttcatttctttcataatttagaaaaatgagtttgtaggaaa
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gi|30 : TTGAT-ACCCA-AA--AAAAATTATG----GTTGAATGGGTTGA------TGT-----A------TA----T--------------T-G-----TT--------------------GGC----------TAAT-AGTT-TT--GAT-AGTA-------A-T-------AA-------G--TA-CA------A------A-----CATT-------AAA--T-T----TC--------A----T-------------------AA--A----------------A-CA---A-A--------T------AAA-----TAA---A----A-----TT----------TG----C------------T-TTT-T-------T-TGA----TGT--TGA--AAA---GT-TG-------C--T--C----TGT---A-TA--------------------A--CC----------------------ATA---A-AC----TCAA-TA--------CA-----A---A-T-TT---------TTTT--T-CAC--------------------A-C-TG----------T--------T----TC-------------A-GA-CT-G----AAT---T---G---G-GAAAT-CA-----T--GG--G-C-A--TAA----AT-T-----ACATTCCATTA--T---ATG--GT-A-A--A-T-----TGAATT-A-TAT-T-----T--AT-TAAT----AT-A-Aaaatgcaacaattataattaaaacatatacaaaatgcttatttcacacaatatcaacgaacgctcttttgatcgacatggtattcgtctttcaaattttcataggccgccaaaga
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gi|61 : gAAA--ATA----AATGCATTGGTTGA------TAT-----G------TG----T--------------G-T-----TT-T------------------GG---------------------------T-TGTA-------A-T-------AC-------G--TA-CATTTGCAA------A-----TAAA-------GAA--G-T--------------T----T-------------------AA--A----------------A-AA---G-A-----------------------AGG---A----G-----CG----------TG----T-A------A-A-T-TTT-C-------CATGA----TGT--TCA--AAA---GT-TG----A
gi|62 : taaggacactcggtT--TCA--AAA---TT-TT----GA-A--T--A----TAT---TGCA----------------TGT-A--CCTCT-----GCC----------TA-----A-AC----------A----------------------------------TTCC--T-C-C--------------------A-C-TGT---T-----T--------T----TT-------------G-GT-TT-T----AAT---C---G---AAAAATT-CA-----C--GG--A-A-A--TAA----AT-C-----AAATTCC---A--TA--ACG--G--G-A--A-T-----TGAATTCA-T-T-G-----T--AC-T--T----
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gi|79 : aaagaata----------TG----T-A------A-A-T-TTT-C-------CATGA----TGT--TCA--AAA---GT-TG----AA-A--ct
gi|8 : gcgA-------ACA--T-T----TC-----T--TA---T-------------------AA--A----------------ATAA---G-----------------TAA-----A-----------------T----------CA----T-A------A-T-T-TTT-C-------TATGA----CTC--TTG--AAA---GT-TT----AA-A--T--G----AAT---T--A----------------TCT-A--CCCCC-----TCC-----------ATA-T-A-AC----TA---TA--------CA-----A---A--------------TTTC--C-C-C--------------------A-C--GT---T-----G--------T---------------------GA-CC-T----CAT---T---A------AAAT-CA-----T--GG--G-G-AACTAACTACATGT-----ACATTCT---G--T---TCT--AT-G-A--A-T-----TGTACTCAAG-T-T-----T--AC-T-------------------------------------A---------A---T------T--TG---G--AT---TT-C-G-CTGTC------A--T-T----A--TT-------T-------T---------A-----A-------
gi|9 : A-------ACA--T-T----TC-----T--T----------------------------A----------------G-AA---A-A--------T--------A-----AGT---A----A-----AT----------CA----T-A------A-T-T-TTT-C-------TATGA----CTC--TTG--AAA---GT-TT----AA-A--T--GAAT-TAT---C-TA----------------CCC------CCT-----CCC----------TATA-T-A-AC----TA---TA--------CA-----A---A--------------TTTC--C-C-C--------------------A-C--GT---T-----T--------T-------------------G-GA-CC-T----CAT---T--------AAAAAT-CA-----T--GG--G-G-AACTAACTACATGT-----ACATTCT---G--T---TCT--AT-G-A--A-T-----TGTACTCAAG-T-T-----T--AC-T-------------------------------------A---------A---T------T--TG---G--AT---TT-C-G-CTGTC------A--T-T----A--TT-------T-------T---------A-----A-------caattatacaaaatgcctacgagtgttctttcgaactacatggtatttcgtcttggaattttcttagcagcaaagacatgataacttggttttttttctctcctccttattttactgacaggggctcgcacgaattgactctttgagctccatt
blockSeqs : T GC TT ATGC CATACG . ATGTCA TTTTTTTTGGTGAGGAGGGGGGTGGGGT T C TCT A CACTGTA TTGGTTTTAACTG TT A TTTGCA ATACAT TACTG TGCACAT TT A CCTTTTTTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA GGTGG GGAGC GTCGTGTGTG ATCT TCAGGG T TGCAATA CCCT CCG CGAT TT TGATATTTAGCCCCCCCCCCCCCCACCCA AACCC ACATGTGGCA T CCGA CAGA TATGAATATTCAAAT AT A CCCCCCCCACACACACACAC A AT TTTTTTTTTTTTTGAGGGG T TTACA TAA GCAGG TTGAG TT GT AC CTAC TAAACC CATT TG TTTATG TT A GTACA A TCATG AA AA ATAAAGCATGCCTACATATGTA GTACAA GG AAC CA AAG AAAAAA TT CTTGT AC CAGATTC GTGAAAC TGAAAAAAAAAGTTTGT CT TTG TT . A
blockSeqs : . . . . . . . TAAAATGTGTGTGTTTTTTTTACT . . T . . TAAGTTAAAA . A . . . ATAT . A CCTTTTCAAAAAAGGGAGGGGTGGGGGGTGG TAAA AG AA . AG A . A . A . TGATATTTAGCCCCCCCCCCCCA . . C . CAA AAAAATGAAACCCAC A A C A C CACCTTCACCTCGCTTT T A . GATTG T . A AC CTAC CT T G TTGTG TT A . A AAATT G . TGAAAACTATACCAACATAAA AAAG GG . . . . G CA AC TG GG GAAAAAGAAAAGTTTAT TT . . . .
blockSeqs : . . . . . . TTTGGGGGGGGGGGGGGGAT . . . . . TAACTACATT . A . . . G . . ATTTAAAAAACAAAACAAAAAACAAAAACA G T . . . . . . . . . ACTAGTATATATTA . . . . CCC TATATTAACAAACAG . . . . A TCCCCTGTTTT . C . GAAA . . A AC CTAC GT C . ACGAT . . . A TA T . ACTGTTACAATAACAAAAA . . . . . . . CC TT G GG TAAAACTTTTTAAAGT TT . . . .
blockSeqs : . . . . . . AGTATAGTTTATGGCT . . . . . GAAT . . . . . . . . TTTAAAAAGGGGGGGGGGGTGGGTGG G . . . . . . . . . . GAATTATCTACCC . . . . A TATAAATCCC . . . . G TTTTAATCTT . T . GCAG . . . . . GT A . AACG . . . . G . . TTAGAATATCATTGCAA . . . . . . . CC . . . TGAAAAAAGAATTGAT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TGTAAAACTTTGGTT . . . . . CTAA . . . . . . . . CCTCCAAAAGAAGGACAATCGTTTAA G . . . . . . . . . . GAATTATCTACCC . . . . T CAAACAAT . . . . T TGTTTT . C . GAA . . . . . GT C . TCG . . . . . . . ATATAACATTAGGATA . . . . . . . C . . . TTGAAAAAGGTTTGT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . AGGTTTTTTTTCCC . . . . . CTAA . . . . . . . . CCTTTAAAAAAGAGGGGTGTGA G . . . . . . . . . . TTATATCATTCA . . . . A TAACAGTA . . . . T TTTTTT . A . GG . . . . . T G . ACT . . . . . . . GTATAAAATCATAAG . . . . . . . C . . . AAAAAACAGATTGT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . GTTTTTGGCTA . . . . . TAA . . . . . . . . CCTTTAAAAAGAGGGGTGTGA G . . . . . . . . . . ATATTGCATGTA . . . . C CAAACAAT . . . . T TTCATA . A . GC . . . . . T C . ACA . . . . . . . CCATGAAAACATAAA . . . . . . . C . . . CAAAAACAGTTTAT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TATTTTTTGCA . . . . . TAA . . . . . . . . TCTAAAAATAAAAAAAAATAA G . . . . . . . . . . AAATCTATCCA . . . . C CGGAATAT . . . . T TCTCAT . A . GG . . . . . T C . ATG . . . . . . . ATAAAGTACAATTA . . . . . . . C . . . TGAAAAAAGTTTGT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TTGTTGGCTAA . . . . . CGG . . . . . . . . CCCTGTTTTTAATTAGGGGAT G . . . . . . . . . . ATATTAATGTA . . . . G TACGAAAT . . . . T TGTTAT . C . GA . . . . . T T . ACA . . . . . . . TTAAGAACATAAAC . . . . . . . C . . . AGAAAAAAGTATGT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TTATGTTGGCA . . . . . TAA . . . . . . . . CAAACCCCCAAAAAAAATTTG G . . . . . . . . . . ATATTTATTTA . . . . A CAAGTAT . . . . T TTTGCT . A . GA . . . . . G C . ACA . . . . . . . ATTGAAAATTAGA . . . . . . . T . . . TGAAAAAAGTTGT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . CTTATATGTTT . . . . . TAT . . . . . . . . CCTAAAACAAAAATGATAATT G . . . . . . . . . . ATATATTACCC . . . . A TCAAAAT . . . . T TTTTTT . A . AG . . . . . C C . TCA . . . . . . . CTAAAGATATAAA . . . . . . . C . . . AAAAATGTAATAA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TTTTTGGGTT . . . . . TAA . . . . . . . . TTTTAAATTACCAAAGCATA A . . . . . . . . . . TAATCATCCAA . . . . A TACAAAT . . . . T TTTTTT . A . AG . . . . . T C . ATG . . . . . . . ATAAAAGCACAAA . . . . . . . C . . . GGGAAAGGTTTGT . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCTTTTTCCT . . . . . AAT . . . . . . . . TCTTATAAAATAAGTAA T . . . . . . . . . . ACAGTGTCCCA . . . . C TAGCAAT . . . . T GTTTTG . C . AG . . . . . T C . ATG . . . . . . . TCAAAATTTAATA . . . . . . . C . . . AAGTTTGTTTGC . . . . .
blockSeqs : . . . . . TATTTCGGTT . . . . . CAA . . . . . . . . TCATAAAACAAATAAA A . . . . . . . . . . AAATTACCCCA . . . . C CAAAATT . . . . T TTTTTT . A . GA . . . . . C C . ACA . . . . . . . GTAAAAGCACGAA . . . . . . . C . . . AAAAAAGTTTAT . . . . .
blockSeqs : . . . . . TTTTATGGTT . . . . . TTA . . . . . . . . CCTTTAAAAAATGATA C . . . . . . . . . . CTATTCATCGA . . . . C TATGAAT . . . . T TGAATT . C . GA . . . . . T T . TCG . . . . . . . ATAAAAGCATAGA . . . . . . . C . . . AAAAGGGGTTGT . . . . .
blockSeqs : . . . . . TTTCTTTGCA . . . . . TAA . . . . . . . . CACTTACAAAAGAATG A . . . . . . . . . . ATATTAACTCA . . . . C TACAAAA . . . . T TATTT . G . G . . . . . T T . ATG . . . . . . . CTATAAACATAAA . . . . . . . C . . . TGAATTTTTTT . . .
blockSeqs : . . . . TTTTTGGTCT . . . . . TTG . . . . . . . . CGCACAAAAACAACT A . . . . . . . . . . ACATTACCCCA . . . . C TGCAAAT . . . . C TTTTT . A . G . . . . . A C . ACA . . . . . . . TTGAAAACCTAAA . . . . . . . C . . . AAAAAGTTTAT . . .
blockSeqs : . . . . GTTTTTGGCA . . . . . TTA . . . . . . . . CCCTGAAAAATAACA G . . . . . . . . . . ATATTTCCATT . . . . A CAAATTT . . . . T TATTT . C . G . . . . . T T . ATG . . . . . . . ATGAAAACATATA . . . . . . . A . . . TGAAAAAAGT . . .
blockSeqs : . . . . TCTTTAGGCT . . . . . GAA . . . . . . . . CTGAAGAAAAAAATA G . . . . . . . . . . ACATTACCCC . . . . C TAAAAGC . . . . C TTTTT . C . G . . . . . T C . GCA . . . . . . . ATGAAAAGATGAA . . . . . . . C . . . GAAATGAAGT . . .
blockSeqs : . . . TTTTCCAACT . . . . . AAA . . . . . . . . TCTTGCTAAAATGA A . . . . . . . . . . GAATTATCTA . . . . C TATAAAT . . . . G ATTTT . A . G . . . . . T A . AAA . . . . . . . ATGAAAACATATA . . . . . . . T . . . AATTTGTT . . .
blockSeqs : . . . TGTTTTGG . . . . . TAA . . . . . . . . CCTATCTAGAAAAG A . . . . . . . . . . ATTTTACCT . . . . C CAAAAAT . . . . T TATA . C . G . . . . . T C . ACG . . . . . . . CTTTTAACATTTA . . . . . . . T . . . AGGTTTGG . . .
blockSeqs : . . . ATTTTT . . . . . GAA . . . . . . . . CATAAAAAAAAAAT G . . . . . . . . . . GAAACACA . . . . A TACAAAT . . . . C TTTA . A . G . . . . . C C . ACG . . . . . . . ATAAAAACGTAAT . . . . . . . C . . . CAGTTTGC . . .
blockSeqs : . . . TTGACT . . . . . TAG . . . . . . . . CCCCTAAAAATTAG G . . . . . . . . . . CTGTATAA . . . . C CACAAGT . . . . C TTTT . A . G . . . . . T C . ATG . . . . . . . TTGAAAAGATAAA . . . . . . . C . . . AAATAGT . . .
blockSeqs : . . . TTACA . . . . . TAA . . . . . . . . CCTTCAAAAGATA G . . . . . . . . . . ATATGAAA . . . . C TAAAAGT . . . . T TTTT . G . G . . . . . T C . ATG . . . . . . . GTCAAAACATAAA . . . . . . . T . . . AAGCTT .
blockSeqs : . . TTGAC . . . . . TTA . . . . . . . . CCTAATAAAGATA C . . . . . . . . . . ATATTA . . . . A TAGAAAT . . . . C TTTT . A . G . . . . . T G . ATG . . . . . . . GTGAAGTGTAAA . . . . . . . A . . . AAAAGT
blockSeqs : . . CT . . . . . TAA . . . . . . . . TTAAATAAAAATA G . . . . . . . . . . GTAATG . . . . A TACATT . . . . T TTTT . A . G . . . . . T C . ATG . . . . . . . AGAAAGCAAAAA . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . CGA . . . . . . . . CCTAAAAATTGA G . . . . . . . . . . GTATGA . . . . T GAAACT . . . . T TTTT . C . G . . . . . C T . GCG . . . . . . . GAAAAACATGAC . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . TAG . . . . . . . . CTAAAAAAAGGG G . . . . . . . . . . ATGTTT . . . . C CAAAGT . . . . T CTTT . A . A . . . . . T C . ATG . . . . . . . TCATATCAAAAT . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . TAA . . . . . . . . TCGTACAAAATG G . . . . . . . . . . ATATTA . . . . C TACAAT . . . . T TTTT . A . G . . . . . T C . AAA . . . . . . . ATCAAAACATAA . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . TGT . . . . . . . . CCATAACAGATA T . . . . . . . . . . ATATTA . . . . T TAAAT . . . . T TTTC . G . G . . . . . T C . ACA . . . . . . . GTAAAAAACATA . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . CAC . . . . . . . . CCTTAAAAAAGA G . . . . . . . . . . ATTTCA . . . . A CAAAA . . . . T TTTT . C . G . . . . . T C . ACG . . . . . . . GCAAAAGACTAA . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . TTA . . . . . . . . CCTATAACCTGA G . . . . . . . . . . ATACAG . . . . C CAAAT . . . . T CTTT . G . G . . . . . T G . ACG . . . . . . . ATAAAATATAAA . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . AAT . . . . . . . . TCTTACAAAATA G . . . . . . . . . . ATCTTA . . . . C TAAAT . . . . T TTTT . A . G . . . . . A C . TCG . . . . . . . GAAAAAACATA . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . TAA . . . . . . . . TCTTAGAAAATA G . . . . . . . . . . GTATTG . . . . T TACAC . . . . T TTTT . G . G . . . . . C T . ATA . . . . . . . AGAAAAACAGA . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . TAC . . . . . . . . AATAATAATAA A . . . . . . . . . . ATATTA . . . . A CAAA . . . . T TTTT . A . G . . . . . T A . ACG . . . . . . . ACAAAAACATA . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . TA . . . . . . . . TCTAAGGTTTG G . . . . . . . . . . ATATCA . . . . C TAAA . . . . A TTTT . A . G . . . . . A T . GCA . . . . . . . AAAAACATAAA . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . TATTCAAAAGA A . . . . . . . . . . ATACTA . . . . C CAAC . . . . T TATT . A . G . . . . . G C . TCT . . . . . . . GCAAAGACATG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . CCTTGAAATAA G . . . . . . . . . . ATGTGG . . . . C CAAA . . . . T CCTT . A . G . . . . . T C . ACG . . . . . . . CTCAACATAA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TCTACAAAATA A . . . . . . . . . . AGTTGA . . . . A CAAA . . . . T TTTT . A . C . . . . . T A . TCT . . . . . . . TTATCAA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . CCTTGAAATAA A . . . . . . . . . . ATATTA . . . . A CAAA . . . . T TTTT . A . G . . . . . T T . TCT . . . . . . . ATAAAAG . . . . .
blockSeqs : . . . . . . CTAAATATTCA G . . . . . . . . . . ACATTA . . . . A CAAA . . . . . TTTT . A . G . . . . . C C . CT . . . . . . . AA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . CCTCAATATTC G . . . . . . . . . . TTACCC . . . . . CAAA . . . . . TTTT . G . G . . . . . T A . TC . . . . . . . AA . . . . .
blockSeqs : . . . . . CTGAACAGATA G . . . . . . . . . . ATATTA . . . . . AAT . . . . . TTGT . C . G . . . . . T T . AG . . . . . . . AA
blockSeqs : . . . . TTAAAAAAGA A . . . . . . . . . . TATCA . . . . . AAT . . . . . TTTT . C . G . . . . . T T . AG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TTTTTATAA . . . . . . . . . . . TACCC . . . . . CAC . . . . . TTT . C . T . . . . . . T . AC . . . . . . .
blockSeqs : . . . AAGTTGA . . . . . . . . . . . ATATA . . . . . . . . . . . TTT . . . A . . . . . . . . AC . . . . . . .
blockSeqs : . . . CAAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : .
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originalCons : NNNNTTAAT-GCACACAA--AAAAA--ATG----GATGCATGGGTTGA------TAT-----A------TA----T--------------T-T-----TT-T------------------GGC----------T--T-AGTT-T---GGT-TGTA-------A-T-------AA-------G--TA-CA------A------A-----TATA-------AAA--T-T----CC-----T--T----T-------------------AA--A----------------A-AA---G-A--------T------TGA-----AGG---G----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TTT-C-------TATGA----TGT--TCA--AAA---GT-TG----AA-A--T--A----TAT---T-TA----------------CCC-A--CCCCT-----CCC----------TATA-T-A-AC----TC---TA--------CA-----A---A-A-AT---------TTTC--C-C-C--------------------A-C-TGT---T-----T--------T----TT-------------G-GA-CT-T----AAT---T---G---GAGAAAT-CA-----T--GG--G-A-A--TAA----AT-T-----ACATTCC---A--T---ACG--GT-A-A--A-T-----TGTATTCA-T-T-T-----T--AC-T--T----NT-A-AA----A-------A-----A-C--A----T----A---T------T--TA---G--TT---TT-C-A-TTTTC------A--T-C----A--TT-------T-------T---------A-----A-------G--T--T-------T------TTGTAG--CA---A--GTGTCG-T-TAAA
finalCons : NNNNTTAAT-GCACACAA--AAAAA--ATG----GATGCATGGGTTGA------TAT-----A------TA----T--------------T-T-----TT-T------------------GGC----------T--T-AGTT-T---GGT-TGTA-------ATAA---------------G--TA-CA------A------A-----TATA-------AAA--T-T----CC-----T--T----T-------------------AA--A----------------A-AA---G-A--------T------TGA-----AGG---G----A-----CT----------TG----T-A------A-A-T-TTT-C-------TATGA----TGT--TCA--AAA---GT-TG----AA-A--TATATTA----------------------------------CCCCT-----CCC----------TATA-T-A-AC----TC---TA--------CA-----A---A-A-AT---------TTTC--C-C-C--------------------A-C-TGTTTT-----------------------------------G-GA-CT-T----AAT---T---G---GAGAAAT-CA-----T--GG--G-A-A--TAA----AT-T-----ACATTCC---A--T---ACG--GT-A-A--A-T-----TGTATTCA-T-T-T-----T--AC-T--T----NT-A-AA----A-------A-----A-C--A----T----A---T------T--TA---G--TT---TT-C-A-TTTTC------A--TC-----A--TT-------T-------TGAAAAAAGTTTGT-------------------------------TTGTAG--CA---A--GTGTCG-T-TAAA
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|40 ): CAAATGTAAACATTCCTAAAGTTTCAAAAATTAGTCAAAATTCCGTAATTGTAATTTTTTTTACTTGTATTCCTACTCTATCCCATCGGAAATGCTTATCCACTATATATATTAGACATGATTGAGAAGGCATTATAAGATTCAATTCAGTGAAATGTATTAATTTTATTATCACAGACAATCATACGTTCGATGTTTAGTTTCATCATTTTTGGA
Unaligned ( gi|42 ): AAATGTAAACATTCTAAAGTTTCAAAAATTAGTCAAAATCCGTAATGGTAATTTTTTTTACTGTATTCCTACTCTATCCAATCGGAAATCTACTCCACATATATAGTTAGAGCATGATATGAGAGGCATTAAGATTTCAATCAGTGAAACTTATTATTATTACTCAAGACAATCATACGTTTGTTTTAGTTCATCAATTTTTGAT
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Unaligned ( gi|48 ): TGTATATGATCTTTTTAAATATACAAAAAACTCTCCTTCAAAGAGTGAAGTTTGAAGCAATTTTAGAGGAAGTTTGAAGGCAATTTAAAATTTAGTCCTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTGCTCTGATGAACTAATGTCTTTTATCTGTTTT
Unaligned ( gi|53 ): TCGGTAAAACATTTGTCGATGATCAAATTTACAAACTATTTTAAGGGAGTTGAGAGTTTAAATATAAATTTAAGCGAAACGGTTTAACAAATGTGTTAAAACGTAATGATACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|65 ): TTATACTATTGTCATCATTTTAAAAACACCTACAAAATGCATACGTTTCACAATATCCACGTTCTGTTGTTAACTACAGCTGTATTTTATGATCATTTCGACAGATCTTAACAA
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Alignments
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Reference ( family-91 ) : NNNNTTAAT-GCACACAA--AAAAA--ATG----GATGCATGGGTTGA------TAT-----A------TA----T--------------T-T-----TT-T------------------GGC----------T--T-AGTT-T---GGT-TGTA-------A-T-------AA-------GT--A-CA------AA-TA------TA-------AAAT-T----C--C-----T--T----T-------------------AA--A-----A-AA----------------G-A--------T------TGA-----AGG---G----A-----CT----------TG----T-A------A--A-T-TTT-C-------TATGA-TGT--TC----A--AAA---GT-----TG----A-A--------AT--A----T-AT--T---------------------A-----CC-C---CT----------CCCTA--------------T-----A-T-AA-C----TC---TA--------CA-----A---A-A-AT------T------TTC-C-------C-C--------------------A-------C--TG-TTT-T---------------G-GA-CT-T----AAT--T---G---GAGAAAT-CAT-----GG-G-A-A--TAA----AT-T--A-----CATTCC---A--T---ACG--GT-A-A--A-------T-----TGTATTC-AT-T--T-----T--AC-T--T----NT-A-AA----A-------A-----A-C--A----T----A---T------T--TA---G--TT---TTC-A-TTTTC-------A--T----C--A----T-T-------T--T--G---AA----A--AA--A---G--T-----TT---G-T-----TTGTAG--CA---A--GTG---TCGT-TAAA
gi|1 : -----TT-T------------------GAT----------T--T-AGTT-T---GAC-T-TA-------A---------AA-------TT--A-AA------AAATA------TA-------ATAT-T----T--G-----T--T----------------------------A-----C-AA----------------A-A--------T------TAA-----AGT---A----A-----CT----------CA----T-A-------------TTT-C-------TATGA-TGC--TC----A--AAT---CT-----T-------A--------ATC-A----T-TT--T---------------------A-----TC-CACTCT----------TCCTA--------------T-----G-T-TA-C----TG---TA--------CA-----A---G-T-AT------T------T-------------C--------------------A-------C--CG-TTC-A---------------A-AA-TT-TT---AAT----------GAGAAAT-CATT----GG-GTG-G--GAA----AT-T--C-----CATTGT---G--G---TCA--AT-A-A--A-------T-----TGTACTT-AT-T--T-----T--AC-T--TA---TT-A-AA----A-------A-----T-T--A----A----A---T------A--TA---A--CT---TTC-A-TTGGC-------A--T-------A----T-T-------T--T------AA----A--AA--T---G--TACCTGTT---G-T-----TT
gi|10 : --AAA---CT-----TA----A-A--------AT--AAATCT-AT--CC--------------------A-----CC-C---CT----------CCCCA--------------T-----A-T-TA-C----CA---TA--------CA-----A---G-T-AT------T------T-------------C--------------------A-------C--CG-TAT-A---------------A-GA-TT-TT---AAT----------GAGGAAT-CATTGAGTGG-G-A-A---------AT-T--C-----CATTGT---G--G---TCG--AT-A-A--A-------T-----TGTACTT-AT-T--T-----T--AC-T--T----AT-T-GA----A-------A-----A-TT-A----G----A---G------T--TA---G--CT---TTC-C-TGGTC-------A--T-------A----T-T-------T--T--G---AA----A--Aaaaaataacacgtagaaagaatatttttcacctgactatgtaccttctgttgaactacatgaaattctatgtcttgaaagtttcataactatttcatcttcatatttttttattaggaggatacggacagaaactcgccaaaaattgacccgttatcttcttta
gi|11 : G----GATGTATGGGTTGA------TATCTAAGA------TA----A--------------T-T-----TT-T------------------GAC----------T--T-AGTT-T---GGT-GGTA-------A-T-------AA-------GA--A-CA------AA-TG------AA-------TAAT-T----C--C-----T--T----TTTTTTTTCAAAAAAAAAAAAA--A-----A-AA----------------A-A--------A------AAA-----AGG---G----AGGAGCCA----------TG----T-A------A--T-T-TTTTC-------AATGA-TGT--TC----A--AA----GT-----TG----A-A--------AT--A----T-AT--T---------------------A----------------------------A--------------T-----G-T-AA-C----GCGA-CA--------CA-----A---A-T-AT------TTACAAATTG-C-------C-C--------------------A-------CAATG-TTT-T---------------G-GA-CT-T----CAT--T---GA--AAAAAAT-CAT-----GC-A-A-A--TAA----GT-T--A-----CA--------------------T-G-A--A-------------------C-AT-T--C-----T--AT-A--T----CT-A-AA----G-------AT----A-T--A----A----A---T------T--TA---G--TT---TTC-ATTTTTC-------A--T----CTTG----T-T-------T--T--T---TA----A-------------T-----TT---GTT-----TTGTAG--CA---T--GGG---TTGT-TAAAtgtaccagtcgtttaaaactcacacgcagaatgaatgtttttcactctgactatttaagttcttttgaagtacatgctatgtcgtctctcggaagtttcataacaacaaagacctgttttattttcttaatattttactggtaggatactgacagggactcgccactatttgacccttgatctt
gi|12 : c--------------T-T-----TG-T------------------GCC----------T--G-AGTT-T---GATATGTA-------G-T-------AA-------GT--A-CA------AA-TACATATATA-------AGAT-G----C--C-----T--T----C-------------------AA--A-----A-------------------G-A--------T--------A-----AAG---G----A-----TT----------T-----T-A------T----T-TTT-T-------TATGG-AGT--TT-------------GC-----TG----A-AC-------ATTTA----T-AT--T---------------------A-----CT-C---TT----------CACTT--------------T-----A-G-AA-T----TA---TA--------TC-----A---A-A-AT------T------ATC-C-------C-T--------------------A-------C--GG-TTT-A---------------G-AA-TT-T----TAT--T---G----AGGACT-CGT-----GG-G-A-A--TGA----AT-T--AAACCACACTTC---A--T---A-------A-A--A-------C-----TGAATTC-AT-T--T-----TAAAC-T--T----AT-A-AA----GC------ATGCCTA-C--ATATGT----A---T------T--TA---G--CT---TTC-A-TGTTC-------A--T----C--A----T-T-------TC-T--GAAAAA----A--AA--A---G--T-----TT---G-T-----TTGCAG--CA---A--ATC---TTGG-TAAAaacaaattgtagaatcacta
gi|13 : tcTGA------TAT-----A------TA----T--------------T-T-----TT-G------------------GGT----------T--C-AGTT-T---GGT-TCAA-------A-TTGGTTTTAACTG----GT----CA------TA-TA------TGG------AAAT-T-------------T--T----T-------------------AA--A-----A-AG----------------G-GGGGGGGGGTGGG---TGG-----GGG---GGTGGA-----CT----------TG----T-A------A--A-T-TTT-C-------TAAAA-TGT--TC----A--AAA---GT-----GG----A-A--------AT--G----T-AA--T---------------------G-----CC-A---TT----------CCCTG--------------T-----A-T-AA----------------------------------A-AT------T------TTC-C-------C-C-------------------------------CA-TTT-T---------------G-GA-CT-T----CGT--T---G----AGAAAT-CAT-----GG-G-A-A--TAT----AT-T--A-----CATTTA---A--T---ACT--GT-A-A--A-------T-----TGT-TTA-AC-T--T-----T--GC-T--T----AT-A-AA----A-------GC----A-C--A----A----A---T------T--TA---T--TT---TTC-A-TTTTT-------A--T----C--AT---T-T-------T--T--G------------AA--T---T--T-----TT---T-T-----TTGTAG--CT---GTTGTG---TTGT-atagtttaattcaagcaataaccaaatcatatgtaaatt
gi|14 : gaTTAAT-GCACACAA--AGAAA---TG----AATATCTGGGATGA------GAT-----A------TA----G--------------T-T-----TT-T------------------GGC----------TA-T-AATT-T-------TGTA-------A-C-------GG-------AT--A-CA------AA-TA------TA-------AAAT-T----C--C-----T--T----T-------------------AA--A-----A-AGAGG-------------G-G--------TG-----TGA-----GGG---G----A-----CT-----------G----T-A------A--A-T-TTT-T-------TACGA--GT--TC----A--AAA---GTG----TG----A-A--------ATTGA----T-AT--TTAGCCCCCCCCCCCCCCACCCA-----CC-C---CCAACCC-----CCCTA--------------T-----A-T-AG-C----TC---TA--------CA-----A---ACA-AT------T------TTC-C-------C-T--------------------A-------C--TGTTTT-T---------------T-GA-CT-T----AAT--TGCAG---GAGAAAT-TTT-----GG-G-A-A--TAA----AT-T--A-----CA-TCC---A--C---ACA--GT-A-A--A-------A-----TGTATTC-AT-A--T-----T--AC-A--T----G--A-AA----A-------A-----A-C--A----T----A---T------CGGTA---G--TT---TTC-A-TGTTC-------A--T----C--A----T-T-------cagtaaagtcattccagtcttcagtaagatt
gi|15 : TG----GAAACATGTGTCGA------TTT-----A------CA----T--------------C-T-----TT-T------------------TCC----------T--TTCGTT-T---GGT-AGTG-------A-T-------AA-------GC--A-TA------AA-TA------TA-------ACAT-T----T--C-----T--AAAAAT-------------------AA--A-----A-AA----------------A-A--------A------TAA-----AAA---G----A------T----------TGATCTT-A------A--A-T-C---C-------TATGG-TGT--TC----A--A-----GT-----CG----A-A---------T--A----T-AT--TTATTT----------------A-----AC-T---CT----------CTCTA--------------C-----T-T-AA-C----CC---TA--------TA-----C---A-A-AT------T------TCC-C-------C-C--------------------A-------C--TG-TTT-TTTTTTTTTTGAGGGGG-GATCT-C----AAT--T-------GAGAAAC-CAT-----GG-G-A-A--CAA----AT-G--A-----C--TAG---A------ATG--GT-A-A--A-------T-----TGTGTTC-AT-C--T-----C--TC-T--T----GT-G-AAGTGTA-------A-----A----------------------------TA---GCATT---TTC-A-TTTTC-------A--T----C--A----T-T-------T--T--T---AA----A--AC--T---T--T-----TTAAAG-T-----TTGTAG--CA---A--
gi|16 : G----AATGCTTGAATTGA------TGT-----A------TA----TAAAATGTGTGTGTTT-T-----TT-T------------------TAC----------T--T-AGTT-T---CAT-TGTACACTGTAA-T-------AT-------GT--A-CA------AA--A------TA-------AAAT------C--C-----T--C----C-------------------AA--A-----A-GAAG--------------G-ACAATCGT-T------TAA-----AAATAAA----A-----TTAA--------TG----T-C------A--T-T-TTC-C-------CATGA-TAT--TC----A--AAA---GT-----TG----A-A--------AT--A----T-ATATT---------------------A-----CC-C---CT----------CCCTA--------------T-----A-T------------------------------------------------------TTT-C-------C-C--------------------A-----------G-TTT-T---------------G-GA-TT-T----AAA--T---G----AGAAAT-CTT-----GG-G-A-G--AAA----AT-C--A-----CATCCC---A--T---ACA--AT-A-C--A-------T-----TGTATTC-AT-T--T-----T--AC-T--TACTGTT-A-CA----AT------A-----A-CAAA----A----A---T------T--TT---G--TC---TCC-A-GTTTT-------A--T----C--A----T-T-------T--T--aagac
gi|17 : tggaacaaATGGATGGGCTGG------TTT-----A------TA----T--------------T------------------------------AC----------A--T-ACCT-T---GGT-TGTA-------A-T-------AA-------GT--G-CA------AA-CG------TA-------AAAT-T----C--CCTGTTT--T----T-------------------AATTA-----G-GG----------------G-A--------T---------------GG---G----A-----CT----------TT----T-ATCAGGGA--A----------------AAGA-TGA--TC----A--AAA---GT-----TG----A-A--------AT--A----T-TT--T---------------------A-----CC-T---TT----------TC-TA--------------T-----A-T-AC-A----TG---TA--------TATGAATATTCA-A-AT------T------ATT-C-------T-C--------------------A-------A--TG-TTT-T---------------G-AA-CT-T----CAT--T-------GAGAATT-CAT------G-A-A-G--TAA----AT-T--T-----CATGTC---A--T---ACA--GT-A-A--A-------T-----T-TA---------------------------------A-GA----A-------A-----G-CAAA----A----A---T------T--CA---T--GT---TTC-A-TTTTC-------A--T----TA-A----C-T-------T--T--G---AA----A--AAACA---G--A-----TT---G-T-----TTGTAA--CA---A--ATG---TTGT-TAAAttctcagattcaatgaa
gi|18 : aaac-----TT-T------------------GAT----------T--T-AGTT-T---GAC-TATT-------A-G-------AA-------TTT-A-CA------AA-TACTGTA-TA-------TAAT-T----TTTC-----T--TGC--T-------------------AA--A-----A-------------------------------------TGA-----AAG---G----AAG---CT----------CA----T-A------AGAA-T-----C-------TATGA-CCC--TCGCTGA--AAA---CT-----TA----A-G--------ATTAA----TCAT--CCA-------------------A-----CC-G---CT----------TCCCC--------------T-----A-T-TA-C----TA---T---------TA-----A---C-A-GTA-----T------TTC--------------------------------A-------C---G-TTCATAAGA-----------G-TA-AT-T----AAT------G---GAGAAAT-CATTG---GGTG-G-A---AA----AT-T--------CATTTT---G--G---TCA--AT-A-A--A-------T-----TGTACTT-AT-T--T-----TG-AC-T--T----TC-A-AA----ATTT----A----------A----T----A---T------C--TA---G---C---TTC-A--TGTC-------A--T-------A----T-A-------T--G--G---AT----T--AC--A---G--T-----GT---G-T-----TTcatgtcatttttggaga
gi|19 : GT-TATA-------A-A-------AT-------GT--A-AA------AA--A-------A-------GAAT-T------------------------------------------A--A-----T-AA----------------T-A--------A------TAA-----GGG---G----A-----CT----------TG----T-A------A--A-T-TGT-T-------TATAA-TGT--TC----A--AGC---GT-----TG----A-A--------AC--G----T-AT--G---------------------A-----TT-C---CT----------CCCTA--------------G-----A-T-AA-C----TA---TG--------TA-----T---A-A-ATCCC---C------CTC-C-------C-C--------------------G-------C--TG-TTT-T---------------G-GG-CT-T----AAT--T----------------------------A-A--TAA----AT-C--A-----AATTAC---A--T---ATG--GT-A-A--A-------T-----TGTACTC-AT-T--T-----T--AC-T--T----GT-A-AA----A-------GC----A-C--G----A----A---T------T--TA---------------A-TTTTC-------A--T----C--A----T-T-------T--T--C---AA----A--AAC-A---G--T-----TT---A-T-----TTGCAG--CA---A--AAG---TCGT-CAAaataagatcatatcacaaatgaatattttgtca
gi|2 : tttctaaggataccaagaatagtgattattaaggacA--AAAAA--ATG----AATGCATGAGTTGA------TAT-----A------TA----T--------------A-T-----TT-C------------------GGT----------T--T-CATT-T---CGT-TGCA-------A-TAAGTTAAAA-------GT--A-CA------AA-GC------TA-------AAATATCAAAC--C-----C--C----C-------------------AA--A-----A-AA----------------A-A--------T------TTG-----AAT---G----A-----CT----------TG----T-A------A--A-T-TTT-C-------CATGA-TGT--TC----A--AAA---GTTGTGATG----A-A--------AC--A----C-AT--A---------------------A-----CT-C---TT-----------------------------T-----A-T-GA-C----TA---TG--------TA-----A---A-----------T------TTT-G-------T-C--------------------A-------C--TC-TCA-T---------------G-GA-CT-T----AAA--T-------GAAAAAT-CAT-----GG-A-A-A--TAA----AT-T--A--------TC-----------ATG--AT-A-A--A-------T-----TGGATTC-AT-T--G-----T--AC-T--T----AT-A-TA----ACATT---A-----G-G--A----T----A---TAAAG--T--GA---G--TT---TTC-A-TTTTC-------A--T----C--A----C-T-------TG-T--G---AA----AC-CA--A---G--T-----TT---G-TTTGC-TTGTAG--CA---A--ATgacagtcagtcgatagatttg
gi|20 : gC----------T--T-AGTT-T---GGT-TGTA---------C-------AA-------GT--A-CA------AA-TG------TA-------AAAT-T----C--C-----T--T----TTC-----------------AA--A-----A-AA----------------G-GGAGGGG--TGGGGGGTGG-----GGG---G----C-----CT----------TG----C-A------A--A-T-TTT-C-------TTTGA-TAT--TC----A--AAA---A-------------------------------------------------------------------C-C---CT----------CCACA--------------T-----A-T-AA-C----TC---TA--------TA-----G---C-A-AT------T------TTC-C-------A-T--------------------A----------TG-TTT-T---------------G-GA-AT-T----CAT--T---G---CA-AAGT-CAT-----G---------TAC----AT-T--A-----CATTCC---A--T---ACA--GT-A-A--AA------C-----TGTATTC-AA-T--T-----T--AC----T----AT---AA----A-------A-----G-C--A----TAG--A---T------T--TA---A--TT---TTC-C-TTGTC-------A--C----CA-A----T-T-------T--T--G---AAAAAGA--AA--A---G--T-----TT---A-T-----TTGTAG--GA---A--ATG---TTGTATAActgcctttatagaaactaaggaccaaattacagacaaattgacagacaaaaagacagtgtgcacagatcatacagaatgaag
gi|21 : TC-T---GGC-CATA-------G-T-------TA-------TT--A-CA------GC-TA------TC-------AAAT-T----T--C-----T---------------------------------------AA----------------G-G--------T------TTG-----AGA---A----A-----CT----------TG----T-A------A--A-T-TTC-C-------TGTGA-TAC--TG----A--AAA---GT-----TG----T-G--------GT--A----T-GT--T---------------------T-----CG-C---TT----------TCTTA--------------T-----A-T-AG-T----TC---TA--------CA-----A---A-A-TT------T------TTA-C-------C-A--------------------A-------C--TG-TAT-T---------------T-GA-CA-T----AAT--T-------GAGAAAT-GGA-----AG-G-C-A--AAA----AT-A--A-----GATTCC---T--T---TCG--GC-G-A--A-------A-----TATCTTT-AT-T--T-----T--AC-T--T----CT---AT----A-------A-----A-C--A----TAA--A---T------T--CA---G--CG---TCC-A-TTTTC-------A--T----C--A----T-T-------T--TTGG---AA----AATAA--A---G--T-----GT---G-T-----C--TAG---A---G--GTGTTTTCGT-CAAtgatctattattattagatt
gi|22 : ACAG--AAATA--ATG----GGTGCTTGGGTTGA------TAT-----A------CA----A--------------T-T-----TT-T------------------------------------AGTT-T---TGT-TGTA-------A-T-------AA-------GT--A-CA------AA-TA------TA-------AGCT-T----T--A-----T--T----C-------------------AA--A-----A--------------------------------------GA-----AGG----------------------------------A------A--ATT-TTT-T-------TATAA-TAT--TC----ATTAAA---GT-----TG----A-A--------AT--A----C-AG--T---------------------G-----TC-C---CA----------CCCTA--------------T-----A-T-AA-CCCGATC---TA--------T------A---C-A-TT------T------TTC-C-------T-C--------------------A-------C--TG--TT-T---------------G-GA-CT-T----CAT--T-------GAGAAAT-CAG-----GG-G-A-A--TAA-------------------------A--T---ATG--AT-G-A--A-------T-----TGTGTTG-AT-T--T-----T--AC-T--T----TT-G-AA----A-------A-----C-CT-A----A----A---T------T--TA-------T---TGT-A-TTTTT-------A--T----C--AT---T-T-------T--T--G---AA----A--AA--A---G--T-----TT---G-TAA---CTCTAG---A--------G---TCGT-TAAgcaaatcatgtattcgatatttatcat
gi|23 : a-------------------AA--A-----A-AA----------------T-A--------T--------A-----AAG---T----A-----CT----------TG----C-A------A--A-T-TTT-C-------TGCGA-TGT--TC----A--AAA---AT-----GG----A-A--------AT--A----T-AT--T---------------------A-----CC-A---CT----------TTCTG--------------T-----A-T-AA-C----AC---TC--------TA-----T---G-A-AT------C------CCC-C-------C-CCCCCCCCCACACACACACACA-------C--TG-TTT-T---------------A-AT-CT-T----CATGAT---T---GAGAA-C-CAT-----GG-A-G-A--TAA----AT-T--A-----CATAAC---A--T---ACA--GT-A-A--A-------T-----TGCATAC-AG-T--C-----T--AC-T--A----G----AA----A-------A-----A-C--A----T----GAC-T------T--TA---G--TT---TTC-A-TTTCC-------A--T----C--A----TCT-------T--T--G---AA----A--AA--A---G--T-----TT---G-T-----TTGCAG--CA---A--ATG---TCGG-TAAttg
gi|24 : aaaaaaataaaacctccgtataaagggtatgagcggggGTTGA------TAT-----A------TA----TA-------------T-T-----TT-T------------------TGC----------A----AGTTCT---GGC-TGTA-------A-T-------TG-------GT--A-CA------AA-----------------------------------------------------------------------------AA----------------G----------T------TGA-----AGG---A----A-----CT----------TG----T-A------A--A-T-TTC-C-------AGTGG-TAT--TC----A--AAA---GT-------------A--------AT-----------------------------------------CC-C---TT----------TCCTA--------------T-----A-T-AA-C----TC---T----------G-----A---A-A-CT------T------TTA-C-------C-
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gi|25 : gttgatatatatattttttgcaagttctggctgtaattggtacaaaaagttgaaggaacttgtaaatttccagtggtattcaaaagtaatccctttcctatataactctgaaacttttacctnnnnnnnnnnccggacatggtatgctgctccatattattctaaacaaaaataattatcaattatagattaactgcantaaaaataagactccT-T------------------GAC----------T--T-AGTT-T---GGT----A-------ACT-------AA-------GT--AACA------AG-AA------TA-------AAAT-T----C--C-----T--T----G-------------------AA--A-------------------------------------------TAA-----AGG---C----------CC----------TG----T-C------A--A-T-ATT-T-------TATGA-T----------------------------------A--------AT--A----T-AT--T---------------------A-----CC-C---CT----------CCCAA--------------T-----C-T-AA-C----TA---TA--------TA-----A---A----T------T------TTC-C-------C-C--------------------AA------C--TG-CTT-T---------------G-GA-CC-T------T--T---G----AGAAAT-CGT-----AA-G-A-A--TAA----AT-T--T-----CATTCC---A--T---ATG--GA-A-A--A-------T-----TGTATTC-AT-T--T-----T--AC-A--T----AT-G-AA----A-------AC----A-T--A----T----A---T------T--TG---G--TT---TTT-G-TTTTC-------A--TC---C--A----T-T-------T--G--GT--AA----A--AA--A---G--T-----TT---A-T-----TTGCAGTTCA---A--GTG---TTGT-t
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gi|27 : aaaaAA--AAAAA--ACA-----ATGCGTGGGTTGC------CAT-----A------TA----T--------------T-T-----CT-T------------------TGC----------A--T-ATTC-T---GGC-TAAA-------A-T-------TA-------GC--AACA------AA-CA------TG-------AAAT-T----C--C-----T-------------------------------------A-AA----------------A-A--------T------TGA-----AGG---A----A-----CT----------CG----T-A------A--A-A-TTA-T-------TGGGA-TGC--TC----A--AAA---GT-----TG----C-G--------AC--A----T-AC--A---------------------G-----TC-C---CT----------CCCTG--------------T-----A-T-GA-C----TC---AA--------CA-----A---A-G--T------T------TTCAC-------C-C--------------------A-------C--TG-TAT-T---------------T-GA-CA-T----CAT--T---G----AGAAAT---------GG-A-AGA--CAA----A------------A-------A--T---AAA--AT-G-A--A-------A-----TGTATT-----T--T-----T--AC-T--T----TT-A-T---------------------C--A---------A---T------T--CA---G--TG---TCC-A-TTTTT----------T----C--AC---T-T-------T--T--G---AA----A--AA--A---G--T-----T----G-T-----TTGTAG--CA---A--GTG---Taggaaa
gi|28 : aa------AG-TA------TA-------AAGT-C----C-----------T----A-------------------AA--A-----A-AA----------------G------------------GG-----GGG---G----G-----GTGTCGTGTGTGTG----T-A------A--A-T-TTT-C-------CGTGA-TGT--TC----A--CAG---GT-----TG----A-A--------AT--A----T-CT--T---------------------A-----CC-C---TT----------CCCTA--------------T-----A-T-AA-C----TC---TG--------TG-----C---A-A-AT------T------ATT-C-------C-C--------------------A-------C--TG-TTT-T---------------G-GA-CT-T-----GT--T-------AAGAA--------------G-A--------------T--A-----CATTTT---A--T---ACG--GT-A-A--A-------T-----TATAATT-AT-T--TTCATGT--AC-A--T----GT-ATAA----A-------A-----T-C--A----T----AAG-T------T--TA---G--TG---TTC-G-TTTTC-------A--G----C--A----T-TCAGATTCT--T--G---AA----AT-GA--A-----------------G-T-----TTGTAG--CA---A--GTG---ACGT-
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gi|3 : aAA--AATAA--ATGATGCGATGAATAAGCTGA------TAT-----A------AA----T--------------G-TAAAACTT-T------------------GGT----------T--T-AGCT-T---GGT-TGTA-------A-A-------AA-------GT--A-CA------AA-TA------TA-------ACAT-T----T--C--------G----T-------------------AC--A-----A-AA----------------------------------TG------AGA---A----A-----CT----------TG----T-A------A--G-T-TTT-C-------TACGA-CGC--CC----A--AAA---TT-----TGCGATA-A--------AT--C----T-AT--TC--------------------A-----TCGA---CT----------CTTCA--------------T-----A-T-AG-T----TA---TA--------C----------A-A-AT------T------TTT-T-------C-C--------------------A-------T--CG-TTT-T---------------T-GA-CT-------------------GAGAAAT-CAT-----GGAA-A-A--TAA----AC-T--A-----CATCCT---A--T----CT--AT-A-G--A-------T-----TGGAGTC-AT-T--T-----T--AC-T--T----AT-G-AA----A-------A-----G----A----TGA--A---T------T--TG---G--AT---CTC-A-TTAAC-------A--T----C--G----T-T-------T--T--A---AA----A--Ataatggtattcgttgttggcaga
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gi|31 : acat-T---AGT-TATA-------A-G-------AA-------GT--A-CT------AA-TA------TT-------AAAC-G----C--C-----T---------------------------AA--A-----ACAA----------------A-A--------A------TGATAATTAGG---G----A-----CT----------TG------G------A--A-T-TAT-C-------TACTG-TGT--TC----A--GAA---GT-----TG----A-A--------AT--A----T-AT--G---------------------A-------------------------AATA--------------T-----ATT-AA-C----TC---TG--------TA-----A---A-A-GC------C------CCC-CCCCCCCTC-C--------------------C-------C--TG-TTT-T---------------G-TA-CT-C----CAT--T---G-----------CGT----------A-A------------------------TCC---A-----------GT-A-A--A-------T-----TGTAATA-AT-T--T-----------T--T----CC-ATGA----A-------A-----A-C--A----TAA--A---T------C--TA---G--TT---TTA-A-TTTGT-------A--T----T--A----T-T-------T--T--G---AA----A--AA--A---
gi|32 : ttagtataaA-TA------CA-------GGAT-T----C--C-----A--T----------------------------A-----A-CA----------------G-A--------T--------A-----AGG---G----A-----CT-----------G----T-A------A--AAT-TTT-C-------TAaagaagaaaatttagcatgtatcgtta
gi|32 : ttt------AA-TA------TA-------A--T-T----T--C-----T-------------------------------A-----C-AA----------------A-A--------T--------A-----AGG---G----A------T----------TG----T-A------T--A-T-TTC-C-------TATG----T--TC----A--AAA---GT-----TG----A-A--------AT--G----T-AT--T---------------------G-----CC-C---TT----------CCCAA--------------T-----C-A-AA-C----TC---TG--------TA-----T---A-A-AT------T------ATC-C-------T-C--------------------A-------C--GG-TTT-T---------------A-GA-CT-T----AAT--T-------GAGAAAT-------------------TAC----AT-T----------TTCA---ATGT---ATG--GT-C-A--A-------T-----TATACTA-TT-T--T-----T--AC-T--T----CT-A-AA----A-------A-----atataatttctacaaaataagggattgtatatttcctatgttcaaaagttgaaatgtattgcccttcccaatcaaactctgtataaattatcctcacggttttagacttaattgagaaattacattttcaatgtatggtcaattatactatttttacttctaaaaacaaaaatttcattggtttgtttgcggcacgcataattaagaaaatg
gi|33 : tttatacaggattccataacagataagggactgtaaaattttctAT-----A------TA----T--------------T-----------------------------GAC----------T--T-AGTT-T---GGT----A-------ACT-------AA-------GT--AACA------AG-AA------TT-------AAAT-T----C--C-----T--T----G-------------------AA--A-------------------------------------------TAA-----AGG---C----------CC----------TG----T-C------A--A-T-ATT-T-------TATGA-T----------------------------------A--------AT--A----T-AT--T---------------------A-----CC-C---CT----------CCA-A--------------T-----C-T-AA-C----TA---TA--------TA-----A---A----T------T------TTC-C-------CAC--------------------AA------C--TG-CTT-T---------------G-GA-CC-T------T--T---G----AGAAAT-CGT-----AA-G-A-A--TAA----AT-T--T-----CATTCC---A--T---ATG--GA-A-A--A-------T-----TGTATTC-AT-A--T-----T--TC-A--T----AT-G-AA----A-------AC----A-T--A----T----A---T------T--TG---G--TT---TTT-G-TTTTC-------A--TC---C--A----T-T-------T--G--G---TA----A--AA--A---G--T-----TT---A-T-----TTGCAGTTCA---A--GTG---Tcaaaaatttcattggtttgtttgcggcacgcataattaagaaaatg
gi|34 : -T-------AG-------AT--A-CA------AC-TA------CA--------------------T-----T--T----T-------------------AA--ATTACCA-AA----------------GCA--------T--------A-----AGG---G----A-----CT----------TG----T-A------A--A-T-TT--C-------TGTGA-TTA--TC----A--AAA---AT-----TT----G-A--------TT--A----T-AT--C---------------------A-----CC-C---CT----------TCC----------------------A-C-GA-C----TA---TA--------CA-----A---A-A-AT------T------T---C-------C-T--------------------A-------T--CG-TTT-T---------------G-GA-CT-T----AAA--T---GATTGAAAAAT-CAT-----AG-G-A-A--TAA----AT-C--A-----TAAGCC---A--T---A
gi|35 : atgatgaagacaataatgggttggtaaaggtcgagggtaaaggtccggtatctcttagat----------T--T-AGGT-T---AGT-TG---------A-T-------AA-------AT--A-CA------AA-------------------AAT-T----C--G-----C--A----C-------------------AA--A-----A-AC----------------A-A--------C------T------------------AT----CT----------AG----T-A------A--A-TGTCT-C-------TATTA-T-----C-------------GT-----TG------------------------T-AT--C---------------------A-----CC-C---CTTACAAATACTCCCTA--------------T-----A-C-AAAT----TC---CA--------CC-----CGCCA-C-AC------C------TTC-A-------C-C--------------------T-------C---G-CTT-T---------------G-GA-CT-T------T--T---G----AGAAAT-CATTT---AG-G-A-A--TTA----ATCT--A-----CAC-CC---A--TTT-GTG--AT-A-A--AA------T-----TGTATTC-AT-T--T-----T--CC-T--T----TC-A-TATC--A-------A-----A----A----T--------T------T--TA---T--TT---CTC---TTTTC----------TCTGAC--A----T-T-------TAAT--G---AA----A--AA--A---tccttcagaaaatggcgcgaaatctttattttac
gi|36 : tatata--ATG----GATACATGGATTGA------TAC-----A------AA----T--------------TAT-----GT-T------------------GGC----------A--T-GTTT-T---GG-----A-------A-T-------TA-------GT--A-CA------AA-TA------TA-------TAAT-T----C--A-----T--A----A-------------------AA--A-----A-AA----------------A-A--------T--------------AAG---G----A-----CT----------TG----T-A------A--A-T-TTT-C-------T---G-TGT--TA----A--AAA---GT-----TA----A-A--------A--------------T---------------------A-----CC-C---CC----------CCC---------------------------------------------------------------------------------C-C-------C------------------------------C--TG-TTT-T---------------G-AA-CT-T----GAT--T-------GAGCAAT-CAT-----TG-G---A--T-A----AT-T--A-----CACTCC---A--T---ATG--GC-A-A--A-------T-----TGTATCA-AT-T--T-----T--AA-T--T----GT-G-A------------------------G----T----A---T------A--TA---A-----------A-TTTTA-------A----------A-----------------T--A---AA----A--AA--A---G--T-----TT---G-T-----T----G--CA---C--GTG---TCTT-TAGA
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gi|39 : aatgaacGGTTGA------TAT-----A------TAAGTATAG------------T-T-----TA-T------------------GGC----------T--T-AGTT-T---AGT-TGTA-------A-T----------------------CA------A--TA------CA-------AAAT-T----C--C-----T--T------------------------AA--A-----A-AA----------------G-A-----------------------AG-------------------------------------------------TTC-C-------TATGA-TGT--TT----A--AAACCGGT-----------A-A--------A---------------------------------------------C---CT----------TCATA--------------T-----A-T-AA-C----TT---TATATATTAACA-----A---A-C-AG---------------A-C-------C-C--------------------A-------C--TG-TTT-T---------------G-GA-CT-T----CCT--T---G---AA-AAAT-CAT-----AG-G-A-A--TAA----AT-T--A-----CATTCT---T--T---AAA--GT-A-A--A-------C-----TGTATTT-AT-T--T-----T--AC-C--T----AC---AA----A-------A-----A-C--A----T----A---
gi|4 : TTAATTGCACACAA--AAGAA--ATG----AATATCTGGGATGA------GAT-----A------TA----G--------------T-T-----TT-T------------------GGC----------A--T-AGTT-T---AAT-TGTA-------A-C-------GA-------AT--A-CA------AA-TA------TA-------AAAT-T----C--C-----T--T----T-------------------AA--A-----A-AA----------------G-AGGGG----TG-----TGA-----GGG---G----A-----CT----------TG----T-A------A--A-T-TTT-T-------TACGA-TGT--TC----A--AAA---GT-----TG----A-A--------ATTGA----T-AT--TTAGCCCCCCCCCCCC------A-----CC-C---CC----------CCCTA--------------T-----A-T-AG-C----TC---TA--------CA-----A---ACA-AT------T------TTC-C-------C-T--------------------A-------C--TG-TTT-TTT-------------G-GA-CT-T----AAT--T---GCA-GAGAAAT-TTT-----GG-G-A-A--TAA----AT-T--A-----CACTCC---A--C---ACA--GT-A-A--A-------T-----TGTATTC-AT-A--T-----T--AC-A--T----GT-A-AA----A-------A-----A-C--A----T----A---T------CGGTA---G--TT---TTC-A-TGTTC-------A--T----C--A----T-T-------a
gi|41 : acatAAAA--ATA----GATGCACAGGTTGA------TA------A-------A----T--------------C-T-----TT-A------------------GGC----------T--T-GGTT-T---GGT-TATA-------G-T-------AG-------GT--A-CA------TG-TA------TATGCACATATAT-A----T--T-----T--T----T-------------------A-----------------------------------------------TAA-----AGG---T----A-----CA----------TG----T-C------A--A-T-TTT-C-------TATGA-TGT--TC----A--AAA---GT-----TG----A-AATACTAGTAT--A----T-AT--T---------------------A-----CC-C---CT----------CCC----------------T-----A-T-AA-T----TC---TA--------CA-----C---A-A-GT------T------TTC-C-------C-C--------------------A-----------G-TTT-T---------------gtaagcttttgtgtcatttattaaacatcgatcaaagtaaaaacatct
gi|43 : acaaaatataaggctgcatattaagaacacttgattACTA--AAGAA--ATG----GATGCCTGGGCCAA------TAC-----AATGTCATA----T--------------T-T-----TC-C------------------AAC----------T--T-AGTT-T---TGC-TATA-------A-T-------AA-------AC--A-CA------AA-TA------TA-------AAAT-T----C--C-----T--A----T-------------------AA--C------------------------------------C------TGA------GA---G----A-----CT----------TG----T-T------A--A-T-TTT-G-------TGTGA-TGT--TC----A--AAA---GT-----TG----A-A--------AT--A----G-TT--G---------------------A-----CC-C---TT----------GCCTA--------------T-----A---------------------------------------A-AT------T------GAC-C-------C-C--------------------T-------T--AG-TTT-TG--------------G-GA-CT-T----AA---T---A---GAAAAAC-CAT-----GG-G-A-tta
gi|44 : a------A--A-T-TTT-T-------TATGC-TGTAAT-----A--AAA---GT-----TA----A-ATTT-----AT--A----TCAT--TC--------------------A-----CC-C---CC----------CCCTA--------------T-----A-T-G--------T---TA--------CG-----G---A-ATAT------T------TCC-C-------T-C----------------------------C--TG-TTT-------------------GG-CT-T----GAT--T---A---GAAAGCT-C-T-----GC---A-A--TAA----CT-T--C-----CACTCC---A--C---ACG--G--A-A--A-------T-----TGTATTC-AT-T--T-----T--ACAT--T----CT---------C-------A-----A-C--A----TA---A---T------T--TG---A--TT---TTC-A-TTTTC-------A--T----C--A----
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11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|40 ): CAAATGTAAACATTCCTAAAGTTTCAAAAATTAGTCAAAATTCCGTAATTGTAATTTTTTTTACTTGTATTCCTACTCTATCCCATCGGAAATGCTTATCCACTATATATATTAGACATGATTGAGAAGGCATTATAAGATTCAATTCAGTGAAATGTATTAATTTTATTATCACAGACAATCATACGTTCGATGTTTAGTTTCATCATTTTTGGA
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Unaligned ( gi|65 ): TTATACTATTGTCATCATTTTAAAAACACCTACAAAATGCATACGTTTCACAATATCCACGTTCTGTTGTTAACTACAGCTGTATTTTATGATCATTTCGACAGATCTTAACAA
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