lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              11111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                            11111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
lowQualScore                  :           11      1           1111                       111                66666666                            11111111   88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888                 111111            111                                                     222                         44       111       11       1111     33333333333333                  111                   11111                       333                 11111111        1111111                         77777777777777777777777777777777777777777777                                              3333                  66666666666666666666666666666666666666666666                                1111111111    3       1111        111       55555555555555555555555555555                         111                       111111111        2222                    2                                              11111   2         222          33333      2222222222   1111           333                                           11                 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888     22             
lowQualScore                  :           55  77  8  2 2      0000   66666   22 2   2 2  000  5 777777  2   22222222   2   2 2  2  2  2 4 5555  00000000   66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 7  2 333    2   333333     2  2 8 888 4 4444  2 2   66 2 333 2 2 33     5555 5555 666666  777     55555  55555        00   888 000  4 55 11 444 2 6666   2 11111111111111     2  2 2 33 2  111  666  2 55555  4  77777     5 2 5  2  2       333      2  2 2 2 2 44444444  222 2 0000000 88  55 33   8888888 2   55555555555555555555555555555555555555555555     2 2 55  5       33  2 444 2 2   33 5 55  1111 2 2     33 2     44444444444444444444444444444444444444444444  6666 888 3      77777 3  44   7777777777    4 3 6   4444  44 3  555       44444444444444444444444444444       3 77 6  3    3    444 3  1  3  99 44   6666 444444444  6666  8888   3  6  3  44  555 7       0     3 3 3 44      3 6666 3 77777     11111 3 1      0  000 3  3 44  55555   3  6666666666   0000       3   000     3   3  6     3  55   88  7  7 3 3   3 33    0      5     555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555     77          4  
lowQualScore                  :           ..  ..  .  . .      ....   .....   .. .   . .  ...  . ......  .   ........   .   . .  .  .  . . ....  ........   ................................................................................ .  . ...    .   ......     .  . . ... . ....  . .   .. . ... . . ..     .... .... ......  ...     .....  .....        ..   ... ...  . .. .. ... . ....   . ..............     .  . . .. .  ...  ...  . .....  .  .....     . . .  .  .       ...      .  . . . . ........  ... . ....... ..  .. ..   ....... .   ............................................     . . ..  .       ..  . ... . .   .. . ..  .... . .     .. .     ............................................  .... ... .      ..... .  ..   ..........    . . .   ....  .. .  ...       .............................       . .. .  .    .    ... .  .  .  .. ..   .... .........  ....  ....   .  .  .  ..  ... .       .     . . . ..      . .... . .....     ..... . .      .  ... .  . ..  .....   .  ..........   ....       .   ...     .   .  .     .  ..   ..  .  . . .   . ..    .      .     .................................................................................     ..          .  
lowQualScore                  :           99  99  7  5 5      3333   22222   77 5   5 5  333  0 222222  5   66666666   4   4 4  4  4  4 7 0000  66666666   66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1  2 999    2   222222     1  1 4 555 2 5555  1 0   88 0 555 0 1 22     0000 0000 888888  666     99999  99999        33   999 666  7 66 22 111 4 2222   4 66666666666666     4  5 5 44 5  222  999  4 99999  7  99999     0 7 3  7  7       999      7  7 5 5 5 11111111  777 5 6666666 44  66 44   1111111 5   99999999999999999999999999999999999999999999     5 5 99  0       44  5 666 5 5   44 0 99  0000 7 7     77 7     55555555555555555555555555555555555555555555  5555 555 1      77777 1  22   4444444444    3 1 1   9999  22 1  888       66666666666666666666666666666       1 33 2  1    1    222 1  5  1  11 22   5555 777777777  5555  1111   1  2  1  22  444 7       2     1 1 1 22      1 5555 1 77777     55555 1 2      7  000 1  1 22  88888   1  8888888888   8888       1   000     3   3  7     6  00   66  3  3 6 6   6 66    5      1     000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000     55          0  
consensus                     :    AAGTTTA-GCT--TTTGA-A-AAAAGC----TTA-----GGGAGT-CAG-C-CA---GT-A------GA-CTG--TTAA-TTAA-GTG-A-AG-GT-GA-T-G----GA----A---TTTTT-CT--TT----T--T-C-A---C-TT---CTT-----------TTTTTT----AT---------GGC-G--------TG-TG-T---TAAT-TGA------AGTAA-TC-A-G--TG-G----CG-G-ATT--T-A---T-A-A--GGGCG----C----A------CAC--TCCCT-----CG-----GGAATTTTT-TAGA--A---TG-T--T--A---T-C----TTT-T-----G-GC--GA-TTTTT-AC-A-G--A-TA---TA---GA-C-----CA-AT-CCC-ACACG-T-C-TC-GC-TGCTGAC---ATACAC-GG-A-A-A-A--------CA-G-C-A-------T--GC-GA--ACA-------A-TGCATTTT-T----A--------TTC---------------------CGGAC-G-T--CC-GAGAAAG--CA-C-T-A-T-ACA--C-A--ACCTC-T-G-CTTGG--T-CAGGC---------C---------T----------TC-TGTC------CGC----C---A-GATTTG-----T-GT--TTTG---------TTGT-T-GTTTT--TNAA--A-CG---GTTACGT-ACATGT-----------------AT---GTAAACG-T--C-AG-AAAA-TATT-A-T-AACTG-GA-AA--GGA----G-A-------TG----CGG---TTG-AA-AG-CA--AA---CTAACAAATGAAATA-A-T-G--AATGAA-A----T-T-----TGACAG-C--A-T-AAAAAAATT---C-CA-A--TC--AT-TAG-AT-------AT-TTG----TGAAAAA-GGT--TGTAAA-TTT-TT-CGTGT-AA--TTG--TA-AA-T-A-CTG-A--TCTTCCCGATACCCGATCNNNNNNNNNNNNTTNTNTTNGNNAAAAGNCTTTGTANNNTGGGGANCGNGNNNNNNCTNCNCGNACNNNNNTTNCCTTTCTCCTTGGTTTTTTTCTTNTA
Reference ( gi|5 )            :    AAGTTTA-ACT--TT-GA-A-AAAAGC----TTA-----GGGAGT-CAG-C-CA---GT-A------GA-CTG-ATTAAGTTAA-GTG-A-AA-GT-GA-T-G----GA----A---TTTGT-CT--TT----T--T-C-A--GC-TT---CTT-----------TTTTTT----AT---------GGC-G--------TG-TG-T---TAAT-TGA------AATAA-TC-A-G--AG-G----CG-G-ATT--T-A---T-A-A--GGGCG----C----A------CA---TCCCT-----CG-----GGAATTTTCATAGG--A---TG-T--T--A---T-C----TTT-T-----G-GC--AT-TTTTT-AC-A-G--A-TA---TA---GA-C-----CA-AT-CCC-ACACG-T-C-TC-GC-TGCTGAC--TATACAC-GG-A-A-A-A--------CA-G-C-A-------T--GC-AA--ACA-------A-TGC--------------------TTC---------------------CGGAC-G-T--CC-GAGAAAG--CA-C-T-A-T-ACA--C-A--ACAT--T-G-CTTGG--T-CAGGC---------C---------T----------TC-TGTC------CGC----C---A-GATTTG-----T-GT--TTTA---------TTGTAT-GTTTT--TTAA--A-CG---GTTACGT-ACATGTGTA------TTTTTTACAT---GTAAACG-T--C-AG-AAAA-TATT-G-T-AACTG-GA-GA--GGA----G-A-------TG----CA----TTG-AA-AG-CA--AA---C-AACAAATAAAATA-A-T-G--AATGAA-A----T-T-----TGACAG-C--A-TAAAAAAAATT---C-CA-A--TC--TA-TAG-AT-------AT-TTG----TGAAAAA-GGT--GGTAAA-TTT-TT-CGTGT-AA--TTG--TA-AA-T-A-CTG-A--TCTTCCCGATACCCGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATTTTT--TTTTTTTTTTTTA
gi|3                          :    AAGTTTA-GCT--TTTGA-A-AAAAGC----TTA-----GGG-GT-CAG-C-CA---GT-A------GA-CTG-GT--A--TAA-GTG-A-AA-GT-GA-C-G----GA----G---TTTTTTCT--TT----T--T-T-----C-TTTCTCTT-----------CTTTTT-----T---------GG--G--------TGGTGGT---TAAT-TTG------AATAA-TC-A-G--TG-G----CG-G-ATT--T-A---T-A-A--GGGCG----C----A------CAC--TCCCT-----CG-----GGAATTTTT-TAAGAAA---TG-G--T--A---T-CT---TTT-T-----G-GCAAAA-TTTTT-AC-A-G--A-TA---TA---GA-C-----CA-AT-CCCAACACG-TCC-TC-GC-TGCTGACA-TAAACAC-GG-A-A-A-A--------CA---C-A-------T--G--AA--ACA-------A-TGCAATTATTATGAAAAAAT---TTC---------------------CGGAC-G-T--CC-GAGAAAG--C--C-T-A-T-AAC--C-A--ACATC-T-G-CTTGG----CAGGC---------C---------T----------TC-TGT-------CGC----CA--A-GATTTG-----T-GG--TT-----------TTG----GTT-----------------GTTACGTAACA-----A------TT-----CATGTAGTAAACG-T--C-AGAAAAA-TA-T-A-T-AGCTGAGA-AG--GAA----G-A-------TG----CG----TTGAAA-AG-CA--AA---CTAACAAATAAAATA-A-T-G--AATGAA-A----T-T-----TGACAG-CAAA-TAAAGAAATTT---C-CA-A--TCATTA--AG-AT-------AT-TTG----TGAAAAA-GGT---GTACA-TTT-TTCCGTGTAAA--TTG--TA-AA-G-ACCTG-A--TCTT-CCGATA-CCGAT
gi|6                          :    AAGTTTA-GCT--TTTGA-A-AAAAGC----TTT-----AGGAGT-CAG-C-CA---GT-A------GA-C----TTAATTAAA-GTA-ATCA-GT-GG-C-G----G-----A---TTTAT-tattatatatttttttaaaaagttttaaatgtttgaagaagtcccagaacagaggattctttctctttcttttttttttcttagcccgtattttgaagtgtatagtatttacgaagaaacatctttacaa
gi|15                         : tacAAGTTAA-GCT--TTTGAGA-AAAAGC----TTA-----TGAAGT-CGA-T-CGC--GT-A------GA-TTG-TATAA-TTAC-ATGTA-AA-GT-GA-A-G----GT----G---TATGT------------------A----------CGT-----------TTTTCT----ATTGGGGGGGAGGG-G---------G-TG-T---TAAT-TGA------AGTAA-TC-A-G--TG-A----AG-A-A----T-A---T-T-A--GCGTG---------A------CACTTTCCCT-----CG-----GGAATTTT--TGAG--A---AG-T--T--ATACT-C----TCT-T-----G-ACG-ATGCTTTT-ACAA-G--ACTG---TA---GA-C-----GACAT-CAT-A-ACG-T-C-TCTGC-TG-TGAC--AGTACAC-GG-ATA-A-A--------TA-C-C-AT------T--GC-GA--ATA-------A-TGCTTTCTGAGTATAGTACAAAATTC---------------------CGGACGG-T--CC-GAGAAAG--CA-C-T-A-T-ATA--C-A--ATCTC-T-G-CTTGG--TACAGGC---------C---------aatggcgcacaactcgggaatttagatgttttatatttttgcgacttttacagaaatagaccatccacacgtccgctgctgacattacataggtaaaatgcctattcatatatataaaaaatcgaaagtccgagaaagaacaactaatacaccaacctctgctggtcaggtcccagaagctatctgatcgtccagagatttggttgtattgttgtattaattaacggttacgtatgtaaacgtcagaaaatattttaactggataaggagattgcagttgaaagcaataactacaaatgaaaaatgaatgaaaattgacaatcataaaaattacacaatcattagattattgactgaaaaagttaaattttcgtgtaattgtaaatcactgacttcccgatacccaatttatatatatatttttttttaaaaaaaagtctttgtaatatagggataaagggatatctccccatacaaggattgcttttcttcttggtttttttttttcttaactcgtattttggaagtgatagtattacaaacacaatctttaccaa
gi|23                         :   cAAGTTTA-GCT--TTTGA-A-AAAAGCTTAATTA-----GGGAGT-CAG-T-CA---GT-A------GA-CTG---TA--TTAA-GTG-A-AA-GT-GA-T-G----GA----G---TTTTT-CT--TTTTTCT--T-C-T--TC-TT---TTT-----------TTTTTT----AT---------GGC-G--------TG-TG-T---TAAT-TG-------AATAA-TC-A-G--TG-G----CG-A-ATT--T-A---T-A-c
gi|2                          :     AGTTTA-GCT--GT-GA-A-AAAAGC----TTA-----GGGA-T-CAG-C-CA---GT-A------GA-CTG---TA--CTAA-GTG-A-AAAGT-GA-TTG----GA----A---TTTTT-CT--TT----T--TTC-A--ACCTT---CTT-----------TTTTTT----AT---------G-C-G--------TG-TG-T---TAAT-TGA------AATAA-TC-A-G--AG-G----CG-G-ATTA-T-A---TAA-A--GGGCG----C----ACGGTCTCA---TGCCT-----CACCCCTGGAATTT---TAGA--A---TG-TGGTTAA---T-CG---TTT-T-----T-GCG-AT-TTT------A-GTAA-TA---TA---GA-C-----CA-AT--CC-ACGCG-T-CATC-GC-TGCTGACAGTA-ACAC-GG-A-A-ACA--------CA-G-CAA-------T--GC-AA--ACA-------A-TGC--------------------TT----------------------CAGAC-G-TA-CC-GAGAAAG--CA-C-T-A-T-ACA--C-A--ACATC-T-G-CTTGG--T-CAGGC---------C---------T----------TC-T-TC--------C----C---A-GATTTG-----T-GT--TTTG---------TTGT-T-GTTTT--TAAA--A-CG---GTTACGT-ACATGTGTATTTTTTTTTTTTACAT---GTAAACGTT--C-AG-AAAA-TATT-A-T-AACTG-GA-AA--GGA----GAA-------TG----CAGTCTTTG--A-AG-CA--AA---CTAACCACTAAAATA-ATT-G--AATGAA-A----T-T-----TGACAG-C--A-TTAAAAAATTT---C-CA-A--TC--AT-TAG-AT--------T-TTG----TGAAAAATGGT---GTAAA-TTT-TT-CGTGT-AA--TTGT-TA-AA-T-A-CTG-AT-TCTTCCCGATACCCGATCATATACATGTAATTATATTTGTTAAAAAGTTTTATATGTTGAGGAGCGTGCCCACGTTACAAGGATTCTCTTTCTCTTTCTCTTT--TTTTTTTCTTATA
gi|12                         :     AGTTTATGCTGTTT-GA-A-AAAATC----TTA-----GGGA-T-CAG-C--A---GTTA------GA-CTG---TAA-TTAA-GTG-A-AG-GT-GA-T-G----GA----A---TTTTT-CT---------------A--A-------------------------TT----GT---------GGG-GGGGGGGGCTG-TG-T---TAAT-TGAC-----AGTAA-TC-AAG--TG-G----CG-G-A-T--T-A---T-A-A--GGCCG----C----A------CAC--TCCCT-----CT-----GGAATTTTTTTAGA--ATTTTG-T--TA-A---T-C----TTT-TTTGCGG-AC------TTTT-AC-A-G--A-TAAATTA---GA-C-----CA-ATGTCC-ACACGTT-C-TC-G--TGCTGAC---ATACAC-GG-A-A-A-AT-------TA-G-C-A-------TG-GC-GA--ACA-------A-TGCATG-----------------TTCTATTTTTATTAAAAAAAAATTCGGAC-G-T--TCGGAGAAAG--CA-C---A-T-ACA--C-A--ACCTC-T-G-CTTGG--T-CAGGC---------CAGAACGCTTT----------TCTTGTT------CGC----C---A-GATTTG-----T-GT--TTTG---------TTGT-T-G-TTT--TAAA--A-CGC--GTTACGT--TATGTcccgtattttgaaagcgatagtaattacgcgaagacatctttaaaa
gi|11                         :     AGTTTATGCTGTTT-GA-A-AAAATC----TTA-----GGGA-T-CAG-C--A---GTTA------GA-CTG---TAA-TTAA-GTG-A-AG-GT-GA-T-G----GA----A---TTTTT-CT---------------A--A-------------------------TT----GT---------GGG-GGGGGGGGCTG-TG-T---TAAT-TGAC-----AGTAA-TC-AAG--TG-G----CG-G-A-T--T-A---T-A-A--GGCCG----C----A------CAC--TCCCT-----CT-----GGAATTTTTTTAGA--ATTTTG-T--TA-A---T-C----TTT-TTTGCGG-AC------TTTT-AC-A-G--A-TAAATTA---GA-C-----CA-ATGTCC-ACACGTT-C-TC-G--TGCTGAC---ATACAC-GG-A-A-A-AT-------TA-G-C-A-------TG-GC-GA--ACA-------A-TGCATG-----------------TTCTATTTTTATTAAAAAAAAATTCGGAC-G-T--TCGGAGAAAG--CA-C---A-T-ACA--C-A--ACCTC-T-G-CTTGG--T-CAGGC---------CAGAACGCTTT----------TCTTGTT------CGC----C---A-GATTTG-----T-GT--TTTG---------TTGT-T-G-TTT--TAAA--A-CGC--GTTACGT--TATGTaaa
gi|24                         :     AGTTTA-GCT--TTTGA-A-AAAAGC----T-A-----GGGAGT-CAG-C-CA---GT-A------GA-CTGTATTA---TAA-GTG-A-AA--T-GA-T-G----GA----ATT-TTTTT-CT--TT----T--T-CAA--GC-TT---CTT-----------TTTTTT----AT---------GGCGG--------TG-TG-T---TAAT-TGA------AATAA-TC-A-G--AG-G----TG-G-ATT--T-A---T-aaa
gi|25                         :     AATTTA-CTT--TT-TG-A-AAAAGC----TT------GGGAGT-CAGTC-CA---GT-A------GA-CTT-ATTAA-------TG-A-AG-GT-GA-T-G----GA----A---TTT--------------------------TT---CTT-----------TTTTT--------------------G---------G-TG-T---TAAT-TGA------AA-GA-TC-ATG--TG-G----C--G-ATT--T-A---T-A-A--GG
gi|14                         :      GTTTA-GCT--TTTGA-A-AAAGAC----TTT-----GGGAGT-CAG-C-CA---GT-A------GA-CTA-------TTAA-GTG-A-AG-GT-AA-T-G----GA----A---TTTTT-CT--AT----T--T---------TT---TTTA----------TTTTTT----TT---------GGC-G--------TG-TG-T---TAAT-TAA------AGTAA-TC-A-G--TG-G----CG-G-ATT--T-A---T-A-A--GGGCG----C----A------CAC--TCCCT-----CG-----GGAATTTT--TAGA--A---TG-C--T--A---TGT----TTT-T-----T-GC--GA-CGTTT-AC-A-G--A-TA---TA---GA-C-----CA-AT--CC-ACAAG-T-C-TC-GC-TGCTGAC---ATACAC-GG-A-A-A-A--------TA-G-C-A-------T--GC-GA--ACA-------A-TGCATTTTCTATATATAAAAAAATTC---------------------CGGAC-G-T--CC-GAGAAAG--CA-C-T-A-T-ACA--C-A--ACCTC-T-G-CTTGG--T-CAGGC---------C---------T----------ctca
gi|4                          :       TTTA-GCT--TTTGA-A-TAAAGC----TTA-----GGG--T-CAG-C--A---G--A------GA-CTG---TA---TAA-G-G-A-AA-GT-GA-T-G----GA----A---TTTTT-CT--TT----T--T-C-------TT---CTT-----------TTATT----------------GGC-G--------TGGTG-T---TAAT-TGA------AATAA-TC-A-GT-GG-G----CG-G-ATTC-T-A---T-A-A--GGGCG----C----A------CA---CTCCC-----CG--------ATGTTT-TAGA--A---TG-T--T--A---T-C----TTT-T-----G-GCG-AT-TTTTTCAC-A-G--A-T----TA---GAAC-----CA-AT-CCA-CCA-G-T-T-CT-GC-TGCTGAC--ACTACCA-GG-A-A-A-A--------CA-A-C-A-------T--GC-CA--ACATTCATTTA-TGAAA------------------TTC---------------------CGGAC-GGT--CC-GAGAAAG---A-C-TTG-T-ACA--CTATTACATC-T-G-CTTGG--T-CAGGC---------C---------T----------TC-TGTC-------GC----C---A-GATTTG-----TTGT--TTTG---------TTGT-T-GTTTT----AA--A-CG-----TACGT-CAATGT-----------------AT---GTAACC--T--C-AG-AAAAATATT-A-T-AACTG-GA-AA--GGA----G-A-------TG----CAG---TTG-AA----CA--AA---CTAACAAATGAAATG-A-TCG--AATGAA-A----T-TTTGAATGACAG----A-T--AAAAAATT---T-CAGA--TCATTA-T-G-AT-------TTGTTG----CTAAAAA-GGT--TGTAAA-TTT-TT-CGTGT-AATTTTG--T--AG-T-A-CTGAA--TCTT-CCGATGTCCagaacgccgtggtccgccggttcccaaggtataccacttgtgtttt
gi|7                          :    agtTTTA-GCT--TT-GA-A-AAA-GCA---TTA-----GGG--T-CA--C-CAAG-GT-A------GAACTGTATTA-------GTG-A-AA-GTAGA-TTG----GA----G---TTT-T-TT--TT----T--T-C-----T-TC---CTT-----------TTTTTT----AT---------GGC----------CG-TG-T---TA-T-TAATG----AATAA-TC-A-G---T-G----CG-G-ATT----A---T-A-A--GG-CGTCACC----A------C----TCCCT-----CG-----G-AATTTT---AGA--A---TG-T--T--A---T-------TT-T-----G-GC--GA-TTTTT-AC-A----A-TT---TAT--GA-C-----CATAT-CC--ACA-G-T-C-TC-GC-TGCTGAC---ATACAC-GG-A-A-A-A--------C--G-C-A-------T--GC-CA--ACA-------A--GCATTTTATGAAAAA-------TTC---------------------CGG-C-G-T--CC-GAAGAAG--CA-C-T-A-A-ACA----A--GCATCAT-G-CT-GG--T-TA------------C---------T----------TC-TGTC-------GC----C---T-AATTTG-----T-----TTTG---------TTGT----TATT--TTAA--A-T-----TTAC-T-ACA-----A------TGTT----AA---GTAAACG-T--C-A--AAAA-TGTTAG-T-A-C---GA-AA--GGA----G---------TG----CG----TTG-AACAG-CA--AA---CTAACAAATAAAATA-A-T-GATAATGAA-A----TAT-----TGACAC-G--A-T-TAAAAAATT---C----A--TC---A-TAG-A--------AT-TTG----TGAAAA---GT--TGTTAA-TTT-TTGCGTGT-AA---TG--T--AA-T-A--TG-A--TCTTTCCGATACCcttcgatttataatatactccttatctatacttcttatcaactacacagttttttaatattgttgaggactcacgctccaagccctcttcaatccattaggaaattaatcttttctctttctctcattt
gi|1                          :       TTTATGCT--TT-AA-A-AATAGCC---TTA-----GGGAGT-CAG-C-CAAAAGT-A------AA-CTG-TGTA--TTAA-GTG-A-AG-GT-GAAT-G----G-------------------------T--T-C-A-----------TT-----------TGTCTC----ATCGGA-----GGA-G--------AG-GG-TGGATAAT---A------AGTAA-TCTA-G--TGAG----CG-G-ATTAGT-ACAAT-A-A--GGGCA----C----A------CAC--TCCCT-----CG-----GGAATTTTT-TAGA--AC--TGTT--T--A---T-CCTTTTTT-T-----C-GC--GA-CTTTC-AA-G-A--A-TA---TA---GA-CGACGATA-AT-CAC-AC-TA-T-C-TC-GCTTGGTGAC---ATACAC-CG-A-ATA-A--------TA-G-C-A-------TCAGCGAA--ACA-------A-Tgagtatattattttaaaaatgttatttaatgttgaggaagccagtcacaaggattctttctctttctattttttctaaacattttgaagtgatagtattacgtaagacatctttacgaa
gi|18                         :             CT--TT-GA-ATAAAAGC----TTA-----GG-AGT-CAG-CGCC---GT-ATGTATTGA-CTG--TTA---TAA-GAG-A-AG-GT-GA-T-G----GAGAAAA---TTT-T-TT--TT----T--T-C-T--TA-TT---CAT-----------TTATTT----------------GC-G--------TGATG-T---TC-T-TGATCAGCTAATA--TC-AAG--AG-GTTGGCG-GTATT--TTA---T-A-A--TGGCG----C----A------CAC--TACCTTGACACG-----GGAATTATTGTAG---A---TGGT--T--A---T-C----TTTGT-----G-GCG-AC-TTT---AC-A-G--A-TA---GATGTGA-------CA-AT--TT-ACACG-tgcatatttttctaatttatagtaataaaaaaaattcacgacgtaacggataaagcactatatatacaacctctgcttgcaggcctcagaaacgcttctgtcatgtttcgctcatcatgacttggtgagtgatctaaattcaaagttgtatcgtttttaaaacgcgtgttacgttatggtaaacgttcagaaaatattataaacgggaaaatgtgaatgtctccgtttgaaagacaaaagctatcaaatgaaatatatgagttgaataattttgacaagatagaaagattacaaactcaatttagtatatttggttttgaagaataagttatgttaactccaaatgttttcaatttgtaattccattcaatactttctatcaattctctcgaatacaactaaaccggaatagtttcagtaattttatgtaaagaatgaatagaagaactaactttttgccataagtctcagtctataacaacggattcttttctctttttttttccttaactcgtattttgaaagtgattatagtattaattgcaaagacatctttacaag
gi|22                         :                 gc-GA-A-ATAAGC----TTAATATAGGGAGTTCAG-T-CA---G--A------TA-TTG-ACTGTATTAATGTG-A-AA-GT-GA-T-A----GG----AGTTTTTGT-CTATTT----T--T-C-T--TC-TTT--CTT-----------TTTTTTTGTTAT---------GGC-G--------TG-TG-T---TAATATG--------ATAT-TC-A-GTCTG-G----CG-A-ATT--T-A---T-A-
gi|19                         :    agtttttgcttttgaaaA-A-AAAAGC----TTT-----AGGAGT-CAG-C-C----GT-A------GA--TG---TAA-TTAA-GTG-T-AG-GT-GA-T-ATTTTAAT---A---TTCGT-TT--TT----TGTT-T-ATTGC-TG---TTTAGTTATAATTATTTTTT----TT---------GG--G--------T--CG-T---TAAT-TGA------AATGA-TC-A-G--TGAG----TG-G-ATT--C-A---T-ACAATGGACG----CCAAAA------CA---CACCT-----CG-----GGAAAAT---TGGG--A---TG-T--T--A-----C----TT--------------AT-TTTTT-
gi|9                          :                                                                                   ttTAA-GTG-A-AC-GT-GA-T-G----GA----A---TTT---------------------------T---TTT-----------TTTTT-----------------GC-G--------TG-TG-T---TAAT-TGA------AGTAA-TC-A-G--TA-G----CGAG-ATT--T-A---T-A-A---GGCG----C----A------CAC--TCCCT-----C------GGAATTTT--TTGA--A---TG-T--T--A---T-CTT--TTT-T-----G-GC--GA-CTTTT-AC-A-G--A-TA---TA---GA-C-----CA-AT--CC-ACACG-T-C-TC-GC-TGCTGAC---ATAC-C-GA-C-A-A-A--------TA-A-C-A-------T--GC-GA--ATA---------------------------------TT---------------------CGGAC-G-T--CC-GAGAAAG--CA-C-T-A-T-ACA--C-A--AACT--C-G-CTTGA--T-CAGCCCAGAACG--C---------T----------TC-TGT-------CGC----C---A-GATTTG-----T-GT--TTTG---------TTGT-T-G--TT--TAAA--A-CG---GTTACGT---ATGT-------------------------AACG-T--CAAG-AAAA-TATT-A-T-AACTG-GA-AA--GGAGATCG-A-------TG----CAG---TTG-AA-AG-CA--AA---CTAACAAATGAAATA-A-T-G--AATGAA-A----T-T-----TGACAG-C--A-T--AAAAAATTA--C-CA-A--TCT-TA-TAG-GT-------TT-TTG----TAGAAAA-GGT---GTAAA-TTT-TT-CGTGT-AA--TTG--TA-AA-T-A-CTG-A--TCTTCCTGATACCCGATttttttttttttatgcgacttttatagatatagcc
gi|8                          :                                                                                                                                                        tgtaTT-----------TTTCTTGG--AG---------GAG-G--------GG-TG-T---TAAT-TGA------AGTAACTC-A-G--TG-G----CG-G-ATT--T-A---T-A-A--GGGCA----C----A------CAC--TCCCT-----CG-----GGAATTTT--TAGA--A---TG-T--T--A---T-C----TTT-T-----T-GC--GC-TTT---AC-A-G--A-TA---TA---GA-C-----CA-AT-CC--ACACG-T-C-TC-GC-TGCTGAC---ATACAC-GGAA-A-A-A--------TA-G-C-A-------T--GC-GA--ACA-------A-TGCATTTTCTATTTATAAAAAAATTC---------------------CGGAC-G-T--CG-GAT-AAG--CA-C-T-A-T-ATA--T-AC-ACCTC-T-G-CTTGG--T-CAGGCCCAGAAACGC---------T----------TC-TGTCAGT---CGC----C---A-GATTTG-----T-GT--TTTG---------TTGT-T-G--TT--TTAA--ACCG---GTTACGT------------------------AT---GTAAACG-T--CAAG-AAAA-AGTT---T-AA-TG-GA-AA--TGA----G---------TG----CG----TTG-AA-AG-CA--AA---C-TATCAATGAAATA-A-T-G--AGTGAA-A----T-T-----TGACAG-C--A-T--AGAAAATTA--C-CA-A--TC--AT-TAG-AT--------T-TTG----TGAAAAA-GGT---GTAAC-TTTATT-CATGT-AA--TTG--TA-AT-A-A-CTG-A--TC-TCTCGATACCCGAttataattttttaaaaaaagttttttaatgtatgaggaagtcccagtacaaggattcttttctcttttttattttcttaactcgtattttgaaagtgatagtattacaaagacatctttacaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                               nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa-T---TAAT-TAA------AGTAA-TC-A-G--TG-G----CG-G-ATT--T-A---T-A-A--TGGCG----C----A------CA-----ACT-----CG-----GGAATTT-----AG--A---TG-T--TTTA---T-A----TTT-T-----T-GC--GA-CTTTT-AC-A-G--A-AA---TA---GA-C-----CA----TCC-ACACG-T-C--C-GC-TGCTGACATTACATAG-GT-A-A-A-ATGCCTATTCATA-T-A-------T--AT-AA--AAA-------A-T----------------------------------------------CGAAA-G-T--CC-GAGAAAGAACAAC-T-AAT-ACA--CCA--ACCTC-T-G-CT-GG--T-CAGGT---------C---------CCAGAAGCTA-TC-TGAT------CGT----CCAGA-GATTTG-------GT--TGTA---------TTGT-T-GTATTAATTAA----CG---GTTACGT-A-----------------------T---GTAAACG-T--C-AG-AAAA-TATT-T-T-AACTG-GATAA--GGA----G-AT------TG----CAG---TTG-AA-AG-CAATAA---C-TACAAATGAAA-A-A-T-G--AATGAA-A----A-T-----TGACA-----A-TCATAAAAATTA--CACA-A--TC--AT-TAG-AT-------TA-TTGAC--TGAAAAA--GT----TAAA--TT-TT-CGTGT-AA--TTG--TA-AA-TCA-CTG-A---CTTCCCGATACCCAATTTATATATATATTTTTTTTTAAAAAAAAGTCTTTGTAATATAGGGATAAAGGGATATCTCCCCATACAAGGATTGCTTTTCTTCTTGGTTTTTTTTTTTatagtctttaatgtatgaggaagtccagctacaaggattcttttctcttttttttttccttaactcgtattttgaaagtgattatagtattaattgcaaagacatctttacaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                               tacaagtttagcttttgaaaaaagctttaggagtcagccagtagac------AGTAA-TC-A-G--TG-G----CG-G-ATT--T-A---T-A-A--TGGCG----C----A------CAC--TCCCT-----AG-----GGAATTTT--TAGA--A---TA-T--T--T---T-C----TTT-T-----TTGC--GA-CTTTT-AC-A-G--A-TA---TA---GA-C-----CA-AT--CC-ACACG-T-C-TC-GC-TGCTGAC--T-TACAC-CG-A-A-A-A--------T--G-C-ATTTTCAGT--AC-AAGGATA-------A-T----------------------TTC---------------------CGGAC-G-T--CC-GAGAAAG--CA-C-G-A-T-ACA--C-A--Acttaactcgtattttggaagtgatagtattacaaacacaatctttaccaa
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                        acaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-ATT--T-A---T-A-A--GG-CG----C----A------CAC--TCCCT------G-----CGAATTTTTTTAGGA-A---TG-T--T--A---T-CTT--TTT-T-----G-GC--GA-TTTTT-AC-A-G--A-TAC--TA---GA-C-----CA-AT-C
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGCA----C----A------CT---TCCCT-----CG-----GAAATTTTT-TAGA--A---TG-TG-T--A---T-C----TTT-TT----G-GC--GA-TTTTT-AC-ACG--A-TA---TA---GA-C-----CA-AT-------ACA-T-C-TC-GC-TGCTGAC---ATACACTGG-A-A-A-A--------CA-GGC-A-------T--GCCAA--ACA-------AGTGCATTTTATGAAAAA-------TTC---------------------CGGAC-G-T--CC-GAGAAAG--CA-CGT-A-T-ACA--C-A--ACAT--C-ATCTTTG--T-CAGGC---------C---------T-----------C-TGTC-------GC----C---A-GA---G-----T-GTAGTTTG---------TTGT-T-GTTTT--T-AA--A-CGTG-GTTACGT-ACATGTA----------------AT---GTAAACG-TTTC-AG-AAAA-TATT-AAT-AACTG-GA-AA--GGA----A-AAAAAGATTG----CAG---TTG-AAGAG-CA--AA---CTAACAAATAAAATA-A-T-G--AATTAA-A----T-T-----TGACAGCC--A-T-AAAAAAATT---C-CA-A--TC--CATTAG-AT-------AT-TTG----TGAAAAA-GGTTCTGTAAATTTT-TT-CGT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -C-----CA-AT-CC--ACACG-T-CCTC-GC-TGCTGAC---ATACAC-GG-A-A-A-A--------CA-G-C-A-------T--GC-AA--ACA-------A-TGC--------------------TTC---------------------CGGA--G-T--CC-GAGAAAG--CA-C-T-A-TAACA--C-A--AT-C--T-G-CTTGGATT-CAGGC-------------------------------C-TG-------------------------TG-----T-GT--TT-----------TTGT-T-GTTGT--TTAAACA-CG---GTTACGT-ACATGTGTA------TTTTTACCAT---GT-AACG-T--C-AG--AAA-TATT-A-T-AACTG-GA-AA--GGA----G-A-------TG----CAG---TTG-AA-AG-CA--AA---C-TACAAATAAAATA-A-T-G--AATGAATA----T-T-----TGACAG-C--AGTAAAAAGATTT---C-CA-A--TC--AT-TAG-AT-------AT-TTG----TGAAAAA-GGT--GTTAAA--TT-TT-CGTGT-AA--TTG--TA-AA-T-A-CTG-A--TCTTCCCGATACCCGATc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -A-A-A--------TA-G-C-A-------T--GC-GA--ACA-------A-TGCATTTTCTATTGATAAAAAAATTC---------------------CGGAC-G-T--CG-GAGAAAG--CG-C-C-A-T-ACA--C-A--ACCT--TTG-CTTGG--T-CAGGC---------CCAGAACGC-T----------TC-TGTC-------GC----C---A-GATTTG-----T-GT--TTTG---------TTGT-T-GTTTT----AA--A-CG---GTTACGT-A-----------------------T---GTAAACG-T--C-AG-AAAA-TATT-A-T-AACTG-GA-AA--GGG----G-A-------TG----CAG---TTG-AA-AG-CA--AA---CTAACAAATGAAATC-A-T-G--CATGAC-A----T-T-----TCACAA-C--A-T-AAAAAAATA---C-CA-A--TC--AT-TAG-AT-------AT-TTG----TGAAAAA-GGT---GTAAA-TTG-TT-CGTGT-AA--TTGTATA-AA-T-A-CTG-A--TCTTCCCGATACCCGATtatatatatatattttttaaaagtttttaattgtttgaggaagtcccagtacaaggattttttctcttcttttttttttctttacccgtatttgaaagtgatagtattacgaagacatctttacaag
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAC-G-TAACG-GATAAAG--CA-C-T-A-T-ATATAC-A--ACCTC-T-G-CTTG-----CAGGC---------C---------TCAGAAACGCTTC-TGTCATGTTTCGCTCATC---ATGACTTGGTGAGT-GA--TCTAAATTCAAAGTTGTATCGTTTT--TAAA--A-CGCGTGTTACGT----TATG---------------------GTAAACG-TT-C-AG-AAAA-TATT-A-TAAACGG-GA-AAATGTG----A-A-------TGTCTCCGT---TTG-AA-AGACA--AAAGCT-ATCAAATGAAATATA-T-G--AGTTGA-ATAATT-T-----TGACAA-G--A-T-AGAAAGATT---A-CA-AACTCAATT-TAGTAT-------AT-TTGGTTTTGAAGAA-tcgtattt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttatgctttaaaaatagccttagggagtcagccaaaagtaaactgtgtattaagtgaaggtgaatggttcatttgtctcatcggaggagagggtggataataagtaatctagtgagcggattagtacaataagggcacacactccctcgggaattttttagaactgtttatcctttttttcgcgactttcaagaatatagacgacgataatcacactatctcgcttggtgacatacaccgaataatagcatcagcgaaacaattgcatatttttctaatttatagtaataaaaaaaattcacAACG-T--C-AG-AAAA-TATT-A-T-AA-TG-GA-AA--GGA----G-A-------TG----AA----GTG-AA-AG-CA--AA---CTAACAAATGAATTA-A-T-G--AATGAA-A----T-T---------AA-G--A-TAAAAAA--TTTAGC-CA-A--TC--AT-TAG-ATTATTTAAATATTG----TGAAAAA-GCC--TGTAAT-TTT-TT-CGTGT-AA--TTG--TATAATT-A-CTG-ATTTCTTCCCGATA-CCGATtaagttatgttaactccaaatgttttcaatttgtaattccattcaatactttctatcaattctctcgaatacaactaaaccggaatagtttcagtaattttatgtaaagaatgaatagaagaactaactttttgccataagtctcagtctataacaacggattcttttctctttttttttccttaactcgtattttgaaagtgattatagtattaattgcaaagacatctttacaag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AACG-T--C-AG-AAAA-TATT-A-T-AA-TG-GA-AA--GGA----G-A-------TG----AA----GTG-AA-AG-CA--AA---CTAACAAATGAATTA-A-T-G--AATGAA-A----T-T---------AA-G--A-TAAAAAA--TTTAGC-CA-A--TC--AT-TAG-ATTATTTAAATATTG----TGAAAAA-GCC--TGTAAT-TTT-TT-CGTGT-AA--TTG--TATAATT-A-CTG-ATTTCTTCCCGATA-CCGATtcgtattctgaaaaag

Unaligned ( gi|26 ): TTTTTAAAGTTTTAATGTTTGAGGAAGTCCCAGTACAAGGATTCTTTTCTCTCTCTTTTTTTTTCTTAACCCGTATTTTGAAAGTGATAGTATACGAGACATCTTTACAAG
Unaligned ( gi|28 ): ATATTGAAGATATTTATAGACATGTGCAATAGATATACATATGTATA

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                            
lowQualScore                  :                                                                                  11111                       111111      22222222                               1111111111                      5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555                                                                                                                                             22222222222222222222222     1111                          111                   11111                        1                  1111111111                        333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                                                                 555555555555555555555555555555      22222222                                  111111111              11        111        777777777777777777777777777                                               111111111           11111                                                                   1111              11                          2222222   1111           111   111111111                                111            11                 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000   11           11          33              
lowQualScore                  :                                                      7   5  3  2 2   2 5555  4   00000    1 2   2 2  999 2 4 000000  2   55555555   7777777 2      2  2 2 2 7   5555555555 2   55555  5555 2  2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 4 4  333    2   66 33   2 22 2 6 77777  4 2  2 1   7777 333  2 55  2  2 4444  2 33 33 2 333   55555  55555    3 2   2 77 33   2 777 55 666  55555555555555555555555   2 7777  33 4 444    33  2 2  2  000  666 2  55555  4  66666      7 5  2  2       2 0 33 2   5   2 2 2 6666666666  2  4 33 4 555     4   555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555      4  55   4      33 2  9999  2   2 2 55  0  2       33 2     555555555555555555555555555555   5  11111111  2 88888888     77777 2 2 2 33   111111111    33 2  5   66 33 2   444     2  000000000000000000000000000        5 33  5 2       2  2 2  0  2  2  33    333333333 6666 6666 22222   2  5  2  33  33               2 2 2 33      2 6666 2 77777      0000 5 2      77  00 2   33 2  33 2 2 2 2 5 3 1111111   0000      33   222   111111111   333  2  5  555   3  44   77  111  6 3 3   3 22           3     77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 11 1  55555  55          55   8       1  
lowQualScore                  :                                                      .   .  .  . .   . ....  .   .....    . .   . .  ... . . ......  .   ........   ....... .      .  . . . .   .......... .   .....  .... .  . ................................................................ . .  ...    .   .. ..   . .. . . .....  . .  . .   .... ...  . ..  .  . ....  . .. .. . ...   .....  .....    . .   . .. ..   . ... .. ...  .......................   . ....  .. . ...    ..  . .  .  ...  ... .  .....  .  .....      . .  .  .       . . .. .   .   . . . ..........  .  . .. . ...     .   ..................................................................      .  ..   .      .. .  ....  .   . . ..  .  .       .. .     ..............................   .  ........  . ........     ..... . . . ..   .........    .. .  .   .. .. .   ...     .  ...........................        . ..  . .       .  . .  .  .  .  ..    ......... .... .... .....   .  .  .  ..  ..               . . . ..      . .... . .....      .... . .      ..  .. .   .. .  .. . . . . . . .......   ....      ..   ...   .........   ...  .  .  ...   .  ..   ..  ...  . . .   . ..           .     .............................................................. . .. .  .....  ..          ..   .       .  
lowQualScore                  :                                                      5   0  2  4 4   4 0000  7   99999    8 4   4 4  777 4 7 000000  4   99999999   2222222 2      4  4 4 4 1   3333333333 4   99999  4444 5  4 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 4  777    1   88 99   0 88 0 0 88888  0 0  0 9   0000 333  0 33  7  2 7777  2 11 11 2 999   66666  66666    2 2   2 55 11   2 888 33 111  88888888888888888888888   2 0000  11 4 888    11  2 2  2  000  111 2  66666  4  88888      5 0  5  5       5 0 44 5   0   4 4 4 1111111111  4  7 22 7 333     7   777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777      7  66   7      22 4  4444  4   4 4 66  9  5       44 5     555555555555555555555555555555   7  66666666  9 55555555     11111 9 9 9 99   444444444    99 9  0   22 99 9   666     9  555555555555555555555555555        7 99  7 9       9  9 9  7  9  9  99    000000000 1111 1111 55555   9  7  9  99  99               9 9 9 99      9 1111 9 11111      4444 7 9      99  77 9   99 9  99 9 9 9 9 7 6 4444444   0000      99   888   444444444   777  9  7  000   1  22   33  555  2 1 1   3 55           8     44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 00 0  00000  22          00   0       0  
consensus                     :                                               AAGTTTA-GCT-TTTGA-A-AAA-A----GC-TTA-----GGGAGT-CAG-C-CA---G-T-A------GA-CTG-T--TAA-TTA-------A-GTGAAG-GT-G-A-T-GGA----------A-TTT-----TT--C-TTTT-T-CA--CTTCT-T------------------TTTT-TT--AT----GGC-G--------T-----G-T-GT---TAAT-TGA--AG-TAA-T--C-A-G-----TG-G-CG-G-ATT--T-A---TA-A--GGGCG-C----AC-A--C--T-C---CCT-----CG-----GGAATT-TTT-T--A--GAA-T---G--T---TA----------------T-C----TTT-T--G-GC--G-AC--TTTT--AC-A-GA-TA---TA---G-AC-----CA-AT-CCC-ACACGT-C-TC-GC-TGCTGAC-A-T--A-CAC-GGA-A-A-A--------C-AG-CA-T--G-C-G-AACAA-TGC-AT-------TTT-T-A---------------------A---------T------T----------CCGGAC-GT--CCG-AGAAAG--C-AC--T-AT-ACA-C-A--ACCTC-TGCTTGG--T-CAGGC----------C---------T---------TCT-GTC------CGC-C---A----GATTT-----G-T-G-T--TTT---------GTTG--T-TGTTTTTAA--A-ACG---GTTAC-GTAC-ATG-T-----------------A-TGTAAACG-T--CA-G-AAAATAT-TA-T-AACTG-GA-AA--GGAG-A-------T----G----CAG---TTG-AA-AG-CA--AA--CTAACAAATGAAATA-A-T-G--AATGAA-A----T-T-----TGACAG-C--A-T-AAAAAAN-TT--C-CAA--T-CA--T-T-A-G-A-TAT-------TTG----TGAAAA--AGGT--TGT---------AAA-T-TT-TT-CG---TGT-AA--TTG--TA---AA-T-A-CTG-A--TCTTCCCGATACCCGATTNNNTATNNNNNNTTTTTTTTAAAAAAAGTTTT---T-GTAATTTGAGGAA-GAGG-A----TCCCAGTACAAGGATTTCTTTTCTCTTT-TTTT-TTTTCTTNTA
Reference ( family-8961 )     :                                               AAGTTTA-GCT-TTTGA-A-AAA-A----GC-TTA-----GGGAGT-CAG-C-CA---G-T-A------GA-CTG-T--TAA-TTA-------A-GTGAAG-GT-G-A-T-GGA----------A-TTT-----TT--C-TTTT-T-CA--CTTCT-T------------------TTTT-TT--AT----GGC-G--------T-----G-T-GT---TAAT-TGA--AG-TAA-T--C-A-G-----TG-G-CG-G-ATT--T-A---TA-A--GGGCG-C----AC-A--C--T-C---CCT-----CG-----GGAATT-TTT-T--A--GAA-T---G--T---TA----------------T-C----TTT-T--G-GC--G-AT--TTTT--AC-A-GA-TA---TA---G-AC-----CA-AT-CCC-ACACGT-C-TC-GC-TGCTGAC-A-T--A-CAC-GGA-A-A-A--------C-AG-CA-T--G-C-G-AACAA-TGC-AT-------TTT-T-----------------------A---------T------T----------CCGGAC-GT--CCG-AGAAAG--C-AC--T-AT-ACA-C-A--ACCTC-TGCTTGG--T-CAGGC----------C---------T---------TCT-GTC------CGC-C---A----GATTT-----G-T-G-T--TTT---------GTTG--T-TGTTTTTNA--A-ACG---GTTAC-GTAC-ATG-T-----------------A-TGTAAACG-T--CA-G-AAAATAT-TA-T-AACTG-GA-AA--GGAG-A-------T----G----CGG---TTG-AA-AG-CA--AA--CTAACAAATGAAATA-A-T-G--AATGAA-A----T-T-----TGACAG-C--A-T-AAAAAAA-TT--C-CAA--T-CA--T-T-A-G-A-TAT-------TTG----TGAAAA--AGGT--TGT---------AAA-T-TT-TT-CG---TGT-AA--TTG--TA---AA-T-A-CTG-A--TCTTCCCGATACCCGATCNNNNNNNNNNNNTTNTNTTNGNNAAAAGNCTT---T-GTANNNTGGGGANCGNGNNNNNNCTNCNCGNACNNNNNTTNCCTTTCTCCTTGGTTT-TTTTCTTNTA
gi|1                          :                                                  TTTATGCT-TT--A-A-AAATA----GCCTTA-----GGGAGT-CAG-C-CAAAAG-T-A------AA-CTG-T--GTA-TTA-------A-GTGAAG-GT-G-AAT-GG------------------------------T-T-CA------T-T------------------TGTC-TC--ATCGGAGGA-G--------A-----G-G-GTGGATAAT---A--AG-TAA-T--CTA-G-----TGAG-CG-G-ATTAGT-ACAATA-A--GGGCA-C----AC-A--C--T-C---CCT-----CG-----GGAATT-TTT-T--A--GAACT---GT-T---TA----------------T-CCTTTTTT-T--C-GC--G-AC--TTTC--AA-G-AA-TA---TA---G-ACGACGATA-AT-CAC-AC-TAT-C-TC-GCTTGGTGAC-A-T--A-CAC-CGA-ATA-A--------T-AG-CA-TCAG-C-GAAACAATTGC-ATA------TTT-TTCTAATTTATAGTAATAAAAAAAA---------T------T----------CACGAC-GTAACGG-ATAAAG--C-ACTAT-AT-ATA-C-A--ACCTC-TGCTTG-----CAGGCCTCAGAAACGC---------T---------TCT-GTCATGTTTCGCTC---ATCATGACTTGGTGAG-T-G-A--TCTAAATTCAAAGTTGTAT-CGTTTTTAA--A-ACGCGTGTTAC-GT-T-ATG----------------------GTAAACGTT--CA-G-AAAATAT-TA-TAAACGG-GA-AAATGTGA-A-------T----GTCTCCGT---TTG-AA-AGACA--AAAGCTATCAAATGAAATATA-T-G--AGTTGA-ATAATT-T-----TGACAA-G--A-T-AGAAAGA-TT--A-CAAACT-CAATT-T-A-GTA-TAT-------TTGGTTTTGAAGAATAAGT--TATGTTAACTCCAAA-TGTT-TT-CAATTTGT-AA--TTC--CATTCAA-T-A-CT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   C-----CA-AT-CC--ACACGT-CCTC-GC-TGCTGAC-A-T--A-CAC-GGA-A-A-A--------C-AG-CA-T--G-C-A-AACAA-TGC------------------------------------------------T------T----------CCGGA--GT--CCG-AGAAAG--C-AC--T-ATAACA-C-A--A--TC-TGCTTGGATT-CAGGC-------------------------------CT-G-------------------------T-----G-T-GTT--TTT---------GTTG--T-TG--TTTAA--ACACG---GTTAC-GTAC-ATG-TGTATTTTTACC------A-TGT-AACG-T--CA-G--AAATAT-TA-T-AACTG-GA-AA--GGAG-A-------T----G----CAG---TTG-AA-AG-CA--AA--CT-ACAAATAAAATA-A-T-G--AATGAATA----T-T-----TGACAG-C--AGT-AAAAAGATTT--C-CAA--T-CA--T-T-A-G-A-TAT-------TTG----TGAAAA--AGGT--GTT---------AAA---TT-TT-CG---TGT-AA--TTG--TA---AA-T-A-CTG-A--TCTTCCCGATACCCGATTATATATATATATTTTT------TAAAAGTTTT---TAATTGTTTGAGGAA-G---------TCCCAGTACAAGGATTTTTTCTCTTCTT-TTTT-TTTTCTTttctatcaattctctcgaatacaactaaaccggaatagtttcagtaattttatgtaaagaatgaatagaagaactaactttttgccataagtctcagtctataacaacggattcttttctctttttttttccttaactcgtattttgaaagtgattatagtattaattgcaaagacatctttacaag
gi|11                         :                                                AGTTTATGCTGTTTGA-A-AAA-A----TC-TTA-----GGGA-T-CAG-C--A---G-TTA------GA-CTG-T---AA-TTA-------A-GTGAAG-GT-G-A-T-GGA----------A-TTT-----TT--C-T-------A--ATT-------------------------------GT----GGG-GGGGGGGGCT-----G-T-GT---TAAT-TGAC-AG-TAA-T--C-AAG-----TG-G-CG-G-ATT----A---TA-A--GGCCG-C----AC-A--C--T-C---CCT-----CT-----GGAATT-TTT-TT-A--GAA-TTTTG--T---TAA---------------T-C----TTT-T--TTGC--GGAC--TTTT--AC-A-GA-TAAATTA---G-AC-----CA-ATGTCC-ACACGTTC-TC-G--TGCTGAC-A-T--A-CAC-GGA-A-A-A--------TTAG-CA-T--GGC-G-AACAA-TGC-ATGTTCTATTTT-T-----------------------A---------T------TAAAAAAAAATTCGGAC-GT--TCGGAGAAAG--C-AC----AT-ACA-C-A--ACCTC-TGCTTGG--T-CAGGC----------CAGAACGCTTT---------TCTTGTT------CGC-C---A----GATTT-----G-T-G-T--TTT---------GTTG--T-TG-TTTTAA--A-ACGC--GTTAC-GT-------T-----------------A-TGTAAAtacccgtatttgaaagtgatagtattacgaagacatctttacaag
gi|12                         :                                                AGTTTATGCTGTTTGA-A-AAA-A----TC-TTA-----GGGA-T-CAG-C--A---G-TTA------GA-CTG-T---AA-TTA-------A-GTGAAG-GT-G-A-T-GGA----------A-TTT-----TT--C-T-------A--ATT-------------------------------GT----GGG-GGGGGGGGCT-----G-T-GT---TAAT-TGAC-AG-TAA-T--C-AAG-----TG-G-CG-G-ATT----A---TA-A--GGCCG-C----AC-A--C--T-C---CCT-----CT-----GGAATT-TTT-TT-A--GAA-TTTTG--T---TAA---------------T-C----TTT-T--TTGC--GGAC--TTTT--AC-A-GA-TAAATTA---G-AC-----CA-ATGTCC-ACACGTTC-TC-G--TGCTGAC-A-T--A-CAC-GGA-A-A-A--------TTAG-CA-T--GGC-G-AACAA-TGC-ATGTTCTATTTT-T-----------------------A---------T------TAAAAAAAAATTCGGAC-GT--TCGGAGAAAG--C-AC----AT-ACA-C-A--ACCTC-TGCTTGG--T-CAGGC----------CAGAACGCTTT---------TCTTGTT------CGC-C---A----GATTT-----G-T-G-T--TTT---------GTTG--T-TG-TTTTAA--A-ACGC--GTTAC-GT-------T-----------------A-TGTAAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       G-C----AC-A--C--TTC---CCT-----CG-----GAAATT-TTT-T--A--GAA-T---G--TG--TA----------------T-C----TTT-TT-G-GC--G-AT--TTTT--AC-ACGA-TA---TA---G-AC-----CA-AT-------ACAT-C-TC-GC-TGCTGAC-A-T--A-CACTGGA-A-A-A--------C-AGGCA-T--G-CCA-AACAAGTGC-AT-------TTTATGAAAA------------------A---------T------T----------CCGGAC-GT--CCG-AGAAAG--C-ACG-T-AT-ACA-C-A--ACATC-ATCTTTG--T-CAGGC----------C---------T----------CT-GTC-------GC-C---A----GA--------G-T-G-TAGTTT---------GTTG--T-TGTTTTT-A--A-ACGTG-GTTAC-GTAC-ATG-T-----------------AATGTAAACG-TTTCA-G-AAAATAT-TAAT-AACTG-GA-AA--GGAA-AAAAAGATT----G----CAG---TTG-AAGAG-CA--AA--CTAACAAATAAAATA-A-T-G--AATTAA-A----T-T-----TGACAGCC--A-T-AAAAAAA-TT--C-CAA--TCCA--T-T-A-G-A-TAT-------TTG----TGAAAA--AGGTTCTGT---------AAATT-TT-TT-CG---T
gi|14                         :                                                gGTTTA-GCT-TTTGA-A-AAA-G----AC-TTT-----GGGAGT-CAG-C-CA---G-T-A------GA-CT-------A-TTA-------A-GTGAAG-GT-A-A-T-GGA----------A-TTT-----TT--C-TATT-T-TT--TTTAT-T------------------TTTT-TT--------GGC-G--------T-----G-T-GT---TAAT-TAA--AG-TAA-T--C-A-G-----TG-G-CG-G-ATT--T-A---TA-A--GGGCG-C----AC-A--C--T-C---CCT-----CG-----GGAA-T-TTT-T--A--GAA-T---G--C---TA----------------TGT----TTT-T--T-GC--G-AC--GTTT--AC-A-GA-TA---TA---G-AC-----CA-AT--CC-ACAAGT-C-TC-GC-TGCTGAC-A-T--A-CAC-GGA-A-A-A--------T-AG-CA-T--G-C-G-AACAA-TGC-AT-------TTT-CTATATATAAAAAA----------A---------T------T----------CCGGAC-GT--CCG-AGAAAG--C-AC--T-AT-ACA-C-A--ACCTC-TGCTTGG--T-CAGGC----------C---------T---------c
gi|15                         :                                               AAGTTAA-GCT-TTTGAGA-AAA-A----GC-TTA-----TGAAGT-CGA-T-CGC--G-T-A------GA-TTG-TA-TAA-TTACATGTAAA-GTGAAG-GT-GTA-T-G-----------------------------------TA--CGTTT-T------------------TCTA-TT--GG----GGG-G--------GAGGGGG-T-GT---TAAT-TGA--AG-TAA-T--C-A-G-----TG-A-AG-A-A----T-A---TT-A--GCGTG------AC-A--CTTT-C---CCT-----CG-----GGAATT-TTT-G--A--GAA-----G--T---TATAC-------------T-C----TCT-T--G-AC--G-ATGCTTTT--ACAA-GACTG---TA---G-AC-----GACAT-CAT-A-ACGT-C-TCTGC-TG-TGAC-AGT--A-CAC-GGATA-A-A--------T-AC-CATT--G-C-G-AATAA-TGC--T-------TTC-TGAGTATAGTACAAA---------A---------T------T----------CCGGACGGT--CCG-AGAAAG--C-AC--T-AT-ATA-C-A--ATCTC-TGCTTGG--TACAGGC----------C---------agaacgccgtggtccgccggttcccaaggtataccacttgtgtttt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c-A-A-A--------T-AG-CA-T--G-C-G-AACAA-TGC-AT-------TTT-CTATTGATAAAAAA----------A---------T------T----------CCGGAC-GT--CGG-AGAAAG--C-GC--C-AT-ACA-C-A--ACCTT-TGCTTGG--T-CAGGC----------CCAGAACGC-T---------TCT-GTC-------GC-C---A----GATTT-----G-T-G-T--TTT---------GTTG--T-TGTTTT--A--A-ACG---GTTAC-GTA--------------------------TGTAAACG-T--CA-G-AAAATAT-TA-T-AACTG-GA-AA--GGGG-A-------T----G----CAG---TTG-AA-AG-CA--AA--CTAACAAATGAAATC-A-T-G--CATGAC-A----T-T-----TCACAA-C--A-T-AAAAAAA-TA--C-CAA--T-CA--T-T-A-G-A-TAT-------TTG----TGAAAA--AGG---TGT---------AAA-T-TG-TT-CG---TGT-AA--TTGTATA---AA-T-A-CTG-A--TCTTCCCGATACCCGATc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  --AG-TAA-T--C-A-G-----TG-G-CG-G-ATT--T-A---TA-A--TGGCG-C----AC-A--C--T-C---CCT-----AG-----GGAA-T-TTT-T--A--GAA-T---A--T---TT----------------T-CT---TTT-T--T-GC--G-AC--TTTT--AC-A-GA-TA---TA---G-AC-----CA-AT--CC-ACACGT-C-TC-GC-TGCTGAC-T-T--A-CAC-CGA-A-A-ATGCATTTTC-AG-TA-C--A-A-G-GATAA-T--------------------------------------------------T------T----------CCGGAC-GT--CCG-AGAAAG--C-AC--G-AT-ACA-C-A--Atcgtattt
gi|18                         : acaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GCC-TTTGA-ATAAA-A----GC-TTA-----GG-AGT-CAG-CGCC---G-T-ATGTATTGA-CTG-T--TA---TA-------A-GAGAAG-GT-G-A-T-GGAGAAA------A-TTT-----TT--T-TTTTCT-TA---TTCA-T------------------TTAT-TT---------GC-G--------T-----GAT-GT---TC-T-TGATCAGCTAA-TATC-A-AGAGGTTG-G-CG-GTATT--TTA---TA-A--TGGCG-C----AC-A--C--T-A---CCTTGACACG-----GGAATTATTG-T--A--GAT-G---G--T---TA----------------T-C----TTTGT--G-GC--G-A---CTTT--AC-A-GA-TA---GATGTG-A------CA-AT--TT-ACACG
gi|19                         :                                                               A-A-AAA-A----GC-TTT-----AGGAGT-CAG-C-C----G-T-A------GA--TG----TAA-TTA-------A-GTGTAG-GT-G-A-T--------------A-TTTTAATATT--CGTTTT-T-TG--TTTAT-TGCTGTTTAGTTATAATTATTTT-TT--TT----GG--G--------T-------C-GT---TAAT-TGA--AA-TGA-T--C-A-G-----TGAG-TG-G-ATT--C-A---TACAATGGACG-CCAAAAC-A--C----A---CCT-----CG-----GGAA---AAT-T--G--GGA-T---G--T---TACTTATTTTTTTTTTTTT-T----TTT-T--ATGC--G-AC--TTTT--AT-A-GA-TA---TA---G-
gi|2                          :                                              ttAGTTTA-GCT-GT-GA-A-AAA-A----GC-TTA-----GGGA-T-CAG-C-CA---G-T-A------GA-CTG-T----A-CTA-------A-GTGAAAAGT-G-A-TTGGA----------A-TTT-----TT--C-TTTT-TTCAACCTTCT-T------------------TTTT-TT--AT----G-C-G--------T-----G-T-GT---TAAT-TGA--AA-TAA-T--C-A-G-----AG-G-CG-G-ATTA-T-A---TA-AA-GGGCG-C----AC-GGTC--T-CATGCCT-----CACCCCTGGAATT-TT-----A--GAA-T---G--TGGTTAA---------------T-CG---TTT-T--T-GC--G-AT--TTTA--GT-A--A-TA---TA---G-AC-----CA-AT-CC--ACGCGT-CATC-GC-TGCTGAC-AGT--AACAC-GGA-A-ACA--------C-AG-CAAT--G-C-A-AACAA-TGC-------------------------------------------------------T----------TCAGAC-GTA-CCG-AGAAAG--C-AC--T-AT-ACA-C-A--ACATC-TGCTTGG--T-CAGGC----------C---------T---------TCT--TC------C---C---A----GATTT-----G-T-G-T--TTT---------GTTG--T-TGTTTTTAA--A-ACG---GTTAC-GTAC-ATG-TGTATTTTTTTTTTTTACA-TGTAAACGTT--CA-G-AAAATAT-TA-T-AACTG-GA-AA--GGAGAA-------T----G----CAGTCTTTG--A-AG-CA--AA--CTAACCACTAAAATA-ATT-G--AATGAA-A----T-T-----TGACAG-C--ATT-AAAAAAT-TT--C-CAA--T-CA--T-T-A-G-A-T-T-------TTG----TGAAAA--ATGG--TGT---------AAA-T-TT-TT-CG---TGT-AA--TTGT-TA---AA-T-A-CTG-AT-TCTTCCCGATACCCGATCATATACATGTAATTATATTTGTTAAAAAGTTT---T-ATATGTTGAGGAGCGTGCCCACGTTACAAGGATTCTCTTTCTCTTTCTCTTT--TTT-TTTTCTTATAcc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AACG-T--CA-G-AAAATAT-TA-T-AA-TG-GA-AA--GGAG-A-------T----G----AAG---T-G-AA-AG-CA--AA--CTAACAAATGAATTA-A-T-G--AATGAA-A----T-T---------AA-G--A-T-AAAAAAT-TTAGC-CAA--T-CA--T-T-A-G-ATTATTTAAATATTG----TGAAAA--AGCC--TGT---------AAT-T-TT-TT-CG---TGT-AA--TTG--TAT--AATT-A-CTG-ATTTCTTCCCGATA-CCGATcccgtattttgaaagcgatagtaattacgcgaagacatctttaaaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AACG-T--CA-G-AAAATAT-TA-T-AA-TG-GA-AA--GGAG-A-------T----G----AAG---T-G-AA-AG-CA--AA--CTAACAAATGAATTA-A-T-G--AATGAA-A----T-T---------AA-G--A-T-AAAAAAT-TTAGC-CAA--T-CA--T-T-A-G-ATTATTTAAATATTG----TGAAAA--AGCC--TGT---------AAT-T-TT-TT-CG---TGT-AA--TTG--TAT--AATT-A-CTG-ATTTCTTCCCGATA-CCGATtcgtattctgaaaaag
gi|22                         :                                                  TTTT-GCT-TTTGA-A-AGA-AATAAGC-TTAATATAGGGAGTTCAG-T-CA---GAT-ATT----GA-CTG-T----A-TTA-------ATGTGAAA-GT-G-A-TAGGAGTTTTTGTCTA-TTT-----TT--C-TTCT-T-T---CTTTT-T------------------TTTTGTT--AT----GGC-G--------T-----G-T-GT---TAATATGA-----TAT-T--C-A-GTC---TG-G-CG-A-ATT--T-A---TA-tcgtattctgaaaaag
gi|23                         :                                            agtAAGTTTA-GCT-TTTGA-A-AAA-A----GC-TTAATTA-GGGAGT-CAG-T-CA---G-T-A------GA-CTG-T----A-TTA-------A-GTGAAA-GT-G-A-T-GGA----------G-TTT-----TT--C-TTTT-T-T---CTTCT-TCTTTTT------------TTTT-TT--AT----GGC-G--------T-----G-T-GT---TAAT-TGA--A--TAA-T--C-A-G-----TG-G-CG-A-ATT--T-A---TA-
gi|24                         :                                                AGTTTA-GCT-TTTGA-A-AAA-A----GC-T-A-----GGGAGT-CAG-C-CA---G-T-A------GA-CTG-TATTA---TA-------A-GTGAAA--T-G-A-T-GGA----------A-TTT-----TTTTC-TTTT-T-CAAGCTTCT-T------------------TTTT-TT--AT----GGC-GG-------T-----G-T-GT---TAAT-TGA--AA-TAA-T--C-A-G-----AG-G-TG-G-ATT--T-A---T
gi|25                         :                                                AATTTA-CTT-TTTGA-A-AAA------GC-TT------GGGAGT-CAGTC-CA---G-T-A------GA-CT-----TA--TTA-------A--TGAAG-GT-G-A-T-GGA----------A-TTT-----TT--C-TTTT-T-T--------------------------------------T----GG-------------------T-GT---TAAT-TGA--AA--GA-T--C-ATG-----TG-G-C--G-ATT--T-A---TA-A--GG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -ATT--T-A---TA-A--GG-CG-C----AC-A--C--T-C---CCT------G-----CGAATT-TTT-TTAG--GAA-T---G--T---TA----------------T-C----TTT-TTTG-GC--G-AT--TTTT--AC-A-GA-TAC--TA---G-AC-----CA-AT-Cctca
gi|3                          :                                               AAGTTTA-GCT-TTTGA-A-AAA-A----GC-TTA-----GGG-GT-CAG-C-CA---G-T-A------GA-CTG-G--TA---TA-------A-GTGAAA-GT-G-A-C-GGA----------GTTTT-----TT--C-TTTT-T-TC--TTTCTCT------------------TCTT-TT--TT----GG--G--------TG----G-TGGT---TAAT-TTG--AA-TAA-T--C-A-G-----TG-G-CG-G-ATT--T-A---TA-A--GGGCG-C----AC-A--C--T-C---CCT-----CG-----GGAATT-TTT-T--AAGAAA-T---G--G---TA----------------T-CT---TTT-T--G-GCAAA-AT--TTTT--AC-A-GA-TA---TA---G-AC-----CA-AT-CCCAACACGTCC-TC-GC-TGCTGAC-A-TAAA-CAC-GGA-A-A-A--------C-A--CA-T--G---A-AACAA-TGCAAT-------TAT-T-----------------------ATGAAAAAATT------T----------CCGGAC-GT--CCG-AGAAAG--C--C--T-AT-AAC-C-A--ACATC-TGCTTGG----CAGGC----------C---------T---------TCT-GT-------CGC-CA--A----GATTT-----G-TGG-T--TTT---------G--G--T-TGTT---------AC----GTAACAATTC-ATG-T-----------------A--GTAAACG-T--CA-G-AAAA-ATATA-T-AGCTGAGA-AG--GAAG-A-------T----G----C-G---TTGAAA-AG-CA--AA--CTAACAAATAAAATA-A-T-G--AATGAA-A----T-T-----TGACAG-CAAA-T-AAAGAAATTT--C-CAA--T-CA--T-TAA-G-A-TAT-------TTG----TGAAAA--AGG---TGT---------ACA-T-TT-TTCCG---TGTAAA--TTG--TA---AA-G-ACCTG-A--TCTT-CCGATA-CCGAT----TATTATATATTTTTTT---AAAAAGTTTTAAAT-GT---TTGAAGAA-G---------TCCCAGAACAGAGGATT-CTTTCTCTTTCTTTT-TTTTTTCTTA
gi|4                          :                                                  TTTA-GCT-TTTGA-A-TAA-A----GC-TTA-----GGG--T-CAG-C--A---G---A------GA-CTG-T----A-T-A-------A-G-GAAA-GT-G-A-T-GGA----------A-TTT-----TT--C-TTTT-T-C----TTCT-T------------------TTAT-T---------GGC-G--------T-----GGT-GT---TAAT-TGA--AA-TAA-T--C-A-G-----TG-GGCG-G-ATTC-T-A---TA-A--GGGCG-C----AC-A--C--T-C---CC------CG--------ATG-TTT-T--A--GAA-T---G--T---TA----------------T-C----TTT-T--G-GC--G-AT--TTTTTCAC-A-GA-T----TA---GAAC-----CA-AT--CC-ACCAGT-T-CT-GC-TGCTGAC-ACT--A-CCA-GGA-A-A-A--------C-AA-CA-T--G-C-C-AAC-A-TTC-AT-------TTA-TGAA--------------------A---------T------T----------CCGGACGGT--CCG-AGAAAG----ACT-T-GT-ACA-CTATTACATC-TGCTTGG--T-CAGGC----------C---------T---------TCT-GT-------CGC-C---A----GATTT-----GTT-G-T--TTT---------GTTG--T-TGTTTT--A--A-ACG-----TAC-GTCA-ATG-T-----------------A-TGT-AACC-T--CA-GAAAAATAT-TA-T-AACTG-GA-AA--GGAG-A-------T----G----CAG---TTG-AA----CA--AA--CTAACAAATGAAATG-A-TCG--AATGAA-A----T-TTTGAATGACAG----A-T-AAAAAAT-TT--C-AGA--T-CA--T-T-ATG-A-TTTG------TTG----CTAAAA--AGGT--TGT---------AAA-T-TT-TT-CG---TGT-AATTTTG--T----AG-T-A-CTGAA--TCTT-CCGATGTCCgcccgtattttgaagtgtatagtatttacgaagaaacatctttacaa
gi|5                          :                                            agtAAGTTTA-ACT-TT-GA-A-AAA-A----GC-TTA-----GGGAGT-CAG-C-CA---G-T-A------GA-CTGAT--TAAGTTA-------A-GTGAAA-GT-G-A-T-GGA----------A-TTT-----GT--C-TTTT-T-CAG-CTTCT-T------------------TTTT-TT--AT----GGC-G--------T-----G-T-GT---TAAT-TGA--AA-TAA-T--C-A-G-----AG-G-CG-G-ATT--T-A---TA-A--GGGCG-C----AC-A-----T-C---CCT-----CG-----GGAATT-TTCAT--A--GGA-T---G--T---TA----------------T-C----TTT-T--G-GC--A-TT--TTTT--AC-A-GA-TA---TA---G-AC-----CA-AT-CCC-ACACGT-C-TC-GC-TGCTGACTA-T--A-CAC-GGA-A-A-A--------C-AG-CA-T--G-C-A-AACAA-TGC------------------------------------------------T------T----------CCGGAC-GT--CCG-AGAAAG--C-AC--T-AT-ACA-C-A--ACAT--TGCTTGG--T-CAGGC----------C---------T---------TCT-GTC------CGC-C---A----GATTT-----G-T-G-T--TTT---------ATTG--TATGTTTTTTA--A-ACG---GTTAC-GTAC-ATG-TGTATTTTTTAC------A-TGTAAACG-T--CA-G-AAAATAT-TG-T-AACTG-GA-GA--GGAG-A-------T----G----C-A---TTG-AA-AG-CA--AA--C-AACAAATAAAATA-A-T-G--AATGAA-A----T-T-----TGACAG-C--A-TAAAAAAAA-TT--C-CAA--T-CT--A-T-A-G-A-TAT-------TTG----TGAAAA--AGGT--GGT---------AAA-T-TT-TT-CG---TGT-AA--TTG--TA---AA-T-A-CTG-A--TCTTCCCGATACCCGATcttcgatttataatatactccttatctatacttcttatcaactacacagttttttaatattgttgaggactcacgctccaagccctcttcaatccattaggaaattaatcttttctctttctctcattt
gi|6                          :                                               AAGTTTA-GCT-TTTGA-A-AAA-A----GC-TTT-----AGGAGT-CAG-C-CA---G-T-A------GA-C---T--TAA-TTA-------A-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattttttttttttttttta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                   tacT---TAAT-TAA--AG-TAA-T--C-A-G-----TG-G-CG-G-ATT--T-A---TA-A--TGGCG-C----AC-A-----------ACT-----CG-----GGAA----TT-T--A--G-A-T---GTTT---TA----------------T-A----TTT-T--T-GC--G-AC--TTTT--AC-A-GA-AA---TA---G-AC-----CA----TCC-ACACGT-C--C-GC-TGCTGAC-ATT--A-CATAGGT-A-A-A--------------A-T--G-C-----CTA-TTC-AT-------ATA-T-----------------------A---------TAAAAAAT-----------CGAAA-GT--CCG-AGAAAGAACAAC--TAAT-ACACC-A--ACCTC-TGC-TGG--T-CAGGT----------C---------CCAGAAGCTATCT-GAT------CGT-CCAGA----GATTT-----G---G-T--TGT---------ATTG--T-TG-TATTAATTA-ACG---GTTAC--------G-T-----------------A-TGTAAACG-T--CA-G-AAAATAT-TT-T-AACTG-GATAA--GGAG-AT------T----G----CAG---TTG-AA-AG-CAATAA--CT-ACAAATGAAA-A-A-T-G--AATGAA-A----A-T-----TGACAATC--A-T---AAAAA-TTA-CACAA--T-CA--T-T-A-G-A-TTA-------TTGAC--TGAAAA--A-GT----T---------AAA---TT-TT-CG---TGT-AA--TTG--TA---AA-TCA-CTG-A---CTTCCCGATACCCAATTTATATATATATTTTTTTTTAAAAAAAAGTCTT---T-GTAATATAGGGATAAAGGGATATCTCCCCATACAAGGATTGCTTTTCTTCTTGGTTT-TTTTTTTagtaatcagtggcggatttataatggcgcacaactcgggaatttagatgttttatatttttgcgacttttacagaaatagaccatccacacgtccgctgctgacattacataggtaaaatgcctattcatatatataaaaaatcgaaagtccgagaaagaacaactaatacaccaacctctgctggtcaggtcccagaagctatctgatcgtccagagatttggttgtattgttgtattaattaacggttacgtatgtaaacgtcagaaaatattttaactggataaggagattgcagttgaaagcaataactacaaatgaaaaatgaatgaaaattgacaatcataaaaattacacaatcattagattattgactgaaaaagttaaattttcgtgtaattgtaaatcactgacttcccgatacccaatttatatatatatttttttttaaaaaaaagtctttgtaatatagggataaagggatatctccccatacaaggattgcttttcttcttggtttttttttttcttaactcgtattttggaagtgatagtattacaaacacaatctttaccaa
gi|7                          :    tacaagtttagcttttgaaaaaagctttaggagtcagccagtagacTTTA-GCT-TT--G-A-AAA-A----GCATTA-----GGG--T-CA--C-CAAG-G-T-A------GAACTG-T----A-TTA---------GTGAAA-GTAG-A-TTGGA----------G-TTT-----TT----TTTT-T-C---TTCCT-T------------------TTTT-TT--AT----GGCCG--------T-----G-TTAT---TAAT--GA--A--TAA-T--C-A-G-----TG---CG-G-ATT----A---TA-A--GG-CGTC----ACCA--C--T-C---CCT-----CG-----GAA----TTT-T--A--GAA-T---G--T---TA----------------T-------TT-T--G-GC--G-AT--TTTT--AC-A--A-TT---TAT--G-AC-----CATAT-CC--ACA-GT-C-TC-GC-TGCTGAC-A-T--A-CAC-GGA-A-A-A--------C--G-CA-T--G-C-C-AACAA--GC-AT-------TTTATGAAAA------------------A---------T------T----------CCGG-C-GT--CCG-AAGAAG--C-AC--T-AA-ACA---A--GCATCATGC-TGG--T-TA-------------C---------T---------TCT-GT-------CGC-C---T----AATT--------T-G-T--TTT---------GTTG--T-TATTTT--A--A-AT-----TTAC--TACAATGTT-----------------A-AGTAAACG-T--CA---AAAATGT-TA-G-TAC---GA-AA--GGAG---------T----G----C-G---TTG-AACAG-CA--AA--CTAACAAATAAAATA-A-T-GATAATGAA-A----TAT-----TGACAC-G--A-T-TAAAAAA-TT--C---A--T-CA----T-A-G-A--AT-------TTG----TGAAAA----GT--TGT---------TAA-T-TT-TTGCG---TGT-AA---TG--T----AA-T-A--TG-A--TCTTTCCGATACCtcttaactcgtattttggaagtgatagtattacaaacacaatctttaccaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                          T-T------------------TTTC-TTGGAG----GAG-G--------G-----G-T-GT---TAAT-TGA--AG-TAACT--C-A-G-----TG-G-CG-G-ATT--T-A---TA-A--GGGCA-C----AC-A--C--T-C---CCT-----CG-----GGAATT-TTT----A--GAA-T---G--T---TA----------------T-C----TTT-T--T-GC--G-----CTTT--AC-A-GA-TA---TA---G-AC-----CA-AT-CC--ACACGT-C-TC-GC-TGCTGAC-A-T--A-CAC-GGA-A-A-AA-------T-AG-CA-T--G-C-G-AACAA-TGC-AT-------TTT-CTATTTATAAAAAA----------A---------T------T----------CCGGAC-GT--CGG-ATAA-G--C-AC--T-AT-ATA-T-AC-ACCTC-TGCTTGG--T-CAGGC----------CCAGAAACGCT---------TCT-GTCAGT---CGC-C---A----GATTT-----G-T-G-T--TTT---------GTTG--T-TGTTTT-AA--A-CCG---GTTAC-GTA--------------------------TGTAAACG-T--CAAG-AAAAAGT-T--T-AA-TG-GA-AA--TGAG---------T----G----CG----TTG-AA-AG-CA--AA--CTATCAA-TGAAATA-A-T-G--AGTGAA-A----T-T-----TGACAG-C--A-T-AGAAAAT-TA--C-CAA--T-CA--T-T-A-G-A-T-T-------TTG----TGAAAA--AGG---TGT---------AAC-T-TTATT-CA---TGT-AA--TTG--TA---AT-A-A-CTG-A--TC-TCTCGATACCCGAgagtatattattttaaaaatgttatttaatgttgaggaagccagtcacaaggattctttctctttctattttttctaaacattttgaagtgatagtattacgtaagacatctttacgaa
gi|9                          :                                                                                                  nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaTA-------A-GTGAAC-GT-G-A-T-GGA----------A-TTT-----TT---------------------T------------------TTTT-TT---------GC-G--------T-----G-T-GT---TAAT-TGA--AG-TAA-T--C-A-G-----TA-G-CGAG-ATT--T-A---TA-A--GG-CG-C----AC-A--C--T-C---CCT-----CG-----G-AATT-TTT-T-----GAA-T---G--T---TA----------------T-C----TTT-TTTG-GC--G-AC--TTTT--AC-A-GA-TA---TA---G-AC-----CA-AT-CC--ACACGT-C-TC-GC-TGCTGAC-A-T--A-C-C-GAC-A-A-A--------T-AA-CA-T--G-C-G-AA---------------------T-----------------------A---------T------T----------C-GGAC-GT--CCG-AGAAAG--C-AC--T-AT-ACA-C-A--AACTC--GCTTGA--T-CAGCC----------CAGAACGC--T---------TCT-GTC-------GC-C---A----GATTT-----G-T-G-T--TTT---------GTTG--T-TGTTT--AA--A-ACG---GTTAC-GTA--------------------------TGTAA-CG-T--CAAG-AAAATAT-TA-T-AACTG-GA-AA--GGAG-A-------TCGATG----CAG---TTG-AA-AG-CA--AA--CTAACAAATGAAATA-A-T-G--AATGAA-A----T-T-----TGACAG-C--A-T-AAAAAAT-TA--C-CAA--T-CT--TAT-A-G-G-TTT-------TTG----TAGAAA--AGG---TGT---------AAA-T-TT-TT-CG---TGT-AA--TTG--TA---AA-T-A-CTG-A--TCTTCCTGATACCCGATTTATAA---------TTTTTTAAAAAAAGTTTT---T--TAATGT-----ATGAGGAAG---TCCCAGTACAAGGATT-CTTTTCTCTTT--TTTATTTTCTTatagtctttaatgtatgaggaagtccagctacaaggattcttttctcttttttttttccttaactcgtattttgaaagtgattatagtattaattgcaaagacatctttacaa